JP2021094022A - 抗ly6g6d抗体及び使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、ASCII形式で電子的に提出された配列表を含み、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。2020年12月11日に作成された前記ASCIIコピーであって、名前は50474−184JP2_Sequence_Listing_12.11.20_ST25で、サイズは146,127バイトである。
本明細書に提供されるのは、抗Ly6G6D(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座G61)抗体及びそれを使用する方法である。
I.定義
本明細書で使用される「約」という用語は、当業者であれば容易に理解するそれぞれの値の通常の誤差範囲を指す。本明細書において、値又はパラメータについての「約」の参照は、それ自体がその値又はパラメータに向けられた側面を含む(及び説明する)。
「フレームワーク」又は「FR」は、超可変領域(HVR)残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、一般に4つのFRドメインから構成されている:FR1,FR2,FR3,and FR4.従って、HVR配列及びFR配列は、一般に、VH(又はVL)における次の配列において現れる。FR1−H1(L1)−FR2−H2(L2)−FR3−H3(L3)−FR4.
本明細書で使用される「ハイパーバリアブル領域」又は「HVR」という用語は、抗体可変ドメインの各領域のうち、配列がハイパーバリアブルである領域(「相補性決定領域」又は「CDR」)を指す。一般的に抗体はVHに3つ(CDR−H1、CDR−H2、CDR−H3)、VLに3つ(CDR−L1、CDR−L2、CDR−L3)の6つのCDRを含む。例示的なCDRは、本明細書では以下のものを含む:
(a)アミノ酸残基26〜32(L1)、50〜52(L2)、91〜96(L3)、26〜32(H1)、53〜55(H2)、及び96〜101(H3)に存在するCDR(Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196:901−917,1987);
(c)アミノ酸残基27c〜36(L1)、46〜55(L2)、89〜96(L3)、30〜35b(H1)、47〜58(H2)、及び93〜101(H3)で発生する抗原接触(MacCallum et al.J.Mol.Biol.262:732−745,1996)。
100掛ける分数X/Y、
ここで、Xは、A及びBの配列アライメントプログラムALIGN−2によって同一の一致としてスコアされたアミノ酸残基の数であり、Yは、Bのアミノ酸残基の総数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、AからBの%アミノ酸配列同一性は、BからAの%アミノ酸配列同一性と等しくないことが理解されるであろう。特に明記されない限り、本明細書で使用されるすべての%アミノ酸配列同一性値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを使用して、直前の段落に記載されているように得られる。
一つの態様において、本発明は、部分的には、抗リンパ球抗原6複合体、遺伝子座G61(抗LY6G6D)抗体に基づく。抗LY6G6D抗体は、多重特異性(例えば、二重特異性)であり、LY6G6D又はその断片に加えて、第二の生物学的分子、例えば、T細胞の表面抗原、例えば、クラスター分化3(CD3)に結合する。本発明の抗体は、例えば、細胞増殖性疾患、例えば癌、例えば結腸直腸癌(CRC)(例えばLY6G6D陽性CRC)の治療又は進行を遅らせるため、又はそのような疾患を有する被験者における免疫機能を増強するために有用である。
一つの態様において、本発明は、LY6G6Dに結合する単離抗体を提供する。いくつかの態様において、抗LY6G6D抗体は、ヒトLY6G6Dポリペプチド(配列番号75)又はカニクイザル(cyno)LY6G6Dポリペプチド(配列番号 77)に結合する。いくつかの態様において、抗LY6G6D抗体は、LY6G6D(例えば、ヒトLY6G6D)のアミノ酸93〜104(配列番号87)、94〜103(配列番号78)、又は99〜101(配列番号79)を含む、又はその中にあるエピトープに結合する。いくつかの態様において、抗LY6G6D抗体は、LY6G6Dの残基Arg94、Leu101、Cys102、及びAsn103のうちの1つ、2つ、3つ、又はすべての4つの残基に結合する。いくつかの態様において、抗LY6G6D抗体は、LY6G6Dの残基Arg94、Asp95、Cys96、Tyr97、Leu98、Gly99、Asp100、Leu101、Cys102及びAsn103を含むエピトープに結合する。いくつかの態様において、抗LY6G6D抗体は、LY6G6Dの残基Arg94、Asp95、Cys96、Tyr97、Leu98、Gly99、Asp100、Leu101、Cys102及びAsn103を含むエピトープに結合する。
別の態様において、本発明は、分化クラスター3(CD3)(例えば、CD3ε及び/又はCD3γ)に結合する単離された抗体を提供し、以下の6つのCDR配列を有する。(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;(b)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;(c)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;(e)配列番号13又は配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び、(f)配列番号14又は配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR−L3、配列番号21、55、90又は92のアミノ酸配列を含むVL配列、配列番号21又は55と20のアミノ酸配列をそれぞれ含むVL配列及びVH配列、又は配列番号90又は92と89のアミノ酸配列をそれぞれ含むVL配列及びVH配列。いくつかの事例では、抗CD3抗体は、ヒトCD3ポリペプチド又はカニクイザル(cyno)CD3ポリペプチドに結合する。いくつかの事例では、ヒトCD3ポリペプチド又はカニクイザルCD3ポリペプチドは、それぞれ、ヒトCD3εポリペプチド(配列番号80)又はカニクイザルCD3εポリペプチド(配列番号81)である。いくつかの事例では、ヒトCD3ポリペプチド又はカニクイザルCD3ポリペプチドは、それぞれ、ヒトCD3γポリペプチド(配列番号82)又はカニクイザルCD3γポリペプチド(配列番号83)である。いくつかの事例では、抗CD3抗体は、ヒトCD3εのアミノ酸1−26(配列番号84)又は1−27(配列番号85)からなるCD3断片(例えば、ヒトCD3ε)内のエピトープに結合する。
特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、≦1μM、≦250nM、≦100nM、≦15nM、≦10nM、≦6nM、≦4nM、≦2nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、又は≦0.001nM(例えば、10−8M以下、例えば、10−8Mから10−13Mまで、例えば、10−9Mから10−13Mまで)の解離定数(KD)を有する。
特定の実施形態では、本明細書に提供される抗体(例えば、抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体)は、抗体断片である。抗体断片としては、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)2、Fv、及びscFv断片、及び以下に記載する他の断片が挙げられるがこれらに限定されない。特定の抗体断片のレビューとしては、Hudson et al.Nat.Med.9:129−134(2003)を参照されたい。scFv断片の参照には、例えばPluckthuen,in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,(Springer−Verlag,New York),pp.269−315(1994)を参照されたい;また、WO 93/16185を参照されたい;及び米国特許第5,571,894号及び同第5,587,458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を構成し、かつインビボ半減期を増加させたFab及びF(ab’)2断片の議論については、米国特許第5,869,046号を参照されたい。
特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体(例えば、抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体)は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号;及びMorrison et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984))に記載されている。一つの例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、又はサルなどの非ヒト霊長類に由来する可変領域)とヒト定常領域を含む。さらなる例では、キメラ抗体は、クラス又はサブクラスが親抗体のそれから変更された「クラス切り替え」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片を含む。
特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体(例えば、抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体)は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当技術分野で知られている様々な技術を用いて作製することができる。ヒト抗体は、van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368−74(2001)and Lonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450−459(2008)で一般的に記載されている。
本発明の抗体(例えば、抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体)は、所望の活性又は活性を有する抗体のコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることにより単離することができる。例えば、ファージディスプレイライブラリーを生成し、所望の結合特性を有する抗体についてそのようなライブラリーをスクリーニングするための様々な方法が当技術分野で知られている。そのような方法については、例えば、Hoogenboom et al.,Methods in Molecular Biology 178:1−37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2001)でレビューし、さらに下に記載されている:McCafferty et al.,Nature 348:552−554;Clackson et al.,Nature 352:624−628(1991);Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581−597(1992);Marks and Bradbury,in Methods in Molecular Biology 248:161−175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299−310(2004);Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073−1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467−12472(2004);及びLee et al.,J.Immunol.Methods 284(1−2):119−132(2004)。
前記のいずれかの態様において、本明細書で提供される抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。も2つの異なる部位に対する結合特異性を有する抗体(例えば、モノクローナル抗体)である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、LY6G6Dの2つの異なるエピトープに結合してもよい。いくつかの態様において、結合特異性の一方はLY6G6Dに対するものであり、他方は任意の他の抗原(例えば、第二の生物学的分子、例えば、T細胞の表面抗原、例えば、CD3)に対するものである。いくつかの態様において、結合特異性の一方は、CD3に対するものであり、他方は、任意の他の抗原(例えば、第2の生物学的分子、例えば、細胞表面抗原、例えば、腫瘍抗原)に対するものである。いくつかの態様において、結合特異性の一方はLY6G6Dに対するものであり、他方はCD3に対するものである。
いくつかの態様において、本発明の抗LY6G6D抗体及び/又は抗CD3抗体のアミノ酸配列変異体(例えば、LY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、例えば高親和性(例えば、20A12.QNTv12)、及び第二の生物学的分子、例えばCD3、本発明のTDB抗体又はその変種など)が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/又は他の生物学的特性を向上させることが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な修飾を導入することにより、又はペプチド合成により調製することができる。このような改変は、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基の欠失、及び/又は挿入、及び/又は置換を含む。欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせは、最終的な構築物が所望の特性、例えば抗原結合性を有することを条件として、最終的な構成体に到達するために行うことができる。
特定の実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換を有する抗体変異体が提供される。置換変異誘発に関心のある部位には、CDR及びFRが含まれる。保守的な置換は、「好ましい置換」の見出しの下で表1に示されている。より実質的な変化は、「例示的な置換」の見出しの下で、及びアミノ酸側鎖クラスに関して以下でさらに説明されるように、表1に提供されている。アミノ酸置換は、関心のある抗体に導入して、所望の活性、例えば、抗原結合の保持/改善、免疫原性の低下、又は改善されたADCC又はCDCのためにスクリーニングされた生成物を得ることができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の配向に影響を与える残基:Gly,Pro;
(6)芳香族:Trp,Tyr,Phe.
特定の実施形態では、本発明の抗LY6G6D及び/又は抗CD3抗体(例えば、好ましくはLY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)、及び第二の生物学的分子、例えば、CD3)は、抗体がグリコシル化される程度を増加又は減少させるように変更することができる。本発明の抗LY6G6D抗体へのグリコシル化部位の追加又は欠失は、1つ又は複数のグリコシル化部位が生成又は除去されるようにアミノ酸配列を変更することによって便利に達成され得る。
特定の実施形態では、本発明の抗LY6G6D及び/又は抗CD3抗体のFc領域に、1つ以上のアミノ酸修飾を導入してもよい(例えば、LY6G6Dに結合する、好ましくは高親和性を有する、本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体(例えば、20A12.QNTv12)、及び第二の生物学的分子、例えばCD3、それによってFc領域の変異体を生成する(例えば、US 2012/0251531を参照されたい)。Fc領域変異体は、1つ以上のアミノ酸位置でのアミノ酸修飾(例えば、置換)を含むヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4 Fc領域)を含んでいてもよい。
特定の実施形態では、抗体の1つ以上の残基がシステイン残基で置換されているシステイン人工抗体、例えば、「thioMAbs」を作成することが望ましいかもしれない。特定の実施形態では、置換された残基は、抗体のアクセス可能な部位に存在する。これらの残基をシステインで置換することにより、反応性チオール基は、それによって抗体のアクセス可能な部位に配置され、本明細書にさらに記載されるように、抗体を薬物部位やリンカー薬物部位などのような他の部位にコンジュゲートするために使用することができる。特定の実施形態では、以下の残基のうちの任意の1つ以上がシステインで置換されていてもよい:軽鎖のV205(カバットナンバリング);ヘビーチェーンのA118(EUナンバリング);及び 重鎖Fc領域のS400(EUナンバリング)。システイン人工抗体は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されているように生成することができる。
特定の実施形態では、本明細書で提供される本発明の抗LY6G6D抗体(例えば、LY6G6Dに好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)で結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体)、及び第二の生物学的分子、例えば、CD3)は、当技術分野で知られており、かつ容易に入手可能な非保護性部位をさらに含むように改変されていてもよい。抗体の誘導体化に適した部位としては、水溶性ポリマーが挙げられるが、これらに限定されるものではない。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない:ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールの共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−1,3−ジオキソラン、ポリ−1,3,6−トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸共重合体。ポリアミノ酸(ホモポリマー又はランダムコポリマーのいずれか)、及びデキストラン又はポリ(N−ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロプロピレングリコールホモポリマー、プロリプロピレンオキサイド/エチレンオキサイドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば g.,グリセロール)、ポリビニルアルコール、及びそれらの混合物。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中での安定性のため、製造上の利点があるかもしれない。ポリマーは、任意の分子量であってもよく、分岐していても、分岐していなくてもよい。抗体に付着しているポリマーの数は様々であり、複数のポリマーが付着している場合には、同じ分子であっても異なった分子であってもよい。一般に、誘導体化のために使用されるポリマーの数及び/又はタイプは、改良される抗体の特定の特性又は機能、抗体誘導体が定義された条件下で治療に使用されるかどうかなどの考慮事項に基づいて決定することができるが、これらに限定されるものではない。
いくつかの態様において、LY6G6D又はCD3を結合する結合ドメインは、荷電領域(CR1)を含むVH1と荷電領域(CR2)を含むVL1を含み、VH1中のCR1はVL1中のCR2と電荷対を形成する。いくつかの態様において、CR1は塩基性アミノ酸残基を含み、CR2は酸性アミノ酸残基を含む。いくつかの態様において、CR1はQ39K置換変異(カバットナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR1はQ39K置換変異からなる。いくつかの態様において、CR2はQ38E置換変異(カバットナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR2はQ38E置換変異からなる。いくつかの態様において、CD3を結合する第2の結合ドメインは、荷電領域(CR3)を含むVH2と荷電領域(CR4)を含むVL2を含み、VL2のCR4はVH2のCR3と電荷対を形成している。いくつかの態様において、CR4は塩基性アミノ酸残基を構成し、CR3は酸性アミノ酸残基を含む。いくつかの態様において、CR4はQ38K置換変異(カバットナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR4はQ38K置換変異からなる。いくつかの態様において、CR3はQ39E置換変異(カバットナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR3はQ39E置換変異からなる。いくつかの態様において、VL1ドメインは軽鎖定常ドメイン(CL1)ドメインに連結され、VH1は第1重鎖定常ドメイン(CH1)に連結され、ここで、CL1は荷電領域(CR5)を有し、CH1は荷電領域(CR6)を有し、ここで、CL1のCR5はCH11のCR6と電荷対を形成している。いくつかの態様において、CR5は塩基性アミノ酸残基を含み、CR6は酸性残基を含む。いくつかの態様において、CR5はV133K置換変異(EUナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR5はV133K置換変異からなる。いくつかの態様において、CR6は、S183E置換変異(EUナンバリング)を含む。いくつかの態様において、CR6はS183E置換変異からなる。
本発明の抗LY6G6D抗体(例えば、好ましくはLY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)、及び第二の生物学的分子、例えば、CD3)及び/又は本発明の抗CD3抗体(例えば、38E4v1 MD1(MD1)、38E4v1 MD4(MD4))は、例えば米国特許第4,816,567号に記載されているような組換え方法及び組成物を用いて製造することができる。一実施形態では、本明細書に記載の抗LY6G6D抗体をコードする単離核酸が提供される。このような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列及び/又は抗体のVHを構成するアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖及び/又は重鎖)をコードしていてもよい。別の実施形態では、本明細書に記載の抗CD3抗体をコードする単離核酸が提供される。このような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列及び/又は抗体のVHを構成するアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖及び/又は重鎖)をコードしていてもよい。さらなる実施形態では、そのような核酸を含む1つ以上のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる実施形態では、このような核酸を含む宿主細胞が提供される。そのような一実施形態では、宿主細胞は、(例えば、形質転換された)以下を含む:(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸と、抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、又は(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクターと、抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクターとを含むベクター。一実施形態では、宿主細胞は、真核細胞、例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞又はリンパ球細胞(例えば、Y0、NS0、Sp20細胞)である。一実施形態では、抗LY6G6D抗体を作製する方法が提供され、ここで、方法は、前記のように、抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を、抗体の発現に適した条件下で培養すること、及び任意に宿主細胞(又は宿主細胞培養培地)から抗体を回収することを含む。
いくつかの態様において、本発明の抗体(例えば、LY6G6D TDB、例えば、抗CD3アーム及び抗LY6G6Dアームを有するLY6G6D TDB(例えば、20A12.QNTv12))は、2つの宿主細胞株を含む方法を用いて製造される。いくつかの態様において、抗体の第1のアーム(例えば、ホール領域を含む第1のアーム)が第1の宿主細胞株で産生され、抗体の第2のアーム(例えば、ノブ領域を構成する第2のアーム)が第2の宿主細胞株で産生される。抗体のアームは宿主細胞株から精製され、インビトロで組み立てられる。
いくつかの態様において、本発明の抗体(例えば、LY6G6D TDB、例えば、抗CD3アーム(例えば、38E4.v1 MD1又は38E4.v1 MD4)及び抗LY6G6Dアーム(例えば、20A12.QNTv12)を有するLY6G6D TDB)は、単一の宿主細胞株を含む方法を用いて製造される。いくつかの態様において、抗体の第1のアーム(例えば、ホール領域を構成する第1のアーム)及び抗体の第2のアーム(例えば、ノブ領域を構成する第2のアーム)は、単一の宿主細胞株中で産生され、そして単一の宿主細胞株から精製される。好ましくは、第1のアーム及び第2のアームは、宿主細胞において同等のレベルで発現され、例えば、両方とも宿主細胞において高レベルで発現される。類似のレベルの発現は、効率的なTDB生産の可能性を高め、TDB成分の軽鎖(LC)ミスペアリングの可能性を低下させる。抗体の第1のアーム及び第2のアームは、それぞれ、本明細書のセクションIIB(8)に記載されているように、電荷対を導入するアミノ酸置換変異をさらに含んでいてもよい。電荷対は、二重特異性抗体の各アームの重鎖と軽鎖のコグナート対のペアリングを促進し、ミスペアリングを最小限に抑えることができる。
抗体コード化ベクターのクローニング又は発現のための好適な宿主細胞には、本明細書に記載の原核細胞又は真核細胞が含まれる。例えば、抗体は、特に糖鎖修飾やFcエフェクター機能を必要としない場合には、細菌中で産生されてもよい。バクテリアにおける抗体断片及びポリペプチドの発現については、例えば、米国特許第5,648,237号、第5,789,199号、及び第5,840,523号を参照されたい。(Charlton,Methods in Molecular Biology,Vol.248(B.K.C.Lo,ed.,Humana Press,Totowa,NJ,2003),pp.245−254,describing expression of antibody fragments in E.coli.も参照されたい)発現後、本発明の抗体は、細菌細胞ペーストから可溶性画分で単離されてもよく、さらに精製されてもよい。
本明細書で提供される本発明の抗LY6G6D抗体(例えば、LY6G6Dに、好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)で結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、及び第二の生物学的分子、例えばCD3、本発明のTDB抗体又はその変種)は、当技術分野で知られている様々なアッセイによって、それらの物理的/化学的特性及び/又は生物学的活性を同定し、スクリーニングし、又は特徴付けることができる。
一態様において、本発明の抗LY6G6D抗体又は抗CD3抗体は、その抗原結合活性について、例えばELISA、ウエスタンブロットなどの公知の方法によって試験される。
一つの態様において、生物学的活性を有するその抗LY6G6D抗体を同定するためのアッセイが提供される。生物学的活性は、例えば、LY6G6D(例えば、腫瘍の表面上のLY6G6D)、又はそのペプチド断片に結合することを、インビボ、インビトロ、又はエクスビボのいずれかで含むことができる。本発明の多重特異性(例えば、二重特異性)抗LY6G6D抗体(例えば、1つの抗LY6G6Dアーム、例えば20A12.QNTv12、及び第2の生物学的分子、例えば細胞表面抗原、例えばCD3を認識する1つのアームを有するTDB抗体)の場合、生物学的活性はまた、例えば、エフェクター細胞の活性化(例えば、T細胞(例えば、CD8+及び/又はCD4+T細胞)活性化)、エフェクター細胞集団の拡大(すなわち、T細胞数の増加)、標的細胞集団の減少(すなわち、細胞表面でLY6G6Dを発現する細胞の集団の減少)、及び/又は標的細胞殺傷を含むことができる。インビボ及び/又はインビトロでそのような生物学的活性を有する抗体が提供される。特定の実施形態では、本明細書の実施例に詳細に記載されているように、本発明の抗体は、そのような生物学的活性について試験される。
本発明はまた、化学療法剤又は薬剤、成長阻害剤、毒素(例えば、タンパク質毒素、細菌、真菌、植物又は動物由来の酵素活性毒素、又はその断片)、又は放射性同位体のような1つ又は複数の細胞傷害性薬剤にコンジュゲートした、本明細書では抗LY6G6D抗体及び/又は抗CD3抗体を含む免疫複合体を提供する。
特定の実施形態では、本発明の抗LY6G6D及び/又は抗CD3抗体のいずれか(例えば、LY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)であり、第二の生物学的分子、例えばCD3)は、生物学的試料中のLY6G6D及び/又はCD3の存在を検出するのに有用である。本明細書で使用される「検出」という用語は、定量的又は定性的な検出を包含する。特定の実施形態では、生物学的試料は細胞又は組織を含む。
本発明の抗LY6G6D抗体及び/又は抗CD3抗体(例えば、LY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、好ましくは高親和性(例えば。20A12.QNTv12)、及び第二の生物学的分子、例えばCD3)を、所望の程度の純度を有するそのような抗体を、1つ以上の任意の製薬学的に許容される担体と混合することによって調製する(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.1980))の形態で、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態で調製される。製薬学的に許容される担体は、一般的に、採用される用量及び濃度において受領者に無毒であり、以下を含むが、これらに限定されるものではない:リン酸塩、クエン酸塩、及び他の有機酸のような緩衝剤;アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤;防腐剤(例えば、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル又はベンジルアルコール;メチル又はプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−クレゾール);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド。血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、又はリジンなどのアミノ酸。単糖類、二糖類、及びグルコース、マンノース、又はデキストリンを含む他の炭水化物;EDTAのようなキレート剤;ショ糖、マンニトール、トレハロース又はソルビトールのような糖類;ナトリウムのような塩形成対イオン;金属錯体(例えば、Zn−タンパク質錯体);及び/又はポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤。本明細書において例示的な製薬学的に許容される担体は、可溶性中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)、例えば、ヒト可溶性PH−20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質、例えば、rHuPH20(HYLENEX(登録商標)、Baxter International、Inc)のような初期薬物分散剤をさらに含む。rHuPH20を含む特定の例示的なsHASEGP及び使用方法は、米国特許公開第2005/0260186号及び2006/0104968号に記載されている。一態様において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼのような1つ以上の付加的なグリコサミノグリカナーゼと組み合わせられる。
本発明の抗LY6G6D抗体及び/又は抗CD3抗体のいずれか(例えば、好ましくはLY6G6Dに結合する本発明の二重特異性抗LY6G6D抗体、好ましくは高親和性(例えば、20A12.QNTv12)を有するLY6G6D抗体、及び第二の生物学的分子、例えばCD3、好ましくは高親和性、例えば20A12.QNTv12などの抗LY6G6Dアーム、及び38E4.v1 MD1又は38E4.v1 MD4などの抗CD3アームを有するLY6G6D TDB)を治療方法に使用することができる。
本発明の抗体は、単独で、又は他の薬剤と組み合わせて治療に用いることができる。例えば、本発明の抗体は、少なくとも1つの追加の治療剤と共投与されてもよい。特定の実施形態では、追加の治療剤は、以下の通りである:化学療法剤、成長阻害剤、細胞毒性剤、放射線療法で使用される薬剤、抗血管新生剤、アポトーシス剤、抗チューブリン剤、又は他の薬剤、例えば、上皮成長因子受容体(EGFR)拮抗剤(例えば、チロシンキナーゼ阻害剤)、HER1/EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ(TARCEVA(商標))、血小板由来成長因子阻害剤(例えば、GLEEVEC(商標)(イマチニブメシル酸塩))、COX−2阻害剤(例えば celecoxib)、インターフェロン、サイトカイン、本発明の抗CD3抗体以外の抗体、例えば、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR−β、BlyS、APRIL、BCMA VEGF、又はVEGF受容体の1つ又は複数に結合する抗体、TRAIL/Apo2、PD−1、PD−L1、PD−L2、又は別の生理活性又は有機化学物質。
いくつかの態様において、追加の治療剤は、成長阻害剤である。例示的な成長阻害剤には、S相以外の場所で細胞周期の進行を阻害する剤、例えば、G1停止を誘導する剤(例えば、タモキシフェン、プレドニゾン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、5−フルオロウラシル、又はアラCなどのDNAアルキル化剤)又はM相停止(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、タキサン類(例えば、パクリタキセル及びドセタキセル)、ドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド、又はブレオマイシン)を誘導する薬剤が挙げられる。
いくつかの態様において、追加の治療剤は、放射線治療である。放射線療法には、細胞が正常に機能する能力を制限するか、又は細胞を完全に破壊するために、細胞に十分な損傷を誘発するために、指向性ガンマ線又はベータ線を使用することが含まれる。代表的な治療法は1回投与で、代表的な投与量は1日10〜200単位(グレイ(Gy))である。
いくつかの態様において、追加の治療剤は、細胞毒性剤、例えば、細胞機能を阻害又は防止する物質、及び/又は細胞死又は細胞破壊を引き起こす物質である。細胞毒性剤には、以下のものが含まれるが、これらに限定されない:放射性同位体(例えば、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212、及びLuの放射性同位体);化学療法剤又は薬剤(例えば、以下のものが含まれる。メトトレキサート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド(ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド)、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、ダウノルビシン又は他の介在剤);成長阻害剤;核分解酵素などの酵素及びその断片。抗生物質;その断片及び/又は変種を含む、細菌、真菌、植物又は動物由来の低分子毒素又は酵素的に活性な毒素のような毒素;及び抗腫瘍剤又は抗癌剤。
いくつかの局面において、追加の治療剤は、免疫調節剤、例えば、PD−L1軸結合拮抗剤であり、これは、PD−1結合拮抗剤、PD−L1結合拮抗剤、又はPD−L2結合拮抗剤であってもよい。PD−1(プログラム細胞死1)は、本技術において、「プログラム細胞死1」、「PDCD1」、「CD279」、及び 「SLEB2」とも呼ばれる。例示的なヒトPD−1は、UniProtKB/Swiss−Prot Accession No.Q15116に示されている。PD−L1(プログラム細胞死リガンド1)は、本技術において、「プログラム細胞死1リガンド1」、「PDCD1LG1」、「CD274」、「B7−H」、及び 「PDL1」とも呼ばれる。例示的なヒトPD−L1はUniProtKB/Swiss−Prot Accession No.Q9NZQ7.1に示されている。PD−L2(プログラム細胞死リガンド2)は、当技術分野では、「プログラム細胞死1リガンド2」、「PDCD1LG2」、「CD273」、「B7−DC」、「Btdc」、及び 「PDL2」とも呼ばれている。例示的なヒトPD−L2は、UniProtKB/Swiss−Prot Accession No.Q9BQ51に示されている。いくつかの実施形態では、PD−1、PD−L1、及びPD−L2は、ヒトPD−1、PD−L1、及びPD−L2である。
本発明の別の態様において、上述の疾患の治療、予防及び/又は診断に有用な材料を含む製造物品が提供される。製造品は、容器と、容器上の又は容器に関連付けられたラベル又はパッケージインサートを含む。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが挙げられる。容器は、ガラス又はプラスチックなどの様々な材料から形成されてもよい。容器は、状態を治療、予防、及び/又は診断するのに有効な別の組成物と単独で又は組み合わせて使用される組成物を保持し、無菌アクセスポートを有していてもよい(例えば、容器は、静脈内溶液バッグ又は皮下注射針によって穿孔可能なストッパーを有するバイアルであってもよい)。組成物中の少なくとも1つの活性剤は、本発明の抗体である。ラベル又はパッケージの挿入物は、組成物が選択された状態を治療するために使用されることを示す。さらに、製造品は、(a)組成物を含む第1の容器を含み、この組成物は本発明の抗体を含み、(b)組成物を含む第2の容器を含み、この組成物は細胞疾患性又は他の治療剤をさらに含む。本発明の本実施形態における製造物品は、組成物が特定の状態を治療するために使用され得ることを示すパッケージインサートをさらに含んでいてもよい。代替的に又は追加的に、製造物品は、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンゲル溶液、デキストロース溶液などの薬剤学的に許容される緩衝剤を含む第2の(又は第3の)容器をさらに含んでもよい。他の緩衝剤、希釈剤、フィルター、針、注射器など、商業的及び使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含んでいてもよい。
以下に、本発明の方法及び組成物の例を示す。前記で提供された一般的な説明から、他の様々な側面が実施され得ることが理解され、実施例は、特許請求の範囲を限定することを意図していない。
ヒト正常組織及び腫瘍組織におけるリンパ球抗原6ファミリーメンバーG6D(LY6G6D)(配列番号75)の発現を、The Cancer Genome Atlas(TCGA)(Grossman et al.,New England Journal of Medicine,375(12):1109−1112)及びGenotype−Tissue Expression Project(GTEx)data(Pierson et al.,PLoS Comput Biol,11,e1004220,2015)及び免疫組織化学(IHC)を用いて評価した。
図1Aは、TCGAデータにおけるヒト組織の正常組織及び腫瘍組織におけるLY6G6D及びリンパ球抗原6ファミリーメンバーG6F(LY6G6F)の発現を示す図である。腫瘍組織では、LY6G6Dの発現が最も高い適応症は大腸であり、LY6G6Dは大腸腫瘍組織でのみ有意に過剰発現している。正常な大腸組織は、はるかに低いレベルではあるが、LY6G6Dの発現を示す。LY6G6Fの注目すべき発現(>1 nRPKM)は、ほとんどの場合、大腸腫瘍組織に見られる。図1Bは、GTExプロジェクトの公開データにおける正常組織におけるLY6G6D及びLY6G6Fの発現を示す。LY6G6Dは、前立腺、精巣、子宮頸部、膣組織で最も高発現しており、正常な大腸組織や皮膚サンプルのサブセットでもかなりの発現が認められる。LY6G6Fは血液中に最も多く発現し、次いで精巣、脾臓、甲状腺、肺組織と続く。
LY6G6D は、マイクロサテライト不安定性(MSI)の状態がマイクロサテライト安定(MSS)、低頻度マイクロサテライト不安定性(MSI−L)、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI−H)の結腸直腸癌(CRC)で最も高発現しており、MSS の CRC は予後が悪い(図 1C)。
ヒトCRC腫瘍をLY6G6Dで染色した。原発性CRCの約20%がIHCによりLY6G6D陽性と同定された。141の組織マイクロアレイ(TMA)原発性大腸腫瘍を評価した。21個の腫瘍が弱(1+)IHC染色(14%)を示し、5個が中(2+)染色を示し、4個が強(3+)染色を示した(合計6−7%)(図2A)。図。2B−2Dは、原発性大腸腫瘍組織におけるLY6G6Dの弱い(1+)、中程度(2+)、及び強い(3+)IHC染色を示している。
A.抗LY6G6D 1G4アームの製造ライアビリティー
キメラ抗LY6G6D 1G4アームと抗CD3 38E4.v1アームを含む抗LY6G6D TDBは、HT55細胞(ヒト大腸癌細胞株)をインビトロで殺傷し(図3A)、NSG(商標)マウスの異種移植LS1034及びHT55腫瘍に対するin vivo活性を示した(図3B)。1G4はマウスハイブリドーマ抗体であり、キメラ1G4(ch1G4)は、1G4のマウス可変ドメイン(VH、VL)を、CH2にN297Gのアミノ酸置換変異を持ち「ホール」領域を構成するヒト重鎖定常ドメイン(CH1、CH2、CH3)とヒト軽鎖定常ドメイン(CL)にそれぞれ遺伝的に融合させたマウス/ヒトキメラ抗体である。1G4アームのヒト化バージョンを生成し、インビトロ及びインビボでの有効性を示した(図3C及び3D)。
抗ヒトLY6G6D(huLY6G6D)モノクローナル抗体(mAbs)をウサギで作製した。ニュージーランド白ウサギをヒトLy6G6Dで免疫し、Offner et al.PLoS ONE,9(2),2014の改変プロトコールを用いて、免疫したウサギから単一B細胞を単離した。この修飾されたワークフローは、IgG+huLy6G6D+B細胞の単一ウェルへの直接FACSソーティングを含んだ。B細胞培養上清を、ヒトLy6G6D及び無関係な対照タンパク質との結合についてELISAでアッセイを行った。Ly6G6D特異的B細胞を溶解し、直ちに−80℃で凍結保存し、分子クローニングまで保存した。各ウサギB細胞モノクローナル抗体の可変領域(VH及びVL)を、前記のように抽出したmRNAから発現ベクターにクローニングした(Offner et al.PloS ONE,9(2),2014)。個々の組換えウサギ抗体をExpi293細胞で発現させた後、プロテインAで精製した。精製した抗Ly6G6D抗体を、機能活性アッセイと速度論的スクリーニングに供した。約280の抗Ly6G6D ELISA+クローンが生成された。96個のクローンは、その後、以下に記載されるように、4つの異なるエピトープビニンググループにビンニングされた。
アレイベースのSPRイメージングシステム(Carterra(登録商標)、米国)は、1G4を含む96のウサギ抗huLY6G6Dモノクローナル抗体のパネルのキネティクステストとエピトープのビニングのために使用された。エピトープビニングのために、LY6G6Dポリペプチドは、分子の表面全体にグリコシル化部位を導入するように設計された(図4A及び4B)。サイトは、ネイティブ配列からの破壊を最小限に抑えてグリコシル化サイトを追加しやすいように選択した。候補の抗LY6G6D抗体を、グリコエンジニアリングされたLY6G6Dポリペプチドとの相互作用について試験した(図4B)。精製した抗体を10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH4.5)で10μg/mlに希釈した。アミンカップリングを用いて、SPRセンサープリズムCMD 200Mチップ(XanTec Bioanalytics、ドイツ)にSPRi−Continuous Flow Microspotter(商標)(Carterra(登録商標)、米国)を用いて抗体を直接固定化し、96個の抗体のアレイを作成した。分析には、IBIS MX96 SPRi(Carterra(登録商標),USA)を使用し、固定化リガンドとの結合を評価した。キネティック解析のために、ヒトLy6G6Dを0〜300nMの3倍希釈で3分間注入し、その後、10分間の解離期間を経た。エピトープビニングのために、ヒトLy6G6Dの各グリコシル化変異体を最初に50nMで4分間注入し、次いで、10μg/mlでの個々のモノクローナル抗体の第2の4分間注入を行った。サイクル間のpH1.5で10mMグリシンで表面を再生した。実験は、HBS−T緩衝液(0.01M HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、0.05%界面活性剤P20)のランニングバッファー中で25℃で行った。キネティックデータはScrubber 2.0(BioLogic Software)を用いて処理し、エピトープビニングデータはWasatchビニングソフトウェアツール(Carterra(登録商標),USA)を用いて処理した。
Ly6G6D陽性腫瘍細胞株を標的とするウサギ抗体の新しいパネルの能力を評価するために、抗CD3 40G5cアームと異なるウサギ抗LY6G6Dアームとのペアを含む二重特異性T細胞依存性抗体(TDB)を作製した。各エピトープビン(ビン1、ビン2、ビン3及びビン4)からの代表的なウサギ抗体を、「ノブ」領域を含むFc領域、キメラウサギ可変ドメイン、及びN297G及びT366Wの変異を有するヒト定常ドメインを有するハーフ抗体に再フォーマットした。精製後、「ノブ 」抗LY6G6Dアームを、「ホール 」領域を構成するFc領域を有する抗CD3 40G5cアームでアニーリングし、HT55細胞への結合及びインビトロでの殺傷についてアッセイを行った(図4F、4G、及び13A〜13E)。1G4を含むビン1(例えば、20A12及び6E10)からのウサギ抗体は、HT55細胞の結合及び殺傷の両方において最も効果的であることがわかった。
抗LY6G6Dウサギ抗体のLY6G6Dに対する結合親和性は、BIAcore(商標)T200マシン(GEヘルスケアライフサイエンス社)を用いて決定した。簡単に言えば、BIAcore(商標)リサーチグレードCM5チップは、サプライヤーの指示に従って、1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)及びN−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)試薬で活性化された。キネティクス測定のために、Ly6G6Dタンパク質をチップに結合して、各フローセル内で約100の応答単位(RU)を達成した。未反応のカップリング基は1Mエタノールアミンでブロックした。ウサギ抗体は、ウサギ可変ドメインとヒト定常ドメインを有するキメラ抗原結合断片(Fabs)として発現させた。Fabsの10倍連続希釈液を37℃のHBS−P緩衝液中に30μL/minの流量で注入した。結合率(ka)及び解離率(kd)は、1:1 Langmuir結合モデル(BIAcore(商標)T200評価ソフトウェアバージョン2.0)を用いて計算した。平衡解離定数(KD)は、比kd/kaとして算出した(図4H)。
Bin 1ウサギモノクローナル抗体20A12及び6E10は、後述するようにヒト化した。残留数はKabat et al.,Sequences of proteins of immunological interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)による。
ウサギ抗体のヒト化における一つの課題は、ウサギの配列とヒトの配列の違いが、げっ歯類の配列とヒトの配列の違いよりも大きいことである。このようにして、20A12のヒト化には複数のフレームワークが適用された。
ヒト化されたrb.20A12抗体として20A12.QNTv12変異体を選択した。20A12.QNTv12
20A12.QNTv12は、KV1−5*01のVLフレームワーク領域、アミノ酸置換S73、T76、V78、P105で修飾されたCDR HV3−23*01のVHフレームワーク領域(ウサギのVernier位置に由来)、及びrb.20A12のCDR(CDR−H1及びCDR−H2のシステイン残基をそれぞれI及びAで置換し、CDR−L3のグリコシル化部位におけるNNTからQNTへの変異を有する)(図32A、40B、及び40C)を含む。KDはrb.20A12では0.23nM、20A12.QNTv12では0.14nMである。
ヒト化されたrb.20A12変異体20A12.QNTv12、ヒト化されたrb.6E10変異体6E10.v114、及び抗LY6G6D 1G4アームをTDBとして抗CD3 38E4v1又は40G5cアームとペアにし、BIAcore(登録商標)アッセイでヒト及びサイノモルグスLY6G6Dに対する親和性を試験した。ウサギ20A12、ウサギ6E10、及びヒト化20A12.QNTv12及び20A12.SNVv12を、抗原結合断片(Fabs)として結合するために追加的にアッセイを行った。rb6E10 Fabを除き、LY6G6D−Fcをチップ上に直接固定化し、25℃でアッセイを行いTDBを37℃で流した。結果を以下の表2に示す。
6E10のヒト化には複数のフレームワークを適用した。rb6E10 VL CDRをヒト生殖細胞配列KV1−5*01及びKV3−20*01にグラフトし、VH CDRをヒト生殖細胞配列HV3−53*01及びHV3−48*01にグラフトした(図43A)。これらの生殖細胞配列は、それらの高い血清有病率及びrb.6E10との高い配列同一性に基づいて選択された(図33A及び33B)。20A12について上述したように、ウサギ抗体からのすべてのVL及びVHVernier位置を、それぞれのヒト生殖細胞フレームワークにグラフトした。全てのウサギのアミノ酸がVernier位置にあるグラフトをバージョン1(KV1−5/HV3−53のためのhu.6E10.v1a;KV1−5/HV3−48のためのhu.6E10.v1b;及びK3−20/HV3−53のためのhu.6E10.v1c)と称する。各生殖細胞に対して軽鎖変異体を5種類追加し(KV1−5:L2−L6、KV3−20:L2−L6)、HV3−53に対して重鎖変異体(H2−H11)を10種類追加した。KV1−5軽鎖については、前記の変異体抗体の結合親和性評価に基づいて、Ala2、Phe36及びArg43(L3)をウサギVernier残基のキー残基と決定した(データは示さない)。同様に、KV3−20軽鎖についても、Ala2、Phe36及びVal58(L4)が、ウサギのVernier残基の鍵となることが決定された。重鎖については、HV3−53*01(H11)へのCDRグラフトは、huLy6G6Dへの親和性を維持するのに十分であることが確認された。ウサギのVernier位置は含まれない。生殖細胞HV3−48*01(3−48H2)に追加のCDRグラフトを作製した。重鎖H11は6E10v114としてKV3−20.L4と対になった。重鎖HV3−48.H2を6E10v23としてKV1−5.L3と対にした(図43A−43D)。
実施例2に記載したように、1G4(実施例2)と重複するエピトープを有するヒト化ウサギ抗体20A12.QNTv12は、強力な抗LY6G6D抗体として同定された。20A12.QNTv12は、37℃でTDBとしてヒトLy6G6Dに対して高い結合親和性を示し(KDは約2nM、1G4では約16nM)、ヒト及びカニクイザルLY6G6Dと同等の結合親和性を示し、BV ELISA法、発現試験、分子評価(MA)熱酸化試験において良好な結果を示した。1セル製造のための電荷対を構成するように修飾された変異体を含む20A12.QNTv12のアミノ酸配列、及びLY6G6Dに結合した20A12.QNTv12の結晶構造を以下に記載する。
20A12.QNTv12の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を図5A及び図5Bに示す(配列番号22及び23)。1セル製造のための電荷対を構成するように改変された20A12.QNTv12の亜種の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列を図5C及び5Dに示す(配列番号10及び11)。
LY6G6Dに結合した20A12.QNTv12の結晶構造を決定するために、LY6G6Dのアミノ酸93〜104を含むポリペプチド(配列番号 78)を、20A12.QNTv12抗体の断片抗原結合領域(Fab)と共結晶化した(図6A〜6F)。20A12.QNTv12−LY6G6D複合体の結晶構造を2.2Å,R/Rfree 19.9/24.3%に分解した(P1スペースグループ:82,138,139,68,75,90.)。10個の20A12.QNTv12 Fabをテストした。LY6G6D残基94〜103は、全10コピーに結合して分解された。このLy6G6D 94−103ポリペプチドは、抗Ly6G6D 1G4の結晶構造において二量体を形成し、20A12.QNTv12とモノマーとして結合していた。
また、LY6G6Dのアミノ酸93〜104を含むポリペプチド(配列番号87)を、20A12.QNTv12抗体(配列番号96〜97)の断片抗原結合領域(Fab)又は1G4のFab(配列番号94、95)と共結晶化した。ペプチドバックボーンのコンフォメーションは、ジスルフィドステープルによる1G4構造と20A12.QNTv12構造の間で類似していたが、側鎖は有意なコンフォメーション移動度を示した(図7A及び7B)。20A12.QNTv12及び1G4は、図7C〜7F及び表3及び4に示すように、LY6G6Dペプチドの異なる残基に結合していることがわかった。
細胞毒性、細胞結合、T細胞活性化、及び細胞殺傷
抗CD3アーム38E4v1又は40G5cのいずれかと対になったLY6G6D TDB(例えば、抗LY6G6Dアーム20A12.QNTv12又はその変種を有するLY6G6D TDB)を、中程度のLY6G6Dを内因性に発現するHT55細胞(ヒト大腸癌細胞株)を用いて、インビトロ活性について試験を行った(図9A−9C、10A−10D、及び11F−11H)。40G5c及び38E4v1は、ヒトCD3εのN末端27アミノ酸にまたがるKLH(keyhole limpet hemocyanin)結合ペプチドで免疫したマウスから得られたヒト化ハイブリドーマ抗体である。40G5cは、CD3に対して比較的低い親和性を有することが以前に観察されているが、38E4v1は高い親和性を有することが観察されている(米国公開第2015−0166661号)。
A.腫瘍体積
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アーム及び抗CD3 40G5c又は38E4.v1アームを含む候補LY6G6D TDBを、NSG(商標)マウスの異種移植LS1034及びHT55腫瘍に対するin vivo活性について試験した(図16A−16C 17A−17C)。マウスは、健康なドナー末梢血単核細胞(PBMC)を用いてヒト化した。対照として、デリバリービークルとPMBCを含む処理、又はTDBを含み、PMBCを含まない処理を行った。TDBの血清濃度は、TDBの単回投与後、ジェネリック免疫グロブリン薬物動態(GRIP)ELISAアッセイ(Yang et al.,J.Immunol.Methods,8−20,2008)を使用して測定した。
抗LY6G6Dアーム20A12.QNTv12と抗CD3 40G5c又は38E4.v1アームを含むLY6G6D TDBのクリアランスを、重症複合免疫不全(SCID)マウスを用いて、GRIP ELISA法を用いて5mg/kgの抗体を単回静脈内投与した後に測定した(図18)。クリアランス率(7.67mL/日/kg)は、38E4v1抗CD3抗体群と対になった他のTDBと同等であった。クリアランスレートは8.6〜16mL/kg/日であった。20A12.QNTv12と38E4v1を含むTDBは、SCIDマウスにおいて許容可能な薬物動態(PK)を示し、対照抗体である抗gD 5B6と比較して、全身性CLに2倍以下の差を示した。LY6G6Dの20A12.QNTv12と38E4v1のアームを含むTDBは、非結合種ではPKライアビリティー(非定型PK)は認められなかった。すべての投与溶液は、公称投与量の±20%以内に回収された。
A.カニクイザルの毒性試験
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アームと抗CD3 38E4.v1アームを含むLY6G6D TDBの毒性試験をカニクイザル(cyno)を用いて実施した。この研究は、反復群と時差投与群による適応がなされていた(図19)。グループ2は、1日目(D1)にLY6G6D TDBを単回投与(1mg/kg)で点滴静注した。第3群、第4群、第5群には単回投与(それぞれ2、4、8mg/kg)の点滴静注を行い、第6群には単回投与(15mg/kg)の点滴静注を行った。D8については、病理組織学的評価のために末期壊死を行った(図19)。本研究の目的は、健康な動物を対象にLY6G6Dのリスクを軽減し、投与量の範囲を試験することである。過去のTDBでの経験に基づき、PK/PD及び標準毒性のエンドポイントが含まれていた。
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アーム及び抗CD3 38E4.v1アーム(図24A)又は40G5Cアーム(図24B)を含むTDBを、BIAcoreアッセイを用いて、ヒト及びcyno Ly6G6Dポリペプチドに対する親和性をアッセイした。Ly6G6D−Fcをチップ上に直接固定化し、37℃でTDBを流した。抗LY6G6D1G4アームおよび抗CD3 38E4.v1アーム(図24C)または40G5Cアーム(図24D)を含むTDBについて同様のアッセイを行った。これらのアッセイの結果を表6に示す。
A.1セル、2セルの製造システム
抗LY6G6D抗体(例えば、20A12.QNTv12)は、図8Aに示すように、抗LY6G6D特異性を有する第1のアームと抗CD3特異性を有する第2のアームを有するLY6G6D T細胞依存性二重特異性抗体(LY6G6D TDB)として製造された。TDBは、2セルシステム(図8B)又は1セルシステム(図8C)のいずれかを用いて製造した。1セル製造のためには、第一アーム及び第二アームが宿主細胞内で同等のレベルで発現されることが重要である:発現レベルの大きな差は、軽鎖(LC)のミスペアリングの可能性を高め、TDBの正しいペアリングの可能性を低下させる。抗CD3 38E4v1アームは相対的に発現が悪いのに対し、抗LY6G6Dアーム20A12.QNTv12は高度に発現している(図37)。TDBアセンブリを評価するための過渡トランスフェクションアッセイにおいて、38E4v1アームと20A12.QNTv12アームを含むLY6G6D TDBは、それぞれのアームをコードするDNAの比率を1:16の比率に変更しても、80%を超える正しいペアリングに到達しなかった(図29D)。
1セルシステムでの製造を容易にするために、20A12.QNTv12アームの重鎖及び軽鎖配列は、電荷対を導入するアミノ酸置換変異を構成するように改変された(図5C、5D、及び8A−8E)。
1セルシステムでの製造に適した38E4v1の発現改善変異体を作製するために、38E4v1のVL配列を、後述するように、38E4v1よりも優れた発現を有する抗CD3抗体である40G5cからの残基で修飾した。2つの38E4v1変異体38E4v1 MD1(MD1)及び38E4v1 MD4(MD4)は、マウスの野生型(WT)38E4v1と比較して、良好なLC−ミスペア不純物比とインビトロ効力、in vivo効力、及びPKを有する。
38E4v1、MD1、及び38E4v1に対するS43P、T51A、K55E、又はK89Tアミノ酸置換のみを含む変異体の発現レベルを、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)11−9宿主細胞における一過性トランスフェクションアッセイで評価した。
38E4v1 MD1及びMD4アームの結合速度は、高親和性野生型抗CD3 38E4v1アーム(WT)に匹敵するヒト及びcyno CD3リガンドへの親和性を示した(表9)。このようにして、MD1及びMD4変異体は、38E4v1の高い親和性を保持した。アッセイでは、BIAcore T200を用いて行った:27merヒト及びcyno CD3ポリペプチドをビオチンにコンジュゲートし、SA CM5チップ上に固定化し、TDBを37℃で100μl/分で流した。
様々な抗CD3アームの薬物動態(PK)を評価するために、38E4v1、40G5c、MD1、MD4及び38E4v1.K55EのPKプロファイルを、各変異体の単回投与後のCB−17 SCIDマウスで測定した。抗gD抗体をコントロールとして使用した。抗gD抗体は、単純ヘルペスウイルスの糖タンパク質Dエピトープを標的とした非結合性コントロールIgGである。すべての抗体は、FcγR媒介エフェクター機能を減衰させるために、N297G変異を有するヒトIgG1アイソタイプを有する単特異的な二価の抗CD3抗体として試験された。
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アームと抗CD3 38E4v1 MD1(MD1)、38E4v1 MD4(MD4)、又は38E4v1(WT)アームを含む1細胞系(図8C〜8E)を用いて組み立てられた候補LY6G6D TDBを、インビトロ活性、インビボ活性、及びCD3ポリペプチドとの親和性について試験した。抗LY6G6D 20A12.QNTv12アームと抗CD3 38E4v1アームを含む2細胞系(図8B)を用いて組み立てられたTDBをコントロールとして使用した。
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アーム及び抗CD3 38E4v1 MD1、38E4v1 MD4、又は38E4v1アーム(WT)を含む1細胞系を用いて組み立てられたLY6G6D TDBを、健康なドナーからのPBMCを補充したHT55細胞におけるインビトロ活性、CD4+T細胞の活性化、及びCD8+T細胞の活性化について試験した(図14A−14C及び15A−15C)。殺傷は、CELLTITER−GLO(登録商標)アッセイにおけるパーセント細胞毒性として定量化し、CD4+T細胞及びCD8+T細胞は、実施例2に記載したように、蛍光活性化細胞ソーティング(FACS)を用いて測定した。TDBはすべて1mg/kgで投与した。変異体38E4v1アームを含むLY6G6D TDBは、HT55に対するインビトロでのT細胞活性化(図14B、14C、15B、15C)及び標的細胞殺傷(図14A及び15A)の誘導において強力であった。MD1及びMD4変異体は、このようにして38E4v1のインビトロでの高い効力を維持しながら、1セルシステムでの製造性を向上させている。
抗LY6G6D 20A12.QNTv12アームと、1セルシステムを用いて組み立てられた変異体38E4v1抗CD3アームを含むLY6G6D TDBを、NSG(商標)マウスの異種移植HT55腫瘍に対するin vivo活性について試験した(図26A及び26B)。マウスは、健康なドナー末梢血単核細胞(PBMC)を用いてヒト化した。対照として、デリバリービークルとPMBCを含む処理、又はTDBを含み、PMBCを含まない処理を行った。抗CD3 38E4v1 MD1又は38E4v1 MD4アームを含む1セル変異体は、2細胞のLY6G6D TDBと同等の腫瘍退縮を示した。
抗CD3 38E4v1 MD1又は38E4v1 MD4アームで構成された1細胞システムを用いて構築された候補LY6G6D TDBは、抗CD3 38E4v1アームで構成された1細胞システム又は2細胞システムを用いて構築されたTDBと同等のCD3に対する親和性を有していた:したがって、MD1および MD4は、38E4v1と同様に、高親和性の抗CD3アームであった(表11)。アッセイは、BIAcore T200を用いて行った。27merヒト及びcyno CD3ポリペプチドをビオチンにコンジュゲートし、SA CM5チップ上に固定化した。LY6G6D TDBを37℃で流した。
Claims (166)
- 抗リンパ球抗原6ファミリーメンバーG6D(LY6G6D)に結合する単離された抗体であって、ここで、前記抗体は、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)を含むLY6G6D結合ドメインを含み、ここで、前記H1は、以下の相補性決定領域(CDR):
(a)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR−H2;及び
(c)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
を含む重鎖可変(VH)ドメイン(VH1)を含み、前記L1は、以下のCDR:
(d)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(e)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(f)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR−L3、
を含む軽鎖可変(VL)ドメイン(VL1)を含む、抗体。 - 請求項1に記載の抗体であって、ここで、(a)VH1が、配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む;(b)VL1が、配列番号11のアミノ酸配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む;又は(c)抗体が、(a)のVH1と(b)のVL1を含む、抗体。
- 請求項1又は2に記載の抗体であって、ここで、前記VH1は、以下のフレームワーク領域(FR):
(a)配列番号34のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号35のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号36のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号37のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項1〜3のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VH1は、配列番号10のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項1又は2に記載の抗体であって、ここで、前記VH1は、以下のFR:
(a)配列番号34のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号58のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号36のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号37のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項1、2及び5のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VH1は、配列番号59のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VL1は以下のFR:
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号41のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項1〜4及び7のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VL1が、配列番号11のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項1、2、5及び6のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VL1は以下のFR:
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号61のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号40のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号41のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項1、2、5、6及び9のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VL1は、配列番号60のアミノ酸配列を含む、抗体。
- LY6G6Dに結合する単離された抗体であって、ここで、前記抗体は重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)を含むLY6G6D結合ドメインを含み、ここで、前記H1は配列番号10のアミノ酸配列を含むVHドメイン(VH1)を含み、L1は配列番号11のアミノ酸配列を含むVLドメイン(VL1)を含む、抗体。
- LY6G6Dに結合する単離された抗体であって、ここで、前記抗体は重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)を含むLY6G6D結合ドメインを含み、ここで、前記H1は配列番号59のアミノ酸配列を含むVHドメイン(VH1)を含み、L1は配列番号60のアミノ酸配列を含むVLドメイン(VL1)を含む、抗体。
- 請求項1〜12のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、BIAcoreアッセイを用いて測定した場合に、37℃で約100pMと10nMの間のKDでヒトLY6G6Dポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項13に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が6.0 nM以下のKDでヒトLY6G6Dポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項14に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が4 nM以下のKDでヒトLY6G6Dポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項15に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が2 nM以下のKDでヒトLY6G6Dポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項1〜16のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体がモノクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体である、抗体。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体がLY6G6Dに結合する抗体断片である、抗体。
- 請求項18に記載の抗体であって、ここで、前記抗体断片が、Fab、Fab’−SH、Fv、scFv、及び(Fab’)2断片からなる群から選択される、抗体。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が完全長抗体である、抗体。
- 請求項1〜17及び20のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体がIgG抗体である、抗体。
- 請求項1〜21のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が単一特異性抗体である、抗体。
- 請求項1〜21のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が多重特異性抗体である、抗体。
- 請求項23に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が二重特異性抗体である、抗体。
- 請求項24に記載の抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体は、分化抗原群(cluster of differentiation)3(CD3)に結合し、重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)を含むCD3結合ドメインを含み、ここで、H2はVHドメイン(VH2)を含み、L2はVLドメイン(VL2)を含む、抗体。
- 請求項25に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインは、ヒトCD3ポリペプチド又はカニクイザルCD3ポリペプチドに結合することができる、抗体。
- 請求項26に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトCD3ポリペプチド又は前記カニクイザルCD3ポリペプチドが、それぞれ、ヒトCD3εポリペプチド又はカニクイザルCD3εポリペプチドである、抗体。
- 請求項26に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトCD3ポリペプチド又は前記カニクイザルCD3ポリペプチドが、それぞれ、ヒトCD3γポリペプチド又はカニクイザルCD3γポリペプチドである、抗体。
- 請求項25〜28のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体は、BIAcoreアッセイを用いて測定した場合に、37℃で約1nMから500nMの間のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項29に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインが、250nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項30に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインが、100nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項31に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインは、15nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項32に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインは、10nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項33に記載の抗体であって、ここで、前記CD3結合ドメインは、5nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項25〜34のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記VH2は、以下のCDR:
(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;及び
(c)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
を含み、前記VL2は以下のCDR:
(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(e)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(f)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR−L3、
を含む、抗体。 - 請求項35に記載の抗体であって、ここで、(a)前記VH2は、配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む;(b)前記VL2は、配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む;又は(c)前記抗体が、(a)のVH2と(b)のVL2を含む、抗体。
- 請求項35又は36に記載の抗体であって、ここで、前記VH2は、配列番号20のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項35〜37のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記VL2は、配列番号21のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項25〜34のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記VH2は、以下のCDR:
(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;及び
(c)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
を含み、前記VL2は以下のCDR:
(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(e)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(f)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR−L3、抗体、
を含む、抗体。 - 前記結合ドメインが、(a)配列番号20のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH2、(b)配列番号55のアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL2、又は(c)(a)と同様のVH2及び(b)と同様のVL2、を含む、請求項39に記載の抗体。
- 請求項39又は40に記載の抗体であって、ここで、前記VH2が配列番号20のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項39〜41のいずれか1項に記載の抗体であって、前記VL2が、配列番号55のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項35、36、39、及び40のいずれか1項に記載の抗体であって、前記VH2が以下のFR:
(a)配列番号42のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号43のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号44のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号45のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項35、36、39、及び40のいずれか1項に記載の抗体であって、前記VH2が以下のFR:
(a)配列番号42のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号44のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号45のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項35、36、39、40及び43のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記VL2は以下のFR:
(a)配列番号46のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号47のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号48のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号49のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項35、36、39、40及び44のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記VL2は以下のFR:
(a)配列番号46のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号63のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号48のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号49のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項25〜46のいずれか一項に記載の抗体であって、前記H1及びH2がそれぞれ重鎖定常ドメイン(CH1)をさらに含み、前記L1及びL2がそれぞれ軽鎖定常ドメイン(CL)をさらに含む、抗体。
- 請求項47に記載の抗体であって、ここで、H1の前記CH1はS183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換基を含み、L1の前記CLはV133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換基を含む、抗体。
- 請求項47又は48に記載の抗体であって、ここで、H1の前記CH1はS183K突然変異を含み、L1の前記CLはV133E突然変異を含む、抗体。
- 請求項49に記載の抗体であって、ここで、H2の前記CH1はS183E突然変異を含み、L2の前記CLはV133K突然変異を含む、抗体。
- 請求項47又は48に記載の抗体であって、ここで、H1の前記CH1はS183E突然変異を含み、L1の前記CLはV133K突然変異を含む、抗体。
- 請求項51に記載の抗体であって、ここで、H2の前記CH1はS183K突然変異を含み、L2の前記CLはV133E突然変異を含む、抗体。
- LY6G6D及びCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで前記二重特異性抗体は以下:重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで、各H1及びH2は、重鎖可変ドメイン(VH)及び重鎖定常ドメイン(CH1)を含み、各L1及びL2は、軽鎖可変ドメイン(VL)及び軽鎖定常ドメイン(CL)を含み、ここで:
(a)前記LY6G6D結合ドメインは、以下の6つのCDR:
(i)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(ii)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(iii)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(iv)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(v)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(vi)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
を含み、
(b)前記CD3結合ドメインは、以下の6つのCDR:
(i)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(ii)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(iii)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(iv)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(v)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(vi)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
を含み、
(c)H1の前記CH1は、S183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、L1の前記CLは、V133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、かつ/又はH2の前記CH1は、S183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、L2の前記CLは、V133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み;かつ
(d)H1の前記VHは位置Q39でのアミノ酸置換を含み、L1の前記VLは位置Q38でのアミノ酸置換を含み、かつ/又はH2の前記VHは位置Q39でのアミノ酸置換を含み、L2の前記VLは位置Q38でのアミノ酸置換を含む(すべてカバットナンバリング)、抗体。 - LY6G6D及びCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで前記二重特異性抗体は以下:重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで、各H1及びH2は、重鎖可変ドメイン(VH)及び重鎖定常ドメイン(CH1)を含み、各L1及びL2は、軽鎖可変ドメイン(VL)及び軽鎖定常ドメイン(CL)を含み、ここで:
(a)前記LY6G6D結合ドメインは、以下の6つのCDR:
(i)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(ii)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(iii)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(iv)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(v)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(vi)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
を含み、
(b)前記CD3結合ドメインは、以下の6つのCDR:
(i)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(ii)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(iii)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(iv)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(v)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(vi)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR−L3;
を含み、
(c)H1の前記CH1は、S183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、L1の前記CLは、V133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、かつ/又はH2の前記CH1は、S183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、L2の前記CLは、V133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換を含み;かつ
(d)H1の前記VHは位置Q39でアミノ酸置換を含み、L1の前記VLは位置Q38でアミノ酸置換を含み、及び/又はH2の前記VHは位置Q39でアミノ酸置換を含み、L2の前記VLは位置Q38でアミノ酸置換を含む(すべてカバットナンバリング)、抗体。 - 請求項53又は54に記載の抗体であって、ここで、H1の前記VHはQ39(カバットナンバリング)でのアミノ酸置換基を含み、L1の前記VLはQ38(カバットナンバリング)でのアミノ酸置換基を含む、抗体。
- 請求項55に記載の抗体であって、ここで、H2の前記CH1はS183(EUナンバリング)でのアミノ酸置換基を含み、L2の前記CLはV133(EUナンバリング)でのアミノ酸置換基を含む、抗体。
- 請求項56に記載の抗体であって、ここで、H2の前記VHは、さらに位置Q39(カバットナンバリング)でのアミノ酸置換を含み、L2の前記VLは、さらに位置Q38(カバットナンバリング)でのアミノ酸置換を含む、抗体。
- 請求項57に記載の抗体であって、ここで、H1の前記CH1がS183K突然変異(EUナンバリング)を含み、L1の前記CLがV133E突然変異(EUナンバリング)を含み、H2の前記CH1がS183E突然変異(EUナンバリング)を含み、L2の前記CLがV133K突然変異(EUナンバリング)を含む、抗体。
- 請求項58に記載の抗体であって、ここで、H1の前記VHはQ39E(カバットナンバリング)変異を含み、L1の前記VLはQ38K変異を含み、H2の前記VHはQ39K変異を含み、L2の前記VLはQ38E変異(カバットナンバリング)を含む、抗体。
- 請求項57に記載の抗体であって、ここで、H1の前記CH1はS183E突然変異(EUナンバリング)を含み、L1の前記CLはV133K突然変異(EUナンバリング)を含み、H2の前記CH1はS183K突然変異(EUナンバリング)を含み、L2の前記CLはV133E突然変異(EUナンバリング)を含む、抗体。
- 請求項60に記載の抗体であって、ここで、H1の前記VHはQ39K突然変異(カバットナンバリング)を含み、L1の前記VLはQ38E突然変異(カバットナンバリング)を含み、H2の前記VHはQ39E突然変異(カバットナンバリング)を含み、L2の前記VLはQ38K突然変異(カバットナンバリング)を含む、抗体。
- 請求項53及び55〜61のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、H2の前記VHは、配列番号20のアミノ酸配列を含み、かつ/又はL2の前記VLは、配列番号21のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項62に記載の抗体であって、ここで、H1の前記VHは配列番号10のアミノ酸配列を含み、L1の前記VLは配列番号11のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項54〜61のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、H2の前記VHは、配列番号20のアミノ酸配列を含み、かつ/又はL2の前記VLは、配列番号55のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項64に記載の抗体であって、ここで、H1の前記VHは配列番号10のアミノ酸配列を含み、L1の前記VLは配列番号11のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項25〜65のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記H1のFc領域の第1のCH3ドメイン(CH31)及び前記H2のFc領域の第2のCH3ドメイン(CH32)は、それぞれ突起又は空洞を含み、かつ、ここで、前記CH31の前記突起又は前記空洞が、前記CH32の前記空洞又は前記突起内にそれぞれ位置することが可能であることを特徴とする、抗体。
- 請求項66に記載の抗体であって、ここで、前記CH31と前記CH32が、前記突起と前記空洞との間の界面で会合する、抗体。
- 請求項66又は67に記載の抗体であって、ここで、前記H1の前記Fc領域の前記CH31は突起を含み、前記H2の前記Fc領域の前記CH32は空洞を含む、抗体。
- 請求項66〜68のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含む;(b)前記前記H2のFc領域の前記CH32は、T366S、L368A、又はY407Vアミノ酸置換変異(EUナンバリング)、又はその組み合わせを含む空洞を含む;又は(c)(a)と(b)の両方である、抗体。
- 請求項69に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含む;(b)前記H2の前記Fc領域の前記CH32は、T366S、L368A、及びY407Vアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む空洞を含む;又は、(c)(a)と(b)の両方である、抗体。
- 請求項70に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含み、(b)前記H2の前記Fc領域の前記CH32は、T366S、L368A、及びY407Vのアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む空洞を含む、抗体。
- 請求項66又は67に記載の抗体であって、ここで、前記H1の前記Fc領域の前記CH31は空洞を含み、前記H2の前記Fc領域の前記CH32は突起を含む、抗体。
- 請求項66、67、又は72のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366S、L368A、又はY407Vアミノ酸置換変異(EUナンバリング)、又はそれらの組み合わせを含む空洞を含む;(b)前記H2の前記Fc領域の前記CH32は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含む;又は(c)(a)と(b)の両方である、抗体。
- 請求項73に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366S、L368A、及びY407Vアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む空洞を含む;(b)前記H2の前記Fc領域の前記CH32は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含む;又は(c)(a)と(b)の両方である、抗体。
- 請求項74に記載の抗体であって、ここで、(a)前記H1の前記Fc領域の前記CH31は、T366S、L368A、及びY407Vのアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む空洞を含み、(b)前記第2重鎖ポリペプチドの前記Fc領域の前記CH32は、T366Wアミノ酸置換変異(EUナンバリング)を含む突起を含む、抗体。
- 請求項66〜75のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記Fc領域は、ヒトIgGアイソタイプFc領域、又はそのFc領域変異体である、抗体。
- 請求項76に記載の抗体であって、ここで、前記Fc領域がヒトIgGアイソタイプFc領域変異体である、抗体。
- 請求項77に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域の変異体は、それぞれ、グリコシル化の非存在をもたらすアミノ酸残基N297(EUナンバリング)での変異を含む、抗体。
- 請求項78に記載の抗体であって、ここで、アミノ酸残基N297における前記変異が置換変異である、抗体。
- 請求項78又は79に記載の抗体であって、ここで、アミノ酸残基N297における前記変異が、前記Fc領域のエフェクター機能を低下させる、抗体。
- 請求項79又は80に記載の抗体であって、ここで、前記置換変異がN297G又はN297Aの変異である、抗体。
- 請求項81に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域の変異体はそれぞれN297G変異を含む、抗体。
- 請求項77〜82のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域の変異体は、それぞれ、前記Fc領域のエフェクター機能を低下させる変異を含む、抗体。
- 請求項83に記載の抗体であって、ここで、Fc領域のエフェクター機能を低下させる前記変異が置換変異である、抗体。
- 請求項84に記載の抗体であって、ここで、前記置換変異がアミノ酸残基E233、L234、L235、D265、及び/又はP329(EUナンバリング)にある、抗体。
- 請求項85に記載の抗体であって、ここで、前記置換変異がE233P、L234A、L234V、L235A、D265A、又はP329G変異である、抗体。
- 請求項86に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域の変異体はそれぞれP329G変異を含む、抗体。
- 請求項82〜87のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体は、それぞれN297G及びP329Gの変異を含む、抗体。
- 請求項82〜88のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体がヒトIgG1又はIgG3アイソタイプFc領域変異体であり、それぞれが前記L234A又はL235A変異をさらに含む、抗体。
- 請求項89に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体がヒトIgG1又はIgG3アイソタイプFc領域変異体であり、それぞれが前記L234A及びL235Aの変異をさらに含む、抗体。
- 請求項82〜88のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体がヒトIgG1又はIgG3アイソタイプFc領域変異体であり、それぞれが、以下の置換変異E233P、L234V及びL235A(EUナンバリング)、及び残基G236の欠失(EUナンバリング)をさらに含む、抗体。
- 請求項91に記載の抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体がヒトIgG1アイソタイプFc領域変異体である、抗体。
- 請求項82〜88のいずれか一項に記載に抗体であって、ここで、前記ヒトIgGアイソタイプFc領域変異体がヒトIgG4アイソタイプFc領域変異体であり、それぞれが、以下の置換変異E233P、F234V、及びL235A(EUナンバリング)、及び残基G236の欠失(EUナンバリング)をさらに含む、抗体。
- 請求項89〜93のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記Fc複合体のFc領域がエフェクターレスFc領域である、抗体。
- 請求項66〜94のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記H1は配列番号7のアミノ酸配列を含み、前記L2は配列番号9のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項95に記載の抗体であって、ここで、前記H2は配列番号18のアミノ酸配列を含み、前記L2は配列番号19のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項95に記載の抗体であって、ここで、前記H2は配列番号18のアミノ酸配列を含み、前記L2は配列番号57のアミノ酸配列を含む、抗体。
- LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号7のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号18のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号19のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号64のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号65のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号69のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号70のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号8のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号67のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号19のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号66のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号65のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号68のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号70のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号7のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号18のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号57のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)を含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号64のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号65のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号69のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号73のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号8のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号9のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号67のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号57のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - LY6G6DとCD3に結合する二重特異性抗体であって、ここで、前記二重特異性抗体が、重鎖ポリペプチド(H1)と軽鎖ポリペプチド(L1)とを含むLY6G6D結合ドメイン、および重鎖ポリペプチド(H2)と軽鎖ポリペプチド(L2)とを含むCD3結合ドメインを含み、ここで:
(a)H1は、配列番号66のアミノ酸配列を含み;
(b)L1は、配列番号65のアミノ酸配列を含み;
(c)H2は、配列番号68のアミノ酸配列を含み;かつ
(d)L2は、配列番号73のアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体。 - 請求項1〜105のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体は、約10ml/kg/日から約35ml/kg/日の間の静脈内注射後のクリアランスを有する、抗体。
- 請求項1〜106のいずれか1項に記載の抗体をコードする1つ以上の単離された核酸、又はLY6G6Dに結合する結合ドメインを含むその一部分。
- 請求項107に記載の1つ以上の単離された核酸を含む1つ以上のベクター。
- 請求項108に記載の1つ以上のベクターを含む1つ以上の宿主細胞。
- 請求項109に記載の1つ以上の宿主細胞であって、ここで、前記1つ以上の宿主細胞が、1つ以上の哺乳類宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項110に記載の1つ以上の宿主細胞であって、ここで、前記1つ以上の哺乳動物宿主細胞は、1つ以上のチャイニーズハムスター卵巣(CHO)宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項109に記載の1つ以上の宿主細胞であって、ここで、前記1つ以上の宿主細胞が、1つ以上の原核生物宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項112に記載の1つ以上の宿主細胞であって、ここで、前記1つ以上の原核生物宿主細胞が、1つ以上の大腸菌宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項1〜106のいずれか1項に記載の抗体を製造する方法であって、請求項109に記載の1つ以上の宿主細胞を培養液中で培養することを含む、方法。
- 請求項114に記載の方法であって、前記抗LY6G6D抗体を前記1つ以上の宿主細胞又は前記培養液から回収することをさらに含む、方法。
- 請求項1〜106のいずれか1項に記載の抗体を含む組成物。
- 請求項116に記載の組成物であって、製薬学的に許容される賦形剤又は希釈剤をさらに含む、組成物。
- 請求項117に記載の組成物であって、ここで、前記製薬学的に許容される賦形剤が緩衝剤、担体、安定剤、又は防腐剤である、組成物。
- 請求項118に記載の組成物であって、ここで、前記組成物が医薬組成物である、組成物。
- 医薬として使用するための請求項1〜106のいずれか一項に記載の抗体。
- それを必要とする被験者におけるLY6G6D陽性癌の治療すること又は進行を遅延させることにおける使用のための、請求項1〜106のいずれか一項に記載の抗体又は請求項116〜119のいずれか一項に記載の組成物。
- 請求項121の使用のための前記抗体又は組成物であって、ここで、前記LY6G6D陽性癌が結腸直腸癌である、抗体又は組成物。
- 請求項122の使用のための前記抗体又は組成物であって、ここで、前記LY6G6D陽性癌は、マイクロサテライト安定型(MSS)又は低頻度マイクロサテライト不安定性(MSI−L)のマイクロサテライト不安定性(MSI)ステータスを有する、抗体又は組成物。
- 被験者におけるLY6G6D陽性癌の進行を治療又は遅延させるための医薬の製造における、請求項1〜106及び120のいずれか一項に記載の抗体又は請求項116〜119のいずれか一項に記載の組成物の使用。
- 請求項124に記載の使用であって、ここで、前記LY6G6D陽性の癌は結腸直腸癌である、使用。
- 請求項125に記載の使用であって、ここで、前記LY6G6D陽性の癌はMSS又はMSI−LのMSIステータスを有する、使用。
- それを必要とする被験者におけるLY6G6D陽性癌の進行を治療又は遅延させる方法であって、請求項1〜106のいずれか一項に記載の抗体又は請求項116〜119のいずれか一項に記載の組成物を前記被験者に投与することを含む、方法。
- 請求項127に記載の方法であって、ここで、前記LY6G6D陽性の癌は結腸直腸癌である、方法。
- 請求項128に記載の方法であって、ここで、前記LY6G6D陽性の癌はMSS又はMSI−LのMSIステータスを有する、方法。
- 請求項1〜106のいずれか1項に記載の抗体と、被験者におけるLY6G6D陽性癌の治療又は進行を遅延させるための前記抗体の使用に関する説明書を含むパッケージインサートとを含むキット。
- 請求項130に記載のキットであって、ここで、前記LY6G6D陽性癌が結腸直腸癌である、キット。
- 請求項131に記載のキットであって、ここで、前記LY6G6D陽性の癌はMSS又はMSI−LのMSIステータスを有する、キット。
- 請求項130〜132のいずれか一項に記載のキットであって、ここで、前記被験者がヒトである、キット。
- CD3に結合する単離された抗体であって、以下のCDR:
(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(e)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(f)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR−L3、
を含む結合ドメインを含む、抗体。 - 請求項134に記載の抗体であって、ここで、前記抗体は以下:(a)配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;(b)配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;又は(c)(a)のVHと(b)のVL、を含む、抗体。
- 請求項134又は135に記載の抗体であって、ここで、前記VHは、配列番号20のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項134〜136のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VLが配列番号21のアミノ酸配列を含む、抗体。
- CD3に結合する単離された抗体であって、以下のCDR:
(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR−H1;
(b)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR−H2;
(c)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR−H3;
(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR−L1;
(e)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR−L2;及び
(f)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR−L3、
を含む結合ドメインを含む、抗体。 - 請求項138に記載の抗体であって、ここで、前記抗体は以下:(a)配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;(b)配列番号55のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;又は(c)(a)のVHと(b)のVL、を含む、抗体。
- 請求項138又は139に記載の抗体であって、ここで、前記VHは、配列番号20のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項138〜140のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VLが配列番号55のアミノ酸配列を含む、抗体。
- 請求項134、135、138、及び139のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VHが以下のFR:
(a)配列番号42のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号43のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号44のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号45のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項134、135、138、及び139のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VHが以下のFR:
(a)配列番号42のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号44のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号45のアミノ酸配列を含むFR−H4、
を含む、抗体。 - 請求項134、135、138、139、及び142のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VLが以下のFR:
(a)配列番号46のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号47のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号48のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号49のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項134、135、138、139、及び143のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記VLが以下のFR:
(a)配列番号46のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号63のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号48のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号49のアミノ酸配列を含むFR−L4、
を含む、抗体。 - 請求項134〜145のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、BIAcoreアッセイを用いて測定した場合に、37℃で約1nMから約500nMの間のKDでヒトCD3εポリペプチドを結合する、抗体。
- 請求項146に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、250nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項147に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、100nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項148に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、15nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項149に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、10nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項150に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、5nM以下のKDでヒトCD3εポリペプチドに結合する、抗体。
- 請求項134〜151のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が、モノクローナル、ヒト、ヒト化又はキメラである、抗体。
- 請求項134〜152のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体がCD3に結合する抗体断片である、抗体。
- 請求項153に記載の抗体であって、ここで、前記抗体断片が、Fab、Fab’−SH、Fv、scFv、及び(Fab’)2断片からなる群から選択される、抗体。
- 請求項134〜152のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体が完全長抗体である、抗体。
- 請求項134〜155のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗体がIgG抗体である、抗体。
- 請求項134〜156のいずれか一項に記載の抗体であって、ここで、前記抗CD3抗体が単一特異性抗体である、抗体。
- 請求項134〜157のいずれか一項に記載の抗体をコードする単離核酸、又はCD3に結合する結合ドメインを含むその一部分。
- 請求項158に記載の単離核酸を含むベクター。
- 請求項159に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項160に記載の宿主細胞であって、ここで、前記宿主細胞が哺乳類宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項161に記載の宿主細胞であって、ここで、前記哺乳動物宿主細胞がチャイニーズハムスター卵巣(CHO)宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項160に記載の宿主細胞であって、ここで、前記宿主細胞が原核生物宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項163に記載の宿主細胞であって、ここで、前記原核宿主細胞が大腸菌宿主細胞である、宿主細胞。
- 請求項134〜157のいずれか一項に記載の抗体の製造方法であって、前記方法は、請求項160に記載の宿主細胞を培養液中で培養することを含む、方法。
- 請求項165に記載の方法であって、ここで、前記方法はさらに、前記抗LY6G6D抗体を前記宿主細胞又は前記培養液から回収することを含む、方法。
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