CN107255863B - 数字显微镜 - Google Patents

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Abstract

一种方法以及包含执行方法的指令的计算机可读介质，该方法包括在不对衬底上的部分组织样本进行放大的情况下利用传感器感测图像；在显示器上以大于1比1的传感器到显示器像素比显示所感测图像；并且执行以下步骤的至少一个：以预定速率刷新所感测图像，存储所感测图像，修改传感器到显示器像素比，以及感测部分组织样本的区域的放大视图。一种包括数字显微镜(150)的装置，包括：至少一个图像传感器(160)；被配置为支持至少一个显微镜载片(210)的台(180)；被配置为利用等于或小于1的放大率投影图像的第一光学器件(168)；部署在至少一个传感器和台之间的第二光学器件(170)，该第二光学器件被配置为以大于1的放大率投影图像；和光源(195，196)；以及计算机(110)，其耦合到数字显微镜(150)并且可操作以指示由至少一个图像传感器对通过第一光学器件或第二光学器件投影在台上的载玻片的一部分进行图像捕捉。

Description

数字显微镜
本申请是于2013年3月26日进入中国国家阶段的、国家申请号为201180047558.X、发明名称为“数字显微镜”的中国发明专利申请的分案申请。
技术领域
数字显微镜。
背景技术
在各种设置中，出于诊断的目的而需要对生物样品进行检验。一般而言，病理学家和其它诊断医生从患者收集样本并利用显微镜检验以及在分子水平评估样本的其它设备对样本进行研究。在病理和其它诊断过程中通常涉及多个步骤，包括收集诸如血液和组织之类的生物样本、处理样本、制备显微镜载片、着色、检验、重新测试或重新着色、收集额外的样本、重新检验样本以及最终给出诊断结论。
生物样本的检验通常涉及放大样本或样本的感兴趣区域，并且由病理学家或诊断医生进行评估。传统上，这是通过将包含样本的载片放置在显微镜上并且查看通过显微镜所放大的组织样本或组织样本的感兴趣区域的视图来进行的。近来，已经研发出了数字显微镜，其中样本特别是显微镜载片上的样本被放置在仪器中并且样本或样本的感兴趣区域的放大数字图像被捕捉并显示在诸如薄膜液晶显示监视器之类的监视器上。虽然能够在显示器上而不是通过显微镜的透镜来观看样本或者样本的感兴趣区域对于病理学家或其它诊断医生可能是有益的，但是在需要对多个样本进行处理(放大)时，对放大图像进行扫描并且显示该图像所占用的时间会出现令人感到不便的延迟或明显延迟。
附图说明
图1是包括用于检验样本的数字显微镜的系统的框图。
图2是用于在数字显微镜系统中使用的载片载体的实施例的顶部透视图。
图3是通过图2的线条3-3’的截面侧视图。
图4示出了其上具有样本和标签的载片实施例的上部视图并且指示了数字显微镜实施例的传感器视场。
图5示出了均由数字显微镜的传感器所捕捉的三个相邻图像的表示形式。
图6示出了它们被接合在一起之后的图5的三个相邻图像。
图7示出了包括接合在一起的图5的三个相邻图像以及载片标签的载片的图像。
图8描述了由包括数字显微镜的系统进行的图像捕捉实施例的流程图。
图9是示出包括数字显微镜的系统的不同使用模式实施例的显示器截屏的实施例。
图10是示出四个载片及其标签的低分辨率图像的显示器截屏的实施例。
图11是以直播模式示出样本的一部分的显示器截屏的实施例。
图12是以直播模式示出三个不同样本的一部分的显示器截屏的实施例。
图13是在高分辨率扫描期间示出单个样本的一部分的显示器截屏的实施例。
图14是在高分辨率扫描期间示出单个样本的一部分的显示器截屏的实施例。
具体实施方式
图1示出了用于对诸如组织样本之类的样本进行检验的系统的框图。参考图1，系统100包括计算机110。计算机110例如包括中央处理器，其在一个实施例中是Intel Core2Quad，或者最好具有至少4GB的随机访问存储以及至少1TB的硬盘存储器。计算机110还包括DVD写入器以及诸如Windows 7的操作系统。
显示器120连接至计算机110，其被配置为显示从计算机110传送的信息。显示器120例如是基于S-IPS或PVA技术的薄膜液晶显示监视器。24英寸或更大的彩色显示器是代表性示例。可替换地，可以将两个、三个或更多显示器连接至计算机110而以更具结构化的方式向用户提供更多信息。例如，一个显示器可以提供具有苏木精伊红(H&E)染色剂的样本图像，而另一个显示器则示出使用不同类型的染色方法的相同案例的图像，并且第三显示器可以示出来自诸如临床化学、血液学、放射学的其它学科的临床数据。键盘130、鼠标1400A和鼠标1400B也连接到计算机110。在一个实施例中，鼠标1400A是二维常规鼠标而鼠标1400B则是诸如3DConnexion Space NavigatorTM的三维鼠标。三维鼠标1400B例如可以被用来定位或导航环境，而鼠标1400A则例如可以被用来进行选择、创建和编辑
计算机110可以具有互联网和/或互联网连接145以允许系统100远程传输操作和/或连接至网络操作系统。
在系统100的该实施例中，数字显微镜150连接至计算机110。数字显微镜150可以包括一个或多个成像系统，其中包括传感器160和传感器165、光学成像子系统168和光学成像子系统170、自动对焦光学器件和照明器件。每个成像系统可以具有不同的光学分辨率或分辨率范围。至少一个光学系统可以实现放大，m≤1。该系统还可以提供具有放大的高分辨率，m>1。该数字显微镜还包括可在x、y和z方向平移的台180以及控制用电子器件。
数字显微镜150可以作为明亮视场和/或荧光显微镜进行操作。在明亮视场操作的情况下，一个或多个传感器感测样本的吸收并且利用关于样本处于(多个)传感器相对一侧的光源来捕捉台180上的样本图像。如图1所示，均例如为发光二极管(LED)光源的光源195和光源196被定位在台180下方。台180中的开口允许光线通过台180射出以照亮诸如台180上的载片的样本。在荧光显微镜操作的情形中，成像系统对已经被荧光照明光源所激励的荧光标记进行成像。荧光光线通常经由校准到无限远的显微镜物镜和镜筒透镜之间的二色镜耦合到光学系统中。在这样的情况下，传感器和照明光源都处于样本的同一侧。参见光学成像子系统168和传感器160，在一个实施例中，传感器160包括可商业获得的数码相机，其具有例如电荷耦合器件(CCD)的区域传感器。CCD传感器被细分为对传感器分辨率进行表述的数百万个光敏正方形单元(像素)。这样的传感器的典型像素大小(传感器分辨率)大约为5微米(μm)×5微米。使用光学系统在样本上的放大率所表示的像素的大小通常被称作像素分辨率。使用具有放大率0.1<m<40的光学系统，产生大约50微米至125纳米的像素分辨率。
在成像系统的一个实施例中，传感器160被配置为感测并捕捉样本图像，诸如台180上的载片或部分载片的图像。数字显微镜150中的光学成像子系统168包括透镜或物镜1680，其将来自照明子系统的光源195的光线聚焦至传感器60上。通过台180上的载片，来自光源195的光线通过台180中的开口射出。光学成像子系统168的镜1682将光线指向透镜或物镜1680。传感器160可以通过感测图像来捕捉这样的图像，而并不通过光学成像子系统168进行放大(m＝1)或者放大率小于1(m<1)。在一个实施例中，光学成像子系统168和传感器的位置是固定的。镜1682可以通过xy步进电机172在x和y方向移动并且通过z步进电机174在z方向移动。
计算机110从传感器160接收表示所感测图像的信号并且生成用于显示的图像并在显示器120上显示这样生成的图像。
在一个实施例中，传感器165与传感器160相类似。传感器165被配置为捕捉样本图像，诸如台180上的载片或部分载片的图像。传感器165通过光学成像系统170(m>1)捕捉这样的图像。数字显微镜150中的光学成像子系统170可以包括多个物镜。示出了物镜1700A、物镜1700B和物镜1700C。物镜1700A例如是来自Carl Zeiss的具有2.5x放大率的无限远校准类型。物镜1700B例如是来自Carl Zeiss的具有20倍(20X)放大率的无限远校准类型。物镜1700C例如是具有40倍(40X)放大率的Carl Zeiss A-plan物镜。互换这些物镜产生不同的光学系统，其中每个系统导致不同的像素分辨率(例如，针对放大率2.5的2微米和针对放大率20的250纳米)。按照需要，能够替换其它物镜或者能够添加更多物镜。单独物镜可通过xy步进电机172在x和y方向进行移动，这允许特定物镜在需要时与传感器165以及台180上的载片相关联。代表性地，在需要时，物镜和镜1682可以被单独连接至轨道并且通过电机化而沿着该轨道移动并被驱使就位。
在一个实施例中，可以将自动对焦系统167部署在传感器165和光学成像子系统170之间，其包括分束器、自动对焦检测器和自动对焦照明。红外滤波器和镜筒透镜也可以被部署在传感器165和光学成像子系统150之间，诸如自动对焦系统167和传感器165之间。
在一个实施例中，当通过光学成像子系统170捕捉图像时，显微镜150使用位于台180下方的照明子系统的光源196。光源196可以类似于光源195。电机化光圈或光阑与光源196相关联(即，部署在光源196和台180之间)并且包括于照明子系统内，其提供对光谱照明有所改善的科勒照明。
计算机110从传感器165接收表示感测图像的信号并且生成用于显示的图像。所生成的图像被显示在显示器120上。
在以上所描述的实施例中，多个传感器(传感器160，传感器165)被描述为捕捉载片上的样本的图像。在成像系统的另一个实施例中，系统100包括单个传感器，其被配置为捕捉载片或部分载片的图像而并不进行放大(m＝1)或利用小于1的放大率进行放大(m<1)，以及通过放大的光学成像子系统170(m>1)捕捉图像或部分图像。在该实施例中，可以结合可互换光学器件(例如，光学成像子系统168和170)使用单个传感器。类似地，在以上实施例中，不同于用于光学成像系统168的光源195以及用于光学成像系统170的光源196，可以对每个成像系统使用单个光源。
在一个实施例中，数字显微镜150包括控制单元175。控制单元175连接至计算机110。控制单元175连接至计算机110。控制单元175还连接至数字显微镜150的各个组件以基于从计算机110接收的信号对数字显微镜的操作进行控制。代表性地，控制单元控制xy步进电机、z步进电机、光源185、光源196、电机化光圈或光阑187、光学成像子系统168、光学成像子系统170、传感器160和传感器165。
参考作为明亮场显微镜进行操作的数字显微镜150，在一个实施例中，其中组织样本是具有其上印刷有患者标识信息和/或其它信息的标签，该信息例如包括染色剂类型或样本所经受的处理，数字显微镜150能够感测并捕捉这样的信息。然而，使用标签以下的光源照亮标签可能不会使标签信息可见。因此，在一个实施例中，第二光源198被用来照亮载片或载片的标签部分以使得载片标签上的数据可以经由反射而被感测。例如可以利用传感器160和光学成像子系统168捕捉标签图像。
参考图1，台180由控制单元175在三个方向上操控：x方向(如所看到的的边到边)、z方向(如所看到的的上下)以及y方向(如所看到的的页面内外)。z方向也可以通过将光学器件关于样本进行移动来实现。台180在x方向和y方向中由控制单元175所控制的xy步进电机172操控而在z方向中由控制单元175所控制的z步进电机操控。
再次参考系统100的数字显微镜150，该显微镜包括台180。在一个实施例中，台180的大小被设置为运载一个或多个载片。在一个实施例中，可以在台180上包含以包括四个载片的载片托盘。系统1示出了载片载体210。在另一个实施例中，载片装载器可以接合至系统100，其允许自动装载和卸载多达大约240个载片。载片装载器允许系统100自动执行载片成像，而无论在反射成像模式中是否存在用户。用户能够选择使用自动载片装载器或载片托盘。
图2示出了显微镜150内的台180上的载片载体210的代表性示例。载片载体210例如是模塑聚合物材料，其包括均用于保持单独载片(例如，25毫米×76毫米的载片)的四个载片腔室220A、220B、220C和220D。在图2的图示中，三个载片腔室(220A、220B和220C)包含载片，而第四腔室(腔室220D)为空。载片可以由用户或者例如与载片装载器相关联的机制(例如，拾取和放置机器人仪器)自动地放置在相应载片腔室中。在一个实施例中，载片并不被载片载体210机械限制而是部分地停靠在载片腔室内。
图3示出了通过图2的线条3-3'的台180上的载片载体210的侧视图。在该实施例中，载片320A、320B和320C被示为分别处于载片腔室220A、220B和220C中，还示出在载片腔室220D中没有载片。每个载片腔室包括腔室(切除)位置以及高台(plateau)位置(330A、330B、330C和330D)。载片水平停靠在高台部分上。每个高台部分具有高度尺寸以使得当载片停靠在高台部分的上表面上时(如所看到的)，载片的部分厚度在载片载体210的高度尺寸上方延伸一段距离315(如所看到的)。
参考图2和图3，可以看到载片载体210处于台180的容器(pocket)或固定器之内。在一个实施例中，台180是具有支撑数字显微镜150内的载片载体210的大小的模塑塑料件。台180的容器或固定器由从台180的表面181(如所看到的顶部表面)突出的相对的L形支架所形成。图2示出了支架183和184，它们均具有反转的L形状并且彼此相对(其中反转L的基部或悬臂部分朝向相对支架)。支架183和支架184以至少大于载片固定器210的宽度尺寸的距离间隔开来。(例如，如果载片固定器210具有10厘米(cm)到12cm量级的宽度尺寸，则支架183和184以加上0.25cm-0.5cm的距离间隔开来)。每个支架从表面181延伸出大于载片固定器的厚度加上距离315的高度尺寸，载片固定器210的载片腔室中的载片以上述距离315突出超过载片固定器210的表面181。例如，如果载片固定器具有1cm量级的厚度，则每个支架183和184的悬臂或反转L部分的基部处于距离台180的表面181为1cm加上距离315之处。例如，如果距离315为1mm，则每个支架183和184的悬臂部分处于距离台180的表面181为1.2cm或更远处。台180的支架183和184的方位和配置允许载片固定器210被引导进出支架所形成的容器。
参考图3，在一个实施例中，台180在表面181上包括处于支架183和支架184所形成的容器远端(远离载片固定器210进入容器的点)的突起188。突起188具有足以使得台固定器210从台180的表面181抬起并且使得载片固定器210的载片腔室中的任意载片与支架183和支架184的悬臂部分相接触的尺寸。以这种方式，支架183和支架184的悬臂部分用来在载片固定器210处于台180上时固定或支撑载片的位置。代表性地，突起具有数毫米量级的厚度或高度尺寸以及0.5cm的长度尺寸，以及在支架183和支架184之间进行延伸的宽度。可替换地，可以使用两个或更多较小宽度尺寸的突起。
在操作中，数字显微镜150使用传感器160和165之一来感测或捕捉载片上的样本或感兴趣样本区域的图像。传感器捕捉样本的载片图像并且将那些图像以数字信号传送至计算机110，并且这样的信号被显示在显示器120上。在一个实施例中，当捕捉图像并且在显示器120上显示该图像时，可能并不期望以其可以在将来被获取的意义而存储该图像。相反，图像从传感器160或165传送至计算机110而并没有来自用户或系统的一些采取另一动作的指示，代表性地，该图像以每秒钟数个图像这种量级的刷新率进行刷新。该刷新率可以有所变化。如果没有显微镜的动作，则例如无需刷新图像。
在一个实施例中，传感器160在等于或小于1的放大率(m≤1)下捕捉载片上的样本图像。换句话说，在放大率小于1(m<1)的情况下，光学成像子系统168在传感器上投影未放大或缩小的样本图像。代表性地，传感器160小于载片(例如，传感器直径大约为3至4毫米，而载片大约为25毫米乘76毫米)。光学成像子系统168包括在传感器160上投影较大视场的物镜。
在一个实施例中，系统100创建载片上整个样本或整个样本的一部分的概要图像。该概要图像是在如以上所描述的没有进行放大的情况下所捕捉的图像(即，放大率等于或小于1)。捕捉概要图像的优势在于其所能够被捕捉的速度。例如，可以以1至2秒的量级捕捉整个载片的图像，而捕捉放大图像则可能需要20秒或更多的量级。
如以上所提到的，传感器小于载片并且通常小于载片上的样本或部分样本。为了获得可接受的图像分辨率，诸如概要图像，传感器单个像素所表示的面积有所减小。在一个实施例中，为了获得载片上样本的可接受概要图像，传感器160将取得多个图像并且将那些图像接合在一起。例如，在一个实施例中，诸如载片上整个样本的载片或图像样本被划分为三份，其中传感器捕捉通过概要图像的所期望面积的三分之一(例如，载片可用面积的三分之一)的光线。为了对表示三分之一样本的光线的捕捉进行协调，在一个实施例中，台180被移动到传感器160的视场内的期望部分。
参考图2，台180可在x和y方向平移。传感器160保持静止。在一个实施例中，台180响应于从控制单元175到xy步进电机172的信号而平移。
在一个实施例中，使用基准载片载体对显微镜150和系统100进行校准以使得载片的标称位置已知处于定义公差之内。定义公差是台180的xz坐标系统的结果(±p)；载片载体210及其位置在插入显微镜150时的机械公差(±q)；以及载片载体210中容纳载片的载片腔室的机械公差(±r)。考虑这些因素的定义公差是p+q+r。在一个实施例中，载片的概要图像由三个交迭图像所构成，其中每个图像的视场和交迭被选择以符合定义公差并且共同捕捉整个载片的图像。换句话说，由于由传感器160所捕捉的图像将被接合，所以在一个实施例中，台180从传感器160的视场平移至不同视场，以使得在不同视场中存在另一个视场(例如，之前的成像视场)的交迭。在一个实施例中，该交迭至少比台、载片载体以及载片载体内的腔室的最大公差大20个像素(例如，20至50个像素)。
图4展现了图像或部分图像的图像捕捉。参考图4，台180被定位为使得载片220A处于传感器160的视场之内。载片220A被定位成使得传感器160所捕捉的第一图像将是载片的一个边缘。例如，假设载片大约为76毫米长，在其一端具有占据该长度大约16毫米的载片标签，剩余的大约60毫米的载片将构成该载片的可用区域(即，可以放置样本的区域)。传感器160将被定位在相对一端以使得其从该端捕捉载片的第一个20至25毫米长度。载片边缘或载片上的载片标签的边缘可以提供x坐标和y坐标。台180能够使用这些坐标来建立位置以从载片标签开始捕捉载片的第一个20至25毫米。在将图像接合在一起时，第一图像可以被认为是其它图像要与之相接合以形成概要图像的固定基准。在图像的第一部分，图4示出了传感器160捕捉在区域310中指定的载片220A部分作为第一或Time1图像。台180随后在x方向移动大约20毫米并且传感器160在区域320所表示的Time2捕捉第二图像。最后，台180移动至传感器160视场内的区域330中的第三位置并且传感器在Time3捕捉区域330的图像。
在相邻图像的图像捕捉的描述中，在一个实施例中，系统要求所捕捉的图像有所交迭。交迭在图5中示出，其中区域420与区域410的一部分交迭并且区域430与区域420的一部分交迭。交迭在图像被接合在一起时是有用的。在一个实施例中，系统力求在相邻图像之间有大约20至50像素的交迭。在捕捉相邻图像之后，相邻图像被组合或结合在一起。
图5和6图示了接合的实施例。在一个实施例中，系统使用样本的地标(landmark)并且试图将共用地标对准以形成整体图像。图5和6示出了简单的几何地标或特征以表示这一概念。图5示出了使用几何符号作为相邻区域共用的地标或特征而将区域410所表示的图像和区域420所表示的图像放置在一起。在该示例中，区域410所表示的图像和区域420所表示的图像需要沿单一轴线进行移动以便对准。然而，系统也允许更多的对准可能性，诸如沿两条轴线和旋转。例如，区域430所表示的图像被示为在y方向关于区域420所表示的图像有所偏移。因此，区域480所表示的图像可以在两个方向(x方向，y方向)进行移动以对准图像之间所识别的共用地标或特征。
如以上所提到的，在一个实施例中，接合图像部分以聚集概要图像是在图像被捕捉时执行。虽然图5示出了三个单独图像，但是在一个实施例中，在与之相关的示例中，区域410所表示的图像和区域430所表示的图像在每个图像捕捉时立即被接合在一起。当捕捉区域430所表示的图像时，该图像被对准并且与区域410和420所表示的合并图像进行接合。单独区域的图像并不保存。相反一旦接合并组合出了足够大的样本图像区域，所组合的区域就被分解为大小相似的分块并且在文件结构中保存，或者可以使用压缩格式(例如，JPEG)进行压缩。所保存的图像区域从计算机110的随机访问存储器(RAM)被删除。
系统100能够基于用来组合概要图像的视场图像来建立样本大致处于载片上的哪里以及显著特征的位置。例如，概要图像的每个像素表示具体区域，例如5.4μm×5.4μm。另外，所组合图像由传感器160中的能够按照x和y坐标得到描述的像素数量表示，例如2504个x方向像素乘3324个y方向像素。利用该信息，鼠标1400A或鼠标1400B在概要图像中进行的位置选择是该图像中一个或多个像素的选择。由于每个像素的大小是已知的，所以系统100能够确定所选择位置(例如，图像特征的位置)相对于例如图像边缘的起始位置处在x方向和y方向中的像素数量。因此能够针对图像建立近似的坐标系统，以使得系统100能够识别包括特定的一个或多个像素所表示的特征的区域的位置。
如以上所提到的，载片通常具有固定至表面的标签。在一个实施例中，希望使得概要图像不仅包括载片上的样本而且还包括载片标签。由于载片标签将会遮挡从载片下方引入数字显微镜150的光线，所以数字显微镜150包括以反射捕捉载片标签的图像的传感器198。图7示出了标签450，其可以被设置大小并操控(例如，旋转)以使得标签450在与取自载片场传感器(传感器160)的概要图像进行组合时可以与该图像相邻。图7示出了被接合在一起的图像部分(区域410所表示的部分，区域420所表示的部分和区域430所表示的部分)的概要图像440以创建载片的有效部分的完全接合在一起的图像。图7还示出了与样本的概要图像相邻的标签450的图像。如以上所提到的，并不保存样本的个体部分，而仅保存复合的接合载片图像(例如，概要图像)。在一个实施例中，接合的载片图像独立于标签图像进行保存。在另一个实施例中，接合的载片图像和与之相邻接合的标签图像一起保存。在任一种情况下，复合图像都可以利用常规的压缩软件(例如，JPEG)进行保存。
在传感器160和光学成像子系统168位于载片上的样本上方以捕捉该载片的图像的情况下，系统100的用户能够进行电子“缩放”以提高分辨率。在一个实施例中，系统100最初利用传感器160捕捉载片上的样本的概要图像(例如，整个样本的概要图像)以及载片标签的图像。初始的概要图像可以如以上所描述的那样被接合在一起。在一个实施例中，初始图像以相对较大的传感器至像素比进行显示(传感器160的多个像素映射至显示器120的一个像素)。所意识到的是，显示器120上的像素通常大于传感器160上的像素。例如，传感器160上的像素具有5微米量级的大小，而显示器120上的像素大小则为0.5毫米的量级。
在一个示例中，初始概要图像以4比1或更大的传感器至显示器像素比进行显示。用户随后使用鼠标1400A来选择样本中的感兴趣区域。用户随后能够进行放大以提高该特定点或该特定感兴趣区域的图像分辨率和/或增加放大率。代表性地，为了在(如以上所描述的由鼠标1400A所选择并且被系统100所定位的)所选择感兴趣区域进行电子放大，用户指示鼠标1400B进行放大，并且系统100作为响应将传感器至显示器像素比例如从4比1向1比1或更大进行修改(即，将更少的传感器像素映射至单个显示器像素)。所意识到而是，随着单个传感器像素被映射至更多的显示器像素，图像将针对用户表现为随着感兴趣区域的显示面积在显示器120上增大而被放大。用户能够以任意所期望的传感器像素至显示器像素比率接受并保存图像。
在一些点，将会达到阈值分辨率(例如，1比1的传感器至显示器像素比)。如果用户希望在感兴趣区域上继续进行放大，则系统100作为响应将自动从等于或小于1的光学放大率切换至显微镜150中下一个更高的放大率。在单独传感器与放大光学器件相关联的实施例中，系统100将自动切换至传感器165并且将放大光学成像子系统170定位在感兴趣区域上方。代表性地，当利用传感器160和光学成像子系统168达到了图像的阈值分辨率时，系统100将进行切换以通过物镜透镜1700A来放大图像。物镜透镜1700A例如为2.5X放大率。
一旦切换至通过放大光学成像子系统170捕捉图像，传感器至显示器像素比就将再次以大于1比1的像素比(例如，4比1)作为开始。用户能够接受所捕捉的图像并且保存该所捕捉图像，或者继续放大并且以任意所期望比率接收和保存图像。继续放大同样最初涉及从大于1比1的传感器至显示器像素比向1比1或更大的比率修改传感器至显示器像素比。一旦达到阈值分辨率，系统100就将把物镜从物镜1700A改变为具有下一个较高光学放大率的物镜1700B。在一个实施例中，物镜1700B为20X放大率。继续缩放遵循相同的操作。
以上讨论涉及指示系统100进行电子放大和/或增加放大率的用户交互。在另一个实施例中，系统100可以自动进行该操作。例如，系统100可以被配置为执行以上操作以捕捉以不同分辨率和/或放大率所保存的图像。
在一个实施例中，当载片被置于数字显微镜150中时，系统100立即利用等于或小于1的放大率创建概要图像。用户能够如以上所描述的对传感器捕捉来自载片中的样本的图像之处进行放大，或者可替换地，用户能够通过告诉系统增加放大率而在样本的感兴趣区域上捕捉更大的放大率。用户这样做的一种方式是通过使用鼠标1400A并选择概要图像上的感兴趣区域，并且指示所期望的放大率。在后者的情况下，要意识到，用户可以在概要图像上选择特定样本/载片当前是否是传感器160可以针对其捕捉图像的载片。例如，在传感器160当前捕捉载片320A(见图3)的图像并且用户想要载片320B的感兴趣区域的放大图像的情况下，用户将使用鼠标1400A例如利用沿显示器120一侧的其它载片的缩略图像而导航至载片320B所呈现的缩略图像。该缩略图像可以是图像或部分图像的较小呈现，例如使用减少数量的像素的部分图像的呈现。用户随后可以利用鼠标1400A(例如，通过在其上进行点击)来选择载片320B的缩略概要图像。系统100随后将在屏幕120上显示载片320B的概要图像的较大图像并且台180可以将载片320B移动到供传感器160进行图像捕捉的位置。如果放大图像被存储在计算机110的存储器中，则系统100将获取它并且将其显示在显示器120上。然而，如果放大图像并不存在，则系统100将进行生成。所要意识到，载片320B必须处于数字显微镜150中的载片载体210中。
使用用户想要载片320B上的部分样本的放大视图的示例，载片320B所保存的概要图像最初将被显示在显示器120上。例如，如果用户想要部分图像(例如，感兴趣区域)的放大图像，则用户可以将鼠标1400A拖至显示器120的期望位置以示出载片320B上样本并且随后通过在鼠标1400A上点击而向系统指示期望放大的区域。如之前所提到的，可以不保存概要图像的具体坐标系统。然而，系统100了解用户所选择的大致位置，因为其了解用户在显示器120上的何处进行指示(例如，点击)，其了解概要图像中个体像素的大小(例如，50μm×50μm)并且其了解图像的像素大小(例如，3324×2504像素)。由于系统之前识别了载片载体210中的载片320B以及载片上样本的大致位置，所以系统100将大致了解感兴趣区域以捕捉感兴趣区域的放大图像。类似地，如果之前已经保存了包括感兴趣区域的放大图像，则系统100能够基于用户在概要图像上指示感兴趣区域而获取该图像。换句话说，通过概要图像中的像素位置识别感兴趣区域的能力不仅应用于样本的概要图像而且还应用于该样本的任意其它图像。
在一个实施例中，系统100允许用户在图像上放置注释并且保存注释的位置。例如，用户可能希望通过指向感兴趣区域的箭头(注释)来识别20x图像中的感兴趣区域。在一个实施例中，用户以20x放大率定位感兴趣区域，随后将鼠标1400A移动至期望进行注释的点。用户向系统100指示其希望在该位置放置注释或对象(例如，通过之前选择显示浏览器中的图标(在其上点击))并且点击鼠标1400A以放置注释。为了放置注释，系统100必须在20x图像中定位所述点。类似于在概要图像中定位点，系统100由于其了解20x的像素分辨率、可以从其确定像素大小(5.4/20×1000＝270nm)的传感器像素大小(例如，5.4μm×5.4μm)，并且其了解像素数量(例如，3324×2504像素)，因此能够找出该点。基于该信息，系统100能够定位并存储与20x放大视图中以及载片的概要图像中的点(例如，一个或多个像素)的位置相关的信息。
在包括载片的感兴趣区域或点的注释或对象的载片信息被保存在系统100中并且载片从数字显微镜150和载片载体210去除的情况下，系统100也能够在该载片被重新插入显微镜150时找出感兴趣区域或点。如之前所描述的，存在与台180、载片载体210和载片载体210内的腔室相关联的误差公差。当载片被去除并且随后重新插入载片载体210和显微镜150中时，这些误差公差会影响注释与载片上样本的特定感兴趣点或区域的对准。为了应对这种潜在的对准误差，在一个实施例中，系统100捕获载片或部分载片的新图像并且将该新图像与所保存的具有注释的图像进行比较。例如，系统100可以拍摄载片标签或样本角落的新图像，并且将该图像分别覆盖在所保存的标签或样本角落的图像上。如果图像并未对准，则系统100旋转和/或线性定位新图像直至其对准。在进行该调节时，系统100存储与调节相关的信息并且使用该存储信息来找出注释位于新的图像视图中的哪里。在简单示例中，重新插入载片载体210和显微镜150中的载片上的样本的新图像被确定为在x方向与包括注释的载片原始图像具有3个像素长度的差异。当在新图像中指示注释时，系统100了解该注释在旧图像中的x方向位置并且随后将注释向右移动三个像素以在新图像中定位注释。
关于保存图像(例如，概要图像、放大图像)，在一个实施例中，保存样本的单个组合图像。在另一实施例中，保存样本的图像层级。在一个实施例中，基于传感器到显示器像素比来创建样本的图像层级。在该实施例中，该层级中排名最高的图像是具有1比1像素比的图像(将每个传感器像素与每个显示器像素进行映射的全分辨率样本)。传感器到显示器像素比有所增大的一个或多个较低排名的图像(感测图像被显示在显示器120上以使得一个传感器像素被映射到多于一个的显示器像素，例如2:1,4:1等)构成其余的图像层级。全分辨率样本以及一个或多个排名较低的图像中的每一个都可以以数据集而被存储在一起。
针对具有高放大率的物镜，景深(即，景深(z方向范围)内的对象)相对小。z方向范围很小(例如，1μm)，使得所捕捉的图像不能在一次图像捕捉中捕捉到例如具有10μm量级厚度的样本中的所有对象。为了捕捉尽可能多的对象，在一个实施例中，系统100可以通过景深在不同焦平面捕捉若干图像。在该实例中，系统100可以捕捉10幅图像，其中在每次捕捉之间将台180在z方向移动1微米。这样的操作将产生表示样本的z方向堆叠或z堆叠的10个图像平面。
在另一个实施例中，可以使用标签图像针对每个载片建立坐标系统。在一个实施例中，载片标签可以被印刷以多于一个的可感知斑或点。图7示出了具有三个点(点4500A、点4500B、点4500C)的载片标签的实施例。传感器160或传感器165可以感知这些点，并且在感知了它们的情况下，系统100能够确定每个点的像素位置以及每个点之间的像素数量。通过关联相邻标签450的图像440，系统100能够基于其距离一个或多个点的x和y距离来定位图像440上的任意位置。
在一个实施例中，如果有的话，包括样本的所保存图像或图像层级、z堆叠、该图像的坐标系统的数据集以及单独保存的标签图像在计算机100的存储器中被整合。这样的数据集还可以包含评论或注释(包括由用户在图像上进行的标注)和标签内容(例如，标签的解释)。
已经对系统100的某些组件进行了描述，现在将对操作给出简要描述。在一个实施例中，系统100的使用是软件驱动的。换句话说，在计算机100中提供有包含程序指令的机器或计算机可读介质，当被执行时，该程序指令将实施所描述的各种操作方法。
在一个实施例中，图8图示了一种操作方法。将参考系统100的部件和各种截屏对方法500进行描述，在一个实施例中，上述截屏在显示器120上显示。
作为开始，载片载体210可以被装载到数字显微镜150中并且被置于台180上。传感器可以被定位在台180上以感测载片载体。计算机110对这样的传感器进行响应。在一个实施例中，当计算机110感测到台180上的载片载体210时，系统100具有三种模式：直播模式；扫描模式；和观看模式。直播模式和观看模式由于它们包括用户交互而是交互模式。扫描模式可以交互操作或者利用用于扫描(保存)图像的具体预定参数或配置全自动操作。例如，在扫描模式中，(多个)载片可以被装载到载片载体上并且被插入数字显微镜，并且该系统将感测并保存载片上的样本的一个或多个图像。
图9示出了系统100的显示器120的截屏示例。这是用户能够选择直播模式、扫描模式或观看模式的登录屏幕的示例。登录屏幕还可以通过选择“设置”640而包括输入或修改仪器基本设置的机会以及通过选择“退出”650而退出系统的机会。
在用户通过选择“直播”610而挑选了直播模式的示例中，计算机110将指示数字显微镜150将载片载体210移动至装载位置，诸如通过将载片载体210延伸至仪器之外以便其可被用户所使用(accessible)。此时，当载片载体210可使用时，计算机110可以指示载片载体可以从数字显微镜150去除并且装载以一个或多个载片。对此进行指示的一种方式是通过监视器120上的声明(图8，框505)。
在载片载体210具有四个载片腔室(载片腔室220A、220B、220C和220D)的实施例中，用户可以将多达四个载片放置在载片载体210上。在将一个或多个载片放在载片载体210上之后，载体被载入仪器之中并且该仪器将载体拉入并且感测其存在和位置(图8，框510)。
一旦载片载体210被置于数字显微镜150以内，系统100就确定插入载片腔室220A、220B、220C和/或220D中的载片的数量和位置(图8，框515)。系统100选择用于成像的每个载片(框520，图8)。系统100随后将所选择的载片和传感器160/光学成像子系统168对准(图8，框520)。如果所选择的载片已经被重新插入仪器并且需要关联之前会议(session)的信息，则系统100确定将所选择载片关于之前的会议进行旋转和位移。在一个实施例中，感测器160最初感测每个载片上的样本的一个或多个图像(在不进行放大的情况下，或者是利用小于1的放大率进行放大的情况下)(图8，框530)。所感测图像连同单独感测的载片上的标签的图像随后可以被显示(图8，框535)。随后取得所有插入载片及其标签的低分辨率概要图像。
图10中的截屏是选择载片的图形用户界面(GUI)的实施例。在GUI标题栏710中，图示了工作流程的步骤并且对当前步骤(“载片选择”)进行高亮显示。在这些标签的右侧(如所看到的)，标题栏包括在工作流程内进行移动(按钮715)、退出载片载体(按钮720)或获得帮助(按钮725)的控制。
屏幕700的主要部分730被划分为载片选择部分740、概略资料选择部分740和载片信息部分760。载片选择部分740示出了载片载体180(见图2)的略图。在载片载体180的被占据腔室中，能够看到载片腔室220A、220B、220C和220D(见图2)中的载片的各自的概要图像770A、770B、770C和770D以及相应载片的标签。该GUI允许用户选择并分组相关载片。在一个实施例中，被分组载片被扫描并同时进行显示。该特征允许用户例如将相同群组的不同载片的结构进行比较。载片群组可以被称作案例。在“直播模式”中，用户能够向案例添加预先扫描的所存储载片。例如，除了数字显微镜150内的载片载体180上出现的任意载片之外，系统100的计算机110可以存储之前所捕捉(保存)的图像(例如，概要图像、放大图像)，这些图像被称作不再呈现的扫描图像。
参考该GUI的概略资料选择部分750，该选择允许用户针对具体染色剂，或者在使用荧光染色图像的实施例中针对荧光编号，选择作为优化和定制图像获取的具体的预定扫描概略资料。例如，针对H&E染色剂的具体概略资料可能是20x图像。部分750允许用户选择工具栏并且提供以20x视图和扫描的选择。载片和标签信息被呈现在载片信息部分760中，并且在一个实施例中，提供与患者以及(样本在为显微镜分析而制备时所经受的)(多个)处理步骤相关的识别信息。
参考图10中的截屏，要进行的选项包括开始单个载片或一组载片的“直播模式”或者退出载片载体(载片载体180)。在“直播模式”中，载片或载片组另外的图像(例如，放大图像)可以被扫描和/或捕捉(保存)。
在用户选择了“直播模式”的情况下，用户可以基于所显示的概要图像而选择特定的一个或多个载片(图8，框540)。图11和12示出了典型的用户界面屏幕。图11示出了具有单个图像或扫描的屏幕，而图12则示出了三个不同图像或扫描的视图。图11中的图像是直播图像(如所看到的，右上角指示以视频图标)。该屏幕被划分为不同区域。上方两个图像(如所看到的)是直播图像(见视频图标)而下方图像则是保存(扫描)图像(见相机图标)。系统100能够示出所保存的组织图像(组织扫描)以及处于数字显微镜150中的载片的直播图像以及预先扫描载片的所存储的组织扫描。在一个实施例中，针对数字显微镜150中出现的载片的“直播”图像，传感器160以若干图像/秒的速率连续获取(刷新)显微镜当前位置的图像(图8，框545)。例如，如果传感器最后感测到载片腔室220A中的载片上的样本并且用户或系统100还没有指示进一步的活动，则传感器160将保持处于载片腔室220A中的载片上并且例如以6幅图像/秒的速率刷新该图像。在一个实施例中，仅刷新图像的样本而并不刷新相关联的标签。虽然图11示出了单个扫描且图12示出了三个扫描，但是同时能够观看多达16个扫描。在这样的情况下，视图被划分以示出所有所选择的扫描。在另一个实施例中，来自案例的图像能够被显示在多于一个的屏幕上。
经由日志(journal)中的选择可以添加视图以及从屏幕去除视图。日志是案例中所有对象的集合并且能够在屏幕右手侧找到。与此同时，仅有一个视图是活跃的。所有控制都反映活跃视图的设置。任意操作将仅对该具体图像有所影响。来自其它扫描的图像被“冷冻”。为了将焦点切换至另一载片，用户需要在所显示图像或日志中的标签之一上进行点击。
在图11和12分别所示的截屏的标题栏810和810中，系统100给出了以下控制：
Figure BDA0001286650420000211
在每个图形中，可以显示图像放大、刻度指示器和焦点控制。
图11以2.5x放大示出了单个图像。用户能够通过在区域(例如见扫描1、区域1、区域2)上调遣鼠标1400A或1400B来指示感兴趣区域或所期望的扫描。图12以20x示出了三个区域。
使用键盘130、鼠标1400A或3D鼠标1400B，用户能够在扫描图像数据内进行导航(图8，框550)。可以有以下动作：
Figure BDA0001286650420000212
Figure BDA0001286650420000221
每个视图都能够以全屏模式进行观看。在该模式中，整个屏幕都被视图所覆盖。仅在图像中显示图像的放大率、刻度指示符以及导航控制。用户能够通过选择(按压)键盘130上的“esc”按键离开该全屏观看模式。
在导航期间的任意时刻，用户可以保存所显示的图像(图8，框860)。
在图11和12中的GUI的右手侧，显示器120示出了导航控制850/950、日志860/960以及图像参数控制870/970。
导航控制850/950示出了活动载片的概要图像。控制指示出了活跃视图(例如，能够以所期望刷新率进行刷新的直播图像)的位置。通过在控制上进行点击，可以移动该位置。控制还指示已经被添加至载片的注释和扫描的位置。
日志860/960处于导航控制850/950以下。日志860/960表示案例的结构。在一个实施例中，日志860/960包含案例中所有载片的载片信息、注释和评论。可以添装载片以及从案例中去除载片。载片被分组为两个部分。在列表上部，能够找到仪器中的载片。用户能够现场检验这些载片。在这种情况下，用户能够通过扫描载片的所选择区域而向这些载片添加扫描。在列表下部(如所看到的)，呈现出来自计算机中的存储器的预先扫描载片。
在日志860/960的结构中，每个载片缺省地具有三个对象：标签图像、载片信息和概要图像。用户能够向日志添加另外的对象(注释、评论、书签和高分辨率扫描)。用户能够在日志860/960中选择条目之一以跳转至具体图像位置。
在一个实施例中，日志860/960将是对具体区域进行评估或创建所考虑案例的报告的起始点。日志860/960还包含“保存会议”按钮。通过选择该按钮，系统将会议(包括所有载片、注释和设置)保存在计算机110中的存储器中。文件包含日志中所定义的标签、概要图像和高分辨率扫描。用户能够在随后恢复该会议。
在一个实施例中，图像参数控制870/970处于图11和图12的日志860/960下面。图像参数控制870/970允许获取相机参数(曝光时间、相机增益等)以及将要修改的图像设置(亮度、对比度、颜色平衡、黑/白平衡、图像过滤器(锐度等))。用户能够保存设置，例如具体染色剂。随后，用户能够访问这些设置而无需展开控制。
在图像参数的任选修改之后，用户可以保存该会议。用户还可以中止会议，如果用户决定中止会议，则用户离开直播模式。如果用户已经修改了日志860/960中的条目，其还没有被保存，则系统100将询问用户是否想要保存会议。随后，系统100移动至“载片(组)选择”屏幕。用户能够以下一个(多个)载片继续。
如果用户在直播模式中定义了高分辨率扫描区域，则访问高分辨率扫描功能。在扫描开始之前，用户选择扫描参数(分辨率、获取参数和z堆叠参数)。图13示出了显示器120上的截屏的实施例，其中建立了扫描参数。用户能够命名所述扫描并关于其进行评论。在区域1020中，用户能够选择扫描显示模式。扫描显示模式描述系统100将如何在扫描期间示出单个相机视场或单元区。用户能够遵循逐个单元区的扫描或者在其构建的同时观看整个扫描。在后者的情况下，用户能够在扫描期间所记录的图像数据中进行摇摄和缩放。
在高分辨率扫描开始之后，系统100移动至高分辨率扫描显示。图14示出了高分辨率扫描显示的实施例的截屏。根据所选择的显示模式，系统100示出当前单元区或整个扫描区域1110。在后者的情况下，用户能够在屏幕构建的同时在所记录数据内进行缩放和摇摄。高分辨率扫描显示还指示扫描屏幕的进展1120。
在高分辨率扫描之后，系统100自动返回至“直播模式”屏幕。所完成的扫描被插入日志并且位于相对应的载片下。
在另一个实施例中，系统100能够被指示以执行多个载片的扫描，诸如载片载体180中的每个载片的高分辨率扫描。在载片载体180保持四个载片的实施例中，用户将多达四个载片放置在载片载体180上并且将载体插入数字显微镜150。数字显微镜150拉入载片载体180并且确定载片载体的类型、载片数量及其位置。例如，与外部载片装载器相结合，可以进行多于四个载片的自动扫描。在该情况下，系统100将与载片装载器进行通信以使得所要扫描的载片被自动装载并获取。例如，可商业获得的载片装载器能够与数字显微镜150相关联。这样的载片装载器被配置为接收并传输载片、因此，载片装载器的传输机构能够将一个或多个载片装载到载片载体210上，并且与数字显微镜150相关联或与之连接的传输机构(例如，拾取和放置机器人手爪)能够在扫描之后将载片返回至载片装载器。传输、扫描和成像的控制可以由控制器110进行控制。
在自动或反射成像模式中，系统100可以被指示以获取整个载片或载片的所选择区域的扫描，这能够在用户进行选择后立即进行或者在后面的时间进行。反射成像模式中的载片扫描通过自动载片装载器而得以得到促进。此外，为了选择完整或部分的载片扫描，用户可以选择扫描参数，诸如但并不局限于放大率和z堆叠。此外，用户能够选择多于一个的不同放大率的扫描或者使用其它用户定义参数。可以将缺省扫描参数编程到系统100中以反映临床医生和/或组织类型之间的差异。在这种情况下，载片或载片组的反射成像的完成可以被自动以信号通知给一个或多个设备，例如经由互联网连接145，以及被通知给计算机110以使得能够进行案例的快速签退(见图1)。
系统100向用户给出针对扫描分辨率的选择以及诸如以上在直播模式中所描述的预定义图像参数集合。此外，用户能够定义z堆叠参数(平面数量、平面之间的距离以及距焦点平面的焦点偏移量)。
用户能够修改保存参数(文件名和扫描目录)。系统设置中定义有缺省参数。在文件名的情况下，用户能够使用标签内容或者定义文件名。在一个实施例中，如果名称以被定义，则系统100将加上累进数字以在载片之间进行区分。
限定以了扫描参数之后，系统100开始逐个载片地对载片载体180进行扫描。对于每个载片，取得低分辨率概要图像和标签图像。在针对每个载片捕捉了概要和标签图像之后，系统100将捕捉高分辨率图像。在一个实施例中，显示器120上的GUI将改变为第一高分辨率扫描屏幕。系统100可以对当前载片的概要和标签图像进行描绘。其自动识别载片上的组织区域并且在概要图像中指示所检测的组织区域。随后，确定载片上的组织区域的焦平面。这些步骤的进展在屏幕上进行指示。
在一个实施例中，在所检测组织区域的实际扫描期间，系统100在一个实施例中根据系统设置而在显示器120上显示当前扫描位置的图像或者示出在其中构建图像的整个当前扫描区域。
针对载片所扫描的高分辨率图像被存储在计算机110的存储器中并且随后可以由用户使用观看模式来访问。在载片上的所有组织区域都被扫描之后，系统100进行下一个载片。在所有载片都被扫描之后，系统100退出载片载体180并且移动至登录屏幕。
在观看模式中，用户能够获取并观看之前所扫描样本(载片)的所存储图像，包括可以构成案例的多个载片。以这种方式，用户能够从直接连接至计算机110和光学显微镜150的显示器120观看图像。可替换地，通过内联网/互联网连接145(图1)，用户能够访问系统100的存储器并且远程观看图像。系统100的企联网/互联网连接145还允许图像从一个位置被发送至另一个位置(例如，经由电子邮件)。
在之前的详细描述中，参考其具体实施例对本发明进行了描述。然而，将会显而易见的是，可以对其进行各种修改和变化而并不背离如权利要求中所给出的本发明的较宽泛精神和范围。因此要以说明性而非限制性的含义来看待说明书和附图。

Claims (24)

1.一种用于检验组织样本的方法，包括：
利用传感器以第一放大率感测衬底上的部分组织样本的图像；
在不存储所感测图像的情况下：
以大于1比1的传感器到显示器像素比显示所感测图像的至少一部分；
响应于用户输入，执行以下步骤中的每一个：
在所述第一放大率下修改所感测图像以其显示在所述显示器上的所述传感器到显示器像素比，以及
在所述第一放大率下达到阈值传感器到显示器像素比时，响应于将所述传感器到显示器像素比修改为超过所述阈值传感器到显示器像素比的尝试，以第二放大率自动感测所述部分组织样本的区域的视图。
2.根据权利要求1所述的方法，其中显示部分组织样本的所感测图像包括整合所述部分组织样本的多个分段并且显示整合后的多个分段。
3.根据权利要求2所述的方法，其中多个分段中的分段与相邻分段交迭，并且整合相邻分段包括对准所述相邻分段中的共用内容。
4.根据权利要求2所述的方法，其中显示所感测图像包括显示该图像的整个横截面区域。
5.根据权利要求1所述的方法，进一步包括响应于用户输入而存储所感测图像。
6.根据权利要求1所述的方法，其中修改所述传感器到显示器像素比包括将大于1比1的比率转变为1比1的比率。
7.根据权利要求1所述的方法，其中修改所述传感器到显示器像素比包括从较大像素比转变为较小像素比。
8.根据权利要求1所述的方法，其中通过所述第二放大率所感测的所述部分组织样本的区域的视图对应于所述用户输入所选择的区域。
9.根据权利要求1所述的方法，进一步包括感测所述衬底上的标签的图像并且在所述显示器上显示所述标签的图像。
10.根据权利要求9所述的方法，其中感测衬底上的部分组织样本的图像包括感测明亮视场图像，并且感测所述标签的图像包括使用反射来感测图像。
11.根据权利要求1所述的方法，进一步包括以所述第二放大率在所述显示器上显示修改后的传感器到显示器像素比的视图和所述视图中的至少一个。
12.根据权利要求11所述的方法，以所述第二放大率同时在所述显示器上显示传感器到显示器像素比大于1比1的所感测图像以及所述修改后的所述传感器到显示器像素比的视图和所述视图中的至少一个中的每一个。
13.根据权利要求1所述的方法，进一步包括提供多个衬底，其中所述多个衬底中的每一个包括组织样本，并且在感测图像之前，所述方法进一步包括指定所述多个衬底中的至少一个衬底用于感测。
14.根据权利要求1所述的方法，进一步包括提供多个衬底，其中所述多个衬底中的每一个包括组织样本，并且在所述显示器上显示所述多个衬底之一的至少一个图像以及所述多个衬底中另一个的至少一个图像。
15.根据权利要求1所述的方法，进一步包括在所述显示器上同时显示所述部分组织样本的至少一个区域的至少一个图像。
16.根据权利要求1所述的方法，其中显示包括在所述显示器上显示第一图像和第二图像，并且刷新所感测图像包括仅刷新第一图像和第二图像之一。
17.根据权利要求16所述的方法，其中所述第一图像和所述第二图像中的另一个是从计算机存储器存储所获取的图像。
18.根据权利要求1所述的方法，其中执行包括：在数据结构中存储所感测图像的至少一部分，并且所述方法进一步包括：
以所述第二放大率感测所述部分组织样本的图像，所述第二放大率是大于1的放大率；以及
将以所述第二放大率所感测的图像存储在所述数据结构中。
19.根据权利要求1所述的方法，其中执行包括：在数据结构中存储所感测图像的至少一部分，其中所述存储包括基于传感器到显示器像素比存储图像层级。
20.根据权利要求1所述的方法，进一步包括基于所感测图像的像素大小、放大率和像素数量在图像中定位区域。
21.根据权利要求20所述的方法，将在所述图像中定位的所述区域与用户所提供的注释相关联并且将在所述图像中定位的所述区域的位置和所述注释存储在数据结构中。
22.根据权利要求1所述的方法，其中衬底上的所述组织样本是载片上的样本，所述载片具有标签并且位于台上，所述方法进一步包括存储所感测图像的至少一部分，以及响应于所述载片从台被去除以及随后返回台，相对于其在去除之前的位置定位所述组织样本的位置。
23.一种成像装置，包括：
数字显微镜，其包括：
至少一个图像传感器；
台，其被配置为支撑至少一个显微镜载片；
第一光学成像子系统，其部署在至少一个传感器和所述台之间，所述第一光学成像子系统被配置为利用第一放大率投影图像；
第二光学成像子系统，其部署在至少一个传感器和所述台之间，所述第二光学成像子系统被配置为利用大于所述第一放大率的第二放大率投影图像；
照明子系统，其包括至少一个光源；显示器；和
计算机，其耦合至所述数字显微镜并且可操作用于指引由至少一个图像传感器对所述台上的显微镜载片的一部分通过所述第一光学成像子系统或所述第二光学成像子系统投影的图像捕捉，并且可操作用于在所述显示器上显示所述图像而不存储所述图像，其中所述计算机包括机器可读指令，所述机器可读指令在被执行时使得所述计算机：响应于用户通过所述第一光学成像子系统将传感器到显示器像素比修改为超过图像的阈值传感器到显示器像素比的尝试，通过所述第二光学成像子系统指示图像捕捉。
24.一种用于检验组织样本的装置，所述装置包括：
用于利用传感器以第一放大率感测衬底上的部分组织样本的图像的部件；
用于以大于1比1的传感器到显示器像素比在显示器上显示所感测图像的至少一部分的部件；
用于在不存储所感测图像的情况下执行以下步骤中的每一个的部件：
在所述第一放大率下修改所感测图像以其显示在所述显示器上的所述传感器到显示器像素比，以及
在所述第一放大率下达到阈值传感器到显示器像素比时，响应于将所述传感器到显示器像素比修改为超过所述阈值传感器到显示器像素比的尝试，以第二放大率自动感测所述部分组织样本的区域的视图；以及
用于执行以下步骤的至少一个的部件：
以计算机控制的速率刷新所感测图像的至少一部分，以及
存储所感测图像的至少一部分。
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