KR20140146180A - 적응 면역의 측정방법 - Google Patents
적응 면역의 측정방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20140146180A KR20140146180A KR1020147031470A KR20147031470A KR20140146180A KR 20140146180 A KR20140146180 A KR 20140146180A KR 1020147031470 A KR1020147031470 A KR 1020147031470A KR 20147031470 A KR20147031470 A KR 20147031470A KR 20140146180 A KR20140146180 A KR 20140146180A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- dna
- artificial sequence
- synthetic dna
- sequence
- segment
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1065—Preparation or screening of tagged libraries, e.g. tagged microorganisms by STM-mutagenesis, tagged polynucleotides, gene tags
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F17/00—Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
- G06F17/10—Complex mathematical operations
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Abstract
면역능력의 측정방법이 기재되어 있다. 본 발명의 방법은 면역계를 손상시키는 질환 또는 상태, 및 재구성을 목적으로 하는 치료법의 효과를 평가하는 수단을 제공한다. 본 발명의 방법은 혈액 세포로부터 다양한 T 세포 수용체(TCR) 베타 쇄 가변 영역의 수를 계산함으로써 T 세포 다양성의 정량화에 기반한다.
Description
본원은 2009년 6월 25일자로 출원되고 전체가 본원에서 참조로서 도입되는 미국 가출원 제61/220,344호의 이익을 우선권으로 청구한다.
적응 면역계 세포로부터 추출한 핵산의 대규모 서열분석을 사용하여 T 세포 수용체 유전자 또는 항체 유전자의 다양성을 분석함으로써 환자의 적응 면역을 측정하는 방법이 기재되어 있다.
면역능력(immunocompetence)은, 살아 있는 생물체(예: 박테리아 또는 진균), 바이러스, 또는 병원체로부터 분리되어 백신에 도입된 특정한 항원성 성분일 수 있는 병원체에 대한 노출 후에 정상 면역 반응(즉, 항체 생성 및/또는 세포 매개 면역성)을 생성하는 신체의 능력이다. 면역능력은 면역결핍(immunodeficient) 또는 면역-비경쟁(immuno-incompetent) 또는 면역손상(immunocompromised)과 반대이다. 몇몇 예는 완전 작용성 면역계를 아직 갖지 않지만 모계 전달된 항체를 가질 수 있는 신생아(면역결핍); 면역계가 약화되었거나 약화되고 있는 말기 AIDS 환자(면역-비경쟁); 수용체 신체가 공여된 기관을 거부할 수 없도록 약물을 투약한 이식 수용체(면역손상); 중장년층에서 T 세포 기능의 연령 관련 감쇠; 또는 방사선 또는 화학요법 약물에 노출된 개체일 수 있다. 이들 용어는 중복되는 경우도 있지만 모두 이상 면역계의 지표이다. 림프구와 관련하여, 면역능력은 B 세포 또는 T 세포가 성숙 상태이고 항원을 인식하여 사람에게 면역 반응을 갖게 하는 것을 의미한다.
면역능력은 B 세포(면역글로불린, Ig) 및 T 세포(T-세포 수용체, TCR)에 의해 코딩된 고도의 다형태 수용체를 사용하여 임의의 잠재적 외래 항원에 특이적인 면역 반응을 갖게 하는 적응 면역계의 능력에 의존한다.
B 세포에 의해 발현된 Ig는 4개의 폴리펩티드 쇄, 즉 2개의 중쇄(H 쇄)와 2개의 경쇄(L 쇄)로 구성되어 H2L2 구조를 형성하는 단백질이다. H 및 L 쇄의 쌍 각각은 VL 및 VH 영역으로 이루어진 초가변성 도메인 및 불변 도메인을 함유한다. Ig의 H 쇄에는 몇개의 형태, μ, δ, γ, α 및 β가 있다. 개체 내에서 Ig의 다양성은 주로 초가변성 도메인에 의해 결정된다. H 쇄의 V 도메인은 3개 형태의 생식세포주 유전자 세그먼트, 즉 VH, DH 및 JH 세그먼트의 조합 연결에 의해 생성된다. 초가변성 도메인 서열 다양성은 Ig 유전자 재배열의 공정 동안 VH-DH, DH-JH 및 VH-JH 결합부에서 뉴클레오티드의 독립적인 부가 및 결실에 의해 추가로 증가된다. 이러한 측면에서, 면역능력은 Ig의 다양성에 반영된다.
αβ T 세포에 의해 발현된 TCR은 각각 TCRA 및 TCRB 유전자에 의해 발현된 2개의 통막(transmembrane) 폴리펩티드 쇄(α 및 β)로 구성된 단백질이다. 유사한 TCR 단백질은 TCRD 및 TCRG 부위로부터 감마-델타 T 세포에서 발현된다. 각각의 TCR 펩티드는 프레임워크 영역(FR) 및 불변 영역뿐만 아니라 가변 상보성 결정 영역(CDR)을 함유한다. αβ T 세포의 서열 다양성은 α 및 β쇄 가변 도메인의 제3 상보성 결정 영역(CDR3) 루프의 아미노산 서열에 의해 주로 결정되며, 다양성은 각각 β쇄 부위에서 가변(Vβ), 다양성(Dβ) 및 결합(Jβ) 유전자 세그먼트 사이, 및 α 쇄 부위에서 유사한 Vα 및 Jα 유전자 세그먼트 사이의 재조합 결과이다. TCR α 및 β 쇄 부위에서 이러한 다수의 유전자 세그먼트의 존재는 다수의 특이적 CDR3 서열을 코딩하게 한다. CDR3 서열 다양성은 TCR 유전자 재배열 공정 동안 Vβ-Dβ, Dβ-Jβ 및 Vα-Jα 결합부에서 뉴클레오티드의 독립적인 부가 및 결실에 의해 추가로 증가된다. 이러한 측면에서, 면역능력은 TCR의 다양성에 반영된다.
자가면역 질환에 있어서 면역손상된 적응 면역 또는 이상조절된 적응 면역의 면역능력이든지, 다양한 세팅에서 환자의 적응 면역 면역계를 평가 또는 측정하는 방법이 오랫동안 요구되어 왔다. 환자의 면역능력을 평가하여 질환 상태 또는 노화 효과를 진단하는 방법에 대한 요구가 존재한다. 동일한 방식으로, 면역계를 변형시키는 치료 결과는 치료를 받는 동안 환자의 면역능력을 평가함으로써 모니터링되어야 한다. 반대로, 치료 반응을 모니터링하기 위해 자가면역 질환 격발 및 경감의 맥락에서 적응 면역계를 모니터링하는 방법이 요구되거나 예방학적 치료를 증상 전에 개시할 필요가 있다.
본 발명의 한 가지 양태는,
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V-세그먼트 프라이머 및
(b) J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J-세그먼트 프라이머를 포함하는 조성물로서,
상기 V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머는 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 TCR CDR3 영역을 증폭시켜 TCR 유전자의 다양성을 정량화하기에 충분한 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는, 조성물이다. 본 발명의 한 가지 양태는, 각각의 V 세그먼트 프라이머가 단일 Vβ 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하고 각각의 J 세그먼트 프라이머가 Jβ 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하며, V 세그먼트 및 J 세그먼트가 TCRβ CDR3 영역을 증폭시키는 조성물이다. 또 다른 양태는, 각각의 V 세그먼트 프라이머가 단일 작용성 Vα 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하고 각각의 J 세그먼트 프라이머가 Jα 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하며, V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머가 TCRα CDR3 영역을 증폭시키는 조성물이다.
본 발명의 또 다른 양태는, V 세그먼트 프라이머가 보존된 세그먼트와 하이브리드화하고 유사한 어닐링 강도를 갖는 조성물이다. 또 다른 양태는 V 세그먼트 프라이머가 재조합 시그날 서열(RSS)에 대해 Vβ 세그먼트 내의 위치 -43에 고정되어 있는 조성물이다. 또 다른 양태는 다수의 V 세그먼트 프라이머가 45개의 상이한 Vβ 유전자에 특이적인 적어도 45개 프라이머로 구성되어 있다. 또 다른 양태는 V 세그먼트 프라이머가 서열번호: 1 내지 45로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 서열을 갖는다. 또 다른 양태는 V 세그먼트 프라이머가 서열번호: 58 내지 102로 이루어진 그룹으로부터 선택된 서열을 갖는다. 또 다른 양태는 각각의 Vβ 세그먼트에 대해 V 세그먼트 프라이머가 존재한다.
본 발명의 또 다른 양태는 J 세그먼트 프라이머가 Jβ 세그먼트의 보존된 프레임워크 영역 요소와 하이브리드화하고 유사한 어닐링 강도를 갖는 조성물이다. 청구항 제2항의 조성물은 다수의 J 세그먼트 프라이머가 13개의 상이한 Jβ 유전자에 특이적인 적어도 13개의 프라이머로 구성된다. 또 다른 양태는 청구항 제2항의 조성물은 J 세그먼트 프라이머가 서열번호: 46 내지 57로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 서열을 갖는다. 또 다른 양태는 J 세그먼트 프라이머가 서열번호: 102 내지 113으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 서열을 갖는다. 또 다른 양태는 각각의 Jβ 세그먼트에 대해 J 세그먼트 프라이머가 존재한다. 또 다른 양태는 모든 J 세그먼트 프라이머가 동일한 보존 모티프에 어닐링되어 있다.
본 발명의 또 다른 양태는, 증폭된 DNA 분자가 상기 보존된 모티프로부터 출발하고, 적절한 서열을 증폭시켜 J 세그먼트를 진단학적으로 동정하며, CDR3 결합부를 포함하고 V 세그먼트로 확장하는 조성물이다. 또 다른 양태는 증폭된 Jβ 유전자 세그먼트가 각각 RSS 부위 하류의 위치 +11 내지 +14에서 4개의 유니크(unique) 염기 태그를 갖는다.
본 발명의 또 다른 양태는 서열분석 올리고뉴클레오티드 세트를 추가로 포함하는 조성물이고, 서열분석 올리고뉴클레오티드는 증폭된 DNA 분자 내의 영역에 하이브리드화한다. 소정 양태는 서열분석 올리고뉴클레오티드가 RSS 부위 하류의 위치 +11 내지 +14에서 증폭된 Jβ 유전자 세그먼트 내의 4개 염기 태그에 인접하여 하이브리드화한다. 또 다른 양태는 서열분석 올리고뉴클레오티드는 서열번호: 58 내지 70으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다. 또 다른 양태는 V 세그먼트 또는 J 세그먼트가 밀접하게 관련된 서열의 병합에 의해 서열 에러-보정을 함유하도록 선택된다. 또 다른 양태는 mRNA로부터 cDNA를 생성하는 범용 C 세그먼트 프라이머를 추가로 포함하는 조성물이다.
본 발명의 또 다른 양태는,
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V-세그먼트 프라이머 및
J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J-세그먼트 프라이머를 포함하는 조성물로서,
상기 V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머는 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 TCRG CDR3 영역을 증폭시켜 항체 중쇄 유전자의 다양성을 정량화하기에 충분한 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는, 조성물이다.
본 발명의 또 다른 양태는,
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V-세그먼트 프라이머 및
J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J-세그먼트 프라이머를 포함하는 조성물로서,
상기 V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머는 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 항체 중쇄(IGH) CDR3 영역을 증폭시켜 항체 중쇄 유전자의 다양성을 정량화하기에 충분한 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는, 조성물이다.
본 발명의 또 다른 양태는,
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V-세그먼트 프라이머 및
J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J-세그먼트 프라이머를 포함하는 조성물로서,
상기 V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머는 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 항체 경쇄(IGL) VL 영역을 증폭시켜 항체 경쇄 유전자의 다양성을 정량화하기에 충분한 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는, 조성물이다.
본 발명의 또 다른 양태는,
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V 세그먼트 프라이머를 선택하는 단계;
J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J 세그먼트 프라이머를 선택하는 단계; 및
V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머를 게놈 DNA 샘플과 조합하여 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 CDR3 영역을 증폭시킴으로써 TCR 유전자의 다양성을 정량화하기에 충분한 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는 단계를 포함하는 방법이다.
본 발명의 한 가지 양태는 각각의 V 세그먼트 프라이머가 단일 작용성 Vβ 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하고, 각각의 J 세그먼트 프라이머가 Jβ 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하며, V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머와 게놈 DNA 샘플의 조합이 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 TCR CDR3 영역을 증폭시켜 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는 방법이다. 또 다른 양태는 각각의 V 세그먼트 프라이머가 단일 작용성 Vα 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하고, 각각의 J 세그먼트 프라이머가 Jα 세그먼트에 상보성인 서열을 포함하며, V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머와 게놈 DNA 샘플의 조합이 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 TCR CDR3 영역을 증폭시켜 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는 방법이다.
본 발명의 또 다른 양태는 증폭된 DNA 분자를 서열분석하는 단계를 추가로 포함하는 방법이다. 또 다른 양태는 서열분석 단계가, 증폭된 DNA 분자 내의 영역과 하이브리드화하는 서열분석 올리고뉴클레오티드 세트를 사용하는 방법이다. 또 다른 양태는 증폭된 DNA 분자 중에서 TCRβ CDR3 서열의 전체 다양성을 계산하는 단계를 추가로 포함하는 방법이다. 또 다른 양태는 정상 사람 피검체의 전체 다양성이 1×106 초과의 서열, 2×106 초과의 서열 또는 3×106 초과의 서열임을 나타내는 방법이다.
본 발명의 또 다른 양태는, 환자의 TCR CDR3 서열의 다양성을 측정하는 단계 및 피검체의 다양성을 정상 피검체로부터 수득한 다양성과 비교하는 단계를 포함하는, 사람 환자에서 면역결핍을 진단하는 방법이다. 본 발명의 양태는, TCR 서열의 다양성을 측정하는 단계가
단일 작용성 V 세그먼트 또는 V 세그먼트의 소부류에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 V 세그먼트 프라이머를 선택하는 단계;
J 세그먼트에 상보성인 서열을 각각 포함하는 다수의 J 세그먼트 프라이머를 선택하는 단계;
V 세그먼트 및 J 세그먼트 프라이머를 게놈 DNA 샘플과 조합하여 다중 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 TCR CDR3 영역을 증폭시킴으로써 다수의 증폭된 DNA 분자를 생성하는 단계;
증폭된 DNA 분자를 서열분석하는 단계; 및
증폭된 DNA 분자 중에서 TCR CDR3 서열의 전체 다양성을 계산하는 단계를 포함하는 방법이다.
본 발명의 양태는 다양성의 비교는 하기 수학식을 사용하여 계산함으로써 측정하는 방법이다:
상기 수학식에서,
G(λ)는 파라미터 λ1, ···, λs의 경험적 분포 함수이고,
nx는 정확하게 x배 서열분석된 클론형 수이고,
본 발명의 또 다른 양태는 게놈 DNA의 적어도 2개 샘플의 다양성이 비교되는 방법이다. 또 다른 양태는 게놈 DNA의 하나의 샘플이 환자의 것이고 다른 샘플이 정상 피검체의 것이다. 또 다른 양태는 게놈 DNA의 하나의 샘플이 치료학적 치료 전의 환자의 것이고 다른 샘플이 치료 후의 환자의 것이다. 또 다른 양태는 게놈 DNA의 2개의 샘플이 치료 동안 상이한 시간에서 동일한 환자의 것이다. 또 다른 양태는 질환이 게놈 DNA의 샘플 중에서 다양성의 비교에 기초하여 진단된다. 또 다른 양태는 사람 환자의 면역능력이 비교에 의해 평가된다.
TCR 및 Ig 유전자는 체세포 돌연변이를 통해 수백만의 특이적 단백질을 생성할 수 있다. 이들의 다양성 생성 메카니즘에 기인하여, 이들 유전자의 초가변성 상보성 결정 영역은 수백만의 리간드와 상호작용할 수 있는 서열을 코딩할 수 있고, 이들 영역은 단백질의 코그네이트(cognate) 리간드의 결합을 나타내는 세포에 시그날을 전달할 수 있는 불변 영역에 연결된다.
적응 면역계는 다양성이 충분한 T 세포 및 B 세포 항원 수용체의 레퍼토리를 생성하여 다수의 잠재적 병원체를 인지하는 몇몇 전략을 사용한다. MHC 분자에 의해 제공된 펩티드 항원을 주로 인지하는 αβ 및 γδ T 세포에 있어서, 대부분의 이러한 수용체 다양성은 T 세포 수용체(TCR) α 및 β 쇄 (또는 γ 및 δ 쇄)의 제3 상보성 결정 영역(CDR3) 내에 함유되어 있다. 적응 면역계가 1018개 이하의 특이적 TCR αβ 쌍을 형성할 수 있는 것으로 평가되고 있지만, TCR CDR3 다양성의 직접 실험 평가는 가능하지 않았다.
본원에 기재된 것은 단일 분자 DNA 서열분석에 기반하여 TCR CDR3 다양성을 측정하고, 이러한 접근법을 2명의 건강한 성인의 말초혈 T 세포로부터 분리된 수백만의 재배열된 TCRβ 유전자에서 CDR3 영역을 서열 분석하는데 사용하는 신규한 방법이다.
개체가 노출될 수 있는 임의의 대다수의 잠재적 외래 항원에 특이적인 면역 반응을 갖게 하는 적응 면역계의 능력은 B 세포(면역글로불린) 및 T 세포(T 세포 수용체; TCR)에 의해 코딩된 고도의 다형태 수용체에 의존한다. 주요 조직접합성 복합체(MHC) 부류 I 및 II 분자에 의해 제공된 펩티드 항원을 주로 인지하는 αβ T 세포에 의해 발현된 TCR은 2개의 통막 폴리펩티드 쇄(α 및 β)로 구성된 헤테로이합체 단백질이고, 각각의 폴리펩티드 쇄는 하나의 가변 도메인과 하나의 불변 도메인을 함유한다. αβ T 세포의 펩티드 특이성은 α 및 β 쇄 가변 도메인의 제3 상보성 결정 영역(CDR3) 루프에서 코딩된 아미노산 서열에 의해 대부분 결정된다. β 및 α 쇄의 CDR3 영역은 각각 β 쇄 부위에서 불연속 가변(Vβ), 다양성(Dβ) 및 결합(Jβ) 유전자 세그먼트 사이의 재조합 및 α 쇄 부위에서 유사한 Vα 및 Jα 유전자 세그먼트 사이의 재조합에 의해 형성된다. TCR α 및 β 쇄 부위에서 이러한 다중 유전자 세그먼트의 존재는 다수의 특이적 CDR3 서열을 코딩하게 한다. CDR3 서열 다양성은 TCR 유전자 재배열의 공정 동안 Vβ-Dβ, Dβ-Jβ 및 Vα-Jα 결합부에서 뉴클레오티드의 주형 독립적 부가 및 결실에 의해 추가로 증가된다.
성인 사람 αβ T 세포 레퍼토리에서 수용체의 다양성을 평가하는 이전의 시도는 당해 레퍼토리의 잘 규정된 소형 서브세트(subset)에서 발현된 재배열된 TCR α 및 β 쇄 유전자를 검사한 다음, 이들 서브세트에 존재하는 다양성을 전체 레퍼토리에 대해 외삽하여, 개체당 대략 106개의 유니크 TCRβ 쇄 CDR3 서열(이들 유니크 TCRβ CDR3 서열의 10 내지 20%는 항원 경험된 CD45RO+ 구획에서 세포에 의해 발현된다)을 평가하는 것에 의존한다. 이들 평가의 정확도 및 정밀도는 수백 개 서열에서 관찰된 다양성을 전체 레퍼토리에 대해 외삽할 필요성에 의해 심각하게 제한되며, αβ T 세포 레퍼토리에서 유니크 TCRβ 쇄 CDR3 서열의 실제 수는 1×106개보다 현저히 많다.
고처리량의 DNA 서열분석 기술에 있어서의 최근 발전은 모세관 기반 기술보다 현저히 난해한 서열분석을 가능하게 했다. 각 말단에 범용 PCR 적응 서열을 포함하는 주형 분자의 복합체 라이브러리는 고체 표면상에 고정된 상보성 올리고뉴클레오티드 론(lawn)에 하이브리드화된다. 고체상 PCR은 하이브리드화된 라이브러리를 증폭시켜 표면상에 수백만의 주형 클러스터를 생성하기 위해 사용된다(라이브러리 각각은 본래 라이브러리와 동일한 단일 DNA 분자의 다중(약 1,000) 복제를 포함한다). 각 클러스터 내의 분자 내의 30 내지 54 bp 간격은 가역적 염료-종결 화학을 사용하여 서열분석되어, 수백만의 T 세포에 포함된 재배열된 TCRβ 쇄 CDR3 영역의 게놈 DNA로부터 동시에 서열분석된다. 이러한 접근법은 αβ T 세포의 모집단에서 유니크하게 재배열된 TCRβ CDR3 영역의 상당한 분획을 직접 서열 분석할 수 있게 하고, 이에 의해 모집단에서 각 CDR3 서열의 상대 도수를 평가할 수 있게 한다.
T 세포의 한정된 샘플에서 측정된 다양성으로부터 전체 αβ T 세포 레퍼토리 중의 TCRβ CDR3 서열의 다양성에 대한 정확한 평가는 샘플에서 관찰되지 않은 레퍼토리에 존재하는 CDR3 서열의 수에 대한 평가를 필요로 한다. 전체 αβ T 세포 레퍼토리에서 TCRβ 쇄 CDR3 다양성은 수백만의 αβ T 세포를 함유하는 혈액 샘플에서 관찰된 유니크 TCRβ CDR3 서열의 수에 대한 직접 측정을 사용하여 평가되었다. 본원에서의 결과는 이전 평가보다 몇배 높은 CD4+ 및 CD8+ T 세포 구획에서 TCRβ CDR3 다양성에 대한 하한을 동정한다. 또한, 본원의 결과는 항원 경험한 T 세포의 CD45RO+ 구획에서 적어도 1.5×106개의 유니크 TCRβ CDR 3 서열이 존재하고, 이들 중의 대부분은 상대적으로 낮은 도수로 존재함을 입증한다. 항원 경험한 세포에서 TCRβ CDR3 서열의 이러한 다양한 모집단의 존재는 이전에는 입증되지 않았다.
각각의 건강한 개체에서 TCRβ 쇄의 다양한 풀은 평가된 이론적 공간으로부터 1011개 초과의 가능한 서열의 샘플이다. 그러나, 재배열된 TCR의 실현된 세트는 이러한 이론적 공간으로부터 균일하게 샘플링되지 않았다. Vβ의 차이 및 Jβ의 차이는 천배 이상의 도수 차이로 발견된다. 추가로, 뉴클레오티드의 삽입 비율은 강력하게 바이어스(biased)되어 있다. 실현된 TCRβ 서열의 이러한 감소된 공간은 사람 사이의 공유된 β 쇄의 가능성을 유도한다. 본원에 기재된 방법으로 생성된 서열 데이터와 함께, 생체내 J 유용성, V 유용성, 모노뉴클레오티드 및 디뉴클레오티드 바이어스, 및 위치 의존적 아미노산 유용성은 컴퓨터화할 수 있다. 이들 바이어스는 TCRβ가 선택되는 서열 공간의 크기를 현저히 좁게 하고, 이는 상이한 개체가 동일한 아미노산 서열을 갖는 TCRβ 쇄를 공유함을 시사한다. 본원의 결과는 수천개의 이러한 동일한 서열의 개개 사람 게놈 사이에서 쌍으로 공유되어 있음을 나타낸다.
분석 기술은 프라이머의 2개 풀을 사용하여 고도의 다중화 PCR 반응을 제공한다. "정방향" 풀은 유전자 내에 각각의 V 세그먼트에 특이적인 프라이머를 갖는다(고도 보존된 영역을 표적화하는 수개의 프라이머가 사용되어, 다수의 V 세그먼트를 동시에 포획한다). "역방향" 풀 프라이머는 결합("J") 세그먼트에서 보존된 서열에 어닐링된다. 증폭된 세그먼트 풀은 적절한 서열을 포함하여 각각의 J 세그먼트를 동정하고, J 세그먼트 특이적 프라이머가 재서열 분석을 위해 어닐링되도록 한다. 이는 개체에 존재하는 체세포 재배열의 다수 분획을 직접 관찰할 수 있게 한다. 이는 또한 개체 중의 TCR 레퍼토리를 대조군의 TCR 레퍼토리에 대해 자가면역 질환(또는 표적 질환 지표)과 신속하게 비교할 수 있게 한다.
적응 면역계는 이론적으로 다양성이 큰 T 세포 수용체 CDR3 서열을 생성할 수 있다(임의의 하나의 개체에서 임의의 한 번의 시간에 발현되는 것 이상으로). 그러나, 이러한 이론적 다양성의 분획이 실제로 성인 αβ T 세포 레퍼토리에서 사용되는 것을 측정하는 종래의 시도는 다양성의 정확한 평가를 허용하지 않았다. 본원에 기재된 것은 한정된 샘플에서 다양성 측정을 사용하는 레퍼토리 다양성의 평가에 대한 단일 분자 DNA 서열분석 및 분석적 컴퓨터 접근법에 기초하는, 당해 문제에 대한 새로운 접근법을 개발하는 것이다. 당해 분석은 성인 레퍼토리에서 유니크 TCRβ CDR3 서열의 수가 당해 레퍼토리 작은 세그먼트의 소모적인 모세관 서열분석에 기반한 종래의 평가치를 현저히 초과하는 것을 증명했다. 본원에 기재된 방법을 사용하여 관찰된 CD45RO- 모집단(천연 T 세포가 풍부함)에서 TCRβ 쇄 다양성은 종래 보고된 것보다 5배 크다. 중요한 발견은 항원 경험한 CD45RO+ T 세포에서 발현된 유니크 TCRβ CDR3 서열의 수이다. 본원의 결과는 당해 수가 종래의 다른 결과에 기반하여 예상된 것보다 10 내지 20배 많음을 나타낸다. CD45RO+ 세포에서 CDR3 서열의 도수 분포는 T 세포 레퍼토리가 작은 클론 크기를 갖는 다수의 클론을 함유함을 시사한다.
본원의 결과는 TCRβ 쇄의 실현된 세트가 서열의 거대 잠재적 공간으로부터 균일하지 않게 샘플링됨을 나타낸다. 특히, 생식 세포주에 보다 유사한 β 쇄 서열(V-D 및 D-J 경계에서 소수의 삽입 및 결실)은 비교적 높은 도수로 생성되는 것처럼 보인다. 생식 세포주에 유사한 TCR 서열은 V의, D의 및 J의 생식 세포주 서열이, 소수의 다형태를 원칙으로 하여, 사람 모집단 중에서 공유되어 있기 때문에 상이한 사람 사이에서 공유되어 있다.
성숙 αβ T 세포에 의해 발현된 T 세포 수용체는 2개의 구성 쇄가 TCR α 및 β 쇄 가변 부위의 독립적 재배열 사건에 의해 생성되는 헤테로이합체이다. α 쇄는 β 쇄보다 다양성이 작고, 따라서 α의 보다 높은 분획이 개체 사이에서 공유되어 있고, 수백 개의 정확한 TCR αβ 수용체가 개체 쌍 사이에서 공유되어 있다.
세포
B 세포 및 T 세포는 골수, 흉선, 임파선, 말초 조직 및 혈액을 포함하는 다양한 조직 샘플로부터 수득할 수 있지만, 말초혈이 가장 용이하게 수득된다. 말초혈 샘플은 피검체로부터 정맥절개에 의해 수득된다. 말초혈 단핵 세포(PBMC)는 당해 기술분야의 통상의 지식을 가진 자에게 공지된 기술, 예를 들면, 피콜-하이파크(Ficoll-HypaqueR) 밀도 구배 분리에 의해 분리된다. 바람직하게는, 전체 PBMC가 분석에 사용된다. 대신에, B 및/또는 T 림파구는 각 피검체를 위해 다수 구획으로 유동 분류될 수 있다: 예를 들면, 형광 표지된 항-사람 항체, 예를 들면, CD4 FITC(클론 M-T466, Miltenyi Biotec), CD8 PE(클론 RPA-T8, BD Biosciences), CD45RO ECD(클론 UCHL-1, Beckman Coulter) 및 CD45RO APC(클론 UCHL-1, BD Biosciences)를 사용하는 CD8+CD45RO+/- 및 CD4+CD45RO+/-. 전체 PBMC의 염색은 항체의 적절한 조합으로 수행할 수 있고, 이어서 세포를 분석 전에 세척한다. 림파구 서브세트는 FACS 분류, 예를 들면, BD FACSAriaTM 세포 분류 시스템(BD Biosciences)에 의해 및 결과를 FlowJo 소프트웨어(Treestar Inc.)로 분석함으로써 및 표면 또는 비드에 고정된 특이적 항체를 수반하는 개념상 유사한 방법에 의해 분리할 수 있다.
핵산 추출
전체 게놈 DNA는 세포로부터, 예를 들면, QIAamp® DNA 혈액 미니 키트(QIAGEN®)를 사용하여 추출한다. 단일 반수체 게놈의 대략적 질량은 3 pg이다. 바람직하게는 적어도 100,000 내지 200,000개 세포를 다양성 분석에 사용한다(즉, 이배체 T 세포로부터 약 0.6 내지 1.2 ㎍ DNA). PBMC를 공급원으로 사용하면, T 세포의 수는 전체 세포의 약 30%인 것으로 평가될 수 있다.
또는, 게놈 DNA 및 mRNA 둘 다를 포함하는 세포로부터 전체 핵산을 분리할 수 있다. 다양성이 핵산 추출물 중의 mRNA로부터 측정되어야 하는 경우, mRNA는 측정 전에 cDNA로 전환되어야 한다. 이는 당업자의 방법에 의해 용이하게 수행할 수 있다.
DNA 증폭
다중 PCR 시스템을 사용하여 게놈 DNA, 바람직하게는 CDR3 영역, 보다 바람직하게는 TCRα, TCRγ 또는 TCRδ CDR3 영역, 가장 바람직하게는 TCRβ CDR3 영역으로부터 재배열된 TCR 부위를 증폭시킨다.
일반적으로, 다중 PCR 시스템은 적어도 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 또는 25개, 바람직하게는 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 또는 39개, 가장 바람직하게는 40, 41, 42, 43, 44 또는 45개 정방향 프라이머(여기서, 각각의 정방향 프라이머는 서열번호: 114 내지 248에 나타낸 하나 이상의 TRB V 영역 세그먼트에 상응하는 서열에 특이적이다) 및 적어도 3, 4, 5, 6 또는 7개, 바람직하게는 8, 9, 10, 11, 12 또는 13개 역방향 프라이머(여기서, 각각의 역방향 프라이머는 서열번호: 249 내지 261에 나타낸 하나 이상의 TRB J 영역 프라이머에 상응하는 서열에 특이적이다)를 사용할 수 있다. 가장 바람직하게는 모든 J 세그먼트에 대해 J 세그먼트 프라이머가 존재한다.
바람직하게는, 인트론/엑손 경계를 교차하지 않도록 프라이머가 설계된다. 정방향 프라이머는 바람직하게는, 이들 프라이머 중에서 서열 보존을 최대화하기 위해, V 세그먼트 사이의 비교적 강력한 서열 보존 영역에서 V 세그먼트에 어닐링되어야 한다. 따라서, 이는 각 프라이머의 상이한 어닐링 특성에 대한 가능성을 최소화하고, 따라서 V 및 J 프라이머 사이의 증폭된 영역은 충분한 TCR V 서열 정보를 함유하여 사용된 특이적 V 유전자 세그먼트를 동정한다.
바람직하게는, J 세그먼트 프라이머는 J 세그먼트의 보존된 요소와 하이브리드화하고, 유사한 어닐링 강도를 갖는다. 가장 바람직하게는, 모든 J 세그먼트 프라이머는 동일한 보존된 프레임워크 영역 모티프에 어닐링된다. 정방향 및 역방향 프라이머는 둘 다 바람직하게는 DNA 서열분석기에 적합한 범용 정방향 프라이머 서열로 5' 말단에서 변형된다.
예를 들면, 다중 PCR 시스템은 각각 작용성 TCR Vβ 세그먼트에 특이적인 45개 정방향 프라이머(표 1), 및 각각 TCR Jβ 세그먼트에 특이적인 13개 역방향 프라이머(표 2)을 사용할 수 있다. Xn 및 Yn은 각각 길이 n 및 m의 폴리뉴클레오티드에 상응하고, 이는 분석의 판독에 사용되는 단일 분자 서열분석 기술에 특이적일 수 있다.
TRBV 유전자 세그먼트(s) | SEQ ID NO: | 프라이머 서열* |
TRBV2 | 1 | XnTCAAATTTCACTCTGAAGATCCGGTCCACAA |
TRBV3-1 | 2 | XnGCTCACTTAAATCTTCACATCAATTCCCTGG |
TRBV4-1 | 3 | XnCTTAAACCTTCACCTACACGCCCTGC |
TRBV(4-2, 4-3) | 4 | XnCTTATTCCTTCACCTACACACCCTGC |
TRBV5-1 | 5 | XnGCTCTGAGATGAATGTGAGCACCTTG |
TRBV5-3 | 6 | XnGCTCTGAGATGAATGTGAGTGCCTTG |
TRBV(5-4, 5-5, 5-6, 5-7, 5-8) | 7 | XnGCTCTGAGCTGAATGTGAACGCCTTG |
TRBV6-1 | 8 | XnTCGCTCAGGCTGGAGTCGGCTG |
TRBV(6-2, 6-3) | 9 | XnGCTGGGGTTGGAGTCGGCTG |
TRBV6-4 | 10 | XnCCCTCACGTTGGCGTCTGCTG |
TRBV6-5 | 11 | XnGCTCAGGCTGCTGTCGGCTG |
TRBV6-6 | 12 | XnCGCTCAGGCTGGAGTTGGCTG |
TRBV6-7 | 13 | XnCCCCTCAAGCTGGAGTCAGCTG |
TRBV6-8 | 14 | XnCACTCAGGCTGGTGTCGGCTG |
TRBV6-9 | 15 | XnCGCTCAGGCTGGAGTCAGCTG |
TRBV7-1 | 16 | XnCCACTCTGAAGTTCCAGCGCACAC |
TRBV7-2 | 17 | XnCACTCTGACGATCCAGCGCACAC |
TRBV7-3 | 18 | XnCTCTACTCTGAAGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-4 | 19 | XnCCACTCTGAAGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-6 | 20 | XnCACTCTGACGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-7 | 21 | XnCCACTCTGACGATTCAGCGCACAG |
TRBV7-8 | 22 | XnCCACTCTGAAGATCCAGCGCACAC |
TRBV7-9 | 23 | XnCACCTTGGAGATCCAGCGCACAG |
TRBV9 | 24 | XnGCACTCTGAACTAAACCTGAGCTCTCTG |
TRBV10-1 | 25 | XnCCCCTCACTCTGGAGTCTGCTG |
TRBV10-2 | 26 | XnCCCCCTCACTCTGGAGTCAGCTA |
TRBV10-3 | 27 | XnCCTCCTCACTCTGGAGTCCGCTA |
TRBV(11-1, 11-3) | 28 | XnCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAG |
TRBV11-2 | 29 | XnCTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAA |
TRBV(12-3, 12-4, 12-5) | 30 | XnCCACTCTGAAGATCCAGCCCTCAG |
TRBV13 | 31 | XnCATTCTGAACTGAACATGAGCTCCTTGG |
TRBV14 | 32 | XnCTACTCTGAAGGTGCAGCCTGCAG |
TRBV15 | 33 | XnGATAACTTCCAATCCAGGAGGCCGAACA |
TRBV16 | 34 | XnCTGTAGCCTTGAGATCCAGGCTACGA |
TRBV17 | 35 | XnCTTCCACGCTGAAGATCCATCCCG |
TRBV18 | 36 | XnGCATCCTGAGGATCCAGCAGGTAG |
TRBV19 | 37 | XnCCTCTCACTGTGACATCGGCCC |
TRBV20-1 | 38 | XnCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTG |
TRBV23-1 | 39 | XnCAGCCTGGCAATCCTGTCCTCAG |
TRBV24-1 | 40 | XnCTCCCTGTCCCTAGAGTCTGCCAT |
TRBV25-1 | 41 | XnCCCTGACCCTGGAGTCTGCCA |
TRBV27 | 42 | XnCCCTGATCCTGGAGTCGCCCA |
TRBV28 | 43 | XnCTCCCTGATTCTGGAGTCCGCCA |
TRBV29-1 | 44 | XnCTAACATTCTCAACTCTGACTGTGAGCAACA |
TRBV30 | 45 | XnCGGCAGTTCATCCTGAGTTCTAAGAAGC |
TRBJ 유전자 세그먼트 | SEQ ID NO: | 프라이머 서열* |
TRBJ1-1 | 46 | YmTTACCTACAACTGTGAGTCTGGTGCCTTGTCCAAA |
TRBJ1-2 | 47 | YmACCTACAACGGTTAACCTGGTCCCCGAACCGAA |
TRBJ1-3 | 48 | YmACCTACAACAGTGAGCCAACTTCCCTCTCCAAA |
TRBJ1-4 | 49 | YmCCAAGACAGAGAGCTGGGTTCCACTGCCAAA |
TRBJ1-5 | 483 | YmACCTAGGATGGAGAGTCGAGTCCCATCACCAAA |
TRBJ1-6 | 50 | YmCTGTCACAGTGAGCCTGGTCCCGTTCCCAAA |
TRBJ2-1 | 51 | YmCGGTGAGCCGTGTCCCTGGCCCGAA |
TRBJ2-2 | 52 | YmCCAGTACGGTCAGCCTAGAGCCTTCTCCAAA |
TRBJ2-3 | 53 | YmACTGTCAGCCGGGTGCCTGGGCCAAA |
TRBJ2-4 | 54 | YmAGAGCCGGGTCCCGGCGCCGAA |
TRBJ2-5 | 55 | YmGGAGCCGCGTGCCTGGCCCGAA |
TRBJ2-6 | 56 | YmGTCAGCCTGCTGCCGGCCCCGAA |
TRBJ2-7 | 57 | YmGTGAGCCTGGTGCCCGGCCCGAA |
표 1의 45개 정방향 PCR 프라이머는 48개 작용성 가변 세그먼트 각각에 상보성이고, 표 2의 13개 역방향 PCR 프라이머는 TRB 부위(TRBJ)로부터의 작용성 결합(J) 유전자 세그먼트 각각에 상보성이다. TRB V 영역 세그먼트는 서열번호: 114 내지 248의 서열목록에서 동정되고, TRB J 영역 세그먼트는 서열번호: 249 내지 261에서 동정된다. 프라이머는 적절한 정보가 증폭된 서열 내에 존재하여 V 및 J 유전자를 유니크하게 동정하도록 설계되었다(V 유전자 재조합 시그날 서열(RSS) 상류의 서열의 > 40개 염기 쌍 및 J 유전자 RSS 하류의 > 30개 염기 쌍). 대체 프라이머는 각 TCR 아단위 유전자의 V 및 J 영역으로부터 당업자에 의해 선택될 수 있다.
정방향 프라이머는 DNA 서열분석기(표 1의 Xn)에 적합한 범용 정방향 프라이머 서열로 5' 말단에서 변형된다. 유사하게는, 모든 역방향 프라이머는 범용 역방향 프라이머 서열(표 2의 Ym)로 변형된다. 이러한 범용 프라이머의 한 가지 예는 일루미나 GAII 단일 말단 판독 서열분석 시스템의 경우에 표 3 및 4에 제시되어 있다. 45개 TCR Vβ 정방향 프라이머는, 이들 프라이머 중에서 서열 보존을 최대화하도록, Vβ 세그먼트 사이의 비교적 강력한 서열 보존 영역에서 Vβ 세그먼트에 어닐링된다.
TRBV 유전자 세그먼트(s) | SEQ ID NO: | 프라이머 서열* |
TRBV2 | 58 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTTCAAATTTCACTCTGAAGATCCGGTCCACAA |
TRBV3-1 | 59 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTCACTTAAATCTTCACATCAATTCCCTGG |
TRBV4-1 | 60 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTTAAACCTTCACCTACACGCCCTGC |
TRBV(4-2, 4-3) | 61 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTTATTCCTTCACCTACACACCCTGC |
TRBV5-1 | 62 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTCTGAGATGAATGTGAGCACCTTG |
TRBV5-3 | 63 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTCTGAGATGAATGTGAGTGCCTTG |
TRBV(5-4, 5-5, 5-6, 5-7, 5-8) | 64 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTCTGAGCTGAATGTGAACGCCTTG |
TRBV6-1 | 65 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTTCGCTCAGGCTGGAGTCGGCTG |
TRBV(6-2, 6-3) | 66 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTGGGGTTGGAGTCGGCTG |
TRBV6-4 | 67 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCTCACGTTGGCGTCTGCTG |
TRBV6-5 | 68 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCTCAGGCTGCTGTCGGCTG |
TRBV6-6 | 69 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCGCTCAGGCTGGAGTTGGCTG |
TRBV6-7 | 70 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCCTCAAGCTGGAGTCAGCTG |
TRBV6-8 | 71 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCACTCAGGCTGGTGTCGGCTG |
TRBV6-9 | 72 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCGCTCAGGCTGGAGTCAGCTG |
TRBV7-1 | 73 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTGAAGTTCCAGCGCACAC |
TRBV7-2 | 74 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCACTCTGACGATCCAGCGCACAC |
TRBV7-3 | 75 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTCTACTCTGAAGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-4 | 76 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTGAAGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-6 | 77 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCACTCTGACGATCCAGCGCACAG |
TRBV7-7 | 78 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTGACGATTCAGCGCACAG |
TRBV7-8 | 79 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTGAAGATCCAGCGCACAC |
TRBV7-9 | 80 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCACCTTGGAGATCCAGCGCACAG |
TRBV9 | 81 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCACTCTGAACTAAACCTGAGCTCTCTG |
TRBV10-1 | 82 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCCTCACTCTGGAGTCTGCTG |
TRBV10-2 | 83 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCCCTCACTCTGGAGTCAGCTA |
TRBV10-3 | 84 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCTCCTCACTCTGGAGTCCGCTA |
TRBV(11-1, 11-3) | 85 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAG |
TRBV11-2 | 86 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAA |
TRBV(12-3, 12-4, 12-5) | 87 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCACTCTGAAGATCCAGCCCTCAG |
TRBV13 | 88 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCATTCTGAACTGAACATGAGCTCCTTGG |
TRBV14 | 89 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTACTCTGAAGGTGCAGCCTGCAG |
TRBV15 | 90 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGATAACTTCCAATCCAGGAGGCCGAACA |
TRBV16 | 91 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTGTAGCCTTGAGATCCAGGCTACGA |
TRBV17 | 92 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTTCCACGCTGAAGATCCATCCCG |
TRBV18 | 93 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTGCATCCTGAGGATCCAGCAGGTAG |
TRBV19 | 94 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCTCTCACTGTGACATCGGCCC |
TRBV20-1 | 95 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTG |
TRBV23-1 | 96 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCAGCCTGGCAATCCTGTCCTCAG |
TRBV24-1 | 97 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTCCCTGTCCCTAGAGTCTGCCAT |
TRBV25-1 | 98 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCTGACCCTGGAGTCTGCCA |
TRBV27 | 99 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCCCTGATCCTGGAGTCGCCCA |
TRBV28 | 100 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTCCCTGATTCTGGAGTCCGCCA |
TRBV29-1 | 101 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCTAACATTCTCAACTCTGACTGTGAGCAACA |
TRBV30 | 102 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCTCGGCAGTTCATCCTGAGTTCTAAGAAGC |
TRBJ 유전자 세그먼트 | SEQ ID NO: | 프라이머 서열* |
TRBJ1-1 | 103 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTTTACCTACAACTGTGAGTCTGGTGCCTTGTCCAAA |
TRBJ1-2 | 468 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACCTACAACGGTTAACCTGGTCCCCGAACCGAA |
TRBJ1-3 | 104 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACCTACAACAGTGAGCCAACTTCCCTCTCCAAA |
TRBJ1-4 | 105 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTCCAAGACAGAGAGCTGGGTTCCACTGCCAAA |
TRBJ1-5 | 484 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACCTAGGATGGAGAGTCGAGTCCCATCACCAAA |
TRBJ1-6 | 106 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTCTGTCACAGTGAGCCTGGTCCCGTTCCCAAA |
TRBJ2-1 | 107 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTCGGTGAGCCGTGTCCCTGGCCCGAA |
TRBJ2-2 | 108 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTCCAGTACGGTCAGCCTAGAGCCTTCTCCAAA |
TRBJ2-3 | 109 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACTGTCAGCCGGGTGCCTGGGCCAAA |
TRBJ2-4 | 110 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTAGAGCCGGGTCCCGGCGCCGAA |
TRBJ2-5 | 111 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTGGAGCCGCGTGCCTGGCCCGAA |
TRBJ2-6 | 112 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTGTCAGCCTGCTGCCGGCCCCGAA |
TRBJ2-7 | 113 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTGTGAGCCTGGTGCCCGGCCCGAA |
* 볼드체 서열은 서열 분석을 위한 범용 R 올리고뉴클레오티드를 나타낸다.
이 시스템을 사용하여 재배열된 TCRβ CDR3 영역에 대한 전체 PCR 생성물은 대략 200 bp 길이일 것으로 예상된다. 게놈 주형은 45개 TCR Vβ F 프라이머의 풀("VF 풀") 및 12개 TCR Jβ R 프라이머의 풀("JR 풀")을 사용하여 PCR 증폭시킨다. 예를 들면, 50 ㎕ PCR 반응물을 1.0 μM VF 풀(각각의 유니크 TCR Vβ F 프라이머에 대해 22 nM), 1.0 μM JR 풀(각각의 유니크 TCRBJR 프라이머에 대해 77 nM), IX QIAGEN 다중 PCR 마스터 혼합물(QIAGEN 파트 넘버 206145), 10% Q-용액(QIAGEN) 및 16 ng/㎕ gDNA와 함께 사용할 수 있다.
IGH 프라이머 세트는, 천연 B 세포의 초기 자극 후에 관찰되는 바와 같이, 재배열된 IGH 유전자 내의 체세포 초돌연변이에 대한 가능성을 조절하기 위해 설계되었다. 결과적으로, 모든 프라이머는 정상보다 약간 길게 설계되었고, 작용성 및 비작용성 체세포 돌연변이체 둘 다에 대해 내성이 있는 3개 이상의 뉴클레오티드의 고도 보존된 서열 내로 각 프라이머의 3' 말단을 고정하도록 설계되었다.
IGHJ 역방향 프라이머는 IGHJ 세그먼트 내의 고도 보존된 GGGG 서열 모티프 상에 각각의 PCR 프라이머의 3' 말단을 고정하도록 설계되었다. 이들 서열은 표 5에 제시되어 있다. 밑줄친 서열은 결실될 수 있는 RSS 내의 10개 염기 쌍이다. 이들은 바코드 설계로부터 제외되었다. 볼드체 서열은 IGH J 역방향 PCR 프라이머의 역방향 보체이다. 이탤릭체 서열은 J 동정을 위한 바코드이다(8개 바코드는 6개 유전자 및 유전자 내의 2개 대립유전자를 나타낸다). 밑줄친 세그먼트 내의 추가의 서열은 추가의 대립유전자 동정을 나타낼 수 있다.
IGHJ 역방향 PCR 프라이머의 서열은 표 6에 제시되어 있다.
V 프라이머는 2개의 보존된 트립토판(W) 코돈 사이의 FR2 보존 영역에 설계되었다.
프라이머 서열은 당해 코돈을 보존하는 모든 IGHV 부류에 있어서 트립토판 코돈 상의 3' 말단에 고정되어 있고, 마지막 3개 뉴클레오티드(트립토판의 TGG)는 체세포 초돌연변이에 대해 내성이 있는 것으로 예상되는 서열상에 고정되고, 이는 각 프라이머에 있어서 6개 뉴클레오티드 중의 5개 뉴클레오티드의 3' 고정을 제공한다. 상류 서열은 정상보다 추가로 연장되고, 디제너레이트(degenerate) 뉴클레오티드를 포함하여, 표 7에 제시된 바와 같이, 프라이머의 어닐링 특성을 현저하게 변화시키지 않고서 미스매치가 초돌연변이(또는 밀접하게 관련된 IGH V 부류 사이)에 의해 유도되도록 한다. V 유전자 세그먼트의 서열은 서열번호: 262 내지 420이다.
IgH V 세그먼트 | SEQ ID NO: | 서열 |
>IGHV1 | 443 | TGGGTGCACCAGGTCCANGNACAAGGGCTTGAGTGG |
>IGHV2 | 444 | TGGGTGCGACAGGCTCGNGNACAACGCCTTGAGTGG |
>IGHV3 | 445 | TGGGTGCGCCAGATGCCNGNGAAAGGCCTGGAGTGG |
>IGHV4 | 446 | TGGGTCCGCCAGSCYCCNGNGAAGGGGCTGGAGTGG |
>IGHV5 | 447 | TGGGTCCGCCAGGCTCCNGNAAAGGGGCTGGAGTGG |
>IGHV6 | 448 | TGGGTCTGCCAGGCTCCNGNGAAGGGGCAGGAGTGG |
>IGH7_3.25p | 449 | TGTGTCCGCCAGGCTCCAGGGAATGGGCTGGAGTTGG |
>IGH8_3.54p | 450 | TCAGATTCCCAAGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGAG |
>IGH9_3.63p | 451 | TGGGTCAATGAGACTCTAGGGAAGGGGCTGGAGGGAG |
열 사이클 조건은 당업자의 방법을 따를 수 있다. 예를 들면, PCR 발현 열 사이클러(Hybaid, Ashford,UK)를 사용하면, 하기 사이클 조건이 사용될 수 있다: 95℃에서 15분 동안 1회 사이클, 94℃에서 30초 동안, 59℃에서 30초 동안 및 72℃에서 1분 동안 25 내지 40회 사이클, 이어서 72℃에서 10분 동안 1회 사이클.
서열분석
서열분석은 증폭된 DNA 분자 내의 규정된 영역에 하이브리드화하는 서열분석 올리고뉴클레오티드 세트를 사용하여 달성된다.
바람직하게는, 증폭된 J 유전자 세그먼트는 각각 RSS 부위로부터 하류의 위치 +11 내지 +14에 유니크한 4개 염기 태그를 갖는다. 따라서, 서열분석 올리고뉴클레오티드는 RSS 부위 하류의 위치 +11 내지 +14에서 증폭된 Jβ 유전자 세그먼트 내에 4개 염기 태그에 인접하여 하이브리드화한다.
예를 들면, TCRB에 대한 서열분석 올리고뉴클레오티드는 당해 "태그"의 하류에서 관찰된 컨센서스 뉴클레오티드 모티프에 어닐링하도록 설계되어, 판독된 서열의 처음 4개 염기는 J 세그먼트를 유니크하게 동정할 것이다(표 8).
서열분석 올리고뉴클레오티드 | SEQ ID NO: | 올리고뉴클레오티드 서열 |
Jseq 1-1 | 470 | ACAACTGTGAGTCTGGTGCCTTGTCCAAAGAAA |
Jseq 1-2 | 471 | ACAACGGTTAACCTGGTCCCCGAACCGAAGGTG |
Jseq 1-3 | 472 | ACAACAGTGAGCCAACTTCCCTCTCCAAAATAT |
Jseq 1-4 | 473 | AAGACAGAGAGCTGGGTTCCACTGCCAAAAAAC |
Jseq 1-5 | 474 | AGGATGGAGAGTCGAGTCCCATCACCAAAATGC |
Jseq 1-6 | 475 | GTCACAGTGAGCCTGGTCCCGTTCCCAAAGTGG |
Jseq 2-1 | 476 | AGCACGGTGAGCCGTGTCCCTGGCCCGAAGAAC |
Jseq 2-2 | 477 | AGTACGGTCAGCCTAGAGCCTTCTCCAAAAAAC |
Jseq 2-3 | 478 | AGCACTGTCAGCCGGGTGCCTGGGCCAAAATAC |
Jseq 2-4 | 479 | AGCACTGAGAGCCGGGTCCCGGCGCCGAAGTAC |
Jseq 2-5 | 480 | AGCACCAGGAGCCGCGTGCCTGGCCCGAAGTAC |
Jseq 2-6 | 481 | AGCACGGTCAGCCTGCTGCCGGCCCCGAAAGTC |
Jseq 2-7 | 482 | GTGACCGTGAGCCTGGTGCCCGGCCCGAAGTAC |
판독된 서열의 J 및 V 세그먼트의 지정에 사용된 정보는 증폭된 서열 내에 전적으로 함유되어 있고, PCR 프라이머의 속성에 의존하지 않는다. 이들 서열분석 올리고뉴클레오티드를 선택하고, 이에 의해 또 다른 J 세그먼트에 특이적인 올리고뉴클레오티드에 의한 하나의 J 세그먼트에 대한 서열분석 반응의 혼잡 프라이밍은 올바른 서열분석 올리고뉴클레오티드로부터의 서열 데이터와 동일한 뉴클레오티드를 정확하게 개시하는 서열 데이터를 생성할 수 있다. 이러한 방식으로, 서열분석 올리고뉴클레오티드의 혼잡 어닐링은 생성된 서열 데이터의 품질에 영향을 미치지 않았다.
V 세그먼트의 제2 보존된 시스테인과 J 세그먼트의 보존된 페닐알라닌 사이의 뉴클레오티드로서 규정된 CDR3 영역의 평균 길이는 35±3이고, 따라서 Jβ 세그먼트 태그로부터 개시하는 서열은 판독된 50개 염기 쌍에서 완벽한 V-D-J 결합을 거의 언제나 포획할 것이다.
TCR βJ 유전자 세그먼트는 길이가 대략 50개 염기쌍이다. 미스매치된 서열을 어닐링하고 연장시키는 PCR 프라이머는 혼잡 프라이머로서 지칭된다. TCR Jβ 역방향 PCR 프라이머는 서열분석 올리고뉴클레오티드와의 중첩을 최소화하여 다중 PCR과 관련하여 혼잡 프라이밍을 최소화하도록 설계된다. 13개 TCR Jβ 역방향 프라이머는 서열분석 프라이머와의 최소 중첩과 함께 컨센서스 스플라이스 부위 모티프의 3' 말단에 고정된다. TCR Jβ 프라이머는 디폴트 파라미터하에 서열분석 프로그램을 사용하는 일정 어닐링 온도를 제공한다.
서열분석 반응에 있어서, IGHJ 서열분석 프라이머는 표 9에 제시된 바와 같이 보존된 CAG 서열까지 3개 뉴클레오티드가 이어져 있다.
서열 데이터의 처리
서열분석 결과의 신속한 분석을 위해, 알고리즘이 당업자에 의해 개발될 수 있다. 바람직한 방법은 다음과 같다.
서열분석 전에 TCRβ CDR3 영역을 증폭시키는 PCR 단계의 사용은, 상이한 Vβ 및 Jβ 유전자 세그먼트를 사용하는 CDR3 영역의 PCR 증폭 효율에 있어서의 차이에 기인하여, 당해 서열의 추정된 상대적 풍부함(abundance)에서 조직적인 바이어스를 잠재적으로 도입할 수 있다. 각각의 PCR 증폭 사이클은 평균 크기 1.51/15=1.027의 바이어스를 잠재적으로 도입한다. 따라서, 25회 사이클의 PCR은 독특한 CDR3 영역 서열의 추정된 상대적 풍부함에서 평균 크기 1.02725=1.95의 전체 바이어스를 도입한다.
서열분석된 판독치를 CDR3 서열을 포함하는 것들에 대해 여과한다. 서열분석기 데이터 처리는 각 판독치의 1차 서열에서 에러를 제거하고 당해 데이터를 압축하는 일련의 단계를 수반한다. 복잡성 여과기는 서열분석기로부터 잘목 판독한 서열의 대략 20%를 제거한다. 이어서, 서열은 13개 TCRB J-영역 중의 하나 및 54 V-영역 중의 하나 둘 다에 대해 최소의 6개 염기 매치를 갖도록 하는 것이 필요하다. 파지(phage) 서열을 함유하는 대조군 레인에 필터를 적용하면, 7백만 내지 8백만 개 서열 중의 단지 하나의 서열만이 이들 단계를 통과했다. 마지막으로, 가장 인접한 알고리즘을 사용하여, PCR 에러 및 서열분석 에러 둘 다를 제거하기 위해, 밀접하게 관련된 서열의 병합에 의해 당해 데이터를 유니크 서열로 정리한다.
당해 데이터를 분석하면, PCR 생성물 중의 서열 비율은 혈액에서 클론형의 진정한 분포를 평가하기 전에 서열 데이터로부터 역방향으로 유도된 작업이어야 한다. 관찰된 각 서열에 있어서, 본원의 데이터에서 소정 수의 시간, 즉 당해 서열이 특정 크기의 PCR 풀로부터 샘플링되는 가능성이 평가된다. 서열분석된 CDR3 영역이 PCR 생성물의 대규모 풀로부터 무작위로 샘플링되기 때문에, 각 서열에 대한 관찰 수는 푸아송(Poisson) 분포로부터 수득했다. 푸아송 파라미터는 PCR용 주형을 제공한 T 세포 게놈의 수에 따라 정량화된다. 단순한 푸아송 혼합물 모델은 둘 다 이들 파라미터를 평가하고 각 분포로부터 수득되는 각 서열에 대한 쌍대 확률(pairwise probability)을 제공한다. 이는 혈액으로부터 수득한 각 서열의 풍부함을 재구성하는 기대 최대화 방법이다.
다양성을 평가하기 위해, "미지 종(unseen species)" 공식이 사용된다. 당해 공식을 적용하기 위해, 유니크한 적응 면역 수용체(예: TCRB) 클론형을 종 대신에 취한다. 수학적 해결책은 TCRβ"종" 또는 클론형의 전체 수, S에 대해, 서열분석 실험이 서열 s의 x s 복제를 관찰함을 제공한다. 모든 관찰되지 않은 클론형에 있어서, x s 는 0이고, 각각 TCR 클론형은 파라미터 λs를 갖는 푸아송 방법에 따라 채혈로 "포획된다". T 세포 게놈의 수는 제1 측정 1 및 제2 측정에서 서열분석된다. 다수의 유니크 서열이 존재하기 때문에, 적분은 합을 나타낸다. G(λ)가 파라미터 λ1, ···, λs의 경험적 분포 함수이고, nx이 정확하게 x배 서열분석된 클론형의 수이면, 클론형의 전체 수, 즉 다양성 E의 측정치는 다음 수학식에 의해 제공된다:
소정 실험에 있어서, T 세포가 몇몇 임의 공급원(채혈)으로부터 샘플링되는 경우, 당해 수학식을 사용하여 전체 공급원 중의 종의 전체 다양성을 평가한다. 당해 아이디어는 각 크기에서 클론형의 샘플링된 수가 전체 공급원 내의 클론형의 근본적인 분포를 평가하기에 충분한 정보를 함유한다는 것이다. 당해 수학식을 유도하기 위해, 정확한 측정을 반복하는 경우에 예상되는 새로운 종의 수를 평가했다. 수학식의 한계는 측정을 무한대로 반복해도 존재한다. 당해 결과는 전체 근본적인 공급원 모집단에서 종의 기대 수이다. 값 △(t), 즉 제2 측정으로 관찰된 신규 클론형의 수는 바람직하게는 하기 수학식을 사용하여 측정되어야 한다:
상기 수학식에서, msmt1 및 msmt2는 각각 측정 1 및 2로부터 클론형의 수이다. 1-e - λt의 테일러 팽창은 △(t)= E(x 1 )t-E(x 2 )t 2 +E(x 3 )t 3 -....을 제공하고, 이는 기대치 E( n x )를 제1 측정에서 관찰된 수로 치환함으로써 접근할 수 있다. 제1 측정에서 관찰된 수에 사용하여, 이 수학식은 1.6×105 신규한 유니크 서열이 제2 측정에서 관찰되어야 한다는 것을 예상한다. 제2 측정의 실제 값은 1.8×105 신규 TCRβ 서열이었고, 이는 예상이 전체 다양성에 대한 유효한 하한을 제공한다는 것을 암시한다. 오일러 변형(Euler's transformation)이 △(∞)을 위한 하한을 생성하기 위해 △(t)를 조정하는데 사용되었다.
다양성 측정을 사용한 질환의 진단
다양성의 측정을 하기와 같이 질환 또는 치료 효과 진단에 사용할 수 있다. T 세포 및/또는 B 세포 수용체 레퍼토리를, 예를 들면, 백혈병에 대한 조혈 간세포 이식(HSCT) 치료 후에 다양한 시점에서 측정할 수 있다. TCRB 레퍼토리의 다양성의 변화 및 전체 다양성의 변화 둘 다를 사용하여 면역능력을 측정할 수 있다. 이식 후의 면역 재구성의 예상 속도에 대한 기준이 사용된다. 임의의 두 시점 사이의 다양성의 변화 속도를 사용하여 치료를 적극적으로 변형시킬 수 있다. 고정된 시점에서의 전체 다양성이 또한 중요한 척도이고, 이는 당해 기준을 사용하여 상이한 환자를 비교할 수 있기 때문이다. 특히, 전체 다양성은 면역 재구성의 임상적 정의와 상호관련되어야 하는 척도이다. 이 정보를 사용하여, 예를 들면, HSCT 후에 항생제, 항바이러스제 및 항균제의 예방적 약물 섭생을 변형시킬 수 있다.
동종이계 조혈 세포 이식 후의 면역 재구성의 평가는 다양성의 변화를 측정하여 결정할 수 있다. 이들 기술은 또한, 백신접종에 대한 T 세포 반응의 분석에 의해 측정한 바와 같이, 노화에 따르는 임파구 다양성 감퇴의 분석을 향상시킬 수 있다. 추가로, 본 발명의 방법은 αβ T 세포의 생성, 성장 및 발달에 대해 직접 효과를 갖는 조사 치료제(예: 인터류킨-7(IL-7))를 평가하는 수단을 제공한다. 더욱이, 이들 기술을 흉선 T 세포 모집단의 연구에 적용하는 것은 흉선세포의 포지티브 및 네가티브 선택 뿐만 아니라 T 세포 수용체 유전자 재배열의 과정을 통찰할 것이다.
충분한 작용성 면역계를 갖지 않지만 모계 전달된 항체를 가질 수 있는 신생아는 면역결핍 상태이다. 신생아는 이의 면역계가 자동적으로 발달할 때까지 다수의 질병에 감수성이고, 본 발명의 적응 면역계의 측정은 신생아 환자에서 유용성을 입증할 것이다.
임파구 다양성은 기타 선천적 또는 후천적 면역결핍 상태에서 평가될 수 있다. 면역계가 약화되었거나 약화되고 있는 AIDS 환자를 모니터링하여, 질환 단계를 측정하고 면역능력의 재구성을 목적으로 하는 요법에 대한 환자의 반응을 측정할 수 있다.
본 발명의 방법의 또 다른 적용은 수용체 신체가 공여된 기관을 거부하지 않도록 약물 치료 중인 고체 기관 이식 수용체를 위한 진단적 측정법을 제공하는 것이다. 일반적으로, 이들 환자는 면역억제 요법하에 있다. 숙주의 면역능력의 모니터링은 이식 전후에 보조할 수 있다.
방사선 또는 화학요법 약물에 노출된 개체는 골수 이식을 하거나, 달리는 관련된 면역능력과 함께 T 세포 모집단의 보충을 필요로 한다. 본 발명의 방법은 골수 이식 또는 이들 치료 과정에서 림프구의 재구성을 정성적 및 정량적으로 평가하는 수단을 제공한다.
다양성을 측정하는 한 가지 방식은, 게놈 DNA의 적어도 2개 샘플을 비교하는 것이며, 바람직하게는 게놈 DNA 중의 하나의 샘플은 환자의 것이고 다른 샘플은 정상 피검체의 것이거나, 달리는 게놈 DNA의 하나의 샘플은 치료학적 처리 전의 환자의 것이고 다른 샘플은 치료 후의 환자의 것이거나, 게놈 DNA의 2개 샘플이 치료 동안 상이한 시점에서의 동일한 환자의 것이다. 또 다른 진단 방식은, 예를 들면, 사람 환자의 면역능력이 비교에 의해 평가되는, 게놈 DNA의 샘플 중에서 다양성의 비교에 기반할 수 있다.
바이오마커
개체 사이의 공유된 TCR 서열은 암, 자가면역 질환 및 감염성 질환을 포함하는 다양한 질병에 대한 새로운 부류의 잠재적 바이오마커를 나타낸다. 이들은 다수의 사람 질환에 대해 보고된 공공 T 세포이다. TCR은 T 세포가 클론 연장의 결과이기 때문에 바이오마커로서 유용하며, 이에 의해 면역계는 신속한 세포 분열을 통해 이들 바이오마커를 증폭시킨다. 증폭 후에, TCR은 표적이 작은 경우(예: 초기 단계 종양)에도 용이하게 검출된다. TCR은 또한, 다수의 경우에 T 세포가 추가로 원인이 되어 질환에 관여할 수 있고 따라서 약물 표적을 구성할 수 있기 때문에 바이오마커로서 유용하다. T 세포 자가 상호작용은 자가면역과 관련된 몇몇 질환, 예를 들면, 다발성 경화증, I형 당뇨병 및 류마티스성 관절염에서 중요 역할을 담당하는 것으로 생각된다.
적응 면역계 세포로부터 추출한 핵산의 대규모 서열분석을 사용하여 T 세포 수용체 유전자 또는 항체 유전자의 다양성을 분석함으로써 환자의 적응 면역을 측정 할 수 있다. 그로 인해 본 발명의 방법은 면역계를 손상시키는 질환 또는 상태, 및 재구성을 목적으로 하는 치료법의 효과를 평가하는 수단을 제공할 수 있다.
실시예
실시예
1: 샘플 획득,
PBMC
분리,
FACS
분류 및 게놈
DNA
추출
35세 및 37세의 2명의 건강한 남성 공여체로부터의 말초 혈액 샘플은 프레드 허친슨 암 연구 센터(FHCRC)의 임상 심사 위원회로부터 승인된 형식을 사용하여 서면 고지에 입각한 동의와 함께 수득했다. 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)는 Ficoll-Hypaque® 밀도 구배 분리로 분리했다. T-림프구는 각 대상 CD8+CD45RO+/- 및 CD4+CD45RO+/-에 대해 4개의 구획으로 유동 분류했다. 림프구의 특성화를 위해, 다음과 같이 접합된 항-사람 항체를 사용했다: CD4 FITC(클론 M-T466, Miltenyi Biotec), CD8 PE(클론 RPA-T8, BD Biosciences), CD45RO ECD(클론 UCHL-1, Beckman Coulter) 및 CD45RO APC(클론 UCHL-1, BD Biosciences). 전체 PBMC의 염색은 4℃에서 20분 동안 적합한 항체의 조합으로 수행하고, 염색된 세포를 분석 전에 1회 세척했다. 림프구 아집단을 BD FACSAriaTM 세포-분류 시스템(BD Biosciences)으로 FACS 분류로 분리했다. 데이터는 FlowJo 소프트웨어(Treestar Inc.)를 사용하여 분석했다.
전체 게놈 DNA를 분류된 세포로부터 QIAamp®DNA 혈액 미니 키트(QIAGEN®)를 사용하여 추출시켰다. 단일 반수체 게놈의 대략적인 질량은 3 pg이다. 각 T 세포 구획에서 수백만 개의 재배열된 TCRB를 샘플링하기 위해, 6 내지 27 ㎍의 주형 DNA를 각 구획으로부터 수득했다(참조: 표 10).
CD8+/CD45RO- | CD8+/CD45RO+ | CD4+/CD45RO- | CD4+/CD45RO+ | 공여체 | |
세포(x106) | 9.9 | 6.3 | 6.3 | 10 | 2 |
DNA(ug) | 27 | 13 | 19 | 25 | |
PCR 사이클 | 25 | 25 | 30 | 30 | |
클러스터 (K/tile) | 29.3 | 27 | 102.3* | 118.3* | |
VJ 서열(x106) | 3.0 | 2.0 | 4.4 | 4.2 | |
세포 | 4.9 | 4.8 | 3.3 | 9 | 1 |
DNA | 12 | 13 | 6.6 | 19 | |
PCR 사이클 | 30 | 30 | 30 | 30 | |
클러스터 | 116.3 | 121 | 119.5 | 124.6 | |
VJ 서열 | 3.2 | 3.7 | 4.0 | 3.8 | |
세포 | NA | NA | NA | 0.03 | PCR 바이어스 평가 |
DNA | NA | NA | NA | 0.015 | |
PCR 사이클 | NA | NA | NA | 25 + 15 | |
클러스터 | NA | NA | NA | 1.4 / 23.8 | |
VJ 서열 | NA | NA | NA | 1.6 |
실시예
2: 실질적 T 세포 수용체 β 쇄 스펙트라타이핑
실질적 TCR β 쇄 스펙트라타이핑은 다음과 같이 수행했다. 상보성 DNA는 분류된 T 세포 집단으로부터 추출된 RNA로부터 합성했고, 재배열된 TCR β 쇄 CDR3 영역의 다중 PCR 증폭용 주형으로서 사용했다. 각 다중 반응은 TCR β 쇄 불변 영역에 특이적인 6-FAM-표지된 안티센스 프라이머, 및 2 내지 5개의 TCR β 쇄 가변(TRBV) 유전자 특이적 센스 프라이머를 함유한다. 모든 23개의 작용성 Vβ 부류를 연구했다. PCR 반응은 다음 사이클 조건하에 하이바이드(Hybaid) PCR 고속 열 사이클러(Hybaid, Ashford, UK) 상에서 수행했다: 95℃에서 6분 동안 1 사이클, 94℃에서 30초 동안, 58℃에서 30초 동안 및 72℃에서 40초 동안 40 사이클, 이어서 72℃에서 10분 동안 1 사이클. 각 반응은 최종 용적 20 ㎕로 cDNA 주형, 500 uM dNTP, 2 mM MgCl2 및 AmpliTaq 골드 완충제 중의 AmpliTaq 골드 DNA 폴리머라제(Perkin Elmer) 1 유닛을 함유한다. 완료 후, PCR 생성물의 분획을 1:50으로 희석하고, DNA 분석기를 사용하여 분석했다. DNA 분석기의 아웃풋은 공지된 크기 표준을 함유하는 참조 샘플의 형광 강도 자취를 비교하여 형광 강도 대 길이의 분포로 전환시켰다.
실시예
3:
TCR
β
CDR3
영역의 다중
PCR
증폭
CDR3 결합(junction) 영역은 다음과 같이 조작적으로 규정된다. 결합은 V-영역의 제2 보존된 시스테인으로 개시하여 J-영역의 보존된 페닐알라닌으로 종결된다. 관찰된 서열의 역방향 보충물을 취하고 플랭킹 영역을 해독하여, 결합 경계를 정의하는 아미노산을 동정했다. 이들 경계 사이의 뉴클레오티드의 수는 길이를 결정하고, 따라서 CDR3 영역의 프레임을 결정한다. 서열분석을 위한 주형 라이브러리를 생성하기 위해, 다중 PCR 시스템을 선택하여 게놈 DNA로부터 재배열된 TCRβ 부위를 증폭시켰다. 다중 PCR 시스템은 각각 작용성 TCR Vβ 세그먼트에 특이적인 45개의 정방향 프라이머(표 3), 및 각각 TCR Jβ 세그먼트에 특이적인 13개의 역방향 프라이머(표 4)를 사용한다. 프라이머를 선택하여, 적당한 정보가 증폭된 서열 내에 존재하여 V 및 J 유전자를 유니크하게 동정하는 것을 제공한다(V 유전자 재조합 시그날 서열(RSS)의 서열 상류의 40개 초과 염기 쌍, 및 J 유전자 RSS의 하류의 30개 초과 염기 쌍).
정방향 프라이머는 5' 말단에서 일루미나 GA2 클러스터 스테이션 고체-상 PCR과 상용성인 범용 정방향 프라이머 서열로 변형된다. 유사하게는, 역방향 프라이머 모두는 GA2 범용 역방향 프라이머 서열로 변형된다. 각 정방향 프라이머의 3' 말단은 재조합 시그날 서열(RSS)에 비해 Vβ 세그먼트 중의 위치 -43에서 고정되어 증폭된 영역 내에서 유니크한 Vβ 태그 서열을 제공한다. 각 Jβ 세그먼트에 특이적인 13개의 역방향 프라이머를, 각 프라이머의 3' 말단을 인트론/엑손 접합을 교차시키면서, 3' 인트론에 고정시켰다. Jβ 세그먼트의 증폭된 부분에 상보성인 Jβ 세그먼트에 상보성인 13개의 서열분석 프라이머를 설계하여, 서열의 처음 소수의 염기가 유니크한 Jβ 태그 서열을 포획하도록 한다.
평균 J 결실은 4bp +/- 2.5bp 이고, 이는 10개 초과의 뉴클레오티드의 J 결실이 1% 미만의 서열에서 발생한다는 것을 의미한다. 13개의 상이한 TCR Jβ 유전자 세그먼트는 각각 RSS 부위 하류의 위치 +11 내지 +14에서 유니크한 4개의 염기 태그를 가졌다. 따라서, 올리고뉴클레오티드의 서열분석은 이 "태그"의 바로 하류에서 관찰된 컨센서스 뉴클레오티드 모티프에 어닐링되도록 설계되어, 서열 판독의 처음 4개 염기가 J 세그먼트를 유니크하게 동정하도록 했다(표 5).
서열 판독의 J 및 V 세그먼트를 지정하는데 사용되는 정보는 증폭된 서열에 완전히 함유되고, PCR 프라이머의 동일성에 의존하지 않는다. 이러한 서열분석 올리고뉴클레오티드를 선택하여, 다른 J 세그먼트에 특이적인 올리고뉴클레오티드에 의한 하나의 J 세그먼트에 대한 서열분석 반응의 혼잡 프라이밍이 올바른 서열분석 올리고뉴클레오티드로부터의 서열 데이터로서 동일한 뉴클레오티드에서 정확하게 개시하는 서열 데이터를 생성할 수 있다. 이러한 방식으로, 서열분석 올리고뉴클레오티드의 혼잡 어닐링은 생성된 서열 데이터의 품질에 영향을 미치지 않았다.
V 세그먼트의 제2 보존된 시스테인과 J 세그먼트의 보존된 페닐알라닌 사이의 뉴클레오티드로서 관례에 따라 정의된 CDR3 영역의 평균 길이는 35+/-3이고, 따라서 Jβ 세그먼트 태그로부터 개시하는 서열은 거의 항상 50 bp 판독에서 완전한 VNDNJ 결합을 포획한다.
TCR βJ 유전자 세그먼트는 길이가 대략 50 bp이다. 미스매치 서열에 어닐링되어 연장되는 PCR 프라이머는 혼잡 프라이머로서 칭명된다. 다중 PCR의 맥락에서, 특히 유전자 부류 맥락에서 혼잡 프라이밍의 위험 때문에, TCR Jβ 역방향 PCR 프라이머를 서열분석 올리고뉴클레오티드와의 중첩을 최소화하도록 설계했다. 따라서, 13개 TCR Jβ 역방향 프라이머를 서열분석 프라이머와의 최소 중첩으로 컨센서스 스플라이싱 부위 모티프 상의 3' 말단에 고정시킨다.
TCR Jβ 프라이머를 디폴트 파라미터하에 OligoCalc 프로그램(http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html)을 사용하여 일정한 어닐링 온도(50 mM 염 중 58°)를 위해 설계했다 .
45개의 TCR Vβ 정방향 프라이머는, 두가지 명시적 목적을 위해, Vβ 세그먼트 사이의 비교적 강력한 서열 보존 영역에서 Vβ 세그먼트에 어닐링하도록 설계했다. 첫째, 이들 프라이머 사이의 서열 보존의 최대화는 각 프라이머의 차별(differential) 어닐링 특성에 대한 가능성을 최소화한다. 둘째, 프라이머는 V 및 J 프라이머 사이의 증폭된 영역이 사용된 특이적 Vβ유전자 세그먼트를 동정하기에 충분한 TCR Vβ 서열 정보를 함유하도록 선택했다. 이는 TCR Vβ 프라이머에 의한 혼잡 프라이밍의 경우에, 잘못된 TCR Vβ유전자 세그먼트 지정 위험을 제거한다. TCR Vβ 정방향 프라이머는 TCRβ 부위에서 모든 공지된 비-위유전자용(non-pseudogene)으로 설계되었다.
이러한 시스템을 사용하여 성공적으로 재배열된 TCRβ CDR3 영역을 위한 전체 PCR 생성물은 길이가 약 200 bp일 것으로 기대된다. 게놈 주형은 45개 TCR Vβ F 프라이머의 등몰량 풀("VF 풀") 및 13개 TCR Jβ R 프라이머의 등몰량 풀("JR 풀")을 사용하여 PCR 증폭시켰다. 50 ㎕ PCR 반응을 1.0 μM VF 풀(각각의 유니크한 TCR Vβ F 프라이머에 대해 22 nM), 1.0 μM JR 풀(각각의 유니크한 TCRBJR 프라이머에 대해 77 nM), 1X QIAGEN 다중 PCR 마스터 혼합물(QIAGEN 파트 번호 206145), 10% Q-용액(QIAGEN) 및 16 ng/ul gDNA로 설정했다. 하기 열 사이클 조건을 다음 사이클 조건하에 PCR 고속 열 사이클러(Hybaid, Ashford, UK)에 사용했다: 95℃에서 15분 동안 1 사이클, 94℃에서 30초 동안, 59℃에서 30초 동안 및 72℃에서 1분 동안 25 내지 40사이클, 이어서 72℃에서 10분 동안 1 사이클. PCR의 12 내지 20개 웰을, 재배열된 TCRβ CDR3 부위의 수천 내지 수백만 중의 수백을 샘플링하기 위해 각 라이브러리에 대해 수행했다.
실시예
4: 서열
데이터의
전처리
서열분석기 데이터 처리는 각 판독의 1차 서열에서 에러를 제거하고, 데이터를 압축하는 일련의 단계를 포함한다. 첫째, 복합성 필터는 서열분석기로부터 잘못 판독된 서열의 약 20%를 제거한다. 이어서, 서열은 13개 J-영역 중의 하나 및 54개 V-영역 중의 하나 모두에 대한 최소 6개의 염기 매치를 가질 것을 필요로 했다. 파지 서열을 함유하는 대조군 레인에 필터를 적용한 후, 평균 7백만 내지 8백만 중의 단지 하나의 서열만이 펄스(false) 포지티브 없이 이들 단계를 통과했다. 최종적으로, 가장 근접한 알고리즘을 사용하여 밀접하게 관련된 서열의 병합에 의해 데이터를 유니크한 서열로 정리함으로써 PCR 에러 및 서열분석 에러 둘 다를 제거했다(참조: 표 10).
실시예
5:
PCR
풀 및 혈액 샘플 중의 상대적
CDR3
서열 풍부함 평가
데이터 정리 후, 혈액 재구성에서 T-세포 서열의 근본적 분포는 서열 데이터로부터 유도했다. 과정은 다음 3단계를 사용한다: 1) 말초 혈액으로부터 채취한 T-세포 유동 분류, 2) PCR 증폭 및 3) 서열분석. 데이터를 분석하여, PCR 생성물 중의 서열 비율은, 혈액 중의 클론형의 진정한 분포를 평가하기 전에, 서열 데이터로부터 역방향 작업으로 유도되어야 한다.
본원의 데이터에서 소정의 시간에 관찰된 각 서열에 있어서, 당해 서열이 특정 크기의 PCR 풀로부터 샘플링되는 확률을 평가한다. 서열분석된 CDR3 영역은 PCR 생성물의 대규모 풀로부터 무작위로 샘플링되기 때문에, 각 서열에 대한 관찰 수는 푸아송 분포(Poisson distributions)로부터 수득된다. 푸아송 변수는 PCR용 주형을 제공한 T 세포 게놈의 수에 따라 정량화된다. 단순한 푸아송 혼합물 모델은 이들 파라미터를 평가하고, 각 분포로부터 수득된 각 서열에 대한 쌍대 확률을 제공한다. 이는 혈액으로부터 수득된 각 서열의 풍부함을 재구성하는 기대 최대화 방법이다.
실시예
6: 진정한 다양성 평가를 위한 미지 종 모델
혼합물 모델은 혈액으로부터 수득한 각 TCRβ CDR3 종의 도수를 재구성할 수 있지만, 더 큰 문제는 얼마나 많은 유니크한 CDR3 종이 공여체에 존재하는지의 여부이다. 이는 이용가능한 샘플이 각 공여체 중에서 제한되고, 이들 기술이 치료를 받는 환자에게서 합리적으로 수득될 수 있는 보다 작은 용적의 혈액으로 외삽됨에 따라 장래에 보다 중요해지기 때문에 대답할 필요가 있는 기본적인 질문이다.
수학적인 해결책은 TCRβ"종" 또는 클론형의 전체 수, S에 대해, 서열분석 실험은 서열 s의 x s 복제를 관찰한다. 모든 관찰되지 않은 클론형에 있어서, x s 는 0이고, 각 TCR 클론형은 변수 λs를 갖는 푸아송 방법에 따라 채혈로 "포획된다". T 세포 게놈의 수는 제1 측정 1, 및 제2 측정에서 서열분석된다. 다수의 유니크 서열이 존재하기 때문에, 적분은 합을 나타낸다. G(λ)가 변수 λ1, ···, λs의 경험적 분포 함수이고, nx가 정확하게 x배 서열분석된 클론형의 수이면, 다음과 같다:
값 △(t)는 제2 서열분석 실험에서 관찰된 신규 클론형의 수이다.
1-e - λt의 테일러 팽창은 △(t)= E(x 1 )t-E(x 2 )t 2 +E(x 3 )t 3 -....을 제공하고, 이는 기대치 E( n x )를 제1 측정에서 관찰된 수로 치환함으로써 접근할 수 있다. 제1 측정에서 관찰된 수에 사용하여, 이 수학식은 1.6×105개 신규 유니크 서열이 제2 측정에서 관찰되어야 한다는 것을 예측한다. 제2 측정의 실제 값은 1.8×105개 신규 TCRβ 서열이었고, 이는 예측이 전체 다양성에 대한 유효한 하한을 제공한다는 것을 암시한다. 오일러 변형(Euler's transformation)이 △(∞)을 위한 하한을 생성하기 위해 △(t)를 조정하는데 사용되었다.
실시예
7: 에러 보정 및 바이어스 평가
1차 서열 데이터에서 서열 에러는 다음 2개의 공급원으로부터 주로 유도한다: (1) TCRβ CDR3 주형 서열의 PCR에 의한 증폭 동안 발생하는 뉴클레오티드 오편입, 및 (2) CDR3 서열의 PCR-증폭된 라이브러리의 서열분석 동안 도입된 기본 호출의 에러. 대량의 데이터는 이러한 2개의 공급원에 기인하는 1차 서열 데이터에서 대부분의 에러를 보정하는 올바른 에러 보정 방식을 실행하도록 한다. 에러 보정 후, 프레임내 유니크 CDR3 서열의 수 및 각 유니크 서열의 관찰 수는 두 공여체로부터 4개의 유동 분류된 T 세포 모집단 각각에 대해 표로 만들었다. 4개의 유동 혈구계산에 의해 정의된 모집단에서 CDR3 서열의 상대 도수 분포는 항원-경험 CD45RO+ 모집단이 CD45RO- 모집단보다 높은 상대 도수로 상당히 많은 유니크 CDR3 서열을 함유한다는 것을 증명한다. CD4, CD8 및 CD45RO의 발현에 의해 구별되고, 혈액에 존재하는 4개의 상이한 T 세포 아집단에서 관찰된 TCRβ CDR3 서열의 도수 막대그래프는 10개의 유니크 서열이 각각 CD4+CD45RO+(항원 경험) T 세포 샘플에서 200회 관찰되었고, 이는 CD4+CD45RO- 모집단에서 관찰된 도수의 2배 이상이었다는 것을 보여주었다.
서열분석 직전에 TCRβCDR3 영역을 증폭시키는 PCR 단계의 사용은 상이한 Vβ 및 Jβ 유전자 세그먼트를 사용하는 CDR3 영역의 PCR 증폭 효율의 차이에 기인하여 서열의 추정된 상대적 풍부함에 조직적 바이어스를 잠재적으로 도입할 수 있다. 이러한 임의의 바이어스의 크기를 평가하기 위해, 약 30,000개의 유니크 CD4+CD45RO+ T 림프구 게놈 샘플로부터 TCRβCDR3 영역을 PCR의 25 사이클을 통해 증폭시켰고, 이 때 PCR 생성물을 절반으로 갈랐다. PCR 생성물의 절반은 비축하고, 나머지 절반은 PCR의 추가 15 사이클 동안, 전체 40 사이클 증폭 동안 증폭시켰다. 이어서, 25 사이클 및 40 사이클 동안 증폭된 PCR 생성물을 서열분석하고 비교했다. 25 사이클 서열의 95% 이상이 또한 40 사이클 샘플에서 발견되었고, 이들 샘플 사이의 서열의 도수를 비교할 경우, 선형 상관(linear correlation)이 관찰된다. 25 사이클 레인에서 소정수 관찰된 서열에 있어서, PCR 바이어스 및 추출 변동(sampling variance)의 조합은 40 사이클에서 관찰수의 평균에 대한 변동을 설명한다. 보존적으로 선에 대한 평균 변동(1.5배)이 전적으로 PCR 바이어스에 있다고 간주하여, PCR 증폭의 각 사이클은 평균 크기 1.51/15 = 1.027의 바이어스를 잠재적으로 도입한다. 따라서, PCR의 25 사이클은 명백한 CDR3 영역 서열의 추정된 상대적 풍부함에서 평균 크기 1.02725 = 1.95의 전체 바이어스를 도입한다.
실시예
8: Jβ 유전자
세그먼트
사용
각 TCR β 쇄 중의 CDR3 영역은 13개의 Jβ 유전자 세그먼트 중의 하나로부터 유도된 서열을 포함한다. 2개 공여체로부터의 4개의 상이한 T 세포 모집단에서 CDR3 서열의 분석은 13개의 상이한 Jβ 유전자 세그먼트로부터 유도된 서열을 도입한 전체 서열의 분획이 20배 이상 변한다는 것을 증명한다. 단일 공여체로부터 4개의 상이한 T 유동 혈구계산에 의해 정의된 T 세포 중 Jβ 사용은 소정의 공여체 내에서 비교적 일정했다. 또한, 2개 공여체 중에서 관찰되고, GA를 사용하여 서열분석된 T 세포로부터 게놈 DNA의 분석에 의해 추정된 Jβ 사용 패턴은 제대혈로부터 및 건강한 성인 공여체로부터의 T 세포에서 관찰된 것과 정성적으로 유사하고, 이들 둘 다는 소모적 모세관 기반 기술을 사용하여 서열분석된 T 세포로부터 cDNA의 분석으로부터 추정되었다.
실시예
9: 뉴클레오티드 삽입 바이어스
TCR α 및 β 쇄 중의 CDR3 결합부에서 다량의 다양성은 효소 말단 데옥시뉴클레오티딜 트랜스퍼라제(TdT)에 의한 비-주형화 뉴클레오티드 삽입에 의해 생성된다. 그러나, 생체 내에서, 선택은 예측불가성을 초래하는 TCR 레퍼토리의 형상화에 중요한 역할을 한다. TdT 뉴클레오티드 삽입 도수는, 선택과 무관하게, 프레임 외 TCR 서열을 사용하여 계산했다. 이러한 서열은 제2 대립유전자가 기능적 재배열을 갖는 T 세포 중의 1개의 대립유전자상에서 수행된 비-기능적 재배열이다. TdT의 모노-뉴클레오티드 삽입 바이어스는 C 및 G를 지지한다(표 11).
A | C | G | T | |
레인 1 | 0.24 | 0.294 | 0.247 | 0.216 |
레인 2 | 0.247 | 0.284 | 0.256 | 0.211 |
레인 3 | 0.25 | 0.27 | 0.268 | 0.209 |
레인 4 | 0.255 | 0.293 | 0.24 | 0.21 |
유사한 뉴클레오티드 도수가 프레임 서열에서 관찰된다(표 12).
A | C | G | T | |
레인 1 | 0.21 | 0.285 | 0.275 | 0.228 |
레인 2 | 0.216 | 0.281 | 0.266 | 0.235 |
레인 3 | 0.222 | 0.266 | 0.288 | 0.221 |
레인 4 | 0.206 | 0.294 | 0.228 | 0.27 |
프레임 외 TCR 서열로부터 N 영역을 사용하여 디-뉴클레오티드 바이어스를 측정했다. 디-뉴클레오티드 바이어스의 난외(marginal) 기여도를 분리하기 위해, 디-뉴클레오티드 도수를 두 염기 각각의 모노뉴클레오티드 도수로 나누었다. 측정은 다음과 같다:
m에 대한 매트릭스는 표 13에서 발견된다.
A | C | G | T | |
A | 1.198 | 0.938 | 0.945 | 0.919 |
C | 0.988 | 1.172 | 0.88 | 0.931 |
G | 0.993 | 0.701 | 1.352 | 0.964 |
T | 0.784 | 1.232 | 0.767 | 1.23 |
다수의 디뉴클레오티드는 제시된 바의 상하에 있다. 예를 들면, GG 쌍을 발견할 승산(odd)은 매우 높다. 코돈 GGN이 글리신으로 해독되기 때문에, 다수의 글리신이 CDR3 영역에서 기대된다.
실시예
10:
CDR3
영역 중의 아미노산 분포
TCRβ 쇄의 CDR3 영역 중의 아미노산의 분포는 V, D 및 J 영역을 위한 생식세포 서열, TdT의 삽입 바이어스 및 선택에 의해 형상화된다. 4개의 상이한 T 세포 하위-구획에 대한 당해 영역에서의 아미노산의 분포는 상이한 세포 아형태 사이에 매우 유사하다. 고정 길이(아미노산 중의 위치 의존 분포)의 β 쇄로 서열의 분리는 6개의 화학적 성질: 작은, 특별한 및 큰 소수성, 중간 극성, 산성 및 염기성으로 분류된다. 분포는, 특히 위치 5에서 고비율의 산성 염기를 갖는 CD8+ 항원 경험 T 세포 이외에, 실질적으로 동일하다.
특히 흥미로운 것은 이들이 부류 I 및 부류 II HLA 분자 각각에 의해 제공된 펩티드에 결합함에 따르는 CD8+ 및 CD4+ TCR 서열의 비교이다. CD8+ 항원 경험 T 세포는 고비율의 산성 아미노산을 갖는 소수의 위치를 갖는다. 이는 부류 II에서가 아니라 HLA 부류 I 분자 상에서 발견된 염기성 잔기와의 결합을 수행할 수 있다.
실시예
11: 상이한 사람에게서 발견된 동일한 아미노산 서열을 갖는
TCR
β 쇄
TCR β 쇄 서열을 아미노산으로 해독한 후, 2개 공여체 사이의 쌍을 비교했다. 수천의 정확한 서열 매치가 관찰되었다. 예를 들면, CD4+ CD45RO- 하위 구획을 비교하면, 공여체 1로부터의 250,000개의 유니크 아미노산 서열 중 약 8,000개가 공여체 2와 정확하게 매치했다. 아미노산 수준에서 이러한 매치 서열 중의 다수는 제3 코돈 위치에서 다수의 뉴클레오티드 차이를 갖는다. 상기 언급한 실시예에 따라, 1,500/8,000 동일한 아미노산 매치가 5 초과의 뉴클레오티드 미스매치를 가졌다. 임의의 2개 T 세포 아형태 사이에는 유니크 TCRβ 서열의 4 내지 5%가 동일한 아미노산 매치를 갖는 것으로 밝혀졌다.
1) TCR 발달 동안의 선택이 이러한 통상적 서열을 생성하는지, 그리고 2) TdT에 의한 뉴클레오티드 삽입 도수에서의 큰 바이어스가 유사한 뉴클레오티드 서열을 창출하는지의 두 가지 가능성을 시험했다. 프레임 내 쌍 매치를 프레임외 쌍 매치와 비교했다(참조: 상기 실시예 1 내지 4). 프레임을 변경하면 유전자 코드의 특징 모두가 보존되고, 따라서 서열 바이어스가 전체 관찰의 원인이면, 동일한 수의 매치가 발견되어야 한다. 그러나, 프레임 외 매치의 거의 2배가량 많은 프레임 내 매치가 발견되고, 이는 단백질 수준에서의 선택이 중요한 역할을 한다는 것을 제시한다.
수천 개의 동일한 TCR β 쇄 아미노산 서열에 대한 이러한 발견을 확인하기 위해, 2개 공여체를 제3 공여체인 44세 CMV+ 백인 여성으로부터의 CD8+ CD62L+ CD45RA+(천연 유사) TCR에 대하여 비교했다. 제3 공여체와 각각의 본래 2개의 공여체 사이의 아미노산 수준에서 수천 개 서열의 많은 동일한 쌍 매치가 발견되었다. 대조적으로, 460개 서열이 모든 3개 공여체 사이에 공유되었다. 공여체 사이의 유니크 서열의 전체 수에서의 큰 변화는 출발 물질 및 서열분석기 상으로 적재량 변화의 산물이고, 공여체의 혈액 중의 진정한 다양성에 대한 변화를 나타내는 것은 아니다.
실시예
12:
고도수
클론형은 생식 세포주에 보다 유사하다.
모든 T세포 아구획 내에서 상이한 서열 사이의 복제 수의 변화는 10,000배 이상의 계수 범위였다. 복제 수와 상관되는 유일한 특성은 (삽입 수 + 결실 수)이고, 이는 역으로 상관된다. 분석 결과는 결실이 복제 수와 역상관 관계로 삽입보다 작은 역할을 함을 나타낸다.
삽입 및 결실이 보다 적은 서열은 생식 세포주에 보다 유사한 수용체 서열을 갖는다. 생식 세포주에 유사한 서열의 수 증가에 대한 한 가지 가능성은 이들이 T 세포 발달 동안 다수의 형성이다. 생식 세포주 서열은 사람 사이에 공유되기 때문에, 공유된 TCRβ 쇄는 소수의 삽입 및 결실을 갖는 TCR에 의해 생성된다.
실시예
13: V 유전자
세그먼트
사용 및
CDR3
길이에 의한
TCR
β
CDR3
서열의 "스펙트라타입" 분석
TCR 다양성은 통상 TCR 스펙트라타이핑 기술을 사용하여 평가되었고, 이는 서열 수준에서 TCR CDR3 다양성을 평가하는 것이 아니라, 동일한 Vα 또는 Vβ 유전자 세그먼트를 사용하는 αβ T 세포의 서브세트에서 mRNA로서 발현된 TCRα 또는 TCRβ CDR3 길이의 다양성을 평가하는 RT-PCR 기반 기술이다. 건강한 젊은 성인의 제대혈 또는 말초혈에서 발견되는 바와 같이, TCR CDR3 서열의 다양한 레퍼토리를 갖는 폴리클로날 T 세포 모집단의 스펙트라타입은 다수의 3개 뉴클레오티드인 8 내지 10개의 상이한 길이의 CDR3 서열을 통상 함유하고, 이는 프레임내 전사체에 대한 선택을 반영한다. 스펙트라타이핑은 또한 각각의 특정한 길이를 갖는 CDR3 서열의 상대 도수에 대한 개략적인 정량적 정보를 제공한다. 서열분석기를 사용하여 T 세포 게놈 DNA로부터 TCRβ CDR3 영역의 직접 서열분석이 스펙트라타이핑에 의해 동정된 CDR3 길이 다양성을 정확하게 포획할 수 있는지의 여부를 평가하기 위해, "실질적" TCRβ 스펙트라타입(하기 실시예 참조)을 서열 데이터로부터 생성하고 통상의 PCR 기술을 사용하여 생성한 TCRβ 스펙트라타입과 비교했다. 실질적 스펙트라타입은 통상의 스펙트라타입에 존재하는 모든 CDR3 길이 및 상대 도수 정보를 함유했다. 직접 TCRβ CDR3 서열분석은 통상의 스펙트라타입에 존재하는 TCR 다양성 정보 모두를 포획한다. 표준 TCRβ 스펙트라타입 데이터와 서열에 대한 계산된 TCRβ CDR3 길이 분포의 비교는 공여체 1로부터 CD4+CD45RO+ 세포에 존재하는 대표적인 TCR Vβ 유전자 세그먼트를 사용한다. 각각의 Vβ 부류 내에 상이한 길이를 갖는 특이적 CDR3 서열의 도수 막대그래프와 비교하여 서열 데이터 내에 함유된 정보의 감소는 스펙트라타입 데이터에 함유된 모든 정보를 용이하게 재생한다. 또한, 실질적 스펙트라타입은 통상의 PCR 기반 스펙트라타이핑에 의해 검출되지 않는 CDR3 길이가 매우 짧고 매우 긴 희귀한 CDR3 서열의 각 Vβ 부류 내의 존재를 나타냈다.
실시예
14: 전체
CDR
서열 다양성의 평가
에러 보정 후, 서열분석기 유동 세포(flow cell)의 각 레인에서 관찰된 특이적 CDR3 서열의 수는 통상 1×105개를 초과했다. 각 레인에서 서열분석된 PCR 생성물이 2개의 공여체 각각에 존재하는 T 세포 게놈의 소분획으로부터 반드시 유도되는 경우, 각 개체의 전체 T 세포 레퍼토리에서 특이적 TCRβ CDR3 서열의 전체 수는 훨씬 높은 것처럼 보인다. 따라서, 전체 레퍼토리에서 유니크 서열 수의 평가는 혈액 내에 존재하지만 샘플에서 관찰되지 않는 추가의 특이적 CDR3 서열 수의 평가를 필요로 한다. 무한 샘플에 존재하는 종 다양성의 측정을 사용하여 거대하고 복잡한 모집단에서 전체 종 다양성의 평가는 조직학적으로 "미지 종 문제"로 지칭했다(상기 실시예 참조). 해결책은 새로운 종 수의 측정, 또는 실험이 반복되는 경우, 즉 서열분석이 반복적으로 말초혈 T 세포의 동일한 샘플, 예를 들면, 서열분석기 유동 세포의 상이한 레인에서 TCRβ CDR3 PCR 생성물의 동일하게 제조된 라이브러리에서 관찰되는 TCRβ CDR3 서열 수의 측정 및 신규 CDR3 서열 수의 계수로 개시한다. 공여체 2로부터 CD8+CD45RO- 세포에 있어서, 제2 레인에서 신규 CDR3 서열의 예상 및 관찰된 수는 5% 이내이고(상기 실시예 참조), 이는 당해 분석적 해결책이 사실 전체 레퍼토리에서 특이적 TCRβ CDR3 서열의 전체 수를 평가하는 데 사용될 수 있음을 시사한다.
4개의 유동 세포 분석학적 규정된 T 세포 구획에서 특이적 TCRβ CDR3 서열의 전체 수에 대한 수득 평가치는 표 14에 제시되어 있다.
공여체 | CD8 | CD4 | CD45RO | 다양성 |
1 | + | - | + | 6.3×105 |
+ | - | - | 1.24×106 | |
- | + | + | 8.2×105 | |
- | + | - | 1.28×106 | |
총 T 세포 다양성 | 3.97×106 | |||
2 | + | - | + | 4.4×105 |
+ | - | - | 9.7×105 | |
- | + | + | 8.7×105 | |
- | + | - | 1.03×106 | |
총 T 세포 다양성 | 3.31×106 |
흥미롭게, 이들 모집단에서 전체 TCRβ 다양성은 말초혈에서 3 내지 4백만 개의 유니크 서열 사이에 존재한다. 놀랍게도, CD45RO+ 또는 항원 경험한 구획은 대략 150만개의 이들 서열을 구성한다. 이는 예상된 것보다 적어도 큰 정도이다. 이러한 불일치는 낮은 상대 도수에서 관찰된 다수의 이들 서열에 기인하는 것 같고, 이는 심층 서열분석을 통해 유일하게 검출될 수 있다. 2개 공여체에서 각 구획의 평가된 TCRβ CDR3 레퍼토리 크기는 서로 20% 이내이다.
본원의 결과는 달성된 TCRβ 수용체 다양성이 이전의 평가치(약 4×106개 독특한 CDR3 서열)보다 적어도 5배 높음을 증명하고, 특히 종래 보고된 것(약 1.5×106개 독특한 CDR3 서열)보다 CD45RO+ 항원 경험 αβ T 세포 중에서 훨씬 큰 TCRβ 다양성을 시사한다. 그러나, TCR 서열 데이터의 생물정보 분석은 모노뉴클레오티드 및 디뉴클레오티드 함량에서 강력한 바이어스를 나타내고, 이는 사용된 TCR 서열이 이론적 크기보다 훨씬 적은 분포로부터 샘플링됨을 암시한다. 서열의 심각하게 제한된 공간으로부터 샘플링된 각 개인에서 TCRβ 쇄의 거대 다양성과 함께 TCR 서열 풀의 중첩이 각 개인 사이에서 예상될 수 있다. 사실, 당해 결과는 정확한 아미노산 매치를 갖는 약 5%의 CD8+ 천연 TCRβ 쇄가 3명의 상이한 개체의 각 쌍 사이에서 공유됨을 나타냈다. TCRα 풀이 이미 이론적 TCRβ 다양성보다 실질적으로(substantially) 작은 것으로 측정되었기 때문에, 이들 결과는 수백 내지 수천 개의 진정한 공공 αβ TCR이 발견될 수 있음을 나타낸다.
<110> FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER
<120> METHOD OF MEASURING ADAPTIVE IMMUNITY
<130> IPA110921-US-D1
<150> US 61/220,344
<151> 2009-06-25
<160> 484
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 1
ntcaaatttc actctgaaga tccggtccac aa 32
<210> 2
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 2
ngctcactta aatcttcaca tcaattccct gg 32
<210> 3
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 3
ncttaaacct tcacctacac gccctgc 27
<210> 4
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(4-2, 4-3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 4
ncttattcct tcacctacac accctgc 27
<210> 5
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 5
ngctctgaga tgaatgtgag caccttg 27
<210> 6
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 6
ngctctgaga tgaatgtgag tgccttg 27
<210> 7
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(5-4, 5-5, 5-6, 5-7, 5-8)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 7
ngctctgagc tgaatgtgaa cgccttg 27
<210> 8
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 8
ntcgctcagg ctggagtcgg ctg 23
<210> 9
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(6-2, 6-3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 9
ngctggggtt ggagtcggct g 21
<210> 10
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-4
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 10
nccctcacgt tggcgtctgc tg 22
<210> 11
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-5
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 11
ngctcaggct gctgtcggct g 21
<210> 12
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 12
ncgctcaggc tggagttggc tg 22
<210> 13
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-7
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 13
ncccctcaag ctggagtcag ctg 23
<210> 14
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-8
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 14
ncactcaggc tggtgtcggc tg 22
<210> 15
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-9
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 15
ncgctcaggc tggagtcagc tg 22
<210> 16
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 16
nccactctga agttccagcg cacac 25
<210> 17
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 17
ncactctgac gatccagcgc acac 24
<210> 18
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 18
nctctactct gaagatccag cgcacag 27
<210> 19
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-4
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 19
nccactctga agatccagcg cacag 25
<210> 20
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-6
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 20
ncactctgac gatccagcgc acag 24
<210> 21
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-7
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 21
nccactctga cgattcagcg cacag 25
<210> 22
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-8
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 22
nccactctga agatccagcg cacac 25
<210> 23
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 23
ncaccttgga gatccagcgc acag 24
<210> 24
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV9
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 24
ngcactctga actaaacctg agctctctg 29
<210> 25
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 25
ncccctcact ctggagtctg ctg 23
<210> 26
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 26
nccccctcac tctggagtca gcta 24
<210> 27
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 27
ncctcctcac tctggagtcc gcta 24
<210> 28
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(11-1, 11-3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 28
nccactctca agatccagcc tgcag 25
<210> 29
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 29
nctccactct caagatccag cctgcaa 27
<210> 30
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(12-3, 12-4, 12-5)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 30
nccactctga agatccagcc ctcag 25
<210> 31
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV13
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 31
ncattctgaa ctgaacatga gctccttgg 29
<210> 32
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV14
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 32
nctactctga aggtgcagcc tgcag 25
<210> 33
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV15
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 33
ngataacttc caatccagga ggccgaaca 29
<210> 34
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV16
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 34
nctgtagcct tgagatccag gctacga 27
<210> 35
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV17
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 35
ncttccacgc tgaagatcca tcccg 25
<210> 36
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV18
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 36
ngcatcctga ggatccagca ggtag 25
<210> 37
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV19
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 37
ncctctcact gtgacatcgg ccc 23
<210> 38
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 38
ncttgtccac tctgacagtg accagtg 27
<210> 39
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV23-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 39
ncagcctggc aatcctgtcc tcag 24
<210> 40
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV24-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 40
nctccctgtc cctagagtct gccat 25
<210> 41
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV25-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 41
nccctgaccc tggagtctgc ca 22
<210> 42
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV27
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 42
nccctgatcc tggagtcgcc ca 22
<210> 43
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV28
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 43
nctccctgat tctggagtcc gcca 24
<210> 44
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV29-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 44
nctaacattc tcaactctga ctgtgagcaa ca 32
<210> 45
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal forward primer
<400> 45
ncggcagttc atcctgagtt ctaagaagc 29
<210> 46
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 46
nttacctaca actgtgagtc tggtgccttg tccaaa 36
<210> 47
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 47
nacctacaac ggttaacctg gtccccgaac cgaa 34
<210> 48
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 48
nacctacaac agtgagccaa cttccctctc caaa 34
<210> 49
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-4
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 49
nccaagacag agagctgggt tccactgcca aa 32
<210> 50
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-6
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 50
nctgtcacag tgagcctggt cccgttccca aa 32
<210> 51
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 51
ncggtgagcc gtgtccctgg cccgaa 26
<210> 52
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-2
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 52
nccagtacgg tcagcctaga gccttctcca aa 32
<210> 53
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 53
nactgtcagc cgggtgcctg ggccaaa 27
<210> 54
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-4
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 54
nagagccggg tcccggcgcc gaa 23
<210> 55
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-5
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 55
nggagccgcg tgcctggccc gaa 23
<210> 56
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-6
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 56
ngtcagcctg ctgccggccc cgaa 24
<210> 57
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-7
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 57
ngtgagcctg gtgcccggcc cgaa 24
<210> 58
<211> 65
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV2
<400> 58
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atcttcaaat ttcactctga agatccggtc 60
cacaa 65
<210> 59
<211> 65
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-1
<400> 59
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctcac ttaaatcttc acatcaattc 60
cctgg 65
<210> 60
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-1
<400> 60
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcttaaa ccttcaccta cacgccctgc 60
60
<210> 61
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(4-2, 4-3)
<400> 61
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcttatt ccttcaccta cacaccctgc 60
60
<210> 62
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-1
<400> 62
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctctg agatgaatgt gagcaccttg 60
60
<210> 63
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-3
<400> 63
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctctg agatgaatgt gagtgccttg 60
60
<210> 64
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(5-4, 5-5, 5-6, 5-7, 5-8)
<400> 64
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctctg agctgaatgt gaacgccttg 60
60
<210> 65
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-1
<400> 65
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atcttcgctc aggctggagt cggctg 56
<210> 66
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(6-2, 6-3)
<400> 66
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctggg gttggagtcg gctg 54
<210> 67
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-4
<400> 67
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccctca cgttggcgtc tgctg 55
<210> 68
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-5
<400> 68
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgctcag gctgctgtcg gctg 54
<210> 69
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6
<400> 69
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcgctca ggctggagtt ggctg 55
<210> 70
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-7
<400> 70
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcccctc aagctggagt cagctg 56
<210> 71
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-8
<400> 71
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcactca ggctggtgtc ggctg 55
<210> 72
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-9
<400> 72
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcgctca ggctggagtc agctg 55
<210> 73
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-1
<400> 73
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tgaagttcca gcgcacac 58
<210> 74
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2
<400> 74
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcactct gacgatccag cgcacac 57
<210> 75
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3
<400> 75
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctctac tctgaagatc cagcgcacag 60
60
<210> 76
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-4
<400> 76
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tgaagatcca gcgcacag 58
<210> 77
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-6
<400> 77
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcactct gacgatccag cgcacag 57
<210> 78
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-7
<400> 78
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tgacgattca gcgcacag 58
<210> 79
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-8
<400> 79
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tgaagatcca gcgcacac 58
<210> 80
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9
<400> 80
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcacctt ggagatccag cgcacag 57
<210> 81
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV9
<400> 81
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgcactc tgaactaaac ctgagctctc 60
tg 62
<210> 82
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-1
<400> 82
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcccctc actctggagt ctgctg 56
<210> 83
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-2
<400> 83
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccccct cactctggag tcagcta 57
<210> 84
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3
<400> 84
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcctcct cactctggag tccgcta 57
<210> 85
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(11-1, 11-3)
<400> 85
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tcaagatcca gcctgcag 58
<210> 86
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-2
<400> 86
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctccac tctcaagatc cagcctgcaa 60
60
<210> 87
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV(12-3, 12-4, 12-5)
<400> 87
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccactc tgaagatcca gccctcag 58
<210> 88
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV13
<400> 88
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcattct gaactgaaca tgagctcctt 60
gg 62
<210> 89
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV14
<400> 89
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctactc tgaaggtgca gcctgcag 58
<210> 90
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV15
<400> 90
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgataac ttccaatcca ggaggccgaa 60
ca 62
<210> 91
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV16
<400> 91
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctgtag ccttgagatc caggctacga 60
60
<210> 92
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV17
<400> 92
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcttcca cgctgaagat ccatcccg 58
<210> 93
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV18
<400> 93
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctgcatcc tgaggatcca gcaggtag 58
<210> 94
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV19
<400> 94
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcctctc actgtgacat cggccc 56
<210> 95
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1
<400> 95
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcttgtc cactctgaca gtgaccagtg 60
60
<210> 96
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV23-1
<400> 96
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcagcct ggcaatcctg tcctcag 57
<210> 97
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV24-1
<400> 97
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctccct gtccctagag tctgccat 58
<210> 98
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV25-1
<400> 98
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccctga ccctggagtc tgcca 55
<210> 99
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV27
<400> 99
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctccctga tcctggagtc gccca 55
<210> 100
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV28
<400> 100
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctccct gattctggag tccgcca 57
<210> 101
<211> 65
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV29-1
<400> 101
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctctaaca ttctcaactc tgactgtgag 60
caaca 65
<210> 102
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30
<400> 102
caagcagaag acggcatacg agctcttccg atctcggcag ttcatcctga gttctaagaa 60
gc 62
<210> 103
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-1
<400> 103
aatgatacgg cgaccaccga gatctttacc tacaactgtg agtctggtgc cttgtccaaa 60
60
<210> 104
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-3
<400> 104
aatgatacgg cgaccaccga gatctaccta caacagtgag ccaacttccc tctccaaa 58
<210> 105
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-4
<400> 105
aatgatacgg cgaccaccga gatctccaag acagagagct gggttccact gccaaa 56
<210> 106
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-6
<400> 106
aatgatacgg cgaccaccga gatctctgtc acagtgagcc tggtcccgtt cccaaa 56
<210> 107
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-1
<400> 107
aatgatacgg cgaccaccga gatctcggtg agccgtgtcc ctggcccgaa 50
<210> 108
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-2
<400> 108
aatgatacgg cgaccaccga gatctccagt acggtcagcc tagagccttc tccaaa 56
<210> 109
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-3
<400> 109
aatgatacgg cgaccaccga gatctactgt cagccgggtg cctgggccaa a 51
<210> 110
<211> 47
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-4
<400> 110
aatgatacgg cgaccaccga gatctagagc cgggtcccgg cgccgaa 47
<210> 111
<211> 47
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-5
<400> 111
aatgatacgg cgaccaccga gatctggagc cgcgtgcctg gcccgaa 47
<210> 112
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-6
<400> 112
aatgatacgg cgaccaccga gatctgtcag cctgctgccg gccccgaa 48
<210> 113
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ2-7
<400> 113
aatgatacgg cgaccaccga gatctgtgag cctggtgccc ggcccgaa 48
<210> 114
<211> 284
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV1*01
<400> 114
gatactggaa ttacccagac accaaaatac ctggtcacag caatggggag taaaaggaca 60
atgaaacgtg agcatctggg acatgattct atgtattggt acagacagaa agctaagaaa 120
tccctggagt tcatgtttta ctacaactgt aaggaattca ttgaaaacaa gactgtgcca 180
aatcacttca cacctgaatg ccctgacagc tctcgcttat accttcatgt ggtcgcactg 240
cagcaagaag actcagctgc gtatctctgc accagcagcc aaga 284
<210> 115
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV2*01
<400> 115
gaacctgaag tcacccagac tcccagccat caggtcacac agatgggaca ggaagtgatc 60
ttgcgctgtg tccccatctc taatcactta tacttctatt ggtacagaca aatcttgggg 120
cagaaagtcg agtttctggt ttccttttat aataatgaaa tctcagagaa gtctgaaata 180
ttcgatgatc aattctcagt tgaaaggcct gatggatcaa atttcactct gaagatccgg 240
tccacaaagc tggaggactc agccatgtac ttctgtgcca gcagtgaagc 290
<210> 116
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV2*03
<400> 116
gaacctgaag tcacccagac tcccagccat caggtcacac agatgggaca ggaagtgatc 60
ttgcgctgtg tccccatctc taatcactta tacttctatt ggtacagaca aatcttgggg 120
cagaaagtcg agtttctggt ttccttttat aataatgaaa tctcagagaa gtctgaaata 180
ttcgatgatc aattctcagt tgagaggcct gatggatcaa atttcactct gaagatccgg 240
tccacaaagc tggaggactc agccatgtac ttctgtgcca gcagtgaa 288
<210> 117
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-1*01
<400> 117
gacacagctg tttcccagac tccaaaatac ctggtcacac agatgggaaa cgacaagtcc 60
attaaatgtg aacaaaatct gggccatgat actatgtatt ggtataaaca ggactctaag 120
aaatttctga agataatgtt tagctacaat aataaggagc tcattataaa tgaaacagtt 180
ccaaatcgct tctcacctaa atctccagac aaagctcact taaatcttca catcaattcc 240
ctggagcttg gtgactctgc tgtgtatttc tgtgccagca gccaaga 287
<210> 118
<211> 279
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-1*02
<400> 118
gacacagctg tttcccagac tccaaaatac ctggtcacac agatgggaaa cgacaagtcc 60
attaaatgtg aacaaaatct gggccatgat actatgtatt ggtataaaca ggactctaag 120
aaatttctga agataatgtt tagctacaat aacaaggaga tcattataaa tgaaacagtt 180
ccaaatcgat tctcacctaa atctccagac aaagctaaat taaatcttca catcaattcc 240
ctggagcttg gtgactctgc tgtgtatttc tgtgccagc 279
<210> 119
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-2*01
<400> 119
gacacagccg tttcccagac tccaaaatac ctggtcacac agatgggaaa aaaggagtct 60
cttaaatgag aacaaaatct gggccataat gctatgtatt ggtataaaca ggactctaag 120
aaatttctga agacaatgtt tatctacagt aacaaggagc caattttaaa tgaaacagtt 180
ccaaatcgct tctcacctga ctctccagac aaagctcatt taaatcttca catcaattcc 240
ctggagcttg gtgactctgc tgtgtatttc tgtgccagca gccaaga 287
<210> 120
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-2*02
<400> 120
gacacagccg tttcccagac tccaaaatac ctggtcacac agatgggaaa aaaggagtct 60
cttaaatgag aacaaaatct gggccataat gctatgtatt ggtataaaca ggactctaag 120
aaatttctga agacaatgtt tatctacagt aacaaggagc caattttaaa tgaaacagtt 180
ccaaatcgct tctcacctga ctctccagac aaagttcatt taaatcttca catcaattcc 240
ctggagcttg gtgactctgc tgtgtatttc tgtgccagca gccaaga 287
<210> 121
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV3-2*03
<400> 121
gacacagccg tttcccagac tccaaaatac ctggtcacac agacgggaaa aaaggagtct 60
cttaaatgag aacaaaatct gggccataat gctatgtatt ggtataaaca ggactctaag 120
aaatttctga agacaatgtt tatctacagt aacaaggagc caattttaaa tgaaacagtt 180
ccaaatcgct tctcacctga ctctccagac aaagttcatt taaatcttca catcaattcc 240
ctggagcttg gtgactctgc tgtgtatttc tgtgccagca gccaa 285
<210> 122
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-1*01
<400> 122
gacactgaag ttacccagac accaaaacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatat ggggcacagg gctatgtatt ggtacaagca gaaagctaag 120
aagccaccgg agctcatgtt tgtctacagc tatgagaaac tctctataaa tgaaagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctctct taaaccttca cctacacgcc 240
ctgcagccag aagactcagc cctgtatctc tgcgccagca gccaaga 287
<210> 123
<211> 258
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-1*02
<400> 123
cacctggtca tgggaatgac aaataagaag tctttgaaat gtgaacaaca tatggggcac 60
agggcaatgt attggtacaa gcagaaagct aagaagccac cggagctcat gtttgtctac 120
agctatgaga aactctctat aaatgaaagt gtgccaagtc gcttctcacc tgaatgcccc 180
aacagctctc tcttaaacct tcacctacac gccctgcagc cagaagactc agccctgtat 240
ctctgcgcca gcagccaa 258
<210> 124
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-2*01
<400> 124
gaaacgggag ttacgcagac accaagacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatct ggggcataac gctatgtatt ggtacaagca aagtgctaag 120
aagccactgg agctcatgtt tgtctacaac tttaaagaac agactgaaaa caacagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctcact tattccttca cctacacacc 240
ctgcagccag aagactcggc cctgtatctc tgtgccagca gccaaga 287
<210> 125
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-2*02
<400> 125
gaaacgggag ttacgcagac accaagacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatct ggggcataac gctatgtatt ggtacaagca aagtgctaag 120
aagccactgg agctcatgtt tgtctacaac tttaaagaac agactgaaaa caacagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctcact tatgccttca cctacacacc 240
ctgcagccag aagactcggc cctgtatctc tgtgccagca cc 282
<210> 126
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-3*01
<400> 126
gaaacgggag ttacgcagac accaagacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatct gggtcataac gctatgtatt ggtacaagca aagtgctaag 120
aagccactgg agctcatgtt tgtctacagt cttgaagaac gggttgaaaa caacagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctcact tattccttca cctacacacc 240
ctgcagccag aagactcggc cctgtatctc tgcgccagca gccaaga 287
<210> 127
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-3*02
<400> 127
gaaacgggag ttacgcagac accaagacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatct gggtcataac gctatgtatt ggtacaagca aagtgctaag 120
aagccactgg agctcatgtt tgtctacagt cttgaagaac gggttgaaaa caacagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctcact tatcccttca cctacacacc 240
ctgcagccag aagactcggc cctgtatctc tgcgccagca gc 282
<210> 128
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-3*03
<400> 128
gaaacgggag ttacgcagac accaagacac ctggtcatgg gaatgacaaa taagaagtct 60
ttgaaatgtg aacaacatct gggtcataac gctatgtatt ggtacaagca aagtgctaag 120
aagccactgg agctcatgtt tgtctacagt cttgaagaac gtgttgaaaa caacagtgtg 180
ccaagtcgct tctcacctga atgccccaac agctctcact tattccttca cctacacacc 240
ctgcagccag aagactcggc cctgtatctc tgcgccagca gc 282
<210> 129
<211> 231
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV4-3*04
<400> 129
aagaagtctt tgaaatgtga acaacatctg gggcataacg ctatgtattg gtacaagcaa 60
agtgctaaga agccactgga gctcatgttt gtctacagtc ttgaagaacg ggttgaaaac 120
aacagtgtgc caagtcgctt ctcacctgaa tgccccaaca gctctcactt attccttcac 180
ctacacaccc tgcagccaga agactcggcc ctgtatctct gcgccagcag c 231
<210> 130
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-1*01
<400> 130
aaggctggag tcactcaaac tccaagatat ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgaca 60
ctgagctgct cccctatctc tgggcatagg agtgtatcct ggtaccaaca gaccccagga 120
cagggccttc agttcctctt tgaatacttc agtgagacac agagaaacaa aggaaacttc 180
cctggtcgat tctcagggcg ccagttctct aactctcgct ctgagatgaa tgtgagcacc 240
ttggagctgg gggactcggc cctttatctt tgcgccagca gcttgg 286
<210> 131
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-1*02
<400> 131
agggctgggg tcactcaaac tccaagacat ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgaca 60
ctgggctgct cccctatctc tgggcatagg agtgtatcct ggtaccaaca gaccctagga 120
cagggccttc agttcctctt tgaatacttc agtgagacac agagaaacaa aggaaacttc 180
cttggtcgat tctcagggcg ccagttctct aactctcgct ctgagatgaa tgtgagcacc 240
ttggagctgg gggactcggc cctttatctt tgcgccagcg cttgc 285
<210> 132
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-3*01
<400> 132
gaggctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacagc agtgtgtcct ggtaccaaca ggccccgggt 120
caggggcccc agtttatctt tgaatatgct aatgagttaa ggagatcaga aggaaacttc 180
cctaatcgat tctcagggcg ccagttccat gactgttgct ctgagatgaa tgtgagtgcc 240
ttggagctgg gggactcggc cctgtatctc tgtgccagaa gcttgg 286
<210> 133
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-3*02
<400> 133
gaggctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacagc agtgtgtcct ggtaccaaca ggccccgggt 120
caggggcccc agtttatctt tgaatatgct aatgagttaa ggagatcaga aggaaacttc 180
cctaatcgat tctcagggcg ccagttccat gactattgct ctgagatgaa tgtgagtgcc 240
ttggagctgg gggactcggc cctgtatctc tgtgccagaa gcttgg 286
<210> 134
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-4*01
<400> 134
gagactggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct cttctcagtc tgggcacaac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat agggaggaag agaatggcag aggaaacttc 180
cctcctagat tctcaggtct ccagttccct aattatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttggagctgg acgactcggc cctgtatctc tgtgccagca gcttgg 286
<210> 135
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-4*02
<400> 135
gagactggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct cttctcagtc tgggcacaac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat agggaggaag agaatggcag aggaaacttc 180
cctcctagat tctcaggtct ccagttccct aattataact ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttggagctgg acgactcggc cctgtatctc tgtgccagca gc 282
<210> 136
<211> 234
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-4*03
<400> 136
cagcaagtga cactgagatg ctcttctcag tctgggcaca acactgtgtc ctggtaccaa 60
caggccctgg gtcaggggcc ccagtttatc tttcagtatt atagggagga agagaatggc 120
agaggaaact tccctcctag attctcaggt ctccagttcc ctaattatag ctctgagctg 180
aatgtgaacg ccttggagct ggacgactcg gccctgtatc tctgtgccag cagc 234
<210> 137
<211> 192
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-4*04
<400> 137
actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt caggggcccc agtttatctt tcagtattat 60
agggaggaag agaatggcag aggaaactcc cctcctagat tctcaggtct ccagttccct 120
aattatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc ttggagctgg acgactcggc cctgtatctc 180
tgtgccagca gc 192
<210> 138
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-5*01
<400> 138
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacaag agtgtgtcct ggtaccaaca ggtcctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gagaaagaag agagaggaag aggaaacttc 180
cctgatcgat tctcagctcg ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctgtatctc tgtgccagca gcttgg 286
<210> 139
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-5*02
<400> 139
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcacgtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacaag agtgtgtcct ggtaccaaca ggtcctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gagaaagaag agagaggaag aggaaacttc 180
cctgatcgat tctcagctcg ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctgtatctc tgtgccagca gc 282
<210> 140
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-5*03
<400> 140
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgagcacaag agtgtgtcct ggtaccaaca ggtcctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gagaaagaag agagaggaag aggaaacttc 180
cctgatcgat tctcagctcg ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctgtatctc tgtgccagca gc 282
<210> 141
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-6*01
<400> 141
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctaagtc tgggcatgac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gaggaggaag agagacagag aggcaacttc 180
cctgatcgat tctcaggtca ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctctatctc tgtgccagca gcttgg 286
<210> 142
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-7*01
<400> 142
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcacgtgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacacc agtgtgtcct cgtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gagaaagaag agagaggaag aggaaacttc 180
cctgatcaat tctcaggtca ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctag gggactcggc cctctatctc tgtgccagca gcttgg 286
<210> 143
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-8*01
<400> 143
gaggctggag tcacacaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagcgact 60
ctgagatgct ctcctatctc tgggcacacc agtgtgtact ggtaccaaca ggccctgggt 120
ctgggcctcc agttcctcct ttggtatgac gagggtgaag agagaaacag aggaaacttc 180
cctcctagat tttcaggtcg ccagttccct aattatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttggagctgg aggactcggc cctgtatctc tgtgccagca gcttgg 286
<210> 144
<211> 238
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV5-8*02
<400> 144
aggacagcaa gcgactctga gatgctctcc tatctctggg cacaccagtg tgtactggta 60
ccaacaggcc ctgggtctgg gcctccagct cctcctttgg tatgacgagg gtgaagagag 120
aaacagagga aacttccctc ctagattttc aggtcgccag ttccctaatt atagctctga 180
gctgaatgtg aacgccttgg agctggagga ctcggccctg tatctctgtg ccagcagc 238
<210> 145
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-1*01
<400> 145
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc caggtcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccataac tccatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atgggactga ggctgattta ttactcagct tctgagggta ccactgacaa aggagaagtc 180
cccaatggct acaatgtctc cagattaaac aaacgggagt tctcgctcag gctggagtcg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gtgaagc 287
<210> 146
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-2*01
<400> 146
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgggtcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgctgtgtg cccaggatat gaaccatgaa tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga ggctgattca ttactcagtt ggtgagggta caactgccaa aggagaggtc 180
cctgatggct acaatgtctc cagattaaaa aaacagaatt tcctgctggg gttggagtcg 240
gctgctccct cccaaacatc tgtgtacttc tgtgccagca gttactc 287
<210> 147
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-3*01
<400> 147
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgggtcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgctgtgtg cccaggatat gaaccatgaa tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga ggctgattca ttactcagtt ggtgagggta caactgccaa aggagaggtc 180
cctgatggct acaatgtctc cagattaaaa aaacagaatt tcctgctggg gttggagtcg 240
gctgctccct cccaaacatc tgtgtacttc tgtgccagca gttactc 287
<210> 148
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-4*01
<400> 148
attgctggga tcacccaggc accaacatct cagatcctgg cagcaggacg gcgcatgaca 60
ctgagatgta cccaggatat gagacataat gccatgtact ggtatagaca agatctagga 120
ctggggctaa ggctcatcca ttattcaaat actgcaggta ccactggcaa aggagaagtc 180
cctgatggtt atagtgtctc cagagcaaac acagatgatt tccccctcac gttggcgtct 240
gctgtaccct ctcagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gtgactc 287
<210> 149
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-4*02
<400> 149
actgctggga tcacccaggc accaacatct cagatcctgg cagcaggacg gagcatgaca 60
ctgagatgta cccaggatat gagacataat gccatgtact ggtatagaca agatctagga 120
ctggggctaa ggctcatcca ttattcaaat actgcaggta ccactggcaa aggagaagtc 180
cctgatggtt atagtgtctc cagagcaaac acagatgatt tccccctcac gttggcgtct 240
gctgtaccct ctcagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gtgactc 287
<210> 150
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-5*01
<400> 150
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc caggtcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccatgaa tacatgtcct ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga ggctgattca ttactcagtt ggtgctggta tcactgacca aggagaagtc 180
cccaatggct acaatgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctgctgtcg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gttactc 287
<210> 151
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6*01
<400> 151
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgcatcctga agataggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgta cccaggatat gaaccataac tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga agctgattta ttattcagtt ggtgctggta tcactgataa aggagaagtc 180
ccgaatggct acaacgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctggagttg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gttactc 287
<210> 152
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6*02
<400> 152
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgcatcctga agataggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccataac tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga agctgattta ttattcagtt ggtgctggta tcactgacaa aggagaagtc 180
ccgaatggct acaacgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctggagttg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gt 282
<210> 153
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6*03
<400> 153
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgcatcctga agataggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccataac tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga agctgattta ttattcagtt ggtgctggta tcactgataa aggagaagtc 180
ccgaatggct acaacgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctggagttg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gt 282
<210> 154
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6*04
<400> 154
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgcatcctga agataggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgta cccaggatat gaaccatgaa tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga agctgattta ttattcagtt ggtgctggta tcactgataa aggagaagtc 180
ccgaatggct acaatgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctggagttg 240
gctgctccct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gtcga 285
<210> 155
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-6*05
<400> 155
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cgcatcctga agataggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccataac tacatgtact ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga agctgattta ttattcagtt ggtgctggta tcactgacaa aggagaagtc 180
ccgaatggct acaacgtctc cagatcaacc acagaggatt tcccgctcag gctggagttg 240
gctgctgcct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccagca gc 282
<210> 156
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-7*01
<400> 156
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cacgtcctga agacaggaca gagcatgact 60
ctgctgtgtg cccaggatat gaaccatgaa tacatgtatc ggtatcgaca agacccaggc 120
aaggggctga ggctgattta ctactcagtt gctgctgctc tcactgacaa aggagaagtt 180
cccaatggct acaatgtctc cagatcaaac acagaggatt tccccctcaa gctggagtca 240
gctgctccct ctcagacttc tgtttacttc tgtgccagca gttactc 287
<210> 157
<211> 284
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-8*01
<400> 157
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cacatcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccatgga tacatgtcct ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga gactgattta ctactcagct gctgctggta ctactgacaa agaagtcccc 180
aatggctaca atgtctctag attaaacaca gaggatttcc cactcaggct ggtgtcggct 240
gctccctccc agacatctgt gtacttgtgt gccagcagtt actc 284
<210> 158
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV6-9*01
<400> 158
aatgctggtg tcactcagac cccaaaattc cacatcctga agacaggaca gagcatgaca 60
ctgcagtgtg cccaggatat gaaccatgga tacttgtcct ggtatcgaca agacccaggc 120
atggggctga ggcgcattca ttactcagtt gctgctggta tcactgacaa aggagaagtc 180
cccgatggct acaatgtatc cagatcaaac acagaggatt tcccgctcag gctggagtca 240
gctgctccct cccagacatc tgtatacttc tgtgccagca gttattc 287
<210> 159
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-1*01
<400> 159
ggtgctggag tctcccagtc cctgagacac aaggtagcaa agaagggaaa ggatgtagct 60
ctcagatatg atccaatttc aggtcataat gccctttatt ggtaccgaca gagcctgggg 120
cagggcctgg agtttccaat ttacttccaa ggcaaggatg cagcagacaa atcggggctt 180
ccccgtgatc ggttctctgc acagaggtct gagggatcca tctccactct gaagttccag 240
cgcacacagc agggggactt ggctgtgtat ctctgtgcca gcagctcagc 290
<210> 160
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2*01
<400> 160
ggagctggag tctcccagtc ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa ggatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca gagcctgggg 120
cagggcctgg agtttttaat ttacttccaa ggcaacagtg caccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc gcttctctgc agagaggact gggggatccg tctccactct gacgatccag 240
cgcacacagc aggaggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 161
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2*02
<400> 161
ggagctggag tctcccagtc ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa ggatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca gaggctgggg 120
cagggcctgg agtttttaat ttacttccaa ggcaacagtg caccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc gcttctctgc agagaggact ggggaatccg tctccactct gacgatccag 240
cgcacacagc aggaggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 162
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2*03
<400> 162
ggagctggag tctcccagtc ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa ggatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca gaggctgggg 120
cagggcctgg agtttttaat ttacttccaa ggcaacagtg caccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc gcttctctgc agagaggact ggggaatccg tctccactct gacgatccag 240
cgcacacagc aggaggactc ggccgtgtat ctctgtacca gcagcttagc 290
<210> 163
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-2*04
<400> 163
ggagctggag tttcccagtc ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa ggatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca gagcctgggg 120
cagggcctgg agtttttaat ttacttccaa ggcaacagtg caccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc gcttctctgc agagaggact gggggatccg tctccactct gacgatccag 240
cgcacacagc aggaggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagctta 288
<210> 164
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3*01
<400> 164
ggtgctggag tctcccagac ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa atatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca aagcctgggg 120
cagggcccag agtttctaat ttacttccaa ggcacgggtg cggcagatga ctcagggctg 180
cccaacgatc ggttctttgc agtcaggcct gagggatccg tctctactct gaagatccag 240
cgcacagagc ggggggactc agccgtgtat ctctgtgcca gcagcttaac 290
<210> 165
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3*02
<400> 165
ggtgctggag tctcccagac ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa agatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca aagcctgggg 120
cagggcccag agtttctaat ttacttccaa ggcacgggtg cggcagatga ctcagggctg 180
cccaaagatc ggttctttgc agtcaggcct gagggatccg tctctactct gaagatccag 240
cgcacagagc agggggactc agccgtgtat ctccgtgcca gcagcttaac 290
<210> 166
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3*03
<400> 166
ggtgctggag tctcccagac ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa agatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca aagcctgggg 120
cagggcccag agtttctaat ttacttccaa ggcacgggtg cggcagatga ctcagggctg 180
cccaaagatc ggttctttgc agtcaggcct gagggatccg tctctactct gaagatccag 240
cgcacagagc agggggactc agccgcgtat ctccgtgcca gcagctta 288
<210> 167
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3*04
<400> 167
ggtgctggag tctcccagac ccccagtaac aaggtcacag agaagggaaa atatgtagag 60
ctcaggtgtg atccaatttc aggtcatact gccctttact ggtaccgaca aagcctgggg 120
cagggcccag agtttctaat ttacttccaa ggcacgggtg cggcagatga ctcagggctg 180
cccaacgatc ggttctttgc agtcaggcct gagggatccg tctctactct gaagatccag 240
cgcacagagc ggggggactc tgccgtgtat ctctgtgcca gcagc 285
<210> 168
<211> 231
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-3*05
<400> 168
tgggagctca ggtgtgatcc aatttcaggt catactgccc tttactggta ccgacaaagc 60
ctggggcagg gcccagagct tctaatttac ttccaaggca cgggtgcggc agatgactca 120
gggctgccca acgatcggtt ctttgcagtc aggcctgagg gatccgtctc tactctgaag 180
atccagcgca cagagcgggg ggactcagcc gtgtatctct gtgccagcag c 231
<210> 169
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-4*01
<400> 169
ggtgctggag tctcccagtc cccaaggtac aaagtcgcaa agaggggacg ggatgtagct 60
ctcaggtgtg attcaatttc gggtcatgta accctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggctcag aggttctgac ttactcccag agtgatgctc aacgagacaa atcagggcgg 180
cccagtggtc ggttctctgc agagaggcct gagagatccg tctccactct gaagatccag 240
cgcacagagc agggggactc agctgtgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 170
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-5*01
<400> 170
ggtgctggag tctcccagtc cccaaggtac gaagtcacac agaggggaca ggatgtagct 60
cccaggtgtg atccaatttc gggtcaggta accctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggccaag agtttctgac ttccttccag gatgaaactc aacaagataa atcagggctg 180
ctcagtgatc aattctccac agagaggtct gaggatcttt ctccacctga agatccagcg 240
cacagagcaa gggcgactcg gctgtgtatc tctgtgccag aagcttag 288
<210> 171
<211> 289
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-5*02
<400> 171
ggtgctggag tctcccagtc cccaaggtac gaagtcacac agaggggaca ggatgtagct 60
cccaggtgtg atccaatttc gggtcaggta accctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggccaag agtttctgac ttccttccag gatgaaactc aacaagataa atcagggctg 180
ctcagtgatc aattctccac agagaggtct gaggatcttt ctccacctga agatccagcg 240
cacagagcaa gggcgactcg gctgtgtatc tctgtgtcag aagcttagc 289
<210> 172
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-6*01
<400> 172
ggtgctggag tctcccagtc tcccaggtac aaagtcacaa agaggggaca ggatgtagct 60
ctcaggtgtg atccaatttc gggtcatgta tccctttatt ggtaccgaca ggccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttcaat tatgaagccc aacaagacaa atcagggctg 180
cccaatgatc ggttctctgc agagaggcct gagggatcca tctccactct gacgatccag 240
cgcacagagc agcgggactc ggccatgtat cgctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 173
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-6*02
<400> 173
ggtgctggag tctcccagtc tcccaggtac aaagtcacaa agaggggaca ggatgtagct 60
ctcaggtgtg atccaatctc gggtcatgta tccctttatt ggtaccgaca ggccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttcaat tatgaagccc aacaagacaa atcagggctg 180
cccaatgatc ggttctctgc agagaggcct gagggatcca tctccactct gacgatccag 240
cgcacagagc agcgggactc ggccatgtat cgctgtgcca gcagc 285
<210> 174
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-7*01
<400> 174
ggtgctggag tctcccagtc tcccaggtac aaagtcacaa agaggggaca ggatgtaact 60
ctcaggtgtg atccaatttc gagtcatgca accctttatt ggtatcaaca ggccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttcaat tatgaagctc aaccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc ggttctctgc agagaggcct gagggatcca tctccactct gacgattcag 240
cgcacagagc agcgggactc agccatgtat cgctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 175
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-7*02
<400> 175
ggtgctggag tctcccagtc tcccaggtac aaagtcacaa agaggggaca ggatgtaact 60
ctcaggtgtg atccaatttc gagtcatgta accctttatt ggtatcaaca ggccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttcaat tatgaagctc aaccagacaa atcagggctg 180
cccagtgatc ggttctctgc agagaggcct gagggatcca tctccactct gacgattcag 240
cgcacagagc agcgggactc agccatgtat cgctgtgcca gcagc 285
<210> 176
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-8*01
<400> 176
ggtgctggag tctcccagtc ccctaggtac aaagtcgcaa agagaggaca ggatgtagct 60
ctcaggtgtg atccaatttc gggtcatgta tccctttttt ggtaccaaca ggccctgggg 120
caggggccag agtttctgac ttatttccag aatgaagctc aactagacaa atcggggctg 180
cccagtgatc gcttctttgc agaaaggcct gagggatccg tctccactct gaagatccag 240
cgcacacagc aggaggactc cgccgtgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 177
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-8*02
<400> 177
ggtgctggag tctcccagtc ccctaggtac aaagtcgcaa agagaggaca ggatgtagct 60
ctcaggtgtg atccaatttc gggtcatgta tccctttttt ggtaccaaca ggccctgggg 120
caggggccag agtttctgac ttatttccag aatgaagctc aactagacaa atcggggctg 180
cccagtgatc gcttctttgc agaaaggcct gagggatccg tctccactct gaagatccag 240
cgcacacaga aggaggactc cgccgtgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 178
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-8*03
<400> 178
ggtgctggag tctcccagtc ccctaggtac aaagtcgcaa agagaggaca ggatgtagct 60
ctcaggtgtg atccaatttc gggtcatgta tccctttttt ggtaccaaca ggccctcggg 120
caggggccag agtttctgac ttatttccag aatgaagctc aactagacaa atcggggctg 180
cccagtgatc gcttctttgc agaaaggcct gagggatccg tctccactct gaagatccag 240
cgcacacagc aggaggactc cgccgtgtat ctctgtgcca gcagccga 288
<210> 179
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*05
<400> 179
gatactggag tctcccagaa ccccagacac aagatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactagaaaa atcaaggctg 180
ctcagtgatc ggttctctgc agagaggcct aagggatctc tctccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcaccaaa 288
<210> 180
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*06
<400> 180
gatactggag tctcccagaa ccccagacac aagatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactagaaaa atcaaggctg 180
ctcagtgatc ggttctctgc agagaggcct aagggatctc tttccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcacgttg 288
<210> 181
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*03
<400> 181
gatactggag tctcccagga ccccagacac aagatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactagaaaa atcaaggctg 180
ctcagtgatc ggttctctgc agagaggcct aagggatctt tctccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcagc 285
<210> 182
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*01
<400> 182
gatactggag tctcccagaa ccccagacac aagatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactagaaaa atcaaggctg 180
ctcagtgatc ggttctctgc agagaggcct aagggatctt tctccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 183
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*02
<400> 183
gatactggag tctcccagaa ccccagacac aacatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaccctgggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactagaaaa atcaaggctg 180
ctcagtgatc ggttctctgc agagaggcct aagggatctt tctccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcagctta 288
<210> 184
<211> 207
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*07
<400> 184
cacaaccgcc tttattggta ccgacagacc ctggggcagg gcccagagtt tctgacttac 60
ttccagaatg aagctcaact agaaaaatca aggctgctca gtgatcggtt ctctgcagag 120
aggcctaagg gatctttctc caccttggag atccagcgca cagaggaggg ggactcggcc 180
atgtatctct gtgccagcag cagcagt 207
<210> 185
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV7-9*04
<400> 185
atatctggag tctcccacaa ccccagacac aagatcacaa agaggggaca gaatgtaact 60
ttcaggtgtg atccaatttc tgaacacaac cgcctttatt ggtaccgaca gaaccctggg 120
cagggcccag agtttctgac ttacttccag aatgaagctc aactggaaaa atcagggctg 180
ctcagtgatc ggatctctgc agagaggcct aagggatctt tctccacctt ggagatccag 240
cgcacagagc agggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcagctct 288
<210> 186
<211> 279
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV8-1*01
<400> 186
gaggcaggga tcagccagat accaagatat cacagacaca cagggaaaaa gatcatcctg 60
aaatatgctc agattaggaa ccattattca gtgttctgtt atcaataaga ccaagaatag 120
gggctgaggc tgatccatta ttcaggtagt attggcagca tgaccaaagg cggtgccaag 180
gaagggtaca atgtctctgg aaacaagctc aagcattttc cctcaaccct ggagtctact 240
agcaccagcc agacctctgt acctctgtgg cagtgcatc 279
<210> 187
<211> 271
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV8-2*01
<400> 187
gatgctggga tcacccagat gccaagatat cacattgtac agaagaaaga gatgatcctg 60
gaatgtgctc aggttaggaa cagtgttctg atatcgacag gacccaagac gggggctgaa 120
gcttatccac tattcaggca gtggtcacag caggaccaaa gttgatgtca cagaggggta 180
ctgtgtttct tgaaacaagc ttgagcattt ccccaatcct ggcatccacc agcaccagcc 240
agacctatct gtaccactgt ggcagcacat c 271
<210> 188
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV9*01
<400> 188
gattctggag tcacacaaac cccaaagcac ctgatcacag caactggaca gcgagtgacg 60
ctgagatgct cccctaggtc tggagacctc tctgtgtact ggtaccaaca gagcctggac 120
cagggcctcc agttcctcat tcagtattat aatggagaag agagagcaaa aggaaacatt 180
cttgaacgat tctccgcaca acagttccct gacttgcact ctgaactaaa cctgagctct 240
ctggagctgg gggactcagc tttgtatttc tgtgccagca gcgtag 286
<210> 189
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV9*03
<400> 189
gattctggag tcacacaaac cccaaagcac ctgatcacag caactggaca gcgagtgacg 60
ctgagatgct cccctaggtc tggagacctc tctgtgtact ggtaccaaca gagcctggac 120
cagggcctcc agttcctcat tcaatattat aatggagaag agagagcaaa aggaaacatt 180
cttgaacgat tctccgcaca acagttccct gacttgcact ctgaactaaa cctgagctct 240
ctggagctgg gggactcagc tttgtatttc tgtgccagca gc 282
<210> 190
<211> 286
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV9*02
<400> 190
gattctggag tcacacaaac cccaaagcac ctgatcacag caactggaca gcgagtgacg 60
ctgagatgct cccctaggtc tggagacctc tctgtgtact ggtaccaaca gagcctggac 120
cagggcctcc agttcctcat tcactattat aatggagaag agagagcaaa aggaaacatt 180
cttgaacgat tctccgcaca acagttccct gacttgcact ctgaactaaa cctgagctct 240
ctggagctgg gggactcagc tttgtatttc tgtgccagca gcgtag 286
<210> 191
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-1*01
<400> 191
gatgctgaaa tcacccagag cccaagacac aagatcacag agacaggaag gcaggtgacc 60
ttggcgtgtc accagacttg gaaccacaac aatatgttct ggtatcgaca agacctggga 120
catgggctga ggctgatcca ttactcatat ggtgttcaag acactaacaa aggagaagtc 180
tcagatggct acagtgtctc tagatcaaac acagaggacc tccccctcac tctggagtct 240
gctgcctcct cccagacatc tgtatatttc tgcgccagca gtgagtc 287
<210> 192
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-1*02
<400> 192
gatgctgaaa tcacccagag cccaagacac aagatcacag agacaggaag gcaggtgacc 60
ttggcgtgtc accagacttg gaaccacaac aatatgttct ggtatcgaca agacctggga 120
catgggctga ggctgatcca ttactcatat ggtgttcacg acactaacaa aggagaagtc 180
tcagatggct acagtgtctc tagatcaaac acagaggacc tccccctcac tctggagtct 240
gctgcctcct cccagacatc tgtatatttc tgcgccagca gt 282
<210> 193
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-2*01
<400> 193
gatgctggaa tcacccagag cccaagatac aagatcacag agacaggaag gcaggtgacc 60
ttgatgtgtc accagacttg gagccacagc tatatgttct ggtatcgaca agacctggga 120
catgggctga ggctgatcta ttactcagca gctgctgata ttacagataa aggagaagtc 180
cccgatggct atgttgtctc cagatccaag acagagaatt tccccctcac tctggagtca 240
gctacccgct cccagacatc tgtgtatttc tgcgccagca gtgagtc 287
<210> 194
<211> 217
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-2*02
<400> 194
aaggcaggtg accttgatgt gtcaccagac ttggagccac agctatatgt tctggtatcg 60
acaagacctg ggacatgggc tgaggctgat ctattactca gcagctgctg atattacaga 120
taaaggagaa gtccccgatg gctacgttgt ctccagatcc aagacagaga atttccccct 180
cactctggag tcagctaccc gctcccagac atctgtg 217
<210> 195
<211> 273
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3*03
<400> 195
gatgctggaa tcacccagag cccaagacac aaggtcacag agacaggaac accagtgact 60
ctgagatgtc accagactga gaaccaccgc tacatgtact ggtatcgaca agacccgggg 120
catgggctga ggctaatcca ttactcatat ggtgttaaag atactgacaa aggagaagtc 180
tcagatggct atagtgtctc tagatcaaag acagaggatt tcctcctcac tctggagtcc 240
gctaccagct cccagacatc tgtgtacttc tgt 273
<210> 196
<211> 273
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3*04
<400> 196
gatgctggaa tcacccagag cccaagacac aaggtcacag agacaggaac accagtgact 60
ctgagatgtc accagactga gaaccaccgc tacatgtact ggtatcgaca agacccgggg 120
catgggctga ggctgatcca ttactcatat ggtgttaaag atactgacaa aggagaagtc 180
tcagatggct atagtgtctc tagatcaaag acagaggatt tcctcctcac tctggagtcc 240
gctaccagct cccagacatc tgtgtacttc tgt 273
<210> 197
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3*01
<400> 197
gatgctggaa tcacccagag cccaagacac aaggtcacag agacaggaac accagtgact 60
ctgagatgtc accagactga gaaccaccgc tatatgtact ggtatcgaca agacccgggg 120
catgggctga ggctgatcca ttactcatat ggtgttaaag atactgacaa aggagaagtc 180
tcagatggct atagtgtctc tagatcaaag acagaggatt tcctcctcac tctggagtcc 240
gctaccagct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccatca gtgagtc 287
<210> 198
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV10-3*02
<400> 198
gatgctggaa tcacccagag cccaagacac aaggtcacag agacaggaac accagtgact 60
ctgagatgtc atcagactga gaaccaccgc tatatgtact ggtatcgaca agacccgggg 120
catgggctga ggctgatcca ttactcatat ggtgttaaag atactgacaa aggagaagtc 180
tcagatggct atagtgtctc tagatcaaag acagaggatt tcctcctcac tctggagtcc 240
gctaccagct cccagacatc tgtgtacttc tgtgccatca gtgagtc 287
<210> 199
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-1*01
<400> 199
gaagctgaag ttgcccagtc ccccagatat aagattacag agaaaagcca ggctgtggct 60
ttttggtgtg atcctatttc tggccatgct accctttact ggtaccggca gatcctggga 120
cagggcccgg agcttctggt tcaatttcag gatgagagtg tagtagatga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccag 240
cctgcagagc ttggggactc ggccatgtat ctctgtgcca gcagcttagc 290
<210> 200
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-3*01
<400> 200
gaagctggag tggttcagtc tcccagatat aagattatag agaaaaaaca gcctgtggct 60
ttttggtgca atcctatttc tggccacaat accctttact ggtacctgca gaacttggga 120
cagggcccgg agcttctgat tcgatatgag aatgaggaag cagtagacga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccag 240
cctgcagagc ttggggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagcttaga 290
<210> 201
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-3*02
<400> 201
gaagctggag tggttcagtc tcccagatat aagattatag agaaaaagca gcctgtggct 60
ttttggtgca atcctatttc tggccacaat accctttact ggtaccggca gaacttggga 120
cagggcccgg agcttctgat tcgatatgag aatgaggaag cagtagacga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccag 240
cctgcagagc ttggggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagc 285
<210> 202
<211> 269
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-3*03
<400> 202
ggtctcccag atataagatt atagagaaga aacagcctgt ggctttttgg tgcaatccaa 60
tttctggcca caataccctt tactggtacc tgcagaactt gggacagggc ccggagcttc 120
tgattcgata tgagaatgag gaagcagtag acgattcaca gttgcctaag gatcgatttt 180
ctgcagagag gctcaaagga gtagactcca ctctcaagat ccagccagca gagcttgggg 240
actcggccat gtatctctgt gccagcagc 269
<210> 203
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-2*01
<400> 203
gaagctggag ttgcccagtc tcccagatat aagattatag agaaaaggca gagtgtggct 60
ttttggtgca atcctatatc tggccatgct accctttact ggtaccagca gatcctggga 120
cagggcccaa agcttctgat tcagtttcag aataacggtg tagtggatga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccag 240
cctgcaaagc ttgaggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagcttaga 290
<210> 204
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-2*03
<400> 204
gaagctggag ttgcccagtc tcccagatat aagattatag agaaaaggca gagtgtggct 60
ttttggtgca atcctatatc tggccatgct accctttact ggtaccagca gatcctggga 120
cagggcccaa agcttctgat tcagtttcag aataacggtg tagtggatga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccaa 240
cctgcaaagc ttgaggactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagc 285
<210> 205
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV11-2*02
<400> 205
gaagctggag ttgcccagtc tcccagatat aagattatag agaaaaggca gagtgtggct 60
ttttggtgca atcctatatc tggccatgct accctttact ggtaccagca gatcctggga 120
cagggcccaa agcttctgat tcagtttcag aataacggtg tagtggatga ttcacagttg 180
cctaaggatc gattttctgc agagaggctc aaaggagtag actccactct caagatccag 240
cctgcaaagc ttgagaactc ggccgtgtat ctctgtgcca gcagt 285
<210> 206
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-1*01
<400> 206
gatgctggtg ttatccagtc acccaggcac aaagtgacag agatgggaca atcagtaact 60
ctgagatgcg aaccaatttc aggccacaat gatcttctct ggtacagaca gacctttgtg 120
cagggactgg aattgctgaa ttacttctgc agctggaccc tcgtagatga ctcaggagtg 180
tccaaggatt gattctcagc acagatgcct gatgtatcat tctccactct gaggatccag 240
cccatggaac ccagggactt gggcctatat ttctgtgcca gcagctttgc 290
<210> 207
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-2*01
<400> 207
gatgctggca ttatccagtc acccaagcat gaggtgacag aaatgggaca aacagtgact 60
ctgagatgtg agccaatttt tggccacaat ttccttttct ggtacagaga taccttcgtg 120
cagggactgg aattgctgag ttacttccgg agctgatcta ttatagataa tgcaggtatg 180
cccacagagc gattctcagc tgagaggcct gatggatcat tctctactct gaagatccag 240
cctgcagagc agggggactc ggccgtgtat gtctgtgcaa gtcgcttagc 290
<210> 208
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-4*01
<400> 208
gatgctggag ttatccagtc accccggcac gaggtgacag agatgggaca agaagtgact 60
ctgagatgta aaccaatttc aggacacgac taccttttct ggtacagaca gaccatgatg 120
cggggactgg agttgctcat ttactttaac aacaacgttc cgatagatga ttcagggatg 180
cccgaggatc gattctcagc taagatgcct aatgcatcat tctccactct gaagatccag 240
ccctcagaac ccagggactc agctgtgtac ttctgtgcca gcagtttagc 290
<210> 209
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-4*02
<400> 209
gatgctggag ttatccagtc accccggcac gaggtgacag agatgggaca agaagtgact 60
ctgagatgta aaccaatttc aggacatgac taccttttct ggtacagaca gaccatgatg 120
cggggactgg agttgctcat ttactttaac aacaacgttc cgatagatga ttcagggatg 180
cccgaggatc gattctcagc taagatgcct aatgcatcat tctccactct gaggatccag 240
ccctcagaac ccagggactc agctgtgtac ttctgtgcca gcagttta 288
<210> 210
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-3*01
<400> 210
gatgctggag ttatccagtc accccgccat gaggtgacag agatgggaca agaagtgact 60
ctgagatgta aaccaatttc aggccacaac tcccttttct ggtacagaca gaccatgatg 120
cggggactgg agttgctcat ttactttaac aacaacgttc cgatagatga ttcagggatg 180
cccgaggatc gattctcagc taagatgcct aatgcatcat tctccactct gaagatccag 240
ccctcagaac ccagggactc agctgtgtac ttctgtgcca gcagtttagc 290
<210> 211
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV12-5*01
<400> 211
gatgctagag tcacccagac accaaggcac aaggtgacag agatgggaca agaagtaaca 60
atgagatgtc agccaatttt aggccacaat actgttttct ggtacagaca gaccatgatg 120
caaggactgg agttgctggc ttacttccgc aaccgggctc ctctagatga ttcggggatg 180
ccgaaggatc gattctcagc agagatgcct gatgcaactt tagccactct gaagatccag 240
ccctcagaac ccagggactc agctgtgtat ttttgtgcta gtggtttggt 290
<210> 212
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV13*01
<400> 212
gctgctggag tcatccagtc cccaagacat ctgatcaaag aaaagaggga aacagccact 60
ctgaaatgct atcctatccc tagacacgac actgtctact ggtaccagca gggtccaggt 120
caggaccccc agttcctcat ttcgttttat gaaaagatgc agagcgataa aggaagcatc 180
cctgatcgat tctcagctca acagttcagt gactatcatt ctgaactgaa catgagctcc 240
ttggagctgg gggactcagc cctgtacttc tgtgccagca gcttagg 287
<210> 213
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV13*02
<400> 213
gctgctggag tcatccagtc cccaagacat ctgatcagag aaaagaggga aacagccact 60
ctgaaatgct atcctatccc tagacacgac actgtctact ggtaccagca gggcccaggt 120
caggaccccc agttcttcat ttcgttttat gaaaagatgc agagcgataa aggaagcatc 180
cctgatcgat tctcagctca acagttcagt gactatcatt ctgaactgaa catgagctcc 240
ttggagctgg gggactcagc cctgtacttc tgtgccagca gc 282
<210> 214
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV14*01
<400> 214
gaagctggag ttactcagtt ccccagccac agcgtaatag agaagggcca gactgtgact 60
ctgagatgtg acccaatttc tggacatgat aatctttatt ggtatcgacg tgttatggga 120
aaagaaataa aatttctgtt acattttgtg aaagagtcta aacaggatga gtccggtatg 180
cccaacaatc gattcttagc tgaaaggact ggagggacgt attctactct gaaggtgcag 240
cctgcagaac tggaggattc tggagtttat ttctgtgcca gcagccaaga 290
<210> 215
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV14*02
<400> 215
gaagctggag ttactcagtt ccccagccac agcgtaatag agaagggcca gactgtgact 60
ctgagatgtg acccaatttc tggacatgat aatctttatt ggtatcgacg tgttatggga 120
aaagaaataa aatttctgtt acattttgtg aaagagtcta aacaggatga atccggtatg 180
cccaacaatc gattcttagc tgaaaggact ggagggacgt attctactct gaaggtgcag 240
cctgcagaac tggaggattc tggagtttat ttctgtgcca gcagc 285
<210> 216
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV15*01
<400> 216
gatgccatgg tcatccagaa cccaagatac caggttaccc agtttggaaa gccagtgacc 60
ctgagttgtt ctcagacttt gaaccataac gtcatgtact ggtaccagca gaagtcaagt 120
caggccccaa agctgctgtt ccactactat gacaaagatt ttaacaatga agcagacacc 180
cctgataact tccaatccag gaggccgaac acttctttct gctttcttga catccgctca 240
ccaggcctgg gggacacagc catgtacctg tgtgccacca gcagaga 287
<210> 217
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV15*03
<400> 217
gatgccatgg tcatccagaa cccaagatac cgggttaccc agtttggaaa gccagtgacc 60
ctgagttgtt ctcagacttt gaaccataac gtcatgtact ggtaccagca gaagtcaagt 120
caggccccaa agctgctgtt ccactactat aacaaagatt ttaacaatga agcagacacc 180
cctgataact tccaatccag gaggccgaac acttctttct gctttctaga catccgctca 240
ccaggcctgg gggacgcagc catgtaccag tgtgccacca gc 282
<210> 218
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV15*02
<400> 218
gatgccatgg tcatccagaa cccaagatac caggttaccc agtttggaaa gccagtgacc 60
ctgagttgtt ctcagacttt gaaccataac gtcatgtact ggtaccagca gaagtcaagt 120
caggccccaa agctgctgtt ccactactat gacaaagatt ttaacaatga agcagacacc 180
cctgataact tccaatccag gaggccgaac acttctttct gctttcttga catccgctca 240
ccaggcctgg gggacgcagc catgtacctg tgtgccacca gc 282
<210> 219
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV16*01
<400> 219
ggtgaagaag tcgcccagac tccaaaacat cttgtcagag gggaaggaca gaaagcaaaa 60
ttatattgtg ccccaataaa aggacacagt tatgtttttt ggtaccaaca ggtcctgaaa 120
aacgagttca agttcttgat ttccttccag aatgaaaatg tctttgatga aacaggtatg 180
cccaaggaaa gattttcagc taagtgcctc ccaaattcac cctgtagcct tgagatccag 240
gctacgaagc ttgaggattc agcagtgtat ttttgtgcca gcagccaatc 290
<210> 220
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV16*02
<400> 220
ggtgaagaag tcgcccagac tccaaaacat cttgtcagag gggaaggaca gaaagcaaaa 60
ttatattgtg ccccaataaa aggacacagt taggtttttt ggtaccaaca ggtcctgaaa 120
aacgagttca agttcttgat ttccttccag aatgaaaatg tctttgatga aacaggtatg 180
cccaaggaaa gattttcagc taagtgcctc ccaaattcac cctgtagcct tgagatccag 240
gctacgaagc ttgaggattc agcagtgtat ttttgtgcca gcagccaatc 290
<210> 221
<211> 285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV16*03
<400> 221
ggtgaagaag tcgcccagac tccaaaacat cttgtcagag gggaaggaca gaaagcaaaa 60
ttatattgtg ccccaataaa aggacacagt tatgtttttt ggtaccaaca ggtcctgaaa 120
aacgagttca agttcttggt ttccttccag aatgaaaatg tctttgatga aacaggtatg 180
cccaaggaaa gattttcagc taagtgcctc ccaaattcac cctgtagcct tgagatccag 240
gctacgaagc ttgaggattc agcagtgtat ttttgtgcca gcagc 285
<210> 222
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV17*01
<400> 222
gagcctggag tcagccagac ccccagacac aaggtcacca acatgggaca ggaggtgatt 60
ctgaggtgcg atccatcttc tggtcacatg tttgttcact ggtaccgaca gaatctgagg 120
caagaaatga agttgctgat ttccttccag taccaaaaca ttgcagttga ttcagggatg 180
cccaaggaac gattcacagc tgaaagacct aacggaacgt cttccacgct gaagatccat 240
cccgcagagc cgagggactc agccgtgtat ctctacagta gcggtgg 287
<210> 223
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV18*01
<400> 223
aatgccggcg tcatgcagaa cccaagacac ctggtcagga ggaggggaca ggaggcaaga 60
ctgagatgca gcccaatgaa aggacacagt catgtttact ggtatcggca gctcccagag 120
gaaggtctga aattcatggt ttatctccag aaagaaaata tcatagatga gtcaggaatg 180
ccaaaggaac gattttctgc tgaatttccc aaagagggcc ccagcatcct gaggatccag 240
caggtagtgc gaggagattc ggcagcttat ttctgtgcca gctcaccacc 290
<210> 224
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV19*01
<400> 224
gatggtggaa tcactcagtc cccaaagtac ctgttcagaa aggaaggaca gaatgtgacc 60
ctgagttgtg aacagaattt gaaccacgat gccatgtact ggtaccgaca ggacccaggg 120
caagggctga gattgatcta ctactcacag atagtaaatg actttcagaa aggagatata 180
gctgaagggt acagcgtctc tcgggagaag aaggaatcct ttcctctcac tgtgacatcg 240
gcccaaaaga acccgacagc tttctatctc tgtgccagta gtataga 287
<210> 225
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV19*02
<400> 225
gatggtggaa tcactcagtc cccaaagtac ctgttcagaa aggaaggaca gaatgtgacc 60
ctgagttgtg aacagaattt gaaccacgat gccatgtact ggtaccgaca ggtcccaggg 120
caagggctga gattgatcta ctactcacac atagtaaatg actttcagaa aggagatata 180
gctgaagggt acagcgtctc tcgggagaag aaggaatcct ttcctctcac tgtgacatcg 240
gcccaaaaga acccgacagc tttctatctc tgtgccagta gtataga 287
<210> 226
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV19*03
<400> 226
gatggtggaa tcactcagtc cccaaagtac ctgttcagaa aggaaggaca gaatgtgacc 60
ctgagttgtg aacagaattt gaaccacgat gccatgtact ggtaccgaca ggacccaggg 120
caagggctga gattgatcta ctactcacac atagtaaatg actttcagaa aggagatata 180
gctgaagggt acagcgtctc tcgggagaag aaggaatcct ttcctctcac tgtgacatcg 240
gcccaaaaga acccgacagc tttctatctc tgtgccagta gc 282
<210> 227
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*05
<400> 227
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagcagg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaaaagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgctag a 291
<210> 228
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*07
<400> 228
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagcagg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaaaagagtc tcatgcagat cgcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgctag a 291
<210> 229
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*04
<400> 229
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagcagg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccttgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaaaagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgctag t 291
<210> 230
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*06
<400> 230
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagtagg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaaaagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgct 288
<210> 231
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*02
<400> 231
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagcagg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaacagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgct 288
<210> 232
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*01
<400> 232
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagctgg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaacagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct ccaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgctag aga 293
<210> 233
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV20-1*03
<400> 233
ggtgctgtcg tctctcaaca tccgagctgg gttatctgta agagtggaac ctctgtgaag 60
atcgagtgcc gttccctgga ctttcaggcc acaactatgt tttggtatcg tcagttcccg 120
aaacagagtc tcatgctgat ggcaacttcc aatgagggct gcaaggccac atacgagcaa 180
ggcgtcgaga aggacaagtt tctcatcaac catgcaagcc tgaccttgtc cactctgaca 240
gtgaccagtg cccatcctga agacagcagc ttctacatct gcagtgct 288
<210> 234
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV21-1*01
<400> 234
gacaccaagg tcacccagag acctagactt ctggtcaaag caagtgaaca gaaagcaaag 60
atggattgtg ttcctataaa agcacatagt tatgtttact ggtatcgtaa gaagctggaa 120
gaagagctca agtttttggt ttactttcag aatgaagaac ttattcagaa agcagaaata 180
atcaatgagc gatttttagc ccaatgctcc aaaaactcat cctgtacctt ggagatccag 240
tccacggagt caggggacac agcactgtat ttctgtgcca gcagcaaagc 290
<210> 235
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV22-1*01
<400> 235
gatgctgaca tctatcagat gccattccag ctcactgggg ctggatggga tgtgactctg 60
gagtggaaac ggaatttgag acacaatgac atgtactgct actggtactg gcaggaccca 120
aagcaaaatc tgagactgat ctattactca agggttgaaa aggatattca gagaggagat 180
ctaactgaag gctacgtgtc tgccaagagg agaaggggct atttcttctc agggtgaagt 240
tggcccacac cagccaaaca gctttgtact tctgtcctgg gagcgcac 288
<210> 236
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV23-1*01
<400> 236
catgccaaag tcacacagac tccaggacat ttggtcaaag gaaaaggaca gaaaacaaag 60
atggattgta cccccgaaaa aggacatact tttgtttatt ggtatcaaca gaatcagaat 120
aaagagttta tgcttttgat ttcctttcag aatgaacaag ttcttcaaga aacggagatg 180
cacaagaagc gattctcatc tcaatgcccc aagaacgcac cctgcagcct ggcaatcctg 240
tcctcagaac cgggagacac ggcactgtat ctctgcgcca gcagtcaatc 290
<210> 237
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV24-1*01
<400> 237
gatgctgatg ttacccagac cccaaggaat aggatcacaa agacaggaaa gaggattatg 60
ctggaatgtt ctcagactaa gggtcatgat agaatgtact ggtatcgaca agacccagga 120
ctgggcctac ggttgatcta ttactccttt gatgtcaaag atataaacaa aggagagatc 180
tctgatggat acagtgtctc tcgacaggca caggctaaat tctccctgtc cctagagtct 240
gccatcccca accagacagc tctttacttc tgtgccacca gtgatttg 288
<210> 238
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV25-1*01
<400> 238
gaagctgaca tctaccagac cccaagatac cttgttatag ggacaggaaa gaagatcact 60
ctggaatgtt ctcaaaccat gggccatgac aaaatgtact ggtatcaaca agatccagga 120
atggaactac acctcatcca ctattcctat ggagttaatt ccacagagaa gggagatctt 180
tcctctgagt caacagtctc cagaataagg acggagcatt ttcccctgac cctggagtct 240
gccaggccct cacatacctc tcagtacctc tgtgccagca gtgaata 287
<210> 239
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV26*01
<400> 239
gatgctgtag ttacacaatt cccaagacac agaatcattg ggacaggaaa ggaattcatt 60
ctacagtgtt cccagaatat gaatcatgtt acaatgtact ggtatcgaca ggacccagga 120
cttggactga agctggtcta ttattcacct ggcactggga gcactgaaaa aggagatatc 180
tctgaggggt atcatgtttc ttgaaatact atagcatctt ttcccctgac cctgaagtct 240
gccagcacca accagacatc tgtgtatctc tatgccagca gttcatc 287
<210> 240
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV27*01
<400> 240
gaagcccaag tgacccagaa cccaagatac ctcatcacag tgactggaaa gaagttaaca 60
gtgacttgtt ctcagaatat gaaccatgag tatatgtcct ggtatcgaca agacccaggg 120
ctgggcttaa ggcagatcta ctattcaatg aatgttgagg tgactgataa gggagatgtt 180
cctgaagggt acaaagtctc tcgaaaagag aagaggaatt tccccctgat cctggagtcg 240
cccagcccca accagacctc tctgtacttc tgtgccagca gtttatc 287
<210> 241
<211> 287
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV28*01
<400> 241
gatgtgaaag taacccagag ctcgagatat ctagtcaaaa ggacgggaga gaaagttttt 60
ctggaatgtg tccaggatat ggaccatgaa aatatgttct ggtatcgaca agacccaggt 120
ctggggctac ggctgatcta tttctcatat gatgttaaaa tgaaagaaaa aggagatatt 180
cctgaggggt acagtgtctc tagagagaag aaggagcgct tctccctgat tctggagtcc 240
gccagcacca accagacatc tatgtacctc tgtgccagca gtttatg 287
<210> 242
<211> 290
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV29-1*01
<400> 242
agtgctgtca tctctcaaaa gccaagcagg gatatctgtc aacgtggaac ctccctgacg 60
atccagtgtc aagtcgatag ccaagtcacc atgatgttct ggtaccgtca gcaacctgga 120
cagagcctga cactgatcgc aactgcaaat cagggctctg aggccacata tgagagtgga 180
tttgtcattg acaagtttcc catcagccgc ccaaacctaa cattctcaac tctgactgtg 240
agcaacatga gccctgaaga cagcagcata tatctctgca gcgttgaaga 290
<210> 243
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV29-1*02
<400> 243
agtgctgtca tctctcaaaa gccaagcagg gatatctgtc aacgtggaac ctccctgacg 60
atccagtgtc aagtcgatag ccaagtcacc atgatgttct ggtaccgtca gcaacctgga 120
cagagcctga cactgatcgc aactgcaaat cagggctctg aggccacata tgagagtgga 180
tttgtcattg acaagtttcc catcagccgc ccaaacctaa cattctcaag tctgactgtg 240
agcaacatga gccctgaaga cagcagcata tatctctgca gcgttgaa 288
<210> 244
<211> 231
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV29-1*03
<400> 244
acgatccagt gtcaagtcga tagccaagtc accatgatat tctggtaccg tcagcaacct 60
ggacagagcc tgacactgat cgcaactgca aatcagggct ctgaggccac atatgagagt 120
ggatttgtca ttgacaagtt tcccatcagc cgcccaaacc taacattctc aactctgact 180
gtgagcaaca tgagccctga agacagcagc atatatctct gcagcgcggg c 231
<210> 245
<211> 284
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30*02
<400> 245
tctcagacta ttcatcaatg gccagcgacc ctggtgcagc ctgtgggcag cccgctctct 60
ctggagtgca ctgtggaggg aacatcaaac cccaacctat actggtaccg acaggctgca 120
ggcaggggcc tccagctgct cttctactcc gttggtattg gccagatcag ctctgaggtg 180
ccccagaatc tctcagcctc cagaccccag gaccggcagt tcatcctgag ttctaagaag 240
ctcctcctca gtgactctgg cttctatctc tgtgcctgga gtgt 284
<210> 246
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30*05
<400> 246
tctcagacta ttcatcaatg gccagcgacc ctggtgcagc ctgtgggcag cccgctctcc 60
ctggagtgca ctgtggaggg aacatcaaac cccaacctat actggtaccg acaggctgca 120
ggacggggcc tccagctgct cttctactcc gttggtattg gccagatcag ctctgaggtg 180
ccccagaatc tctcagcctc cagaccccag gaccggcagt tcatcctgag ttctaagaag 240
ctccttctca gtgactctgg cttctatctc tgtgcctggg ga 282
<210> 247
<211> 284
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30*01
<400> 247
tctcagacta ttcatcaatg gccagcgacc ctggtgcagc ctgtgggcag cccgctctct 60
ctggagtgca ctgtggaggg aacatcaaac cccaacctat actggtaccg acaggctgca 120
ggcaggggcc tccagctgct cttctactcc gttggtattg gccagatcag ctctgaggtg 180
ccccagaatc tctcagcctc cagaccccag gaccggcagt tcatcctgag ttctaagaag 240
ctccttctca gtgactctgg cttctatctc tgtgcctgga gtgt 284
<210> 248
<211> 276
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV30*04
<400> 248
actattcatc aatggccagc gaccctggtg cagcctgtgg gcagcccgct ctctctggag 60
tgcactgtgg agggaacatc aaaccccaac ctatactggt accgacaggc tgcaggcagg 120
ggcctccagc tgctcttcta ctccattggt attgaccaga tcagctctga ggtgccccag 180
aatctctcag cctccagacc ccaggaccgg cagttcattc tgagttctaa gaagctcctc 240
ctcagtgact ctggcttcta tctctgtgcc tggagt 276
<210> 249
<211> 448
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S1
<400> 249
ttgaaaaagg aacctaggac cctgtggatg gactctgtca ttctccatgg tcctaaaaag 60
caaaagtcaa agtgttcttc tgtgtaatac ccataaagca caggaggaga tttcttagct 120
cactgtcctc catcctagcc agggccctct cccctctcta tgccttcaat gtgattttca 180
ccttgacccc tgtcactgtg tgaacactga agctttcttt ggacaaggca ccagactcac 240
agttgtaggt aagacatttt tcaggttctt ttgcagatcc gtcacaggga aaagtgggtc 300
cacagtgtcc cttttagagt ggctatattc ttatgtgcta actatggcta caccttcggt 360
tcggggacca ggttaaccgt tgtaggtaag gctgggggtc tctaggaggg gtgcgatgag 420
ggaggactct gtcctgggaa atgtcaaa 448
<210> 250
<211> 448
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S2
<400> 250
gccagggccc tctcccctct ctatgccttc aatgtgattt tcaccttgac ccctgtcact 60
gtgtgaacac tgaagctttc tttggacaag gcaccagact cacagttgta ggtaagacat 120
ttttcaggtt cttttgcaga tccgtcacag ggaaaagtgg gtccacagtg tcccttttag 180
agtggctata ttcttatgtg ctaactatgg ctacaccttc ggttcgggga ccaggttaac 240
cgttgtaggt aaggctgggg gtctctagga ggggtgcgat gagggaggac tctgtcctgg 300
gaaatgtcaa agagaacaga gatcccagct cccggagcca gactgaggga gacgtcatgt 360
catgtcccgg gattgagttc aggggaggct ccctgtgagg gcgaatccac ccaggcttcc 420
cagaggctct gagcagtcac agctgagc 448
<210> 251
<211> 450
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S3
<400> 251
gattttatag gaggccactc tgtgtctctt tttgtcacct gcctgagtct tgggcaagct 60
ctggaaggga acacagagta ctggaagcag agctgctgtc cctgtgaggg aagagttccc 120
atgaactccc aacctctgcc tgaatcccag ctgtgctcag cagagactgg ggggttttga 180
agtggccctg ggaggctgtg ctctggaaac accatatatt ttggagaggg aagttggctc 240
actgttgtag gtgagtaagt caaggctgga cagctgggaa cttgcaaaaa ggggctggaa 300
tccagacgga gcctttgtct ctagtgctta ggtgaaagtg tatttttgtc aggaaggcct 360
atgaggcaga tgaggagggg atagcctccc tctcctctcg actattttgt agactgcctg 420
tgccaagtta ggttccccta ctgagagatg 450
<210> 252
<211> 451
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S4
<400> 252
cagaagaggg aacttggggg atcacacggg gcctaattgg tctgctgacc accgcatttt 60
gggttgtacc attgtctacc cctctaccca ccagggttaa aattctacta aggaacagga 120
gaggacctgg caggtggact tggggaggca ggagtggaag gcagcaggtc gcggttttcc 180
ttccagtctt taatgttgtg caactaatga aaaactgttt tttggcagtg gaacccagct 240
ctctgtcttg ggtatgtaaa agacttcttt cgggatagtg tatcataagg tcggagttcc 300
aggaggaccc cttgcgggag ggcagaaact gagaacacag ccaagaaaag ctcataaaat 360
gtgggtcagt ggagtgtgtg gtggggcccc aagagttctg tgtgtaagca gcttctggaa 420
ggaagggccc acaccagctc ctctggggtt t 451
<210> 253
<211> 450
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S5
<400> 253
gatagtgtat cataaggtcg gagttccagg aggacccctt gcgggagggc agaaactgag 60
aacacagcca agaaaagctc ataaaatgtg ggtcagtgga gtgtgtggtg gggccccaag 120
agttctgtgt gtaagcagct tctggaagga agggcccaca ccagctcctc tggggtttgc 180
cacactcatg atgcactgtg tagcaatcag ccccagcatt ttggtgatgg gactcgactc 240
tccatcctag gtaagttgca gaatcagggt ggtatggcca ttgtcccttg aaggcagagt 300
tctctgcttc tcctcccggt gctggtgagg cagattgagt aaaatctctt accccatggg 360
gtaagagctg tgcctgtgcc tgcgttccct ttggtgtgtc ttggttgact cctctatttc 420
tcttctctaa gtcttcagtc cataatctgc 450
<210> 254
<211> 453
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ1S6
<400> 254
atggctctgc ctctcctaag cctcttcctc ttgcgcctta tgctgcacag tatgcttagg 60
cctttttcct aacagaatcc ctttggtcca gagccatgaa tccaggcaga gaaaggcagc 120
catcctgctg tcagggagct aagacttgcc ctctgactgg agatcgccgg gtgggtttta 180
tctaagcctc tgcagctgtg ctcctataat tcacccctcc actttgggaa cgggaccagg 240
ctcactgtga caggtatggg ggctccactc ttgactcggg ggtgcctggg tttgactgca 300
atgatcagtt gctgggaagg gaattgagtg taagaacgga ggtcagggtc accccttctt 360
acctggagca ctgtgccctc tcctcccctc cctggagctc ttccagcttg ttgctctgct 420
gtgttgcctg cagttcctca gctgtagagc tcc 453
<210> 255
<211> 449
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S1
<400> 255
aatccactgt gttgtccccc agccaagtgg attctcctct gcaaattggt ggtggcctca 60
tgcaagatcc agttaccgtg tccagctaac tcgagacagg aaaagatagg ctcaggaaag 120
agaggaaggg tgtgccctct gtctgtgcta agggaggtgg ggaaggagaa ggaattctgg 180
gcagcccctt cccactgtgc tcctacaatg agcagttctt cgggccaggg acacggctca 240
ccgtgctagg taagaagggg gctccaggtg ggagagaggg tgagcagccc agcctgcacg 300
accccagaac cctgttctta ggggagtgga cactgggcaa tccagggccc tcctcgaggg 360
aagcggggtt tgcgccaggg tccccagggc tgtgcgaaca ccggggagct gttttttgga 420
gaaggctcta ggctgaccgt actgggtaa 449
<210> 256
<211> 451
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S2
<400> 256
ctgtgctcct acaatgagca gttcttcggg ccagggacac ggctcaccgt gctaggtaag 60
aagggggctc caggtgggag agagggtgag cagcccagcc tgcacgaccc cagaaccctg 120
ttcttagggg agtggacact gggcaatcca gggccctcct cgagggaagc ggggtttgcg 180
ccagggtccc cagggctgtg cgaacaccgg ggagctgttt tttggagaag gctctaggct 240
gaccgtactg ggtaaggagg cggttggggc tccggagagc tccgagaggg cgggatgggc 300
agaggtaagc agctgcccca ctctgagagg ggctgtgctg agaggcgctg ctgggcgtct 360
gggcggagga ctcctggttc tgggtgctgg gagagcgatg gggctctcag cggtgggaag 420
gacccgagct gagtctggga cagcagagcg g 451
<210> 257
<211> 449
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S3
<400> 257
gggcgggatg ggcagaggta agcagctgcc ccactctgag aggggctgtg ctgagaggcg 60
ctgctgggcg tctgggcgga ggactcctgg ttctgggtgc tgggagagcg atggggctct 120
cagcggtggg aaggacccga gctgagtctg ggacagcaga gcgggcagca ccggtttttg 180
tcctgggcct ccaggctgtg agcacagata cgcagtattt tggcccaggc acccggctga 240
cagtgctcgg taagcggggg ctcccgctga agccccggaa ctggggaggg ggcgccccgg 300
gacgccgggg gcgtcgcagg gccagtttct gtgccgcgtc tcggggctgt gagccaaaaa 360
cattcagtac ttcggcgccg ggacccggct ctcagtgctg ggtaagctgg ggccgccggg 420
ggaccgggga cgagactgcg ctcgggttt 449
<210> 258
<211> 450
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S4
<400> 258
gacagcagag cgggcagcac cggtttttgt cctgggcctc caggctgtga gcacagatac 60
gcagtatttt ggcccaggca cccggctgac agtgctcggt aagcgggggc tcccgctgaa 120
gccccggaac tggggagggg gcgccccggg acgccggggg cgtcgcaggg ccagtttctg 180
tgccgcgtct cggggctgtg agccaaaaac attcagtact tcggcgccgg gacccggctc 240
tcagtgctgg gtaagctggg gccgccgggg gaccggggac gagactgcgc tcgggttttt 300
gtgcggggct cgggggccgt gaccaagaga cccagtactt cgggccaggc acgcggctcc 360
tggtgctcgg tgagcgcggg ctgctggggc gcgggcgcgg gcggcttggg tctggttttt 420
gcggggagtc cccgggctgt gctctggggc 450
<210> 259
<211> 448
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S5
<400> 259
ccccggaact ggggaggggg cgccccggga cgccgggggc gtcgcagggc cagtttctgt 60
gccgcgtctc ggggctgtga gccaaaaaca ttcagtactt cggcgccggg acccggctct 120
cagtgctggg taagctgggg ccgccggggg accggggacg agactgcgct cgggtttttg 180
tgcggggctc gggggccgtg accaagagac ccagtacttc gggccaggca cgcggctcct 240
ggtgctcggt gagcgcgggc tgctggggcg cgggcgcggg cggcttgggt ctggtttttg 300
cggggagtcc ccgggctgtg ctctggggcc aacgtcctga ctttcggggc cggcagcagg 360
ctgaccgtgc tgggtgagtt ttcgcgggac cacccgggcg gcgggattca ggtggaaggc 420
ggcggctgct tcgcggcacc cggtccgg 448
<210> 260
<211> 453
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S6
<400> 260
cagtgctggg taagctgggg ccgccggggg accggggacg agactgcgct cgggtttttg 60
tgcggggctc gggggccgtg accaagagac ccagtacttc gggccaggca cgcggctcct 120
ggtgctcggt gagcgcgggc tgctggggcg cgggcgcggg cggcttgggt ctggtttttg 180
cggggagtcc ccgggctgtg ctctggggcc aacgtcctga ctttcggggc cggcagcagg 240
ctgaccgtgc tgggtgagtt ttcgcgggac cacccgggcg gcgggattca ggtggaaggc 300
ggcggctgct tcgcggcacc cggtccggcc ctgtgctggg agacctgggc tgggtcccca 360
gggtgggcag gagctcgggg agccttagag gtttgcatgc gggggtgcac ctccgtgctc 420
ctacgagcag tacttcgggc cgggcaccag gct 453
<210> 261
<211> 447
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TCRBJ2S7
<400> 261
tgactttcgg ggccggcagc aggctgaccg tgctgggtga gttttcgcgg gaccacccgg 60
gcggcgggat tcaggtggaa ggcggcggct gcttcgcggc acccggtccg gccctgtgct 120
gggagacctg ggctgggtcc ccagggtggg caggagctcg gggagcctta gaggtttgca 180
tgcgggggtg cacctccgtg ctcctacgag cagtacttcg ggccgggcac caggctcacg 240
gtcacaggtg agattcgggc gtctccccac cttccagccc ctcggtcccc ggagtcggag 300
ggtggaccgg agctggagga gctgggtgtc cggggtcagc tctgcaaggt cacctccccg 360
ctcctgggga aagactgggg aagagggagg gggtggggag gtgctcagag tccggaaagc 420
tgagcagagg gcgaggccac ttttaat 447
<210> 262
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-46*02
<400> 262
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg catctggata caccttcaac agctactata tgcactgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaata atcaacccta gtggtggtag cacaagctac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accagggaca cgtccacgag cacagtctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 263
<211> 260
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1/OR15-5*01
<400> 263
agaagcctgg ggcctcagtg aaggtctcct gcaaggcttc tggatacacc ttcaccagct 60
actgtatgca ctgggtgcac caggtccatg cacaagggct tgagtggatg ggattggtgt 120
gccctagtga tggcagcaca agctatgcac agaagttcca ggccagagtc accataacca 180
gggacacatc catgagcaca gcctacatgg agctaagcag tctgagatct gaggacacgg 240
ccatgtatta ctgtgtgaga 260
<210> 264
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1/OR15-5*03
<400> 264
caggtacagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc aactactgta tgcactgggt gcgccaggtc 120
catgcacaag ggcttgagtg gatgggattg gtgtgcccta gtgatggcag cacaagctat 180
gcacaaaagt tccaggccag agtcaccata accagggaca catccatgag cacagcctac 240
atggagctaa gcagtctgag atctgaggac acggccatgt attactgtgt gaga 294
<210> 265
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1/OR15-9*01
<400> 265
caggtacagc tgatgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaggatc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc agctactgta tgcactgggt gtgccaggcc 120
catgcacaag ggcttgagtg gatgggattg gtgtgcccta gtgatggcag cacaagctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccata accagggaca catccatggg cacagcctac 240
atggagctaa gcagcctgag atctgaggac acggccatgt attactgtgt gagaga 296
<210> 266
<211> 260
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-c*01
<400> 266
ggaagtctgg ggcctcagtg aaagtctcct gtagtttttc tgggtttacc atcaccagct 60
acggtataca ttgggtgcaa cagtcccctg gacaagggct tgagtggatg ggatggatca 120
accctggcaa tggtagccca agctatgcca agaagtttca gggcagattc accatgacca 180
gggacatgtc cacaaccaca gcctacacag acctgagcag cctgacatct gaggacatgg 240
ctgtgtatta ctatgcaaga 260
<210> 267
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-NL1*01
<220>
<221> misc_feature
<222> (136)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (253)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 267
caggttcagc tgttgcagcc tggggtccag gtgaagaagc ctgggtcctc agtgaaggtc 60
tcctgctagg cttccagata caccttcacc aaatacttta cacggtgggt gtgacaaagc 120
cctggacaag ggcatnagtg gatgggatga atcaaccctt acaacgataa cacacactac 180
gcacagacgt tctggggcag agtcaccatt accagtgaca ggtccatgag cacagcctac 240
atggagctga gcngcctgag atccgaagac atggtcgtgt attactgtgt gagaga 296
<210> 268
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-58*01
<400> 268
caaatgcagc tggtgcagtc tgggcctgag gtgaagaagc ctgggacctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggatt cacctttact agctctgctg tgcagtgggt gcgacaggct 120
cgtggacaac gccttgagtg gataggatgg atcgtcgttg gcagtggtaa cacaaactac 180
gcacagaagt tccaggaaag agtcaccatt accagggaca tgtccacaag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atccgaggac acggccgtgt attactgtgc ggcaga 296
<210> 269
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-58*02
<400> 269
caaatgcagc tggtgcagtc tgggcctgag gtgaagaagc ctgggacctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggatt cacctttact agctctgcta tgcagtgggt gcgacaggct 120
cgtggacaac gccttgagtg gataggatgg atcgtcgttg gcagtggtaa cacaaactac 180
gcacagaagt tccaggaaag agtcaccatt accagggaca tgtccacaag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atccgaggac acggccgtgt attactgtgc ggcaga 296
<210> 270
<211> 275
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*03
<400> 270
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgatgac acggc 275
<210> 271
<211> 233
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*07
<400> 271
agaagcctgg gtcctcggtg aaggtctcct gcaaggcttc tggaggcacc ttcagcagct 60
atgctatcag ctgggtgcga caggcccctg gacaagggct tgagtggatg ggaaggatca 120
tccctatctt tggtacagca aactacgcac agaagttcca gggcagagtc acgattaccg 180
cggacgaatc cacgagcaca gcctacatgg agctgagcag cctgagatct gag 233
<210> 272
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*12
<400> 272
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 273
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*05
<400> 273
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accacggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 274
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*13
<400> 274
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 275
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*01
<400> 275
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 276
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*06
<400> 276
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 277
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*02
<400> 277
caggtccagc tggtgcaatc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatacta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtat agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 278
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*08
<400> 278
caggtccagc tggtgcaatc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatacta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 279
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*04
<400> 279
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtat agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 280
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*11
<400> 280
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 281
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*09
<400> 281
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtat agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 282
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-69*10
<400> 282
caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tccttggtat agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 283
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-f*01
<400> 283
gaggtccagc tggtacagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggctac agtgaaaatc 60
tcctgcaagg tttctggata caccttcacc gactactaca tgcactgggt gcaacaggcc 120
cctggaaaag ggcttgagtg gatgggactt gttgatcctg aagatggtga aacaatatac 180
gcagagaagt tccagggcag agtcaccata accgcggaca cgtctacaga cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc aaca 294
<210> 284
<211> 233
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-f*02
<400> 284
agaagcctgg ggctacagtg aaaatctcct gcaaggtttc tggatacacc ttcaccgact 60
actacatgca ctgggtgcaa caggcccctg gaaaagggct tgagtggatg ggacttgttg 120
atcctgaaga tggtgaaaca atatatgcag agaagttcca gggcagagtc accataaccg 180
cggacacgtc tacagacaca gcctacatgg agctgagcag cctgagatct gag 233
<210> 285
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV1-24*01
<400> 285
caggtccagc tggtacagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg tttccggata caccctcact gaattatcca tgcactgggt gcgacaggct 120
cctggaaaag ggcttgagtg gatgggaggt tttgatcctg aagatggtga aacaatctac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accgaggaca catctacaga cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc aacaga 296
<210> 286
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV7-4-1*01
<400> 286
caggtgcagc tggtgcaatc tgggtctgag ttgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcact agctatgcta tgaattgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atcaacacca acactgggaa cccaacgtat 180
gcccagggct tcacaggacg gtttgtcttc tccttggaca cctctgtcag cacggcatat 240
ctgcagatct gcagcctaaa ggctgaggac actgccgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 287
<211> 274
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV7-4-1*03
<400> 287
caggtgcagc tggtgcaatc tgggtctgag ttgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcact agctatgcta tgaattgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atcaacacca acactgggaa cccaacgtat 180
gcccagggct tcacaggacg gtttgtcttc tccttggaca cctctgtcag cacggcatat 240
ctgcagatca gcacgctaaa ggctgaggac actg 274
<210> 288
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV7-4-1*02
<400> 288
caggtgcagc tggtgcaatc tgggtctgag ttgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcact agctatgcta tgaattgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atcaacacca acactgggaa cccaacgtat 180
gcccagggct tcacaggacg gtttgtcttc tccttggaca cctctgtcag cacggcatat 240
ctgcagatca gcagcctaaa ggctgaggac actgccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 289
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV7-81*01
<400> 289
caggtgcagc tggtgcagtc tggccatgag gtgaagcagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggtta cagtttcacc acctatggta tgaattgggt gccacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg ttcaacacct acactgggaa cccaacatat 180
gcccagggct tcacaggacg gtttgtcttc tccatggaca cctctgccag cacagcatac 240
ctgcagatca gcagcctaaa ggctgaggac atggccatgt attactgtgc gagata 296
<210> 290
<211> 289
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV7-40*03
<400> 290
ctgcagctgg tgcagtctgg gcctgaggtg aagaagcctg gggcctcagt gaaggtctcc 60
tataagtctt ctggttacac cttcaccatc tatggtatga attgggtatg atagacccct 120
ggacagggct ttgagtggat gtgatggatc atcacctaca ctgggaaccc aacgtatacc 180
cacggcttca caggatggtt tgtcttctcc atggacacgt ctgtcagcac ggcgtgtctt 240
cagatcagca gcctaaaggc tgaggacacg gccgagtatt actgtgcga 289
<210> 291
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-51*01
<400> 291
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagaca 296
<210> 292
<211> 245
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-51*05
<400> 292
aaaagcccgg ggagtctctg aagatctcct gtaagggttc tggatacagc tttaccagct 60
actggatcgg ctgggtgcgc cagatgccca ggaaaggcct ggagtggatg gggatcatct 120
atcctggtga ctctgatacc agatacagcc cgtccttcca aggccaggtc accatctcag 180
ccgacaagtc catcagcacc gcctacctgc agtggagcag cctgaaggcc tcggacaccg 240
ccatg 245
<210> 293
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-51*02
<400> 293
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga ccggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcttggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagaca 296
<210> 294
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-51*03
<400> 294
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc cgggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gaga 294
<210> 295
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-51*04
<400> 295
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc cgggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agcccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gaga 294
<210> 296
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-a*01
<400> 296
gaagtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaggatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcagctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggagg attgatccta gtgactctta taccaactac 180
agcccgtcct tccaaggcca cgtcaccatc tcagctgaca agtccatcag cactgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gaga 294
<210> 297
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-a*03
<400> 297
gaagtgcagc tggtgcagtc cggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaggatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcagctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggagg attgatccta gtgactctta taccaactac 180
agcccgtcct tccaaggcca cgtcaccatc tcagctgaca agtccatcag cactgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gaga 294
<210> 298
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-a*04
<400> 298
gaagtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaggatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcagctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggagg attgatccta gtgactctta taccaactac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagctgaca agtccatcag cactgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gaga 294
<210> 299
<211> 295
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-a*02
<400> 299
gaagtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaggatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcagctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcttggagtg gatggggagg attgatccta gtgactctta taccaactac 180
agcccgtcct tccaaggcca cgtcaccatc tcagctgaca agtccatcag cactgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggctcggaca ccgccatgta ttactgtgcg agaca 295
<210> 300
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV5-78*01
<400> 300
gaggtgcagc tgttgcagtc tgcagcagag gtgaaaagac ccggggagtc tctgaggatc 60
tcctgtaaga cttctggata cagctttacc agctactgga tccactgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag aactggagtg gatggggagc atctatcctg ggaactctga taccagatac 180
agcccatcct tccaaggcca cgtcaccatc tcagccgaca gctccagcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac gccgccatgt attattgtgt gaga 294
<210> 301
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-11*01
<400> 301
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtcaagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgagctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtggtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagggaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 302
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-11*03
<400> 302
caggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtcaagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgagctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtagtagtta cacaaactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 303
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-21*01
<400> 303
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ctggtcaagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatagca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtagta gtagtagtta catatactac 180
gcagactcag tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 304
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-21*02
<400> 304
gaggtgcaac tggtggagtc tgggggaggc ctggtcaagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatagca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtagta gtagtagtta catatactac 180
gcagactcag tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 305
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-48*01
<400> 305
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatagca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtagtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca atgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 306
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-48*02
<400> 306
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatagca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtagtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca atgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agacgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 307
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-h*01
<400> 307
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtagta gtagtaccat atactacgca 180
gactctgtga agggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaactc actgtatctg 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag aga 293
<210> 308
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-h*02
<400> 308
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtagta gtagtaccat atactacgca 180
gactctgtga agggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaactc actgtatctg 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtttatt actgtgcgag aga 293
<210> 309
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-48*03
<400> 309
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agttatgaaa tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtggtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgttt attactgtgc gagaga 296
<210> 310
<211> 292
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-8*01
<400> 310
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactg 60
tcctgtccag cctctggatt caccttcagt aaccactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggagtg ggtttcatac attagtggtg atagtggtta cacaaactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagggaca acgccaataa ctcaccgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgt ga 292
<210> 311
<211> 292
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-9*01
<400> 311
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aaccactaca cgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggagtg ggtttcatac agtagtggta atagtggtta cacaaactac 180
gcagactctg tgaaaggccg attcaccatc tccagggaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgt ga 292
<210> 312
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-13*01
<400> 312
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctacgaca tgcactgggt ccgccaagct 120
acaggaaaag gtctggagtg ggtctcagct attggtactg ctggtgacac atactatcca 180
ggctccgtga agggccgatt caccatctcc agagaaaatg ccaagaactc cttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cggggacacg gctgtgtatt actgtgcaag aga 293
<210> 313
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-13*03
<400> 313
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctgtggatt caccttcagt agctacgaca tgcactgggt ccgccaagct 120
acaggaaaag gtctggagtg ggtctcagct attggtactg ctggtgacac atactatcca 180
ggctccgtga agggccaatt caccatctcc agagaaaatg ccaagaactc cttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cggggacacg gctgtgtatt actgtgcaag a 291
<210> 314
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-13*02
<400> 314
gaggtgcatc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctgggggggc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aactacgaca tgcactgggt ccgccaagct 120
acaggaaaag gtctggagtg ggtctcagcc aatggtactg ctggtgacac atactatcca 180
ggctccgtga aggggcgatt caccatctcc agagaaaatg ccaagaactc cttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cggggacacg gctgtgtatt actgtgcaag aga 293
<210> 315
<211> 123
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-47*02
<400> 315
atactatgca gactccgtga tgggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaagtc 60
cttgtatctt caaatgaaca gcctgatagc tgaggacatg gctgtgtatt attgtgcaag 120
aga 123
<210> 316
<211> 282
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-47*03
<400> 316
gaggatcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagaccc 60
tcctgtgcag cctctggatt cgccttcagt agctatgttc tgcactgggt tcgccgggct 120
ccagggaagg gtccggagtg ggtatcagct attggtactg gtggtgatac atactatgca 180
gactccgtga tgggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaagtc cttgtatctc 240
aaatgaacag cctgatagct gaggacatgg ctgtgtatta tg 282
<210> 317
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-47*01
<400> 317
gaggatcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgcgaccc 60
tcctgtgcag cctctggatt cgccttcagt agctatgctc tgcactgggt tcgccgggct 120
ccagggaagg gtctggagtg ggtatcagct attggtactg gtggtgatac atactatgca 180
gactccgtga tgggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaagtc cttgtatctt 240
catatgaaca gcctgatagc tgaggacatg gctgtgtatt attgtgcaag a 291
<210> 318
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-10*01
<400> 318
gaggttcagc tggtgcagtc tgggggaggc ttggtacatc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag gctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt tcgccaggct 120
ccaggaaaag gtctggagtg ggtatcagct attggtactg gtggtggcac atactatgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatg ccaagaactc cttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacatg gctgtgtatt actgtgcaag a 291
<210> 319
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-10*02
<400> 319
gaggttcagc tggtgcagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag gctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt tcgccaggct 120
ccaggaaaag gtctggagtg ggtatcagct attggtactg gtggtggcac atactatgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatg ccaagaactc cttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacatg gctgtgtatt actgtgcaag a 291
<210> 320
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-62*01
<400> 320
gaggtgcagc tggtggagtc tggggaaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctctgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaagaaagg gtttgtagtg ggtctcagtt attagtacaa gtggtgatac cgtactctac 180
acagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca atgcccagaa ttcactgtct 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgagggc acagttgtgt actactgtgt gaaaga 296
<210> 321
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-64*01
<400> 321
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggaata tgtttcagct attagtagta atgggggtag cacatattat 180
gcaaactctg tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
cttcaaatgg gcagcctgag agctgaggac atggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 322
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-64*02
<400> 322
gaggtgcagc tggtggagtc tggggaaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggaata tgtttcagct attagtagta atgggggtag cacatattat 180
gcagactctg tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
cttcaaatgg gcagcctgag agctgaggac atggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 323
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-64*03
<400> 323
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgttcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggaata tgtttcagct attagtagta atgggggtag cacatactac 180
gcagactcag tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
gtccaaatga gcagtctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgt gaaaga 296
<210> 324
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-64*05
<400> 324
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgttcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggaata tgtttcagct attagtagta atgggggtag cacatactac 180
gcagactcag tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
gttcaaatga gcagtctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgt gaaaga 296
<210> 325
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-64*04
<400> 325
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgttcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gactggaata tgtttcagct attagtagta atgggggtag cacatactac 180
gcagactcag tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 326
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-16*01
<400> 326
gaggtacaac tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggc ccgcaaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtatcgggt gttagttgga atggcagtag gacgcactat 180
gtggactccg tgaagcgccg attcatcatc tccagagaca attccaggaa ctccctgtat 240
ctgcaaaaga acagacggag agccgaggac atggctgtgt attactgtgt gagaaa 296
<210> 327
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-16*02
<400> 327
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggc ccgcaaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtatcgggt gttagttgga atggcagtag gacgcactat 180
gtggactccg tgaagcgccg attcatcatc tccagagaca attccaggaa ctccctgtat 240
ctgcaaaaga acagacggag agccgaggac atggctgtgt attactgtgt gagaaa 296
<210> 328
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-15*02
<400> 328
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagacac 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggt cctctaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtctcgggt attagttgga atggcggtaa gacgcactat 180
gtggactccg tgaagggcca atttaccatc tccagagaca attccagcaa gtccctgtat 240
ctgcaaaaga acagacagag agccaaagac atggccgtgt attactgtgt gaga 294
<210> 329
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-16*01
<400> 329
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagacac 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggt cctctaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtctcggat attagttgga atggcggtaa gacgcactat 180
gtggactccg tgaagggcca atttaccatc tccagagaca attccagcaa gtccctgtat 240
ctgcaaaaga acagacagag agccaaggac atggccgtgt attactgtgt gaga 294
<210> 330
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-15*01
<400> 330
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgtatt caccttcagt aacagtgaca taaactgggt cctctaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtctcgggt attagttgga atggcggtaa gacgcactat 180
gtggactccg tgaagggcca attttccatc tccagagaca attccagcaa gtccctgtat 240
ctgcaaaaga acagacagag agccaaggac atggccgtgt attactgtgt gagaaa 296
<210> 331
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-19*01
<400> 331
acagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtagagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtatcgggt gttagttgga atggcagtag gacgcactat 180
gcagactctg tgaagggccg attcatcatc tccagagaca attccaggaa cttcctgtat 240
cagcaaatga acagcctgag gcccgaggac atggctgtgt attactgtgt gagaaa 296
<210> 332
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-35*01
<400> 332
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctgggggatc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt aacagtgaca tgaactgggt ccatcaggct 120
ccaggaaagg ggctggagtg ggtatcgggt gttagttgga atggcagtag gacgcactat 180
gcagactctg tgaagggccg attcatcatc tccagagaca attccaggaa caccctgtat 240
ctgcaaacga atagcctgag ggccgaggac acggctgtgt attactgtgt gagaaa 296
<210> 333
<211> 298
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-43*01
<400> 333
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggagtc gtggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatacca tgcactgggt ccgtcaagct 120
ccggggaagg gtctggagtg ggtctctctt attagttggg atggtggtag cacatactat 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acagcaaaaa ctccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag aactgaggac accgccttgt attactgtgc aaaagata 298
<210> 334
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-43*02
<400> 334
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccgtcaagct 120
ccagggaagg gtctggagtg ggtctctctt attagtgggg atggtggtag cacatactat 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acagcaaaaa ctccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag aactgaggac accgccttgt attactgtgc aaaa 294
<210> 335
<211> 298
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-9*01
<400> 335
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagct 120
ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt attagttgga atagtggtag cataggctat 180
gcggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac acggccttgt attactgtgc aaaagata 298
<210> 336
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-20*01
<400> 336
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggt gtggtacggc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatggca tgagctgggt ccgccaagct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctctggt attaattgga atggtggtag cacaggttat 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agccgaggac acggccttgt atcactgtgc gagaga 296
<210> 337
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-74*01
<400> 337
gaggtgcagc tggtggagtc cgggggaggc ttagttcagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctactgga tgcactgggt ccgccaagct 120
ccagggaagg ggctggtgtg ggtctcacgt attaatagtg atgggagtag cacaagctac 180
gcggactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc aagaga 296
<210> 338
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-74*02
<400> 338
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttagttcagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctactgga tgcactgggt ccgccaagct 120
ccagggaagg ggctggtgtg ggtctcacgt attaatagtg atgggagtag cacaagctac 180
gcggactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc aaga 294
<210> 339
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-74*03
<400> 339
gaggtgcagc tggtggagtc cgggggaggc ttagttcagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctactgga tgcactgggt ccgccaagct 120
ccagggaagg ggctggtgtg ggtctcacgt attaatagtg atgggagtag cacaacgtac 180
gcggactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc aagaga 296
<210> 340
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-13*01
<400> 340
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttagtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctactgga tgcactgggt ccgccaagct 120
ccagggaagg ggctggtgtg ggtctcacgt attaatagtg atgggagtag cacaagctac 180
gcagactcca tgaagggcca attcaccatc tccagagaca atgctaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac atggctgtgt attactgtac taga 294
<210> 341
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-14*01
<400> 341
gaggtgcagc tggaggagtc tgggggaggc ttagtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctactgga tgcactgggt ccgccaatct 120
ccagggaagg ggctggtgtg agtctcacgt attaatagtg atgggagtag cacaagctac 180
gcagactcct tgaagggcca attcaccatc tccagagaca atgctaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac atggctgtgt attactgtac taga 294
<210> 342
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*01
<400> 342
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 343
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*08
<400> 343
caggtgcagc tggtggactc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgcatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 344
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*17
<400> 344
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccgggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 345
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*11
<400> 345
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 346
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*10
<400> 346
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
acagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 347
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*16
<400> 347
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggcc 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 348
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*15
<400> 348
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga gcagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 349
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*07
<400> 349
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 350
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*04
<400> 350
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 351
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*09
<400> 351
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcgccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 352
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*14
<400> 352
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
cttcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 353
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30-3*01
<400> 353
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagcaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 354
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30-3*02
<400> 354
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagcaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaga 296
<210> 355
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*03
<400> 355
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 356
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*18
<400> 356
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaga 296
<210> 357
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*06
<400> 357
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 358
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*12
<400> 358
caggtgcagc tggtggagtc tggggggggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 359
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*19
<400> 359
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 360
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-33*05
<400> 360
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 361
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*05
<400> 361
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgagggc acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 362
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*13
<400> 362
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa caggctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 363
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-33*01
<400> 363
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 364
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-33*04
<400> 364
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctagagtg ggtggcagtt atatggtatg acggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 365
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-33*02
<400> 365
caggtacagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg cgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccacgaa cacgctgttt 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 366
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-33*03
<400> 366
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca actccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaga 296
<210> 367
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-30*02
<400> 367
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcattt atacggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaga 296
<210> 368
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-52*01
<400> 368
gaggtgcagc tggtggagtc tgggtgaggc ttggtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctcctgga tgcactgggt ctgccaggct 120
ccggagaagg ggctggagtg ggtggccgac ataaagtgtg acggaagtga gaaatactat 180
gtagactctg tgaagggccg attgaccatc tccagagaca atgccaagaa ctccctctat 240
ctgcaagtga acagcctgag agctgaggac atgaccgtgt attactgtgt gagagg 296
<210> 369
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-52*02
<400> 369
gaggtgcagc tggtggagtc tgggtgaggc ttggtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctcctgga tgcactgggt ctgccaggct 120
ccggagaagg ggcaggagtg ggtggccgac ataaagtgtg acggaagtga gaaatactat 180
gtagactctg tgaagggccg attgaccatc tccagagaca atgccaagaa ctccctctat 240
ctgcaagtga acagcctgag agctgaggac atgaccgtgt attactgtgt gaga 294
<210> 370
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-52*03
<400> 370
gaggtgcagc tggtcgagtc tgggtgaggc ttggtacagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctcctgga tgcactgggt ctgccaggct 120
ccggagaagg ggctggagtg ggtggccgac ataaagtgtg acggaagtga gaaatactat 180
gtagactctg tgaagggccg attgaccatc tccagagaca atgccaagaa ctccctctat 240
ctgcaagtga acagcctgag agctgaggac atgaccgtgt attactgtgt gaga 294
<210> 371
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-7*01
<400> 371
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagt agctattgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtggccaac ataaagcaag atggaagtga gaaatactat 180
gtggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaga 296
<210> 372
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-7*02
<400> 372
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagt agctattgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaaag ggctggagtg ggtggccaac ataaagcaag atggaagtga gaaatactat 180
gtggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gaga 294
<210> 373
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-23*01
<400> 373
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct attagtggta gtggtggtag cacatactac 180
gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaaga 296
<210> 374
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-23*04
<400> 374
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct attagtggta gtggtggtag cacatactac 180
gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaaga 296
<210> 375
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-23*02
<400> 375
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct attagtggta gtggtggtag cacatactac 180
ggagactccg tgaagggccg gttcaccatc tcaagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaaga 296
<210> 376
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-23*03
<400> 376
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagtag cacatactat 180
gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagata attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaa 294
<210> 377
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-23*05
<400> 377
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctatgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct atttatagca gtggtagtag cacatactat 180
gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaa 294
<210> 378
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-53*01
<400> 378
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag aga 293
<210> 379
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-53*02
<400> 379
gaggtgcagc tggtggagac tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag a 291
<210> 380
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-66*03
<400> 380
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagct gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc tgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag aga 293
<210> 381
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-53*03
<400> 381
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccagcct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactctgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgctag gga 293
<210> 382
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-66*01
<400> 382
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggcagatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag aga 293
<210> 383
<211> 293
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-66*04
<400> 383
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggcagatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag aca 293
<210> 384
<211> 291
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-66*02
<400> 384
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc tgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag a 291
<210> 385
<211> 292
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-38*01
<400> 385
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctagggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaatgaga tgagctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtggtg gtagcacata ctacgcagac 180
tccaggaagg gcagattcac catctccaga gacaattcca agaacacgct gtatcttcaa 240
atgaacaacc tgagagctga gggcacggcc gcgtattact gtgccagata ta 292
<210> 386
<211> 292
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-38*02
<400> 386
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctagggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaatgaga tgagctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcatcc attagtggtg gtagcacata ctacgcagac 180
tccaggaagg gcagattcac catctccaga gacaattcca agaacacgct gtatcttcaa 240
atgaacaacc tgagagctga gggcacggcc gtgtattact gtgccagata ta 292
<210> 387
<211> 288
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-d*01
<400> 387
gaggtgcagc tggtggagtc tcggggagtc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaatgaga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gtctggagtg ggtctcatcc attagtggtg gtagcacata ctacgcagac 180
tccaggaagg gcagattcac catctccaga gacaattcca agaacacgct gcatcttcaa 240
atgaacagcc tgagagctga ggacacggct gtgtattact gtaagaaa 288
<210> 388
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR16-12*01
<400> 388
gaggtgcagc tggtagagtc tgggagaggc ttggcccagc ctggggggta cctaaaactc 60
tccggtgcag cctctggatt caccgtcggt agctggtaca tgagctggat ccaccaggct 120
ccagggaagg gtctggagtg ggtctcatac attagtagta gtggttgtag cacaaactac 180
gcagactctg tgaagggcag attcaccatc tccacagaca actcaaagaa cacgctctac 240
ctgcaaatga acagcctgag agtggaggac acggccgtgt attactgtgc aaga 294
<210> 389
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*01
<400> 389
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt attaaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 390
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*02
<400> 390
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagcc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt attaaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 391
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*04
<400> 391
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt attgaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 392
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*05
<400> 392
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt attaaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag tctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 393
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*06
<400> 393
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtcggccgt attaaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
aactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 394
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*07
<400> 394
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggttt cactttcagt aacgcctgga tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtcggccgt attaaaagca aaactgatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacccgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 395
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*03
<400> 395
gaggtgcagc tggtggagtc tgccggagcc ttggtacagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacttgcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt attaaaagca aagctaatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagttgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtaccaca 300
ga 302
<210> 396
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-15*08
<400> 396
gaggtgcagc tggtggagtc tgcgggaggc ttggtacagc ctggggggtc ccttagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacttgcagt aacgcctgga tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggctgt attaaaagca aagctaatgg tgggacaaca 180
gactacgctg cacctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaaaaacacg 240
ctgtatctgc aaatgatcag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgtaccaca 300
gg 302
<210> 397
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-72*01
<400> 397
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gaccactaca tggactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggttggccgt actagaaaca aagctaacag ttacaccaca 180
gaatacgccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc aaagaactca 240
ctgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgtgctaga 300
ga 302
<210> 398
<211> 165
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-72*02
<400> 398
accttcagtg accactacat ggactgggtc cgccaggctc cagggaaggg gctggagtgg 60
gttggccgta ctagaaacaa agctaacagc tacaccacag aatacgccgc gtctgtgaaa 120
ggcagattca ccatctcaag agatgattca aagaactcac tgtat 165
<210> 399
<211> 300
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR15-7*01
<400> 399
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctgggggttc tctgagactc 60
tcatgtgcag cctctggatt caccttcagt gaccactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
caagggaaag ggctagagtt ggtaggttta ataagaaaca aagctaacag ttacacgaca 180
gaatatgctg cgtctgtgaa aggcagactt accatctcaa gagaggattc aaagaacacg 240
atgtatctgc aaatgagcaa cctgaaaacc gaggacttgg ccgtgtatta ctgtgctaga 300
300
<210> 400
<211> 300
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR15-7*03
<400> 400
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctgggggttc tctgagactc 60
tcatgtgcag cctctggatt caccttcagt gaccactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
caagggaaag ggctagagtt ggtaggttta ataagaaaca aagctaacag ttacacgaca 180
gaatatgctg cgtctgtgaa aggcagactt accatctcaa gagaggattc aaagaacacg 240
ctgtatctgc aaatgagcag cctgaaaacc gaggacttgg ccgtgtatta ctgtgctaga 300
300
<210> 401
<211> 300
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3/OR15-7*02
<400> 401
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctgggggttc tctgagactc 60
tcatgtgctg cctctggatt caccttcagt gaccactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
caagggaaag ggctagagtt ggtaggttta ataagaaaca aagctaacag ttacacgaca 180
gaatatgctg cgtctgtgaa aggcagactt accatctcaa gagaggattc aaagaacacg 240
ctgtatctgc aaatgagcag cctgaaaacc gaggacttgg ccgtgtatta ctgtgctaga 300
300
<210> 402
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-73*01
<400> 402
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgaaactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccttcagt ggctctgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
tccgggaaag ggctggagtg ggttggccgt attagaagca aagctaacag ttacgcgaca 180
gcatatgctg cgtcggtgaa aggcaggttc accatctcca gagatgattc aaagaacacg 240
gcgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgtactaga 300
ca 302
<210> 403
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-73*02
<400> 403
gaggtgcagc tggtggagtc cgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgaaactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccttcagt ggctctgcta tgcactgggt ccgccaggct 120
tccgggaaag ggctggagtg ggttggccgt attagaagca aagctaacag ttacgcgaca 180
gcatatgctg cgtcggtgaa aggcaggttc accatctcca gagatgattc aaagaacacg 240
gcgtatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgtactaga 300
ca 302
<210> 404
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-22*01
<400> 404
gaggtgcatc tggtggagtc tgggggagcc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt tactactaca tgagcggggt ccgccaggct 120
cccgggaagg ggctggaatg ggtaggtttc attagaaaca aagctaatgg tgggacaaca 180
gaatagacca cgtctgtgaa aggcagattc acaatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
acctatctgc aaatgaagag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgttccaga 300
ga 302
<210> 405
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-22*02
<400> 405
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt tactactaca tgagcggggt ccgccaggct 120
cccgggaagg ggctggaatg ggtaggtttc attagaaaca aagctaatgg tgggacaaca 180
gaatagacca cgtctgtgaa aggcagattc acaatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
acctatctgc aaatgaagag cctgaaaacc gaggacacgg ccgtgtatta ctgttccaga 300
ga 302
<210> 406
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-71*01
<400> 406
gaggtgcagc tggtggagtc cgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
cccgggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaaaca aagctaatgg tgggacaaca 180
gaatagacca cgtctgtgaa aggcagattc acaatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
acctatctgc aaatgaacag cctgagagcc gaggacacgg ccgtgtatta ctgtgcgaga 300
ga 302
<210> 407
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-49*03
<400> 407
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc cagggcggtc cctgagactc 60
tcctgtacag cttctggatt cacctttggt gattatgcta tgagctggtt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaagca aagcttatgg tgggacaaca 180
gaatacgccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
gcctatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtactaga 300
ga 302
<210> 408
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-49*05
<400> 408
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtaaagc cagggcggtc cctgagactc 60
tcctgtacag cttctggatt cacctttggt gattatgcta tgagctggtt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaagca aagcttatgg tgggacaaca 180
gaatacgccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
gcctatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtactaga 300
ga 302
<210> 409
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: |IGHV3-49*01
<400> 409
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc cagggcggtc cctgagactc 60
tcctgtacag cttctggatt cacctttggt gattatgcta tgagctggtt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaagca aagcttatgg tgggacaaca 180
gaatacaccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatggttc caaaagcatc 240
gcctatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtactaga 300
ga 302
<210> 410
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-49*04
<400> 410
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc cagggcggtc cctgagactc 60
tcctgtacag cttctggatt cacctttggt gattatgcta tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaagca aagcttatgg tgggacaaca 180
gaatacgccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
gcctatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtactaga 300
ga 302
<210> 411
<211> 302
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-49*02
<400> 411
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc cagggccgtc cctgagactc 60
tcctgtacag cttctggatt cacctttggg tattatccta tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtaggtttc attagaagca aagcttatgg tgggacaaca 180
gaatacgccg cgtctgtgaa aggcagattc accatctcaa gagatgattc caaaagcatc 240
gcctatctgc aaatgaacag cctgaaaacc gaggacacag ccgtgtatta ctgtactaga 300
ga 302
<210> 412
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-25*01
<400> 412
gagatgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttgcaaaagc ctgcgtggtc cccgagactc 60
tcctgtgcag cctctcaatt caccttcagt agctactaca tgaactgtgt ccgccaggct 120
ccagggaatg ggctggagtt ggtttgacaa gttaatccta atgggggtag cacatacctc 180
atagactccg gtaaggaccg attcaatacc tccagagata acgccaagaa cacacttcat 240
ctgcaaatga acagcctgaa aaccgaggac acggccctct attagtgtac cagaga 296
<210> 413
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-25*02
<400> 413
gagatgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggcaaagc ctgcgtggtc cccgagactc 60
tcctgtgcag cctctcaatt caccttcagt agctactaca tgaactgtgt ccgccaggct 120
ccagggaatg ggctggagtt ggtttgacaa gttaatccta atgggggtag cacatacctc 180
atagactccg gtaaggaccg attcaatacc tccagagata acgccaagaa cacacttcat 240
ctgcaaatga acagcctgaa aaccgaggac acggccctct attagtgtac cagaga 296
<210> 414
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-25*03
<400> 414
gagatgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggcaaagc ctgcgtggtc cccgagactc 60
tcctgtgcag cctctcaatt caccttcagt agctactaca tgaactgtgt ccgccaggct 120
ccagggaatg ggctggagtt ggttggacaa gttaatccta atgggggtag cacatacctc 180
atagactccg gtaaggaccg attcaatacc tccagagata acgccaagaa cacacttcat 240
ctgcaaatga acagcctgaa aaccgaggac acggccctgt attagtgtac caga 294
<210> 415
<211> 298
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-63*01
<400> 415
gaggtggagc tgatagagtc catagagggc ctgagacaac ttgggaagtt cctgagactc 60
tcctgtgtag cctctggatt caccttcagt agctactgaa tgagctgggt caatgagact 120
ctagggaagg ggctggaggg agtaatagat gtaaaatatg atggaagtca gatataccat 180
gcagactctg tgaagggcag attcaccatc tccaaagaca atgctaagaa ctcaccgtat 240
ctccaaacga acagtctgag agctgaggac atgaccatgc atggctgtac ataaggtt 298
<210> 416
<211> 294
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-63*02
<400> 416
gaggtggagc tgatagagtc catagagggc ctgagacaac ttgggaagtt cctgagactc 60
tcctgtgtag cctctggatt caccttcagt agctactgaa tgagctgggt caatgagact 120
ctagggaagg ggctggaggg agtaatagat gtaaaatatg atggaagtca gatataccat 180
gcagactctg tgaagggcag attcaccatc tccaaagaca atgctaagaa ctcaccgtat 240
ctgcaaacga acagtctgag agctgaggac atgaccatgc atggctgtac ataa 294
<210> 417
<211> 298
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-32*01
<400> 417
gaggtggagc tgatagagtc catagaggac ctgagacaac ctgggaagtt cctgagactc 60
tcctgtgtag cctctagatt cgccttcagt agcttctgaa tgagccgagt tcaccagtct 120
ccaggcaagg ggctggagtg agtaatagat ataaaagatg atggaagtca gatacaccat 180
gcagactctg tgaagggcag attctccatc tccaaagaca atgctaagaa ctctctgtat 240
ctgcaaatga acactcagag agctgaggac gtggccgtgt atggctatac ataaggtc 298
<210> 418
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-54*01
<400> 418
gaggtacagc tggtggagtc tgaagaaaac caaagacaac ttgggggatc cctgagactc 60
tcctgtgcag actctggatt aaccttcagt agctactgaa tgagctcaga ttcccaagct 120
ccagggaagg ggctggagtg agtagtagat atatagtagg atagaagtca gctatgttat 180
gcacaatctg tgaagagcag attcaccatc tccaaagaaa atgccaagaa ctcactctgt 240
ttgcaaatga acagtctgag agcagagggc acggccgtgt attactgtat gtgagy 296
<210> 419
<211> 296
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-54*04
<400> 419
gaggtacagc tggtggagtc tgaagaaaac caaagacaac ttgggggatc cctgagactc 60
tcctgtgcag actctggatt aaccttcagt agctactgaa tgagctcaga ttcccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg agtagtagat atatagtagg atagaagtca gctatgttat 180
gcacaatctg tgaagagcag attcaccatc tccaaagaaa atgccaagaa ctcactctgt 240
ttgcaaatga acagtctgag agcagagggc acggccgtgt attactgtat gtgagt 296
<210> 420
<211> 207
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: IGHV3-54*02
<400> 420
tagctactga atgagctcag attcccaggc tccagggaag gggctggagt gagtagtaga 60
tatatagtac gatagaagtc agatatgtta tgcacaatct gtgaagagca gattcaccat 120
ctccaaagaa aatgccaaga actcactccg tttgcaaatg aacagtctga gagcagaggg 180
cacggccgtg tattactgta tgtgagg 207
<210> 421
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4_1
<400> 421
tgaggagacg gtgaccaggg ttccttggcc c 31
<210> 422
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4_3
<400> 422
tgaggagacg gtgaccaggg tcccttggcc c 31
<210> 423
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4_2
<400> 423
tgaggagacg gtgaccaggg ttccctggcc c 31
<210> 424
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ3_12
<400> 424
ctgaagagac ggtgaccatt gtcccttggc cc 32
<210> 425
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6_1
<400> 425
ctgaggagac ggtgaccgtg gtcccttgcc cc 32
<210> 426
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6_2
<400> 426
tgaggagacg gtgaccgtgg tcccttggcc c 31
<210> 427
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6_34
<400> 427
ctgaggagac ggtgaccgtg gtccctttgc cc 32
<210> 428
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ2_1
<400> 428
ctgaggagac agtgaccagg gtgccacggc cc 32
<210> 429
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ5_1
<400> 429
ctgaggagac ggtgaccagg gttccttggc cc 32
<210> 430
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ5_2
<400> 430
ctgaggagac ggtgaccagg gttccctggc cc 32
<210> 431
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ1_1
<400> 431
ctgaggagac ggtgaccagg gtgccctggc cc 32
<210> 432
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ4_1
<400> 432
tgaggagacg gtgaccaggg ttccttggcc ccag 34
<210> 433
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ4_3
<400> 433
tgaggagacg gtgaccaggg tcccttggcc ccag 34
<210> 434
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ4_2
<400> 434
tgaggagacg gtgaccaggg ttccctggcc ccag 34
<210> 435
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ3_12
<400> 435
ctgaagagac ggtgaccatt gtcccttggc cccag 35
<210> 436
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ6_1
<400> 436
ctgaggagac ggtgaccgtg gtcccttgcc cccag 35
<210> 437
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ6_2
<400> 437
tgaggagacg gtgaccgtgg tcccttggcc ccag 34
<210> 438
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ6_34
<400> 438
ctgaggagac ggtgaccgtg gtccctttgc cccag 35
<210> 439
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ2_1
<400> 439
ctgaggagac agtgaccagg gtgccacggc cccag 35
<210> 440
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ5_1
<400> 440
ctgaggagac ggtgaccagg gttccttggc cccag 35
<210> 441
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ5_2
<400> 441
ctgaggagac ggtgaccagg gttccctggc cccag 35
<210> 442
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJSEQ1_1
<400> 442
ctgaggagac ggtgaccagg gtgccctggc cccag 35
<210> 443
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV1
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 443
tgggtgcacc aggtccangn acaagggctt gagtgg 36
<210> 444
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV2
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 444
tgggtgcgac aggctcgngn acaacgcctt gagtgg 36
<210> 445
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV3
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 445
tgggtgcgcc agatgccngn gaaaggcctg gagtgg 36
<210> 446
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV4
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 446
tgggtccgcc agscyccngn gaaggggctg gagtgg 36
<210> 447
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV5
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 447
tgggtccgcc aggctccngn aaaggggctg gagtgg 36
<210> 448
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHV6
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 448
tgggtctgcc aggctccngn gaaggggcag gagtgg 36
<210> 449
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGH7_3.25p
<400> 449
tgtgtccgcc aggctccagg gaatgggctg gagttgg 37
<210> 450
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGH8_3.54p
<400> 450
tcagattccc aagctccagg gaaggggctg gagtgag 37
<210> 451
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGH9_3.63p
<400> 451
tgggtcaatg agactctagg gaaggggctg gagggag 37
<210> 452
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4*01/1-48
<400> 452
actactttga ctactggggc caaggaaccc tggtcaccgt ctcctcag 48
<210> 453
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4*03/1-48
<400> 453
gctactttga ctactggggc caagggaccc tggtcaccgt ctcctcag 48
<210> 454
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ4*02/1-48
<400> 454
actactttga ctactggggc cagggaaccc tggtcaccgt ctcctcag 48
<210> 455
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ3*01/1-50
<400> 455
tgatgctttt gatgtctggg gccaagggac aatggtcacc gtctcttcag 50
<210> 456
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ3*02/1-50
<400> 456
tgatgctttt gatatctggg gccaagggac aatggtcacc gtctcttcag 50
<210> 457
<211> 63
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6*01/1-63
<400> 457
attactacta ctactacggt atggacgtct gggggcaagg gaccacggtc accgtctcct 60
cag 63
<210> 458
<211> 63
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6*02/1-62
<400> 458
attactacta ctactacggt atggacgtct ggggccaagg gaccacggtc accgtctcct 60
cag 63
<210> 459
<211> 63
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6*04/1-63
<400> 459
attactacta ctactacggt atggacgtct ggggcaaagg gaccacggtc accgtctcct 60
cag 63
<210> 460
<211> 63
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ6*03/1-62
<400> 460
attactacta ctactactac atggacgtct ggggcaaagg gaccacggtc accgtctcct 60
cag 63
<210> 461
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ2*01/1-53
<400> 461
ctactggtac ttcgatctct ggggccgtgg caccctggtc actgtctcct cag 53
<210> 462
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ5*01/1-51
<400> 462
acaactggtt cgactcctgg ggccaaggaa ccctggtcac cgtctcctca g 51
<210> 463
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ5*02/1-51
<400> 463
acaactggtt cgacccctgg ggccagggaa ccctggtcac cgtctcctca g 51
<210> 464
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ1*01/1-52
<400> 464
gctgaatact tccagcactg gggccagggc accctggtca ccgtctcctc ag 52
<210> 465
<211> 61
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ2P*01/1-61
<400> 465
ctacaagtgc ttggagcact ggggcagggc agcccggaca ccgtctccct gggaacgtca 60
g 61
<210> 466
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ1P*01/1-54
<400> 466
aaaggtgctg ggggtcccct gaacccgacc cgccctgaga ccgcagccac atca 54
<210> 467
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: >IGHJ3P*01/1-52
<400> 467
cttgcggttg gacttcccag ccgacagtgg tggtctggct tctgaggggt ca 52
<210> 468
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-2
<400> 468
aatgatacgg cgaccaccga gatctaccta caacggttaa cctggtcccc gaaccgaa 58
<210> 469
<211> 284
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBV2*02
<400> 469
gaacctgaag tcacccagac tcccagccat caggtcacac agatgggaca ggaagtgatc 60
ttgcactgtg tccccatctc taatcactta tacttctatt ggtacagaca aatcttgggg 120
cagaaagtcg agtttctggt ttccttttat aataatgaaa tctcagagaa gtctgaaata 180
ttcgatgatc aattctcagt tgaaaggcct gatggatcaa atttcactct gaagatccgg 240
tccacaaagc tggaggactc agccatgtac ttctgtgcca gcag 284
<210> 470
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-1
<400> 470
acaactgtga gtctggtgcc ttgtccaaag aaa 33
<210> 471
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-2
<400> 471
acaacggtta acctggtccc cgaaccgaag gtg 33
<210> 472
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-3
<400> 472
acaacagtga gccaacttcc ctctccaaaa tat 33
<210> 473
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-4
<400> 473
aagacagaga gctgggttcc actgccaaaa aac 33
<210> 474
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-5
<400> 474
aggatggaga gtcgagtccc atcaccaaaa tgc 33
<210> 475
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 1-6
<400> 475
gtcacagtga gcctggtccc gttcccaaag tgg 33
<210> 476
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-1
<400> 476
agcacggtga gccgtgtccc tggcccgaag aac 33
<210> 477
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-2
<400> 477
agtacggtca gcctagagcc ttctccaaaa aac 33
<210> 478
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-3
<400> 478
agcactgtca gccgggtgcc tgggccaaaa tac 33
<210> 479
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-4
<400> 479
agcactgaga gccgggtccc ggcgccgaag tac 33
<210> 480
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-5
<400> 480
agcaccagga gccgcgtgcc tggcccgaag tac 33
<210> 481
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-6
<400> 481
agcacggtca gcctgctgcc ggccccgaaa gtc 33
<210> 482
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: Jseq 2-7
<400> 482
gtgaccgtga gcctggtgcc cggcccgaag tac 33
<210> 483
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-5
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)
<223> n is a, c, g, or t; 5 end modified with universal reverse primer
<400> 483
nacctaggat ggagagtcga gtcccatcac caaa 34
<210> 484
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic DNA: TRBJ1-5
<400> 484
aatgatacgg cgaccaccga gatctaccta ggatggagag tcgagtccca tcaccaaa 58
Claims (2)
- 본 출원 명세서에 기재된 바와 같이 적응 면역 레퍼토리의 다양성을 측정하기 위한 방법.
- 제1항의 방법을 수행하기 위한 조성물.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US22034409P | 2009-06-25 | 2009-06-25 | |
US61/220,344 | 2009-06-25 | ||
PCT/US2010/037477 WO2010151416A1 (en) | 2009-06-25 | 2010-06-04 | Method of measuring adaptive immunity |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020117030953A Division KR20120044941A (ko) | 2009-06-25 | 2010-06-04 | 적응 면역의 측정방법 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20140146180A true KR20140146180A (ko) | 2014-12-24 |
Family
ID=42543134
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020117030953A KR20120044941A (ko) | 2009-06-25 | 2010-06-04 | 적응 면역의 측정방법 |
KR1020147031470A KR20140146180A (ko) | 2009-06-25 | 2010-06-04 | 적응 면역의 측정방법 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020117030953A KR20120044941A (ko) | 2009-06-25 | 2010-06-04 | 적응 면역의 측정방법 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (10) | US20100330571A1 (ko) |
EP (2) | EP3409792B1 (ko) |
JP (2) | JP2012531202A (ko) |
KR (2) | KR20120044941A (ko) |
CN (1) | CN102459643B (ko) |
AU (1) | AU2010263172B2 (ko) |
CA (1) | CA2765949C (ko) |
IL (1) | IL217200A (ko) |
RU (2) | RU2539032C2 (ko) |
SG (2) | SG176691A1 (ko) |
WO (1) | WO2010151416A1 (ko) |
Families Citing this family (73)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8628927B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-01-14 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
EP2719774B8 (en) | 2008-11-07 | 2020-04-22 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods of monitoring conditions by sequence analysis |
US9506119B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-11-29 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method of sequence determination using sequence tags |
US9365901B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-06-14 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia |
US8748103B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-06-10 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
US8691510B2 (en) * | 2008-11-07 | 2014-04-08 | Sequenta, Inc. | Sequence analysis of complex amplicons |
US9528160B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-12-27 | Adaptive Biotechnolgies Corp. | Rare clonotypes and uses thereof |
DK3059337T3 (da) | 2009-01-15 | 2019-07-22 | Adaptive Biotechnologies Corp | Adaptive immunity profiling og metoder til frembringelse af monoklonale antibodier |
KR20120044941A (ko) | 2009-06-25 | 2012-05-08 | 프레드 헛친슨 켄서 리서치 센터 | 적응 면역의 측정방법 |
US9043160B1 (en) | 2009-11-09 | 2015-05-26 | Sequenta, Inc. | Method of determining clonotypes and clonotype profiles |
WO2011106738A2 (en) | 2010-02-25 | 2011-09-01 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Use of tcr clonotypes as biomarkers for disease |
WO2012097374A1 (en) | 2011-01-14 | 2012-07-19 | Cb Biotechnologies, Inc. | Immunodiversity assessment method and its use |
US10385475B2 (en) | 2011-09-12 | 2019-08-20 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Random array sequencing of low-complexity libraries |
US9279159B2 (en) * | 2011-10-21 | 2016-03-08 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells |
EP3904536A1 (en) | 2011-12-09 | 2021-11-03 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection |
US9499865B2 (en) | 2011-12-13 | 2016-11-22 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes |
CN103205420B (zh) * | 2012-01-13 | 2015-04-01 | 深圳华大基因科技有限公司 | 用于扩增T细胞受体β链CDR3编码序列的引物组合物及其用途 |
CN103289994B (zh) * | 2012-03-05 | 2015-08-05 | 深圳华大基因科技有限公司 | 用于扩增T细胞受体α链CDR3编码序列的引物组合物及其用途 |
WO2013097744A1 (zh) * | 2011-12-27 | 2013-07-04 | 深圳华大基因科技有限公司 | 用于扩增cdr3编码序列的引物组合物及其用途 |
CN103184216B (zh) * | 2011-12-27 | 2015-03-18 | 深圳华大基因科技有限公司 | 用于扩增免疫球蛋白重链cdr3编码序列的引物组合物及其用途 |
EP2823060B1 (en) | 2012-03-05 | 2018-02-14 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Determining paired immune receptor chains from frequency matched subunits |
JP5756247B1 (ja) | 2012-05-08 | 2015-07-29 | アダプティブ バイオテクノロジーズ コーポレイション | マルチプレックスpcr反応における増幅バイアスを測定し校正する組成物及び方法 |
WO2013188831A1 (en) * | 2012-06-15 | 2013-12-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Uniquely tagged rearranged adaptive immune receptor genes in a complex gene set |
EP2870264A4 (en) * | 2012-07-03 | 2016-03-02 | Sloan Kettering Inst Cancer | QUANTITATIVE ASSESSMENT OF THE RECOVERY OF HUMAN T-CELL REPERTOIR AFTER TRANSPLANTATION OF ALLOGENIC BLOOD-GENERATING STEM CELLS |
US10876152B2 (en) | 2012-09-04 | 2020-12-29 | Guardant Health, Inc. | Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation |
IL269097B2 (en) | 2012-09-04 | 2024-01-01 | Guardant Health Inc | Systems and methods for detecting rare mutations and changes in number of copies |
US20160040229A1 (en) | 2013-08-16 | 2016-02-11 | Guardant Health, Inc. | Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation |
US11913065B2 (en) | 2012-09-04 | 2024-02-27 | Guardent Health, Inc. | Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation |
EP2904111B1 (en) | 2012-10-01 | 2017-12-06 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Immunocompetence assessment by adaptive immune receptor diversity and clonality characterization |
US10150996B2 (en) | 2012-10-19 | 2018-12-11 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells |
US20160024493A1 (en) | 2013-03-15 | 2016-01-28 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Uniquely tagged rearranged adaptive immune receptor genes in a complex gene set |
US9816088B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-11-14 | Abvitro Llc | Single cell bar-coding for antibody discovery |
US9708657B2 (en) | 2013-07-01 | 2017-07-18 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method for generating clonotype profiles using sequence tags |
EP3572510B1 (en) | 2013-11-21 | 2022-09-21 | Repertoire Genesis Incorporation | T cell receptor and b cell receptor repertoire analysis system, and use of same in treatment and diagnosis |
JP2017506500A (ja) | 2013-12-10 | 2017-03-09 | コネクシオ ゲノミクス ピーティーワイ リミテッド | 遺伝子アリルを同定するための方法及びプローブ |
CA2934822A1 (en) | 2013-12-28 | 2015-07-02 | Guardant Health, Inc. | Methods and systems for detecting genetic variants |
WO2015134787A2 (en) | 2014-03-05 | 2015-09-11 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods using randomer-containing synthetic molecules |
US11390921B2 (en) | 2014-04-01 | 2022-07-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Determining WT-1 specific T cells and WT-1 specific T cell receptors (TCRs) |
US10066265B2 (en) | 2014-04-01 | 2018-09-04 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Determining antigen-specific t-cells |
US10202640B2 (en) * | 2014-05-07 | 2019-02-12 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Single cell analysis of T cells using high-throughput multiplex amplification and deep sequencing |
EP3194593B1 (en) | 2014-09-15 | 2019-02-06 | AbVitro LLC | High-throughput nucleotide library sequencing |
WO2016069886A1 (en) | 2014-10-29 | 2016-05-06 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Highly-multiplexed simultaneous detection of nucleic acids encoding paired adaptive immune receptor heterodimers from many samples |
US10246701B2 (en) | 2014-11-14 | 2019-04-02 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Multiplexed digital quantitation of rearranged lymphoid receptors in a complex mixture |
EP3498866A1 (en) | 2014-11-25 | 2019-06-19 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing |
WO2016138122A1 (en) | 2015-02-24 | 2016-09-01 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Methods for diagnosing infectious disease and determining hla status using immune repertoire sequencing |
AU2016242967B2 (en) | 2015-04-01 | 2021-07-01 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method of identifying human compatible T cell receptors specific for an antigenic target |
CN105040111B (zh) * | 2015-05-28 | 2017-07-14 | 眭维国 | 系统性红斑狼疮图谱模型的构建方法 |
US9422547B1 (en) | 2015-06-09 | 2016-08-23 | Gigagen, Inc. | Recombinant fusion proteins and libraries from immune cell repertoires |
EP3325646B1 (en) | 2015-07-22 | 2020-08-19 | F.Hoffmann-La Roche Ag | Identification of antigen epitopes and immune sequences recognizing the antigens |
US10539564B2 (en) | 2015-07-22 | 2020-01-21 | Roche Sequencing Solutions, Inc. | Identification of antigen epitopes and immune sequences recognizing the antigens |
US20180300453A1 (en) * | 2015-08-07 | 2018-10-18 | Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. | Estimation of Descriptive Parameters from a Sample |
CN105154440B (zh) * | 2015-08-14 | 2016-11-30 | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 | 一种基于高通量测序构建白血病微小残留病灶tcr文库的多重pcr引物和方法 |
WO2017086394A1 (ja) * | 2015-11-18 | 2017-05-26 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構 | 標的核酸の定量方法及びそのためのキット |
SG11201805119QA (en) | 2015-12-17 | 2018-07-30 | Guardant Health Inc | Methods to determine tumor gene copy number by analysis of cell-free dna |
CN105447336B (zh) * | 2015-12-29 | 2018-06-19 | 北京百迈客生物科技有限公司 | 基于生物云平台的微生物多样性分析系统 |
US11306356B2 (en) | 2016-06-01 | 2022-04-19 | Roche Sequencing Solutions, Inc. | Immuno-PETE |
US10428325B1 (en) | 2016-09-21 | 2019-10-01 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Identification of antigen-specific B cell receptors |
CN106957905B (zh) * | 2016-12-23 | 2020-12-04 | 孙涛 | 一种用于评估肿瘤免疫治疗效果的分子检测方法及引物组合物及试剂盒 |
GB201718238D0 (en) * | 2017-11-03 | 2017-12-20 | Univ Oxford Innovation Ltd | Method and system for determining the disease status of a subject |
US11254980B1 (en) | 2017-11-29 | 2022-02-22 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods of profiling targeted polynucleotides while mitigating sequencing depth requirements |
RU2694412C9 (ru) | 2017-12-25 | 2019-09-18 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) | Моноклональные антитела и способы их применения |
WO2019232525A1 (en) * | 2018-06-01 | 2019-12-05 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods and materials for assessing and treating cancers |
EP3802870A4 (en) * | 2018-06-11 | 2022-03-23 | Monoquant PTY LTD | AMPLIFICATION METHOD AND PRIMER THEREFOR |
EP3807636B1 (en) | 2018-06-15 | 2024-01-31 | F. Hoffmann-La Roche AG | A system for identification of antigens recognized by t cell receptors expressed on tumor infiltrating lymphocytes |
RU2711871C1 (ru) * | 2018-12-25 | 2020-01-23 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) | Моноклональные антитела, которые специфически связываются с участком бета цепи семейства TRBV-9 Т-клеточного рецептора человека, и способы их применения |
RU2712251C1 (ru) * | 2018-12-25 | 2020-01-27 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) | Гуманизированные антитела против участка бета цепи 9-го семейства TRBV9 TKP человека, и способы их применения |
WO2020191365A1 (en) | 2019-03-21 | 2020-09-24 | Gigamune, Inc. | Engineered cells expressing anti-viral t cell receptors and methods of use thereof |
CN109929924B (zh) * | 2019-03-27 | 2022-11-08 | 上海科医联创医学检验所有限公司 | 一种基于高通量测序的igh基因重排检测方法 |
CN111755075B (zh) * | 2019-03-28 | 2023-09-29 | 深圳华大生命科学研究院 | 对免疫组库高通量测序样本间序列污染进行过滤的方法 |
CN110246539B (zh) * | 2019-04-15 | 2020-04-28 | 成都益安博生物技术有限公司 | 一种免疫力水平评估的方法及装置 |
EP4031679A1 (en) | 2019-09-20 | 2022-07-27 | F. Hoffmann-La Roche AG | Immune repertoire profiling by primer extension target enrichment |
WO2023201265A1 (en) * | 2022-04-12 | 2023-10-19 | The Johns Hopkins University | Method of measuring level of immune suppression |
CN116153407A (zh) * | 2023-04-03 | 2023-05-23 | 广州华银医学检验中心有限公司 | 基于基因测序判断受试者抗新冠免疫力强弱的系统 |
Family Cites Families (328)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3270960A (en) | 1964-09-11 | 1966-09-06 | Sperry Rand Corp | Fluid sensor |
US3773919A (en) | 1969-10-23 | 1973-11-20 | Du Pont | Polylactide-drug mixtures |
DE3211263A1 (de) | 1981-03-31 | 1983-01-27 | Otsuka Pharmaceutical Co. Ltd., Tokyo | Human-interferon verwandte peptide, antigene und antikoerper, sowie verfahren zu deren herstellung |
DE3238353A1 (de) | 1982-10-15 | 1984-04-19 | Max Planck Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V., 3400 Göttingen | Verfahren zur simultanen quantitativen bestimmung der blutzellen und reagenz hierfuer |
US5189147A (en) | 1984-06-13 | 1993-02-23 | Massachusetts Institute Of Technology | Meterodimeric T lymphocyte receptor antibody |
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
DE3541033A1 (de) | 1985-11-19 | 1987-05-21 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren zur quantifizierung von zellpopulationen bzw. subpopulationen sowie hierfuer geeignetes reagenz |
US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
US5149625A (en) | 1987-08-11 | 1992-09-22 | President And Fellows Of Harvard College | Multiplex analysis of DNA |
US4942124A (en) | 1987-08-11 | 1990-07-17 | President And Fellows Of Harvard College | Multiplex sequencing |
US5667967A (en) | 1990-05-01 | 1997-09-16 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | T-cell receptor varible transcripts as disease related markers |
US5506126A (en) | 1988-02-25 | 1996-04-09 | The General Hospital Corporation | Rapid immunoselection cloning method |
US5168038A (en) | 1988-06-17 | 1992-12-01 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | In situ transcription in cells and tissues |
JP2781438B2 (ja) | 1988-10-20 | 1998-07-30 | モーリィ,アリグザンダー,アラン | 白血病及びリンパ腫におけるモノクローナリテイーの診断法 |
US5075217A (en) | 1989-04-21 | 1991-12-24 | Marshfield Clinic | Length polymorphisms in (dC-dA)n ·(dG-dT)n sequences |
US5231012A (en) | 1989-06-28 | 1993-07-27 | Schering Corporation | Nucleic acids encoding cytokine synthesis inhibitory factor (interleukin-10) |
CA2020958C (en) | 1989-07-11 | 2005-01-11 | Daniel L. Kacian | Nucleic acid sequence amplification methods |
US5336598A (en) | 1989-11-15 | 1994-08-09 | National Jewish Center For Immunology And Respiratory Medicine | Method for diagnosing a superantigen caused pathologial condition via assay of T-cells |
US5298396A (en) | 1989-11-15 | 1994-03-29 | National Jewish Center For Immunology And Respiratory Medicine | Method for identifying T cells disease involved in autoimmune disease |
US6054034A (en) | 1990-02-28 | 2000-04-25 | Aclara Biosciences, Inc. | Acrylic microchannels and their use in electrophoretic applications |
US5126022A (en) | 1990-02-28 | 1992-06-30 | Soane Tecnologies, Inc. | Method and device for moving molecules by the application of a plurality of electrical fields |
US6916605B1 (en) | 1990-07-10 | 2005-07-12 | Medical Research Council | Methods for producing members of specific binding pairs |
GB9015198D0 (en) | 1990-07-10 | 1990-08-29 | Brien Caroline J O | Binding substance |
EP0542810A1 (en) | 1990-08-02 | 1993-05-26 | B.R. Centre Limited | Methods for the production of proteins with a desired function |
US5210015A (en) | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
IE76732B1 (en) | 1990-08-07 | 1997-11-05 | Becton Dickinson Co | One step test for absolute counts |
US5699798A (en) | 1990-08-10 | 1997-12-23 | University Of Washington | Method for optically imaging solid tumor tissue |
US5635354A (en) | 1991-01-09 | 1997-06-03 | Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) | Method for describing the repertoires of antibodies (Ab) and of T-cell receptors (TcR) of an individual's immune system |
US5364759B2 (en) | 1991-01-31 | 1999-07-20 | Baylor College Medicine | Dna typing with short tandem repeat polymorphisms and identification of polymorphic short tandem repeats |
KR100227303B1 (ko) * | 1991-02-12 | 1999-12-01 | 장-끌로드 비에이으포스 | 인체 t 임파구 수용체의 베타 사슬의 가변성 영역을 코딩하는 뉴클레오티드 서열, 대응하는 펩티드 세그먼트 및 진단 및 치료 용도 |
JP3080178B2 (ja) | 1991-02-18 | 2000-08-21 | 東洋紡績株式会社 | 核酸配列の増幅方法およびそのための試薬キット |
US6091000A (en) | 1991-03-15 | 2000-07-18 | Duke University | SCID mouse engrafted with human synovium tissue |
JP3266311B2 (ja) | 1991-05-02 | 2002-03-18 | 生化学工業株式会社 | 新規ポリペプチドおよびこれを用いる抗hiv剤 |
US5674679A (en) | 1991-09-27 | 1997-10-07 | Amersham Life Science, Inc. | DNA cycle sequencing |
US5981179A (en) | 1991-11-14 | 1999-11-09 | Digene Diagnostics, Inc. | Continuous amplification reaction |
US5213960A (en) | 1992-03-09 | 1993-05-25 | Tanox Biosystems, Inc. | Methods for selecting low frequency antigen-specific single B lymphocytes |
US5256542A (en) | 1992-03-09 | 1993-10-26 | Tanox Biosystems, Inc. | Selecting low frequency antigen-specific single B lymphocytes with correction for background noise |
US5837447A (en) | 1992-04-15 | 1998-11-17 | Blood Center Research Foundation, Inc., The | Monitoring an immune response by analysis of amplified immunoglobulin or T-cell-receptor nucleic acid |
US5498392A (en) | 1992-05-01 | 1996-03-12 | Trustees Of The University Of Pennsylvania | Mesoscale polynucleotide amplification device and method |
US5587128A (en) | 1992-05-01 | 1996-12-24 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Mesoscale polynucleotide amplification devices |
US5981176A (en) | 1992-06-17 | 1999-11-09 | City Of Hope | Method of detecting and discriminating between nucleic acid sequences |
US5925517A (en) | 1993-11-12 | 1999-07-20 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits |
JPH10504181A (ja) | 1994-04-18 | 1998-04-28 | ニューヨーク ソサエティ フォー ザ リリーフ オブ ザ ラプチャード アンド クリップルド メインティニング ザ ホスピタル フォー スペシャル サージェリー | 保存されたt細胞レセプター配列 |
US6001229A (en) | 1994-08-01 | 1999-12-14 | Lockheed Martin Energy Systems, Inc. | Apparatus and method for performing microfluidic manipulations for chemical analysis |
US6090592A (en) | 1994-08-03 | 2000-07-18 | Mosaic Technologies, Inc. | Method for performing amplification of nucleic acid on supports |
FR2724182B1 (fr) | 1994-09-02 | 1996-12-13 | Pasteur Institut | Obtention d'un anticorps monoclonal recombinant a partir d'un anticorps monoclonal humain anti-rhesus d, sa production en cellules d'insecte, et ses utilisations |
US5604097A (en) | 1994-10-13 | 1997-02-18 | Spectragen, Inc. | Methods for sorting polynucleotides using oligonucleotide tags |
US5846719A (en) | 1994-10-13 | 1998-12-08 | Lynx Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide tags for sorting and identification |
US5776737A (en) | 1994-12-22 | 1998-07-07 | Visible Genetics Inc. | Method and composition for internal identification of samples |
US6919434B1 (en) | 1995-02-20 | 2005-07-19 | Sankyo Co., Ltd. | Monoclonal antibodies that bind OCIF |
US5698396A (en) | 1995-06-07 | 1997-12-16 | Ludwig Institute For Cancer Research | Method for identifying auto-immunoreactive substances from a subject |
WO1997013868A1 (en) | 1995-10-11 | 1997-04-17 | Leonard Adleman | Large scale dna sequencing by position sensitive hybridization |
WO1997013877A1 (en) | 1995-10-12 | 1997-04-17 | Lynx Therapeutics, Inc. | Measurement of gene expression profiles in toxicity determination |
US6087096A (en) | 1995-11-13 | 2000-07-11 | Dau; Peter C. | Method of intrafamily fragment analysis of the T cell receptor α and β chain CDR3 regions |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
US20020076725A1 (en) | 1996-03-13 | 2002-06-20 | Tomoko Toyosaki-Maeda | Human t cell clone specific for rheumatoid arthritis |
US6458530B1 (en) | 1996-04-04 | 2002-10-01 | Affymetrix Inc. | Selecting tag nucleic acids |
CA2257152C (en) * | 1996-06-03 | 2009-01-27 | Linda M. Pilarski | Methods for detection of rearranged dna |
PT912766E (pt) | 1996-06-04 | 2009-07-16 | Univ Utah Res Found | Monitorização da hibridização durante a pcr |
AU3878697A (en) | 1996-06-20 | 1998-02-02 | Cornell Research Foundation Inc. | Identification of abnormalities in the expression of t and cell antigen receptors as indicators of disease diagnosis, prognosis and therapeutic predictors |
US6074827A (en) | 1996-07-30 | 2000-06-13 | Aclara Biosciences, Inc. | Microfluidic method for nucleic acid purification and processing |
CA2264925C (en) | 1996-09-06 | 2010-12-07 | Alain T. Luxembourg | Purification of antigen-specific t cells |
WO1998015644A2 (en) | 1996-09-27 | 1998-04-16 | The Chinese University Of Hong Kong | Parallel polynucleotide sequencing method |
GB9626815D0 (en) | 1996-12-23 | 1997-02-12 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
GB9704444D0 (en) | 1997-03-04 | 1997-04-23 | Isis Innovation | Non-invasive prenatal diagnosis |
DE69837913T2 (de) | 1997-04-01 | 2008-02-07 | Solexa Ltd., Saffron Walden | Verfahren zur vervielfältigung von nukleinsäure |
US6143496A (en) | 1997-04-17 | 2000-11-07 | Cytonix Corporation | Method of sampling, amplifying and quantifying segment of nucleic acid, polymerase chain reaction assembly having nanoliter-sized sample chambers, and method of filling assembly |
ATE487790T1 (de) | 1997-07-07 | 2010-11-15 | Medical Res Council | In-vitro-sortierverfahren |
US6794499B2 (en) | 1997-09-12 | 2004-09-21 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
US7572582B2 (en) | 1997-09-12 | 2009-08-11 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
AU1517999A (en) | 1997-10-15 | 1999-05-03 | Aclara Biosciences, Inc. | Laminate microstructure device and method for making same |
CA2307177C (en) | 1997-10-23 | 2004-06-29 | Exact Laboratories, Inc. | Methods for detecting contamination in molecular diagnostics using pcr |
US7351578B2 (en) | 1999-12-10 | 2008-04-01 | Invitrogen Corp. | Use of multiple recombination sites with unique specificity in recombinational cloning |
US6210910B1 (en) | 1998-03-02 | 2001-04-03 | Trustees Of Tufts College | Optical fiber biosensor array comprising cell populations confined to microcavities |
JP4262799B2 (ja) | 1998-04-16 | 2009-05-13 | 平田機工株式会社 | 生タイヤ供給方法 |
DE19833738A1 (de) | 1998-07-27 | 2000-02-03 | Michael Giesing | Verfahren zur Isolierung von Krebszellen aus zellhaltigen Körperflüssigkeiten sowie Sets zur Durchführung dieses Verfahrens |
US6787308B2 (en) | 1998-07-30 | 2004-09-07 | Solexa Ltd. | Arrayed biomolecules and their use in sequencing |
DE19844931C1 (de) | 1998-09-30 | 2000-06-15 | Stefan Seeger | Verfahren zur DNS- oder RNS-Sequenzierung |
AR021833A1 (es) | 1998-09-30 | 2002-08-07 | Applied Research Systems | Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico |
US6541608B1 (en) * | 1999-02-23 | 2003-04-01 | Baylor College Of Medicine | T cell receptor Vβ-Dβ-Jβ sequence and methods for its detection |
US6307024B1 (en) | 1999-03-09 | 2001-10-23 | Zymogenetics, Inc. | Cytokine zalpha11 Ligand |
US6300070B1 (en) | 1999-06-04 | 2001-10-09 | Mosaic Technologies, Inc. | Solid phase methods for amplifying multiple nucleic acids |
US6440706B1 (en) | 1999-08-02 | 2002-08-27 | Johns Hopkins University | Digital amplification |
US20040209314A1 (en) | 1999-09-06 | 2004-10-21 | Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale France | Means for detection and purification of CD8+ T lymphocyte populations specific to peptides presented in the context of HLA |
US6235483B1 (en) | 2000-01-31 | 2001-05-22 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and kits for indirect labeling of nucleic acids |
US20040170977A1 (en) | 2000-03-31 | 2004-09-02 | Peter Laird | Epigenetic sequences for esophageal adenocarcinoma |
AUPQ687600A0 (en) | 2000-04-13 | 2000-05-11 | Flinders Technologies Pty Ltd | A method of detection |
US20030207300A1 (en) | 2000-04-28 | 2003-11-06 | Matray Tracy J. | Multiplex analytical platform using molecular tags |
GB0016138D0 (en) * | 2000-06-30 | 2000-08-23 | Novartis Ag | Organic compounds |
US6596492B2 (en) | 2000-07-11 | 2003-07-22 | Colorado State University Research Foundation | PCR materials and methods useful to detect canine and feline lymphoid malignancies |
US7567870B1 (en) | 2000-07-31 | 2009-07-28 | Institute For Systems Biology | Multiparameter analysis for predictive medicine |
US6939451B2 (en) | 2000-09-19 | 2005-09-06 | Aclara Biosciences, Inc. | Microfluidic chip having integrated electrodes |
AU2002246612B2 (en) | 2000-10-24 | 2007-11-01 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Direct multiplex characterization of genomic DNA |
US6778724B2 (en) | 2000-11-28 | 2004-08-17 | The Regents Of The University Of California | Optical switching and sorting of biological samples and microparticles transported in a micro-fluidic device, including integrated bio-chip devices |
ATE488576T1 (de) | 2001-02-20 | 2010-12-15 | Univ Georgia | Schnellproduktion monoklonaler antikörper |
US7265208B2 (en) | 2001-05-01 | 2007-09-04 | The Regents Of The University Of California | Fusion molecules and treatment of IgE-mediated allergic diseases |
EP1395114A2 (en) | 2001-05-24 | 2004-03-10 | Guard Inc., | Methods for selecting and producing animals having a predicted level of immune response |
US20050260570A1 (en) | 2001-05-29 | 2005-11-24 | Mao Jen-I | Sequencing by proxy |
US6720144B1 (en) | 2001-06-21 | 2004-04-13 | Quest Diagnostics | Detection of clonal T-cell receptor-γ gene rearrangement by PCR/temporal temperature gradient gel electrophoresis (TTGE) |
WO2003008624A2 (en) | 2001-07-15 | 2003-01-30 | Keck Graduate Institute | Nucleic acid amplification using nicking agents |
US20030096277A1 (en) | 2001-08-30 | 2003-05-22 | Xiangning Chen | Allele specific PCR for genotyping |
US7432084B2 (en) | 2001-08-31 | 2008-10-07 | Rosetta Inpharmatics Llc | Methods for preparing nucleic acid samples |
PT1421115E (pt) | 2001-08-31 | 2005-07-29 | Avidex Ltd | Receptor de celulas t soluvel |
AU2002341752B2 (en) | 2001-09-19 | 2008-04-03 | Alexion Pharmaceuticals, Inc. | Engineered templates and their use in single primer amplification |
KR20040064275A (ko) | 2001-11-09 | 2004-07-16 | 소스 프리시전 메디슨, 인코포레이티드 | 유전자 발현 프로파일을 이용한 질병의 동정, 모니터링,치료 및 생물학적 상태의 확인 |
GB2382137A (en) | 2001-11-20 | 2003-05-21 | Mats Gullberg | Nucleic acid enrichment |
GB0128153D0 (en) | 2001-11-23 | 2002-01-16 | Bayer Ag | Profiling of the immune gene repertoire |
WO2003052101A1 (en) | 2001-12-14 | 2003-06-26 | Rosetta Inpharmatics, Inc. | Sample tracking using molecular barcodes |
GB0130267D0 (en) | 2001-12-19 | 2002-02-06 | Neutec Pharma Plc | Focussed antibody technology |
CN1688708A (zh) | 2002-01-09 | 2005-10-26 | 曼盛基因技术有限公司 | 检测t细胞增殖的基因序列方法 |
US7157274B2 (en) | 2002-06-24 | 2007-01-02 | Cytonome, Inc. | Method and apparatus for sorting particles |
AU2003299503A1 (en) | 2002-05-16 | 2004-06-15 | Vanderbilt University | Method for predicting autoimmune diseases |
US20060259248A1 (en) | 2002-07-01 | 2006-11-16 | Institut Pasteur | System, method, device, and computer program product for extraction, gathering, manipulation, and analysis of peak data from an automated sequencer |
US7691994B2 (en) | 2002-07-03 | 2010-04-06 | Brewer Jamie L | Compositions and methods for the detection of human T cell receptor variable family gene expression |
JP5068931B2 (ja) | 2002-07-12 | 2012-11-07 | ザ ジョンズ ホプキンス ユニバーシティー | 独自のクローン形質のリンパ球受容体に結合する試薬および方法 |
DE60332948D1 (de) | 2002-07-19 | 2010-07-22 | Althea Technologies Inc | Strategien zur genexpressionsanalyse |
US7157228B2 (en) | 2002-09-09 | 2007-01-02 | Bioarray Solutions Ltd. | Genetic analysis and authentication |
US7459273B2 (en) | 2002-10-04 | 2008-12-02 | Affymetrix, Inc. | Methods for genotyping selected polymorphism |
ATE483822T1 (de) | 2002-10-11 | 2010-10-15 | Univ Erasmus | Primer für nukleinsäureamplifikation in pcr- basierten klonalitätsstudien |
EP1597557A4 (en) | 2002-10-11 | 2008-06-11 | Univ California | METHOD FOR DIAGNOSING AND PROGNOSING MULTIPLE SCLEROSIS |
WO2004044209A1 (en) | 2002-11-13 | 2004-05-27 | Monoquant Pty Ltd | A method of detection |
ATE536548T1 (de) | 2002-11-14 | 2011-12-15 | Vivalis | Mikrowell-array-chip zum nachweis eines antigenspezifischen lymphozyten, verfahren zum nachweis eines antigenspezifischen lymphozyten und verfahren zur klonierung eines antigenrezeptorgens eines antigenspezifischen lymphozyten |
WO2004053104A2 (en) | 2002-12-11 | 2004-06-24 | Coley Pharmaceutical Group, Inc. | 5’ cpg nucleic acids and methods of use |
WO2004063706A2 (en) | 2003-01-08 | 2004-07-29 | Maxx Genetech Co., Ltd. | Method of detecting over-expression of t-cell receptor genes by real-time pcr |
DE602004024034D1 (de) | 2003-01-29 | 2009-12-24 | 454 Corp | Nukleinsäureamplifikation auf basis von kügelchenemulsion |
GB0304068D0 (en) | 2003-02-22 | 2003-03-26 | Avidex Ltd | Substances |
WO2004096985A2 (en) | 2003-04-24 | 2004-11-11 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods for assessing biologic diversity |
AU2003902299A0 (en) | 2003-05-13 | 2003-05-29 | Flinders Medical Centre | A method of analysing a marker nucleic acid molecule |
WO2005020784A2 (en) | 2003-05-23 | 2005-03-10 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Surrogate cell gene expression signatures for evaluating the physical state of a subject |
US20050010030A1 (en) | 2003-07-02 | 2005-01-13 | Zang Jingwu Z. | T cell receptor CDR3 sequence and methods for detecting and treating rheumatoid arthritis |
EP1641809B2 (en) | 2003-07-05 | 2018-10-03 | The Johns Hopkins University | Method and compositions for detection and enumeration of genetic variations |
US20060228350A1 (en) * | 2003-08-18 | 2006-10-12 | Medimmune, Inc. | Framework-shuffling of antibodies |
US20050048498A1 (en) | 2003-08-29 | 2005-03-03 | Applera Corporation | Compositions, methods, and kits for assembling probes |
WO2005026686A2 (en) | 2003-09-09 | 2005-03-24 | Compass Genetics, Llc | Multiplexed analytical platform |
TWI333977B (en) | 2003-09-18 | 2010-12-01 | Symphogen As | Method for linking sequences of interest |
FR2863274B1 (fr) * | 2003-12-05 | 2012-11-16 | Commissariat Energie Atomique | Procede d'evaluation quantitative d'un rearrangement ou d'une recombinaison genetique ciblee d'un individu et ses applications. |
WO2005053603A2 (en) | 2003-12-08 | 2005-06-16 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Antigen receptor variable region typing |
EP1704251A1 (en) | 2003-12-15 | 2006-09-27 | Institut Pasteur | Repertoire determination of a lymphocyte b population |
US20080166718A1 (en) | 2003-12-15 | 2008-07-10 | Institut Pasteur | Repertoire determination of a lymphocyte B population |
DE60326052D1 (de) | 2003-12-15 | 2009-03-19 | Pasteur Institut | Ermittlung des Repertoires von B-Lymphozyten Populationen |
US7709262B2 (en) | 2004-02-18 | 2010-05-04 | Trustees Of Boston University | Method for detecting and quantifying rare mutations/polymorphisms |
US20060046258A1 (en) | 2004-02-27 | 2006-03-02 | Lapidus Stanley N | Applications of single molecule sequencing |
US20070161001A1 (en) | 2004-03-04 | 2007-07-12 | Dena Leshkowitz | Quantifying and profiling antibody and t cell receptor gene expression |
JP4480423B2 (ja) | 2004-03-08 | 2010-06-16 | 独立行政法人科学技術振興機構 | 免疫細胞クローンの拡大の有無の判定方法 |
DE102004016437A1 (de) | 2004-04-04 | 2005-10-20 | Oligene Gmbh | Verfahren zur Erkennung von Signaturen in komplexen Genexpressionsprofilen |
US20050250147A1 (en) | 2004-05-10 | 2005-11-10 | Macevicz Stephen C | Digital profiling of polynucleotide populations |
WO2006076025A2 (en) | 2004-05-14 | 2006-07-20 | Amaox, Inc. | Immune cell biosensors and methods of using same |
EP1598429A1 (en) | 2004-05-19 | 2005-11-23 | Amplion Ltd. | Detection of amplicon contamination during PCR exhibiting two different annealing temperatures |
GB0412973D0 (en) | 2004-06-10 | 2004-07-14 | Celltech R&D Ltd | Identification of antibody producing cells |
US20060020397A1 (en) | 2004-07-21 | 2006-01-26 | Kermani Bahram G | Methods for nucleic acid and polypeptide similarity search employing content addressable memories |
CN101087890A (zh) | 2004-07-26 | 2007-12-12 | 帕拉列勒生物科学公司 | 多个基因组的同时分析 |
US7820382B2 (en) | 2004-08-03 | 2010-10-26 | Bauer A Robert | Method for the early detection of breast cancer, lung cancer, pancreatic cancer and colon polyps, growths and cancers as well as other gastrointestinal disease conditions and the preoperative and postoperative monitoring of transplanted organs from the donor and in the recipient and their associated conditions related and unrelated to the organ transplantation |
US20060094018A1 (en) | 2004-08-03 | 2006-05-04 | Bauer A R Jr | Discovery and a method for the early detection of pancreatic cancer and other disease conditions |
AU2005267720B2 (en) | 2004-08-05 | 2012-02-23 | Genentech, Inc. | Humanized anti-cmet antagonists |
US7915036B2 (en) | 2004-09-13 | 2011-03-29 | The United States Of America As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Compositions comprising T cell receptors and methods of use thereof |
US7170050B2 (en) | 2004-09-17 | 2007-01-30 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Apparatus and methods for optical analysis of molecules |
US8053235B2 (en) | 2004-10-29 | 2011-11-08 | Benaroya Research Institute At Virginia Mason | Methods of generating antigen-specific CD4+CD25+regulatory T cells, compositions and methods of use |
US7966988B2 (en) | 2005-01-11 | 2011-06-28 | Exxonmobil Research And Engineering Company | Method for controlling soot induced lubricant viscosity increase |
US8029783B2 (en) | 2005-02-02 | 2011-10-04 | Genentech, Inc. | DR5 antibodies and articles of manufacture containing same |
FR2881436B1 (fr) | 2005-02-03 | 2007-04-27 | Commissariat Energie Atomique | Procede de determination de la diversite des lymphocytes t dans un echantillon biologique |
US7393665B2 (en) | 2005-02-10 | 2008-07-01 | Population Genetics Technologies Ltd | Methods and compositions for tagging and identifying polynucleotides |
BRPI0607753A2 (pt) | 2005-02-16 | 2009-10-06 | Wyeth Corp | método para prever um efeito clìnico em resposta a um tratamento de uma leucemia; método para prever um efeito clìnico de uma leucemia; método para selecionar um tratamento para um paciente com leucemia; método para o diagnóstico ou monitoramento de ocorrência, desenvolvimento, progressão ou tratamento de uma leucemia; arranjo para uso num método para prever um efeito clìnico para um paciente aml; arranjo para uso num método de diagnóstico de aml; meio legìvel por computador; kit para o prognóstico de aml |
US7537894B2 (en) | 2005-03-02 | 2009-05-26 | The University Of Chicago | Methods and kits for monitoring Barrett's metaplasia |
WO2006099164A2 (en) | 2005-03-10 | 2006-09-21 | Applera Corporation | Methods for multiplex amplification |
WO2006099604A2 (en) | 2005-03-16 | 2006-09-21 | Compass Genetics, Llc | Methods and compositions for assay readouts on multiple analytical platforms |
ES2404311T3 (es) * | 2005-04-12 | 2013-05-27 | 454 Life Sciences Corporation | Métodos para determinar variantes de secuencias usando secuenciación ultraprofunda |
WO2006116155A2 (en) | 2005-04-21 | 2006-11-02 | The Regents Of The University Of California | A method for diagnosis and prognosis of multiple sclerosis subtypes |
US20060263789A1 (en) | 2005-05-19 | 2006-11-23 | Robert Kincaid | Unique identifiers for indicating properties associated with entities to which they are attached, and methods for using |
US7208795B2 (en) | 2005-05-24 | 2007-04-24 | Atmel Corporation | Low-cost, low-voltage single-layer polycrystalline EEPROM memory cell integration into BiCMOS technology |
DK1907571T3 (en) | 2005-06-15 | 2017-08-21 | Complete Genomics Inc | NUCLEIC ACID ANALYSIS USING INCIDENTAL MIXTURES OF NON-OVERLAPPING FRAGMENTS |
US20070020670A1 (en) | 2005-07-07 | 2007-01-25 | Hematologics, Inc. | Methods for detecting and confirming minimal disease |
US20070020640A1 (en) | 2005-07-21 | 2007-01-25 | Mccloskey Megan L | Molecular encoding of nucleic acid templates for PCR and other forms of sequence analysis |
GB0521521D0 (en) | 2005-10-21 | 2005-11-30 | Medical Res Council | Diagnostic methods and kits |
GB0522310D0 (en) * | 2005-11-01 | 2005-12-07 | Solexa Ltd | Methods of preparing libraries of template polynucleotides |
US20070105165A1 (en) | 2005-11-04 | 2007-05-10 | Charles Goolsby | Composite profiles of cell antigens and target signal transduction proteins for analysis and clinical management of hematologic cancers |
US7375211B2 (en) * | 2005-11-18 | 2008-05-20 | Kou Zhong C | Method for detection and quantification of T-cell receptor Vβ repertoire |
US8137936B2 (en) | 2005-11-29 | 2012-03-20 | Macevicz Stephen C | Selected amplification of polynucleotides |
US7537897B2 (en) | 2006-01-23 | 2009-05-26 | Population Genetics Technologies, Ltd. | Molecular counting |
US7544473B2 (en) | 2006-01-23 | 2009-06-09 | Population Genetics Technologies Ltd. | Nucleic acid analysis using sequence tokens |
SG10201405158QA (en) | 2006-02-24 | 2014-10-30 | Callida Genomics Inc | High throughput genome sequencing on dna arrays |
WO2007101441A1 (en) | 2006-03-06 | 2007-09-13 | Symphogen A/S | Recombinant polyclonal antibody for treatment of respiratory syncytial virus infections |
ES2546848T3 (es) | 2006-03-10 | 2015-09-29 | Epigenomics Ag | Un método para identificar una muestra biológica para el análisis de la metilación |
WO2007114693A2 (en) | 2006-04-04 | 2007-10-11 | Keygene N.V. | High throughput detection of molecular markers based on aflp and high throughput sequencing |
EP2021460A4 (en) | 2006-05-11 | 2010-11-17 | Univ Maryland Biotech Inst | GENERAL PROCEDURE FOR GENERATING HUMAN ANTIBODY REACTIONS IN VITRO |
WO2007136518A2 (en) | 2006-05-17 | 2007-11-29 | Torrey Pines Institute For Molecular Studies | Treatment of autoimmune disorders |
CA2653256C (en) | 2006-05-25 | 2018-08-28 | Institute For Advanced Study | Methods for identifying sequence motifs, and applications thereof |
US7833716B2 (en) | 2006-06-06 | 2010-11-16 | Gen-Probe Incorporated | Tagged oligonucleotides and their use in nucleic acid amplification methods |
US7486865B2 (en) | 2006-06-12 | 2009-02-03 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Substrates for performing analytical reactions |
US20100027896A1 (en) * | 2006-06-28 | 2010-02-04 | Amir Geva | Automated application interaction using a virtual operator |
AU2007269408A1 (en) | 2006-06-30 | 2008-01-10 | Applied Biosystems, Llc. | Reversible terminator nucleotides and methods of use |
WO2008108803A2 (en) | 2006-07-13 | 2008-09-12 | Amaox, Ltd. | Immune cell biosensors and methods of using same |
US8394590B2 (en) | 2006-08-02 | 2013-03-12 | California Institute Of Technology | Capture agents and related methods and systems for detecting and/or sorting targets |
US20080274904A1 (en) | 2006-08-10 | 2008-11-06 | Niall Anthony Gormley | Method of target enrichment |
WO2008026927A2 (en) | 2006-08-30 | 2008-03-06 | Academisch Medisch Centrum | Process for displaying t- and b-cell receptor repertoires |
WO2008039818A2 (en) | 2006-09-26 | 2008-04-03 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Modified t cell receptors and related materials and methods |
US20100035764A1 (en) | 2006-09-26 | 2010-02-11 | St. Jude Children's Research Hospital | Methods and compositions for monitoring t cell receptor diversity |
JP5026047B2 (ja) | 2006-10-18 | 2012-09-12 | 株式会社膠原病研究所 | 自己免疫疾患の発症に関わる自己応答性t細胞またはt細胞受容体の同定方法、およびその利用 |
WO2008140484A2 (en) | 2006-11-09 | 2008-11-20 | Xdx, Inc. | Methods for diagnosing and monitoring the status of systemic lupus erythematosus |
US8262900B2 (en) | 2006-12-14 | 2012-09-11 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
US7862999B2 (en) | 2007-01-17 | 2011-01-04 | Affymetrix, Inc. | Multiplex targeted amplification using flap nuclease |
NZ578851A (en) | 2007-03-01 | 2011-09-30 | Symphogen As | Method for cloning cognate antibodies |
WO2008147879A1 (en) | 2007-05-22 | 2008-12-04 | Ryan Golhar | Automated method and device for dna isolation, sequence determination, and identification |
CA2689356A1 (en) | 2007-06-01 | 2008-12-11 | 454 Life Sciences Corporation | System and meth0d for identification of individual samples from a multiplex mixture |
WO2009015296A1 (en) | 2007-07-24 | 2009-01-29 | The Regents Of The University Of California | Microfabricated dropley generator |
CN101802220B (zh) | 2007-07-26 | 2013-07-31 | 加利福尼亚太平洋生物科学股份有限公司 | 分子冗余测序法 |
ITRM20070429A1 (it) | 2007-08-06 | 2009-02-07 | Uni Cattolica Del Sacro Cuor E | Mezzi per la diagnosi la prevenzione e la cura dell'artrite reumatoide. |
CN101842159B (zh) | 2007-08-09 | 2014-09-24 | 赛路拉公司 | 关联的多参数单细胞测定及残余生物材料回收的方法和装置 |
US8268564B2 (en) | 2007-09-26 | 2012-09-18 | President And Fellows Of Harvard College | Methods and applications for stitched DNA barcodes |
US7960116B2 (en) | 2007-09-28 | 2011-06-14 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Nucleic acid sequencing methods and systems |
WO2009045898A2 (en) | 2007-09-28 | 2009-04-09 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Assessing t cell repertoires |
CN101910414B (zh) | 2007-11-07 | 2016-01-13 | 健泰科生物技术公司 | 用于评估b细胞淋巴瘤对抗cd40抗体治疗的响应性的方法和组合物 |
WO2009070767A2 (en) | 2007-11-28 | 2009-06-04 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Systemic instigation systems to study tumor growth or metastasis |
EP2062982A1 (fr) | 2007-11-26 | 2009-05-27 | ImmunID | Procédé d'étude de la diversité combinatoire V(D)J |
CN101225441B (zh) | 2007-12-05 | 2010-12-01 | 浙江大学 | 一种检测克隆特异性t淋巴细胞tcr bv cdr3基因组成的方法 |
US8621502B2 (en) | 2007-12-21 | 2013-12-31 | Microsoft Corporation | Obtaining user reactions to video |
US7767400B2 (en) | 2008-02-03 | 2010-08-03 | Helicos Biosciences Corporation | Paired-end reads in sequencing by synthesis |
EP2088432A1 (en) | 2008-02-11 | 2009-08-12 | MorphoSys AG | Methods for identification of an antibody or a target |
JP2011517283A (ja) | 2008-02-28 | 2011-06-02 | ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション | 前立腺関連障害の予後診断及び治療のためのマイクロrnaに基づく方法及び組成物 |
AU2009219203B2 (en) | 2008-02-28 | 2014-04-03 | The Ohio State University Research Foundation | MicroRNA signatures associated with cytogenetics and prognosis in acute myeloid leukemia (AML) and uses thereof |
US20090226975A1 (en) | 2008-03-10 | 2009-09-10 | Illumina, Inc. | Constant cluster seeding |
TW200938840A (en) | 2008-03-12 | 2009-09-16 | Emo Biomedicine Corp | A method for in vitro study of immune modulation using pig blood cell |
US8143007B2 (en) | 2008-03-13 | 2012-03-27 | National Institute Of Immunology | Nested primer sets for amplifying mouse immunoglobulin variable gene segments |
JP2011515102A (ja) | 2008-03-28 | 2011-05-19 | パシフィック バイオサイエンシーズ オブ カリフォルニア, インコーポレイテッド | 核酸シーケンシング用組成物及び方法 |
ATE530497T1 (de) | 2008-03-31 | 2011-11-15 | Sony Deutschland Gmbh | Verfahren zur herstellung einer membran mit konischer pore |
ES2549184T3 (es) * | 2008-04-16 | 2015-10-23 | Cb Biotechnologies, Inc. | Método para evaluar y comparar inmunorepertorios |
US8911948B2 (en) | 2008-04-30 | 2014-12-16 | Integrated Dna Technologies, Inc. | RNase H-based assays utilizing modified RNA monomers |
US20120003225A1 (en) | 2008-05-09 | 2012-01-05 | Duke University | Autoantibodies in the detection and treatment of cancer |
US9068181B2 (en) | 2008-05-23 | 2015-06-30 | The General Hospital Corporation | Microfluidic droplet encapsulation |
DE102008025656B4 (de) | 2008-05-28 | 2016-07-28 | Genxpro Gmbh | Verfahren zur quantitativen Analyse von Nukleinsäuren, Marker dafür und deren Verwendung |
DK2297333T3 (en) | 2008-05-30 | 2015-04-07 | Massachusetts Inst Technology | Method for spatial separation and for screening cells |
WO2009151628A2 (en) | 2008-06-12 | 2009-12-17 | Gov't Of The Usa, As Represented By The Secretary, Department Of Health Human Services | Monitoring tcr-b to determine hiv therapy and disease progression |
AP2011005546A0 (en) | 2008-06-25 | 2011-02-28 | Baylor Res Intitute | Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection. |
CA2769002C (en) | 2008-07-24 | 2018-05-08 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Vh4 codon signature for multiple sclerosis |
JP5924937B2 (ja) | 2008-07-25 | 2016-05-25 | エックス−ボディ インコーポレイテッド | タンパク質スクリーニング法 |
US9156010B2 (en) | 2008-09-23 | 2015-10-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet-based assay system |
EP3964821A1 (en) | 2008-09-23 | 2022-03-09 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet-based assay system |
US8699361B2 (en) | 2008-09-30 | 2014-04-15 | Qualcomm Incorporated | Out-of-synchronization handling method and apparatus |
US20100137143A1 (en) | 2008-10-22 | 2010-06-03 | Ion Torrent Systems Incorporated | Methods and apparatus for measuring analytes |
US8546128B2 (en) | 2008-10-22 | 2013-10-01 | Life Technologies Corporation | Fluidics system for sequential delivery of reagents |
US8691510B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-04-08 | Sequenta, Inc. | Sequence analysis of complex amplicons |
US20140234835A1 (en) | 2008-11-07 | 2014-08-21 | Sequenta, Inc. | Rare clonotypes and uses thereof |
US9365901B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-06-14 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia |
US9506119B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-11-29 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method of sequence determination using sequence tags |
US8748103B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-06-10 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
US9528160B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-12-27 | Adaptive Biotechnolgies Corp. | Rare clonotypes and uses thereof |
US9394567B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-07-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Detection and quantification of sample contamination in immune repertoire analysis |
US8628927B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-01-14 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
EP2719774B8 (en) | 2008-11-07 | 2020-04-22 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods of monitoring conditions by sequence analysis |
US20110105343A1 (en) | 2008-11-21 | 2011-05-05 | Emory University | Systems Biology Approach Predicts Immunogenicity of Vaccines |
US8367330B2 (en) | 2008-12-22 | 2013-02-05 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Methods for detecting TCR-gamma gene rearrangement |
AU2009333489A1 (en) | 2008-12-30 | 2010-07-08 | Centocor Ortho Biotech Inc. | Serum markers predicting clinical response to anti-TNF antibodies in patients with ankylosing spondylitis |
DK3059337T3 (da) | 2009-01-15 | 2019-07-22 | Adaptive Biotechnologies Corp | Adaptive immunity profiling og metoder til frembringelse af monoklonale antibodier |
US9329170B2 (en) | 2009-01-20 | 2016-05-03 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Single cell gene expression for diagnosis, prognosis and identification of drug targets |
US20100323348A1 (en) | 2009-01-31 | 2010-12-23 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Methods and Compositions for Using Error-Detecting and/or Error-Correcting Barcodes in Nucleic Acid Amplification Process |
US8574835B2 (en) | 2009-05-29 | 2013-11-05 | Life Technologies Corporation | Scaffolded nucleic acid polymer particles and methods of making and using |
US8673627B2 (en) | 2009-05-29 | 2014-03-18 | Life Technologies Corporation | Apparatus and methods for performing electrochemical reactions |
KR20120044941A (ko) * | 2009-06-25 | 2012-05-08 | 프레드 헛친슨 켄서 리서치 센터 | 적응 면역의 측정방법 |
JP5829606B2 (ja) | 2009-06-29 | 2015-12-09 | カリフォルニア・インスティテュート・オブ・テクノロジーCalifornia Institute Oftechnology | 単一細胞からの未知の再配列されたt細胞受容体の単離 |
JP5926183B2 (ja) | 2009-09-22 | 2016-05-25 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | 疾患関連kirハプロタイプの決定 |
US9043160B1 (en) | 2009-11-09 | 2015-05-26 | Sequenta, Inc. | Method of determining clonotypes and clonotype profiles |
US8835358B2 (en) | 2009-12-15 | 2014-09-16 | Cellular Research, Inc. | Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse labels |
US9315857B2 (en) | 2009-12-15 | 2016-04-19 | Cellular Research, Inc. | Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse label-tags |
US8545248B2 (en) | 2010-01-07 | 2013-10-01 | Life Technologies Corporation | System to control fluid flow based on a leak detected by a sensor |
KR101323827B1 (ko) | 2010-01-08 | 2013-10-31 | 키스트 유럽 에프게엠베하 | 강직성척추염 진단용 프라이머 및 이를 이용한 강직성 척추염 진단 방법 |
GB201000375D0 (en) | 2010-01-09 | 2010-02-24 | Univ Cardiff | T Cell clonotypes |
WO2011106738A2 (en) | 2010-02-25 | 2011-09-01 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Use of tcr clonotypes as biomarkers for disease |
EP2367000A1 (en) | 2010-03-04 | 2011-09-21 | Charité Universitätsmedizin Berlin | High throughput analysis of T-cell receptor repertoires |
SG10201503534RA (en) | 2010-05-06 | 2015-06-29 | Sequenta Inc | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
WO2011140433A2 (en) | 2010-05-07 | 2011-11-10 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Measurement and comparison of immune diversity by high-throughput sequencing |
US20130123120A1 (en) | 2010-05-18 | 2013-05-16 | Natera, Inc. | Highly Multiplex PCR Methods and Compositions |
WO2011156707A2 (en) | 2010-06-11 | 2011-12-15 | Life Technologies Corporation | Alternative nucleotide flows in sequencing-by-synthesis methods |
WO2012027503A2 (en) | 2010-08-24 | 2012-03-01 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Method of measuring adaptive immunity |
DK2623613T3 (en) | 2010-09-21 | 2016-10-03 | Population Genetics Tech Ltd | Increasing the reliability of the allele-indications by molecular counting |
EP3447155A1 (en) | 2010-09-30 | 2019-02-27 | Raindance Technologies, Inc. | Sandwich assays in droplets |
EP3561159B1 (en) | 2010-10-08 | 2023-09-20 | President and Fellows of Harvard College | High-throughput single cell barcoding |
US10392726B2 (en) | 2010-10-08 | 2019-08-27 | President And Fellows Of Harvard College | High-throughput immune sequencing |
EP2633069B1 (en) | 2010-10-26 | 2015-07-01 | Illumina, Inc. | Sequencing methods |
WO2012061832A1 (en) | 2010-11-05 | 2012-05-10 | Illumina, Inc. | Linking sequence reads using paired code tags |
WO2012083069A2 (en) | 2010-12-15 | 2012-06-21 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Measurement and monitoring of cell clonality |
DK2652155T3 (en) | 2010-12-16 | 2017-02-13 | Gigagen Inc | Methods for Massive Parallel Analysis of Nucleic Acids in Single Cells |
WO2012118555A1 (en) | 2010-12-29 | 2012-09-07 | Life Technologies Corporation | Time-warped background signal for sequencing-by-synthesis operations |
EP3582224A1 (en) | 2010-12-30 | 2019-12-18 | Life Technologies Corporation | Models for analyzing data from sequencing-by-synthesis operations |
US8759036B2 (en) | 2011-03-21 | 2014-06-24 | Affymetrix, Inc. | Methods for synthesizing pools of probes |
US9476095B2 (en) | 2011-04-15 | 2016-10-25 | The Johns Hopkins University | Safe sequencing system |
FI3892295T3 (fi) | 2011-05-24 | 2023-05-10 | BioNTech SE | Yksilöityjä rokotteita syöpää varten |
US9834766B2 (en) | 2011-09-02 | 2017-12-05 | Atreca, Inc. | DNA barcodes for multiplexed sequencing |
WO2013036459A2 (en) | 2011-09-09 | 2013-03-14 | Sequenta, Inc. | Sequence-based measures of immune response |
US10385475B2 (en) | 2011-09-12 | 2019-08-20 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Random array sequencing of low-complexity libraries |
WO2013055595A1 (en) | 2011-10-11 | 2013-04-18 | Sequenta, Inc. | Determining responsiveness of autoimmune patients to dmard treatment |
US9279159B2 (en) | 2011-10-21 | 2016-03-08 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells |
EP2773773B1 (en) | 2011-11-04 | 2017-01-11 | Adaptive Biotechnologies Corporation | T-cell receptor clonotypes shared among ankylosing spondylitis patients |
WO2013085855A1 (en) | 2011-12-05 | 2013-06-13 | Sequenta, Inc. | Clonotypes as biometric specimen tags |
EP2788507A4 (en) | 2011-12-09 | 2015-07-08 | Sequenta Inc | METHOD FOR MEASURING IMMUNE ACTIVATION |
EP3904536A1 (en) | 2011-12-09 | 2021-11-03 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection |
WO2013090390A2 (en) | 2011-12-13 | 2013-06-20 | Sequenta, Inc. | Method of measuring immune activation |
US9499865B2 (en) | 2011-12-13 | 2016-11-22 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes |
WO2013096480A2 (en) | 2011-12-20 | 2013-06-27 | Sequenta, Inc. | Monitoring transformation of follicular lymphoma to diffuse large b-cell lymphoma by immune repertoire analysis |
US20150031555A1 (en) | 2012-01-24 | 2015-01-29 | Gigagen, Inc. | Method for correction of bias in multiplexed amplification |
US11177020B2 (en) | 2012-02-27 | 2021-11-16 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Methods and uses for molecular tags |
WO2013131074A1 (en) | 2012-03-02 | 2013-09-06 | Diogenix, Inc. | Methods and reagents for evaluating autoimmune disease and determining antibody repertoire |
US20150038346A1 (en) | 2012-03-05 | 2015-02-05 | Sequenta, Inc. | Monitoring immune responsiveness to cancer vaccination |
EP2823060B1 (en) | 2012-03-05 | 2018-02-14 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Determining paired immune receptor chains from frequency matched subunits |
WO2013134302A1 (en) | 2012-03-05 | 2013-09-12 | Sequenta, Inc. | Monitoring immune responsiveness to cancer vaccination |
WO2013155119A1 (en) | 2012-04-13 | 2013-10-17 | Sequenta, Inc. | Detection and quantitation of sample contamination in immune repertoire analysis |
WO2013158936A1 (en) | 2012-04-20 | 2013-10-24 | Sequenta, Inc | Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in b-cell acute lymphoblastic leukemia |
JP5756247B1 (ja) | 2012-05-08 | 2015-07-29 | アダプティブ バイオテクノロジーズ コーポレイション | マルチプレックスpcr反応における増幅バイアスを測定し校正する組成物及び方法 |
WO2013181428A2 (en) | 2012-05-31 | 2013-12-05 | Sequenta, Inc. | Predicting relapse of chronic lymphocytic leukemia patients treated by allogeneic stem cell transplantation |
US20130324422A1 (en) | 2012-06-04 | 2013-12-05 | Sequenta, Inc. | Detecting disease-correlated clonotypes from fixed samples |
CA2875542A1 (en) | 2012-06-11 | 2013-12-19 | Sequenta, Inc. | Method of sequence determination using sequence tags |
WO2013188831A1 (en) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Uniquely tagged rearranged adaptive immune receptor genes in a complex gene set |
EP2877604A1 (en) | 2012-07-24 | 2015-06-03 | Sequenta, Inc. | Single cell analysis using sequence tags |
US20160115532A1 (en) | 2012-08-10 | 2016-04-28 | Sequenta, Inc. | High sensitivity mutation detection using sequence tags |
US9938578B2 (en) | 2012-09-24 | 2018-04-10 | iRepertoire, Inc. | Multiplex pyrosequencing using non-interfering noise cancelling polynucleotide identification tags |
AU2013331212A1 (en) | 2012-10-19 | 2015-05-07 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Monitoring clonotypes of plasma cell proliferative disorders in peripheral blood |
US10150996B2 (en) | 2012-10-19 | 2018-12-11 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells |
JP2015534806A (ja) | 2012-10-19 | 2015-12-07 | シーケンタ・インコーポレイテッド | 末梢血試料によるびまん性大細胞型b細胞性リンパ腫のモニタリング関連出願の相互参照本出願は、2012年10月19日出願の米国特許仮出願第61/716,270号の利益を主張するものであり、当該出願は参照により本明細書にその全体が組み込まれる。 |
AU2013335021A1 (en) | 2012-10-22 | 2015-05-07 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Monitoring mantle cell lymphoma clonotypes in peripheral blood after immunotransplant |
ES2748204T3 (es) | 2013-02-22 | 2020-03-13 | Adaptive Biotechnologies Corp | Procedimiento para seleccionar clonotipos raros |
US20140255944A1 (en) | 2013-03-08 | 2014-09-11 | Sequenta, Inc. | Monitoring treatment-resistant clones in lymphoid and myeloid neoplasms by relative levels of evolved clonotypes |
US20140255929A1 (en) | 2013-03-11 | 2014-09-11 | Sequenta, Inc. | Mosaic tags for labeling templates in large-scale amplifications |
WO2014189635A1 (en) * | 2013-05-20 | 2014-11-27 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Tracking donor-reactive tcr as a biomarker in transplantation |
US9708657B2 (en) | 2013-07-01 | 2017-07-18 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method for generating clonotype profiles using sequence tags |
WO2015013461A2 (en) | 2013-07-26 | 2015-01-29 | Sequenta, Inc. | Cancer vaccination with antigen evolution |
AU2014337063A1 (en) | 2013-10-18 | 2016-05-19 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Predicting patient responsiveness to immune checkpoint inhibitors |
US20150218656A1 (en) | 2014-02-03 | 2015-08-06 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Methods for detection and diagnosis of a lymphoid malignancy using high throughput sequencing |
WO2016069886A1 (en) | 2014-10-29 | 2016-05-06 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Highly-multiplexed simultaneous detection of nucleic acids encoding paired adaptive immune receptor heterodimers from many samples |
-
2010
- 2010-06-04 KR KR1020117030953A patent/KR20120044941A/ko not_active Application Discontinuation
- 2010-06-04 SG SG2011090099A patent/SG176691A1/en unknown
- 2010-06-04 JP JP2012517553A patent/JP2012531202A/ja active Pending
- 2010-06-04 CN CN201080028875.2A patent/CN102459643B/zh active Active
- 2010-06-04 EP EP18184843.3A patent/EP3409792B1/en active Active
- 2010-06-04 CA CA2765949A patent/CA2765949C/en active Active
- 2010-06-04 RU RU2012101828/10A patent/RU2539032C2/ru active
- 2010-06-04 RU RU2014144463/10A patent/RU2014144463A/ru not_active Application Discontinuation
- 2010-06-04 SG SG10201403451QA patent/SG10201403451QA/en unknown
- 2010-06-04 KR KR1020147031470A patent/KR20140146180A/ko not_active Application Discontinuation
- 2010-06-04 US US12/794,507 patent/US20100330571A1/en active Granted
- 2010-06-04 WO PCT/US2010/037477 patent/WO2010151416A1/en active Application Filing
- 2010-06-04 EP EP10722512.0A patent/EP2446052B1/en active Active
- 2010-06-04 AU AU2010263172A patent/AU2010263172B2/en active Active
-
2011
- 2011-12-25 IL IL217200A patent/IL217200A/en active IP Right Grant
-
2013
- 2013-12-03 US US14/095,629 patent/US20140194295A1/en not_active Abandoned
-
2014
- 2014-02-18 US US14/183,163 patent/US20140206548A1/en not_active Abandoned
- 2014-02-18 US US14/183,177 patent/US20140206549A1/en not_active Abandoned
- 2014-04-01 US US14/242,299 patent/US20140256567A1/en not_active Abandoned
- 2014-04-02 US US14/243,875 patent/US20140213463A1/en not_active Abandoned
- 2014-04-14 US US14/252,189 patent/US20140221220A1/en not_active Abandoned
-
2015
- 2015-07-31 JP JP2015151866A patent/JP6125578B2/ja active Active
-
2016
- 2016-03-04 US US15/061,827 patent/US9809813B2/en active Active
-
2017
- 2017-09-20 US US15/709,719 patent/US11214793B2/en active Active
-
2018
- 2018-06-29 US US16/023,010 patent/US11905511B2/en active Active
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2010263172B2 (en) | Method of measuring adaptive immunity | |
KR101621643B1 (ko) | 다중 pcr 반응에서 증폭 바이어스를 측정 및 교정하기 위한 조성물 및 방법 | |
US20170335386A1 (en) | Method of measuring adaptive immunity | |
Kirsch et al. | T-cell receptor profiling in cancer | |
AU2012325791B2 (en) | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells | |
EP2387627B1 (en) | Adaptive immunity profiling and methods for generation of monoclonal antibodies | |
CN110191959A (zh) | 用于免疫组库测序的核酸样品制备方法 | |
JP2022522668A (ja) | 抗体を最適化するための変異体核酸ライブラリ | |
CN107941681A (zh) | 鉴定生物样品中定量细胞组成的方法 | |
CN107312861A (zh) | 一种b‑all患者预后风险评估标记物 | |
WO2012071436A1 (en) | Method of treating autoimmune inflammatory disorders using il-23r loss-of-function mutants | |
Yumoto et al. | CDR3 Sequences of MALT Lymphoma Show Homology with Those of Autoreactive B‐Cell Lines | |
Fairhurst et al. | A DNA repair abnormality specific for rearranged immunoglobulin variable genes in germinal center B cells | |
Perez et al. | Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence | |
CN114940990A (zh) | 与颅内动脉瘤相关的基因突变位点及其应用 | |
Masqué Soler | Gene expression profiling and immunoglobulin stereotypy in Burkitt lymphoma | |
Cremer et al. | Ultrasensitive PCR detection of tumor cells in myeloma |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A107 | Divisional application of patent | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E601 | Decision to refuse application |