JP6462763B2 - デジタル顕微鏡を備えたシステム及びこれを用いた試料の検査方法 - Google Patents
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Description
色法を利用して同じケースの画像を表示し、第3のディスプレイは臨床化学、血液学、放射線学など他の専門領域から臨床データを表示してもよい。また、コンピュータ110に接続するのはキーボード130、マウス1400Aおよびマウス1400Bである。1つの実施態様ではマウス1400Aは二次元の通常のマウスであり、マウス1400Bは3D Connexion Space Navigator(登録商標)などの三次元マウスである。三次元マウス1400Bは例えば、環境の配置またはナビゲートに使用し、マウス1400Aは例えば選択、作製または編集に使用し得る。
電子回路も備える。
像する。蛍光照明は通常、無限遠補正した顕微鏡の対物レンズと鏡筒との間で、ダイクロイックミラーを介して光学システムに連結されている。このような場合、センサーおよび蛍光源は共に試料と同じ側にある。光学撮像サブシステム168およびセンサー160を参照すると、1つの実施態様では、センサー160はエリアセンサー、例えば荷電結合デバイス(CCD)を有する市販のデジタルカメラを備える。CCDセンサーはセンサー解像度を表す数百万の感光正方形単位(画素)にさらに分割される。このようなセンサーの標準的な画素サイズ(センサー解像度)は約5ミクロン(μm)×5ミクロンである。試料における光学システムの倍率を用いて画素を表すサイズのことを通常、画素分解能という。倍率0.1<m<40で光学システムを使用すると画素分解能は約50ミクロン〜125ナノメートルになる。
る。例えばセンサー160および光学撮像サブシステム168でラベルの画像を取得することも可能である。
。使用者は自動スライド装填装置またはスライドトレイのどちらかを使用することが選択できる。
84の片持ち部はスライドの一部を固定または支持するように作用する。典型的に、丘状部の厚さまたは高さは数ミリメートルほどであり、長さは0.5cmであり、幅はブラケット183とブラケット184との間の距離である。あるいは、幅の小さい突起を2つ以上使用してもよい。
えられるようにセンサー160を反対端に配置する。スライドの一端またはスライド上のスライドラベルの一端によってx座標およびy座標が決まる。ステージ180はこれらの座標を使用し、スライドラベルからスライドの最初の20〜25ミリメートルを捉えられる配置を確立することができる。画像を継ぎ合わせる際、第1の画像は、他の画像と継ぎ合わせて概観画像を形成する固定基準になると考えられる。画像の最初の部分では、図4は第1の画像または時間1の画像として領域310に指定されたスライド320Aの一部を捉えるセンサー160を示す。その後ステージ180はx方向に約20ミリメートル移動し、センサー160は領域320に表される時間2で第2の画像を取得する。最終的にステージ180はセンサー160の視野内で領域330の第3位置まで移動し、センサーは時間3で領域330の画像を取得する。
の圧縮ソフトウエア(例えばJPEG)で保存し得る。
いセンサー画素を個々のディスプレイ画素に割り振る)。当然のことながら、個々のセンサー画素をより多くのディスプレイ画素に割り振ると、ディスプレイ120上の関心領域の表示部位が拡大するため、画像が拡大したと使用者に分かる。ディスプレイ画素に対するセンサー画素の任意の望ましい比率で、使用者は画像を受け取り、保存できる。
者が概観画像にて選択する。例えば、センサー160が現時点でスライド320Aの画像を取得し(図3参照)、使用者がスライド320Bの関心領域の拡大画像を希望する場合、例えばディスプレイ120のスライドに沿って他のスライドのサムネイル画像と共にスライド320Bのサムネイル画像が提示されるように、使用者はマウス1400Aでナビゲートする。サムネイル画像は画像またはその一部を小さくした表示であり、例えば画素数を減少させて画像の一部を表示したものとすることも可能である。その後使用者はマウス1400Aで(例えばクリックによって)スライド320Bのサムネイル概観画像を選択できる。その後システム100はスクリーン120上のスライド320Bの概観画像の大きい方の画像を表示し、ステージ180はセンサー160によって画像を取得するための位置内にスライド320Bを移動させることができる。拡大画像をコンピュータ110のメモリーに保存するのであれば、システム100はそれを読み出し、ディスプレイ120上に表示する。しかし、拡大画像が存在しない場合、システム100はそれを作成する。当然のことながら、スライド320Bがデジタル顕微鏡150のスライドキャリア210内に収まる必要がある。
の配置に効果をもたらす。1つの実施態様では、この配置エラーの可能性を説明するために、システム100はスライドまたはスライドの一部の新規の画像を取得し、その新規の画像と標記の付いた保存画像とを比較する。例えば、システム100はスライドラベルまたは試料の一隅の新規の画像を取得し、その画像を、それぞれラベルまたは試料の一隅の保存画像に上書きすることもできる。画像の位置が合っていないなら、合うまでシステム100は新規の画像を回転させ、そして/あるいは直線的に配置する。この調整の際、システム100は調整についての情報を保存し、この保存情報を使用して、画像の新規ビューの中で標記が配置されている場所を見つける。簡単な例では、スライドキャリア210および顕微鏡150に再挿入したスライド上の試料の新規の画像は、x方向に3画素の長さであり、標記を含むスライドの元画像とは異なると判断される。新規画像中の標記を示す場合、システム100は古い画像中の標記のx方向位置を理解し、その後、新規画像中に標記を配置するために標記を右に3画素移動させる。
ャンした)画像(カメラアイコン参照)である。システム100は、デジタル顕微鏡150内の保存した組織画像(組織スキャン像)およびスライドのライブ画像、ならびに事前スキャンしたスライドの保存組織スキャン像を表示することが可能である。1つの実施態様では、デジタル顕微鏡150にあるスライドの「ライブ」画像では、センサー160は1秒間に数画像という速度で顕微鏡の現時点での画像を連続的に取得する(再読込する)(ブロック545、図8)。例えば、最後にセンサーがスライド溝220A内のスライド上の試料を感知し、使用者またはシステム100がさらなる動作を指示しないのであれば、センサー160はスライド溝220A内のスライド上に残り、例えば1秒間に6画像という速度で画像を再読込する。1つの実施態様では、画像の試料のみが再読込され、それに付随するラベルは読込まれない。図11では1つのスキャン像を表示し、図12では3つのスキャン像を表示しているが、同時に表示し得るスキャン像は16枚までである。このような場合、選択されたスキャン像すべてを表示するためにビューを分割する。別の実施態様では、1つのケースの複数の画像を複数のスクリーンに表示することも可能である。
Claims (23)
- センサーで基板上の組織試料の一部の画像を第1の倍率で感知する工程と、
感知画像を保存することなく、
センサーにおいて感知したディスプレイ上の画像の少なくとも一部に対して、
保存しない感知画像を表示するようにセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程と、センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比が解像閾値を越える場合、組織試料の一部の領域を第2の倍率で感知して、解像閾値を超えてセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更するために自動的にセンサーを変更する工程とのうち、ユーザの入力に応じて、少なくとも1つの工程を実行することを含む試料の検査方法。 - 組織試料の一部の感知した画像を表示する工程が、前記組織試料の一部の複数の断片を集合させる工程、および集合させた複数の断片を表示する工程を含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 複数の断片の中の1つの断片が隣接の断片と重複し、隣接する断片を集合させる工程には隣接し合う断片の共通する内容を揃える工程が含まれる請求項2記載の試料の検査方法。
- 感知した画像を表示する工程が組織試料全体の画像を表示する工程を含む請求項2記載の試料の検査方法。
- 感知画像を保存することなく、
センサーにおいて感知したディスプレイ上の画像の少なくとも一部に対して、
保存しない感知画像を表示するようにセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程と、センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比が解像閾値を越える場合、組織試料の一部の領域を第2の倍率で感知して、解像閾値を超えてセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更するために自動的にセンサーを変更する工程とのうち、ユーザの入力に応じて、少なくとも1つの工程を実行する工程を実行した後に、
感知した画像を、第1の倍率で保存する工程を含む請求項1記載の試料の検査方法。 - センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程が、1:1を超える比率から1:1の比率へ移行させる工程を含む請求項1記載の試料の検査方法。
- センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程及び第2の倍率で組織試料の一部の画像を感知する工程を含み、
センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程が、大きい画素数比から小さい画素数比へ移行させる工程を含み、
第2の倍率で組織試料の一部の画像を感知する工程の後に、当該感知した画像をディスプレイに表示する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。 - 第2の倍率で感知された組織試料の一部の領域が使用者の入力によって選択された領域に対応している請求項7記載の試料の検査方法。
- 基板上のラベル画像を感知する工程及びディスプレイ上にその画像を表示する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 基板上の組織試料の画像を感知する工程が明視野画像を感知する工程を含み、ラベルの画像を感知する工程が反射率を利用して画像を感知する工程を含む請求項9記載の試料の検査方法。
- センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更した画像及び第2の倍率による画像の少なくとものいずれか1つを表示する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 第1の倍率で感知した画像、センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更した画像、及び第2の倍率で感知した画像をディスプレイ上で同時に表示する請求項11記載の試料の検査方法。
- 複数のスライドを提供する工程をさらに含む方法であって、複数のスライドの各々は組織試料を含み、前記方法は画像を感知するに先だって感知のための複数のスライドの少なくとも1つを指定する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 複数のスライドを提供する工程をさらに含む方法であって、複数のスライドの各々は組織試料を含み、複数のスライドのうちの少なくとも1つの画像及び別のスライドの少なくとも1つの画像をディスプレイ上に表示する請求項1記載の試料の検査方法。
- 前記画像は第1画像であり、
表示する工程は、前記第1画像および第2画像をディスプレイ上に表示する工程を含み、感知した画像を再読込する工程は前記第1画像のみ再読込する工程を含む請求項1記載の試料の検査方法。 - 前記第2画像はコンピュータメモリー記憶域から読み出した画像である請求項15記載の試料の検査方法。
- データ構造内の第1の倍率で感知された画像の少なくとも一部を保存する工程が実行過程に含まれる方法であって、
1を超える第2の倍率で試料の画像を感知する工程、
データ構造内で1を超える第2の倍率で感知した画像を保存する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。 - データ構造内の第1の倍率で感知された画像の少なくとも一部を保存する工程が、感知画像を保存することなく、センサーにおいて感知したディスプレイ上の画像の少なくとも一部に対して、保存しない感知画像を表示するようにセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程と、センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比が解像閾値を越える場合、組織試料の一部の領域を第2の倍率で感知して、解像閾値を超えてセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更するために自動的にセンサーを変更する工程とのうち、ユーザの入力に応じて、少なくとも1つの工程を実行する工程を実行した後の実行過程に含まれる方法であって、
保存する工程が、センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比に基づいた階層画像を保存する工程を含む請求項1記載の試料の検査方法。 - 感知した画像の画素サイズ、倍率及び画素数に基づいて、ある領域を画像内に配置する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 感知した画像の領域を使用者に提供された標記と関連付け、データ構造内で前記領域と前記標記の配置を保存する請求項19記載の試料の検査方法。
- 前記基板はスライドであって、該スライドはラベルを有してステージ上に設置され、感知した画像の少なくとも一部を保存する工程が実行過程に含まれる方法であって、前記方法は、ステージからスライドを取り外してその後ステージに戻すことに対応して、取り外し前の位置に対して組織試料の位置を正しく配置する工程をさらに含む請求項1記載の試料の検査方法。
- 少なくとも1つの画像センサーと、
少なくとも1つの顕微鏡スライドを支持するように構成されたステージと、
少なくとも1つの前記画像センサーと前記ステージとの間に設置され、第1の倍率で画像を投影するように構成された第1光学撮像サブシステムと、
少なくとも1つの前記画像センサーと前記ステージとの間に設置され、第2の倍率で画像を投影するように構成された第2光学撮像サブシステムと、を有するデジタル顕微鏡と、
少なくとも1つの光源を備える照明装置サブシステムと、
前記デジタル顕微鏡に接続し、前記第1光学撮像サブシステムまたは前記第2光学撮像サブシステムを経て投影された前記ステージ上のマイクロスライドの一部の少なくとも1つの画像センサーによって画像を取得するように操作できるコンピュータと、
前記コンピュータに接続し、少なくとも1個の前記画像センサーで取得された画像を表示可能に構成されたディスプレイと、を具備し、
前記コンピュータは、
少なくとも1個の前記画像センサーが取得した画像を保存することなく前記ディスプレイ上に表示し、
且つ、ユーザ入力によって、前記第1光学撮像サブシステムを経て少なくとも1個の前記画像センサーが取得した画像の解像閾値を超えるセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比で表示する場合には、前記第2光学撮像サブシステムを経て取得された画像を自動的に表示させる機械可読命令を含むことを特徴とする装置。 - センサーでスライド上の組織試料の一部の画像を第1の倍率で感知する工程と、
感知画像を保存することなく、
センサーにおいて感知したディスプレイ上の画像の少なくとも一部を、
保存しない感知画像を表示するようにセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更する工程と、
センサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比が解像閾値を越える場合、組織試料の一部の領域を第2の倍率で感知して、解像閾値を超えてセンサー画素からディスプレイ画素への割り振りの比を変更するために自動的にセンサーを変更する工程とのうち、ユーザの入力に応じて、少なくとも1つの工程を実行することを、命令として組み入れたコンピュータ読み取り媒体。
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