RU2017113727A - Праймеры и зонды для полимеразной цепной реакции для обнаружения mycobacterium tuberculosis - Google Patents

Праймеры и зонды для полимеразной цепной реакции для обнаружения mycobacterium tuberculosis Download PDF

Info

Publication number
RU2017113727A
RU2017113727A RU2017113727A RU2017113727A RU2017113727A RU 2017113727 A RU2017113727 A RU 2017113727A RU 2017113727 A RU2017113727 A RU 2017113727A RU 2017113727 A RU2017113727 A RU 2017113727A RU 2017113727 A RU2017113727 A RU 2017113727A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
gene
primers
sequence
pair
promoter
Prior art date
Application number
RU2017113727A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2717655C2 (ru
RU2017113727A3 (ru
Inventor
Дэвид АЛЛАНД
Сумитеш ЧАКРАВОРТИ
Original Assignee
Рутгерс, Зе Стейт Юниверсити Оф Нью-Джерси
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Рутгерс, Зе Стейт Юниверсити Оф Нью-Джерси filed Critical Рутгерс, Зе Стейт Юниверсити Оф Нью-Джерси
Publication of RU2017113727A publication Critical patent/RU2017113727A/ru
Publication of RU2017113727A3 publication Critical patent/RU2017113727A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2717655C2 publication Critical patent/RU2717655C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6865—Promoter-based amplification, e.g. nucleic acid sequence amplification [NASBA], self-sustained sequence replication [3SR] or transcription-based amplification system [TAS]
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
    • C12Q2525/10—Modifications characterised by
    • C12Q2525/143—Modifications characterised by incorporating a promoter sequence
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
    • C12Q2525/10—Modifications characterised by
    • C12Q2525/185—Modifications characterised by incorporating bases where the precise position of the bases in the nucleic acid string is important
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (44)

1. Набор олигонуклеотидов для амплификации фрагмента области М. tuberculosis, выбранной из группы, состоящей из гена rpoB, гена gyrA, гена gyrB, промотора inhA, гена rrs, промотора eis, гена embB, гена katG, гена dosR, гена IS6110, гена IS1081, содержащий пару из прямого и обратного праймеров, специфичных по отношению к указанному фрагменту, причем каждый праймер обладает последовательностью, которая по существу идентична последовательности олигонуклеотида, выбранного из олигонуклеотидов, перечисленных в Таблицах 1А и 1В.
2. Олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что его последовательность идентична указанной последовательности олигонуклеотида, выбранного из олигонуклеотидов, перечисленных в Таблицах 1А и 1В.
3. Выделенная нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, которая по существу идентична последовательности, выбранной из последовательностей, перечисленных в Таблице 2.
4. Нуклеиновая кислота по п. 3, содержащая последовательность, выбранную из последовательностей, перечисленных в Таблице 2.
5. Нуклеиновая кислота по п. 3 или 4, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота является меченой.
6. Нуклеиновая кислота по п. 5, отличающаяся тем, что указанная нуклеиновая кислота мечена флуорофором и гасителем по своим двум концам, соответственно.
7. Нуклеиновая кислота по п. 6, отличающаяся тем, что указанный флуорофор представляет собой флуоресцеин, цианин 5 или TexasRed или TAMRA.
8. Нуклеиновая кислота по п. 6, отличающаяся тем, что указанный гаситель представляет собой BHQ1, BHQ2 или DABCYL.
9. Набор, содержащий набор олигонуклеотидов или нуклеиновую кислоту по любому из пп. 1-8.
10. Набор по п. 9, дополнительно содержащий ДНК-полимеразу, нуклеотиды для удлинения последовательности и буфер.
11. Способ обнаружения лекарственной устойчивости у М. tuberculosis, включающий
амплификацию первой нуклеотидной последовательности-мишени с использованием первой пары праймеров и получением первого ампликона, причем указанная первая пара праймеров специфична по отношению к фрагменту области, выбранной из группы, состоящей из гена rpoB, гена gyrA, гена gyrB, промотора inhA, гена rrs, промотора eis, гена embB и гена katG, и каждый праймер обладает последовательностью, которая по существу идентична последовательности олигонуклеотида, выбранного из олигонуклеотидов, перечисленных в Таблицах 1А и 1В, и
обнаружение мутации в указанном первом ампликоне,
причем наличие мутации указывает на лекарственную устойчивость.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный этап обнаружения осуществляют посредством секвенирования.
13. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный этап обнаружения осуществляют посредством способа, включающего
приведение в контакт указанного первого ампликона с первым зондом, специфичным по отношению к указанной мутации в условиях, благоприятствующих гибридизации, с образованием гибрида зонд-мишень;
выполнение анализа температуры плавления (Tm) с целью определения тестового значения Tm для указанного гибрида зонд-мишень; и
сравнение указанного тестового значения Tm с заранее определенным значением Tm, при этом тестовое значение Tm, отличающееся от заранее определенного значения Tm, указывает на наличие мутации.
14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что указанное тестовое значение Tm, которое ниже, чем указанное заранее определенное значение Tm, указывает на наличие мутации.
15. Способ по любому из пп. 11-14, дополнительно включающий амплификацию второй нуклеотидной последовательности-мишени с использованием второй пары праймеров и с получением второго ампликона, причем указанная вторая пара праймеров специфична по отношению к фрагменту второй области, выбранной из группы, состоящей из гена rpoB, гена gyrA, гена gyrB, промотора inhA, гена rrs, промотора eis, гена embB и гена katG.
16. Способ по п. 15, отличающийся тем, что указанная первая область представляет собой ген rrs или промотор eis.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что указанная первая область представляет собой ген rrs.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанная вторая область представляет собой промотор eis.
19. Способ по пп. 16, отличающийся тем, что указанная мутация представляет собой мутацию A1401G или С1402Т в гене rrs.
20. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанная мутация находится в пределах области промотора eis, на исследование которой направлены праймеры, используемые для амплификации области промотора eis.
21. Способ по любому из пп. 11-20, отличающийся тем, что указанная устойчивость представляет собой устойчивость к лекарственному средству, выбранному из группы, состоящей из изониазида, рифампицина, лекарственных средств класса фторхинолонов, амикацина, канамицина, капреомицина и этамбутола.
22. Способ по любому из пп. 11-21, отличающийся тем, что указанная пара праймеров представляет собой пару праймеров, выбранную из праймеров, перечисленных в Таблицах 1А и 1В.
23. Способ по любому из пп. 13-22, отличающийся тем, что указанный зонд содержит последовательность, по существу или полностью идентичную последовательности, выбранной из последовательностей, перечисленных в Таблице 2.
24. Способ обнаружения присутствия М. tuberculosis в тестовом образце, включающий
приведение в контакт указанного тестового образца с первой парой праймеров в условиях, благоприятствующих реакции амплификации, с целью получения первого ампликона, и
обнаружение присутствия указанного ампликона, что позволяет обнаружить присутствие Mycobacterium tuberculosis в указанном тестовом образце,
причем указанная первая пара праймеров представляет собой набор олигонуклеотидов для амплификации фрагмента области М. tuberculosis, выбранной из группы, состоящей из гена gyrB, промотора inhA, промотора eis, гена embB, гена katG, гена dosR, гена IS6110, гена IS1081, и
при этом каждый праймер указанной первой пары праймеров обладает последовательностью, которая по существу идентична последовательности олигонуклеотида, выбранного из олигонуклеотидов, перечисленных в Таблице 1В.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что указанная пара праймеров представляет собой пару праймеров, выбранную из праймеров, перечисленных в Таблице 1В.
26. Способ по любому из пп. 24-25, дополнительно включающий
приведение в контакт указанного тестового образца со второй парой праймеров в условиях, благоприятствующих реакции амплификации, с целью получения второго ампликона, и
обнаружение присутствия указанного второго ампликона,
причем присутствие как указанного первого, так и указанного второго ампликона указывает на присутствие Mycobacterium tuberculosis в указанном тестовом образце.
27. Способ обнаружения присутствия М. tuberculosis в тестовом образце, включающий
приведение в контакт указанного тестового образца с первым зондом-молекулярным маяком в условиях, благоприятствующих реакции гибридизации, с целью получения гибрида зонд-мишень, и
обнаружение присутствия указанного гибрида зонд-мишень, что позволяет обнаружить присутствие Mycobacterium tuberculosis в указанном тестовом образце,
причем указанный первый зонд-молекулярный маяк содержит последовательность, которая по существу идентична последовательности, выбранной из последовательностей, перечисленных в Таблице 2.
28. Способ по п. 26, отличающийся тем, что указанный первый зонд-молекулярный маяк выбран из группы, состоящей из SEQ ID No. 67-69.
RU2017113727A 2014-10-10 2015-10-09 Праймеры и зонды для полимеразной цепной реакции для обнаружения mycobacterium tuberculosis RU2717655C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462062351P 2014-10-10 2014-10-10
US62/062,351 2014-10-10
PCT/US2015/054916 WO2016057905A1 (en) 2014-10-10 2015-10-09 Polymerase chain reaction primers and probes for mycobacterium tuberculosis

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2017113727A true RU2017113727A (ru) 2018-11-13
RU2017113727A3 RU2017113727A3 (ru) 2019-05-20
RU2717655C2 RU2717655C2 (ru) 2020-03-24

Family

ID=55653846

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017113727A RU2717655C2 (ru) 2014-10-10 2015-10-09 Праймеры и зонды для полимеразной цепной реакции для обнаружения mycobacterium tuberculosis

Country Status (12)

Country Link
US (2) US11180816B2 (ru)
EP (2) EP3204517B1 (ru)
JP (3) JP6835712B2 (ru)
CN (2) CN116042880A (ru)
AU (1) AU2015330738B2 (ru)
BR (1) BR112017007229A2 (ru)
CA (1) CA2964265A1 (ru)
ES (1) ES2896198T3 (ru)
LT (1) LT3204517T (ru)
PT (1) PT3204517T (ru)
RU (1) RU2717655C2 (ru)
WO (1) WO2016057905A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2776163C1 (ru) * 2021-06-25 2022-07-14 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) Способ выявления ДНК бактерии Mycobacterium tuberculosis с помощью изотермической петлевой амплификации

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JOP20160086B1 (ar) 2015-05-08 2021-08-17 2 Katholieke Univ Leuven Ku Leuven Research And Development مشتقات اندول مستبدلة احاديا او ثنائيا بصفتها مانعات للتكاثر الفيروسي لحمى الفنك
CN107557435B (zh) * 2017-10-08 2021-04-06 福建医科大学 MC-ARMS-mMB三联技术在耐药结核菌诊断试剂盒的制备方法和应用
KR101962831B1 (ko) * 2017-11-13 2019-03-27 연세대학교 원주산학협력단 퀀타매트릭스 어세이 플랫폼 기반 결핵균 및 비결핵항산균 검출 및 결핵균의 리팜핀, 아이소니아지드, 퀴놀론계, 아미노글라이코사이드계 항생제항생제 내성여부를 동시 확인할 수 있는 진단법 및 그 키트
CN108192989A (zh) * 2018-03-28 2018-06-22 首都医科大学附属北京胸科医院 用于检测结核分枝杆菌和结核病的成套试剂与试剂盒
KR102030005B1 (ko) * 2018-05-24 2019-11-08 연세대학교 원주산학협력단 개선된 퀀타매트릭스 어세이 플랫폼 기반 결핵균 검출 및 결핵균의 리팜핀, 아이소니아지드, 에탐부톨, 퀴놀론, 아미카신, 카나마이신, 카프레오마이신와 같은 이차 주사제 및 스트렙토마이신 약제에 대한 내성여부를 동시 확인할 수 있는 진단법 및 그 키트
WO2020227016A1 (en) * 2019-05-03 2020-11-12 Meso Scale Technologies, Llc. Kits for detecting one or more target nucleic acid analytes in a sample and methods of making and using the same
US20230087018A1 (en) * 2020-02-06 2023-03-23 The Administrators Of The Tulane Educational Fund Crispr-based assay for detecting tb in bodily fluids
CN112481399B (zh) * 2020-12-21 2022-08-30 上海国际旅行卫生保健中心(上海海关口岸门诊部) 一种基于二代测序技术用于结核分枝杆菌mlst分型的引物组及建库方法
CN112680534B (zh) * 2021-01-21 2022-10-28 哈尔滨医科大学 一种用于识别假阳性反应的结核分枝杆菌sRNA荧光定量PCR标准品及其应用
CN112725486A (zh) * 2021-02-03 2021-04-30 四川大学华西医院 一种结核分枝杆菌复合群快速检测诊断试剂盒及制备方法
CN115992272B (zh) * 2022-10-17 2023-08-04 杭州遂真生物技术有限公司 用于结核分枝杆菌及其耐药基因检测的组合物及一体式试剂盒
CN117070645A (zh) * 2023-07-25 2023-11-17 鲲鹏基因（北京）科技有限责任公司 检测结核分枝杆菌氨基糖苷耐药的组合物、试剂盒及方法

Family Cites Families (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6060237A (en) 1985-02-26 2000-05-09 Biostar, Inc. Devices and methods for optical detection of nucleic acid hybridization
US5541308A (en) * 1986-11-24 1996-07-30 Gen-Probe Incorporated Nucleic acid probes for detection and/or quantitation of non-viral organisms
US5994056A (en) 1991-05-02 1999-11-30 Roche Molecular Systems, Inc. Homogeneous methods for nucleic acid amplification and detection
US5652106A (en) * 1993-06-04 1997-07-29 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Rapid amplification-based subtyping of mycobacterium tuberculosis
US5925517A (en) 1993-11-12 1999-07-20 The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits
EP0771360B1 (en) * 1994-06-09 2004-03-10 Innogenetics N.V. Method for the detection of the antibiotic resistance spectrum of mycobacterium species
US6235479B1 (en) * 1999-04-13 2001-05-22 Bio Merieux, Inc. Methods and devices for performing analysis of a nucleic acid sample
US6277607B1 (en) * 1999-05-24 2001-08-21 Sanjay Tyagi High specificity primers, amplification methods and kits
JP2001103981A (ja) * 1999-08-03 2001-04-17 Nisshinbo Ind Inc 結核菌診断キット
EP1076099A3 (en) * 1999-08-03 2003-03-05 Nisshinbo Industries, Inc. Kit for diagnosis of tubercle bacilli
ATE336591T1 (de) 1999-10-22 2006-09-15 New York Health Res Inst Nachweisverfahren für kurze sequenzvarianten
CN1151270C (zh) 2000-10-31 2004-05-26 亚能生物技术（深圳）有限公司 诊断结核杆菌及其耐药性的dna芯片
CN1153969C (zh) 2001-04-13 2004-06-16 中国科学院上海冶金研究所 结核分支杆菌耐药性检测芯片及其制作方法和应用方法
US7226732B2 (en) * 2001-07-16 2007-06-05 Cepheid Methods, apparatus, and computer programs for verifying the integrity of a probe
US20110111389A1 (en) * 2001-11-07 2011-05-12 Diagcor Bioscience Incorporation Limited Rapid genotyping analysis for human papillomavirus and the device thereof
AU2003299867A1 (en) 2002-12-27 2004-07-29 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey Method for single nucleotide polymorphism detection
GB0403039D0 (en) * 2004-02-11 2004-03-17 Health Prot Agency TB resistance assay
CA2584569C (en) 2004-10-18 2014-09-30 Brandeis University Primers, probes and methods for nucleic acid amplification
CN101168767A (zh) 2006-10-25 2008-04-30 复旦大学附属华山医院 一种快速检测结核分支杆菌多重耐药性的试剂盒
CN102149822A (zh) 2008-09-12 2011-08-10 株式会社Lg生命科学 用于检测结核分枝杆菌复合群或分枝杆菌属的组合物和使用所述组合物通过多重实时pcr来同时检测结核分枝杆菌复合群和分枝杆菌属的方法
CN101580879B (zh) 2009-04-30 2012-04-11 广西医科大学 检测结核杆菌耐药基因膜芯片
US20130095489A1 (en) * 2010-05-04 2013-04-18 Centers For Disease Control And Prevention Process for detection of multidrug resistant tuberculosis using real-time pcr and high resolution melt analysis
CN101845503B (zh) * 2010-06-10 2013-02-06 无锡锐奇基因生物科技有限公司 检测耐药结核分枝杆菌(mdr-tb)的试剂盒
KR101261292B1 (ko) 2010-06-28 2013-05-06 주식회사 인트론바이오테크놀로지 실시간 ｐｃｒ을 이용한 미코박테리움 속 균종의 동시 감별 방법 및 이를 위한 키트
MX2013001133A (es) * 2010-07-29 2013-06-07 Bigtec Private Ltd Sondas y cebadores para deteccion de dengue.
CN103562405B (zh) 2010-11-10 2018-01-09 布兰代斯大学 用于检测和鉴定分枝杆菌属的组合物、方法和试剂盒
CN103045716B (zh) 2011-10-11 2015-04-08 上海市肺科医院 焦磷酸测序技术检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的方法
CN103184270A (zh) * 2011-12-28 2013-07-03 北京宏微特斯生物科技有限公司 检测结核分枝杆菌（tb）的耐药基因突变型的方法和试剂盒
CN102559916B (zh) * 2012-02-24 2014-04-16 孙爱华 一种结核分枝杆菌耐多药检测方法
US9708671B2 (en) 2012-04-10 2017-07-18 Rutgers, The State University Of New Jersey Detection of drug resistant Mycobacterium tuberculosis
TWM467671U (zh) 2012-09-14 2013-12-11 Fooyin University Hospital 結核病快速診斷及藥效檢測結構
RU127074U1 (ru) 2012-12-27 2013-04-20 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России) Молекулярно-генетическая тест-система для экспресс-определения устойчивости микобактерий туберкулеза к противотуберкулезным препаратам группы фторхинолонов, аминогликозидам (амикацину, канамицину) и капреомицину
CN105392896B (zh) * 2013-03-15 2017-10-20 达雅高生命科技有限公司 快速并灵敏基因型鉴定及核酸检测

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2776163C1 (ru) * 2021-06-25 2022-07-14 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) Способ выявления ДНК бактерии Mycobacterium tuberculosis с помощью изотермической петлевой амплификации

Also Published As

Publication number Publication date
CA2964265A1 (en) 2016-04-14
RU2717655C2 (ru) 2020-03-24
CN116042880A (zh) 2023-05-02
EP3957753A1 (en) 2022-02-23
AU2015330738A1 (en) 2017-05-04
CN107002148A (zh) 2017-08-01
CN107002148B (zh) 2023-02-17
ES2896198T3 (es) 2022-02-24
JP2020168007A (ja) 2020-10-15
EP3204517A1 (en) 2017-08-16
JP2024026210A (ja) 2024-02-28
US20170247747A1 (en) 2017-08-31
PT3204517T (pt) 2021-11-16
JP2017530710A (ja) 2017-10-19
EP3204517B1 (en) 2021-08-11
JP7432237B2 (ja) 2024-02-16
RU2017113727A3 (ru) 2019-05-20
BR112017007229A2 (pt) 2021-02-09
EP3204517A4 (en) 2018-07-04
AU2015330738B2 (en) 2021-10-14
LT3204517T (lt) 2021-11-25
US11180816B2 (en) 2021-11-23
US20220064715A1 (en) 2022-03-03
WO2016057905A1 (en) 2016-04-14
JP6835712B2 (ja) 2021-02-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2017113727A (ru) Праймеры и зонды для полимеразной цепной реакции для обнаружения mycobacterium tuberculosis
Andersson et al. Properties of targeted preamplification in DNA and cDNA quantification
JP2009077712A5 (ru)
JP2018509174A5 (ru)
CA2748117A1 (en) Method for detection of xmrv
JP6707072B2 (ja) 核酸増幅のための核酸
JP2011530296A5 (ru)
JP2020521440A5 (ru)
JP2018516594A5 (ru)
JP2015522271A5 (ru)
RU2018113750A (ru) Улучшенное выявление коротких гомополимерных повторов
JP6007652B2 (ja) メチシリン耐性黄色ブドウ球菌を検出するためのプライマーおよびプローブ、ならびに、それらを用いたメチシリン耐性黄色ブドウ球菌の検出方法
JPWO2009011297A1 (ja) Ｊａｋ２遺伝子の変異検出用プローブおよびその用途
RU2558236C2 (ru) Система анализа для обнаружения близкородственных серотипов вируса папилломы человека (впч)
RU2016136727A (ru) Набор олигонуклеотидных праймеров, зондов и способ выявления мутации 35delg гена gjb2 методом аллель-специфическая пцр амплификации при наследственной несиндромальной глухоте
KR20160009397A (ko) 약제 내성 결핵균을 검출하는 방법
KR20130081468A (ko) 절단 가능한 프로브를 이용한 ｃ―Ｍｅｔ 유전자 검출 방법
ES2843848T3 (es) Ensayo de referencia para múltiples copias
RU2013116589A (ru) Зонд и способ детекции полиморфизма, используя таковой
JP6277603B2 (ja) 百日咳菌の検出方法
JP2015128399A (ja) Ｃｙｐ３ａ５の検出方法
WO2012069484A3 (de) Verfahren zum qualitativen und quantitativen nachweis von spezifischen nukleinsäuresequenzen in echtzeit
JP2015070808A (ja) Ｊａｋ２変異遺伝子の検出方法
JP2016007176A (ja) 核酸を増幅し検出する方法
JP2018088883A (ja) 上皮成長因子受容体遺伝子変異の検出方法