ES2573945T3 - Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores - Google Patents

Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores Download PDF

Info

Publication number
ES2573945T3
ES2573945T3 ES09792559.8T ES09792559T ES2573945T3 ES 2573945 T3 ES2573945 T3 ES 2573945T3 ES 09792559 T ES09792559 T ES 09792559T ES 2573945 T3 ES2573945 T3 ES 2573945T3
Authority
ES
Spain
Prior art keywords
pixels
image
data
sets
exposure time
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
ES09792559.8T
Other languages
English (en)
Inventor
Jason Christiansen
Robert Pinard
Mark Gustavson
Brian Bourke
Gregory R. Tedeschi
Dylan M. Reilly
Maciej P. Zerkowski
Christine Williams
Dongxiao Wang
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Novartis AG
Original Assignee
Novartis AG
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Novartis AG filed Critical Novartis AG
Application granted granted Critical
Publication of ES2573945T3 publication Critical patent/ES2573945T3/es
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00—Image analysis
    • G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
    • G06T7/0012—Biomedical image inspection
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00—Image analysis
    • G06T7/40—Analysis of texture
    • G06T7/41—Analysis of texture based on statistical description of texture
    • G06T7/44—Analysis of texture based on statistical description of texture using image operators, e.g. filters, edge density metrics or local histograms
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
    • G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
    • G06V20/60—Type of objects
    • G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
    • G06V20/698—Matching; Classification
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
    • G16B40/30—Unsupervised data analysis
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B45/00—ICT specially adapted for bioinformatics-related data visualisation, e.g. displaying of maps or networks
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B5/00—ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30004—Biomedical image processing
    • G06T2207/30024—Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Evolutionary Computation (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Artificial Intelligence (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Software Systems (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Quality & Reliability (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Probability & Statistics with Applications (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Multimedia (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

Método para cuantificar reproductivamente la expresión de biomarcadores en una muestra de tejido montada en una diapositiva que comprende: (a) obtención de una muestra de tejido montada en una diapositiva, que se ha manchado para permitir la localización de al menos un compartimento celular y al menos un biomarcador; (b) obtención de una o más imágenes formadas por píxeles de la muestra de tejido manchada utilizando un sistema óptico estandarizado, y análisis de una o más imágenes formadas por píxeles para obtener uno o más conjuntos de datos; (c) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos del ruido; (d) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a cada uno de dicho al menos un compartimento celular; (e) análisis automático de uno o más conjuntos de datos derivados a partir de los píxeles de la imagen para diferenciar la señal de datos atribuible a dicho al menos un biomarcador para cada uno de dicho al menos un compartimento celular; (f) cuantificación de la cantidad de biomarcador expresado en cada uno de dicho al menos un compartimento celular para llegar a una puntuación estandarizada, que es un producto de una puntuación bruta, un factor de fuente luminosa, un factor de trayectoria óptica, y opcionalmente un factor de cubo de calibración, por lo cual el sistema óptico estandarizado está dispuesto para ajuste automático de tiempo de exposición para proporcionar un rango dinámico optimizado de datos capturados en los píxeles de la imagen, y donde un tiempo de exposición nuevo se calcula como:**Fórmula** donde**Fórmula** donde E es el nuevo tiempo de exposición, E' es el tiempo de exposición actualmente establecido. A es un nivel de agresión, SL es el límite de saturación, CCDx y CCDy representan las dimensiones de píxel de la imagen capturada, y P es el recuento de píxeles a intensidad máxima.

Description

imagen1
imagen2
imagen3
imagen4
imagen5
imagen6
imagen7
imagen8
imagen9
imagen10
imagen11
imagen12
imagen13
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
Un umbral de calidad de coloración mínimo aceptable se puede fijar o ajustar por un usuario. Tales muestras identificadas como que no llegan al umbral de coloración mínimo se pueden excluir de los datos ajustados y de posterior análisis por el programa de validación.
[0084] La suficiencia de tejido se puede analizar por recuento de los píxeles de una imagen con intensidades de señal por encima de una intensidad de umbral luego determinando si el número total de píxeles positivos cumple un criterio mínimo para tejido suficiente. Asimismo, el porcentaje de píxeles positivos del total se pueden utilizar como el criterio.
[0085] Cuando se analizan los microarrays tisulares, la posición de la muestra de tejido se puede evaluar por cálculo de la intensidad de píxel media en cada una de las diferentes secciones identificadas en el campo de visión. Muestras o histopuntos individuales se deben identificar para determinar la posición, que se puede usar para comparar la posición del borde de la muestra con el centro de la muestra. El borde de la muestra se determina basado en la intensidad de píxel de áreas rectangulares para valorar si el centrado debidamente, y la intensidad de píxel central se mide para determinar si los bordes no se deben más de una muestra. La detección del borde de muestra se puede realizar utilizando un operador de diferenciación discreta, tal como un detector de borde Sobel, o cualquier otro número de detectores de borde bien conocidos en la técnica. Muestras incorrectamente posicionadas o puntos de división que contienen más de un objetivo se pueden identificar luego y excluir de posterior análisis.
[0086] El enfoque de la muestra puede ser evaluado, tal como por determinación de un valor de curtosis para las intensidades de píxel de la imagen. Los valores de intensidad de coloración de píxeles en una imagen digitalizada se pueden fijar en un histograma. La distribución se puede analizar como una indicación de foco. Una imagen enfocada típicamente tendrá una distribución de intensidad de píxel con un valor máximo definido relativamente alto, (curtosis más alta) en comparación con una imagen desenfocada que tendrá una distribución de intensidad de píxel con un valor máximo aplanado (curtosis más baja). La altura o la planicie de tal distribución se puede representar en un valor único, tal como un valor de curtosis. Un valor de curtosis más alto es indicativo de un valor máximo definido con relativamente alto; mientras que, un valor de curtosis más baja es indicativo de un valor máximo aplanado.
[0087] La curtosis es una medida de si los datos son maximizados o planos con respecto a una distribución normal. Esto es, conjuntos de datos con alta curtosis tienden a tener un valor máximo diferente cerca de la media, descienden bastante rápidamente, y tienen colas pesadas. Conjuntos de datos con baja curtosis tienden a tener un máximo plano más bien que un máximo elevado. Para datos univariantes Y1, Y2, ..., YN, la fórmula para curtosis es:
imagen14
donde Y es la media, s es la desviación típica, y N es el número de puntos de datos. La curtosis de exceso se puede definir como
imagen15
de modo que la distribución normal estándar tiene una curtosis de cero. La curtosis positiva indica una distribución "en pico" y la curtosis negativa indica una distribución "plana". Imágenes con curtosis negativa se pueden entonces excluir de posterior análisis.
[0088] La intensidad de señal se puede evaluar por selección de los datos de intensidad de señal medidos a partir de imágenes adquiridas en cada canal pertinente para cada histopunto e identificando el número de muestras con bajas intensidades de coloración. Tales muestras se pueden excluir de posterior análisis.
Puntuación AQUA®
[0089] Una vez que la imagen se optimiza y convalida, con cualquier histopuntos inválidos o imágenes retiradas, la imagen se enmascara virtualmente, aproximaciones tridimensionales de células en la muestra pueden ser generadas, y marcadores biológicos se asocian con compartimentos subcelulares de células individuales. Tal algoritmo para automáticamente realizar estas tareas es la plataforma de análisis cuantitativo automatizado (plataforma AQUA®). Esta técnica se describe también en la patente de EE.UU. nº 7.219.016 y Camp et al., 2002 Nature Medicine 8(11)1323-1327
15
imagen16
5
15
25
35
45
55
compartimento (por ejemplo, imagen DAPI, representando el compartimento nuclear) y las asignaciones de píxeles se basan en cuatro criterios:
1.) Intensidad baja tanto en la primera como en la segunda imagen (por ejemplo, DAPI y Cy3):FONDO: ELIMINAR 2.) Intensidad alta de la segunda mancha (por ejemplo; DAPI) con respecto a la intensidad de la primera mancha (Cy3): SEGUNDO COMPARTIMENTO (por ejemplo, NUCLEAR) 3.) Intensidad alta de la primera mancha (por ejemplo; Cy3) con respecto a la intensidad de la segunda mancha(por ejemplo, DAPI): PRIMER COMPARTIMENTO (por ejemplo, CITOPLÁSMICO) 4.) Intensidad alta de la segunda mancha y la primera mancha (por ejemplo, DAPI y Cy3):INDETERMINANTE: ELIMINAR
[0095] El agrupamiento es una función algorítmica matemática por la cual centroides dentro de conjuntos de datos se definen por distancias relativas de cada punto de datos entre sí, como se determina, por ejemplo, por distancia de logaritmo de verosimilitud o eucleidiana. Si bien no se desea estar limitado por la teoría, se cree que el agrupamiento de intensidades de píxel de al menos dos imágenes (por ejemplo, DAPI y Cy3), podrían dar como resultado centroides que definen píxeles como se describe, al menos, por los criterios anteriores. Debido a que el agrupamiento es objetivo y se puede realizar individualmente en cada imagen, el agrupamiento es un método fiable para asignación de píxeles a compartimentos, independiente de la intervención de operador.
[0096] En otra forma de realización, píxeles que contienen señales indicativas de tanto la primera como la segunda mancha se asignan a compartimentos por el siguiente método. Cada píxel de las imágenes adquiridas tiene tres atributos aportación de intensidad a partir de marcador de compartimento A, aportación de intensidad a partir del marcador de compartimento B y una aportación de intensidad a partir del objetivo o biomarcador de interés. Estas intensidades se miden en sus canales de fluorescencia respectivos por la configuración experimental. Para evitar el sesgo experimental, la intensidad objetivo no se manipula en este método actual. Así, los datos para los dos atributos de compartimento se pueden ilustrar en un gráfico bidimensional esquemáticamente.
[0097] Píxeles con una fuerte tendencia hacia cualquiera del ejes se pueden asignar a ese compartimento (por ejemplo, píxeles en las regiones de A y B se podrían asignar absolutamente a los compartimentos A y B respectivamente). Píxeles cerca del origen representan bajas intensidades para ambos canales y se pueden descartar como fondo junto con píxeles atípicos que tienen alta intensidad pero valores similares. Píxeles que permanecen en la región A/B pueden después ser asignados a cada compartimento basado en la probabilidad. Esta asignación permite señal objetivo en los píxeles que se van a distribuir a través de ambos compartimentos basados en la caracterización de probabilidad.
[0098] Para definir las regiones anteriormente descritas, por ejemplo, para cada imagen, se usa el agrupamiento para determinar tres centroides en los datos. Este método es completamente automatizado y no requiere ninguna decisión de operador para proceder. El análisis se realiza mediante la realización de agrupamiento con medios K en tres centroides utilizando distancias euclidianas.
[0099] Los datos son luego analizados de la siguiente manera: (i) píxeles de fondo y atípicos son descartados de posterior cálculo. Un píxel se define como de fondo si su distancia al origen es inferior a dos veces la distancia del centroide de fondo al origen. Un píxel se define como atípico si su intensidad excede el valor definido por la línea o plano definido por los centroides más exteriores; (ii) píxeles de las regiones A y B se asignan exclusivamente a esos dos compartimentos; (iii) píxeles en la región triangular A/B se les asigna luego un valor de probabilidad que les permite esencialmente ser distribuidos en compartimentos múltiples. Este valor de probabilidad se puede calcular basado en la distancia a partir de las dos regiones A y B, o, utilizando una función de forma que también asignará una probabilidad de cada píxel que tiene una aportación a partir de la región de fondo examinando cada distancia el píxel desde los tres vértices dados por los centroides; (iv) con todos los píxeles asignados, las puntuaciones objetivo asociadas se pueden sumar para cada compartimento y una puntuación se puede calcular utilizando métodos estándar:
imagen17
donde Int es la intensidad del píxel, P es la probabilidad del píxel asignado a un compartimento particular (que varía de 0 a 1).
[0100] Los puntos de corte se establecen usando algoritmos para separar muestras en grupos con características específicas, tales como muestras que contienen tejidos con niveles de expresión de biomarcadores diferentes para uno
o más biomarcador, como se describe con más detalle en McCabe et al., J. Natl. Cane. Inst. (2005) 97(24):1808-1815, que se incorpora en la presente por referencia en su totalidad. Al reducir los resultados de cuantificación de
17
imagen18
imagen19
imagen20
[0117] Un parámetro crítico para análisis HER2 en el laboratorio clínico es la capacidad para clasificar reproductivamente pacientes como positivos o negativos. Utilizando la supervivencia como una etiqueta sustituta para classification22 positiva/negativa, un punto de corte de puntuación de AQUA® óptimo fue establecido utilizando X-tile19 para puntuaciones de AQUA® HER2 normalizadas producidas para instrumento 1, operador 1 y ronda de coloración 1. La figura 5A muestra análisis de supervivencia Kaplan-Meier de clasificación HER2 positiva/negativa para instrumento 1. Como se describe en materiales y métodos, el punto de corte fue convalidado con importancia por la simulación Monte Carlo (P < 0,001) y subconjuntos de formación/validación (P = 0,002). Este punto de corte validado se aplicó a puntuaciones de AQUA® generadas en instrumentos 2 y 3 con importancia, P < 0,001 y P = 0,004 respectivamente (figuras 5B y 5C). Se observó reproducibilidad similar a través de operador independiente y adquisiciones de ronda de coloración con valores P todos ≤ 0,01 (datos no mostrados).
[0118] Las actuales pautas ASCO-CAP están sugiriendo que los laboratorios consigan 95% de concordancia positiva/negativa para metodologías de ensayo HER2 actuales (Wolff AC et al, Arch Pathol Lab Med. (2007) 131:18). Un estudio reciente muestra que para puntuación basada en IHC HER2, la concordancia entre observadores varía de 5485%, por debajo de estas pautas (Hameed et al.; en prensa; comunicación directa). Concordancia positiva/negativa para puntuación de AQUA® normalizada a través de instrumentos, operadores y días de coloración fue examinada utilizando los puntos de corte establecidos por encima. Como se muestra en la figura 6, la concordancia total oscilaba de 94,5% (instrumento 1 a instrumento 3; figura 6B) a 99,3% (operador 1 a operador 2, figura 6C). Estos análisis incluyen todos los casos que incluyen los que serían considerados ambiguos.
[0119] Para valorar donde se produjo la clasificación diferencial en la distribución de puntuaciones de AQUA® normalizadas, histogramas de frecuencia panelados fueron generados para examinar donde casos diferencialmente clasificados estaban ocurriendo. Como se muestra en la figura 7, para instrumento a instrumento, operador a operador y ronda a ronda, casos diferencialmente clasificados ocurren en el punto de corte y no sobre toda la distribución. Estos datos sugieren que el error de clasificación concierne a la no generación de selección de punto de corte y reproducibilidad de la puntuación de AQUA® HER2 normalizada. Tomados en conjunto, estos datos muestran clasificación de pacientes para evaluación interinstrumento, interoperador e interronda de expresión HER2 usando puntuación de AQUA® es altamente reproducible con índices de concordancia que se acercan, si no superan, los sugeridos por ASCO/CAP.
Ejemplo 2: análisis AQUA® de EGFR: datos de rendimiento analítico
[0120] Los métodos de la presente invención fueron aplicados a la evaluación del biomarcador EGFR en las secciones de tejido de cáncer de mama. Como se muestra en figura 8A, una cohorte TMA de 748 especímenes fue analizada para expresión HER2 por análisis de AQUA® normalizado a través de tres instrumentos, 3 operadores y 3 rondas de coloración separadas con un %CV medio de 4,3%. La evaluación de rendimiento analítico preliminar fue realizada con EGFR PharDx (Dako). Como muestran las figuras 8B-D, el análisis AQUA®) de expresión EGFR a través de 3 diapositivas y 3 días de coloración en un TMA compuesto por tumor de mama y líneas celulares (n=152) muestra un grado alto de precisión diapositiva a diapositiva y día a día con una pendiente media de 1,00047, un R de Pearson medio de 0,95, un %CV medio para tejido tumoral de 3,3%, y un %CV medio para líneas celulares de 4,7%. Tomados en conjunto, estos datos demuestran que el análisis de AQUA® permite un ensayo EGFR con un grado alto de precisión, y combinado con controles de instrumento y software, el desarrollo de un ensayo de biomarcador clínico robusto es posible.
Ejemplo 3: análisis AQUA® de expresión ER: reproducibilidad
[0121] Para demostrar la reproducibilidad del AQUAnalysis™ con otro biomarcador, cuatro bloques de tejido de mama fueron obtenidos que representaban un rango de expresión de receptor de estrógenos (ER) (según puntuación de Allred). Secciones de estos bloques de tejido se tomaron para generar diapositivas H&E sobre las que un patólogos certificado por la junta rodeó el área de tumor para todos los análisis posteriores. Un conjunto en serie de secciones fue manchado con DAB con el receptor α de estrógenos de ratón anti-humano monoclonal, anticuerpo de clon 1D5 y evaluado para puntuación Allred por el mismo patólogo. Véase, por ejemplo, Harvey JM, et al., (1999) J. Clin. Oncol. 12:1474, que se incorpora en la presente por referencia en su totalidad.
[0122] Secciones en serie fueron luego manchadas utilizando el protocolo de coloración de inmunofluorescencia anteriormente descrito. Las imágenes fueron recogidas en la plataforma de microscopía HistoRx PM-2000™ y luego pasadas a AQUAnalysis™ para puntuación. Todas las puntuaciones fueron transformadas en una log2.
[0123] Ficheros de imagen para las cuatro diapositivas fueron adquiridos y luego pasados a través del paquete de software AQUAnalysis™ n=10 veces por el mismo operador para demostrar reproducibilidad de software total. Para todos los ficheros, el %CV fue esencialmente 0 (menos luego 1E-7).
[0124] Los mismos cuatro ficheros de imagen fueron luego proporcionados a tres operadores diferentes junto con las instrucciones de funcionamiento del software. Aquí, los operadores censuraron imágenes en el método descrito para revisión técnica de calidad de imagen, que refleja uso típico. Los resultados, mostrados en la tabla 1, demuestran que
21
imagen21
imagen22
imagen23

Claims (1)

  1. imagen1
    imagen2
    imagen3
ES09792559.8T 2008-09-16 2009-09-15 Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores Active ES2573945T3 (es)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US9741508P 2008-09-16 2008-09-16
US97415P 2008-09-16
PCT/US2009/056996 WO2010033508A1 (en) 2008-09-16 2009-09-15 Reproducible quantification of biomarker expression

Publications (1)

Publication Number Publication Date
ES2573945T3 true ES2573945T3 (es) 2016-06-13

Family

ID=41461054

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES09792559.8T Active ES2573945T3 (es) 2008-09-16 2009-09-15 Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores

Country Status (8)

Country Link
US (1) US9240043B2 (es)
EP (1) EP2335221B8 (es)
JP (1) JP5551702B2 (es)
CN (1) CN102165489B (es)
AU (1) AU2009293380B2 (es)
CA (1) CA2737116C (es)
ES (1) ES2573945T3 (es)
WO (1) WO2010033508A1 (es)

Families Citing this family (114)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8055034B2 (en) * 2006-09-13 2011-11-08 Fluidigm Corporation Methods and systems for image processing of microfluidic devices
WO2008143849A2 (en) 2007-05-14 2008-11-27 Historx, Inc. Compartment segregation by pixel characterization using image data clustering
WO2008156669A1 (en) 2007-06-15 2008-12-24 Historx, Inc. Method and system for standardizing microscope instruments
WO2009029810A1 (en) * 2007-08-31 2009-03-05 Historx, Inc. Automatic exposure time selection for imaging tissue
EP2335221B8 (en) 2008-09-16 2016-05-25 Novartis AG Reproducible quantification of biomarker expression
WO2011146928A2 (en) * 2010-05-21 2011-11-24 On-Q-ity Methods for calibrating protein levels in cells and tissue specimens
EP2646831A1 (en) 2010-12-03 2013-10-09 Historx, Inc. Identification of cancer patients likely to benefit from radiation therapy
US9522396B2 (en) 2010-12-29 2016-12-20 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Apparatus and method for automatic detection of pathogens
US9152861B2 (en) 2011-03-04 2015-10-06 Nec Corporation Individual product identification system, individual product identification method, and device and program used by same
CN104093415B (zh) 2011-10-24 2017-04-05 哈洛齐梅公司 抗乙酰透明质酸剂疗法的同伴诊断剂及其使用方法
EP2798350B1 (en) 2011-12-29 2021-07-28 Sight Diagnostics Ltd. Methods and systems for detecting a pathogen in a biological sample
CA2867359A1 (en) * 2012-03-30 2013-10-03 Clarient Diagnostic Services, Inc. Methods for generating an image of a biological sample
DE13731071T1 (de) * 2012-06-14 2016-08-18 Assistance Publique Hôpitaux De Paris Verfahren zur Quantifizierung von Immunzellen in Tumorgewebe und dessen Anwendungen
US9278124B2 (en) 2012-10-16 2016-03-08 Halozyme, Inc. Hypoxia and hyaluronan and markers thereof for diagnosis and monitoring of diseases and conditions and related methods
US10225483B1 (en) * 2013-05-01 2019-03-05 Pierce Biotechnology, Inc. Method and system for projecting image with differing exposure times
US10115034B2 (en) * 2013-05-01 2018-10-30 Life Technologies Holdings Pte Limited Method and system for projecting image with differing exposure times
EP2999988A4 (en) 2013-05-23 2017-01-11 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Method and system for imaging a cell sample
IL227276A0 (en) 2013-07-01 2014-03-06 Parasight Ltd A method and system for obtaining a monolayer of cells, for use specifically for diagnosis
WO2015029032A1 (en) 2013-08-26 2015-03-05 Parasight Ltd. Digital microscopy systems, methods and computer program products
AU2015212758B2 (en) 2014-01-30 2019-11-21 Bd Kiestra B.V. A system and method for image acquisition using supervised high quality imaging
WO2015124702A1 (en) 2014-02-21 2015-08-27 Ventana Medical Systems, Inc. Single-stranded oligonucleotide probes for chromosome or gene copy enumeration
WO2015131151A2 (en) * 2014-02-28 2015-09-03 Erythron, Llc Method and apparatus for determining markers of health by analysis of blood
EP3117259B1 (en) * 2014-03-10 2020-01-15 Visiopharm A/s Assessment of staining quality
US9797767B2 (en) * 2014-08-26 2017-10-24 General Electric Company Calibration of microscopy systems
US10746980B2 (en) * 2014-08-26 2020-08-18 General Electric Company Calibration of microscopy systems
CN107077732B (zh) 2014-08-27 2020-11-24 思迪赛特诊断有限公司 用于对数字显微镜计算聚焦变化的系统及方法
HUE043847T2 (hu) 2014-08-28 2019-09-30 Halozyme Inc Hialuronán-lebontó enzimmel és egy immun checkpoint inhibitorral végzett kombinációs terápia
EP3207130B1 (en) 2014-10-14 2019-08-07 Halozyme, Inc. Compositions of adenosine deaminase-2 (ada2), variants thereof and methods of using same
CN107209934B (zh) * 2014-12-03 2021-03-30 文塔纳医疗系统公司 用于定量分析异质生物标志物分布的方法、系统和装置
JP6450832B2 (ja) * 2015-03-17 2019-01-09 浜松ホトニクス株式会社 蛍光画像生成装置及び蛍光画像生成方法
WO2017032867A1 (en) 2015-08-27 2017-03-02 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of patients suffering from a lung cancer
JP6725646B2 (ja) 2015-09-02 2020-07-22 ベンタナ メディカル システムズ， インコーポレイテッド 解析的に別個の検体染色のパターンの混合を有する細胞サンプルの自動化解析
WO2017046799A1 (en) 2015-09-17 2017-03-23 S.D. Sight Diagnostics Ltd Methods and apparatus for detecting an entity in a bodily sample
WO2017060397A1 (en) 2015-10-09 2017-04-13 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of subjects suffering from melanoma metastases
WO2017067944A1 (en) 2015-10-19 2017-04-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of subjects suffering from triple negative breast cancer
EP3719143B1 (en) * 2015-10-23 2023-07-26 Novartis AG Method of deriving a value for percent biomarker positivity for selected cells present in a field of view
EP3365682B1 (en) * 2015-10-23 2020-10-07 Novartis AG System for deriving cell-to-cell spatial proximities
US20180327499A1 (en) 2015-11-13 2018-11-15 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Anti- nkg2d single domain antibodies and uses thereof
US20200264165A1 (en) 2016-01-04 2020-08-20 Inserm (Institut National De La Sante Et De Larecherche Medicale) Use of pd-1 and tim-3 as a measure for cd8+ cells in predicting and treating renal cell carcinoma
WO2017126420A1 (ja) * 2016-01-19 2017-07-27 コニカミノルタ株式会社 画像処理装置及びプログラム
EP3407912B1 (en) 2016-01-28 2022-05-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for enhancing the potency of the immune checkpoint inhibitors
TWI733772B (zh) * 2016-03-14 2021-07-21 美商身體邏輯股份有限公司 用於合成吲哚環核鹼基結合物之組成物及方法
WO2017168411A1 (en) 2016-03-30 2017-10-05 S.D. Sight Diagnostics Ltd Image processing device for identifying blood parasites
US11307196B2 (en) 2016-05-11 2022-04-19 S.D. Sight Diagnostics Ltd. Sample carrier for optical measurements
CA3022770A1 (en) 2016-05-11 2017-11-16 S.D. Sight Diagnostics Ltd Performing optical measurements on a sample
EP3463452A1 (en) 2016-05-24 2019-04-10 Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM) Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of non small cell lung cancer (nsclc) that coexists with chronic obstructive pulmonary disease (copd)
EP3469548B1 (en) * 2016-06-10 2020-05-13 H. Hoffnabb-La Roche Ag System for bright field image simulation
WO2018009202A1 (en) * 2016-07-07 2018-01-11 Flagship Biosciences Inc. Continuous tissue analysis scoring scheme based on cell classifications
WO2018011107A1 (en) 2016-07-11 2018-01-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of er-alpha 46 in methods and kits for assessing the status of breast cancer
CN106327508B (zh) * 2016-08-23 2019-04-02 马跃生 Ki67指数自动分析方法
WO2018046736A1 (en) 2016-09-12 2018-03-15 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of patients suffering from cancer
KR102682483B1 (ko) * 2016-09-30 2024-07-05 삼성전자주식회사 픽셀 기반 학습을 이용한 마스크 최적화 방법
EP3520004A2 (en) * 2016-09-30 2019-08-07 GE Healthcare Bio-Sciences Corp. Computer device for detecting an optimal candidate compound and methods thereof
EP3532807A4 (en) * 2016-10-25 2020-07-01 Abbott Laboratories ASSESSMENT AND CONTROL OF REAGENTS IN THE AUTOMATED PREPARATION OF SLIDES
CN108229098A (zh) * 2016-12-09 2018-06-29 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 单分子的识别、计数方法及装置
WO2018122249A1 (en) 2016-12-28 2018-07-05 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the survival time of patients suffering from a microsatellite stable colorectal cancer
WO2018122245A1 (en) 2016-12-28 2018-07-05 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods of predicting the survival time of patients suffering from cms3 colorectal cancer
WO2018146253A1 (en) 2017-02-10 2018-08-16 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of cancers associated with activation of the mapk pathway
CA3054068A1 (en) 2017-03-16 2018-09-20 Alpine Immune Sciences, Inc. Cd80 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
EP3619534A1 (en) 2017-05-05 2020-03-11 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Microtubule-targeting drugs as immune checkpoint inhibitors and methods of screening novel immune checkpoint inhibitors for the treatment of cancers and infectious diseases
US11450121B2 (en) * 2017-06-27 2022-09-20 The Regents Of The University Of California Label-free digital brightfield analysis of nucleic acid amplification
WO2019002281A1 (en) * 2017-06-28 2019-01-03 Ventana Medical Systems, Inc. CALIBRATION OF SYSTEM LEVEL
CN107463913B (zh) * 2017-08-11 2020-07-14 苏炯龙 基于Lab的图像胶原纤维识别计算系统及方法
WO2019037863A1 (en) * 2017-08-24 2019-02-28 Toyota Motor Europe SYSTEM AND METHOD FOR TAG INCREASE IN VIDEO DATA
WO2019043138A1 (en) 2017-09-01 2019-03-07 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) METHOD FOR PREDICTING OUTCOME OF CANCER
WO2019074489A1 (en) * 2017-10-10 2019-04-18 Flagship Biosciences, Inc. METHODS FOR QUANTITATIVE EVALUATION OF MUSCLE FIBERS IN MUSCLE DYSTROPHY
CN107729932B (zh) * 2017-10-10 2019-07-26 杭州智微信息科技有限公司 骨髓细胞标记方法和系统
US12031975B2 (en) 2017-11-01 2024-07-09 Juno Therapeutics, Inc. Methods of assessing or monitoring a response to a cell therapy
JP7214729B2 (ja) 2017-11-14 2023-01-30 エス．ディー．サイト ダイアグノスティクス リミテッド 光学測定用試料収容器
EP3713963A1 (en) 2017-11-23 2020-09-30 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) A new marker for predicting the sensitivity to pi3k inhibitors
EP3729369A2 (en) * 2017-12-24 2020-10-28 Ventana Medical Systems, Inc. Computational pathology approach for retrospective analysis of tissue-based companion diagnostic driven clinical trial studies
EP3756012A1 (en) 2018-02-21 2020-12-30 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sk1 as biomarker for predicting response to immunecheckpoint inhibitors
BR112020018585A8 (pt) 2018-03-12 2022-12-06 Inst Nat Sante Rech Med Uso de mimeticos de restrição calórica para potencializar a quimioimunoterapia para o tratamento de câncer
EP3775908A1 (en) 2018-04-13 2021-02-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting outcome and treatment of patients suffering from prostate cancer or breast cancer
WO2019207030A1 (en) 2018-04-26 2019-10-31 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting a response with an immune checkpoint inhibitor in a patient suffering from a lung cancer
WO2019241758A1 (en) 2018-06-15 2019-12-19 Alpine Immune Sciences, Inc. Pd-1 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
WO2020048942A1 (en) 2018-09-04 2020-03-12 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cytotoxic t lymphocyte-dependent immune responses
CN113396160A (zh) 2018-09-19 2021-09-14 国家医疗保健研究所 治疗对免疫检查点疗法具有抗性的癌症的方法和药物组合物
AU2019345151A1 (en) 2018-09-19 2021-04-29 Alpine Immune Sciences, Inc. Methods and uses of variant CD80 fusion proteins and related constructs
WO2020070053A1 (en) 2018-10-01 2020-04-09 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of inhibitors of stress granule formation for targeting the regulation of immune responses
WO2020120592A1 (en) 2018-12-12 2020-06-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for predicting and treating melanoma
US20220047556A1 (en) 2018-12-17 2022-02-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sulconazole as a furin inhibitor
CN113574386A (zh) 2019-01-03 2021-10-29 国家医疗保健研究所 用于增强癌症患者的cd8+t细胞依赖性免疫应答的方法和药物组合物
TW202102272A (zh) 2019-03-29 2021-01-16 美商樂天醫藥生技股份有限公司 光免疫療法之方法及相關之生物標記
WO2020201362A2 (en) 2019-04-02 2020-10-08 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods of predicting and preventing cancer in patients having premalignant lesions
EP3948800A4 (en) 2019-04-04 2023-05-10 Centerline Biomedical, Inc. SPACE TRACKING SYSTEM RECORDING WITH AUGMENTED REALITY DISPLAY
JP7440534B2 (ja) 2019-04-04 2024-02-28 センターライン バイオメディカル，インコーポレイテッド ２次元画像投影を用いた、トラッキングシステムと画像との空間レジストレーション
WO2020208060A1 (en) 2019-04-09 2020-10-15 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of sk2 inhibitors in combination with immune checkpoint blockade therapy for the treatment of cancer
CN114072676B (zh) 2019-06-03 2024-07-12 法国国家卫生及研究医学协会 调节治疗方案的方法
US20220229072A1 (en) 2019-06-04 2022-07-21 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Use of cd9 as a biomarker and as a biotarget in glomerulonephritis or glomerulosclerosis
WO2021074391A1 (en) 2019-10-17 2021-04-22 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for diagnosing nasal intestinal type adenocarcinomas
US20230076415A1 (en) 2020-01-17 2023-03-09 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for treating melanoma
US20230113705A1 (en) 2020-02-28 2023-04-13 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for diagnosing, prognosing and managing treatment of breast cancer
CN111089967B (zh) * 2020-03-25 2020-06-26 中南大学湘雅二医院 红斑狼疮分型的皮肤组织免疫细胞原位检测试剂盒的应用
JP2023531290A (ja) 2020-06-30 2023-07-21 アンスティチュ ナショナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシュ メディカル 術前補助療法及び根治手術後の固形がんを患っている患者の再発及び／又は死亡のリスクを予測するための方法
US20230235408A1 (en) 2020-06-30 2023-07-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the risk of recurrence and/or death of patients suffering from a solid cancer after preoperative adjuvant therapies
FR3116061A1 (fr) * 2020-11-06 2022-05-13 Commissariat A L'energie Atomique Et Aux Energies Alternatives Procédé de détection d’un évènement cellulaire
EP4291898A1 (en) 2021-02-12 2023-12-20 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Method for prognosis and treating a patient suffering from cancer
JP2024512567A (ja) 2021-03-23 2024-03-19 インサーム（インスティテュ ナシオナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシェ メディカル） Ｔ細胞リンパ腫の診断および治療方法
WO2022229136A1 (en) 2021-04-27 2022-11-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for predicting the risk of lymph node metastasis and/or recurrence of patients suffering from a t1 cancer treated by endoscopic resection
TWI793865B (zh) 2021-11-18 2023-02-21 倍利科技股份有限公司 Ai自動輔助標記之系統及方法
WO2023144235A1 (en) 2022-01-27 2023-08-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for monitoring and treating warburg effect in patients with pi3k-related disorders
WO2023144303A1 (en) 2022-01-31 2023-08-03 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Cd38 as a biomarker and biotarget in t-cell lymphomas
WO2023172883A1 (en) 2022-03-07 2023-09-14 Alpine Immune Sciences, Inc. Immunomodulatory proteins of variant cd80 polypeptides, cell therapies thereof and related methods and uses
AU2022447608A1 (en) 2022-03-17 2024-09-26 Assistance Publique - Hôpitaux De Paris Methods for predicting response to an immunotherapeutic treatment in a patient with a cancer
WO2023198648A1 (en) 2022-04-11 2023-10-19 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of t-cell malignancies
WO2023198874A1 (en) 2022-04-15 2023-10-19 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of t cell-lymphomas
WO2024003310A1 (en) 2022-06-30 2024-01-04 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods for the diagnosis and treatment of acute lymphoblastic leukemia
WO2024018046A1 (en) 2022-07-22 2024-01-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Garp as a biomarker and biotarget in t-cell malignancies
WO2024023283A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Lrrc33 as a biomarker and biotarget in cutaneous t-cell lymphomas
CN115541579B (zh) * 2022-10-09 2023-07-07 广州医科大学附属第一医院（广州呼吸中心） 非诊断和治疗目的的在肿瘤切片中Ki-67阳性肿瘤细胞比例的分析方法及装置
WO2024079192A1 (en) 2022-10-12 2024-04-18 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Cd81 as a biomarker and biotarget in t-cell malignancies
WO2024153636A1 (en) 2023-01-17 2024-07-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Vasorin as a biomarker and biotarget in nephrology
WO2024185434A1 (ja) * 2023-03-03 2024-09-12 ソニーグループ株式会社 情報処理装置、生体試料解析システム及び生体試料解析方法

Family Cites Families (238)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US1914322A (en) * 1929-01-22 1933-06-13 Everett H Bickley Device for the comparison of colors
US3958122A (en) * 1974-12-19 1976-05-18 United Technologies Corporation Exhaust gas analyzer having pressure and temperature compensation
DE3037622C2 (de) 1980-10-04 1987-02-26 Theodor Prof. Dr.-Ing. 1000 Berlin Gast Einrichtung zur Bestimmung der Oberflächengüte
US4480189A (en) 1981-11-20 1984-10-30 Kasei Optonix, Ltd. Thermoluminescence dosimeter reader
JPH0730753Y2 (ja) 1984-03-02 1995-07-19 日本ゼニスパイプ株式会社 プレキャストコンクリ−トケ−ソンブロック
US4557599A (en) 1984-03-06 1985-12-10 General Signal Corporation Calibration and alignment target plate
DE3429541C2 (de) * 1984-08-10 1992-10-22 Seidenberg, Jürgen, Dipl.-Ing., 5100 Aachen Verfahren zur gleichzeitigen Bestimmung der Wellenlänge und der Strahlungsleistung einer monochromatischen Lichtquelle
US4902131A (en) * 1985-03-28 1990-02-20 Kabushiki Kaisha Toshiba Surface inspection method and apparatus therefor
US5134662A (en) * 1985-11-04 1992-07-28 Cell Analysis Systems, Inc. Dual color camera microscope and methodology for cell staining and analysis
US4998284A (en) 1987-11-17 1991-03-05 Cell Analysis Systems, Inc. Dual color camera microscope and methodology for cell staining and analysis
JPH07119Y2 (ja) * 1988-03-18 1995-01-11 三和シヤッター工業株式会社 電動式昇降ベッド
EP0307483A4 (en) * 1987-03-30 1990-02-06 Anritsu Corp LIGHT SIGNAL GENERATOR AND CALIBRATION METHOD OF A LIGHT POWER MEASURING DEVICE WITH THIS LIGHT SIGNAL GENERATOR.
US4912034A (en) * 1987-09-21 1990-03-27 Biogenex Laboratories Immunoassay test device and method
US4892817A (en) * 1987-09-21 1990-01-09 Biogenex Laboratories Stable phosphatase substrate composition
US5015098A (en) * 1987-10-05 1991-05-14 X-Rite, Incorporated Densitometer with error correction
JPH0663758B2 (ja) * 1987-10-14 1994-08-22 株式会社東芝 パターンの測定方法
DE3800427C2 (de) * 1988-01-09 1997-05-28 Breitmeier Ulrich Gerät zum Ermitteln des Abstands eines auf einer Prüffläche liegenden Prüfpunktes von einer Referenzfläche
JPH06103251B2 (ja) 1989-03-06 1994-12-14 株式会社ニレコ 画像解析による組織定量方法
US5068909A (en) 1989-05-18 1991-11-26 Applied Imaging Corporation Method and apparatus for generating quantifiable video displays
US5070455A (en) 1989-11-22 1991-12-03 Singer Imaging, Inc. Imaging system and method using scattered and diffused radiation
US5115673A (en) * 1990-07-20 1992-05-26 The United States Of America As Represented By The United States National Aeronautics And Space Administration Non-destructive method for determining elastic moduli of material
US5244787A (en) 1991-01-31 1993-09-14 Biogenex Laboratories Antigen retrieval in formalin-fixed tissues using microwave energy
US6411377B1 (en) 1991-04-02 2002-06-25 Hitachi, Ltd. Optical apparatus for defect and particle size inspection
JP2907571B2 (ja) 1991-04-15 1999-06-21 浜松ホトニクス株式会社 レーザ走査型蛍光顕微鏡
US5126577A (en) * 1991-06-27 1992-06-30 Electro-Optical Industries, Inc. Infrared target plate handling apparatus with improved thermal control
KR960002145B1 (ko) * 1991-07-30 1996-02-13 가부시기가이샤 히다찌세이사구쇼 박막트랜지스터 액정기판의 검사방법 및 그 장치
CA2084099C (en) 1991-12-06 1996-06-18 James V. Bacus Method and apparatus for automated cell analysis
US5578452A (en) 1992-01-16 1996-11-26 Biogenex Laboratories Enhancement of immunochemical staining in aldehyde-fixed tissues
US5254845A (en) 1992-08-18 1993-10-19 Applied Imaging International Limited Automatic focusing system using focal length-changing element
US5889881A (en) 1992-10-14 1999-03-30 Oncometrics Imaging Corp. Method and apparatus for automatically detecting malignancy-associated changes
US6026174A (en) * 1992-10-14 2000-02-15 Accumed International, Inc. System and method for automatically detecting malignant cells and cells having malignancy-associated changes
US6252242B1 (en) 1992-12-03 2001-06-26 Brown & Sharpe Surface Inspection Systems, Inc. High speed optical inspection apparatus using Gaussian distribution analysis and method therefore
US5427910A (en) * 1992-12-09 1995-06-27 Compucyte Corporation Method of cytogenetic analysis
US5517193A (en) * 1993-04-30 1996-05-14 International Business Machines Corporation Meteorological workstation
US5587833A (en) * 1993-07-09 1996-12-24 Compucyte Corporation Computerized microscope specimen encoder
US5492837A (en) * 1993-08-27 1996-02-20 Biogenex Laboratories Mounting medium for microscope slide preparations
US5439649A (en) 1993-09-29 1995-08-08 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
US6136540A (en) * 1994-10-03 2000-10-24 Ikonisys Inc. Automated fluorescence in situ hybridization detection of genetic abnormalities
US6309601B1 (en) 1993-11-01 2001-10-30 Nanogen, Inc. Scanning optical detection system
US5432054A (en) 1994-01-31 1995-07-11 Applied Imaging Method for separating rare cells from a population of cells
US5422018A (en) * 1994-01-31 1995-06-06 Applied Imaging Centrifuge tube and adaptor
US5489386A (en) * 1994-01-31 1996-02-06 Applied Imaging Density gradient medium for the separation of cells
US6451551B1 (en) 1994-03-11 2002-09-17 Biogenex Laboratories Releasing embedding media from tissue specimens
US6632598B1 (en) 1994-03-11 2003-10-14 Biogenex Laboratories Deparaffinization compositions and methods for their use
US5561556A (en) 1994-04-21 1996-10-01 Compucyte Corporation Slide analysis system with slide having self contained microscope analysis information
US6463438B1 (en) 1994-06-03 2002-10-08 Urocor, Inc. Neural network for cell image analysis for identification of abnormal cells
US5672881A (en) 1994-09-14 1997-09-30 Glyko, Inc. Charge-coupled device imaging apparatus
US5978497A (en) 1994-09-20 1999-11-02 Neopath, Inc. Apparatus for the identification of free-lying cells
WO1996009604A1 (en) 1994-09-20 1996-03-28 Neopath, Inc. Apparatus for automated identification of cell groupings on a biological specimen
DE19532897A1 (de) 1994-09-27 1996-03-28 Zeiss Carl Fa Verfahren zur Belichtungssteuerung bei Mikroskopkameras und entsprechendes Photomikroskop
US5633945A (en) * 1994-10-05 1997-05-27 Compucyte Corporation Accuracy in cell mitosis analysis
US5523207A (en) * 1994-10-17 1996-06-04 Compucyte Corporation Method for accurate counting of probe spots in cell nuclei
GB2294376B (en) 1994-10-18 1999-02-10 Rank Cintel Ltd Method and apparatus for correcting noise in a film scanner
EP0720114B1 (en) 1994-12-28 2001-01-24 Siemens Corporate Research, Inc. Method and apparatus for detecting and interpreting textual captions in digital video signals
ATE211506T1 (de) 1995-01-31 2002-01-15 Bioimage As Ein verfahren zum nachweis biologisch aktiver substanzen
US5694212A (en) 1995-06-20 1997-12-02 Compucyte Corporation Method for calibrating specimen with specimen holder of a microscope
US5717198A (en) * 1995-07-10 1998-02-10 Qc Optics, Inc. Pellicle reflectivity monitoring system having means for compensating for portions of light reflected by the pellicle
CA2185511C (en) 1995-09-15 2008-08-05 Vladimir Dadeshidze Cytological specimen analysis system with individualized patient data
EP0860695B1 (en) * 1995-10-30 2006-01-04 Arkray, Inc. Method for measuring an analyte and corresponding device
US6418236B1 (en) 1999-06-24 2002-07-09 Chromavision Medical Systems, Inc. Histological reconstruction and automated image analysis
US6330349B1 (en) 1995-11-30 2001-12-11 Chromavision Medical Systems, Inc. Automated method for image analysis of residual protein
JP2000501184A (ja) * 1995-11-30 2000-02-02 クロマビジョン メディカル システムズ，インコーポレイテッド 生体標本の自動画像分析の方法および装置
US6718053B1 (en) * 1996-11-27 2004-04-06 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for automated image analysis of biological specimens
US6151405A (en) 1996-11-27 2000-11-21 Chromavision Medical Systems, Inc. System and method for cellular specimen grading
US6239868B1 (en) * 1996-01-02 2001-05-29 Lj Laboratories, L.L.C. Apparatus and method for measuring optical characteristics of an object
US6882873B2 (en) * 1996-01-17 2005-04-19 Respironics, Inc. Method and system for determining bilirubin concentration
US6165739A (en) 1996-03-13 2000-12-26 Compucyte Corporation Multiple simultaneous testing media
DE69725611T2 (de) 1996-05-15 2004-07-29 Biogenex Laboratories, San Ramon Nicht-Nukleotid verknüpfende Reagentien
US6292582B1 (en) 1996-05-31 2001-09-18 Lin Youling Method and system for identifying defects in a semiconductor
US6458585B1 (en) 1996-08-14 2002-10-01 Nexell Therapeutics Inc. Cytokine-free culture of dendritic cells
JP3837165B2 (ja) 1996-08-16 2006-10-25 アマーシャム バイオサイエンセズ ナイアガラ，インク． ウェルプレート、ゲル及びブロットにおける検査用のディジタルイメージングシステム
US6031930A (en) * 1996-08-23 2000-02-29 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for testing a progression of neoplasia including cancer chemoprevention testing
US6396941B1 (en) * 1996-08-23 2002-05-28 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for internet, intranet, and local viewing of virtual microscope slides
US6404906B2 (en) 1997-03-03 2002-06-11 Bacus Research Laboratories,Inc. Method and apparatus for acquiring and reconstructing magnified specimen images from a computer-controlled microscope
US6272235B1 (en) 1997-03-03 2001-08-07 Bacus Research Laboratories, Inc. Method and apparatus for creating a virtual microscope slide
US5731156A (en) * 1996-10-21 1998-03-24 Applied Imaging, Inc. Use of anti-embryonic hemoglobin antibodies to identify fetal cells
WO1998017992A2 (en) * 1996-10-25 1998-04-30 Applied Imaging, Inc. Multifluor-fluorescence in situ hybridization (m-fish) imaging techniques using multiple multiband filters with image registration
US5880473A (en) * 1997-07-28 1999-03-09 Applied Imaging, Inc. Multifluor-fluorescence in-situ hybridization (M-FISH) imaging techniques using multiple multiband filters with image registration
US5916750A (en) * 1997-01-08 1999-06-29 Biogenex Laboratories Multifunctional linking reagents for synthesis of branched oligomers
US6087134A (en) 1997-01-14 2000-07-11 Applied Imaging Corporation Method for analyzing DNA from a rare cell in a cell population
US5885840A (en) * 1997-02-10 1999-03-23 Compucyte Corp. Multiple assays of cell specimens
GB9704054D0 (en) 1997-02-27 1997-04-16 Univ Cambridge Tech Assay
US5948359A (en) 1997-03-21 1999-09-07 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
DE69816289T2 (de) 1997-04-25 2004-04-22 Universiteit Van Amsterdam Photobleichbare lumineszenzschichten zur kalibrierung und standardisierung in optischer mikroskopie
US6259807B1 (en) 1997-05-14 2001-07-10 Applied Imaging Corp. Identification of objects of interest using multiple illumination schemes and finding overlap of features in corresponding multiple images
US6169816B1 (en) * 1997-05-14 2001-01-02 Applied Imaging, Inc. Identification of objects of interest using multiple illumination schemes and finding overlap of features in corresponding multiple images
US6052190A (en) * 1997-09-09 2000-04-18 Utoptics, Inc. Highly accurate three-dimensional surface digitizing system and methods
US6002788A (en) 1997-09-24 1999-12-14 Compucyte Corporation Method and device for rendering cells observable with laser scanning cytometry
US5962234A (en) 1997-10-20 1999-10-05 Applied Imaging Corporation Use of anti-embryonic epsilon hemoglobin antibodies to identify fetal cells
DE19754909C2 (de) 1997-12-10 2001-06-28 Max Planck Gesellschaft Verfahren und Vorrichtung zur Erfassung und Bearbeitung von Abbildungen biologischen Gewebes
JPH11183381A (ja) 1997-12-22 1999-07-09 Bunshi Bio Photonics Kenkyusho:Kk 蛍光顕微鏡評価方法および装置
US6746873B1 (en) 1998-02-20 2004-06-08 Xy, Inc. Vibratory system for a sorting flow cytometer
US6699710B1 (en) 1998-02-25 2004-03-02 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Tumor tissue microarrays for rapid molecular profiling
US6248590B1 (en) 1998-02-27 2001-06-19 Cytomation, Inc. Method and apparatus for flow cytometry
US6495106B1 (en) 1998-03-24 2002-12-17 Biogenex Laboratories Automated staining apparatus
US6606413B1 (en) * 1998-06-01 2003-08-12 Trestle Acquisition Corp. Compression packaged image transmission for telemicroscopy
US6049220A (en) * 1998-06-10 2000-04-11 Boxer Cross Incorporated Apparatus and method for evaluating a wafer of semiconductor material
CA2338675A1 (en) * 1998-07-27 2000-02-10 Cedars-Sinai Medical Center Spectral topography of mammalian matter
WO2000011208A1 (en) 1998-08-25 2000-03-02 University Of Washington Rapid quantitative analysis of proteins or protein function in complex mixtures
DE19915057A1 (de) 1999-04-01 2000-10-19 Forschungszentrum Borstel Monoklonale Antikörper gegen das humane Mcm3 Protein, Verfahren zu ihrer Herstellung und ihre Verwendung
WO2000062247A1 (en) 1999-04-13 2000-10-19 Chromavision Medical Systems, Inc. Histological reconstruction and automated image analysis
US6486915B2 (en) 1999-04-20 2002-11-26 Intel Corporation Determining a final exposure setting automatically for a solid state camera without a separate light metering circuit
US7151847B2 (en) 2001-02-20 2006-12-19 Cytokinetics, Inc. Image analysis of the golgi complex
US6876760B1 (en) * 2000-12-04 2005-04-05 Cytokinetics, Inc. Classifying cells based on information contained in cell images
AU5875900A (en) 1999-06-18 2001-01-09 Genomic Solutions, Inc. An automated, ccd-based microarray imaging system
AU5606500A (en) * 1999-06-18 2001-01-09 Applied Imaging Corporation High efficiency methods for combined immunocytochemistry and in-situ hybridization
US6453060B1 (en) 1999-06-29 2002-09-17 Tri Path Imaging, Inc. Method and apparatus for deriving separate images from multiple chromogens in a branched image analysis system
WO2001015452A1 (en) * 1999-07-13 2001-03-01 Chromavision Medical Systems, Inc. Device for applying accurate color thresholds in real time
EP1218849A1 (en) 1999-07-13 2002-07-03 Chromavision Medical Systems, Inc. Apparatus for counting color transitions and areas in real time camera images
WO2001011547A1 (en) 1999-08-04 2001-02-15 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for applying color thresholds in light microscopy
DK1232392T3 (da) 1999-10-12 2003-07-28 Connex Ges Zur Optimierung Von Forbedret fremgangsmåde til påvisning af syreresistente bakterier af slægten Helicobacter i afføring
US7024316B1 (en) * 1999-10-21 2006-04-04 Dakocytomation Colorado, Inc. Transiently dynamic flow cytometer analysis system
US6852986B1 (en) * 1999-11-12 2005-02-08 E. I. Du Pont De Nemours And Company Fluorometer with low heat-generating light source
JP2001211896A (ja) 1999-11-26 2001-08-07 Olympus Optical Co Ltd 画像解析方法、装置、及び記録媒体
GB0001568D0 (en) * 2000-01-24 2000-03-15 Isis Innovation Method and apparatus for measuring surface configuration
US20050230315A1 (en) 2003-01-13 2005-10-20 Regents Of The University Of Michigan Protein microarray system
US6778714B1 (en) 2000-03-10 2004-08-17 Imagexpert, Inc. Portable image analysis system
US6408048B2 (en) 2000-03-14 2002-06-18 Therma-Wave, Inc. Apparatus for analyzing samples using combined thermal wave and X-ray reflectance measurements
US7236623B2 (en) 2000-04-24 2007-06-26 International Remote Imaging Systems, Inc. Analyte recognition for urinalysis diagnostic system
US6518554B1 (en) * 2000-05-24 2003-02-11 Chromavision Medical Systems, Inc. Reverse focusing methods and systems
US6522744B1 (en) * 2000-05-31 2003-02-18 Jung-Hsun Chiang Volume control apparatus of telephone
IL136884A0 (en) * 2000-06-19 2001-06-14 Yissum Res Dev Co A system for cancer detection and typing and for grading of malignancy
AU2001277964A1 (en) * 2000-07-21 2002-02-05 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Method and apparatus for image mosaicing
US6816625B2 (en) 2000-08-16 2004-11-09 Lewis Jr Clarence A Distortion free image capture system and method
US6674058B1 (en) * 2000-09-20 2004-01-06 Compucyte Corporation Apparatus and method for focusing a laser scanning cytometer
US7262799B2 (en) * 2000-10-25 2007-08-28 Canon Kabushiki Kaisha Image sensing apparatus and its control method, control program, and storage medium
US7298402B2 (en) 2000-10-26 2007-11-20 Olympus Corporation Image-pickup apparatus with expanded dynamic range capabilities
US7714301B2 (en) 2000-10-27 2010-05-11 Molecular Devices, Inc. Instrument excitation source and calibration method
GB2406908B (en) 2000-12-04 2005-07-27 Cytokinetics Inc Classifying cells based on information contained in cell images
US20030215936A1 (en) 2000-12-13 2003-11-20 Olli Kallioniemi High-throughput tissue microarray technology and applications
US6466690C1 (en) 2000-12-19 2008-11-18 Bacus Res Lab Inc Method and apparatus for processing an image of a tissue sample microarray
JP3576523B2 (ja) 2000-12-26 2004-10-13 オリンパス株式会社 蛍光輝度測定方法及び装置
US8009206B2 (en) 2001-01-11 2011-08-30 Melexis Tessenderlo Nv Adaptive sensitivity control, on a pixel-by-pixel basis, for a digital imager
US6993169B2 (en) * 2001-01-11 2006-01-31 Trestle Corporation System and method for finding regions of interest for microscopic digital montage imaging
DE10109130B4 (de) 2001-02-24 2015-02-19 Carl Zeiss Microscopy Gmbh Verfahren zur Aufzeichnung und Darstellung von Fluoreszenzbildern mit hoher räumlicher Auflösung
US7146062B2 (en) 2001-03-08 2006-12-05 Clarient, Inc. Apparatus and method for labeling rows and columns in an irregular array
JP2002287039A (ja) * 2001-03-22 2002-10-03 Olympus Optical Co Ltd 顕微鏡用撮影装置
DE10119005A1 (de) 2001-04-18 2002-10-24 Roche Diagnostics Gmbh Verfahren zur Proteinexpression ausgehend von stabilisierter linearer kurzer DNA in zellfreien in vitro-Transkription/Translations-Systemen mit Exonuklease-haltigen Lysaten oder in einem zellulären System enthaltend Exonukleasen
US7219016B2 (en) * 2001-04-20 2007-05-15 Yale University Systems and methods for automated analysis of cells and tissues
US7123756B2 (en) 2001-04-27 2006-10-17 Fuji Photo Film Co., Ltd. Method and apparatus for standardized fluorescence image generation
DE10121064A1 (de) * 2001-04-28 2002-10-31 Evotec Ag Vorrichtung und Verfahren zur optischen Messung von chemischen und/oder biologischen Proben
CA2469843A1 (en) 2001-06-04 2002-12-12 Ikonisys Inc. Method for detecting infectious agents using computer controlled automated image analysis
CA2445991A1 (en) 2001-06-05 2002-12-12 Genomics, Ltd. Compositions and methods for the detection of biomarkers associated with cardiovascular disease
US7133543B2 (en) 2001-06-12 2006-11-07 Applied Imaging Corporation Automated scanning method for pathology samples
US7116354B2 (en) 2001-06-20 2006-10-03 Xenogen Corporation Absolute intensity determination for a light source in low level light imaging systems
JP3788279B2 (ja) 2001-07-09 2006-06-21 株式会社日立製作所 パターン検査方法及び装置
WO2003008963A1 (en) 2001-07-18 2003-01-30 University Of Louisville Research Foundation, Inc. E-genechip online web service for data mining bioinformatics
US7332290B2 (en) * 2001-08-02 2008-02-19 The Regents Of The University Of Michigan Dectection of AMACR cancer markers in urine
US7229774B2 (en) 2001-08-02 2007-06-12 Regents Of The University Of Michigan Expression profile of prostate cancer
US6648506B2 (en) 2001-09-07 2003-11-18 Board Of Trustees Of Michigan State University Fluorescence emission ratio imaging thermography for use in heat transfer analysis
US6697509B2 (en) * 2001-10-04 2004-02-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Method and apparatus for scoring the uptake of markers in cells
GB0130845D0 (en) 2001-12-22 2002-02-06 James Peter Analysis
US7383134B2 (en) 2002-01-15 2008-06-03 Piper James R Method and/or system for analyzing biological samples using a computer system
WO2003097850A1 (en) 2002-01-18 2003-11-27 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services National Institutes Of Health Simulating microarrays using a parameterized model
US6780377B2 (en) * 2002-01-22 2004-08-24 Dakocytomation Denmark A/S Environmental containment system for a flow cytometer
US7205154B2 (en) * 2002-01-31 2007-04-17 Agilent Technologies, Inc. Calibrating array scanners
US20030165263A1 (en) 2002-02-19 2003-09-04 Hamer Michael J. Histological assessment
JP2003284713A (ja) 2002-03-28 2003-10-07 Konica Corp 医用画像処理装置、画像処理パラメータの補正方法、プログラム、記憶媒体
JP2003294734A (ja) 2002-03-29 2003-10-15 Mitsubishi Chemicals Corp 分子間の相互作用の分析方法
WO2003088123A1 (de) * 2002-04-16 2003-10-23 Evotec Oai Ag Verfahren zur untersuchung chemischer und/oder biologischer proben mittels partikelbildern
DE60323625D1 (de) * 2002-05-03 2008-10-30 Vialogy Llc Verfahren zur charakterisierung der ausgangssignale eines microarrays
AU2003225508A1 (en) 2002-05-17 2003-12-02 Pfizer Products Inc. Apparatus and method for statistical image analysis
US20040027618A1 (en) * 2002-06-03 2004-02-12 Fuji Photo Film Co., Ltd. Image defect detecting method
US20050037406A1 (en) * 2002-06-12 2005-02-17 De La Torre-Bueno Jose Methods and apparatus for analysis of a biological specimen
US7272252B2 (en) 2002-06-12 2007-09-18 Clarient, Inc. Automated system for combining bright field and fluorescent microscopy
WO2003106157A2 (en) 2002-06-14 2003-12-24 Chromavision Medical Systems, Inc. Automated slide staining apparatus
US20060127946A1 (en) 2002-08-16 2006-06-15 Montagu Jean I Reading of fluorescent arrays
AU2003270687B2 (en) 2002-09-13 2008-05-08 Life Technologies Corporation Interactive and automated tissue image analysis with global training database and variable-abstraction processing in cytological specimen classification and laser capture microdissection applications
US7173663B2 (en) * 2002-10-31 2007-02-06 Freescale Semiconductor, Inc. Automatic exposure control system for a digital camera
JP2004157018A (ja) 2002-11-06 2004-06-03 Dkk Toa Corp 蛍光検出装置の感度校正方法及び蛍光検出装置
GB2395263A (en) 2002-11-12 2004-05-19 Qinetiq Ltd Image analysis
GB2396406A (en) 2002-12-17 2004-06-23 Qinetiq Ltd Image analysis
US7648678B2 (en) 2002-12-20 2010-01-19 Dako Denmark A/S Method and system for pretreatment of tissue slides
JP4389445B2 (ja) 2003-01-10 2009-12-24 株式会社ニコン レーザ顕微鏡
US7062079B2 (en) 2003-02-14 2006-06-13 Ikonisys, Inc. Method and system for image segmentation
US7233340B2 (en) 2003-02-27 2007-06-19 Applied Imaging Corp. Linking of images to enable simultaneous viewing of multiple objects
US7064829B2 (en) 2003-03-20 2006-06-20 Timbre Technologies, Inc. Generic interface for an optical metrology system
US7369696B2 (en) * 2003-04-02 2008-05-06 Ge Healthcare Uk Limited Classification of cells into subpopulations using cell classifying data
US7171054B2 (en) * 2003-05-01 2007-01-30 Eastman Kodak Company Scene-based method for determining focus
US7084386B2 (en) 2003-05-02 2006-08-01 International Business Machines Corporation System and method for light source calibration
JP2004354346A (ja) 2003-05-30 2004-12-16 Olympus Corp 測定装置
FI116246B (fi) * 2003-06-30 2005-10-14 Nokia Corp Menetelmä ja järjestelmä digitaalisessa kuvannuksessa valotuksen säätämiseksi ja vastaava laite
JP4504644B2 (ja) 2003-08-26 2010-07-14 オリンパス株式会社 顕微鏡像撮像装置及び顕微鏡像撮像方法
US20050136549A1 (en) 2003-10-30 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for automatically determining diagnostic saliency of digital images
US20050136509A1 (en) 2003-09-10 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for quantitatively analyzing biological samples
US8068988B2 (en) * 2003-09-08 2011-11-29 Ventana Medical Systems, Inc. Method for automated processing of digital images of tissue micro-arrays (TMA)
US7760927B2 (en) 2003-09-10 2010-07-20 Bioimagene, Inc. Method and system for digital image based tissue independent simultaneous nucleus cytoplasm and membrane quantitation
US7316907B2 (en) * 2003-09-10 2008-01-08 Board Of Regents, The University Of Texas System 14-3-3 zeta over-expression as a poor prognosis factor, and a therapeutic target in multiple cancer types
DE10343375A1 (de) 2003-09-17 2005-04-28 Axaron Bioscience Ag Verfahren zur Detektion und Analyse von Protein-Protein-Interaktionen
US20050106712A1 (en) * 2003-11-14 2005-05-19 Eastman Kodak Company Yellow low fluorescence dye for coated optical bead random array DNA analysis
US20050282179A1 (en) * 2003-12-05 2005-12-22 Applera Corporation Biomarkers for interferon-alpha response in hepatitis C virus infected patients
JP2005181244A (ja) * 2003-12-24 2005-07-07 Yokogawa Electric Corp 光量分布補正方法およびバイオチップ読取装置
WO2005076197A2 (en) 2004-01-31 2005-08-18 Bioimagene, Inc. Method and system for morphology based mitosis identification and classification of digital images
WO2005076216A2 (en) 2004-02-03 2005-08-18 Bioimagene, Inc. Method and system for automaticed digital image based flourescent in situ hybridization (fish) analysis
WO2005077263A2 (en) 2004-02-06 2005-08-25 Wake Forest University Health Services Non-invasive imaging for determining global tissue characteristics
JP4338551B2 (ja) 2004-03-04 2009-10-07 富士フイルム株式会社 画像再生方法、画像再生装置及び画像再生プログラム
WO2005096225A1 (en) 2004-03-27 2005-10-13 Bioimagene, Inc. Method and system for automated detection of immunohistochemical (ihc) patterns
US7330250B2 (en) * 2004-05-18 2008-02-12 Agilent Technologies, Inc. Nondestructive evaluation of subsurface damage in optical elements
JP2005331394A (ja) 2004-05-20 2005-12-02 Olympus Corp 画像処理装置
WO2005114578A1 (en) 2004-05-21 2005-12-01 Bioimagene, Inc. Method and system for automated quantitation of tissue micro-array (tma) digital image analysis
JP2008509400A (ja) 2004-08-06 2008-03-27 コンピュサイト コーポレイション 染色サンプルにおける光吸収のカラー表示型単色光吸収定量法
CA2580795A1 (en) * 2004-09-22 2006-04-06 Tripath Imaging, Inc. Methods and compositions for evaluating breast cancer prognosis
WO2006039396A2 (en) 2004-10-01 2006-04-13 Ambion, Inc. Non-embedded tissue microarray technology for protein and nucleic acid analyses
CA2587765A1 (en) 2004-11-17 2006-05-26 Immunivest Corporation Magnetic enrichment of circulating cells, fragments and debris for enabling hts proteomics and genomics in disease detection
US20060160169A1 (en) 2004-12-03 2006-07-20 Board Of Regents, The University Of Texas System Cell microarray for profiling of cellular phenotypes and gene function
JP2006194711A (ja) 2005-01-13 2006-07-27 Matsushita Electric Ind Co Ltd 蛍光発光色素の性能評価方法および性能評価装置
JP4982385B2 (ja) 2005-02-01 2012-07-25 アムニス コーポレイション イメージングフローサイトメータを使用した血液及び細胞の分析
GB0503087D0 (en) 2005-02-15 2005-03-23 Medical Solutions Plc Apparatus and method for processing of specimen images for use in computer analysis thereof
WO2007024264A2 (en) 2005-02-23 2007-03-01 Bioimagene, Inc. Method and system for digital image based tissue independent simultaneous nucleus, cytoplasm and membrane quantitation
WO2006102233A2 (en) 2005-03-18 2006-09-28 Immunivest Corporation Method and apparatus for imaging target components in a biological sample using permanent magnets
WO2006113747A2 (en) 2005-04-19 2006-10-26 Prediction Sciences Llc Diagnostic markers of breast cancer treatment and progression and methods of use thereof
BRPI0501535B8 (pt) 2005-04-26 2021-07-27 Mario Augusto Pazoti método de identificação do guignardia citricarpa
WO2006122251A2 (en) 2005-05-10 2006-11-16 Bioimagene, Inc. Method and system for automated digital image analysis of prostrate neoplasms using morphologic patterns
WO2006133325A2 (en) 2005-06-08 2006-12-14 Vanderbilt University Analysis of tissue samples surrounding malignancies
WO2006133460A2 (en) 2005-06-09 2006-12-14 Yale University Methods for diagnosing and treating breast cancer based on a her/er ratio
US7557963B2 (en) 2005-08-12 2009-07-07 Seiko Epson Corporation Label aided copy enhancement
GB2430026A (en) 2005-09-09 2007-03-14 Qinetiq Ltd Automated selection of image regions
ES2434491T3 (es) 2005-10-13 2013-12-16 Funda��O D. Anna Sommer Champalimaud E Dr. Carlos Montez Champalimaud An�lisis inmunohistoqu�mico multiplex in situ
JP4863692B2 (ja) * 2005-11-02 2012-01-25 株式会社島津製作所 イメージ質量分析装置
US7199360B1 (en) * 2006-01-13 2007-04-03 Jean Montagu System and method for calibrating a fluorescence microscope
DE602007009645D1 (de) 2006-02-16 2010-11-18 Ventana Med Syst Inc Reagenzien und verfahren für krebsprognose und pathologische einstufung
EP1989216A4 (en) * 2006-03-01 2010-03-31 Univ Michigan DIAGNOSIS AND TREATMENT OF PROSTATE CANCER
JP4748719B2 (ja) 2006-03-02 2011-08-17 国立大学法人大阪大学 生細胞内の特定タンパク質の定量方法および標準蛍光マイクロビーズの作製方法
JP2007271484A (ja) 2006-03-31 2007-10-18 Toyobo Co Ltd 細胞成分分析装置の感度を向上する方法
JP4864519B2 (ja) 2006-04-11 2012-02-01 浜松ホトニクス株式会社 光測定装置、光測定方法、及び光測定プログラム
CA2652027C (en) 2006-05-12 2017-06-06 Immunivest Corporation A laser illumination system in fluorescent microscopy
CA2657324A1 (en) * 2006-07-13 2008-01-17 Yale University Methods for making cancer prognoses based on subcellular localization of biomarkers
AU2007278128B2 (en) 2006-07-25 2013-07-18 The Procter & Gamble Company Methods and products for analyzing gingival tissues
RU2446796C2 (ru) 2006-12-26 2012-04-10 Фармасайкликс, Инк. Способ использования ингибиторов гистондеацетилазы и мониторинга биомаркеров в комбинированной терапии
WO2008143849A2 (en) * 2007-05-14 2008-11-27 Historx, Inc. Compartment segregation by pixel characterization using image data clustering
WO2008156669A1 (en) * 2007-06-15 2008-12-24 Historx, Inc. Method and system for standardizing microscope instruments
US7873215B2 (en) * 2007-06-27 2011-01-18 Seiko Epson Corporation Precise identification of text pixels from scanned document images
CA2604317C (en) 2007-08-06 2017-02-28 Historx, Inc. Methods and system for validating sample images for quantitative immunoassays
CA2596204C (en) * 2007-08-07 2019-02-26 Historx, Inc. Method and system for determining an optimal dilution of a reagent
WO2009020621A1 (en) 2007-08-07 2009-02-12 Historx, Inc. Method and system for determining an optimal dilution of a reagent
WO2009029810A1 (en) 2007-08-31 2009-03-05 Historx, Inc. Automatic exposure time selection for imaging tissue
TWI335252B (en) 2007-11-30 2011-01-01 Ind Tech Res Inst Calibration strip and the laser calibration system using thereof
EP2335221B8 (en) 2008-09-16 2016-05-25 Novartis AG Reproducible quantification of biomarker expression

Also Published As

Publication number Publication date
JP5551702B2 (ja) 2014-07-16
AU2009293380A1 (en) 2010-03-25
WO2010033508A1 (en) 2010-03-25
US9240043B2 (en) 2016-01-19
CA2737116A1 (en) 2010-03-25
EP2335221B1 (en) 2016-03-23
AU2009293380B2 (en) 2016-05-19
CA2737116C (en) 2019-01-15
EP2335221B8 (en) 2016-05-25
US20100136549A1 (en) 2010-06-03
EP2335221A1 (en) 2011-06-22
CN102165489B (zh) 2015-11-25
JP2012503180A (ja) 2012-02-02
CN102165489A (zh) 2011-08-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2573945T3 (es) Cuantificación reproducible de expresión de biomarcadores
Aeffner et al. The gold standard paradox in digital image analysis: manual versus automated scoring as ground truth
ES2639559T3 (es) Análisis de imágenes para el pronóstico de cáncer de mama
Ivashkevich et al. γH2AX foci as a measure of DNA damage: a computational approach to automatic analysis
JP6031513B2 (ja) 網赤血球の同定および測定
ES2902879T3 (es) Método de cuantificación de células inmunitarias en tejidos tumorales y sus aplicaciones
Fenech et al. HUMN project initiative and review of validation, quality control and prospects for further development of automated micronucleus assays using image cytometry systems
CN103907023B (zh) 检测生物学样品中的异常的系统和方法
ES2267825T3 (es) Metodo y sistema para analizar celulas.
ES2804770T3 (es) Análisis de vasos en imágenes multiplexadas
JP2011515683A (ja) 血小板を個々に、及び凝集塊として検出及び計数するための方法及び装置
Krecsák et al. Technical note on the validation of a semi-automated image analysis software application for estrogen and progesterone receptor detection in breast cancer
US11988658B2 (en) Methods of assessing cellular breast samples and compositions for use in practicing the same
Iwabuchi et al. Evaluation of the effectiveness of Gaussian filtering in distinguishing punctate synaptic signals from background noise during image analysis
US20180328848A1 (en) Cell detection, capture, analysis, aggregation, and output methods and apparatus
WO2017171720A1 (en) Digital image analysis of inflammatory cells and mediators of inflammation
Keshtgar et al. Optical scanning for rapid intraoperative diagnosis of sentinel node metastases in breast cancer
WO2023008369A1 (ja) 細胞自家蛍光の画像を用いて細胞を分類する方法及び解析装置
Maiques et al. Recent advances in tissue imaging for cancer research
US20190256885A1 (en) Cell measurement method
Sethi et al. Patient and tumor factors at diagnosis in a multi‐ethnic primary head and neck squamous cell carcinoma cohort
KR20150023808A (ko) 조직 절편 내 단일 세포에서의 마커 정량
Laokulrath et al. Invasive breast cancer reporting guidelines: ICCR, CAP, RCPath, RCPA datasets and future directions
Wang et al. Laboratory validation studies in Ki-67 digital image analysis of breast carcinoma: a pathway to routine quality assurance
JP2023534252A (ja) 細胞の診断および分析方法