JPWO2019137541A5 - - Google Patents
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本出願の別の態様は、上述の単離核酸またはベクターのいずれか1つを含む宿主細胞を培養すること、またはコードされた抗PD-1構築物の発現に効果的な条件下で上述の単離宿主細胞のいずれか1つを培養すること;及び発現された抗PD-1構築物を前記宿主細胞から得ることを含む、上述の単離抗PD-1構築物のいずれか1つの産生方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、上述の単離核酸またはベクターのいずれか1つを含む宿主細胞を産生することをさらに含む。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
PD-1を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分を含む単離抗PD-1構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号37~72のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号109~144のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号181~216のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、前記単離抗PD-1構築物。
(項目2)
前記sdAb部分が、配列番号37~72のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号109~144のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号181~216のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において、最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目1に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目3)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号185のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号186のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号115のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号187のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号116のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号188のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号117のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号189のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号118のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号190のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号119のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号191のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号120のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号192のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号121のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号193のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号122のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号194のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号123のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号195のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号124のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号196のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号125のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号197のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号126のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号198のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号127のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号199のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号128のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号200のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号129のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号201のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号130のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号202のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号131のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号203のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号132のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号204のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号133のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号205のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号134のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号206のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(27)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号135のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号207のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(28)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号136のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号208のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(29)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号137のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号209のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(30)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号138のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号210のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(31)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号139のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号211のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(32)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号140のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号212のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(33)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号141のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(34)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号142のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(35)配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号143のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;または
(36)配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号144のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1または2に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目4)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号185のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号186のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号115のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号187のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号116のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号188のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号117のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号189のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号118のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号190のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号119のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号191のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号120のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号192のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号121のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号193のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号122のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号194のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号123のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号195のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号124のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号196のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号125のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号197のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号126のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号198のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号127のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号199のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号128のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号200のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号129のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号201のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号130のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号202のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号131のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号203のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号132のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号204のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号133のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号205のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号134のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号206のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(27)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号135のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号207のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(28)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号136のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号208のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(29)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号137のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号209のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(30)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号138のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号210のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(31)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号211のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(32)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号140のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号212のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(33)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号141のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(34)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(35)配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号143のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;または
(36)配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号144のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR3;または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1~3のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目5)
前記sdAb部分が、以下:
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、G、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、及びCからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、及びSからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E、Q、及びGからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、Rであり;
b-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、及びSからなる群から選択され;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択され;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメインを含み、
アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位がQである場合、108位が、Lに適宜ヒト化することができる、項目1~4のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目6)
前記sdAb部分が、配列番号289~324のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または配列番号289~324のいずれか1つに対して少なくとも約80%の配列同一性を有するその変異体を含む、項目1~5のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目7)
前記sdAb部分が、配列番号289~324のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または前記V H Hドメインにおいて最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目6に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目8)
前記sdAb部分と前記PD-1の間の結合のK d が、約10 -5 M~約10 -12 Mである、項目1~7のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目9)
前記sdAb部分と前記PD-1の間の結合のK d が、約10 -7 M~約10 -12 Mである、項目8に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目10)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分が、ラクダ、キメラ、ヒト、部分ヒト化、または完全ヒト化である、項目1~9のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目11)
前記単離抗PD-1構築物が、適宜リンカーを介してFc断片に融合したPD-1を特異的に認識する前記sdAb部分を含む重鎖のみ抗体(HCAb)である、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目12)
前記HCAbが、単量体または二量体である、項目11に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目13)
前記Fc断片が、ヒトIgG1(hIgG1)Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、またはhIgG4 Fc(S228P)である、項目11または12に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目14)
前記適宜リンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目11~13のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目15)
前記HCAbが、配列番号325~360のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目11~14のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目16)
前記単離抗PD-1構築物が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分をさらに含む、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目17)
前記第2の抗体部分が、完全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’) 2 、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、またはsdAbである、項目16に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目18)
前記抗PD-1構築物が、多重特異性である、項目16または17に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目19)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分、及び前記第2の抗体部分が、ペプチドリンカーによって適宜連結される、項目16~18のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目20)
前記ペプチドリンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目19に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目21)
前記第2の抗体部分が、PD-1またはCTLA-4を特異的に認識する第2のsdAbである、項目16~20のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目22)
前記第2の抗体部分が、2本の重鎖及び2本の軽鎖からなる完全長抗体である、項目16~20のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目23)
前記重鎖のFc断片が、ヒトIgG1(hIgG1)Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、またはhIgG4 Fc(S228P)である、項目22に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目24)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目25)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目26)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目27)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目28)
前記完全長抗体が、TIGITを特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目29)
前記完全長抗体が、配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び、配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目28に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目30)
前記完全長抗体が、配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目28または29に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目31)
前記完全長抗体が、LAG-3を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目32)
前記完全長抗体が、配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目31に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目33)
前記完全長抗体が、配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目31または32に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目34)
前記完全長抗体が、TIM-3を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目35)
前記完全長抗体が、配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目34に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目36)
前記完全長抗体が、配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目34または35に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目37)
前記完全長抗体が、CTLA-4を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目38)
前記完全長抗体が、配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目37に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目39)
前記完全長抗体が、配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目37または38に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目40)
前記完全長抗体が、PD-1を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目41)
前記完全長抗体が、配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目40に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目42)
前記完全長抗体が、配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目40または41に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目43)
PD-1を特異的に認識するsdAb部分を含む単離抗PD-1構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号289~324のうちのいずれか1つのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む、前記単離抗PD-1構築物。
(項目44)
項目1~43のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物と競合的にPD-1に特異的に結合する、単離抗PD-1構築物。
(項目45)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物、及び適宜、医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
(項目46)
PD-1関連疾患を有する個体の治療方法であって、前記個体に有効量の項目45に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
(項目47)
前記PD-1関連疾患が、がんである、項目46に記載の方法。
(項目48)
前記がんが、固形腫瘍である、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記がんが、大腸がんである、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記個体に追加療法を投与することをさらに含む、項目46~49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記個体が、ヒトである、項目46~50のいずれか1項に記載の方法。
(項目52)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物をコードする、単離核酸。
(項目53)
項目52に記載の単離核酸を含む、ベクター。
(項目54)
項目52に記載の単離核酸、または項目53に記載のベクターを含む、単離宿主細胞。
(項目55)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物、項目52に記載の単離核酸、項目53に記載のベクター、または項目54に記載の単離宿主細胞を含む、キット。
(項目56)
抗PD-1構築物の産生方法であって、
(a)コードされた抗PD-1構築物を発現するのに効果的な条件下で、項目52に記載の単離核酸または項目53に記載のベクターを含む宿主細胞、または項目54に記載の単離宿主細胞を培養すること;及び
(b)前記宿主細胞から発現した抗PD-1構築物を得ること
を含む、前記方法。
(項目57)
工程(a)が、項目52に記載の単離核酸または項目53に記載のベクターを含む宿主細胞を産生することをさらに含む、項目56に記載の方法。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
PD-1を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分を含む単離抗PD-1構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号37~72のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号109~144のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号181~216のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、前記単離抗PD-1構築物。
(項目2)
前記sdAb部分が、配列番号37~72のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号109~144のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号181~216のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において、最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目1に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目3)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号185のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号186のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号115のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号187のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号116のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号188のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号117のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号189のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号118のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号190のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号119のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号191のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号120のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号192のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号121のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号193のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号122のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号194のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号123のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号195のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号124のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号196のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号125のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号197のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号126のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号198のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号127のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号199のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号128のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号200のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号129のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号201のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号130のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号202のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号131のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号203のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号132のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号204のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号133のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号205のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号134のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号206のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(27)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号135のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号207のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(28)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号136のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号208のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(29)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号137のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号209のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(30)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号138のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号210のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(31)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号139のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号211のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(32)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号140のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号212のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(33)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号141のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(34)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号142のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(35)配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号143のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;または
(36)配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号144のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1または2に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目4)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号185のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号186のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号115のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号187のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号116のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号188のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号117のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号189のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号118のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号190のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号119のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号191のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号120のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号192のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号121のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号193のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号122のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号194のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号123のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号195のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号124のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号196のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号125のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号197のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号126のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号198のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号127のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号199のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号128のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号200のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号129のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号201のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号130のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号202のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号131のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号203のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号132のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号204のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号133のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号205のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号134のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号206のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(27)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号135のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号207のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(28)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号136のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号208のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(29)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号137のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号209のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(30)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号138のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号210のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(31)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号139のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号211のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(32)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号140のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号212のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(33)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号141のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(34)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号142のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(35)配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号143のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;または
(36)配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号144のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR3;または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1~3のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目5)
前記sdAb部分が、以下:
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、G、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、及びCからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、及びSからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E、Q、及びGからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、Rであり;
b-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、及びSからなる群から選択され;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択され;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメインを含み、
アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位がQである場合、108位が、Lに適宜ヒト化することができる、項目1~4のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目6)
前記sdAb部分が、配列番号289~324のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または配列番号289~324のいずれか1つに対して少なくとも約80%の配列同一性を有するその変異体を含む、項目1~5のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目7)
前記sdAb部分が、配列番号289~324のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または前記V H Hドメインにおいて最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目6に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目8)
前記sdAb部分と前記PD-1の間の結合のK d が、約10 -5 M~約10 -12 Mである、項目1~7のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目9)
前記sdAb部分と前記PD-1の間の結合のK d が、約10 -7 M~約10 -12 Mである、項目8に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目10)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分が、ラクダ、キメラ、ヒト、部分ヒト化、または完全ヒト化である、項目1~9のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目11)
前記単離抗PD-1構築物が、適宜リンカーを介してFc断片に融合したPD-1を特異的に認識する前記sdAb部分を含む重鎖のみ抗体(HCAb)である、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目12)
前記HCAbが、単量体または二量体である、項目11に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目13)
前記Fc断片が、ヒトIgG1(hIgG1)Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、またはhIgG4 Fc(S228P)である、項目11または12に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目14)
前記適宜リンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目11~13のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目15)
前記HCAbが、配列番号325~360のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目11~14のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目16)
前記単離抗PD-1構築物が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分をさらに含む、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目17)
前記第2の抗体部分が、完全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’) 2 、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、またはsdAbである、項目16に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目18)
前記抗PD-1構築物が、多重特異性である、項目16または17に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目19)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分、及び前記第2の抗体部分が、ペプチドリンカーによって適宜連結される、項目16~18のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目20)
前記ペプチドリンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目19に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目21)
前記第2の抗体部分が、PD-1またはCTLA-4を特異的に認識する第2のsdAbである、項目16~20のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目22)
前記第2の抗体部分が、2本の重鎖及び2本の軽鎖からなる完全長抗体である、項目16~20のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目23)
前記重鎖のFc断片が、ヒトIgG1(hIgG1)Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、またはhIgG4 Fc(S228P)である、項目22に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目24)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目25)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目26)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目27)
PD-1を特異的に認識する前記sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、項目22または23に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目28)
前記完全長抗体が、TIGITを特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目29)
前記完全長抗体が、配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び、配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目28に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目30)
前記完全長抗体が、配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目28または29に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目31)
前記完全長抗体が、LAG-3を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目32)
前記完全長抗体が、配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目31に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目33)
前記完全長抗体が、配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目31または32に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目34)
前記完全長抗体が、TIM-3を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目35)
前記完全長抗体が、配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目34に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目36)
前記完全長抗体が、配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目34または35に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目37)
前記完全長抗体が、CTLA-4を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目38)
前記完全長抗体が、配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目37に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目39)
前記完全長抗体が、配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目37または38に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目40)
前記完全長抗体が、PD-1を特異的に認識する、項目22~27のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目41)
前記完全長抗体が、配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3を含む、項目40に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目42)
前記完全長抗体が、配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目40または41に記載の単離抗PD-1構築物。
(項目43)
PD-1を特異的に認識するsdAb部分を含む単離抗PD-1構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号289~324のうちのいずれか1つのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む、前記単離抗PD-1構築物。
(項目44)
項目1~43のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物と競合的にPD-1に特異的に結合する、単離抗PD-1構築物。
(項目45)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物、及び適宜、医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
(項目46)
PD-1関連疾患を有する個体の治療方法であって、前記個体に有効量の項目45に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
(項目47)
前記PD-1関連疾患が、がんである、項目46に記載の方法。
(項目48)
前記がんが、固形腫瘍である、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記がんが、大腸がんである、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記個体に追加療法を投与することをさらに含む、項目46~49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記個体が、ヒトである、項目46~50のいずれか1項に記載の方法。
(項目52)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物をコードする、単離核酸。
(項目53)
項目52に記載の単離核酸を含む、ベクター。
(項目54)
項目52に記載の単離核酸、または項目53に記載のベクターを含む、単離宿主細胞。
(項目55)
項目1~44のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物、項目52に記載の単離核酸、項目53に記載のベクター、または項目54に記載の単離宿主細胞を含む、キット。
(項目56)
抗PD-1構築物の産生方法であって、
(a)コードされた抗PD-1構築物を発現するのに効果的な条件下で、項目52に記載の単離核酸または項目53に記載のベクターを含む宿主細胞、または項目54に記載の単離宿主細胞を培養すること;及び
(b)前記宿主細胞から発現した抗PD-1構築物を得ること
を含む、前記方法。
(項目57)
工程(a)が、項目52に記載の単離核酸または項目53に記載のベクターを含む宿主細胞を産生することをさらに含む、項目56に記載の方法。
Claims (30)
- PD-1を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分(抗PD-1sdAb部分)を含む単離抗PD-1構築物であって、前記抗PD-1sdAb部分が、以下:
(1)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号142のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号115のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号187のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号186のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号120のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号192のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号117のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号189のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号134のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号206のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号119のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号191のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号118のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号190のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号185のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号116のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号188のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号121のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号193のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号122のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号194のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号123のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号195のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号124のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号196のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号125のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号197のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号126のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号198のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号127のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号199のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号128のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号200のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号129のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号201のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号130のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号202のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号131のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号203のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号132のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号204のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(27)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号133のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号205のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(28)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号135のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号207のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(29)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号136のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号208のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(30)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号137のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号209のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(31)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号138のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号210のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(32)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号139のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号211のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;並びに
(33)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号140のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号212のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
のいずれか1つを含む、単離抗PD-1構築物。 - 前記抗PD-1sdAb部分が、以下:
(I)
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、G、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、及びCからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、及びSからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
(II)
b-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E、Q、及びGからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、Rであり;
b-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、及びSからなる群から選択され;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択され;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVHHドメインを含み、
アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位がQである場合、108位が、Lに適宜ヒト化することができる、請求項1に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗PD-1sdAb部分が、
(i)配列番号289~324のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVHHドメイン、
(ii)配列番号289~324のいずれか1つに対して少なくとも約80%の配列同一性を有するV H Hドメイン、または
(iii)配列番号289~324のいずれか1つに対して最大で約3つのアミノ酸置換を含むV H Hドメイン
を含む、請求項1または2に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗PD-1sdAb部分が、ラクダ、キメラ、部分ヒト化、または完全ヒト化である、請求項1~3のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記単離抗PD-1構築物が、適宜リンカーを介してFc断片に融合した前記抗PD-1sdAb部分を含む重鎖のみ抗体(HCAb)である、請求項1~4のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
- (i)前記HCAbが、二量体である、および/または
(ii)前記Fc断片が、ヒトIgG1(hIgG1)Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、もしくはhIgG4 Fc(S228P)である、および/または
(iii)前記リンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、
請求項5に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記HCAbが、配列番号325~360のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項5または6に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記単離抗PD-1構築物が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分をさらに含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記第2の抗体部分が、完全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’)2、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、またはsdAbである、請求項8に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記抗PD-1sdAb部分、及び前記第2の抗体部分が、リンカーによって適宜連結される、請求項8または9に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記リンカーが、配列番号367~376のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記第2の抗体部分が、PD-1またはCTLA-4を特異的に認識する第2のsdAbである、請求項8~11のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記第2の抗体部分が、2本の重鎖及び2本の軽鎖からなる完全長抗体である、請求項8~11のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記重鎖のFc断片が、hIgG1Fc、エフェクターレス(不活性)hIgG1 Fc、hIgG4 Fc、またはhIgG4 Fc(S228P)である、請求項13に記載の単離抗PD-1構築物。
- 前記単離抗PD-1構築物が、
(i)前記抗PD-1sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、
(ii)前記抗PD-1sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、
(iii)前記抗PD-1sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のC末端に融合される、
(iv)前記抗PD-1sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1本のN末端に融合される、
(v)前記単離抗PD-1構築物が、4個の抗PD-1sdAb部分を含み、各抗PD-1sdAb部分の前記C末端が、前記完全長抗体の各鎖の前記N末端に融合される、および
(vi)前記単離抗PD-1構築物が、4個の抗PD-1sdAb部分を含み、前記4個の抗PD-1sdAb部分のうちの2個が互いに融合し、前記完全長抗体の各重鎖の前記N末端にさらに融合される
からなる群から選択される構成を含む、請求項13または14に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記完全長抗体が、
(1)TIGITを特異的に認識する(抗TIGIT完全長抗体)、
(2)LAG-3を特異的に認識する(抗LAG-3完全長抗体)、
(3)TIM-3を特異的に認識する(抗TIM-3完全長抗体)、
(4)CTLA-4を特異的に認識する(抗CTLA-4完全長抗体)、または
(5)PD-1を特異的に認識する(抗PD-1完全長抗体)、
請求項13~15のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗TIGIT完全長抗体が、
(i)配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び、配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号377のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号378のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項16に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗LAG-3完全長抗体が、
(i)配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号379のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号380のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項16に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗TIM-3完全長抗体が、
(i)配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号381のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号382のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項16に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗CTLA-4完全長抗体が、
(i)配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号383のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号384のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項16に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記抗PD-1完全長抗体が、
(i)配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖のHC-CDR1、HC-CDR2、及びHC-CDR3、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖のLC-CDR1、LC-CDR2、及びLC-CDR3、ならびに/または
(ii)配列番号385のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項16に記載の単離抗PD-1構築物。 - 前記単離抗PD-1構築物が、
(a)前記単離抗PD-1構築物が、N末端からC末端に4個のポリペプチド(i)V L -C L 、(ii)V H -C H 1-適宜ペプチドリンカー-第1の抗PD-1sdAb部分-C H 2-C H 3、(iii)V H -C H 1-適宜ペプチドリンカー-第2の抗PD-1sdAb部分-C H 2-C H 3、および(iv)V L -C L を含み、ポリペプチド(i)のV L -C L およびポリペプチド(ii)のV H -C H 1が第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分を形成し、ポリペプチド(iv)のV L -C L およびポリペプチド(iii)のV H -C H 1が第3のエピトープを特異的に認識する第3の抗体部分を形成する、
(b)前記単離抗PD-1構築物が、N末端からC末端に2個のポリペプチド(i)第2のエピトープを特異的に認識する第1のscFv-適宜ペプチドリンカー-第1の抗PD-1sdAb部分-C H 2-C H 3および(ii)第3のエピトープを特異的に認識する第2のscFv-適宜ペプチドリンカー-第2の抗PD-1sdAb部分-C H 2-C H 3を含む、
(c)前記単離抗PD-1構築物が、N末端からC末端に4個のポリペプチド(i)V L -C L -適宜ペプチドリンカー-第1の抗PD-1sdAb部分-C L 、(ii)V H -C H 1-適宜ペプチドリンカー-第2の抗PD-1sdAb部分-C H 1-C H 2-C H 3、(iii)V H -C H 1-適宜ペプチドリンカー-第3の抗PD-1sdAb部分-C H 1-C H 2-C H 3、および(iv)V L -C L -適宜ペプチドリンカー-第4の抗PD-1sdAb部分-C L を含み、ポリペプチド(i)のV L -C L およびポリペプチド(ii)のV H -C H 1が第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分を形成し、ポリペプチド(iv)のV L -C L およびポリペプチド(iii)のV H -C H 1が第3のエピトープを特異的に認識する第3の抗体部分を形成する、
(d)前記単離抗PD-1構築物が、N末端からC末端に4個のポリペプチド(i)第1の抗PD-1sdAb部分-C L 、(ii)第2のエピトープを特異的に認識する第1のscFv-適宜ペプチドリンカー-第2の抗PD-1sdAb部分-C H 1-C H 2-C H 3、(iii)第3のエピトープを特異的に認識する第2のscFv-適宜ペプチドリンカー-第3の抗PD-1sdAb部分-C H 1-C H 2-C H 3および(iv)第4の抗PD-1sdAb部分-C L を含む、
からなる群から選択される構成を含む、請求項8~11のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物。 - 請求項1~22のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物、及び適宜、医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
- 個体においてPD-1関連疾患を治療するための医薬であって、請求項1~22のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物または請求項23に記載の医薬組成物を、前記PD-1関連疾患の治療に有効な量で含む、医薬。
- 前記PD-1関連疾患が、がん、病原性感染または免疫関連疾患である、請求項24に記載の医薬。
- (i)前記がんが、固形腫瘍である、または
(ii)前記病原性感染がウイルス感染である、または
(iii)前記免疫関連疾患がT細胞機能不全障害と関連する、
請求項25に記載の医薬。 - (i)前記固形腫瘍が、大腸がんである、または
(ii)前記T細胞機能不全障害が、T細胞アネルギー、サイトカイン分泌能力の低下、増殖能力の低下、細胞溶解活性実行能力の低下もしくはT細胞消耗によって特徴付けられる、
請求項26に記載の医薬。 - 請求項1~22のいずれか1項に記載の単離抗PD-1構築物をコードする、単離核酸。
- 請求項28に記載の単離核酸を含む、ベクター。
- 請求項28に記載の単離核酸、または請求項29に記載のベクターを含む、単離宿主細胞。
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