JP6197648B2 - メタクリル酸及び/又はそのエステルの製造方法 - Google Patents
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Description
(2)メタクリル酸及び/又はそのエステルを0.04ppm以上蓄積させる、(1)の製造方法。
(3)炭素源及び/又はエネルギー源としての、再生可能原料及び/又は該再生可能原料の利用から生じるバイオマスから、メタクリル酸生成能を有する微生物を用いてメタクリル酸及び/又はそのエステルを生成する、(1)または(2)の製造方法。
(4)メタクリル酸生成能を有する微生物が、イソ酪酸あるいはバリンを含む有機物からメタクリル酸を生成可能な微生物である、(1)〜(3)のいずれかの製造方法。
(5)メタクリル酸生成能を有する微生物が、配列番号1〜41に記載された塩基配列のいずれかに対して81%以上の同一性を示す塩基配列からなる16S rRNA遺伝子を有する微生物である(1)〜(4)のいずれかの製造方法。
(6)メタクリル酸生成能を有する微生物が、配列番号42〜49に記載された塩基配列のいずれかに対して81%以上の同一性を示す塩基配列からなるLSUrRNA遺伝子を有する微生物である(1)〜(4)のいずれかの製造方法。
(7)メタクリル酸生成能を有する微生物が、シュードモナス(Pseudomonas)属、バシラス(Bacillus)属、スフィンゴバクテリウム(Sphingobacterium)属、コマモナス(Comamonas)属、ブレバンディモナス(Brevundimonas)属、スフィンゴモナス(Sphingomonas)属、オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属、ペドバクター(Pedobacter)属、パエニバシラス(Paenibacillus)属、アクロモバクター(Achromobacter)属、アシネトバクター(Acinetobacter)属、シュワネラ(Shewanella)属、リストネラ(Listonella)属、アグロバクテリウム(Agrobacterium)属、メソリゾビウム(Mesorhizobium)属、リゾビウム(Rhizobium)属、パラコッカス(Paracoccus)属、キサントバクター(Xanthobacter)属、ストレプトマイセス(Streptomyces)属、ゲオバシラス(Geobacillus)属、ロドコッカス(Rhodococcus)属、サッカロマイセス(Saccharomyces)属、カンディダ(Candida)属またはアスペルギルス(Aspergillus)属に属する微生物である(1)〜(6)のいずれかの製造方法。
(8)AATの存在下、メタクリリル−CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、メタクリル酸エステルを製造する(1)〜(7)のいずれかの製造方法。
(9)AATが植物由来である(8)の製造方法。
(10)(7)のメタクリル酸生成能を有する微生物。
(11)(10)の微生物由来のメタクリル酸合成に関与する酵素。
(12)(11)の酵素をコードする遺伝子。
(13)炭素源及び/又はエネルギー源としての、再生可能原料及び/又は該再生可能原料の利用から生じるバイオマスから、メタクリル酸生成能を有する微生物により産生されたメタクリル酸及び/又はそのエステル。
(14)メタクリル酸生成能を有する微生物と、メタクリル酸及び/又はそのエステルと、を含有する該微生物の培養物。
(15)以下の(a)〜(c)からなる群より選択される蛋白質からなる、(11)記載の酵素。
(a)配列番号50または52に示すアミノ酸配列からなる蛋白質。
(b)配列番号50または52に示すアミノ酸配列からなる蛋白質と45%以上の同一性を示すアミノ酸配列からなり、且つACD活性を有する蛋白質。
(c)配列番号50または52に示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換及び又は付加したアミノ酸配列からなり、且つACD活性を有する蛋白質。
(16)(15)の酵素を使用することを含むメタクリル酸及び/又はそのエステルの製造方法。
(17)メタクリル酸生成能を有する微生物が、スフィンゴバクテリウム(Sphingobacterium)属、コマモナス(Comamonas)属、ブレバンディモナス(Brevundimonas)属、スフィンゴモナス(Sphingomonas)属、オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属、ペドバクター(Pedobacter)属、パエニバシラス(Paenibacillus)属、アクロモバクター(Achromobacter)属、アシネトバクター(Acinetobacter)属、シュワネラ(Shewanella)属、リストネラ(Listonella)属、アグロバクテリウム(Agrobacterium)属、メソリゾビウム(Mesorhizobium)属、パラコッカス(Paracoccus)属、キサントバクター(Xanthobacter)属、ゲオバシラス(Geobacillus)属、ロドコッカス(Rhodococcus)属またはカンディダ(Candida)属に属する微生物である(1)〜(7)のいずれかの製造方法。
(3A)イソブチリル−CoAあるいは3−ヒドロキシイソブチリル−CoAからメタクリリル−CoAを製造する工程をさらに含む、(1A)または(2A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(4A)イソブチリル−CoAが2−オキソイソ吉草酸から製造されることを特徴とする、(3A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(5A)AATが植物由来である(1A)から(4A)のいずれかに記載のメタクリル酸エステルの製造方法。
(6A)植物が、ショウガ(Zingiberales)目、バラ(Rosales)目、ツツジ(Ericales)目、ウリ(Cucurbitales)目、アブラナ(Brassicales)目およびクスノキ(Laurales)目からなる群から選択されるいずれかの目に属するものである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(7A)植物が、バショウ(Musa)科、バラ(Rosales)科、ツツジ(Ericales)科、マタタビ(Actinidia)科、ウリ(Cucurbitales)科、パパイア(Carica)科およびクスノキ(Laurales)科からなる群から選択されるいずれかの科に属するものである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(8A)植物が、バショウ(Musa)属、オランダイチゴ(Fragaria)属、リンゴ(Malus)属、アンズ(Armeniaca)属、ナシ(Pyrus)属、スノキ(Vaccinium)属、マタタビ(Actinidia)属、キュウリ(Cucumis)属、パパイア(Carica)属およびワニナシ(Persea)属からなる群から選択されるいずれかの属に属するものである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(9A)植物が、バナナ、イチゴ、リンゴ、ウメ、セイヨウナシ、ブルーベリー、キウイ、メロン、パパイアおよびアボカドなる群から選択されるいずれかである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(10A)AATを発現するように遺伝子導入された遺伝子組み換え微生物を用いる(1A)〜(9A)のいずれかに記載のメタクリル酸エステルの製造方法。
(11A)植物が、バショウ属、リンゴ属、サクラ属、ナシ属、スノキ属、マタタビ属、キュウリ属、パパイア属又はワニナシ属に属する植物から選択されるいずれかである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(12A)植物が、バショウ属、リンゴ属、ナシ属、マタタビ属、キュウリ属、パパイア属又はワニナシ属に属する植物から選択されるいずれかである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(13A)植物が、バナナ、リンゴ、ウメ、セイヨウナシ、ブリーベリー、キウイ、メロン、パパイアおよびアボカドからなる群より選択されるいずれかである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(14A)植物が、バナナ、リンゴ、セイヨウナシ、キウイ、メロン、パパイアおよびアボカドからなる群より選択されるいずれかである(5A)のメタクリル酸エステルの製造方法。
(a)配列番号50または52で示すアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする遺伝子、
(b)配列番号51または53で示す塩基配列からなる遺伝子、
(c)配列番号50または52で示すアミノ酸配列からなるタンパク質と45%以上の同一性を示すアミノ酸配列からなり、且つACD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、及び
(d)配列番号50または52で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、ACD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(2B)ACD遺伝子に加え、更にBCKAD複合体遺伝子が導入された、(1B)の形質転換体。
(3B)BCKAD複合体遺伝子が、下記(e)〜(h)からなる群より選択される遺伝子である、(2B)の形質転換体。
(e)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子。
(f)配列番号55、57、59および61で示す塩基配列からなる遺伝子。
(g)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(h)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(4B)BCKAD複合体遺伝子が、下記(i)〜(l)からなる群より選択される遺伝子である、(2B)の形質転換体。
(i)配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子。
(j)配列番号63、65、67および69で示す塩基配列からなる遺伝子。
(k)配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(l)配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(5B)BCKAD複合体遺伝子が、下記(m)〜(p)からなる群より選択される遺伝子である、(2B)の形質転換体。
(m)配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列を有する3つのポリペプチドをコードする遺伝子。
(n)配列番号71、73および75で示す塩基配列からなる遺伝子。
(o)配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列を有する3つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(p)配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(6B)形質転換体が、グルコースから2−オキソイソ吉草酸の代謝経路を有する宿主に遺伝子導入されたものである、(1B)〜(5B)のいずれかの形質転換体。
(7B)更にAAT活性を有する酵素遺伝子が導入された、(1B)〜(6B)のいずれかの形質転換体。
(8B)更にメタクリリル−CoAを加水分解する活性を有する酵素遺伝子が導入された、(1B)〜(7B)のいずれかの形質転換体。
(9B)(1B)の形質転換体を使用し、ACD活性を有するタンパク質を発現させ、これを使用することを含むメタクリリル−CoAの製造方法。
(10B)(2B)〜(5B)のいずれかの形質転換体を使用して、ACD活性とイソ吉草酸脱水素酵素活性を有するタンパク質とを発現させ、これらを使用することを含むメタクリリル−CoAの製造方法。
(11B)(1B)の(a)〜(d)からなる群より選択されるACD遺伝子を宿主に導入し、前記宿主と同一または異なる宿主に、(3B)から(5B)の(e)〜(h)、(i)〜(l)及び(m)〜(p)からなる群より選択されるBCKAD複合体遺伝子を導入して、ACD活性とイソ吉草酸脱水素酵素活性を有するタンパク質とを発現させ、これらを使用することを含むメタクリリル−CoAの製造方法。
「バイオマス」とは、再生可能な、生物由来の有機性エネルギー等として利用することができる資源全般を意味する。バイオマスには、植物性材料、動物性材料及び生分解性廃棄物などが含まれる。
「炭素源」とは、微生物が同化可能であり、新しい細胞を作り出すのに使用できる有機化合物を意味する。
「エネルギー源」とは、炭素源が代謝中間体を経て細胞構成成分に同化されるために必要なエネルギー分子(ATP)を生成するための化合物全般を意味する。微生物が、ATPを生成するための代謝すなわち異化の過程に必要なエネルギー源を種々の化合物の酸化反応に求める場合、これらの化合物は「エネルギー源」となる。
「再生可能原料の利用」とは、再生可能原料から燃料成分及び各種有機物等を得るための、ガス化、液化、糖化、酵素処理、発酵、発酵産物蒸留、加水分解、脱水、濃縮及び乾燥などの各種処理工程を少なくとも1つ含む、再生可能原料の統合的利用方法を意味する。
「誘導株」とは、一般に、ある微生物株から天然に又は化学的若しくは物理的処理によって誘導される菌株である。本発明においては、特に、メタクリル酸生成能を有する微生物株から誘導され、依然として再生可能原料を炭素源及び/又はエネルギー源としてメタクリル酸を生成する能力を保持する菌株を意味する。
「水性媒体」とは、水、あるいは水を主成分とする水溶液及びゲル(寒天)を指し、溶解していない液体・固体が分散したものも含む。
「気相」とは培養槽(微生物を培養する容器)又は反応槽(反応を行う容器)において液体(培地等)が占める部分を除いた気体や水蒸気等が占める部分をいう。
「培養物」とは、菌体、培養液、無細胞抽出液、細胞膜などの培養により得られるものを意味する。無細胞抽出液は、培養後の菌体を、例えばリン酸ナトリウム緩衝液を加えてホモジナイザーなどで物理的に破砕した後、遠心(15,000rpm,10min,4℃)し、未破砕菌や細胞膜が除かれた上清を回収することにより得ることができる。
本発明に係るメタクリル酸及び/又はそのエステルの製造方法(以下、単に「メタクリル酸の製造方法」とも称する)では、炭素源及び/又はエネルギー源としての、再生可能原料及び/又は該再生可能原料の利用から生じるバイオマスから、メタクリル酸生成能を有する微生物を用いてメタクリル酸を製造する。具体的には、メタクリル酸生成能を有する微生物を再生可能原料及び/又はバイオマスと接触させる工程により、メタクリル酸を製造する。より具体的には、前記微生物を再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体中で培養することによって水性媒体中にメタクリル酸を得る。
本発明に係るメタクリル酸の製造方法で用いる微生物には、メタクリル酸生成能を有する微生物であれば特に限定されない。微生物には、例えば以下のような微生物を利用できる。微生物には、以下の微生物から選択される1種を単独で、又は2種以上を組み合わせて使用できる。
本発明に適した原核微生物として、具体的なものとして、例えば、ロドスピリルム目(Rhodospirillales)、ロドバクター目(Rhodobacterales)、スフィンゴモナス目(Sphingomonadales)、カウロバクター目(Caulobacterales)、リゾビウム目(Rhizobiales)、パルブルアーキュラ目(Parvularculales)、バークホルデリア目(Burkholderiales)、ヒドロゲノフィルス目(Hydrogenophilales)、ナイセリア目(Neisseriales)、ニトロソモナス目(Nitrosomonadales)、ロドサイクルス目(Rhodocyclales)、クロマチウム目(Chromatiales)、アシドチオバシラス目Acidithiobacillales、キサントモナス目(Xanthomonadales)、チオスリックス目(Thiotrichales)、オセアノスピリルム目(Oceanospirillales)、シュードモナス目(Pseudomonadales)、アルテロモナス目(Alteromonadales)、ビブリオ目(Vibrionales)、エアロモナス目(Aeromonadales)、サリニスファエラ目(Salinisphaerales)、レジオネラ目(Legionellales)、デスルフォバクター目(Desulfobacterales)、デスルファルクルス目(Desulfarculales)、デスルフロモナス目(Desulfuromonadales)、シントロフォバクター目(Syntrophobacterales)、デロビブリオ目(Bdellovibrionales)、ミクソコックス目(Myxococcales)、アシドバクテリウム目(Acidobacteriales)、アクチノバクテリア目(Actinomycetales)、ビフィドバクテリウム目(Bifidobacteriales)、ルブロバクター目(Rubrobacterales)、ソリルブロバクター目(Solirubrobacterales)、バシラス目(Bacillales)、ラクトバシラス目(Lactobacillales)、クロストリジウム目(Clostridiales)、サーモアナエロバクター目(Thermoanaerobacterales)、ナトロアナエロビウス目(Natranaerobiales)、スフィンゴバクテリア目(Sphingobacteriales)、バクテロイデス目(Bacteroidales)、サイトファガ目(Cytophagales)、フラボバクテリウム目(Flavobacteriales)、デイノコッカス目(Deinococcales)、サーマス目(Thermales)、ゲマティモナス目(Gemmatimonadales)、フソバクテリア目(Fusobacteriales)、クロロフレクサス目(Chloroflexales)、ヘルペトシフォン目(Herpetosiphonales)、サーモミクロビア目(Thermomicrobiales)、サーモトーガ目(Thermotogales)、デフェリバクター目(Deferribacterales)、スルフォロブス目(Sulfolobales)、デスルフロコックス目(Desulfurococcales)、サーモプロテウス目(Thermoproteales)、アキディロブス目(Acidilobales)、ハロバクテリウム目(Halobacteriales)、サーモプラズマ目(Thermoplasmatales)およびアーケオグロブス目(Archaeoglobales)に属する微生物が挙げられる。
ロドスピリルム目(Rhodospirillales)に属するものとしてはロドスピリルム科(Rhodospirillaceae)およびアセトバクター科(Acetobacteraceae)、ロドバクター目(Rhodobacterales)に属するものとしてはロドバクター科(Rhodobacteraceae)およびヒフォモナス科(Hyphomonadaceae)、スフィンゴモナス目(Sphingomonadales)に属するものとしてはスフィンゴモナス科(Sphingomonadaceae)およびエリスロバクター科(Erythrobacteraceae)、カウロバクター目(Caulobacterales)に属するものとしてはカウロバクター科(Caulobacteraceae)、リゾビウム目(Rhizobiales)に属するものとしてはリゾビウム科(Rhizobiaceae)、キサントバクター科(Xanthobacteraceae)、ブルセラ科(Brucellaceae)、フィロバクテリウム科(Phyllobacteriaceae)、アウランチモナス科(Aurantimonadaceae)、ブラディリゾビウム科(Bradyrhizobiaceae)、メチロバクテリウム科(Methylobacteriaceae)、ヒフォミクロビウム科(Hyphomicrobiaceae)、ロドビウム科(Rhodobiaceae)およびメチロシスティス科(Methylocystaceae)、パルブルアーキュラ目(Parvularculales)に属するものとしてはパルブルアーキュラ科(Parvularculaceae)、バークホルデリア目(Burkholderiales)に属するものとしてはバークホルデリア科(Burkholderiaceae)、アルカリゲネス科(Alcaligenaceae)、コマモナス科(Comamonadaceae)およびオキサロバクター科(Oxalobacteraceae)、ヒドロゲノフィルス目(Hydrogenophilales)に属するものとしてはヒドロゲノフィルス科(Hydrogenophilaceae)、ナイセリア目(Neisseriales)に属するものとしてはナイセリア科(Neisseriaceae)、ニトロソモナス目(Nitrosomonadales)に属するものとしてはニトロソモナス科(Nitrosomonadaceae)、ロドサイクルス目(Rhodocyclales)に属するものとしてはロドサイクルス科(Rhodocyclaceae)、クロマチウム目(Chromatiales))に属するものとしてはクロマチウム科(Chromatiaceae)およびエクトチオロドスピラ科(Ectothiorhodospiraceae)、アシドチオバシラス目(Acidithiobacillales)に属するものとしてはアシドチオバシラス科(Acidithiobacillaceae)、キサントモナス目(Xanthomonadales)に属するものとしてはキサントモナス科(Xanthomonadaceae)、チオスリックス目(Thiotrichales)に属するものとしてはフランシセラ科(Francisellaceae)およびピスキリケッチア科(Piscirickettsiaceae)、オセアノスピリルム目(Oceanospirillales)に属するものとしてはオセアノスピリルム科(Oceanospirillaceae)、ハヘラ科(Hahellaceae)、ハロモナス科(Halomonadaceae)およびアルカニヴォラックス科(Alcanivoracaceae)、シュードモナス目(Pseudomonadales)に属するものとしてはシュードモナス科(Pseudomonadaceae)およびモラクセラ科(Moraxellaceae)、アルテロモナス目(Alteromonadales)に属するものとしてはアルテロモナス科(Alteromonadaceae)、シェワネラ科(Shewanellaceae)、フェリモナス科(Ferrimonadaceae)、イディオマリナ科(Idiomarinaceae)、コルウェリア科(Colwelliaceae)およびシュードアルテロモナス科(Pseudoalteromonadaceae)、ビブリオ目(Vibrionales)に属するものとしてはビブリオ科(Vibrionaceae)、エアロモナス目(Aeromonadales)に属するものとしてはエロモナス科(Aeromonadaceae)、サリニスファエラ目(Salinisphaerales)に属するものとしてはサリニスファエラ科(Salinisphaeraceae)、レジオネラ目(Legionellales)に属するものとしてはレジオネラ科(Legionellaceae)およびコクシエラ科(Coxiellaceae)、デスルフォバクター目(Desulfobacterales)に属するものとしてはデスルフォバルブス科(Desulfobulbaceae)、デスルファルクルス目(Desulfarculales)に属するものとしてはデスルファルクルス科(Desulfarculaceae)、デスルフロモナス目(Desulfuromonadales)に属するものとしてはゲオバクター科(Geobacteraceae)、シントロフォバクター目(Syntrophobacterales)に属するものとしてはシントロフォバクター科 (Syntrophobacteraceae)およびシントロファス科(Syntrophaceae)、デロビブリオ目(Bdellovibrionales)に属するものとしてはデロビブリオ科(Bdellovibrionaceae)およびバクテリオヴォラックス科(Bacteriovoracaceae)、ミクソコックス目(Myxococcales)に属するものとしてはシストバクター科(Cystobacteraceae)、ミクソコックス科(Myxococcaceae)、ポリアンギウム科(Polyangiaceae)およびコフレリア科(Kofleriaceae)、アシドバクテリウム目(Acidobacteriales)に属するものとしてはアシドバクテリウム科(Acidobacteriaceae)、アシディミクロビウム目(Acidimicrobiales)に属するものとしてはアシディミクロビウム科(Acidimicrobiaceae)、アクチノバクテリア目(Actinomycetales)に属するものとしてはストレプトスポランギウム科(Streptosporangiaceae)、ノカルジオプシス科(Nocardiopsaceae)、サーモモノスポラ科(Thermomonosporaceae)、シュードノカルディア科(Pseudonocardiaceae)、アクチノシンネーマ科(Actinosynnemataceae)、ミクロモノスポラ科(Micromonosporaceae)、アクチノポリスポラ科(Actinopolysporaceae)、プロピオニバクテリウム科(Propionibacteriaceae)、ノカルジオイデス科(Nocardioidaceae)、コリネバクテリウム科(Corynebacteriaceae)、ノカルディア科(Nocardiaceae)、ゴルドニア科(Gordoniaceae)、デイエッチア科(Dietziaceae)、マイコバクテリウム科(Mycobacteriaceae)、ツカムレラ科(Tsukamurellaceae)セグニリパラス科(Segniliparaceae)、ミクロバクテリウム科(Microbacteriaceae)、マイクロコッカス科(Micrococcaceae)、デルマバクター科(Dermabacteraceae)、デルマトフィラス科(Dermatophilaceae)、ブレビバクテリウム科(Brevibacteriaceae)、セルロモナス科(Cellulomonadaceae)、イントラスポランギウム科(Intrasporangiaceae)、ヨネシア科(Jonesiaceae)、ラロバクター科(Rarobacteraceae)、フランキア科(Frankiaceae)、アシドサーマス科(Acidothermaceae)、ナカムラエラ科(Nakamurellaceae)、クリプトスポランギウム科(Cryptosporangiaceae)、ゲオデルマトフィラス科(Geodermatophilaceae)、グリコミセス科(Glycomycetaceae)、アクチノマイセス科Actinomycetaceae)、ストレプトマイセス科(Streptomycetaceae)、カテニュリスポラ科(Catenulisporaceae)およびキネオスポリア科(Kineosporiaceae)、ビフィドバクテリウム目(Bifidobacteriales)に属するものとしてはビフィドバクテリウム科(Bifidobacteriaceae)、ルブロバクター目(Rubrobacterales)に属するものとしてはルブロバクター科(Rubrobacteraceae)、ソリルブロバクター目(Solirubrobacterales)に属するものとしてはコネクシバクター科(Conexibacteraceae)、バシラス目(Bacillales)に属するものとしてはバシラス科(Bacillaceae)、アリシクロバシラス科(Alicyclobacillaceae)、パエニバシラス科(Paenibacillaceae)、プラノコッカス科(Planococcaceae)、スポロラクトバシラス科(Sporolactobacillaceae)およびサーモアクチノミセス科(Thermoactinomycetaceae)、ラクトバシラス目(Lactobacillales)に属するものとしてはラクトバシラス科(Lactobacillaceae)、ロイコノストック科(Leuconostocaceae)、アエロコッカス科(Aerococcaceae)、カルノバクテリウム科(Carnobacteriaceae)およびストレプトコッカス科(Streptococcaceae)、クロストリジウム目(Clostridiales)に属するものとしてはクロストリジウム科(Clostridiaceae)、シントロフォモナス科(Syntrophomonadaceae)、ユウバクテリウム科(Eubacteriaceae)、ペプトコッカス科(Peptococcaceae)、ペプトストレプトコッカス科(Peptostreptococcaceae)、ラクノスピラ科(Lachnospiraceae)およびオシロスピラ科(Oscillospiraceae)、サーモアナエロバクター目(Thermoanaerobacterales)に属するものとしてはサーモアナエロバクター科(Thermoanaerobacteraceae)、ナトロアナエロビウス目(Natranaerobiales)に属するものとしてはナトロアナエロビウス科(Natranaerobiaceae)、スフィンゴバクテリア目(Sphingobacteriales)に属するものとしてはスフィンゴバクテリウム科(Sphingobacteriaceae)およびサプロスピラ科(Saprospiraceae)、バクテロイデス目(Bacteroidales)に属するものとしてはバクテロイデス科(Bacteroidaceae)、マリニラビリア科(Marinilabiliaceae)、プレボテラ科(Prevotellaceae)およびポルフィロモナス科(Porphyromonadaceae)、サイトファガ目(Cytophagales)に属するものとしてはサイトファガ科(Cytophagaceae)およびフラモヴァーガ科(Flammeovirgaceae)、フラボバクテリウム目(Flavobacteriales)に属するものとしてはフラボバクテリウム科(Flavobacteriaceae)、デイノコッカス目(Deinococcales)に属するものとしてはデイノコッカス科(Deinococcaceae)、サーマス目(Thermales)に属するものとしてはサーマス科(Thermaceae)、ゲマティモナス目(Gemmatimonadales)に属するものとしてはゲマティモナス科(Gemmatimonadaceae)、フソバクテリア目(Fusobacteriales)に属するものとしてはフソバクテリア科(Fusobacteriaceae)、クロロフレクサス目(Chloroflexales)に属するものとしてはクロロフレクサス科(Chloroflexaceae)、ヘルペトシフォン目(Herpetosiphonales)に属するものとしてはヘルペトシフォン科(Herpetosiphonaceae)、サーモミクロビア目(Thermomicrobiales)に属するものとしてはサーモミクロビア科(Thermomicrobiaceae)、サーモトーガ目(Thermotogales)に属するものとしてはサーモトーガ科(Thermotogaceae)、デフェリバクター目(Deferribacterales)に属するものとしてはデフェリバクター科(Deferribacteraceae)、スルフォロブス目(Sulfolobales)に属するものとしてはスルフォロブス科(Sulfolobaceae)、デスルフロコックス目(Desulfurococcales)に属するものとしてはデスルフロコッカス科(Desulfurococcaceae)、サーモプロテウス目(Thermoproteales)に属するものとしてはサーモプロテウス科(Thermoproteaceae)、アキディロブス目(Acidilobales)に属するものとしてはアキディロブス科(Acidilobaceae)、ハロバクテリウム目(Halobacteriales)に属するものとしてはハロバクテリウム科(Halobacteriaceae)、サーモプラズマ目(Thermoplasmatales)に属するものとしてはサーモプラズマ科(Thermoplasmataceae)、ピクロフィルス科(Picrophilaceae)およびフェロプラズマ科(Ferroplasmaceae)、アーケオグロブス目(Archaeoglobales)に属するものとしてはアーケオグロブス科(Archaeoglobaceae)が挙げられる。
ロドスピリルム科(Rhodospirillaceae)に属するものとしてはMagnetospirillum属、Rhodospirillum属、Azospirillum属およびTistrella属、アセトバクター科(Acetobacteraceae)に属するものとしてはAcetobacter属、Acidiphilium属およびGluconacetobacter属、ロドバクター科(Rhodobacteraceae)に属するものとしてはRhodobacter属、Paracoccus属、Ruegeria属、Jannaschia属、Roseobacter属、Dinoroseobacter属、Pseudovibrio属、Phaeobacter属、Octadecabacter属およびAhrensia属、ヒフォモナス科(Hyphomonadaceae)に属するものとしてはHyphomonas属、Maricaulis属、Hirschia属、スフィンゴモナス科(Sphingomonadaceae)に属するものとしてはSphingomonas属、Novosphingobium属、Sphingopyxis属、Sphingobium属、Lutibacterium属およびZymomonas属、エリスロバクター科(Erythrobacteraceae)に属するものとしてはErythrobacter属、カウロバクター科(Caulobacteraceae)に属するものとしてはBrevundimonas属、Caulobacter属、Phenylobacterium属およびAsticcacaulis属、リゾビウム科(Rhizobiaceae)に属するものとしてはAgrobacterium属、Rhizobium属およびSinorhizobium属、キサントバクター科(Xanthobacteraceae)に属するものとしてはXanthobacter属およびAzorhizobium属、ブルセラ科(Brucellaceae)に属するものとしてはBrucella属およびOchrobactrum属、フィロバクテリウム科(Phyllobacteriaceae)に属するものとしてはMesorhizobium属およびChelativorans属、アウランチモナス科(Aurantimonadaceae)に属するものとしてはAurantimonas属、ブラディリゾビウム科(Bradyrhizobiaceae)に属するものとしてはBradyrhizobium属、Agromonas属、Rhodopseudomonas属およびNitrobacter属、メチロバクテリウム科(Methylobacteriaceae)に属するものとしてはMethylobacterium属、ヒフォミクロビウム科(Hyphomicrobiaceae)に属するものとしてはHyphomicrobium属、Rhodomicrobium属およびPelagibacterium属、ロドビウム科(Rhodobiaceae)に属するものとしてはParvibaculum属、メチロシスティス科(Methylocystaceae)に属するものとしてはMethylocystis属、パルブルアーキュラ科(Parvularculaceae)に属するものとしてはParvularcula属、バークホルデリア科(Burkholderiaceae)に属するものとしてはBurkholderia属、Ralstonia属、Cupriavidus属および、Polynucleobacter属、アルカリゲネス科(Alcaligenaceae)に属するものとしてはAchromobacter属、Alcaligenes属、Bordetella属、Taylorella属、Pusillimonas属およびOligella属、コマモナス科(Comamonadaceae)に属するものとしてはComamonas属、Alicycliphilus属、Delftia属、Ramlibacter属、Rhodoferax属、Variovorax属、Polaromonas属、Acidovorax属およびVerminephrobacter属、オキサロバクター科(Oxalobacteraceae)に属するものとしてはHerminiimonas属、Herbaspirillum属およびCollimonas属、ヒドロゲノフィルス科(Hydrogenophilaceae)に属するものとしてはHydrogenophilus属およびThiobacillus属、ナイセリア科(Neisseriaceae)に属するものとしてはChromobacterium属、Laribacter属およびPseudogulbenkiania属、ニトロソモナス科(Nitrosomonadaceae)に属するものとしてはNitrosomonas属およびNitrosospira属、ロドサイクルス科(Rhodocyclaceae)に属するものとしてはAromatoleum属、Azoarcus属、Dechloromonas属、Thauera属およびAzospira(Dechlorosoma)属、クロマチウム科(Chromatiaceae)に属するものとしてはRheinheimera属、Thiosphaera属およびNitrosococcus属、エクトチオロドスピラ科(Ectothiorhodospiraceae)に属するものとしてはHalorhodospira属、アシドチオバシラス科(Acidithiobacillaceae)に属するものとしてはAcidithiobacillus属、キサントモナス科に属するものとしてはXanthomonas属、Stenotrophomonas属、Pseudoxanthomonas属およびRhodanobacter属、フランシセラ科(Francisellaceae)に属するものとしてはFrancisella属、ピスキリケッチア科(Piscirickettsiaceae)に属するものとしてはCycloclasticus属、オセアノスピリルム科(Oceanospirillaceae)に属するものとしてはOceanospirillum属およびMarinospirillum属、ハヘラ科(Hahellaceae)に属するものとしてはHahella属、ハロモナス科(Halomonadaceae)に属するものとしてはHalomonas属、アルカニヴォラックス科(Alcanivoracaceae)に属するものとしてはAlcanivorax属およびKangiella属、シュードモナス科(Pseudomonadaceae)に属するものとしてはPseudomonas属およびAzotobacter属、モラクセラ科(Moraxellaceae)に属するものとしてはAcinetobacter属およびPsychrobacter属、アルテロモナス科(Alteromonadaceae)に属するものとしてはAlishewanella属、Alteromonas属、Glaciecola属、Marinobacter属、Marinobacterium属およびSaccharophagus属、シェワネラ科(Shewanellaceae)に属するものとしてはShewanella属、フェリモナス科(Ferrimonadaceae)に属するものとしてはFerrimonas属、イディオマリナ科(Idiomarinaceae)に属するものとしてはIdiomarina属、コルウェリア科(Colwelliaceae)に属するものとしてはColwellia属、シュードアルテロモナス科(Pseudoalteromonadaceae)に属するものとしてはPseudoalteromonas属、ビブリオ科(Vibrionaceae)に属するものとしてはListonella属、Vibrio属およびPhotobacterium属、エロモナス科(Aeromonadaceae)に属するものとしてはAeromonas属およびOceanimonas属、サリニスファエラ科(Salinisphaeraceae)に属するものとしてはSalinisphaera属、レジオネラ科(Legionellaceae)に属するものとしてはLegionella属、コクシエラ科(Coxiellaceae)に属するものとしてはCoxiella属、デスルフォバルブス科(Desulfobulbaceae)に属するものとしてはDesulfococcus属、Desulfobacterium属およびDesulfatibacillum属、デスルファルクルス科(Desulfarculaceae)に属するものとしてはDesulfobulbus属およびDesulfarculus属、ゲオバクター科(Geobacteraceae)に属するものとしてはGeobacter属、シントロフォバクター科(Syntrophobacteraceae)に属するものとしてはSyntrophobacter属、シントロファス科(Syntrophaceae)に属するものとしてはSyntrophus属およびDesulfomonile属、デロビブリオ科(Bdellovibrionaceae)に属するものとしてはBdellovibrio属、バクテリオヴォラックス科(Bacteriovoracaceae)に属するものとしてはBacteriovorax属、シストバクター科(Cystobacteraceae)に属するものとしてはStigmatella属、ミクソコックス科(Myxococcaceae)に属するものとしてはMyxococcus属およびAnaeromyxobacter属、ポリアンギウム科(Polyangiaceae)に属するものとしてはSorangium属、コフレリア科(Kofleriaceae)に属するものとしてはHaliangium属、アシドバクテリウム科(Acidobacteriaceae)に属するものとしてはAcidobacterium属およびGranulicella属、アシディミクロビウム科(Acidimicrobiaceae)に属するものとしてはIlumatobacter属、ストレプトスポランギウム科(Streptosporangiaceae)に属するものとしてはStreptosporangium属、Acrocarpospora属、Herbidospora属、Microbispora属、Nonomuraea属、Planobispora属およびPlanomonospora属、ノカルジオプシス科(Nocardiopsaceae)に属するものとしてはNocardiopsis属およびThermobifida属、サーモモノスポラ科(Thermomonosporaceae)に属するものとしてはActinocorallia属、Actinomadura属およびThermomonospora属、シュードノカルディア科(Pseudonocardiaceae)に属するものとしてはPseudonocardia属、Actinoalloteichus属、Amycolatopsis属、Kibdelosporangium属、Saccharomonospora属、Saccharopolyspora属、Saccharothrix属、Streptoalloteichus属、Thermobispora属およびThermocrispum属、アクチノシンネーマ科(Actinosynnemataceae)に属するものとしてはActinokineospora属およびActinosynnema属、ミクロモノスポラ科(Micromonosporaceae)に属するものとしてはMicromonospora属、Actinoplanes属、Catellatospora属、Couchioplanes属、Dactylosporangium属、Pilimelia属、Salinispora属およびVerrucosispora属、アクチノポリスポラ科(Actinopolysporaceae)に属するものとしてはActinopolyspora属、プロピオニバクテリウム科(Propionibacteriaceae)に属するものとしてはPropionibacterium属およびLuteococcus属、ノカルジオイデス科(Nocardioidaceae)に属するものとしてはNocardioides属、Aeromicrobium属、Kribbella属およびPimelobacter属、コリネバクテリウム科(Corynebacteriaceae)に属するものとしてはCorynebacterium属、ノカルディア科(Nocardiaceae)に属するものとしてはNocardia属およびRhodococcus属、ゴルドニア科(Gordoniaceae)に属するものとしてはGordonia属、デイエッチア科(Dietziaceae)に属するものとしてはDietzia属、マイコバクテリウム科(Mycobacteriaceae)に属するものとしてはMycobacterium属およびAmycolicicoccus属、ツカムレラ科(Tsukamurellaceae)に属するものとしてはTsukamurella属、セグニリパラス科(Segniliparaceae)に属するものとしてはSegniliparus属、ミクロバクテリウム科(Microbacteriaceae)に属するものとしてはMicrobacterium属、Agromyces属、Clavibacter属、Curtobacterium属およびRathayibacter属、マイクロコッカス科(Micrococcaceae)に属するものとしてはMicrococcus属、Arthrobacter属、Citricoccus属、Renibacterium属、Kocuria属およびRothia属、デルマバクター科(Dermabacteraceae)に属するものとしてはBrachybacterium属、Dermacoccus属、Demetria属およびKytococcus属、デルマトフィラス科(Dermatophilaceae)に属するものとしてはDermatophilus属、ブレビバクテリウム科(Brevibacteriaceae)に属するものとしてはBrevibacterium属、セルロモナス科(Cellulomonadaceae)に属するものとしてはCellulomonas属およびOerskovia属、イントラスポランギウム科(Intrasporangiaceae)に属するものとしてはIntrasporangium属、Janibacter属、Terrabacter属およびSerinicoccus属、ヨネシア科(Jonesiaceae)に属するものとしてはJonesia属、ラロバクター科(Rarobacteraceae)に属するものとしてはRarobacter属、フランキア科(Frankiaceae)に属するものとしてはFrankia属、アシドサーマス科(Acidothermaceae)に属するものとしてはAcidothermus属、ナカムラエラ科(Nakamurellaceae)に属するものとしてはNakamurella属、クリプトスポランギウム科(Cryptosporangiaceae)に属するものとしてはCryptosporangium属、ゲオデルマトフィラス科(Geodermatophilaceae)に属するものとしてはGeodermatophilus属、グリコミセス科(Glycomycetaceae)に属するものとしてはGlycomyces属およびStackebrandtia属、アクチノマイセス科Actinomycetaceae)に属するものとしてはArcanobacterium属、ストレプトマイセス科(Streptomycetaceae)に属するものとしてはStreptomyces属およびKitasatospora属、カテニュリスポラ科(Catenulisporaceae)に属するものとしてはCatenulispora属、キネオスポリア科(Kineosporiaceae)に属するものとしてはKineosporia属およびKineococcus属、ビフィドバクテリウム科(Bifidobacteriaceae)に属するものとしてはBifidobacterium属、ルブロバクター科(Rubrobacteraceae)に属するものとしてはRubrobacter属、コネクシバクター科(Conexibacteraceae)に属するものとしてはConexibacter属、バシラス科(Bacillaceae)に属するものとしてはBacillus属、Geobacillus属、Oceanobacillus属、Lysinibacillus属およびHalobacillus属、アリシクロバシラス科(Alicyclobacillaceae)に属するものとしてはAlicyclobacillus属およびKyrpidia属、パエニバシラス科(Paenibacillaceae)に属するものとしてはPaenibacillus属およびBrevibacillus属、プラノコッカス科(Planococcaceae)に属するものとしてはPlanococcus属およびKurthia属、スポロラクトバシラス科(Sporolactobacillaceae)に属するものとしてはSporolactobacillus属、サーモアクチノミセス科(Thermoactinomycetaceae)に属するものとしてはThermoactinomyces属、ラクトバ
シラス科(Lactobacillaceae)に属するものとしてはLactobacillus属およびPediococcus属、ロイコノストック科(Leuconostocaceae)に属するものとしてはLeuconostoc属およびWeissella属、アエロコッカス科(Aerococcaceae)に属するものとしてはAerococcus属およびGlobicatella属、カルノバクテリウム科(Carnobacteriaceae)に属するものとしてはAlloiococcus属およびCarnobacterium属、ストレプトコッカス科(Streptococcaceae)に属するものとしてはStreptococcus属、クロストリジウム科(Clostridiaceae)に属するものとしてはClostridium属およびAlkaliphilus属、シントロフォモナス科(Syntrophomonadaceae)に属するものとしてはSyntrophomonas属およびSyntrophothermus属、ユウバクテリウム科(Eubacteriaceae)に属するものとしてはEubacterium属、ペプトコッカス科(Peptococcaceae)に属するものとしてはPeptococcus属、Desulfitobacterium属、Desulfotomaculum属およびPelotomaculum属、ペプトストレプトコッカス科(Peptostreptococcaceae)に属するものとしてはPeptostreptococcus属、ラクノスピラ科(Lachnospiraceae)に属するものとしてはButyrivibrio属およびRoseburia属、オシロスピラ科(Oscillospiraceae)に属するものとしてはOscillibacter属、サーモアナエロバクター科(Thermoanaerobacteraceae)に属するものとしてはThermoanaerobacter属およびCarboxydothermus属、ナトロアナエロビウス科(Natranaerobiaceae)に属するものとしてはNatranaerobius属、スフィンゴバクテリウム科(Sphingobacteriaceae)に属するものとしてはSphingobacterium属、Pedobacter属およびMucilaginibacter属、サプロスピラ科(Saprospiraceae)に属するものとしてはHaliscomenobacter属、バクテロイデス科(Bacteroidaceae)に属するものとしてはBacteroides属、マリニラビリア科(Marinilabiliaceae)に属するものとしてはMarinilabilia属、プレボテラ科(Prevotellaceae)に属するものとしてはPrevotella属、ポルフィロモナス科(Porphyromonadaceae)に属するものとしてはPorphyromonas属およびOdoribacter属、サイトファガ科(Cytophagaceae)に属するものとしてはFlexibacter属、Spirosoma属およびRunella属、フラモヴァーガ科(Flammeovirgaceae)に属するものとしてはFlammeovirga属、フラボバクテリウム科(Flavobacteriaceae)に属するものとしてはFlavobacterium属、Chryseobacterium属およびMaribacter属、デイノコッカス科(Deinococcaceae)に属するものとしてはDeinococcus属、サーマス科(Thermaceae)に属するものとしてはThermus属、Meiothermus属、Oceanithermus属およびMarinithermus属、ゲマティモナス科(Gemmatimonadaceae)に属するものとしてはGemmatimonas属、フソバクテリア科(Fusobacteriaceae)に属するものとしてはFusobacterium属およびIlyobacter属、クロロフレクサス科(Chloroflexaceae)に属するものとしてはRoseiflexus属、ヘルペトシフォン科(Herpetosiphonaceae)に属するものとしてはHerpetosiphon属、サーモミクロビア科(Thermomicrobiaceae)に属するものとしてはThermomicrobium属、サーモトーガ科(Thermotogaceae)に属するものとしてはThermotoga属、Thermosipho属およびFervidobacterium属、デフェリバクター科(Deferribacteraceae)に属するものとしてはDeferribacter属、Calditerrivibrio属およびFlexistipes属、スルフォロブス科(Sulfolobaceae)に属するものとしてはMetallosphaera属およびAcidianus属、デスルフロコッカス科(Desulfurococcaceae)に属するものとしてはAeropyrum属、サーモプロテウス科(Thermoproteaceae)に属するものとしてはPyrobaculum属、Caldivirga属およびVulcanisaeta属、アキディロブス科(Acidilobaceae)に属するものとしてはAcidilobus属、ハロバクテリウム科(Halobacteriaceae)に属するものとしてはHalobacterium属、Halococcus属、Haloarcula属、Haloquadratum属、Natronomonas属、Halorubrum属、Haloterrigena属、Natrialba属、Halalkalicoccus属およびHalogeometricum属、サーモプラズマ科(Thermoplasmataceae)に属するものとしてはThermoplasma属、ピクロフィルス科(Picrophilaceae)に属するものとしてはPicrophilus属、フェロプラズマ科(Ferroplasmaceae)に属するものとしてはFerroplasma属、アーケオグロブス科(Archaeoglobaceae)に属するものとしてはArchaeoglobus属およびFerroglobus属が挙げられる。さらに、分類上の目の定まらない微生物としてPolymorphum属、Micavibrio属、Simiduia属、Leptothrix属、Thiomonas属、Rubrivivax属およびMethylibium属が、バシラス目(Bacillales)に属し分類上の科の定まらない微生物としてExiguobacterium属、クロストリジウム目(Clostridiales)に属し分類上の科の定まらない微生物としてAnaerococcus属が挙げられる。
〔シュードモナス属〕
シュードモナス(Pseudomonas)属に分類される微生物としては、例えば、シュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)、シュードモナス・アガリシ(Pseudomonas agarici)、シュードモナス・アルカリゲネス(Pseudomonas alcaligenes)、シュードモナス・アミグダレ(Pseudomonas amygdale)、シュードモナス・アングイリセプチカ(Pseudomonas anguiliseptica)、シュードモナス・アンチミクロビカ(Pseudomonas antimicrobica)、シュードモナス・アスプレニ(Pseudomonas aspleni)、シュードモナス・オーランチアカ(Pseudomonas aurantiaca)、シュードモナス・オーレオファシエンス(Pseudomonas aureofaciens)、シュードモナス・アベラナエ(Pseudomonas avellanae)、シュードモナス・アゾトフォルマンス(Pseudomonas azotoformans)、シュードモナス・バレアリカ(Pseudomonas balearica)、シュードモナス・ベイジェリンスキイ(Pseudomonas beijerinsckii)、シュードモナス・ベテリ(Pseudomonas beteli)、シュードモナス・ボレオポリス(Pseudomonas boreopolis)、シュードモナス・カルボキシヒドロゲナ(Pseudomonas carboxyhydrogena)、シュードモナス・カリカパパヤエ(Pseudomonas caricapapayae)、シュードモナス・シコリイ(Pseudomonas cichorii)、シュードモナス・シッシコラ(Pseudomonas cissicola)、シュードモナス・シトロネロリス(Pseudomonas citronellolis)、シュードモナス・コロナファシエンス(Pseudomonas coronafaciens)、シュードモナス・コルガテ(Pseudomonas corrugate)、シュードモナス・ドゥードロフィイ(Pseudomonas doudoroffii)、シュードモナス・エキノイズス(Pseudomonas echinoids)、シュードモナス・エロンガテ(Pseudomonas elongate)、シュードモナス・フィクセレクタエ(Pseudomonas ficuserectae)、シュードモナス・フラベッセンス(Pseudomonas flavescens)、シュードモナス・フレクテンス(Pseudomonas flectens)、シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens)、シュードモナス・フラギ(Pseudomonas fragi)、シュードモナス・フルバ(Pseudomonas fulva)、シュードモナス・フスコバギナエ(Pseudomonas fuscovaginae)、シュードモナス・ゲリディコラ(Pseudomonas gelidicola)、シュードモナス・ゲニクラタ(Pseudomonas geniculata)、シュードモナス・グラテイ(Pseudomonas glathei)、シュードモナス・ハロフィラ(Pseudomonas halophila)、シュードモナス・ヒビシコラ(Pseudomonas hibiscicola)、シュードモナス・フッチエンシス(Pseudomonas huttiensis)、シュードモナス・イネルス(Pseudomonas iners)、シュードモナス・ランセロタ(Pseudomonas lancelota)、シュードモナス・レモイグネイ(Pseudomonas lemoignei)、シュードモナス・ルンデンシス(Pseudomonas lundensis)、シュードモナス・ルテオラ(Pseudomonas luteola)、シュードモナス・マルギナリス(Pseudomonas marginalis)、シュードモナス・メリアエ(Pseudomonas meliae)、シュードモナス・メンドシナ(Pseudomonas mendocina)、シュードモナス・ムシドレンス(Pseudomonas mucidolens)、シュードモナス・モンテイリ(Pseudomonas monteilli)、シュードモナス・ナウチカ(Pseudomonas nautica)、シュードモナス・ニトロレデュセンス(Pseudomonas nitroreducens)、シュードモナス・オレオボランス(Pseudomonas oleovorans)、シュードモナス・オリジハビタンス(Pseudomonas oryzihabitans) 、シュードモナス・パーツシノゲナ(Pseudomonas pertucinogena)、シュードモナス・フェナジニウム(Pseudomonas phenazinium)、シュードモナス・ピクトルム(Pseudomonas pictorum)、シュードモナス・シュードアルカリゲネス(Pseudomonas pseudoalcaligenes)、シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida)、シュードモナス・ピロシニア(Pseudomonas pyrrocinia)、シュードモナス・レシノボランス(Pseudomonas resinovorans)、シュードモナス・ローデシアエ(Pseudomonas rhodesiae)、シュードモナス・サッカロフィラ(Pseudomonas saccharophila)、シュードモナス・サバスタノイ(Pseudomonas savastanoi)、シュードモナス・スピノサ(Pseudomonas spinosa)、シュードモナス・スタニエリ(Pseudomonas stanieri)、シュードモナス・ストラミナエ(Pseudomonas straminae)、シュードモナス・スツッツェリ(Pseudomonas stutzeri)、シュードモナス・シンキサンタ(Pseudomonas synxantha)、シュードモナス・シリンガエ(Pseudomonas syringae)、シュードモナス・シジギイ(Pseudomonas syzygii)、シュードモナス・タエロレンス(Pseudomonas taetrolens)、シュードモナス・トラアシイ(Pseudomonas tolaasii)、シュードモナス・ベロニイ(Pseudomonas veronii)、シュードモナス・ビリディフラバ(Pseudomonas viridiflava)、シュードモナス・ブルガリス(Pseudomonas vulgaris)、シュードモナス・ウィスコンシエンシス(Pseudomonas wisconsinensis)等が挙げられる。
バシラス属(Bacillus)に分類される微生物としては、例えば、バシラス・セレウス(Bacillus cereus)、バシラス・サブティリス(Bacillus subtilis)、バシラス・チューリンゲンシス(Bacillus thuringiensis)、バシラス・アシディセラー(Bacillus acidiceler)、バシラス・アシディコーラ(Bacillus acidicola)、バシラス・アエオリウス(Bacillus aeolius)、バシラス・アエリウス(Bacillus aerius)、バシラス・アエロフィルス(Bacillus aerophilus)、バシラス・アガラドヘレンス(Bacillus agaradhaerens)、バシラス・アキバイ(Bacillus akibai)、バシラス・アルカリフィルス(Bacillus alcalophilus)、バシラス・アルギコーラ(Bacillus algicola)、バシラス・アルカリジアゾトロフィカス(Bacillus alkalidiazotrophicus)、バシラス・アルカリテルリス(Bacillus alkalitelluris)、バシラス・アルティチュジニス(Bacillus altitudinis)、バシラス・アルベアユエンシス(Bacillus alveayuensis)、バシラス・アミロリクエファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)、バシラス・アンスラシス(Bacillus anthracis)、バシラス・アクイマリス(Bacillus aquimaris)、バシラス・アレノシイ(Bacillus arenosi)、バシラス・アルセニシセレナティス(Bacillus arseniciselenatis)、バシラス・アルセニカス(Bacillus arsenicus)、バシラス・アーヴァイ(Bacillus arvi)、バシラス・アサヒイ(Bacillus asahii)、バシラス・アトロファエウス(Bacillus atrophaeus)、バシラス・アウランティアカス(Bacillus aurantiacus)、バシラス・アキサクィエンシス(Bacillus axarquiensis)、バシラス・アゾトフォーマンス(Bacillus azotoformans)、バシラス・バディウス(Bacillus badius)、バシラス・バーバリカス(Bacillus barbaricus)、バシラス・バタビエンシス(Bacillus bataviensis)、バシラス・ベンゾボランス(Bacillus benzoevorans)、バシラス・ボゴリエンシス(Bacillus bogoriensis)、バシラス・ボロニフィルス(Bacillus boroniphilus)、バシラス・ブタノリボランス(Bacillus butanolivorans)、バシラス・カーボニフィルス(Bacillus carboniphilus)、バシラス・セセンベンシス(Bacillus cecembensis)、バシラス・セルロシリティカス(Bacillus cellulosilyticus)、バシラス・チャガノレンシス(Bacillus chagannorensis)、バシラス・シービー(Bacillus cibi)、バシラス・サーキュランス(Bacillus circulans)、バシラス・クラーキー(Bacillus clarkii)、バシラス・クラウシー(Bacillus clausii)、バシラス・コアギュランス(Bacillus coagulans)、バシラス・コアウイレンシス(Bacillus coahuilensis)、バシラス・コーニー(Bacillus cohnii)、バシラス・デシシフロンディス(Bacillus decisifrondis)、バシラス・デコロラチオニス(Bacillusdecolorationis)、バシラス・ドレンテンシス(Bacillus drentensis)、バシラス・エダフィカス(Bacillus edaphicus)、バシラス・エンドフィティカス(Bacillus endophyticus)、バシラス・ファラギニス(Bacillus farraginis)、バシラス・フォスティディオサス(Bacillus fastidiosus)、バシラス・ファルマス(Bacillus firmus)、バシラス・フレクサス(Bacillus flexus)、バシラス・ホラミニス(Bacillus foraminis)、バシラス・フォルディ(Bacillus fordii)、バシラス・フォルティス(Bacillus fortis)、バシラス・フマリオリィ(Bacillus fumarioli)、バシラス・フニクラス(Bacillus funiculus)、バシラス・ガラクトシディリティカス(Bacillus galactosidilyticus)、バシラス・ゲラティニ(Bacillus gelatini)、バシラス・ギブソニー(Bacillus gibsonii)、バシラス・ハルマパラス(Bacillus halmapalus)、バシラス・ハロデュランス(Bacillus halodurans)、バシラス・ハロフィルス(Bacillus halophilus)、バシラス・ヘミセルロシリティカス(Bacillus hemicellulosilyticus)、バシラス・ハーバーステイネンシス(Bacillus herbersteinensis)、バシラス・ホリコシー(Bacillus horikoshii)、バシラス・ホルティ(Bacillus horti)、バシラス・フミ(Bacillus humi)、バシラス・ファジンポエンシス(Bacillus hwajinpoensis)、バシラス・イドリエンシス(Bacillus idriensis)、バシラス・インディカス(Bacillus indicus)、バシラス・インファンティス(Bacillus infantis)、バシラス・インファーナス(Bacillus infernus)、バシラス・インソリタス(Bacillus insolitus)、バシラス・イサベリエ(Bacillus isabeliae)、バシラス・チョッカリ(Bacillus jeotgali)、バシラス・コリエンシス(Bacillus koreensis)、バシラス・クルーウィッチアエ(Bacillus krulwichiae)、バシラス・レヘンシス(Bacillus lehensis)、バシラス・レンタス(Bacillus lentus)、バシラス・リケニホルミス(Bacillus licheniformis)、バシラス・リトラリス(Bacillus litoralis)、バシラス・ルシフェレンシス(Bacillus luciferensis)、バシラス・マカウエンシス(Bacillus macauensis)、バシラス・マキアエ(Bacillus macyae)、バシラス・マラシテンシス(Bacillus malacitensis)、バシラス・マンナニリティカス(Bacillus mannanilyticus)、バシラス・マリナス(Bacillus marinus)、バシラス・マリスフラビィ(Bacillus marisflavi)、バシラス・マシリエンシス(Bacillus massiliensis)、バシラス・メガテリウム(Bacillus megaterium)、バシラス・メタノリカス(Bacillus methanolicus)、バシラス・モジャベンシス(Bacillus mojavensis)、バシラス・ムシラギノサス(Bacillus mucilaginosus)、バシラス・ムラリス(Bacillus muralis)、バシラス・ムリマルティニ(Bacillus murimartini)、バシラス・ミコイデス(Bacillus mycoides)、バシラス・ネールソニー(Bacillus nealsonii)、バシラス・ニアベンシス(Bacillus niabensis)、バシラス・ニアシニ(Bacillus niacini)、バシラス・ノバリス(Bacillus novalis)、バシラス・オデッセイ(Bacillus odysseyi)、バシラス・オクヘンシス(Bacillus okhensis)、バシラス・オクヒデンシス(Bacillus okuhidensis)、バシラス・オレロニウス(Bacillusoleronius)、バシラス・オシメンシス(Bacillus oshimensis)、バシラス・パリダス(Bacillus pallidus)、バシラス・パナシテラエ(Bacillus panaciterrae)、バシラス・パタゴニエンシス(Bacillus patagoniensis)、バシラス・プラコルチディス(Bacillus plakortidis)、バシラス・ポチェオネンシス(Bacillus
pocheonensis)、バシラス・ポリゴニ(Bacillus polygoni)、バシラス・シュードアルカリフィルス(Bacillus pseudalcaliphilus)、バシラス・シュードファーマス(Bacillus pseudofirmus)、バシラス・シュードミコイデス(Bacillus pseudomycoides)、バシラス・シクロデュランス(Bacillus psychrodurans)、バシラス・フィクロサッカロリティカス(Bacillus psychrosaccharolyticus)、バシラス・フィクロトレランス(Bacillus psychrotolerans)、バシラス・プミラス(Bacillus pumilus)、バシラス・ピクナス(Bacillus pycnus)、バシラス・キングダオネンシス(Bacillus qingdaonensis)、バシラス・ルリス(Bacillus ruris)、バシラス・サフェンシス(Bacillus safensis)、バシラス・サラリウス(Bacillus salarius)、バシラス・サリフィルス(Bacillus saliphilus)、バシラス・シュリジェリー(Bacillus schlegelii)、バシラス・セレナターセナティス(Bacillus selenatarsenatis)、バシラス・セレニティレドセンス(Bacillus selenitireducens)、バシラス・セオハエアネンシス(Bacillus seohaeanensis)、バシラス・サックレトニー(Bacillus shackletonii)、バシラス・シルベストリス(Bacillus silvestris)、バシラス・シンプレックス(Bacillus simplex)、バシラス・シラリス(Bacillus siralis)、バシラス・スミシー(Bacillus smithii)、バシラス・ソリ(Bacillus soli)、バシラス・ソノレンシス(Bacillus sonorensis)、バシラス・スフェリカス(Bacillus sphaericus)、バシラス・スポロサーモデュランス(Bacillus sporothermodurans)、バシラス・ストラトスフェリカス(Bacillus stratosphericus)、バシラス・サブテラネウス(Bacillus subterraneus)、バシラス・タエアネンシス(Bacillus taeanensis)、バシラス・テクィレンシス(Bacillus
tequilensis)、バシラス・サーマンタルクティカス(Bacillus thermantarcticus)、バシラス・サーモアミロボランス(Bacillus thermoamylovorans)、バシラス・サーモクローカー(Bacillus thermocloacae)、バシラス・チオパランス(Bacillus thioparans)、バシラス・ツスシー(Bacillus tusciae)、バシラス・バリスモーチス(Bacillus vallismortis)、バシラス・ベデリ(Bacillus vedderi)、バシラス・ベレゼンシス(Bacillus velezensis)、バシラス・ビエトナメンシス(Bacillus vietnamensis)、バシラス・ビレティ(Bacillus vireti)、バシラス・ワコエンシス(Bacillus wakoensis)、バシラス・ヴェイヘンステファネンシス(Bacillus weihenstephanensis)等が挙げられる。
スフィンゴバクテリウム(Sphingobacterium)属に分類される微生物としては、例えば、スフィンゴバクテリウム・マルチボーラム(Sphingobacterium multivorum)、スフィンゴバクテリウム・スピリチボーラム(Sphingobacterium spiritivorum)、スフィンゴバクテリウム・アリメンタリウム(Sphingobacterium alimentarium)、スフィンゴバクテリウム・アンフイエンス(Sphingobacterium anhuiense)、スフィンゴバクテリウム・アンタークチカム(Sphingobacterium antarcticum)、スフィンゴバクテリウム・バンブサエ(Sphingobacterium bambusae)、スフィンゴバクテリウム・カナデンス(Sphingobacterium canadense)、スフィンゴバクテリウム・コンポスチ(Sphingobacterium
composti)、スフィンゴバクテリウム・デジョネンス(Sphingobacterium daejeonense)、スフィンゴバクテリウム・ファシウム(Sphingobacterium faecium)、スフィンゴバクテリウム・ヘパリナム(Sphingobacterium heparinum)、スフィンゴバクテリウム・キタヒロシマエンス(Sphingobacterium kitahiroshimense)、スフィンゴバクテリウム・ラクティス(Sphingobacterium lactis)、スフィンゴバクテリウム・ミズタニー(Sphingobacterium mizutaii)、スフィンゴバクテリウム・ネマトシダ(Sphingobacterium nematocida)、スフィンゴバクテリウム・ピスシウム(Sphingobacterium piscium)、スフィンゴバクテリウム・シャイエンス(Sphingobacterium shayense)、スフィンゴバクテリウム・シヤンゲンス(Sphingobacterium siyangense)、スフィンゴバクテリウム・タルポフィラム(Sphingobacterium thalpophilum)、スフィンゴバクテリウム・ウェンキシニアエ(Sphingobacterium wenxiniae)等が挙げられる。
コマモナス(Comamonas)属に分類される微生物としては、例えば、コマモナス・アシドボランス(Comamonas acidovorans)、コマモナス・アクアティカ(Comamonas aquatica)、コマモナス・バディア(Comamonas badia)、コマモナス・コムポスティ(Comamonas composti)、コマモナス・デニトリフィカンス(Comamonas denitrificans)、コマモナス・グラヌリ(Comamonas granuli)、コマモナス・カーステリッシ(Comamonas
kerstersii)、コマモナス・コレンシス(Comamonas koreensis)、コマモナス・ニトラティボランス(Comamonas nitrativorans)、コマモナス・オドントターミッツ(Comamonas odontotermites)、コマモナス・テラエ(Comamonas terrae)、コマモナス・テリジェナ(Comamonas terrigena)、コマモナス・テストステロニ(Comamonas testosteroni)、カマモナス・チオオキシダンス(Comamonas thiooxydans)、コマモナス・ゾングリアニ(Comamonas zonglianii)等が挙げられる。
ブレバンディモナス(Brevundimonas)属に分類される微生物としては、例えば、ブレバンディモナス・アルバ(Brevundimonas alba)、ブレバンディモナス・アウランティアカ(Brevundimonas aurantiaca)、ブレバンディモナス・バクテロイデス(Brevundimonas bacteroides)、ブレバンディモナス・バソルティス(Brevundimonas basaltis)、ブレバンディモナス・バラタ(Brevundimonas bullata)、ブレバンディモナス・ディミヌタ(Brevundimonas diminuta)、ブレバンディモナス・インターメディア(Brevundimonas intermedia)、ブレバンディモナス・クワンチュネンシス(Brevundimonas kwangchunensis)、ブレバンディモナス・レンタ(Brevundimonas lenta)、ブレバンディモナス・メディターラネア(Brevundimonas mediterranea)、ブレバンディモナス・ナスダエ(Brevundimonas nasdae)、ブレバンディモナス・オレイ(Brevundimonas olei)、ブレバンディモナス・サブビブリオイデス(Brevundimonas subvibrioides)、ブレバンディモナス・テラエ(Brevundimonas terrae)、ブレバンディモナス・バンカンニーティ(Brevundimonas vancanneytii)、ブレバンディモナス・バリアビリス(Brevundimonas variabilis)、ブレバンディモナス・ベシキュラリス(Brevundimonas vesicularis)、ブレバンディモナス・ビスコサ(Brevundimonas viscosa)等が挙げられる。
スフィンゴモナス(Sphingomonas)属に分類される微生物としては、例えば、スフィンゴモナス・アバシ(Sphingomonas abaci)、スフィンゴモナス・アドハエシバ(Sphingomonas adhaesiva)、スフィンゴモナス・アエロラータ(Sphingomonas aerolata)、スフィンゴモナス・アクアティーリス(Sphingomonas aquatilis)、スフィンゴモナス・アサッカロリティカ(Sphingomonas asaccharolytica)、スフィンゴモナス・アスタキサンチニファシエンス(Sphingomonas astaxanthinifaciens)、スフィンゴモナス・アウランティアカ(Sphingomonas aurantiaca)、スフィンゴモナス・アゾティファイゲンス(Sphingomonas azotifigens)、スフィンゴモナス・アゾトフォルナンス(Sphingomonas azotofornans)、スフィンゴモナス・カプスラータ(Sphingomonas capsulata)、スフィンゴモナス・チャングバイエンシス(Sphingomonas changbaiensis)、スフィンゴモナス・クロロフェノリカ(Sphingomonas chlorophenolica)、スフィンゴモナス・サイナレ(Sphingomonas cynarae)、スフィンゴモナス・デシカビリス(Sphingomonas
desiccabilis)、スフィンゴモナス・ドクドネンシス(Sphingomonas dokdonensis)、スフィンゴモナス・エキノイデス(Sphingomonas echinoides)、スフィンゴモナス・エンドフィティカ(Sphingomonas endophytica)、スフィンゴモナス・ファエニ(Sphingomonas faeni)、スフィンゴモナス・フェニカ(Sphingomonas fennica)、スフィンゴモナス・ギンセノシディミュータンス(Sphingomonas ginsenosidimutans)、スフィンゴモナス・ハロアロマティカマンス(Sphingomonas haloaromaticamans)、スフィンゴモナス・ヘルビシドボランス(Sphingomonas herbicidovorans)、スフィンゴモナス・ヒューミ(Sphingomonas humi)、スフィンゴモナス・インサラエ(Sphingomonas insulae)、スフィンゴモナス・ジャポニカ(Sphingomonas japonica)、スフィンゴモナス・ジャスピシ(Sphingomonas jaspsi)、スフィンゴモナス・ジェジュエンシス(Sphingomonas jejuensis)、スフィンゴモナス・コレエンシス(Sphingomonas koreensis)、スフィンゴモナス・マクロゴルタビダス(Sphingomonas macrogoltabidus)、スフィンゴモナス・マリー(Sphingomonas mali)、スフィンゴモナス・メロニス(Sphingomonas melonis)、スフィンゴモナス・モルスコーラム(Sphingomonas molluscorum)、スフィンゴモナス・ミューコシシマ(Sphingomonas mucosissima)、スフィンゴモナス・ナタトリア(Sphingomonas natatoria)、スフィンゴモナス・オリゴフェノリカ(Sphingomonas oligophenolica)、スフィンゴモナス・パニー(Sphingomonas panni)、スフィンゴモナス・パラポウシモビリス(Sphingomonas parapaucimobilis)、スフィンゴモナス・パウシモビリス(Sphingomonas paucimobilis)、スフィンゴモナス・フィロスフェレ(Sphingomonas phyllosphaerae)スフィンゴモナス・ピテュイトサ(Sphingomonas
pituitosa)、スフィンゴモナス・ポリアロマティシボランス(Sphingomonas polyaromaticivorans)、スフィンゴモナス・プルーニ(Sphingomonas pruni)、スフィンゴモナス・ローサ(Sphingomonas rosa)、スフィンゴモナス・ローゼイフラバ(Sphingomonas roseiflava)、スフィンゴモナス・ルブラ(Sphingomonas rubra)、スフィンゴモナス・サングイニス(Sphingomonas sanguinis)、スフィンゴモナス・ソリー(Sphingomonas soli)、スフィンゴモナス・スベリファシエンス(Sphingomonas suberifaciens)、スフィンゴモナス・サブテラニア(Sphingomonas subterranea)、スフィンゴモナス・テラエ(Sphingomonas terrae)、スフィンゴモナス・トゥルーペリ(Sphingomonas
trueperi)、スフィンゴモナス・ウルシンコラ(Sphingomonas ursincola)、スフィンゴモナス・ウイッチ(Sphingomonas wittichii)、スフィンゴモナス・ヤブーチャエ(Sphingomonas yabuuchiae)、スフィンゴモナス・ヤノイクエ(Sphingomonas yanoikuyae)、スフィンゴモナス・ユナネンシス(sphingomonas yunnanensis)等が挙げられる。
オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属に分類される微生物としては、例えば、オクロバクテリウム・アンスロピ(Ochrobactrum anthropi)、オクロバクテリウム・サイティシ(Ochrobactrum cytisi)、オクロバクテリウム・デジョネンス(Ochrobactrum daejeonense)、オクロバクテリウム・ガリニファエシス(Ochrobactrum gallinifaecis)、オクロバクテリウム・グリグノネンス(Ochrobactrum grignonense)、オクロバクテリウム・ハエモフィラム(Ochrobactrum haemophilum)、オクロバクテリウム・インターメディウム(Ochrobactrum intermedium)、オクロバクテリウム・ルピニ(Ochrobactrum lupini)、オクロバクテリウム・オリゼ(Ochrobactrum oryzae)、オクロバクテリウム・シューディンターミディウム(Ochrobactrum pseudintermedium)、オクロバクテリウム・シュードグリグノネンス(Ochrobactrum pseudogrignonense)、オクロバクテリウム・チオフェニボランス(Ochrobactrum thiophenivorans)、オクロバクテリウム・トリティシ(Ochrobactrum tritici)等が挙げられる。
ペドバクター(Pedobacter)属に分類される微生物としては、例えば、ペドバクター・アフリカヌス(Pedobacter africanus)、ペドバクター・アグリ(Pedobacter agri)、ペドバクター・アルビアス(Pedobacter alluvius)、ペドバクター・アクアティリス(Pedobacter aquatilis)ペドバクター・ボリアリス(Pedobacter borealis)、ペドバクター・カエニ(Pedobacter caeni)、ペドバクター・コンポスティ(Pedobacter composti)、ペドバクター・クリオコニティス(Pedobacter cryoconitis)、ペドバクター・デチャンギンシス(Pedobacter daechungensis)、ペドバクター・ドゥラクエ(Pedobacter duraquae)、ペドバクター・ギンセンギソリ(Pedobacter ginsengisoli)、ペドバクター・ハートニウス(Pedobacter hartonius)、ペドバクター・ヘパリヌス(Pedobacter heparinus)、ペドバクター・ヒマライエンシス(Pedobacter himalayensis)、ペドバクター・ジョングニュンゲンシス(Pedobacter jeongneungensis)、ペドバクター・コリーンシス(Pedobacter koreensis)、ペドバクター・レンタス(Pedobacter lentus)、ペドバクター・メタボリパウパー(Pedobacter metabolipauper)、ペドバクター・ニャケンシス(Pedobacter nyackensis)、ペドバクター・パナシテラエ(Pedobacter panaciterrae)、ペドバクター・ピスシウム(Pedobacter piscium)、ペドバクター・ロゼウス(Pedobacter roseus)、ペドバクター・サルタンス(Pedobacter saltans)、ペドバクター・スティーニ(Pedobacter steynii)、ペドバクター・サウォネンシス(Pedobacter suwonensis)、ペドバクター・テリコラ(Pedobacter terricola)等が挙げられる。
パエニバシラス(Paenibacillus)属に分類される微生物としては、例えば、パエニバシラス・アエスツアリ(Paenibacillus aestuarii)、パエニバシラス・アルギノリティカス(Paenibacillus alginolyticus)、パエニバシラス・アルゴリフォンティコラ(Paenibacillus algorifonticola)、パエニバシラス・アルベイ(Paenibacillus alvei)、パエニバシラス・アマイロリティカス(Paenibacillus amylolyticus)、パエニバシラス・アピアリウス(Paenibacillus apiarius)、パエニバシラス・アサメンシス(Paenibacillus assamensis)、パエニバシラス・アゾリドセンス(Paenibacillus azoreducens)、パエニバシラス・アゾトフィキサンス(Paenibacillus azotofixans)パエニバシラス・バーシノネンシス(Paenibacillus barcinonensis)、パエニバシラスバレンゴルトジ(Paenibacillus barengoltzii)、パエニバシラス・キャンピナセンシス(Paenibacillus campinasensis)、パエニバシラス・セルトシりティカス(Paenibacillus cellulosilyticus)、パエニバシラス・チベンシス(Paenibacillus chibensis)、パエニバシラス・チティノリティカス(Paenibacillus chitinolyticus)、パエニバシラス・チョンドロイティナス(Paenibacillus chondroitinus)、パエニバシラス・カードラノリティカス(Paenibacillus curdlanolyticus)、パエニバシラス・ダエジョネンシス(Paenibacillus daejeonensis)、パエニバシラス・ダラス(Paenibacillus durus)、パエニバシラス・エヒメンシス(Paenibacillus ehimensis)、パエニバシラス・エルギ(Paenibacillus elgii)、パエニバシラス・フィリシス(Paenibacillus filicis)パエニバシラス・フリゴリレシステンス(Paenibacillus frigoriresistens)、パエニバシラス・ガンスエンシス(Paenibacillus gansuensis)、パエニバシラス・ギンセンギフミ(Paenibacillus ginsengihumi)、パエニバシラス・グルカノリティクス(Paenibacillus glucanolyticus)、パエニバシラス・グリカノリティクス(Paenibacillus glycanilyticus)、パエニバシラス・グラミニス(Paenibacillus graminis)、パエニバシラス・ホドガエンシス(Paenibacillus hodogayensis)、パエニバシラス・ホーデイ(Paenibacillus hordei)、パエニバシラス・ヒューミカス(Paenibacillus humicus)、パエニバシラス・イリノイセンシス(Paenibacillus illinoisensis)、パエニバシラス・ジャミラエ(Paenibacillus jamilae)、パエニバシラス・コベンシス(Paenibacillus kobensis)、パエニバシラス・コレオボランス(Paenibacillus koleovorans)、パエニバシラス・コンシデンシス(Paenibacillus konsidensis)、パエニバシラス・クリブベンシス(Paenibacillus kribbensis)、パエニバシラス・ラーバエ・サブスピーシーズ・ラーバエ(Paenibacillus larvae subsp. larvae)、パエニバシラス・ラーバエ・サブスピーシーズ・パルビファシエンス(Paenibacillus larvae subsp. pulvifaciens)、パエニバシラス・ロータス(Paenibacillus lautus)、パエニバシラス・マセランス(Paenibacillus macerans)、パエニバシラス・マクアリエンシス・サブスピーシーズ・デフェンサー(Paenibacillus macquariensis subsp. defensor)、パエニバシラス・メンデリ(Paenibacillus mendelii)、パエニバシラス・モトブエンシス(Paenibacillus motobuensis)、パエニバシラス・ナファタレノボランス(Paenibacillus naphthalenovorans)、パエニバシラス・ネマトフィラス(Paenibacillus nematophilus)、パエニバシラス・オーシャニセディミニス(Paenibacillus oceanisediminis)、パエニバシラス・オドリファー(Paenibacillus odorifer)、パエニバシラス・パブリ(Paenibacillus pabuli)、パエニバシラス・パサデネンシス(Paenibacillus pasadenensis)、パエニバシラス・ペオリエ(Paenibacillus peoriae)、パエニバシラス・ホエニシス(Paenibacillus phoenicis)、パエニバシラス・ピニ(Paenibacillus pini)、パエニバシラス・ピニフミ(Paenibacillus pinihumi)、パエニバシラス・ポリミキサ(Paenibacillus polymyxa)、パエニバシラス・プエリ(Paenibacillus pueri)、パエニバシラス・リグイ(Paenibacillus rigui)、パエニバシラス・ステリファー(Paenibacillus stellifer)、パエニバシラス・タイワネンシス(Paenibacillus taiwanensis)、パエニバシラス・テラエ(Paenibacillus terrae)、パエニバシラス・テリゲナ(Paenibacillus terrigena)、パエニバシラス・サーモフィラス(Paenibacillus thermophilus)、パエニバシラス・チアミノリティカス(Paenibacillus thiaminolyticus)、パエニバシラス・ツンドラエ(Paenibacillus tundrae)、パエニバシラス・バリダス(Paenibacillus validus)、パエニバシラス・バルネリス(Paenibacillusvulneris)、パエニバシラス・ウーポネンシス(Paenibacillus wooponensis)、パエニバシラス・キシラニックカスティカス(Paenibacillus xylaniclasticus)等が挙げられる。
アクロモバクター(Achromobacter)属に分類される微生物としては、例えば、アクロモバクター・アーセニトキシダンス(Achromobacter arsenitoxydans)、アクロモバクター・チョリノファガム(Achromobacter cholinophagum)、アクロモバクター・サイクロクラステス(Achromobacter cycloclastes)、アクロモバクター・デニトリフィカンス(Achromobacter denitrificans)、アクロモバクター・フィシェリ(Achromobacter
fischeri)、アクロモバクター・ハートレビ(Achromobacter hartlebii)、アクロモバクター・イモビリス(Achromobacter immobilis)、アクロモバクター・インソリタス(Achromobacter insolitus)、アクロモバクター・ラクトリティカス(Achromobacter
lactolyticus)、アクロモバクター・ライティカス(Achromobacter lyticus)、アクロモバクター・メタノロフィラ(Achromobacter methanolophila)、アクロモバクター・ペスティファー(Achromobacter pestifer)、アクロモバクター・ピーチャウディ(Achromobacter piechaudii)、アクロモバクター・ルーハランディ(Achromobacter ruhlandii)、アクロモバクター・スパニオス(Achromobacter spanios)、アクロモバクター・ビスコサス(Achromobacter viscosus)、アクロモバクター・キセロシス(Achromobacter xerosis)、アクロモバクター・キシロソキシダンス(Achromobacter xylosoxidans)、アクロモバクター・キシロソキシダンス・サブスピーシーズ・デニトリフィカンス(Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans)、アクロモバクター・キシロソキシダンス・サブスピーシーズ・キシロソキシダンス(Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans)等が挙げられる。
アシネトバクター(Acinetobacter)属に分類される微生物としては、例えば、アシネトバクター・バウマニ(Acinetobacter baumannii)、アシネトバクター・バイリイ(Acinetobacter aylyi)、アシネトバクター・ベイジェリンキイ(Acinetobacter beijerinckii)、アシネトバクター・ブレジニエ(Acinetobacter bereziniae)、アシネトバクター・ボウベテイ(Acinetobacter boubetii)、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus)、アシネトバクター・ガーネリ(Acinetobacter gerneri)、アシネトバクター・グリモンティ(Acinetobacter grimontii)、アシネトバクター・ギロウイエ(Acinetobacter guilouiae)、アシネトバクター・ジレンバーギイ(Acinetobacter gyllenbergii)、アシネトバクター・ハエモリティカス(Acinetobacter haemolyticus)、アシネトバクター・ジョンソニイ(Acinetobacter johnsonii)、アシネトバクター・ジュニ(Acinetobacter junii)、アシネトバクター・キョンギエンシス(Acinetobacter kyonggiensis)、アシネトバクター・ロウフォイ(Acinetobacter
lwoffii)、アシネトバクター・オレビボランス(Acinetobacter oleivorans)、アシネトバクター・パルブス(Acinetobacter parvus)、アシネトバクター・サイクロトレランス(Acinetobacter psychrotolerans)アシネトバクター・ラジオレシステンス(Acinetobacter radioresistens)、アシネトバクター・シンドレリ(Acinetobacter schindleri)、アシネトバクター・ソリ(Acinetobacter soli)、アシネトバクター・タンドイ(Acinetobacter tandoii)、アシネトバクター・タータロゲネス(Acinetobacter
tartarogenes)、アシネトバクター・テジェランバーギエ(Acinetobacter tjernbergiae)、アシネトバクター・トウネリ(Acinetobacter towneri)、アシネトバクター・アーシンギイ(Acinetobacterursingii)、アシネトバクター・ベネチアナス(Acinetobacter venetianus)等が挙げられる。
シュワネラ(Shewanella)属に分類される微生物としては、例えば、シュワネラ・ピエゾトランス(Shewanella piezotolerans)、シュワネラ・アバイシ(Shewanella abyssi)、シュワネラ・アフィニス(Shewanella affinis)、シュワネラ・アルガエ(Shewanella algae)、シュワネラ・アルギディピシコラ(Shewanella algidipiscicola)、シュワネラ・アマゾネンシス(Shewanella amazonensis)、シュワネラ・アクイマリーナ(Shewanella aquimarina)、シュワネラ・アークティカ(Shewanella arctica)、シュワネラ・アトランティカ(Shewanella atlantica)、シュワネラ・バルティカ(Shewanella baltica)、シュワネラ・バサルティス(Shewanella basaltis)、シュワネラ・ベンシカ(Shewanella benthica)、シュワネラ・キャンダデンシス(Shewanella candadensis)、シュワネラ・チリケンシス(Shewanella chilikensis)、シュワネラ・コルウェリアナ(Shewanella colwelliana)、シュワネラ・コラリイ(Shewanella corallii)、シュワネラ・デコラレイショニス(Shewanella decolorationis)、シュワネラ・デニトリフィカンス(Shewanella denitrificans)、シュワネラ・ドンガエンシス(Shewanella donghaensis)、シュワネラ・フィデリス(Shewanella fidelis)、シュワネラ・フォディナエ(Shewanella fodinae)、シュワネラ・フリギディマリーナ(Shewanella frigidimarina)、シュワネラ・ガエトブリ(Shewanella gaetbuli)、シュワネラ・ゲリディマリナ(Shewanella gelidimarina)、シュワネラ・グラシアリピシコラ(Shewanella glacialipiscicola)、シュワネラ・ゴフェリ(Shewanella gopherii)、シュワネラ・ハフヒエンシス(Shewanella hafniensis)、シュワネラ・ハリファクセンシス(Shewanella halifaxensis)、シュワネラ・ハリオティス(Shewanella haliotis)、シュワネラ・ハネダイ(Shewanella hanedai)、シュワネラ・ジャポニカ(Shewanella japonica)、シュワネラ・カイレイティカ(Shewanella kaireitica)、シュワネラ・リビングストネンシス(Shewanella ivingstonensis)、シュワネラ・ロイヒカ(Shewanella loihica)、シュワネラ・マリーナ(Shewanella marina)、シュワネラ・マリニンテスティナ(Shewanella marinintestina)、シュワネラ・マリスフラビ(Shewanella marisflavi)、シュワネラ・モーヒュアエ(Shewanella morhuae)、シュワネラ・オレヤナ(Shewanella olleyana)、シュワネラ・オネイデンシス(Shewanella oneidensis)、シュワネラ・パシフィカ(Shewanella pacifica)、シュワネラ・ピリナ(Shewanella pealeana)、シュワネラ・プニュマトファリ(Shewanella pneumatophori)、シュワネラ・プロファンダ(Shewanella profunda)、シュワネラ・プトレファシエンス(Shewanella putrefaciens)、シュワネラ・サイラエ(Shewanella sairae)、シュワネラ・スクレジリアナ(Shewanella schlegeliana)、シュワネラ・セディミニス(Shewanella sediminis)、シュワネラ・スルゲンシス(Shewanella surugensis)、シュワネラ・ヴェシキュロサ(Shewanella vesiculosa)、シュワネラ・バイオレイシア(Shewanella violacea)、シュワネラ・ワクスマニ(Shewanella waksmanii)、シュワネラ・ウーディイ(Shewanella woodyi)、シュワネラ・キサメネンシス(Shewanella xiamenensis)等が挙げられる。
リストネラ(Listonella)属に分類される微生物としては、例えば、リストネラ・アンギララ(Listonella anguillara)、リストネラ・アンギララム(Listonella anguillarum)、リストネラ・ペラギア(Listonella pelagia)等が挙げられる。
アグロバクテリウム(Agrobacterium)属に分類される微生物としては、例えば、アグロバクテリウム・アギル(Agrobacterium agile)、アグロバクテリウム・オーレウム(Agrobacterium aureum)、アグロバクテリウム・アゾトフィラム(Agrobacterium azotophilum)、アグロバクテリウム・ジプソフィリー(Agrobacterium gypsophilae)、アグロバクテリウム・ルテウム(Agrobacterium luteum)、アグロバクテリウム・シュードツガエ(Agrobacterium pseudotsugae)、アグロバクテリウム・リゾーゲネス(Agrobacterium rhizogenes)、アグロバクテリウム・フェルギネウム(Agrobacterium ferrugineum)、アグロバクテリウム・サンギネウム(Agrobacterium sanguineum)、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)、アグロバクテリウム・ビスコサム(Agrobacterium viscosum)、アグロバクテリウム・ビティス(Agrobacterium vitis)等が挙げられる。
メソリゾビウム(Mesorhizobium)属に分類される微生物としては、例えば、メソリゾビウム・アルビジエ(Mesorhizobium albiziae)、メソリゾビウム・アモルファエ(Mesorhizobium amorphae)、メソリゾビウム・オーストラリカム(Mesorhizobium australicum)、メソリゾビウム・カラゲイネ(Mesorhizobium caraganae)、メソリゾビウム・チャコエンス(Mesorhizobium chacoense)、メソリゾビウム・シセリ(Mesorhizobium ciceri)、メソリゾビウム・ゴビエンス(Mesorhizobium gobiense)、メソリゾビウム・ロティ(Mesorhizobium loti)、メソリゾビウム・メディテラニュウム(Mesorhizobium mediterraneum)、メソリゾビウム・メタリデュランス(Mesorhizobium metallidurans)、メソリゾビウム・オポテュニスタム(Mesorhizobium opportunistum)、メソリゾビウム・プルリファリウム(Mesorhizobium plurifarium)、メソリゾビウム・ファクイイ(Mesorhizobium huakuii)、メソリゾビウム・セプテントリオナーレ(Mesorhizobium septentrionale)、メソリゾビウム・シャングリレンス(Mesorhizobium shangrilense)、メソリゾビウム・タリメンス(Mesorhizobium tarimense)、メソリゾビウム・テンパラータム(Mesorhizobium temperatum)、メソリゾビウム・チオガンゲティカム(Mesorhizobium thiogangeticum)、メソリゾビウム・ティエンシャネンス(Mesorhizobium tianshanense)等が挙げられる。
リゾビウム(Rhizobium)属に分類される微生物としては、例えば、リゾビウム・アラミ(Rhizobium alamii)、リゾビウム・アルカリソリ(Rhizobium alkalisoli)、リゾビウム・セルロシライティカム(Rhizobium cellulosilyticum)、リゾビウム・ダエジェオネンス(Rhizobium daejeonense)、リゾビウム・エンドフィティカム(Rhizobium
endophyticum)、リゾビウム・エトリ(Rhizobium etli)、リゾビウム・ファバエ(Rhizobium fabae)、リゾビウム・ガリカム(Rhizobium gallicum)、リゾビウム・ギアルディニ(Rhizobium giardinii)、リゾビウム・グラハミ(Rhizobium grahamii)、リゾビウム・ハイナネンセ(Rhizobium hainanense)、リゾビウム・フアウトレンス(Rhizobium huautlense)、リゾビウム・ガレガーエ(Rhizobium galegae)、リゾビウム・インディカ(Rhizobium indica)、リゾビウム・インディカス(Rhizobium indicus)、リゾビウム・インディゴフフェラエ(Rhizobium indigoferae)、リゾビウム・ラリームーレイ(Rhizobium larrymoorei)、リゾビウム・レグミノサルム(Rhizobium leguminosarum)、リゾビウム・ロイカエナエ(Rhizobium leucaenae)、リゾビウム・ロエセンス(Rhizobium loessense)、リゾビウム・ルピニ(Rhizobium lupini)、リゾビウム・ラシタナム(Rhizobium lusitanum)、リゾビウム・メソシニカム(Rhizobium mesosinicum)、リゾビウム・ミルオネンス(Rhizobium miluonense)、リゾビウム・モンゴレンス(Rhizobium mongolense)、リゾビウム・マルチホスピティウム(Rhizobium
multihospitium)、リゾビウム・ナガージュナ・ナガレンシス(Rhizobium nagarjuna
nagarensis)、リゾビウム・オリゼ(Rhizobium oryzae)、リゾビウム・ファゼオリ(Rhizobium phaseoli)、リゾビウム・ピシ(Rhizobium pisi)、リゾビウム・ピュセンス(Rhizobium pusense)、リゾビウム・ラジオバクター(Rhizobium radiobacter)、リゾビウム・リゾゲンス(Rhizobium rhizogenes)、リゾビウム・ルビ(Rhizobium rubi)、リゾビウム・セレニティレデゥセンス(Rhizobium selenitireducens)、リゾビウム・ソリ(Rhizobium soli)、リゾビウム・スラエ(Rhizobium sullae)、リゾビウム・ティベティカム(Rhizobium tibeticum)、リゾビウム・トリフォリ(Rhizobium
trifolii)、リゾビウム・トロピシ(Rhizobium tropici)、リゾビウム・ツクストレンス(Rhizobium tuxtlense)、リゾビウム・アンディコラ(Rhizobium undicola)、リゾビウム・ヴァリダム(Rhizobium validum)、リゾビウム・ヴィティス(Rhizobium
vitis)、等が挙げられる。
パラコッカス(Paracoccus)属に分類される微生物としては、例えば、パラコッカス・アエストゥアリ(Paracoccus aestuarii)、パラコッカス・アルカリフィルス(Paracoccus alcaliphilus)、パラコッカス・アルケニファー(Paracoccus alkenifer)、パラコッカス・アミノフィラス(Paracoccus aminophilus)、パラコッカス・アミノボランス(Paracoccus aminovorans)、パラコッカス・ベイビュエンシス(Paracoccus beibuensis)、パラコッカス・ベンガレンシス(Paracoccus bengalensis)、パラコッカス・チネンシス(Paracoccus chinensis)、パラコッカス・デニトリフィカンス(Paracoccus denitrificans)、パラコッカス・ハロフィラス(Paracoccus halophilus)、パラコッカス・ホミーンシス(Paracoccus homiensis)、パラコッカス・コクリ(Paracoccus kocurii)、パラコッカス・カエニ(Paracoccus caeni)、パラコッカス・コンドラティーバエ(Paracoccus kondratievae)、パラコッカス・コーリエンシス(Paracoccus koreensis)、パラコッカス・マリナス(Paracoccus marinus)、パラコッカス・メチルテンス(Paracoccus methylutens)、パラコッカス・オーシャネンス(Paracoccus oceanense)、パラコッカス・パントトロファス(Paracoccus pantotrophus)、パラコッカス・セリニフィルス(Paracoccus seriniphilus)、パラコッカス・ソルベンティボランス(Paracoccus solventivorans)、パラコッカス・サルフロキシダンス(Paracoccus sulfuroxidans)、パラコッカス・チオシアナタス(Paracoccus thiocyanatus)、パラコッカス・ベルスタス(Paracoccus versutus)、パラコッカス・イーイ(Paracoccus yeei)、パラコッカス・ゼアキサンチニファシエンス(Paracoccus zeaxanthinifaciens)等が挙げられる。
キサントバクター(Xanthobacter)属に分類される微生物としては、例えば、キサントバクター・アギリス(Xanthobacter agilis)、キサントバクター・アミノキシダンス(Xanthobacter aminoxidans)、キサントバクター・オートロフィカス(Xanthobacter autotrophicus)、キサントバクター・フラバス(Xanthobacter flavus)、キサントバクター・ターゲッティディス(Xanthobacter tagetidis)、キサントバクター・ビスコーサス(Xanthobacter viscosus)等が挙げられる。
ストレプトマイセス(Streptomyces)属に分類される微生物としては、例えば、ストレプトマイセス・アビコエンシス(Streptomyces abikoensis)、ストレプトマイセス・アブラビエンシス(Streptomyces aburaviensis)、ストレプトマイセス・アブラビエンシス・サブスピーシーズ・タフトフォルミス(Streptomyces aburaviensis subsp. tuftformis)、ストレプトマイセス・アクロモゲネス(Streptomyces achromogenes)、ストレプトマイセス・アクロモゲネス・サブスピーシーズ・アクロモゲネス(Streptomyces achromogenes subsp. achromogenes)、ストレプトマイセス・アクロモゲネス・サブスピーシーズ・ラブラディリス(Streptomyces achromogenes subsp. rubradiris)、ストレプトマイセス・アクロモゲネス・サブスピーシーズ・ステレプトゾティカス(Streptomyces achromogenes subsp. streptozoticus)、ストレプトマイセス・アクロモゲネス・サブスピーシーズ・トメイマイセティカス(Streptomyces achromogenes subsp. tomaymyceticus)、ストレプトマイセス・アシディスカビエス(Streptomyces acidiscabies)、ストレプトマイセス・アシドレシスタンス(Streptomyces acidoresistans)、ストレプトマイセス・アクリミシニ(Streptomyces acrimycini)、ストレプトマイセス・アクトゥオサス(Streptomyces actuosus)、ストレプトマイセス・アクレオラタス(Streptomyces aculeolatus)、ストレプトマイセス・アデフォスフォリティカス(Streptomyces adephospholyticus)、ストレプトマイセス・アフガニエンシス(Streptomyces
afghaniensis)、ストレプトマイセス・アフリカヌス(Streptomyces africanus)、ストレプトマイセス・アグロメラタス(Streptomyces agglomeratus)、ストレプトマイセス・アヒグロスコピカス(Streptomyces ahygroscopicus)、ストレプトマイセス・アキヨシエンシス(Streptomyces akiyoshiensis)、ストレプトマイセス・アラノシニカス(Streptomyces alanosinicus)、ストレプトマイセス・アルバドゥンカス(Streptomyces albaduncus)、ストレプトマイセス・アルビアキシアリス(Streptomyces albiaxialis)、ストレプトマイセス・アルビドクロモゲネス(Streptomyces albidochromogenes)、ストレプトマイセス・アルビドフラブス(Streptomyces albidoflavus)、ストレプトマイセス・アルビダス(Streptomyces albidus)、ストレプトマイセス・アルビレティクリ(Streptomyces albireticuli)、ストレプトマイセス・アルボクロモゲネス(Streptomyces albochromogenes)、ストレプトマイセス・アルボシネレセンス(Streptomyces albocinerescens)、ストレプトマイセス・アルボファシエンス(Streptomyces albofaciens)、ストレプトマイセス・アルボフラブス(Streptomyces alboflavus)、ストレプトマイセス・アルボグリセオルス(Streptomyces albogriseolus)、ストレプトマイセス・アルボヘルバタス(Streptomyces albohelvatus)、ストレプトマイセス・アルボロングス(Streptomyces albolongus)、ストレプトマイセス・アルボニガー(Streptomyces alboniger)、ストレプトマイセス・アルボピヌス(Streptomyces albospinus)、ストレプトマイセス・アルボスポレウス(Streptomyces albosporeus)、ストレプトマイセス・アルボスポレウス・サブスピーシーズ・ラビロマイセティカス(Streptomyces albosporeus subsp. labilomyceticus)、ストレプトマイセス・アルボビナセウス(Streptomyces albovinaceus)、ストレプトマイセス・アルボバリディス(Streptomyces alboviridis)、ストレプトマイセス・アルブルス(Streptomyces albulus)、ストレプトマイセス・アルブス(Streptomyces albus)、ストレプトマイセス・アルブス・サブスピーシーズ・アルブス(Streptomyces albus subsp. albus)、ストレプトマイセス・アルブス・サブスピーシーズ・コレイマイセティカス(Streptomyces albus subsp. coleimyceticus)、ストレプトマイセス・アルブス・サブスピーシーズ・パソシディカス(Streptomyces albus subsp. pathocidicus)、ストレプトマイセス・アルカロフィラス(Streptomyces alcalophilus)、ストレプトマイセス・アルムクイスティイ(Streptomyces almquistii)、ストレプトマイセス・アルニ(Streptomyces alni)、ストレプトマイセス・アルチオティカス(Streptomyces althioticus)、ストレプトマイセス・アマガサケンシス(Streptomyces amagasakensis)、ストレプトマイセス・アマクサエンシス(Streptomyces amakusaensis)、ストレプトマイセス・アムボファシエンス(Streptomyces ambofaciens)、ストレプトマイセス・アミノフィラス(Streptomyces aminophilus)、ストレプトマイセス・アナンディイ(Streptomyces anandii)、ストレプトマイセス・アンガストマイセティカス(Streptomyces angustmyceticus)、ストレプトマイセス・アンソクロモゲネス・サブスピーシーズ・アンソクロモゲネス(Streptomyces ansochromogenes subsp. ansochromogenes)、ストレプトマイセス・アンソシアニカス(Streptomyces anthocyanicus)、ストレプトマイセス・アンチバイオティカス(Streptomyces antibioticus)、ストレプトマイセス・アンチフィブリノリティカス(Streptomyces antifibrinolyticus)、ストレプトマイセス・アンチマイコティカス(Streptomyces antimycoticus)、ストレプトマイセス・アヌラトス(Streptomyces anulatus)、ストレプトマイセス・アオミエンシス(Streptomyces aomiensis)、ストレプトマイセス・アラビカス(Streptomyces arabicus)、ストレプトマイセス・アルダス(Streptomyces ardus)、ストレプトマイセス・アレナエ(Streptomyces arenae)、ストレプトマイセス・アルゲンテオラス(Streptomyces argenteolus)、ストレプトマイセス・アルゲンテオラス・サブスピーシーズ・トヨナケンシス(Streptomyces argenteolus subsp. toyonakensis)、ストレプトマイセス・アルギラセウス(Streptomyces argillaceus)、ストレプトマイセス・アルメニアカス(Streptomyces armeniacus)、ストレプトマイセス・アルメントサス(Streptomyces armentosus)、ストレプトマイセス・アルシティエンシス(Streptomyces arsitiensis)、ストレプトマイセス・アスコミシニカス(Streptomyces ascomycinicus)、ストレプトマイセス・アジアティカス(Streptomyces asiaticus)、ストレプトマイセス・アステロスポルス(Streptomyces asterosporus)、ストレプトマイセス・アトラタス(Streptomyces atratus)、ストレプトマイセス・アトロアウランティアカス(Streptomyces atroaurantiacus)、ストレプトマイセス・アトロシアネウス(Streptomyces atrocyaneus)、ストレプトマイセス・アトロファシエンス(Streptomyces atrofaciens)、ストレプトマイセス・アトロファッカス(Streptomyces atrolaccus)、ストレプトマイセス・アトロオリバセウス(Streptomyces atroolivaceus)、ストレプトマイセス・アトロビオラセウス(Streptomyces atroviolaceus)、ストレプトマイセス・アトロビレンス(Streptomyces atrovirens)、ストレプトマイセス・アウランティアコグリセウス(Streptomyces aurantiacogriseus)、ストレプトマイセス・アウランティアカス(Streptomyces aurantiacus)、ストレプトマイセス・アウランティオグリセウス(Streptomyces aurantiogriseus)、ストレプトマイセス・アウラタス(Streptomyces auratus)、ストレプトマイセス・アウレオサーキュレイタス(Streptomyces aureocirculatus)、ストレプトマイセス・アウレオファシエンス(Streptomyces aureofaciens)、ストレプトマイセス・アウレオモノピディアレス(Streptomyces aureomonopodiales)、ストレプトマイセス・アウレオレクタス(Streptomyces aureorectus)、ストレプトマイセス・アウレオバーティシラタス(Streptomyces aureoverticillatus)、ストレプトマイセス・アウレウス(Streptomyces aureus)、ストレプトマイセス・アウリンギネウス(Streptomyces aurigineus)、ストレプトマイセス・アベラネウス(Streptomyces avellaneus)、ストレプトマイセス・アベルメクティニウス(Streptomyces avermectinius)、ストレプトマイセス・アルベミティリス(Streptomyces avermitilis)、ストレプトマイセス・アビセニエ(Streptomyces avicenniae)、ストレプトマイセス・アビディニイ(Streptomyces avidinii)、ストレプトマイセス・アキシネラエ(Streptomyces axinellae)、ストレプトマイセス・アズレウス(Streptomyces azureus)、ストレプトマイセス・バーネンシス(Streptomyces baarnensis)、ストレプトマイセス・バシラリス(Streptomyces bacillaris)、ストレプトマイセス・バディウス(Streptomyces badius)、ストレプトマイセス・バリーンシス(Streptomyces baliensis)、ストレプトマイセス・バムバーギーンシス(Streptomyces bambergiensis)、ストレプトマイセス・バングラデシェンシス(Streptomyces bangladeshensis)、ストレプトマイセス・バングラデシエンシス(Streptomyces bangladeshiensis)、ストレプトマイセス・ベイジアンゲンシス(Streptomyces beijiangensis)、ストレプトマイセス・ベルス(Streptomyces bellus)、ストレプトマイセス・ベルス・サブスピーシーズ・サーロレロサス(Streptomyces bellus subsp.
cirolerosus)、ストレプトマイセス・バーネンシス(Streptomyces bernensis)、ストレプトマイセス・ビカラー(Streptomyces bicolor)、ストレプトマイセス・ビファーカス(Streptomyces bifurcus)、ストレプトマイセス・バイキニエンシス(Streptomyces bikiniensis)、ストレプトマイセス・バイキニエンシス・サブスピーシーズ・ゾーボネンシス(Streptomyces bikiniensis subsp. zorbonensis)、ストレプトマイセス・ブラストマイセティカス(Streptomyces blastmyceticus)、ストレプトマイセス・ブルンシス(Streptomyces bluensis)、ストレプトマイセス・ボビリ(Streptomyces bobili)、ストレプトマイセス・ボトロペンシス(Streptomyces bottropensis)、ストレプトマイセス・ブラシリエンシス(Streptomyces brasiliensis)、ストレプトマイセス・ブレビスポロラス(Streptomyces brevisprorus)、ストレプトマイセス・ブラネオグリセウス(Streptomyces brunneogriseus)、ストレプトマイセス・バンゴエンシス(Streptomyces bungoensis)、ストレプトマイセス・カカオイ(Streptomyces cacaoi)、ストレプトマイセス・カカオイ・サブスピーシーズ・アソエンシス(Streptomyces cacaoi subsp. asoensis)、ストレプトマイセス・カカオイ・サブスピーシーズ・カカオイ(Streptomyces cacaoi subsp. cacaoi)、ストレプトマイセス・カエレスティス(Streptomyces caelestis)、ストレプトマイセス・カエリカス(Streptomyces caelicus)、ストレプトマイセス・カエルレウス(Streptomyces caeruleus)、ストレプトマイセス・カエシウス(Streptomyces caesius)、ストレプトマイセス・カリフォルニカス(Streptomyces californicus)、ストレプトマイセス・カルブス(Streptomyces calvus)、ストレプトマイセス・カナディエンシス(Streptomyces canadiensis)、ストレプトマイセス・カナリウス(Streptomyces canarius)、ストレプトマイセス・カンディダス(Streptomyces candidus)、ストレプトマイセス・カネセンス(Streptomyces canescens)、ストレプトマイセス・カングリンゲンシス(Streptomyces cangkringensis)、ストレプトマイセス・カニフェルス(Streptomyces caniferus)、ストレプトマイセス・カヌス(Streptomyces canus)、ストレプトマイセス・カピリスピラリス(Streptomyces capillispiralis)、ストレプトマイセス・カポアムス(Streptomyces capoamus)、ストレプトマイセス・カピューエンシス(Streptomyces capuensis)、ストレプトマイセス・カーノサス(Streptomyces carnosus)、ストレプトマイセス・カパティカス(Streptomyces carpaticus)、ストレ
プトマイセス・カーピネンシス(Streptomyces carpinensis)、ストレプトマイセス・カスタネオグロビスポラス(Streptomyces castaneoglobisporus)、ストレプトマイセス・カスタネウス(Streptomyces castaneus)、ストレプトマイセス・カステラレンシス(Streptomyces castelarensis)、ストレプトマイセス・カテヌラエ(Streptomyces
catenulae)、ストレプトマイセス・カトレヤ(Streptomyces cattleya)、ストレプトマイセス・カボーレンシス(Streptomyces cavourensis)、ストレプトマイセス・カボーレンシス・サブスピーシーズ・カボーレンシス(Streptomyces cavourensis subsp. cavourensis)、ストレプトマイセス・セビマレンシス(Streptomyces cebimarensis)、ストレプトマイセス・セルロスタティカス(Streptomyces cellostaticus)、ストレプトマイセス・セルロファブス(Streptomyces celluloflavus)、ストレプトマイセス・ベルロサエ(Streptomyces cellulosae)、ストレプトマイセス・キャムパビティイ(Streptomyces champavatii)、ストレプトマイセス・チャトレウシス(Streptomyces
chartreusis)、ストレプトマイセス・チャトタヌーゲンシス(Streptomyces chattanoogensis)、ストレプトマイセス・チェオナネンシス(Streptomyces cheonanensis)、ストレプトマイセス・チアングマイエンシス(Streptomyces chiangmaiensis)、ストレプトマイセス・チバエンシス(Streptomyces chibaensis)、ストレプトマイセス・クロロクロモゲネス(Streptomyces chlorochromogenes)、ストレプトマイセス・クレストマイセティカス(Streptomyces chrestomyceticus)、ストレプトマイセス・クレストマイセティカス・サブスピーシーズ・ラビセンス(Streptomyces chrestomyceticus subsp. rubescens)、ストレプトマイセス・クロモフスカス(Streptomyces chromofuscus)、ストレプトマイセス・クロモゲナス(Streptomyces chromogenus)、ストレプトマイセス・クリセウス(Streptomyces chryseus)、ストレプトマイセス・クリソマラス(Streptomyces chrysomallus)、ストレプトマイセス・クリソマラス・サブスピーシーズ・フミガタス(Streptomyces chrysomallus subsp.fumigatus)、ストレプトマイセス・チュングフェンシス(Streptomyces chungwhensis)、ストレプトマイセス・シネレオレクタス(Streptomyces cinereorectus)、ストレプトマイセス・シネレオルバー(Streptomyces cinereoruber)、ストレプトマイセス・シネレオルバー・サブスピーシーズ・シネレオルバー(Streptomyces cinereoruber subsp.cinereoruber)、ストレプトマイセス・シネレオルバー・サブスピーシーズ・フルクトファーメンタンス(Streptomyces
cinereoruber subsp. fructofermentans)、ストレプトマイセス・シネレオスピヌス(Streptomyces cinereospinus)、ストレプトマイセス・シネレウス(Streptomyces cinereus)、ストレプトマイセス・シネロクロモゲネス(Streptomyces cinerochromogenes)、ストレプトマイセス・シンナバリヌス(Streptomyces cinnabarinus)、ストレプトマイセス・シンナモカスタネウス(Streptomyces cinnamocastaneus)、ストレプトマイセス・シンナモネンシス(Streptomyces cinnamonensis)、ストレプトマイセス・シンナモネウス(Streptomyces cinnamoneus)、ストレプトマイセス・シンナモネウス・サブスピーシーズ・アルボスポラス(Streptomyces cinnamoneus subsp. albosporus)、ストレプトマイセス・シンナモネウス・サブスピーシーズ・フォルマ・アザコルタ(Streptomyces cinnamoneus subsp. forma azacoluta)、ストレプトマイセス・シンナモネウス・サブスピーシーズ・ラノサス(Streptomyces cinnamoneus subsp. lanosus)、ストレプトマイセス・シンナモネウス・サブスピーシーズ・スパーサス(Streptomyces cinnamoneus subsp. sparsus)、ストレプトマイセス・サーキュレイタス(Streptomyces circulatus)、ストレプトマイセス・サーレイタス(Streptomyces cirratus)、ストレプトマイセス・シスカウカシカス(Streptomyces ciscaucasicus)、ストレプトマイセス・シトレオフルオレセンス(Streptomyces citreofluorescens)、ストレプトマイセス・シトレウス(Streptomyces citreus)、ストレプトマイセス・シトリカラー(Streptomyces citricolor)、ストレプトマイセス・クラビファー(Streptomyces
clavifer)、ストレプトマイセス・クラブリゲルス(Streptomyces clavuligerus)、ストレプトマイセス・コアサービタス(Streptomyces coacervatus)、ストレプトマイセス・コクレンシス(Streptomyces cocklensis)、ストレプトマイセス・コエレッセンス(Streptomyces coelescens)、ストレプトマイセス・コエリアタス(Streptomyces coeliatus)、ストレプトマイセス・コエリコファブス(Streptomyces coelicoflavus)、ストレプトマイセス・コエリカラー(Streptomyces coelicolor)、ストレプトマイセス・コエルレオアウランティアカス(Streptomyces coeruleoaurantiacus)、ストレプトマイセス・コエルレオフスカス(Streptomyces coeruleofuscus)、ストレプトマイセス・コエルレオプルナス(Streptomyces coeruleoprunus)、ストレプトマイセス・コエルレオルビダス(Streptomyces coeruleorubidus)、ストレプトマイセス・コエルレセンス(Streptomyces coerulescens)、ストレプトマイセス・コリヌス(Streptomyces collinus)、ストレプトマイセス・コリヌス・サブスピーシーズ・アルベセンス(Streptomyces collinus subsp. albescens)、ストレプトマイセス・コロンビエンシス(Streptomyces colombiensis)、ストレプトマイセス・コレイラス(Streptomyces coralus)、ストレプトマイセス・コーコルシイ(Streptomyces corchorusii)、ストレプトマイセス・コリオファシエンス(Streptomyces coriofaciens)、ストレプトマイセス・コスタリカヌス(Streptomyces costaricanus)、ストレプトマイセス・クレイテリファー(Streptomyces craterifer)、ストレプトマイセス・クレメウス(Streptomyces cremeus)、ストレプトマイセス・クロセウス(Streptomyces croceus)、ストレプトマイセス・クリルタリヌス(Streptomyces crystallinus)、ストレプトマイセス・クラコイ(Streptomyces curacoi)、ストレプトマイセス・クスピドスポラス(Streptomyces cuspidosporus)、ストレプトマイセス・シアネフスカタス(Streptomyces cyaneofuscatus)、ストレプトマイセス・シアネグリセウス(Streptomyces cyaneogriseus)、ストレプトマイセス・シアネウス(Streptomyces cyaneus)、ストレプトマイセス・シアノアルバス(Streptomyces cyanoalbus)、ストレプトマイセス・シアノカラー(Streptomyces cyanocolor)、ストレプトマイセス・シアノゲナス(Streptomyces cyanogenus)、ストレプトマイセス・シアノグリセウス(Streptomyces cyanogriseus)、ストレプトマイセス・シアリンドスポラス(Streptomyces cylindosporus)、ストレプトマイセス・ダゲスタニカス(Streptomyces daghestanicus)、ストレプトマイセス・ダバウェンシス(Streptomyces davawensis)、ストレプトマイセス・デコイカス(Streptomyces decoyicus)、ストレプトマイセス・ダマイニイ(Streptomyces demainii)、ストレプトマイセス・ディアスタティカス(Streptomyces diastaticus)、ストレプトマイセス・ディアスタティカス・サブスピーシーズ・アルデシアカス(Streptomyces diastaticus
subsp. ardesiacus)、ストレプトマイセス・ディアスタティカス・サブスピーシーズ・ディアスタティカス(Streptomyces diastaticus subsp. diastaticus)、ストレプトマイセス・ディアスタトクロモゲネス(Streptomyces diastatochromogenes)、ストレプトマイセス・ディアスタトクロモゲネス・サブスピーシーズ・ルテウス(Streptomyces diastatochromogenes subsp. luteus)、ストレプトマイセス・ディスタリカス(Streptomyces distallicus)、ストレプトマイセス・ジャカルテンシス(Streptomyces djakartensis)、ストレプトマイセス・ドロズドウィクツィイ(Streptomyces drozdowiczii)、ストレプトマイセス・ダーラメンシス(Streptomyces durhamensis)、ストレプトマイセス・ダーミトレンシス(Streptomyces durmitorensis)、ストレプトマイセス・エブロスポレウス(Streptomyces eburosporeus)、ストレプトマイセス・エキナトス(Streptomyces echinatus)、ストレプトマイセス・エキノルバー(Streptomyces echinoruber)、ストレプトマイセス・エデレンシス(Streptomycesederensis)、ストレプトマイセス・エルグレテウス(Streptomyces elgreteus)、ストレプトマイセス・エリザベシイ(Streptomyces elizabethii)、ストレプトマイセス・エメイエンシス(Streptomyces emeiensis)、ストレプトマイセス・エンダス(Streptomyces endus)、ストレプトマイセス・エニソカエシリス(Streptomyces enissocaesilis)、ストレプトマイセス・エリダニ(Streptomyces eridani)、ストレプトマイセス・エルムペンス(Streptomyces erumpens)、ストレプトマイセス・エリスロクロモゲネス(Streptomyces erythrochromogenes)、ストレプトマイセス・エリスログリセウス(Streptomyces erythrogriseus)、ストレプトマイセス・エスピノサス(Streptomyces espinosus)、ストレプトマイセス・ユーロシディカス(Streptomyces eurocidicus)、ストレプトマイセス・ユーロパエイスカビエイ(Streptomyces europaeiscabiei)、ストレプトマイセス・ユリサーマス(Streptomyces eurythermus)、ストレプトマイセス・エクスフォリアタス(Streptomyces exfoliatus)、ストレプトマイセス・ファシキュレイタス(Streptomyces fasiculatus)、ストレプトマイセス・フェレウス(Streptomyces felleus)、ストレプトマイセス・フェラリティス(Streptomyces ferralitis)、ストレプトマイセス・ファーベンス・サブスピーシーズ・メルロスポルス(Streptomyces fervens subsp.
melrosporus)、ストレプトマイセス・フィセラス(Streptomyces ficellus)、ストレプトマイセス・フィラメントサス(Streptomyces filamentosus)、ストレプトマイセス・フィリピネンシス(Streptomyces filipinensis)、ストレプトマイセス・フィムブリアトス(Streptomyces fimbriatus)、ストレプトマイセス・フィミィカリウス(Streptomyces fimicarius)、ストレプトマイセス・フィンレイ(Streptomyces finlayi)、ストレプトマイセス・フラベオルス(Streptomyces flaveolus)、ストレプトマイセス・フラベウス(Streptomyces flaveus)、ストレプトマイセス・フラビドフスカス(Streptomyces flavidofuscus)、ストレプトマイセス・フラビドビレンス(Streptomyces
flavidovirens)、ストレプトマイセス・フラビドビレンス・サブスピーシーズ・フスカス(Streptomyces flavidovirens subsp. fuscus)、ストレプトマイセス・フラビスクレオティカス(Streptomyces flaviscleroticus)、ストレプトマイセス・フラボクロモゲネス(Streptomyces flavochromogenes)、ストレプトマイセス・フラボファンギニー(Streptomyces flavofungini)、ストレプトマイセス・フラボフュスカス(Streptomyces flavofuscus)、ストレプトマイセス・フラボグリセウス(Streptomyces flavogriseus)、ストレプトマイセス・フラボマクロスポルス(Streptomyces flavomacrosporus)、ストレプトマイセス・フラボレクタス(Streptomyces flavorectus)、ストレプトマイセス・フラボトリシニ(Streptomyces flavotricini)、ストレプトマイセス・フラボトリシニ・サブスピーシーズ・シュードクロモゲネス(Streptomyces flavotricini
subsp. pseudochromogenes)、ストレプトマイセス・フラボバリアビリス(Streptomyces flavovariabilis)、ストレプトマイセス・フラボビレンス(Streptomyces flavovirens)、ストレプトマイセス・フラボビリディス(Streptomyces flavoviridis)、ストレプトマイセス・フラバズ(Streptomyces flavus)
、ストレプトマイセス・フロキュラス(Streptomyces flocculus)、ストレプトマイセス・フロリダエ(Streptomyces floridae)、ストレプトマイセス・フロレセンス(Streptomyces fluorescens)、ストレプトマイセス・フラディアエ(Streptomyces fradiae)、ストレプトマイセス・フラディアエ・サブスピーシーズ・アシニカラー(Streptomyces fradiae subsp. acinicolor)、ストレプトマイセス・フラディアエ・サブスピーシーズ・イタリカス(Streptomyces fradiae subsp. italicus)、ストレプトマイセス・フラギリス(Streptomyces fragilis)、ストレプトマイセス・フラグメンタンス(Streptomyces fragmentans)、ストレプトマイセス・フラグメンタンス・サブスピーシーズ・アクアティカ(Streptomyces fragmentans subsp. aquatica)、ストレプトマイセス・フルビシムス(Streptomyces fulvissimus)、ストレプトマイセス・フルボロベウス(Streptomyces fulvorobeus)、ストレプトマイセス・フルボビオラセウス(Streptomyces fulvoviolaceus)、ストレプトマイセス・フルボビリディス(Streptomyces
fulvoviridis)、ストレプトマイセス・フマヌス(Streptomyces fumanus)、ストレプトマイセス・フミガティスクレロティカス(Streptomyces fumigatiscleroticus)、ストレプトマイセス・ファンギシディカス(Streptomyces fungicidicus)、ストレプトマイセス・ファーロンガス(Streptomyces furlongus)、ストレプトマイセス・ファーロンガス・サブスピーシーズ・ファーロンガス(Streptomyces furlongus subsp. furlongus)、ストレプトマイセス・フスコアトラス(Streptomyces fuscoatrus)、ストレプトマイセス・ガボナエ(Streptomyces gabonae)、ストレプトマイセス・ガルブス(Streptomyces galbus)、ストレプトマイセス・ガリラエウス(Streptomyces galilaeus)、ストレプトマイセス・ガリナリウス(Streptomyces gallinarius)、ストレプトマイセス・ガンシディカス(Streptomyces gancidicus)、ストレプトマイセス・ガングトケンシス(Streptomyces gangtokensis)、ストレプトマイセス・ガンマイセカス(Streptomyces gannmycicus)、ストレプトマイセス・ガーデン(Streptomyces garden)、ストレプトマイセス・ガードネリ(Streptomyces gardneri)、ストレプトマイセス・ゲダネンシス(Streptomyces gedanensis)、ストレプトマイセス・ゲラティカス(Streptomyces gelaticus)、ストレプトマイセス・ゲルダナマイシニナス(Streptomyces geldanamycininus)、ストレプトマイセス・ガイシリエンシス(Streptomyces geysiriensis)、ストレプトマイセス・ガーナエンシス(Streptomyces ghanaensis)、ストレプトマイセス・ギブソニイ(Streptomyces gibsonii)、ストレプトマイセス・ギンセンギソリ(Streptomyces ginsengisoli)、ストレプトマイセス・グロセッセンス(Streptomyces glaucescens)、ストレプトマイセス・グラウシニガー(Streptomyces glauciniger)、ストレプトマイセス・グロコスポルス(Streptomyces glaucosporus)、ストレプトマイセス・グロクス(Streptomyces glaucus)、ストレプトマイセス・グロビファー(Streptomyces globifer)、ストレプトマイセス・グロウビスポラス(Streptomyces globisporus)、ストレプトマイセス・グロウビスポラス・サブスピーシーズ・ガウカシカス(Streptomyces globisporus subsp. caucasicus)、ストレプトマイセス・グロウビスポラス・サブスピーシーズ・グロウビスポラス(Streptomyces globisporus subsp.
globisporus)、ストレプトマイセス・グロボサス(Streptomyces globosus)、ストレプトマイセス・グロメラタス(Streptomyces glomeratus)、ストレプトマイセス・グロメロアウランティアカス(Streptomyces glomeroaurantiacus)、ストレプトマイセス・グロマロクロモゲンシス(Streptomyces glomerochromogenes)、ストレプトマイセス・ゴビトリシニ(Streptomyces gobitricini)、ストレプトマイセス・ゴシキエンシス(Streptomyces goshikiensis)、ストレプトマイセス・ゴウゲロティイ(Streptomyces
gougerotii)、ストレプトマイセス・グラミネアラス(Streptomyces graminearus)、ストレプトマイセス・グラミネウス(Streptomyces gramineus)、ストレプトマイセス・グラミノファシエンス(Streptomyces graminofaciens)、ストレプトマイセス・グリセイニガー(Streptomyces griseiniger)、ストレプトマイセス・グリセイヌス(Streptomyces griseinus)、ストレプトマイセス・グリセオアウランティアカス(Streptomyces griseoaurantiacus)、ストレプトマイセス・グリセオブルネウス(Streptomyces
griseobrunneus)、ストレプトマイセス・グリセオカルネウス(Streptomyces griseocarneus)、ストレプトマイセス・グリセオクロモゲネス(Streptomyces griseochromogenes)、ストレプトマイセス・グリセオクロモゲネス・サブスピーシーズ・スイタエンシス(Streptomyces griseochromogenes subsp. suitaensis)、ストレプトマイセス・グリセオファシエンス(Streptomyces griseofaciens)、ストレプトマイセス・グリセオフラバス(Streptomyces griseoflavus)、ストレプトマイセス・グリセオフラバス・サブスピーシーズ・ピリンディカス(Streptomyces griseoflavus subsp. pyrindicus)、ストレプトマイセス・グリセオフュスカス(Streptomyces griseofuscus)、ストレプトマイセス・グリセオインカーナタス(Streptomyces griseoincarnatus)、ストレプトマイセス・グリセオロアルブス(Streptomyces griseoloalbus)、ストレプトマイセス・グリセオロサフュスカス(Streptomyces griseolosuffuscus)、ストレプトマイセス・グリセオルス(Streptomyces griseolus)、ストレプトマイセス・グリセオルテウス(Streptomyces griseoluteus)、ストレプトマイセス・グリセオマイシニ(Streptomyces griseomycini)、ストレプトマイセス・グリセオプラヌス(Streptomyces griseoplanus)、ストレプトマイセス・グリセオルーベンス(Streptomyces griseorubens)、ストレプトマイセス・グリセオルバー(Streptomyces griseoruber)、ストレプトマイセス・グリセオルビギノザス(Streptomyces griseorubiginosus)、ストレプトマイセス・グリセオスピラリス(Streptomyces griseospiralis)、ストレプトマイセス・グリセオスポレウス(Streptomyces griseosporeus)、ストレプトマイセス・グリセオストラミネウス(Streptomyces griseostramineus)、ストレプトマイセス・グリセオバーティシラタス(Streptomyces griseoverticillatus)、ストレプトマイセス・グリセオビリディス(Streptomyces griseoviridis)、ストレプトマイセス・グリセウス(Streptomyces griseus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・ブルネウス(Streptomyces griseus subsp. bruneus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・デシデウス(Streptomyces griseussubsp. desideus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・エリゼンシス(Streptomyces griseus subsp.
erizensis)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・フォーミカス(Streptomyces griseus subsp. formicus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・グリセウス(Streptomyces griseus subsp. griseus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・パーパレウス(Streptomyces griseus subsp.
purpureus)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・ロドクロウス(Streptomyces griseus subsp. rhodochrous)、ストレプトマイセス・グリセウス・サブスピーシーズ・ソルビフィシエンス(Streptomyces griseus subsp. solvifaciens)、ストレプトマイセス・グアンデュエンシス(Streptomyces guanduensis)、ストレプトマイセス・グルバーゲンシス(Streptomyces gulbargensis)、ストレプトマイセス・ジシュース(Streptomyces gypseus)、ストレプトマイセス・ハイナネンシス(Streptomyces hainanensis)、ストレプトマイセス・ハリクロナエ(Streptomyceshaliclonae)、ストレプトマイセス・ハロトレランス(Streptomyces halotolerans)、ストレプトマイセス・ハルステディイ(Streptomyces halstedii)、ストレプトマイセス・ハワイエンシス(Streptomyces hawaiiensis)、ストレプトマイセス・ハゼリエンシス(Streptomyces hazeliensis)、ストレプトマイセス・ホーペイエンシス(Streptomyceshebeiensis)、ストレプトマイセス・ヘイミ(Streptomyces heimi)、ストレプトマイセス・ヘリオマイシニ(Streptomyces heliomycini)、ストレプトマイセス・ヘルバティカス(Streptomyces helvaticus)、ストレプトマイセス・ヘネタス(Streptomyces henetus)、ストレプトマイセス・ハーバリカラー(Streptomyces herbaricolor)、ストレプトマイセス・ヘテロモーファス(Streptomyces heteromorphus)、ストレプトマイセス・ヒムグリエンシス(Streptomyces himgriensis)、ストレプトマイセス・ヒロシメンシス(Streptomyces hiroshimensis)、ストレプトマイセス・ヒルスタス(Streptomyces hirsutus)、ストレプトマイセス・ホートン(Streptomyces horton)、ストレプトマイセス・ヒュミダス(Streptomyces humidus)、ストレプトマイセス・ヒュミダス・サブスピーシーズ・アンティツモリス(Streptomyces humidus subsp. antitumoris)、ストレプトマイセス・ヒュミファー(Streptomyces humifer)、ストレプトマイセス・ヒュミフェルス(Streptomyces humiferus)、ストレプトマイセス・ハンダンゲンシス(Streptomyces hundungensis)、ストレプトマイセス・ヒャリヌス(Streptomyces hyalinus)、ストレプトマイセス・ハイドラバデンシス(Streptomyces hyderabadensis)、ストレプトマイセス・ハイドロゲナンス(Streptomyces hydrogenans)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・アボマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. aabomyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・アンガストマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. angustmyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・アザロマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. azalomyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・クリスタロゲネス(Streptomyces
hygroscopicus subsp. crystallogenes)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・デコイカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. decoyicus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・デュアマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. duamyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・ゲルダヌス(Streptomyces hygroscopicus subsp. geldanus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・グレボサス(Streptomyces hygroscopicus subsp. glebosus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・ヒアロマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. hialomyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. hygroscopicus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・ハイグロスコピウス(Streptomyces hygroscopicus subsp. hygroscopius)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・リモネウス(Streptomyces hygroscopicus subsp. limoneus)、ストレプトマイセス・ハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・オサマイセティカス(Streptomyces hygroscopicus subsp. ossamyceticus)、ストレプトマイセス・ハイグロスピノサス(Streptomyces hygrospinosu
s)、ストレプトマイセス・イアカイルス(Streptomyces iakyrus)、ストレプトマイセス・イナエクアリス(Streptomyces inaequalis)、ストレプトマイセス・インディアエンシス(Streptomyces indiaensis)、ストレプトマイセス・インディカス(Streptomyces indicus)、ストレプトマイセス・インディゴカラー(Streptomyces indigocolor)、ストレプトマイセス・インディゴフェラス(Streptomyces indigoferus)、ストレプトマイセス・インドネシエンシス(Streptomyces indonesiensis)、ストレプトマイセス・インサイニス(Streptomyces insignis)、ストレプトマイセス・インターメディウス(Streptomyces intermedius)、ストレプトマイセス・イヌシテイタス(Streptomyces inusitatus)、ストレプトマイセス・イポモエアエ(Streptomyces ipomoeae)、ストレプトマイセス・イラネンシス(Streptomyces iranensis)、ストレプトマイセス・イシガキエンシス(Streptomyces ishigakiensis)、ストレプトマイセス・ジャマイセンシス(Streptomyces jamaicensis)、ストレプトマイセス・ジャンシナス(Streptomyces janthinus)、ストレプトマイセス・ジャベンシス(Streptomycesjavensis)、ストレプトマイセス・ジェタイシエンシス(Streptomyces jietaisiensis)、ストレプトマイセス・ジュジュイ(Streptomyces jujuy)、ストレプトマイセス・ジュモンジネンシス(Streptomyces jumonjinensis)、ストレプトマイセス・カガワエンシス(Streptomyces kagawaensis)、ストレプトマイセス・カゴシマヌス(Streptomyces kagoshimanus)、ストレプトマイセス・カナマイセティカス(Streptomyces kanamyceticus)、ストレプトマイセス・カニハラエンシス(Streptomyces kaniharaensis)、ストレプトマイセス・カーナタケンシス(Streptomyces karnatakensis)、ストレプトマイセス・カスガエンシス(Streptomyces kasugaensis)、ストレプトマイセス・カスガスピナス(Streptomyces kasugaspinus)、ストレプトマイセス・カトラエ(Streptomyces katrae)、ストレプトマイセス・ケンタケンシス(Streptomyces kentuckensis)、ストレプトマイセス・クハンダレンシス(Streptomyces khandalensis)、ストレプトマイセス・キタセトエンシス(Streptomyces kitasatoensis)、ストレプトマイセス・コベネンシス(Streptomyces kobenensis)、ストレプトマイセス・コヤンゲンシス(Streptomyces koyangensis)、ストレプトマイセス・クレインスキイ(Streptomyces krainskii)、ストレプトマイセス・クンミンゲンシス(Streptomyces kunmingensis)、ストレプトマイセス・カーサノビイ(Streptomyces kurssanovii)、ストレプトマイセス・クウェイティエンシス(Streptomyces kuwaitiensis)、ストレプトマイセス・ラベダエ(Streptomyces labedae)、ストレプトマイセス・ラセイ(Streptomyces laceyi)、ストレプトマイセス・ラキュラツスポラス(Streptomyces laculatusporus)、ストレプトマイセス・ラエテビオラセウス(Streptomyces laeteviolaceus)、ストレプトマイセス・ラナタス(Streptomyces lanatus)、ストレプトマイセス・ラネンシス(Streptomyces lannensis)、ストレプトマイセス・ラサリエンシス(Streptomyces lasaliensis)、ストレプトマイセス・ラテリティウス(Streptomyces lateritius)、ストレプトマイセス・ラウレンティイ(Streptomyces laurentii)、ストレプトマイセス・ラベンドフォリアエ(Streptomyces lavendofoliae)、ストレプトマイセス・ラベンデゥラエ(Streptomyces lavendulae)、ストレプトマイセス・ラベンデゥラエ・サブスピーシーズ・フスカス(Streptomyces lavendulae subsp. fuscus)、ストレプトマイセス・ラベンデゥラエ・サブスピーシーズ・グラッサーリウス(Streptomyces lavendulae subsp. grasserius)、ストレプトマイセス・ラベンデゥラエ・サブスピーシーズ・ラベンデゥラエ(Streptomyces lavendulae subsp. lavendulae)、ストレプトマイセス・ラベンデゥラレクタス(Streptomyces lavendularectus)、ストレプトマイセス・ラベンデゥリグリセウス(Streptomyces lavenduligriseus)、ストレプトマイセス・ラベンデゥロカラー(Streptomyces lavendulocolor)、ストレプトマイセス・ラズレウス(Streptomyces lazureus)、ストレプトマイセス・レビス(Streptomyces levis)、ストレプトマイセス・レボリス(Streptomyces levoris)、ストレプトマイセス・リバニー(Streptomyces libani)、ストレプトマイセス・リバニー・サブスピーシーズ・リバニー(Streptomyces libani subsp. libani)、ストレプトマイセス・リバニー・サブスピーシーズ・ルーファス(Streptomyces libani subsp. rufus)、ストレプトマイセス・リエノマイシニー(Streptomyces lienomycini)、ストレプトマイセス・リエスケイ(Streptomyces lieskei)、ストレプトマイセス・リラセウス(Streptomyces lilaceus)、ストレプトマイセス・リラシノファルブス(Streptomyces lilacinofulvus)、ストレプトマイセス・リラシヌス(Streptomyces lilacinus)、ストレプトマイセス・リモサス(Streptomyces
limosus)、ストレプトマイセス・リンコルネンシス(Streptomyces lincolnensis)、ストレプトマイセス・リプマニイ(Streptomyces lipmanii)、ストレプトマイセス・リサンドリ(Streptomyces lisandri)、ストレプトマイセス・リトモシディニー(Streptomyces litmocidini)、ストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans)、ストレプトマイセス・リビドクラバタス(Streptomyces lividoclavatus)、ストレプトマイセス・リビダス(Streptomyces lividus)、ストレプトマイセス・ロイデンシス(Streptomyces loidensis)、ストレプトマイセス・ローモンデンシス(Streptomyces lomondensis)、ストレプトマイセス・ロンギスポロフラバス(Streptomyces longisporoflavus)、ストレプトマイセス・ロンギスポロルバー(Streptomyces longispororuber)、ストレプトマイセス・ロンギスポラス(Streptomyces longisporus)、ストレプトマイセス・ロンギシマス(Streptomyces longissimus)、ストレプトマイセス・ロングウーデンシス(Streptomyces longwoodensis)、ストレプトマイセス・ルセンシス(Streptomyces lucensis)、ストレプトマイセス・ルーナリンハレンシス(Streptomyces
lunalinharensis)、ストレプトマイセス・ルーナリンハレシイ(Streptomyces lunalinharesii)、ストレプトマイセス・ルリディスケイビエイ(Streptomyces luridiscabiei)、ストレプトマイセス・ルリダス(Streptomyces luridus)、ストレプトマイセス・ルシタヌス(Streptomyces lusitanus)、ストレプトマイセス・ルシタヌス・サブスピーシーズ・テトラサイクリニ(Streptomyces lusitanus var. tetracyclini)、ストレプトマイセス・ルテイレティクリ(Streptomyces luteireticuli)、ストレプトマイセス・ルテオカラー(Streptomyces luteocolor)、ストレプトマイセス・ルテオグリセウス(Streptomyces luteogriseus)、ストレプトマイセス・ルテオルテセンス(Streptomyces luteolutescens)、ストレプトマイセス・ルテオスポレウス(Streptomyces luteosporeus)、ストレプトマイセス・ルテオバーティシラタス(Streptomyces luteoverticillatus)、ストレプトマイセス・ライディカス(Streptomyces lydicus)、ストレプトマイセス・マクロモマイセティカス(Streptomyces macromomyceticus)、ストレプトマイセス・マクロスポレウス(Streptomyces macrosporeus)、ストレプトマイセス・マクロスポルス(Streptomyces macrosporus)、ストレプトマイセス・マイゼウス(Streptomyces maizeus)、ストレプトマイセス・マラキティカス(Streptomyces malachiticus)、ストレプトマイセス・マラキティカス・サブスピーシーズ・グリセオスピノサス(Streptomyces malachiticus subsp. griseospinosus)、ストレプトマイセス・マラキトフュスカス(Streptomyces malachitofuscus)、ストレプトマイセス・マラキトレクタス(Streptomyces malachitorectus)、ストレプトマイセス・マラキトスピナス(Streptomyces malachitospinus)、ストレプトマイセス・マレーエンシス(Streptomyces malayensis)、ストレプトマイセス・マレーシエンシス(Streptomyces malaysiensis)、ストレプトマイセス・マニプレンシス(Streptomyces manipurensis)、ストレプトマイセス・マリナス(Streptomyces marinus)、ストレプトマイセス・マリティマス(Streptomyces maritimus)、ストレプトマイセス・マーロッコネンシス(Streptomyces marokkonensis)、ストレプトマイセス・マシュエンシス(Streptomyces mashuensis)、ストレプトマイセス・マサスポレウス(Streptomyces massasporeus)、ストレプトマイセス・マテンシス(Streptomyces matensis)、ストレプトマイセス・マウベカラー(Streptomyces mauvecolor)、ストレプトマイセス・メイテニ(Streptomyces mayteni)、ストレプトマイセス・メディオシディカス(Streptomyces mediocidicus)、ストレプトマイセス・メディオラニ(Streptomyces mediolani)、ストレプトマイセス・メガスポラス(Streptomyces megasporus)、ストレプトマイセス・メラノゲネス(Streptomyces melanogenes)、ストレプトマイセス・メラノスポロファシエンス(Streptomyces melanosporofaciens)、ストレプトマイセス・メントウゴウエンシス(Streptomyces mentougouensis)、ストレプトマイセス・メキシカヌス(Streptomyces mexicanus)、ストレプトマイセス・ミシガネンシス(Streptomyces michiganensis)、ストレプトマイセス・ミシガネンシス・サブスピーシーズ・アミロリティカス(Streptomyces michiganensis subsp. amylolyticus)、ストレプトマイセス・ミクロフラバス(Streptomyces microflavus)、ストレプトマイセス・ミクロスポラス(Streptomyces microsporus)、ストレプトマイセス・ミハラエンシス(Streptomyces miharaensis)、ストレプトマイセス・ミノエンシス(Streptomyces minoensis)、ストレプトマイセス・ミヌティスクレロティカス(Streptomyces minutiscleroticus)、ストレプトマイセス・ミラビリス(Streptomyces mirabilis)、ストレプトマイセス・ミサキエンシス(Streptomyces misakiensis)、ストレプトマイセス・ミサワネンシス(Streptomyces misawanensis)、ストレプトマイセス・ミシオネンシス(Streptomyces misionensis)、ストレプトマイセス・モバラエンシス(Streptomyces mobaraensis)、ストレプトマイセス・モデレイタス(Streptomyces moderatus)、ストレプトマイセス・モノマイシニ(Streptomyces monomycini)、ストレプトマイセス・モーダースキイ(Streptomyces mordarskii)、ストレプトマイセス・モルーカエンス(Streptomyces morookaense)、ストレプトマイセス・モルーカエンシス(Streptomyces morookaensis)、ストレプトマイセス・ムコフラバス(Streptomyces mucoflavus)、ストレプトマイセス・マルチスピラリス(Streptomyces multispiralis)、ストレプトマイセス・ムリナス(Streptomyces murinus)、ストレプトマイセス・ムタビリス(Streptomycesmutabilis)、ストレプトマイセス・ムトマイシニ(Streptomyces mutomycini)、ストレプトマイセス・マイカロファシエンス(Streptomyces mycarofaciens)、ストレプトマイセス・ミキソゲネス(Streptomyces myxogenes)、ストレプトマイセス・ナガニシイ(Streptomyces naganishii)、ストレプトマイセス・ナニンゲンシス(Streptomyces nanningensis)、ストレプトマイセス・ナンシェンシス(Streptomyces nanshensis)、ストレプトマイセス・ナラエンシス(Streptomyces naraensis)、ストレプトマイセス・ナーボネンシス(Streptomyces narbonensis)、ストレプトマイセス・ナシュビレンシス(Streptomyces nashvillensis)、ストレプトマイセス・ナタレンシス(Streptomyces natalensis)、ストレプトマイセス・ネブロサス(Streptomyces neburosus)、ス
トレプトマイセス・ネオカリベリス(Streptomyces neocaliberis)、ストレプトマイセス・ネトロプシス(Streptomyces netropsis)、ストレプトマイセス・ネヤガワエンシス(Streptomyces neyagawaensis)、ストレプトマイセス・ニゲラス(Streptomyces nigellus)、ストレプトマイセス・ニガー(Streptomyces niger)、ストレプトマイセス・ニグレセンス(Streptomyces nigrescens)、ストレプトマイセス・ニグリファシエンス(Streptomyces nigrifaciens)、ストレプトマイセス・ニグログリセオウス(Streptomyces nigrogriseolus)、ストレプトマイセス・ニグロビオレンス(Streptomyces nigroviolens)、ストレプトマイセス・ニトロスポレウス(Streptomyces nitrosporeus)、ストレプトマイセス・ニベオラバー(Streptomyces niveoruber)、ストレプトマイセス・ニベウス(Streptomyces niveus)、ストレプトマイセス・ノビリス(Streptomyces
nobilis)、ストレプトマイセス・ノボリトエンシス(Streptomyces noboritoensis)、ストレプトマイセス・ノドサス(Streptomyces nodosus)、ストレプトマイセス・ノドサス・サブスピーシーズ・アスカエンシス(Streptomyces nodosus subsp. asukaensis)、ストレプトマイセス・ノガラター(Streptomyces nogalater)、ストレプトマイセス・ノジリエンシス(Streptomyces nojiriensis)、ストレプトマイセス・ノウルセイ(Streptomyces noursei)、ストレプトマイセス・ノバエカエサレアエ(Streptomyces novaecaesareae)、ストレプトマイセス・ノボバーティシラス(Streptomyces novoverticillus)、ストレプトマイセス・オークラセイスクレロティカス(Streptomyces ochraceiscleroticus)、ストレプトマイセス・オクロスポラス(Streptomyces ochrosporus)、ストレプトマイセス・オドリファー(Streptomyces odorifer)、ストレプトマイセス・オゲエンシス(Streptomyces ogaensis)、ストレプトマイセス・オイディオスポラス(Streptomyces oidiosporus)、ストレプトマイセス・オリバセイスクレロティカス(Streptomyces olivaceiscleroticus)、ストレプトマイセス・オリバセオビリディス(Streptomyces olivaceoviridis)、ストレプトマイセス・オリバセウス(Streptomyces olivaceus)、ストレプトマイセス・オリボクロモゲンシス(Streptomyces olivochromogenes)、ストレプトマイセス・オリボクロモゲンシス・サブスピーシーズ・サイトビリナス(Streptomyces olivochromogenes subsp. cytovirinus)、ストレプトマイセス・オリボグリセウス(Streptomyces olivogriseus)、ストレプトマイセス・オリボバーティシラタス(Streptomyces olivoverticillatus)、ストレプトマイセス・オリボビリディス(Streptomyces olivoviridis)、ストレプトマイセス・オーミヤエンシス(Streptomyces omiyaensis)、ストレプトマイセス・オリノシー(Streptomyces orinoci)、ストレプトマイセス・オーナタス(Streptomyces ornatus)、ストレプトマイセス・オスマニエンシス(Streptomyces osmaniensis)、ストレプトマイセス・オストレオグリセウス(Streptomyces ostreogriseus)、ストレプトマイセス・オワシエンシス(Streptomyces owasiensis)、ストレプトマイセス・パクトム(Streptomyces pactum)、ストレプトマイセス・パダナス(Streptomyces padanus)、ストレプトマイセス・パリダス(Streptomyces pallidus)、ストレプトマイセス・パナカグリ(Streptomyces panacagri)、ストレプトマイセス・パナシテラエ(Streptomyces panaciterrae)、ストレプトマイセス・パナイエンシス(Streptomyces panayensis)、ストレプトマイセス・パラドキサス(Streptomyces paradoxus)、ストレプトマイセス・パラグアエンシス(Streptomyces paraguayensis)、ストレプトマイセス・パルブルス(Streptomyces parvulus)、ストレプトマイセス・パルブス(Streptomyces parvus)、ストレプトマイセス・パウシディアスタティカス(Streptomyces paucidiastaticus)、ストレプトマイセス・パウシスポレウス(Streptomyces paucisporeus)、ストレプトマイセス・パウシスポロゲネス(Streptomyces paucisporogenes)、ストレプトマイセス・パウラス(Streptomyces paulus)、ストレプトマイセス・ペルビエンシス(Streptomyces peruviensis)、ストレプトマイセス・ペウセティウス (Streptomyces peucetius)、ストレプトマイセス・ペウセティウス・サブスピーシーズ・カエシウス(Streptomyces peucetius subsp. caesius)、ストレプトマイセス・ペウセティウス・サブスピーシーズ・カーネウス(Streptomyces peucetius subsp. carneus)、ストレプトマイセス・ファエオクロモゲネス(Streptomyces phaeochromogenes)、ストレプトマイセス・ファエオファシエンス(Streptomyces phaeofaciens)、ストレプトマイセス・ファエオルテイクロモゲネス(Streptomyces phaeoluteichromatogenes)、ストレプトマイセス・ファエオルテイグリセウス(Streptomyces phaeoluteigriseus)、ストレプトマイセス・ファエオパーピュレウス(Streptomyces phaeopurpureus)、ストレプトマイセス・ファエオバーティシレイタス・サブスピーシーズ・タカツキエンシス(Streptomyces phaeoverticillatus subsp. takatsukiensis)、ストレプトマイセス・ファエオバリディス(Streptomyces phaeoviridis)、ストレプトマイセス・ファレトラエ(Streptomyces pharetrae)、ストレプトマイセス・フェモルファス(Streptomyces phemorphus)、ストレプトマイセス・フィトハビタンス(Streptomyces phytohabitans)、ストレプトマイセス・ピロサス(Streptomyces pilosus)、ストレプトマイセス・ピロビオロフスカス(Streptomyces piloviolofuscus)、ストレプトマイセス・ピオモゲネス(Streptomyces piomogenus)、ストレプトマイセス・プラテンシス(Streptomyces platensis)、ストレプトマイセス・プラテンシス・サブスピーシーズ・クラレンシス(Streptomyces platensis
subsp. clarensis)、ストレプトマイセス・プラテンシス・サブスピーシーズ・マルビナス(Streptomyces platensis subsp. malvinus)、ストレプトマイセス・プラテンシス・サブスピーシーズ・ロビゴシディカス(Streptomyces platensis subsp. robigocidicus)、ストレプトマイセス・プリカタス(Streptomyces plicatus)、ストレプトマイセス・プラムベウス(Streptomyces plumbeus)、ストレプトマイセス・プラムビレシステンス(Streptomyces plumbiresistens)、ストレプトマイセス・プルリカラレッセンス(Streptomyces pluricolorescens)、ストレプトマイセス・ポリアンティバイオティカス(Streptomyces polyantibioticus)、ストレプトマイセス・ポリクロモゲネス(Streptomyces polychromogenes)、ストレプトマイセス・ポリクロモゲネス・サブスピーシーズ・アレニコラス(Streptomyces polychromogenes subsp. arenicolus)、ストレプトマイセス・プーネンシス(Streptomyces poonensis)、ストレプトマイセス・プラエコックス(Streptomyces praecox)、ストレプトマイセス・プラシノピロサス(Streptomyces prasinopilosus)、ストレプトマイセス・プラシノスポルス(Streptomyces prasinosporus)、ストレプトマイセス・プラシヌス(Streptomyces prasinus)、ストレプトマイセス・(Streptomyces pristinaespiralis)、ストレプトマイセス・(Streptomyces propurpuratus)、ストレプトマイセス・プルニカラー(Streptomyces prunicolor)、ストレプトマイセス・プサモティカス(Streptomyces psammoticus)、ストレプトマイセス・シュードエキノスポレウス(Streptomyces pseudoechinosporeus)、ストレプトマイセス・シュードグリセオルス(Streptomyces pseudogriseolus)、ストレプトマイセス・シュードグリセオルス・サブスピーシーズ・フルコファーメンタンス(Streptomyces pseudogriseolus subsp. glucofermentans)、ストレプトマイセス・シュードベネズエラエ(Streptomyces pseudovenezuelae)、ストレプトマイセス・パルチャー(Streptomyces pulcher)、ストレプトマイセス・プルベラセウス(Streptomyces pulveraceus)、ストレプトマイセス・プニセウス(Streptomyces puniceus)、ストレプトマイセス・プニセウス・サブスピーシーズ・ドリセウス(Streptomyces puniceus subsp. doliceus)、ストレプトマイセス・プニシスカビエイ(Streptomyces puniciscabiei)、ストレプトマイセス・パーペオクロモゲネス(Streptomyces purpeochromogenes)、ストレプトマイセス・パーペオフュスカス(Streptomyces purpeofuscus)、ストレプトマイセス・パープラッセンス(Streptomyces purpurascens)、ストレプトマイセス・パープレオフスカス(Streptomyces purpureofuscus)、ストレプトマイセス・パープレオフスカス・サブスピーシーズ・アコアグランス(Streptomyces purpureofuscus subsp. acoagulans)、ストレプトマイセス・パープレウス(Streptomyces purpureus)、ストレプトマイセス・パープロゲネイスクレロティカス(Streptomyces purpurogeneiscleroticus)、ストレプトマイセス・ピリドマイセティカス(Streptomyces pyridomyceticus)、ストレプトマイセス・レイスモクロモゲネス(Streptomyces racemochromogenes)、ストレプトマイセス・ラセモサス(Streptomyces racemosus)、ストレプトマイセス・ラジオピュグナンス(Streptomyces radiopugnans)、ストレプトマイセス・ラフィノサス(Streptomyces raffinosus)、ストレプトマイセス・ラメウス(Streptomyces rameus)、ストレプトマイセス・ラモシスシムス(Streptomyces ramosissimus)、ストレプトマイセス・ラムローサス(Streptomyces ramulosus)、ストレプトマイセス・ラングーン(Streptomyces rangoon)、ストレプトマイセス・ラングーンエンシス(Streptomyces rangoonensis)、ストレプトマイセス・ラパマイシンカス(Streptomyces rapamycincus)、ストレプトマイセス・レシフェンシス(Streptomyces recifensis)、ストレプトマイセス・レクティビオラセウス(Streptomyces rectiviolaceus)、ストレプトマイセス・レフュイネウス・サブスピーシーズ・サーモトレランス(Streptomyces refuineus subsp. thermotolerans)、ストレプトマイセス・レガリス(Streptomyces regalis)、ストレプトマイセス・レゲンシス(Streptomyces regensis)、ストレプトマイセス・レジストマイシフィカス(Streptomyces resistomycificus)、ストレプトマイセス・レティクリ・サブスピーシーズ・プロトマイシカス(Streptomyces reticuli subsp. protomycicus)、ストレプトマイセス・レティクリスカビエイ(Streptomyces reticuliscabiei)、ストレプトマイセス・リゾスファエリカス(Streptomyces rhizosphaericus)、ストレプトマイセス・リボシディフィカス(Streptomyces ribosidificus)、ストレプトマイセス・リモファシエンス(Streptomyces rimofaciens)、ストレプトマイセス・リモーサス(Streptomyces rimosus)、ストレプトマイセス・リモーサス・サブスピーシーズ・パロモマイシナス(Streptomyces rimosus subsp. paromomycinus)、ストレプトマイセス・リモーサス・サブスピーシーズ・リモーサス(Streptomyces rimosus subsp. rimosus)、ストレプトマイセス・リシリエンシス(Streptomyces rishiriensis)、ストレプトマイセス・ロベフスカス(Streptomyces robefuscus)、ストレプトマイセス・ロシェイ(Streptomyces rochei)、ストレプトマイセス・ローサ(Streptomyces rosa)、ストレプトマイセス・ローサ・サブスピーシーズ・ノトエンシス(Streptomyces rosa subsp. notoensis)、ストレプトマイセス・ロゼイスクレロティカス(Streptomyces roseiscleroticus)、ストレプトマイセス・ロゼオアルバス(Streptomyces roseoalbus)、ストレプトマイセス・ロゼオアウランティウス(Streptomyces roseoaurantius)、ストレプトマイセス・ロゼオクロモゲネス(Streptomyces roseochromogenes)、ストレプトマイ
セス・ロゼオクロモゲナス(Streptomyces roseochromogenus)、ストレプトマイセス・ロゼオクロモゲナス・サブスピーシーズ・アルボサイクリニ(Streptomyces roseochromogenus subsp. albocyclini)、ストレプトマイセス・ロゼオシネレウス(Streptomyces roseocinereus)、ストレプトマイセス・ロゼオディアスタティカス(Streptomyces roseodiastaticus)、ストレプトマイセス・ロゼオフラバス(Streptomyces roseoflavus)、ストレプトマイセス・ロゼオフルバス(Streptomyces roseofulvus)、ストレプトマイセス・ロゼオグリセウス(Streptomyces roseogriseus)、ストレプトマイセス・ロゼオリラシナス(Streptomyces roseolilacinus)、ストレプトマイセス・ロゼオラス(Streptomyces roseolus)、ストレプトマイセス・ロゼオルテウス(Streptomyces roseoluteus)、ストレプトマイセス・ロゼオプラタス(Streptomyces roseoplatus)、ストレプトマイセス・ロゼオルーベンス(Streptomyces roseorubens)、ストレプトマイセス・ロゼオスポラス(Streptomyces roseosporus)、ストレプトマイセス・ロゼオバーティシラタス(Streptomyces roseoverticillatus)、ストレプトマイセス・ロゼオビオラセウス(Streptomyces roseoviolaceus)、ストレプトマイセス・ロゼオビオラセンス(Streptomyces roseoviolascens)、ストレプトマイセス・ロゼオビリディス(Streptomyces roseoviridis)、ストレプトマイセス・ロゼウス(Streptomyces roseus)、ストレプトマイセス・ルバー(Streptomyces ruber)、ストレプトマイセス・ルビカラー(Streptomyces rubicolor)、ストレプトマイセス・ルビダス(Streptomyces rubidus)、ストレプトマイセス・ルビギノソヘルボルス(Streptomyces rubiginosohelvolus)、ストレプトマイセス・ルビギノーサス(Streptomyces rubiginosus)、ストレプトマイセス・ルブリレティクリ(Streptomyces rubrireticuli)、ストレプトマイセス・ルブロサイアノディアスタティカス・サブスピーシーズ・ピガー(Streptomyces rubrocyanodiastaticussubsp. piger)、ストレプトマイセス・ルブログリセウス(Streptomyces
rubrogriseus)、ストレプトマイセス・ルブロラベンデゥラエ(Streptomyces rubrolavendulae)、ストレプトマイセス・ルブロバールコサス(Streptomyces rubroverrucosus)、ストレプトマイセス・ルブラス(Streptomyces rubrus)、ストレプトマイセス・ルフォクロモゲネス(Streptomyces rufochromogenes)、ストレプトマイセス・ルトガーセンシス(Streptomyces rutgersensis)、ストレプトマイセス・レンシス(Streptomyces ryensis)、ストレプトマイセス・サハチロイ(Streptomyces sahachiroi)、ストレプトマイセス・サカイエンシス(Streptomyces sakaiensis)、ストレプトマイセス・サリナラム(Streptomyces salinarum)、ストレプトマイセス・サムプソニイ(Streptomyces sampsonii)、ストレプトマイセス・サングリエリー(Streptomyces sanglieri)、ストレプトマイセス・サナンエンシス(Streptomyces sannanensis)、ストレプトマイセス・サンヌレンシス(Streptomyces sannurensis)、ストレプトマイセス・サンエンシス(Streptomyces sanyensis)、ストレプトマイセス・サプロフィティカス(Streptomyces saprophyticus)、ストレプトマイセス・サラセティカス(Streptomyces saraceticus)、ストレプトマイセス・サヤマエンシス(Streptomyces sayamaensis)、ストレプトマイセス・スカビエイー(Streptomyces scabiei)、ストレプトマイセス・スカブリスポルス(Streptomyces scabrisporus)、ストレプトマイセス・スクレログラヌラタス(Streptomyces sclerogranulatus)、ストレプトマイセス・スクレロティアルス(Streptomyces sclerotialus)、ストレプトマイセス・スコピフォルミス(Streptomyces scopiformis)、ストレプトマイセス・セディ(Streptomyces sedi)、ストレプトマイセス・セノエンシス(Streptomyces senoensis)、ストレプトマイセス・ソウレンシス(Streptomyces seoulensis)、ストレプトマイセス・セプタタス(Streptomyces septatus)、ストレプトマイセス・セリアニマタス(Streptomyces serianimatus)、ストレプトマイセス・セタエ(Streptomyces setae)、ストレプトマイセス・セトネンシス(Streptomyces setonensis)、ストレプトマイセス・セトニイ(Streptomyces setonii)、ストレプトマイセス・シャンキシエンシス(Streptomyces shaanxiensis)、ストレプトマイセス・シオダエンシス(Streptomyces shiodaensis)、ストレプトマイセス・ショウドエンシス(Streptomyces showdoensis)、ストレプトマイセス・シンデネンシス(Streptomyces sindenensis)、ストレプトマイセス・シオヤエンシス(Streptomyces sioyaensis)、ストレプトマイセス・ソディイフィルス(Streptomyces sodiiphilus)、ストレプトマイセス・ソマリエンシス(Streptomyces somaliensis)、ストレプトマイセス・スパディシス(Streptomyces spadicis)、ストレプトマイセス・スパーソゲネス(Streptomyces sparsogenes)、ストレプトマイセス・スパーサス(Streptomyces sparsus)、ストレプトマイセス・スペシアリス(Streptomyces specialis)、ストレプトマイセス・スペクタビリス(Streptomyces spectabilis)、ストレプトマイセス・スペイボナエ(Streptomyces speibonae)、ストレプトマイセス・スフェロイデス(Streptomyces spheroides)、ストレプトマイセス・スピニクロモゲネス(Streptomyces spinichromogenes)、ストレプトマイセス・スピニコウマレンシス(Streptomyces spinicoumarensis)、ストレプトマイセス・スピノベルコサス(Streptomyces spinoverrucosus)、ストレプトマイセス・スピラリス(Streptomyces spiralis)、ストレプトマイセス・スピロバーティシラタス(Streptomyces spiroverticillatus)、ストレプトマイセス・スポンギアエ(Streptomyces spongiae)、ストレプトマイセス・スポロシネレウス(Streptomyces sporocinereus)、ストレプトマイセス・スポロクリベイタス(Streptomyces sporoclivatus)、ストレプトマイセス・スポロラベウス(Streptomyces spororaveus)、ストレプトマイセス・スポロベルコサス(Streptomyces sporoverrucosus)、ストレプトマイセス・ステフィスバーゲンシス(Streptomyces steffisburgensis)、ストレプトマイセス・ステフィスバーゲンシス・サブスピーシーズ・ステフィスバーゲンシス(Streptomyces steffisburgensis subsp. steffisburgensis)、ストレプトマイセス・ステリスカビエイ(Streptomyces stelliscabiei)、ストレプトマイセス・ストラミネウス(Streptomyces stramineus)、ストレプトマイセス・サブルティラス(Streptomyces subrutilus)、ストレプトマイセス・サダネンシス(Streptomyces sudanensis)、ストレプトマイセス・スルフォノファシエンス(Streptomyces sulfonofaciens)、ストレプトマイセス・スルフレウス(Streptomyces sulphureus)、ストレプトマイセス・スビセウス(Streptomyces sviceus)、ストレプトマイセス・シンネマトフォルマンス(Streptomyces synnematoformans)、ストレプトマイセス・タナシエンシス(Streptomyces tanashiensis)、ストレプトマイセス・タナシエンシス・サブスピーシーズ・セファロマイセティカス(Streptomyces tanashiensis subsp. cephalomyceticus)、ストレプトマイセス・タテヤメンシス(Streptomyces tateyamensis)、ストレプトマイセス・トウリカス(Streptomyces tauricus)、ストレプトマイセス・テンダエ(Streptomyces tendae)、ストレプトマイセス・テネブラリウス(Streptomyces tenebrarius)、ストレプトマイセス・テンジマリエンシス(Streptomyces tenjimariensis)、ストレプトマイセス・ターミタム(Streptomyces termitum)、ストレプトマイセス・テスタセウス(Streptomyces testaceus)、ストレプトマイセス・テタヌセムス(Streptomyces tetanusemus)、ストレプトマイセス・サーモアルカリトラレンス(Streptomyces
thermoalcalitolerans)、ストレプトマイセス・サーモアトロビリディス(Streptomyces thermoatroviridis)、ストレプトマイセス・サーモカルボキシドボランス(Streptomyces thermocarboxydovorans)、ストレプトマイセス・サーモカルボキシダス(Streptomyces thermocarboxydus)、ストレプトマイセス・サーモカスタネウス(Streptomyces
thermocastaneus)、ストレプトマイセス・サーモコエルレセンス(Streptomyces thermocoerulescens)、ストレプトマイセス・サーモコプロフィラス(Streptomyces thermocoprophilus)、ストレプトマイセス・サーモシアネオマキュレイタス(Streptomyces thermocyaneomaculatus)、ストレプトマイセス・サーモシアネオビオラセウス(Streptomyces thermocyaneoviolaceus)、ストレプトマイセス・サーモディアステイティカス(Streptomyces thermodiastaticus)、ストレプトマイセス・サーモフラバス(Streptomyces thermoflavus)、ストレプトマイセス・サーモグリセビオラセウス(Streptomyces
thermogriseoviolaceus)、ストレプトマイセス・サーモグリセウス(Streptomyces thermogriseus)、ストレプトマイセス・サーモハイグロスコピカス・サブスピーシーズ・ラビギノサス(Streptomyces thermohygroscopicus subsp. rubiginosus)、ストレプトマイセス・サーモリラシナス(Streptomyces thermolilacinus)、ストレプトマイセス・サーモリネアタス(Streptomyces thermolineatus)、ストレプトマイセス・サーモルテウス(Streptomyces thermoluteus)、ストレプトマイセス・サーモルテウス・サブスピーシーズ・フスカス(Streptomyces thermoluteus subsp. fuscus)、ストレプトマイセス・サーモニトリフィカンス(Streptomyces thermonitrificans)、ストレプトマイセス・サーモオリバセウス・サブスピーシーズ・フスカス(Streptomyces thermoolivaceus subsp. fuscus)、ストレプトマイセス・サーモオリバセウス・サブスピーシーズ・サーモオリバセウス(Streptomyces thermoolivaceus subsp. thermoolivaceus)、ストレプトマイセス・サーモフィラス(Streptomyces thermophilus)、ストレプトマイセス・サーモスピノシスポラス(Streptomyces thermospinosisporus)、ストレプトマイセス・サーモトレランス(Streptomyces thermotolerans)、ストレプトマイセス・サーモビオラセウス(Streptomyces thermoviolaceus)、ストレプトマイセス・サーモビオラセウス・サブスピーシーズ・アピンゲンス(Streptomyces thermoviolaceus subsp. apingens)、ストレプトマイセス・サーモビオラセウス・サブスピーシーズ・サーモビオラセウス(Streptomyces thermoviolaceus subsp. thermoviolaceus)、ストレプトマイセス・サーモバルガリス(Streptomyces thermovulgaris)、ストレプトマイセス・シングヒレンシス(Streptomyces thinghirensis)、ストレプトマイセス・チオルテウス(Streptomyces thioluteus)、ストレプトマイセス・スレオマイセティカス(Streptomyces threomyceticus)、ストレプトマイセス・トルロサス(Streptomyces torulosus)、ストレプトマイセス・トサエンシス(Streptomyces tosaensis)、ストレプトマイセス・トキシファーティリス(Streptomyces toxifertilis)、ストレプトマイセス・トキシトリシニ(Streptomyces toxytricini)、ストレプトマイセス・トヨカエンシス(Streptomyces toyocaensis)、ストレプトマイセス・トリアングラタス(Streptomyces triangulatus)、ストレプトマイセス・トリカラー(Streptomyces tricolor)、ストレプトマイセス・トリカラミニカス(Streptomyces triculaminicus)、ストレプトマイセス・トリオスティニカス(Streptomyces triostinicus)、ストレプトマイセス・トリトレランス(Streptomyces tritolerans)、ストレプトマイセス・ツキヨネンシス(Streptomyces tsukiyonensis)、ストレプトマイセス・ツシマエンシス(Streptomyces tsusimaensis)、ストレプトマイセ
ス・チュバーシディカス(Streptomyces tubercidicus)、ストレプトマイセス・ツイラス(Streptomyces tuirus)、ストレプトマイセス・ツメマセランス(Streptomyces tumemacerans)、ストレプトマイセス・ツムリ(Streptomyces tumuli)、ストレプトマイセス・ツーギディスカビエス(Streptomyces turgidiscabies)、ストレプトマイセス・アムブリナス(Streptomyces umbrinus)、ストレプトマイセス・アムブロサス(Streptomyces umbrosus)、ストレプトマイセス・バリアビィス(Streptomyces variabilis)、ストレプトマイセス・バリエガタス(Streptomyces variegatus)、ストレプトマイセス・バリウス(Streptomyces varius)、ストレプトマイセス・バーソビエンシス(Streptomyces varsoviensis)、ストレプトマイセス・バスタス(Streptomyces vastus)、ストレプトマイセス・ベロサス(Streptomyces vellosus)、ストレプトマイセス・ベンダーゲンシス(Streptomyces vendargensis)、ストレプトマイセス・ベネズエラエ(Streptomyces venezuelae)、ストレプトマイセス・ベルネ(Streptomyces verne)、ストレプトマイセス・バーシペリス(Streptomyces versipellis)、ストレプトマイセス・バーティシレイタス(Streptomyces verticillatus)、ストレプトマイセス・バーティシラス(Streptomyces verticillus)、ストレプトマイセス・ビアトナメンシス(Streptomyces vietnamensis)、ストレプトマイセス・ビナセウス(Streptomyces vinaceus)、ストレプトマイセス・ビナセウスドラッパス(Streptomyces vinaceusdrappus)、ストレプトマイセス・ビオラセオクロモゲネス(Streptomyces violaceochromogenes)、ストレプトマイセス・ビオラセオラタス(Streptomyces violaceolatus)、ストレプトマイセス・ビオラセオレクタス(Streptomyces violaceorectus)、ストレプトマイセス・ビオラセオルバー(Streptomyces violaceoruber)、ストレプトマイセス・ビオラセオルビダス(Streptomyces violaceorubidus)、ストレプトマイセス・ビオラセウス(Streptomyces violaceus)、ストレプトマイセス・ビオラセウスニガー(Streptomyces violaceusniger)、ストレプトマイセス・ビオラルス(Streptomyces violarus)、ストレプトマイセス・ビオラセンス(Streptomyces violascens)、ストレプトマイセス・ビオレンス(Streptomyces violens)、ストレプトマイセス・ビオロルーベンス(Streptomyces violorubens)、ストレプトマイセス・ビレンス(Streptomyces virens)、ストレプトマイセス・バーギニアエ(Streptomyces virginiae)、ストレプトマイセス・バーギニアエ・サブスピーシーズ・リポキサエ(Streptomyces virginiae subsp. lipoxae)、ストレプトマイセス・ビリダンス(Streptomyces viridans)、ストレプトマイセス・ビリディファシエンス(Streptomyces viridifaciens)、ストレプトマイセス・ビリディフラバス(Streptomyces viridiflavus)、ストレプトマイセス・ビリディス(Streptomyces viridis)、ストレプトマイセス・ビリディビオラセウス(Streptomyces viridiviolaceus)、ストレプトマイセス・ビリドブルンネウス(Streptomyces viridobrunneus)、ストレプトマイセス・ビリドクロモゲネス(Streptomyces viridochromogenes)、ストレプトマイセス・ビリドクロモゲネス・サブスピーシーズ・コマベンシス(Streptomyces viridochromogenessubsp. komabensis)、ストレプトマイセス・ビリドクロモゲネス・サブスピーシーズ・サルフォマイシニ(Streptomyces viridochromogenes subsp. sulfomycini)、ストレプトマイセス・ビリドディアステイティカス(Streptomyces viridodiastaticus)、ストレプトマイセス・ビリドゲネス(Streptomyces viridogenes)、ストレプトマイセス・ビリドスポラス(Streptomyces viridosporus)、ストレプトマイセス・ビリドバールコサス(Streptomyces viridoverrucosus)、ストレプトマイセス・ビタミノフィラス(Streptomyces vitaminophilus)、ストレプトマイセス・バルガリス(Streptomyces vulgaris)、ストレプトマイセス・ウェドモレンシス(Streptomyces wedmorensis)、ストレプトマイセス・ウェリングトニアエ(Streptomyces wellingtoniae)、ストレプトマイセス・ウェラエンシス(Streptomyces werraensis)、ストレプトマイセス・ウィルモレイ(Streptomyces willmorei)、ストレプトマイセス・ウィスターリオプシス(Streptomyces wistariopsis)、ストレプトマイセス・ウーレンシス(Streptomyces woolensis)、ストレプトマイセス・キサントクロモゲネス(Streptomyces xanthochromogenes)、ストレプトマイセス・キサントシディカス(Streptomyces xanthocidicus)、ストレプトマイセス・キサントリティカス(Streptomyces
xantholiticus)、ストレプトマイセス・キサントファエウス(Streptomyces xanthophaeus)、ストレプトマイセス・キシアメネンシス(Streptomyces xiamenensis)、ストレプトマイセス・キシングハイエンシス(Streptomyces xinghaiensis)、ストレプトマイセス・キシロファガス(Streptomyces xylophagus)、ストレプトマイセス・ヤングリネンシス(Streptomyces yanglinensis)、ストレプトマイセス・ヤニイ(Streptomyces
yanii)、ストレプトマイセス・ヤテンシス(Streptomyces yatensis)、ストレプトマイセス・ヤオチョネンシス(Streptomyces yeochonensis)、ストレプトマイセス・ヤレバネンシス(Streptomyces yerevanensis)、ストレプトマイセス・ヨグヤカーテンシス(Streptomyces yogyakartensis)、ストレプトマイセス・ヨコスカネンシス(Streptomyces yokosukanensis)、ストレプトマイセス・ヨウソウフィエンシス(Streptomyces
youssoufiensis)、ストレプトマイセス・ユンナネンシス(Streptomyces yunnanensis)、ストレプトマイセス・ザオマイセティカス(Streptomyces zaomyceticus)、ストレプトマイセス・ザレンシス(Streptomyces zelensis)、ストレプトマイセス・ジンシレシステンス(Streptomyces zinciresistens)等が挙げられる。
ゲオバシラス(Geobacillus)属に分類される微生物としては、例えば、ゲオバシラス・カルドプロテオライティカス(Geobacillus caldoproteolyticus)、ゲオバシラス・カルドキシロシライティカス(Geobacillus caldoxylosilyticus)、ゲオバシラス・デビリス(Geobacillus debilis)、ゲオバシラス・ガラクトシダシウス(Geobacillus galactosidasius)、ゲオバシラス・ガーゲンシス(Geobacillus gargensis)、ゲオバシラス・ジュラシカス(Geobacillus jurassicus)、ゲオバシラス・カウストフィラス(Geobacillus kaustophilus)、ゲオバシラス・リトゥアニカス(Geobacillus lituanicus)、ゲオバシラス・パリダス(Geobacillus pallidus)、ゲオバシラス・ステアロサーモフィラス(Geobacillus stearothermophilus)、ゲオバシラス・ストロムボリエンシス(Geobacillus stromboliensis)、ゲオバシラス・サブテラネウス(Geobacillus subterraneus)、ゲオバシラス・テピダマンス(Geobacillus tepidamans)、ゲオバシラス・サーモカテヌレイタス(Geobacillus thermocatenulatus)、ゲオバシラス・サーモデニトリフィカンス(Geobacillus thermodenitrificans)、ゲオバシラス・サーモデニトリフィカンス・サブスピーシーズ・カリダス(Geobacillus thermodenitrificans subsp. calidus)、ゲオバシラス・サーモグルコシダシウス(Geobacillus thermoglucosidasius)、ゲオバシラス・サーモレオボランス(Geobacillus thermoleovorans)、ゲオバシラス・トエビ(Geobacillus toebii)、ゲオバシラス・ウゼンシス(Geobacillus
uzensis)、ゲオバシラス・バルカニ(Geobacillus vulcani)、ゲオバシラス・ザリハエ(Geobacillus zalihae)等が挙げられる。
ロドコッカス(Rhodococcus)属に分類される微生物としては、例えば、ロドコッカス・ロドクロウス(Rhodococcus rhodochrous)、ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)、ロドコッカス・エクイ(Rhodococcus equi)、ロドコッカス・ロドニ(Rhodococcus rhodnii)、 ロドコッカス・コラリヌス(Rhodococcus corallinus)、ロドコッカス・ルブロペルチンクタス(Rhodococcus rubropertinctus)、ロドコッカス・コプロフィラス(Rhodococcus coprophilus)、ロドコッカス・グロベルルス(Rhodococcus globerulus)、ロドコッカス・クロロフェノリカス(Rhodococcus chlorophenolicus)、ロドコッカス・ルテウス(Rhodococcus luteus)、ロドコッカス・アイシェンシス(Rhodococcus aichiensis)、ロドコッカス・チュブエンシス(Rhodococcus chubuensis)、ロドコッカス・マリス(Rhodococcus maris)、ロドコッカス・ファシエンス(Rhodococcus fascines)等が挙げられる。
さらに、Magnetospirillum属に分類される微生物としてはMagnetospirillum magneticum、Rhodospirillum属に分類される微生物としてはRhodospirillum rubrum、Rhodospirillum centenumおよびRhodospirillum photometricum、Azospirillum属に分類される微生物としては、Azospirillum lipoferumおよびAzospirillum brasilense、Tistrella属に分類される微生物としてはTistrella mobilis、Acidiphilium属に分類される微生物としてはAcidiphilium cryptumおよびAcidiphilium multivorum、Rhodobacter属に分類される微生物としてはRhodobacter sphaeroidesおよびRhodobacter capsulatus、Ruegeria属に分類される微生物としてはRuegeria pomeroyi、Roseobacter属に分類される微生物としてはRoseobacter denitrificansおよびRoseobacter litoralis、Dinoroseobacter属に分類される微生物としてはDinoroseobacter shibae、Phaeobacter属に分類される微生物としてはPhaeobacter gallaeciensis、Octadecabacter属に分類される微生物としてはOctadecabacter antarcticusおよびOctadecabacter arcticus、Hyphomonas属に分類される微生物としてはHyphomonas neptunium、Maricaulis属に分類される微生物としてはMaricaulis maris、Hirschia属に分類される微生物としてはHirschia baltica、Novosphingobium属に分類される微生物としてはNovosphingobium aromaticivorans、Sphingopyxis属に分類される微生物としてはSphingopyxis alaskensis、Sphingobium属に分類される微生物としてはSphingobium japonicumおよびSphingobium chlorophenolicum、Erythrobacter属に分類される微生物としてはErythrobacter litoralis、Caulobacter属に分類される微生物としてはCaulobacter crescentusおよびCaulobacter segnis、Phenylobacterium属に分類される微生物としてはPhenylobacterium zucineum、Asticcacaulis属に分類される微生物としてはAsticcacaulis excentricus、Sinorhizobium属に分類される微生物としてはSinorhizobium meliloti、Sinorhizobium medicaeおよびSinorhizobium fredii、Azorhizobium属に分類される微生物としてはAzorhizobium caulinodans、Brucella属に分類される微生物としてはBrucella melitensis、Brucella abortus、Brucella suis、Brucella ovis、Brucella canis、Brucella microti、Brucella pinnipedialisおよびBrucella ceti、Aurantimonas属に分類される微生物としてはAurantimonas manganoxydans、Bradyrhizobium属に分類される微生物としてはBradyrhizobium japonicum、Agromonas属に分類される微生物としてはAgromonas oligotrophica、Rhodopseudomonas属に分類される微生物としてはRhodopseudomonas palustris、Nitrobacter属に分類される微生物としてはNitrobacter winogradskyiおよびNitrobacter hamburgensis、Methylobacterium属に分類される微生物としてはMethylobacterium extorquens、Methylobacterium radiotoleransおよびMethylobacterium nodulans、Rhodomicrobium属に分類される微生物としてはRhodomicrobium vannielii、Pelagibacterium属に分類される微生物としてはPelagibacterium halotolerans、Parvibaculum属に分類される微生物としてはParvibaculum lavamentivorans、Parvularcula属に分類される微生物としてはParvularcula bermudensis、Burkholderia属に分類される微生物としてはBurkholderia mallei、Burkholderia pseudomallei、Burkholderia thailandensis、Burkholderia vietnamiensis、Burkholderia cenocepacia、Burkholderia ambifaria、Burkholderia multivorans、Burkholderia cepacia、Burkholderia xenovorans、Burkholderia phymatum、Burkholderia phytofirmans、Burkholderia glumae、Burkholderia rhizoxinica、Burkholderia gladioli、Burkholderia phenoliruptrixおよびBurkholderia oklahomensis、Ralstonia属に分類される微生物としてはRalstonia solanacearum、Ralstonia
pickettiiおよびRalstonia eutropha、Cupriavidus属に分類される微生物としてはCupriavidus metallidurans、Cupriavidus taiwanensisおよびCupriavidus necator、Polynucleobacter属に分類される微生物としてはPolynucleobacter necessarius、Bordetella属に分類される微生物としてはBordetella pertussis、Bordetella parapertussis、Bordetella petriiおよびBordetella avium、Taylorella属に分類される微生物としてはTaylorella equigenitalis、Alicycliphilus属に分類される微生物としてはAlicycliphilus denitrificans、Delftia属に分類される微生物としてはDelftia acidovorans、Ramlibacter属に分類される微生物としてはRamlibacter tataouinensis、Rhodoferax属に分類される微生物としてはRhodoferax ferrireducens、Variovorax属に分類される微生物としてはVariovorax paradoxus、Polaromonas属に分類される微生物としてはPolaromonas naphthalenivorans、Acidovorax属に分類される微生物としてはAcidovorax citrulli、Acidovorax ebreusおよびAcidovorax avenae、Verminephrobacter属に分類される微生物としてはVerminephrobacter eiseniae、Herminiimonas属に分類される微生物としてはHerminiimonas arsenicoxydans、Herbaspirillum属に分類される微生物としてはHerbaspirillum seropedicae、Collimonas属に分類される微生物としてはCollimonas fungivorans、Chromobacterium属に分類される微生物としてはChromobacterium violaceum、Laribacter属に分類される微生物としてはLaribacter hongkongensis、Pseudogulbenkiania属に分類される微生物としてはPseudogulbenkiania ferrooxidans、Nitrosomonas属に分類される微生物としてはNitrosomonas europaea、Nitrosospira属に分類される微生物としてはNitrosospira multiformis、Aromatoleum属に分類される微生物としてはAromatoleum aromaticum、Dechloromonas属に分類される微生物としてはDechloromonas aromatica、Azospira (Dechlorosoma)属に分類される微生物としてはAzospira oryzae(Dechlorosoma suillum)、Rheinheimera属に分類される微生物としてはRheinheimera nanhaiensis、Nitrosococcus属に分類される微生物としてはNitrosococcus oceani、Halorhodospira属に分類される微生物としてはHalorhodospira halophila、Xanthomonas属に分類される微生物としてはXanthomonas campestris、Xanthomonas axonopodis、Xanthomonas oryzae、Xanthomonas albilineansおよびXanthomonas citri、Stenotrophomonas属に分類される微生物としてはStenotrophomonas maltophilia、Pseudoxanthomonas属に分類される微生物としてはPseudoxanthomonas suwonensisおよびPseudoxanthomonas spadix、Francisella属に分類される微生物としてはFrancisella tularensisおよびFrancisella novicida、Cycloclasticus 属に分類される微生物としてはCycloclasticus zancles、Hahella属に分類される微生物としてはHahella chejuensis、Halomonas属に分類される微生物としてはHalomonas elongata、Alcanivorax属に分類される微生物としてはAlcanivorax borkumensisおよびAlcanivorax dieselolei、Kangiella属に分類される微生物としてはKangiella koreensis、Azotobacter属に分類される微生物としてはAzotobacter vinelandii、Psychrobacter属に分類される微生物としてはPsychrobacter arcticusおよびPsychrobacter cryohalolentis、Alishewanella属に分類される微生物としてはAlishewanella jeotgali、Alteromonas属に分類される微生物としてはAlteromonas macleodii、Glaciecola属に分類される微生物としてはGlaciecola nitratireducens、Glaciecola psychrophilaおよびGlaciecola punicea、Marinobacter属に分類される微生物としてはMarinobacter aquaeolei、Marinobacter hydrocarbonoclasticus、Marinobacter adhaerens、Marinobacter algicolaおよびMarinobacter manganoxydans、Marinobacterium属に分類される微生物としてはMarinobacterium stanieri、Saccharophagus属に分類される微生物としてはSaccharophagus degradans、Ferrimonas属に分類される微生物としてはFerrimonas balearica、Idiomarina属に分類される微生物としてはIdiomarina loihiensisおよびIdiomarina baltica、Colwellia属に分類される微生物としてはColwellia psychrerythraea、Pseudoalteromonas属に分類される微生物としてはPseudoalteromonas haloplanktis、Pseudoalteromonas atlanticaおよびPseudoalteromonas tunicata、Vibrio属に分類される微生物としてはVibrio parahaemolyticus、Vibrio vulnificus、Vibrio harveyi、Vibrio furnissii、Vibrio tubiashii、Vibrio sinaloensis、Vibrio rotiferianus、Vibrio orientalis、Vibrio harveyi、Vibrio coralliilyticus、Vibrio caribbenthicus、Vibrio brasiliensisおよびVibrio alginolyticus、Photobacterium属に分類される微生物としてはPhotobacterium profundum、Aeromonas属に分類される微生物としてはAeromonas hydrophila、Aeromonas salmonicidaおよびAeromonas veronii、Salinisphaera属に分類される微生物としてはSalinisphaera shabanensis、Legionella属に分類される微生物としてはLegionella pneumophilaおよびLegionella
longbeachae、Coxiella属に分類される微生物としてはCoxiella burnetii、Desulfococcus属に分類される微生物としてはDesulfococcus oleovorans、Desulfobacterium属に分類される微生物としてはDesulfobacterium autotrophicum、Desulfatibacillum属に分類される微生物としてはDesulfatibacillum alkenivorans、Desulfobulbus属に分類される微生物としてはDesulfobulbus propionicus、Desulfarculus属に分類される微生物としてはDesulfarculus baarsii、Geobacter属に分類される微生物としてはGeobacter metallireducens、Geobacter uraniireducensおよびGeobacter bemidjiensis、Syntrophobacter属に分類される微生物としてはSyntrophobacter fumaroxidans、Syntrophus属に分類される微生物としてはSyntrophus aciditrophicus、Desulfomonile属に分類される微生物としてはDesulfomonile tiedjei、Bdellovibrio属に分類される微生物としてはBdellovibrio bacteriovorusおよびBdellovibrio exovorus、Bacteriovorax属に分類される微生物としてはBacteriovorax marinus、Stigmatella属に分類される微生物としてはStigmatella aurantiaca、Myxococcus属に分類される微生物としてはMyxococcus xanthusおよびMyxococcus fulvus、Anaeromyxobacter属に分類される微生物としてはAnaeromyxobacter dehalogenans、Sorangium属に分類される微生物としてはSorangium cellulosum、Haliangium属に分類される微生物としてはHaliangium ochraceum、Acidobacterium属に分類される微生物としてはAcidobacterium capsulatum、Granulicella属に分類される微生物としてはGranulicella tundricola、Ilumatobacter属に分類される微生物としてはIlumatobacter coccineum、Streptosporangium属に分類される微生物としてはStreptosporangium roseum、Nocardiopsis属に分類される微生物としてはNocardiopsis dassonvillei、Thermobifida属に分類される微生物としてはThermobifida fusca、Thermomonospora属に分類される微生物としてはThermomonospora curvata、Pseudonocardia属に分類される微生物としてはPseudonocardia dioxanivorans、Amycolatopsis属に分類される微生物としてはAmycolatopsis mediterranei、Saccharomonospora属に分類される微生物としてはSaccharomonospora viridisおよびSaccharomonospora xinjiangensis、Saccharopolyspora属に分類される微生物としてはSaccharopolyspora erythraeaおよびSaccharopolyspora spinosa、Thermobispora属に分類される微生物としてはThermobispora bispora、Actinosynnema属に分類される微生物としてはActinosynnema mirum、Micromonospora属に分類される微生物としてはMicromonospora aurantiaca、Salinispora属に分類される微生物としてはSalinispora tropicaおよびSalinispora arenicola、Verrucosispora属に分類される微生物として
はVerrucosispora maris、Kribbella属に分類される微生物としてはKribbella flavida、Corynebacterium属に分類される微生物としてはCorynebacterium jeikeium、Corynebacterium urealyticum、Corynebacterium glutamicum、Corynebacterium ammoniagenesおよびCorynebacterium kroppenstedtii、Nocardia属に分類される微生物としてはNocardia farcinica、Nocardia brasiliensisおよびNocardia cyriacigeorgica、Gordonia属に分類される微生物としてはGordonia bronchialis、Gordonia neofelifaecisおよびGordonia terrae、Dietzia属に分類される微生物としてはDietzia cinnamea、Mycobacterium属に分類される微生物としてはMycobacterium tuberculosis、Mycobacterium bovis、Mycobacterium leprae、Mycobacterium avium、Mycobacterium smegmatis、Mycobacterium ulcerans、Mycobacterium vanbaalenii、Mycobacterium gilvum、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium marinu、Mycobacterium massiliense、Mycobacterium phlei、Mycobacterium thermoresistibile、Mycobacterium tusciae、Mycobacterium xenopiおよびMycobacterium rhodesiae、Amycolicicoccus属に分類される微生物としてはAmycolicicoccus subflavus、Tsukamurella属に分類される微生物としてはTsukamurella paurometabola、Segniliparus属に分類される微生物としてはSegniliparus rotundus、Microbacterium属に分類される微生物としてはMicrobacterium testaceum、Micrococcus属に分類される微生物としてはMicrococcus luteus、Arthrobacter属に分類される微生物としてはArthrobacter arilaitensis、Arthrobacter chlorophenolicus、Arthrobacter globiformisおよびArthrobacter phenanthrenivorans、Renibacterium属に分類される微生物としてはRenibacterium salmoninarum、Kocuria属に分類される微生物としてはKocuria rhizophila、Kytococcus属に分類される微生物としてはKytococcus sedentarius、Cellulomonas属に分類される微生物としてはCellulomonas fimi、Intrasporangium属に分類される微生物としてはIntrasporangium calvum、Serinicoccus属に分類される微生物としてはSerinicoccus profundi、Frankia属に分類される微生物としてはFrankia alni、Acidothermus属に分類される微生物としてはAcidothermus cellulolyticus、Nakamurella属に分類される微生物としてはNakamurella multipartita、Geodermatophilus属に分類される微生物としてはGeodermatophilus obscurus、Stackebrandtia属に分類される微生物としてはStackebrandtia nassauensis、Catenulispora属に分類される微生物としてはCatenulispora acidiphila、Rubrobacter属に分類される微生物としてはRubrobacter xylanophilus、Conexibacter属に分類される微生物としてはConexibacter woesei、Oceanobacillus属に分類される微生物としてはOceanobacillus iheyensis、Lysinibacillus属に分類される微生物としてはLysinibacillus sphaericus、Halobacillus属に分類される微生物としてはHalobacillus halophilus、Alicyclobacillus属に分類される微生物としてはAlicyclobacillus acidocaldarius、Kyrpidia属に分類される微生物としてはKyrpidia tusci、Brevibacillus属に分類される微生物としてはBrevibacillus choshinensis、Lactobacillus属に分類される微生物としてはLactobacillus buchneri、、Clostridium属に分類される微生物としてはClostridium acetobutylicum、Clostridium perfringens、Clostridium kluyveri、Clostridium cellulovorans、Clostridium difficileおよびClostridium sticklandii、Alkaliphilus属に分類される微生物としてはAlkaliphilus metalliredigensおよびAlkaliphilus oremlandii、Syntrophomonas属に分類される微生物としてはSyntrophomonas wolfei、Syntrophothermus属に分類される微生物としてはSyntrophothermus lipocalidus、Eubacterium属に分類される微生物としてはEubacterium rectaleおよびEubacterium limosum、Desulfitobacterium属に分類される微生物としてはDesulfitobacterium hafniense、Desulfotomaculum属に分類される微生物としてはDesulfotomaculum reducens、Pelotomaculum属に分類される微生物としてはPelotomaculum thermopropionicum、Butyrivibrio属に分類される微生物としてはButyrivibrio proteoclasticus、Roseburia属に分類される微生物としてはRoseburia hominis、Oscillibacter属に分類される微生物としてはOscillibacter valericigenes、Thermoanaerobacter属に分類される微生物としてはThermoanaerobacter tengcongensis、Carboxydothermus属に分類される微生物としてはCarboxydothermus hydrogenoformans、Natranaerobius属に分類される微生物としてはNatranaerobius thermophilus、Haliscomenobacter属に分類される微生物としてはHaliscomenobacter hydrossis、Porphyromonas属に分類される微生物としてはPorphyromonas gingivalisおよびPorphyromonas asaccharolytica、Odoribacter属に分類される微生物としてはOdoribacter splanchnicus、Spirosoma属に分類される微生物としてはSpirosoma linguale、Runella属に分類される微生物としてはRunella slithyformis、Deinococcus属に分類される微生物としてはDeinococcus radiodurans、Deinococcus geothermalis、Deinococcus deserti、Deinococcus maricopensis、Deinococcus proteolyticusおよびDeinococcus gobiensis、Thermus属に分類される微生物としてはThermus thermophilus、Thermus agnaticus、Thermus flavus、Thermus caldophilus、Thermus ruderおよびThermus scotoductus、Meiothermus属に分類される微生物としてはMeiothermus ruberおよびMeiothermus silvanus、Oceanithermus属に分類される微生物としてはOceanithermus profundus、Marinithermus属に分類される微生物としてはMarinithermus hydrothermalis、Gemmatimonas属に分類される微生物としてはGemmatimonas aurantiaca、Fusobacterium属に分類される微生物としてはFusobacterium nucleatum、Ilyobacter属に分類される微生物としてはIlyobacter polytropus、Roseiflexus属に分類される微生物としてはRoseiflexus castenholzii、Herpetosiphon属に分類される微生物としてはHerpetosiphon aurantiacus、Thermomicrobium属に分類される微生物としてはThermomicrobium roseum、Thermotoga属に分類される微生物としてはThermotoga lettingae、Thermosipho属に分類される微生物としてはThermosipho melanesiensisおよびThermosipho africanus、Fervidobacterium属に分類される微生物としてはFervidobacterium nodosum、Deferribacter属に分類される微生物としてはDeferribacter desulfuricans、Calditerrivibrio属に分類される微生物としてはCalditerrivibrio nitroreducens、Flexistipes属に分類される微生物としてはFlexistipes sinusarabici、Metallosphaera属に分類される微生物としてはMetallosphaera sedula、Aeropyrum属に分類される微生物としてはAeropyrum pernix、Pyrobaculum属に分類される微生物としてはPyrobaculum aerophilum、Pyrobaculum islandicum、Pyrobaculum calidifontisおよびPyrobaculum neutrophilum、Caldivirga属に分類される微生物としてはCaldivirga maquilingensis、Vulcanisaeta属に分類される微生物としてはVulcanisaeta
distributa、Acidilobus属に分類される微生物としてはAcidilobus saccharovorans、Haloarcula属に分類される微生物としてはHaloarcula marismortui、Haloquadratum属に分類される微生物としてはHaloquadratum walsbyi、Natronomonas属に分類される微生物としてはNatronomonas pharaonis、Halorubrum属に分類される微生物としてはHalorubrum lacusprofundi、Haloterrigena属に分類される微生物としてはHaloterrigena turkmenica、Natrialba属に分類される微生物としてはNatrialba magadii、Halalkalicoccus属に分類される微生物としてはHalalkalicoccus jeotgali、Halogeometricum属に分類される微生物としてはHalogeometricum borinquense、Thermoplasma属に分類される微生物としてはThermoplasma acidophilumおよびThermoplasma volcanium、Picrophilus属に分類される微生物としてはPicrophilus torridus、Ferroplasma属に分類される微生物としてはFerroplasma acidarmanus、Archaeoglobus属に分類される微生物としてはArchaeoglobus fulgidusおよびArchaeoglobus veneficus、Ferroglobus属に分類される微生物としてはFerroglobus placidus、Polymorphum属に分類される微生物としてはPolymorphum
gilvum、Micavibrio属に分類される微生物としてはMicavibrio aeruginosavorus、Simiduia属に分類される微生物としてはSimiduia agarivorans、Leptothrix属に分類される微生物としてはLeptothrix cholodnii、Thiomonas属に分類される微生物としてはThiomonas intermedia、Rubrivivax属に分類される微生物としてはRubrivivax gelatinosus、Methylibium属に分類される微生物としてはMethylibium petroleiphilum、Anaerococcus属に分類される微生物としてはAnaerococcus prevotiiが特に好ましい。
真核生物に属する微生物としては、ユーロチウム目(Eurotiales)、サッカロミケス目(Saccharomycetales)、カプノディウム目(Capnodiales)、プレオスポラ目(Pleosporales)、クロボキン目(Ustilaginales)、シロキクラゲ目(Tremellales)、シストフィロバシディウム目(Cystofilobasidiales)、ビョウタケ目(Helotiales)、チャワンタケ目(Pezizales)、サルノコシカケ目(Polyporales)、ハラタケ目(Agaricales)、プクシニア目(Pucciniales)、マグナポルテ目(Magnaporthales)、フンタマカビ目(Sordariales)、ミクロアスクス目(Microascales)、ニクザキン目(Hypocreales)、スポリディオボルス目(Sporidiobolales)、モチビョウキン目(Exobasidiales)、マラッセジア目(Malasseziales)、ホネタケ目(Onygenales)、ラブルベニア目(Laboulbeniales)およびケカビ目(Mucorales)に属する微生物が挙げられる。
カプノディウム目(Capnodiales)に分類される微生物としてはMycosphaerella属、Zygophiala属、Zymoseptoria属、Cladosporium属およびCapnodium属、プレオスポラ目(Pleosporales)に分類される微生物としてはPreussia属、Brachycladium属、Cochliobolus属、Pleospora属、Pleospora属、Leptosphaeria属、Leptosphaerulina属、Phaeosphaeria属およびPyrenophora属、クロボキン目(Ustilaginales)に分類される微生物としてはPseudozyma属、Tolyposporium属およびUstilago属、シロキクラゲ目(Tremellales)に分類される微生物としてはBulleromyces属、Filobasidiella(Cryptococcus)属、Bullera属、Fellomyces属、Kockovaella属およびTrichosporon属、シストフィロバシディウム目(Cystofilobasidiales)に分類される微生物Mrakia属、Xanthophyllomyces属およびUdeniomyces属、ビョウタケ目(Helotiales)に分類される微生物としてはBotryotinia属、Monilia属、Monilinia属およびSclerotinia属、チャワンタケ目(Pezizales)に分類される微生物としてはPeziza属、Morchella属、Helvella属、Ascodesmis属、Ascobolus属およびTuber属、サルノコシカケ目(Polyporales)に分類される微生物としてはMycoleptodonoides属、Mycoaciella属、Parmastomyces 属およびPostia属、ハラタケ目(Agaricales)に分類される微生物としてはArthromyces 属、Mycenoporella属、Laccaria属、Moniliophthora属、Coprinopsis属およびSchizophyllum属、プクシニア目(Pucciniales)に分類される微生物としてはPuccinia属、Melampsora属、Cronartium属、Cyttaria属、Coleosporium属、Blastospora属およびRavenelia属、マグナポルテ目(Magnaporthales)に分類される微生物としてはMagnaporthe属、フンタマカビ目(Sordariales)に分類される微生物としてはPodospora属、Neurospora属、Sordaria属、Chaetomium属、Thielavia属、Myceliophthora 属およびMonotosporella属、ミクロアスクス目(Microascales)に分類される微生物としてはMicroascus属、Nodulosphaeria属Okeanomyces属およびCeratocystis属、ニクザキン目(Hypocreales)に分類される微生物としてはFusarium属、Nectria属、Hypocrea属、Hypomyces属、Trichoderma属、Cordyceps属、Claviceps属およびAcremonium属、スポリディオボルス目(Sporidiobolales)に分類される微生物としてはRhodosporidium属、Rhodotorula属、Sporidiobolus属およびSporobolomyces属、モチビョウキン目(Exobasidiales)に分類される微生物としてはGraphiola属、Exobasidium属およびDicellomyces属、マラッセジア目(Malasseziales)に分類される微生物としてはMalassezia属、ホネタケ目(Onygenales)に分類される微生物としてはGymnoascus属、Eremascus属、Arthroderma属、Coccidioides属、Paracoccidioides属、Uncinocarpus属Trichophyton属およびAjellomyces属、ラブルベニア目(Laboulbeniales)に分類される微生物としてはRhachomyces属、Rickia属、Stigmatomyces属およびCeratomyces属、ケカビ目(Mucorales) に分類される微生物としてはAbsidia属、Mucor属、Rhizomucor属およびRhizopus属に属する微生物が挙げられる。
ユーロチウム目(Eurotiales)に分類される微生物としてはNeopetromyces属、Aspergillus属、Neosartorya属、Byssochlamys属、Emericella属、Eupenicillium属、Eurotium属、Hemicarpenteles属、Penicillium属、Talaromyces属およびMonascus属が挙げられる。
サッカロミケス目(Saccharomycetales)に分類される微生物としてはArthroascus属、Guilliermondella属、Clavispora属、Metschnikowia属、Lipomyces 属、Endomyces属、Ascoidea属、Cephaloascus属、Wickerhamiella属 、Zygoascus 属、Trichomonascus属 Aciculoconidium属、Ambrosiozyma属、Blastobotrys属、Botryozyma属、Brettanomyces属、Myxozyma属、Ogataea属、Komagataella属、Trigonopsis属、Schizoblastosporion属およびSympodiomyces属が挙げられる。さらに、サッカロミケス目(Saccharomycetales)に属する微生物で、好ましい微生物としては、サッカロミケス科(Saccharomycodaceae)、ピキア科(Pichiaceae)、ジポドアスクス科(Dipodascaceae)およびmitosporic Saccharomycetalesに分類される微生物が挙げられる。その科に属する微生物としてはHanseniaspora属、Kloeckera属、Saccharomycodes属、Nadsonia属、Ashbya属、Citeromyces属、Dekkera属、Issatchenkia属、Kluyveromyces属、Pachysolen属、Saccharomyces属、Saturnispora属、Tetrapisispora属、Torulaspora属、Zygosaccharomyces属、Zygotorulaspora属、Eremothecium属、Lachancea属、Vanderwaltozyma属、Naumovozyma属、Kazachstania属、Eremothecium属、Williopsis属、Pichia属、Yarrowia属、Dipodascus属、Arxula属、Galactomyces属、Geotrichum属、Babjevia属、Debaryomyces属、Schwanniomyces属、Priceomyces属、Yamadazyma属、Scheffersomyces属、Meyerozyma属、Lodderomyces属、Sporopachydermia属 およびCandida属が挙げられる。
〔サッカロマイセス属〕
サッカロマイセス(Saccharomyces)属に分類される微生物としては、例えば、サッカロマイセス・バーネティ(Saccharomyces barnettii)、サッカロマイセス・バイヤヌス(Saccharomyces bayanus)、サッカロマイセス・バイヤヌス・バー・ウバルム(Saccharomyces bayanus var. uvarum)、サッカロマイセス・ボウラーディ(Saccharomyces boulardii)、サッカロマイセス・ブルデリ(Saccharomyces bulderi)、サッカロマイセス・カリオカヌス(Saccharomyces cariocanus)、サッカロマイセス・セレビッシェ(Saccharomyces cerevisiae)、サッカロマイセス・カステリイ(Saccharomyces castellii)、サッカロマイセス・ダイレネンシス(Saccharomyces dairenensis)、サッカロマイセス・ディアスタティカス(Saccharomyces diastaticus)、サッカロマイセス・ドウグラシ(Saccharomyces douglasii)、サッカロマイセス・エグジクス(Saccharomyces exiguus)、サッカロマイセス・ヒューマティカス(Saccharomyces humaticus)、サッカロマイセス・クルイベリ(Saccharomyces kluyveri)、サッカロマイセス・クドリアベゼビイ(Saccharomyces kudriavzevii)、サッカロマイセス・クナシレンシス(Saccharomyces kunashirensis)、サッカロマイセス・マティニアエ(Saccharomyces martiniae)、サッカロマイセス・ミカタエ(Saccharomyces mikatae)、サッカロマイセス・ナガニシイ(Saccharomyces naganishii)、サッカロマイセス・ノバルバリエタティス(Saccharomyces novalvarietatis)、サッカロマイセス・パラドキサス(Saccharomyces paradoxus)、サッカロマイセス・パストリアヌス(Saccharomyces pastorianus)、サッカロマイセス・ロシニイ(Saccharomyces rosinii)、サッカロマイセス・ロウクシイ(Saccharomyces rouxii)、サッカロマイセス・ステラタス(Saccharomyces stellatus)、サッカロマイセス・サーバジイ(Saccharomyces servazzii)、サッカロマイセス・スペンセロラム(Saccharomyces spencerorum)、サッカロマイセス・トランシバレンシス(Saccharomyces transvaalensis)、サッカロマイセス・ツリセンシス(Saccharomyces turicensis)、サッカロマイセス・ヤクシマエンシス・バー・ヤクシマエンシス(Saccharomyces yakushimaensis var. yakushimaensis)、サッカロマイセス・ユニスポラス(Saccharomyces unisporus)、サッカロマイセス・ウバラム(Saccharomyces uvarum)等が挙げられる。
カンディダ(Candida)属に分類される微生物としては、例えば、カンディダ・アアセリ(Candida aaseri)、カンディダ・アフリカナ(Candida africana)、カンディダ・アグリプティニア(Candida aglyptinia)、カンディダ・アグレスティス(Candida agrestis)、カンディダ・アカバネンシス(Candida akabanensis)、カンディダ・アライ(Candida alai)、カンディダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンディダ・アリシャニカ(Candida alishanica)、カンディダ・アルロシフェリイ(Candida allociferrii)、カンディダ・アマパエ(Candida amapae)、カンディダ・アムブロシアエ(Candida ambrosiae)、カンディダ・アムフィキシアエ(Candida amphixiae)、カンディダ・アナトミアエ(Candida anatomiae)、カンディダ・アンキュデンシス(Candida
ancudensis)、カンディダ・アンダマネンシス(Candida andamanensis)、カンディダ・アングリカ(Candida anglica)、カンディダ・アンネリセアエ(Candida anneliseae)、カンディダ・アンティランカエ(Candida antillancae)、カンディダ・アヌタエ(Candida anutae)、カンディダ・アピコラ(Candida apicola)、カンディダ・アピス(Candida apis)、カンディダ・アピス・バー・アピス(Candida apis var. apis)、カンディダ・アクアエテクストリス(Candida aquaetextoris)、カンディダ・アラビノファーメンタンス(Candida arabinofermentans)、カンディダ・アーカナ(Candida arcana)、カンディダ・アスカラフィダラム(Candida ascalaphidarum)、カンディダ・アジアティカ(Candida asiatica)、カンディダ・アトビ(Candida atbi)、カンディダ・アタカポラム(Candida atakaporum)、カンディダ・アセンセンシス(Candida athensensis)、カンディダ・アトランティカ(Candida atlantica)、カンディダ・アトモスファエリカ(Candida atmosphaerica)、カンディダ・オーリンギエンシス(Candida auringiensis)、カンディダ・オーリス(Candida auris)、カンディダ・オーリタ(Candida aurita)、カンディダ・オーストロマリナ(Candida austromarina)、カンディダ・アジマ(Candida azyma)、カンディダ・バールカララデンシス(Candida barrocoloradensis)、カンディダ・バティスタエ(Candida batistae)、カンディダ・ビーチイ(Candida beechii)、カンディダ・バータエ(Candida bertae)、カンディダ・バーセティイ(Candida berthetii)、カンディダ・ビトゥミニフィラ(Candida bituminiphila)、カンディダ・ブラックウェラエ(Candida blackwellae)、カンディダ・ブランキイ(Candida blankii)、カンディダ・ブラッタエ(Candida blattae)、カンディダ・ブラッタリアエ(Candida blattariae)、カンディダ・ボヒエンシス(Candida bohiensis)、カンディダ・ボイディニイ(Candida boidinii)、カンディダ・ボカトラム(Candida bokatorum)、カンディダ・ボレティコラ(Candida boleticola)、カンディダ・ボリトセリ(Candida bolitotheri)、カンディダ・ボンビ(Candida
bombi)、カンディダ・ボンビコラ(Candida bombicola)、カンディダ・ボンダーゼウィアエ(Candida bondarzewiae)、カンディダ・ボビナ(Candida bovina)、カンディダ・ブリブロラム(Candida bribrorum)、カンディダ・ブラムプティ(Candida brumptii)、カンディダ・ブエナビスタエンシス(Candida buenavistaensis)、カンディダ・ビネンシス(Candida buinensis)、カンディダ・ブルルネンシス(Candida bullrunensis)、カンディダ・ブティリ(Candida butyri)、カンディダ・カカオイ(Candida cacaoi)、カンディダ・カンバーラエンシス(Candida canberraensis)、カンディダ・カンタレリ(Candida cantarellii)、カンディダ・カリオシリグニコラ(Candida
cariosilignicola)、カンディダ・カーポフィラ(Candida carpophila)、カンディダ・カリイコラ(Candida caryicola)、カンディダ・カセイノリティカ(Candida caseinolytica)、カンディダ・カステリ(Candida castellii)、カンディダ・カストレンシス(Candida castrensis)、カンディダ・カテヌラタ(Candida catenulata)、カンディダ・ヴェルロリティカ(Candida cellulolytica)、カンディダ・セラムバイセダラム(Candida cerambycidarum)、カンディダ・チャウリオデス(Candida chauliodes)、カンディダ・チッカサウォラム(Candida chickasaworum)、カンディダ・チレンシス(Candida chilensis)、カンディダ・チロプテロラム(Candida chiropterorum)、カンディダ・チョクタウォラム(Candida choctaworum)、カンディダ・チリソメリダラム(Candida chrysomelidarum)、カンディダ・シドリ(Candida cidri)、カンディダ・シフェリイ(Candida ciferrii)、カンディダ・クレリダラム(Candida cleridarum)、カンディダ・コイポメンシス(Candida coipomensis)、カンディダ・コリキュロサ(Candida colliculosa)、カンディダ・コングロバタ(Candida conglobata)、カンディダ・コリダリ(Candida corydali)、カンディダ・シリンドラセア(Candida cylindracea)、カンディダ・ダジエンシス(Candida dajiaensis)、カンディダ・ダニエリアエ(Candida danieliae)、カンディダ・ダベンポーティ(Candida davenportii)、カンディダ・ダビシアナ(Candida davisiana)、カンディダ・デフォルマンス(Candida
deformans)、カンディダ・デンドリカ(Candida dendrica)、カンディダ・デンドロネマ(Candida dendronema)、カンディダ・デロドンティ(Candida derodonti)、カンディダ・デザーティコラ(Candida deserticola)、カンディダ・デデンシアエ(Candida diddensiae)、カンディダ・デグビオエンシス(Candida digboiensis)、カンディダ・ディバーサ(Candida diversa)、カンディダ・ドッシイ(Candida dosseyi)、カンディダ・ドリマイディス(Candida drimydis)、カンディダ・ドロソフィラエ(Candida drosophilae)、カンディダ・ドゥブリニエンシス(Candida dubliniensis)、カンディダ・イアサネンシス(Candida easanensis)、カンディダ・エダックス(Candida
edax)、カンディダ・エラテリダラム(Candida elateridarum)、カンディダ・エレガンス(Candida elegans)、カンディダ・エムベロラム(Candida emberorum)、カンディダ・エンドマイチダラム(Candida endomychidarum)、カンディダ・エントモフィラ(Candida entomophila)、カンディダ・エピンギアエ(Candida eppingiae)、カンディダ・エレモフィリア(Candida eremophlia)、カンディダ・エルガテンシス(Candida ergatensis)、カンディダ・エルノビイ(Candida ernobii)、カンディダ・エチェルシイ(Candida etchellsii)、カンディダ・エサノリカ(Candida ethanolica)、カンディダ・ファマタ(Candida famata)、カンディダ・ファマタ・バー・ファマタ(Candida famata var. famata)、カンディダ・フェニカ(Candida fennica)、カンディダ・ファーメンタティ(Candida fermentati)、カンディダ・ファーメンティカレンス(Candida fermenticarens)、カンディダ・フロリコラ(Candida floricola)、カンディダ・フラビアティリス(Candida fluviatilis)、カンディダ・フラギ(Candida fragi)、カンディダ・フラギコラ(Candida fragicola)、カンディダ・フレイシュシイ(Candida freyschussii)、カンディダ・フレドリチ(Candida friedrichii)、カンディダ・フリジョレンセンシス(Candida frijolensensis)、カンディダ・フラクタス(Candida fructus)、カンディダ・フカザワエ(Candida fukazawae)、カンディダ・フクヤマネンシス(Candida fukuyamanensis)、カンディダ・フィンフィコラ(Candida
fungicola)、カンディダ・フィジフォーマタ(Candidafusiformata)、カンディダ・ギラクタ(Candida galacta)、カンディダ・ガリス(Candida galis)、カンディダ・ガトゥネンシス(Candida gatunensis)、カンディダ・ゲオチャレス(Candida geochares)、カンディダ・ガーマニカ(Candida germanica)、カンディダ・ガナエンシス(Candida ghanaensis)、カンディダ・ギガンテンシス(Candida gigantensis)、カンディダ・ガルブラタ(Candida glabrata)、カンディダ・グラエボサ(Candida glaebosa)、カンディダ・グロボサ(Candida globosa)、カンディダ・グルコソフィラ(Candida glucosophila)、カンディダ・ゴルベビイ(Candida golubevii)、カンディダ・ゴーガシイ(Candida gorgasii)、カンディダ・ゴシンギカ(Candida gosingica)、カンディダ・ゴトイ(Candida gotoi)、カンディダ・グロペンギセリ(Candida gropengiesseri)、カンディダ・グアイモラム(Candida guaymorum)、カンディダ・ギリーモンディ(Candida guilliermondii)、カンディダ・ハエムロニイ(Candida haemulonii)、カンディダ・ハロニトラトフィラ(Candida halonitratophila)、カンディダ・ハロフィラ(Candida halophila)、カンディダ・ハセガワエ(Candida hasegawae)、カンディダ・ヘレニカ(Candida hellenica)、カンディダ・ホルミ(Candida holmii)、カンディダ・ホミレントマ(Candida homilentoma)、カンディダ・ホーデイ(Candida hordei)、カンディダ・ヒシンツィビュエンシス(Candida hsintzibuensis)、カンディダ・フミリス(Candida humilis)、カンディダ・ハンガリカ(Candida hungarica)、カンディダ・ハングチュナナ(Candida hungchunana)、カンディダ・インコムニス(Candida incommunis)、カンディダ・インコンスピキュア(Candida inconspicua)、カンディダ・インゲンス(Candida ingens)、カンディダ・インセクタレンス(Candida insectalens)、カンディダ・インセクタマンス(Candida insectamans)、カンディダ・インセクトラム(Candida insectorum)、カンディダ・インセクトサ(Candida insectosa)、カンディダ・インターメディア(Candida intermedia)、カンディダ・インターメディア・バー・インターメディア(Candida intermedia var. intermedia)、カンディダ・イポモエアエ(Candida ipomoeae)、カンディダ・イシワダエ(Candida
ishiwadae)、カンディダ・ジャポニカ(Candida japonica)、カンディダ・ジャルーニイ(Candida jaroonii)、カンディダ・ジェフリエシ(Candida jeffriesii)、カンディダ・ジアンシヘンシス(Candida jianshihensis)、カンディダ・ジウフェンゲンシス(Candida jiufengensis)、カンディダ・カンチャナブリエンシス(Candida kanchanaburiensis)、カンディダ・カオーシウンゲンシス(Candida kaohsiungensis)、カンディダ・カラワイエウィ(Candida karawaiewii)、カンディダ・カシナゴコラ(Candida kashinagacola)、カンディダ・カズオイ(Candida kazuoi)、カンディダ・ケフィール(Candida kefyr)、カンディダ・カオヤイエンシス(Candida khaoyaiensis)、カンディダ・クハメレンシス(Candida khmerensis)、カンディダ・コフュエンシス(Candida kofuensis)、カンディダ・クラビエンシス(Candida krabiensis)、カンディダ・クリシイ(Candida krissii)、カンディダ・クルイシ(Candida kruisii)、カンディダ・クルセイ(Candida krusei)、カンディダ・クルソイデス(Candida krusoides)、カンディダ・クノラム(Candida kunorum)、カンディダ・クンウィエンシス(Candida kunwiensis)、カンディダ・ラビドゥリダラム(Candida labiduridarum)、カンディダ・ラクティスコンデンシ(Candida lactis-condensi)、カンディダ・ラエムソネンシス(Candida laemsonensis)、カンディダ・ラムビカ(Candida lambica)、カンディダ・ラセネンシス(Candida lassenensis)、カンディダ・ラウレリアエ(Candida
laureliae)、カンディダ・ランドレエ(Candida leandrae)、カンディダ・レセピシ(Candida lessepsii)、カンディダ・レバンティナ(Candida levantina)、カンディダ・リドングシャニカ(Candida lidongshan
ica)、カンディダ・リグニコラ(Candida lignicola)、カンディダ・リグノハビタンス(Candida lignohabitans)、カンディダ・リグノフィラ(Candida lignophila)、カンディダ・リグノサ(Candida lignosa)、カンディダ・リポリティカ(Candida lipolytica)カンディダ・リトサエアエ(Candida litsaeae)カンディダ・ランクイヒューエンシス(Candida llanquihuensis)、カンディダ・ロデラエ(Candida lodderae)、カンディダ・ランディナ(Candida lundiana)、カンディダ・ラジタニアエ(Candida lusitaniae)、カンディダ・リコパーディナエ(Candida lycoperdinae)、カンディダ・リキソソフィラ(Candida lyxosophila)、カンディダ・マエサ(Candida maesa)、カンディダ・マグノリアエ(Candida magnoliae)、カンディダ・マルトサ(Candida maltosa)、カンディダ・マニトファシエンス(Candida mannitofaciens)、カンディダ・マリス(Candida maris)、カンディダ・マリティマ(Candida maritima)、カンディダ・マクシイ(Candida maxii)、カンディダ・メリビオシカ(Candida melibiosica)、カンディダ・メリニイ(Candida melinii)、カンディダ・メンブレニファシエンス(Candida membranifaciens)、カンディダ・メサンテリカ(Candida mesenterica)、カンディダ・メタプシロシス(Candida metapsilosis)、カンディダ・メサノロベセンス(Candida methanolovescens)、カンディダ・メサノソーボサ(Candida methanosorbosa)、カンディダ・メシリカ(Candida methylica)カンディダ・ミカエリ(Candida
michaelii)、カンディダ・ミレイ(Candida milleri)、カンディダ・モギ(Candida
mogii)、カンディダ・モコエナイ(Candida mokoenaii)、カンディダ・モリシアナ(Candida molischiana)、カンディダ・モンタナ(Candida montana)、カンディダ・モラコティアエ(Candida morakotiae)、カンディダ・ムシフェラ(Candida mucifera)、カンディダ・マルチゲミス(Candida multigemmis)、カンディダ・ムサエ(Candida musae)、カンディダ・マイセタンギ(Candida mycetangii)、カンディダ・ナエオデンドラ(Candida naeodendra)、カンディダ・ナコンラッチャシメンシス(Candida nakhonratchasimensis)、カンディダ・ナナスポラ(Candida nanaspora)、カンディダ・ナタレンシス(Candida natalensis)、カンディダ・ニーランディカ(Candida neerlandica)、カンディダ・ネモデンドラ(Candida nemodendra)、カンディダ・ニューストネンシス(Candida neustonensis)、カンディダ・ニトラティボランス(Candida nitrativorans)、カンディダ・ニトラトフィラ(Candida nitratophila)、カンディダ・ノダエンシス(Candida nodaensis)、カンディダ・ノンソーボフィラ(Candida nonsorbophila)、カンディダ・ノーベゲンシス(Candida norvegensis)、カンディダ・ノーベギカ(Candida norvegica)、カンディダ・ノバキイ(Candida novakii)、カンディダ・オブツサ・バー・オブツサ(Candida obtusa var. obtusa)、カンディダ・オデントソバエ(Candida odintsovae)、カンディダ・オレフィラ(Candida oleophila)、カンディダ・オリバエ(Candida olivae)、カンディダ・オンタリオエンシス(Candida ontarioensis)、カンディダ・オオイテンシス(Candida ooitensis)、カンディダ・オルバ(Candida orba)、カンディダ・オレゴネンシス(Candida oregonensis)、カンディダ・オーソプシロシス(Candida orthopsilosis)、カンディダ・オートニイ(Candida ortonii)、カンディダ・オバリス(Candida ovalis)、カンディダ・オキセントニアエ(Candida oxycentoniae)、カンディダ・パロデス(Candida pallodes)、カンディダ・パルミオレフィラ(Candida palmioleophila)、カンディダ・パルマイレンシス(Candida palmyrensis)、カンディダ・パルディゲナ(Candida paludigena)、カンディダ・パナメンシス(Candida panamensis)、カンディダ・パナメリカナ(Candida panamericana)、カンディダ・パラポリモーファ(Candida parapolymorpha)、カンディダ・パラプシロシス(Candida parapsilosis)、カンディダ・パラプシロシス・バー・パラプシロシス(Candida parapsilosis var. parapsilosis)、カンディダ・パラルゴーサ(Candida pararugosa)、カンディダ・パタニエンシス(Candida pattaniensis)、カンディダ・ペルタタ(Candida peltata)、カンディダ・ペオリアエンシス(Candida peoriaensis)、カンディダ・ペトロヒューエンシス(Candida petrohuensis)、カンディダ・ファングンゲンシス(Candida phangngensis)、カンディダ・ピカチョエンシス(Candida picachoensis)、カンディダ・ピセアエ(Candida piceae)、カンディダ・ピグナリアエ(Candida pignaliae)、カンディダ・ピメンシス(Candida
pimensis)、カンディダ・ピニ(Candida pini)、カンディダ・ピントロペシイ(Candida pintolopesii)、カンディダ・ピントロペシイ・バー・ピントロペシイ(Candida
pintolopesii var. pintolopesii)、カンディダ・ピントロペシイ・バー・スルーフィアエ(Candida pintolopesii var. sloofiae)、カンディダ・ピナス(Candida pinus)、カンディダ・プルテイ(Candida plutei)、カンディダ・ポリモーファ(Candida polymorpha)、カンディダ・ポミフィラ(Candida pomiphila)、カンディダ・ポンデロサエ(Candida ponderosae)、カンディダ・ポプリ(Candida populi)、カンディダ・ポウェリイ(Candida powellii)、カンディダ・プラチュアペンシス(Candida prachuapensis)、カンディダ・プルニコラ(Candida prunicola)、カンディダ・シュードフロスキュロラム(Candida pseudoflosculorum)、カンディダ・シュードグラエボサ(Candida pseudoglaebosa)、カンディダ・シュードハエムロニイ(Candida pseudohaemulonii)、カンディダ・シュードインターメディア(Candida pseudointermedia)、カンディダ・シュードジゥフェンゲンシス(Candida pseudojiufengensis)、カンディダ・シュードラムビカ(Candida pseudolambica)、カンディダ・シュードベンダークリフティ(Candida pseudovanderkliftii)、カンディダ・フィジクロフィラ(Candida psychrophila)、カンディダ・プルチェリマ(Candida pulcherrima)、カンディダ・ピラリダエ(Candida pyralidae)、カンディダ・クエルシトラサ(Candida quercitrusa)、カンディダ・クエルクーム(Candida quercuum)、カンディダ・レイレネンシス(Candida railenensis)、カンディダ・ラルネンシス(Candida ralunensis)、カンディダ・ラノンゲンシス(Candida ranongensis)、カンディダ・ラチャシメンシス(Candida ratchasimensis)、カンディダ・レスティンガエ(Candida restingae)、カンディダ・レバーサ(Candida reversa)、カンディダ・ルハギイ(Candida rhagii)、カンディダ・ロブネティアエ(Candida robnettiae)、カンディダ・ロゴペリキュロサ(Candida rugopelliculosa)、カンディダ・ルゴーザ(Candida rugosa)、カンディダ・ルゴーザ・バー・ルゴーザ(Candida rugosa var. rugosa)、カンディダ・サガミナ(Candida sagamina)、カンディダ・サイトアナ(Candida saitoana)、カンディダ・サケ(Candida sake)、カンディダ・サルマンティセンシス(Candida salmanticensis)、カンディダ・サニティ(Candida sanitii)、カンディダ・サンタマリアエ(Candida
santamariae)、カンディダ・サンタマリアエ・バー・メンブレニファシエンス(Candida santamariae var. membranifaciens)、カンディダ・サンタマリアエ・バー・サンタマリアエ(Candida santamariae var. santamariae)、カンディダ・サントジャコベンシス(Candida santjacobensis)、カンディダ・サンイエンシス(Candida sanyiensis)、カンディダ・サラブリエンシス(Candida saraburiensis)、カンディダ・サボニカ(Candida savonica)、カンディダ・スチャタビイ(Candida schatavii)、カンディダ・セキイ(Candida sekii)、カンディダ・セクアネンシス(Candida sequanensis)、カンディダ・サーギペンシス(Candida sergipensis)、カンディダ・シハタエ(Candida shehatae)、カンディダ・シハタエ・バー・イセクトサ(Candida shehatae var. insectosa)、カンディダ・シハタエ・バー・リグノサ(Candida shehatae var.
lignosa)、カンディダ・シハタエ・バー・シハタエ(Candida shehatae var. shehatae)、カンディダ・ジーアメンシス(Candida siamensis)、カンディダ・シルバエ(Candida silvae)、カンディダ・シルバノラム(Candida silvanorum)、カンディダ・シルバティカ(Candida silvatica)、カンディダ・シルビカルトリクス(Candida silvicultrix)、カンディダ・シノラボランティウム(Candida sinolaborantium )、カンディダ・シセペンシス(Candida sithepensis)、カンディダ・スルーフィアエ(Candida slooffiae)、カンディダ・スマグサ(Candida smagusa)、カンディダ・スミスソニイ(Candida smithsonii)、カンディダ・ソジャエ(Candida sojae)、カンディダ・ソラニ(Candida solani)、カンディダ・ソリコラ(Candida solicola)、カンディダ・ソンクキイ(Candida sonckii)、カンディダ・ソングカラエンシス(Candida songkhlaensis)、カンディダ・ソノレンシス(Candida sonorensis)、カンディダ・ソフィアエレギナエ(Candida sophiaereginae)、カンディダ・ソーボフィラ(Candida sorbophila)、カンディダ・ソーボサ(Candida sorbosa)、カンディダ・ソーボシボランス(Candida sorbosivorans)、カンディダ・ソーボキシロサ(Candida sorboxylosa)、カンディダ・スパンドベンシス(Candida spandovensis)、カンディダ・スファエリカ(Candida sphaerica)、カンディダ・スタウントニカ(Candida stauntonica)、カンディダ・ステラタ(Candida stellata)、カンディダ・ステリマリコラ(Candida stellimalicola)、カンディダ・ステリ(Candida stri)、カンディダ・スシフィラ(Candida succiphila)、カンディダ・スエシカ(Candida suecica)、カンディダ・スセペンシス(Candida suthepensis)、カンディダ・スワナリティ(Candida suwanaritii)、カンディダ・スズキイ(Candida suzukii)、カンディダ・タカマツズケンシス(Candida takamatsuzukensis)、カンディダ・タカタ(Candida takata)、カンディダ・タリアエ(Candida taliae)、カンディダ・タマニエンシス(Candida tammaniensis)、カンディダ・タノトレランス(Candida tannotolerans)、カンディダ・タンティチャロエニアエ(Candida tanticharoeniae)、カンディダ・タンザワエンシス(Candida tanzawaensis)、カンディダ・タオユアニカ(Candida taoyuanica)、カンディダ・タータリボランス(Candida tartarivorans)、カンディダ・テムノチラエ(Candida temnochilae)、カンディダ・テヌイス(Candida tenuis)、カンディダ・テパエ(Candida tepae)、カンディダ・テレブラ(Candida terebra)、カンディダ・テラボラム(Candida
terraborum)、カンディダ・テトリギダラム(Candida tetrigidarum)、カンディダ・タイランディカ(Candida thailandica)、カンディダ・タイムエアンゲンシス(Candida thaimueangensis)、カンディダ・ゼアエ(Candida theae)、カンディダ・サーモフィリカ(Candida thermophila)、カンディダ・ティルニイ(Candida tilneyi)、カンディダ・トレランス(Candida tolerans)、カンディダ・トレシイ(Candida torresii)、カンディダ・トリトマエ(Candida tritomae)、カンディダ・トロピカリス(Candida tropicalis)、カンディダ・トロピカリス・バー・トロピカリス(Candida tropicalis var. tropicalis)、カンディダ・トリポデンドロニ(Candida trypodendroni)、カンディダ・ツチヤエ(Candida tsuchiyae)、カンディダ・ツクバエンシス(Candida tsukubaensis)、カンディダ・ツムリ
コラ(Candida tumulicola)、カンディダ・ウルミ(Candida ulmi)、カンディダ・ユティリス(Candida utilis)、カンディダ・バシニイ(Candida vaccinii)、カンディダ・バルデビアナ(Candida valdiviana)、カンディダ・バリダ(Candida valida)、カンディダ・ベンダーワルティ(Candida vanderwaltii)、カンディダ・バリアビリス(Candida variabilis)、カンディダ・バーティオバラエ(Candida vartiovaarae)、カンディダ・ベロナエ(Candida veronae)、カンディダ・バーサティリス(Candida versatilis)、カンディダ・ビナリア(Candida vinaria)、カンディダ・ビニ(Candida
vini)、カンディダ・ビスワナジイ(Candida viswanathii)、カンディダ・ワンチェルニアエ(Candida wancherniae)、カンディダ・ウィカーハミ(Candida wickerhamii)、カンディダ・ウォナノラム(Candida wounanorum)、カンディダ・ウヨミンゲンシス(Candida wyomingensis)カンディダ・キシストビ(Candida xestobii)、カンディダ・キシロテリニ(Candida xyloterini)、カンディダ・ユアンシャニカス(Candida yuanshanicus)、カンディダ・ユコラム(Candida yuchorum)、カンディダ・ゼプリニナ(Candida zemplinina)、カンディダ・ズィラノイデス(Candida zeylanoides)、カンディダ・ズィラノイデス・バー・ズィラノイデス(Candida zeylanoides var. zeylanoides)等が挙げられる。
アスペルギルス(Aspergillus)属に分類される微生物としては、例えば、アスペルギルス・アカンソスポラス(Aspergillus acanthosporus)、アスペルギルス・アコラムナリス(Aspergillus acolumnaris)、アスペルギルス・アキュレアタス(Aspergillus aculeatus)、アスペルギルス・アエネウス(Aspergillus aeneus)、アスペルギルス・アフィニス(Aspergillus affinis)、アスペルギルス・アラハバデイ(Aspergillus allahabadii)、アスペルギルス・アリアセウス(Aspergillus alliaceus)、アスペルギルス・アルタセウス(Aspergillus alutaceus)、アスペルギルス・アムビグス(Aspergillus ambiguus)、アスペルギルス・アムステロダミ(Aspergillus amstelodami)、アスペルギルス・アミロボラス(Aspergillus amylovorus)、アスペルギルス・アノマラス(Aspergillus anomalus)、アスペルギルス・アンソデスミス(Aspergillus anthodesmis)、アスペルギルス・アピカ(Aspergillus apica)、アスペルギルス・アペンディキュレイタス(Aspergillus appendiculatus)、アスペルギルス・アレナリウス(Aspergillus arenarius)、アスペルギルス・アスパレセンス(Aspergillus asperescens)、アスペルギルス・アセシウス(Aspergillus athecius)、アスペルギルス・アウランティオブルネウス(Aspergillus aurantiobrunneus)、アスペルギルス・アウレイタス(Aspergillus auratus)、アスペルギルス・アウレイタス・バー・アシダス(Aspergillus aureus var. acidus)、アスペルギルス・アウレイタス・バー・ミノー(Aspergillus aureus var. minor)、アスペルギルス・アウレオフルゲンス(Aspergillus aureofulgens)、アスペルギルス・アウレオラタス(Aspergillus aureolatus)、アスペルギルス・アウレオラス(Aspergillus aureolus)、アスペルギルス・アウリコマス(Aspergillus auricomus)、アスペルギルス・アベニセウス(Aspergillus avenaceus)、アスペルギルス・アワモリ(Aspergillus awamori)、アスペルギルス・アワモリ・バー・フメウス(Aspergillus awamori var. fumeus)、アスペルギルス・アワモリ・バー・フスカス(Aspergillus awamori var. fuscus)、アスペルギルス・アワモリ・バー・ミニマス(Aspergillus awamori var.minimus)、アスペルギルス・アワモリ・バー・ピセウス(Aspergillus awamori var. piceus)、アスペルギルス・バタタス(Aspergillus batatas)、アスペルギルス・ビカラー(Aspergillus bicolor)、アスペルギルス・ビプラナス(Aspergillus biplanus)、アスペルギルス・ビスポラス(Aspergillus bisporus)、アスペルギルス・ボムバイシス(Aspergillus bombycis)、アスペルギルス・ブラシリエンシス(Aspergillus brasiliensis)、アスペルギルス・ブレビペス(Aspergillus brevipes)、アスペルギルス・ブリッジリ(Aspergillus bridgeri)、アスペルギルス・ブルネオユニセリアタス(Aspergillus brunneo-uniseriatus)、アスペルギルス・ブルネオユニセリアタス・バー・ナナス(Aspergillus brunneo-uniseriatus var. nanus)、アスペルギルス・カエレイタス(Aspergillus caelatus)、アスペルギルス・カエジーラス(Aspergillus caesiellus)、アスペルギルス・カエスピトサス(Aspergillus caespitosus)、アスペルギルス・キャンペステリス(Aspergillus campestris)、アスペルギルス・キャンディダス(Aspergillus candidus)、アスペルギルス・カーボナリウス(Aspergillus carbonarius)、アスペルギルス・カーニュス(Aspergillus carneus)、アスペルギルス・カーノイ(Aspergillus carnoyi)、アスペルギルス・セルロサエ(Aspergillus cellulosae)、アスペルギルス・サービナス(Aspergillus cervinus)、アスペルギルス・チェバリエリ(Aspergillus chevalieri)、アスペルギルス・チェバリエリ・バー・インターメディウス(Aspergillus chevalieri var. intermedius)、アスペルギルス・クリセラス(Aspergillus chrysellus)、アスペルギルス・シナモメウス(Aspergillus cinnamomeus)、アスペルギルス・シトリスポラス(Aspergillus citrisporus)、アスペルギルス・クラバトフラバス(Aspergillus clavatoflavus)、アスペルギルス・クラバトナニカ(Aspergillus clavatonanica)、アスペルギルス・クラバトナニカス(Aspergillus clavatonanicus)、アスペルギルス・クラバタス(Aspergillus clavatus)、アスペルギルス・クレイストミヌタス(Aspergillus cleistominutus)、アスペルギルス・コニカス(Aspergillus conicus)、アスペルギルス・コンジャンクタス(Aspergillus conjunctus)、アスペルギルス・コレミフォルミス(Aspergillus coremiiformis)、アスペルギルス・コルガタス(Aspergillus corrugatus)、アスペルギルス・クラッシハイファエ(Aspergillus crassihyphae)、アスペルギルス・クレメウス(Aspergillus cremeus)、アスペルギルス・クリステイタス(Aspergillus cristatus)、アスペルギルス・クルストサス(Aspergillus crustosus)、アスペルギルス・クリスタリナス(Aspergillus crystallinus)、アスペルギルス・デフレクタス(Aspergillus deflectus)、アスペルギルス・ディモルフィカス(Aspergillus dimorphicus)、アスペルギルス・ディバーサス(Aspergillus diversus)、アスペルギルス・ドロシカス(Aspergillus dorothicus)、アスペルギルス・ドゥリカウリス(Aspergillus duricaulis)、アスペルギルス・エブルネオクレメウス(Aspergillus eburneocremeus)、アスペルギルス・エキヌレイタス(Aspergillus echinulatus)、アスペルギルス・エジプティアカス(Aspergillus egyptiacus)、アスペルギルス・エレガンス(Aspergillus elegans)、アスペルギルス・エリプティカス(Aspergillus ellipticus)、アスペルギルス・エロンガタス(Aspergillus elongatus)、アスペルギルス・フェネリアエ(Aspergillus fennelliae)、アスペルギルス・フィクーム(Aspergillus ficuum)、アスペルギルス・フィシェリ(Aspergillus fischeri)、アスペルギルス・フィシェリ・バー・ブラジリエンシス(Aspergillus fischeri
var. brasiliensis)、アスペルギルス・フィシェリ・バー・グラバー(Aspergillus
fischeri var. glaber)、アスペルギルス・フィシェリ・バー・スピノサス(Aspergillus fischeri var. spinosus)、アスペルギルス・フラッシェントラエゲリ(Aspergillus flaschentraegeri)、アスペルギルス・フラビペス(Aspergillus flavipes)、アスペルギルス・フラボファーカタス(Aspergillus flavofurcatus)、アスペルギルス・フラバス(Aspergillus flavus)、アスペルギルス・フラバス・バー・カラムナリス(Aspergillus flavus var. columnaris)、アスペルギルス・フラバス・バー・フラバス(Aspergillus flavus var. flavus)、アスペルギルス・フラバス・バー・ソジャエ(Aspergillus flavus var. sojae)、アスペルギルス・フロキュロサス(Aspergillus flocculosus)、アスペルギルス・フロリフォルミス(Aspergillus floriformis)、アスペルギルス・フォエティダス(Aspergillus foetidus)、アスペルギルス・フォエティダス・バー・アシダス(Aspergillus foetidus var. acidus)、アスペルギルス・フォエティダス・バー・パリダス(Aspergillus foetidus var. pallidus)、アスペルギルス・フォベオレイタス(Aspergillus foveolatus)、アスペルギルス・フレセニイ(Aspergillus fresenii)、アスペルギルス・フルティキュロサス(Aspergillus fruticulosus)、アスペルギルス・フマリカス(Aspergillus fumaricus)、アスペルギルス・フミガタス(Aspergillus fumigatus)、アスペルギルス・フミガタス・バー・アカラムナリス(Aspergillus fumigatus var. acolumnaris)、アスペルギルス・フミガタス・バー・エリプティカス(Aspergillus fumigatus var. ellipticus)、アスペルギルス・フミガタス・バー・フミガタス(Aspergillus fumigatus var. fumigatus )、アスペルギルス・フミガタス・バー・ヘルボラス(Aspergillus fumigatus
var. helvolus)、アスペルギルス・ファニキュロサス(Aspergillus funiculosus)、アスペルギルス・ギガンテウス(Aspergillus giganteus)、アスペルギルス・グラバー(Aspergillus glaber)、アスペルギルス・グラウカス(Aspergillus glaucus)、アスペルギルス・ゴラクピュレンシス(Aspergillus gorakhpurensis)、アスペルギルス・グラシリス(Aspergillus gracilis)、アスペルギルス・グラヌレイタス(Aspergillus granulatus)、アスペルギルス・グラヌロサス(Aspergillus granulosus)、アスペルギルス・ジムノサーダエ(Aspergillus gymnosardae)、アスペルギルス・ハロフィリカス(Aspergillus halophilicus)、アスペルギルス・ヘリコスリクス(Aspergillus helicothrix)、アスペルギルス・ヘネバギイ(Aspergillus hennebergii)、アスペルギルス・ヘテロカーヨティカス(Aspergillus heterocaryoticus)、アスペルギルス・ヘテロモーファス(Aspergillus heteromorphus)、アスペルギルス・ヘテロサリカス(Aspergillus heterothallicus)、アスペルギルス・イイズカエ(Aspergillus iizukae)、アスペルギルス・イムプリカタス(Aspergillus implicatus)、アスペルギルス・インズエタス(Aspergillus insuetus)、アスペルギルス・インズリコラ(Aspergillus insulicola)、アスペルギルス・イヌイ(Aspergillus inuii)、アスペルギルス・イタコニカス(Aspergillus itaconicus)、アスペルギルス・イボリエンシス(Aspergillus ivoriensis)、アスペルギルス・ジャナス(Aspergillus janus)、アスペルギルス・ジャナス・バー・ブレビス(Aspergillus janus var. brevis)、アスペルギルス・ジャナス・バー・ジャナス(Aspergillus janus var. janus)、アスペルギルス・ジャポニカス(Aspergillus japonicus)、アスペルギルス・ジャポニカス・バー・アトロフスカス(Aspergillus japonicus var. atrofuscus)、アスペルギルス・ジャポニカス・バー・ビリディフラバス(Aspergillus japonicus var. viridiflavus)、アスペルギルス・カムバレンシス(Aspergillus kambarensis)、アスペルギルス・カナガワエンシス(Aspergillus kanagawaensis)、アスペルギルス・カワチイ(Aspergillus
kawachii)、アスペルギルス・レイノサス(Aspergillus lanosus)、アスペルギルス・レントゥラス(Aspergillus lentulus)、アスペルギルス・レポリス(Aspergillus leporis)、アスペルギルス・ロイコカーパス(Aspergillus leucocarpus)、アスペルギルス・ロンギベシカ(Aspergillus longivesica)、アスペルギルス・ラクエンシス(Aspergillus luchuensis)、アスペルギルス・ラクノウエンシス(Aspergillus lucknowensis)、アスペルギルス・ルテオニガー(Aspergillus luteo-niger)、アスペルギルス・マリグナス(Aspergillus malignus)、アスペルギルス・マルドラタス(Aspergillus malodoratus)、アスペルギルス・マンギニイ(Aspergillus manginii)、アスペルギルス・メディウス(Aspergillus medius)、アスペルギルス・メレウス(Aspergillus
melleus)、アスペルギルス・マイクロセファラス(Aspergillus microcephalus)、アスペルギルス・マイクロビリディシトリナス(Aspergillus microviridicitrinus)、アスペルギルス・マイクロサイスティカス(Aspergillus microcysticus)、アスペルギルス・ミニマス(Aspergillus minimus)、アスペルギルス・ミヨコエンシス(Aspergillus miyokoensis)、アスペルギルス・モンテビデンシス(Aspergillus montevidensis)、アスペルギルス・マルチカラー(Aspergillus multicolor)、アスペルギルス・ムタビリス(Aspergillus mutabilis)、アスペルギルス・ヌドゥランス(Aspergillus nidulans)、アスペルギルス・ヌドゥランス・バー・アクリステイタス(Aspergillus nidulans var. acristatus)、アスペルギルス・ヌ
ドゥランス・バー・デンタタス(Aspergillus nidulans var. dentatus)、アスペルギルス・ヌドゥランス・バー・エキヌレイタス(Aspergillus nidulans var. echinulatus)、アスペルギルス・ヌドゥランス・バー・レイタス(Aspergillus nidulans var. latus)、アスペルギルス・ヌドゥランス・バー・ロゼウス(Aspergillus nidulans
var. roseus)、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、アスペルギルス・ニガー・ムト・シナモメウス(Aspergillus niger mut. cinnamomeus)、アスペルギルス・ニガー・バー・インターメディウス(Aspergillus niger var. intermedius)、アスペルギルス・ニガー・バー・マクロスポラス(Aspergillus niger var. macrosporus)、アスペルギルス・ニガー・バー・ナヌス(Aspergillus niger var. nanus)、アスペルギルス・ニガー・バー・ニガー(Aspergillus niger var. niger)、アスペルギルス・ニガー・バー・ニガー・エフ・ヘネゲルギイ(Aspergillus niger var. niger f. hennebergii)、アスペルギルス・ニガー・バー・フォエニシス(Aspergillus niger var. phoenicis)、アスペルギルス・ニガー・ムト・シエマニ(Aspergillus
niger mut. schiemanni)、アスペルギルス・ニベオグラウカス(Aspergillus niveoglaucus)、アスペルギルス・ニベウス(Aspergillus niveus)、アスペルギルス・ニベウス・バー・インディカ(Aspergillus niveus ver. indica)、アスペルギルス・ノミウス(Aspergillus nomius)、アスペルギルス・ヌタンス(Aspergillus nutans)、アスペルギルス・オケラセオロセウス(Aspergillus ochraceoroseus)、アスペルギルス・オケラセウス(Aspergillus ochraceus)、アスペルギルス・オーナタス(Aspergillus ornatus)、アスペルギルス・オリゼ(Aspergillus oryzae)、アスペルギルス・オリゼ・バー・ブルネウス(Aspergillus oryzae var. brunneus)、アスペルギルス・オリゼ・バー・エフュサス(Aspergillus oryzae var. effusus)、アスペルギルス・オリゼ・バー・マグナスポラス(Aspergillus oryzae var. magnasporus)、アスペルギルス・オリゼ・バー・オリゼ(Aspergillus oryzae var. oryzae)、アスペルギルス・オリゼ・バー・スポロフラバス(Aspergillus oryzae var. sporoflavus)、アスペルギルス・オリゼ・バー・バリアビリス(Aspergillus oryzae var. variabilis)、アスペルギルス・オリゼ・バー・ビリディス(Aspergillus oryzae var. viridis)、アスペルギルス・オスティアヌス(Aspergillus ostianus)、アスペルギルス・パリダス(Aspergillus pallidus)、アスペルギルス・パナメンシス(Aspergillus panamensis)、アスペルギルス・パラドキサス(Aspergillus paradoxus)、アスペルギルス・パラスティカス(Aspergillus parasiticus)、アスペルギルス・パラスティカス・バー・グロボサス(Aspergillus parasiticus var. globosus)、アスペルギルス・パラベセシウス(Aspergillus parvathecius)、アスペルギルス・パーブラス(Aspergillus
parvulus)、アスペルギルス・ペニシリオフォルミス(Aspergillus penicillioformis)、アスペルギルス・ペニシリオイデス(Aspergillus penicillioides)、アスペルギルス・パーシイ(Aspergillus persii)、アスペルギルス・ペトラキ(Aspergillus petrakii)、アスペルギルス・ペイロネリ(Aspergillus peyronelii)、アスペルギルス・フィアリセプタス(Aspergillus phialiseptus)、アスペルギルス・フォエニシス(Aspergillus phoenicis)、アスペルギルス・プロリフェランス(Aspergillus proliferans)、アスペルギルス・プロツベラス(Aspergillus protuberus)、アスペルギルス・シュードデフレクタス(Aspergillus pseudodeflectus)、アスペルギルス・シュードグラウカス(Aspergillus pseudoglaucus)、アスペルギルス・シュードタマリ(Aspergillus pseudotamarii)、アスペルギルス・プルベルレンタス(Aspergillus pulverulentus)、アスペルギルス・プルビナス(Aspergillus pulvinus)、アスペルギルス・パニセウス(Aspergillus puniceus)、アスペルギルス・クアドリシンクタス(Aspergillus
quadricinctus)、アスペルギルス・クアドリネアタス(Aspergillus quadrilineatus)、アスペルギルス・クエルシナス(Aspergillus quercinus)、アスペルギルス・クエルシナス・バー・ペトラキ(Aspergillus quercinus var. petrakii)、アスペルギルス・ラペリ(Aspergillus raperi)、アスペルギルス・レキュベイタス(Aspergillus recurvatus)、アスペルギルス・レペンス(Aspergillus repens)、アスペルギルス・リストリクタス(Aspergillus restrictus)、アスペルギルス・リゾポダス(Aspergillus rhizopodus)、アスペルギルス・ロバスタス(Aspergillus robustus)、アスペルギルス・ルバー(Aspergillus ruber)、アスペルギルス・ルガロサス(Aspergillus rugulosus)、アスペルギルス・サイトイ・バー・カゴシマエンシス(Aspergillus saitoi var. kagoshimaensis)、アスペルギルス・サルビコラ(Aspergillus salviicola)、アスペルギルス・サクレロティオラム(Aspergillus sclerotiorum)、アスペルギルス・セプルタス(Aspergillus sepultus)、アスペルギルス・シルバティカス(Aspergillus silvaticus)、アスペルギルス・ソジャエ(Aspergillus sojae)、アスペルギルス・スパーサス(Aspergillus sparsus)、アスペルギルス・スパスレイタス(Aspergillus spathulatus)、アスペルギルス・スペクタビリス(Aspergillus spectabilis)、アスペルギルス・スペランセウス(Aspergillus spelunceus)、アスペルギルス・スペルネウス(Aspergillus speluneus)、アスペルギルス・スピヌソサス(Aspergillus spinulosus)、アスペルギルス・ステレイタス(Aspergillus stellatus)、アスペルギルス・ステレイタス・バー・アステレイタス(Aspergillus stellatus var. astellatus)、アスペルギルス・ステラメニウス(Aspergillus stramenius)、アスペルギルス・ストリエイタス(Aspergillus striatus)、アスペルギルス・ストロマトイデス(Aspergillus stromatoides)、アスペルギルス・サボリバセウス(Aspergillus subolivaceus)、アスペルギルス・サブセシリス(Aspergillus subsessilis)、アスペルギルス・サルフュレウス(Aspergillus sulphureus)、アスペルギルス・サルフュレウス・バー・ミニマス(Aspergillus sulphureus var. minimus)、アスペルギルス・サンダーバニ(Aspergillus sunderbanii)、アスペルギルス・サイドウイ(Aspergillus sydowii)、アスペルギルス・タマリ(Aspergillus tamarii)、アスペルギルス・ターダス(Aspergillus tardus)、アスペルギルス・テレウス(Aspergillus terreus)、アスペルギルス・テレウス・バー・アフリカナス(Aspergillus terreus var. africanus)、アスペルギルス・テレウス・バー・アウレウス(Aspergillus terreus var. aureus)、アスペルギルス・テレウス・バー・バエディジニ(Aspergillus terreus var.baedijnii )、アスペルギルス・テレウス・バー・グロボサス(Aspergillus terreus var. globosus)、アスペルギルス・テレウス・バー・テレウス(Aspergillus terreus var. terreus)、アスペルギルス・テリコラ(Aspergillus terricola)、アスペルギルス・テリコラ・バー・アメリカナ(Aspergillus terricola var. americana)、アスペルギルス・テリコラ・バー・インディカス(Aspergillus terricola var. indicus)、アスペルギルス・テスタセオカラランス(Aspergillus testaceocolorans)、アスペルギルス・サーモミュテイタス(Aspergillus thermomutatus)、アスペルギルス・ソミイ(Aspergillus thomii)、アスペルギルス・トゴエンシス(Aspergillus togoensis)、アスペルギルス・トノフィラス(Aspergillus tonophilus)、アスペルギルス・トキシカリウス(Aspergillus toxicarius)、アスペルギルス・ツビンゲンシス(Aspergillus tubingensis)、アスペルギルス・アムブロサス(Aspergillus umbrosus)、アスペルギルス・アンギイス(Aspergillus unguis)、アスペルギルス・ユニレイテラリス(Aspergillus unilateralis)、アスペルギルス・ウサミ・ムト・シロウサミ(Aspergillus usamii mut. shirousamii)、アスペルギルス・ウサミ・バー・シロウサミ(Aspergillus usamii var. shiro-usamii)、アスペルギルス・ウスタス(Aspergillus ustus)、アスペルギルス・ウバラム(Aspergillus uvarum)、アスペルギルス・バデンシス(Aspergillus vadensis)、アスペルギルス・バリアンス(Aspergillus varians)、アスペルギルス・バーシカラー(Aspergillus versicolor)、アスペルギルス・ビオラセオフスカス(Aspergillus violaceofuscus)、アスペルギルス・ビオラセウス(Aspergillus violaceus)、アスペルギルス・ビリディヌタンス(Aspergillus viridinutans)、アスペルギルス・ビティス(Aspergillus vitis)、アスペルギルス・ビティス・バー・モンティビデンシス(Aspergillus vitis var. montevidensis)、アスペルギルス・ウェンティ(Aspergillus wentii)、アスペルギルス・ウェンティ・バー・ミニマス(Aspergillus wentii var. minimus)、アスペルギルス・ザオキンゲンシス(Aspergillus zhaoqingensis)、アスペルギルス・ゾナタス(Aspergillus zonatus)等が挙げられる。
さらに、Zymoseptoria属に分類される微生物としてはZymoseptoria tritici、Phaeosphaeria属に分類される微生物としてはPhaeosphaeria nodorum、Pyrenophora属に分類される微生物としてはPyrenophora teres、Ustilago属に分類される微生物としてはUstilago maydis、Ashbya属に分類される微生物としてはAshbya gossypii (Eremothecium gossypii)、Kluyveromyces属に分類される微生物としてはKluyveromyces lactis、Yarrowia属に分類される微生物としてはYarrowia lipolytica、Debaryomyces属に分類される微生物としてはDebaryomyces hansenii、Scheffersomyces属に分類される微生物としてはScheffersomyces stipitis、Meyerozyma属に分類される微生物としてはMeyerozyma guilliermondii、Lodderomyces属に分類される微生物としてはLodderomyces elongisporus、Filobasidiella(Cryptococcus)属に分類される微生物としてはCryptococcus neoformans、Cryptococcus gattiiおよびCryptococcus amylolentus、Botryotinia属に分類される微生物としてはBotryotinia fuckeliana、Sclerotinia属に分類される微生物としてはSclerotinia sclerotiorum、Tuber属に分類される微生物としてはTuber melanosporum、Postia属に分類される微生物としてはPostia placenta、Laccaria属に分類される微生物としてはLaccaria bicolor、Moniliophthora属に分類される微生物としてはMoniliophthora perniciosa、Coprinopsis属に分類される微生物としてはCoprinopsis cinerea、Schizophyllum属に分類される微生物としてはSchizophyllum commune、Puccinia属に分類される微生物としてはPuccinia graminis、Magnaporthe属に分類される微生物としてはMagnaporthe oryzae、Podospora属に分類される微生物としてはPodospora anserina、Neurospora属に分類される微生物としてはNeurospora crassa、Sordaria属に分類される微生物としてはSordaria macrospora、Thielavia属に分類される微生物としてはThielavia terrestris、Myceliophthora属に分類される微生物としてはMyceliophthora thermophila、Fusarium属に分類される微生物としてはFusarium graminearum、Nectria属に分類される微生物としてはNectria haematococca、Malassezia属に分類される微生物としてはMalassezia globosa、Neosartorya属に分類される微生物としてはNeosartorya fischeri、Arthroderma属に分類される微生物としてはArthroderma benhamiae、Coccidioides属に分類される微生物としてはCoccidioides immitisおよびCoccidioides posadasii、Paracoccidioides属に分類される微生物としてはParacoccidioides brasiliensis、Uncinocarpus属に分類される微生物としてはUncinocarpus reesii、Trichophyton属に分類される微生物としてはTrichophyton verrucosum、Ajellomyces属に分類される微生物としてはAjellomyces capsulatus、Hypocrea属に分類される微生物としてはHypocrea rufa、Acremonium属に分類される微生物としてはAcremonium chrysogenum、Penicillium属に分類される微生物としてはPenicillium camembertii、Ogataea属に分類される微生物としてはOgataea minuta、Komagataella属に分類される微生物としてはKomagataella
pastoris、Trigonopsis属に分類される微生物としてはTrigonopsis variabilis、Schizosaccharomyces属に分類される微生物としてはSchizosaccharomyces pombe、Scytalidium属に分類される微生物としてはScytalidium thermophirumが挙げられる。
本発明に係るメタクリル酸の製造方法で用いるメタクリル酸生成能を有する微生物の特に好ましい例としては、以下の高いメタクリル酸生成能を有する菌株が挙げられる(後述する実施例参照)。
(iv)コマモナス(Comamonas)属に属する、Comamonas terrigena NBRC13299。
(v)ブレバンディモナス(Brevundimonas)属に属する、Brevundimonas diminuta ATCC11568、Brevundimonas vesicularis ATCC11426又はBrevundimonas subvibrioides NBRC16000。
(vi)スフィンゴモナス(Sphingomonas)属に属する、Sphingomonas paucimobilis NBRC 13935。
(vii)オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属に属する、Ochrobactrum sp. NBRC12951、Ochrobactrum intermedium NBRC15820、Ochrobactrum intermedium NBRC13694、Ochrobactrum anthropic ATCC49237、Ochrobactrum grignonense NBRC 102586又はOchrobactrum lupini NBRC 102587。
(viii)ペドバクター(Pedobacter)属に属する、Pedobacter heparinus NBRC12017。
(ix)パエニバシラス(Paenibacillus)属に属する、Paenibacillus sp. NBRC13157。(x)アクロモバクター(Achromobacter)属に属する、Achromobacter denitrificans NBRC12669。
(xi)アシネトバクター(Acinetobacter)属に属する、Acinetobacter haemolyticus ATCC17906又はAcinetobacter junii ATCC17908。
(xii)シュワネラ(Shewanella)属に属する、Shewanella fodinae NBRC105216。
(xiii)リストネラ(Listonella)属に属する、Listonella anguillarum ATCC19264。
(xiv)アグロバクテリウム(Agrobacterium)属に属する、Agrobacterium luteum NBRC15768。
(xv)メソリゾビウム(Mesorhizobium)属に属する、Mesorhizobium loti ATCC700743。
(xvi)リゾビウム(Rhizobium)属に属する、Rhizobium leguminosarum ATCC10004。(xvii)パラコッカス(Paracoccus)属に属する、Paracoccus aminophilus NBRC16710。
(xviii)キサントバクター(Xanthobacter)属に属する、Xanthobacter autotrophicus ATCC35674。
(xix)ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属する、Streptomyces griseus NBRC13350。
(xx)ゲオバシラス(Geobacillus)属に属する、Geobacillus stearothermophilus
NBRC12983。
(xxi)ロドコッカス・エリスロポリスが挙げられる。より好ましい株としては、ロドコッカス・エリスロポリスPR−4株、ロドコッカス・エリスロポリスKA2−5−1株、ロドコッカス・エリスロポリスIGTS8株、ロドコッカス・エリスロポリスD−1株、ロドコッカス・エリスロポリスH−2株、ロドコッカス・エリスロポリスN1−36株、ロドコッカス・エリスロポリスI−19株、ロドコッカス・エリスロポリスECRD−1株、ロドコッカス・エリスロポリスB1株、ロドコッカス・エリスロポリスSY−1株、ロドコッカス・エリスロポリスUM3株、ロドコッカス・エリスロポリスUM9株又はロドコッカス・エスピーT09株等が挙げられ、特に好ましくはロドコッカス・エリスロポリスPR−4株が挙げられる。
(xxii)サッカロマイセス(Saccharomyces)属に属する、Saccharomyces cerevisiae NBRC1136、Saccharomyces cerevisiae NBRC2347又はSaccharomyces paradoxus NBRC10609。
(xxiii)カンディダ(Candida)属に属する、Candida utilis NBRC1086又はCandida parapsilosis ATCC22019。
(xxiv)アスペルギルス(Aspergillus)属に属する、Aspergillus niger ATCC6275、Aspergillus flavus NBRC8558又はAspergillus oryzae NBRC4255。
メタクリル酸生成能を有する微生物は、土壌、河川水、湖沼水、海水、汚泥、動物、植物、昆虫などから、アミノ酸又は脂肪酸の資化性を指標に平板分離法や集積培養法などのスクリーニングにより見出すことができる。
微生物として、メタクリル酸生成能を有する微生物(例えば上記(i)〜(xxiv)の菌株)から天然に又は化学的若しくは物理的処理によって誘導され、依然として再生可能原料及び/又はバイオマスを炭素源及び/又はエネルギー源としてメタクリル酸を生成する能力を保持する誘導株を用いてもよい。誘導株には以下に示す「変異株」や「遺伝子改変株」が含まれる。
変異株は、メタクリル酸生成能を有する微生物に、化学的若しくは物理的処理(例えばγ線照射など)によって、遺伝子変異を誘発して得ることができる。
[遺伝子改変株]
遺伝子改変株は、メタクリル酸生成能を有する微生物に、下記のようにして活性が強化された、あるいは活性を欠損又は低下させた株である。
(a)BCKAD遺伝子及び/又はACD遺伝子が導入されたことにより、メタクリル酸生成活性が強化されている。
(b)エノイルCoAヒドラターゼ遺伝子、3−ヒドロキシイソブチリルCoAヒドロラーゼ遺伝子及び/又は3−ヒドロキシイソ酪酸デヒドロゲナーゼ遺伝子の欠損又は不活化により、メタクリル酸生成活性が強化されている。欠損又は不活化は、遺伝子の全部又は塩基配列の一部に置換、欠失もしくは挿入により行う。
加えて、微生物として、メタクリル酸生成能を有する微生物から同定されるメタクリル酸合成に関与する酵素を、メタクリル酸生成能を有さない微生物に遺伝子導入することによって、新たに再生可能原料及び/又はバイオマスを炭素源及び/又はエネルギー源としてメタクリル酸を生成する能力を付与した株を用いることもできる。遺伝子組換え株の作製に当たっては、上記の遺伝子改変株の作製と同様の手法により行うことができる。
さらに、微生物として、メタクリル酸生成能を有する微生物(例えば上記(i)〜(xxiv)の菌株)の近縁種であって、同様に再生可能原料及び/又はバイオマスを炭素源及び/又はエネルギー源としてメタクリル酸を生成する能力を保持する株を用いることもできる。近縁種は、例えば、核酸の塩基配情報をもとに分子系統解析を行って得ることができる。近縁種は、具体的には、リボゾームRNA遺伝子(rRNA遺伝子;以下rDNA)の塩基配列の相同性解析によって得ることができる。
(1)シュードモナス(Pseudomonas)属に属し、上記(i)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号1〜8)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(2)バシラス(Bacillus)属に属し、上記(ii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号9〜15)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(3)スフィンゴバクテリウム(Sphingobacterium)属に属し、上記(iii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号16)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(4)コマモナス(Comamonas)属に属し、上記(iv)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号17)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(5)ブレバンディモナス(Brevundimonas)属に属し、上記(v)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号18〜20)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(6)スフィンゴモナス(Sphingomonas)属に属し、上記(vi)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号21)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(7)オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属に属し、上記(vii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号22〜26)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S
rDNAを有する微生物。
(8)ペドバクター(Pedobacter)属に属し、上記(viii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号27)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(9)パエニバシラス(Paenibacillus)属に属し、上記(ix)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号28)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(10)アクロモバクター(Achromobacter)属に属し、上記(x)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号29)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(11)アシネトバクター(Acinetobacter)属に属し、上記(xi)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号30〜31)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(12)シュワネラ(Shewanella)属に属し、上記(xii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号32)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(13)リストネラ(Listonella)属に属し、上記(xiii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号33)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(14)アグロバクテリウム(Agrobacterium)属に属し、上記(xiv)の菌株の16S
rDNAの部分塩基配列(配列番号34)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(15)メソリゾビウム(Mesorhizobium)属に属し、上記(xv)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号35)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(16)リゾビウム(Rhizobium)属に属し、上記(xvi)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号36)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(17)パラコッカス(Paracoccus)属に属し、上記(xvii)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号37)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(18)キサントバクター(Xanthobacter)属に属し、上記(xviii)の菌株の16S
rDNAの部分塩基配列(配列番号38)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(19)ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、上記(xix)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号39)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(20)ゲオバシラス(Geobacillus)属に属し、上記(xx)の菌株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号40)に示す部分塩基配列に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物。
(21)ロドコッカス・エリスロポリスPR−4株の16S rDNAの部分塩基配列(配列番号41)に対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する微生物が挙げられる。
(22)サッカロマイセス(Saccharomyces)属に属し、上記(xxii)の菌株のLSUrDNAの部分塩基配列(配列番号42〜44)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含むLSUrDNAを有する微生物。
(23)カンディダ(Candida)属に属し、上記(xxiii)の菌株のLSUrDNAの部分塩基配列(配列番号45〜46)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含むLSUrDNAを有する微生物。
(24)アスペルギルス(Aspergillus)属に属し、上記(xxiv)の菌株のLSUrDNAの部分塩基配列(配列番号47〜49)のいずれかに対して81%以上、好ましくは88%以上、より好ましくは95%以上、より好ましくは97%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99.5%以上の同一性を有する塩基配列を含むLSUrDNAを有する微生物。
〔AAT〕
AATは、アルコールまたはフェノール類にアシル−CoAのアシル基を転移させてエステルを合成する触媒作用を有する酵素である。AATは、種々の果物におけるエステルの生成に関与していると言われている。AATはショウガ目(バナナ)、バラ目(イチゴ、リンゴ、ナシ、モモ)、ウリ目(メロン)、ツツジ目(キウイ)、シソ目(オリーブ)、ナス目(トマト)、ムクロジ目(レモン、マンゴー)等の植物に存在することが知られている。
lycopersicum)、トウガラシ属に属するものとしてはピーマン(Capsicum annuum)およびハバネロ(Capsicum chinense)、タバコ属に属するものとしてはタバコ(Nicotiana tabacum、Nicotiana attenuata)、ツクバネアサガオ属に属するものとしてはペチュニア(Petunia x hybrida)、オリーブ属に属するものとしてはオリーブ(Olea europaea)、グランデュラリア属に属するものとしてはビジョザクラ(Glandularia x hybrida)、アキギリ属に属するものとしてはサルビア(Salvia splendens)、ラウオルフィア属に属するものとしてはインドジャボク(Rauvolfia serpentina)、ニチニチソウ属に属するものとしてはニチニチソウ(Catharanthus roseus)、カミツレ属に属するものとしてはローマカミツレ(Chamaemelum nobile)が特に好ましい。その中でも、バナナ、イチゴ、リンゴ、ウメ、セイヨウナシ、ブリーベリー、キウイ、メロン、パパイアおよびボカドが好ましい。バナナ、リンゴ、ウメ、セイヨウナシ、ブリーベリー、キウイ、メロン、パパイアおよびボカドがより好ましい。バナナ、リンゴ、セイヨウナシ、キウイ、メロン、パパイアおよびボカドが特に好ましい。
105121)に従うものとする。
Kit(ストラタジーン社)、GeneTailorTM Site−Directed Mutagenesis System(インビトロジェン社)、TaKaRa Site−Directed Mutagenesis System(Mutan−K、Mutan−Super Express Km等:タカラバイオ社)等を用いることができる。あるいは、変異を含む配列を有する遺伝子全体を人工合成してもよい。
本明細書において、ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、「Molecular
Cloning, A Laboratory Manual 2nd ed.」(ColdSpring Harbor Laboratory Press(1989))、「Current Protocols in Molecular Biology」(John Wiley & Sons(1987−1997))等を参照することができる。
本明細書において、ストリンジェントな条件は、例えば、DNAを固定したナイロン膜を、6×SSC(1×SSCは塩化ナトリウム8.76g、クエン酸ナトリウム4.41gを1リットルの水に溶かしたもの)、1%SDS、100μg/mlサケ精子DNA、0.1%ウシ血清アルブミン、0.1%ポリビニルピロリドン、0.1%フィコールを含む溶液中で65℃にて20時間プローブとともに保温してハイブリダイゼーションを行う条件を挙げることができるが、これに限定されるわけではない。当業者であれば、このようなバッファーの塩濃度、温度等の条件に加えて、その他のプローブ濃度、プローブの長さ、反応時間等の諸条件を加味し、ハイブリダイゼーションの条件を設定することができる。ハイブリダイゼーション後の洗浄条件として、例えば、「2×SSC、0.1%SDS、42℃」、「1×SSC、0.1%SDS、37℃」、よりストリンジェントな条件としては、例えば、「1×SSC、0.1%SDS、65℃」、「0.5×SSC、0.1%SDS、50℃」等の条件を挙げることができる。
本願発明であるメタクリル酸生成能を有する微生物を宿主として、上記AAT遺伝子をコードするDNAを導入して当該微生物内でタンパク質に転写翻訳させることで、メタクリル酸エステルの製造を可能とする。さらに、メタクリル酸生成活性を強化する酵素遺伝子(例えば、ACD、BCKAD等の遺伝子)を同時に導入してもよい。
(2−1)培養によるメタクリル酸の製造
本発明に係るメタクリル酸の製造方法では、前記微生物を再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体中で培養することによって培養物中にメタクリル酸を得ることができる。
微生物培養に用いられる再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体(培地)は、微生物が増殖可能な、少なくとも一種類の炭素源を含む十分な栄養素を含む固形培地又は液体培地とされる。ある実施形態において、培地は、細胞の生存及び増殖に最適なpH及び塩濃度に有利に処方される。
培地への微生物の播種は、従来公知の手法によって行えばよい。培養方法も、特に限定されず、振盪培養、通気撹拌培養及び静置培養などの公知手法を用いることができる。
本発明に係るメタクリル酸の製造方法では、上述のように、再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体中で、増殖を伴う微生物の培養を行う方法の他に以下の方法も採用できる。微生物が増殖能を有していてもいなくてもよく、予め培養した微生物を再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体に接触させ、実質的に増殖を伴わない休止菌体反応によりメタクリル酸を産生させることもできる。
休止菌体反応に用いられる再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体(反応液)に含まれる再生可能原料及びその濃度は、上記の培養によるメタクリル酸の製造の場合と同様であってよい。
休止菌体反応には、予め培養した微生物の培養液をそのまま用いるか、あるいはろ過又は遠心分離などで回収した菌体を使用する。回収した微生物は、適当な緩衝液等に再懸濁させ、任意の菌濃度にして用いることができる。緩衝液等には、生理食塩水、リン酸カリウム緩衝液、トリス−塩酸緩衝液、グリシン−水酸化ナトリウム緩衝液及びホウ酸−水酸化ナトリウム緩衝液などが用いられる。
培地中又は反応液中に生成したメタクリル酸及びその生成量は、高速液体クロマトグラフィー及びLC−MSなどの通常の方法を用いて検出し、測定することができる。
(3−1)培養によるメタクリル酸エステルの製造
本発明において、メタクリル酸エステルの製造は、メタクリル酸生成能を有する微生物およびそれら誘導株にAAT遺伝子が導入された遺伝子組み換え微生物を、再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体中で培養することによって培養菌体又は培養物中にメタクリル酸エステルを生成蓄積させ、該培養菌体又は培養物又は培養容器気相部からメタクリル酸エステルを回収することにより行われる。
微生物の培養に用いられる再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体(培地)は、微生物が増殖可能な、少なくとも一種類の炭素源を含む十分な栄養素を含む固形培地又は液体培地とされる。ある実施形態において、培地は、細胞の生存及び増殖に最適なpH及び塩濃度に有利に処方される。
アルコールまたはフェノール類の培地中における濃度は、メタクリル酸エステルを産生することができれば特に限定されない。濃度は、例えば、0.01〜20(w/v)%、好ましくは0.05〜10(w/v)%、より好ましくは0.1〜5(w/v)%とされる。また、アルコールまたはフェノール類は、予め培地に添加しておくこともできるし、培養を行いながら連続的に又は2回以上に分けて間欠的に添加することもできる。
窒素源の培地中における濃度は、メタクリル酸エステルを産生することができれば特に限定されない。濃度は、例えば、0.01〜10(w/v)%、好ましくは0.05〜8(w/v)%、より好ましくは0.1〜4(w/v)%とされる。
無機金属塩としては、例えば、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム等が用いられる。
無機塩類の培地中における濃度は、メタクリル酸エステルを産生することができれば特に限定されない。濃度は、例えば、0.001〜1.6(w/v)%、好ましくは0.005〜1.3(w/v)%、より好ましくは0.01〜1(w/v)%とされる。0.01(w/v)%以上用いるのは微生物のメタクリル酸エステル産生能が上昇するからであり、1(w/v)%以下とするのはそれ以上添加しても飛躍的な効果の上昇が認められないからである。
この他、培地には、微量金属、ビタミンなどが必要に応じて添加される。また、必要に応じて微生物の生育に必要な各種の有機物、無機物、界面活性剤あるいは通常用いられる消泡剤などを培地中に追添加することができる。
培地への微生物の播種は、従来公知の手法によって行えばよい。培養方法も、特に限定されず、振盪培養、通気撹拌培養及び静置培養などの公知手法を用いることができる。
微生物の培養条件は、微生物が生育し、かつメタクリル酸エステルを生成する限りにおいて特に限定されない。培養は、好気的条件下で行われても嫌気的条件下で行われてもよい。
pH、温度及び培養時間は、微生物が生育し、かつメタクリル酸エステルを生成し得る条件であれば特に限定されない。pHは、好ましくは3〜10、より好ましくは4〜9、さらに好ましくは5〜8とされる。温度は、好ましくは10〜45℃、より好ましくは15〜40℃、さらに好ましくは20〜35℃とされる。培養時間は、好ましくは10〜1000時間、より好ましくは15〜480時間、さらに好ましくは20〜240時間とされる。
これらの培養条件は、再生可能原料及び/又はバイオマスの利用量に対するメタクリル酸エステルの産生量の比率を最大化するように、菌株毎に適宜選択又は最適化される。なお、炭素源の量及び培養条件を適宜調整することで、メタクリル酸エステルの産生量を調整することもできる。
本発明に係るメタクリル酸エステルの製造方法では、上述のように、再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体中で、増殖を伴う微生物の培養を行う方法の他に以下の方法も採用できる。微生物が増殖能を有していてもいなくてもよく、予め培養した微生物を再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体に接触させ、実質的に増殖を伴わない休止菌体反応によりメタクリル酸エステルを産生させることもできる。
休止菌体反応に用いられる再生可能原料及び/又はバイオマスを含む水性媒体(反応液)に含まれる再生可能原料及びその濃度は、上記の培養によるメタクリル酸エステルの製造の場合と同様であってよい。
休止菌体反応に用いられるアルコールまたはフェノール類及びその濃度は、上記の培養によるメタクリル酸エステルの製造の場合と同様であってよい。
反応液には、無機金属塩類等を添加しても良い。無機金属塩としては、例えば、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム等が用いられる。
無機塩類の反応液中における濃度は、メタクリル酸エステルを産生することができれば特に限定されない。濃度は、例えば、0.0001〜2(w/v)%、好ましくは0.0003〜1.3(w/v)%、より好ましくは0.001〜1(w/v)%とされる。
この他、反応液には、微量金属、ビタミンなどが必要に応じて添加される。また、必要に応じて反応に必要な各種の有機物、無機物、界面活性剤あるいは通常用いられる消泡剤などを反応液中に追添加することができる。
休止菌体反応には、予め培養した微生物の培養液をそのまま用いるか、あるいはろ過又は遠心分離などで回収した菌体を使用する。回収した微生物は、適当な緩衝液等に再懸濁させ、任意の菌濃度にして用いることができる。緩衝液等には、生理食塩水、リン酸カリウム緩衝液、トリス−塩酸緩衝液、グリシン−水酸化ナトリウム緩衝液及びホウ酸−水酸化ナトリウム緩衝液などが用いられる。
また、休止菌体反応には、回収した微生物の処理物(例えば、破砕物、粗酵素又は精製酵素など)を使用することもできる。さらに、微生物又はその処理物を公知の方法で適当な担体に固定化し、その固定化物を反応に使用してもよい。
反応条件は、メタクリル酸エステルを生成する限りにおいて特に限定されない。反応は、好気的条件下で行われても嫌気的条件下で行われてもよい。反応方法も、特に限定されず、振盪反応、通気撹拌反応及び静置反応などの公知手法を用いることができる。
pH、温度及び反応時間は、メタクリル酸を生成し得る条件であれば特に限定されない。pHは、好ましくは3〜10、より好ましくは4〜9、さらに好ましくは5〜8とされる。温度は、好ましくは10〜45℃、より好ましくは15〜40℃、さらに好ましくは20〜35℃とされる。反応時間は、好気的条件で好ましくは5〜180時間、より好ましくは10〜150時間、さらに好ましくは15〜120時間とされる。
培地中又は反応液中に生成したメタクリル酸エステル及びその生成量は、高速液体クロマトグラフィー及びLC−MSなどの通常の方法を用いて検出し、測定することができる。また、培養容器又は反応容器の気相部(ヘッドスペース部)に揮発したメタクリル酸エステル及びその生成量は、ガスクロマトグラフィーなどの通常の方法を用いて検出し、測定することができる。
メタクリル酸エステルは、ろ過、遠心分離、真空濃縮、イオン交換又は吸着クロマトグラフィー、溶媒抽出、蒸留及び結晶化などの周知の操作を必要に応じて適宜組み合わせて用いることにより、培地又は反応液中から分離・精製できる。
本発明の一側面であるメタクリル酸合成に関与する酵素およびその遺伝子について以下詳述する。
その結果、Pseudomonas aeruginosa PAO1よりPA_acd1と命名した遺伝子とRhodococcus erythropolis PR4よりRE_acd1と命名した遺伝子が導入された組換え体に極めて高い活性を得ることができた(配列番号51及び53)。PA_acd1とRE_acd1はそのコードするアミノ酸配列(配列番号50及び52)において相互に57%の同一性を示した。一方、活性が認められなかったPA_acd2、RE_acd2や微弱な活性しか認められなかったacdH(Streptomyces)については、高い活性が認められたPA_acd1とRE_acd1とのアミノ酸レベルでのホモロジーは以下に示すとおりであった。PA_acd2は、PA_acd1およびRE_acd1とそれぞれ40%および41%の同一性を示した。RE_acd2は、PA_acd1およびRE_acd1とそれぞれ36%の同一性を示した。acdHは、PA_acd1およびRE_acd1とそれぞれ38%および36%の同一性を示した。
(a)配列番号50または52で示すアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする遺伝子、
(b)配列番号51または52で示す塩基配列からなる遺伝子、
(c)配列番号50または52で示すアミノ酸配列からなるタンパク質と45%以上の同一性を示すアミノ酸配列からなり、且つACD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、及び
(d)配列番号50または52で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、ACD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
続けて、メタクリル酸合成に関与しているBCKADについて記載する。BCKADは2−オキソイソ吉草酸からイソブチリル−CoAを生成させることができる酵素である。本発明であるメタクリル酸生産能を有する微生物からBCKADおよびその遺伝子を取得することができる。
(e)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子。
(f)配列番号55、57、59および61で示す塩基配列からなる遺伝子。
(g)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(h)配列番号54、56、58および60で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(j)配列番号63、65、67および69で示す塩基配列からなる遺伝子。
(k)配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列を有する4つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(l)配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列アミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(n)配列番号71、73および75で示す塩基配列からなる遺伝子。
(o)配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列を有する3つのポリペプチドをコードする遺伝子の相補鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズし、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(p)配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、且つBCKAD活性を有するタンパク質をコードする遺伝子。
(i)配列番号54、56、58および60に示されるアミノ酸、配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列または配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列において、1〜20個(例えば1〜10個、好ましくは1〜5個、さらに好ましくは1〜2個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、
(ii)配列番号54、56、58および60に示されるアミノ酸、配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列または配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列の1〜20個(例えば1〜10個、好ましくは1〜5個、さらに好ましくは1〜2個)のアミノ酸が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列、
(iii)配列番号54、56、58および60に示されるアミノ酸、配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列または配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列に1〜20個(例えば1〜10個、好ましくは1〜5個、さらに好ましくは1〜2個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、
(iv)配列番号54、56、58および60に示されるアミノ酸、配列番号62、64、66および68で示すアミノ酸配列または配列番号70、72および74で示すアミノ酸配列に1〜20個(例えば1〜10個、好ましくは1〜5個、さらに好ましくは1〜2個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、
(v)上記(i)〜(iv)を組み合わせたアミノ酸配列が挙げられる。
こうして得られた酵素は、その酵素が作用する条件下で、原料となる化合物と接触させることにより、それぞれの目的産物を得ることができる。
日本国内の異なる地点から採取した土壌及び昆虫を微生物源として、集積培養によりメタクリル酸生産菌の探索を行った。バリンの代謝中間体にはメタクリル酸の誘導体であるメタクリリル−CoAが含まれることから、培地にはL−バリンを含むものを用い、バリンの資化性を指標としてスクリーニングを行った。
滅菌水5mLに土壌を適量加えて撹拌し、静置後、適量の上清を10ml液体培地に添加した。培地の組成を以下に示す。
K2HPO4 1.0 g/l
MgSO4・7H2O 0.2 g/l
FeSO4・7H2O 0.01 g/l
CaCl2 0.01 g/l
L−バリン 5.0 g/l
pH 7.0
採取したアオオサムシ(Carabus insulicola)を飢餓状態で2日間飼育した後、虫体を95%エタノール及び滅菌した生理食塩水でそれぞれ2回洗浄した。虫体腹部を分離し0.3mLの滅菌水に懸濁した後、上清0.1mLをLB液体培地に添加し30℃で48時間培養した。適量の培養上清を10ml液体培地に添加した。培地の組成を以下に示す。
K2HPO4 1.0 g/l
MgSO4・7H2O 0.2 g/l
FeSO4・7H2O 0.01 g/l
CaCl2 0.01 g/l
L−バリン 5.0 g/l
pH 7.0
IAM(東京大学分子細胞生物学研究所カルチャーコレクション)1568株(NBRC102199)及びPseudomonas japonica IAM 15071株(NBRC103040)に対し99.2%の最も高い同一性を示した。(NBRC株は、独立行政法人製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンターから入手可能である。)
12633株、Pseudomonas fuscovaginae MAFF 301177株、Pseudomonas
asplenii ATCC 23835株及びPseudomonas agarici LMG 2112株に対し99.0%の最も高い同一性を示した。
12633株、Pseudomonas fuscovaginae MAFF 301177株及びPseudomonas asplenii ATCC 23835株に対し98.6%の最も高い同一性を示した。
実施例1で取得された分離株を用いて合成培地中でのメタクリル酸製造を行った。
K2HPO4 1.0 g/l
MgSO4・7H2O 0.2 g/l
FeSO4・7H2O 0.01 g/l
CaCl2 0.01 g/l
L−バリン 5.0 g/l
pH 7.0
装置:e2695(Waters社製)
カラム:有機酸分析用イオン排除型ポリマーカラムT−132−E(WAKO社製)
溶離液:0.1%(v/v)リン酸溶液
流速:0.5ml/min
カラム温度:40℃
サンプル注入量:10μl
分析時間:40min
検出器:UV
装置:6890/5875A(Agilent Technologies社製)
カラム:DB−FFAPカラム(J&W社製)
キャリアー:He
オーブン温度:50℃(1min)の後、5℃/minで150℃まで昇温し、さらに20℃/minで250℃まで昇温した。
注入口温度:200℃
カラム流量:1ml/min(コンスタントフローモード)
スプリット比:1/50
サンプル注入量:1μl
検出器:MSD(EI)
実施例1で取得された分離株を用いて天然培地中でのメタクリル酸製造を行った。
トリプトン(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 10g/l
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 5g/l
NaCl 10g/l
pH7.0
実施例1で取得された分離株を用いて休止菌体反応によりメタクリル酸の製造を行った。
K2HPO4 1.0 g/l
MgSO4・7H2O 0.2 g/l
FeSO4・7H2O 0.01 g/l
CaCl2 0.01 g/l
L−バリン 5.0 g/l
pH 7.0
Pseudomonas putida NBRC12996を寒天培地(LB培地、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1〜4日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
装置:e2695(Waters社製)
カラム:有機酸分析用イオン排除型ポリマーカラムT−132−E(WAKO社製)
溶離液:0.1%(v/v)リン酸溶液
流速:0.5ml/min
カラム温度:40℃
サンプル注入量:10μl
分析時間:40min
検出器:UV
分析条件B
装置:JASCO UV−970、CO−960、PU−980、DG−1580−54(日本分光社製)
カラム:InertsilRODS−3V(GLサイエンス社製)
溶離液:20%(v/v)メタノール、0.2%(v/v)リン酸溶液
流速:1.0ml/min
カラム温度:40℃
サンプル注入量:5μl
分析時間:15min
検出器:UV
Brevundimonas subvibrioides NBRC16000、Ochrobactrum grignonense NBRC102586、Ochrobactrum lupini NBRC102587、Paracoccus aminophilus NBRC16710を寒天培地に生育させた(プレート培養)。プレート培養用の培地組成を以下に示す。
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 2g
MgSO4・7H2O 1g
Distilled water 1l
Ager 15g
pH7.0
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Sphingomonas paucimobilis NBRC13935、Ochrobactrum intermedium NBRC15820、Paenibacillus sp. NBRC13157、Mesorhizobium loti ATCC700743をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230rpm)、好気条件にて、1〜4日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Bacillus badius ATCC14574をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10mlニュートリエント培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Ochrobactrum sp. NBRC12951をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソンアンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。100ml液体培地(培地100ml/500ml容三角フラスコ)に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、8日間培養を行った(本培養)。本培養用の培地組成を以下に示す。
L−バリン 2.0 g/l
Brevundimonas diminuta ATCC11568をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10mlニュートリエント培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。前培養液と40%グリセロール水溶液を1:1で混合し、−80℃で凍結保存した。
L−バリン 2.0 g/l
Candida utilis NBRC1086をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン
アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に生育した菌を1白金耳植菌し、24℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。
ポリペプトン(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 20g/l
グルコース 20 g/l
L−バリン 2.0 g/l
(NH4)2SO4 6.0g/l
KCl 2.4g/l
NaCl 0.12g/l
H3PO4 3.0g/l
MgSO4・7H2O 2.4g/l
FeSO4・7H2O 0.01g/l
ZnSO4・7H2O 0.12g/l
MnSO4・4−6H2O 0.024g/l
CuSO4・5H2O 0.006g/l
CaCl2 0.12g/l
Vitamin Mix 30ml
ビオチン 0.2g/l
パントテン酸カルシウム 2g/l
葉酸 0.002g/l
塩酸チアミン 0.4g/l
リボフラビン 0.2g/l
ニコチン酸 0.4g/l
塩酸ピリドキシン 0.4/lg
イノシトール 1g/l
p−アミノ安息香酸 0.2g/l
Aspergillus flavus NBRC8558、Aspergillus oryzae NBRC4255をポテトデキストロース寒天培地(日水製薬社製)に生育させた。生育した菌糸と胞子を滅菌水5mlに懸濁し、その1mlを100ml液体培地(培地100ml/500ml容三角フラスコ)に植菌した。24℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、2日間培養を行った(本培養)。本培養用の培地組成を以下に示す。
NaNO3 2.5g/l
K2HPO4 1.25g/l
MgSO4・7H2O 0.63g/l
KCl 0.63g/l
FeSO4・7H2O 0.013g/l
小麦ふすま 5g/l
pH7.0
Sphingomonas paucimobilis NBRC13935、Pedobacter heparinus NBRC12017、Bacillus subtilis NBRC12210、Listonella anguillarum ATCC19264をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1〜3日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Ochrobactrum grignonense NBRC102586、Ochrobactrum lupini NBRC102587、Paracoccus aminophilus NBRC16710を寒天培地に生育させた(プレート培養)。プレート培養用の培地組成を以下に示す。
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 2g
MgSO4・7H2O 1g
Distilled water 1l
Ager 15g
pH7.0
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Bacillus megaterium NBRC15308、Bacillus simplex ATCC49097、Streptomyces griseus NBRC13350をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10mlニュートリエント培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
L−バリン 2.0 g/l
グルコース 2.0 g/l
Comamonas terrigena NBRC13299、Acinetobacter junii ATCC17908、Xanthobacter
autotrophicus ATCC35674をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンドカンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10mlニュートリエント培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。
L−バリン 2.0 g/l
Ochrobactrum sp. NBRC12951、Ochrobactrum intermedium NBRC13694、Ochrobactrum anthropi ATCC49237、Achromobacter denitrificans NBRC12669、Acinetobacter
haemolyticus ATCC17906をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。100ml液体培地(培地100ml/500ml容三角フラスコ)に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、3〜4日間培養を行った(本培養)。本培養用の培地組成を以下に示す。
L−バリン 2.0 g/l
Shewanella fodinae NBRC 105216をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。100ml液体培地(培地100ml/500ml容三角フラスコ)に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、3日間培養を行った(本培養)。本培養用の培地組成を以下に示す。
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 2g
MgSO4・7H2O 1g
Sea water(海産微細藻類用ダイゴ人工海水SP、日本製薬株式会社製) 750ml
Distilled water 250ml
L−バリン 2.0 g/l
pH7.2−7.4
Agrobacterium luteum NBRC15768を25℃で寒天培地に生育させた(プレート培養)。プレート培養用の培地組成を以下に示す。
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 2g
MgSO4・7H2O 1g
Sea water(海産微細藻類用ダイゴ人工海水SP、日本製薬株式会社製) 750ml
Distilled water 250ml
Ager 15g
pH7.2−7.4
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 2g
MgSO4・7H2O 1g
Sea water(海産微細藻類用ダイゴ人工海水SP、日本製薬株式会社製) 750ml
Distilled water 250ml
L−バリン 2.0 g/l
pH7.2−7.4
Brevundimonas vesicularis ATCC11426、Rhizobium leguminosarum ATCC10004をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、4日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。前培養液と40%グリセロール水溶液を1:1で混合し、−80℃で凍結保存した。
KH2PO4 3.0 g/l
NaCl 0.5g/l
NH4Cl 1.0 g/l
1M MgSO4・7H2O 1ml
1M CaCl2 0.1ml
1% Thiamin 1ml
グルコース 2.0 g/l
L−バリン 2.0 g/l
Brevundimonas diminuta ATCC11568をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10mlニュートリエント培地に生育した菌を1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、1日間培養を行った(前培養)。前培養液と40%グリセロール水溶液を1:1で混合し、−80℃で凍結保存した。
L−バリン 2.0 g/l
Geobacillus stearothermophilus NBRC 12983をニュートリエント寒天培地(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製、寒天1.5%)に生育させた。10ml液体培地に生育した菌を1白金耳植菌し、37℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、2日間培養を行った(前培養)。前培養用の培地組成を以下に示す。
グルコース 2.0 g/l
L−バリン 2.0 g/l
Saccharomyces cerevisiae NBRC1136、Saccharomyces cerevisiae NBRC2347、Saccharomyces paradoxus NBRC10609、Candida parapsilosis ATCC22019を寒天培地に生育させた(プレート培養)。プレート培養用の培地組成を以下に示す。Saccharomyces属は30℃、Candida属は24℃で培養を行った。
ポリペプトン(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 20g/l
グルコース 20 g/l
Ager 15g/l
酵母エキス(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 20g/l
ポリペプトン(ベクトン・ディッキンソン アンド カンパニー社製) 20g/l
グルコース 20 g/l
グルコース 2.0g/l
L−バリン 2.0 g/l
(NH4)2SO4 6.0g/l
KCl 2.4g/l
NaCl 0.12g/l
H3PO4 3.0g/l
MgSO4・7H2O 2.4g/l
FeSO4・7H2O 0.01g/l
ZnSO4・7H2O 0.12g/l
MnSO4・4−6H2O 0.024g/l
CuSO4・5H2O 0.006g/l
CaCl2 0.12g/l
Vitamin Mix 30ml
ビオチン 0.2g/l
パントテン酸カルシウム 2g/l
葉酸 0.002g/l
塩酸チアミン 0.4g/l
リボフラビン 0.2g/l
ニコチン酸 0.4g/l
塩酸ピリドキシン 0.4/lg
イノシトール 1g/l
p−アミノ安息香酸 0.2g/l
L−バリンまたはイソ酪酸 2.0 g/l
(NH4)2SO4 6.0g/l
KCl 2.4g/l
NaCl 0.12g/l
H3PO4 3.0g/l
MgSO4・7H2O 2.4g/l
FeSO4・7H2O 0.01g/l
ZnSO4・7H2O 0.12g/l
MnSO4・4−6H2O 0.024g/l
CuSO4・5H2O 0.006g/l
CaCl2 0.12g/l
Vitamin Mix 30ml
ビオチン 0.2g/l
パントテン酸カルシウム 2g/l
葉酸 0.002g/l
塩酸チアミン 0.4g/l
リボフラビン 0.2g/l
ニコチン酸 0.4g/l
塩酸ピリドキシン 0.4/lg
イノシトール 1g/l
p−アミノ安息香酸 0.2g/l
Aspergillus niger ATCC6275、Aspergillus flavus NBRC8558、Aspergillus oryzae NBRC4255をポテトデキストロース寒天培地(日水製薬社製)に生育させた。生育した菌糸あるいは胞子を滅菌水5mlに懸濁し、その1mlを100ml液体培地(培地100ml/500ml容三角フラスコ)に植菌した。24℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、2日間培養を行った(本培養)。本培養用の培地組成を以下に示す。
NaNO3 2.5g/l
K2HPO4 1.25g/l
MgSO4・7H2O 0.63g/l
KCl 0.63g/l
FeSO4・7H2O 0.013g/l
小麦ふすま 5g/l
pH7.0
L−バリン、50mM リン酸バッファー pH7.0である。
GENETYX CORPORATIONの遺伝情報処理ソフトウェアGENETYX ver.10のホモロジー解析プログラムを用いて、配列番号1〜8、9〜15、18〜20、22〜26、30〜31、42〜44、45〜46、47〜49に示す各微生物の16S rDNA又はLSU rDNAの塩基配列の同一性をそれぞれ比較した。「表26〜33」に結果を示す。
ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)PR4(製品評価技術基盤機構生物遺伝資源部門;受託番号:NBRC 100887)を特開2011‐200133号公報に記載の方法により改変し、120mg/Lのクロラムフェニコールに耐性を示し、且つカナマイシン耐性遺伝子を欠失した誘導株を作製し、PR4KS株と命名した。
extract、0.3% malt extract、0.2% KH2PO4、0.2% K2HPO4、1.5%寒天)にて培養することにより、pKM043がRhCmSR−09株ゲノム内に挿入された相同組換え株を得た。前記相同組換え株を、10%スクロース含有MYK寒天培地にて培養し、得られたコロニーの中からカナマイシン感受性株となった誘導株、すなわちカナマイシン耐性遺伝子欠失変異誘導株PR4KS株を得た。
PR4KS株のLigDホモログ遺伝子(accession no: YP_002767969)を標的遺伝子とした。LigD遺伝子周辺配列を含む約5.4 kbのDNAをPCRにより増幅後、特開2011‐200133号公報に記載された、sacB遺伝子がカナマイシン耐性遺伝子の下流且つ同方向に導入されたプラスミドベクターpK19mobsacB1にクローニングし、プラスミドpTJ001を得た。PCR条件は以下の通りである。
GB−138: 5’− GGCCTGCAGGTACCGATCATCACCATCGGTGTC −3’ (配列番号94)
GB−139: 5’− GGTCTAGACTGAGCAGTGTTCCAATGCG −3’(配列番号95)
滅菌水 22 μl
2×PrimeSTAR(タカラバイオ社製) 25 μl
GB−138 1 μl
GB−139 1 μl
PR4KSゲノム(50 ng/μl) 1 μl
総量 50 μl
98℃ 10秒、55℃ 10秒及び72℃ 120秒の反応を35サイクル
GB−140: GAGGAAATGGTCACAGGGCGAGAATAGGTTG
(配列番号96)
GB−141: GCCCTGTGACCATTTCCTCATTGTGCTGG (配列番号97)
滅菌水 22 μl
2×PrimeSTAR(タカラバイオ社製) 25 μl
GB−140 1 μl
GB−141 1 μl
pTJ001 1 μl
総量 50 μl
98℃ 10秒、50度 10秒及び72℃ 180秒の反応を30サイクル
miniprep kit(QIAGEN社製)を用いた。
大腸菌(Escherichia coli)S17−1λpirをpTJ002により形質転換したものをドナーとし、参考例1の方法により得られたPR4KSをレシピエントとして、特開2011‐200133号公報に記載の方法と同様に接合伝達を行い、相同組換えによって生じた13株のLigDホモログ遺伝子欠失誘導株を得た。前記欠失誘導株から1株を選び、PR4KSΔligD誘導株と命名した。
(1)pLK005の取得と解析
pK4(特開平5−64589号公報参照)を用いて、上記エレクトロポレーション法によりロドコッカス sp. N775(独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター 寄託番号FERM BP−961)を形質転換した。得られた形質転換体を10mlのMYK培地に植菌し、30℃にて1日培養した。これをクリーンベンチ内で紫外線を照射することにより変異処理を行った。変異処理を行った培養液を50〜400μg/mlのカナマイシンを含むMYK寒天培地に塗布し、30℃にて3日間培養した。
プラスミドpSJ034は、特開平10−337185号公報記載の方法によりプラスミドpSJ023から作製したものである。pSJ034には3カ所のEcoRI制限酵素部位が存在するが、このうちの1カ所をSpeI部位に変換したプラスミドpSJ040を作製した。作製方法は、pSJ034を制限酵素EcoRIにより部分分解し、タカラBluntingキットを用いて切断個所の平滑化を行った。SpeIリンカーの存在下でライゲーション反応を行い、反応液を用いて大腸菌JM109株を形質転換した。形質転換体を培養後、プラスミドを抽出し、SpeIリンカーが挿入されたプラスミドを選別した。pSJ034の3つのEcoRI部位のうち、カナマイシン耐性遺伝子の下流に存在するEcoRI部位にSpeIリンカーが挿入されたものをpSJ040と命名した。
pLK005をHindIIIで切断し、約2.1kbの断片を調製した。一方、pSJ040をHindIIIで切断し、約9.8kbの断片を調製した。これらの2断片を用いてライゲーション反応を行い、反応液を用いて大腸菌JM109株を形質転換した。形質転換体を培養後、プラスミドを抽出し、その塩基配列を確認した結果、pLK005由来の変異配列(GTTGTAGGの重複)を持ち、それ以外はpSJ040と同様の配列を有するプラスミドをpSJ201と命名した。
(1)In Fusion法を用いた遺伝子欠失用プラスミドの作製
PR4KS株のRE_acd1/RE_echA/RE_hchA/RE_mmsB遺伝子を標的遺伝子としたIn−Fusion HD Cloning kit(タカラバイオ社製)による遺伝子欠失用プラスミドの作製を行った(図5参照)。
MMA−061: CGACTCTAGAGGATCGCTCAGTACATCTACGAGAC (配列番号98)
MMA−062: AGTGTGAGGAAAGTGTTCCGATCAGTTCAT
(配列番号99)
断片2用プライマー
MMA−063: CACTTTCCTCACACTCGTCGAGAGTATGAG
(配列番号100)
MMA−064: CGGTACCCGGGGATCAGCGCGACGAACAACGAGAC (配列番号101)
鋳型(PR4 wild typeゲノムDNA) 1μl
2×PrimeSTAR Max Premix(TAKARA社製)25μl
Fw Primer(20 μM) 1μl
Rv Primer(20 μM) 1μl
D.W. 22μl
Total 50μl
98℃ 10秒、60℃ 10秒及び72℃ 120秒の反応を30サイクル
In−Fusion HD Cloning Kitを用い、上記断片とベクターの連結を行った。反応条件は以下の通りである。
5x In−Fusion HD Enzyme Premix 2μl
ベクター断片 1.5μl
DNA断片1 1μl
DNA断片2 2μl
D.W. 3.5μl
Total 10μl
PR4KSΔligD株コンピテントセル20μlに pMMA302を1μl添加し、氷上で10分間インキュベートした。インキュベートした上記溶液を氷冷したエレクトロポレーションキュベット(0.1cm)に全量移し、1.5kV (200Ω)の高電圧をかけ、直ちに600μlのLB液体培地を加え、30℃にて6時間静置した。200μlをLB Km10寒天培地に撒き30℃にて4日間培養した。生育したコロニーをLB Km10寒天培地にストリークし、4日間培養した後、以下に示した条件によりコロニーPCRを行い相同組換え誘導株の確認を行った。
MMA−069: GCGCATCTACAAGGAAGAGATC(配列番号102)
MMA−070: GCGACGCTCATCGAGATCTC(配列番号103)
鋳型 4.0μl
2×MightyAmpBuffer(TAKARA社製) 5.0μl
Fw Primer(20 μM) 0.25μl
Rv Primer(20 μM) 0.25μl
D.W. 0.3μl
MightyAmpDNAPolymerase(TAKARA社製) 0.2μl
Total 10.0μl
98℃ 10秒、68℃ 180秒の反応を30サイクル
ロドコッカス属に属する微生物においてACD又はAATを発現させるためのプラスミドを作製した。
MMA−114 GGTCTAGAATGTTTACTCTGACCGATGACGAGCG(配列番号126)
MMA−022 GGCCTGCAGGCCGTCACGCTTTTCGATCAATAC(配列番号115)
MMA−109 GGTCTAGAATGAAATCATTCTCAGTACTTCAG(配列番号127)
MMA−045 CGGTACGCGCGGATCTTCCAGAG(配列番号83)
Rhodococcus erythropolis PR4野生株ゲノムDNA
プラスミドpAAT001(実施例45参照)
鋳型 1μl
2×PrimeSTAR Max Premix(TAKARA社製) 25μl
Fw Primer(20 μM) 1μl
Rv Primer(20 μM) 1μl
D.W. 22μl
Total 50μl
98℃ 10秒、60℃ 10秒、72℃ 60秒の反応を30サイクル
PCR増幅断片 20μl
10×M 5μl
0.1%BSA 5μl
XbaI(TAKARA社製) 2μl
Sse8387I(TAKARA社製) 2μl
D.W. 16μl
Total 50μl
ベクター断片(pSJ201) 44μl
10×SAP Buffer 5μl
SAP(Promega社製) 1μl
Total 50μl
ベクター断片 4μl
目的断片 1μl
Ligation Mix(TAKARA社製)3μl
Total 8μl
以下に実施例27で得られたRhodococcus属微生物でメタクリル酸エステルを製造するためのプラスミドの作製を行った。
MMA−133(Sse−ProFw): TGACCTGCAGGTGCACTCCGCTGCGACATGTATCGA (配列番号104)
MMA−131(Sse−001Rv): ACTCTAGCCTGCAGGTCATTGACTAGTTGATCTAAGGTTGTTACA (配列番号105)
鋳型(pAAT301) 1μl
2×PrimeSTAR Max Premix(TAKARA社製)10μl
Fw Primer(10 μM) 0.6μl
Rv Primer(10 μM) 0.6μl
D.W. 7.8μl
Total 20μl
98℃ 5秒、60℃ 5秒、72℃ 45秒の反応を30サイクル
PCR増幅断片 40μl
10×Mバッファー 5μl
0.1% BSA 4μl
Sse8387I(TAKARA社製) 1μl
Total 50μl
pMMA401(ベクター) 3μl
10×Mバッファー 4μl
0.1% BSA 4μl
AP 1μl
Sse8387I(Promega社製) 1μl
D.W. 27μl
Total 40μl
pMMA401 1μl
挿入断片 2μl
Ligation Mix(TAKARA社製) 3μl
Total 6μl
実施例27の(3)で得られたDMA008株を、プラスミドpMMA401により形質転換した。得られた組換え体(DMA008/pMMA401)を用いて休止菌体反応によりメタクリル酸の製造を行った。以下に示すM9/Frc/Km10液体培地(ワッセルマン試験管)2mLに1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(180 rpm)、好気条件にて、2日間培養を行った(前培養)。
6.0 g/L Na2HPO4
3.0 g/L KH2PO4
0.5 g /L NaCl
1.0 g/L NH4Cl
1 mM MgSO4・7H2O
1 mM CaCl2
0.01 g/L Thiamine
2.0 g/L フルクトース
10 μg/L カナマイシン
OD630=10 菌体 (終濃度)
5.0g/l 2−オキソイソ吉草酸(終濃度)
50mM リン酸バッファー/pH7.0(終濃度)
装置:Waters 2695
カラム:ICsep USP L−17, φ 4.0 mm×250 mm
移動相:0.01N H2SO4
流量: 0.35 ml/min
ランタイム:20 min
カラム温度:40 ℃
サンプル温度:20 ℃
検出:UV 210 nm
実施例27の(3)で得られたDMA008株にプラスミドpACDAAT1、pACDAAT2、pACDAAT3、pACDAAT4、pACDAAT6、及びpACDAAT8をそれぞれ形質転換した。得られた組換え体(DMA008/pACDAAT1、DMA008/pACDAAT2、DMA008/pACDAAT3、DMA008/pACDAAT4、DMA008/pACDAAT6及びDMA008/pACDAAT8)を用いて休止菌体反応によりメタクリル酸エステルの製造を行った。2mlLB Km10液体培地(ワッセルマン試験管)に1白金耳植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(180 rpm)、好気条件にて、2日間培養を行った(前培養)。前培養液を100mLLB Km10(培地100mL/500mL容三角フラスコ)に1ml植菌し、30℃、ロータリーシェーカー(230 rpm)、好気条件にて、3日間培養を行った(本培養)。なお、コントロールには、プラスミドDMA008/pLK005を用いた。
OD630=10 菌体 (終濃度)
5.0g/l 2−オキソイソ吉草酸(終濃度)
40mM アルコール(終濃度)
50mM リン酸バッファー/pH7.5(終濃度)
実施例27の(3)で得られたDMA008株を、プラスミドpACDAAT1によりそれぞれ形質転換した。得られた組換え体(DMA008/pACDAAT1)を用いて休止菌体反応によりメタクリル酸エステルの製造を行った。また、コントロールとして、DMA008/pLK005を用いた。実施例31記載の方法を用いて、組換え体の培養を行い菌体を得た。
OD630=10 菌体 (終濃度)
5.0g/l 2−オキソイソ吉草酸(終濃度)
40mM アルコール(終濃度)
50mM リン酸バッファー/pH7.5(終濃度)
メタクリル酸生産能を有するPseudomonas属微生物のメタクリル酸合成に関与する遺伝子の単離を行った。
<ゲノムDNAの調製>
LB寒天培地(1%バクトトリプトン、0.5%バクトイ−ストエキス、0.5% NaCl、1.5%寒天)上で生育させたPseudomonas aeruginosa
PAO1株(NBRC106052)を10mLのLB液体培地に植菌し、37℃にて15時間振盪培養を行った。培養終了後、2mLの培養液より菌体を遠心により回収し、Wizard Genomic DNA Purification Kit(プロメガ株式会社)を用いてゲノムDNA50μLを取得した。
得られたゲノムDNAを鋳型にして、ACDをコ−ドすることが推定された遺伝子を含むDNA断片を、発現ベクターに容易に導入可能な制限酵素認識部位が付加された形となるようオリゴヌクレオチドを設計し、PCR法により調製した。
MMA−003: 5’− GACCCATGGATTTCGACCTCACCGAAGAAC −3’ (配列番号106)
MMA−004: 5’− GCCCTGCAGGATGCGATGGTTCGCGGCGTTC −3’ (配列番号107)
MMA−020: 5’− GGACATGTTTCGTGATCCGGAAACCCTGAAC −3’ (配列番号108)
MMA−006: 5’− GGCCTGCAGGCGAAGGATCGACGCTAGCCCTG −3’ (配列番号109)
MMA−018: 5’− GGACATGTTTCCCTGCGAAGAAGAGATCCAG −3’ (配列番号110)
MMA−008: 5’− GGCCTGCAGGCGCCGTTGCGGAAACGACGG −3’ (配列番号111)
MMA−019: 5’− GGCCATGGTACCGAGAACCCTGTTCAGCTC −3’ (配列番号112)
MMA−010: 5’− GGCCTGCAGGCTGGACGAGGAGGTGCTCGC −3’ (配列番号113)
滅菌水 22 μL
2×PrimeSTAR(タカラバイオ社製) 25 μL
Forward primer 1 μL
Reverse primer 1 μL
ゲノムDNA 1 μL
総量 50 μL
98℃ 10秒、55℃ 15秒及び72℃ 150秒の反応を30サイクル
得られた組換えプラスミドDNAについて、その塩基配列をCEQ DTCS Quick Start Kitおよび蛍光シ−ケンサCEQ 2000XL DNA Analysis(いずれもBECKMAN COULTER、米国)を用いて確認し、プラスミドpMMA002〜pMMA005と命名した(表36)。
メタクリル酸生産能を有するRhodococcus属微生物のメタクリル酸合成に関与する遺伝子の単離を行った。
<ゲノムDNAの調製>
LB寒天培地培地(LB培地、1.5%寒天)上で生育させたRhodococcus
erythropolis PR4株(NBRC100887)を10mLのLB液体培地に植菌し、30℃にて36時間振盪培養を行った。培養終了後、2mLの培養液より菌体を遠心により回収し、Wizard Genomic DNA Purification Kit(プロメガ株式会社)を用いてゲノムDNA100μLを取得した。
得られたゲノムDNAを鋳型にして、ACDをコ−ドすることが推定された遺伝子を含むDNA断片を、発現ベクターに容易に導入可能な制限酵素認識部位が付加された形となるようオリゴヌクレオチドを設計し、PCR法により調製した。
MMA−021: 5’−GGACATGTTTACTCTGACCGATGACGAGCG −3’ (配列番号114)
MMA−022: 5’−GGCCTGCAGGCCGTCACGCTTTTCGATCAATAC −3’(配列番号115)
MMA−023: 5’−CCACATGTCCGATTACCTTGCCACCGGAGC −3’ (配列番号116)
MMA−024: 5’−GGCCTGCAGGATCTTCTTGGGGTTCGTCACAAC −3’ (配列番号117)
得られた増幅産物のバンドをQIAquick Gel Extraction Kit(QIAGEN)で精製し、制限酵素PciI(Forward Primer中に切断認識部位が含まれる)およびSse8387I(Reverse Primer中に切断認識部位が含まれる)で切断した。以下の操作は実施例33と同様に行い、pTrc99AをベクターとするプラスミドpMMA009及び010、pET16bをベクターとするプラスミドpMMA109及び110を得た(表37)。
実施例33及び34で作製したACDホモログ遺伝子を含む発現プラスミドを用いて、大腸菌JM109(pMMA002〜pMMA005、pMMA009及び010の場合)または大腸菌BL21(DE3)(pMMA102〜pMMA105、pMMA109及び110の場合)を形質転換した。大腸菌JM109の形質転換株は以下のようにして培養を行った。
ACD活性は、以下のようにイソブチリル−CoAを基質としたメタクリリル−CoAの生成により測定した。100mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH8.0)中に終濃度がそれぞれ6mMの1−メトキシ−5−メチルフェナジニウムメチル硫酸塩、0.4mMのフラビンアデニンジヌクレオチドおよび1mMのイソブチリル−CoAを含む溶液1.84mLに、実施例35のようにして得られた細胞抽出液0.16mLを加え、2mLとした。37℃で30分間反応後、セントリカット超ミニW−10(倉敷紡績株式会社)を用いた限外濾過により除タンパク質を行い反応を停止させ、以下の条件にてHPLCによる分析を行った。結果を表38に示した。PA_acd1およびRE_acd1には高いACD活性が認められ、これら酵素により、イソブチリル−CoAからメタクリリル−CoAの生産できることが確認できた。
カラム:Inertsil ODS−3V,4.6mm×250mm
移動相:30%MeOH,50mM H3PO4,pH5.7
流量:1.0ml/min カラム温度:35℃ 検出:UV254nm(210nm)
注入量10μl 反応溶液を移動相で10倍希釈し測定。
遺伝子のクローニングと発現プラスミドの作製および組換え体の作製は、実施例33と同様にして行った。Pseudomonas aeruginosa PAO1株のゲノムDNAを鋳型にして、BCKAD複合体遺伝子をコ−ドする遺伝子オペロン全体を含むDNA断片を、表39に示すプライマーを用いてPCR法により調製した。得られた断片を制限酵素BspHIとSse8387Iにより消化し、実施例33と同様にしてベクターpTrc99A及びpET16bに挿入して組換えプラスミド(pWA108及びpWA008)を得た。
MAA−15: 5’− GGCCTGTCATGAGTGATTACGAGCCG −3’ (配列番号118)
MAA−16: 5’− CGGCCCTGCAGGTTCGCGGGAATCAGATGTGC −3’(配列番号119)
Rhodococcus属細菌においてはBCKAD遺伝子についての知見がなかったことから、Pseudomonas aeruginosa PAO1株のBCKAD複合体遺伝子のアミノ酸配列を元にRhodococcus erythropolis PR4株のゲノム配列をホモロジー検索したところ2つの候補遺伝子クラスターを見出した。これらをクラスター1とクラスター2とした。
MMA−187: 5’− GGTCATGACTCTTGTCGAGCCCTTG −3’ (配列番号120)
MMA−140: 5’− GACCTGCAGGTCCTCTTCTGGTCATGGTTC −3’(配列番号121)
クラスター2のBCKAD複合体遺伝子のクローニングと発現プラスミドの作製および組換え体の作製は、以下の様にして行った。Rhodococcus erythropolis PR4株のゲノムDNAを鋳型にして、下記に示すプライマーを用いてPCR法により調製した。
MMA−188: 5’− AGGAAACAGACCATGATCGACAACCTCGATTA −3’ (配列番号122)
MMA−189: 5’− CTTGCATGCCTGCAGGCTCACTCGTTCCTTTTTACAG −3’(配列番号123)
BCKAD活性は、以下のように2−オキソイソ吉草酸を基質としたイソブチリル−CoAの生成により測定した。
カラム:Inertsil ODS−3V,4.6mm×250mm
移動相:35%MeOH,50mM H3PO4,pH5.7
流量:1.0ml/min カラム温度:35℃ 検出:UV 254nm(210nm)
注入量10μl 反応溶液を移動相で10倍希釈し測定。
100mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)中に終濃度がそれぞれ1mMMgCl2、0.2mMのチアミンピロリン酸、1mMCoA−SH、2mMDTT、2mMニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD)、0.04mMフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)、2mMバリンを含む溶液0.6mLに、実施例35及び40のようにして得られた細胞抽出液(JM109/pMMA002及びJM109/pWA108)各0.1mLを加え、0.8mLとした。これに2−オキソイソ吉草酸カルシウム塩0.1mL(終濃度4mM)を加え37℃で30分間反応後、HPLCによりイソブチリル−CoAの生成を確認するとともに、0.1mLの1−メトキシ−5−メチルフェナジニウムメチル硫酸塩(終濃度6mM)を加え更に3時間反応させた。反応後、セントリカット超ミニW−10(倉敷紡績株式会社)を用いた限外濾過を行った。除タンパク質を行うことにより反応を停止させ、HPLCによる分析を行った。その結果、0.2mMのメタクリリル−CoAの生成が認められた。
100mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH8.0)中に終濃度がそれぞれ6mM1−メトキシ−5−メチルフェナジニウムメチル硫酸塩、0.4mMFADおよび1mMイソブチリル−CoAを含む溶液1.84mLに実施例35のようにして得られたACD活性を有する細胞抽出液0.16mLを加え、反応液2mLに調整した。37℃で30分間反応させ、実施例41に示すHPLC条件にて分析を行った。その結果、イソブチリル−CoAのピークは消失し、メタクリリル−CoAの生成が認められた。
カラム:DB−WAX, 30m×0.32mm
カラム温度:50℃・5min→5℃/min→100℃(計15min)
キャリアガス:He
Inject:200℃ スプリットレス(サンプリングタイム1min)
Detect:250℃ FID 注入量:150μL
<実施例43:大腸菌用BCKADとACDの共発現用プラスミドの作製>
ACD遺伝子(PA_acd1遺伝子)を含むDNA断片を、実施例37で作製したpWA108のBCKADの下流にIn−Fusion
HD Cloning kit(タカラバイオ社製TAKARA)を用いて挿入し、BCKADとACDの共発現用プラスミドpMMA201およびpMMA202を作製した。また、同様にして、BCKAD遺伝子を含むDNA断片が、実施例33で作製されたpMMA002のPA_acd1遺伝子の下流に挿入された共発現用プラスミドpMMA203およびpMMA204を作製した。詳細を以下に示す。
実施例33で作製したpMMA102を鋳型にしてPA_acd1遺伝子をPCR法により増幅した。PCR条件は以下の通りである。
MMA−039 TAGAGTCGACCTGCACGAGATCTCGATCCCGCGAAAT(配列番号128)
Rv Primer
MMA−040 GCTTGCATGCCTGCACAGCAGCCAACTCAGCTTCCTTT(配列番号129)
鋳型(pMMA102) 1μ1
2×PrimeSTAR Max Premix(TAKARA社製) 25μ1
FW Primer(20 μM) 1μ1
Rv Primer(20 μM) 1μ1
D.W. 22μ1
Total 50μ1
98℃ 10秒、60℃ 10秒及び72℃ 120秒の反応を30サイクル
5x In-Fusion HD Enzyme Premix 2μl
ベクター側断片 1.5μl
PCR断片 1μl
D.W. 3.5μl
Total 10μl
実施例33で作製したpMMA102を鋳型にしてPA_acd1遺伝子をPCR法により増幅した。PCR Primerは以下の通りである。
MMA−042 TAGAGTCGACCTGCACCTCTAGAAATAATTTTGTTTA(配列番号130)
Rv Primer
MMA−040 GCTTGCATGCCTGCACAGCAGCCAACTCAGCTTCCTTT(配列番号129)
実施例37で作製したpWA008を鋳型にしてBCKAD遺伝子をPCR法により増幅した。PCR Primerは以下の通りである。
MMA−041 CCATCGCATCCTGCACGAGATCTCGATCCCGCGAAAT (配列番号131)
Rv Primer
MMA−040 GCTTGCATGCCTGCACAGCAGCCAACTCAGCTTCCTTT (配列番号129)
実施例37で作製したpWA008を鋳型にしてBCKAD遺伝子をPCR法により増幅した。PCR Primerは以下の通りである。
MMA−043 CCATCGCATCCTGCACCTCTAGAAATAATTTTGTTTA (配列番号132)
Rv Primer
MMA−040 GCTTGCATGCCTGCACAGCAGCCAACTCAGCTTCCTTT (配列番号129)
実施例35記載の方法と同様にして、JM109/pMMA204株の細胞抽出液を得た。対照株としてJM109/pTrc99Aを用いた。実施例40記載の方法と同様にして、JM109/pMMA204細胞抽出液に2−オキソイソ吉草酸カルシウム塩0.1mL(終濃度4mM)を加え37℃で30分間反応後、HPLCによりイソブチリル−CoAの生成を確認するとともに、0.1mLの1−メトキシ−5−メチルフェナジニウムメチル硫酸塩(終濃度6mM)を加え更に3時間反応させた。反応後、セントリカット超ミニW−10(倉敷紡績株式会社)を用いた限外濾過による除タンパク(反応停止)を行い、以下の条件にてHPLCによる分析を行った。
カラム:Capcell Pak ODS−UG120(資生堂), 粒子径μm, 2.0
mm I.D.×250 mm
移動相:25%MeOH,50mM H3PO4,pH5.7
流量:1.0ml/min
カラム温度:35℃
検出:UV254nm(210nm)
注入量10μl 反応溶液を移動相で10倍希釈し測定。
BCKADおよびACDを発現させた大腸菌組換え体を用いて2−オキソイソ吉草酸からのメタクリル酸あるいはのメタクリリル−CoAの合成を実施した。
カラム:Wakopak Wakobeads−T−132−E, φ7.8mm×300mm
移動相:0.1% リン酸
流量:0.5 ml/min
カラム温度:40 ℃
検出:UV 210 nm
注入量:5 ul
実施例35記載の方法と同様にして、JM109/pMMA201株を培養した。得られた培養液から遠心分離(3,700×g、10分間、4℃)により菌体を回収し、10mMリン酸−ナトリウム緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液に懸濁し菌体懸濁液を得た。本菌体懸濁液を用いて、以下のように休止菌体反応液3mLを調製し、30℃、180rpmにて24時間反応を行った。
50mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7.0)
0.5%2−オキソイソ吉草酸カルシウム
OD10菌体懸濁液
実施例33〜32に記載された方法により、Streptomyces coelicolor A3(2)由来のacdH遺伝子を組み込んだ発現組換え体を作製し、細胞抽出液の調製、タンパク質の発現解析及びACD活性の測定を行った。タンパク質の発現解析結果は図7(C)に、酵素活性測定結果は表38に示した。なお、プラスミド作製時、PCRに用いたオリゴヌクレオチドは以下のとおりである。
MMA−001: 5’−CACCATGGACCACAAGCTCTCCCCCGAAC −3’ (配列番号124)
MMA−002: 5’−GCCCTGCAGGCTCAGCCCACCAGCCCCAAC −3’ (配列番号125)
バナナの皮を取り除き、果肉をカッターで約1ミリ厚さにスライスし、さらにそれを4分割した。スライスしたバナナ2g、2.3mMメタクリリル−CoAおよび0.35MKClを含む溶液2mlおよび5μlイソブチルアルコールを100mlフラスコに順に加えた。密閉し、30℃で反応させた。1、2または3時間後の生成したメタクリル酸イソブチルを含む反応混合物を、100mlフラスコのヘッドスペース150μlを採取して以下のGC条件にて分析を行った。その結果を表41に示す。
カラム:DB−WAX, 30m×0.32mm
カラム温度:50℃・5min→5℃/min→100℃(計15min)
キャリアガス:He
Inject:200℃ スプリットレス(サンプリングタイム1min)
Detect:250℃ FID 注入量:150μl
イソブチルアルコールの代わりにn−ブチルアルコールを用いた以外は参考例7と同様に実施した。その結果を表42に示す。
表43に示す植物片を2g、2.3mMメタクリリル−CoAおよび0.35M KClを含む溶液2mlおよび10μlのn−ブチルアルコールを100mlフラスコに順に加えた。密閉し、30℃で反応させた。メタクリル酸エステルの分析は参考例7と同様に実施した。その結果を表43に示す。
表44に示す植物片を2g、2.3mM メタクリリル−CoAおよび0.35M KClを含む溶液2mlおよび6.4μl エチルアルコールを100mlフラスコに順に加えた。密閉し、30℃で反応させた。メタクリル酸エステルの分析は参考例7と同様に実施した。その結果を表44に示す。
表45に示す植物片を2g、2.3mMメタクリリル−CoAおよび0.35M KClを含む溶液2mlおよび4.4μl メチルアルコールを100mlフラスコに順に加えた。密閉し、30℃で反応させた。メタクリル酸エステルの分析は参考例7と同様に実施した。その結果を表45に示す。
配列番号77、79及び81に示される植物由来AAT遺伝子をタカラバイオ株式会社で委託合成した。
リンゴAAT(MpAAT1):アミノ酸配列(配列番号76)、塩基配列(配列番号77)
イチゴAAT(SAAT):アミノ酸配列(配列番号78)、塩基配列(配列番号79)
イチゴAAT(VAAT):アミノ酸配列(配列番号80)、塩基配列(配列番号81)
MMA−044:5’−GTTTGCACGCCTGCCGTTCGACG−3’(配列番号82)
MMA−045:5’−CGGTACGCGCGGATCTTCCAGAG−3’(配列番号83)
滅菌水 22 μL
2×PrimeSTAR(タカラバイオ社製) 25 μL
Forward primer 1 μL
Reverse primer 1 μL
ゲノムDNA 1 μL
総量 50 μL
98℃ 10秒、55℃ 15秒及び72℃ 150秒の反応を30サイクル
Primer中に切断認識部位が含まれる)およびSse8387I(Reverse
Primer中に切断認識部位が含まれる)で切断した。アガロースゲル電気泳動により分離を行い、ゲルから目的のバンドを切り出し、精製を行った。精製にはGel/PCR Purification Kit(FAVORGEN社製)を用い、30μLの滅菌水に溶出した。
(1)pTrc99Aをベクターとして用いた大腸菌組換え体の培養
実施例45で得られた大腸菌組換え体JM109/pAAT101〜pAAT103を1mlの100μg/mlアンピシリンを含むLB培地に植菌し、37℃にて7時間前培養を行った。培養液を0.1ml取り、100mlの同培地(100μg/mlアンピシリン、1mMIPTG含有)に加え、37℃にて15時間振盪培養した。得られた培養液から遠心分離(3,700×g、10分間、4℃)により菌体を回収し、10mMリン酸−ナトリウム緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液に懸濁した。対照株としてJM109/pTrc99Aを用いた。
実施例45で得られた大腸菌組換え体BL21(DE3)/pAAT201〜pAAT203を1mLの100μg/mLアンピシリンを含むLB培地に植菌し、37℃にて14時間前培養を行った。培養液を0.1mL取り、100mLの同培地(100μg/mLアンピシリン)に加え、37℃にてODが0.3になるまで振盪培養した後、終濃度が1mMになるようにIPTGを添加し更に数時間振盪培養した。得られた培養液から遠心分離(3,700×g、10分間、4℃)により菌体を回収し、10mMリン酸−ナトリウム緩衝液(pH7.0)で洗浄した後、同緩衝液にOD6(630nm)になるよう懸濁した。対照株としてBL21(DE3)/pET16bを用いた。
得られた菌体懸濁液から細胞抽出液を調製した。超音波破砕機VP−15S(タイテック、日本)を用いて、出力コントロ−ル4、DUTY CYCLE 40%、PULS、TIMER=Bモ−ド10sの条件で菌体懸濁液を氷冷しながら1分間破砕した。次に遠心分離を行い(10,000×g、5分間、4℃)、得られた上清(細胞抽出液)1mlを採取した。
実施例46に記載された方法で調製された細胞抽出液を用いて以下の反応を行った。反応液の終濃度が7mMメタクリリル−CoAと40.5mMn−ブタノールとなるようにメタクリリル−CoAとアルコールの溶液が0.8ml入った10ml容量のセプタム付サンプル瓶(GC用)に、0.2mlの細胞抽出液を添加することにより反応を開始した。セプタム付サンプル瓶を30℃で1〜5時間インキュベートして反応させた。
アルコールとして、メタノール、エタノールまたはn−ブタノールを用い、細胞抽出液に、BL21(DE3)/pAAT201(リンゴ)由来のものを用いて、実施例47と同様にして反応を行った。表48に5時間後の生成物の分析結果を示した。
アルコールとして、イソブタノール、フェノール、ベンジルアルコールまたは2−エチルヘキシルアルコールを用い、実施例46で得られたBL21(DE3)/pAAT201(リンゴ)の細胞抽出液で以下の反応を行った。
装置:Waters 2695
カラム:Shiseido CAPCELL PAK C18 UG120 5 μm
移動相:65 % MeOH, 0.2% リン酸
流量: 0.25 ml/min
カラム温度:35℃
検出:UV 210 nm
注入量:10μL
実施例45と同様にして酵母由来AAT遺伝子発現プラスミドを作製し(表50)、これらを用いて大腸菌を形質転換しAAT発現組換え体を得た。
配列番号83:MMA−045
配列番号84:MMA−003
配列番号85:MMA−004
配列番号88:MMA−031
配列番号89:MMA−032
配列番号92:MAA−15
配列番号93:MAA−16
配列番号94:GB−138
配列番号95:GB−139
配列番号96:GB−140
配列番号97:GB−141
配列番号98:MMA−061
配列番号99:MMA−062
配列番号100:MMA−063
配列番号101:MMA−064
配列番号102:MMA−069
配列番号103:MMA−070
配列番号104:MMA−133
配列番号105:MMA−131
配列番号106:MMA−003
配列番号107:MMA−004
配列番号108:MMA−020
配列番号109:MMA−006
配列番号110:MMA−018
配列番号111:MMA−008
配列番号112:MMA−019
配列番号113:MMA−010
配列番号114:MMA−021
配列番号115:MMA−022
配列番号116:MMA−023
配列番号117:MMA−024
配列番号118:MAA−15
配列番号119:MAA−16
配列番号120:MMA−187
配列番号121:MMA−140
配列番号122:MMA−188
配列番号123:MMA−189
配列番号124:MMA−001
配列番号125:MMA−002
配列番号126:MMA−114
配列番号127:MMA−109
配列番号128:MMA−039
配列番号129:MMA−040
配列番号130:MMA−042
配列番号131:MMA−041
配列番号132:MMA−043
Claims (7)
- 炭素源及び/又はエネルギー源としての、再生可能原料及び/又は該再生可能原料の利用から生じるバイオマスから、イソ酪酸あるいはバリンを含む有機物からメタクリル酸を生成可能な天然の微生物又はそれらの誘導株を用いて、メタクリル酸及び/又はそのエステルを製造する方法。
- メタクリル酸及び/又はそのエステルを0.04ppm以上蓄積させる、請求項1記載の製造方法。
- イソ酪酸あるいはバリンを含む有機物からメタクリル酸を生成可能な天然の微生物又はそれらの誘導株が、配列番号1〜41に記載された塩基配列のいずれかに対して81%以上の同一性を示す塩基配列からなる16S rRNA遺伝子を有する微生物である請求項1又は2記載の製造方法。
- イソ酪酸あるいはバリンを含む有機物からメタクリル酸を生成可能な天然の微生物又はそれらの誘導株が、配列番号42〜49に記載された塩基配列のいずれかに対して81%以上の同一性を示す塩基配列からなるLSUrRNA遺伝子を有する微生物である請求項1又は2記載の製造方法。
- イソ酪酸あるいはバリンを含む有機物からメタクリル酸を生成可能な天然の微生物又はそれらの誘導株が、シュードモナス(Pseudomonas)属、バシラス(Bacillus)属、スフィンゴバクテリウム(Sphingobacterium)属、コマモナス(Comamonas)属、ブレバンディモナス(Brevundimonas)属、スフィンゴモナス(Sphingomonas)属、オクロバクテリウム(Ochrobactrum)属、ペドバクター(Pedobacter)属、パエニバシラス(Paenibacillus)属、アクロモバクター(Achromobacter)属、アシネトバクター(Acinetobacter)属、シュワネラ(Shewanella)属、リストネラ(Listonella)属、アグロバクテリウム(Agrobacterium)属、メソリゾビウム(Mesorhizobium)属、リゾビウム(Rhizobium)属、パラコッカス(Paracoccus)属、キサントバクター(Xanthobacter)属、ストレプトマイセス(Streptomyces)属、ゲオバシラス(Geobacillus)属、ロドコッカス(Rhodococcus)属、サッカロマイセス(Saccharomyces)属、カンディダ(Candida)属またはアスペルギルス(Aspergillus)属に属する微生物である請求項1〜4のいずれか1項に記載の製造方法。
- アルコールアシルトランスフェラーゼの存在下、メタクリリル−CoAにアルコールまたはフェノール類を作用させて、メタクリル酸エステルを製造する請求項1〜5のいずれか1項に記載の製造方法。
- アルコールアシルトランスフェラーゼが植物由来である請求項6記載の製造方法。
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BR112016000541B1 (pt) * | 2013-08-01 | 2023-01-10 | Mitsubishi Chemical Corporation | Método para produção de metacrilil-coa e conversão de metacrilil-coa em ácido metacrílico ou éster metacrilato |
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WO2017069267A1 (ja) * | 2015-10-23 | 2017-04-27 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | メチルメタクリレートの生物生産 |
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GB201808424D0 (en) * | 2018-05-23 | 2018-07-11 | Lucite Int Uk Ltd | Methods for producing BMA and MMA using genetically modified microorganisms |
CN110846240B (zh) * | 2018-07-31 | 2022-11-08 | 复旦大学 | 具有杀螺效果的放射菌菌株及其应用 |
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CN109880778B (zh) * | 2019-04-24 | 2022-09-09 | 贵州大学 | 一种对辣椒具有促生增产作用的复合菌剂及其应用 |
CN110438033B (zh) * | 2019-07-02 | 2021-04-27 | 浙江工业大学 | 一种油脂降解菌、应用及油脂降解方法 |
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CN111235057B (zh) * | 2020-02-01 | 2022-06-07 | 烟台大学 | 一种处理聚丙烯酰胺废水的生物菌剂及其制备方法和应用 |
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CN114606154A (zh) * | 2021-12-31 | 2022-06-10 | 浙江华庆元生物科技有限公司 | 尾菜废水资源化菌剂及其在制备植物营养液中的应用 |
CN114381401B (zh) * | 2022-01-20 | 2024-02-20 | 青岛蔚蓝赛德生物科技有限公司 | 一种降解污废水中cod的厌氧复合菌剂及其应用 |
GB2621337A (en) | 2022-08-08 | 2024-02-14 | Mitsubishi Chemical Uk Ltd | Process for the biological production of methacrylic acid and derivatives thereof |
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CN115232777B (zh) * | 2022-09-23 | 2022-12-23 | 云南省微生物发酵工程研究中心有限公司 | 一种防治烟草黑胫病的假浅灰链霉菌菌剂及其应用 |
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Family Cites Families (25)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS5446887A (en) | 1977-09-19 | 1979-04-13 | Nitto Chem Ind Co Ltd | Preparation of acrylic acid or methacrylic acid |
JPS61162191A (ja) | 1985-01-11 | 1986-07-22 | Nitto Chem Ind Co Ltd | 微生物による有機酸類の製造法 |
JPS6214788A (ja) | 1985-07-12 | 1987-01-23 | Res Assoc Util Of Light Oil | メタクリル酸の製造方法 |
JPH01132392A (ja) | 1987-11-18 | 1989-05-24 | Res Assoc Util Of Light Oil | モノカルボン酸の微生物学的製造法 |
DE69231939T2 (de) | 1991-03-04 | 2002-04-04 | Teruhiko Beppu | Hybrid-Plasmid-Vektoren, die für Nitril-abbauende Enzyme kodierende Gene enthalten und Verfahren zur Herstellung von Amiden und Säuren |
JP3142349B2 (ja) | 1991-03-04 | 2001-03-07 | 輝彦 別府 | 複合プラスミドベクターおよび形質転換微生物 |
JP3355939B2 (ja) | 1996-07-10 | 2002-12-09 | 三菱自動車工業株式会社 | 車両用エンジンのアンダーカバー |
JPH10337185A (ja) | 1997-06-06 | 1998-12-22 | Mitsubishi Rayon Co Ltd | アスパルターゼ活性を有する新規なタンパク質および該タンパク質をコードする遺伝子dna |
JPH11243957A (ja) | 1998-03-04 | 1999-09-14 | Ozeki Corp | 新規なアルコールアシルトランスフェラーゼ遺伝子 |
WO2000032789A1 (en) | 1998-12-02 | 2000-06-08 | Centrum Voor Plantenveredelings- En Reproduktieonderzoek (Cpro-Dlo) | Fruit flavour related genes and use thereof |
MXPA03004324A (es) | 2000-11-20 | 2004-01-26 | Cargill Inc | Acido 3-hidroxipropionico y otros compuestos organicos. |
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GB0406217D0 (en) * | 2004-03-19 | 2004-04-21 | Ciba Spec Chem Water Treat Ltd | Biocatalytic manufacturing of (meth)acrylyicholine or 2- (N, N-dimethylamino) ethyl (meth)acrylate |
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EP1926822B1 (en) * | 2005-09-19 | 2010-06-30 | Basf Se | Biocatalytic manufacturing of (meth)acrylic esters |
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