BRPI0609797B1 - Nanocorpos melhorados para o tratamento de desordens mediadas por agregação - Google Patents

Nanocorpos melhorados para o tratamento de desordens mediadas por agregação Download PDF

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Abstract

nanocorpos melhorados para o tratanento de desordens mediadas por agregação. a presente invenção se relaciona a nanocorpos melhorado contra o fator de von willebrand (vwf), bem como à polipeptídios compreendendo ou essencialmente compostos de um ou vários de tais nanocorpos. a invenção também se refere a ácidos nucléicos que codificam tais nanocorpos e polipeptidios; a métodos para preparar tais nanocorpos e polipeptídios; apresentar células que expressam ou são capazes de expressar tais nanocorpos ou polipeptídios, a composições que compreendem tais nanocorpos, polipeptidios, ácidos nucléicos ou células hospedeiras; e a usos de tais nanocorpos, tais polipeptidios, tais ácidos nucléicos, tais células hospedeiras ou tais composições, especialmente para objetivos profiláticos, terapêuticos ou diagnósticos, como objetivos profiláticos, terapêuticos ou diagnósticos.

Description

(54) Título: NANOCORPOS MELHORADOS PARA O TRATAMENTO DE DESORDENS MEDIADAS
POR AGREGAÇÃO (51) lnt.CI.: C07K 16/36; A61K 38/36 (30) Prioridade Unionista: 20/05/2005 US 60/683,474 (73) Titular(es): ABLYNX N.V.
(72) Inventor(es): KAREN SILENCE
2*
NANOCORPOS MELHORADOS PARA O TRATAMENTO DE DESORDENS
MEDIADAS POR AGREGAÇÃO
A presente invenção relaciona a nanocorpos™ melhorado contra o Fator de von Willebrand (vWF), bem como à polipeptidios compreendendo ou essencialmente compostos de um ou vários de tais nanocorpos. [Observação: Nanocorpo(s) se referem a Nanobody™, Nanobodies™ e Nanoclone ™, que são marcas registradas da Ablynx N.V.]
A invenção também se refere aos ácidos nucléicos que codificam tais nanocorpos e polipeptidios; a métodos para preparar tais nanocorpos e polipeptidios; apresentar células que expressam ou são capazes de expressar tais nanocorpos ou polipeptidios; a composições que compreendem tais nanocorpos, polipeptidios, ácidos nucléicos ou células hospedeiras; e a usos de tais nanocorpos, tais polipeptidios, tais ácidos nucléicos, tais células hospedeiras ou tais composições, especialmente para objetivos profiláticos, terapêuticos ou diagnósticos, como objetivos profiláticos, terapêuticos ou diagnósticos mencionados mais adiante.
Outros aspectos, modalidades de execução, vantagens e aplicações da invenção ficarão claros da nova descrição a seguir.
WO 04/062551 do Solicitante relaciona a nanocorpos contra o Fator de von Willebrand (vWF) e à preparação e uso do mesmo, especialmente para a prevenção e/ou o tratamento
2ί de doenças e desordens que se relacionam com agregação mediada por plaqueta.
nanocorpos anti-vWF segundo o WO 04/062551 pode ser humanizado e pode ser monovalente ou multivalente, o último do qual leva à afinidade aumentada para vWF. 0 nanocorpos anti-vWF segundo o WO 04/062551 também pode ser multiespecifico, e ser especialmente na forma de um construto multiespecifico compreendendo dois ou mais nanocorpos contra vWF e um novo nanocorpo dirigido contra uma proteína de soro como albumina de soro humana, que leva a uma meia-vida aumentada in vivo.
Os nanocorpos anti-vWF descritos em WO 04/062551 podem ser dirigidos contra qualquer epitope ou a conformação de vWF (como o domínio de Al ou domínio A3), mas são preferivelmente dirigidos contra o domínio de Al, e especialmente contra a conformação ativada do domínio Al.
O WO 04/062551 também descreve a preparação do nanocorpos anti-vWF, seqüências de nucleotídeos que codificam o nanocorpos anti-vWF, bem como composições farmacêuticas que compreendem o nanocorpos anti-vWF.
O nanocorpos anti-vWF e composições descritas em WO 04/062551 pode ser usado para a prevenção e o tratamento de doenças e desordens relacionadas à agregação mediada por plaqueta, como a formação de um trombo não-oclusivo, a formação de um trombo oclusivo, formação trombo arterial, oclusão coronária aguda, doença oclusiva arterial periférica, restenose e desordens que resultam de enxerto de
Figure BRPI0609797B1_D0001
desvio coronário, substituição de válvula de artéria coronária e intervenções coronárias tais como angioplastia, stenting ou aterectomia, hiperplasia depois angioplastia, aterectomia ou stenting arterial, sindrome oclusiva em um sistema vascular ou a falta de revelação de artérias de doente, púrpura trombótica trombocitopénica (TTP), ataque de isquemia cerebral transiente, angina pectoris estável ou instável, enfarte cerebral, sindrome de HELLP, endarterectomia carótida, estenose da artéria carótida, isquemia do limbo critico, cardioembolismo, doença vascular periférica, restenose e enfarte do miocárdio..
As composições farmacêuticas descritas em WO 04/062551 podem ser convenientes para a administração intravenosa, subcutânea, oral, sublingual, tópica, nasal, vaginal ou retal, ou para administração pela inalação; e também pode compreender um agente trombolitico, como estafiloquinase, ativador plasminogênico de tecido, estreptoquinase, estreptoquinase de cadeia única, uroquinase e complexo de estreptoquinase acil plasminogênico. O nanocorpos anti-vWF descritos em WO 04/062551 também pode ser usado para objetivos de diagnósticos (opcionaimente na forma de um kitde-partes) ou em revestimentos para dispositivos médicos como stents.
Ele é um objeto geral da presente invenção de fornecer nanocorpos contra vWF, especialmente contra vWF humano.
Especialmente, é um objeto da presente invenção fornecer nanocorpos contra vWF, especialmente contra vWF
2?
Figure BRPI0609797B1_D0002
humano, e fornecer proteína ou polipeptídios que compreendam os mesmos, que sejam convenientes para o uso terapêutico e/ou diagnóstico, e especialmente para a prevenção, tratamento e/ou diagnóstico de uma ou várias doenças e desordens associadas com e/ou mediadas por vWF como as acima mencionados, e/ou que pode ser usado na preparação de uma composição farmacêutica para a prevenção e/ou o tratamento de uma ou várias doenças associadas com e/ou mediadas por vWF, como os acima mencionados.
Mais especialmente, é um objeto da invenção fornecer nanocorpos contra vWF, e fornecer proteína e polipeptídios que compreendam os mesmos, que são qualquer uma alternativa ao nanocorpos e polipeptídios contra vWF descritos em WO 04/062551 e/ou que tem uma ou várias propriedades ou características melhoradas, em comparação com os nanocorpos e polipeptídios contra vWF descrito em WO 04/062551.
Mais especialmente, é um objeto da invenção fornecer nanocorpos contra vWF, e fornecer proteína ou polipeptídios que compreendam os mesmos, que são melhorados em comparação com os nanocorpos e polipeptídios contra vWF descrito em WO 04/062551 com respeito a uma ou várias das propriedades ou características seguintes:
afinidade aumentada para vWF, seja em um formato monovalente, em um formato multivalente (por exemplo, em um formato bivalente) e/ou em um formato multiespecífico (por exemplo, um dos formatos multiespecíficos descritos em WO 04/062551 ou a seguir);
zh
Figure BRPI0609797B1_D0003
melhor conveniência para formatação em um formato multivalente (por exemplo, em um formato bivalente);
melhor conveniência para formatação em um formato multiespecifico (por exemplo, um dos formatos multiespecificos descritos em WO 04/062551 ou a seguir);
conveniência melhorada ou suscetibilidade que humaniza substituições (como definido neste lugar); e/ou menos imunogenicidade, seja em um formato monovalente, em um formato multivalente (por exemplo, em um 10 formato bivalente) e/ou em um formato multiespecifico (por exemplo, um dos formatos multiespecificos descritos em WO
04/062551 ou a seguir) em um formato monovalente;
estabilidade aumentada, seja em um formato monovalente, em um formato multivalente (por exemplo, em um 15 formato bivalente) e/ou em um formato multiespecifico (por exemplo, um dos formatos multiespecificos descritos em WO
04/062551 ou a seguir) em um formato monovalente;
- especificidade aumentada em direção a vWF, seja em um formato monovalente, em um formato multivalente (por 20 exemplo, em um formato bivalente) e/ou em um formato multiespecifico (por exemplo, um dos formatos multiespecificos descritos em WO 04/062551 ou a seguir) em um formato monovalente;
reduzido ou onde desejado reatividade cruzada 25 aumentada com vWF de espécie diferente;
e/ou uma ou várias outras propriedades melhoradas
Figure BRPI0609797B1_D0004
Figure BRPI0609797B1_D0005
desejáveis para uso farmacêutico (inclusive uso profilático e/ou uso terapêutico) e/ou uso para diagnóstico (inclusive, mas nâo limitado a, usar para objetivos de visualização) , seja em um formato monovalente, em um formato multivalente (por exemplo, em um formato bivalente) e/ou em um formato multiespecifico (por exemplo, um dos formatos multiespecificos descritos em WO 04/062551 ou a seguir) .
Esses objetos são realizados pelo nanocorpos contra vWF e pelos polipeptidios descritos na presente. Os nanocorpos contra vWF e polipeptidios descritos na presente são especialmente dirigidos contra vWF humano, mas está incluído dentro dos limites da invenção que alguns nanocorpos anti-vWF e os polipeptidios da invenção podem mostrar reatividade cruzada com vWF de outros animais vertebrados, especialmente de outros animais de sangue quente, mais especialmente de outros mamíferos, e especialmente de outra espécie de primatas, como os babuínos usados nos Exemplos mais adiante. Contudo, como com nanocorpos anti-vWF descritos em WO 04/062551, a presente invenção no seu sentido mais amplo não é em particular limitada a ou definida por um epitope específico, domínio ou confirmação de vWF contra o qual os nanocorpos e os polipeptidios da invenção são dirigidos. Contudo, é geralmente assumido e preferido que os nanocorpos e os polipeptidios da invenção sejam dirigidos contra um domínio 1 de vWF, na sua confirmação ativada ou não-ativada.
Portanto, em um primeiro aspecto, a invenção refere-se a um nanocorpo (conforme definido na presente), contra vWF, que se compõem de 4 regiões de armação (FR'S I a FR4 respectivamente) e 3 regiões que determinam complementaridade (CDR1 a CDR3 respectivamente), em que:
i) O CDR1 compreende ou essencialmente compõe-se de uma seqüência aminoácida escolhida de grupo composto de :
NYGMG [SEQ ID n. 15]
SYTLG [SEQ ID n. 16]
NYNMG [SEQ ID n. Π]
SSAMA [SEQ ID n. 18]
YYNTG [SEQ ID n. 19]
IGAMG [SEQ ID n. 20]
IGTMG [SEQ ID n. 21]
YNPMG [SEQ ID n. 22]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas,
Figure BRPI0609797B1_D0006
Figure BRPI0609797B1_D0007
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença(s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
ii) O CDR2 compreende ou essencialmente compoe-se de uma seqüência aminoácida
SISWSGTYTAYSDNVKG
GISWSGVSTDYAEFAKG
TSISWSGSYTAYADNVKG
SISWSGMSTYYTDSVKG
TITSGGRTSYADSVKG
AISWSGGLTYYADSVKG
TITSGGSTNYADPVKG
TITSGGSTNYADSVKG
AISRTGGSTYYARSVEG
AISRTGGSTYYPDSVEG escolhida do grupo composto de
[SEQ ID n. 23]
[SEQ ID n. 24]
[SEQ ID n. 25]
[SEQ ID n. 26]
[SEQ ID n. 27]
[SEQ ID n. 28]
[SEQ ID n. 29]
[SEQ ID n. 30]
[SEQ ID n. 31]
[SEQ ID n. 32]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
iii) 0 CDR3 compreende ou essencialmente compõese de uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
QSRYRSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 33] [SEQ ID n. 34]
LGRYRSNWRNIGQYDY
Figure BRPI0609797B1_D0008
QSRYSSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 35]
SNRYRTHTTQAMYNY [SEQ ID n. 36]
VVDGKRAP [SEQ ID n. 37]
NRRQKTVQMGERAYDY [SEQ ID n. 38]
NLKQGSYGYRFNDY [SEQ ID n. 39]
NLKQGDYGYRFNDY [SEQ ID n. 40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [SEQ ID n. 41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID n. 42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [SEQ ID n. 43]
ou do grupo composto de sequências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das sequências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só 20 contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente
Figure BRPI0609797B1_D0009
Figure BRPI0609797B1_D0010
uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Em outro aspecto, a invenção refere-se a um nanocorpo (conforme definido na presente), contra os vWF, que se compõem de 4 regiões de armação (FR1 a 10 FR4 respectivamente) e 3 regiões que determinam complementaridade (CDR1 a CDR3 respectivamente), em que:
i) O CDR1 é uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
NYGMG [SEQ ID n. 15]
15 SYTLG [SEQ ID n. 16]
NYNMG [SEQ ID n. 17]
SSAMA [SEQ ID n. 18]
YYNTG [SEQ ID n. 19]
IGAMG [SEQ ID n. 20)
20 IGTMG [SEQ ID n. 211
YNPMG [SEQ ID n. 22]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos
Identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima
I mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
ii) 0 CDR2 é uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
SISWSGTYTAYSDNVKG
GISWSGVSTDYAEFAKG
TSISWSGSYTAYADNVKG
SISWSGMSTYYTDSVKG
TITSGGRTSYADSVKG [SEQ ID n. 23] [SEQ ID n. 24] [SEQ ID n. 25] [SEQ ID n. 26] [SEQ ID n. 27]
AISWSGGLTYYADSVKG
TITSGGSTNYADPVKG
TITSGGSTNYADPVKG
AISRTGGSTYYARSVEG
AISRTGGSTYYPDSVEG
[SEQ ID n. 28]
[SEQ ID n. 29]
(SEQ ID n. 30]
[SEQ ID n. 31]
[SEQ ID n. 32]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou
Figure BRPI0609797B1_D0011
inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
iii) 0 CDR3 é uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
QSRYRSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [SEQ ID n. 34]
QSRYSSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 35]
SNRYRTHTTQAMYNY [SEQ ID n. 36]
VVDGKRAP [SEQ ID n. 37]
NRRQKTVQMGERAY DY [SEQ ID n. 38]
NLKQGSYGYRFNDY [SEQ lo n. 39]
NLKQGDYGYRFNDY [SEQ ID n. 40]
AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [SEQ ID n. 41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID n. 42]
AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [SEQ ID n. 43]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou
Figure BRPI0609797B1_D0012
inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de sequências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Os nanocorpos contra vWF conforme descrito anteriormente e conforme adicionalmente descrito a seguir também são mencionados na presente como nanocorpos da invenção.
Do nanocorpos da invenção, nanocorpos que compreendem um ou vários do CDR'S explicitamente enumerado anteriormente são em particular preferidos; os nanocorpos compreensão de dois ou mais do CDR'S explicitamente enumerado anteriormente são mais em particular preferidos; e os nanocorpos compreensão de três do CDR'S explicitamente enumerado anteriormente são mais em particular preferidos.
Em outro aspecto, a invenção refere-se a um nanocorpo contra vWF, que se compõem de 4 regiões de armação (FRl a FR4 respectivamente) e regiões que determinam $
complementaridade (CDR1 a
CDR3 respectivamente), que é escolhido do grupo composto de nanocorpos com aquela das combinações seguintes de CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente:
CDR1:NYGMG;
CDR2:SISWSGTYTAYSDNVKG; CDR3:QSRYRSNYYDHDDKYAY
CDRI:SYTLG; CDR2:GISWSGVSTDYAEFAKG;
CDR3:LGRYRSNWRNIGQYDY
CDRI:NYGMG;
CDR2:TSISWSGSYTAYADNVKG; CDR3:QSRYSSNYYDHDDKYAY
CDRI:NYNMG; CDR2:SISWSGMSTYYTDSVKG;
CDR3:SNRYRTHTTQAMYNY
CDRI: SSAMA; CDR2 : T1TSGGRTSYADSVKG; CDR3 : WDGKRAP CDRI:YYNTG; CDR2:AISWSGGLTYYADSVKG; CDR3:NRRQKTVQMGERAYDY
CDRI:IGAMG;CDR2:TITSGGSTNYADPVKG;CDR3:NLKQGSYGYRFNDY
CDRI:IGAMG;CDR2:TITSGGSTNYADSVKG;CDR3:NLKQGSYGYRFNDY
CDRI:IGAMG; CDR2:TITSGGSTNYADSVKG;
CDR3:NLKQGDYGYRFNDY
- CDRI:IGTMG;CDR2:TITSGGSTNYADSVKG;CDR3:NLKQGDYGYRFNDY
CDRI:YNPMG; CDR2:AISRTGGSTYYARSVEG; CDR3:AGVRAEDGRVRTLPSEYNF
CDRI:YNPMG; CDR2:AISRTGGSTYYPDSVEG;
CDR3:AGVRAEDGRVRTLPSEYTF
CDRI:YNPMG; CDR2:AISRTGGSTYYPDSVEG;
CDR3:AGVRAEDGRVRSLPSEYTF
Nos nanocorpos da invenção que compreendem as
combinações do CDR' S acima mencionadas, cada CDR pode ser
substituído por um CDR escolhido do grupo composto de
seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%,
Figure BRPI0609797B1_D0013
Figure BRPI0609797B1_D0014
preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com o CDR'S mencionado; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou escolhido do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I (como indicado no parágrafo precedente) diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com o CDR mencionado (s) um do acima mencionado seqüências aminoácidas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente um aminoácido conservador substituição (conforme definido na presente); e/ou 20 (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Contudo, dos nanocorpos da invenção que compreendem as 25 combinações do CDR'S acima mencionadas, nanocorpos que compreendem um ou vários do CDR'S enumerado anteriormente são em particular preferidos; os nanocorpos compreensão de
Figure BRPI0609797B1_D0015
dois ou mais do CDR'S enumerado anteriormente são mais em particular preferidos; e os nanocorpos compreensão de três do CDR'S enumerado anteriormente são mais em particular
Figure BRPI0609797B1_D0016
/'
Figure BRPI0609797B1_D0017
TABELA I: combinações preferenciais de CDR'S, DE CDR'S e do FR'S e humanizado de CDR e seqüências de armação,
Figure BRPI0609797B1_D0018
VA
TABELA I (continua):
Figure BRPI0609797B1_D0019
FR4 WGQGTQVTVSS WGQGTQVTVSS WGQGTQVTVSS wgqgtlvtvss | WGQGTQVTVSS WGQGTQVTVSS WGQGTQVTVSS
ΞΓΟ (Μ (D s f\| O) 00 cm ο σ> ro o o Λ Or- Γ0 O CM CO O CO
o (X O O AGVRAEDGRVRTLPS EYTF AGVRAEDGRVRTLPS EYTF AGVRAEDGRVRTLPS EYTF ω Ol _J H (X > £X O Q UJ < %£ CD > < UJ > o z ü- (X > o > ω O Q ÍC _J z NLKQGSYGYRFNDY NLKQGSYGYRFNDY
cm r* T- C\| b^ CM cm b- co cm r- v> CM b- <O CM b- b-
CO or u RFTISRDNAKNMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAA RFTISRDNAKRSVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAA RFTISRDNAKRMVYLQ | MNSLRAEDTAVYYCAA RFTISRDNAKNSVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAA o> z «í tu S 02 a < a a (Λ _J ί=ω u. Z CX 2 RFTISRDGAKNTVYLQ MNSLRAEDTAVYYCYA I RFTISRDNAKNTVYLQ MNSLRAEDTAVYYCYA
Σ. O CM -«T CM 'O' tO CM M* b- cm co Μ ΤΓ o> CM IO O
í o o AISRTGGST YYPDSVEG AISRTGGST YYPDSVEG AISRTGGST | YYPDSVEG I AISRTGGST YYPDSVEG TITSGGSTNY ADPVKG TITSGGSTNY ADPVKG TITSGGSTNY • ADPVKG
ΣΓΏ <M T- O CM CM O CM CM CM CM CM CM CM <*> CM CM M- CM CM IO
FR2 WFRQAPGK GRELVA xr O á> a iu u. (X 50 WFRQAPGK | GRELVA WFRQAPGK GRELVA MYRQAPGK GRELVA MYRQAPGK GRELVA I MYRQAPGK I GRELVA
t—* O> CO w- Oi if T- σ> m r- Oi CO v- Oi h* o> co
CDR1 YNPMG YNPMG t YNPMG o 2 a. z > IGAMG IGAMG IGAMG
ΖΊ5 r- (D S i~ (O 00 1- <O <3> r- b- O *- b- v- V- b- CM ▼— Γ— CQ
í u. O _í CO O QC Lu CO _i H w wtr fíoo > o çn o. < σ σ < > > ο LU J w ÉVQLvESGGG LVQPGGSLRL SCAASGRTFS Ο _ι (Λ O a: u. O-Ity) O ULU O O > o <2 u Q. < □ σ < > > o LU -J W EVQLVESGGG ] LVQPGGSLRL SCAASGFTFS O _i O OC íf CO _J — to w a ul o o > o <2 o > > o UJ _ι ω EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGRIFS OCX £ C0 —* — to W oc LU-O O > C0 «Λ -I 0- < >>^ UJ _l </)
ΣΓΉ i— »— τΓ CM V- M CO -T- xf m T- Tf <O
CLONE } 12A2H3 12A2H4 12A2H11 l 12A2H13 ▼· I in < CM 12A5H2 12A5H3
Portanto, nos nanocorpos da invenção, pelo menos uma das seqüências CDR1, CDR2 e CDR3 presentes é apropriadamente escolhida do grupo composto das seqüências CDR1, CDR2 e CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I; ou do grupo das seqüências CDR1, CDR2 e CDR3, respectivamente, que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com pelo menos uma das seqüências
CDR1, CDR2 e CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto do CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com pelo menos uma das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I. Neste contexto, por apropriadamente escolhido quer dizer que, como aplicável, uma seqüência CDRI é escolhida de seqüências CDRI convenientes (isto é, conforme definido na presente) , uma seqüência CDR2 é escolhida de seqüências CDR2 convenientes (isto é, conforme definido na presente), e uma seqüência CDR3 é escolhida da seqüência CDR3 conveniente (isto é, conforme definido na presente), respectivamente.
Especialmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos a seqüência CDR3 presente é apropriadamente escolhida do grupo composto das seqüências CDR3 enumeradas na Tabela I ou do grupo de seqüências CDR3 que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo
Figure BRPI0609797B1_D0020
menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de sequência de 99% com pelo menos uma das seqüências CDR3 enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDR3 que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) com pelo menos uma das seqüências CDR3 enumeradas na Tabela I.
Preferivelmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos dois dos CDRI, CDR2 e presente de seqüências CDR3 são apropriadamente escolhidas do grupo composto das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I ou do grupo composto das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos um dos CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, que têm 3, 2 ou só diferença (s) aminoácida(s) com pelo menos uma das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, me inclinei na Tabela I.
Especialmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos a seqüência CDR3 presente é apropriadamente escolhida do grupo composto das seqüências CDR3 enumeradas na Tabela I ou do grupo de seqüências CDR3 que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos uma das seqüências CDR3
Figure BRPI0609797B1_D0021
enumeradas na Tabela I, respectivamente; e pelo menos uma das seqüências CDR1 e CDR2 presentes é apropriadamente escolhida do grupo composto do CDRI e seqüências CDR2, respectivamente, enumeradas na Tabela I ou do grupo de CDR I e seqüências CDR2, respectivamente, que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos uma das Seqüências CDRI e CDR2, respectivamente, enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDRI e CDR2, respectivamente, que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) com pelo menos uma das Seqüências CDRI e CDR2, respectivamente, enumeradas na Tabela I.
Mais preferivelmente, nos nanocorpos da invenção, os três CDRI, CDR2 e o presente de seqüências CDR3 são apropriadamente escolhidas do grupo composto do CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I ou do grupo de CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos um dos CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDRI, CDR2 e CDR3, respectivamente, que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) com pelo menos um dos CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na
Tabela I.
Figure BRPI0609797B1_D0022
Mesmo mais preferivelmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos uma das sequências CDR1, CDR2 e CDR3 presentes é apropriadamente escolhida do grupo composto do CDRI, CDR2 e sequências CDR3, respectivamente, enumeradas na
Tabela I. Preferivelmente, nesta modalidade de execução, pelo menos uma ou preferivelmente ambas as seqüências CDR presentes são apropriadamente escolhidas de seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos uma da correspondência seqüências de CDR, respectivamente, enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDR que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida com pelo menos uma das seqüências correspondentes, respectivamente, listadas na Tabela I.
Especialmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos a seqüência CDR3 presente é apropriadamente escolhida do grupo composto do CDR3 enumeradas na Tabela I. Preferivelmente, nesta modalidade de execução, pelo menos um e preferivelmente ambos dos CDRI e presente de seqüências CDR2 são apropriadamente escolhidas dos grupos de Seqüências CDRI e CDR2, respectivamente, que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com o Seqüências CDRI e CDR2, respectivamente, enumerado em enumeradas na Tabela I; e/ou do grupo composto das seqüências CDRI e CDR2, ·· respectivamente, que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) com pelo menos uma das Seqüências CDRl e CDR2, respectivamente, enumeradas na Tabela I.
Mesmo mais preferivelmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos dois dos CDRI, CDR2 e presente de seqüências CDR3 são apropriadamente escolhidas do grupo composto do CDRI, CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I. Preferivelmente, nesta modalidade de execução, o resto da seqüência CDR presente é apropriadamente escolhida do grupo de seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos uma das seqüências CDR correspondentes enumeradas na Tabela I;
e/ou do grupo composto de seqüências CDR que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) com pelo menos uma das seqüências correspondentes enumeradas na Tabela I.
Especialmente, nos nanocorpos da invenção, pelo menos a seqüência CDR3 é apropriadamente escolhida do grupo composto das seqüências CDR3 enumeradas na Tabela I, e a seqüência CDRI ou a seqüência CDR2 são apropriadamente escolhidas do grupo composto do CDRI e seqüências CDR2, respectivamente, enumeradas na Tabela I. Preferivelmente, nesta modalidade de execução, o resto da seqüência CDR presente é apropriadamente escolhida do grupo de seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais
Figure BRPI0609797B1_D0023
preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com pelo menos uma das sequências CDR correspondentes enumeradas na Tabela 1; e/ou do grupo composto de sequências CDR que têm 3, 2 ou só I diferença(s) aminoácida(s) com a correspondência que as seqüências de CDR enumeraram na
Tabela I.
Mesmo mais preferivelmente, nos nanocorpos da invenção, os três CDRI, CDR2 e o presente de seqüências CDR3 são apropriadamente escolhidas do grupo composto do CDRI,
CDR2 e seqüências CDR3, respectivamente, enumeradas na
Tabela I.
Também, geralmente, as combinações do CDR'S enumeradas na Tabela I (isto é, os mencionados na mesma linha na Tabela I) são preferidas. Portanto, é geralmente preferido que, quando um CDR em um nanocorpo da invenção é uma seqüência CDR mencionada na Tabela I ou é apropriadamente escolhida do grupo de seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com uma seqüência CDR enumerada na Tabela I; e/ou do grupo composto de seqüências CDR que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) com uma seqüência
CDR enumerada na Tabela I, isto pelo menos um e
preferivelmente ambos de outro CDR's são apropriadamente
25 escolhidas das seqüências CDR que pertencem à mesma
combinação na Tabela I (isto é, mencionado na mesma linha na Tabela I) ou são apropriadamente escolhidas do grupo de
Figure BRPI0609797B1_D0024
Figure BRPI0609797B1_D0025
seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com a seqüência(s) CDR que pertence à mesma combinação e/ou do grupo composto de seqüências CDR que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) com a seqüência(s) CDR que pertence à mesma combinação. Outras preferências indicadas nos acima mencionados parágrafos também se aplicam às combinações do CDR'S mencionado na Tabela I.
Portanto, por meio de exemplos não-restritivos, um nanocorpo da invenção, por exemplo, pode compreender uma seqüência CDR1 que tem a identidade de seqüência de mais de 80% com uma das seqüências CDRl mencionadas na Tabela I, uma seqüência CDR2 que tem 3, 2 ou 1 diferença aminoácida com uma das seqüências CDR2 mencionadas na Tabela I (mas pertencendo a uma combinação diferente), e uma seqüência
CDR3.
Alguns nanocorpos preferidos da invenção, por exemplo,
podem compreender: (1) uma seqüência cdr: 1 que tem a
20 identidade de seqüência de mais de 80% com uma das
seqüências CDRl mencionadas na Tabela I; uma seqüência CDR2
que tem - 3, 2 ou 1 diferença aminoácida com uma das
seqüências CDR2 mencionadas na Tabela I (mas pertencendo a uma combinação diferente) ; e uma seqüência CDR3 que tem a identidade de seqüência de mais de 80% com uma das seqüências CDR3 mencionadas na Tabela I (mas pertencendo a uma combinação diferente); ou (2) uma seqüência CDRl que tem
Figure BRPI0609797B1_D0026
Figure BRPI0609797B1_D0027
a identidade de seqüência de mais de 80% com uma das seqüências CDR1 mencionadas na Tabela I; uma seqüência CDR2, e uma das seqüências CDR3 inclinaram-se na Tabela I; ou (3) uma seqüência CDR1; uma seqüência CDR2 que tem a identidade de seqüência de mais de 80% com uma da seqüência CDR2 enumerada na Tabela I; e uma seqüência CDR3 que tem 3, 2 ou 1 diferenças aminoácidas com a seqüência CDR3 mencionada na Tabela I que pertence à mesma combinação que a seqüência CDR2.
Alguns nanocorpos particularmente preferidos da invenção, por exemplo, podem compreender: (1) uma seqüência CDR1 que tem a identidade de seqüência de mais de 8 0% com uma das seqüências CDR1 mencionadas na Tabela I; uma seqüência CDR2 que tem 3, 2 ou I diferença aminoácida com a seqüência CDR2 mencionada na Tabela I que pertence à mesma combinação; e uma seqüência CDR3 que tem a identidade de seqüência de mais de 80% com a seqüência CDR3 mencionada na Tabela I que pertence à mesma combinação; (2) uma seqüência CDRl; um CDR 2 enumeradas na Tabela I e uma seqüência CDR3 listadas na Tabela I (no qual a seqüência CDR2 e a seqüência CDR3 podem pertencer a combinações diferentes).
Alguns nanocorpos até mais preferencial da invenção, por exemplo, podem compreender: (1) uma seqüência CDRl que tem a identidade de seqüência de mais de 80% com um dos CDR] seqüências mencionadas na Tabela I; a seqüência CDR2 listadas na Tabela I que pertence à mesma combinação; e uma seqüência CDR3 mencionada na Tabela I que pertence a uma
Figure BRPI0609797B1_D0028
Figure BRPI0609797B1_D0029
combinação diferente; ou (2) uma seqüência CDRl mencionada na Tabela I; uma seqüência CDR2 que tem 3, 2 ou 1 diferenças aminoácidas com a seqüência CDR2 mencionada na Tabela I que pertence à mesma combinação; e a identidade de seqüência de mais de 80% com a seqüência CDR3 listadas na Tabela I que pertence à mesma combinação diferente.
nanocorpos particularmente preferidas da invenção, por exemplo, pode compreender uma seqüência CDRl mencionada na Tabela I, uma seqüência CDR2 que tem mais de 8 0 identidade de seqüência com a seqüência CDR2 mencionada na Tabela I que pertence à mesma combinação; e a seqüência CDR3 mencionada na Tabela I que pertence ao mesmo.
No mais preferencial nos nanocorpos da invenção, as seqüências CDRl, CDR2 e CDR3 presentes são apropriadamente escolhidas daquela das combinações das seqüências CDRl, CDR2 e CDR3, respectivamente, enumeradas na Tabela I.
Preferivelmente, quando uma seqüência CDR é apropriadamente escolhida do grupo de seqüências CDR que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências CDR enumeradas na Tabela I; e/ou quando uma seqüência CDR é apropriadamente escolhida do grupo composto de seqüências CDR que têm 3, 2 ou só I a diferença(s) aminoácida(s) com uma das seqüências CDR listadas na Tabela 1:
i) qualquer substituição aminoácida é
Figure BRPI0609797B1_D0030
preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou ii) os referidos que a seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a seqüência CDR enumerada na Tabela I.
Segundo uma modalidade de execução preferida mas não limitada da invenção, as seqüências CDR nos nanocorpos da invenção são como definidos anteriormente e são também tais que o nanocorpo da invenção liga a vWF com uma dissociação constante (KD) de 10-5 a 1012 mol/litro (M) ou menos, e preferivelmente 10-7 a 10-12 mol/litro (M) ou menos e mais preferivelmente 10-8 a 10-12 mol/litro (M) , e/ou com uma associação constante (KA) de pelo menos 107 m-1, preferivelmente pelo menos 108 m-1, mais preferivelmente pelo menos 109 m-1, como pelo menos 1012 m-1; e especialmente com um KD menos de 500 nM, preferivelmente menos de 200 nM, mais preferivelmente menos de 10 nM, como menos de 500 da tarde. O KD e os Valores de KA do nanocorpo da invenção contra vWF podem ser determinados em uma maneira conhecida por si, por exemplo, usando o ensaio descrito na presente. Mais geralmente, os nanocorpos descritos na presente preferivelmente têm uma dissociação constante com respeito a vWF que é como descrito neste parágrafo.
Em outro aspecto, a invenção refere-se a um nanocorpo com uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto de lo NO's SEQ: 60 para 73 e SEQ ID NO's: 8 6 para
Figure BRPI0609797B1_D0031
Figure BRPI0609797B1_D0032
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm mais de 80%, preferivelmente mais de 90%, mais preferivelmente mais de 95%, como 99% ou mais identidade de seqüência (conforme definido na presente) com uma ou várias das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's: 60 para 73 e SEQ ID NO's: 8 6 para 97, que seqüências aminoácidas o mais preferivelmente têm seqüências de armação que são mais adiante definidas conforme a descrição geral das seqüências de armação de nanocorpos.
Segundo uma modalidade de execução especifica, mas não-restritiva, as últimas seqüências aminoácidas foram humanizadas, conforme adicionalmente descrito mais adiante.
Mais preferivelmente, os nanocorpos da invenção são escolhidos do grupo composto de SEQ ID NO's: 60 para 7 3 e SEQ ID NO’s: 8 6 para 97, de que os nanocorpos humanizado de SEQ ID NO's: 86 para 97 pode ser em particular preferido.
Os nanocorpos que são determinados preferidos segundo a invenção são nanocorpo 12B6 (SEQ ID n. 62) e homólogos e variantes disso, e em determinadas variantes humanizadas disso. Alguns em particular preferidos, mas nâo-limitando homólogos e variantes (humanizadas) são, por exemplo, nanocorpos 12A2 (SEQ ID n. 71); 12F2 (SEQ ID n. 72); 14H10 (SEQ ID n. 73) e variantes humanizadas disso, como 12B6H1 (SEQ ID n. 86); 12B6H2 (SEQ ID n. 87); 12B6H3 (SEQ ID n. 88); 12B6H4 (SEQ ID n. 89); 12A2H1 (SEQ ID n. 90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H11 (SEQ ID n.
Figure BRPI0609797B1_D0033
93) e 12A2H13 (SEQ ID n. 94).
Particularmente preferidas na invenção é um nanocorpo
12A2 (SEQ ID n. 71) e homólogos e variantes disso, e em determinadas variantes humanizadas disso. Alguns em particular preferidos, mas não-limitando homólogos e variantes (humanizadas) são, por exemplo, nanocorpos 12A2H1 (SEQ ID n. 90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n.
92); 12A2H11 (SEQ ID n. 93) e 12A2H13 (SEQ ID n. 94), do qual nanocorpo 12A2H1 (SEQ ID n. 90) é especialmente preferido.
Portanto, um aspecto preferencial mas não-restritivo da invenção relaciona a nanocorpo contra o Fator de von Willebrand (vWF), o referido nanocorpo composto de 4 regiões de armação (FRl a FR4 respectivamente) e 3 regiões que determinam complementaridade (CDR1 a CDR3 respectivamente), em que:
a) O CDR1 compreende ou essencialmente compõe-se de: a seqüência aminoácida YNPMG; ou umas seqüências aminoácidas que tem 2 ou só I 20 diferença(s) aminoácida(s) com a seqüência aminoácida YNPMG;
e
b) O CDR2 compreende ou essencialmente compõe-se de: a seqüência aminoácida AISRTGGSTYYPDSVEG; ou uma seqüência aminoácida que tem pelo menos 8 0%, 25 preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos 99% identidade de seqüência com a seqüência aminoácida ζ3
AISRTGGSTYYPDSVEG; ou umas seqüências aminoácidas que tem 2 ou só I diferença(s) aminoácida(s) com a seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG;
e
c) O CDR3 compreende ou essencialmente compõe-se de: a seqüência aminoácida AGVRAEDGRVRTLPSEYTF; ou
- uma seqüência aminoácida que tem pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com a seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF; ou umas seqüências aminoácidas que tem só 1 diferença aminoácida com o seqüência de aminoácido AGVRAEDGRVRTLPSEYTF.
Especialmente, a invenção refere-se a tal nanocorpo, em que:
CDR1 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida YNPMG;
ou em que:
O CDR2 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida AISRTGGSTYYPDSVEG;
ou em que
O CDR3 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida AGVRAEDGRVRTLPSEYTF.
Por exemplo, a invenção refere-se a tais nanocorpos, em que:
Figure BRPI0609797B1_D0034
- O CDR1 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR3 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;
ou em que:
- O CDR1 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR2 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG;
ou em que:
O CDR2 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG; e o CDR3 compreende ou essencialmente compõe-se de o seqüência de aminoácido AGVRAEDGRVRTLPSEYTF
Em um aspecto, a invenção refere-se a tal nanocorpo, no qual CDR1 compreende ou essencialmente se compõe da seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR3 compreende ou essencialmente compõe-se da seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF.
A invenção também se refere a variantes humanizadas de tal nanocorpo. Algumas substituições preferidas, mas nãolimitadas, que se humanizam serão descritas na presente, ou serão claras para a pessoa experimentada comparando os correspondentes nanocorpos não-humanizado e humanizado revelados na presente. Algumas substituições de humanização especialmente úteis são um ou vários daqueles apresentam nas
Figure BRPI0609797B1_D0035
variantes humanizadas de 12A2 (como estará claro para a pessoa experimentada de uma comparação das seqüências de 12A2H 1 (SEQ ID n. 90) com as correspondentes seqüências humanizadas de 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92);
12A2H11 (SEQ ID n. 93) e 12A2H13 (SEQ ID n. 94).
Outro aspecto preferido mas não-restritivo da invenção relaciona a nanocorpo contra o Fator de von Willebrand (vWF), o referido nanocorpo composto de 4 regiões de armação (FR1 a FR4 respectivamente) e 3 regiões que determinam complementaridade (CDR1 a CDR3 respectivamente), em que:
d) O CDR1 é:
a seqüência aminoácida YNPMG; ou umas seqüências aminoácidas que tem 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) com a seqüência aminoácida YNPMG;
e
e) O CDR2 é a seqüência aminoácida AISRTGGSTYYPDSVEG; ou - uma seqüência aminoácida que tem pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo 20 menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com a seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG; ou umas seqüências aminoácidas que tem 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) com a seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG;
e
f) O CDR3 é:
Figure BRPI0609797B1_D0036
a seqüência aminoácida AGVRAEDGRVRTLPSEYTF; ou - uma seqüência aminoácida que tem pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% com a seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF; ou umas seqüências aminoácidas que tem só I diferença aminoácida com o seqüência de aminoácido AGVRAEDGRVRTLPSEYTF. 10 Especialmente, a invenção refere-se a tal nanocorpo, em que:
o CDR1 é a seqüência aminoácida YNPMG;
ou em que:
O CDR2 é a seqüência aminoácida AISRTGGSTYYPDSVEG; ou em que
- O CDR3 é a seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF.
Por exemplo, a invenção refere-se a tais nanocorpos, em que:
O CDR1 é a seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR3 é 20 a seqüência aminoácida
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF;
ou em que:
O CDR1 é a seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR2 é a seqüência aminoácida AISRTGGSTYYPDSVEG;
ou em que:
CDR2 é a seqüência aminoácida
AISRTGGSTYYPDSVEG; e o CDR3 é a seqüência de aminoácido
Figure BRPI0609797B1_D0037
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF
Em um aspecto, a invenção refere-se a tal nanocorpo, no qual CDRI é a seqüência aminoácida YNPMG; e o CDR3 é a seqüência aminoácida AGVRAEDGRVRTLPSEYTF.
A invenção também se refere a variantes humanizadas de tal nanocorpo. Algumas substituições preferidas, mas nãolimitadas, que se humanizam serão descritas na presente, ou serão aparentes à pessoa experimentada comparando a correspondência nâo-humanizada e nanocorpo humanizado revelado na presente. Algumas substituições de humanização especialmente úteis são um ou vários daqueles apresentam nas variantes humanizadas de 12A2 (como estará claro para a pessoa experimentada de uma comparação das seqüências de 12A2111 (SEQ ID n. 90) com as correspondentes seqüências humanizadas de 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ lo n. 92); 12A2H11 (SEQ ID n. 93) e 12A2H13 (SEQ ID n. 94).
O nanocorpos descrito na presente pode ser nanocorpos de classe GLEW, 103 P, R ou S - classe nanocorpos ou KERE-classe nanocorpos (todos conforme descrito na presente). Especialmente, os nanocorpos descrito na presente pode ser KERE-classe nanocorpos, embora a invenção não seja limitada a isso.
Em outro aspecto, a invenção refere-se ao nanocorpo que tem pelo menos 80%, ou pelo menos 90%, ou pelo menos
95%, ou identidade de seqüência pelo menos de 99% (conforme definido na presente) com pelo menos um dos nanocorpos do grupo composto de SEQ ID NO's 60-73 e SEQ ID NO's 86-97.
Especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo que tem pelo menos 80%, ou pelo menos 90%, ou pelo menos 95%, ou identidade de seqüência pelo menos de 99% (conforme definido na presente) com pelo menos um dos nanocorpos 12B6 (SEQ ID n. 62); 12A2 (SEQ ID n. 71); 12F2 (SEQ ID n. 72); 14H10 (SEQ
ID n. 73); 12B6H1 (SEQ ID n. 86); 12136H2 (SEQ ID n. 87);
12B6H3 (SEQ ID n. 88); 12B6H4 (SEQ ID n. 89); 12A2H1 (SEQ ID
n. 90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H11 (SEQ ID n. 93) e/ou 12A2H 13 (SEQ ID n. 94).
Mais especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo que tem pelo menos 80%, ou pelo menos 90%, ou pelo menos 95%, ou identidade de seqüência pelo menos de 99% (conforme definido na presente) com pelo menos um dos nanocorpos 12A2 (SEQ ID n. 71); 12A2H1 (SEQ ID n. 90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H11 (SEQ ID n. 93) e/ou 12A2H 13 (SEQ ID n. 94).
Mesmo mais especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo que tem pelo menos 80%, ou pelo menos 90%, ou pelo menos 95%, ou identidade de seqüência pelo menos de 99% (conforme definido na presente) com nanocorpo 12A2H1 (SEQ ID n. 90) .
A invenção também se refere às variantes humanizadas de tais nanocorpos. Algumas substituições preferidas, mas não-limitadas, que se humanizam serão descritas na presente, ou serão claras para a pessoa experimentada comparando os correspondentes nanocorpos não-humanizado e humanizado revelados na presente. Algumas substituições de humanização
Figure BRPI0609797B1_D0038
especialmente úteis são um ou vários daqueles apresentam nas variantes humanizadas de 12A2 (como estará claro para a pessoa experimentada de uma comparação das seqüências de 12A2H1 (SEQ ID n. 90) com as correspondentes seqüências humanizadas de 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H1I (SEQ ID n. 93) e 12A2H13 (SEQ ID n. 94).
A invenção também se refere ao nanocorpo que é escolhido do grupo composto dos nanocorpos de SEQ ID NO's
60-73 e SEQ ID NO's 86-97.
Especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo que é escolhido do grupo composto dos nanocorpos 12B6 (SEQ ID n. 62); 12A2 (SEQ ID n. 71); 12F2 (SEQ ID n. 72); 14H10 (SEQ ID
n. 73); 12B6H1 (SEQ ID n. 86); 12B6H2 (SEQ ID n. 87); 12B6H3 (SEQ ID n. 88); 12B6H4 (SEQ ID n. 89); 12A2H1 (SEQ ID n.
90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91); 12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H 11 (SEQ ID n. 93) e/ou 12A2H13 (SEQ lo n. 94).
Mais especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo que é escolhido do grupo composto dos nanocorpos 12A2 (SEQ ID n. 71); 12A2H1 (SEQ ID n. 90); 12A2H3 (SEQ ID n. 91);
12A2H4 (SEQ ID n. 92); 12A2H11 (SEQ ID n. 93) e/ou 12A2H13 (SEQ ID n. 94). nanocorpo especialmente útil é um nanocorpo 12A2H1 (SEQ ID NO:90).
Os nanocorpos descritos na presente preferivelmente têm seqüências de armação que são como além disso descritas na presente. Algumas seqüências de armação em particular preferenciais (FR1, FR2, FR3 e FR4, respectivamente) são aqueles do nanocorpo 12A2 e as suas variantes humanizadas; e
Figure BRPI0609797B1_D0039
Figure BRPI0609797B1_D0040
as seqüências de armação que têm pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma de ditas seqüências de armação; e e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma de ditas seqüências de armação (no qual qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora; e/ou no quai a referida seqüência aminoácida preferivelmente contém substituições aminoácidas e não mais do que 3 eliminações aminoácidas ou não mais do que 3 inserções aminoácidas). Os nanocorpos contra vWF com tais seqüências de armação formam um novo aspecto da invenção.
Especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo contra vWF, no qual FR1 é lo n. 140 SEQ; o FR2 é SEQ ID n. 192; o FR3 é SEQ ID 244; e o FR4 é SEQ ID n. 296; ou as seqüências de armação que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma de ditas seqüências de armação; e e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma de ditas seqüências de armação (no qual qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora; e/ou no qual os referidos a seqüência
Figure BRPI0609797B1_D0041
aminoácida preferivelmente contém substituições aminoácidas e não mais do que 3 eliminações aminoácidas ou não mais do que 3 inserções aminoácidas).
Mais especialmente, a invenção refere-se ao nanocorpo contra vWF, no qual FR1 é SEQ ID n. 140; o FR2 é lo n. 192 SEQ; o FR3 é SEQ ID 244; e o FR4 é SEQ ID n. 296.
Em outro aspecto, a invenção refere-se a um polipeptidio que compreende ou essencialmente se compõe de pelo menos um nanocorpo contra vWF conforme definido na presente. Tais polipeptidios também são mencionados na presente como os polipeptidios da invenção e podem ser conforme mais adiante descritos na presente e/ou como geralmente descrito em WO 02/062551 para os nanocorpos revelados na presente, e, por exemplo, podem ser polipeptidios multivalentes ou polipeptidios multiespecificos, novamente como mais adiante descrito na presente.
Preferivelmente, um polipeptidio da invenção é bivalente ou trivalente (isto é, compreensão de dois ou três nanocorpos da invenção, respectivamente, opcionalmente ligado via um ou dois linkers conforme definido na presente, respectivamente) ou um polipeptidio multiespecifico, compreendendo um ou dois, e preferivelmente dois, nanocorpos da invenção e pelo menos um nanocorpo dirigido contra uma proteína de soro, e especialmente contra uma proteína de soro humana, como contra uma albumina de soro humano.
Em modalidades de execução preferenciais, mas não-
Figure BRPI0609797B1_D0042
Figure BRPI0609797B1_D0043
restritivas, os nanocorpos da invenção presentes nos polipeptidios da invenção são escolhidos do grupo composto de SEQ ID NO's: 60 para 73 e SEQ ID NO's: 86 para 97, e especialmente do humanizado nanocorpos de lo NO's SEQ 86 para 97. Os nanocorpos contra a albumina de soro humano presente nos polipeptidios da invenção são preferivelmente como definidos na presente, e mais preferivelmente escolhidos do grupo composto de SEQ ID NO's: 107 para 121, e especialmente dos nanocorpos humanizados contra albumina de soro humana de SEQ ID NO's
114-121.
Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos dos polipeptidios da invenção são os polipeptidios de SEQ ID NO's: 74 para 82 e os polipeptidios de SEQ ID NO's 98106.
Outros polipeptidios da invenção, por exemplo, podem ser escolhidos do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm mais de 80%, preferivelmente mais de 90%, mais preferivelmente mais de 95%, como 99% ou mais identidade de seqüência (conforme definido na presente) com uma ou várias das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's: 7 4 para 82 e/ou SEQ ID NO's 98 para 106, no qual os nanocorpos compreendidos dentro de ditas seqüências aminoácidas são preferivelmente como definidos na presente.
Segundo um aspecto da invenção, o nanocorpos, a proteína e os polipeptidios descritos na presente não têm essencialmente nenhuma influência na rachadura de ULvWF por ADAMTS-13. Especialmente, quando o nanocorpos, a proteína e
Figure BRPI0609797B1_D0044
os polipeptídios descritos na presente são usados nas doses descritas na presente, a rachadura de ULvWF por ADAMTS-13 (qualquer in vivo sobre a administração e/ou como medido utilização de um ensaio conveniente, como o ensaio descrito na presente), essencialmente não reduz ou inibe a rachadura de ULvWF por ADAMTS-13, isto é, em não mais de 50%, preferivelmente não mais de 20%, mesmo mais preferivelmente não mais de 10%, como menos de 5% ou essencialmente de modo nenhum). Portanto, um novo aspecto da invenção refere-se ao nanocorpo, proteína ou polipeptídio, e especialmente nanocorpo, proteína ou polipeptídio conforme descrito na presente, isto essencialmente não reduz ou inibe a rachadura de ULvWF por ADAMTS-13.
Em outro aspecto, a invenção refere-se a um ácido nucléico que codifica nanocorpo da invenção e/ou um polipeptídio da invenção. Um ácido tão nucléico também serão referidos abaixo como um ácido nucléico da invenção e, por exemplo, pode ser na forma de um construto genético, conforme definido na presente.
Em outro aspecto, a invenção refere-se à célula hospedeira ou hospedeira que expressa ou é capaz de expressar nanocorpo da invenção e/ou um polipeptídio da invenção; e/ou que contém um ácido nucléico que codifica nanocorpo da invenção e/ou a polipeptídio da invenção. Tal hospedeira ou uma célula hospedeira também podem ser análogos aos anfitriões e apresentar células descritas em WO 02/062551, mas
Figure BRPI0609797B1_D0045
expressando ou capazes de expressar nanocorpo da invenção e/ou um polipeptidio da invenção e/ou conter um ácido nucléico conforme descrito na presente.
A invenção além disso refere-se a um produto ou composição conter ou compreender do nanocorpo da invenção, um polipeptidio da invenção; e/ou um ácido nucléico da invenção. Tal produto ou a composição, por exemplo, podem ser uma composição farmacêutica (conforme descrito mais adiante) ou um produto ou a composição para uso diagnóstico (como também descrito mais adiante). Tal produto ou a composição também podem ser análogos aos produtos e composições descritas em WO 02/062551, mas conter ou compreender nanocorpo da invenção, um polipeptidio da invenção ou um ácido nucléico da invenção.
A invenção além disso refere-se a métodos para preparar ou gerar nanocorpos, polipeptidios, ácidos nucléicos, células hospedeiras, produtos e composições tão descritas na presente, que métodos são conforme mais adiante descritos mais adiante. Também, geralmente, o nanocorpos, os polipeptidios, os ácidos nucléicos, as células hospedeiras, os produtos e as composições descritas na presente também podem estar preparados e usados em uma maneira análoga à maneira descrita em WO 02/062551.
A invenção além disso relaciona a aplicações e usos do acima mencionado nanocorpos, polipeptidios, ácidos nucléicos, células hospedeiras, produtos e composições descritas na presente, que as aplicações e os usos incluem,
Figure BRPI0609797B1_D0046
Figure BRPI0609797B1_D0047
mas não são limitados a, as aplicações e os usos descreveram a seguir e/ou os novos usos e aplicações para nanocorpos contra vWF e/ou para polipeptídios que contêm o mesmo em WO
02/062551.
Outros aspectos, modalidades de execução, vantagens e aplicações da invenção ficarão claros da nova descrição a seguir.
Descrição detalhada da invenção
Os aspectos acima mencionados e outros e modalidades de execução da invenção ficarão claros da nova descrição a seguir, em que:
a) A menos que não indicado ou definido de outra maneira, todos os termos usados têm a sua significação habitual na técnica, que será clara à pessoa experimentada. A referência, por exemplo, é feita aos manuais padrão, como Sambrook e al, Molecular Cloning: um Laboratório
Manual (2a Ed.), Vols. 1-3, a Cold Spring Harbor Laboratory press (1989); F. Ausubel e al, editores., protocolos Atuais em biologia molecular, Green Publication & InterScience Wiley, Nova York (1987); Roitt et al., Immunology (6o. Editor), Mosby/Elsevier, Edimburgo (2001); e Janeway et al., Immunobiology (6o ed.), Ciência de Grinalda Publishing/Churchill Livingstone, Nova York (2005), bem como a fundamentos técnicos gerais citada acima;
b) A menos que indicado de outra maneira, o termo seqüência de (Â imunoglobulina
- se ele usou na presente para
referir-se a um anticorpo de cadeia pesada ou a um anticorpo de 4 cadeias convencional - é usado como um termo geral para incluir tanto anticorpo de tamanho natural, o indivíduo encadeia disso, como todas as partes, domínios ou fragmentos disso (inclusive, mas não limitado a, domínios de ligação de antígeno ou fragmentos como domínios VHH ou domínios VHNL, respectivamente). Além do mais, o termo seqüência como usado na presente (por exemplo, em termos como seqüência de imunoglobulina, a seqüência de anticorpo, seqüência de domínio variável, seqüência de VHH ou seqüência de proteína), deve ser geralmente entendido para incluir tanto seqüência aminoácida relevante como seqüências ácidas nucléicas ou seqüências de nucleotídeos que codificam o mesmo, a menos que o contexto requeira uma interpretação mais limitada;
c) A menos que indicado de outra maneira, todos os métodos, os passos, as técnicas e as manipulações que não são especificamente descritas detalhadamente podem ser executados e foram executados em uma maneira conhecida por si, como estará claro para a pessoa experimentada. A referência, por exemplo, é novamente feita aos manuais padrão, à fundamentos técnicos gerais mencionada anteriormente e às novas referências citadas na presente;
d) Os resíduos de aminoácido serão indicados segundo o código aminoácido de três letras padrão ou de uma letra, como mencionado na Tabela 1;
Tabela 1: uma Código Aminoácido de 1 letra e três »· letras
Alanina Ala A
Valina Vai V
Leucina Leu L
Isoleucina Ile I
Fenilalanina Phe F
Metionina(1' Met M
Triptofan Trp W
Prolina Pro P
Glicina12 Gly G
Serina Ser S
Treonina Thr T
Cisteina Cys C
Asparagina Asn N
Glutamina Gin Q
Tirosina Tyr Y
Lisina Lys K
Arginina Arg R
Histidina(4) His H
Aspartato Asp D
Glutamato Glu E
Figure BRPI0609797B1_D0048
Notas:
(1) As vezes também considerado ser um aminoácido polar não carregado.
(2) Às vezes também considerado ser um aminoácido não-polar não carregado.
(3) Como estará claro para a pessoa experimentada, o fato que um resíduo aminoácido se mostre nesta Tabela como ou carregado ou não carregado a pH 6.0 a 7.0 não reflete de nenhum modo na carga que o referido resíduo aminoácido pode ter a um pH de mais do que 6.0 e/ou a um pH de mais do que 7.0; os resíduos aminoácidos mencionados na Tabela podem ser carregados e/ou não carregados em um pH tão mais alto ou mais baixo, como estará claro para a pessoa experimentada.
(4) Como é conhecido na técnica, a carga do resíduo His é muito dependente até de pequenas mudanças no pH, mas o resíduo His pode ser geralmente considerado essencialmente não carregado para um pH de aproximadamente 6.5.
e) Para os objetivos de comparar duas ou mais seqüências de nucleotideos, a porcentagem da identidade de seqüência entre uma primeira seqüência de nucleotideos e uma segunda seqüência de nucleotideos podem ser calculados dividindo-se [o número de nucleotideos na primeira seqüência de nucleotideos que são idênticos ao nucleotideos nas posições correspondentes na segunda seqüência de nucleotideos] [pelo número total de nucleotideos na primeira seqüência de nucleotideos] e multiplicando por [100%], nos quais cada eliminação, inserção, substituição ou adição de um nucleotideos na segunda seqüência de nucleotideos - em comparação com a primeira seqüência de nucleotideos - são consideradas como uma diferença em um nucleotideo único (posição). Alternativamente, o grau da identidade de
Figure BRPI0609797B1_D0049
seqüência entre duas ou mais seqüências de nucleotídeos pode ser calculado usando um algoritmo de computador conhecido para alinhamento de seqüência como NCBI Blast v2.0, usando configurações padrão.
Algumas outras técnicas, algoritmos de computador e configurações para determinar o grau da identidade de seqüência, por exemplo, são descritos em WO 04/037999, EP 0 967284, EP 1085089, WO 00/55318, WO 00/78972, WO 98/49185 e a GB 2357 768-A.
Normalmente, para o objetivo de determinar a porcentagem da identidade de seqüência entre duas seqüências de nucleotídeos conforme o método de cálculo delineado mais acima, a seqüência de nucleotídeos com o número maior de nucleotídeos será tomada como a primeira seqüência de nucleotídeos, e outra seqüência de nucleotídeos será tomada como a segunda seqüência de nucleotídeos;
f) Para os objetivos de comparar duas ou mais seqüências aminoácidas, a porcentagem da identidade de seqüência entre uma primeira seqüência aminoácida e uma segunda seqüência aminoácida podem ser calculados dividindose [o número de resíduos aminoácidos na primeira seqüência aminoácida que são idênticos aos resíduos aminoácidos nas posições correspondentes na segunda seqüência aminoácida] [pelo número total de nucleotídeos na primeira seqüência aminoácida] e multiplicando por [100%], nos quais cada eliminação, inserção, substituição ou adição de um resíduo aminoácido na segunda seqüência aminoácida - em comparação
Figure BRPI0609797B1_D0050
com a primeira seqüência aminoácida - são consideradas como uma diferença em um resíduo aminoácido único (posição), isto é, como uma diferença aminoácida conforme definido na presente. Alternativamente, o grau da identidade de seqüência entre duas seqüências aminoácidas pode ser calculado usando um algoritmo de computador conhecido, como os acima mencionados para determinação do grau da identidade de seqüência para seqüências de nucleotídeos, novamente usando configurações padrão.
Normalmente, para o objetivo de determinar a porcentagem da identidade de seqüência entre duas seqüências aminoácidas conforme o método de cálculo delineado mais acima, a seqüência aminoácida com o número maior de resíduos aminoácidos será tomada como a primeira seqüência aminoácida, e outra seqüência aminoácida será tomada como a segunda seqüência aminoácida.
Também, na determinação do grau da identidade de seqüência entre duas seqüências aminoácidas, a pessoa experimentada pode considerar assim chamadas substituições aminoácidas conservadoras, que podem ser geralmente descritas como substituições aminoácidas nas quais um resíduo aminoácido é substituído com outro resíduo aminoácido da estrutura química semelhante e que não tem pouco ou essencialmente nenhuma influência na função, atividade ou outras propriedades biológicas do polipeptídio. Tais substituições aminoácidas conservadoras são bem conhecidas na técnica, por exemplo, de WO 04/037999, a GB uns 2357768, WO 98/49185, WO 00/46383 e WO 01/09300; e os tipos (preferidos) e/ou as combinações de tais substituições podem ser selecionados com base nos ensinos pertinentes de WO 04/037999 bem como WO 98/49185 e das novas referências citadas na presente.
Tais substituições conservadoras preferivelmente são substituições nas quais aminoácido dentro dos grupos seguintes (a) - (e) é substituído por outro resíduo aminoácido dentro do mesmo grupo: (a) pequeno alifático, resíduos não-polares ou ligeiramente polares: Ala, Ser, Thr, Pro e Gly; (b) polar, resíduos negativamente carregados e His (não carregado) amidas: Asp, Asn, Glu e Gin; (c) polar, / resíduos positivamente carregados: His, Arg e Lys; (d) grande alifático, resíduos não-polares: Met, Leu, Ile, Vai e *
Cys; e resíduos aromáticos (e): Phe, Tyr e Trp.
As substituições conservadoras em particular preferenciais são como se segue: Ala em Gly ou em Ser; Arg em Lys; Asn em Gin ou no Seu; Asp em Glu; Cys em Ser; Gin em Asn; Glu em Asp; Gly em Ala ou em Pro; His em Asn ou em Gin;
20 Ile em Leu ou em Vai; Leu em Ile ou em Vai; Lys em Arg, em
Gin ou em Glu; Met em Leu, em Tyr ou em Ile; Phe em Met, em
Leu ou em Tyr; Ser em Thr; Thr em Ser; Trp em Tyr; Tyr em
Trp; e/ou Phe em Vai, em Ile ou em Leu.
Qualquer substituição aminoácida aplicada aos 25 polipeptídios descritos na presente também pode ser baseada na análise das freqüências de variações aminoácidas entre a proteína homóloga da espécie diferente desenvolvida por ^3
Schulz et al., Princípios de Estrutura de Proteína, Springer-Verlag, 1978, nas análises de estrutura que forma potenciais desenvolvidos por Chou e Fasman, Bioquímica 13: 211, 1974 e Adv. Enzymol., 47: 45149, 1978, e na análise de modelos hidrofobicidade em proteína desenvolvida por Eisenberg et al·., Proc. Louco. Acad Sei. Os EUA 81: 140-144, 1984; Kyte e Doolittle; J Molec. Biol. 157: 105-132, 198 1, e Goldman et al., Ann. Chapman Biophys. Chem. 15: 321353,
1986, todos incorporado na presente no seu conjunto por referência. Informação na estrutura primária, secundária e terciária de nanocorpos dado na descrição mais adiante e na técnica de fundo geral citada anteriormente. Também, com esta finalidade, a estrutura cristalina de um domínio VHH de uma lhama, por exemplo, é dada por Desmyter et al., Natureza
Biologia Estrutural, volume 3, 9, 803 (1996); Spinelli et al., Biologia Estrutural Natural (1996); 3, 752757; e
Decanniere et al., Estrutura, volume 7, 4, 361 (1999);
g) diz-se que seqüências de aminoácido e seqüências ácidas nucléicas sejam exatamente o mesmo se eles tiverem a identidade de seqüência de 100% (conforme definido na presente) por cima do seu comprimento inteiro;
h) comparando duas seqüências aminoácidas, o termo diferença aminoácida refere-se a uma inserção, eliminação ou substituição de um resíduo aminoácido único em uma posição da primeira seqüência, em comparação com a segunda seqüência; sendo entendido que duas seqüências aminoácidas podem conter um, duas ou mais tais diferenças aminoácidas;
Figure BRPI0609797B1_D0051
i) considera-se que uma seqüência ácida nucléica ou a seqüência aminoácida é em essencialmente isolado (forma) por exemplo, em comparação com a sua fonte biológica nativa e/ou o meio de reação ou meio de cultivo do qual foi obtido - quando foi separado de pelo menos um outro componente com o qual ele se associa normalmente em dita fonte ou meio, como outro ácido nucléico, outra proteina/polipeptidio, outro componente biológico ou macromolécula ou pelo menos um contaminante, impureza ou componente menor. Especialmente, uma seqüência ácida nucléica ou a seqüência aminoácida são consideradas essencialmente isoladas quando foi purificado pelo menos de 2 vezes, especialmente pelo menos lOfold, mais especialmente pelo menos de 100 vezes, e até a 1000 vezes ou mais. Uma seqüência ácida nucléica ou a seqüência aminoácida que é na forma essencialmente isolada são preferivelmente essencialmente homogêneas, como determinado utilização de uma técnica conveniente, como uma técnica cromatográfica conveniente, como poliacrilamida-geleletroforese;
j) O termo domínio como usado na presente geralmente refere-se a uma região globular de uma cadeia de anticorpos, e especialmente a uma região globular de um anticorpo de cadeia pesada, ou a um polipeptídio que essencialmente se compõe de tal região globular. Normalmente, tal domínio compreenderá laços de peptídeos (por exemplo, 3 ou 4 laços de peptídeos) estabilizado, por exemplo, como uma folha ou por ligações bissulfeto.
k) O termo antigênico determinante' refere-se ao epitope no antígeno reconhecido pela molécula de ligação de antígeno (como um Nanobody ou um polipeptidio da invenção) e mais especialmente pelo sítio de ligação de antígeno da referida molécula. Os termos antigênico determinante e epitope* também podem ser usados de modo trocável na presente.
l) Uma seqüência aminoácida (como um Nanobody, um anticorpo, um polipeptidio da invenção, ou geralmente um proteína de ligação de antígeno ou polipeptidio ou um fragmento disso) que pode ligar a, que tem a afinidade para e/ou que tem a especificidade para diz-se que um determinante antigênico específico, epitope, o antígeno ou a proteína (ou para pelo menos uma parte, fragmento ou epitope disso) esteja contra ou dirigido contra dito determinante antigênico, epitope, antígeno ou proteína.
m) 0 termo especificidade refere-se ao número de tipos diferentes de antígenos ou determinantes antigênicos aos quais uma determinada molécula de ligação de antígeno ou proteína de ligação de antígeno (como um Nanobody ou um polipeptidio da invenção) a molécula pode ligar. A especificidade de uma proteína de ligação de antígeno pode ser determinada baseada em afinidade e/ou avidez. A afinidade, representada pelo equilíbrio constante para a dissociação de um antígeno com uma proteína de ligação de antígeno (KD) , é uma medida para a força de ligação entre um determinante antigênico e um sítio de ligação de antígeno na proteína de ligação de antígeno: o menor o valor do KD, o mais forte a força de ligação entre um determinante antigênico e a molécula de ligação de antígeno (alternativamente, a afinidade também pode ser expressa como a afinidade constante (KA), que é 1/KD). Como estará claro para a pessoa experimentada (por exemplo, com base na nova revelação na presente) , a afinidade pode ser determinada em uma maneira conhecida por si, dependendo do antígeno específico do interesse. A avidez é a medida da força da ligação entre uma molécula de ligação de antígeno (como um Nanobody ou o polipeptídio da invenção) e o antígeno pertinente. A avidez está relacionada tanto à afinidade entre um determinante antigênico e sítio de ligação de antígeno na molécula de ligação de antígeno como ao número de sítios de ligação presentes pertinente na molécula de ligação de antígeno. Tipicamente, a proteína de ligação de antígeno (como os nanocorpos e/ou os polipeptídios da invenção) ligará com uma dissociação constante (KD) de 10-5 a 10-12 mol/litro (M) ou menos, e preferivelmente 10-7 a 1012 mol/litro (M) ou menos e mais preferivelmente 10-8 a 1012 mol/litro, e/ou com uma associação constante (KA) de pelo menos 107 M_l, preferivelmente pelo menos 108 M, mais preferivelmente pelo menos 109 M-l, como pelo menos 1012 m1. Considera-se geralmente que qualquer valor de KD maior do que 10-4 M indica a ligação não-específica. Preferivelmente, um Nanobody ou o polipeptídio da invenção ligarão ao antígeno desejado com um KD menos de 500 nM, preferivelmente menos de 200 nM, mais preferivelmente menos de 10 nM, como menos de 500 da tarde. A ligação especifica de uma proteína antígeno-ligante a um antígeno ou determinante antigênico pode ser determinada em qualquer maneira conveniente conhecida por si, inclusive, por exemplo, análise de Scatchard e/ou ensaios de ligação competitivos, como rádioinumoensaios (RIA), imunoensaios de enzima (EIA) e ensaios de competição de sandwitch, e as variantes diferentes deles conhecidas per se na técnica, o n) conforme adicionalmente descrito a seguir, a seqüência aminoácida e a estrutura de um Nanobody pode ser considerado - sem ser limitado contudo a isso - para ser compreendido de quatro regiões de armação ou FR'S, que são referidos na técnica e a seguir como região de Armação 1 ou FR1; como região de Armação 2 ou FR2; como região de Armação 3 ou FRITO'; e como região de Armação 4 ou FR4, respectivamente; que regiões de armação são interrompidas por três regiões de determinação complementares ou CDR's, que são referidos na técnica como Região que Determina Complementaridade] ou CDRI; como Região que Determina Complementaridade 2 ou CDR2; e como Região que Determina Complementaridade 3 ou CDR3, respectivamente;
o) como também adicionalmente descrito a seguir, o número total de resíduos aminoácidos em um Nanobody pode estar na região de 110-120, é preferivelmente 112-115, e é mais preferivelmente 113. Deve contudo ser observado que as partes, os fragmentos ou os análogos (conforme adicionalmente descrito a seguir) de um Nanobody não são em particular limitados quanto ao seu comprimento e/ou tamanho, enquanto tais partes, os fragmentos ou os análogos satisfazem condições delineadas a seguir e são também preferivelmente convenientes para os objetivos descritos na presente;
p) os resíduos aminoácidos de um Nanobody são numerados segundo a numeração geral para domínios de VH dados por Kabat et al. (A seqüência da proteína do interesse imunológico, os Serviços de Saúde Pública dos Estados Unidos, NIH Bethesda, MD, Publicação n. 91) , aplicado a domínios VHH de Camelídeos no artigo de Riechmann e Muyldermans, mencionado anteriormente (ver, por exemplo, a Figura 2 da referida referência). Segundo esta numeração, FR1 de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 130, CDRl de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 31-36, FR2 de um Nanobody compreende os aminoácidos nas posições 36-49, CDR2 de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 5065, FR3 de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 66-94, CDR3 de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 95-102, e FR4 de um Nanobody compreende os resíduos aminoácidos nas posições 103-113. [Neste aspecto, deve ser observado que - como é bem conhecido na técnica para domínios de VH e para domínios de VHH - o número total de resíduos aminoácidos em cada um do CDR'S pode variar e corresponder não ao número total de resíduos aminoácidos indicados pela numeração de Kabat (isto é, uma ou várias posições segundo a numeração de Kabat não podem ser ocupadas na seqüência real, ou a seqüência real pode conter mais resíduos aminoácidos do que o número levado em conta pela numeração de Kabat). Isto significa que, geralmente, a numeração segundo Kabat podem ou não corresponder à numeração real dos resíduos aminoácidos na seqüência real. Geralmente, contudo, se pode dizer que, segundo a numeração de Kabat e independente do número de resíduos aminoácidos no CDR'S, a posição 1 segundo a numeração de Kabat corresponde ao início de FR1 e visto versa, a posição 36 segundo a numeração de Kabat corresponde ao início de FR2 e visto versa, a posição 66 segundo a numeração de Kabat corresponde ao início de FR3 e visto versa, e a posição 103 segundo a numeração de Kabat corresponde ao início de FR4 e visto versa.].
Os métodos alternativos para numeração dos resíduos aminoácidos de domínios VH, cujos métodos também podem ser aplicados em uma maneira análoga a domínios VHH de Camelídeos e a nanocorpos, são o método descrito por Chothia et al. (Nature 342, 877-883 (1989)), a assim chamada definição de AbM e a assim chamada definição de contato. Contudo, na descrição presente, as reivindicações e as figuras, a numeração segundo Kabat aplicada a domínios VHH por Riechmann e Muyldermans serão seguidas, a menos que indicado de outra maneira; e
q) as Figuras, a Listagem de Seqüência e a Parte/Exemplos Experimental só são dadas para ilustrar além êô disso a invenção e não devem ser interpretadas ou entendidas como limitação do alcance da invenção e/ou das reivindicações anexas de qualquer modo, a menos que explicitamente indicado de outra maneira na presente.
Para uma descrição geral de anticorpos de cadeias pesadas e domínios variáveis dos mesmos, a referência é entre outras coisas feita às referências seguintes, que são mencionadas como fundamentos técnicos gerais: WO 94/04678, WO 95/04079 e WO 96/34103 da Vrije Universiteit Brussel; WO 94/25591, WO 99/37681, WO 00/40968, WO 00/43507, WO 00/65057, WO 01/40310, WO 01/44301, EP 1134231 e WO 02/48193 de Unilever; WO 97/49805, WO 01/21817, WO 03/035694, WO
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Figure BRPI0609797B1_D0052
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Conforme acima mencionado, a invenção geralmente refere-se aos nanocorpos dirigidos contra vWF, bem como à polipeptídios compreendendo ou essencialmente compostos de um ou vários de tais nanocorpos, que podem ser usados para fins profiláticos, terapêuticos e/ou diagnósticos descritos mais adiante e em WO 04/062551.
Conforme também acima mencionado e além disso descrito mais adiante, a invenção além disso se refere aos ácidos nucléicos que codificam tais nanocorpos e polipeptídios, a métodos para preparar tais nanocorpos e polipeptídios, apresentar células que expressam ou são capazes de expressar tais nanocorpos ou polipeptídios, a usos de tais nanocorpos, polipeptídios, ácidos nucléicos ou células hospedeiras, e a composições que compreendem tais nanocorpos, polipeptídios, ácidos nucléicos ou células hospedeiras.
Geralmente, deve ser observado que o termo Nanobody como usado na presente no seu sentido mais amplo não é limitado a uma fonte biológica específica ou a um método específico da preparação. Por exemplo, como será discutido mais detalhadamente mais adiante, os nanocorpos da invenção podem ser obtidos (1) isolando o domínio VHH de um anticorpo de cadeia pesada que ocorre naturalmente; (2) por expressão de uma seqüência de nucleotídeos que codifica um domínio VHH de ocorrência natural; (3) por humanização (conforme descrito mais adiante) de um domínio VHH de ocorrência natural ou por expressão de um ácido nucléico que codifica tal domínio VHH humanizado; (4) por camelização (conforme descrito mais adiante) de um domínio VH de ocorrência natural de qualquer espécie dos animais, especialmente uma espécie de mamífero, como de um ser humano, ou por expressão de um ácido nucléico que codifica tal domínio VH camelizado; (5) por camelização de um anticorpo de domínio ou Dab como descrito por Ward e al (supra), ou pela expressão de um ácido nucléico que codifica tal domínio VH camelizado; (6) técnicas sintéticas ou semi-sintéticas usam que para preparam proteína, polipeptídios ou outras seqüências aminoácidas; (7) preparando um ácido nucléico que codifica um Nanobody utilizando técnicas síntese ácida para nucléica, seguida por expressão do ácido nucléico conseqüentemente obtido; e/ou (8) por qualquer combinação do precedente. Os métodos convenientes e as técnicas para executar o precedente serão claras para a pessoa experimentada baseada na revelação na presente e, por exemplo, incluirão os métodos e técnicas descritas mais detalhadamente a seguir.
Contudo, segundo uma modalidade de execução específica, os nanocorpos da invenção não têm uma seqüência aminoácida que é exatamente o mesmo como (isto é, como um grau de identidade de seqüência de 100% com) a seqüência aminoácida de um domínio VH de ocorrência natural, como a
Figure BRPI0609797B1_D0054
seqüência aminoácida de um domínio VH de ocorrência natural de um mamífero, e especialmente de um ser humano.
Uma classe em particular preferencial de nanocorpos da invenção compreende nanocorpos com uma seqüência aminoácida que corresponde à seqüência aminoácida de um domínio VHH de ocorrência natural, mas que foi humanizado, isto é, substituindo um ou vários resíduos aminoácidos na seqüência aminoácida da referida seqüência VHH de ocorrência natural por um ou vários dos resíduos aminoácidos que ocorrem na posição(ões) correspondente em um domínio VH de um anticorpo de 4 cadeias convencional de um ser humano (p. ex. indicado anteriormente). Isto pode ser executado em uma maneira conhecida por si, o que ficará claro para a pessoa experimentada, por exemplo, com base na nova descrição mais adiante e a arte prévia na humanização mencionada na presente. Novamente, deve ser observado que tais nanocorpos humanizados da invenção podem ser obtidos em qualquer maneira conveniente conhecida por si (isto é, como indicado conforme os pontos (1) - (8) acima) e, portanto não são estritamente limitados a polipeptídios que foram obtidos usando um polipeptídio que compreende um domínio VHH de ocorrência natural como um material inicial.
Outra classe em particular preferencial de nanocorpos da invenção compreende nanocorpos com uma seqüência aminoácida que corresponde à seqüência aminoácida de um domínio VH de ocorrência natural que foi camelizado, isto é, substituindo um ou vários resíduos aminoácidos na
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seqüência aminoácida de um domínio VH de ocorrência natural de um anticorpo de 4 cadeias convencional por um ou vários dos resíduos aminoácidos que ocorrem na posição(ões) correspondente em um domínio VHH de um anticorpo de cadeia pesada. Isto pode ser executado em uma maneira conhecida por si, o que ficará claro para a pessoa experimentada, por exemplo, com base na nova descrição mais adiante. A referência também é feita a WO 94/04678. Tal camelização pode ocorrer preferencialmente nas posições aminoácidas que estão presentes na interface VH-VL e nos assim chamados resíduos de Hallmark Camelidae (ver, por exemplo, também WO 94/04678), como também mencionado mais adiante. Preferivelmente, o domínio VH ou a seqüência que é usada como um material inicial ou ponto de partida que para gera ou e projeta o Nanobody camelizado é preferivelmente uma seqüência VH de um mamífero, mais preferivelmente a seqüência VH de um ser humano. Contudo, deve ser observado que tais nanocorpos camelizados da invenção podem ser obtidos em qualquer maneira conveniente conhecida por si (isto é, como indicado conforme os pontos (1) - (8) acima) e portanto não são estritamente limitados a polipeptídios que foram obtidos usando um polipeptídio que compreende um domínio VH de ocorrência natural como um material inicial.
Por exemplo, novamente conforme adicionalmente descrito mais adiante, tanto humanização como camelização pode ser executado fornecendo uma seqüência de nucleotídeos que codifica uma tal domínio VHH ou domínio VH
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que ocorrem naturalmente, respectivamente, e logo modificação, em uma maneira conhecida por si, um ou vários codons na seqüência de nucleotídeos tal que a nova seqüência de nucleotídeos codifica um Nanobody humanizado ou camelizado da invenção, respectivamente, e logo expressando a seqüência de nucleotídeos portanto obtida em uma maneira conhecida por si para fornecer o Nanobody desejado da invenção. Alternativamente, baseado na seqüência aminoácida de um domínio VHH de ocorrência natural ou o domínio VH, respectivamente, a seqüência aminoácida do desejado Nanobody humanizado ou camelizado da invenção, respectivamente, podem ser projetados e logo sintetizados de novo utilizando técnicas para síntese de peptídeo conhecida por si. Também, baseado na seqüência aminoácida ou a seqüência de nucleotídeos de um domínio VHH de ocorrência natural ou o domínio VH, respectivamente, uma seqüência de nucleotídeos que codifica o desejado Nanobody humanizado ou camelizado da invenção, respectivamente, podem ser projetados e logo sintetizados de novo utilizando técnicas síntese ácida para nucléica conhecida por si, depois o qual a seqüência de nucleotídeos portanto obtida pode ser expressa em uma maneira conhecida por si para fornecer o Nanobody desejado da invenção.
Outros caminhos convenientes e técnicas para obter nanocorpos da invenção e/ou seqüências de nucleotídeos e/ou ácidos nucléicos que codificam o mesmo, que começa (da seqüência aminoácida de) domínios VH que ocorrem «· naturalmente ou preferivelmente os domínios de VHH e/ou de seqüências de nucleotídeos e/ou seqüências ácidas nucléicas que codificam o mesmo serão claros para a pessoa experimentada, e pode, por exemplo, compreendendo combinar uma ou várias seqüências aminoácidas e/ou seqüências de nucleotídeos de domínios VH que ocorrem naturalmente (como um ou vários FR' S e/ou CDR’s) com uma ou várias uma ou várias seqüências aminoácidas e/ou seqüências de nucleotídeos de domínios VHH que ocorrem naturalmente (um ou vários FR'S ou CDR's), em uma maneira conveniente para fornecer (uma seqüência de nucleotídeos ou codificação de ácido nucléica) um Nanobody da invenção.
Segundo um aspecto preferencial, mas não-restritivo do aspecto da invenção, um Nanobody no seu sentido mais amplo pode ser geralmente definido como um polipeptídio compreendendo:
a) uma seqüência aminoácida que é compreendida de quatro regiões/seqüências de armação interrompidas por três regiões/seqüências que determinam complementaridade, nas quais o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é Q; e/ou:
b) uma seqüência aminoácida que é compreendida de quatro regiões/seqüências de armação interrompidas por três regiões/seqüências que determinam complementaridade, nas quais o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é E e no qual o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é um R;
Ψ3 e/ou:
c) uma seqüência aminoácida que é compreendida de quatro regiões/seqüências de armação interrompidas por três regiões/seqüências que determinam complementaridade, nas quais o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de P, Re S, e é especialmente escolhido do grupo composto de R e S.
Portanto, em um primeiro aspecto preferido, mas nãorestritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FR1-CDRI - FR2 - CDR2 - FR3-CDR3-FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e em que CDR a CDR3 me refiro à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que
i) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a
numeração de Kabat é Q ; e/ou em que:
ii) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a
numeração de Kabat é E e no qual o resíduo aminoácido na
posição 45 segundo a numeração de Kabat é um R; e/ou em que:
iii) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de P, Re S, e especialmente escolhido do grupo composto de Re S;
e em que:
iv) O CDR 1 é uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas
Figure BRPI0609797B1_D0057
seguintes :
NYGMG [SEQ ID NO: 15] SYTLG [SEQ ID NO: 16] NYNMG [SEQ ID NO: 17] SSAMA [SEQ ID NO: 18] YYNTG [SEQ ID NO: 19] IGAMG [SEQ ID NO: 20] IGTMG [SEQ ID NO: 21]
YNPMG [SEQ ID NO: 22] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou
Figure BRPI0609797B1_D0058
inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
v) 0 CDR 2 é uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas seguintes:
SISWSGTYTAYSDNVKG [SEQ ID n. 23] GISWSGVSTDYAEFAKG [SEQ ID n. 24] TSISWSGSYTAYADNVKG [SEQ ID n. 25] SISWSGMSTYYTDSVKG [SEQ ID n. 26] TITSGGRTSYADSVKG [SEQ ID n. 27] AISWSGGLTYYADSVKG [SEQ lo n. 28] TITSGGSTNYADPVKG [SEQ ID n. 29] TITSGGSTNYADSVKG [SEQ ID n. 30] AISRTGGSTYYARSVEG [SEQ ID n. 31] AISRTGGSTYYPDSVEG [SEQ lo n. 32] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme
Figure BRPI0609797B1_D0059
definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
vi) O CDR 3 é uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas seguintes:
QSRYRSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 33] LGRYRSNWRNIGQYDY [SEQ
ID n. 34] QSRYSSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 35] SNRYRTHTTQAMYNY [SEQ ID n. 36] VVDGKRAP [SEQ ID n. 37] NRRQKTVQMGERAYDY [SEQ ID n. 38] NLKQGSYGYRFNDY [SEQ ID n. 39] NLKQGDYGYRFNDY [SEQ ID n. 40] AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [SEQ lo n. 41]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID n. 42] AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [SEQ ID n. 43] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente
Figure BRPI0609797B1_D0060
uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Preferivelmente, nos nanocorpos da invenção:
quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1)
NYGMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1)
Figure BRPI0609797B1_D0061
SISWSGTYTAYSDNVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) QSRYRSNYYDHDDKYAY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRl é escolhido do grupo composto (de 1) SYTLG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) GISWSGVSTDYAEFAKG; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo
Figure BRPI0609797B1_D0062
menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) LGRYRSNWRNIGQYDY; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRl é escolhido do grupo composto (de 1) NYGMG; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TSISWSGSYTAYADNVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência
Figure BRPI0609797B1_D0063
aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) QSRYSSNYYDHDDKYAY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) NYNMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) SISWSGMSTYYTDSVKG; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) SNRYRTHTTQAMYNY; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) SSAMA; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TITSGGRTSYADSVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1)
VVDGKRAP; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo
7^7 menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) YYNTG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) AISWSGGLTYYADSVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) eNRRQKTVQMGERAYDY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
- quando CDR1 é escolhido do grupo composto (de 1) IGAMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TITSGGSTNYADPVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) NLKQGSYGYRFNDY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência y ( aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
- quando CDR1 é escolhido do grupo composto (de 1) IGAMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TITSGGSTNYADSVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) NLKQGSYGYRFNDY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na /6«?
presente) com a referida seqüência aminoácida;
- quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1)
IGAMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TITSGGSTNYADSVKG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) NLKQGDYGYRFNDY; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) IGTMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) TITSGGSTNYADSVKG; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) NLKQGDYGYRFNDY; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) YNPMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) AISRTGGSTYYARSVEG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) AGVRAEDGRVRTLPSEYNF; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; quando CDRI é escolhido do grupo composto (de 1) YNPMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; então o CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) AISRTGGSTYYPDSVEG; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 8 0%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) AGVRAEDGRVRTLPSEYTF; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
- quando CDR1 é escolhido do grupo composto (de 1) YNPMG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida;
então ο CDR2 é escolhido do grupo composto (de 1) AISRTGGSTYYPDSVEG; (2) seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e o CDR3 é escolhido do grupo composto (de 1) AGVRAEDGRVRSLPSEYTF; (2) as seqüências de aminoácido que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; e (3) seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com a referida seqüência aminoácida; no qual (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Especialmente, um Nanobody contra vWF segundo a invenção pode ter a estrutura:
FR1 - CDR1 - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação I a 4, respectivamente, e no qual CDRl a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que
i) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a
numeração de Kabat é Q; e/ou em que:
ii) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a
numeração de Kabat é E e no qual o resíduo aminoácido na
posição 45 segundo a numeração de Kabat é um R; e/ou em que:
iii) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de P, Re S, e especialmente escolhido do grupo composto de Re S;
e em que:
iv) O CDR 1 é uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas seguintes:
NYGMG [SEQ ID n. 15] SYTLG [SEQ lo n. 16] NYNMG [SEQ ID n. 17] SSAMA [SEQ ID n. 18] YYNTG [SEQ ID n. 19] IGAMG [SEQ ID n. 20] IGTMG [SEQ ID n. 21] YNPMG [SEQ ID n. 22] e em que:
v) O CDR 2 é uma seqüência aminoácida que é escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas seguintes:
SISWSGTYTAYSDNVKG [SEQ ID n. 23] GISWSGVSTDYAEFAKG [SEQ ID n. 24] TSISWSGSYTAYADNVKG [SEQ ID n. 25]
Figure BRPI0609797B1_D0064
SISWSGMSTYYTDSVKG [SEQ ID n. 26] TITSGGRTSYADSVKG [SEQ ID n. 27] AISWSGGLTYYADSVKG [SEQ ID n. 28] TITSGGSTNYADPVKG [SEQ ID n. 29] TITSGGSTNYADSVKG [SEQ ID n. 30] AISRTGGSTYYARSVEG
[SEQ ID n. 31] AISRTGGSTYYPDSVEG [SEQ ID n. 32]
e em que
vi) 0 CDR 3 é uma seqüência aminoácida que é
escolhida do grupo composto das seqüências aminoácidas
seguintes:
QSRYRSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 33]
LGRYRSNWRNIGQYDY [SEQ ID n. 34] QSRYSSNYYDHDDKYAY [SEQ ID n. 35] SNRYRTHTTQAMYNY [SEQ ID n. 36] VVDGKRAP [SEQ ID n. 37] NRRQKTVQMGERAYDY [SEQ ID n. 38] NLKQGSYGYRFNDY [SEQ ID
n. 39] NLKQGDYGYRFNDY [SEQ ID n. 40] AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [SEQ ID n. 41] AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID n. 42]
AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID n. 43] Preferivelmente, nos nanocorpos da invenção segundo o último aspecto:
Quando CDRI is:NYGMG; então CDR2 is:SISWSGTYTAYSDNVKG; e CDR3 is:QSRYRSNYYDHDDKYAY
Quando CDRI is:SYTLG; então CDR2 is:GISWSGVSTDYAEFAKG;
e CDR3 is:LGRYRSNWRNIGQYDY
Quando CDRI is:NYGMG; então CDR2 is:TSISWSGSYTAYADNVKG; e CDR3 is:QSRYSSNYYDHDDKYAY
Quando CDRI is:NYNMG; então CDR2 is:SISWSGMSTYYTDSVKG; e CDR3 is:SNRYRTHTTQAMYNY
Quando CDRI is:SSAMA; então CDR2 is:TITSGGRTSYADSVKG;
e CDR3 is:VVDGKRAP
Quando CDRI is:YYNTG; então CDR2 is:AISWSGGLTYYADSVKG;
e CDR3 is:NRRQKTVQMGERAYDY
Quando CDRl is:IGAMG; então CDR2 is:TITSGGSTNYADPVKG;
e CDR3 is:NLKQGSYGYRFNDY
Quando CDRl is:IGAMG; então CDR2 is:TITSGGSTNYADSVKG;
e CDR3 is:NLKQGSYGYRFNDY
Quando CDRl is:IGAMG; então CDR2 is:TITSGGSTNYADSVKG;
e CDR3 is:NLKQGDYGYRFNDY
Quando CDRl is:IGTMG; então CDR2 é: T1TSGGSTNYADSVKG;
e CDR3 is:NLKQGDYGYRFNDY
Quando CDRl is:YNPMG; então CDR2 is:AISRTGGSTYYARSVEG;
e CDR3 is:AGVRAEDGRVRTLPSEYNF
Quando CDRl is:YNPMG; CDR2:AISRTGGSTYYPDSVEG; e
CDR3 is:AGVRAEDGRVRTLPSEYTF
Quando CDRl is:YNPMG; então CDR2 is:AISRTGGSTYYPDSVEG;
e CDR3 is:AGVRAEDGRVRSLPSEYTF
Especialmente, segundo um aspecto preferencial, mas não-restritivo do aspecto da invenção, um Nanobody pode ser geralmente definido como um polipeptídio que compreende uma seqüência aminoácida que é compreendida de quatro regiões/seqüências de armação interrompidas por três regiões/seqüências que determinam complementaridade, em que;
o a-1) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de G, E, D, G, Q, R, S, L; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de G, E ou Q; e o a-2) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de L, R ou
Figure BRPI0609797B1_D0065
C; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de L ou
R; e o a-3) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de W, R ou S; e é preferivelmente W ou R, e é mais preferivelmente W;
o a-4) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é Q; ou em que:
o b-l) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de E e Q; e o b-2) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é R; e o b-3) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de W, Re S; e é preferivelmente W;
o b-4) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de Q e L; e é preferivelmente Q; ou em que:
o c-1) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de G, E, D, Q, R, S e L; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de G, E e Q; e o c-2) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de L, Re C; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de L e R;
e o c-3) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de P, Re
S; e é especialmente escolhido do grupo composto de R e S; e o c-4) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de Q e L; é preferivelmente Q.
Portanto, num outro aspecto preferido, mas nãorestritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FRI - CDRl - FR2 - CDR2 - FR3-CDR3-FR4 no qual FRI a FR4 se referem a regiões de armação 1 a
4, respectivamente, e no qual CDRl a CDR3 se referem à
regiões que determinam complementaridade 1 a 3,
respectivamente, e em que:
i) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a
numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de G, E, D,
G, Q, R, S, L; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de G, E ou Q;
e em que:
o ii) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de L, R ou C; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de L ou
R;
e em que:
o iii) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de W, R ou S; e é preferivelmente W ou R, e é mais preferivelmente W;
e em que
Figure BRPI0609797B1_D0066
iv) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é Q; e em que:
v) 0 CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima, num outro aspecto preferido, mas nãorestritivo, um Nanobody da invenção pode tenha a estrutura
FR1 - CDRI - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação I a 4, respectivamente, e no qual CDRI a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade I a 3, respectivamente, e em que:
i) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de E e Q;
e em que:
ii) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é R; e em que:
iii) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de W, Re S; e é preferivelmente W;
e em que:
iv) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo a numeração de Kabat é Q;
e em que:
Figure BRPI0609797B1_D0067
vi) O CDRl, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
No outro aspecto preferido, mas não-restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FR1 - CDRl - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRl a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que:
i) o resíduo aminoácido na posição 44 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de G, E, D, Q, R, S e L; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de G, E e Q;
e em que:
o ii) o resíduo aminoácido na posição 45 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de L, Re C; e é preferivelmente escolhido do grupo composto de L e R;
e em que:
o iii) o resíduo aminoácido na posição 103 segundo a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de P, Re S; e é especialmente escolhido do grupo composto de R e S;
e em que:
iv) o resíduo aminoácido na posição 108 segundo
Figure BRPI0609797B1_D0068
a numeração de Kabat é escolhido do grupo composto de Q e L; é preferivelmente Q; e em que:
v) 0 CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Dois grupos em particular preferidos, mas nãorestritivos dos nanocorpos da invenção são aqueles segundo o
a) acima; segundo o a-1) a a-4) acima; segundo o b) em cima; segundo o b-l) a b-4) acima; segundo o c) acima; e/ou segundo o c-1) a c-4) acima, em que;
a) os resíduos aminoácidos nas posições 44-47 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência GLEW (ou uma seqüência semelhante a GLEW conforme definido na presente) e o resíduo aminoácido na posição 108 é Q;
ou em que:
b) os resíduos aminoácidos nas posições 43-46 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência KERE ou KQRE (ou uma seqüência semelhante a KERE) e o resíduo aminoácido na posição 108 é Q ou L, e é preferivelmente Q.
Portanto, num outro aspecto preferido, mas nãorestritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FR1 - CDRI - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a
Figure BRPI0609797B1_D0069
4, respectivamente, e no qual CDR1 a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade I a 3, respectivamente, e em que:
i) os resíduos aminoácidos nas posições 44-47 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência GLEW (ou uma seqüência semelhante a GLEW conforme definido na presente) e o resíduo aminoácido na posição 108 é Q;
e em que:
ii) CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
No outro aspecto preferido, mas não-restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FRl - CDR I - FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 no qual FRl a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRI a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que:
i) os resíduos aminoácidos nas posições 43-46 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência KERE ou KQRE (ou uma seqüência semelhante a KERE) e o resíduo aminoácido na posição 108 é Q ou L, e é preferivelmente Q;
e em que:
ii) O CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na
Figure BRPI0609797B1_D0070
presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Nos nanocorpos da invenção na qual os resíduos aminoácidos nas posições 43-46 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência KERE ou KQRE, o resíduo aminoácido na posição 37 é o mais preferivelmente F. nos nanocorpos da invenção na qual os resíduos aminoácidos nas posições 44-47 segundo a numeração de Kabat formam a seqüência GLEW, o resíduo aminoácido na posição 37 é escolhido do grupo composto de Y, Η, I, V ou F, e é mais preferivelmente F.
Portanto, sem ser limitado a isto de qualquer modo, com base nos resíduos aminoácidos presentes nas posições acima mencionadas, os nanocorpos da invenção podem ser geralmente classificados com base nos três grupos seguintes:
a) 0 GLEW-grupo: nanocorpos com a seqüência aminoácida GLEW nas posições 44-47 segundo a numeração de Kabat e Q na posição 103 segundo a numeração de Kabat. Conforme mais adiante descrito na presente, nanocorpos dentro deste grupo normalmente têm um V na posição 37, e podem ter um W, P, R ou S na posição 103, e preferivelmente ter um W na posição 103. 0 grupo GLEW também compreende algumas seqüências semelhantes a GLEW como as mencionadas na Tabela 2 mais adiante;
b) 0 Grupo KERE: nanocorpos com a seqüência aminoácida KERE ou KQRE ou nas posições 43-46 segundo a
Figure BRPI0609797B1_D0071
numeração de Kabat e Q ou L na posição 108 segundo a numeração de Kabat. Conforme mais adiante descrito na presente, nanocorpos dentro deste grupo normalmente têm um F na posição 37, um L ou F na posição 47; e podem ter um W, P, R ou S na posição 103, e preferivelmente ter um W na posição
103;
c) Os 103 P, R, S-grupo: nanocorpos com um P R ou S na posição 103. Esses nanocorpos podem ter seqüência aminoácida GLEW nas posições 44-47 da numeração de Kabat ou a seqüência aminoácida KERE ou KQRE nas posições 43-46 segundo a numeração de Kabat, o último mais preferivelmente em combinação com um F na posição 37 e um L ou um F na posição 47 (conforme definido para o Grupo KERE); e podem ter Q ou L na posição 108 segundo a numeração de Kabat, e preferivelmente ter Q.
Portanto, num outro aspecto preferido, mas nâorestritivo, um Nanobody da invenção pode ser um Nanobody que pertence ao GLEW-grupo (conforme definido na presente), e no qual CDR 1, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
No outro aspecto preferido, mas não-restritivo, um Nanobody da invenção pode ser um Nanobody que pertence ao Grupo KERE (conforme definido na presente), e no qual CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente
Figure BRPI0609797B1_D0072
conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Portanto, num outro aspecto preferido, mas não5 restritivo, um Nanobody da invenção pode ser um Nanobody que pertence aos 103 P, R, S-grupo (conforme definido na presente), e no qual CDR1, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Também, mais geralmente e além dos resíduos 108Q, 43E/44R e 103P, R, S acima mencionados, os nanocorpos da invenção pode conter, em uma ou várias posições que, em um domínio VH convencional, formariam (parte de) a interface VH/VL, conteriam um ou vários resíduos aminoácidos que são mais altamente carregados do que os resíduos aminoácidos que ocorrem naturalmente na mesma posição(ões) no domínio VH ou VHH que ocorre naturalmente, e especialmente um ou vários resíduos aminoácidos carregados (como mencionado na Tabela 1) ·
Tais substituições incluem, mas não são limitadas às seqüências Semelhantes a GLEW mencionadas na Tabela 2 mais adiante; bem como as substituições que são descritas na
Solicitação Internacional WO 00/29004 para assim chamados microcorpos, p. ex. um Q na posição 108 e KLEW nas posições 44-47.
//7
Nos nanocorpos da invenção, o resíduo aminoácido na posição 83 é escolhido do grupo composto de L, M, S, V e W; e é preferivelmente L.
Também, nos nanocorpos da invenção, o resíduo aminoácido na posição 83 é escolhido do grupo composto de R, K, N, Ε, I e Q; e é mais preferivelmente K ou E (para nanocorpos correspondentes a domínios VHH que ocorrem naturalmente) ou R (para nanocorpos humanizados, conforme descrito mais adiante). 0 resíduo aminoácido na posição 84 é escolhido do grupo composto de P, A, R, S, D e V, e é mais preferivelmente P (para nanocorpos correspondentes a domínios VHH que ocorrem naturalmente) ou R (para nanocorpos humanizados, conforme descrito mais adiante).
Além disso, nos nanocorpos da invenção, o resíduo aminoácido na posição 104 é escolhido do grupo composto de G e D; e é mais preferivelmente G.
Coletivamente, os resíduos aminoácidos nas posições 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 e 108, cujos nanocorpos são acima mencionados, também serão mencionados na presente como os Resíduos de Hallmark. Os Resíduos de Hallmark e os resíduos aminoácidos nas posições correspondentes do domínio VH humano o mais estreitamente relacionado, VH3, são resumidos na Tabela 2.
Algumas combinações especialmente preferenciais desses Resíduos de Hallmark como ocorrem em domínios VHH que ocorrem naturalmente são mencionados na Tabela 3. Para a comparação, os correspondentes resíduos aminoácidos do VH3
100
ΙΊΟ humano chamado DP-47 foi indicada no itálico.
Tabela 2: Resíduos de Hallmark em nanocorpos
osiçãc P > Humano VH3 Resíduo de Hallmarks
1 L, V; L, M, S, V,W;
1 predominantemente L preferivelmente L
3 V, I, F; F(1), Y, Η, I ou V,
7 usualmente V preferivelmente F(1) ou Y
4 G G(2’, E(31, D, Q, R, S,
4(8) L; preferivelmente G(2>,
e<3> ou Q;
mais preferivelmente
g<2> ou E(3>,
4 L L(2), R(3,z C, I, L, P,
5(β) Q, V; preferivelmente L(2>
ou r(3)
4 W, Y W(2)' L(1> ou F(1), A, G,
η (8) 1, M, R, S ou Y;
preferivelmente W<2>' L(1),
F(i> ou R
8 R ou K; R, Kt5), N, E(5), I, M
3 usualmente R ou Q; preferivelmente K ou
R; mais preferivelmente K
8 A, T, D; P(5), A, L, R, S, D,
4 predominantemente A V; preferivelmente P
101
1 w w<4), p(6>, r<6>, s;
03 preferivelmente W
1 G G ou D;
04 preferivelmente G
1 L, M ou T; Q, L(7) ou R;
08 predominantemente L preferivelmente Q ou L<7)
Notas:
(1): Especialmente, mas não exclusivamente, em combinação com KERE ou KQRE nas posições 4346.
(2): Normalmente como GLEW nas posições 44-47.
(3) : Normalmente como KERE ou KQRE nas posições 43-46, p. ex. como KEREL, KEREF, KQREL, KQREF ou KEREG nas posições 43-47. Alternativamente, também as seqüências como TERE (por exemplo, TEREL), KECE (por exemplo, KECEL ou KECER), RERE (por exemplo, REREG) , QERE (por exemplo, QEREG) , KGRE (por exemplo, KGREG), KDRE (por exemplo, KDREV) são possíveis. Alguns outras seqüências possíveis, mas menos preferenciais incluem, por exemplo, DECKL e NVCEL.
(4) : Tanto com GLEW nas posições 44-47 como com
KERE ou KQRE nas posições 43-46.
(5) : Freqüentemente como KP ou EP nas posições
83-84 de domínios VHH que ocorrem naturalmente.
(6) : Especialmente, mas não exclusivamente, em combinação com GLEW nas posições 44-47.
(7) : Com a prescrição que quando as posições 4447 são GLEW, a posição 108 seja sempre Q.
Figure BRPI0609797B1_D0073
102 (8): O grupo GLEW também seqüências nas posições 44-47, como para exemplo GVEW, EPEW, GLER, DQEW, contém GLEW-como
DLEW, GIEW, ELEW,
GPEW, EWLP,
GPER, GLER e ELEW.
Tabela 3: Algumas combinações preferenciais de
Resíduos de Hallmark em nanocorpos que ocorrem naturalmente.
Para a humanização dessas combinações, é feita referência à especificação.
11 37 44 45 47 83 84 104 08
DP-47 (humano) M V G L W R A W G
“KERE” grupo L F E R L K P W G
L F E R F E P W G
L F E R F K P W G
L Y Q R L K P W G
L F L R V K P Q G
L F Q R L K P w G
L F E R F K P w G
“GLEW” grupo L V G L W K S w G
M V G L W K P R G
Figure BRPI0609797B1_D0074
103
Nos nanocorpos, cada resíduo aminoácido em qualquer outra posição do que os Resíduos de Hallmark pode ser qualquer resíduo aminoácido que naturalmente ocorre na posição correspondente (segundo numeração de Kabat) de um domínio VHH de ocorrência natural.
Tais resíduos aminoácidos serão claros para a pessoa experimentada. As tabelas 4-7 mencionam alguns resíduos não-restritivos que podem estar presentes em cada posição (segundo numeração de Kabat) do FR1, FR2, FR3 e FR4 de domínios VHH que ocorrem naturalmente. Para cada posição, o resíduo aminoácido que mais freqüentemente ocorre em cada posição de um domínio VHH de ocorrência natural (e que é o resíduo aminoácido mais preferencial para a referida posição em um Nanobody) é indicada em negrito; e outros resíduos aminoácidos preferenciais para cada posição foram sublinhados (nota: o número de resíduos aminoácidos que são encontrados nas posições 2630 de domínios VHH que ocorrem naturalmente apóia a hipótese que é a base da numeração Chothia (supra) que os resíduos nessas posições já fazem parte de CDRl.)
Nas Tabelas 4-7, alguns resíduos não-restritivos que podem estar presentes em cada posição de um domínio VH3 humano também foram mencionados. Novamente, para cada posição, o resíduo aminoácido que mais freqüentemente ocorre em cada posição de um domínio VH3 humano que ocorre naturalmente é indicada em negrito; e outros resíduos aminoácidos preferenciais foram sublinhados.
104 /2/
Tabela 4: os exemplos nâo-restritivos dos resíduos aminoácidos em FR1 (para as notas, ver as notas à Tabela 2)
Pos. Resíduo(s) Aminoácido(s):
Humano Vh3 Camelídeo Vhh’ s
1 E.Q Q, A, E, D, H, R
2 V V, A, E, G, L, M, Q
3 Q Q, K, Ε, Η, P, R, Y
4 L L, F, P, R, V
5 V.L Q, E, L, V, Μ, P, A, I
6 E E, D, Q, A, H
7 S.T S, F, H
8 G, R G, A, R
9 G G.E
10 G.V G, D, R, A, Ε, N, T, V
11 Resíduo de Hallmark: L, M, S, V,W, F, N, P, T, Y; preferivelmente L
12 V, I V, A, G, M
13 Q, K, R Q, Ε, K, D, G, A, H, L, N, P, R, T
14 P A, Q, A, G, P, T, V, E, F, I, N, S
15 G G
16 G, R G, A, E, D, N, P, R, S, V, W
17 S S, F, T, N, P, A, C
105
625
18 L L, V, M, Q, R
19 R, K R, K, L, N, S, T, A, F, G, I, M, Q
20 L L, F, I. V. M, S
21 S S, F, T, G, Η, P, A
22 C C
23 A.T A, D, P, S, T, V, E, G, I, L, Q, R
24 A A, I, S, T, V, C, E, F, G, L, N, P, Q.Y
Tabela 4: exemplos não-restritivos de resíduos aminoácidos em FRl (continua)
Resíduo(s) Aminoácido(s):
os.
Humano VH3 Camelídeo Vhh' s
S S, A, F, P, T, L,
5 V
G G, D, E, R, S, V t
6 k, I, Μ, P, T
F S t F, R, L, P, G,
7 N, A, D, E, Η, I, K, M,
Q, T, V, Y
T N, T, E, D, S, I,
8 R, A, G, R, F, Y, L, M,
P, V
F, V F zL t D, S, Σ z G /
Figure BRPI0609797B1_D0075
106
9 V, A, E, P, T, Y
S, D, G N, S, E, G, A, D,
0 Μ, T, Η, I, P, R, V, W
Tabela 5: os exemplos não-restritivos dos resíduos aminoácidos em FR2 (para as notas, ver as notas à Tabela 2)
os. Resíduo(s) Aminoácido(s):
Humano VH3 Camelídeo Vhh's
W W
6
Resíduo de Hallmark: F(1), Y, Η, I, A, L, P, S ou
7 V preferivelmente F(1) ou Y
R R
8
Q Q, Η, P, R, A, D,
9 G, L, E
A A, F, G, P, T, V,
0 I, L, N, R, S, Y
P, s, T P, A, L, S, I, Q,
1 T
G G, E, D, R, T, V
2
K K, D, E, N, Q, R,
3 T, V, A, L, M, S
107 ¢2 3
4 F, Resíduo de Hallmark: G(Z), E(3), D, Q, R, S, L, A,
K, Μ, Ν, P, V, W, Y; preferivelmente G<2>, E<3) ou Q;
mais preferivelmente G(2) ou E (3)
Resíduo de Hallmark: L<2), R(3> , C, I, L, P, Q, V,
5 D, E, G, Η, K, T; preferivelmente L (2) ou R,3)
Ε, V E, D, K, Q, V, A,
6 G, N
Resíduo de Hallmark: W<2)' L(1> ou F(1), A, G, I,
7 M, R, S, D, Ε, Η, K, Q, T, V ou Y; preferivelmente
W(2), LU)f F(i> Qu R
V V, I, L, A, C, E,
8 F, G, Η, Μ, P, Q, R, S,
T, V, W, Y
S, A, G A, S, A, G, T, V,
9 D, E, 1/ L, Q, R, Y
Tabela 6: os exemplos não-restritivos dos resíduos aminoácidos em FR3 {para as notas, ver as notas à Tabela 2)
os. Resíduo(s) Aminoácido(s):
Humano Vh3 Camelídeo Vhh' s
6 R R
7 F F, L, V, A, D, I, S, Y
T T / A, S, D, F, G,
108 //0
8 I, K, N
I I, Μ, V, A, F, L,
9 R, S, T
s S, A, F, E, G, K,
0 P, T, V
R R, G, I, K, Q, S,
1 T, W, A, F, L, Μ, N
D, E D, E, G, Ν, V, A,
2 Η, I, L, Q, S, T
N, D, G N, D, F, I, K, S,
3 T, Y, A, G, H, L, M, R,
V
A, S A, D, G, Ν, P, S,
4 T, F, Η, I, L, R, V, Y
K K, A, Ε, K, L, N,
5 Q, R, D, G, I, M, S, T,
V, W
N, S N, D, K, R, S, T,
6 Y, E, G, Η, I, Q
S, T, I T, A, Ε, I, M, S,
7 K, L, N, R, V
L, A V, L,A, F, G, I,
8 Μ, Ε, N, Q, R, S, T, W
Y, H Y, A, D, F, H, S,
9 T, C, Ε, I, L, Ν, V, W
L L, F, V, M
109 /a'?
0
Q Q, E, R, T, G, H,
1 I, K, L, Μ, N
M Μ, I, L, V, G, P,
2 T
N, G N, D, G, H, S, T,
2a A, Ε, I, K, R, V
S Sz N, Dz Gz Rz Az
2b C, E, F, I, K, Μ, P, T,
V
L L, P, Μ, T, V
2c
Figure BRPI0609797B1_D0076
t
Tabela 6: exemplos não-restritivos de resíduos aminoácidos em FR3 (continua)
os. Resíduo(s) Aminoácido(s):
Humano VH3 Camelídeo Vhh' s
Resíduo de Hallmark: R, K(5), N, E(5), I, Μ, A, D,
3 θ t Ij/ Qz S f T ou Q; preferivelmente K ou R; mais
preferivelmente K
Resíduo de Hallmark: P(5), A, L, R, S, D, V, F,
4 G, Η, N, T, Y; preferivelmente P
E, G Ez Dz Gz Qz Az Nz
5 R, V, Y
D D, E, F, Y
110
430
6
T, M T, S, A, C, M
7
A A f G / S f D f L f N /
8 P
V, L V, A, D, I, L, M,
9 N, R, T, E, F, S
Y Y, F, E, Η, N
0
Y, H Y, D, F, H, L, S,
1 T, V, C, I, N, R, W
C C
2
A, K, T A, N, G, Η, K, R,
3 S, T, V, Y, E, F, I, L,
M, Q
K, R, T A, V, C, F, G, I,
4 L, R, S, D, E, K, Μ, N,
P, Q, T, W, Y T ou K;
Tabela 7: os exemplos não-restritivos dos resíduos aminoácidos em FR4 (para as notas, ver as notas à Tabela 2)
os. Resíduo(s) Aminoácido(s):
Humano VH3 Camelídeo Vhh' s
111 ¢3/
03 Resíduo de Hallmark: W(4), p (6) p (6) , S, F, G, K,
L, N, Q, V, Y; preferivelment 5 W
Resíduo de Hallmark: G, A, R, S, T ou D;
04 preferivelmente G
Q, R Q, E, K, P, R, G,
05 H, L, S, V
G G
06
T T, A, I, N, P
07
Resíduo de Hallmark: Q, l<7) , Ε, H, N, P, T ou R;
08 preferivelmente Q ou L<7)
V V
09
T T, I, A
10
V v, A, I, G
11
S S, F, A, L, P, T,
12 Y
S S, A, L, P, F, T
13
Portanto, num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FRl
CDRI - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3
FR4
112
Figure BRPI0609797B1_D0077
no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRI a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: i) os resíduos de Hallmark são como definidos na presente;
e em que:
ii) O CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima. Num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter o estrutura
FR1 - CDRI - FR2 - CDR2-FR3-CDR3-FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRI a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: e em que
i) O FR1 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[1] QVQLQESGGGXVQAGGSLRLSCAASG [26] [SEQ ID η. 1] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm
113 pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
114 ii)
O FR2 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[36] WXRQAPGKXXEXVA [49] [SEQ ID n. 2] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma
115
Α^ substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
iii) 0 FR3 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[66] RFTISRDNAKNTVYLQMNSLXXEDTAVYYCAA [94] [SEQ ID n.
3] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que
116
1¾ têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
iv) 0 FR4 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[103] XXQGTXVTVSS [113] [SEQ ID n. 4] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma
117 substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas, e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas;
e em que:
v) O CDRl, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima;
no qual os Resíduos de Hallmark são indicados por X e como definidos mais acima e no qual os números entre colchetes se referem às posições aminoácidas segundo a
118
Figure BRPI0609797B1_D0078
numeração de Kabat.
Num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FR1 - CDRI - FR2 - CDR2 - FR3-CDR3-FR4 no qual FR1 a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRI a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: e em que
i) O FR1 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[1] QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG [26] [SEQ ID n. 5] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s)
Figure BRPI0609797B1_D0079
119 aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na seqüência acima;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na seqüência acima; e em que:
ii) 0 FF <2 é esc olhido do grupo composto das
seqüências aminoácidas: [36] WFRQAPGKERELVA [49] [SEQ ID n. 6] [36]
WFRQAPGKEREFVA [49] [SEQ ID n. 7] [36] WFRQAPGKEREGA [49]
[SEQ ID n. 8] [36] WFRQAPGKQRELVA [49] [SEQ ID n. 9] [36]
WFRQAPGKC-REFVA [49] [SEQ ID n. 10] [36] WYRQAPGKGLEWA [49]
[SEQ ID n. 11]
Figure BRPI0609797B1_D0080
120 (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 37, 44, 45 e 47 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
iii) O FR3 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[66] RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA [94] [SEQ ID n.
12] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com a seqüência aminoácida acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e
121 /4/ (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
iv) 0 FR4 é escolhido do grupo composto das seqüências aminoácidas:
[103] WGQGTQVTVSS [113] [SEQ ID n. 13] [103] WGQGTLVTVSS [113] [SEQ ID n. 14] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente
Figure BRPI0609797B1_D0081
122 pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima; em que (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e 108 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e
123 (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e
108 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
v) O CDRl, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e estão preferivelmente como definido segundo uma das definições preferenciais acima, e estão mais preferivelmente como definido segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FRI - CDRl - FR2 - CDR2 - FR3-CDR3-FR4 no qual FRI a FR4 se referem a regiões de armação 1 a 4, respectivamente, e no qual CDRl a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: e em que
i) O FRI é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[1] QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG [2 6] [SEQ ID n. 5] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra
Figure BRPI0609797B1_D0082
124 posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na seqüência acima; e em que:
o ii) FR2 é escolhido do grupo composto das seqüências aminoácidas:
[36] WFRQAPGKERELVA [49] [SEQ ID n. 6] [36]
WFRQAPGKEREFVA [49] [SEQ ID n. 7] [36] WFRQAPGKEREGA [49]
[SEQ ID n. 8] [36] WFRQAPGK-RELVA [49] [SEQ ID n. 9] [36]
WFRQAPGKQREFVA [49] [SEQ ID n. 10]
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou
Figure BRPI0609797B1_D0083
125 (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência (s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 37, 44, 45 e 47 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
o iii) FR3 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[66] RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA [94] [SEQ ID n.
12] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são
Figure BRPI0609797B1_D0084
126 como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
o iv) FR4 é escolhido do grupo composto das seqüências aminoácidas:
[103] WGQGTQVTVSS [113] [103] WGQGTLVTVSS [113] [SEQ ID n. 13] [SEQ ID n. 14] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 7; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e 108 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
v) 0 CDRl, CDR2 e CDR3 são conforme definido na presente, e são preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e estão mais
Figure BRPI0609797B1_D0085
127 preferivelmente como definido segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FR1 - CDR1 - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 no qual FRl a FR4 se referem a regiões de armação 1 a
4, respectivamente, e no qual CDR1 a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: e em que
i) O FRl é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[1] QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASG [26] [SEQ ID n. 5] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s)
Figure BRPI0609797B1_D0086
128
Ίaminoácida(s) acima mencionadas; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na seqüência acima; e em que:
ii) O FR2 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[36] WYRQAPGKGLEWA [49] [SEQ ID n. 11] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 37, 44, 45 e 47 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
iii) 0 FR3 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
Figure BRPI0609797B1_D0087
129 [66] RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAA [94] [SEQ ID n.
12] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
iv) O FR4 é escolhido do grupo composto da seqüência aminoácida:
[103] WGQGT (QVTVSS [113] [SEQ ID n. 13] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas
130
Figure BRPI0609797B1_D0088
acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 7; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e
108 são como indicados em cada uma das seqüências acima;
e em que:
v) O CDRl, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e estão preferivelmente como definido segundo uma das definições preferenciais acima, e são mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Num outro aspecto preferido, mas não restritivo, um Nanobody da invenção pode ter a estrutura
FRI - CDRl - FR2 - CDR2 - FR3-CDR3-FR4 no qual FRI a FR4 se referem a regiões de armação I a 4, respectivamente, e no qual CDRl a CDR3 se referem à regiões que determinam complementaridade 1 a 3, respectivamente, e em que: e em que
Figure BRPI0609797B1_D0089
131
i) 0 FRl é escolhido do grupo composto de seqüências FR1 presentes nos nanocorpos de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 8 6 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO's 86 para 97, ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma de ditas seqüências FRI; no qual (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na
Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FRl; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na referida seqüência FRl;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FRl, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é
Figure BRPI0609797B1_D0090
132 preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 4; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR1; e (3) o resíduo de Hallmark na posição é como indicado na referida seqüência FR1;
e em que:
ii) 0 FR2 é escolhido do grupo composto das seqüências FR2 presentes nos nanocorpos de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de lo NO's SEQ 8 6 para 97, ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FR2; no qual (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida
Figure BRPI0609797B1_D0091
133 seqüência FR2; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 37, 44, 45 e 47 são como indicados na referida seqüência FR2;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FR2, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 5; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR2; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 37, 44, 45 e 47 são como indicados na referida seqüência FR2;
e em que:
o iii) FR3 é escolhido do grupo composto das seqüências FR3 presentes nos nanocorpos de SEQ ID N0's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO's 86-97, ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido
134
Figure BRPI0609797B1_D0092
na presente) com uma das referidas seqüências FR3; no qual (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR3; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são como indicados na referida seqüência FR3;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FR3, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR3; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 83 e 84 são como indicados na referida seqüência FR3;
Figure BRPI0609797B1_D0093
135 e em que: <
iv) O FR4 é escolhido, do grupo composto das seqüências FR4 presentes nos nanocorpos de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO's 8 6 para 97, ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FR4; no qual (1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR4; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e 108 são como indicados na referida seqüência FR3;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das referidas seqüências FR4, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é
Figure BRPI0609797B1_D0094
136 itafcv -··* ‘i»· ··♦ ZH^· preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida conforme definido na Tabela 6; e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só 5 contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a referida seqüência FR4; e (3) os resíduos de Hallmark nas posições 103, 104 e
108 são como indicados na referida seqüência FR4;
e em que:
v) O CDRI, CDR2 e CDR3 são tão definidos na presente, e preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições preferenciais acima, e mais preferivelmente conforme definidos segundo uma das definições mais preferenciais acima.
Alguns nanocorpos particularmente preferidos da invenção podem ser escolhidos do grupo composto das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO's 86 para 97 ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97 (e preferivelmente de SEQ ID NO's 86 para 97); em que (1) os resíduos de Hallmark podem ser como indicados
Figure BRPI0609797B1_D0095
137 na Tabela 2 acima;
(2) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida como definido em Tabelas 4-7; e/ou (3) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as seqüência(s) aminoácida(s) acima mencionadas.
Alguns nanocorpos até mais particularmente preferidos da invenção podem ser escolhidos do grupo composto das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente nos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO's 86 para 97 ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97 (e preferivelmente de SEQ ID NO's 86 para 97); em que (1) os resíduos de Hallmark são como indicados na seqüência pertinente escolhida de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97 (e preferivelmente de SEQ ID NO's 86 para 97) ;
(2) qualquer substituição aminoácida em qualquer outra posição que não seja uma posição de Hallmark é
138
Figure BRPI0609797B1_D0096
preferivelmente qualquer uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente) e/ou uma substituição aminoácida como definido em Tabelas 4-7; e/ou (3) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com a seqüência pertinente escolhida de lo NO's SEQ 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97 (e preferivelmente de SEQ ID NO's 86 para 97).
Alguns nanocorpos mais preferenciais da invenção podem ser escolhidos do grupo composto das seqüências aminoácidas de SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97, e especialmente dos nanocorpos humanizados de SEQ ID NO’s 86 para 97.
Como ficará claro do acima mencionado, o termo nanocorpos da invenção como usado na presente no seu sentido mais amplo também compreende mutantes naturais ou sintéticos, variantes, alelos, análogos e ortólogos (a seguir tratados coletivamente como análogos) dos nanocorpos mencionado no SEQ ID NO's 60 para 73 e SEQ ID NO's 86 para 97.
Geralmente, tais análogos, por exemplo, podem compreender seqüências homólogas, porções funcionais, ou uma porção funcional de uma seqüência homóloga (conforme posteriormente definido mais adiante) de um Nanobody. Geralmente, em tais análogos, cada resíduo aminoácido (outro que não o Resíduo de Hallmark) em cada uma das regiões de armação pode ser substituído por qualquer outro resíduo
Figure BRPI0609797B1_D0097
139 aminoácido, contanto que o grau total da identidade de seqüência das regiões de armação permaneça conforme definido na presente. Preferivelmente, contudo, em tais análogos:
um ou resíduos aminoácidos nas acima mencionadas seqüências de armação são substituídos por um ou vários resíduos aminoácidos que ocorrem naturalmente na mesma posição em um domínio VHH que ocorre naturalmente. Alguns exemplos de tais substituições são mencionados em Tabelas 47 acima;
e/ou:
um ou resíduos aminoácidos nas acima mencionadas seqüências de armação são substituídos por um ou vários resíduos aminoácidos que podem ser considerados uma substituição aminoácida conservadora, conforme descrito mais acima;
e/ou:
um ou resíduos aminoácidos nas acima mencionadas seqüências de armação são substituídos por um ou vários resíduos aminoácidos que ocorrem naturalmente na mesma posição em uma naturalmente ocorrência o domínio de Vii de um ser humano. Isto é, a humanização geralmente tratada como da naturalmente ocorrência VHH/Nanobody em geral e da referida posição especialmente, e será discutido mais detalhadamente a seguir;
e:
as posições para que só um resíduo aminoácido é mencionado para ambos o domínio VH
Figure BRPI0609797B1_D0098
140 e o domínio VHH em Tabelas 4-7 anteriormente nâo é preferivelmente substituído.
Também, embora geralmente menos preferencial, em tais análogos, um ou vários resíduos aminoácidos possam ser eliminados das regiões de armação e/ou inseridos nas regiões de armação (opcionalmente além de uma ou várias substituições aminoácidas conforme acima mencionado), contanto que o grau total da identidade de seqüência das regiões de armação permaneça conforme definido na presente.
Os resíduos de Hallmark não devem ser eliminados. Também, o mais preferivelmente, resíduos aminoácidos para os quais só um resíduo aminoácido é mencionado tanto para o domínio VH como para o domínio VHH nas Tabelas 4-7 acima não são preferivelmente eliminados.
Preferivelmente, tais análogos devem ser tais que eles ainda podem ligar a, ter afinidade para e/ou ter especificidade para vWF, isto é, com uma afinidade e/ou uma especificidade que é pelo menos 10%, preferivelmente pelo menos 50%, mais preferivelmente pelo menos 70%, mesmo mais preferivelmente pelo menos 80%, como pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 99% ou mais, da afinidade e/ou a especificidade de pelo menos um dos nanocorpos de SEQ ID No's 60 para 73 e SEQ ID NO’s 86 para 97, conforme determinado utilizando um ensaio conveniente, por exemplo, um ensaio para determinar a ligação do análogo a vWF, e em particular um dos ensaios conforme usados nos Exemplos apresentados posteriormente.
Figure BRPI0609797B1_D0099
141
Geralmente, tais análogos, por exemplo, podem ser obtidos fornecendo um ácido nucléico que codifica um domínio VHH de ocorrência natural, modificando os codons para um ou vários resíduos aminoácidos que devem ser humanizados nos codons para o(s) resíduo(s) aminoácido(s) humano(s) correspondente(s), expressando a seqüência ácida/nucleotídea nucléica portanto obtida em um hospedeiro ou sistema de expressão conveniente; e opcionalmente isolação e/ou purificação do análogo portanto obtido para prover o referido análogo na forma essencialmente isolada (conforme definido acima). Isto pode ser geralmente executado usando métodos e técnicas conhecidas por si, o que ficará claro para a pessoa experimentada, por exemplo, dos manuais e referências citadas na presente e/ou da nova descrição a seguir. Alternativamente, e por exemplo, um ácido nucléico que codifica um análogo pode ser sintetizado em uma maneira conhecida por si (por exemplo, usando um aparelho automatizado que sintetiza seqüências ácidas nucléicas com uma seqüência aminoácida predestinada) e pode ser expresso em um hospedeiro ou sistema de expressão conveniente, sobre o qual o análogo portanto obtido pode ser opcionalmente isolado e/ou purificado para prover os referidos análogos na forma essencialmente isolada (conforme definido acima). Outro modo de fornecer os análogos implica a síntese química da seqüência aminoácida pertinente que usa técnicas para síntese de peptídeo conhecida por si, como as mencionadas a seguir.
142
Será também geralmente ser claro para a pessoa experimentada que nanocorpos (inclusive análogos dos mesmos) também podem ser preparados começando de seqüências VH humanas (isto é, seqüências aminoácidas ou as seqüências de nucleotídeos correspondentes) , como seqüências VH3, por exemplo, humanas como DP-47, DP-51 ou DP-29, modificando um ou vários resíduos aminoácidos na seqüência aminoácida do referido domínio VH humano, para fornecer uma seqüência aminoácida que tem a um Q na posição 108; e/ou (b) E na posição 44 e/ou R na posição 45, e preferivelmente E na posição 44 e R na posição 45; e/ou (c) P, R ou S na posição 103, conforme descrito acima. Novamente, isto pode ser geralmente executado usando vários métodos e técnicas mencionadas no parágrafo prévio, usando uma seqüência aminoácida e/ou seqüência de nucleotídeos para um domínio VH humano como um ponto de partida.
termo nanocorpos conforme usado na presente no seu sentido mais amplo também compreende partes ou fragmentos dos nanocorpos (inclusive análogos) da invenção tão definida na presente, que pode ser novamente conforme adicionalmente descrito mais adiante.
Geralmente, as partes ou os fragmentos dos nanocorpos e/ou análogos têm seqüências aminoácidas nas quais, em comparação com a seqüência aminoácida do Nanobody ou análogo de comprimento completo correspondente, um ou vários dos resíduos aminoácidos no fim do N-terminal, um ou vários resíduos aminoácidos no fim do C-terminal, um ou vários
Figure BRPI0609797B1_D0100
143
Figure BRPI0609797B1_D0101
resíduos aminoácidos internos contíguos, ou qualquer combinação dos mesmos, foram eliminados e/ou retirados. É também possível combinar uma ou várias de tais partes ou fragmentos para fornecer um Nanobody da invenção.
Preferivelmente, a seqüência aminoácida de um Nanobody que compreende uma ou várias partes ou fragmentos de um Nanobody e/ou análogo de comprimento completo deve ter um grau de identidade de seqüência de pelo menos 50%, preferivelmente pelo menos 60%, mais preferivelmente pelo menos 70%, como pelo menos 80%, pelo menos 90% ou pelo menos 95%, com a seqüência aminoácida do correspondente Nanobody de comprimento completo.
Também, a seqüência aminoácida de um Nanobody que compreende uma ou várias partes ou fragmentos de um Nanobody e/ou análogo de comprimento completo é preferivelmente tal que compreende pelo menos 10 resíduos aminoácidos contíguos, preferivelmente pelo menos 20 resíduos aminoácidos contíguos, mais preferivelmente pelo menos 30 resíduos aminoácidos contíguos, como pelo menos 40 resíduos aminoácidos contíguos, da seqüência aminoácida do correspondente Nanobody de comprimento completo.
Geralmente, tais partes ou fragmentos dos nanocorpos da invenção terão seqüências aminoácidas nas quais, em comparação com a seqüência aminoácida do correspondente
Nanobody de comprimento completo da invenção, um ou vários dos resíduos aminoácidos no fim do N-terminal, um ou vários resíduos aminoácidos no fim do C-terminal, um ou vários
Figure BRPI0609797B1_D0102
144 resíduos aminoácidos internos contíguos, ou qualquer combinação dos mesmos, foram eliminados e/ou retirados. É também possível combinar uma ou várias de tais partes ou fragmentos para fornecer um Nanobody da invenção.
Segundo uma modalidade de execução preferencial, um fragmento conforme usado na presente compreende pelo menos um dos CDR's presentes em um Nanobody de tamanho natural da invençào, preferivelmente pelo menos dois dos CDR' s presentes em um Nanobody de tamanho natural da invenção, mais preferivelmente pelo menos CDR2 e CDR3 presentes em um Nanobody de tamanho natural da invenção, tais como, por exemplo, o três CDR's presentes em um Nanobody de tamanho natural da invenção.
Segundo outra modalidade de execução em particular preferida, mas não-restritiva, tal parte ou fragmento compreendem pelo menos FR3, CDR3 e FR4 do correspondente Nanobody de comprimento completo da invençào, isto é, como, por exemplo, descrito na solicitação internacional WO 03/050531 (Lasters et al.).
Preferivelmente, tais partes ou fragmentos devem ser tais que eles ainda podem ligar a, ter afinidade para e/ou ter especificidade para vWF, isto é, com uma afinidade e/ou uma especificidade que é pelo menos 10%, preferivelmente pelo menos 50%, mais preferivelmente pelo menos 70%, mesmo mais preferivelmente pelo menos 80%, como pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 99% ou mais, da afinidade e/ou a
Figure BRPI0609797B1_D0103
145 especificidade do Nanobody de tamanho natural correspondente da invenção, por exemplo, um ensaio para determinar a ligação do análogo a vWF, e em particular um dos ensaios conforme usados nos Exemplos apresentados posteriormente.
Da descrição mais acima, ficará claro que as seqüências aminoácidas dos nanocorpos usados na presente se diferenciam em pelo menos uma posição aminoácida em pelo menos uma das regiões de armação das seqüências aminoácidas de domínios VH que ocorrem naturalmente, como as seqüências aminoácidas de domínios VH que ocorrem naturalmente de anticorpos de seres humanos. Especialmente, ficará claro que as seqüências aminoácidas dos nanocorpos usados na presente se diferenciam em pelo menos um dos Resíduos de Hallmark de seqüências aminoácidas de domínios VH que ocorrem naturalmente, como as seqüências aminoácidas de domínios VH
que ocorrem naturalmente de anticorpos de Camelídeos e/ou
seres humanos.
Portanto, segundo uma modalidade de execução
específica, um Nanobody da invenção tem uma seqüência
aminoácida que se diferencia em pelo menos uma posição aminoácida em uma das regiões de armação da seqüência aminoácida de um domínio VH que ocorre naturalmente. Segundo uma modalidade de execução mais específica, mas nãorestritiva da invenção, um Nanobody da invenção tem uma seqüência aminoácida que se diferencia em pelo menos um dos resíduos de Hallmark da seqüência aminoácida de um domínio VH que ocorre naturalmente.
Figure BRPI0609797B1_D0104
146
Figure BRPI0609797B1_D0105
Da descrição mais acima, também ficará claro que as seqüências aminoácidas de alguns nanocorpos da invenção, como os nanocorpos humanizados da invenção, se diferenciarão em pelo menos uma posição aminoácida em pelo menos uma das regiões de armação (isto é, na posição de um resíduo de Hallmark ou em outra posição) das seqüências aminoácidas de domínios VHH que ocorrem naturalmente. Portanto, segundo uma modalidade de execução específica, mas não-restritiva, um Nanobody da invenção tem uma seqüência aminoácida que se diferencia em pelo menos uma posição aminoácida em uma das regiões de armação da seqüência aminoácida de um domínio VHH de ocorrência natural. Segundo uma modalidade de execução mais específica, mas não-restritiva da invenção, um Nanobody da invenção tem uma seqüência aminoácida que se diferencia em pelo menos um dos resíduos de Hallmark da seqüência aminoácida de um domínio VHH de ocorrência natural.
Conforme acima mencionado, a invenção também se refere a proteína ou polipeptídios que compreendem pelo menos um domínio VHH (isto é, como identificado utilização dos métodos da invenção) ou pelo menos um Nanobody baseado nisso.
Segundo uma modalidade de execução não-restritiva da invenção, tal polipeptídio da invenção essencialmente compõe-se de um Nanobody. Por essencialmente compõem-se de ' quer dizer que a seqüência aminoácida do polipeptídio da invenção qualquer é exatamente o mesmo como a seqüência aminoácida de um Nanobody (como acima mencionado) ou
Figure BRPI0609797B1_D0106
147
Figure BRPI0609797B1_D0107
corresponde à seqüência aminoácida de um Nanobody no qual um número limitado de resíduos aminoácidos, como 1-10 resíduos aminoácidos e preferivelmente 1-6 resíduos aminoácidos, como 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 resíduos aminoácidos, foram acrescentados ao fim terminal amino, ao fim terminal carboxi, ou tanto ao fim terminal amino como ao fim terminal carboxi da seqüência aminoácida do Nanobody.
Ditos resíduos aminoácidos podem ou nâo modificar-se, alterar-se ou de outra maneira influir nas propriedades (biológicas) do Nanobody e podem ou não acrescentar a nova funcionalidade ao Nanobody. Por exemplo, ditos resíduos aminoácidos pode:
a) formar uma etiqueta, isto é, uma seqüência aminoácida ou o resíduo que permite ou facilita a purificação do Nanobody, por exemplo, usando técnicas de afinidade dirigidas contra dita seqüência ou resíduo. Depois disso, a dita seqüência ou o resíduo podem ser retirados (p. ex. por produto químico ou rachadura enzimáticas) para fornecer a seqüência de nucleotídeos da invenção (com esta finalidade, a seqüência ou o resíduo podem ser opcionalmente ligados à seqüência aminoácida da invenção via uma seqüência de linker separável). Alguns exemplos preferidos, mas nâorestritivos de tais resíduos são múltiplos resíduos histidina e resíduos glutatione,
b) pode ser um Resíduo N-terminal Met, por exemplo, como o resultado da expressão em uma célula hospedeira heteróloga ou organismo hospedeiro.
Figure BRPI0609797B1_D0108
148
Figure BRPI0609797B1_D0109
c) pode ser um ou vários resíduos aminoácidos que podem ser munidos de grupos funcionais e/ou foi funcionalizados, em uma maneira conhecida por si. Por exemplo, como é conhecido na técnica, resíduos aminoácidos como lisina e em determinado cisteina levam em conta o anexo de grupos de PEG, que podem mascarar o sítio superficial em uma proteína e portanto, por exemplo, reduzir imunogenicidade, melhorar a meia-vida no plasma e estabilizar-se contra a rachadura proteolítica;
d) aumentar a meia-vida no soro de um Nanobody ou o polipeptidio da invenção. As seqüências de aminoácido que podem ser ligadas a e/ou fundidas com a proteína terapêutica para aumentar a sua meia-vida in vivo são bem sabem à pessoa experimentada e incluem proteína de soro humana ou fragmentos disso (como albumina de soro humana ou uma parte ou fragmento disso), ou até as porções de Fe dos anticorpos (especialmente de anticorpos humanos). Também, como já descrito na presente, uma tal seqüência aminoácida que para aumenta a meia-vida pode ser uma seqüência aminoácida dirigida contra uma proteína de soro, como um Nanobody dirigido contra uma proteína de soro, por exemplo, contra uma albumina de soro humano.
Quanto a pegilação, deve ser observado que geralmente, a invenção também abrange qualquer Nanobody da invenção e/ou o polipeptidio da invenção que foi pegilado em uma ou várias posições aminoácidas, preferivelmente de tal modo que qualquer pegilação preferida (1) aumenta a meia-vida in
149
Figure BRPI0609797B1_D0110
Figure BRPI0609797B1_D0111
vivo; (2) reduz imunogenicidade; (3) fornece uma ou várias novas propriedades benéficas conhecidas por si para pegilação; (4) não afeta essencialmente a afinidade do Nanobody e/ou polipeptídio para vWF (p. ex. não reduz a referida afinidade em mais de 90%, preferivelmente não em mais de 50%, e mais preferivelmente não em mais de 10%, como determinado por um ensaio conveniente, como os descritos nos Exemplos mais adiante); e/ou (4) não afeta nenhuma das outras propriedades desejadas dos nanocorpos e/ou polipeptídios da invenção. Os GRUPOS PEG convenientes e os métodos que para os ligam, especificamente ou nãoespecificamente, serão claros para a pessoa experimentada. Os conjuntos convenientes e os reagentes para tal pegilação, por exemplo, podem ser obtidos de Nektar (CA, os EUA).
Segundo uma modalidade de execução não-restritiva, um ou vários resíduos aminoácidos podem ser acrescentados a, inseridos em e/ou substituídos na seqüência aminoácida de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção, para fornecer um ou vários resíduos aminoácidos específicos para ligação de um grupo PEG.
A invenção também abrange qualquer Nanobody da invenção e/ou o polipeptídio da invenção que foi glicosilado em uma ou várias posições aminoácidas, normalmente dependendo do hospedeira usado para expressar o Nanobody ou o polipeptídio da invenção (conforme adicionalmente descrito mais adiante).
Segundo uma modalidade de execução não-restritiva, um
Figure BRPI0609797B1_D0112
150 ou vários resíduos aminoácidos podem ser acrescentados a, inseridos em e/ou substituídos na seqüência aminoácida de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção, para fornecer um ou vários resíduos aminoácidos específicos e/ou um sítio que pode ser glicosilado pelo organismo hospedeiro usado. Por meio de um exemplo preferencial, mas não-restritivo, o Nresíduo na posição 50 dentro de CDR2 de um Nanobody da invenção, por exemplo, pode ser substituído por um Resíduo Q, D ou S para fornecer um sítio de glicosilação, p. ex.
para glicosilação por Pichia.
Segundo outra modalidade de execução, um polipeptídio da invenção pode compreender a seqüência aminoácida de um Nanobody, que é fundido na sua extremidade terminal amino, na sua extremidade terminal carboxi, ou tanto na sua extremidade terminal amino como na sua extremidade terminal carboxi com pelo menos uma nova seqüência aminoácida.
Novamente, ditas seqüências aminoácidas adicionais podem ou não modificar-se, alterar-se ou de outra maneira influir nas propriedades (biológicas) do Nanobody e podem ou não acrescentar a nova funcionalidade ao Nanobody.
Por exemplo, segundo uma modalidade de execução preferencial, mas não-restritiva, as referidas seqüências aminoácidas adicionais compreendem pelo menos um novo Nanobody, para fornecer um polipeptídio da invenção que compreende pelo menos dois, como três, quatro ou cinco, nanocorpos, nos quais os referidos nanocorpos podem ser opcionalmente ligados via uma ou várias seqüências de
Figure BRPI0609797B1_D0113
151
Figure BRPI0609797B1_D0114
linkers (conforme definido na presente).
Os polipeptídios da invenção que compreendem dois ou mais nanocorpos fazem também mencionado na presente como multivalente polipeptídios., por exemplo, um polipeptídio bivalente da Invenção compreende dois nanocorpos, opcionalmente ligado via uma seqüência de linker, ao passo que um polipeptídio trivalente da invenção compreende três nanocorpos, opcionalmente ligados via duas seqüências de linkers; etc.
Em um polipeptídio multivalente da invenção, dois ou mais nanocorpos podem ser os mesmos ou diferentes. Por exemplo, dois ou mais nanocorpos em um polipeptídio multivalente da invenção:
pode ser dirigido contra o mesmo antígeno, isto é, contra as mesmas partes ou epitopes do referido antígeno ou contra duas ou mais partes diferentes ou epitopes do referido antígeno; e/ou: pode ser dirigido contra os antígenos diferentes;
ou uma combinação disso.
Portanto, um polipeptídio bivalente da invenção por exemplo:
pode compreender dois nanocorpos idênticos;
pode compreender um primeiro Nanobody dirigido contra
uma primeira parte ou epitope de um antígeno e um segundo
25 Nanobody dirigido contra a mesma parte ou epitope do
referido antígeno ou contra outra parte ou epitope do
referido antígeno;
152 ou pode compreender um primeiro Nanobody dirigido contra um primeiro antígeno e um segundo Nanobody dirigido contra um segundo antígeno diferente do primeiro referido antígeno; ao passo que um Polipeptídio trivalente da
Invenção por exemplo:
pode compreender três nanocorpos idênticos ou diferentes dirigidos contra as mesmas partes ou diferentes ou epitopes do mesmo antígeno;
pode compreender dois nanocorpos idênticos ou 10 diferentes dirigidos contra as mesmas partes ou diferentes ou epitopes em um primeiro antígeno e um terceiro Nanobody dirigido contra um segundo antígeno diferente do primeiro referido antígeno; ou pode compreender um primeiro Nanobody dirigido 15 contra um primeiro antígeno, um segundo Nanobody dirigido contra um segundo antígeno diferente do primeiro referido antígeno, e um terceiro Nanobody dirigiu contra um terceiro antígeno diferente do primeiro e segundo referido antígeno, os Polipeptídios da invenção que contêm pelo menos dois nanocorpos, nos quais pelo menos um Nanobody é dirigido contra um primeiro antígeno e pelo menos um Nanobody é dirigido contra um segundo Nanobody diferente do primeiro antígeno, também se mencionará como nanocorpos multiespecífico. Portanto, um biespecífico Nanobody é um
Nanobody que compreende pelo menos um Nanobody dirigido contra um primeiro antígeno e pelo menos um novo Nanobody dirigido contra um segundo antígeno, ao passo que um
Figure BRPI0609797B1_D0115
153 triespecífico Nanobody é um Nanobody que compreende pelo menos um Nanobody dirigido contra um primeiro antigeno, pelo menos um novo Nanobody dirigido contra um segundo antigeno, e pelo menos um novo Nanobody dirigido contra um terceiro antigeno; etc.
Conseqüentemente, na sua forma mais simples, um polipeptídio biespecífico da invenção é um polipeptídio bivalente da invenção (conforme definido na presente), compreendendo um primeiro Nanobody dirigido contra um primeiro antigeno e um segundo Nanobody dirigido contra um segundo antigeno, no qual os referidos primeiro e segundo Nanobody podem ser opcionaimente ligados via uma seqüência de linker (conforme definido na presente); ao passo que um polipeptídio triespecífico da invenção na sua forma mais simples é um polipeptídio trivalente da invenção (conforme definido na presente), compreendendo um primeiro Nanobody dirigido contra um primeiro antigeno, um segundo Nanobody dirigido contra um segundo antigeno e um terceiro Nanobody dirigido contra um terceiro antigeno, no qual os referidos primeiro, segundo e terceiro Nanobody pode ser opcionaimente ligado via uma ou mais, e em particular uma, e mais em particular, duas seqüências de linkers.
Contudo, como ficará claro da descrição mais acima, a invenção não é limitada a isso, no sentido de que um polipeptídio multiespecífico da invenção pode compreender qualquer número de nanocorpos dirigidos contra dois ou mais antígenos diferentes.
Figure BRPI0609797B1_D0116
154
Figure BRPI0609797B1_D0117
Para polipeptídios multivalentes e multiespecíficos que contêm um ou vários domínios VHH e a sua preparação, a referência também é feita a Conrath et al., J. Biol. Chem., volume 276, 10. 7346-7350, bem como a EP 0 822985.
Os Linkers para uso em polipeptídios multivalentes e multiespecíficos serão claros para a pessoa experimentada, e, por exemplo, incluirão gly-ser linkers, por exemplo, do tipo (glyxsery) Z, como (por exemplo, (gly4ser) 3 ou (gly3ser2) 3i como descrito em WO 99/42077, regiões pregadas como as regiões pregadas de anticorpos de cadeias pesadas que ocorrem naturalmente ou seqüências semelhantes. Para outros linkers convenientes, a referência também é feita à fundamentos técnicos gerais citada anteriormente. Alguns em particular preferiram que linkers sejam dados em SEQ ID NO's
15 83 para 85, no qual os linkers de SEQ ID NO's 84 e 85 são em
particular preferidos.
Linkers também podem fornecer um pouco de
funcionalidade para o polipeptídio multivalente ou
multiespecífico. Por exemplo, linkers contendo um ou vários 20 resíduos aminoácidos carregados (ver a Tabela 1 anteriormente) pode prover propriedades hidrofílicas melhoradas, ao passo que linkers que formam ou contêm pequenos epitopes ou etiquetas podem ser usados para os objetivos de detecção, identificação e/ou purificação.
Como também além disso descrito na presente, um polipeptídio multiespecífico da invenção dirigida contra um antígeno desejado e contra pelo menos uma proteína de soro,
Figure BRPI0609797B1_D0118
155
Figure BRPI0609797B1_D0119
como a proteína de soro mencionada a seguir, e especialmente contra uma albumina de soro humano, pode mostrar a meia-vida aumentada no soro, em comparação com o correspondente Nanobody monovalente.
Como mencionado mais acima, os métodos descritos na presente são em particular ajustados para gerando tais polipeptídios multiespecíficos multivalentes da invenção.
Em um polipeptídio da invenção, pelo menos um Nanobody também pode ser ligado a um domínio VH convencional ou a um análogo natural ou sintético de um domínio VH, opcionaimente via uma seqüência de linker.
Em um polipeptídio da invenção, pelo menos um Nanobody também pode ser ligado a um domínio VL ou a um análogo natural ou sintético de um VL domínio, opcionaimente via uma seqüência de linker, para fornecer um polipeptídio da invenção que está na forma análoga a um fragmento scFv convencional, mas conter um Nanobody em vez de um domínio
VH.
Em um polipeptídio da invenção, pelo menos um Nanobody também pode ser ligado a um ou vários de um CHI, CH2 e/ou domínio CH3, opcionaimente via uma seqüência de linker. Por exemplo, um Nanobody ligado a um domínio CHI conveniente, por exemplo, pode ser usado - em conjunto com conveniente as cadeias leves - para gerar fragmentos/estruturas de anticorpo análogos a fragmentos Fab convencionais ou F (ab') 2 fragmentos, mas no qual ou (em caso de um F (ab') 2 fragmento) um ou ambos dos domínios VH convencionais foi
Figure BRPI0609797B1_D0120
156 substituído por um Nanobody. Tais fragmentos também podem ser heteroespecíficos ou biespecífico, isto é, dirigido contra dois ou mais antígenos. Um Nanobody ligado a CH2 conveniente e domínios CH3, por exemplo, derivou de Camelídeos, pode ser usado para formar um anticorpo de cadeia pesada monoespecífico ou biespecífico. Finalmente, um Nanobody ligado a CHI conveniente, CH2 e domínios CH3, por exemplo, derivada de um ser humano, pode ser usado - em conjunto com cadeias leves convenientes - para formar um anticorpo que é análogo a um anticorpo de 4 cadeias convencional, mas no qual ou ambos dos domínios VH convencionais foram substituídos por um Nanobody.
Também, além de um ou vários nanocorpos, os Polipeptídios da Invenção também podem conter grupos funcionais, metades ou resíduos, por exemplo, substâncias terapeuticamente ativas, como os mencionados mais adiante, e/ou marcadores ou etiquetas, como marcadores fluorescentes, isótopos, etc., conforme adicionalmente descrito a seguir.
nanocorpos da invenção, os polipeptídios da invenção, e ácidos nucléicos que codificam o mesmo, pode estar preparado em uma maneira conhecida por si, ou estará claro para a pessoa experimentada da nova descrição na presente. Alguns os métodos preferidos, mas não-restritivos que para preparam nanocorpos, polipeptídios e ácidos nucléicos incluem os métodos e técnicas acima mencionadas e/ou novas descreveram a seguir.
Como estará claro para a pessoa experimentada, um
157 método especialmente útil para preparar um Nanobody e/ou um polipeptídio da invenção geralmente compreende os passos de
- a expressão, em uma célula hospedeira conveniente ou organismo hospedeiro (também mencionada na presente como um hospedeiro da invenção) ou em outro sistema de expressão conveniente de um ácido nucléico que codifica os referidos Nanobody ou o polipeptídio da invenção (também mencionada na presente como um ácido nucléico da invenção), opcionalmente seguido por :
isolação e/ou purificação do Nanobody ou polipeptídio da invenção portanto obtido.
Especialmente, tal método pode compreender os passos de
- a cultivação e/ou a manutenção de um hospedeiro da invenção em condições que são tais que a referida hospedeira da invenção expressa e/ou produz pelo menos um Nanobody e/ou o polipeptídio da invenção; opcionalmente seguido por :
isolação e/ou purificação do Nanobody ou polipeptídio da invenção portanto obtido.
Um ácido nucléico da invenção pode ser na forma de ADN ou ARN de trançado simples ou duplo, e é preferivelmente na forma do ADN de trançado duplo. Por exemplo, as seqüências de nucleotídeos da invenção podem ser ADN genômico, cDNA ou o ADN sintético (como ADN com um uso de codon que foi especificamente adaptado para expressão na célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro).
158
Segundo uma modalidade de execução da invenção, o ácido nucléico da invenção está em essencialmente isolado de, conforme definido acima.
ácido nucléico da invenção também pode ser na forma de, estar presente em e/ou ser parte de um vetor, como, por exemplo, um plasmídeo, cosmídeo ou YAC, que novamente pode estar na forma essencialmente isolada.
Os ácidos nucléicos da invenção podem estar preparados ou obtidos em uma maneira conhecida por si, baseado na informação nas seqüências aminoácidas para os polipeptídios da invenção dada na presente, e/ou ser isolados de uma fonte natural conveniente. Para fornecer análogos, seqüências de nucleotídeos que codificam domínios de VHH que ocorrem naturalmente, por exemplo, podem ser submetidos a mutagenese direcionada a local, de modo a fornecer um ácido nucléico da invenção que codifica os referidos análogos. Também, como estará claro para a pessoa experimentada, preparar um ácido nucléico da invenção, também várias seqüências de nucleotídeos, como pelo menos uma seqüência de nucleotídeos que codifica Nanobody e ácidos, por exemplo, nucléicos que codificam um ou vários linkers podem ser ligadas em conjunto em uma maneira conveniente.
As técnicas para gerar os ácidos nucléicos da invenção serão claras à pessoa experimentada e podem incluir por exemplo, mas não são limitadas a, síntese de ADN automatizada; mutagenese direcionada a local; a combinação de duas ou mais seqüências que ocorrem naturalmente e/ou
159 sintéticas (ou dois ou mais partes das mesmas), a introdução de mutações que levam à expressão de um produto de expressão truncado; a introdução de um ou vários sítios de restrição (p. ex. para criar cassetes e/ou regiões que podem ser facilmente digeridas e/ou ligadas utilizando enzimas de restrição convenientes) , e/ou a introdução de mutações por meio de uma reação PCR que usa um ou vários escorvadores mal combinados, usando, por exemplo, uma seqüência de uma GPCR de ocorrência natural como um padrão. Estas e outras técnicas serão claras à pessoa experimentada, e a referência é novamente feita aos manuais padrão, como Sambrook. e Ausubel et al., acima mencionado, bem como os Exemplos mais adiante.
ácido nucléico da invenção também pode ser na forma de, estar presente em e/ou ser parte de um construto genético, como estará claro para a pessoa experimentada na técnica. Tais construtos genéticos geralmente compreendem pelo menos um ácido nucléico da invenção que é opcionalmente ligada a um ou vários elementos de construto genético conhecido por si, como, por exemplo, um ou vários elementos reguladores convenientes (como um promotor(es) conveniente, realçador(es), exterminador(es), etc.) e os novos elementos dos construtos genéticos mencionados a seguir. Tais construtos genéticos compreendendo pelo menos um ácido nucléico da invenção também serão referidos na presente como construto genético da invenção.
construto genético da invenção pode ser ADN ou o
160 tW
ARN, e são o ADN preferivelmente de trançado duplo. 0 construto genético da invenção também pode estar em uma forma conveniente para a transformação da célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro, em uma forma conveniente para integração no ADN genômico da célula hospedeira desejada ou em uma forma de réplica independente conveniente, manutenção e/ou herança no organismo hospedeiro desejado. Por exemplo, o construto genético da invenção pode ser na forma de um vetor, como, por exemplo, um plasmídeo, cosmídeo, YAC, um vetor viral ou transposon. Especialmente, o vetor pode ser um vetor de expressão, isto é, um vetor que pode prover a expressão in vitro e/ou in vivo (p. ex. em uma célula hospedeira conveniente, organismo hospedeiro e/ou sistema de expressão).
Em uma modalidade de execução preferencial mas nãorestritiva, um construto genético da invenção compreende
a) pelo menos um ácido nucléico da invenção; operavelmente conectado a
b) um ou vários elementos reguladores, como um promotor e opcionaimente um exterminadores conveniente;
c) e opcionaimente também
d) um ou vários novos elementos dos construtos genéticos conhecido por si;
no qual os termos elemento regulador, o promotor, exterminadores e operavelmente conectado tem a sua significação habitual na técnica (conforme adicionalmente descrito mais adiante); e no qual os referidos novos
161 /8l elementos ο presente no construto genético, por exemplo,
pode ser 3' -ou 5 seqüências ' -UTR, seqüências de líder,
marcadores de seleção, genes de marcadores/repórter de
expressão, e/ou elementos que podem facilitar ou aumentar (a
eficiência de) a transformação ou a integração. Estes e
outros elementos convenientes para tal construto genético ficará claro para a pessoa experimentada, e pode depender, por exemplo, do tipo de construto usado, a célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro; a maneira na qual as seqüências de nucleotídeos da invenção do interesse devem ser expressas (p. ex. via a expressão constitutiva, transiente ou induzível); e/ou a técnica de transformação a ser usada.
Preferivelmente, no construto genético da invenção, os referidos pelo menos um ácido nucléico da invenção e os referidos elementos reguladores, e opcionalmente os referidos um ou vários novos elementos, são operavelmente ligados um a outro, pelo qual geralmente quer dizer que eles estão em uma relação funcional um com outro. Por exemplo, um promotor é considerado operavelmente ligado a uma seqüência de codificação se o referido promotor for capaz de iniciar ou controlar/regular de outra maneira a transcrição e/ou a expressão de uma seqüência de codificação (no qual os referidos codificação de seqüência deve ser entendido como sendo no controle de 1 os referidos promotor). Geralmente, quando duas seqüências de nucleotídeos são operavelmente ligado, eles estarão na mesma
162 orientação e normalmente também na mesma armação de leitura. Eles também serão normalmente essencialmente contíguos, embora isto também não possa ser requerido.
Preferivelmente, os elementos reguladores e novos dos construtos genéticos da invenção são tais que eles são capazes de fornecer a sua função biológica desejada na célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro.
Por exemplo, um promotor, realçador ou exterminadores deve ser operável na célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro, pelo qual se quer dizer que (por exemplo) o referido promotor deve ser capaz da iniciação ou de outra maneira controlar/regular a transcrição e/ou a expressão de uma seqüência de nucleotídeos - p. ex. uma seqüência de codificação - ao qual ele está operavelmente ligado (conforme definido na presente).
Alguns promotores em particular preferenciais incluem, mas não são limitados a, promotores conhecidos por si para a expressão em células bacterianas, como as mencionadas a seguir e/ou os usados nos Exemplos.
Um marcador de seleção deve ser tal que permita - isto é, em condições de seleção apropriadas - células hospedeiras e/ou organismos hospedeiros que foram (com sucesso) transformadas com a seqüência de nucleotídeos da invenção a ser distinguida de células/organismos hospedeiros que não foram (com sucesso) transformados. Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos de tais marcadores são genes que fornecem a resistência contra antibióticos (como
163 canamicina ou ampicilina), genes que proveem resistência à temperatura, ou genes que permitem a célula hospedeira ou organismo hospedeiro a serem mantidos na ausência de certos fatores, compostos e/ou componentes (alimentares) no meio que são essenciais para a sobrevivência das células nãotransformadas ou organismos.
Uma seqüência líder deve ser tal que - na célula hospedeira desejada ou organismo hospedeiro - ela leva em conta as modificações pós-translação desejadas e/ou tal que ela dirige o mRNA transcrito a uma parte desejada ou organela de uma célula. Uma seqüência líder também pode levar em conta a secreção do produto de expressão da referida célula. Como tal, a seqüência líder pode ser alguma pro-, pre, ou a prepro-seqüência operável na célula hospedeira ou organismo hospedeiro. As seqüências de líder não podem ser requeridas para expressão em uma célula bacteriana.
Um marcador de expressão ou o gene de repórter devem ser tais que - na célula hospedeira ou organismo hospedeiro
- ele leva em conta a detecção da expressão (de um gene ou seqüência de nucleotídeos presente em) os construtos genéticos. Um marcador de expressão também pode levar em . conta opcionalmente a localização do produto expresso, p. ex. em uma parte específica ou organela de uma célula e/ou em célula(s) específica (a), tecido(s), órgão (es) ou parte (s) de um organismo multicelular. Tais genes de repórter também podem ser expressos como uma fusão de
164 proteína com a seqüência aminoácida da invenção. Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos incluem a proteína fluorescente como GFP.
Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos dos 5 promotores convenientes, exterminadores e novos elementos incluem os usados nos Exemplos mais adiante. Para alguns (novos) exemplos não-restritivos dos promotores, marcadores de seleção, seqüências de líder, marcadores de expressão e novos elementos que podem ser apresentados/usados no construto genético da invenção - como exterminadores, realçadores transcricionais e/ou de translação e/ou fatores de integração - é feita referência aos manuais gerais como Sambrook. e Ausubel acima mencionados, bem como aos exemplos que são dados em WO 95/07463, WO 96/23810, WO 95/07463, WO
95/21191, WO 97/11094, WO 97/42320, WO 98/06737, WO
98/21355, os US-A-6, 207, 410, US - - 5, 693,492 e EP 1085089. Outros exemplos serão claros para a pessoa experimentada. A referência também é feita à fundamentos técnicos gerais citados anteriormente e as novas referências citadas a seguir.
construto genético da invenção pode ser geralmente fornecido por apropriadamente ligando a seqüência(s) nucleotídeos da invenção a um ou vários novos elementos descritos anteriormente, por exemplo, usando as técnicas descritas nos manuais gerais como Sambrook. e Ausubel et al., acima mencionado.
Freqüentemente, o construto genético da invenção será
165 obtido inserindo uma seqüência de nucleotídeos da invenção em um vetor conveniente (expressão) conhecido por si. Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos dos vetores de expressão convenientes são os usados nos Exemplos mais adiante, bem como os mencionados mais adiante.
Os ácidos nucléicos da invenção e/ou o construto genético da invenção pode seja usado para transformar uma célula hospedeira ou o organismo hospedeiro, isto é, para expressão e/ou produção de o
Nanobody ou polipeptidio da invenção. Os anfitriões convenientes ou as células hospedeiras serão claros para a pessoa experimentada, e, por exemplo, podem ser convenientes fungoso, procariótica ou a célula eucariótica ou linha de célula ou algum conveniente fungoso, procariótica ou organismo eucariótico, por exemplo:
- uma classe bacteriana, inclusive, mas não limitado a, classes negativas de grama como classes de Escherichia coli; de Proteus, por exemplo, de Proteus mirabilis; de Pseudomonas, por exemplo, de Pseudomonas fluorescens; e classes positivas de grama como classes de Bacillus, por exemplo, de Bacillus subtilis ou de Bacillus brevis; de Streptomyces, por exemplo, de Streptomyces lividans; de Estafilococo, por exemplo, de Estafilococo carnosus; e de Lactococcus, por exemplo, de Lactococcus lactis;
- uma célula fungosa, inclusive, mas não limitado a, células de espécie de Trichoderma, por exemplo, de
166 /è/b
Trichoderma reesei; de Neurospora, por exemplo, de Neurospora crassa; de Sordaria, por exemplo, de Sordaria macrospora; de Aspergillus, por exemplo, do Niger Aspergillus ou de Aspergillus sojae; ou de outros fungos filamentosos;
uma célula de levedura, inclusive, mas não limitado a, células de espécie de Saccharomyces, por exemplo, de Saccharomyces cerevisiae; de Schizosaccharomyces, por exemplo, de Schizosaccharomyces pombe; de Pichia, por exemplo, de Pichia pastoris ou de Pichia methanolica; de Hansenula, por exemplo, de Hansenula polymorpha; de Kluyveromyces, por exemplo, de Kluyveromyces lactis; de Arxula, por exemplo, de Arxula adeninivorans; de Yarrowia, por exemplo, de Yarrowia lipolytica;
uma linha de célula ou célula anfíbia, como Xenopus oocytes;
uma linha de célula ou célula derivada por inseto, como linhas de células/célula derivadas de lepidoptera, inclusive mas não limitado a Spodoptera SF9 e células Sf21 ou as linhas de células/célula derivadas de Drosophila, como Schneider e células Kc;
uma planta ou célula de planta, por exemplo, em
plantas de fumo; e/ou
uma linha de célula ou célula de mamífero, por
exemplo, derivada de uma linha de célula ou célula derivada
de um ser humano, de mamíferos inclusive mas não limitado a
CHO-células, BHK-células (por exemplo, células de BHK-21) e
Figure BRPI0609797B1_D0121
167 células humanas ou linhas de célula como HeLa, COS (por exemplo, COS 7) e PER C6 células;
bem como todos outros anfitriões ou células hospedeiras conhecidas por si para a expressão e a produção de anticorpos e fragmentos de anticorpo (inclusive, mas não limitado a, anticorpos de domínio (únicos) e fragmentos ScFv), o que ficará claro para a pessoa experimentada. A referência também é feita à fundamentos técnicos gerais citados mais acima, bem como a, por exemplo, WO 94/29457; WO 96/34103; WO 99/42077; Frenken et al., (1998), supra; Riechmann e Muyldermans, (1999), supra; perua der Tília, (2000), supra; Thomassen et al., (2002), supra; Joosten et al., (2003), supra; Joosten et al., (2005), supra; e as novas referências citadas na presente.
nanocorpos e os polipeptídios da invenção também podem ser apresentados e expressos em uma ou várias células, tecidos ou órgãos de um organismo multicelular, por exemplo, para objetivos profiláticos e/ou terapêuticos (p. ex. como uma terapia genética). Com esta finalidade, as seqüências de nucleotídeos da invenção podem ser introduzidas nas células ou tecidos de qualquer modo conveniente, por exemplo, como tal (p. ex. utilização de lipossomas) ou depois que eles foram inseridos em um vetor de terapia genético conveniente (por exemplo, derivados de retroviruses como adenovirus, ou parvoviruses como vírus adeno-associado). Como também ficará claro para a pessoa experimentada, tal terapia genética pode ser executada in vivo e/ou em situ no corpo de um paciente
Figure BRPI0609797B1_D0122
168 administrando um ácido nucléico da invenção ou um vetor de terapia genético conveniente codificando o mesmo ao paciente ou a células específicas ou um tecido específico ou órgão do paciente; ou as células convenientes (freqüentemente tomado do corpo do paciente a ser tratado, como linfocitos explantados, aspirados do tutano dos ossos ou biópsias de tecido) podem ser tratadas in vitro com uma seqüência de nucleotídeos da invenção e logo ser apropriadamente (re) introduzidas no corpo do paciente. Tudo isso pode ser executado usando vetores de terapia genéticos, técnicas e sistemas de entrega que são bem conhecidos à pessoa experimentada, para Culver, K. W., Terapia Genética, 1994, p. xii, Mary Ann Liebert, Inc., Publishers, Nova York,N.Y.). Giordano, Nature F Medicine 2 (1996), 534-539; Schaper,
Circ. Res. 79 (1996), 911-919; Anderson, Ciência 256 (1992), 808-813; Verma, Nature 389 (1994), 239; Isner, Lanceta 348 (1996), 370-374; Muhlhauser, Circ. Res. 77 (1995), 10771086; Onodera, Sangue 91; (1998), 30-36; Verma, Gene Ther. 5 (1998), 692-699; Nabel, Ann. N.Y. Acad. Jogo.: 811 (1997),
289-292; Verzeletti, Hum. Gene Ther. 9 (1998), 2243-51;
Wang, Nature Medicine 2 (1996), 714-716; WO 94/29469; WO
97/00957, US 5,580,859; os 1 US 5,5895466; ou Schaper, Current Opinion in Biotechnology 7 (1996), 63 5-640. Por exemplo, expressão in situ de fragmentos ScFv (Afanasieva et al., Gene Ther., 10, 1850-1859 (2003)) e de diabodies (Blanco et al., J. O Immunol, 171, 1070-1077 (2003)) foi descrito na técnica.
Figure BRPI0609797B1_D0123
169
Para a expressão dos nanocorpos em uma célula, eles também podem ser expressos como assim chamados ou como os assim chamados intracorpos, como, por exemplo, descrito em WO 94/02610, WO 95/22618 e USA 7004940; WO 03/014960; em Cattaneo, A. e Biocca, S. (1997) Intracellular Antibodies: Development and Applications. Landes e Springer-Verlag; e em Kontermann, Methods 34, (2004), 163-170.
Para a produção, os nanocorpos e os polipeptídios da invenção, por exemplo, também podem ser produzidos no leite de mamíferos transgênicos, por exemplo, no leite de coelhos, vacas, cabras ou ovelhas (ver, por exemplo, os US-A6,741,957, os US-A-6,304,489 e US-A-6,849,992 para técnicas gerais para introduzir transgenes em mamíferos), em plantas ou partes de plantas inclusive mas não limitado às suas folhas, flores, frutos, semente, raízes ou tubérculos (por exemplo, em fumo, milho, feijão-soja ou alfafa) ou em, por exemplo, pupas do bicho da seda Bombix mori.
Além disso, os nanocorpos e os polipeptídios da invenção também podem ser expressos e/ou produzidos em sistemas de expressão sem célula, e os exemplos convenientes de tais sistemas serão claros para a pessoa experimentada. Alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos incluem a expressão no sistema de germe de trigo; em reticulocite lysates em coelhos; ou no S, coli Zubay sistema.
Conforme acima mencionado, uma das vantagens do uso de nanocorpos é que os polipeptídios baseados neles podem estar preparados através de expressão em um sistema bacteriano
170
Figure BRPI0609797B1_D0124
conveniente, e os sistemas de expressão bacterianos convenientes, os vetores, as células hospedeiras, os elementos reguladores, etc., serão claros para a pessoa experimentada, por exemplo, das referências citadas anteriormente. Deve contudo ser observado que a invenção no seu sentido mais amplo não é limitada à expressão em sistemas bacterianos.
Preferivelmente, na invenção, um (em vivo ou em vitro) sistema de expressão, como um sistema de expressão bacteriano, é usado que fornece os polipeptídios da invenção em uma forma que é conveniente para uso farmacêutico, e tais sistemas de expressão serão novamente claros para a pessoa experimentada. Como também ficará claro para a pessoa experimentada, os Polipeptídios da invenção convenientes para uso farmacêutico podem ser preparados usando técnicas para síntese de peptídeo.
Para produção em escala industrial, anfitriões heterólogos preferidos para a produção (industrial) de nanocorpos ou proteína terapêutica que contém Nanobody inclui classes de E. coli, Pichia pastoris, S. cerevisiae que são convenientes para expressão/produção/fermentação em grande escala, e especialmente para expressão/produção/fermentação farmacêutica em grande escala. Os exemplos convenientes de tais classes serão claros para a pessoa experimentada. Tais classes e os sistemas de produção/expressão também são postos à disposição por companhias como Biovitrum (Úpsala, Suécia) .
Figure BRPI0609797B1_D0125
171
Alternativamente, as linhas de célula de mamíferos, em determinadas células dos ovários de hamster chinês (CHO), podem ser usadas para expressão/produção/fermentação em grande escala, e especialmente para expressão/produçào/fermentaçào farmacêutica em grande escala. Novamente, tais sistemas de expressão/produção também são postos à disposição por algumas companhias acima mencionadas.
A escolha do sistema de expressão específico dependería em parte do requisito para certas modificações pós-translação, mais especificamente glicosilação. A produção de uma proteína recombinante que contenha Nanobody para a qual a glicosilação é desejada ou requerida exigiría o uso de anfitriões de expressão mamíferos que têm a capacidade de glicosilar a proteína expressa. Neste aspecto, estará claro para a pessoa experimentada que o modelo de glicosilação obtido (isto é, a espécie, número e posição de resíduos ligados) dependerá da linha de célula ou célula que é usada para a expressão. Preferivelmente, uma linha de célula ou célula humana é usada (isto é, levar a uma proteína que essencialmente tem um modelo da glicosilação humana) ou outra linha de célula de mamífero é usada que pode fornecer um modelo de glicosilação que é essencialmente e/ou funcionalmente o mesmo como glicosilação humana ou pelo menos imita glicosilação humana. Geralmente, anfitriões procarióticos como E. coli não têm a capacidade de glicosilar proteína, e o uso de eucariotes inferiores como
Figure BRPI0609797B1_D0126
172 levedura que normalmente leva a um modelo de glicosilação que se diferencia da glicosilação humana. Sem embargo, deve ser entendido que todas as células hospedeiras precedentes e os sistemas de expressão podem ser usados na invenção, dependendo do Nanobody desejado ou proteína a ser obtida.
Portanto, segundo uma modalidade de execução nãorestritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é glicosilado. Segundo outra modalidade de execução não-restritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é não-glicosilado.
Segundo uma modalidade de execução preferencial, mas não-restritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é produzido em uma célula bacteriana, especialmente uma célula bacteriana conveniente para produção farmacêutica em grande escala, como as células das classes acima mencionadas.
Segundo outra modalidade de execução preferida, mas não-restritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é produzido em uma célula de levedura, especialmente uma célula de levedura conveniente para produção farmacêutica em grande escala, como as células da espécie acima mencionada.
Segundo ainda outra modalidade de execução preferida, mas não-restritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é produzido em uma célula de mamífero, especialmente em uma célula humana ou em uma célula de uma linha de célula humana, e mais especialmente em uma célula
Figure BRPI0609797B1_D0127
173 humana ou em uma célula de uma linha de célula humana que é conveniente a para produção farmacêutica em grande escala, como as linhas de célula mencionadas mais acima.
Quando a expressão em uma célula hospedeira é usada para produzir os nanocorpos e a proteína da invenção, os nanocorpos e a proteína da invenção podem ser produzidos intracelularmente (p. ex. no cytosol, no periplasma ou em corpos de inclusão) e logo isolados das células hospedeiras e opcionaimente além disso purificados; ou podem ser produzidos extracelularmente (p. ex. no meio no qual as células hospedeiras são cultivadas) e logo isolados do meio de cultura e opcionaimente além disso purificados. Quando as células hospedeiras eucarióticas são usadas, a produção extracelular é normalmente preferida desde que isto consideravelmente facilita a nova isolaçâo e processamento posterior dos nanocorpos e proteína obtida. As células bacterianas como as classes de E. coli acima mencionadas normalmente não segregam a proteína extracelularmente, exceto algumas classes da proteína como toxinas e hemolisina, e produção secretórios em Ε. o coli refere-se à deslocamento da proteína através da membrana interior ao espaço periplásmico. A produção de Periplásmico fornece várias vantagens por cima da produção citosólica. Por exemplo, o Nterminal amino a seqüência ácida do produto segregado pode ser idêntico ao produto genético natural depois da rachadura da seqüência de sinal de secreção por um sinal específico peptidase. Também, parece haver muito menos
Figure BRPI0609797B1_D0128
174 atividade de protease no periplasma do que no citoplasma. Além do mais, a purificação de proteína é mais simples devido a menos proteína de contaminação no periplasma. Outra vantagem é que as ligações bissulfeto corretas podem formarse porque o periplasma fornece mais ambiente oxidativo do que o citoplasma. A proteína sobreexpressada em E. coli freqüentemente é encontrada em agregados insolúveis, assim chamados corpos de inclusão. Esses corpos de inclusão podem ser localizados no cytosol ou no periplasma; a recuperação da proteína biologicamente ativa desses corpos de inclusão requer um processo de denaturação/repregado. Muita proteína recombinante, inclusive a proteína terapêutica, é recuperada de corpos de inclusão. Alternativamente, como estará claro para a pessoa experimentada, classes recombinantes de bactérias que foram geneticamente modificadas para segregar uma proteína desejada, e especialmente um Nanobody ou um polipeptídio da invenção, pode ser usado.
Portanto, segundo uma modalidade de execução nãorestritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é um Nanobody ou o polipeptídio que foi produzido intracelularmente e foi isolado da célula hospedeira, e especialmente de uma célula bacteriana ou de um corpo de inclusão em uma célula bacteriana. Segundo outra modalidade de execução não-restritiva da invenção, o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é um Nanobody ou o polipeptídio que foi produzido extracelularmente, e foi isolado do meio no qual a célula hospedeira é cultivada.
Figure BRPI0609797B1_D0129
175
Alguns promotores preferidos, mas não-restritivos para uso com essas células hospedeiras incluem,
- para expressão em E. coli: promotor de lac (e derivados disso como o promotor lacUV5); promotor de arabinose; deixado - (PL) e para a direita (PR) promotor de lambda fago; promotor do trp operon; híbrido lac/trp promotores (tac e trc); T7-promotor (mais especificamente que de 10 genéticos T7-fago) e outros promotores T-fago; promotor do Tn 10 gene de resistência tetraciclina; as variantes projetadas dos promotores acima mencionados que incluem uma ou várias cópias de uma seqüência de operador reguladora estranha;
- para expressão em S. cerevisiae: constitutivo: ADH1 (álcool dehidrogenase 1) , ENO (enolase), CYC1 (citocromo c iso-1), GAPDH (gliceraldeidos-3-fosfato dehidrogenase); PGK1 (fosfoglicerato quinase), PYK1 (piruvato quinase); regulado: GAL 1,10,7 (galactose enzimas metabólicas), ADH2 (álcool dehidrogenase 2), PHO5 (ácido fosfatase), XÍCARA I (cobre metalotioneina); heterólogo: CaMV (promotor de 35 de vírus de mosaico de couve-flor);
para expressão em Pichia pastoris: o promotor AOXI (álcool oxidase I) para expressão em células de mamíferos: citomegalovirus humano (hCMV) primeiro realçador/promotor imediato; citomegalovirus humano (hCMV) primeira variante de promotor imediata que contém duas seqüências de operador tetraciclina tal que o promotor pode ser regulado pelo Tet
Figure BRPI0609797B1_D0130
176 repressor; Herpes Vírus de Simplex timidina quinase (TK) promotor; Vírus de Sarcoma de Rous repetição terminal longa (RSV LTR) realçador/promotor; fator de alongamento la (hEFla) promotor de ser humano, chimpanzé, rato ou camundongo; o SV40 primeiro promotor; HIV-1 promotor de repetição terminal longo; (promotor 3-actin;
Alguns que os vetores preferidos, mas nâo-restritivos para uso com essas células hospedeiras incluem:
- vetores para expressão em células de mamíferos: pMAMneo (Clontech), pcDNA3 (Invitrogen), pMClneo (Stratagene), pSG5 (Stratagene), EBO-pSV2-neo (ATCC 37593), pBPV-1 (8-2) (ATCC 37110), pdBPV-MMTneo (342-12) (ATCC 37224), pRSVgpt (ATCC37199), pRSVneo (ATCC37198), pSV2-dhfr (ATCC 37146), pUCTag (ATCC 37460) e 1ZD35 (ATCC 37565), bem como sistemas de expressão virais, como aqueles baseados em adenovirus;
vetores para expressão em células bacteriais: vetores de estimação (Novagen) e vetores pQE (Qiagen);
vetores para expressão em levedura ou outras células fungosas: pYES2 (Invitrogen) e vetores de expressão Pichia (Invitrogen);
vetores para expressão em células de inseto: pBlueBacII (Invitrogen) e outros vetores baculovirus
- vetores para expressão em plantas ou células de planta:, por exemplo, os vetores baseados em vírus de mosaico de couve-flor ou vírus de mosaico de fumo, as classes convenientes do Agrobacterium, ou Vetores baseados
Figure BRPI0609797B1_D0131
177 em Ti-plasmídeo.
Algumas seqüências secretoras preferidas, mas nãolimitadas para uso com essas células hospedeiras incluem:
para uso em células bacterianas como E. coli: PelB, Bla, OmpA, OmpC, OmpF, OmpT, Stll, PhoA, PhoE, MalE, Lpp, LamB, e assim por diante; BILRE peptideo de sinal, hemolisina C sinal de secreção terminal para uso em levedura: acasalando prepro-seqüência de fator, fosfatase (phol), invertase (Suc), etc.;
para uso em células de mamíferos: o sinal nativo em caso de que a proteína objetivo seja de origem eucariótica; os murinos Ig de K-cadeia V-J2-C transmitem o peptideo; etc.
As técnicas convenientes que para transformar uma célula hospedeira ou hospedeiro da invenção serão claras à pessoa experimentada e podem depender do organismo hospedeiro/ célula hospedeira desejado e os construtos genéticos a serem usados. A referência é novamente feita aos manuais e pedidos de patentes acima mencionados.
Depois da transformação, um passo para detectar e selecionar aquelas células hospedeiras ou organismos hospedeiros que foram com sucesso transformados com a seqüência de nucleotídeos / construto genético da invenção pode ser executado. Isto pode ser, por exemplo, um passo de seleção baseado em um marcador selecionável presente no construto genético da invenção ou um passo que implica a detecção da seqüência aminoácida da invenção, p. ex. usando
Figure BRPI0609797B1_D0132
178 anticorpos específicos.
A célula hospedeira transformada (que pode estar na forma ou uma linha de célula estável) ou organismos hospedeiros (que pode ser na forma de uma linha ou classe mutante estável) formam novos aspectos da presente invenção.
Preferivelmente, essas células hospedeiras ou os organismos hospedeiros são tais que eles expressam, ou são (pelo menos) capazes de expressar (p. ex. em condições convenientes), uma seqüência aminoácida da invenção (e em caso de um organismo hospedeiro: em pelo menos uma célula, parte, tecido ou órgão disso). A invenção também inclui novas gerações, progênie e/ou descendência da célula hospedeira ou o organismo hospedeiro da invenção, que pode ser, por exemplo, obtida pela divisão de célula ou pela reprodução sexual ou assexual.
Produzir/obter a expressão das seqüências aminoácidas da invenção, a célula hospedeira transformada ou o organismo hospedeiro transformado podem ser geralmente guardados, mantidos e/ou cultivados em condições tais que a seqüência aminoácida (desejada) da invenção é expressada/produzida. As condições convenientes serão claras à pessoa experimentada e dependerão normalmente do organismo hospedeiro/ célula hospedeira usado, bem como dos elementos reguladores que controlam a expressão da seqüência de nucleotídeos (relevante) da invenção. Novamente, é feita referência aos manuais e pedidos de patentes acima mencionados nos
Figure BRPI0609797B1_D0133
179 parágrafos no construto genético da invenção.
Geralmente, as condições convenientes podem incluir o uso de um meio conveniente, a presença de uma fonte conveniente de nutrimentos alimentares e/ou convenientes, o uso de uma temperatura conveniente, e opcionalmente a presença de um fator de indução ou composto conveniente (p. ex. quando as seqüências de nucleotídeos da invenção estão sob o controle de um promotor induzível); todos os quais podem ser selecionados pela pessoa experimentada. Novamente, em tais condições, as seqüências aminoácidas da invenção podem ser expressas em uma maneira constitutiva, de uma maneira transiente, ou só quando apropriadamente induzido.
Também estará claro para a pessoa experimentada que a seqüência aminoácida da invenção pode ser (primeiro) gerada em uma forma imatura (como acima mencionado), que então pode ser submetida à modificação pós-translação, dependendo do organismo hospedeiro/ célula hospedeira usado. Também, a seqüência aminoácida da invenção pode ser glicosilada, novamente dependendo do organismo hospedeiro/ célula hospedeira usado.
A seqüência aminoácida da invenção então pode ser isolada do organismo hospedeiro/ célula hospedeira e/ou do meio no qual os referidos célula hospedeira ou organismo hospedeiro foram cultivados, usando isolação de proteína e/ou técnicas de purificação conhecidas por si, como cromatografia (preparativo) e/ou técnicas de eletroforese, técnicas de precipitação diferenciais, técnicas de afinidade
Figure BRPI0609797B1_D0134
180 opcionalmente (p. ex. usando uma seqüência aminoácida específica, separável fundida com a seqüência aminoácida da invenção) e/ou técnicas imunológicas preparativas (isto é, usando anticorpos contra a seqüência aminoácida a ser isolada).
Geralmente, para uso farmacêutico, os polipeptídios da invenção podem ser formulados como uma preparação farmacêutica que compreende pelo menos um polipeptídio da invenção e pelo menos uma transportadora farmaceuticamente aceitável, diluente ou excipiente e/ou adjuvante, e um ou vários polipeptídios novos farmaceuticamente ativos e/ou compostos. Por meio de exemplos não-restritivos, tal formulação pode estar em uma forma conveniente para administração oral, para administração parenteral (como por injeção intravenosa, intramuscular ou subcutânea ou infusão intravenosa), para administração tópica, para administração pela inalação, por um adesivo na pele, por um implante, por um supositório, etc... Tais formas de administração convenientes - que pode ser sólido, semi-sólido ou líquido, dependendo da maneira de administração - bem como métodos e transportadoras para uso na preparação disso, serão claras à pessoa experimentada, e são além disso descritas a seguir.
Portanto, em um novo aspecto, a invenção refere-se a uma composição farmacêutica que contém pelo menos um Nanobody da invenção ou pelo menos um polipeptídio da invenção e pelo menos uma transportadora conveniente (isto é, uma transportadora conveniente para uso veterinário), e
Figure BRPI0609797B1_D0135
181 opcionalmente uma ou várias novas substâncias ativas.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio a compreensão:
pelo menos um Nanobody da invenção, isto é, dirigido contra algum de vWF, vWF domínio de Al, domínio de Al de vWF ativado, vWF A3 domínio.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio conforme descrito acima, em que o Nanobody da invenção dirigida contra o domínio de Al de vWF ativado especificamente reconhece a conformação vWF ativada no sítio da formação trombo mas não liga à circulação das formas não ativadas do vWF.
O nanocorpos da invenção também pode ser dirigido contra um fragmento de vWF, vWF Al domínio, o domínio de Al de vWF ativado, vWF A3 domínio, como um fragmento capaz de eliciar uma resposta imune. Um objetivo é também um fragmento de vWF, vWF domínio de Al, o domínio de Al de vWF ativado, vWF A3 domínio, capaz da ligação a um Nanobody da invenção levantado contra o objetivo de comprimento completo 'de pais'.
Um fragmento conforme usado na presente refere-se a menos de 100% da seqüência (p. ex., 99%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10% etc.), mas compreendendo 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 ou mais aminoácidos. Um fragmento é do comprimento suficiente tal que a interação do interesse é mantida com a afinidade de 1 10-6 M x ou melhor.
182
2χ>7
Um fragmento conforme usado na presente também se refere a inserções opcionais, as eliminações e as substituições de um ou vários aminoácidos que não alteram substancialmente a capacidade do objetivo de ligar a um Nanobody da invenção levantaram contra o objetivo de tipo natural. 0 número de eliminações de inserções aminoácidas ou substituições está à altura preferivelmente 1, 2, 3, 4, 5,
6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,
22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36,
37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51,
52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66,
67, 68, 69 ou 70 aminoácidos.
Um Nanobody da invenção dirigida contra um objetivo geralmente significa Nanobody da invenção que é capaz da ligação ao seu objetivo com uma afinidade de melhor do que
10-6 M.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio conforme descrito acima em que pelo menos um Nanobody da invenção é uma seqüência humanizada.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio conforme descrito acima em que pelo menos um Nanobody da invenção é um Camelidae VHH anticorpo.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio conforme descrito acima, em que o referido Nanobody da invenção é uma seqüência homóloga, uma
Figure BRPI0609797B1_D0136
183 porção funcional, ou uma porção funcional de uma seqüência homóloga de nanobody de o comprimento completo da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptidio conforme descrito acima, em que os referidos que construtos de polipeptidios é uma seqüência homóloga do referido construto polipeptidio, uma porção funcional disso, de uma seqüência homóloga de uma porção funcional disso.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptidio conforme descrito acima, além disso compreendendo pelo menos um Nanobody da invenção dirigida contra uma ou várias proteína de soro, especialmente uma ou várias proteína de soro humana.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptidio conforme descrito acima em que os referidos pelo menos que uma (humana) proteína de soro é alguma de albumina de soro (humana), imunoglobulinas de soro (humanas), proteína ligada com tiroxina (humana), transferrina (humano), ou fibrinogênio (humano) ou um fragmento disso.
Segundo um aspecto específico, mas não-restritivo da invenção, os polipeptidios da invenção contêm, além de um ou vários nanocorpos da invenção, pelo menos um Nanobody contra uma albumina de soro humano. Embora esses nanocorpos contra uma albumina de soro humano possam ser como geralmente descritos em W04/062551 ou nas novas referências citadas nisso, segundo uma modalidade de execução em
Figure BRPI0609797B1_D0137
184 particular preferencial, mas não-restritiva, os referidos
que o Nanobody contra uma albumina de soro humano se compõe
de 4 regiões de armação (FR1 a FR4 respectivamente) e 3
regiões que determinam complementaridade (CDRI a CDR3
respectivamente), em que: i) 0 CDRI é uma seqüência
aminoácida escolhida do grupo composto de :
SFGMS [SEQ ID n. 44]
LNLMG [SEQ lo n. 45]
INLLG [SEQ ID n. 46]
NYWMY; [SEQ ID n. 47]
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que
têm 2 ou só 1 diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas;
e em que:
ii) 0 CDR2 é uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
SISGSGS DTLYADSVKG [SEQ ID n. 48]
TITVGDSTNYADSVKG [SEQ ID n. 49]
TITVGDSTSYADSVKG [SEQ ID n. 50]
Figure BRPI0609797B1_D0138
185
SINGRGDDTRYADSVKG
AISADSSTKNYADSVKG
AISADSSDKRYADSVKG
RISTGGGYSYYADSVKG
[SEQ ID n. 51]
[SEQ ID n. 52]
[SEQ ID n. 53]
[SEQ ID n. 54]
ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima
Figure BRPI0609797B1_D0139
186 mencionadas seqüências aminoácidas;
e em que:
iii) 0 CDR3 é uma seqüência aminoácida escolhida do grupo composto de :
DREAQVDTLDFDY [SEQ ID n. 55] ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas;
e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só 1 diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou
Figure BRPI0609797B1_D0140
187 inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas;
ou do grupo composto de :
GGSLSR [SEQ ID n. 56] RRTWHSEL [SEQ ID n. 57] GRSVSRS [SEQ ID n. 58] GRGSP [SEQ ID n. 59] e/ou do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I diferença (s) aminoácida (s) (conforme definido na presente) com uma das seqüências aminoácidas acima mencionadas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas.
Em outro aspecto, a invenção refere-se ao Nanobody contra vWF, que se compõem de 4 regiões de armação (FRl a FR4 respectivamente) e 3 complementar a determinação de regiões (CDR/a CDR3 respectivamente), que é escolhido do grupo composto de nanocorpos com aquela das combinações
seguintes de CDR1, CDR2 e CDR3, respectivamente: - CDR1:
SFGMS; CDR2: SISGSGSDTLYADSVKG; CDR3: GGSLSR;
- CDR1: LNLMG; CDR2: T1TVGDSTNYADSVKG; CDR3:
RRTWHSEL;
- CDR1: INLLG; CDR2: TITVGDSTSYADSVKG; CDR3:
RRTWHSEL;
Figure BRPI0609797B1_D0141
188
- CDRl: SFGMS; CDR2: SINGRGDDTRYADSVKG; CDR3:
GRSVSRS; CDRl: SFGMS; CDR2: AISADSSDKRYADSVKG; CDR3:
GRGSP; CDRl: SFGMS; CDR2: AISADSSDKRYADSVKG; CDR3 :
GRGSP; CDRl: NYWMY; CDR2: RISTGGGYSYYADSVKG;
CDR3:
DREAQVDTLDFDY.
Nos nanocorpos da invenção que compreendem as combinações do CDR'S acima mencionadas, cada CDR pode ser substituído por um CDR escolhido do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm pelo menos 80%, preferivelmente pelo menos 90%, mais preferivelmente pelo menos 95%, mesmo mais preferivelmente pelo menos identidade de seqüência de 99% (conforme definido na presente) com o CDR'S mencionado; em que (1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas;
e/ou escolhido do grupo composto de seqüências aminoácidas que têm 3, 2 ou só I (como indicado no parágrafo precedente) diferença(s) aminoácida(s) (conforme definido
189 na presente) com o CDR mencionado(s) um do acima mencionado seqüências aminoácidas, em que:
(1) qualquer substituição aminoácida é preferivelmente uma substituição aminoácida conservadora (conforme definido na presente); e/ou (2) a referida seqüência aminoácida preferivelmente só contém substituições aminoácidas, e nenhuma eliminação ou inserções aminoácidas, em comparação com as acima mencionadas seqüências aminoácidas.
Contudo, dos nanocorpos da invenção que compreendem as combinações do CDR'S acima mencionadas, nanocorpos que compreendem um ou vários do CDR’S enumerado anteriormente são em particular preferidos; os nanocorpos compreensão de dois ou mais do CDR'S enumerado anteriormente são mais em particular preferidos; e os nanocorpos compreensão de três do CDR'S enumerado anteriormente são mais em particular preferidos.
Nesses nanocorpos contra uma albumina de soro humano, as regiões de Armação FR1 a FR4 são preferivelmente como definidos mais acima para os nanocorpos da invenção.
nanocorpos em particular preferidos contra uma albumina de soro humano são escolhidos do grupo composto de SEQ ID NO's: 107-121. Esses correspondem ao nanocorpos contra uma albumina de soro humano de SEQ ID NO's: 61 para 67, SEQ ID NO's 87 para 89 e SEQ ID NO's 100-104 da aplicação provisória dos Estados Unidos co-pendente de solicitante nanocorpos™ Melhorado intitulado contra Fator
190 uo
Alfa de Necrose Tumoral com uma data que entra do dia 18 de
Maio de 2005.
Mais geralmente, nanocorpos contra a albumina de soro conveniente para uso na invenção são descritos na solicitação internacional pelo solicitante intitulado albumina de soro proteína de ligação com uma data de arquivamento internacional do dia 17 de Maio de 2006.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um ácido nucléico que codifica um construto de polipeptídio conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é uma composição que compreende um construto de polipeptídio conforme descrito acima e pelo menos um agente trombolítico, para administração simultânea, separada ou subseqüente a um sujeito.
Outra modalidade de execução da presente invenção está uma composição conforme descrito acima em que os referidos que o agente trombolítico é algum de estafiloquinase, ativador plasminogênico de tecido, estreptoquinase, estreptoquinase de cadeia única, uroquinase e complexo de estreptoquinase acil plasminogênico.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio conforme descrito anteriormente, ou um ácido nucléico conforme descrito anteriormente, ou uma composição como descrito acima de para o uso no tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens que se relacionam com agregação mediana de plaqueta ou disfunção disso.
Figure BRPI0609797B1_D0142
191
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso de um construto de polipeptidio conforme descrito anteriormente, ou um ácido nucléico conforme descrito anteriormente, ou uma composição como descrito acima para a preparação de um medicamento para o tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens que se relacionam com agregação mediana de plaqueta ou disfunção disso.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptidio, ácido nucléico ou a composição conforme descrito acima ou um uso de um construtos de polipeptidios, ácido nucléico ou composição conforme descrito acima em que as referidas desordens são algum que resulta de ataque de isquemia cerebral transiente, angina instável ou estável, angina pectoris, enfarte cerebral, enfarte do miocárdio, doença oclusiva arterial periférica, restenose, enxerto de desvio coronário, ou substituição de válvula de artéria coronária e intervenções coronárias tal angioplastia, stenting, endarterectomia carótida ou aterectomia.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptidio, ácido nucléico ou a composição conforme descrito acima ou um uso de um construtos de polipeptidios, ácido nucléico ou composição conforme descrito acima em que as referidas desordens são alguma da formação de um trombo não-oclusivo, a formação de um trombo oclusivo, formação trombo arterial, oclusão coronária aguda, restenose, restenose depois de PCTA ou stenting, trombo
Figure BRPI0609797B1_D0143
192 formação em artérias estenosadas, hiperplasia depois angioplastia, aterectomia ou stenting arterial, síndrome oclusiva em um sistema vascular ou a falta de revelação de artérias de doente.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio, ácido nucléico ou a composição conforme descrito acima ou um uso de um construtos de polipeptídios, ácido nucléico ou composição conforme descrito acima em que os referidos que a desordem é a placa ou a formação trombo em altos ambientes absolutos.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um construto de polipeptídio, ácido nucléico ou a composição conforme descrito anteriormente ou um uso de um construtos de polipeptídios conforme descrito acima em que os referidos que construtos de polipeptídios é administrado intravenosamente, subcutaneamente, oralmente, sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação.
Outra modalidade de execução da presente invenção é uma composição que compreende um construto de polipeptídio conforme descrito acima ou um ácido nucléico que codifica os referidos que o construtos de polipeptídios, ou uma composição conforme descrito acima e um veículo farmaceuticamente aceitável.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um método de produzir um polipeptídio conforme descrito acima, compreendendo
193
Figure BRPI0609797B1_D0144
(a) cultivo de células hospedeiras compreendendo ácido nucléico capaz de codificar um polipeptídio conforme descrito acima em condições que permitem a expressão do polipeptídio, e, (b) recuperação do polipeptídio produzido da cultura.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um método conforme descrito acima, em que as referidas células hospedeiras são bacterianas ou levedura.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um método para tratar dispositivos médicos invasivos para impedir agregação mediana de plaqueta em volta do sítio da invasão que compreende o passo do revestimento de dito dispositivo com um construto de polipeptídio conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um dispositivo médico invasivo que para logra agregação mediana de plaqueta em volta do sítio da invasão, em que os referidos que o dispositivo é coberto de um construto de polipeptídio conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um método de identificar um agente que modula compreender a agregação mediada por plaqueta (a) contatar com construtos de polipeptidios conforme descrito acima com um polipeptídio correspondente ao seu objetivo, ou um fragmento disso, na presença e a ausência de um modulador candidato em condições que permitem a ligação entre ditos polipeptidios, e
194
2/4 (b) medir a ligaçào entre os polipeptídios do passo (a) , em que uma redução na ligação na presença do referido modulador candidato, quanto à ligação na ausência do referido modulador candidato identificado o referido modulador candidato como um agente que modula a agregação platelet-mediatizada.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um conjunto para proteger agentes que modulam a agregação mediada por plaqueta segundo o método conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um agente desconhecido que modula a agregação mediada por plaqueta identificada segundo o método conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um método de diagnosticar uma doença ou a desordem caracterizada pela disfunção da agregação mediada por plaqueta que compreende os passos de :
(a) contatar uma amostra com um construtos de polipeptídios conforme descrito acima, e (b) o descobrimento da ligação do referido construto de polipeptídios à referida amostra, e (c) a comparação da ligação descobriu no passo (b) com um padrão, em que uma diferença na ligação quanto à referida amostra é o diagnóstico de uma doença ou desordem caracterizada pela disfunção da agregação mediada por plaqueta.
Figure BRPI0609797B1_D0145
195
Outra modalidade de execução da presente invenção é um conjunto que protege para diagnosticar uma doença ou desordem caracterizada pela disfunçâo da agregação mediada por plaqueta segundo o método conforme descrito acima.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um conjunto conforme descrito acima da compreensão de um construto de polipeptídio conforme descrito acima.
Nos polipeptídios da invenção, um ou vários nanocorpos da invenção que são dirigidos contra um objetivo podem ser da mesma seqüência. Alternativamente eles podem não ter todos a mesma seqüência. É dentro dos limites da invenção que um polipeptídio da invenção compreende o anti-nanocorpos objetivo da invenção que não compartilham todos a mesma seqüência, mas que são dirigidos contra o mesmo objetivo, ou fragmento disso, um ou vários antígenos disso.
Ele é outro aspecto da invenção que o polipeptídio da invenção compreende dois ou mais nanocorpos da invenção, em que quaisquer dois nanocorpos da invenção são dirigidos contra epitopes/alvos diferentes, isto é, contra algum de vWF, vWF domínio de Al, domínio de Al de vWF ativado, domínio vWF A3.
Outro aspecto da invenção é um polipeptídio biespecífico da invenção que compreende um Nanobody da invenção dirigida contra o domínio de Al vWF, o domínio de Al de vWF ativado, e outro Nanobody da invenção dirigida contra vWF A3 domínio. Dito polipeptídio biespecífico da invenção inibe a interação entre vWF e colágeno, e a
Figure BRPI0609797B1_D0146
196 interação entre vWF e plaquetas.
Segundo um aspecto da presente invenção um polipeptídio da invenção pode compreender dois ou mais nanocorpos da invenção que foram juntados, os nanocorpos da invenção pode ser idêntico na seqüência e dirigido contra o mesmo objetivo ou antígeno.
Dependendo do número de VHHS ligado, um VHH multivalente pode ser bivalente (2 VHHS), trivalente (3 VHHs), tetravalente (4 VHHS) ou ter umas mais altas moléculas de valência.
A presente invenção também se relaciona ao achado que um polipeptídio da invenção que, além disso, compreende um ou vários nanocorpos da invenção cada um dirigido contra uma proteína de soro de um sujeito, surpreendentemente prolongou significativamente a meia-vida na circulação do dito sujeito comparado com a meia-vida do anti-Nanobody objetivo da invenção (ões) quando não a parte dos referidos construtos. Além disso, acima citado construtos foram encontrados para expor as mesmas propriedades favoráveis de VHHs como alta estabilidade que permanece intactos em ratos, resistência de pH extrema, alta estabilidade de temperatura e alta afinidade de objetivo. A proteína de soro pode ser qualquer proteína conveniente encontrada no soro de sujeito, ou fragmento disso. Em um aspecto da invenção, a proteína de soro é albumina de soro, imunoglobulinas de soro, proteína ligada com tiroxina, transferrina, ou fibrinogênio. Dependendo do uso desejado como a meia-vida requerida para
Figure BRPI0609797B1_D0147
197 tratamento eficaz e/ou compartimentalizaçâo do antígeno de objetivo, o VHH-parceiro pode ser dirigido a uma da acima mencionada proteína de soro.
Tais construtos são capazes de fazer circular no soro do sujeito por vários dias, reduzindo a freqüência do tratamento, a inconveniência ao sujeito e resultando em um custo reduzido do tratamento. Além disso, é um aspecto da invenção que a meia-vida do polipeptidio da invenção revelada na presente pode ser controlada pelo número de nanobodies de proteína anti-soro do construto da presente invenção. Uma meia-vida controlável é desejável em várias circunstâncias, por exemplo, na aplicação de uma dose determinada de um polipeptidio terapêutico da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um polipeptidio da invenção como mencionado na presente, além disso compreendendo um agente trombolítico.
Dito agente trombolítico pode ser não-covalentemente ou covalentemente ligado a um Nanobody da invenção via meios não-covalentes ou covalentes. Tais meios covalentes são descritos mais adiante. Os meios Não-covalentes incluem via uma interação de proteína como biotina/estrepavidina, ou via um imunoconjugado.
Alternativamente, o agente trombolítico pode ser administrado simultâneo, separado ou subseqüente a respeito de um polipeptidio da invenção.
Outro aspecto da invenção é uma composição que compreende pelo menos um polipeptidio da invenção e pelo
198
7)6 menos um agente trombolítico, para administração simultânea, separada ou subseqüente a um sujeito.
Um aspecto da invenção é um método para tratar administração de compreensão de doença autoimune a um indivíduo uma quantidade eficaz de pelo menos um polipeptídio da invenção e pelo menos um agente trombolítico, simultaneamente, separadamente ou em seqüência.
Outro aspecto da invenção é um conjunto que contém pelo menos um polipeptídio da invenção e pelo menos um agente trombolítico para administração simultânea, separada ou subseqüente a um sujeito. É um aspecto da invenção que o conjunto pode ser usado segundo a invenção. É um aspecto da invenção que o conjunto pode ser usado para tratar as doenças como citado na presente.
Por meios de administração simultâneos que o polipeptídio e o agente trombolítico são administrados a um sujeito ao mesmo tempo. Por exemplo, como uma mistura ou uma composição que compreende disseram componentes. Os exemplos incluem, mas não são limitados a uma solução administrada intravenosamente, uma pastilha, creme líquida, tópica, etc., em que cada preparação compreende os componentes do interesse.
Por que polipeptídio de meios de administração separado e agente trombolítico são administrados a um sujeito ao mesmo tempo ou substancialmente o mesmo tempo. Os componentes estão presentes no conjunto como preparações
Figure BRPI0609797B1_D0148
199 separadas, não misturadas. Por exemplo, o polipeptídio e o agente de trombolítico pode estar presente no conjunto como pastilhas individuais. As pastilhas podem ser administradas ao sujeito engolindo ambas as pastilhas ao mesmo tempo, ou uma pastilha diretamente depois do outro.
Por meios de administração seqüentes que o polipeptídio e o agente trombolítico são administrados a um sujeito em seqüência. 0 polipeptídio e o agente trombolítico estão presentes no conjunto como preparações separadas, não misturadas. Há um intervalo de tempo entre doses. Por exemplo, um componente poderia ser administrado até 336, 312, 288, 264, 240, 216, 192, 168, 144, 120, 96, 72, 48, 24, 20, 16, 12, 8, 4, 2, 1, ou 0.5 horas depois de outro componente.
Na administração subseqüente, um componente pode ser administrado uma vez, ou qualquer número de tempos e em várias doses antes e/ou depois da administração de outro componente. A administração subseqüente pode ser combinada com a administração simultânea ou subseqüente.
Os usos médicos do polipeptídio da invenção descrita mais adiante, também se aplique à composição que compreende um polipeptídio da invenção e pelo menos um polipeptídio agente trombolítico, para administração simultânea, separada ou subseqüente a um sujeito como revelado aqui anteriormente.
Os agentes de Trombolítico segundo a invenção podem incluir, por exemplo, estafiloquinase, ativador
Figure BRPI0609797B1_D0149
200 plasminogênico de tecido, estreptoquinase, estreptoquinase de cadeia única, uroquinase e complexo de estreptoquinase acil plasminogênico.
O nanocorpos da invenção pode ser juntado para formar algum do polipeptídio da invenção revelada na presente compreendendo mais de um Nanobody da invenção que usa métodos conhecidos na técnica ou qualquer futuro método. Por exemplo, eles podem ser fundidos pela ligação cruzada química reagindo resíduos aminoácidos com um agente derivatização orgânico como descrito por Blattler e al, Bioquímica 24,1517-1524; EP294703. Alternativamente, o Nanobody da invenção pode ser fundido geneticamente ao nível de ADN isto é, um construto polinucleotídeo formado que codifica o polipeptídio completo da invenção que compreende um ou vários anti-nanobodies alvo da invenção e um ou vários nanobodies de proteína anti-soro da invenção. Um método que para produz bivalente ou multivalente VF-, o polipeptídio da invenção é revelado na aplicação de patente PCT WO 96/34103. Um modo de juntar múltiplos nanobodies da invenção é através da via genética ligando Nanobody da invenção que codifica seqüências diretamente ou via um linker de peptídeo. Por exemplo, o fim de C-terminal do primeiro Nanobody da invenção pode ser ligado ao fim do N-terminal do seguinte Nanobody da invenção. Este modo de vinculação pode ser estendido para ligar nanocorpos adicionais da invenção para a construção e a produção de construtos tri-, tetra-, etc.
funcionais.
Figure BRPI0609797B1_D0150
201
O polipeptídio da invenção revelada na presente pode ser feito pelo técnico experimentado segundo os métodos conhecidos na técnica ou qualquer futuro método. Por exemplo, VHHS pode ser obtido usando métodos conhecidos na técnica como imunizando um camelo e obtendo hibridomas disto, ou clonando uma biblioteca de nanocorpos da invenção que usa técnicas de biologia moleculares conhecidas na seleção de arte e subsequente usando fago-exposição.
Os nanocorpos têm uma estrutura única que se compõe de um domínio variável único. As moléculas de VHH derivaram de anticorpos Camelidae estão entre os domínios de ligação de antígeno intatos menores conhecidos (aproximadamente 15 kDa, ou 10 vezes menores do que um IgG convencional) e daqui são bem ajustados em direção à entrega a tecidos densos e para o acesso do espaço limitado entre macromoléculas que participam em ou começam o processo da plaqueta mediadas a agregação.
Apesar do pequeno tamanho de nanobodies, e portanto vantagens para penetração, é ainda surpreendente que uma tão pequena molécula possa inibir interações entre o grande polímero como vWF (até 60 monômeros) e colágeno e com uma tão alta eficiência. Foi descrito que só as grandes formas multiméricas de vWF são hemostaticamente ativas (Furlan, M. 1996, Ann. Hematol. 72:341-348). A ligação de multiméricas vWF a colágeno ocorre com - mais alta afinidade de 100 vezes do que a ligação de monoméricas vWF fragmentos.
Os resultados de experimentos de alto corte indicam
Figure BRPI0609797B1_D0151
202 que uma dose mais baixa pode ser administrada a pacientes. Por isso, menos efeitos colaterais são esperados (como imunogenicidade ou problemas de sangramento).
Em outra modalidade de execução da presente invenção, um polipeptídio da invenção compreende um ou vários nanocorpos da invenção dirigida ao mesmo objetivo, e além disso compreende um ou vários nanocorpos da invenção dirigida ao mesmo objetivo mas a um epitope diferente no mesmo domínio.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um polipeptídio da invenção em que o número de nanocorpos da invenção dirigida ao mesmo objetivo é dois ou mais.
Em outra modalidade de execução da presente invenção, um polipeptídio da invenção compreende um ou vários nanocorpos da invenção dirigida a um domínio do mesmo objetivo, e um ou vários nanocorpos da invenção dirigida ao mesmo objetivo mas a outro domínio do mesmo objetivo. Os exemplos de domínios diferentes poderiam ser Al e domínios
A3 de vWF
Ele é aquele o aspecto não-restritivo da invenção que pelo menos um VHH dirigido ao domínio de Al em um polipeptídio heteroespecíficos da invenção reconhece a conformação ativa de vWF. Tal polipeptídio da invenção pode ter efeitos anti-trombóticos superiores em comparação com o VHH'S monoméricas. 0 experimento de perfusão foi executado em uma câmara de fluxo, estudar agregação de plaqueta sob alto corte para estudar os efeitos dos polipeptídio da
Figure BRPI0609797B1_D0152
203 invenção.
A descoberta de naturalmente ocorrer nanocorpos da invenção em lhama, dromedário e camelo revelou uma nova classe de moléculas terapêuticas que combinam as vantagens de anticorpos monoclônicos, por exemplo, especificidade, toxicidade baixa com as vantagens de pequenas moléculas, por exemplo, penetração de tecido e estabilidade. Infelizmente, o desenvolvimento de produtos terapêuticos apropriados baseados nessa proteína tem o desconto de ser Camelidae derivado, e portanto não ser humano. A proteína não-humana contém resíduos aminoácidos que podem ser imunogênicos quando injetados em um paciente humano. Embora os estudos tenham mostrado que VHH Camelidae-derivados não são imunogênica quando injetado em ratos, substituindo resíduos de Camelidae por resíduos humanos é preferível. Esses polipeptídios humanizados devem ser substancialmente nãoimunogênica em seres humanos, mas reter a afinidade e a atividade do polipeptídio de tipo natural.
resultado de humanização é preferivelmente que imunogenicidade sobre a administração em pacientes humanos é menor ou não existente. Humanização de um polipeptídio, segundo a invenção presente, compreende um passo de substituir um ou vários dos Camelidae aminoácidos pelo seu duplo humano como encontrado na seqüência de consenso humana, sem aquele polipeptídio que perde o seu caráter típico, isto é, a humanização não afeta significativamente a capacidade de ligação do antígeno do polipeptídio
Figure BRPI0609797B1_D0153
204 resultante .
Os WO 04/062551 e a nova descrição na presente descrevem alguns exemplos preferidos, mas não-restritivos dos resíduos aminoácidos do domínio variável de anticorpo (VHH) que pode ser modificado sem diminuir a afinidade nativa do domínio para antígeno e reduzindo o seu imunogenicidade com respeito a uma espécie heteróloga; o uso de VHHS tendo modificações nos resíduos identificados que são úteis para a administração à espécie heteróloga; e ao VHH assim modificado. Mais especificamente, a invenção também abrange a preparação de VHHS modificados, que são modificados para administração a seres humanos, o próprio VHH resultante, e o uso de tal VHHS humanizado no tratamento de doenças em seres humanos.
Como mencionado em WO 04/062551 e na nova descrição na presente, a humanização de polipeptídios VHH requer a introdução e mutagenese de só um número limitado de aminoácidos em uma cadeia de polipeptídio única sem a perda dramática de atividade de inibição e/ou ligação. Isto é, em contraste com a humanização de scFv, Fab, (Fab) 2 e IgG, que requer a introdução de modificações aminoácidas em duas cadeias, a cadeia leve e pesada e a preservação da união de ambas as cadeias.
Uma técnica humanização pode ser executada por um método que compreende a substituição de algum dos resíduos seguintes sozinhos ou em combinação: posições de FR1 1, 5, 28 e 30, o Hallmark aminoácido na posição 37, 44, 45 e 47 em
205
5
FR2, resíduos de FR3 74, 75, 76, 83, 84, 93 e 94 e posições 103, 104, 108 e 111 em FR4; numeração segundo a numeração de
Kabat.
Os nanocorpos da invenção têm um alto grau da homologia a germline humano VH DP-47. A nova humanização também pode implicar a introdução e mutagenese de uma quantidade limitada de aminoácidos em uma cadeia de polipeptídio única. Isto é, em contraste com a humanização de scFv, Fab, (Fab) 2 e IgG, que requer a introdução de modificações aminoácidas em duas cadeias, a cadeia leve e pesada e a preservação da união de ambas as cadeias.
Os polipeptídios contêm resíduos parecidos a um ser humanos em FR2. A humanização também pode implicar mutagenese de resíduos em FR1 na posição 1 e 5 que foram introduzidos pelo escorvador usado para clonagem de repertório e não ocorrer naturalmente na seqüência de lhama. A Mutagenese daqueles resíduos não resultou na perda de atividade de inibição e/ou ligação. A humanização de FR1 também requereu mutagenese da posição 28 e 30. A Mutagenese daqueles resíduos também não resultou na perda de atividade de inibição e/ou ligação.
A humanização também pode implicar mutagenese de resíduos em FR3 na posição 74, 75, 76, 83, 84, 93, 94. A
Mutagenese daqueles resíduos não resultou na perda de atividade de inibição e/ou ligação.
A humanização também pode implicar mutagenese de resíduos em FR4 na posição 104, 108 e 111. A Mutagenese de
Figure BRPI0609797B1_D0154
206
Q108L resultou no nível de produção mais baixo em Escherichia coli. A posição 108 é exposta a solvente em VHH camelídeo, enquanto em anticorpos humanos esta posição é enterrada na interface VH-VL (Spinelli, 1996; Nieba, 1997). Na posição VHS isolada 108 é exposta a solvente. A introdução de um hidrofóbico não-polar Leu em vez de polar não mudado que Gin pode ter um efeito drástico na dobrabilidade/estabilidade intrínseca da molécula.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um método que para humaniza um VHH compreendendo os passos de:
(a) substituição de algum dos resíduos seguintes sozinhos ou em combinação: posições de FRl 1, 5, 28 e 30, o Hallmark aminoácido na posição 37, 44, 45 e 47 em
FR2,
Resíduos de FR3 74, 75, 76, 83, 84, 93 e 94, e posições 103, 104, 108 e 111 em FR4; numeração segundo a numeração de Kabat.
Os exemplos de tais seqüências humanizadas são dados mais adiante e na listagem de seqüência em anexo.
O uso de anticorpos derivados de fontes como rato, ovelhas, cabra, coelho etc., e derivados humanizados disso como um tratamento para condições que requerem uma modulação da agregação associada por plaqueta, é problemático para várias razões. Os anticorpos tradicionais não são estáveis na temperatura ambiente, e têm de ser refrigerados para preparação e armazenamento, requerendo equipamento de laboratório refrigerado necessário, armazenamento e
Figure BRPI0609797B1_D0155
207 transporte, que aumentam o tempo e a despesa. A refrigeração não é às vezes fatível em países em desenvolvimento. Os rendimentos da expressão de ditas moléculas de Fab são muito baixos e o método da produção é muito de trabalho intensivo. Além disso, a fabricação ou a produção em escala modesta de ditos anticorpos são caras porque os sistemas celulares mamíferos necessários para a expressão de anticorpos intatos e ativos requer altos níveis do suporte quanto a tempo e equipamento, e os rendimentos são muito baixos. Além disso, os anticorpos tradicionais têm uma atividade de ligação que depende de pH, e daqui é imprópria para uso em ambientes fora da variedade de pH fisiológica habitual como, por exemplo, no tratamento de hemorragia gástrica, cirurgia gástrica. Além disso, os anticorpos tradicionais são movediços em pH baixo ou alto e daqui não convenientes para administração oral. Contudo, foi demonstrado que os anticorpos camelídeos resistem condições ásperas, como pH extremo, reagentes desnaturantes e altas temperaturas (Ewert S e al, Bioquímica 2002 19 de março; 41 (11):3628-36), fazendo assim eles convenientes para administração por administração oral. Além disso, os anticorpos tradicionais têm uma atividade de ligação que depende da temperatura, e daqui é imprópria para uso em ensaios ou conjuntos executados em temperaturas fora de variedades biologicamente de temperatura ativas (p. ex. 37 ± 20°C).
Os nanocorpos e os polipeptidios da invenção não só possuem as características vantajosas de anticorpos
208
Figure BRPI0609797B1_D0156
convencionais, como toxicidade baixa e alta seletividade, mas eles também expõem propriedades adicionais. Eles são mais solúveis, significando que eles podem ser fornecidos e/ou administrados em mais altas concentrações comparadas com anticorpos convencionais. Eles são estáveis na significação de temperatura ambiente eles podem estar preparados, fornecidos e/ou transportados sem o uso do equipamento de refrigeração, transmitindo um custo, tempo e economias ambientais. Outras características vantajosas comparando com anticorpos convencionais incluem a meia-vida curta na circulação que pode ser modulada segundo a invenção por, por exemplo, a união de albumina, um biespecífico nanobody com uma especificidade contra a albumina e outro contra o objetivo, união de Fe, VFIH que liga (VHHS bivalente) ou por pegilação. Uma meia-vida curta e controlável é desejável procedimentos para cirúrgicos, por exemplo, que requerem uma inibição da agregação mediada por plaqueta por um tempo limitado período. Também, quando os problemas sangradores ocorrem ou outras complicações, a dosagem pode ser abaixada imediatamente. Os polipeptídios da presente invenção também retêm a atividade de ligação em um pH e temperatura fora daqueles de variedades fisiológicas habituais, que significa que eles podem ser úteis em situações de pH extremo e temperatura que requerem uma modulação da agregação mediada por plaqueta, como na cirurgia gástrica, controle da hemorragia gástrica, ensaios executados na temperatura ambiente etc. Os polipeptídios da
Figure BRPI0609797B1_D0157
209 presente invenção também expõem uma estabilidade prolongada em extremes de pH, significando que eles seriam convenientes para a entrega pela via oral. Os polipeptídios da presente invenção podem ser rentavelmente produzidos através de fermentação em organismos hospedeiros de recombinante convenientes como Escherichia coli e levedura; diferentemente de anticorpos convencionais que também requerem facilidades de cultura de célula de mamíferos caras, os níveis realizáveis da expressão são altos. Os exemplos de rendimentos dos polipeptídios da presente invenção são 1 para 10 mg/ml (E. coli) e até 1 g/1 (levedura). Os polipeptídios da presente invenção também expõem a alta afinidade de ligação para uma larga variedade de tipos de antígeno diferentes, e capacidade de ligar a epitopes não reconhecidos por anticorpos convencionais;, por exemplo, eles expõem muito tempo estruturas de laço baseado em CDR com o potencial para penetrar em cavidades e inibição de função de enzima anexa. Além disso, como a ligação freqüentemente ocorre através do laço CDR3 só, é visto que os peptídeos derivados de CDR3 podem ser usados terapeuticamente (Desmyter et al., J Biol Chem, 2001, 276: 26285-90). Os polipeptídios da invenção são também capazes de reter a capacidade de ligação plena como proteína de fusão com uma enzima ou toxina. Além disso, poderia ser esperado que o trombocitopenia indesejável causado pelo receptor Fc:Fc mediadas a ativação da agregação de plaqueta e/ou F (ab') (2) - mediadas ligação cruzada de plaquetas que
Figure BRPI0609797B1_D0158
210 foi observado usando IgG intacto ou F (ab' ) (2) terapeuticamente in vivo (ver Cauwenberghs N. e al, a Arteriosclerose, Trombose e a biologia Vascular, 2000, 20: 1347), será evitado no uso de VHH, desde que VHH não contém nenhum Fc e não é bivalente. Portanto os polipeptídios da invenção, homólogos ou porções funcionais disso fornecem um custo considerável e o tempo salvando no tratamento e o diagnóstico de condições relacionadas à agregação mediada por plaqueta, e o paciente na necessidade dos referidos polipeptídios encontraria menos dos problemas associados com agentes convencionais.
A agregação mediada por plaqueta é o processo em que vWF-ligado o colágeno adere a plaquetas e/ou receptores de plaqueta, enfim resultando em ativação de plaqueta. A ativação de plaqueta leva à ligação de fibrinogênio, e finalmente à agregação de plaqueta. É dentro dos limites da presente invenção para fornecer polipeptídios que modulam os processos que compreendem a agregação mediada por plaqueta como ligação de vWF-colágeno, adesão de receptor de vWFplaqueta, adesão de receptor de colágeno-plaqueta, ativação de plaqueta, fibrinogênio agregação de plaqueta e/ou ligação.
Segundo um aspecto da invenção um polipeptídio da invenção pode ser uma seqüência homóloga de um polipeptídio de corpo inteiro da invenção. Segundo outro aspecto da invenção, um polipeptídio da invenção pode ser uma porção funcional de um polipeptídio de corpo inteiro da invenção.
Figure BRPI0609797B1_D0159
211
Segundo outro aspecto da invenção, um polipeptídio da invenção pode ser uma seqüência homóloga de um polipeptídio de comprimento cheio da invenção. Segundo outro aspecto da invenção, um polipeptídio da invenção pode ser uma porção funcional de uma seqüência homóloga de um polipeptídio de comprimento cheio da invenção. Segundo um aspecto da invenção um polipeptídio da invenção pode compreender uma seqüência de um polipeptídio da invenção.
Segundo um aspecto da invenção um Nanobody da invenção usada para formar um polipeptídio da invenção pode ser um Nanobody completo da invenção (p. ex. um VHH) ou uma seqüência homóloga disso. Segundo outro aspecto da invenção, um Nanobody da invenção usada para formar o polipeptídio da invenção pode ser uma porção funcional de um Nanobody completo da invenção. Segundo outro aspecto da invenção, um Nanobody da invenção usada para formar o polipeptídio da invenção pode ser uma seqüência homóloga de um Nanobody completo da invenção. Segundo outro aspecto da invenção, um Nanobody da invenção usada para formar o polipeptídio da invenção pode ser uma porção funcional de uma seqüência homóloga de um Nanobody completo da invenção.
Segundo outro aspecto da invenção um polipeptídio da invenção pode ser uma seqüência homóloga da seqüência de pais. Segundo outro aspecto da invenção, um polipeptídio da invenção pode ser uma seqüência de pai de porção funcional. Segundo outro aspecto da invenção, um polipeptídio da invenção pode ser uma porção funcional de uma seqüência
212 lAl homóloga da seqüência de pais.
Como usado na presente, uma seqüência homóloga pode compreender adições, eliminações ou substituições de um ou vários aminoácidos, que não alteram substancialmente as características funcionais do polipeptídio. 0 número de eliminações aminoácidas ou substituições está à altura
preferiv elme nte 1, 2, 3, , 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13,
14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28,
29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43,
44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58,
59, 60, 61 t 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69 ou 70
aminoácidos.
Uma seqüência homóloga segundo a presente invenção inclui polipeptídios extensos pela adição de aminoácidos para formar o anticorpo de cadeia pesada humano ou o domínio único humano anticorpo de cadeia pesada, que não alteram
substancialmente as características funcionais do
polipeptídio não modificado.
Onde a seqüência homóloga indica a identidade de
seqüência, ele significa uma seqüência que apresenta uma
alta identidade de seqüência (mais de 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, identidade de seqüência de 95% ou de 98%) com a seqüência de pais, e é preferivelmente caracterizada por propriedades semelhantes da seqüência de pais, a saber afinidade, a referida identidade calculada usando métodos conhecidos.
Alternativamente, uma seqüência homóloga também pode
213 ser qualquer seqüência aminoácida que resulta de substituições permitidas em qualquer número de posições da seqüência de pais segundo a fórmula mais adiante:
Ser substituído por Ser, Thr, Gly, e Asn;
Arg substituído por um de Arg, His, Gim, Lys, e Glu; Leu substituído por um de Leu, Ile, Phe, Tyr, Met, e
Vai;
Pro substituído por um de Pro, Gly, Ala, e Thr;
Thr substituído por um de Thr, Pro, Ser, Ala, Gly,
His, e Gin; Ala substituído por um de Ala, Gly, Thr, e Pro;
Vai substituído por um de Vai, Met, Tyr, Phe, Ile, e
Leu;
Gly substituído por um de Gly, Ala, Thr, Pro, e Ser; Ile substituído por um de Ile, Met, Tyr, Phe, Vai, e
Leu;
Phe substituído por um de Phe, Trp, Met, Tyr, Ile
Vai, e Leu; Tyr substituído por um de Tyr, Trp, Met, Phe
Ile, Vai, e Leu; His substituído por um do Seu, Glu, Lys
Gin, Thr, e Arg;
Gin substituído por um de Gim, Glu, Lys, Asn, His
t t
Thr, e Arg; Asn substituído por um de Asn, Glu, Asp, Gim, e
Ser;
Lys substituído por um de Lys, Glu, Gin, His, e Arg;
Asp substituída por uma de Asp, Glu, e Asn;
Glu substituído por um de Glu, Asp, Lys, Asn, Gim,
His, e Arg; Met substituído por um dos Met, Phe, Ile, Vai,
Leu, e Tyr.
214
Um homólogo segundo a presente invenção pode referirse a seqüências de nucleotídeos de mais de 50, 100, 200,
300, 400, 500, 600, 800 ou 1000 nucleotídeos capaz a hibridizar ao complemento inverso da seqüência de nucleotídeos capaz de codificar um polipeptídio em condições hibridização estritas (como aqueles descritos por SAMBROOK et al., a Molecular Cloning, Laboratory Manuel, Cold Spring, Harbor Laboratory press, Nova York).
Como usado na presente, uma porção funcional envia a um Nanobody da invenção do comprimento suficiente tal que a interação do interesse é mantida com a afinidade de 1 10-6 M x ou melhor.
Alternativamente uma porção funcional de um Nanobody da invenção compreende uma eliminação parcial da seqüência
15 aminoácida completa e ainda mantém o sítio(s) de ligação e o
domínio(s) de proteína necessário para a ligação de e
interação com o objetivo.
Alternativamente uma porção funcional de algum do
Nanobody da invenção é um polipeptídio que compreende uma 20 eliminação parcial da seqüência aminoácida completa e que ainda mantém o sítio (s) de ligação e o domínio (s) de proteína necessário para a inibição da ligação de vWF a colágeno.
Alternativamente uma porção funcional de qualquer 25 Nanobody da invenção é um polipeptídio que compreende uma eliminação parcial da seqüência aminoácida completa e que ainda mantém o sítio (s) de ligação e o domínio (s) de
Figure BRPI0609797B1_D0160
215 proteína necessário para a ligação de e interação com o domínio Al de vWF.
Alternativamente uma porção funcional de qualquer Nanobody da invenção é um polipeptídio que compreende uma eliminação parcial da seqüência aminoácida completa e que ainda mantém o sítio(s) de ligação e o domínio (s) de proteína necessário para a ligação de e interação com colágeno.
Alternativamente uma porção funcional compreende uma eliminação parcial da seqüência aminoácida completa de um polipeptídio e que ainda mantém o sítio(s) de ligação e o domínio(s) de proteína necessário para a ligação de e interação com o antígeno contra o qual foi levantado. Ele inclui, mas não é limitado a domínios VHH.
Tão usado na presente, uma porção funcional como ele se refere a uma seqüência de polipeptídio refere-se a menos de 100% da seqüência (p. ex., 99%, 90%, 80%, 70%, 60% 50% etc.), mas compreendendo de 5 ou mais aminoácidos.
Uma porção como ele se refere a uma seqüência de nucleotídeos que codifica uma seqüência de polipeptídio refere-se a menos de 100% da seqüência (p. ex., 99%, 90%, 80%,
70%, 60% 50% etc.), mas - compreensão de 15 ou mais nucleotídeos.
Um aspecto da presente invenção é a administração de um polipeptídio da invenção segundo a invenção pode evitar a necessidade para injeção. A terapêutica baseada em anticorpo
Figure BRPI0609797B1_D0161
216 convencional tem o potencial significativo como fármacos porque eles têm a especificidade seleta ao seu objetivo e uma toxicidade inerente baixa, contudo, eles têm um desconto importante: eles são relativamente movediços, e sensíveis ao esgotamento por proteases. Isto significa que as fármacos de anticorpo convencionais não podem ser administradas oralmente, sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação porque eles não são resistentes ao pH baixo nesses sítios, a ação de proteases nesses sítios e no sangue e/ou por causa do seu grande tamanho. Eles têm de ser administrados pela injeção (intravenosamente, subcutaneamente, etc.) superar alguns desses problemas. A administração pela injeção requer o treinamento de especialista para usar uma seringa hipodérmica ou a agulha corretamente e seguramente. Ele além disso requer o equipamento estéril, uma formulação líquida do polipeptidio terapêutico, a embalagem de frasco do referido polipeptidio em uma forma estéril e estável e, do sujeito, um sítio conveniente para a entrada da agulha. Além disso, os sujeitos comumente experimentam estresse físico e psicológico antes de e para receber uma injeção.
Um aspecto da presente invenção supera esses problemas da arte prévia, fornecendo os polipeptidios construtos da invenção. Ditos construtos são suficientemente 5 estáveis para ser entregue presente pequenos, oralmente, resistentes sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação substancial sem a
217 perda da atividade. Os polipeptídios construto da presente invenção evitam a necessidade para injeções, não são só economias de custo/tempo, mas são também mais convenientes e mais cômodos para o sujeito.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através do ambiente gástrico sem que a substância seja desativada.
Como conhecido por pessoas experimentadas na técnica, uma vez na posse do referido polipeptídio da invenção, a tecnologia de formulação pode ser aplicada para lançar uma quantidade máxima do polipeptídio na posição certa (no estômago, no cólon, etc.). Este método de administração é importante para tratar, prevenir e/ou aliviar os sintomas de desordens cujos objetivos são localizados no sistema intestinal.
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de uma desordem suscetível à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através do ambiente gástrico sem ser desativado, por oralmente administrando a um sujeito um polipeptídio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou
Figure BRPI0609797B1_D0162
218 aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através do ambiente gástrico sem ser desativado.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ao sistema intestinal sem que a referida substância seja desativada, por oralmente administrando a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sangüínea de um sujeito sem que a substância seja desativada, por oralmente administrando a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas ou desordens suscetível à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada ao trato vaginal e/ou retal.
Em um exemplo não-restritivo, uma formulação segundo a invenção compreende um Nanobody ou o polipeptídio da invenção, na forma de um gel, creme, supositório, filme, ou na forma de uma esponja ou como um anel vaginal que lentamente lança o ingrediente ativo dentro de algum tempo (tais formulações são descritas em EP 707473, EP 684814, US
Figure BRPI0609797B1_D0163
219
5629001).
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada ao trato vaginal e/ou retal, por administração vaginalmente e/ou retalmente a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada ao trato vaginal e/ou retal.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ao trato vaginal e/ou retal sem ser dita substância que é desativada, administrando ao trato vaginal e/ou retal de um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sangüínea de um sujeito sem que a referida substância seja desativada, administrando ao trato vaginal e/ou retal de um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um
Nanobody ou o polipeptídio da invenção, para usar em
Figure BRPI0609797B1_D0164
220 tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens suscetível à modulação por uma substância que controla a plaqueta mediadas a agregação ministrado ao nariz, tratamento respiratório superior e/ou pulmão.
Em um exemplo não-restritivo, uma formulação segundo a invenção, compreende um Nanobody ou o polipeptídio da invenção na forma de um borrifo nasal (p. ex. um aerossol) ou inalador. Desde o Nanobody ou o polipeptídio da invenção é pequeno, ele pode conseguir o seu objetivo muito mais efetivamente do que moléculas IgG terapêuticas.
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrado ao trato respiratório superior e pulmão, administrando a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção, pela inalação através da boca ou nariz.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada ao nariz, trato respiratório superior e/ou pulmão, sem que o referido polipeptídio seja desativado.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ao nariz, trato respiratório superior e
221
L á' pulmão sem inativação, administrando ao nariz, trato respiratório superior e/ou pulmão de um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sangüínea de um sujeito sem inativação administrando ao nariz, trato respiratório superior e/ou pulmão de um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada à mucosa intestinal, em que os referidos desordens aumentam a permeabilidade da mucosa intestinal. Por causa do seu pequeno tamanho, um Nanobody ou o polipeptídio da invenção podem passar pela mucosa intestinal e atingir a circulação sangüínea mais eficientemente em sujeitos que sofrem de desordens que causam um aumento na permeabilidade da mucosa intestinal.
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada à mucosa intestinal, em que os referidos desordens aumentam a permeabilidade da mucosa intestinal, por oralmente administrando a um sujeito um
222
Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Este processo pode ser até adicionalmente realçado por um aspecto adicional da presente invenção - o uso de transportadoras de transporte ativas. Neste aspecto da invenção, VHH é fundido a uma transportadora que realça a transferência através da parede intestinal na circulação sangüínea. Em um exemplo não-restritivo, esta transportadora é um segundo VHH que é fundido ao VHH terapêutico. Tais construtos de fusão são feitos usando métodos conhecidos na técnica. 0 VHH de transportadora liga especificamente a um receptor na parede intestinal que induz uma transferência ativa através da parede.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta ministrada à mucosa intestinal, em que os referidos desordens aumentam a permeabilidade da mucosa intestinal.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à mucosa intestinal sem ser desativada, administrando oralmente a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sangüínea de um sujeito sem
Figure BRPI0609797B1_D0165
223 ser desativada, administrando oralmente a um sujeito um Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Este processo pode ser até adicionalmente realçado por um aspecto adicional da presente invenção - o uso de transportadoras de transporte ativas. Neste aspecto da invenção, um Nanobody ou o polipeptídio da invenção conforme descrito na presente é fundido a uma transportadora que realça a transferência através da parede intestinal na circulação sangüínea. Em um exemplo não-restritivo, esta transportadora é um VHH que é fundido ao referido polipeptídio. Tais construtos de fusão são feitos utilizando métodos conhecidos na técnica. 0 VHH de transportadora liga especificamente a um receptor na parede intestinal que induz uma transferência ativa através da parede.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através dos tecidos abaixo da língua com efetividade. Uma formulação do referido Nanobody ou o polipeptídio da invenção, por exemplo, uma pastilha, borrifo, uma gota é colocada embaixo da língua e adsorvida através das membranas de muco na rede capilar embaixo da língua.
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação
224
1% mediada de plaqueta que é capaz de passar através dos tecidos abaixo da língua com efetividade, por administração sublingual a um sujeito Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso do Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar pelos tecidos abaixo da língua.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta aos tecidos abaixo da língua sem ser desativada, administrando sublingualmente a um sujeito Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sanguínea de um sujeito sem ser desativada, administrando oralmente a um sujeito Nanobody ou o polipeptídio da invenção.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através da pele efetivamente.
Uma formulação do referido Nanobody ou o polipeptídio
Figure BRPI0609797B1_D0166
225 da invenção, por exemplo, uma creme, filme, borrifo, baixa, remendo, é colocada na pele e passa através dela.
Um aspecto da invenção é um método para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através da pele efetivamente, por atualmente administrando a um sujeito Nanobody ou o polipeptidio da invenção.
Outra modalidade de execução da presente invenção é um uso do Nanobody ou o polipeptidio da invenção para a preparação de um medicamento para tratar, impedir e/ou aliviar os sintomas de desordens suscetíveis à modulação por uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta que é capaz de passar através da pele efetivamente.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à pele sem ser desativada, administrando topicamente a um sujeito Nanobody ou o polipeptidio da invenção.
Um aspecto da invenção é um método que para administração uma substância que controla a agregação mediada de plaqueta à circulação sanguínea de um sujeito, administrando topicamente a um sujeito Nanobody ou o polipeptidio da invenção.
Em outra modalidade de execução da presente invenção, Nanobody ou o polipeptidio da invenção além disso compreende um nanobody transportador da invenção (p. ex. 0 VHH) que
226 atua como uma transportadora de transporte ativa para o transporte do referido Nanobody ou o polipeptídio da invenção via o lúmen de pulmão ao sangue.
Nanobody ou o polipeptídio da invenção que, além disso, compreende uma transportadora que liga especificamente a um receptor presente na superfície de mucosa (células epiteliais bronquiais) resultar no transporte ativo do polipeptídio do lúmen de pulmão ao sangue. A transportadora Nanobody da invenção pode ser fundida ao Nanobody ou o polipeptídio da invenção. Tais construtos de fusão são feitos utilizando métodos conhecidos na técnica e é descrevem na presente. A transportadora Nanobody da invenção liga especificamente a um receptor na superfície de mucosa que induz uma transferência ativa através da superfície.
Outro aspecto da presente invenção é um método para determinar que nanocorpos da invenção (p. ex. 0 VHHS) são ativamente transportados na circulação sanguínea sob administração nasal. Semelhantemente um VHH ingênuo ou imune fago biblioteca pode ser administrado nasalmente, e depois de pontos de tempo diferentes depois da administração, o sangue ou os órgãos podem ser isolados para resgatar fagos que foram ativamente transportados à circulação sanguínea. Um exemplo não-restritivo de um receptor para transporte ativo do lúmen de pulmão à circulação sangüínea é o receptor Fc N (Feto). Um aspecto da invenção inclui as moléculas VHH identificadas pelo método. Tal VHH então pode ser usado como
Figure BRPI0609797B1_D0167
227 uma transportadora VHH para a entrega de um VHH terapêutico ao objetivo correspondente na circulação sangüínea sob administração nasal.
Uma modalidade de execução da presente invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso em tratamento, prevenção e/ou alívio dos sintomas de desordens que se relacionam com agregação mediada por plaqueta ou disfunção disso. As referidas desordens incluem púrpura trombótica trombocitopénica (TTP), o ataque de isquemia cerebral transiente, angina pectoris estável ou instável, enfarte cerebral, enfarte do miocárdio, doença oclusiva arterial periférica, restenose. As referidas desordens além disso incluem os que resultam de enxerto de desvio coronário, substituição de válvula de artéria coronária e intervenções coronárias como angioplastia, stenting, ou aterectomia.
Outras desordens são alguma da formação de um trombo não-oclusivo, a formação de trombo oclusivo, formação trombo arterial, oclusão coronária aguda, restenose, restenose depois de PCTA ou stenting, trombo formação em artérias estenosadas, hiperplasia depois angioplastia, aterectomia ou stenting arterial, síndrome oclusiva em um sistema vascular ou a falta de revelação de artérias de doente.
Um aspecto da invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso no tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens ou condições que se relacionam plateletmediatizada agregação ou disfunção disso, em que o referido
228
Nanobody ou polipeptídio da invenção são administrados intravenosamente, subcutaneamente, oralmente, sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação.
Outro aspecto da invenção é o uso do Nanobody ou o polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para o tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens ou condições que se relacionam com agregação mediada por plaqueta ou disfunção disso, em que o referido Nanobody ou polipeptídio da invenção são administrados intravenosamente, subcutaneamente, oralmente, sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação.
Outro aspecto da invenção é um método de tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens ou condições agregação mediada por plaqueta se relaciona que se relaciona ou disfunção disso, compreendendo administrando a um sujeito Nanobody ou o polipeptídio da invenção, em que o referido Nanobody heteroespecíficos ou o polipeptídio da invenção são administrados intravenosamente, subcutaneamente, oralmente, sublingualmente, topicamente, nasalmente, vaginalmente, retalmente ou pela inalação.
Outro aspecto da invenção é um Nanobody ou o polipeptídio da invenção para uso no tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens ou condições que se relacionam platelet-mediatizada agregação ou disfunção disso.
Outro aspecto da invenção é um uso de um polipeptídio da invenção para a preparação de um medicamento para o
Figure BRPI0609797B1_D0168
229 tratamento, prevenção e/ou alívio de desordens ou condições que se relacionam com agregação mediada por plaqueta ou disfunção disso.
Cada um pode usar Nanobody ou o polipeptídio da invenção da presente invenção para analisar agentes que modulam a ligação do polipeptídio a um vWF. Quando identificado em um ensaio que mede a ligação ou o referido deslocamento de polipeptídio sozinho, os agentes terão de ser submetidos à prova funcional para determinar se eles atuam como os moduladores da agregação mediada por plaqueta. Alguns exemplos de métodos de proteção convenientes são discutidos em WO 04/062551. Naturalmente, esses métodos podem ser facilmente aplicados à proteção para moduladores candidatos que alteram a ligação entre Nanobody ou o polipeptídio da invenção revelada na presente e vWF.
Uma célula que é útil segundo a invenção é preferivelmente selecionada do grupo composto de células bacterianas como, por exemplo, E. coli, células de levedura como, por exemplo, S. cerevisiae, P. pastoris, células de inseto ou células de mamíferos, p. ex. conforme acima mencionado.
Uma célula que é útil segundo a invenção pode ser qualquer célula na qual uma seqüência ácida nucléica que codifica Nanobody ou o polipeptídio da invenção pode ser ou foi introduzida de modo tal que o polipeptídio é expresso a níveis naturais ou acima de níveis naturais, conforme definido na presente. Preferivelmente um polipeptídio da
Figure BRPI0609797B1_D0169
230 invenção que é expresso em uma célula expõe farmacologia normal ou perto da normal, conforme definido na presente.
Segundo uma modalidade de execução preferencial da presente invenção, uma célula é selecionada do grupo composto de COS7-células, uma célula CHO, um LM (TK-) célula, uma célula NIH-3T3, célula de HEK-293, célula de K562 ou um 1321N1 célula astrocitoma mas também outras linhas de célula transfectável.
Em geral, a quantidade terapeuticamente eficaz, a dose terapeuticamente eficaz e quantidade eficaz significa a quantidade necessária para atingir o resultado ou resultados desejados (agregação de plaqueta que trata ou impede). Uma habilidade ordinária na técnica reconhecerá que a potência e, por isso, uma quantidade eficaz pode variar para vários nanocorpos ou polipeptídios que inibem a agregação mediada por plaqueta usada na invenção. Um experimentado na técnica pode avaliar prontamente a potência do Nanobody ou polipeptídio.
Por farmaceuticamente aceitável se que dizer um material que não é biologicamente ou de outra maneira indesejável, isto é, o material pode ser administrado a um indivíduo junto com Nanobody ou polipeptídio sem causar qualquer efeito biológico indesejável ou interagir em uma maneira deletéria com algum de outros componentes da composição farmacêutica na qual é contido.
A invenção revelada na presente é útil para o tratamento ou a prevenção de uma condição da agregação
231
26/ do Nanobody ou tratamento ou a administração a útil para compreende quantidade e
uma mediada por plaqueta, e compreende a administração a um sujeito de uma quantidade farmaceuticamente eficaz do Nanobody ou polipeptídio ou composição que inibe BTK e isto inibe a agregação mediada por plaqueta.
A invenção revelada na presente é útil para o tratamento ou a prevenção dos primeiros passos da formação trombo, e compreende a administração a um sujeito de uma quantidade farmaceuticamente eficaz polipeptídio ou composição segundo a invenção
A invenção revelada na presente é prevenção restenose, um sujeito de farmaceuticamente eficaz do Nanobody ou polipeptídio ou composição segundo a invenção.
Um aspecto da presente invenção é o uso de nanocorpos ou os polipeptídios da invenção para tratar ou e previne uma condição da agregação mediada por plaqueta, em um sujeito e compreende administração de uma quantidade farmaceuticamente eficaz do Nanobody ou polipeptídio em combinação com o outro, como, por exemplo, aspirina.
Um aspecto da presente invenção é o uso de nanocorpos ou os polipeptídios da invenção para tratar ou e previne uma condição da agregação mediada por plaqueta, em um sujeito e compreende administração de uma quantidade farmaceuticamente eficaz do Nanobody ou polipeptídio em combinação com o outro, como, por exemplo, um agente trombolítico.
Outro aspecto da presente invenção é um uso do
Figure BRPI0609797B1_D0170
232
Nanobody ou o polipeptídio da invenção para tratar ou prevenir placa ou trombo em um indivíduo. A referida placa ou a formação de trombo podem ser em condições de alto desvio. Tanto em trombose como em re-oclusão, a adesão reversível ou amarração das plaquetas em alto taxa de corte é seguido por uma adesão firme através do receptor colágeno em plaquetas que resultam em ativação de plaqueta; amarração de plaquetas por vWF a colágeno exposto na parede de vaso danificada é especialmente importante sob altas condições de corte. Os inventores encontraram que o Nanobody ou polipeptídio da invenção da presente invenção inesperadamente funcionava bem em altas condições absolutas.
A presente invenção não é limitada à administração de
formulações que compreendem Nanobody único ou o polipeptídio
da invenção. É dentro dos limites da invenção para fornecer
tratamentos de combinação em que uma formulação é
administrada a um paciente na necessidade disso que
compreende mais de um Nanobody ou o polipeptídio da
invenção.
As condições da agregação mediada por plaqueta incluem, mas não são limitadas a, angina instável, angina estável, angina pectoris, formação de embolus, trombose profundamente vã, síndrome urêmico hemolítico, anemia hemolítica, a falha renal aguda, complicações trombolíticas, púrpura trombótica trombocitopénica, comgelopatia intravascular disseminada, trombose, doença cardíaca coronária, complicações tromboembólicas, enfarte do
233 miocárdio, restenose, e formação de trombose atrial em fibrilaçâo atrial, angina instável crônica, ataques e derrames isquêmicos transientes, doença vascular periférica, trombose arterial, pre-eclampsia, embolia, restenose e/ou trombose depois de angioplastia, endarterectomia carótida , anastomose de enxertos vasculares e exposição crônica a dispositivos cardiovasculares. Tais condições também podem resultar de tromboembolismo e reoculsâo durante e depois da terapia trombolítica, depois de angioplastia, e depois do desvio de artéria coronária.
É bem conhecido na técnica como determinar a inibição da agregação mediada por plaqueta que usa os testes padrão descritos na presente, ou usa outros testes semelhantes. Preferivelmente, o método resultaria em pelo menos uma redução de 10% da agregação mediada por plaqueta, inclusive, por exemplo, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, ou qualquer quantidade no meio, mais preferivelmente em 90%.
Semelhantemente o método resultaria em pelo menos uma redução de 10% do cálcio intracelular mobilisation inclusive, por exemplo, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%. Semelhantemente o método resultaria em pelo menos uma redução de 10% do nível de PLCg 2 fosforilado inclusive, por exemplo, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90 100%.
A redução pode ser medida, por exemplo, comparando a impedância ótica em uma agregômetro de plaqueta de
234 cronologia. Qualquer outro método de medição conhecido também pode ser usado. Por exemplo, (1) sobre a estimulação colágeno, o nível de aumentos de mobilização de cálcio intracelulares colágeno-induzidos dentro de algum tempo e portanto a medição pode incluir o medir do nível de cálcio intracelular colágeno-induzido ou (2) sobre a estimulação colágeno, o nível de fosforilado PLCg 2 aumentos dentro de algum tempo e portanto a medição pode incluir o medir do nível de fosforilado PLCg 2.
As células podem ser contatadas em vitro, por exemplo, acrescentando Nanobody ou o polipeptídio da invenção ao meio de cultura (pela infusão contínua, pela entrega no bolo, ou modificando o meio para um meio que contém Nanobody ou o polipeptídio) ou acrescentando Nanobody ou polipeptídio ao fluido extracelular in vivo (por entrega local, entrega sistêmica, inalação, injeção intravenosa, bolo entrega, ou infusão contínua). A duração do contato com uma célula ou a população de células é determinada Nanobody ou polipeptídio está presente a níveis fisiologicamente eficazes ou a níveis supostos fisiologicamente eficazes no fluido médio ou extracelular que banha a célula ou células. Preferivelmente, a duração do contato é 1-96 horas, e mais preferivelmente, para 24 horas, mas tais tempos variariam baseado meia-vida do Nanobody ou polipeptídio e podem ser otimizadas por um experimentado na experimentação de rotina de utilização de arte.
Nanobody ou o polipeptídio útil na presente invenção
235
Figure BRPI0609797B1_D0171
podem ser formulados como composições farmacêuticas e administrados a um hospedeiro mamífero, como um paciente humano ou um animal doméstico em várias formas adaptadas à via escolhida da administração, isto é, oralmente ou parenteralmente, por intra-nasalmente por inalação, vias intravenosas, intramusculares, tópicas ou subcutâneas.
Nanobody ou o polipeptidio da presente invenção também podem ser administrados usando métodos de administração de terapia genética. Ver, p. ex.,Patente U.S. n. 5,399,346, que é incorporada por referência em sua totalidade. Usando um método de administração por terapia genética, células primárias transfetadas com o gene para Nanobody ou o polipeptidio da presente invenção podem ser adicionalmente transfetadas com promotores específicos de tecido para visar órgãos específicos, tecido, enxertos, tumores, ou células.
Portanto, o presente Nanobody ou polipeptidio pode ser sistemicamente administrado, p. ex., oralmente, em combinação com um veículo farmaceuticamente aceitável como um diluente inerte ou uma transportadora comestível assimilável. Eles podem ser incluídos em cápsulas de gelatina de capas duras ou suaves, podem ser compressos em pastilhas, ou incorporados diretamente com a comida da dieta do paciente. Para a administração terapêutica oral, Nanobody ou o polipeptidio podem ser combinados com um ou vários excipientes e usados na forma de pastilhas ingeríveis, pastilhas bucais, pastilhas, cápsulas, elixires, suspensões, xaropes, bolinhos delgados, e assim por diante. Tais
236
T.F>
composições e as preparações devem conter pelo menos 0.1% do Nanobody ou polipeptídio. A porcentagem das composições e preparações pode ser, naturalmente, variada e pode estar convenientemente entre aproximadamente 2 a aproximadamente 60% do peso de uma forma de dosagem de unidade dada. A quantidade do Nanobody ou polipeptídio em tais composições terapeuticamente úteis é tal que um nível de dosagem eficaz será obtido.
As pastilhas, comprimidos, pílulas, cápsulas, e assim por diante também podem conter o seguinte: aglutinantes como goma tragacanth, acácia, amido de grão ou gelatina; excipientes como fosfato bicálcico; um agente que se desintegra como amido de grão, amido de batatas, algínico ácido e assim por diante; um lubrificante como magnésio estearato; e um agente de adoçamento como sacarose, fructose, lactose ou aspartame ou um agente de sabor como hortelã, o óleo de pirola, ou sabor de cereja pode ser acrescentado. Quando a forma de dosagem de unidade é uma cápsula, ela pode conter, além de materiais do tipo acima mencionado, um portador líquido, como um óleo vegetal ou um glicol de polietileno. Vários outros materiais podem estar presentes como revestimentos ou modificar de outra maneira a forma física da forma de dosagem de unidade sólida. Por exemplo, as pastilhas, as pílulas, ou as cápsulas podem ser cobertas de gelatina, cera, goma-laca ou açúcar e assim por diante. Um xarope ou o elixir podem conter Nanobody ou o polipeptídio, a sacarose ou fructose como um agente de
Figure BRPI0609797B1_D0172
237 adoçamento, metila e propilparabenos como preservantes, uma tintura e sabor como sabor de cereja ou cor de laranja. Naturalmente, qualquer material usado na preparação de qualquer forma de dosagem de unidade deve ser farmaceuticamente aceitável e substancialmente não-tóxica nas quantidades empregadas. Além do mais, Nanobody ou o polipeptídio podem ser incorporados em preparações e dispositivos de administração prolongada.
Nanobody ou o polipeptídio também podem ser administrados intravenosamente ou intraperitonealmente por infusão ou injeção. As soluções do Nanobody ou polipeptídio podem ser preparadas em água, opcionalmente misturada com um surfactante não-tóxico. As dispersões também podem ser preparadas em glicerol, glicol de polietileno líquido, triacetin, e misturas disso e em óleos. Em condições ordinárias de armazenamento e uso, essas preparações contêm um conservante para prevenir o crescimento de microrganismos.
As formas de dosagem farmacêuticas convenientes para a injeção ou a infusão podem incluir soluções aquosas estéreis ou dispersões ou pó estéril que compreende o ingrediente ativo que são adaptados para a preparação extemporânea de soluções injetáveis ou infusíveis estéreis ou dispersões, opcionalmente encapsuladas em lipossomas. Em todos os casos, a forma de dosagem última deve ser estéril, fluida e estável nas condições de fabricação e armazenamento. A transportadora líquida ou o veículo podem ser um meio de
238
4η dispersão solvente ou líquido, compreendendo, por exemplo, água, etanol, um poliol (por exemplo, glicerol, glicol de propileno, glicol de polietileno líquido, e assim por diante), óleos vegetais, ésteres gliceril não-tóxicos , e misturas convenientes disso. A fluidez apropriada pode ser mantida, por exemplo, pela formação de lipossomas, pela manutenção do tamanho de partícula requerido em caso de dispersões ou pelo uso de surfactantes. A prevenção da ação de microrganismos pode ser ocasionada por vários agentes antibacterianos e antifungosos, por exemplo, parabenos, clorobutanol, phenol, ácido sórbico, timerosal, e assim por diante. Em muitos casos, será preferível incluir agentes isotônicos, por exemplo, açúcar, buffers ou cloreto de sódio. A absorção prolongada das composições injetáveis pode ser ocasionada pelo uso nas composições de agentes que atrasam absorção, por exemplo, alumínio monostearato e gelatina.
As soluções injetáveis estéreis estão preparadas incorporando Nanobody ou polipeptídio na quantidade requerida no solvente apropriado com vários de outros ingredientes enumerados anteriormente, como requerido, seguido pela esterilização com filtro. Em caso do pó estéril para a preparação de soluções injetáveis estéreis, os métodos preferenciais da preparação são a secagem à vácuo e a técnicas de secagem por congelamento, que produzem um pó do ingrediente ativo mais qualquer presente de ingrediente desejado adicional nas soluções anteriormente estéreis-
Figure BRPI0609797B1_D0173
239 filtradas .
para administração tópica, o presente Nanobody ou o polipeptídio podem ser aplicados na forma pura, isto é, quando eles são líquidos. Contudo, será geralmente desejável administrá-los à pele como composições ou formulações, em combinação com uma transportadora dermatologicamente aceitável, que pode ser um sólido ou um líquido.
Os portadores sólidos úteis incluem sólidos finamente divididos como talco, barro, celulose microcristalina, sílica, alumina e assim por diante. Os portadores líquidos úteis incluem água, hidroálcalis ou glicol ou misturas de água-álcool/glicol, nas quais o presente Nanobody ou o polipeptídio podem ser dissolvidos ou dispersados a níveis eficazes, opcionalmente com a ajuda de surfactantes nãotóxicos. Adjuvantes como fragrâncias e agentes antimicrobiais adicionais podem ser acrescentados para otimizar as propriedades para um uso dado. As composições líquidas resultantes podem ser aplicadas de almofadas absorventes, usaram para impregnar bandagens e outro curativos, ou borrifados na área afetada que usa pulverizadores de aerossol ou tipo de bomba.
Os espessantes como polímero sintético, ácidos gordurosos, sais e ésteres de ácidos gordurosos, álcoois gordurosos, celuloses modificadas ou materiais minerais modificados também podem ser empregados com transportadoras líquidas para formar pastas para borrifar, géis, unguentos, sabões, e assim por diante, para aplicação diretamente à
240
Figure BRPI0609797B1_D0174
pele do usuário.
Exemplos de composições dermatológicas úteis que podem ser usadas para entregar Nanobody ou o polipeptídio à pele são conhecidos na técnica; por exemplo, ver Jacquet et al. (U.S. Pat. N°. 4,608,392), Geria (U.S. Pat. N°. 4,992,478),
Smith et al. (U.S. Pat. N°. 4,559,157) e Wortzman (U.S. Pat.
N° . 4,820,508) .
preferivelmente de concentração em uma
Dosagens úteis do Nanobody ou polipeptídio podem ser determinadas comparando sua atividade in vitro, e na atividade in vivo em modelos animais. Os métodos para a extrapolação de dosagens eficazes em ratos, e outros animais, a seres humanos são conhecidos na técnica; por exemplo, ver U.S. Pat. N°. 4,938,949.
Geralmente, a concentração do Nanobody ou polipeptídio em uma composição líquida, como uma loção, será de aproximadamente 0.1-25 wt-%, aproximadamente 0.5-10 wt-%. A composição semi-sólida ou sólida como um gel ou um pó será aproximadamente 0.15% de wt, preferivelmente aproximadamente
0.5-2.5 wt-%.
A quantidade do Nanobody ou polipeptídio requereu para que o uso no tratamento varie com a via de administração, a natureza da condição que é tratada e a idade e a condição do paciente e será enfim à discrição do médico ou clínico atendente. Também a dosagem do Nanobody ou polipeptídio varia dependendo da célula objetivo, tumor, tecido, enxerto, ou órgão.
241 ^1
A dose desejada pode ser convenientemente apresentada em uma dose única ou como doses divididas administradas em intervalos apropriados, por exemplo, como dois, três, quatro ou mais sub-doses por dia. A própria sub-dose pode ser além disso dividida, p. ex., em um número de administrações discretas livremente espaçadas; como múltiplas inalações de um insuflador ou pela aplicação de uma pluralidade de gotas no olho.
Um regime de administração pode incluir o tratamento de longo prazo, diário. Por de longo prazo se entende pelo menos duas semanas e preferivelmente, várias semanas, meses, ou anos da duração. As modificações necessárias nesta variedade de dosagem podem ser determinadas por uma habilidade ordinária na técnica usando só experimentação de rotina dada nos ensinamentos na presente. Ver Remington's Pharmaceuticals Sciences (Martin, E.W., editor 4), Mack Publishing Co, Easton, PA. A dosagem também pode ser ajustada pelo médico individual no caso de qualquer complicação.
A invenção provê um agente que é um modulador da agregação mediada por plaqueta.
agente de candidato pode ser um agente sintético, ou uma mistura de agentes, ou ser um produto natural (p. ex. um extrato de planta ou cultura supernadante). Um agente de candidato segundo a invenção inclui uma pequena molécula que pode ser sintetizada, um extrato natural, peptídeos, proteína, carboidratos, lipídios etc.
242
Figure BRPI0609797B1_D0175
Os Agentes moduladores candidato de grandes bibliotecas de agentes sintéticos ou naturais podem ser protegidos. Os meios numerosos são atualmente usados para a síntese casual e dirigida de sacarida, peptídeo, e agentes baseados em ácido nucléico. As bibliotecas de agente sintéticas são comercialmente disponíveis de um número de companhias inclusive Maybridge Chemical Co (Trevillet, o Cornwall, Reino Unido), Comgenex (Princeton, NJ) , Brandon Associates (Merrimack, NH), e Microsource (New Milford, CT) . Uma biblioteca química rara é disponível de Aldrich (Milwaukee, WI) . As bibliotecas combinatórias são disponíveis e podem ser preparadas. Alternativamente, as bibliotecas de agentes naturais na forma de extratos bacteriano, fungoso, planta e dos animais são disponíveis de p. ex., Pan Laboratories (Bothell, WA) ou MycoSearch (NC) , ou são prontamente produzíveis por métodos bem conhecidos na técnica. Adicionalmente, as bibliotecas naturais e sinteticamente produzidas e os agentes são prontamente modificados por meios químicos, físicos, e bioquímicos através de convencionais.
Os agentes úteis podem ser encontrados dentro de classes químicas numerosas. Os agentes úteis podem ser agentes orgânicos, ou pequenos agentes orgânicos. Os pequenos agentes orgânicos têm um peso molecular de mais de 50 ainda menos de aproximadamente 2,500 daltons, preferivelmente menos de aproximadamente 750, mais preferivelmente menos de aproximadamente 350 daltons. As
Figure BRPI0609797B1_D0176
243 classes exemplares incluem heterociclos, peptídeos, sacarídeos, esteróides, e assim por diante. Os agentes podem ser modificados para realçar a eficácia, a estabilidade, a compatibilidade farmacêutica, e assim por diante. A identificação estrutural de um agente pode ser usada para identificar, gerar, ou proteger agentes adicionais. Por exemplo, onde os agentes de peptídeo são identificados, eles podem ser modificados de vários modos para realçar a sua estabilidade, como utilização de um aminoácido desnatural, como um ácido D-amino, em particular D-alanina, por funcionalização do amino ou término carboxíiico, p. ex. para o grupo amino, acilação ou alquilação, e para o grupo carboxilo, esterificação ou amidificação, ou o parecido.
Para análise primária, uma concentração útil de um agente de candidato segundo a invenção é de aproximadamente 10 mm a aproximadamente 100 μ M ou mais (isto é, 1 mM, 10 mM, 100 mM, I M etc.). A concentração de análise primária será usada como um limite superior, junto com nove concentrações adicionais, em que as concentrações adicionais são determinadas reduzindo a concentração de análise primária em intervalos de meio-log (p. ex. para mais 9 concentrações) para análises secundárias ou para geração de curvas de concentração.
Um conjunto de análise de alto rendimento segundo a invenção compreende todos os meios necessários e meios de comunicação para executar a detecção de um agente que modula a agregação mediada por plaqueta interagindo com um objetivo
Figure BRPI0609797B1_D0177
244 da invenção, como, por exemplo, vWF, ou fragmento disso na presença de um polipeptídio, preferivelmente em uma concentração na variedade de 1 manual técnico a 1 mm. 0 conjunto compreende o seguinte. As células Recombinantes da invenção, compreendendo e expressando a seqüência de nucleotídeos que codifica vWF, ou fragmento disso, que é cultivado segundo o conjunto em um suporte sólido, como uma chapa de microtitragem, mais preferivelmente uma placa de microtritragem com 96 cavidades, segundo os métodos bem conhecidos à pessoa experimentada na técnica sobretudo como descrito em WO 00/02045. Alternativamente o vWF, ou o fragmento disso são fornecidos em uma forma purificada a ser imobilizada em, por exemplo, uma placa de microtritragem com 96 cavidades pela pessoa experimentada na técnica. Alternativamente o vWF, ou o fragmento disso são fornecidos no conjunto pré-imobilizado em, por exemplo, uma placa de microtritragem com 96 cavidades. Agentes moduladores segundo a invenção, em concentrações de aproximadamente 1 μ M a 1 mm ou mais, são acrescentados a cavidades definidas na presença de uma concentração apropriada do Nanobody ou o polipeptídio da invenção os referidos a concentração do referido polipeptídio preferivelmente na variedade de 1 μ M a 1 mm. Os conjuntos podem conter mais de um polipeptídio
Os ensaios de ligação são executados como segundo os métodos já revelados na presente e os resultados são em comparação com o nível de base de, por exemplo, vWF, ou fragmento disso que liga a um polipeptídio da invenção, mas
Figure BRPI0609797B1_D0178
245 a ausência do agente modulador acrescentado. As cavidades que mostram pelo menos 2 vezes, preferivelmente 5 vezes, mais preferivelmente 10 vezes e o mais preferivelmente uma 100 vezes ou mais aumento ou redução no vWF-polipeptídio que liga (por exemplo) comparando com o nível da atividade a ausência do modulador, são selecionados para nova análise.
A invenção provê conjuntos úteis para proteção para os moduladores da agregação platelet-mediatizada, bem como conjuntos úteis para o diagnóstico de doenças ou desordens caracterizado por de-regulação de agregação mediada por plaqueta. Os conjuntos úteis segundo a invenção podem incluir um vWF isolado, ou o fragmento disso. Alternativamente, ou além do mais, um conjunto pode compreender células transformadas para expressar vWF, ou o fragmento disso. Em uma nova modalidade de execução, um conjunto segundo a invenção pode compreender um polinucleotídeo que codifica vWF, ou o fragmento disso. Em uma ainda nova modalidade de execução, um conjunto segundo a invenção pode compreender os escorvadores específicos úteis para a amplificação de vWF, ou fragmento disso os Conjuntos úteis segundo a invenção podem compreender um Nanobody ou o polipeptídio da invenção. Um conjunto segundo a invenção pode compreender as células transformadas para expressar o referido polipeptídio.
Os conjuntos podem conter mais de um polipeptídio. Em uma nova modalidade de execução, um conjunto segundo a invenção pode compreender um polinucleotídeo codificação de
Figure BRPI0609797B1_D0179
246 uma macromolécula, por exemplo, vWF, ou fragmento disso. Em uma ainda nova modalidade de execução, um conjunto segundo a invenção pode compreender os escorvadores específicos úteis para a amplificação de uma macromolécula como, por exemplo, vWF, ou fragmento disso. Todos os conjuntos segundo a invenção compreenderão os itens determinados ou combinações de itens e materiais de embalagem, por isso. Os conjuntos também incluirão instruções para uso.
A invenção também provê dispositivos médicos invasivos cobertos de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção ou um agente que resulta de um método de proteção da invenção para usa em dispositivos que requerem o mesmo. Os exemplos nãorestritivos de dispositivos incluem tubulação cirúrgico, dispositivos de oclusão, dispositivos proféticos. A aplicação para os referidos que os dispositivos incluem procedimentos cirúrgicos que requerem uma modulação da agregação mediada por plaqueta em volta do sítio da invasão.
Uma modalidade de execução do presente é um método para tratar dispositivos médicos invasivos para prevenir a agregação mediana de plaqueta em volta do sítio da invasão que compreende o passo do revestimento de dito dispositivo com um Nanobody ou o polipeptídio da invenção ou agente segundo a invenção.
Outra modalidade de execução do presente é uns dispositivos médicos invasivos que logra a agregação mediana de plaqueta em volta do sítio da invasão, em que os referidos que o dispositivo é coberto de um Nanobody ou o
247
Figure BRPI0609797B1_D0180
polipeptídio da invenção ou agente segundo a invenção.
Em outro aspecto, a invenção se refere a um método para a prevenção e/ou o tratamento de pelo menos uma desordem mediada por agregação (conforme descrito na presente), o referido método compreendendo a administração, a um sujeito na necessidade disso, de uma quantidade farmaceuticamente ativa de um Nanobody da invenção, de um polipeptídio da invenção, e/ou de uma composição farmacêutica que compreende o mesmo.
No contexto da presente invenção, o termo a prevenção e/ou o tratamento não só compreende a prevenção e/ou o tratamento da doença, mas também geralmente compreendem a prevenção do ataque da doença, redução de velocidade ou reversão do progresso de doença, prevenção ou redução de velocidade do ataque de um ou vários sintomas associados com a doença, redução e/ou alívio de um ou vários sintomas associados com a doença, redução da gravidade e/ou a duração da doença e/ou de qualquer sintoma associado com isso e/ou prevenção de um novo aumento na gravidade da doença e/ou de qualquer sintoma associado com isso, prevenção, redução ou reversão de qualquer dano fisiológico causado pela doença, e geralmente qualquer ação farmacológica que é benéfica ao paciente que é tratado.
sujeito a ser tratado pode ser qualquer animal de sangue quente, mas é especialmente um mamífero, e mais especialmente um ser humano. Como estará claro para a pessoa experimentada, o sujeito a ser tratado será especialmente
248
Figure BRPI0609797B1_D0181
uma pessoa que sofre de, ou em perigo de, as doenças e desordens mencionadas na presente.
A invenção se refere a um método para a prevenção e/ou o tratamento de pelo menos uma doença ou desordem que pode ser prevenida e/ou tratada administrando um Nanobody ou polipeptídio da invenção a um paciente, o referido método compreendendo a administração a um sujeito na necessidade disso, de uma quantidade farmaceuticamente ativa de um Nanobody da invenção, de um polipeptídio da invenção, e/ou de uma composição farmacêutica que compreende o mesmo.
Mais especialmente, a invenção se refere a um método para a prevenção e/ou o tratamento de pelo menos uma doença ou desordem escolhida do grupo composto das doenças e desordens enumerados na presente, o referido método compreendendo a administração, a um sujeito na necessidade disso, de uma quantidade farmaceuticamente ativa de um Nanobody da invenção, de um polipeptídio da invenção, e/ou de uma composição farmacêutica que compreende o mesmo.
Em outra modalidade de execução, a invenção se refere a um método para a imunoterapia, e especialmente para imunoterapia passiva, cujo método compreende a administração, a um sujeito que sofre de ou está em perigo das doenças e desordens mencionados na presente, uma quantidade farmaceuticamente ativa de um Nanobody da invenção, de um polipeptídio da invenção, e/ou de uma composição farmacêutica que compreende o mesmo.
Nos acima mencionados métodos, os nanocorpos e/ou os
Figure BRPI0609797B1_D0182
249 polipeptídios da invenção e/ou as composições que compreendem o mesmo podem ser administrados em qualquer maneira conveniente, dependendo da formulação farmacêutica específica ou composição a ser usada. Portanto, os nanocorpos e/ou os polipeptídios da invenção e/ou as composições que compreendem os mesmos, por exemplo, podem ser administrados oralmente, intraperitonealmente (p. ex. intravenosamente, subcutaneamente, intramuscularmente, ou via qualquer outra via de administração que acesse o trato gastrintestinal), intranasalmente, transdermicamente, topicamente, por meio de um supositório, pela inalação, novamente dependendo da formulação farmacêutica específica ou composição a ser usada. 0 clínico será capaz de selecionar uma via conveniente de administração e uma formulação farmacêutica conveniente ou composição a ser usada em tal administração, dependendo da doença ou desordem a ser prevenida ou tratada e outro fatores bem conhecidos ao clínico.
Como mencionado na presente e como estará claro para a pessoa experimentada, condições para agudas e complicações (isto é, como pode ocorrer com algumas desordens mediadas por agregação mencionadas na presente), normalmente a administração diretamente no torrente sanguíneo por infusão ou injeção ou qualquer outro meio conveniente será preferido.
nanocorpos e/ou os polipeptídios da invenção e/ou as composições que compreendem o mesmo são administrados
250 2 TC segundo um regime do tratamento que é conveniente para a prevenção e/ou o tratamento da doença ou desordem a ser prevenida ou tratada. O clínico será geralmente capaz de determinar um regime de tratamento conveniente, dependendo de fatores como a doença ou desordem a ser prevenida ou tratada, a gravidade da doença a ser tratada e/ou a gravidade dos sintomas disso, o Nanobody específico ou o polipeptídio da invenção a ser usado, a via específica de administração e formulação farmacêutica ou composição a ser usada, a idade, gênero, peso, dieta, a condição geral do paciente, e fatores semelhantes bem conhecidos ao clínico.
Geralmente, o regime de tratamento compreenderá a administração de um ou vários nanocorpos e/ou os polipeptídios da invenção, ou de uma ou várias composições que compreendem os mesmos, em uma ou várias quantidades farmaceuticamente eficazes ou doses. A quantidade(s) específica ou as doses a serem administradas podem ser determinadas pelo clínico, novamente baseado nos fatores citados anteriormente.
Geralmente, para a prevenção e/ou o tratamento das doenças e desordens mencionadas na presente e dependendo da doença específica ou desordem a ser tratada, a potência do Nanobody específico e o polipeptídio da invenção a ser usado, a via específica de administração e a formulação farmacêutica específica ou composição usada, os nanocorpos e polipeptídios da invenção serão geralmente administrados em uma quantidade entre 1 grama e 0.01 microgramas por peso de
251
Figure BRPI0609797B1_D0183
corpo de quilograma por dia, preferivelmente entre 0.1 gramas e 0.1 microgramas por peso de corpo de quilograma por dia, como aproximadamente 1, 10, 100 ou 1000 microgramas por peso de corpo de quilograma por dia, qualquer continuamente (p. ex. pela infusão), como uma dose diária única ou como múltiplas doses divididas durante o dia. O clínico será geralmente capaz de determinar uma dose diária conveniente, dependendo dos fatores mencionados na presente. Também ficará claro que em casos específicos, o clínico pode decidir desviar-se dessas quantidades, por exemplo, com base nos fatores citados anteriormente e o seu juízo de perito. Geralmente, um pouco de orientação nas quantidades a ser administradas pode ser obtida das quantidades normalmente administradas para anticorpos convencionais comparáveis ou fragmentos de anticorpo contra o mesmo objetivo administrado via essencialmente a mesma rota, considerando contudo diferenças em afinidade/avidez, eficácia, biodistribuição, meia-vida e fatores semelhantes bem conhecidos à pessoa experimentada.
Normalmente, no acima mencionado método, um Nanobody único ou o polipeptidio da invenção serão usados. É contudo dentro dos limites da invenção para usar dois ou mais nanocorpos e/ou polipeptidios da invenção em combinação.
Os nanocorpos e os polipeptidios da invenção também podem ser usados em combinação com um ou vários compostos ou princípios novos farmaceuticamente ativos, isto é, como um regime de tratamento combinado, que pode ou pode não levar a
252
272 um efeito sinergístico. Novamente, o clínico será capaz de selecionar tais novos compostos ou princípios, bem como um regime de tratamento combinado conveniente, baseado nos fatores citados anteriormente e o seu juízo de perito.
Especialmente, os nanocorpos e os polipeptídios da invenção podem ser usados em combinação com outros compostos farmaceuticamente ativos ou princípios que são ou podem ser usados para a prevenção e/ou o tratamento das doenças e desordens citadas na presente, em conseqüência do qual um efeito sinergístico pode ou não ser obtido. Os exemplos de tais compostos e princípios, bem como vias, métodos e formulações farmacêuticas ou composições que para os administram serão claros ao clínico, e, por exemplo, incluirão, mas não são limitados a heparina, aspirina (p. ex. Aspegic®), Plavix e/ou Reopro.
Quando duas ou mais substâncias ou princípios devem ser usados como parte de um regime de tratamento combinado, eles podem ser administrados via a mesma rota de administração ou via rotas diferentes da administração, em essencialmente o mesmo tempo ou em tempos diferentes (p. ex. essencialmente simultaneamente, consecutivamente, ou segundo um regime alternante). Quando as substâncias ou os princípios são administrados para ser simultaneamente via a mesma rota de administração, eles podem ser administrados como formulações farmacêuticas diferentes ou composições ou parte de uma formulação farmacêutica combinada ou composição, como estará claro para a pessoa experimentada.
253
Figure BRPI0609797B1_D0184
Também, quando duas ou mais substâncias ativas ou princípios devem ser usados como parte de um regime de tratamento combinado, cada uma das substâncias ou princípios pode ser administrada na mesma quantidade e segundo o mesmo regime que usado quando o composto ou o princípio são usados sozinhos, e tal uso combinado pode ou não levar a um efeito sinergístico. Contudo, quando o uso combinado de duas ou mais substâncias ativas ou princípios leva a um efeito sinergístico, também pode ser possível reduzir a quantidade de um, mais ou todas das substâncias ou princípios a ser administrados, ainda realizando a ação terapêutica desejada. Isto, por exemplo, pode ser útil para a evitação, a limitação ou a redução de quaisquer efeitos colaterais não desejados que se associam com o uso de uma ou várias das substâncias ou princípios quando eles são usados nas suas quantidades habituais, ainda obtendo o efeito farmacêutico ou terapêutico desejado.
A eficácia do regime de tratamento usado segundo a invenção pode ser determinada e/ou seguida em qualquer maneira conhecida por si para a doença ou a desordem implicada, como serão claras ao clínico. O clínico também será capaz, onde apropriado e ou um IM a base de caso-por-caso, de mudar ou modificar um determinado regime de tratamento, para realizar o efeito terapêutico desejado, para evitar, para limitar ou reduzir efeitos colaterais não desejados, e/ou realizar um equilíbrio apropriado entre a realização do efeito
254 terapêutico desejado de um lado e evitação, limitação ou redução dos efeitos colaterais indesejados de outro lado.
O sujeito a ser tratado pode ser qualquer animal de sangue quente, mas é especialmente um mamífero, e mais especialmente um ser humano. Como estará claro para a pessoa experimentada, o sujeito a ser tratado será especialmente uma pessoa que sofre de, ou em perigo de, as doenças e desordens mencionadas na presente.
A invenção também relaciona ao uso de um Nanobody ou o polipeptídio da invenção na preparação de uma composição farmacêutica para a prevenção e/ou o tratamento de pelo menos uma doença ou desordem (p. ex. uma desordem de agregação como mencionado na presente) que pode ser prevenido e/ou tratado administrando um Nanobody ou polipeptídio da invenção a um paciente.
Geralmente, o regime de tratamento será seguido até que o efeito terapêutico desejado seja realizado e/ou contanto que o efeito terapêutico desejado seja mantido. Novamente, isto pode ser determinado pelo clínico.
Finalmente, também estará claro para a pessoa experimentada que pode ser possível enxertar um ou vários dos CDR'S acima mencionados para os nanocorpos da invenção para outros andaimes, inclusive, mas não limitado a, andaimes humanos ou andaimes de não-imunoglobulina. Andaimes convenientes e técnicas para tal enxerto de CDR estará claro para a pessoa experimentada e é bem conhecido na técnica, vide, por exemplo, os US-A-7,180,370, WO 01/27160, EP 0
Figure BRPI0609797B1_D0185
255
605522, EP 0 460167, os US-A-7,054,297, Nicaise et al., Protein Science (2004), 13:1882-1891; Ewert et al., Métodos, 2004 Oct; 34 (2):184-199; Kettleborough et al., Proteína Eng. Out de 1991; 4 (7): 773-783; O'Brien e Jones, Métodos Mol. Biol. 2003: 207: 81-100; e Skerra, J. Mol. Recognit. 2000: 13: 167-187, e Saerens et al., J. Mol. Biol. 2005 Sep 23; 352 (3):597-607, e as novas referências citadas na presente; e também inclua, por exemplo, as regiões de armação de outros (únicos) anticorpos de domínio. Por exemplo, as técnicas conhecidas por si para enxertando rato ou CDR's de rato para armações humanas e andaimes podem ser usadas em uma maneira análoga para fornecer a proteína quimérica que compreende um ou vários do CDR'S dos nanocorpos da invenção e um ou regiões ou seqüências de armação humanas.
Portanto, em outra modalidade de execução, a invenção compreende um polipeptídio quimérico que compreende pelo menos uma seqüência CDR escolhida do grupo composto de seqüências CDRI, as seqüências de CDR2 e as seqüências CDR3 mencionadas na presente para os nanocorpos da invenção. Preferivelmente, tal polipeptídio quimérico compreende pelo menos uma seqüência CDR escolhida do grupo composto das seqüências CDR3 mencionada na presente para os nanocorpos da invenção, e opcionalmente também pelo menos uma seqüência CDR escolhida do grupo composto das seqüências CDRI e CDR2 mencionada na presente para os nanocorpos da invenção. Por exemplo, tal polipeptídio quimérico pode compreender uma
256
Figure BRPI0609797B1_D0186
seqüência CDR escolhida do grupo composto das seqüências CDR3 mencionada na presente para os nanocorpos da invenção, uma seqüência CDR escolhida do grupo composto das seqüências CDRl mencionada na presente para os nanocorpos da invenção e uma seqüência CDR escolhida do grupo composto das seqüências CDRl e CDR2 mencionada na presente para os nanocorpos da invenção. As combinações do CDR'S que são mencionadas na presente como preferidas para os nanocorpos da invenção também serão normalmente preferidas para esses polipeptídios quiméricos.
nos referidos polipeptídios quiméricos, o CDR'S pode ser ligado a novas seqüências de seqüências aminoácidas e/ou ligado um a outro via seqüências aminoácidas, nas quais as referidas seqüências aminoácidas são preferivelmente seqüências de armação ou são seqüências aminoácidas que atuam como seqüências de armação, ou em conjunto formam um andaime para apresentar o CDR'S. A referência é novamente feita à arte prévia mencionada no parágrafo último. Segundo uma modalidade de execução preferencial, as seqüências aminoácidas são seqüências de armação humanas, por exemplo, seqüências de armação de VH3. Contudo, seqüências de armação não-humanas, sintéticas, semi-sintéticas ou de nãoimunoglobulina também pode ser usadas. Preferivelmente, as seqüências de armação usadas são tais que (1) o polipeptídio quimérico é capaz de ligar xxxx, isto é, com uma afinidade que é pelo menos 1%, preferivelmente pelo menos 5%, mais preferivelmente pelo menos 10%, como pelo menos 25% e até
257
Figure BRPI0609797B1_D0187
50% ou 90% ou mais da afinidade do correspondente Nanobody da invenção; (2) o polipeptídio quimérico é conveniente para uso farmacêutico; e (3) o polipeptídio quimérico é preferivelmente essencialmente nâo-imunogênico nas condições desejadas para uso farmacêutico (isto é, indicação, modo de administração, dose e regime de tratamento) disso (que pode ser essencialmente análogo às condições descritas na presente para o uso dos nanocorpos da invenção).
Segundo uma modalidade de execução não-restritiva, o polipeptídio quimérico compreende pelo menos duas seqüências CDR (como acima mencionado) ligado via pelo menos uma seqüência de armação, na qual preferivelmente pelo menos uma de duas seqüências CDR é uma seqüência CDR3, com outra seqüência CDR que é um CDRI ou seqüência CDR2. Segundo uma modalidade de execução preferencial, mas não-restritiva, o polipeptídio quimérico compreende pelo menos duas seqüências CDR (como acima mencionado) ligado pelo menos duas seqüências de armação, nas quais preferivelmente pelo menos uma de três seqüências CDR é uma seqüência CDR3, com outras duas seqüências CDR que são seqüências CDRI ou CDR2, e preferivelmente sendo uma seqüência CDRI e uma seqüência CDR2. Segundo uma modalidade de execução especificamente preferencial, mas não-restritiva, os polipeptídios quiméricos têm a estrutura FRI' - CDRI - FR2' - CDR2 - FR3' - CDR3 - FR4', no qual CDRI, CDR2 e CDR3 são como definidos na presente para o CDR'S dos nanocorpos da invenção, e FRI', FR2', FR3' e FR41 são seqüências de armação. FRI', FR2' ,
258 /7^
FR3' e FR4' pode ser especialmente Armação 1, Armação 2, Armação 3 e Armação 4 seqüências, respectivamente, de um anticorpo humano (como seqüências VH3) e/ou partes ou fragmentos de tais seqüências de Armação. É também possível usar partes ou fragmentos de um polipeptídio quimérico com a estrutura FR1' - CDRl - FR2' - CDR2 - FR3' - CDR3 - FR4.
Preferivelmente, tais partes ou fragmentos são tais que eles encontram os critérios estabelecidos no parágrafo precedente.
A invenção será além disso descrita agora por meio dos exemplos não-restritivos seguintes e figuras, nas quais as Figuras mostram:
Figura 1: Ligação de nanobodies a vWF em ELISA
Figura 2: Alinhamento de 12A5 homólogo nanobody seqüências
Figura 3: Alinhamento de 12B6 homólogo nanobody seqüências
Figura 4: Ligação de 12A5 homólogo nanobodies a vWF em
BIACORE
Figura 5: Ligação de 12B6 homólogo nanobodies a vWF em
BIACORE
Figura 6: adesão de plaqueta em concentrações diferentes de 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies
Figura 7a: Ligação em ELISA a vWF para 12B6 nanobody depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 7b: Ligação em ELISA a vWF para 12A2 nanobody depois de aquecer em temperaturas crescentes
259
Figure BRPI0609797B1_D0188
Figura 7c: Ligação em ELISA a vWF para 12A5 nanobody depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 8a: Ligação de vWF de espécie diferente a 12B6 nanobody em ELISA
Figura 8b: Ligação de vWF de espécie diferente a 12A2 nanobody em ELISA
Figura 8c: Ligação de vWF de espécie diferente a 12A5 nanobody em ELISA
Figura 9: Ligação dos bivalentes 12B6 nanobodies a vWF em BIACORE
Figura 10: Ligação dos bivalentes 12A2 nanobodies a vWF em BIACORE
Figura 11: Ligação dos bivalentes 12A5 nanobodies a vWF em BIACORE
Figura 12: Ligação em ELISA a vWF dos bivalentes 12B6 nanobodies depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 13: Ligação em ELISA a vWF dos bivalentes 12A2 nanobodies depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 14: Ligação em ELISA a vWF dos bivalentes 12A5 nanobodies depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 15: Alinhamento dos humanizados 12B6 nanobody seqüências
Figura 16: Ligação em ELISA a vWF de tipo natural e humanizado 12B6 nanobody
Figura 17: Alinhamento dos humanizados 12A2 nanobody seqüências
Figura 18: Ligação em ELISA a vWF dos humanizados 12A2
260 nanobodies, depois de aquecer em temperaturas crescentes
Figura 19: Ligação em ELISA a vWF dos humanizados 12A2 nanobodies
Figura 20: Alinhamento dos humanizados 12A5 nanobody seqüências
Figura 21: Ligação em ELISA a vWF de tipo natural e humanizado 12A5 nanobody
Figura 22: o Alinhamento de nanobodies selecionou a forma para bivalente
Figura 23: a adesão de plaqueta em concentrações diferentes dos bivalentes (humanizou) nanobodies
Figura 24: o modelo de fluxo de sangue para Folts modela em babuínos
Figura 25: a organização experimental para Folts modela em babuínos
Figura 26: o estudo de Folts do babuíno controla o grupo. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 2 experimentos independentes)
Figura 27: o estudo de Folts do grupo de babuíno tratado com Aspegic. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 3 experimentos independentes)
Figura 28: o estudo do grupo de babuíno tratado com
Heparina. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 3 experimentos independentes)
261
Figure BRPI0609797B1_D0189
Figura 29: o estudo de Folts do grupo de babuíno tratado com Plavix. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 4 experimentos independentes)
Figura 30: o estudo de Folts do grupo de babuíno tratado com Reopro. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 3 experimentos independentes)
Figura 31: o estudo de Folts do grupo de babuíno tratado com ALX-0081 (SEQ ID NO:98). 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs (o representante de 8 experimentos independentes)
Figura 32: o Fluxo lido fora do babuíno ID 6 tratou com uma combinação de Aspegic, Heparina, Plavix e ALX-0081
Figura 33: Médias de perda de sangue relativa em função de doses diferentes de Plavix, Reopro e ALX-0081
Figura 34: o comprimento médio de CFRs e a quantidade relativa média da perda de sangue para animais tratados com Plavix em função da dose de fármaco crescente.
Figura 35: o comprimento médio de CFRs e a quantidade relativa média da perda de sangue para animais tratados com Reopro em função da dose de fármaco crescente
Figura 36: o comprimento médio de CFRs e a quantidade relativa média da perda de sangue para animais tratados com ALX-0081 em função da dose de fármaco crescente
Figura 37: a agregação ristocetina-induzida (%, ) e comprimento de CFRs (s, +) para cada babuíno tratado com
262
Figure BRPI0609797B1_D0190
ALX-0081 em função de todas as doses
Figura 38: a Concentração de ALX-0081 no plasma contra o comprimento de CFRs para todos os babuínos tratados com
ALX-0081
Figura 39: Concentração de ALX-0081 em plasma contra quantidade relativa de perda de sangue da gaze
Figura 40: o estudo de Folts do babuíno 1 tratou com ALX-0081 e vWF. 0 fluxo de sangue em função do tempo é mostrado, indicando o CFRs
Figura 41: cadeias (flechas) de plaquetas aderidas em ULvWF segregado de células endotelial estimuladas
Figura 42: a Ausência de cadeias quando as plaquetas são perfused por cima de ULvWF na presença de ALX-0081
Figura 43: experimento de perfusão de controle: as cadeias de ULvWF antes (painel A, indicado com flechas vermelhas) e durante (painel B) a perfusão com o plasma normal. No painel B, as cadeias de ULvWF que são rachadas por ADAMTS-13 são indicadas com uma flecha azul e vermelha para uma parte de uma cadeia de ULvWF se afastar ou para basicamente cadeias de ULvWF rachadas respectivamente
Figura 44: experimento de perfusão em presença de ALX-0081. A imagem microscópica de um campo antes (painel A) e do mesmo campo depois (painel B) a perfusão com o plasma normal. Uma cadeia de UlvWF é indicada no painel um com uma flecha vermelha que é ausente no painel B devido à rachadura do ULvWF por ADAMTS-13.
Figura 45: a rachadura de A1-A2-A3 por ADAMTS-13
263
Figure BRPI0609797B1_D0191
apresenta no plasma de consórcio normal (NPP) na ausência e a presença de ALX-0081 e em que as Tabelas, que formam uma parte integrante da descrição presente, são como se segue:
Tabela 8: listagem de seqüência de nanocorpos anti-vWF Tabela 9: rendimentos de expressão de nanocorpos antivWF
Tabela 10: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de nanocorpos anti-vWF
Tabela 11: listagem de seqüência de 12B6 e 12A5 homólogo nanobodies
Tabela 12: K-on Previsto, K-off e KD valores para 12A5 homólogo nanobodies
Tabela 13: K-on Previsto, K-off e KD valores para 12B6 homólogo nanobodies
Tabela 14: verdadeiro valor de KD de 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies
Tabela 15: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies
Tabela 16: Concentração de 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 17: listagem de seqüência de nanobodies bivalente
Tabela 18: listagem de seqüência de seqüências de linkers
Tabela 19: rendimentos de expressão dos bivalentes 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies
264
Figure BRPI0609797B1_D0192
Tabela 20: Concentração de 12136 nanobodies bivalentes depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 21: Concentração de 12A2 nanobodies bivalente depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 22: Concentração de 12A5 nanobodies bivalente depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 23: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de
12A2 nanobodies bivalente
Tabela 24: listagem de seqüência dos humanizados 12B6 nanobodies
Tabela 25: rendimentos de expressão de tipo nanobodies 12B6 natural e humanizado
Tabela 26: Concentração de tipo nanobodies 12B6 natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 27: Valores de KD do tipo para natural e humanizado 12136 nanobodies
Tabela 28: listagem de seqüência dos humanizados 12A2 nanobodies
Tabela 29: rendimentos de expressão de tipo natural e humanizado 12A2 nanobodies
Tabela 30: Concentração de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 31: adesão de plaqueta de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado em câmara de perfusão em 0.7 e 1.5 ug/ml
265
28/
Tabela 32: adesão de plaqueta de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado em câmara de perfusâo em 0.5, 1 e 2 uglml
Tabela 33: Valores de KD do tipo para natural e humanizado 12A2 nanobodies
Tabela 34: listagem de seqüência dos humanizados 12A5 nanobodies
Tabela 35: rendimentos de expressão de tipo natural e humanizado 12A5 nanobodies
Tabela 36: Concentração de nanobodies 12A5 de tipo natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 37: Valores de KD do tipo para natural e humanizado 12A5 nanobodies
Tabela 38: listagem de seqüência de nanobodies bivalente humanizado
Tabela 39: rendimentos de expressão de nanobodies bivalente humanizado
Tabela 40: Concentração do Nanobody bivalente humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Tabela 41: adesão de plaqueta de tipo natural e nanobodies bivalente humanizado
Tabela 42: os babuínos usados com diferentes compostos de teste no estudo de Folts
Tabela 43: o Comprimento de CFRs(s) para controla animais (ND = não feito)
Tabela 44: o Comprimento de CFRs(s) para animais
266 tratados com AspegicTM (ND = não feito)
Tabela 45: o Comprimento de CFRs(s) para animais
tratados com HeparinTM (ND = não feito)
Tabela 46: o Comprimento de CFRs(s) para animais
tratados com PlavixTM (ND = não feito)
Tabela 47: o Comprimento de CFRs(s) para animais
tratados com ReoproTM (ND = não feito)
Tabela 48: o Comprimento de CFRs(s) para animais
tratados com ALX-0081 (ND = não feito)
Tabela 49: os babuínos usados com diferentes compostos de teste no estudo de Folts
Tabela 50: a Inibição de CFRs no Folts modela para as fármacos diferentes testadas. O número de experimentos nos quais uma inibição de CFRs foi observada nas condições diferentes mencionadas é mostrado como uma função do número total de repetições independentes daquela condição.
Tabela 51: Comprimento de CFRs (segundos) para cada babuíno e cada dose de Aspegic, Heparina, Plavix e ALX-008
1. A dose eficaz é indicada em amarelo
Tabela 52: a perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com PlavixTM em função da dose final (STD = desvio padrão)
Tabela 53: a perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com ReoproTM em função da dose final (STD = desvio padrão)
Tabela 54: a perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com ALX0081 em função da dose
267
Figure BRPI0609797B1_D0193
final (STD = desvio padrão)
Tabela 55: a média da soma total de perda de sangue (= soma de perda de sangue de cinco primeiras doses de composto de teste) como quanto à segunda gaze de controle
Tabela 56: a perda de sangue na gaze quanto à segunda gaze de controle para cada babuíno tratado com Aspegic, Heparina, Plavix e ALX-0081 em função da dose de fármaco. A dose de fármaco eficaz na qual uma inibição completa de CFRs foi observada, é indicada em amarelo
Tabela 57: o% agregação de plaqueta ristocetinainduzida para cada babuíno tratado com Aspegic, Heparina, Plavix e ALX-0081 em função da dose de fármaco
Tabela 58: concentração de ALX-0081 [pg/ml] em amostras de sangue obtidas em 10 minutos depois de administração
Tabela 59: o Comprimento do CFRs [segundos] para babuínos tratados com ALX-0081 e com vWF
Tabela 60: Volumes [pl] para preparar as misturas diferentes para o estudo da rachadura de A1A2A3 por ADAMTS
13.
EXEMPLOS
A. Seleção e proteção dos nanobodies específico para vWF e inibição de adesão de plaqueta
268
Exemplo 1: nanobodies monovalente específico de Antígeno
O nanobodies representados na Tabela 8 ID Números SEQ: 60 para 66 são obtidos de lhamas imunizadas com vWF humano ou com o domínio de Al recombinante de vWF. Os nanobodies ligam a um 1 domínio de vWF e inibem a interação entre vWF e gplb nas plaquetas.
Exemplo 2: Expressão e purificação de nanobodies
O Plasmídeo foi preparado (QIAGEN, segundo as instruções de fabricantes) e foi transformado em WK6 ou células eletro-competentes TG1. Uma colônia única foi usada para começar uma cultura noturna em LB que contém glicose de 2% e 100 gg/ml ampicilina. Esta cultura noturna foi diluída 100 vezes em 2x300 ml TB meio que contém 100 4g/ml ampicilina, e incubou a 37°C até OD600nm = 0.5. IPTG de 1 mm foi acrescentado e a cultura foi incubada para mais 3 horas a 37°C ou durante a noite em 28°C.
As culturas foram centrifugadas para 20 minutos em 10000 rotações por minuto em 4°C. A pílula foi congelada durante a noite ou para 1 hora em-20°c. Depois, a pílula foi descongelada na temperatura ambiente para 40 minutos, resuspensos em 20 ml peri buffer (NaH2PO4 de 50 mm e NaCl de 300 MM) e sacudida na temperatura ambiente para 1 hora. A fração de Periplásmico foi isolada por centrifugação para 20 minutos em 4°C em 20000 rotações por minuto. Os nanobodies
269
1$\ foram purificados em uma coluna de Nickel (TALON, Clonetech) conforme descrito pelo fabricante e os rendimentos de expressão foram calculados como representado na Tabela 9.
Exemplo 3: Ligação de nanobodies a vWF em ELISA Os nanobodies do Exemplo 1 foram testados para atando a vWF em ELISA. Por isso, uma microplaca de titragem (Nunc, Maxisorb) foi coberta do vWF (Cruz Vermelha) em uma diluição de 200 vezes e pré-aqueceu para 15 minutos a 37°C. A chapa foi coberta durante a noite em 4°C. A chapa então foi lavada com o PBS-TWEEN e bloqueada para duas horas na temperatura ambiente com o PSB 1% casein_ Depois da lavagem, as amostras foram aplicadas começando em uma concentração de 10 tg/ml e 3 diluições de vezes foram feitas no PSB. Depois de um período de incubação de duas horas, as chapas foram lavadas e rato o anticorpo anti-myc monoclônico em uma diluição de 1000 vezes foi aplicado para 1 hora na temperatura ambiente. As chapas foram lavadas e anti-rato-HRP policlônico (o DAKO) foi aplicado em uma diluição de 1000 vezes para uma hora na temperatura ambiente. As chapas foram lavadas e ABTS/H2O2 o substrato foi aplicado. O OD 405 nm foi medido. Os resultados são mostrados na Figura 1.
Exemplo 4: Inibição de adesão de plaqueta por nanobodies em uma câmara de fluxo
As amostras de proteína foram analisadas em uma câmara de perfusão. As placas de vidro Thermanox (Nunc) foram
270 embebidas durante a noite em etanol de 80%, enxaguado completamente com água destilada e secados no ar. Colágeno humano de placenta tipo III (Sigma) foi solubilizado em 0.05 mol ácido acético e borrifado nas placas de vidro em uma densidade final de 304g/cm 2 com um aerógrafo de retoque. Depois de borrifar as placas de vidro foram bloqueadas com a solução de albumina humana de 1% no PSB por pelo menos 1 hora em RT. As aspersões foram executadas com uma câmara de perfusão de passo único em condições de fluxo não-pulsátil que usam uma pequena câmara de perfusão modificada com uma altura de fenda de 0.1 mm e uma largura de fenda de 2 mm. O sangue foi obtido por punção na veia de voluntários sãos e anti-coagulado com Penta/PPACK. Placas de vidro triplicadas foram inseridas na câmara. Cinco mililitros do sangue foram pré-aquecidos a 37 °C por 5 minutos com ou sem adição de 2 micrograma/ml nanobody e logo fizeram circular através da câmara por 5 minutos em uma parede cortada a uma taxa de 1600 s-1 utilização de uma bomba de infusão. Depois que uma corrida de perfusão, a placa de vidro foi tomada da câmara, enxaguada em Hepes com buffer salino (Hepes de 10 mm, NaCL de 150 mm, ph 7.4), fixado em 0.5% gutaraldeído no PSB, desidratado no metanol e manchado com MayGrunwald e Giemsa (Riedel de Haen). A deposição de plaqueta foi avaliada como cobertura de superfície de plaqueta que usa microscopia leve e análise assistida por computador. Os resultados são mostrados na Tabela 10. Os nanocorpos 12B6 e 12A5 claramente inibem a adesão de plaqueta ao tipo de colágeno III na
271 câmara de perfusão em alta taxa de corte.
Exemplo 5: a Análise em BIACORE que para liga a vWF para homólogos nanobodies nanocorpos 12B6 e 12A5 inibe a adesão de plaqueta na câmara de perfusão. As seqüências de Homólogo foram obtidas da lhama que compreende as diferenças aminoácidas como mostrado na Tabela 11 SEQ ID Número 67 a 73. A figura 2 e 3 representa o alinhamento do 12A5 e 12136 homólogo nanobody seqüências.
o vWF foi covalentemente ligado à superfície de chip sensor via a união de amina. A superfície de CM5 do chip foi ativada pela injeção de EDC/NHS (1:1 a mistura de 0,4 m 1etil-3 (3-dimetilaminopropil)-carbodiimida e Nhidroxisuccinimida de 0,1 m em água) por 7 minutos. Sobre a ativação o vWF foi injetado até que um aumento de 6000 unidades de resposta fosse descoberto. O excesso de grupos reativos foi desativado com Etanolamina-HCl de 1 m (pH 8,5) para 7 minutos. O fluxo foi guardado constante durante o procedimento de imobilização em 5 uUmin. O buffer de eluente foi HEPES de 0,01 m (pH 7,4) com NaCl de 0,15 m, EDTA de 3 mm e 0,005% Surfactante P20.
Os nanobodies 12B6 e 12A5 e a sua proteína homólogo foram analisados em BIACORE em vWF em uma concentração do nanobody de 5 pg/ml como mostrado na Figura 4 e 5. Previsto o kon, K-off e os valores de KD são representados na Tabela 12 e 13. Os nanocorpos 12A5 e 12B5 têm o melhor K-on e tarifas K-off. Os nanocorpos 12A2 e 12B6 têm a melhor tarifa
272 /41
K-on, as tarifas K-off são muito comparáveis para todo os nanocorpos testado.
A tabela 14 demonstrações o verdadeiro KD avalia para vWF em BIACORE utilização de uma variedade de concentrações do nanobodies. Do jogo de curvas que foram geradas para cada nanobody, só aquelas curvas onde o equilíbrio foi conseguido, foram usadas para derivar o valor de KD via a afinidade de estado constante.
Para o tratamento de eventos agudos, a inibição rápida de vWF é muito importante, e portanto uma tarifa K-on rápida é preferida. A tarifa K-on determina a que velocidade um nanobody liga o seu objetivo (vWF) quando injetado em ser humano ou animais.
Exemplo 6: Compare a inibição nanobodies para potência na câmara de perfusão
Para comparar a potência para a inibição da adesão de plaqueta, os nanobodies 12A2, 12B6 e 12A5 foram testados na câmara de perfusão em 0.2, 0.4 e 0.6 pg/ml. O experimento foi executado usando o mesmo doador para todo o nanobodies. Os resultados são mostrados na Tabela 15 e a Figura 6. Os nanobodies mostram uma capacidade de inibição muito comparável na câmara de perfusão, com a inibição completa da adesão de plaqueta em uma concentração de 0.6 pg/ml nanobody.
Exemplo 7: Estabilidade de nanobodies em temperaturas elevadas
273
273
Uma solução de estoque de nanobodies em uma concentração de 200 gg/ml no PSB esteve preparada e dividiuse em vários tubos. Cada tubo que contém nanobody foi incubado em temperaturas diferentes para 1 hora, logo esfriou na temperatura ambiente para 2 horas e pôs em 4°C durante a noite. No dia seguinte, as amostras foram centrifugadas por 30 minutos em 13000 rotações por minuto, e o supernadante foi testado para OD280 nm. A concentração de supernadantes foi medida espectrometricamente e expressa como uma porcentagem da concentração na temperatura ambiente. Os resultados são resumidos na Tabela 16.
Os supernadantes também foram testados em ELISA que para liga a vWF conforme descrito acima no Exemplo 3. Como mostrado na Figura 7a (12B6), 7b (12A2) e 7c (12A5) , os nanobodies são muito estáveis em temperaturas elevadas.
Exemplo 8: Reatividade cruzada dos nanocorpos com vWF de outra espécie
Uma microplaca de titragem foi coberto do rato anti20 myc em 1/1000 durante a noite em 4°C. A chapa foi lavada com o PBS-TWEEN e bloqueada por duas horas na temperatura ambiente com caseina de PBS1%. Depois da lavagem, os nanobodies foram aplicados em uma concentração de 10 pg/ml em PSB. Depois de um período de incubação de 1 hora, as chapas foram lavadas e o plasma (cão, porco, ser humano, babuíno e macaco cynomologues) foi aplicado começando em uma diluição quíntupla e fazendo diluições além disso duplas no
Figure BRPI0609797B1_D0194
274
PSB. As chapas foram incubadas para 1 hora na temperatura ambiente. As chapas foram lavadas e anti-vWF-HRP policlônico (o DAKO) foi aplicado em uma diluição de 2000 vezes para uma hora na temperatura ambiente. As chapas foram lavadas e ABTS/H202 o substrato foi aplicado. 0 OD 405 nm foi medido.
Como mostrado na Figura 8a (12B6), 8b (12A2) e 8c (12A5), nanobodies 12A5, 12A2 e 12B6 são reativos zangados com ser humano, babuíno e macaco cynomologues vWF. Os nanobodies 12A2 e 12B6 são também reativos zangados com o porco vWF. Esses nanobodies, por isso, podem ser testados para eficácia e segurança em porcos. Nenhum dos nanobodies é reativo zangado com o cão vWF.
B. Construção dos bivalentes nanobodies específico para vWF e Exemplo de adesão de plaqueta de inibição 9: seqüências de aminoácido dos nanocorpos bivalente
A tabela 17 SEQ ID Número 74 a 82 representa nanobodies bivalente construído para 12B6, 12A2 e 12A5. Os nanobodies foram ligados com o linkers representado na Tabela 18 SEQ ID Número 83 a 85.
Exemplo 10: Expressão e purificação dos nanocorpos bivalente
As expressões foram executadas conforme descrito acima no Exemplo 2. Os rendimentos de expressão são resumidos na
Tabela 19.
Exemplo 11: Análise dos nanocorpos bivalente em
Figure BRPI0609797B1_D0195
275
BIACORE
Os nanobodies bivalentes do Exemplo 9 foram analisados em BIACORE em 1,3 nM conforme descrito acima no Exemplo 5 para comparar as afinidades para vWF contra o monovalente nanobody. Os nanobodies bivalentes 12B6 (a Figura 9) , 12A2 (a Figura 10) e 12A5 (a Figura 11) têm uma afinidade melhorada para vWF quando em comparação com o monovalente nanobody.
Exemplo 12: Estabilidade dos nanocorpos bivalente em temperaturas elevadas
A estabilidade dos nanocorpos bivalente foi medida conforme descrito acima no Exemplo 7. A concentração (μ o g/ml) do supernadantes foi medido e expresso como uma porcentagem da concentração na temperatura ambiente. Os resultados são resumidos na Tabela 20 (bivalente 12B6), Tabela 21 (bivalente 12A2) e Tabela 22 (bivalente 12A5).
Os supernadantes foram testados em ELISA que para liga a vWF conforme descrito acima no Exemplo 3. Os supernadantes foram aplicados começando em uma diluição 1/100 e as diluições 1/5 foram feitas no PSB. Os resultados são mostrados na Figura 12 (12B6), a Figura 13 (12A2) e a Figura 14 (12A5).
Exemplo 13: Análise de monovalente e bivalente 12A2 na câmara de fluxo
O Nanobody 12A2 (monovalente e as formas bivalentes)
276 ΐΨ foi testado na câmara de perfusâo conforme descrito acima no Exemplo 4. 0 experimento foi executado usando o mesmo doador para todo o nanobodies. Os resultados são resumidos na
Tabela 23. Os nanobodies bivalentes inibem a adesão de plaqueta mais eficientemente então a forma de monovalente.
C. Humanização dos nanobodies específico para vWF e Exemplo de adesão de plaqueta de inibição 14: Humanização de 12B6 nanobody
Tabela 24 SEQ ID Números: 86 para 89 representa quatro humanizado 12B6 nanobodies. A tabela II listas as modificações aminoácidas que foram executadas para realizar essas seqüências. A figura 15 representa o alinhamento das seqüências humanizadas para 12B6.
Tabela II: não-limitação de substituições se humanizam
1E 14P 17S 44G 46E 76N 77S 82bS 83R 84A
2B6H1
2B6H2
2B6H3
2B6H4
Figure BRPI0609797B1_D0196
277
As expressões foram executadas como descrito no Exemplo 2. Os rendimentos de expressão são resumidos na
Tabela 25.
A estabilidade dos nanocorpos humanizado foi medida como descrito no Exemplo 7. A tabela 26 resume o OD280 nm concentrações (pg/ml) do supernadantes expresso como uma porcentagem da concentração em temperatura ambiente.
A figura 16 mostra a ligação de humanizado 12B6 nanobodies a vWF em ELISA executado como descrito no Exemplo
3.
A afinidade de 12136 nanobodies humanizados para vWF foi determinada em BIACORE. Os valores de KD são resumidos na Tabela 27.
Exemplo 15: Humanização de 12A2 nanobody
Tabela 28 SEQ ID Números: 90 para 94 representa cinco humanizado 12A2 nanobodies. As tabelas III e IV enumeram as modificações aminoácidas seguintes que foram executadas para realizar essas seqüências. A figura 17 representa o alinhamento das seqüências humanizadas para 12A2.
Tabela III: não-limitação de substituições se humanizam:
1E
3Q
5V
14P
17S
27F
44G
6E
2A2H1
Figure BRPI0609797B1_D0197
278
2A2H3
1 2A2H4
1 2A2H11
1 2A2H13
Tabela IV:
76N 77S 82bS 83R 84A 108L
1 2A2H1
1 2A2H3
1 2A2H4
1 2A2H11
1 2A2H13
As expressões foram executadas como descrito no
Exemplo 2. Os rendimentos de expressão são resumidos na Tabela 29.
Figure BRPI0609797B1_D0198
279
A estabilidade dos nanocorpos humanizado foi medida como descrito no Exemplo 7. A tabela 30 resume o OD280 nm concentrações (pg/ml) do supernadantes expresso como uma porcentagem da concentração em temperatura ambiente. Todos humanizado 12A2 nanobodies é muito estável para aquecer-se em temperaturas crescentes.
O ELISA da Figura 18 e 19 foi executado como descrito no Exemplo 3. 12A2H1 e 12A2H4 ligam muito bem a vWF em
ELISA.
Os nanobodies foram testados na câmara de fluxo em uma concentração de 0.7 pg/ml e 1.5 gg/ml. O mesmo doador foi usado para todos os experimentos. O experimento foi executado como descrito no Exemplo 4. Os resultados são resumidos na Tabela 31 e 32.
A afinidade dos humanizados 12A2 nanobodies para vWF foi determinada em BIACORE. Os valores de KD são resumidos na Tabela 33.
Exemplo 16: Humanização de 12A5 nanobody
Tabela 34 SEQ ID Números: 95 para 97 representa três humanizado 12A5 nanobodies. A Tabela V enumera as modificações aminoácidas que foram executadas para realizar essas seqüências. A figura 20 representa o alinhamento das seqüências humanizadas para 12A5.
Tabela V: não-limitação de substituições se humanizam:
280
Vo
1E 23A 44G 73N 74A 83R 84A
1 2A5H1
1 2A5H2
1 2A5H3
As expressões foram executadas conforme descrito acima no Exemplo 2. Os rendimentos de expressão depois da purificação de TALON são resumidos na Tabela 35 para cada um humanizado 12A5 nanobody.
A estabilidade do humanizado 12A5 nanobodies foi medida conforme descrito acima no Exemplo 7. O OD280 do supernadantes foi medido e expresso como a porcentagem do OD280 na temperatura ambiente. Os resultados são resumidos na Tabela 36. Todos humanizado 12A5 nanobodies é de maneira comparável estável para aquecer-se em temperaturas crescentes ao tipo natural.
O ELISA foi executado como descrito no Exemplo 3. A figura 21 ilustra a atividade de ligação para vWF em ELISA.
A afinidade dos humanizados 12A5 nanobodies para vWF foi determinada em BIACORE. Os valores de KD são resumidos na Tabela 37.
Exemplo 17: Bivalente humanizou nanobodies
Três humanizou nanobodies 12A2H1, 12A2H4 e 12B6H2 foram selecionados forma para bivalente com o 3a linker. As
Figure BRPI0609797B1_D0199
281 seqüências desses 3 nanobodies diferenciam-se só por alguns aminoácidos como mostrado na Figura 22. Tabela 38 SEQ ID Número 98 a 100 listas as seqüências dos nanocorpos bivalente. Tabela 38 SEQ ID Número 101 - a 106 listas as seqüências de nanobodies bivalente humanizado ligado com o GS9 e GS30 linker, respectivamente.
As expressões foram executadas como descrito no Exemplo 2. Os nanobodies conter (A sua) 6 etiqueta foram purificados em uma coluna de Nickel (TALON, Clonetech) como descrito pelo fabricante. A seqüência de etiqueta é EQKLISEEDLNGAAHHHHHH. Os nanocorpos sem etiquetas foram purificados na proteína A. Os rendimentos de expressão foram calculados e são resumidos na Tabela 39.
A estabilidade dos nanocorpos bivalente humanizado foi medida como descrito no Exemplo 7. O OD280 do supernadantes foi medido e expresso como a porcentagem do OD280 na temperatura ambiente. Os resultados são resumidos na Tabela
40.
Os nanobodies (tipo humanizado mas também natural) foram testados na câmara de fluxo em uma concentração de 0.15 pg/ml, 0.3 tg/ml e 0.6 pg/ml. 0 mesmo doador foi usado para todos os experimentos. 0 experimento foi executado como descrito no Exemplo 4. A figura 23 mostra a adesão de plaqueta em concentrações diferentes de nanobodies bivalente. Tabela 41 adesão de plaqueta de listas de tipo natural e nanobodies bivalente humanizado.
Figure BRPI0609797B1_D0200
282
D. O efeito do Nanobody (bivalente) na trombose arterial em um babuíno FOLTS modela o Exemplo 18: o Babuíno
FOLTS modela com ALX-0081
Neste estudo a eficácia e a segurança de ALX-0081 foram avaliadas em um modelo de trombose Folts em babuínos.
Também, a eficácia e a segurança de ALX-0081 em um modelo de trombose Folts em babuínos foram em comparação com outras fármacos atualmente usadas na clínica, como Reopro, Plavix, Aspegic, Heparina e Epinefrina. Todos esses foram diluídos no cloreto de sódio de 0.9% e administrados como injeções bolo intravenosas. Este estudo foi também projetado para determinar a dose eficaz para cada um desses compostos.
Finalmente, a eficácia em uma trombose Folts modelam em babuínos de uma combinação de fármacos que é atualmente usada na clínica em uma colocação de (PCI) de intervenção coronária percutânea foi testado: Aspegic, Heparina, e Plavix. Além disso avaliamos se ALX-0081 pode melhorar a eficácia desta combinação quando topo acrescentado.
Vimos parâmetros de segurança como a indução de hemorragia, vWF e fator VIII níveis, e contagem de plaqueta, PT, e aPTT.
Protocolo de Estudo protocolo de estudo que foi aplicado é o modelo de Folts original e algumas modificações descritas mais adiante (Folts JD, e al, Circulation. 1976; 54:365-370).
Babuínos masculinos ou femininos sãos (Papio ursinus) foram usados. Os animais tinham 8-17 kg de peso e foram sem
Figure BRPI0609797B1_D0201
283 doença por pelo menos 2 semanas antes do uso. Os babuínos foram alimentados com comida seca padrão só. Os babuínos foram usados em pontos de tempo diferentes. 0 peso dos babuínos são resumidos na tabela 42 (estudo de eficácia ALX0081 e comparação com fármacos individuais) e tabela 50 (eficácia de uma combinação de fármacos e ALX-0081 além desta combinação).
Os animais foram anestesiados e a temperatura de corpo é mantida a 37 °C com uma mesa aquecida. Um segmento de uma artéria femoral foi dissecado livre do tecido circundante.
Desvio foi colocado entre a veia femoral e artéria femoral para obter altas taxas de corte. O fluxo de sangue médio e fásico foi registrado continuamente em todas as partes do experimento. O fluxo de base foi registrado por 20 minutos. O sítio de dissecação proximal da artéria femoral então foi prejudicado aplicando duas oclusões de sobreposição da artéria por 1 segundo usando um fórceps. Uma braçadeira foi colocada por cima do sítio ferido para criar uma estenose externa.
Um declínio gradual no fluxo de sangue devido a adesão de plaqueta e agregação foi observado. Quando o fluxo foi reduzido ao zero, o fluxo de sangue foi restaurado abrindo a braçadeira para desalojar o trombo rico em plaquetas. Este modelo repetitivo do fluxo de sangue que diminui depois da restauração mecânica menciona-se como reduções de fluxo cíclicas (CFRs). 0 dano endotelial adicional foi repetido se necessário para obter finalmente CFRs estável nesses
Figure BRPI0609797B1_D0202
284 babuínos. O número de vezes que o trombo tinha de ser desalojado determina o número de CFRs. A figura 24 ilustra o modelo de fluxo de sangue durante o modelo de Folts em babuínos.
Depois de um período de controle de 30 minutos de CFRs reprodutível, o veículo foi administrado como um controle interno e CFRs foram acompanhados por mais 30 minutos. Depois deste período, agentes de teste (salina (n=2), Reopro (n=3) , Aspegic (n=3), Plavix (n=4), Heparina (n=3) ou ALX0081 Nanobody™ (n=9)) foram fornecidos via uma injeção de bolo intravenoso (seguido por uma infusão contínua para ALX0081) e a monitorização foi continuada até 30 minutos depois da administração de fármaco. Este procedimento foi repetido para várias vezes com o escalamento de doses da substância de teste. O efeito de anti-trombótico foi quantificado comparando o comprimento de CFRs antes e depois da administração de fármaco. Quando a inibição plena de CFRs foi observada, um novo dano foi aplicado para confirmar que a inibição foi um efeito do tratamento mas não de um fenômeno de cura natural. No fim dos experimentos, Epinefrina (2.2 .tg/kg/min) foi injetada para distinguir-se entre uma inibição débil e uma forte do CFRs. De fato, foi demonstrado antes que CFRs reaparecem na presença de Epinefrina quando a aspirina (uma fármaco de anti-plaqueta débil) é usada no mesmo modelo.
A organização do experimento é ilustrada na Figura 25.
Os comprimentos dos CFRs, depois de cada dose do
285 composto de teste são resumidos nas tabelas 43-48. As doses nas quais a inibição plena de CFRs é obtida são sombreadas.
Uma leitura representativa do fluxo de sangue durante os experimentos de modelo de Folts é mostrada nas figuras
26-31.
Os resultados demonstram que CFRs pode ser obtido nos animais de controle por pelo menos 3 horas, sem a necessidade para um novo dano no meio. 0 comprimento médio do CFRs é 2-5 minutos e não há nenhum efeito no comprimento do CFRs pela injeção salina (figura 26, tabela 43).
Aspegic
Três animais foram injetados com Aspegic (Aspirina injetável) e procurada inibição de CFRs. Na clinica, uma injeção de bolo de 250 mgs (f 3-5 mgs/kg) é administrada ao paciente, justo antes de começar um procedimento de intervenção coronária percutânea (PCI). Em dois animais (babuíno 3 e 5) nenhuma inibição de CFRs pode ser obtida em doses tão altas como 80 e Aspegic de 40 mgs/kg respectivamente (figura 27, tabela 44) . No babuíno 4, foi muito difícil estabelecer um modelo repetitivo estável de CFRs na fase de controle. Depois que vários novos danos foram feitos (isto é, no momento que injetamos a salina), CFRs estáveis foram obtidos. A inibição completa de CFRs foi obtida na dose de Aspegic de 5 mgs/kg, mas em mais altas doses e sobre o novo dano, o CFRs devolvido, embora o comprimento médio do CFRs fosse 3-4 vezes mais longo do que
Figure BRPI0609797B1_D0203
286 antes da administração de Aspegic. Depois de infusão de Epinefrina, o CFRs voltou imediata e completamente (tabela 44) .
Heparina
Três animais foram injetados com Heparina não fracionada e procurados por inibição de CFRs. Na clínica, uma injeção de bolo de 60-70 IU/kg é administrada ao paciente, e o aPTT (tempo de tromboplastina parcial ativado) é controlado a cada 30 minutos. Heparina extra é administrada se o aPTT for <250 segundos. Nos babuínos 7 e 8, nenhuma inibição do CFRs pode ser obtida mesmo em doses tão altas como 240 IU/kg (a figura 28, tabela 45) . No babuíno 6, a inibição completa do CFRs foi obtida na primeira dose de 15 IU/kg e em mais altas doses, mas quando fizemos um novo dano o CFRs voltou cada vez. Na dose mais alta de 240 IU/kg, CFRs foram inibidos até depois de um novo dano, mas o fluxo diminuía e na infusão da Epinefrina, o
CFRs retornava imediatamente.
Plavix
Quatro babuínos foram tratados com Plavix e usados para o estudo de Folts. Usamos Plavix como fármaco injetável re-suspendendo pastilhas no metanol. Por isso, fomos capazes de executar um experimento de escalamento de dose quanto a outros fármacos. Em pacientes, Plavix de 300-600 mgs é administrado oralmente, a inibição da agregação de plaqueta
287 pode ser vista 2 horas depois de doses orais únicas de Plavix. Já na dose final de 2.5 mgs/kg nos babuínos, um efeito no comprimento do CFRs pode ser demonstrado, mas este efeito inibitivo começou só 10 minutos depois da injeção (figura 29, tabela 46) . No babuíno 12, a inibição completa do CFRs foi obtida nesta dose de 2,5 mgs/kg. Em outros três babuínos a inibição completa de CFRs foi obtida na dose final de 5 mgs/kg. 0 CFRs permaneceu inibido quando um novo dano foi feito, mas voltou depois da infusão de Epinefrina. Quando a infusão Epinefrina foi parada, o CFRs permaneceu por outros 5 minutos, mas então novamente a inibição completa foi obtida (a figura 29).
Reopro
Reopro foi testado para eficácia no modelo de Folts em três babuínos. Na clínica, os pacientes recebem uma dose de 250 pg/kg seguido por uma infusão contínua de 7,5 pg/kg/hora. Isto é, também a dose da qual precisamos em babuínos 13, 14 e 15 para obter a inibição completa do CFRs (dose final de 170-420 gg/kg (a figura 30, tabela 47). Administramos aos babuínos uma injeção de bolo só. Quando um novo dano foi aplicado, a inibição completa do CFRs foi retida e a infusão de Epinefrina não pode inverter esta inibição (a figura 30).
ALX-0081
Figure BRPI0609797B1_D0204
288
Nove babuínos receberam ALX-0081 e foram usados no modelo de Folts. Em todos os babuínos a inibição completa de CFRs foi obtida na dose de 30 pg/kg + 45 pg/kg/hora (dose final de 43 pg/kg) . Em 2 babuínos, a inibição completa já foi obtida na 10 jig/quilograma + 15 gg/kg/hora (babuínos 17 e 22). A inibição foi retida sobre um novo dano e depois da infusão de Epinefrina nos nove babuínos (a figura 31, tabela 48) .
Aspegic-Heparina-Plavix-ALX-0081 (Asp/Hep/Plav/ALX) combinações
Sete babuínos receberam uma injeção de bolo de Aspirina de 5 mgs/kg, 60 IU/kg Heparina e doses crescentes de Plavix. Heparina extra foi administrada em pontos de tempo diferentes para segurar certo nível (aPTT deve ser pelo menos dobrado contra o controle). Os CFRs foram controlados por 30 minutos depois de cada dose de compostos de teste. Começamos em uma dose de Plavix de 1 mg/quilograma e acrescentamos 1 mg/quilograma depois de 30 minutos. 0 efeito anti-trombótico foi quantificado comparando o comprimento de CFRs antes e depois da administração de fármaco. Quando a inibição completa de CFRs foi observada, um novo dano foi aplicado. A Epinefrina foi injetada e continuada até o fim do experimento.
Se CFRs não voltava, um novo dano era aplicado. Depois de 2-3 CFRs as doses crescentes de ALX0081 foram acrescentadas: (1), 3, 10 ou 30 pg/kg. Esperamos depois de cada dose de ALX-0081 para 2 CFRs e aumentamos a dose até
Figure BRPI0609797B1_D0205
289 que a inibição completa de CFRs fosse obtida. Na inibição completa do CFRs, a infusão continua foi começada de dose de 1,5 tempos ALX-0081/kg/hora para a 30 infusão de epinefrina e minutos foi continuada. Um novo dano foi aplicado depois de 10-15 minutos. As especificações dos babuínos que foram usados neste estudo são representadas na tabela 49.
Os resultados desses estudos para cada composto de teste individualmente são resumidos na tabela 50. Um efeito anti-trombótico superior claro no modelo de babuíno de trombose Folts é observado para ALX-0081 e Reopro quando em comparação com a Aspirina, Heparina ou Plavix: sobre o novo dano e depois da infusão de Epinefrina, os CFRs não voltam no modelo de Folts no ALX0081 e babuínos tratados com Reopro em contraste com o modelo em Aspegic, Heparina ou Plavix trataram animais. A dose de ALX-0081 requerida para inibição completa de CFRs é aproximadamente de 10 vezes mais baixa do que a dose necessária para Reopro. Por isso, é concluído que ALX-0081 é mais potente do que Reopro.
Depois da administração de uma combinação da Aspirina de 5 mgs/kg, 60 IU/kg Heparina e doses crescentes de Plavix, nos sete babuínos a inibição completa de CFRs foi obtida nesta dose final. A dose de Plavix requereu que a inibição plena seja de 2,5 vezes mais baixa do que a dose necessária quando Plavix sozinho é administrado. Para todos os babuínos testados, CFRs não voltou quando um novo dano foi feito (a figura 32). Contudo, com injeção de Epinefrina, CFRs retornava espontaneamente em babuínos 5, 8, 9 e 10 e sobre
290 um novo dano em babuínos 4, 6 e 7. Heparina extra foi injetada ao mesmo tempo como epinefrina. Depois de 2 CFRs, as doses crescentes de ALX0081 foram administradas continuando a infusão de Epinefrina. A dose de ALX-0081 foi aumentada de 1 mais de 3-10 a 30 pg/kg. Quando a inibição completa de CFRs foi obtida, uma infusão contínua de ALX0081 foi começada em 1,5 vezes a dose/quilograma/hora eficaz. Nos sete babuínos, a inibição completa do CFRs foi obtida na 30 dose de gg/kg. Esta dose eficaz de ALX-0081 é a mesma requerida para a inibição completa de CFRs no modelo de Folts quando ALX-0081 é administrado sozinho.
Por isso, podemos concluir que a eficácia de ALX-0081 não é aumentada pela infusão simultânea de Plavix, Heparina e Aspegic. Esta observação corresponde completamente à nossa hipótese: o ALX-0081 inibe muito a primeira interação entre plaquetas e o colágeno exposto na parede arterial danificada. O Plavix e Aspegic por outro lado inibe o fluxo ulterior na cascata que leva ao desenvolvimento de um trombo. Por isso, Plavix e a Aspirina não contribuem para a melhor eficácia, dado que ALX-0081 interfere já no primeiro passo na formação do trombo. Além disso, quando um novo dano foi aplicado na dose eficaz de ALX-008 1, o CFRs não voltou, demonstrando um efeito antitrombótico potente deste Nanobody™. Os resultados são resumidos na tabela 51.
Medições
Os parâmetros seguintes foram medidos: a) análise de
Figure BRPI0609797B1_D0206
291 sangramento, b) concentração de vWF, níveis de Fator VIII, e contagem de plaqueta, PT e aPTT c) agregação de plaqueta ristocetina-induzida d) ALX-0081 concentração, e análise e) de seções arteriais para restenose, f) imunogenicidade de
ALX-0081
a) Análise de hemorragia
Para analisar a hemorragia, uma incisão foi feita com um escalpelo na virilha. Isto foi feito 15 minutos depois de registrar fluxo de base, quando o dano foi feito na artéria. A gaze foi inserida na ferida e substituída a cada 30 minutos justo antes de cada nova dose do composto de teste. A quantidade da perda de sangue depois de cada dose do composto de teste foi determinada pesando a gaze. A perda de sangue é expressa quanto à quantidade da perda de sangue na segunda gaze de controle (durante a injeção salina) (tabelas 52-54).
Para todos os babuínos tratados com Plavix e Reopro, a perda de sangue é alta (até 9-40 vezes respectivamente na dose mais alta), começando da dose eficaz. Para os animais tratados com ALX-0081 a hemorragia é mais baixa do que em animais tratados do Plavix, e muito mais baixa quando em comparação com animais tratados com Reopro.
Para determinar a segurança contra o nível de eficácia de Plavix, Reopro e ALX-0081 como fármacos antitrombóticos, as médias da perda de sangue quanto à segunda gaze de controle são mostradas para esses fármacos em função da dose
292
ΆΙ de fármaco como múltiplo da dose eficaz (a figura 33) . A dose eficaz para Plavix é 5 mgs/kg, para Reopro 250 tg/kg e para ALX-0081 30 pg/kg (tabela 46-48). Esses resultados agradavelmente demonstram a segurança superior de ALX-0081 quando em comparação com Reopro e Plavix: a janela na qual
ALX-0081 pode ser administrado sem um aumento principal na
hemorragia é muito mais larga em comparação com Plavix e
Reopro.
Os resultados das médias da perda de sangue na gaze
(se disponível) foram combinados com as médias dos comprimentos do CFRs nas figuras 34-36.
Uma larga janela terapêutica foi observada para ALX0081 no modelo de Folts: um efeito antitrombótico forte pode ser demonstrado sem qualquer maior hemorragia para doses cumulativas nos limites de 43 .tg/kg até 403 pg/kg (a figura 36) . Em contraste contudo, a janela terapêutica para Reopro e Plavix no mesmo modelo foi muito mais estreita em comparação com ALX0081, combinando um efeito de antitrombótico eficaz com uma alta perda de sangue (a figura 34-35).
A média da soma total da perda de sangue (= a soma da perda de sangue da gaze de cinco primeiras doses do composto de teste) como quanto à segunda gaze de controle é resumida na tabela 55. Nesta tabela também indicamos a dose final como múltiplo da dose eficaz (= a soma das cinco doses divididas pela dose eficaz). Como mencionado antes, a dose eficaz para Plavix é 5 mgs/kg, para Reopro 250 pg/kg e para
293
313
ALX-0081 30 pg/kg.
Os resultados mostrados na tabela 55 claramente demonstram que a perda de sangue total é significativamente aumentada nos animais tratados com Plavix e a uma extensão mesmo mais alta nos animais tratados com Reopro. A perda de sangue em animais que recebem ALX-0081 é de 2 vezes e 4 vezes menos do que em Plavix ou em animais tratados com Reopro, respectivamente. Isto novamente claramente demonstra que ALX0081 está mais seguro do que Plavix e Reopro quanto a risco de sangramento, embora doses de mais do que 10 vezes a dose eficaz fossem usadas.
A combinação eficaz de Aspegic, Heparina e Plavix resulta em um aumento na perda de sangue de até 14 vezes quando em comparação com a gaze de controle (tabela 56) . A adição de ALX0081 anteriormente da combinação de Aspegic, Heparina e Plavix não resulta em hemorragia aumentada exceto nos babuínos 4 e 7. No babuíno 7, a hemorragia foi muito aumentada depois da administração de epinefrina, extra heparina e não doses eficazes de ALX-0081, mas foi mais baixa novamente depois da administração da dose eficaz de ALX-0081. Esses resultados demonstraram que ALX-0081 é seguro quando acrescentado anteriormente à combinação de fármacos que é atualmente usada em uma ambiente clínico.
b) Concentração de vWF, Fator VIII nível, contagem de plaqueta, PT e aPTT
Figure BRPI0609797B1_D0207
294 vWF
Os níveis de vWF em plasma rico em plaquetas (PRP) de amostras de sangue tomado depois da administração das doses diferentes das fármacos no modelo de Folts foram determinados usando um ensaio de imunosorbente e expressos como uma porcentagem do padrão humano (QUEM 5 'h Padrão Internacional para fator VIII e VWF)
Os resultados claramente demonstram que os fármacos diferentes usados no modelo não têm nenhum efeito principal no nível de vWF.
Fator VIII
O fator que VIII níveis no PRP de amostras de sangue tomado depois da administração das doses diferentes dos fármacos no modelo de Folts foi determinado usando o teste de aPTT. Não testamos as amostras de plasma dos babuínos tratados com Heparina, como demonstramos que Heparina prolonga o tempo aPTT. Os níveis de FVIII foram expressos como a porcentagem da primeira amostra de controle, tomada 10 minutos depois do dano da artéria femoral. Não vemos nenhum efeito dos tratamentos no teste de aPTT.
Contagem de plaqueta, PT e aPTT
As medições de contagem de plaqueta durante os experimentos de modelo de Folts foram executadas. Os dados mostraram que o babuíno 15 tem uma contagem de plaqueta
295
Figure BRPI0609797B1_D0208
muito baixa quando em comparação com outros animais. As contagens de plaquetas para toda espécie de tratamentos, exceto o tratamento Plavix, são muito comparáveis com o que vemos nos animais de controle e são regularmente constantes dentro de algum tempo.
Os valores de PT não demonstram nenhum efeito dos compostos de teste no tempo de PT, exceto babuínos tratados com a dose de 240 IU/kg de Heparina onde um aumento menor no
PT foi observado.
Os valores de aPTT observados durante os estudos de modelo de Folts são resumidos. Esses resultados indicam que os compostos de teste não têm nenhum efeito nos valores de aPTT, exceto os babuínos tratados com Heparina. Nesses animais, valores de aPTT são prolongados da dose de 30-60 IU/kg em diante, como também é observado em pacientes. A Heparina atua como um anticoagulante formando um complexo com antitrombina e catalisando a inibição de fatores de coagulação de sangue ativados como Xla, IXa, Xa e trombina (fator Ila). Esses fatores estão todos implicados na cascata de coagulação intrínseca da qual a sua funcionalidade é medida no teste de aPTT.
c) A medição da agregação de plaqueta ristocetinainduzida no sangue obtido de babuínos tratados com ALX-0081
O sangue obtido de babuínos tratados com ALX-0081 foi analisado para a inibição da agregação de plaqueta. As agregações de plaqueta foram executadas em um sangue inteiro
296
Figure BRPI0609797B1_D0209
Chronolog e Agregômetro ótico (Modelo 560CA, Chronolog, os EUA). O PRP foi preparado (colhido em citrato 0.38 mol/L) , por centrifugação do sangue inteiro em 1200 rotações por minuto por 5 minutos. A fração superior que contém o PRP foi cuidadosamente retirada. A fração mais baixa foi além disso centrifugada a 3000 rotações por minuto por 10 minutos para preparar o plasma pobre em plaquetas (PPP). As plaquetas foram contadas em PRP e diluíram-se em PPP a uma concentração final de 200.000 plaquetas por microlitro. 3 mg/ml ristocetina (DAKO) foram acrescentados e a agregação foi medida.
A agregação de plaquetas ex-vivo é medida nas amostras de sangue tomadas durante o experimento de Folts nos babuínos tratados com ALX-0081. A agregação de plaqueta dependente de GPlb-IX-V através de vWF é medida usando ristocetina como um modulador. 0 % de agregação é medido em cada ponto de tempo e em cada dose. A amostra de controle é tomada 10 minutos depois do dano arterial.
Os resultados do teste de RIPA são comparados com a inibição do CFRs para cada babuíno tratado com ALX-0081 (figura 37). Como mostrado na figura 37, uma relação inversa entre o RIPA e o comprimento do CFRs é observada. Além disso, esses resultados manifestam que a inibição completa no teste de RIPA é obtida em doses mais baixas do que a inibição completa de CFRs em babuínos 16, 18, 19 e 23. Para os babuínos 20, 21, 22 e 24 os resultados com RIPA se comparam muito bem com os resultados para a eficácia no
297
R modelo de Folts.
d) Concentração de ALX-0081
As Microplacas de titragem são cobertas do rato antimyc policlônico durante a noite a 4°C em uma diluição de 1000 vezes. As chapas são lavadas com o PBS-TWEEN e bloqueadas por 2 horas em RT com caseina de 1% de PSB. As amostras são diluídas em uma microplaca de titragem nãocoberta no plasma de babuíno de referência de 25%. A curva padrão está preparada diluindo o nanobody na mesma amostra de plasma de babuíno de referência. As amostras são aplicadas nas chapas cobertas com anti-myc e deixadas se ligar por 2 horas em RT. As chapas são lavadas 5 vezes com o PBS-TWEEN. Anti-vWF-HRP de coelho (DAKO) é aplicado em uma diluição de 3000 vezes por uma hora em RT. Para medir OD405 nm, as amostras são lavadas 5 vezes com o PBS-TWEEN e substrato ABTS/H202 é acrescentado.
Determinamos a concentração de ALX-0081 em amostras de plasma tomadas 10 minutos depois de cada injeção de bolo. A injeção de bolo foi imediatamente seguida por uma infusão contínua. As concentrações (pg/ml) são resumidas na tabela
58.
Para todos os babuínos um nível crescente de ALX-0081 nas amostras de plasma foram medidos por ELISA depois do escalamento de dose de ALX-0081. Para o babuíno 16, as quantidades constantemente mais altas de ALX-0081 foram determinadas na amostra de plasma tomada depois de dose de
Figure BRPI0609797B1_D0210
298 pg/kg em comparação com a amostra tomada depois de 30 gg/kg. O nível de ALX-0081 naquela amostra é também substancialmente mais alto do que o que é observado para todos outros babuínos dado o mesmo horário de dosagem de
ALX-0081. Como os níveis de ALX-0081 para o babuíno 16 depois das mais altas doses está na linha das expectativas, assumimos que uma anormalidade desconhecida durante a amostragem de sangue acontece para este contas este valor marginal.
A concentração de ALX-0081 para cada dose nos babuínos diferentes é variável. Para a dose de 3 pg/kg, a concentração percorre entre 0,03 e 0,14 pg/ml para 10 pg/kg entre 0,18 e 1,23 pg/ml, para 30 pg/kg entre 0,51 e 1,14 pg/ml, para 90 pg/kg entre 1,38 e 6,77 pg/ml e para 270 pg/kg entre 4,03 e 35,14 pg/ml. Na figura 38, traçamos a concentração de ALX-0081 no plasma contra o comprimento do
CFRs.
A concentração de ALX-0081 requereu que a inibição total de CFRs esteja entre 0,3 e 0,5 Vg/ml, que está em pleno acordo com a concentração requerida para inibir a adesão de plaqueta a colágeno na câmara de fluxo em alta taxa de corte, quando ALX-0081 é pregado no sangue humano. Em azul (a figura 38, painel B) indicamos a variedade de concentração de ALX-0081 onde a inibição começa (omitir a dose de 10 Vg/kg no babuíno 16).
Quando traçamos a concentração de ALX-0081 contra a quantidade relativa da perda de sangue da gaze, observamos
299 um aumento de mais do que 2 vezes na hemorragia em doses acima de 1 pg/ml (a figura 39) . Um aumento de 10 vezes na perda de sangue foi observado quando a concentração ALX-0081 é 19 pg/ml, que é 40-60 vezes a concentração eficaz.
e) Análise de seções arteriais para restenose
Quatro semanas depois do tratamento da segunda artéria, as artérias são dissecadas livres do tecido circundante. A artéria é ligada no sítio superior e abaixo do dano endotelial inclusive o sítio onde o desvio foi colocado. Uma seção é retirada de 2 centímetros, cortada em uma parte mais baixa (local do desvio) e a parte superior (local estenosado e prejudicado) e armazenado em formaldeído a 10%. Os babuínos então são sacrificados por injeção de eutanásia. As artérias são marcadas segundo a origem e cortadas em anéis de 2 mm cada um. Os anéis são colocados em cassetes marcados convenientes para processamento de histologia. Os cassetes então são colocados durante a noite em um Processador VIP Tissue Tek automatizado seguindo o horário de processamento noturno como descrito em Bancroft (Bancroft, John D., Stevens Alan (1990). Teoria e Prática de Técnicas Histológicas. Terceira Edição).
Depois do processamento, as artérias são embutidas em blocos de cera de parafina marcados e esfriadas em uma chapa congelada. Os blocos de cera são cortados em série as seções do 4 mícron cada um em um micrótomo rotativo. As seções são colhidas em slides de vidro e manchadas para avaliação
Figure BRPI0609797B1_D0211
300 histológica. O método de Haematoxylin e Eosin, bem como o método de Verhoeff para manchas de fibras elásticas são executados em cada uma das artérias (Bancroft, John D., Stevens Alan (1990). Theory and Practice of Histological Techniques. Terceira Edição). Depois de manchar, os slides são desidratados, compensados, montados e etiquetados. A análise cega das seções é executada.
f) Análise de Imunogenicidade
A presença de imunoglobulinas ALX-0081 no plasma de três babuínos foi avaliada por dois métodos, respectivamente um método ELISA e um método baseado em SPR em Biacore. Os babuínos foram tratados por 8 semanas com o aumento de doses de ALX-0081 (começando de 10 pg/kg). Durante as referidas 8 semanas, nenhuma resposta imunogênica pode ser observada sobre a injeção de ALX-008 1. A meia-vida de ALX-0081 percorreu entre 7 e 9 horas. Exemplo 20: Uso de vWF como um antídoto para ALX-0081
Apesar da segurança provada de ALX-0081 em babuínos, e o despejo rápido do Nanobody™, decidimos avaliar o uso de vWF como um antídoto para ALX-0081. Isto foi testado em um modelo de Folts em babuínos onde avaliamos se o efeito inibitivo de ALX-0081 na formação trombo arterial pode ser invertido pela injeção de vWF.
O procedimento experimental seguiu o modelo de Folts original com as modificações como descrito no exemplo prévio
18.
301
Figure BRPI0609797B1_D0212
Babuínos masculinos sãos (Papio ursinus) foram usados neste estudo. Os animais tinham 9-12 kg de peso e ficaram sem doença por pelo menos 2 semanas antes do uso. Os babuínos foram alimentados com a comida padrão seca só.
Três babuínos foram usados neste estudo, o comprimento do CFRs durante a fase de controle, depois de administração salina, ALX-0081 e vWF é resumido na tabela 59.
O fluxo de sangue como uma função do tempo para cada babuíno e experimento é mostrado na figura 40.
Nos três babuínos, a inibição completa de CFRs foi obtida com uma dose de 30 pg/kg + 45 μ de g/kg/hora de ALX0081, mesmo quando um novo dano foi aplicado, o CFRs não voltou. Sobre a injeção da primeira dose de vWF (250 IU), o fluxo gradualmente diminuiu, mas CFRs não voltou até que uma dose extra de 250 IU de vWF fosse administrada. Este resultado demonstrou agradavelmente que a atividade de ALX0081 pode ser invertida pela administração de vWF, e que, por isso, o vWF seria um bom antídoto para este Nanobody™
Portanto, outro aspecto da invenção refere-se ao uso de vWF, de um fragmento conveniente disso, de DDAVP (desmopressinor) ou um fragmento conveniente disso, ou de uma composição farmacêutica que compreende algum do precedente, como um antídoto para complicações ou efeitos colaterais indesejados associados com o uso de um Nanobody, proteína ou polipeptídio contra vWF, especialmente um Nanobody, proteína ou polipeptídio conforme descrito na presente.
302
322
Exemplo 21: Efeitos de ALX-0081 em adesão de plaqueta a célula endotelial derivada UIvWF e na atividade de ADAMTS13
Este estudo serve como prova do conceito para o uso de
ALX-0081 como um fármaco em pacientes TTP. As aspersões de plaquetas reconstituídas no plasma TTP (nenhum ADAMTS 13) são executadas em células endoteliais que segregam ULvWF, na ausência e presença de ALX-0081. Em um experimento separado testamos se ALX-0081, que liga ao domínio de Al de vWF, interfere na atividade de ADAMTS-13. ADAMTS-13 liga a e racha o domínio A2 de vWF.
As células Endoteliais foram obtidas de veias de cordão umbilical humanas pelo método de Maruyama (Z.Zellforsch. Mikrosk. A4nat. 60:69; 1963). As células endoteliais foram ativadas com 100 μ M de histamina (SigmaAldrich, St Louis, MO) por 15 minutos em temperatura ambiente antes dos experimentos de perfusão.
sangue foi extraído de voluntários sãos que negaram a ingestão da aspirina ou outros fármacos anti-inflamatórios não esteroidais (NSAIDs) pelos 10 dias precedentes em um décimo de volume de citrato de sódio 3.4%. O plasma rico em plaquetas (PRP) foi preparado do sangue inteiro por centrifugação (10 minutos em 200g na temperatura ambiente).
O PRP foi acidificado pela adição de um décimo de volume de ACD (2.5% trissódio citrato, ácido cítrico de 1.5%, e Dglicose de 2%), e as plaquetas foram giradas (500g, 15
303
923 minutos). A pílula de plaquetas foi re-suspensa em HEPES (N2-hidroxyietilpiperazina-N '-2-etanesulfônico ácido)-Tyrode buffer (HEPES de 10 mm, NaCl de 137 mm, KCI de 2.68 mm, NaH2PO4 de 0.42 mm, MgCI2 de 1.7 mm, D-glicose de 5 mm, pH 6.5). Prostaciclina (PGI2, 10 ng/mL) foi acrescentada para prevenir a ativação de plaquetas durante o passo de lavagem subsequente. As plaquetas foram giradas e re-suspensas em um pequeno volume do buffer HEPES-Tyrode. Esta suspensões de
plaqueta foi diluída no buffer HEPES em PH 7.4, ou no plasma
TTP.
As aspersões foram executadas em uma câmara de
perfusão de passo único como descrito anteriormente. 0
experimento foi seguido por vídeo-microscopia em tempo real.
Em um segundo tipo do experimento, as misturas de reação diferentes estiveram preparadas como resumido na tabela 60, contudo, sem a adição do construto A1A2A3. 0 construto A1A2A3 é um fragmento recombinante consistente em domínios Al, A2 e A3 de vWF. As misturas foram pré-incubadas por 5 minutos a 37 °C depois que o fragmento A1A2A3 é acrescentado e a mistura é incubada em um banho de água durante a noite a 37°C. No dia seguinte um SDS-PAGE redutor é dirigido às amostras (12%, e usando como marcador os Precision PLus Protein Standard de BioRad) e manchada em Immobilon-FL (Millipore) . A mancha foi bloqueada por 2 horas na temperatura ambiente com blockbuffer (1:1 Odyssey blockbuffer em lxTBS pH=7,4) e incubado com anti-vWF de coelho policlônico (DAKO) . Alexa Fluor 680 anti-coelho de
304 cabra foi usado para detecção. A exploração foi feita no ODYSSEY para descobrir os produtos de degradação.
Experimento de controle: ligação de plaquetas a ULvWF
Células endoteliais foram isoladas de cordão umbilical humano recentemente obtidas por digestão de colagenase do interior da veia umbilical. As células foram cultivadas na cultura de tecido como uma população homogênea. As células endotelial humanas cultivadas crescem como monocamadas de grandes células poligonais estreitamente opostas, e elas contêm inclusões citoplasmáticas (corpos de WeibelPalade). Estimuladas por histamina endotelial, células isoladas de cordão umbilical humano expressam Fator Von Willebrand (ULvWF) ultra-grande na sua superfície. A perfusão dessas células estimuladas com plaquetas de sangue isoladas, que são suspensas em buffer ou em plasma de um paciente com TTP adquirido, resulta na deposição de plaquetas para o ULvWF (8) . Essas plaquetas ULvWF-aderidas aparecem como assim chamadas 'cadeias, que são visíveis quando o experimento de perfusão é controlado pela microscopia de vídeo de tempo real (a figura 41).
Inibição por ALX-0081 para a geração de cadeias de plaquetas
As plaquetas foram re-suspensas no buffer ou no plasma
TTP e as concentrações de ALX0081 usado neste experimento foram 0,2, 2 e 10 pg/ml. Estimuladas por histamina endotelial células isoladas de cordão umbilical humano são
Figure BRPI0609797B1_D0213
305 perfundidas com essas suspensões de plaqueta conforme descrito acima.
A adição de ALX-0081 a plaquetas re-suspensas no buffer ou no plasma de um paciente TTP resulta em uma inibição completa da formação de cadeia em todas as condições testadas (a figura 42). Os experimentos de perfusão foram executados em taxa de corte de 2.5 dyn/cm2 por 4 minutos. Durante esta perfusão de 4 minutos pelo menos 20 campos microscópicos foram examinados, e na presença do
Nanobody™, nenhuma cadeia pode ser demonstrada em todas as condições testadas (a figura 42).
Rachadura de ULvWF por ADAMTS-13
O ADAMTS-13 reduz o tamanho de multímeros grandes e ultra-grandes VWF a formas menores especificamente rachando a ligação de peptídeo Y842/M843 no VWF A2 domínio. Dois tipos de ensaios foram usados para avaliar o efeito de ALX0081 na rachadura de ULvWF por ADAMTS-13: isto é, um ensaio de perfusão e um ensaio que observa a rachadura de um fragmento recombinante vWF.
Em um primeiro experimento, as cadeias foram geradas por uma perfusão de 4 minutos de plaquetas lavadas resuspensas no buffer por cima de células endoteliais estimuladas por histamina. Posteriormente, as plaquetas nãoaderidas foram tiradas ao lavar por uma perfusão de 4 minutos do buffer. Depois disto, o buffer foi perfundido por outros 4 minutos, seguidos por uma perfusão de 4 minutos de plasma normal juntado que contém ADAMTS-13. A separação das
306 cadeias de plaqueta foi observada depois da perfusâo de plasma normal juntado (a figura 43). Mais de 95% das cadeias foram rachadas depois da perfusâo de 4 minutos.
Em um seguinte experimento, as cadeias foram geradas por uma perfusâo de 4 minutos de plaquetas lavadas resuspensas no buffer por cima de células endoteliais estimulado por histamina e as plaquetas não-aderidas foram tiradas ao lavar por uma perfusâo de 4 minutos do buffer como anteriormente. Depois disto, ALX-0081 (10 μ o g/ml no buffer) foi perfundido por 4 minutos, seguidos por uma perfusâo de 4 minutos de plasma normal juntado que contém ALX-0081 (10 4g/ml = excesso de molar de 10 vezes por cima de vWF) e ADAMTS-13. Podemos demonstrar claramente a separação das cadeias de plaqueta e 95% das cadeias foram rachadas depois da perfusâo de 4 minutos (a figura 44)
Esses resultados claramente demonstram que ALX-0081 não tem um efeito na rachadura de cadeias de ULvWF por
ADAMTS-13.
Em um segundo ensaio, um fragmento recombinante que contém o domínio A1-A2-A3 de vWF foi misturado com o plasma de coletivo normal (NPP) que contém ADAMTS-13, resultando a rachadura proteolítica do fragmento que foi observado por uma análise de Western Blot. A atividade de ADAMTS-13 foi testada na ausência e presença de 10 pg/ml ALX-0081. Como indicado na figura 45 ALX-0081 não tem nenhum efeito na rachadura do fragmento vWF (travessas 6-7-8).
Para demonstrar que a rachadura observada é específica
307 para ADAMTS-13, um experimento de controle na presença de EDTA foi executado, dado que EDTA inibe a atividade de ADAMTS-13. Como esperado, a presença de EDTA em NPP resultou na inibição da rachadura do fragmento (a figura 451ane 4) .
Este experimento novamente comprova que ALX-0081 não tem nenhum efeito na atividade ADAMTS-13.
Tabela 8: listagem de seqüência de nanocorpos anti-vWF
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A5 60 AVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGMYRQAPGKQRELVATITS GGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYANLKQGSYGY RFNDYWGQGTQVTVSS
12B1 61 QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSNYGMGWFRQAPGKEREFVTSISW SGTYTAYSDNVKGRFTISRDNAKNTVYLQMDSLKPEDTAVYYCAAQSRYRSNY YDHDDKYAYWGQGTQVTVSS
12B6 62 QVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDVVAAISR TGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNALKPEDTAVYYCAAAGVRAEDG RVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12D11 63 AVQLVDSGGGLVQAGGSLRLSCTASERTTFSSYTLGWFRQAPGKEREFVGGIS WSGVSTDYAEFAKGRFTISRDHAANTVYLEMNSLKPEDTAVYYCAALGRYRSN WRNIGQYDYWGQGTQVTVSS
12E3 64 EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFNNYGMGWFRQAPGKEREFVTSISW SGSYTAYADNVKGRFTISRDNAKNTVYLQMDSLKPGDTAVYYCAAQSRYSSNY YDHDDKYAYWGQGTQVTVSS
12C9 65 AVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCATSGSIFSSSAMAWYRQASGKQRELVATITS GGRTSYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYDCNFVVDGKRAPW GQGTQVTVSS
14F8 66 AVQLVESGGGLVQAGESLRLSCTSSGRAFSYYNTGWFRQAPGKEREFVAAISW SGGLTYYADSVKGRFTISRDNAKDMVYLQMASLKPEDTAVYYCAANRRQKTVQ MGERAYDYWGQGTQVTVSS
Tabela 9: rendimentos de expressão de nanocorpos anti-vWF
Nanobody Rendimento (mg/l) depois de TALON
12A5 13
12B1 6
12B6 16
308
320
12D11 8
12E3 4
12C9 25
14F8 48
Tabela 10: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de nanocorpos anti-vWF
Nanobody Controle % Adesão de plaquetas a 2 pg/ml
12A5 60 ±7 10±3
12B1 60 ±7 56 ±3
12B6 60 ±7 19±5
12D11 60 ±7 61 ±7
12E3 60 ±7 54 ± 1
12C9 71 ±3 68 ±8
14F8 71 ±3 51 ± 10
Tabela 11: listagem de seqüência de 12B6 e 12A5 homólogo nanobodies
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A5 homólogo seqüências
12B4 67 QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFS IGAMGLYRQAPGKQRELVATIT SGGSTNYADSVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYANLKQGSY GYRFN DYWGQGTQVTVSS
12E8 68 AVQLEESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGLYRQAPGKQRELVATIT SGGSTNYADSVKGRFTISRDGAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYANLKQGDY GYRFN DYWGQGTQVTVSS
12A6 69 QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGTMGLYRQAPGKQRELVATIT SGGSTNYADSVKGRFTISRDGAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCYANLKQGDY GYRFN DYWGQGTQVTVSS
12D8 70 AVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGTMGLYRQAPGKQRELVATIT SGGSTNYADSVKGRFTISRDGAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCYANLKQGDY GYRFNDYWGQGTQVTVSS
12B6 homólogo seqüências
12A2 71 QVKLEESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVAAIS RTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAAAGVRAE DGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12F2 72 QVKLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGRERDVVAAIS RTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAAAGVRAE DGRVRSLPSEYTFWGQGTQVTVSS
14H10 73 QVKLEESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDVVAAIS RTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLEMNNLKPDDTAVYYCAAAGVRAE DGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
309
Tabela 12: K-on Previsto, K-off e KD valores para nanobodies 12A5 homólogos
Nanobody Koff (x1(r7s) Kon (x 106 1/Ms) KD (nM)
12A5 2.51 0.629 3.98
12B4 2.2 0.544 4.05
12E8 2.93 0.171 17.1
12A6 4.72 0.188 25.1
12D8 5.84 0.139 41.9
Tabela 13: K-on Previsto, K-off e KD valores para nanobodies 12B6 homólogos
Nanobody Koff (x10¼) Kon (x 10® 1/Ms) KD (nM)
12B6 5.97 2.55 2.33
12A2 3.49 1.11 3.13
12F2 4.04 6.41 6.3
14H10 3.97 6.84 5.81
Tabela 14: verdadeiro valor de KD de nanobodies 12B6,12A2 e 12A5
Nanobody Koff (x1 O^/s) KÕn (x 10® 1/Ms) KD (nM)
12B6 10.03 2.28 4.5
12A2 9.9 2.24 4.4
12A5 3.3 1.22 2.7
Tabela 15: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de nanobodies 12B6, 12A2 e 12A5
% Adesã o de plaquetas
Nanobody 0 gg/ml 0.2 pg/ml 0.4 pg/ml 0.6 pg/ml
Controle 71 ±3 - - -
12B6 - 59 ±6 43 ±7 27 ±8
12A2 - 58 ±8 40 ± 10 11 ±8
12A5 - 50 ±7 27 ± 10 2±2
Figure BRPI0609797B1_D0214
310
Tabela 16: Concentração de 12B6, 12A2 e 12A5 nanobodies depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12B6 100 97 100 104 94 91 68
12A2 100 106 104 100 93 87 90
12A5 100 108 107 98 83 75 66
311
39/
Tabela 17: listagem de seqüência de nanobodies bivalentes
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A2-3a-12A2 74 QVKLEESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVA AISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSSAAAEVQLVESGGGLVQAGG ALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVAAISRTGGSTYYPDSVE GRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSE YTFWGQGTQVTVSS
12A2-GS9-12A2 75 QVKLEESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVA AISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGG LVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVAAISRTGGSTY YPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPE DT AV Y YCAAAGVRAE DGRV RTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2-GS30-12A2 76 QVKLEESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDLVA AISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLKPEDTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFR QAPGKERDLVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNNLK PEGTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVS S
12A5-3a-12A5 77 AVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGMYRQAPGKQRELVA TITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYAN LKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSSAAAEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSC LASGRXFSIGAMGMYRQAPGKQRELVATITSGGSTNYADPVKGRFTISR DGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYANLKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTV SS
12A5-GS9-12A5 78 AVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGMYRQAPGKQRELVA TITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYAN LKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGG SLRLSCLASGRIFSIGAMGMYRQAPGKQRELVATITSGGSTNYADPVKG RFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYANLKQGSYGYRFNDYWGQ GTQVTVSS
12A5-GS30-12A5 79 AVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGMYRQAPGKQRELVA TITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYAN LKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGRIFSIGAMGMYROAPGKQ RELVATITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCYANLKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSS
12B6-3a-12B6 80 QVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDVVA AI SRTGGST Y YARSVEGRFTI SRDNAKRMV YLQMNALKPE DTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSSAAAEVQLVESGGGLVQAGG ALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDVVAAISRTGGSTYYARSVE GRFTISRDNAKRMVYLQMNALKPEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSE YNFWGQGTQVTVSS
12B6-GS9-12B6 81 QVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDWA AISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNALKPEDTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGG LVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDVVAAISRTGGSTY YARSVEGRFT ISRDNAKRMVYLQMNALKPE DTAV Y YCAAAGVRAEDGRV RTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12B6-GS30-12B6 82 QVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKERDWA AISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNALKPEDTAVYYCAA AGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGALRLSCAASGRTFSYNPMGWFR QAPGKERDVVAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNALK PEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
Tabela 18: listagem de seqüência de seqüências de linkers
312
532
Nome SEQ ID NO Seqüência
3a 83 AAA
GS9 84 GGGGSGGGS
GS30 85 GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
Tabela 19: rendimentos de expressão dos nanobodies bivalentes 12B6, 12A2 e 12A5
Nanobody Rendimento (mg/l) after TALON ou outra purificação
12B6 16
12B6-3a-12B6 9
12B6-GS9-12B6 16
12B6-GS30-12B6 17
12A2 18
12A2-3a-12A2 45
12A2-GS9-12a2 22
12A2-GS30-12A2 11
12A5 13
12A5-3a-12A5 10
12A5-GS9-12a5 11
12A5-GS30-12A5 18
Tabela 20: Concentração de 12B6 nanobodies bivalentes depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12B6 100 97 100 104 94 91 68
12B6-3a-12B6 100 103 96 87 9 8 6
12B6-GS9-12B6 100 103 94 88 19 8 7
12B6-GS30-12B6 100 100 100 98 46 14 11
Tabela 21: Concentração de 12A2 nanobodies bivalentes depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12A2 100 106 104 100 93 87 90
12A2-3a-12A2 100 87 88 91 55 50 43
12A2-GS9-12A2 100 102 113 138 91 13 15
12A2-GS30-12A2 100 115 93 116 81 49 34
313
333
Tabela 22: Concentração de nanobodies 12A5 bivalentes depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12A5 100 108 107 98 83 75 66
12A5-3a-12A5 100 101 114 29 6 4 6
12A5-GS9-12A5 100 104 115 32 13 14 10
12A5-GS30-12A5 100 104 87 7 6 35 21
Tabela 23: adesão de plaqueta em câmara de perfusão de nanobodies I2A2 bivalentes
% Adesão de plaquetas
Nanobody 0 gg/ml 0.1 gg/ml 0.2 gg/ml 0.4 pg/ml
Controle 81±5 - - -
12A2 - 78±2 72±6 61±8
12A2-3a-12A2 - 74±5 50±3 33±0
12A2-GS9-12A2 - 81±1 73±1 40±2
12A2-GS30-12A2 - 81±3 73±3 37±1
Tabela 24: listagem de seqüência dos nanobodies 12B6 humanizados
Nome SEQ ID NO Seqüência
12B6H 1 86 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGRDVV AAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRAEDTAVYYC AAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12B6H 2 87 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREVV AAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRAEDTAVYYC AAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12B6H 3 88 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGRDVV AAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKNMVYLQMNSLRAEDTAVYYC AAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12B6H 4 89 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGRDW AAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRSVYLQMNSLRAEDTAVYYC AAAGVRAE DGRVRTLPSEYN FWGQGTQVTVS S
Tabela 25: rendimentos de expressão de tipo nanobodies 12B6 natural e humanizado
Nanobody Rendimento (mg/l) after TALON ou outra purificação
12B6 16
12B6H1 3
Figure BRPI0609797B1_D0215
314
12B6H2 9
12B6H3 8
12B6H4 3
Tabela 26: Concentração de tipo nanobodies 12B6 natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12B6 100 97 100 104 94 91 68
12B6H1 100 101 100 97 45 58 54
12B6H2 100 97 96 96 83 46 53
12B6H3 100 101 98 97 74 73 65
12B6H4 100 101 100 93 41 66 54
Tabela 27: Valores de KD do tipo para nanobodies 12B6 natural e humanizado
Nanobody KD (nM)
12B6 4.4
12B6H1 4.4
12B6H2 3.5
12B6H3 9
12B6H4 7.3
Tabela 28: listagem de seqüência dos nanobodies 12A2 humanizados
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A2H1 90 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRAEDTAVY YCAAAGVRAE DGRVRTLPS EYT FWGQGTQVTVS S
12A2H3 91 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKNMVYLQMNSLRAEDTAVY YCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2H4 92 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRSVYLQMNSLRAEDTAVY YCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2H1 1 93 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRAEDTAVY
Figure BRPI0609797B1_D0216
315
YCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2H1 3 94 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKNSVYLQMNSLRAEDTAVY YCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTLVTVSS
Tabela 29: rendimentos de expressão de nanobodies 12A2 tipo natural e humanizado
Nanobody Rendimento (mg/l) after TALON ou outra purificação
12A2 18
12A2H1 11
12A2H3 11
12A2H4 11
12A2H11 15
12A2H13 11
Tabela 30: Concentração de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody RT 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12A2 100 106 104 100 93 87 90
12A2H1 100 99 99 99 100 89 80
12A2H3 100 102 101 102 102 90 89
12A2H4 100 100 101 100 99 90 83
12A2H11 100 111 113 107 103 85 67
12A2H13 100 104 103 103 100 90 81
Tabela 31: adesão de plaqueta de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado em 0 câmara de perfusão em 0.7 e 1.5 ug/ml
% Adesão de plaquetas
Nanobody 0 ug/ml 0.7 pg/ml 1.5 ug/ml
Controle 73±4 - -
12A2 - 36±3 34±5
12A2H1 - 49±1 47±3
12A2H3 - 62±4 63±1
12A2H4 - 55±1 54±1
12A2H11 - 57±1 52±1
12A2H13 - 67±4 67±4
Figure BRPI0609797B1_D0217
316
Tabela 32: adesão de plaqueta de nanobodies 12A2 de tipo natural e humanizado em câmara de perfusão em 0.5, 1 e 2 ug/ml
% Adesão de plaquetas
Nanobody 0 gg/ml 0.5 pg/ml 1 pg/ml 2 pg/ml
Controle 72±1 - - -
12A2 - 33±10 35±11 10±10
12A2H1 - 40±9 43±3 38±5
12A2H4 - 61±1 57±1 46±5
Tabela 33: Valores de KD para nanobodies 12A2 tipo natural e humanizado
Nanobody KD (nM)
12A2 3,1
12A2 H3 14,6
12A2 H11 10,6
12A2 H13 38,8
Tabela 34: listagem de seqüência dos nanobodies 12A5 humanizados
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A5H1 95 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSIGAMGMYRQAPGKGREL VATITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGPKNTVYLQMNSLRAEDTAVYY CYANLKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSS
12A5H2 96 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSIGAMGMYRQAPGKGREL VATITSGGSTNYADPVKGRFTISRDGAKNTVYLQMNSLRAEDTAVYY CYANLKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSS
12A5H3 97 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSIGAMGMYRQAPGKGREL VATIT S GGS TNYAD PVKGR FTIS R DNAKNTVYLQMNS LRAE DTAVYY CYANLKQGSYGYRFNDYWGQGTQVTVSS
Tabela 35: rendimentos de expressão de nanobodies 12A5 tipo natural e humanizado
Nanobody Rendimento (mg/l) after TALON
12A5 13
12A5H1 8
12A5H2 9
Figure BRPI0609797B1_D0218
317
12Α5Η3 11
Tabela 36: Concentração de nanobodies 12A5 de tipo natural e humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12A5 108 107 98 83 75 66
12A5H1 99 91 86 60 69 63
12A5H2 99 108 90 58 67 60
12A5H3 101 97 97 67 73 64
Tabela 37: Valores de KD do nanobodies 12A5 tipo para natural e humanizado
Nanobody KD (nM)
12A5 1,6
12A5H1 1,8
12A5H2 12,8
12A5H3 ND
318
Tabela 38: listagem de seqüência de nanobodies bivalente humanizado
Nome SEQ ID NO Seqüência
12A2Hl-3a- 12A2H1 98 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSAAAEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNP MGWFRQAPGKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDN AKRMVYLQMNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEY TFWGQGTQVTVSS
12A2H4-3a- 12A2H4 99 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRSVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSAAAEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNP MGWFRQAPGKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDN AKRS VY LQMNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRT L P S EY TFWGQGTQVTVSS
12B6H2-3a- 12B6H2 100 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGREVVAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQ VTVSSAAAEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNP MGWFRQAPGKGREVVAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDN AKRMVY LQMN S LRAE DTAVYYCAAAGVRAE DGRVRT L P SEY NFWGQGTQVTVSS
12A2H1-GS9- 12A2H1 101 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGR TFSYNPMGWFRQAPGKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRF TISRDNAKRMVYLQMNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVR TLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2H4-GS9- 12A2H4 102 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRSVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGR TFSYNPMGWFRQAPGKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRF TIS RDNAKRSVYLQMN S LRAE DTAVYYCAAAGVRAE DGRVR TLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12B6H2-GS9- 12B6H2 103 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGREVVAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGR TFSYNPMGWFRQAPGKGREVVAAISRTGGSTYYARSVEGRF ΤISRDNAKRMVYLQMNS LRAE DTAVYYCAAAGVRAEDGRVR TLPSEYNFWGQGTQVTVSS
12A2H1-GS30- 12A2H1 104 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVE SGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREL
319
3$ ί
VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRA EDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQVTVSS
12A2H4-GS30- 12A2H4 105 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGRELVAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRSVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYTFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVE SGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREL VAAISRTGGSTYYPDSVEGRFTISRDNAKRSVYLQMNSLRA E DTAVYYCAAAGVRAE DGRVRTLPS E YT FWGQGTQVTVS S
12B6H2-GS30- 12B6H2 106 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAP GKGREVVAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQ MNSLRAEDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQ VTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVE SGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSYNPMGWFRQAPGKGREV VAAISRTGGSTYYARSVEGRFTISRDNAKRMVYLQMNSLRA EDTAVYYCAAAGVRAEDGRVRTLPSEYNFWGQGTQVTVSS
Tabela 39: rendimentos de expressão de nanobodies bivalente humanizado
Nanobody Tags Rendimento (mg/l)
12A2H1-3a-12A2H1 Sim 5
12A2H1-3a-12A2H1 Não 6
12A2H4-3a-12A2H4 Sim 10
12A2H4-3a-12A2H4 Não 7
12B6H2-3a-12B6H2 Sim 10
12B6H2-3a-12B6H2 Não 2
Tabela 40: Concentração do Nanobody bivalente humanizado depois de aquecer em temperaturas crescentes
Nanobody Tags 37°C 50°C 60°C 70°C 80°C 90°C
12A2H1-3a-12A2H1 Sim 98 96 93 63 8 9
12A2H1-3a-12A2H1 Não 100 99 100 77 14 15
12A2H4-3a-12A2H4 Sim 100 99 95 9 6 9
12A2H4-3a-12A2H4 Não 98 98 98 18 17 26
12B6H2-3a-12B6H2 Sim 100 91 85 7 6 7
12B6H2-3a-12B6H2 Não 100 99 99 28 13 18
Tabela 41: adesão de plaqueta de tipo natural e nanobodies bivalente humanizado
% Adesão de plaquel tas
Nanobody 0 pg/ml 0.15 gg/ml 0.3 pg/ml 0.6 pg/ml
Controle 65 ±8 - - -
12B6-3a-12B6 - 50 ±5 15±6 8±6
12B6H2-3a-12B6H2 - 53 ±4 30 ± 16 17±6
12A2-3a-12A2 - 36 ±8 10±8 4± 3
12A2H1-3a-12A2H1 - 54 ±4 10 ±11 12 ± 7
320
12A2H4-3a-12A2H4 ±2
10±6
8±4
Figure BRPI0609797B1_D0219
Figure BRPI0609797B1_D0220
321
Tabela 42: babuínos usados com os diferentes compostos de teste no estudo de Folts
Babuíno ID Sex Peso [kg] Perna esquerda Perna direita
1 mach 0 9,8 Controle
2 mach 0 10,0 Controle
13 mach 0 12,4 Reopro
14 mach 0 9,5 Reopro
15 mach 0 10,8 Reopro
16 mach 0 ALX-0081
17 mach 0 15,6 ALX-0081
18 mach 0 17,2 ALX-0081
20/22 mach 0 12,7 ALX-0081 ALX-0081
21 fêmea 8,0 ALX-0081
23 mach 0 ALX-0081
24 mach 0 9,4 ALX-0081
3/19 mach 0 15,2 Aspegic ALX-0081
4 fêmea 13,6 Aspegic
5 mach 0 17,4 Aspegic
9 mach 0 13,2 Plavix
6/10 mach 0 10,2 Heparina Plavix
7/11 mach 0 9,4 Heparina Plavix
8/12 mach 0 10,5 Heparina Plavix
Tabela 43: Comprimento de CFRs(s) para animais de controle (ND = não feito)
Controle Babu no ID
Final dose Dose 1 2
322
Figure BRPI0609797B1_D0221
0 controle 291 249
0 saline 294 278
0 saline 427 185
0 saline 285 203
0 saline 438 175
323
Tabela 44: Comprimento de CFRs(s) para animais tratados com Aspegic ™ (ND = não feito)
Aspegic Babuíno ID
Final dose Dose 3 4 5
0 controle 88 no CFRs 148
0 saline 147 204 184
1 mg/kg 1 mg/kg 149 164 135
2,5 mg/kg 1,5 mg/kg 102 325 115
5 mg/kg 2,5 mg/kg 102 1800 245
10 mg/kg 5 mg/kg 113 905 156
20 mg/kg 10 mg/kg 125 657 169
40 mg/kg 20mg/kg 110 ND 145
80 mg/kg 40 mg/kg 129 ND ND
Epinefrina ND 161 ND
Tabela 45: Comprimento de CFRs(s) para animais tratados com Heparina ™ (ND = não feito)
Babuíno ID
Final dose Dose 6 7 8
0 controle 232 11 3 166
0 saline 298 13 1 246
15 IU/kg 15 IU/kg 630 20 8 255
30 IU/kg 30 IU/kg 355 24 1 320
60 IU/kg 60 IU/kg 432 24 6 332
120 IU/kg 120 IU/kg 610 16 0 206
240 IU/kg 240 IU/kg >180 0 22 1 169
Epinefrina 109 65 ND
Figure BRPI0609797B1_D0222
324
Tabela 46: o Comprimento de CFRs(s) para animais tratados com Plavix ™ (ND = não feito)
Plavix Babuíno ID
Final dose Dose 9 10 11 12
0 controle 215 178 84 144
0 saline 168 160 88 189
1 mg/kg 1 mg/kg 189 ND 132 179
2,5 mg/kg 2,5 mg/kg 883 400 258 >180 0
5 mg/kg 2,5 mg/kg >180 0 >180 0 >180 0 >180 0
10 mg/kg 5 mg/kg >180 0 >180 0 >180 0 >180 0
20 mg/kg 10 mg/kg >180 0 >180 0 >180 0 >180 0
Epinefrina 241 91 83 66
Tabela 47: o Comprimento de CFRs(s) para animais tratados com Reopro ™ (ND = não feito)
ReoWO Babuíno ID
Final dose Dose 13 14 15
0 controle 144 90 308
0 saline 141 103 268
20Mg/kg 20 gg/kg 98 82 254
70 gg/kg 50 gg/kg 90 90 248
170gg/kg 100gg/kg 90 >180 0 >180 0
420gg/kg 250gg/kg >180 0 >180 0 >180 0
920gg/kg 500 gg/k g >180 0 >180 0 >180 0
Epinefrina >120 0 >120 0 >120 0
325
Tabela 48: o Comprimento de CFRs(s) para animais tratados com ALX-0081 (ND = não feito)
ÁLX- Babuíno ID
Final dose Dose 16 17 18 19 20 21 22 23 24
0 controle 168 293 185 90 94 117 188 164 161
0 saline 151 236 242 117 98 107 233 105 178
3 gg/kg 3 microgram/kg 193 ND ND 144 133 183 312 112 295
13 gg/kg 10 microgram/kg 913 >1800 298 237 620 525 >1800 213 380
43 gg/kg 30 microgram/kg >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800
133 gg/kg 90 microgram/kg >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800
403 gg/kg 270 microgram/kg >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800 >1800
Epinefrina >1200 >1200 >900 >900 >900 >900 >900 >900 >900
Tabela 49: babuínos usados com diferentes compostos de teste no estudo de Folts
Babuíno ID Sex Peso [kg] Mix
1 Macho 9,8 Asp/Hep/Plav/AL X
2 Fême a 13,6 Asp/Hep/Plav/AL X
3 Fême a 7,8 Asp/Hep/Plav/AL X
4 Macho 12,1 Asp/Hep/Plav/AL X
5 Macho 11,4 Asp/Hep/Plav/AL X
6 Macho 11,4 Asp/Hep/Plav/AL X
7 Macho 14,0 Asp/Hep/Plav/AL X
Tabela 50: a Inibição de CFRs no Folts modela para as fármacos diferentes testadas. O número de experimentos nos quais uma inibição de CFRs foi observada nas condições diferentes mencionadas é mostrado como uma função do número total de repetições independentes daquela condição.
Composto Inibição de Inibição de Inibição de CFRs Dose efetiva
de teste CFRs CFRs depois depois de
326
Figure BRPI0609797B1_D0223
de nova lesão administração de Epinefrina
Controle 0/2 ND ND -
Aspegic 0/3 0/3 0/1 -
Heparina 1/3 1/3 0/2 -
Plavix 4/4 4/4 0/4 5 mg/kg
Reopro 3/3 3/3 3/3 170-420 Mg/kg
ALX-0081 9/9 9/9 9/9 13-43 pg/kg + 1,5 x dose/kg/hora
Tabela 51: Comprimento de CFRs (segundos) para cada babuíno e cada dose de Aspegic,
Heparina, Plavix e ALX-0081. A dose eficaz é indicada em amarelo
4 5 6 7 8 9 10
controle 82 99 109 95 113 142 113
saline 113 119 108 114 131 168 92
5 mg/kg Aspegic + 60 lU/kg Heparina + 1 mg/kg Plavix 153 135 272 742 146 219 223
+1 mg/kg Plavix >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0
Epinefrina + sem doses efetivas ALX0081 + Heparina 250 72 87 95 106 105 105
Epinefrina + dose efetiva ALX-0081 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0 >180 0
Tabela 52: Perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com Plavix ™ em função da dose final (STD = desvio padrão) ___
Plavix Babuíno ID
Final dose Dose 9 10 11 12 Média STD
1 mg/kg 1 mg/kg 0, 6 1, 3 1, 6 1,2 1,4 0,2
2,5 mg/kg 1,5 mg/kg 1, 5 1, 4 1, 1 1,0 1,2 0,2
5 mg/kg 2,5 mg/kg 5, 1 4, 7 1, 4 6,6 4,5 2,2
10 mg/kg 5 mg/kg 6, 5 4, 5 5, 8 13, 6 7,6 4.1
20 mg/kg 10 mg/kg 3, 7 4, 1 9, 1 2,6 4,9 2,9
Figure BRPI0609797B1_D0224
327
Tabela 53: Perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com Reopro ™ em função da dose final (STD = desvio padrão)
Reopro Babuíno ID
Final dose Dose 13 14 15 Média STD
20pg/kg 20 pg/kg 2.7 0,6 2.1 1,8 1
70 pg/kg 50 pg/kg 1.2 2,1 0,4 1f2 1
170Mg/kg 100 pg/kg 1.2 6,0 4,7 4,0 2
420pg/kg 250pg/kg 28. 3 7,1 13, 9 16,4 11
920pg/kg 500pg/kg 39, 8 14, 5 6.3 20,2 17
Tabela 54: Perda de sangue quanto à segunda gaze de controle para animais tratados com a função de ALX-0081 in da dose final (STD = desvio padrão)
ALX-0081 Babuíno ID
Final dose Dose 17 18 19 20 21 22 23 24 Média STD
3 pg/kg 3 pg/kg ND ND 0, 4 1, 2 0, 5 1, 1 1,8 0, 8 1,0 » 0,5
13 pg/kg 10 pg/kg 1,2 0,8 o, 1 1, 2 1, 1 1, 3 1,1 1, 1 1,0 0,4
43 pg/kg 30 pg/kg 2,8 2,0 4, 1 3, 9 2, 1 3, 8 3,0 1, 6 2,9 1,0
133 pg/kg 90 pg/kg 2,5 3.1 2, 0 0, 4 4, 0 5, 3 5,6 1, 4 3,0 1,8
403 pg/kg 270 pg/kg 2,6 2,3 2, 3 0, 4 0, 8 5, 6 10, 7 0, 9 3,2 3.4
Tabela 55: Média da soma total de perda de sangue ( = 10 soma de perda de sangue de cinco primeiras doses de composto de teste) como quanto à segunda gaze de controle
Composto de teste Dose total como múltiplo da dose efetiva Média da perda de sangue total Desvio padrão da perda de sangue
Piavix 4 19,4 4,0
Reopro 3,5 44 26
ALX-0081 13 10,8 5,7
Figure BRPI0609797B1_D0225
328
Tabela 56: Perda de sangue na gaze quanto à segunda gaze de controle para cada babuíno tratado com Aspegic, Heparina, Plavix e ALX-0081 em função da dose de fármaco. A dose de fármaco eficaz na qual uma inibição completa de CFRs foi observada, é indicada em amarelo
4 5 6 7 8 9 10 mediana* STD .
5 mg/kg Aspegic + 60 IU/kg Heparina + 1 mg/kg Plavix 2.6 1 4,6 12.1 1,3 1,4 1,8 1,8 ±3.5
+ 1 mg/kg Plavix 3.7 13,9 4.8 13,1 1,4 4,3 5,6 U.±.6b7
Epinefrina + sem doses efetivas ALX-0081 + Heparina 9,4 2,7 2,7 67 0.3 4.8 9,2 4,8 ± 13,7
Epinefrina + dose efetiva ALX0081 23,4 2,0 1 39,4 1,3 4,5 0.8 2.0 ± 10,3
Tabela 57: % agregação de plaqueta ristocetina10 induzida para cada babuíno tratado com Aspegic, Heparina,
Plavix e ALX-0081 em função da dose de fármaco
4 5 6 7 8 9 1 0
controle 7 7 7 7 4 7 4
5 8 9 0 6 0 6
saline 4 7 7 2 4 6 4
8 8 4 4 5 5 7
5 mg/kg Aspegic + 60 IU/kg Heparina + 1 6 6 8 6 6 6 5
mg/kg Plavix 2 5 9 4 6 8 5
+ 1 mg/kg Plavix 4 6 6 8 5 7 6
2 3 6 3 9 6 0
Epinefrina + dose efetiva ALX-0081 0 2 4 2 4 6 1 7 7 8
Tabela 58: Concentração de ALX-0081 [pg/ml] em amostras de sangue obtidas em 10 minutos depois de administração
Figure BRPI0609797B1_D0226
329
ALX-0081 Babuíno ID
Final dose Dose 16 17 18 19 20 21 22 23 24
3 pg/kg 3 pg/kg 0,1 0 0,03 0,0 5 0,0 8 0,0 4 0,14 0,08
13 pg/kg 10 pg/kg 1,2 3 0,3 4 0,2 9 0,26 0,5 0 0,3 9 0,4 1 0,18 0,42
43 pg/kg 30 pg/kg 1,0 0 0,5 1 0,7 2 1,14 1,0 1 0,6 1 1,0 1 0,87 1,21
133 pg/kg 90 pg/kg 1,8 7 1,3 8 1,7 7 1,61 2,6 4 1,6 0 6,7 7 2,75 5,01
403 pg/kg 270 pg/kg 6,7 7 4,0 3 6,7 3 35,1 4 7,6 6 6,0 1 9,2 4 18,5 6 16,6 2
Tabela 59: Comprimento do CFRs [segundos] para babuínos tratados com ALX-0081 e com vWF
Babuíno ID
Dose 1 2 3
Controle 119 140 111
Saline ND 158 158
30 pg/kg + 45 pg/kg/hora ALX-0081 >180 0 >180 0 >180 0
250 IU vWF >420 >180 0 >180 0
250 IU vWF 246 256 230
Tabela 60: Volumes [μΐ] para preparar as misturas diferentes para o estudo da rachadura de A1A2A3 por ADAMTS13
NPP NPP + EDTA NPP + ALX-0081 PBS
Tris (100 mM) 5 5 5 5
BaCI2(10mM) 5 5 5 5
Pefablock (100 mM) 1.3 1.3 1.3 1.3
Plasma 3.3 3.3 3.3 3.3
ALX 0081 (2,48 mg/ml) - - 4 -
PBS - - - 4
EDTA (0.35M) pH=8,3 - 2.6 - -
H2O 81.9 79.3 77.9 77.9
A1A2A3 (460 pg/ml) 3.5 3.5 3.5 3.5
1/5

Claims (13)

  1. REIVINDICAÇÕES
    1. Proteína ou polipéptido caracterizada por ser constituído por compreender dois VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados, em que os referidos VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados são dirigidos contra o Fator de Von Willebrand (vWF) e os referidos VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados consistem em 4 regiões estruturais (FRl a FR4 respectivamente) e 3 regiões determinantes de complementaridade (CDRl a CDR3, respectivamente), nas quais:
    i) CDRl compreende ou consiste na sequência de aminoácidos YNPMG [SEQ ID NO: 22]; e em que:
    ii) CDR2 compreende ou consiste numa sequência de
    aminoácidos escolhida do grupo que consiste em: AISRTGGSTYYPDSVEG [SEQ ID NO: 32] , e AISRTGGSTYYARSVEG [SEQ ID NO: 31] ; e em que: iii) CDR3 compreende ou consiste numa sequência aminoácidos escolhida do grupo que consiste em: AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID NO: 42] , AGVRAEDGRVRSLPSEYTF [SEQ ID NO: 43], e AGVRAEDGRVRTLPSEYNF [SEQ ID NO: 41] .
  2. 2. Proteína ou polipéptido de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que:
    i) CDRl consiste na sequência de aminoácidos YNPMG [SEQ ID NO: 22]; e em que:
    ii) CDR2 consiste na sequência de aminoácidos AISRTGGSTYYPDSVEG [SEQ ID NO: 32];
    Petição 870180007446, de 29/01/2018, pág. 10/15
    2/5 e em que:
    iii) CDR3 consiste na sequência de aminoácidos AGVRAEDGRVRTLPSEYTF [SEQ ID NO: 42] .
  3. 3. Proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1-2, caracterizada pelo fato de que os referidos VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados são VHHs da classe KERE, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados.
  4. 4. Proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1-3, caracterizada pelo fato de que os referidos VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados são variantes humanizadas dos referidos VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados.
  5. 5. Proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1-4, caracterizada pelo fato de que os VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados presentes na proteína ou polipéptido são escolhidos do grupo que consiste em VHHs, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados 12B6 (SEQ ID NO: 62); 12A2 (SEQ ID NO: 71);
    12F2 (SEQ ID NO: 72); 14H10 (SEQ ID NO: 73); 12B6H1 (SEQ ID
    NO: 86); 12B6H2 (SEQ ID NO: 87); 12B6H3 (SEQ ID NO: 88);
    12B6H4 (SEQ ID NO: 89); 12A2H1 (SEQ ID NO: 90); 12A2H3 (SEQ
    ID NO: 91); 12A2H4 (SEQ ID NO: 92); 12A2H11 (SEQ ID NO: 93) e 12A2H13 (SEQ ID NO: 94).
  6. 6. Proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1-5, caracterizada pelo fato de que os domínios VHH humanizados ou os domínios VH camelizados presentes na proteína ou polipéptido consistem nos domínios
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    3/5
    VHH, domínio VHH humanizado ou domínio VH camelizado 12A2H1 (SEQ ID NO: 90) .
  7. 7. Proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1-6, caracterizada pelo fato de que os dois domínios VHH, domínios VHH humanizados ou domínios VH camelizados estão intimamente ligados uns aos outros ou ligados um ao outro através de um ligante, de preferência o referido ligante é uma sequência de aminoácidos, mais preferencialmente o referido ligante compreende entre 1 e 40 resíduos de aminoácidos, tais como entre 2 e 30 resíduos de aminoácidos, de preferência em que o ligante compreende ou consiste essencialmente em resíduos de glicina e serina; ou em que o ligante compreende ou consiste essencialmente em resíduos de alanina.
  8. 8. Proteína ou polipéptido caracterizado por ser escolhido do grupo que consiste em SEQ ID NO: s 74-76, SEQ ID NO: s 80-82 ou SEQ ID NO: s 98-106, de preferência o polipeptídeo de SEQ ID NO: 98.
  9. 9. Proteína ou polipéptido caracterizado por ser constituído por SEQ ID NO: 98.
  10. 10. Sequência de nucleótido ou ácido nucléico, caracterizado por codificar uma proteína ou polipéptido
    conforme definido em qualquer uma das reivindicações anteriores. 11. Método para preparar uma proteína ou polipéptido conforme definida em qualquer uma das
    reivindicações 1-9, caracterizado por compreender cultivar ou manter uma célula hospedeira que compreende uma sequência
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    4/5 de nucleotídeo ou ácido nucléico capaz de expressar uma proteína ou polipéptido conforme definida em qualquer uma das reivindicações 1 -9; e que, opcionalmente, compreende ainda o isolamento da proteína ou polipéptido conforme definida em qualquer uma das reivindicações 1-9.
  11. 12. Composição farmacêutica, caracterizada por compreender pelo menos uma proteína ou polipéptido conforme definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 9 e opcionalmente pelo menos um veículo farmaceuticamente aceitável.
  12. 13. Composição farmacêutica de acordo com a reivindicação 12, ou proteína ou polipéptido de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizados por serem para a prevenção ou tratamento de uma doença ou distúrbio relacionado com a agregação mediada por plaquetas, escolhida a partir de trombo não oclusivo, a formação de um trombo oclusivo, formação de trombo arterial, oclusão coronariana aguda, doença arterial oclusiva periférica, restenose e distúrbios decorrentes do enxerto de desvio coronário, substituição da válvula da artéria coronariana e intervenções nas coronárias, como angioplastia, stent ou aterectomia, hiperplasia após angioplastia, aterectomia ou stenting arterial, síndrome oclusiva em sistema vascular ou falta de permeabilidade das artérias doentes, púrpura trombocitopênica trombótica (TTP), ataque isquêmico cerebral transitório e acidentes vasculares cerebrais, angina pectoris instável ou estável, infarto cerebral, síndrome de HELLP, endarterectomia carotídea, estenose da artéria
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    5/5 carótida, isquemia do limbo crítico, cardioembolismo, doença vascular periférica, reestenose e infarto do miocárdio e opcionaimente contendo adicionalmente uma ou mais outras substâncias activas para a prevenção ou tratamento de distúrbios mediados pela agregação, tais como asperina (Aspegic), heparina, Plavix® e/ou Reopro®.
  13. 14. Uso de uma proteína ou polipéptido conforme definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizado por ser na preparação de um medicamento para a prevenção ou tratamento de uma doença ou distúrbio relacionado com a agregação mediada por plaquetas, escolhida a partir de trombo não oclusivo, a formação de um trombo oclusivo, formação de trombo arterial, oclusão coronariana aguda, doença arterial oclusiva periférica, restenose e distúrbios decorrentes do enxerto de desvio coronário, substituição da válvula da artéria coronária e intervenções coronárias, como angioplastia, stent ou aterectomia, hiperplasia após angioplastia, aterectomia ou stenting, hiperplasia após angioplastia, aterectomia ou stent arterial, síndrome oclusiva em sistema vascular ou falta de permeabilidade das artérias doentes, púrpura trombocitopênica trombótica (TTP), ataque isquêmico cerebral transitório e acidentes vasculares cerebrais, angina de peito instável ou estável, infarto cerebral, Síndrome de HELLP, endarterectomia carotídea, estenose da artéria carótida, isquemia de limbo crítico, cardioembolismo, doença vascular periférica, restenose e infarto do miocárdio.
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    12A5 AVQLVESGGGLVOPGGSLRl^CLASGRl FSIGA.MGW YRQAPGRQRELVAT1 TSSGSTtlYAD 12B4 QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGR1FSIGAMGLYRQAPGKQRELVAT1TSGCSTNYAO 12E8 AVQLEESGGGLVÇPCCSLALSC1ASCRI FSIGAXGEYRQAPGKQRELVAT1 TSGGSTNYAD 12A6 CVQLVESGSGLVQPGGSLRbSCLASGRI FSIGTMGLYROAPGKQRF.LVATITSGGSTHYAO 1208 A^OLVESOGGLVOPGGSLRLSCIASGRI FSiGTMGLY RQAPGKgRELVATlTSGGSTNYAD
    12A5 PVKGKtl í SRDÜPKXTVYLQt-WSLKPEDTAVYYCYANLKQCSYC.YRFNDYXGQGTOVTVSS 12B4 SyXGRmSRDG?KKTVYLQMN3LKPEDTAVYYCYA»L^JGSYGYRFNDYHGQGTQVTVSS 12E8 SVyGRmSRDGMOiTVYLQMtJSI.KPEÜTAVYYCYAHLKCyiDYGYRrXDYWGQnTOVTVSS 12A6 SVRGRFT15RDGAKNTVYLQHNSX.RPEOTAVYYCYANLKQGDYGYRFNDYWGQGTQVTVSS 1208 SyKGRFTISRCGAKNTVYlXJKMSLRPEOrAVYYCYAMLKgGDYGYRFNDYWCQGTOVTVSS
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