JP2020506704A - 操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよびステビオール配糖体グルコシル化方法 - Google Patents

操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよびステビオール配糖体グルコシル化方法 Download PDF

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Abstract

本発明は、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ(GT)酵素、GT活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明は、操作されたスクロースシンターゼ(SuS)酵素、SuS活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明はまた、GT酵素を含む組成物、およびβ−グルコース結合を有する産物を作製するために操作されたGT酵素を使用する方法も提供する。本発明はさらに、レバウジオシド(例えば、レバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、およびレバウジオシドD)を産生するための組成物および方法を提供する。

Description

本出願は、全ての目的に関してその両方の全体が参照により本明細書に組み込まれる、2017年2月3日に提出された米国仮特許出願第62/454,417号および2017年3月30日に提出された米国仮特許出願第62/479,262号への優先権を主張する。
本発明は、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ(GT)酵素、GT活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明は、操作されたスクロースシンターゼ(SuS)酵素、SuS活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明はまた、GT酵素を含む組成物およびβ−グルコース結合を有する産物を作製するために操作されたGT酵素を使用する方法も提供する。本発明はさらに、レバウジオシド(例えば、レバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、およびレバウジオシドD)を産生するための組成物および方法を提供する。本発明はまた、SuS酵素を含む組成物およびそれらを使用する方法も提供する。GTおよびSuS酵素を産生する方法も提供される。
配列表、表、またはコンピュータープログラムへの言及
配列表の公式のコピーは、EFS−Webを介して、ファイル名「CX8−162WO3_ST25.txt」、作成日2018年1月24日、およびサイズ31,100キロバイトのASCIIフォーマットテキストファイルとして本明細書と同時に提出されている。EFS−Webを介して提出された配列表は、本明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
グリコシルトランスフェラーゼ(GT)は、活性化ヌクレオシド糖からグリコシル残基を単量体および多量体受容体分子(例えば、他の糖、タンパク質、脂質、および他の有機基質)に翻訳後転移させる酵素である。このように、これらの酵素は、置換されたホスフェート脱離基を含有する活性化供与体糖基質を利用する。供与体糖基質(すなわち、「グリコシル供与体」)は、一般的にヌクレオシド二リン酸糖として活性化される。しかし、ヌクレオシド一リン酸糖などの他の糖、脂質ホスフェート、および非置換ホスフェートも使用される(例えば、Lairsonら、Ann.Rev.Biochem.、77巻:25号、1〜25、35頁[2008年]を参照のこと)。GTは、基質および反応産物の立体化学に基づいて、保持型または反転型酵素として分類される。供与体のアノマー結合の立体化学が保持される反応(例えば、アルファからアルファ)では、GTは保持型酵素である。立体化学が反転する(例えば、アルファからベータ)反応では、GTは反転型酵素である。これらのグリコシル化産物は、様々な代謝経路およびプロセスに関係している。実際に、多数の二糖、オリゴ糖、および多糖の生合成は、様々なグリコシルトランスフェラーゼの作用を伴う。グルコシル部分の転移は、受容体の生物活性、溶解度、および細胞内の輸送特性を変更し得る。GTは、特定の化合物(例えば、複合糖質および配糖体)の標的化合成、ならびに異なるようにグリコシル化された薬物、生物学的プローブ、または天然産物ライブラリーの産生に使用されている。一部の方法では、複合糖質合成のためのGTの大規模使用は、大量のグリコシル供与体を必要とし、そのようなアプローチの費用を増大させる。放出されたヌクレオチドからグリコシル供与体の再合成を可能にするために、ヌクレオチド再利用システムが開発されている。これらの再利用システムはまた、反応中に形成されるヌクレオチド副産物の量も低減させ、それによってGTによって引き起こされる阻害を低減させる。それにもかかわらず、GTによる複合糖質の大規模産生にとって適した改善された方法がなおも必要である。
Lairsonら、Ann.Rev.Biochem.(2008年)77巻:25号、1〜25、35頁
本発明は、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ(GT)酵素、GT活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明は、操作されたスクロースシンターゼ(SuS)酵素、SuS活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明はまた、GT酵素を含む組成物およびβ−グルコース結合を有する産物を作製するために操作されたGT酵素を使用する方法も提供する。本発明はさらに、レバウジオシド(例えば、レバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、およびレバウジオシドD)を産生するための組成物および方法を提供する。本発明はまた、SuS酵素を含む組成物およびそれらを使用する方法も提供する。GTおよびSuS酵素を産生する方法も提供される。
本発明は、配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも90%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも91%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも92%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも93%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号44、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも94%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも95%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも96%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも97%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号44、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも98%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号44、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088に対して少なくとも99%の配列同一性を有するポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088から選択されるポリペプチドを含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ベータ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼおよびベータ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼから選択される。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ウラシル−二リン酸以外の糖供与体を優先的に使用する。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、表2.1、3.1、5.1、6.1、6.3、8.1、9.1、9.2、9.4、11.1、12.1、14.1、15.1、15.2、15.3、16.1、17.1、43.1、43.2、44.2、45.1、45.3、46.1、46.2、46.3、47.1、47.2、47.3、48.1、48.2、49.1、49.3、50.1、50.2、50.3、50.4、51.1、51.2、52.1、53.1、53.3、54.1、54.2、54.3、55.1、55.2、55.3、56.1、56.2、56.3、57.1、58.1、58.2、58.3、59.1、59.3、59.3、60.1、60.2、61.1、61.2、62.1、62.2、63.1、63.2、64.1、64.2、65.1、65.2、66.1、66.2、67.1、67.2、67.3、68.1、68.2、69.1、69.2、70.1、70.2、71.1、71.2、71.3、72.1、72.2、72.3、73.1、73.2、74.1、74.2、74.3,75.1、75.2、75.3、77.1、および/または77.2に提供される操作された改変体グリコシルトランスフェラーゼを含む。本発明は、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、22、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、3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6596、6598、6600、6602、6604、6606、6608、6610、6612、6614、6616、6618、6620、6622、6624、6626、6628、6630、6632、6634、6636、6638、6640、6642、6644、6646、6648、6650、6652、6654、6656、6658、6660、6662、6664、6666、6668、6670、6672、6674、6676、6678、6680、6682、6684、6686、6688、6690、6692、6694、6696、6698、6700、6702、6704、6706、6708、6710、6712、6714、6716、6718、6720、6722、6724、6726、6728、6730、6732、6734、6736、6738、6740、6742、6744、6746、6748、6750、6752、6754、6756、6758、6760、6762、6764、6766、6768、6770、6772、6774、6776、6778、6780、6782、6784、6786、6788、6790、6792、6794、6796、6798、6800、6802、6804、6806、6808、6810、6812、6814、6816、6818、6820、6822、6824、6826、6828、6830、6832、6834、6836、6838、6840、6842、6844、6846、6848、6850、6852、6854、6856、6858、6860、6862、6864、6866、6868、6870、6872、6874、6876、6878、6880、6882、6884、6886、6888、6890、6892、6894、6896、6898、6900、6902、6904、6906、6908、6910、6912、6914、6916、6918、6920、6922、6924、6926、6928、6930、6932、6934、6936、6938、6940、6942、6944、6946、6948、6950、6952、6954、6956、6958、6960、6962、6964、6966、6968、6970、6972、6974、6976、6978、6980、6982、6984、6986、6988、6990、6992、6994、6996、6998、7000、7002、7004、7006、7008、7010、7012、7014、7016、7018、7020、7022、7024、7026、7028、7030、7032、7034、7036、7038、7040、7042、7044、7046、7048、7050、7052、7054、7056、7058、7060、7062、7064、7066、7068、7070、7072、7074、7076、7078、7080、7082、7084、7086、7088、7090、7092、7094、7096、7098、7100、7102、7104、7106、7108、7110、7112、7114、7116、7118、7120、7122、7124、7126、7128、7130、7132、7134、7136、7138、7140、7142、7144、7146、7148、7150、7152、7154、7156、7158、7160、7162、7164、7166、7168、7170、7172、7174、7176、7178、7180、7182、7184、7186、7188、7190、7192、7194、7196、7198、7200、7202、7204、7206、7208、7210、7212、7214、7216、7218、7220、7222、7224、7226、7228、7230、7232、7234、7236、7238、7240、7242、7244、7246、7248、7250、7252、7254、7256、7258、7260、7262、7264、7266、7268、7270、7272、7274、7276、7278、7280、7282、7284、7286、7288、7290、7292、7294、7296、7298、7300、7302、7304、7306、7308、7310、7312、7314、7316、7318、7320、7322、7324、7326、7328、7330、7332、7334、7336、7338、7340、7342、7344、7346、7348、7350、7352、7354、7356、7358、7360、7362、7364、7366、7368、7370、7372、7374、7376、7378、7380、7382、7384、7386、7388、7390、7392、7394、7396、7398、7400、7402、7404、7406、7408、7410、7412、7414、7416、7418、7420、7422、7424、7426、7428、7430、7432、7434、7436、7766、7768、7770、7772、7774、7776、7778、7780、7782、7784、7786、7788、7790、7792、7794、7796、7798、7800、7812、7814、7816、7818、7820、7822、7824、7826、7828、7830、7832、7834、7836、7838、7840、7842、7844、7846、7848、7850、7852、7854、7856、7858、7860、7862、7864、7866、7868、7870、7872、7874、7876、7878、7880、7882、7884、7886、7888、7890、7892、7894、7896、7898、7900、7902、7904、7906、7908、7910、7912、7914、7916、7918、7920、7922、7924、7926、7928、7930、7932、7934、7936、7938、7940、7942、7944、7946、7948、7950、7952、7954、7956、7958、7960、7962、7964、7966、7968、7970、7972、7974、7976、7978、7980、7982、7984、7986、7988、7990、7992、7994、7996、7998、8000、8002、8004、8006、8008、8010、8012、8014、8016、8018、8020、8022、8024、8026、8028、8030、8032、8034、8036、8038、8040、8042、8044、8046、8048、8050、8052、8054、8056、8058、8060、8062、8064、8066、8068、8070、8072、8074、8076、8078、8080、8082、8084、8086、8088、8090、8092、8094、8096、8098、8100、8102、8104、8106、8108、8110、8112、8114、8116、8118、8120、8122、8124、8126、8128、8130、8132、8134、8136、8138、8140、8142、8144、8146、8148、8150、8152、8154、8156、8158、8160、8162、8164、8166、8168、8170、8172、8174、8176、8178、8180、8182、8184、8186、8188、8190、8192、8194、8196、8198、8200、8202、8204、8206、8208、8210、8212、8214、8216、8218、8220、8222、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330、8332、8334、8336、8338、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366、8368、8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528、8530、8532、
8534、8536、8538 ,8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、8624、8626、8628、8630、8632、8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220、9222、9224、9226、9228、9230、9232、9234、9236、9238、および/または9240に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供する。
一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、10、10/309、262、278/284/311/339/360、283、307、309、339/361、344/361、および361から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、10−/309R、262K、262L、278L/284I/311G/339A/360G、283T、307V、309L/N/R/S、339A/361G、344I/361G、および361Gから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4を参照して番号付けられている。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、R10−/V309R、R262K、R262L、Y278L/T284I/R311G/V339A/N360G、S283T、L307V、V309L/N/R/S、V339A/S361G、V344I/S361G、およびS361Gから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4を参照して番号付けられている。さらに一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、および/または30のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、および/または30のいずれかに対して少なくとも同一である配列を含む。なお一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、および/または30を含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、112/172/283/318、112/261/318、112/282/283/431、137/283、137/283/431、163/318、261/283/306/337、261/283/337、261/337、269/318、282/283、282/283/431、283、283/306/308/360、283/306/337/426、283/318/337/360、283/360、318、360および431から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号8を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、112S/172S/283Q/318E、112S/261S/318E、112S/282T/283Q/431E、137K/283Q、137K/283Q/431E、163K/318E、261S/283Q/306V/337F、261S/283Q/337F、261S/337S、269T/318E、282T/283Q、282T/283Q/431E、283Q、283Q/306V/308S/360G、283Q/306V/337S/426V、283Q/318E/337S/360G、283Q/360G、318E、360Gおよび431Eから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8を参照して番号付けられている。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E112S/T172S/T283Q/T318E、 E112S/R261S/T318E、E112S/S282T/T283Q/Q431E、N137K/T283Q、N137K/T283Q/Q431E、 L163K/T318E、R261S/T283Q/L306V/W337F、 R261S/T283Q/W337F、 R261S/W337S、Q269T/T318E、S282T/T283Q、S282T/T283Q/Q431E、 T283Q、T283Q/L306V/R308S/S360G、T283Q/L306V/W337S/A426V、T283Q/T318E/W337S/S360G、T283Q/S360G、T318E、S360GおよびQ431Eから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8を参照して番号付けられている。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、および/または70のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、および/または70のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、および/または70を含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、4、6、22、64、74、84、87、97、106、110、112、137、139、154、159、169、179、191、195、198、199、207、233、259、261、262、306、347、356、396、417、421、427、および435から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号32を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。なお一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、4P、6P、22A/L/H/P、64P、74W、84A/G、87A/H、97S、106D/G/S/T、110S、112A/P、137G、139P、154A/L/Q/V、159M/R、169T、179V、191R、195G、198M/S/V、199A/D/G/K/Q/S、207L、233R、259Q、261A/H/P/W、262G、306V、347D、356G、396R、417A/R/P、421V、427Aおよび435Q/Rから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号32を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、K4P、E6P、Q22A/L/H/P、F64P、R74W、L84A/G、M87A/H、A97S、L106D/G/S/T、A110S、E112A/P、N137G、R139P、H154A/L/Q/V、Q159M/R、 D169T、S179V、S191R、N195G、I198M/S/V、 L199A/D/G/K/Q/S、I207L、I233R、H259Q、R261A/H/P/W、T262G、L306V、G347D、S356G、Y396R、E417A/R/P、Y421V、R427AおよびV435Q/Rから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号32を参照して番号付けられている。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、22/84/87/154/198/199/356、22/84/87/154/198/199/306/356、22/84/87/154/199/306/356、 22/84/87/154/356、22/84/87/154/198/199/306/356、22/84/87/154/199/306/356、22/84/87/198/199/306/356、22/84/87/198/199/356、22/84/87/198/199/306/356、 22/84/87/198/199/356、22/84/87/199/306/356、22/84/87/199/356、22/84/154/198/199/207/306、22/84/154/198/199/306、22/84/154/198/199/356、22/84/154/198/199/356、22/84/154/198/199/356、22/84/154/199/356、22/84/154/199/207、22/84/154/199/356、22/84/154/207/306/356、22/84/154/306/356、22/84/154/198/199/306/356、22/84/154/198/199、22/84/154/198/199/306/356、22/84/154/199/306/356、22/84/154/199/356、22/84/154/199/356、22/84/198/199/306/356、22/84/199/356、22/84/207/356、22/84/356、22/84/154/198/199/306/356、22/87/154/198/199/356、22/87/154/199/306/356、22/87/154/322/356、22/87/154/198/199/356、22/87/154/199/356、22/87/154/198/199/207/306/356、22/87/154/199/207/356、22/87/154/199/356、22/87/154/199/306/356、22/87/198/199/306/356、22/87/198/199/306/356、22/87/198/199/207/356、22/87/198/199/356、22/87/199/356、22/87/199/356、22/154/198/199/207/306/356、22/154/198/199/356、22/154/199/356、22/154/198/199/306/356、22/154/199/356、22/154/199/207/306/356、22/198/199/356、22/198/199/207/329/356、22/199/356、22/207/356、22/356および84/154/198/199から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号32を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、22P/84G/87H/154L/198S/199A/356G、22P/84G/87H/154L/198S/199S/306V/356G、22P/84G/87H/154L/199K/306V/356G、22P/84G/87H/154L/356G、22P/84G/87H/154V/198S/199S/306V/356G、22P/84G/87H/154V/199K/306V/356G、22P/84G/87H/198S/199A/306V/356G、22P/84G/87H/198S/199K/356G、22P/84G/87H/198S/199S/306V/356G、22P/84G/87H/198S/199S/356G、22P/84G/87H/199A/306V/356G、22P/84G/87H/199S/356G、22P/84G/154L/198S/199A/207L/306V、22P/84G/154L/198S/199A/306V、22P/84G/154L/198S/199A/356G、22P/84G/154L/198S/199K/356G、22P/84G/154L/198S/199S/356G、22P/84G/154L/199A/356G、22P/84G/154L/199K/207L、22P/84G/154L/199S/356G、22P/84G/154L/207L/306V/356G、22P/84G/154L/306V/356G,22P/84G/154V/198S/199A/306V/356G、22P/84G/154V/198S/199K、22P/84G/154V/198S/199K/306V/356G、22P/84G/154V/199A/306V/356G、22P/84G/154V/199A/356G、22P/84G/154V/199S/356G、22P/84G/198S/199K/306V/356G、22P/84G/199S/356G、22P/84G/207L/356G、22P/84G/356G、22P/84V/154V/198S/199S/306V/356G、22P/87H/154L/198S/199K/356G、22P/87H/154L/199A/306V/356G、22P/87H/154L/322S/356G、22P/87H/154V/198S/199K/356G、22P/87H/154V/199S/356G、22P/87H/154V/198S/199S/207L/306V/356G、22P/87H/154V/199A/207L/356G、22P/87H/154V/199K/356G、22P/87H/154V/199S/306V/356G、22P/87H/198S/199A/306V/356G、22P/87H/198S/199K/306V/356G、22P/87H/198S/199S/207L/356G、22P/87H/198S/199K/356G、22P/87H/199A/356G、22P/87H/199K/356G、22P/154L/198S/199A/207L/306V/356G、22P/154L/198S/199A/356G、22P/154L/199A/356G、22P/154V/198S/199S/306V/356G、22P/154V/199A/356G、22P/154V/199K/207L/306V/356G、22P/198S/199A/356G、22P/198S/199K/207L/329C/356G、22P/199A/356G、22P/207L/356G、22P/356Gおよび84G/154L/198S/199Kから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号32を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Q22P/L84G/M87H/H154L/I198S/L199A/S356G、Q22P/L84G/M87H/H154L/I198S/L199S/L306V/S356G、Q22P/L84G/M87H/H154L/L199K/L306V/S356G、 Q22P/L84G/M87H/H154L/S356G、Q22P/L84G/M87H/H154V/I198S/L199S/L306V/S356G、Q22P/L84G/M87H/H154V/L199K/L306V/S356G、Q22P/L84G/M87H/I198S/L199A/L306V/S356G、 Q22P/L84G/M87H/I198S/L199K/S356G、Q22P/L84G/M87H/I198S/L199S/L306V/S356G、Q22P/L84G/M87H/I198S/L199S/S356G、Q22P/L84G/M87H/L199A/L306V/S356G、Q22P/L84G/M87H/L199S/S356G、Q22P/L84G/H154L/I198S/L199A/I207L/L306V、Q22P/L84G/H154L/I198S/L199A/L306V、Q22P/L84G/H154L/I198S/L199A/S356G、Q22P/L84G/H154L/I198S/L199K/S356G、Q22P/L84G/H154L/I198S/L199S/S356G、Q22P/L84G/H154L/L199A/S356G、Q22P/L84G/H154L/L199K/I207L、Q22P/L84G/H154L/L199S/S356G、Q22P/L84G/H154L/I207L/L306V/S356G、Q22P/L84G/H154L/L306V/S356G、Q22P/L84G/H154V/I198S/L199A/L306V/S356G、Q22P/L84G/H154V/I198S/L199K、Q22P/L84G/H154V/I198S/L199K/L306V/S356G、Q22P/L84G/H154V/L199A/L306V/S356G、Q22P/
L84G/H154V/L199A/S356G、Q22P/L84G/H154V/L199S/S356G、Q22P/L84G/I198S/L199K/L306V/S356G、Q22P/L84G/L199S/S356G、Q22P/L84G/I207L/S356G、Q22P/L84G/S356G、Q22P/L84V/H154V/I198S/L199S/L306V/S356G、Q22P/M87H/H154L/I198S/L199K/S356G、Q22P/M87H/H154L/L199A/L306V/S356G、Q22P/M87H/H154L/P322S/S356G、Q22P/M87H/H154V/I198S/L199K/S356G、Q22P/M87H/H154V/L199S/S356G、Q22P/M87H/H154V/I198S/L199S/I207L/L306V/S356G、Q22P/M87H/H154V/L199A/I207L/S356G、Q22P/M87H/H154V/L199K/S356G、Q22P/M87H/H154V/L199S/L306V/S356G、Q22P/M87H/I198S/L199A/L306V/S356G、Q22P/M87H/I198S/L199K/L306V/S356G、Q22P/M87H/I198S/L199S/I207L/S356G、Q22P/M87H/I198S/L199K/S356G、Q22P/M87H/L199A/S356G、Q22P/M87H/L199K/S356G、Q22P/H154L/I198S/L199A/I207L/L306V/S356G、Q22P/H154L/I198S/L199A/S356G、Q22P/H154L/L199A/S356G、Q22P/H154V/I198S/L199S/L306V/S356G、Q22P/H154V/L199A/S356G、Q22P/H154V/L199K/I207L/L306V/S356G、Q22P/I198S/L199A/S356G、Q22P/I198S/L199K/I207L/G329C/S356G、Q22P/L199A/S356G、Q22P/I207L/S356G、Q22P/S356GおよびL84G/H154L/I198S/L199Kから選択される少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号32を参照して番号付けられている。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346および1290のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346および1290のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346および1290のいずれかを含む。
本発明はさらに、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、64/106/109/112/131/159/233/421/427/431、64/106/109/112/417/421/427/431、64/106/109/139/179/417/421/427/431、64/106/109/233/347/427/431、64/106/112/347/417/421、64/106/139/179/233/417/427/431、64/106/417/421、64/106/431、64/106/109/112/131/179/417/427/431、64/106/109/417/421/427/431/439、64/106/112/139/159/179/204/396/417、64/106/112/159/179/417/421、64/106/204/417/421/427、64/109/112/139/159/179/417/431、64/109/112/139/417、 64/109/139/233/417/421、64/109/159/179/204/233/417/421、64/109/417/421、64/109/417/421、64/139/233/417/427/431/439、64/139/347/417/421/427/431、64/417/421/431、106/109/112/131/159/179/417/421、106/109/112/131/159/204/347/417/421/427、106/109/112/204/347/421/439、106/109/112/261/417/431、106/109/112/347/427、106/109/139/427/431、106/109/417/421/427、106/112/159/204/233/417/421/427/431、106/112/233/417、106/112/396/417/421、106/139/159/233/347/417/421/427/431、106/233/421/427、106/417、106/109/139/347/417/421/427、106/109、106/109/139/233/417/421、106/109/139/417、106/109/233/427/431、106/112/159/179/204/417/421、106/112/159/179/233/417/421/427/439、106/131/179/233/421/427/431、106/139/421、106/347/417/427/431、109/112/131/159/179/439、109/112/131/159/417/421、109/112/139/179/417/427、109/112/159/179/417/421、109/112/159/417/427、109/112/179/204/233/417/421/427、109/112/179/347/417、109/112/204/233/417、109/112/204/427、109/112/233/417/431、109/112/417/421/427、109/112/417/427/431、109/131/139/179/261/396/421、109/131/204、109/139/179/417/421/427、109/139/179/417/427、109/179/233/421、109/204/417/431、109/417/421、109/417/427/431、112/131/179/204/417/421/427、112/131/179/347/417/421、112/139/179/204/233/347/427、112/159/417/421、112/417/421、131/179/233/417/427、139/233/417、159/347/417/421/431、179/417/421、233/417/421/427/431および347/417から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号232を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、64P/106S/109R/112P/131P/159R/233R/421V/427L/431D、64P/106S/109R/112P/417A/421V/427A/431D、64P/106S/109R/139P/179L/417R/421V/427L/431D、64P/106S/109R/233R/347D/427A/431D、64P/106S/112P/347D/417A/421V、64P/106S/139P/179L/233R/417A/427A/431D、64P/106S/417R/421V、64P/106S/431D、64P/106T/109R/112P/131P/179L/417R/427A/431D、64P/106T/109R/417A/421V/427L/431D/439P、64P/106T/112P/139P/159R/179V/204D/396R/417A、64P/106T/112P/159R/179L/417R/421V、64P/106T/204D/417A/421V/427A、64P/109R/112P/139P/159R/179L/417R/431D、64P/109R/112P/139P/417A、64P/109R/139P/233R/417R/421V、64P/109R/159R/179V/204D/233R/417R/421V、64P/109R/417A/421V、64P/109R/417R/421V、64P/139P/233R/417R/427L/431D/439P、64P/139P/347D/417R/421V/427L/431D、64P/417R/421V/431D、 106S/109R/112P/131P/159R/179L/417A/421V、106S/109R/112P/131P/159R/204D/347D/417A/421V/427L、106S/109R/112P/204D/347D/421V/439P、106S/109R/112P/261P/417R/431D、106S/109R/112P/347D/427A、106S/109R/139P/427A/431D、106S/109R/417R/421V/427L、106S/112P/159R/204D/233R/417R/421V/427A/431D、106S/112P/233R/417R、106S/112P/396R/417R/421V、106S/139P/159R/233R/347D/417R/421V/427A/431D、106S/233R/421V/427A、106S/417A、106T/109R/139P/347D/417A/421V/427A、106T/109R、106T/109R/139P/233R/417R/421V、106T/109R/139P/417R、106T/109R/233R/427A/431D、106T/112P/159R/179L/204D/417A/421V、 106T/112P/159R/179V/233R/417A/421V/427L/439P、106T/131P/179L/233R/421V/427L/431D、 106T/139P/421V、106T/347D/417R/427A/431D、109R/112P/131P/159R/179V/439P、109R/112P/131P/159R/417R/421V、109R/112P/139P/179V/417R/427A、109R/112P/159R/179V/417R/421V、109R/112P/159R/417R/427L、109R/112P/179V/204D/233R/417A/421V/427L、109R/112P/179V/347D/417R、109R/112P/204D/233R/417R、109R/112P/204D/427A、109R/112P/233R/417A/431D、109R/112P/417A/421V/427L、109R/112P/417A/427A/431D、109R/131P/139P/179V/261P/396R/421V、109R/131P/204D、 109R/139P/179L/417R/421V/427A、109R/139P/179L/417R/427L、109R/179V/233R/421V、109R/204D/417R/431D、109R/417R/421V、109R/417R/427A/431D、112P/131P/179V/204D/417R/421V/427L、112P/131P/179L/347D/417R/421V、112P/139P/179V/204D/233R/347D/427L、112P/159R/417R/421V、112P/417R/421V、131P/179L/233R/417R/427A、139P/233R/417A、159R/347D/417A/421V/431D、179V/417R/421V、233R/417R/421V/427L/
431Dおよび347D/417Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号232を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、F64P/L106S/L109R/E112P/S131P/Q159R/I233R/Y421V/R427L/Q431D、F64P/L106S/L109R/E112P/E417A/Y421V/R427A/Q431D、F64P/L106S/L109R/R139P/S179L/E417R/Y421V/R427L/Q431D、F64P/L106S/L109R/I233R/G347D/R427A/Q431D、 F64P/L106S/E112P/G347D/E417A/Y421V、F64P/L106S/R139P/S179L/I233R/E417A/R427A/Q431D、F64P/L106S/E417R/Y421V、F64P/L106S/Q431D、F64P/L106T/L109R/E112P/S131P/S179L/E417R/R427A/Q431D、F64P/L106T/L109R/E417A/Y421V/R427L/Q431D/K439P、F64P/L106T/E112P/R139P/Q159R/S179V/G204D/Y396R/E417A、F64P/L106T/E112P/Q159R/S179L/E417R/Y421V、F64P/L106T/G204D/E417A/Y421V/R427A、F64P/L109R/E112P/R139P/Q159R/S179L/E417R/Q431D、F64P/L109R/E112P/R139P/E417A、F64P/L109R/R139P/I233R/E417R/Y421V、F64P/L109R/Q159R/S179V/G204D/I233R/E417R/Y421V、F64P/L109R/E417A/Y421V、F64P/L109R/E417R/Y421V、F64P/R139P/I233R/E417R/R427L/Q431D/K439P、F64P/R139P/G347D/E417R/Y421V/R427L/Q431D、F64P/E417R/Y421V/Q431D、L106S/L109R/E112P/S131P/Q159R/S179L/E417A/Y421V、L106S/L109R/E112P/S131P/Q159R/G204D/G347D/E417A/Y421V/R427L、L106S/L109R/E112P/G204D/G347D/Y421V/K439P、L106S/L109R/E112P/R261P/E417R/Q431D、 L106S/L109R/E112P/G347D/R427A、L106S/L109R/R139P/R427A/Q431D、L106S/L109R/E417R/Y421V/R427L、L106S/E112P/Q159R/G204D/I233R/E417R/Y421V/R427A/Q431D、L106S/E112P/I233R/E417R、L106S/E112P/Y396R/E417R/Y421V、L106S/R139P/Q159R/I233R/G347D/E417R/Y421V/R427A/Q431D、L106S/I233R/Y421V/R427A、L106S/E417A、L106T/L109R/R139P/G347D/E417A/Y421V/R427A、L106T/L109R、L106T/L109R/R139P/I233R/E417R/Y421V、L106T/L109R/R139P/E417R、L106T/L109R/I233R/R427A/Q431D、L106T/E112P/Q159R/S179L/G204D/E417A/Y421V、L106T/E112P/Q159R/S179V/I233R/E417A/Y421V/R427L/K439P、L106T/S131P/S179L/I233R/Y421V/R427L/Q431D、L106T/R139P/Y421V、L106T/G347D/E417R/R427A/Q431D、L109R/E112P/S131P/Q159R/S179V/K439P、L109R/E112P/S131P/Q159R/E417R/Y421V、L109R/E112P/R139P/S179V/E417R/R427A、L109R/E112P/Q159R/S179V/E417R/Y421V、L109R/E112P/Q159R/E417R/R427L、L109R/E112P/S179V/G204D/I233R/E417A/Y421V/R427L、L109R/E112P/S179V/G347D/E417R、L109R/E112P/G204D/I233R/E417R、L109R/E112P/G204D/R427A、L109R/E112P/I233R/E417A/Q431D、L109R/E112P/E417A/Y421V/R427L、L109R/E112P/E417A/R427A/Q431D、L109R/S131P/R139P/S179V/R261P/Y396R/Y421V、L109R/S131P/G204D、L109R/R139P/S179L/E417R/Y421V/R427A、L109R/R139P/S179L/E417R/R427L、L109R/S179V/I233R/Y421V、L109R/G204D/E417R/Q431D、L109R/E417R/Y421V、L109R/E417R/R427A/Q431D、E112P/S131P/S179V/G204D/E417R/Y421V/R427L、E112P/S131P/S179L/G347D/E417R/Y421V、E112P/R139P/S179V/G204D/I233R/G347D/R427L、E112P/Q159R/E417R/Y421V、E112P/E417R/Y421V、S131P/S179L/I233R/E417R/R427A、R139P/I233R/E417A、Q159R/G347D/E417A/Y421V/Q431D、S179V/E417R/Y421V、I233R/E417R/Y421V/R427L/Q431DおよびG347D/E417Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号232を参照して番号付けられている。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374 376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、および/または498のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374 376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、および/または498のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374 376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、および/または498のいずれかを含む。
本発明はさらに、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、106/112/204/347/396/417、106/112/204/347/396/417/427、106/112/204/347/396/417/427/431、112/204/347/396/417/427、112/204/347/396/417/427/431、および204/347/396/417/431から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号348を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供する。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、106S/112P/204D/347D/396Y/417R、106S/112P/204D/347D/396Y/417R/427A、106S/112P/204D/347D/396Y/417R/427A/431D、112P/204D/347D/396Y/417R/427A、112P/204D/347D/396Y/417R/427A/431Dおよび204D/347D/396Y/417R/431Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号348を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、L106S/E112P/G204D/G347D/R396Y/E417R、L106S/E112P/G204D/G347D/R396Y/E417R/R427A、L106S/E112P/G204D/G347D/R396Y/E417R/R427A/Q431D、E112P/G204D/G347D/R396Y/E417R/R427A、E112P/G204D/G347D/R396Y/E417R/R427A/Q431DおよびG204D/G347D/R396Y/E417R/Q431Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号348を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、および/または510のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、および/または510のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、および/または510を含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、14/100、28/44/365/407、38/118/290/351/375/401/422、38/178/401、38/290/351/401/422、54/413、74/102/137/161/259/289、92/118、98/233、102/161/250/435、110/222/250/259/435、118/156/178/290/375/401/422、137/161/435、137/169、159/169/173/300/424/438、185/290/401/422、290/351/401および435/438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号348を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14V/100F、28M/44V/365I/407E、38R/118A/290E/351G/375P/401L/422M、38R/178V/401L、38R/290E/351G/401L/422M、54P/413L、74W/102K/137G/161L/259S/289S、92L/118A、98P/233W、102K/161L/250A/435E、110G/222R/250R/259P/435G、118A/156A/178V/290E/375P/401L/422M、137G/161L/435R、137G/169G、159M/169S/173G/300Q/424E/438A、185R/290E/401L/422M、290E/351G/401Lおよび435Q/438Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号348を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、I14V/L100F、I28M/I44V/V365I/A407E、K38R/S118A/D290E/A351G/D375P/W401L/I422M、K38R/A178V/W401L、K38R/D290E/A351G/W401L/I422M、T54P/V413L、R74W/R102K/N137G/D161L/H259S/K289S、I92L/S118A、D98P/I233W、R102K/D161L/T250A/V435E、A110G/K222R/T250R/H259P/V435G、S118A/S156A/A178V/D290E/D375P/W401L/I422M、N137G/D161L/V435R、N137G/D169G、Q159M/D169S/R173G/D300Q/Q424E/M438A、K185R/D290E/W401L/I422M、D290E/A351G/W401LおよびV435Q/M438Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号348を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、222、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、および/または548のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、222、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、および/または548のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、222、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、および/または548のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、14/28/38/74/100/102/118/161/169/178/233/250/407/422/438、14/28/38/74/102/156/159/233/250/289/413/422/424/435/438、 14/28/38/100/102/110/159/161/233/259/290/300/351/435、14/28/38/110/137/161/222/289/401、14/28/44/74/98/102/137/159/161/185/222/250、14/28/44/92、14/28/44/161/169、14/28/44/375、14/28/54/161/185/413、14/28/54/365、14/28/74/98/100/102/161/173/178/233/250/259/290/407、14/28/92/100/102/159/161/169/233、14/28/92/100/102/159/161/233/351/422、14/28/92/100/102/422/424/435、14/28/92/100/161/222/233/289/300、14/28/100/137/156/161/222/259/289/365/401/435/438、14/28/100/156/161/250、14/28/102/118/137/161/185/222/250/259/401、14/28/159/289/290/300、14/28/159/365/435、14/28/35、14/38/74/110/156/161/173/178/222/300、14/38/100/102/161/173/178/222/250/375/401/413、44/74/100/102/161/233/365/435/438、14/74/110/159/161/169/173/250/259/290/375/407/422、14/74/161/375/401、14/92/98/100/159/161/259/365/422/424/435、14/110/156/161/375/401/435/438、14/159/161/365/435/438、14/161/222/250/259/289/375/401/413、14/161/222/250/435/438、14/161/300、28、28/38/92/98/100/102/156/161、28/44/74/401、28/44/92/161/222/300/413、28/44/98/100/102/118、28/44/118/156/161/222/289/435/M438、28/44/289/290/351/422、28/44/435/438、28/54/92/159/161/290、28/54/159/290/438、28/54/250/439、28/74/156/159/161/178/300/365/435/438、28/74/156/161/365/407、 28/74/161/290/365、28/92/100/102/110/161/185/250/300/375/435、28/92/98/100/110/156/161/401、28/92/118/159/222/250/259/300/407、28/156/161/185/435/438、28/156/161/233/259/300/435、 28/98/100/102/161/185/351/401/435/438、38/161/300/438、74/98/100/102/110/118/161/178/250/289/290/300/435/438、74/98/100/102/118/156/159/161/435/438、74/156/161/173/178/424/435、74/375/435、98/100/118/159/161/300、98/100/156/159/161/178/259/289/290/351/422、102/137/159/161/422/424、118、137/159/161/185/300/351/365/435、156/159/161/169、159/161/222/290/375/407、159/161/401および 161/259/289/435/438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号548を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14V/28M/38R/74/100F/102K/118A/161L/169G/178V/233W/250R/407E/422M/438A、14V/28M/38R/74W/102K/156A/159M/233W/250A/289S/413L/422M/424E/435R/438A、14V/28M/38R/100F/102K/110G/159M/161L/233W/259S/290E/300Q/351G/435Q、14V/28M/38R/110G/137G/161L/222R/289S/401L、14V/28M/44V/74W/98P/102K/137G/159M/161L/185R/222R/250A、14V/28M/44V/92L、14V/28M/44V/161L/169S、14V/28M/44V/375P、14V/28M/54P/161L/185R/413L、14V/28M/54P/365I、14V/28M/74W/98P/100F/102K/161L/173G/178V/233W/250A/259S/290E/407E、14V/28M/92L/100F/102K/159M/161L/169S/233W、14V/28M/92L/100F/102K/159M/161L/233W/351G/422M、14V/28M/92L/100F/102K/422M/424E/435Q、14V/28M/92L/100F/161L/222R/233W/289S/300Q、14V/28M/100F/137G/156A/161L/222R/259S/289S/365I/401L/435R/438A、14V/28M/100F/156A/161L/250R、14V/28M/102K/118A/137G/161L/185R/222R/250R/259P/401L、14V/28M/159M/289S/290E/300Q、14V/28M/159M/365I/435Q、14V/28M/351G、14V/38R/74W/110G/156A/161L/173G/178V/222R/300Q、14V/38R/100F/102K/161L/173G/178V/222R/250R/375P/401L/413L、44V/74W/100F/102K/161L/I33W/365I/435G/438A、14V/74W/110G/159M/161L/169G/173G/250A/259P/290E/375P/407E/422M、14V/74W/161L/375P/401L、14V/92L/98P/100F/159M/161L/259P/365I/422M/424E/435R、14V/110G/156A/161L/375P/401L/435EM438A、14V/159M/161L/365I/435E/438A、14V/161L/222R/250R/259S/289S/375P/401L/413L、14V/161L/222R/250R/435Q/438A、14V/161L/300Q、28M、28M/38R/92L/98P/100F/102K/156A/161L、28M/44V/74W/401L、28M/44V/92L/161L/222R/300Q/413L、28M/44V/98P/100F/102K/118A、28M/44V/118A/156A/161L/222R/289S/435Q/438A、28M/44V/289S/290E/351G/422M、28M/44V/435R/438A、28M/54P/92L/159M/161L/290E、28M/54P/159M/290E/438A、28M/54P/250R/439N 28M/74W/156A/159M/161L/178V/300Q/365I/435Q/438A、28M/74W/156A/161L/365I/407E、28M/74W/161L/290E/365I、28M/92L/98P/100F/110G/156A/161L/401L、28M/92L/100F/102K/110G/161L/185R/250A/300Q/375P/435Q、28M/92L/118A/159M/222R/250R/259P/300Q/407E、28M/98P/100F/102K/161L/185R/351G/401L/435E/438A、28M/156A/161L/185R/435R/438A、28M/156A/161L/233W/259S/300Q/435R、38R/161L/300Q/438A、74W/98P/100F/102K/110G/118A/161L/178V/250R/289S/290E/300Q/435E/438A、74W/98P/100F/102K/118A/156A/159M/161L/435E/438A、74W/156A/161L/173G/178V/424E/435E、74W/375P/435G、98P/100F/118A/159M/161L/300Q、98P/100F/156A/159M/161L/178V/259S/289S/290E/351G/422M、102K/137G/159M/161L/422M/424E、118A、137G/159M/161L/185R/300Q/351G/365I/435Q、156A/159M/161L/169S、159M/161L/222R/290E/375P/407E、159M/161L/401Lおよび161L/259S/
289S/435R/438Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号548を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、I14V/I28M/K38R/R74W/L100F/R102K/S118A/D161L/D169G/A178V/I233W/T250R/A407E/I422M/M438A、I14V/I28M/K38R/R74W/R102K/S156A/Q159M/I233W/T250A/K289S/V413L/I422M/Q424E/V435R/M438A、I14V/I28M/K38R/L100F/R102K/A110G/Q159M/D161L/I233W/H259S/D290E/D300Q/A351G/V435Q、I14V/I28M/K38R/A110G/N137G/D161L/K222R/K289S/W401L、I14V/I28M/I44V/R74W/D98P/R102K/N137G/Q159M/D161L/K185R/K222R/T250A、I14V/I28M/I44V/I92L、I14V/I28M/I44V/D161L/D169S、I14V/I28M/I44V/D375P、I14V/I28M/T54P/D161L/K185R/V413L、I14V/I28M/T54P/V365I、I14V/I28M/R74W/D98P/L100F/R102K/D161L/R173G/A178V/I233W/T250A/H259S/D290E/A407E、I14V/I28M/I92L/L100F/R102K/Q159M/D161L/D169S/I233W、I14V/I28M/I92L/L100F/R102K/Q159M/D161L/I233W/A351G/I422M、I14V/I28M/I92L/L100F/R102K/I422M/Q424E/V435Q、I14V/I28M/I92L/L100F/D161L/K222R/I233W/K289S/D300Q、I14V/I28M/L100F/N137G/S156A/D161L/K222R/H259S/K289S/V365I/W401L/V435R/M438A、I14V/I28M/L100F/S156A/D161L/T250R、I14V/I28M/R102K/S118A/N137G/D161L/K185R/K222R/T250R/H259P/W401L、I14V/I28M/Q159M/K289S/D290E/D300Q、 I14V/I28M/Q159M/V365I/V435Q、I14V/I28M/A351G、I14V/K38R/R74W/A110G/S156A/D161L/R173G/A178V/K222R/D300Q、I14V/K38R/L100F/R102K/D161L/R173G/A178V/K222R/T250R/D375P/W401L/V413L、I44V/R74W/L100F/R102K/D161L/I233W/V365I/V435G/M438A、I14V/R74W/A110G/Q159M/D161L/D169G/R173G/T250A/H259P/D290E/D375P/A407E/I422M、I14V/R74W/D161L/D375P/W401L、I14V/I92L/D98P/L100F/Q159M/D161L/H259P/V365I/I422M/Q424E/V435R、I14V/A110G/S156A/D161L/D375P/W401L/V435E/M438A、I14V/Q159M/D161L/V365I/V435E/M438A、I14V/D161L/K222R/T250R/H259S/K289S/D375P/W401L/V413L、I14V/D161L/K222R/T250R/V435Q/M438A、I14V/D161L/D300Q、I28M、I28M/K38R/I92L/D98P/L100F/R102K/S156A/D161L、I28M/I44V/R74W/W401L、I28M/I44V/I92L/D161L/K222R/D300Q/V413L、I28M/I44V/D98P/L100F/R102K/S118A、I28M/I44V/S118A/S156A/D161L/K222R/K289S/V435Q/M438A、I28M/I44V/K289S/D290E/A351G/I422M、I28M/I44V/V435R/M438A、I28M/T54P/I92L/Q159M/D161L/D290E、I28M/T54P/Q159M/D290E/M438A、I28M/T54P/T250R/K439N、I28M/R74W/S156A/Q159M/D161L/A178V/D300Q/V365I/V435Q/M438A、I28M/R74W/S156A/D161L/V365I/A407E、I28M/R74W/D161L/D290E/V365I、I28M/D98P/L100F/R102K/D161L/K185R/A351G/W401L/V435E/M438A、I28M/I92L/L100F/R102K/A110G/D161L/K185R/T250A/D300Q/D375P/V435Q、I28M/I92L/S118A/Q159M/K222R/T250R/H259P/D300Q/A407E、I28M/S156A/D161L/K185R/V435R/M438A、I28M/S156A/D161L/I233W/H259S/D300Q/V435R、I28M/I92L/D98P/L100F/A110G/S156A/D161L/W401L、K38R/D161L/D300Q/M438A、R74W/D98P/L100F/R102K/A110G/S118A/D161L/A178V/T250R/K289S/D290E/D300Q/V435E/M438A、R74W/D98P/L100F/R102K/S118A/S156A/Q159M/D161L/V435E/M438A、R74W/S156A/D161L/R173G/A178V/Q424E/V435E、R74W/D375P/V435G、D98P/L100F/S118A/Q159M/D161L/D300Q、D98P/L100F/S156A/Q159M/D161L/A178V/H259S/K289S/D290E/A351G/I422M、R102K/N137G/Q159M/D161L/I422M/Q424E、S118A、N137G/Q159M/D161L/K185R/D300Q/A351G/V365I/V435Q、S156A/Q159M/D161L/D169S、 Q159M/D161L/K222R/D290E/D375P/A407E、Q159M/D161L/W401LおよびD161L/H259S/K289S/V435R/M438Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号548を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678および680のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含み、位置は、配列番号548を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678および680のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含み、位置は、配列番号548を参照して番号付けられている。
一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678および680のいずれかの配列を含み、位置は、配列番号548を参照して番号付けられている。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、19/44/110/191/198/199/208/300/365、19/75/76/87/92/199/207/208、19/87/92/191/199/209/413/435、44/76/197/199/208/351、44/87/92/137/159/199/209、44/87/137/159/169/191/199/208、44/87/137/191/197/209/289/401、44/87/199/208、75/76/87/92、75/76/87/92/290/300、75/76/87/191、75/76/87/191/197/199/209/300、75/87/92/169/207/208/300/413/435、75/87/110/137/169/191/199/208/209/289/435、75/87/110/191/197/198/207/208/289/290/300/401/413、75/87/300、75/110/197/199/208/290/300/401/413、76/92/199/209、87/92/197/198/199/208/300、 87/137/435、87/169/191/199/207/209/401/413、87/191/198/199/222/244/289/300/435、87/92/110/169/199/207/209/290/300、87/92/159/169/191/198/290/413/435、87/92/159/191/199/208/209/289/290、87/92/208/401、87/435、92/137/191/199/209、92/197/199/207/208/401、137/198/199/207/208/426/435、137/199/208/209/290/435、137/365、159/197/199/207/209、169/191/197/199/207/208、169/197/199/207/209/222/300/413/435、191/207/208/289/290/413/435および197/198/199/208/209から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号562を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、19L/44V/110G/191R/198M/199K/208A/300Q/365I、19L/75L/76R/87W/92L/199K/207L/208A、19L/87W/92L/191R/199K/209G/413L/435Q、44V/76R/197R/199K/208D/351G、44V/87W/92L/137G/159M/199K/209G、44V/87W/137G/159M/169S/191R/199K/208D、44V/87W/137G/191R/197R/209G/289S/401L、44V/87W/199K/208A、75L/76R/87W/92L、75L/76R/87W/92L/290E/300Q、75L/76R/87W/191R、75L/76R/87W/191R/197R/199K/209G/300Q、75L/87W/92L/169S/207L/208A/300Q/413L/435Q、75L/87W/110G/137G/169S/191R/199K/208A/209G/289S/435Q、75L/87W/110G/191R/197R/198M/207L/208D/289S/290E/300Q/401L/413L、75L/87W/300Q、75L/110G/197R/199K/208A/290E/300Q/401L/413L、76R/92L/199K/209G、87L/92L/197R/198M/199K/208D/300Q、 87W/137G/435R、87W/169S/191R/199K/207L/209G/401L/413L、87W/191R/198M/199K/222R/244L/289S/300Q/435R、87W/92L/110G/169S/199K/207L/209G/290E/300Q、87W/92L/159M/169S/191R/198M/290E/413L/435Q、87W/92L/159M/191R/199K/208A/209G/289S/290E、87W/92L/208A/401L、87W/435R、92L/137G/191R/199K/209G、92L/197R/199K/207L/208D/401L、137G/198M/199K/207L/208D/426V/435R、137G/199K/208A/209G/290E/435R、137G/365I、159M/197R/199K/207L/209G、169S/191R/197R/199K/207L/208D、169S/197R/199K/207L/209G/222R/300Q/413L/435R、191R/207L/208A/289S/290E/413L/435Qおよび197R/198M/199K/208D/209Gから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、V19L/I44V/A110G/S191R/I198M/A199K/K208A/D300Q/V365I、V19L/I75L/S76R/M87W/I92L/A199K/I207L/K208A、V19L/M87W/I92L/S191R/A199K/Q209G/V413L/V435Q、I44V/S76R/Q197R/A199K/K208D/A351G、I44V/M87W/I92L/N137G/Q159M/A199K/Q209G、I44V/M87W/N137G/Q159M/G169S/S191R/A199K/K208D、I44V/M87W/N137G/S191R/Q197R/Q209G/K289S/W401L、 I44V/M87W/A199K/K208A、I75L/S76R/M87W/I92L、I75L/S76R/M87W/I92L/D290E/D300Q、I75L/S76R/M87W/S191R、I75L/S76R/M87W/S191R/Q197R/A199K/Q209G/D300Q、I75L/M87W/I92L/G169S/I207L/K208A/D300Q/V413L/V435Q、I75L/M87W/A110G/N137G/G169S/S191R/A199K/K208A/Q209G/K289S/V435Q、I75L/M87W/A110G/S191R/Q197R/I198M/I207L/K208D/K289S/D290E/D300Q/W401L/V41 L、I75L/M87W/D300Q、 I75L/A110G/Q197R/A199K/K208A/D290E/D300Q/W401L/V413L、S76R/I92L/A199K/Q209G、M87L/I92L/Q197R/I198M/A199K/K208D/D300Q、 M87W/N137G/V435R、M87W/G169S/S191R/A199K/I207L/Q209G/W401L/V413L、 M87W/S191R/I198M/A199K/K222R/P244L/K289S/D300Q/V435R、M87W/I92L/A110G/G169S/A199K/I207L/Q209G/D290E/D300Q、 M87W/I92L/Q159M/G169S/S191R/I198M/D290E/V413L/V435Q、M87W/I92L/Q159M/S191R/A199K/K208A/Q209G/K289S/D290E、M87W/I92L/K208A/W401L、M87W/V435R、I92L/N137G/S191R/A199K/Q209G、I92L/Q197R/A199K/I207L/K208D/W401L、N137G/I198M/A199K/I207L/K208D/A426V/V435R、N137G/A199K/K208A/Q209G/D290E/V435R、N137G/V365I、Q159M/Q197R/A199K/I207L/Q209G、G169S/S191R/Q197R/A199K/I207L/K208D、G169S/Q197R/A199K/I207L/Q209G/K222R/D300Q/V413L/V435R、S191R/I207L/K208A/K289S/D290E/V413L/V435Qおよび Q197R/I198M/A199K/K208D/Q209Gから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、および/または754のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、および/または754のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、および/または754を含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、22、25、51、56、71、78、80、81、88、157、185/208/230/252/255/290/365、189/206/208/365、200、208/365/435、243、245、249、259、262/401、279、282、284、304/322/365/401、308、338、339、352、362、364、365/401/413/435、366、および374から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号696を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、22L、25L、25V、51A、56L、71R、78E、78F、78G、78I、78K、78M、78P、78Q、78R、80L、81C、88I、88K、88V、157G、157Q、185R/208A/230S/252N/255N/290E/365I、189L/206K/208A/365I、200N、200S、208A/365I/435Q、243C、243L、243M、243V、243Y、245G、249E、249H、249I、249M、249N、249P、249S、249T、249Y、259G、259S、259Y、262S/401L、279G、282T、284T、304P/322S/365I/401L、308F、308Y、338C、339D、352Q、362T、364G、365I/401L/413L/435Q、366Aおよび374Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号696を参照して番号付けられている。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、P22L、I25L、I25V、K51A、N56L、Q71R、L78E、L78F、L78G、L78I、L78K、L78M、L78P、L78Q、L78R、T80L、H81C、R88I、R88K、R88V、L157G、L157Q、K185R/K208A/E230S/S252N/S255N/D290E/V365I、I189L/M206K/K208A/V365I、K200N、K200S、K208A/V365I/V435Q、I243C、I243L、I243M、I243V、I243Y、L245G、L249E、L249H、L249I、L249M、L249N、L249P、L249S、L249T、L249Y、H259G、H259S、H259Y、T262S/W401L、S279G、S282T、S284T、S304P/P322S/V365I/W401L、R308F、R308Y、V338C、P339D、F352Q、L362T、S364G、V365I/W401L/V413L/V435Q、C366AおよびS374Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4684、4686、4688、4690、4692、4694、4696、4698、4700、4702、4704、4706、4708、4710、4712、4714、4716、4718、4720、4722、4724、4726、4728、4730、4732、4734、4736、4738、4740、4742、4744、4746、4748、4750、4752、4754、4756、4758、4760、4762、4764、4766、4768、4770、4772、4774、4776、4778、4780、4782、4784、4786、4788、4790、4792、4794、4796、4798、4800、4902、4804、4806、4808、4810および4812のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4684、4686、4688、4690、4692、4694、4696、4698、4700、4702、4704、4706、4708、4710、4712、4714、4716、4718、4720、4722、4724、4726、4728、4730、4732、4734、4736、4738、4740、4742、4744、4746、4748、4750、4752、4754、4756、4758、4760、4762、4764、4766、4768、4770、4772、4774、4776、4778、4780、4782、4784、4786、4788、4790、4792、4794、4796、4798、4800、4902、4804、4806、4808、4810および4812のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4684、4686、4688、4690、4692、4694、4696、4698、4700、4702、4704、4706、4708、4710、4712、4714、4716、4718、4720、4722、4724、4726、4728、4730、4732、4734、4736、4738、4740、4742、4744、4746、4748、4750、4752、4754、4756、4758、4760、4762、4764、4766、4768、4770、4772、4774、4776、4778、4780、4782、4784、4786、4788、4790、4792、4794、4796、4798、4800、4902、4804、4806、4808、4810および4812のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、51/56、51/56/243/249/282/353/362/366、51/56/243/249/308/362/364、51/56/249/353、51/56/249/362/364、51/56/249/362/366、51/243/249/308/353、51/243/249/348/362/366、51/249、51/249/282/284/364、51/249/282/353/366、51/249/284/308/362/366、51/249/353/362/364、51/353/362、56、56/243/249/282/364/366、56/243/364/366、56/249、56/249/284/353、56/249/353、56/284/366、243/249/282/284/362/364/366、243/249/308/353/366、243/249/353/362/366、243/282/353/362/364、243/282/362/364/366、243/308/353、249/353/362/366、282、308/366および362/366から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号4684を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、51A/56H、51A/56H/243L/249E/282T/353Y/362M/366S、51A/56H/243L/249E/308F/362M/364G、51A/56H/249M/362M/364G、51A/56H/249M/362M/366S、51A/56H/249Y/353Y、51A/243L/249E/308F/353Y、51A/243L/249E/348S/362M/366V、51A/249E/353Y/362M/364G、51A/249M、51A/249M/282T/284T/364G、51A/249M/282T/353Y/366S、51A/249Y/284T/308F/362M/366V、51A/353Y/362M、56H、56H/243L/249E/282T/364G/366V、56H/243L/364G/366V、56H/249M/284T/353Y、56H/249M/353Y、56H/249Y、56H/284T/366V、243L/249E/282T/284T/362M/364G/366S、243L/249M/308F/353Y/366A、243L/249Y/353Y/362M/366S、243L/282T/353Y/362M/364G、243L/282T/362M/364G/366V、243L/308F/353Y、249Y/353Y/362M/366S、282T、308F/366Aおよび362M/366Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4684を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、K51A/N56H、K51A/N56H/I243L/L249E/S282T/W353Y/L362M/C366S、K51A/N56H/I243L/L249E/R308F/L362M/S364G、K51A/N56H/L249M/L362M/S364G、K51A/N56H/L249M/L362M/C366S、K51A/N56H/L249Y/W353Y、K51A/I243L/L249E/R308F/W353Y、K51A/I243L/L249E/A348S/L362M/C366V、K51A/L249E/W353Y/L362M/S364G、K51A/L249M、K51A/L249M/S282T/S284T/S364G、K51A/L249M/S282T/W353Y/C366S、K51A/L249Y/S284T/R308F/L362M/C366V、K51A/W353Y/L362M、N56H、N56H/I243L/L249E/S282T/S364G/C366V、N56H/I243L/S364G/C366V、N56H/L249M/S284T/W353Y、N56H/L249M/W353Y、N56H/L249Y、N56H/S284T/C366V、I243L/L249E/S282T/S284T/L362M/S364G/C366S、I243L/L249M/R308F/W353Y/C366A、I243L/L249Y/W353Y/L362M/C366S、I243L/S282T/W353Y/L362M/S364G、I243L/S282T/L362M/S364G/C366V、I243L/R308F/W353Y、L249Y/W353Y/L362M/C366S、S282T、R308F/C366AおよびL362M/C366Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4684を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4814、4816、4818、4820、4822、4824、4826、4828、4830、4832、4834、4836、4838、4840、4842、4844、4846、4848、4850、4852、4854、4856、4858、4860、4862、4864、4866、4868、4870、4872、および4874のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4814、4816、4818、4820、4822、4824、4826、4828、4830、4832、4834、4836、4838、4840、4842、4844、4846、4848、4850、4852、4854、4856、4858、4860、4862、4864、4866、4868、4870、4872、および4874のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4814、4816、4818、4820、4822、4824、4826、4828、4830、4832、4834、4836、4838、4840、4842、4844、4846、4848、4850、4852、4854、4856、4858、4860、4862、4864、4866、4868、4870、4872、および4874のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、25、25/56/353、25/243/249/259/366、25/243/249/362、25/362/366、51、51/56/200/243/249/259/338、51/56/362、51/71/249/279/284/362/366、56/243/249、56/362/366、70/198/259/313、85、88、88/173、110、159、163、171、174、175、177、198、198/313、198/313/428、200/243/249/259、208、208/320、209、209/234、222、226、234、234/408、243/338/362/366、253、256、259、265、272、289、322、336、353/362、405、411、428および439から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号4838を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、25L、25L/56L/353Y、25V/243M/249I/362M、25V/243M/249Y/259G/366A、25V/362M/366S、51A、51A/56L/200S/243M/249I/259G/338C、51A/56L/362M、51A/71R/249M/279G/284T/362M/366S、56L/243M/249M、56L/243M/249Y、56L/362M/366A、70S/198D/259E/313S、85E、88C/173S、88I、110S、159N、163K、171D、171E、171P、171V、174E、174S、175N、177K、177P、177S、198D、198D/313S、198D/313S/428S、198E、198S、198T、200S/243M/249Y/259G、208E、208G、208I、208L、208N、208T、208V、208W/320I、209A、209E/234Q、222P、226R、226T、234A、234E、234H/408D、234T、243M/338C/362M/366S、253A、256A、259N、259S、259T、265A、272D、289H、289T、322V、336E、353Y/362M、405Q、411T、428K、439Dおよび439Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4838を参照して番号付けられている。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、I25L、I25L/H56L/W353Y、I25V/L243M/E249I/L362M、I25V/L243M/E249Y/H259G/V366A、I25V/L362M/V366S、K51A、K51A/H56L/K200S/L243M/E249I/H259G/V338C、K51A/H56L/L362M、K51A/Q71R/E249M/S279G/S284T/L362M/V366S、H56L/L243M/E249M、H56L/L243M/E249Y、H56L/L362M/V366A、P70S/I198D/H259E/F313S、A85E、R88C/R173S、R88I、A110S、Q159N、L163K、K171D、K171E、K171P、K171V、L174E、L174S、E175N、Q177K、Q177P、Q177S、I198D、I198D/F313S、I198D/F313S/V428S、I198E、I198S、I198T、K200S/L243M/E249Y/H259G、K208E、K208G、K208I、K208L、K208N、K208T、K208V、K208W/V320I、Q209A、Q209E/R234Q、K222P、E226R、E226T、R234A、R234E、R234H/N408D、R234T、L243M/V338C/L362M/V366S、S253A、L256A、H259N、H259S、H259T、Q265A、P272D、K289H、K289T、P322V、K336E、W353Y/L362M、E405Q、R411T、V428K、K439DおよびK439Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4838を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4876、4878、4880、4882、4884、4886、4888、4890、4892、4894、4896、4898、4900、4902、4904、4906、4908、4910、4912、4914、4916、4918、4920、4922、4924、4926、4928、4930、4932、4934、4936、4938、4940、4942、4944、4946、4948、4950、4952、4954、4956、4958、4960、4962、4964、4966、4968、4970、4972、4974、4976、4978、4980、4982、4984、4986、4988、4990、4992、4994、4996、4998、5000、5002、5004、5006、5008、5010、5012、5014および5016のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4876、4878、4880、4882、4884、4886、4888、4890、4892、4894、4896、4898、4900、4902、4904、4906、4908、4910、4912、4914、4916、4918、4920、4922、4924、4926、4928、4930、4932、4934、4936、4938、4940、4942、4944、4946、4948、4950、4952、4954、4956、4958、4960、4962、4964、4966、4968、4970、4972、4974、4976、4978、4980、4982、4984、4986、4988、4990、4992、4994、4996、4998、5000、5002、5004、5006、5008、5010、5012、5014および5016のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4876、4878、4880、4882、4884、4886、4888、4890、4892、4894、4896、4898、4900、4902、4904、4906、4908、4910、4912、4914、4916、4918、4920、4922、4924、4926、4928、4930、4932、4934、4936、4938、4940、4942、4944、4946、4948、4950、4952、4954、4956、4958、4960、4962、4964、4966、4968、4970、4972、4974、4976、4978、4980、4982、4984、4986、4988、4990、4992、4994、4996、4998、5000、5002、5004、5006、5008、5010、5012、5014および5016のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、8、9、25、25/198/209、25/200/209/338、25/200/243/249、25/209/243、25/209/243/249、25/209/243/259、25/209/249/259/366、25/209/259、25/209/279/366、25/209/289/366、25/249、25/259/279、25/259/279/289、25/279/284、25/279/284/289、25/289、34、53、54、55、61、69、70、73、79、87、91、107、108、111、141、153、158、174、190、194、198、198/200/209/243/249/289、198/249/338、200/209/366、201、205、209、209/249/259/279/338/366、209/249/259/289、209/249/279/284/289、209/249/338、209/279/289、209/366、234/297、238、247、249/259、252、253、254、256、259/366、279、279/338、289、297、308、321、322、327、336、338、341、342、364、366、388、392、411、412、414、426、430、432、446および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号4876を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、8D、8L、9G、25H/209E/243M/249Y、25L、25L/198D/209E、25L/200S/209E/338C、25L/200S/243M/249M、25L/209E/243M、25L/209E/243M/249Y、25L/209E/243M/259G、25L/209E/249I/259G/366A、25L/209E/259G、25L/209E/279G/366A、25L/209E/289T/366A、25L/249I、25L/259G/279G、25L/259G/279G/289T、25L/279G/284T、25L/279G/284T/289T、25L/289T、34I、53C、53L、53R、53V、54P、54V、55T、55W、61S、69N、69Q、69S、69T、70K、73S、79G、79S、79V、87L、87M、87R、91Q、91R、91T、107A、107C、107T、108C、111C、111G、141M、153S、158Q、174M、190R、194Q、198D、198D/200S/209E/243M/249Y/289T、198D/249M/338C、200S/209E/366A、201P、201T、205P、209E、209E/249I/259G/289T、209E/249M/338C、209E/249Y/259G/279G/338C/366A、209E/249Y/279G/284T/289T、209E/279G/289T、209E/366A、234H/297A、238K、247A、247L、249M/259G、252A、252E、252Q、253G、253P、254G、254M、254P、256D、256T、256W、259G/366A、279G、279G/338C、289T、297A、308C、308L、308T、321D、322M、322R、322T、327L、336M、336Y、338C、341V、342R、364S、366A、388T、388V、392H、392Q、411E、411S、412H、412T、414L、426T、430R、432T、446Fおよび449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4876を参照して番号付けられている。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、T8D、T8L、V9G、I25H/Q209E/L243M/E249Y、I25L、I25L/I198D/Q209E、I25L/K200S/Q209E/V338C、I25L/K200S/L243M/E249M、I25L/Q209E/L243M、I25L/Q209E/L243M/E249Y、I25L/Q209E/L243M/H259G、I25L/Q209E/E249I/H259G/V366A、I25L/Q209E/H259G、I25L/Q209E/S279G/V366A、I25L/Q209E/K289T/V366A、I25L/E249I、I25L/H259G/S279G、I25L/H259G/S279G/K289T、I25L/S279G/S284T、I25L/S279G/S284T/K289T、I25L/K289T、V34I、K53C、K53L、K53R、K53V、T54P、T54V、S55T、S55W、T61S、D69N、D69Q、D69S、D69T、P70K、E73S、P79G、P79S、P79V、W87L、W87M、W87R、I91Q、I91R、I91T、L107A、L107C、L107T、M108C、S111C、S111G、L141M、A153S、P158Q、L174M、K190R、S194Q、I198D、I198D/K200S/Q209E/L243M/E249Y/K289T、I198D/E249M/V338C、K200S/Q209E/V366A、E201P、E201T、K205P、Q209E、Q209E/E249I/H259G/K289T、Q209E/E249M/V338C、Q209E/E249Y/H259G/S279G/V338C/V366A、Q209E/E249Y/S279G/S284T/K289T、Q209E/S279G/K289T、Q209E/V366A、R234H/G297A、A238K、K247A、K247L、E249M/H259G、S252A、S252E、S252Q、S253G、S253P、S254G、S254M、S254P、L256D、L256T、L256W、H259G/V366A、S279G、S279G/V338C、K289T、G297A、R308C、R308L、R308T、E321D、P322M、P322R、P322T、F327L、K336M、K336Y、V338C、Q341V、E342R、G364S、V366A、S388T、S388V、K392H、K392Q、R411E、R411S、R412H、R412T、M414L、A426T、K430R、K432T、S446FおよびS449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4876を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5018、5020、5022、5024、5026、5028、5030、5032、5034、5036、5038、5040、5042、5044、5046、5048、5050、5052、5054、5056、5058、5060、5062、5064、5066、5068、5070、5072、5074、5076、5078、5080、5082、5084、5086、5088、5090、5092、5094、5096、5098、5100、5102、5104、5106、5108、5110、5112、5114、5116、5118、5120、5122、5124、5126、5128、5130、5132、5134、5136、5138、5140、5142、5144、5146、5148、5150、5152、5154、5156、5158、5160、5162、5164、5166、5168、5170、5172、5174、5176、5178、5180、5182、5184、5186、5188、5190、5192、5194、5196、5198、5200、5202、5204、5206、5208、5210、5212、5214、5216、5218、5220、5222、5224、5226、5228、5230、5232、5234、5236、5238、5240、5242、5244、5246、5248、5250、5252、5254、5256、5258および5260のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5018、5020、5022、5024、5026、5028、5030、5032、5034、5036、5038、5040、5042、5044、5046、5048、5050、5052、5054、5056、5058、5060、5062、5064、5066、5068、5070、5072、5074、5076、5078、5080、5082、5084、5086、5088、5090、5092、5094、5096、5098、5100、5102、5104、5106、5108、5110、5112、5114、5116、5118、5120、5122、5124、5126、5128、5130、5132、5134、5136、5138、5140、5142、5144、5146、5148、5150、5152、5154、5156、5158、5160、5162、5164、5166、5168、5170、5172、5174、5176、5178、5180、5182、5184、5186、5188、5190、5192、5194、5196、5198、5200、5202、5204、5206、5208、5210、5212、5214、5216、5218、5220、5222、5224、5226、5228、5230、5232、5234、5236、5238、5240、5242、5244、5246、5248、5250、5252、5254、5256、5258および5260のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5018、5020、5022、5024、5026、5028、5030、5032、5034、5036、5038、5040、5042、5044、5046、5048、5050、5052、5054、5056、5058、5060、5062、5064、5066、5068、5070、5072、5074、5076、5078、5080、5082、5084、5086、5088、5090、5092、5094、5096、5098、5100、5102、5104、5106、5108、5110、5112、5114、5116、5118、5120、5122、5124、5126、5128、5130、5132、5134、5136、5138、5140、5142、5144、5146、5148、5150、5152、5154、5156、5158、5160、5162、5164、5166、5168、5170、5172、5174、5176、5178、5180、5182、5184、5186、5188、5190、5192、5194、5196、5198、5200、5202、5204、5206、5208、5210、5212、5214、5216、5218、5220、5222、5224、5226、5228、5230、5232、5234、5236、5238、5240、5242、5244、5246、5248、5250、5252、5254、5256、5258および5260のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、88、88/110、88/110/159/198/200、88/110/159/198/234/259/265、88/110/159/198/259、88/110/198、88/110/234、88/159/198、88/198、88/198/200/259、88/198/259、88/259、88/259/265、110/259/265/411、159/198/411、159/259/411、171/174/175/177/208/320/428/439、171/175/177/208/320/428、171/177、171/177/226/428/439、171/208/320、171/208/320/428、171/208/428、174/175/177/208/320/428、174/175/428、174/320、198、198/200、198/200/234、198/234、198/259、208、208/320/331/428、208/320/428、208/428、234、259、320/428および428から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5066を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、88I、88I/110D、88I/110D/159N/198D/234T/259N/265A、88I/110D/159N/198D/259E、88I/110D/159N/198E/200S、88I/110D/198D、88I/110D/198S、88I/110D/234T、88I/159N/198D、88I/198D/200S/259E、88I/198D/259E、88I/198S、88I/259E/265A、88I/259N、110D/259N/265A/411T、159N/198E/411T、159N/259E/411T、171E/177P/226T/428K/439D、171E/208E/320I、171E/208E/320I/428K、171E/208E/428K、171P/174E/175N/177P/208W/320I/428K/439D、171P/175N/177P/208L/320I/428K、171P/177P、174E/175N/177P/208E/320I/428K、174E/175N/428K、174E/320I、198D、198D/200S/234E、198D/234Q、198E/200S、198E/259E、208E、208E/320I/428K、208E/428K、208L/320I/331C/428K、234E、259E、320I/428Kおよび428Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5066を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列はR88I、R88I/A110D、R88I/A110D/Q159N/I198D/R234T/G259N/Q265A、R88I/A110D/Q159N/I198D/G259E、R88I/A110D/Q159N/I198E/K200S、R88I/A110D/I198D、R88I/A110D/I198S、R88I/A110D/R234T、R88I/Q159N/I198D、R88I/I198D/K200S/G259E、R88I/I198D/G259E、R88I/I198S、R88I/G259E/Q265A、R88I/G259N、A110D/G259N/Q265A/R411T、Q159N/I198E/R411T、Q159N/G259E/R411T、K171E/Q177P/E226T/V428K/K439D、K171E/K208E/V320I、K171E/K208E/V320I/V428K、K171E/K208E/V428K、K171P/L174E/E175N/Q177P/K208W/V320I/V428K/K439D、K171P/E175N/Q177P/K208L/V320I/V428K、K171P/Q177P、L174E/E175N/Q177P/K208E/V320I/V428K、L174E/E175N/V428K、L174E/V320I、I198D、I198D/K200S/R234E、I198D/R234Q、I198E/K200S、I198E/G259E、K208E、K208E/V320I/V428K、K208E/V428K、K208L/V320I/R331C/V428K、R234E、G259E、V320I/V428KおよびV428Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5066を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5262、5264、5266、5268、5270、5272、5274、5276、5278、5280、5282、5284、5286、5288、5290、5292、5294、5296、5298、5300、5302、5304、5306、5308、5310、5312、5314、5316、5318、5320、5322、5324、5326、5328、5330、5332、5334、5336、5338、5340および5342のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5262、5264、5266、5268、5270、5272、5274、5276、5278、5280、5282、5284、5286、5288、5290、5292、5294、5296、5298、5300、5302、5304、5306、5308、5310、5312、5314、5316、5318、5320、5322、5324、5326、5328、5330、5332、5334、5336、5338、5340および5342のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5262、5264、5266、5268、5270、5272、5274、5276、5278、5280、5282、5284、5286、5288、5290、5292、5294、5296、5298、5300、5302、5304、5306、5308、5310、5312、5314、5316、5318、5320、5322、5324、5326、5328、5330、5332、5334、5336、5338、5340および5342のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2、7、25/61/208/252/253、25/61/428、25/107/208/320/428、25/208/247/252/253/364/428、25/247/249/252/364/428、38、53/54/55/153/201、53/54/308/392、53/171/308/392、54、61/107/208/252/253/254/364/428、61/208/252/254/428、64、68、73/87/201、91/201/439/444、99、106、107、107/208/320/364/428、107/247/249/252/254/364、107/247/252、107/247/428、109、159、169、171、172、177、179、190、190/208/247/252/428、222、233、233/269、247/249/252/254/320/428、249/252/253/254、249/252/254/428、251、252/253/254、253/320、259、264、289、296、300、308、308/327/439、317、318、320、320/364/428、320/428、347、404、408、417、424、427、428、428/434、431、435および438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5290を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2L、2N、7P、25L/61S/208N/252E/253G、25L/61S/428K、25L/107T/208E/320I/428K、25L/208E/247L/252E/253G/364S/428K、25L/247L/249I/252E/364S/428K、38Q、53R/54V/55T/153S/201P、53V/54V/308L/392H、53V/171P/308L/392H、54A、61S/107T/208N/252E/253G/254M/364S/428K、61S/208W/252E/254M/428K、64S、68K、73S/87M/201P、91T/201P/439D/444H、99P、106T、107A、107A/208N/320I/364S/428K、107A/247A/249I/252E/254M/364S、107A/247A/252E、107A/247A/428K、109S、159L、169C、169E、169L、169Q、169V、171S、171T、171V、172H、172N、177P、179A、179S、190R、190R/208N/247L/252E/428K、222A、233C、233G、233K、233L、233M、233Q、233Q/269R、233V、247A/249I/252E/254M/320I/428K、249I/252E/253G/254M、249I/252E/254M/428K、251L、252E/253G/254M、253G/320I、259T、264A、289S、296A、296H、296Q、300G、308L、308L/327L/439D、317R、318T、320I、320I/364S/428K、320I/428K、347H、347K、347P、347R、404T、408R、417P、424A、424W、427L、427R、428E/434N、428F、428I、428K、428Q、428R、428S、431E、431R、435C、435K、435M、435Q、435R、435Tおよび438Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5290を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E2L、E2N、T7P、I25L/T61S/K208N/S252E/S253G、I25L/T61S/V428K、I25L/L107T/K208E/V320I/V428K、I25L/K208E/K247L/S252E/S253G/G364S/V428K、I25L/K247L/Y249I/S252E/G364S/V428K、R38Q、K53R/T54V/S55T/A153S/E201P、K53V/T54V/R308L/K392H、K53V/K171P/R308L/K392H、T54A、T61S/L107T/K208N/S252E/S253G/S254M/G364S/V428K、T61S/K208W/S252E/S254M/V428K、F64S、N68K、E73S/W87M/E201P、I91T/E201P/K439D/Y444H、E99P、S106T、L107A、L107A/K208N/V320I/G364S/V428K、L107A/K247A/Y249I/S252E/S254M/G364S、L107A/K247A/S252E、L107A/K247A/V428K、R109S、N159L、G169C、G169E、G169L、G169Q、G169V、K171S、K171T、K171V、T172H、T172N、Q177P、V179A、V179S、K190R、K190R/K208N/K247L/S252E/V428K、K222A、W233C、W233G、W233K、W233L、W233M、W233Q、W233Q/Q269R、W233V、K247A/Y249I/S252E/S254M/V320I/V428K、Y249I/S252E/S253G/S254M、Y249I/S252E/S254M/V428K、A251L、S252E/S253G/S254M、S253G/V320I、E259T、F264A、K289S、R296A、R296H、R296Q、D300G、R308L、R308L/F327L/K439D、S317R、E318T、V320I、V320I/G364S/V428K、V320I/V428K、D347H、D347K、D347P、D347R、G404T、N408R、R417P、Q424A、Q424W、A427L、A427R、V428E/D434N、V428F、V428I、V428K、V428Q、V428R、V428S、D431E、D431R、V435C、V435K、V435M、V435Q、V435R、V435TおよびA438Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5290を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5344、5346、5348、5350、5352、5354、5356、5358、5360、5362、5364、5366、5368、5370、5372、5374、5376、5378、5380、5382、5384、5386、5388、5390、5392、5394、5396、5398、5400、5402、5404、5406、5408、5410、5412、5414、5416、5418、5420、5422、5424、5426、5428、5430、5432、5434、5436、5438、5440、5442、5444、5446、5448、5450、5452、5454、5456、5458、5460、5462、5464、5466、5468、5470、5472、5474、5476、5478、5480、5482、5484、5486、5488、5490、5492、5494、5496、5498、5500、5502、5504、5506、5508、5510、5512、5514、5516、5518、5520、5522、5524、5526、5528、5530、5532、5534、5536、5538、5540および5542のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5344、5346、5348、5350、5352、5354、5356、5358、5360、5362、5364、5366、5368、5370、5372、5374、5376、5378、5380、5382、5384、5386、5388、5390、5392、5394、5396、5398、5400、5402、5404、5406、5408、5410、5412、5414、5416、5418、5420、5422、5424、5426、5428、5430、5432、5434、5436、5438、5440、5442、5444、5446、5448、5450、5452、5454、5456、5458、5460、5462、5464、5466、5468、5470、5472、5474、5476、5478、5480、5482、5484、5486、5488、5490、5492、5494、5496、5498、5500、5502、5504、5506、5508、5510、5512、5514、5516、5518、5520、5522、5524、5526、5528、5530、5532、5534、5536、5538、5540および5542のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5344、5346、5348、5350、5352、5354、5356、5358、5360、5362、5364、5366、5368、5370、5372、5374、5376、5378、5380、5382、5384、5386、5388、5390、5392、5394、5396、5398、5400、5402、5404、5406、5408、5410、5412、5414、5416、5418、5420、5422、5424、5426、5428、5430、5432、5434、5436、5438、5440、5442、5444、5446、5448、5450、5452、5454、5456、5458、5460、5462、5464、5466、5468、5470、5472、5474、5476、5478、5480、5482、5484、5486、5488、5490、5492、5494、5496、5498、5500、5502、5504、5506、5508、5510、5512、5514、5516、5518、5520、5522、5524、5526、5528、5530、5532、5534、5536、5538、5540および5542のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2、49、73、87、87/88、87/88/94/159/177/208、87/88/159/198、87/88/177/198/249、87/88/208、87/159/177、87/159/320、87/177/249、87/198、87/198/199、87/198/208/320、87/208、87/208/320、87/320、88、88/177、88/177/208、88/177/320、88/198、88/199、88/199/208、88/208、88/208/249/320、88/320、113、134、135、158、159/177/198、159/177/208、159/198/208/320、171、173、177/198、177/208、195、214、222、253、256、257、268、272、289、300、302、330、348、374、392、399、408、411、412、437、439、445および453から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5372を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2G、2H、2P、49A、73P、73T、87M、87M/88R、87M/88R/94K/159Q/177P/208E、87M/88R/159Q/198E、87M/88R/177P/198E/249I、87M/88R/208E、87M/159Q/177P、87M/159Q/320I、87M/177P/249I、87M/198E、87M/198E/199K、87M/198E/208E/320I、87M/208E、87M/208E/320I、87M/320I、88R、88R/177P、88R/177P/208E、88R/177P/320I、88R/198I、88R/199K、88R/199K/208E、88R/208E、88R/208E/249I/320I、88R/320I、113S、134G、134S、135A、158D、158E、159Q/177P/198E、159Q/177P/208E、159Q/198I/208E/320I、171T、173N、173P、177P/198E、177P/208E、195H、214L、222R、253G、256P、257A、257Q、268A、268G、268H、272K、289T、300G、302R、330D、348C、374K、374R、392D、399D、408D、411Q、412H、437I、437T、437V、439A、445Tおよび453Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5372を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E2G、E2H、E2P、F49A、E73P、E73T、W87M、W87M/I88R、W87M/I88R/E94K/N159Q/Q177P/K208E、W87M/I88R/N159Q/D198E、W87M/I88R/Q177P/D198E/Y249I、W87M/I88R/K208E、W87M/N159Q/Q177P、W87M/N159Q/V320I、W87M/Q177P/Y249I、W87M/D198E、W87M/D198E/A199K、W87M/D198E/K208E/V320I、W87M/K208E、W87M/K208E/V320I、W87M/V320I、I88R、I88R/Q177P、I88R/Q177P/K208E、I88R/Q177P/V320I、I88R/D198I、I88R/A199K、I88R/A199K/K208E、I88R/K208E、I88R/K208E/Y249I/V320I、I88R/V320I、E113S、D134G、D134S、S135A、P158D、P158E、N159Q/Q177P/D198E、N159Q/Q177P/K208E、N159Q/D198I/K208E/V320I、K171T、R173N、R173P、Q177P/D198E、Q177P/K208E、N195H、S214L、K222R、S253G、L256P、L257A、L257Q、D268A、D268G、D268H、P272K、K289T、D300G、K302R、E330D、A348C、S374K、S374R、K392D、N399D、N408D、R411Q、R412H、L437I、L437T、L437V、K439A、E445TおよびY453Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5372を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5544、5546、5548、5550、5552、5554、5556、5558、5560、5562、5564、5566、5568、5570、5572、5574、5576、5578、5580、5582、5584、5586、5588、5590、5592、5594、5596、5598、5600、5602、5604、5606、5608、5610、5612、5614、5616、5618、5620、5622、5624、5626、5628、5630、5632、5634、5636、5638、5640、5642、5644、5646、5648、5650、5652、5654、5656、5658、5660、5662、5664、5666、5668、5670、5672、5674、5676、5678、5680、5682、5684、5686、5688および5690のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5544、5546、5548、5550、5552、5554、5556、5558、5560、5562、5564、5566、5568、5570、5572、5574、5576、5578、5580、5582、5584、5586、5588、5590、5592、5594、5596、5598、5600、5602、5604、5606、5608、5610、5612、5614、5616、5618、5620、5622、5624、5626、5628、5630、5632、5634、5636、5638、5640、5642、5644、5646、5648、5650、5652、5654、5656、5658、5660、5662、5664、5666、5668、5670、5672、5674、5676、5678、5680、5682、5684、5686、5688および5690のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5544、5546、5548、5550、5552、5554、5556、5558、5560、5562、5564、5566、5568、5570、5572、5574、5576、5578、5580、5582、5584、5586、5588、5590、5592、5594、5596、5598、5600、5602、5604、5606、5608、5610、5612、5614、5616、5618、5620、5622、5624、5626、5628、5630、5632、5634、5636、5638、5640、5642、5644、5646、5648、5650、5652、5654、5656、5658、5660、5662、5664、5666、5668、5670、5672、5674、5676、5678、5680、5682、5684、5686、5688および5690のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/7/107/233/252/253/320、2/7/107/233/252/253/320/408/428、2/7/233/252/253/320/427/428、2/233/252/317/320、7/107/190/233/252/253/317/408/427、7/107/233/252/253、7/107/233/252/317/320、7/107/233/252/317/408、7/190/233/252/253/320/427、7/190/233/252/317/320/427/428、7/190/233/252/408/427、7/233/252/253/317/408/427、7/233/252/253/408、7/233/252/317/320/427、7/233/252/317/428、64/169/201/347/392、64/172/264/268/347/392/417、91/94/171/172/201/264/347、91/201/264/347/392、94/201/264/347/435、107/190/233/252、107/190/233/252/317/320、107/233/252/253、107/252/317、169/171/172/264/392/435、169/171/201/264/392/435、169/172/201/264/347、169/172/201/264/347/392/435、169/172/201/347/392、169/172/201/417/435、171/172/201/264/392/417/435、171/201/392/417、190/233/252、190/233/252/253/317/320/408/428、190/233/252/317/408、190/233/252/320/408、201/264/347/392/417/435、201/264/347/392/435、201/264/347/417/435、233/252/253/317/320/427/428、233/252/253/408/427、233/252/317/408、233/252/317/427、233/252/320、233/252/320/408/428、348/374/435および374から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5562を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2L/7P/233K/252E/253G/320I/427R/428R、2N/7P/107A/233K/252E/253G/320I、2N/7P/107A/233K/252E/253G/320I/408R/428R、2N/233K/252E/317R/320I、7P/107A/190R/233K/252E/253G/317R/408R/427R、7P/107A/233K/252E/253G、7P/107A/233K/252E/317R/320I、7P/107A/233K/252E/317R/408R、7P/190R/233K/252E/253G/320I/427L、7P/190R/233K/252E/317R/320I/427R/428R、7P/190R/233K/252E/408R/427R、7P/233K/252E/253G/317R/408R/427L、7P/233K/252E/253G/408R、7P/233K/252E/317R/320I/427L、7P/233K/252E/317R/428R、64S/169E/201P/347P/392H、64S/172H/264A/268V/347P/392H/417P、91T/94E/171T/172H/201P/264A/347G、91T/201P/264A/347G/392H、94E/201P/264A/347G/435Q、107A/190R/233K/252E、107A/190R/233K/252E/317R/320I、107A/233K/252E/253G、107A/252E/317R、169E/171T/172H/264A/392H/435Q、169E/171T/201P/264A/392H/435Q、169E/172H/201P/264A/347G、169E/172H/201P/264A/347K/392H/435R、169E/172H/201P/347G/392H、169E/172H/201P/417P/435R、171T/172H/201P/264A/392H/417P/435R、171T/201P/392H/417P、190R/233K/252E、190R/233K/252E/253G/317R/320I/408R/428R、190R/233K/252E/317R/408R、190R/233K/252E/320I/408R、201P/264A/347K/392H/417P/435R、201P/264A/347K/417P/435R、201P/264A/347P/392H/435Q、233K/252E/253G/317R/320I/427R/428R、233K/252E/253G/408R/427L、233K/252E/317R/408R、233K/252E/317R/427R、233K/252E/320I、233K/252E/320I/408R/428R、348S/374R/435Rおよび374Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E2L/T7P/W233K/S252E/S253G/V320I/A427R/K428R、E2N/T7P/L107A/W233K/S252E/S253G/V320I、E2N/T7P/L107A/W233K/S252E/S253G/V320I/N408R/K428R、E2N/W233K/S252E/S317R/V320I、T7P/L107A/K190R/W233K/S252E/S253G/S317R/N408R/A427R、T7P/L107A/W233K/S252E/S253G、T7P/L107A/W233K/S252E/S317R/V320I、T7P/L107A/W233K/S252E/S317R/N408R、T7P/K190R/W233K/S252E/S253G/V320I/A427L、T7P/K190R/W233K/S252E/S317R/V320I/A427R/K428R、T7P/K190R/W233K/S252E/N408R/A427R、T7P/W233K/S252E/S253G/S317R/N408R/A427L、T7P/W233K/S252E/S253G/N408R、T7P/W233K/S252E/S317R/V320I/A427L、T7P/W233K/S252E/S317R/K428R、F64S/G169E/E201P/D347P/K392H、F64S/T172H/F264A/D268V/D347P/K392H/R417P、I91T/K94E/K171T/T172H/E201P/F264A/D347G、I91T/E201P/F264A/D347G/K392H、K94E/E201P/F264A/D347G/V435Q、L107A/K190R/W233K/S252E、L107A/K190R/W233K/S252E/S317R/V320I、L107A/W233K/S252E/S253G、L107A/S252E/S317R、G169E/K171T/T172H/F264A/K392H/V435Q、G169E/K171T/E201P/F264A/K392H/V435Q、G169E/T172H/E201P/F264A/D347G、G169E/T172H/E201P/F264A/D347K/K392H/V435R、G169E/T172H/E201P/D347G/K392H、G169E/T172H/E201P/R417P/V435R、K171T/T172H/E201P/F264A/K392H/R417P/V435R、K171T/E201P/K392H/
R417P、K190R/W233K/S252E、K190R/W233K/S252E/S253G/S317R/V320I/N408R/K428R、K190R/W233K/S252E/S317R/N408R、K190R/W233K/S252E/V320I/N408R、E201P/F264A/D347K/K392H/R417P/V435R、E201P/F264A/D347K/R417P/V435R、E201P/F264A/D347P/K392H/V435Q、W233K/S252E/S253G/S317R/V320I/A427R/K428R、W233K/S252E/S253G/N408R/A427L、W233K/S252E/S317R/N408R、W233K/S252E/S317R/A427R、W233K/S252E/V320I、W233K/S252E/V320I/N408R/K428R、A348S/S374R/V435RおよびS374Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14、55、56、255、282、308、336、342、364、391、407、および422から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14I、55V、56A、255L、282S、308L、308Q、336Q、342W、364A、364S、391C、407C、407V、および422Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、V14I、S55V、L56A、S255L、T282S、R308L、R308Q、K336Q、E342W、G364A、G364S、L391C、E407C、E407V、およびM422Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5562を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5692、5694、5696、5698、5700、5702、5704、5706、5708、5710、5712、5714、5716、5718、5720、5722、5724、5726、5728、5730、5732、5734、5736、5738、5740、5742、5744、5746、5748、5750、5752、5754、5756、5758、5760、5762、5764、5766、5768、5770、5772、5774、5776、5778、5780、5782、5784、5786、5788、5790、5792、5794、5796、5798、5800、5802、5804、5806、5808、5810、5812および5814のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5692、5694、5696、5698、5700、5702、5704、5706、5708、5710、5712、5714、5716、5718、5720、5722、5724、5726、5728、5730、5732、5734、5736、5738、5740、5742、5744、5746、5748、5750、5752、5754、5756、5758、5760、5762、5764、5766、5768、5770、5772、5774、5776、5778、5780、5782、5784、5786、5788、5790、5792、5794、5796、5798、5800、5802、5804、5806、5808、5810、5812および5814のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5692、5694、5696、5698、5700、5702、5704、5706、5708、5710、5712、5714、5716、5718、5720、5722、5724、5726、5728、5730、5732、5734、5736、5738、5740、5742、5744、5746、5748、5750、5752、5754、5756、5758、5760、5762、5764、5766、5768、5770、5772、5774、5776、5778、5780、5782、5784、5786、5788、5790、5792、5794、5796、5798、5800、5802、5804、5806、5808、5810、5812および5814のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/4/113/158/163/302/364/399/449、2/4/113/158/163/330/449、2/4/113/163/449、2/4/158/163/364/449、2/4/158/222/257/302/330、2/4/158/330、2/4/163/222/302/330/364/449、2/4/163/257、2/4/163/257/330/399/449、2/4/163/330/449、2/4/163/364、2/4/163/364/453、2/4/302、2/113、2/113/163、2/113/163/449、2/113/330/399、2/113/449、2/158/163、2/158/163/364/399、2/163/364/453、2/364/449、4/113/158/163/330/364/399、4/113/158/302/330/364、4/113/163/364/399、4/158/163/364/399、4/364/449、87、87/95/198、87/198、87/266、87/322、107/134/135/195/412/417、107/195/268/322/439、107/195/272、107/195/417/439、107/374/417/439、113/158/163/364/399、134、134/135/195/268/317、158/163/257/330/364/449、158/163/302/330/364/399、158/163/364、163/257/302/364、163/302/330/364/449、163/364、173、173/190/233/252/427/437、173/190/252/257/347/427/437、173/190/257/374/437、173/190/257/427/437、173/233/252/257/427、173/233/437、173/252、173/252/268/437、173/252/347/411、173/257/374/437、173/374/437、173/427/437、190/233/252/257/347/411/437、190/252、190/252/257/285/427、190/252/257/411/437、190/252/257/427、190/374/427/437、195/272/320/439、195/317/320、198、198/244、198/292、233/252、233/252/257、233/252/257/347、233/252/257/347/411/437、233/252/257/427/437、233/252/285、233/252/285/437、233/252/411/437、233/252/437、233/374、233/374/437、252/257、252/257/347/437、257/347/411/437、268/417、285/347/437、302/364、330/364、347/411/437、347/427/437、364/399、374、374/411/437、408/417、411/437および437から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5708を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2P/4T/113S/158D/163A/330D/449R、2P/4T/113S/158D/163R/302R/364S/399D/449R、2P/4T/113S/163R/449R、2P/4T/158D/163A/364S/449R、2P/4T/158D/222R/257Q/302R/330D、2P/4T/158D/330D、2P/4T/163A/257Q、2P/4T/163A/330D/449R、2P/4T/163A/364S、2P/4T/163A/364S/453R、2P/4T/163R/222R/302R/330D/364S/449R、2P/4T/163R/257Q/330D/399D/449R、2P/4T/302R、2P/113S、2P/113S/163A、2P/113S/163R/449R、2P/113S/330D/399D、2P/113S/449R、2P/158D/163A/364S/399D、2P/158D/163R、2P/163R/364S/453R、2P/364S/449R、4T/113S/158D/163A/330D/364S/399D、4T/113S/158D/302R/330D/364S、4T/113S/163A/364S/399D、4T/158D/163A/364S/399D、4T/364S/449R、87W、87W/95L/198E、87W/198E、87W/198I、87W/266L、87W/322S、107A/134S/135A/195H/412H/417P、107A/195H/268A/322L/439P、107A/195H/272K、107A/195H/417P/439P、107A/374T/417P/439P、113S/158D/163A/364S/399D、113S/158D/163R/364S/399D、134S、134S/135A/195H/268A/317R、158D/163A/257Q/330D/364S/449R、158D/163A/364S、158D/163R/302R/330D/364S/399D、163A/257Q/302R/364S、163A/364S、163R/302R/330D/364S/449R、173N、173N/190R/233K/252E/427R/437V、173N/190R/252E/257A/347G/427R/437I、173N/190R/257A/374K/437V、173N/190R/257A/427R/437I、173N/233K/252E/257A/427R、173N/233K/437I、173N/252E、173N/252E/268H/437V、173N/252E/347G/411Q、173N/257A/374K/437V、173N/374K/437I、173N/427R/437I、190R/233K/252E/257A/347G/411Q/437I、190R/252E、190R/252E/257A/285Q/427R、190R/252E/257A/411Q/437I、190R/252E/257A/427R、190R/374K/427R/437V、195H/272K/320I/439P、195H/317R/320I、198E、198E/292P、198I、198I/244L、233K/252E、233K/252E/257A、233K/252E/257A/347G、233K/252E/257A/347G/411Q/437I、233K/252E/257A/427R/437V、233K/252E/285Q、233K/252E/285Q/437V、233K/252E/411Q/437V、233K/252E/437V、233K/374K、233K/374K/437I、252E/257A、252E/257A/347G/437V、257A/347G/411Q/437V、268A/417P、285Q/347G/437V、302R/364S、330D/364S、347G/411Q/437I、347G/427R/437V、364S/399D、374K、374K/411Q/437I、374K/411Q/437V、408D/417P、411Q/437Vおよび437Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5708を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E2P/K4T/E113S/P158D/L163A/E330D/S449R、E2P/K4T/E113S/P158D/L163R/K302R/G364S/N399D/S449R、E2P/K4T/E113S/L163R/S449R、E2P/K4T/P158D/L163A/G364S/S449R、E2P/K4T/P158D/K222R/L257Q/K302R/E330D、E2P/K4T/P158D/E330D、E2P/K4T/L163A/L257Q、E2P/K4T/L163A/E330D/S449R、E2P/K4T/L163A/G364S、E2P/K4T/L163A/G364S/Y453R、E2P/K4T/L163R/K222R/K302R/E330D/G364S/S449R、E2P/K4T/L163R/L257Q/E330D/N399D/S449R、E2P/K4T/K302R、E2P/E113S、E2P/E113S/L163A、E2P/E113S/L163R/S449R、E2P/E113S/E330D/N399D、E2P/E113S/S449R、E2P/P158D/L163A/G364S/N399D、E2P/P158D/L163R、E2P/L163R/G364S/Y453R、E2P/G364S/S449R、K4T/E113S/P158D/L163A/E330D/G364S/N399D、K4T/E113S/P158D/K302R/E330D/G364S、K4T/E113S/L163A/G364S/N399D、K4T/P158D/L163A/G364S/N399D、K4T/G364S/S449R、M87W、M87W/H95L/D198E、M87W/D198E、M87W/D198I、M87W/W266L、M87W/P322S、L107A/D134S/S135A/N195H/R412H/R417P、L107A/N195H/D268A/P322L/K439P、L107A/N195H/P272K、L107A/N195H/R417P/K439P、L107A/S374T/R417P/K439P、E113S/P158D/L163A/G364S/N399D、E113S/P158D/L163R/G364S/N399D、D134S、D134S/S135A/N195H/D268A/S317R、P158D/L163A/L257Q/E330D/G364S/S449R、P158D/L163A/G364S、P158D/L163R/K302R/E330D/G364S/N399D、L163A/L257Q/K302R/G364S、L163A/G364S、L163R/K302R/E330D/G364S/S449R、R173N、R173N/K190R/W233K/S252E/A427R/L437V、R173N/K190R/S252E/L257A/K347G/A427R/L437I、R173N/K190R/L257A/S374K/L437V、R173N/K190R/L257A/A427R/L437I、R173N/W233K/S252E/L257A/A427R、R173N/W233K/L437I、R173N/S252E、R173N/S252E/D268H/L437V、R173N/S252E/K347G/R411Q、R173N/L257A/S374K/L437V、R173N/S374K/
L437I、R173N/A427R/L437I、K190R/W233K/S252E/L257A/K347G/R411Q/L437I、K190R/S252E、K190R/S252E/L257A/E285Q/A427R、K190R/S252E/L257A/R411Q/L437I、K190R/S252E/L257A/A427R、K190R/S374K/A427R/L437V、N195H/P272K/V320I/K439P、N195H/S317R/V320I、D198E、D198E/L292P、D198I、D198I/P244L、W233K/S252E、W233K/S252E/L257A、W233K/S252E/L257A/K347G、W233K/S252E/L257A/K347G/R411Q/L437I、W233K/S252E/L257A/A427R/L437V、W233K/S252E/E285Q、W233K/S252E/E285Q/L437V、W233K/S252E/R411Q/L437V、W233K/S252E/L437V、W233K/S374K、W233K/S374K/L437I、S252E/L257A、S252E/L257A/K347G/L437V、L257A/K347G/R411Q/L437V、D268A/R417P、E285Q/K347G/L437V、K302R/G364S、E330D/G364S、K347G/R411Q/L437I、K347G/A427R/L437V、G364S/N399D、S374K、S374K/R411Q/L437I、S374K/R411Q/L437V、N408D/R417P、R411Q/L437VおよびL437Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5708を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5816、5818、5820、5822、5824、5826、5828、5830、5832、5834、5836、5838、5840、5842、5844、5846、5848、5850、5852、5854、5856、5858、5860、5862、5864、5866、5868、5870、5872、5874、5876、5878、5880、5882、5884、5886、5888、5890、5892、5894、5896、5898、5900、5902、5904、5906、5908、5910、5912、5914、5916、5918、5920、5922、5924、5926、5928、5930、5932、5934、5936、5938、5940、5942、5944、5946、5948、5950、5952、5954、5956、5958、5960、5962、5964、5966、5968、5970、5972、5974、5976、5978、5980、5982、5984、5986、5988、5990、5992、5994、5996、5998、6000、6002、6004、6006、6008、6010、6012および6014のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5816、5818、5820、5822、5824、5826、5828、5830、5832、5834、5836、5838、5840、5842、5844、5846、5848、5850、5852、5854、5856、5858、5860、5862、5864、5866、5868、5870、5872、5874、5876、5878、5880、5882、5884、5886、5888、5890、5892、5894、5896、5898、5900、5902、5904、5906、5908、5910、5912、5914、5916、5918、5920、5922、5924、5926、5928、5930、5932、5934、5936、5938、5940、5942、5944、5946、5948、5950、5952、5954、5956、5958、5960、5962、5964、5966、5968、5970、5972、5974、5976、5978、5980、5982、5984、5986、5988、5990、5992、5994、5996、5998、6000、6002、6004、6006、6008、6010、6012および6014のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号5816、5818、5820、5822、5824、5826、5828、5830、5832、5834、5836、5838、5840、5842、5844、5846、5848、5850、5852、5854、5856、5858、5860、5862、5864、5866、5868、5870、5872、5874、5876、5878、5880、5882、5884、5886、5888、5890、5892、5894、5896、5898、5900、5902、5904、5906、5908、5910、5912、5914、5916、5918、5920、5922、5924、5926、5928、5930、5932、5934、5936、5938、5940、5942、5944、5946、5948、5950、5952、5954、5956、5958、5960、5962、5964、5966、5968、5970、5972、5974、5976、5978、5980、5982、5984、5986、5988、5990、5992、5994、5996、5998、6000、6002、6004、6006、6008、6010、6012および6014のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/4/14/158/282/364/449、2/4/14/158/282/407、2/4/14/163/198、2/4/14/163/282/399、2/4/14/198/308/407、2/4/14/282/308/364、2/4/14/282/308/407、2/4/14/282/364、2/4/158/163/364/399/407、2/4/158/198/282/364/407、2/4/163/198/282/308/342、2/4/163/282/342/364、2/4/163/364/399/449、2/4/198/282/449、2/4/198/364/391/449、2/4/282/342/364/407、2/14/158/198/407/449、2/14/163/308/364、2/14/163/364/407、2/14/282、2/14/282/308、2/14/282/308/364、2/14/282/399、2/14/308、2/14/308/364、2/158/163/407/449、2/163/282、2/163/282/308/364、2/198/282/308/342、2/198/282/399、2/282、2/282/308/342/407、2/282/308/391/407、2/282/399、2/282/399/407、2/308、2/308/364/399、4/14/158/163/198/282/407、4/14/158/282/364/391/407、4/14/163/282、4/14/163/282/308/342/407/449、4/14/198/308/364、4/14/282、4/14/282/308/364/407/449、4/14/282/342/399/407、4/14/364/391、4/158/282/364/399、4/163/282/308/407、4/198/399/407、4/282/342/364/407、4/282/364/407、4/364、12、14/158/163/198/364、14/158/163/282/364、14/158/198/282/342/364/449、14/158/364、14/163/198/282/342/364/449、14/163/282/308、14/282、14/282/308、14/282/342/364/391、14/282/364、14/282/364/391/407/449、14/282/399/407/449、14/407、37、44、70、71/331、74、75、90、106、108、112、114、115、131、138、139、156、158/282/407、158/282/407/449、158/364/399/407/449、158/364/449、162、163/198/282/342、163/282/308/364/399、163/282/399/407、163/282/407/449、174、198/282/308/342、198/282/407、198/308、247、248、254、258、282/308/342/364/449、282/308/449、365、389、401/402、416、427、429、432、433および456から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号5976を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2P/4T/14I/158D/282S/364A/449R、2P/4T/14I/158D/282S/407V、2P/4T/14I/163A/198E、2P/4T/14I/163A/282S/399D、2P/4T/14I/198E/308L/407V、2P/4T/14I/282S/308L/364A、2P/4T/14I/282S/308L/407V、2P/4T/14I/282S/364A、2P/4T/158D/163A/364A/399D/407V、2P/4T/158D/198E/282S/364A/407V、2P/4T/163A/198E/282S/308L/342W、2P/4T/163A/282S/342W/364A、2P/4T/163A/364A/399D/449R、2P/4T/198E/282S/449R、2P/4T/198E/364A/391C/449R、2P/4T/282S/342W/364A/407V、2P/14I/158D/198E/407V/449R、2P/14I/163A/308L/364A、2P/14I/163A/364A/407V、2P/14I/282S、2P/14I/282S/308L、2P/14I/282S/308L/364A、2P/14I/282S/399D、2P/14I/308L、2P/14I/308L/364A、2P/158D/163A/407V/449R、2P/163A/282S、2P/163A/282S/308L/364A、2P/198E/282S/308L/342W、2P/198E/282S/399D、2P/282S、2P/282S/308L/342W/407V、2P/282S/308L/391C/407V、2P/282S/399D、2P/282S/399D/407V、2P/308L、2P/308L/364A/399D、4T/14I/158D/163A/198E/282S/407V、4T/14I/158D/282S/364A/391C/407V、4T/14I/163A/282S、4T/14I/163A/282S/308L/342W/407V/449R、4T/14I/198E/308L/364A、4T/14I/282S、4T/14I/282S/308L/364A/407V/449R、4T/14I/282S/342W/399D/407V、4T/14I/364A/391C、4T/158D/282S/364A/399D、4T/163A/282S/308L/407V、4T/198E/399D/407V、4T/282S/342W/364A/407V、4T/282S/364A/407V、4T/364A、12S、14I/158D/163A/198E/364A、14I/158D/163A/282S/364A、14I/158D/198E/282S/342W/364A/449R、14I/158D/364A、14I/163A/198E/282S/342W/364A/449R、14I/163A/282S/308L、14I/282S、14I/282S/308L、14I/282S/342W/364A/391C、14I/282S/364A、14I/282S/364A/391C/407V/449R、14I/282S/399D/407V/449R、14I/407V、37R、44V、70K、71L/331K、74H、75G、75M、90Q、90S、90T、106Y、108H、112N、114P、115R、131V、138V、139A、139R、139S、156C、158D/282S/407V、158D/282S/407V/449R、158D/364A/399D/407V/449R、158D/364A/449R、162A、163A/198E/282S/342W、163A/282S/308L/364A/399D、163A/282S/399D/407V、163A/282S/407V/449R、174P、198E/282S/308L/342W、198E/282S/407V、198E/308L、247C、247L、248C、248L、248W、254Q、258N、282S/308L/342W/364A/449R、282S/308L/449R、365I、389A、389E、389S、401F/402L、416L、416S、427K、427R、429W、432L、433Lおよび456Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5976を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E2P/K4T/V14I/P158D/T282S/G364A/S449R、E2P/K4T/V14I/P158D/T282S/E407V、E2P/K4T/V14I/L163A/D198E、E2P/K4T/V14I/L163A/T282S/N399D、E2P/K4T/V14I/D198E/R308L/E407V、E2P/K4T/V14I/T282S/R308L/G364A、E2P/K4T/V14I/T282S/R308L/E407V、E2P/K4T/V14I/T282S/G364A、E2P/K4T/P158D/L163A/G364A/N399D/E407V、E2P/K4T/P158D/D198E/T282S/G364A/E407V、E2P/K4T/L163A/D198E/T282S/R308L/E342W、E2P/K4T/L163A/T282S/E342W/G364A、E2P/K4T/L163A/G364A/N399D/S449R、E2P/K4T/D198E/T282S/S449R、E2P/K4T/D198E/G364A/L391C/S449R、E2P/K4T/T282S/E342W/G364A/E407V、E2P/V14I/P158D/D198E/E407V/S449R、E2P/V14I/L163A/R308L/G364A、E2P/V14I/L163A/G364A/E407V、E2P/V14I/T282S、E2P/V14I/T282S/R308L、E2P/V14I/T282S/R308L/G364A、E2P/V14I/T282S/N399D、E2P/V14I/R308L、E2P/V14I/R308L/G364A、E2P/P158D/L163A/E407V/S449R、E2P/L163A/T282S、E2P/L163A/T282S/R308L/G364A、E2P/D198E/T282S/R308L/E342W、E2P/D198E/T282S/N399D、E2P/T282S、E2P/T282S/R308L/E342W/E407V、E2P/T282S/R308L/L391C/E407V、E2P/T282S/N399D、E2P/T282S/N399D/E407V、E2P/R308L、E2P/R308L/G364A/N399D、K4T/V14I/P158D/L163A/D198E/T282S/E407V、K4T/V14I/P158D/T282S/G364A/L391C/E407V、K4T/V14I/L163A/T282S、K4T/V14I/L163A/T282S/R308L/E342W/E407V/S449R、K4T/V14I/D198E/R308L/G364A、K4T/V14I/T282S、K4T/V14I/T282S/R308L/G364A/E407V/S449R、K4T/V14I/T282S/E342W/N399D/E407V、K4T/V14I/G364A/L391C、K4T/P158D/T282S/G364A/N399D、K4T/L163A/T282S/R308L/E407V、K4T/D198E/N399D/E407V、K4T/T282S/E342W/G364A/E407V、K4T/T282S/G364A/E407V、K4T/G364A、R12S、V14I/P158D/L163A/D198E/G364A、V14I/P158D/L163A/T282S/G364A、V14I/P158D/D198E/T282S/E342W/G364A/S449R、V14I/P158D/G364A、V14I/L163A/D198E/T282S/
E342W/G364A/S449R、V14I/L163A/T282S/R308L、V14I/T282S、V14I/T282S/R308L、V14I/T282S/E342W/G364A/L391C、V14I/T282S/G364A、V14I/T282S/G364A/L391C/E407V/S449R、V14I/T282S/N399D/E407V/S449R、V14I/E407V、S37R、I44V、P70K、Q71L/R331K、W74H、L75G、L75M、P90Q、P90S、P90T、S106Y、M108H、P112N、D114P、E115R、P131V、L138V、P139A、P139R、P139S、S156C、P158D/T282S/E407V、P158D/T282S/E407V/S449R、P158D/G364A/N399D/E407V/S449R、P158D/G364A/S449R、E162A、L163A/D198E/T282S/E342W、L163A/T282S/R308L/G364A/N399D、L163A/T282S/N399D/E407V、L163A/T282S/E407V/S449R、L174P、D198E/T282S/R308L/E342W、D198E/T282S/E407V、D198E/R308L、K247C、K247L、H248C、H248L、H248W、S254Q、D258N、T282S/R308L/E342W/G364A/S449R、T282S/R308L/S449R、V365I、D389A、D389E、D389S、L401F/E402L、D416L、D416S、A427K、A427R、L429W、K432L、A433LおよびS456Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号5976を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6016、6018、6020、6022、6024、6026、6028、6030、6032、6034、6036、6038、6040、6042、6044、6046、6048、6050、6052、6054、6056、6058、6060、6062、6064、6066、6068、6070、6072、6074、6076、6078、6080、6082、6084、6086、6088、6090、6092、6094、6096、6098、6100、6102、6104、6106、6108、6110、6112、6114、6116、6118、6120、6122、6124、6126、6128、6130、6132、6134、6136、6138、6140、6142、6144、6146、6148、6150、6152、6154、6156、6158、6160、6162、6164、6166、6168、6170、6172、6174、6176、6178、6180、6182、6184、6186、6188、6190、6192、6194、6196、6198、6200、6202、6204、6206、6208、6210、6212、6214、6216、6218、6220、6222、6224、6226、6228、6230、6232、6234、6236、6238、6240、6242、6244、6246、6248、6250、6252、6254、6256、6258および6260のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6016、6018、6020、6022、6024、6026、6028、6030、6032、6034、6036、6038、6040、6042、6044、6046、6048、6050、6052、6054、6056、6058、6060、6062、6064、6066、6068、6070、6072、6074、6076、6078、6080、6082、6084、6086、6088、6090、6092、6094、6096、6098、6100、6102、6104、6106、6108、6110、6112、6114、6116、6118、6120、6122、6124、6126、6128、6130、6132、6134、6136、6138、6140、6142、6144、6146、6148、6150、6152、6154、6156、6158、6160、6162、6164、6166、6168、6170、6172、6174、6176、6178、6180、6182、6184、6186、6188、6190、6192、6194、6196、6198、6200、6202、6204、6206、6208、6210、6212、6214、6216、6218、6220、6222、6224、6226、6228、6230、6232、6234、6236、6238、6240、6242、6244、6246、6248、6250、6252、6254、6256、6258および6260のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、14/113/158、14/113/158/163、14/113/158/163/190/257/308/342、14/113/158/163/437、14/113/158/308/317/330/449、14/113/163/190/308/317、14/113/163/257/308/342/437/449、14/113/163/257/437、14/113/163/308/317/320/322/330/449、14/113/320/437/449、14/158、14/158/163/190/257/308/317/330/437、14/158/163/190/342/437、14/158/163/257、14/158/163/257/308/449、14/158/257/308/437/449、14/158/317/320/330/437、14/163/317/320、14/190、14/190/257/317/320/322、14/257/308/320/322/330、14/257/308/322/330/437、14/317、14/330、14/449、19、29/375、41、45、46、71、72、80、81、83、84、85、88、95、105、113/158/163/190/257/437、113/158/163/190/308/317/322、113/158/163/190/308/320、113/158/163/257/308/317/322/437/449、113/158/190/257/320、113/158/190/320/322/449、113/158/320/322/437、113/257/308、113/257/317/322/437、155、158/163、158/163/190/257/308/342/449、158/163/308、158/163/322/437、158/308/320/437、158/320/437/449、163/308/330/437/449、168、190/449、197、199、202、209、243、249、263、273、317/320/322/330、322/330、366、375および383から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号6138を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14I/113S/158P、14I/113S/158P/163A、14I/113S/158P/163A/190R/257Q/308L/342W、14I/113S/158P/163A/437I、14I/113S/158P/308L/317R/330D/449R、14I/113S/163A/190R/308L/317R、14I/113S/163A/257Q/308L/342W/437I/449R、14I/113S/163A/257Q/437I、14I/113S/163A/308L/317R/320I/322L/330D/449R、14I/113S/320I/437I/449R、14I/158P、14I/158P/163A/190R/257Q/308L/317R/330D/437I、14I/158P/163A/190R/342W/437I、14I/158P/163A/257Q、14I/158P/163A/257Q/308L/449R、14I/158P/257Q/308L/437I/449R、14I/158P/317R/320I/330D/437I、14I/163A/317R/320I、14I/190R、14I/190R/257Q/317R/320I/322L、14I/257Q/308L/320I/322L/330D、14I/257Q/308L/322L/330D/437I、14I/317R、14I/330D、14I/449R、19Q、29M/375P、41A、45L、46S、71V、72S、72T、80P、81T、83A、83K、83N、83S、83T、84D、84H、84N、85L、88A、88C、88H、88K、88T、95N、105A、113S/158P/163A/190R/257Q/437I、113S/158P/163A/190R/308L/317R/322L、113S/158P/163A/190R/308L/320I、113S/158P/163A/257Q/308L/317R/322L/437I/449R、113S/158P/190R/257Q/320I、113S/158P/190R/320I/322L/449R、113S/158P/320I/322L/437I、113S/257Q/308L、113S/257Q/317R/322L/437I、155L、158P/163A、158P/163A/190R/257Q/308L/342W/449R、158P/163A/308L、158P/163A/322L/437I、158P/308L/320I/437I、158P/320I/437I/449R、163A/308L/330D/437I/449R、168C、168T、190R/449R、197K、199E、199H、199M、199Q、199Y、202H、202Q、202T、202V、209T、243I、249S、263T、273A、273H、273R、317R/320I/322L/330D、322L/330D、366C、366L、366S、366T、366V、375A、375P、375T、375Vおよび383Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6138を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、V14I/E113S/D158P、V14I/E113S/D158P/L163A、V14I/E113S/D158P/L163A/K190R/L257Q/R308L/E342W、V14I/E113S/D158P/L163A/L437I、V14I/E113S/D158P/R308L/S317R/E330D/S449R、V14I/E113S/L163A/K190R/R308L/S317R、V14I/E113S/L163A/L257Q/R308L/E342W/L437I/S449R、V14I/E113S/L163A/L257Q/L437I、V14I/E113S/L163A/R308L/S317R/V320I/P322L/E330D/S449R、V14I/E113S/V320I/L437I/S449R、V14I/D158P、V14I/D158P/L163A/K190R/L257Q/R308L/S317R/E330D/L437I、V14I/D158P/L163A/K190R/E342W/L437I、V14I/D158P/L163A/L257Q、V14I/D158P/L163A/L257Q/R308L/S449R、V14I/D158P/L257Q/R308L/L437I/S449R、V14I/D158P/S317R/V320I/E330D/L437I、V14I/L163A/S317R/V320I、V14I/K190R、V14I/K190R/L257Q/S317R/V320I/P322L、V14I/L257Q/R308L/V320I/P322L/E330D、V14I/L257Q/R308L/P322L/E330D/L437I、V14I/S317R、V14I/E330D、V14I/S449R、V19Q、L29M/D375P、S41A、F45L、H46S、Q71V、D72S、D72T、T80P、H81T、P83A、P83K、P83N、P83S、P83T、G84D、G84H、G84N、A85L、R88A、R88C、R88H、R88K、R88T、H95N、E105A、E113S/D158P/L163A/K190R/L257Q/L437I、E113S/D158P/L163A/K190R/R308L/S317R/P322L、E113S/D158P/L163A/K190R/R308L/V320I、E113S/D158P/L163A/L257Q/R308L/S317R/P322L/L437I/S449R、E113S/D158P/K190R/L257Q/V320I、E113S/D158P/K190R/V320I/P322L/S449R、E113S/D158P/V320I/P322L/L437I、E113S/L257Q/R308L、E113S/L257Q/S317R/P322L/L437I、V155L、D158P/L163A、D158P/L163A/K190R/L257Q/R308L/E342W/S449R、D158P/L163A/R308L、D158P/L163A/P322L/L437I、D158P/R308L/V320I/L437I、D158P/V320I/L437I/S449R、L163A/R308L/E330D/L437I/S449R、P168C、P168T、K190R/S449R、Q197K、A199E、A199H、A199M、A199Q、A199Y、I202H、I202Q、I202T、I202V、E209T、L243I、Y249S、V263T、S273A、S273H、S273R、S317R/V320I/P322L/E330D、P322L/E330D、A366C、A366L、A366S、A366T、A366V、D375A、D375P、D375T、D375VおよびN383Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6138を参照して番号付けられている。
一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6262、6264、6266、6268、6270、6272、6274、6276、6278、6280、6282、6284、6286、6288、6290、6292、6294、6296、6298、6300、6302、6304、6306、6308、6310、6312、6314、6316、6318、6320、6322、6324、6326、6328、6330、6332、6334、6336、6338、6340、6342、6344、6346、6348、6350、6352、6354、6356、6358、6360、6362、6364、6366、6368、6370、6372、6374、6376、6378、6380、6382、6384、6386、6388、6390、6392、6394、6396、6398、6400、6402、6404、6406、6408、6410、6412、6414、6416、6418、6420、6422、6424、6426、6428、6430、6432、6434、6436、6438、6440、6442、6444、6446、6448、6450、6452、6454、6456、6458および6460のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6262、6264、6266、6268、6270、6272、6274、6276、6278、6280、6282、6284、6286、6288、6290、6292、6294、6296、6298、6300、6302、6304、6306、6308、6310、6312、6314、6316、6318、6320、6322、6324、6326、6328、6330、6332、6334、6336、6338、6340、6342、6344、6346、6348、6350、6352、6354、6356、6358、6360、6362、6364、6366、6368、6370、6372、6374、6376、6378、6380、6382、6384、6386、6388、6390、6392、6394、6396、6398、6400、6402、6404、6406、6408、6410、6412、6414、6416、6418、6420、6422、6424、6426、6428、6430、6432、6434、6436、6438、6440、6442、6444、6446、6448、6450、6452、6454、6456、6458および6460のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6262、6264、6266、6268、6270、6272、6274、6276、6278、6280、6282、6284、6286、6288、6290、6292、6294、6296、6298、6300、6302、6304、6306、6308、6310、6312、6314、6316、6318、6320、6322、6324、6326、6328、6330、6332、6334、6336、6338、6340、6342、6344、6346、6348、6350、6352、6354、6356、6358、6360、6362、6364、6366、6368、6370、6372、6374、6376、6378、6380、6382、6384、6386、6388、6390、6392、6394、6396、6398、6400、6402、6404、6406、6408、6410、6412、6414、6416、6418、6420、6422、6424、6426、6428、6430、6432、6434、6436、6438、6440、6442、6444、6446、6448、6450、6452、6454、6456、6458および6460のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、37/71/125/174/247/248/427、37/71/247/331/365/389/401/429、37/139/329/365/427/433/449、37/139/427/432/433/449、37/139/429/432/433、37/174/401/402/433/449、37/248/331/389/427/433、37/248/389/401/429、37/331/432/433、71/139/389/427/429/432/433/449、71/174/329/427/429/432/433、71/174/365/427/432、71/248/365/389/401、71/248/449、71/254/433/449、71/427/432/433/449、71/432/433、139/156/174/389/401/427/433/449、139/156/247/365/401/433/449、139/156/247/389/401/427/433/449、139/156/248/389、139/156/248/389/401/416/427/429/433、139/156/365、139/174/248/331/389/401/449、139/174/254、139/174/365/401/402/427/433/449、139/247/248/331/401/417/432/449、139/248/254/449、139/248/402/416/427/433/449、139/248/432/433、139/254/401/416/427/433/449、139/401/449、156/248/256、156/254/331/365/427/432/449、156/389/401/402/416/432/433、174/247/248/389/401/432/433、174/329/432/449、174/365、174/389/429/432/433/449、247/248/401、247/248/449、247/331/401/427/432/449、247/401、247/427/432、248/331/427/429/433、248/365/389/427/429/432/449、248/401/429/432/433、248/416、248/416/449、248/449、254/365、254/427/433、331/365/429/432/433/449、365/401/402/429/432/433、389/401/416/432/449、389/401/427/432、401/427、416/427/433/449、416/432/433、416/432/433/449、427/432、427/432/449、432および433/449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号6288を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、37R/71L/125M/174P/247C/248W/427R、37R/71L/247C/331K/365I/389E/401F/429W、37R/139K/329P/365I/427R/433L/449R、37R/139K/427R/432L/433L/449R、37R/139K/429W/432L/433L、37R/174P/401F/402L/433L/449R、37R/248W/331K/389E/427R/433L、37R/248W/389A/401F/429W、37R/331K/432L/433L、71L/139K/389A/427R/429W/432L/433L/449R、71L/174P/329P/427R/429W/432L/433L、71L/174P/365I/427R/432L、71L/248W/365I/389A/401F、71L/248W/449R、71L/254Q/433L/449R、71L/427R/432L/433L/449R、71L/432L/433L、139K/156C/174P/389E/401F/427R/433L/449R、139K/156C/247C/365I/401F/433L/449R、139K/156C/247L/389E/401F/427R/433L/449R、139K/156C/248W/389A/401F/416S/427R/429W/433L、139K/156C/248W/389E、139K/156C/365I、139K/174P/248W/331K/389A/401F/449R、139K/174P/254Q、139K/174P/365I/401F/402L/427R/433L/449R、139K/247C/248W/331K/401F/417Q/432L/449R、139K/248W/254A/449R、139K/248W/402L/416L/427R/433L/449R、139K/248W/432L/433L、139K/254Q/401F/416S/427R/433L/449R、139K/401F/449R、156C/248W/256M、156C/254Q/331K/365I/427R/432L/449R、156C/389E/401F/402L/416L/432L/433L、174P/247C/248W/389A/401F/432L/433L、174P/329P/432L/449R、174P/365I、174P/389E/429W/432L/433L/449R、247C/248W/401F、247C/331K/401F/427R/432L/449R、247C/427R/432L、247L/248W/449R、247L/401F、248W/331K/427R/429W/433L、248W/365I/389E/427R/429W/432L/449R、248W/401F/429W/432L/433L、248W/416L、248W/416L/449R、248W/449R、254Q/365I、254Q/427R/433L、331K/365I/429W/432L/433L/449R、365I/401F/402L/429W/432L/433L、389A/401F/416S/432L/449R、389E/401F/427R/432L、401F/427R、416L/427R/433L/449R、416L/432L/433L/449R、416S/432L/433L、427R/432L、427R/432L/449R、432Lおよび433L/449Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6288を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S37R/Q71L/L125M/L174P/K247C/H248W/A427R、S37R/Q71L/K247C/R331K/V365I/D389E/L401F/L429W、S37R/P139K/G329P/V365I/A427R/A433L/S449R、S37R/P139K/A427R/K432L/A433L/S449R、S37R/P139K/L429W/K432L/A433L、S37R/L174P/L401F/E402L/A433L/S449R、S37R/H248W/R331K/D389E/A427R/A433L、S37R/H248W/D389A/L401F/L429W、S37R/R331K/K432L/A433L、Q71L/P139K/D389A/A427R/L429W/K432L/A433L/S449R、Q71L/L174P/G329P/A427R/L429W/K432L/A433L、Q71L/L174P/V365I/A427R/K432L、Q71L/H248W/V365I/D389A/L401F、Q71L/H248W/S449R、Q71L/S254Q/A433L/S449R、Q71L/A427R/K432L/A433L/S449R、Q71L/K432L/A433L、P139K/S156C/L174P/D389E/L401F/A427R/A433L/S449R、P139K/S156C/K247C/V365I/L401F/A433L/S449R、P139K/S156C/K247L/D389E/L401F/A427R/A433L/S449R、P139K/S156C/H248W/D389A/L401F/D416S/A427R/L429W/A433L、P139K/S156C/H248W/D389E、P139K/S156C/V365I、P139K/L174P/H248W/R331K/D389A/L401F/S449R、P139K/L174P/S254Q、P139K/L174P/V365I/L401F/E402L/A427R/A433L/S449R、P139K/K247C/H248W/R331K/L401F/P417Q/K432L/S449R、P139K/H248W/S254A/S449R、P139K/H248W/E402L/D416L/A427R/A433L/S449R、P139K/H248W/K432L/A433L、P139K/S254Q/L401F/D416S/A427R/A433L/S449R、P139K/L401F/S449R、S156C/H248W/L256M、S156C/S254Q/R331K/V365I/A427R/K432L/S449R、S156C/D389E/L401F/E402L/D416L/K432L/A433L、L174P/K247C/H248W/D389A/L401F/K432L/A433L、L174P/G329P/K432L/S449R、L174P/V365I、L174P/D389E/L429W/K432L/A433L/S449R、K247C/H248W/L401F、K247C/R331K/L401F/A427R/K432L/S449R、K247C/A427R/K432L、K247L/H248W/S449R、K247L/L401F、H248W/R331K/A427R/L429W/A433L、H248W/V365I/D389E/A427R/L429W/K432L/S449R、H248W/L401F/L429W/K432L/A433L、H248W/D416L、H248W/D416L/S449R、H248W/S449R、S254Q/V365I、S254Q/A427R/A433L、R331K/V365I/L429W/K432L/A433L/S449R、V365I/L401F/E402L/L429W/K432L/A433L、D389A/L401F/D416S/K432L/S449R、D389E/L401F/A427R/K432L、L401F/A427R、D416L/A427R/A433L/S449R、D416L/K432L/A433L/S449R、D416S/K432L/A433L、A427R/K432L、A427R/K432L/S449R、K432LおよびA433L/S449Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号6288を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、5/449、6、10、25、25/449、69、69/449、87、87/449、91、91/449、144/449、153、153/449、159、159/449、172、172/449、212/449、233、233/449、288/449、303、317、347/449、361、369、
および421から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6288を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、5S/449R、6P、10K、25I/449R、25M/449R、25Q/449R、25S、69A、69M/449R、87A/449R、87E、87K、87Q、87R、91L、91N/449R、91Q、91T/449R、91V、144Q/449R、153T/449R、153V、159K、159R/449R、172S、172T/449R、212L/449R、233A、233C、233G、233L/449R、233M/449R、233Q/449R、233R、233S、233V、288P/449R、303C、303V、317Y、347P/449R、361C、369Kおよび421Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6288を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、T5S/S449R、E6P、R10K、L25I/S449R、L25M/S449R、L25Q/S449R、L25S、D69A、D69M/S449R、M87A/S449R、M87E、M87K、M87Q、M87R、I91L、I91N/S449R、I91Q、I91T/S449R、I91V、M144Q/S449R、A153T/S449R、A153V、Q159K、Q159R/S449R、H172S、H172T/S449R、A212L/S449R、W233A、W233C、W233G、W233L/S449R、W233M/S449R、W233Q/S449R、W233R、W233S、W233V、E288P/S449R、Q303C、Q303V、S317Y、K347P/S449R、T361C、V369KおよびV421Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6288を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6462、6464、6466、6468、6470、6472、6474、6476、6478、6480、6482、6484、6486、6488、6490、6492、6494、6496、6498、6500、6502、6504、6506、6508、6510、6512、6514、6516、6518、6520、6522、6524、6526、6528、6530、6532、6534、6536、6538、6540、6542、6544、6546、6548、6550、6552、6554、6556、6558、6560、6562、6564、6566、6568、6570、6572、6574、6576、6578、6580、6582、6584、6586、6588、6590、6592、6594、6596、6598、6600、6602、6604、6606、6608、6610、6612、6614、6616、6618、6620、6622、6624、6626、6628、6630、6632、6634、6636、6638、6640、6642、6644、6646、6648、6650、6652、6654、6656、6658、6660、6662、6664、6666、6668、6670、6672、6674および6676のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6462、6464、6466、6468、6470、6472、6474、6476、6478、6480、6482、6484、6486、6488、6490、6492、6494、6496、6498、6500、6502、6504、6506、6508、6510、6512、6514、6516、6518、6520、6522、6524、6526、6528、6530、6532、6534、6536、6538、6540、6542、6544、6546、6548、6550、6552、6554、6556、6558、6560、6562、6564、6566、6568、6570、6572、6574、6576、6578、6580、6582、6584、6586、6588、6590、6592、6594、6596、6598、6600、6602、6604、6606、6608、6610、6612、6614、6616、6618、6620、6622、6624、6626、6628、6630、6632、6634、6636、6638、6640、6642、6644、6646、6648、6650、6652、6654、6656、6658、6660、6662、6664、6666、6668、6670、6672、6674および6676のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6462、6464、6466、6468、6470、6472、6474、6476、6478、6480、6482、6484、6486、6488、6490、6492、6494、6496、6498、6500、6502、6504、6506、6508、6510、6512、6514、6516、6518、6520、6522、6524、6526、6528、6530、6532、6534、6536、6538、6540、6542、6544、6546、6548、6550、6552、6554、6556、6558、6560、6562、6564、6566、6568、6570、6572、6574、6576、6578、6580、6582、6584、6586、6588、6590、6592、6594、6596、6598、6600、6602、6604、6606、6608、6610、6612、6614、6616、6618、6620、6622、6624、6626、6628、6630、6632、6634、6636、6638、6640、6642、6644、6646、6648、6650、6652、6654、6656、6658、6660、6662、6664、6666、6668、6670、6672、6674および6676のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、37/41/45/72/81/83/84/88/155/163/168/190/331/375、37/41/45/72/81/83/84/88/155/263/273/331/375/432、37/41/45/72/81/83/84/88/155/331/366/375、37/41/45/72/81/83/84/88/155/331/375、37/41/45/72/81/83/84/88/248/375、37/41/45/72/81/83/84/88/331/366/432/433、37/41/45/72/88/155/168/190/331/366/375/432、37/41/45/72/88/155/168/190/331/375、37/41/45/72/88/190/263/273/331/366、37/41/45/72/155/163/168/190/243/263/273/331/366/432、37/41/45/72/155/163/168/243/248/273/331/366/432/433、37/41/45/72/155/163/168/263/366/432/433、37/41/45/72/155/163/331/366/375、37/41/45/72/155/190/243/248/273/331/432/433、37/41/45/72/155/190/248/263/331、37/41/45/72/155/190/263/331/366、37/41/45/72/155/190/273/331/366/375、37/41/45/72/155/190/273/366、37/41/45/72/155/190/273/366/375/432、37/41/45/72/155/248/263/273/366、37/41/45/72/155/263/331/375、37/41/45/72/155/263/375、37/41/45/72/155/273/366、37/41/45/72/155/331/366/375/432/433、37/41/45/72/190/263/273/331、37/41/45/72/190/331/366、37/41/45/72/190/366、37/41/45/72/263/331/366、37/41/45/72/263/366/432/433、37/41/45/72/331/366、37/41/45/81/83/84/88/155/168/190/243/331/366、37/41/45/81/83/84/88/155/168/331/375、37/41/45/81/83/84/88/155/263/273/331/366、37/41/45/81/83/84/88/163/168/263/273/331/366/375、37/41/45/155/163/168/263/331/375、37/41/45/155/168/248/273/331/375、37/41/45/155/190/331/366/375、37/41/45/155/366、37/41/45/155/366/432/433、37/41/45/155/375、37/41/45/243/248/273/331、37/41/45/263/331/375/432、37/41/45/331/366/432/433、37/72/81/83/88/155/190、37/72/197/273/331/375/432、37/83/263/365/366/375、37/190/202、41/45/72/155/263/331/366/375/432/433、41/45/163/168/243/248/273/366/432、45/72/84/88/197/375、45/72/88/366、45/72/163/202/365/366/375、45/72/168/243/331/365/366/429/432、45/84/168/190/199/254/273/365/366、45/163/168/190/199/366/429/432、45/163/168/197/263/331/365/366、72/81/83/84/88/155/163/168/190/366、72/81/83/84/88/155/190、72/81/83/84/88/155/190/273/331/366/432、72/81/83/84/88/155/273/331/375、72/81/83/84/88/155/366、72/81/83/84/88/163/168/190/243/263/331/366、72/81/83/84/88/163/168/263/331/375、72/81/84/190/248、72/83/84/88/202/254/273/366/375、72/83/84/197/202/243/263/365/366、72/83/88/243/263/331/365/366、72/155/163/168/190/366/432/433、72/155/190、72/155/190/263/331/366、72/155/190/366、72/155/273/331/375/432、72/243/248/263/366/432/433、72/243/248/273/366/432/433、72/243/248/366/432/433、72/248、81/83/84/88/155/163/168/273/331/375、81/83/84/88/155/190/263/331/366、81/83/84/88/155/263/366/375、81/83/84/88/155/366、81/83/84/88/190/263/375、81/83/84/88/263/273/331/366/432、81/83/169/190/263、81/83/190/263/365/366、81/83/202/365/366/402、81/88/375/402、83/88/155/273/366/375、84/155/168/197/199/331/366/375/383/402、84/168/197/202/263/366、84/197/366/402、155/168/190/197/199/366、155/168/375、155/263/366/432/433、190/199/202/331/366、197/199/202、197/202/248、197/248、199/263/331/365/366、248/375、365/366および365/375/402から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号6468を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/155L/163A/168T/190R/331K/375P、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/155L/263T/273R/331K/375P/432L、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/155L/331K/366C/375P、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/155L/331K/375P、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/248W/375P、37R/41A/45L/72T/81T/83S/84N/88T/331K/366V/432L/433A、37R/41A/45L/72T/88T/155L/168T/190R/331K/366C/375P/432L、37R/41A/45L/72T/88T/155L/168T/190R/331K/375P、37R/41A/45L/72T/88T/190R/263T/273R/331K/366C、37R/41A/45L/72T/155L/163A/168T/190R/243I/263T/273R/331K/366C/432L、37R/41A/45L/72T/155L/163A/168T/243I/248W/273R/331K/366V/432L/433A、37R/41A/45L/72T/155L/163A/168T/263T/366C/432L/433A、37R/41A/45L/72T/155L/163A/331K/366C/375P、37R/41A/45L/72T/155L/190R/243I/248W/273R/331K/432L/433A、37R/41A/45L/72T/155L/190R/248W/263T/331K、37R/41A/45L/72T/155L/190R/263T/331K/366C、37R/41A/45L/72T/155L/190R/273R/331K/366V/375P、37R/41A/45L/72T/155L/190R/273R/366C、37R/41A/45L/72T/155L/190R/273R/366C/375P/432L、37R/41A/45L/72T/155L/248W/263T/273R/366C、37R/41A/45L/72T/155L/263T/331K/375P、37R/41A/45L/72T/155L/263T/375P、37R/41A/45L/72T/155L/273R/366C、37R/41A/45L/72T/155L/331K/366V/375P/432L/433A、37R/41A/45L/72T/190R/263T/273R/331K、37R/41A/45L/72T/190R/331K/366C、37R/41A/45L/72T/190R/366C、37R/41A/45L/72T/263T/331K/366C、37R/41A/45L/72T/263T/366C/432L/433A、37R/41A/45L/72T/331K/366C、37R/41A/45L/81T/83S/84N/88T/155L/168T/190R/243I/331K/366C、37R/41A/45L/81T/83S/84N/88T/155L/168T/331K/375P、37R/41A/45L/81T/83S/84N/88T/155L/263T/273R/331K/366C、37R/41A/45L/81T/83S/84N/88T/163A/168T/263T/273R/331K/366C/375P、37R/41A/45L/155L/163A/168T/263T/331K/375P、37R/41A/45L/155L/168T/248W/273R/331K/375P、37R/41A/45L/155L/190R/331K/366V/375P、37R/41A/45L/155L/366C、37R/41A/45L/155L/366C/432L/433A、37R/41A/45L/155L/375P、37R/41A/45L/243I/248W/273R/331K、37R/41A/45L/263T/331K/375P/432L、37R/41A/45L/331K/366V/432L/433A、37R/72T/81T/83S/88T/155L/190R、37R/72T/197K/273R/331K/375P/432L、37R/83S/263T/365I/366V/375P、37R/190R/202H、41A/45L/72T/155L/263T/331K/366V/375P/432L/433A、41A/45L/163A/168T/243I/248W/273R/366C/432L、45L/72T/84N/88T/197K/375P、45L/72T/88T/366C、45L/72T/163A/202H/365I/366V/375P、45L/72T/168T/
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72T/V155L/S273R/R331K/D375P/K432L、D72T/L243I/H248W/V263T/A366V/K432L/L433A、D72T/
L243I/H248W/S273R/A366V/K432L/L433A、D72T/L243I/H248W/A366V/K432L/L433A、D72T/H248W、H81T/P83S/G84N/R88T/V155L/L163A/P168T/S273R/R331K/D375P、H81T/P83S/G84N/R88T/V155L/K190R/V263T/R331K/A366C、H81T/P83S/G84N/R88T/V155L/V263T/A366V/D375P、H81T/P83S/G84N/R88T/V155L/A366C、H81T/P83S/G84N/R88T/K190R/V263T/D375P、H81T/P83S/G84N/R88T/V263T/S273R/R331K/A366C/K432L、H81T/P83S/E169D/K190R/V263T、H81T/P83S/K190R/V263T/V365I/A366C、H81T/P83S/I202H/V365I/A366C/E402L、H81T/R88T/D375P/E402L、P83S/R88T/V155L/S273R/A366V/D375P、G84N/V155L/P168T/Q197K/A199Q/R331K/A366V/D375P/N383V/E402L、G84N/P168T/Q197K/I202H/V263T/A366C、G84N/Q197K/A366C/E402L、V155L/P168T/K190R/Q197K/A199Q/A366C、V155L/P168T/D375P、V155L/V263T/A366C/K432L/L433A、K190R/A199Q/I202H/R331K/A366C、Q197K/A199Q/I202H、Q197K/I202H/H248W、Q197K/H248W、A199Q/V263T/R331K/V365I/A366C、H248W/D375P、V365I/A366CおよびV365I/D375P/E402Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6468を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2、3、4、9、53/437、61、64、72/170、72/405、94、96、98、113、118、118/120、120、129、134/158、158、165、170、171、173、183、193、214、214/222、222、226、229、234、253、265、269、272、289、296、300、302、304、322、322/407、330、390、395/439、396、398、399、403、405、408、411、412、423、428、434、435、438、439、442、444、448、449、452および454から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6468を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2F、2H、2K、2M、2Q、2R、2V、3F、3L、3M、4N、4S、9A、9G、9K、9M、9S、53E/437T、61Q、64L、64M、72E/170A、72E/405S、94R、96C、96K、98E、98S、98T、113D、113G、113P、118C、118T/120V、118V、120V、129P、134E/158N、158T、165L、170A、170G、170H、170P、170V、171A、171L、171P、171Q、173I、173K、173L、173S、183I、183L、183P、193F、214K、214R、214R/222H、222A、222N、222Q、222R、226S、229M、229Q、234N、234S、234T、253D、253E、253N、253P、253T、253V、265H、269L、269M、269N、269R、272S、289D、289G、289N、289R、296Q、300A、300E、302G、304K、304P、322A、322G、322K、322P、322P/407I、322S、322T、322V/407I、330S、390I、390R、395I/439V、396T、396V、398S、399P、399Q、399S、403V、405A、405D、405P、405S、405T、408D、408K、408S、411H、411K、411T、412K、423T、428E、428G、428I、428L、428N、428Q、428R、428S、428T、428V、428Y、434E、434G、435A、435D、435E、435G、435I、435K、435L、435N、435S、435V、435Y、438E、438R、438S、439A、439E、439G、439H、439M、439R、439W、442F、442T、444A、448K、448Q、449G、449L、449S、452Tおよび454Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6468を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、P2F、P2H、P2K、P2M、P2Q、P2R、P2V、N3F、N3L、N3M、T4N、T4S、V9A、V9G、V9K、V9M、V9S、K53E/I437T、S61Q、F64L、F64M、D72E/D170A、D72E/E405S、K94R、G96C、G96K、D98E、D98S、D98T、S113D、S113G、S113P、A118C、A118T/L120V、A118V、L120V、A129P、D134E/P158N、P158T、Y165L、D170A、D170G、D170H、D170P、D170V、K171A、K171L、K171P、K171Q、R173I、R173K、R173L、R173S、M183I、M183L、M183P、Y193F、S214K、S214R、S214R/K222H、K222A、K222N、K222Q、K222R、E226S、L229M、L229Q、R234N、R234S、R234T、S253D、S253E、S253N、S253P、S253T、S253V、Q265H、Q269L、Q269M、Q269N、Q269R、P272S、K289D、K289G、K289N、K289R、R296Q、D300A、D300E、K302G、S304K、S304P、L322A、L322G、L322K、L322P、L322P/V407I、L322S、L322T、L322V/V407I、E330S、V390I、V390R、V395I/P439V、Y396T、Y396V、E398S、N399P、N399Q、N399S、R403V、E405A、E405D、E405P、E405S、E405T、N408D、N408K、N408S、R411H、R411K、R411T、R412K、R423T、K428E、K428G、K428I、K428L、K428N、K428Q、K428R、K428S、K428T、K428V、K428Y、D434E、D434G、R435A、R435D、R435E、R435G、R435I、R435K、R435L、R435N、R435S、R435V、R435Y、A438E、A438R、A438S、P439A、P439E、P439G、P439H、P439M、P439R、P439W、S442F、S442T、Y444A、E448K、E448Q、R449G、R449L、R449S、S452TおよびI454Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6468を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6678、6680、6682、6684、6686、6688、6690、6692、6694、6696、6698、6700、6702、6704、6706、6708、6710、6712、6714、6716、6718、6720、6722、6724、6726、6728、6730、6732、6734、6736、6738、6740、6742、6744、6746、6748、6750、6752、6754、6756、6758、6760、6762、6764、6766、6768、6770、6772、6774、6776、6778、6780、6782、6784、6786、6788、6790、6792、6794、6796、6798、6800、6802、6804、6806、6808、6810、6812、6814、6816、6818、6820、6822、6824、6826、6828、6830、6832、6834、6836、6838、6840、6842、6844、6846、6848、6850、6852、6854、6856、6858、6860、6862、6864、6866、6868、6870、6872、6874、6876、6878、6880、6882、6884、6886、6888、6890、6892、6894、6896、6898、6900、6902、6904、6906、6908、6910、6912、6914、6916、6918、6920、6922、6924、6926、6928、6930、6932、6934、6936、6938、6940、6942、6944、6946、6948、6950、6952、6954、6956、6958、6960、6962、6964、6966、6968、6970、6972、6974、6976、6978、6980、6982、6984、6986、6988、6990、6992、6994、6996、6998、7000、7002、7004、7006、7008、7010、7012、7014、7016、7018、7020、7022、7024、7026、7028、7030、7032、7034、7036、7038、7040、7042、7044、7046、7048、7050、7052、7054、7056、7058、7060、7062、7064、7066、7068、7070、7072、7074、7076、7078、7080、7082、7084、7086、7088、7090、7092、7094、7096、7098、7100、7102、7104、7106、7108、7110、7112、7114、7116、7118、7120、7122、7124、7126、7128、7130、7132、7134、7136、7138、7140、7142、7144、7146、7148、7150、7152、7154、7156、7158、7160、7162、7164、7166、7168、7170、7172、7174、7176、7178、7180、7182、7184、7186、7188、7190、7192、7194、7196、7198、7200、7202、7204、7206、7208、7210、7212および7214のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。
一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6678、6680、6682、6684、6686、6688、6690、6692、6694、6696、6698、6700、6702、6704、6706、6708、6710、6712、6714、6716、6718、6720、6722、6724、6726、6728、6730、6732、6734、6736、6738、6740、6742、6744、6746、6748、6750、6752、6754、6756、6758、6760、6762、6764、6766、6768、6770、6772、6774、6776、6778、6780、6782、6784、6786、6788、6790、6792、6794、6796、6798、6800、6802、6804、6806、6808、6810、6812、6814、6816、6818、6820、6822、6824、6826、6828、6830、6832、6834、6836、6838、6840、6842、6844、6846、6848、6850、6852、6854、6856、6858、6860、6862、6864、6866、6868、6870、6872、6874、6876、6878、6880、6882、6884、6886、6888、6890、6892、6894、6896、6898、6900、6902、6904、6906、6908、6910、6912、6914、6916、6918、6920、6922、6924、6926、6928、6930、6932、6934、6936、6938、6940、6942、6944、6946、6948、6950、6952、6954、6956、6958、6960、6962、6964、6966、6968、6970、6972、6974、6976、6978、6980、6982、6984、6986、6988、6990、6992、6994、6996、6998、7000、7002、7004、7006、7008、7010、7012、7014、7016、7018、7020、7022、7024、7026、7028、7030、7032、7034、7036、7038、7040、7042、7044、7046、7048、7050、7052、7054、7056、7058、7060、7062、7064、7066、7068、7070、7072、7074、7076、7078、7080、7082、7084、7086、7088、7090、7092、7094、7096、7098、7100、7102、7104、7106、7108、7110、7112、7114、7116、7118、7120、7122、7124、7126、7128、7130、7132、7134、7136、7138、7140、7142、7144、7146、7148、7150、7152、7154、7156、7158、7160、7162、7164、7166、7168、7170、7172、7174、7176、7178、7180、7182、7184、7186、7188、7190、7192、7194、7196、7198,7200、7202、7204、7206、7208、7210、7212および7214のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号6678、6680、6682、6684、6686、6688、6690、6692、6694、6696、6698、6700、6702、6704、6706、6708、6710、6712、6714、6716、6718、6720、6722、6724、6726、6728、6730、6732、6734、6736、6738、6740、6742、6744、6746、6748、6750、6752、6754、6756、6758、6760、6762、6764、6766、6768、6770、6772、6774、6776、6778、6780、6782、6784、6786、6788、6790、6792、6794、6796、6798、6800、6802、6804、6806、6808、6810、6812、6814、6816、6818、6820、6822、6824、6826、6828、6830、6832、6834、6836、6838、6840、6842、6844、6846、6848、6850、6852、6854、6856、6858、6860、6862、6864、6866、6868、6870、6872、6874、6876、6878、6880、6882、6884、6886、6888、6890、6892、6894、6896、6898、6900、6902、6904、6906、6908、6910、6912、6914、6916、6918、6920、6922、6924、6926、6928、6930、6932、6934、6936、6938、6940、6942、6944、6946、6948、6950、6952、6954、6956、6958、6960、6962、6964、6966、6968、6970、6972、6974、6976、6978、6980、6982、6984、6986、6988、6990、6992、6994、6996、6998、7000、7002、7004、7006、7008、7010、7012、7014、7016、7018、7020、7022、7024、7026、7028、7030、7032、7034、7036、7038、7040、7042、7044、7046、7048、7050、7052、7054、7056、7058、7060、7062、7064、7066、7068、7070、7072、7074、7076、7078、7080、7082、7084、7086、7088、7090、7092、7094、7096、7098、7100、7102、7104、7106、7108、7110、7112、7114、7116、7118、7120、7122、7124、7126、7128、7130、7132、7134、7136、7138、7140、7142、7144、7146、7148、7150、7152、7154、7156、7158、7160、7162、7164、7166、7168、7170、7172、7174、7176、7178、7180、7182、7184、7186、7188、7190、7192、7194、7196、7198,7200、7202、7204、7206、7208、7210、7212および7214のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、5/6/25/317、5/6/69/288/303、5/6/91/288/317、5/25/91/212/303/317、5/25/91/263、5/25/288、5/69/91/212/288、5/69/91/212/303、5/91/288/303、5/91/303、5/91/317/421、5/288、6/91/212/288/303/369/421、6/212/288/303、6/288、25/91/212/288、25/91/263/288/303、25/91/303/317/369、25/91/317/369、25/263/317、87/144、87/144/159/361、87/144/159/361/433、87/433、88/144、88/144/159、91/263/317/369、91/288/303/317/369、91/288/317/369/421、91/303、91/317、91/317/369、109/144/153/155/159/433、144、212/288、263/288/303/317および288から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号6864を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、5S/6P/25I/317Y、5S/6P/69A/288P/303V、5S/6P/91Q/288P/317Y、5S/25Q/91Q/212L/303V/317Y、5S/25Q/91Q/263T、5S/25Q/288P、5S/69A/91Q/212L/288P、5S/69A/91Q/212L/303V、5S/91Q/288P/303V、5S/91Q/303V、5S/91Q/317Y/421I、5S/288P、6P/91Q/212L/288P/303V/369K/421I、6P/212L/288P/303V、6P/288P、25Q/91Q/212L/288P、25Q/91Q/263T/288P/303V、25Q/91Q/317Y/369K、25Q/91T/303V/317Y/369K、25Q/263T/317Y、87K/144Q、87K/144Q/159K/361C、87K/144Q/159K/361C/433A、87K/433A、88T/144Q、88T/144Q/159K、91Q/263T/317Y/369K、91Q/288P/303V/317Y/369K、91Q/288P/317Y/369K/421I、91Q/303V、91Q/317Y、91Q/317Y/369K、109W/144Q/153V/155L/159K/433A、144Q、212L/288P、263T/288P/303V/317Yおよび288Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6864を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、T5S/E6P/L25I/S317Y、T5S/E6P/D69A/E288P/Q303V、T5S/E6P/I91Q/E288P/S317Y、T5S/L25Q/I91Q/A212L/Q303V/S317Y、T5S/L25Q/I91Q/V263T、T5S/L25Q/E288P、T5S/D69A/I91Q/A212L/E288P、T5S/D69A/I91Q/A212L/Q303V、T5S/I91Q/E288P/Q303V、T5S/I91Q/Q303V、T5S/I91Q/S317Y/V421I、T5S/E288P、E6P/I91Q/A212L/E288P/Q303V/V369K/V421I、E6P/A212L/E288P/Q303V、E6P/E288P、L25Q/I91Q/A212L/E288P、L25Q/I91Q/V263T/E288P/Q303V、L25Q/I91Q/S317Y/V369K、L25Q/I91T/Q303V/S317Y/V369K、L25Q/V263T/S317Y、M87K/M144Q、M87K/M144Q/Q159K/T361C、M87K/M144Q/Q159K/T361C/L433A、M87K/L433A、R88T/M144Q、R88T/M144Q/Q159K、I91Q/V263T/S317Y/V369K、I91Q/E288P/Q303V/S317Y/V369K、I91Q/E288P/S317Y/V369K/V421I、I91Q/Q303V、I91Q/S317Y、I91Q/S317Y/V369K、R109W/M144Q/A153V/V155L/Q159K/L433A、M144Q、A212L/E288P、V263T/E288P/Q303V/S317YおよびE288Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号6864を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7362、7364、7366、7368、7370、7372、7374、7376、7378、7380、7382、7384、7386、7388、7390、7392、7394、7396、7398、7400、7402、7404、7406、7408、7410、7412、7414、7416、7418、7420、7422、7424、7426、7428、7430、7432、7434および7436のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含み、位置は、配列番号6864を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7362、7364、7366、7368、7370、7372、7374、7376、7378、7380、7382、7384、7386、7388、7390、7392、7394、7396、7398、7400、7402、7404、7406、7408、7410、7412、7414、7416、7418、7420、7422、7424、7426、7428、7430、7432、7434および7436のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7362、7364、7366、7368、7370、7372、7374、7376、7378、7380、7382、7384、7386、7388、7390、7392、7394、7396、7398、7400、7402、7404、7406、7408、7410、7412、7414、7416、7418、7420、7422、7424、7426、7428、7430、7432、7434および7436のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/3/433/435/442、2/81、9/37/113/396、9/87、9/144/331、37/113/144/396、37/233、53/144/233/269/331/428、53/233/269/390/395/396、53/234、61/120/156/163/165/197/303/308、61/120/159/300/308/407、61/120/300/303/407、61/156/159/163/165/243/248/253/300/303/308、61/156/163/243/248/300/303/308/407、61/156/163/300/365/411、61/156/197/253、61/163/300/303/308/405/407/411、61/165/248/253/407/411、61/214、61/214/300/308、61/243/300/308/407/411、61/300/303/308、61/300/303/405、61/365/405、69、69/81、69/134、69/263、69/263/434/438/439、69/439、81、81/134、81/222、81/222/263/322/435/442、81/433/435/438/442、85/156/159/243/248/253/308/405/407/411、87/144、87/144/396、113/233/234、120/156/159/169/197/214/303/308/365/405/407、120/156/159/248/300/308、120/156/248/303/308/411、120/159、120/159/165/197、120/159/197/308/407/411、120/159/197/365/411、120/197/253/300/308、120/253/300/303/308/407、120/308/407/411、134/222/263、144/234/269、156/165/248/300/303/308、156/197/248/300/411、156/214/308/411、156/248/253/308、159/163/165/197/214/243/300/303/308/407、163/197/253/300/303/308/365、171/263、183/233/234/331/428、197/253/308/407、197/300/303/308/365、197/300/308/411、222、222/263/435/442、233/396/399、263、269、269/428/437、300/303/308、300/308/405/411、308および322から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号7388を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2K/3M/433A/435E/442F、2K/81T、9G/37S/113D/396T、9G/87K、9G/144Q/331R、37S/113D/144Q/396T、37S/233S、53E/144Q/233Q/269R/331R/428I、53E/233Q/269R/390I/395I/396T、53E/234N、61Q/120V/156S/163A/165L/197K/303V/308L、61Q/120V/159K/300A/308L/407I、61Q/120V/300A/303V/407I、61Q/156S/159K/163A/165L/243I/248W/253T/300A/303V/308L、61Q/156S/163A/243I/248W/300A/303V/308L/407I、61Q/156S/163A/300A/365I/411T、61Q/156S/197K/253E、61Q/163A/300A/303V/308L/405P/407I/411T、61Q/165L/248W/253T/407I/411T、61Q/214R、61Q/214R/300A/308L、61Q/243I/300A/308L/407I/411T、61Q/300A/303V/308L、61Q/300A/303V/405P、61Q/365I/405P、69A、69A/81T、69A/134E、69A/263T、69A/263T/434E/438S/439H、69A/439H、81T、81T/134E、81T/222A、81T/222A/263T/322S/435E/442F、81T/433A/435I/438R/442F、85V/156S/159K/243I/248W/253T/308L/405P/407I/411T、87K/144Q、87K/144Q/396T、113D/233Q/234N、120V/156S/159K/169D/197K/214R/303V/308L/365I/405P/407I、120V/156S/159K/248W/300A/308L、120V/156S/248W/303V/308L/411T、120V/159K、120V/159K/165L/197K、120V/159K/197K/308L/407I/411T、120V/159K/197K/365I/411T、120V/197K/253T/300A/308L、120V/253T/300A/303V/308L/407I、120V/308L/407I/411T、134E/222A/263T、144Q/234N/269R、156S/165L/248W/300A/303V/308L、156S/197K/248W/300A/411T、156S/214R/308L/411T、156S/248W/253T/308L、159K/163A/165L/197K/214R/243I/300A/303V/308L/407I、163A/197K/253E/300A/303V/308L/365I、171P/263T、183L/233Q/234N/331R/428I、197K/253T/308L/407I、197K/300A/303V/308L/365I、197K/300A/308L/411T、222A、222A/263T/435I/442F、233Q/396T/399Q、263T、269R、269R/428I/437L、300A/303V/308L、300A/308L/405P/411T、308Lおよび322Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7388を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、P2K/N3M/L433A/R435E/S442F、P2K/H81T、V9G/R37S/S113D/Y396T、V9G/M87K、V9G/M144Q/K331R、R37S/S113D/M144Q/Y396T、R37S/W233S、K53E/M144Q/W233Q/Q269R/K331R/K428I、K53E/W233Q/Q269R/V390I/V395I/Y396T、K53E/R234N、S61Q/L120V/C156S/L163A/Y165L/Q197K/Q303V/R308L、S61Q/L120V/Q159K/D300A/R308L/V407I、S61Q/L120V/D300A/Q303V/V407I、S61Q/C156S/Q159K/L163A/Y165L/L243I/H248W/S253T/D300A/Q303V/R308L、S61Q/C156S/L163A/L243I/H248W/D300A/Q303V/R308L/V407I、S61Q/C156S/L163A/D300A/V365I/R411T、S61Q/C156S/Q197K/S253E、S61Q/L163A/D300A/Q303V/R308L/E405P/V407I/R411T、S61Q/Y165L/H248W/S253T/V407I/R411T、S61Q/S214R、S61Q/S214R/D300A/R308L、S61Q/L243I/D300A/R308L/V407I/R411T、S61Q/D300A/Q303V/R308L、S61Q/D300A/Q303V/E405P、S61Q/V365I/E405P、D69A、D69A/H81T、D69A/D134E、D69A/V263T、D69A/V263T/D434E/A438S/P439H、D69A/P439H、H81T、H81T/D134E、H81T/K222A、H81T/K222A/V263T/L322S/R435E/S442F、H81T/L433A/R435I/A438R/S442F、A85V/C156S/Q159K/L243I/H248W/S253T/R308L/E405P/V407I/R411T、M87K/M144Q、M87K/M144Q/Y396T、S113D/W233Q/R234N、L120V/C156S/Q159K/E169D/Q197K/S214R/Q303V/R308L/V365I/E405P/V407I、L120V/C156S/Q159K/H248W/D300A/R308L、L120V/C156S/H248W/Q303V/R308L/R411T、L120V/Q159K、L120V/Q159K/Y165L/Q197K、L120V/Q159K/Q197K/R308L/V407I/R411T、L120V/Q159K/Q197K/V365I/R411T、L120V/Q197K/S253T/D300A/R308L、L120V/S253T/D300A/Q303V/R308L/V407I、L120V/R308L/V407I/R411T、D134E/K222A/V263T、M144Q/R234N/Q269R、C156S/Y165L/H248W/D300A/Q303V/R308L、C156S/Q197K/H248W/D300A/R411T、C156S/S214R/R308L/R411T、C156S/H248W/S253T/R308L、Q159K/L163A/Y165L/Q197K/S214R/L243I/D300A/Q303V/R308L/V407I、L163A/Q197K/S253E/D300A/Q303V/R308L/V365I、K171P/V263T、M183L/W233Q/R234N/K331R/K428I、Q197K/S253T/R308L/V407I、Q197K/D300A/Q303V/R308L/V365I、Q197K/D300A/R308L/R411T、K222A、K222A/V263T/R435I/S442F、W233Q/Y396T/N399Q、V263T、Q269R、Q269R/
K428I/I437L、D300A/Q303V/R308L、D300A/R308L/E405P/R411T、R308LおよびL322Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7388を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、41、56、61、72、76、87、88、107、139、156、338、および407から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7388を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、41E、56D、61D、61E、72P、76S、87E、88L、88M、107L、107V、139N、156S、338V、および407Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7388を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、A41E、L56D、S61D、S61E、T72P、R76S、M87E、R88L、R88M、A107L、A107V、K139N、C156S、C338V、およびV407Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7388を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7946、7948、7950、7952、7954、7956、7958、7960、7962、7964、7966、7968、7970、7972、7974、7976、7978、7980、7982、7984、7986、7988、7990、7992、7994、7996、7998、8000、8002、8004、8006、8008、8010、8012、8014、8016、8018、8020、8022、8024、8026、8028、8030、8032、8034、8036、8038、8040、8042、8044、8046、8048、8050、8052、8054、8056、8058、8060、8062、8064、8066、8068、8070、8072、8074、8076、8078、8080、8082、8084、8086、8088、8090、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366および8368のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7946、7948、7950、7952、7954、7956、7958、7960、7962、7964、7966、7968、7970、7972、7974、7976、7978、7980、7982、7984、7986、7988、7990、7992、7994、7996、7998、8000、8002、8004、8006、8008、8010、8012、8014、8016、8018、8020、8022、8024、8026、8028、8030、8032、8034、8036、8038、8040、8042、8044、8046、8048、8050、8052、8054、8056、8058、8060、8062、8064、8066、8068、8070、8072、8074、8076、8078、8080、8082、8084、8086、8088、8090、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366および8368のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7946、7948、7950、7952、7954、7956、7958、7960、7962、7964、7966、7968、7970、7972、7974、7976、7978、7980、7982、7984、7986、7988、7990、7992、7994、7996、7998、8000、8002、8004、8006、8008、8010、8012、8014、8016、8018、8020、8022、8024、8026、8028、8030、8032、8034、8036、8038、8040、8042、8044、8046、8048、8050、8052、8054、8056、8058、8060、8062、8064、8066、8068、8070、8072、8074、8076、8078、8080、8082、8084、8086、8088、8090、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366および8368のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、37/72/76/81、37/72/76/107/156/331、37/72/195/331、53/81/195/197、69/72/76/107、72/76/107/156、72/76/107/195/197、72/269、81/107/195、87、87/91、87/91/94、87/91/94/120、87/91/94/233、87/91/94/233/259、87/91/94/263/389、87/91/120/233、87/91/120/233/411/431/435/437、87/91/144/259、87/91/163、87/91/163/233、87/91/163/233/263、87/91/163/389、87/91/233、87/91/233/389、87/91/259/263/389/428/431/435/437、87/91/263/389、87/91/322、87/91/389、87/94、87/94/144/263/428/435、87/94/263、87/163/233、87/233、87/233/259、87/233/322/389/411、87/233/389、87/259、87/263、87/428/431/435、87/435、91、91/94、91/94/120/233、91/94/120/233/389/431/438、91/94/233/259、91/120、91/120/233、91/233、91/233/259/389、91/233/389、94/233/411、144/389、163/233、195/197、197、233、233/259/263、233/259/389、233/438、259、263、263/389、322、389および428/431/435から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号8088を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、37S/72P/76S/81T、37S/72P/76S/107L/156S/331R、37S/72P/195Q/331R、53E/81T/195Q/197K、69A/72P/76S/107L、72P/76S/107L/156S、72P/76S/107L/195Q/197K、72P/269R、81T/107L/195Q、87A、87A/91L、87A/91L/94C/233Q、87A/91L/94C/233Q/259T、87A/91L/120L/233Q、87A/91L/120L/233Q/411T/431M/435E/437L、87A/91L/163A、87A/91L/233Q、87A/91L/233Q/389L、87A/91L/259T/263T/389L/428I/431M/435I/437L、87A/91L/322S、87A/94C、87A/94C/263T、87A/233Q、87A/233Q/259T、87A/233Q/322S/389L/411T、87A/233Q/389L、87A/259T、87A/263T、87A/428I/431M/435E、87A/435E、87K、87K/91L、87K/91L/94C、87K/91L/94C/120L、87K/91L/94C/233Q、87K/91L/94C/263T/389L、87K/91L/120L/233Q、87K/91L/144Q/259T、87K/91L/163A/233Q、87K/91L/163A/233Q/263T、87K/91L/163A/389L、87K/91L/233Q、87K/91L/263T/389L、87K/91L/389L、87K/94C/144Q/263T/428I/435E、87K/163A/233Q、91L、91L/94C、91L/94C/120L/233Q、91L/94C/120L/233Q/389L/431M/438S、91L/94C/233Q/259T、91L/120L、91L/120L/233Q、91L/233Q、91L/233Q/259T/389L、91L/233Q/389L、94C/233Q/411T、144Q/389L、163A/233Q、195Q/197K、197K、233Q、233Q/259T/263T、233Q/259T/389L、233Q/438S、259T、263T、263T/389L、322S、389Lおよび428I/431M/435Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8088を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、R37S/T72P/R76S/H81T、R37S/T72P/R76S/A107L/C156S/K331R、R37S/T72P/H195Q/K331R、K53E/H81T/H195Q/Q197K、D69A/T72P/R76S/A107L、T72P/R76S/A107L/C156S、T72P/R76S/A107L/H195Q/Q197K、T72P/Q269R、H81T/A107L/H195Q、M87A、M87A/Q91L、M87A/Q91L/K94C/W233Q、M87A/Q91L/K94C/W233Q/E259T、M87A/Q91L/V120L/W233Q、M87A/Q91L/V120L/W233Q/R411T/D431M/R435E/I437L、M87A/Q91L/L163A、M87A/Q91L/W233Q、M87A/Q91L/W233Q/E389L、M87A/Q91L/E259T/V263T/E389L/K428I/D431M/R435I/I437L、M87A/Q91L/L322S、M87A/K94C、M87A/K94C/V263T、M87A/W233Q、M87A/W233Q/E259T、M87A/W233Q/L322S/E389L/R411T、M87A/W233Q/E389L、M87A/E259T、M87A/V263T、M87A/K428I/D431M/R435E、M87A/R435E、M87K、M87K/Q91L、M87K/Q91L/K94C、M87K/Q91L/K94C/V120L、M87K/Q91L/K94C/W233Q、M87K/Q91L/K94C/V263T/E389L、M87K/Q91L/V120L/W233Q、M87K/Q91L/M144Q/E259T、M87K/Q91L/L163A/W233Q、M87K/Q91L/L163A/W233Q/V263T、M87K/Q91L/L163A/E389L、M87K/Q91L/W233Q、M87K/Q91L/V263T/E389L、M87K/Q91L/E389L、M87K/K94C/M144Q/V263T/K428I/R435E、M87K/L163A/W233Q、Q91L、Q91L/K94C、Q91L/K94C/V120L/W233Q、Q91L/K94C/V120L/W233Q/E389L/D431M/A438S、Q91L/K94C/W233Q/E259T、Q91L/V120L、Q91L/V120L/W233Q、Q91L/W233Q、Q91L/W233Q/E259T/E389L、Q91L/W233Q/E389L、K94C/W233Q/R411T、M144Q/E389L、L163A/W233Q、H195Q/Q197K、Q197K、W233Q、W233Q/E259T/V263T、W233Q/E259T/E389L、W233Q/A438S、E259T、V263T、V263T/E389L、L322S、E389LおよびK428I/D431M/R435Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8088を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、55、111、252、255、324、328、413、および451から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8088を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、55G、111T、252P、255T、324D、324G、328T、413L、および451Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8088を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S55G、S111T、S252P、S255T、P324D、P324G、L328T、V413L、およびV451Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8088を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528 ,8530 ,8532、8534、8536、8538 ,8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、9224、9226、9228、9230、9232、9234、9236、9238および9240のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528 ,8530 ,8532、8534、8536、8538 ,8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、9224、9226、9228、9230、9232、
9234、9236、9238および9240のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528 ,8530 ,8532、8534、8536、8538 ,8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、9224、9226、9228、9230、9232、9234、9236、9238および9240のいずれかを含む。
一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、および/または108のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、および/または108のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、および/または108を含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、69/173/175/243/246/354/365/383/399、69/173/243/383/399、56/191/354/383/399、70/225/246/409/413、70/115/225/409、70/225/413、70/225/247、74/310/396/424、74/396、および173/175/191/365/383/399から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号758を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、69H/173N/175S/243A/246K/354I/365I/383V/399A、69H/173N/243A/383V/399A、56T/191D/354I/383V/399A、70L/225G/246P/409K/413V、70L/115S/225G/409K、70L/225G/413V、70L/225G/247G、74T/310D/396E/424S、74T/396Eおよび173H/175S/191D/365I/383V/399Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号758を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、R69H/Y173N/P175S/V243A/M246K/L354I/M365I/M383V/T399A、R69H/Y173N/V243A/M383V/T399A、I56T/N191D/L354I/M383V/T399A、F70L/N225G/M246P/E409K/I413V、F70L/Q115S/N225G/E409K、F70L/N225G/I413V、F70L/N225G/E247G、H74T/K310D/G396E/N424S、H74T/G396EおよびY173H/P175S/N191D/M365I/M383V/T399Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号758を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号770、772、774、776、778、780、782、784、786、および/または788のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号770、772、774、776、778、780、782、784、786、および/または788のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号770、772、774、776、778、780、782、784、786、および/または788のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、24/28、24/28/262、24/28/262/264、24/28/262/264/423、24/264/294、28、28/262/264、28/423、69/173/175/243/246/354/365/383/399、69/173/243/383/399、56/191/354/383/399、70/115/225/409、70/225/246/409/413、70/225/247、70/225/413、74/310/396/424、74/396、159、173/175/191/365/383/399、199、262/264および264/29から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号770を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、24E/28N、24E/28N/262Y、24E/28N/262Y/264S、24E/28N/262Y/264S/423E、24E/264S/294V、28N、28N/262Y/264S、28N/423E、69H/173N/175S/243A/246K/354I/365I/383V/399A、 69H/173N/243A/383V/399A、56T/191D/354I/383V/399A、70L/115S/225G/409K、70L/225G/246P/409K/413V、70L/225G/247G、70L/225G/413V、74T/310D/396E/424S、74T/396E、159R、173H/175S/191D/365I/383V/399A、199H、262Y/264Sおよび264S/291Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Y24E/S28N、Y24E/S28N/F262Y、Y24E/S28N/F262Y/C264S、Y24E/S28N/F262Y/C264S/K423E,Y24E/C264S/A294V、S28N、S28N/F262Y/C264S、S28N/K423E、R69H/Y173N/P175S/V243A/M246K/L354I/M365I/M383V/T399A、R69H/Y173N/V243A/M383V/T399A、I56T/N191D/L354I/M383V/T399A、F70L/Q115S/N225G/E409K、F70L/N225G/M246P/E409K/I413V、F70L/N225G/E247G、F70L/N225G/I413V、H74T/K310D/G396E/N424S、H74T/G396E、F156R、Y173H/P175S/N191D/M365I/M383V/T399A、G199H、F262Y/C264SおよびC264S/I291Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、1292、および/または1294のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、1292、および/または1294のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、1292、および/または1294のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、24、28、32、264、269、325、341、351、および366から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号770を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、24L/V、28G/K/L、32C/R/S、264A/G、269S/W、325G/H、341V、351L、および366L/Q/Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Y24L/V、S28G/K/L、N32C/R/S、C264A/G、Y269S/W、K325G/H、F341V、M351L、およびH366L/Q/Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、および/または846のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、および/または846のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、および/または846のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、56/69/70/175/191/246、56/69/70/175/191/246/354、56/69/70/175/354、56/69/70/191/246/354/365、56/69/70/246/354、56/69/175/191/246/354、56/69/175/246/354、56/69/175/246/354/365、56/69/246/354、56/69/246/365、56/70/175/191/246、56/70/175/191/246/354、56/70/175/191/354/365、56/70/175/246/354、56/70/175/246/365、56/70/191/246/354/365、56/70/191/354、56/175/246、56/175/354、56/175/354/365、56/191/246/354、56/246、56/246/354/365、56/354、69、69/70/175/191/246/354/365、 69/70/191/246/354/365、69/70/246、69/70/354/365、69/175/191/246/354、69/175/354、69/246/354/365、69/354、70、70/175/191/246/354/365、70/175/191/354/365、70/191/246/354/365、70/191/246/365、126、126/220、126/403、175、175/191、175/191/246/354/365、175/191/354、175/191/354/365、175/246/354、175/246/354/365、175/354、191/246/354、246/354、354および354/365から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号770を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、56T/69Q/70L/175S/191D/246K、56T/69Q/70L/175S/191D/246K/354I、56T/69Q/70L/175S/354I、56T/69Q/70L/191D/246K/354I/365I、56T/69Q/70L/246K/354I、56T/69Q/175S/191D/246K/354I、56T/69Q/175S/246K/354I、56T/69Q/175S/246K/354I/365I、56T/69Q/246K/354I、56T/69Q/246K/M65I、56T/70L/175S/191D/246K、56T/70L/175S/191D/246K/354I、56T/70L/175S/191D/354I/365I、56T/70L/175S/246K/354I、56T/70L/175S/246K/365I、56T/70L/191D/246K/354I/365I、56T/70L/191D/354I、56T/175S/246K、56T/175S/354I、56T/175S/354I/365I、56T/191D/246K/354I、56T/246K、56T/246K/354I/365I、56T/354I、69Q、69Q/70L/175S/191D/246K/354I/365I、69Q/70L/191D/246K/354I/365I、69Q/70L/246K、69Q/70L/354I/365I、69Q/175S/191D/246K/354I、69Q/175S/354I、69Q/246K/354I/365I、69Q/354I、70L、70L/175S/191D/246K/354I/365I、70L/175S/191D/354I/365I、70L/191D/246K/354I/365I、70L/191D/246K/365I、126F、126F/220L、126F/403R、175S、175S/191D、175S/191D/246K/354I/365I、175S/191D/354I、175S/191D/354I/365I、175S/246K/354I、175S/246K/354I/365I、175S/354I、191D/246K/354I、246K/354I、354Iおよび354I/365Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、I56T/H69Q/F70L/P175S/N191D/M246K、I56T/H69Q/F70L/P175S/N191D/M246K/L354I、I56T/H69Q/F70L/P175S/L354I、I56T/H69Q/F70L/N191D/M246K/L354I/M365I、I56T/H69Q/F70L/M246K/L354I、I56T/H69Q/P175S/N191D/M246K/L354I、I56T/H69Q/P175S/M246K/L354I、I56T/H69Q/P175S/M246K/L354I/M365I、 I56T/H69Q/M246K/L354I、I56T/H69Q/M246K/M365I、I56T/F70L/P175S/N191D/M246K、 I56T/F70L/P175S/N191D/M246K/L354I、I56T/F70L/P175S/N191D/L354I/M365I、I56T/F70L/P175S/M246K/L354I、I56T/F70L/P175S/M246K/M365I、I56T/F70L/N191D/M246K/L354I/M365I、I56T/F70L/N191D/L354I、 I56T/P175S/M246K、I56T/P175S/L354I、I56T/P175S/L354I/M365I、I56T/N191D/M246K/L354I、 I56T/M246K、I56T/M246K/L354I/M365I、I56T/L354I、H69Q、H69Q/F70L/P175S/N191D/M246K/L354I/M365I、 H69Q/F70L/N191D/M246K/L354I/M365I、H69Q/F70L/M246K、H69Q/F70L/L354I/M365I、H69Q/P175S/N191D/M246K/L354I、 H69Q/P175S/L354I、 H69Q/M246K/L354I/M365I、H69Q/L354I、F70L、F70L/P175S/N191D/M246K/L354I/M365I、F70L/P175S/N191D/L354I/M365I、F70L/N191D/M246K/L354I/M365I、F70L/N191D/M246K/M365I、I126F、I126F/C220L、I126F/K403R、P175S、P175S/N191D、P175S/N191D/M246K/L354I/M365I、P175S/N191D/L354I、P175S/N191D/L354I/M365I、P175S/M246K/L354I、P175S/M246K/L354I/M365I、P175S/L354I、N191D/M246K/L354I、M246K/L354I、L354IおよびL354I/M365Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号770を参照して番号付けられている。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、および/または952のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、および/または952のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、および/または952のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、24/32/264/269/330/402/403、24/32/264/269/382/403/406、24/32/264/330、24/32/269、24/32/269/382/385/389/402/406、24/32/269/403、24/32/330、24/264/269/389/402/406、70/126/175/191/246/325/354/366、70/126/175/325/330/351/354/366、70/126/191/246/325/351/354/366/423、70/126/191/246/325/351/354/423、 70/126/191/246/325/351/366/423、70/126/191/246/354/366、70/126/246/330/366、 70/126/246/354/366、126/211/220/253/316/342、126/211/220/275/279/323、126/211/260/423、126/220/260、126/220/316、56/220/260/423、220/260および220/260/423から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号792を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、24L/32S/264A/269S/330Q/402V/403R、24L/32S/264A/269S/382G/403R/406M、24L/32S/264A/330Q、24L/32S/269S、24L/32S/269S/382G/385V/389E/402I/406M、24L/32S/269S/403R、24L/32S/330Q、24L/264A/269S/389E/402V/406M、70L/126F/175S/191D/246K/325H/354I/366Q、70L/126F/175S/325H/330Q/351L/354I/366Q、70L/126F/191D/246K/325H/351L/354I/366Q/423K、70L/126F/191D/246K/325H/351L/354I/423K、70L/126F/191D/246K/325H/351L/366Q/423K、70L/126F/191D/246K/354I/366Q、70L/126F/246K/330Q/366Q、70L/126F/246K/354I/366Q、126F/211E/220L/253D/316V/342L、126F/211E/220L/275Q/279L/323V、126F/211E/260V/423K、126F/220L/260V、126F/220L/316V、56V/220L/260V/423K、220L/260Vおよび220L/260V/423Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号792を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E24L/N32S/S264A/Y269S/P330Q/L402V/K403R、E24L/N32S/S264A/Y269S/A382G/K403R/I406M、E24L/N32S/S264A/P330Q、E24L/N32S/Y269S、E24L/N32S/Y269S/A382G/I385V/D389E/L402I/I406M、E24L/N32S/Y269S/K403R、E24L/N32S/P330Q、E24L/S264A/Y269S/D389E/L402V/I406M、F70L/I126F/P175S/N191D/M246K/K325H/L354I/H366Q、F70L/I126F/P175S/K325H/P330Q/M351L/L354I/H366Q、F70L/I126F/N191D/M246K/K325H/M351L/L354I/H366Q/E423K、F70L/I126F/N191D/M246K/K325H/M351L/L354I/E423K、 F70L/I126F/N191D/M246K/K325H/M351L/H366Q/E423K、F70L/I126F/N191D/M246K/L354I/H366Q、F70L/I126F/M246K/P330Q/H366Q、F70L/I126F/M246K/L354I/H366Q、I126F/T211E/C220L/G253D/I316V/I342L、I126F/T211E/C220L/D275Q/V279L/L323V、I126F/T211E/T260V/E423K、I126F/C220L/T260V、I126F/C220L/I316V、I56V/C220L/T260V/E423K、C220L/T260VおよびC220L/T260V/E423Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号792を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、および/または1000のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、および/または1000のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、および/または1000のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、24/32/97/162/202、24/32/126/198/201/367、24/32/126/198/202/220/226/260/269S、24/32/146/226、24/32/198/201/220/226、24/32/198/201/226、24/97/260/367、32/97/198/202/226/260、32/202/367、32/226/367、56/175/197/211/330/382/385、56/175/197/253/385/389、56/175/264/382/385/389/402/406、56/197/264/279/330/382/389/402/403/406、56/211/253/316/323、56/211/264/316/389、56/211/279/323/330/402、56/264/385/389、97/202/367、162/220/226/367、175/197/211/264/330、175/211/264/279/316/323、175/211/279/323/330/402/403/406、175/211/323/382/402/403/406、175/211/403/406、175/264/316/323/330/403/406、175/264/316/389/402、175/264/323/330、197/211/316/342/406、197/211/316/382/389/402/403、197/211/402、197/279/323、198/201/367、198/202/220/269/367、 201/202/367、211/382/406、211/385/389、211/402/403および389から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号954を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、24L/32S/97G/162R/202G、24L/32S/126A/198P/201G/367W、24L/32S/126A/198P/202G/220L/226V/260V/269S、24L/32S/146A/226V、24L/32S/198P/201G/220L/226V、24L/32S/198P/201G/226V、24L/97G/260V/367W、32S/97G/198P/202G/226V/260V、32S/202G/367W、32S/226V/367W、56V/175S/197P/211E/330Q/382G/385V、56V/175S/197P/253D/385V/389E、56V/175S/264A/382G/385V/389E/402V/406M、 56V/197P/264A/279L/330Q/382G/389E/402V/403R/406M、56V/211E/253D/316V/323V、56V/211E/264A/316V/389E、56V/211E/279L/323V/330Q/402I、56V/264A/385V/389E、97G/202G/367W、162R/220L/226V/367W、175S/197P/211E/264A/330Q、175S/211E/264A/279L/316V/323V、175S/211E/279L/323V/330Q/402I/403R/406M、175S/211E/323V/382G/402I/403R/406M、175S/211E/403R/406M、175S/264A/316V/323V/330Q/403R/406M、175S/264A/316V/389E/402V、175S/264A/323V/330Q、197P/211E/316V/342L/406M、197P/211E/316V/382G/389E/402I/403R、197P/211E/402I、197P/279L/323V、198P/201G/367W、198P/202G/220L/269S/367W、201G/202G/367W、211E/382G/406M、211E/385V/389E、211E/402I/403RおよびD389Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号954を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E24L/N32S/H97G/N162R/Q202G、E24L/N32S/F126A/E198P/M201G/N367W、E24L/N32S/F126A/E198P/Q202G/C220L/W226V/T260V/Y269S、E24L/N32S/L146A/W226V、E24L/N32S/E198P/M201G/C220L/W226V、E24L/N32S/E198P/M201G/W226V、E24L/H97G/T260V/N367W、N32S/H97G/E198P/Q202G/W226V/T260V、N32S/Q202G/N367W、N32S/W226V/N367W、I56V/P175S/A197P/T211E/P330Q/A382G/I385V、I56V/P175S/A197P/G253D/I385V/D389E、I56V/P175S/S264A/A382G/I385V/D389E/L402V/I406M、 I56V/A197P/S264A/V279L/P330Q/A382G/D389E/L402V/K403R/I406M、 I56V/T211E/G253D/I316V/L323V、I56V/T211E/S264A/I316V/D389E、I56V/T211E/V279L/L323V/P330Q/L402I、 I56V/S264A/I385V/D389E、H97G/Q202G/N367W、N162R/C220L/W226V/N367W、P175S/A197P/T211E/S264A/P330Q、P175S/T211E/S264A/V279L/I316V/L323V、P175S/T211E/V279L/L323V/P330Q/L402I/K403R/I406M、P175S/T211E/L323V/A382G/L402I/K403R/I406M、P175S/T211E/K403R/I406M、P175S/S264A/I316V/L323V/P330Q/K403R/I406M、P175S/S264A/I316V/D389E/L402V、P175S/S264A/L323V/P330Q、A197P/T211E/I316V/I342L/I406M、A197P/T211E/I316V/A382G/D389E/L402I/K403R、A197P/T211E/L402I、A197P/V279L/L323V、E198P/M201G/N367W、E198P/Q202G/C220L/Y269S/N367W、 M201G/Q202G/N367W、T211E/A382G/I406M、T211E/I385V/D389E、T211E/L402I/K403RおよびD389Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号954を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、および/または1078のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、および/または1078のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、および/または1078のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、24/32/175/211/260/330/403/406、24/32/175/226/253/275/316、24/32/201/226/260/264/330/402/406、24/162/175/198/211/226/275/316/323/389、24/162/175/201/275/316、24/162/198/201/211/226/323/351、24/162/198/201/226/351、24/162/201/253/264/351/402/406、24/175/198/211/226/253/316、24/175/201/275/316/351、24/175/201/316、24/175/211/220/260/275/330/389、24/175/211/253/316、24/175/211/316/330、24/175/226/323/351、24/198/201、24/198/201/211、24/198/201/211/220/260、24/198/201/220/275/389/402/406、24/198/201/226/330/389、24/198/201/351、24/201/211/253/323/351/366/389/402/403、24/201/226/253/402/403/406、24/226/330/351/403、175/198/201/211/226/260/264/323/402/406および175/198/226/260/351/402/403/406から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1054を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、24L/32S/175S/211E/260V/330Q/403R/406M、24L/32S/175S/226V/253D/275Q/316V、24L/32S/201G/226V/260V/264A/330Q/402I/406M、24L/162R/175S/198P/211E/226V/275Q/316V/323V/389E、24L/162R/175S/201G/275Q/316V、24L/162R/198P/201G/211E/226V/323V/351M、24L/162R/198P/201G/226V/351M、24L/162R/201G/253D/264A/351M/402I/406M、24L/175S/198P/211E/226V/253D/316V、24L/175S/201G/275Q/316V/351M、24L/175S/201G/316V、24L/175S/211E/220L/260V/275Q/330Q/389E、24L/175S/211E/253D/316V、24L/175S/211E/316V/330Q、24L/175S/226V/323V/351M、24L/198P/201G、24L/198P/201G/211E、24L/198P/201G/211E/220L/260V、24L/198P/201G/220L/275Q/389E/402I/406M、24L/198P/201G/226V/330Q/389E、24L/198P/201G/351M、24L/201G/211E/253D/323V/351M/366H/389E/402I/403R、24L/201G/226V/253D/402I/403R/406M、24L/226V/330Q/351M/403R、175S/198P/201G/211E/226V/260V/264A/323V/402I/406Mおよび175S/198P/226V/260V/351M/402I/403R/406Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1054を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、E24L/N32S/P175S/T211E/T260V/P330Q/K403R/I406M、E24L/N32S/P175S/W226V/G253D/D275Q/I316V、E24L/N32S/M201G/W226V/T260V/S264A/P330Q/L402I/I406M、E24L/N162R/P175S/E198P/T211E/W226V/D275Q/I316V/L323V/D389E、E24L/N162R/P175S/M201G/D275Q/I316V、E24L/N162R/E198P/M201G/T211E/W226V/L323V/L351M、E24L/N162R/E198P/M201G/W226V/L351M、E24L/N162R/M201G/G253D/S264A/L351M/L402I/I406M、E24L/P175S/E198P/T211E/W226V/G253D/I316V、E24L/P175S/M201G/D275Q/I316V/L351M、E24L/P175S/M201G/I316V、E24L/P175S/T211E/C220L/T260V/D275Q/P330Q/D389E、E24L/P175S/T211E/G253D/I316V、E24L/P175S/T211E/I316V/P330Q、E24L/P175S/W226V/L323V/L351M、E24L/E198P/M201G、E24L/E198P/M201G/T211E、E24L/E198P/M201G/T211E/C220L/T260V、E24L/E198P/M201G/C220L/D275Q/D389E/L402I/I406M、E24L/E198P/M201G/W226V/P330Q/D389E、E24L/E198P/M201G/L351M、E24L/M201G/T211E/G253D/L323V/L351M/Q366H/D389E/L402I/K403R、E24L/M201G/W226V/G253D/L402I/K403R/I406M、E24L/W226V/P330Q/L351M/K403R、P175S/E198P/M201G/T211E/W226V/T260V/S264A/L323V/L402I/I406MおよびP175S/E198P/W226V/T260V/L351M/L402I/K403R/I406Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1054を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2596、2598、2600、2602、2604、2606、2608、2610、2612、2614、2616、2618、2620、2622、2624、2626、2628、2630、2632、2634、2636、2638、2640、2642、2644、および2646のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2596、2598、2600、2602、2604、2606、2608、2610、2612、2614、2616、2618、2620、2622、2624、2626、2628、2630、2632、2634、2636、2638、2640、2642、2644、および2646のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2596、2598、2600、2602、2604、2606、2608、2610、2612、2614、2616、2618、2620、2622、2624、2626、2628、2630、2632、2634、2636、2638、2640、2642、2644、および2646のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、21/127/129/161、21/127/129/161/162、21/127/129/162/199/200、127/129/161/162/199、127/129/161/199/200、127/129/162、156、156/161、156/161/162、156/162/199、および156/199/200から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1002を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、21Y/127H/129A/161S、21Y/127H/129A/161S/162G、21Y/127H/129A/162T/199H/200A、127H/129A/162T、127Q/129A/161S/162G/199H、127Q/129A/161S/199H/200A、156R、156R/161S、156R/161S/162G、156R/161S/162T、156R/162G/199Hおよび156R/199H/200Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1002を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、W21Y/L127H/P129A/K161S、W21Y/L127H/P129A/K161S/N162G、W21Y/L127H/P129A/N162T/G199H/N200A、L127H/P129A/N162T、L127Q/P129A/K161S/N162G/G199H、L127Q/P129A/K161S/G199H/N200A、F156R、F156R/K161S、F156R/K161S/N162G、F156R/K161S/N162T、F156R/N162G/G199HおよびF156R/G199H/N200Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1002を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2648、2650、2652、2654、2656、2658、2660、2662、2664、2666、2668、2670、2672、2674、2676、2678、2680、2682、および2684のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2648、2650、2652、2654、2656、2658、2660、2662、2664、2666、2668、2670、2672、2674、2676、2678、2680、2682、および2684のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2648、2650、2652、2654、2656、2658、2660、2662、2664、2666、2668、2670、2672、2674、2676、2678、2680、2682、および2684のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/7/12/15/175/260/318、7/12/400/435、7/318/451、12/15/57/71/175/260/400/402、12/15/57/220/254/260/318/402、12/15/57/318/402/435、12/15/318/400/402/406、12/57/175/451、12/175/260/264/318/400、12/175/400/402/406、12/318/402/404/406/451、12/318/402/404/451、15/175/318/400/402、57/175/220/260/264/402、57/175/404、57/220/260/400/402/406、57/260/400/402/404、57/400/402、57/402、152/192/195、160/186/195、195、260および400/402から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2600を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2−/7E/12S/15K/175S/260V/318D、7E/12S/400Q/435V、7E/318D/451N、12S/15K/57K/71I/175S/260V/400Q/402I、12S/15K/57K/220L/254K/260V/318D/402I、12S/15K/57K/318D/402I/435V、12S/15K/318D/400Q/402I/406M、12S/57K/175S/451N、12S/175S/260V/264A/318D/400Q、12S/175S/400Q/402I/406M、12S/318D/402I/404S/406M/451N、12S/318D/402I/404S/451N、15K/175S/318D/400Q/402I、57K/175S/220L/260V/264A/402I、57K/175S/404G、57K/220L/260V/400Q/402I/406M、57K/260V/400Q/402I/404S、57K/400Q/402I、57K/402I、152V/192D/195P、160V/186M/195P、195P、260Vおよび400Q/402Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2600を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2−/H7E/A12S/R15K/P175S/T260V/E318D、H7E/A12S/E400Q/A435V、H7E/E318D/K451N、A12S/R15K/I57K/V71I/P175S/T260V/E400Q/L402I、A12S/R15K/I57K/C220L/T254K/T260V/E318D/L402I、A12S/R15K/I57K/E318D/L402I/A435V、A12S/R15K/E318D/E400Q/L402I/I406M、A12S/I57K/P175S/K451N、A12S/P175S/T260V/S264A/E318D/E400Q、A12S/P175S/E400Q/L402I/I406M、A12S/E318D/L402I/D404S/I406M/K451N、A12S/E318D/L402I/D404S/K451N、R15K/P175S/E318D/E400Q/L402I、I57K/P175S/C220L/T260V/S264A/L402I、I57K/P175S/D404G、I57K/C220L/T260V/E400Q/L402I/I406M、I57K/T260V/E400Q/L402I/D404S、I57K/E400Q/L402I、I57K/L402I、L152V/E192D/R195P、L160V/F186M/R195P、R195P、T260VおよびE400Q/L402Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2600を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、32、135、148、152、186、237、239、240、323、325、326、327、330、331、および356から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2600を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、32R、135A、148A、152V、186V、237T、239E、239F、239Y、240A、240P、323L、325G、325R、326M、327V、330A、331C、331H、331S、および356Gから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2600を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、N32R、V135A、S148A、L152V、F186V、D237T、I239E、I239F、I239Y、T240A、T240P、V323L、H325G、H325R、F326M、A327V、P330A、R331C、R331H、R331S、およびF356Gから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2600を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2686、2688、2690、2692、2694、2696、2698、2700、2702、2704、2706、2708、2710、2712、2714、2716、2718、2720、2722、2724、2726、2728、2730、2732、2734、2736、2738、2740、2742、2744、2746、2748、2750、2752、2754、2756、2758、2760、2762、2764、2766、2768、2770、2772および2774のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2686、2688、2690、2692、2694、2696、2698、2700、2702、2704、2706、2708、2710、2712、2714、2716、2718、2720、2722、2724、2726、2728、2730、2732、2734、2736、2738、2740、2742、2744、2746、2748、2750、2752、2754、2756、2758、2760、2762、2764、2766、2768、2770、2772および2774のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2686、2688、2690、2692、2694、2696、2698、2700、2702、2704、2706、2708、2710、2712、2714、2716、2718、2720、2722、2724、2726、2728、2730、2732、2734、2736、2738、2740、2742、2744、2746、2748、2750、2752、2754、2756、2758、2760、2762、2764、2766、2768、2770、2772および2774のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、14/23/274/326/329、14/31/184/274/322/326/329/330、14/56/184/185/194/238/239/274/329/399、14/56/184/194/234/315/326/329/399/401、14/56/194/238/315/325/326/329/330/399、14/56/252/274/315/326/329/330/401、14/184/185/194/234/325/326/329、14/184/185/194/388/399/401、14/184/194/355/399、14/185/194/238/399、14/185/236/238/239/274/322/326/329/355/399/401、14/194、14/322/326/330、14/326/330、14/355、14/355/399、23/31/147/184/185/238/252/325/329/330/388/401、31/56/315/329/330、65、65/114/132/238、65/238/240、147/236/238/243/315/329/330/399/401、185/194/236/239/325/326、223/412および238から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2718を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14R/23Q/274Q/326V/329A、14R/31R/184A/274Q/322L/326V/329A/330H、14R/56K/184A/185M/194P/238M/239A/274Q/329A/399Q、14R/56K/184A/194P/234Y/315V/326V/329Q/399Q/401I、14R/56K/194P/238M/315V/325M/326V/329A/330H/399Q、14R/56K/252D/274Q/315V/326V/329A/330H/401I、14R/184A/185M/194P/234Y/325M/326V/329A、14R/184A/185M/194P/388E/399Q/401I、14R/184A/194P/355G/399Q、14R/185M/194P/238M/399Q、14R/185M/236T/238M/239A/274Q/322L/326V/329Q/355G/399Q/401I、14R/194P、14R/322L/326V/330H、14R/326V/330H、14R/355G、14R/355G/399Q、23Q/31R/147A/184A/185M/238M/252D/325M/329A/330H/388E/401I、31R/56K/315V/329A/330H、65D、65D/114E/132R/238M、65D/238T/240S、147A/236T/238M/243G/315V/329A/330H/399Q/401I、185M/194P/236T/239A/325M/326V、223T/412Sおよび238Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2718を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、K14R/L23Q/D274Q/A326V/P329A、K14R/N31R/M184A/D274Q/V322L/A326V/P329A/R330H、K14R/I56K/M184A/F185M/R194P/I238M/T239A/D274Q/P329A/E399Q、K14R/I56K/M184A/R194P/F234Y/I315V/A326V/P329Q/E399Q/L401I、K14R/I56K/R194P/I238M/I315V/F325M/A326V/P329A/R330H/E399Q、K14R/I56K/G252D/D274Q/I315V/A326V/P329A/R330H/L401I、K14R/M184A/F185M/R194P/F234Y/F325M/A326V/P329A、K14R/M184A/F185M/R194P/D388E/E399Q/L401I、K14R/M184A/R194P/F355G/E399Q、K14R/F185M/R194P/I238M/E399Q、K14R/F185M/D236T/I238M/T239A/D274Q/V322L/A326V/P329Q/F355G/E399Q/L401I、K14R/R194P、K14R/V322L/A326V/R330H、K14R/A326V/R330H、K14R/F355G、K14R/F355G/E399Q、L23Q/N31R/S147A/M184A/F185M/I238M/G252D/F325M/P329A/R330H/D388E/L401I、N31R/I56K/I315V/P329A/R330H、E65D、E65D/Q114E/H132R/I238M、E65D/I238T/N240S、S147A/D236T/I238M/D243G/I315V/P329A/R330H/E399Q/L401I、F185M/R194P/D236T/T239A/F325M/A326V、S223T/I412SおよびI238Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2718を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11、45、55、56、58、65、104、113、114、132、135、138、165、238、256、273、286、309、391、422、430、および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2718を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11G、11Q、45F、45V、55L、56T、58R、65N、65S、104L、113V、114R、132Q、132S、135L、138G、138K、165P、238G、256P、273R、286R、309E、309H、391R、422R、430L、430V、および449Fから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2718を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S11G、S11Q、L45F、L45V、I55L、I56T、K58R、E65N、E65S、M104L、L113V、Q114R、H132Q、H132S、N135L、N138G、N138K、E165P、I238G、E256P、E273R、N286R、K309E、K309H、N391R、K422R、E430L、E430V、およびY449Fから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2718を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2776、2778、2780、2782、2784、2786、2788、2790、2792、2794、2796、2798、2800、2802、2804、2806、2808、2810、2812、2814、2816、2818、2820、2822、2824、2826、2828、2830、2832、2834、2836、2838、2840、2842、2844、2846、2848、2850、2852、2854、2856、2858、2860、2862、2864、2866、2868、2870、2872、2874、2876、2878、2880および2882のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2776、2778、2780、2782、2784、2786、2788、2790、2792、2794、2796、2798、2800、2802、2804、2806、2808、2810、2812、2814、2816、2818、2820、2822、2824、2826、2828、2830、2832、2834、2836、2838、2840、2842、2844、2846、2848、2850、2852、2854、2856、2858、2860、2862、2864、2866、2868、2870、2872、2874、2876、2878、2880および2882のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2776、2778、2780、2782、2784、2786、2788、2790、2792、2794、2796、2798、2800、2802、2804、2806、2808、2810、2812、2814、2816、2818、2820、2822、2824、2826、2828、2830、2832、2834、2836、2838、2840、2842、2844、2846、2848、2850、2852、2854、2856、2858、2860、2862、2864、2866、2868、2870、2872、2874、2876、2878、2880および2882のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、配列番号2814を参照して番号付けられている、23/31/185/324/401、23/31/185/355、31/134/185/252/274/324/388、31/134/238/252/322/324/388、31/134/252/324、31/184/185/238/239/322、31/236、31/322、31/388、134/184/185/234/236/239/274/324/388、184/185/322、234/236/238/322/324/355、236、238/324/329/355、322/324および324/329/355/401から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2814を参照して番号付けられている、23Q/31R/185M/324G/401I、23Q/31R/185M/355G、31R/134A/185M/252D/274Q/324G/388E、31R/134A/238E/252D/322L/324G/388E、31R/134A/252D/324G、31R/184A/185M/238Y/239A/322L、31R/236T、31R/322L、31R/388E、134A/184A/185M/234Y/236T/239A/274Q/324G/388E、184A/185M/322L、234Y/236T/238E/322L/324G/355G、236T、238Y/324G/329Q/355G、322L/324Gおよび324G/329Q/355G/401Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2814を参照して番号付けられている、L23Q/N31R/F185M/H324G/L401I、L23Q/N31R/F185M/F355G、N31R/V134A/F185M/G252D/D274Q/H324G/D388E、N31R/V134A/M238E/G252D/V322L/H324G/D388E、N31R/V134A/G252D/H324G、N31R/M184A/F185M/M238Y/T239A/V322L、N31R/D236T、N31R/V322L、N31R/D388E、V134A/M184A/F185M/F234Y/D236T/T239A/D274Q/H324G/D388E、M184A/F185M/V322L、F234Y/D236T/M238E/V322L/H324G/F355G、D236T、M238Y/H324G/A329Q/F355G、V322L/H324GおよびH324G/A329Q/F355G/L401Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2814を参照して番号付けられている、122、164、176、177、316、325、400、425、426、427、440、および446から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2814を参照して番号付けられている、122L、164H、164M、164R、176K、176L、176N、176R、177A、316R、325L、400V、425R、426A、426R、427R、440R、および446Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2814を参照して番号付けられている、I122L、V164H、V164M、V164R、V176K、V176L、V176N、V176R、E177A、G316R、M325L、T400V、K425R、S426A、S426R、I427R、I440R、およびS446Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2884、2886、2888、2890、2892、2894、2896、2898、2900、2902、2904、2906、2908、2910、2912、2914、2916、2918、2920、2922、2924、2926、2928、2830、2932、2934、2936、2938、2940、2942、2944、2946、2948および2950のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含み、配列番号2814を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2884、2886、2888、2890、2892、2894、2896、2898、2900、2902、2904、2906、2908、2910、2912、2914、2916、2918、2920、2922、2924、2926、2928、2830、2932、2934、2936、2938、2940、2942、2944、2946、2948および2950のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2884、2886、2888、2890、2892、2894、2896、2898、2900、2902、2904、2906、2908、2910、2912、2914、2916、2918、2920、2922、2924、2926、2928、2830、2932、2934、2936、2938、2940、2942、2944、2946、2948および2950のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、11、11/45/58/132/138/286、11/58、11/58/65/104/107/138/286、11/58/65/107/135/223/286/391/430、11/58/65/135/138、11/58/104/107/114/138/223/391、11/58/114/286/309/391、11/58/132/165/286/391/422/430、11/58/138/309、11/65/104/107/138/165/286/391/430、11/65/107/135/165/391/430、11/65/132/135/138/223/391、11/65/132/135/252、11/65/132/391/430、11/65/135/138、11/104/132/138/309/391、11/104/132/138/391、11/107/114/223/309/430、11/107/138、11/114/135/138/223、11/114/223/252/286/391、11/132/135/138/223/286、11/132/138/223/286/391、11/138/165/223/309、58/65/138、58/65/138/165、58/65/165/309/430、58/104/114/165/391、107/114/132/138、107/430、135/138/165/309/430および223/309から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2884を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11G/45V/58R/132Q/138G/286R、11G/58R/104L/107G/114R/138K/223T/391R、11G/58R/114R/286R/309H/391R、11G/58R/132Q/165P/286R/391R/422S/430L、11G/65N/132Q/391R/430L、11G/104L/132Q/138G/309H/391R、11G/107G/114R/223T/309H/430L、11Q、11Q/58R、11Q/58R/65N/104L/107G/138G/286R、11Q/58R/65N/107G/135L/223T/286R/391R/430L、11Q/58R/65N/135L/138G、11Q/58R/138G/309E、11Q/65N/104L/107G/138G/165P/286R/391R/430L、11Q/65N/107G/135L/165P/391R/430L、11Q/65N/132Q/135L/138G/223T/391R、11Q/65N/132Q/135L/252D、11Q/65N/135L/138G、11Q/104L/132Q/138K/391R、11Q/107G/138G、11Q/114R/135L/138G/223T、11Q/114R/223T/252D/286R/391R、11Q/132Q/135L/138K/223T/286R、11Q/132Q/138G/223T/286R/391R、11Q/138K/165P/223T/309H、58R/65N/138G/165P、58R/65N/138K、58R/65N/165P/309H/430L、58R/104L/114R/165P/391R、107G/114R/132Q/138G、107G/430L、135L/138G/165P/309H/430Lおよび223T/309Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2884を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S11G/L45V/K58R/H132Q/N138G/N286R、S11G/K58R/M104L/P107G/Q114R/N138K/S223T/N391R、S11G/K58R/Q114R/N286R/K309H/N391R、S11G/K58R/H132Q/E165P/N286R/N391R/K422S/E430L、S11G/E65N/H132Q/N391R/E430L、S11G/M104L/H132Q/N138G/K309H/N391R、S11G/P107G/Q114R/S223T/K309H/E430L、S11Q、S11Q/K58R、S11Q/K58R/E65N/M104L/P107G/N138G/N286R、S11Q/K58R/E65N/P107G/N135L/S223T/N286R/N391R/E430L、S11Q/K58R/E65N/N135L/N138G、S11Q/K58R/N138G/K309E、S11Q/E65N/M104L/P107G/N138G/E165P/N286R/N391R/E430L、S11Q/E65N/P107G/N135L/E165P/N391R/E430L、S11Q/E65N/H132Q/N135L/N138G/S223T/N391R、S11Q/E65N/H132Q/N135L/G252D、S11Q/E65N/N135L/N138G、S11Q/M104L/H132Q/N138K/N391R、S11Q/P107G/N138G、S11Q/Q114R/N135L/N138G/S223T、S11Q/Q114R/S223T/G252D/N286R/N391R、S11Q/H132Q/N135L/N138K/S223T/N286R、S11Q/H132Q/N138G/S223T/N286R/N391R、S11Q/N138K/E165P/S223T/K309H、K58R/E65N/N138G/E165P、K58R/E65N/N138K、K58R/E65N/E165P/K309H/E430L、K58R/M104L/Q114R/E165P/N391R、P107G/Q114R/H132Q/N138G、P107G/E430L、N135L/N138G/E165P/K309H/E430LおよびS223T/K309Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2884を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2952、2954、2956、2958、2960、2962、2964、2966、2968、2970、2972、2974、2976、2978、2980、2982、2984、2986、2988、2990、2992、2994、2996、2998、3000、3002、3004、3006、3008、3010、3012、3014および3016のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2952、2954、2956、2958、2960、2962、2964、2966、2968、2970、2972、2974、2976、2978、2980、2982、2984、2986、2988、2990、2992、2994、2996、2998、3000、3002、3004、3006、3008、3010、3012、3014および3016のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号2952、2954、2956、2958、2960、2962、2964、2966、2968、2970、2972、2974、2976、2978、2980、2982、2984、2986、2988、2990、2992、2994、2996、2998、3000、3002、3004、3006、3008、3010、3012、3014および3016のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、8/448、58/107/122/176/236/324/325/400/426/427、58/107/122/236/324/400/425/446、58/107/122/322/400/425/427/440/446、58/107/164/400、58/107/236/400、58/107/400、58/122/164/236/446、58/122/176/236/400/446、58/122/176/322/324/426/427、58/122/322/325、58/122/325、58/122/440、58/164/176、58/164/324/425/427、58/176/236、58/236、107/122/236/425/426/446、107/164/236/400/446、107/176/322/325/440/446、107/176/400/425/427/440、107/236、107/440、122/164/176/324/400、122/164/400/440、122/164/400/440/446、122/176/236/400、122/176/324/400/440、122/400、122/425/426/446、122/440/446、139、139/252、164、164/271/425/426、164/322/324/325/400/425/440/446、164/400、176/400、189および324/400/425/426/440/446から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3016を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、8S/448A、58R/107G/122L/176R/236T/324G/325L/400V/426R/427R、58R/107G/122L/236T/324G/400V/425R/446R、58R/107G/122L/322L/400V/425R/427R/440R/446R、58R/107G/164H/400V、58R/107G/236T/400V、58R/107G/400V、58R/122L/164H/236T/446R、58R/122L/176R/236T/400V/446R、58R/122L/176R/322L/324G/426A/427R、58R/122L/322L/325L、58R/122L/325L、58R/122L/440R、58R/164H/176R、58R/164H/324G/425R/427R、58R/176R/236T、58R/236T、107G/122L/236T/425R/426A/446R、107G/164H/236T/400V/446R、107G/176R/322L/325L/440R/446R、107G/176R/400V/425R/427R/440R、107G/236T、107G/440R、122L/164H/176R/324G/400V、122L/164H/400V/440R、122L/164H/400V/440R/446R、122L/176R/236T/400V、122L/176R/324G/400V/440R、122L/400V、122L/425R/426R/446R、122L/440R/446R、139V、139V/252D、164H、164H/271G/425R/426R、164H/322L/324G/325L/400V/425R/440R/446R、164H/400V、176R/400V、189Rおよび324G/400V/425R/426R/440R/446Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3016を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、G8S/K448A、K58R/P107G/I122L/V176R/D236T/H324G/M325L/T400V/S426R/I427R、K58R/P107G/I122L/D236T/H324G/T400V/K425R/S446R、K58R/P107G/I122L/V322L/T400V/K425R/I427R/I440R/S446R、K58R/P107G/V164H/T400V、K58R/P107G/D236T/T400V、K58R/P107G/T400V、K58R/I122L/V164H/D236T/S446R、K58R/I122L/V176R/D236T/T400V/S446R、K58R/I122L/V176R/V322L/H324G/S426A/I427R、K58R/I122L/V322L/M325L、K58R/I122L/M325L、K58R/I122L/I440R、K58R/V164H/V176R、K58R/V164H/H324G/K425R/I427R、K58R/V176R/D236T、K58R/D236T、P107G/I122L/D236T/K425R/S426A/S446R、P107G/V164H/D236T/T400V/S446R、P107G/V176R/V322L/M325L/I440R/S446R、P107G/V176R/T400V/K425R/I427R/I440R、P107G/D236T、P107G/I440R、I122L/V164H/V176R/H324G/T400V、I122L/V164H/T400V/I440R、I122L/V164H/T400V/I440R/S446R、I122L/V176R/D236T/T400V、I122L/V176R/H324G/T400V/I440R、I122L/T400V、I122L/K425R/S426R/S446R、I122L/I440R/S446R、I139V、I139V/G252D、V164H、V164H/S271G/K425R/S426R、V164H/V322L/H324G/M325L/T400V/K425R/I440R/S446R、V164H/T400V、V176R/T400V、P189RおよびH324G/T400V/K425R/S426R/I440R/S446Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3016を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、9、65、106、115、116、172、178、200、210、213、240、242、245、255、324/423、385、408、409、411、412、415、416、423、および447から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3016を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、9C、9M、65S、106A、115D、115R、116V、172R、172S、178K、200A、200T、200V、210L、210V、213G、240C、240E、240L、240P、240V、242I、242Y、245M、255P、324R/423R、385R、408P、409L、411Q、412R、415A、415H、415K、415R、416R、423A、423R、447Lおよび447Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3016を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S9C、S9M、N65S、K106A、N115D、N115R、L116V、N172R、N172S、Q178K、G200A、G200T、G200V、E210L、E210V、A213G、N240C、N240E、N240L、N240P、N240V、A242I、A242Y、K245M、D255P、H324R/N423R、V385R、E408P、T409L、E411Q、I412R、G415A、G415H、G415K、G415R、K416R、N423A、N423R、N447LおよびN447Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3016を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3018、3020、3022、3024、3026、3028、3030、3032、3034、3036、3038、3040、3042、3044、3046、3048、3050、3052、3054、3056、3058、3060、3062、3064、3066、3068、3070、3072、3074、3076、3078、3080、3082、3084、3086、3088、3090、3092、3094、3096、3098、3100、3102、3104、3106、3108、3110、3112、3114、3116、3118、3120、3122、3124、3126、3128、3130、3132、3134、3136、3138、3140、3142、3144、3146、3148、3150、3152、3154、3156、3158、3160、3162、3164、3166、3168、3170、3172、3174、3176、3178および3180のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3018、3020、3022、3024、3026、3028、3030、3032、3034、3036、3038、3040、3042、3044、3046、3048、3050、3052、3054、3056、3058、3060、3062、3064、3066、3068、3070、3072、3074、3076、3078、3080、3082、3084、3086、3088、3090、3092、3094、3096、3098、3100、3102、3104、3106、3108、3110、3112、3114、3116、3118、3120、3122、3124、3126、3128、3130、3132、3134、3136、3138、3140、3142、3144、3146、3148、3150、3152、3154、3156、3158、3160、3162、3164、3166、3168、3170、3172、3174、3176、3178および3180のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3018、3020、3022、3024、3026、3028、3030、3032、3034、3036、3038、3040、3042、3044、3046、3048、3050、3052、3054、3056、3058、3060、3062、3064、3066、3068、3070、3072、3074、3076、3078、3080、3082、3084、3086、3088、3090、3092、3094、3096、3098、3100、3102、3104、3106、3108、3110、3112、3114、3116、3118、3120、3122、3124、3126、3128、3130、3132、3134、3136、3138、3140、3142、3144、3146、3148、3150、3152、3154、3156、3158、3160、3162、3164、3166、3168、3170、3172、3174、3176、3178および3180のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、8、8/107/139/164/415/416/440/448、8/107/139/255/322/325/415/416/440/448、8/107/164/255、8/107/164/423/440、8/139、8/139/164/200/236/240/322/440/448、8/139/164/236/416/423/440、8/139/189/240/325/416、8/139/200/236/240/255/423、8/139/255/415/416、8/164、8/164/189/200/322/324/325/416/448、8/164/240/423、8/164/252/255/448、8/164/448、8/236/240/252/448、8/240/423、8/252/255/322/325/448、12/164/440、107/139、107/139/200/240/322/324/325/448、107/236/240/325/440、107/240/252/423/448、107/423、139、139/164/236/240、139/255/325/415/440、164/189、164/189/236/240、164/189/240/252/415/423、164/200/236、164/200/236/240/324/416/440、164/200/236/255/322/324/423/440、164/236、164/236/240/440、164/236/423、164/322/325、164/322/325/416/423、164/416/448、200/236/322/325/416、200/322/325/415/448、236/415/416、240、240/252/255/322/415/416、240/252/255/415/448、255/423、325および415/416/448から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3082を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2−、8S、8S/107G/139V/164H/415A/416R/440R/448A、8S/107G/139V/255P/322L/325L/415A/416R/440R/448A、8S/107G/164H/255P、8S/107G/164H/423R/440R、8S/139V、8S/139V/164H/200A/236T/240E/322L/440R/448A、8S/139V/164H/236T/416R/423R/440R、8S/139V/189R/240E/325L/416R、8S/139V/200A/236T/240E/255P/423R、8S/139V/255P/415A/416R、8S/164H、8S/164H/189R/200A/322L/324G/325L/416R/448A、8S/164H/240E/423R、8S/164H/252D/255P/448A、8S/164H/448A、8S/236T/240E/252D/448A、8S/240E/423R、8S/252D/255P/322L/325L/448A、12S/164H/440R、107G/139V、107G/139V/200A/240E/322L/324G/325L/448A、107G/236T/240E/325L/440R、107G/240E/252D/423R/448A、107G/423R、139V、139V/164H/236T/240E、139V/255P/325L/415A/440R、164H/189R、164H/189R/236T/240E、164H/189R/240E/252D/415A/423R、164H/200A/236T、164H/200A/236T/240E/324G/416R/440R、164H/200A/236T/255P/322L/324G/423R/440R、164H/236T、164H/236T/240E/440R、164H/236T/423R、164H/322L/325L、164H/322L/325L/416R/423R、164H/416R/448A、200A/236T/322L/325L/416R、200A/322L/325L/415A/448A、236T/415A/416R、240E、240E/252D/255P/322L/415A/416R、240E/252D/255P/415A/448A、255P/423R、325Lおよび415A/416R/448Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2−、G8S、G8S/P107G/I139V/V164H/G415A/K416R/I440R/K448A、G8S/P107G/I139V/D255P/V322L/M325L/G415A/K416R/I440R/K448A、G8S/P107G/V164H/D255P、G8S/P107G/V164H/N423R/I440R、G8S/I139V、G8S/I139V/V164H/G200A/D236T/N240E/V322L/I440R/K448A、G8S/I139V/V164H/D236T/K416R/N423R/I440R、G8S/I139V/P189R/N240E/M325L/K416R、G8S/I139V/G200A/D236T/N240E/D255P/N423R、G8S/I139V/D255P/G415A/K416R、G8S/V164H、G8S/V164H/P189R/G200A/V322L/H324G/M325L/K416R/K448A、G8S/V164H/N240E/N423R、G8S/V164H/G252D/D255P/K448A、G8S/V164H/K448A、G8S/D236T/N240E/G252D/K448A、G8S/N240E/N423R、G8S/G252D/D255P/V322L/M325L/K448A、T12S/V164H/I440R、P107G/I139V、P107G/I139V/G200A/N240E/V322L/H324G/M325L/K448A、P107G/D236T/N240E/M325L/I440R、P107G/N240E/G252D/N423R/K448A、P107G/N423R、I139V、I139V/V164H/D236T/N240E、I139V/D255P/M325L/G415A/I440R、V164H/P189R、V164H/P189R/D236T/N240E、V164H/P189R/N240E/G252D/G415A/N423R、V164H/G200A/D236T、V164H/G200A/D236T/N240E/H324G/K416R/I440R、V164H/G200A/D236T/D255P/V322L/H324G/N423R/I440R、V164H/D236T、V164H/D236T/N240E/I440R、V164H/D236T/N423R、V164H/V322L/M325L、V164H/V322L/M325L/K416R/N423R、V164H/K416R/K448A、G200A/D236T/V322L/M325L/K416R、G200A/V322L/M325L/G415A/K448A、D236T/G415A/K416R、N240E、N240E/G252D/D255P/V322L/G415A/K416R、N240E/G252D/D255P/G415A/K448A、D255P/N423R、M325LおよびG415A/K416R/K448Aから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2、3、8、34、72、73、75、113、114、186、189、221、235、237、239、256、286、299、305、309、312、313、323、355、389、406、422、438、および446から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2N、2S、2T、3I、8S、34R、72Y、73A、73P、73T、73V、75H、113I、114V、186G、186I、189S、221K、235M、237L、237M、237V、239A、256I、256L、256S、256T、286L、286S、299A、299L、299R、299V、305G、309R、312S、312T、312V、313D、323P、355A、389F、389G、406F、406G、406N、406Q、422C、422R、422S、438T、446Hおよび446Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2N、H2S、H2T、H3I、G8S、K34R、L72Y、H73A、H73P、H73T、H73V、P75H、L113I、Q114V、E186G、E186I、P189S、E221K、Q235M、P237L、P237M、P237V、T239A、E256I、E256L、E256S、E256T、N286L、N286S、E299A、E299L、E299R、E299V、D305G、K309R、L312S、L312T、L312V、E313D、D323P、F355A、D389F、D389G、T406F、T406G、T406N、T406Q、K422C、K422R、K422S、E438T、R446HおよびR446Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、20/126/128/155/161、20/126/128/160/161、20/126/128/160/161/198、20/126/128/161、20/126/128/161/198/199、20/126/155/160/198、20/126/155/161、20/126/160、20/126/160/161、20/126/161、20/128/155/160/161/198、20/128/155/161/199、20/128/155/199、20/128/160/161/198、20/155/160、20/155/160/161、20/155/161、20/155/161/199、20/
160/161/198、121/126/128/161/369、126/128/155/160/161、126/128/155/160/161/199、126/128/155/161/199、126/128/160/161/369、126/128/160/198/369、126/128/160/199/369、126/128/160/369、126/128/161/199/369、126/128/161/369、126/128/369、126/160/161/199/369、126/160/198/369、126/196/198/369、126/198/369、126/199/369、126/369、128/155/160/161、128/155/160/161/199、128/155/160/198、128/155/199、128/160/161/369、128/161/199/369、128/198/199/369、128/199/369、128/369、155/161/198/199、155/199、160/161/369、161/198/369、161/369および199/369から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、20Y/126H/128A/155R/161T、20Y/126H/128A/161T、20Y/126H/155R/160S/198P、20Y/126H/160S、20Y/126H/160S/161T、20Y/126Q/128A/160S/161T、20Y/126Q/128A/160S/161T/198H、20Y/126Q/128A/161T/198H/199A、20Y/126Q/155R/161G、20Y/126Q/161G、20Y/128A/155R/160S/161T/198H、20Y/128A/155R/161T/199A、20Y/128A/155R/199A、20Y/128A/160S/161T/198P、20Y/155R/160S、20Y/155R/160S/161G、20Y/155R/161T、20Y/155R/161T/199A、20Y/160S/161T/198H、121F/126H/128A/161T/369N、126H/128A/155R/160S/161T、126H/128A/160S/198H/369N、126H/128A/161G/199A/369N、126H/128A/161G/369N、126H/128A/369N、126H/160S/161G/199A/369N、126H/160S/198P/369N、126H/196V/198P/369N、126Q/128A/155R/160S/161T/199A、126Q/128A/155R/161G/199A、126Q/128A/160S/161T/369N、126Q/128A/160S/199A/369N、126Q/128A/160S/369N、126Q/198P/369N、126Q/199A/369N、126Q/369N、128A/155R/160S/161T、128A/155R/160S/161T/199A、128A/155R/160S/198P、128A/155R/199A、128A/160S/161G/369N、128A/161G/199A/369N、128A/198H/199A/369N、128A/199A/369N、128A/369N、155R/161G/198H/199A、155R/199A、160S/161G/369N、160S/161T/369N、161T/198P/369N、161T/369Nおよび199A/369Nから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、W20Y/L126H/P128A/F155R/R161T、W20Y/L126H/P128A/R161T、W20Y/L126H/F155R/K160S/G198P、W20Y/L126H/K160S、W20Y/L126H/K160S/R161T、W20Y/L126Q/P128A/K160S/R161T、W20Y/L126Q/P128A/K160S/R161T/G198H、W20Y/L126Q/P128A/R161T/G198H/N199A、W20Y/L126Q/F155R/R161G、W20Y/L126Q/R161G、W20Y/P128A/F155R/K160S/R161T/G198H、W20Y/P128A/F155R/R161T/N199A、W20Y/P128A/F155R/N199A、W20Y/P128A/K160S/R161T/G198P、W20Y/F155R/K160S、W20Y/F155R/K160S/R161G、W20Y/F155R/R161T、W20Y/F155R/R161T/N199A、W20Y/K160S/R161T/G198H、V121F/L126H/P128A/R161T/P369N、L126H/P128A/F155R/K160S/R161T、L126H/P128A/K160S/G198H/P369N、L126H/P128A/R161G/N199A/P369N、L126H/P128A/R161G/P369N、L126H/P128A/P369N、L126H/K160S/R161G/N199A/P369N、L126H/K160S/G198P/P369N、L126H/A196V/G198P/P369N、L126Q/P128A/F155R/K160S/R161T/N199A、L126Q/P128A/F155R/R161G/N199A、L126Q/P128A/K160S/R161T/P369N、L126Q/P128A/K160S/N199A/P369N、L126Q/P128A/K160S/P369N、L126Q/G198P/P369N、L126Q/N199A/P369N、L126Q/P369N、P128A/F155R/K160S/R161T、P128A/F155R/K160S/R161T/N199A、P128A/F155R/K160S/G198P、P128A/F155R/N199A、P128A/K160S/R161G/P369N、P128A/R161G/N199A/P369N、P128A/G198H/N199A/P369N、P128A/N199A/P369N、P128A/P369N、F155R/R161G/G198H/N199A、F155R/N199A、K160S/R161G/P369N、K160S/R161T/P369N、R161T/G198P/P369N、R161T/P369NおよびN199A/P369Nから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3082を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3182、3184、3186、3188、3190、3192、3194、3196、3198、3200、3202、3204、3206、3208、3210、3212、3214、3216、3218、3220、3222、3224、3226、3228、3230、3232、3234、3236、3238、3240、3242、3244、3246、3248、3250、3252、3254、3256、3258、3260、3262、3264、3266、3268、3270、3272、3274、3276、3278、3280、3282、3284、3286、3288、3290、3292、3294、3296、3298、3300、3302、3304、3306、3308、3310、3312、3314、3316、3318、3320、3322、3324、3326、3328、3330、3332、3334、3336、3338、3340、3342、3344、3346、3348、3350、3352、3354、3356、3358、3360、3362、3364、3366、3368、3370、3372、3374、3376、3378、3380、3382、3384、3386、3388、3390、3392、3394、3396、3398、3400、3402、3404、3406、3408、3410、3412、3414、3416、3418、3420、3422、3424、3426、3428、3430、3432、3434、3436、3438、3440、3442、3444、3446、3448、3450、3452、3454、3456、3458、3460、3462、3464、3466、3468、3470、
3472、3474、3476、3478、3480、3482、3484、3486、3488および3490のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3182、3184、3186、3188、3190、3192、3194、3196、3198、3200、3202、3204、3206、3208、3210、3212、3214、3216、3218、3220、3222、3224、3226、3228、3230、3232、3234、3236、3238、3240、3242、3244、3246、3248、3250、3252、3254、3256、3258、3260、3262、3264、3266、3268、3270、3272、3274、3276、3278、3280、3282、3284、3286、3288、3290、3292、3294、3296、3298、3300、3302、3304、3306、3308、3310、3312、3314、3316、3318、3320、3322、3324、3326、3328、3330、3332、3334、3336、3338、3340、3342、3344、3346、3348、3350、3352、3354、3356、3358、3360、3362、3364、3366、3368、3370、3372、3374、3376、3378、3380、3382、3384、3386、3388、3390、3392、3394、3396、3398、3400、3402、3404、3406、3408、3410、3412、3414、3416、3418、3420、3422、3424、3426、3428、3430、3432、3434、3436、3438、3440、3442、3444、3446、3448、3450、3452、3454、3456、3458、3460、3462、3464、3466、3468、3470、3472、3474、3476、3478、3480、3482、3484、3486、3488および3490のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3182、3184、3186、3188、3190、3192、3194、3196、3198、3200、3202、3204、3206、3208、3210、3212、3214、3216、3218、3220、3222、3224、3226、3228、3230、3232、3234、3236、3238、3240、3242、3244、3246、3248、3250、3252、3254、3256、3258、3260、3262、3264、3266、3268、3270、3272、3274、3276、3278、3280、3282、3284、3286、3288、3290、3292、3294、3296、3298、3300、3302、3304、3306、3308、3310、3312、3314、3316、3318、3320、3322、3324、3326、3328、3330、3332、3334、3336、3338、3340、3342、3344、3346、3348、3350、3352、3354、3356、3358、3360、3362、3364、3366、3368、3370、3372、3374、3376、3378、3380、3382、3384、3386、3388、3390、3392、3394、3396、3398、3400、3402、3404、3406、3408、3410、3412、3414、3416、3418、3420、3422、3424、3426、3428、3430、3432、3434、3436、3438、3440、3442、3444、3446、3448、3450、3452、3454、3456、3458、3460、3462、3464、3466、3468、3470、3472、3474、3476、3478、3480、3482、3484、3486、3488および3490のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、106/164/172/200/409、106/164/172/210/240/415、106/164/172/242/409/416、106/164/200/210/242、106/164/200/210/415、106/164/200/240/408/409/416、106/164/210/240/408/409/416、106/164/210/408/409、106/164/240/415、106/164/409/415/423、106/172/200/210/240/242/408/415/416/423、106/172/200/210/242、106/172/240、106/172/240/242/409/415、106/172/242、106/172/242/416/423、106/172/408/409、106/172/409/423、106/200/210/409、106/210/240、106/210/240/408/415、106/240/242、106/240/242/409、106/242/408/409、164/172/200/210/242/409、164/172/240/242/415、164/172/242/408、164/200/408/415/416、164/240/242/408、164/240/242/415/423、164/423、172/200/210/240/408、172/200/240、172/200/408/416、172/210/415、172/240、172/240/242/415、172/240/409、200/210/240/242/409、200/240/242/407、200/242/415/416/423、200/408/409、210/240、240、240/242、240/242/408/416、240/242/415/423、240/408、240/415および409/415から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3244を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、106A/164H/172R/200A/409L、106A/164H/172R/210V/240E/415R、106A/164H/172R/242I/409L/416R、106A/164H/200A/210V/242I、106A/164H/200A/210V/415A、106A/164H/200A/240E/408P/409L/416R、106A/164H/210V/240E/408P/409L/416R、106A/164H/210V/408P/409L、106A/164H/240E/415A、106A/164H/409L/415A/423R、106A/172R/200A/210V/240E/242I/408P/415A/416R/423R、106A/172R/200A/210V/242I、106A/172R/240E、106A/172R/240E/242I/409L/415R、106A/172R/242I、106A/172R/242I/416R/423R、106A/172R/408P/409L、106A/172R/409L/423R、106A/200A/210V/409L、106A/210V/240E、106A/210V/240E/408P/415R、106A/240E/242I、106A/240E/242I/409L、106A/242I/408P/409L、164H/172R/200A/210V/242I/409L、164H/172R/240E/242I/415R、164H/172R/242I/408P、164H/200A/408P/415A/416R、164H/240E/242I/408P、164H/240E/242I/415R/423R、164H/423R、172R/200A/210V/240E/408P、172R/200A/240E、172R/200A/408P/416R、172R/210V/415A、172R/240E、172R/240E/242I/415R、172R/240E/409L、200A/210V/240E/242I/409L、200A/240E/242I/407S、200A/242I/415A/416R/423R、200A/408P/409L、210V/240E、240E、240E/242I、240E/242I/408P/416R、240E/242I/415A/423R、240E/408P、240E/415Rおよび409L/415Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3244を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、K106A/V164H/N172R/G200A/T409L、K106A/V164H/N172R/E210V/N240E/G415R、K106A/V164H/N172R/A242I/T409L/K416R、K106A/V164H/G200A/E210V/A242I、K106A/V164H/G200A/E210V/G415A、K106A/V164H/G200A/N240E/E408P/T409L/K416R、K106A/V164H/E210V/N240E/E408P/T409L/K416R、K106A/V164H/E210V/E408P/T409L、K106A/V164H/N240E/G415A、K106A/V164H/T409L/G415A/N423R、K106A/N172R/G200A/E210V/N240E/A242I/E408P/G415A/K416R/N423R、K106A/N172R/G200A/E210V/A242I、K106A/N172R/N240E、K106A/N172R/N240E/A242I/T409L/G415R、K106A/N172R/A242I、K106A/N172R/A242I/K416R/N423R、K106A/N172R/E408P/T409L、K106A/N172R/T409L/N423R、K106A/G200A/E210V/T409L、K106A/E210V/N240E、K106A/E210V/N240E/E408P/G415R、K106A/N240E/A242I、K106A/N240E/A242I/T409L、K106A/A242I/E408P/T409L、V164H/N172R/G200A/E210V/A242I/T409L、V164H/N172R/N240E/A242I/G415R、V164H/N172R/A242I/E408P、V164H/G200A/E408P/G415A/K416R、V164H/N240E/A242I/E408P、V164H/N240E/A242I/G415R/N423R、V164H/N423R、N172R/G200A/E210V/N240E/E408P、N172R/G200A/N240E、N172R/G200A/E408P/K416R、N172R/E210V/G415A、N172R/N240E、N172R/N240E/A242I/G415R、N172R/N240E/T409L、G200A/E210V/N240E/A242I/T409L、G200A/N240E/A242I/G407S、G200A/A242I/G415A/K416R/N423R、G200A/E408P/T409L、E210V/N240E、N240E、N240E/A242I、N240E/A242I/E408P/K416R、N240E/A242I/G415A/N423R、N240E/E408P、N240E/G415RおよびT409L/G415Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3244を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14、35、42、46、49、105、134、143、179、181、232、278、290、336、373、381、401、および441から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3244を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、14K、35D、42F、42I、42V、46T、46V、49A、49M、49P、49Q、49S、105A、134A、134C、134S、143P、179A、179D、179T、181L、232T、278I、278L、290L、336A、373R、381G、401V、441I、および441Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3244を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、R14K、Q35D、L42F、L42I、L42V、C46T、C46V、L49A、L49M、L49P、L49Q、L49S、S105A、V134A、V134C、V134S、K143P、V179A、V179D、V179T、M181L、P232T、V278I、V278L、I290L、S336A、K373R、A381G、L401V、Q441I、およびQ441Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3244を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3492、3494、3496、3498、3500、3502、3504、3506、3508、3510、3512、3514、3516、3518、3520、3522、3524、3526、3528、3530、3532、3534、3536、3538、3540、3542、3544、3546、3548、3550、3552、3554、3556、3558、3560、3562、3564、3566、3568、3570、3572、3574、3576、3578、3580、3582、3584、3586、3588、3590、3592、3594、3596、3598、3600、3602、3604、3606、3608、3610、3612、3614、3616、3618、3620、3622、3624、3626、3628、3630、3632、3634、3636、3638、3640、3642、3644、
3646、3648、3650および3652のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3492、3494、3496、3498、3500、3502、3504、3506、3508、3510、3512、3514、3516、3518、3520、3522、3524、3526、3528、3530、3532、3534、3536、3538、3540、3542、3544、3546、3548、3550、3552、3554、3556、3558、3560、3562、3564、3566、3568、3570、3572、3574、3576、3578、3580、3582、3584、3586、3588、3590、3592、3594、3596、3598、3600、3602、3604、3606、3608、3610、3612、3614、3616、3618、3620、3622、3624、3626、3628、3630、3632、3634、3636、3638、3640、3642、3644、3646、3648、3650および3652のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3492、3494、3496、3498、3500、3502、3504、3506、3508、3510、3512、3514、3516、3518、3520、3522、3524、3526、3528、3530、3532、3534、3536、3538、3540、3542、3544、3546、3548、3550、3552、3554、3556、3558、3560、3562、3564、3566、3568、3570、3572、3574、3576、3578、3580、3582、3584、3586、3588、3590、3592、3594、3596、3598、3600、3602、3604、3606、3608、3610、3612、3614、3616、3618、3620、3622、3624、3626、3628、3630、3632、3634、3636、3638、3640、3642、3644、3646、3648、3650および3652のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、21、91、125、127、130/187、143、143/150、145、152、156、186、187、195、197、200、201、202、264、268、364、365、および415から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3346を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、21M、21P、91M、125C、125M、125V、127G、130T/187Q、143H、143P/150S、145W、152L、156P、156Q、186N、186V、187S、195F、195G、195R、195S、195T、195Y、197D、197L、197Q、197W、200E、200P、200R、200T、201A、201R、201S、201W、202A、202W、264S、264T、268F、268Q、268W、364S、364W、365Lおよび415Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3346を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、L21M、L21P、P91M、F125C、F125M、F125V、Q127G、A130T/K187Q、K143H、K143P/A150S、L145W、F152L、F156P、F156Q、E186N、E186V、K187S、L195F、L195G、L195R、L195S、L195T、L195Y、P197D、P197L、P197Q、P197W、G200E、G200P、G200R、G200T、G201A、G201R、G201S、G201W、I202A、I202W、F264S、F264T、Y268F、Y268Q、Y268W、M364S、M364W、Q365LおよびG415Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3346を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3760、3762、3764、3766、3768、3770、3772、3774、3776、3778、3780、3782、3784、3786、3788、3790、3792、3794、3796、3798、3800、3802、3804、3806、3808、3810、3812、3814、3816、3818、3820、3822、3824、3826、3828、3830、3832、3834、3836、3838、3840、3842、3844、3846、3848および3850のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3760、3762、3764、3766、3768、3770、3772、3774、3776、3778、3780、3782、3784、3786、3788、3790、3792、3794、3796、3798、3800、3802、3804、3806、3808、3810、3812、3814、3816、3818、3820、3822、3824、3826、3828、3830、3832、3834、3836、3838、3840、3842、3844、3846、3848および3850のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3760、3762、3764、3766、3768、3770、3772、3774、3776、3778、3780、3782、3784、3786、3788、3790、3792、3794、3796、3798、3800、3802、3804、3806、3808、3810、3812、3814、3816、3818、3820、3822、3824、3826、3828、3830、3832、3834、3836、3838、3840、3842、3844、3846、3848および3850のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/5/113/186/237/406、2/73/186/237、2/189/286、2/286/355/416/422、5/34/73/113/406、5/73/186/406、5/113/237/406、5/186/237/245/256/406、5/186/237/406、5/256/406、34/113/186/237/406、72/73/172/235/240/242/438、72/172/239/240/242/408、72/172/240/242、73/172、73/172/235/239/240、73/172/235/239/242、73/172/239/240、73/172/239/240/242、73/172/240/242/408、73/172/240/408、73/186/237/406、73/235/240/323、73/235/240/408、73/237、73/239/242、113/186/406、172、172/188/323、172/235、172/235/239/240/242、172/235/239/408、172/235/240、172/235/240/242/438、172/239/240/242/323/408、172/240、172/240/299/323、186、186/237、186/237/286、186/406、189/333/355/421、235/239/240、235/240/242、237、239/240、239/240/242/256/323、239/240/242/323/408、239/240/408、239/242/408、240/242/256/438および242/408から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3502を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2−/5N/113I/186G/237V/406Q、2−/73A/186G/237V、2S/189S/286Q、2S/286Q/355A/416R/422R、5N/34R/73A/113I/406N、5N/73A/186G/406N、5N/113I/237V/406N、5N/186G/237V/245T/256I/406Q、5N/186G/237V/406Q、5N/256L/406Q、34R/113I/186G/237L/406N、72Y/73P/172R/235M/240E/242I/438T、72Y/172R/239A/240E/242I/408P、72Y/172R/240E/242I、73A/186G/237L/406Q、73A/237V、73P/172R、73P/172R/235M/239A/240E、73P/172R/235M/239A/242I、73P/172R/239A/240E、73P/172R/239A/240E/242I、73P/172R/240E/242I/408P、73P/172R/240E/408P、73P/235M/240E/323P、73P/235M/240E/408P、73P/239A/242I、113I/186G/406Q、172R、172R/188G/323P、172R/235M、172R/235M/239A/240E/242I、172R/235M/239A/408P、172R/235M/240E、172R/235M/240E/242I/438T、172R/239A/240E/242I/323P/408P、172R/240E、172R/240E/299A/323P、186G、186G/237L、186G/237V/286S、186G/406N、186G/406Q、189S/333H/355A/421Q、235M/239A/240E、235M/240E/242I、237L、239A/240E、239A/240E/242I/256S/323P、239A/240E/242I/323P/408P、239A/240E/408P、239A/242I/408P、240E/242I/256S/438Tおよび242I/408Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3502を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2−/H5N/L113I/E186G/P237V/T406Q、H2−/H73A/E186G/P237V、H2S/P189S/N286Q、H2S/N286Q/F355A/K416R/K422R、H5N/K34R/H73A/L113I/T406N、H5N/H73A/E186G/T406N、H5N/L113I/P237V/T406N、H5N/E186G/P237V/K245T/E256I/T406Q、H5N/E186G/P237V/T406Q、H5N/E256L/T406Q、K34R/L113I/E186G/P237L/T406N、L72Y/H73P/N172R/Q235M/N240E/A242I/E438T、L72Y/N172R/T239A/N240E/A242I/E408P、L72Y/N172R/N240E/A242I、H73A/E186G/P237L/T406Q、H73A/P237V、H73P/N172R、H73P/N172R/Q235M/T239A/N240E、H73P/N172R/Q235M/T239A/A242I、H73P/N172R/T239A/N240E、H73P/N172R/T239A/N240E/A242I、H73P/N172R/N240E/A242I/E408P、H73P/N172R/N240E/E408P、H73P/Q235M/N240E/D323P、H73P/Q235M/N240E/E408P、H73P/T239A/A242I、L113I/E186G/T406Q、N172R、N172R/E188G/D323P、N172R/Q235M、N172R/Q235M/T239A/N240E/A242I、N172R/Q235M/T239A/E408P、N172R/Q235M/N240E、N172R/Q235M/N240E/A242I/E438T、N172R/T239A/N240E/A242I/D323P/E408P、N172R/N240E、N172R/N240E/E299A/D323P、E186G、E186G/P237L、E186G/P237V/N286S、E186G/T406N、E186G/T406Q、P189S/N333H/F355A/S421Q、Q235M/T239A/N240E、Q235M/N240E/A242I、P237L、T239A/N240E、T239A/N240E/A242I/E256S/D323P、T239A/N240E/A242I/D323P/E408P、T239A/N240E/E408P、T239A/A242I/E408P、N240E/A242I/E256S/E438TおよびA242I/E408Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3502を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、96、127、132、144、153、155、156、186、187、196、199、および200から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3502を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、96A、96P、127I、127L、127V、132H、132K、132T、144V、153A、153G、155M、156W、186A、186G、186R、187A、187R、187T、196S、199A、199S、199Y、および200Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3502を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、G96A、G96P、Q127I、Q127L、Q127V、Q132H、Q132K、Q132T、I144V、S153A、S153G、F155M、F156W、E186A、E186G、E186R、K187A、K187R、K187T、A196S、N199A、N199S、N199Y、およびA200Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3502を参照して番号付けられている。
一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3654、3656、3658、3660、3662、3664、3666、3668、3670、3672、3674、3676、3678、3680、3682、3684、3686、3688、3690、3692、3694、3696、3698、3700、3702、3704、3706、3708、3710、3712、3714、3716、3718、3720、3722、3724、3726、3728、3730、3732、3734、3736、3738、3740、3742、3744、3746、3748、3750、3752、3754、3756、3758、3852、3854、3856、3858、3860、3862、3864、3866、3868、3870、3872、3874、3876、3878、3880、3882、3884、3886、3888、3890、3892、3894、3896および3898のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3654、3656、3658、3660、3662、3664、3666、3668、3670、3672、3674、3676、3678、3680、3682、3684、3686、3688、3690、3692、3694、3696、3698、3700、3702、3704、3706、3708、3710、3712、3714、3716、3718、3720、3722、3724、3726、3728、3730、3732、3734、3736、3738、3740、3742、3744、3746、3748、3750、3752、3754、3756、3758、3852、3854、3856、3858、3860、3862、3864、3866、3868、3870、3872、3874、3876、3878、3880、3882、3884、3886、3888、3890、3892、3894、3896および3898のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3654、3656、3658、3660、3662、3664、3666、3668、3670、3672、3674、3676、3678、3680、3682、3684、3686、3688、3690、3692、3694、3696、3698、3700、3702、3704、3706、3708、3710、3712、3714、3716、3718、3720、3722、3724、3726、3728、3730、3732、3734、3736、3738、3740、3742、3744、3746、3748、3750、3752、3754、3756、3758、3852、3854、3856、3858、3860、3862、3864、3866、3868、3870、3872、3874、3876、3878、3880、3882、3884、3886、3888、3890、3892、3894、3896および3898のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、2/5/35/105/143/237/373/416/422、2/5/35/143/232/237/416/422/441、2/5/35/232/278/373/416、2/5/105/143/232/373/416/422、2/5/278、2/105/143/232/237/278/373/441、2/143/232/373/441、2/143/373/441、5/35/232/373/416/422、5/105/232/237/373/416/441、5/105/237/278/422/441、5/105/237/416/422/441、5/143/189/232/237/441、5/143/232/237/278、5/143/232/237/416/422、5/143/232/373/422/441、5/143/237/278/373/416/422、5/143/373、5/189/237/278/373/416/422/441、5/232/416/422、5/237/373/422、5/373/416、26/42、26/42/46/49、26/42/46/49/134、26/42/46/49/134/186、26/42/46/134、26/42/49/134、26/42/49/134/186/355、26/42/49/134/401、26/42/134/401、26/49/134、26/134、26/134/186/355/401、26/134/355、26/134/401、26/355/401、35、35/105/189/232/373/416、42/46/49/97/134/401、42/46/49/134、42/46/49/134/186、42/46/49/134/186/355、42/46/49/134/235/355/401、42/46/49/134/401、42/46/49/186、42/49/134/186/355、42/49/134/186/401、42/49/134/355/401、42/134/186、42/186/355、46/49/134、49/134/355、105/143/232/237/373/416/422/441、105/143/278/373、105/189/237、105/237/278/373/416/422、105/237/373/422/441、105/373、105/373/441、134/401、143、143/189、143/189/232/422/441、143/189/237/373/416/422、143/232、143/237、143/237/422/441、186/355、189/232/373/416/422/441、189/237/278/416/441、232/237、237/373、237/373/441および237/422から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3696を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2−/5N/35D/105A/143P/237V/373R/416R/422R、2−/5N/35D/143P/232T/237L/416R/422R/441R、2−/5N/35D/232T/278L/373R/416R、2−/5N/105A/143P/232T/373R/416R/422R、2−/5N/278L、2−/105A/143P/232T/237L/278L/373R/441R、2−/143P/232T/373R/441R、2−/143P/373R/441R、5N/35D/232T/373R/416R/422R、5N/105A/232T/237L/373R/416R/441R、5N/105A/237L/278I/422R/441R、5N/105A/237V/416R/422R/441R、5N/143P/189S/232T/237V/441R、5N/143P/232T/237L/278L、5N/143P/232T/237L/416R/422R、5N/143P/232T/373R/422R/441R、5N/143P/237L/278L/373R/416R/422R、5N/143P/373R、5N/189S/237V/278I/373R/416R/422R/441R、5N/232T/416R/422R、5N/237L/373R/422R、5N/373R/416R、26V/42I/49Q/134C/186G/355A、26V/42I/49Q/134C/401V、26V/42V、26V/42V/46V/49A、26V/42V/46V/49A/134A、26V/42V/46V/49A/134C/186G、26V/42V/46V/134A、26V/42V/49S/134C、26V/42V/134C/401V、26V/49Q/134A、26V/134A、26V/134A/186G/355A/401V、26V/134C/355A、26V/134T/401V、26V/355A/401V、35D、35D/105A/189S/232T/373R/416R、42I/46V/49A/134A、42I/46V/49S/134C/186G、42I/46V/49S/186G、42V/46V/49A/134A/401V、42V/46V/49A/134T/186G/355A、42V/46V/49P/134C/235R/355A/401V、42V/46V/49S/97P/134C/401V、42V/49A/134C/186G/355A、42V/49S/134A/186G/401V、42V/49S/134C/355A/401V、42V/134C/186G、42V/186G/355A、46V/49Q/134T、49S/134C/355A、105A/143P/232T/237V/373R/416R/422R/441R、105A/143P/278L/373R、105A/189S/237V、105A/237L/278L/373R/416R/422R、105A/237L/373R/422R/441R、105A/373R、105A/373R/441R、134C/401V、143P、143P/189S、143P/189S/232T/422R/441R、143P/189S/237L/373R/416R/422R、143P/232T、143P/237L/422R/441R、143P/237V、186G/355A、189S/232T/373R/416R/422R/441R、189S/237L/278I/416R/441R、232T/237L、237L/422R、237V/373Rおよび237V/373R/441Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2−/H5N/Q35D/S105A/K143P/P237V/K373R/K416R/K422R、H2−/H5N/Q35D/K143P/P232T/P237L/K416R/K422R/Q441R、H2−/H5N/Q35D/P232T/V278L/K373R/K416R、H2−/H5N/S105A/K143P/P232T/K373R/K416R/K422R、H2−/H5N/V278L、H2−/S105A/K143P/P232T/P237L/V278L/K373R/Q441R、H2−/K143P/P232T/K373R/Q441R、H2−/K143P/K373R/Q441R、H5N/Q35D/P232T/K373R/K416R/K422R、H5N/S105A/P232T/P237L/K373R/K416R/Q441R、H5N/S105A/P237L/V278I/K422R/Q441R、H5N/S105A/P237V/K416R/K422R/Q441R、H5N/K143P/P189S/P232T/P237V/Q441R、H5N/K143P/P232T/P237L/V278L、H5N/K143P/P232T/P237L/K416R/K422R、H5N/K143P/P232T/K373R/K422R/Q441R、H5N/K143P/P237L/V278L/K373R/K416R/K422R、H5N/K143P/K373R、H5N/P189S/P237V/V278I/K373R/K416R/K422R/Q441R、H5N/P232T/K416R/K422R、H5N/P237L/K373R/K422R、H5N/K373R/K416R、I26V/L42I/L49Q/V134C/E186G/F355A、I26V/L42I/L49Q/V134C/L401V、I26V/L42V、I26V/L42V/C46V/L49A、I26V/L42V/C46V/L49A/V134A、I26V/L42V/C46V/L49A/V134C/E186G、I26V/L42V/C46V/V134A、I26V/L42V/L49S/V134C、I26V/L42V/V134C/L401V、I26V/L49Q/V134A、I26V/V134A、I26V/V134A/E186G/F355A/L401V、I26V/V134C/F355A、I26V/V134T/L401V、I26V/F355A/L401V、Q35D、Q35D/S105A/P189S/P232T/K373R/K416R、L42I/C46V/L49A/V134A、L42I/C46V/L49S/V134C/E186G、L42I/C46V/L49S/E186G、L42V/C46V/L49A/V134A/L401V、L42V/C46V/L49A/V134T/E186G/F355A、L42V/C46V/L49P/V134C/Q235R/F355A/L401V、L42V/C46V/L49S/T97P/V134C/L401V、L42V/L49A/V134C/E186G/F355A、L42V/L49S/V134A/E186G/L401V、L42V/L49S/V134C/F355A/L401V、L42V/V134C/E186G、L42V/E186G/F355A、C46V/L49Q/V134T、L49S/V134C/F355A、S105A/K143P/P232T/P237V/K373R/K416R/K422R/Q441R、S105A/K143P/V278L/K373R、S105A/P189S/P237V、S105A/P237L/V278L/K373R/K416R/K422R、S105A/P237L/K373R/K422R/Q441R、S105A/K373R、S105A/K373R/Q441R、V134C/L401V、K143P、K143P/P189S、K143P/P189S/P232T/K422R/Q441R、K143P/P189S/P237L/K373R/K416R/K422R、K143P/P232T、K143P/P237L/K422R/Q441R、K143P/P237V、E186G/F355A、P189S/P232T/K373R/K416R/K422R/Q441R、P189S/P237L/V278I/K416R/Q441R、P232T/P237L、P237L/K422R、P237V/K373RおよびP237V/K373R/Q441Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、3、8、50、61、62、101、137、158、161、164、176、193、
223、223/243、235、237、239、240、243、244、248、249、301、323、330、352、364、426、および427から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、3N、8R、8V、50P、50V、61N、61Y、62A、101L、137R、158W、161L、164A、164E、164F、164L、176P、176Q、176T、193F、223A、223L/243G、235R、237A、237L、239F、239G、239M、239P、239Q、239Y、240V、243G、243H、243R、243S、243Y、244N、248T、249G、249H、301A、323T、330C、352A、364Q、426L、427Sおよび427Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H3N、S8R、S8V、I50P、I50V、E61N、E61Y、K62A、A101L、Q137R、F158W、R161L、H164A、H164E、H164F、H164L、R176P、R176Q、R176T、D193F、T223A、T223L/D243G、Q235R、P237A、P237L、T239F、T239G、T239M、T239P、T239Q、T239Y、E240V、D243G、D243H、D243R、D243S、D243Y、D244N、I248T、D249G、D249H、Q301A、D323T、H330C、S352A、M364Q、A426L、R427SおよびR427Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3696を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3900、3902、3904、3906、3908、3910、3912、3914、3916、3918、3920、3922、3924、3926、3928、3930、3932、3934、3936、3938、3940、3942、3944、3946、3948、3950、3952、3954、3956、3958、3960、3962、3964、3966、3968、3970、3972、3974、3976、3978、3980、3982、3984、3986、3988、3990、3992、3994、3996、3998、4000、4002、4004、4006、4008、4010、4012、4014、4016、4018、4020、4022、4024、4026、4028、4030、4032、4034、4036、4038、4040、4042、4044、4046、4048、4050、4052、4054、4056、4058、4060、4062、4064、4066、4068、4070、4072、4074、4076、4078、4080、4082、4084、4086、4088、4090、4092、4094、4096、4098、4100、4102、4104、4106、4108、4110、4112、4114、4116、4118、4120、4122、4124、4126、4128、4130、4132、4134、4136、4138、4140、4142、4144および4146のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3900、3902、3904、3906、3908、3910、3912、3914、3916、3918、3920、3922、3924、3926、3928、3930、3932、3934、3936、3938、3940、3942、3944、3946、3948、3950、3952、3954、3956、3958、3960、3962、3964、3966、3968、3970、3972、3974、3976、3978、3980、3982、3984、3986、3988、3990、3992、3994、3996、3998、4000、4002、4004、4006、4008、4010、4012、4014、4016、4018、4020、4022、4024、4026、4028、4030、4032、4034、4036、4038、4040、4042、4044、4046、4048、4050、4052、4054、4056、4058、4060、4062、4064、4066、4068、4070、4072、4074、4076、4078、4080、4082、4084、4086、4088、4090、4092、4094、4096、4098、4100、4102、4104、4106、4108、4110、4112、4114、4116、4118、4120、4122、4124、4126、4128、4130、4132、4134、4136、4138、4140、4142、4144および4146のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号3900、3902、3904、3906、3908、3910、3912、3914、3916、3918、3920、3922、3924、3926、3928、3930、3932、3934、3936、3938、3940、3942、3944、3946、3948、3950、3952、3954、3956、3958、3960、3962、3964、3966、3968、3970、3972、3974、3976、3978、3980、3982、3984、3986、3988、3990、3992、3994、3996、3998、4000、4002、4004、4006、4008、4010、4012、4014、4016、4018、4020、4022、4024、4026、4028、4030、4032、4034、4036、4038、4040、4042、4044、4046、4048、4050、4052、4054、4056、4058、4060、4062、4064、4066、4068、4070、4072、4074、4076、4078、4080、4082、4084、4086、4088、4090、4092、4094、4096、4098、4100、4102、4104、4106、4108、4110、4112、4114、4116、4118、4120、4122、4124、4126、4128、4130、4132、4134、4136、4138、4140、4142、4144および4146のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、5/73/113/186/187/373/423、5/73/143/144/179/186/187/422、5/73/144/179/186/373/423、5/73/144/187/373/422、5/143/144/179/181/186/187/373、5/144/179/181/373/422、5/144/373/422、49/96/127/132/156/196、49/96/127/153/278、49/96/132/153/155/156/237/278/406、49/96/132/153/199/200、49/96/132/155、49/96/132/155/237/278、49/96/155/199/200/406、49/153/155、73/113/143/179/181/422、73/113/179/181/186/187、73/143/144/179/186/187/373/423、73/179/181/186/187/373、73/179/181/186/373/422、73/181/186/187、96/127/132/153/278、96/127/153/155、96/132/153/155、96/132/153/155/156、96/132/153/155/156/200、96/132/153/156、96/132/196/199、96/132/278、96/153/155/156、96/153/155/199/200/237、96/153/406、113/143/179/186/187、113/144/186/423、113/144/373、113/181/186/373/422、113/373/422、127/132、127/132/153/156、127/132/155/156/406、127/153/155/199/200/237、127/406、132/153/155、132/153/237/406、132/155、132/237、143/144/179/181/186/187/422、143/179/181/186/187/422/423、144/179/181/186/187/373、144/179/186/187/373、153/155/156/237、153/155/196/199/237、153/199/406、153/237、155/199、179/181/186、179/181/186/187/423、179/186/187、179/187/373/422、181/186/187/422/423および373/423から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号3956を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、5N/73A/113I/186G/187R/373R/423R、5N/73A/143P/144V/179D/186G/187R/422R、5N/73A/144V/179D/186A/373R/423R、5N/73A/144V/187R/373R/422R、5N/143P/144V/179T/181L/186G/187R/373R、5N/144V/179T/181L/373R/422R、5N/144V/373R/422R、49S/96A/127I/132K/156W/196S、49S/96A/132H/153A/199S/200S、49S/96P/127I/153A/278L、49S/96P/132H/153A/155M/156W/237L/278L/406Q、49S/96P/132H/155M、49S/96P/132K/155M/237L/278L、49S/96P/155M/199S/200S/406Q、49S/153A/155M、73A/113I/143P/179T/181L/422R、73A/113I/179T/181L/186A/187R、73A/143P/144V/179D/186G/187T/373R/423R、73A/179D/181L/186A/373R/422R、73A/179D/181L/186G/187R/373R、73A/181L/186A/187T、96A/132H/153A/156W、96A/132K/153A/155M/156W、96A/132K/153A/155M/156W/200S、96A/153A/155M/156W、96P/127I/132H/153A/278L、96P/127I/153A/155M、96P/132H/153A/155M/156W、96P/132H/196S/199S、96P/132K/153A/155M、96P/132K/278L、96P/153A/155M/199S/200S/237L、96P/153A/406Q、113I/143P/179D/186G/187R、113I/144V/186G/423R、113I/144V/373R、113I/181L/186A/373R/422R、113I/373R/422R、127I/132H、127I/132H/153A/156W、127I/132H/155M/156W/406Q、127I/153A/155M/199S/200S/237L、127I/406Q、132H/153A/237L/406Q、132H/155M、132K/153A/155M、132K/237L、143P/144V/179T/181L/186G/187R/422R、143P/179T/181L/186G/187R/422R/423R、144V/179T/181L/186A/187R/373R、144V/179T/186A/187T/373R、153A/155M/156W/237L、153A/155M/196S/199S/237L、153A/199S/406Q、153A/237L、155M/199S、179D/181L/186G/187R/423R、179D/187T/373R/422R、179T/181L/186A、179T/186A/187T、181L/186G/187R/422R/423Rおよび373R/423Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3956を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H5N/P73A/L113I/E186G/K187R/K373R/N423R、H5N/P73A/K143P/I144V/V179D/E186G/K187R/K422R、H5N/P73A/I144V/V179D/E186A/K373R/N423R、H5N/P73A/I144V/K187R/K373R/K422R、H5N/K143P/I144V/V179T/M181L/E186G/K187R/K373R、H5N/I144V/V179T/M181L/K373R/K422R、H5N/I144V/K373R/K422R、A49S/G96A/Q127I/Q132K/F156W/A196S、A49S/G96A/Q132H/S153A/N199S/A200S、A49S/G96P/Q127I/S153A/V278L、A49S/G96P/Q132H/S153A/F155M/F156W/P237L/V278L/T406Q、A49S/G96P/Q132H/F155M、A49S/G96P/Q132K/F155M/P237L/V278L、A49S/G96P/F155M/N199S/A200S/T406Q、A49S/S153A/F155M、P73A/L113I/K143P/V179T/M181L/K422R、P73A/L113I/V179T/M181L/E186A/K187R、P73A/K143P/I144V/V179D/E186G/K187T/K373R/N423R、P73A/V179D/M181L/E186A/K373R/K422R、P73A/V179D/M181L/E186G/K187R/K373R、P73A/M181L/E186A/K187T、G96A/Q132H/S153A/F156W、G96A/Q132K/S153A/F155M/F156W、G96A/Q132K/S153A/F155M/F156W/A200S、G96A/S153A/F155M/F156W、G96P/Q127I/Q132H/S153A/V278L、G96P/Q127I/S153A/F155M、G96P/Q132H/S153A/F155M/F156W、G96P/Q132H/A196S/N199S、G96P/Q132K/S153A/F155M、G96P/Q132K/V278L、G96P/S153A/F155M/N199S/A200S/P237L、G96P/S153A/T406Q、L113I/K143P/V179D/E186G/K187R、L113I/I144V/E186G/N423R、L113I/I144V/K373R、L113I/M181L/E186A/K373R/K422R、L113I/K373R/K422R、Q127I/Q132H、Q127I/Q132H/S153A/F156W、Q127I/Q132H/F155M/F156W/T406Q、Q127I/S153A/F155M/N199S/A200S/P237L、Q127I/T406Q、Q132H/S153A/P237L/T406Q、Q132H/F155M、Q132K/S153A/F155M、Q132K/P237L、K143P/I144V/V179T/M181L/E186G/K187R/K422R、K143P/V179T/M181L/E186G/K187R/K422R/N423R、I144V/V179T/M181L/E186A/K187R/K373R、I144V/V179T/E186A/K187T/K373R、S153A/F155M/F156W/P237L、S153A/F155M/A196S/N199S/P237L、S153A/N199S/T406Q、S153A/P237L、F155M/N199S、V179D/M181L/E186G/K187R/N423R、V179D/K187T/K373R/K422R、V179T/M181L/E186A、V179T/E186A/K187T、M181L/E186G/K187R/K422R/N423RおよびK373R/N423Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3956を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11、12、41、44、44/187、45、55、56、57、65、66、70、72、73、74/238、82、83、85、103、111、113、114、117、132、135、138、140、159、160、162、167、182、214、220、222、223、226、236、238、256、286、299、309、387、388、389、391、393、406、408、412、418、422、429、430、449および450から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3956を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11D、
11L、12I、12L、41H、44H、44S/187T、45Y、55A、55G、55L、56R、57G、57H、57P、65C、65G、65P、65Q、65R、66L、70W、72V、73H、73S、74M/238V、82S、83R、85W、103H、103Q、111F、113S、114G、114I、117N、117S、132G、135E、138K、138S、138T、140C、140G、159N、160D、160Q、160T、162L、167L、182I、182L、182Q、182T、182V、182Y、214H、214T、220G、220S、222F、223D、226Q、236L、236T、236V、238A、238G、238I、238R、238S、238T、256R、286G、299V、309P、309R、309S、309T、387P、387Q、387R、388A、388S、389A、389G、389L、389V、391A、391L、391S、391V、393P、393T、406G、406S、408L、408T、412G、412R、418A、418H、418M、422L、429D、430P、449G、449H、449L、449R、449S、450Nおよび450Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3956を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Q11D、Q11L、T12I、T12L、F41H、Y44H、Y44S/K187T、L45Y、I55A、I55G、I55L、K56R、K57G、K57H、K57P、N65C、N65G、N65P、N65Q、N65R、S66L、V70W、L72V、P73H、P73S、L74M/M238V、P82S、H83R、H85W、K103H、K103Q、K111F、L113S、Q114G、Q114I、K117N、K117S、Q132G、L135E、G138K、G138S、G138T、P140C、P140G、L159N、K160D、K160Q、K160T、P162L、P167L、R182I、R182L、R182Q、R182T、R182V、R182Y、K214H、K214T、T220G、T220S、L222F、T223D、K226Q、D236L、D236T、D236V、M238A、M238G、M238I、M238R、M238S、M238T、E256R、N286G、E299V、K309P、K309R、K309S、K309T、D387P、D387Q、D387R、E388A、E388S、D389A、D389G、D389L、D389V、R391A、R391L、R391S、R391V、H393P、H393T、T406G、T406S、P408L、P408T、I412G、I412R、R418A、R418H、R418M、K422L、E429D、E430P、Y449G、Y449H、Y449L、Y449R、Y449S、K450NおよびK450Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号3956を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4148、4150、4152、4154、4156、4158、4160、4162、4164、4166、4168、4170、4172、4174、4176、4178、4180、4182、4184、4186、4188、4190、4192、4194、4196、4198、4200、4202、4204、4206、4208、4210、4212、4214、4216、4218、4220、4222、4224、4226、4228、4230、4232、4234、4236、4238、4240、4242、4244、4246、4248、4250、4252、4254、4256、4258、4260、4262、4264、4266、4268、4270、4272、4274、4276、4278、4280、4282、4284、4286、4288、4290、4292、4294、4296、4298、4300、4302、4304、4306、4308、4310、4312、4314、4316、4318、4320、4322、4324、4326、4328、4330、4332、4334、4336、4338、4340、4342、4344、4346、4348、4350、4352、4354、4356、4358、4360、4362、4364、4366、4368、4370、4372、4374、4376、4378、4380、4382、4384、4386、4388、4390、4392、4394、4396、4398、4400、4402、4404、4406、4408、4410、4412、4414、4416、4418、4420、4422、4424、4426、4428、4430、4432、4434、4436、4438、4440、4442、4444、4446、4448、4450、4452、4454、4456、4458、4460、4462、4464、4466、4468、4470、4472、4474、4476、4478、4480、4482、4484、4486、4488、4490、4492、4494および4496のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4148、4150、4152、4154、4156、4158、4160、4162、4164、4166、4168、4170、4172、4174、4176、4178、4180、4182、4184、4186、4188、4190、4192、4194、4196、4198、4200、4202、4204、4206、4208、4210、4212、4214、4216、4218、4220、4222、4224、4226、4228、4230、4232、4234、4236、4238、4240、4242、4244、4246、4248、4250、4252、4254、4256、4258、4260、4262、4264、4266、4268、4270、4272、4274、4276、4278、4280、4282、4284、4286、4288、4290、4292、4294、4296、4298、4300、4302、4304、4306、4308、4310、4312、4314、4316、4318、4320、4322、4324、4326、4328、4330、4332、4334、4336、4338、4340、4342、4344、4346、4348、4350、4352、4354、4356、4358、4360、4362、4364、4366、4368、4370、4372、4374、4376、4378、4380、4382、4384、4386、4388、4390、4392、4394、4396、4398、4400、4402、4404、4406、4408、4410、4412、4414、4416、4418、4420、4422、4424、4426、4428、4430、4432、4434、4436、4438、4440、4442、4444、4446、4448、4450、4452、4454、4456、4458、4460、4462、4464、4466、4468、4470、4472、4474、4476、4478、4480、4482、4484、4486、4488、4490、4492、4494および4496のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4148、4150、4152、4154、4156、4158、4160、4162、4164、4166、4168、4170、4172、4174、4176、4178、4180、4182、4184、4186、4188、4190、4192、4194、4196、4198、4200、4202、4204、4206、4208、4210、4212、4214、4216、4218、4220、4222、4224、4226、4228、4230、4232、4234、4236、4238、4240、4242、4244、4246、4248、4250、4252、4254、4256、4258、4260、4262、4264、4266、4268、4270、4272、4274、4276、4278、4280、4282、4284、4286、4288、4290、4292、4294、4296、4298、4300、4302、4304、4306、4308、4310、4312、4314、4316、4318、4320、4322、4324、4326、4328、4330、4332、4334、4336、4338、4340、4342、4344、4346、4348、4350、4352、4354、4356、4358、4360、4362、4364、4366、4368、4370、4372、4374、4376、4378、4380、4382、4384、4386、4388、4390、4392、4394、4396、4398、4400、4402、4404、4406、4408、4410、4412、4414、4416、4418、4420、4422、4424、4426、4428、4430、4432、4434、4436、4438、4440、4442、4444、4446、4448、4450、4452、4454、4456、4458、4460、4462、4464、4466、4468、4470、4472、4474、4476、4478、4480、4482、4484、4486、4488、4490、4492、4494および4496のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、8/375、50/137/189/375、62/153/155/156/159、62/153/155/156/159/427、62/153/155/199/406、137/164/375、153、153/155/156、153/155/156/159/199/238/406、153/155/237/238/239/406、153/155/238/239、153/155/427、153/156/159、153/156/199/237/427、153/156/427、153/159/237/238/352、153/176/181/427、155/156、155/156/176/181/199、155/156/176/238/427、155/181/199/238/406、156/199、156/199/427、164/375/433、223/375、375および427から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号4256を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、8V/375L、50V/137R/189G/375L、62A/153A/155M/156W/159V、62A/153A/155M/156W/159V/427T、62A/153A/155M/199S/406Q、137R/164E/375L、153A、153A/155M/156W、153A/155M/156W/159V/199S/238G/406Q、153A/155M/237L/238T/239F/406Q、153A/155M/238T/239F、153A/155M/427T、153A/156W/159V、153A/156W/199S/237L/427T、153A/156W/427T、153A/159V/237L/238G/352A、153A/176Q/181L/427S、155M/156W、155M/156W/176Q/181L/199S、155M/156W/176Q/238T/427S、155M/181L/199S/238G/406Q、156W/199S、156W/199S/427T、164E/375L/433D、223A/375L、375Lおよび427Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4256を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、S8V/I375L、I50V/Q137R/P189G/I375L、K62A/S153A/F155M/F156W/L159V、K62A/S153A/F155M/F156W/L159V/R427T、K62A/S153A/F155M/N199S/T406Q、Q137R/H164E/I375L、S153A、S153A/F155M/F156W、S153A/F155M/F156W/L159V/N199S/M238G/T406Q、S153A/F155M/P237L/M238T/T239F/T406Q、S153A/F155M/M238T/T239F、S153A/F155M/R427T、S153A/F156W/L159V、S153A/F156W/N199S/P237L/R427T、S153A/F156W/R427T、S153A/L159V/P237L/M238G/S352A、S153A/R176Q/M181L/R427S、F155M/F156W、F155M/F156W/R176Q/M181L/N199S、F155M/F156W/R176Q/M238T/R427S、F155M/M181L/N199S/M238G/T406Q、F156W/N199S、F156W/N199S/R427T、H164E/I375L/N433D、T223A/I375L、I375LおよびR427Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4256を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、7、9、10、12、53、65、68、99、106、110、115、116、131、132、136、170、178、190、192、194、200、220、238、242、245、257、272、280、302、304、335、385、395、399、402、408、412、416、423、445、447および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4256を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、7H、9G、10D、12S、53N、65F、68I、99R、106K、106R、106S、110G、115A、115T、116I、131C、131S、132G、132R、132T、136D、136G、136R、136S、170E、178L、190T、192A、192L、192P、194F、200S、220M、220Q、220S、238I、238L、242L、245P、257H、272H、280W、302P、302S、304I、335K、335R、385A、385C、385P、385S、395Q、399K、402R、408E、412R、416R、423L、445H、445K、445R、447L、449K、449L、449Qおよび449Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4256を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、G7H、S9G、G10D、T12S、E53N、N65F、H68I、H99R、A106K、A106R、A106S、S110G、N115A、N115T、L116I、E131C、E131S、Q132G、Q132R、Q132T、E136D、E136G、E136R、E136S、A170E、Q178L、D190T、E192A、E192L、E192P、P194F、A200S、T220M、T220Q、T220S、M238I、M238L、I242L、K245P、N257H、R272H、F280W、N302P、N302S、E304I、P335K、P335R、V385A、V385C、V385P、V385S、G395Q、Q399K、K402R、P408E、I412R、K416R、R423L、N445H、N445K、N445R、N447L、Y449K、Y449L、Y449QおよびY449Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4256を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4498、4500、4502、4504、4506、4508、4510、4512、4514、4516、4518、4520、4522、4524、4526、4528、4530、4532、4534、4536、4538、4540、4542、4544、4546、4548、4550、4552、4554、4556、4558、4560、4562、4564、4566、4568、4570、4572、4574、4576、4578、4580、4582、4584、4586、4588、4590、4592、4594、4596、4598、4600、4602、4604、4606、4608、4610、4612、4614、4616、4618、4620、4622、4624、4626、4628、4630、4632、4634、4636、4638、4640、4642、4644、4646、4648、4650、4652、4654、4656、4658、4660、4662、4664、4666、4668、4670、4672、4674、4676、4678、4680および4682のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4498、4500、4502、4504、4506、4508、4510、4512、4514、4516、4518、4520、4522、4524、4526、4528、4530、4532、4534、4536、4538、4540、4542、4544、4546、4548、4550、4552、4554、4556、4558、4560、4562、4564、4566、4568、4570、4572、4574、4576、4578、4580、4582、4584、4586、4588、4590、4592、4594、4596、4598、4600、4602、4604、4606、4608、4610、4612、4614、4616、4618、4620、4622、4624、4626、4628、4630、4632、4634、4636、4638、4640、4642、4644、4646、4648、4650、4652、4654、4656、4658、4660、4662、4664、4666 4668、4670、4672、4674、4676、4678、4680および4682のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号4498、4500、4502、4504、4506、4508、4510、4512、4514、4516、4518、4520、4522、4524、4526、4528、4530、4532、4534、4536、4538、4540、4542、4544、4546、4548、4550、4552、4554、4556、4558、4560、4562、4564、4566、4568、4570、4572、4574、4576、4578、4580、4582、4584、4586、4588、4590、4592、4594、4596、4598、4600、4602、4604、4606、4608、4610、4612、4614、4616、4618、4620、4622、4624、4626、4628、4630、4632、4634、4636、4638、4640、4642、4644、4646、4648、4650、4652、4654、4656、4658、4660、4662、4664、4666 4668、4670、4672、4674、4676、4678、4680および4682のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、11/41/44/127/132/406、11/41/44/127/278/406、11/41/45/73/127/278/406/408、11/41/45/127/278/406、11/41/132/278、11/44/45/127、11/44/73/127/132/135、11/44/73/127/132/135/406/408、11/44/127、11/44/132/278/406、11/45/73/127/135、11/45/127/132/135/138/182、11/45/406、11/73/127/132/135/182/278、11/73/127/132/278/406/408、11/73/127/132/406/408、11/73/132、11/73/132/135/408、11/127/132/135、11/127/132/135/182、11/127/132/135/406、11/127/132/138/182、11/127/132/182、11/132/135/406、11/182/406、41/44/45/73/127/132/278、41/45/127/132/135/278/406、41/73/132/135/406、44/45/73/132/135/406、44/45/127/132/135/138/182/406/408、44/45/127/132/278、44/73/127/135、44/73/127/135/182/278/406/408、44/73/132/135/406/408、45/73/127/132/135/406/408、45/73/132、45/73/132/135/182、45/73/278/406/408、45/127/132、45/127/132/135/182、45/127/132/135/182/406/408、45/127/135、45/132/408、45/406、56/309/449、57、65/114/422/427、65/114/427、65/143、65/143/235/427、73/127、73/127/132、127、127/132/135/182、127/132/135/182/406、132/135、132/135/182、132/135/406、132/406、164、164/220/309/449、164/220/449、164/449、182、220/449、309、309/449、406、418/427、427、427/429および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号4550を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11L/41H/44H/127I/132K/406G、11L/41H/44H/127I/278L/406S、11L/41H/45Y/73H/127I/278L/406G/408A、11L/41H/45Y/127I/278L/406G、11L/41H/132K/278L、11L/44H/45Y/127I、11L/44H/73H/127I/132K/135E、11L/44H/73S/127I/132K/135E/406G/408A、11L/44H/127I、11L/44H/132K/278L/406G、11L/45Y/73H/127I/135E、11L/45Y/127I/132K/135E/138T/182T、11L/45Y/406G、11L/73H/127I/132K/278L/406G/408A、11L/73H/127I/132K/406G/408A、11L/73H/132K、11L/73S/127I/132K/135E/182L/278L、11L/73S/132K/135E/408A、11L/127I/132K/135E、11L/127I/132K/135E/182L、11L/127I/132K/135E/406S、11L/127I/132K/138T/182L、11L/127I/132K/182T、11L/132K/135E/406G、11L/182L/406S、41H/44H/45Y/73H/127I/132K/278L、41H/45Y/127I/132K/135E/278L/406S、41H/73H/132K/135E/406G、44H/45Y/73H/132K/135E/406G、44H/45Y/127I/132K/135E/138T/182L/406S/408A、44H/45Y/127I/132K/278L、44H/73H/127I/135E、44H/73S/127I/135E/182L/278L/406G/408A、44H/73S/132K/135E/406G/408A、45Y/73H/127I/132K/135E/406G/408A、45Y/73H/132K、45Y/73H/132K/135E/182L、45Y/73S/278L/406G/408A、45Y/127I/132K、45Y/127I/132K/135E/182L、45Y/127I/132K/135E/182T/406G/408A、45Y/127I/135E、45Y/132K/408A、45Y/406G、56R/309P/449L、57G、65G/114I/422L/427S、65G/114I/427S、65G/143K、65G/143K/235R/427S、73H/127I、73H/127I/132K、127I、127I/132K/135E/182I/406G、127I/132K/135E/182L、132K/135E、132K/135E/182I、132K/135E/406G、132K/406S、164E、164E/220G/309S/449H、164E/220G/449L、164E/449H、182L、220G/449H、309P/449L、309R、309T/449H、406G、418A/427S、427S、427S/429Dおよび449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4550を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Q11L/F41H/Y44H/Q127I/Q132K/T406G、Q11L/F41H/Y44H/Q127I/V278L/T406S、Q11L/F41H/L45Y/A73H/Q127I/V278L/T406G/P408A、Q11L/F41H/L45Y/Q127I/V278L/T406G、Q11L/F41H/Q132K/V278L、Q11L/Y44H/L45Y/Q127I、Q11L/Y44H/A73H/Q127I/Q132K/L135E、Q11L/Y44H/A73S/Q127I/Q132K/L135E/T406G/P408A、Q11L/Y44H/Q127I、Q11L/Y44H/Q132K/V278L/T406G、Q11L/L45Y/A73H/Q127I/L135E、Q11L/L45Y/Q127I/Q132K/L135E/G138T/R182T、Q11L/L45Y/T406G、Q11L/A73H/Q127I/Q132K/V278L/T406G/P408A、Q11L/A73H/Q127I/Q132K/T406G/P408A、Q11L/A73H/Q132K、Q11L/A73S/Q127I/Q132K/L135E/R182L/V278L、Q11L/A73S/Q132K/L135E/P408A、Q11L/Q127I/Q132K/L135E、Q11L/Q127I/Q132K/L135E/R182L、Q11L/Q127I/Q132K/L135E/T406S、Q11L/Q127I/Q132K/G138T/R182L、Q11L/Q127I/Q132K/R182T、Q11L/Q132K/L135E/T406G、Q11L/R182L/T406S、F41H/Y44H/L45Y/A73H/Q127I/Q132K/V278L、F41H/L45Y/Q127I/Q132K/L135E/V278L/T406S、F41H/A73H/Q132K/L135E/T406G、Y44H/L45Y/A73H/Q132K/L135E/T406G、Y44H/L45Y/Q127I/Q132K/L135E/G138T/R182L/T406S/P408A、Y44H/L45Y/Q127I/Q132K/V278L、Y44H/A73H/Q127I/L135E、Y44H/A73S/Q127I/L135E/R182L/V278L/T406G/P408A、Y44H/A73S/Q132K/L135E/T406G/P408A、L45Y/A73H/Q127I/Q132K/L135E/T406G/P408A、L45Y/A73H/Q132K、L45Y/A73H/Q132K/L135E/R182L、L45Y/A73S/V278L/T406G/P408A、L45Y/Q127I/Q132K、L45Y/Q127I/Q132K/L135E/R182L、L45Y/Q127I/Q132K/L135E/R182T/T406G/P408A、L45Y/Q127I/L135E、L45Y/Q132K/P408A、L45Y/T406G、K56R/K309P/Y449L、K57G、N65G/Q114I/K422L/R427S、N65G/Q114I/R427S、N65G/P143K、N65G/P143K/Q235R/R427S、A73H/Q127I、A73H/Q127I/Q132K、Q127I、Q127I/Q132K/L135E/R182I/T406G、Q127I/Q132K/L135E/R182L、Q132K/L135E、Q132K/L135E/R182I、Q132K/L135E/T406G、Q132K/T406S、H164E、H164E/T220G/K309S/Y449H、H164E/T220G/Y449L、H164E/Y449H、R182L、T220G/Y449H、K309P/Y449L、K309R、K309T/
Y449H、T406G、R418A/R427S、R427S、R427S/E429DおよびY449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号4550を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7216、7218、7220、7222、7224、7226、7228、7230、7232、7234、7236、7238、7240、7242、7244、7246、7248、7250、7252、7254、7256、7258、7260、7262、7264、7266、7268、7270、7272、7274、7276、7278、7280、7282、7284、7286、7288、7290、7292、7294、7296、7298、7300、7302、7304、7306、7308、7310、7312、7314、7316、7318、7320、7322、7324、7326、7328、7330、7332、7334、7336、7338、7340、7342、7344、7346、7348、7350、7352、7354、7356、7358および7360のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7216、7218、7220、7222、7224、7226、7228、7230、7232、7234、7236、7238、7240、7242、7244、7246、7248、7250、7252、7254、7256、7258、7260、7262、7264、7266、7268、7270、7272、7274、7276、7278、7280、7282、7284、7286、7288、7290、7292、7294、7296、7298、7300、7302、7304、7306、7308、7310、7312、7314、7316、7318、7320、7322、7324、7326、7328、7330、7332、7334、7336、7338、7340、7342、7344、7346、7348、7350、7352、7354、7356、7358および7360のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7216、7218、7220、7222、7224、7226、7228、7230、7232、7234、7236、7238、7240、7242、7244、7246、7248、7250、7252、7254、7256、7258、7260、7262、7264、7266、7268、7270、7272、7274、7276、7278、7280、7282、7284、7286、7288、7290、7292、7294、7296、7298、7300、7302、7304、7306、7308、7310、7312、7314、7316、7318、7320、7322、7324、7326、7328、7330、7332、7334、7336、7338、7340、7342、7344、7346、7348、7350、7352、7354、7356、7358および7360のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、7/10/73/127/132/385/423、10、10/53/73/99、10/53/272/423/427、10/53/423、10/73、10/73/127、10/127/132/385、10/132/302/385、53/73/200/423、53/127/132/385、53/127/136/385、53/132/136/302/423/427、53/132/302/385/423/427、65/106/445/447/449、65/143/220、65/220/309/445/447、65/220/445/449、65/399/406/447/449、65/402/406/445/449、65/445/447/449、65/447/449、73、73/127/427、73/132/136/385/427、73/385、73/385/427、106/220/399/402/406、115/116/278、115/170/190/238/412、115/190/194、115/245/278、116/170/190、116/190/406/408、116/238、116/238/245、116/416、127、132、143/220/445/447、143/309/402、143/309/445/447/449、170、170/190/192/194、170/192、170/192/194/278、170/192/194/335、170/194、170/194/335/416、170/238、170/335、170/335/416、190、190/192/194、190/194、190/194/238/245、190/194/335/416、190/194/412、190/245/412、192/194、192/194/242/406/408、194、200、200/385、220/399、220/445、220/445/447、257/385、272/302、272/385、278、302/385、309/399/449、309/445/447/449、385、385/427、399/406、399/406/449、402/445/449、406/445/447/449、406/445/449、423/427、445/447/449、445/449、447および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号7324を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、7V/10D/73H/127I/132G/385P/423L、10D、10D/53N/73H/99R、10D/53N/272H/423L/427S、10D/53N/423L、10D/73H、10D/73H/127I、10D/127I/132R/385P、10D/132R/302P/385P、53N/73H/200S/423L、53N/127I/132R/385S、53N/127I/136R/385L、53N/132G/136R/302P/423L/427S、53N/132G/302P/385S/423L/427S、65G/106R/445K/447L/449L、65G/143K/220Q、65G/220Q/309P/445R/447L、65G/220Q/445R/449K、65G/220Q/445R/449R、65G/399K/406G/447L/449R、65G/402R/406G/445R/449R、65G/445K/447L/449R、65G/447L/449L、73H、73H/127I/427S、73H/132R/136R/385S/427S、73H/385S、73H/385S/427S、106R/220Q/399K/402R/406G、115A/170E/190T/238L/412R、115A/190T/194F、115A/245P/278L、115T/116I/278L、116I/170E/190T、116I/190T/406G/408A、116I/238L、116I/238L/245P、116I/416R、127I、132G、143K/220Q/445K/447L、143K/309P/402R、143K/309P/445K/447L/449L、170E、170E/190T/192L/194F、170E/192L、170E/192L/194F/278L、170E/192L/194F/335K、170E/194F、170E/194F/335R/416R、170E/238L、170E/335K、170E/335K/416R、190T、190T/192L/194F、190T/194F、190T/194F/238L/245P、190T/194F/335R/416R、190T/194F/412R、190T/245P/412R、192L/194F、192L/194F/242L/406G/408A、194F、200S、200S/385S、220M/445K、220Q/399K、220Q/445K/447L、257H/385S、272H/302P、272H/385P、278L、302P/385P、302P/385S、309P/399K/449L、309P/445K/447L/449L、385S、385S/427S、399K/406G、399K/406G/449L、402R/445R/449L、406G/445K/449R、406G/445R/447L/449L、406G/445R/449K、423L/427S、445K/449L、445R/447L/449L、445R/449L、447Lおよび449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7324を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、G7V/G10D/A73H/Q127I/K132G/V385P/R423L、G10D、G10D/E53N/A73H/H99R、G10D/E53N/R272H/R423L/R427S、G10D/E53N/R423L、G10D/A73H、G10D/A73H/Q127I、G10D/Q127I/K132R/V385P、G10D/K132R/N302P/V385P、E53N/A73H/A200S/R423L、E53N/Q127I/K132R/V385S、E53N/Q127I/E136R/V385L、E53N/K132G/E136R/N302P/R423L/R427S、E53N/K132G/N302P/V385S/R423L/R427S、N65G/A106R/N445K/N447L/Y449L、N65G/P143K/T220Q、N65G/T220Q/K309P/N445R/N447L、N65G/T220Q/N445R/Y449K、N65G/T220Q/N445R/Y449R、N65G/Q399K/S406G/N447L/Y449R、N65G/K402R/S406G/N445R/Y449R、N65G/N445K/N447L/Y449R、N65G/N447L/Y449L、A73H、A73H/Q127I/R427S、A73H/K132R/E136R/V385S/R427S、A73H/V385S、A73H/V385S/R427S、A106R/T220Q/Q399K/K402R/S406G、N115A/A170E/D190T/M238L/I412R、N115A/D190T/P194F、N115A/K245P/V278L、N115T/L116I/V278L、L116I/A170E/D190T、L116I/D190T/S406G/P408A、L116I/M238L、L116I/M238L/K245P、L116I/K416R、Q127I、K132G、P143K/T220Q/N445K/N447L、P143K/K309P/K402R、P143K/K309P/N445K/N447L/Y449L、A170E、A170E/D190T/E192L/P194F、A170E/E192L、A170E/E192L/P194F/V278L、A170E/E192L/P194F/P335K、A170E/P194F、A170E/P194F/P335R/K416R、A170E/M238L、A170E/P335K、A170E/P335K/K416R、D190T、D190T/E192L/P194F、D190T/P194F、D190T/P194F/M238L/K245P、D190T/P194F/P335R/K416R、D190T/P194F/I412R、D190T/K245P/I412R、E192L/P194F、E192L/P194F/I242L/S406G/P408A、P194F、A200S、A200S/V385S、T220M/N445K、T220Q/Q399K、T220Q/N445K/N447L、N257H/V385S、R272H/N302P、R272H/V385P、V278L、N302P/V385P、N302P/V385S、K309P/Q399K/Y449L、K309P/N445K/N447L/Y449L、V385S、V385S/R427S、Q399K/S406G、Q399K/S406G/Y449L、K402R/N445R/Y449L、S406G/N445K/Y449R、S406G/N445R/N447L/Y449L、S406G/N445R/Y449K、R423L/R427S、N445K/Y449L、N445R/N447L/Y449L、N445R/Y449L、N447LおよびY449Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7324を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2、4、11/44、11/71、11/287、11/441、37、40、42、42/138、42/141、43、46、47、48/398、49、
49/406/408、51、64、71、76、97、100、108、108/172、109、112、117/157/301、118、118/406/408、119、119/172、130、133、134、141、157、169、172/420、172/437、179、181、259、274、275、287、288、333/398、333/406/408、338、356、357、376、381、385、394/420、396、397/406/408、398、401、406/408、410、417、420、434、437および441から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7324を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、2T、4F、11L/44H、11L/71P、11L/71T、11L/287S、11L/441S、37G、40Q、42A、42A/141P、42D/138C、42G、43A、43L、43M、43T、46C、46L、46Q、46T、47N、48S/398V、49G、49K、49N/406G/408A、51M、51Q、51V、64A、64F、64G、64L、64Q、64R、64V、71T、76H、76L、97L、97V、100R、108G/172H、108T、109L、109V、109Y、112N、112Q、112R、112T、112V、117R/157T/301R、118A、118A/406G/408A、118I、118L、118S、118V、119A、119G、119S、119T/172H、130S、133H、133L、133R、133S、134S、141G、141Q、141S、157C、157E、157T、169E、172H/420L、172H/437D、179I、179R、181H、181T、259T、274Q、274T、275L、287A、287K、287L、287S、288P、333S/398T、333S/406G/408A、338S、356S、356T、357T、376G、376M、376N、376R、376S、381C、385A、394H/420W、396A、396S、397L/406G/408A、398H、398K、398L、398M、398R、401T、406G/408A、410R、417C、417S、420F、420L、434C、437G、437Vおよび441Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7324を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、H2T、H4F、Q11L/Y44H、Q11L/E71P、Q11L/E71T、Q11L/V287S、Q11L/Q441S、A37G、G40Q、V42A、V42A/A141P、V42D/G138C、V42G、I43A、I43L、I43M、I43T、V46C、V46L、V46Q、V46T、S47N、T48S/A398V、A49G、A49K、A49N/S406G/P408A、N51M、N51Q、N51V、S64A、S64F、S64G、S64L、S64Q、S64R、S64V、E71T、E76H、E76L、T97L、T97V、K100R、N108G/R172H、N108T、F109L、F109V、F109Y、I112N、I112Q、I112R、I112T、I112V、K117R/N157T/Q301R、P118A、P118A/S406G/P408A、P118I、P118L、P118S、P118V、D119A、D119G、D119S、D119T/R172H、A130S、V133H、V133L、V133R、V133S、A134S、A141G、A141Q、A141S、N157C、N157E、N157T、P169E、R172H/I420L、R172H/E437D、D179I、D179R、M181H、M181T、V259T、D274Q、D274T、M275L、V287A、V287K、V287L、V287S、N288P、N333S/A398T、N333S/S406G/P408A、G338S、G356S、G356T、V357T、V376G、V376M、V376N、V376R、V376S、A381C、V385A、R394H/I420W、E396A、E396S、I397L/S406G/P408A、A398H、A398K、A398L、A398M、A398R、L401T、S406G/P408A、G410R、V417C、V417S、I420F、I420L、A434C、E437G、E437VおよびQ441Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7324を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7766、7768、7770、7772、7774、7776、7778、7780、7782、7784、7786、7788、7790、7792、7794、7796、7798、7800、7812、7814、7816、7818、7820、7822、7824、7826、7828、7830、7832、7834、7836、7838、7840、7842、7844、7846、7848、7850、7852、7854、7856、7858、7860、7862、7864、7866、7868、7870、7872、7874、7876、7878、7880、7882、7884、7886、7888、7890、7892、7894、7896、7898、7900、7902、7904、7906、7908、7910、7912、7914、7916、7918、7920、7922、7924、7926、7928、7930、7932、7934、7936、7938、7940、7942、7944、8092、8094、8096、8098、8100、8102、8104、8106、8108、8110、8112、8114、8116、8118、8120、8122、8124、8126、8128、8130、8132、8134、8136、8138、8140、8142、8144、8146、8148、8150、8152、8154、8156、8158、8160、8162、8164、8166、8168、8170、8172、8174、8176、8178、8180、8182、8184、8186、8188、8190、8192、8194、8196、8198、8200、8202、8204、8206、8208、8210、8212、8214、8216、8218、8220、8222、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330、8332、8334、8336および8338のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7766、7768、7770、7772、7774、7776、7778、7780、7782、7784、7786、7788、7790、7792、7794、7796、7798、7800、7812、7814、7816、7818、7820、7822、7824、7826、7828、7830、7832、7834、7836、7838、7840、7842、7844、7846、7848、7850、7852、7854、7856、7858、7860、7862、7864、7866、7868、7870、7872、7874、7876、7878、7880、7882、7884、7886、7888、7890、7892、7894、7896、7898、7900、7902、7904、7906、7908、7910、7912、7914、7916、7918、7920、7922、7924、7926、7928、7930、7932、7934、7936、7938、7940、7942、7944、8092、8094、8096、8098、8100、8102、8104、8106、8108、8110、8112、8114、8116、8118、8120、8122、8124、8126、8128、8130、8132、8134、8136、8138、8140、8142、8144、8146、8148、8150、8152、8154、8156、8158、8160、8162、8164、8166、8168、8170、8172、8174、8176、8178、8180、8182、8184、8186、8188、8190、8192、8194、8196、8198、8200、8202、8204、8206、8208、8210、8212、8214、8216、8218、8220、8222、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330
、8332、8334、8336および8338のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号7766、7768、7770、7772、7774、7776、7778、7780、7782、7784、7786、7788、7790、7792、7794、7796、7798、7800、7812、7814、7816、7818、7820、7822、7824、7826、7828、7830、7832、7834、7836、7838、7840、7842、7844、7846、7848、7850、7852、7854、7856、7858、7860、7862、7864、7866、7868、7870、7872、7874、7876、7878、7880、7882、7884、7886、7888、7890、7892、7894、7896、7898、7900、7902、7904、7906、7908、7910、7912、7914、7916、7918、7920、7922、7924、7926、7928、7930、7932、7934、7936、7938、7940、7942、7944、8092、8094、8096、8098、8100、8102、8104、8106、8108、8110、8112、8114、8116、8118、8120、8122、8124、8126、8128、8130、8132、8134、8136、8138、8140、8142、8144、8146、8148、8150、8152、8154、8156、8158、8160、8162、8164、8166、8168、8170、8172、8174、8176、8178、8180、8182、8184、8186、8188、8190、8192、8194、8196、8198、8200、8202、8204、8206、8208、8210、8212、8214、8216、8218、8220、8222、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330、8332、8334、8336および8338のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列が、11、11/64/109、11/445、42/43、42/44/71/73/116、43/73/141、46/47/51、46/51、47/49、47/51、64、64/65/109、64/65/112、64/112、64/134、64/445、65/112、65/112/445、71、71/73、71/73/141、71/141、71/302、73、73/116/141、73/141、73/302、109、109/112、109/115/118、109/134、109/406、112、112/445、116/287、127、127/169/172、127/169/287、127/169/376/398/399、127/169/398/399、127/287、127/376、141、141/302、169/172/287、169/172/288、169/172/288/398/399/420/423/427、169/172/398/399、169/287、169/398、169/398/399、287、287/288、287/376、287/398、287/399、287/420/423/427、288、288/376/398、288/398、288/399、302、376、376/398、376/399、398、398/399、398/399/420、398/427、399および420から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号7784を参照して番号付けられている、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、11L、11L/64R/109V、11L/445K、42A/44H/71T/73H/116I、42G/43M、43T/73H/141P、46L/47N/51Q、46T/51Q、47N/49G、47N/51V、64R、64R/65G/109V、64R/65G/112N、64R/65G/112T、64R/112N、64R/134S、64R/445K、65G/112N、65G/112N/445K、71T、71T/73H、71T/73H/141G、71T/73H/141S、71T/141P、71T/302P、73H、73H/116I/141P、73H/141G、73H/141P、73H/141S、73H/302P、109L/112T、109V、109V/112T、109V/115A/118V、109V/134S、109V/406G、112N/445K、112T、116I/287S、127I、127I/169E/172H、127I/169E/287S、127I/169E/376M/398M/399K、127I/169E/398L/399K、127I/287S、127I/376M、141G、141G/302P、141P、141S、141S/302P、169E/172H/287S、169E/172H/288P、169E/172H/288P/398L/399K/420F/423L/427S、169E/172H/398M/399K、169E/287S、169E/398M/399K、169E/398T、287L/288P、287L/399K、287M、287S、287S/376M、287S/398T、287S/399K、287S/420F/423L/427S、288P、288P/376S/398L、288P/398K、288P/399K、302P、376M、376M/398L、376M/398M、376M/399K、398L、398L/399K、398L/427S、398M、398M/399K、398M/399K/420F、398R、398R/399K、398T/399K、399Kおよび420Fから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7784を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、Q11L、Q11L/S64R/F109V、Q11L/N445K、V42A/Y44H/E71T/A73H/L116I、V42G/I43M、I43T/A73H/A141P、V46L/S47N/N51Q、V46T/N51Q、S47N/A49G、S47N/N51V、S64R、S64R/N65G/F109V、S64R/N65G/I112N、S64R/N65G/I112T、S64R/I112N、S64R/A134S、S64R/N445K、N65G/I112N、N65G/I112N/N445K、E71T、E71T/A73H、E71T/A73H/A141G、E71T/A73H/A141S、E71T/A141P、E71T/N302P、A73H、A73H/L116I/A141P、A73H/A141G、A73H/A141P、A73H/A141S、A73H/N302P、F109L/I112T、F109V、F109V/I112T、F109V/N115A/P118V、F109V/A134S、F109V/S406G、I112N/N445K、I112T、L116I/V287S、Q127I、Q127I/P169E/R172H、Q127I/P169E/V287S、Q127I/P169E/V376M/A398M/Q399K、Q127I/P169E/A398L/Q399K、Q127I/V287S、Q127I/V376M、A141G、A141G/N302P、A141P、A141S、A141S/N302P、P169E/R172H/V287S、P169E/R172H/N288P、P169E/R172H/N288P/A398L/Q399K/I420F/R423L/R427S、P169E/R172H/A398M/Q399K、P169E/V287S、P169E/A398M/Q399K、P169E/A398T、V287L/N288P、V287L/Q399K、V287M、V287S、V287S/V376M、V287S/A398T、V287S/Q399K、V287S/I420F/R423L/R427S、N288P、N288P/V376S/A398L、N288P/A398K、N288P/Q399K、N302P、V376M、V376M/A398L、V376M/A398M、V376M/Q399K、A398L、A398L/Q399K、A398L/R427S、A398M、A398M/Q399K、A398M/Q399K/I420F、A398R、A398R/Q399K、A398T/Q399K、Q399KおよびI420Fから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7784を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、10、10/144、10/199、13、14、15、15/394、16、22、36、89、93、96、116、116/123、116/143、116/350、123、125、127、143、144、149、156、186、187、197、198、199、201、202、203、268、287、324、331、および350から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7784を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、10D、10D/144L、10D/199G、13Q、14Q、15A、15L/394H、16A、16G、16T、22G、36M、89A、93A、96M、116I、116I/123N、116I/123S、116I/143R、116I/350L、123A、123G、123L、123S、123V、125L、127A、127G、127V、143G、144G、144Q、144S、149S、156V、186N、187G、187Y、197H、198Q、199G、199P、199R、199S、199Y、201A、201K、201L、201N、202A、202Y、203T、268W、287A、324R、331C、331Vおよび350Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7784を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、G10D、G10D/V144L、G10D/N199G、L13Q、R14Q、V15A、V15L/R394H、L16A、L16G、L16T、A22G、L36M、G89A、H93A、G96M、L116I、L116I/Y123N、L116I/Y123S、L116I/P143R、L116I/M350L、Y123A、Y123G、Y123L、Y123S、Y123V、F125L、Q127A、Q127G、Q127V、P143G、V144G、V144Q、V144S、A149S、F156V、G186N、T187G、T187Y、P197H、G198Q、N199G、N199P、N199R、N199S、N199Y、G201A、G201K、G201L、G201N、I202A、I202Y、M203T、Y268W、V287A、H324R、I331C、I331VおよびM350Lから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7784を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8624、8626、8628、8630、8632、8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220および9222のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8624、8626、8628、8630、8632、
8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220および9222のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼのポリペプチド配列は、配列番号8624、8626、8628、8630、8632、8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220および9222のいずれかを含む。
本発明はまた、配列番号72に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも90%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも91%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも92%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも93%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも94%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも95%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも96%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも97%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも98%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも99%またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。一部の実施形態では、本発明は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420のポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。追加の実施形態では、本発明は、表18.1、19.1、19.2、20.1、20.2、20.3、31.2、31.3、32.1、32.2、33.1、33.2、34.1、34.2、35.1、35.2、36.1、36.2、37.1、37.2、37.3、38.1、38.2、38.3、39.1、39.2、39.3、40.1、40.2、40.3、41.1、41.2、42.1、および/または42.2に提供されるスクロースシンターゼを提供する。本発明はまた、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、
2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316、2318、2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500、2502、2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592、2594、7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762、7764、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104、および/または9106に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼも提供する。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、4/9/349/532、4/13/113/343/532、4/13/113/532、4/33/47/52/343/532、4/47/52/532、4/113/532、4/13/113、4/13/532、4/33/113、4/343、7、8、44、95、117/440、136、221、343/532、440、444、478、532、583、611、615、615/789、695、722および788から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号74を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、4E/9T/349H/532S、4E/13R/113Q/343H/532S、4E/13R/113Q/532S、4E/33Q/47H/52D/343H/532S、4E/47H/52D/532S、4E/113Q/532S、4E/13R/113Q、4E/13R/532S、4E/33Q/113Q、4E/343H、7T、8M、44K、95S、117D/440T、136S、221A/H、343S/532S、440P/T、444K/T、478T/V、532R/T、583Q、611V、615C/E/T/V、615L/789D、695L、722Yおよび788Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号74を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、A4E/L9T/Q349H/F532S、A4E/P13R/I113Q/V343H/F532S、A4E/P13R/I113Q/F532S、 A4E/Y33Q/L47H/A52D/V343H/F532S、A4E/L47H/A52D/F532S、A4E/I113Q/F532S、A4E/P13R/I113Q、A4E/P13R/F532S、A4E/Y33Q/I113Q、A4E/V343H、Q7T、Q8M、R44K、Q95S、G117D/R440T、 R136S、R221A/H、V343S/F532S、R440P/T、Q444K/T、R478T/V、F532R/T、R583Q、R611V、R615C/E/T/V、R615L/A789D、V695L、R722YおよびH788Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号74を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142,1144、1146、1148、1150、および/または1152のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142,1144、1146、1148、1150、および/または1152のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142,1144、1146、1148、1150、および/または1152のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、8/221、47/221、68/129/248、68/129/248/595/600/756、68/146/248/387/506/550、68/189/272/316/477/719/756、75/105/154/215/264/345、75/105/345/410/769、75/105/530、75/345/530、85/170/225/266/534、87/125/230/267/375/464/708、93/129/506/550/595/719/756、93/477/635、95/136/788、95/201/478/583/724/788、95/385/478/583/788、95/440/478/724/788/792、95/444/478/603/792、95/444/478/724/788、95/478/724、98/250、113/225/266/415、126/314/499/549/589/755、136/440/444/478/603、136/440/444/478/583/788、136/444/478/583/788/792、225/372/534、266、306/358/703/776、358/636/737、440/444/583/724/788、440/478および466から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1080を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、8M/221H、47L/221H、68A/129E/248A、68A/129E/248A/595V/600I/756V、68A/146N/248A/387I/506P/550H、68A/189R/272L/316I/477K/719C/756V、75V/105E/154H/215F/264V/345T、75V/105E/345T/410S/769R、75V/105E/530L、75V/345T/530L、85V/170L/225E/266N/534H、87E/125E/230D/267V/375Y/464F/708A、93V/129E/506P/550H/595V/719C/756V、93V/477K/635S、95S/136S/788E、95S/201E/478V/583Q/724H/788E、95S/385L/478V/583Q/788E、95S/440T/478V/724H/788E/792S、95S/444T/478V/603S/792S、95S/444T/478V/724H/788E、95S/478T/724H、98V/250D、113L/225E/266N/415K、126L/314L/499H/549E/589E/755G、136S/440P/444T/478T/603S、136S/440T/444T/478V/583Q/788E、136S/444T/478V/583Q/788E/792S、225E/372V/534H、266N、306L/358E/703Y/776E、358E/636Q/737I、440P/444T/583Q/724H/788E、440T/478Vおよび466Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1080を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Q8M/R221H、H47L/R221H、V68A/R129E/S248A、V68A/R129E/S248A/I595V/V600I/I756V、V68A/D146N/S248A/V387I/S506P/R550H、V68A/G189R/I272L/V316I/D477K/A719C/I756V、 M75V/A105E/R154H/I215F/I264V/A345T、M75V/A105E/A345T/T410S/Q769R、M75V/A105E/P530L、M75V/A345T/P530L、R85V/I170L/A225E/R266N/E534H、I87E/T125E/N230D/I267V/W375Y/I464F/T708A、R93V/R129E/S506P/R550H/I595V/A719C/I756V、R93V/D477K/A635S、Q95S/R136S/H788E、Q95S/Q201E/R478V/R583Q/K724H/H788E、Q95S/R385L/R478V/R583Q/H788E、Q95S/R440T/R478V/K724H/H788E/M792S、Q95S/Q444T/R478V/G603S/M792S、Q95S/Q444T/R478V/K724H/H788E、Q95S/R478T/K724H、L98V/S250D、 I113L/A225E/R266N/R415K、V126L/V314L/N499H/D549E/G589E/R755G、 R136S/R440P/Q444T/R478T/G603S、 R136S/R440T/Q444T/R478V/R583Q/H788E、 R136S/Q444T/R478V/R583Q/H788E/M792S、A225E/I372V/E534H、R266N、R306L/P358E/N703Y/Q776E、P358E/L636Q/V737I、R440P/Q444T/R583Q/K724H/H788E、R440T/R478VおよびV466Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1080を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、および/または1220のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、および/または1220のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、および/または1220のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、8/68/95/98/358/478/595/724/792、8/68/98/221/248/250/440/477/534/595/724、8/68/788、8/93/95/98/136/221/595/600/788、8/93/95/113/250/440/595/600/724/788、8/95/98/440/478/534/600/788、8/136/248/478/788、47/75/85/105/125/129/170/635、47/75/85/105/375/756/776、47/75/85/264/267/372/415/635、47/75/85/87/129/375/776、47/75/85/87/170/372/756、47/85/105/129/201/230/267/583、47/85/125/372/583/635/756、47/85/170/756、47/85/87/105/125/635、47/85/87/154/756、47/125/129/375/756/776、47/129/170/635、47/154/372/375/583/635/708/756、68/93/95/358/440/444/478/534/595/603、68/93/95/444/788、68/93/98/136/248/250/358/440/534/724、75/85/87/105/264/267/583/708、75/85/129/154/264/375、85/125/215/375/415/635/776、85/87/105/215/267/756、85/87/129/375/756/776、87/125/129/170/230/756、87/154/306/375/756、93/95/98/534/792、95/440/444/724/788、129/215/372/756および170/264/267から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1158を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、8M/68A/95S/98V/358E/478T/595V/724H/792S、8M/68A/98V/221H/248A/250D/440P/477K/534H/595V/724H、8M/68A/788E、8M/93V/95S/98V/136S/221H/595V/600I/788E、8M/93V/95S/113I/250D/440T/595V/600I/724H/788E、8M/95S/98V/440P/478V/534H/600I/788E、8M/136S/248A/478V/788E、47L/75V/85V/105E/125E/129E/170L/635S、47L/75V/85V/105E/375Y/756V/776E、47L/75V/85V/264V/267V/372V/415R/635S、H47L/M75V/R85V/I87E/R129E/W375Y/Q776E、47L/75V/85V/87E/170L/372V/756V、47L/85V/105E/129E/201E/230D/267V/583Q、47L/85V/125E/372V/583Q/635S/756V、47L/85V/170L/756V、47L/85V/87E/105E/125E/635S、47L/85V/87E/154H/756V、47L/125E/129E/375Y/756V/776E、47L/129E/170L/635S、47L/154H/372V/375Y/583Q/635S/708A/756V、68A/93V/95S/358E/440T/444T/478V/534H/595V/603S、68A/93V/95S/444T/788E、68A/93V/98V/136S/248A/250D/358E/440P/534H/724H、75V/85V/87E/105E/264V/267V/583Q/708A、75V/85V/129E/154H/264V/375Y、85V/125E/215F/375Y/415R/635S/776E、85V/87E/105E/215F/267V/756V、85V/87E/129E/375Y/756V/776E、87E/125E/129E/170L/230D/756V、87E/154H/306L/375Y/756V、93V/95S/98V/534H/792S、95S/440P/444T/724H/788E、129E/215F/372V/756V、170L/264V/267V、8M/68A/95S/98V/358E/478T/595V/724H/792S、8M/68A/98V/221H/248A/250D/440P/477K/534H/595V/724H、8M/68A/788E、8M/93V/95S/98V/136S/221H/595V/600I/788E、8M/93V/95S/113I/250D/440T/595V/600I/724H/788E、8M/95S/98V/440P/478V/534H/600I/788E、8M/136S/248A/478V/788E、47L/75V/85V/105E/125E/129E/170L/635S、47L/75V/85V/105E/375Y/756V/776E、47L/75V/85V/264V/267V/372V/415R/635S、47L/75V/85V/87E/129E/375Y/776E、47L/75V/85V/87E/170L/372V/756V、47L/85V/105E/129E/201E/230D/267V/583Q、47L/85V/125E/372V/583Q/635S/756V、47L/85V/170L/756V、 47L/85V/87E/105E/125E/635S、47L/85V/87E/154H/756V、47L/125E/129E/375Y/756V/776E、47L/129E/170L/635S、47L/154H/372V/375Y/583Q/635S/708A/756V、68A/93V/95S/358E/440T/444T/478V/534H/595V/603S、68A/93V/95S/444T/788E、68A/93V/98V/136S/248A/250D/358E/440P/534H/724H、75V/85V/87E/105E/264V/267V/583Q/708A、75V/85V/129E/154H/264V/375Y、85V/125E/215F/375Y/415R/635S/776E、85V/87E/105E/215F/267V/756V、85V/87E/129E/375Y/756V/776E、87E/125E/129E/170L/230D/756V、87E/154H/306L/375Y/756V、93V/95S/98V/534H/792S、95S/440P/444T/724H/788E、129E/215F/372V/756Vおよび170L/264V/267Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1158を参照して番号付けられている。一部のさらなる実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Q8M/V68A/Q95S/L98V/P358E/R478T/I595V/K724H/M792S、Q8M/V68A/L98V/R221H/S248A/S250D/R440P/D477K/E534H/I595V/K724H、Q8M/V68A/H788E、Q8M/R93V/Q95S/L98V/R136S/R221H/I595V/V600I/H788E、Q8M/R93V/Q95S/L113I/S250D/R440T/I595V/V600I/K724H/H788E、Q8M/Q95S/L98V/R440P/R478V/E534H/V600I/H788E、Q8M/R136S/S248A/R478V/H788E、H47L/M75V/R85V/A105E/T125E/R129E/I170L/A635S、H47L/M75V/R85V/A105E/W375Y/I756V/Q776E、H47L/M75V/R85V/I264V/I267V/I372V/K415R/A635S、H47L/M75V/R85V/I87E/R129E/W375Y/Q776E、 H47L/M75V/R85V/I87E/I170L/I372V/I756V、H47L/R85V/A105E/R129E/Q201E/N230D/I267V/R583Q、H47L/R85V/T125E/I372V/R583Q/A635S/I756V、H47L/R85V/I170L/I756V、 H47L/R85V/I87E/A105E/T125E/A635S、 H47L/R85V/I87E/R154H/I756V、H47L/T125E/R129E/W375Y/I756V/Q776E、H47L/R129E/I170L/A635S、 H47L/R154H/I372V/W375Y/R583Q/A635S/T708A/I756V、V68A/R93V/Q95S/P358E/R440T/Q444T/R478V/E534H/I595V/G603S、V68A/R93V/Q95S/Q444T/H788E、V68A/R93V/L98V/R136S/S248A/S250D/P358E/R440P/E534H/K724H、M75V/R85V/I87E/A105E/I264V/I267V/R583Q/T708A、M75V/R85V/R129E/R154H/I264V/W375Y、R85V/T125E/I215F/W375Y/K415R/A635S/Q776E、 R85V/I87E/A105E/I215F/I267V/I756V、R85V/I87E/R129E/W375Y/I756V/Q776E、I87E/T125E/R129E/I170L/N230D/I756V、I87E/R154H/R306L/W375Y/I756V、R93V/Q95S/L98V/E534H/M792S、Q95S/R440P/Q444T/K724H/H788E、
R129E/I215F/I372V/I756VおよびI170L/I264V/I267Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1158を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、および/または1288のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部のさらなる実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、および/または1288のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、および/または1288のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、47/68/93/98/358/440、47/68/154/372/375、47/93/98/136/154/772/776、47/93/98/154/372/375/776、47/93/98/358/583/635、47/93/129/136/154/250/372/534/635/724、47/93/129/136/375/534/583、47/93/358/372/375/440/724、47/93/358/372/375/776、47/98/129/358/372/375/438/534、47/98/129/375/534/635/724/776、47/98/372/375、47/125/154、47/129/136/372/375/534、47/129/248/250/372/375/534/724、47/136/583/776、47/358/440/724、47/358/635/776、47/372/635/776、68/93/98/129/358/375/724、68/93/154/358/372/440/776、68/129/440、68/129/583/724、68/136/724、68/154/358/375、68/154/534/635、68/375/440/534/724/776、93/98/125/154/248、93/98/125/154/250/440、93/98/129/154/248、93/98/154/250/358/375/534、93/98/154/635/776、93/98/534、93/125/154/440/534、93/129/250/358/372/375/583、93/154/248/724、93/358/534/635、98/129/375/583、98/534/583/635、129/136/154/248/250/372/375/534、129/136/375、129/154/248/250/358/375/534/635、129/358/372/635、154/250/358/375/583、154/358/375/534/776、154/534/635/724、372/375/776、375/635および534/583から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1222を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、47L/68A/93V/98V/358E/440P、47L/68A/154H/372V/375Y、47L/93V/98V/136S/154H/772G/776E、47L/93V/98V/154H/372V/375Y/776E、47L/93V/98V/358E/583Q/635S、47L/93V/129E/136S/154H/250D/372V/534H/635S/724H、47L/93V/129E/136S/375Y/534H/583Q、47L/93V/358E/372V/375Y/440P/724H、47L/93V/358E/372V/375Y/776E、47L/98V/129E/358E/372V/375Y/438Q/534H、47L/98V/129E/375Y/534H/635S/724H/776E、47L/98V/372V/375Y、47L/125E/154H、47L/129E/136S/372V/375Y/534H、47L/129E/248A/250D/372V/375Y/534H/724H、47L/136S/583Q/776E、47L/358E/440P/724H、47L/358E/635S/776E、47L/372V/635S/776E、68A/93V/98V/129E/358E/375Y/724H、68A/93V/154H/358E/372V/440P/776E、68A/129E/440P、68A/129E/583Q/724H、68A/136S/724H、68A/154H/358E/375Y、68A/154H/534H/635S、68A/375Y/440P/534H/724H/776E、93V/98V/125E/154H/248A、93V/98V/125E/154H/250D/440P、93V/98V/129E/154H/248A、93V/98V/154H/250D/358E/375Y/534H、93V/98V/154H/635S/776E、93V/98V/534H、93V/125E/154H/440P/534H、93V/129E/250D/358E/372V/375Y/583Q、93V/154H/248A/724H、93V/358E/534H/635S、98V/129E/375Y/583Q、98V/534H/583Q/635S、129E/136S/154H/248A/250D/372V/375Y/534H、129E/136S/375Y、129E/154H/248A/250D/358E/375Y/534H/635S、129E/358E/372V/635S、154H/250D/358E/375Y/583Q、154H/358E/375Y/534H/776E、154H/534H/635S/724H、372V/375Y/776E、375Y/635Sおよび534H/583Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1222を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、H47L/V68A/R93V/L98V/P358E/R440P、H47L/V68A/R154H/I372V/W375Y、H47L/R93V/L98V/R136S/R154H/E772G/Q776E、H47L/R93V/L98V/R154H/I372V/W375Y/Q776E、H47L/R93V/L98V/P358E/R583Q/A635S、H47L/R93V/R129E/R136S/R154H/S250D/I372V/E534H/A635S/K724H、H47L/R93V/R129E/R136S/W375Y/E534H/R583Q、H47L/R93V/P358E/I372V/W375Y/R440P/K724H、H47L/R93V/P358E/I372V/W375Y/Q776E、H47L/L98V/R129E/P358E/I372V/W375Y/H438Q/E534H、H47L/L98V/R129E/W375Y/E534H/A635S/K724H/Q776E、H47L/L98V/I372V/W375Y、H47L/T125E/R154H、H47L/R129E/R136S/I372V/W375Y/E534H、H47L/R129E/S248A/S250D/I372V/W375Y/E534H/K724H、H47L/R136S/R583Q/Q776E、H47L/P358E/R440P/K724H、H47L/P358E/A635S/Q776E、H47L/I372V/A635S/Q776E、V68A/R93V/L98V/R129E/P358E/W375Y/K724H、V68A/R93V/R154H/P358E/I372V/R440P/Q776E、V68A/R129E/R440P、V68A/R129E/R583Q/K724H、V68A/R136S/K724H、V68A/R154H/P358E/W375Y、V68A/R154H/E534H/A635S、V68A/W375Y/R440P/E534H/K724H/Q776E、R93V/L98V/T125E/R154H/S248A、R93V/L98V/T125E/R154H/S250D/R440P、R93V/L98V/R129E/R154H/S248A、R93V/L98V/R154H/S250D/P358E/W375Y/E534H、R93V/L98V/R154H/A635S/Q776E、R93V/L98V/E534H、R93V/T125E/R154H/R440P/E534H、R93V/R129E/S250D/P358E/I372V/W375Y/R583Q、R93V/R154H/S248A/K724H、R93V/P358E/E534H/A635S、L98V/R129E/W375Y/R583Q、L98V/E534H/R583Q/A635S、R129E/R136S/R154H/S248A/S250D/I372V/W375Y/E534H、R129E/R136S/W375Y、R129E/R154H/S248A/S250D/P358E/W375Y/E534H/A635S、R129E/P358E/I372V/A635S、R154H/S250D/P358E/W375Y/R583Q、R154H/P358E/W375Y/E534H/Q776E、R154H/E534H/A635S/K724H、I372V/W375Y/Q776E、W375Y/A635SおよびE534H/R583Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1222を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390および1392のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390および1392のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390および1392のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、17/357/364/434/519/684、17/357/434/519/684、17/434/684、17/684、54/97/118/307/694/727/738、68/98/129/136、68/98/129/136/154、68/98/129/136/154/534、68/98/129/154/534、68/98/129/154/635、68/98/136/154/534/635、68/98/136/154/635、68/98/154、68/98/154/534、68/98/154/534/635、68/129/136、68/129/136/154、68/129/136/154/464/635、68/129/136/534/635、68/129/154、68/129/154/765、68/136/154/534/635、68/136/534/635、68/136/635、68/154、68/154/534/635、68/154/635、97/118/442/694/727/738、98/129/136/154、98/129/136/154/635、98/129/136/534、98/129/136/635、98/129/154、98/129/154/534/635、98/129/534/635、98/136/154/635、98/136/534/635、98/136/635、98/154、98/154/534、122、129/136、129/136/154/635、129/136/534、129/136/635、129/154/534、129/154/635、129/635、132/136/154/534/635、136/154/635、136/534/635、136/603、136/635、154、154/635、157、160、161、167、253、285、381、519、550、563、564、635および785から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1392を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、17D/357K/364R/434H/519T/684H、17D/357K/434H/519T/684H、17D/434H/684H、17D/684H、54D/97V/118N/307E/694N/727E/738E、68A/98V/129E/136S、68A/98V/129E/136S/154H、68A/98V/129E/136S/154H/534H、68A/98V/129E/154H/534H、68A/98V/129E/154H/635S、68A/98V/136S/154H/534H/635S、68A/98V/136S/154H/635S、68A/98V/154H、68A/98V/154H/534H、68A/98V/154H/534H/635S、68A/129E/136S、68A/129E/136S/154H、68A/129E/136S/154H/464F/635S、68A/129E/136S/534H/635S、68A/129E/154H、68A/129E/154H/765H、68A/136S/154H/534H/635S、68A/136S/534H/635S、68A/136S/635S、68A/154H、68A/154H/534H/635S、68A/154H/635S、97V/118N/442N/694N/727E/738E、98V/129E/136S/154H、98V/129E/136S/154H/635S、98V/129E/136S/534H、98V/129E/136S/635S、98V/129E/154H、98V/129E/154H/534H/635S、98V/129E/534H/635S、98V/136S/154H/635S、98V/136S/534H/635S、98V/136S/635S、98V/154H、98V/154H/534H、122D、122E、129E/136S、129E/136S/154H/635S、129E/136S/534H、129E/136S/635S、129E/154H/534H、129E/154H/635S、129E/635S、132C/136S/154H/534H/635S、136S/154H/635S、136S/534H/635S、136S/603D、136S/635S、154H、154H/635S、157A、157F、160A、160E、160M、160N、160S、160W、161Q、167E、253G、253T、253V、285A、381S、519A、519G、519L、519S、519T、550I、550M、550Q、550S、563V、564A、635D、635E、635Rおよび785Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1392を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Y17D/Y357K/P364R/Y434H/F519T/F684H、Y17D/Y357K/Y434H/F519T/F684H、Y17D/Y434H/F684H、Y17D/F684H、G54D/A97V/A118N/N307E/G694N/L727E/A738E、V68A/L98V/R129E/R136S、V68A/L98V/R129E/R136S/R154H、V68A/L98V/R129E/R136S/R154H/E534H、V68A/L98V/R129E/R154H/E534H、V68A/L98V/R129E/R154H/A635S、V68A/L98V/R136S/R154H/E534H/A635S、V68A/L98V/R136S/R154H/A635S、V68A/L98V/R154H、V68A/L98V/R154H/E534H、V68A/L98V/R154H/E534H/A635S、V68A/R129E/R136S、V68A/R129E/R136S/R154H、V68A/R129E/R136S/R154H/I464F/A635S、V68A/R129E/R136S/E534H/A635S、V68A/R129E/R154H、V68A/R129E/R154H/D765H、V68A/R136S/R154H/E534H/A635S、V68A/R136S/E534H/A635S、V68A/R136S/A635S、V68A/R154H、V68A/R154H/E534H/A635S、V68A/R154H/A635S、A97V/A118N/H442N/G694N/L727E/A738E、L98V/R129E/R136S/R154H、L98V/R129E/R136S/R154H/A635S、L98V/R129E/R136S/E534H、L98V/R129E/R136S/A635S、L98V/R129E/R154H、L98V/R129E/R154H/E534H/A635S、L98V/R129E/E534H/A635S、L98V/R136S/R154H/A635S、L98V/R136S/E534H/A635S、L98V/R136S/A635S、L98V/R154H、L98V/R154H/E534H、A122D、A122E、R129E/R136S、R129E/R136S/R154H/A635S、R129E/R136S/E534H、R129E/R136S/A635S、R129E/R154H/E534H、R129E/R154H/A635S、R129E/A635S、R132C/R136S/R154H/E534H/A635S、R136S/R154H/A635S、R136S/E534H/A635S、R136S/G603D、R136S/A635S、R154H、R154H/A635S、G157A、G157F、F160A、F160E、F160M、F160N、F160S、F160W、S161Q、R167E、A253G、A253T、A253V、P285A、Q381S、F519A、F519G、F519L、F519S、F519T、R550I、R550M、R550Q、R550S、L563V、S564A、A635D、A635E、A635RおよびP785Dから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1392を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564および1566のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。
一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564および1566のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564および1566のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、17/54/97/136/329/550/684/738、17/54/97/329/524/684、17/54/161/519/727/738、17/54/524/550/727、17/161/434/524/766、17/434/524/684、17/434/738、17/442/524/550/684/721、17/727、17/738、54/97/161/434/442、54/97/434/524/550/684/727、54/136/442/550、54/434/524/738、97/136/519/550/727/738および329/550/684/727/738から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1456を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、17D/54D/97V/136P/329Q/550I/684H/738E、17D/54D/97V/329Q/524T/684H、17D/54D/161T/519T/727E/738E、17D/54D/524T/550I/727E、17D/161T/434H/524T/766H、17D/434H/524T/684H、17D/434H/738E、17D/442N/524T/550I/684H/721K、17D/727E、17D/738E、54D/97V/161T/434H/442N、54D/97V/434H/524T/550I/684H/727E、54D/136P/442N/550I、54D/434H/524T/738E、97V/136P/519T/550I/727E/738Eおよび329Q/550I/684H/727E/738Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1456を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Y17D/G54D/A97V/R136P/E329Q/R550I/F684H/A738E、Y17D/G54D/A97V/E329Q/A524T/F684H、Y17D/G54D/S161T/F519T/L727E/A738E、Y17D/G54D/A524T/R550I/L727E、Y17D/S161T/Y434H/A524T/R766H、Y17D/Y434H/A524T/F684H、Y17D/Y434H/A738E、Y17D/H442N/A524T/R550I/F684H/E721K、Y17D/L727E、Y17D/A738E、G54D/A97V/S161T/Y434H/H442N、G54D/A97V/Y434H/A524T/R550I/F684H/L727E、G54D/R136P/H442N/R550I、G54D/Y434H/A524T/A738E、A97V/R136P/F519T/R550I/L727E/A738EおよびE329Q/R550I/F684H/L727E/A738Eから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1456を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、および1598のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、および1598のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、および1598のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、14/137/356/745、14/570、14/570/745、26/117/365、26/164/165/213/586、71/158/222/356、71/222/236、71/319/356/606、117/158/213/332/608、117/164/707、117/213/365/517、117/311/332、117/608、122、122/160/161/167/550、122/160/161/282/381/550、122/160/161/282/381/550/636、122/160/161/282/550、122/160/161/550/636、122/160/167/282/381/550/636、122/160/282/381、122/160/282/381/550、122/160/282/550、122/160/381/550、122/160/381/550/636、122/160/550、122/160/550/636、122/161/550、122/167、122/167/550、122/282/381/550、122/282/550、122/282/550/636、122/381/706、122/550、137/319/570、157/253/519、160/161、160/161/282/381/550、160/161/282/550、160/161/550/636/735、160/167/282/381/636、160/282、160/282/381/550、160/282/550/636、160/381/550/636/681、161/282/550/636、161/381/550、165/311、167/282/636、167/550、213/365/517/707、236、253/519、253/519/563、253/519/635、253/563/635、270/322/517、270/367/452/517/613/700/750、270/452/517/700/750、270/570、282/381/550、282/550、356/570、381/550、517、517/562/750、517/640、519/563、550、550/636および562から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1582を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、14D/137K/356H/745L、14D/570H、14D/570H/745L、26E/117E/365E、26E/164E/165E/213E/586E、71Q/158T/222L/356H、71Q/222L/236S、71Q/319K/356H/606S、117E/158E/213E/332E/608E、117E/164E/707E、117E/213E/365E/517E、117E/311E/332E、117E/608E、122D、122D/160M/282M/550S、122D/160W/161Q/167E/550M、122D/160W/161Q/282M/550Q、122D/160W/282M/381S/550M、122D/160W/550M、122D/160W/550Q/636Q、122D/167E、122D/282M/381S/550M、122D/282M/550Q、122D/550M、122E/160I/167E/282M/381H/550Q/636Q、122E/160M/161Q/282M/381S/550M/636Q、122E/160M/550Q/636Q、122E/160W/161Q/167E/550S、122E/160W/161Q/282M/381S/550S、122E/160W/161Q/550M/636Q、122E/160W/282M/381S、122E/160W/381S/550M/636Q、122E/160W/381S/550Q、122E/161Q/550Q、122E/167E/550M、122E/282M/550M/636Q、122E/282M/550Q、122E/282M/550S、122E/381S/706K、122E/550Q、137K/319K/570H、157A/253T/519L、160M/161Q、160M/161Q/282M/381S/550M、160M/161Q/282M/550Q、160M/282M、160M/282M/381S/550M、160M/282M/550M/636Q、160W/161Q/282M/550M、160W/161Q/282M/550Q、160W/161Q/550Q/636Q/735V、160W/167E/282M/381S/636Q、160W/282M/381S/550M、160W/381S/550Q/636Q/681V、161Q/282M/550Q/636Q、161Q/381S/550Q、165E/311E、167E/282M/636Q、167E/550Q、213E/365E/517E/707E、236S、253G/519L、253T/519L、253T/519L/563V、253T/519L/635D、253T/519L/635E、253T/563V/635R、253V/519G、253V/519L、270L/322V/517A、270L/367V/452Y/517A/613Q/700F/750M、270L/452Y/517A/700F/750M、270L/570H、282M/381S/550S、282M/550Q、356H/570H、381S/550Q、381S/550S、517A、517A/562I/750M、517A/640N、519L/563V、550M/636Q、550Qおよび562Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1582を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、R14D/R137K/R356H/R745L、R14D/R570H、R14D/R570H/R745L、S26E/G117E/H365E、S26E/A164E/A165E/A213E/R586E、R71Q/R158T/R222L/R356H、R71Q/R222L/R236S、R71Q/R319K/R356H/R606S、G117E/R158E/A213E/G332E/A608E、G117E/A164E/A707E、G117E/A213E/H365E/P517E、G117E/Q311E/G332E、G117E/A608E、A122D、A122D/F160M/L282M/R550S、A122D/F160W/T161Q/R167E/R550M、A122D/F160W/T161Q/L282M/R550Q、A122D/F160W/L282M/Q381S/R550M、A122D/F160W/R550M、A122D/F160W/R550Q/L636Q、A122D/R167E、A122D/L282M/Q381S/R550M、A122D/L282M/R550Q、A122D/R550M、A122E/F160I/R167E/L282M/Q381H/R550Q/L636Q、A122E/F160M/T161Q/L282M/Q381S/R550M/L636Q、A122E/F160M/R550Q/L636Q、A122E/F160W/T161Q/R167E/R550S、A122E/F160W/T161Q/L282M/Q381S/R550S、A122E/F160W/T161Q/R550M/L636Q、A122E/F160W/L282M/Q381S、A122E/F160W/Q381S/R550M/L636Q、A122E/F160W/Q381S/R550Q、A122E/T161Q/R550Q、A122E/R167E/R550M、A122E/L282M/R550M/L636Q、A122E/L282M/R550Q、A122E/L282M/R550S、A122E/Q381S/E706K、A122E/R550Q、R137K/R319K/R570H、G157A/A253T/T519L、F160M/T161Q、F160M/T161Q/L282M/Q381S/R550M、F160M/T161Q/L282M/R550Q、F160M/L282M、F160M/L282M/Q381S/R550M、F160M/L282M/R550M/L636Q、F160W/T161Q/L282M/R550M、F160W/T161Q/L282M/R550Q、F160W/T161Q/R550Q/L636Q/A735V、F160W/R167E/L282M/Q381S/L636Q、F160W/L282M/Q381S/R550M、F160W/Q381S/R550Q/L636Q/A681V、T161Q/L282M/R550Q/L636Q、T161Q/Q381S/R550Q、A165E/Q311E、R167E/L282M/L636Q、R167E/R550Q、A213E/H365E/P517E/A707E、R236S、A253G/T519L、A253T/T519L、A253T/T519L/L563V、
A253T/T519L/S635D、A253T/T519L/S635E、A253T/L563V/S635R、A253V/T519G、A253V/T519L、V270L/I322V/P517A、V270L/I367V/F452Y/P517A/E613Q/I700F/L750M、V270L/F452Y/P517A/I700F/L750M、V270L/R570H、L282M/Q381S/R550S、L282M/R550Q、R356H/R570H、Q381S/R550Q、Q381S/R550S、P517A、P517A/L562I/L750M、P517A/T640N、T519L/L563V、R550M/L636Q、R550QおよびL562Iから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1582を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770および1772のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770および1772のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770および1772のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、63/536、117/122/270/540/681、181/536/548、181/536/548/705、181/548/705、270/681、347/532、347/536/548/705、407/570/681、407/681、536、536/548、536/548/699、536/705、548、548/580、548/705、580、681、699、および705から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1764を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、63I/536L、117E/122D/270L/540M/681A、181N/536L/548P、181N/536L/548P/705M、181N/548P/705P、270L/681A、347R/532Y、347R/536L/548P/705P、407I/570H/681A、407T/681A、536L、536L/548P、536L/548P/699F、536L/705M、548P、548P/580M、548P/705P、580M、681A、699F、705Mおよび705Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1764を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、A63I/E536L、G117E/A122D/V270L/L540M/V681A、G181N/E536L/A548P、G181N/E536L/A548P/H705M、G181N/A548P/H705P、V270L/V681A、N347R/S532Y、N347R/E536L/A548P/H705P、L407I/R570H/V681A、L407T/V681A、E536L、E536L/A548P、E536L/A548P/H699F、E536L/H705M、A548P、A548P/L580M、A548P/H705P、L580M、V681A、H699F、H705MおよびH705Pから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1764を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、および1820のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、および1820のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、および1820のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、13、17、18、30、37、52、57、60、71、85、87、90、98、99、118、129、164、180、183、347/434/517/562/640/681、347/434/532/562/640/681、347/434/550/562/681、347/434/681、347/517/532/681、347/532/550/640/681/699、347/536/562/681、347/550/580/681、347/550/681、347/681、365、388、389、415、433、434/517/532/681、517/681、531、532/681、535、536/580/681、539、562/681、589、606、608、707、711、727、738、748、765、769および789から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1804を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、13H、13K、13N、17R、18G、30H、37G、37R、52G、52P、52R、52W、57R、57W、60L、71G、71Q、85H、87H、87L、90H、98L、99I、118G、118N、129A、129G、129T、164S、164T、180P、183P、347R/434H/517A/562I/640N/681A、347R/434H/532Y/562I/640N/681A、347R/434H/550I/562I/681A、347R/434H/681A、347R/517A/532Y/681A、347R/532Y/550I/640N/681A/699F、347R/536L/562I/681A、347R/550I/580M/681A、347R/550I/681A、347R/681A、365W、388K、388R、389G、415H、433K、433P、434H/517A/532Y/681A、517A/681A、531A、531R、531T、532Y/681A、535A、535H、535S、536L/580M/681A、539A、539R、562I/681A、589S、606A、606H、606I、606L、606M、606Q、606V、608P、707G、711K、727K、738S、748T、765A、765S、769K、769R、789Nおよび789Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1804を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、P13H、P13K、P13N、D17R、A18G、S30H、Q37G、Q37R、D52G、D52P、D52R、D52W、P57R、P57W、D60L、R71G、R71Q、V85H、E87H、E87L、R90H、V98L、E99I、A118G、A118N、E129A、E129G、E129T、A164S、A164T、D180P、N183P、N347R/Y434H/P517A/L562I/T640N/V681A、N347R/Y434H/S532Y/L562I/T640N/V681A、N347R/Y434H/Q550I/L562I/V681A、N347R/Y434H/V681A、N347R/P517A/S532Y/V681A、N347R/S532Y/Q550I/T640N/V681A/H699F、N347R/E536L/L562I/V681A、N347R/Q550I/L580M/V681A、N347R/Q550I/V681A、N347R/V681A、H365W、L388K、L388R、A389G、K415H、L433K、L433P、Y434H/P517A/S532Y/V681A、P517A/V681A、S531A、S531R、S531T、S532Y/V681A、P535A、P535H、P535S、E536L/L580M/V681A、S539A、S539R、L562I/V681A、G589S、R606A、R606H、R606I、R606L、R606M、R606Q、R606V、A608P、A707G、R711K、E727K、E738S、E748T、D765A、D765S、Q769K、Q769R、A789NおよびA789Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1804を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982および1984のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982および1984のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982および1984のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、17/52/87/118/129/388/589/738/765、17/52/87/118/129/589/738、17/52/87/118/129/589/738/765、17/52/87/118/129/589/765、17/52/87/129/388/589、17/52/87/129/388/589/738、17/52/87/129/738、17/52/87/388/589/765、17/52/87/589/738/765、17/52/118/129/265/589/765、17/52/118/129/388/589/738/765、17/52/118/129/589/738/765、17/52/118/129/738/765、17/52/118/388/589/738、17/52/118/388/589/738/765、17/52/118/388/738/765、17/52/129/388/589/738、17/52/129/388/589/738/765、17/52/129/589、17/52/129/589/738、17/52/129/589/765、17/52/129/653/738/765、17/52/129/738、17/52/129/738/765、17/52/388/589/738、17/52/388/589/738/765、17/52/589/738/765、17/52/589/765、17/87/118/388/738、17/87/129/388/738、17/118/129/388/738/765、17/129/589、17/129/589/738、17/129/589/738/765、17/129/738/765、17/388/589/738、17/589/738、17/589/765、17/738/765、52/84/129/388/738/765、52/87/118/129/388/765、52/87/118/388/589/738、52/87/118/589/738/765、52/87/129/388/738/765、52/87/129/765、52/87/589/738、52/87/738、52/118/129/589/738、52/118/129/765、52/118/388/589/738、52/118/388/738/765、52/129/589/738/765、52/129/589/765、52/129/738、52/388/738/765、52/589/738、52/589/738/765、52/738/765、84/129/589/738/765、87/118/129/765、87/129/388/589および589/738/765から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号1840を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、17R/52G/87H/118N/129G/589S/738S、17R/52G/87H/118N/129T/589S/765S、17R/52G/87H/129T/388K/589S/738S、17R/52G/87H/129T/738S、17R/52G/87H/388K/589S/765S、17R/52G/118N/129T/388K/589S/738S/765S、17R/52G/118N/388K/738S/765S、17R/52G/129G/589S/738S、17R/52G/129T/388K/589S/738S、17R/52G/129T/589S、17R/52G/129T/653H/738S/765S、17R/52G/589S/765S、17R/52P/87H/118N/129T/388K/589S/738S/765S、17R/52P/87H/118N/129T/589S/738S/765S、17R/52P/87H/129G/388K/589S、17R/52P/87H/129T/388K/589S/738S、17R/52P/87H/589S/738S/765S、17R/52P/118N/129T/265T/589S/765S、17R/52P/118N/129T/589S/738S/765S、17R/52P/118N/129T/738S/765S、17R/52P/118N/388K/589S/738S、17R/52P/118N/388K/589S/738S/765S、17R/52P/129G/388K/589S/738S/765S、17R/52P/129G/738S/765S、17R/52P/129T/589S/765S、17R/52P/129T/738S、17R/52P/388K/589S/738S、17R/52P/388K/589S/738S/765S、17R/52P/589S/738S/765S、17R/87H/118N/388K/738S、17R/87H/129T/388K/738S、17R/118N/129T/388K/738S/765S、17R/129T/589S、17R/129T/589S/738S、17R/129T/589S/738S/765S、17R/129T/738S/765S、17R/388K/589S/738S、17R/589S/738S、17R/589S/765S、17R/738S/765S、52G/84A/129T/388K/738S/765S、52G/87H/118N/589S/738S/765S、52G/87H/129T/388K/738S/765S、52G/87H/738S、52G/118N/388K/589S/738S、52G/118N/388K/738S/765S、52G/129G/589S/765S、52G/388K/738S/765S、52G/589S/738S/765S、52G/738S/765S、52P/87H/118N/129T/388K/765S、52P/87H/118N/388K/589S/738S、52P/87H/129G/765S、52P/87H/589S/738S、52P/118N/129T/589S/738S、52P/118N/129T/765S、52P/129T/589S/738S/765S、52P/129T/738S、52P/589S/738S、52P/589S/738S/765S、84A/129T/589S/738S/765S、87H/118N/129T/765S、87H/129T/388K/589Sおよび589S/738S/765Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1840を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、D17R/D52G/E87H/A118N/E129G/G589S/E738S、D17R/D52G/E87H/A118N/E129T/G589S/D765S、D17R/D52G/E87H/E129T/L388K/G589S/E738S、D17R/D52G/E87H/E129T/E738S、D17R/D52G/E87H/L388K/G589S/D765S、D17R/D52G/A118N/E129T/L388K/G589S/E738S/D765S、D17R/D52G/A118N/L388K/E738S/D765S、D17R/D52G/E129G/G589S/E738S、D17R/D52G/E129T/L388K/G589S/E738S、D17R/D52G/E129T/G589S、D17R/D52G/E129T/R653H/E738S/D765S、D17R/D52G/G589S/D765S、D17R/D52P/E87H/A118N/E129T/L388K/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/E87H/A118N/E129T/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/E87H/E129G/L388K/G589S、D17R/D52P/E87H/E129T/L388K/G589S/E738S、D17R/D52P/E87H/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/A118N/E129T/S265T/G589S/D765S、D17R/D52P/A118N/E129T/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/A118N/E129T/E738S/D765S、D17R/D52P/A118N/L388K/G589S/E738S、D17R/D52P/A118N/L388K/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/E129G/L388K/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/E129G/E738S/D765S、D17R/D52P/E129T/G589S/D765S、D17R/D52P/E129T/E738S、D17R/D52P/L388K/G589S/E738S、D17R/D52P/L388K/G589S/E738S/D765S、D17R/D52P/G589S/E738S/D765S、D17R/E87H/A118N/L388K/E738S、D17R/E87H/E129T/L388K/E738S、D17R/A118N/E129T/L388K/E738S/D765S、D17R/E129T/G589S、D17R/E129T/G589S/E738S、D17R/E129T/G589S/E738S/D765S、D17R/E129T/E738S/D765S、D17R/L388K/G589S/E738S、D17R/G589S/E738S、D17R/G589S/D765S、D17R/E738S/D765S、D52G/G84A/E129T/L388K/E738S/D765S、D52G/E87H/A118N/G589S/E738S/D765S、D52G/E87H/E129T/L388K/E738S/D765S、D52G/E87H/E738S、D52G/A118N/L388K/G589S/E738S、D52G/A118N/L388K/E738S/D765S、D52G/E129G/G589S/D765S、D52G/L388K/E738S/D765S、D52G/G589S/E738S/D765S、D52G/E738S/D765S、D52P/E87H/A118N/E129T/L388K/D765S、D52P/E87H/A118N/L388K/G589S/E738S、D52P/E87H/E129G/D765S、D52P/E87H/G589S/E738S、D52P/A118N/E129T/G589S/E738S、D52P/A118N/E129T/D765S、D52P/E129T/G589S/E738S/D765S、D52P/E129T/E738S、D52P/G589S/E738S、D52P/G589S/E738S/D765S、G84A/E129T/G589S/E738S/D765S、E87H/A118N/E129T/D765S、E87H/E129T/L388K
/G589SおよびG589S/E738S/D765Sから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1840を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、14、15、18/362、20、24、26、33、33/154、46、50、54、58、59、59/72、79、81、92、93、97/154、104、105、130、134、154、165、175、185、212、213、218、241、256、263、316、319、349、360、362、364、390、393、434、480、498、530、534、534/739、542、603および652から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1840を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、14K、15A、15I、15P、18V/362A、20M、24S、26A、26E、26I、26T、33H/154C、33L、33P、33S、46G、46I、46R、46T、46V、50R、54M、58M、59A、59C、59N/72N、59R、59S、59V、59W、79H、79Y、81G、81I、81L、92G、93T、97V/154S、104T、105S、130Y、134A、134P、154A、154E、154R、154S、165I、165L、165T、175G、175T、185L、212Y、213V、218A、218N、218Q、218S、218T、218V、241T、256G、263S、263Y、316H、316T、319S、349D、349R、349T、360D、360E、360R、362E、364S、390M、393H、434G、434R、480P、480V、498L、498Q、530F、534G、534K、534L、534R、534T、534W、534W/739K、542W、603A、603E、603H、603Q、603S、652K、652L、652R、652Sおよび652Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1840を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、R14K、S15A、S15I、S15P、A18V/I362A、L20M、V24S、S26A、S26E、S26I、S26T、Q33H/H154C、Q33L、Q33P、Q33S、Q46G、Q46I、Q46R、Q46T、Q46V、G50R、D54M、L58M、E59A、E59C、E59N/D72N、E59R、E59S、E59V、E59W、W79H、W79Y、P81G、P81I、P81L、H92G、V93T、A97V/H154S、D104T、E105S、D130Y、V134A、V134P、H154A、H154E、H154R、H154S、A165I、A165L、A165T、S175G、S175T、M185L、W212Y、A213V、D218A、D218N、D218Q、D218S、D218T、D218V、L241T、S256G、M263S、M263Y、V316H、V316T、R319S、Q349D、Q349R、Q349T、G360D、G360E、G360R、I362E、P364S、E390M、S393H、Y434G、Y434R、I480P、I480V、E498L、E498Q、P530F、E534G、E534K、E534L、E534R、E534T、E534W、E534W/E739K、F542W、G603A、G603E、G603H、G603Q、G603S、G652K、G652L、G652R、G652SおよびG652Tから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号1840を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316および2318のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316および2318のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316および2318のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、57/71/87/347/434/562/606、57/71/129/180/434/536/562、57/71/129/434/531/536/562、57/71/129/531/532/536/539/606、57/71/562/606/711/789、57/71/789、57/87/180/531/532/562/606/612/711、57/87/347/562、57/90/129/562、57/90/129/562/711、57/96/129/180/531/532/550/562、57/129/347/531/532/539/562/711/747、57/129/347/536/550/562/711/789、57/129/347/550/711、57/129/531/539/562/789、57/129/536/606/789、57/129/606、57/180/562、57/180/562/606/612、57/347/434/531/532/539/789、57/434/550/562/606/612/789、57/531/532/536/562、57/562/606/711、57/562/711、71/129/180/347/531/539/550、71/129/180/434/532/536/539/711/789、71/129/531、71/129/606、71/347/532/550/562/711、71/347/536/562/612/789、71/536/539/562、87/189/532/536/562/711/789、87/347/531/606/789、87/347/536/539/550、90/129/539/550/606、129/180/434/562/711/789、129/180/606/711/789、129/347/562、129/536/539/562、129/539/562/789、129/550、129/550/562、129/562/606/711、180/532、180/550/606、347/531/550/711、347/536/539/550/711/789、347/536/562/606/612、347/550/562/606、434/531/539/550/562/711、434/550、531/532/536/539/562/711/789、531/532/536/550/562/606/789、531/532/562/606/711、532/539/550および562/711から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2064を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、57W/71Q/87H/347R/434H/562I/606H、57W/71Q/129G/531R/532Y/536L/539R/606H、57W/71Q/129T/180P/434H/536L/562I、57W/71Q/129T/434H/531R/536L/562I、57W/71Q/562I/606M/711K/789N、57W/71Q/789N、57W/87H/180P/531R/532Y/562I/606M/612A/711K、57W/87H/347R/562I、57W/90H/129G/562I、57W/90H/129T/562I/711K、57W/96Q/129T/180P/531R/532Y/550I/562I、57W/129G/531R/539R/562I/789N、57W/129G/536L/606M/789N、57W/129T/347R/531R/532Y/539R/562I/711K/747V、57W/129T/347R/536L/550I/562I/711K/789N、57W/129T/347R/550I/711K、57W/129T/606M、57W/180P/562I、57W/180P/562I/606H/612A、57W/347R/434H/531R/532Y/539R/789N、57W/434H/550I/562I/606H/612A/789N、57W/531R/532Y/536L/562I、57W/562I/606M/711K、57W/562I/711K、71Q/129T/180P/347R/531R/539R/550I、71Q/129T/180P/434H/532Y/536L/539R/711K/789N、71Q/129T/531R、71Q/129T/606M、71Q/347R/532Y/550I/562I/711K、71Q/347R/536L/562I/612A/789N、71Q/536L/539R/562I、87H/189D/532Y/536L/562I/711K/789N、87H/347R/531R/606M/789N、87H/347R/536L/539R/550I、90H/129T/539R/550I/606H、129G/550I、129G/550I/562I、129G/562I/606M/711K、129T/180P/434H/562I/711K/789N、129T/180P/606M/711K/789N、129T/347R/562I、129T/536L/539R/562I、129T/539R/562I/789N、129T/550I/562I、180P/532Y、180P/550I/606M、347R/531R/550I/711K、347R/536L/539R/550I/711K/789N、347R/536L/562I/606M/612A、347R/550I/562I/606H、434H/531R/539R/550I/562I/711K、434H/550I、531R/532Y/536L/539R/562I/711K/789N、531R/532Y/536L/550I/562I/606M/789N、531R/532Y/562I/606H/711K、532Y/539R/550Iおよび562I/711Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2064を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、P57W/R71Q/E87H/N347R/Y434H/L562I/R606H、P57W/R71Q/E129G/S531R/S532Y/E536L/S539R/R606H、P57W/R71Q/E129T/D180P/Y434H/E536L/L562I、P57W/R71Q/E129T/Y434H/S531R/E536L/L562I、P57W/R71Q/L562I/R606M/R711K/A789N、P57W/R71Q/A789N、P57W/E87H/D180P/S531R/S532Y/L562I/R606M/E612A/R711K、P57W/E87H/N347R/L562I、P57W/R90H/E129G/L562I、P57W/R90H/E129T/L562I/R711K、P57W/L96Q/E129T/D180P/S531R/S532Y/Q550I/L562I、P57W/E129G/S531R/S539R/L562I/A789N、P57W/E129G/E536L/R606M/A789N、P57W/E129T/N347R/S531R/S532Y/S539R/L562I/R711K/A747V、P57W/E129T/N347R/E536L/Q550I/L562I/R711K/A789N、P57W/E129T/N347R/Q550I/R711K、P57W/E129T/R606M、P57W/D180P/L562I、P57W/D180P/L562I/R606H/E612A、P57W/N347R/Y434H/S531R/S532Y/S539R/A789N、P57W/Y434H/Q550I/L562I/R606H/E612A/A789N、P57W/S531R/S532Y/E536L/L562I、P57W/L562I/R606M/R711K、P57W/L562I/R711K、R71Q/E129T/D180P/N347R/S531R/S539R/Q550I、R71Q/E129T/D180P/Y434H/S532Y/E536L/S539R/R711K/A789N、R71Q/E129T/S531R、R71Q/E129T/R606M、R71Q/N347R/S532Y/Q550I/L562I/R711K、R71Q/N347R/E536L/L562I/E612A/A789N、R71Q/E536L/S539R/L562I、E87H/G189D/S532Y/E536L/L562I/R711K/A789N、E87H/N347R/S531R/R606M/A789N、E87H/N347R/E536L/S539R/Q550I、R90H/E129T/S539R/Q550I/R606H、E129G/Q550I、E129G/Q550I/L562I、E129G/L562I/R606M/R711K、E129T/D180P/Y434H/L562I/R711K/A789N、E129T/D180P/R606M/R711K/A789N、E129T/N347R/L562I、E129T/E536L/S539R/L562I、E129T/S539R/L562I/A789N、E129T/Q550I/L562I、D180P/S532Y、D180P/Q550I/R606M、N347R/S531R/Q550I/R711K、N347R/E536L/S539R/Q550I/R711K/A789N、N347R/E536L/L562I/R606M/E612A、N347R/Q550I/L562I/R606H、Y434H/S531R/S539R/Q550I/L562I/R711K、Y434H/Q550I、S531R/S532Y/E536L/S539R/L562I/R711K/A789N、S531R/S532Y/E536L/Q550I/L562I/R606M/A789N、S531R/S532Y/L562I/R606H/R711K、S532Y/S539R/Q550IおよびL562I/R711Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2064を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、21、25/112、41、89、91、112、186、200、226、259、318、330、485、487、641、674、684、688、763、および764から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2064を参照して番号付けられている。
一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、21Q、25T/112W、41K、89L、89M、91C、91G、112Q、112R、186V、200A、226V、259G、318A、330A、485A、485S、487I、487K、487R、487T、487V、641L、674A、684G、684H、684M、684T、688A、688F、688G、688H、688Q、763Lおよび764Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2064を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、R21Q、A25T/G112W、A41K、V89L、V89M、I91C、I91G、G112Q、G112R、L186V、V200A、P226V、D259G、P318A、S330A、G485A、G485S、Q487I、Q487K、Q487R、Q487T、Q487V、V641L、S674A、F684G、F684H、F684M、F684T、L688A、L688F、L688G、L688H、L688Q、V763LおよびL764Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2064を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500および2502のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500および2502のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500および2502のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、33/47/59/81/175/530/534/550/606、33/58/59/81/130/480/530/534/550/652、33/58/59/480/530/534/550、33/58/154/480/534/550/603/606、33/59/480/530/534/550/606、33/79/81/175/530/534、33/79/81/175/530/534/603、33/79/154/480/530/534/550、33/81/130/480/530/534/550、33/81/175/530/534/542/550/652、33/130/530/534/550、33/154/480/530/534/603/606、33/154/534、33/530/534/550、58/59/79/175/480/534/550/652、59/154/530/534/550、79/81/480/530/534/550/603/606/652、81/480/530/534/550および130/480/530/534/550/603/606から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2432を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、33H/47P/59A/81L/175G/530F/534W/550I/606M、33H/58M/59A/81G/130Y/480V/530F/534W/550I/652K、33H/58M/59A/480P/530F/534W/550I、33H/58M/154A/480P/534W/550I/603A/606M、33H/59A/480P/530F/534W/550I/606M、33H/79H/81G/175G/530F/534W、33H/79H/81L/175G/530F/534W/603Q、33H/79H/154A/480P/530F/534W/550I、33H/81G/130Y/480V/530F/534W/550I、33H/81I/175G/530F/534W/542W/550I/652R、33H/130Y/530F/534W/550I、33H/154A/480P/530F/534W/603Q/606M、33H/154A/534W、33H/530F/534W/550I、58M/59A/79H/175G/480P/534W/550I/652R、59A/154A/530F/534W/550I、79H/81I/480P/530F/534W/550I/603E/606M/652R、81G/480V/530F/534W/550Iおよび130Y/480V/530F/534W/550I/603Q/606Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2432を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Q33H/L47P/E59A/P81L/S175G/P530F/E534W/Q550I/R606M、Q33H/L58M/E59A/P81G/D130Y/I480V/P530F/E534W/Q550I/G652K、Q33H/L58M/E59A/I480P/P530F/E534W/Q550I、Q33H/L58M/H154A/I480P/E534W/Q550I/G603A/R606M、Q33H/E59A/I480P/P530F/E534W/Q550I/R606M、Q33H/W79H/P81G/S175G/P530F/E534W、Q33H/W79H/P81L/S175G/P530F/E534W/G603Q、Q33H/W79H/H154A/I480P/P530F/E534W/Q550I、Q33H/P81G/D130Y/I480V/P530F/E534W/Q550I、Q33H/P81I/S175G/P530F/E534W/F542W/Q550I/G652R、Q33H/D130Y/P530F/E534W/Q550I、Q33H/H154A/I480P/P530F/E534W/G603Q/R606M、Q33H/H154A/E534W、Q33H/P530F/E534W/Q550I、L58M/E59A/W79H/S175G/I480P/E534W/Q550I/G652R、E59A/H154A/P530F/E534W/Q550I、W79H/P81I/I480P/P530F/E534W/Q550I/G603E/R606M/G652R、P81G/I480V/P530F/E534W/Q550IおよびD130Y/I480V/P530F/E534W/Q550I/G603Q/R606Mから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2432を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、25、42、70、75、77、106、199、265、267、380、410、561、642、および758から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2432を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、25E、25G、25L、42H、42S、42T、70H、70N、70R、70S、70V、75T、75W、77L、77W、106W、199A、265A、265Q、267I、380T、410S、561I、561V、642V、758Q、および758Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2432を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、A25E、A25G、A25L、D42H、D42S、D42T、F70H、F70N、F70R、F70S、F70V、M75T、M75W、F77L、F77W、Y106W、T199A、S265A、S265Q、V267I、A380T、T410S、L561I、L561V、A642V、G758QおよびG758Rから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2432を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592および2594のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592および2594のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592および2594のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、41、41/71、41/71/112、41/71/112/259/485/487/684/688、41/71/112/259/485/688、41/71/259/485/532、41/71/485、41/71/485/532/684、41/71/487、41/71/487/532/684、41/71/532、41/71/532/684、41/71/684、41/84/259/485/487、41/91/112/485、41/91/112/485/487/532/684、41/91/112/485/532/684、41/91/485、41/112、41/112/259/485/487、41/112/259/487/532/684、41/112/485/684、41/112/487/684、41/112/532、41/112/684/688、41/259/485、41/259/485/487、41/259/485/487/532/684、41/259/485/487/684/688、41/259/532、41/485、41/485/487、41/485/487/684/688、41/485/532、41/485/532/688、41/485/684/688、41/487/684、41/532、41/684、41/684/688、44/112/684/688、71/112/259/485/487/684、71/112/485/688、71/485/684/688、71/532、71/684/688、112、112/259、112/259/532/684/688、112/259/684/688、112/485/684、112/485/684/688、226/487/684/688、259/485/487/684、259/485/532、259/487/684/688、259/532、485、485/487、485/487/532、485/487/532/684、485/487/684、485/487/684/688、485/532、485/684、485/684/688、532、532/684/688、684および684/688から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号2510を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、41K、41K/71Q、41K/71Q/112Q、41K/71Q/112Q/259G/485A/688Q、41K/71Q/112W/259G/485S/487R/684H/688Q、41K/71Q/259G/485A/532Y、41K/71Q/485A、41K/71Q/485A/532Y/684H、41K/71Q/487R、41K/71Q/487R/532Y/684H、41K/71Q/532Y、41K/71Q/532Y/684H、41K/71Q/684H、41K/84A/259G/485A/487I、41K/91C/112Q/485S、41K/91C/112Q/485S/487K/532Y/684H、41K/91C/112Q/485S/532Y/684H、41K/91C/485S、41K/112Q/259G/485S/487R、41K/112Q/259G/487R/532Y/684H、41K/112Q/485S/684H、41K/112Q/487I/684H、41K/112Q/532Y、41K/112Q/684H/688A、41K/112W、41K/259G/485A/487I、41K/259G/485A/487R/532Y/684H、41K/259G/485A/487R/684H/688A、41K/259G/485S、41K/259G/532Y、41K/485A、41K/485A/487K、41K/485A/487R、41K/485A/532Y、41K/485A/532Y/688G、41K/485S/487I/684M/688G、41K/485S/684M/688A、41K/487I/684M、41K/487R/684M、41K/532Y、41K/684H、41K/684M/688A、44C/112W/684H/688A、71Q/112Q/259G/485A/487R/684M、71Q/112W/485S/688A、71Q/485S/684M/688Q、71Q/532Y、71Q/684M/688A、112Q、112Q/259G/532Y/684M/688G、112Q/259G/684M/688Q、112Q/485S/684H、112Q/485S/684H/688G、112Q/485S/684M/688G、112W、112W/259G、226V/487I/684M/688A、259G/485S/487K/684H、259G/485S/532Y、259G/487I/684M/688G、259G/532Y、485A、485A/487R、485A/532Y、485A/684H/688G、485A/684M、485S、485S/487I/684H/688Q、485S/487I/684M、485S/487K/532Y、485S/487R/532Y/684H、485S/684M/688G、532Y、532Y/684H/688Q、684Hおよび684M/688Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2510を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、A41K、A41K/R71Q、A41K/R71Q/G112Q、A41K/R71Q/G112Q/D259G/G485A/L688Q、A41K/R71Q/G112W/D259G/G485S/Q487R/F684H/L688Q、A41K/R71Q/D259G/G485A/S532Y、A41K/R71Q/G485A、A41K/R71Q/G485A/S532Y/F684H、A41K/R71Q/Q487R、A41K/R71Q/Q487R/S532Y/F684H、A41K/R71Q/S532Y、A41K/R71Q/S532Y/F684H、A41K/R71Q/F684H、A41K/G84A/D259G/G485A/Q487I、A41K/I91C/G112Q/G485S、A41K/I91C/G112Q/G485S/Q487K/S532Y/F684H、A41K/I91C/G112Q/G485S/S532Y/F684H、A41K/I91C/G485S、A41K/G112Q/D259G/G485S/Q487R、A41K/G112Q/D259G/Q487R/S532Y/F684H、A41K/G112Q/G485S/F684H、A41K/G112Q/Q487I/F684H、A41K/G112Q/S532Y、A41K/G112Q/F684H/L688A、A41K/G112W、A41K/D259G/G485A/Q487I、A41K/D259G/G485A/Q487R/S532Y/F684H、A41K/D259G/G485A/Q487R/F684H/L688A、A41K/D259G/G485S、A41K/D259G/S532Y、A41K/G485A、A41K/G485A/Q487K、A41K/G485A/Q487R、A41K/G485A/S532Y、A41K/G485A/S532Y/L688G、A41K/G485S/Q487I/F684M/L688G、A41K/G485S/F684M/L688A、A41K/Q487I/F684M、A41K/Q487R/F684M、A41K/S532Y、A41K/F684H、A41K/F684M/L688A、R44C/G112W/F684H/L688A、R71Q/G112Q/D259G/G485A/Q487R/F684M、R71Q/G112W/G485S/L688A、R71Q/G485S/F684M/L688Q、R71Q/S532Y、R71Q/F684M/L688A、G112Q、G112Q/D259G/S532Y/F684M/L688G、G112Q/D259G/F684M/L688Q、G112Q/G485S/F684H、G112Q/G485S/F684H/L688G、G112Q/G485S/F684M/L688G、G112W、G112W/D259G、P226V/Q487I/F684M/L688A、D259G/G485S/Q487K/F684H、D259G/G485S/S532Y、D259G/Q487I/F684M/L688G、D259G/S532Y、G485A、G485A/Q487R、G485A/S532Y、G485A/F684H/L688G、G485A/F684M、G485S、G485S/Q487I/F684H/L688Q、G485S/Q487I/F684M、G485S/Q487K/S532Y、G485S/Q487R/S532Y/F684H、G485S/F684M/L688G、S532Y、S532Y/F684H/L688Q、F684HおよびF684M/L688Qから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2510を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、7/12、12、27、29、44、45、47、48、51、55、72、95、100、116、136、139、176、178、198、201、205、205/485、207、208、280、303、317、343、358、361、440、478、611、615、630、675、724、756、および788から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2510を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、7K/12L、12C、12N、12Q、12S、12V、27R、29A、29G、29L、29P、44L、44V、45A、45C、45G、45L、45S、45V、47C、47D、47I、47L、47N、47T、47V、48A、48V、51P、51S、55D、55S、72E、95D、95L、95N、95T、95V、100K、100P、100Q、116A、116F、136A、136F、136K、136N、136P、136Q、139K、176M、176R、176T、176V、178H、198A、198R、201S、205R/485S、205S、207K、208K、280G、303V、317I、343A、343N、358P、358S、361A、361L、361T、440R、478H、478I、478Q、611A、615C、615K、
615L、615M、630M、675C、724G、724K、724S、756Cおよび788Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2510を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Q7K/D12L、D12C、D12N、D12Q、D12S、D12V、Q27R、D29A、D29G、D29L、D29P、R44L、R44V、E45A、E45C、E45G、E45L、E45S、E45V、P47C、P47D、P47I、P47L、P47N、P47T、P47V、P48A、P48V、Y51P、Y51S、I55D、I55S、D72E、Q95D、Q95L、Q95N、Q95T、Q95V、E100K、E100P、E100Q、L116A、L116F、R136A、R136F、R136K、R136N、R136P、R136Q、R139K、L176M、L176R、L176T、L176V、R178H、Q198A、Q198R、Q201S、T205R/G485S、T205S、P207K、R208K、K280G、R303V、E317I、H343A、H343N、E358P、E358S、R361A、R361L、R361T、P440R、R478H、R478I、R478Q、R611A、R615C、R615K、R615L、R615M、L630M、S675C、H724G、H724K、H724S、V756CおよびH788Kから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号2510を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762および7764のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762および7764のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762および7764のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、8/25/55/95/208/358/440/517/788、12/45/47、12/45/47/48/51/136/142/630、12/45/47/51/136/139/630/758、12/45/47/136/139/142/675/758、12/45/51/136/139/630/675/756/758、12/45/51/630/756、12/48/51/136/139/758、12/136/139/142/756/758、12/136/142、12/630/756、25/29/208/440、25/100/154/208/440/517/705/788、25/517、29/208/361/517/788、42/198/199/480/532/539/561、42/198/532/561、42/198/532/561/724、42/199/480/532/561、42/259/480/561、42/259/480/652、42/480/561、42/480/561/724、42/561、47/51/136/756/758、55、55/410/440/603/788、55/517、55/517/788、70、70/642、77/176/487/615/642、95/603、106/199/539/561/652、116、136/139/142、154/361/440/517/603/788、176、198/199/480/561、198/199/480/561/724、198/199/561/724、198/480/561、198/480/724、199/532/539/561/652/724、259/480、267/611/642、280/440/517、380、480/561/652、480/561/652/724/764、480/724、517、532/539/561、532/561/724、603および642から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号7506を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、8R/25E/55D/95T/208K/358S/440V/517P/788K、12N/45A/47I/51P/136P/139K/630M/758R、12N/45A/51P/136P/139K/630M/675C/756C/758Q、12N/48A/51P/136Q/139K/758Q、12N/136Q/142N、12S/45A/51P/630M/756C、12S/630M/756C、12V/45A/47I/48A/51S/136Q/142N/630M、12V/45A/47I/136Q/139K/142N/675C/758Q、12V/45A/47L、12V/136Q/139K/142N/756C/758Q、25E/29P/208K/440R、25E/100K/154A/208K/440R/517P/705M/788K、25E/517P、29P/208K/361T/517P/788K、42T/198R/199A/480V/532Y/539R/561V、42T/198R/532Y/561I/724K、42T/198R/532Y/561V、42T/199A/480V/532Y/561V、42T/259G/480V/561V、42T/259G/480V/652K、42T/480P/561I、42T/480V/561I/724K、42T/561I、47I/51S/136Q/756C/758Q、55D、55D/410S/440R/603E/788K、55D/517P、55D/517P/788K、70N、70N/642V、77L/176M/487K/615M/642V、95T/603E、106W/199A/539R/561I/652R、116F、136P/139K/142N、154A/361T/440R/517P/603E/788K、176T、198R/199A/480P/561I、198R/199A/480P/561V/724K、198R/199A/561V/724G、198R/480P/561I、198R/480V/724K、199A/532Y/539R/561I/652R/724S、259G/480V、267I/611Q/642V、280G/440R/517P、380T、480V/561V/652R、480V/561V/652R/724K/764R、480V/724K、517P、532Y/539R/561V、532Y/561I/724K、603Eおよび642Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7506を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、Q8R/A25E/I55D/Q95T/R208K/E358S/P440V/A517P/H788K、D12N/E45A/P47I/Y51P/R136P/R139K/L630M/G758R、D12N/E45A/Y51P/R136P/R139K/L630M/S675C/V756C/G758Q、D12N/P48A/Y51P/R136Q/R139K/G758Q、D12N/R136Q/S142N、D12S/E45A/Y51P/L630M/V756C、D12S/L630M/V756C、D12V/E45A/P47I/P48A/Y51S/R136Q/S142N/L630M、D12V/E45A/P47I/R136Q/R139K/S142N/S675C/G758Q、D12V/E45A/P47L、D12V/R136Q/R139K/S142N/V756C/G758Q、A25E/D29P/R208K/P440R、A25E/E100K/H154A/R208K/P440R/A517P/P705M/H788K、A25E/A517P、D29P/R208K/R361T/A517P/H788K、D42T/Q198R/T199A/I480V/S532Y/S539R/L561V、D42T/Q198R/S532Y/L561I/H724K、D42T/Q198R/S532Y/L561V、D42T/T199A/I480V/S532Y/L561V、D42T/D259G/I480V/L561V、D42T/D259G/I480V/G652K、D42T/I480P/L561I、D42T/I480V/L561I/H724K、D42T/L561I、P47I/Y51S/R136Q/V756C/G758Q、I55D、I55D/T410S/P440R/G603E/H788K、I55D/A517P、I55D/A517P/H788K、F70N、F70N/A642V、F77L/L176M/Q487K/R615M/A642V、Q95T/G603E、Y106W/T199A/S539R/L561I/G652R、L116F、R136P/R139K/S142N、H154A/R361T/P440R/A517P/G603E/H788K、L176T、Q198R/T199A/I480P/L561I、Q198R/T199A/I480P/L561V/H724K、Q198R/T199A/L561V/H724G、Q198R/I480P/L561I、Q198R/I480V/H724K、T199A/S532Y/S539R/L561I/G652R/H724S、D259G/I480V、V267I/R611Q/A642V、K280G/P440R/A517P、A380T、I480V/L561V/G652R、I480V/L561V/G652R/H724K/L764R、I480V/H724K、A517P、S532Y/S539R/L561V、S532Y/L561I/H724K、G603EおよびA642Vから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号7506を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478および8480のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478および8480のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478および8480のいずれかを含む。
本発明はまた、操作されたスクロースシンターゼであって、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列が、12/45/95/136/139/199/517/630/756、12/45/95/136/756、12/45/136/139/199/517/603、12/45/136/139/208/603/630/756、12/45/136/139/517/603/756、12/45/136/139/517/630/642/756、12/45/136/139/517/756、12/45/136/139/603/756、12/45/136/139/642/756、12/45/136/176/517/603/630/642、12/45/136/208/517/630/756、12/45/136/517/603/642/756/789、12/45/136/517/630/642/756、12/45/136/603/756、12/45/136/630/642、12/45/139/176/208/517/603/630、12/45/139/199/208/603、12/45/139/517/756、12/45/139/756、12/45/176/603/630/642/756、12/45/199/208/517/603/630/756、12/45/208/517/603/642/756、12/95/136/139/517/603/756、12/95/139/517/630/756、12/95/139/517/642、12/95/139/630/642、12/95/199/517/642、12/95/517/630/756、12/95/630/756、12/136、12/136/139/176/517/603/630、12/136/139/176/517/603/756、12/136/139/176/630/756、12/136/139/176/642、12/136/139/176/756、12/136/139/199/208/517/603/756、12/136/139/199/208/517/630/642/756、12/136/139/208/517、12/136/139/517、12/136/139/517/603/630/642/756、12/136/139/517/603/630/756、12/136/139/517/603/756、12/136/139/517/630、12/136/139/517/630/642、12/136/139/517/630/642/756、12/136/139/517/756、12/136/139/603/630、12/136/139/603/630/642、12/136/139/603/630/756、12/136/139/603/642/756、12/136/139/630、12/136/139/630/642/756、12/136/139/630/756、12/136/139/642/756、12/136/176/208/517/603/630/756、12/136/176/517/642、12/136/176/603/756、12/136/199/208/517/603/642/756、12/136/199/208/630/642、12/136/199/517/756、12/136/208、12/136/208/603/642、12/136/517/603/630/642、12/136/517/603/630/756、12/136/517/630、12/136/517/630/642、12/136/517/642、12/136/517/642/756、12/136/517/756、12/136/603/630/642/756、12/136/603/630/756、12/136/603/642、12/136/603/642/756、12/136/603/756、12/136/630、12/136/630/756、12/139/176/517/603/630/756、12/139/176/630/756、12/139/199/208/642、12/139/199/517/630/756、12/139/208/517、12/139/208/642、12/139/517/603/642/756、12/139/517/630/642/756、12/139/517/642、12/139/603/642/756、12/139/603/756、12/139/630/642、12/139/630/642/756、12/139/630/756、12/176/517/603/630、12/176/517/630/642/756、12/176/517/756、12/176/603/630/756、12/176/603/756、12/199/208/517/642、12/199/630/642/756、12/199/642/756、12/199/756、12/208/517/603/623/630/642、12/208/603/630/756、12/208/630/756、12/517/603/630/642/756、12/517/603/630/756、12/517/603/756、12/517/630/642/756、12/517/642/756、12/603/630/756、12/603/642/756、12/603/756、12/630/642/756、12/630/756、25/176/198/532/539、116/142/198/434/440、136/139/176/199/208/517/630/642、136/139/176/517/630/642/756、136/139/199/517/603/756、136/139/208/517/630/756、136/139/208/603/630/756、136/139/517/603/630/642/756、136/139/517/603/642/756、136/139/517/603/756、136/139/517/756、136/139/603、136/139/630/642/756、136/517/756、136/603/756、136/630/642、136/630/756、136/642、136/642/756、136/756、139/199/208/517/630/756、139/199/517/642、139/208/517/630/642/756、139/517/603/756、139/517/630/756、139/642/756、154/532/652/788、199/517/603/630/756、208/517/630/642/756、517/603/630/642/756、517/630/756、603/630/756および603/756から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置が、配列番号8420を参照して番号付けられている、操作されたスクロースシンターゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、12N/45A/95T/136Q/139K/199A/517P/630M/756C、12N/45A/136Q/139K/199A/517P/603E、12N/45A/136Q/139K/517P/603E/756C、12N/45A/136Q/139K/517P/630M/642V/756C、12N/45A/136Q/139K/603E/756C、12N/45A/136Q/139K/642V/756C、12N/45A/136Q/208K/517P/630M/756C、12N/45A/136Q/517P/630M/642V/756C、12N/45A/136Q/603E/756C、12N/45A/136Q/630M/642V、12N/45A/139K/199A/208K/603E、12N/45A/139K/517P/756C、12N/45A/199A/208K/517P/603E/630M/756C、12N/95T/136Q/139K/517P/603Q/756C、12N/95T/139K/517P/642V、12N/95T/139K/630M/642V、12N/95T/199A/517P/642V、12N/95T/517P/630M/756C、12N/136Q、12N/136Q/139K/176T/517P/603Q/756C、12N/136Q/139K/176T/630M/756C、12N/136Q/139K/176T/642V、12N/136Q/139K/199A/208K/517P/630M/642V/756C、12N/136Q/139K/517P、12N/136Q/139K/517P/630M/642V、12N/136Q/139K/517P/630M/642V/756C、12N/136Q/139K/517P/756C、12N/136Q/139K/603E/630M、12N/136Q/139K/603Q/642V/756C、12N/136Q/139K/630M、12N/136Q/139K/642V/756C、12N/136Q/176T/603Q/756C、12N/136Q/199A/208K/517P/603E/642V/756C、12N/136Q/199A/517P/756C、12N/136Q/208K、12N/136Q/517P/630M、12N/136Q/603E/642V、12N/136Q/603E/642V/756C、12N/136Q/603Q/630M/756C、12N/136Q/603Q/642V/756C、12N/136Q/603Q/756C、12N/139K/199A/208K/642V、12N/139K/199A/517P/630M/756C、12N/139K/208K/517P、12N/139K/517P/603Q/642V/756C、12N/139K/603E/642V/756C、12N/139K/603Q/756C、12N/139K/630M/642V、12N/139K/630M/642V/756C、12N/139K/630M/756C、12N/176T/517P/603E/630M、12N/176T/517P/630M/642V/756C、12N/176T/517P/756C、12N/199A/208K/517P/642V、12N/199A/630M/642V/756C、12N/199A/642V/756C、12N/208K/517P/603E/623N/630M/642V、12N/208K/630M/756C、12N/517P/603E/756C、12N/517P/603Q/630M/756C、12N/517P/630M/642V/756C、12N/603E/642V/756C、12N/603Q/630M/756C、12N/603Q/642V/756C、12N/603Q/756C、12N/630M/642V/756C、12S/45A/95T/136Q/756C、12S/45A/136Q/139K/208K/603E/630M/756C、12S/45A/136Q/139K/517P/756C、12S/45A/136Q/176T/517P/603E/630M/642V、12S/45A/136Q/517P/603Q/642V/756C/789V、12S/45A/139K/176T/208K/517P/603E/630M、12S/45A/139K/517P/756C、12S/45A/139K/756C、12S/45A/176T/603Q/630M/642V/756C、12S/45A/208K/517P/603E/642V/756C、12S/95T/139K/517P/630M/756C、12S/95T/630M/756C、12S/136Q/139K/176T/517P/603Q/630M、12S/136Q/139K/176T/756C、12S/
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V756C、D12S/R136Q/R139K/L630M/A642V/V756C、D12S/R136Q/R139K/L630M/V756C、D12S/R136Q/L176T/R208K/A517P/G603E/L630M/V756C、D12S/R136Q/L176T/A517P/A642V、D12S/R136Q/T199A/R208K/L630M/A642V、D12S/R136Q/R208K/G603Q/A642V、D12S/R136Q/A517P/G603Q/L630M/A642V、D12S/R136Q/A517P/G603Q/L630M/V756C、D12S/R136Q/A517P/L630M/A642V、D12S/R136Q/A517P/A642V、D12S/R136Q/A517P/A642V/V756C、D12S/R136Q/A517P/V756C、D12S/R136Q/G603E/V756C、D12S/R136Q/G603Q/L630M/A642V/V756C、D12S/R136Q/L630M、D12S/R136Q/L630M/V756C、D12S/R139K/L176T/A517P/G603Q/L630M/V756C、D12S/R139K/L176T/L630M/V756C、D12S/R139K/R208K/A642V、D12S/R139K/A517P/L630M/A642V/V756C、D12S/R139K/A517P/A642V、D12S/R139K/G603Q/V756C、D12S/L176T/G603E/V756C、D12S/L176T/G603Q/L630M/V756C、D12S/T199A/V756C、D12S/R208K/G603Q/L630M/V756C、D12S/A517P/G603Q/L630M/A642V/V756C、D12S/A517P/L630M/A642V/V756C、D12S/A517P/A642V/V756C、D12S/G603Q/L630M/V756C、D12S/L630M/V756C、A25E/L176M/Q198R/S532Y/S539R、L116F/S142N/Q198R/Y434H/P440R、R136Q/R139K/L176T/T199A/R208K/A517P/L630M/A642V、R136Q/R139K/L176T/A517P/L630M/A642V/V756C、R136Q/R139K/T199A/A517P/G603E/V756C、R136Q/R139K/R208K/A517P/L630M/V756C、R136Q/R139K/R208K/G603Q/L630M/V756C、R136Q/R139K/A517P/G603E/A642V/V756C、R136Q/R139K/A517P/G603Q/L630M/A642V/V756C、R136Q/R139K/A517P/G603Q/V756C、R136Q/R139K/A517P/V756C、R136Q/R139K/G603Q、R136Q/R139K/L630M/A642V/V756C、R136Q/A517P/V756C、R136Q/G603Q/V756C、R136Q/L630M/A642V、R136Q/L630M/V756C、R136Q/A642V、R136Q/A642V/V756C、R136Q/V756C、R139K/T199A/R208K/A517P/L630M/V756C、R139K/T199A/A517P/A642V、R139K/R208K/A517P/L630M/A642V/V756C、R139K/A517P/G603Q/V756C、R139K/A517P/L630M/V756C、R139K/A642V/V756C、H154A/S532Y/G652R/H788K、T199A/A517P/G603Q/L630M/V756C、R208K/A517P/L630M/A642V/V756C、A517P/G603E/L630M/A642V/V756C、A517P/L630M/V756C、G603E/L630M/V756CおよびG603Q/V756Cから選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、位置は、配列番号8420を参照して番号付けられている。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104および9106のいずれかに対して少なくとも90%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104および9106のいずれかに対して少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、操作されたスクロースシンターゼのポリペプチド配列は、配列番号8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104および9106のいずれかを含む。
本発明はまた、NDP−グリコシルトランスフェラーゼである操作されたグリコシルトランスフェラーゼであって、操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼが、ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(AGT)、CDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(CGT)、GDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(GGT)、TDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(TGT)、およびIDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(IGT)から選択されるNDP−グリコシルトランスフェラーゼである、操作されたグリコシルトランスフェラーゼも提供する。一部の実施形態では、操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼである。一部の実施形態では、操作されたNDP−グリコトランスフェラーゼは、UDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼではない。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドをコードする操作されたポリヌクレオチドも提供する。一部の実施形態では、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼをコードする操作されたポリヌクレオチドは、配列番号5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1289、1291、1293、2595、2597、2599、2601、2603、2605、2607、2609、2611、2613、2615、2617、2619、2621、2623、2625、2627、2629、2631、2633、2635、2637、2639、2641、2643、2645、2647、2649、2651、2653、2655、2657、2659、2661、2663、2665、2667、2669、2671、2673、2675、2677、2679、2681、2683、2685、2687、2689、2691、2693、2695、2697、2699、2701、2703、2705、2707、2709、2711、2713、2715、2717、2719、2721、2723、2725、2727、2729、2731、2733、2735、2737、2739、2741、2743、2745、2747、2749、2751、2753、2755、2757、2759、2761、2763、2765、2767、2769、2771、2773、2775、2777、2779、2781、2783、2785、2787、2789、2791、2793、2795、2797、2799、2801、2803、2805、2807、2809、2811、2813、2815、2817、2819、2821、2823、2825、2827、2829、2831、2833、2835、2837、2839、2841、2843、2845、2847、2849、2851、2823、2855、2857、2859、2861、2863、2865、2867、2869、2871、2873、2875、2877、2879、2881、2883、2885、2887、2889、2891、2893、2895、2897、2899、2901、2903、2905、2907、2909、2911、2913、2915、2917、2919、2921、2923、2925、2927、2829、2931、2933、2935、2937、2939、2941、2943、2945、2947、2949、2951、2953、2955、2957、2959、2961、2963、2965、2967、2969、2971、2973、2975、2977、2979、2981、2983、2985、2987、2989、2991、2993、2995、2997、2999、3001、3003、3005、3007、3009、3011、3013、3015、3017、3019、3021、3023、3025、3027、3029、3031、3033、3035、3037、3039、3041、3043、3045、3047、3049、3051、3053、3055、3057、3059、3061、3063、3065、3067、3069、3071、3073、3075、3077、3079、3081、3083、3085、3087、3089、3091、3093、3095、3097、3099、3101、3103、3105、3107、3109、3111、3113、3115、3117、3119、3121、3123、3125、3127、3129、3131、3133、3135、3137、3139、3141、3143、3145、3147、3149、3151、3153、3155、3157、3159、3161、3163、3165、3167、3169、3171、3173、3175、3177、3179、3181、3183、3185、3187、3189、3191、3193、3195、3197、3199、3201、3203、3205、3207、3209、3211、3213、3215、3217、3219、3221、3223、3225、3227、3229、3231、3233、3235、3237、3239、3241、3243、3245、3247、3249、3251、3253、3255、3257、3259、3261、3263、3265、3267、3269、3271、3273、3275、3277、3279、3281、3283、3285、3287、3289、3291、3293、3295、3297、3299、3301、3303、3305、3307、3309、3311、3313、3315、3317、3319、3321、3323、3325、3327、3329、3331、3333、3335、3337、3339、3341、3343、3345、3347、3349、3351、3353、3355、3357、3359、3361、3363、3365、3367、3369、3371、3373、3375、3377、3379、3381、3383、3385、3387、3389、3391、3393、3395、3397、3399、3401、3403、3405、3407、3409、3411、3413、3415、3417、3419、3421、3423、3425、3427、3429、3431、3433、3435、3437、3439、3441、3443、3445、3447、3449、3451、3453、3455、3457、3459、3461、3463、3465、3467、3469、3471、3473、3475、3477、3479、3481、3483、3485、3487、3489、3491、3493、3495、3497、3499、3501、3503、3505、3507、3509、3511、3513、3515、3517、3519、3521、3523、3525、3527、3529、3531、3533、3535、3537、3539、3541、3543、3545、3547、3549、3551、3553、3555、3557、3559、3561、3563、3565、3567、3569、3571、3573、3575、3577、3579、3581、3583、3585、3587、3589、3591、3593、3595、3597、3599、3601、3603、3605、3607、3609、3611、3613、3615、3617、3619、3621、3623、3625、3627、3629、3631、3633、3635、3637、3639、3641、3643、3645、3647、3649、3651、3653、3655、3657、3659、3661、3663、3665、3667、3669、3671、3673、3675、3677、3679、3681、3683、3685、3687、3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本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼポリペプチドをコードする操作されたポリヌクレオチドも提供する。一部の実施形態では、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼをコードする操作されたポリヌクレオチドは、配列番号1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、2205、2207、2209、2211、2213、2215、2217、2219、2221、2223、2225、2227、2229、2231、2233、2235、2237、2239、2241、2243、2245、2247、2249、2251、2253、2255、2257、2259、2261、2263、2265、2267、2269、2271、2273、2275、2277、2279、2281、2283、2285、2287、2289、2291、2293、2295、2297、2299、2301、2303、2305、2307、2309、2311、2313、2315、2317、2319、2321、2323、2325、2327、2329、2331、2333、2335、2337、2339、2341、2343、2345、2347、2349、2351、2353、2355、2357、2359、2361、2363、2365、2367、2369、2371、2373、2375、2377、2379、2381、2383、2385、2387、2389、2391、2393、2395、2397、2399、2401、2403、2405、2407、2409、2411、2413、2415、2417、2419、2421、2423、2425、2427、2429、2431、2433、2435、2437、2439、2441、2443、2445、2447、2449、2451、2453、2455、2457、2459、2461、2463、2465、2467、2469、2471、2473、2475、2477、2479、2481、2483、2485、2487、2489、2491、2493、2495、2497、2499、2501、2503、2505、2507、2509、2511、2513、2515、2517、2519、2521、2523、2525、2527、2529、2531、2533、2535、2537、2539、2541、2543、2545、2547、2549、2551、2553、2555、2557、2559、2561、2563、2565、2567、2569、2571、2573、2575、2577、2579、2581、2583、2585、2587、2589、2591、2593、7437、7439、7441、7443、7445、7447、7449、7451、7453、7455、7457、7459、7461、7463、7465、7467、7469、7471、7473、7475、7477、7479、7481、7483、7485、7487、7489、7491、7493、7495、7497、7499、7501、7503、7505、7507、7509、7511、7513、7515、7517、7519、7521、7523、7525、7527、7529、7531、7533、7535、7537、7539、7541、7543、7545、7547、7549、7551、7553、7555、7557、7559、7561、7563、7565、7567、7569、7571、7573、7575、7577、7579、7581、7583、7585、7587、7589、7591、7593、7595、7597、7599、7601、7603、7605、7607、7609、7611、7613、7615、7617、7619、7621、7623、7625、7627、7629、7631、7633、7635、7637、7639、7641、7643、7645、7647、7649、7651、7653、7655、7657、7659、7661、7663、7665、7667、7669、7671、7673、7675、7677、7679、7681、7683、7685、7687、7689、7691、7693、7695、7697、7699、7701、7703、7705、7707、7709、7711、7713、7715、7717、7719、7721、7723、7725、7727、7729、7731、7733、7735、7737、7739、7741、7743、7745、7747、7749、7751、7753、7755、7757、7759、7761、7763、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8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8839、8841、8843、8845、8847、8849、8851、8853、8855、8857、8859、8861、8863、8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、および/または9105に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を含む。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。一部の実施形態では、ベクターは、少なくとも1つの制御配列をさらに含む。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたポリペプチドを含む宿主細胞も提供する。一部の実施形態では、宿主細胞は、本明細書に提供される少なくとも1つのベクターを含む。一部の実施形態では、宿主細胞は、真核生物および原核生物から選択される。一部の追加の実施形態では、宿主細胞は、E.coliである。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体を産生する方法であって、本明細書に提供される宿主細胞を、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体が宿主細胞によって産生される条件下で培養するステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、方法は、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体を回収するステップをさらに含む。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体および/またはスクロースシンターゼ改変体を含む組成物も提供する。一部の実施形態では、組成物は、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体を含む。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼ改変体を産生する方法であって、本明細書に提供される宿主細胞を、操作されたスクロースシンターゼ改変体が宿主細胞によって産生される条件下で培養するステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、方法は、操作されたスクロースシンターゼ改変体を回収するステップをさらに含む。一部の実施形態では、組成物は、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼ改変体を含む。
本発明はまた、基質をグリコシル化する方法であって、少なくとも1つの基質、本明細書に提供される偶数番号の配列から選択される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ;基質にグリコシルトランスフェラーゼを、基質がグリコシル化されて少なくとも1つのグリコシル化産物を産生する条件下で接触させるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、基質は少なくとも1つのステビオール配糖体を含む。一部の実施形態では、グリコシル化産物は、少なくとも1つのモノグリコシル化および/またはポリグリコシル化産物を含む。本発明は、産物のグリコシル化の程度(例えば、ジグリコシル化、トリグリコシル化、および本発明において使用されるより高度のグリコシル化レベルを有する産物)に関していかなる制限にも限定されないことが意図される。
本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、ならびに本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドDおよびレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、ならびにグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の追加の実施形態では、本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部のさらなる実施形態では、本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドI基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドI基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、NDP−グルコースは、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースから選択される。一部の追加の実施形態では、NDP−グルコースは、UDP−グルコースではない。
本発明は、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の実施形態では、本発明は、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の追加の実施形態では、本発明は、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、NDP−グルコースは、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースから選択される。一部の追加の実施形態では、NDP−グルコースは、UDP−グルコースではない。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、NDP−グルコースは、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースから選択される。一部の追加の実施形態では、NDP−グルコースは、UDP−グルコースではない。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の追加の実施形態では、本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドI基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドI基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。
本発明はまた、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の実施形態では、本発明は、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。一部の追加の実施形態では、本発明は、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。一部の追加の実施形態では、NDPは、ADP、CDP、TDP、GDP、および/またはIDTから選択される。一部の追加の実施形態では、NDPはUDPではない。
本発明はまた、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、本発明は、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の追加の実施形態では、本発明は、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。一部の追加の実施形態では、NDPは、ADP、CDP、TDP、GDP、および/またはIDTから選択される。一部の追加の実施形態では、NDPは、UDPではない。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。一部の追加の実施形態では、NDPは、ADP、CDP、TDP、GDP、および/またはIDTから選択される。一部の追加の実施形態では、NDPは、UDPではない。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、少なくとも1つのステビオシドおよび/またはステビオシドとrebAの混合物を含むステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびに本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。一部の追加の実施形態では、NDPは、ADP、CDP、TDP、GDP、および/またはIDTから選択される。一部の追加の実施形態では、NDPは、UDPではない。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、少なくとも1つのスクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが最初に産生され、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドIが次に産生され、レバウジオシドMが最終的に産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。本実施形態の一部では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、ADP−グリコシルトランスフェラーゼを含む。一部の追加の実施形態では、NDPは、ADP、CDP、TDP、GDP、および/またはIDTから選択される。一部の追加の実施形態では、NDPは、UDPではない。
レバウジオシドを産生するための本発明の方法の一部の実施形態では、方法は、ワンポット反応として実施される。一部の追加の実施形態では、方法は逐次的に実施される。一部の追加の実施形態では、方法は、方法のステップを繰り返すステップをさらに含む。一部のさらなる実施形態では、スクロースは繰り返されるステップの間に再利用される。一部の追加の実施形態では、少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび/または他の反応構成要素は再利用される。一部の追加の実施形態では、ステビオシド基質は、Stevia rebaudianaから抽出されるが、一部の代替の実施形態では、ステビオシド基質は合成によって産生され、さらに一部のさらなる実施形態では、ステビオシド基質は、天然でおよび/または合成のいずれかによって産生されたステビオシドの混合物である。方法の一部のさらなる実施形態では、少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼは固定される。本発明の一部の追加の実施形態では、スクロースシンターゼは固定される。さらに一部の追加の実施形態では、少なくとも1つのグリコシルトランスフェラーゼおよび/またはスクロースシンターゼは固定される。方法の一部のさらなる実施形態では、フルクトースを含む反応産物が産生される。一部の実施形態では、フルクトースは、反応産物から除去される。なお一部の追加の実施形態では、方法は、洗浄ステップをさらに含む。一部の実施形態では、洗浄ステップは、方法によって産生されたレバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、および/またはレバウジオシドDを溶媒に曝露するステップを含む。一部の実施形態では、溶媒は水である。さらにさらなる実施形態では、方法は、少なくとも1つのカラムクロマトグラフィーステップをさらに含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのカラムクロマトグラフィーステップを、方法によって産生されたレバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、および/またはレバウジオシドDについて実施する。方法の一部の追加の実施形態では、少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、本明細書に提供されるベータ−1,2グリコシルトランスフェラーゼである。方法の一部のさらなる実施形態では、少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、本明細書に提供されるベータ−1,3グリコシルトランスフェラーゼである。方法のなお一部の追加の実施形態では、少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、本明細書に提供されるベータ−1,2グリコシルトランスフェラーゼであり、少なくとも1つの追加の操作されたグリコシルトランスフェラーゼは、本明細書に提供されるベータ−1,3グリコシルトランスフェラーゼである。方法の一部のさらなる実施形態では、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼを使用する。
本明細書に提供される方法では、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、22、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1290、1292、1294、2596、2598、2600、2602、2604、2606、2608、2610、2612、2614、2616、2618、2620、2622、2624、2626、2628、2630、2632、2634、2636、2638、2640、2642、2644、2646、2648、2650、2652、2654、2656、2658、2660、2662、2664、2666、2668、2670、2672、2674、2676、2678、2680、2682、2684、2686、2688、2690、2692、2694、2696、2698、2700、2702、2704、2706、2708、2710、2712、2714、2716、2718、2720、2722、2724、2726、2728、2730、2732、2734、2736、2738、2740、2742、2744、2746、2748、2750、2752、2754、2756、2758、2760、2762、2764、2766、2768、2770、2772、2774、2776、2778、2780、2782、2784、2786、2788、2790、2792、2794、2796、2798、2800、2802、2804、2806、2808、2810、2812、2814、2816、2818、2820、2822、2824、2826、2828、2830、2832、2834、2836、2838、2840、2842、2844、2846、2848、2850、2852、2854、2856、2858、2860、2862、2864、2866、2868、2870、2872、2874、2876、2878、2880、2882、2884、2886、2888、2890、2892、2894、2896、2898、2900、2902、2904、2906、2908、2910、2912、2914、2916、2918、2920、2922、2924、2926、2928、2830、2932、2934、2936、2938、2940、2942、2944、2946、2948、2950、2952、2954、2956、2958、2960、2962、2964、2966、2968、2970、2972、2974、2976、2978、2980、2982、2984、2986、2988、2990、2992、2994、2996、2998、3000、3002、3004、3006、3008、3010、3012、3014、3016、3018、3020、3022、3024、3026、3028、3030、3032、3034、3036、3038、3040、3042、3044、3046、3048、3050、3052、3054、3056、3058、3060、3062、3064、3066、3068、3070、3072、3074、3076、3078、3080、3082、3084、3086、3088、3090、3092、3094、3096、3098、3100、3102、3104、3106、3108、3110、3112、3114、3116、3118、3120、3122、3124、3126、3128、3130、3132、3134、3136、3138、3140、3142、3144、3146、3148、3150、3152、3154、3156、3158、3160、3162、3164、3166、3168、3170、3172、3174、3176、3178、3180、3182、3184、3186、3188、3190、3192、3194、3196、3198、3200、3202、3204、3206、3208、3210、3212、3214、3216、3218、3220、3222、3224、3226、3228、3230、3232、3234、3236、3238、3240、3242、3244、3246、3248、3250、3252、3254、3256、3258、3260、3262、3264、3266、3268、3270、3272、3274、3276、3278、3280、3282、3284、3286、3288、3290、3292、3294、3296、3298、3300、3302、3304、3306、3308、3310、3312、3314、3316、3318、3320、3322、3324、3326、3328、3330、3332、3334、3336、3338、3340、3342、3344、3346、3348、3350、3352、3354、3356、3358、3360、3362、3364、3366、3368、3370、3372、3374、3376、3378、3380、3382、3384、3386、3388、3390、3392、3394、3396、3398、3400、3402、3404、3406、3408、3410、3412、3414、3416、3418、3420、3422、3424、3426、3428、3430、3432、3434、3436、3438、3440、3442、3444、3446、3448、3450、3452、3454、3456、3458、3460、3462、3464、3466、3468、3470、3472、3474、3476、3478、3480、3482、3484、3486、3488、3490、3492、3494、3496、3498、3500、3502、3504、3506、3508、3510、3512、3514、3516、3518、3520、3522、3524、3526、3528、3530、3532、3534、3536、3538、3540、3542、3544、3546、3548、3550、3552、3554、3556、3558、3560、3562、3564、3566、3568、3570、3572、3574、3576、3578、3580、3582、3584、3586、3588、3590、3592、3594、3596、3598、3600、3602、3604、3606、3608、3610、3612、3614、3616、3618、3620、3622、3624、3626、3628、3630、3632、3634、3636、3638、3640、3642、3644、3646、3648、3650、3652、3654、3656、3658、3660、3662、3664、3666、3668、3670、3672、3674、3676、3678、3680、3682、3684、3686、3688、3690、3692、3694、3696、3698、3700、3702、3704、3706、3708、3710、3712、3714、3716、3718、3720、3722、3724、3726、3728、3730、3732、3734、3736、3738、3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本明細書に提供される方法では、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316、2318、2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500、2502、2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592、2594、7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762、7764、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、
8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104、および/または9106に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを使用する。
本発明はまた、本明細書に提供する方法に従って産生されたレバウジオシドおよびレバウジオシドを含む組成物も提供する。一部の実施形態では、レバウジオシドは、レバウジオシドMであり、一部の代替の実施形態では、レバウジオシドは、レバウジオシドAであり、さらにさらなる実施形態では、レバウジオシドは、レバウジオシドIであり、一部の追加の実施形態では、レバウジオシドは、レバウジオシドDである。一部のさらなる実施形態では、本発明は、レバウジオシドの濃度の任意の組合せのレバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、および/またはレバウジオシドDの混合物、ならびに目的の他の構成要素を含む、本明細書に提供される方法に従って産生されたレバウジオシドの混合物を提供する。一部の実施形態では、本発明は、レバウジオシドの濃度の任意の組合せでのレバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、および/またはレバウジオシドDの混合物、ならびに目的の他の構成要素を含む組成物を提供する。実際に、本発明が、本発明の方法に従って産生されたレバウジオシドの任意の特定の組合せまたは混合物に限定されることは意図されない。
本発明は、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドDおよびレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドI基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドI基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびNDP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法を提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドI基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドI基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、および/または118、ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドI基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、レバウジオシドIおよび/またはレバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドAを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドIを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドDを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、少なくとも1つのステビオシドおよび/またはステビオシドとrebAの混合物を含むステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびに本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。一部の実施形態では、スクロース以外の糖を、適切なシンターゼと組み合わせて使用する。
本発明はまた、レバウジオシドMを産生する方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、少なくとも1つのスクロースシンターゼ、および本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、ステビオシド基質、NDP、およびADP−グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが最初に産生され、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドIが次に産生され、レバウジオシドMが最終的に産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、方法は、スクロースおよびスクロースシンターゼをさらに含む。一部の実施形態では、スクロースシンターゼは、本明細書に提供される操作されたスクロースシンターゼである。
一部の実施形態では、本発明によって提供される方法は、ワンポット反応として実施され、一部の代替の実施形態では、方法は、複数の反応容器で実施される。一部の実施形態では、方法は、単一および/または複数の反応容器で逐次的に実施される。一部の実施形態では、方法のステップは繰り返される(すなわち、方法のステップの一部または全てを複数回繰り返す)。一部の実施形態では、スクロースは、繰り返されるステップの間に再利用される。一部の追加の実施形態では、操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび/または他の反応構成要素(例えば、補助因子)は、再利用される。方法の一部の実施形態では、ステビオシド基質は、Stevia rebaudianaから抽出されるが、一部の代替の方法では、ステビオシド基質は合成によって産生される。一部のさらなる実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼは固定される。一部の追加の実施形態では、スクロースシンターゼは固定される。一部のさらなる実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼおよび/またはスクロースシンターゼは、固定される。方法の一部の実施形態では、フルクトースが産生される。一部の追加の実施形態では、フルクトースは、反応産物から除去される。
本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼ改変体を含む組成物も提供する。本発明はまた、本明細書に提供される少なくとも1つの天然に存在しないグリコシルトランスフェラーゼ改変体を含む組成物も提供する。
本発明はまた、基質をグリコシル化してベータ−グリコシル化産物を産生する方法であって、少なくとも1つのグリコシル基供与体、少なくとも1つのグリコシル基受容体、および少なくとも1つのグリコシルトランスフェラーゼ酵素を提供するステップ;グリコシル基供与体およびグリコシル基受容体を、グリコシル基受容体がグリコシル化されて、ベータ−グルコース結合を有する少なくとも1つの産物を産生する条件下で、グリコシルトランスフェラーゼ酵素と接触させるステップを含む、方法も提供する。方法の一部の実施形態では、グリコシル基供与体は、ヌクレオチド二リン酸糖、例えばアデニンジホスホグルコース(ADP−グルコース)である。方法の一部のさらなる実施形態では、グリコシル基受容体は、グリコシル、アルコキシ、カルボキシ、アミノカルボニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボキシアルキル、アミノアルキル、ハロアルキル、アルキルチオアルキル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロアリール、およびヘテロアリールアルキル基から選択される。方法の一部のなお追加の実施形態では、ベータ−グルコース結合を有する産物はステビオール配糖体である。方法の一部のさらなる実施形態では、グリコシル基受容体は、レバウジオシドDであり、グリコシル基供与体は、ADP−グルコースであり、ベータ−グルコース結合を有する産物はレバウジオシドMである。方法の一部のさらなる実施形態では、グリコシル基受容体はステビオシドであり、グリコシル基供与体はADP−グルコースであり、ベータ−グルコース結合を有する産物は、レバウジオシドAまたはレバウジオシドIである。
本発明はまた、ヌクレオシドジホスホグルコースを産生する方法であって、ヌクレオシド二リン酸依存性シンターゼ、ヌクレオシド二リン酸、およびシンターゼの二糖、三糖、またはオリゴ糖基質を提供するステップ;シンターゼ、ヌクレオシド二リン酸、および糖を、糖が切断されてより低分子量の糖およびヌクレオシドジホスホグルコースを産生する条件下で接触させるステップを含む、方法も提供する。方法の一部の実施形態では、本方法を、既に記載された方法と組み合わせる。方法の一部の追加の実施形態では、ヌクレオシド二リン酸はADPであり、ヌクレオシドジホスホグルコースはADP−グルコースであり、シンターゼ基質はスクロースである。
図1は、グリコシルトランスフェラーゼにより、ヌクレオシドジホスホグルコース(NDP−グルコース)、例えばADP−グルコースから、受容体、例えばR−OH(式中、Rは、任意のグリコシル、アルコキシ、カルボキシ、アミノカルボニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボキシアルキル、アミノアルキル、ハロアルキル、アルキルチオアルキル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロアリール、またはヘテロアリールアルキル基である)へのグルコシル基の転移が触媒される酵素反応スキームを提供する。さらなる実施形態では、R−OHはステビオシドまたはレバウジオシドDであり、生成物は、レバウジオシドA、レバウジオシドI、またはレバウジオシドMである。ヌクレオシド二リン酸依存性シンターゼにより、グルコース供与体(例えば、スクロース)からヌクレオシド二リン酸へのグルコシル基の転移が触媒され、それにより、NDP−グルコースが再生され、副生成物(例えば、フルクトース)が放出される。
図2は、炭素が番号付けられたレバウジオシドMの構造を提供する。
図3は、炭素が番号付けられたレバウジオシドIの構造を提供する。
本発明は、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ(GT)酵素、GT活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明は、操作されたスクロースシンターゼ(SuS)酵素、SuS活性を有するポリペプチド、およびこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含むベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明はまた、GT酵素を含む組成物および操作されたGT酵素を使用して、β−グルコース結合を有する産物を作製する方法も提供する。本発明はさらに、レバウジオシド(例えば、レバウジオシドM、レバウジオシドA、レバウジオシドI、およびレバウジオシドD)を産生するための組成物および方法を提供する。本発明はまた、SuS酵素を含む組成物、およびそれらを使用する方法も提供する。GTおよびSuS酵素を産生する方法も提供される。
別様に定義されない限り、本明細書において使用する全ての科学技術用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。一般的に、本明細書において使用される命名法、ならびに以下に記載される細胞培養、分子遺伝学、微生物学、有機化学、分析化学、および核酸化学の実験手順は、当技術分野で周知であり、一般的に使用されるものである。そのような技術は周知であり、当業者に周知の多数のテキストおよび参考文献に記載されている。標準的な技術またはその変化形態を、化学合成および化学分析のために使用する。本明細書において上記および下記の両方で言及した全ての特許、特許出願、論文および刊行物は、それにより明白に参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に記載の方法および材料と類似または同等の任意の適した方法および材料を、本発明の実践において使用するが、いくつかの方法および材料を本明細書に記載する。本発明は、記載される特定の方法論、プロトコール、および試薬が、それらが当業者によって使用される状況に応じて異なり得ることから、これらに限定されないことを理解すべきである。したがって、直下に定義される用語は、全体として本発明を参照することによってより完全に説明される。
前述の一般的な説明および以下の詳細な説明はいずれも例示および説明に過ぎず、本発明の制限ではないことを理解すべきである。本明細書に使用したセクションの見出しは、構成的目的に限られ、記載の主題を限定すると解釈すべきではない。数値範囲は、範囲を定義する数字を含む。このように、本明細書に開示されるあらゆる数値範囲は、そのようなより狭い数値範囲が全て本明細書に明白に記載されているかのように、そのようなより広い数値範囲内に入るあらゆるより狭い数値範囲を包含することを意図される。本明細書に開示されるあらゆる最大の(または最小の)数値限定は、そのようなより小さい(またはより大きい)数値限定が本明細書において明白に記載されているかのように、あらゆるより小さい(またはより大きい)数値限定を含むことも意図される。
略語
遺伝子コードされるアミノ酸に関して使用する略語は従来のものであり、以下の通りである。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
三文字表記を使用する場合、特に「L」もしくは「D」が最初に記載されている場合または略語が使用されている文脈から明白である場合を除き、アミノ酸は、α−炭素(Cα)に関してLまたはD−立体配置のいずれであってもよい。例えば、「Ala」は、α−炭素に関する立体配置を特定していないアラニンを示すが、「D−Ala」および「L−Ala」はそれぞれ、D−アラニンおよびL−アラニンを示す。一文字表記を使用する場合、大文字はα−炭素に関してL−立体配置のアミノ酸を示し、小文字は、α−炭素に関してD−立体配置のアミノ酸を示す。例えば、「A」は、L−アラニンを示し、「a」はD−アラニンを示す。ポリペプチド配列を、一続きの一文字または三文字表記(またはその混合物)として表す場合、配列は一般的な慣例に従ってアミノ(N)からカルボキシ(C)方向に表す。
遺伝子コードヌクレオシドに関して使用する略語は慣例的であり、以下の通りである:アデノシン(A);グアノシン(G);シチジン(C);チミジン(T);およびウリジン(U)。特に特定していない限り、略語のヌクレオシドは、リボヌクレオシドまたは2’−デオキシリボヌクレオシドのいずれかであり得る。ヌクレオシドは、個別にまたはまとめて、リボヌクレオシドまたは2’−デオキシリボヌクレオシドのいずれかとして特定され得る。核酸配列を一続きの一文字表記として表す場合、配列は一般的な慣例に従って5’から3’方向に表され、ホスフェートは表記しない。
定義
本発明を参照して、本明細書の説明に使用する科学技術用語は、別のものを具体的に定義していない限り、当業者によって一般的に理解される意味を有する。したがって、以下の用語は以下の意味を有することが意図される。
本明細書で使用される場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、および「その」は、文脈が明らかにそれ以外であることを示していない限り、複数の指示対象を含む。このように、例えば、「1つのポリペプチド」への言及は、1つより多くのポリペプチドを含む。
同様に「含む(comprise)」、「含む(comprises)」、「含む(comprising)」、「含む(include)」、「含む(includes)」、および「含む(including)」は、互換的であり、限定的であることを意図しない。このように、本明細書で使用される場合、用語「含む(comprising)」およびその同語源語は、その包括的意味で使用される(すなわち、用語「含む(including)」およびその対応する同語源語と同等である)。
様々な実施形態の説明が用語「含む(comprising)」を使用する場合、当業者は、一部の特定の例において、用語「本質的にからなる」または「からなる」を使用して、実施形態を代替的に説明することができることを理解することをさらに理解すべきである。
本明細書で使用される場合、用語「約」は、特定の値に関して許容される誤差を意味する。一部の例では、「約」は、所与の値の範囲の0.05%、0.5%、1.0%、または2.0%以内を意味する。一部の例では、「約」は、所与の値の1、2、3、または4標準偏差以内を意味する。
本明細書で使用される場合、「EC」番号は、国際生化学・分子生物学連合の命名委員会の酵素命名法(NC−IUBMB)を指す。IUBMB生化学分類は、それらが触媒する化学反応に基づく酵素の数値分類系である。
本明細書で使用される場合、「ATCC」は、そのバイオレポジトリコレクションが遺伝子および株を含むAmerican Type Culture Collectionを指す。
本明細書で使用される場合、「NCBI」は、国立生物工学情報センターおよびそこで提供される配列データベースを指す。
「タンパク質」、「ポリペプチド」、および「ペプチド」は、本明細書において互換的に使用され、長さまたは翻訳後修飾(例えば、グリコシル化またはリン酸化)にかかわらず、アミド結合によって共有結合された少なくとも2つのアミノ酸のポリマーを指す。この定義には、D−およびL−アミノ酸、ならびにD−およびL−アミノ酸の混合物、ならびにD−およびL−アミノ酸ならびにD−およびL−アミノ酸の混合物を含むポリマーが含まれる。
「アミノ酸」は、本明細書において、その一般的に公知の三文字表記またはIUPAC−IUB生化学命名法委員会によって推奨される一文字表記によって言及される。同様に、ヌクレオチドは、その一般的に許容される一文字表記によって言及され得る。
本明細書で使用される場合、「ポリヌクレオチド」および「核酸」は、共に共有結合される2つまたはそれより多くのヌクレオチドを指す。ポリヌクレオチドは、全体がリボヌクレオチド(すなわち、RNA)で構成されてもよく、全体が2’デオキシリボヌクレオチド(すなわち、DNA)で構成されてもよく、またはリボヌクレオチドおよび2’デオキシリボヌクレオシドの混合物で構成されてもよい。ヌクレオシドは、典型的には標準的なホスホジエステル結合を介して共に連結されるが、ポリヌクレオチドは、1つまたは複数の非標準的な結合を含んでもよい。ポリヌクレオチドは、一本鎖もしくは二本鎖であり得るか、または一本鎖領域と二本鎖領域の両方を含み得る。その上、ポリヌクレオチドは典型的には天然に存在するコード核酸塩基(すなわち、アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、およびシトシン)で構成されるが、これは1つまたは複数の改変および/または合成核酸塩基、例えば、イノシン、キサンチン、ヒポキサンチン等を含んでもよい。一部の実施形態では、そのような改変または合成核酸塩基は、アミノ酸配列をコードする核酸塩基である。
本明細書で使用される場合、「ヌクレオシド」は、核酸塩基(すなわち、窒素塩基)および5炭糖(例えば、リボースまたはデオキシリボース)を含むグリコシルアミンを指す。ヌクレオシドの非制限的な例には、シチジン、ウリジン、アデノシン、グアノシン、チミジン、およびイノシンが挙げられる。これに対し、用語「ヌクレオチド」は、核酸塩基、5炭糖、および1つまたは複数のリン酸基を含むグリコシルアミンを指す。一部の実施形態では、ヌクレオシドは、キナーゼによってリン酸化されて、ヌクレオチドを産生することができる。
本明細書で使用される場合、「ヌクレオシド二リン酸」は、核酸塩基(すなわち、窒素塩基)、5炭糖(例えば、リボースまたはデオキシリボース)、および二リン酸(すなわち、ピロリン酸)部分を含むグリコシルアミンを指す。本明細書における一部の実施形態では、「ヌクレオシド二リン酸」は、「NDP」と略される。ヌクレオシド二リン酸の非制限的な例には、シチジン二リン酸(CDP)、ウリジン二リン酸(UDP)、アデノシン二リン酸(ADP)、グアノシン二リン酸(GDP)、チミジン二リン酸(TDP)、およびイノシン二リン酸が挙げられる。用語「ヌクレオシド」および「ヌクレオチド」は、一部の文脈において互換的に使用され得る。
本明細書で使用される場合、「コード配列」は、タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸(例えば、遺伝子)のその部分を指す。
本明細書で使用される場合、用語「生体触媒作用」、「生体触媒の」、「生体内変換」および「生合成」は、酵素を使用して有機化合物に化学反応を行うことを指す。
本明細書で使用される場合、「グリコシルトランスフェラーゼ」(GT)は、活性化された糖供与体からグリコシル残基を単量体および多量体受容体分子に転移させる酵素的能力を有するポリペプチドを指す。一部の実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼは、「グリコシルトランスフェラーゼ改変体」または「グリコシルトランスフェラーゼコンビナトリアル改変体」と呼ばれる。一部の実施形態では、「グリコシルトランスフェラーゼ」は、分類EC2.4.1.17のUDP−グルクロノシルトランスフェラーゼ酵素を指し、これはUDP−α−D−グルクロネート(UDP−グルコースとしても知られる)から受容体へのグルコースの転移を触媒し、UDPを放出し、受容体β−D−グルクロノシドを形成する。炭水化物活性酵素データベース(CAZy)は、グリコシルトランスフェラーゼファミリーの絶えず更新されるリストを提供する。一部の実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼは、GT1ファミリーに分類される酵素を含むがこれらに限定されない。一部の好ましい実施形態では、本発明のグリコシルトランスフェラーゼ改変体は、ADP−グルコースを優先的に利用する。一部の追加の実施形態では、本発明のグリコシルトランスフェラーゼ酵素は、UDP−グルコースを利用しない。一部のさらなる実施形態では、本発明のグリコシルトランスフェラーゼ改変体は、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースを利用するが、UDP−グルコースを利用しない。このように、一部の好ましい実施形態では、本発明は、ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(ADP−グリコシルトランスフェラーゼ;AGT)、CDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(CDP−グリコシルトランスフェラーゼ;CGT)、GDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(GDP−グリコシルトランスフェラーゼ;GGT)、TDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(TDP−グリコシルトランスフェラーゼ;TGT)、およびIDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(IDP−グリコシルトランスフェラーゼ;IGT)を提供する。
本明細書で使用される場合、「NDP−グリコシルトランスフェラーゼ」(NDP−GT)は、NDPである活性化糖供与体からグリコシル残基を、単量体および多量体の受容体分子に転移させる酵素的能力を有するポリペプチドを指す。一部の実施形態では、NDP−グリコシルトランスフェラーゼは、一般的に「グリコシルトランスフェラーゼ」と呼ばれる。実際に、本明細書で使用される用語「グリコシルトランスフェラーゼ」は、ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(ADP−グリコシルトランスフェラーゼ;AGT)、CDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(CDP−グリコシルトランスフェラーゼ;CGT)、GDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(GDP−グリコシルトランスフェラーゼ;GGT)、TDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(TDP−グリコシルトランスフェラーゼ;TGT)、およびIDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(IDP−グリコシルトランスフェラーゼ;IGT)を含むがこれらに限定されないNDP−グリコシルトランスフェラーゼを包含する。一部の実施形態では、本発明のグリコシルトランスフェラーゼ酵素は、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースを利用するが、UDP−グルコースを利用しない。一部の追加の実施形態では、酵素は「改変体」または「コンビナトリアル改変体」(例えば、ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体)と呼ばれる。
本明細書で使用される場合、「トランスグリコシル化」は、グリコシル残基を、二糖、三糖、またはオリゴ糖供与体から非グリコシル化またはグリコシル化受容体分子へと転移させる反応を指す。
本明細書で使用される場合、「トランスグルコシル化」は、転移されるグリコシル残基がグルコースであり、二糖、三糖、またはオリゴ糖供与体がグルコースを含有するトランスグリコシル化反応を指す。
本明細書で使用される場合、「グリコシル化」は、グリコシル残基と受容体分子との間のグリコシド結合の形成を指す。
本明細書で使用される場合、「グルコシル化」は、グルコース残基と受容体分子との間のグリコシド結合の形成を指す。
本明細書で使用される場合、「グリコシル」は、一価のフリーラジカル、または単糖、低級オリゴ糖、もしくはオリゴ糖誘導体の環状型からヘミアセタールヒドロキシル基を除去することによって得られる置換構造である有機基を指す。グリコシル基は無機酸(例えば、リン酸)と反応してエステル(例えば、グルコース1−リン酸)を形成する。
本明細書で使用される場合、「配糖体」は、炭水化物(例えば、糖)がグリコシド結合によって別の官能基に結合する分子を指す。配糖体を加水分解して、糖および非糖(例えば、アグリコン)成分を産生することができる。
本明細書で使用される場合、用語「ステビオール配糖体」は、天然に存在するステビオール配糖体(例えば、ステビオシド、ステビオールモノシド、ステビオールビオシド、ルブソシド(rubusoside)、ズルコシドB、ズルコシドA、レバウジオシドB、レバウジオシドG、レバウジオシドC、レバウジオシドF、レバウジオシドA、レバウジオシドI、レバウジオシドE、レバウジオシドH、レバウジオシドL、レバウジオシドK、レバウジオシドJ、レバウジオシドM(レバウジオシドXとも呼ばれる)、レバウジオシドD、レバウジオシドN、レバウジオシドO)、および合成ステビオール配糖体(例えば、酵素的にグルコシル化されたステビオール配糖体)、ならびにその組合せを含むがこれらに限定されない、ステビオールの配糖体を指す。ステビオールおよびその配糖体の化学構造は以下である(WO2013/176738を参照のこと)。
本明細書で使用される場合、「ステビオシド基質」は、少なくとも1つのステビオール配糖体を含む任意の適した材料を指す。
Figure 2020506704
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本明細書で使用される場合、「スクロースシンターゼ」は、NDP−グルコース+D−フルクトースのNDPおよびスクロースへの化学反応を可逆的に触媒するグリコシルトランスフェラーゼ酵素(EC2.4.1.1.13)を指す。一部の実施形態では、本発明は、Acidithiobacillus caldusスクロースシンターゼ(「AcSuS」)の改変体を提供する。一部の実施形態では、これらの酵素は、「スクロースシンターゼ改変体」、「SuS」、「SUS」、「SuS改変体」、「SUS改変体」、「スクロースシンターゼコンビナトリアル改変体」、または「SuSコンビナトリアル改変体」、または「SUSコンビナトリアル改変体」と呼ばれる。一部の実施形態では、これらの改変体は、ウリジン以外のNDPを優先的に利用する(すなわち、UDP−グルコースではなくて、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDP−グルコースを利用する)。一部の実施形態では、これらの改変体は、UDP−グルコースを利用しない。
本明細書で使用される場合、用語「ワンポット反応」は、1つの反応容器中での目的のレバウジオシドの産生を指す。一部の実施形態では、用語は、rebAおよび/またはステビオシドを含むがこれらに限定されない開始材料から、他のレバウジオシド(例えば、rebDおよび/またはrebI)の中間体の産生を伴うrebMの産生に関連して使用される。一部の実施形態では、ステビオシドのRebAへの変換、RebAのRebDおよび/またはRebIへの変換、ならびにRebDおよび/またはRebIのRebMへの変換は、1つの反応容器において多酵素カスケードとして実施される。
本明細書で使用される場合、「野生型」および「天然に存在する」は、天然に見出される型を指す。例えば、野生型ポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は、天然の供給源から単離することができ、ヒトの操作によって意図的に改変されていない、生物に存在する配列である。
本明細書で使用される場合、細胞、核酸、またはポリペプチドに関連して使用される場合の「組換え」、「操作された」、および「天然に存在しない」は、そうでなければ天然に存在しない様式で改変されている材料、または材料の天然もしくはネイティブ型に対応する材料を指す。一部の実施形態では、細胞、核酸、またはポリペプチドは、天然に存在する細胞、核酸、またはポリペプチドと同一であるが、合成材料からおよび/または組換え技術を使用する操作によって産生されるまたは導出される。非制限的な例には、中でも細胞のネイティブ(非組換え)型では見出されない遺伝子を発現する、またはそうでなければ異なるレベルで発現されるネイティブ遺伝子を発現する組換え細胞が挙げられる。
用語「配列同一性のパーセント(%)」は、本明細書において、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドにおける比較を指すために使用され、2つの最適に整列させた配列を比較ウィンドウに対して比較することによって決定され、比較ウィンドウにおけるポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列の部分は、2つの配列の最適なアライメントのために参照配列と比較して付加または欠失(すなわち、ギャップ)を含み得る。パーセンテージは、両方の配列において同一の核酸塩基またはアミノ酸残基が存在する位置の数を決定して、マッチした位置の数を得、マッチした位置の数を、比較ウィンドウにおける位置の総数で除算し、結果に100を乗じて配列同一性のパーセンテージを得ることによって計算され得る。あるいは、パーセンテージは、両方の配列に同一の核酸塩基もしくはアミノ酸残基が存在する位置の数、または核酸塩基もしくはアミノ酸残基をギャップと共に整列させてマッチした位置の数を決定し、マッチした位置の数を、比較ウィンドウにおける位置の総数で除算し、結果に100を乗じて配列同一性のパーセンテージを得ることによって計算され得る。当業者は、2つの配列を整列させるために利用可能な多くの確立されたアルゴリズムが存在することを認識する。比較のための配列の最適なアライメントは、当技術分野で公知であるように、SmithおよびWatermanのローカルホモロジーアルゴリズム(SmithおよびWaterman、Adv. Appl. Math.、2巻:482頁[1981年])、NeedlemanおよびWunschのホモロジーアライメントアルゴリズム(NeedlemanおよびWunsch、J. Mol. Biol.、48巻:443頁[1970年])、PearsonおよびLipmanの類似性検索方法(PearsonおよびLipman、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、85巻:2444頁[1988年])、これらのアルゴリズムのコンピューターによる実行(例えば、GCG WisconsinソフトウェアパッケージにおけるGAP、BESTFIT、FASTA、およびTFASTA)、または目視検査を含むがこれらに限定されない任意の適した方法によって実施することができる。配列同一性および配列類似性のパーセントを決定するために適しているアルゴリズムの例には、Altschulら(それぞれ、Altschulら、J. Mol. Biol.、215巻:403〜410頁[1990年];およびAltschulら、Nucl. Acids Res.、3389〜3402頁[1977年]を参照のこと)によって記載されるBLASTおよびBLAST 2.0アルゴリズムが挙げられるがこれらに限定されない。BLAST解析を行うためのソフトウェアは、国立生物工学情報センターのウェブサイトを通して公開されている。このアルゴリズムは、データベース配列における同じ長さのワードと整列させた場合に、何らかの正の値の閾値スコアTとマッチするまたは満たす、クエリ配列における短いワード長Wを同定することによって高スコアリング配列ペア(HSP)を最初に同定することを伴う。Tは、隣接ワードスコア閾値と呼ばれる(Altschulら、上記を参照のこと)。これらの最初の隣接ワードヒットは、それらを含むより長いHSPを発見する探索を開始するためのシードとして作用する。次にワードヒットを、累積アライメントスコアを増加させることができる限り、各々の配列に沿った両方の方向に伸長させる。累積スコアは、ヌクレオチド配列の場合、パラメータM(マッチする残基のペアに関するリワードスコア:常に>0)およびN(ミスマッチ残基に関するペナルティスコア;常に<0)を使用して計算する。アミノ酸配列の場合、スコアリング行列を使用して累積スコアを計算する。各方向におけるワードヒットの伸長は、累積アライメントスコアがその最大達成値から量X低下した場合;1つもしくは複数の負のスコアリング残基アライメントの蓄積により、累積スコアがゼロもしくはそれ未満となる場合;またはいずれかの配列の末端に達した場合に停止する。BLASTアルゴリズムパラメータW、T、およびXは、アライメントの感度および速度を決定する。BLASTNプログラム(ヌクレオチド配列に関して)は、デフォルトとしてワード長(W)11、期待値(E)10、M=5、N=−4、および両方の鎖の比較を使用する。アミノ酸配列に関して、BLASTPプログラムは、デフォルトとしてワード長(W)3、期待値(E)10、およびBLOSUM62スコアリング行列を使用する(HenikoffおよびHenikoff、 Proc. Natl. Acad. Sci. USA、89巻:10915頁[1989年]を参照のこと)。配列アライメントおよび%配列同一性の例示的な決定は、GCG Wisconsinソフトウェアパッケージ(Accelrys、Madison WI)におけるBESTFITまたはGAPプログラムを、提供されるデフォルトパラメータを使用して利用することができる。
本明細書で使用される場合、「参照配列」は、配列および/または活性の比較のための基礎として使用される定義された配列を指す。参照配列は、より大きい配列のサブセット、例えば、完全長の遺伝子またはポリペプチド配列のセグメントであり得る。一般的に、参照配列は、少なくとも20ヌクレオチド長またはアミノ酸残基長、少なくとも25残基長、少なくとも50残基長、少なくとも100残基長、または核酸もしくはポリペプチドの完全長である。2つのポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、各々が(1)2つの配列間で類似である配列(すなわち、完全な配列の一部)を含み得、(2)2つの配列間で相違する配列をさらに含み得ることから、2つの(またはそれより多くの)ポリヌクレオチドまたはポリペプチド間の配列比較は、典型的に「比較ウィンドウ」に対して2つのポリヌクレオチドまたはポリペプチドの配列を比較して、配列類似性の局所領域を同定および比較することによって行われる。一部の実施形態では、「参照配列」は、参照配列が、一次配列において1つまたは複数の変化を有し得る配列である場合、一次アミノ酸配列に基づくことができる。
本明細書で使用される場合、「比較ウィンドウ」は、少なくとも約20連続するヌクレオチド位置またはアミノ酸残基の概念的セグメントであって、配列が、少なくとも20連続するヌクレオチドまたはアミノ酸の参照配列と比較され得、比較ウィンドウにおける配列の一部が、2つの配列の最適なアライメントのために参照配列(付加または欠失を含まない)と比較して20パーセントまたはそれ未満の付加または欠失(すなわち、ギャップ)を含み得る、概念的セグメントを指す。比較ウィンドウは、20連続残基より長くなり得、必要に応じて、30、40、50、100、またはそれより長いウィンドウを含む。
本明細書で使用される場合、所与のアミノ酸またはポリヌクレオチド配列の番号付けの文脈において使用される場合の「対応する」、「参照して」および「比較して」は、所与のアミノ酸またはポリヌクレオチド配列を参照配列と比較した場合の特定された参照配列の残基の番号付けを指す。言い換えれば、所与のポリマーの残基番号または残基位置は、所与のアミノ酸またはポリヌクレオチド配列内の残基の実際の数値位置ではなくて参照配列に関連して示される。例えば、所与のアミノ酸配列、例えば操作されたグリコシルトランスフェラーゼの配列を、2つの配列間の残基のマッチを最適にするためにギャップを導入することによって、参照配列と整列させることができる。これらの場合、ギャップは存在するが、所与のアミノ酸またはポリヌクレオチド配列における残基の番号付けは、それを整列させた参照配列に関して行われる。
本明細書で使用される場合、「実質的な同一性」は、少なくとも20残基位置の比較ウィンドウに対して、しばしば少なくとも30〜50残基のウィンドウに対して、参照配列と比較した場合に少なくとも80パーセントの配列同一性、少なくとも85パーセントの配列同一性、少なくとも89〜95パーセントの配列同一性、またはより通常少なくとも99パーセントの配列同一性を有するポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列を指し、配列同一性のパーセンテージは、比較ウィンドウに対して参照配列の全体で20パーセントまたはそれ未満である欠失または付加を含む配列に対して参照配列を比較することによって計算される。ポリペプチドに適用される一部の特定の実施形態では、用語「実質的な同一性」は、プログラムGAPまたはBESTFITなどによってデフォルトのギャップ荷重を使用して最適に整列させた場合、2つのポリペプチド配列が、少なくとも80パーセントの配列同一性、好ましくは少なくとも89パーセントの配列同一性、少なくとも95パーセント、またはそれより高い配列同一性(例えば、99パーセントの配列同一性)を共有することを意味する。一部の実施形態では、比較される配列において同一でない残基位置は、保存的アミノ酸置換によって異なる。
本明細書で使用される場合、「アミノ酸の差異」および「残基の差異」は、参照配列における対応する位置でのアミノ酸残基と比較したポリペプチド配列の位置でのアミノ酸残基の差異を指す。一部の例では、参照配列は、ヒスチジンタグを有するが、番号付けは、ヒスチジンタグを有しない同等の参照配列と比較して維持される。アミノ酸の差異の位置は、一般的に本明細書において「Xn」と呼ばれ、nは、残基の差異がそれに基づく参照配列における対応する位置を指す。例えば、「配列番号4と比較したX93位での残基の差異」は、配列番号4の93位に対応するポリペプチド位置でのアミノ酸残基の差異を指す。このように、配列番号4の参照ポリペプチドが93位でセリンを有する場合、「配列番号4と比較したX93位での残基の差異」は、配列番号4の93位に対応するポリペプチドの位置でのセリン以外の任意の残基のアミノ酸置換を指す。本明細書におけるほとんどの例では、ある位置での特定のアミノ酸残基の差異は、「XnY」として示され、式中「Xn」は、上記の対応する位置を特定し、「Y」は、操作されたポリペプチドにおいて見出されるアミノ酸の一文字識別子(すなわち、参照ポリペプチドとは異なる残基)である。一部の例(例えば、実施例に示す表)では、本発明はまた、慣例的な表記「AnB」によって示される特定のアミノ酸の差異も提供し、式中Aは、参照配列における残基の一文字識別子であり、「n」は、参照配列における残基位置の番号であり、Bは、操作されたポリペプチドの配列における残基置換の一文字識別子である。一部の例では、本発明のポリペプチドは、参照配列と比較して残基の差異が存在する特定された位置のリストによって示される、参照配列と比較した1つまたは複数のアミノ酸残基の差異を含み得る。一部の実施形態では、1つより多くのアミノ酸をポリペプチドの特定の残基位置で使用することができる場合、使用することができる様々なアミノ酸残基は、「/」(例えば、X307H/X307PまたはX307H/P)によって隔てられる。スラッシュはまた、所与の改変体内の複数の置換を示すためにも使用され得る(すなわち、コンビナトリアル改変体などの所与の配列に1つより多くの置換が存在する)。一部の実施形態では、本発明は、保存的または非保存的アミノ酸置換を含む1つまたは複数のアミノ酸の差異を含む操作されたポリペプチド配列を含む。一部の追加の実施形態では、本発明は、保存的および非保存的アミノ酸置換の両方を含む操作されたポリペプチド配列を提供する。
本明細書で使用される場合、「保存的アミノ酸置換」は、ある残基を、類似の側鎖を有する異なる残基に置換することを指し、このように典型的には、ポリペプチドにおけるアミノ酸を、同じまたは類似の定義されたアミノ酸のクラス内のアミノ酸に置換することを伴う。限定ではなく例として、一部の実施形態では、脂肪族側鎖を有するアミノ酸を、別の脂肪族アミノ酸(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシン)に置換し;ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸を、ヒドロキシル側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、セリンおよびスレオニン)に置換し;芳香族側鎖を有するアミノ酸を、芳香族側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、およびヒスチジン)に置換し;塩基性側鎖を有するアミノ酸を、塩基性側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、リシンおよびアルギニン)に置換し;酸性側鎖を有するアミノ酸を、酸性側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、アスパラギン酸またはグルタミン酸)に置換し;および/または疎水性もしくは親水性アミノ酸をそれぞれ、別の疎水性もしくは親水性アミノ酸に交換する。
本明細書で使用される場合、「非保存的置換」は、ポリペプチドにおけるアミノ酸を、有意に異なる側鎖特性を有するアミノ酸に置換することを指す。非保存的置換は、定義された群内ではなく、群の間のアミノ酸を使用してもよく、(a)置換(例えば、プロリンをグリシンの代わりに)の領域でのペプチド骨格の構造、(b)電荷もしくは疎水性、または(c)側鎖のかさに影響を及ぼす。限定ではなく例として、例示的な非保存的置換は、塩基性または脂肪族アミノ酸による酸性アミノ酸の置換、小型アミノ酸による芳香族アミノ酸の置換;および疎水性アミノ酸による親水性アミノ酸の置換であり得る。
本明細書で使用される場合、「欠失」は、参照ポリペプチドからの1つまたは複数のアミノ酸の除去によるポリペプチドの改変を指す。欠失は、1個もしくはそれより多くのアミノ酸、2個もしくはそれより多くのアミノ酸、5個もしくはそれより多くのアミノ酸、10個もしくはそれより多くのアミノ酸、15個もしくはそれより多くのアミノ酸、または20個もしくはそれより多くのアミノ酸、参照酵素を構成するアミノ酸の総数の最大10%、またはアミノ酸の総数の最大20%の除去を含み得るが、操作されたグリコシルトランスフェラーゼ酵素の酵素活性を保持し、および/または改善された特性を保持する。欠失は、ポリペプチドの内部部分および/または末端部分を対象とし得る。多様な実施形態では、欠失は、連続するセグメントを含み得るか、または不連続であり得る。欠失は典型的に、アミノ酸配列において「−」によって示される。
本明細書で使用される場合、「挿入」は、参照ポリペプチドからの1つまたは複数のアミノ酸の付加によるポリペプチドの改変を指す。挿入は、ポリペプチドの内部部分にあり得るか、またはカルボキシもしくはアミノ末端にあり得る。本明細書で使用される挿入は、当技術分野で公知の融合タンパク質を含む。挿入は、アミノ酸の連続するセグメントであり得るか、または天然に存在するポリペプチドにおいてアミノ酸の1つまたは複数によって隔てられ得る。
「機能的断片」および「生物活性断片」は、本明細書において互換的に使用され、アミノ末端および/またはカルボキシ末端欠失および/または内部欠失を有するが、残りのアミノ酸配列は、それが比較される配列(例えば、本発明の完全長の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ)における対応する部分と同一であり、完全長のポリペプチドの活性の実質的に全てを保持するポリペプチドを指す。
本明細書で使用される場合、「単離されたポリペプチド」は、それが天然で伴う他の夾雑物(例えば、タンパク質、脂質、およびポリヌクレオチド)から実質的に分離されているポリペプチドを指す。用語は、天然に存在する環境または発現系(例えば、宿主細胞内またはin vitro合成を介して)から除去されているか、または精製されているポリペプチドを包含する。組換えグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドは、細胞内に存在してもよく、細胞培地に存在してもよく、または様々な形態で、例えば溶解物もしくは単離調製物として調製されてもよい。したがって、一部の実施形態では、組換えグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドは、単離ポリペプチドであり得る。
本明細書で使用される場合、「実質的に純粋なポリペプチド」または「精製されたタンパク質」は、そのポリペプチド種が存在する主たる種である(すなわち、分子または重量に基づいて、それが組成物における他の任意の個々の高分子種より豊富である)組成物を指し、目的の種がモルまたは重量%によって、存在する高分子種の少なくとも約50パーセントを構成する場合、一般的に実質的に精製された組成物である。しかし、一部の実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼを含む組成物は、50%未満(例えば、約10%、約20%、約30%、約40%、または約50%)純粋であるグリコシルトランスフェラーゼを含む。一般的に、実質的に純粋なグリコシルトランスフェラーゼ組成物は、組成物に存在するモルまたは重量%で全ての高分子種の約60%またはそれより多く、約70%またはそれより多く、約80%またはそれより多く、約90%またはそれより多く、約95%またはそれより多く、および約98%またはそれより多くを構成する。一部の実施形態では、目的の種は、本質的に均一となるまで(すなわち、夾雑種が従来の検出法によって組成物中に検出することができなくなるまで)精製され、組成物は本質的に単一の高分子種からなる。溶媒種、小型分子(<500ダルトン)および元素イオン種は、高分子種とは見なされない。一部の実施形態では、単離された組換えグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドは、実質的に純粋なポリペプチド組成物である。
本明細書で使用される場合、「改善された酵素特性」は、酵素の少なくとも1つの改善された特性を指す。一部の実施形態では、本発明は、参照グリコシルトランスフェラーゼポリペプチドおよび/または野生型グリコシルトランスフェラーゼポリペプチド、および/または別の操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドと比較して、任意の酵素特性の改善を示す操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドを提供する。このように、「改善」のレベルは、野生型、ならびに操作されたグリコシルトランスフェラーゼを含む、様々なグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドの間で決定および比較することができる。改善された特性には、増加したタンパク質発現、増加した熱活性、増加した熱安定性、増加したpH活性、増加した安定性、増大した酵素活性、増加した基質特異性もしくは親和性、増大した比活性、基質または最終産物阻害に対する増加した耐性、増加した化学安定性、改善された化学選択性、改善された溶媒安定性、酸性pHに対する増加した許容性、タンパク質分解活性に対する増加した許容性(すなわち、タンパク質分解に対する減少した感受性)、低減された凝集、増加した溶解度、および変更された温度プロファイルなどの特性が挙げられるがこれらに限定されない。追加の実施形態では、用語は、スクロースシンターゼ酵素の少なくとも1つの改善された特性に関連して使用される。一部の実施形態では、本発明は、参照スクロースシンターゼポリペプチドおよび/または野生型スクロースシンターゼポリペプチド、および/または別の操作されたスクロースシンターゼポリペプチドと比較して、何らかの酵素特性の改善を示す操作されたスクロースシンターゼポリペプチドを提供する。このように、「改善」のレベルを、野生型ならびに操作されたスクロースシンターゼを含む様々なスクロースシンターゼポリペプチドの間で決定および比較することができる。
本明細書で使用される場合、「増加した酵素活性」および「増強された触媒活性」は、参照酵素と比較して、比活性(例えば、産生された産物/時間/重量タンパク質)の増加、または基質の産物へのパーセント変換(例えば、特定された量の酵素を使用して特定された期間での開始量の基質の産物へのパーセント変換)の増加によって表され得る、操作されたポリペプチドの改善された特性を指す。一部の実施形態では、用語は、本明細書に提供される操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドの改善された特性を指し、これは、参照グリコシルトランスフェラーゼ酵素と比較して、比活性(例えば、産生された産物/時間/重量タンパク質)の増加、または基質の産物へのパーセント変換(例えば、特定された量のグリコシルトランスフェラーゼを使用して特定された期間での開始量の基質の産物へのパーセント変換)の増加によって表され得る、本明細書に提供される操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドの改善された特性を指す。一部の実施形態では、用語は、本明細書に提供される改善されたスクロースシンターゼ酵素に関連して使用される。本発明の操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよびスクロースシンターゼの酵素活性を決定する例示的な方法を実施例に提供する。その変化が酵素活性の増加をもたらし得る、K、Vmax、またはkcatの古典的な酵素特性を含む、酵素活性に関するいかなる特性も影響を受け得る。例えば、酵素活性の改善は、対応する野生型酵素の酵素活性の約1.1倍から、天然に存在するグリコシルトランスフェラーゼまたはグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドが由来する別の操作されたグリコシルトランスフェラーゼの2倍、5倍、10倍、20倍、25倍、50倍、75倍、100倍、150倍、200倍、またはそれより高い酵素活性であり得る。
本明細書で使用される場合、「変換」は、基質の対応する産物への酵素的変換(または生体内変換)を指す。「パーセント変換」は、特定された条件下で一定の期間内に産物に変換される基質のパーセントを指す。このように、グリコシルトランスフェラーゼポリペプチドの「酵素活性」または「活性」は、特定の期間での基質の産物への「パーセント変換」として表記することができる。
「万能型特性」を有する酵素(または「万能型酵素」)は、親配列と比較して広範囲の基質に関して改善された活性を示す酵素を指す。万能型酵素は、可能性があるあらゆる基質に関して改善された活性を必ずしも実証する必要はない。一部の実施形態では、本発明は、それらが広範囲の立体的および電子的に多様な基質に関して、親遺伝子と比較して類似のまたは改善された活性を実証するという点において、万能型特性を有するグリコシルトランスフェラーゼ改変体を提供する。加えて、本明細書に提供される万能型酵素は、代謝産物/産物の産生を増加させるために広範囲の多様な分子に対して改善されるように操作された。
用語「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」は、本明細書において核酸ハイブリッドが安定である条件を指す。当業者に公知であるように、ハイブリッドの安定性は、ハイブリッドの融解温度(T)において反映される。一般的に、ハイブリッドの安定性は、イオン強度、温度、G/C含有量、およびカオトロピック剤の存在の関数である。ポリヌクレオチドのT値は、融解温度を予測する公知の方法を使用して計算することができる(例えば、Baldinoら、Meth. Enzymol.、168巻:761〜777頁[1989年];Boltonら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、48巻:1390頁[1962年];Bresslauerら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、83巻:8893〜8897頁[1986年];Freierら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、83巻:9373〜9377頁[1986年];Kierzekら、Biochem.、25巻:7840〜7846頁[1986年];Rychlikら、Nucl. Acids Res.、18巻:6409〜6412頁[1990年](erratum、Nucl. Acids Res.、19巻:698頁[1991年]);Sambrookら、上記);Suggsら、1981年、Developmental Biology Using Purified Genes、Brownら[編]、683〜693頁、Academic Press、Cambridge、MA[1981年];およびWetmur、Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol.、26巻:227〜259頁[1991年]を参照のこと)。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、本明細書に開示されるポリペプチドをコードし、定義された条件、例えば中程度にストリンジェントなまたは高ストリンジェントな条件下で、本発明の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ酵素をコードする配列の相補体とハイブリダイズする。
本明細書で使用される場合、「ハイブリダイゼーションのストリンジェンシー」は、核酸のハイブリダイゼーションにおける洗浄条件などのハイブリダイゼーション条件に関する。一般的にハイブリダイゼーション反応は、より低いストリンジェンシーの条件下で行われ、その後に多様なしかしより高いストリンジェンシーでの洗浄を行う。用語「中程度にストリンジェントなハイブリダイゼーション」は、標的DNAを、標的DNAに対して約60%の同一性、好ましくは約75%の同一性、約85%の同一性、標的ポリヌクレオチドに対して約90%より高い同一性を有する相補的核酸に結合することを可能にする条件を指す。例示的な中程度にストリンジェントな条件は、50%ホルムアミド、5×デンハルト溶液、5×SSPE、0.2%SDS中、42℃でのハイブリダイゼーションの後に、0.2×SSPE、0.2%SDS中、42℃での洗浄と同等の条件である。「高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション」は一般的に、定義されたポリヌクレオチド配列に関する溶液条件下で決定された熱融解温度Tから約10℃またはそれより低い条件を指す。一部の実施形態では、高ストリンジェンシー条件は、0.018M NaCl中、65℃で安定なハイブリッドを形成する核酸配列のみのハイブリダイゼーションを可能にする条件を指す(すなわち、ハイブリッドが、0.018M NaCl中、65℃で安定ではない場合、これは本明細書で企図されるように、高ストリンジェンシー条件下で安定ではない)。高ストリンジェンシー条件は、例えば、50%ホルムアミド、5×デンハルト溶液、5×SSPE、0.2%SDSと同等の条件での42℃でのハイブリダイゼーションの後に、0.1×SSPE、および0.1%SDSでの65℃での洗浄によって提供され得る。別の高ストリンジェンシー条件は、0.1%(W/V)SDSを含有する5×SSC中、65℃でのハイブリダイズと同等の条件でハイブリダイズし、0.1%SDSを含有する0.1×SSC中、65℃で洗浄することである。他の高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件ならびに中程度にストリンジェントな条件は、上記で引用した参考文献に記載されている。
本明細書で使用される場合、「コドン最適化」は、コードされるタンパク質が目的の生物において効率的に発現されるように、タンパク質をコードするポリヌクレオチドのコドンを、特定の生物において優先的に使用されるコドンに変化させることを指す。遺伝子コードは、ほとんどのアミノ酸が、「同義」または「同義の」コドンと呼ばれるいくつかのコドンによって表されるという点において縮重しているが、特定の生物によるコドン使用は、非ランダムであり、特定のコドントリプレットに偏っていることは周知である。このコドン使用バイアスは、所与の遺伝子、共通の機能または先祖起源の遺伝子、高度に発現されるタンパク質 対 低コピー数タンパク質、および生物ゲノムの集中したタンパク質コード領域に関連してより高くなり得る。一部の実施形態では、グリコシルトランスフェラーゼ酵素をコードするポリヌクレオチドは、発現のために選択される宿主生物において最適に産生されるようにコドン最適化され得る。
本明細書で使用される場合、「好ましい」、「最適な」、および「高いコドン使用バイアス」コドンは、単独または組み合わせて使用する場合、同じアミノ酸をコードする他のコドンより高い頻度でタンパク質コード領域において使用されるコドンを互換的に指す。好ましいコドンは、単一の遺伝子、共通の機能もしくは起源の一組の遺伝子、高度に発現された遺伝子におけるコドン使用、生物全体の集中したタンパク質コード領域におけるコドン使用頻度、関連する生物の集中したタンパク質コード領域におけるコドン使用頻度、またはその組合せに関連して決定され得る。その使用頻度が遺伝子発現レベルと共に増加するコドンは典型的に、発現にとって最適なコドンである。例えば、クラスタ解析またはコレスポンデンス分析、および遺伝子において使用されるコドンの有効数を使用する多変量解析を含む多様な方法が、コドン使用頻度の決定(例えば、コドン使用、相対的に同義のコドン使用)および特定の生物におけるコドン優先性に関して公知である(例えば、GCG CodonPreference、Genetics Computer Group Wisconsin Package;CodonW、Peden、University of Nottingham;McInerney、Bioinform.、14巻:372〜73頁[1998年];Stenicoら、Nucl. Acids Res.、222437〜46頁[1994年];およびWright、Gene、87巻:23〜29頁[1990年]を参照のこと)。多くの異なる生物に関するコドン使用表が利用可能である(例えば、Wadaら、Nucl. Acids Res.、20巻:2111〜2118頁[1992年];Nakamuraら、Nucl. Acids Res.、28巻:292頁[2000年];Duretら、上記;HenautおよびDanchin、Escherichia coli and Salmonella、Neidhardtら(編)、ASM Press、Washington D.C.、2047〜2066頁[1996年]を参照のこと)。コドン使用を得るためのデータソースは、タンパク質をコードすることができる任意の利用可能なヌクレオチド配列に依存し得る。これらのデータセットは、発現されたタンパク質をコードすることが実際に既知である核酸配列(例えば、完全なタンパク質コード配列−CDS)、発現された配列タグ(ESTS)、またはゲノム配列の予想されるコード領域を含む(例えば、Mount、Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis、第8章、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.[2001年];Uberbacher、Meth. Enzymol.、266巻:259〜281頁[1996年];およびTiwariら、Comput. Appl. Biosci.、13巻:263〜270頁[1997年]を参照のこと)。
本明細書で使用される場合、「制御配列」は、本発明のポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチドの発現にとって必要なまたは有利である全ての構成要素を含む。各々の制御配列は、ポリペプチドをコードする核酸配列に対してネイティブまたは外来性であり得る。そのような制御配列には、リーダー、ポリアデニル化配列、プロペプチド配列、プロモーター配列、シグナルペプチド配列、開始配列および転写ターミネーターが挙げられるがこれらに限定されない。最低でも、制御配列は、プロモーター、ならびに転写および翻訳終止シグナルを含む。制御配列とポリペプチドをコードする核酸配列のコード領域とのライゲーションを容易にする特異的制限部位を導入する目的で、制御配列にリンカーを提供してもよい。
「作動可能に連結された」は、本明細書において、制御配列が、目的のポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチドの発現を指示または調節するように、制御配列が、目的のポリヌクレオチドと比較した位置で適切に(すなわち、機能的な関係で)配置される構成として定義される。
「プロモーター配列」は、コード配列などの目的のポリヌクレオチドの発現のために宿主細胞によって認識される核酸配列を指す。プロモーター配列は、目的のポリヌクレオチドの発現を媒介する転写制御配列を含有する。プロモーターは、変異体、切断型およびハイブリッドプロモーターを含む、選択される宿主細胞において転写活性を示す任意の核酸配列であってもよく、宿主細胞に対して同種または異種のいずれかである細胞外または細胞内ポリペプチドをコードする遺伝子から得てもよい。
語句「適した反応条件」は、本発明のグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドが、基質を所望の産物化合物に変換することができる酵素的変換反応溶液中の条件(例えば、酵素添加量の範囲、基質添加量、温度、pH、緩衝液、共溶媒等)を指す。一部の例示的な「適した反応条件」を本明細書に提供する。
本明細書で使用される場合、「化合物添加量」または「酵素添加量」などの「添加量(loading)」は、反応の開始時の反応混合物中の構成要素の濃度または量を指す。
本明細書で使用される場合、酵素的変換反応プロセスの文脈における「基質」は、本明細書に提供される操作された酵素(例えば、操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド)が作用する化合物または分子を指す。
本明細書で使用される場合、用語「バイオマス」、「バイオマス基質」、「セルロースバイオマス」、「セルロース供給材料」、および「セルロース基質」は、セルロースを含有する任意の材料を指す。バイオマスは、植物、動物、または微生物に由来してもよく、農業、工業、および林業の残留物、工業および都市廃棄物、ならびにエネルギー目的で成長させた陸生および水生作物を含み得るがこれらに限定されない。セルロース基質の例には、木材、木材パルプ、紙パルプ、トウモロコシ繊維、トウモロコシ穀粒、トウモロコシ穂軸、作物残留物、例えば、トウモロコシの皮、トウモロコシ茎葉、草、小麦、麦わら、大麦、大麦わら、干し草、稲、稲わら、スイッチグラス、紙くず、紙およびパルプ加工廃棄物、木本または草本、果肉または野菜パルプ、トウモロコシ穂軸、醸造かす(distillers grain)、草、籾殻、綿、麻、亜麻、サイザル麻、サトウキビバガス、モロコシ、大豆、スイッチグラス、穀粒の粉砕から得られた構成要素、木、枝、根、葉、ウッドチップ、おがくず、低木および灌木、野菜、果実および花、ならびにその任意の適した混合物が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、セルロースバイオマスは、栽培作物(例えば、C4草を含む草、例えば、スイッチグラス、コードグラス、ライグラス、ススキ、クサヨシ、またはその任意の組合せ)、糖加工残留物、例えば、これに限定されないが、バガス(例えば、サトウキビバガス、ビートパルプ[例えば、テンサイ]、またはその組合せ)、農業残留物(例えば、大豆茎葉、トウモロコシ茎葉、トウモロコシ繊維、稲わら、サトウキビわら、稲、籾殻、大麦わら、トウモロコシ穂軸、麦わら、アブラナわら、オート麦わら、オート麦外皮、トウモロコシ繊維、麻、亜麻、サイザル麻、綿、またはその任意の組合せ)、果肉、野菜パルプ、醸造かす、森林バイオマス(例えば、木材、木材パルプ、紙パルプ、再利用された木材パルプ繊維、おがくず、堅木、例えばアスペン木、軟木、またはその組合せ)を含むがこれらに限定されない。さらに、一部の実施形態では、セルロースバイオマスは、紙およびパルプ加工廃棄物、新聞紙、段ボール等を含むがこれらに限定されないセルロース廃棄物材料および/または林業廃棄物材料を含む。一部の実施形態では、セルロースバイオマスは、1つの種の繊維を含むが、一部の代替の実施形態では、セルロースバイオマスは、異なるセルロースバイオマスを起源とする繊維の混合物を含む。一部の実施形態では、バイオマスはまた、リグニナーゼおよび/またはセルラーゼ酵素を発現するトランスジェニック植物も含み得る(例えば、参照により本明細書に組み込まれているUS2008/0104724を参照のこと)。
本明細書で使用される場合、用語「スラリー」は、1つまたは複数の固体構成要素、例えばセルロース基質が分散されている水溶液を指す。
本明細書で使用される場合、反応からの産物(例えば、ステビオール配糖体)の収量を「増加させること」は、反応中に存在する特定の構成要素(例えば、GH酵素)が、同じ基質および他の代替物を用いて、しかし目的の構成要素の非存在下で同じ条件下で実施した反応と比較してより多くの産物を生じさせる場合に起こる。
本明細書で使用される場合、セルロースまたは他の多糖を「加水分解すること」は、基質に存在する2つの単糖の間のグリコシド結合の少なくとも一部が加水分解され、それによってこれまで結合していた2つの単量体を互いに離れさせる場合に起こる。
反応は、反応の触媒に関与する他の酵素と比較してその酵素の量が、約2%、約1%、または約0.1%(重量/重量)未満である場合に、特定の酵素を「実質的に含まない」と言われる。
本明細書で使用される場合、液体(例えば、培養ブロス)を「分画する」とは、分離プロセス(例えば、塩沈殿、カラムクロマトグラフィー、サイズ排除、および濾過)またはそのようなプロセスの組合せを適用して、所望のタンパク質(例えば、レバウジオシド)が、最初の液体産物より溶液中に大きいパーセンテージの総タンパク質を含む溶液を提供することを意味する。
本明細書で使用される場合、「開始組成物」は、少なくとも1つの基質を含む任意の組成物を指す。一部の実施形態では、開始組成物は、任意のセルロース基質を含む。
一部の代替の実施形態では、用語「開始組成物」は、少なくとも1つのステビオール配糖体を含む任意の組成物であって、ステビオール配糖体の1つまたは複数が生体内変換のための基質として作用する、組成物を指す。一部の実施形態では、開始組成物は、水溶液として提供される。一部の実施形態では、開始組成物は、ステビオシド、ステビオールモノシド、ステビオールビオシド、ルブソシド、ズルコシドB、ズルコシドA、レバウジオシドB、レバウジオシドG、レバウジオシドC、レバウジオシドF、レバウジオシドA、レバウジオシドI、レバウジオシドE、レバウジオシドH、レバウジオシドL、レバウジオシドK、レバウジオシドJ、レバウジオシドM(レバウジオシドXとも呼ばれる)、レバウジオシドD、レバウジオシドN、レバウジオシドO、および合成ステビオール配糖体(例えば、酵素的にグルコシル化されたステビオール配糖体)から選択される少なくとも1つのステビオール配糖体を含む。一部の実施形態では、開始組成物は、2つまたはそれより多くのステビオール配糖体を含む。一部の実施形態では、開始組成物は、Stevia rebaudiana植物材料(例えば、葉)の精製から得られた抽出物を含む。一部の代替の実施形態では、開始組成物は、市販のステビア抽出物を含む。追加の開始組成物は、ステビオール配糖体を単離および精製するために使用されるプロセスの副産物を含む。一部の実施形態では、開始組成物は、精製されたまたは部分精製されたステビオール配糖体基質を含む。一部の実施形態では、開始組成物は、特定のステビオール配糖体を約99重量%より多く含む。
一部の実施形態では、開始組成物は、少なくとも1つのステビオール配糖体(例えば、レバウジオシドA、D等)を産生するために、少なくとも1つの配糖体および基質としてのセルロース構成要素を含む。
本明細書で使用される場合、酵素的変換プロセスの文脈における「産物」は、基質に対する酵素的ポリペプチドの作用に起因する化合物または分子を指す。本明細書で使用される場合、一部の実施形態では、用語は、基質に対するグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドの作用に起因する化合物または分子を指す。一部の実施形態では、本発明によって提供される産物はステビオール配糖体である。一部の実施形態では、産物は、ステビオシド、ステビオールモノシド、ステビオールビオシド、ルブソシド、ズルコシドB、ズルコシドA、レバウジオシドB、レバウジオシドG、レバウジオシドC、レバウジオシドF、レバウジオシドA、レバウジオシドI、レバウジオシドE、レバウジオシドH、レバウジオシドL、レバウジオシドK、レバウジオシドJ、レバウジオシドM(レバウジオシドXとも呼ばれる)、レバウジオシドD、レバウジオシドN、レバウジオシドO、および合成ステビオール配糖体(例えば、酵素的にグルコシル化されたステビオール配糖体)から選択される少なくとも1つのステビオール配糖体を含む。
本明細書で使用される場合、用語「培養する」は、任意の適した条件下(例えば、液体、ゲルまたは固体培地を使用して)で微生物細胞集団を成長させることを指す。
組換えポリペプチドは、当技術分野で公知の任意の適した方法を使用して産生することができる。目的の野生型ポリペプチドをコードする遺伝子を、ベクター、例えばプラスミドにおいてクローニングし、所望の宿主、例えばE.coli等において発現させることができる。組換えポリペプチドの改変体は、当技術分野で公知の様々な方法によって生成することができる。実際に、当業者に周知である広く多様な異なる変異誘発技術が存在する。加えて、変異誘発キットも多くの市販の分子生物学供給元から入手可能である。定義されたアミノ酸での特定の置換(部位特異的)、遺伝子の局所領域における特異的もしくはランダム変異(領域特異的)、または遺伝子全体に対するランダム変異誘発(例えば、飽和変異誘発)を行う方法を利用することができる。PCRを使用する一本鎖DNAまたは二本鎖DNAの部位特異的変異誘発、カセット変異誘発、遺伝子合成、エラープローンPCR、シャッフリング、および化学的飽和変異誘発、または当技術分野で公知の任意の他の適した方法を含むがこれらに限定されない、酵素改変体を生成するための多数の適した方法が当業者に公知である。変異誘発および定方向進化方法を、酵素コードポリヌクレオチドに容易に適用して改変体ライブラリーを生成し、これを発現させ、スクリーニングし、アッセイすることができる。任意の適した変異誘発および定方向進化方法を本発明において使用し、それらは当技術分野で周知である(例えば、その全てが参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第5,605,793、5,811,238、5,830,721、5,834,252、5,837,458、5,928,905、6,096,548、6,117,679、6,132,970、6,165,793、6,180,406、6,251,674、6,265,201、6,277,638、6,287,861、6,287,862、6,291,242、6,297,053、6,303,344、6,309,883、6,319,713、6,319,714、6,323,030、6,326,204、6,335,160、6,335,198、6,344,356、6,352,859、6,355,484、6,358,740、6,358,742、6,365,377、6,365,408、6,368,861、6,372,497、6,337,186、6,376,246、6,379,964、6,387,702、6,391,552、6,391,640、6,395,547、6,406,855、6,406,910、6,413,745、6,413,774、6,420,175、6,423,542、6,426,224、6,436,675、6,444,468、6,455,253、6,479,652、6,482,647、6,483,011、6,484,105、6,489,146、6,500,617、6,500,639、6,506,602、6,506,603、6,518,065、6,519,065、6,521,453、6,528,311、6,537,746、6,573,098、6,576,467、6,579,678、6,586,182、6,602,986、6,605,430、6,613,514、6,653,072、6,686,515、6,703,240、6,716,631、6,825,001、6,902,922、6,917,882、6,946,296、6,961,664、6,995,017、7,024,312、7,058,515、7,105,297、7,148,054、7,220,566、7,288,375、7,384,387、7,421,347、7,430,477、7,462,469、7,534,564、7,620,500、7,620,502、7,629,170、7,702,464、7,747,391、7,747,393、7,751,986、7,776,598、7,783,428、7,795,030、7,853,410、7,868,138、7,783,428、7,873,477、7,873,499、7,904,249、7,957,912、7,981,614、8,014,961、8,029,988、8,048,674、8,058,001、8,076,138、8,108,150、8,170,806、8,224,580、8,377,681、8,383,346、8,457,903、8,504,498、8,589,085、8,762,066、8,768,871、9,593,326および全ての関連するUSならびにPCTおよび非US相対物;Lingら、Anal. Biochem.、254巻(2号):157〜78頁[1997年];Daleら、Meth. Mol. Biol.、57巻:369〜74頁[1996年];Smith、Ann. Rev. Genet.、19巻:423〜462頁[1985年];Botsteinら、Science、229巻:1193〜1201頁[1985年];Carter、Biochem. J.、237巻:1〜7頁[1986年];Kramerら、Cell、38巻:879〜887頁[1984年];Wellsら、Gene、34巻:315〜323頁[1985年];Minshullら、Curr. Op. Chem. Biol.、3巻:284〜290頁[1999年];Christiansら、Nat. Biotechnol.、17巻:259〜264頁[1999年];Crameriら、Nature、391巻:288〜291頁[1998年];Crameriら、Nat. Biotechnol.、15巻:436〜438頁[1997年];Zhangら、Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A.、94巻:4504〜4509頁[1997年];Crameriら、Nat. Biotechnol.、14巻:315〜319頁[1996年];Stemmer、Nature、370巻:389〜391頁[1994年];Stemmer、Proc. Nat. Acad. Sci. USA、91巻:10747〜10751頁[1994年];WO95/22625;WO97/0078;WO97/35966;WO98/27230;WO00/42651;WO01/75767;およびWO2009/152336を参照のこと)。
一部の実施形態では、変異誘発処置後に得られた酵素クローンを、酵素調製物を規定の温度(または他のアッセイ条件)に供すること、および熱処置または他の適したアッセイ条件後に残っている酵素活性の量を測定することによってスクリーニングする。次に、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するクローンを遺伝子から単離して、シークエンシングし、ヌクレオチド配列変化(もしあれば)を同定し、宿主細胞において酵素を発現させるために使用する。発現ライブラリーから酵素活性を測定することは、当技術分野で公知の任意の適した方法(例えば、標準的な生化学技術、例えばHPLC分析)を使用して実施することができる。
改変体が産生された後、それらを任意の所望の特性(例えば、高いもしくは増大した活性、または低いもしくは低減された活性、増加した熱活性、増加した熱安定性、および/または酸性pH安定性等)に関してスクリーニングすることができる。一部の実施形態では、「組換えグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド」(本明細書において「操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド」、「改変体グリコシルトランスフェラーゼ酵素」、「グリコシルトランスフェラーゼ改変体」、および「グリコシルトランスフェラーゼコンビナトリアル改変体」とも呼ばれる)を使用する。一部の実施形態では、「組換えスクロースシンターゼポリペプチド」(「操作されたスクロースシンターゼポリペプチド」、「改変体スクロースシンターゼ酵素」、「スクロースシンターゼ改変体」、および「スクロースシンターゼコンビナトリアル改変体」とも呼ばれる)を使用する。
本明細書で使用される場合、「ベクター」は、DNA配列を細胞に導入するためのDNA構築物である。一部の実施形態では、ベクターは、適した宿主において、DNA配列にコードされるポリペプチドの発現を行うことができる、適した制御配列に作動可能に連結された発現ベクターである。一部の実施形態では、「発現ベクター」は、宿主細胞において発現を駆動するためにDNA配列(例えば、導入遺伝子)に作動可能に連結されたプロモーター配列を有し、一部の実施形態では、転写ターミネーター配列も含む。
本明細書で使用される場合、用語「発現」は、転写、転写後修飾、翻訳、および翻訳後修飾を含むがこれらに限定されないポリペプチドの産生に関与する任意のステップを含む。一部の実施形態では、用語はまた、細胞からのポリペプチドの分泌も包含する。
本明細書で使用される場合、用語「産生する」は、細胞によるタンパク質および/または他の化合物の産生を指す。用語は、転写、転写後修飾、翻訳、および翻訳後修飾を含むがこれらに限定されないポリペプチドの産生に関与する任意のステップを包含することが意図される。一部の実施形態では、用語はまた、細胞からのポリペプチドの分泌も包含する。
本明細書で使用される場合、アミノ酸またはヌクレオチド配列(例えば、プロモーター配列、シグナルペプチド、ターミネーター配列等)は、2つの配列が天然において会合していない場合、それが作動可能に連結している別の配列に対して「異種」である。例えば、「異種ポリヌクレオチド」は、実験技術によって宿主細胞に導入される任意のポリヌクレオチドであり、宿主細胞から除去されて実験手技に供され、その後宿主細胞に再導入されるポリヌクレオチドを含む。
本明細書で使用される場合、用語「宿主細胞」および「宿主株」は、本明細書に提供されるDNA(例えば、グリコシルトランスフェラーゼ改変体をコードするポリヌクレオチド)を含む発現ベクターにとって適した宿主を指す。一部の実施形態では、宿主細胞は、当技術分野で公知である組換えDNA技術を使用して構築されたベクターによって形質転換されているまたはベクターをトランスフェクトされている原核細胞または真核細胞である。
用語「アナログ」は、参照ポリペプチドに対して70%より高い配列同一性であるが、100%未満の配列同一性(例えば、75%、78%、80%、83%、85%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%より高い配列同一性)を有するポリペプチドを意味する。一部の実施形態では、アナログは、ホモアルギニン、オルニチン、およびノルバリンを含むがこれらに限定されない1つまたは複数の天然に存在しないアミノ酸残基、ならびに天然に存在するアミノ酸を含有するポリペプチドを意味する。一部の実施形態では、アナログはまた、1つまたは複数のD−アミノ酸残基を含み、2つまたはそれより多くのアミノ酸残基の間に非ペプチド結合を含む。
用語「有効量」は、所望の結果をもたらすのに十分な量を意味する。当業者は、通例の実験を使用することによって有効量を決定してもよい。
用語「単離された」および「精製された」は、それが天然に会合する少なくとも1つの他の構成要素から取り出されている分子(例えば、単離された核酸、ポリペプチド等)または他の構成要素を指すために使用される。用語「精製された」は、絶対的な純度を必要とせず、むしろこれは相対的な定義として意図される。
本明細書で使用される場合、「立体選択性」は、化学または酵素反応において別の立体異性体より1つの立体異性体が優先的に形成されることを指す。立体選択性は、1つの立体異性体の形成が他方より好ましい場合、部分的であり得るか、または1つのみの立体異性体が形成される場合には完全であり得る。立体異性体がエナンチオマーである場合、立体選択性は、エナンチオ選択性と呼ばれ、それは両方の総和における一方のエナンチオマーの割合(典型的にパーセンテージとして報告される)である。それはあるいは、当技術分野において一般的に、式[主要なエナンチオマー−少量のエナンチオマー]/[主要なエナンチオマー+少量のエナンチオマー]に従って計算されたエナンチオマー過剰率([e.e])として報告される(典型的にパーセンテージとして)。立体異性体がジアステレオマーである場合、立体選択性は、ジアステレオ選択性と呼ばれ、それは2つのジアステレオマーの混合物における一方のジアステレオマーの割合(典型的にパーセンテージとして報告される)であり、あるいは一般的にジアステレオマー過剰率(「d.e.」)として報告される。エナンチオマー過剰率およびジアステレオマー過剰率は、立体異性体過剰率の種類である。
本明細書で使用される場合、「位置選択性」および「位置選択的反応」は、結合の形成または切断の1つの方向が、他の全ての起こり得る方向より優先的に起こる反応を指す。反応は、識別が完全である場合、完全に(100%)位置選択的であり得、1つの部位の反応の産物が他の部位の反応の産物より優勢である場合、実質的に位置選択的(少なくとも75%)または部分的に位置選択的(X%、パーセンテージは、目的の反応に依存して設定される)であり得る。
本明細書で使用される場合、「熱安定な」は、上昇した温度(例えば、40〜80℃)に一定期間(例えば、0.5〜24時間)曝露後に、同じ上昇した温度に曝露した野生型酵素と比較して類似の(例えば60%〜80%より高い)活性を維持するグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドを指す。
本明細書で使用される場合、「溶媒安定な」は、異なる濃度(例えば、5〜99%)の溶媒(エタノール、イソプロピルアルコール、ジメチルスルホキシド[DMSO]、テトラヒドロフラン、2−メチルテトラヒドロフラン、アセトン、トルエン、酢酸ブチル、メチルtert−ブチルエーテル等)に一定期間(例えば、0.5〜24時間)曝露後に、同じ溶媒の同じ濃度に曝露した野生型酵素と比較して類似の(例えば60%〜80%より高い)活性を維持するグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドを指す。
本明細書で使用される場合、「熱および溶媒安定な」は、熱安定かつ溶媒安定であるグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドを指す。
本明細書で使用される場合、「還元剤」は、Fe+3をFe+2に変換することができる化合物または作用物質を指す。例示的な還元剤は、アスコルビン酸であり、一般的にL−アスコルビン酸の形態である。
本明細書で使用される場合、「必要に応じた」および「必要に応じて」は、続いて記載される事象または状況が起こっても起こらなくてもよいこと、および記載が、事象または状況が起こる例と、起こらない例とを含むことを意味する。当業者は、1つまたは複数の必要に応じた置換基を含有すると記載された任意の分子に関して、立体的に実際的なおよび/または合成的に実現可能な化合物のみを含めることを意味すると理解するであろう。「必要に応じて置換された」は、1つの用語または一連の化学基における全てのその後の修飾語を指す。
グリコシル化
グリコシル化は、安定性、薬力学、溶解度、および膜輸送を含む天然および合成産物の多くの特性を変更し得る。本発明は、様々なアグリコンおよびグリコシル化基質から新規グリコシル化化合物を生成するのに適した組成物、方法、および酵素を提供する。一部の実施形態では、本発明は、容易に得られる前駆体から既知のグリコシル化化合物を効率的に生成する手段を提供する。一部の例では、グリコシル化は、化学合成法を通して達成される。しかし、これらの方法は典型的に、望ましくない化学物質およびプロセスを必要とし、混合産物(例えば、不正確な位置での結合および/または望ましくないアノマー配置を有する)をもたらし得る。さらに、炭水化物化学は、複数の保護および脱保護ステップを必要とする。
対照的に、グリコシル化酵素は、穏やかな条件下で活性であり得、単一のステップで高い位置選択性および立体特異性を付与することができる。多くの天然に存在するグリコシル化代謝産物は、様々な糖ヌクレオシドから糖部分を転移するグリコシルトランスフェラーゼを使用してin vivoで生成される。抗菌、抗腫瘍、天然の甘味特性等を有する多くの二次代謝産物を含む多くの分子は、非リボソームペプチド、ポリケチド、またはβ−グリコシド結合によって改変されたテルペノイド骨格を含む。植物Stevia rebaudiana Bertoniから抽出されたジテルペン配糖体の多くは、β−結合したグルコース分子を含有する。天然では、これらの分子は、UDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ酵素を使用してin vivoでグリコシル化される。本発明は、新規の操作されたグリコシルトランスフェラーゼを使用してヌクレオシドジホスホグルコースからグルコース部分を基質(例えば、レバウジオシドDまたはステビオシド)に転移させ、1つまたは複数のβ−グルコース結合産物(例えば、レバウジオシドM、レバウジオシドA、またはレバウジオシドI)を産生する方法を提供する(図1を参照のこと)。しかし、in vitroで使用する場合、UDP−グルコースは、非常に高価であり、および/または入手できない場合がある。一部の追加の実施形態では、シンターゼ(例えば、スクロースシンターゼまたはトレハロースシンターゼ)は、逆方向に作用して、ヌクレオシド二リン酸およびグルコース供与体(例えば、スクロース、トレハロース、またはデンプン)からヌクレオシドジホスホグルコース化合物を形成する。
このように、グリコシル化を、香草Stevia rebaudiana Bertoniに由来する天然甘味料などの天然甘味料の産生に使用する。上記のように、この植物は、非常に強い甘味と、他の多くの非常に強力な甘味料の特性より優れた感覚特性を特徴とするいくつかのジテルペン配糖体を産生する。上記の甘味配糖体は、共通のアグリコン(すなわち、ステビオール)を有し、C13およびC19位で炭水化物残基の数および種類が異なる。ステビオール配糖体は、その分子構造のみならず、その味覚特性も互いに異なる。通常、ステビオシドは、スクロースより89〜143倍甘いと報告されているが、レバウジオシドAは、スクロースより85〜242倍甘いと報告されている(例えば、Kasaiら、Nippon Kagaku Kaishi、1981巻:726〜735頁[1981年]を参照のこと)。これらの一般的な化合物の中で、レバウジオシドAは、最も収れん性が少なく、最も苦みが少なく、最も持続的な後味が少ない。このように、これは、主要なステビオール配糖体の最も好ましい感覚属性を有し、市販されている。しかし、レバウジオシドAは、Stevia rebaudiana Bertoniから単離された配糖体全体の小さい画分(約20%)を構成するに過ぎず、ステビオシド(約70%)および少量のステビオール配糖体が残りを構成する(例えば、FAO、Chemical and Technical Assessment、63rd JECFA、Steviol Glycosides[2004年]を参照のこと)。天然に存在するが、さらにより少量の化合物であるレバウジオシドMは、レバウジオシドXとしても公知であり、スクロースより200〜350倍甘く、レバウジオシドAと比較して低減された後味を有する(例えば、Prakashら、Food、3巻:162〜175頁[2014年]を参照のこと)。このように、例えば天然の甘味料としてのレバウジオシドMの商品化に関心が集まっているが、現在では、この化合物を合成するために実行可能な商業用経路はない。
操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド
本発明は、グリコシルトランスフェラーゼポリペプチド、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドを調製する方法、およびポリペプチドを使用する方法を提供する。記載がポリペプチドに関する場合、これはまた、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドも記載すると理解すべきである。一部の実施形態では、本発明は、野生型GT酵素と比較して改善された特性を有する、操作された天然に存在しないGT酵素を提供する。任意の適した反応条件を本発明において使用する。一部の実施形態では、方法を使用して、トランスフェラーゼ反応を行うための操作されたポリペプチドの改善された特性を分析する。一部の実施形態では、反応条件は、以下におよび実施例にさらに説明するように、ポリペプチドの濃度もしくは量、基質、補基質、緩衝液、共溶媒、pH、温度および反応時間を含む条件、ならびに/またはポリペプチドが固相支持体に固定される条件によって調整される。
一部の実施形態では、本明細書に記載される操作されたGTポリペプチドは、ステビオール配糖体のさらにグリコシル化されたステビオール配糖体への変換(例えば、ステビオシドのレバウジオシドAへの、またはレバウジオシドDのレバウジオシドMへの)およびアデニンジホスホグルコースまたは他のヌクレオシド二リン酸の使用などにおいて、野生型GT酵素と比較して改善された特性を有する。一部の実施形態では、操作されたGT酵素は、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、4256、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、684、7388、および/または8088と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、操作されたGT酵素は、配列番号758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、7324、および/または7784と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するベータ−1,2グリコシルトランスフェラーゼ改変体である。一部の実施形態では、操作されたGT酵素は、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するベータ−1,3グリコシルトランスフェラーゼ改変体である。一部のさらなる実施形態では、操作されたGTポリペプチドは、ペプチドリンカーがN末端とC末端の間に遺伝子レベルで組み込まれ、新しいアミノ酸位置が新しいN末端およびC末端の場所として選択される、循環置換された(circular permuted)タンパク質である。一部の実施形態では、循環置換されたGT酵素は、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、循環置換されたGT酵素は、配列番号32と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、GT酵素は、本明細書に記載される少なくとも1つの配列を含む。一部の実施形態では、本発明は、配列番号6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、22、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1290、1292、1294、2596、2598、2600、2602、2604、2606、2608、2610、2612、2614、2616、2618、2620、2622、2624、2626、2628、2630、2632、2634、2636、2638、2640、2642、2644、2646、2648、2650、2652、2654、2656、2658、2660、2662、2664、2666、2668、2670、2672、2674、2676、2678、2680、2682、2684、2686、2688、2690、2692、2694、2696、2698、2700、2702、2704、2706、2708、2710、2712、2714、2716、2718、2720、2722、2724、2726、2728、2730、2732、2734、2736、2738、2740、2742、2744、2746、2748、2750、2752、2754、2756、2758、2760、2762、2764、2766、2768、2770、2772、2774、2776、2778、2780、2782、2784、2786、2788、2790、2792、2794、2796、2798、2800、2802、2804、2806、2808、2810、2812、2814、2816、2818、2820、2822、2824、2826、2828、2830、2832、2834、2836、2838、2840、2842、2844、2846、2848、2850、2852、2854、2856、2858、2860、2862、2864、2866、2868、2870、2872、2874、2876、2878、2880、2882、2884、2886、2888、2890、2892、2894、2896、2898、2900、2902、2904、2906、2908、2910、2912、2914、2916、2918、2920、2922、2924、2926、2928、2830、2932、2934、2936、2938、2940、2942、2944、2946、2948、2950、2952、2954、2956、2958、2960、2962、2964、2966、2968、2970、2972、2974、2976、2978、2980、2982、2984、2986、2988、2990、2992、2994、2996、2998、3000、3002、3004、3006、3008、3010、3012、3014、3016、3018、3020、3022、3024、3026、3028、3030、3032、3034、3036、3038、3040、3042、3044、3046、3048、3050、3052、3054、3056、3058、3060、3062、3064、3066、3068、3070、3072、3074、3076、3078、3080、3082、3084、3086、3088、3090、3092、3094、3096、3098、3100、3102、3104、3106、3108、3110、3112、3114、3116、3118、3120、3122、3124、3126、3128、3130、3132、3134、3136、3138、3140、3142、3144、3146、3148、3150、3152、3154、3156、3158、3160、3162、3164、3166、3168、3170、3172、3174、3176、3178、3180、3182、3184、3186、3188、3190、3192、3194、3196、3198、3200、3202、3204、3206、3208、3210、3212、3214、3216、3218、3220、3222、3224、3226、3228、3230
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、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316、2318、2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500、2502、2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592、2594、7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762、7764、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104および9106に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を有するポリペプチド配列を含む操作されたスクロースシンターゼを提供する。
一部の実施形態では、追加の反応構成要素または追加の技術を利用して、反応条件を補足する。一部の実施形態では、これらは、酵素を安定化する、または酵素の不活化を防止する、産物阻害を低減する、反応の平衡をグルコシル化産物形成にシフトさせるための手段を講じることを含む。
一部のさらなる実施形態では、基質化合物を産物化合物に変換するための上記のプロセスのいずれかは、産物化合物の抽出、単離、精製、および結晶化、濾過、または凍結乾燥から選択される1つまたは複数のステップをさらに含み得る。上記で開示されたプロセスによって産生された生体触媒反応混合物からグルコシル化産物を抽出、単離、精製、および/または結晶化するための方法、技術、およびプロトコールは、当業者に公知であるか、および/または通例の実験を通してアクセスされる。加えて、例示的な方法を以下の実施例に提供する。
操作されたスクロースシンターゼポリペプチド
本発明は、操作されたスクロースシンターゼ(SuS)ポリペプチド、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドを調製する方法、およびポリペプチドを使用する方法を提供する。記載がポリペプチドに関する場合、これはまた、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドも記載すると理解すべきである。一部の実施形態では、本発明は、野生型SuS酵素と比較して改善された特性を有する、操作された天然に存在しないSuS酵素を提供する。任意の適した反応条件を本発明において使用する。一部の実施形態では、方法を使用して、シンターゼ反応を行うための操作されたポリペプチドの改善された特性を分析する。一部の実施形態では、反応条件は、以下におよび実施例にさらに説明するように、操作されたSuSの濃度もしくは量、基質、緩衝液、溶媒、pH、温度および反応時間を含む条件、ならびに/または操作されたSuSポリペプチドが固相支持体に固定される条件によって調整される。
一部の実施形態では、本明細書に記載される操作されたSuSポリペプチドは、本明細書に記載される反応などにおいて、野生型SuS酵素と比較して改善された特性を有する。一部の実施形態では、操作されたSuS酵素は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本発明は、操作されたSuS酵素であって、SuS酵素のポリペプチドが、配列番号1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、2208、2210、2212、2214、2216、2218、2220、2222、2224、2226、2228、2230、2232、2234、2236、2238、2240、2242、2244、2246、2248、2250、2252、2254、2256、2258、2260、2262、2264、2266、2268、2270、2272、2274、2276、2278、2280、2282、2284、2286、2288、2290、2292、2294、2296、2298、2300、2302、2304、2306、2308、2310、2312、2314、2316、2318、2320、2322、2324、2326、2328、2330、2332、2334、2336、2338、2340、2342、2344、2346、2348、2350、2352、2354、2356、2358、2360、2362、2364、2366、2368、2370、2372、2374、2376、2378、2380、2382、2384、2386、2388、2390、2392、2394、2396、2398、2400、2402、2404、2406、2408、2410、2412、2414、2416、2418、2420、2422、2424、2426、2428、2430、2432、2434、2436、2438、2440、2442、2444、2446、2448、2450、2452、2454、2456、2458、2460、2462、2464、2466、2468、2470、2472、2474、2476、2478、2480、2482、2484、2486、2488、2490、2492、2494、2496、2498、2500、2502、2504、2506、2508、2510、2512、2514、2516、2518、2520、2522、2524、2526、2528、2530、2532、2534、2536、2538、2540、2542、2544、2546、2548、2550、2552、2554、2556、2558、2560、2562、2564、2566、2568、2570、2572、2574、2576、2578、2580、2582、2584、2586、2588、2590、2592、2594、7438、7440、7442、7444、7446、7448、7450、7452、7454、7456、7458、7460、7462、7464、7466、7468、7470、7472、7474、7476、7478、7480、7482、7484、7486、7488、7490、7492、7494、7496、7498、7500、7502、7504、7506、7508、7510、7512、7514、7516、7518、7520、7522、7524、7526、7528、7530、7532、7534、7536、7538、7540、7542、7544、7546、7548、7550、7552、7554、7556、7558、7560、7562、7564、7566、7568、7570、7572、7574、7576、7578、7580、7582、7584、7586、7588、7590、7592、7594、7596、7598、7600、7602、7604、7606、7608、7610、7612、7614、7616、7618、7620、7622、7624、7626、7628、7630、7632、7634、7636、7638、7640、7642、7644、7646、7648、7650、7652、7654、7656、7658、7660、7662、7664、7666、7668、7670、7672、7674、7676、7678、7680、7682、7684、7686、7688、7690、7692、7694、7696、7698、7700、7702、7704、7706、7708、7710、7712、7714、7716、7718、7720、7722、7724、7726、7728、7730、7732、7734、7736、7738、7740、7742、7744、7746、7748、7750、7752、7754、7756、7758、7760、7762、7764、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、
8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104および9106に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を含む、操作されたSuS酵素を提供する。
一部の実施形態では、追加の反応構成要素または追加の技術を利用して、反応条件を補足する。一部の実施形態では、これらは、酵素を安定化する、または酵素の不活化を防止する、産物阻害を低減する、反応の平衡をグルコシル化産物形成にシフトさせるための手段を講じることを含む。
一部のさらなる実施形態では、基質化合物を産物化合物に変換するための上記のプロセスのいずれかは、産物化合物の抽出、単離、精製、結晶化、濾過、および/または凍結乾燥から選択される1つまたは複数のステップをさらに含み得る。本明細書に提供されるプロセスによって産生された生体触媒反応混合物から産物(例えば、レバウジオシド)を抽出、単離、精製、および/または結晶化するための方法、技術、およびプロトコールは、当業者に公知であるか、および/または通例の実験を通してアクセスされる。加えて、例示的な方法を以下の実施例に提供する。
操作されたポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、発現ベクター、および宿主細胞
本発明は、本明細書に記載される操作された酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドを、遺伝子発現を制御する1つまたは複数の異種調節配列に作動可能に連結させて、ポリペプチドを発現することができる組換えポリヌクレオチドを作製する。一部の実施形態では、操作された酵素ポリペプチドをコードする少なくとも1つの異種ポリヌクレオチドを含有する発現構築物を適切な宿主細胞に導入し、対応する酵素ポリペプチドを発現させる。
当業者に明らかであるように、タンパク質配列が利用可能で、様々なアミノ酸に対応するコドンを知っていることにより、対象のポリペプチドをコードすることができる全てのポリヌクレオチドの説明が提供される。同じアミノ酸が代替のまたは同義のコドンによってコードされる遺伝子コードの縮重により、操作された酵素(例えば、GTまたはSuS)ポリペプチドをその全てがコードする極めて多数の核酸を作製することができる。このように、本発明は、可能性があるコドンの選択に基づいて組合せを選択することによって、本明細書に記載される酵素ポリペプチドをコードする、作製することができる酵素ポリヌクレオチドの各々全ての可能のあるバリエーションを産生する方法および組成物を提供し、実施例(例えば、様々な表)に示されるアミノ酸配列を含む本明細書に記載される任意のポリペプチドに関して、そのような全てのバリエーションが、具体的に開示されると考えられる。
一部の実施形態では、コドンは、好ましくはタンパク質産生のために選択された宿主細胞が利用するために最適化される。例えば、細菌において使用される好ましいコドンは、典型的に細菌での発現のために使用される。その結果、操作された酵素ポリペプチドをコードするコドン最適化されたポリヌクレオチドは、完全長のコード領域におけるコドン位置の約40%、50%、60%、70%、80%、90%、または90%より多くの位置で好ましいコドンを含有する。
一部の実施形態では、酵素ポリヌクレオチドは、本明細書に開示される特性を有する酵素活性を有する操作されたポリペプチドをコードし、ポリペプチドは、本明細書に提供される配列番号から選択される参照配列に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い同一性を有するアミノ酸配列、または任意の改変体(例えば、実施例に提供される改変体)のアミノ酸配列、および参照ポリヌクレオチドまたは実施例に開示される任意の改変体のアミノ酸配列と比較して1つまたは複数の残基の差異(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個、またはそれより多くのアミノ酸残基位置)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、参照ポリペプチド配列は、配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、770、792、954、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3346、3502、3696、3956、4256、4550、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、6864、7324、7388、7784、および/または8088から選択される。一部の代替の実施形態では、参照ポリペプチド配列は、配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420から選択される。
一部の実施形態では、参照ポリヌクレオチド配列は、配列番号3、7、31、231、347、547、561、695、757、769、791、953、1001、1053、2599、2717、2813、2883、3015、3081、3243、3345、3501、3695、3955、4255、4549、4683、4837、4875、5065、5289、5371、5561、5707、5975、6137、6287、6467、6863、7323、7387、7783、および/または8087から選択される。一部の実施形態では、参照ポリヌクレオチド配列は、配列番号757、769、791、953、1001、1053、2599、2717、2813、2883、3015、3081、3243、3345、3501、3695、3955、4255、4549、7323、および/または7783から選択されるが、一部の代替の実施形態では、参照ポリヌクレオチド配列は、配列番号3、7、31、231、347、547、561、695、4683、4837、4875、5065、5289、5371、5561、5707、5975、6137、6287、6467、6863、7387、および/または8087から選択される。さらに一部の追加の実施形態では、参照ポリヌクレオチド配列は、配列番号73、1079、1157、1221、1391、1455、1581、1763、1803、1839、2063、2431、2509、7505、および/または8419から選択される。
一部の実施形態では、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼをコードする操作されたポリヌクレオチドは、配列番号5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1289、1291、1293、2595、2597、2599、2601、2603、2605、2607、2609、2611、2613、2615、2617、2619、2621、2623、2625、2627、2629、2631、2633、2635、2637、2639、2641、2643、2645、2647、2649、2651、2653、2655、2657、2659、2661、2663、2665、2667、2669、2671、2673、2675、2677、2679、2681、2683、2685、2687、2689、2691、2693、2695、2697、2699、2701、2703、2705、2707、2709、2711、2713、2715、2717、2719、2721、2723、2725、2727、2729、2731、2733、2735、2737、2739、2741、2743、2745、2747、2749、2751、2753、2755、2757、2759、2761、2763、2765、2767、2769、2771、2773、2775、2777、2779、2781、2783、2785、2787、2789、2791、2793、2795、2797、2799、2801、2803、2805、2807、2809、2811、2813、2815、2817、2819、2821、2823、2825、2827、2829、2831、2833、2835、2837、2839、2841、2843、2845、2847、2849、2851、2823、2855、2857、2859、2861、2863、2865、2867、2869、2871、2873、2875、2877、2879、2881、2883、2885、2887、2889、2891、2893、2895、2897、2899、2901、2903、2905、2907、2909、2911、2913、2915、2917、2919、2921、2923、2925、2927、2829、2931、2933、2935、2937、2939、2941、2943、2945、2947、2949、2951、2953、2955、2957、2959、2961、2963、2965、2967、2969、2971、2973、2975、2977、2979、2981、2983、2985、2987、2989、2991、2993、2995、2997、2999、3001、3003、3005、3007、3009、3011、3013、3015、3017、3019、3021、3023、3025、3027、3029、3031、3033、3035、3037、3039、3041、3043、3045、3047、3049、3051、3053、3055、3057、3059、3061、3063、3065、3067、3069、3071、3073、3075、3077、3079、3081、3083、3085、3087、3089、3091、3093、3095、3097、3099、3101、3103、3105、3107、3109、3111、3113、3115、3117、3119、3121、3123、3125、3127、3129、3131、3133、3135、3137、3139、3141、3143、3145、3147、3149、3151、3153、3155、3157、3159、3161、3163、3165、3167、3169、3171、3173、3175、3177、3179、3181、3183、3185、3187、3189、3191、3193、3195、3197、3199、3201、3203、3205、3207、3209、3211、3213、3215、3217、3219、3221、3223、3225、3227、3229、3231、3233、3235、3237、3239、3241、3243、3245、3247、3249、3251、3253、3255、3257、3259、3261、3263、3265、3267、3269、3271、3273、3275、3277、3279、3281、3283、3285、3287、3289、3291、3293、3295、3297、3299、3301、3303、3305、3307、3309、3311、3313、3315、3317、3319、3321、3323、3325、3327、3329、3331、3333、3335、3337、3339、3341、3343、3345、3347、3349、3351、3353、3355、3357、3359、3361、3363、3365、3367、3369、3371、3373、3375、3377、3379、3381、3383、3385、3387、3389、3391、3393、3395、3397、3399、3401、3403、3405、3407、3409、3411、3413、3415、3417、3419、3421、3423、3425、3427、3429、3431、3433、3435、3437、3439、3441、3443、3445、3447、3449、3451、3453、3455、3457、3459、3461、3463、3465、3467、3469、3471、3473、3475、3477、3479、3481、3483、3485、3487、3489、3491、3493、3495、3497、3499、3501、3503、3505、3507、3509、3511、3513、3515、3517、3519、3521、3523、3525、3527、3529、3531、3533、3535、3537、3539、3541、3543、3545、3547、3549、3551、3553、3555、3557、3559、3561、3563、3565、3567、3569、3571、3573、3575、3577、3579、3581、3583、3585、3587、3589、3591、3593、3595、3597、3599、3601、3603、3605、3607、3609、3611、3613、3615、3617、3619、3621、3623、3625、3627、3629、3631、3633、3635、3637、3639、3641、3643、3645、3647、3649、3651、3653、3655、3657、3659、3661、3663、3665、3667、3669、3671、3673、3675、3677、3679、3681、3683、3685、3687、3689、3691、3693、3695、3697、3699、3791、3703、3705、3707、3709、3711、3713、3715、3717、3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一部の追加の実施形態では、本明細書に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼをコードする操作されたポリヌクレオチドは、配列番号1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、2205、2207、2209、2211、2213、2215、2217、2219、2221、2223、2225、2227、2229、2231、2233、2235、2237、2239、2241、2243、2245、2247、2249、2251、2253、2255、2257、2259、2261、2263、2265、2267、2269、2271、2273、2275、2277、2279、2281、2283、2285、2287、2289、2291、2293、2295、2297、2299、2301、2303、2305、2307、2309、2311、2313、2315、2317、2319、2321、2323、2325、2327、2329、2331、2333、2335、2337、2339、2341、2343、2345、2347、2349、2351、2353、2355、2357、2359、2361、2363、2365、2367、2369、2371、2373、2375、2377、2379、2381、2383、2385、2387、2389、2391、2393、2395、2397、2399、2401、2403、2405、2407、2409、2411、2413、2415、2417、2419、2421、2423、2425、2427、2429、2431、2433、2435、2437、2439、2441、2443、2445、2447、2449、2451、2453、2455、2457、2459、2461、2463、2465、2467、2469、2471、2473、2475、2477、2479、2481、2483、2485、2487、2489、2491、2493、2495、2497、2499、2501、2503、2505、2507、2509、2511、2513、2515、2517、2519、2521、2523、2525、2527、2529、2531、2533、2535、2537、2539、2541、2543、2545、2547、2549、2551、2553、2555、2557、2559、2561、2563、2565、2567、2569、2571、2573、2575、2577、2579、2581、2583、2585、2587、2589、2591、2593、7437、7439、7441、7443、7445、7447、7449、7451、7453、7455、7457、7459、7461、7463、7465、7467、7469、7471、7473、7475、7477、7479、7481、7483、7485、7487、7489、7491、7493、7495、7497、7499、7501、7503、7505、7507、7509、7511、7513、7515、7517、7519、7521、7523、7525、7527、7529、7531、7533、7535、7537、7539、7541、7543、7545、7547、7549、7551、7553、7555、7557、7559、7561、7563、7565、7567、7569、7571、7573、7575、7577、7579、7581、7583、7585、7587、7589、7591、7593、7595、7597、7599、7601、7603、7605、7607、7609、7611、7613、7615、7617、7619、7621、7623、7625、7627、7629、7631、7633、7635、7637、7639、7641、7643、7645、7647、7649、7651、7653、7655、7657、7659、7661、7663、7665、7667、7669、7671、7673、7675、7677、7679、7681、7683、7685、7687、7689、7691、7693、7695、7697、7699、7701、7703、7705、7707、7709、7711、7713、7715、7717、7719、7721、7723、7725、7727、7729、7731、7733、7735、7737、7739、7741、7743、7745、7747、7749、7751、7753、7755、7757、7759、7761、7763、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8475、8477、8479、8797、8799、8801、8803、8805、8807、8809、8811、8813、8815、8817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8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、および/または9105に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性を含む。
一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、本明細書に提供される任意のポリヌクレオチド配列から選択される参照ポリヌクレオチド配列、もしくはその相補体、または本明細書に提供される改変体酵素ポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチド配列に対して高ストリンジェント条件下でハイブリダイズすることができる。一部の実施形態では、高ストリンジェント条件下でハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドは、参照配列と比較して1つまたは複数の残基の差異を有するアミノ酸配列を含む酵素ポリペプチドをコードする。
一部の実施形態では、本明細書における操作された酵素ポリペプチドのいずれかをコードする単離されたポリヌクレオチドは、酵素ポリペプチドの発現を容易にするために多様な方法で処理される。一部の実施形態では、酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、酵素ポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチドの発現を調節するために、1つまたは複数の制御配列が存在する発現ベクターを含む。単離されたポリヌクレオチドをベクターに挿入前に処理することは、利用される発現ベクターに応じて望ましいまたは必要であり得る。組換えDNA法を利用してポリヌクレオチドおよび核酸配列を改変する技術は当技術分野で周知である。一部の実施形態では、制御配列は、中でも、プロモーター、リーダー配列、ポリアデニル化配列、プロペプチド配列、シグナルペプチド配列、および転写ターミネーターを含む。一部の実施形態では、適したプロモーターは、宿主細胞の選択に基づいて選択される。細菌宿主細胞の場合、本開示の核酸構築物の転写を指示するのに適したプロモーターには、E.coli lacオペロン、Streptomyces coelicolorアガラーゼ遺伝子(dagA)、Bacillus subtilisレバンスクラーゼ遺伝子(sacB)、Bacillus licheniformisアルファ−アミラーゼ遺伝子(amyL)、Bacillus stearothermophilusマルトース生成アミラーゼ遺伝子(amyM)、Bacillus amyloliquefaciensアルファ−アミラーゼ遺伝子(amyQ)、Bacillus licheniformisペニシリナーゼ遺伝子(penP)、Bacillus subtilis xylAおよびxylB遺伝子、ならびに原核生物ベータ−ラクタマーゼ遺伝子(例えば、Villa−Kamaroffら、Proc. Natl Acad. Sci. USA、75巻:3727〜3731頁[1978年]を参照のこと)から得られるプロモーター、ならびにtacプロモーター(例えば、DeBoerら、Proc. Natl Acad. Sci. USA、80巻:21〜25頁[1983年]を参照のこと)が挙げられるがこれらに限定されない。糸状菌宿主細胞の例示的なプロモーターには、Aspergillus oryzae TAKAアミラーゼ、Rhizomucor mieheiアスパラギン酸プロテナーゼ、Aspergillus niger中性アルファ−アミラーゼ、Aspergillus niger酸安定アルファ−アミラーゼ、Aspergillus nigerまたはAspergillus awamoriグルコアミラーゼ(glaA)、Rhizomucor mieheiリパーゼ、Aspergillus oryzaeアルカリプロテアーゼ、Aspergillus oryzaeトリオースリン酸イソメラーゼ、Aspergillus nidulansアセトアミダーゼ、およびFusarium oxysporumトリプシン様プロテアーゼ(例えば、WO96/00787)の遺伝子から得られるプロモーター、ならびにNA2−tpiプロモーター(Aspergillus niger中性アルファ−アミラーゼおよびAspergillus oryzaeトリオースリン酸イソメラーゼの遺伝子からのプロモーターのハイブリッド)、ならびにその変異体、切断型、およびハイブリッドプロモーターが挙げられるがこれらに限定されない。例示的な酵母細胞プロモーターは、Saccharomyces cerevisiaeエノラーゼ(ENO−1)、Saccharomyces cerevisiaeガラクトキナーゼ(GAL1)、Saccharomyces cerevisiaeアルコールデヒドロゲナーゼ/グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(ADH2/GAP)、およびSaccharomyces cerevisiae 3−ホスホグリセリン酸キナーゼの遺伝子に由来し得る。酵母宿主細胞に関する他の有用なプロモーターは、当技術分野で公知である(例えば、Romanosら、Yeast、8巻:423〜488頁[1992年]を参照のこと)。
一部の実施形態では、制御配列はまた、適した転写ターミネーター配列(すなわち、転写を終止するために宿主細胞によって認識される配列)である。一部の実施形態では、ターミネーター配列は、酵素ポリペプチドをコードする核酸配列の3’末端に作動可能に連結される。選択される宿主細胞において機能的である任意の適したターミネーターを、本発明において使用する。糸状菌宿主細胞の例示的な転写ターミネーターは、Aspergillus oryzae TAKAアミラーゼ、Aspergillus nigerグルコアミラーゼ、Aspergillus nidulansアントラニル酸シンターゼ、Aspergillus nigerアルファ−グルコシダーゼ、およびFusarium oxysporumトリプシン様プロテアーゼの遺伝子から得ることができる。酵母宿主細胞の例示的なターミネーターは、Saccharomyces cerevisiaeエノラーゼ、Saccharomyces cerevisiaeチトクロームC(CYC1)、およびSaccharomyces cerevisiaeグリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼの遺伝子から得ることができる。酵母宿主細胞の他の有用なターミネーターは、当技術分野で公知である(例えば、Romanosら、上記を参照のこと)。
一部の実施形態では、制御配列はまた、適したリーダー配列である(すなわち、宿主細胞による翻訳にとって重要であるmRNAの非翻訳領域)。一部の実施形態では、リーダー配列は、酵素ポリペプチドをコードする核酸配列の5’末端に作動可能に連結される。選択される宿主細胞において機能的である任意の適したリーダー配列を、本発明において使用する。糸状菌宿主細胞の例示的なリーダー配列は、Aspergillus oryzae TAKAアミラーゼおよびAspergillus nidulansトリオースリン酸イソメラーゼの遺伝子から得られる。酵母宿主細胞の適したリーダーは、Saccharomyces cerevisiaeエノラーゼ(ENO−1)、Saccharomyces cerevisiae 3−ホスホグリセリン酸キナーゼ、Saccharomyces cerevisiaeアルファ−因子、およびSaccharomyces cerevisiaeアルコールデヒドロゲナーゼ/グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(ADH2/GAP)の遺伝子から得られる。
一部の実施形態では、制御配列はまた、ポリアデニル化配列(すなわち、核酸配列の3’末端に作動可能に連結され、転写されると、転写されたmRNAにポリアデノシン残基を付加するシグナルとして宿主細胞によって認識される配列)である。選択される宿主細胞において機能的である任意の適したポリアデニル化配列を、本発明において使用する。糸状菌宿主細胞の例示的なポリアデニル化配列には、Aspergillus oryzae TAKAアミラーゼ、Aspergillus nigerグルコアミラーゼ、Aspergillus nidulansアントラニル酸シンターゼ、Fusarium oxysporumトリプシン様プロテアーゼ、およびAspergillus nigerアルファ−グルコシダーゼの遺伝子が挙げられるがこれらに限定されない。酵母宿主細胞の有用なポリアデニル化配列は公知である(例えば、GuoおよびSherman、Mol. Cell. Bio.、15巻:5983〜5990頁[1995年]を参照のこと)。
一部の実施形態では、制御配列はまた、シグナルペプチド(すなわち、ポリペプチドのアミノ末端に連結されたアミノ酸配列をコードし、コードされたポリペプチドを細胞の分泌経路へと方向付けるコード領域)である。一部の実施形態では、核酸配列のコード配列の5’末端は、翻訳読み取り枠において、分泌されたポリペプチドをコードするコード領域のセグメントに天然に連結されたシグナルペプチドコード領域を固有に含有する。あるいは、一部の実施形態では、コード配列の5’末端は、コード配列に対して外来であるシグナルペプチドコード領域を含有する。発現されたポリペプチドを、選択される宿主細胞の分泌経路へと方向付ける任意の適したシグナルペプチドコード領域を、操作されたポリペプチドの発現のために使用する。細菌宿主細胞の有効なシグナルペプチドコード領域は、Bacillus NClB 11837マルトース生成アミラーゼ、Bacillus stearothermophilusアルファ−アミラーゼ、Bacillus licheniformisサブチリシン、Bacillus licheniformisベータ−ラクタマーゼ、Bacillus stearothermophilus中性プロテアーゼ(nprT、nprS、nprM)、およびBacillus subtilis prsAの遺伝子から得られる領域が挙げられるがこれらに限定されないシグナルペプチドコード領域である。さらなるシグナルペプチドは、当技術分野で公知である(例えば、SimonenおよびPalva、Microbiol. Rev.、57巻:109〜137頁[1993年]を参照のこと)。一部の実施形態では、糸状菌宿主細胞の有効なシグナルペプチドコード領域には、Aspergillus oryzae TAKAアミラーゼ、Aspergillus niger中性アミラーゼ、Aspergillus nigerグルコアミラーゼ、Rhizomucor mieheiアスパラギン酸プロテナーゼ、Humicola insolensセルラーゼ、およびHumicola lanuginosaリパーゼの遺伝子から得られるシグナルペプチドコード領域が挙げられるがこれらに限定されない。酵母宿主細胞の有用なシグナルペプチドには、Saccharomyces cerevisiaeアルファ−因子およびSaccharomyces cerevisiaeインベルターゼの遺伝子からのシグナルペプチドが挙げられるがこれらに限定されない。
一部の実施形態では、制御配列はまた、ポリペプチドのアミノ末端に位置するアミノ酸配列をコードするプロペプチドコード領域である。得られたポリペプチドは、「プロ酵素」、「プロポリペプチド」、または「酵素原」と呼ばれる。プロポリペプチドは、プロポリペプチドからのプロペプチドの触媒的または自己触媒的切断によって成熟活性ポリペプチドに変換することができる。プロペプチドコード領域は、Bacillus subtilisアルカリプロテアーゼ(aprE)、Bacillus subtilis中性プロテアーゼ(nprT)、Saccharomyces cerevisiaeアルファ−因子、Rhizomucor mieheiアスパラギン酸プロテアーゼ、およびMyceliophthora thermophilaラクターゼ(例えば、WO95/33836を参照のこと)の遺伝子が挙げられるがこれらに限定されない任意の適した供給源から得られ得る。シグナルペプチドおよびプロペプチド領域がいずれもポリペプチドのアミノ末端に存在する場合、プロペプチド領域はポリペプチドのアミノ末端の隣に位置し、シグナルペプチド領域はプロペプチド領域のアミノ末端の隣に位置する。
一部の実施形態では、調節配列も利用する。これらの配列は、宿主細胞の成長に対するポリペプチドの発現の調節を容易にする。調節系の例は、調節化合物の存在を含む化学的または物理的刺激に応答して遺伝子の発現をオンまたはオフにする系である。原核宿主細胞では、適した調節配列には、lac、tac、およびtrpオペレーター系が挙げられるがこれらに限定されない。酵母宿主細胞では、適した調節系には、ADH2系またはGAL1系が挙げられるがこれらに限定されない。糸状菌では、適した調節配列には、TAKAアルファ−アミラーゼプロモーター、Aspergillus nigerグルコアミラーゼプロモーター、およびAspergillus oryzaeグルコアミラーゼプロモーターが挙げられるがこれらに限定されない。
別の態様では、本発明は、操作された酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ならびにそれらが導入される宿主の種類に応じて、プロモーターおよびターミネーター、複製開始点等などの1つまたは複数の発現調節領域を含む組換え発現ベクターを対象とする。一部の実施形態では、本明細書に記載される様々な核酸および制御配列を共に結合して、そのような部位で酵素ポリペプチドをコードする核酸配列の挿入または置換を可能にするために1つまたは複数の便利な制限部位を含む組換え発現ベクターを産生する。あるいは、一部の実施形態では、本発明の核酸配列は、核酸配列またはその配列を含む核酸構築物を、発現のための適切なベクターに挿入することによって発現される。発現ベクターの作製を伴う一部の実施形態では、コード配列は、コード配列が発現のための適切な制御配列に作動可能に連結されるようにベクターに位置する。
組換え発現ベクターは、組換えDNA技法に便利に供され、酵素ポリヌクレオチド配列の発現をもたらすことができる任意の適したベクター(例えば、プラスミドまたはウイルス)であり得る。ベクターの選択は典型的には、ベクターと、ベクターが導入される宿主細胞との適合性に依存する。ベクターは、線形または閉環状プラスミドであり得る。
一部の実施形態では、発現ベクターは、自律複製ベクター(すなわち、その複製が染色体の複製とは無関係である染色体外実体として存在するベクター、例えば、プラスミド、染色体外エレメント、ミニ染色体、または人工染色体)である。ベクターは、自己複製を確実にする任意の手段を含有し得る。一部の代替の実施形態では、ベクターは、宿主細胞に導入されると、ゲノムに組み込まれ、それが組み込まれている染色体と共に複製されるベクターである。さらに、一部の実施形態では、単一のベクターもしくはプラスミド、または宿主細胞のゲノムに導入される総DNAを共に含有する2つもしくはそれより多くのベクターもしくはプラスミドおよび/またはトランスポゾンを利用する。
一部の実施形態では、発現ベクターは、形質転換された細胞の容易な選択を可能にする1つまたは複数の選択可能マーカーを含有する。「選択可能マーカー」は、その産物が、殺生物剤もしくはウイルスに対する耐性、重金属に対する耐性、栄養要求株に対する原栄養性等を提供する遺伝子である。細菌の選択可能マーカーの例には、Bacillus subtilisもしくはBacillus licheniformisのdal遺伝子、または抗生物質耐性、例えばアンピシリン、カナマイシン、クロラムフェニコール、もしくはテトラサイクリン耐性を付与するマーカーが挙げられるがこれらに限定されない。酵母宿主細胞の適したマーカーには、ADE2、HIS3、LEU2、LYS2、MET3、TRP1、およびURA3が挙げられるがこれらに限定されない。糸状菌宿主細胞において使用するための適したマーカーには、amdS(アセトアミダーゼ;例えば、A.nidulansまたはA.orzyae由来)、argB(オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼ)、bar(ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ;例えば、S.hygroscopicus由来)、hph(ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ)、niaD(硝酸レダクターゼ)、pyrG(オロチジン−5’−リン酸デカルボキシラーゼ;例えば、A.nidulansまたはA.orzyae由来)、sC(硫酸アデニルトランスフェラーゼ)、およびtrpC(アントラニル酸シンターゼ)、ならびにその同等物が挙げられるがこれらに限定されない。別の態様では、本発明は、本発明の少なくとも1つの操作された酵素ポリペプチドをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む宿主細胞であって、ポリヌクレオチドが宿主細胞において操作された酵素を発現させるための1つまたは複数の制御配列に作動可能に連結されている、宿主細胞を提供する。本発明の発現ベクターによってコードされるポリペプチドの発現に使用するために適した宿主細胞は、当技術分野で周知であり、細菌細胞、例えばE.coli、Vibrio fluvialis、Streptomyces、およびSalmonella typhimurium細胞;真菌細胞、例えば酵母細胞(例えば、Saccharomyces cerevisiaeまたはPichia pastoris(ATCC受託番号201178));昆虫細胞、例えばDrosophila S2およびSpodoptera Sf9細胞;動物細胞、例えばCHO、COS、BHK、293、およびBowes黒色腫細胞;ならびに植物細胞が挙げられるがこれらに限定されない。例示的な宿主細胞はまた、様々なEscherichia coli株(例えば、W3110(ΔfhuA)およびBL21)を含む。
したがって、別の態様では、本発明は、操作された酵素的ポリペプチドを産生する方法であって、ポリペプチドの発現にとって適した条件下で、操作された酵素的ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現させることができる宿主細胞を培養するステップを含む、方法を提供する。一部の実施形態では、方法は、本明細書に記載される酵素ポリペプチドを単離および/または精製するステップをさらに含む。
宿主細胞にとって適切な培養培地および成長条件は、当技術分野で周知である。酵素ポリペプチドを発現させるためにポリヌクレオチドを細胞に導入するための任意の適した方法を本発明において使用することが企図される。適した技術には、エレクトロポレーション、遺伝子銃粒子衝突(biolistic particle bombardment)、リポソーム媒介トランスフェクション、塩化カルシウムトランスフェクション、およびプロトプラスト融合が挙げられるがこれらに限定されない。
本発明の様々な特色および実施形態を、以下の代表的な実施例において説明するが、それらは、説明であって、限定ではないことが意図される。
以下の実施例は、実験および得られた結果を含め、例示する目的でのみ提供され、本発明を限定するものとは解釈されない。実際に、下記の試薬および設備の多くには種々の適切な供給源が存在する。本発明は、任意の試薬または設備項目に関して任意の特定の供給源に限定されるものではない。
以下の実験の開示では、以下の略語を適用する:M(モル濃度);mM(ミリモル濃度)、uMおよびμM(マイクロモル濃度);nM(ナノモル濃度);mol(モル);gmおよびg(グラム);mg(ミリグラム);ugおよびμg(マイクログラム);Lおよびl(リットル);mlおよびmL(ミリリットル);cm(センチメートル);mm(ミリメートル);umおよびμm(マイクロメートル);sec.(秒);min(s)(分);h(s)およびhr(s)(時間);U(単位);MW(分子量);rpm(毎分回転数);psiおよびPSI(ポンド毎平方インチ);℃(摂氏度);RTおよびrt(室温);CV(変動係数);CAMおよびcam(クロラムフェニコール);PMBS(硫酸ポリミキシンB);IPTG(イソプロピルβ−D−1−チオガラクトピラノシド);LB(Luria broth);TB(terrific broth);SFP(振とうフラスコ粉末(shake flask powder));CDS(コード配列);DNA(デオキシリボ核酸);RNA(リボ核酸);nt(ヌクレオチド;ポリヌクレオチド);aa(アミノ酸;ポリペプチド);E.coli W3110(Coli Genetic Stock Center[CGSC]、New Haven、CTから入手可能な、一般に使用される実験用E.coli株);AcSus(Acidithiobacillus caldusスクロースシンターゼ);SUS、SuS、およびSuSy(スクロースシンターゼ、スクロースシンテターゼとしても公知);NDP(ヌクレオシド二リン酸);アデノシン二リン酸(ADP);シチジン二リン酸(CDP);グアノシン二リン酸(GDP);チミジン二リン酸(TDP);ウリジン二リン酸(UDP);イノシン二リン酸(IDP);GT(グリコシルトランスフェラーゼ);UGT(UDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);NGT(NDP−ヌクレオシド二リン酸依存性グリコシルトランスフェラーゼ);AGT(ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);CGT(CDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);GGT(GDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);TGT(TDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);IGT(IDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);UGT(UDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ);reb(レバウジオシド);rebA(レバウジオシドA);rebD(レバウジオシドD);rebI(レバウジオシドI);rebM(レバウジオシドM);「Reb A 60」は、それぞれステビオシドおよびレバウジオシドAの約1:2混合物である;HTP(ハイスループット);HPLC(高圧液体クロマトグラフィー);HPLC−UV(HPLC−Ultraviolet Visible Detector);1H NMR(プロトン核磁気共鳴分光法);HSQC NMR(異核種単一量子コヒーレンス分光法NMR);COSY NMR(等核相関分光法NMR);Acorn(Acorn NMR、Livermore、CA);FIOPC(陽性対照に対する改善倍率);SigmaおよびSigma−Aldrich(Sigma−Aldrich、St.Louis、MO;Difco(Difco Laboratories、BD Diagnostic Systems、Detroit、MI);Microfluidics(Microfluidics、Westwood、MA);ChromaDex(ChromaDex,Inc.、Irvine、CA);Life Technologies(Life Technologies、Fisher Scientificの一部、Waltham、MA);Amresco(Amresco,LLC、Solon、OH);Carbosynth(Carbosynth,Ltd.、Berkshire、UK);Varian(Varian Medical Systems、Palo Alto、CA);Agilent(Agilent Technologies,Inc.、Santa Clara、CA);ならびにThermotron(Thermotron,Inc.、Holland、MI)。
(実施例1)
グルコシル化活性を有するUGT酵素の合成、最適化、およびアッセイ
本実施例では、グルコシル化活性を有するUGT酵素の合成、最適化およびアッセイに使用する方法を記載する。
遺伝子合成および最適化:
ステビオールビオシドをグルコシル化してレバウジオシドBにすること、およびステビオシドをグルコシル化してレバウジオシドAにすることが報告されている(例えば、Richmanら、Plant J.、41巻:56〜67頁[2005年]を参照されたい)、野生型Stevia rebaudianaポリペプチド(配列番号2)をコードするポリヌクレオチド配列(配列番号1)をコドン最適化し、配列番号3の遺伝子として合成した。この合成遺伝子(配列番号3)をpCK110900ベクター系にクローニングし(例えば、これによって本明細書に参照により組み込まれる米国特許出願公開第2006/0195947号を参照されたい)、その後、E.coli W3110(ΔfhuA)において発現させた。E.coli株W3110にlacプロモーターの制御下でUGT酵素を発現させた。
振とうフラスコ粉末(SFP)の産生:
振とうフラスコ手順を使用して、本明細書に記載の生体触媒プロセスにおいて使用される特徴付けアッセイのためのグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド振とうフラスコ粉末(SFP)を生成した。酵素の振とうフラスコ粉末(SFP)調製物により、HTPアッセイで使用される細胞溶解物と比較してより精製された酵素の調製物(例えば、総タンパク質の>30%に至るまで)がもたらされ、より濃縮された酵素溶液を使用することが可能になる。目的の操作されたポリペプチドをコードするプラスミドを含有するE.coliの単一のコロニーを、30μg/mlのクロラムフェニコールおよび1%グルコースを含有するLuria Bertaniブロス5mL中に接種した。細胞をインキュベーター中、30℃、250rpmで振とうしながら終夜(少なくとも16時間)成長させた。培養物を、1Lフラスコ中、30μg/mlのCAMを含有するTerrific Broth(12g/Lのバクトトリプトン、24g/Lの酵母抽出物、4mL/Lのグリセロール、65mMのリン酸カリウム、pH7.0、1mMのMgSO4)250mLに、600nmにおける光学濃度(OD600)0.2まで希釈し、30℃で成長させた。
培養物のOD600が0.6〜0.8になったらIPTGを最終濃度1mMまで添加することによってグリコシルトランスフェラーゼ遺伝子の発現を誘導した。次いで、インキュベーションを終夜(少なくとも16時間)継続した。細胞を遠心分離(5000rpm、15min、4℃)によって収集し、上清を廃棄した。細胞ペレットを、2体積の25mMのトリエタノールアミン緩衝液、pH7.5に再懸濁させ、標準のE.coli溶解設定でMICROFLUIDIZER(登録商標)高圧ホモジナイザー(Microfluidics)を通過させ、4℃で維持した。細胞残屑を遠心分離(10,000rpm、45分、4℃)によって除去した。清澄化された溶解物上清を採取し、−80℃で凍結させ、次いで、His−アフィニティー精製し、透析して精製タンパク質を作製するか、または凍結乾燥して粗タンパク質の乾燥振とうフラスコ粉末を作製した。
ステビオシドグルコシル化のためのSFPのアッセイ:
SFPを再構成して20g/Lの粉末を提供した。次いで、これらのストック50μLを、3mMのMgSO4および1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)を伴い、2mMのウリジンジホスホグルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、総反応体積200μL中に希釈した。反応を、30℃、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら16〜18hにわたって実施した。
HPLC−MS/MS分析:
上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化されたステビオシド産物を、LC−MS/MSにより、以下の計器およびパラメータを用いて検出した:
Figure 2020506704
Figure 2020506704
配列番号4について活性が検出された。上記のアッセイ試料のLC−MS/MS分析においてレバウジオシドAへのステビオシドの高い変換(すなわち>95%)が観察された。
(実施例2)
配列番号4のGT改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。酵素のある特定の構造的特徴に関連する位置が変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号3によってコードされるGT(すなわち、配列番号4)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド12種の第1のラウンド(「ラウンド1」)をもたらした。
HTPの成長、発現、および溶解物調製
細胞を96ウェルプレート中に採集し、1%グルコースおよび30μg/mLのCAMを含有するLB培地中、30℃、200rpm、85%湿度で終夜成長させた。次いで、終夜成長物20μLを、30μg/mLのCAMを含有するTB成長培地380μLを含有するディープウェルプレートに移し、1mMのIPTGを用いて誘導し、30℃、200rpm、85%湿度で18hインキュベートした。細胞培養物を4000rpm、4℃で10分遠心分離し、培地を廃棄した。こうして得られた細胞ペレットを−80℃で凍結させ、溶解緩衝液(20mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5中、0.5g/Lのリゾチームおよび0.5g/LのPMBS)250μL中に、タイタープレート振とう機において、室温、低スピードで振とうしながら2hにわたって溶解させた。次いで、プレートを4000rpm、4℃で20min遠心分離し、清澄化された溶解物上清を下記のHTPアッセイ反応に使用した。
ADP−グルコースからステビオシドへのグルコース転移についてのHTPアッセイ:
配列番号3改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物200μL中溶解物50μLの溶解物添加量、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量、および0.5mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら18h。反応物を、100μL/ウェルの0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、4℃で10分遠心分離し、上清を実施例1、表1.1に記載の通りHPLC−MS/MSによって分析した。
ADP−グルコースを用いた、野生型UGT76G1(配列番号4)の存在下でのステビオシドからのレバウジオシドAの形成は、酵素制御がない場合と区別できなかった。配列番号4の野生型酵素とは対照的に、グリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドは、ADP−グルコースを用いてステビオシドからレバウジオシドAを産生させたことが同定された。操作されたポリペプチドを表2.1に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べて変異が番号付けられている。タンパク質精製のために振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させた。配列番号4と比べて表2.1に示されている以下のアミノ酸変異を有する改変体を分析した。
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する精製タンパク質特徴付けアッセイおよび分析:
まず、250mL振とうフラスコ培養物を、実施例1に記載の通り、成長させ、誘導し、溶解させ、ヒスチジン−アフィニティー精製し、透析し、グリセロールを用いて1:1希釈して、精製タンパク質を作製した。次いで、これらのタンパク質50μLを、1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(Sigma、>93%の純度)および0.5mMのADP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積200μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら16hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
変異R10−およびV309R、S361G、V309S、L307V、およびS283Tを有する改変体(配列番号8、10、12、14、および16)はADP−グルコースを用いてステビオシドからレバウジオシドAを上記の陰性対照および配列番号2レベルを上回るレベルで産生させた。変異R10−およびV309Rを有する改変体(配列番号8)および変異V309Sを有する改変体(配列番号12)はADP−グルコースを用いてレバウジオシドDからレバウジオシドMを陰性対照および配列番号2レベルを上回って産生させた。したがって、これらの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼ酵素により、ステビオシドのレバウジオシドAへのβ−グルコシル化、およびレバウジオシドDのレバウジオシドMへのβ−グルコシル化のための新しい方法において使用するための新しい生体触媒試薬がもたらされる。変異R10−およびV309Rを有する改変体(配列番号8)が、ADP−グルコースを補基質として用いてステビオシドおよびレバウジオシドDの両方に対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号7)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例3)
配列番号8のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号8に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。ラウンド1における活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号7によってコードされるGT(すなわち、配列番号8)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、実施例2に記載のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド20種の第2のラウンド(「ラウンド2」)をもたらした。操作されたポリペプチドを表3.1に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べて変異が番号付けられている。下記の通り配列番号8と比べて表3.1に示されているアミノ酸変異を有する改変体に関してタンパク質精製のために実施例1に記載の通り成長させた振とうフラスコ規模の培養物を分析した。
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する精製タンパク質特徴付けアッセイおよび分析
タンパク質を実施例2に記載の通り精製し、アッセイし、分析した。
Figure 2020506704
表3.2の改変体の全て(配列番号32、34、36、および38)がADP−グルコースを用いて配列番号8よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。変異T283Q、T318E、W337S、およびS360Gを有する改変体(配列番号32)が、ADP−グルコースを補基質として用いて、ステビオシドおよびレバウジオシドDの両方に対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号31)をさらなる定向進化のために選択した。
NDP−グルコースからステビオシドへのグルコシル転移に関する精製タンパク質特徴付けアッセイおよび分析
配列番号4の配列番号32と比べたヌクレオチド二リン酸特異性をプロファイリングするために、以下の実験を実施した。まず、精製タンパク質50μLを、1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)および0.5mMのADP−グルコース、UDP−グルコース、またはTDP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積200μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら16hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。配列番号32は、配列番号4よりも、ADP−グルコースを用いると13倍多くのレバウジオシドAを産生させ、UDP−グルコースを用いると90%程度のレバウジオシドAを産生させ、TDP−グルコースを用いると22%程度のレバウジオシドAを産生させた。配列番号31によってコードされるグリコシルトランスフェラーゼ(すなわち、配列番号32)は、配列番号3によってコードされるグリコシルトランスフェラーゼ(すなわち、配列番号4)と比較して実質的に改変されたNDP−グルコース特異性を有する。
配列番号31によってコードされるGTのレバウジオシドDおよびNDP−グルコースに対する比活性の決定
配列番号32のヌクレオチド二リン酸特異性をプロファイリングするために、以下の実験を実施した。まず、精製タンパク質5μLを、1mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および2mMのADP−グルコース、UDP−グルコース、TDP−グルコース、またはGDP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら1〜18hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。配列番号31によってコードされるグリコシルトランスフェラーゼ(すなわち、配列番号32)は、ADP−グルコースと比べて、GDP−グルコースを用いると50%程度のレバウジオシドMを産生させ、UDP−グルコースを用いると70%程度のレバウジオシドMを産生させ、TDP−グルコースを用いると検出限界を下回る量のレバウジオシドMを産生させた。レバウジオシドDおよびADP−グルコースを用いたGT配列番号32の比活性(毎分精製タンパク質1mg毎に形成されるRebMのμmol)は、UDP−グルコースを用いた場合の比活性の1.4倍であった。したがって、配列番号31によってコードされるグリコシルトランスフェラーゼ(すなわち、配列番号32)は、新しいアデニンジホスホグルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ、または「AGT」である。
(実施例4)
操作されたAGT配列番号32を用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換およびADP−グルコースのin situ形成
本実施例では、ステビオール配糖体をグルコシル化するためのADP−グルコースのin situ形成を評価するための実験(図1を参照されたい)を記載する。
遺伝子合成および最適化
可逆的変換においてフルクトースにグルコースを供与してスクロースを形成するためにADP−グルコースを優先的に利用することが報告されている(例えば、Diricksら、Appl. Microbiol. Biotechnol.、99巻:8465〜74頁[2015年]およびFigueroaら、FEBS Lett.、587巻:165〜9頁[2013年]を参照されたい)、野生型Acidithiobacillus caldusスクロースシンターゼおよびThermosynechococcus elongatusスクロースシンターゼポリペプチド(それぞれ配列番号72および74)をコードするポリヌクレオチド配列を、コドン最適化し、配列番号71および73の遺伝子として合成した。これらの合成遺伝子(配列番号71および73)をpCK110900ベクター系に個別にクローニングし(例えば、これによって本明細書に参照により組み込まれる米国特許出願公開第2006/0195947号を参照されたい)、その後、E.coli W3110(ΔfhuA)において発現させた。E.coli株W3110に当該酵素をlacプロモーターの制御下で発現させた。当該株を振とうフラスコ規模で成長させ、Hisアフィニティータンパク質精製のために溶解させ、これは、実施例1に記載の通り実施した。
精製されたAGTおよびスクロースシンターゼを用いたカップリングアッセイ
スクロースシンターゼ(SuS)と配列番号31によってコードされるAGT(すなわち、配列番号32)をカップリングすることによるNDP再利用の潜在性を調査するために、以下の実験を実施した。まず、精製されたスクロースシンターゼポリペプチド(配列番号72または74)20μLおよび精製されたAGTポリペプチド(配列番号32)30μLを、1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)、200mMのスクロース、および5mMのアデノシン二リン酸(ADP)、シチジン二リン酸(CDP)、グアノシン二リン酸(GDP)、チミジン二リン酸(TDP)、またはウリジン二リン酸(UDP)(Sigma、5種全て>93%の純度)を伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、5mMのMgCl、総反応体積200μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら16hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。
上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
配列番号32およびSuS(配列番号74)に関しては、ADP、UDP、およびGDPを用いると同等量のレバウジオシドAが形成され、CDPおよびTDPを用いるとレバウジオシドAはほとんど形成されなかった。配列番号32およびSuS(配列番号72)に関しては、ADPを用いて形成されるレバウジオシドAのレベルは、SuS(配列番号74)によりADPを用いて形成されるレベルと同等であった。UDPを用いて形成されるレバウジオシドAの量は、ADPを用いて形成される量の20%未満であり、GT(配列番号32)およびSuS(配列番号72)、ならびにCDP、GDP、またはTDPを用いるとレバウジオシドAはほとんど形成されなかった。これらの結果から、配列番号72および74がどちらもin situにおいてスクロースからADP−グルコースを生成させることが可能であり、スクロース、および、補基質として、より費用のかかる基質であるADP−グルコースの代わりにADPを用いてステビオール配糖体をグルコシル化するために、AGT(配列番号32)と共に使用されることが実証された。さらに、配列番号72は、GDPおよびUDPと共に使用することもできる。ADP選択的カップリング系を伴う一部の実施形態では、配列番号74が使用される。
(実施例5)
配列番号32のADP−グリコシルトランスフェラーゼ循環置換改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体をグルコシル化するための、配列番号32に由来するGTポリペプチドの設計、構築、および評価に関する実験を記載する。配列番号31によってコードされるGTの定向進化を、N末端およびC末端がコード配列内で連結しており、酵素のある特定の構造的特徴に関連する位置が当該タンパク質の新しいN末端として選択された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。次いで、この循環置換改変体のライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT循環置換改変体ポリペプチド17種の「ラウンド3.2」をもたらした。非順列(unpermuted)配列番号32よりも高い活性を有する改変体はなかったが、表5.1に列挙されている17種の操作されたポリペプチドは、酵素を伴わない陰性対照よりも高い活性を有した。
ADP−グルコースからステビオシドへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号31改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物200μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量、および0.5mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、100μL/ウェルの0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、4℃で10分遠心分離し、上清を実施例1、表1.1に記載の通りHPLC−MS/MSによって分析した。
分析した操作されたポリペプチドを表5.1に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べてアミノ酸が番号付けられている。配列番号32と比べて以下の最初のアミノ酸:71、170、259、および401を有する改変体について、タンパク質精製のために振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させた。これらの改変体は、タンパク質の最も異なる領域からの循環置換体(circular permutant)を表した。
Figure 2020506704
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精製された循環置換GTのレバウジオシドDおよびADP−グルコースに対する比活性の決定
まず、精製タンパク質10μLを、1mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および2mMのADP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら1〜4hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。
上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。4種の循環置換体のうち、配列番号106が最も高い比活性(毎分精製タンパク質1mg毎に形成されるRebMのμmol)を有し、配列番号100、および配列番号90がそれに続いた。配列番号78は検出可能な活性をほとんど有さなかった。したがって、配列番号105によってコードされるグリコシルトランスフェラーゼ(すなわち、配列番号106)がこれらの実験において、さらなる定向進化のための最良の候補循環置換AGTとして同定された。
(実施例6)
配列番号32のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号32に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。酵素のある特定の構造的特徴に関連する位置が変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号31によってコードされるGT(すなわち、配列番号32)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド60種の第3のラウンド(「ラウンド3.1」)をもたらした。
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号32改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物200μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの0.5mMのレバウジオシドDまたは1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量および0.5mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、100μL/ウェルの0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、4℃で10分遠心分離し、上清を実施例1、表1.1に記載の通りHPLC−MS/MSによって分析した。
操作されたポリペプチドを表6.1に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べて変異が番号付けられている。配列番号32と比べて表6.1に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、タンパク質精製のために振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する精製タンパク質特徴付けアッセイおよび分析
まず、精製タンパク質1μLを、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および2mMのADP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら1〜30hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。ステビオシドおよびレバウジオシドDについて表6.2に記載されている比活性を、反応進行曲線の直線部分から毎分精製タンパク質1mg毎に形成される産物のμmolとして決定した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
配列番号31によってコードされるGT(すなわち、配列番号32)の定向進化を、上記の活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、レバウジオシドDを用いた上記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド59種を伴うラウンド3.3をもたらした。操作されたポリペプチドを表6.3に列挙する。配列番号32と比べて表6.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、タンパク質精製のために振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する精製タンパク質特徴付けアッセイおよび分析
まず、精製タンパク質2μLを、1mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および2mMのADP−グルコースを伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら1〜18hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。
上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:50希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。表6.4に記載されているステビオシドに対する比活性を毎分精製タンパク質1mg毎に形成されるレバウジオシドA産物のμmolとして、および、レバウジオシドDに対する比活性を毎分精製タンパク質1mg毎に形成されるレバウジオシドM産物のμmolとして、反応進行曲線の直線部分から決定した。表6.4に列挙されている酵素は、0.8g/Lのステビオシドまたは1.3g/LのrebD、2モル濃度過剰のADP−グルコース、および35〜77mg/Lの精製タンパク質を用いて、18h未満で、RebMへのRebDの変換を>99%変換まで触媒し、RebAおよびRebIの混合物へのステビオシドの変換を>85%変換で触媒した。
Figure 2020506704
(実施例7)
AGT(配列番号232)を用いたレバウジオシドDからレバウジオシドMへの転換
実施例1に記載の通り、ポリペプチド配列番号232のタンパク質精製のために振とうフラスコ培養物250mLを成長させた。次いで、50%グリセロールストック2.4mLを、50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl2、2mMのADP−グルコース、および1mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)を伴う250mLのバッフルフラスコ中、総反応体積60mLに希釈した。Innova(登録商標)振とうインキュベーター中、30℃、250RPMで振とうしながら2hにわたって反応を実施し、ギ酸0.12mLを用いてクエンチしてpH<4にした。反応物を4℃、10,000RPMで10分の遠心分離によって沈殿させた。XAD−4樹脂(Sigma)6gを上清に添加し、振とうフラスコ中で2hインキュベートした。樹脂を濾過し、50:24:26の水:ACN:EtOH、16.3mLを用い、4hインキュベートし、再濾過することによって溶出させた。第2の溶出を50:50の水:EtOH、10mLを用いて実施し、これを濾過し、第1の溶出と組み合わせた。溶出液を回転蒸発によって約6mLまで濃縮し、WHATMAN(登録商標)UNIPREP(登録商標)シリンジレスフィルターを通して濾過し、表7.1に記載されている計器およびパラメータを使用してHPLCによって分画した。C18カラムから、保持時間5.8〜6.2分で画分を手動で採取した。画分をプールし、回転蒸発によって濃縮し、凍結乾燥した。次いで、試料をエタノール1.5mLに再懸濁させ、撹拌プレート上、80℃で2hインキュベートし、回転蒸発によって濃縮し、真空下、40℃で14h乾燥させた。試料をピリジン−d5に再懸濁させ、Acorn NMRにより実施された1H、COSY、およびHSQC NMRスペクトル取得のために使用した。
Figure 2020506704
単離された産物は、信頼できるレバウジオシドM標準物質(Chromadex、HPLCによる純度95.6%)のスペクトルとのスペクトル同一性に基づいて、レバウジオシドMであることが決定された。H NMRによると、試料中の交換可能なプロトンが標準物質のものよりも広範であり、試料は微量のメチル夾雑物を含有した。他の点では、試料と標準物質のスペクトルは同一であった。微量の不純物に関するもの以外は、試料と標準物質のCOSYおよびHSQCスペクトルは同一であった。HおよびH−13C HSQC スペクトル[δ6.44、δ5.85、δ5.524、δ5.518、δ5.49、δ5.34]から明らかな6つのアノマー位プロトンの存在により、構造内に6つの糖単位が存在することが確認され、これは、標準物質と一致し、β−アノマーコンフォメーションが示される。C2’およびC3’ヒドロキシル位における糖の付着は、C−19における2,3−分枝−D−グルコトリオシル置換基を示唆する、糖Iにおける比較的低磁場のH−2’の化学シフト(δ4.54)およびH−3’の化学シフト(δ5.15)によって裏付けられる(炭素番号付けについては図2を参照されたい)。ピーク割り当てを表7.2に列挙し、これは、H、COSY、およびHSQCスペクトルから決定され、文献(例えば、Prakashら、Nat. Prod. Comm.、11巻:1523〜6頁[2013年]を参照されたい)と比較したものである。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例8)
配列番号232のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号232に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号231によってコードされるGT(すなわち、配列番号232)の定向進化を、ラウンド3における活性改善に関連する表面残基変異が組み換えられたライブラリーを構築することによって行った。次いで、このライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド76種の第4のラウンド(「ラウンド4」)をもたらした。
ADP−グルコースからレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号232改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物2.5μLの溶解物添加量を用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの0.5mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量および0.5mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を、アッセイを1:10に希釈し、次いで、50μL/ウェルの0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチすることによってクエンチし、4℃で10分遠心分離し、上清を水中に1:10希釈し、実施例1、表1.1に記載の通りHPLC−MS/MSによって分析した。
操作されたポリペプチドを表8.1に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べて変異が番号付けられている。配列番号348、350、352、354、356、364、408、および428を有する改変体について、実施例1に記載の通り振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド4改変体のステビオシドおよびレバウジオシドDに対する活性を特徴付けるためにタイムコース実験を実施した。1g/Lの振とうフラスコ粉末(SFP)を、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および1mMのADP−グルコースを伴う、50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、2.5%v/vエタノールを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中30℃、300RPMで振とうしながら0.5〜2hにわたって反応を実施した。反応物を、0.2%ギ酸含有アセトニトリル50μLを添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:50希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。8種の改変体全てがステビオシドおよびレバウジオシドDの両方に対して配列番号232よりも高い活性を有した。1時間の時点での、配列番号232と比べた、改変体によってステビオシドから産生されたレバウジオシドAのレベルを表8.2に列挙する。
Figure 2020506704
8種の操作された改変体の活性は、レバウジオシドDに対して配列番号232の活性よりも明白に高かったが、互いとはタイムコース内で十分に区別されなかった。したがって、フォローアップ実験を以下の通り実施した:0.03〜1g/Lの振とうフラスコ粉末(SFP)の用量反応曲線を、1mMのレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および1mMのADP−グルコースを伴う、50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、2.5%v/vエタノールを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら0.5hにわたって反応を実施した。反応物を、0.2%ギ酸含有アセトニトリル50μLを添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:67希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。0.0625g/LのSFPの添加量でのラウンド4改変体のレバウジオシドDに対する活性を表8.3に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例9)
配列番号348のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号348に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号347によってコードされるGT(すなわち、配列番号348)の定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、かつ公的に利用可能なデータベース内のホモログから同定された変異が組み換えられたライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、6種がライブラリー5.01(表9.1)に由来し、18種がラウンドの残りのライブラリー(表9.2)に由来する、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第5のラウンド(「ラウンド5」)をもたらした。
ADP−グルコースからステビオール配糖体へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号348改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を前のラウンドで使用した250uLから400uLまで増大させ、溶解物を10倍に希釈した。ラウンド5.01に関しては、反応物100μL中溶解物10μLを用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotronタイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を、アッセイ物10μlを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離した。上清を水中に1:10希釈し、表9.3に記載の通りRapidFire SPE−MS/MS(Agilent)によって分析した。残りのラウンド5ライブラリーに関しては、溶解物を10倍ではなく4倍に希釈し、Tris−HClの代わりに50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7を使用し、温度を50℃にし、反応時間を2hにし、ステビオシドおよびレバウジオシドD(Chromadex、>93%)の両方を用いてアッセイを実施した。
操作されたポリペプチドを表9.1および表9.2に列挙する。親および改変体構築物はアフィニティー精製のためのN末端ヒスチジンタグを含有するが、明確にするために、タグが付されていない参照配列と比べて変異が番号付けられている。配列番号500について、実施例1に記載の通り振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
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ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施して、操作されたラウンド5改変体配列番号500の、配列番号348と比べたステビオシドおよびレバウジオシドDに対する活性を特徴付けた。0.03〜1g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および1mMのADP−グルコースを伴う、50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、2.5%v/vエタノールを含有する総反応体積100μLに添加した。サーモサイクラー中、40℃で0.5hにわたって反応を実施し、反応物を、0.2%ギ酸含有アセトニトリル50μLを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:67希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。1g/Lの添加量では、配列番号500は、配列番号348の>1.2倍のレバウジオシドAをステビオシドから産生させ、>1.07倍のレバウジオシドMをレバウジオシドDから産生させた。その後、配列番号499(すなわち、500)を再クローニングしてN末端ヒスチジンタグを削除し、ハイスループットに発現させ、プレートを400μL中に溶解させた。改変体配列番号548を含有する、得られた粉末を、配列番号500改変体と比べてアッセイし、これは、溶解物2.5μLを、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および1mMのADP−グルコースを伴う、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、2.5%v/vエタノールを含有する総反応体積100μLに添加することを伴った。Thermotron(登録商標)振とうインキュベーター中、50℃、300RPMで4hにわたって反応を実施し、反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関して表9.3に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。これらの条件下で、配列番号548改変体は、配列番号500改変体のほぼ1.5倍のレバウジオシドAをステビオシドから産生させ、1.6倍を超えるレバウジオシドMをレバウジオシドDから産生させた。
その後、配列番号548の改変体を含有する振とうフラスコ粉末を調製し、それを、配列番号348改変体と比べてアッセイした。0.25〜10g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、2mMのADP−グルコース、および1g/LのレバウジオシドA 60(60%レバウジオシドA、>35%ステビオシド)またはレバウジオシドD(Chromadex、>93%の純度)を含有する総反応体積100μLに添加した。サーモサイクラー中、40℃で1hにわたって反応を実施し、反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。配列番号548改変体は、レバウジオシドAとレバウジオシドIの混合物へのレバウジオシドA 60の>65%の変換、およびレバウジオシドMへのレバウジオシドDのほぼ完全な変換に達した。0.25g/Lの振とうフラスコ粉末添加量では、配列番号548改変体は、配列番号348改変体の1.4倍のレバウジオシドDの変換、および2.2倍のレバウジオシドA 60の変換に達した。
AGT酵素の発現解析
ステビオール配糖体のβ−1,3−グルコシル化のための、第6のラウンドの操作されたAGTポリペプチドをポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析して、相対的なタンパク質発現レベルを決定した。1×LDSローディング緩衝液および1×還元剤(Life Technologies)を用いて試料を調製した。4〜12%Bis−Trisアクリルアミドゲル(Life Technologies)を振とうフラスコ規模の培養物由来の凍結乾燥させた可溶性粗溶解物のレーン当たり5μgでローディングし、MES泳動緩衝液を200Vで25minにわたって泳動し、ImageJ解析ソフトウェアを使用してバンドを定量化した。相対的な発現レベルを表9.4に列挙する。配列番号547/548、499/500、および347/348は、有意により良好に発現した遺伝子および/または有意により良好にフォールディングされた/より安定なタンパク質である。したがって、これらの遺伝子は、野生型遺伝子よりも多くのタンパク質を産生させた。
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(実施例10)
AGT(配列番号500)を用いたレバウジオシドAからレバウジオシドIへの転換
本実施例では、配列番号500改変体を使用してレバウジオシドAをレバウジオシドIに転換する反応のスケールアップ、ならびにレバウジオシドIの単離および特徴付けを記載する。総体積10mLを有する、5g/Lの配列番号500改変体凍結乾燥振とうフラスコ粉末、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、10.3mMの塩化マグネシウム、10g/LのレバウジオシドA(>97%の純度)、および10.3mMのADP−グルコース(Sigma)を含有する反応物を撹拌プレート上、300RPMおよび35℃で89h撹拌した。反応物は反応開始時には透明であり、反応の終わりまでに白色エマルションになった。アッセイ物を水中に1:10希釈し、希釈したアッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加し、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。この分析により、レバウジオシドIの高い変換での産生が確認された。レバウジオシドIは、溶解度が低いので、底に沈んだ。したがって、上清を除去し、沈渣を最小体積の水に再懸濁させ、遠心分離することによって単離を行った。この洗浄ステップを2回繰り返し、白色沈渣の表面の褐色沈渣を削ぎ落した。材料を凍結乾燥させ、Acorn NMRによって分析した。材料をピリジン−d5中に溶解させ、H 1−D、13C DEPT−135、H−13C HSQC NMR実験をVarian Inova 500 NMR分光計を用いて実施した。NMRスペクトルはレバウジオシドIに関する文献による報告と完全に一致した(表10.1参照)。炭素が番号付けられたレバウジオシドIの構造に関しては図3を参照されたい。
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(実施例11)
配列番号548のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号548に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号547によってコードされるGT(すなわち、配列番号548)の定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられたライブラリーを構築することによって行った。次いで、このライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド66種の第6のラウンド(「ラウンド6」)をもたらした(表11.1)。
ADP−グルコースからステビオール配糖体へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号548改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積は400uLであり、溶解物を4倍に希釈した。アッセイを、反応物100μL中溶解物10μLを用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いて行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、アッセイ物10μlを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離した。上清を水中に1:10希釈し、表9.3に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。上位84種の改変体を、同じ条件を用い、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、またはレバウジオシドD(Chromadex、>93%の純度)を使用して再試験した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表11.1に列挙する。配列番号554、562、568、および576を有する改変体について、実施例1に記載の通り振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
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ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移に関する振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施して、操作されたラウンド6改変体のステビオシドおよびレバウジオシドDに対する活性を特徴付けた。0.03〜1g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)またはレバウジオシドD(ChromaDex、>93%の純度)および1mMのADP−グルコースを伴う、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、2.5%v/vエタノールを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotronタイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで1hにわたって反応を実施し、反応物を水150μLで希釈し、次いで、12.5μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル87.5μLに移すことによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:20希釈し、ステビオール配糖体に関して実施例9、表9.3に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。酵素の相対的な産生力を表11.2に列挙する。
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(実施例12)
配列番号562のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号562に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号561によってコードされるGT(すなわち、配列番号562)の定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられたライブラリーを構築することによって行った。次いで、このライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド37種の第7のラウンド(「ラウンド7」)をもたらした(表12.1)。
ADP−グルコースからステビオール配糖体へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号562改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積は400uLであり、溶解物を4倍に希釈した。アッセイを、反応物100μL中溶解物10μLを用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのステビオシド(ChromaDex、>94%の純度)の基質添加量、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いて行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を、アッセイ物10μlを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離した。上清を水中に1:10希釈し、表9.3に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。上位84種の改変体を、同じ条件を用い、1mMのステビオシド(Chromadex、>94%の純度)、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、またはレバウジオシドD(Chromadex、>93%の純度)を使用して再試験した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表12.1に列挙する。
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(実施例13)
グルコシル化活性を有するグリコシルトランスフェラーゼ酵素の合成、最適化、およびアッセイ
本実施例では、グルコシル化活性を有するUGT酵素の合成、最適化およびアッセイに使用する方法を記載する。
遺伝子合成および最適化
Oryza sativa Japonica、Solanum tuberosum、Lycium barbarum、およびSolanum lycopersicum由来のグリコシルトランスフェラーゼをコードするポリヌクレオチド配列をコドン最適化し、配列番号755、757、759、761、763、765、および767の遺伝子として合成した。これらの合成遺伝子を、pCK110900ベクター系にクローニングし(例えば、これによって参照により組み込まれる米国特許出願公開第2006/0195947号を参照されたい)、その後、E.coli W3110(ΔfhuA)において発現させた。E.coli株W3110にlacプロモーターの制御下でUGT酵素を発現させた。
振とうフラスコ粉末(SFP)の産生
振とうフラスコ手順を使用して、本明細書に記載の生体触媒プロセスにおいて使用される特徴付けアッセイのためのグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド振とうフラスコ粉末(SFP)を生成した。酵素の振とうフラスコ粉末(SFP)調製物により、HTPアッセイで使用される細胞溶解物と比較してより精製された酵素の調製物(例えば、総タンパク質の>30%に至るまで)がもたらされ、より濃縮された酵素溶液を使用することが可能になる。目的の操作されたポリペプチドをコードするプラスミドを含有するE.coliの単一のコロニーを、30μg/mlのクロラムフェニコールおよび1%グルコースを含有するLuria Bertaniブロス5mL中に接種した。細胞をインキュベーター中、30℃、250rpmで振とうしながら終夜(少なくとも16時間)成長させた。培養物を、1Lフラスコ中、30μg/mlのCAMを含有するTerrific Broth(12g/Lのバクトトリプトン、24g/Lの酵母抽出物、4mL/Lのグリセロール、65mMのリン酸カリウム、pH7.0、1mMのMgSO)250mL中に、600nmにおける光学濃度(OD600)が0.2になるまで希釈し、30℃で成長させた。
培養物のOD600が0.6〜0.8になったらIPTGを最終濃度1mMまで添加することによってグリコシルトランスフェラーゼ遺伝子の発現を誘導した。次いで、インキュベーションを終夜(少なくとも16時間)継続した。細胞を遠心分離(5000rpm、15min、4℃)によって収集し、上清を廃棄した。細胞ペレットを、2体積の25mMのトリエタノールアミン緩衝液、pH7.5に再懸濁させ、標準のE.coli溶解設定でMICROFLUIDIZER(登録商標)高圧ホモジナイザー(Microfluidics)を通過させ、4℃で維持した。細胞残屑を遠心分離(10,000rpm、45分、4℃)によって除去した。清澄化された溶解物上清を採取し、−80℃で凍結させ、次いで、His−アフィニティー精製し、透析して精製タンパク質を作製するか、または凍結乾燥して粗タンパク質の乾燥振とうフラスコ粉末を作製した。
精製タンパク質を用いたレバウジオシドAグルコシル化についてのアッセイ
まず、精製タンパク質50μLを50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMの塩化マグネシウム、1mMのレバウジオシドA、および0.5mMのウリジンジホスホグルコースからなる総反応体積200μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら18hにわたって反応を実施した。煮沸した酵素反応物を陰性対照として使用した。反応物10μLを、0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化されたレバウジオシドA産物を実施例1、表1.1に記載の通りLC−MS/MSによって検出した。
配列番号756、758、762、および768についてレバウジオシドAからのレバウジオシドDの産生が検出された。一部の酵素は、6連結分子レバウジオシドD2と同様にレバウジオシドDの位置異性体も産生させた。可溶性発現が不十分であったにもかかわらず、配列番号758は、ステビオール配糖体基質におけるβ−1,2−グルコース結合の生成に対して高い比活性および良好な選択性を示した。
振とうフラスコ粉末を用いたレバウジオシドAグルコシル化についてのアッセイ
凍結乾燥振とうフラスコ粉末を20mg/mLに再構成した。次いで、これらのストック10μLを、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、および2mMのウリジンジホスホグルコース(UDP−グルコース)を伴う、50mMのリン酸カリウム(KPhos)緩衝液、pH7、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら 16〜18hにわたって反応を実施した。配列番号758について、陰性対照を超える活性が検出された。LC−MS/MS分析ではレバウジオシドDへのレバウジオシドAの低変換(すなわち、<10%)が観察された。
(実施例14)
配列番号758のGT改変体
本実施例では、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号758に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号757によってコードされるGT(すなわち、配列番号758)の定向進化を、酵素の表面残基に関連する位置が変異誘発に供された改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ステビオール配糖体に対するβ−1,2−グルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド10種の第1のラウンド(「ラウンド1」)をもたらした。
HTPの成長、発現、および溶解物調製
細胞を96ウェルプレート中に採集し、1%グルコースおよび30μg/mLのCAMを含有するLB培地中、30℃、200rpm、85%湿度で終夜成長させた。次いで、終夜成長物20μLを、30μg/mLのCAMを含有するTB成長培地380μLを含有するディープウェルプレートに移し、1mMのIPTGを用いて誘導し、30℃、200rpm、85%湿度で18hインキュベートした。細胞培養物を4000rpm、4℃で10分遠心分離し、培地を廃棄した。こうして得られた細胞ペレットを−80℃で凍結させ、室温、タイタープレート振とう機で2h、低スピードで振とうしながら溶解緩衝液(20mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5中、0.5g/Lのリゾチームおよび0.5g/LのPMBS)250μL中に溶解させた。次いで、プレートを4000rpmおよび4℃で20min遠心分離し、清澄化された溶解物上清を下記のHTPアッセイ反応に使用した。
レバウジオシドAグルコシル化についてのHTPアッセイ
配列番号757改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、50%エタノール中20mMのストック溶液からの1mMのレバウジオシドA(Sigma、>96%の純度)の基質添加量、および0.5mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら4h。0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いて反応物をクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:20希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。レバウジオシドAからレバウジオシドDを配列番号758よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表14.1に列挙する。配列番号758と比べて表14.1に示されている以下のアミノ酸変異を有する改変体を分析するための凍結乾燥粉末産生のために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させた。
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レバウジオシドAグルコシル化についての振とうフラスコ溶解物の特徴付けアッセイおよび分析
まず、250mL振とうフラスコ培養物を成長させ、誘導し、溶解させた。細胞残屑を実施例1に記載の通り遠心分離によって除去し、清澄化された溶解物上清を採取した。次いで、溶解物10μLを、50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(Sigma、>96%の純度)、および2mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)の総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら0〜18hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:20希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
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配列番号770および772に対応する改変体は、レバウジオシドAからレバウジオシドDを配列番号758の改変体よりも大きな分量で産生させた。配列番号770の改変体がRebAに対して最も高い活性を示した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号769)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例15)
配列番号770のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号770改変体に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号769によってコードされるGT(すなわち、配列番号770)の定向進化を行った。ライブラリーは、実施例14において同定された有益な変異(ラウンド1)を組み換えたか、公的に利用可能なデータベース内のホモログ由来の多様性がコンビナトリアルに組み入れられたか、または酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第2のラウンド(「ラウンド2」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から10種同定され(表15.1)、飽和変異誘発から19種が同定され(表15.2)、表面残基およびホモログ多様性から53種が同定された(表15.3)。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号769改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドA(Sigma、>96%の純度)の基質添加量および4mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら18h。0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いて反応物をクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号770よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。組み換えられた有益な変異由来の操作されたポリペプチドを表15.1に列挙する。飽和変異誘発ライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表15.2に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
レバウジオシドAのグルコシル化についてのHTPアッセイ
残りのコンビナトリアルラウンド2ライブラリーを以下の通りスクリーニングした:配列番号769改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量または反応物100μL中4倍希釈溶解物10μLを用い、1mMのレバウジオシドA(Sigma、>96%の純度)の基質添加量および1mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら1〜2h。反応物を0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチしたか、または、反応物10μLを、0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:100または1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。レバウジオシドAからレバウジオシドDを配列番号770よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表15.3に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
レバウジオシドIのグルコシル化についてのHTPアッセイ
ラウンド2飽和変異誘発ライブラリー由来の88種の改変体を以下の通りスクリーニングした:配列番号769改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドI(実施例10に記載の通りレバウジオシドAから調製されたもの)の基質添加量および1mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotronタイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら66h。反応物を、反応物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、表15.5に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。レバウジオシドIからレバウジオシドMを配列番号770よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。上位2種の操作されたポリペプチドは、配列番号770と比べてそれぞれ変異F156RおよびG199Hを有する配列番号1292および1294であった。
振とうフラスコ規模の培養物を、表15.4に示されているアミノ酸変異を有する改変体(配列番号770と比べて)を分析するためのSFP産生のために実施例1に記載の通り成長させた。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末を再構成して20g/Lの粉末を提供した。次いで、これらのストック10μLを、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(Sigma、>96%の純度)、および4mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)を伴う50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、30℃、300RPMで振とうしながら0〜19hにわたって反応を実施した。反応物を実施例14に記載の通りクエンチし、沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:100希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
表15.4の改変体の全て(すなわち、配列番号790、792、794、および796の改変体)が、レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号770よりも大きな分量で産生させた。したがって、これらの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼ酵素により、レバウジオシドAのレバウジオシドDへのβ−グルコシル化のための新しい生体触媒試薬がもたらされる。これらの実験では、配列番号792の改変体が、ADP−グルコースを補基質として用いてレバウジオシドAに対して最も高い初期活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号791)をさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例16)
配列番号792のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号792に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。上記の前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号791によってコードされるGT(すなわち、配列番号792)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第3のラウンド(「ラウンド3」)をもたらした。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号792改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)の基質添加量および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら5〜6h。次いで、反応物10μLを、0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLを用いてクエンチし、4℃で10分遠心分離し、上清を実施例9、表9.3に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号792よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表16.1に列挙する。振とうフラスコ規模の培養物を、表16.1に示されている改変体を配列番号792と比べて分析するためのSFP産生のために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末を再構成して20g/Lの粉末を提供した。次いで、これらのストック10μLを、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、および2mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)を伴う50mMのKPhos緩衝液、pH7、総反応体積100μL中に希釈した。
Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら0〜21hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通りクエンチし、沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例1、表1.1に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表16.2の改変体の全て(すなわち、配列番号954、956、および990)が、レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号792よりも大きな分量で産生させた。これらの実験では、配列番号954の改変体が、ADP−グルコースを補基質として用いてレバウジオシドAに対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号953)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例17)
レバウジオシドIからレバウジオシドMへのグルコシル化を含めたステビオール配糖体グルコシル化のための、配列番号954のADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号954に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。上記の前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号953によってコードされるGT(すなわち、配列番号954)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第4のラウンド(「ラウンド4」)をもたらした。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
実施例13に記載の通り、溶解緩衝液400μLを用いて細胞を溶解させた。配列番号954改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物20μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)の基質添加量および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を実施例16に記載の通りクエンチし、上清を実施例9、表9.3に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号954よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表17.1に列挙する。振とうフラスコ規模の培養物を、表17.1に示されている以下のアミノ酸変異を有する改変体(配列番号150と比べて)を分析するためのSFP産生のために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末を再構成して50g/Lの粉末を提供した。次いで、これらのストック1μLを、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、および2mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)を伴う50mMのKPhos緩衝液、pH7、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら2hにわたって反応を実施した。次いで、反応物を水中に1:5希釈し、希釈した反応物25μLを、0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、RapidFire−MS/MSにより、実施例9、表9.3に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、配列番号1030を例外として、表17.2の他の全ての改変体(配列番号1054、1032、1028、1052、1058、1014、および1002)が、レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて配列番号954よりも大きな分量で産生させた。これらの実験では、配列番号954と比べて変異H97G、Q202G、およびN367Wを有する改変体(配列番号1054)が、ADP−グルコースを補基質として用いてレバウジオシドAに対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号1053)をさらなる定向進化のために選択した。
UDP−グルコースからレバウジオシドIへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末を再構成して50g/Lの粉末を提供した。次いで、これらのストック2μLを、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、および2mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)を伴う50mMのKPhos緩衝液、pH7、総反応体積100μL中に希釈した。Thermotronタイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら20hにわたって反応を実施した。次いで、反応物を、0.5体積/体積の0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いてクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:20希釈した後、LC−MS/MSにより、実施例15、表15.5に記載の計器およびパラメータを用いて検出した。
Figure 2020506704
配列番号954および表17.3の全ての改変体(配列番号1054、1032、1028、1052、1014、1002、および1030)が、レバウジオシドIからレバウジオシドMをUDP−グルコースを用いて陰性対照を上回るレベルで産生させた。配列番号1002、1032、および1058は、レバウジオシドIからレバウジオシドMをUDP−グルコースを用いて配列番号954によるレベルと同等のレベルまたはそれを上回るレベルで産生させた。配列番号954と比べて変異P175S、T211E、S264A、V279L、I316V、およびL323Vを有する改変体(配列番号1002)が、UDP−グルコースを補基質として用いてレバウジオシドIに対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号1001)を、レバウジオシドIからレバウジオシドMへの転換に関するさらなる定向進化のために選択した。
(実施例18)
配列番号74のスクロースシンターゼ改変体
本実施例では、スクロースおよびADPからのADP−グルコースの産物の改善のための、配列番号73に由来するスクロースシンターゼ(SuS)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号73によってコードされるSuS(すなわち、配列番号74)の定向進化を、酵素のある特定の構造的特徴に関連する位置が飽和変異誘発に供され、公的に利用可能なデータベース内のホモログ由来の多様性が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、37種の、ADP−グルコースの合成に対する活性が改善された操作されたSuS改変体ポリペプチドの第1のラウンド(「ラウンド1」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号73改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、水中60%ストック溶液からの30%w/vスクロース(Sigma)の基質添加量および2mMのADP(Sigma、>95%)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのTris−HCl緩衝液、pH7.5、3mMのMgCl、サーモサイクラー中、30℃で2h。反応物を、95℃で10分にわたって熱クエンチし、次いで、文献から適応させた比色定量D−フルクトースデヒドロゲナーゼアッセイによって分析した(例えば、Ameyamaら、J. Bacteriol.、145巻:814〜823頁[1981年];およびAmeyama、Meth. Enzymol.、89巻:20〜29頁[1982年]を参照されたい)。簡単に述べると、フルクトース濃度が<1g/Lになるように希釈した試料20μL、100mMのフェリシアン化カリウム(Sigma P−8131)20μL、および0.8単位/mLのフルクトースデヒドロゲナーゼ(Sigma F4892)160μLを0.1%Triton X−100を伴うpH4.6、McIlvaine緩衝液に溶解させた96ウェルプレートにおいて終夜酵素カップリングアッセイを行った。この反応ではフルクトースがKFe(CN)に定量的に変換され、次いでこれを、終夜反応物67μLを停止液(0.3%w/vドデシル硫酸ナトリウム、Sigma L−4509、8.1%v/vリン酸、Sigma P−6560、および0.5%w/v硫酸第二鉄、Sigma F−1135)33μLに添加し、20分にわたって振とうしてKFe(CN)をプルシアンブルーに完全に変換させ、波長690nmにおけるその吸光度をプレートリーダーで読み取ることによって比色定量により定量化する。
一次アッセイ後、配列番号74よりも高いフルクトース形成活性、したがってより高い化学量論的ADP−グルコース形成活性を有する操作されたスクロースシンターゼ(SuS)改変体ポリペプチド84種を、2%w/vスクロース(Sigma)の低基質負荷量および1mMのADP(Sigma、>95%)の補基質負荷量で、3連でスクリーニングした。操作されたポリペプチドを表18.1に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例19)
配列番号1080のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1079によってコードされるSuS(すなわち、配列番号1080)の定向進化を、上記の活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーおよび追加的なホモログ多様性が組み換えられたライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、実施例18に記載のハイスループット(HTP)アッセイを使用し、低基質負荷量でスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド34種の第2のラウンド(「ラウンド2」)をもたらした。
一次スクリーニング後、同じ条件下で以下の改変を伴って、42種の改変体を2連で再試験し、56種の改変体を3連で再試験した:50mMのTris−HCl、pH7.5を50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7に変更し、温度を50℃に上昇させた。実施例18に記載のフルクトースデヒドロゲナーゼアッセイを使用して、フルクトース産生を化学量論的ADP−グルコースの代理として定量化した。得られた操作されたポリペプチドを表19.1に列挙する。表19.1に示されているアミノ酸変異を有する改変体(配列番号1080と比べて)について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
SuSによってスクロースおよびADPから産生されたADP−グルコースを使用したレバウジオシドAのグルコシル化についてのカップリングアッセイを用いたSuS振とうフラスコ粉末の特徴付け
まず、SuS凍結乾燥振とうフラスコ粉末を水中に再構成し、総反応体積中タンパク質0.025〜1g/Lにわたる最終濃度に添加した。反応条件は以下の通りであった:1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、10mMのスクロース(Sigma)、および1mMのADP(Sigma)を伴う、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl。ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移を触媒するために添加したGTは、配列番号548、総反応体積100μL中、最終濃度2g/Lであった。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、実施例9、表9.3に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。カップリング振とうフラスコ粉末アッセイにおいてレバウジオシドAから産生されたレバウジオシドIの相対レベルを表19.2に列挙する。
Figure 2020506704
(実施例20)
配列番号1158のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1157によってコードされるSuS(すなわち、配列番号1158)の定向進化を、上記の活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド34種の第3のラウンド(「ラウンド3」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のハイスループット(HTP)酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした:1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)の基質添加量ならびに1mMのADP(Sigma、>95%)および10mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量を伴う、反応体積100μL中、SuS溶解物10μLおよび2g/LのGT配列番号548。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。上記の反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体産物を、実施例9、表9.3に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性を示した操作されたSuS改変体ポリペプチド56種を、同じ条件を用い、溶解物負荷量を2.5分の1に減少させて、3連で再試験した。得られた操作されたポリペプチドを表20.1に列挙する。
表20.1に示されているアミノ酸変異を有する改変体(配列番号1158と比べて)について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
SuSによってスクロースおよびADPから産生されたADP−グルコースを使用したレバウジオシドAのグルコシル化についてのカップリングアッセイを用いたSuS振とうフラスコ粉末の特徴付け
まず、SuS凍結乾燥振とうフラスコ粉末を水中に再構成し、総反応体積中タンパク質0.025〜5g/Lにわたる最終濃度に添加した。反応条件は以下の通りであった:1g/LのレバウジオシドD、10mMのスクロース(Sigma)、および1mMのADP(Sigma)を伴う、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl。ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移を触媒するために添加したGTは、配列番号561/562、総反応体積100μL中最終濃度1g/Lであった。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1hにわたって反応を実施した。上記の反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清中のグリコシル化された産物を、水中に1:10希釈した後、実施例9、表9.3に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。カップリング振とうフラスコ粉末アッセイにおいてレバウジオシドDから産生されたレバウジオシドMの相対レベルを表20.2に列挙する。
Figure 2020506704
SuS酵素の発現解析
スクロースを用いたADP再利用のための操作されたSuSポリペプチドの3ラウンドをポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析して、相対的なタンパク質発現レベルを決定した。1×LDSローディング緩衝液および1×還元剤(Life Technologies)を用いて試料を調製した。4〜12%Bis−Trisアクリルアミドゲル(Life Technologies)を、振とうフラスコ規模の培養物由来の凍結乾燥させた可溶性粗溶解物のレーン当たり5μgでローディングし、MES泳動緩衝液を200Vで25minにわたって泳動し、ImageJ解析ソフトウェアを使用してバンドを定量化した。相対的な発現レベルを表20.3に列挙する。配列番号1079/1080、1157/1158、および1221/1222は、有意により良好に発現した遺伝子および/または有意により良好にフォールディングされた/より安定なタンパク質である。これらは、野生型遺伝子よりも多くのタンパク質を産生する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例21)
AGTおよびACSuSを用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換
本実施例では、AGTおよびACSuSを使用してレバウジオシドAを産生するために行った実験を記載する。使用した緩衝液は、3mMのMgSOを伴う50mMのpH7.0リン酸カリウムであった。酵素およびスクロースストック溶液(400g/L)を緩衝液中に調製した。「Reb A 60」は、ステビオシドとレバウジオシドAそれぞれ約1:2の混合物であった。空気下のバイアルに、400g/Lのスクロース中、8g/Lのβ−1,3−GT配列番号1290ストック溶液250μL、2g/LのSuS配列番号1158ストック溶液250μLならびに50g/LのReb A 60および2.6g/LのADPストック溶液500μLを添加した。最終組成は、25g/LのReb A 60、200g/Lのスクロース、2g/Lの配列番号1290、0.5g/Lの配列番号1158、および1.3g/L(3mM)のADPであった。得られた清澄な均一の溶液を空気下で撹拌した(沈殿物が形成されるに伴って反応物が徐々に濁った)。アリコートを取ることによって反応の進行を追跡し、1:1アセトニトリル/水を用いてクエンチした。4000rpm/r.t./5minで遠心分離した後、清澄な均一の上清を、表21.1および表21.2に列挙されている計器およびパラメータを使用してHPLCによって分析した。48h後、反応混合物は、>90%Reb Aからなった(表21.3)。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例22)
AGTおよびACSuSを用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換およびレバウジオシドAからレバウジオシドDへの転換
本実施例では、レバウジオシドAおよびレバウジオシドDを産生するために行った実験を記載する。空気下のバイアルに、400g/Lのスクロース中、20g/Lのβ−1,3−GT配列番号1290ストック溶液250μL、40g/Lのβ−1,2−GT配列番号954ストック溶液250μLならびに20g/LのReb A 60、2.6g/LのADPおよび1g/LのSuS配列番号1158ストック溶液500μLを添加した。使用した緩衝液は、3mMのMgSOを伴う50mMのpH7.0リン酸カリウムであった。酵素およびスクロースストック溶液(400g/L)を緩衝液中に調製した。最終組成は、10g/LのReb A 60、200g/Lのスクロース、5g/Lの配列番号1290、10g/Lの配列番号954、0.5g/Lの配列番号1158、および1.3g/L(3mM)のADPであった。得られた清澄な均一の溶液を空気下で撹拌した(沈殿物が形成されるに伴って反応物が徐々に濁った)。アリコートを取ることによって反応の進行を追跡し、1:1アセトニトリル/水を用いてクエンチした。4000rpm/r.t./5minで遠心分離した後、清澄な均一の上清を、表21.1および表21.2に列挙されている計器およびパラメータを使用してHPLCによって分析した。24h後、ステビオシドは残っておらず、16%のReb Dの形成が観察された(表22.1)。
Figure 2020506704
(実施例23)
AGTおよびACSuSを用いたレバウジオシドDからレバウジオシドMへの転換
本実施例では、AGTおよびACSuS改変体を使用してレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生するために行った実験を記載する。空気下のバイアルに、400g/Lのスクロース中、Reb D、100mg、80g/Lのβ−1,3−GT配列番号548ストック溶液250μL、10g/LのSuS配列番号1158ストック溶液250μLおよび2.6g/LのADPストック溶液500μLを添加した。使用した緩衝液は、3mMのMgSOを伴う50mMのpH7.0リン酸カリウムであった。酵素およびスクロースストック溶液(400g/L)を緩衝液中に調製した。最終組成は、100g/LのReb D、200g/Lのスクロース、20g/Lの配列番号548、2.5g/Lの配列番号1158、および1.3g/L(3mM)のADPであった。得られた濃いスラリーを空気下で撹拌した。アリコートを取ることによって反応の進行を追跡し、1:1アセトニトリル/水を用いてクエンチした。4000rpm/r.t./5minで遠心分離した後、清澄な均一の上清を、表21.1および表21.2に列挙されている計器およびパラメータを使用してHPLCによって分析した。48h後、反応混合物は、>90%Reb Mからなった(表23.1)。
Figure 2020506704
(実施例24)
AGTおよびACSuSを用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換、レバウジオシドAからレバウジオシドDへの転換、およびレバウジオシドDからレバウジオシドMへの転換
本実施例では、ステビオシドからレバウジオシドAを産生し、レバウジオシドAからレバウジオシドDを産生し、レバウジオシドDからレバウジオシドMを産生するために行った実験を記載する。空気下のバイアルに、400g/Lのスクロース中、20g/Lのβ−1,3−GT配列番号1290ストック溶液250μL、40g/Lのβ−1,2−GT配列番号954ストック溶液250μL、ならびに50g/LのReb A 60、2.6g/LのADP、5g/Lのβ−1,3−GT配列番号548、および1g/LのSuS配列番号1158ストック溶液500μLを添加した。使用した緩衝液は、3mMのMgSOを伴う50mMのpH7.0リン酸カリウムであった。酵素およびスクロースストック溶液(400g/L)を緩衝液中に調製した。最終組成は、25g/LのReb A 60、200g/Lのスクロース、5g/Lの配列番号1290、10g/Lの配列番号954、2.5g/Lの配列番号548、0.5g/Lの配列番号1158および1.3g/L(3mM)のADPであった。得られた清澄な均一の溶液を空気下で撹拌した(沈殿物が形成されるに伴って反応物が徐々に濁った)。アリコートを取ることによって反応の進行を追跡し、1:1アセトニトリル/水を用いてクエンチした。4000rpm/r.t./5minで遠心分離した後、清澄な均一の上清を、表21.1および表21.2に列挙されている計器およびパラメータを使用してHPLCによって分析した。24h後、<5%ステビオシドが残っており、9%のReb Mの形成が観察された(表24.1)。
Figure 2020506704
(実施例25)
AGTおよび/またはACSuSの固定化
本実施例では、AGT(例えば、配列番号1290、954、および/または548の改変体)および/またはACSuS改変体(例えば、配列番号1158)を固定化するために行った実験を記載する。容器に、単独でまたは酵素の組合せとして(すなわち、AGTおよび/またはACSuS酵素)のいずれかの酵素溶液、および固体支持体を添加する。固体支持体は、カチオン性、アニオン性、疎水性、親水性であり、チオール、アルコール、アミン、オレフィン、ハロゲン化アルキルおよび/またはエポキシドなどの、共有結合を形成する官能基の存在を伴うまたは伴わない。固体支持体は、別個のポリマー樹脂または無定形(ナノ)粘土または活性炭のいずれかである。産物の単離/酵素の再利用に適する場合には磁気粒子が使用される。反応は、グルタルアルデヒドの存在下または不在下で行われる。固体支持体による酵素取り込みの進行をBradfordアッセイによって追跡する。あるいは、固体支持体をカラム内に充填し、酵素溶液をカラムを通して流し、必要であれば、所望の程度の酵素捕捉に到達するまで、再利用する。一部の実施形態では目的の酵素全てを同じ反応容器中で同じ固体支持体上に固定化するが、一部の代替的な実施形態では酵素を別々の容器に個別に固定化するか、またはこれらの組合せである。一部の実施形態では、固定化された酵素を濾過によって単離するか、または、緩衝液、スクロース、ADPおよび基質を固定化反応混合物に添加することによってすぐに使用する。
(実施例26)
固定化されたAGTおよび/またはACSuSならびに糖溶液の再利用を用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換
本実施例では、固定化されたAGT(例えば、配列番号1290)およびACSuS(例えば、配列番号1158)、ならびに糖溶液の再利用を使用した、ステビオシドからレバウジオシドAへの転換を記載する。容器に、固定化されたβ−1,3−GT(例えば、配列番号1290)および固定化されたSuS(例えば、配列番号1158)を添加する。あるいは、一部の実施形態では、酵素の一方を固定化された形態で使用し、他方を溶液形態で使用する。緩衝液、スクロース、ADPおよび基質(すなわち、ステビオシドまたはReb A 60)の添加後、所望の変換に到達するまで反応をモニタリングする。一部の実施形態では、産物および固定化された酵素を濾過によって単離する。一部の実施形態では、固定化された酵素を、遠心分離、粒子サイズ濾過または磁気回収のいずれかによって産物からさらに分離し、再使用する。糖濾液を次の反復のために容器に戻す。
(実施例27)
固定化されたAGTおよび/またはACSuSならびに糖溶液の再利用を用いた、レバウジオシドAからレバウジオシドDへの転換
本実施例では、固定化されたAGTおよびACSuS、ならびに糖溶液の再利用を用いてレバウジオシドDからレバウジオシドDを産生するために行った実験を記載する。容器に、固定化されたβ−1,2−GT(例えば、配列番号954)および固定化されたSuS(例えば、配列番号1158)を添加する。あるいは、一部の実施形態では、酵素の一方を固定化された形態で使用し、他方を溶液形態で使用する。緩衝液、スクロース、ADPおよび基質(ステビオシドまたはReb A 60)の添加後、所望の変換に到達するまで反応をモニタリングする。一部の実施形態では、産物および固定化された酵素を濾過によって単離する。一部の実施形態では、固定化された酵素を、遠心分離、粒子サイズ濾過または磁気回収のいずれかによって産物からさらに分離し、再使用する。糖濾液を次の反復のために容器に戻す。
(実施例28)
固定化されたAGTおよび/またはACSuSならびに糖溶液の再利用を用いた、レバウジオシドDからレバウジオシドMへの転換
本実施例では、固定化されたAGTおよびACSuS、ならびに糖溶液の再利用を用いてレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生するために行った実験を記載する。容器に、固定化されたβ−1,3−GT(例えば、配列番号548)および固定化されたSuS(例えば、配列番号1158)を添加する。あるいは、一部の実施形態では、酵素の一方を固定化された形態で使用し、他方を溶液形態で使用する。緩衝液、スクロース、ADPおよびReb Dの添加後、所望の変換に到達するまで反応をモニタリングする。一部の実施形態では、産物および固定化された酵素を濾過によって単離する。一部のさらなる実施形態では、固定化された酵素を、遠心分離、粒子サイズ濾過または磁気回収のいずれかによって産物からさらに分離し、再使用する。糖濾液を次の反復のために容器に戻す。
(実施例29)
固定化されたAGTおよびACSuSならびに糖溶液の再利用を用いたステビオシドからレバウジオシドAへの転換およびレバウジオシドAからレバウジオシドDへの転換
本実施例では、固定化されたAGTおよびACSuS、ならびに糖溶液の再利用を用いて、ステビオシドからレバウジオシドAを産生し、レバウジオシドAからレバウジオシドDを産生するために行った実験を記載する。容器に、固定化されたβ−1,3−GT(例えば、配列番号1290)およびβ−1,2−GT(例えば、配列番号954)および固定化されたSuS(例えば、配列番号1158)を添加する。あるいは、これらの酵素の1つまたは2つを固定化された形態で使用し、他の酵素を溶液形態で使用する。緩衝液、スクロース、ADPおよび基質(ステビオシドまたはReb A 60)の添加後、所望の変換に到達するまで反応をモニタリングする。一部の実施形態では、産物および固定化された酵素を濾過によって単離する。一部の実施形態では、固定化された酵素を、遠心分離、粒子サイズ濾過または磁気回収のいずれかによって産物からさらに分離し、再使用する。糖濾液を次の反復のために容器に戻す。
(実施例30)
固定化されたAGTおよびACSuSならびに糖溶液の再利用を用いた、ステビオシドからレバウジオシドAへの転換、レバウジオシドAからレバウジオシドDへの転換、およびレバウジオシドDからレバウジオシドMへの転換
容器に、固定化されたβ−1,3−GT(例えば、配列番号1290)、β−1,2−GT(例えば、配列番号954)、β−1,3−GT(例えば、配列番号548)、および固定化されたSuS(例えば、配列番号1158)を添加する。あるいは、一部の実施形態では、これらの酵素のうちの1つ、2つまたは3つを固定化された形態で使用し、他の酵素を溶液形態で使用する。緩衝液、スクロース、ADPおよび基質(ステビオシドまたはReb A 60)の添加後、所望の変換に到達するまで反応をモニタリングする。一部の実施形態では、産物および固定化された酵素を濾過によって単離する。一部の実施形態では、固定化された酵素を、遠心分離、粒子サイズ濾過または磁気回収のいずれかによって産物からさらに分離し、再使用する。糖濾液を次の反復のために容器に戻す。
(実施例31)
配列番号1222のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1222によってコードされるSuSの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド49種の第4のラウンド(「ラウンド4」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、250μLに溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をTris−HCl、pH7.5中に20倍希釈した。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよび2g/LのGT配列番号696(Rd8BB)を、約1mMのレバウジオシドDの基質添加量ならびに1MmのADP(Sigma、>95%)および10mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量と共に、反応体積100μLに組み合わせた。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら2h。上記の反応物を、アッセイ混合物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に10倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドDに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを49種同定した。得られた操作されたポリペプチドを表31.2に列挙する。表31.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために以下に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
振とうフラスコ粉末(SFP)の産生
振とうフラスコ手順を使用して、本明細書に記載の生体触媒プロセスにおいて使用される特徴付けアッセイのためのグリコシルトランスフェラーゼポリペプチド振とうフラスコ粉末(SFP)を生成した。酵素の振とうフラスコ粉末(SFP)調製物により、HTPアッセイで使用される細胞溶解物と比較してより精製された酵素の調製物(例えば、総タンパク質の>30%に至るまで)がもたらされ、より濃縮された酵素溶液の使用も可能になる。目的の操作されたポリペプチドをコードするプラスミドを含有するE.coliの単一のコロニーを、30μg/mlのクロラムフェニコールおよび1%グルコースを含有するLuria Bertaniブロス5mL中に接種した。細胞をインキュベーター中、30℃、250rpmで振とうしながら終夜(少なくとも16時間)成長させた。培養物を、1Lフラスコ中、30μg/mlのCAMを含有するTerrific Broth(12g/Lのバクトトリプトン、24g/Lの酵母抽出物、4mL/Lのグリセロール、65mMのリン酸カリウム、pH7.0、1mMのMgSO)250mLに、600nmにおける光学濃度(OD600)0.2まで希釈し、30℃で成長させた。
スクロースからレバウジオシドDへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドDからのレバウジオシドMの形成を容易にするための、操作されたラウンド4 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMの塩化マグネシウム、1g/LのレバウジオシドD、10mMのスクロース、1mMのADP、および2g/LのGT配列番号734を含有する総反応体積100μLに0.125g/Lの濃度で添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1hにわたって反応を実施した。反応物を、反応混合物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に10倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。少なくとも3種の改変体が配列番号1222よりも高い活性を有した。配列番号1222と比べた、改変体によってレバウジオシドDから産生されたレバウジオシドMのレベルを表31.3に列挙する。変異H47L、R93V、P358E、I372V、W375Y、R440P、およびK724Hを有する改変体(配列番号1392)が、配列番号1222と比べて、最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号1391)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例32)
配列番号1392のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1391によってコードされるSuSの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド86種の第5のラウンド(「ラウンド5」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLに溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物を、約1mMのレバウジオシドDの基質添加量ならびに1mMのADP(Sigma、>95%)および10mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量を伴う、反応体積100μL中、Tris−HCl、pH7.5、希釈したSuS溶解物10μLおよび2g/LのGT配列番号4684(Rd9BB)中に25〜60倍希釈した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl2、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。上記の反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に10倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。
分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドDに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを86種同定した。得られた操作されたポリペプチドを表32.1に列挙する。表32.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために以下に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドDへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドDからのレバウジオシドMの形成を容易にするための、操作されたラウンド4 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMの塩化マグネシウム、1g/LのレバウジオシドD、10mMのスクロース、1mMのADP、および2g/LのGT配列番号4684を含有する総反応混合物体積100μLに、0.05g/Lの濃度で添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1〜2hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に2.5倍希釈することによって可溶化し、希釈した反応物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.33倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。表32.2の改変体の全てが配列番号1392よりも高い活性を有した。配列番号1392と比べた、改変体によってレバウジオシドDから産生されたレバウジオシドMのレベルを表32.2に列挙する。配列番号1392と比べて変異V68A、L98V、R129E、R154H、およびA635Sを有する改変体(配列番号1455)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例33)
配列番号1456のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1455によってコードされるSuSの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド16種の第6のラウンド(「ラウンド6」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLに溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をTris−HCl、pH7.5中に30倍希釈した。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよび1g/LのGT配列番号2814(Rd8BB)を、4.5mMのレバウジオシドA97の基質添加量ならびに0.25mMのADP(Sigma、>95%)および10mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量と共に、反応体積100μLに組み合わせた。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。上記の反応物を、アッセイ混合物10μLを水90μLに添加することによって可溶化し、可溶化したアッセイ混合物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に7.3倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。
分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを16種同定した。得られた操作されたポリペプチドを表33.1に列挙する。表33.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド6 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、4.5mMのレバウジオシドA97、30mMのスクロース、0.25mMのADP、および1g/LのGT配列番号2814を含有する総反応体積100μLに0.01g/Lの濃度で添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1〜2hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に10倍希釈することによって可溶化し、希釈した反応物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に4.4倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。少なくとも4種の改変体が配列番号1456よりも高い活性を有した。配列番号1456と比べた、改変体によってレバウジオシドAから産生されたレバウジオシドDのレベルを表33.2に列挙する。配列番号1456と比べて変異Y17D、G54D、S161T、F519T、L727E、およびA738Eを有する改変体(配列番号1582)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例34)
配列番号1582のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1581によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド87種の第7のラウンド(「ラウンド7」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
コンビナトリアルライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をTris−HCl、pH7.5中に約90倍希釈した。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよび1g/LのGT配列番号2884(Rd9BB)を、4.5〜7.5mMのレバウジオシドA97の基質添加量ならびに0.2〜0.25mMのADP(Sigma、>95%)および30mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量と共に、反応体積100μLに組み合わせた。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2h。上記の反応物を、アッセイ物10μLを水90〜190μLに添加することによって可溶化し、可溶化したアッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に4.4〜6.7倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。
分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを87種同定した。得られた操作されたポリペプチドを表34.1に列挙する。表34.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド7 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、7.5mMのレバウジオシドA97、30mMのスクロース、0.2mMのADP、および1g/LのGT配列番号2884を含有する総反応体積100μLに0.02g/Lの濃度で添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、希釈した反応物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に4.4倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。少なくとも3種の改変体が配列番号1582よりも高い活性を有した。配列番号1582と比べた、改変体によってレバウジオシドAから産生されたレバウジオシドDのレベルを表34.2に列挙する。配列番号1582と比べて変異F160W、Q381S、R550Q、L636Q、およびA681Vを有する改変体(配列番号1764)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例35)
配列番号1764のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1763によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性を有する操作されたSuS改変体ポリペプチド24種の第8のラウンドおよび第9のラウンド(「ラウンド8」および「ラウンド9」)をもたらした。
ラウンド8についてのスクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
コンビナトリアルライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をTris−HCl、pH7.5中に15倍希釈した。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよび1g/LのGT配列番号2884(Rd9BB)を、15mMのレバウジオシドA97の基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>93%)および45mMのスクロース(ショ糖)の補基質添加量と共に、反応体積100μLに組み合わせた。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2h。上記の反応物を、アッセイ物10μLを水390μLに添加することによって可溶化し、可溶化したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル180μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。配列番号1764と比べて実質的に改善されたコンビナトリアル改変体は同定されず、したがって、別のコンビナトリアルおよび飽和変異誘発ライブラリーの組を、同じ骨格を使用して生成し、この組を「ラウンド9」と名付けた。
ラウンド9についてのスクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
コンビナトリアルライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。希釈していない溶解物(飽和変異誘発ライブラリー)または32×(ラウンド9コンビナトリアルライブラリー)をTris−HCl、pH7.5に添加した。ラウンド9ライブラリー溶解物を62℃で1h(コンビナトリアルライブラリー)または3.75h(飽和変異誘発ライブラリー)プレインキュベートして酵素を熱的に攻撃した。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよび1g/LのGT配列番号3244(Rd12B)を、15mMのレバウジオシドA97の基質添加量、0.2mMのADP(Sigma、>95%)、45mMのスクロース(ショ糖)、および9mMのフルクトース(Sigma)の補基質添加量と共に、反応体積100μLに組み合わせた。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら2〜3h。上記の反応物を、アッセイ物10μLを水390μLに添加することによって可溶化し、可溶化したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル180μLに添加することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを24種同定した。得られた操作されたポリペプチドを表35.1に列挙する。表35.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド9 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、45mMのスクロース、9mMのフルクトース、0.2mMのADP、および1g/LのGT配列番号3244を含有する総反応体積100μLに0.006〜0.2g/Lの濃度で添加した。プレインキュベーションを伴わずに、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら2hにわたって反応を実施した、またはSFPをpH6リン酸カリウム緩衝液中10倍の最終濃度、62℃で1hプレインキュベートした後、60℃で反応を2h行った。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。表35.2に列挙されている改変体8種全てが配列番号1764よりも高い活性を有した。配列番号1764と比べて変異G181N、A548P、H705Pを有する改変体(配列番号1804)が最も有益な変異を有し、これを、スクロースからADPにグルコシルを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例36)
配列番号1804のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1803によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド82種の第10のラウンド(「ラウンド10」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に20倍希釈し、64℃(コンビナトリアルライブラリー)または65℃(飽和変異誘発ライブラリー)で15分プレインキュベートした。次いで、希釈したSuS溶解物10μLおよびそれぞれ0.5〜1g/LのGT配列番号3696または3502を、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのADP(Sigma、>93%)、45mMのスクロース(ショ糖)、および9mMのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら3h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体産物を表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表36.1に列挙されている。表36.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド10 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)をリン酸カリウム緩衝液、pH6中0.06〜2g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中、64℃で15分プレインキュベートした。次いで、これらのSFP希釈物10μLをプレインキュベートするかまたはプレインキュベートせずに、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、45mMのスクロース、9mMのフルクトース、0.2mMのADP、および1g/LのGT配列番号3696を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしていないSFP試料については55℃で、およびプレインキュベートしたSFPについては60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら3hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。プレインキュベートした条件下では表36.2に列挙されている改変体7種全てが配列番号1804よりも高い活性を有し、55℃条件下では1種を除いて全てが同様に高い活性を有した。変異P517AおよびV681Aを有する改変体(配列番号1840)が両方の条件下で配列番号1804と比べて最も改善され、したがって、これを、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例37)
配列番号1840のスクロースシンターゼ改変体
配列番号1839によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド167種の第11のラウンド(「ラウンド11」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中10〜20倍希釈し、66℃で15分プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μLおよび0.5g/LのGT配列番号3696または3956を、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのADP(Amresco、>93%)、45mMのスクロース(ショ糖)、および9mMのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中5〜10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に希釈して、約10μMのステビオール配糖体およびステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表37.1および37.2に列挙されている。表37.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド11 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)をリン酸カリウム緩衝液、pH6中0.03〜1g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中66℃で15分プレインキュベートした。次いで、これらのSFP希釈物10μLをプレインキュベートするかまたはプレインキュベートせずに、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、45mMのスクロース、9mMのフルクトース、0.2mMのADP、および0.5g/LのGT配列番号3956を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしていないSFP試料については55℃で、およびプレインキュベートしたSFPについては60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。プレインキュベートした条件下では表37.3に列挙されている改変体8種全てが配列番号1840よりも高い活性を有し、55℃条件下では3種を除いて全てが同様に高い活性を有した。両方の条件下で配列番号1840と比べて改善された、変異D17R、D52P、L388K、G589S、E738S、およびD765Sを有する改変体(配列番号2064)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例38)
配列番号2064のスクロースシンターゼ改変体
配列番号2063によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド92種の第12のラウンド(「ラウンド12」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物をリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に10倍希釈し、68℃で15分プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μLおよび0.5g/LのGT配列番号3956または4256を、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのADP(Amresco、>93%)、37.5mMのスクロース(ショ糖)、および9mMのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に7.5倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表38.1および38.2に列挙されている。表38.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド12 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)をリン酸カリウム緩衝液、pH6中0.03〜1g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中、68℃で15分プレインキュベートした。次いで、これらのSFP希釈物10μLをプレインキュベートするかまたはプレインキュベートせずに、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、37.5mMのスクロース、9mMのフルクトース、0.2mMのADP、および0.5g/LのGT配列番号4256を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしていないSFP試料については55℃で、およびプレインキュベートしたSFPについては60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に10倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。凍結乾燥前に、以下の通り、清澄化した振とうフラスコ溶解物を用いてさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を緩衝液中に400倍希釈し、サーモサイクラー中、55〜70℃の勾配で16〜18hインキュベートした。%残存活性を決定するために、プレインキュベートした溶解物を、ステビオシドまたはレバウジオシドDのいずれか、および55℃で4hのインキュベーションを用いて上記の通りアッセイした。パーセント残存活性を、高温での活性を最低プレインキュベート温度での活性で割ったものとして表した。プレインキュベートした条件下では表38.3に列挙されている改変体7種全てが配列番号2064よりも高い活性を有し、55℃条件下では、2種が同様に有害性が低かった。全ての条件下で配列番号2064と比べて改善され、かつラウンド10飽和変異誘発スクリーニング由来の上位の変異を含有した、変異P57W、L562I、およびR711Kを有する改変体(配列番号2432)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例39)
配列番号2432のスクロースシンターゼ改変体
配列番号2431によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド46種の第13のラウンド(「ラウンド13」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。コンビナトリアルライブラリーに関しては、溶解物をリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に10倍希釈し、73℃で15分プレインキュベートした。飽和変異誘発ライブラリーに関しては、溶解物をリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に20倍希釈し、62℃で17.5時間プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μLおよび0.5g/LのGT配列番号4256または4550を、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのADP(Amresco、>93%)、37.5mMのスクロース(ショ糖)、および9mMのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら3〜4h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に7.5倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表39.1および39.2に列挙されている。表39.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド13 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)をリン酸カリウム緩衝液、pH6中0.03〜1g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中、73℃で15分プレインキュベートした。次いで、これらのSFP希釈物10μLをプレインキュベートするかまたはプレインキュベートせずに、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、37.5mMのスクロース、9mMのフルクトース、0.2mMのADP、および0.5g/LのGT配列番号4550を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしていないSFP試料については55℃で、およびプレインキュベートしたSFPについては60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4hにわたって反応を実施した。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に3.3倍希釈し、ステビオール配糖体に関して表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。凍結乾燥前に、以下の通り、清澄化した振とうフラスコ溶解物を用いてさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を緩衝液中に400倍希釈し、サーモサイクラー中、62〜78℃の勾配で16.7hインキュベートした。パーセント残存活性を決定するために、プレインキュベートした溶解物を、ステビオシドまたはレバウジオシドDのいずれか、および60℃で4hのインキュベーションを用いて上記の通りアッセイした。パーセント残存活性を、高温での活性を最低プレインキュベート温度での活性で割ったものとして表した。表39.3に列挙されている改変体8種全てが少なくとも1つの条件下で配列番号2432よりも高い活性を有し、5種が全ての条件下で改善された。配列番号2432と比べて全ての条件下で改善された変異Q33H、L47P、E59A、P81L、S175G、P530F、E534W、Q550I、およびR606Mを有する改変体(配列番号2510)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用について最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例40)
配列番号2510のスクロースシンターゼ改変体
配列番号2509によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド164種の第14のラウンド(「ラウンド14」)をもたらした。
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物を14.5g/LのRebA60を伴うリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に35倍希釈し、73℃で15分プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号4550、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号6864を、20g/LのRebA60、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に15倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表40.1および40.2に列挙されている。表40.3に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
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Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド14 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、リン酸カリウム緩衝液、pH6中、14.5g/LのRebA60において0.03〜1g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中、73℃で15分プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号4550、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号6864を、20g/LのRebA60、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に15倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。表40.3に列挙されている改変体8種全てが配列番号2510よりも高い活性を有した。配列番号2510と比べて最も改善された、変異A41K、G112Q、G485S、およびF684Hを有する改変体(配列番号7506)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用について最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例41)
配列番号7506のスクロースシンターゼ改変体
配列番号7505によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド56種の第15のラウンド(「ラウンド15」)をもたらした。
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物を14.5g/LのRebA60を伴うリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に50倍希釈し、73℃で15分プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号4550、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号6864を、20g/LのRebA60、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に20倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表41.1に列挙されている。表41.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドDの形成を容易にするための、操作されたラウンド15 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、リン酸カリウム緩衝液、pH6中、14.5g/LのRebA60において0.03〜1g/Lに構成し、アリコートをサーモサイクラー中、73℃で15分プレインキュベートした。希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号4550、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号6864を、20g/LのRebA60、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に20倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。表41.2に列挙されている改変体8種全てが配列番号7506よりも高い活性を有した。配列番号7506と比べて最も改善された、変異D42T、I480V、L561I、およびH724Kを有する改変体(配列番号8420)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用について最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例42)
配列番号8420のスクロースシンターゼ改変体
配列番号8419によってコードされるスクロースシンターゼの定向進化を、進化のより早期のラウンドにおける産生の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって継続した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースの生成に対する活性が増大した操作されたSuS改変体ポリペプチド155種の第16のラウンド(「ラウンド16」)をもたらした。
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
ライブラリーを、以下のHTP酵素カップリングアッセイを使用してスクリーニングした。ペレット化したE.coli培養物を、1mMの硫酸マグネシウムおよび0.5mg/mLのリゾチームおよび硫酸ポリミキシンB(PMBS)を伴うTris−HCl、pH7.5、400μLを用いて溶解させ、遠心分離によって清澄化した。溶解物を14.5g/LのRebA60を伴うリン酸カリウム緩衝液、pH6.0中に30倍希釈し、75℃で1時間プレインキュベートした。次いで、希釈し、プレインキュベートしたSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号7784、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号8088を、20g/LのRebA60、0.025g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に20倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。分析後、GTとカップリングしてレバウジオシドAに対する活性改善を示した操作されたSuS改変体ポリペプチドを同定し、それらが表42.1に列挙されている。表42.2に示されているアミノ酸変異を有する改変体について、振とうフラスコ規模の培養物をタンパク質特徴付けのために実施例1に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
レバウジオシドMを形成するためのスクロースからレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
レバウジオシドAからのレバウジオシドMの形成を容易にするための、操作されたラウンド16 SUS改変体のスクロースおよびADPに対する活性を特徴付けるための実験を実施した。振とうフラスコ粉末(SFP)を、リン酸カリウム緩衝液、pH6中、14.5g/LのRebA60において0.03〜1g/Lに構成し、アリコートを75℃で1時間プレインキュベートした。希釈し、プレインキュベートしたかまたはプレインキュベートしていないSuS溶解物10μL、0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号7784、および0.2g/Lのβ1,3GT SFP配列番号8088を、20g/LのRebA60、0.025g/LのADP(Amresco、超高純度)、40g/Lのスクロース(ショ糖)、および9.6g/Lのフルクトースと共に、反応体積100μLで使用した。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。上記の反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させた。上清を水中に20倍希釈し、ステビオール配糖体産物を、表31.1に記載の計器およびパラメータを用いてRapidFire SPE−MS/MSによって検出した。表42.2に列挙されている改変体8種全てが、プレインキュベーション後に配列番号8420よりも高い産生を有した。配列番号8420と比べて最も改善された、変異D12S、R136Q、R139K、A517P、G603Q、L630M、A642V、およびV756Cを有する改変体(配列番号8910)を、スクロースからADPにグルコースを転移させる再利用反応の触媒作用について最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例43)
配列番号1054のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号1054に由来するGTポリペプチド(β1,2GT)の進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号1053によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられたライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド26種の第5のラウンド(「ラウンド5」)をもたらした。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号1053改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を4倍に希釈した。1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)の基質添加量および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を伴う反応体積100μL中10μLの希釈した溶解物を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を水中に1:5希釈し、次いで、希釈したアッセイ物25μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:5希釈し、表31.1に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定し、操作されたポリペプチドを表43.1に列挙する。表43.2に列挙されている改変体について、実施例31に記載の通り振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド5改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、1mMのレバウジオシドA、および1mMのADP−グルコースを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで1hにわたって反応を実施した。反応物を水中に1:5希釈し、次いで、希釈したアッセイ物25μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:5希釈し、ステビオール配糖体に関してRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。0.05g/LのSFPの添加量でのラウンド5改変体のレバウジオシドAに対する活性を表43.2に列挙する。表43.2に列挙されている改変体6種全てが配列番号1054よりも高い活性を有した。変異E24L、N162R、E198P、M201G、T211E、W226V、L323V、およびL351Mを有する改変体(配列番号2600)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号2599)をレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例44)
レバウジオシドIをグルコシル化してレバウジオシドMにするための配列番号1002のグリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号1002に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号1001によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおけるレバウジオシドIに対するグリコシルトランスフェラーゼ活性の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、UDP−グルコースおよびレバウジオシドIに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドのラウンド(ラウンド5 RebI)をもたらした。
UDP−グルコースからレバウジオシドIへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
溶解緩衝液250μLを用いて細胞を溶解させた。配列番号1002改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドIの基質添加量および1mMのUDP−グルコース(Sigma、>98%の純度)の補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら18h。反応物を、アッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:5希釈し、表44.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。UDP−グルコースを用いてレバウジオシドIからレバウジオシドMを配列番号1002よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表44.2に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例45)
配列番号2600のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号2600に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号2599によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、酵素の表面残基に関連する変異および前のラウンドにおける活性改善に関連する有益な変異を組み換えたか、公的に利用可能なデータベース内のホモログ由来の多様性がコンビナトリアルに組み入れられたか、または酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第6のラウンド(「ラウンド6」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異およびホモログ多様性から24種同定され(表45.1)、飽和変異誘発から21種が同定された(表45.2)。
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号2600改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)の基質添加量および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の補基質添加量を伴う反応体積100μL中10μLの希釈した溶解物を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、45℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を水中に1:5希釈し、次いで、希釈したアッセイ物25μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:5希釈し、RapidFire SPE−MS/MSによって分析した。レバウジオシドAからレバウジオシドDをADP−グルコースを用いて産生させ、コンビナトリアルライブラリーから同定された操作された改変体を表45.1に列挙する。飽和変異誘発ライブラリーからの上位84種の改変体を50℃、3連で上記の通り再試験した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表45.2に列挙する。表45.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド6改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.003〜0.1g/LのレベルのSFPを用いて実施例40に記載の通り実験を実施した。0.025g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド6改変体の変換を表45.3に列挙する。表45.3に列挙されている改変体5種全てが配列番号2600よりも高い活性を有した。変異H2−、H7E、A12S、R15K、P175S、T260V、およびE318Dを有する改変体(配列番号2718)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号2717)をレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例46)
配列番号2718のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号2718に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号2717によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおける活性または発現の改善に関連する有益な変異が組み換えられた改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。別のライブラリーは、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第7のラウンド(「ラウンド7」)をもたらした。組み換えられた有益な変異から操作された改変体が25種同定され(表46.1)、飽和変異誘発から操作された改変体が29種同定された(表46.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号2717改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を10倍に希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.2g/LのSUS SFP配列番号1392を用い、7.5mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに1mMのADP(Sigma、>95%)および15mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら2h。反応物を水中に1:10希釈し、次いで、希釈したアッセイ物10μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル90μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、表31.1に記載の通りRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。残りの2つのラウンド7ライブラリーに関しては、0.2g/LのSUS SFP配列番号1456 SFPおよび30mMのスクロースを使用したことを例外として、上記の通りスクリーニングを実施した。組み換えられた有益な変異に由来する、SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作された改変体を表46.1に列挙する。飽和変異誘発ライブラリー由来の上位の改変体を、0.8mMのADPを使用し、反応物を水中に1:20希釈し、次いで、希釈したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル80μLに添加することによってクエンチしたことを除いて上記の手順を使用して、3連で再試験した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表46.2に列挙する。表46.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
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ADP−グルコースからレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド7改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.002〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、2mMのレバウジオシドA、および2mMのADP−グルコースを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで1hにわたって反応を実施した。反応物を水中に1:5希釈し、次いで、希釈したアッセイ物25μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関してRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。0.025g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド7改変体の変換を表46.3に示す。表46.3に列挙されている改変体7種全てが配列番号2718よりも高い活性を有した。変異K14R、I56K、R194P、I238M、I315V、F325M、A326V、P329A、R330H、およびE399Qを有する改変体(配列番号2814)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号2813)をレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例47)
配列番号2814のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号2814に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号2813によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する有益な変異が組み換えられ、酵素のある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第8のラウンド(「ラウンド8」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から16種同定され(表47.1)、飽和変異誘発から18種が同定された(表47.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号2813改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.2g/LのSUS SFP配列番号1456を用い、7.5mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.4mMのADP(Sigma、>95%)および30mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を水中に1:20希釈し、次いで、希釈したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル80μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、RapidFire SPE−MS/MSによって分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表47.1に列挙する。ラウンド8飽和変異誘発ライブラリーに関しては、0.2g/LのSUS SFP配列番号1582、0.2mMのADP、および以下の反応条件:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2hを使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。このライブラリー由来の上位56種の改変体を、0.15g/LのSUS SFP配列番号1582を使用したことを除いて同じアッセイ条件を使用して、3連で再試験した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表47.2に列挙する。表47.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
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スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド8改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.002〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、8mMのレバウジオシドA、0.4mMのADP、30mMのスクロース、および0.2g/LのSUS SFP配列番号1456を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで1hにわたって反応を実施した。反応物を水中に1:20希釈し、次いで、希釈したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル80μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関してRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。0.1g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド8改変体の変換を表47.3に示す。表47.3に列挙されている改変体8種全てが配列番号2814よりも高い活性を有した。変異N31RおよびD388Eを有する改変体(配列番号2884)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号2883)をレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例48)
配列番号2884のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号2884に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号2883によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおける活性改善に関連する有益な変異が組み換えられた改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド33種の第9のラウンド(「ラウンド9」)をもたらした。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号2883改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20倍希釈した。反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.15g/LのSUS SFP配列番号1582を用い、7.5mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および24mMのスクロース(Sigma)の補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表48.1に列挙する。表48.2に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド9改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.002〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、8mMのレバウジオシドA、0.4mMのADP、24mMのスクロース、および0.15g/LのSUS SFP配列番号1582を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで1hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.05g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド9改変体の変換を表48.2に示す。表48.2に列挙されている改変体6種全てが配列番号2884よりも高い活性を有した。変異S11Q、E65N、H132Q、N135L、N138G、S223T、およびN391Rを有する改変体(配列番号3016)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3015)が最も改善され、これらをレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例49)
配列番号3016のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3016に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3015によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第10のラウンド(「ラウンド10」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から40種同定され、(表49.1)飽和変異誘発から40種が同定された(表49.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3015改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を用い、8mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および24mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を水中に1:20希釈し、次いで、希釈したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル80μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、RapidFire SPE−MS/MSによって分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表49.1に列挙する。ラウンド10飽和変異誘発ライブラリーに関しては、溶解物を10倍に希釈し、以下の反応条件:Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら2hを使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表49.2に列挙する。表49.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド10改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.002〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、8mMのレバウジオシドA、0.4mMのADP、24mMのスクロース、および0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで1hにわたって反応を実施した。反応物を水中に1:20希釈し、次いで、希釈したアッセイ物20μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル80μLに添加することによってクエンチし、4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:10希釈し、ステビオール配糖体に関してRapidFire SPE−MS/MSによって分析した。0.25g/LのSFPの添加量でのラウンド10改変体のレバウジオシドAに対する活性を表49.3に示す。表49.3に列挙されている改変体5種全てが配列番号3016よりも高い活性を有した。変異K58R、I122L、V176R、T400V、K425R、S426A、I427R、およびS446Rを有する改変体(配列番号3082)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3081)が最も改善され、これらをレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例50)
配列番号3082のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3082に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3081によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第11のラウンド(「ラウンド11」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から50種同定され(表50.1)、飽和変異誘発から53種が同定された(表50.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3081改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を用い、8mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および24mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら2h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表50.1に列挙する。ラウンド11飽和変異誘発ライブラリーに関しては、10mMのレバウジオシドAの基質添加量を使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表50.2に列挙する。いくつかの改変体について、振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド11改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、24mMのスクロース、および0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで2hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.025g/LのSFPの添加量でレバウジオシドAに対して最も改善されたラウンド11改変体は配列番号3244であり、これは、配列番号1764と比べて変異G8S、G252D、D255P、V322L、M325L、およびK448Aを有した。この改変体、配列番号3244をさらなる定向進化のために使用した。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドIへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3081によってコードされるGTの定向進化を、前のラウンドにおけるレバウジオシドIに対するグリコシルトランスフェラーゼ活性の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびレバウジオシドIに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドのラウンド(「ラウンド11.04」)をもたらした。溶解緩衝液400μLを用いて細胞を溶解させた。配列番号3081改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対して、反応物100μL中溶解物25μLの溶解物添加量を用い、1mMのレバウジオシドIの基質添加量および1mMのADP−グルコースの補基質添加量を用いたアッセイを実施した。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、40℃、300RPMで振とうしながら18h。反応物を水中に1:4希釈し、次いで、希釈したアッセイ物25μLを0.2%ギ酸含有アセトニトリル75μLに添加することによってクエンチした。得られた混合物を4℃で10分遠心分離することによって沈殿させた。上清を水中に1:5希釈し、表44.1に記載の通りLC−MS/MSによって分析した。得られた、レバウジオシドIに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する52種の操作された改変体を表50.3に列挙する。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドIへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド11.04改変体のレバウジオシドIに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.16〜5g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、1mMのレバウジオシドI、および1mMのADP−グルコースを含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで4hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.3g/LのSFPの添加量でのラウンド11.04改変体によるレバウジオシドMの産生レベルを表50.4に示す。表50.4に列挙されている改変体5種全てがRebIに対して配列番号3082よりも高い活性を有した。変異L126Q、P128A、F155R、K160S、R161T、およびN199Aを有する改変体(配列番号3346)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3345)が最も改善され、これらをレバウジオシドIのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例51)
配列番号3244のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3244に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3243によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第12のラウンド(「ラウンド12」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から50種同定され(表51.1)、飽和変異誘発から31種が同定された(表51.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3243改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、希釈した溶解物をEppendorfサーモサイクラー中、62℃で0.5hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を用い、15mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および37.5mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4.5h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SUS配列番号1764とカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表51.1に列挙する。ラウンド12飽和変異誘発ライブラリーに関しては、希釈した溶解物を65℃で0.5hプレインキュベートしたことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表51.2に列挙する。表51.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド12改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を62℃で0.5hプレインキュベートし、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、37.5mMのスクロース、および0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃および60℃、300RPMで4.5hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.025g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド12改変体の変換を表51.3に列挙する。60℃では表51.3に列挙されている改変体7種全てが配列番号3244よりも高い活性を有し、および50℃では4種が有意な活性を失わなかった。変異K106A、V164H、G200A、E210V、およびG415Aを有する改変体(配列番号3502)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3501)をレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例52)
レバウジオシドIからレバウジオシドMを産生するための配列番号3346のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3346に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3345によってコードされるGTの定向進化を、酵素のある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供されたライブラリーを構築することによって行った。次いで、ライブラリーを、プレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびレバウジオシドIに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドのラウンド(「ラウンド12 RebI」)をもたらした。
スクロースからADP、そしてレバウジオシドMへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号3345改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、次いで、1mMのレバウジオシドIの基質添加量および1mMのADP(Sigma、>95%)および15mMのスクロースの補基質添加量を伴う反応体積100μL中溶解物25μLおよび0.1g/LのSUS SFP配列番号1804を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を実施例50に記載の通り希釈し、クエンチし、分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドIに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表52.1に示す。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
(実施例53)
配列番号3502のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3502に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3501によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第13のラウンド(「ラウンド13」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から53種同定され(表53.1)、飽和変異誘発から24種が同定された(表53.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3501改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、希釈した溶解物をEppendorfサーモサイクラー中、69℃で0.8hプレインキュベートした。次いで、100μL反応体積中、希釈した溶解物10μLおよび0.15g/LのSUS SFP配列番号1764を用い、15mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および37.5mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SUS配列番号1764とカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表53.1に列挙する。ラウンド13飽和変異誘発ライブラリーに関しては、希釈した溶解物を68℃で0.5hプレインキュベートし、0.1g/LのSUS SFP配列番号1804を使用し、0.1mMまたは0.2mMのADPを使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表53.2に列挙する。表53.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド13改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を69℃で50minプレインキュベートし、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、37.5mMのスクロース、および0.1g/LのSUS SFP配列番号1804を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotronタイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで4hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.025g/LのSFPの添加量でのレバウジオシドAに対するラウンド13改変体の変換を表53.3に列挙する。表53.3に列挙されている改変体10種全てが配列番号3502よりも高い活性を有した。変異H73P、N172R、N240E、A242I、およびE408Pを有する改変体(配列番号3696)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3695)が最も改善され、これらをレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例54)
配列番号3696のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3696に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3695によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第14のラウンド(「ラウンド14」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から75種同定され(表54.1)、飽和変異誘発から49種が同定された(表54.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3695改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、希釈した溶解物をEppendorfサーモサイクラー中、72℃で0.5hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.1g/Lのスクロースシンテターゼ(SUS)SFP配列番号1804を用い、20mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および50mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表54.1に列挙する。ラウンド14飽和変異誘発ライブラリーに関しては、溶解物を80倍希釈し、70℃で0.5hプレインキュベートしたことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表54.2に列挙する。表54.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド14改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を72℃で0.5hプレインキュベートし、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、50mMのスクロース、および0.1g/LのSUS SFP配列番号1804を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしたSFPを用いて60℃で、またはプレインキュベートしていないSFPを用いて55℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで4hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.05g/LのSFPの添加量でのラウンド14改変体によるレバウジオシドDの産生レベルを表54.3に示す。表54.3に列挙されている改変体8種のうち3種が、両方の条件下で配列番号3696よりも高い活性を有した。変異I26V、L42V、C46V、L49A、およびV134Aを有する改変体(配列番号3956)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号3955)が、両方の条件を考慮に入れて最も改善され、これらをレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例55)
配列番号3956のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号3956に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号3955によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第15のラウンド(「ラウンド15」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から62種同定され(表55.1)、飽和変異誘発から113種が同定された(表55.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号3956改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、希釈した溶解物をEppendorfサーモサイクラー中、76℃で0.5hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.1g/LのSUS SFP配列番号1840を用い、20mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および50mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SUS配列番号1840とカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表55.1に列挙する。ラウンド15飽和変異誘発ライブラリーに関しては、希釈した溶解物を65℃で16hプレインキュベートし、0.1g/LのSUS SFP配列番号2064を使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表55.2に列挙する。表55.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド15改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.006〜0.2g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を76℃で0.5hプレインキュベートし、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、50mMのスクロース、および0.1g/LのSUS SFP配列番号2064を含有する総反応体積100μLに添加した。プレインキュベートしたSFPを用いて60℃で、またはプレインキュベーションを伴わずに55℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで4hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.025g/LのSFPの添加量でのラウンド15改変体によるレバウジオシドDの産生を表55.3に列挙する。表55.3に列挙されている改変体9種のうち5種が、両方の条件下で配列番号3956よりも高い活性を有した。変異P73A、K143P、I144V、V179D、E186G、K187T、K373R、およびN423Rを有する改変体(配列番号4256)およびそれをコードするポリヌクレオチド(配列番号4255)が、両方の条件を考慮に入れて最も改善され、これらをレバウジオシドAのグルコシル化に関するさらなる定向進化のために選択した。
Figure 2020506704
(実施例56)
配列番号4256のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4256に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号4255によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、前のラウンドにおける活性改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第16のラウンド(「ラウンド16」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から27種同定され(表56.1)、飽和変異誘発から66種が同定された(表56.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドAへのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号4255改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を40倍希釈した。前のラウンドからの有益な変異が組み換えられたライブラリーをスクリーニングするために、希釈した溶解物をEppendorfサーモサイクラー中、79℃で0.5hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μLおよび0.05g/Lのスクロースシンテターゼ(SUS)SFP配列番号2064を用い、20mMのレバウジオシドAの基質添加量ならびに0.2mMのADP(Sigma、>95%)および50mMのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。SUS配列番号2064とカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表56.1に列挙する。ラウンド16飽和変異誘発ライブラリーに関しては、0.05g/LのスクロースシンテターゼSFP配列番号2510を使用したことを除いて上記の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表56.2に列挙する。表56.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドAへのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド16改変体のレバウジオシドAに対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。0.003〜0.1g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)を79℃で0.5hプレインキュベートし、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20mMのレバウジオシドA、0.2mMのADP、50mMのスクロース、および0.05g/LのSUS SFP配列番号2432を含有する総反応体積100μLに添加した。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで4hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.0125g/LのSFPの添加量でのラウンド16改変体によるレバウジオシドDの産生レベルを表56.3に示す。配列番号4550が最も改善され、これをレバウジオシドDを形成するためのADP−グルコースからレバウジオシドAへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例57)
配列番号4550のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4550に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号4549によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異を組み換えた。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第17のラウンド(「ラウンド17」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から73種同定された(表57.1)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号4549改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20g/LのレバウジオシドA 60%中に50倍または100倍希釈し、75℃で2hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μL、0.1g/LのSUS SFP配列番号2510、および0.2g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号6864を用い、20g/LのレバウジオシドA 60%(RebA60)の基質添加量ならびに0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)および40g/Lのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させ、上記の通り分析するために水中に10倍希釈した。SuSとカップリングしてレバウジオシドAに対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表57.1に列挙する。表57.2に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADP、そしてレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド17改変体のレバウジオシドA 60%に対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20g/LのRebA60、0.1g/LのADP、40g/Lのスクロース、0.1g/LのSUS SFP配列番号2510、および0.2g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号6864を含有する総反応体積100μL中、0.0003〜0.04g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)をアッセイした。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃で、300RPMで16〜18hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.005g/LのSFPの添加量でのラウンド17改変体によるワンポット反応でのレバウジオシドMの産生についての結果を表57.2に示す。配列番号7324が最も改善されたものと同定され、これをレバウジオシドDを形成するためのADP−グルコースからレバウジオシドAへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例58)
配列番号7324のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号7324に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号7323によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のコンビナトリアルライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第18のラウンド(「ラウンド18」)をもたらした。操作された改変体が、組み換えられた有益な変異から90種同定され(表58.1)、飽和変異誘発から124種が同定された(表58.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号7323改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を20g/LのレバウジオシドA 60%中に80倍希釈し、75℃で1.5hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μL、0.05g/LのSUS SFP配列番号7506、および0.1g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号7388を用い、20g/LのレバウジオシドA 60%(RebA60)の基質添加量ならびに0.05g/LのADP(Amresco、超高純度)および40g/Lのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させ、上記の通り分析するために水中に10倍希釈した。SuSとカップリングしてRebA60に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表58.1に列挙する。ラウンド18飽和変異誘発ライブラリーに関しては、溶解物を50mMのKphos pH6中に100倍希釈し、75℃で1hプレインキュベートしたことを除いて、以前に記載の通りスクリーニングを実施した。得られた操作されたGT改変体ポリペプチドを表58.2に列挙する。表58.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
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スクロースからADP、そしてレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド18改変体のレバウジオシドA 60%に対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20g/LのRebA60、0.05g/LのADP、40g/Lのスクロース、0.05g/LのSUS SFP配列番号7506、および0.15g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号7388を含有する総反応体積100μL中、0.0013〜0.04g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)をアッセイした。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃で、300RPMで16〜18hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。0.005g/LのSFPの添加量でのラウンド18改変体によるワンポット反応でのレバウジオシドMの産生レベルを表58.3に示す。配列番号7784を有する改変体が最も改善された改変体であった。したがって、この改変体を、レバウジオシドDを形成するためのADP−グルコースからレバウジオシドAへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例59)
配列番号7784のベータ−1,2−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号7784に由来するGTポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。配列番号7783によってコードされるGTの定向進化を、改変体遺伝子のライブラリーを構築することによって行った。ライブラリーは、本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異を組み換え、酵素のある特定の構造的特徴を飽和変異誘発に供した。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のHTPアッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチドの第19のラウンド(「ラウンド19」)をもたらした。操作された改変体が、コンビナトリアルライブラリーから87種同定され(表59.1)、飽和変異誘発ライブラリーから58種が同定された(表59.2)。
スクロースからADPへ、そしてレバウジオシドA60へのグルコース転移についてのHTPカップリングアッセイ
配列番号7783改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。溶解緩衝液の体積を400μLとし、溶解物を50mMのリン酸カリウム、pH6.0中に100倍希釈し、75℃で1hプレインキュベートした。次いで、反応体積100μL中、希釈した溶解物10μL、0.04g/LのSUS SFP配列番号8420、および0.1g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号8088を用い、20g/LのレバウジオシドA 60%(RebA60)の基質添加量ならびに0.025g/LのADP(Amresco、超高純度)および40g/Lのスクロースの補基質添加量を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16〜18h。反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって沈殿させ、上記の通り分析するために水中に20倍希釈した。SuSとカップリングしてRebA60に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する、得られた操作された改変体を表59.1および59.2に列挙する。表59.3に列挙されている改変体について振とうフラスコ規模の培養物を成長させ、溶解させ、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
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スクロースからADP、そしてレバウジオシドA60へのグルコシル転移についての振とうフラスコ粉末特徴付けアッセイおよび分析
操作されたラウンド19改変体のレバウジオシドA 60%に対する活性を特徴付けるための振とうフラスコ粉末負荷用量反応実験を実施した。50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20g/LのRebA60またはRebA97、0.025g/LのADP、20g/L(単一基質)または40g/L(ワンポット)のスクロース、0.04g/LのSUS SFP配列番号8420、および、ワンポット反応に関してのみ0.15g/Lのβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)SFP配列番号8088を含有する総反応体積100μL中、0.0013〜0.04g/Lのレベルの振とうフラスコ粉末(SFP)をアッセイした。Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃で、300RPMで16〜18hにわたって反応を実施した。反応物を上記の通り希釈し、クエンチし、分析した。それぞれ0.0025g/LのSFP添加量および0.005g/LのSFP添加量でのラウンド19改変体による単一基質でのレバウジオシドDの産生レベルおよびワンポット反応でのレバウジオシドMの産生レベルを表59.3に示す。配列番号9180を有する改変体が最も改善された改変体であった。したがって、この改変体を、レバウジオシドDを形成するためのADP−グルコースからレバウジオシドAへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
Figure 2020506704
(実施例60)
配列番号696のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、ADP−グルコースを使用してステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号696に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。上記の前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号695によってコードされるGT(すなわち、配列番号696)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド65種の第8のラウンド(「ラウンド8」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号695改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。ペレットを、25mMのTris−HCl、pH7.5中、0.5mg/mLのリゾチームおよび0.5mg/mLのPMBSを伴う溶解緩衝液400μLを用いて1.5hにわたって溶解させ、遠心分離によって清澄化した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、5mMのレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1222、および15mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら4〜5h。次いで、反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することでクエンチし、4℃で10分遠心分離し、分析のために上清を水中に5倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてレバウジオシドDからレバウジオシドMを配列番号696よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。大半を、ステビオシド(95%の純度)に関して3連で再試験した。操作されたポリペプチドを表60.1に列挙する。振とうフラスコ規模の培養物を、表60.2に示されている改変体を配列番号696と比べて分析するためのSFP産生のために実施例31に記載の通り成長させた。
Figure 2020506704
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ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、3mMのMgCl、1mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)を伴う50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、総反応体積100μL中、0.002〜5g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で5倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に4倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表60.2の改変体の全て(すなわち、配列番号4684、4686、および4694)がADP−グルコースを用いて配列番号696よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。改変体配列番号4684をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例61)
配列番号4684のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4684に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。上記の前のラウンドにおける活性改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号4684によってコードされるGT(すなわち、配列番号4683)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド31種の第9のラウンド(「ラウンド9」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号4684改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、5mMのステビオシド(>95%の純度)基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1222、および15mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのKPhos緩衝液、pH7、3mMのMgCl、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら4〜5h。反応物を実施例60に記載の通り可溶化し、クエンチし、希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いて、ステビオシドからレバウジオシドAを配列番号4684よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表61.1に列挙する。表61.2に示されている改変体を配列番号4684と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、3mMのMgCl、1mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)を伴う50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH7、総反応体積100μL中、0.002〜5g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で5倍希釈することによって可溶化し、アセトニトリルおよび0.2%ギ酸で4倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表61.2の改変体の全て(すなわち、配列番号4822、4824、4826、4834、および4838)がADP−グルコースを用いて配列番号4684よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。これらの実験では、配列番号4838の改変体が、ADP−グルコースを補基質として用いてステビオシドおよびレバウジオシドDに対して最も高い活性を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号4837)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例62)
配列番号4838のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4838に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号4837によってコードされるGT(すなわち、配列番号4838)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド123種の第10のラウンド(「ラウンド10」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号4838改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、リン酸カリウム緩衝液、pH6.5中に4倍希釈した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、5mMのステビオシド(>95%の純度)基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.2g/LのSUS SFP配列番号1222、および15mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を実施例60に記載の通り可溶化し、クエンチし、希釈した。試料を実施例1、表1.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。選択された改変体を、同様のアッセイで、10倍溶解物希釈、4mMのステビオシドまたはレバウジオシドD、0.375mMのADP、0.5g/Lのスクロースシンターゼ配列番号1392、30mMのスクロース、および2hのインキュベーションを用いて再試験した。in situで合成されたADP−グルコースを用いて、レバウジオシドDからレバウジオシドMを配列番号4838よりも大きな分量で産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表62.1に列挙する。表62.2に示されている改変体を配列番号4838と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
ADP−グルコースからステビオシドまたはレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、1mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、および1mMのADP−グルコース(Sigma、>93%の純度)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で5倍希釈することによって可溶化し、アセトニトリルおよび0.2%ギ酸で4倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表62.2の1種の改変体(すなわち、配列番号4876)がADP−グルコースを用いて配列番号4838よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号4875)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例63)
配列番号4876のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号4876に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号4875によってコードされるGT(すなわち、配列番号4876)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド122種の第11のラウンド(「ラウンド11」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号4875改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、リン酸カリウム緩衝液、pH6.5中に10倍希釈した。コンビナトリアルライブラリーのアッセイを、反応物100μL中溶解物10μLを用い、4mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.2g/LのSUS SFP配列番号1456、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いて行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1h。反応物を実施例60に記載の通り可溶化し、クエンチし、希釈した。試料を実施例1、表1.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。飽和変異誘発ライブラリーに関しては、同じアッセイを実施したが、5倍希釈した溶解物、pH6リン酸カリウム緩衝液、および55℃で1〜2hのインキュベーションを用いた。選択された改変体をまた、これらの条件下、3連で再試験した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号4876よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表63.1に列挙する。表63.2に示されている改変体を配列番号4876と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6.5、4mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.2g/LのSUS SFP配列番号1456、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表63.2の6種の改変体(すなわち、配列番号5076、5042、5026、5066、5074、および5044)がADP−グルコースを用いて配列番号4876よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。配列番号5066が一次スクリーニングにおいて最も良好に動作し(表63.1)、最も有益な変異を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号5065)をさらなる定向進化のために選択した。配列番号5076を有する改変体はRebDからRebMへの活性が高かったので、これをプロセス開発のために使用した。
(実施例64)
配列番号5066のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5066に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5065によってコードされるGT(すなわち、配列番号5066)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド40種の第12のラウンド(「ラウンド12」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5066改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、リン酸カリウム緩衝液、pH6中に10倍希釈した。コンビナトリアルライブラリーのアッセイを、反応物100μL中溶解物10μLを用い、4mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1582、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いて行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2h。反応物を実施例63に記載の通り可溶化し、クエンチし、希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5066よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表64.1に列挙する。表64.2に示されている改変体を配列番号5066と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、4mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、0.4mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1582、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表64.2の6種の改変体(すなわち、配列番号5280、5290、5302、5314、5324)がADP−グルコースを用いて配列番号5066よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。配列番号5290がレバウジオシドDに対して最も良好に動作し、最も有益な変異を有した。したがって、コードするポリヌクレオチド(配列番号5289)をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例65)
配列番号5290のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5290に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5289によってコードされるGT(すなわち、配列番号5290)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド100種の第13のラウンド(「ラウンド13」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5289改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、リン酸カリウム緩衝液、pH6中に5倍希釈した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、4mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃、300RPMで振とうしながら2h。反応物を実施例33に記載の通り可溶化し、クエンチし、希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5290よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表65.1に列挙する。表65.2に示されている改変体を配列番号5290と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、4mMのステビオシド(95%の純度)、レバウジオシドD、またはレバウジオシドA(97%の純度)、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃および55℃、300RPMで振とうしながら1時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
これらの実験では、表65.2の5種の改変体(すなわち、配列番号5348、5356、5364、5372、および5386)がADP−グルコースを用いて配列番号5290よりも大きな分量で、ステビオシドからレバウジオシドAを産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。配列番号5372をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例66)
配列番号5372のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5372に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5371によってコードされるGT(すなわち、配列番号5372)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド74種の第14のラウンド(「ラウンド14」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5371改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、リン酸カリウム緩衝液、pH6中に10倍希釈した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および40mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら2h。実施例60に記載の通り反応物を可溶化し、クエンチし、約10μMのステビオール配糖体まで希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5372よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表66.1に列挙する。表66.2に示されている改変体を配列番号5372と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、4mMのステビオシド(95%の純度)、レバウジオシドD、レバウジオシドE、またはレバウジオシドA(97%の純度)、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、55℃および60℃、300RPMで振とうしながら2時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表66.2の6種の改変体(すなわち、配列番号5552、5562、6675、5578、5582、および5590)がADP−グルコースを用いて配列番号5372よりも、ステビオシドからより多くのレバウジオシドAを産生させ、レバウジオシドAからより少ないレバウジオシドIを産生させ、レバウジオシドEからより多くのレバウジオシドMを産生させ、かつ/または大きな分量でレバウジオシドDからレバウジオシドMを産生させた。配列番号5562が4つの反応全てに関して最も改善され、したがって、これをさらなる定向進化のために選択した。
(実施例67)
配列番号5562のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5562に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された活性改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5561によってコードされるGT(すなわち、配列番号5562)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド62種の第15のラウンド(「ラウンド15」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5562改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に5倍希釈した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.1〜0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24〜40mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50または60℃、300RPMで振とうしながら2h。実施例60に記載の通り反応物を可溶化し、クエンチし、約10μMのステビオール配糖体まで希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5562よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。コンビナトリアルライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表67.1に列挙し、飽和変異誘発ライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表67.2に列挙する。表67.3に示されている改変体を配列番号5562と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのステビオシド(95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃および60℃、300RPMで振とうしながら2時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で5倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
これらの実験では、表67.3の8種の改変体が、50℃および/または60℃で、配列番号5562よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号5708が、どちらの温度においてもレバウジオシドAへのステビオシドの変換に関して最も改善され、かつ、60℃におけるレバウジオシドMへのレバウジオシドDの変換に関しても改善され、したがって、これをさらなる定向進化のために選択した。
(実施例68)
配列番号5708のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5708に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5707によってコードされるGT(すなわち、配列番号5708)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド100種の第16のラウンド(「ラウンド16」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5708改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に20倍希釈した。反応物100μL中溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)、レバウジオシドD、レバウジオシドA(>97%の純度)、またはレバウジオシドE基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら3h。実施例60に記載の通り反応物を可溶化し、クエンチし、約10μMのステビオール配糖体まで希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5708よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表68.1に列挙する。表68.2に示されている改変体を配列番号5708と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのステビオシド(>95%の純度)、レバウジオシドD、レバウジオシドE、またはレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.15g/LのSUS SFP配列番号1764、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、50℃および60℃、300RPMで振とうしながら3時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で10倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表68.2の13種の改変体が、50℃および/または60℃で、配列番号5708よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号5976が、レバウジオシドAへのステビオシドの変換に関して最大の改善を有し、どちらの温度でもレバウジオシドDからレバウジオシドMへの活性の喪失を伴わず、したがって、この改変体をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例69)
配列番号5976のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号5976に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号5975によってコードされるGT(すなわち、配列番号5976)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド123種の第17のラウンド(「ラウンド17」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号5976改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、緩衝液中に20倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物をサーモサイクラー中、65.5℃で15分プレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1804、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で10倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号5976よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表69.1に列挙する。表69.2に示されている改変体を配列番号5976と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1804、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、プレインキュベーションを伴わずに55℃で、または65.5℃で15分プレインキュベートした後に60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で10倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
これらの実験では、表69.2の8種の改変体が、55℃および/または60℃で配列番号5976よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、かつ/またはレバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号6138が、プレインキュベーション後に60℃でのアッセイの条件下でレバウジオシドAへのステビオシドの変換に関して最大の改善を有し、他の条件下でも同様に改善され、したがって、この改変体をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例70)
配列番号6138のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号6138に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号6137によってコードされるGT(すなわち、配列番号6138)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド100種の第18のラウンド(「ラウンド18」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号6137改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に20〜40倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物をサーモサイクラー中、68.6℃で15分プレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1840、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で10倍希釈した。
試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号6138よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表70.1に列挙する。表70.2に示されている改変体を配列番号6138と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
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スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.1g/LのSUS SFP配列番号1804、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、プレインキュベーションを伴わずに55℃で、または68.6℃で15分プレインキュベートした後60℃で、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間インキュベートした。反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水中に10倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表70.2の5種の改変体(配列番号6262、6268、6288、6300、および6334)が、60℃で、プレインキュベーションを伴って、配列番号6138よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号6288が、プレインキュベーション後に60℃でのアッセイの条件下でレバウジオシドAへのステビオシドの変換に関して最大の改善を有し、レバウジオシドDからMに関して2番目に大きく改善され、したがって、この改変体をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例71)
配列番号6288のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号6288に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号6287によってコードされるGT(すなわち、配列番号6288)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド108種の第19のラウンド(「ラウンド19」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号6288改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に40倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物を、サーモサイクラー中、73.5℃で15分、またはThermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、65℃、300RPMで振とうしながら16hのいずれかでプレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2064、および24mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で10倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号6288よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。15分プレインキュベートすることでスクリーニングしたコンビナトリアルライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表71.1に列挙し、16hプレインキュベートすることでスクリーニングした飽和変異誘発ライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表71.2に列挙する。表71.3に示されている改変体を配列番号6288と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
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スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、10mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2064、および24mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、プレインキュベーションを伴わずに55℃で、または、73.5℃で15分プレインキュベートした後に60℃で、インキュベートした。反応物を、水中に20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で10倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。清澄化した振とうフラスコ溶解物を用い、凍結乾燥する前に以下の通りさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を緩衝液中に400倍希釈し、サーモサイクラー中、55〜70℃の勾配で16hインキュベートした。残存活性のパーセントを決定するために、プレインキュベートした溶解物を、ステビオシドまたはレバウジオシドDのいずれかを用い、60℃で4hのインキュベーションを伴って、上記の通りアッセイした。パーセント残存活性を、高温での産生を最低プレインキュベート温度での産生で割ったものとして表す。
Figure 2020506704
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これらの実験では、表71.3の8種の改変体が、60℃で、プレインキュベーションを伴って、配列番号6288よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号6468が、プレインキュベーション後に60℃でのアッセイの条件下で、レバウジオシドMへのレバウジオシドDの変換に関して最大の改善を有し、また、16hの熱攻撃後に最大のパーセント残存活性を有し、したがって、この改変体をさらなる定向進化のために選択した。
(実施例72)
配列番号6468のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号6468に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号6467によってコードされるGT(すなわち、配列番号6468)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド269種の第20のラウンド(「ラウンド20」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号6467改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に40倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物を、サーモサイクラー中、79℃で15分、またはThermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、65℃、300RPMで振とうしながら16hのいずれかでプレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD基質、0.1g/LのADP(Sigma、>93%の純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2432、および37.5mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で15倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号6468よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。15分プレインキュベートすることでスクリーニングしたコンビナトリアルライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表72.1に列挙し、16hプレインキュベートすることでスクリーニングした飽和変異誘発ライブラリー由来の操作されたポリペプチドを表72.2に列挙する。表72.3に示されている改変体を配列番号6468と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
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スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2432、および37.5mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.006〜0.2g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、プレインキュベーションを伴わずに55℃で、または79℃で15分プレインキュベートした後に60℃で、インキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で15倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。凍結乾燥前に、以下の通り、清澄化した振とうフラスコ溶解物を用いてさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を緩衝液中に400倍希釈し、サーモサイクラー中、60〜75℃の勾配で16hインキュベートした。パーセント残存活性を決定するために、プレインキュベートした溶解物を、ステビオシドまたはレバウジオシドDのいずれか、および60℃で4hのインキュベーションを用いて上記の通りアッセイした。残存活性のパーセントを、高温での産生を最低プレインキュベート温度での産生で割ったものとして表す。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
これらの実験では、表72.3の14種の改変体が、60℃で、プレインキュベーションを伴って、配列番号6468よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させ、また、4種を除いて全てが、プレインキュベーションを伴わずに55℃でも優れた。配列番号6864を、それぞれレバウジオシドAおよびレバウジオシドMを形成するための、ADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
(実施例73)
配列番号6864のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号6864に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられた改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号6863によってコードされるGT(すなわち、配列番号6864)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド37種の第21のラウンド(「ラウンド21」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからレバウジオシドA 60へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号6863改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例34に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に40倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物をThermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、75℃、300RPMで振とうしながら1hプレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、20g/LのレバウジオシドA 60%基質、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2510、0.1g/Lのβ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β12GT)配列番号4550および37.5mMのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら4h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いて5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で15倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いてステビオシド/レバウジオシドDからレバウジオシドA/レバウジオシドMを配列番号6864よりも大きな分量で産生したグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表73.1に列挙する。表73.2に示されている改変体を配列番号6864と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2510、および37.5mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.003〜0.1g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、60℃でインキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルで5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で15倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。凍結乾燥前に、以下の通り、清澄化した振とうフラスコ溶解物を用いてさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に400倍希釈し、サーモサイクラー中、60〜75℃の勾配で16hインキュベートした。残存活性のパーセントを決定するために、プレインキュベートした溶解物を、ステビオシドまたはレバウジオシドDのいずれか、および60℃で4hのインキュベーションを用いて上記の通りアッセイした。残存活性のパーセントを、高温での産生を最低プレインキュベート温度での産生で割ったものとして表す。
Figure 2020506704
これらの実験では、表73.2の5種の改変体が、60℃で、配列番号6864よりも、ステビオシドからレバウジオシドAを多く産生させ、レバウジオシドDからレバウジオシドMを多く産生させた。配列番号7388を、それぞれレバウジオシドAおよびレバウジオシドMを形成するための、ADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
(実施例74)
配列番号7388のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号7388に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号7387によってコードされるGT(すなわち、配列番号7388)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド88種の第22のラウンド(「ラウンド22」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからレバウジオシドA 60へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号7387改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例60に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に20倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物をThermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、75℃、300RPMで振とうしながら1hプレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、20g/LのレバウジオシドA 60%基質、0.05g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2510、0.08g/Lのβ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β12GT)配列番号7324、および40g/Lのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いて5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で20倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いて、配列番号7388よりも大きな分量で、レバウジオシドA 60からレバウジオシドMを産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表74.1および表74.2に列挙する。表74.3に示されている改変体を配列番号7388と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例31に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
Figure 2020506704
スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2510、および37.5mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.005〜0.15g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、60℃でインキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルで5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で15倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。凍結乾燥前に、以下の通り、清澄化した振とうフラスコ溶解物を用いてさらなる熱安定性特徴付けを行った:溶解物を、リン酸緩衝液中に20倍希釈し、サーモサイクラー中、60〜75℃の勾配で24hインキュベートした。残存活性のパーセントを決定するために、プレインキュベートした溶解物を、50mMのリン酸カリウム緩衝液中、pH6で、20g/LのレバウジオシドA 60、0.05g/LのADP、40g/Lのスクロース、0.05g/LのSUS SFP配列番号2510、および0.08g/Lのβ1,2GT SFP配列番号7324を用い、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら60℃で16hのインキュベーションを伴ってアッセイした。反応物を、ハイスループットアッセイに関する記載の通り、可溶化し、クエンチし、希釈した。パーセント残存活性を、高温での産生を最低プレインキュベート温度での産生で割ったものとして表した。
Figure 2020506704
これらの実験では、表74.3の11種の改変体全てが配列番号7388よりもレバウジオシドA 60からレバウジオシドMを多く産生させ、8種の改変体はまた、ステビオシドからレバウジオシドAおよびレバウジオシドDからレバウジオシドMをより多く産生させた。配列番号8034および8088は、全体的に最も良好に動作した。配列番号8088を、ワンポットアッセイにおける優れた性能に起因して、それぞれレバウジオシドAおよびレバウジオシドMを形成するための、ADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
(実施例75)
配列番号8088のベータ−1,3−ADP−グリコシルトランスフェラーゼ改変体
本実施例では、in situで合成されたADP−グルコースを使用して、ステビオール配糖体のグルコシル化を改善するための、配列番号8088に由来するβ1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT)ポリペプチドの進化およびスクリーニングに関する実験を記載する。本発明の開発中に同定された産生の改善に関連する変異が組み換えられ、ある特定の構造的特徴が飽和変異誘発に供された改変体遺伝子のライブラリーを構築することにより、配列番号8087によってコードされるGT(すなわち、配列番号8088)の定向進化を行った。次いで、これらのライブラリーをプレーティングし、成長させ、下記のハイスループット(HTP)アッセイを使用してスクリーニングして、ADP−グルコースおよびステビオール配糖体に対するグルコシルトランスフェラーゼ活性を有する操作されたGT改変体ポリペプチド80種の第23のラウンド(「ラウンド23」)をもたらした。
スクロースからADPへのグルコース転移、次いでADP−グルコースからレバウジオシドA 60へのグルコース転移についてのHTPアッセイ
配列番号8087改変体を発現する清澄化されたE.coli培養溶解物の96ウェルプレートに対してアッセイを実施した。実施例34に記載の通りペレットを溶解させ、溶解物を清澄化し、次いで、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中に10倍希釈した。溶解物を熱的に攻撃するために、溶解物をThermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、75℃、300RPMで振とうしながら1hプレインキュベートした。反応物100μL中、プレインキュベートした溶解物10μLを用い、20g/LのレバウジオシドA 60%基質、0.025g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号8420、0.08g/Lのβ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β12GT)配列番号7784、および40g/Lのスクロース(ショ糖)を用いてアッセイを行った。以下の反応条件を使用した:50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、60℃、300RPMで振とうしながら16h。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルを用いて5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水で20倍希釈した。試料を実施例31、表31.1に記載の通りRapidFire−MS/MSによって分析した。in situで合成されたADP−グルコースを用いて、配列番号8088よりも大きな分量で、レバウジオシドA 60からレバウジオシドMを産生させたグリコシルトランスフェラーゼ改変体ポリペプチドを同定した。操作されたポリペプチドを表75.1および表75.2に列挙する。表75.3に示されている改変体を配列番号8088と比べて分析するために、振とうフラスコ規模の培養物を実施例1に記載の通り成長させ、溶解させ、清澄化し、凍結乾燥して粉末にした。
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スクロースからADPへのグルコシル転移、次いでADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグルコシル転移についてのSFP特徴付けアッセイおよび分析
振とうフラスコ粉末(SFP)を20g/Lの濃度に再構成し、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.1g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号8420、および37.5mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中0.005〜0.15g/LのSFPまで希釈した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、60℃でインキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルで5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で15倍希釈した。グリコシル化された産物を実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって検出した。50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、20g/LのRebA60、0.025g/LのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号8420、0.12g/Lのβ1,2GT SFP配列番号7784、および40g/Lのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中、0.01〜0.3g/LのSFPを用いてワンポット反応を行った。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら16時間、60℃でインキュベートした。反応物を、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリルで5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、分析のために水で20倍希釈した。
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これらの実験では、表75.3の11種の改変体全てが配列番号8088よりも、レバウジオシドA 60からレバウジオシドMを多く産生させ、8種の改変体はまた、ステビオシドからレバウジオシドAおよびレバウジオシドDからレバウジオシドMをより多く産生させた。配列番号8598を、ワンポットアッセイにおける優れた性能に起因して、それぞれレバウジオシドAおよびレバウジオシドMを形成するための、ADP−グルコースからステビオシドおよびレバウジオシドDへのグリコシル転移の触媒作用に関する最良の酵素として選択した。
(実施例76)
操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび再利用酵素の熱耐性
操作されたβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT、配列番号6864)、β−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,2GT、配列番号4550)、およびスクロースシンターゼ再利用酵素(sucrose synthase recycling enzyme)(SUS、配列番号2510)の熱耐性を決定するために、振とうフラスコ粉末(SFP)を使用して3つのアッセイを実施した。
第1に、60℃における複数日安定性アッセイを、50mMのリン酸カリウム、pH6中に各酵素SFPを希釈し(β1,3GT、0.5g/L;β1,2GT、0.25g/L;SUS、0.1g/L)、0〜48hの種々の時間にわたってインキュベートした後、アッセイすることによって実施した。残存活性の量を、本実施例に記載の条件下でアッセイすることによって決定した。β1,3GTに関しては、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6、15mMのステビオシド(>95%の純度)またはレバウジオシドD、0.2mMのADP(Amresco、超高純度)補基質、0.05g/LのSUS SFP配列番号2432、および37.5mMのスクロース(ショ糖)の総反応体積100μL中、0〜48hプレインキュベートした振とうフラスコ粉末10μLを使用した。反応物を、Thermotron(登録商標)タイタープレート振とう機中、300RPMで振とうしながら4時間、60℃でインキュベートし、次いで、水で20倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、遠心分離によって清澄化し、実施例31、表31.1に記載の通りSPE−QQQによって分析するために水で15倍希釈した。28h時点で、レバウジオシドDからレバウジオシドMについてはプレインキュベートしていない場合の活性の60%が残存し、48h時点では活性の39%が残存した。ステビオシドからレバウジオシドAについては、28h後には34%が残存し、48h後には19%が残存した。したがって、β1,3GT配列番号6864の半減期は60℃で20〜40hである。β1,2GTに関しては、20mMのレバウジオシドA(>97%の純度)および50mMのスクロースを用い、同様にアッセイを実施した。24h時点では、プレインキュベートしていない場合の活性の50〜74%が残存し、46h時点では、活性の33%が残存した。したがって、β1,2GT配列番号4550の半減期は60℃で29〜58hである。SUSに関しては、15mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、37.5mMのスクロース、9mMのフルクトース、およびカップリング酵素として0.5g/Lのβ1,2GT配列番号4550を用い、同様にアッセイを実施した。24h時点では、プレインキュベートしていない場合の活性の89%が残存し、48h時点では、活性の86%が残存した。したがって、SUS配列番号2510の半減期は60℃で>100hである。これらの60℃での半減期の3つ全てが、周囲温度を超えると有意な安定性を有さない野生型酵素とは大きな差異を示す。
第2に、3種の酵素それぞれの同一のストックを、サーモサイクラー中、60〜69.1℃(SUS)、59.9〜79.9℃(β1,2GT)、または59.7〜75.1℃の温度勾配にわたって24hプレインキュベートし、酵素を上記の通りアッセイして、最低プレインキュベーション温度(3種全てについて約60℃)と比べた残存活性を決定した。β1,3GTに関しては、73.5℃でプレインキュベートした後、59.7℃でプレインキュベートした場合と比べて、活性の20%が保持された。β1,2GTに関しては、73.6℃でプレインキュベートした後、活性の17%が保持された。SUSに関しては、69.1℃でプレインキュベートした後、活性の85%が保持された。24h時点で>70℃の温度に至るまでの安定性により、広範囲の発酵下流プロセス温度および広範囲のステビオール配糖体変換温度が可能になる。ステビオール配糖体変換反応を加熱することにより、微生物混入のリスクが低下し、ステビオール配糖体基質および産物溶解度が増強され、変換速度が上昇する。さらに、温度を上昇させることにより固有の反応速度がわずかに上昇する。
第3に、β1,3GT、0.1g/L;β1,2GT、0.025g/L;およびSUS、0.01g/Lを、上記の単一基質変換アッセイで、プレインキュベートせず、55〜65℃でインキュベートしてアッセイして、酵素がこの温度範囲で堅固であるかどうかを決定した。3種の酵素全てに関して、65℃で4h後に測定された変換が、55℃と比べて<36%増大または低減した。
(実施例77)
追加的なNDPおよびNDP−グルコースを用いた、操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび再利用酵素のアッセイ
複数のヌクレオシド二リン酸(NDP)およびヌクレオシド二リン酸−グルコース(NDP−グルコース)を操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび再利用系で使用することができる。
代替NDP−グルコース供与体のために、操作されたβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT、配列番号6864)およびβ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,2GT、配列番号4550)の許容性(promiscuity)を決定するために、3種の市販のNDP−グルコース:ADP−グルコース(Amresco、超高純度)、GDP−グルコース(Sigma、>97%の純度)、およびTDP−グルコース(Carbosynth、>95%の純度)を酵素振とうフラスコ粉末(SFP)を用いて試験した。β1,3GTに関しては、1mMのステビオシド(>95%の純度)、1mMのNDP−グルコース、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中0.025g/LのSFPを用いて反応を行った。1h時点、2h時点、および3h時点で、反応物を、水中に4倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水中に5倍希釈した。β1,2GTに関しては、1mMのレバウジオシドA(>97%の純度)中0.0025g/LのSFPを用いて反応を行ったが、他の点では上記の方法と同一であった。結果を表68.1に、最初の1時間でのステビオール配糖体基質のパーセント(%)変換として要約する。
Figure 2020506704
代替NDP補助因子のために、操作されたβ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,2GT、配列番号4550)およびスクロースシンターゼ再利用酵素(SUS、配列番号2510)の許容性を決定するために、4種の市販のNDPを試験した:ADP(Sigma、>95%)、CDP(Sigma、>95%)、GDP(Sigma、>96%)、IDP(Sigma、>96%)。10mMのレバウジオシドA(>97%の純度)、0.2mMのNDP、50mMのリン酸カリウム緩衝液、pH6中、0.001g/LのSUS SFPおよび0.1g/Lのβ1,2GT SFPを用いて反応を行った。1h時点、2h時点、および3h時点で、反応物を、水中に40倍希釈することによって可溶化し、0.2%ギ酸含有アセトニトリル中に5倍希釈することによってクエンチし、分析のために水中に5倍希釈した。第2のスクロースシンターゼ(配列番号72)も、反応物100μL中、精製タンパク質グリセロールストック10μLを使用して試験した。結果を表77.2に、最初の1時間でのNDPターンオーバー(レバウジオシドDのmmol/補助因子のmmol)として要約する。これらのデータから示される通り、ADP/ADP−グルコースの使用により、有用な反応条件がもたらされる。さらに、これらの化合物は、経済的展望から、他の選択肢(例えば、UDP/UDP−グルコース)と比較して有益である。
Figure 2020506704
(実施例78)
レバウジオシドA 60%をレバウジオシドMに変換するためのプロセス
Reb A 60(ステビオシドとレバウジオシドA[reb A]の質量で約1:2混合物)は、水およびスクロース溶液中への予想外に高い溶解度を有する。ステビオシドおよびReb Aの個々の水溶解度は、3〜5g/Lの範囲であることが報告されている。驚くべきことに、水中または200g/Lのスクロース中、Reb A 60の100〜200g/L溶液を調製し、室温で1週間静置しても前記溶液中に沈殿物は生じなかった。注記すべきことに、反応の過程中、Reb D中間体およびReb M産物の両方が、それらの報告された溶解度限界(約0.3〜0.5および3〜5g/L、それぞれ)をはるかに超えるレベル(ca.30〜50g/L)で可溶性のままであった(均一の反応混合物によって明らか)。プロセスの効率は、Reb A 60出発材料およびReb D中間体の予測外に高い溶解度によって著しく増強された。
Reb A 60をレバウジオシドMに変換するためのプロセスを、操作されたβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT、配列番号6138)、β−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,2GT、配列番号3696)、およびスクロースシンターゼ(SUS、配列番号1846)を用いて開発した。50mMのpH6リン酸カリウム緩衝液中、0.2g/LのSUS、0.1g/LのADP、および200g/Lのスクロースからなる再利用ストック溶液を調製した。β1,2GTをこの溶液中に1.6g/Lまで溶解させ、別のβ1,3GTのストックを再利用ストック溶液中に2.0g/Lまで溶解させた。次いで、100mgのReb A 60を1つのドラムバイアルに入れ、1.6g/Lのβ1,2GTストックおよび2.0g/Lのβ1,3GTストック各0.5mLを添加した。得られた均一の溶液を55℃で撹拌した。沈殿物が徐々に生じ、24h時点の反応混合物は濃い白色スラリーであった。HPLC分析により、90〜94%のReb M(約120〜130g/LのReb M)が存在することが示された。
別の実験では、上記の反応を、0.5g/LのADPおよび10mMのEDTAの存在下で実行した。これらの条件下では、β1,2GTおよびβ1,3GT添加量をどちらも0.4g/Lまで減少させたが、それでもReb Mへの変換は>90%に達した。凍結乾燥させた酵素粉末を10〜15L規模の発酵で産生させ、60℃での加熱処理および限外濾過で下流の処理を行った場合、Reb A 60中のステビオシドおよびレバウジオシドAの95%が、β1,2GTストックのβ1,3GTストックに対するある特定の比で、レバウジオシドMに変換された。
Reb A 60をレバウジオシドMに変換するためのプロセスを、操作されたβ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,3GT、配列番号6864)、β−1,2−グリコシルトランスフェラーゼ(β1,2GT、配列番号4550)、およびスクロースシンターゼ(SUS、配列番号2510)酵素の別の組を用いて開発した。10mMのEDTAを伴う50mMのpH6リン酸カリウム緩衝液中、0.2g/LのSUS、0.5g/LのADPおよび200g/Lのスクロースからなる再利用ストック溶液を調製した。β1,2GTをこの溶液中に0.6g/Lまで溶解させ、別のβ1,3GTのストックを再利用ストック溶液中に1.2g/Lまで溶解させた。次いで、100mgのReb A 60を1つのドラムバイアルに入れ、0.6g/Lのβ1,2GTストックおよび1.2g/Lのβ1,3GTストック各0.5mLを添加した。得られた均一の溶液を60℃で撹拌した。沈殿物が徐々に生じ、24h時点の反応混合物は濃い白色スラリーであった。HPLC分析により、90〜92%のReb M(約120〜130g/LのReb M)が存在することが示された。この反応を、0.6g/Lのβ1,2GT、0.2g/LのSUS、および1.2g/Lのβ1,3GTを伴い、0.5g/LのADPおよび10mMのEDTAを伴い、60℃で20mL中、2グラムのReb A 60の規模にし、JECFA法を使用し、曲線下面積により、87.1%のRebMが得られたことが決定された。精製のために、反応混合物を40℃で遠心分離し、上清をデカントし、ペレットを1体積の脱イオン水に再懸濁させ、20℃で遠心分離し、上清をデカントした。この洗浄を繰り返して全部で4回洗浄し、ペレットを凍結乾燥させ、それにより、JECFA法を使用して曲線下面積によって決定して、94.3%のRebMを得た。
本出願において引用されている全ての刊行物、特許、特許出願および他の文書は、あらゆる目的に関して、個々の刊行物、特許、特許出願または他の文書が個別にあらゆる目的に関して参照により組み込まれることが示されたものと同じ程度に、これによってそれらの全体が参照により組み込まれる。
種々の特定の実施形態を例示し、記載してきたが、本発明の主旨および範囲から逸脱することなく種々の変化をなすことができることが理解されよう。

Claims (131)

  1. 配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  2. 配列番号4、8、32、232、348、548、562、696、758、696、770、792、954、696、1002、1054、2600、2718、2814、2884、3016、3082、3244、3502、3346、3502、3696、4256、4684、4838、4876、5066、5290、5372、5562、5708、5976、6138、6288、6468、684、7388、および/または8088に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチドを含む、請求項1に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  3. ウラシル二リン酸以外の糖供与体を優先的に使用する、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  4. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、10、262、10/262、278/284/311/339/360、283、307、309、339/361、344/361、および361から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  5. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、112/172/283/318、112/261/318、112/282/283/431、137/283、137/283/431、163/318、261/283/306/337、261/283/337、261/337、269/318、282/283、282/283/431、283、283/306/308/360、283/306/337/426、283/318/337/360、283/360、318、360、および431から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号8を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  6. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、4、6、22、22/84/87/154/198/199/356、22/84/87/154/198/199/306/356、22/84/87/154/199/306/356、 22/84/87/154/356、22/84/87/154/198/199/306/356、22/84/87/154/199/306/356、22/84/87/198/199/306/356、22/84/87/198/199/356、22/84/87/198/199/306/356、 22/84/87/198/199/356、22/84/87/199/306/356、22/84/87/199/356、22/84/154/198/199/207/306、22/84/154/198/199/306、22/84/154/198/199/356、22/84/154/198/199/356、22/84/154/198/199/356、22/84/154/199/356、22/84/154/199/207、22/84/154/199/356、22/84/154/207/306/356、22/84/154/306/356、22/84/154/198/199/306/356、22/84/154/198/199、22/84/154/198/199/306/356、22/84/154/199/306/356、22/84/154/199/356、22/84/154/199/356、22/84/198/199/306/356、22/84/199/356、22/84/207/356、22/84/356、22/84/154/198/199/306/356、22/87/154/198/199/356、22/87/154/199/306/356、22/87/154/322/356、22/87/154/198/199/356、22/87/154/199/356、22/87/154/198/199/207/306/356、22/87/154/199/207/356、22/87/154/199/356、22/87/154/199/306/356、22/87/198/199/306/356、22/87/198/199/306/356、22/87/198/199/207/356、22/87/198/199/356、22/87/199/356、22/87/199/356、22/154/198/199/207/306/356、22/154/198/199/356、22/154/199/356、22/154/198/199/306/356、22/154/199/356、22/154/199/207/306/356、22/198/199/356、22/198/199/207/329/356、22/199/356、22/207/356、22/356、64、74、84、84/154/198/199、87、97、106、 110、112、137、139、154、159、 169、179、191、195、198、199、 207、233、259、261、 262、306、347、356、396、417、 421、427および435から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号32を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  7. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、64/106/109/112/131/159/233/421/427/431、64/106/109/112/417/421/427/431、64/106/109/139/179/417/421/427/431、64/106/109/233/347/427/431、64/106/112/347/417/421、64/106/139/179/233/417/427/431、64/106/417/421、64/106/431、64/106/109/112/131/179/417/427/431、64/106/109/417/421/427/431/439、64/106/112/139/159/179/204/396/417、64/106/112/159/179/417/421、64/106/204/417/421/427、64/109/112/139/159/179/417/431、64/109/112/139/417、 64/109/139/233/417/421、64/109/159/179/204/233/417/421、64/109/417/421、64/109/417/421、64/139/233/417/427/431/439、64/139/347/417/421/427/431、64/417/421/431、106/109/112/131/159/179/417/421、106/109/112/131/159/204/347/417/421/427、106/109/112/204/347/421/439、106/109/112/261/417/431、106/109/112/347/427、106/109/139/427/431、106/109/417/421/427、106/112/159/204/233/417/421/427/431、106/112/233/417、106/112/396/417/421、106/139/159/233/347/417/421/427/431、106/233/421/427、106/417、106/109/139/347/417/421/427、106/109、106/109/139/233/417/421、106/109/139/417、106/109/233/427/431、106/112/159/179/204/417/421、106/112/159/179/233/417/421/427/439、106/131/179/233/421/427/431、106/139/421、106/347/417/427/431、109/112/131/159/179/439、109/112/131/159/417/421、109/112/139/179/417/427、109/112/159/179/417/421、109/112/159/417/427、109/112/179/204/233/417/421/427、109/112/179/347/417、109/112/204/233/417、109/112/204/427、109/112/233/417/431、109/112/417/421/427、109/112/417/427/431、 109/131/139/179/261/396/421、109/131/204、109/139/179/417/421/427、109/139/179/417/427、 109/179/233/421、109/204/417/431、109/417/421、109/417/427/431、112/131/179/204/417/421/427、112/131/179/347/417/421、112/139/179/204/233/347/427、112/159/417/421、112/417/421、131/179/233/417/427、139/233/417、159/347/417/421/431、179/417/421、233/417/421/427/431および347/417から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号232を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  8. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、14/100、28/44/365/407、38/118/290/351/375/401/422、38/178/401、38/290/351/401/422、54/413、74/102/137/161/259/289、92/118、98/233、102/161/250/435、106/112/204/347/396/417、106/112/204/347/396/417/427、106/112/204/347/396/417/427/431、110/222/250/259/435、112/204/347/396/417/427、112/204/347/396/417/427/431、118/156/178/290/375/401/422、137/161/435、137/169、159/169/173/300/424/438、185/290/401/422、204/347/396/417/431、290/351/401および435/438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号348を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  9. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、14/28/38/74/100/102/118/161/169/178/233/250/407/422/438、14/28/38/74/102/156/159/233/250/289/413/422/424/435/438、 14/28/38/100/102/110/159/161/233/259/290/300/351/435、14/28/38/110/137/161/222/289/401、14/28/44/74/98/102/137/159/161/185/222/250、14/28/44/92、14/28/44/161/169、14/28/44/375、14/28/54/161/185/413、14/28/54/365、14/28/74/98/100/102/161/173/178/233/250/259/290/407、14/28/92/100/102/159/161/169/233、14/28/92/100/102/159/161/233/351/422、14/28/92/100/102/422/424/435、14/28/92/100/161/222/233/289/300、14/28/100/137/156/161/222/259/289/365/401/435/438、14/28/100/156/161/250、14/28/102/118/137/161/185/222/250/259/401、14/28/159/289/290/300、14/28/159/365/435、14/28/35、14/38/74/110/156/161/173/178/222/300、14/38/100/102/161/173/178/222/250/375/401/413、44/74/100/102/161/233/365/435/438、14/74/110/159/161/169/173/250/259/290/375/407/422、14/74/161/375/401、14/92/98/100/159/161/259/365/422/424/435、14/110/156/161/375/401/435/438、14/159/161/365/435/438、14/161/222/250/259/289/375/401/413、14/161/222/250/435/438、14/161/300、28、28/38/92/98/100/102/156/161、28/44/74/401、28/44/92/161/222/300/413、28/44/98/100/102/118、28/44/118/156/161/222/289/435/M438、28/44/289/290/351/422、28/44/435/438、28/54/92/159/161/290、28/54/159/290/438、28/54/250/439、28/74/156/159/161/178/300/365/435/438、28/74/156/161/365/407、 28/74/161/290/365、28/92/100/102/110/161/185/250/300/375/435、28/92/98/100/110/156/161/401、28/92/118/159/222/250/259/300/407、28/156/161/185/435/438、28/156/161/233/259/300/435、 28/98/100/102/161/185/351/401/435/438、38/161/300/438、74/98/100/102/110/118/161/178/250/289/290/300/435/438、74/98/100/102/118/156/159/161/435/438、74/156/161/173/178/424/435、74/375/435、98/100/118/159/161/300、98/100/156/159/161/178/259/289/290/351/422、102/137/159/161/422/424、118、137/159/161/185/300/351/365/435、156/159/161/169、159/161/222/290/375/407、159/161/401および 161/259/289/435/438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号548を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  10. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、19/44/110/191/198/199/208/300/365、19/75/76/87/92/199/207/208、19/87/92/191/199/209/413/435、44/76/197/199/208/351、44/87/92/137/159/199/209、44/87/137/159/169/191/199/208、44/87/137/191/197/209/289/401、44/87/199/208、75/76/87/92、75/76/87/92/290/300、75/76/87/191、75/76/87/191/197/199/209/300、75/87/92/169/207/208/300/413/435、75/87/110/137/169/191/199/208/209/289/435、75/87/110/191/197/198/207/208/289/290/300/401/413、75/87/300、75/110/197/199/208/290/300/401/413、76/92/199/209、87/92/197/198/199/208/300、 87/137/435、87/169/191/199/207/209/401/413、87/191/198/199/222/244/289/300/435、87/92/110/169/199/207/209/290/300、87/92/159/169/191/198/290/413/435、87/92/159/191/199/208/209/289/290、87/92/208/401、87/435、92/137/191/199/209、92/197/199/207/208/401、137/198/199/207/208/426/435、137/199/208/209/290/435、137/365、159/197/199/207/209、169/191/197/199/207/208、169/197/199/207/209/222/300/413/435、191/207/208/289/290/413/435および197/198/199/208/209から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号562を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  11. 前記操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、69/173/175/243/246/354/365/383/399、69/173/243/383/399、56/191/354/383/399、70/225/246/409/413、70/115/225/409、70/225/413、70/225/247、74/310/396/424、74/396および173/175/191/365/383/399から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号758を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼ。
  12. 前記操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、24、24/28、24/28/262、24/28/262/264、24/28/262/264/423、24/264/294、28、28/262/264、28/423、32、56/69/70/175/191/246、56/69/70/175/191/246/354、56/69/70/175/354、56/69/70/191/246/354/365、56/69/70/246/354、56/69/175/191/246/354、56/69/175/246/354、56/69/175/246/354/365、56/69/246/354、56/69/246/365、56/70/175/191/246、56/70/175/191/246/354、56/70/175/191/354/365、56/70/175/246/354、56/70/175/246/365、56/70/191/246/354/365、56/70/191/354、56/175/246、56/175/354、56/175/354/365、56/191/246/354、56/191/354/383/399、56/246、56/246/354/365、56/354、69、69/70/175/191/246/354/365、69/70/191/246/354/365、69/70/246、69/70/354/365、69/173/175/243/246/354/365/383/399、69/173/243/383/399、69/175/191/246/354、69/175/354、69/246/354/365、69/354、70、70/115/225/409、70/175/191/246/354/365、70/175/191/354/365、70/191/246/354/365、70/191/246/365、70/225/246/409/413、70/225/247、70/225/413、74/310/396/424、74/396、126、126/220、126/403、173/175/191/365/383/399、175、175/191、175/191/246/354/365、175/191/354、175/191/354/365、175/246/354、175/246/354/365、175/354、191/246/354、246/354、262/264、264、264/29、269、325、341、351、354、354/365および366から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号770を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたNDP−グリコシルトランスフェラーゼ。
  13. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、24/32/264/269/330/402/403、24/32/264/269/382/403/406、24/32/264/330、24/32/269、24/32/269/382/385/389/402/406、24/32/269/403、24/32/330、24/264/269/389/402/406、70/126/175/191/246/325/354/366、70/126/175/325/330/351/354/366、70/126/191/246/325/351/354/366/423、70/126/191/246/325/351/354/423、 70/126/191/246/325/351/366/423、70/126/191/246/354/366、70/126/246/330/366、 70/126/246/354/366、126/211/220/253/316/342、126/211/220/275/279/323、126/211/260/423、126/220/260、126/220/316、56/220/260/423、220/260および220/260/423から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号792を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  14. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、24/32/97/162/202、24/32/126/198/201/367、24/32/126/198/202/220/226/260/269S、24/32/146/226、24/32/198/201/220/226、24/32/198/201/226、24/97/260/367、32/97/198/202/226/260、32/202/367、32/226/367、56/175/197/211/330/382/385、56/175/197/253/385/389、56/175/264/382/385/389/402/406、56/197/264/279/330/382/389/402/403/406、56/211/253/316/323、56/211/264/316/389、56/211/279/323/330/402、56/264/385/389、97/202/367、162/220/226/367、175/197/211/264/330、175/211/264/279/316/323、175/211/279/323/330/402/403/406、175/211/323/382/402/403/406、175/211/403/406、175/264/316/323/330/403/406、175/264/316/389/402、175/264/323/330、197/211/316/342/406、197/211/316/382/389/402/403、197/211/402、197/279/323、198/201/367、198/202/220/269/367、201/202/367、211/382/406、211/385/389、211/402/403および389から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号954を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  15. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、24/32/175/211/260/330/403/406、24/32/175/226/253/275/316、24/32/201/226/260/264/330/402/406、24/162/175/198/211/226/275/316/323/389、24/162/175/201/275/316、24/162/198/201/211/226/323/351、24/162/198/201/226/351、24/162/201/253/264/351/402/406、24/175/198/211/226/253/316、24/175/201/275/316/351、24/175/201/316、24/175/211/220/260/275/330/389、24/175/211/253/316、24/175/211/316/330、24/175/226/323/351、24/198/201、24/198/201/211、24/198/201/211/220/260、24/198/201/220/275/389/402/406、24/198/201/226/330/389、24/198/201/351、24/201/211/253/323/351/366/389/402/403、24/201/226/253/402/403/406、24/226/330/351/403、175/198/201/211/226/260/264/323/402/406および175/198/226/260/351/402/403/406から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1054を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  16. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、21/127/129/161、21/127/129/161/162、21/127/129/162/199/200、127/129/161/162/199、127/129/161/199/200、127/129/162、156、156/161、156/161/162、156/162/199、および156/199/200から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1002を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  17. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/7/12/15/175/260/318、7/12/400/435、7/318/451、12/15/57/71/175/260/400/402、12/15/57/220/254/260/318/402、12/15/57/318/402/435、12/15/318/400/402/406、12/57/175/451、12/175/260/264/318/400、12/175/400/402/406、12/318/402/404/406/451、12/318/402/404/451、15/175/318/400/402、32、57/175/220/260/264/402、57/175/404、57/220/260/400/402/406、57/260/400/402/404、57/400/402、57/402、135、148、152、152/192/195、160/186/195、186、195、260、237、239、240、323、325、326、327、330、331、356および400/402から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2600を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  18. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、11、14/23/274/326/329、14/31/184/274/322/326/329/330、14/56/184/185/194/238/239/274/329/399、14/56/184/194/234/315/326/329/399/401、14/56/194/238/315/325/326/329/330/399、14/56/252/274/315/326/329/330/401、14/184/185/194/234/325/326/329、14/184/185/194/388/399/401、14/184/194/355/399、14/185/194/238/399、14/185/236/238/239/274/322/326/329/355/399/401、14/194、14/322/326/330、14/326/330、14/355、14/355/399、23/31/147/184/185/238/252/325/329/330/388/401、31/56/315/329/330、45、55、56、58、65、65/114/132/238、65/238/240、104、113、114、132、135、138、147/236/238/243/315/329/330/399/401、165、185/194/236/239/325/326、223/412、238、256、273、286、309、391、422、430および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2718を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  19. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、23/31/185/324/401、23/31/185/355、31/134/185/252/274/324/388、31/134/238/252/322/324/388、31/134/252/324、31/184/185/238/239/322、31/236、31/322、31/388、122、134/184/185/234/236/239/274/324/388、164、176、177、184/185/322、234/236/238/322/324/355、236、238/324/329/355、316、322/324、324/329/355/401、325、400、425、426、427、440および446から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2814を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  20. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、11、11/45/58/132/138/286、11/58、11/58/65/104/107/138/286、11/58/65/107/135/223/286/391/430、11/58/65/135/138、11/58/104/107/114/138/223/391、11/58/114/286/309/391、11/58/132/165/286/391/422/430、11/58/138/309、11/65/104/107/138/165/286/391/430、11/65/107/135/165/391/430、11/65/132/135/138/223/391、11/65/132/135/252、11/65/132/391/430、11/65/135/138、11/104/132/138/309/391、11/104/132/138/391、11/107/114/223/309/430、11/107/138、11/114/135/138/223、11/114/223/252/286/391、11/132/135/138/223/286、11/132/138/223/286/391、11/138/165/223/309、58/65/138、58/65/138/165、58/65/165/309/430、58/104/114/165/391、107/114/132/138、107/430、135/138/165/309/430および223/309から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2884を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  21. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、8/448、9、58/107/122/176/236/324/325/400/426/427、58/107/122/236/324/400/425/446、58/107/122/322/400/425/427/440/446、58/107/164/400、58/107/236/400、58/107/400、58/122/164/236/446、58/122/176/236/400/446、58/122/176/322/324/426/427、58/122/176/400/425/426/427/446、58/122/322/325、58/122/325、58/122/440、58/164/176、58/164/324/425/427、58/176/236、58/236、65、106、107/122/236/425/426/446、107/164/236/400/446、107/176/322/325/440/446、107/176/400/425/427/440、107/236、107/440、115、116、122/164/176/324/400、122/164/400/440、122/164/400/440/446、122/176/236/400、122/176/324/400/440、122/400、122/425/426/446、122/440/446、139、139/252、164、164/271/425/426、164/322/324/325/400/425/440/446、164/400、172、176/400、178、189、200、210、213、240、242、245、255、324/400/425/426/440/446、324/423、385、408、409、411、412、415、416、423、447および448から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3016を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  22. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、3,8、8/107/139/164/415/416/440/448、8/107/139/255/322/325/415/416/440/448、8/107/164/255、8/107/164/423/440、8/139、8/139/164/200/236/240/322/440/448、8/139/164/236/416/423/440、8/139/189/240/325/416、8/139/200/236/240/255/423、8/139/255/415/416、8/164、8/164/189/200/322/324/325/416/448、8/164/240/423、8/164/252/255/448、8/164/448、8/236/240/252/448、8/240/423、8/252/255/322/325/448、12/164/440、20/126/128/155/161、20/126/128/160/161、20/126/128/160/161/198、20/126/128/161、20/126/128/161/198/199、20/126/155/160/198、20/126/155/161、20/126/160、20/126/160/161、20/126/161、20/128/155/160/161/198、20/128/155/161/199、20/128/155/199、20/128/160/161/198、20/155/160、20/155/160/161、20/155/161、20/155/161/199、20/160/161/198、34、72、73、75、107/139、107/139/200/240/322/324/325/448、107/236/240/325/440、107/240/252/423/448、107/423、113、114、121/126/128/161/369、126/128/155/160/161、126/128/155/160/161/199、126/128/155/161/199、126/128/160/161/369、126/128/160/198/369、126/128/160/199/369、126/128/160/369、126/128/161/199/369、126/128/161/369、126/128/369、126/160/161/199/369、126/160/198/369、126/196/198/369、126/198/369、126/199/369、126/369、128/155/160/161、128/155/160/161/199、128/155/160/198、128/155/199、128/160/161/369、128/161/199/369、128/198/199/369、128/199/369、128/369、139、139/164/236/240、139/255/325/415/440、155/161/198/199、155/199、160/161/369、161/198/369、161/369、164/189、164/189/236/240、164/189/240/252/415/423、164/200/236、164/200/236/240/324/416/440、164/200/236/255/322/324/423/440、164/236、164/236/240/440、164/236/423、164/322/325、164/322/325/416/423、164/416/448、186、189、199/369、200/236/322/325/416、200/322/325/415/448、221、235、236/415/416、237、239、240、240/252/255/322/415/416、240/252/255/415/448、255/423、256、286、299、305、309、312、313、323、325、355、389、406、415/416/448、422、438および446から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3082を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  23. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、14、35、42、46、49、105、106/164/172/200/409、106/164/172/210/240/415、106/164/172/242/409/416、106/164/200/210/242、106/164/200/210/415、106/164/200/240/408/409/416、106/164/210/240/408/409/416、106/164/210/408/409、106/164/240/415、106/164/409/415/423、106/172/200/210/240/242/408/415/416/423、106/172/200/210/242、106/172/240、106/172/240/242/409/415、106/172/242、106/172/242/416/423、106/172/408/409、106/172/409/423、106/200/210/409、106/210/240、106/210/240/408/415、106/240/242、106/240/242/409、106/242/408/409、134、143、164/172/200/210/242/409、164/172/240/242/415、164/172/242/408、164/200/408/415/416、164/240/242/408、164/240/242/415/423、164/423、172/200/210/240/408、172/200/240、172/200/408/416、172/210/415、172/240、172/240/242/415、172/240/409、179、181、200/210/240/242/409、200/240/242/407、200/242/415/416/423、200/408/409、210/240、232、240、240/242、240/242/408/416、240/242/415/423、240/408、240/415、278、290、336、373、381、401、409/415および441から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3244を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  24. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、21、91、125、127、130/187、143、143/150、145、152、156、186、187、195、197、200、201、202、264、268、364、365、および415から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3346を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  25. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/5/113/186/237/406、2/73/186/237、2/189/286、2/286/355/416/422、5/34/73/113/406、5/73/186/406、5/113/237/406、5/186/237/245/256/406、5/186/237/406、5/256/406、34/113/186/237/406、72/73/172/235/240/242/438、72/172/239/240/242/408、72/172/240/242、73/172、73/172/235/239/240、73/172/235/239/242、73/172/239/240、73/172/239/240/242、73/172/240/242/408、73/172/240/408、73/186/237/406、73/235/240/323、73/235/240/408、73/237、73/239/242、96、113/186/406、127、132、144、153、155、156、172、172/188/323、172/235、172/235/239/240/242、172/235/239/408、172/235/240、172/235/240/242/438、172/239/240/242/323/408、172/240、172/240/299/323、186、186/237、186/237/286、186/406、187、189/333/355/421,196、199、200、235/239/240、235/240/242、237、239/240、239/240/242/256/323、239/240/242/323/408、239/240/408、239/242/408、240/242/256/438および242/408から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3502を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  26. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/5/35/105/143/237/373/416/422、2/5/35/143/232/237/416/422/441、2/5/35/232/278/373/416、2/5/105/143/232/373/416/422、2/5/278、2/105/143/232/237/278/373/441、2/143/232/373/441、2/143/373/441、3、5/35/232/373/416/422、5/105/232/237/373/416/441、5/105/237/278/422/441、5/105/237/416/422/441、5/143/189/232/237/441、5/143/232/237/278、5/143/232/237/416/422、5/143/232/373/422/441、5/143/237/278/373/416/422、5/143/373、5/189/237/278/373/416/422/441、5/232/416/422、5/237/373/422、5/373/416、8、26/42、26/42/46/49、26/42/46/49/134、26/42/46/49/134/186、26/42/46/134、26/42/49/134、26/42/49/134/186/355、26/42/49/134/401、26/42/134/401、26/49/134、26/134、26/134/186/355/401、26/134/355、26/134/401、26/355/401、35、35/105/189/232/373/416、42/46/49/97/134/401、42/46/49/134、42/46/49/134/186、42/46/49/134/186/355、42/46/49/134/235/355/401、42/46/49/134/401、42/46/49/186、42/49/134/186/355、42/49/134/186/401、42/49/134/355/401、42/134/186、42/186/355、46/49/134、49/134/355、50、61、62、101、105/143/232/237/373/416/422/441、105/143/278/373、105/189/237、105/237/278/373/416/422、105/237/373/422/441、105/373、105/373/441、134/401、137、143、143/189、143/189/232/422/441、143/189/237/373/416/422、143/232、143/237、143/237/422/441、158、161、164、176、186/355、189/232/373/416/422/441、189/237/278/416/441、193、223、223/243、232/237、237/373、235、237、 237/373/441および239、240、243、244、248、249、301、323、330、352、364、426および427から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3696を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  27. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、5/73/113/186/187/373/423、5/73/143/144/179/186/187/422、5/73/144/179/186/373/423、5/73/144/187/373/422、5/143/144/179/181/186/187/373、5/144/179/181/373/422、5/144/373/422、11、12、41、44、44/187、45、49/96/127/132/156/196、49/96/127/153/278、49/96/132/153/155/156/237/278/406、49/96/132/153/199/200、49/96/132/155、49/96/132/155/237/278、49/96/155/199/200/406、49/153/155、55、56、57、65、66、70、72、73、73/113/143/179/181/422、73/113/179/181/186/187、73/143/144/179/186/187/373/423、73/179/181/186/187/373、73/179/181/186/373/422、73/181/186/187、74/238、82、83、85、 96/127/132/153/278、96/127/153/155、96/132/153/155、96/132/153/155/156、96/132/153/155/156/200、96/132/153/156、96/132/196/199、96/132/278、96/153/155/156、96/153/155/199/200/237、96/153/406、103、111、113、113/143/179/186/187、113/144/186/423、113/144/373、113/181/186/373/422、113/373/422、114、117、127/132、127/132/153/156、127/132/155/156/406、127/153/155/199/200/237、127/406、 132、132/153/155、132/153/237/406、132/155、132/237、135、138、140、143/144/179/181/186/187/422、143/179/181/186/187/422/423、144/179/181/186/187/373、144/179/186/187/373、153/155/156/237、153/155/196/199/237、153/199/406、153/237、155/199、159、160、162、167、179/181/186、179/181/186/187/423、179/186/187、179/187/373/422、181/186/187/422/423、182、214、220、222、223、226、236、238、256、286、299、309、373/423、387、388、389、391、393、406、408、412、418、422、429、430、449および450および373/423から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号3956を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  28. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、7、8/375、9、10、12、50/137/189/375、53、62/153/155/156/159、62/153/155/156/159/427、62/153/155/199/406、65、68、99、106、110、115、116、131、132、136、137/164/375、153、153/155/156、153/155/156/159/199/238/406、153/155/237/238/239/406、153/155/238/239、153/155/427、153/156/159、153/156/199/237/427、153/156/427、153/159/237/238/352、153/176/181/427、155/156、155/156/176/181/199、155/156/176/238/427、155/181/199/238/406、156/199、156/199/427、164/375/433、170、178、190、192、194、200、220、223/375、238、242、245、257、272、280、302、304、335、375、385、395、399、402、408、412、416、423、427、445、447および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4256を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  29. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、11/41/44/127/132/406、11/41/44/127/278/406、11/41/45/73/127/278/406/408、11/41/45/127/278/406、11/41/132/278、11/44/45/127、11/44/73/127/132/135、11/44/73/127/132/135/406/408、11/44/127、11/44/132/278/406、11/45/73/127/135、11/45/127/132/135/138/182、11/45/406、11/73/127/132/135/182/278、11/73/127/132/278/406/408、11/73/127/132/406/408、11/73/132、11/73/132/135/408、11/127/132/135、11/127/132/135/182、11/127/132/135/406、11/127/132/138/182、11/127/132/182、11/132/135/406、11/182/406、41/44/45/73/127/132/278、41/45/127/132/135/278/406、41/73/132/135/406、44/45/73/132/135/406、44/45/127/132/135/138/182/406/408、44/45/127/132/278、44/73/127/135、44/73/127/135/182/278/406/408、44/73/132/135/406/408、45/73/127/132/135/406/408、45/73/132、45/73/132/135/182、45/73/278/406/408、45/127/132、45/127/132/135/182、45/127/132/135/182/406/408、45/127/135、45/132/408、45/406、56/309/449、57、65/114/422/427、65/114/427、65/143、65/143/235/427、73/127、73/127/132、127、127/132/135/182、127/132/135/182/406、132/135、132/135/182、132/135/406、132/406、164、164/220/309/449、164/220/449、164/449、182、220/449、309、309/449、406、418/427、427、427/429および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4550を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  30. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、4、7/10/73/127/132/385/423、10、10/53/73/99、10/53/272/423/427、10/53/423、10/73、10/73/127、10/127/132/385、10/132/302/385、11/44、11/71、11/287、11/441、37、40、42、42/138、42/141、43、46、47、48/398、49、49/406/408、51、53/73/200/423、53/127/132/385、53/127/136/385、53/132/136/302/423/427、53/132/302/385/423/427、64、65/106/445/447/449、65/143/220、65/220/309/445/447、65/220/445/449、65/399/406/447/449、65/402/406/445/449、65/445/447/449、65/447/449、71、73、73/127/427、73/132/136/385/427、73/385、73/385/427、76、97、100、106/220/399/402/406、108、108/172、109、112、115/116/278、115/170/190/238/412、115/190/194、115/245/278、116/170/190、116/190/406/408、116/238、116/238/245、116/416、117/157/301、118、118/406/408、119、119/172、127、130、132、133、134、141、143/220/445/447、143/309/402、143/309/445/447/449、157、169、170、170/190/192/194、170/192、170/192/194/278、170/192/194/335、170/194、170/194/335/416、170/238、170/335、170/335/416、172/420、172/437、179、181、190、190/192/194、190/194、190/194/238/245、190/194/335/416、190/194/412、190/245/412、192/194、192/194/242/406/408、194、200、200/385、220/399、220/445、220/445/447、257/385、259、272/302、272/385、274、275、278、287、288、302/385、309/399/449、309/445/447/449、333/398、333/406/408、338、356、357、376、381、385、394/420、396、397/406/408、398、401、385、385/427、399/406、399/406/449、402/445/449、406/408、406/445/447/449、406/445/449、410、417、420、423/427、434、437、441、445/447/449、445/449、447および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号7324を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  31. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、10、10/144、10/199、11、11/64/109、11/445、13、14、15、15/394、16、22、36、42/43、42/44/71/73/116、43/73/141、46/47/51、46/51、47/49、47/51、64、64/65/109、64/65/112、64/112、64/134、64/445、65/112、65/112/445、71、71/73、71/73/141、71/141、71/302、73、73/116/141、73/141、73/302、89、93、96、109、109/112、109/115/118、109/134、109/406、112、112/445、116、116/123、116/287、116/143、116/350、123、125、127、127/169/172、127/169/287、127/169/376/398/399、127/169/398/399、127/287、127/376、141、141/302、143、144、149、156、169/172/287、169/172/288、169/172/288/398/399/420/423/427、169/172/398/399、169/287、169/398、169/398/399、186、187、197、198、199、201、202、203、268、287、287/288、287/376、287/398、287/399、287/420/423/427、288、288/376/398、288/398、288/399、302、324、331、350、376、376/398、376/399、398、398/399、398/399/420、398/427、399および420から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号7784を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  32. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、22、25、51、56、71、78、80、81、88、157、185/208/230/252/255/290/365、189/206/208/365、200、208/365/435、243、245、249、259、262/401、279、282、284、304/322/365/401、308、338、339、352、362、364、365/401/413/435、366および374から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号696を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  33. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、51/56、51/56/243/249/282/353/362/366、51/56/243/249/308/362/364、51/56/249/353、51/56/249/362/364、51/56/249/362/366、51/243/249/308/353、51/243/249/348/362/366、51/249、51/249/282/284/364、51/249/282/353/366、51/249/284/308/362/366、51/249/353/362/364、51/353/362、56、56/243/249/282/364/366、56/243/364/366、56/249、56/249/284/353、56/249/353、56/284/366、243/249/282/284/362/364/366、243/249/308/353/366、243/249/353/362/366、243/282/353/362/364、243/282/362/364/366、243/308/353、249/353/362/366、282、308/366および362/366から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4684を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  34. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、25、25/56/353、25/243/249/259/366、25/243/249/362、25/362/366、51、51/56/200/243/249/259/338、51/56/362、51/71/249/279/284/362/366、56/243/249、56/362/366、70/198/259/313、85、88、88/173、110、159、163、171、174、175、177、198、198/313、198/313/428、200/243/249/259、208、208/320、209、209/234、222、226、234、234/408、243/338/362/366、253、256、259、265、272、289、322、336、353/362、405、411、428および439から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4838を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  35. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、8、9、25、25/198/209、25/200/209/338、25/200/243/249、25/209/243、25/209/243/249、25/209/243/259、25/209/249/259/366、25/209/259、25/209/279/366、25/209/289/366、25/249、25/259/279、25/259/279/289、25/279/284、25/279/284/289、25/289、34、53、54、55、61、69、70、73、79、87、91、107、108、111、141、153、158、174、190、194、198、198/200/209/243/249/289、198/249/338、200/209/366、201、205、209、209/249/259/279/338/366、209/249/259/289、209/249/279/284/289、209/249/338、209/279/289、209/366、234/297、238、247、249/259、252、253、254、256、259/366、279、279/338、289、297、308、321、322、327、336、338、341、342、364、366、388、392、411、412、414、426、430、432、446および449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号4876を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  36. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、88、88/110、88/110/159/198/200、88/110/159/198/234/259/265、88/110/159/198/259、88/110/198、88/110/234、88/159/198、88/198、88/198/200/259、88/198/259、88/259、88/259/265、110/259/265/411、159/198/411、159/259/411、171/174/175/177/208/320/428/439、171/175/177/208/320/428、171/177、171/177/226/428/439、171/208/320、171/208/320/428、171/208/428、174/175/177/208/320/428、174/175/428、174/320、198、198/200、198/200/234、198/234、198/259、208、208/320/331/428、208/320/428、208/428、234、259、320/428および428から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5066を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  37. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、7、25/61/208/252/253、25/61/428、25/107/208/320/428、25/208/247/252/253/364/428、25/247/249/252/364/428、38、53/54/55/153/201、53/54/308/392、53/171/308/392、54、61/107/208/252/253/254/364/428、61/208/252/254/428、64、68、73/87/201、91/201/439/444、99、106、107、107/208/320/364/428、107/247/249/252/254/364、107/247/252、107/247/428、109、159、169、171、172、177、179、190、190/208/247/252/428、222、233、233/269、247/249/252/254/320/428、249/252/253/254、249/252/254/428、251、252/253/254、253/320、259、264、289、296、300、308、308/327/439、317、318、320、320/364/428、320/428、347、404、408、417、424、427、428、428/434、431、435および438から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5290を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  38. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、49、73、87、87/88、87/88/94/159/177/208、87/88/159/198、87/88/177/198/249、87/88/208、87/159/177、87/159/320、87/177/249、87/198、87/198/199、87/198/208/320、87/208、87/208/320、87/320、88、88/177、88/177/208、88/177/320、88/198、88/199、88/199/208、88/208、88/208/249/320、88/320、113、134、135、158、159/177/198、159/177/208、159/198/208/320、171、173、177/198、177/208、195、214、222、253、256、257、268、272、289、300、302、330、348、374、392、399、408、411、412、437、439、445および453から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5372を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  39. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/7/107/233/252/253/320、2/7/107/233/252/253/320/408/428、2/7/233/252/253/320/427/428、2/233/252/317/320、7/107/190/233/252/253/317/408/427、7/107/233/252/253、7/107/233/252/317/320、7/107/233/252/317/408、7/190/233/252/253/320/427、7/190/233/252/317/320/427/428、7/190/233/252/408/427、7/233/252/253/317/408/427、7/233/252/253/408、7/233/252/317/320/427、7/233/252/317/428、14、55、56、64/169/201/347/392、64/172/264/268/347/392/417、91/94/171/172/201/264/347、91/201/264/347/392、94/201/264/347/435、107/190/233/252、107/190/233/252/317/320、107/233/252/253、107/252/317、169/171/172/264/392/435、169/171/201/264/392/435、169/172/201/264/347、169/172/201/264/347/392/435、169/172/201/347/392、169/172/201/417/435、171/172/201/264/392/417/435、171/201/392/417、190/233/252、190/233/252/253/317/320/408/428、190/233/252/317/408、190/233/252/320/408、201/264/347/392/417/435、201/264/347/392/435、201/264/347/417/435、233/252/253/317/320/427/428、233/252/253/408/427、233/252/317/408、233/252/317/427、233/252/320、233/252/320/408/428、255、282、308、336、342、348/374/435、364、374、391、407および422から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5562を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  40. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/4/113/158/163/302/364/399/449、2/4/113/158/163/330/449、2/4/113/163/449、2/4/158/163/364/449、2/4/158/222/257/302/330、2/4/158/330、2/4/163/222/302/330/364/449、2/4/163/257、2/4/163/257/330/399/449、2/4/163/330/449、2/4/163/364、2/4/163/364/453、2/4/302、2/113、2/113/163、2/113/163/449、2/113/330/399、2/113/449、2/158/163、2/158/163/364/399、2/163/364/453、2/364/449、4/113/158/163/330/364/399、4/113/158/302/330/364、4/113/163/364/399、4/158/163/364/399、4/364/449、87、87/95/198、87/198、87/266、87/322、107/134/135/195/412/417、107/195/268/322/439、107/195/272、107/195/417/439、107/374/417/439、113/158/163/364/399、134、134/135/195/268/317、158/163/257/330/364/449、158/163/302/330/364/399、158/163/364、163/257/302/364、163/302/330/364/449、163/364、173、173/190/233/252/427/437、173/190/252/257/347/427/437、173/190/257/374/437、173/190/257/427/437、173/233/252/257/427、173/233/437、173/252、173/252/268/437、173/252/347/411、173/257/374/437、173/374/437、173/427/437、190/233/252/257/347/411/437、190/252、190/252/257/285/427、190/252/257/411/437、190/252/257/427、190/374/427/437、195/272/320/439、195/317/320、198、198/244、198/292、233/252、233/252/257、233/252/257/347、233/252/257/347/411/437、233/252/257/427/437、233/252/285、233/252/285/437、233/252/411/437、233/252/437、233/374、233/374/437、252/257、252/257/347/437、257/347/411/437、268/417、285/347/437、302/364、330/364、347/411/437、347/427/437、364/399、374、374/411/437、408/417、411/437および437から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5708を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  41. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/4/14/158/282/364/449、2/4/14/158/282/407、2/4/14/163/198、2/4/14/163/282/399、2/4/14/198/308/407、2/4/14/282/308/364、2/4/14/282/308/407、2/4/14/282/364、2/4/158/163/364/399/407、2/4/158/198/282/364/407、2/4/163/198/282/308/342、2/4/163/282/342/364、2/4/163/364/399/449、2/4/198/282/449、2/4/198/364/391/449、2/4/282/342/364/407、2/14/158/198/407/449、2/14/163/308/364、2/14/163/364/407、2/14/282、2/14/282/308、2/14/282/308/364、2/14/282/399、2/14/308、2/14/308/364、2/158/163/407/449、2/163/282、2/163/282/308/364、2/198/282/308/342、2/198/282/399、2/282、2/282/308/342/407、2/282/308/391/407、2/282/399、2/282/399/407、2/308、2/308/364/399、4/14/158/163/198/282/407、4/14/158/282/364/391/407、4/14/163/282、4/14/163/282/308/342/407/449、4/14/198/308/364、4/14/282、4/14/282/308/364/407/449、4/14/282/342/399/407、4/14/364/391、4/158/282/364/399、4/163/282/308/407、4/198/399/407、4/282/342/364/407、4/282/364/407、4/364、12、14/158/163/198/364、14/158/163/282/364、14/158/198/282/342/364/449、14/158/364、14/163/198/282/342/364/449、14/163/282/308、14/282、14/282/308、14/282/342/364/391、14/282/364、14/282/364/391/407/449、14/282/399/407/449、14/407、37、44、70、71/331、74、75、90、106、108、112、114、115、131、138、139、156、158/282/407、158/282/407/449、158/364/399/407/449、158/364/449、162、163/198/282/342、163/282/308/364/399、163/282/399/407、163/282/407/449、174、198/282/308/342、198/282/407、198/308、247、248、254、258、282/308/342/364/449、282/308/449、365、389、401/402、416、427、429、432、433および456から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号5976を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  42. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、14/113/158、14/113/158/163、14/113/158/163/190/257/308/342、14/113/158/163/437、14/113/158/308/317/330/449、14/113/163/190/308/317、14/113/163/257/308/342/437/449、14/113/163/257/437、14/113/163/308/317/320/322/330/449、14/113/320/437/449、14/158、14/158/163/190/257/308/317/330/437、14/158/163/190/342/437、14/158/163/257、14/158/163/257/308/449、14/158/257/308/437/449、14/158/317/320/330/437、14/163/317/320、14/190、14/190/257/317/320/322、14/257/308/320/322/330、14/257/308/322/330/437、14/317、14/330、14/449、19、29/375、41、45、46、71、72、80、81、83、84、85、88、95、105、113/158/163/190/257/437、113/158/163/190/308/317/322、113/158/163/190/308/320、113/158/163/257/308/317/322/437/449、113/158/190/257/320、113/158/190/320/322/449、113/158/320/322/437、113/257/308、113/257/317/322/437、155、158/163、158/163/190/257/308/342/449、158/163/308、158/163/322/437、158/308/320/437、158/320/437/449、163/308/330/437/449、168、190/449、197、199、202、209、243、249、263、273、317/320/322/330、322/330、366、375および383から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号6138を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  43. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、5/449、6、10、25、25/449、37/71/125/174/247/248/427、37/71/247/331/365/389/401/429、37/139/329/365/427/433/449、37/139/427/432/433/449、37/139/429/432/433、37/174/401/402/433/449、37/248/331/389/427/433、37/248/389/401/429、37/331/432/433、69、69/449、71/139/389/427/429/432/433/449、71/174/329/427/429/432/433、71/174/365/427/432、71/248/365/389/401、71/248/449、71/254/433/449、71/427/432/433/449、71/432/433、87、87/449、91、91/449、139/156/174/389/401/427/433/449、139/156/247/365/401/433/449、139/156/247/389/401/427/433/449、139/156/248/389、139/156/248/389/401/416/427/429/433、139/156/365、139/174/248/331/389/401/449、139/174/254、139/174/365/401/402/427/433/449、139/247/248/331/401/417/432/449、139/248/254/449、139/248/402/416/427/433/449、139/248/432/433、139/254/401/416/427/433/449、139/401/449、144/449、153、153/449、156/248/256、156/254/331/365/427/432/449、156/389/401/402/416/432/433、159、159/449、172、172/449、174/247/248/389/401/432/433、174/329/432/449、174/365、174/389/429/432/433/449、212/449、233、233/449、247/248/401、247/248/449、247/331/401/427/432/449、247/401、247/427/432、248/331/427/429/433、248/365/389/427/429/432/449、248/401/429/432/433、248/416、248/416/449、248/449、254/365、254/427/433、288/449、303、317、331/365/429/432/433/449、347/449、361、365/401/402/429/432/433、369、389/401/416/432/449、389/401/427/432、401/427、416/427/433/449、416/432/433、416/432/433/449、421、427/432、427/432/449、432および433/449から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号6288を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  44. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2、3、4、9、37/41/45/72/81/83/84/88/155/163/168/190/331/375、37/41/45/72/81/83/84/88/155/263/273/331/375/432、37/41/45/72/81/83/84/88/155/331/366/375、37/41/45/72/81/83/84/88/155/331/375、37/41/45/72/81/83/84/88/248/375、37/41/45/72/81/83/84/88/331/366/432/433、37/41/45/72/88/155/168/190/331/366/375/432、37/41/45/72/88/155/168/190/331/375、37/41/45/72/88/190/263/273/331/366、37/41/45/72/155/163/168/190/243/263/273/331/366/432、37/41/45/72/155/163/168/243/248/273/331/366/432/433、37/41/45/72/155/163/168/263/366/432/433、37/41/45/72/155/163/331/366/375、37/41/45/72/155/190/243/248/273/331/432/433、37/41/45/72/155/190/248/263/331、37/41/45/72/155/190/263/331/366、37/41/45/72/155/190/273/331/366/375、37/41/45/72/155/190/273/366、37/41/45/72/155/190/273/366/375/432、37/41/45/72/155/248/263/273/366、37/41/45/72/155/263/331/375、37/41/45/72/155/263/375、37/41/45/72/155/273/366、37/41/45/72/155/331/366/375/432/433、37/41/45/72/190/263/273/331、37/41/45/72/190/331/366、37/41/45/72/190/366、37/41/45/72/263/331/366、37/41/45/72/263/366/432/433、37/41/45/72/331/366、37/41/45/81/83/84/88/155/168/190/243/331/366、37/41/45/81/83/84/88/155/168/331/375、37/41/45/81/83/84/88/155/263/273/331/366、37/41/45/81/83/84/88/163/168/263/273/331/366/375、37/41/45/155/163/168/263/331/375、37/41/45/155/168/248/273/331/375、37/41/45/155/190/331/366/375、37/41/45/155/366、37/41/45/155/366/432/433、37/41/45/155/375、37/41/45/243/248/273/331、37/41/45/263/331/375/432、37/41/45/331/366/432/433、37/72/81/83/88/155/190、37/72/197/273/331/375/432、37/83/263/365/366/375、37/190/202、41/45/72/155/263/331/366/375/432/433、41/45/163/168/243/248/273/366/432、45/72/84/88/197/375、45/72/88/366、45/72/163/202/365/366/375、45/72/168/243/331/365/366/429/432、45/84/168/190/199/254/273/365/366、45/163/168/190/199/366/429/432、45/163/168/197/263/331/365/366、53/437、61、64、72/81/83/84/88/155/163/168/190/366、72/81/83/84/88/155/190、72/81/83/84/88/155/190/273/331/366/432、72/81/83/84/88/155/273/331/375、72/81/83/84/88/155/366、72/81/83/84/88/163/168/190/243/263/331/366、72/81/83/84/88/163/168/263/331/375、72/81/84/190/248、72/83/84/88/202/254/273/366/375、72/83/84/197/202/243/263/365/366、72/83/88/243/263/331/365/366、72/155/163/168/190/366/432/433、72/155/190、72/155/190/263/331/366、72/155/190/366、72/155/273/331/375/432、72/243/248/263/366/432/433、72/243/248/273/366/432/433、72/243/248/366/432/433、72/248、72/170、72/405、81/83/84/88/155/163/168/273/331/375、81/83/84/88/155/190/263/331/366、81/83/84/88/155/263/366/375、81/83/84/88/155/366、81/83/84/88/190/263/375、81/83/84/88/263/273/331/366/432、81/83/169/190/263、81/83/190/263/365/366、81/83/202/365/366/402、81/88/375/402、83/88/155/273/366/375、84/155/168/197/199/331/366/375/383/402、84/168/197/202/263/366、84/197/366/402、94、96、98、113、118、118/120、120、129、134/158、155/168/190/197/199/366、155/168/375、155/263/366/432/433、158、165、170、171、173、183、190/199/202/331/366、193、197/199/202、197/202/248、197/248、199/263/331/365/366、214、214/222、222、226、229、234、248/375、253、265、269、272、289、296、300、302、304、322、322/407、330、365/366、365/375/402、390、395/439、396、398、399、403、405、408、411、412、423、428、434、435、438、439、442、444、448、449、452および454から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号6468を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  45. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、5/6/25/317、5/6/69/288/303、5/6/91/288/317、5/25/91/212/303/317、5/25/91/263、5/25/288、5/69/91/212/288、5/69/91/212/303、5/91/288/303、5/91/303、5/91/317/421、5/288、6/91/212/288/303/369/421、6/212/288/303、6/288、25/91/212/288、25/91/263/288/303、25/91/303/317/369、25/91/317/369、25/263/317、87/144、87/144/159/361、87/144/159/361/433、87/433、88/144、88/144/159、91/263/317/369、91/288/303/317/369、91/288/317/369/421、91/303、91/317、91/317/369、109/144/153/155/159/433、144、212/288、263/288/303/317および288から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号6864を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  46. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、2/3/433/435/442、2/81、9/37/113/396、9/87、9/144/331、37/113/144/396、37/233、41、53/144/233/269/331/428、53/233/269/390/395/396、53/234、61、56、61/120/156/163/165/197/303/308、61/120/159/300/308/407、61/120/300/303/407、61/156/159/163/165/243/248/253/300/303/308、61/156/163/243/248/300/303/308/407、61/156/163/300/365/411、61/156/197/253、61/163/300/303/308/405/407/411、61/165/248/253/407/411、61/214、61/214/300/308、61/243/300/308/407/411、61/300/303/308、61/300/303/405、61/365/405、69、69/81、69/134、69/263、69/263/434/438/439、69/439、72、76、 81、81/134、81/222、81/222/263/322/435/442、81/433/435/438/442、85/156/159/243/248/253/308/405/407/411、87、87/144、87/144/396、88、107、113/233/234、120/156/159/169/197/214/303/308/365/405/407、120/156/159/248/300/308、120/156/248/303/308/411、120/159、120/159/165/197、120/159/197/308/407/411、120/159/197/365/411、120/197/253/300/308、120/253/300/303/308/407、120/308/407/411、134/222/263、139、144/234/269、156、156/165/248/300/303/308、156/197/248/300/411、156/214/308/411、156/248/253/308、159/163/165/197/214/243/300/303/308/407、163/197/253/300/303/308/365、171/263、183/233/234/331/428、197/253/308/407、197/300/303/308/365、197/300/308/411、222、222/263/435/442、233/396/399、263、269、269/428/437、300/303/308、300/308/405/411、308、322、338および407から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号7388を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  47. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼの前記ポリペプチド配列が、37/72/76/81、37/72/76/107/156/331、37/72/195/331、53/81/195/197、55、69/72/76/107、72/76/107/156、72/76/107/195/197、72/269、81/107/195、87、87/91、87/91/94、87/91/94/120、87/91/94/233、87/91/94/233/259、87/91/94/263/389、87/91/120/233、87/91/120/233/411/431/435/437、87/91/144/259、87/91/163、87/91/163/233、87/91/163/233/263、87/91/163/389、87/91/233、87/91/233/389、87/91/259/263/389/428/431/435/437、87/91/263/389、87/91/322、87/91/389、87/94、87/94/144/263/428/435、87/94/263、87/163/233、87/233、87/233/259、87/233/322/389/411、87/233/389、87/259、87/263、87/428/431/435、87/435、91、91/94、91/94/120/233、91/94/120/233/389/431/438、91/94/233/259、91/120、91/120/233、91/233、91/233/259/389、91/233/389、94/233/411、111、144/389、163/233、195/197、197、233、233/259/263、233/259/389、233/438、252、255、259、263、263/389、322、324、328、389、413、428/431/435および451から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号8088を参照して番号付けられている、請求項2に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  48. ベータ−1,2−グリコシルトランスフェラーゼおよびベータ−1,3−グリコシルトランスフェラーゼから選択される、請求項2〜47のいずれかに記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  49. ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(AGT)、CDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(CGT)、GDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(GGT)、TDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(TGT)、およびIDP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼ(IGT)から選択されるNDP−グリコシルトランスフェラーゼである、請求項1〜48のいずれかに記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  50. ADP−グルコース依存性グリコシルトランスフェラーゼである、請求項48に記載の操作されたグリコシルトランスフェラーゼ。
  51. 請求項1〜50のいずれかに提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼポリペプチドをコードする、操作されたポリヌクレオチド。
  52. 請求項51に記載の少なくとも1つの操作されたポリヌクレオチドを含むベクター。
  53. 少なくとも1つの制御配列をさらに含む、請求項52に記載のベクター。
  54. 請求項51に記載の少なくとも1つの操作されたポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
  55. 請求項52および/または53に記載の少なくとも1つのベクターを含む宿主細胞。
  56. 真核生物および原核生物から選択される、請求項54または55に記載の宿主細胞。
  57. 請求項1〜50のいずれかに提供される少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを産生するための方法であって、請求項54〜56のいずれかに記載の宿主細胞を、前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼが前記宿主細胞において産生される条件下で培養するステップを含む、方法。
  58. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼを回収するステップをさらに含む、請求項57に記載の方法。
  59. 請求項1〜50のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを含む組成物。
  60. 配列番号72に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む、操作されたスクロースシンターゼ。
  61. 配列番号74、1080、1158、1222、1392、1456、1582、1764、1804、1840、2064、2432、2510、7506、および/または8420に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれより高い配列同一性であるポリペプチド配列を含む、操作されたスクロースシンターゼ。
  62. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、4/9/349/532、4/13/113/343/532、4/13/113/532、4/33/47/52/343/532、4/47/52/532、4/113/532、4/13/113、4/13/532、4/33/113、4/343、7、8、44、95、117/440、136、221、343/532、440、444、478、532、583、611、615、615/789、695、722および788から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号74を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  63. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、8/221、47/221、68/129/248、68/129/248/595/600/756、68/146/248/387/506/550、68/189/272/316/477/719/756、75/105/154/215/264/345、75/105/345/410/769、75/105/530、75/345/530、85/170/225/266/534、87/125/230/267/375/464/708、93/129/506/550/595/719/756、93/477/635、95/136/788、95/201/478/583/724/788、95/385/478/583/788、95/440/478/724/788/792、95/444/478/603/792、95/444/478/724/788、95/478/724、98/250、113/225/266/415、126/314/499/549/589/755、136/440/444/478/603、136/440/444/478/583/788、136/444/478/583/788/792、225/372/534、266、306/358/703/776、358/636/737、440/444/583/724/788、440/478および466から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1080を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  64. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、8/68/95/98/358/478/595/724/792、8/68/98/221/248/250/440/477/534/595/724、8/68/788、8/93/95/98/136/221/595/600/788、8/93/95/113/250/440/595/600/724/788、8/95/98/440/478/534/600/788、8/136/248/478/788、47/75/85/105/125/129/170/635、47/75/85/105/375/756/776、47/75/85/264/267/372/415/635、47/75/85/87/129/375/776、47/75/85/87/170/372/756、47/85/105/129/201/230/267/583、47/85/125/372/583/635/756、47/85/170/756、47/85/87/105/125/635、47/85/87/154/756、47/125/129/375/756/776、47/129/170/635、47/154/372/375/583/635/708/756、68/93/95/358/440/444/478/534/595/603、68/93/95/444/788、68/93/98/136/248/250/358/440/534/724、75/85/87/105/264/267/583/708、75/85/129/154/264/375、85/125/215/375/415/635/776、85/87/105/215/267/756、85/87/129/375/756/776、87/125/129/170/230/756、87/154/306/375/756、93/95/98/534/792、95/440/444/724/788、129/215/372/756および170/264/267から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1158を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  65. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、47/68/93/98/358/440、47/68/154/372/375、47/93/98/136/154/772/776、47/93/98/154/372/375/776、47/93/98/358/583/635、47/93/129/136/154/250/372/534/635/724、47/93/129/136/375/534/583、47/93/358/372/375/440/724、47/93/358/372/375/776、47/98/129/358/372/375/438/534、47/98/129/375/534/635/724/776、47/98/372/375、47/125/154、47/129/136/372/375/534、47/129/248/250/372/375/534/724、47/136/583/776、47/358/440/724、47/358/635/776、47/372/635/776、68/93/98/129/358/375/724、68/93/154/358/372/440/776、68/129/440、68/129/583/724、68/136/724、68/154/358/375、68/154/534/635、68/375/440/534/724/776、93/98/125/154/248、93/98/125/154/250/440、93/98/129/154/248、93/98/154/250/358/375/534、93/98/154/635/776、93/98/534、93/125/154/440/534、93/129/250/358/372/375/583、93/154/248/724、93/358/534/635、98/129/375/583、98/534/583/635、129/136/154/248/250/372/375/534、129/136/375、129/154/248/250/358/375/534/635、129/358/372/635、154/250/358/375/583、154/358/375/534/776、154/534/635/724、372/375/776、375/635および534/583から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1222を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  66. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、17/357/364/434/519/684、17/357/434/519/684、17/434/684、17/684、54/97/118/307/694/727/738、68/98/129/136、68/98/129/136/154、68/98/129/136/154/534、68/98/129/154/534、68/98/129/154/635、68/98/136/154/534/635、68/98/136/154/635、68/98/154、68/98/154/534、68/98/154/534/635、68/129/136、68/129/136/154、68/129/136/154/464/635、68/129/136/534/635、68/129/154、68/129/154/765、68/136/154/534/635、68/136/534/635、68/136/635、68/154、68/154/534/635、68/154/635、97/118/442/694/727/738、98/129/136/154、98/129/136/154/635、98/129/136/534、98/129/136/635、98/129/154、98/129/154/534/635、98/129/534/635、98/136/154/635、98/136/534/635、98/136/635、98/154、98/154/534、122、129/136、129/136/154/635、129/136/534、129/136/635、129/154/534、129/154/635、129/635、132/136/154/534/635、136/154/635、136/534/635、136/603、136/635、154、154/635、157、160、161、167、253、285、381、519、550、563、564、635および785から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1392を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  67. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、17/54/97/136/329/550/684/738、17/54/97/329/524/684、17/54/161/519/727/738、17/54/524/550/727、17/161/434/524/766、17/434/524/684、17/434/738、17/442/524/550/684/721、17/727、17/738、54/97/161/434/442、54/97/434/524/550/684/727、54/136/442/550、54/434/524/738、97/136/519/550/727/738および329/550/684/727/738から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1456を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  68. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、14/137/356/745、14/570、14/570/745、26/117/365、26/164/165/213/586、71/158/222/356、71/222/236、71/319/356/606、117/158/213/332/608、117/164/707、117/213/365/517、117/311/332、117/608、122、122/160/161/167/550、122/160/161/282/381/550、122/160/161/282/381/550/636、122/160/161/282/550、122/160/161/550/636、122/160/167/282/381/550/636、122/160/282/381、122/160/282/381/550、122/160/282/550、122/160/381/550、122/160/381/550/636、122/160/550、122/160/550/636、122/161/550、122/167、122/167/550、122/282/381/550、122/282/550、122/282/550/636、122/381/706、122/550、137/319/570、157/253/519、160/161、160/161/282/381/550、160/161/282/550、160/161/550/636/735、160/167/282/381/636、160/282、160/282/381/550、160/282/550/636、160/381/550/636/681、161/282/550/636、161/381/550、165/311、167/282/636、167/550、213/365/517/707、236、253/519、253/519/563、253/519/635、253/563/635、270/322/517、270/367/452/517/613/700/750、270/452/517/700/750、270/570、282/381/550、282/550、356/570、381/550、517、517/562/750、517/640、519/563、550、550/636および562から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1582を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  69. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、63/536、117/122/270/540/681、181/536/548、181/536/548/705、181/548/705、270/681、347/532、347/536/548/705、407/570/681、407/681、536、536/548、536/548/699、536/705、548、548/580、548/705、580、681、699および705から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1764を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  70. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、13、17、18、30、37、52、57、60、71、85、87、90、98、99、118、129、164、180、183、347/434/517/562/640/681、347/434/532/562/640/681、347/434/550/562/681、347/434/681、347/517/532/681、347/532/550/640/681/699、347/536/562/681、347/550/580/681、347/550/681、347/681、365、388、389、415、433、434/517/532/681、517/681、531、532/681、535、536/580/681、539、562/681、589、606、608、707、711、727、738、748、765、769および789から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1804を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  71. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、14、15、17/52/87/118/129/388/589/738/765、17/52/87/118/129/589/738、17/52/87/118/129/589/738/765、17/52/87/118/129/589/765、17/52/87/129/388/589、17/52/87/129/388/589/738、17/52/87/129/738、17/52/87/388/589/765、17/52/87/589/738/765、17/52/118/129/265/589/765、17/52/118/129/388/589/738/765、17/52/118/129/589/738/765、17/52/118/129/738/765、17/52/118/388/589/738、17/52/118/388/589/738/765、17/52/118/388/738/765、17/52/129/388/589/738、17/52/129/388/589/738/765、17/52/129/589、17/52/129/589/738、17/52/129/589/765、17/52/129/653/738/765、17/52/129/738、17/52/129/738/765、17/52/388/589/738、17/52/388/589/738/765、17/52/589/738/765、17/52/589/765、17/87/118/388/738、17/87/129/388/738、17/118/129/388/738/765、17/129/589、17/129/589/738、17/129/589/738/765、17/129/738/765、17/388/589/738、17/589/738、17/589/765、17/738/765、18/362、20、24、26、33、33/154、46、50、52/84/129/388/738/765、52/87/118/129/388/765、52/87/118/388/589/738、52/87/118/589/738/765、52/87/129/388/738/765、52/87/129/765、52/87/589/738、52/87/738、52/118/129/589/738、52/118/129/765、52/118/388/589/738、52/118/388/738/765、52/129/589/738/765、52/129/589/765、52/129/738、52/388/738/765、52/589/738、52/589/738/765、52/738/765、54、58、59、59/72、79、81、84/129/589/738/765、87/118/129/765、87/129/388/589、92、93、97/154、104、105、130、134、154、165、175、185、212、213、218、241、256、263、316、319、349、360、362、364、390、393、434、480、498、530、534、534/739、542、589/738/765、603および652から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号1840を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  72. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、21、25/112、41、57/71/87/347/434/562/606、57/71/129/180/434/536/562、57/71/129/434/531/536/562、57/71/129/531/532/536/539/606、57/71/562/606/711/789、57/71/789、57/87/180/531/532/562/606/612/711、57/87/347/562、57/90/129/562、57/90/129/562/711、57/96/129/180/531/532/550/562、57/129/347/531/532/539/562/711/747、57/129/347/536/550/562/711/789、57/129/347/550/711、57/129/531/539/562/789、57/129/536/606/789、57/129/606、57/180/562、57/180/562/606/612、57/347/434/531/532/539/789、57/434/550/562/606/612/789、57/531/532/536/562、57/562/606/711、57/562/711、71/129/180/347/531/539/550、71/129/180/434/532/536/539/711/789、71/129/531、71/129/606、71/347/532/550/562/711、71/347/536/562/612/789、71/536/539/562、87/189/532/536/562/711/789、87/347/531/606/789、87/347/536/539/550、89、90/129/539/550/606、91、112、129/180/434/562/711/789、129/180/606/711/789、129/347/562、129/536/539/562、129/539/562/789、129/550、129/550/562、129/562/606/711、180/532、180/550/606、186、200、226、259、318、330、347/531/550/711、347/536/539/550/711/789、347/536/562/606/612、347/550/562/606、434/531/539/550/562/711、434/550、485、487、531/532/536/539/562/711/789、531/532/536/550/562/606/789、531/532/562/606/711、532/539/550、562/711、641、674、684、688、763および764から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2064を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  73. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、25、33/47/59/81/175/530/534/550/606、33/58/59/81/130/480/530/534/550/652、33/58/59/480/530/534/550、33/58/154/480/534/550/603/606、33/59/480/530/534/550/606、33/79/81/175/530/534、33/79/81/175/530/534/603、33/79/154/480/530/534/550、33/81/130/480/530/534/550、33/81/175/530/534/542/550/652、33/130/530/534/550、33/154/480/530/534/603/606、33/154/534、33/530/534/550、42、58/59/79/175/480/534/550/652、59/154/530/534/550、70、75、77、79/81/480/530/534/550/603/606/652、81/480/530/534/550、106、130/480/530/534/550/603/606、199、265、267、380、410、561、642および758から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2432を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  74. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、7/12、12、27、29、41、41/71、41/71/112、41/71/112/259/485/487/684/688、41/71/112/259/485/688、41/71/259/485/532、41/71/485、41/71/485/532/684、41/71/487、41/71/487/532/684、41/71/532、41/71/532/684、41/71/684、41/84/259/485/487、41/91/112/485、41/91/112/485/487/532/684、41/91/112/485/532/684、41/91/485、41/112、41/112/259/485/487、41/112/259/487/532/684、41/112/485/684、41/112/487/684、41/112/532、41/112/684/688、41/259/485、41/259/485/487、41/259/485/487/532/684、41/259/485/487/684/688、41/259/532、41/485、41/485/487、41/485/487/684/688、41/485/532、41/485/532/688、41/485/684/688、41/487/684、41/532、41/684、41/684/688、44、44/112/684/688、45、47、48、51、55、71/112/259/485/487/684、71/112/485/688、71/485/684/688、71/532、71/684/688、72、95、100、112、112/259、112/259/532/684/688、112/259/684/688、112/485/684、112/485/684/688、116、136、139、176、178、198、201、205、205/485、207、208、226/487/684/688、259/485/487/684、259/485/532、259/487/684/688、259/532、280、303、317、343、358、361、440、478、485、485/487、485/487/532、485/487/532/684、485/487/684、485/487/684/688、485/532、485/684、485/684/688、532、532/684/688、611、615、630、675、684、684/688、724、756および788から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号2510を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  75. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、8/25/55/95/208/358/440/517/788、12/45/47、12/45/47/48/51/136/142/630、12/45/47/51/136/139/630/758、12/45/47/136/139/142/675/758、12/45/51/136/139/630/675/756/758、12/45/51/630/756、12/48/51/136/139/758、12/136/139/142/756/758、12/136/142、12/630/756、25/29/208/440、25/100/154/208/440/517/705/788、25/517、29/208/361/517/788、42/198/199/480/532/539/561、42/198/532/561、42/198/532/561/724、42/199/480/532/561、42/259/480/561、42/259/480/652、42/480/561、42/480/561/724、42/561、47/51/136/756/758、55、55/410/440/603/788、55/517、55/517/788、70、70/642、77/176/487/615/642、95/603、106/199/539/561/652、116、136/139/142、154/361/440/517/603/788、176、198/199/480/561、198/199/480/561/724、198/199/561/724、198/480/561、198/480/724、199/532/539/561/652/724、259/480、267/611/642、280/440/517、380、480/561/652、480/561/652/724/764、480/724、517、532/539/561、532/561/724、603および642から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号7506を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  76. 前記操作されたスクロースシンターゼの前記ポリペプチド配列が、12/45/95/136/139/199/517/630/756、12/45/95/136/756、12/45/136/139/199/517/603、12/45/136/139/208/603/630/756、12/45/136/139/517/603/756、12/45/136/139/517/630/642/756、12/45/136/139/517/756、12/45/136/139/603/756、12/45/136/139/642/756、12/45/136/176/517/603/630/642、12/45/136/208/517/630/756、12/45/136/517/603/642/756/789、12/45/136/517/630/642/756、12/45/136/603/756、12/45/136/630/642、12/45/139/176/208/517/603/630、12/45/139/199/208/603、12/45/139/517/756、12/45/139/756、12/45/176/603/630/642/756、12/45/199/208/517/603/630/756、12/45/208/517/603/642/756、12/95/136/139/517/603/756、12/95/139/517/630/756、12/95/139/517/642、12/95/139/630/642、12/95/199/517/642、12/95/517/630/756、12/95/630/756、12/136、12/136/139/176/517/603/630、12/136/139/176/517/603/756、12/136/139/176/630/756、12/136/139/176/642、12/136/139/176/756、12/136/139/199/208/517/603/756、12/136/139/199/208/517/630/642/756、12/136/139/208/517、12/136/139/517、12/136/139/517/603/630/642/756、12/136/139/517/603/630/756、12/136/139/517/603/756、12/136/139/517/630、12/136/139/517/630/642、12/136/139/517/630/642/756、12/136/139/517/756、12/136/139/603/630、12/136/139/603/630/642、12/136/139/603/630/756、12/136/139/603/642/756、12/136/139/630、12/136/139/630/642/756、12/136/139/630/756、12/136/139/642/756、12/136/176/208/517/603/630/756、12/136/176/517/642、12/136/176/603/756、12/136/199/208/517/603/642/756、12/136/199/208/630/642、12/136/199/517/756、12/136/208、12/136/208/603/642、12/136/517/603/630/642、12/136/517/603/630/756、12/136/517/630、12/136/517/630/642、12/136/517/642、12/136/517/642/756、12/136/517/756、12/136/603/630/642/756、12/136/603/630/756、12/136/603/642、12/136/603/642/756、12/136/603/756、12/136/630、12/136/630/756、12/139/176/517/603/630/756、12/139/176/630/756、12/139/199/208/642、12/139/199/517/630/756、12/139/208/517、12/139/208/642、12/139/517/603/642/756、12/139/517/630/642/756、12/139/517/642、12/139/603/642/756、12/139/603/756、12/139/630/642、12/139/630/642/756、12/139/630/756、12/176/517/603/630、12/176/517/630/642/756、12/176/517/756、12/176/603/630/756、12/176/603/756、12/199/208/517/642、12/199/630/642/756、12/199/642/756、12/199/756、12/208/517/603/623/630/642、12/208/603/630/756、12/208/630/756、12/517/603/630/642/756、12/517/603/630/756、12/517/603/756、12/517/630/642/756、12/517/642/756、12/603/630/756、12/603/642/756、12/603/756、12/630/642/756、12/630/756、25/176/198/532/539、116/142/198/434/440、136/139/176/199/208/517/630/642、136/139/176/517/630/642/756、136/139/199/517/603/756、136/139/208/517/630/756、136/139/208/603/630/756、136/139/517/603/630/642/756、136/139/517/603/642/756、136/139/517/603/756、136/139/517/756、136/139/603、136/139/630/642/756、136/517/756、136/603/756、136/630/642、136/630/756、136/642、136/642/756、136/756、139/199/208/517/630/756、139/199/517/642、139/208/517/630/642/756、139/517/603/756、139/517/630/756、139/642/756、154/532/652/788、199/517/603/630/756、208/517/630/642/756、517/603/630/642/756、517/630/756、603/630/756および603/756から選択される1つまたは複数の位置で少なくとも1つの変異または変異の組を含み、前記位置が、配列番号8420を参照して番号付けられている、請求項61に記載の操作されたスクロースシンターゼ。
  77. 請求項60〜76のいずれかに提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼポリペプチドをコードする、操作されたポリヌクレオチド。
  78. 請求項77に記載の少なくとも1つの操作されたポリヌクレオチドを含むベクター。
  79. 少なくとも1つの制御配列をさらに含む、請求項78に記載のベクター。
  80. 請求項78に記載の少なくとも1つの操作されたポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
  81. 請求項78または請求項79に記載のベクターを含む宿主細胞。
  82. 真核生物および原核生物から選択される、請求項80および/または81に記載の宿主細胞。
  83. 請求項60〜76に提供される少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼ改変体を産生するための方法であって、請求項80〜82のいずれかに記載の宿主細胞を、前記操作されたスクロースシンターゼ改変体が前記宿主細胞によって産生される条件下で培養するステップを含む、方法。
  84. 前記操作されたスクロースシンターゼ改変体を回収するステップをさらに含む、請求項83に記載の方法。
  85. 請求項60〜75のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼ改変体を含む組成物。
  86. 基質をグリコシル化するための方法であって、少なくとも1つの基質、請求項1〜50のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、および前記基質がグリコシル化されて少なくとも1つのグリコシル化産物を産生する条件下で、前記基質に前記グリコシルトランスフェラーゼを接触させるステップを含む、方法。
  87. 前記基質が、少なくとも1つのステビオール配糖体を含む、請求項86に記載の方法。
  88. 前記グリコシル化産物が、少なくとも1つのモノグリコシル化および/またはポリグリコシル化産物を含む、請求項86に記載の方法。
  89. レバウジオシドMを産生するための方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、ならびに請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記レバウジオシドDおよびレバウジオシドI基質、NDP−グルコース、ならびに前記グリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  90. レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生するための方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  91. レバウジオシドDを産生するための方法であって、ステビオシド基質、NDP−グルコース、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  92. 前記NDP−グルコースが、ADP−グルコース、CDP−グルコース、TDP−グルコース、GDP−グルコース、および/またはIDT−グルコースから選択される、請求項86〜91のいずれかに記載の方法。
  93. 前記NDP−グルコースがUDP−グルコースではない、請求項86〜92のいずれかに記載の方法。
  94. 前記グリコシルトランスフェラーゼが、請求項48〜50のいずれかに記載のグリコシルトランスフェラーゼを含む、請求項86〜93のいずれかに記載の方法。
  95. レバウジオシドMを産生するための方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、ならびに請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、ADP−グルコース、ならびにグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  96. レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生するための方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたADP−グリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  97. レバウジオシドDを産生するための方法であって、ステビオシド基質、ADP−グルコース、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、ADP−グルコース、およびグリコシルトランスフェラーゼをレバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  98. レバウジオシドMを産生するための方法であって、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドI基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびに請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記レバウジオシドD基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびにグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  99. レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIを産生するための方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびに請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAおよび/またはレバウジオシドIが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  100. レバウジオシドDを産生するための方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドDが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  101. レバウジオシドMを産生するための方法であって、少なくとも1つのステビオシドおよび/またはステビオシドとrebAの混合物を含むステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、ならびに請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP、スクロース、スクロースシンターゼ、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドMが産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  102. レバウジオシドMを産生するための方法であって、ステビオシド基質、NDP、スクロース、少なくとも1つのスクロースシンターゼ、および請求項1〜50に記載の少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼを提供するステップ、前記ステビオシド基質、NDP、およびグリコシルトランスフェラーゼを、レバウジオシドAが最初に産生され、レバウジオシドDおよび/またはレバウジオシドIが次に産生され、レバウジオシドMが最終的に産生される条件下で組み合わせるステップを含む、方法。
  103. 前記スクロースシンターゼが、請求項60〜76のいずれかに提供される操作されたスクロースシンターゼである、請求項98〜102のいずれかに記載の方法。
  104. ワンポット反応として実施される、請求項86〜103のいずれかに記載の方法。
  105. 逐次的に実施される、請求項86〜104のいずれかに記載の方法。
  106. 前記方法のステップを繰り返すステップをさらに含む、請求項86〜104のいずれかに記載の方法。
  107. 前記スクロースが繰り返されるステップの間に再利用される、請求項106に記載の方法。
  108. 前記操作されたグリコシルトランスフェラーゼおよび/または他の反応構成要素が再利用される、請求項106および/または101に記載の方法。
  109. 前記ステビオシド基質が、Stevia rebaudianaから抽出される、請求項86〜108のいずれかに記載の方法。
  110. 前記ステビオシド基質が合成により産生される、請求項86〜108のいずれかに記載の方法。
  111. 前記グリコシルトランスフェラーゼおよび/または前記スクロースシンターゼが固定される、請求項86〜110のいずれかに記載の方法。
  112. フルクトースを含む反応産物を産生する、請求項86〜110のいずれかに記載の方法。
  113. 前記フルクトースが、前記反応産物から除去される、請求項112に記載の方法。
  114. 洗浄ステップをさらに含む、請求項86〜113のいずれかに記載の方法。
  115. 少なくとも1つのカラムクロマトグラフィーステップをさらに含む、請求項86〜114のいずれかに記載の方法。
  116. 前記少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼが、請求項11〜31のいずれかに記載のグリコシルトランスフェラーゼから選択されるベータ−1,2グリコシルトランスフェラーゼである、請求項86〜115のいずれかに記載の方法。
  117. 前記少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼが、請求項4〜10および32〜47のいずれかに記載のグリコシルトランスフェラーゼから選択されるベータ−1,3グリコシルトランスフェラーゼである、請求項86〜116のいずれかに記載の方法。
  118. 前記少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼが、請求項11〜31のいずれかに記載のグリコシルトランスフェラーゼから選択されるベータ−1,2グリコシルトランスフェラーゼであり、請求項4〜10および31〜47のいずれかに記載のグリコシルトランスフェラーゼから選択されるベータ−1,3グリコシルトランスフェラーゼである少なくとも1つの操作されたグリコシルトランスフェラーゼをさらに含む、請求項86〜117のいずれかに記載の方法。
  119. 請求項60〜76のいずれかに記載の少なくとも1つの操作されたスクロースシンターゼをさらに含む、請求項86〜118に記載の方法。
  120. 請求項86〜119のいずれかに記載の方法に従って産生された少なくとも1つのレバウジオシド。
  121. 請求項120に記載のレバウジオシドを含む組成物。
  122. 請求項86〜89、92〜95、98、および/または101〜121のいずれかに記載の方法に従って産生されたレバウジオシドM。
  123. 請求項122に記載のレバウジオシドMを含む組成物。
  124. 請求項86〜94、96、99、および/または101〜121のいずれかに記載の方法に従って産生されたレバウジオシドA。
  125. 請求項124に記載のレバウジオシドAを含む組成物。
  126. 請求項86〜94、96、99、および/または101〜121のいずれかに記載の方法に従って産生されたレバウジオシドI。
  127. 請求項126に記載のレバウジオシドIを含む組成物。
  128. 請求項86〜94、97、および/または100〜121のいずれかに記載の方法に従って産生されたレバウジオシドD。
  129. 請求項128に記載のレバウジオシドDを含む組成物。
  130. 請求項122、124、126、および/または128に提供される少なくとも2つのレバウジオシドを含む組成物。
  131. 請求項123、125、127、および/または129に提供される少なくとも2つの組成物の混合物を含む組成物。
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