JP2014509837A - 抗ｃｄ３８抗体 - Google Patents

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Abstract

ヒトＣＤ３８及びカニクイザルＣＤ３８と結合する単離された抗体を開示する。さらに、開示抗体を含む医薬組成物、開示抗体を用いるための治療及び診断方法も開示する。
【選択図】図１１

Description

（背景）
本願は、２０１０年１２月３０に出願されたＵＳＳＮ６１／４２８，６９９；２０１１年３月３１日に出願されたＵＳＳＮ６１／４７０，３８２；２０１１年３月３１日に出願されたＵＳＳＮ６１／４７０，４０６；及び２０１１年５月１１日に出願されたＵＳＳＮ６１／４８５，１０４の３５Ｕ．Ｓ．Ｃ．§１１９（ｅ）下での利益を主張し、これらの出願は全て、その全体が参照によって本明細書に援用される。
ＣＤ３８は、サイクリックＡＤＰリボースヒドロラーゼとしても知られ、長いＣ末端細胞外ドメインと、短いＮ末端細胞質ドメインとを有するＩＩ型膜貫通糖タンパク質である。ＣＤ３８は、ＣＤ１５７及びＡｐｌｙｓｉａ ＡＤＰＲを含む、関連する膜結合酵素又は可溶性酵素のグループのメンバーである。この酵素ファミリーは、ＮＡＤをサイクリックＡＤＰリボース又はニコチン酸（ｎｉｃｔｏｔｉｎｉｃ ａｃｉｄ）−アデニンジヌクレオチドホスフェートに変換する独特の能力を有する。
さらに、ＣＤ３８は、Ｃａ２＋動員に関与すること、及び多数のシグナル伝達分子（ホスホリパーゼＣγ、ＺＡＰ−７０、ｓｙｋ及びｃ−ｃｂｌを含む）のチロシンリン酸化を介したシグナル伝達に関与することが報告されている。これらの観察結果に基づいて、ＣＤ３８は、リンパ系細胞の正常な発達の間、その成熟及び活性化において重要なシグナル伝達分子であることが提案された。
造血細胞の間での様々な機能的効果は、ＣＤ３８媒介性のシグナル伝達に起因しており、これには、リンパ球増殖、サイトカイン放出、Ｂ細胞及び骨髄性細胞の発達及び生存の制御、並びに樹状細胞の成熟誘導が含まれる。
それにも関わらず、シグナル伝達及び造血におけるＣＤ３８の正確な役割は不明確なままである。なぜなら、シグナル伝達研究の大半は、ＣＤ３８を異所的に過剰発現する細胞株及び抗ＣＤ３８モノクローナル抗体（非生理的リガンドである）を使用しているからである。
ＣＤ３８の予測される天然リガンドは、ＣＤ３１（ＰＥＣＡＭ−１；血小板内皮細胞接着分子−１）である。ＣＤ３１は、１３０ｋＤの免疫グロブリンスーパーファミリーメンバーであり、循環血小板、好中球、単球及びナイーブＢリンパ球の表面に発現している。機能的には、ＣＤ３１は接着分子として作用とすると考えられる。ＣＤ３８とＣＤ３１の相互作用が、白血病細胞の生存の促進に作用し得ることが示唆されている。
単一分子を欠損した動物モデルは、多くの例において、その動物における分子の生物学的役割を理解する基本的ツールである。その根底にある前提は、タンパク質が必須の機能を発揮しているなら、その完全な喪失により、当該機能の完全な喪失がもたらされるというものである。
ＣＤ３８ノックアウトマウスが作出されている。これらの動物は、組織関連ＮＡＤａｓｅ活性のほぼ完全な喪失を示す。それにも関わらず、これらの動物は生存可能であり、これにより、ＣＤ３８及びその活性は生存に必要ではないとの結論が導かれる。しかしながら、これらのマウスは、先天性免疫の欠損及びＴ細胞依存性液性免疫応答の低下を示す。
マウスでの結果とは対照的に、ヒトにおいては、ＣＤ３８の欠如と生存とは相容れないとの強力な状況証拠が存在する。新生児由来の５，０００超の血液サンプルを分析しても、ＣＤ３８−個体を一つも同定できなかった；これは、マウスとは異なって、ＣＤ３８が生存に必要であることを示唆する。従って、ＣＤ３８機能についてマウスで観察された結果をヒトに外挿できるかは不明である。
ＣＤ３８は、多くの造血器悪性腫瘍、及び様々な造血器悪性腫瘍に由来する細胞株で上方制御されており、当該悪性腫瘍としては、非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、バーキットリンパ腫（ＢＬ）、多発性骨髄腫（ＭＭ）、Ｂ細胞慢性リンパ性白血病（Ｂ−ＣＬＬ）、Ｂ細胞及びＴ細胞急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、Ｔ細胞リンパ腫（ＴＣＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、有毛細胞白血病（ＨＣＬ）、ホジキンリンパ腫（ＨＬ）及び慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）が挙げられる。一方、造血系の最も未発達な多能性幹細胞はＣＤ３８−である（図１）。
抗ガン剤の発見及び開発における最近の進歩にも関わらず、ＣＤ３８発現腫瘍を伴う多くの種類のガンは、依然として予後が不良である。従って、このような種類のガンを治療するための方法が必要とされている。
（本発明の要旨）
本明細書では、ＣＤ３８に結合するための試薬及び方法、並びにＣＤ３８特異的抗体を含むＣＤ３８特異的結合剤を用いた、ＣＤ３８関連疾患の治療方法及びＣＤ３８の検出方法を提供する。
従って、いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的な単離された抗体を記載する。この抗体は、重鎖可変領域と軽鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域は、３つの相補性決定領域（ＣＤＲｓ）であるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３から構成され、軽鎖可変領域も３つのＣＤＲであるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３から構成される。ＣＤＲの配列は、ＨＣＤＲ１（配列番号３）、ＨＣＤＲ２（配列番号４）、ＨＣＤＲ３（配列番号５）、ＬＣＤＲ１（配列番号６）、ＬＣＤＲ２（配列番号７）及びＬＣＤＲ３（配列番号８）により表される。
他の実施態様において、単離された抗体は重鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域の配列は配列番号９により包含される。他の実施態様において、単離された抗体は軽鎖可変領域から構成されており、ここで軽鎖可変領域の配列は配列番号１０により包含される。
いくつかの実施態様において、単離された抗体は重鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域の配列は配列番号９により包含される。他の実施態様において、単離された抗体は軽鎖可変領域から構成されており、ここで軽鎖可変領域の配列は配列番号１０により包含される。重鎖可変領域と軽鎖可変領域のこの組合せは、Ａｂ７９と称される。
いくつかの実施態様において、単離された抗体は、重鎖及び軽鎖から構成されており、ここで重鎖の配列は配列番号１１により包含され、軽鎖は配列番号１２により包含される。
いくつかの実施態様において、単離された抗体はＦｃドメインを含む。他の実施態様において、ＦｃドメインはヒトＦｃドメインである。さらに他の実施態様において、Ｆｃドメインは変異型Ｆｃドメインである。
いくつかの実施態様において、配列番号１１の重鎖をコードする単離された核酸を提供する。他の実施態様において、配列番号１２の軽鎖をコードする単離された核酸を提供する。
いくつかの実施態様において、配列番号１１の重鎖をコードする単離された核酸と、配列番号１２の軽鎖をコードする単離された核酸とを含む、宿主細胞を提供する。
いくつかの実施態様において、本発明の抗体の製造方法を提供する。当該方法は、配列番号１１の重鎖をコードする単離された核酸と、配列番号１２の軽鎖をコードする単離された核酸とを含む宿主細胞を、前記単離された核酸が発現し、抗体が製造される条件下で培養する工程を包含する。
いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的な単離された抗体を記載する。この抗体は、６つのＣＤＲから構成されており、ここで、この抗体の各ＣＤＲは、０個、１個又は２個のアミノ酸置換により、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７及び配列番号８とは異なり得る。
他の実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的な単離された抗体を記載する。この抗体は、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域は、３つの相補性決定領域（ＣＤＲｓ）であるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３から構成されており、軽鎖可変領域も３つのＣＤＲであるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３から構成されている。ＣＤＲの配列は、ＨＣＤＲ１（配列番号１３）、ＨＣＤＲ２（配列番号１４）、ＨＣＤＲ３（配列番号１５）、ＬＣＤＲ１（配列番号１６）、ＬＣＤＲ２（配列番号１７）及びＬＣＤＲ３（配列番号１８）により表される。
他の実施態様において、単離された抗体は重鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域の配列は配列番号１９により包含される。他の実施態様において、単離された抗体は軽鎖可変領域から構成されており、ここで軽鎖可変領域の配列は配列番号２０により包含される。
いくつかの実施態様において、単離された抗体は重鎖可変領域から構成されており、ここで重鎖可変領域の配列は配列番号１９により包含される。他の実施態様において、単離された抗体は軽鎖可変領域から構成されており、ここで軽鎖可変領域の配列は配列番号２０により包含される。重鎖可変領域と軽鎖可変領域のこの組合せはＡｂ１９と称される。
いくつかの実施態様において、単離された抗体は、重鎖及び軽鎖から構成されており、ここで重鎖の配列は配列番号２１により包含され、軽鎖は配列番号２２により包含される。
いくつかの実施態様において、重鎖をコードする配列番号２１の単離された核酸を提供する。他の実施態様において、軽鎖をコードする配列番号２２の単離された核酸を提供する。
いくつかの実施態様において、配列番号２１の重鎖をコードする単離された核酸と、配列番号２２の軽鎖をコードする単離された核酸とを含む、宿主細胞を提供する。
いくつかの実施態様において、本発明の抗体の製造方法を提供する。当該方法は、配列番号２１の重鎖をコードする単離された核酸と、配列番号２２の軽鎖をコードする単離された核酸とを含む宿主細胞を、前記単離された核酸が発現し、抗体が製造される条件下で培養する工程を包含する。
他の実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的な単離された抗体を記載する。この抗体は、６つのＣＤＲから構成されており、ここで、この抗体の各ＣＤＲは、０個、１個又は２個のアミノ酸置換により、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７及び配列番号１８とは異なり得る。
いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的に結合する単離された抗ＣＤ３８抗体を提供し、ここで該抗体は、約１０−６、１０−７、１０−８、１０−９以上のＫＤでヒトＣＤ３８に結合し、約１０−６、１０−７、１０−８、１０−９以上のＫＤでカニクイザルＣＤ３８と結合する。
いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８及び／又はカニクイザルＣＤ３８との結合についてＡｂ７９及び／又はＡｂ１９と競合する抗体を提供する。
これらの及び他の実施態様、特徴及び潜在的利点は、以下の記載及び図面を参照することにより明らかとなるだろう。
図１は、リンパ系細胞のＣＤ３８発現プロファイルを示し、星印はＣＤ３８高発現を示す。ＣＤ３８発現は、プロＢ細胞（ＣＤ３４＋ＣＤ１９＋ＣＤ２０−）、活性化Ｂ細胞（ＣＤ１９＋ＣＤ２０＋）、形質細胞（ＣＤ１３８＋ＣＤ１９−ＣＤ２０−）、活性化ＣＤ４＋及びＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞（ＣＤ３＋ＣＤ５６＋）及びＮＫ細胞（ＣＤ５６＋ＣＤ１６＋）において同定された。さらに、ＣＤ３８発現は、リンパ球前駆細胞（ＣＤ３４＋ＣＤ４５ＲＡ＋ＣＤ１０＋ＣＤ１９−）でも見られるが、リンパ系幹細胞では見られない。さらに、成熟ＤＣ及び活性化単球においてＣＤ３８発現の増加が見られる。 図２はＡｂ７９及びＡｂ１９の重鎖及び軽鎖の配列を示す。 図３は、ヒト及びカニクイザルＣＤ３８の配列を表す。 図４は、ベンチマーク１及び２、Ａｂ１９及びＡｂ７９の各抗体に結合するヒトＣＤ３８のエピトープを示す。 図５は、市販のヒトＣＤ３８抗体を用いた、ＳＬＥ患者由来のＰＭＢＣにおけるＣＤ３８発現の増加を示す。 図６は、投与２４時間後のカニクイザルにおける細胞数の変化の割合を示す。 図７は、Ａｂ７９の単回投与後の枯渇の回復を示す。 図８は、Ａｂ７９の単回投与後の全てのＩｇアイソタイプの有意な減少に関して、単一のＨｕＳＣＩＤマウスから得られた結果を示す。 図９は、実施例に記載のとおり、ＨｕＳＣＩＤマウスにおけるＡｂ７９枯渇活性についての図８と同様である。 図１０は、Ａｂ７９処置時のＨｕＳＣＩＤモデルにおける抗破傷風応答（ａｎｔｉ−ｔｅｔａｎｕｓ ｒｅｓｐｏｎｓｅ）の有意な減少を示す。 図１１は、再度ＨｕＳＣＩＤモデルにおいて（本質的には移植片対宿主モデルの一種）、Ａｂ７９処置時の生存率の有意な増加を示す。 図１２は、ヒト及びマウスＰＢＭＣにおける、それぞれに対する市販の抗体を用いたＣＤ３８抗原の発現差を示す。 図１３は、代替（ｓｕｒｒｏｇａｔｅ）マウス抗ＣＤ３８抗体が、末梢血由来の免疫細胞を枯渇することを示す、炎症状況における治療効果を示す。
（本発明の詳細な説明）
概説
ＣＤ３８の細胞外ドメインは、ＡＤＰリボシルシクラーゼ活性とＡＤＰリボシルヒドロラーゼ活性の両方を有する、二機能（ｂｉｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ）酵素活性を有することが示されている。従って、ＣＤ３８は、ＮＡＤ＋のｃＡＤＰＲへの変換を触媒でき（シクラーゼ）、さらにそれをＡＤＰリボースに加水分解できる（ヒドロラーゼ）。ｃＡＤＰＲは、細胞増殖、分化及びアポトーシスに重要なセカンドメッセンジャーアクティビティーであるカルシウムの細胞内ストアからの動員に機能する。
ＣＤ３８の発現の増加は、造血起源の様々な疾患で報告されており、慢性リンパ芽球性白血病におけるネガティブな予後マーカーとして記載されている。このような疾患としては、多発性骨髄腫（Ｊａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８））、慢性リンパ芽球性白血病（Ｍｏｒｉｂｉｔｏ ｅｔ ａｌ．（２００１）、Ｊｅｌｉｎｅｋ ｅｔ ａｌ．（２００１）、Ｃｈｅｖａｌｉｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００２）、Ｄuｒｉｇ ｅｔ ａｌ．（２００２））、Ｂ細胞慢性リンパ性白血病、Ｂ細胞急性リンパ性白血病を含む急性リンパ芽球性白血病（Ｋｅｙｈａｎｉ ｅｔ ａｌ（２０００））、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、原発性全身性アミロイドーシス、マントル細胞リンパ腫、前リンパ球性／骨髄性白血病、急性骨髄性白血病（Ｋｅｙｈａｎｉ ｅｔ ａｌ．（１９９３））、慢性骨髄性白血病（Ｍａｒｉｎｏｖ ｅｔ ａｌ．（１９９３））、濾胞性リンパ腫、ＮＫ細胞白血病及び形質細胞白血病が挙げられるが、これらに限定されない。このように、ＣＤ３８は、造血系疾患の治療において有用な標的を提供する。
複数の抗ＣＤ３８抗体が、ＣＤ３８関連ガンの治療について臨床試験されている。従って、治療効果及び／又は診断的適用を有するＣＤ３８に対する抗体が有用である。本発明は、異なるＣＤ３８エピトープに結合する、２つの異なる抗ＣＤ３８のＣＤＲセットであって、ＣＤ３８のヒト及びカクニイザイル形態の両方に結合するもの、並びにこれらのＣＤＲを含む抗体を提供する。
さらに、本発明は、活性化リンパ球と関連する炎症及び／又は免疫学的障害（具体的には自己免疫疾患を含む）の診断及び／又は治療における、抗ＣＤ３８抗体の利用を見出すことを示す。本明細書で示すとおり、ＣＤ３８は未熟な造血細胞で発現し、成熟細胞では下方制御され、活性化リンパ球及び形質細胞において高レベルで再発現する。例えば、ＣＤ３８の高発現は、活性化Ｂ細胞、形質細胞、活性化ＣＤ４＋Ｔ細胞、活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、成熟樹状細胞（ＤＣ）及び活性化単球で見られる。
本明細書における発見は、ＣＤ３８に対する自己抗体の存在が、糖尿病、慢性自己免疫性甲状腺炎及びグレーブス病と関連するという点で驚くべきものである（Ａｎｔｏｎｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ，Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１ １２６：４２６−４３１；Ｍａｌｌｏｎｅ ｅｔ ａｌ．，Ｄｉａｂｅｔｅｓ ５０：７５２（２００１）及びＡｎｔｏｎｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．Ｉｎｖｅｓｔ．２７：６９５−７０７（２００４）を参照されたい。これらは全て参照により援用される）。
従って、本発明の抗体は多数の疾患の診断及び／又は治療における利用が見出されており、当該疾患としては、以下に記載の自己免疫疾患に限定されないが、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、関節リウマチ（ＲＡ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）及び潰瘍性大腸炎が挙げられるが、これらに限定されない。
従って、例えば、高い形質細胞を呈するＳＬＥ患者や、ＣＤ２０に基づく治療に不応答性のＲＡ患者などの、高い形質細胞量を有する患者が選択され得る。
本発明の治療的抗ＣＤ３８抗体は、ＣＤ３８陽性細胞と結合し、その結果、ＣＤＣ、ＡＤＣＣ及びアポトーシス経路（これらに限定されない）を含む複数の作用メカニズムを介して、活性化リンパ球などのこれらの細胞の枯渇をもたらし、本明細書で概説するように、自己免疫疾患の治療及び／又は改善を導く。
ガン臨床試験におけるいくつかの抗ＣＤ３８抗体では見られない利点の一つは、カニクイザルＣＤ３８に結合できることである。なぜなら、これらの霊長類は前臨床試験での利用が見出されており、従って、投与、毒性、有効性などの初期の評価につながり得るからである。
ＣＤ３８タンパク質
従って、本発明は、ヒトＣＤ３８タンパク質に特異的に結合する（及び、以下に記載のとおり、追加として、好ましくは、霊長類ＣＤ３８タンパク質に特異的に結合する）単離された抗ＣＤ３８抗体を提供する。当分野で既知のとおり、ＣＤ３８タンパク質は多数の種で見られる。本発明で特に有用なものは、ヒトＣＤ３８タンパク質と霊長類ＣＤ３８タンパク質、特に、臨床試験で使用される霊長類、例えば、カニクイザル（マカカ・ファシキュラリス（Ｍａｃａｃａ ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）、カニクイザル（Ｃｒａｂ ｅａｔｉｎｇ ｍａｃａｑｕｅ）、本明細書では「サイノ」（ｃｙｎｏ）と称する場合もある）などのＣＤ３８タンパク質の両方に結合する抗体である。「ヒトＣＤ３８」又は「ヒトＣＤ３８抗原」とは、配列番号１、又はエピトープなどの機能性断片（本明細書で定義するとおり）のタンパク質を意味する。一般に、ＣＤ３８は、短い細胞質内テイル、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインを有し、特定の実施態様において、本発明の抗体は、ＣＤ３８タンパク質の細胞外部分と結合する。本明細書において「カニクイザルＣＤ３８」とは、ヒトＣＤ３８と９２％同一である配列番号２を意味する。
ＣＤ３８の同義語には、ＡＤＰリボシルシクラーゼ１、ｃＡＤＰｒヒドロラーゼ１、Ｃｄ３８−ｒｓ１、サイクリックＡＤＰ−リボースヒドロラーゼ１、Ｉ−１９及びＮＩＭ−Ｒ５抗原が含まれる。
いくつかの実施態様において、本発明の抗ＣＤ３８ Ａｂ７９抗体は、多数のアミノ酸残基においてＣＤ３８と相互作用し、該アミノ酸残基としては、Ｋ１２１、Ｆ１３５、Ｑ１３９、Ｄ１４１、Ｍ１４２、Ｄ２０２、Ｖ２０３、Ｈ２０５、Ｑ２３６、Ｅ２３９、Ｗ２４１、Ｓ２７４、Ｃ２７５、Ｋ２７６、Ｆ２８４、Ｃ２８７、Ｖ２８８、Ｋ２８９、Ｎ２９０、Ｐ２９１、Ｅ２９２、Ｄ２９３が挙げられる。本明細書で概説するように、これらの残基と相互作用する他の抗体も、治療及び診断的適用における使用が見出される。
いくつかの実施態様において、本発明の抗ＣＤ３８抗体は、任意選択で（いくつかの場合においては好ましくは）、ＣＤ１５７などのＣＤ３８ファミリーの他のメンバーと結合しない。例えば、本明細書における好ましい実施態様は、配列番号２３（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＮＰ＿００４３２５）のヒトＣＤ１５７と結合しない。
抗体
本発明は、抗ＣＤ３８抗体、通常は本明細書に記載のとおり、治療及び／又は診断抗体を提供する。本発明での使用が発見される抗体は、本明細書に記載のとおり、多数のフォーマットをとることができ、これには、従来の抗体、並びに抗体誘導体、断片及び模倣物（ｍｉｍｅｔｉｃｓ）（以下に記載）が挙げられる。原則として、本発明は、本明細書で定義するとおり６個のＣＤＲのセット（以下に記載のとおり、少数のアミノ酸の変化を含む）を含む抗体構造を提供する。
従来の抗体構造ユニットは、典型的には４量体を含む。各４量体は、典型的には、２つの同一のポリペプチチド鎖対からなり、各対は、１つの「軽」鎖（典型的には約２５ｋＤａの分子量を有する）と１つの「重」鎖（典型的には、約５０〜７０ｋＤａの分子量を有する）を有する。ヒト軽鎖は、κ軽鎖とλ軽鎖に分類される。重鎖は、μ、δ、γ、α又はεに分類され、それぞれ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＥとして抗体アイソタイプを定義する。ＩｇＧは複数のサブクラスを有し、サブクラスとしては、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４が挙げられるがこれらに限定されない。ＩｇＭは、ＩｇＭ１及びＩｇＭ２を含むサブクラスを有するが、これらに限定されない。従って、本明細書で使用される場合、「アイソタイプ」は、その定常領域の化学的及び抗原的特徴により定義される免疫グロブリンの任意のサブクラスを意味する。既知のヒト免疫グロブリンアイソタイプは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＭ１、ＩｇＭ２、ＩｇＤ及びＩｇＥである。治療用抗体には、アイソタイプ及び／又はサブクラスのハイブリッドも含まれ得ることが理解されるべきである。
各鎖のアミノ末端部分には、抗原認識に主に関与する約１００〜１１０以上のアミノ酸の可変領域が含まれる。可変領域では３つのループが重鎖及び軽鎖の各Ｖドメインについて集合しており、抗原結合部位を形成する。各ループは、相補性決定領域とも称され（以下、「ＣＤＲ」とも称する）、この部分におけるアミノ酸配列の変異（ｖａｒｉａｔｉｏｎ）が最も顕著である。「可変」とは、可変領域の特定のセグメントが、抗体の配列において広範囲に異なるという事実を意味する。可変領域内の可変性は、均一に分布していない。代わりに、Ｖ領域は、それぞれ９〜１５アミノ酸長以上の「超可変領域」と称される極度に可変性の短い領域により分離される１５〜３０アミノ酸のフレームワーク領域（ＦＲ）と称される比較的不変のストレッチからなる。
各ＶＨ及びＶＬは、３つの超可変領域（「相補性決定領域」、「ＣＤＲ」）と４つのＦＲからなり、以下の順序でアミノ末端からカルボキシ末端へ配置される：ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４。
超可変領域は、一般に、軽鎖可変領域における、アミノ酸残基約２４〜３４（ＬＣＤＲ１；「Ｌ」は軽鎖を意味する）、５０〜５６（ＬＣＤＲ２）及び８９〜９７（ＬＣＤＲ３）と重鎖可変領域における、約３１〜３５Ｂ（ＨＣＤＲ１；「Ｈ」は重鎖を意味する）、５０〜６５（ＨＣＤＲ２）及び９５〜１０２（ＨＣＤＲ３）のアミノ酸残基；Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，ＳＥＱＵＥＮＣＥＳ ＯＦ ＰＲＯＴＥＩＮＳ ＯＦ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＩＣＡＬ ＩＮＴＥＲＥＳＴ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１）、及び／又は超可変性ループを形成するそれらの残基（例えば、軽鎖可変領域における残基２６〜３２（ＬＣＤＲ１）、５０〜５２（ＬＣＤＲ２）及び９１〜９６（ＬＣＤＲ３）と、重鎖可変領域における２６〜３２（ＨＣＤＲ１）、５３〜５５（ＨＣＤＲ２）及び９６〜１０１（ＨＣＤＲ３）；Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ（１９８７）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１−９１７を包含する。本発明の具体的なＣＤＲは以下に記載する。
本明細書にわたり、可変ドメインの残基（およそ、軽鎖可変領域の残基１〜１０７及び重鎖可変領域の残基１〜１１３）について言及する場合には、Ｆｃ領域で使用されるＥＵナンバーシステムとともに、Ｋａｂａｔナンバリングシステムを通常用いる（例えば、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，上記（１９９１））。
ＣＤＲは、抗原結合の形成に寄与し、より詳細には、抗体のエピトープ結合部位の形成に寄与する。「エピトープ」とは、パラトープとして知られる、抗体分子の可変領域における特異的な抗原結合部位と相互作用する決定基を意味する。エピトープは、アミノ酸や糖側鎖などの分子にグループ分けされ、通常、特異的な構造特性及び特異的な電荷特性を有する。単一の抗原が、２以上のエピトープを有してもよい。例えば、本明細書で示すとおり、「Ａｂ１９」及び「Ａｂ７９」と本明細書で称する２つの異なる抗体は、ＣＤ３８分子上の異なるエピトープに結合する。
エピトープは、結合に直接関与するアミノ酸残基（エピトープの免疫優性コンポーネント（ｉｍｍｕｎｏｄｏｍｉｎａｎｔ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）とも称される）、及び結合に直接関与しない他のアミノ酸残基（特異的な抗原結合ペプチドにより有効に阻害されるアミノ酸残基など）（換言すれば、当該アミノ酸残基は、特異的な抗原結合ペプチドのフットプリント（ｆｏｏｔｐｒｉｎｔ）内である）を含んでよい。
エピトープは、立体構造であるか、直線状であるかのいずれかであってよい。立体構造エピトープは、直線状のポリペプチド鎖の異なるセグメントから空間的に並置されたアミノ酸により製造される。直線状エピトープは、ポリペプチド鎖の隣接アミノ酸残基により作製されたものである。立体構造及び非立体構造エピトープは、変性溶媒の存在下、後者ではなく前者との結合が失われることで区別され得る。
エピトープは、典型的には、特有の空間配置において、少なくとも３つ、通常は、少なくとも５又は８〜１０アミノ酸を含む。同一のエピトープを認識する抗体は、１つの抗体が、標的抗原ともう一つの抗体との結合をブロックする能力を示す単純な免疫アッセイで検証することができ、これは、例えば、実施例で概説するような、「ビニング（ｂｉｎｎｉｎｇ）」などである。実施例に示すようなＸ線結晶学研究により、図４に示すとおり、本発明の抗体（Ａｂ１９及びＡｂ７９を含む）と従来技術の抗体（ベンチマーク１及びベンチマーク２）の両方に結合するアミノ酸残基が同定される。
本発明において、実施例で概説するとおりＡｂ７９は、ＣＤ３８の多数のアミノ酸残基と相互作用し、該アミノ酸残基としては、Ｋ１２１、Ｆ１３５、Ｑ１３９、Ｄ１４１、Ｍ１４２、Ｅ２３９、Ｗ２４１、Ｓ２７４、Ｃ２７５、Ｋ２７６、Ｆ２８４、Ｖ２８８、Ｋ２８９、Ｎ２９０、Ｐ２９１、Ｅ２９２及びＤ２９３が挙げられる。これらの残基は、Ｓ２７４がシアン（ｃｙａｎ）で実際にはＦ２７４である以外は、ヒト及びカニクイザル（ｃｙａｎ ｍｏｎｋｅｙｓ）の両方で同一であることに留意すべきである。これらの残基は、免疫優性エピトープ及び／又は特異的抗原結合ペプチドのフットプリント内の残基を表してよい。
本発明において、Ａｂ１９は、異なるエピトープと結合し、これには、Ｇ９１、Ｅ１０３、Ｅ１０３４、Ｄ１０５、Ｑ１０７、Ｍ１１０、Ｋ１１１、Ｔ１１４、Ｑ１１５、Ｔ１４８、Ｖ１９２、Ｒ１９４、Ｒ１９５、Ｆ１９６、Ａ１９９、Ｈ２２８、Ｎ２２９、Ｑ２３１、Ｅ２３３及びＫ２３４が挙げられる。これらの残基は、Ｍ１１０がシアン（ｃｙａｎ）ではＶ１１０であり、Ａ１９９がシアン（ｃｙａｎ）ではＴ１９９であることを除いて、ヒトとカニクイザル（ｃｙａｎ ｍｏｎｋｅｙｓ）の両方で同一であることに留意すべきである。
従って、いくつかの実施態様において、これらのエピトープのいずれかでの結合によりＡＢ７９及びＡｂ１９と競合する抗体も自己免疫疾患を治療するために使用され得る。Ａｂ７９とＢＭ１は、いくらか重複しており、従って、Ａｂ７９と競合するがＢＭ１とは競合しない抗体の本発明での使用も見出される点に留意すべきである。
従って、本発明は、ヒト及びシアン（ｃｙａｎ）ＣＤ３８の両方に結合し、これらの残基の少なくとも８０％、９０％、９５％又は９８％と相互作用する抗体を提供する。言い換えれば、相互作用ゾーンの表面領域は、これらの残基の領域に過ぎない。
各鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能に主に関与する定常領域を定義する。Ｋａｂａｔらは、重鎖及び軽鎖可変領域の多数の一次配列を集めた。配列の保存の程度に基づいて、彼らは、個々の一次配列をＣＤＲとフレームワークとに分類し、そのリストを作成した（ＳＥＱＵＥＮＣＥＳ ＯＦ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＩＣＡＬ ＩＮＴＥＲＥＳＴ，５ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，ＮＩＨ ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｎｏ．９１−３２４２，Ｅ．Ａ．Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．を参照されたい。参照によりその全体が本明細書に援用される）。
免疫グロブリンのＩｇＧサブクラスでは、重鎖に複数の免疫グロブリンドメインが存在する。本明細書において「免疫グロブリン（Ｉｇ）ドメイン」とは、異なる三次構造を有する免疫グロブリンの領域を意味する。本発明で関心のあるものは、重鎖定常（ＣＨ）ドメインとヒンジドメインを含む、重鎖ドメインである。ＩｇＧ抗体との関連において、ＩｇＧアイソタイプはそれぞれ３つのＣＨ領域を有する。従って、ＩｇＧとの関連において「ＣＨ」ドメインは以下のとおりである：「ＣＨ１」とは、Ｋａｂａｔに示すＥＵインデックスに従って、１１８〜２２０位を意味する。「ＣＨ２」とは、Ｋａｂａｔに示すＥＵインデックスに従って、２３７〜３４０位を意味し、「ＣＨ３」とは、Ｋａｂａｔに示すＥＵインデックスに従って、３４１〜４４７位を意味する。
重鎖の別のタイプのＩｇドメインはヒンジ領域である。本明細書において「ヒンジ」又は「ヒンジ領域」又は「抗体ヒンジ領域」又は「免疫グロブリンヒンジ領域」とは、抗体の第一と第二の定常領域の間のアミノ酸を含むフレキシブルなポリペプチドを意味する。構造的には、ＩｇＧ ＣＨ１ドメインは、ＥＵ２２０位で終了し、ＩｇＧ ＣＨ２ドメインは、ＥＵ２３７位の残基で開始する。従って、ＩｇＧについての抗体ヒンジは、本明細書では、２２１位（ＩｇＧ１のＤ２２１）から２３６位（ＩｇＧ１ではＧ２３６）を含むと定義され、ここで、番号付けはＫａｂａｔに示すＥＵインデックスに従うものである。いくつかの実施態様において、例えばＦｃ領域との関連で、下方（ｌｏｗｅｒ）のヒンジが含まれ、「下方のヒンジ」とは一般に２２６位又は２３０位を意味する。
本発明で特に関心があるのはＦｃ領域である。本明細書で使用する場合、「Ｆｃ」又は「Ｆｃ領域」又は「Ｆｃドメイン」とは、第一の定常領域免疫グロブリンドメインを除く抗体定常領域を含むポリペプチドを意味し、いくつかの場合においては、ヒンジの一部も含まれる。従って、Ｆｃとは、ＩｇＡ、ＩｇＤ及びＩｇＧの最後の２つの定常領域免疫グロブリンドメイン、ＩｇＥ及びＩｇＭの最後の３つの定常領域免疫グロブリンドメイン、並びにこれらのドメインのＮ末端のフレキシブルなヒンジを意味する。ＩｇＡとＩｇＭについては、ＦｃにＪ鎖が含まれてもよい。ＩｇＧについては、Ｆｃドメインは、免疫グロブリンドメインＣγ２及びＣγ３（Ｃγ２及びＣγ３）、並びにＣγ１（Ｃγ１）とＣγ２（Ｃγ２）の間の下方のヒンジを含む。Ｆｃ領域の境界は変化し得るとはいえ、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は通常、そのカルボキシ末端にＣ２２６又はＰ２３０残基を含ものと定義され、ここで番号付けはＫａｂａｔに示すＥＵインデックスに従う。いくつかの実施態様において、以下に詳述するとおり、アミノ酸修飾がＦｃ領域でなされて、例えば、１つ以上のＦｃγＲレセプター、又はＦｃＲｎレセプターとの結合が変更される。
いくつかの実施態様において、抗体は完全長である。本明細書において「完全長抗体」とは、抗体の天然の生物学的形態を構成する構造を意味し、これは、可変及び定常領域を含み、本明細書で概説するとおり１つ以上の修飾を含む。
あるいは、抗体は、様々な構造、例えば、抗体断片、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、ミニボディ、ドメイン抗体、合成抗体（本明細書では「抗体模倣物」と称する場合もある）、キメラ抗体、ヒト化抗体、抗体融合物（「抗体コンジュゲート」とも称される場合がある）、及びそれぞれの断片などであってよいが、これらに限定されない。構造は依然として依存する。
一実施態様において、抗体は抗体断片である。具体的な抗体断片としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：（ｉ）ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ及びＣＨ１ドメインからなるＦａｂ断片；（ｉｉ）ＶＨ及びＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｉｉ）単一抗体のＶＬ及びＶＨドメインからなるＦｖ断片；（ｉｖ）単一の可変領域からなるｄＡｂ断片（Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４−５４６、参照により全体を援用する）；（ｖ）単離されたＣＤＲ領域；（ｖｉ）２つの結合したＦａｂ断片を含む二価の断片であるＦ（ａｂ’）２断片；（ｖｉｉ）単鎖Ｆｖ分子（ｓｃＦｖ）であって、ＶＨドメイン及びＶＬドメインが、２つのドメインが会合して抗原結合部位を形成することができるペプチドリンカーにより結合されているもの（Ｂｉｒｄ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３−４２６、Ｈｕｓｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８５：５８７９−５８８３、参照によりその全体が援用される）；（ｖｉｉｉ）二重特異性単鎖Ｆｖ（ＷＯ０３／１１１６１、参照により本明細書に援用される）；及び（ｉｘ）遺伝子融合により構築された多価又は多重特異性（ｍｕｌｔｉｓｐｅｃｉｆｉｃ）断片である「ダイアボディ」又は「トリアボディ」（Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ ｅｔ． ａｌ．，２０００，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．３２６：４６１−４７９；ＷＯ９４／１３８０４；Ｈｏｌｌｉｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９０：６４４４−６４４８、参照により全て、その全体が援用される）。
キメラ及びヒト化抗体
いくつかの実施態様において、抗体は異なる種由来の混合物であってよく、例えば、キメラ抗体及び／又はヒト化抗体などであってよい。すなわち、本発明において、ＣＤＲセットは、本明細書において配列により具体的に記載されるもの以外のフレームワーク及び定常領域とともに使用されてよい。
一般に、「キメラ抗体」及び「ヒト化抗体」はともに、２以上の種由来の領域を組み合わせた抗体を意味する。例えば、「キメラ抗体」は、従来、マウス（又はいくつかの場合ではラット）由来の可変領域（１つ以上）とヒト由来の定常領域（１つ以上）とを含む。「ヒト化抗体」は、通常、ヒト抗体で見られる配列と交換された可変ドメインフレームワーク領域を有している非ヒト抗体を意味する。一般に、ヒト化抗体においては、ＣＤＲを除く抗体全体は、ヒト起源のポリヌクレオチドによりコードされるか、又はそのＣＤＲ内を除いてそのような抗体と同一である。ＣＤＲは、そのいくつか又は全てが非ヒト生物由来の核酸によりコードされ、ヒト抗体可変領域のβシートフレームワークへとグラフトされて抗体を作っており、その特異性はグラフトされたＣＤＲにより決定される。このような抗体の作製は、例えば、ＷＯ９２／１１０１８、Ｊｏｎｅｓ，１９８６，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２−５２５、Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９：１５３４−１５３６などに記載されており、これらは全て、参照によりその全体が本明細書に援用される。選択されたアクセプターフレームワーク残基の対応するドナー残基への「復帰突然変異（Ｂａｃｋｍｕｔａｔｉｏｎ）」は、多くの場合、最初のグラフト構築物で失われた親和性を取り戻すために必要である（ＵＳ５５３０１０１；ＵＳ５５８５０８９；ＵＳ５６９３７６１；ＵＳ５６９３７６２；ＵＳ６１８０３７０；ＵＳ５８５９２０５；ＵＳ５８２１３３７；ＵＳ６０５４２９７；ＵＳ６４０７２１３、これらは全て、参照によりその全体が援用される）。ヒト化抗体は、最も有利には、少なくとも免疫グロブリン定常領域の一部、典型的にはヒト免疫グロブリンのものを含み、従って、典型的にはヒトＦｃ領域を含む。ヒト化抗体は、遺伝子組換えされた免疫系を有するマウスを用いて作製されてもよい。Ｒｏｑｕｅ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．２０：６３９−６５４、参照によりその全体が援用される。非ヒト抗体をヒト化及び再形成のための様々な技術及び方法が当分野で公知である（Ｔｓｕｒｕｓｈｉｔａ＆Ｖａｓｑｕｅｚ，２００４，Ｈｕｍａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｂ Ｃｅｌｌｓ，５３３−５４５，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ（ＵＳＡ）及びそこで引用される参考文献を参照されたい。これらは全て、参照によりその全体が援用される）。ヒト化方法としては、以下に記載の方法が挙げられるが、これらに限定されない：Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９８６，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２−５２５；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８；Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３−３２９；Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：１５３４−１５３６；Ｑｕｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ，ＵＳＡ８６：１００２９−３３；Ｈｅ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６０：１０２９−１０３５；Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：４２８５−９，Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７（２０）：４５９３−９；Ｇｏｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８８：４１８１−４１８５；Ｏ’Ｃｏｎｎｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ １１：３２１−８、これら全て、参照によりその全体が援用される。ヒト化、又は非ヒト抗体可変領域の免疫原性を低下させる他の方法には、例えば、Ｒｏｇｕｓｋａ ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９１：９６９−９７３（参照によりその全体が援用される）などに記載されるような表面再形成（ｒｅｓｕｒｆａｃｉｎｇ）方法が含まれてよい。一実施態様において、親抗体は、当分野で既知であるとおり、親和性成熟されている。構造に基づく方法は、ヒト化及び親和性成熟について実施されてよく、例えばＵＳＳＮ１１／００４，５９０に記載される方法などである。選択に基づく方法は、抗体可変領域をヒト化及び／又は親和性成熟するために実施されてよく、この方法としては、以下に記載の方法が挙げられるが、これらに限定されない：Ｗｕ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９４：１５１−１６２；Ｂａｃａ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２（１６）：１０６７８−１０６８４；Ｒｏｓｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７１（３７）：２２６１１−２２６１８；Ｒａｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９５：８９１０−８９１５；Ｋｒａｕｓｓ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ １６（１０）：７５３−７５９（これらは全て、参照によりその全体が援用される）。他のヒト化方法は、ＣＤＲの一部のみのグラフトを伴ってよく、これには、以下に記載の方法が挙げられるが、これらに限定されない：ＵＳＳＮ０９／８１０，５１０；Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：１１１９−１１２５；Ｄｅ Ｐａｓｃａｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：３０７６−３０８４（これらは全て、参照によりその全体が援用される）。
一実施態様において、本発明の抗体は、多重特異性抗体、とりわけ二重特異性抗体であってよく、二重特異性抗体は、「ダイアボディ」と称される場合もある。これらは、２つ（以上）の異なる抗原、又は同一抗原上の異なるエピトープに結合する抗体である。ダイアボディは、当分野で既知の様々な方法で作製され得（Ｈｏｌｌｉｇｅｒ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，１９９３，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．４：４４６−４４９、参照によりその全体が援用される）、例えば、化学的に又はハイブリッドハイブリドーマ（ｈｙｂｒｉｄ ｈｙｂｒｉｄｏｍａ）から調製され得る。
一実施態様において、抗体はミニボディである。ミニボディは、ＣＨ３ドメインと連結されたｓｃＦｖを含む最小化抗体様タンパク質である。Ｈｕ ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５６：３０５５−３０６１、参照によりその全体が援用される。いくつかの場合において、ｓｃＦｖはＦｃ領域と連結され得、ヒンジ領域のいくつか又は全体を含んでよい。
本発明の抗体は、通常、単離されるか、又は組換えられる。「単離される」とは、本明細書で開示する様々なポリペプチドを記載するために使用する場合、ポリペプチドが発現される細胞又は細胞培養物から同定され且つ分離され、及び／又は回収されたポリペプチドを意味する。通常、単離されたポリペプチドは、少なくとも１つの精製工程により調製される。「単離された抗体」とは、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を意味する。例えば、ＣＤ３８と特異的に結合する単離された抗体は、ＣＤ３８以外の抗原と特異的に結合する抗体を実質的に含まない。
しかしながら、ヒトＣＤ３８又はカニクイザルＣＤ３８のエピトープ、アイソフォーム又は変異体と特異的に結合する単離された抗体は、例えば、ＣＤ３８種ホモログ（ｓｐｅｃｉｅｓ ｈｏｍｏｌｏｇ）などの他の種由来の他の関連抗原と交差反応性を有してよい。さらに、単離された抗体は、他の細胞物質及び／又は化学物質を実質的に含まないものであってよい。
異なる特異性を有する単離されたモノクローナル抗体は、良く定義された組成物中で組み合わされ得る。従って、例えば、Ａｂ７９及びＡｂ１９は、所望する場合、単一の製剤で組み合わされ得る。
本発明の抗ＣＤ３８抗体は、ＣＤ３８リガンド（例えば、配列番号１及び２のヒト及びカニクイザルＣＤ３８タンパク質など）と特異的に結合する。「特異的結合」又は「特異的に結合する」、又は特定の抗原若しくはエピトープに「特異的」であるとは、非特異的相互作用と測定可能な程度に異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、コントロール分子の結合と比較して、分子の結合を決定することにより測定でき、コントロール分子は、通常、結合活性を有さない類似構造の分子である。例えば、特異的結合は、標的と類似するコントロール分子との競合により決定され得る。
特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、少なくとも約１０−４Ｍ、少なくとも約１０−５Ｍ、少なくとも約１０−６Ｍ、少なくとも約１０−７Ｍ、少なくとも約１０−８Ｍ、少なくとも約１０−９Ｍ、或いは少なくとも約１０−１０Ｍ、少なくとも約１０−１１Ｍ、少なくとも約１０−１２Ｍ以上の抗原又はエピトープに対するＫＤを有する抗体により示され得、ここで、ＫＤとは、特定の抗体−抗原相互作用の解離速度を意味する。典型的には、抗原に特異的に結合する抗体は、抗原又はエピトープに対するコントロール分子について２０〜、５０〜、１００〜、５００〜、１０００〜、５，０００〜、１０，０００〜倍以上のＫＤを有する。
さらに、特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、コントロールに対するエピトープについて少なくとも２０〜、５０〜、１００〜、５００〜、１０００〜、５，０００〜、１０，０００〜倍以上の抗原又はエピトープに対するＫＡ又はＫａを有する抗体により示され得、ここで、ＫＡ又はＫａは、特定の抗体−抗原相互作用の結合（ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）速度を意味する。
抗体修飾
本発明は、さらに変異抗体も提供する。すなわち、本発明の抗体は多数の修飾がなされてよく、これには、ＣＤＲにおけるアミノ酸修飾（親和性成熟）、Ｆｃ領域におけるアミノ酸修飾、グリコシル化変異体、他のタイプの共有結合修飾などが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書において「変異体」とは、少なくとも１つのアミノ酸修飾によって親ポリペプチドのものと異なるポリペプチド配列を意味する。アミノ酸修飾には、置換、挿入、及び欠失が含まれてよく、多くの場合、前者が好ましい。
一般に、本明細書に記載するとおり、タンパク質の機能が依然として存在する限り、変異体には任意数の修飾が含まれてよい。すなわち、Ａｂ７９又はＡｂ１９のいずれかのＣＤＲで作製されたアミノ酸変異体の場合、例えば、抗体は、ヒト及びカニクイザルＣＤ３８の両方に依然として、特異的に結合すべきである。同様に、アミノ酸変異体が、Ｆｃ領域で作製された場合、例えば、変異抗体は、抗体の特定の適用又は適応のため、必要なレセプター結合機能を保持すべきである。
しかしながら、一般に、多くの場合、そのゴールは最小数の修飾で機能を変更することであるので、１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個のアミノ酸置換が通常利用される。いくつかの場合において、１〜５個修飾が存在し、多くの実施態様においては、１〜２、１〜３、及び１〜４個の修飾の使用も認められる。
アミノ酸修飾の数は、機能的ドメインの範囲内であってよいことに留意すべきである：例えば、野生型又は改変タンパク質のＦｃ領域では１〜５個の修飾、例えばＦｖ領域ではる１〜５個の修飾を有することが望ましい場合がある。変異ポリペプチド配列は、親配列（例えば、Ａｂ７９及び／又はＡｂ１９の可変領域、定常領域、並びに／又は重鎖及び軽鎖配列など）と少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％又は最大で９８若しくは９９％の同一性を有することが好ましい。配列サイズにもよるが、同一性の割合は、アミノ酸の数によって決まることに留意すべきである。
本明細書において「アミノ酸置換」又は「置換」とは、親ポリペプチド配列の特定の位置のアミノ酸を別のアミノ酸と交換することを意味する。例えば、置換Ｓ１００Ａとは、１００位のセリンをアラニンと交換した変異ポリペプチドをいう。本明細書で使用する場合、「アミノ酸挿入」又は「挿入」とは、親ポリペプチド配列の特定の位置のアミノ酸の追加を意味する。本明細書で使用する場合に、「アミノ酸欠失」又は「欠失」とは、親ポリペプチド配列における特定の位置のアミノ酸の除去を意味する。
本明細書で使用する場合、「親ポリペプチド」、「親タンパク質」、「前駆体ポリペプチド」又は「前駆体タンパク質」とは、変異体を作製するためにその後修飾される、非修飾のポリペプチドを意味する。通常、本明細書における親ポリペプチドはＡｂ７９及びＡｂ１９である。親ポリペプチドは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、又はそれをコードするアミノ酸配列をいうこともある。従って、本明細書で使用する場合、「親Ｆｃポリペプチド」とは、変異体を作製するために修飾されるＦｃポリペプチドを意味し、本明細書で使用する場合、「親抗体」とは、変異抗体を作製するために修飾される抗体を意味する。
本明細書において「野生型」又は「ＷＴ」又は「天然」とは、アレル変異を含む、天然で発見されるアミノ酸配列又はヌクレオチド配列を意味する。ＷＴタンパク質、ポリペプチド、抗体、免疫グロブリン、ＩｇＧなどは、意図的に修飾されていないアミノ酸配列又はヌクレオチド配列を有する。
本明細書において「変異Ｆｃ領域」とは、少なくとも１つのアミノ酸修飾によって、野生型Ｆｃ配列のものとは異なるＦｃ配列を意味する。Ｆｃ変異体は、Ｆｃポリペプチド自体、Ｆｃ変異体ポリペプチドを含む組成物、又はアミノ酸配列をいうこともある。
いくつかの実施態様において、１つ以上のアミノ酸修飾が、抗体（Ａｂ７９又はＡｂ１９のいずれか）の１つ以上のＣＤＲにおいてなされる。一般に、１又は２又は３個のアミノ酸のみが、いずれかの単一のＣＤＲにおいて置換され、通常は４から、５、６、７、８、９又は１０個以上の変化はＣＤＲのセット内ではなされない。しかしながら、任意のＣＤＲにおいて、置換されないか、１個、２個又は３個の置換のいずれかの組合せが、任意の他の置換と、独立して任意選択で組み合わされ得る。
いくつかの場合において、ＣＤＲにおけるアミノ酸修飾は、「親和性成熟」と称される。「親和性成熟された」抗体は、１つ以上のＣＤＲにおいて１つ以上の変更を有するものであり、その結果、これらの変更を有さない親抗体と比較して、抗原に対する抗体の親和性が改善される。いくつかの場合において、稀ではあるが、その抗原に対する抗体の親和性を低下させることが望ましい場合があるが、通常、これは好ましくない。
親和性成熟は、「親」抗体と比較して、少なくとも約１０％〜５０〜１００〜１５０％以上、又は１〜５倍、抗原に対する抗体の結合親和性を増加させるためになされ得る。好ましい親和性成熟抗体は、標的抗原に対して、ナノモル、又はさらにはピコモル親和性を有する。親和性成熟抗体は、既知の手順により製造される。例えば、重鎖可変（ＶＨ）ドメイン及び軽鎖可変（ＶＬ）ドメインシャッフリングによる親和性成熟を記載したＭａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：７７９−７８３を参照されたい。ＣＤＲ及び／又はフレームワーク残基のランダム変異導入法は、以下に記載される：例えば、Ｂａｒｂａｓ，ｅｔ ａｌ．１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ，ＵＳＡ ９１：３８０９−３８１３；Ｓｈｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｇｅｎｅ １６９：１４７−１５５；Ｙｅｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５５：１９９４−２００４；Ｊａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４（７）：３３１０−９；及びＨａｗｋｉｎｓ ｅｔ ａｌ，１９９２，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２６：８８９−８９６など。
あるいは、アミノ酸修飾は、「サイレント」である、例えば、抗原に対する抗体の親和性を有意に変更しない、本発明の抗体の１つ以上のＣＤＲでなされ得る。これらは、発現を最適化する（本発明の抗体をコードする核酸についてなし得る）ことを含む様々な理由でなされ得る。
従って、変異ＣＤＲ及び抗体は、本発明のＣＤＲ及び抗体の定義内に含まれる；すなわち、本発明の抗体は、Ａｂ７９及びＡｂ１９の１つ以上のＣＤＲにおいて、アミノ酸修飾を含み得る。さらに、以下で概説するとおり、アミノ酸修飾は、ＣＤＲ外の任意の領域（フレームワーク及び定常領域を含む）において、独立して任意選択でなされ得る。
いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に対して特異的な、Ａｂ７９及びＡｂ１９変異抗体を記載する。この抗体は６つのＣＤＲからなり、ここで、この抗体の各ＣＤＲは、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７及び配列番号８と０、１又は２個のアミノ酸置換により異なり得る。他の実施態様において、変異抗ＣＤ３８抗体は、６つのＣＤＲからなり、ここで、この抗体の各ＣＤＲは、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７及び配列番号１８と０、１又は２個のアミノ酸置換により異なり得る。
いくつかの実施態様において、本発明の抗ＣＤ３８抗体は、変異Ｆｃドメインからなる。当分野で既知のとおり、抗体のＦｃ領域は、多数のＦｃレセプター及びリガンドと相互作用し、エフェクター機能と称される重要な機能的能力の数々を与える。これらのＦｃレセプターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：（ヒトにおける）アイソフォームＦｃγＲＩａ、ＦｃγＲＩｂ及びＦｃγＲＩｃを含むＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）；アイソフォームＦｃγＲＩＩａ（アロタイプＨ１３１及びＲ１３１を含む）、ＦｃγＲＩＩｂ（ＦｃγＲＩＩｂ−１及びＦｃγＲＩＩｂ−２を含む）及びＦｃγＲＩＩｃを含むＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）；並びにアイソフォームＦｃγＲＩＩＩａ（アロタイプＶ１５８及びＦ１５８を含み、抗体依存性細胞傷害（ＡＤＣＣ）と関連する））及びＦｃγＲＩＩＩｂ（アロタイプＦｃγＲＩＩＩｂ−ＮＡ１及びＦｃγＲＩＩＩｂ−ＮＡ２を含む）を含むＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６）；ＦｃＲｎ（新生児型レセプター）、Ｃ１ｑ（補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）に関与する補体タンパク質）並びにＦｃＲｎ（血清半減期に関与する新生児型レセプター）。適した修飾は、以下で一般に概説されるように、１つ以上の位置でなされ得る：例えば、ＵＳ特許出願１１／８４１，６５４及びそこで引用される参考文献、ＵＳ２００４／０１３２１０、ＵＳ２００５／００５４８３２、ＵＳ２００６／００２４２９８、ＵＳ２００６／０１２１０３２、ＵＳ２００６／０２３５２０８、ＵＳ２００７／０１４８１７０、ＵＳＳＮ１２／３４１，７６９、ＵＳ特許Ｎｏ．６，７３７，０５６、ＵＳ特許Ｎｏ．７，６７０，６００、ＵＳ特許Ｎｏ．６，０８６，８７５（これらは全て、参照によりその全体が明確に援用される）（特に、Ｆｃレセプターとの結合を増加させる特定のアミノ酸置換について）。
上記で概説する修飾に加えて、他の修飾がなされ得る。例えば、分子は、ＶＨドメインとＶＬドメインを連結するジスルフィド架橋の組込みにより安定化され得る（Ｒｅｉｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．１４：１２３９−１２４５、参照によりその全体が援用される）。さらに、以下で概説するようになされ得る抗体の様々な共有結合修飾が存在する。
抗体の共有結合修飾は、本発明の範囲内に含まれ、常にではないが通常は、翻訳後に行われる。例えば、選択された側鎖又はＮ末端若しくはＣ末端残基と反応可能な有機誘導体化剤を抗体の特定のアミノ酸残基と反応させることにより、複数のタイプの抗体共有結合修飾が分子に導入される。
最も一般的には、システイニル残基が、クロロ酢酸又はクロロアセトアミドなどのα−ハロアセテート（及び対応するアミン）と反応して、カルボキシメチル又はカルボキシアミドメチル誘導体を生成する。システイニル残基はまた、ブロモトリフルオロアセトン、α−ブロモ−β−（５−イミドゾイル）プロピオン酸、クロロアセチルホスフェート、Ｎ−アルキルマレイミド、３−ニトロ−２−ピリジルジスルフィド、メチル ２−ピリジルジスルフィド、ｐ−クロロメルクリベンゾアート、２−クロロメルクリ−４−ニトロフェノール、又はクロロ−７−ニトロベンゾ−２−オキサ−１，３−ジアゾールなどとの反応により、誘導体化されてよい。
ヒスチジル残基は、ジエチルピロカーボネートとｐＨ５．５〜７．０で反応させることにより誘導体化される。なぜなら、この薬剤は、ヒスチジル側鎖に対して比較的特異的だからである。パラ−ブロモフェナシルブロミドも有用である；反応は、ｐＨ６．０で０．１Ｍカコジル酸ナトリウム中で実施されることが好ましい。
リシニル（ｌｙｓｉｎｙｌ）及びアミノ末端残基は、コハク酸又は他のカルボン酸無水物と反応する。この薬剤を用いた誘導体化は、リジニル残基の電荷を逆転させる効果を有する。α−アミノ含有残基を誘導体化するために適した他の薬剤は、メチルピコリンイミデートなどのイミドエステル；ピリドキサールホスフェート；ピリドキサール；クロロボロヒドリド；トリニトロベンゼンスルホン酸；Ｏ−メチルイソウレア；２，４−ペンタンジオン；及びグリオキシル酸とのアミノ基転移酵素触媒反応が挙げられる。
アルギニル残基は、１つ又は複数の従来の試薬との反応により修飾され、これらのなかには、フェニルグリオキサール、２，３−ブタンジオン、１，２−シクロヘキサンジオン、及びニンヒドリンがある。アルギニン残基の誘導体化は、グアニジン官能基の高いｐＫａにより、反応がアルカリ条件で実施されることを必要とする。さらに、これらの試薬は、リシンの基、及びアルギニンイプシロンアミノ基と反応してよい。
チロシル残基の特定の修飾は、チロシル残基にスペクトル標識を導入することに特に関心がある場合には、芳香族ジオゾニウム化合物又はテトラニトロメタンと反応させることによりなされてよい。最も一般的には、Ｎ−アセチルイミドゾール及びテトラニトロメタンを用いて、それぞれ、Ｏ−アセチルチロシル種及び３−ニトロ誘導体を形成する。チロシル残基は、１２５Ｉ又は１３１Ｉを用いてヨウ素化して、ラジオイムノアッセイ、クロラミンＴ法（適しているとして上記に記載したもの）で使用するための標識されたタンパク質を調製する。
カルボキシル側鎖基（アスパルチル又はグルタミル）は、カルボジイミド（Ｒ’−Ｎ＝Ｃ＝Ｎ−Ｒ’）［式中、Ｒ及びＲ’は、任意選択で異なるアルキル基である］との反応により選択的に修飾され、例えば、１−シクロヘキシル−３−（２−モルホリニル−４−エチル）カルボジイミド、１−エチル−３−（４−アゾニア−４，４−ジメチルペンチル）カルボジイミドなどである。さらに、アスパルチル及びグルタミル残基は、アンモニウムイオンとの反応によりアスパラギニル及びグルタミニル残基に変換される。
二官能性剤を用いた誘導体化は、以下に記載の方法に加えて様々な方法で使用するため、水不溶性のサポートマトリックス又は表面への抗体の架橋に有用である。一般的に使用される架橋剤としては、例えば、１，１−ビス（ジアゾアセチル）−２−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば、４−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ二官能性イミドエステル（３，３’−ジチオビス（スクシンイミジルプロピオネート）などのジスクシンイミジルエステルを含む）及び二官能性マレイミド（ビス−Ｎ−マレイミド−１，８−オクタンなど）が挙げられる。メチル−３−［（ｐ−アジドフェニル）ジチオ］プロピオイミデートなどの誘導体化剤は、光の存在下で架橋を形成できる光活性化可能（ｐｈｏｔｏａｃｔｉｖａｔａｂｌｅ）な中間体を生成する。あるいは、サイノモルガソジェン（ｃｙｎｏｍｏｌｇｕｓｏｇｅｎ）ブロミド活性化炭水化物などの反応性水不溶性マトリックス及び反応性基質（Ｕ．Ｓ．特許Ｎｏ．３，９６９，２８７；３，６９１，０１６；４，１９５，１２８；４，２４７，６４２；４，２２９，５３７；及び４，３３０，４４０（全て参照により援用される）に記載のもの）がタンパク質固定化に用いられる。
グルタミニル及びアスパラギニル残基は、それぞれ、対応するグルタミル及びアスパルチル残基に頻繁に脱アミノ化される。あるいは、これらの残基は、中程度の酸性条件下で脱アミド化される。これらの残基のいずれの形態も、本発明の範囲内に含まれる。
他の修飾として、プロリン及びリシンのヒドロキシル化、セリル又はスレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニン及びヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化（Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ＆Ｃｏ．，Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ｐｐ．７９−８６［１９８３］、参照によりその全体が援用される）、Ｎ−末端アミンのアセチル化、及びＣ末端カルボキシル基のアミド化が挙げられる。
さらに、当業者に理解されるように、標識（蛍光、酵素、磁気、放射性などを含む）は全て抗体（及び本発明の他の組成物）に追加され得る。
グリコシル化
別のタイプの共有結合修飾は、グリコシル化での変更である。別の実施態様において、本明細書で開示する抗体は、１つ以上の改変糖型（ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ｇｌｙｃｏｆｏｒｍ）を含むよう修飾され得る。本明細書で使用される場合、「改変糖型」とは抗体と共有結合した炭水化物組成物を意味し、ここで、前記炭水化物組成物は、化学的に親抗体のものとは異なる。改変糖型は、エフェクター機能の増強又は低下を含む（これらに限定されない）種々の目的のために有用であり得る。改変糖型の好ましい形態は、アフコシル化（ａｆｕｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ）であり、これは、おそらくＦｃγＲＩＩＩａレセプターへの強固（ｔｉｇｈｔｅｒ）な結合を介して、ＡＤＣＣ機能の増加と関連することを示している。これに関連して、「アフコシル化」とは、宿主細胞で製造される抗体の大多数が、実質的にフコースを欠いていることを意味し、例えば、作製された抗体の９０〜９５〜９８％が、抗体の炭水化物部分（通常、Ｆｃ領域のＮ２９７で結合される）の成分として相当量（ａｐｐｒｅｃｉａｂｌｅ）のフコースを有さないことを意味する。機能的に定義すると、アフコシル化抗体は、通常、ＦｃγＲＩＩＩａレセプターに対して、少なくとも５０％以上の親和性を示す。
改変糖型は、当分野で既知の様々な方法で作製されてよい（Ｕｍａnａ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １７：１７６−１８０；Ｄａｖｉｅｓ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｂｉｏｅｎｇ ７４：２８８−２９４；Ｓｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７：２６７３３−２６７４０；Ｓｈｉｎｋａｗａ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８：３４６６−３４７３；ＵＳ６，６０２，６８４；ＵＳＳＮ１０／２７７，３７０；ＵＳＳＮ１０／１１３，９２９；ＰＣＴ ＷＯ００／６１７３９Ａ１；ＰＣＴ ＷＯ０１／２９２４６Ａ１；ＰＣＴ ＷＯ０２／３１１４０Ａ１；ＰＣＴ ＷＯ０２／３０９５４Ａ１（全て参照によりその全体が援用される）；（Ｐｏｔｅｌｌｉｇｅｎｔ（登録商標）技術［Ｂｉｏｗａ，Ｉｎｃ．，Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ，ＮＪ］；ＧｌｙｃｏＭＡｂ（登録商標）グリコシル化改変技術［Ｇｌｙｃａｒｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ＡＧ，Ｚuｒｉｃｈ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ］）。これらの技術の多くが、Ｆｃ領域に共有結合するフコシル化及び／又は二分化（ｂｉｓｅｃｔｉｎｇ）オリゴ糖のレベルを制御することに基づき、例えば、種々の生物又は細胞株（改変されたか、そうではないもの）、例えば、Ｌｅｃ−１３ ＣＨＯ細胞又はラットハイブリドーマＹＢ２／０細胞などでＩｇＧを発現させること、グリコシル化経路に関与する酵素（例えば、ＦＵＴ８［α１，６−フコシルトランスフェラーゼ（α１，６−ｆｕｃｏｓｙｌｔｒａｎｓｅｒａｓｅ）］及び／又はβ１−４−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩＩＩ［ＧｎＴＩＩＩ］）を制御すること、又はＩｇＧを発現させた後に１つ以上の炭水化物を修飾することなどによる。例えば、「糖改変抗体（ｓｕｇａｒ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ａｎｔｉｂｏｄｙ）」又はＳｅａｔｔｌｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓの「ＳＥＡ技術」は、製造の間にフコシル化を阻害する修飾されたサッカリドを添加することにより機能する；例えば、２００９０３１７８６９を参照されたい（参照によりその全体が援用される）。改変糖型は、典型的には、異なる炭水化物又はオリゴ糖を意味し、従って、抗体は、改変糖型を含み得る。
あるいは、改変糖型は、異なる炭水化物又はオリゴ糖を含むＩｇＧ変異体を意味してもよい。当分野で既知のとおり、グリコシル化パターンは、タンパク質の配列（例えば、以下に記載する特定のグリコシル化アミノ酸残基の有無）、又はタンパク質が製造される宿主細胞若しくは生物の両方によって決まり得る。特定の発現系を以下に記載する。
ポリペプチドのグリコシル化は、典型的には、Ｎ結合型又はＯ結合型のいずれかである。Ｎ結合型とは、炭水化物部分がアスパラギン残基の側鎖に結合することを意味する。アスパラギン−Ｘ−セリン及びアスパラギン−Ｘ−スレオニンのトリペプチド配列（ここで、Ｘはプロリン以外の任意のアミノ酸である）は、炭水化物部分のアスパラギン側鎖への酵素結合に対する認識配列である。従って、ポリペプチドにこれらのトリペプチド配列のいずれかが存在することにより、潜在的グリコシル化部位が形成される。Ｏ結合型グリコシル化とは、糖であるＮ−アセチルガラクトサミン、ガラクトース又はキシロースの１つの、ヒドロキシアミノ酸、最も一般的にはセリン又はトレオニンへの結合を意味するが、５−ヒドロキシプロリン又は５−ヒドロキシリシンを使用してもよい。
抗体へのグリコシル化部位の付加は、上記トリペプチド配列の１つ以上を含むようにアミノ酸配列を変更（ａｌｔｅｒａｔｉｏｎ）することにより都合よく達成される（Ｎ結合型グリコシル化部位について）。変更は、１つ以上のセリン又はスレオニン残基の出発配列への付加、又はそれによる置換によりなされてもよい（Ｏ結合型グリコシル化部位について）。容易にするために、抗体アミノ酸配列は、ＤＮＡレベルでの変化を介して好ましくは変更され、特に、所望のアミノ酸に翻訳されるコドンが作製されるように、予め選択した塩基で標的ポリペプチドをコードするＤＮＡを変異させることによる。
抗体上の炭水化物部分の数を増加させる別の手段は、化学的又は酵素的にグリコシドをタンパク質に結合させることによる。これらの手順は、Ｎ結合型及びＯ結合型グリコシル化に関するグリコシル化能力を有する宿主細胞でのタンパク質製造を必要としないという点において有利である。使用される結合様式によって、１つ以上の糖が以下に結合されてよい：（ａ）アルギニン及びヒスチジン、（ｂ）遊離カルボキシル基、（ｃ）遊離スルフヒドリル基（システインのものなど）、（ｄ）遊離ヒドロキシル基（セリン、スレオニン、ヒドロキシプロリンのものなど）、（ｅ）芳香族残基（フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンのものなど）、又は（ｆ）グルタミンのアミド基。これらの方法は、ＷＯ８７／０５３３０及びＡｐｌｉｎ ａｎｄ Ｗｒｉｓｔｏｎ，１９８１，ＣＲＣ Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，ｐｐ．２５９−３０６に記載されており、これらはともに参照によりその全体が援用される。
出発抗体に存在する炭水化物部分の除去（例えば、翻訳後）は、化学的又は酵素的に達成されてよい。化学的な脱グリコシル化は、化合物トリフルオロメタンスルホン酸又は同等の化合物へのタンパク質の暴露を必要とする。この処理により、結合する糖（Ｎ−アセチルグルコサミン又はＮ−アセチルガラクトサミン）を除く、大部分又は全ての糖が切断される一方で、ポリペプチドは無傷のままである。化学的脱グリコシル化は、Ｈａｋｉｍｕｄｄｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２５９：５２及びＥｄｇｅ ｅｔ ａｌ．，１９８１，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１１８：１３１に記載されており、これらはともに参照によりその全体が援用される。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Ｔｈｏｔａｋｕｒａ ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３８：３５０（参照によりその全体が援用される）に記載されるとおり、様々なエンド及びエキソ−グリコシダーゼを使用することにより達成できる。潜在的グリコシル化部位でのグリコシル化は、Ｄｕｓｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８２，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５７：３１０５（参照によりその全体が援用される）に記載されるとおり、化合物ツニカマイシンの使用により妨げられ得る。ツニカマイシンは、タンパク質−Ｎ−グリコシド結合の形成を阻害する。
抗体の共有結合修飾の別のタイプは、様々な非タンパク性ポリマーと抗体との結合を含み、当該ポリマーとしては、例えば、Ｎｅｋｔａｒ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓの２００５−２００６ＰＥＧカタログ（Ｎｅｋｔａｒウェブサイトから入手可能）、ＵＳ特許Ｎｏ．４，６４０，８３５；４，４９６，６８９；４，３０１，１４４；４，６７０，４１７；４，７９１，１９２又は４，１７９，３３７（これらは全て参照によりその全体が援用される）に記載されるように、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレンなどの各種ポリオールが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、当分野で既知のとおり、アミノ酸置換は、ＰＥＧなどのポリマーの付加を容易にするために、抗体内の様々な位置で行われてよい。例えば、Ｕ．Ｓ．公報Ｎｏ．２００５／０１１４０３７Ａ１（参照によりその全体が援用される）を参照されたい。
特定のＣＤＲ及び可変領域の実施態様
本発明は、それぞれ特定のＣＤＲセット（上記で概説するように、いくつかのアミノ酸置換を含む）を有する多数の抗体を提供する。上記で概説するように、抗体は、６つのＣＤＲのセット、可変領域、又は全長の重鎖及び軽鎖（定常領域を含む）により定義され得る。さらに、上記で概説するように、アミノ酸置換がなされてもよい。一般に、ＣＤＲ内の変化との関連で、アミノ酸修飾は、ＣＤＲの長さが比較的短いことに起因して、なされ得るアミノ酸修飾の数に関して通常記載される。これは、可変、定常又は全長配列に導入され得るアミノ酸修飾の数の議論にも適用できる一方、変化の数に加えて、「％同一性」に関してこれらの変化を定義することも適切である。従って、本明細書に記載されるように、本発明内に含まれる抗体は、本明細書に列挙した配列番号と８０、８５、９０、９５、９８又は９９％同一である。
Ａｂ７９抗体の関連で、ＣＤＲのセットは以下のとおりである：重鎖の３つのＣＤＲは、ＨＣＤＲ１配列番号３（ＨＣＤＲ１）、配列番号４（ＨＣＤＲ２）及び配列番号５（ＨＣＤＲ３）を含み、かつ軽鎖の３つのＣＤＲは、配列番号６（ＬＣＤＲ１）、配列番号７（ＬＣＤＲ２）及び配列番号８（ＬＣＤＲ３）を含む。
Ａｂ１９の関連で、ＣＤＲのセットは以下のとおりである：ＨＣＤＲ１（配列番号１３）、ＨＣＤＲ２（配列番号１４）及びＨＣＤＲ３（配列番号１５）、並びにＬＣＤＲ１（配列番号１６）、ＬＣＤＲ２（配列番号１７）及びＬＣＤＲ３（配列番号１８）。
本発明から特に排除される抗体は、配列番号２４及び２５（ベンチマーク１の重鎖及び軽鎖）並びに配列番号２６及び２７（ベンチマーク２の重鎖及び軽鎖）のものである。これらの抗体は、下記のカニクイザルＣＤ３８と交差反応しないことに留意すべきである。
本発明の抗体は、ヒト及びカニクイザルＣＤ３８と交差反応し、従って種交差反応性抗体（ｓｐｅｃｉｅｓ ｃｒｏｓｓ−ｒｅａｃｔｉｖｅ ａｎｔｉｂｏｄｙ）である。「種交差反応性抗体」とは、第一の哺乳動物種由来の抗原に対する結合親和性とほぼ同一の、第二の哺乳動物種由来のその抗原のホモログに対する結合親和性を有する抗体である。種交差反応性は、例えば、第一の哺乳動物種の抗原に対する抗体のＫＤを、第二の哺乳動物種のその抗原ホモログに対する同一抗体のＫＤで割った比率として表すことができ、当該比率は、１．１、１．２、１．３、１．４、１．５、２、５、１０、１５、最大で２０である。あるいは又はさらに、抗体は、第二の種に投与されて治療又は診断効果を示す場合に、「種交差反応性」である。従って、本ケースでは、本発明の抗体は、カクニイザルＣＤ３８と交差反応性であり、カニクイザル霊長類に投与されて前臨床効果を示し、従って、交差反応性と考えられる。
いくつかの実施態様において、ヒトＣＤ３８及び／又はカニクイザルＣＤ３８との結合に対して、本発明の抗体（例えば、Ａｂ７９及び／又はＡｂ１９）と競合する抗体を提供するが、これには、ＢＭ１又はＢＭ２のいずれも含まれない。２つ以上の抗ＣＤ３８抗体によるＣＤ３８又はＣＤ３８の一部との結合の競合は、当分野で既知の任意の適した技術により決定されてよい。
本発明の関連で競合とは、試験化合物の存在下、本発明の抗体（例えば、Ａｂ７９又はＡｂ１９）が、例えばＣＤ３８などの特定の結合パートナーと結合する性向を、検出可能に有意に減少させることをいう。典型的には、競合とは、ＥＬＩＳＡやＢｉａｃｏｒｅ（登録商標）アッセイなどの標準的な技術により測定されるように、競合物質の存在下、本発明の抗体がＣＤ３８と結合するのを少なくとも約１０〜１００％減少させることを意味する。従って、例えば、競合についての基準を、少なくとも約１０％の相対的阻害が検出される；少なくとも約１５％の相対的阻害が検出される；又は、少なくとも約２０％の相対的阻害が検出された後、抗体は十分に競合すると考えられる、と設定することが可能である。競合抗体の属するエピトープが抗原中に近接して位置する場合、競合は、ＣＤ３８結合の約４０％超の相対的阻害により特徴付けられてよい（例えば、少なくとも約４５％阻害、例えば少なくとも約５０％阻害、例えば少なくとも約５５％阻害、例えば少なくとも約６０％阻害、例えば少なくとも約６５％阻害、例えば少なくとも約７０％阻害、例えば少なくとも約７５％阻害、例えば少なくとも約８０％阻害、例えば少なくとも約８５％阻害、例えば少なくとも約９０％阻害、例えば少なくとも約９５％阻害、又はそれより高いレベルの相対的阻害）。
いくつかの場合において、競合的結合アッセイの１つ以上の成分が、診断的適用の関連で、以下に記載するように標識される。
競合は、２以上のＣＤ３８エピトープについて、及び／又はＣＤ３８の一部について、抗ＣＤ３８抗体間で存在してもよい場合もあり、例えば、ＣＤ３８の特定の領域の抗体結合特性がその断片中に保持される場合、例えば、様々な試験断片に位置するうまく提示された（ｗｅｌｌ−ｐｒｅｓｅｎｔｅｄ）直線状エピトープ、又は十分に大きなＣＤ３８断片及びＣＤ３８で提示される立体構造エピトープの場合などである。
競合の評価は、典型的には、本発明の抗体、ＣＤ３８（ヒト若しくはカニクイザルのいずれか、又は両方）、及び試験分子を用いて、相対的阻害結合を評価することを伴う。試験分子としては任意の分子が挙げられ、他の抗体、低分子、ペプチドなどが挙げられる。化合物は、他に存在する分子に対する、問題となる分子の選択性及び／又は特異性に関する情報が比較により与えられるのに十分な量で混合される。
試験化合物、ＣＤ３８及び本発明の抗体の量は変更されてよい。例えば、ＥＬＩＳＡ評価のためには、約５〜５０μｇ（例えば、約１０〜５０μｇ、約２０〜５０μｇ、約５〜２０μｇ、約１０〜２０μｇなど）の抗ＣＤ３８抗体及び／又はＣＤ３８標的が、競合が存在するかを評価するために必要である。条件は、結合に適するべきでもある。典型的には、生理学的又はほぼ生理学的条件（例えば、約２０〜４０℃の温度、ｐＨ＝約７〜８など）が、抗ＣＤ３８：ＣＤ３８結合に適する。
多くの場合、競合は、ＥＬＩＳＡ及び／又はＦＡＣＳ分析により決定されるように、約５％よりもかなり高い相対的阻害により特徴づけられる。特定の状況（例えば、ＣＤ３８に結合する別のペプチド又は分子（例えば、ＣＤ３８の天然の結合パートナー、例えば、ＣＤ３１抗原とも称されるＣＤ３１、ＥｎｄｏＣＡＭ、ＧＰＩＩＡ、ＰＥＣＡＭ−１、血小板／内皮細胞接着分子、天然に存在する抗ＣＤ３８抗体など）の結合を阻害するという目的の機能を有するよう設計された新規抗体について、競合アッセイを用いて選択又はスクリーニングする場合）では、競合に適したレベルの基準／決定因子として、より高い相対的阻害の閾値を設定することが望ましい場合がある。
いくつかの実施態様において、本発明の抗ＣＤ３８抗体は、ＣＤ３８の１つ以上の残基又は領域と特異的に結合するが、ＣＤ３８と相同性を有する他のタンパク質、例えば、ＢＳＴ−１（骨髄間質細胞抗原−１）、Ｍｏ５（ＣＤ１５７とも称される）などと交差反応しないものでもある。
典型的には、交差反応性の欠如は、適切なアッセイ条件下、十分量の分子を用いたＥＬＩＳＡ及び／又はＦＡＣＳ分析により評価される場合、分子間の相対的競合阻害が約５％未満であることを意味する。
ＣＤ３８活性の阻害
開示する抗体は、リガンド−レセプター相互作用のブロック、又はレセプターコンポーネント相互作用の阻害での使用が見出され得る。本発明の抗ＣＤ３８は、「遮断（ｂｌｏｃｋｉｎｇ）」又は「中和」するものであってよい。「中和抗体」は、ＣＤ３８への結合により、ＣＤ３８の生物活性、例えば、リガンドと相互作用する能力、酵素活性、シグナリング能力、及び特に活性化リンパ球を生じさせる能力を阻害する抗体を意味することが意図される。ＣＤ３８の生物活性の阻害は、当分野で既知の複数の標準的ｉｎ ｖｉｔｒｏ又はｉｎ ｖｉｖｏアッセイの１つ以上により評価され得る（以下の実施例を参照されたい）。
「結合を阻害する」又は「結合を遮断する」（例えば、ＣＤ３８結合パートナーとＣＤ３８との結合の阻害／遮断について言及する場合）には、部分的及び完全な阻害／遮断の両方が包含される。ＣＤ３８結合パートナーとＣＤ３８との結合の阻害／遮断は、阻害又は遮断されることなくＣＤ３８結合パートナーがＣＤ３８と結合した場合に生じる細胞シグナリングの正常なレベル又はタイプを低下又は変更してもよい。阻害及び遮断はまた、抗ＣＤ３８抗体と接触しないリガンドと比較して、抗ＣＤ３８抗体と接触させた場合のＣＤ３８結合パートナーとＣＤ３８との結合親和性が、測定可能に減少することを含むことが意図され、例えば、ＣＤ３８結合パートナーとＣＤ３８との結合が、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９９％又は１００％遮断されることなどである。
開示する抗ＣＤ３８抗体はまた、細胞増殖を阻害してもよい。「増殖を阻害する」とは、抗ＣＤ３８抗体と接触しない細胞の増殖と比較して、抗ＣＤ３８抗体と接触した場合の同一の細胞の増殖が、測定可能に減少することを含み、例えば、細胞培養物の増殖が少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９９％又は１００％阻害されることなどである。
いくつかの実施態様において、開示する抗ＣＤ３８抗体は、活性化リンパ球及び形質細胞を枯渇することができる。この文脈での「枯渇」とは、未処理の動物と比較した場合に、活性化リンパ球及び／又は形質細胞の血清レベル（例えば、カニクイザル（ｃｙａｎ ｍｏｎｋｅｙ）で試験する場合）での測定可能な減少を意味する。一般に、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９９％又は１００％の枯渇が見られる。さらに、下記実施例で示すとおり、本発明の抗体が示す特定の利点の一つは、投与後にこれらの細胞が復元可能なことである；すなわち、いくつかの治療で知られるように（例えば、抗ＣＤ２０抗体を用いた場合など）、細胞枯渇が長期間継続すると、所望しない副作用が生じ得る。本明細書で示すように、活性化リンパ球及び／又は形質細胞の効果は復元可能である。
本発明の抗体の製造方法
本発明は、開示する抗ＣＤ３８抗体の製造方法をさらに提供する。これらの方法は、本発明の抗体をコードする、１つ以上の単離された核酸を含む宿主細胞を培養する工程を含む。当業者に理解されるように、これは、抗体の特性に応じて、様々な方法で実施され得る。いくつかの実施態様において、本発明の抗体が全長の従来の抗体である場合、例えば、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域である場合には、例えば、抗体が製造され、単離可能な条件下で実施される。
一般に、本発明の抗体をコードする核酸を提供する。このようなポリヌクレオチドは、重鎖及び軽鎖それぞれの可変領域及び定常領域の両方をコードするものであるが、本明細書に記載の組成物に従って、他の組合せも本発明により企図される。本発明は、開示するポリヌクレオチド由来のオリゴヌクレオチド断片、及びこれらのポリヌクレオチドと相補的な核酸配列も企図する。
ポリヌクレオチドはＲＮＡの形態であってもＤＮＡの形態であってもよい。ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、核酸アナログ及び合成ＤＮＡの形態であるポリヌクレオチドは、本発明の範囲内である。ＤＮＡは二本鎖であっても一本鎖であってもよく、一本鎖の場合には、コーディング（センス）鎖又は非コーディング（アンチセンス）鎖であってよい。ポリペプチドをコードするコーディング配列は、本明細書で提供するコーディング配列と同一であってもよく、又は異なるコーディング配列であって、遺伝コードの冗長性又は縮重の結果として、本明細書で提供するＤＮＡと同一のポリペプチドをコードする配列であってもよい。
いくつかの実施態様において、本発明の抗体をコードする１つ以上の核酸は、発現ベクターに組み込まれ、当該発現ベクターは、導入される宿主細胞の染色体外であるか、又はそのゲノム中にインテグレートされるよう設計され得る。発現ベクターは、任意数の適切な制御配列（転写及び翻訳調節配列、プロモーター、リボソーム結合部位、エンハンサー、複製起点などが挙げられるが、これらに限定されない）又は他の要素（選択遺伝子など）を含むことができ、これらは全て、当分野でよく知られるように操作可能に連結される。いくつかの場合、２つの核酸を用いて、それぞれを異なる発現ベクターに入れるか（例えば、第一の発現ベクターに重鎖、第二の発現ベクターに軽鎖）、あるいはそれらを同一の発現ベクターにいれることができる。制御配列の選択を含む、１つ以上の発現ベクターの設計は、宿主細胞の選択、所望するタンパク質の発現レベルなどの因子によって決まり得ることが当業者に理解されるだろう。
一般に、選択される宿主細胞に適した任意の方法（例えば、トランスフォーメーション、トランスフェクション、エレクトロポレーション、インフェクションなど）を用いて、１つ以上の核酸が１つ以上の発現調節要素に操作可能に連結されるように（例えば、ベクターにおいて、細胞でのプロセスにより作出される構築物において、宿主細胞のゲノムにインテグレートされて）、核酸及び／又は発現が適した宿主細胞に導入され、組換え宿主細胞が作出される。得られた組換え宿主細胞は、発現に適した条件下（例えば、インデューサーの存在下、適した非ヒト動物中、適した塩、増殖因子、抗生物質、栄養補助剤などを添加した適した培地など）で維持でき、それによりコードされた１つ以上のポリペプチドが製造される。いくつかの場合において、重鎖が１つの細胞で製造され、軽鎖が別の細胞で製造される。
発現のための宿主として利用可能な哺乳動物細胞株は当分野で既知であり、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ），Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡから入手可能な多くの不死化細胞株が含まれ、これには、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ＨＥＫ ２９３細胞、ＮＳＯ細胞、ＨｅＬａ細胞、ベビーハムスター腎臓（ＢＨＫ）細胞、サル腎臓細胞（ＣＯＳ）、ヒト肝細胞ガン細胞（例えば、Ｈｅｐ Ｇ２）、及び多数の他の細胞株が挙げられるが、これらに限定されない。細菌、酵母、昆虫及び植物を含む（これらに限定されない）非哺乳動物細胞を用いて、組換え抗体を発現させることもできる。いくつかの実施態様において、抗体は、ウシやニワトリなどのトランスジェニック動物において製造することができる。
抗体分子生物学、発現、精製及びスクリーニングの一般的な方法は、例えば、Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ ＆ Ｄｕｂｅｌにより編集されたＡｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，２００１ ａｎｄ ２０１０ Ｈａｙｈｕｒｓｔ ＆ Ｇｅｏｒｇｉｏｕ，２００１，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｃｈｅｍ Ｂｉｏｌ ５：６８３−６８９；Ｍａｙｎａｒｄ ＆ Ｇｅｏｒｇｉｏｕ，２０００，Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｂｉｏｍｅｄ Ｅｎｇ ２：３３９−７６；及びＭｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓ．（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：１２０２に記載される。
適用及び適応
本発明の抗体が作製された場合には、ＣＤ３８関連疾患の診断及びその治療を含む様々な適用での使用が見出される。
ＣＤ３８関連病態
一つの側面において、本発明は、炎症性疾患及び免疫疾患と関連する病態を診断及び治療する方法を提供し、特に、活性化リンパ球と関連する疾患の診断及び治療方法を提供する。本明細書に示すように、ＣＤ３８は、未成熟な造血細胞で発現し、成熟細胞で下方制御され、活性化リンパ球及び形質細胞において高レベルで再発現する。例えば、ＣＤ３８の高発現は、活性化Ｂ細胞、形質細胞、活性化ＣＤ４＋Ｔ細胞、活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、成熟樹状細胞（ＤＣ）及び活性化単球で見られる。
本発明の治療抗ＣＤ３８抗体は、ＣＤ３８陽性細胞と結合し、その結果、ＣＤＣ及びＡＤＣＣ経路の両方を含む複数の作用メカニズムを介して、活性化リンパ球などのこれらの細胞を枯渇させる。
従って、本発明の抗体を用いて、疾患要素としてＣＤ３８発現の増加又はＣＤ３８発現細胞数の増加を示す任意の自己免疫疾患を治療してよい。これら疾患として、以下の疾患が挙げられるが、これらに限定されない：同種膵島移植片拒絶（ａｌｌｏｇｅｎｉｃ ｉｓｌｅｔ ｇｒａｆｔ ｒｅｊｅｃｔｉｏｎ）、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性アジソン病、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性心筋炎、自己免疫性好中球減少症、自己免疫性卵巣炎及び精巣炎、自己免疫性血小板減少症、自己免疫性蕁麻疹、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、真菌ミオパチー、キャッスルマン症候群、セリアックスプルー皮膚炎、慢性疲労免疫機能障害症候群、慢性炎症性脱髄性多発性神経障害、チャーグ−ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、ＣＲＥＳＴ症候群、寒冷凝集素病、クローン病、皮膚筋炎、円板状狼瘡、本態性混合型寒冷グロブリン血症、第８因子欠乏症、線維筋痛−線維筋炎、糸球体腎炎、グレーブス病、ギランバレー、グッドパスチャー症候群、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、橋本甲状腺炎、血友病Ａ、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、ＩｇＡ腎症、ＩｇＭ多発ニューロパシー、免疫介在性血小板減少症、若年性関節炎、川崎病、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合性結合組織病、多発性硬化症、１型糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発性動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発筋痛、多発性筋炎及び皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン症候群、固形臓器移植拒絶、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞性動脈炎、血栓性血小板減少性紫斑病、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、血管炎、例えば、疱疹状皮膚炎型血管炎（ｄｅｒｍａｔｉｔｉｓ ｈｅｒｐｅｔｉｆｏｒｍｉｓ ｖａｓｃｕｌｉｔｉｓ）、白斑、及びウェジナー肉芽腫症。
特定の使用は、いくつかの実施態様において、多数の疾患の診断及び／又は治療に使用するための本発明の抗体の使用であり、当該疾患としては、限定されないが自己免疫疾患が挙げられ、自己免疫疾患としては、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、関節リウマチ（ＲＡ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、潰瘍性大腸炎及び移植片対宿主病が挙げられるが、これらに限定されない。
従って、例えば、高い形質細胞を示すＳＬＥ患者や、ＣＤ２０に基づく治療に不応性を示すＲＡ患者などの高い形質細胞量を有する患者を選択できる。
一つの側面において、本発明は、医薬上有効量の開示抗体を患者に投与する工程を含む、ＣＤ３８を発現する細胞の増殖と関連する病態の治療法を提供する。ある実施態様において、病態はガンであり、特定の実施態様において、ガンは血液ガンである。他の特定の実施態様において、病態は、多発性骨髄腫、慢性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病、形質細胞白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、Ｂ−細胞リンパ腫又はバーキットリンパ腫である。
特定の病態は、ＣＤ３８を発現する細胞と関連し、特定の病態は、細胞表面上のＣＤ３８の過剰発現、高密度発現又は上方制御された発現と関連することが当分野で既知である。細胞集団がＣＤ３８を発現するかどうかは、当分野で既知の方法、例えば、所与の集団において、ＣＤ３８と特異的に結合する抗体により標識された細胞の割合をフローサイトメトリーにより決定する方法や、免疫組織化学アッセイなどにより決定でき、これは、診断的適用について以下で一般に記載するとおりである。例えば、ＣＤ３８の発現が細胞の約１０〜３０％で検出される細胞集団は、ＣＤ３８に対して弱陽性（ｗｅａｋ ｐｏｓｉｔｉｖｉｔｙ）を有するとみなすことができ；ＣＤ３８の発現が細胞の約３０％超で検出される細胞集団は、ＣＤ３８に対して明確に（ｄｅｆｉｎｉｔｅ）陽性であるとみなすことができるが（Ｊａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８），Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．７２：３５１−３５６で示すとおり）、とはいえ他の基準を用いて、細胞集団がＣＤ３８を発現するかを決定できる。細胞表面上の発現密度は、当分野で既知の方法、例えば、ＣＤ３８と特異的に結合する抗体を用いて蛍光標識されている細胞の平均蛍光密度をフローサイトメトリーにより測定することなどにより、決定できる。
いくつかの実施態様において、本発明の組成物及び方法は、「血液ガン」などのガンに適用され、この用語は、血液形成組織の悪性新生物を意味し、白血病、リンパ腫及び多発性骨髄腫を包含する。ＣＤ３８発現と関連する病態の非限定的な例として、以下を挙げることができるが、これらに限定されない：多発性骨髄腫（Ｊａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８），Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．７２：３５１−３５６）、Ｂ細胞慢性リンパ性白血病（Ｂ−ＣＬＬ）（Ｄｕｒｉｇ ｅｔ ａｌ．（２００２），Ｌｅｕｋｅｍｉａ １６：３０−５；Ｍｏｒａｂｉｔｏ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｌｅｕｋｅｍｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２５：９２７−３２；Ｍａｒｉｎｏｖ ｅｔ ａｌ．（１９９３），Ｎｅｏｐｌａｓｍａ ４０（６）：３５５−８；及びＪｅｌｉｎｅｋ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１１５：８５４−６１）、急性リンパ芽球性白血病（Ｋｅｙｈａｎｉ ｅｔ ａｌ．（１９９９），Ｌｅｕｋｅｍｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２４：１５３−９；及びＭａｒｉｎｏｖ ｅｔ ａｌ．（１９９３），Ｎｅｏｐｌａｓｍａ ４０（６）：３５５−８）、慢性骨髄性白血病（Ｍａｒｉｎｏｖ ｅｔ ａｌ．（１９９３），Ｎｅｏｐｌａｓｍａ ４０（６）：３５５−８）、急性骨髄性白血病（Ｋｅｙｈａｎｉ ｅｔ ａｌ．（１９９９），Ｌｅｕｋｅｍｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２４：１５３−９）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ又はｍｙｅｌｏｉｄ）白血病（ＣＭＬ）、急性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ又はｍｙｅｌｏｉｄ）白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病（ＨＣＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、又は急性期慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ−ＢＰ）、及びこれらの白血病の全てのサブタイプ（当分野で公知の形態学的、組織化学的及び免疫学的技術により定義されるもの）。
「新生物」又は「新生物病態（ｎｅｏｐｌａｓｔｉｃ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎ）」とは、正常なコントロールを失い、その結果１以上の症状（制御不能の増殖、分化の欠如、局所的な組織浸潤及び転移を含む）を生じることにより特徴づけられる、細胞増殖と関連する病態を意味する。
本発明のいくつかの実施態様において、血液ガンは、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）及び急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）からなる群から選択される。
さらに、ＣＤ３８発現が、例えば、Ｂ細胞慢性リンパ性白血病（Ｄｕｒｉｇ ｅｔ ａｌ．（２００２），Ｌｅｕｋｅｍｉａ １６：３０−５；及びＭｏｒａｂｉｔｏ ｅｔ ａｌ．（２００１），Ｌｅｕｋｅｍｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２５：９２７−３２）及び急性骨髄性白血病（Ｋｅｙｈａｎｉ ｅｔ ａｌ．（１９９９），Ｌｅｕｋｅｍｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２４：１５３−９）などの病態を有する患者に対する予後指標であることが当分野で既知である。
ＣＬＬは、西側諸国における成人の最も一般的は白血病である。ＣＬＬは、リンパ節や他のリンパ系組織に関与する、成熟した外観を有するリンパ球のクローン性増殖であり、骨髄への進行性浸潤を有し、末梢血での存在がみられる。Ｂ細胞型（Ｂ−ＣＬＬ）が、大部分のケースの代表である。
Ｂ−ＣＬＬ
Ｂ−ＣＬＬは、長年にわたり、持続的な形で骨髄及び末梢血に蓄積する反応不顕性の単クローン性Ｂ系細胞の進行性の増加により特徴付けられる難病である。ＣＤ３８の発現は、Ｂ−ＣＬＬに対する独立した予後不良因子と考えられる。Ｈａｍｂｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ ９９：１０２３−９（２００２）。
Ｂ−ＣＬＬの現在の標準的治療法は、一時的な緩和であり、細胞増殖抑制剤であるクロラムブシル又はフルダラビンを用いて主に実施される。再発した場合には、リツキシマブ（ＣＤ２０に対するモノクローナル抗体）又はキャンパス（ＣＤ５２に対するモノクローナル抗体）と組み合わせてフルダラビン、シクロホスファミドを用いる併用療法が多くの場合開始される。従って、Ｂ−ＣＬＬの治療に対して、未だ満たされていない重大な医学的ニーズが存在する。いくつかの実施態様において、開示する抗ＣＤ３８抗体を用いたＢ−ＣＬＬの治療方法を提供する（かつ、以下で概説するように、これは、任意選択且つ独立して、上記薬物のいずれかを含む併用療法を用いて実施されてよい）。
Ｂ−ＣＬＬは、緩慢性と進行性の２つのサブタイプにより特徴付けられる。これらの臨床表現型は、免疫グロブリン重鎖可変領域（ＩｇＶＨ）遺伝子における体細胞突然変異の有無と相関する。本明細書で使用する場合、緩慢性Ｂ−ＣＬＬとは、変異したＩｇＶＨ遺伝子を有し、且つ／又は緩慢性Ｂ−ＣＬＬと関連する１つ以上の臨床表現型を示す対象における障害を意味する。本明細書で使用する場合、進行性Ｂ−ＣＬＬとは、変異していないＩｇＶＨ遺伝子を有し、且つ／又は進行性Ｂ−ＣＬＬと関連する１つ以上の臨床表現型を示す対象における障害を意味する。
多発性骨髄腫
多発性骨髄腫は、骨髄における形質細胞の新生増殖により特徴付けられるＢ細胞系の悪性障害である。現在治療レジメンは、中等度の奏効率を示す。しかし、全体の生存率は横ばいでしかなく、平均生存期間はおよそ３年である。従って、多発性骨髄腫の治療に対して、未だ満たされていない重大な医学的ニーズが存在する。いくつかの実施態様において、開示する抗ＣＤ３８抗体を用いた多発性骨髄腫の治療方法を提供する。
ＣＤ３８は、最終的にＢ細胞に分化する形質細胞に高度に発現する。
骨髄腫細胞の増殖は、様々な作用を引き起こし、これには、骨における溶解性病変（穴）、赤血球数の減少、異常タンパク質の産生（腎臓、神経及び他の臓器へのダメージを伴う）、免疫系機能の低下及び血中カルシムレベルの上昇（高カルシウム血症）が挙げられる。
現在の治療オプションには、化学療法、好ましくは、可能であれば自家幹細胞移植（ＡＳＣＴ）と関連する化学療法が含まれる。
意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症及びくすぶり型多発性骨髄腫
いくつかの実施態様において、開示抗体を用いた単クローン性免疫グロブリン血症の治療方法を提供する。他の実施態様において、開示抗体を用いたくすぶり型多発性骨髄腫の治療方法を提供する。
意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症（ＭＧＵＳ）及びくすぶり型多発性骨髄腫（ＳＭＭ）は、骨髄における単クローン性形質細胞増殖と、末端器官障害の欠如により特徴付けられる無症候性の前腫瘍性障害である。
くすぶり型多発性骨髄腫（ＳＭＭ）は、症候性又は活動型多発性骨髄腫への高い進行リスクを有する、形質細胞の無症候性増殖障害である（Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３５６（２５）：２５８２−２５９０（２００７））。
ＳＭＭを定義する国際コンセンサス基準が２００３年に採択され、当該基準は、患者が、＞３０ｇ／ＬのＭタンパク質レベル、及び／又は＞１０％の骨髄クローン性形質細胞を有することを必要とする（Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１２１：７４９−５７（２００３））。患者は、骨病変又は症状を含む臓器又は関連組織の損傷を有してはならない（Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１２１：７４９−５７（２００３））。
最近の研究により、２つのＳＭＭサブセットが同定されている：ｉ）進行性疾患を有する患者及びｉｉ）非進行性疾患を有する患者（Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１２１：６３１−６３６（２００３））。ＭＧＵＳを定義する国際コンセンサス基準は、患者が、＜３０ｇ／ＬのＭタンパク質レベル、＜１０％の骨髄形質細胞、及び骨病変又は症状を含む臓器又は関連組織の損傷を有さないことを必要とする（Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１２１：７４９−５７（２００３））。
ＳＭＭは、末端器官障害が存在しないことから、意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症（ＭＧＵＳ）と類似する（Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３５６（２５）：２５８２−２５９０（２００７））。しかしながら、臨床的には、ＳＭＭは、２０年で活動型多発性骨髄腫又はアミロイドーシスに進行する可能性が遥かに高い（ＳＭＭでは７８％の確率であるのに対し、ＭＧＵＳでは２１％）（Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３５６（２５）：２５８２−２５９０（２００７））。
Ｉｎ Ｖｉｖｏ投与のための抗体組成物
本発明に従って使用される抗体の製剤は、任意選択で医薬上許容される担体、賦形剤又は安定化剤とともに、所望の純度を有する抗体を混合することにより保存のために凍結乾燥製剤又は水溶性の形態で調製される（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．［１９８０］）。許容される担体、賦形剤又は安定化剤は、実施される用量及び濃度において、レシピエントに対して非毒性であり、リン酸、クエン酸及び他の有機酸などのバッファー；アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤；保存料（オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド；ヘキサメトニウムクロリド；ベンザルコニウムクロリド、ベンゼトニウムクロリド；フェノール、ブチル又はベンジルアルコール：アルキルパベン（メチル又はプロピルパラベンなど）；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３−ペンタノール；及びｍ−クレゾールなど）；低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド；タンパク質（血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリンなど）；親水性ポリマー（ポリビニルピロリドンなど）；アミノ酸（グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリシンなど）；単糖、二糖及び他の炭水化物（グルコース、マンノース又はデキストリンを含む）；キレート化剤（ＥＤＴＡなど）；糖類（スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトールなど）；塩形成カウンターイオン（ナトリウムなど）；金属錯体（例えば、Ｚｎ−タンパク質錯体）；及び／又は非イオン性界面活性剤（ＴＷＥＥＮ（商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ（商標）又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）など）が挙げられる。
本明細書における製剤は、治療されるべき特定の適応のために、必要に応じて２以上の活性化合物を含んでよく、好ましくは、互いに悪影響を及ぼさない相補的な活性を有するものである。例えば、他の特異性を有する抗体を提供することが望ましいことがある。あるいは、又はさらに、組成物は、細胞毒性剤、サイトカイン、増殖阻害剤及び／又は低分子アンタゴニストを含んでよい。このような分子は、意図される目的のために有効な量で組み合わせて適切に存在する。
活性成分は、例えば、コアセルベーション技術又は界面重合により、調製されたマイクロカプセル中に封入されてよく、例えば、コロイド状ドラッグデリバリーシステム（例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル）又はマクロエマルションにおける、それぞれ、ヒドロキシメチルセルロース又はゼラチン−マイクロカプセル及びポリ−（メチルメタクリレート）マイクロカプセルなどである。このような技術は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０）に記載されている。
Ｉｎ ｖｉｖｏ投与のために使用されるべき製剤は、無菌であるか、ほぼ無菌に近いものであるべきである。これは、滅菌ろ過膜を介したろ過により容易に達成される。
徐放性調製物を調製してよい。徐放性調製物の適した例としては、抗体を含む固形疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、このマトリックスは、例えば、フィルム又はマイクロカプセルなどの成形品の形態である。徐放性調製物の例としては、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ（２−ヒドロキシエチル−メタクリレート）又はポリ（ビニルアルコール））、ポリラクチド（Ｕ．Ｓ．特許Ｎｏ．３，７７３，９１９）、Ｌ−グルタミン酸とガンマエチル−Ｌ−グルタメートのコポリマー、非分解性エチレン−ビニルアセテート、分解性乳酸−グリコール酸コポリマー、例えば、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴ（商標）（乳酸−グリコール酸コポリマーとロイプロリドアセテートからなる注入可能なマイクロスフェア）、及びポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。エチレン−ビニルアセテート及び乳酸−グリコール酸などのポリマーは、１００日間にわたって分子を放出することができるが、ある種のヒドロゲルは、より短い期間、タンパク質を放出する。
カプセル化された抗体が、長期間体内で保持される場合、３７℃での湿気の曝露の結果、それらは変性又は凝集し得、結果として生物学的活性を喪失し、免疫原性の潜在的変化を引き起こす。合理的戦略として、関与するメカニズムに応じた安定化が考案され得る。例えば、凝集メカニズムが、チオ−ジスルフィド交換を介した分子内Ｓ−Ｓ結合形成であることを発見した場合には、スルフヒドリル残基を修飾し、酸性溶液から凍結乾燥し、含水量を調節し、適切な添加物をしようし、特定のポリマーマトリックス組成物を開発することにより、安定化が達成され得る。
投与様式
本発明の抗体及び化学療法剤は、既知の方法に従って対象に投与され、例えば、ボーラスとして又は一定期間にわたる持続注入による静脈内投与、筋肉内、腹腔内、脳髄腔内（ｉｎｔｒａｃｅｒｏｂｒｏｓｐｉｎａｌ）、皮下、関節内、滑液内、クモ膜下腔内、経口、局所又は吸入による経路により患者に投与される。抗体の静脈内又は皮下投与が好ましい。
治療様式
本発明の方法において、治療は、疾患又は病態に対する正の治療応答（ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｒｅｓｐｏｎｓｅ）を提供するために使用される。「正の治療応答」とは、疾患若しくは病態の改善、及び／又は疾患若しくは病態と関連する症状の改善を意図する。例えば、正の治療応答は、疾患における以下の改善の１つ以上を意味し得る：（１）新生細胞数の減少；（２）新生細胞死の増加；（３）新生細胞生存の阻害；（５）腫瘍増殖の阻害（すなわち、ある程度遅らせる、好ましくは停止）；（６）患者生存率の増加；及び（７）疾患又は病態と関連する１つ以上の症状のある程度の緩和。
任意の所与の疾患又は病態に対する正の治療応答は、その疾患又は病態に特異的な標準化された応答基準により決定され得る。腫瘍応答は、スクリーニング技術、例えば、磁気共鳴画像（ＭＲＩ）スキャン、Ｘ−放射線イメージング、コンピューター断層撮影（ＣＴ）スキャン、骨スキャンイメージング、内視鏡検査及び腫瘍生検サンプリング（骨髄穿刺（ＢＭＡ）を含む）及び循環腫瘍細胞の計測などを用いて、腫瘍形態の変化（すなわち、全腫瘍組織量、腫瘍サイズなど）について評価できる。
これらの正の治療応答に加えて、治療を受ける対象は、疾患と関連する症状において、改善の有益な効果を受け得る。
従って、Ｂ細胞腫瘍について、対象は、いわゆるＢ症状、すなわち、盗汗、発熱、体重減少及び／又は蕁麻疹の低下を受け得る。前ガン状態について、抗ＣＤ３８療法での治療は、例えば、意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症（ＭＧＵＳ）に罹患した対象における多発性骨髄腫の発症などの、関連する悪性疾患の発症までの期間を遮断及び／又は引き延ばし得る。
疾患の改善は、完全寛解として特徴付けられてよい。「完全寛解」とは、骨髄腫の場合には、なんらかの以前は異常であった放射線学的検査、骨髄、及び脳脊髄液（ＣＳＦ）又は異常な単クローン性タンパク質の正常化とともに、臨床的に検出可能な疾患がなくなることを意図する。
このような応答は、本発明の方法による治療後、少なくとも４〜８週間、場合によっては６〜８週間持続してよい。あるいは、疾患における改善は、部分寛解として分類されてよい。「部分寛解」とは、新たな病変の不在下で、全ての測定可能な腫瘍組織量（すなわち、対象に存在する悪性細胞数、又は測定される腫瘍塊の大部分又は異常な単クローン性タンパク質の量）が少なくとも約５０％減少し、それが４〜８週間又は６〜８週間持続し得ることを意図する。
本発明の治療は、「治療上有効量」の使用される医薬を含む。「治療上有効量」とは、必要な用量及び期間で、所望の治療結果を達成するのに有効な量をいう。
治療上有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別及び体重や、個体において所望の反応を導く医薬の能力などの要因によって変動し得る。治療上有効量はまた、抗体又は抗体部分の毒性又は有害作用のいずれかより治療上有益な効果が上回るものでもある。
腫瘍療法における「治療上有効量」は、疾患の進行を一定に保つ能力により測定されてよい。ガンを阻害する化合物の能力は、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系で評価されてよい。
あるいは、組成物のこの特性は、当業者に既知のｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイにより、化合物が細胞増殖を阻害する能力又はアポトーシスを誘導する能力を調べることにより評価されてよい。治療化合物の治療上有効量は、腫瘍サイズを減少させるか、あるいは対象における症状を改善し得る。当業者であれば、対象のサイズ、対象の症状の重篤度、及び特定の組成物又は選択される投与経路などの因子に基づいて、このような量を決定できるだろう。
用量レジメンは、最適な所望の反応（例えば、治療応答）を提供するために調整される。例えば、単回ボーラスを投与してよく、複数の分割量を時間をかけて投与してよく、又は用量を比例的に減少又は増加（危急的治療状況により示されるとおり）させてもよい。非経口組成物は、投与を容易にするために、また投薬量を一様にするために、投薬単位形態に製剤化してもよい。本明細書で使用する場合、投薬単位形態（ｄｏｓａｇｅ ｕｎｉｔ ｆｏｒｍ）とは、治療されるべき対象のために単一用量として適切な、物理的に別個の単位を意味し、各単位は、必要な医薬担体と関連して所望の治療効果を生じるよう計算された、予め決められた量の活性化合物を含む。
本発明の投薬単位形態についての規格は、（ａ）活性化合物に特有の特性及び達成されるべき特定の治療効果、並びに（ｂ）個体における治療感受性（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ）のために、そのような活性化合物を配合する当分野に固有の限界、により決定され、それらに直接依存する。
本発明で使用される抗ＣＤ３８抗体についての有効量及び投薬レジメンは、治療されるべき疾患又は病態によって決まり、当業者により決定され得る。
本発明で使用される抗ＣＤ３８抗体の治療上有効量についての非限定的な例示範囲は、約０．１〜１００ｍｇ／ｋｇ、例えば約０．１〜５０ｍｇ／ｋｇなど、例えば約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ、例えば約０．１〜１０ｍｇ／ｋｇ、例えば約０．５、例えば約０．３、約１、又は約３ｍｇ／ｋｇなどである。別の実施態様において、抗体は、１ｍｇ／ｋｇ以上の用量、例えば１〜２０ｍｇ／ｋｇの用量、例えば５〜２０ｍｇ／ｋｇの用量、例えば８ｍｇ／ｋｇの用量で投与される。
当分野の通常の技術を有する医師であれば、必要な医薬組成物の有効量を容易に決定し、処方し得る。例えば、医師又は獣医は、所望の治療効果を達成するのに必要な量よりも低いレベルで、医薬組成物に用いられる医薬の用量をスタートし、所望の効果が達成されるまで徐々に用量を増加させることができる。
一実施態様において、抗ＣＤ３８抗体は、１週間の投与量が１０〜５００ｍｇ／ｋｇ、例えば２００〜４００ｍｇ／ｋｇで注入により投与される。このような投与は、例えば、１〜８回（３〜５回など）、反復してよい。投与は、２〜２４時間、例えば２〜１２時間の期間に亘って持続注入により実施されてよい。
一実施態様において、毒性を含む副作用を低下させることが必要な場合には、抗ＣＤ３８抗体は、２４時間超などの長期間に亘ったゆっくりした持続注入により投与される。
一実施態様において、抗ＣＤ３８抗体は、１週間の投与量が２５０ｍｇ〜２０００ｍｇ、例えば３００ｍｇ、５００ｍｇ、７００ｍｇ、１０００ｍｇ、１５００ｍｇ又は２０００ｍｇなどで、最大８回、例えば４〜６回など投与される。投与は、２〜２４時間、例えば２〜１２時間などに亘る持続注入により実施されてよい。このようなレジメンは、例えば６ヶ月又は１２ヶ月後に、必要に応じて１回以上反復されてよい。用量は、例えば、生物学的サンプルを取り出し、抗ＣＤ３８抗体の抗原結合領域を標的とする抗イディオタイプ抗体を用いることにより、投与時の血中の本発明の化合物量を測定することにより決定されるか、又は調整されてよい。
さらなる実施態様において、抗ＣＤ３８抗体は、２〜１２週間、例えば３〜１０週間、例えば４〜８週間、週に一回投与される。
一実施態様において、抗ＣＤ３８抗体は、維持療法により投与され、これは、例えば、６ヶ月以上の期間、週に一回投与される。
一実施態様において、抗ＣＤ３８抗体は、抗ＣＤ３８抗体の一回の注入とそれに続く放射性同位体結合抗ＣＤ３８抗体の注入を含むレジメンにより投与される。レジメンは、例えば７〜９日後などに反復されてよい。
本発明に従った治療は、非限定例として、単回又は分割量を２４、１２、８、６、４若しくは２時間ごとに又は任意の組合せで使用して、治療の開始後、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９又は４０日目に少なくとも１回、あるいはまた１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９又は２０週目に少なくとも１回、又はその任意の組合せで、一日当たり、約０．１〜１００ｍｇ／ｋｇ、例えば０．５、０．９、１．０、１．１、１．５、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、４０、４５、５０、６０、７０、８０、９０又は１００ｍｇ／ｋｇの抗体量を一日当たりの用量として提供してよい。
いくつかの実施態様において、その抗ＣＤ３８抗体分子は、１つ以上の追加の治療剤、例えば化学療法剤と組み合わせて使用する。ＤＮＡ損傷化学療法剤の非限定例として、トポイソメラーゼＩ阻害剤（例えば、イリノテカン、トポテカン、カムトテシン及びそのアナログ又は代謝物、ドキソルビシンなど）；トポイソメラーゼＩＩ阻害剤（例えば、エトポシド、テニポシド、ダウノルビシンなど）；アルキル化剤（例えば、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、チオテパ、イフォスファミド、カルムスチン、ロムスチン、セムスチン、ストレプトゾシン、デカルバジン、メトトレキサート、マイトマイシンＣ、シクロホスファミドなど）；ＤＮＡインターカレーター（例えば、シスプラチン、オキサリプラチン、カルボプラチンなど）；ＤＮＡインターカレーター及びフリーラジカルジェネレーター（ブレオマイシンなど）；及びヌクレオシド模倣物（例えば、５−フルオロウラシル、カペシチビン、ゲムシタビン、フルダラビン、シタラビン、メルカプトプリン、チオグアニン、ペントスタチン、ヒドロキシウレアなど）が挙げられる。
細胞複製を妨げる化学療法剤として、以下が挙げられる：パクリタキセル、ドセタキセル及び関連アナログ；ビンクリスチン、ビンブラスチン及び関連アナログ；サリドマイド、レナリドミド及び関連アナログ（例えば、ＣＣ−５０１３、ＣＣ−４０４７など）；タンパク質チロシンキナーゼ阻害剤（例えば、イマチニブメシレート及びゲフィチニブ）；プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ）；ＮＦ−κＢ阻害剤（ＩκＢキナーゼの阻害剤を含む）；ガンで過剰発現するタンパク質と結合し、それにより細胞複製を下方制御する抗体（例えば、トラスツズマブ、リツキシマブ、セツキシマブ、ベバシズマブなど）；及びガンで上方制御、過剰発現又は活性化されることが既知のタンパク質又は酵素の他の阻害剤であって、その阻害が細胞複製を下方制御するもの。
いくつかの実施態様において、本発明の抗体は、ベルケイド（登録商標）（ボルテゾミブ）での治療前、同時、又は後に使用できる。
診断用途
提供する抗ＣＤ３８抗体は、ＣＤ３８と関連する腫瘍又は自己免疫疾患病態のｉｎ ｖｉｔｒｏ又はｉｎ ｖｉｖｏイメージングでの使用も見出される。いくつかの実施態様において、本明細書の記載の抗体は、診断及び治療のために使用され、又は診断のみに使用される。抗ＣＤ３８抗体を診断と治療の両方に使用する場合には、いくつかの実施態様は、診断抗体が治療抗体との結合に競合しないように、２つの異なるエピトープに対する２つの異なる抗ＣＤ３８抗体に依拠するが、とはいえ、いくつかの場合では同一の抗体を両方の目的のために使用できる。例えば、いくつかの例において、Ａｂ１９抗体を診断的（通常、以下に記載のように標識される）に使用し、一方でＡｂ７９を治療的に使用するか、逆もまた同様である。従って、本発明に含まれる組成物は、診断抗体と治療抗体を含むものであり、いくつかの実施態様においては、診断抗体は本明細書に記載のように標識される。さらに、治療抗体と診断抗体の組成物は、本明細書で概説するように、他の薬物と同時投与されてもよい。
多くの実施態様において、診断抗体は標識される。本明細書において「標識される」とは、本明細書に開示する抗体が、スクリーニング又は診断手順で検出できるよう結合される１つ以上の要素、アイソトープ又は化合物を有することを意味する。一般に、標識は複数のクラスに分類される：ａ）免疫標識（抗体により認識される融合パートナーとして組み込まれるエピトープであってよい）、ｂ）同位体標識（放射性同位体又は重同位体であってよい）、ｃ）低分子標識（蛍光及び比色（ｃｏｌｏｒｉｍｅｔｒｉｃ）色素、又は他の標識方法を可能にするビオチンなどの分子を含んでよい）、及びｄ）粒子などの標識（超音波標識のためのバブルを含む）又は体内イメージングを可能にする常磁性標識。当分野で既知であるように、標識は任意の位置で抗体に組み込まれてよく、タンパク質発現の間にｉｎ ｖｉｔｒｏ又はｉｎ ｖｉｖｏで組み込まれてよい。
診断は、下記に記載するように体全体のイメージングを可能にする診断抗体の投与によりｉｎ ｖｉｖｏで実施されることもでき、又は患者から取り出したサンプル上でｉｎ ｖｉｔｒｏで実施することもできる。この関連において、「サンプル」には、体液（血液、尿、血清、リンパ液、唾液、肛門及び膣分泌物、汗及び精液を含むがこれらに限定されない）、及び関連組織の生検から得られるものなどの組織サンプルを含む（これらに限定されない）、任意数の物を含む。
いくつかの実施態様において、ｉｎ ｖｉｖｏイメージングは、例えば、超音波、ＣＴスキャン、Ｘ線、ＭＲＩ及びＰＥＴスキャン、並びに光学技術（体の表面に近い腫瘍について光学標識を用いるものなど）を含む（これらに限定されない）ものにより実施される。
ＣＤ３８と関連する疾患のｉｎ ｖｉｖｏイメージングは、任意の適した技術により実施されてよい。例えば、９９Ｔｃ−標識、又は別のβ線放射同位体での標識を用いて、抗ＣＤ３８抗体を標識してよい。この技術の変形例として、ガンマカメラ技術よりも画像を改善するために磁気共鳴映像法（ＭＲＩ）の使用が挙げられてよい。同様の免疫シンチグラフィー法及び原理は、例えば、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ（ｅｄ．），Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｉｍａｇｉｎｇ Ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ（Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ １９８８），Ｃｈａｓｅ，“Ｍｅｄｉｃａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｒａｄｉｏｉｓｏｔｏｐｅｓ”，ｉｎ Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｇｅｎｎａｒｏ ｅｔ ａｌ．，（ｅｄｓ．），ｐｐ．６２４−６５２（Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，１９９０）、及びＢｒｏｗｎ，“Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｕｓｅ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ”，ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ａｎｄ Ｐｈａｒｍａｃｙ ２２７−４９，Ｐｅｚｚｕｔｏ ｅｔ ａｌ．，（ｅｄｓ．）（Ｃｈａｐｍａｎ ＆ Ｈａｌｌ １９９３）などに記載されている。
一実施態様において、本発明は、抗ＣＤ３８抗体が検出促進剤に結合され、結合抗体を血流に注入することなどにより宿主に投与して、宿主における標識抗体の存在及び位置を分析する、ｉｎ ｖｉｖｏイメージング方法を提供する。この技術、及び本明細書で提供する任意の他の診断方法を介して、本発明は、ヒト患者、又はヒト患者から得られた生物学的サンプルにおける、疾患関連細胞の存在をスクリーニングする方法を提供する。
診断イメージングについては、放射性同位体を抗ＣＤ３８抗体に直接結合させるか、又は媒介となる（ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｒｙ）官能基を用いることにより間接的に結合させるかのいずれかであってよい。有用な媒介となる官能基としては、エチレンジアミンテトラ酢酸、ジエチレントリアミンペンタ酢酸などのキレーターが挙げられる（例えば、Ｕ．Ｓ．特許Ｎｏ．５，０５７，３１３を参照されたい）。放射性同位体に結合させた抗ＣＤ３８抗体を伴うこのような診断アッセイにおいて、患者にデリバリーされる結合抗ＣＤ３８抗体の用量は、典型的には、検出及び正確な測定を可能にする、最小限の半減期、最小限の体内保持及び最小限の同位体量の最もよい組み合わせについて同位体を選択することを通じて、可能な限り低いレベルで維持される。
放射性同位体及び放射線不透過性剤に加えて、診断方法は、色素（例えば、ビオチン−ストレプトアジビン複合体など）、造影剤、蛍光化合物又は分子、及び増強剤（例えば、常磁性イオン）（磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）（例えば、ＭＲＩ技術、及びＭＲＩ増強剤に結合する抗体の調製を記載したＵ．Ｓ．特許Ｎｏ．６，３３１，１７５などを参照されたい）について）に結合させた抗ＣＤ３８抗体を用いて実施してよい。このような診断／検出剤は、磁気共鳴イメージングで使用するための剤、及び蛍光化合物から選択されてよい。
抗ＣＤ３８抗体に放射性金属又は常磁性イオンを負荷するために、イオンを結合するための多様なキレート基が結合されたロングテールを有する試薬と、抗体とを反応させる必要があり得る。このようなテールは、ポリリシンや多糖などのポリマー、又はキレート基との結合が可能なペンダント基を有する他の誘導体化若しくは誘導可能な鎖、例えば、ポルフィリン、ポリアミン、クラウンエーテル、ビスチオセミカルバゾン、ポリオキシム、及びこの目的のために有用であることが既知の基などであってよい。
キレートは、標準化学を用いて抗ＣＤ３８抗体に結合されてよい。キレートは、免疫反応性の最小限の喪失、及び最小限の凝集及び／又は内部交差反応性を有する分子への結合形成を可能にする基により抗ＣＤ３抗体に通常は結合される。
潜在的に有用な金属キレート組み合わせの例として、２−ベンジル−ＤＴＰＡ及びそのモノメチル及びシクロヘキシルアナログが挙げられ、通常のエネルギー範囲である６０〜４，０００ｋｅＶの診断同位体、例えば、１２５Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、１８Ｆ、１１１Ｉｎ、６７Ｇａ、９９Ｔｃ、９４Ｔｃ、１１Ｃ、１３Ｎ、５Ｏ、７６Ｂｒなど（ラジオイメージングについて）とともに使用される。
標識として、放射性核種、放射性物質造影剤、常磁性イオン、金属、蛍光標識、化学発行標識、超音波造影剤、光活性剤が挙げられる。このような診断剤は公知であり、このような公知の診断剤のいずれも使用してよい。診断剤の非限定的な例として、放射性核種、例えば、１１０Ｉｎ、１１１Ｉｎ、１７７Ｌｕ、１８Ｆ、５２Ｆｅ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、８６Ｙ、９０Ｙ、８９Ｚｒ、９４ｍＴｃ、９４Ｔｃ、９９ｍＴｃ、１２０Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１５４−１５８Ｇｄ、３２Ｐ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、５１Ｍｎ、５２ｍＭｎ、５５Ｃｏ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、８２ｍＲｂ、８３Ｓｒ、又は他のγ−、β−若しくは陽電子放射体などが挙げられてよい。
使用される常磁性イオンとして、クロム（ＩＩＩ）、マンガン（ＩＩ）、鉄（ＩＩＩ）、鉄（ＩＩ）、コバルト（ＩＩ）、ニッケル（ＩＩ）、銅（ＩＩ）、ネオジム（ＩＩＩ）、サマリウム（ＩＩＩ）、イッテルビウム（ＩＩＩ）、ガドリニウム（ＩＩＩ）、バナジウム（ＩＩ）、テルビウム（ＩＩＩ）、ジスプロシウム（ＩＩＩ）、ホルミウム（ＩＩＩ）又はエルビウム（ＩＩＩ）を挙げてよい。金属造影剤として、ランタン（ＩＩＩ）、金（ＩＩＩ）、鉛（ＩＩ）又はビスマス（ＩＩＩ）を挙げてよい。
超音波造影剤は、リポソーム、例えばガス封入（ｆｉｌｌｅｄ）リポソームを含んでよい。放射線不透過性診断剤は、化合物、バリウム化合物、ガリリウム化合物及びタリウム化合物から選択されてよい。
これらの及び同様のキレートは、マンガン、鉄、カドリニウムなどの非放射線金属と複合化させる場合に、抗ＣＤ３８抗体と関連して、ＭＲＩ診断方法に有用であり得る。ＮＯＴＡ、ＤＯＴＡ、ＴＥＴＡなどの大環状キレートは、様々な金属及び放射性金属で有用であり、とりわけ、それぞれ、ガリウム、イッテリウム及び銅の放射性核種で有用である。このような金属キレート複合体は、対象となる金属に対する環のサイズを調節することにより非常に安定化させ得る。２２３Ｒａなどの核種との安定した結合について関心対象である大環状ポリエーテルなどの他の環系キレートも診断方法に適切であり得る。
従って、本発明は、診断抗ＣＤ３８抗体結合体であって、抗ＣＤ３８抗体結合体が造影剤（例えば、磁気共鳴イメージング、コンピューター断層撮影法、超音波造影増強剤などのため）又は例えば、γ−、β−、α−、オージェ電子−、又は陽電子放出同位体などであってよい放射性核種に結合されている、結合体を提供する。
抗ＣＤ３８抗体はまた、例えば、特定の細胞、組織又は血清における対象抗原の発現を検出するのに有用であり得る。診断的適用のために、抗体は典型的には、ｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイで検出可能な部分で標識される。当業者に理解されるように、ｉｎ ｖｉｔｒｏ試験での使用に適した標識は広範囲にわたって存在する。本発明のこの側面での使用に適した色素（ｄｙｅ）としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：蛍光ランタニド複合体（ユーロピウム及びテルビウムを含む）、フルオレセイン、ローダミン、テトラムエチルローダミン、エオシン、エリスロシン、クマリン、メチル−クマリン、量子ドット（「ナノクリスタル」とも称される；Ｕ．Ｓ．Ｓｅｒ．Ｎｏ．０９／３１５，５８４を参照されたい（参照により援用される））、ピレン、マラカイトグリーン、スチルベン、ルシファーイエロー、カスケードブルー（商標）、テキサスレッド、Ｃｙ色素（Ｃｙ３、Ｃｙ５など）、アレクサを含むアレクサ色素、フィコエリトリン、ボディピー及びＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｂｙ Ｒｉｃｈａｒｄ Ｐ． Ｈａｕｇｌａｎｄの第６版に記載の他のもの（参照により本明細書に援用される）。
次いで、染色された組織は、腫瘍におけるＣＤ３８関連ペプチド量のインディケーターとして放射活性を計測するために評価され得る。例えば、浸潤性ガン細胞の存在に対するバイオマーカーとしてＣＤ３８を使用する場合においては、このような技術の使用により得られた画像を用いて、患者、哺乳動物又は組織における生体分布を評価してよい。
製品
他の実施態様において、上述の障害の治療に有用な物質を含む製品を提供する。当該製品は、容器とラベルを含む。適した容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ及び試験管などが挙げられる。容器は、ガラスやプラスチックなど様々な物質から成型されてよい。容器は、病態の治療に有効な組成物を保持し、滅菌アクセスポート（例えば、容器は、皮下注射針による穿刺可能なストッパーを有する注入可能な溶液バッグ又はバイアルであってよい）を有してよい。組成物中の活性剤は抗体である。容器上に又は容器に付随するラベルは、組成物が、選択する病態の治療に使用されることを示す。製品はさらに、リン酸緩衝生理食塩水、リンガー溶液、デキストロース溶液などの医薬上許容されるバッファーを含む第二の容器を含んでよい。製品は、商業上及びユーザーの点から見て好ましい他の物質をさらに含んでよく、これには、他のバッファー、希釈剤、フィルター、ニードル、シリンジ及び使用方法を記載した添付文書が挙げられる。
以下の実施例は、本発明を例証するために提供するものであり、本発明を何ら限定するものではない。
実施例１：ヒト、カニクイザル及びマウスＣＤ３８をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター構築物
ヒトＣＤ３８（ｈｕＣＤ３８）を発現するベクターを構築するために、ｈｕＣＤ３８をコードするポリヌクレオチドをＯｒｉｇｅｎｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｔｒｕｅｃｌｏｎｅ（登録商標）ｈｕｍａｎから得たｃＤＮＡから単離した。Ｇ４１８（Ｇｅｎｅｔｉｃｉｎ）耐性トランスフェクタントの選択を可能にするネオマイシン耐性（ｎｅｏＲ）遺伝子を含む安定な発現ベクター（ＸＯＭＡ，Ｉｎｃ．）に単離したｈｕＣＤ３８をクローニングした。選択されたトランスフェクタントに存在するｈｕＣＤ３８遺伝子をシーケンシングして、任意の配列エラーを同定した。ＧｅｎｂａｎｋアクセッションＮＭ＿００１７７５から外れた配列エラーをＰＣＲ部位特異的変異導入により訂正した。最終的なベクターＤＮＡを５’シーケンシングにより確認した。
カニクイザルＣＤ３８（ｃｙＣＤ３８）を発現するベクターを構築するために、Ｂｉｏｃｈａｉｎ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ’ｓ ｃＤＮＡ−ｍｏｎｋｅｙ（カニクイザル）−正常脾臓組織から得たＤＮＡからｃｙＣＤ３８をコードするポリヌクレオチドを単離した。Ｇ４１８（Ｇｅｎｅｔｉｃｉｎ）耐性トランスフェクタントの選択を可能にするｎｅｏＲ遺伝子を含む安定な発現ベクター（ＸＯＭＡ，Ｉｎｃ．）に単離したｃｙＣＤ３８をクローニングした。選択されたトランスフェクタントに存在するｃｙＣＤ３８遺伝子をシーケンシングして、任意の配列エラーを同定した。ＧｅｎｂａｎｋアクセッションＡＹ５５５１４８から外れた配列エラーをＰＣＲ部位特異的変異導入により訂正した。最終的なベクターＤＮＡをシーケンシングにより確認した。
マウスＣＤ３８（ｍｏＣＤ３８）を発現するベクターを構築するためにＯｒｉｇｅｎｅ’ｓ ＴｒｕｅＯＲＦコレクションから得たＤＮＡからｍｏＣＤ３８をコードするポリヌクレオチドを単離した。Ｇ４１８（Ｇｅｎｅｔｉｃｉｎ）耐性トランスフェクタントの選択を可能にするｎｅｏＲ遺伝子を含む安定な発現ベクター（ＸＯＭＡ，Ｉｎｃ．）に単離したｍｏＣＤ３８をクローニングした。選択されたトランスフェクタントに存在するｍｏＣＤ３８遺伝子をシーケンシングして、任意の配列エラーを同定した。ＧｅｎｂａｎｋアクセッションＮＭ＿００７６４６から外れた配列エラーをＰＣＲ部位特異的変異導入により訂正した。最終的なベクターＤＮＡをシーケンシングにより確認した。
実施例２：ＣＤ３８を発現するチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞の開発
ｈｕＣＤ３８、ｍｕＣＤ３８及びｃｙＣＤ３８を発現するＣＨＯ細胞を開発するために、ＣＨＯ細胞を直鎖化ＤＮＡでトランスフェクトした。選択下で一週間置いた後、フローサイトメトリーにより細胞をソーティングし、最も高いｈｕＣＤ３８、ｍｕＣＤ３８又はｃｙＣＤ３８発現細胞（最大１５％）を９６ウェルプレートに播種して、単一コロニーを生じさせた。残りの細胞も選択下で播種し、バックアップコロニーを生じさせた。播種してからおよそ１２〜１４日後に単一コロニーを同定し、９６ディープウェルプレートに移した。第二継代後、ＦＡＣＳ分析によりクローンをスクリーニングした。トップの産生クローンを継代し、振とうフラスコに広げた。マイコプラズマＡＶＡ試験及びスケールアップのために、トップの２クローンを凍結及び／又は培養した。
播種性（ｄｉｓｓｅｍｉｎａｔｅｄ）ゼノグラフトモデルのためのルシフェラーゼレポーターを構築するために、ＣＭＶプロモーター／ルシフェラーゼ遺伝子／ネオマイシン選択可能なマーカーを含む市販のベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）を用いて、Ｄａｕｄｉバーキットリンパ腫細胞の安定発現株を作製した。
実施例３：ファージディスプレイライブラリー及びＣＤ３８と結合する薬剤のスクリーニング
標的特異抗体のファージディスプレイライブラリーからの選択は、Ｍａｒｋｓらにより記載される方法（２００４，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２４８：１６１−７６）に従って実施した。簡単に述べると、ファージディスプレイライブラリーを室温で１時間、１００ｐｍｏｌのビオチン化ＣＤ３８とともにインキュベートし、次いで１００μＬのストレプトアジビンビーズ懸濁液（ＤＹＮＡＢＥＡＤＳ（登録商標）Ｍ−２８０ Ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ，Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、形成した複合体を捕捉した。洗浄バッファー（ＰＢＳ中５％ミルク）でビーズを洗浄することにより非特異的なファージを除去した。結合したファージを０．５ｍＬの１００ｎＭトリエチルアミン（ＴＥＡ）で溶出し、等量の１Ｍ ＴＲＩＳ−ＣＩ（ｐＨ７．４）を添加することによりすぐに中和した。溶出したファージプールを用いて、対数増殖期のＴＧ１ Ｅ．ｃｏｌｉに感染させ、Ｍａｒｋｓらの上記文献に記載のように、ファージミドをレスキューした。選択を計３ラウンド繰り返した。
あるいは、固定化したＣＤ３８（Ｒ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓ）に対してファージディスプレイライブラリーをパンニングして、ＣＤ３８との結合能力を有する抗体断片パネルを同定した。パンニングは、標準的なプロトコルを用いて実施した（例えば、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，ｖｏｌ．１７８：Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｈａｇｅ Ｄｉｓｐｌａｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ Ｅｄｉｔｅｄ ｂｙ：Ｐ．Ｍ．Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ａｎｄ Ｒ．Ａｉｔｋｅｎ，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ；“Ｐａｎｎｉｎｇ ｏｆ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｈａｇｅ−Ｄｉｓｐｌａｙ Ｌｉｂｒａｒｉｅｓ”，Ｃｏｏｍｂｅｒ，Ｄ．Ｗ．Ｊ．，ｐｐ．１３３−１４５、及び“Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ａｇａｉｎｓｔ Ｂｉｏｔｉｎｙｌａｔｅｄ Ａｎｔｉｇｅｎｓ”，Ｃｈａｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，ｐｐ．１４７−１５７を参照されたい）。簡単に述べると、ＮＵＮＣ（登録商標）ＭＡＸＩＳＯＲＰプレートの３つのウェルに、ＰＢＳ中、１０μｇ／ｍＬの濃度の組換えＣＤ３８（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）５０μＬをコーティングした。４℃で一晩インキュベートした後、ＰＢＳ中５％ミルクを用いて、結合していない結合部位を１時間、室温でブロッキングした。次いで、５％ミルク／ＰＢＳ中、およそ２００μＬのファージライブラリーをブロッキングしたウェルに添加し、室温でおよそ１〜２時間インキュベートした。ウェルを洗浄し、結合したファージを標準的な方法を用いて溶出した（例えば、Ｓａｍ ｂｒｏｏｋ ａｎｄ Ｒｕｓｓｅｌｌ，Ｍｏｌｅｃｕｌｅ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，３ｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，２００１を参照されたい）。溶出したファージは、対数増殖期にあるＥ．ｃｏｌｉ ＴＧ１宿主細胞への感染を介して増幅させた。２，５００ＲＰＭで５分間遠心分離することにより感染ＴＧ１細胞を回収し、１５ｃｍの２ＹＴ−アンピシリン−２％グルコース寒天プレート上に播種し、３０℃で一晩インキュベートした。ついで、増幅させたファージを用いてパンニング工程を繰り返した。パンニング、溶出及び増幅のサイクルを３ラウンド繰り返した。
パンニングが完了した後、播種したＴＧ１細胞由来の単一コロニーを用いて、９６ウェルプレート中、培地に接種した。ミクロ培養をＯＤ６００＝０．６まで増殖させ、その時点で、１ｍＭのＩＰＴＧを添加することにより可溶性ｓｃＦＶの発現を誘導し、シェーカー中、３０℃で一晩インキュベートした。遠心分離により細菌をペレット化し、標準的なＥＬＩＳＡアッセイ及びＦＡＣＳ結合アッセイにより固定化ＣＤ３８に結合するｓｃＦｖを試験するために、ペリプラズム抽出物を用いた。
ＦＡＣＳ結合スクリーニングのために、ＣＤ３８を安定発現するＣＨＯ細胞を用いて、天然の膜結合ＣＤ３８に結合する能力についてペリプラズム抽出物（ＰＰＥ）中のｓｃＦｖをスクリーニングした。親及びＣＨＯトランスフェクタント（ヒトＣＤ３８又はカニクイザルＣＤ３８又はマウスＣＤ３８発現細胞株）を、ＰＢＳ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）、０．５％ＢＳＡ（Ｓｉｇｍａ-Ａｌｄｒｉｃｈ）及び０．１％ＮａＮ３（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）（ＦＡＣＳバッファー）中、別々に、２×１０６細胞／ｍＬで再懸濁した。ＣＤ３８を発現しない親ＣＨＯ細胞をネガティブコントロールとして使用した。２５μＬの細胞アリコートをＶ底９６ウェルプレート（Ｃｏｓｔａｒ Ｃａｔ＃３８９７）に播種し、ｍｙｃタグｓｃＦｖ抗体断片を含むペリプラズム抽出物２５μＬを細胞に添加し、次いで混合物を４℃で３０分間インキュベートした。次いで、細胞を２回洗浄し、その後、ペレットを２５μＬのマウス抗ｃ−ｍｙｃ（ＦＡＣＳバッファー中、１／１０００）（Ｒｏｃｈｅ）に再懸濁し、再度４℃で３０分間インキュベートした。次いで、細胞を２回洗浄し、ＦＡＣＳバッファー（Ｊａｃｋｓｏｎ ｌａｂｓ）中、１／２００希釈した抗マウスＩｇＧ−ＰＥ２５μＬ中に再懸濁し、再度、４℃で３０分間インキュベートした。次いで、細胞を２回洗浄して、過剰な非結合抗体を除去し、７０μＬのＦＡＣＳバッファーに再懸濁し、ＢＤ ＦＡＣＳｃａｎ（登録商標）で分析した。得られたデータをＦｌｏｗＪｏ ｓｏｆｔｗａｒｅ（ＴｒｅｅＳｔａｒ，Ｉｎｃ．）を用いて評価した。陽性サンプルは、親ＣＨＯ細胞株（ＣＤ３８−）の平均蛍光強度に対する、ＣＤ３８トランスフェクトＣＨＯ細胞の平均蛍光強度を比較することにより同定した。
ヒトＣＤ３８に結合した抗体クローンをシーケンシングして、独特のクローンを同定した。次いで、独特のｓｃＦｖクローンを、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）分析により決定されたオフレートに基づき、ランク付けした。標準的なアミンカップリングケミストリーにより（Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標））、２００ＲＵ〜５００ＲＵのヒト組換えＣＤ３８（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ’ ｃａｔ＃２４０４−ＡＣ又は同等物）をＣＭ５又は同等のチップに固定した。リファレンススポットも調製し、これを活性化し、次いでタンパク質を固定化することなくブロッキングした。これは、アセテートバッファー（ｐＨ５．０）中、１〜３μｇ／ｍＬに抗原を希釈し、必要なレベルが固定化されるまで（３〜５）分間、活性化表面に注入することにより実施した。次いで、表面をエタノールアミンでブロッキングした。ペリプラズム抽出物を、２ｍｇ／ｍＬＢＳＡ（ウシ血清アルブミン））を有する、アッセイランニングバッファー１０ｍＭ ＨＥＰＥＳ、１５０ｍＭ ＮａＣｌ、３ｍＭ ＥＤＴＡ（エチレンジアミンテトラ酢酸）及び０．０５％ポリソルベート２０（ｐＨ７．４）で１：１に希釈した。希釈したペリプラズム抽出物を表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）表面に、３０分で、３００秒間と追加の９００秒間（モニタリングされる解離時間）で注入した。１００ｍＭ ＨＣｌを８秒間、１回注入して再生（ｒｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ）させた。リファレンススポットから得られたデータを、活性表面から得られたデータから減算し、次いでＢｉａｃｏｒｅ（登録商標）Ｔ１００ソフトウェアにおいて１：１解離モデルを用いて、解離曲線をフィッティングした。
トップランクのｓｃＦｖクローンをＩｇＧ１抗体に変換した。保持された結合特性を保証し、種間交差反応性を評価するため、親ＣＨＯ細胞、並びにヒト、マウス及びカニクイザルＣＤ３８を発現するＣＨＯ細胞を用いて、ＩｇＧ１再フォーマット（ｒｅｆｏｒｍａｔｔｅｄ）クローンに対しＦＡＣＳ結合スクリーニングを繰り返した。ＩｇＧ再フォーマットクローンのＦＡＣＳ特徴付けを上述のとおり実施したが、抗ｃ−ｍｙｃ抗体及び抗マウスＩｇＧ−ＰＥの添加からなる工程は、全長ヒトＩｇＧの結合が、フィコエリトリン結合抗ヒトＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ Ｌａｂｓ）の添加により検出される１回の工程に置き換えた。
実施例４：ＩｇＧ再フォーマットクローンのｉｎ ｖｉｔｒｏ細胞系アッセイ
約１５０のクローンをヒトＩｇＧ１抗体として再フォーマットし、以下に記載するとおり、アッセイのパネルを用いて、５つ（Ａｂ１９、Ａｂ４３、Ａｂ７２、Ａｂ７９及びＡｂ１１０）を十分に評価した。Ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏアッセイの両方におけるＩｇＧ再フォーマットクローンのパフォーマンスを２つの抗体、ＢＭＴＫ４−１（ベンチマーク１、ＢＭ−１又はＢＭＴＫ−１とも称する）（配列番号２４及び２５；重鎖及び軽鎖可変領域）及びＢＭＴＫ４−２（ベンチマーク２、ＢＭ−２又はＢＭＴＫ−２とも称する）（配列番号２６及び２７；重鎖及び軽鎖可変領域）と比較した。これらのアミノ酸配列は、それぞれ、既知の抗ＣＤ３８抗体ダラツムマブ（ＨｕＭａｘ−ＣＤ３８とも称され、国際公開Ｎｏ．０６／０９９８７５に開示される）及びＳＡＲ６５０９８４（国際公開Ｎｏ．０８／０４７２４２に開示される）に由来した。呼吸系発疹ウイルスを認識する臨床的に認可された抗体であるパリビズマブ（ＳＹＮＡＧＩＳ（登録商標））（Ｍｅｄｌｍｍｕｎｅ）をＣＤ３８結合に対するネガティブコントロールとした。
実施例５：免疫蛍光法によるＡｂ７９結合の検出
Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８色素で標識されたＡｂ７９を正常ヒト結腸直腸組織、前立腺及びリンパ凍結切片に適用した。Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８色素で標識されたパリビズマブ（Ｓｙｎａｇｉｓ（登録商標））をネガティブ染色コントロールとした。得られた免疫蛍光像を図４に示す。正常ヒト結腸直腸組織、前立腺及びリンパ節において、Ａｂ７９について観察された染色パターンは、市販のポリクローナル抗ＣＤ３８抗体で見られたものと同一であった（データ示さず）。
Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８色素標識されたＡｂ７９を正常及び多発性骨髄腫の骨髄試料にも適用した（データ示さず）。Ａｂ７９は正常骨髄細胞の〜１０％と結合したのに対し、多発性骨髄腫の骨髄細胞は＞９０％がＡｂ７９結合を示した（４つの試験サンプルのうち４つにおいて）。
Ａｂ７９が多数の細胞株（ＭＯＬＰ−８、ＤＡＵＤＩ、ＲＰＭＩ及びＭＣＦ７）と結合する能力についても検証した。ＭＯＬＰ−８（ヒト多発性骨髄腫）、ＤＡＵＤＩ（バーキットリンパ腫罹患者由来のリンパ芽球）及びＲＰＭＩ（慢性骨髄性白血病罹患者から樹立された細胞株）細胞はすべて、Ａｂ７９による結合を示した。乳癌株であるＭＣＦ７は、Ａｂ７９結合に対して、概してネガティブであるようだった（データ示さず）。
Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８結合抗体を８μｍのクリオスタット凍結切片上で染色し、エタノール／アセトン混合物で５分間固定し、その後、湿度制御チャンバー中、室温で１時間、抗体とともにインキュベートした。次いで、切片を洗浄し、ＤＡＰＩ含有包埋剤（Ｖｅｃｔｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，ｃａｔ＃Ｈ１５００）を添加し、カバーガラスをのせた。
実施例６：多発性骨髄腫（ＭＭ）及び慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）に対するＡｂ７９発現の評価
多発性骨髄腫患者由来の骨髄サンプルに対するＡｂ７９結合は、ＣＤ１３８＋細胞の濃縮（ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ）後か、或いはＣＤ１３８＋ＣＤ４５−／ｌｏ細胞のゲーティングによるかのいずかによりフローサイトメトリーにより分析した（図７Ａ）。Ａｂ７９は、６つの多発性骨髄腫サンプルのうち４つにおいて、＞９５％の細胞で発現が見られた。Ａｂ７９の結合パターンは、臨床検査室で使用された抗ＣＤ３８抗体のものと、概して類似しているようであった。さらに、Ａｂ７９は、慢性リンパ性白血病罹患者由来の細胞と結合した（図７Ｂ）。
ＭＭ及びＣＬＬと結合するＡｂ７９をＦＡＣＳにより測定するために、患者サンプルを２４時間以内に処理した。製造者の指示書に従って、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐａｑｕｅ（商標）（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）により末梢血単核細胞を単離した。括弧内のクローンと以下の抗体パネルを用いて、発現分析を実施した。ＭＭパネル：Ａｂ７９−Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８、ＣＤ４５−ＰｅｒＣＰ（２Ｄ１）、ＣＤ１３８−ＡＰＣ（ＭＩ１５）。ＣＬＬパネル：Ａｂ７９−Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８；ＣＤ５−ＰＥ（ＵＣＨＴ２）、ＣＤ４５−ＰｅｒＣＰ（２Ｄ１）、ＣＤ１９−ＡＰＣ（ＳＪ２５Ｃ１）。５μＬのＰＥ、ＰｅｒＣＰ若しくはＡＰＣ標識抗体、又は１０μＬのＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８標識抗体又はアイソタイプコントロールを、１００μＬの０．２×１０６ ＰＢＭＣ又はＣＤ１３８濃縮細胞（骨髄穿刺液由来）のいずれかを含む各ウェル又はチューブに添加した。サンプルを室温で３０分間インキュベートし、その後、製造者の指示書に従って、赤血球細胞をＢＤ Ｐｈａｒｍｌｙｓｅを用いて溶解した。全てのサンプルをＦＡＣＳバッファーで３回洗浄した。１％パラホルムアルデヒドでサンプルを固定し、ＢＤ ＦＡＣＳＣａｎｔｏ（商標）ＩＩ又はＢＤ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｅｒ（商標）で分析した。
実施例７：抗ＣＤ３８誘導ＣＤＣアッセイ
カニクイザル交差反応性クローンを、補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）を誘導する能力について試験した。ＭＯＬＰ−８細胞を、５０μＬの完全培地（１０％胎児ウシ血清を添加したＲＰＭＩ）中、黒色の９６ウェル平底組織培養プレートにウェル当たり１０，０００細胞の密度で播種した。５０μＬの２×抗ＣＤ３８抗体、コントロールＩｇＧ抗体又は培地のみのものを各ウェルに添加し、室温で１０分間インキュベートしておいた。細胞株に応じて量を変更した（２〜１５μＬ）精製ウサギ補体（ｃａｔ＃ＣＬ３４４１ Ｃｅｄａｒｌａｎｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｃａｎａｄａ）を、コントロールウェル以外の各ウェルに添加した。３７℃で１時間インキュベートした後、プレートを室温にし、ウェル当たり１００μＬのセルタイターＣｙｔｏＴｏｘ Ｇｌｏ（商標）試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｇ７５７１／Ｇ７５７３）を添加し、プレートを５〜７分間振とうさせ、発光をＥｎＶｉｓｉｏｎ（登録商標）（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）発光プレートリーダーで読み取った。試験条件：細胞のみ；細胞＋補体；細胞＋ＩｇＧコントロール＋補体；細胞＋抗体＋補体。ＣＤＣ％は、下記式を用いて計算した：
１００−（ＲＬＵＴ／ＲＬＵＣ）×１００
［式中、ＲＬＵＴは、試験サンプルの相対発光単位（ｒｅｌａｔｉｖｅ ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｃｅ ｕｎｉｔ）であり、ＲＬＵＣは、補体のみのサンプルの相対発光単位である］。統計分析はＰＲＩＳＭソフトウェアを用いて実施した。抗体濃度に対するＣＤＣ％をプロットすることにより決定されたＥＣ５０値を表１に示す。
実施例８：抗ＣＤ３８誘導ＡＤＣＣアッセイ
抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ＡＤＣＣ）は、標的細胞としてＤａｕｄｉ、ＭＯＬＰ−８及びＲＰＭＩ−８２２６細胞株を用いて評価した。Ｓｔａｎｆｏｒｄ Ｂｌｏｏｄ Ｃｅｎｔｅｒ（Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）から得られた軟膜又はＬＲＳから、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐｌａｑｕｅ（商標）分離によりエフェクター細胞としてＰＢＭＣを単離した。ＰＢＳ中２％ＦＢＳを用いて試料を１：３希釈した。３５ｍＬの希釈試料の下に１５ｍＬのＦｉｃｏｌｌ−Ｐｌａｑｕｅ（商標）（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を徐々に層状にし、１８００ｒｐｍ（ブレーキオフ）で２５分間遠心分離した。ＰＢＭＣを含む濁った中間層を集め、ＰＢＳ中２％ＦＢＳで３回洗浄し、１０％ＤＭＳＯ／ＦＢＳ中、アリコート当たり５０×１０６細胞／ｍＬのアリコートを凍結した。必要な場合には、凍結したＰＢＭＣアリコートを融解し、２×１０６／ｍＬで、１０％ＦＢＳ／ＲＭＰＩ＋５ｎｇ／ｍＬ 組換えヒトＩＬ２（Ｒ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓ ＃２０２−ＩＬ）中、一晩培養した。
ＡＤＣＣアッセイのために、すべての工程は完全培地中で実施した。ウェル当たり５０００の標的細胞を、５０μＬの３×抗ＣＤ３８、コントロールＩｇＧ又は培地のみが添加された９６ウェルプレートに播種し、その後、５０μＬのヒトエフェクターＰＢＭＣを、標的：エフェクター（Ｔ：Ｅ）細胞が１：２５〜１：５０となる比率で添加した。〜３０秒間、８００ｒｐｍでプレートを簡単に遠心分離して、全ての細胞を近づけた。３７℃で４時間後、プレートを１１００ｒｐｍで５分間遠心分離し、１００μＬの上清を白色プレートに移した。１００μＬのＣｙｔｏＴｏｘ Ｇｌｏ（商標）試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ ｃａｔ＃Ｇ９２９２）を上清に添加し、プレートを２０〜３０分間、ＲＴで振とうさせた。発光をＥｎＶｉｓｉｏｎ（登録商標）（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）発光プレートリーダーで読み取り、特異的溶解の割合を下記式を用いて測定した：
（ＲＬＵＴ／ＲＬＵＥ／Ｔ）／（ＲＬＵＬ／ＲＬＵＥ／Ｔ）×１００
［式中、ＲＬＵＴは、試験サンプルの相対発光単位であり、ＲＬＵＥ／Ｔは、標的細胞及びエフェクター細胞のみを含むサンプルの相対発光単位であり、ＲＬＵＬは、ＴｒｉｔｏｎＸ−１００で溶解した細胞についての相対発光単位である。］統計分析は、ＰＲＩＳＭソフトウェアを用いて実施した。抗体濃度に対する特異的溶解％をプロットすることにより決定されたＥＣ５０値を表１に示す。
実施例９：ＦＡＣＳによる親和性決定
ＣＤ３８を発現するＭＯＬＰ−８細胞は、およそ２００万細胞／ｍＬの生存細胞濃度で、１％ＦＢＳバッファーに懸濁した。試験すべきｍＡｂは、１×ＰＢＳ中、２つの９６ウェルプレート上、ウェルにわたって段階希釈（２倍）した。各滴定（ｔｉｔｒａｔｉｏｎ）の最後のウェルは、バッファーのみを含んだ。最終体積が３００〜Ｌ／ウェルとなり、各ウェルがおよそ１００，０００細胞含むように各ウェルに追加のＰＢＳ及び細胞懸濁液を追加した。ｍＡｂを下記に列挙し、滴定で使用した、対応する最終的なｍＡｂ結合部位濃度（２×分子濃度）範囲も示す：
ベンチマーク１、［ｍＡｂ］結合部位＝５０．８ｎＭ〜４９．７ｐＭ
ベンチマーク２、［ｍＡｂ］結合部位＝４９．５ｎＭ〜４８．３ｐＭ
Ａｂ４３、［ｍＡｂ］結合部位＝４９．３ｎＭ〜４８．２ｐＭ
Ａｂ１１０、［ｍＡｂ］結合部位＝２０４ｎＭ〜４９．９ｐＭ
Ａｂ７９、［ｍＡｂ］結合部位＝１０３ｎＭ〜２５．３ｐＭ
Ａｂ７２、［ｍＡｂ］結合部位＝１０３ｎＭ〜２５．２ｐＭ
Ａｂ１９、［ｍＡｂ］結合部位＝１００ｎＭ〜１２．２ｐＭ
プレートをプレートシェーカーに４℃で５時間置き、その後、プレートを１×ＰＢＳで４℃、３回洗浄した。次いで、２００μＬの９９ｎＭ Ｃｙ５ヤギ抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ特異ポリクローナル抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，＃１０９−１７５−００８）を各ウェルに添加し、プレートを４℃で３０分間振とうさせた。プレートを再度１×ＰＢＳで４℃、２回洗浄し、次いで、ＦＡＣＳＣａｎｔｏ（商標）ＩＩ ＨＴＳフローサイトメーターを用いて、独特のｍＡｂ結合部位濃度を含む各ウェルについて、５０００イベントの平均蛍光強度（ＭＦＩ）を記録した。抗体結合部位濃度の関数としての平均蛍光強度のプロットは、ＫＤを見積もるための下記式を用いて、Ｓｃｉｅｎｔｉｓｔ ３．０ソフトウェアで非線形フィッティングした：
Ｆ＝ｐ［（ＫＤ＋ＬＴ＋ｎ（Ｍ））−｛（ＫＤ＋ＬＴ＋ｎ（Ｍ））２−４ｎ（Ｍ）（ＬＴ）｝１／２］／２＋Ｂ
［式中、Ｆ（平均蛍光強度）、ＬＴ（トータルのｍＡｂ結合部位濃度）、ｐ（ｍＡｂに結合する任意の蛍光単位に関する比例定数）、Ｍ（細胞内モル濃度；３００μＬ中、１００，０００細胞に基づいて０．５５３ｆＭ）、ｎ（細胞当たりのレセプター数）、Ｂ（バックグラウンドシグナル）、及びＫＤ＝平衡解離定数。］。
各抗体の滴定曲線について、ＫＤの見積もりはＰとして得、ｎ、Ｂ及びＬＤは、非線形分析において自由にフロート（ｆｌｏａｔｅｄ ｆｒｅｅｌｙ）させた。上記方程式の詳細な導出については、Ｄｒａｋｅ ａｎｄ Ｋｌａｋａｍｐ（２００７），“Ａ ｒｉｇｏｒｏｕｓ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｂｉｎｄｉｎｇ ｓｉｔｅ ｍｏｄｅｌ ｆｏｒ ｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇ ｃｅｌｌ−ｂａｓｅｄ ｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ ｄｉｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｃｏｎｓｔａｎｔｓ”，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ３１８：１５７ −６２（参照により本明細書に援用される）を参照されたい。全ての抗体について得られたＫＤのものを、括弧内において各フィットの９５％信頼区間とともに親和性が減少した順に表３に列記する。抗体結合部位濃度（２×分子濃度）を非線形曲線フィッティングのために使用した。
実施例１０：Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）による親和性決定
可溶性ＣＤ３８エクトドメイン（ＥＣＤ）に対するＩｇＧ抗体の親和性は、２２℃、Ｂｉａｃｏｒｅ（商標）Ａ１００上で、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）分析により決定した。ヤギ抗ヒトＩｇＧポリクローナル抗体（Ｃａｌｔａｇ Ｈ１０５００）を、チップの４つ全てのフローセル内のスポット１、２、４及び５への標準的なアミンカップリングを用いて、ＣＭ５バイオセンサーチップに固定化した。各スポット上の固定化レベルは、５８６５ＲＵ〜６８９９ＲＵの範囲であった。ヒトＣＤ３８はＲ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ（Ｃａｔ＃２４０４−ＡＣ，Ｌｏｔ＃ＰＥＨ０２０８１２Ａ）から得た。ＣＤ３８のストック濃度は、Ｐａｃｅら（（１９９５）“Ｈｏｗ ｔｏ ｍｅａｓｕｒｅ ａｎｄ ｐｒｅｄｉｃｔ ｍｏｌａｒ ａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ａ ｐｒｏｔｅｉｎ” Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ ４（１１）：２４１１−２３ ａｎｄ Ｐａｃｅ ａｎｄ Ｇｒｉｍｓｌｅｙ（２００４）“Ｓｐｅｃｔｒｏｐｈｏｔｏｍｅｔｒｉｃ ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ”，ｉｎ Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｃｈａｐｔｅｒ ３： Ｕｎｉｔ ３．１）に詳述される方法を用いて決定した（各参考文献の教示は参照により本明細書に援用される）。
ＨＥＰＥＳ緩衝生理食塩水、０．００５％ポリソルベート２０を脱ガスし、濾過したＢＳＡを最終濃度１００μｇ／ｍＬで添加することによりランニングバッファーを調製した。８つの精製ｍＡｂ全てをランニングバッファーでおよそ２μｇ／ｍＬに希釈した。予備実験により、〜１００ＲＵと同じくらいの表面容量（Ｒｍａｘ）を維持するために捕捉されるべき捕捉されるべき各ｍＡｂの量を見積もった。各ｍＡｂ捕捉／抗原注入サイクルについて、ｍＡｂは、それぞれのリファレンス表面として働くスポット２と４に近接する、各フローセル内のスポット１及び５で捕捉された。各希釈ｍＡｂは、１０μＬ／分の流速で１分間捕捉され、その後、表面を安定化するため、ランニングバッファーを３分間流した。ＨｕＣＤ３８は、全ての４つのフローセルに１２０秒間、３０μＬ／分、１９３．７ｎＭ〜３．０ｎＭ（２×段階希釈）の濃度範囲にわたって注入し、その後、１５分間解離段階とした。サンプルは全てランニングバッファー中で調製し、二重参照（ｄｏｕｂｌｅ ｒｅｆｅｒｅｎｃｉｎｇ）のために散在（ｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄ）された７つのバッファー注入物を用いてランダムに３連で注入した。１０ｍＭのグリシン（ｐＨ１．７）での２０秒間のパルスを２回行い、表面を再生した。
全てのセンサーグラムデータをＳｃｒｕｂｂｅｒ ２．０ｃソフトウェアで処理し、Ｓｃｒｕｂｂｅｒ ２．０ｃの１：１相互作用モデルにグローバリーにフィッティングさせた。得られた結合定数を表２に示す。
実施例１１：免疫蛍光内在化アッセイ
免疫蛍光技術を用いて、抗ＣＤ３８抗体のＭＯＬＰ−８細胞への内在化を評価した。ＭＯＬＰ−８細胞を集め、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８に直接結合させた各抗ＣＤ３８抗体１μｇを用いて、ＲＰＭＩ−１６４０中、５×１０６細胞を４℃、１０分間染色した。１％ＢＳＡ含有ＰＢＳで細胞を洗浄し、１×１０６細胞を４℃又は３７℃で３時間又は６時間インキュベートした。２μｇのウサギ抗Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、４℃、３０分間、表面染色をクエンチした。細胞を洗浄し、１％ＰＦＡを含むＰＢＳで固定し、Ｍｉｃｒｏｔｅｓｔ ９６ウェルプレート（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）に移し、ＦＡＣＳＣａｎｔｏ（商標）ＩＩ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）フローサイトメーターを用いたフローサイトメトリーにより評価するか、ＩｍａｇｅＸｐｒｅｓｓ（登録商標）Ｍｉｃｒｏ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ）を２０倍の倍率で用いて画像化するかのいずれか行った。
実施例１２：Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）によるエピトープビニング
Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）Ａ１００機器を用いて、２つのベンチマーク抗体とＡｂ１９及びＡｂ７９をビニングした。最初に、ＮＨＳ／ＥＤＣカップリング化学を用いて、ＣＭ５チップ上に高密度及び低密度で抗体を固定化した。エピトープビニング実験の各サイクルについて、ＣＤ３８をこれらの表面上に最初に注入した。次いで、ＥＬＩＳＡフォーマットにおけるサンドイッチアッセイと類似して、独特の抗体（固定化抗体のセットから得られたもの）をＣＤ３８／抗体複合体を含む表面上に注入した。各サイクルの最後にリン酸パルスを用いて表面を再生した。ＢＳＡ添加ＨＢＳ−Ｐ（１０ ｍＭ １０ ＨＥＰＥＳ ｐＨ ７．４、１５０ ｍＭ ＮａＣＩ、０．００５％）Ｐ−２０を用いて、２２℃でデータを集めた。得られたセンサーグラムをＢｉａｃｏｒｅ（登録商標） Ａ１００ Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎソフトウェアパッケージの「Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ」モジュールとＳｃｒｕｂｂｅｒ ｆｏｒ Ａ１００データセットのトライアルバージョンを用いて処理した。再現データを使用して、表３に示すとおり、２つの別々の実験から上記４つのｍＡｂに対する二元４×４マトリックスを作製した。
実施例１３：腫瘍学におけるｉｎ ｖｉｖｏ分析
ヒトリンパ腫の播種性Ｄａｕｄｉ−ルシフェラーゼモデルについて、Ａｂ１９及びＡｂ７９のｉｎ ｖｉｖｏ有効性を試験した。Ｔａｃｏｎｉｃ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓから得た６〜８週齢のメスＣＢ．１７ ＳＣＩＤマウスに１×１０６個のＤａｕｄｉ−Ｌｕｃ腫瘍細胞を静脈注射した。研究７日目に、パリビズマブ、Ａｂ７９、Ａｂ１９、ベンチマーク１及びベンチマーク２をマウス腹腔内に注射した。ＩＶＩＳ Ｘｅｎｏｇｅｎ ｓｙｓｔｅｍ（Ｃａｌｉｐｅｒ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いて、２１日目から毎週、生物発光イメージングを実施し、全身腫瘍組織量をモニタリングした。イメージングのために、イメージジングの１０分前にルシフェラーゼ基質（１５０ｍｇ／ｋｇ）を動物にＩＰ注射し、次いでイソフルラン下で動物を麻酔し、イメージングした。結果を図８及び９に示す。
実施例１４：炎症性／免疫学的疾患の相関
ＣＤ３８は、活性化後のＰＢＭＣ細胞において劇的に上方制御されることが示された。正常ドナー由来の静止ＰＭＢＣでは、２０％未満の静止細胞がＣＤ３８を発現し、レセプター数は、細胞当たりおよそ１０，０００〜２０，０００と計算される。正常ドナー由来に対して、活性化ＰＭＢＣは、６０〜７５％の細胞がＣＤ３８を発現しており、レセプター数は細胞当たり１１０，０００〜１６０，０００と示された。
さらに、図５に示すように、ＳＬＥ患者由来のＰＭＢＣにおいて、ＣＤ３８の発現上昇が示された。
ＣＤ３８の過剰発現についてサンプルを免疫組織学的に試験した。ＳＬＥ患者由来の１９のサンプルを分析したところ、Ｂ及びＴメモリー細胞並びにｐＤＣにおいて、ＣＤ３８発現の上昇が観察された。３人のＲＡ患者を分析したところ、３人の患者全てにおいて、滑膜組織におけるＣＤ３８形質細胞の浸潤が示され、Ａｂ７９での滑膜組織の染色が増加した。７人のクローン病患者及び６人の潰瘍性大腸炎患者を分析したところ、結腸の平滑筋（患者由来の２つの初代細胞サンプルについて試験）において、ＣＤ３８発現形質細胞の浸潤が示された。同数の正常患者で試験した場合、これらの結果は示されなかった点に留意すべきである。
実施例１５：抗ＣＤ３８抗体を用いた枯渇
カニクイザルへＡｂ７９を投与すると、リンパ球、Ｂ及びＴ細胞並びにＮＫ細胞の有意な減少が示される。抗体を図６に示す容量で３０分間のＩＶ注射を介して投与し、２４時間でデータを集めた。同様のデータを４日目、７日目、１１日目及び１８日目でも示された（ｓｏｗｎ）。
しかしながら、ｐＫ／ｐＤデータは、投与後の動物の回復を示す。図７に示すように、リンパ球数は、単回のＩＶ３０分注入投与後（たとえ最も高用量であっても）、数日後にコントロール数と同程度まで回復し、これは、リンパ球前駆細胞の問題ではないことを示している。
実施例１６：自己免疫疾患モデル
３つの異なるモデルを使用する。
ＨｕＳｃｉｄマウスモデルを、偽移植片対宿主モデル（ｐｓｅｕｄｏ−ｇｒａｖｔ−ｖ−ｈｏｓｔモデル）、抗破傷風応答（ａｎｔｉ−ｔｅｔａｎｕｓ ｒｅｓｐｏｎｓｅ）、ＩｇＧ枯渇、及び全生存に対するモデルとした。ＣＢ１７／ＨｕＳＣＩＤマウスにＡＳＧＭ１を注入してＮＫ細胞を枯渇させ、次いで、一日後にヒトＰＢＭＣを注入した。ヒトＩｇランダム化のために集めた血清を用いて、生着（ｅｎｇｒａｆｔｍｅｎｔ）は７〜１０日間で進行することが可能であった。一日後、マウスにＡｂ７９を１０ｍｇ／ｋｇ、その後ＴＴｄを注入し、４日後に第２の投与を、その３日後に第３の投与を行い、ヒトＩｇ計測及び抗破傷風検出のために、その３日後に血清を集めた（最初の投与から計１０日）。単一のマウスドナーから得られた結果を図８に示す。図８では、処理時の全てのＩｇアイソタイプの有意な減少を示す。図９は、各レシピエントグループに対する平均Ｉｇレベルの結果を示しており、各データポイントはグループごとの平均値を表す（ｎ＝５〜ｎ＝１０）。図１０は、Ａｂ７９処理時の抗破傷風応答の有意な低下を示す。最後に、図１１は、Ａｂ７９処理を用いた場合の、全体の有意な生存率を示す。
代替マウス実験
Ａｂ７９は、げっ歯類ＣＤ３８と交差反応しないので、代替抗体（ｓｕｒｒｏｇａｔｅ ａｎｔｉｂｏｄｙ）を開発した。事前準備として、ヒトＣＤ３８に対する市販抗体及びマウスＣＤ３８に対する市販抗体を用いて、ヒト及びマウス間の細胞タイプ中でのＣＤ３８発現レベルの有意な差を示し（図１２を参照されたい）、その病気の生態が異なることを示す。従って、サルモデルにおいて、サルＣＤ３８と交差反応する抗体を用いることは、かなり有利な結果を生じ得る。
脾臓、血液及び骨髄（データ示さず）、並びに末梢血（図１３を参照されたい）から集めたＣＤ３８＋細胞の同様の枯渇を示す、代替抗体を開発した。さらに、マウス代替抗体を１０ｍｇ／ｋｇで単回投与してから１、２又は３日後に集めた脾臓、血液及び骨髄における、枯渇の反応速度を図１４に示す。血中Ｂ細胞の急速な枯渇が２４時間以内に示され、脾臓及び骨髄では、よりゆっくりとした枯渇が示された。
マウスＳＬＥモデル
血液からは、以下の中間の読み出し（ｉｎｔｅｒｉｍ ｒｅａｄｏｕｔ）（例えば、２週間ごと）を用いて、ＭＲＬ／ｌｐｒモデルにおける代替マウス抗ＣＤ３８を試験する：抗ｄｓＤＮＡ自己抗体、ＣＢＣ、ＦＡＣＳ（Ｔ／Ｂ細胞枯渇について）、尿におけるタンパク質アルブミン及び皮膚炎。最終的な読み出しとして以下が挙げられるが、これらに限定されない：血液からは、抗ｄｓＤＮＡ自己抗体、ＣＢＣ、ＦＡＣＳ（Ｔ／Ｂ細胞枯渇について）、脾臓、リンパ節及び骨髄からは、臓器重量、免疫細胞数、ＦＡＣＳ（Ｔ／Ｂ細胞枯渇について）、腎臓からは、臓器重量、組織病理（Ｈ＆Ｅ ａｎｄ ＰＡＳ）、ＩＣ沈着、炎症細胞、及び皮膚炎症（組織病理）。
コラーゲン誘導関節炎（ＣＩＡ）モデル
マウス代替抗体を用いてマウスＣＩＡモデルを使用し、７つのマウスグループにて、前予防的、予防的及び治療的有効性の両方を評価した。全てのマウスを０日目にＣＩＩ／ＣＦＡで免疫し、２１日目にＣＩＩ／ＣＦＡでブーストし、通常、２１日目から４２日目に疾患の進行が生じた（研究終了）。０日目（前予防）から開始して、グループ１（１０匹のマウス）に１週間に２回、１０ｍｇ／ｋｇの代替抗体をＩＰ注射した。グループ２（ｎ＝１０）でも同様に投与したが、２１日目から開始した。グループ３（ｎ＝１０）では、疾患発症時（２５〜２８日目）に同様に注射した。グループ４（ｎ＝１０）は、０日目に、ｈＩｇＧ１（例えば、アイソタイプ）を用いたが同一レベルで投与した。グループ５（ｎ＝１０）では、ｈＩｇＧ１を同一レベルで投与したが２１日目から開始した、グループ６（ｎ＝１０）では、２１日目に、０．５ｍｇ／Ｌのデキサメタゾン水を投与し、グループ７（ｎ＝５）は処置しなかった。
各グループについてｎ＝３を用いて、カニクイザルＣＩＡ研究を実施し、グループ１はナイーブ動物であり、ビヒクルのみである。グループ２は、Ａｂ７９を３ｍｇ／ｋｇ又は１０ｍｇ／ｋｇ、ｑ１ｗ（予防的処置はコラーゲン免疫後７日目に開始する）で単回投与する。グループ３は、治療的処置のために、疾患発症時、２１日目又は２８日目から開始して、３ｍｇ／ｋｇ又は１０ｍｇ／ｋｇ ｑ１ｗのＡｂ７９である。グループ４は、疾患発症時にも、デキサメタゾンで０．１ｍｇ／ｋｇ ｑ１ｄで処置する。
（配列表）
配列番号１（ＣＤ３８ホモ・サピエンス；ＮＰ＿００１７６６．２）
ＭＡＮＣＥＦＳＰＶＳＧＤＫＰＣＣＲＬＳＲＲＡＱＬＣＬＧＶＳＩＬＶＬＩＬＶＶＶＬＡＶＶＶＰＲＷＲＱＱＷＳＧＰＧＴＴＫＲＦＰＥＴＶＬＡＲＣＶＫＹＴＥＩＨＰＥＭＲＨＶＤＣＱＳＶＷＤＡＦＫＧＡＦＩＳＫＨＰＣＮＩＴＥＥＤＹＱＰＬＭＫＬＧＴＱＴＶＰＣＮＫＩＬＬＷＳＲＩＫＤＬＡＨＱＦＴＱＶＱＲＤＭＦＴＬＥＤＴＬＬＧＹＬＡＤＤＬＴＷＣＧＥＦＮＴＳＫＩＮＹＱＳＣＰＤＷＲＫＤＣＳＮＮＰＶＳＶＦＷＫＴＶＳＲＲＦＡＥＡＡＣＤＶＶＨＶＭＬＮＧＳＲＳＫＩＦＤＫＮＳＴＦＧＳＶＥＶＨＮＬＱＰＥＫＶＱＴＬＥＡＷＶＩＨＧＧＲＥＤＳＲＤＬＣＱＤＰＴＩＫＥＬＥＳＩＩＳＫＲＮＩＱＦＳＣＫＮＩＹＲＰＤＫＦＬＱＣＶＫＮＰＥＤＳＳＣＴＳＥＩ
配列番号２（ＣＤ３８ マカカ・ファシキュラリス（Ｍａｃａｃａ ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）；ＡＡＴ３６３３０．１）
ＭＡＮＣＥＦＳＰＶＳＧＤＫＰＣＣＲＬＳＲＲＡＱＶＣＬＧＶＣＬＬＶＬＬＩＬＶＶＶＶＡＶＶＬＰＲＷＲＱＱＷＳＧＳＧＴＴＳＲＦＰＥＴＶＬＡＲＣＶＫＹＴＥＶＨＰＥＭＲＨＶＤＣＱＳＶＷＤＡＦＫＧＡＦＩＳＫＹＰＣＮＩＴＥＥＤＹＱＰＬＶＫＬＧＴＱＴＶＰＣＮＫＴＬＬＷＳＲＩＫＤＬＡＨＱＦＴＱＶＱＲＤＭＦＴＬＥＤＭＬＬＧＹＬＡＤＤＬＴＷＣＧＥＦＮＴＦＥＩＮＹＱＳＣＰＤＷＲＫＤＣＳＮＮＰＶＳＶＦＷＫＴＶＳＲＲＦＡＥＴＡＣＧＶＶＨＶＭＬＮＧＳＲＳＫＩＦＤＫＮＳＴＦＧＳＶＥＶＨＮＬＱＰＥＫＶＱＡＬＥＡＷＶＩＨＧＧＲＥＤＳＲＤＬＣＱＤＰＴＩＫＥＬＥＳＩＩＳＫＲＮＩＲＦＦＣＫＮＩＹＲＰＤＫＦＬＱＣＶＫＮＰＥＤＳＳＣＬＳＧＩ
配列番号３（ＨＣＤＲ１ Ａｂ７９）
ＧＦＴＦＤＤＹＧ
配列番号４（ＨＣＤＲ２ Ａｂ７９）
ＩＳＷＮＧＧＫＴ
配列番号５（ＨＣＤＲ３ Ａｂ７９）
ＡＲＧＳＬＦＨＤＳＳＧＦＹＦＧＨ
配列番号６（ＬＣＤＲ１ Ａｂ７９）
ＳＳＮＩＧＤＮＹ
配列番号７（ＬＣＤＲ２ Ａｂ７９）
ＲＤＳ
配列番号８（ＬＣＤＲ３ Ａｂ７９）
ＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳ
配列番号９（重鎖Ａｂ７９）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＤＤＹＧＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＤＩＳＷＮＧＧＫＴＨＹＶＤＳＶＫＧＱＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＧＳＬＦＨＤＳＳＧＦＹＦＧＨＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡ
配列番号１０（軽鎖Ａｂ７９）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＤＮＹＶＳＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＲＤＳＱＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬ
配列番号１１（重鎖Ａｂ１９）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＮＮＹＤＭＴＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＶＩＳＹＤＧＳＤＫＤＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＶＹＹＹＧＦＳＧＰＳＭＤＶＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡ
配列番号１２（軽鎖Ａｂ１９）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＮＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＳＤＳＮＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＲＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬ
配列番号１３（ＨＣＤＲ１ Ａｂ１９）
ＧＦＴＦＮＮＹＧ
配列番号１４（ＨＣＤＲ２ Ａｂ１９）
ＩＳＹＤＧＳＤＫ
配列番号１５（ＨＣＤＲ３ Ａｂ１９）
ＡＲＶＹＹＹＧＦＳＧＰＳＭＤＶ
配列番号１６（ＬＣＤＲ１ Ａｂ１９）
ＮＳＮＩＧＳＮＴ
配列番号１７（ＬＣＤＲ２ Ａｂ１９）
ＳＤＳ
配列番号１８（ＬＣＤＲ３ Ａｂ１９）
ＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＲ
配列番号１９（重鎖Ａｂ１９）ｗ／定常（ｃｏｎｓｔａｎｔ）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＮＮＹＤＭＴＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＶＩＳＹＤＧＳＤＫＤＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＶＹＹＹＧＦＳＧＰＳＭＤＶＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号２０（軽鎖Ａｂ１９）ｗ／定常
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＮＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＳＤＳＮＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＲＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
配列番号２１（重鎖Ａｂ７９）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＤＤＹＧＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＤＩＳＷＮＧＧＫＴＨＹＶＤＳＶＫＧＱＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＧＳＬＦＨＤＳＳＧＦＹＦＧＨＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号２２（軽鎖Ａｂ７９）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＤＮＹＶＳＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＲＤＳＱＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
配列番号２３（ＣＤ１５７ホモ・サピエンス；ＮＰ＿００４３２５）
ＭＡＡＱＧＣＡＡＳＲＬＬＱＬＬＬＱＬＬＬＬＬＬＬＬＡＡＧＧＡＲＡＲＷＲＧＥＧＴＳＡＨＬＲＤＩＦＬＧＲＣＡＥＹＲＡＬＬＳＰＥＱＲＮＫＮＣＴＡＩＷＥＡＦＫＶＡＬＤＫＤＰＣＳＶＬＰＳＤＹＤＬＦＩＮＬＳＲＨＳＩＰＲＤＫＳＬＦＷＥＮＳＨＬＬＶＮＳＦＡＤＮＴＲＲＦＭＰＬＳＤＶＬＹＧＲＶＡＤＦＬＳＷＣＲＱＫＮＤＳＧＬＤＹＱＳＣＰＴＳ ＥＤＣＥＮＮＰＶＤＳＦＷＫＲＡＳＩＱＹＳＫＤＳＳＧＶＩＨＶＭＬＮＧＳＥＰＴＧＡＹＰＩＫＧＦＦＡＤＹＥＩＰＮＬＱＫＥＫＩＴＲＩＥＩＷＶＭＨＥＩＧＧＰＮＶＥＳＣＧＥＧＳＭＫＶＬＥＫＲＬＫＤＭＧＦＱＹＳＣＩＮＤＹＲＰＶＫＬＬＱＣＶＤＨＳＴＨＰＤＣＡＬＫＳＡＡＡＡＴＱＲＫＡＰＳＬＹＴＥＱＲＡＧＬＩＩＰＬＦＬＶＬＡＳＲＴＱＬ
配列番号２４（ベンチマーク１；重鎖可変領域）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＶＳＧＦＴＦＮＳＦＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＡＩＳＧＳＧＧＧＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＦＣＡＫＤＫＩＬＷＦＧＥＰＶＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
配列番号２５（ベンチマーク１；軽鎖可変領域）
ＥＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＱＳＶＳＳＹＬＡＷＹＱＱＫＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹＤＡＳＮＲＡＴＧＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＱＲＳＮＷＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ
配列番号２６（ベンチマーク２；重鎖可変領域）
ＱＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＡＫＰＧＴＳＶＫＬＳＣＫＡＳＧＹＴＦＴＤＹＷＭＱＷＶＫＱＲＰＧＱＧＬＥＷＩＧＴＩＹＰＧＤＧＤＴＧＹＡＱＫＦＱＧＫＡＴＬＴＡＤＫＳＳＫＴＶＹＭＨＬＳＳＬＡＳＥＤＳＡＶＹＹＣＡＲＧＤＹＹＧＳＮＳＬＤＹＷＧＱＧＴＳＶＴＶＳＳ
配列番号２７（ベンチマーク２；軽鎖可変領域）
ＤＩＶＭＴＱＳＨＬＳＭＳＴＳＬＧＤＰＶＳＩＴＣＫＡＳＱＤＶＳＴＶＶＡＷＹＱＱＫＰＧＱＳＰＲＲＬＩＹＳＡＳＹＲＹＩＧＶＰＤＲＦＴＧＳＧＡＧＴＤＦＴＦＴＩＳＳＶＱＡＥＤＬＡＶＹＹＣＱＱＨＹＳＰＰＹＴＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫＲ
配列番号２８（重鎖Ａｂ４３）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＧＭＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＲＩＮＳＤＧＳＳＴＳＹＡＤＳＭＫＧＱＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＧＧＹＹＹＹＡＭＤＶＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号２９（軽鎖Ａｂ４３）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＧＳＳＮＩＧＹＫＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＤＮＮＫＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＡＡＷＤＤＳＬＮＧＬＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
配列番号３０（重鎖Ａｂ７２）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＧＭＮＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＧＩＳＧＳＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＫＤＳＮＹＤＦＷＳＧＹＹＹＧＭＤＶＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号３１（軽鎖Ａｂ７２）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＳＫＴＶＳＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＤＮＮＫＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＳＳＹＡＡＲＳＴＮＩＩＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
配列番号３２（重鎖Ａｂ１１０）
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＧＭＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＩＩＹＳＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＡＴＷＧＧＡＴＨＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号３３（軽鎖Ａｂ１１０）
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＲＮＮＱＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＡＴＷＤＤＳＬＮＧＶＬＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
配列番号３４（重鎖Ａｂ１９）ｗ／定常
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＮＮＹＤＭＴＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＶＩＳＹＤＧＳＤＫＤＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＶＹＹＹＧＦＳＧＰＳＭＤＶＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ
配列番号３５（軽鎖Ａｂ１９）ｗ／定常
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＮＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＹＳＤＳＮＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＴＳＡＳＬＡＩＳＧＬＲＳＥＤＥＡＤＹＹＣＱＳＹＤＳＳＬＳＧＳＲＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＮＰＴＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＧＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＫＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ
本発明の実施態様を明確にするために、詳細に参照により本発明を説明するが、添付の特許請求の範囲に定義される発明の範囲から逸脱することなく、改作及び改変が可能であることは明らかである。より詳細には、特に有利な例として、本明細書において本発明のいくつかの側面を特定するが、本発明は、これらの特定の本発明の側面により限定される必要はないことが企図される。

Claims (20)

  1. ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的に結合する単離された抗体であって、
    ａ）以下を含む重鎖可変領域：
    ｉ）配列番号３を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号４を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号５を含む第３のＣＤＲ；及び
    ｂ）以下を含む軽鎖可変領域：
    ｉ）配列番号６を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号７を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号８を含む第３のＣＤＲ；
    を含む、抗体。
  2. 前記重鎖可変領域が配列番号９を含む、請求項１記載の単離された抗体。
  3. 前記軽鎖可変領域が配列番号１０を含む、請求項１記載の単離された抗体。
  4. 前記重鎖可変領域が配列番号９を含み、前記軽鎖可変領域が配列番号１０を含む、請求項１記載の単離された抗体。
  5. 重鎖が配列番号２１を含み、軽鎖が配列番号２２を含む、請求項１記載の単離された抗体。
  6. ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的に結合する単離された抗体であって、
    ａ）以下を含む重鎖可変領域：
    ｉ）配列番号１３を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号１４を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号１５を含む第３のＣＤＲ；及び
    ｂ）以下を含む軽鎖可変領域：
    ｉ）配列番号１６を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号１７を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号１８を含む第３のＣＤＲ；
    を含む、抗体。
  7. 前記重鎖可変領域が配列番号１１を含む、請求項６記載の単離された抗体。
  8. 前記軽鎖可変領域が配列番号１２を含む、請求項６記載の単離された抗体。
  9. 前記重鎖可変領域が配列番号１９を含み、前記軽鎖可変領域が配列番号２０を含む、請求項６記載の単離された抗体。
  10. 重鎖が配列番号３４を含み、軽鎖が配列番号３５を含む、請求項６記載の単離された抗体。
  11. さらにＦｃドメインを含む、請求項１又は６記載の単離された抗体。
  12. 前記Ｆｃドメインがヒトである、請求項１１記載の単離された抗体。
  13. 前記Ｆｃドメインが変異Ｆｃドメインである、請求項７記載の単離された抗体。
  14. 請求項２又は７記載の重鎖をコードする、単離された核酸。
  15. 請求項３又は８記載の軽鎖をコードする、単離された核酸。
  16. 請求項１４又は１５記載の単離された核酸を含む、宿主細胞。
  17. 請求項１又は６記載の抗体の製造方法であって、前記抗体が製造される条件下で請求項１６記載の宿主細胞を培養する工程を含む、方法。
  18. ヒトＣＤ３８タンパク質（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）の生物活性を阻害する方法であって、配列番号１及び配列番号２の少なくともＫ１２１、Ｆ１３５、Ｑ１３９、Ｄ１４１、Ｅ２３９、Ｗ２４１、Ｃ２７５、Ｋ２７６、Ｆ２８４、Ｐ２９１及びＥ２９２と相互作用する抗体と前記タンパク質を接触させることによる、方法。
  19. ヒトＣＤ３８（配列番号１）及びカニクイザルＣＤ３８（配列番号２）に特異的に結合する単離された抗体であって、
    ａ）以下を含む重鎖可変領域：
    ｉ）配列番号３を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号４を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号５を含む第３のＣＤＲ；及び
    ｂ）以下を含む軽鎖可変領域：
    ｉ）配列番号６を含む第１のＣＤＲ；
    ｉｉ）配列番号７を含む第２のＣＤＲ；
    ｉｉｉ）配列番号８を含む第３のＣＤＲ；
    を含む抗体を、それを必要とする患者に投与することを含む、自己免疫疾患の治療方法。
  20. 前記自己免疫疾患が、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患、潰瘍性大腸炎及び移植片対宿主病からなる群から選択される、請求項１９記載の方法。
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