JP2014511177A - 呼吸器系ウイルスによる疾患の同時診断キット - Google Patents
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Abstract
【選択図】
なし
Description
鼻咽頭の吸引物或いはスワブ(swab)検体(NPS(Nasopharyngeal swabs)、NS(Nasla swabs)、TS(Throat swabs)、NA(Nasal aspirates))を対象として14種の呼吸器系ウイルスの検出及び区分を行うためのプライマー及びプローブを製作した。
本発明者は、コロナウイルス229Eの核タンパク質(N)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号1及び2の塩基配列を有するプライマー、コロナウイルスOC43の核タンパク質(N)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号3及び4の塩基配列を有するプライマー、コロナウイルスNL63のポリタンパク質(1a)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号5及び6の塩基配列を有するプライマー、パラインフルエンザウイルス1のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号7及び8の塩基配列を有するプライマー、パラインフルエンザウイルス2のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号9及び10の塩基配列を有するプライマー、パラインフルエンザウイルス3のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号11及び12の塩基配列を有するプライマー、A型インフルエンザウイルスの基質タンパク質(M)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号13及び14の塩基配列を有するプライマー、RNase Pを標的とする内部対照群であって、RNA抽出過程の有効性に対する判断基準を提供する配列番号15及び16の塩基配列を有するプライマー、B型インフルエンザウイルスのヘマグルチニン(HA)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号17及び18の塩基配列を有するプライマー、RsウイルスA型の融合タンパク質遺伝子を増幅させることが可能な配列番号19及び20の塩基配列を有するプライマー、RsウイルスB型の融合タンパク質遺伝子を増幅させることが可能な配列番号21及び22の塩基配列を有するプライマー、アデノウイルスのヘキソンタンパク質遺伝子を増幅させることが可能な配列番号25及び26の塩基配列を有するプライマー、ライノーウイルスA、B、Cの5’UTRを増幅させることが可能な配列番号27及び31の塩基配列を有するプライマー、メタニューモウイルスの核タンパク質(N)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号23及び24の塩基配列を有するプライマー、及びボカウイルスのNP(nucleocapsid protein)遺伝子、VP(Viral protein)遺伝子を増幅させることが可能な配列番号32及び33の塩基配列を有するプライマーを通常の方法を用いてそれぞれ作製した(表1参照)。
本発明者らは、コロナウイルス229Eの核タンパク質(N)遺伝子を検出することが可能な配列番号34の塩基配列を有するプローブ、コロナウイルスOC43の核タンパク質(N)遺伝子を検出することが可能な配列番号35の塩基配列を有するプローブ、コロナウイルスNL63のポリタンパク質(1a)遺伝子を検出することが可能な配列番号36の塩基配列を有するプローブ、パラインフルエンザウイルス1のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を検出することが可能な配列番号37の塩基配列を有するプローブ、パラインフルエンザウイルス2のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を検出することが可能な配列番号38の塩基配列を有するプローブ、パラインフルエンザウイルス3のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を検出することが可能な配列番号39の塩基配列を有するプローブ、A型インフルエンザウイルスの基質タンパク質(M)遺伝子を検出することが可能な配列番号40の塩基配列を有するプローブ、内部対照群として、RNase Pを検出することが可能な配列番号41の塩基配列を有するプローブ、B型インフルエンザウイルスのヘマグルチニン(HA)遺伝子を検出することが可能な配列番号42の塩基配列を有するプローブ、RsウイルスA型の融合タンパク質遺伝子を検出することが可能な配列番号43の塩基配列を有するプローブ、RsウイルスB型の融合タンパク質遺伝子を検出することが可能な配列番号44の塩基配列を有するプローブ、メタニューモウイルスの核タンパク質(N)遺伝子を検出することが可能な配列番号45の塩基配列を有するプローブ、アデノウイルスのヘキソンタンパク質遺伝子を検出することが可能な配列番号46〜49の塩基配列を有するプローブ、ライノーウイルスA、B、Cの5’UTRを検出することが可能な配列番号50及び51の塩基配列を有するプローブ、ボカウイルスのヌクレオカプシドタンパク質(NP)遺伝子を検出することが可能な配列番号52の塩基配列を有するプローブを、通常の方法を用いてそれぞれ製作した(表2参照)。
実施例2−1:必要な溶液の準備
下記表3に示す試薬を準備した。これらは使用前に常温で放置し、解凍した。常温で30分以上放置しないことが好ましい。
鼻咽頭の吸引物或いはスワブ(swab)検体(NPS(Nasopharyngeal swabs)、NS(Nasla swabs)、TS(Throat swabs)、NA(Nasal aspirates))を使用した。
実施例2−2で準備された検体からRNA抽出キットを用いてRNAを抽出した。RT−PCR プレミックスが10μLずつ分注されている200μLのPCRチューブを、試料、陽性対照液及び陰性対照液を加えた個数の分を準備した。予め分注されて提供された各RT−PCR プレミックスチューブにRVPプライマー/プローブの混合液5μLと抽出した試料、陽性対照液または陰性対照液を5μLずつ添加した(表4参照)。
(1)各対照群別Ct値
対照群を対象として反応したときのCt値(threshold cycle:カットオフ値 を通過するサイクル数)は次のとおりであり(表6及び表7参照)、試料のCt値が各項目(FAM、HEX及びCY5)において全て37以下の場合に陽性と判定した(表6及び表7参照)。
各反応別にFAM、HEX、CY5波長のシグナル形成を確認し、下記表のとおり反応有効性と陽性、陰性を分析した(表8参照)。
Claims (13)
- (i)呼吸器疾患が発病したり、呼吸器疾患の発病が疑われる個体から分離された試料内のDNAまたはRNAを配列番号1〜14及び17〜33の塩基配列からなる群から選ばれる塩基配列を有するプライマーで増幅させる段階と、
(ii)コロナウイルス229E(Corona Virus 229E)、コロナウイルスOC43(Corona Virus OC43)、コロナウイルスNL63(Corona Virus NL63)、A型インフルエンザウイルス(Influenza A Virus)、B型インフルエンザウイルス(Influenza B Virus)、パラインフルエンザウイルス1(Parainfluenza Virus 1)、パラインフルエンザウイルス2(Parainfluenza Virus 2)、パラインフルエンザウイルス3(Parainfluenza Virus 3)、RsウイルスA型(RS Virus A)、RsウイルスB型(RS Virus B)、アデノウイルス(Adeno Virus)、ライノウイルスA型(Rhino Virus A)、ライノウイルスB型、ライノウイルスC型、メタニューモウイルス(Metapneumovirus)、及びボカウイルス(Boca Virus)よりなる群から選ばれる1種以上のウイルスをそれぞれ独立、または同時に検出する段階とを含んでなる、呼吸器系ウイルスによる疾患の診断方法。 - 配列番号1または2の塩基配列を有するプライマーがコロナウイルス229Eの核タンパク質(N)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号3または4の塩基配列を有するプライマーがコロナウイルスOC43の核タンパク質(N)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号5または6の塩基配列を有するプライマーがコロナウイルスNL63のポリタンパク質(la)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号7または8の塩基配列を有するプライマーがパラインフルエンザウイルス1のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号9または10の塩基配列を有するプライマーがパラインフルエンザウイルス2のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号11または12の塩基配列を有するプライマーがパラインフルエンザウイルス3のヘマグルチニン−ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号13または14の塩基配列を有するプライマーがA型インフルエンザウイルスの基質タンパク質(M)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号17または18の塩基配列を有するプライマーがB型インフルエンザウイルスのヘマグルチニン(HA)遺伝子を特異的に増幅し、配列番号19または20の塩基配列を有するプライマーがRsウイルスA型の融合タンパク質遺伝子を特異的に増幅し、配列番号21または22の塩基配列を有するプライマーがRsウイルスB型の融合タンパク質遺伝子を特異的に増幅し、配列番号25または26の塩基配列を有するプライマーがアデノウイルスのヘキソンタンパク質遺伝子を特異的に増幅し、配列番号27〜31よりなる群から選ばれる塩基配列を有するプライマーがライノウイルスA型、B型、C型の5’UTRを特異的に増幅し、配列番号23または24の塩基配列を有するプライマーがメタニューモウイルスの核タンパク質(N)遺伝子を特異的に増幅し、及び配列番号32または33の塩基配列を有するプライマーがボカウイルスのヌクレオカプシドタンパク質(NP)遺伝子を特異的に増幅する、請求項1に記載の方法。
- 内部対照群として、RNase Pを検出することが可能な配列番号15及び16の塩基配列を有するプライマーを用いて、遺伝子を特異的に増幅する段階をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記遺伝子を、配列番号34〜40及び42〜52の塩基配列よりなる群から選ばれる塩基配列を有するプローブを用いて検出する段階をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 内部対照群として、RNase Pを検出することが可能な配列番号41の塩基配列を有するプローブを用いて、遺伝子を特異的に増幅する段階をさらに含む、請求項4に記載の方法。
- 前記(i)段階が1〜5個の反応容器で行われる、請求項1に記載の方法。
- 前記試料が唾または痰(NPS(Nasopharyngeal swabs)、NS(Nasla swabs)、TS(Throat swabs)、NA(Nasal aspirates))である、請求項1に記載の方法。
- 配列番号1及び2の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号3及び4の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号5及び6の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号7及び8の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号9及び10の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号11及び12の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号13及び14の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号15及び16の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号17及び18の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号19及び20の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号21及び22の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号23及び24の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号25及び26の塩基配列を有するプライマーセット、配列番号27〜29の塩基配列を有する正方向プライマーと配列番号30及び31の塩基配列を有する逆方向プライマーの組み合わせからなるプライマーセット、並びに配列番号32及び33の塩基配列を有するプライマーセットよりなる群から選ばれる、呼吸器系ウイルスによる疾患診断用プライマーセット。
- 前記ウイルスが、コロナウイルス229E(Corona Virus 229E)、コロナウイルスOC43(Corona Virus OC43)、コロナウイルスNL63(Corona Virus NL63)、A型インフルエンザウイルス(Influenza A Virus)、B型インフルエンザウイルス(Influenza B Virus)、パラインフルエンザウイルス1(Parainfluenza Virus 1)、パラインフルエンザウイルス2(Parainfluenza Virus 2)、パラインフルエンザウイルス3(Parainfluenza Virus 3)、RsウイルスA型(RS Virus B)、RsウイルスB型(RS Virus B)、アデノウイルス(Adeno Virus)、ライノウイルスA型(Rhino Virus A)、ライノウイルスB型、ライノウイルスC型、メタニューモウイルス(Metapneumovirus)、及びボカウイルス(Boca Virus)である、請求項8に記載のプライマーセット。
- 請求項8のプライマーセットを含む、呼吸器系ウイルスによる疾患の同時診断用組成物。
- 配列番号34〜40及び配列番号42〜52の塩基配列から選ばれる塩基配列を有するプローブをさらに含む、請求項10に記載の組成物。
- ホットスタートTaq DNAポリメラーゼ及び逆転写酵素をさらに含む、請求項10に記載の組成物。
- 請求項10〜12のいずれか1項の組成物を含む、呼吸器系ウイルスによる疾患の同時診断キット。
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---|---|---|---|
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101821547B1 (ko) | 2015-07-29 | 2018-01-25 | 대한민국 | 호흡기 질환 원인체 검출용 조성물 |
KR101857685B1 (ko) * | 2017-09-22 | 2018-05-14 | 주식회사 코젠바이오텍 | 코로나바이러스의 아형을 동시에 검출하기 위한 프라이머 및 프로브, 및 이를 이용한 코로나바이러스의 검출방법 |
Families Citing this family (27)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108239676A (zh) * | 2016-12-23 | 2018-07-03 | 上海星耀医学科技发展有限公司 | 一种副流感病毒一步法荧光分型rt-pcr检测试剂盒 |
WO2018175883A1 (en) * | 2017-03-24 | 2018-09-27 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and methods for detecting or quantifying parainfluenza virus |
KR101886274B1 (ko) * | 2017-05-08 | 2018-08-08 | (주)바이오니아 | 메르스 코로나 바이러스의 검출용 조성물 및 이를 포함하는 메르스 코로나바이러스 검출방법 및 키트 |
KR101886272B1 (ko) * | 2017-11-30 | 2018-08-08 | (주)바이오니아 | 메르스 코로나 바이러스의 검출용 조성물 및 이를 포함하는 메르스 코로나바이러스 검출방법 및 키트 |
CN108504774B (zh) * | 2018-02-26 | 2021-12-14 | 宁波海尔施基因科技有限公司 | 一种检测鼻病毒分型和肠道病毒的方法 |
KR102040303B1 (ko) * | 2018-06-19 | 2019-11-04 | 국방과학연구소 | 생물학작용제 검출용 프라이머, 프로브, 이를 포함하는 키트 및 이를 이용한 검출 방법 |
KR102146113B1 (ko) * | 2018-11-22 | 2020-08-19 | 한국표준과학연구원 | 인간 알파코로나바이러스 전장유전체 증폭을 통한 진단키트 및 전장 유전체 서열 확인 방법 |
CN109487008B (zh) * | 2018-12-26 | 2022-03-29 | 中元汇吉生物技术股份有限公司 | 呼吸道病原体的多重pcr检测试剂盒、用途及其使用方法 |
CN110273025A (zh) * | 2019-06-19 | 2019-09-24 | 佛山科学技术学院 | 一种阿龙山病毒pcr检测引物组、试剂盒及应用 |
CN110331232B (zh) * | 2019-06-20 | 2022-07-05 | 广州达安基因股份有限公司 | 一种呼吸道病原体多重核酸检测试剂盒 |
CN110468234A (zh) * | 2019-08-09 | 2019-11-19 | 厦门安普利生物工程有限公司 | 用于19种人呼吸道病毒检测的多重荧光定量pcr试剂盒 |
CN110468238A (zh) * | 2019-09-11 | 2019-11-19 | 深圳市芯思微生物科技有限公司 | 一种恒温扩增检测甲型和乙型流感病毒的引物探针组、试剂盒及应用 |
CN111411172A (zh) * | 2020-02-28 | 2020-07-14 | 江苏硕世生物科技股份有限公司 | 一种同时检测人新型冠状病毒和甲型流感、乙型流感病毒的探针及引物组合物 |
CN111394514B (zh) * | 2020-03-30 | 2023-01-06 | 杭州千基生物科技有限公司 | 一种同时检测24种呼吸道病原菌量子点核酸检测试剂盒及方法 |
WO2022015053A1 (en) * | 2020-07-14 | 2022-01-20 | Seegene, Inc. | Sampling kits and methods for detecting respiratory pathogens |
KR102526524B1 (ko) * | 2020-09-02 | 2023-04-27 | 한국표준과학연구원 | 전장유전체 증폭을 위한 인간 사스-코로나바이러스-2 범용 프라이머 세트 및 이를 이용한 진단 키트 |
US20220162600A1 (en) * | 2020-11-23 | 2022-05-26 | Zunyi Yang | Compositions for the Multiplexed Detection of Viruses |
CN112593013B (zh) * | 2020-12-29 | 2022-07-05 | 西北农林科技大学 | 牛副流感病毒和牛呼吸道合胞体病毒双重rpa检测试剂盒 |
CN113005228B (zh) * | 2021-04-06 | 2023-10-10 | 上海君远生物科技有限公司 | 一种同步检测多项呼吸道病原体的检测试剂盒及其检测方法 |
CN113073149A (zh) * | 2021-04-26 | 2021-07-06 | 济南国益生物科技有限公司 | 一种基于lfd-rma法检测人腺病毒的引物探针组 |
CN113430301B (zh) * | 2021-06-09 | 2024-01-02 | 上海伯杰医疗科技有限公司 | 一种呼吸道病原体检测用组合物、试剂盒及其应用 |
CN113817870B (zh) * | 2021-09-10 | 2023-12-22 | 宁波海尔施基因科技股份有限公司 | 同时检测七种呼吸道相关病毒的引物组合物及其应用 |
CN114262759B (zh) * | 2022-02-11 | 2024-02-27 | 重庆巴斯德生物医药科技有限公司 | 一种联合检测多种呼吸道病毒的pcr引物组及试剂盒 |
CN114836580B (zh) * | 2022-06-02 | 2024-05-10 | 昆明理工大学 | 呼吸道感染性疾病病原体的多重qPCR检测引物组合 |
CN116287434B (zh) * | 2022-10-21 | 2024-03-26 | 深圳康美生物科技股份有限公司 | 一种呼吸道症候群病原体核酸检测试剂盒 |
CN116219075B (zh) * | 2023-03-15 | 2023-09-22 | 北京华瑞康源生物科技发展有限公司 | 可覆盖45种基因型合胞病毒的引物对、探针组合、检测方法及试剂盒 |
CN117144063B (zh) * | 2023-09-15 | 2024-04-19 | 果然基因科技(山东)股份有限公司 | 一种12种呼吸道病原体荧光pcr熔解曲线试剂盒 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006180878A (ja) * | 2004-12-24 | 2006-07-13 | Samsung Electronics Co Ltd | 呼吸器感染に関連したウイルスに特異的な核酸プライマーセットおよびプローブオリゴヌクレオチド |
WO2009009900A1 (en) * | 2007-07-17 | 2009-01-22 | Universite Laval | Nucleic acid sequences for the amplification and detection of respiratory viruses |
JP2009523451A (ja) * | 2006-01-18 | 2009-06-25 | リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ コロラド | 既存のおよび新興のインフルエンザ株の診断法としてのdnaアレイ解析の方法 |
JP2009538146A (ja) * | 2006-05-23 | 2009-11-05 | モレキュラー ディテクション,インコーポレイテッド | 室温で安定な分子診断用キット |
Family Cites Families (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6015664A (en) * | 1995-11-03 | 2000-01-18 | Mcw Research Foundation | Multiplex PCR assay using unequal primer concentrations to detect HPIV 1,2,3 and RSV A,B and influenza virus A, B |
US6110457A (en) * | 1995-12-08 | 2000-08-29 | St. Louis University | Live attenuated vaccines based on cp45 HPIV-3 strain and method to ensure attenuation in such vaccines |
WO2004057021A2 (en) * | 2002-12-19 | 2004-07-08 | UNIVERSITé LAVAL | Molecular methods and compositions for detecting and quantifying respiratory viruses |
CA2522379C (en) * | 2003-04-10 | 2012-10-23 | Chiron Corporation | The severe acute respiratory syndrome coronavirus |
BRPI0413825A (pt) * | 2003-08-22 | 2006-10-24 | Birch Biomedical Res Llc | detecção molecular multialélica de coronavìrus associado com sars |
US8318423B2 (en) * | 2004-07-06 | 2012-11-27 | Focus Diagnostics, Inc. | Methods and compositions for detecting rhinoviruses |
ES2303395B1 (es) | 2004-12-24 | 2009-05-29 | Instituto De Salud Carlos Iii | Sondas y metodos para la deteccion e identificacion simultanea de multiples virus causantes de infecciones respiratorias en humanos. |
US20070087336A1 (en) * | 2005-10-17 | 2007-04-19 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of influenza viruses |
US20070092871A1 (en) * | 2005-10-20 | 2007-04-26 | Combimatrix Corporation | Microarray for pathogen identification |
KR100824414B1 (ko) * | 2005-11-11 | 2008-04-23 | 대한민국 | 호흡기바이러스 진단을 위한 단일튜브-멀티플렉스rt-pcr 방법 및 프라이머 |
US8110350B2 (en) | 2005-11-17 | 2012-02-07 | Karolinska Institutet Innovations Ab | Human Bocavirus and methods of diagnosis and treatment |
WO2008042450A2 (en) * | 2006-01-20 | 2008-04-10 | Lawrence Livermore National Security, Llc. | Multiplex detection of respiratory pathogens |
WO2007130519A2 (en) * | 2006-05-02 | 2007-11-15 | Government Of The Usa, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Viral nucleic acid microarray and method of use |
US7972786B2 (en) * | 2006-07-07 | 2011-07-05 | Brandeis University | Detection and analysis of influenza virus |
WO2008016594A1 (en) * | 2006-07-31 | 2008-02-07 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Picornavirus and uses thereof |
CA2687888A1 (en) * | 2007-05-31 | 2008-12-11 | Becton, Dickinson And Company | Sequences and methods for detecting influenza a and influenza b virus |
KR100909621B1 (ko) | 2007-06-19 | 2009-07-29 | 대한민국 | 사람 보카바이러스의 절대 정량을 위한 실시간 pcr 분석방법 |
CN101812532A (zh) * | 2009-02-24 | 2010-08-25 | 江苏默乐生物科技有限公司 | 呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒和流感病毒检测引物和探针 |
KR101055629B1 (ko) | 2009-06-02 | 2011-08-09 | 대한민국 | 사람 코로나 바이러스(HCoV)-HKU1의 절대 정량을 위한 실시간 PCR 분석 방법 |
CN103562389B (zh) * | 2011-02-08 | 2020-06-23 | 淡马锡生命科学研究院有限公司 | 用于有效表面展示抗原蛋白的新颖表达盒 |
-
2011
- 2011-02-18 KR KR1020110014807A patent/KR101939336B1/ko active IP Right Grant
-
2012
- 2012-02-20 JP JP2013554403A patent/JP6329370B2/ja active Active
- 2012-02-20 WO PCT/KR2012/001262 patent/WO2012112012A2/ko active Application Filing
- 2012-02-20 EP EP12747732.1A patent/EP2677038B1/en active Active
- 2012-02-20 US US14/000,153 patent/US10106860B2/en active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006180878A (ja) * | 2004-12-24 | 2006-07-13 | Samsung Electronics Co Ltd | 呼吸器感染に関連したウイルスに特異的な核酸プライマーセットおよびプローブオリゴヌクレオチド |
JP2009523451A (ja) * | 2006-01-18 | 2009-06-25 | リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ コロラド | 既存のおよび新興のインフルエンザ株の診断法としてのdnaアレイ解析の方法 |
JP2009538146A (ja) * | 2006-05-23 | 2009-11-05 | モレキュラー ディテクション,インコーポレイテッド | 室温で安定な分子診断用キット |
WO2009009900A1 (en) * | 2007-07-17 | 2009-01-22 | Universite Laval | Nucleic acid sequences for the amplification and detection of respiratory viruses |
Non-Patent Citations (10)
Title |
---|
A. WISDOM, ET AL., JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 47, no. 12, JPN6015001069, 14 October 2009 (2009-10-14), pages 3958 - 3967, ISSN: 0002983501 * |
AMIT KAPOOR, ET AL., THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, vol. Vol. 201, Issue. 11, JPN6015001074, 1 June 2010 (2010-06-01), pages 1633 - 1643, ISSN: 0002983503 * |
BONITA E. LEE, ET AL., JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY, vol. Vol. 78, Issue. 5, JPN6015001065, 22 May 2006 (2006-05-22), pages 702 - 710, ISSN: 0002983500 * |
HEIDI SMUTS AND DI HARDIE, EMERGING INFECTIOUS DISEASES, vol. 12, no. 9, JPN6015001079, September 2006 (2006-09-01), pages 1457 - 1458, ISSN: 0002983505 * |
JACQUES SIZUN, ET AL., JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, vol. Vol. 72, Issue. 2, JPN6015001062, June 1998 (1998-06-01), pages 145 - 152, ISSN: 0002983499 * |
JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 42, no. 4, JPN6015048943, 2004, pages 1564 - 1569, ISSN: 0003209728 * |
JULIA DINA, ET AL., JOURNAL OF PAEDIATRICS AND CHILD HEALTH, vol. Vol. 45, Issue. 3, JPN6015001076, 3 February 2009 (2009-02-03), pages 149 - 153, ISSN: 0002983504 * |
SHANNON L. EMERY, ET AL., EMERGING INFECTIOUS DISEASES, vol. 10, no. 2, JPN6015001083, February 2004 (2004-02-01), pages 311 - 316, ISSN: 0003209731 * |
XIAOYAN LU, ET AL., JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 44, no. 9, JPN6015001080, September 2006 (2006-09-01), pages 3231 - 3235, ISSN: 0002983506 * |
鈴木 陽, 外2名, 感染症誌, vol. 77, no. 6, JPN6015001071, 2003, pages 467 - 468, ISSN: 0002983502 * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101821547B1 (ko) | 2015-07-29 | 2018-01-25 | 대한민국 | 호흡기 질환 원인체 검출용 조성물 |
KR101857685B1 (ko) * | 2017-09-22 | 2018-05-14 | 주식회사 코젠바이오텍 | 코로나바이러스의 아형을 동시에 검출하기 위한 프라이머 및 프로브, 및 이를 이용한 코로나바이러스의 검출방법 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
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