ES2573945T3 - Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores - Google Patents

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Abstract

Método para cuantificar reproductivamente la expresión de biomarcadores en una muestra de tejido montada en una diapositiva que comprende: (a) obtención de una muestra de tejido montada en una diapositiva, que se ha manchado para permitir la localización de al menos un compartimento celular y al menos un biomarcador; (b) obtención de una o más imágenes formadas por píxeles de la muestra de tejido manchada utilizando un sistema óptico estandarizado, y análisis de una o más imágenes formadas por píxeles para obtener uno o más conjuntos de datos; (c) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos del ruido; (d) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a cada uno de dicho al menos un compartimento celular; (e) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a dicho al menos un biomarcador para cada uno de dicho al menos un compartimento celular; (f) cuantificación de la cantidad de biomarcador expresado en cada uno de dicho al menos un compartimento celular para llegar a una puntuación estandarizada, que es un producto de una puntuación bruta, un factor de fuente luminosa, un factor de trayectoria óptica, y opcionalmente un factor de cubo de calibración, por lo cual el sistema óptico estandarizado está dispuesto para ajuste automático de tiempo de exposición para proporcionar un rango dinámico optimizado de datos capturados en los píxeles de la imagen, y donde un tiempo de exposición nuevo se calcula como:**Fórmula** donde**Fórmula** donde E es el nuevo tiempo de exposición, E' es el tiempo de exposición actualmente establecido. A es un nivel de agresión, SL es el límite de saturación, CCDx y CCDy representan las dimensiones de píxel de la imagen capturada, y P es el recuento de píxeles a intensidad máxima.

Description

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Un umbral de calidad de coloración mínimo aceptable se puede fijar o ajustar por un usuario. Tales muestras identificadas como que no llegan al umbral de coloración mínimo se pueden excluir de los datos ajustados y de posterior análisis por el programa de validación.
[0084] La suficiencia de tejido se puede analizar por recuento de los píxeles de una imagen con intensidades de señal por encima de una intensidad de umbral luego determinando si el número total de píxeles positivos cumple un criterio mínimo para tejido suficiente. Asimismo, el porcentaje de píxeles positivos del total se pueden utilizar como el criterio.
[0085] Cuando se analizan los microarrays tisulares, la posición de la muestra de tejido se puede evaluar por cálculo de la intensidad de píxel media en cada una de las diferentes secciones identificadas en el campo de visión. Muestras o histopuntos individuales se deben identificar para determinar la posición, que se puede usar para comparar la posición del borde de la muestra con el centro de la muestra. El borde de la muestra se determina basado en la intensidad de píxel de áreas rectangulares para valorar si el centrado debidamente, y la intensidad de píxel central se mide para determinar si los bordes no se deben más de una muestra. La detección del borde de muestra se puede realizar utilizando un operador de diferenciación discreta, tal como un detector de borde Sobel, o cualquier otro número de detectores de borde bien conocidos en la técnica. Muestras incorrectamente posicionadas o puntos de división que contienen más de un objetivo se pueden identificar luego y excluir de posterior análisis.
[0086] El enfoque de la muestra puede ser evaluado, tal como por determinación de un valor de curtosis para las intensidades de píxel de la imagen. Los valores de intensidad de coloración de píxeles en una imagen digitalizada se pueden fijar en un histograma. La distribución se puede analizar como una indicación de foco. Una imagen enfocada típicamente tendrá una distribución de intensidad de píxel con un valor máximo definido relativamente alto, (curtosis más alta) en comparación con una imagen desenfocada que tendrá una distribución de intensidad de píxel con un valor máximo aplanado (curtosis más baja). La altura o la planicie de tal distribución se puede representar en un valor único, tal como un valor de curtosis. Un valor de curtosis más alto es indicativo de un valor máximo definido con relativamente alto; mientras que, un valor de curtosis más baja es indicativo de un valor máximo aplanado.
[0087] La curtosis es una medida de si los datos son maximizados o planos con respecto a una distribución normal. Esto es, conjuntos de datos con alta curtosis tienden a tener un valor máximo diferente cerca de la media, descienden bastante rápidamente, y tienen colas pesadas. Conjuntos de datos con baja curtosis tienden a tener un máximo plano más bien que un máximo elevado. Para datos univariantes Y1, Y2, ..., YN, la fórmula para curtosis es:
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donde Y es la media, s es la desviación típica, y N es el número de puntos de datos. La curtosis de exceso se puede definir como
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de modo que la distribución normal estándar tiene una curtosis de cero. La curtosis positiva indica una distribución "en pico" y la curtosis negativa indica una distribución "plana". Imágenes con curtosis negativa se pueden entonces excluir de posterior análisis.
[0088] La intensidad de señal se puede evaluar por selección de los datos de intensidad de señal medidos a partir de imágenes adquiridas en cada canal pertinente para cada histopunto e identificando el número de muestras con bajas intensidades de coloración. Tales muestras se pueden excluir de posterior análisis.
Puntuación AQUA®
[0089] Una vez que la imagen se optimiza y convalida, con cualquier histopuntos inválidos o imágenes retiradas, la imagen se enmascara virtualmente, aproximaciones tridimensionales de células en la muestra pueden ser generadas, y marcadores biológicos se asocian con compartimentos subcelulares de células individuales. Tal algoritmo para automáticamente realizar estas tareas es la plataforma de análisis cuantitativo automatizado (plataforma AQUA®). Esta técnica se describe también en la patente de EE.UU. nº 7.219.016 y Camp et al., 2002 Nature Medicine 8(11)1323-1327
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compartimento (por ejemplo, imagen DAPI, representando el compartimento nuclear) y las asignaciones de píxeles se basan en cuatro criterios:
1.) Intensidad baja tanto en la primera como en la segunda imagen (por ejemplo, DAPI y Cy3):FONDO: ELIMINAR 2.) Intensidad alta de la segunda mancha (por ejemplo; DAPI) con respecto a la intensidad de la primera mancha (Cy3): SEGUNDO COMPARTIMENTO (por ejemplo, NUCLEAR) 3.) Intensidad alta de la primera mancha (por ejemplo; Cy3) con respecto a la intensidad de la segunda mancha(por ejemplo, DAPI): PRIMER COMPARTIMENTO (por ejemplo, CITOPLÁSMICO) 4.) Intensidad alta de la segunda mancha y la primera mancha (por ejemplo, DAPI y Cy3):INDETERMINANTE: ELIMINAR
[0095] El agrupamiento es una función algorítmica matemática por la cual centroides dentro de conjuntos de datos se definen por distancias relativas de cada punto de datos entre sí, como se determina, por ejemplo, por distancia de logaritmo de verosimilitud o eucleidiana. Si bien no se desea estar limitado por la teoría, se cree que el agrupamiento de intensidades de píxel de al menos dos imágenes (por ejemplo, DAPI y Cy3), podrían dar como resultado centroides que definen píxeles como se describe, al menos, por los criterios anteriores. Debido a que el agrupamiento es objetivo y se puede realizar individualmente en cada imagen, el agrupamiento es un método fiable para asignación de píxeles a compartimentos, independiente de la intervención de operador.
[0096] En otra forma de realización, píxeles que contienen señales indicativas de tanto la primera como la segunda mancha se asignan a compartimentos por el siguiente método. Cada píxel de las imágenes adquiridas tiene tres atributos aportación de intensidad a partir de marcador de compartimento A, aportación de intensidad a partir del marcador de compartimento B y una aportación de intensidad a partir del objetivo o biomarcador de interés. Estas intensidades se miden en sus canales de fluorescencia respectivos por la configuración experimental. Para evitar el sesgo experimental, la intensidad objetivo no se manipula en este método actual. Así, los datos para los dos atributos de compartimento se pueden ilustrar en un gráfico bidimensional esquemáticamente.
[0097] Píxeles con una fuerte tendencia hacia cualquiera del ejes se pueden asignar a ese compartimento (por ejemplo, píxeles en las regiones de A y B se podrían asignar absolutamente a los compartimentos A y B respectivamente). Píxeles cerca del origen representan bajas intensidades para ambos canales y se pueden descartar como fondo junto con píxeles atípicos que tienen alta intensidad pero valores similares. Píxeles que permanecen en la región A/B pueden después ser asignados a cada compartimento basado en la probabilidad. Esta asignación permite señal objetivo en los píxeles que se van a distribuir a través de ambos compartimentos basados en la caracterización de probabilidad.
[0098] Para definir las regiones anteriormente descritas, por ejemplo, para cada imagen, se usa el agrupamiento para determinar tres centroides en los datos. Este método es completamente automatizado y no requiere ninguna decisión de operador para proceder. El análisis se realiza mediante la realización de agrupamiento con medios K en tres centroides utilizando distancias euclidianas.
[0099] Los datos son luego analizados de la siguiente manera: (i) píxeles de fondo y atípicos son descartados de posterior cálculo. Un píxel se define como de fondo si su distancia al origen es inferior a dos veces la distancia del centroide de fondo al origen. Un píxel se define como atípico si su intensidad excede el valor definido por la línea o plano definido por los centroides más exteriores; (ii) píxeles de las regiones A y B se asignan exclusivamente a esos dos compartimentos; (iii) píxeles en la región triangular A/B se les asigna luego un valor de probabilidad que les permite esencialmente ser distribuidos en compartimentos múltiples. Este valor de probabilidad se puede calcular basado en la distancia a partir de las dos regiones A y B, o, utilizando una función de forma que también asignará una probabilidad de cada píxel que tiene una aportación a partir de la región de fondo examinando cada distancia el píxel desde los tres vértices dados por los centroides; (iv) con todos los píxeles asignados, las puntuaciones objetivo asociadas se pueden sumar para cada compartimento y una puntuación se puede calcular utilizando métodos estándar:
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donde Int es la intensidad del píxel, P es la probabilidad del píxel asignado a un compartimento particular (que varía de 0 a 1).
[0100] Los puntos de corte se establecen usando algoritmos para separar muestras en grupos con características específicas, tales como muestras que contienen tejidos con niveles de expresión de biomarcadores diferentes para uno
o más biomarcador, como se describe con más detalle en McCabe et al., J. Natl. Cane. Inst. (2005) 97(24):1808-1815, que se incorpora en la presente por referencia en su totalidad. Al reducir los resultados de cuantificación de
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[0117] Un parámetro crítico para análisis HER2 en el laboratorio clínico es la capacidad para clasificar reproductivamente pacientes como positivos o negativos. Utilizando la supervivencia como una etiqueta sustituta para classification22 positiva/negativa, un punto de corte de puntuación de AQUA® óptimo fue establecido utilizando X-tile19 para puntuaciones de AQUA® HER2 normalizadas producidas para instrumento 1, operador 1 y ronda de coloración 1. La figura 5A muestra análisis de supervivencia Kaplan-Meier de clasificación HER2 positiva/negativa para instrumento 1. Como se describe en materiales y métodos, el punto de corte fue convalidado con importancia por la simulación Monte Carlo (P < 0,001) y subconjuntos de formación/validación (P = 0,002). Este punto de corte validado se aplicó a puntuaciones de AQUA® generadas en instrumentos 2 y 3 con importancia, P < 0,001 y P = 0,004 respectivamente (figuras 5B y 5C). Se observó reproducibilidad similar a través de operador independiente y adquisiciones de ronda de coloración con valores P todos ≤ 0,01 (datos no mostrados).
[0118] Las actuales pautas ASCO-CAP están sugiriendo que los laboratorios consigan 95% de concordancia positiva/negativa para metodologías de ensayo HER2 actuales (Wolff AC et al, Arch Pathol Lab Med. (2007) 131:18). Un estudio reciente muestra que para puntuación basada en IHC HER2, la concordancia entre observadores varía de 5485%, por debajo de estas pautas (Hameed et al.; en prensa; comunicación directa). Concordancia positiva/negativa para puntuación de AQUA® normalizada a través de instrumentos, operadores y días de coloración fue examinada utilizando los puntos de corte establecidos por encima. Como se muestra en la figura 6, la concordancia total oscilaba de 94,5% (instrumento 1 a instrumento 3; figura 6B) a 99,3% (operador 1 a operador 2, figura 6C). Estos análisis incluyen todos los casos que incluyen los que serían considerados ambiguos.
[0119] Para valorar donde se produjo la clasificación diferencial en la distribución de puntuaciones de AQUA® normalizadas, histogramas de frecuencia panelados fueron generados para examinar donde casos diferencialmente clasificados estaban ocurriendo. Como se muestra en la figura 7, para instrumento a instrumento, operador a operador y ronda a ronda, casos diferencialmente clasificados ocurren en el punto de corte y no sobre toda la distribución. Estos datos sugieren que el error de clasificación concierne a la no generación de selección de punto de corte y reproducibilidad de la puntuación de AQUA® HER2 normalizada. Tomados en conjunto, estos datos muestran clasificación de pacientes para evaluación interinstrumento, interoperador e interronda de expresión HER2 usando puntuación de AQUA® es altamente reproducible con índices de concordancia que se acercan, si no superan, los sugeridos por ASCO/CAP.
Ejemplo 2: análisis AQUA® de EGFR: datos de rendimiento analítico
[0120] Los métodos de la presente invención fueron aplicados a la evaluación del biomarcador EGFR en las secciones de tejido de cáncer de mama. Como se muestra en figura 8A, una cohorte TMA de 748 especímenes fue analizada para expresión HER2 por análisis de AQUA® normalizado a través de tres instrumentos, 3 operadores y 3 rondas de coloración separadas con un %CV medio de 4,3%. La evaluación de rendimiento analítico preliminar fue realizada con EGFR PharDx (Dako). Como muestran las figuras 8B-D, el análisis AQUA®) de expresión EGFR a través de 3 diapositivas y 3 días de coloración en un TMA compuesto por tumor de mama y líneas celulares (n=152) muestra un grado alto de precisión diapositiva a diapositiva y día a día con una pendiente media de 1,00047, un R de Pearson medio de 0,95, un %CV medio para tejido tumoral de 3,3%, y un %CV medio para líneas celulares de 4,7%. Tomados en conjunto, estos datos demuestran que el análisis de AQUA® permite un ensayo EGFR con un grado alto de precisión, y combinado con controles de instrumento y software, el desarrollo de un ensayo de biomarcador clínico robusto es posible.
Ejemplo 3: análisis AQUA® de expresión ER: reproducibilidad
[0121] Para demostrar la reproducibilidad del AQUAnalysis™ con otro biomarcador, cuatro bloques de tejido de mama fueron obtenidos que representaban un rango de expresión de receptor de estrógenos (ER) (según puntuación de Allred). Secciones de estos bloques de tejido se tomaron para generar diapositivas H&E sobre las que un patólogos certificado por la junta rodeó el área de tumor para todos los análisis posteriores. Un conjunto en serie de secciones fue manchado con DAB con el receptor α de estrógenos de ratón anti-humano monoclonal, anticuerpo de clon 1D5 y evaluado para puntuación Allred por el mismo patólogo. Véase, por ejemplo, Harvey JM, et al., (1999) J. Clin. Oncol. 12:1474, que se incorpora en la presente por referencia en su totalidad.
[0122] Secciones en serie fueron luego manchadas utilizando el protocolo de coloración de inmunofluorescencia anteriormente descrito. Las imágenes fueron recogidas en la plataforma de microscopía HistoRx PM-2000™ y luego pasadas a AQUAnalysis™ para puntuación. Todas las puntuaciones fueron transformadas en una log2.
[0123] Ficheros de imagen para las cuatro diapositivas fueron adquiridos y luego pasados a través del paquete de software AQUAnalysis™ n=10 veces por el mismo operador para demostrar reproducibilidad de software total. Para todos los ficheros, el %CV fue esencialmente 0 (menos luego 1E-7).
[0124] Los mismos cuatro ficheros de imagen fueron luego proporcionados a tres operadores diferentes junto con las instrucciones de funcionamiento del software. Aquí, los operadores censuraron imágenes en el método descrito para revisión técnica de calidad de imagen, que refleja uso típico. Los resultados, mostrados en la tabla 1, demuestran que
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Families Citing this family (116)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8055034B2 (en) * 2006-09-13 2011-11-08 Fluidigm Corporation Methods and systems for image processing of microfluidic devices
JP5425762B2 (ja) 2007-05-14 2014-02-26 ヒストロックス,インコーポレイテッド. イメージデータクラスタリングを使用した画素評価によるコンパートメント分離
WO2008156669A1 (en) 2007-06-15 2008-12-24 Historx, Inc. Method and system for standardizing microscope instruments
WO2009029810A1 (en) * 2007-08-31 2009-03-05 Historx, Inc. Automatic exposure time selection for imaging tissue
ES2573945T3 (es) 2008-09-16 2016-06-13 Novartis Ag Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores
WO2011146928A2 (en) * 2010-05-21 2011-11-24 On-Q-ity Methods for calibrating protein levels in cells and tissue specimens
US20130344510A1 (en) 2010-12-03 2013-12-26 Uti Limited Partnership Identification of cancer patients likely to benefit from radiation therapy
US9522396B2 (en) 2010-12-29 2016-12-20 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Apparatus and method for automatic detection of pathogens
EP2682913A4 (en) * 2011-03-04 2014-08-27 Nec Corp INDIVIDUAL PRODUCT IDENTIFICATION SYSTEM, INDIVIDUAL PRODUCT IDENTIFICATION METHOD AND DEVICE AND PROGRAM THEREWITH
SG11201401797TA (en) 2011-10-24 2014-09-26 Halozyme Inc Companion diagnostic for anti-hyaluronan agent therapy and methods of use thereof
BR112014016072B1 (pt) 2011-12-29 2021-01-12 Sight Diagnostics Ltd. método e sistema para detectar uma infecção por plasmodium em uma amostra de sangue
RU2014137125A (ru) 2012-03-30 2016-05-27 Клариент Дайагностик Сервисез, Инк. Способы формирования изображения биологического образца
SG11201408107RA (en) * 2012-06-14 2015-01-29 Inserm Inst Nat De La Santé Et De La Rech Médicale Method for quantifying immune cells in tumoral tissues and its applications
US9278124B2 (en) 2012-10-16 2016-03-08 Halozyme, Inc. Hypoxia and hyaluronan and markers thereof for diagnosis and monitoring of diseases and conditions and related methods
US10225483B1 (en) * 2013-05-01 2019-03-05 Pierce Biotechnology, Inc. Method and system for projecting image with differing exposure times
US10115034B2 (en) * 2013-05-01 2018-10-30 Life Technologies Holdings Pte Limited Method and system for projecting image with differing exposure times
EP2999988A4 (en) 2013-05-23 2017-01-11 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Method and system for imaging a cell sample
IL227276A0 (en) 2013-07-01 2014-03-06 Parasight Ltd A method and system for obtaining a monolayer of cells, for use specifically for diagnosis
EP3039477B1 (en) 2013-08-26 2021-10-20 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Digital microscopy systems, methods and computer program products
AU2015212758B2 (en) * 2014-01-30 2019-11-21 Bd Kiestra B.V. A system and method for image acquisition using supervised high quality imaging
AU2015220749B2 (en) * 2014-02-21 2020-12-24 Ventana Medical Systems, Inc. Single-stranded oligonucleotide probes for chromosome or gene copy enumeration
US20150338338A1 (en) * 2014-02-28 2015-11-26 Erythron, Llc Method and Apparatus for Determining Markers of Health by Analysis of Blood
DK3117259T3 (da) * 2014-03-10 2020-04-14 Visiopharm As Vurdering af farvningskvalitet
US10746980B2 (en) * 2014-08-26 2020-08-18 General Electric Company Calibration of microscopy systems
US9797767B2 (en) * 2014-08-26 2017-10-24 General Electric Company Calibration of microscopy systems
WO2016030897A1 (en) 2014-08-27 2016-03-03 S.D. Sight Diagnostics Ltd System and method for calculating focus variation for a digital microscope
PT3186281T (pt) 2014-08-28 2019-07-10 Halozyme Inc Terapia de combinação com uma enzima de degradação de hialuronano e um inibidor de pontos de verificação imunológica
WO2016061286A2 (en) 2014-10-14 2016-04-21 Halozyme, Inc. Compositions of adenosine deaminase-2 (ada2), variants thereof and methods of using same
CA2969038C (en) * 2014-12-03 2023-07-04 Ventana Medical Systems, Inc. Methods, systems, and apparatuses for quantitative analysis of heterogeneous biomarker distribution
EP3273223A4 (en) * 2015-03-17 2018-09-26 Hamamatsu Photonics K.K. Device for generating fluorescence image and method for generating fluorescence image
ES2955775T3 (es) 2015-08-27 2023-12-07 Inst Nat Sante Rech Med Métodos para predecir el tiempo de supervivencia de pacientes que padecen cáncer de pulmón
WO2017037180A1 (en) * 2015-09-02 2017-03-09 Ventana Medical Systems, Inc. Automated analysis of cellular samples having intermixing of analytically distinct patterns of analyte staining
AU2016322966B2 (en) 2015-09-17 2021-10-14 S.D. Sight Diagnostics Ltd Methods and apparatus for detecting an entity in a bodily sample
WO2017060397A1 (en) 2015-10-09 2017-04-13 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of subjects suffering from melanoma metastases
WO2017067944A1 (en) 2015-10-19 2017-04-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of subjects suffering from triple negative breast cancer
JP6938489B2 (ja) * 2015-10-23 2021-09-22 ノバルティス・エイジーNovartis AG 視野に存在する選択された細胞のバイオマーカー陽性率の値を導き出す方法
EP3365682B1 (en) * 2015-10-23 2020-10-07 Novartis AG System for deriving cell-to-cell spatial proximities
EP3374389A1 (en) 2015-11-13 2018-09-19 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Anti- nkg2d single domain antibodies and uses thereof
EP3400443B1 (en) 2016-01-04 2020-09-16 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of pd-1 and tim-3 as a measure for cd8+ cells in predicting and treating renal cell carcinoma
US10761027B2 (en) * 2016-01-19 2020-09-01 Konica Minolta, Inc. Image processing apparatus and computer-readable recording medium storing program
WO2017129769A1 (en) 2016-01-28 2017-08-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for enhancing the potency of the immune checkpoint inhibitors
BR112018017316B1 (pt) * 2016-03-14 2022-08-02 Somalogic Operating Co., Inc Compostos e métodos para a síntese de 5-(n-protegido-triptaminocarboxiamida)-2´- desoxiuridina fosforamidita, oligonucleotídeo e seu método de produção
EP3436864B1 (en) 2016-03-30 2021-04-28 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Image processing device for identifying blood parasites
CA3022770A1 (en) 2016-05-11 2017-11-16 S.D. Sight Diagnostics Ltd Performing optical measurements on a sample
EP3455610B1 (en) 2016-05-11 2023-01-04 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Sample carrier for optical measurements
EP3463452A1 (en) 2016-05-24 2019-04-10 Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM) Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of non small cell lung cancer (nsclc) that coexists with chronic obstructive pulmonary disease (copd)
JP6755975B2 (ja) * 2016-06-10 2020-09-16 エフ・ホフマン−ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト 明視野像シミュレーションのためのシステム
WO2018009202A1 (en) * 2016-07-07 2018-01-11 Flagship Biosciences Inc. Continuous tissue analysis scoring scheme based on cell classifications
WO2018011107A1 (en) 2016-07-11 2018-01-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of er-alpha 46 in methods and kits for assessing the status of breast cancer
CN106327508B (zh) * 2016-08-23 2019-04-02 马跃生 Ki67指数自动分析方法
WO2018046736A1 (en) 2016-09-12 2018-03-15 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of patients suffering from cancer
KR102682483B1 (ko) * 2016-09-30 2024-07-05 삼성전자주식회사 픽셀 기반 학습을 이용한 마스크 최적화 방법
JP7130630B2 (ja) * 2016-09-30 2022-09-05 モレキュラー デバイシーズ, エルエルシー 最適候補化合物を検出するためのコンピュータ装置およびその方法
EP3532807A4 (en) * 2016-10-25 2020-07-01 Abbott Laboratories ASSESSMENT AND CONTROL OF REAGENTS IN THE AUTOMATED PREPARATION OF SLIDES
CN108229098A (zh) * 2016-12-09 2018-06-29 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 单分子的识别、计数方法及装置
WO2018122245A1 (en) 2016-12-28 2018-07-05 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods of predicting the survival time of patients suffering from cms3 colorectal cancer
WO2018122249A1 (en) 2016-12-28 2018-07-05 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of patients suffering from a microsatellite stable colorectal cancer
US11471538B2 (en) 2017-02-10 2022-10-18 INSERM (Institut National de la Santéet de la Recherche Medicale) Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of cancers associated with activation of the MAPK pathway
BR112019018747A2 (pt) 2017-03-16 2020-05-05 Alpine Immune Sciences Inc proteínas imunomoduladoras variantes de cd80 e usos das mesmas
US20200150109A1 (en) 2017-05-05 2020-05-14 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Microtubule-targeting drugs as immune checkpoint inhibitors and methods of screening novel immune checkpoint inhibitors for the treatment of cancers and infectious diseases
US11450121B2 (en) * 2017-06-27 2022-09-20 The Regents Of The University Of California Label-free digital brightfield analysis of nucleic acid amplification
EP3646006B1 (en) 2017-06-28 2024-10-23 Ventana Medical Systems, Inc. System level calibration
CN107463913B (zh) * 2017-08-11 2020-07-14 苏炯龙 基于Lab的图像胶原纤维识别计算系统及方法
WO2019037863A1 (en) * 2017-08-24 2019-02-28 Toyota Motor Europe SYSTEM AND METHOD FOR TAG INCREASE IN VIDEO DATA
WO2019043138A1 (en) 2017-09-01 2019-03-07 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) METHOD FOR PREDICTING OUTCOME OF CANCER
WO2019074489A1 (en) * 2017-10-10 2019-04-18 Flagship Biosciences, Inc. METHODS FOR QUANTITATIVE EVALUATION OF MUSCLE FIBERS IN MUSCLE DYSTROPHY
CN107729932B (zh) * 2017-10-10 2019-07-26 杭州智微信息科技有限公司 骨髓细胞标记方法和系统
WO2019089858A2 (en) 2017-11-01 2019-05-09 Juno Therapeutics, Inc. Methods of assessing or monitoring a response to a cell therapy
CA3081669A1 (en) 2017-11-14 2019-05-23 S.D. Sight Diagnostics Ltd Sample carrier for optical measurements
WO2019101871A1 (en) 2017-11-23 2019-05-31 Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) A new marker for predicting the sensitivity to pi3k inhibitors
EP3729369A2 (en) * 2017-12-24 2020-10-28 Ventana Medical Systems, Inc. Computational pathology approach for retrospective analysis of tissue-based companion diagnostic driven clinical trial studies
WO2019162325A1 (en) 2018-02-21 2019-08-29 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sk1 as biomarker for predicting response to immunecheckpoint inhibitors
KR20210004966A (ko) 2018-03-12 2021-01-13 인쎄름 (엥스띠뛰 나씨오날 드 라 쌍떼 에 드 라 흐쉐르슈 메디깔) 암 치료를 위한 화학-면역요법 강화용 열량 제한 모방물질의 용도
EP3775908A1 (en) 2018-04-13 2021-02-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting outcome and treatment of patients suffering from prostate cancer or breast cancer
WO2019207030A1 (en) 2018-04-26 2019-10-31 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting a response with an immune checkpoint inhibitor in a patient suffering from a lung cancer
US12065476B2 (en) 2018-06-15 2024-08-20 Alpine Immune Sciences, Inc. PD-1 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
WO2020048942A1 (en) 2018-09-04 2020-03-12 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cytotoxic t lymphocyte-dependent immune responses
CN113544144A (zh) 2018-09-19 2021-10-22 高山免疫科学股份有限公司 变体cd80融合蛋白和相关构建体的方法和用途
JP7618950B2 (ja) 2018-09-19 2025-01-22 インサーム (インスティテュート ナショナル デ ラ サンテ エ デ ラ ルシェルシェ メディカル) 免疫チェックポイント治療に抵抗性のある癌の治療のための方法および医薬組成物
EP3860578A1 (en) 2018-10-01 2021-08-11 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Use of inhibitors of stress granule formation for targeting the regulation of immune responses
WO2020120592A1 (en) 2018-12-12 2020-06-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for predicting and treating melanoma
WO2020127059A1 (en) 2018-12-17 2020-06-25 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sulconazole as a furin inhibitor
SG11202107257UA (en) 2019-01-03 2021-07-29 Inst Nat Sante Rech Med Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cd8+ t cell-dependent immune responses in subjects suffering from cancer
EP3948274A1 (en) 2019-03-29 2022-02-09 Rakuten Medical, Inc. Methods for photoimmunotherapy and related biomarkers
US20220177978A1 (en) 2019-04-02 2022-06-09 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods of predicting and preventing cancer in patients having premalignant lesions
US11393110B2 (en) 2019-04-04 2022-07-19 Centerline Biomedical, Inc. Spatial registration of tracking system with an image using two-dimensional image projections
US11538574B2 (en) 2019-04-04 2022-12-27 Centerline Biomedical, Inc. Registration of spatial tracking system with augmented reality display
US20220160692A1 (en) 2019-04-09 2022-05-26 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sk2 inhibitors in combination with immune checkpoint blockade therapy for the treatment of cancer
AU2020288603A1 (en) 2019-06-03 2021-12-16 Assistance Publique - Hôpitaux De Paris Methods for modulating a treatment regimen
WO2020245208A1 (en) 2019-06-04 2020-12-10 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of cd9 as a biomarker and as a biotarget in glomerulonephritis or glomerulosclerosis
EP4022286A1 (en) * 2019-08-28 2022-07-06 Ventana Medical Systems, Inc. Label-free assessment of biomarker expression with vibrational spectroscopy
US20240301497A1 (en) 2019-10-17 2024-09-12 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for diagnosing nasal intestinal type adenocarcinomas
EP4073566A1 (en) 2019-12-12 2022-10-19 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Artificial generation of color blood smear image
WO2021144426A1 (en) 2020-01-17 2021-07-22 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for treating melanoma
EP4110955A1 (en) 2020-02-28 2023-01-04 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for diagnosing, prognosing and managing treatment of breast cancer
CN111089967B (zh) * 2020-03-25 2020-06-26 中南大学湘雅二医院 红斑狼疮分型的皮肤组织免疫细胞原位检测试剂盒的应用
EP4172621A1 (en) 2020-06-30 2023-05-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the risk of recurrence and/or death of patients suffering from a solid cancer after preoperative adjuvant therapies
WO2022002874A1 (en) 2020-06-30 2022-01-06 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the risk of recurrence and/or death of patients suffering from a solid cancer after preoperative adjuvant therapy and radical surgery
FR3116061A1 (fr) * 2020-11-06 2022-05-13 Commissariat A L'energie Atomique Et Aux Energies Alternatives Procédé de détection d’un évènement cellulaire
EP4291898A1 (en) 2021-02-12 2023-12-20 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Method for prognosis and treating a patient suffering from cancer
WO2022200303A1 (en) 2021-03-23 2022-09-29 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for the diagnosis and treatment of t cell-lymphomas
US20240210404A1 (en) 2021-04-27 2024-06-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the risk of lymph node metastasis and/or recurrence of patients suffering from a t1 cancer treated by endoscopic resection
TWI793865B (zh) * 2021-11-18 2023-02-21 倍利科技股份有限公司 Ai自動輔助標記之系統及方法
WO2023144235A1 (en) 2022-01-27 2023-08-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for monitoring and treating warburg effect in patients with pi3k-related disorders
EP4472740A1 (en) 2022-01-31 2024-12-11 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Cd38 as a biomarker and biotarget in t-cell lymphomas
EP4490173A1 (en) 2022-03-07 2025-01-15 Alpine Immune Sciences, Inc. Immunomodulatory proteins of variant cd80 polypeptides, cell therapies thereof and related methods and uses
US20250035635A1 (en) 2022-03-17 2025-01-30 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale Methods for predicting response to an immunotherapeutic treatment in a patient with a cancer
WO2023198648A1 (en) 2022-04-11 2023-10-19 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of t-cell malignancies
WO2023198874A1 (en) 2022-04-15 2023-10-19 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of t cell-lymphomas
WO2024003310A1 (en) 2022-06-30 2024-01-04 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of acute lymphoblastic leukemia
WO2024018046A1 (en) 2022-07-22 2024-01-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Garp as a biomarker and biotarget in t-cell malignancies
WO2024023283A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Lrrc33 as a biomarker and biotarget in cutaneous t-cell lymphomas
CN115541579B (zh) * 2022-10-09 2023-07-07 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) 非诊断和治疗目的的在肿瘤切片中Ki-67阳性肿瘤细胞比例的分析方法及装置
WO2024079192A1 (en) 2022-10-12 2024-04-18 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Cd81 as a biomarker and biotarget in t-cell malignancies
WO2024153636A1 (en) 2023-01-17 2024-07-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Vasorin as a biomarker and biotarget in nephrology
WO2024185434A1 (ja) * 2023-03-03 2024-09-12 ソニーグループ株式会社 情報処理装置、生体試料解析システム及び生体試料解析方法

Family Cites Families (238)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US1914322A (en) 1929-01-22 1933-06-13 Everett H Bickley Device for the comparison of colors
US3958122A (en) 1974-12-19 1976-05-18 United Technologies Corporation Exhaust gas analyzer having pressure and temperature compensation
DE3037622C2 (de) 1980-10-04 1987-02-26 Theodor Prof. Dr.-Ing. 1000 Berlin Gast Einrichtung zur Bestimmung der Oberflächengüte
US4480189A (en) 1981-11-20 1984-10-30 Kasei Optonix, Ltd. Thermoluminescence dosimeter reader
JPH0730753Y2 (ja) 1984-03-02 1995-07-19 日本ゼニスパイプ株式会社 プレキャストコンクリ−トケ−ソンブロック
US4557599A (en) 1984-03-06 1985-12-10 General Signal Corporation Calibration and alignment target plate
DE3429541C2 (de) 1984-08-10 1992-10-22 Seidenberg, Jürgen, Dipl.-Ing., 5100 Aachen Verfahren zur gleichzeitigen Bestimmung der Wellenlänge und der Strahlungsleistung einer monochromatischen Lichtquelle
US4902131A (en) 1985-03-28 1990-02-20 Kabushiki Kaisha Toshiba Surface inspection method and apparatus therefor
US4998284A (en) 1987-11-17 1991-03-05 Cell Analysis Systems, Inc. Dual color camera microscope and methodology for cell staining and analysis
US5134662A (en) 1985-11-04 1992-07-28 Cell Analysis Systems, Inc. Dual color camera microscope and methodology for cell staining and analysis
JPH07119Y2 (ja) 1988-03-18 1995-01-11 三和シヤッター工業株式会社 電動式昇降ベッド
WO1988007700A1 (en) 1987-03-30 1988-10-06 Anritsu Corporation Light signal generator and light power meter calibration system using the same
US4912034A (en) 1987-09-21 1990-03-27 Biogenex Laboratories Immunoassay test device and method
US4892817A (en) 1987-09-21 1990-01-09 Biogenex Laboratories Stable phosphatase substrate composition
US5015098A (en) 1987-10-05 1991-05-14 X-Rite, Incorporated Densitometer with error correction
JPH0663758B2 (ja) 1987-10-14 1994-08-22 株式会社東芝 パターンの測定方法
DE3800427C2 (de) 1988-01-09 1997-05-28 Breitmeier Ulrich Gerät zum Ermitteln des Abstands eines auf einer Prüffläche liegenden Prüfpunktes von einer Referenzfläche
JPH06103251B2 (ja) 1989-03-06 1994-12-14 株式会社ニレコ 画像解析による組織定量方法
US5068909A (en) 1989-05-18 1991-11-26 Applied Imaging Corporation Method and apparatus for generating quantifiable video displays
US5070455A (en) 1989-11-22 1991-12-03 Singer Imaging, Inc. Imaging system and method using scattered and diffused radiation
US5115673A (en) 1990-07-20 1992-05-26 The United States Of America As Represented By The United States National Aeronautics And Space Administration Non-destructive method for determining elastic moduli of material
US5244787A (en) 1991-01-31 1993-09-14 Biogenex Laboratories Antigen retrieval in formalin-fixed tissues using microwave energy
US6411377B1 (en) 1991-04-02 2002-06-25 Hitachi, Ltd. Optical apparatus for defect and particle size inspection
JP2907571B2 (ja) 1991-04-15 1999-06-21 浜松ホトニクス株式会社 レーザ走査型蛍光顕微鏡
US5126577A (en) 1991-06-27 1992-06-30 Electro-Optical Industries, Inc. Infrared target plate handling apparatus with improved thermal control
KR960002145B1 (ko) 1991-07-30 1996-02-13 가부시기가이샤 히다찌세이사구쇼 박막트랜지스터 액정기판의 검사방법 및 그 장치
CA2084099C (en) 1991-12-06 1996-06-18 James V. Bacus Method and apparatus for automated cell analysis
US5578452A (en) 1992-01-16 1996-11-26 Biogenex Laboratories Enhancement of immunochemical staining in aldehyde-fixed tissues
US5254845A (en) 1992-08-18 1993-10-19 Applied Imaging International Limited Automatic focusing system using focal length-changing element
US6026174A (en) 1992-10-14 2000-02-15 Accumed International, Inc. System and method for automatically detecting malignant cells and cells having malignancy-associated changes
US5889881A (en) 1992-10-14 1999-03-30 Oncometrics Imaging Corp. Method and apparatus for automatically detecting malignancy-associated changes
US6252242B1 (en) 1992-12-03 2001-06-26 Brown & Sharpe Surface Inspection Systems, Inc. High speed optical inspection apparatus using Gaussian distribution analysis and method therefore
US5427910A (en) 1992-12-09 1995-06-27 Compucyte Corporation Method of cytogenetic analysis
US5517193A (en) 1993-04-30 1996-05-14 International Business Machines Corporation Meteorological workstation
US5587833A (en) 1993-07-09 1996-12-24 Compucyte Corporation Computerized microscope specimen encoder
US5492837A (en) 1993-08-27 1996-02-20 Biogenex Laboratories Mounting medium for microscope slide preparations
US5439649A (en) 1993-09-29 1995-08-08 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
US6136540A (en) 1994-10-03 2000-10-24 Ikonisys Inc. Automated fluorescence in situ hybridization detection of genetic abnormalities
US6309601B1 (en) 1993-11-01 2001-10-30 Nanogen, Inc. Scanning optical detection system
US5422018A (en) 1994-01-31 1995-06-06 Applied Imaging Centrifuge tube and adaptor
US5489386A (en) 1994-01-31 1996-02-06 Applied Imaging Density gradient medium for the separation of cells
US5432054A (en) 1994-01-31 1995-07-11 Applied Imaging Method for separating rare cells from a population of cells
US6451551B1 (en) 1994-03-11 2002-09-17 Biogenex Laboratories Releasing embedding media from tissue specimens
US6632598B1 (en) 1994-03-11 2003-10-14 Biogenex Laboratories Deparaffinization compositions and methods for their use
US5561556A (en) 1994-04-21 1996-10-01 Compucyte Corporation Slide analysis system with slide having self contained microscope analysis information
US6463438B1 (en) 1994-06-03 2002-10-08 Urocor, Inc. Neural network for cell image analysis for identification of abnormal cells
US5672881A (en) 1994-09-14 1997-09-30 Glyko, Inc. Charge-coupled device imaging apparatus
US5978497A (en) 1994-09-20 1999-11-02 Neopath, Inc. Apparatus for the identification of free-lying cells
WO1996009604A1 (en) 1994-09-20 1996-03-28 Neopath, Inc. Apparatus for automated identification of cell groupings on a biological specimen
DE19532897A1 (de) 1994-09-27 1996-03-28 Zeiss Carl Fa Verfahren zur Belichtungssteuerung bei Mikroskopkameras und entsprechendes Photomikroskop
US5633945A (en) 1994-10-05 1997-05-27 Compucyte Corporation Accuracy in cell mitosis analysis
US5523207A (en) 1994-10-17 1996-06-04 Compucyte Corporation Method for accurate counting of probe spots in cell nuclei
GB2294376B (en) 1994-10-18 1999-02-10 Rank Cintel Ltd Method and apparatus for correcting noise in a film scanner
DE69519980T2 (de) 1994-12-28 2001-06-07 Siemens Corp. Research, Inc. Verfahren und Gerät zur Detektion und Interpretation von Untertiteln in digitalen Videosignalen
WO1996023898A1 (en) 1995-01-31 1996-08-08 Novo Nordisk A/S A method of detecting biologically active substances
US5694212A (en) 1995-06-20 1997-12-02 Compucyte Corporation Method for calibrating specimen with specimen holder of a microscope
US5717198A (en) 1995-07-10 1998-02-10 Qc Optics, Inc. Pellicle reflectivity monitoring system having means for compensating for portions of light reflected by the pellicle
CA2185511C (en) 1995-09-15 2008-08-05 Vladimir Dadeshidze Cytological specimen analysis system with individualized patient data
DE69635717T2 (de) 1995-10-30 2006-08-31 Arkray, Inc. Verfahren zum Bestimmen eines Analyten und Vorrichtung dafür
US6418236B1 (en) 1999-06-24 2002-07-09 Chromavision Medical Systems, Inc. Histological reconstruction and automated image analysis
US6330349B1 (en) 1995-11-30 2001-12-11 Chromavision Medical Systems, Inc. Automated method for image analysis of residual protein
CA2236268A1 (en) 1995-11-30 1997-06-05 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for automated image analysis of biological specimens
US6151405A (en) 1996-11-27 2000-11-21 Chromavision Medical Systems, Inc. System and method for cellular specimen grading
US6718053B1 (en) 1996-11-27 2004-04-06 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for automated image analysis of biological specimens
US6239868B1 (en) 1996-01-02 2001-05-29 Lj Laboratories, L.L.C. Apparatus and method for measuring optical characteristics of an object
US6882873B2 (en) 1996-01-17 2005-04-19 Respironics, Inc. Method and system for determining bilirubin concentration
US6165739A (en) 1996-03-13 2000-12-26 Compucyte Corporation Multiple simultaneous testing media
EP0954606B1 (en) 1996-05-15 2003-10-15 Biogenex Laboratories Non-nucleotide linking reagents
US6292582B1 (en) 1996-05-31 2001-09-18 Lin Youling Method and system for identifying defects in a semiconductor
US6458585B1 (en) 1996-08-14 2002-10-01 Nexell Therapeutics Inc. Cytokine-free culture of dendritic cells
IL128539A (en) 1996-08-16 2004-01-04 Imaging Res Inc Digital imaging system for tests in lions, gels and absorbers
US6404906B2 (en) 1997-03-03 2002-06-11 Bacus Research Laboratories,Inc. Method and apparatus for acquiring and reconstructing magnified specimen images from a computer-controlled microscope
US6396941B1 (en) 1996-08-23 2002-05-28 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for internet, intranet, and local viewing of virtual microscope slides
US6031930A (en) 1996-08-23 2000-02-29 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for testing a progression of neoplasia including cancer chemoprevention testing
US6272235B1 (en) 1997-03-03 2001-08-07 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for creating a virtual microscope slide
US5731156A (en) 1996-10-21 1998-03-24 Applied Imaging, Inc. Use of anti-embryonic hemoglobin antibodies to identify fetal cells
AU4920297A (en) 1996-10-25 1998-05-15 Applied Imaging, Inc. Multifluor-fluorescence in situ hybridization (m-fish) imaging techniques using multiple multiband filters with image registration
US5880473A (en) 1997-07-28 1999-03-09 Applied Imaging, Inc. Multifluor-fluorescence in-situ hybridization (M-FISH) imaging techniques using multiple multiband filters with image registration
US5916750A (en) 1997-01-08 1999-06-29 Biogenex Laboratories Multifunctional linking reagents for synthesis of branched oligomers
US6087134A (en) 1997-01-14 2000-07-11 Applied Imaging Corporation Method for analyzing DNA from a rare cell in a cell population
US5885840A (en) 1997-02-10 1999-03-23 Compucyte Corp. Multiple assays of cell specimens
GB9704054D0 (en) 1997-02-27 1997-04-16 Univ Cambridge Tech Assay
US5948359A (en) 1997-03-21 1999-09-07 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
WO1998049537A1 (en) 1997-04-25 1998-11-05 Akzo Nobel N.V. Photobleachable luminescent layers for calibration and standardization in optical microscopy
US6169816B1 (en) 1997-05-14 2001-01-02 Applied Imaging, Inc. Identification of objects of interest using multiple illumination schemes and finding overlap of features in corresponding multiple images
US6259807B1 (en) 1997-05-14 2001-07-10 Applied Imaging Corp. Identification of objects of interest using multiple illumination schemes and finding overlap of features in corresponding multiple images
US6052190A (en) 1997-09-09 2000-04-18 Utoptics, Inc. Highly accurate three-dimensional surface digitizing system and methods
US6002788A (en) 1997-09-24 1999-12-14 Compucyte Corporation Method and device for rendering cells observable with laser scanning cytometry
US5962234A (en) 1997-10-20 1999-10-05 Applied Imaging Corporation Use of anti-embryonic epsilon hemoglobin antibodies to identify fetal cells
DE19754909C2 (de) 1997-12-10 2001-06-28 Max Planck Gesellschaft Verfahren und Vorrichtung zur Erfassung und Bearbeitung von Abbildungen biologischen Gewebes
JPH11183381A (ja) 1997-12-22 1999-07-09 Bunshi Bio Photonics Kenkyusho:Kk 蛍光顕微鏡評価方法および装置
US6746873B1 (en) 1998-02-20 2004-06-08 Xy, Inc. Vibratory system for a sorting flow cytometer
US6699710B1 (en) 1998-02-25 2004-03-02 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Tumor tissue microarrays for rapid molecular profiling
US6248590B1 (en) 1998-02-27 2001-06-19 Cytomation, Inc. Method and apparatus for flow cytometry
US6495106B1 (en) 1998-03-24 2002-12-17 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
US6606413B1 (en) 1998-06-01 2003-08-12 Trestle Acquisition Corp. Compression packaged image transmission for telemicroscopy
US6049220A (en) 1998-06-10 2000-04-11 Boxer Cross Incorporated Apparatus and method for evaluating a wafer of semiconductor material
CA2338675A1 (en) * 1998-07-27 2000-02-10 Cedars-Sinai Medical Center Spectral topography of mammalian matter
EP1329513B1 (en) 1998-08-25 2011-12-07 University of Washington Rapid quantitative analysis of proteins or protein function in complex mixtures
DE19915057A1 (de) 1999-04-01 2000-10-19 Forschungszentrum Borstel Monoklonale Antikörper gegen das humane Mcm3 Protein, Verfahren zu ihrer Herstellung und ihre Verwendung
JP2002541494A (ja) 1999-04-13 2002-12-03 クロマビジョン メディカル システムズ インコーポレイテッド 組織学的再構成と自動画像分析
US6486915B2 (en) 1999-04-20 2002-11-26 Intel Corporation Determining a final exposure setting automatically for a solid state camera without a separate light metering circuit
US6876760B1 (en) 2000-12-04 2005-04-05 Cytokinetics, Inc. Classifying cells based on information contained in cell images
US7151847B2 (en) 2001-02-20 2006-12-19 Cytokinetics, Inc. Image analysis of the golgi complex
WO2000079005A1 (en) 1999-06-18 2000-12-28 Applied Imaging Corporation High efficiency methods for combined immunocytochemistry and in-situ hybridization
US6496309B1 (en) 1999-06-18 2002-12-17 Genomic Solutions, Inc. Automated, CCD-based DNA micro-array imaging system
US6453060B1 (en) 1999-06-29 2002-09-17 Tri Path Imaging, Inc. Method and apparatus for deriving separate images from multiple chromogens in a branched image analysis system
EP1198956A1 (en) 1999-07-13 2002-04-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Device for applying accurate color thresholds in real time
EP1218849A1 (en) 1999-07-13 2002-07-03 Chromavision Medical Systems, Inc. Apparatus for counting color transitions and areas in real time camera images
US6404916B1 (en) 1999-08-04 2002-06-11 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for applying color thresholds in light microscopy
CA2387473C (en) 1999-10-12 2010-02-02 Connex Gesellschaft Zur Optimierung Von Forschung Und Entwicklung Mbh Improved method for the detection of acid resistant microorganisms in a stool
US7024316B1 (en) 1999-10-21 2006-04-04 Dakocytomation Colorado, Inc. Transiently dynamic flow cytometer analysis system
US6852986B1 (en) 1999-11-12 2005-02-08 E. I. Du Pont De Nemours And Company Fluorometer with low heat-generating light source
JP2001211896A (ja) 1999-11-26 2001-08-07 Olympus Optical Co Ltd 画像解析方法、装置、及び記録媒体
GB0001568D0 (en) 2000-01-24 2000-03-15 Isis Innovation Method and apparatus for measuring surface configuration
US20050230315A1 (en) 2003-01-13 2005-10-20 Regents Of The University Of Michigan Protein microarray system
US6778714B1 (en) 2000-03-10 2004-08-17 Imagexpert, Inc. Portable image analysis system
US6408048B2 (en) 2000-03-14 2002-06-18 Therma-Wave, Inc. Apparatus for analyzing samples using combined thermal wave and X-ray reflectance measurements
US7236623B2 (en) 2000-04-24 2007-06-26 International Remote Imaging Systems, Inc. Analyte recognition for urinalysis diagnostic system
US6518554B1 (en) 2000-05-24 2003-02-11 Chromavision Medical Systems, Inc. Reverse focusing methods and systems
US6522744B1 (en) 2000-05-31 2003-02-18 Jung-Hsun Chiang Volume control apparatus of telephone
IL136884A0 (en) 2000-06-19 2001-06-14 Yissum Res Dev Co A system for cancer detection and typing and for grading of malignancy
US7440637B2 (en) 2000-07-21 2008-10-21 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Method and apparatus for image mosaicing
US6816625B2 (en) 2000-08-16 2004-11-09 Lewis Jr Clarence A Distortion free image capture system and method
US6674058B1 (en) 2000-09-20 2004-01-06 Compucyte Corporation Apparatus and method for focusing a laser scanning cytometer
US7262799B2 (en) 2000-10-25 2007-08-28 Canon Kabushiki Kaisha Image sensing apparatus and its control method, control program, and storage medium
US7298402B2 (en) 2000-10-26 2007-11-20 Olympus Corporation Image-pickup apparatus with expanded dynamic range capabilities
US7714301B2 (en) 2000-10-27 2010-05-11 Molecular Devices, Inc. Instrument excitation source and calibration method
GB2406908B (en) 2000-12-04 2005-07-27 Cytokinetics Inc Classifying cells based on information contained in cell images
US20030215936A1 (en) 2000-12-13 2003-11-20 Olli Kallioniemi High-throughput tissue microarray technology and applications
US6466690C1 (en) 2000-12-19 2008-11-18 Bacus Res Lab Inc Method and apparatus for processing an image of a tissue sample microarray
JP3576523B2 (ja) 2000-12-26 2004-10-13 オリンパス株式会社 蛍光輝度測定方法及び装置
EP1352518B1 (en) 2001-01-11 2009-03-04 Smal Camera Technologies, INC. Adaptive sensitivity control, on a pixel-by-pixel basis, for a digital imager
US6993169B2 (en) 2001-01-11 2006-01-31 Trestle Corporation System and method for finding regions of interest for microscopic digital montage imaging
DE10109130B4 (de) 2001-02-24 2015-02-19 Carl Zeiss Microscopy Gmbh Verfahren zur Aufzeichnung und Darstellung von Fluoreszenzbildern mit hoher räumlicher Auflösung
AU2002254162A1 (en) 2001-03-08 2002-09-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Apparatus and method for labeling rows and columns in an irregular array
JP2002287039A (ja) 2001-03-22 2002-10-03 Olympus Optical Co Ltd 顕微鏡用撮影装置
DE10119005A1 (de) 2001-04-18 2002-10-24 Roche Diagnostics Gmbh Verfahren zur Proteinexpression ausgehend von stabilisierter linearer kurzer DNA in zellfreien in vitro-Transkription/Translations-Systemen mit Exonuklease-haltigen Lysaten oder in einem zellulären System enthaltend Exonukleasen
US7219016B2 (en) 2001-04-20 2007-05-15 Yale University Systems and methods for automated analysis of cells and tissues
US7123756B2 (en) 2001-04-27 2006-10-17 Fuji Photo Film Co., Ltd. Method and apparatus for standardized fluorescence image generation
DE10121064A1 (de) 2001-04-28 2002-10-31 Evotec Ag Vorrichtung und Verfahren zur optischen Messung von chemischen und/oder biologischen Proben
CA2469843A1 (en) 2001-06-04 2002-12-12 Ikonisys Inc. Method for detecting infectious agents using computer controlled automated image analysis
CA2445991A1 (en) 2001-06-05 2002-12-12 Genomics, Ltd. Compositions and methods for the detection of biomarkers associated with cardiovascular disease
US7133543B2 (en) 2001-06-12 2006-11-07 Applied Imaging Corporation Automated scanning method for pathology samples
US7116354B2 (en) 2001-06-20 2006-10-03 Xenogen Corporation Absolute intensity determination for a light source in low level light imaging systems
JP3788279B2 (ja) 2001-07-09 2006-06-21 株式会社日立製作所 パターン検査方法及び装置
WO2003008963A1 (en) 2001-07-18 2003-01-30 University Of Louisville Research Foundation, Inc. E-genechip online web service for data mining bioinformatics
US7229774B2 (en) 2001-08-02 2007-06-12 Regents Of The University Of Michigan Expression profile of prostate cancer
US7332290B2 (en) 2001-08-02 2008-02-19 The Regents Of The University Of Michigan Dectection of AMACR cancer markers in urine
US6648506B2 (en) 2001-09-07 2003-11-18 Board Of Trustees Of Michigan State University Fluorescence emission ratio imaging thermography for use in heat transfer analysis
US6697509B2 (en) 2001-10-04 2004-02-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for scoring the uptake of markers in cells
GB0130845D0 (en) 2001-12-22 2002-02-06 James Peter Analysis
US7383134B2 (en) 2002-01-15 2008-06-03 Piper James R Method and/or system for analyzing biological samples using a computer system
AU2003210592A1 (en) 2002-01-18 2003-12-02 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Simulating microarrays using a parameterized model
EP1468266A4 (en) 2002-01-22 2009-03-11 Beckman Coulter Inc ENVIRONMENTALLY COMPLETED SYSTEM FOR A FLOW CYTOMETER
US7205154B2 (en) 2002-01-31 2007-04-17 Agilent Technologies, Inc. Calibrating array scanners
US20030165263A1 (en) 2002-02-19 2003-09-04 Hamer Michael J. Histological assessment
JP2003284713A (ja) 2002-03-28 2003-10-07 Konica Corp 医用画像処理装置、画像処理パラメータの補正方法、プログラム、記憶媒体
JP2003294734A (ja) 2002-03-29 2003-10-15 Mitsubishi Chemicals Corp 分子間の相互作用の分析方法
USRE44555E1 (en) 2002-04-16 2013-10-22 Evotec Ag Method for analyzing chemical and/or biological samples by means of particle images
AU2003245269A1 (en) 2002-05-03 2003-11-17 Vialogy Corporation System and method for characterizing microarray output data
AU2003225508A1 (en) 2002-05-17 2003-12-02 Pfizer Products Inc. Apparatus and method for statistical image analysis
US20040027618A1 (en) 2002-06-03 2004-02-12 Fuji Photo Film Co., Ltd. Image defect detecting method
US20050037406A1 (en) 2002-06-12 2005-02-17 De La Torre-Bueno Jose Methods and apparatus for analysis of a biological specimen
US7272252B2 (en) 2002-06-12 2007-09-18 Clarient, Inc. Automated system for combining bright field and fluorescent microscopy
WO2003106157A2 (en) 2002-06-14 2003-12-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Automated slide staining apparatus
US20060127946A1 (en) 2002-08-16 2006-06-15 Montagu Jean I Reading of fluorescent arrays
WO2004025569A2 (en) 2002-09-13 2004-03-25 Arcturus Bioscience, Inc. Tissue image analysis for cell classification and laser capture microdissection
US7173663B2 (en) 2002-10-31 2007-02-06 Freescale Semiconductor, Inc. Automatic exposure control system for a digital camera
JP2004157018A (ja) 2002-11-06 2004-06-03 Dkk Toa Corp 蛍光検出装置の感度校正方法及び蛍光検出装置
GB2395263A (en) 2002-11-12 2004-05-19 Qinetiq Ltd Image analysis
GB2396406A (en) 2002-12-17 2004-06-23 Qinetiq Ltd Image analysis
US7648678B2 (en) 2002-12-20 2010-01-19 Dako Denmark A/S Method and system for pretreatment of tissue slides
JP4389445B2 (ja) 2003-01-10 2009-12-24 株式会社ニコン レーザ顕微鏡
US7062079B2 (en) 2003-02-14 2006-06-13 Ikonisys, Inc. Method and system for image segmentation
US7233340B2 (en) 2003-02-27 2007-06-19 Applied Imaging Corp. Linking of images to enable simultaneous viewing of multiple objects
US7064829B2 (en) 2003-03-20 2006-06-20 Timbre Technologies, Inc. Generic interface for an optical metrology system
US7369696B2 (en) 2003-04-02 2008-05-06 Ge Healthcare Uk Limited Classification of cells into subpopulations using cell classifying data
US7171054B2 (en) 2003-05-01 2007-01-30 Eastman Kodak Company Scene-based method for determining focus
US7084386B2 (en) 2003-05-02 2006-08-01 International Business Machines Corporation System and method for light source calibration
JP2004354346A (ja) 2003-05-30 2004-12-16 Olympus Corp 測定装置
FI116246B (fi) 2003-06-30 2005-10-14 Nokia Corp Menetelmä ja järjestelmä digitaalisessa kuvannuksessa valotuksen säätämiseksi ja vastaava laite
JP4504644B2 (ja) 2003-08-26 2010-07-14 オリンパス株式会社 顕微鏡像撮像装置及び顕微鏡像撮像方法
US20050136549A1 (en) 2003-10-30 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for automatically determining diagnostic saliency of digital images
US20050136509A1 (en) 2003-09-10 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for quantitatively analyzing biological samples
US8068988B2 (en) 2003-09-08 2011-11-29 Ventana Medical Systems, Inc. Method for automated processing of digital images of tissue micro-arrays (TMA)
US7760927B2 (en) 2003-09-10 2010-07-20 Bioimagene, Inc. Method and system for digital image based tissue independent simultaneous nucleus cytoplasm and membrane quantitation
WO2005055925A2 (en) 2003-09-10 2005-06-23 Board Of Regents, The University Of Texas System 14-3-3 zeta over-expression as a poor prognosis factor, and a therapeutic target in multiple cancer types
DE10343375A1 (de) 2003-09-17 2005-04-28 Axaron Bioscience Ag Verfahren zur Detektion und Analyse von Protein-Protein-Interaktionen
US20050106712A1 (en) * 2003-11-14 2005-05-19 Eastman Kodak Company Yellow low fluorescence dye for coated optical bead random array DNA analysis
US20050282179A1 (en) * 2003-12-05 2005-12-22 Applera Corporation Biomarkers for interferon-alpha response in hepatitis C virus infected patients
JP2005181244A (ja) 2003-12-24 2005-07-07 Yokogawa Electric Corp 光量分布補正方法およびバイオチップ読取装置
WO2005076197A2 (en) 2004-01-31 2005-08-18 Bioimagene, Inc. Method and system for morphology based mitosis identification and classification of digital images
WO2005076216A2 (en) 2004-02-03 2005-08-18 Bioimagene, Inc. Method and system for automaticed digital image based flourescent in situ hybridization (fish) analysis
JP5231736B2 (ja) 2004-02-06 2013-07-10 ウェイク・フォレスト・ユニヴァーシティ・ヘルス・サイエンシズ 非侵襲的イメージングのグローバル組織特性を用いた組織評価および画像のグローバル組織特性を決定するシステム
JP4338551B2 (ja) 2004-03-04 2009-10-07 富士フイルム株式会社 画像再生方法、画像再生装置及び画像再生プログラム
WO2005096225A1 (en) 2004-03-27 2005-10-13 Bioimagene, Inc. Method and system for automated detection of immunohistochemical (ihc) patterns
US7330250B2 (en) 2004-05-18 2008-02-12 Agilent Technologies, Inc. Nondestructive evaluation of subsurface damage in optical elements
JP2005331394A (ja) 2004-05-20 2005-12-02 Olympus Corp 画像処理装置
WO2005114578A1 (en) 2004-05-21 2005-12-01 Bioimagene, Inc. Method and system for automated quantitation of tissue micro-array (tma) digital image analysis
CA2576510C (en) 2004-08-06 2014-10-14 Compucyte Corporation Multiple-color monochromatic light absorption and quantification of light absorption in a stained sample
MX2007003502A (es) 2004-09-22 2007-10-10 Tripath Imaging Inc Metodos y productos de programas de computadora para analisis y optimizacion de los candidatos marcadores para el pronostico del cancer.
WO2006039396A2 (en) 2004-10-01 2006-04-13 Ambion, Inc. Non-embedded tissue microarray technology for protein and nucleic acid analyses
CA2587765A1 (en) 2004-11-17 2006-05-26 Immunivest Corporation Magnetic enrichment of circulating cells, fragments and debris for enabling hts proteomics and genomics in disease detection
US20060160169A1 (en) 2004-12-03 2006-07-20 Board Of Regents, The University Of Texas System Cell microarray for profiling of cellular phenotypes and gene function
JP2006194711A (ja) 2005-01-13 2006-07-27 Matsushita Electric Ind Co Ltd 蛍光発光色素の性能評価方法および性能評価装置
WO2006083969A2 (en) 2005-02-01 2006-08-10 Amnis Corporation Blood analysis using a flow imaging cytometer
GB0503087D0 (en) 2005-02-15 2005-03-23 Medical Solutions Plc Apparatus and method for processing of specimen images for use in computer analysis thereof
WO2007024264A2 (en) 2005-02-23 2007-03-01 Bioimagene, Inc. Method and system for digital image based tissue independent simultaneous nucleus, cytoplasm and membrane quantitation
WO2006102233A2 (en) 2005-03-18 2006-09-28 Immunivest Corporation Method and apparatus for imaging target components in a biological sample using permanent magnets
WO2006113747A2 (en) 2005-04-19 2006-10-26 Prediction Sciences Llc Diagnostic markers of breast cancer treatment and progression and methods of use thereof
BRPI0501535B8 (pt) 2005-04-26 2021-07-27 Mario Augusto Pazoti método de identificação do guignardia citricarpa
WO2006122251A2 (en) 2005-05-10 2006-11-16 Bioimagene, Inc. Method and system for automated digital image analysis of prostrate neoplasms using morphologic patterns
AU2006254923A1 (en) 2005-06-08 2006-12-14 Vanderbilt University Analysis of tissue samples surrounding malignancies
WO2006133460A2 (en) 2005-06-09 2006-12-14 Yale University Methods for diagnosing and treating breast cancer based on a her/er ratio
US7557963B2 (en) 2005-08-12 2009-07-07 Seiko Epson Corporation Label aided copy enhancement
GB2430026A (en) 2005-09-09 2007-03-14 Qinetiq Ltd Automated selection of image regions
WO2007047450A1 (en) 2005-10-13 2007-04-26 Aureon Laboratories, Inc. Multiplex in situ immunohistochemical analysis
JP4863692B2 (ja) 2005-11-02 2012-01-25 株式会社島津製作所 イメージ質量分析装置
US7199360B1 (en) 2006-01-13 2007-04-03 Jean Montagu System and method for calibrating a fluorescence microscope
EP1984735B1 (en) 2006-02-16 2010-10-06 Ventana Medical Systems, Inc. Reagents and methods for cancer prognosis and pathological staging
WO2007100920A2 (en) 2006-03-01 2007-09-07 The Regents Of The University Of Michigan Diagnosis and treatment of prostate cancer
JP4748719B2 (ja) 2006-03-02 2011-08-17 国立大学法人大阪大学 生細胞内の特定タンパク質の定量方法および標準蛍光マイクロビーズの作製方法
JP2007271484A (ja) 2006-03-31 2007-10-18 Toyobo Co Ltd 細胞成分分析装置の感度を向上する方法
JP4864519B2 (ja) 2006-04-11 2012-02-01 浜松ホトニクス株式会社 光測定装置、光測定方法、及び光測定プログラム
WO2007133465A2 (en) 2006-05-12 2007-11-22 Immunivest Corporation A laser illumination system in fluorescent microscopy
JP2009544007A (ja) 2006-07-13 2009-12-10 イェール・ユニバーシティー バイオマーカーの細胞内局在性に基づいて癌予後を行う方法
WO2008012771A2 (en) 2006-07-25 2008-01-31 The Procter & Gamble Company Methods and products for analyzing gingival tissues
PT2099442E (pt) 2006-12-26 2015-02-10 Pharmacyclics Inc Métodos de utilização de inibidores de histona desacetilase e monitorização de biomarcadores em terapia de combinação
JP5425762B2 (ja) 2007-05-14 2014-02-26 ヒストロックス,インコーポレイテッド. イメージデータクラスタリングを使用した画素評価によるコンパートメント分離
WO2008156669A1 (en) 2007-06-15 2008-12-24 Historx, Inc. Method and system for standardizing microscope instruments
US7873215B2 (en) 2007-06-27 2011-01-18 Seiko Epson Corporation Precise identification of text pixels from scanned document images
CA2604317C (en) 2007-08-06 2017-02-28 Historx, Inc. Methods and system for validating sample images for quantitative immunoassays
CA2596204C (en) 2007-08-07 2019-02-26 Historx, Inc. Method and system for determining an optimal dilution of a reagent
WO2009020621A1 (en) 2007-08-07 2009-02-12 Historx, Inc. Method and system for determining an optimal dilution of a reagent
WO2009029810A1 (en) 2007-08-31 2009-03-05 Historx, Inc. Automatic exposure time selection for imaging tissue
TWI335252B (en) 2007-11-30 2011-01-01 Ind Tech Res Inst Calibration strip and the laser calibration system using thereof
ES2573945T3 (es) 2008-09-16 2016-06-13 Novartis Ag Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores

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