JP4986997B2 - 凝集媒介障害の治療における改良ナノボディ(商標) - Google Patents
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- C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
- C07K2317/22—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from camelids, e.g. camel, llama or dromedary
-
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-
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- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
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-
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-
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Description
− 一価型、多価型(例、二価型)および/または多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)のいずれかでのvWFに対する親和性の増大;
− 多価型(例、二価型)設定に対する適合性の改良;
− 多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)設定に対する適合性の改良;
− 「ヒト化」置換(本明細書で規定)に対する適合性または感受性の改良;および/または
− 一価型、多価型(例、二価型)および/または多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)、一価型のいずれかでの免疫原性の低下;
− 一価型、多価型(例、二価型)、および/または多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)、一価型のいずれかにおける安定性の増大;
− 一価型、多価型(例、二価型)、および/または多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)、一価型のいずれかにおけるvWFに対する特異性の増大;
− 異なる種由来のvWFとの交差感受性の低下、または必要に応じて、上昇;
および/または
− 一価型、多価型(例、二価型)、および/または多特異型(例、国際公開第04/062551号記載または後述の多特異型の1つ)のいずれかでの医薬用途(予防的使用または治療的使用など)および/または診断的用途(撮像目的での使用、しかしこれに限定されない)に望ましい1つ以上の特性の改良。
i)CDR1が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、または本質
的にアミノ酸配列からなり:
NYGMG [配列番号:15]
SYTLG [配列番号:16]
NYNMG [配列番号:17]
SSAMA [配列番号:18]
YYNTG [配列番号:19]
IGAMG [配列番号:20]
IGTMG [配列番号:21]
YNPMG [配列番号:22]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、または本質的にアミノ酸配列からなり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、あるいは本質的にアミノ酸配列からなり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
ii)CDR2が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、または本質的にアミノ酸配列からなり:
SISWSGTYTAYSDNVKG [配列番号:23]
GISWSGVSTDYAEFAKG [配列番号:24]
TSISWSGSYTAYADNVKG [配列番号:25]
SISWSGMSTYYTDSVKG [配列番号:26]
TITSGGRTSYADSVKG [配列番号:27]
AISWSGGLTYYADSVKG [配列番号:28]
TITSGGSTNYADPVKG [配列番号:29]
TITSGGSTNYADSVKG [配列番号:30]
AISRTGGSTYYARSVEG [配列番号:31]
AISRTGGSTYYPDSVEG [配列番号:32]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、または本質的に前記アミノ酸配列からなり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、あるいは本質的にアミノ酸配列からなり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
iii)CDR3が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、または本質的にアミノ酸配列からなり:
QSRYRSNYYDHDDKYAY [配列番号:33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [配列番号:34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [配列番号:35]
SNRYRTHTTQAMYNY [配列番号:36]
VVDGKRAP [配列番号:37]
NRRQKTVQMGERAYDY [配列番号:38]
NLKQGSYGYRFNDY [配列番号:39]
NLKQGDYGYRFNDY [配列番号:40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [配列番号:41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [配列番号:42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [配列番号:43]
あるいは、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、あるいは本質的に前記アミノ酸配列からなり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、あるいは本質的に前記アミノ酸配列からなり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
i)CDR1が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
NYGMG [配列番号:15]
SYTLG [配列番号:16]
NYNMG [配列番号:17]
SSAMA [配列番号:18]
YYNTG [配列番号:19]
IGAMG [配列番号:20]
IGTMG [配列番号:21]
YNPMG [配列番号:22]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
ii)CDR2が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SISWSGTYTAYSDNVKG [配列番号:23]
GISWSGVSTDYAEFAKG [配列番号:24]
TSISWSGSYTAYADNVKG [配列番号:25]
SISWSGMSTYYTDSVKG [配列番号:26]
TITSGGRTSYADSVKG [配列番号:27]
AISWSGGLTYYADSVKG [配列番号:28]
TITSGGSTNYADPVKG [配列番号:29]
TITSGGSTNYADSVKG [配列番号:30]
AISRTGGSTYYARSVEG [配列番号:31]
AISRTGGSTYYPDSVEG [配列番号:32]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
iii)CDR3が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
QSRYRSNYYDHDDKYAY [配列番号:33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [配列番号:34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [配列番号:35]
SNRYRTHTTQAMYNY [配列番号:36]
VVDGKRAP [配列番号:37]
NRRQKTVQMGERAYDY [配列番号:38]
NLKQGSYGYRFNDY [配列番号:39]
NLKQGDYGYRFNDY [配列番号:40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [配列番号:41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [配列番号:42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [配列番号:43]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)で
あり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
[配列表]
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは、保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくは、アミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸配列の1つの、記載したCDRと3つ、2つまたは1つのみ(前項に示す)「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有している、アミノ酸配列からなるグループ選択されるCDRにより置換でき;ここで、
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは、保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくは、アミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
i)任意のアミノ酸置換は、好ましくは、保存アミノ酸置換(本明細書で規定)であり;および/または
ii)アミノ酸配列は、表2に記載のCDR配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
a)CDR1が以下を含む、あるいは以下から本質的になり:
− アミノ酸配列YNPMG;あるいは
− アミノ酸配列YNPMGと2つまたは1つのみアミノ酸が異なるアミノ酸配
列;
および
b)CDR2が以下を含む、あるいは以下から本質的になり:
− アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG;あるいは
− アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;あるいは
− アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGと2つまたは1つだけアミノ酸が異なるアミノ酸配列;
および
c)CDR3が以下を含む、あるいは以下から本質的になる:
− アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;あるいは
− アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;あるいは
− アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFと1つだけアミノ酸が異なるアミノ酸配列。
− CDR1がアミノ酸配列YNPMGを含む、または本質的にYNPMGからなり;
または:
− CDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGを含む、または本質的にAISRTGGSTYYPDSVEGからなり;
または
− CDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFを含む、または本質的にAGVRAEDGRVRTLPSEYTFからなる。
− CDR1がアミノ酸配列YNPMGを含む、または本質的にYNPMGからなり;およびCDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFを含む、または本質的にAGVRAEDGRVRTLPSEYTFからなり;
または:
− CDR1がアミノ酸配列YNPMGを含む、または本質的にYNPMGからなり;
およびCDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGを含む、または
本質的にAISRTGGSTYYPDSVEGからなり;
または:
− CDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGを含む、または本質的にAISRTGGSTYYPDSVEGからなり;およびCDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFを含む、または本質的にAGVRAEDGRVRTLPSEYTFからなる。
d)CDR1が:
− 前記アミノ酸配列YNPMG;または
− 前記アミノ酸配列YNPMGと2つまたは1つのみアミノ酸が異なるアミノ酸
配列であり;
および
e)CDR2が:
− 前記アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG;または
− 前記アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
− 前記アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGと2つまたは1つだけアミノ酸が異なるアミノ酸配列であり;
および
f)CDR3が:
− 前記アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;または
− 前記アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
− 前記アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFと1つだけアミノ酸が異なるアミノ酸配列である。
CDR1がアミノ酸配列YNPMGであり、
またはCDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGであり、
またはCDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFである、前記ナノボディと関連する。
例えば、本発明は、CDR1がアミノ酸配列YNPMGであり、CDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFである、
またはCDR1がアミノ酸配列YNPMGであり、CDR2がアミノ酸配列AISRT GGSTYYPDSVEGである、
またはCDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEGであり、CDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTFである、
前記ナノボディと関連する。
本発明の上記および他の態様、そして実施態様は、以下の更なる記述から明らかになり、a)特に断らない限り、または規定しない限り、使用する全ての用語は該技術分野において通常の意味を有しており、当業者には明らかであろう。例えば、Sambrookら、"Molecular Cloning:A Laboratory Manual" (2nd.Ed.),Vols.1-3,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989);F.Ausubelら, ds.,Current protocols in molecular biology,Green Publishing and Wiley Interscience,New York (1987);Roittら、"Immunology"(6th.Ed.), Mosby / Elsevier,Edinburgh(2001);and Janewayら、"Immunobiology"(6th Ed.)Garland Science Publishing / Churchill Livingstone, Ne w York(2005)などの標準的便覧、そして上記の一般的な背景技術を参照されたい;
b)特に断らない限り、「免疫グロブリン配列」という用語は、重鎖抗体または従来の4鎖抗体のいずれを示すために使用するかを問わず、全長の抗体、その個々の鎖、そして全ての部分、ドメイン、断片のいずれも含む一般用語として使用する(VHHドメインまたはVH/VLドメインなどの抗原結合ドメインまたは断片が含まれるが、これらに限定されない)。また、本明細書で使用する「配列」(例、「免疫グロブリン配列」、「抗体配列」、「可変領域の配列」、「VHH配列」、「タンパク質配列」などの)という用語は、文脈から限定した解釈が要求されない場合、関連するアミノ酸配列、そして該アミノ酸配列をコードする核酸配列またはヌクレオチド配列を含むと一般に理解されたい。
c)特に断らない限り、具体的に詳述される全ての方法、段階、技術、操作は、当業者には明らかであるように、それ自体公知の方法で実施可能であり、また実施されている。例えば、標準的便覧、前記一般的な背景技術、そして本明細書中のさらなる引用文献を参照されたい。
d)アミノ酸残基は、表3記載の標準的な3文字または1文字のアミノ酸コードで示される。
(1)極性非荷電アミノ酸とも見なされる場合がある。
(2)非極性非荷電アミノ酸とも見なされる場合がある。
(3)当業者には明らかであるように、この表においてアミノ酸残基がpH6.0〜7.0で荷電、非荷電と呼ばれることは、アミノ酸残基がpH6.0未満および/または7.0以上で有する荷電を決して反映しておらず、表に記載のアミノ酸残基はこのような高いまたは低いpHで荷電している、および/または非荷電のいずれかでありうることは、当業者には明らかであろう。
(4)当該技術分野において周知のとおり、His残基の荷電はpHの小さな変化にさえ大きく左右されるが、His残基は一般に約pH6.5で基本的に非荷電であると見なされうる。
または、2つ以上のヌクレオチド配列間での配列同一性の程度は、標準的な設定を利用して、NCBI Blast v2.0といった配列アラインメントに関する周知のコンピュータアルゴリズムを利用して算出されうる。
f)2つ以上のアミノ酸配列を比較する目的で、第一のアミノ酸配列と第二のアミノ酸配列との「配列の同一性」の割合が、[第一のアミノ酸配列のアミノ酸総数]で[第二のアミノ酸配列内の対応する位置のアミノ酸と同じ第一のアミノ酸配列内のアミノ酸数]を割り、[100%]を乗じることで算出可能であり、ここで第一のアミノ酸配列と比較した第二のアミノ酸配列における各欠失、挿入、置換または付加が単一アミノ酸(位置)での差違(つまり、本明細書で規定する「アミノ酸の差違」)と見なされる。
g)アミノ酸配列と核酸配列はそれらが全長にわたり100%の配列同一性(本明細書で規定)を有する場合、「厳密に同じ」であると言われる。
h)2つのアミノ酸配列を比較する場合、「アミノ酸の差違」という用語は、第二の配列と比較して、第一の配列の任意の位置での1つのアミノ酸残基の挿入、欠失、または置換を言い、2つのアミノ酸配列が1つ、2つ以上のこのようなアミノ酸の違いを含むことができると理解されたい。
i)核酸配列またはアミノ酸配列は、−例えば入手した天然の生物原料および/または反応媒質または培養媒体と比較した場合、−別の核酸、別のタンパク質/ポリペプチド、別の生物学的成分または巨大分子、または少なくとも1つの汚染物質、不純物、微小成分といった原料または培地において通常関連する少なくとも1つの他の成分から分離されている場合、「本質的な分離(型)」と見なされる。特に、少なくとも2倍、特に少なくとも100倍、そして最高1000倍以上に精製されていた場合、核酸配列またはアミノ酸配列は「本質的に分離されている」と見なされる。「本質的な分離型」の核酸配列またはアミノ酸配列は、適切なクロマトグラフィー技術、ポリアクリルアミドゲル電気泳動法といった適切な方法を利用して測定される場合、好ましくは均質である。
j)本明細書で使用する「ドメイン」という用語は、一般に抗体鎖の球状領域、特に重鎖抗体の球状領域、または該球状領域から本質的になるポリペプチドを示す。通常、該ドメインは、例えばシートまたはジスルフィド結合として、安定化したペプチドループ(例、3つまたは4つのペプチドループ)を含む。
k)「抗原決定基」という用語は、抗原結合分子(本発明のナノボディまたはポリペプチドなど)および特に該分子の坑原結合部位によって認識される坑原上にエピトープを示す。「抗原決定基」および「エピトープ」という用語は本明細書で互換性をもって使用できる場合もある。
l)特定の抗原決定基、エピトープ、抗原、またはタンパク質に結合可能であり、これらに対して親和性および/または特異性を有するアミノ酸配列(本発明のナノボディ、抗体、ポリペプチド、または一般に抗原結合タンパク質またはポリペプチドまたはその断片)は、前記抗原決定基、エピトープ、抗原、またはタンパク質(あるいは、その少なくとも一部、断片、エピトープ)に「対する」または「対して指向性を有する」と言われる。
m)「特異性」という用語は、特定の抗原結合分子または抗原結合タンパク質(本発明のナノボディまたはポリペプチドなど)分子が結合可能な多種多様な抗原または抗原決定基を示す。抗原結合タンパク質の特異性は、親和性および/または親和力に基づいて決めることができる。抗原結合タンパク質と抗原との解離平衡定数(KD)で表される親和性は、抗原結合タンパク質上での抗原決定基と抗原結合部位との結合活性の測定値であり、KD値が小さいほど、抗原決定基と抗原結合分子との結合力は強まる(または、親和性は1/KDである親和定数(KA)でも表すことが可能である)。当業者であれば明らかであるように(例えば本明細書でのさらなる開示に基づいて)、親和性は、目的の特定抗原に応じて、それ自体公知の方法で測定可能である。親和力は抗原結合分子(本発明のナノボディまたはポリペプチドなど)と関連抗原との結合活性の測定値である。親和力は、抗原結合分子上での抗原決定基とその抗原結合部位との親和性、および抗原結合分子上に存在する関係のある結合部位の数のいずれとも関連している。通常、抗原結合タンパク質(本発明のナノボディおよび/またはポリペプチドなど)は、10−5〜10−12moles/liter(M)以下、好ましくは10−7〜10−12moles/liter(M)以下、より好ましくは10−8〜10−12moles/literの解離定数(KD)、および/または少なくとも107M−1、好ましくは少なくとも108M−1、より好ましくは少なくとも109M−1(例、少なくとも1012M−1)の結合定数(KA)で結合する。10−4M以上のKD値は非特異的結合を示すと一般に考えられる。好ましくは、本発明のナノボディまたはポリペプチドは、500nM未満、好ましくは200nM未満、より好ましくは10nM未満(例、500pM未満)のKDで目的の抗原と結合しうる。抗原または抗原決定基への抗原結合タンパク質の特異的結合は、例えば、スキャチャード解析および/またはラジオイムノアッセイ(RIA)、エンザイムイムノアッセイ(EIA)とサンドウィッチ競合分析などの競合結合アッセイなどそれ該技術分野において自体公知の適切な任意の方法で測定可能である。
n)以下でさらに記載されているとおり、ナノボディのアミノ酸配列および構造は、限定されないが、4つのフレームワーク領域または「FR」を含むと考えることができ、これらは該技術分野および以下で「フレームワーク領域1」または「FR1」、「フレームワーク領域2」または「FR2」、「フレームワーク領域3」または「FR3」、「フレームワーク領域4」または「FR4」とそれぞれ呼ばれ、フレームワーク領域には3つの相補性決定領域または「CDR」が割り込んでおり、これらは該技術分野において「相補性決定領域1」または「CDR1」、「相補性決定領域2」または「CDR2」、「相補性決定領域3」または「CDR3」とそれぞれ呼ばれる。
o)以下でもさらに記載するとおり、ナノボディのアミノ酸残基の総数は110〜120個、好ましくは112〜115個の範囲内、最も好ましくは113個でありうる。一方、ナノボディの部位、断片、または類似体(以下でさらに記載)は、該部位、断片、類似体が下記のさらなる要件を満たし、好ましくは本明細書に記載の目的にも適している限り、その長さおよび/または大きさに特に限度はなく、好ましくは本明細書に記載の目的にも適合しており、
p)前記Riechmann & Muyldermansの文献におけるラクダ由来のVHHドメインに適用されるように(例えば前記参考文献の図2を参照)、ナノボディのアミノ酸残基はKabatら(「Sequence of proteins of immunological interest」メリーランド州ベセズダNIHアメリカ合衆国公衆衛生局、発表番号:91)が示すVHドメインの一般的なナンバリングに従って番号がつけられる。このナンバリングに従って、ナノボディのFR1は1〜30番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのCDR1は31〜36番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR2は36〜49番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのCDR2は50〜65番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR3は66〜94番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのCDR3は95〜102番目の位置のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR4は103〜113番目の位置のアミノ酸残基を含む。[この点に関して、VHドメインおよびVHHドメインについて該技術分野において周知の通り、各CDRのアミノ酸残基の総数が変化して、Kabatのナンバリングによって示されたアミノ酸残基の総数と一致しない(つまり、Kabatのナンバリングに従った1つ以上の位置が実際の配列では占有されない、または実際の配列がKabatのナンバリングによって可能な数よりも多くのアミノ酸残基を含みうる)可能性を指摘する必要がある。このことは、一般に、Kabatのナンバリングが実際の配列のアミノ酸残基の実際のナンバリングに対応するかどうか分からないことを意味する。しかし、一般に、Kabatのナンバリングに従い、そしてCDR内のアミノ酸残基の数とは無関係に、Kabatのナンバリングに従った1番目の位置はFR1の開始に対応しており、その逆の場合も同じであり、Kabatのナンバリングに従った36番目の位置はFR2の開始に対応しており、その逆の場合も同じであり、Kabatのナンバリングに従った66番目の位置はFR3の開始に対応しており、その逆の場合も同じであり、Kabatのナンバリングに従った103番目の位置はFR4の開始に対応しており、その逆の場合も同じであると言える。]
q)図面、配列表、実験部分/実施例は本発明の説明のためのみに示しており、本明細書で明確に示さない限り、本発明、および/または添付請求項の範囲を限定したりするものと、解釈したり、または理解しないで頂きたい。
Hamers-Castermanら、Nature 1993 June 3; 363 (6428): 446-8; Davies and Riechmann, FEBS Lett. 1994 Feb 21; 339(3): 285-90; Muyldermansら、Protein Eng. 1994 Sep; 7(9): 1129-3; Davies and Riechmann, Biotechnology (NY) 1995 May; 13(5): 475-9; Gharoudiら、9th Forum of Applied Biotechnology, Med. Fac. Landbouw Univ. Gent. 1995; 60/4a part I: 2097-2100; Davies and Riechmann, Protein Eng. 1996 Jun; 9(6): 531-7; Desmyterら、Nat Struct Biol. 1996 Sep; 3(9): 803-11; Sheriffら、Nat Struct Biol. 1996 Sep; 3(9): 733-6; Spinelliら、Nat Struct Biol. 1996 Sep; 3(9): 752-7; Arbabi Ghahroudiら、FEBS Lett. 1997 Sep 15; 414(3): 521-6; Vuら、Mol Immunol. 1997 Nov-Dec; 34(16-17): 1121-31; Atarhouchら、Journal of Camel Practice and Research 1997; 4: 177-182; Nguyenら、J. Mol. Biol. 1998 Jan 23; 275(3): 413-8; Lauwereysら、EMBO J. 1998 Jul 1; 17(13): 3512-20; Frenkenら、Res Immunol. 1998 Jul-Aug;149(6):589-99; Transueら、Proteins 1998 Sep 1; 32(4): 515-22; Muyldermans and Lauwereys, J. Mol. Recognit. 1999 Mar-Apr; 12 (2): 131-40; van der Lindenら、Biochim. Biophys. Acta 1999 Apr 12; 1431(1): 37-46.; Decanniereら、Structure Fold. Des. 1999 Apr 15; 7(4): 361-70; Ngyuenら、Mol. Immunol. 1999 Jun; 36(8): 515-24; Woolvenら、Immunogenetics 1999 Oct; 50 (1-2): 98-101; Riechmann and Muyldermans, J. Immunol. Methods 1999 Dec 10; 231 (1-2): 25-38; Spinelliら、Biochemistry 2000 Feb 15; 39(6): 1217-22; Frenkenら、J. Biotechnol. 2000 Feb 28; 78(1): 11-21; Nguyenら、EMBO J. 2000 Mar 1; 19(5): 921-30; van der Lindenら、J. Immunol. Methods 2000 Jun 23; 240 (1-2): 185-95; Decanniereら、J. Mol. Biol. 2000 Jun 30; 300 (1): 83-91; van der Lindenら、J. Biotechnol. 2000 Jul 14; 80(3): 261-70; Harmsenら、Mol. Immunol. 2000 Aug; 37(10): 579-90; Perezら、Biochemistry 2001 Jan 9; 40(1): 74-83; Conrathら、J. Biol. Chem. 2001 Mar 9; 276 (10): 7346-50; Muyldermansら、Trends Biochem Sci. 2001 Apr;26(4):230-5; Muyldermans S.,J. Biotechnol. 2001 Jun; 74 (4): 277-302; Desmyterら、J. Biol. Chem. 2001 Jul 13 ;276 (28): 26285-90; Spinelliら、J. Mol. Biol. 2001 Aug 3; 311 (1): 123-9; Conrathら、Antimicrob Agents Chemother. 2001 Oct; 45 (10): 2807-12; Decanniereら、J. Mol. Biol. 2001 Oct 26; 313(3): 473-8; Nguyenら、Adv Immunol. 2001; 79: 261-96; Muruganandamら、FASEB J. 2002 Feb; 16 (2): 240-2; Ewertら、Biochemistry 2002 Mar 19; 41 (11): 3628-36; Dumoulinら、Protein Sci. 2002 Mar; 11 (3): 500-15; Cortez-Retamozoら、Int. J. Cancer. 2002 Mar 20; 98 (3): 456-62; Suら、Mol. Biol. Evol. 2002 Mar; 19 (3): 205-15; van der Vaart JM., Methods Mol Biol. 2002; 178: 359-66; Vrankenら、Biochemistry 2002 Jul 9; 41 (27): 8570-9; Nguyenら、Immunogenetics 2002 Apr; 54 (1): 39-47; Renisioら、Proteins 2002 Jun 1; 47 (4): 546-55; Desmyterら、J. Biol. Chem. 2002 Jun 28; 277 (26): 23645-50; Ledeboerら、J. Dairy Sci. 2002 Jun; 85 (6): 1376-82; De Genstら、J. Biol. Chem. 2002 Aug 16; 277 (33): 29897-907; Ferratら、Biochem. J. 2002 Sep 1; 366 (Pt 2): 415-22; Thomassenら、Enzyme and Microbial Technol. 2002; 30: 273-8; Harmsenら、Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002 Dec; 60 (4): 449-54; Joblingら、Nat Biotechnol. 2003 Jan; 21 (1): 77-80; Conrathら、Dev. Comp. Immunol. 2003 Feb; 27 (2): 87-103; Pleschbergerら、Bioconjug. Chem. 2003 Mar-Apr; 14 (2): 440-8; Lahら、J. Biol. Chem. 2003 Apr 18; 278 (16): 14101-11; Nguyenら、Immunology. 2003 May; 109 (1): 93-101; Joostenら、Microb. Cell Fact. 2003 Jan 30; 2 (1): 1; Liら、Proteins 2003 Jul 1; 52 (1): 47-50; Lorisら、Biol Chem. 2003 Jul 25; 278 (30): 28252-7; van Koningsbruggenら、J. Immunol. Methods. 2003 Aug; 279 (1-2): 149-61; Dumoulinら、Nature. 2003 Aug 14; 424 (6950): 783-8; Bondら、J. Mol. Biol. 2003 Sep 19; 332 (3): 643-55; Yauら、J. Immunol. Methods. 2003 Oct 1; 281 (1-2): 161-75; Dekkerら、J. Virol. 2003 Nov; 77 (22): 12132-9; Meddeb-Mouelhiら、Toxicon. 2003 Dec; 42 (7): 785-91; Verheesenら、Biochim. Biophys. Acta 2003 Dec 5; 1624 (1-3): 21-8; Zhangら、J Mol Biol. 2004 Jan 2; 335 (1): 49-56; Stijlemansら、J Biol Chem. 2004 Jan 9; 279 (2): 1256-61; Cortez-Retamozoら、Cancer Res. 2004 Apr 15; 64 (8): 2853-7; Spinelliら、FEBS Lett. 2004 Apr 23; 564 (1-2): 35-40; Pleschbergerら、Bioconjug. Chem. 2004 May-Jun; 15 (3): 664-71; Nicaiseら、Protein Sci. 2004 Jul; 13 (7): 1882-91; Omidfarら、Tumour Biol. 2004 Jul-Aug; 25 (4): 179-87; Omidfarら、Tumour Biol. 2004 Sep-Dec; 25(5-6): 296-305; Szynolら、Antimicrob Agents Chemother. 2004 Sep;48(9):3390-5; Saerensら、J. Biol. Chem. 2004 Dec 10; 279 (50): 51965-72; De Genstら、J. Biol. Chem. 2004 Dec 17; 279 (51): 53593-601; Dolkら、Appl. Environ. Microbiol. 2005 Jan; 71(1): 442-50; Joostenら、Appl Microbiol Biotechnol. 2005 Jan; 66(4): 384-92; Dumoulinら、J. Mol. Biol. 2005 Feb 25; 346 (3): 773-88; Yauら、J Immunol Methods. 2005 Feb; 297 (1-2): 213-24; De Genstら、J. Biol. Chem. 2005 Apr 8; 280 (14): 14114-21; Huangら、Eur. J. Hum. Genet. 2005 Apr 13; Dolkら、Proteins. 2005 May 15; 59 (3): 555-64; Bondら、J. Mol. Biol. 2005 May 6;348(3):699-709; Zarebskiら、J. Mol. Biol. 2005 Apr 21; [E-publication ahead of print]
a)3つの相補性決定領域/配列で分断された4つのフレームワーク領域/配列からなるアミノ酸配列において、Kabatのナンバリングによる108番目の位置での該アミノ酸残基はQであり;
および/または:
b)3つの相補性決定領域/配列で分断された4つのフレームワーク領域/配列からなるアミノ酸配列において、Kabatのナンバリングによる44番目の位置での該アミノ酸残基はE、Kabatのナンバリングによる45番目の位置での該アミノ酸残基はRであり;
および/または:
c)3つの相補性決定領域/配列で分断された4つのフレームワーク領域/配列からなるアミノ酸配列おいて、Kabatのナンバリングによる103番目の位置での該アミノ酸残基はP、R、およびSであり、RおよびSからなるグループから特に選択される。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり;
および/または:
ii)Kabatナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はEであり、Kabatナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はRであり;
および/または:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はP、R、およびSからなるグループ、特にRおよびSからなるグループから選択され;
および:
iv)CDR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
NYGMG [配列番号:15]
SYTLG [配列番号:16]
NYNMG [配列番号:17]
SSAMA [配列番号:18]
YYNTG [配列番号:19]
IGAMG [配列番号:20]
IGTMG [配列番号:21]
YNPMG [配列番号:22]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず、
および:
v)CDR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SISWSGTYTAYSDNVKG [配列番号:23]
GISWSGVSTDYAEFAKG [配列番号:24]
TSISWSGSYTAYADNVKG [配列番号:25]
SISWSGMSTYYTDSVKG [配列番号:26]
TITSGGRTSYADSVKG [配列番号:27]
AISWSGGLTYYADSVKG [配列番号:28]
TITSGGSTNYADPVKG [配列番号:29]
TITSGGSTNYADSVKG [配列番号:30]
AISRTGGSTYYARSVEG [配列番号:31]
AISRTGGSTYYPDSVEG [配列番号:32]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず、
および:
vi)CDR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
QSRYRSNYYDHDDKYAY [配列番号:33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [配列番号:34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [配列番号:35]
SNRYRTHTTQAMYNY [配列番号:36]
VVDGKRAP [配列番号:37]
NRRQKTVQMGERAYDY [配列番号:38]
NLKQGSYGYRFNDY [配列番号:39]
NLKQGDYGYRFNDY [配列番号:40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [配列番号:41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [配列番号:42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [配列番号:43]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
− CDR1が、(1)NYGMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)SISWSGTYTAYSDNVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)QSRYRSNYYDHDDKYAY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)SYTLG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)GISWSGVSTDYAEFAKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)LGRYRSNWRNIGQYDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)NYGMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TSISWSGSYTAYADNVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)QSRYSSNYYDHDDKYAY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)NYNMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)SISWSGMSTYYTDSVKG、(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)SNRYRTHTTQAMYNY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)SSAMA;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGRTSYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)VVDGKRAP;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YYNTG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISWSGGLTYYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3、は(1)NRRQKTVQMGERAYDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADPVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGSYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGSYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGDYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGTMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGDYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYARSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRTLPSEYNF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYPDSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYPDSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRSLPSEYTF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり;
および/または:
ii)Kabatナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はEであり、Kabatナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はRであり;
および/または:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はP、R、およびSからなるグループ、特にRおよびSからなるグループから選択され;
および:
iv)CDR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
NYGMG [配列番号:15]
SYTLG [配列番号:16]
NYNMG [配列番号:17]
SSAMA [配列番号:18]
YYNTG [配列番号:19]
IGAMG [配列番号:20]
IGTMG [配列番号:21]
YNPMG [配列番号:22]
および:
v)CDR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SISWSGTYTAYSDNVKG [配列番号:23]
GISWSGVSTDYAEFAKG [配列番号:24]
TSISWSGSYTAYADNVKG [配列番号:25]
SISWSGMSTYYTDSVKG [配列番号:26]
TITSGGRTSYADSVKG [配列番号:27]
AISWSGGLTYYADSVKG [配列番号:28]
TITSGGSTNYADPVKG [配列番号:29]
TITSGGSTNYADSVKG [配列番号:30]
AISRTGGSTYYARSVEG [配列番号:31]
AISRTGGSTYYPDSVEG [配列番号:32]
および:
vi)CDR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列である。
QSRYRSNYYDHDDKYAY [配列番号:33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [配列番号:34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [配列番号:35]
SNRYRTHTTQAMYNY [配列番号:36]
VVDGKRAP [配列番号:37]
NRRQKTVQMGERAYDY [配列番号:38]
NLKQGSYGYRFNDY [配列番号:39]
NLKQGDYGYRFNDY [配列番号:40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [配列番号:41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [配列番号:42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [配列番号:43]
− CDR1がNYGMGの場合;CDR2がSISWSGTYTAYSDNVKGであり;CDR3がQSRYRSNYYDHDDKYAYである。
− CDR1がSYTLGの場合;CDR2がGISWSGVSTDYAEFAKGであり;CDR3がLGRYRSNWRNIGQYDYである。
− CDR1がNYGMGの場合;CDR2がTSISWSGSYTAYADNVKGであり;CDR3がQSRYSSNYYDHDDKYAYである。
− CDR1がNYNMGの場合;CDR2がSISWSGMSTYYTDSVKGであり;CDR3がSNRYRTHTTQAMYNYである。
− CDR1がSSAMAの場合;CDR2がTITSGGRTSYADSVKGであり;
CDR3がVVDGKRAPである。
− CDR1がYYNTGの場合;CDR2がAISWSGGLTYYADSVKGであり;CDR3がNRRQKTVQMGERAYDYである。
− CDR1がIGAMGの場合、CDR2がTITSGGSTNYADPVKGであり、
CDR3がNLKQGSYGYRFNDYである。
− CDR1がIGAMGの場合;CDR2がTITSGGSTNYADSVKGであり;
CDR3がNLKQGSYGYRFNDYである。
− CDR1がIGAMGの場合;CDR2がTITSGGSTNYADSVKGであり;
CDR3がNLKQGDYGYRFNDYである。
− CDR1がIGTMGである場合;CDR2がTITSGGSTNYADSVKGであり;CDR3がNLKQGDYGYRFNDYである。
− CDR1がYNPMGである場合;CDR2がAISRTGGSTYYARSVEGであり;CDR3がAGVRAEDGRVRTLPSEYNFである。
− CDR1がYNPMGである場合;CDR2がAISRTGGSTYYPDSVEGであり;CDR3がAGVRAEDGRVRTLPSEYTFである。
− CDR1がYNPMGである場合;CDR2がAISRTGGSTYYPDSVEGであり;CDR3がAGVRAEDGRVRSLPSEYTFである。
a−1)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はG、E、D、G、Q、R、S、Lからなるグループ、好ましくはG、E、またはQからなるグループから選択され;および
a−2)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はL、R、またはCからなるグループ、好ましくはLあるいはRからなるグループから選択され;
および
a−3)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はW、R、またはSからなるグループ、好ましくはWまたはRからなるグループから選択され、最も好ましくはWであり;
a−4)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり、または:
b−1)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はEおよびQからなるグループから選択され、
b−2)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はRであり、
b−3)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はW、R、およびSからなるグループから選択され、好ましくはWであり、
b−4)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQおよびLからなるグループから選択され、好ましくはQであり、
または:
c−1)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はG,E,D,Q,R,S、およびLからなるグループ、好ましくはG,E,Qからなるグループから選択され、
c−2)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はL、R、およびCからなるグループ、好ましくはL、Rからなるグループから選択され、
c−3)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はP、R、およびSからなるグループ、特にR、Sからなるグループから選択され、
c−4)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQおよびLからなるグループから選択され、好ましくはQである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はG、E、D、G、Q、R、S、Lからなるグループ、好ましくはG、E、またはQからなるグループ
から選択され、
および:
ii)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はL、R、またはCからなるグループ、好ましくはLまたはRからなるグループから選択され、
および:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はW、R、またはSからなるグループ、好ましくはWまたはRからなるグループから選択され、最も好ましくはWであり、
および:
iv)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり、
および:
v)CDR1、CDR2、およびCDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記の
より好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はEおよびQからなるグループから選択され、
および:
ii)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はRであり、
および:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はW、R、およびSから選択され、最も好ましくはWであり、
および:
iv)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり、
および:
v)CDR1、CDR2、およびCDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記の
より好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatのナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はG、E、D、Q、R、S、およびLからなるグループ、好ましくはG、E、およびQからなるグループ
から選択され、
および:
ii)Kabatのナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はL、R、およびCからなるグループ、好ましくはLおよびRからなるグループから選択され、
および:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はP、R、およびSからからなるグループ、特にRおよびSからなるグループから選択され、
および:
iv)Kabatのナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQおよび、Lからからなるグループから選択され、好ましくはQであり、
および:
v)CDR1、CDR2、およびCDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
a)Kabatのナンバリングによる44〜47番目の位置のアミノ酸残基は、配列GLEW(または本明細書に規定するGLEW様配列)を形成しており、108番目の位置のアミノ酸残基がQであり;
または:
b)Kabatのナンバリングによる43〜46番目の位置のアミノ酸残基は、配列KEREまたはKQRE(またはKERE様配列)を形成しており、108番目の位置のアミノ酸残基がQまたはL、好ましくはQである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatのナンバリングによる44〜47番目の位置のアミノ酸残基は、配列GLEW(または本明細書に規定するGLEW様配列)を形成しており、108番目の位置のアミノ酸残基がQであり;
および:
ii)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatのナンバリングによる43〜46番目の位置のアミノ酸残基は、配列KEREまたはKQRE(またはKERE様配列)を形成しており、108番目の位置のアミノ酸残基がQまたはL、好ましくはQであり;
および:
ii)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
a)「GLEWグループ」:Kabatのナンバリングによる44〜47番目の位置がアミノ酸配列GLEWであり、Kabatのナンバリングによる108番目の位置がQであるナノボディ。本明細書にさらに記載するとおり、このグループのナノボディは通常、37番目の位置がVであり、103番目の位置がW、P、R、Sであり、好ましくは103番目の位置がWである。GLEWグループは以下の表4に記載する配列などのGLEW様配列も含む。
b)「KEREグループ」:Kabatのナンバリングによる43〜46番目の位置がアミノ酸配列KEREまたはKQREであり、Kabatのナンバリングによる108番目の位置がQまたはLであるナノボディ。本明細書にさらに記載するとおり、このグループのナノボディは通常、37番目の位置がFであり、47番目の位置がLまたはFであり、103番目の位置がW、P、R、Sであり、好ましくは103番目の位置がWである。
c)「103 P、R、Sグループ」:103番目の位置がP、R、Sであるナノボディ。これらのナノボディはKabatのナンバリングによる44〜47番目の位置にアミノ酸配列GLEWまたはKabatのナンバリングによる43〜46番目の位置アミノ酸配列KEREまたはKQREのいずれかを有しており、後者は最も好ましくは37番目の位置がFであり、47番目の位置がLまたはFとの組み合わせであり(KEREグループで規定されるとおり)、Kabatのナンバリングによる108番目の位置がQまたはL、好ましくはQでありうる。
(1)特に、限定しないが、43〜46番目の位置のKEREまたはKQREとの組み合わせ。
(2)通常、44〜47番目の位置のGLEW。
(3)通常、43〜46番目の位置のKEREまたはKQRE、例えば43〜47番目の位置のKEREL、KEREF、KQREL、KQREF、KEREG。または、TERE(例、TEREL)、KECE(例、KECELまたはKECER)、RERE(例、REREG)、QERE(例、QEREG)、KGRE(例、KGREG)、KDRE(例、KDREV)などの配列も可能である。それほど好ましくはないが、可能な他の配列として、例えば、DECKLおよびNVCELが挙げられる。
(4)44〜47番目の位置のGLEWおよび43〜46番目の位置のKEREまたはKQREのいずれも。
(5)多くの場合、天然VHHドメインの83〜84番目の位置のKPまたはEPとして。
(6)特に、限定しないが、44〜47番目の位置のGLEWとの組み合わせ。
(7)44〜47番目の位置がGLEWの場合、108番目の位置が常にQであるという条件で。
(8)GLEWグループには、44〜47番目の位置に、例えばGVEW、EPEW、GLER、DQEW、DLEW、GIEW、ELEW、GPEW、EWLP、GPER、GLER、ELEWなどのGLEW様配列も含まれる。
これらの組み合わせのヒト化に関しては明細書を参照されたい。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し、
i)特徴的残基は本明細書に記載のとおりであり;
および:
ii)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
でき、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
および
i)FR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[1]QVQLQESGGGXVQAGGSLRLSCAASG[26]
[配列番号:1]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本
明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失ままたは挿入を含まず;
および:
ii)FR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[36]WXRQAPGKXXEXVA[49] [配列番号:2]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失ままたは挿入を含まず;
および:
iii)FR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[66]RFTISRDNAKNTVYLQMNSLXXEDTAVYYCAA[94][配列番号:3]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失ままたは挿入を含まず;
および:
iv)FR4が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[103]XXQGTXVTVSS[113] [配列番号:4]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および
v)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、
特徴的残基は「X」で示され、上記で規定するとおりであり、カッコ間の数字はKabatナンバリングによるアミノ酸の位置を示す。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
および
i)FR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[1]QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG[26]
[配列番号:5]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
ii)FR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[36]WFRQAPGKERELVA[49] [配列番号:6]
[36]WFRQAPGKEREFVA[49] [配列番号:7]
[36]WFRQAPGKEREGA [49] [配列番号:8]
[36]WFRQAPGKQRELVA[49] [配列番号:9]
[36]WFRQAPGKQREFVA[49] [配列番号:10]
[36]WYRQAPGKGLEWA[49] [配列番号:11]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、および47番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、および47番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
iii)FR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[66]RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA[94][配列番号:12]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83および84番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83および84番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
iv)FR4が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[103]WGQGTQVTVSS[113] [配列番号:13]
[103]WGQGTLVTVSS[113] [配列番号:14]
または、上記のアミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本
明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され;
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、および108番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、および108番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
v)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
および
i)FR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[1] QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG[26][配列番号:5]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
ii)FR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[36]WFRQAPGKERELVA[49] [配列番号:6]
[36]WFRQAPGKEREFVA[49] [配列番号:7]
[36]WFRQAPGKEREGA [49] [配列番号:8]
[36]WFRQAPGKQRELVA[49] [配列番号:9]
[36]WFRQAPGKQREFVA[49] [配列番号:10]
および/または、上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差
違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、および47番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
iii)FR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[66]RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA[94] [配列番号:12]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83、および84番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
iv)FR4が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[103]WGQGTQVTVSS[113] [配列番号:13]
[103]WGQGTLVTVSS[113] [配列番号:14]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差
違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸
の置換(本明細書で規定)、および/または表9に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸
置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、および108番目の位置での特徴的残基が上記の配列内に示
されており;
および:
CDR1、CDR2、CDR3は本明細書において規定するとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
および
i)FR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[1]QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG[26] [配列番号:5]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)位置での特徴的残基が上記の配列内に示されており;
および:
ii)FR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[36]WYRQAPGKGLEWA[49] [配列番号:11]
および/または、上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、および47番目の位置での特徴的残基が上記の各配列内に示されており;
および:
iii)FR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[66]RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA [94][配列番号:12]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83および84番目の位置での特徴的残基が上記の各配列内に示されており;
および:
iv)FR4が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択され:
[103]WGQGTQVTVSS[113] [配列番号:13]
および/または、上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され:
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表9に規定するアミノ酸置換であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、および108番目の位置の特徴的残基が上記の各配列内に示されており;
および:
v)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書に規定するとおりであり、好ましは上記の好ましい規定の1つに従って規定するとおりであり、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定するとおりである。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
および
i)FR1が、配列番号:60〜73および配列番号86〜97のナノボディ、特に配列番号:86〜97のヒト化ナノボディに存在するFR1配列からなるグループ、または前記FR1配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有しており;
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸が、前記FR1配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)位置の特徴的残基が前記FR1配列内に示されている;
アミノ酸配列からなるグループ、および/または前記FR1配列の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され、:
(1)特徴的位置以外の任意の位置の任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表6に規定するアミノ酸置換であり、
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、前記FR1配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず、
(3)位置の特徴的残基が前記FR1配列内に示されているアミノ酸配列からなるグループから選択され;
および:
ii)FR2が、配列番号:60〜73および配列番号86〜97のナノボディ、特に配列番号:86〜97のヒト化ナノボディに存在するFR2配列からなるグループ、または前記FR1配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有しており、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり;および/または
(2)前記アミノ酸が、前記FR2配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、47番目の位置の特徴的残基が前記FR2配列内に示されている;
アミノ酸配列からなるグループ、および/または前記FR2配列の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表7に規定するアミノ酸置換であり、
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、前記FR2配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)37、44、45、47番目の位置の特徴的残基が前記FR2配列内に示されている;アミノ酸配列からなるグループから選択され、
および:
iii)FR3が、配列番号:60〜73および配列番号86〜97のナノボディ、特に配列番号:86〜97のヒト化ナノボディに存在するFR3配列からなるグループ、または前記FR3配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有しており、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸が、前記FR3配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83、84番目の位置の特徴的残基が前記FR3配列内に示されている;
アミノ酸配列からなるグループ、および/または前記FR3配列の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、前記FR3配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)83、84番目の位置の特徴的残基が前記FR3配列内に示されている;
アミノ酸配列からなるグループから選択され;
および:
iv)FR4が、配列番号:60〜73および配列番号86〜97のナノボディ、特に配列番号:86〜97のヒト化ナノボディに存在するFR4配列からなるグループ、または前記FR4配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有しており、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸が、前記FR4配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、108番目の位置の特徴的残基が前記FR4配列内に示されている;
アミノ酸配列からなるグループ、および/または前記FR4配列の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択され、
(1)特徴的位置以外の任意の位置での任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)、および/または表8に規定するアミノ酸置換であり;
および/または
(2)前記アミノ酸配列が、前記FR4配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;および
(3)103、104、108番目の位置の特徴的残基が前記FR4配列内に示されているアミノ酸配列からなるグループから選択され;
および:
v)CDR1、CDR2、CDR3は本明細書において規定されるとおりであり、好ましくは上記の好ましい規定の1つに従って規定され、より好ましくは上記のより好ましい規定の1つに従って規定されるとおりである。
(1)特徴的残基が上記の表4に示しているとおりであり得るし;
(2)特徴的部位以外の任意の部位での任意のアミノ酸置換は、好ましくは保存アミノ酸置換(本明細書で規定)および/または表6〜9に規定するアミノ酸置換のいずれかであり;および/または
(3)前記アミノ酸配列は、前記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
(1)特徴的残基が配列番号:60〜73および配列番号:86〜97(好ましくは配列番号:86〜97)から選択される関連配列に示されているとおりであり;
(2)特徴的部位以外の任意の部位の任意のアミノ酸置換は、好ましくは保存アミノ酸置換(本明細書で規定)および/または表6〜9で規定されるアミノ酸置換のいずれかであり;および/または
(3)前記アミノ酸配列は、好ましくは、配列番号:60〜73および配列番号:86〜97(好ましくは配列番号:86〜97)から選択される関連配列と比較して、アミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
− 上記のフレームワーク配列内の1つ以上のアミノ酸残基は、天然VHHドメインの同じ位置に天然に現れる1つ以上のアミノ酸残基で置換される。該置換のいくつかの例は上記の表6〜9に記載しており、
および/または:
− 上記のフレームワーク配列内の1つ以上のアミノ酸残基は、上記の「保存」アミノ酸置換と見なされる1つ以上のアミノ酸残基で置換され、
および/または:
− 上記のフレームワーク配列内の1つ以上のアミノ酸残基は、天然VHHドメインの同じ位置に天然に現れる1つ以上のアミノ酸残基で置換される。これは一般に天然V
HH/ナノボディの全体、特に前記位置において「ヒト化」と呼ばれ、以下に詳述しており、
および:
− 1つ以上のアミノ酸残基が表6〜9のVHドメインおよびVHHドメインのいずれについても記載される位置は好ましくは置換されない。
a)例えば、その配列または残基に対して指向性を有するアフィニティー法を用いて、ナノボディの精製を可能にし、または容易にするアミノ酸配列または残基である「タグ」を形成していてよい。その後、その配列または残基を(化学分解または酵素分解等により)除去し、本発明のヌクレオチド配列を得ることができる(このために、配列または残基は、場合によっては、分解可能なリンカー配列を介して本発明のアミノ酸配列に結合してもよい)。該残基の好ましいが非限定的ないくつかの例は、複数のヒスチジン配列またはグルタチオン残基である。
b)例えば、異種宿主細胞または宿主生物で発現された結果としてのN−末端のMet残基であってよい。
c)官能基を有していてもよく、かつ/またはそれ自体公知の方法で官能基化されていてもよい1つ以上のアミノ酸残基であってよい。例えば、公知であるように、リジン等のアミノ酸残基、特にシステインは、PEG基と結合することができ、タンパク質の表面部位を被覆することにより、例えば、免疫源性を低下させ、血漿中での半減期を増大させ、タンパク質分解酵素による切断に対する安定性を増大させることができる;
d)ナノボディまたは本発明のポリペプチドの血清中での半減期を増大させる。インビボにおける半減期を増大させるために、治療効果を有するタンパク質と結合および/または融合することができるアミノ酸配列は当業者に周知であり、ヒト血清タンパク質またはその断片(ヒト血清アルブミンまたはその断片)、さらには、抗体(特にヒト抗体)のFc領域が挙げられる。また、上述のとおり、該半減期を増大させるためのアミノ酸配列は、血清タンパク質、例えばヒト血清アルブミンに対して指向性を有するナノボディ等の、血清タンパク質に対して指向性を有するアミノ酸配列であってよい。
− 同一の抗原、すなわち、同一の抗原における同一の部分もしくはエピトープ、または
同一の抗原における2つ以上の異なる部分もしくはエピトープに対して指向性を有するものであってもよく;および/または:
− 異なる抗原に対して指向性を有するものであってもよく;
または両者を組み合わせたものであってもよい。
− 2つの同一のナノボディを含んでいてもよく;
− 抗原の第1の部分または第1のエピトープに対する第1のナノボディと、該抗原の同一の部分もしくはエピトープに対して指向性を有する、または該抗原の異なる部分もしくはエピトープに対して指向性を有する第2のナノボディを含んでいてもよく;
− または第1の抗原に対して指向性を有する第1のナノボディと、該第1の抗原とは異なる第2の抗原に対して指向性を有する第2のナノボディを含んでいてもよく、本発明の3価ポリペプチドは、例えば:
− 同一の抗原の同一または異なる部分もしくはエピトープに対して指向性を有する、3つの同一または異なるナノボディを含んでいてもよく;
− 第1の抗原の同一または異なる部分もしくはエピトープに対する、2つの同一または異なるナノボディと、第1の抗原とは異なる第2の抗原に対して指向性を有する第3のナノボディを含んでいてもよく;または
− 第1の抗原に対して指向性を有する第1のナノボディと、該第1の抗原とは異なる第2の抗原に対して指向性を有する第2のナノボディと、該第1および第2の抗原とは異なる第3の抗原に対して指向性を有する第3のナノボディを含んでいてもよい。少なくとも2つのナノボディを含み、そのうち少なくとも1つのナノボディが第1の抗原に対して指向性を有するものであり、少なくとも1つのナノボディが第1の抗原とは異なる第2の抗原に対して指向性を有するものである本発明のポリペプチドは、「多特異性」ナノボディとも呼ばれる。したがって、「2特異性」ナノボディは、第1の抗原に対して指向性を有する少なくとも1つのナノボディと、第2の抗原に対して指向性を有する少なくとも1つの別のナノボディを含むナノボディであり、「3特異性」ナノボディは、第1の抗原に対して指向性を有する少なくとも1つのナノボディと、第2の抗原に対して指向性を有する少なくとも1つの別のナノボディと、第3の抗原に対して指向性を有する少なくとも1つの別のナノボディを含むナノボディであり、4特異性以上の場合も同様である。
− 適切な宿主細胞または宿主生物(本明細書において「本発明の宿主」ともいう)または本発明の該ナノボディまたはポリペプチドをコードする核酸(本明細書において「本発明の核酸」ともいう)の他の適切な発現系における発現、次いで:
− このようにして、得た本発明の、ナノボディまたはポリペプチドの単離および/または精製。
− 本発明の宿主が本発明の、少なくとも1種類のナノボディおよび/またはポリペプチドを発現および/または産生するような条件下での本発明の宿主の培養および/または維持;場合によって、次いで:
− 得た本発明のナノボディまたはポリペプチドの単離および/または精製。
a)少なくとも1つの本発明の核酸であって、場合によっては
b)プロモーター、および場合によっては好適なターミネーター等の、1種類以上の制御要素に結合しており、
c)場合によっては、さらに
d)1つ以上のそれ自体公知の遺伝子構造物の要素とも結合している;
この場合、「制御要素」、「プロモーター」、「ターミネーター」、および「動作可能に結合している」という語句は、本技術分野における通常の意味(後に詳述する)を有しており、遺伝子構造物中に存在する該「他の要素」は、例えば、3'−または5'−UTR配列、リーダー配列、選択マーカー、発現マーカー/レポーター配列、および/または形質転換または組み込み(の効率)を促進または増大させる要素であってよい。該遺伝子構造物に好適なこれらおよび他の好適な要素は当業者に明らかであり、例えば、用いる構造物の種類、目的とする宿主細胞または宿主生物、対象となる本発明のヌクレオチド配列が発現される方法(構成的発現、一時的発現、または誘導性発現等)、および/または用いる形質転換手法に依存する。
− CDR1が、(1)NYGMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)SISWSGTYTAYSDNVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)QSRYRSNYYDHDDKYAY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)SYTLG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)GISWSGVSTDYAEFAKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)LGRYRSNWRNIGQYDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)NYGMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TSISWSGSYTAYADNVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)QSRYSSNYYDHDDKYAY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)NYNMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)SISWSGMSTYYTDSVKG、(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)SNRYRTHTTQAMYNY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)SSAMA;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGRTSYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)VVDGKRAP;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YYNTG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISWSGGLTYYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3、は(1)NRRQKTVQMGERAYDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADPVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGSYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGSYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGAMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGDYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)IGTMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)TITSGGSTNYADSVKG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)NLKQGDYGYRFNDY;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYARSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRTLPSEYNF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYPDSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
− CDR1が、(1)YNPMG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択される場合は、CDR2は、(1)AISRTGGSTYYPDSVEG;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;
からなるグループから選択され、およびCDR3は、(1)AGVRAEDGRVRSLPSEYTF;(2)前記アミノ酸配列と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;(3)前記アミノ酸配列と3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有するアミノ酸配列;からなるグループから選択され、
(1)任意のアミノ酸置換が好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記アミノ酸配列と比較した場合、好ましくアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
FR1〜FR4はそれぞれフレームワーク領域1〜4をそれぞれ示し、CDR1〜CDR3はそれぞれ相補性決定領域1〜3をそれぞれ示し:
i)Kabatナンバリングによる108番目の位置のアミノ酸残基はQであり;
および/または:
ii)Kabatナンバリングによる44番目の位置のアミノ酸残基はEであり、Kabatナンバリングによる45番目の位置のアミノ酸残基はRであり;
および/または:
iii)Kabatのナンバリングによる103番目の位置のアミノ酸残基はP、R、およびSからなるグループ、特にRおよびSからなるグループから選択され;
および:
iv)CDR1が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
NYGMG [配列番号:15]
SYTLG [配列番号:16]
NYNMG [配列番号:17]
SSAMA [配列番号:18]
YYNTG [配列番号:19]
IGAMG [配列番号:20]
IGTMG [配列番号:21]
YNPMG [配列番号:22]
および:
v)CDR2が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SISWSGTYTAYSDNVKG [配列番号:23]
GISWSGVSTDYAEFAKG [配列番号:24]
TSISWSGSYTAYADNVKG [配列番号:25]
SISWSGMSTYYTDSVKG [配列番号:26]
TITSGGRTSYADSVKG [配列番号:27]
AISWSGGLTYYADSVKG [配列番号:28]
TITSGGSTNYADPVKG [配列番号:29]
TITSGGSTNYADSVKG [配列番号:30]
AISRTGGSTYYARSVEG [配列番号:31]
AISRTGGSTYYPDSVEG [配列番号:32]
および:
vi)CDR3が、以下のアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列である。
QSRYRSNYYDHDDKYAY [配列番号:33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [配列番号:34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [配列番号:35]
SNRYRTHTTQAMYNY [配列番号:36]
VVDGKRAP [配列番号:37]
NRRQKTVQMGERAYDY [配列番号:38]
NLKQGSYGYRFNDY [配列番号:39]
NLKQGDYGYRFNDY [配列番号:40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [配列番号:41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [配列番号:42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [配列番号:43]
ターミネーター、転写および/または翻訳エンハンサーおよび/または組込み因子等の、本発明の遺伝子構造物中に存在する/用いることができるプロモーター、選択マーカー、リーダー配列、発現マーカー、及び他の要素についての(他の)非限定的ないくつかの例については、上述のSambrookら、およびAubuselらによるハンドブック、および国際公開第95/07463号、国際公開第96/23810号、国際公開第95/07463号、国際公開第95/21191号、国際公開第97/11094号、国際公開第97/42320号、国際公開第98/06737号、国際公開第98/21355号、米国特許第6,207,410号、米国特許第5,693,492、および欧州特許第1 085 089号に示されたものを参照されたい。他の例は当業者に明らかである。上述の一般的な背景技術に関する参考文献および後述する参考文献も参照されたい。
− 大腸菌の菌株、ミラビリス変形菌等のプロテウス属の菌株、蛍光菌等のシュードモナス属の菌株等のグラム陰性菌株、枯草菌またはブレビス菌等のバチルス属の菌株、ストレプトミセスリビダンス等のストレプトミセス属の菌株、スタフィロコッカスカルノザス等のブドウ球菌の菌株、および乳酸連鎖球菌等のラクトコッカス属の菌株等のグラム陽性菌が挙げられるが、これらに限定されない細菌株;
− トリコデルマリーゼイ等のトリコデルマ属、ニューロスポラクラッサ等のニューロスポラ属、ソルダリアマクロスポラ等のソルダリア属、アスペルギルスニガーまたはアスペルギルスソーヤ等のアスペルギルス属、または他の糸状菌由来の細胞が挙げられるが、これらに限定されない真菌細胞;
− 出芽酵母等のサッカロミセス属、シゾサッカロミセスポンベ等のシゾサッカロミセス属、ピチアパストリスまたはピチアメタノリカ等のピチア属、ハンセヌラポリモルファ等のハンセヌラ属、クルイベロミセスラクティス等のクルイベロミセス属、Arxulaadeninivorans等のArxula属、ヤロウィアリポリチカ等のヤロウィア属由来の細胞
が挙げられるが、これらに限定されない酵母細胞;
− アフリカツメガエル卵母細胞等の両生類細胞;
− シロイチモンジヨトウSF9およびSF21細胞等の鱗翅目より誘導された細胞/細胞株、またはシュナイダー細胞およびKc細胞等のショウジョウバエより誘導された細胞/細胞株等の昆虫より誘導された細胞または細胞株;
− タバコ等の植物または植物細胞;および/または
− CHO細胞、BHK細胞(BHK-21細胞等)、およびHeLa細胞、COS細胞(COS-7細胞等)、およびPER C6細胞等のヒトから誘導された細胞または細胞株を含むがこれらに限定されない、ヒト、哺乳類から誘導された細胞または細胞株等の哺乳類細胞または細胞株;
および抗体および抗体断片((単一の)抗体領域およびscFv断片が挙げられるがこれらに限定されない)を発現および産生することが公知な他の宿主または宿主細胞であってよく、これらは当業者に明らかである。上で引用した一般背景技術に関する文献および、例えば、国際公開第94/29457号、国際公開第96/34103号、国際公開第99/42077号、Frenkenら、(1998)、上掲、RiechmannおよびMuyldermans、(1999)、上掲、van der Linden、(2000)、上掲、Thomassen ら(2002)、上掲、Joostenら、(2003)、上掲、Joostenら、(2005)、上掲、および本明細書でさらに引用した文献を参照されたい。
− 大腸菌中での発現のための:lacプロモーター(lac5プロモーター等のこれらの誘導体)、アラビノースプロモーター、λファージの左側(PL)および右側(PR)プロモーター、trpオペロンのプロモーター、ハイブリッドlac/trpプロモーター(tacおよびtrc)、T7-プロモーター(より具体的にはT7-ファージ遺伝子10のプロモーター)、
および他のT-ファージプロモーター、Tn10テトラサイクリン耐性遺伝子のプロモーター、1つ以上の外来制御オペレーター配列を含む上述のプロモーターの組換え変異体;
− 出芽酵母中での発現のための: ADH1(アルコール脱水素酵素1)、ENO(エノラーゼ)、CYC1(チトクロームc異性化酵素1)、GAPDH(グリセルアルデヒド−3−リン酸脱水酵素)、PGK1(ホスホグリセリン酸キナーゼ)、PYK1(ピルビン酸キナーゼ)の構成的プロモーター、GAL1,10,7(ガラクトース代謝酵素)、ADH2(アルコール脱水素酵素2)、PHO5(酸ホスファターゼ)、CUP1(銅メタロチオネイン)の制御的プロモーター、CaMV(カリフラワーモザイクウィルス35Sプロモーター)の外来プロモーター;
− ピチアパストリスでの発現のための:AOX1プロモーター(アルコール酸化酵素I);
− 哺乳類細胞での発現のための:ヒトサイトメガロウィルス(hCMV)前初期エンハンサー/プロモーター、プロモーターがTetリプレッサーによって制御可能なように2つのテトラサイクリンオペレーター配列を含むヒトサイトメガロウィルス(hCMV)
前初期プロモーター変異体、単純ヘルペスウィルスチミジンキナーゼ(TK)プロモーター、ラウス肉腫ウィルスの長い末端反復(RSV LTR)エンハンサー/プロモーター、
ヒト、チンパンジー、マウス、またはラット由来の伸長因子1α(hEF-1α)プロモーター、SV40初期プロモーター、HIV-1の長い末端反復プロモーター、βアクチン
プロモーター;
これらの宿主細胞で用いるためのベクターの、好ましいが非限定的ないくつかの例としては、以下が含まれ:
− 哺乳類細胞中での発現のためのベクター:pMAMneo(Clontech)、pcDNA3(Invitrogen), pMC1neo (Stratagene)、pSG5 (Stratagene)、EBO-pSV2-neo(ATCC 37593)、pBPV-1(8-2)(ATCC 37110)、pdBPV-MMTneo(342-12)(ATCC 37224)、pRSVgpt (ATCC37199)、pRSVneo(ATCC37198)、pSV2-dhfr(ATCC 37146)、
pUCTag(ATCC 37460)および1ZD35(ATCC 37565)、ならびにアデノウィルスに基づくもの等のウィルスに基づく発現系;
− 細菌細胞中での発現のためのベクター:pET ベクター(Novagen)およびpQEベクター(Qiagen);
− 酵母または別の真菌細胞中での発現のためのベクター:pYES2(Invitrogen)およびピチア発現ベクター(Invitrogen);
− 昆虫細胞中での発現のためのベクター:pBlueBacII(Invitrogen)および別のバキュロウィルスベクター;
− 植物または植物細胞中での発現のためのベクター:例えば、カリフラワーモザイクウィルスまたはタバコモザイクウィルス、アグロバクチリウムの好適な菌株またはTi-プラスミドに基づくベクター;
これらの宿主細胞で用いるための分泌配列の、好ましいが非限定的ないくつかの例としては、以下が含まれる:
− 大腸菌等の細菌細胞中での発現のための:PelB、Bla、OmpA、OmpC、OmpF、OmpT、StII、PhoA、PhoE、MalE、Lpp、LamB等、TATシグナルペプチド、ヘモリシン
C−末端分泌シグナル;
− 酵母中での発現のための:α−接合因子プレプロ配列、ホスファターゼ(pho1)、インベルターゼ(Suc);
− 哺乳類細胞での発現のための:標的タンパク質が真核細胞由来である場合には、固有シグナル、マウスIgκ鎖V-J2-Cシグナルペプチド等;
i)CDR1が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SFGMS [配列番号:44]
LNLMG [配列番号:45]
INLLG [配列番号:46]
NYWMY [配列番号:47]
および/または上記のアミノ酸の1つと2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
ii)CDR2が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
SISGSGSDTLYADSVKG [配列番号:48]
TITVGDSTNYADSVKG [配列番号:49]
TITVGDSTSYADSVKG [配列番号:50]
SINGRDDTRYADSVKG [配列番号:51]
AISADSSTKNYADSVKG [配列番号:52]
AISADSSDKRYADSVKG [配列番号:53]
RISTGGGYSYYADSVKG [配列番号:54]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および:
iii)CDR3が、以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
DREAQVDTLDFDY [配列番号:55]
または、上記のアミノ酸配列の1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の配列同一性(本明細書で規定)を有する、アミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり;
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず;
または以下からなるグループから選択されるアミノ酸配列であり:
GGSLSR [配列番号:56]
RRTWHSEL [配列番号:57]
GRSVSRS [配列番号:58]
GRGSP [配列番号:59]
および/または上記のアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるアミノ酸配列を含む、本質的にアミノ酸配列からなる、もしくはアミノ酸配列であり:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まず、
および/または上述のCDRアミノ酸の1つと3つ、2つまたは1つのみ(前章に提示)「アミノ酸の差違」(本明細書で規定)を有しているアミノ酸配列からなるグループから選択されるCDRにより置換でき:
(1)任意のアミノ酸置換が、好ましくは保存アミノ酸の置換(本明細書で規定)であり;および/または
(2)前記アミノ酸配列が、上記のアミノ酸配列と比較した場合、好ましくはアミノ酸置換のみを含み、アミノ酸の欠失または挿入を含まない。
(a)上述のポリペプチドをコードすることができる核酸を含む宿主細胞を、ポリペプチドの発現を可能とする条件下で培養する工程と、
(b)産生されたポリペプチドを培養物から回収する工程を含む、上述のポリペプチドを製造する方法である。
(a)上述のポリペプチド構造物を、調節剤の候補の存在下または非存在下、該ポリペプチドとの結合を可能にする条件下で、その標的に対応するポリペプチドまたはその断片に接触させる工程と、
(b)工程(a)のポリペプチドとの結合を測定し、該調節剤の候補の存在下において、該調節剤の候補の非存在下における結合に対する結合の減少により、該調節剤の候補が血小板媒介凝集を調節する薬剤として同定される工程を含む血小板媒介凝集を調節する薬剤の同定方法である。
(a)サンプルを上述のポリペプチド構造物と接触させる工程と、
(b)該ポリペプチド構造物の該サンプルに対する結合を検出する工程と、
(c)工程(b)における結合を標準と比較した場合、該サンプルに対する結合との差が、血小板媒介凝集の機能不全を特徴とする疾患または障害の存在を示す診断結果である工程を含む、血小板媒介凝集の機能不全を特徴とする疾患または障害を診断する方法である。
(a)以下の残基の単独または組み合わせのいずれかの置換:
FR1位置1、5、28および30、
FR2における位置37、44、45および47での特質アミノ酸、
FR3残基74、75、76、83、84、93および94、
およびFR4における位置103、104、108および111;
Kobat ナンバリングにしたがったナンバリング
Ser、Thr、GlyおよびAsnによって置換されたSer;
Arg、His、Gln、LysおよびGluの中の1つによって置換されたArg;
Leu、Ile、Phe、Tyr、MetおよびValの中の1つによって置換されたLeu;
Pro、Gly、AlaおよびThrの中の1つによって置換されたPro;
Thr、Pro、Ser、Ala、Gly、HisおよびGlnの中の1つによって置換されたThr;
Ala、Gly、ThrおよびProの中の1つによって置換されたAla;
Val、Met、Tyr、Phe、IleおよびLeuの中の1つによって置換されたVal;
Gly、Ala、Thr、ProおよびSerの中の1つによって置換されたGly;
Ile、Met、Tyr、Phe、ValおよびLeuの中の1つによって置換されたIle;
Phe、Trp、Met、Tyr、Ile、ValおよびLeuの中の1つによって置換されたPhe;
Tyr、Trp、Met、Phe、Ile、ValおよびLeuの中の1つによって置換されたTyr;
His、Glu、Lys、Gln、ThrおよびArgの中の1つによって置換されたHis;
Gln、Glu、Lys、Asn、His、ThrおよびArgの中の1つによって置換されたGln;
Asn、Glu、Asp、GlnおよびSerの中の1つによって置換されたAsn;
Lys、Glu、Gln、HisおよびArgの中の1つによって置換されたLys;
Asp、GluおよびAsnの中の1つによって置換されたAsp;
Glu、Asp、Lys、Asn、Gln、HisおよびArgの中の1つによって置換されたGlu;
Met、Phe、Ile、Val、LeuおよびTyrの中の1つによって置換されたMet。
実施例1:抗原特異性一価ナノボディ
表15の配列番号60〜66に示されるナノボディは、ヒトvWFまたはvWFの組み替えA1ドメインで免疫化したラマから得る。ナノボディはvWFのA1ドメインに結合し、血小板上のvWFおよびgpIb間相互作用を阻害する。
ナノボディの発現および精製
プラスミドを調製(QIAGEN、メーカーの使用説明書にしたがって)し、WK6またはTG1エレクトロコンピテント細胞へ形質転換した。単一コロニーを使用し、2%のグルコースおよび100μg/mlのアンピシリンを含むLB中で一夜培養を開始した。この一夜培養した培養液を、100μg/mlのアンピシリンを含む2x300mlのTB培地に100倍希釈し、600nmでのODが0.5になるまで37℃でインキュベートした。1mMのIPTGを添加し、培養液を37℃で3時間以上、または28℃で一晩インキュベートした。
ELISAにおけるvWFへのナノボディの結合
ELISAにおけるvWFへの結合について実施例1のナノボディを試験した。したがって、200倍希釈したvWF(Red Cross)でマイクロタイタープレート(Nunc、Maxisorb)を被覆し37℃で15分間、事前に加温した。プレートは4℃で一晩コーティングした。その後プレートはPBS‐Tween で洗浄し、PBS‐1%カゼインを使用し室温で2時間ブロッキングした。洗浄後、試料を10mg/mlの濃度から接触させ、PBS中に3倍希釈した。2時間インキュベートした後、プレートを洗浄し、1000倍希釈したマウスモノクローナル抗myc抗体を室温で1時間接触させた。プレートを洗浄し、ポリクローナル抗マウスHRP(DAKO)を1000倍希釈し室温で1時間接触させた。プレートを洗浄し、ABTS/H2O2 基質を接触させた。405nmでのODを測定した。結果を図1に示す。
フローチャンバーにおけるナノボディによる血小板付着の阻害
タンパク質試料をかん流チャンバーで分析した。Thermanox coverslips(Nunc)を80%エタノールに一晩浸漬し、蒸留水で完全に洗い流し風乾した。ヒト胎盤コラーゲンIII型(Sigma)を0.05mol/l の酢酸に可溶化し、レタッチエアブラシにより30μg/cm2の最終密度でカバースリップ上にスプレーした。スプレー後、カバースリップをPBSの1%ヒトアルブミン溶液で、室温で少なくとも1時間ブロッキングした。かん流を一過式かん流チャンバーによって非拍動のフロー条件で、0.1mmのスリット高さおよび2mmのスリット幅を有する、改変した小かん流チャンバーを用いて行った。血液は健常ボランティアから静脈穿刺によって得、Penta/PPACKで抗凝固処理した。3重カバースリップをチャンバーに挿入した。5mlの血液を、2μg/mlのナノボディを添加して、あるいは添加せずに37℃で5分間事前に加温し、その後、輸液ポンプを用いて1600s‐1の壁せん断速度でチャンバーに5分間循環させた。かん流運転の後、カバースリップをチャンバーから取り出し、Hepesバッファーで緩衝した生理食塩水(10mM のHepes、150mMのNaCL、ph7.4)で洗い流し、0.5%のグルタルアルデヒドを含むPBS中で固定し、メタノール中で脱水し、May-GrunwaldおよびGiemsa(Riedel de Haen)で染色した。光学顕微鏡およびコンピューター支援機器を使用して血小板表面被覆率として血小板沈着を評価した。結果を表17に示す。明らかにナノボディ12B6および12A5は、高せん断速度にてかん流チャンバー中でコラーゲンIII型への血小板付着を阻害する。
相同体ナノボディのvWFへの結合についてのBIACORE分析
ナノボディ12B6および12A5はかん流チャンバーにおける血小板付着を阻害する。相同体配列は、表18の配列番号67〜73に示されるアミノ酸の相違を有するラマから得た。図2および3は、12A5および12B6相同体ナノボディ配列のアラインメントを表している。
かん流チャンバーにおける作用強度についてのナノボディ阻害の比較
血小板付着の阻害について作用強度を比較するために、ナノボディ12A2、12B6および12A5を0.2、0.4および0.6μg/mlで、かん流チャンバー中で試験した。実験はすべてのナノボディに対して同一のドナーで行った。結果を表22および図6に示す。かん流チャンバー中でナノボディは、0.6μg/mlのナノボディ濃度での血小板付着の完全な阻害とかなり同程度の阻害能を示す。
上昇温度でのナノボディの安定性
PBS中200μg/ml濃度のナノボディ原液を調製し、いくつかの試験管に分注した。ナノボディが入った各試験管を様々な温度で1時間インキュベートし、その後室温で2時間冷却し、4℃で一晩置いた。翌日、試料を13000rpmで30分間遠心分離し、280nmでのODについて上清を試験した。上清濃度を分光測光法で測定し、室温でのパーセント濃度として表した。結果を表23に要約する。
他の種から得たナノボディのvWFとの交差反応
マイクロタイタープレートを1/1000希釈したマウス抗mycで4℃で一晩コーティングした。プレートはPBS‐Tween で洗浄し、PBS‐1%カゼインを使用し室温で2時間ブロッキングした。洗浄後、PBS中10mg/mlの濃度でナノボディを接触させた。1時間インキュベートした後、プレートを洗浄し、初めは5倍希釈から血漿(イヌ、ブタ、ヒト、ヒヒおよびカキクイザル)を接触させ、PBSでさらに2倍希釈した。プレートを室温で1時間インキュベートした。プレートを洗浄し、ポリクローナル抗vWF‐HRP(DAKO)を、室温で1時間、2000倍希釈で接触させた。プレートを洗浄し、ABTS/H2O2基質を接触させた。405nmでのODを測定した。
実施例9
二価ナノボディのアミノ酸配列
表24の配列番号74〜82は、12B6、12A2および12A5に対して構築された二価ナノボディを表している。ナノボディは表25の配列番号83〜85に示されるリンカーと結合した。
二価ナノボディの発現および精製
実施例2で上述したように発現を行った。発現率を表26に要約する。
BIACOREにおける二価ナノボディの分析
実施例5で上述したようにBIACOREで、実施例9の二価ナノボディを1,3nMで分析し、vWF対一価ナノボディについての親和性を比較した。二価ナノボディ12B6(図9)、12A2(図10)および12A5(図11)では、一価ナノボディと比較してvWFに対する親和性が改善されている。
上昇温度での二価ナノボディの安定性
実施例7で上述したように二価ナノボディの安定性を測定した。上清濃度(mg/ml)を測定し、室温での濃度パーセントとして表した。結果を表27(二価12B6)、表28(二価12A2)および表29(二価12A5)に要約する。
フローチャンバー中の一価および二価12A2の分析
実施例4で上述したように、かん流チャンバーでナノボディ12A2(一価および二価形態)を試験した。実験はすべてのナノボディに対して同一のドナーで行った。結果を表30に要約する。二価ナノボディは一価形態よりも効率的に血小板付着を阻害する。
実施例14
12B6ナノボディのヒト化
表31の配列番号86〜89は4つのヒト化12B6ナノボディを示している。表11では、これらの配列を可能にするために起こったアミノ酸変化を一覧にしている。図15は12B6に対するヒト化配列のアラインメントを示している。
12A2ナノボディのヒト化
表35の配列番号90〜94は5つのヒト化12A2ナノボディを表している。表12および13では、これらの配列を可能にするために行われた以下のアミノ酸変化を一覧にしている。図17は12A2に対するヒト化配列のアラインメントを示している。
12A5ナノボディのヒト化
表41の配列番号95〜97は3つのヒト化12A5ナノボディを示している。表14では、これらの配列を可能にするために行われたアミノ酸変化を一覧にしている。図20は12A5に対するヒト化配列のアラインメントを示している。
二価ヒト化ナノボディ
3つのヒト化ナノボディ12A2H1、12A2H4および12B6H2を、3aリンカーを有する二価形態のために選択した。これら3つのナノボディの配列は、図22に示すとおり2、3のアミノ酸のみが異なっている。表45の配列番号98〜100では、二価ナノボディの配列を一覧にしている。表45の配列番号101〜106では、それぞれGS9およびGS30リンカーと結合しているヒト化二価ナノボディの配列を一覧にしている。
実施例18:ALX-0081でのヒヒFOLTSモデル
本試験では、ヒヒのFolts血栓症モデルにおいてALX-0081の有効性および安全性を評価した。
適用された研究プロトコールは、後述の元のFoltsモデルおよびいくつかの改変型である(Folts JDら、Circulation. 1976; 54: 365-370)。
3匹の動物にAspegic(注入可能なアスピリン)を注入し、CFRの阻害を調査した。診療所では、経皮的冠動脈インターベンション(PCI)手技の開始直前に患者に250mg(±3〜5mg/kg)をボーラス注射で投与する。2匹の動物(ヒヒ3および5)において、それぞれ80および40mg/kgものAspegicの用量でCFRは阻害され得なかった(図27、表51)。ヒヒ4では、対照相でCFRの安定した反復パターンを定着させることは非常に難しかった。損傷を新しく数回(本発明者らが生理食塩水を注入した時点に)行った後、安定したCFRを得た。Aspegic の5mg/kg 用量でCFRは完全に阻害されたが、より高い用量で新たに阻害すると、CFRの平均的長さはAspegic 投与前より3〜4倍長かったにもかかわらずCFRは元に戻った。Epinephrinの投与後、CFRはすみやかに完全に元に戻った(表51)。
3匹の動物に非分画Heparinを注入し、CFRの阻害を調査した。診療所では、患者に60〜70IU/kgをボーラス注射で投与し、aPTT(活性化部分トロンボプラスチン時間)を30分間毎に監視した。aPTTが<250秒なら過剰なHeparinを投与する。ヒヒ7および8において、240IU/kgほどの用量ではないときでさえCFRは阻害され得なかった(図28、表52)。ヒヒ6において、最初の15IU/kg用量およびさらに高用量でCFRは完全に阻害されたが、新たに阻害するとCFRは各時点で戻った。240IU/kgの最高用量で、新たな損傷の後でさえCFRは阻害されたが、流量は減少し、Epinephrinを注入するとCFRはすみやかに元に戻った。
4匹のヒヒにPlavix を投与し、Folts試験に使用した。本発明者らは、タブレットをメタノールに再懸濁することによって注入可能薬剤として使用した。したがって、本発明者らは、他の薬剤に関して用量漸増実験行うことができた。患者に300〜600mgのPlavixを経口投与し、Plavixの単独経口投与の2時間後に血小板凝集の阻害が見られた。ヒヒに2.5mg/kgを最終投与した時点ですでに、CFRの長さに効果的であることが分かったが、この阻害効果は注入からわずか10分後に始まった(図29、表53)。ヒヒ12において、この2,5mg/kg 用量でCFRは完全に阻害された。他の3匹のヒヒにおいて、5mg/kgの最終用量でCFRは完全に阻害された。新たに損傷したときCFRは阻害されたままであったが、Epinephrinの注入後元に戻った。Epinephrin注入を止めると、CFRはさらに5分間残っていたがその後再び完全に阻害された(図29)。
3匹のヒヒのFolts モデルで有効性についてReoproを試験した。診療所では、患者に250μg/kgを投与し、その後7,5μg/kg/時間で連続的に点滴する。これも、CFRが完全に阻害されるために、ヒヒ13、14および15に必要とされる用量である(最終用量170〜420μg/kg(図30、表54)。本発明者らはボーラス注射のみでヒヒに投与した。新たに損傷したとき、CFRの完全な阻害は維持され、Epinephrinを注入してもこの阻害は逆行できなかった(図30)。
ALX-0081を9匹のヒヒに投与しFoltsモデルで使用した。すべてのヒヒにおいて、30μg/kg+45μg/kg/時(最終用量43μg/kg)の用量でCFRは完全に阻害された。2匹のヒヒにおいて、10μg/kg+15μg/kg/時ですでに完全に阻害された(ヒヒ17および22)。9匹のヒヒすべてにおいて、新たに損傷し、Epinephrinを注入した後、阻害は維持されていた(図31、表55)。
7匹のヒヒに5mg/kgのAspirin、60IU/kgのHeparinおよび漸増用量のPlavixをボーラス注射で投与した。過剰なHeparinを異なる時点で投与し、一定のレベルを維持した(aPTTは対照に対して少なくとも2倍行うことが好ましい)。試験化合物の各服用後30分間CFRを監視した。Plavixの投与を1mg/kgで開始し、30分後に1 mg/kgを追加した。薬剤投与の前後のCFRの長さを比較して抗血栓効果を定量した。CFRが完全に阻害されていることを観察したときに、新たに損傷を行った。Epinephrinを注入し、実験が終了するまで継続した。CFRが元に戻らなければ、新たに損傷を行う。2〜3回CFRがあった後、漸増用量のALX-0081を添加した:(1)、3、10または30μg/kg。本発明者らはALX-0081の各服用後、2回のCFRを待ち、CFRが完全に阻害されるまで用量を増加した。CFRが完全に阻害された時点で、1,5倍用量/kg/時のALX-0081の連続的な点滴を開始し、30分間行い、epinephrin注入を続けた。10〜15分後、新たに損傷を行った。本試験で使用のヒヒの詳細を表56に示す。
以下のパラメーターを測定した:a)出血分析、b)vWF濃度、因子VIIIレベル、および血小板数、PTおよびaPTT c)リストセチン誘導血小板凝集 d)ALX-0081の濃度、およびe)再狭窄についての動脈区分の分析、f)ALX-0081の免疫原性。
出血を分析するために、鼠径部をメスで切開した。このことは基準流量を記録した15分後に行い、このとき動脈に損傷を加えた。ガーゼを創傷に挿入し、試験化合物を各々新たに服用する直前に30分毎に交換した。試験化合物の各服用後の失血量を、ガーゼを秤量して測定した。(生理食塩水の注入の間)第二の対照ガーゼの失血量と比較した失血を表す(表59〜61)。
vWF
Foltsモデルにおける異なる用量の薬剤投与後に得た血液試料の多血小板血漿(PRP)のvWFレベルは、免疫吸着分析法で判定しヒト標準(因子VIIIおよびVWFに関するWHO第5国際基準)の百分率で表した。
Folts モデルにおける異なる用量の薬剤投与後に得た血液試料のPRPの因子VIIIレベルは、aPTT試験で判定した。本発明者らはHeparinがaPTT時間を延長することを立証したので、Heparinを投与したヒヒの血漿試料は試験しなかった。FVIIIレベルを、大腿動脈の損傷から10分後に得た最初の対照試料に対する百分率で表した。aPTT試験への治療効果は何も見られなかった。
Foltsモデル実験での血小板数を測定した。データから、ヒヒ15は他の動物と比較して血小板数がかなり少ないことが判った。Plavix投与以外の全種の治療で血小板数は対照動物に見られるものとかなり同程度であり、長時間ほとんど一定である。
ALX-0081を投与したヒヒから得た血液を血小板凝集の阻害について分析した。Chronolog 全血および光学凝集能測定装置で血小板凝集を行った(Model 560CA、Chronolog、USA)。全血を1200rpmで5分間遠心分離しPRPを調製した(0.38mol/Lのクエン酸塩に集めた)。PRPを含む上方の画分を注意深く分離した。下方の画分をさらに3000rpmで10分間遠心分離し乏血小板血漿(PPP)を調製した。PRP中で血小板を計数し、終濃度が200、000個/μlになるようにPPPに希釈した。3mg/mlのリストセチン(DAKO)を添加し、凝集を測定した。
マイクロタイタープレートを1000希釈したマウスポリクローナル抗mycで4℃で一晩コーティングする。プレートはPBS‐Tween で洗浄し、PBS‐1%カゼインを使用し室温で2時間ブロッキングする。25%の基準ヒヒ血漿中にある非被覆マイクロタイタープレートに試料を希釈する。ナノボディを同一の基準ヒヒ血漿試料に希釈して標準曲線を調製する。試料を抗myc被覆プレートに接触させ、室温で2時間結合させる。プレートをPBS‐Tweenで5回洗浄する。ウサギ抗vWF‐HRP(DAKO)を3000倍希釈で室温にて1時間接触させる。405nmでのODを測定するため、試料をPBS‐Tweenで5回洗浄し、ABTS/H2O2 基質を添加する。
図38では、血漿中ALX-0081濃度対CFRの長さをプロットしている。
第2の動脈の治療の4週間後に、動脈を切開し周囲組織が無い状態にする。動脈を、シャントを留置した部位を含む内皮損傷の上および下部で縛る。ある部位を2cm切り取り、下部(シャント部位)および上部(狭窄および損傷した部位)でカットし、10%ホルムアルデヒドで保存する。その後ヒヒをeuthanase注射で屠殺する。起源にしたがって動脈に印を付し、各2mmに輪切りにする。輪は、組織学的手技に適した、印を付けたカセットに入れる。その後カセットを自動VIP組織Tek処理機中で、Bancroft に記述された一夜処理スケジュールにしたがって一晩放置する。(Bancroft, John D., Stevens Alan (1990). Theory and Practice of Histological Techniques. 第3版)。
3匹のヒヒの血漿におけるALX-0081免疫グロブリンの有無を2つの方法、BiacoreでのそれぞれELISA法およびSPRをベースにした方法で評価した。ヒヒに漸増用量(10mg/kgから開始)のALX-0081を8週間投与した。その8週間の間、ALX-0081の注入で免疫原性反応は見られなかった。ALX-0081の半減期は7〜9時間の範囲であった。
ALX-0081の解毒剤としてのvWFの使用
ヒヒにおけるALX-0081の安全性が分かり、ナノボディ(商標)をすみやかに除去したにもかかわらず、本発明者らはALX-0081の解毒剤としてのvWFの使用を評価することを決定した。このことはヒヒのFolts モデルで試験し、動脈血栓形成へのALX-0081 の阻害効果がvWF注入によって逆行が可能かを評価した。
内皮細胞由来UlvWFへの血小板付着およびADAMTS‐13の活性に対するALX-0081の効果
本試験は、TTP患者の薬剤としてALX-0081 が使用できるという考えを裏付けるものである。ALX-0081の非存在および存在下で、TTP血漿(非ADAMTS13)で再構築された血小板のかん流を、ULvWFを分泌する内皮細胞上で行う。別の実験において、vWFのA1ドメインに結合するALX-0081がADAMTS‐13活性に干渉するかを試験する。ADAMTS‐13はvWFのA2ドメインに結合し切断する。
臍静脈の内部のコラゲナーゼ消化によって新たに得たヒト臍帯から、内皮細胞を単離した。細胞を均質集団として組織培地中で培養した。培養したヒト内皮細胞は、正反対の多角大細胞の単分子層として成長し、それらは細胞質内封入も行う(Weibel-Palade体)。ヒト臍帯から単離した、ヒスタミン刺激性の内皮細胞は特大von Willebrand因子(ULvWF)をその表面上で発現する。これらの刺激細胞を、バッファーあるいはTTPに罹患した患者由来の血漿のいずれかに懸濁した単離血小板とともにかん流させると、血小板はULvWFで沈殿する(8)。これらのULvWF付着血小板はいわゆる「糸」として現れ、かん流実験を実時間ビデオ顕微鏡で監視すると目に見える(図41)。
血小板をバッファーまたはTTP血漿に再懸濁し、本実験で使用したALX-0081の濃度は0,2、2および10mg/mlであった。ヒト臍帯から単離した、ヒスタミン刺激性の内皮細胞を上述のようにこれらの血小板懸濁液とともにかん流させる。
ADAMTS‐13は、VWF A2ドメイン中のY842/M843ペプチド結合を特異的に切断することによって、大および特大VWF多量体のサイズをより小さな形へと減少させる。ADAMTS‐13によるULvWFの切断に対するALX-0081の効果を評価するために、2つのタイプの分析法、すなわちかん流分析法および組み替えvWF断片の切断を観察する分析法を使用した。
(表15) 抗vWFナノボディの配列リスト
(表16) 抗vWFナノボディの発現率
(表17) 抗vWFナノボディのかん流チャンバーにおける血小板付着
(表18) 12B6および12A5相同体ナノボディの配列リスト
(表19) 12A5相同体ナノボディの評価されたK‐on、K‐offおよびKD値
(表20) 12B6相同体ナノボディの評価されたK‐on、K‐offおよびKD値
(表21) 12B6、12A2および12A5ナノボディの実質KD値
(表22) 12B6、12A2および12A5ナノボディのかん流チャンバーにおける血小板付着
(表23) 上昇温度での加熱後の12B6、12A2および12A5ナノボディの濃度
(表24) 二価ナノボディの配列リスト
(表25) リンカー配列の配列リスト
(表26) 二価12B6、12A2および12A5ナノボディの発現率
(表27) 上昇温度での加熱後の12B6二価ナノボディの濃度
(表28) 上昇温度での加熱後の12A2二価ナノボディの濃度
(表29) 上昇温度での加熱後の12A5二価ナノボディの濃度
(表30) 12A2二価ナノボディのかん流チャンバーにおける血小板付着
(表31) 12B6ナノボディの配列リスト
(表32) 野生型およびヒト化12B6ナノボディの発現率
(表33) 上昇温度での加熱後の野生型およびヒト化12B6ナノボディの濃度
(表34) 野生型およびヒト化12B6ナノボディのKD値
(表35) ヒト化12A2ナノボディの配列リスト
(表36) 野生型およびヒト化12A2ナノボディの発現率
(表37) 上昇温度での加熱後の野生型およびヒト化12A2ナノボディの濃度
(表38) 0.7および1.5ug/mlでのかん流チャンバーにおける野生型およびヒト化12A2ナノボディの血小板付着
(表39) 0.5、1および2ug/mlでのかん流チャンバーにおける野生型およびヒト化12A2ナノボディの血小板付着
(表40) 野生型およびヒト化12A2ナノボディのKD値
(表41) ヒト化12A5ナノボディの配列リスト
(表42) 野生型およびヒト化12A5ナノボディの発現率
(表43) 上昇温度での加熱後の野生型およびヒト化12A5ナノボディの濃度
(表44) 野生型およびヒト化12A5ナノボディのKD値
(表45) ヒト化二価ナノボディの配列リスト
(表46) ヒト化二価ナノボディの発現率
(表47) 上昇温度での加熱後のヒト化二価ナノボディの濃度
(表48) 野生型およびヒト化二価ナノボディの血小板付着
(表49) Foltsの研究において異なる試験化合物で使用するヒヒ
(表50) 対照動物のCFR(秒)の長さ(ND=未判定)
(表51) Aspegic(商標)を投与した動物のCFRの長さ(秒)(ND=未判定)
(表52) Heparin(商標)を投与した動物のCFRの長さ(秒)(ND=未判定)
(表53) Plavix (商標)を投与した動物のCFRの長さ(秒)(ND=未判定)
(表54) Reopro (商標)を投与した動物のCFRの長さ(秒)(ND=未判定)
(表55) ALX-0081(商標)を投与した動物のCFRの長さ(秒)(ND=未判定)
(表56) Foltsの研究において異なる試験化合物で使用するヒヒ
(表57) 異なる試験薬剤についてのFoltsモデルにおけるCFRの阻害:CFRの阻害を上述の様々な条件で観察した実験の数を、その条件の独立した反復の総数の関数として示す。
(表58) 各ヒヒについてのCFR(秒)の長さ、ならびにAspegic、Heparin、PlavixおよびALX-0081の各用量:有効量は黄色で示す。
(表59) 最終用量の関数における、Plavix(商標)を投与した動物に対する第二の対照ガーゼに相関する失血(STD=標準偏差)
(表60) 最終用量の関数における、Reopro(商標)を投与した動物に対する第二の対照ガーゼに相関する失血(STD=標準偏差)
(表61) 最終用量の関数における、ALX-0081を投与した動物に対する第二の対照ガーゼに相関する失血(STD=標準偏差)
(表62) 第二の対照ガーゼに相関する、失血の平均総量(試験化合物の最初の5回の服用から得た失血総量)
(表63) 薬剤用量の関数における、Aspegic、Heparin、PlavixおよびALX-0081を投与した各ヒヒに対する第二の対照ガーゼに相関するガーゼの失血:CFRの完全な阻害が観察される有効用量を黄色で示す。
(表64) 薬剤用量の関数における、Aspegic、Heparin、PlavixおよびALX-0081を投与した各ヒヒについてのリストセチン誘導血小板凝集(%)
(表65) 投与から10分後に得られた血液試料中のALX-0081濃度[μg/ml]
(表66) ALX-0081およびvWFを投与したヒヒについてのCFRの長さ(秒)
(表67) ADAMTS13によるA1A2A3の切断を研究するために異なる混合物を調製するための量[ml]
Claims (29)
- 4つのフレームワーク領域(それぞれFR1〜FR4)および3つの相補性決定領域(それぞれCDR1〜CDR3)から成るフォンウィルブランド因子(vWF)に対するナノボディであって、
i)CDR1が、アミノ酸配列YNPMG[配列番号:22]から成り、
ii)CDR2が、アミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG[配列番号:32]またはアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG[配列番号:32]とアミノ酸が2つもしくは1つ異なるアミノ酸配列から成り、および
iii)CDR3が、アミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF[配列番号:42]またはアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF[配列番号:42]とアミノ酸が1つ異なるアミノ酸配列から成る、
2つの同一の該ナノボディを含むタンパク質またはポリペプチド。 - CDR2がAISRTGGSTYYPDSVEG[配列番号:32]またはAISRTGGSTYYARSVEG[配列番号:31]のアミノ酸配列からなる、請求項1に記載のタンパク質またはポリペプチド。
- CDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG[配列番号:32]である、請求項2記載のタンパク質またはポリペプチド。
- CDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF[配列番号:42]、AGVRAEDGRVRTLPSEYNF[配列番号:41]またはAGVRAEDGRVRSLPSEYTF[配列番号:43]のアミノ酸配列からなる、請求項1記載のタンパク質またはポリペプチド。
- CDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF[配列番号:42]である、請求項4記載のタンパク質またはポリペプチド。
- 請求項1〜5のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドであって、CDR1がアミノ酸配列YNPMG[配列番号:22]であり;CDR2がアミノ酸配列AISRTGGSTYYPDSVEG[配列番号:32]であり、およびCDR3がアミノ酸配列AGVRAEDGRVRTLPSEYTF[配列番号:42]である、タンパク質またはポリペプチド。
- ナノボディがKEREクラスナノボディである、請求項1〜6のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- タンパク質またはポリペプチドがナノボディのヒト化変異体である、請求項1〜7のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- ナノボディが12B6(配列番号:62)、12A2(配列番号:71)、12F2(配列番号:72)、14H10(配列番号:73)、12B6H1(配列番号:86)、12B6H2(配列番号:87)、12B6H3(配列番号:88)、12B6H4(配列番号:89)、12A2H1(配列番号:90)、12A2H3(配列番号:91)、12A2H4(配列番号:92)、12A2H11(配列番号:93)および/または12A2H13(配列番号:94)からなるグループから選択される、請求項1〜9のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- ナノボディが12A2(配列番号:71)、12A2H1(配列番号:90)、12A2H3(配列番号:91)、12A2H4(配列番号:92)、12A2H11(配列番号:93)および/または12A2H13(配列番号:94)からなるグループから選択される、請求項1〜9のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- ナノボディが12A2H1(配列番号:90)である、請求項1〜10のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- 2つのナノボディがリンカーを介して互いに連結している、請求項1〜11のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーがアミノ酸からなる、請求項12記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーが1〜40個のアミノ酸残基を含む、請求項13記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーがグリシン残基およびセリン残基を含む、請求項14記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーがリンカーGS9(配列番号:84)を含む、請求項15記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーが1〜10個のアラニン残基を含む、請求項14記載のタンパク質またはポリペプチド。
- リンカーが3個のアラニン残基からなる、請求項17に記載のタンパク質またはポリペプチド。
- タンパク質またはポリペプチドが配列番号:98のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のタンパク質またはポリペプチド。
- 請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドをコードする、ヌクレオチドまたは核酸。
- 請求項20記載のヌクレオチドもしくは核酸を含む、または請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質もしくはポリペプチドを発現するかもしくは発現可能な、宿主細胞。
- 前記宿主細胞が請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドを産生または発現する条件下での請求項21記載の宿主細胞の培養・維持を含み、そして請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドの分離をさらに任意に含む、請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドの調製方法。
- 請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド、そして少なくとも1つの医薬的に許容可能な担体を任意に含む、医薬組成物。
- 血小板媒介凝集と関連する疾患または障害の予防または治療のための、請求項23記載の医薬組成物、または請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- 非閉塞性血栓、閉塞性血栓形成、動脈血栓形成、急性冠動脈閉塞、末梢動脈閉塞症、冠状動脈バイパス移植に起因する再狭窄および障害、冠動脈弁置換術および血管形成、ステント術、または粥腫切除などの冠状動脈インターベンション、血管形成、粥腫切除、または動脈ステント術後の肥厚化、血管系での閉塞性症候群または罹患動脈における開通性の欠如、血小板減少性血栓性紫斑病(TTP)、一過性脳虚血発作および虚血脳卒中、不安定/安定狭心症、脳梗塞、ヘルプ症候群、頚動脈内膜切除術、頸動脈狭窄症、危機的四肢虚血、心塞栓症、末梢性の血管疾患、再狭窄、心筋梗塞から選択される、血小板媒介凝集と関連する疾患または障害の予防または治療のための、請求項24記載の医薬組成物、または請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチド。
- 凝固媒介性の障害の予防・治療のための1つ以上の他の有効成分をさらに含む、請求項24記載の医薬組成物。
- 1つ以上の他の有効成分がアスピリン(Aspegic)、ヘパリンからなるグループから選択される、請求項26に記載の医薬組成物。
- 血小板媒介凝集と関連する疾患または障害の予防または治療用の薬剤の調製における、請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドの使用。
- 非閉塞性血栓、閉塞性血栓形成、動脈血栓形成、急性冠動脈閉塞、末梢動脈閉塞症、冠状動脈バイパス移植に起因する再狭窄および障害、冠動脈弁置換術および血管形成、ステント術、または粥腫切除などの冠状動脈インターベンション、血管形成、粥腫切除、または動脈ステント術後の肥厚化、血管系での閉塞性症候群または罹患動脈における開通性の欠如、血小板減少性血栓性紫斑病(TTP)、一過性脳虚血発作および虚血脳卒中、不安定/安定狭心症、脳梗塞、ヘルプ症候群、頚動脈内膜切除術、頸動脈狭窄症、危機的四肢虚血、心塞栓症、末梢性の血管疾患、再狭窄、心筋梗塞から選択される、血小板媒介凝集と関連する疾患または障害の予防または治療用の薬剤の調製時での、請求項1〜19のいずれかに記載のタンパク質またはポリペプチドの使用。
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