HU221001B1 - Egyláncú anti-EGFR Fv-k és anti-EGFR ellenanyagok - Google Patents
Egyláncú anti-EGFR Fv-k és anti-EGFR ellenanyagok Download PDFInfo
- Publication number
- HU221001B1 HU221001B1 HU9503285A HU9503285A HU221001B1 HU 221001 B1 HU221001 B1 HU 221001B1 HU 9503285 A HU9503285 A HU 9503285A HU 9503285 A HU9503285 A HU 9503285A HU 221001 B1 HU221001 B1 HU 221001B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- antibody
- ser
- cells
- egfr
- gly
- Prior art date
Links
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 130
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 109
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 98
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 72
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims description 72
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 53
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 46
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 38
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 claims description 32
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 claims description 31
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 claims description 31
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 claims description 20
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 19
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 16
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 11
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 10
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 claims description 10
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 claims description 10
- 238000010367 cloning Methods 0.000 claims description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 8
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 8
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 7
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 7
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 7
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 7
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 6
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 claims description 5
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 claims description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 3
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000004807 localization Effects 0.000 claims description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 6
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 3
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 claims 2
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 claims 1
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 claims 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 claims 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 64
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 60
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 50
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 42
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 41
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 41
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 41
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 38
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 30
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 30
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 30
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 30
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 29
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 29
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 28
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 28
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 25
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 25
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 22
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 22
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 22
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 22
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 21
- 108010001064 glycyl-glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 21
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 20
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 20
- ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N 0.000 description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 18
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 18
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 18
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 18
- AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N Arg-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 17
- PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N Lys-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 17
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 17
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 17
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 16
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 16
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 15
- OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Tyr Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 15
- 108010081404 acein-2 Proteins 0.000 description 15
- 239000004753 textile Substances 0.000 description 15
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 14
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 14
- WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N Ser-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 14
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 14
- SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N Ser-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 13
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N Thr-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N 0.000 description 13
- ANHVRCNNGJMJNG-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O ANHVRCNNGJMJNG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 13
- 230000004044 response Effects 0.000 description 13
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 13
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 12
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 12
- VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N Thr-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 12
- YOPQYBJJNSIQGZ-JNPHEJMOSA-N Thr-Tyr-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 YOPQYBJJNSIQGZ-JNPHEJMOSA-N 0.000 description 12
- ARKBYVBCEOWRNR-UBHSHLNASA-N Trp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ARKBYVBCEOWRNR-UBHSHLNASA-N 0.000 description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 12
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 11
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 11
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 11
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 11
- QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 11
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 11
- STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N Thr-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 11
- TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N Tyr-Asp-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 11
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 11
- LPXHYGGZJOCAFR-MNXVOIDGSA-N Ile-Glu-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N LPXHYGGZJOCAFR-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 10
- WRODMZBHNNPRLN-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WRODMZBHNNPRLN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 10
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 10
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 10
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 10
- JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N Tyr-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 10
- 238000011161 development Methods 0.000 description 10
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 10
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 10
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 9
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 9
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 9
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 9
- VVKVHAOOUGNDPJ-SRVKXCTJSA-N Ser-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VVKVHAOOUGNDPJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 9
- MMTOHPRBJKEZHT-BWBBJGPYSA-N Thr-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MMTOHPRBJKEZHT-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 9
- LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 9
- FQPDRTDDEZXCEC-SVSWQMSJSA-N Thr-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FQPDRTDDEZXCEC-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 9
- BIBYEFRASCNLAA-CDMKHQONSA-N Thr-Phe-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 BIBYEFRASCNLAA-CDMKHQONSA-N 0.000 description 9
- NUQZCPSZHGIYTA-HKUYNNGSSA-N Tyr-Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N NUQZCPSZHGIYTA-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 9
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 9
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 9
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 9
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 9
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 9
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 9
- DLQPMEMYCIGJIM-UHFFFAOYSA-N Adjuvant peptide Natural products CC(NC(=O)CCOC1C(O)C(CO)OC(O)C1NC(=O)C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)N DLQPMEMYCIGJIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 8
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 8
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 8
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 8
- HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N Leu-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 8
- CUMXHKAOHNWRFQ-BZSNNMDCSA-N Phe-Asp-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 CUMXHKAOHNWRFQ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 8
- RHAPJNVNWDBFQI-BQBZGAKWSA-N Ser-Pro-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O RHAPJNVNWDBFQI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 8
- RZAGEHHVNYESNR-RNXOBYDBSA-N Tyr-Trp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O RZAGEHHVNYESNR-RNXOBYDBSA-N 0.000 description 8
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- BSOQXXWZTUDTEL-QAQREVAFSA-N muramyl dipeptide Chemical compound OC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](C)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)OC(O)[C@@H]1NC(C)=O BSOQXXWZTUDTEL-QAQREVAFSA-N 0.000 description 8
- BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M sodium;(6r,7r)-3-[[[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonylamino]methyl]-8-oxo-7-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate Chemical compound [Na+].N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)CNS(=O)(=O)C1=C2C=CC=C(C2=CC=C1)N(C)C)C([O-])=O)C(=O)CC1=CC=CS1 BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M 0.000 description 8
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JRCUFCXYZLPSDZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 7
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 7
- UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 7
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 7
- ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 7
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 7
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 7
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 7
- CUXJENOFJXOSOZ-BIIVOSGPSA-N Ser-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O CUXJENOFJXOSOZ-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 7
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 7
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 7
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 7
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 7
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 7
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 7
- JEXPNDORFYHJTM-IHRRRGAJSA-N Arg-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JEXPNDORFYHJTM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 6
- KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N Asp-Ile-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)CN)O XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N 0.000 description 6
- LHRXAHLCRMQBGJ-RYUDHWBXSA-N Gly-Glu-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CN LHRXAHLCRMQBGJ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 6
- YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 6
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 6
- 102100022337 Integrin alpha-V Human genes 0.000 description 6
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 6
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 6
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 6
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 6
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 6
- FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N Ser-Cys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 6
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 6
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- JVTHIXKSVYEWNI-JRQIVUDYSA-N Thr-Asn-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O JVTHIXKSVYEWNI-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 6
- AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 6
- MQGGXGKQSVEQHR-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MQGGXGKQSVEQHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 6
- 108010048673 Vitronectin Receptors Proteins 0.000 description 6
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 6
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 6
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 6
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 6
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 6
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 6
- HGKHPCFTRQDHCU-IUCAKERBSA-N Arg-Pro-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O HGKHPCFTRQDHCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N Asn-Gly-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 5
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 5
- JVZLZVJTIXVIHK-SXNHZJKMSA-N Glu-Trp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N JVZLZVJTIXVIHK-SXNHZJKMSA-N 0.000 description 5
- DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N Gly-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 5
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 5
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000012981 Hank's balanced salt solution Substances 0.000 description 5
- NXRNRBOKDBIVKQ-CXTHYWKRSA-N Ile-Tyr-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O)N NXRNRBOKDBIVKQ-CXTHYWKRSA-N 0.000 description 5
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 5
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N Leu-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 5
- AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N Lys-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N Lys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 5
- WGXOKDLDIWSOCV-MELADBBJSA-N Phe-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O WGXOKDLDIWSOCV-MELADBBJSA-N 0.000 description 5
- VYWNORHENYEQDW-YUMQZZPRSA-N Pro-Gly-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 VYWNORHENYEQDW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 5
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 5
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- SPVHQURZJCUDQC-VOAKCMCISA-N Thr-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SPVHQURZJCUDQC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 5
- PITVQFJBUFDJDD-XEGUGMAKSA-N Trp-Ile Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 PITVQFJBUFDJDD-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 5
- TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N Trp-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 5
- VXFXIBCCVLJCJT-JYJNAYRXSA-N Tyr-Pro-Pro Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VXFXIBCCVLJCJT-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 5
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 5
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 5
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 5
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 5
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- 101710117290 Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 description 4
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CPYHLXSGDBDULY-IHPCNDPISA-N Asn-Trp-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O CPYHLXSGDBDULY-IHPCNDPISA-N 0.000 description 4
- YNCHFVRXEQFPBY-BQBZGAKWSA-N Asp-Gly-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YNCHFVRXEQFPBY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 4
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 4
- 102400001368 Epidermal growth factor Human genes 0.000 description 4
- 101800003838 Epidermal growth factor Proteins 0.000 description 4
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 4
- RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N Glu-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N Gly-Glu-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N 0.000 description 4
- XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 4
- JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 4
- OMDWJWGZGMCQND-CFMVVWHZSA-N Ile-Tyr-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N OMDWJWGZGMCQND-CFMVVWHZSA-N 0.000 description 4
- 102000009786 Immunoglobulin Constant Regions Human genes 0.000 description 4
- 108010009817 Immunoglobulin Constant Regions Proteins 0.000 description 4
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 4
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 4
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 4
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 4
- PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 4
- FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N Ser-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 4
- OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N Ser-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 4
- UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N 0.000 description 4
- LMKKMCGTDANZTR-BZSNNMDCSA-N Tyr-Phe-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 LMKKMCGTDANZTR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N Tyr-Thr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 4
- BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N Tyr-Trp Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C([O-])=O)C1=CC=C(O)C=C1 BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 4
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 4
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 4
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 description 4
- -1 ethyl oleate Chemical class 0.000 description 4
- 108010079413 glycyl-prolyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 4
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 4
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 4
- HKZAAJSTFUZYTO-LURJTMIESA-N (2s)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HKZAAJSTFUZYTO-LURJTMIESA-N 0.000 description 3
- OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- LFWOQHSQNCKXRU-UFYCRDLUSA-N Arg-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 LFWOQHSQNCKXRU-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 3
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 3
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 3
- XTZDZAXYPDISRR-MNXVOIDGSA-N Glu-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N XTZDZAXYPDISRR-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 3
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 3
- NPROWIBAWYMPAZ-GUDRVLHUSA-N Ile-Asp-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N NPROWIBAWYMPAZ-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 3
- OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N Leu-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- NRFGTHFONZYFNY-MGHWNKPDSA-N Leu-Ile-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NRFGTHFONZYFNY-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 3
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N Phe-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N 0.000 description 3
- BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N Phe-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- 102000015795 Platelet Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108010010336 Platelet Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- HFNPOYOKIPGAEI-SRVKXCTJSA-N Pro-Leu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HFNPOYOKIPGAEI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N Thr-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 3
- 240000002657 Thymus vulgaris Species 0.000 description 3
- 235000007303 Thymus vulgaris Nutrition 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GLNADSQYFUSGOU-GPTZEZBUSA-J Trypan blue Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[Na+].C1=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C=C(S([O-])(=O)=O)C(/N=N/C3=CC=C(C=C3C)C=3C=C(C(=CC=3)\N=N\C=3C(=CC4=CC(=CC(N)=C4C=3O)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)C)=C(O)C2=C1N GLNADSQYFUSGOU-GPTZEZBUSA-J 0.000 description 3
- PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N Tyr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- UPODKYBYUBTWSV-BZSNNMDCSA-N Tyr-Phe-Cys Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 UPODKYBYUBTWSV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 3
- BIWVVOHTKDLRMP-ULQDDVLXSA-N Tyr-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BIWVVOHTKDLRMP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 3
- FCIROHDMPFOSFG-LAVSNGQLSA-N disialyllacto-N-tetraose Chemical compound O1[C@@H]([C@H](O)[C@H](O)CO)[C@H](NC(=O)C)[C@@H](O)C[C@@]1(C(O)=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@]3(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C3)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@@H](NC(C)=O)[C@H](O[C@@H]2[C@H]([C@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)C(O)O[C@@H]3CO)O)O[C@H](CO)[C@@H]2O)O)O1 FCIROHDMPFOSFG-LAVSNGQLSA-N 0.000 description 3
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 3
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 3
- 210000003127 knee Anatomy 0.000 description 3
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 3
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 3
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 3
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 3
- 238000004091 panning Methods 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 3
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 3
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 3
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000007447 staining method Methods 0.000 description 3
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 3
- 238000003211 trypan blue cell staining Methods 0.000 description 3
- QMOQBVOBWVNSNO-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-azaniumylacetyl)amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetate Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O QMOQBVOBWVNSNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N Arg-Thr-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- ZUVDFJXRAICIAJ-BPUTZDHNSA-N Arg-Trp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 ZUVDFJXRAICIAJ-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PPCORQFLAZWUNO-QWRGUYRKSA-N Asn-Phe-Gly Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N PPCORQFLAZWUNO-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- RTFXPCYMDYBZNQ-SRVKXCTJSA-N Asn-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RTFXPCYMDYBZNQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- HTSSXFASOUSJQG-IHPCNDPISA-N Asp-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O HTSSXFASOUSJQG-IHPCNDPISA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 101100298998 Caenorhabditis elegans pbs-3 gene Proteins 0.000 description 2
- WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- RJPKQCFHEPPTGL-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RJPKQCFHEPPTGL-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 2
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 2
- NKLRYVLERDYDBI-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NKLRYVLERDYDBI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- YKBUCXNNBYZYAY-MNXVOIDGSA-N Glu-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O YKBUCXNNBYZYAY-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N Glu-Lys-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N Gly-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 2
- HAXARWKYFIIHKD-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ile-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAXARWKYFIIHKD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- NTBOEZICHOSJEE-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NTBOEZICHOSJEE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- NVTPVQLIZCOJFK-FOHZUACHSA-N Gly-Thr-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NVTPVQLIZCOJFK-FOHZUACHSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 101000851181 Homo sapiens Epidermal growth factor receptor Proteins 0.000 description 2
- UKTUOMWSJPXODT-GUDRVLHUSA-N Ile-Asn-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N UKTUOMWSJPXODT-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 2
- FBGXMKUWQFPHFB-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Cys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N FBGXMKUWQFPHFB-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 2
- PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N Ile-Tyr-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)NCC(=O)O)N PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 2
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 2
- QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N KIZIOFNVSOSKJI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LJBVRCDPWOJOEK-PPCPHDFISA-N Leu-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LJBVRCDPWOJOEK-PPCPHDFISA-N 0.000 description 2
- GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N Lys-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- KNPVDQMEHSCAGX-UWVGGRQHSA-N Phe-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 KNPVDQMEHSCAGX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N Phe-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N 0.000 description 2
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- VCYJKOLZYPYGJV-AVGNSLFASA-N Pro-Arg-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VCYJKOLZYPYGJV-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- WVXQQUWOKUZIEG-VEVYYDQMSA-N Pro-Thr-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WVXQQUWOKUZIEG-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- UEKYKRQIAQHOOZ-KBPBESRZSA-N Pro-Trp Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)[O-])C(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 UEKYKRQIAQHOOZ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- VPBQDHMASPJHGY-JYJNAYRXSA-N Pro-Trp-Ser Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O VPBQDHMASPJHGY-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N Ser-Asn-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N Ser-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- KMWFXJCGRXBQAC-CIUDSAMLSA-N Ser-Cys-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CO)N KMWFXJCGRXBQAC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N Ser-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N Ser-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- ABWNZPOIUJMNKT-IXOXFDKPSA-N Thr-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ABWNZPOIUJMNKT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N Thr-Pro-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NDXSOKGYKCGYKT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N Thr-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 2
- XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N Thr-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 2
- BVZABQIRMYTKCF-JSGCOSHPSA-N Trp-Met Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O)=CNC2=C1 BVZABQIRMYTKCF-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N Tyr-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N Tyr-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 2
- WJKJJGXZRHDNTN-UWVGGRQHSA-N Tyr-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 WJKJJGXZRHDNTN-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 2
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 2
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N Valyl-Serine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 238000013357 binding ELISA Methods 0.000 description 2
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 201000008274 breast adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 201000010897 colon adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 2
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 150000002270 gangliosides Chemical class 0.000 description 2
- 108010021083 hen egg lysozyme Proteins 0.000 description 2
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 2
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010057952 lysyl-phenylalanyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 2
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 2
- XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M propidium iodide Chemical compound [I-].[I-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CCC[N+](C)(CC)CC)=C1C1=CC=CC=C1 XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 2
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N (2s)-2-amino-3-phenylpropanoic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N 0.000 description 1
- FJQZXCPWAGYPSD-UHFFFAOYSA-N 1,3,4,6-tetrachloro-3a,6a-diphenylimidazo[4,5-d]imidazole-2,5-dione Chemical compound ClN1C(=O)N(Cl)C2(C=3C=CC=CC=3)N(Cl)C(=O)N(Cl)C12C1=CC=CC=C1 FJQZXCPWAGYPSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GHCZTIFQWKKGSB-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid;phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O.OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O GHCZTIFQWKKGSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N Ala-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N Arg-Asp Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VRZDJJWOFXMFRO-ZFWWWQNUSA-N Arg-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O VRZDJJWOFXMFRO-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- AMIQZQAAYGYKOP-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AMIQZQAAYGYKOP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N Arg-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SYFHFLGAROUHNT-VEVYYDQMSA-N Arg-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SYFHFLGAROUHNT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N Asn-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N Asn-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OROMFUQQTSWUTI-IHRRRGAJSA-N Asn-Phe-Arg Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N OROMFUQQTSWUTI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JBDLMLZNDRLDIX-HJGDQZAQSA-N Asn-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JBDLMLZNDRLDIX-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- LGCVSPFCFXWUEY-IHPCNDPISA-N Asn-Trp-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LGCVSPFCFXWUEY-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- VGRHZPNRCLAHQA-IMJSIDKUSA-N Asp-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O VGRHZPNRCLAHQA-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- HOQGTAIGQSDCHR-SRVKXCTJSA-N Asp-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O HOQGTAIGQSDCHR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N Asp-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FAUPLTGRUBTXNU-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FAUPLTGRUBTXNU-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XYPJXLLXNSAWHZ-SRVKXCTJSA-N Asp-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O XYPJXLLXNSAWHZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N Asp-Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101150023103 CHI gene Proteins 0.000 description 1
- 101100285688 Caenorhabditis elegans hrg-7 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100028791 Caenorhabditis elegans pbs-5 gene Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 102000004381 Complement C2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000955 Complement C2 Proteins 0.000 description 1
- 102220587546 Cysteinyl leukotriene receptor 1_S42D_mutation Human genes 0.000 description 1
- 102100030497 Cytochrome c Human genes 0.000 description 1
- 108010052832 Cytochromes Proteins 0.000 description 1
- 102000018832 Cytochromes Human genes 0.000 description 1
- 108010075031 Cytochromes c Proteins 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N D-lysine Chemical compound NCCCC[C@@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N Elaidinsaeure-aethylester Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 1
- JPHYJQHPILOKHC-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O JPHYJQHPILOKHC-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- SBCYJMOOHUDWDA-NUMRIWBASA-N Glu-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SBCYJMOOHUDWDA-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- GJBUAAAIZSRCDC-GVXVVHGQSA-N Glu-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GJBUAAAIZSRCDC-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- ZYRXTRTUCAVNBQ-GVXVVHGQSA-N Glu-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N ZYRXTRTUCAVNBQ-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBOAPAXLTUSMQI-JHEQGTHGSA-N Gly-Glu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MBOAPAXLTUSMQI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- HKSNHPVETYYJBK-LAEOZQHASA-N Gly-Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN HKSNHPVETYYJBK-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- IBYOLNARKHMLBG-WHOFXGATSA-N Gly-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IBYOLNARKHMLBG-WHOFXGATSA-N 0.000 description 1
- GGAPHLIUUTVYMX-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)C[NH3+])CC1=CC=CC=C1 GGAPHLIUUTVYMX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- JJGBXTYGTKWGAT-YUMQZZPRSA-N Gly-Pro-Glu Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JJGBXTYGTKWGAT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N Gly-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBTYOQIYBULKEH-ZFWWWQNUSA-N His-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CNC=N1 FBTYOQIYBULKEH-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- 101000690301 Homo sapiens Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 description 1
- 101001116548 Homo sapiens Protein CBFA2T1 Proteins 0.000 description 1
- QYZYJFXHXYUZMZ-UGYAYLCHSA-N Ile-Asn-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N QYZYJFXHXYUZMZ-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 1
- SPQWWEZBHXHUJN-KBIXCLLPSA-N Ile-Glu-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SPQWWEZBHXHUJN-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N Ile-Leu-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- PXKACEXYLPBMAD-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PXKACEXYLPBMAD-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 1
- HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N Ile-Tyr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N L-Prolyl-L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HFBCHNRFRYLZNV-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HFBCHNRFRYLZNV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N Leu-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- YNNPKXBBRZVIRX-IHRRRGAJSA-N Lys-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YNNPKXBBRZVIRX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N Lys-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- SKRGVGLIRUGANF-AVGNSLFASA-N Lys-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SKRGVGLIRUGANF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- RVKIPWVMZANZLI-ZFWWWQNUSA-N Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- USPJSTBDIGJPFK-PMVMPFDFSA-N Lys-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O USPJSTBDIGJPFK-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JHVNNUIQXOGAHI-KJEVXHAQSA-N Met-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O JHVNNUIQXOGAHI-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- 101000930477 Mus musculus Albumin Proteins 0.000 description 1
- WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N N-L-arginyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCCN=C(N)N WYBVBIHNJWOLCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- 108010038988 Peptide Hormones Proteins 0.000 description 1
- 102000015731 Peptide Hormones Human genes 0.000 description 1
- BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N Phe-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- FGXIJNMDRCZVDE-KKUMJFAQSA-N Phe-Cys-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N FGXIJNMDRCZVDE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N Phe-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N Phe-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- UNBFGVQVQGXXCK-KKUMJFAQSA-N Phe-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UNBFGVQVQGXXCK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- ZSKJPKFTPQCPIH-RCWTZXSCSA-N Pro-Arg-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZSKJPKFTPQCPIH-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XQSREVQDGCPFRJ-STQMWFEESA-N Pro-Gly-Phe Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XQSREVQDGCPFRJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N Pro-Ser-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OWQXAJQZLWHPBH-FXQIFTODSA-N Pro-Ser-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O OWQXAJQZLWHPBH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GMJDSFYVTAMIBF-FXQIFTODSA-N Pro-Ser-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GMJDSFYVTAMIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N Pro-Thr-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- QFBNNYNWKYKVJO-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CCCN=C(N)N QFBNNYNWKYKVJO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asn-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BLPYXIXXCFVIIF-FXQIFTODSA-N Ser-Cys-Arg Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CO)N)CN=C(N)N BLPYXIXXCFVIIF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GZBKRJVCRMZAST-XKBZYTNZSA-N Ser-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZBKRJVCRMZAST-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- KDGARKCAKHBEDB-NKWVEPMBSA-N Ser-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O KDGARKCAKHBEDB-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- MQQBBLVOUUJKLH-HJPIBITLSA-N Ser-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O MQQBBLVOUUJKLH-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AZWNCEBQZXELEZ-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AZWNCEBQZXELEZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BIWBTRRBHIEVAH-IHPCNDPISA-N Ser-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O BIWBTRRBHIEVAH-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 101710147732 Small envelope protein Proteins 0.000 description 1
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N Thr-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- UYTYTDMCDBPDSC-URLPEUOOSA-N Thr-Ile-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N UYTYTDMCDBPDSC-URLPEUOOSA-N 0.000 description 1
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- IVDFVBVIVLJJHR-LKXGYXEUSA-N Thr-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IVDFVBVIVLJJHR-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N Thr-Ser-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N)O XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N Thr-Ser-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- SJPDTIQHLBQPFO-VLCNGCBASA-N Thr-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O SJPDTIQHLBQPFO-VLCNGCBASA-N 0.000 description 1
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- 102100023935 Transmembrane glycoprotein NMB Human genes 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- KIMOCKLJBXHFIN-YLVFBTJISA-N Trp-Ile-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 KIMOCKLJBXHFIN-YLVFBTJISA-N 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 108010040002 Tumor Suppressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000001742 Tumor Suppressor Proteins Human genes 0.000 description 1
- JWHOIHCOHMZSAR-QWRGUYRKSA-N Tyr-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 JWHOIHCOHMZSAR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- YMUQBRQQCPQEQN-CXTHYWKRSA-N Tyr-Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N YMUQBRQQCPQEQN-CXTHYWKRSA-N 0.000 description 1
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- XJPXTYLVMUZGNW-IHRRRGAJSA-N Tyr-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XJPXTYLVMUZGNW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QHONGSVIVOFKAC-ULQDDVLXSA-N Tyr-Pro-His Chemical compound N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O QHONGSVIVOFKAC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- AXQLFFDZXPOFPO-UHFFFAOYSA-N UNPD216 Natural products O1C(CO)C(O)C(OC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)C(NC(=O)C)C1OC(C1O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)OC1CO AXQLFFDZXPOFPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N Val-Ser-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- HWNYVQMOLCYHEA-IHRRRGAJSA-N Val-Ser-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N HWNYVQMOLCYHEA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 108010086434 alanyl-seryl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000002096 anti-tetanic effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 1
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 238000000211 autoradiogram Methods 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-UHFFFAOYSA-N azane;3-ethyl-2-[(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C1=NN=C1SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- AXQLFFDZXPOFPO-UNTPKZLMSA-N beta-D-Galp-(1->3)-beta-D-GlcpNAc-(1->3)-beta-D-Galp-(1->4)-beta-D-Glcp Chemical compound O([C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]([C@H]1O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H](O)[C@@H](CO)O1)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)C)[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]1CO AXQLFFDZXPOFPO-UNTPKZLMSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 201000008275 breast carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- BPKIGYQJPYCAOW-FFJTTWKXSA-I calcium;potassium;disodium;(2s)-2-hydroxypropanoate;dichloride;dihydroxide;hydrate Chemical compound O.[OH-].[OH-].[Na+].[Na+].[Cl-].[Cl-].[K+].[Ca+2].C[C@H](O)C([O-])=O BPKIGYQJPYCAOW-FFJTTWKXSA-I 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical group BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000001079 digestive effect Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 210000001339 epidermal cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N ethyl oleate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N 0.000 description 1
- 229940093471 ethyl oleate Drugs 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 238000012921 fluorescence analysis Methods 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 1
- 125000002421 ganglioside group Chemical group 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 238000005469 granulation Methods 0.000 description 1
- 230000003179 granulation Effects 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 102000045108 human EGFR Human genes 0.000 description 1
- 102000054751 human RUNX1T1 Human genes 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 238000009399 inbreeding Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- USIPEGYTBGEPJN-UHFFFAOYSA-N lacto-N-tetraose Natural products O1C(CO)C(O)C(OC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)C(NC(=O)C)C1OC1C(O)C(CO)OC(OC(C(O)CO)C(O)C(O)C=O)C1O USIPEGYTBGEPJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DVCSNHXRZUVYAM-BQBZGAKWSA-N leu-asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O DVCSNHXRZUVYAM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 238000012917 library technology Methods 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N methanone Chemical compound O=[14CH2] WSFSSNUMVMOOMR-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 239000012457 nonaqueous media Substances 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 235000008390 olive oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000004006 olive oil Substances 0.000 description 1
- 150000002895 organic esters Chemical class 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 239000000813 peptide hormone Substances 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 229940043517 specific immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 108091007466 transmembrane glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 230000000381 tumorigenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 210000003905 vulva Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2863—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for growth factors, growth regulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
Description
A találmány tárgyát anti-EGFR ellenanyagok és ellenanyagfragmensek, előnyösen egyláncú „Fv”-k (scFv-k) képezik, melyek immunizált emlős, előnyösen egér sejtjeiből előállított fágalapú ellenanyag-génkönyvtárakból nyerhetők. A fágalapú ellenanyag-génkönyvtárakból izolált ellenanyagfragmenseket a találmány szerinti géntechnológiai eljárásokkal úgy módosíthatjuk, hogy részlegesen humanizált teljes ellenanyag-molekulákat kapjunk. A találmány szerinti a kiméra anti-EGFR ellenanyagok humánimmunglobulin konstans régiókat tartalmaznak, és - csakúgy mint találmány szerinti fragmenseik - alkalmasak humántumorok diagnosztizálására és kezelésére.
A találmány szerinti megoldás világossá teszi továbbá, hogy immunizált emlősökből ellenanyagok izolálására fág ellenanyag-génkönyvtárak alkalmazása a szokásos hibridómatechnológiához képest egy alternatív, sokoldalúbb eljárást képvisel.
A találmány tárgyát képezik továbbá, a fenti ellenanyagokat vagy fragmenseket tartalmazó, tumorok - például melanoma, glioma vagy karcinóma - kezelésére alkalmas gyógyászati készítmények. Az említett ellenanyagokat vagy fragmenseiket diagnosztikai célra is alkalmazhatjuk in vitro vagy in vivő az említett tumorok lokalizálására és azonosítására.
A leírásban előforduló szakkifejezések közül az alábbiakat a megadott definíciók értelmében használjuk:
„FR”-knek (keretrégióknak) nevezzük a könnyű- és nehézlánc variábilis régiójának négy alrégióját, melyek a három CDR-t közrefogják.
„CDR”-eknek (komplementeritást meghatározó régióknak) nevezzük a könnyű- és nehézlánc variábilis régiójának három alrégióját, melyek hipervariábilis szekvenciákkal rendelkeznek, és hurokszerkezetet vesznek fel, melyek elsősorban felelősek az antigénnel történő közvetlen kontaktus létrehozásáért.
„Kiméra ellenanyagok” vagy részlegesen humanizált ellenanyagok alatt olyan ellenanyagokat értünk, melyek humáneredetű konstans régókat és nemhumán eredetű, például egérből származó variábilis régiókat (ezen belül CDR-régiókat) tartalmaznak.
„Humanizált” vagy teljesen humanizált ellenanyagoknak olyan ellenanyagokat nevezünk, melyek humáneredetű konstans régiókat és FR-régiókat, valamint nemhumán eredetű CDR-régiókat tartalmaznak.
„EGF” valamint „EGFR” alatt az epidermális növekedési faktort, valamint annak receptorát értjük.
A „PCR” rövidítés polimeráz-láncreakciós eljárásra vonatkozik.
Az „scFv” rövidítés egyláncú Fv-re vonatkozik, amely egy ellenanyagfragmens.
„VL”-nek a könnyűlánc variábilis régióját nevezzük.
„VK”-nak a kappa-lánc variábilis régióját nevezzük.
„VH”-nak a nehézlánc variábilis régióját nevezzük.
A „PBS” rövidítés foszfátpufferes fiziológiás sóoldatot jelent.
Az „FCS” fötális boíjúszérumot jelent.
A „HBSS”-nek Hanks-pufferolt sóoldatot nevezünk.
A „FITC” rövidítés fluoreszcein-izotiocianátra vonatkozik.
Az „MTC” rövidítés kevert timocita sejttenyészetet jelöl.
Az epidermális növekedési faktor (EGF) epidermális és epithetiális sejtekre nézve mitogén, polipeptidhormon. A fogékony sejtekkel történő kölcsönhatása során az EGF membránreceptorokhoz (EGFR-receptorokhoz) kötődik. Az EGFR körülbelül 170 kD molekulatömegű transzmembrán-glikoprotein, és a c-erb-B proto-onkogén génterméke.
A Mab-425 a jól ismert, humán A431 karcinómasejtvonallal szemben (ATCC CRL 1555) előállított egér monoklonális ellenanyag, amely a humán-EGFR külső doménján található polipeptidepitóphoz kötődik, és gátolja az EGF kötődését. A Mab-425 ellenanyagról (ATCC HB 9629) kimutatták, hogy képes in vitro tumorcitotoxicitás közvetítésére, valamint epidermoid vagy kolorektális (vastagbél és végbél) karcinómaeredetű sejtvonalakban in vitro gátolja a tumorsejtek szaporodását [Rodeck és munkatársai: Cancer Rés. 47, 3692 (1987)]. A Mab-425 ellenanyag humanizált, valamint kiméra változatával foglalkozik a WO 92/15683 nemzetközi közzétételi irat.
Az elmúlt néhány év során olyan eljárásokat írtak le, melyek alkalmazásával prokarióta gazdasejtekben, például E. co/z-sejtekben funkcionális ellenanyagfragmensek állíthatók elő. Ilyenek például az Fv-fragmens és az Fab-fragmens, melyek közül az Fv-fragmensnek van különös jelentősége. Leírtak egyláncú Fv-fragmenseket is, (melyekben a VL- és VH-lánc össze van kapcsolva) [Bírd és munkatársai: Science 242, 423 (1988); Huston és munkatársai: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 5879 (1988)].
A fág ellenanyag-génkönyvtárak ellenanyagoknak immunizált állatokból történő izolálása szempontjából alternatív technológiát képviselnek a hibridómatechnológiához képest. A hibridómatechnológia úgy működik, hogy az ellenanyag-termelő sejteket folyamatos szaporodásává („halhatatlanná”) tesszük. A fág ellenanyagtechnológia szerint, az ellenanyagot kódoló géneket tesszük „halhatatlanná” [Winter G. és Milstein C.: Natúré 349, 293 (1991)]. A fág ellenanyag-technológiában az ellenanyag nehézlánc variábilis régióját (VH), valamint a könnyűlánc variábilis régióját (VL) képező géneket PCR-eljárással amplifikáljuk, a variábilis régiókat véletlenszerű módon kombináljuk és fágrészecskék felszínén, ellenanyagfragmensekként expresszáljuk, majd a fág ellenanyag-génkönyvtárat a kérdéses antigénhez kötődő ellenanyagokra nézve átvizsgáljuk.
A hibridómatechnológiát, amennyiben az állatok lépében erős immunválaszt lehetett kiváltani, igen sikeresen alkalmazták egér monoklonális ellenanyagok izolálására. Például humán epidermális növekedésifaktorreceptorral szembeni egér monoklonális ellenanyagokat izoláltak intraperitoneálisan humán A431-tumorsejtekkel immunizált egerek lépéből [Murthy és munkatársai: Arch. Biochem. Biophys. 252, 549 (1987)]. A fág ellenanyag-technológia előnye a hibridómatechnológiával szemben az, hogy kiindulási anyagként gya2
HU 221 001 Bl korlatilag bármilyen forrásból származó, ellenanyagexpresszáló sejt alkalmazható, és rövid idő alatt nagyszámú különböző ellenanyag vizsgálható át. A fág ellenanyag-technológia további előnye, hogy azzal a kérdéses ellenanyagok variábilis régióját kódoló géneket már klónoztuk, és azonnal rendelkezésére állnak további géntechnológiai módosítás céljára.
Egy közlemény szerint, fág ellenanyag-génkönyvtárból izolált antitetanusz-toxoid Fab-fragmenst alakítottak teljes ellenanyag-molekulává [Bender és munkatársai : Hűm. Antibod. Hybridomas 4, 74 (1993)].
Az elmúlt tíz év folyamán, az aktív immunizációs technika alternatívájaként az in vitro immunizációt alkalmazták mind humán-, mind egérrendszerből származó antigének széles skálájával szembeni monoklonális ellenanyagok (,qnAb”-k) előállítására [például: Vaux D. J. T., Helenius A. és Mellman I.: Natúré 336, 36 (1988); Gathuru J. K. és munkatársai: J. Immunoi. Methods 137, 95 (1991); Borrebaeck C. A. K.: Immunoi. Today 9, 355 (1988)]. A fenti megközelítési mód előnye, hogy csak kis mennyiségű antigénre van szükség, és az eljárás alkalmazható humánhihridómák előállítására. De a gyenge affinitással rendelkező IgM-ellenanyagok előállítása, valamint azok a nehézségek, melyek az in vitro immunizációt követően a humánlimfociták folyamatos szaporodásúvá történő alakításával kapcsolatosan jelentkeztek, állandó problémát jelentettek a fenti technológia alkalmazásánál.
Az ellenanyagok előállításának új módját jelenti a nehézlánc (Vjj) és könnyűlánc (VL) variábilis régiókat kódoló génekből álló készlet PCR-amplifikációja, melyeket ezután véletlenszerűen rekombinálunk és „ellenanyag-prezentáló” fág génkönyvtárakként expresszálunk (7-9). Ellenanyag variábilis régiókat kódoló géneket klónoztak és füzionáltak egyláncú Fvfragmensekként (scFv) a kisméretű burokproteinhez (a 3. génhez) (10). A fágrészecske felszínén bemutatja (prezentálja) az ellenanyagfragmenst, és az az ellenanyagok kötő tulajdonságait kihasználva, „panning”-eljárással (többszöri, egymást követő felviteli és mosási lépéseket tartalmazó eljárás) szelektálható. Az eljárás előnye, hogy a V-gének véletlenszerű rekombinációja olyan új specifitással és affinitással rendelkező új párosításokat eredményezhet, melyeket természetes úton nem szelektálhattunk volna. Az eljárás lehetővé teszi továbbá, egérből vagy emberből származó, antigénnel nem találkozott vagy in vitro immunizált limfociták alkalmazását.
A korábbi próbálkozások egér-B-sejtek in vitro immunizálásával EGFR-receptorral szembeni mAb-k előállítására alacsony affinitású, keresztreakciókat mutató ellenanyagokat eredményeztek. Abból a célból, hogy a fenti hátrányokat kiküszöböljük, in vitro immunizációt végeztünk, majd a PCR-klónozási technológiát követtük.
A találmány tárgyát képezi tehát az EGF-receptorhoz nagy affinitással kötődni képes ellenanyagok és ellenanyagfragmensek kifejlesztése, melyeket a fentiekben és az alábbiakban ismertetett előnyös eljárás szerint állítunk elő.
Az alábbiakban összefoglaljuk a találmány szerinti megoldást.
A találmányban három különböző fág ellenanyaggénkönyvtárból izolált, egér-anti-EGFR ellenanyagokat hasonlítunk össze szokásos hibridómatechnológiával nyert, egér-Mab(425) ellenanyaggal [Murthy és munkatársai: Arch. Biochem. Biophys. 252, 549 (1987); Kettlehorough és munkatársai: Protein Eng. 4, ΤΓ3 (1991)]. Nemcsak az immunizált egér lépéből készítettünk génkönyvtárat, hanem az immunizált egér elvezető nyirokcsomójából és in vitro immunizált egérsejtekből is. A génkönyvtárakból izolált két, egyláncú „Fv”-t (scFv-t) géntechnológiai úton úgy módosítottunk, hogy kiméra, teljes ellenanyag-molekulákat kapjunk, melyekben az egér variábilis régiók humán konstans régiókhoz kapcsolódnak.
Közelebbről, a találmány tárgyát immunizált emlős, előnyösen egér sejtjeiből, előnyösen lépéből vagy elvezető nyirokcsomójából származó sejtekből vagy in vitro immunizált sejtekből előállított fág ellenanyaggénkönyvtárból nyerhető anti-EGFR, egyláncú Fv képezi. Általánosságban, a találmány tárgya nem korlátozódik scFv-fragmensekre, hanem annak tárgyát képezik egyéb anti-EGFR ellenanyagfragmensek, mint például Fab-fragmensek vagy F(ab’)2-fragmensek is.
Több, a találmány szerinti scFv jól definiált DNS- és aminosavszekvenciával rendelkezik. A találmány tárgyát képezik tehát olyan egyláncú Fv-ffagmensek, melyekben a nehézlánc és könnyűlánc variábilis régiók a felsorolt, 1-32. azonosító számú, előnyösen az 5-8. ábrán bemutatott nehézlánc- és könnyűlánc-szekvenciák közül valamelyik DNS-szekvenciával és/vagy aminosavszekvenciával rendelkeznek.
Mivel diagnosztikai vagy terápiás célra sok esetben csak teljesen működőképes, teljes ellenanyag alkalmazható, a találmány célja, hogy az egyláncú Fv-fragmensekből származó variábilis régiókat humánimmunglobulin konstans régiókkal kapcsoljuk össze, hogy teljes, részlegesen vagy teljesen humanizált anti-EGFR ellenanyagokat kapjunk.
A találmány célja tehát, hogy a fentiekben, az alábbiakban, valamint az igénypontokban definiált ellenanyagfragmensekből származó DNS-szekvenciákból, valamint humánimmunglobulin konstans régiókból teljes anti-EGFR ellenanyagot állítsunk elő, melyben, a találmány egy előnyös megvalósítási módja szerint, a nehézlánc a gamma-l-lánc aminosavszekvenciájával, a könnyűlánc a kappa-lánc aminosavszekvenciájával rendelkezik.
A találmány szerint, az anti-EGFR scFv-ffagmenst fág ellenanyag-génkönyvtár technológiával izoláljuk. A találmány tárgyát képezi tehát anti-EGFR egyláncú Fv-fragmensek előállítására szolgáló eljárás, mely az alábbi lépéseket tartalmazza:
(i) immunizált emlőssejtekből, előnyösen egérsejtekből RNS-t izolálunk;
(ii) első cDNS-szálat szintetizáljuk;
(iii) az immunizált sejtekből származó cDNS-ben található VH- és VK-géneket amplifíkáljuk;
(iv) az említett géneket megfelelő restrikciós hasítási helyekkel fágmid-vektorba klónozzuk;
(v) a ligálási reakció termékével prokarióta sejteket transzformálunk;
HU 221 001 Bl (vi) a fág génkönyvtárakat tisztított EGFR alkalmazásával EGFR-receptorral szemben irányuló fág ellenanyagokra nézve átvizsgáljuk; és (vii) a kívánt egyláncú Fv-fragmenst prokarióta gazdasejtben, előnyösen E. coliban termeljük.
A találmány tárgyát képezi továbbá, teljes antiEGFR ellenanyagok előállítására szolgáló eljárás, melyben a fent ismertetettek szerint, vagy az igénypontokban definiáltak szerint előállított anti-EGFR ellenanyagfragmensek variábilis régióit kódoló DNS-t legalább egy, humánimmunglobulin konstans régiókat kódoló genomi DNS-t tartalmazó eukarióta expressziós vektorba klónozzuk, a fenti vektorral eukarióta sejteket transzformálunk, és az ellenanyagot expresszáljuk, majd izoláljuk.
Az anti-EGFR scFv-fragmensek, főképp a teljes anti-EGFR ellenanyagok humántumorok diagnózisára és terápiájára alkalmazhatók. A találmány tárgyát képezik tehát a fentiekben definiált vagy az igénypontokban definiált anti-EGFR egyláncú Fv-fragmenst vagy teljes anti-EGFR ellenanyagot tartalmazó gyógyászati készítmények.
A találmány eredményeit és előnyeit az alábbiakban foglalhatjuk össze.
Új, egér-anti-EGFR ellenanyagokat izoláltunk fág ellenanyag-génkönyvtárakból. Az új ellenanyagok legalább négy különböző VH-alosztályt és négy különböző VK-alosztályt képviselnek [Kábát és munkatársai: „Sequences of proteins of immunological interest” 5. kiadás, „U. S. Dept. of Health and Humán Services”, Bethesda (1991)]. Ezeket a hibridómatechnológiával izolált, egér-Mab-425 ellenanyagtól eltérő párosítások és szekvenciák jellemezték. Az egér-Mab-425 ellenanyag VH2b és VK4 párosítással rendelkezik, mely a fág ellenanyagokban nem volt megfigyelhető. A 425VH-régióval az scFv-L3-llD mutatta a legnagyobb fokú azonosságot (84,9%). Az eltérések legnagyobb része a CDR-régiókban mutatkozott. A 425VKrégióval az scFv-S4-2D mutatta a legnagyobb fokú azonosságot (83,2%). Az eltérések legnagyobb része itt is a CDR-régiókban, különösen a CDR3 régióban volt megfigyelhető. A találmány szerinti eljárás alkalmazásával fág ellenanyag-génkönyvtárakból számos különböző, új, anti-EGFR ellenanyagot izoláltunk, ezek az ellenanyagok mind különböznek a MAb-425 ellenanyagtól, amennyiben legalább két scFv az EGFRreceptoron a MAb-425 ellenanyagtól eltérő epitópot ismert fel. Ez ellentmond egy korábbi közleménynek, mely szerint kombinációs génkönyvtárakból izolált ellenanyagok nagymértékű hasonlóságot mutattak a hibridómatechnológiával izoláltakhoz [Caton és Koprowski: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 6450 (1990)].
A három fág ellenanyag-génkönyvtár közül nagy affinitású ellenanyagok előállításához szükséges szelekciós lépések számát és a nagy affinitású ellenanyagok változatosságát tekintve a legjobb génkönyvtámak az elvezető nyirokcsomóból előállított génkönyvtár bizonyult. Két okból határoztunk úgy, hogy a fág ellenanyag-génkönyvtár előállításához nyirokcsomóból nyerünk RNS-t. Először, korábbi vizsgálatok azt mutatták, hogy a talpon keresztül történő immunizálást követően a térdhajlati nyirokcsomókból nagyobb arányban kaptunk nagy affinitású IgG-ellenanyagokat termelő Bsejteket, mint intraperitoneális (hasüregen át történő) immunizálást követően a lépből [Venn és Dresser: J. Immunoi. Methods 702, 95 (1987)]. Másodszor, az elvezető nyirokcsomókból közismerten könnyen lizálhatók humánantitumor ellenanyagok. Talpon át immunizált egér térdhajlati nyirokcsomójából izolált egér-anti-EGFR ellenanyagok előállítása szolgált modellként tehát humán-anti-EGFR ellenanyagok izolálásához egy emlőkarcinómában szenvedő beteg hónalji nyirokcsomóiból. Kimutattuk, hogy kis mennyiségű nyirokcsomómintából megfelelő méretű génkönyvtárak állíthatók elő, majd a génkönyvtárakból nagy affinitású ellenanyagok izolálhatok.
Bár mindhárom fág ellenanyag-génkönyvtárból sikerült egér-anti-EGFR ellenanyagokat izolálni, nem világos, hogy az újonnan izolált ellenanyagok bármelyike nagyobb affinitással rendelkezik-e, mint a hibridómatechnológiával izolált MAb-425 ellenanyag. Az első analízisek során, a fág ellenanyaggénkönyvtáreredetű scFv-fragmensek látszólag jobban kötődtek az EGFR-receptorhoz, mint a MAb-425 ellenanyagból származó scFv-fragmens (2. ábra). Kiméra, teljes ellenanyag-molekulákkal végzett további kísérletekben a kiméra ellenanyagok egyike (S4-2D) a kiméra-425 ellenanyaggal megegyező affinitást mutatott az EGFR-receptorhoz. A második kiméra ellenanyag (L3-11D) a kiméra-425 ellenanyaghoz képest négyszer alacsonyabb affinitással rendelkezett (4. ábra). Az scFv-fragmensek alkalmazásával kapott kötődési eredmények valószínűleg azért félrevezetőek, mivel az scFv-készítmények monomerek és dimerek elegyét tartalmazhatják [Griffiths és munkatársai: EMBO J. 72, 725 (1993)]. Ezzel szemben, a kiméra IgG-ellenanyagok várhatóan nem képeznek dimereket, és a kiméra L3-1 ID és S4-2D ellenanyagok mérete megfelelt a bivalens, monomer kiméra IgG-ellenanyagok méretének. A 425, L3-1 ID és S4-2D scFv-ffagmenseket tartalmazó, affinitásos eljárással tisztított készítmények analízise azonban azt mutatta, hogy a fenti scFvkészítmények monomer, dimer és más multimer formákat tartalmaztak. Ezenkívül, a monomer és multimer formák viszonylagos aránya az egyes scFv-k esetében más-más volt. A 425-scFv tartalmazott legkisebb arányban dimer formákat. Amint az megjósolható, a dimer, és különösen a nagyobb multimer formák erősebben kötődtek a tisztított EGFR-receptorhoz, mint a monomer forma. Úgy tűnik, a 425-scFv kevésbé hajlamos dimerképzésre, mint egyes újonnan izolált scFvfragmensek.
Bár az ellenanyagfragmensek expresszálása fágrészecskék felszínén a kívánt specifitással rendelkező ellenanyagok gyors szelektálására szolgáló hatékony eljárás alapját képezi, valószínűleg sem a fág ellenanyagok, sem maguk az ellenanyagfragmensek (scFv-fragmensek vagy Fab-fragmensek) nem képviselik a kívánt végterméket. Bemutatjuk továbbá, hogy a
HU 221 001 Bl fág ellenanyag-génkönyvtárakból izolált egér-scFvfragmensek hogy alakíthatók könnyen teljes ellenanyag-molekulákká. Ebben az esetben, az egér variábilis régiókat humán konstans régiókhoz kapcsoltuk, hogy részlegesen humanizált, kiméra ellenanyagokat kapjunk.
A fenti eredmények azt mutatják, hogy fág ellenanyag-technológia alkalmazásával, immunizált egerekből változatos anti-EGFR ellenanyagfragmensek izolálhatok. Az ellenanyagfragmensekből ezután a kívánt konstans régiókat tartalmazó, teljes ellenanyagmolekulák állíthatók elő. Monoklonális ellenanyagok izolálására egerekből, esetenként még a hibridómatechnológia lehet a választandó eljárás. Amennyiben nagy immunogenitású antigén áll rendelkezésre, és egy, vagy néhány különböző anti-antigén ellenanyagot termelő, kisszámú hibridóma-sejtvonalat kívánunk nyerni, valószínűleg kevés okunk van a fág ellenanyagtechnológia alkalmazásának mérlegelésére. Ha azonban nagy affinitású ellenanyagok előállítása céljából speciális immunizálási eljárás, mint például talpon át történő injektálás alkalmazása tűnik előnyösnek, vagy ha az antigénen található sok különböző epitóp ellen irányuló, nagyszámú ellenanyagot kívánunk előállítani, vagy nagyon kevéssé domináns, feltehetően kevésbé immunogén epitóp ellen irányuló ellenanyagot kívánunk előállítani, akkor a fág ellenanyag-technológia a választandó eljárás. Abban az esetben is, ha várhatóan az ellenanyagok további géntechnológiai módosítására van szükség, a fág ellenanyag-technológia alkalmazása előnyös, mivel ezáltal az ellenanyaggének már klónozva vannak.
A találmány szerinti megközelítési mód, melyben az adott antigénnel történő in vitro immunizálást PCRklónozási technológiával kombináltuk, olyan scFvfragmenseket eredményezett, melyek reagáltak az EGFR-receptorral, és más antigénekkel nem mutattak keresztreaktivitást. A találmány szerinti immunizálási eljárás alapját olyan antigénprezentálás képezi, mely nem oldható, hanem membránvezikulum-készítmény, valamint maga a tenyésztő tápfolyadék, amely FCSmentes. Mindkét eljárásról leírták, hogy alkalmazásukkal az in vitro immunizálás hatékonysága fokozható, mivel az antigéneket az antigénprezentáló sejtek számára hozzáférhetővé teszi [például: Brams P. és munkatársa: J. Immunoi. Methods 98, 11 (1987)].
Az MTC alkalmazásával kapott eredmények összhangban vannak korábbi közleményekkel [például, Borrebaeck C. A. K. és Möller S. A. : J. Immunoi. 136, 3710 (1986); Möller S. A. és Borrebaeck C. A. K.: „In Vitro Immunization in Hybridoma Technology”, „Elsevier Science Publishers Β. V.”, szerk.: Borrebaeck C. A. K., Amszterdam, 3. oldal, (1983)], melyekben limfokinforrásként MTC-felülúszó használatát javasolták az in vitro immunizációs eljárás hatékonyságának javítására. A membránvezikulumkészítmény poliantigénnek tekinthető, mivel az ilyen vezikulumban sok különböző antigéndetermináns van jelen. Ezért úgy tűnik, mintha bizonyos mértékű poliklonális aktivációt hoznának létre. Mi ezt a feltevést kizártuk, mivel az anti-EGFR-specifikus válasz nyilvánvalóan különbözött standard poliklonális aktivátorral kiváltott választól.
Ahelyett, hogy az in vitro immunizációt követően a B-sejteket tettük volna folyamatos szaporodásüvá („halhatatlanná”), a molekuláris stratégiát alkalmaztuk, melyben a VH és VL ellenanyaggéneket tettük „halhatatlanná”. Ezeket a monoklonális ellenanyagffagmenseket baktériumokban expresszáltuk és termeltük. A fágprezentációs rendszer hatékony módszer specifikus antigének ellen irányuló ellenanyagfragmensek izolálására. Az ellenanyagfragmens és a gp3-burokprotein közti stopkodon jelenléte, szupresszor és nem szupresszor törzsek alkalmazásán keresztül megteremti a lehetőségét annak, hogy váltsunk a felszínen történő prezentálás és oldható scFv-fragmens szekréciója között [Hoogenboom és munkatársai: Nucl. Acids Rés. 19, 4133 (1991)].
Az in vitro antigénstimulált B-sejtekben a specifikus válasz fokozódásának és az mRNS-szint növekedésének köszönhetően, az in vitro immunizálás az antigénnel szemben nagymértékű specifítást mutató ellenanyagfragmensek izolálásához vezet. Két szelekciós kört követően a kiónok 100%-a pozitívnak bizonyult EGFR-kötődésre nézve. Ezzel szemben, in vivő immunizációs eljárásokból származó kiónok csak négy szelekciós kört követően váltak 100%-ban pozitívakká [Kettleborough és munkatársai : EP 94 104 160 számú európai szabadalmi leírás; és Eur. J. Immunoi. 24, 952 (1994)].
„Naív” (ellenanyaggal nem stimulált) ellenanyaggénekből előállított, ellenanyagfragmens-prezentáló fág génkönyvtárak alkalmazása lehetővé teszi specifikus humán ellenanyagfragmensek előállítását immunizálás nélkül, vagy in vitro immunizációt követően. Az ellenanyagfragmensek egyszerű, gyors és gazdaságos módon, közvetlenül baktériumokban állíthatók elő.
A találmány szerinti eljárások során az alábbi biológiai eredetű anyagokat és általános módszereket alkalmaztuk.
A leírás vonatkozásában említett mikroorganizmusok, sejtvonalak, plazmidok, fágmidek, promoterek, rezisztenciamarkerek, replikációs origók vagy egyéb vektorfragmensek a kereskedelemben vagy másképp, általánosan hozzáférhetőek. Amennyiben azokra vonatkozólag a leírásban más információt nem adtunk meg, azok csak a példaként szolgálnak, nem esszenciálisak a találmány szempontjából, és egyéb megfelelő eszközökkel vagy biológiai anyagokkal helyettesíthetők.
Az scFv-fragmensek klónozására és az scFv-proteinek előállítására előnyösen baktérium-gazdasejteket alkalmazunk. Ilyen gazdasejtek például az E. coli vagy Bacillus.
A találmány szerinti teljes anti-EGFR ellenanyagok előállítására előnyösen eukarióta gazdasejteket, például COS-, CHO- vagy élesztősejteket alkalmazunk.
A találmány szempontjából esszenciális technikákat a leírásban részletesen ismertetjük. A leírásban részletesen nem ismertetett technikák szakember számára jól ismert standard eljárásoknak felelnek meg, vagy azo5
HU 221 001 BI kát az idézett szakirodalmi hivatkozásokban, szabadalmi bejelentésekben, valamint a szokásos szakirodalomban részletesen ismertetik.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a leírásokhoz csatolt ábrákat.
Az 1. ábra a fág ellenanyag-génkönyvtárakból izolált scFv-fragmensek aminosavszekvenciáit mutatja. (A) a nyirokcsomó-génkönyvtárból származó scFvfragmenseket ismerteti. (B) a lépgénkönyvtárból származó scFv-fragmenseknek felel meg. Feltüntettük a komplementeritást meghatározó régiókat (CDR-régiókat) és a keretrégiókat (FR-régiókat).
A 2. ábra az scFv-fragmensek EGFR-receptorhoz történő kötődését szemlélteti. A bakteriális felülúszóban meghatároztuk az scFv-fragmensek koncentrációját, és az scFv-fragmenseket ELISA-eljárással tisztított EGFRreceptorhoz történő kötődésre nézve teszteltük. (A) a nyirokcsomó-génkönyvtárból származó scFvfragmensek kötődését mutatja. (B) a lépgénkönyvtárból származó scFv-fragmensek kötődését mutatja. Pl (pozitív kontroll) a MAb-425 ellenanyagból származó scFvfragmens. L1 és SÍ (negatív kontrollok) az előszelektált nyirokcsomó- és lépgénkönyvtárból származó, nem kötődő scFv-fragmensek.
A 3. ábra a variábilis régiók emlőssejtekben történő expresszálás céljából történő összeépítésénél alkalmazott köztivektorokat ábrázol. (A)VH-vektor. (B)VK-vektor.
A 4. ábra kiméra, teljes ellenanyagok EGFRreceptorhoz történő kötődését szemlélteti. A COSsejtek felülúszójában az ellenanyagok koncentrációját ELISA-eljárással határoztuk meg, és az ellenanyagokat ELISA-eljárással tisztított EGFR-receptorhoz történő kötődésre nézve teszteltük.
Az 5. ábra az L2-11C azonosító jelű scFv-fragmens DNS- és aminosavszekvenciáját mutatja. (A) könnyűlánc; (B) nehézlánc.
Aminosavpozíciók:
(A)FR-l | 1-23, | CDR-1: 24-34, |
FR-2 | 35-49, | CDR-2: 50-56, |
FR-3 | 57-88, | CDR-3: 89-97, |
FR-4 | 98-109. | |
(B)FR-l | 1-30, | CDR-1: 31-35, |
FR-2 | 36-49, | CDR-2: 50-66, |
FR-3 | 67-98, | CDR-3: 99-108, |
FR-4 | 109-119. |
A 6. ábra az L2-12B azonosító jelű scFv-fragmens DNS- és aminosavszekvenciáját mutatja. (A) könnyűlánc; (B) nehézlánc.
Aminosavpozíciók:
(A)FR-l | 1-23, | CDR-1: 24-38 |
FR-2 | 39-49, | CDR-2: 50-56, |
FR-3 | 57-88, | CDR-3: 89-97, |
FR-4 | 98-109. | |
(B)FR-l | 1-30, | CDR-1: 31-35, |
FR-2 | 36-49, | CDR-2: 50-66, |
FR-3 | 67-98, | CDR-3: 99-108, |
FR-4 | 109-119. |
A 7. ábra az L3-11D azonosító jelű scFv-fragmens DNS- és aminosavszekvenciáját mutatja. (A) könnyűlánc; (B) nehézlánc.
Az FR-régiók és CDR-régiók aminosavpozíciói megfelelnek a 6. ábrán bemutatottaknak.
A 8. ábra az S4-2D azonosító jelű scFv-fragmens DNS- és aminosavszekvenciáját mutatja. (A) könnyűlánc; (B) nehézlánc.
Aminosavpozíciók:
(A)FR-l | 1-23, | CDR-1: 24-35, |
FR-2 | 36-50, | CDR-2: 51-57, |
FR-3 | 58-89, | CDR-3: 90-98, |
FR-4 | 99-110. | |
(B)FR-l | 1-30, | CDR-1: 31-35, |
FR-2 | 36-49, | CDR-2: 50-66, |
FR-3 | 67-98, | CDR-3: 99-107, |
FR-4 | 108-118. |
Az 5-8. ábra szerinti szekvenciák ugyancsak megtalálhatók a leíráshoz csatolt szekvencialistában, amely a találmány szerinti kitanítás részét képezi.
Az alábbiakban részletesen ismertetjük a találmány szerinti megoldást.
(1) Fág ellenanyag-génkönyvtárak előállítása és átvizsgálása.
Három fág ellenanyag-génkönyvtárat állítottunk elő, egyet A431 jelzésű, humán karcinóma-sejtvonallal immunizált egér lépéből (8,8 χ 105 kiónt tartalmazó génkönyvtár), egyet talpon keresztül, tisztított EGFR-receptorral immunizált egér térdhajlati nyirokcsomójából (6,5 x1ο6 kiónt tartalmazó génkönyvtár), egyet pedig in vitro A431 vezikulumokkal immunizált egérlimfocitákból (1,1 χ 105 kiónt tartalmazó génkönyvtár), (az A431 vezikulumok előállítására és az in vitro immunizációra vonatkozó részleteket az 1. és 2. példákban ismertetjük).
A szelekciót megelőzően mindegyik génkönyvtárból származó legalább 46 klón esetében BstNI-emésztéssel analizáltuk a kiónokra jellemző emésztési mintát („ujjlenyomatot”) [Clackson és munkatársai: Natúré 352, 624 (1991)], hogy a klónkészlet változatosságának mértékét meghatározzuk. Az emésztéssel kapott minták sokfélesége volt megfigyelhető. Ugyancsak a szelekciót megelőzően valamennyi génkönyvtárból 96 kiónt ELISAeljárással EGFR-receptorhoz történő kötődésre teszteltünk. A lép- és a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárakból származó scFv-fragmensek egyike sem kötődött EGFRreceptorhoz. Az in vitro immunizációval előállított génkönyvtárból származó scFv-fragmensek egyike kötődött az EGFR-receptorhoz. EGFR-receptorral fedett immuncsövek alkalmazásával végzett egyetlen szelekciós kört követően a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtár és az in vitro immunizációval előállított génkönyvtár esetében az EGFR-receptorhoz kötődő scFv-fragmensek nyilvánvaló feldúsulása volt megfigyelhető. A léperedetű génkönyvtár esetében egy második szelekciós körre volt szükség, mielőtt EGFR-receptorhoz kötődő scFvfragmenst tudtunk kimutatni. A harmadik szelekciós kört követően a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból és az in vitro immunizációval előállított génkönyvtárból származó scFv-fragmensek többsége pozitívnak bizonyult EGFR-kötődésre nézve. A léperedetű génkönyvtár esetében végzett, egy negyedik szelekciós kört követően, az abból származó scFv-fragmensek többsége pozitívnak bizonyult EGFR-kötődésre nézve (1. táblázat).
HU 221 001 Bl
1. táblázat
Az EGFR-receptorhoz kötődő kiónok százalékos aránya az egyes szelekciós köröket követően
Nyirokcsomó-eredetű génkönyvtár | Léperedetű génkönyvtár | In vitro immunizált sejtekből előállított génkönyvtár | |
Szelekciót megelőzően | 0 | 0 | 1 |
Első szelekciós kör | 77 | 0 | 84 |
Második szelekciós kör | 86 | 26 | 100 |
Harmadik szelekciós kör | 90 | 77 | 100 |
Negyedik szelekciós kör | nem teszteltük | 97 | nem teszteltük |
(2) Az EGFR-receptorhoz kötődő klánok szekvenciaanalizise
Valamennyi szelekciós kört követően az EGFRreceptorhoz kötődő kiónokban található scFvfragmensek emésztési mintáját BstNI-emésztéssel analizáltuk [Clackson és munkatársai: Natúré 352, 624 (1991)]. Nyilvánvaló volt, hogy bizonyos emésztési minták feldúsultak. A nyirokcsomó-eredetű génkönyvtár esetében a második és harmadik szelekciós körből, a léperedetű génkönyvtár esetében a harmadik és negyedik szelekciós körből származó, eltérő BstNI-lenyomatokkal rendelkező kiónokat választottunk a VH- és Vk-régiók DNS-szekvenciájának meghatározására. A későbbi szelekciós körökből származó kiónokat analizáltunk, mivel ezekben várhatóan nagyobb affinitású kiónok találhatók [Clackson és munkatársai: Natúré 352, 624 (1991)].
A nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból tizenhat kiónt szekvenáltunk és hat különböző scFv-fragmenst figyeltünk meg (1. ábra). Ezek közül öt, egyedi VH- és Vk-régió párosításokat tartalmazott. A hatodik, egy előzőleg már előfordult VH-régió-variánst tartalmazott, melyben hat aminosavváltozás volt megfigyelhető, ezek közül öt az 1. keretrégióban (1. FR-régióban). A fenti változások közül kettő a degenerált VH1BACKSFI láncindító oligonukleotid alkalmazásának lehet tulajdonítható [Hoogenboom és munkatársai: Nucl. Acids Rés. 19, 4133 (1991)]. A többi, a PCReljárás közben keletkezett hiba következménye lehet. A VH-régiók két alosztályba voltak sorolhatók, a VH2b és VH3d alosztályokba, míg a Vk-régiók négy alcsoportba tartoztak, a Vk3, Vk4, Vk5 és Vk6 alcsoportokba [Kábát és munkatársai: „Sequences of proteins of immunological interest” 5. kiadás, „U. S. Dept. of Health and Humán Services”, Bethesda (1991)]. A léperedetű génkönyvtárból tíz független kiónt szekvenáltunk, és négy különböző scFv-fragmenst találtunk. Ezek közül három, egyedi VH- és Vk-régiókból álló párosításokat tartalmazott, míg a negyedik, egy előzőleg már előfordult párosításhoz volt hasonló, ebben a VH-régión belül csupán két aminosaveltérés volt kimutatható, ezek közül az egyik a 2. komplementeritást meghatározó régióban (2. CDR-régióban) jött létre, két aminosaveltérés pedig a Vk-régióban volt megfigyelhető. Az alcsoport-felosztás VH2a, VH2c és VH3d VH-alcsoportok, valamint Vk3, valamint Vk4 Vk-alcsoportok jelenlétére mutatott. A nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból és a léperedetű génkönyvtárból származó scFv-fragmensek összehasonlítása alkalmával csak egy olyan scFv-fragmenst találtunk, amely mindkét génkönyvtárban közös volt, ezek az L3-10A és az S4-10H scFv-fragmensek voltak (1. ábra). Erről a kiónról ELISA-eljárással kimutattuk, hogy erősen kötődik EGFR-receptorhoz. Nagy gondossággal jártunk el, hogy a génkönyvtárak közti kontamináció lehetőségét kizárjuk, mégis, egy erős EGFR-kötődést mutató kiónnal történő minimális kontamináció lehetőségét nehéz kizárni. Figyelembe véve azonban a Balb/c-egerek beltenyésztett természetét, lehetséges, hogy két különböző génkönyvtárban egymástól függetlenül ugyanazt az scFv-fragmenst mutatjuk ki.
(3) Az EGFR-receptorhoz történő kötődés affinitásának és specifitásának analízise.
Az antigénhez történő jó kötődési sajátság és a DNS-szekvenciában megfigyelhető változatosság alapján a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból és a léperedetű génkönyvtárból néhány kiónt további analízis céljára kiválasztottunk. Ezeket az scFv-fragmenseket ELISA-eljárással analizáltuk tisztított EGFRreceptorhoz, irreleváns antigénekhez és EGFRreceptort expresszáló vagy nem expresszáló tumorsejtvonalakhoz történő kötődésre nézve. Pozitív kontrollként scFv-fragmenseket állítottunk elő egérMAb-425 ellenanyagból (Pl). Negatív kontrollokként a szelekciót megelőzően scFv-fragmenseket állítottunk elő (Ll és Sl) a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból és a léperedetű génkönyvtárból. Az scFv-fragmensek koncentrációját a tesztelendő scFv-fragmensek hígításainak és ismert koncentrációjú, tisztított scFvfragmens hígításainak, Westem-blot alapján történő összehasonlításával határoztuk meg.
Az scFv-fragmenseket ELISA-eljárással tisztított EGFR-receptorhoz történő kötődésre nézve teszteltük, és az eredményeket grafikusan ábrázoltuk (2. ábra). Az így felállított rangsor az egyes kísérletek során reprodukálhatónak bizonyult. Az EGFR-receptorhoz legerősebben kötődő scFv-fragmensek a nyirokcsomó-eredetű génkönyvtárból származó L2-1C, és L3-10A fragmensek, valamint a léperedetű génkönyvtárból származó S4-10H-fragmensek voltak. Amint azt az előzőekben említettük, az L3-10A és S4-10H scFvfragmensek azonos DNS-szekvenciával rendelkeztek. Egy, az S4-10H scFv-fragmenshez igen hasonló scFv7
HU 221 001 Bl fragmens (S4-5A), amely két aminosaveltérést tartalmazott a VH-régióban és kettőt a Vk-régióban, következetesen alacsonyabb kötődést mutatott, mint az S4-10H. Ezzel szemben, az L2-12B és L3-11D fragmensek között megfigyelhető eltéréseknek nem volt kifejezett hatásuk a kötődésre. Az izolált scFvfragmensek közül csupán kettő mutatott a 425 jelzésű scFv-fragmensnél kisebb mértékű kötődést.
Az scFv-fragmenseket ELISA-eljárással teszteltük műanyaghoz és egy sor semleges proteinhez (ovalbumin, tyúktojáslizozim, citokróm-C, glicerinaldehid-3foszfát-dehidrogenáz, CBA-albumin és BSA) történő kötődésre nézve. Egyik scFv-fragmens sem adott a háttérnél magasabb értéket.
Az scFv-fragmenseket ELISA-eljárással teszteltük három tumorsejt vonalhoz történő kötődésre. Az A431 és MDA-MB468 sejtvonalak vulvából, valamint emlőből izolált, EGFR-receptort hordozó tumorsejtek. Az SK-MEL-23 sejtvonal egy gangliozidot hordozó, melanóma-sejtvonal, melyet negatív kontrollként alkalmaztunk. A tíz tesztelt scFv-fragmens közül csak négy kötődött mind tisztított EGFR-receptorhoz, mind EGFR-receptort hordozó tumorsejtekhez (L2-12B, L3-11D, L2-11C és S4-2D; lásd, 5-8. ábrák). Az SK-MEL23 sejtekhez nem volt kötődés kimutatható. Ennek a meglepő eredménynek több magyarázata lehet. Az egyik szerint, az immunizáció, szelekció és az ELISA-eljárás során alkalmazott EGFR egy szekretált EGFR-proteinszármazék volt [Weber és munkatársai: Science 224,294 (1984)]. Ez a protein a C-terminális végen 17 további aminosavat tartalmaz [Günther és munkatársai: J. Bioi. Chem. 265, 22082 (1990)]. Az scFvfragmenseket ELISA-eljárással teszteltük arra nézve, hogy kötődnek-e ehhez a 17 aminosavból álló peptidhez, ennek során nem volt kötődés megfigyelhető. Lehetséges, hogy a szekretált EGFR-protein-származék és a tumorsejtek felszínén található EGFR konformáció vagy glikozilezés tekintetében tér el egymástól.
A tumorsejtekhez történő kötődés további vizsgálata céljából három scFv-fragmenst (L2-11A, L3-11D és S4-2D) tisztítottunk és „flow cytometriás” eljárással A431 tumorsejtekhez történő kötődésre nézve analizáltunk. A 425 jelzésű scFv-fragmenseket alkalmaztuk pozitív kontrollként. A három vizsgált scFv-fragmens közül csak az L3-11D és az S4-2D kötődött az A 431 sejtekhez. Ez a két scFv-fragmens hasonló kötődési jellemzőkkel rendelkezik, mint a 425 jelzésű scFv-fragmens.
Mind tisztított EGFR-receptorhoz, mind EGFRreceptort hordozó tumorsejtekhez kötődő izolátumokból előállított, tisztított scFv-fragmenseket kompetíciós kötődési vizsgálatban teszteltünk egér-Mab-425 ellenanyaggal szemben. Míg a tisztított 425-scFv-fragmens az adott koncentrációtartomány alkalmazása mellett képes volt az egér-MAb-425 ellenanyag EGFRreceptorhoz történő kötődését gátolni, az L3-11D és S4-2D ezen koncentrációk mellett nem gátolta az egérMAb-425 ellenanyag EGFR-receptorhoz történő kötődését. A fenti két scFv-fragmens úgy tűnik, az egérMAb-425 ellenanyagtól eltérő epitópokat ismer fel az EGFR-receptoron.
(4) scFv-fragmensekből előállított kiméra, teljes ellenanyagok.
Két scFv-fragmenst (L3-11D és S4-2D) választottunk ki, hogy azokból teljes ellenanyagmolekulákat állítsunk elő. Az egér-VH- és -Vkfragmenseket immunoglobulin szignálszekvenciákat és összekapcsolási („splice”) donorszignálokat tartalmazó köztivektorokba klónoztuk (3. ábra). A VH köztivektorban a klónozási helyek elhelyezkedése azzal a következménnyel járt, hogy a VH-fragmensben az első aminosav aszparaginsavról glutaminsavra cserélődött. A köztivektorokból, a most már szignálszekvenciákkal és összekapcsolási („splice”) donorszekvenciákkal ellátott VH- és Vk-régiókat tartalmazó DNSfragmenseket humán gamma-1 konstans régiót vagy humán kappa konstans régiót kódoló DNS-eket tartalmazó emlőssejt expressziós vektorokba klónoztuk [Maeda és munkatársai: Hűm. Antibod. Hybridomas 2, 124 (1991)]. Valamennyi kiméra ellenanyag esetében, a nehézlánc és könnyűlánc expressziós vektorokat együttesen COS-sejtekbe transzfektáltuk. Pozitív kontrollként a sejteket kiméra-425 ellenanyagot kódoló nehézlánc és könnyűlánc expressziós vektorokkal expresszáltuk együtt [Kettleborough és munkatársai: Protein Eng. 4, 773 (1991)]. A sejtekről tápfolyadékot gyűjtöttünk, és ELISA-eljárással meghatároztuk az abban található ellenanyagok koncentrációját, valamint az ellenanyagok kötődési képességét az EGFR-receptorhoz (4. ábra). Amikor az antigénhez történő maximális kötődés felének eléréséhez szükséges ellenanyag-koncentrációkat összehasonlítottuk, azt találtuk, hogy a kiméra S4-2D ellenanyag a kiméra-425 ellenanyaggal azonos mértékben kötődött az EGFR-receptorhoz. A kiméra L3-11D ellenanyag kötődésének mértéke az EGFR-receptorhoz azonban, körülbelül négyszer alacsonyabb volt, mint a kiméra-425 ellenanyagé. A kiméra-425 ellenanyag affinitása [Kettleborough és munkatársai: Protein Eng. 4, 773 (1991)] kompetíciós kötődési vizsgálattal történő meghatározás alapján 1,9 χ 108 (mol/1)1 volt. A fenti eredmények azért voltak meglepőek, mivel az scFvfragmensek analízisével kapott adatok arra utaltak, hogy mind az S4-2D, mind az L3-11D scFvfragmens jobban kötődik az EGFR-receptorhoz, mint a 425-scFv-fragmens (2. ábra). Protein-A alkalmazásával tisztított, kiméra L3-11D és S4-2D ellenanyagmintákat SDS-PAGE-eljárással analizáltunk redukáló és nem redukáló feltételek mellett „Flow-citometriás” eljárással teszteltük a kiméra L3-11D és S4-2D ellenanyagok kötődését A431 és SK-MEL-23 sejtekhez is. Mindkét kiméra ellenanyag jól kötődött az EGFR-expresszáló A431 sejtekhez és nem kötődött az EGFR-negatív SK-MEL-23 sejtekhez.
(5) Terápiás és diagnosztikai célú alkalmazás
A találmány szerinti ellenanyagfragmensek és teljes ellenanyagok terápiás célból beadhatók humán betegeknek. A találmány tárgyát képezi tehát aktív összetevőként a fentiekben és az igénypontokban definiált, legalább egy ellenanyagot vagy ellenanyagfragmenst, valamint egy vagy több gyógyászatilag elfogadható hordo8
HU 221 001 Bl zó segédanyagot, kötőanyagot vagy hígítóanyagot tartalmazó gyógyászati készítmény.
Tipikusan, a találmány szerinti ellenanyagot intravénásán vagy parenterálisan adjuk be. Általánosságban, az ellenanyagffagmensek beadható dózistartománya elég nagy a kívánt tumorszupresszáló vagy tumorizáló hatás kiváltásához. A dózis függ az életkortól, az általános állapottól, nemtől, a betegben a betegség előrehaladottságának fokától, és a dózis 0,1 mg/kg-200 mg/kg között, előnyösebben 0,1 mg/kg-100 mg/kg között változhat, naponta egy vagy több dózisban, egy vagy több napig adagolva.
Parenterális beadásra alkalmas készítmények steril vizes vagy nemvizes oldatok, szuszpenziók vagy emulziók lehetnek. Nemvizes oldószerek lehetnek például polipropilénglikol, növényi olajok, mint például olívaolaj, injektálható szerves észterek, mint például etiloleát, valamint egyéb, a célnak megfelelő, a technika állása szerint ismert oldószerek. A találmány szerinti ellenanyagok alkalmazhatók egy fiziológiásán elfogadható hordozó segédanyagot tartalmazó készítményben. Ilyen megfelelő hordozó segédanyagok például a fiziológiás sóoldat, PBS, Ringer-oldat vagy laktátos Ringer-oldat. A gyógyászati készítmény tartalmazhat ezenkívül tartósítószereket, vagy más adalékanyagokat, mint például antibiotikumokat, antioxidánsokat, és kelátorokat.
Az ellenanyagokat (fragmenseket) citotoxicitásuk fokozása céljából ismert eljárásokkal citokinekkel, például IL-2-vel konjugálhatjuk.
A találmány szerinti gyógyászati készítmények alkalmasak valamennyi típusú tumor, például melanomák, gliomák, és karcinómák, valamint keringésirendszereredetű tumorok és körülhatárolt tumorok kezelésére.
Diagnosztikai célokra az ellenanyagok konjugálhatók például röntgensugárzás számára átlátszatlan festékkel vagy radioaktívan jelölhetők. Előnyös jelölési eljárás a „Iodogen”-módszer. Diagnosztikus célra az ellenanyagot előnyösen F(ab’)2-fragmensekként vagy scFvfragmensekként adjuk be. Ez olyan kiváló eredményt ad, hogy nincs szükség a háttér kivonására.
A találmány szerinti megoldást a pontosabb értelmezhetőség céljából a továbbiakban konkrét megvalósítási példákon keresztül kívánjuk szemléltetni.
1. példa
A431 vezikulumok
Levált membránvezikulumokat a korábbiakban ismertetett, kismértékben módosított eljárás szerint állítottunk elő [Cohen és munkatársai: J. Bioi. Chem. 257, 1523 (1982); Yeaton és munkatársai: J. Bioi. Chem. 258, 9254 (1983)]. Összefüggő A431 sejttenyészetet tartalmazó palackokat kalciumot és magnéziumot tartalmazó PBS-sel mostunk. A palackokhoz hipotóniás PBS-t adtunk és 15 percig ráztuk. A sejteket ezután vezikulumképző pufferrel mostuk (100 mmol/1 NaCl, 50 mmol/1 Na2HPO4, 5 mmol/1 KC1, 0,5 mmol/1 MgSO2, pH 8,5). A palackokhoz vezikulumképző puffért adtunk és a palackokat rázás mellett, szobahőmérsékleten és 37 °C-on tartottuk. Ezután a puffért fémszűrőn át, jégre állított 50 ml-es csövekbe beöntöttük, és 150 g mellett, 5 percig, 4 °C-on centrifugáltuk. Az üledéket kidobtuk és a felülúszót 39 000 rpm mellett, 90 percig ultracentrifúgáltuk. Az így kapott üledéket 10 mmol/1 Hepes-pufferben (pH 7,4) szuszpendáltuk. A vezikulumokból származó EGFR analízise céljából a mintákat 9 térfogat etanollal precipitáltuk, 0,08 mol/1 Tris-pufferben szuszpendáltuk (pH 6,8), és standardként MAb-425 ellenanyag alkalmazása mellett SDSPAGE-analízist végeztünk.
A készítmények proteintartalmát módosított „Coomassie Plus” eljárással határoztuk meg, standardként BSA-t alkalmaztunk, és a leolvasást 595 nm-en végeztük. A vezikulumokból származó EGFR analízise céljából a mintákat 9 térfogat etanollal (egy éjszakán át, 4 °C-on) precipitáltuk. Az üledéket Trispufferben szuszpendáltuk (0,08 mol/1, pH 6,8), majd SDS-PAGE-analízist végeztünk [5%-os felső gél („stacking” gél), 1 óra, 35 mA; 10%-os futtató (alsó) gél, 2,5 óra, 40 mA], A mintákat és standardokat duplikátumban alkalmaztuk. Az egyiket „Coomassie Blue” festékkel festettük, a másikat nitrocellulóz lapokra biotoltuk (12 V, 16 óra, 4 °C), és egér-MAb-425 ellenanyaggal (anti-EGFR ellenanyaggal), majd alkalikus foszfatázzal konjugált, anti-egér IgGellenanyaggal kezeltük.
Az in vitro immunizációk során három tápfolyadékot alkalmaztunk. Ezek az alábbiak voltak: 1. tápfolyadék (Ml), 2. tápfolyadék (M2) és kevert timocita tápfolyadék („Mixed Thymocyte Culture Médium”) (MTC). Az Ml 50 mmol/1 2-merkaptoetanollal és 2 mmol/1 L-Glutaminnal (Gibco) kiegészített HL1 tápfolyadék volt (Ventrex Laboratories, USA). Az M2 tápfolyadék 50 mmol/1 2-merkaptoetanollal, 40 egység/ml IL-2-vel (Genzyme), 20 mg/ml adjuváns peptiddel („Adjuvant Peptid”, Sigma), 2 mmol/1 L-glutaminnal, 100 egység/ml penicillinnel (Gibco) és 100 mg/ml streptomycinnel kiegészített HL1 tápfolyadék volt (Ventrex Laboratories, USA). Az M2 tápfolyadékhoz 4% vagy 20% FCS-t (Biological Industries) adtunk. Az MTC tápfolyadékot Vaux eljárása szerint állítottuk elő (1). Röviden, háromhetes korú Balb/c- és C57/BL-1 egerek timuszából különálló sejteket tartalmazó sejtszuszpenziót állítottunk elő oly módon, hogy a csecsemőmirigyet (timuszt) steril 50 „mesh” méretű szitán átnyomtuk. A sejtszuszpenziót összegyűjtöttük, HBSSpufferrel kétszer mostuk, és az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel meghatároztuk. Ezt követően, a timocitákat 4% FCS-t, 2 mmol/1 Lglutamint, 100 egység/ml penicillint és 100 mg/ml streptomycint tartalmazó HL1 tápfolyadékban az egyes törzsekre vonatkoztatva, milliliterenként 2,5xlO6 sejtdenzitás eléréséig tenyésztettük. Negyvennyolc óra elteltével a felülúszókat eltávolítottuk, 0,22 mm-es szűrőn átszűrtük, és -70 °C-on tároltuk.
Nem immunizált, nyolchetes korú Balb/c-egerekból származó lépsejtszuszpenziót a timociták esetében leirt módszerrel állítottunk elő. Az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel határoztuk meg.
HU 221 001 Bl
2. példa
In vitro immunizáció és szűrővizsgálat
Az in vitro immunizáció során három tápfolyadékot alkalmaztunk. Ezek az alábbiak voltak: 1. tápfolyadék (Ml), 2. tápfolyadék (M2) és kevert timocita tápfolyadék („Mixed Thymocyte Culture Médium”) (MTC). Az Ml 50 mmol/1 2-merkaptoetanollal és 2 mmol/1 LGlutaminnal (Gibco) kiegészített HL1 tápfolyadék volt (Ventrex Laboratories, USA). Az M2 tápfolyadék 50 mmol/12-merkaptoetanollal, 40 egység/ml IL-2-vel (Genzyme), 20 mg/ml adjuváns peptiddel („Adjuvant Peptid”, Sigma), 2 mmol/1 L-glutaminnal, 100 egység/ml penicillinnel (Gibco) és 100 mg/ml streptomycinnel kiegészített HL1 tápfolyadék volt (Ventrex Laboratories, USA). Az M2 tápfolyadékhoz 4% vagy 20% FCS-t (Biological Industries) adtunk. Az MTC tápfolyadékot Vaux eljárása szerint állítottuk elő (1). Röviden, háromhetes korú Balb/c- és C57/BL-1 egerek timuszából különálló sejteket tartalmazó sejtszuszpenziót állítottunk elő oly módon, hogy a csecsemőmirigyet (timuszt) steril 50 „mesh” méretű szitán átnyomtuk. A sejtszuszpenziót összegyűjtöttük, HBSS-pufferrel kétszer mostuk, és az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel meghatároztuk. Ezt követően, a timocitákat 4% FCS-t, 2 mmol/1 Lglutamint, 100 egység/ml penicillint és 100 mg/ml streptomycint tartalmazó HL1 tápfolyadékban az egyes törzsekre vonatkoztatva, milliliterenként 2,5 xlO6 sejtdenzitás eléréséig tenyésztettük. Negyvennyolc óra elteltével a felülúszókat eltávolítottuk, 0,22 mm-es szűrőn átszűrtük, és -70 °C-on tároltuk.
Nem immunizált, nyolchetes korú Balb/c-egerekból származó lépsejtszuszpenziót a timociták esetében leírt módszerrel állítottunk elő. Az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel határoztuk meg.
Háromhetes korú Balb/c- és C57/BL-1 egerek timuszából különálló sejteket tartalmazó sejtszuszpenziót állítottunk elő oly módon, hogy a csecsemőmirigyet (timuszt) steril 50 „mesh” méretű szitán átnyomtuk. A sejtszuszpenziót összegyűjtöttük, HBSSpufferrel mostuk, és az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel meghatároztuk. Ezt követően, a timocitákat 4% FCS-t, 2 mmol/1 L-glutamint, 100 egység/ml penicillint és 100 pg/ml streptomycint tartalmazó HL1 tápfolyadékban az egyes törzsekre vonatkoztatva, mililiterenként 2,5xlO6 sejtdenzitás eléréséig tenyésztettük. Negyvennyolc óra elteltével a felülúszókat eltávolítottuk, átszűrtük, és tároltuk. Nem immunizált, nyolchetes korú Balb/c-egerekből származó lépsejtszuszpenziót a timociták esetében leírt módszerrel állítottunk elő. Az élő sejtek számát tripánkék festékkizárásos módszerrel határoztuk meg.
Az in vitro immunizációt 6 mélyületű lemezeken (Costar) végeztük. A rekeszekben 3,5 ml térfogatú Ml tápfolyadékban [50 pmol/1 2-merkaptoetanollal és 2 mmol/1 L-Glutaminnal (Gibco) kiegészített HL1 tápfolyadékban (Ventrex Laboratories, USA)] 107 lépsejtet inkubáltunk, a kívánt koncentrációban EGFR-t tartalmazó vezikulumok jelenlétében (37 °C-on, 5% CO2 mellett). A kontrollrekeszekhez EGFR-receptort nem expresszáló sejtekből származó vezikulumokat vagy PBS-t adtunk. Néhány óra múlva valamennyi mélyülethez 3,5 ml, 4% vagy 10% FCS-t (Biological Industries) tartalmazó M2 tápfolyadékot adtunk, [amely 50 pmol/1
2-merkaptoetanollal, 40 egység/ml IL-2-vel (Genzyme), 20 pg/ml adjuvánspeptiddel (,Adjuvant Peptid”, Sigma), 2 mmol/1 L-glutaminnal, 100 egység/ml penicillinnel (Gibco) és 100 pg/ml streptomycinnel kiegészített HL1 tápfolyadék volt (Ventrex Laboratories, USA)]. Egyes kísérletekben az M2 tápfolyadékot adjuváns peptiddel (20 pg/ml) és IL-2-vel (40 egység/ml) kiegészített MTC tápfolyadékkal (kevert timocita tápfolyadékkal) helyettesítettük [Vaux és munkatársai: Natúré. 336, 36 (1988).]. (Megjegyezzük, hogy az FCS, IL-2 és adjuváns peptid végkoncentrációja a tenyészetben ennél 50%-kal kisebb.) A sejteket 72, 96, 120 vagy 144 óráig a fentiekkel megegyező feltételek mellett inkubáltuk, végül, a sejteket specifikus immunglobulin jelenlétére teszteltük vagy azokból RNS-t izoláltunk.
A szűrővizsgálatot tisztított antigénekkel vagy fixált A431 sejtekkel végeztük. Az eljárás némi módosítással, lényegében megegyezett a korábban leírt eljárással [Caroll és munkatársai: Hybridoma 9, 81 (1990)]. Röviden, steril, 96 mélyületű lemezeket egy éjszakán át, PBS-ben oldott, tisztított EGFR-receptorral (2,5 pg/ml), GD3-ganglioziddal (2 pg/ml), vagy ribonukleázzal (10 pg/ml) fedtünk. Amennyiben antigénként A431 sejteket alkalmaztunk, a sejteket 96 mélyületű lemezeken egyrétegű tenyészet kialakulásáig tenyésztettük és 0,1%-os glutáraldehiddel fixáltuk. Az in vitro immunizált limfocitákat mostuk, 5xlO5 sejt/ml sűrűség eléréséig 2% fotális boíjúszérummal és 2 mmol/1 L-glutaminnal kiegészített HL1 tápfolyadékban szuszpendáltuk, valamennyi mélyülethez lxlO5 sejtet adtunk, és a sejteket 48 óráig (37 °C-on, 5% CO2 mellett) inkubáltuk. Valamennyi csoport esetében tizenhat duplikátumot készítettünk. Ezt követően, a limfocitákat 0,1% Tween-20-at tartalmazó PBS-sel történő ötszöri mosással eltávolítottuk. A specifikus immunglobulinokat peroxidázzal jelölt, nyálban termelt anti-egér-immunglobuliimal (Dako) mutattuk ki (1 óra, 37 °C). Szubsztrátként citrát-foszfát-pufferben (0,55 mg/ml) oldott 2,2’-azino-bisz(3-etilbenz-tiazolin6-szulfonsav)-diammóniumsót (ABTS) (Sigma) használtunk.
3. példa
A génkönyvtárak előállítása
Három fág ellenanyag-génkönyvtárat állítottunk elő, egyet intraperitoneálisan A431 sejtekkel immunizált egér lépéből [Murthy és munkatársai: Arch. Biochem. Biophys. 252, 549 (1987)], egyet talpon keresztül, tisztított EGFR-receptorral immunizált egér térdhajlati nyirokcsomójából, egyet pedig in vitro A431 vezikulumokkal immunizált egérsejtekből nyert RNS alapján. Első cDNS-szálat szintetizáltunk. A VHés Vk-géneket PCR-eljárással amplifikáltuk és összeállítottuk [Clackson és munkatársai: Natúré 352, 624 (1991)]. PCR-technikával a ffagmenseket NotI és
HU 221 001 Β1
Sfil restrikciós hasítási helyekkel toldottuk meg, és az scFv-ftagmenseket pHENl fágmid-vektorba klónoztuk [Hoogenboom és munkatársai: Nucl. Acids Rés. 19, 4133 (1991)]. A ligálási reakció termékét elektroporációval E. co/z'-sejtekbe juttattuk, a kapott telepeket lekapartuk és tápfolyadékba tettük, hogy génkönyvtártörzstenyészeteket kapjunk [Marks és munkatársai: J. Mól. Bioi. 222, 581 (1991)].
4. példa
A génkönyvtárak átvizsgálása A génkönyvtárakból M13K07 „helper-fág” alkalmazásával (Promega, Madison, WI) fág ellenanyagokat szabadítottunk fel [Marks és munkatársai: J. Mól. Bioi. 222, 581 (1991)]. Immunvizsgálat céljára készült csöveket („Immunotube”, Nunc, Life Sciences, Paisley, UK) egy éjszakán át, 4 ml, 2,5 pg/ml koncentrációjú, PBSben oldott EGFR-receptorral fedtünk. PBS-sel végzett három mosást követően a csöveket legalább egy óráig, 37 °C-on, 2% tejport tartalmazó PBS-pufferrel (PBSMpufferrel) inkubáltuk. A fágokat (1012—1013) 4 ml PBSM-pufferben szuszpendáltuk, és az EGFRreceptorral fedett csövekben 1 óráig, szobahőmérsékleten inkubáltuk. A csöveket hússzor 0,1% Tween-t tartalmazó PBS-sel, majd hússzor PBS-sel mostuk. A kötődött fágokat 10 percig, 1 ml térfogatú, 0,1 mol/1 trietilaminnal, rotációs keverővei végzett inkubálást követően eluáltuk. Az eluált fágokat 0,5 ml, 1 mol/1 TrisHCl (pH 7,5) hozzáadásával neutralizáltuk, majd azokkal log-fázisú, E. coli TG1 törzshöz tartozó sejteket fertőztünk. A fertőzött sejteket kioltottuk és különálló telepeket választottunk scFv-fragmensek kis mennyiségű indukciója céljára. A megmaradt telepeket tápfolyadékba kapartuk, és abból vettünk mintát, hogy a következő vizsgálati körhöz fágokat állítsunk elő.
5. példa scFv-fragmensek előállítása és analízise A korábbiakban leírtak szerint [Kettleborough és munkatársai: lásd fent] oldható scFv-ffagmenseket állítottunk elő E. coli HB2151 törzsben. A baktérium felülúszóban az scFv-fragmensek koncentrációját ismert koncentrációjú, tisztított scFv-fragmens készítmény standardként történő alkalmazásával határoztuk meg. A felülúszókat szűrtük, és 0,1% koncentráció eléréséig nátrium-azidot adtunk hozzájuk. A felülúszókból és a standardból készített sorozathígításokat 96 mérőhelyes „dot-blot”-készülékkel foltok formájában Immobilon-PVDF filterekre vittünk fel. A filtereket Westem-blot-analízisnél alkalmazott eljárás szerint kezeltük [Towbin és munkatársai: Proc. Nat. Acad. Sci. USA 76, 4350 (1979)]. Az scFv-ffagmenseket a C-terminális-toldalék ellen termelt ellenanyag [Munro és Pelham: Cell 46, 291 (1986)], majd peroxidázzal konjugált, kecskében termelt anti-egér IgG- és IgM-ellenanyagok (Jackson ImmunoResearch Láb Inc., West Grove, PA) alkalmazásával mutattuk ki. A reakciót az ECL-rendszer (Amersham, Aylesbury, UK) alkalmazásával hívtuk elő. Denzitométerrel, előzőleg villanásszerűen megvilágított („pre-flashed”) autoradiogramokat tapogattunk le.
Standard görbét készítettünk, és annak alapján a felülúszókban meghatároztuk az scFv-fragmensek koncentrációját.
Antigén-kötődési ELISA-vizsgálatokat EGFRreceptorral (2,5 pg/ml) lemezek alkalmazásával végeztünk. Az scFv-fragmenseket tartalmazó felülúszókat PBSM-pufferben hígítottuk és a lemezekhez adtuk. A kötődött scFv-ffagmenseket a fent leírtak szerint, 9E10-ellenanyagok alkalmazásával mutattuk ki. A felülúszókat egy sor semleges proteinhez és műanyaghoz történő kötődésre is teszteltük. ELISA-lemezeket egy éjszakán át, 100 pg/ml koncentráció mellett, ovalbuminnal, tyúktojás-lizozimmal, citokróm-c-vel, glicerinaldehid-3-foszfát-dehidrogenázzal, egéralbuminnal (CBA-törzs), valamint BSA-val fedtünk. A fedett lemezekhez duplikátumokban, 2% tejport tartalmazó, hígítatlan felülúszót adtunk, és a kötődött scFv-fragmenseket a fent leírtak szerint kimutattuk.
A sejtkötődési ELISA-vizsgálatokat tumorsejtvonalak, nevezetesen A431 (ATCC CRL 1555), MDA-MB-468 (ATCC HTB 132) és SK-MEL-23 (negatív kontroll) sejtvonalak alkalmazásával végeztük. A sejteket poli-D-lizinnel kezelt, 96-mélyületű szövettenyésztő lemezeken (Nunc) összefüggő sejttenyészet kialakulásáig tenyésztettük. A sejteket DMEM-pufferrel mostuk, és 37 °C-on, 2 óráig, 2,5% BSA-t tartalmazó PBS-sel blokkoltuk. A leszívást követően valamennyi mélyülethez felülúszót, valamint azzal megegyező térfogatú, 4% tejport tartalmazó 2xYT-tápfolyadékot adtunk, és a sejteket 1 órán át, 4 °C-on inkubáltuk. A kötődött scFvfragmenseket a fent leírtak szerint mutattuk ki.
Kompetíción alapuló ELISA-vizsgálatot végeztünk oly módon, hogy EGFR-receptorral fedett lemezeket 50 pl tisztított scFv-fragmenssel (100 pg/ml) 10 percig előinkubáltunk. A lemezekhez MAb-425 ellenanyagot (50 pl) adtunk 3,13-200 ng/ml koncentrációkban. Az inkubációt és mosást követően a kötődött MAb-425 ellenanyagokat kecskében termelt, antiegér IgG- és IgM-ellenanyagok alkalmazásával mutattuk ki.
6. példa
DNS-analízis
A BstNI-ujjlenyomat készítéséhez az egyes kiónokból származó scFv-fragmens-inszerteket PCReljárással amplifikáltuk, és a terméket BstNI-enzimmel emésztettük [Clackson és munkatársai: Natúré 352, 624 (1991)]. A DNS-t Sequenase-reagenskészlet alkalmazásával szekvenáltuk (United States Biochemicals, Clevland, OH).
7. példa
Az scFv-fragmensek tisztítása
A bakteriális felülúszókat centrifügálással feltisztítottuk, 0,2 pm áteresztőképességű filtereken átszűrtük, majd 1 ml térfogatú, cianogén-bromiddal aktivált „Sepharose-4B”-hez (Pharmacia, Uppsala, Svédország) kötött, tisztított EGFR-receptort (5 mg) tartalma11
HU 221 001 Bl zó oszlopra vittük fel. Az oszlopot 30 ml PBS-sel, majd 5 ml 0,2 mol/1 glicinnel (pH 5,0) mostuk. Az scFvfragmenseket 0,2 mol/1 glicin/HCl oldattal (pH 2,8) eluáltuk. Az eluátumot 10 χ PBS-pufferrel neutralizáltuk. A proteintartalmú frakciókat összegyűjtöttük, és puffért ultrafiltrációval (Amicon, Stonehouse, UK) 1% BSA-t és 0,05% nátrium-azidot tartalmazó PBS-re cseréltük.
8. példa
A tisztított scFv-fragmensekFACS-analízise
A431 sejteket tripszinnel kezeltünk és 10% FCS-t tartalmazó DMEM-ben inkubáltunk. A sejteket hideg DMEM-pufferrel kétszer mostuk, és 45 pm áteresztőképességű filteren átszűrtük. A sejteket (106) 30 percig, jégen, 50 μΐ térfogatú, 1% BSA-t tartalmazó PBSben oldott, tisztított scFv-fragmensekkel inkubáltuk. Hideg PBS-pufferrel végzett két mosást követően a kötődött scFv-fragmenseket 50 μΐ FITC-konjugált 9E10 ellenanyag (100 pg/ml) alkalmazásával mutattuk ki. Miután a sejteket 30 percig jégen tartottuk, azokat PBS-sel egyszer mostuk, 1% formaldehidet tartalmazó PBS-sel fixáltuk, és FACSCAN-készülékkel (Becton-Dickinson, Cowley, UK) analizáltuk.
9. példa
Teljes, kiméra-ellenanyagok előállítása, analízise és expresszálása
PstI és BstEII hasítási helyek felhasználásával a kiválasztott scFv-fragmensek VH-régióit kódoló DNSeket humán-HG3-CL ellenanyagból [Rechavi és munkatársai: Proc. Nat. Acad. Sci. USA 80, 855 (1983)] származó eukarióta szignálszekvenciát és összekapcsolási donorhelyet tartalmazó, VH köztivektorba szubklónoztuk (3. ábra). A Vk-régiókat kódoló DNSeket Vk köztivektorba történő inszertálás céljából PCR láncinditó oligonukleotidok alkalmazásával úgy módosítottuk, hogy azok az 5’- és 3’-végeken Xhol és SstI hasítási helyeket tartalmazzanak:
[Vk „Fór” (előre irányuló):
5’-CCG TTT CAG CTC GAC CTT GGT CCC-3’, Vk Back” (visszafelé irányuló):
5’-GAC ATT GAG CTC ACC CAG TCT CCA3’]. Az Sstl-Xhol ffagmenseket átalakított humán CAMPATH-1 könnyűláncból származó eukarióta szignálszekvenciát [Riechmann és munkatársai: Natúré 332, 21 (1988)] és összekapcsolási donorhelyet tartalmazó Vk köztivektorba klónoztuk (3. ábra). A variábilis régiókat valamint eukariótahatároló („flanking”) régiókat kódoló DNS-eket HindlII-BamHIfragmensekként humán-gamma-1 konstans régiót vagy humán kappa konstans régiót kódoló genomi DNS-t tartalmazó emlőssejt expressziós vektorba klónoztuk [Maeda és munkatársai: Hűm. Antibod. Hybridomas 2, 124 (1991)]. A nehézlánc és könnyűlánc expressziós vektorokat elektroporációval COS-sejtekbe juttattuk. 72 óra elteltével a tápfolyadékot összegyűjtöttük, és a kiméra anti-EGFR ellenanyagokat ELISA-eljárással analizáltuk [Kettleborough és munkatársai: Protein Eng. 4, 773 (1991)].
10. példa
In vitro immunizált sejtekből származó scFvfragmensek előállítása
Az alábbiakban leírt eljárások a fent ismertetett eljárások kismértékben módosított változatai. Az immunizálást, a génkönyvtárak előállítását és átvizsgálását az 1-4. példákban leírtak szerint végeztük. Az azt követő lépéseket az alábbiakban részletesen ismertetjük.
Az elsődleges génkönyvtár, valamint a három lépésben végrehajtott „panning”-eljárás után nyert kiónok vizsgálatát követően néhány különálló, ampicillinrezisztens kolóniát választottunk ki. Alkalikus lizálással fágmid DNS-t állítottunk elő, és hő-sokk alkalmazásával egy nem szupresszor törzset, közelebbről, E. coli HB2151 törzset transzfektáltunk. Telepeket 2 xTY-Amp-Glu-tápfolyadékba oltottunk, és egy éjszakán át, 30 °C-on tenyésztettünk. Egy 5 ml térfogatú mintával 50 ml térfogatú, 100 mg/ml ampicillint és 0,1% glükózt tartalmazó 2xTY-tápfolyadékot oltottunk be, és 1 órán át (a „log”-fázis eléréséig), rázás mellett, 30 °C-on folytattuk a tenyésztést. A sejteket összegyűjtöttük, és az oldható scFv-fragmensek expresszálódását 1 mmol/1 végkoncentrációig izopropil-P-D-tiogalaktopiranozid (IPTG) hozzáadásával indukáltuk [De Bellis D. és Schwartz I.: Nucleic Acids Rés. 18, 1311 (1990)]. A tenyészeteket egy éjszakán át, 30 °C-on, rázás mellett tenyésztettük. Az scFvfragmenseket tartalmazó felülúszókat centrifugálással feltisztítottuk, és 0,22 mm-es szűrőn átszűrtük és teszteltük. A bakteriális felülúszókat a fent leírtak szerint, ELISA-eljárással EGFR-receptorhoz történő kötődésre teszteltük [Kettleborough és munkatársai: EP 94 104 160; és Eur. Immunoi. 24, 952 (1994)]. Kiválasztott scFv-fragmensek specifitását ELISA-eljárással vizsgáltuk különböző, EGFR-receptorral rokonságot mutató vagy EGFR-receptorral rokonságot nem mutató proteinekkel vagy egyéb antigénekkel fedett lemezek, valamint műanyagok alkalmazásával. Az alábbi antigéneket alkalmaztuk: RN-áz, BSA, ÓVA, GD3gangliozid, vitronektin-receptor (VNR), IlblIIa vérlemezke-glikoprotein (GPIIblIIa), és diszialil-laktoN-tetraóz (DSLNT). A fedést egy éjszakán át, az egyes antigének esetében optimális koncentráció mellett végeztük. A fedett ELISA-lemezeket 1 órán át, 37 °C-on, PBS-ben (vegyes %) oldott 1,5% fölözött tejporral fedtük. Mosást követően a mikrotitráló lemezek mélyületeihez 100 μΐ scFv-ffagmenst tartalmazó felülúszót adtunk, és a lemezeket 2 órán át, 37 °C-on inkubáltuk. A kötődött scFv-fragmenseket a 9E10 antic-myc ellenanyag (Mycl-9E10,2 hibridoma kondicionált tápfolyadéka), valamint alkalikus foszfatázzal konjugált, nyúlban termelt anti-egér ellenanyag (Dako) alkalmazásával mutattuk ki.
Három EGFR-receptort hordozó tumorsejtvonalat, az A431, az MDA-MB-231 humánemlő-adenokarcinóma (ATCC, HTB 26) és a HT29 humánvastagbéladenokarcinóma (ATCC, HTB 38) sejtvonalakat, valamint egy EGFR-receptort nem expresszáló, WM-164 jelzésű sejtvonalat használtunk az scFvfragmensek sejteken található EGFR-receptorhoz való
HU 221 001 Bl kötődési képességének tesztelésére, FACS-analízis és immunfluoreszcencia alkalmazásával, fixálatlan sejteken. Az indirekt fluoreszcencia-analízishez a sejteket Terasaki-lemezekre oltottuk (2 x1ο4 sejt/mélyűlet) és 24 óráig tenyésztettük. Ezután a sejteket 90 percig, szobahőmérsékleten, 20 ml térfogatú, az scFvfragmenseket tartalmazó nyers, bakteriális felülúszóval inkubáltuk. Az első ellenanyaggal (anti-c-myc) és második ellenanyaggal történő inkubálást 60-60 percig, szobahőmérsékleten végeztük. A második ellenanyagot, amely FITC-konjugált, nyúlban termelt anti-egér ellenanyag volt (Dako) 1:20 arányban hígítottuk.
A FACS-analízishez 5 χ 105 sejtet 1% BSA-t és 0,1% nátrium-azidot tartalmazó PBS-sel (PBS-BSA) mostunk, és 20 percig, 4 °C-on, 50 ml térfogatú, nyers bakteriális felülúszóval inkubáltunk. Hideg PBS-BSApufferrel végzett két mosást követően a kötődött scFvffagmenseket anti-c-myc ellenanyaggal és 1:25 arányban hígított, FITC-konjugált, kecskében termelt antiegér ellenanyaggal (Becton-Dickinson) mutattuk ki. A sejtekhez 5 mg/ml végkoncentrációban propidiumjodidot (Pl) adtunk. Egy léghűtéses argonlézerrel felszerelt „EPICS Profile Il”-készülékkel „flow-citometriás” analízist végeztünk. A 488 nm hullámhosszot (15 mV) alkalmaztuk gerjesztésre. A FITC-emissziót egy 530 nm-es sávszűrővel, a PI-emissziót egy 625 nm-es sávszűrővel gyűjtöttük. Élő sejteket szelektáltunk az előreeső fényszórás (a sejt granuláltságának a mértékére jellemző) és az oldalirányú szórás (a sejt méretére jellemző) adatainak pontdiagramon történő ábrázolása és a PI-festődött sejtek kizárása alapján.
Az elsődleges és a szelektált génkönyvtárak változatosságát klónozott fragmensek PCR-amplifikációjával [Güssow D. és Clackson T.: Nucleic Acids Rés. 17, 4000 (1989)] és a BstNI emésztéssel kapott minták analízisével (8) határoztuk meg. Néhány kiónt Sequenasereagenskészlet alkalmazásával (USB), didezoxiláncterminációs eljárással szekvenáltunk [Sanger F. és munkatársai: Proc. Nat. Acad. Sci. USA 74, 5463 (1977)].
Nyers bakteriális felülúszókat (10 μΐ) SDS-PAGEeljárással, 12,5%-os gélen vizsgáltunk. Westem-blotanalízist végeztünk, lényegében Towbin leírása szerint [Towbin és munkatársai: J. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 76, 4350 (1979)]. A proteineket elektrobloteljárással Immobilon-P (Millipore) vagy nitrocellulóz (Bio-Rad) membránokra vittük át. A blotot 2% (vegyes %) fölözött tejet tartalmazó PBS-sel blokkoltuk. Az scFv-fragmenseket anti-wyc-ellenanyag (9E10 ellenanyag), peroxidázzal konjugált, anti-egér ellenanyag (Jackson) és erősített kemilumineszcens rendszer (ECL, Amersham) alkalmazásával mutattuk ki.
A levált membránvezikulumok kvantitatív analízise szerint az összproteinkoncentráció 2,5 mg/ml volt, melynek csak 10-14%-a, azaz 250-350 ng/ml képviselt EGFR-receptort [Sato és munkatársai: J. Natl. Cancer Inst. 21, 1601 (1989); Yeaton és munkatársai : J. Bioi. Chem. 258, 9254 (1983)]. SDS-PAGEeljárással végzett elektroforetikus analízis, majd „Coomassie-blue” festékkel történő festés azt mutatta, hogy a vezikulumok igen összetett proteinkeveréket tartalmaztak. ProteindegradáciÓTa utaló jelet nem láttunk. Westem-blot-analízis alapján megállapítottuk, hogy az általunk alkalmazott kísérleti feltételek mellett a membránvezikulum készítményben teljes EGFreceptor-molekulák voltak jelen.
Az FCS- és limfokinszükségletet meghatározása céljából 20% vagy 4% FCS-t tartalmazó MTC és M2 tápfolyadékokat hasonlítottunk össze. Antigénként és kontrollként EGFR-tartalmú vezikulumokat, valamint PBSt alkalmaztunk. A lépsejteket 3 órán át, hat mélyületű lemezeken Ml tápfolyadékban (szérummentes tápfolyadékban) inkubáltuk antigén jelenlétében vagy anélkül. Ezt követően a sejtekhez MTC vagy M2 tápfolyadékot adtunk, és 72, 96,120 vagy 144 óra elteltével vizsgálatot végeztünk fixált A431 sejtek alkalmazásával. A visszanyert élő sejtek száma valamennyi kísérletben 20-40% közé esett, ami megegyezik korábbi közleményekben leírt eredményekkel [Gavilondo-Cowley J. és munkatársai: „In vitro Immunization in Hybridoma Technology”, „Elsevier Science Publishers Β. V.” Amszterdam, 131. oldal (1988)]. A specifikus válasz maximumát MTC alkalmazása mellett, a negyedik napon mértük; míg a 4% vagy 20% FCS-t tartalmazó (2% vagy 10% FCS-végkoncentrációjú) M2 tápfolyadék a hatodik napig késleltette a maximális válasz kialakulását (2. táblázat). Az MTC azonban 10% FCS mellett, valószínűleg poliklonális aktiválás révén, nem specifikus választ váltott ki, amint azt láttuk akkor, amikor az eredményeket a specifikus és nem specifikus válasz hányadosaként fejeztük ki. A további kísérletekben 4% FCS-t tartalmazó M2 tápfolyadék alkalmazása és 6 napos tenyésztés mellett döntöttünk.
Az EGFR jelenléte a vezikulumok felszínén erősen megnövelte az antigénre adott válasz mértékét. A fent leírthoz hasonló eljárás szerint, EGFR-t expresszáló és nem expresszáló sejtvonalakból származó vezikulumokat hasonlítottunk össze. Limfocitákat 3 órán át, Ml tápfolyadékban, vezikulumok jelenlétében inkubáltunk. Ezt követően, a sejtekhez 4% FCS-t tartalmazó M2 tápfolyadékot adtunk. Hat nap elteltével, az egyes csoportokból származó limfocitákat 48 óráig, EGFR-receptorral, fixált A431 sejtekkel, RNáz-zal vagy GD3-mal fedett, 96 mélyületű lemezeken inkubáltuk. A vártnak megfelelően, ezeknek a vizsgálatoknak az eredményei multispecifikus válaszmintát mutattak (3. táblázat). Az optikai denzitás alapján az EGFR-receptorral szemben kimutatható reaktivitás nyilvánvalóan nagyobb volt, amennyiben antigénként EGFR-expresszáló vezikulumokat alkalmaztunk.
Összefoglalva, ezek az eredmények arra utalnak, hogy az in vitro immunizációt követően, habár éretlen, de kimutatható mértékű, antigéndependens válasz jött létre, mely révén több, EGFR-receptorral szemben irányuló, variábilis régiók PCR-klónozására alkalmas, immunizált limfocitacsoport keletkezett.
Az in vitro immunizációt követően kapott scFvfragmensek pHENl fágmidba történő klónozását követően 1,1 χ 105 klónból álló génkönyvtárat nyertünk. Ezt a génkönyvtárat két másik, in vivő immunizációval ka13
HU 221 001 Bl pott génkönyvtárral párhuzamosan állítottuk elő. Ezeknek a fág génkönyvtáraknak az előállítását a korábbiakban leírták [Kettleborough és munkatársai: EP 94 104 160; és Eur. J. Immunoi. 24, 952 (1994)].
Az EGFR-receptorhoz kötődő scFv-fragmensek szelektálása céljából a fágokat EGFR-receptorral fedett immuncsövek felhasználásával „panning”eljárásnak vetettük alá. Az eluált fágokkal SupE E. coli-törzset fertőztünk, összesen három szelekciós kört végeztünk. Mindegyik körben, a háttér kiszámítása céljából egy antigénmentes csövet teszteltünk párhuzamosan. Az első mosás során az immuncsőbe
1,5 χ 1010 fágrészecskét mértünk, és a fedett immuncsőből 6,6xlO4 fágrészecskét eluáltunk; míg a háttérpopulációból csupán 200 kolóniát kaptunk. A harmadik mosás során a csőbe 1 χ 1011 fágrészecskét mértünk, és 5,6 χ 1010 fágrészecskét eluáltunk.
Az scFv-fragmensek további jellemzése céljából, a fágpopulációkból a szelekciót megelőzően és az egyes szelekciós köröket követően 22-22 kiónt választottunk ki.
A génkönyvtár változatosságát a klónozott fragmensek BstNI-enzimmel kapott emésztési mintája alapján analizáltuk. A szelekciót megelőzően a génkönyvtár rendkívül változatosnak tűnt. Az első szelekciós kört követően a kötődött kiónok emésztési mintája több azonos restrikciós mintával rendelkező csoport jelenlétére utalt.
A különböző szelekciós körökből a kiónok kiválasztása az emésztési minták alapján történt. A DNSszekvenálás a legtöbb szelektált kiónban eltérő szekvenciák jelenlétét mutatta. A 10D2, 5D3, 10E2, 1B3, 4B3 és 5E2 kiónokban található komplementeritást meghatározó régiók (CDR-régiók) hosszúsága és összetétele eltérő volt. A legtöbb variáció a VH- és VL-szekvenciák CDR3 régiójában volt megfigyelhető. A 5D3 és 1E3 kiónok a harmadik szelekciós körből származtak. Ezek ELISA-analízis és „flow cytometriás” vizsgálat alapján erősen kötődtek EGFR-receptorhoz, és azonos szekvenciával rendelkeztek.
Oldható scFv-fragmenseket a HB-2151 jelzésű, nem szupresszor E. coli-törzs IPTG jelenlétében történő tenyésztésével nyertünk.
Az scFv-termelődés igazolására, az egyes kiónokból származó bakteriális tápfolyadékot gélelektroforézissel analizáltuk. Western-blotanalízissel, egy körülbelül 35 000 kD nagyságú, jól kivehető csíkot mutattunk ki.
Az EGFR-receptorral szemben kötődési aktivitást mutató kiónokat ELISA-eljárással azonosítottuk. A szelektált kiónok keresztreaktivitásának vizsgálatára különböző antigének alkalmazásával ELISA-vizsgálatokat végeztünk. Az antigénekkel (EGFR, RN-áz, BSA, KLH, ÓVA, GD3-gangliozid, vitronektin-receptor, IlblIIa vérlemezke-glikoprotein és diszialil-lakto-N-tetraóz) az optimális koncentráció alkalmazása mellett ELISA-lemezeket fedtünk (4. táblázat). A nem EGFR-antigénekhez nem volt kötődés kimutatható. Az scFv-fragmensek három EGFR-receptort hordozó tumorsejtvonalhoz (A431 humán epidermoid karcinóma, MDA-MB-231 humánemlő-adenokarcinóma és HT-29 humánvastagbél-adenokarcinóma sejtvonalakhoz) történő kötődését is teszteltük. Negatív kontrollként egy EGFR-receptort nem expresszáló, WM-164 jelzésű, humánmelanomasejtvonalat alkalmaztunk. A tumorsejtvonalakhoz kötődő kiónokat fixálatlan sejtek alkalmazásával, indirekt immunfluoreszcenciás eljárással is teszteltük, az eredményeket FACS-analízissel mennyiségileg meghatároztuk. A fixálatlan sejtek alkalmazása biztosítja a membránreceptorok természetes konformációjának megtartását. A pozitív kiónok A431 sejtek felhasználása mellett jól kivehető fluoreszcenciát mutattak. A többi EGFR-receptort hordozó tumorsejtvonal alkalmazása esetén gyenge fluoreszcenciát figyeltünk meg. A negatív sejtvonalhoz nem volt kötődés kimutatható. Az eredményeket „flow cytometriás” eljárással megerősítettük. Tizenhét pozitív kiónt és három negatív kiónt vizsgáltunk „flow cytometriás” eljárással A431, MDA-MB-231 és HT-29 sejtvonalakhoz történő kötődésre nézve. Negatív sejtvonalként WM-164 sejtvonalat alkalmaztunk. Pozitív kontrollként a 425-scFv-fragmenst (Pl kiónt), negatív kontrollként a klónozóvektort (HEN) alkalmaztuk. Az eredményeket az 5. táblázatban összegeztük. Két klón, a 4B2 és 5E2 klón, ELISA-vizsgálat alapján az EGFRreceptorhoz történő kötődésre pozitívnak bizonyult, de az EGFR-receptort expresszáló tumorsejtvonalakhoz történő kötődésre nézve negatív volt.
2. táblázat
Különböző tápfolyadékok hatása az in vitro immunizációra2)
A431-sejtekkel szemben történő vizsgálat napja
3. nap 4. nap 5. nap 6. nap
Vizsgálat Antigén | O.D.C) | arány4) | O.D. | arány | O.D. | arány | O.D. | arány |
1. vezikulumok | 0,39 | 2,11 | 0,80 | 3,76 | 0,78 | 3,90 | 0,95 | 10,3 |
PBS | 3 | 1 | 4 | 1 | ||||
0,18 | 0,21 | 0,20 | 0,09 | |||||
6 | 3 | 1 | 2 |
HU 221 001 Bl
2. táblázat (folytatás)
A431-sejtekkel szemben történő vizsgálat napja
Vizsgálat | Antigén | 3. nap | O.D. | 4. nap arány | 5. nap | 6. nap | |||
O.D.c) | arány4) | O.D. | arány | O.D. | arány | ||||
2. | vezikulumok | 0,52 | 2,50 | 0,85 | 1,76 | 0,86 | 2,75 | 1,16 | 3,94 |
PBS | 7 | 2 | 3 | 8 | |||||
0,21 | 0,48 | 0,31 | 0,29 | ||||||
0 | 2 | 3 | 6 | ||||||
3. | vezikulumok | 0,76 | 1,48 | 1,16 | 2,01 | 1,08 | 2,07 | LU | 1,91 |
PBS | 3 | 9 | 9 | 5 | |||||
0,51 | 0,58 | 0,52 | 0,58 | ||||||
3 | 1 | 5 | 1 |
1. vizsgálat: Ml, valamint 4% FCS-t tartalmazó M2 (FCS végkoncentráció: 2%);
2. vizsgálat: Ml, valamint 20% FCS-t tartalmazó M2 (FCS végkoncentráció: 10%);
3. vizsgálat: A tápfolyadék, valamint 4% FCS-t tar- gc talmazó MTC (FCS végkoncentráció: 2%);
a) BALB/c egerekből nyert lépsejteket (107) hat mélyületű lemezeken, 3 órán át, 3,5 ml, A431 sejtekből származó vezikulumokat tartalmazó Ml tápfolyadékban vagy PBS-ben inkubáltunk. Ezt követően a sejtekhez 3,5 ml, θθ 4% vagy 20% FCS-t tartalmazó MTC tápfolyadékot vagy M2 tápfolyadékot adtunk, és a lemezeket inkubáltuk.
A 3., 4., 5. és 6. napokon in vitro immunizált limfocitákat a tápfolyadékból eltávolítottuk, a vezikulumok eltávolítása céljából HBSS-pufferrel mostuk, és fixált A431 sejtek- gg kel fedett, 96 mélyületű lemezekre oltottuk, majd 48 órán át inkubáltuk (lásd a módszerek leírását).
b) Az FCS végkoncentrációja a tápfolyadékban.
c) O.D.: a 405 nm-en mért optikai denzitást jelenti.
Az eredmények tizenhat rekesz átlagát képviselik.
d) A specifikus válasz (antigénként vezikulumok alkalmazása mellett) és a nem specifikus válasz (antigénként PBS alkalmazása mellett) aránya.
3. táblázat ^5
Az in vitro immunizációt követően létrejött válasz multispecifitása»)
A vizsgálatot az alábbi antigénekkel szemben végeza) Limfocitákat in vitro immunizáltunk EGFRreceptort expresszáló (EGFR+) vagy EGFR-receptort nem expresszáló (EGFR-) vezikulumokkal. Hat napig tartó inkubációt követően a sejteket eltávolítottuk a tenyészetből, és a fent felsorolt antigénekkel szemben vizsgáltuk.
b) A választ optikai denzitásban (405 nm) adtuk meg.
4. táblázat
Kiválasztott scFv-fragmensek keresztreaktivitása néhány antigénnel szemben»)
Antigénb> | Fedés [mg/ml] | Eredmény |
EGFR | 2,5 | + |
RN-áz | 10 | - |
BSA | 10 | - |
KLH | 10 | - |
ÓVA | 10 | - |
GD3-gangliozid | 2 | - |
VNR | 1 | - |
GPIIblIIa | 1 | - |
DSLNT | 5 | - |
antigén A431- csoport sejtek | EGFR | GD3 | RN-áz | |
1. vizs- | EGFR+ 0,5120») | 0,326 | 0,140 | 0,249 |
gálát | EGFR- 0,427 | 0,070 | 0,123 | 0, 304 |
2. vizs- | EGFR+ 1,430 | 0,730 | 0,233 | 0,670 |
gálát | EGFR- 0,789 | 0,195 | 0,118 | 0,561 |
a) Az ELISA-vizsgálatokat a leírtak szerint végeztük.
b) Vitronektin-receptor (VNR); IlblIIa vérlemezkeglikoprotein (GPIIblIIa); diszialil-lakto-N-tetraóz (DSLNT).
HU 221 001 Bl
5. táblázat scFv-klónok EGFR-receptorral szemben mért reaktivitása. Tisztított, oldható antigénnel végzett ELISA-eljárás és sejtvonalak alkalmazásával végzett citometriás analízis összehasonlító eredményei
Kiónok pozitív | Tumorsejtvonalak citometriás analízise3) (önkényes fluoreszcenciaegységek átlagértéke)4 | ELISA (O.D.) EGFR | |||
WM164 | A431 | MDAAMÖB231 | HT29 | ||
7H1 | 1,5 | 112,9 | 16,4 | 2,6 | 1,2 |
4B2 | 1,2 | 5,3 | 4,2 | 0,6 | 2 |
10D2 | 1,5 | 145,3 | 36,3 | 4,8 | 2 |
12D2 | 1,8 | 129,5 | 29,3 | 5,7 | 2 |
5E2 | 1,4 | 2,5 | 7,1 | 0,5 | 1,8 |
8E2 | 1,5 | 134,5 | 47,7 | 5,1 | 1,9 |
5F2 | 1,3 | 146,3 | 40,6 | 5,7 | 1,9 |
11H2 | 1,9 | 152,2 | 25,3 | 2 | 1,9 |
1B3 | 0,6 | 105,1 | 36,4 | 5,2 | >2 |
4B3 | 0,5 | 78 | 15,8 | 2,3 | 2 |
3D3 | 1,2 | 94,3 | 25,1 | 4,8 | 1,9 |
5D3 | 0,5 | 112 | 22,2 | 5,5 | >2 |
4F3 | 0,4 | 110,3 | 32,3 | 6,2 | >2 |
4G3 | 0,4 | 76,5 | 20,4 | 2 | >2 |
1E3 | 0,4 | 118,3 | 33,8 | 5,1 | 2 |
3H3 | 0,6 | 76,5 | 33,7 | 4,2 | >2 |
negatív | |||||
5F1 | 2,4 | 2,3 | 3,6 | 1,8 | 0,2 |
7G1 | 1,4 | 10,2 | 4 | 2,8 | 0,2 |
1H1 | 0,5 | 5 | 4 | 0,75 | 0,2 |
kontrollok | |||||
HEN | 0,4 | 4,1 | 3,7 | 1 | 0,2 |
Pl | 0,6 | 85,5 | 21,3 | 2,5 | 1,9 |
a) Három EGFR-receptort hordozó sejtvonalat b) Negatív és pozitív kontrolokként inszertált (A431, MDAAMB231 és HT29) és egy EGFR- 50 fragmenst nem tartalmazó vektort (HEN) és receptort nem expresszáló sejtvonalat (WM164) alkal- Mab-425 ellenanyagból származó scFv-fragmenst máztunk az scFv-fragmensek tumorsejtekhez történő (Pl) használtunk.
kötődésének fent ismertetettek szerint végzett citometriás analízisére.
HU 221 001 Bl
SZEKVENCIALISTA
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 327 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ : egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L2 1 IC (könnyűlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-327
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAC Asp 1 | ATT GAG | CTC Leu | ACC Thr 5 | CAG Gin | TCT CCA GCC TCC | CTG GCT | GCA Al a | TCT Ser | GTG Val 15 | GGA Gly | 48 | |||||
Ile | Glu | Ser | Pro | Al a | Ser 10 | Leu | Al a | |||||||||
GAA | ACT | GTC | ACC | ATC | ACA | TGT | CGA | GCA | AGT | GAG | AAC | ATT | TAC | TAT | AGT | 96 |
Glu | The | Val | Thr | Ile | Thr | Cys | Arg | Al a | Ser | Glu | Asn | Ile | Tyr | Tyr | Ser | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
TTA | GCA | TGG | TAT | CAG | CAG | AAG | CAA | GGG | AAA | TCT | CCT | CAG | CTC | CTG | ATC | 144 |
Leu | Al a | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Gin | Gly | Lys | Ser | Pro | Gin | Leu | Leu | I le | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
TAT | AGT | GCA | AGC | GCC | TTG | GAA | GAT | GGT | GTC | CCA | TCG | AGG | TTC | AGT | GGC | 192 |
Tyr | Ser | Al a | Ser | Al a | Leu | Glu | Asp | Gly | Val | Pro | Ser | Arg | Phe | Ser | Gly | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
AGT | GGA | TCT | GGG | ACA | CAG | TAT | TCT | TTA | AAG | ATC | AAC | AAC | ATG | CAG | CCT | 240 |
Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Gin | Tyr | Ser | Leu | Ly s | Ile | Asn | Asn | Me t | Gin | Pro | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GAA | GAT | ACC | GCT | ACT | TAC | TTC | TGT | AAA | CAG | ACT | TAT | GAC | GTT | CCG | TGG | 288 |
Glu | Asp | Thr | Al a | Thr | Tyr | Phe | Cy s | Lys | Gin | Thr | Tyr | Asp | Val | Pro | Trp | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
ACG | TTC | GGT | GGA | GGG | ACC | AAG | CTG | GAA | ATA | AAA | CGG | GCG | 327 | |||
Thr | Phe | Gly | Gly | Gly | Thr | Ly s | Leu | Glu | Ile | Ly s | Arg | Al a |
100 105
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 109 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
HU 221 001 Bl
Asp 1 | Ile | Glu | Leu | Thr 5 | Gin | Ser | Pro | Al a | Ser 10 | Leu | Al a | Al a | Ser | Val 15 | Gly |
Glu | Thr | Val | Thr | Ile | Thr | Cys | Arg | Al a | Ser | Glu | Asn | Ile | Tyr | Tyr | Ser |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Leu | Al a | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Gin | Gly | Lys | Ser | Pro | Gin | Leu | Leu | Ile |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Tyr | Se r | Al a | Ser | Al a | Leu | Glu | As p | Gly | Val | Pro | Ser | Arg | Phe | Ser | Gly |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Gin | Tyr | Ser | Leu | Lys | Ile | Asn | Asn | Me t | Gin | Pro |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Glu | As p | Thr | Al a | Thr | Tyr | Phe | Cys | Lys | Gin | Thr | Tyr | Asp | Val | Pro | Trp |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Thr | Phe | Gly | Gly | Gly | Thr | Ly s | Leu | Glu | Ile | Lys | Arg | Al a | |||
100 | 105 |
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 357 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L2 1 IC (nehézlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-357
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CAG GTG | CAA Gin | CTG CAG GAG | TCA GGG | CCT GAG | CTG GTG AGC CCT GGG GCT | ||||||||||
Gin 110 | Val | Leu | Gin | Glu 115 | Ser | G1 y | Pro | Glu | Leu 120 | Val | Arg | Pro | Gly | Al a 125 | |
TCA | GTG | AAG | ATG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCA | GGC | TAT | ACC | TTC | ACT | ACC | TAC |
Ser | Val | Lys | Me t | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Thr | Tyr |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
TGG | ATA | CAC | TGG | ATG | AAA | CAG | AGG | CCT | GGA | CAA | GGC | CTT | CAG | TGG | ATT |
Trp | Ile | Hi s | Trp | Me t | Ly s | Gin | Arg | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu | Gin | Trp | Ile |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
GGC | ATG | ATT | GAT | CCT | TCC | AAT | AGT | GAA | ACT | AGG | TTA | AAT | CAG | AAT | TTC |
Gly | Me t | Ile | Asp | Pro | Ser | Asn | Ser | Glu | Thr | Arg | Leu | Asn | Gin | Asn | Phe |
160 | 165 | 170 |
144
192
HU 221 001 BI
AGG GAC Arg Asp 175 | AAG Lys | GCC Al a | ACA Thr | TTG AGT GTA GAC AAA TCC TCC AAT AAA GCC TAC | 240 | |||||||||||
Leu | Ser 180 | Va 1 | As p | Lys | Ser | Ser 185 | Asn | Ly s | Al a | Tyr | ||||||
ATG | CAG | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCA | ATC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Ile | Tyr | Tyr | Cy s | |
190 | 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
GCA | AGA | TGG | GAC | TAC | GGT | AGT | GGC | CAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | CAA | GGG | 336 |
Al a | Arg | Trp | Asp | Tyr | Gly | Ser | Gly | Hi s | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | 357 | |||||||||
Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser |
225
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 119 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: protein
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Gin 1 | Val | Gin | Leu | Gin 5 | Glu | Ser | Gly | Pro | Glu 10 | Leu | Val | Arg | Pr o | Gly 15 | Al a |
Ser | Val | Lys | Me t 20 | Se r | Cys | Lys | Al a | Ser 25 | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr 30 | Thr | Tyr |
Trp | Ile | Hi s 35 | Trp | Me t | Lys | Gin | Arg 40 | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu 45 | Gin | Trp | Ile |
Gly | Me t 50 | Ile | Asp | Pro | Ser | Asn 55 | Ser | Glu | Thr | Arg | Leu 60 | Asn | Gin | Asn | Phe |
Arg 65 | Asp | Lys | Al a | Thr | Leu 70 | Ser | Val | Asp | Lys | Ser 75 | Ser | Asn | Ly s | Al a | Tyr 80 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser 85 | Leu | Thr | Ser | Glu | As p 90 | Se r | Al a | Ile | Tyr | Tyr 95 | Cys |
Al a | Arg | Trp | Asp 100 | Tyr | Gly | Ser | Gly | Hi s 105 | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly 110 | Gin | Gly |
Thr | Thr | Val 115 | Thr | Val | Ser | Ser |
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 339 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ : nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
HU 221 001 Bl
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L2 12B (könnyűlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-339
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAC ATT | GAG CTC | ACC Thr | CAG Gin 125 | TCT CCA GCT TCT | TTG GCT Leu Alá 130 | CTG Val | TCT Se r | CTA Leu | GGG Gly 135 | ||||||
Asp 120 | Ile | Glu | Leu | Ser | Pro Alá | Ser | |||||||||
CAG | AGG | GCC | ACC | ATC | TCC | TGC | AGA | GCC | AGC | GAA | AGT | GTT | GAT | AAT | TTT |
Gin | Arg | Al a | Thr | Ile | Ser | Cys | Arg | Al a | Ser | Glu | Ser | Va 1 | Asp | Asn | Phe |
140 | 145 | 150 | |||||||||||||
GGC | ATT | AGT | TTT | ATG | AAC | TGG | TTC | CAA | CAG | AAA | CCA | GGA | CAG | CCA | CCC |
Gly | Ile | Ser | Phe | Me t | Asn | Trp | Phe | Gin | Gin | Ly s | Pro | Gly | Gin | Pro | Pro |
155 | 160 | 165 | |||||||||||||
AAA | CTC | CTC | ATC | TAT | GGT | GCA | TCC | AAC | CAA | GGA | TCC | GGG | GTC | CCT | GCC |
Lys | Leu | Leu | Ile | Tyr | Gly | Al a | Ser | Asn | Gin | Gl y | Ser | Gly | Val | Pro | Al a |
170 | 175 | 180 | |||||||||||||
AGG | TTT | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACA | GAC | TTC | AGC | CTC | AAC | ATC | CAT |
Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Asp | Phe | Ser | Leu | Asn | Ile | Hi s |
185 | 190 | 195 | |||||||||||||
CCT | CTG | GAG | GAG | GAT | GAT | ACT | GCA | ATG | TAT | TTC | TGT | CAG | CAA | AGT | AAG |
Pro | Leu | Glu | Glu | Asp | Asp | Thr | Al a | Me t | Tyr | Phe | Cys | Gin | Gin | Ser | Ly s |
200 | 205 | 210 | 215 | ||||||||||||
GAG | GTT | CCG | CTC | ACG | TTC | GGT | GCT | GGG | ACC | AAG | CTG | GAA | ATA | AAA | CGG |
Glu | Val | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly | Alá | Gly | Thr | Ly s | Leu | Glu | Ile | Lys | Arg |
220 | 225 | 230 |
144
192
240
288
336
GCG
Al a
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 113 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
339
Asp 1 | Ile | Glu | Leu | Thr 5 | Gin | Ser | Pro | Al a | Ser 10 | Leu | Al a | Val | Ser | Leu 15 | Gly |
Gin | Arg | Al a | Thr 20 | Ile | Ser | Cys | Arg | Al a 25 | Ser | Glu | Ser | Val | As p 30 | Asn | Phe |
Gly | Ile | Ser 35 | Phe | Me t | Asn | Trp | Phe 40 | Gin | Gin | Ly s | Pro | Gly 45 | Gin | Pro | Pro |
Lys | Leu 50 | Leu | Ile | Tyr | Gly | Al a 55 | Ser | Asn | Gin | Gly | Ser 60 | Gly | Va 1 | Pro | Al a |
HU 221 001 Bl
Arg 65 | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly 70 | Ser | Gly | Thr | Asp | Phe 75 | Ser | Leu | As n | Ile | Hi s 80 |
Pro | Leu | Glu | Glu | As p | As p | Thr | Al a | Me t | Tyr | Phe | Cys | Gin | Gin | Ser | Lys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Glu | Val | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly | Al a | Gly | Thr | Lys | Leu | Glu | Ile | Ly s | Arg |
100 | 105 | 110 |
Al a
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 357 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ : nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L2 12B (nehézlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-357
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CAG GTG CAG CTG | CAG Gin | GAG Glu | TCT GGA CCT GAG CTG GTG AAG CCT GGG GCT | 48 | ||||||||||||
Gin Val 115 | Gin | Leu | Ser 120 | Gly | Pro Glu | Leu Val 125 | Lys | Pro | Gly | Alá | ||||||
TTA | GTG | AAG | ATA | TCC | TGC | AAG | GCT | TCT | GGT | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | TAC | 96 |
Leu | Va 1 | Ly s | Ile | Ser | Cy s | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Tyr | |
130 | 135 | 140 | 145 | |||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | CCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC | 144 |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile | |
150 | 155 | 160 | ||||||||||||||
GGA | GAG | ATT | GAT | CCT | TCT | GAT | AGT | TAT | ACT | AAC | TAC | AAT | CAA | AAG | TTC | 192 |
Gly | Glu | Ile | Asp | Pro | Ser | Asp | Ser | Tyr | Thr | Asn | Tyr | Asn | Gin | Lys | Phe | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
AAG | GGC | AAG | GCC | ACA | TTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AAC | ACA | GCC | TAC | 240 |
Ly s | GI y | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Ser | Asn | Thr | Al a | Tyr | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
ATG | CAG | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | As p | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
GCA | AGA | TCG | GAC | TAC | GGT | AGT | AGC | CAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | CAA | GGG | 336 |
Al a | Arg | Ser | Asp | Tyr | Gly | Ser | Ser | Hi s | Phe | As p | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly | |
210 | 215 | 220 | 225 |
HU 221 001 Bl
ACC ACG GTC ACC GTC TCC TCA
Thr Thr Val Thr Val Ser Ser 230
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 119 bázispár
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
357
Gin 1 | Val | Gin | Leu | Gin 5 | Glu | Ser | Gly | Pro | Glu 10 | Leu | Val | Lys | Pro | Gly 15 | Al a |
Leu | Val | Lys | lle 20 | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser 25 | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr 30 | Ser | Tyr |
Trp | Me t | Hi s 35 | Trp | Val | Lys | Gin | Arg 40 | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu 45 | Glu | Trp | lle |
Gly | Glu 50 | lle | Asp | Pro | Ser | Asp 55 | Ser | Tyr | Thr | Asn | Tyr 60 | Asn | Gin | Ly s | Phe |
Lys 65 | Gly | Lys | Al a | Thr | Leu 70 | Thr | Va 1 | Asp | Lys | Ser 75 | Ser | Asn | Thr | Al a | Tyr 80 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser 85 | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp 90 | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr 95 | Cy s |
Al a | Arg | Ser | Asp 100 | Tyr | Gly | Ser | Ser | Hi s 105 | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gl y 110 | Gin | Gly |
Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser |
115
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 339 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS :
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L3 1 ID (könnyűlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-339
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
HU 221 001 Bl
GAC ATT | GAG Glu | CTC ACC CAG | TCT Ser | CCA GCT | TCT TTG GCT GTG | TCT Ser | CTA Leu | GGG Gly 135 | 48 | |||||||
Asp 120 | lle | Leu | Thr | Gin 125 | Pro | Al a | Ser | Leu 130 | Al a | Val | ||||||
CAG | AGG | GCC | ACC | ATC | TCC | TGC | CGA | GCC | AGC | GAA | AGT | GTT | GAT | AAT | TTT | 96 |
Gin | Arg | Al a | Thr | lle 140 | Ser | Cys | Arg | Al a | Ser 145 | Glu | Ser | Val | As p | Asn 150 | Phe | |
GGC | ATT | AGT | TTT | ATG | AAC | TGG | TTC | CAA | CAG | AAA | CCA | GGA | CAG | CCA | CCC | 144 |
Gly | lle | Ser | Phe 155 | Me t | Asn | Trp | Phe | Gin 160 | Gin | Ly s | Pro | Gly | Gin 165 | Pro | Pro | |
AAA | CTC | CTC | ATC | TAT | GGT | GCA | TCC | AAC | CAA | GGA | TCC | GGG | GTC | CCT | GCC | 192 |
Lys | Leu | Leu 170 | lle | Tyr | Gly | Al a | Ser 175 | Asn | Gin | G1 y | Ser | Gly 180 | Val | Pro | Al a | |
AGG | TTT | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACA | GAC | TTC | AGC | CTC | AAC | ATC | CAT | 240 |
Arg | Phe 185 | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser 190 | Gly | Thr | Asp | Phe | Ser 195 | Leu | Asn | lle | Hi s | |
CCT | TTG | GAG | GAG | GAT | GAT | ACT | GCA | ATG | TAT | TTC | TGT | CAG | CAA | AGT | AAG | 288 |
Pro 200 | Leu | Glu | Glu | Asp | Asp 205 | Thr | Al a | Me t | Tyr | Phe 210 | Cys | Gin | Gin | Ser | Lys 215 | |
GAG | GTT | CCG | CTC | ACG | TTC | GGT | GCT | GGG | ACC | AAG | CTG | GAG | CTG | AAA | CGG | 336 |
Glu | Val | Pro | Leu | Thr 220 | Phe | Gly | Al a | Gly | Thr 225 | Ly s | Leu | Glu | Leu | Lys 230 | Arg |
GCG 339
Alá
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 113 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Asp 1 | lle | Glu | Leu | Thr 5 | Gin | Ser | Pro | Al a | Ser 10 | Leu | Al a | Val | Ser | Leu 15 | Gly |
Gin | Arg | Al a | Thr 20 | lle | Ser | Cys | Arg | Al a 25 | Ser | Glu | Ser | Val | Asp 30 | Asn | Phe |
Gly | lle | Ser 35 | Phe | Me t | Asn | Trp | Phe 40 | Gin | Gin | Ly s | Pro | Gly 45 | Gin | Pro | Pro |
Lys | Leu 50 | Leu | lle | Tyr | Gly | Al a 55 | Ser | Asn | Gin | G1 y | Ser 60 | Gly | Va 1 | Pro | Al a |
Arg 65 | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly 70 | Ser | Gly | Thr | Asp | Phe 75 | Ser | Leu | Asn | lle | Hi s 80 |
Pro | Leu | Glu | Glu | Asp 85 | Asp | Thr | Al a | Me t | Tyr 90 | Phe | Cys | Gin | Gin | Ser 95 | Ly s |
Glu Al a | Val | Pro | Leu 100 | Thr | Phe | Gly | Al a | Gly 105 | Thr | Ly s | Leu | Glu | Leu 110 | Lys | Arg |
HU 221 001 Bl
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 357bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ : nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: L3 11D (nehézlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-357
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTG Glu Val 115 | CAG Gin | CTG Leu | CAG CAG TCA | GGG Gly | GCT Al a | GAG Glu | CTT GTG AAG CCT | GGG Gly | GCT Al a | 48 | ||||||
Gin Gin | Ser 120 | Leu | Val 125 | Lys | Pro | |||||||||||
TCA | GTG | AAG | CTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCT | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | TAC | 96 |
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Tyr | |
130 | 135 | 140 | 145 | |||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | CCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC | 144 |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Ly s | Gin | Arg | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile | |
150 | 155 | 160 | ||||||||||||||
GGA | GAG | ATT | GAT | CCT | TCT | GAT | AGT | TAT | ACT | AAC | TAC | AAT | CAA | AAG | TTC | 192 |
Gly | Glu | Ile | As p | Pro | Ser | Asp | Ser | Tyr | Thr | Asn | Tyr | Asn | Gin | Lys | Phe | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
AAG | GGC | AAG | GCC | ACA | TTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC | 240 |
Lys | Gly | Ly s | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
ATG | CAG | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 188 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | As p | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cy s | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
GCA | AGA | TCG | GAC | TAC | GGT | AGT | AGC | CAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | CAA | GGG | 336 |
Al a | Arg | Ser | As p | Tyr | Gly | Ser | Ser | Hi s | Phe | As p | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly | |
210 | 215 | 220 | 225 | |||||||||||||
ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | 357 | |||||||||
Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser |
230
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 119 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
HU 221 001 Bl
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu | Val | Gin | Leu | Gin | Gin | Ser | Gly | Al a | Glu | Leu | Va 1 | Lys | Pro | Gly | Al a |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Tyr |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gly | Glu | Ile | Asp | Pr o | Ser | Asp | Ser | Tyr | Thr | Asn | Tyr | Asn | Gin | Lys | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Gly | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Al a | Arg | Ser | Asp | Tyr | Gly | Ser | Se r | Hi s | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser |
115
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 327 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: S4 2D (könnyűlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-327
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | ACC | ACC | ATG | GCT | GCA | TCT | CCC | GGG |
Asp 120 | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin 125 | Se r | Pro | Thr | Thr | Me t 130 | Al a | Al a | Ser | Pro | Gly 135 |
GAG | AAG | ATC | ACT | ATC | ACC | TGC | AGT | GCC | AGC | TCA | AGT | ATA | AGT | TCC | AAT |
Glu | Lys | Ile | Thr | Ile 140 | Thr | Cys | Ser | Al a | Ser 145 | Ser | Ser | Ile | Ser | Ser 150 | Asn |
TAC | TTG | CAT | TGG | TAT | CAG | CAG | AAG | CCA | GGA | TTC | TCC | CCT | AAA | CTC | TTG |
Tyr | Leu | Hi s | Trp 155 | Tyr | Gin | Gin | Lys | Pro 160 | Gly | Phe | Ser | Pro | Lys 165 | Leu | Leu |
144
HU 221 001 Bl
192
ATT TAT AGG | ACA Thr | TCC Ser | AAT Asn | CTG GCT TCT GGA | GTC CCA GCT CGC | TTC Phe | AGT Ser | ||||||||
Ile | Tyr | Arg 170 | Leu | Ala 175 | Ser | Gly | Va 1 | Pro | Al a 1 80 | Arg | |||||
GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC | ACA | ATT | GGC | ACC | ATG | GAG |
Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | Thr | Ile | Gly | Thr | Me t | Glu |
185 | 190 | 195 | |||||||||||||
GCT | GAA | GAT | GTT | GCC | ACT | TAC | TAC | TGC | CAG | CAG | GGT | AGT | AGT | ATA | CCA |
Al a | Glu | Asp | Val | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin | Gin | G1 y | Ser | Ser | Ile | Pro |
200 | 205 | 210 | 215 | ||||||||||||
CGC | ACG | TTC | GGA | GGG | GGC | ACC | AAG | CTG | GAA | ATC | AAA | CGG | |||
Arg | Thr | Phe | Gly | Gly | G1 y | Thr | Lys | Leu | Glu | Ile | Ly s | Arg | |||
220 | 225 | ||||||||||||||
A 14. | AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: | ||||||||||||||
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: | |||||||||||||||
HOSSZA: 109 aminosav | |||||||||||||||
TÍPUSA: aminosav | |||||||||||||||
TOPOLÓGIÁJA: | lineáris | ||||||||||||||
MOLEKULATÍPUS: | fehérje | ||||||||||||||
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: | |||||||||||||||
Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro | Thr | Thr | Me t | Al a | Al a | Ser | Pro | Gly |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Glu | Lys | Ile | Thr | Ile | Thr | Cys | Ser | Al a | Ser | Ser | Ser | Ile | Ser | Ser | Asn |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Hi s | Trp | Tyr | Gin | Gin | Ly s | Pro | Gly | Phe | Ser | Pro | Ly s | Leu | Leu |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ile | Tyr | Arg | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly | Val | Pro | Al a | Arg | Phe | Ser |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | Thr | Ile | Gly | Thr | Me t | Glu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Al a | Glu | Asp | Val | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin | Gin | Gly | Ser | Se r | Ile | Pro |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Arg | Thr | Phe | Gly | Gly | Gly | Thr | Lys | Leu | Glu | Ile | Lys | Arg | |||
100 | 105 | ||||||||||||||
A 15. | AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: |
240
288
327
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: HOSSZA: 354bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
HIPOTETIKUS: nem
ANTISZENSZ : nem
FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS: ORGANIZMUS: egér TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt SZÖVETTÍPUS: nyirokcsomó
HU 221 001 Bl
KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: S42D (nehézlánc)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-354
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTC AAG CTG | CAG CAG TCA GGA CCT GAG | CTG GTA AAG CCT GGG GCT | |||||||||||||
Glu Val 110 | Lys | Leu | Gin | Gin 115 | Ser | Gly | Pro | Glu | Leu 120 | Val | Lys | Pro | Gly | Al a 125 | |
TCA | GTG | AAG | ATG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCT | GGA | TAC | GCA | TTC | ATA | AGT | TTT |
Ser | Val | Lys | Me t | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser | Gly | Tyr | Al a | Phe | Ile | Ser | Phe |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
GTT | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AAG | CCT | GGG | CAG | GGC | CTT | GAG | TGG | ATT |
Val | Me t | Hi s | Trp | Val | Ly s | Gin | Ly s | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
GGA | TTT | ATT | AAT | CCT | TAC | AAT | GAT | GGT | ACT | AAG | TAC | AAT | GAG | AAG | TTC |
Gly | Phe | Ile | Asn | Pro | Tyr | Asn | As p | Gly | Thr | Ly s | Tyr | Asn | Glu | Ly s | Phe |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
AAA | GAC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | TCA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC |
Lys | As p | Ly s | Al a | Thr | Leu | Thr | Ser | Asp | Lys | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
ATG | GAG | CTC | AGC | AGC | CTG | ACC | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT |
Me t | Glu | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
190 | 195 | 200 | 205 | ||||||||||||
GCA | AGT | GGG | GAT | TAC | GAC | AGG | GCT | ATG | GAC | TAC | TGG | GGC | CAA | GGG | ACC |
Al a | Ser | Gly | Asp | Tyr | Asp | Arg | Al a | Me t | Asp | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly | Thr |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | ||||||||||
Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser |
225
144
192
240
288
336
354
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 118 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu 1 | Val | Lys | Leu | Gin 5 | Gin | Ser | G1 y | Pro | Glu 10 | Leu | Val | Ly s | Pro | Gly 15 | Al a |
Ser | Va 1 | Lys | Me t 20 | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser 25 | G1 y | Tyr | Al a | Phe | Ile 30 | Ser | Phe |
Val | Me t | Hi s 35 | Trp | Va 1 | Ly s | Gin | Ly s 40 | Pro | Gly | Gin | Gly | Leu 45 | Glu | Trp | Ile |
Gly | Phe 50 | Ile | Asn | Pro | Tyr | Asn 55 | As p | Gly | Thr | Ly s | Tyr 60 | Asn | G1 u | Lys | Phe |
HU 221 001 Bl
Lys 65 | As p | Ly s | Al a | Thr | Leu 70 | Thr | Ser | Asp | Ly s | Ser 75 | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr 80 |
Me t | Glu | Leu | Ser | Se r | Leu | Thr | Se r | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Al a | Ser | Gly | Asp | Tyr | Asp | Arg | Al a | Me t | Asp | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly | Thr |
100 | 105 | 110 |
Thr Val Thr Val Ser Ser 115
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 717 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
EGYEDFEJLŐDÉSI FÁZIS: felnőtt
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 4B2 SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-717
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG Glu | GTG Va 1 120 | AAG Lys | CTG CAG GAG | TCT GGG GGA GAC | TTA GTG AAG CCT GGA GGG | 48 | ||||||||||
Leu | Gin | Glu | Ser 125 | Gly | Gly | Asp | Leu | Val 130 | Lys | Pro | Gly | Gly | ||||
TCC | CTG | AAA | CTC | TCC | TGT | GCA | GCC | TCT | GGA | TTC | ACT | TTC | AGT | AGC | TAT | 96 |
Ser 135 | Leu | Ly s | Leu | Ser | Cys 140 | Al a | Al a | Ser | Gly | Phe 145 | Thr | Phe | Ser | Ser | Tyr 150 | |
GGC | ATG | TCT | TGG | GTT | CGG | CAG | ACT | CCA | GAC | AAG | AGG | CTG | GAG | TCT | GTC | 144 |
Gly | Me t | Ser | Trp | Val 155 | Arg | Gin | Thr | Pro | Asp 160 | Ly s | Arg | Leu | Glu | Ser 165 | Val | |
GCA | ACC | ATT | AGT | AGT | GGT | GGT | GCT | TAC | ATC | TAC | TAT | CCA | GAC | AGT | GTG | 192 |
Al a | Thr | Ile | Ser 170 | Ser | Gly | Gly | Al a | Tyr 175 | Ile | Tyr | Tyr | Pro | As p 180 | Ser | Val | |
AAG | GGG | CGA | TTC | ACC | ATC | TCC | AGA | GAC | AAT | GCC | AAG | AAC | ACC | CTG | TAC | 240 |
Lys | Gly | Arg 185 | Phe | Thr | Ile | Ser | Arg 190 | Asp | Asn | Al a | Lys | Asn 195 | Thr | Leu | Tyr | |
CTG | CAA | ATG | AGC | AGT | CTG | AAG | TCT | GAG | GAC | ACA | GCC | ATG | TAT | TAC | TGT | 288 |
Leu | Gin 200 | Me t | Ser | Ser | Leu | Lys 205 | Ser | Glu | Asp | Thr | Al a 210 | Me t | Tyr | Tyr | Cys | |
GCA | AGA | CTT | GAA | ACC | GGG | GAC | TAT | GCT | TTG | GAC | TAC | TGG | GGC | CAA | GGG | 336 |
Al a 215 | Arg | Leu | Glu | Thr | Gly 220 | Asp | Tyr | Al a | Leu | As p 225 | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly 230 |
HU 221 001 Bl
ACC ACG GTC ACC | GTC Va 1 235 | TCC TCA GGT | GGC GGT GGC TCG GGC GGT | GGT Gly 245 | GGG Gly | 384 | ||||||||||
Thr | Thr | Val | Thr | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly 240 | Gly | Ser | Gly | Gly | ||||
TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | GCT | TCT | 432 |
Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro | Al a | Ser | |
250 | 255 | 260 | ||||||||||||||
TTG | GCT | GTC | TCT | CTA | GGG | CAG | AGG | GCC | ACC | ATA | TTC | TGC | AAG | GAC | AGC | 480 |
Leu | Al a | Val | Ser | Leu | Gly | Gin | Arg | Al a | Thr | Ile | Phe | Cy s | Ly s | Asp | Ser | |
265 | 270 | 275 | ||||||||||||||
CAA | AGT | GTT | GAT | TAT | GAT | GGT | GAT | AGT | TAT | ATG | AAC | TGG | TAC | CAA | CAG | 528 |
Gin | Ser | Val | Asp | Tyr | Asp | Gly | As p | Ser | Tyr | Me t | Asn | Trp | Tyr | Gin | Gin | |
280 | 285 | 290 | ||||||||||||||
AAA | CCA | GGA | CAG | CCA | CCC | AAA | CTC | CTC | ATC | TAT | GCT | CGA | TCC | AAT | CTA | 576 |
Lys | Pro | Gly | Gin | Pro | Pro | Lys | Leu | Leu | He | Tyr | Al a | Arg | Ser | Asn | Leu | |
295 | 300 | 305 | 310 | |||||||||||||
GAA | TCT | GGG | GTC | CCT | GCC | AGG | TTT | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACA | GAC | 624 |
Glu | Ser | Gly | Val | Pro | Al a | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Asp | |
315 | 320 | 325 | ||||||||||||||
TTC | AGC | CTC | AAC | ATC | CAT | CCT | CTG | GAG | GAG | GAT | GAT | ATT | GCA | ATG | TAT | 672 |
Phe | Ser | Leu | Asn | Ile | Hi s | Pro | Val | Glu | Glu | Asp | Asp | Ile | Al a | Me t | Tyr | |
330 | 335 | 340 | ||||||||||||||
TTC | TGT | CAG | CAA | AGT | AGG | AAG | GTT | CCG | TGG | TCG | TTC | GGT | GGA | GGG | 717 | |
Phe | Cys | Gin | Gin | Ser | Arg | Lys | Val | Pro | Trp | Ser | Phe | Gly | Gly | Gly | ||
345 | 350 | 355 |
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 239 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu Val 1 | Lys | Leu | Gin Glu 5 | Ser | Gly | Gly | Asp 10 | Le u | Val | Lys | Pro | Gly 15 | Gly | ||
Ser | Leu | Lys | Leu | Ser | Cy s | Al a | Al a | Ser | Gly | Phe | Thr | Phe | Ser | Ser | Tyr |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Gly | Me t | Ser | Trp | Val | Arg | Gin | Thr | Pro | Asp | Lys | Arg | Leu | Glu | Ser | Val |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Al a | Thr | Ile | Ser | Ser | Gly | Gly | Al a | Tyr | Ile | Tyr | Tyr | Pro | Asp | Ser | Val |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Gly | Arg | Phe | Thr | Ile | Ser | Arg | Asp | Asn | Al a | Ly s | Asn | Thr | Leu | Tyr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Leu | Gin | Me t | Ser | Ser | Leu | Ly s | Ser | Glu | Asp | Thr | Al a | Me t | Tyr | Tyr | Cys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Al a | Arg | Leu | Glu | Thr | Gly | Asp | Tyr | Al a | Leu | As p | Tyr | Trp | Gly | Gin | Gly |
100 | 105 | 110 |
HU 221 001 BI
Thr | Thr | Val 115 | Thr | Va 1 | Ser | Ser | Gly 120 | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly 125 | Gly | Gly | Gly |
Ser | Gly 130 | Gly | Gly | Gly | Ser | As p 135 | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin 140 | Ser | Pro | Al a | Ser |
Leu 145 | Al a | Val | Ser | Leu | Gly 150 | Gin | Arg | Al a | Thr | Ile 155 | Phe | Cys | Lys | Asp | Ser 160 |
Gin | Ser | Val | As p | Tyr 165 | Asp | Gly | As p | Ser | Tyr 170 | Me t | Asn | Trp | Tyr | Gin 175 | Gin |
Lys | Pro | Gly | Gin 180 | Pro | Pro | Lys | Leu | Leu 185 | Ile | Tyr | Al a | Arg | Se r 190 | Asn | Leu |
Glu | Ser | Gly 195 | Val | Pro | Al a | Arg | Phe 200 | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser 205 | Gly | Thr | Asp |
Phe | Ser 210 | Leu | Asn | Ile | Hi s | Pro 215 | Va 1 | Glu | Glu | Asp | Asp 220 | Ile | Al a | Me t | Tyr |
Phe | Cys | Gin | Gin | Ser | Arg | Ly s | Val | Pro | Trp | Ser | Phe | Gly | Gly | Gly |
225 230 235
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 732 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 10 C 2 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid) SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-732
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTG Glu Val 240 | CAG CTG | CAG CAG TCT | GGG Gly | GCT GAA | CTG GTG AAG CCT GGG GCT | ||||||||||
Gin | Leu | Gin Gin 245 | Ser | Al a | Glu | Leu 250 | Val | Lys | Pro | Gly | Al a 255 | ||||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC |
Ser | Va 1 | Lys | Le u | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Va 1 | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
GGA | GAG | TTT | AAT | CCC | AGC | AAC | GGC | CGT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | TTC |
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Ly s | Phe |
290 | 295 | 300 |
144
192
HU 221 001 Bl
AAG Lys | AGC AAG | GCC Al a | ACA CTG ACT GTA GAC AAA TCC TCC AGC ACA GCC | TAC Tyr | 240 | |||||||||||
Ser 305 | Lys | Thr | Leu | Thr 310 | Val | Asp | Ly s | Ser | Ser 315 | Ser | Thr | Al a | ||||
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys | |
320 | 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | 336 |
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | As p | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT | 384 |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
GGT | GGG | TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | 432 |
Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
GCA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT | 480 |
Alá | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser | Pro | Gly | Glu | Ly s | Val | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser | |
385 | 390 | 395 | ||||||||||||||
GCC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAA | CCA | GGA | 528 |
Al a | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Ly s | Pro | Gly | |
400 | 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
TCC | TCC | CCC | AGA | CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA | 576 |
Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC | 624 |
Val | Pr o | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG | 672 |
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
CAG | TGG | AGT | AGT | TAC | CCA | CCC | ATG | TAC | ACG | TTC | GGA | GGG | GGG | ACC | AAG | 720 |
Gin | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro | Pro | Me t | Tyr | Thr | Phe | Gly | Gly | Gly | Thr | Lys |
465 470 475
CTG GAA ATA AAA 732
Leu Glu Ile Lys
480
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 244 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehéije
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu Val Gin Leu Gin Gin Ser Gly Alá Glu Leu Val Lys Pro Gly Alá 15 10 15
HU 221 001 BI
Ser | Val | Lys | Leu 20 | Ser | Cy s | Lys | Al a | Ser 25 | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr 30 | Ser | Hi s |
Trp | Me t | Hi s 35 | Trp | Val | Lys | Gin | Arg 40 | Al a | Gly | G1 n | Gly | Leu 45 | Glu | Trp | Ile |
Gly | Glu 50 | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn 55 | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr 60 | Asn | Glu | Lys | Phe |
Lys 65 | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu 70 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 75 | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr 80 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser 85 | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp 90 | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr 95 | Cys |
Al a | Ser | Arg | Asp 100 | Tyr | Asp | Tyr | Asp | Gly 105 | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr 110 | Trp | Gly |
Gin | Gly | Thr 115 | Thr | Va 1 | Thr | Val | Ser 120 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | G1 y | Gly 135 | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu 140 | Thr | Gin | Ser | Pro |
Al a 145 | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser 150 | Pro | Gly | Glu | Ly s | Va 1 155 | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser 160 |
Al a | Ser | Ser | Ser | Val 165 | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp 170 | Tyr | Gin | Gin | Lys | Pro 175 | Gly |
Ser | Ser | Pro | Arg 180 | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp 185 | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a 190 | Ser | Gly |
Val | Pro | Val 195 | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser 200 | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser 205 | Tyr | Ser | Leu |
Thr | Ile 210 | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a 215 | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr 220 | Tyr | Tyr | Cy s | Gin |
Gin 225 | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro 230 | Pro | Me t | Tyr | Thr | Phe 235 | Gly | Gly | Gly | Thr | Lys 240 |
Leu Glu Ile Lys
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 732 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 3 D 3 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid)
HU 221 001 Bl
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-732
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTC Glu Val 245 | CAA Gin | CTG CAG | CAG TCA GGG GCT GAA CTG GTG AAG CCT GGG GCT | 48 | ||||||||||||
Leu | Gin | Gin 250 | Ser | Gly | Ala | Glu | Leu 255 | Val | Lys | Pro | Gly | Al a 260 | ||||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC | 96 |
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s | |
265 | 270 | 275 | ||||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC | 144 |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile | |
280 | 285 | 290 | ||||||||||||||
GGA | GAG | TTT | AAT | CCC | AGC | AAC | GGC | CGT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | ATC | 192 |
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Ile | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC | 240 |
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Ly s | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr | |
310 | 315 | 320 | ||||||||||||||
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | As p | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys | |
325 | 330 | 335 | 340 | |||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | 336 |
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | As p | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | |
345 | 350 | 355 | ||||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT | 384 |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Se r | Gly | Gly | |
360 | 365 | 370 | ||||||||||||||
GGT | GGG | TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | 432 |
Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro | |
375 | 380 | 385 | ||||||||||||||
ACA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT | 480 |
Thr | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser | Pro | Gly | Glu | Lys | Val | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser | |
390 | 395 | 400 | ||||||||||||||
GAC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG | ACA | GGA | 528 |
Asp | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr | Gly | |
405 | 410 | 415 | 420 | |||||||||||||
TCC | TCC | CCC | AGA | CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA | 576 |
Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn | Leu | Ala | Ser | Gly | |
425 | 430 | 435 | ||||||||||||||
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC | 624 |
Val | Pro | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | |
440 | 445 | 450 | ||||||||||||||
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG | 672 |
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cy s | Gin | |
455 | 460 | 465 |
HU 221 001 Bl
720
CAG Gin | TGG AGT AGT | TAC CCA CCC ATG | TAC Tyr | ACG Thr | TTC Phe | GGA GGG | GGG Gly | ACC Thr | AAG Lys | ||||||
Trp 470 | Ser | Ser | Tyr | Pro | Pro 475 | Me t | Gly 480 | Gly | |||||||
CTG | GAA | ATA | AAA | ||||||||||||
Leu | G1 u | Ile | Ly s |
732
485
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 244 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu 1 | Val | Gin | Leu | Gin 5 | Gin | Ser | Gly | Al a | Glu 10 | Leu | Val | Lys | Pro | Gly 15 | Al a |
Ser | Val | Lys | Leu 20 | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser 25 | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr 30 | Ser | Hi s |
Trp | Me t | His 35 | Trp | Val | Lys | Gin | Arg 40 | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu 45 | Glu | Trp | Ile |
Gly | Glu 50 | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn 55 | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr 60 | Asn | Glu | Lys | Ile |
Lys 65 | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu 70 | Thr | Va 1 | Asp | Lys | Ser 75 | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr 80 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser 85 | Leu | Thr | Ser | Glu | As p 90 | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr 95 | Cys |
Al a | Ser | Arg | Asp 100 | Tyr | As p | Tyr | Asp | Gly 105 | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr 110 | Trp | Gly |
Gin | Gly | Thr 115 | Thr | Val | Thr | Val | Ser 120 | Ser | Gly | G1 y | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Se r | Asp | Ile | Glu | Leu 140 | Thr | Gin | Ser | Pro |
Thr 145 | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser 150 | Pro | Gly | Glu | Ly s | Val 155 | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser 160 |
Asp | Ser | Ser | Ser | Val 165 | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp 170 | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr 175 | Gly |
Ser | Ser | Pro | Arg 180 | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp 185 | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a 190 | Ser | Gly |
Val | Pro | Val 195 | Arg | Phe | Ser | Gly | Se r 200 | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser 205 | Tyr | Ser | Leu |
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin |
210 215 220
HU 221 001 Bl
Gin Trp Ser Ser Tyr Pro Pro Met Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys 225 230 235 240
Leu Glu Ile Lys
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 738 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 1 E 3 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-738
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTG CAG CTG CAG CAG TCT GGG GCT GAA CTG GTG AAG CCT GGG GCT | 48 | |||||||||||||||
Glu Val 245 | Gin | Leu Gin | Gin 250 | Ser | Gly | Al a | Glu | Leu 255 | Val | Lys | Pro | Gly | Al a 260 | |||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC | 96 |
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cy s | Ly s | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s | |
265 | 270 | 275 | ||||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC | 144 |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Ly s | Gin | Arg | Alá | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile | |
280 | 285 | 290 | ||||||||||||||
GGA | GAG | TTT | AAT | CCC | AGC | AAC | GGC | CGT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | TTC | 192 |
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCT | TAC | 240 |
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Se r | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr | |
310 | 315 | 320 | ||||||||||||||
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys | |
325 | 330 | 335 | 340 | |||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | 336 |
Al a | Ser | Arg | As p | Tyr | Asp | Tyr | Asp | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | |
345 | 350 | 355 | ||||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT | 384 |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | |
360 | 365 | 370 |
HU 221 001 Bl
432
GGT GGG Gly Gly | TCG GGT GGC | GGC GGA TCT GGA | TCT Se r | GAC Asp | ATT GAG CTC ACC | CAG Gin | |||||||
Ser 375 | Gly | Gly | Gly Gly | Ser 380 | Gly | lle | Glu 385 | Leu | Thr | ||||
TCT CCA | ACA | ATC | ATG | TCT GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC |
Ser Pro | Thr | lle | Me t | Ser Alá | Se r | Pro | Gly | Glu | Lys | Val | Thr | Me t | Thr |
390 | 395 | 400 | |||||||||||
TGC AGT | GAC | AGC | TCA | AGT GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG |
Cys Ser | Asp | Ser | Ser | Ser Val | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys |
405 | 410 | 415 | 420 | ||||||||||
CCA GGA | TCC | TCC | CCC | AGA CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT |
Pro Gly | Ser | Ser | Pro | Arg Leu | Leu | lle | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a |
425 | 430 | 435 | |||||||||||
TCT GGA | GTC | CCT | GTT | CGC TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC |
Ser Gly | Val | Pro | Val | Arg Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr |
440 | 445 | 450 | |||||||||||
TCT CTC | ACA | ATC | AGC | CGA ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC |
Ser Leu | Thr | lle | Ser | Arg Met | Glu | Al a | Glu | As p | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr |
455 | 460 | 465 | |||||||||||
TGC CAG | CAG | TGG | AGT | AGT TAC | CCA | CCC | ATG | TAC | ACG | TTC | GGA | GGG | GGG |
Cys Gin | Gin | Trp | Ser | Ser Tyr | Pro | Pro | Me t | Tyr | Thr | Phe | Gly | Gly | Gly |
470 | 475 | 480 | |||||||||||
ACC AAG | CTG | GAA | ATA | AAA | |||||||||
Thr Lys | Leu | Glu | lle | Lys | |||||||||
485 | 490 | ||||||||||||
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: | |||||||||||||
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: | |||||||||||||
HOSSZA: 246 aminosav | |||||||||||||
TÍPUSA: aminosav | |||||||||||||
TOPOLÓGIÁJA: | lineáris | ||||||||||||
MOLEKULATÍPUS: | fehérje | ||||||||||||
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEIRASA: | |||||||||||||
Glu Val | Gin | Leu | Gin | Gin Ser | Gly | Al a | Glu | Le u | Val | Lys | Pro | Gly | Al a |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||
Ser Val | Lys | Leu | Ser | Cys Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s |
20 | 25 | 30 | |||||||||||
Trp Met | Hi s | Trp | Val | Lys Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | lle |
35 | 40 | 45 | |||||||||||
Gly Glu | Phe | Asn | Pro | Ser Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Ly s | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||
Lys Ser | Lys | Al a | Thr | Leu Thr | Val | Asp | Ly s | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||
Me t Gin | Leu | Ser | Ser | Leu Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cy s |
85 | 90 | 95 | |||||||||||
Alá Ser | Arg | As p | Tyr | Asp Tyr | Asp | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly |
100 | 105 | 110 |
480
528
576
672
720
738
624
HU 221 001 Β1
Gin | Gly | Thr 115 | Thr | Val | Thr | Val | Ser 120 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Ser | Gly | Ser | As p | Ile 140 | Glu | Leu | Thr | Gin |
Ser 145 | Pr o | Thr | Ile | Me t | Ser 150 | Al a | Ser | Pro | Gly | Glu 155 | Lys | Val | Thr | Me t | Thr 160 |
Cys | Ser | Asp | Ser | Ser 165 | Ser | Val | Ser | Tyr | Me t 170 | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin 175 | Lys |
Pro | Gly | Ser | Se r 180 | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile 185 | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn 190 | Leu | Al a |
Ser | Gly | Val 195 | Pro | Val | Arg | Phe | Ser 200 | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly 205 | Thr | Ser | Tyr |
Ser | Leu 210 | Thr | Ile | Ser | Arg | Me t 215 | Glu | Al a | Glu | As p | Al a 220 | Al a | Thr | Tyr | Tyr |
Cys 225 | Gin | Gin | Trp | Ser | Ser 230 | Tyr | Pro | Pro | Me t | Tyr 235 | Thr | Phe | Gly | Gly | Gly 240 |
Thr Lys Leu Glu Ile Lys 245
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 726 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 5 F 1 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid) SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-726
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CAG | GTG | AAA | CTG | CAG | GAG | TCT | GGG | GCT | GAA | CTG | GTG | AAG | CCT | GGG | GCT |
Gin | Val | Lys | Leu 250 | Gin | Glu | Ser | Gly | Al a 255 | Glu | Leu | Val | Lys | Pro 260 | Gly | Al a |
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC |
Ser | Val | Lys 265 | Leu | Se r | Cys | Lys | Al a 270 | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe 275 | Thr | Ser | Hi s |
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC |
Trp | Me t 280 | Hi s | Trp | Va 1 | Lys | Gin 285 | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly 290 | Leu | Glu | Trp | Ile |
144
HU 221 001 Bl
192
GGA | GAG | ATT | AAT | CCC | AGA | ACG | GCG | CCT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | TTC |
Gly 295 | GI u | Ile | Asn | Pro | Arg 300 | Thr | Alá | Pro | Thr | Asn 305 | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe 310 |
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC |
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr 315 | Leu | Thr | Val | Asp | Lys 320 | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a 325 | Tyr |
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT |
Me t | Gin | Leu | Se r 330 | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu 335 | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr 340 | Tyr | Cys |
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC |
Al a | Ser | Arg 345 | As p | Tyr | Asp | Tyr | Asp 350 | Gly | Arg | Tyr | Phe | As p 355 | Tyr | Trp | Gly |
CAA | GGG | ACA | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT |
Gin | Gly 360 | Thr | Thr | Val | Thr | Val 365 | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly 370 | Gly | Ser | Gly | Gly |
GGT | GGG | TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA |
Gly 375 | GI y | Ser | Gly | Gly | Gly 380 | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu 385 | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro 390 |
ACA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT |
Thr | He | Me t | Se r | Al a 395 | Ser | Pro | Gly | Glu | Lys 400 | Val | Thr | Me t | Thr | Cys 405 | Ser |
GAC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ACG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG | ACA | GGA |
Asp | Ser | Ser | Ser 410 | Val | Ser | Tyr | Thr | Tyr 415 | Trp | Tyr | Gin | Gin | Ly s 420 | Thr | Gly |
TCC | TCC | CCC | AGA | CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA |
Ser | Ser | Pro 425 | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr 430 | As p | Thr | Ser | Asn | Leu 435 | Al a | Ser | Gly |
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC |
Val | Pro 440 | Val | Arg | Phe | Ser | Gly 445 | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr 450 | Ser | Tyr | Ser | Leu |
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG |
Thr 455 | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu 460 | Al a | Glu | As p | Al a | Al a 465 | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin 470 |
CAG | TGG | AGT | AGT | TAC | CCG | CTC | ACG | TTC | GGT | GCT | GGG | ACC | AAG | CTG | CAA |
Gin | Trp | Ser | Ser | Tyr 475 | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly 480 | Al a | Gly | Thr | Lys | Leu 485 | Glu |
240
288
336
384
432
480
528
576
624
672
720
ATA AAA
Ile Lys
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 242 bázispár
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
726
HU 221 001 Bl
Gin 1 | Va 1 | Lys | Leu | Gin Glu 5 | Ser | Gly Alá | Glu 10 | Leu | Val | Ly s | Pro | Gly 15 | Alá | ||
Ser | Va 1 | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | G1 u | Trp | Ile |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gly | Glu | Ile | Asn | Pro | Arg | Thr | Al a | Pro | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Ser | Ser | Thr | Alá | Tyr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | As p | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | Asp | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | G1 y |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly | Gly |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Thr | Ile | Me t | Ser | Alá | Ser | Pro | Gly | Glu | Ly s | Va 1 | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Asp | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Thr | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Val | Pro | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cy s | Gin |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Gin | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly | Alá | Gly | Thr | Lys | Leu | Glu |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ile | Lys | ||||||||||||||
A 27. | AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: |
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: HOSSZA: 726 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
HIPOTETIKUS: nem
ANTISZENSZ: nem
FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS: ORGANIZMUS: egér TÖRZS: Balb/c
HU 221 001 Bl
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KÖNYVTÁR: 7 G 1 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid) SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTC Glu Val | AAG Lys 245 | CTG Leu | CAG Gin | CAG TCA GGG | GCT GAA CTG GTG AAG CCT GGG GCT | 48 | ||||||||||
Gin | Ser | Gly 250 | Ala | Glu | Leu | Val | Lys 255 | Pro | Gly | Al a | ||||||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC | 96 |
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | His | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
TTG | GAT | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GGC | TGG | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC | 144 |
Leu | As p | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Gly | Trp | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile | |
275 | 280 | 285 | 290 | |||||||||||||
GGA | CAG | TTT | AAT | CCC | AGC | AAC | GGC | CGT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | TTC | 192 |
Gly | Gin | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC | 240 |
Ly s | Ser | Ly s | Al a | Thr | Leu | Thr | Va 1 | As p | Lys | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr | |
310 | 315 | 320 | ||||||||||||||
ATC | GAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TGC | TCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Ile | Glu | Leu | Ser | Se r | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Cy s | Ser | Val | Tyr | Tyr | Cy s | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | 336 |
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | As p | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT | 384 |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | |
355 | 360 | 365 | 370 | |||||||||||||
GGT | GGG | TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | 432 |
Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | As p | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro | |
375 | 380 | 385 | ||||||||||||||
ACA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT | 480 |
Thr | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser | Pro | G1 y | Glu | Lys | Val | Thr | Me t | Thr | Cy s | Ser | |
390 | 395 | 400 | ||||||||||||||
GAC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG | ACA | GGA | 528 |
Asp | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr | Gly | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
TCC | TCC | CCC | AGA | CTT | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA | 576 |
Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr | As p | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC | 624 |
Val | Pro | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | G1 y | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | |
435 | 440 | 445 | 450 |
HU 221 001 Bl
672
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG |
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t 455 | Glu | Al a | Glu | As p | Al a 460 | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cy s 465 | Gin |
CAG | TGG | AGT | AGT | TAC | CCG | CTC | ACG | TTC | GGT | GCT | GGG | ACC | AAG | CTG | GAA |
Gin | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly | Al a | Gly | Thr | Ly s | Leu | Glu |
470 475 480
720
ATA AAA
Ile Lys
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 242 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
726
Glu 1 | Val | Lys | Leu | Gin 5 | Gin | Ser | Gly | Al a | Glu 10 | Leu | Val | Lys | Pro | Gly 15 | Al a |
Ser | Val | Lys | Leu 20 | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser 25 | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr 30 | Ser | Hi s |
Leu | Asp | Hi s 35 | Trp | Val | Lys | Gin | Arg 40 | Gly | Trp | Gin | Gly | Leu 45 | Glu | Trp | Ile |
Gly | Gin 50 | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn 55 | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr 60 | Asn | Glu | Lys | Phe |
Lys 65 | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu 70 | Thr | Val | Asp | Lys | Se r 75 | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr 80 |
Ile | Glu | Leu | Ser | Se r 85 | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp 90 | Cys | Ser | Val | Tyr | Tyr 95 | Cys |
Al a | Ser | Arg | Asp 100 | Tyr | Asp | Tyr | Asp | Gly 105 | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr 110 | Trp | Gly |
Gin | Gly | Thr 115 | Thr | Val | Thr | Val | Ser 120 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu 140 | Thr | Gin | Ser | Pro |
Thr 145 | Ile | Me t | Se r | Al a | Ser 150 | Pro | Gly | Glu | Lys | Val 155 | Thr | Me t | Thr | Cy s | Ser 160 |
Asp | Ser | Ser | Ser | Va 1 165 | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp 170 | Tyr | Gin | Gin | Ly s | Thr 175 | Gly |
Ser | Se r | Pro | Arg 180 | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp 185 | Thr | Se r | Asn | Leu | Al a 190 | Ser | Gly |
Val | Pro | Val 195 | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser 200 | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser 205 | Tyr | Ser | Leu |
Thr | Ile 210 | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a 215 | Glu | As p | Al a | Al a | Thr Tyr 220 | Tyr | Cy s | Gin |
HU 221 001 Bl
Gin Trp Ser Ser Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Alá Gly Thr Lys Leu Glu 225 230 235 240
Ile Lys
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 726 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 11 Η 1 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid)
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-726
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTC AAG | CTG Leu | CAG CAG TCA GGG GCT GAA CTG GTG | AAG CCT GGG GCT | 48 | ||||||||||||
Glu Val | Lys 245 | Gin | Gin | Ser | Gly 250 | Al a | Glu | Leu | Val | Lys 255 | Pro | Gly | Al a | |||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC | 96 |
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | TTG | GAG | TGG | ATC | 144 |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Gl u | Trp | Ile | |
275 | 280 | 285 | 290 | |||||||||||||
GGA | GAG | TTT | AAT | CCC | AGC | AAC | GGC | CGT | ACT | AAC | TAC | AAT | GAG | AAA | TTC | 192 |
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||||
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCC | TAC | 240 |
Lys | Ser | Ly s | Al a | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Ly s | Se r | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr | |
310 | 315 | 320 | ||||||||||||||
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT | 288 |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Se r | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC | 336 |
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | As p | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT | 384 |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gl y | Ser | Gly | Gly | |
355 | 360 | 365 | 370 |
HU 221 001 Bl
GGT Gly | GGG Gly | TCG GGT GGC | GGC Gly | GGA Gly | TCT GAC | ATT GAG CTC ACC CAG TCT CCA | 432 | |||||||||
Ser | Gly Gly 375 | Ser | Asp | lle 380 | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser 385 | Pro | ||||||
TCA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT | 480 |
Ser | lle | Me t | Ser | Al a | Ser | Pro | Gly | Glu | Lys | Val | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser | |
390 | 395 | 400 | ||||||||||||||
GAC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG | ACA | GGA | 528 |
Asp | Ser | Ser | Ser | Va 1 | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr | Gly | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
TCC | TCC | CCC | AGA | CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA | 576 |
Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Leu | lle | Tyr | Asp | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC | 624 |
Val | Pro | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu | |
435 | 440 | 445 | 450 | |||||||||||||
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG | 672 |
Thr | lle | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin |
455 460 465
CAG TGG AGT AGT TAC CCA CAC ACG TTC GGT GCT GGG ACC AAG CTG GAA 720
Gin | Trp Ser | Ser Tyr Pro His Thr Phe Gly Alá Gly Thr 470 475 | Lys Leu Glu 480 |
ATA | AAA | ||
lle | Lys |
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 242 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Glu Val 1 | Lys | Leu | Gin Gin 5 | Ser | Gly | Al a | Glu 10 | Leu | Val | Lys | Pro | Gly 15 | Al a | ||
Ser | Val | Lys | Leu | Ser | Cys | Ly s | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | lle |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro | Ser | Asn | Gly | Arg | Thr | Asn | Tyr | Asn | Glu | Lys | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Va 1 | Asp | Lys | Se r | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Ser | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | As p | Tyr | As p | Gly | Arg | Tyr | Phe | As p | Tyr | Trp | Gly |
100 | 105 | 110 |
HU 221 001 Bl
Gin | G1 y | Thr 115 | Thr | Va 1 | Thr | Val | Ser 120 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Ser | Asp | Ile | G1 u | Leu 140 | Thr | Gin | Ser | Pro |
Ser 145 | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser 150 | Pro | Gly | Glu | Lys | Val 155 | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser 160 |
As p | Ser | Ser | Ser | Val 165 | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp 170 | Tyr | Gin | Gin | Ly s | Thr 175 | G1 y |
Ser | Ser | Pro | Arg 180 | Leu | Leu | Ile | Tyr | Asp 185 | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a 190 | Ser | Gly |
Val | Pro | Val 195 | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser 200 | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser 205 | Tyr | Ser | Leu |
Thr | Ile 210 | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a 215 | Glu | Asp | Al a | Al a | Thr 220 | Tyr | Tyr | Cy s | Gin |
Gin 225 | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro 230 | Hi s | Thr | Phe | Gly | Al a 235 | Gly | Thr | Ly s | Leu | Glu 240 |
Ile Lys
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 732 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS HIPOTETIKUS: nem ANTISZENSZ: nem FRAGMENSTÍPUS: N-terminális.
EREDETI FORRÁS:
ORGANIZMUS: egér
TÖRZS: Balb/c
SZÖVETTÍPUS: splenociták KÖZVETLEN FORRÁS:
KLÓN: 1 A 1 (egyláncú Fv, könnyű- és nehézlánc plusz kapcsoló oligonukleotid) SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-732
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GAG GTG CAG CTG CAG CAG TCT | GGG GCT | GAA CTG GTG AAG | CCT Pro | GGG Gly | GCT Al a | ||||||||||
Glu | Val | Gin 245 | Leu | Gin | Gin | Ser | Gly 250 | Al a | Glu | Leu | Val | Lys 255 | |||
TCA | GTG | AAG | TTG | TCC | TGC | AAG | GCT | TCC | GGC | TAC | ACC | TTC | ACC | AGC | CAC |
Ser | Va 1 | Lys | Leu | Ser | Cys | Lys | Al a | Ser | Gly | Tyr | Thr | Phe | Thr | Ser | Hi s |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
TGG | ATG | CAC | TGG | GTG | AAG | CAG | AGG | GCT | GGA | CAA | GGC | CTT | GAG | TGG | ATC |
Trp | Me t | Hi s | Trp | Val | Lys | Gin | Arg | Al a | Gly | Gin | Gly | Leu | Glu | Trp | Ile |
275 | 280 | 285 | 290 |
144
HU 221 001 Bl
192
GGA GAG TTT | AAT CCC AGC AAC GGC | CGT Arg | ACT Thr 300 | AAC Asn | TAC Tyr | AAT Asn | GAG Glu | AAA Lys 305 | TTC Phe | ||||||
Gly | Glu | Phe | Asn | Pro 295 | Ser | Asn Gly | |||||||||
AAG | AGC | AAG | GCC | ACA | CTG | ACT | GTA | GAC | AAA | TCC | TCC | AGC | ACA | GCT | TAC |
Lys | Ser | Lys | Al a | Thr | Leu | Thr | Va 1 | Asp | Ly s | Ser | Ser | Ser | Thr | Al a | Tyr |
310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ATG | CAA | CTC | AGC | AGC | CTG | ACA | TCT | GAG | GAC | TCT | GCG | GTC | TAT | TAC | TGT |
Me t | Gin | Leu | Ser | Ser | Leu | Thr | Ser | Glu | Asp | Se r | Al a | Val | Tyr | Tyr | Cys |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
GCC | AGT | CGG | GAC | TAT | GAT | TAC | GAC | GGA | CGG | TAC | TTT | GAC | TAC | TGG | GGC |
Al a | Ser | Arg | Asp | Tyr | Asp | Tyr | Asp | Gly | Arg | Tyr | Phe | Asp | Tyr | Trp | Gly |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
CAA | GGG | ACC | ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCA | GGT | GGC | GGT | GGC | TCG | GGC | GGT |
Gin | Gly | Thr | Thr | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Gly | Gly |
355 | 360 | 365 | 370 | ||||||||||||
GGT | GGG | TCG | GGT | GGC | GGC | GGA | TCT | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA |
Gly | Gly | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Asp | Ile | Glu | Leu | Thr | Gin | Ser | Pro |
375 | 380 | 385 | |||||||||||||
ACA | ATC | ATG | TCT | GCA | TCT | CCA | GGG | GAG | AAG | GTC | ACC | ATG | ACC | TGC | AGT |
Thr | Ile | Me t | Ser | Al a | Ser | Pr o | Gly | Glu | Ly s | Val | Thr | Me t | Thr | Cys | Ser |
390 | 395 | 400 | |||||||||||||
GAC | AGC | TCA | AGT | GTA | AGT | TAC | ATG | TAC | TGG | TAC | CAG | CAG | AAG | ACA | GGA |
Asp | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Me t | Tyr | Trp | Tyr | Gin | Gin | Lys | Thr | Gly |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
TCC | TCC | CCC | AGA | CTC | CTG | ATT | TAT | GAC | ACA | TCC | AAC | CTG | GCT | TCT | GGA |
Ser | Se r | Pro | Arg | Leu | Leu | Ile | Tyr | As p | Thr | Ser | Asn | Leu | Al a | Ser | Gly |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
GTC | CCT | GTT | CGC | TTC | AGT | GGC | AGT | GGG | TCT | GGG | ACC | TCT | TAC | TCT | CTC |
Val | Pro | Val | Arg | Phe | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ser | Leu |
435 | 440 | 445 | 450 | ||||||||||||
ACA | ATC | AGC | CGA | ATG | GAG | GCT | GAA | GAT | GCT | GCC | ACT | TAT | TAC | TGC | CAG |
Thr | Ile | Ser | Arg | Me t | Glu | Al a | Glu | As p | Al a | Al a | Thr | Tyr | Tyr | Cys | Gin |
455 | 460 | 465 | |||||||||||||
CAG | TGG | AGT | AGT | TAC | CCA | CCC | ATG | TAC | ACG | TTC | GGA | GGG | GGG | ACA | AAG |
Gin | Trp | Ser | Ser | Tyr | Pro | Pro | Me t | Tyr | Thr | Phe | Gly | Gly | Gly | Thr | Ly s |
470 | 475 | 480 | |||||||||||||
TTG | GAA | ATA | AAA | ||||||||||||
Leu | Glu | Ile | Lys |
485
240
288
336
384
432
480
528
576
624
672
720
732
A 32. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 244 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 32. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
HU 221 001 Bl
Glu Val 1
Ser Val
Trp Met
Gly Glu 50
Lys Ser 65
Met Gin
Alá Ser
Gin Gly
Gly Gly 130
Thr Ile 145
Asp Ser
Ser Ser
Val Pro
Thr Ile 210
Gin Trp 225
Leu Glu
Gin Leu
Lys Leu 20
His Trp 35
Phe Asn
Lys Alá
Leu Ser
Arg Asp 100
Thr Thr 115
Ser Gly
Met Ser
Ser Ser
Pro Arg 180
Val Arg 195
Ser Arg
Ser Ser
Ile Lys
Gin Gin 5
Ser Cys
Val Lys
Pro Ser
Thr Leu 70
Ser Leu 85
Tyr Asp
Val Thr
Gly Gly
Alá Ser 150
Val Ser 165
Leu Leu
Phe Ser
Me t Glu
Tyr Pro 230
Ser Gly
Lys Alá
Gin Arg 40
Asn Gly 55
Thr Val
Thr Ser
Tyr Asp
Val Ser 120
Gly Ser 135
Pro Gly
Tyr Me t
Ile Tyr
Gly Ser 200
Alá Glu 215
Pro Me t
Al a | Glu 10 |
Ser 25 | Gly |
Alá | Gly |
Arg | Thr |
Asp | Lys |
Glu | Asp 90 |
Gly 105 | Arg |
Ser | Gly |
Asp | Ile |
Glu | Lys |
Tyr | Trp 170 |
Asp 185 | Thr |
Gly | Ser |
As p | Alá |
Tyr | Thr |
Leu Val
Tyr Thr
Gin Gly
Asn Tyr 60
Ser Ser 75
Ser Alá
Tyr Phe
Gly Gly
Glu Leu 140
Val Thr 155
Tyr Gin
Gly Thr
Alá Thr 220
Phe Gly 235
Ser Asn
Lys Pro
Phe Thr 30
Leu Glu 45
Asn Glu
Ser Thr
Val Tyr
Asp Tyr 110
Gly Ser 125
Thr Gin
Me t Thr
Gin Lys
Gly Alá 15
Ser His
Trp Ile
Lys Phe
Alá Tyr 80
Tyr Cys 95
Trp Gly
Gly Gly
Ser Pro
Cys Ser 160
Thr Gly 175
Leu Alá 190
Ser Gly
Ser Tyr 205
Tyr Tyr
Gly Gly
Ser Leu
Cys Gin
Thr Lys
Claims (10)
1. Immunizált emlős sejtjeiből előállított fágalapú ellenanyag-génkönyvtárból előállítható egyláncú antiEGFR Fv-fragmens, melynek variábilis régiója a következők bármelyike szerinti nehézlánc aminosavszekvenciát: 4., 8., 12., 16., 18., 20., 22., 24., 26. vagy 28. azonosító számú szekvencia; és a következők bármelyike szerinti könnyűlánc aminosavszekvenciát tartalmaz: 2., 6., 10., 14., 18., 20., 22., 24., 26. vagy 28. azonosító számú szekvencia.
2. Az 1. igénypont szerinti ellenanyagfragmens, amely immunizált egér sejtjeiből előállított ellenanyaggénkönyvtárból állítható elő.
3. Az 1. vagy 2. igénypont szerinti ellenanyagfragmens, amely az alábbi eredetű sejtekből előállított ellenanyag-génkönyvtárból állítható elő:
(i) nyirokcsomó, (ii) lép, vagy (iii) in vitro immunizált sejtek.
4. Az 1-3. igénypontok bármelyike szerinti ellenanyagfragmens nehéz- vagy könnyűláncának
HU 221 001 Bl aminosavszekvenciáját kódoló DNS-molekula, melynek szekvenciája a következő DNS-szekvenciák bármelyike szerinti: 1., 3., 5., 7., 9., 11., 13. vagy 15. azonosító számú szekvencia; vagy az 1-3. igénypontok bármelyike szerinti ellenanyagfragmens nehézláncának vagy könnyűláncának aminosavszekvenciáját kódoló DNSmolekula, melynek szekvenciája a következő DNS-szekvenciák bármelyike szerinti: 17., 19., 21., 23., 25., 27., 29. vagy 31. azonosító számú szekvencia.
5. Ellenanyag, amelyet 4. igénypont szerinti DNSszekvenciát és humánimmunglobulinok konstans régióiból származtatott DNS-szekvenciát tartalmazó DNSmolekula kódol.
6. Az 5. igénypont szerinti ellenanyag, amelyben a nehéz konstanslánc-régió a humán gamma-l-lánc aminosavszekvenciáját, a könnyű konstanslánc-régió pedig egy humán kappa-lánc aminosavszekvenciáját tartalmazza.
7. Eljárás az 1-3. igénypontok bármelyike szerinti egyláncú anti-EGFR Fv-fragmens előállítására, azzal jellemezve, hogy:
(i) immunizált emlőssejtekből, előnyösen egérsejtekből RNS-t izolálunk, (ii) első cDNS-szálat szintetizáljuk, (iii) az immunizált sejtekből származó cDNS-ben található VH- és Vk-géneket amplifikáljuk, (iv) a fenti géneket megfelelő restrikciós helyekkel fágmid-vektorba klónozzuk, (v) a ligálási reakció termékével prokarióta sejteket transzformálunk, (vi) a fág ellenanyag-génkönyvtárakat tisztított EGFR alkalmazásával EGFR-receptorhoz kötődő fág ellenanyagokra átvizsgáljuk, és (vii) a kívánt egyláncú scFv-fragmenst prokarióta gazdasejtben, előnyösen E. coliban termeltetjük.
8. Eljárás teljes anti-EGFR ellenanyag előállítására, azzal jellemezve, hogy a 7. igénypont szerint előállítható anti-EGFR ellenanyagfragmensek variábilis régióit kódoló 4. igénypont szerinti DNS-t legalább egy, humánimmunglobulinok konstans régióit kódoló genomi DNS-t tartalmazó eukarióta expressziós vektorba klónozzuk, a vektorral (vektorokkal) eukarióta sejteket transzformálunk, majd az ellenanyagot expresszáltatjuk, és izoláljuk.
9. Gyógyászati készítmény, amely 1-3. igénypontok bármelyike szerinti anti-EGFR ellenanyagfragmenst vagy 5. vagy 6. igénypont szerinti, teljes anti-EGFR ellenanyagot tartalmaz.
10. Az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti antiEGFR ellenanyagfragmens vagy az 5. vagy 6. igénypontok szerinti, teljes anti-EGFR ellenanyag alkalmazása tumorellenes hatóanyag előállítására, vagy tumomövekedés diagnosztikus lokalizálására és nyomon követésére alkalmas készítmény előállítására.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP94104160 | 1994-03-17 | ||
EP94118970 | 1994-12-02 | ||
PCT/EP1995/000978 WO1995025167A1 (en) | 1994-03-17 | 1995-03-16 | Anti-egfr single-chain fvs and anti-egfr antibodies |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9503285D0 HU9503285D0 (en) | 1996-02-28 |
HUT73461A HUT73461A (en) | 1996-08-28 |
HU221001B1 true HU221001B1 (hu) | 2002-07-29 |
Family
ID=26135522
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9503285A HU221001B1 (hu) | 1994-03-17 | 1995-03-16 | Egyláncú anti-EGFR Fv-k és anti-EGFR ellenanyagok |
Country Status (20)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5844093A (hu) |
EP (1) | EP0699237B1 (hu) |
JP (2) | JPH08510922A (hu) |
KR (1) | KR100376038B1 (hu) |
AT (1) | ATE232902T1 (hu) |
AU (1) | AU2071695A (hu) |
CA (1) | CA2163012C (hu) |
CZ (1) | CZ292061B6 (hu) |
DE (1) | DE69529649T2 (hu) |
DK (1) | DK0699237T3 (hu) |
ES (1) | ES2191702T3 (hu) |
HU (1) | HU221001B1 (hu) |
MX (1) | MX9504802A (hu) |
NO (1) | NO322252B1 (hu) |
PL (1) | PL181342B1 (hu) |
PT (1) | PT699237E (hu) |
RU (1) | RU2170257C2 (hu) |
SK (1) | SK283889B6 (hu) |
UA (1) | UA41929C2 (hu) |
WO (1) | WO1995025167A1 (hu) |
Families Citing this family (125)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
PT659439E (pt) | 1993-12-24 | 2002-04-29 | Merck Patent Gmbh | Imunoconjugados |
US7060808B1 (en) * | 1995-06-07 | 2006-06-13 | Imclone Systems Incorporated | Humanized anti-EGF receptor monoclonal antibody |
AU4373197A (en) * | 1996-09-19 | 1998-04-14 | Diagnocure Inc. | Recombinant single chain antibodies directed against the gp54 cancer marker, composition comprising same and use thereof |
ATE549918T1 (de) * | 1996-12-03 | 2012-04-15 | Amgen Fremont Inc | Menschliche antikörper, die ausdrücklich menschliches tnf alpha binden |
WO1999011792A1 (fr) * | 1997-09-02 | 1999-03-11 | Sumitomo Pharmaceuticals Company, Limited | Anticorps a simple brin dirige contre une proteine noyau du virus de l'hepatite b, gene correspondant et agent therapeutique de l'hepatite b les contenant |
DE19744531A1 (de) * | 1997-10-09 | 1999-05-27 | Klaus Dr Rer Nat Bosslet | Bindemoleküle gegen Rezeptor-Ligand-Komplexe |
ES2334184T3 (es) | 1997-11-17 | 2010-03-05 | Micromet Ag | Metodo de identificacion de dominios de sitios de union que conservan la capacidad de unirse a un epitopo. |
US20030224001A1 (en) * | 1998-03-19 | 2003-12-04 | Goldstein Neil I. | Antibody and antibody fragments for inhibiting the growth of tumors |
ZA200007412B (en) * | 1998-05-15 | 2002-03-12 | Imclone Systems Inc | Treatment of human tumors with radiation and inhibitors of growth factor receptor tyrosine kinases. |
DK1107996T3 (da) | 1998-08-28 | 2002-09-16 | Genentech Inc | Humane anti-faktor IX/IXa-antistoffer |
HUP0201480A3 (en) * | 1999-05-14 | 2009-03-30 | Imclone Systems Inc | Treatment of refractory human tumors with epidermal growth factor receptor antagonists |
US7144991B2 (en) | 1999-06-07 | 2006-12-05 | Aletheon Pharmaceuticals, Inc. | Streptavidin expressed gene fusions and methods of use thereof |
US7361338B2 (en) * | 1999-10-05 | 2008-04-22 | Agensys, Inc. | Methods to inhibit growth of prostate cancer cells |
US6790631B1 (en) * | 1999-10-05 | 2004-09-14 | Agensys, Inc. | G protein-coupled receptor up-regulated in prostate cancer and uses thereof |
AU2001258567A1 (en) * | 2000-05-19 | 2001-11-26 | Scancell Limited | Humanised antibodies to the epidermal growth factor receptor |
WO2001096401A1 (fr) * | 2000-06-14 | 2001-12-20 | Medical & Biological Laboratories Co., Ltd. | Procede de construction d'un anticorps scfv fusionne a une proteine fluorescente |
US8697394B2 (en) | 2000-06-28 | 2014-04-15 | Glycofi, Inc. | Production of modified glycoproteins having multiple antennary structures |
DK1297172T3 (da) * | 2000-06-28 | 2006-02-13 | Glycofi Inc | Fremgangsmåder til frembringelse af modificerede glucoproteiner |
US7449308B2 (en) | 2000-06-28 | 2008-11-11 | Glycofi, Inc. | Combinatorial DNA library for producing modified N-glycans in lower eukaryotes |
US7598055B2 (en) * | 2000-06-28 | 2009-10-06 | Glycofi, Inc. | N-acetylglucosaminyltransferase III expression in lower eukaryotes |
JP2004527456A (ja) * | 2000-08-09 | 2004-09-09 | イムクローン システムズ インコーポレイティド | Egf受容体拮抗剤による過増殖性の疾患の治療 |
EP1458411A4 (en) * | 2000-08-21 | 2004-09-22 | Smithkline Beecham Corp | ANTI-RANK LIGAND MONOCLONAL ANTIBODIES SUITABLE FOR THE TREATMENT OF RANK LIGAND RELATED DISORDERS |
US7754208B2 (en) * | 2001-01-17 | 2010-07-13 | Trubion Pharmaceuticals, Inc. | Binding domain-immunoglobulin fusion proteins |
US20030133939A1 (en) * | 2001-01-17 | 2003-07-17 | Genecraft, Inc. | Binding domain-immunoglobulin fusion proteins |
US7829084B2 (en) * | 2001-01-17 | 2010-11-09 | Trubion Pharmaceuticals, Inc. | Binding constructs and methods for use thereof |
EP2706116A1 (en) * | 2001-01-17 | 2014-03-12 | Emergent Product Development Seattle, LLC | Binding domain-immunoglobulin fusion proteins |
GB0103389D0 (en) * | 2001-02-12 | 2001-03-28 | Novartis Ag | Organic compounds |
WO2002072790A2 (en) | 2001-03-14 | 2002-09-19 | Myriad Genetics, Inc | Tsg101-gag interaction and use thereof |
US20080008704A1 (en) * | 2001-03-16 | 2008-01-10 | Mark Rubin | Methods of treating colorectal cancer with anti-epidermal growth factor antibodies |
PT2163256E (pt) | 2001-05-11 | 2015-11-20 | Ludwig Inst For Cancer Res Ltd | Proteínas de ligação específica e suas utilizações |
US20100056762A1 (en) | 2001-05-11 | 2010-03-04 | Old Lloyd J | Specific binding proteins and uses thereof |
US20020193569A1 (en) * | 2001-06-04 | 2002-12-19 | Idec Pharmaceuticals Corporation | Bispecific fusion protein and method of use for enhancing effector cell killing of target cells |
US7595378B2 (en) | 2001-06-13 | 2009-09-29 | Genmab A/S | Human monoclonal antibodies to epidermal growth factor receptor (EGFR) |
JP4298498B2 (ja) * | 2001-06-13 | 2009-07-22 | ゲンマブ エー/エス | 上皮成長因子受容体(egfr)に対するヒトモノクローナル抗体 |
JP2006506317A (ja) | 2002-01-11 | 2006-02-23 | バイオマリン ファーマシューティカル インコーポレイテッド | 治療用リソソーム酵素の送達のための酵素送達系としてのp97の使用 |
WO2005117986A2 (en) | 2004-06-01 | 2005-12-15 | Genentech, Inc. | Antibody drug conjugates and methods |
US8034904B2 (en) * | 2002-06-14 | 2011-10-11 | Immunogen Inc. | Anti-IGF-I receptor antibody |
CA2490758C (en) | 2002-07-15 | 2014-09-23 | Genentech, Inc. | Dosage form of recombinant humanized monoclonal antibody 2c4 |
US20060228355A1 (en) | 2003-11-07 | 2006-10-12 | Toon Laeremans | Camelidae single domain antibodies vhh directed against epidermal growth factor receptor and uses therefor |
PT1565478T (pt) | 2002-11-12 | 2017-11-14 | The Brigham And Women`S Hospital Inc | Vacina de polissacáridos para infeções estafilocócicas |
US20040147428A1 (en) * | 2002-11-15 | 2004-07-29 | Pluenneke John D. | Methods of treatment using an inhibitor of epidermal growth factor receptor |
US7332299B2 (en) | 2003-02-20 | 2008-02-19 | Glycofi, Inc. | Endomannosidases in the modification of glycoproteins in eukaryotes |
EP1622941A2 (en) * | 2003-03-20 | 2006-02-08 | ImClone Systems Incorporated | Method of producing an antibody to epidermal growth factor receptor |
US7754209B2 (en) | 2003-07-26 | 2010-07-13 | Trubion Pharmaceuticals | Binding constructs and methods for use thereof |
DK1735348T3 (da) * | 2004-03-19 | 2012-07-16 | Imclone Llc | Humant anti-epidermalt vækstfaktorreceptorantistof |
PT1745075E (pt) * | 2004-04-21 | 2013-06-17 | Brigham & Womens Hospital | Péptidos de ligação a poli-n-acetilglucosamina (pnag/dpnag) e métodos da sua utilização |
GB0410627D0 (en) * | 2004-05-12 | 2004-06-16 | Scancell Ltd | Specific binding members |
US20100111856A1 (en) | 2004-09-23 | 2010-05-06 | Herman Gill | Zirconium-radiolabeled, cysteine engineered antibody conjugates |
DK1791565T3 (en) | 2004-09-23 | 2016-08-01 | Genentech Inc | Cysteingensplejsede antibodies and conjugates |
ES2460517T3 (es) | 2005-07-25 | 2014-05-13 | Emergent Product Development Seattle, Llc | Reducción de células b mediante el uso de moléculas de unión específica a cd37 y de unión específica a cd20 |
EA013878B1 (ru) * | 2005-12-06 | 2010-08-30 | Домантис Лимитед | Лиганды, имеющие специфичность связывания в отношении рецептора эпидермального фактора роста (egfr) и/или сосудистого эндотелиального фактора роста (vegf), и способы их применения |
US7503217B2 (en) * | 2006-01-27 | 2009-03-17 | Weatherford/Lamb, Inc. | Sonar sand detection |
AU2007222165A1 (en) * | 2006-03-06 | 2007-09-13 | Agency For Science, Technology And Research | Human embryonic stem cell methods and PODXL expression |
AU2007257692B2 (en) | 2006-06-12 | 2013-11-14 | Aptevo Research And Development Llc | Single-chain multivalent binding proteins with effector function |
EP2078732B1 (en) | 2006-07-10 | 2015-09-16 | Fujita Health University | Method of identifying a candidate diagnostic or therapeutic antibody using flow cytometry |
CN101687032A (zh) * | 2006-12-07 | 2010-03-31 | 诺瓦提斯公司 | 抗ephb3的拮抗剂抗体 |
JP2010513321A (ja) * | 2006-12-22 | 2010-04-30 | ノヴェリクス・セラピューティクス・ゲゼルシャフト・ミット・ベシュレンクテル・ハフツング | 少なくとも一種の上皮細胞増殖因子受容体特異抗体またはその誘導体を用いる糖尿病の治療 |
CN101711284A (zh) | 2007-01-25 | 2010-05-19 | 达娜-法勃肿瘤研究所 | 抗egfr抗体在治疗egfr突变体介导的疾病中的用途 |
CN101688229B (zh) | 2007-03-15 | 2013-06-12 | 路德维格癌症研究所 | 包含egfr抗体和src抑制剂的组合物及其在制备用于治疗哺乳动物癌症的药物中的用途 |
US20100322939A1 (en) * | 2007-06-21 | 2010-12-23 | Genmab A/S | Novel methods for treating egfr-associated tumors |
CN108424454B (zh) | 2007-08-14 | 2022-05-31 | 路德维格癌症研究所有限公司 | 靶向egf受体的单克隆抗体175及其衍生物和用途 |
KR101661770B1 (ko) | 2007-09-21 | 2016-10-04 | 더 리전트 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | 표적화된 인터페론이 강력한 아폽토시스 및 항-종양 활성을 발휘함 |
DK2132228T3 (da) * | 2008-04-11 | 2011-10-10 | Emergent Product Dev Seattle | CD37-immunterapeutisk middel og kombination med bifunktionelt kemoterapeutisk middel deraf |
KR20110014607A (ko) | 2008-04-29 | 2011-02-11 | 아보트 러보러터리즈 | 이원 가변 도메인 면역글로불린 및 이의 용도 |
WO2009149189A2 (en) | 2008-06-03 | 2009-12-10 | Abbott Laboratories | Dual variable domain immunoglobulins and uses thereof |
CN102112494A (zh) | 2008-06-03 | 2011-06-29 | 雅培制药有限公司 | 双重可变结构域免疫球蛋白及其用途 |
BRPI0915448A2 (pt) | 2008-07-08 | 2015-11-10 | Abbott Lab | imunoglobulinas de domínio variável duplo para prostaglandina e2 e usos das mesmas |
CN102159540B (zh) | 2008-07-21 | 2015-08-12 | 布赖汉姆妇女医院 | 与合成的β-1,6葡糖胺寡糖相关的方法和组合物 |
KR101108642B1 (ko) * | 2009-09-29 | 2012-02-09 | 주식회사 녹십자 | 표피 성장 인자 수용체에 특이적으로 결합하는 항체 |
RU2012119756A (ru) | 2009-10-15 | 2013-11-20 | Эбботт Лэборетриз | Иммуноглобулины с двумя вариабельными доменами и их применение |
UY32979A (es) | 2009-10-28 | 2011-02-28 | Abbott Lab | Inmunoglobulinas con dominio variable dual y usos de las mismas |
US20120282274A1 (en) * | 2009-11-20 | 2012-11-08 | Northshore University Health System Research Institute | Targeting of the c-terminal segment of c.difficile toxin b for improved clinical diagnosis, prevention, and treatment |
JP6184695B2 (ja) | 2009-12-04 | 2017-08-23 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 多重特異性抗体、抗体アナログ、組成物、及び方法 |
CN102167743B (zh) * | 2010-02-25 | 2014-05-14 | 上海百迈博制药有限公司 | 一种全人源抗egfr单克隆抗体、其制备方法及用途 |
CA2796633C (en) | 2010-04-23 | 2020-10-27 | Genentech, Inc. | Production of heteromultimeric proteins |
US9029513B2 (en) | 2010-06-04 | 2015-05-12 | Toagosei Co. Ltd. | Anti-EGFR antibody and use thereof |
EP3252072A3 (en) | 2010-08-03 | 2018-03-14 | AbbVie Inc. | Dual variable domain immunoglobulins and uses thereof |
WO2012027570A2 (en) | 2010-08-26 | 2012-03-01 | Abbott Laboratories | Dual variable domain immunoglobulins and uses thereof |
KR101273918B1 (ko) * | 2010-09-17 | 2013-06-13 | 강원대학교산학협력단 | 인간 항-상피세포성 성장인자수용체 Fab 항체 및 이를 포함하는 종양 치료용 약학 조성물 |
JP5828901B2 (ja) | 2010-10-29 | 2015-12-09 | イミュノジェン, インコーポレイテッド | 新規egfr結合分子およびその免疫抱合体 |
EA201390575A1 (ru) | 2010-10-29 | 2014-01-30 | Иммьюноджен, Инк. | Неантагонистические egfr-связывающие молекулы и их иммуноконъюгаты |
US10689447B2 (en) | 2011-02-04 | 2020-06-23 | Genentech, Inc. | Fc variants and methods for their production |
EP2670776B1 (en) | 2011-02-04 | 2018-11-21 | F. Hoffmann-La Roche AG | Fc VARIANTS AND METHODS FOR THEIR PRODUCTION |
JP6130307B2 (ja) | 2011-03-17 | 2017-05-17 | ザ ユニバーシティ オブ バーミンガム | 再指向性免疫療法 |
CN103747807B (zh) | 2011-07-05 | 2016-12-07 | 比奥阿赛斯技术有限公司 | P97‑抗体缀合物和使用方法 |
DK2739649T3 (en) | 2011-08-05 | 2018-01-08 | Bioasis Technologies Inc | P97 FRAGMENTS WITH TRANSFER ACTIVITY |
EA028879B1 (ru) | 2011-09-30 | 2018-01-31 | Ридженерон Фармасьютикалз, Инк. | АНТИТЕЛА К ErbB3 И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ |
US9273143B2 (en) | 2011-09-30 | 2016-03-01 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions comprising a combination of an anti-ErbB3 antibody and an anti-EGFR antibody |
BR112014009925B1 (pt) | 2011-10-28 | 2022-09-20 | Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd | Construtores de polipeptídeos e seus usos |
JP2014533954A (ja) | 2011-11-21 | 2014-12-18 | イミュノジェン, インコーポレイテッド | Egfr抗体細胞傷害性薬物複合体による、egfr療法に耐性である腫瘍の治療方法 |
JP2015508994A (ja) | 2011-12-30 | 2015-03-26 | アッヴィ・インコーポレイテッド | Il−13および/またはil−17に対する二重可変ドメイン免疫グロブリン |
KR20150003719A (ko) * | 2012-03-21 | 2015-01-09 | 프라운호퍼-게젤샤프트 추르 푀르데룽 데어 안제반텐 포르슝 에 파우 | 광역동 요법에 사용하기 위한 신규 광면역접합체 |
JP6441792B2 (ja) * | 2012-05-17 | 2018-12-19 | ソレント・セラピューティクス・インコーポレイテッドSorrento Therapeutics, Inc. | Egfrに結合する抗原結合蛋白質 |
TW201843172A (zh) | 2012-06-25 | 2018-12-16 | 美商再生元醫藥公司 | 抗-egfr抗體及其用途 |
AU2013296557B2 (en) | 2012-07-31 | 2019-04-18 | Bioasis Technologies Inc. | Dephosphorylated lysosomal storage disease proteins and methods of use thereof |
EP2914625A2 (en) | 2012-11-01 | 2015-09-09 | AbbVie Inc. | Anti-vegf/dll4 dual variable domain immunoglobulins and uses thereof |
EP2970433B1 (en) | 2013-03-13 | 2019-09-18 | Bioasis Technologies Inc. | Fragments of p97 and uses thereof |
US9062108B2 (en) | 2013-03-15 | 2015-06-23 | Abbvie Inc. | Dual specific binding proteins directed against IL-1 and/or IL-17 |
EA033115B1 (ru) | 2013-04-29 | 2019-08-30 | Тева Фармасьютикалз Острэйлиа Пти Лтд. | АНТИТЕЛА ПРОТИВ CD38 И СЛИТЫЕ БЕЛКИ С ОСЛАБЛЕННЫМ ИНТЕРФЕРОНОМ АЛЬФА-2b |
US11117975B2 (en) | 2013-04-29 | 2021-09-14 | Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd | Anti-CD38 antibodies and fusions to attenuated interferon alpha-2B |
WO2015031673A2 (en) | 2013-08-28 | 2015-03-05 | Bioasis Technologies Inc. | Cns-targeted conjugates having modified fc regions and methods of use thereof |
JP6603227B2 (ja) | 2014-02-03 | 2019-11-06 | バイオアシス テクノロジーズ インコーポレイテッド | P97融合タンパク質 |
JP6605482B2 (ja) | 2014-02-19 | 2019-11-13 | バイオアシス テクノロジーズ インコーポレイテッド | P97−ids融合タンパク質 |
US10058619B2 (en) | 2014-05-01 | 2018-08-28 | Bioasis Technologies, Inc. | P97-polynucleotide conjugates |
UA119352C2 (uk) | 2014-05-01 | 2019-06-10 | Тева Фармасьютикалз Острейліа Пті Лтд | Комбінація леналідоміду або помалідоміду і конструкції анти-cd38 антитіло-атенуйований інтерферон альфа-2b та спосіб лікування суб'єкта, який має cd38-експресуючу пухлину |
DK3154587T3 (da) | 2014-06-13 | 2020-03-09 | Tenboron Oy | Konjugater omfattende et anti-egfr1-antistof |
KR102639037B1 (ko) | 2014-10-29 | 2024-02-20 | 테바 파마슈티컬즈 오스트레일리아 피티와이 엘티디 | 인터페론 α2b 변이체 |
US10093733B2 (en) | 2014-12-11 | 2018-10-09 | Abbvie Inc. | LRP-8 binding dual variable domain immunoglobulin proteins |
TW201710286A (zh) | 2015-06-15 | 2017-03-16 | 艾伯維有限公司 | 抗vegf、pdgf及/或其受體之結合蛋白 |
UA126278C2 (uk) | 2015-09-21 | 2022-09-14 | Аптево Рісьорч Енд Девелопмент Ллс | Поліпептиди, які зв'язують cd3 |
SG11201810327XA (en) | 2016-05-20 | 2018-12-28 | Harpoon Therapeutics Inc | Single domain serum albumin binding protein |
US11623958B2 (en) | 2016-05-20 | 2023-04-11 | Harpoon Therapeutics, Inc. | Single chain variable fragment CD3 binding proteins |
WO2018014067A1 (en) | 2016-07-19 | 2018-01-25 | Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd | Anti-cd47 combination therapy |
CN110300603B (zh) * | 2017-02-14 | 2023-04-14 | 亘喜生物科技(上海)有限公司 | Cd47-car-t细胞 |
EP3589662A4 (en) | 2017-02-28 | 2020-12-30 | Harpoon Therapeutics, Inc. | INDUCTIBLE MONOVALENT ANTIGBINDING PROTEIN |
JP7090347B2 (ja) | 2017-05-12 | 2022-06-24 | ハープーン セラピューティクス,インク. | メソテリン結合タンパク質 |
CN109879964B (zh) * | 2017-12-06 | 2022-08-05 | 北京科立思维生物科技有限公司 | 抗egfr单链抗体、抗pd1单链抗体及融合蛋白 |
WO2019195959A1 (en) | 2018-04-08 | 2019-10-17 | Cothera Biosciences, Inc. | Combination therapy for cancers with braf mutation |
JP7425049B2 (ja) | 2018-09-25 | 2024-01-30 | ハープーン セラピューティクス,インク. | Dll3結合タンパク質および使用方法 |
JP2022514262A (ja) | 2018-12-17 | 2022-02-10 | レビトープ リミテッド | 双子型免疫細胞エンゲージャー |
CA3181566A1 (en) * | 2020-04-30 | 2021-11-04 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Anti-cd79b antibodies and chimeric antigen receptors and methods of use thereof |
CA3128035A1 (en) | 2020-08-13 | 2022-02-13 | Bioasis Technologies, Inc. | Combination therapies for delivery across the blood brain barrier |
EP4225792A1 (en) | 2020-10-08 | 2023-08-16 | Affimed GmbH | Trispecific binders |
CA3216098A1 (en) | 2021-07-30 | 2023-02-02 | Uwe Reusch | Duplexbodies |
WO2023078968A1 (en) | 2021-11-03 | 2023-05-11 | Affimed Gmbh | Bispecific cd16a binders |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2016842A1 (en) * | 1989-05-16 | 1990-11-16 | Richard A. Lerner | Method for tapping the immunological repertoire |
US5395750A (en) * | 1992-02-28 | 1995-03-07 | Hoffmann-La Roche Inc. | Methods for producing proteins which bind to predetermined antigens |
GB9401182D0 (en) * | 1994-01-21 | 1994-03-16 | Inst Of Cancer The Research | Antibodies to EGF receptor and their antitumour effect |
-
1995
- 1995-03-16 ES ES95913134T patent/ES2191702T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-03-16 RU RU95122645/13A patent/RU2170257C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 PL PL95311661A patent/PL181342B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 KR KR1019950705118A patent/KR100376038B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 JP JP7523847A patent/JPH08510922A/ja active Pending
- 1995-03-16 PT PT95913134T patent/PT699237E/pt unknown
- 1995-03-16 CZ CZ19953014A patent/CZ292061B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 AU AU20716/95A patent/AU2071695A/en not_active Abandoned
- 1995-03-16 DK DK95913134T patent/DK0699237T3/da active
- 1995-03-16 DE DE69529649T patent/DE69529649T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-03-16 CA CA002163012A patent/CA2163012C/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-03-16 SK SK1430-95A patent/SK283889B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 WO PCT/EP1995/000978 patent/WO1995025167A1/en active IP Right Grant
- 1995-03-16 MX MX9504802A patent/MX9504802A/es not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 AT AT95913134T patent/ATE232902T1/de not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 HU HU9503285A patent/HU221001B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1995-03-16 EP EP95913134A patent/EP0699237B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-03-16 US US08/553,497 patent/US5844093A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-03-16 UA UA95114873A patent/UA41929C2/uk unknown
- 1995-11-16 NO NO19954626A patent/NO322252B1/no not_active IP Right Cessation
-
2005
- 2005-08-11 JP JP2005233093A patent/JP2006025794A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
PL181342B1 (pl) | 2001-07-31 |
AU2071695A (en) | 1995-10-03 |
DK0699237T3 (da) | 2003-05-26 |
JPH08510922A (ja) | 1996-11-19 |
JP2006025794A (ja) | 2006-02-02 |
EP0699237A1 (en) | 1996-03-06 |
ES2191702T3 (es) | 2003-09-16 |
US5844093A (en) | 1998-12-01 |
EP0699237B1 (en) | 2003-02-19 |
DE69529649D1 (de) | 2003-03-27 |
DE69529649T2 (de) | 2003-12-18 |
CZ292061B6 (cs) | 2003-07-16 |
HU9503285D0 (en) | 1996-02-28 |
CA2163012A1 (en) | 1995-09-21 |
NO954626L (no) | 1995-11-16 |
CA2163012C (en) | 2009-12-08 |
CZ301495A3 (en) | 1996-02-14 |
KR100376038B1 (ko) | 2003-06-09 |
SK283889B6 (sk) | 2004-04-06 |
HUT73461A (en) | 1996-08-28 |
ATE232902T1 (de) | 2003-03-15 |
SK143095A3 (en) | 1996-11-06 |
WO1995025167A1 (en) | 1995-09-21 |
UA41929C2 (uk) | 2001-10-15 |
RU2170257C2 (ru) | 2001-07-10 |
MX9504802A (es) | 1997-05-31 |
PL311661A1 (en) | 1996-03-04 |
NO954626D0 (no) | 1995-11-16 |
PT699237E (pt) | 2003-07-31 |
NO322252B1 (no) | 2006-09-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HU221001B1 (hu) | Egyláncú anti-EGFR Fv-k és anti-EGFR ellenanyagok | |
US10556954B2 (en) | Anti-PD-L1 nanobody, coding sequence and use thereof | |
JP4231862B2 (ja) | リンパ球抗原cd2および腫瘍抗原を認識する二特異性トリガー分子 | |
US6410690B1 (en) | Therapeutic compounds comprised of anti-Fc receptor antibodies | |
US7968685B2 (en) | Antibodies against Tenascin-C | |
JP2004511430A (ja) | 二重特異性免疫グロブリン様抗原結合蛋白および製造方法 | |
US8071730B2 (en) | Anti-JAM-A antibodies | |
US20040005643A1 (en) | Anti-human tenascin monoclonal antibody | |
JP2005518336A (ja) | Vegf受容体に結合する二重特異性抗体 | |
RU2518239C2 (ru) | Антитела, специфично связывающиеся с рецепторами эпидермального фактора роста | |
JP7457822B2 (ja) | 抗cd3および抗cd123二重特異性抗体およびその使用 | |
EP4112647A1 (en) | Anti-cd47/anti-pd-l1 antibody and applications thereof | |
US7901677B1 (en) | Use of an antibody against the laminin receptor or laminin receptor precursor for the treatment or diagnosis of several cancer types | |
AU767443B2 (en) | Immunological reagent specifically interacting with the extracellular domain of the human zeta chain | |
JPH10155489A (ja) | 組換え抗体及びそれをコードする核酸 | |
WO2022184155A1 (zh) | 抗ctla-4抗体及其应用 | |
WO2022063100A1 (zh) | 抗tigit抗体及双抗体和它们的应用 | |
AU724562B2 (en) | Anti-EGFR single-chain Fvs and anti-EGFR antibodies | |
Helfrich et al. | Recent Developments in the Construction of Bispecific Antibodies | |
MXPA01000325A (en) | Immunological reagent specifically interacting with the extracellular domain of the human zeta chain |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees |