JP2020007351A - Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓに対して免疫化するための組成物 - Google Patents

Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓに対して免疫化するための組成物 Download PDF

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Abstract

【課題】Ｓ．ａｕｒｅｕｓワクチンで用いるための、特に複数のＳ．ａｕｒｅｕｓ病理に対して有用なワクチンのためのさらなる改善された抗原を同定すること。【解決手段】Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗原の種々の組み合わせを、免疫化に用いるために同定する。これらのポリペプチドは、所望により、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ糖類と組み合わせて用いてよい。本発明者らは、以下の３６ポリペプチド：ｃｌｆＡ、ｃｌｆＢ、ｃｏＡ、ｅａｐ、ｅｂｈＡ、ｅｂｐＳ、ｅｆｂ、ｅｍｐ、ｅｓａＣ、ｅｓｘＡ、ｅｓｘＢ、ＦｎＢＡ、ＦｎＢＢ、Ｈｌａ、ｈｌｇＢ、ｈｌｇＣ、ｉｓｄＡ、ｉｓｄＢ、ｉｓｄＣ、ｉｓｄＧ、ｉｓｄＨ、ｉｓｄＩ、ｌｕｋＤ、ｌｕｋＥ、ｌｕｋＦ、ｌｕｋＳ、ｎｕｃ、ｓａｓＡ、ｓａｓＢ、ｓａｓＣ、ｓａｓＤ、ｓａｓＦ、ｓｄｒＣ、ｓｄｒＤ、ｓｐａ、およびｓｄｒＥ２を同定した。【選択図】なし

Description

（技術分野）
本発明は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓに由来する抗原および免疫化におけるそれらの使用に関する。
（背景技術）
Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓは、グラム陽性球状細菌である。年間の米国での死亡率は、ＨＩＶ／ＡＩＤＳを含むいずれのその他の感染症の死亡率も超え、Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、血流、下気道、皮膚および軟部組織感染の主要な原因である。承認されたワクチンは、現在のところない。細菌の５および８型からの表面多糖の混合物に基づくワクチンであるＳｔａｐｈＶＡＸＴＭは、２００５年の第ＩＩＩ相臨床試験においてプラセボ群と比較した場合に感染を低減できなかった。
非特許文献１は、ＭｅｒｃｋおよびＩｎｔｅｒｃｅｌｌからの「Ｖ７１０」ワクチンが、心胸郭手術を受ける患者に対する第２／３相試験を受けていることを報告している。Ｖ７１０ワクチンは、保存された鉄捕捉細胞表面タンパク質（ｉｒｏｎ−ｓｅｑｕｅｓｔｅｒｉｎｇ ｃｅｌｌ−ｓｕｒｆａｃｅ ｐｒｏｔｅｉｎ）である単一抗原ＩｓｄＢに基づく［非特許文献２］。
Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、軽度の皮膚感染から肺炎、髄膜炎、骨髄炎、菌血症、心内膜炎、毒素ショック症候群、臓器膿瘍および敗血症のような生命を脅かす疾患までの範囲の疾病の原因である。細菌は、その生活環の異なる段階において異なって発現される複数の病毒性因子を有するので、ある疾患を予防できるワクチンは、別の疾患を予防できないことがある。例えば、Ｖ７１０ワクチンは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓの血液による拡散に対して効果的であり得るが、肺炎に対しては効果がないことがあり、いずれのオプソニン活性も惹起しないことがある。本発明の１つの目的は、血液による拡散および肺炎に対して防御でき、オプソニン応答も惹起できるワクチンを提供することである。
Ｓｈｅｒｉｄａｎ，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ （２００９） ２７：４９９−５０１． Ｋｕｋｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ Ｉｍｍｕｎ． （２００６） ７４（４）：２２１５−２３．
よって、Ｓ．ａｕｒｅｕｓワクチンで用いるための、特に複数のＳ．ａｕｒｅｕｓ病理に対して有用なワクチンのためのさらなる改善された抗原を同定する必要性がまだ存在する。
（発明の開示）
本発明者らは、単独または組み合わせのいずれかで免疫化のために有用である種々のＳ．ａｕｒｅｕｓポリペプチドを同定した。これらのポリペプチドは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ糖またはその他のＳ．ａｕｒｅｕｓポリペプチドと組み合わせてよい。抗原は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓワクチンにおいて有用であるが、複数の病原体に対する免疫化のためのワクチンにおける成分としても用い得る。
本発明者らは、以下の３６ポリペプチド：ｃｌｆＡ、ｃｌｆＢ、ｃｏＡ、ｅａｐ、ｅｂｈＡ、ｅｂｐＳ、ｅｆｂ、ｅｍｐ、ｅｓａＣ、ｅｓｘＡ、ｅｓｘＢ、ＦｎＢＡ、ＦｎＢＢ、Ｈｌａ、ｈｌｇＢ、ｈｌｇＣ、ｉｓｄＡ、ｉｓｄＢ、ｉｓｄＣ、ｉｓｄＧ、ｉｓｄＨ、ｉｓｄＩ、ｌｕｋＤ、ｌｕｋＥ、ｌｕｋＦ、ｌｕｋＳ、ｎｕｃ、ｓａｓＡ、ｓａｓＢ、ｓａｓＣ、ｓａｓＤ、ｓａｓＦ、ｓｄｒＣ、ｓｄｒＤ、ｓｐａ、およびｓｄｒＥ２を同定した。この１セットの抗原は、本明細書において、「第１抗原群」という。よって、本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、（１）ｃｌｆＡ抗原；（２）ｃｌｆＢ抗原；（３）ｃｏＡ抗原；（４）ｅａｐ抗原；（５）ｅｂｈＡ抗原；（６）ｅｂｐＳ抗原；（７）ｅｆｂ抗原；（８）ｅｍｐ抗原；（９）ｅｓａＣ抗原；（１０）ｅｓｘＡ抗原；（１１）ｅｓｘＢ抗原；（１２）ＦｎＢＡ抗原；（１３）ＦｎＢＢ抗原；（１４）Ｈｌａ抗原；（１５）ｈｌｇＢ抗原；（１６）ｈｌｇＣ抗原；（１７）ｉｓｄＡ抗原；（１８）ｉｓｄＢ抗原；（１９）ｉｓｄＣ抗原；（２０）ｉｓｄＧ抗原；（２１）ｉｓｄＨ抗原；（２２）ｉｓｄＩ抗原；（２３）ｌｕｋＤ抗原；（２４）ｌｕｋＥ抗原；（２５）ｌｕｋＦ抗原；（２６）ｌｕｋＳ抗原；（２７）ｎｕｃ抗原；（２８）ｓａｓＡ抗原；（２９）ｓａｓＢ抗原；（３０）ｓａｓＣ抗原；（３１）ｓａｓＤ抗原；（３２）ｓａｓＦ抗原；（３３）ｓｄｒＣ抗原；（３４）ｓｄｒＤ抗原；（３５）ｓｐａ抗原；（３６）ｓｄｒＥ２抗原からなる群より選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物を提供する。
第１抗原群のうち、抗原は、好ましくは、３６ポリペプチドのうちの１６のサブセット、すなわちｃｌｆＡ、ｃｌｆＢ、ｅｍｐ、ｅｓａＣ、ｅｓｘＡ、ｅｓｘＢ、ｈｌａ、ｉｓｄＡ、ｉｓｄＢ、ｉｓｄＣ、ｓａｓＤ、ｓａｓＦ、ｓｄｒＣ、ｓｄｒＤ、ｓｐａおよびｓｄｒＥ２から選択される。よって、本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、これらの１６の抗原からなる群より選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物を提供する。
本発明者らは、以下の１２８ポリペプチド：
も同定した。この１セットの抗原は、本明細書において、「第２抗原群」という。よって、本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、（１）ｓｔａ００１抗原；（２）ｓｔａ００２抗原；（３）ｓｔａ００３抗原；（４）ｓｔａ００４抗原；（５）ｓｔａ００５抗原；（６）ｓｔａ００６抗原；（７）ｓｔａ００７抗原；（８）ｓｔａ００８抗原；（９）ｓｔａ００９抗原；（１０）ｓｔａ０１０抗原；（１１）ｓｔａ０１１抗原；（１２）ｓｔａ０１２抗原；（１３）ｓｔａ０１３抗原；（１４）ｓｔａ０１４抗原；（１５）ｓｔａ０１５抗原；（１６）ｓｔａ０１６抗原；（１７）ｓｔａ０１７抗原；（１８）ｓｔａ０１８抗原；（１９）ｓｔａ０１９抗原；（２０）ｓｔａ０２０抗原；（２１）ｓｔａ０２１抗原；（２２）ｓｔａ０２２抗原；（２３）ｓｔａ０２３抗原；（２４）ｓｔａ０２４抗原；（２５）ｓｔａ０２５抗原；（２６）ｓｔａ０２６抗原；（２７）ｓｔａ０２７抗原；（２８）ｓｔａ０２８抗原；（２９）ｓｔａ０２９抗原；（３０）ｓｔａ０３０抗原；（３１）ｓｔａ０３１抗原；（３２）ｓｔａ０３２抗原；（３３）ｓｔａ０３３抗原；（３４）ｓｔａ０３４抗原；（３５）ｓｔａ０３５抗原；（３６）ｓｔａ０３６抗原；（３７）ｓｔａ０３７抗原；（３８）ｓｔａ０３８抗原；（３９）ｓｔａ０３９抗原；（４０）ｓｔａ０４０抗原；（４１）ｓｔａ０４１抗原；（４２）ｓｔａ０４２抗原；（４３）ｓｔａ０４３抗原；（４４）ｓｔａ０４４抗原；（４５）ｓｔａ０４５抗原；（４６）ｓｔａ０４６抗原；（４７）ｓｔａ０４７抗原；（４８）ｓｔａ０４８抗原；（４９）ｓｔａ０４９抗原；（５０）ｓｔａ０５０抗原；（５１）ｓｔａ０５１抗原；（５２）ｓｔａ０５２抗原；（５３）ｓｔａ０５３抗原；（５４）ｓｔａ０５４抗原；（５５）ｓｔａ０５５抗原；（５６）ｓｔａ０５６抗原；（５７）ｓｔａ０５７抗原；（５８）ｓｔａ０５８抗原；（５９）ｓｔａ０５９抗原；（６０）ｓｔａ０６０抗原；（６１）ｓｔａ０６１抗原；（６２）ｓｔａ０６２抗原；（６３）ｓｔａ０６３抗原；（６４）ｓｔａ０６４抗原；（６５）ｓｔａ０６５抗原；（６６）ｓｔａ０６６抗原；（６７）ｓｔａ０６７抗原；（６８）ｓｔａ０６８抗原；（６９）ｓｔａ０６９抗原；（７０）ｓｔａ０７０抗原；（７１）ｓｔａ０７１抗原；（７２）ｓｔａ０７２抗原；（７３）ｓｔａ０７３抗原；（７４）ｓｔａ０７４抗原；（７５）ｓｔａ０７５抗原；（７６）ｓｔａ０７６抗原；（７７）ｓｔａ０７７抗原；（７８）ｓｔａ０７８抗原；（７９）ｓｔａ０７９抗原；（８０）ｓｔａ０８０抗原；（８１）ｓｔａ０８１抗原；（８２）ｓｔａ０８２抗原；（８３）ｓｔａ０８３抗原；（８４）ｓｔａ０８４抗原；（８５）ｓｔａ０８５抗原；（８６）ｓｔａ０８６抗原；（８７）ｓｔａ０８７抗原；（８８）ｓｔａ０８８抗原；（８９）ｓｔａ０８９抗原；（９０）ｓｔａ０９０抗原；（９１）ｓｔａ０９１抗原；（９２）ｓｔａ０９２抗原；（９３）ｓｔａ０９３抗原；（９４）ｓｔａ０９４抗原；（９５）ｓｔａ０９５抗原；（９６）ｓｔａ０９６抗原；（９７）ｓｔａ０９７抗原；（９８）ｓｔａ０９８抗原；（９９）ｓｔａ０９９抗原；（１００）ｓｔａ１００抗原；（１０１）ｓｔａ１０１抗原；（１０２）ｓｔａ１０２抗原；（１０３）ｓｔａ１０３抗原；（１０４）ｓｔａ１０４抗原；（１０５）ｓｔａ１０５抗原；（１０６）ｓｔａ１０６抗原；（１０７）ｓｔａ１０７抗原；（１０８）ｓｔａ１０８抗原；（１０９）ｓｔａ１０９抗原；（１１０）ｓｔａ１１０抗原；（１１１）ｓｔａ１１１抗原；（１１２）ｓｔａ１１２抗原；（１１３）ｓｔａ１１３抗原；（１１４）ｓｔａ１１４抗原；（１１５）ｓｔａ１１５抗原；（１１６）ｓｔａ１１６抗原；（１１７）ｓｔａ１１７抗原；（１１８）ｓｔａ１１８抗原；（１１９）ｓｔａ１１９抗原；（１２０）ｓｔａ１２０抗原；（１２１）ＮＷ＿６抗原；（１２２）ＮＷ＿９抗原；（１２３）ＮＷ＿１０抗原；（１２４）ＮＷ＿７抗原；（１２５）ＮＷ＿８抗原；（１２６）ＮＷ＿２抗原；（１２７）ＮＷ＿１抗原；および（１２８）ＮＷ＿５抗原からなる群より選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物を提供する。
１２８抗原の第２抗原群のうち、１１３抗原の好ましいサブセットは、このリストから（８１）および（１０７）〜（１２０）が取り除かれたものである。
第２抗原群のうち、１２８ポリペプチドのうちの２７のサブセットは、本明細書において、「第３抗原群」といい、すなわち
である。本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、第３抗原群から選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物を提供する。
第２抗原群中にあるが第３抗原群中にない１０１抗原は、本明細書において、「第４抗原群」という。１０１抗原の第４抗原群のうち、８６抗原の好ましいサブセットは、上記のリストから（８１）および（１０７）〜（１２０）が取り除かれたものである。よって、第２抗原群は、第３抗原群と第４抗原群との組み合わせからなる。
第２抗原群のうち、１２８ポリペプチドのうちの８のサブセットは、本明細書において、「第５抗原群」といい、すなわちｓｔａ００４、ｓｔａ００６、ｓｔａ００７、ｓｔａ０１１、ｓｔａ０２８、ｓｔａ０６０、ｓｔａ０９８およびｓｔａ１１２である。本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、第５抗原群から選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物を提供する。
第１抗原群の３６抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が６３０存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記６３０の対の１つである組成物を提供する。
第２抗原群の１２８抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が８１２８存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記８１２８の対の１つである組成物を提供する。
第２抗原群の好ましい１１３抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が６３２８存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記６３２８の対の１つである組成物を提供する。
第３抗原群の好ましい２７抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が３５１存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記３５１の対の１つである組成物を提供する。
第４抗原群の１０１抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が５０５０存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記５０５０の対の１つである組成物を提供する。
第４抗原群の好ましい８６抗原のうち、異なる抗原の可能性のある対が３６５５存在する。このような対は全て本明細書に開示され、本発明の一部である。よって、本発明は、抗原の対を含む免疫原性組成物であって、前記対が、前記３６５５の対の１つである組成物を提供する。
ある実施形態において、組成物は、第１抗原群から選択される少なくとも１の抗原（すなわち１、２、３、４、５、６以上）と、第２抗原群から選択される少なくとも１の抗原（すなわち１、２、３、４、５、６以上）とを含む。第１抗原群からの抗原は、１６抗原の好ましいサブセットから選択してよく、第２抗原群からの抗原は、第３抗原群または第５抗原群から選択してよい。
本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、（１）ｃｌｆＡ抗原；（２）ｃｌｆＢ抗原；（３）ｓｄｒＥ２抗原；（４）ｓｄｒＣ抗原；（５）ＳａｓＦ抗原；（６）ｅｍｐ抗原；（７）ｓｄｒＤ抗原；（８）ｓｐａ抗原；（９）ｅｓａＣ抗原；（１０）ｅｓｘＡ抗原；（１１）ｅｓｘＢ抗原；（１２）ｓｔａ００６抗原；（１３）ｉｓｄＣ抗原；（１４）ｈｌａ抗原；（１５）ｓｔａ０１１抗原；（１６）ｉｓｄＡ抗原；（１７）ｉｓｄＢ抗原；（１８）ｓａｓＦ抗原からなる群より選択される２以上（すなわち２、３、４、５、６以上）の抗原を含む組成物も提供する。１８抗原のこの群は、本明細書において、時折、「第６抗原群」という。
本発明は、抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、前記組み合わせが、（１）ｅｓｘＡ抗原、（２）ｅｓｘＢ抗原、（３）ｓｔａ００６抗原、（４）ｈｌａ抗原および／または（５）ｓｔａ０１１抗原からなる群より選択される２以上（すなわち２、３、４または５）の抗原を含む組成物も提供する。組成物は、アジュバント、例えば水酸化アルミニウムアジュバントも含んでよい。
本発明の有利な組み合わせは、２以上の抗原が相乗的に作用するものである。よって、それらの組み合わせ投与により達成されるＳ．ａｕｒｅｕｓ疾患に対する防御は、それらの個別の防御効力の単なる相加により予測されるものを超える。
問題の具体的な組み合わせは、それらに限定されないが、以下のものを含む。
（１）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原およびｉｓｄＣ抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（２）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原およびｓｄｒＣ抗原を含む免疫原性組成物。
（３）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原およびｃｌｆＡ抗原を含む免疫原性組成物。
（４）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原、ｉｓｄＣ抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（５）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原およびｓｔａ００６抗原を含む免疫原性組成物。
（６）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原、ｉｓｄＣ抗原およびｈｌａ抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（７）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原およびｅｓｘＡ抗原を含む免疫原性組成物。
（８）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｈｌａ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（９）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原、ｉｓｄＣ抗原およびｅｓｘＡ抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（１０）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばＥｓｘＡＢハイブリッドとして組み合わせてよい。
（１１）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（１２）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原およびｓｐａ抗原を含む免疫原性組成物。
（１３）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｉｓｄＡ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｓｔａ０１１抗原およびｓｐａ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばＥｓｘＡＢハイブリッドとして組み合わせてよい。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。ｓｐａ抗原は、ＩｇＧ Ｆｃとの結合が破壊または減少するように変異したＳｐａ（Ｄ）ドメインのような全長ｓｐａ抗原の断片であってよい。
（１４）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、Ｈｌａ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばＥｓｘＡＢハイブリッドとして組み合わせてよい。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（１５）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原、ｉｓｄＣ抗原およびｓｄｒＥ２抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（１６）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原およびｈｌａ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（１７）ｈｌａ抗原、ｉｓｄＡ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（１８）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｉｓｄＡ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。
（１９）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原およびｈｌａ抗原を含む免疫原性組成物。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（２０）Ｈｌａ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（２１）ｅｓｘＡ抗原およびｅｓｘＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。（２２）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原およびｓｔａ００６抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（２３）ｓｐａ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｓｐａ抗原は、ＩｇＧ Ｆｃとの結合が破壊または減少するように変異したＳｐａ（Ｄ）ドメインのような全長ｓｐａ抗原の断片であってよい。
（２４）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｉｓｄＡ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばＥｓｘＡＢハイブリッドとして組み合わせてよい。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。
（２５）ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。
（２６）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｉｓｄＡ抗原およびｃｌｆＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。ｃｌｆＢ抗原は、全長ｃｌｆＢ抗原の断片、例えば配列番号１６３であってよい。
（２７）ｓｔａ００６抗原、ｓｔａ０１１抗原およびｓｔａ０１９抗原を含む免疫原性組成物。
（２８）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｈｌａ抗原およびｃｌｆＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｃｌｆＢ抗原は、全長ｃｌｆＢ抗原の断片、例えば配列番号１６３であってよい。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（２９）ｓｔａ００６抗原、ｓｔａ０１１抗原、ｓｔａ０１９抗原およびｈｌａ抗原を含む免疫原性組成物。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。
（３０）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｓｔａ０１１抗原およびｃｌｆＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｃｌｆＢ抗原は、全長ｃｌｆＢ抗原の断片、例えば配列番号１６３であってよい。
（３１）ｓｐａ抗原、ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。ｓｐａ抗原は、ＩｇＧ Ｆｃとの結合が破壊または減少するように変異したＳｐａ（Ｄ）ドメインのような全長ｓｐａ抗原の断片であってよい。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばＥｓｘＡＢハイブリッドとして組み合わせてよい。
（３２）ｓｄｒＤ抗原、ｓｄｒＥ２抗原、ｉｓｄＣ抗原およびｅｓｘＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｓｄｒＤおよびｓｄｒＥ２抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｓｄｒＤ抗原の下流のｓｄｒＥ２抗原を有するＳｄｒＤＥハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（３３）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｓｔａ０１１抗原およびｓｔａ０１９抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（３４）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原、ｓｔａ００６抗原、ｉｓｄＡ抗原およびｓｄｒＤ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。ｓｄｒＤ抗原は、全長ｓｄｒＤ抗原の断片、例えば配列番号１５６であってよい。
（３５）ｅｓｘＡ抗原、ｅｓｘＢ抗原およびｉｓｄＡ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。ｉｓｄＡ抗原は、全長ｉｓｄＡ抗原の断片、例えば配列番号１５７であってよい。
（３６）ｓａｓＤ抗原、ｃｌｆＢ抗原、ｓｄｒＣ抗原、ｅｓｘＡ抗原およびｅｓｘＢ抗原を含む免疫原性組成物。ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢ抗原は、以下に論じるようにハイブリッドポリペプチド、例えばｅｓｘＡ抗原の下流のｅｓｘＢ抗原を有するＥｓｘＡＢハイブリッドとして有用に組み合わせることができる。
（３７）Ｈｌａ抗原、ｓｐａ抗原、ｓｔａ００６抗原およびｓｔａ０１１抗原を含む免疫原性組成物。Ｈｌａ抗原は、例えばＨ３５Ｌ変異を含む解毒化変異体であってよい。ｓｐａ抗原は、ＩｇＧ Ｆｃとの結合が破壊または減少するように変異したＳｐａ（Ｄ）ドメインのような全長ｓｐａ抗原の断片であってよい。
いくつかの実施形態において、これらの３７組成物のいずれも、追加のブドウ球菌抗原を含んでよく、これらのさらなる抗原は、ポリペプチドおよび／または糖であり得る。例えば、これらは、通常、例えば血清型５および／または血清型８株に対する１または複数のＳ．ａｕｒｅｕｓ莢膜糖結合体（複数可）も含むことができる。このような結合体の一方または両方を含むことは、組み合わせ（８）、（１０）、（２０）、（２３）、（２５）、（３１）および（３７）について特に有用である。
その他の実施形態において、これらの３７組成物は、追加のブドウ球菌ポリペプチド抗原を含まない。その他の実施形態において、これらの３７組成物は、追加のブドウ球菌抗原を含まない。その他の実施形態において、これらの３７組成物は、追加の抗原を含まない。
本発明は、（ａ）配列番号１５１と８０％以上の同一性（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／または（ｂ）配列番号１５１のアミノ酸１〜９７からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸と、配列番号１５１のアミノ酸１０４〜２０７からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸との断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含むポリペプチドも提供する。本発明は、（ａ）配列番号１５２と８０％以上の同一性（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／または（ｂ）配列番号１５２のアミノ酸１〜１０４からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸と、配列番号１５２のアミノ酸１１１〜２０７からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸との断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含むポリペプチドも提供する。これらのポリペプチドは、配列番号１０を含む野生型ブドウ球菌タンパク質と、配列番号１１を含む野生型ブドウ球菌タンパク質とをともに認識する抗体（例えばヒトに投与した場合に）を惹起できる。よって、免疫応答は、抗原ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢをともに認識する。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０からのエピトープと、配列番号１１からのエピトープとを提供する。本発明は、このようなタンパク質と水酸化アルミニウムアジュバントのようなアジュバントとの組み合わせを含む免疫原性組成物も提供する。
本発明は、（ａ）配列番号２４１と８０％以上の同一性（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／または（ｂ）配列番号２４１のアミノ酸１〜９６からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片と、配列番号２４１のアミノ酸１０３〜２０５からの少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）とをともに含む、アミノ酸配列を含むポリペプチドも提供する。これらのポリペプチド（例えば配列番号２５０）は、配列番号１０を含む野生型ブドウ球菌タンパク質と、配列番号１１を含む野生型ブドウ球菌タンパク質とをともに認識する抗体（例えばヒトに投与した場合に）を惹起できる。よって、免疫応答は、抗原ｅｓｘＡおよびｅｓｘＢをともに認識する。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０からのエピトープと、配列番号１１からのエピトープとを提供する。本発明は、このようなタンパク質と水酸化アルミニウムアジュバントのようなアジュバントとの組み合わせを含む免疫原性組成物も提供する。
本発明は、ブドウ球菌溶血素配列を含むポリペプチドであって、前記配列が、配列番号２１７と少なくとも９０％の同一性を有する配列を含まないが、ブドウ球菌を死滅させることができる抗体を惹起できるポリペプチドも提供する。ポリペプチドは、配列番号２１８と８０％以上の同一性（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有する第１配列と、配列番号２１９と８０％以上の同一性（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有する第２配列とを有してよく、ここで、第１および第２配列は、直接接合されるか、または４０未満のアミノ酸（例えば≦３５アミノ酸、≦３０アミノ酸、≦２５アミノ酸、≦２０アミノ酸、≦１５アミノ酸、≦１０アミノ酸、≦５アミノ酸）を有する介在アミノ酸配列により接合される。配列番号１８９および２１６は、第１および第２配列が、テトラペプチドＰＳＧＳ配列（配列番号２２５）により接合されたこのようなポリペプチドの例である。
本発明は、Ｓｔａ０１１抗原とＣａ＋＋イオンとを含む免疫原性組成物も提供する。抗原とＣａ＋＋イオンは錯体を形成してよく、例えば抗原中の原子がＣａ＋＋イオンに配位してよい。免疫原性組成物は、アジュバントも含んでよい。
本発明は、Ｓｔａ０１１抗原のオリゴマーと、このようなオリゴマーを含む免疫原性組成物も提供する。オリゴマーは、ダイマー、トリマー、テトラマー、ペンタマー、ヘキサマー、ヘプタマー、オクタマーまたはより長いものであり得る。オリゴマーはＣａ＋＋イオンを含んでよく、Ｓｔａ０１１オリゴマーを含む組成物は、５〜５００ｍＭのＣａ＋＋イオンを含んでよい。
（さらなるポリペプチド抗原）
本発明の種々の抗原群からの抗原に加えて、免疫原性組成物は、以下のＳ．ａｕｒｅｕｓ抗原（またはその免疫原性断片（複数可）を含む抗原）の１または複数を含んで、組成物により惹起される免疫応答のＳ．ａｕｒｅｕｓに対する効力を増進し得る［例えば参考文献３〜１０を参照されたい］：
・ＡｈｐＣ
・ＡｈｐＦ
・自己溶解素アミダーゼ
・自己溶解素グルコサミニダーゼ
・コラーゲン結合タンパク質ＣＡＮ
・ＥｂｈＢ
・ＧｅｈＤリパーゼ
・ヘパリン結合タンパク質ＨＢＰ（１７ｋＤａ）
・ラミニン受容体
・ＭＡＰ
・ＭｎｔＣ（ＳｉｔＣとしても公知）
・ＭＲＰＩＩ
・Ｎｐアーゼ
・ＯＲＦ０５９４
・ＯＲＦ０６５７ｎ
・ＯＲＦ０８２６
・ＰＢＰ４
・ＲＡＰ（ＲＮＡ ＩＩＩ活性化タンパク質）
・Ｓａｉ−１
・ＳａｓＫ
・ＳＢＩ
・ＳｄｒＧ
・ＳｄｒＨ
・ＳＳＰ−１
・ＳＳＰ−２
・ビトロネクチン結合タンパク質
（糖との組み合わせ）
本発明の抗原群で同定される個別の抗原は、結合体化糖抗原と組み合わせて用いてよい。よって、本発明は、
（１）第１、第２、第３または第４抗原群（上記で定義されるとおり）から選択される１または複数の抗原と、
（２）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ菌体外多糖（ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ）とキャリアタンパク質との１または複数の結合体と
の組み合わせを含む免疫原性組成物を提供する。
この組み合わせの成分（２）で用いられる結合体は、糖部分とキャリア部分とを含む。糖部分は、ポリ−Ｎ−アセチルグルコサミン（ＰＮＡＧ）であるＳ．ａｕｒｅｕｓの菌体外多糖からである。糖は、細菌からの菌体外多糖の精製中に生じるサイズを有する多糖であっても、またはこれは、このような多糖の断片化により達成されるオリゴ糖であってよく、例えば、サイズは、４００ｋＤａを超えるものから７５と４００ｋＤａとの間、または１０と７５ｋＤａとの間、または３０までの反復単位で変動できる。糖部分は、種々の程度のＮ−アセチル化を有することができ、参考文献１１に記載されるように、ＰＮＡＧは、４０％未満がＮ−アセチル化されてよい（例えば３５、３０、２０、１５、１０または５％未満がＮ−アセチル化されている；脱アセチル化ＰＮＡＧは、ｄＰＮＡＧとしても公知である）。ＰＮＡＧの脱アセチル化エピトープは、オプソニン死滅を媒介できる抗体を惹起できる。ＰＮＡＧは、Ｏ−スクシニル化されてもまたはされなくてもよく、例えばこれは、２５、２０、１５、１０、５、２、１または０．１％未満より少ない残基がＯ−スクシニル化されてよい。
本発明は、
（１）第１、第２、第３または第４抗原群から選択される１または複数の抗原と、
（２）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ莢膜糖とキャリアタンパク質との１または複数の結合体と
の組み合わせを含む免疫原性組成物も提供する。
この組み合わせの成分（２）で用いられる結合体は、糖部分とキャリア部分とを含む。糖部分は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓの莢膜糖からである。糖は、細菌からの莢膜多糖の精製中に生じるサイズを有する多糖であっても、またはこれは、このような多糖の断片化により達成されるオリゴ糖であってもよい。莢膜糖は、５型および／もしくは８型Ｓ．ａｕｒｅｕｓ株ならびに／または３３６型Ｓ．ａｕｒｅｕｓ株のようなＳ．ａｕｒｅｕｓの任意の適切な株（または同様もしくは同一の糖を有する任意の細菌）から得てよい。感染性Ｓ．ａｕｒｅｕｓのほとんどの株は、５型または８型莢膜糖のいずれかを含有する。これらはともに、それらの反復単位中にＦｕｃＮＡｃｐと、連結のためのスルフヒドリル基を導入するために用いることができるＭａｎＮＡｃＡとを有する。５型糖の反復単位は、→４）−β−Ｄ−ＭａｎＮＡｃＡ−（１→４）−α−Ｌ−ＦｕｃＮＡｃ（３ＯＡｃ）−（１→３）−β−Ｄ−ＦｕｃＮＡｃ−（１→であり、８型糖の反復単位は、→３）−β−Ｄ−ＭａｎＮＡｃＡ（４ＯＡｃ）−（１→３）−α−Ｌ−ＦｕｃＮＡｃ（１→３）−α−Ｄ−ＦｕｃＮＡｃ（１→である。３３６型糖は、Ｏ−アセチル化を有さないβ−連結ヘキソサミンであり［１２、１３］、３３６株（ＡＴＣＣ５５８０４）に対して生成された抗体と交差反応性である。５型および８型糖の組み合わせが典型的であり、３３６型糖は、この対に加えてよい［１４］。
本発明は、
（１）第１、第２、第３または第４抗原群から選択される１または複数の抗原と、
（２）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ菌体外多糖とキャリアタンパク質との１または複数の結合体と、（３）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ莢膜糖とキャリアタンパク質との１または複数の結合体と
の組み合わせを含む免疫原性組成物も提供する。
これらの結合体におけるキャリア部分は、通常タンパク質であるが、通常、（１）の抗原のものでない。典型的なキャリアタンパク質は、ジフテリアもしくは破傷風毒素、またはそのトキソイドもしくは変異体もしくは断片のような細菌毒素である。ＣＲＭ１９７ジフテリア毒素変異体［１５］が有用である。その他の適切なキャリアタンパク質は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜タンパク質複合体［１６］、合成ペプチド［１７、１８］、熱ショックタンパク質［１９、２０］、百日咳タンパク質［２１、２２］、サイトカイン［２３］、リンホカイン［２３］、ホルモン［２３］、成長因子［２３］、種々の病原体由来抗原からの複数のヒトＣＤ４＋Ｔ細胞エピトープを含む人工タンパク質［２４］、例えば、Ｎ１９［２５］、Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅからのタンパク質Ｄ［２６〜２８］、ニューモリシン［２９］またはその非毒性誘導体［３０］、肺炎球菌表面タンパク質ＰｓｐＡ［３１］、鉄取り込みタンパク質［３２］、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅからの毒素ＡまたはＢ［３３］、組換えＰ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａエキソタンパク質Ａ（ｒＥＰＡ）［３４］などを含む。いくつかの実施形態において、キャリアタンパク質は、第１、第２、第３または第４抗原群から選択される抗原のようなＳ．ａｕｒｅｕｓタンパク質である。
組成物が１より多い結合体を含む場合、それぞれの結合体は、同じキャリアタンパク質または異なるキャリアタンパク質を用いてよい。
結合体は、過剰のキャリア（ｗ／ｗ）または過剰の糖（ｗ／ｗ）を有してよい。いくつかの実施形態において、結合体は、それぞれを実質的に等しい重量で含んでよい。
キャリア分子は、キャリアに、直接またはリンカーを介して共有的に結合体化してよい。タンパク質への直接の連結は、例えば参考文献３５および３６に記載されるように、例えば糖とキャリアとの間の還元的アミノ化により達成してよい。糖は、まず、例えば酸化により活性化する必要があることがある。リンカー基を介する連結は、任意の公知の手順、例えば参考文献３７および３８に記載される手順を用いて作製してよい。好ましい型の連結は、遊離の−ＮＨ２基（例えばアミノ化によりグルカンに導入される）とアジピン酸とのカップリングと（例えばジイミド活性化を用いて）、次いで得られた糖−アジピン酸中間体へのタンパク質のカップリングにより形成し得る［３９、４０］、アジピン酸リンカーである。別の好ましい型の連結は、糖ＣＤＩの遊離のヒドロキシル基の反応［４１、４２］と、その後のタンパク質との反応によりカルバメート連結を形成することにより形成され得るカルボニルリンカーである。その他のリンカーは、β−プロピオンアミド［４３］、ニトロフェニル−エチルアミン［４４］、ハロアシルハロゲン化物［４５］、グリコシドの連結［４６］、６−アミノカプロン酸［４７］、ＡＤＨ［４８］、Ｃ４〜Ｃ１２部分［４９］などを含む。カルボジイミド縮合も用いることができる［５０］。
ＰＮＡＧ結合体は、種々の様式、例えばａ）マレイミド基を含むリンカーを付加してＰＮＡＧを活性化することにより活性化ＰＮＡＧを形成するステップと、ｂ）スルフヒドリル基を含むリンカーを付加してキャリアタンパク質を活性化することにより活性化キャリアタンパク質を形成するステップと、ｃ）活性化ＰＮＡＧと活性化キャリアタンパク質とを反応させて、ＰＮＡＧ−キャリアタンパク質結合体を形成するステップとを含むプロセス、またはａ）スルフヒドリル基を含むリンカーを付加してＰＮＡＧを活性化することにより活性化ＰＮＡＧを形成するステップと、ｂ）マレイミド基を含むリンカーを付加してキャリアタンパク質を活性化することにより活性化キャリアタンパク質を形成するステップと、ｃ）活性化ＰＮＡＧと活性化キャリアタンパク質とを反応させて、ＰＮＡＧ−キャリアタンパク質結合体を形成するステップとを含むプロセス、またはａ）スルフヒドリル基を含むリンカーを付加してＰＮＡＧを活性化することにより活性化ＰＮＡＧを形成するステップと、ｂ）スルフヒドリル基を含むリンカーを付加してキャリアタンパク質を活性化することにより活性化キャリアタンパク質を形成するステップと、ｃ）活性化ＰＮＡＧと活性化キャリアタンパク質とを反応させて、ＰＮＡＧ−キャリアタンパク質結合体を形成するステップとを含むプロセスにより調製し得る。
本発明の抗原群において同定される個別の抗原は、菌体外多糖のためのキャリアタンパク質として用いて、共有結合の結合体を形成し得る。よって、本発明は、（１）第１、第２、第３および第４抗原群から選択される抗原と、（２）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ菌体外多糖との結合体を含む免疫原性組成物を提供する。本発明は、（１）第１、第２、第３および第４抗原群から選択される抗原と、（２）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ莢膜糖との結合体を含む免疫原性組成物も提供する。このような結合体のさらなる特徴は、上に記載している。これらの結合体は、本明細書に開示される任意の抗原と組み合わせてよい。
（非ブドウ球菌抗原との組み合わせ）
本発明の抗原群において同定される個別の抗原は、非ブドウ球菌抗原、特に院内感染と関連する細菌からの抗原との組み合わせで用いてよい。よって、本発明は、
（１）第１、第２、第３および第４抗原群（上記で定義されるとおり）から選択される１または複数の抗原と、
（２）Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓおよび腸外病原性Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉからなる群より選択される１または複数の抗原と
の組み合わせを含む免疫原性組成物を提供する。
本発明のブドウ球菌抗原との組み合わせで用いるためのさらに適する抗原は、参考文献５１の第３３〜４６頁に列挙されている。
（第１抗原群）
（ｃｌｆＡ）
「ｃｌｆＡ」抗原は、「クランピング因子Ａ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｃｌｆＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿００８１２であり、配列番号１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５７２）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０７５６（ＧＩ：１５１２２０９６８）である。
有用なｃｌｆＡ抗原は、配列番号１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｃｌｆＡタンパク質は、配列番号１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１の最後の３６８のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１の最初の３９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
配列番号２２４は、配列番号１の有用な断片である（「ＣｌｆＡ４０−５５９」）。この断片は、配列番号１のＣ末端付近の長い反復領域が取り除かれている。
（ｃｌｆＢ）
「ｃｌｆＢ」抗原は、「クランピング因子Ｂ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｃｌｆＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２９６３であり、配列番号２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６５８５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２５２９（ＧＩ：１５１２２２７４１）である。
有用なｃｌｆＢ抗原は、配列番号２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｃｌｆＢタンパク質は、配列番号２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２の最後の４０のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２の最初の４４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＣｌｆＢは、天然では長いタンパク質であるので、断片の使用は、例えば精製、取り扱い、融合、発現などの助けになる。
配列番号１６３は、配列番号２の有用な断片である（「ＣｌｆＢ４５−５５２」）。この断片は、ＣｌｆＢの最も露出されるドメインを含み、工業的規模でより容易に用いられる。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。ＣｌｆＢの３−ドメインモデルに基づくその他の有用な断片は、ＣｌｆＢ４５−３６０（ＣＬｆＢ−Ｎ１２としても公知である；配列番号１９６）、ＣｌｆＢ２１２−５４２（ＣＬｆＢ−Ｎ２３としても公知である；配列番号１９７）およびＣｌｆＢ３６０−５４２（ＣＬｆＢ−Ｎ３としても公知である；配列番号１９８）を含む。
（ｃｏＡ）
「ｃｏＡ」抗原は、「コアグラーゼＣｏａ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｃｏＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿００１９２であり、配列番号３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４００２）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０１６６（ＧＩ：１５１２２０３７８）である。
有用なｃｏＡ抗原は、配列番号３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｃｏＡタンパク質は、配列番号３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３の最初の１４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅａｐ）
「ｅａｐ」抗原は、「ＭＨＣクラスＩＩ類似体タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅａｐはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２１６１であり、配列番号４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５８４０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１８７２（ＧＩ：１５１２２２０８４）である。
有用なｅａｐ抗原は、配列番号４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅａｐタンパク質は、配列番号４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅｂｈＡ）
「ｅｂｈＡ」抗原は、「ＥｂｈＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｂｈＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１４４７であり、配列番号５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５１６８）を有する。
有用なｅｂｈＡ抗原は、配列番号５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｂｈＡタンパク質は、配列番号５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５の最初の３９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅｂｐＳ）
「ｅｂｐＳ」抗原は、「エラスチン結合タンパク質ＥｂｐＳ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｂｐＳはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１５０１であり、配列番号６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５２１７）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１３８９（ＧＩ：１５１２２１６０１）である。
有用なｅｂｐＳ抗原は、配列番号６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｂｐＳタンパク質は、配列番号６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
配列番号１６５は、配列番号６の有用な断片である（「ＥｂｐＳ１−１９８」）。この断片は、ＥｂｐＳの最も露出されるドメインを含み、工業的規模でより容易に用いられる。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。
（ｅｆｂ）
「ｅｆｂ」抗原は、「フィブリノゲン結合タンパク質切断型」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｆｂはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１１４であり、配列番号７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８６０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１０６９（ＧＩ：１５１２２１２８１）である。
有用なｅｆｂ抗原は、配列番号７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｆｂタンパク質は、配列番号７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７の最初の１４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅｍｐ）
「ｅｍｐ」抗原は、「細胞外マトリックスおよびプラズマ結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｍｐはＳＡＯＵＨＳＣ＿００８１６であり、配列番号８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５７５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０７５８（ＧＩ：１５１２２０９７０）である。
有用なｅｍｐ抗原は、配列番号８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｍｐタンパク質は、配列番号８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
配列番号１９０、１９１、１９２および１９３は、配列番号８の有用な断片である（それぞれ「Ｅｍｐ３５−３４０」、「Ｅｍｐ２７−３３４」、「Ｅｍｐ３５−３３４」および「Ｅｍｐ２７−１４７」）。
（ｅｓａＣ）
「ｅｓａＣ」抗原は、「ｅｓａＣ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｓａＣはＳＡＯＵＨＳＣ＿００２６４であり、配列番号９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０６９）を有する。
有用なｅｓａＣ抗原は、配列番号９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｓａＣタンパク質は、配列番号９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅｓｘＡ）
「ｅｓｘＡ」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｓｘＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿００２５７であり、配列番号１０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０６３）を有する。
有用なｅｓｘＡ抗原は、配列番号１０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｓｘＡタンパク質は、配列番号１０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｅｓｘＢ）
「ｅｓｘＢ」抗原は、「ｅｓｘＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｅｓｘＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿００２６５であり、配列番号１１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０７０）を有する。
有用なｅｓｘＢ抗原は、配列番号１１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｅｓｘＢタンパク質は、配列番号１１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＦｎＢＡ）
「ＦｎＢＡ」抗原は、「フィブロネクチン結合タンパク質Ａ前駆体ＦｎＢＰＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ＦｎＢＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８０３であり、配列番号１２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４３８）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２３９９（ＧＩ：１５１２２２６１１）である。プロテオミクス分析により、このタンパク質は分泌されるかまたは表面に露出されることが明らかになっている。
有用なＦｎＢＡ抗原は、配列番号１２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＦｎＢＡタンパク質は、配列番号１２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２の最後の３７のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＦｎＢＡは、天然では長いタンパク質であるので、断片の使用は、例えば精製、取り扱い、融合、発現などの助けになる。
配列番号１６６（「ＦｎＢＡ１−５１１」）および１６７（「ＦｎＢＡ５１２−９５３」）は、配列番号１２の有用な断片である。これらの断片は、工業的規模でより容易に用いられる。
（ＦｎＢＢ）
「ＦｎＢＢ」抗原は、「フィブロネクチン結合タンパク質Ｂ ＦｎＢＰＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ＦｎＢＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８０２であり、配列番号１３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４３７）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２３９７（ＧＩ：１５１２２２６０９）である。
有用なＦｎＢＢ抗原は、配列番号１３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＦｎＢＢタンパク質は、配列番号１３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３の最後の３７のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（Ｈｌａ）
「Ｈｌａ」抗原は、「アルファ毒素」または単に「溶血素」としても公知の「アルファ溶血素前駆体」である。ＮＣＴＣ８３２５株において、ＨｌａはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１２１であり、配列番号１４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８６５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１０７３（ＧＩ：１５１２２１２８５）である。Ｈｌａは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのほとんどの株により生成される重要な病毒性決定基であり、孔形成および溶血活性を有する。抗Ｈｌａ抗体は、動物モデルにおける毒素の有害な影響を中和でき、Ｈｌａは、肺炎に対する防御のために特に有用である。
有用なＨｌａ抗原は、配列番号１４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＨｌａタンパク質は、配列番号１４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる（例えば配列番号２３１が得られる）。Ｃ末端での切断を用いて、例えば５０アミノ酸だけ（配列番号１４の残基２７〜７６）を残すこともできる［５２］。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
Ｈｌａの毒性は、本発明の組成物において、化学的不活性化（例えばホルムアルデヒド、グルタルアルデヒドまたはその他の架橋剤を用いて）により回避できる。しかし、代わりに、その免疫原性を保持しながら毒性活性が除去されたＨｌａの変異体の形態を用いることが好ましい。このような解毒化変異体は、当該技術分野において既に公知である。ある有用なＨｌａ抗原は、配列番号１４の残基６１（これは、成熟抗原の残基３５である（すなわち、最初の２６のＮ末端アミノ酸を取り除いた後＝配列番号２３１の残基３５））にて変異を有する。よって、残基６１はヒスチジンではない場合があり、代わりに例えばＩｌｅ、Ｖａｌまたは好ましくはＬｅｕであり得る。この位置でのＨｉｓ−Ａｒｇ変異を用いることもできる。例えば、配列番号１５０は、成熟変異体Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ配列（すなわち、Ｈ３５Ｌ変異を有する配列番号２３１）であり、有用なＨｌａ抗原は、配列番号１５０を含む。その他の有用な変異は、長いループを短い配列で置き換えて、例えば配列番号１４の残基１３６〜１７４での３９マーを、配列番号１８９（Ｈ３５Ｌ変異も含む）および配列番号２１６（Ｈ３５Ｌ変異を含まない）でのようにＰＳＧＳ（配列番号２２５）のようなテトラマーに置き換える。別の有用な変異は、残基Ｙ１０１を、例えばロイシンで置き換える（配列番号２４２）。別の有用な変異は、残基Ｄ１５２を、例えばロイシンで置き換える（配列番号２４３）。別の有用な変異体は、残基Ｈ３５およびＹ１０１を、例えばロイシンで置き換える（配列番号２４４）。別の有用な変異体は、残基Ｈ３５およびＤ１５２を、例えばロイシンで置き換える（配列番号２４５）。
さらに有用なＨｌａ抗原は、参考文献５３および５４に開示されている。
配列番号１６０、１６１および１９４は、配列番号１４の３つの有用な断片である（それぞれ「Ｈｌａ２７−７６」、「Ｈｌａ２７−８９」および「Ｈｌａ２７−７９」）。配列番号１５８、１５９および１９５は、配列番号１５０からの対応する断片である。
ある有用なＨｌａ配列は配列番号２３２であり、これは、実施例において用いた。これは、Ｎ末端Ｍｅｔと、次いで発現ベクターからのＡｌａ−Ｓｅｒジペプチドと、次いで配列番号１５０（ＮＣＴＣ８３２５株から）とを有する。これは、配列番号２３３によりコードされる。
（ｈｌｇＢ）
「ｈｌｇＢ」抗原は、「ロイコシジンｆサブユニット前駆体ＨｌｇＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｈｌｇＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７１０であり、配列番号１５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６３５０）を有する。
有用なｈｌｇＢ抗原は、配列番号１５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｈｌｇＢタンパク質は、配列番号１５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１５の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｈｌｇＣ）
「ｈｌｇＣ」抗原は、「ロイコシジンｓサブユニット前駆体ＨｌｇＣ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｈｌｇＣはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７０９であり、配列番号１６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６３４９）を有する。
有用なｈｌｇＣ抗原は、配列番号１６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｈｌｇＣタンパク質は、配列番号１６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１６の最初の２９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｉｓｄＡ）
「ｉｓｄＡ」抗原は、「ＩｓｄＡタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８１であり、配列番号１７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８２９）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１０４１（ＧＩ：１５１２２１２５３）である。
有用なｉｓｄＡ抗原は、配列番号１７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＡタンパク質は、配列番号１７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１７の最後の３８のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１７の最初の４６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１７のＣ末端の３８マーを除く切断（ＬＰＫＴＧモチーフで開始する）も有用である。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
配列番号１５７は、配列番号１７の有用な断片であり（配列番号１７のアミノ酸４０〜１８４；「ＩｓｄＡ４０−１８４」）、これは、天然タンパク質のヘム結合部位を含み、抗原の最も露出されるドメインを含む。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。その他の有用な断片は、参考文献５５および５６に開示されている。
ＩｓｄＡは、水酸化アルミニウムアジュバントに良好に吸着しないので、組成物に存在するＩｓｄＡは、吸着されないか、または代替アジュバント、例えばリン酸アルミニウムに吸着されてよい。
抗ＩｓｄＡ抗体は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ膿瘍形成および致死的チャレンジに対してマウスを防御する［５７］。
（ｉｓｄＢ）
「ｉｓｄＢ」抗原は、「神経フィラメントタンパク質ｉｓｄＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０７９であり、配列番号１８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８２８）を有する。ＩｓｄＢは、それ自体でワクチン抗原として用いることが提案されているが［２］、これは、肺炎を予防しないことがある。
有用なｉｓｄＢ抗原は、配列番号１８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＢタンパク質は、配列番号１８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８の最後の３６のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１８の最初の４０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＩｓｄＢの有用な断片は、参考文献５６および５８に開示され、例えば配列番号１８の３７の内部アミノ酸を欠失している。
抗ＩｓｄＢ抗体は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ膿瘍形成および致死的チャレンジに対してマウスを防御する［５７］。
いくつかの実施形態において、本発明の組成物は、ｉｓｄＢ抗原を含まない。
（ｉｓｄＣ）
「ｉｓｄＣ」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＣはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８２であり、配列番号１９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８３０）を有する。
有用なｉｓｄＣ抗原は、配列番号１９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＣタンパク質は、配列番号１９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１９の最後の３９のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１９の最初の２８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＩｓｄＢの有用な断片は、参考文献５６に開示されている。
参考文献５９は、ＩｓｄＢおよびＩｓｄＨの両方からのエピトープを有用に含む抗原を開示する。
（ｉｓｄＧ）
「ｉｓｄＧ」抗原は、「ヘム分解性モノオキシゲナーゼＩｓｄＧ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＧはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８９であり、配列番号２０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８３６）を有する。
有用なｉｓｄＧ抗原は、配列番号２０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＧタンパク質は、配列番号２０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２０の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｉｓｄＨ）
「ｉｓｄＨ」抗原は、「ｉｓｄＨ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＨはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１８４３であり、配列番号２１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５５４２）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１６２４（ＧＩ：１５１２２１８３６）である。これは、ＨａｒＡとしても公知である。
有用なｉｓｄＨ抗原は、配列番号２１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＨタンパク質は、配列番号２１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２１の最後の３５のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２１の最初の４０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
参考文献５９は、ＩｓｄＢおよびＩｓｄＨの両方からのエピトープを有用に含む抗原を開示する。
（ｉｓｄＩ）
「ｉｓｄＩ」抗原は、「ヘム分解性モノオキシゲナーゼＩｓｄＩ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｉｓｄＩはＳＡＯＵＨＳＣ＿００１３０であり、配列番号２２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９４３）を有する。
有用なｉｓｄＩ抗原は、配列番号２２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｉｓｄＩタンパク質は、配列番号２２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２２の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｌｕｋＤ）
「ｌｕｋＤ」抗原は、「ロイコトキシンＬｕｋＤ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｌｕｋＤはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９５４であり、配列番号２３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６４７）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１７１８（ＧＩ：１５１２２１９３０）である。
有用なｌｕｋＤ抗原は、配列番号２３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｌｕｋＤタンパク質は、配列番号２３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２３の最後の４３のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２３の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｌｕｋＥ）
「ｌｕｋＥ」抗原は、「ロイコトキシンＬｕｋＥ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｌｕｋＥはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９５５であり、配列番号２４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６４８）を有する。
有用なｌｕｋＥ抗原は、配列番号２４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｌｕｋＥタンパク質は、配列番号２４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２４の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｌｕｋＦ）
「ｌｕｋＦ」抗原は、「ロイコシジン／溶血素毒素ファミリーＬｕｋＦ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｌｕｋＦはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２２４１であり、配列番号２５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９１４）を有する。
有用なｌｕｋＦ抗原は、配列番号２５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｌｕｋＦタンパク質は、配列番号２５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２５の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｌｕｋＳ）
「ｌｕｋＳ」抗原は、「推定ロイコシジンＳサブユニットＬｕｋＳ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｌｕｋＳはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２２４３であり、配列番号２６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９１５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１９２８（ＧＩ：１５１２２２１４０）である。
有用なｌｕｋＳ抗原は、配列番号２６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｌｕｋＳタンパク質は、配列番号２６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２６の最初の２２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｎｕｃ）
「ｎｕｃ」抗原は、「サーモヌクレアーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｎｕｃはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１３１６であり、配列番号２７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５０４６）を有する。
有用なｎｕｃ抗原は、配列番号２７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｎｕｃタンパク質は、配列番号２７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２７の最後の３９のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２７の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓａｓＡ）
「ｓａｓＡ」抗原は、「ＳａｓＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓａｓＡはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２９９０であり、配列番号２８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６６０９）を有する。
有用なｓａｓＡ抗原は、配列番号２８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓａｓＡタンパク質は、配列番号２８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２８の最後の４３のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２８の最初の９０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓａｓＢ）
「ｓａｓＢ」抗原は、「ｆｍｔＢタンパク質；ＳａｓＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓａｓＢはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２４０４であり、配列番号２９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６０６５）を有する。
有用なｓａｓＢ抗原は、配列番号２９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓａｓＢタンパク質は、配列番号２９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号２９の最後の３９のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号２９の最初の３８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓａｓＣ）
「ｓａｓＣ」抗原は、「Ｍｒｐタンパク質；ＳａｓＣ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓａｓＣはＳＡＯＵＨＳＣ＿０１８７３であり、配列番号３０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５５７０）を有する。
有用なｓａｓＣ抗原は、配列番号３０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓａｓＣタンパク質は、配列番号３０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３０の最後の３６のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３０の最初の３７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓａｓＤ）
「ｓａｓＤ」抗原は、「ＳａｓＤタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓａｓＤはＳＡＯＵＨＳＣ＿０００９４であり、配列番号３１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９０９）を有する。
有用なｓａｓＤ抗原は、配列番号３１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓａｓＤタンパク質は、配列番号３１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３１の最初の２８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓａｓＦ）
「ｓａｓＦ」抗原は、「ｓａｓＦタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓａｓＦはＳＡＯＵＨＳＣ＿０２９８２であり、配列番号３２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６６０１）を有する。
有用なｓａｓＦ抗原は、配列番号３２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓａｓＦタンパク質は、配列番号３２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３２の最後の３９のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３２の最初の３７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｄｒＣ）
「ｓｄｒＣ」抗原は、「ｓｄｒＣタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｄｒＣはＳＡＯＵＨＳＣ＿００５４４であり、配列番号３３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４３２４）を有する。
有用なｓｄｒＣ抗原は、配列番号３３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｄｒＣタンパク質は、配列番号３３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３３の最後の３８のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３３の最初の５０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＳｄｒＣは、天然では長いタンパク質であるので、断片の使用は、例えば精製、取り扱い、融合、発現などの助けになる。
配列番号１６４は、配列番号３３の有用な断片である（「ＳｄｒＣ１−５１８」）。この断片は、ＳｄｒＣの最も露出されるドメインを含み、工業的規模でより容易に用いられる。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。
（ｓｄｒＤ）
「ｓｄｒＤ」抗原は、「ｓｄｒＤタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｄｒＤはＳＡＯＵＨＳＣ＿００５４５であり、配列番号３４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４３２５）を有する。
有用なｓｄｒＤ抗原は、配列番号３４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｄｒＤタンパク質は、配列番号３４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３４の最後の３８のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３４の最初の５２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＳｄｒＤは、天然では長いタンパク質であるので、断片の使用は、例えば精製、取り扱い、融合、発現などに非常に助けになる。
配列番号１５６は、配列番号３４の有用な断片である（「ＳｄｒＤ５３−５９２」）。この断片は、ＳｄｒＤの最も露出されるドメインを含み、工業的規模でより容易に用いられる。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。同じＣ末端残基を有する別の有用な断片は、ＳｄｒＤ３９４−５９２（ＳｄｒＤ−Ｎ３としても公知である；配列番号１９９）である。別の有用な断片は、本明細書において「ＳｄｒＤＣｎａＢ」という配列番号２３６（配列番号３４のアミノ酸５９３〜１１２３）である。
（ｓｄｒＥ２）
「ｓｄｒＥ２」抗原は、「Ｓｅｒ−Ａｓｐリッチフィブリノゲン／骨シアロタンパク質結合タンパク質ＳｄｒＥ」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ｓｄｒＥ２はＮＷＭＮ＿０５２５であり、配列番号３５のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２０７３７）を有する。
有用なｓｄｒＥ２抗原は、配列番号３５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｄｒＥ２タンパク質は、配列番号３５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３５の最後の３８のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３５の最初の５２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ＳｄｒＥ２は、天然では長いタンパク質であるので、断片の使用は、例えば精製、取り扱い、融合、発現などに非常に助けになる。
配列番号１５５は、配列番号３５の有用な断片である（「ＳｄｒＥ５３−６３２」）。この断片は、ＳｄｒＥ２の最も露出されるドメインを含み、工業的規模でより容易に用いられる。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。
（ｓｐａ）
「ｓｐａ」抗原は、「タンパク質Ａ」または「ＳｐＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｐａはＳＡＯＵＨＳＣ＿０００６９であり、配列番号３６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３８８５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿００５５（ＧＩ：１５１２２０２６７）である。全てのＳ．ａｕｒｅｕｓ株は、詳細に特徴決定された病毒性因子（その細胞壁に繋留された表面タンパク質生成物はＥ、Ｄ、Ａ、ＢおよびＣと呼ばれる５つの高度に相同性の免疫グロブリン結合ドメインを有する）であるｓｐａについての構造遺伝子を発現する［６０］。これらのドメインは、アミノ酸レベルで約８０％の同一性を示し、５６〜６１残基の長さであり、タンデムリピートとして組織化されている［６１］。ＳｐＡは、Ｎ末端シグナルペプチドとＣ末端ソーティングシグナルとを有する前駆体タンパク質として合成される［６２、６３］。細胞壁に繋留されたｓｐａは、ブドウ球菌表面上で非常に豊富に提示される［６４、６５］。その免疫グロブリン結合ドメインのそれぞれは、３つのヘリックスの束に組み立てられる逆平行α−ヘリックスで構成され、免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）のＦｃドメイン［６６、６７］、ＩｇＭのＶＨ３重鎖（Ｆａｂ）（すなわちＢ細胞受容体）［６８］、そのＡ１ドメインでのフォン・ビルブラント因子［６９］および／または気道上皮の表面上に提示されるＴＮＦ−α受容体Ｉ（ＴＮＦＲＩ）［７０］と結合できる。
有用なｓｐａ抗原は、配列番号３６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｐａタンパク質は、配列番号３６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３６の最後の３５のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３６の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。参考文献７１は、個別のＩｇＧ結合ドメインが、単独または組み合わせて有用な免疫原である可能性があることを示唆している。
配列番号１６２は、配列番号３６の有用な断片である（「Ｓｐａ３７−３２５」）。この断片は、５つのＳｐＡ Ｉｇ結合ドメイン全て（これらは、Ｎ末端からＣ末端にＥ、Ｄ、Ａ、Ｂ、Ｃの順序で天然では配置されている）を含有し、ＳｐＡの最も露出されるドメインを含む。これは、ヒトタンパク質との抗原の類似性も低減する。その他の有用な断片は、ｓｐａがＢ細胞スーパー抗原として機能する場合に生じる可能性がある過剰なＢ細胞増殖（ｅｘｐａｎｓｉｏｎ）と、その後のアポトーシスを防ぐために、天然のＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄおよび／またはＥドメインの１、２、３または４つを取り除いてよい。参考文献７１に報告されるように、その他の有用な断片は、天然のＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄおよび／またはＥドメインの１、２、３または４つだけを含んでよく、例えばＳｐＡ（Ａ）ドメインだけであってＢ〜Ｅを含まないか、またはＳｐＡ（Ｄ）ドメインだけであってＡ、Ｂ、ＣもしくはＥを含まないなどである。よって、本発明で有用なｓｐａ抗原は、１、２、３、４または５のＩｇＧ結合ドメインを含み得るが、理想的には４以下を有する。
抗原が、１つだけの型のｓｐａドメイン（例えばＳｐａ（Ａ）またはＳｐＡ（Ｄ）ドメインだけ）を含む場合、これは、このドメインの１より多いコピー、例えば単一ポリペプチド鎖中に複数のＳｐＡ（Ｄ）ドメインを含んでよい。
抗原内の個別のドメインは、配列番号３６に対して１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０以上のアミノ酸にて変異され得る（例えば、ドメインＤの残基３および／または２４、ドメインＡの残基４６および／または５３での変異を開示する参考文献７１を参照されたい）。このような変異体は、配列番号３６を認識する抗体を惹起する抗原の能力を除去しないものであるべきだが、ＩｇＧおよび／またはその他のヒトタンパク質（例えばヒト血液タンパク質）との抗原の結合を除去し得る。
ある態様において、ｓｐａ抗原は、（ａ）ＩｇＧ Ｆｃとの結合を破壊するかもしくは減少させる、ＳｐＡドメインＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄおよび／またはＥのＩｇＧ Ｆｃ結合サブドメインにおける１または複数のアミノ酸置換と、（ｂ）ＶＨ３との結合を破壊するかもしくは減少させる、ＳｐＡドメインＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄおよび／またはＥのＶＨ３結合サブドメインにおける１または複数のアミノ酸置換とでの置換を含む。ある実施形態において、改変体ＳｐＡは、少なくともまたは多くて１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０以上の改変体ＳｐＡドメインＤペプチドを含む。
（第２抗原群）
（ｓｔａ００１）
「ｓｔａ００１」抗原は、「５’−ヌクレオチダーゼファミリータンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０００２５であり、配列番号３７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３８４６）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿００２２（ＧＩ：１５１２２０２３４）である。これは、ＡｄｓＡおよびＳａｓＨおよびＳＡ００２４とも呼ばれている。
有用なｓｔａ００１抗原は、配列番号３７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００１タンパク質は、配列番号３７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３７の最後の３４のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号３７の最初の３８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００２）
「ｓｔａ００２」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３５６であり、配列番号３８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１５５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０３６４（ＧＩ：１５１２２０５７６）である。
有用なｓｔａ００２抗原は、配列番号３８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００２タンパク質は、配列番号３８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３８の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
配列番号１５３（「ｓｔａ００２１９−１８７」）および１５４（「ｓｔａ００２１９−１２４」）は、ヒトタンパク質との抗原の類似性を低減する配列番号３８の２つの有用な断片である。
（ｓｔａ００３）
「ｓｔａ００３」抗原は、「表面タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００４００であり、配列番号３９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１９５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０４０１（ＧＩ：１５１２２０６１３）である。
有用なｓｔａ００３抗原は、配列番号３９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号３９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号３９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００３タンパク質は、配列番号３９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号３９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号３９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号３９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号３９の最初の３２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００４）
「ｓｔａ００４」抗原は、「シデロホア結合タンパク質ＦａｔＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００７４９であり、配列番号４０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５１４）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０７０５（ＧＩ：１５１２２０９１７）である。
有用なｓｔａ００４抗原は、配列番号４０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００４タンパク質は、配列番号４０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４０の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００５）
「ｓｔａ００５」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１２７であり、配列番号４１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８７０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１０７７（ＧＩ：１５１２２１２８９）である。
有用なｓｔａ００５抗原は、配列番号４１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００５タンパク質は、配列番号４１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４１の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００６）
「ｓｔａ００６」抗原は、「フェリクローム結合タンパク質」としてアノテートされ、文献中で「ＦｈｕＤ２」とも呼ばれている［７２］。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２５５４であり、配列番号４２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６１９９）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２１８５（ＧＩ：１５１２２２３９７）である。
有用なｓｔａ００６抗原は、配列番号４２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００６タンパク質は、配列番号４２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４２の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる（配列番号２４６が得られる）。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ｓｔａ００６の変異体の形態は、参考文献７３に報告されている。ｓｔａ００６抗原は、例えばアシル化Ｎ末端システインを用いて脂質付加されてよい。ある有用なｓｔａ００６配列は、配列番号２４８であり、これは、Ｎ末端にＭｅｔ−Ａｌａ−Ｓｅｒ−配列を有する。
（ｓｔａ００７）
「ｓｔａ００７」抗原は、「分泌型抗原前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２５７１であり、配列番号４３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６２１５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２１９９（ＧＩ：１５１２２２４１１）である。プロテオミクス分析により、このタンパク質は分泌されるかまたは表面に露出されることが明らかになっている。
有用なｓｔａ００７抗原は、配列番号４３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００７タンパク質は、配列番号４３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４３の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００８）
「ｓｔａ００８」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２６５０であり、配列番号４４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６２９０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２２７０（ＧＩ：１５１２２２４８２）である。
有用なｓｔａ００８抗原は、配列番号４４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００８タンパク質は、配列番号４４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４４の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ００９）
「ｓｔａ００９」抗原は、「免疫グロブリンＧ結合タンパク質Ｓｂｉ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ００９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７０６であり、配列番号４５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６３４６）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２３１７（ＧＩ：１５１２２２５２９）である。
有用なｓｔａ００９抗原は、配列番号４５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ００９タンパク質は、配列番号４５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４５の最初の２９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１０）
「ｓｔａ０１０」抗原は、「免疫優性抗原Ａ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８８７であり、配列番号４６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６５１５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２４６９（ＧＩ：１５１２２２６８１）である。プロテオミクス分析により、このタンパク質は分泌されるかまたは表面に露出されることが明らかになっている。
有用なｓｔａ０１０抗原は、配列番号４６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１０タンパク質は、配列番号４６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４６の最初の２９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１１）
「ｓｔａ０１１」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０００５２であり、配列番号４７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３８７２）を有する。
有用なｓｔａ０１１抗原は、配列番号４７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１１タンパク質は、配列番号４７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４７の最初の２３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる（配列番号２４７が得られる）。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。ｓｔａ０１１抗原は、例えばアシル化Ｎ末端システインを用いて脂質付加されてよい。ある有用なｓｔａ０１１配列は、配列番号２４９であり、これはＮ末端メチオニンを有する。
ｓｔａ０１１抗原としてまたはそれを調製するために用い得る配列番号４７の改変体の形態は、それらに限定されないが、種々のＩｌｅ／Ｖａｌ／Ｌｅｕ置換を有する配列番号２１３、２１４および２１５を含む。
Ｓｔａ０１１は、モノマーまたはオリゴマーとして存在でき、Ｃａ＋＋イオンがオリゴマー形成のために好都合である。本発明は、Ｓｔａ０１１のモノマーおよび／またはオリゴマーを用いることができる。
（ｓｔａ０１２）
「ｓｔａ０１２」抗原は、「リーダーを有するタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１０６であり、配列番号４８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９１９）を有する。
有用なｓｔａ０１２抗原は、配列番号４８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１２タンパク質は、配列番号４８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号４８の最初の２１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１３）
「ｓｔａ０１３」抗原は、「ポリガンマグルタミン酸莢膜生合成タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１０７であり、配列番号４９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９２０）を有する。
有用なｓｔａ０１３抗原は、配列番号４９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号４９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号４９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１３タンパク質は、配列番号４９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号４９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号４９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号４９の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１４）
「ｓｔａ０１４」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１３７であり、配列番号５０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９５０）を有する。
有用なｓｔａ０１４抗原は、配列番号５０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１４タンパク質は、配列番号５０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５０の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１５）
「ｓｔａ０１５」抗原は、「細胞外溶質結合タンパク質；ＲＧＤ含有リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１７０であり、配列番号５１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９８０）を有する。
有用なｓｔａ０１５抗原は、配列番号５１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１５タンパク質は、配列番号５１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５１の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１６）
「ｓｔａ０１６」抗原は、「ガンマ−グルタミルトランスペプチダーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１６はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１７１であり、配列番号５２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９８１）を有する。
有用なｓｔａ０１６抗原は、配列番号５２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１６タンパク質は、配列番号５２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５２の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１７）
「ｓｔａ０１７」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１７はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１８６であり、配列番号５３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９９６）を有する。
有用なｓｔａ０１７抗原は、配列番号５３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１７タンパク質は、配列番号５３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５３の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１８）
「ｓｔａ０１８」抗原は、「細胞外溶質結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１８はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２０１であり、配列番号５４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０１１）を有する。
有用なｓｔａ０１８抗原は、配列番号５４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１８タンパク質は、配列番号５４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５４の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０１９）
「ｓｔａ０１９」抗原は、「ペプチドグリカンヒドロラーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０１９はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２４８であり、配列番号５５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０５５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０２１０（ＧＩ：１５１２２０４２２）である。
有用なｓｔａ０１９抗原は、配列番号５５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０１９タンパク質は、配列番号５５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５５の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。有用な断片は、配列番号２２８および２２９である。
Ｓｔａ０１９は、水酸化アルミニウムアジュバントに良好に吸着しないので、組成物に存在するＳｔａ０１９は、吸着されないか、または代替アジュバント、例えばリン酸アルミニウムに吸着されてよい。
（ｓｔａ０２０）
「ｓｔａ０２０」抗原は、「輸出タンパク質（ｅｘｐｏｒｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ）」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２０はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２５３であり、配列番号５６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０５９）を有する。
有用なｓｔａ０２０抗原は、配列番号５６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２０タンパク質は、配列番号５６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５６の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２１）
「ｓｔａ０２１」抗原は、「分泌型抗原ＳｓａＡ様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２１はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２５６であり、配列番号５７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０６２）を有する。
有用なｓｔａ０２１抗原は、配列番号５７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２１タンパク質は、配列番号５７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５７の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２２）
「ｓｔａ０２２」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２７９であり、配列番号５８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０８３）を有する。
有用なｓｔａ０２２抗原は、配列番号５８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２２タンパク質は、配列番号５８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５８の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２３）
「ｓｔａ０２３」抗原は、「５’−ヌクレオチダーゼ；リポタンパク質ｅ（Ｐ４）ファミリー」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００２８４であり、配列番号５９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４０８７）を有する。
有用なｓｔａ０２３抗原は、配列番号５９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号５９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号５９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２３タンパク質は、配列番号５９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号５９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号５９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号５９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号５９の最初の３１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２４）
「ｓｔａ０２４」抗原は、「リパーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３００であり、配列番号６０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１０１）を有する。
有用なｓｔａ０２４抗原は、配列番号６０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２４タンパク質は、配列番号６０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６０の最初の３７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２５）
「ｓｔａ０２５」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３６２であり、配列番号６１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１６０）を有する。
有用なｓｔａ０２５抗原は、配列番号６１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２５タンパク質は、配列番号６１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６１の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２６）
「ｓｔａ０２６」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２６はＳＡＯＵＨＳＣ＿００４０４であり、配列番号６２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１９８）を有する。
有用なｓｔａ０２６抗原は、配列番号６２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２６タンパク質は、配列番号６２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６２の最初の２２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２７）
「ｓｔａ０２７」抗原は、「推定リパーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２７はＳＡＯＵＨＳＣ＿００６６１であり、配列番号６３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４２６）を有する。
有用なｓｔａ０２７抗原は、配列番号６３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２７タンパク質は、配列番号６３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６３の最初の２３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２８）
「ｓｔａ０２８」抗原は、「分泌型抗原ＳｓａＡ様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２８はＳＡＯＵＨＳＣ＿００６７１であり、配列番号６４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４３６）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０６３４（ＧＩ：１５１２２０８４６）である。
有用なｓｔａ０２８抗原は、配列番号６４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２８タンパク質は、配列番号６４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６４の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０２９）
「ｓｔａ０２９」抗原は、「フェリクローム結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０２９はＳＡＯＵＨＳＣ＿００７５４であり、配列番号６５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５１８）を有する。
有用なｓｔａ０２９抗原は、配列番号６５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０２９タンパク質は、配列番号６５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６５の最後の２５のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号６５の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３０）
「ｓｔａ０３０」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３０はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８０８であり、配列番号６６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５６８）を有する。
有用なｓｔａ０３０抗原は、配列番号６６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３０タンパク質は、配列番号６６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６６の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３１）
「ｓｔａ０３１」抗原は、「５’−ヌクレオチダーゼファミリータンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３１はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８６０であり、配列番号６７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４６１７）を有する。
有用なｓｔａ０３１抗原は、配列番号６７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３１タンパク質は、配列番号６７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６７の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３２）
「ｓｔａ０３２」抗原は、「セリンプロテアーゼＨｔｒＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００９５８であり、配列番号６８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７１５）を有する。
有用なｓｔａ０３２抗原は、配列番号６８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３２タンパク質は、配列番号６８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６８の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３３）
「ｓｔａ０３３」抗原は、「システインプロテアーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００９８７であり、配列番号６９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７４４）を有する。
有用なｓｔａ０３３抗原は、配列番号６９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号６９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号６９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３３タンパク質は、配列番号６９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号６９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号６９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号６９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号６９の最初の２９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３４）
「ｓｔａ０３４」抗原は、「グルタミルエンドペプチダーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００９８８であり、配列番号７０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７４５）を有する。
有用なｓｔａ０３４抗原は、配列番号７０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３４タンパク質は、配列番号７０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７０の最初の２９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３５）
「ｓｔａ０３５」抗原は、「ｆｍｔタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００９９８であり、配列番号７１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７５４）を有する。
有用なｓｔａ０３５抗原は、配列番号７１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３５タンパク質は、配列番号７１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７１の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３６）
「ｓｔａ０３６」抗原は、「リーダーを有する鉄調節タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８４であり、配列番号７２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８３１）を有する。
有用なｓｔａ０３６抗原は、配列番号７２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３６タンパク質は、配列番号７２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７２の最後の２７のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号７２の最初の３２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３７）
「ｓｔａ０３７」抗原は、「鉄ＡＢＣトランスポーター；鉄結合タンパク質ＩｓｄＥ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８５であり、配列番号７３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８３２）を有する。
有用なｓｔａ０３７抗原は、配列番号７３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３７タンパク質は、配列番号７３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７３の最初の９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３８）
「ｓｔａ０３８」抗原は、「ＮＰＱＴＮ特異的ソルターゼＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０８８であり、配列番号７４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８３５）を有する。
有用なｓｔａ０３８抗原は、配列番号７４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３８タンパク質は、配列番号７４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７４の最初の２１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０３９）
「ｓｔａ０３９」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０３９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１２４であり、配列番号７５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８６８）を有する。
有用なｓｔａ０３９抗原は、配列番号７５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０３９タンパク質は、配列番号７５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７５の最初の２２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４０）
「ｓｔａ０４０」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１２５であり、配列番号７６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８６９）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１０７６（ＧＩ：１５１２２１２８８）である。
有用なｓｔａ０４０抗原は、配列番号７６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４０タンパク質は、配列番号７６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７６の最初の２１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４１）
「ｓｔａ０４１」抗原は、「フィブロネクチン結合タンパク質Ａ−関連」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１７５であり、配列番号７７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９１４）を有する。
有用なｓｔａ０４１抗原は、配列番号７７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４１タンパク質は、配列番号７７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７７の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４２）
「ｓｔａ０４２」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４２はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１８０であり、配列番号７８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９１９）を有する。
有用なｓｔａ０４２抗原は、配列番号７８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４２タンパク質は、配列番号７８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７８の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４３）
「ｓｔａ０４３」抗原は、「細胞壁ヒドロラーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４３はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１２１９であり、配列番号７９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９５５）を有する。
有用なｓｔａ０４３抗原は、配列番号７９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号７９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号７９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４３タンパク質は、配列番号７９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号７９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号７９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号７９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号７９の最初の３８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４４）
「ｓｔａ０４４」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１５０８であり、配列番号８０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５２２３）を有する。
有用なｓｔａ０４４抗原は、配列番号８０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４４タンパク質は、配列番号８０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８０の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４５）
「ｓｔａ０４５」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１６２７であり、配列番号８１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５３３７）を有する。
有用なｓｔａ０４５抗原は、配列番号８１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４５タンパク質は、配列番号８１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８１の最初の１６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４６）
「ｓｔａ０４６」抗原は、「エクスカリバータンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９１８であり、配列番号８２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６１３）を有する。
有用なｓｔａ０４６抗原は、配列番号８２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４６タンパク質は、配列番号８２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８２の最初の５３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４７）
「ｓｔａ０４７」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９２０であり、配列番号８３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６１５）を有する。
有用なｓｔａ０４７抗原は、配列番号８３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４７タンパク質は、配列番号８３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８３の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４８）
「ｓｔａ０４８」抗原は、「細胞内セリンプロテアーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９４９であり、配列番号８４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６４２）を有する。
有用なｓｔａ０４８抗原は、配列番号８４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４８タンパク質は、配列番号８４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８４の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０４９）
「ｓｔａ０４９」抗原は、「タンパク質輸送タンパク質ＰｒｓＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０４９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９７２であり、配列番号８５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６６３）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿１７３３（ＧＩ：１５１２２１９４５）である。
有用なｓｔａ０４９抗原は、配列番号８５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０４９タンパク質は、配列番号８５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８５の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５０）
「ｓｔａ０５０」抗原は、「スタホパインチオールプロテイナーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２１２７であり、配列番号８６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５８０８）を有する。
有用なｓｔａ０５０抗原は、配列番号８６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５０タンパク質は、配列番号８６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８６の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５１）
「ｓｔａ０５１」抗原は、「リーダーを有するタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２１４７であり、配列番号８７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５８２７）を有する。
有用なｓｔａ０５１抗原は、配列番号８７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５１タンパク質は、配列番号８７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８７の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５２）
「ｓｔａ０５２」抗原は、「ヒドロキサム酸第二鉄受容体１」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５２はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２２４６であり、配列番号８８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９１８）を有する。
有用なｓｔａ０５２抗原は、配列番号８８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５２タンパク質は、配列番号８８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８８の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５３）
「ｓｔａ０５３」抗原は、「ｓｒｄＨファミリータンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５３はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２２５７であり、配列番号８９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９２８）を有する。
有用なｓｔａ０５３抗原は、配列番号８９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号８９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号８９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５３タンパク質は、配列番号８９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号８９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号８９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号８９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号８９の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５４）
「ｓｔａ０５４」抗原は、「推定トランスグリコシラーゼｉｓａＡ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２３３３であり、配列番号９０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９９９）を有する。
有用なｓｔａ０５４抗原は、配列番号９０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５４タンパク質は、配列番号９０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９０の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５５）
「ｓｔａ０５５」抗原は、「表面ヒドロラーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２４４８であり、配列番号９１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６１００）を有する。
有用なｓｔａ０５５抗原は、配列番号９１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５５タンパク質は、配列番号９１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９１の最初の３１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５６）
「ｓｔａ０５６」抗原は、「ヒアルロン酸リアーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２４６３であり、配列番号９２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６１１５）を有する。
有用なｓｔａ０５６抗原は、配列番号９２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５６タンパク質は、配列番号９２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９２の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５７）
「ｓｔａ０５７」抗原は、「分泌型抗原前駆体ＳｓａＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２５７６であり、配列番号９３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６２２０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２２０３（ＧＩ：１５１２２２４１５）である。
有用なｓｔａ０５７抗原は、配列番号９３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５７タンパク質は、配列番号９３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９３の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５８）
「ｓｔａ０５８」抗原は、「Ｚｎ結合リポタンパク質ａｄｃＡ様」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２６９０であり、配列番号９４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６３３０）を有する。
有用なｓｔａ０５８抗原は、配列番号９４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５８タンパク質は、配列番号９４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９４の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０５９）
「ｓｔａ０５９」抗原は、「ガンマ溶血素ｈ−ガンマ−ｉｉサブユニット」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０５９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７０８であり、配列番号９５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６３４８）を有する。
有用なｓｔａ０５９抗原は、配列番号９５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０５９タンパク質は、配列番号９５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９５の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６０）
「ｓｔａ０６０」抗原は、「ペプチドＡＢＣトランスポーター；ペプチド結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７６７であり、配列番号９６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４０３）を有する。
有用なｓｔａ０６０抗原は、配列番号９６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６０タンパク質は、配列番号９６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９６の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６１）
「ｓｔａ０６１」抗原は、「リーダーを有するタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７８３であり、配列番号９７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４１９）を有する。
有用なｓｔａ０６１抗原は、配列番号９７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６１タンパク質は、配列番号９７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９７の最初の２１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６２）
「ｓｔａ０６２」抗原は、「リーダーを有するタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６２はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２７８８であり、配列番号９８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４２４）を有する。
有用なｓｔａ０６２抗原は、配列番号９８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６２タンパク質は、配列番号９８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９８の最初の２２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６３）
「ｓｔａ０６３」抗原は、「アウレオリシン（ａｕｒｅｏｌｙｓｉｎ）」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６３はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２９７１であり、配列番号９９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６５９２）を有する。
有用なｓｔａ０６３抗原は、配列番号９９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号９９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号９９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６３タンパク質は、配列番号９９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号９９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号９９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号９９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号９９の最初の１６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６４）
「ｓｔａ０６４」抗原は、「リパーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０３００６であり、配列番号１００のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６６２５）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿２５６９（ＧＩ：１５１２２２７８１）である。
有用なｓｔａ０６４抗原は、配列番号１００を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１００と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１００の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６４タンパク質は、配列番号１００の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１００からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１００のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１００の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１００の最初の３４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６５）
「ｓｔａ０６５」抗原は、「１−ホスファチジルイノシトールホスホジエステラーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０００５１であり、配列番号１０１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３８７１）を有する。
有用なｓｔａ０６５抗原は、配列番号１０１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６５タンパク質は、配列番号１０１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０１の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６６）
「ｓｔａ０６６」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６６はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１７２であり、配列番号１０２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９８２）を有する。
有用なｓｔａ０６６抗原は、配列番号１０２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６６タンパク質は、配列番号１０２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０２の最初の２１のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６７）
「ｓｔａ０６７」抗原は、「細菌細胞外溶質結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６７はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１７６であり、配列番号１０３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９８６）を有する。
有用なｓｔａ０６７抗原は、配列番号１０３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６７タンパク質は、配列番号１０３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０３の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６８）
「ｓｔａ０６８」抗原は、「鉄パーミアーゼＦＴＲ１」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６８はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３２７であり、配列番号１０４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１２７）を有する。
有用なｓｔａ０６８抗原は、配列番号１０４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６８タンパク質は、配列番号１０４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０４の最後の２０のＣ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。配列番号１０４の最初の１４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０６９）
「ｓｔａ０６９」抗原は、「自己溶解素前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０６９はＳＡＯＵＨＳＣ＿００４２７であり、配列番号１０５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４２１９）を有する。
有用なｓｔａ０６９抗原は、配列番号１０５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０６９タンパク質は、配列番号１０５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０５の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７０）
「ｓｔａ０７０」抗原は、「免疫原性分泌型前駆体様タンパク質（切断型）」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７０はＳＡＯＵＨＳＣ＿００７７３であり、配列番号１０６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５３５）を有する。
有用なｓｔａ０７０抗原は、配列番号１０６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７０タンパク質は、配列番号１０６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０６の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７１）
「ｓｔａ０７１」抗原は、「溶血素」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７１はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８５４であり、配列番号１０７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４６１２）を有する。
有用なｓｔａ０７１抗原は、配列番号１０７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７１タンパク質は、配列番号１０７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０７の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７２）
「ｓｔａ０７２」抗原は、「膜外タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８７２であり、配列番号１０８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４６２９）を有する。
有用なｓｔａ０７２抗原は、配列番号１０８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７２タンパク質は、配列番号１０８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０８の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７３）
「ｓｔａ０７３」抗原は、「二機能性自己溶解素前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００９９４であり、配列番号１０９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７５０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０９２２（ＧＩ：１５１２２１１３４）である。プロテオミクス分析により、このタンパク質は分泌されるかまたは表面に露出されることが明らかになっている。
有用なｓｔａ０７３抗原は、配列番号１０９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１０９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１０９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７３タンパク質は、配列番号１０９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１０９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１０９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１０９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１０９の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
Ｓｔａ０７３抗原は、Ｓｔａ１１２と組み合わせて、組成物に有用に含めることができる［７４］。
Ｓｔａ０７３は、水酸化アルミニウムアジュバントに良好に吸着しないので、組成物に存在するＳｔａ０７３は、吸着されないか、または代替アジュバント、例えばリン酸アルミニウムに吸着されてよい。
（ｓｔａ０７４）
「ｓｔａ０７４」抗原は、「メチシリン耐性に必須の因子」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１２２０であり、配列番号１１０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９５６）を有する。
有用なｓｔａ０７４抗原は、配列番号１１０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７４タンパク質は、配列番号１１０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１０の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７５）
「ｓｔａ０７５」抗原は、「インスリジン；ペプチダーゼファミリーＭ１６」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１２５６であり、配列番号１１１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９８９）を有する。
有用なｓｔａ０７５抗原は、配列番号１１１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７５タンパク質は、配列番号１１１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１１の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７６）
「ｓｔａ０７６」抗原は、「ヒドロラーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１２６３であり、配列番号１１２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４９９６）を有する。
有用なｓｔａ０７６抗原は、配列番号１１２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７６タンパク質は、配列番号１１２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１２の最初の２４のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７７）
「ｓｔａ０７７」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１３１７であり、配列番号１１３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５０４７）を有する。プロテオミクス分析により、このタンパク質は分泌されるかまたは表面に露出されることが明らかになっている。
有用なｓｔａ０７７抗原は、配列番号１１３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７７タンパク質は、配列番号１１３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１３の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７８）
「ｓｔａ０７８」抗原は、「ＦｔｓＫ／ＳｐｏＩＩＩＥファミリータンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１８５７であり、配列番号１１４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５５５５）を有する。
有用なｓｔａ０７８抗原は、配列番号１１４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７８タンパク質は、配列番号１１４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１４の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０７９）
「ｓｔａ０７９」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＦ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０７９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９３５であり、配列番号１１５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３０）を有する。
有用なｓｔａ０７９抗原は、配列番号１１５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０７９タンパク質は、配列番号１１５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１５の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８０）
「ｓｔａ０８０」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＥ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９３６であり、配列番号１１６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３１）を有する。
有用なｓｔａ０８０抗原は、配列番号１１６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８０タンパク質は、配列番号１１６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１６の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８１）
「ｓｔａ０８１」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＤ（ＥＣ：３．４．２１．１９）」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９３８であり、配列番号１７０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３３）を有する。
有用なｓｔａ０８１抗原は、配列番号１７０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１７０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１７０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８１タンパク質は、配列番号１７０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１７０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１７０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１７０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１７０の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８２）
「ｓｔａ０８２」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＣ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８２はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９３９であり、配列番号１１７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３４）を有する。
有用なｓｔａ０８２抗原は、配列番号１１７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８２タンパク質は、配列番号１１７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１７の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８３）
「ｓｔａ０８３」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＢ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８３はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９４１であり、配列番号１１８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３５）を有する。
有用なｓｔａ０８３抗原は、配列番号１１８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８３タンパク質は、配列番号１１８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１８の最初の３６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８４）
「ｓｔａ０８４」抗原は、「セリンプロテアーゼＳｐｌＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１９４２であり、配列番号１１９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５６３６）を有する。
有用なｓｔａ０８４抗原は、配列番号１１９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１１９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１１９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８４タンパク質は、配列番号１１９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１１９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１１９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１１９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１１９の最初の３５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８５）
「ｓｔａ０８５」抗原は、「スタフィロキナーゼ前駆体」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８５はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２１７１であり、配列番号１２０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５８４８）を有する。
有用なｓｔａ０８５抗原は、配列番号１２０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８５タンパク質は、配列番号１２０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２０の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８６）
「ｓｔａ０８６」抗原は、「ＯｘａＡ様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２３２７であり、配列番号１２１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９９３）を有する。
有用なｓｔａ０８６抗原は、配列番号１２１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８６タンパク質は、配列番号１２１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２１の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８７）
「ｓｔａ０８７」抗原は、「テイコプラニン耐性タンパク質ＴｃａＡ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２６３５であり、配列番号１２２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６２７６）を有する。
有用なｓｔａ０８７抗原は、配列番号１２２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８７タンパク質は、配列番号１２２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２２の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８８）
「ｓｔａ０８８」抗原は、「エステラーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８４４であり、配列番号１２３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４７７）を有する。
有用なｓｔａ０８８抗原は、配列番号１２３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８８タンパク質は、配列番号１２３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２３の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０８９）
「ｓｔａ０８９」抗原は、「ＬｙｓＭドメインタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０８９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８５５であり、配列番号１２４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６４８６）を有する。
有用なｓｔａ０８９抗原は、配列番号１２４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０８９タンパク質は、配列番号１２４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２４の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９０）
「ｓｔａ０９０」抗原は、「ＬｙｓＭドメインタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２８８３であり、配列番号１２５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６５１２）を有する。
有用なｓｔａ０９０抗原は、配列番号１２５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９０タンパク質は、配列番号１２５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２５の最初の２６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９１）
「ｓｔａ０９１」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９１はＳＡＯＵＨＳＣ＿００６８５であり、配列番号１２６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４５０）を有する。
有用なｓｔａ０９１抗原は、配列番号１２６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９１タンパク質は、配列番号１２６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２６の最初の１５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９２）
「ｓｔａ０９２」抗原は、「Ｍ２３／Ｍ３７ペプチダーゼドメインタンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００１７４であり、配列番号１２７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９３９８４）を有する。
有用なｓｔａ０９２抗原は、配列番号１２７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９２タンパク質は、配列番号１２７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２７の最初の２５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９３）
「ｓｔａ０９３」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９３はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１８５４であり、配列番号１２８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５５５２）を有する。
有用なｓｔａ０９３抗原は、配列番号１２８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９３タンパク質は、配列番号１２８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２８の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９４）
「ｓｔａ０９４」抗原は、「タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９４はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１５１２であり、配列番号１２９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５２２６）を有する。
有用なｓｔａ０９４抗原は、配列番号１２９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１２９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１２９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９４タンパク質は、配列番号１２９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１２９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１２９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１２９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１２９の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９５）
「ｓｔａ０９５」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３８３であり、配列番号１３０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８０）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０３８８（ＧＩ：１５１２２０６００）である。
有用なｓｔａ０９５抗原は、配列番号１３０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９５タンパク質は、配列番号１３０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３０の最初の３２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９６）
「ｓｔａ０９６」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９６はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３８４であり、配列番号１３１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８１）を有する。
有用なｓｔａ０９６抗原は、配列番号１３１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９６タンパク質は、配列番号１３１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３１の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９７）
「ｓｔａ０９７」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９７はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３８６であり、配列番号１３２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８２）を有する。
有用なｓｔａ０９７抗原は、配列番号１３２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９７タンパク質は、配列番号１３２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３２の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９８）
「ｓｔａ０９８」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９８はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３８９であり、配列番号１３３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８４）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０３９１（ＧＩ：１５１２２０６０３）である。
有用なｓｔａ０９８抗原は、配列番号１３３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９８タンパク質は、配列番号１３３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３３の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ０９９）
「ｓｔａ０９９」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質５」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ０９９はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９０であり、配列番号１３４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８５）を有する。
有用なｓｔａ０９９抗原は、配列番号１３４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ０９９タンパク質は、配列番号１３４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３４の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１００）
「ｓｔａ１００」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１００はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９１であり、配列番号１３５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８６）を有する。
有用なｓｔａ１００抗原は、配列番号１３５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１００タンパク質は、配列番号１３５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３５の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０１）
「ｓｔａ１０１」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質７」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０１はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９２であり、配列番号１３６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８７）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０３９４（ＧＩ：１５１２２０６０６）である。
有用なｓｔａ１０１抗原は、配列番号１３６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０１タンパク質は、配列番号１３６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３６の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０２）
「ｓｔａ１０２」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９３であり、配列番号１３７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８８）を有する。
有用なｓｔａ１０２抗原は、配列番号１３７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０２タンパク質は、配列番号１３７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３７の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０３）
「ｓｔａ１０３」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９４であり、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１８９）を有する。
有用なｓｔａ１０３抗原は、配列番号１３８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０３タンパク質は、配列番号１３８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１３８の最初の２３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０４）
「ｓｔａ１０４」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９５であり、配列番号１３９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１９０）を有する。
有用なｓｔａ１０４抗原は、配列番号１３９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１３９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１３９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０４タンパク質は、配列番号１３９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１３９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１３９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１３９の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０５）
「ｓｔａ１０５」抗原は、「スーパー抗原様タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３９９であり、配列番号１４０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１９４）を有する。Ｎｅｗｍａｎ株において、これはｎｗｍｎ＿０４００（ＧＩ：１５１２２０６１２）である。
有用なｓｔａ１０５抗原は、配列番号１４０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０５タンパク質は、配列番号１４０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４０の最初の３０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０６）
「ｓｔａ１０６」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１１５であり、配列番号１４１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８６１）を有する。
有用なｓｔａ１０６抗原は、配列番号１４１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０６タンパク質は、配列番号１４１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４１の最初の１６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０７）
「ｓｔａ１０７」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０７はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３５４であり、配列番号１７７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１５３）を有する。
有用なｓｔａ１０７抗原は、配列番号１７７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１７７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１７７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０７タンパク質は、配列番号１７７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１７７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１７７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１７７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１７７の最初の３５のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０８）
「ｓｔａ１０８」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０８はＳＡＯＵＨＳＣ＿００７１７であり、配列番号１７８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４８２）を有する。
有用なｓｔａ１０８抗原は、配列番号１７８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１７８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１７８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０８タンパク質は、配列番号１７８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１７８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１７８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１７８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１７８の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１０９）
「ｓｔａ１０９」抗原は、「Ｎ−アセチルムラモイル−Ｌ−アラニンアミダーゼ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１０９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２９７９であり、配列番号１７９のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９６５９９）を有する。
有用なｓｔａ１０９抗原は、配列番号１７９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１７９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１７９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１０９タンパク質は、配列番号１７９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１７９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１７９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１７９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１７９の最初の２７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１０）
「ｓｔａ１１０」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１０はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１０３９であり、配列番号１８０のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７９１）を有する。
有用なｓｔａ１１０抗原は、配列番号１８０を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８０と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８０の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１０タンパク質は、配列番号１８０の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８０からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８０のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８０の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８０の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１１）
「ｓｔａ１１１」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１１はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１００５であり、配列番号１８１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４７６０）を有する。
有用なｓｔａ１１１抗原は、配列番号１８１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１１タンパク質は、配列番号１８１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８１の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８１の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１２）
「ｓｔａ１１２」抗原は、推定「ＡＢＣトランスポーター、基質結合タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１２はＳＡＯＵＨＳＣ＿００６３４であり、配列番号１８２のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４０２）を有する。
有用なｓｔａ１１２抗原は、配列番号１８２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１２タンパク質は、配列番号１８２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８２の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
Ｓｔａ１１２抗原は、Ｓｔａ０７３と組み合わせて、組成物に有用に含めることができる［７４］。
（ｓｔａ１１３）
「ｓｔａ１１３」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１３はＳＡＯＵＨＳＣ＿００７２８であり、配列番号１８３のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４４９３）を有する。
有用なｓｔａ１１３抗原は、配列番号１８３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１３タンパク質は、配列番号１８３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８３の最初の１７３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１４）
「ｓｔａ１１４」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１４はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８１０であり、配列番号１８４のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５７０）を有する。
有用なｓｔａ１１４抗原は、配列番号１８４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１４タンパク質は、配列番号１８４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８４の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１５）
「ｓｔａ１１５」抗原は、「仮想タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１５はＳＡＯＵＨＳＣ＿００８１７であり、配列番号１８５のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４５７６）を有する。
有用なｓｔａ１１５抗原は、配列番号１８５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１５タンパク質は、配列番号１８５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８５の最初の１８のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１６）
「ｓｔａ１１６」抗原は、「ホルミルペプチド受容体様１阻害タンパク質」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１６はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１１２であり、配列番号１８６のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８５８）を有する。
有用なｓｔａ１１６抗原は、配列番号１８６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１６タンパク質は、配列番号１８６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１８６の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１７）
「ｓｔａ１１７」抗原は、「切断型ベータ溶血素」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１７はＳＡＯＵＨＳＣ＿０２２４０であり、配列番号１８７のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９５９１３）を有する。
有用なｓｔａ１１７抗原は、配列番号１８７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１７タンパク質は、配列番号１８７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８７の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１８）
「ｓｔａ１１８」抗原は、「細胞分裂タンパク質ＦｔｓＺ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１８はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１５０であり、配列番号１８８のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８９２）を有する。
有用なｓｔａ１１８抗原は、配列番号１８８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１８８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１８８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１８タンパク質は、配列番号１８８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１８８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１８８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１８８の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１１９）
「ｓｔａ１１９」抗原は、「チオレドキシン」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１１９はＳＡＯＵＨＳＣ＿０１１００であり、配列番号２００のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４８４６）を有する。
有用なｓｔａ１１９抗原は、配列番号２００を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２００と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２００の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１１９タンパク質は、配列番号２００の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２００からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２００のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２００の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ｓｔａ１２０）
「ｓｔａ１２０」抗原は、「アルキルヒドロペルオキシド還元酵素サブユニットＣ」としてアノテートされている。ＮＣＴＣ８３２５株において、ｓｔａ１２０はＳＡＯＵＨＳＣ＿００３６５であり、配列番号２０１のアミノ酸配列（ＧＩ：８８１９４１６３）を有する。
有用なｓｔａ１２０抗原は、配列番号２０１を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号２０１と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２０１の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのｓｔａ１２０タンパク質は、配列番号２０１の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号２０１からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２０１のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２０１の少なくとも１つのエピトープを保持している。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿６）
「ＮＷ＿６」抗原は、「分泌フォン・ビルブラント因子結合タンパク質前駆体」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿６はＮＷＭＮ＿０７５７であり、配列番号１４２のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２０９６９）を有する。
有用なＮＷ＿６抗原は、配列番号１４２を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４２と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４２の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿６タンパク質は、配列番号１４２の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４２からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４２のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４２の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４２の最初の１３のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿９）
「ＮＷ＿９」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿９はＮＷＭＮ＿０９５８であり、配列番号１４３のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２１１７０）を有する。
有用なＮＷ＿９抗原は、配列番号１４３を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４３と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４３の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿９タンパク質は、配列番号１４３の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４３からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４３のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４３の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４３の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿１０）
「ＮＷ＿１０」抗原は、「フィブリノゲン結合関連タンパク質」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿１０はＮＷＭＮ＿１０６６であり、配列番号１４４のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２１２７８）を有する。
有用なＮＷ＿１０抗原は、配列番号１４４を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿１０タンパク質は、配列番号１４４の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４４からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４４のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４４の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４４の最初の２０のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿７）
「ＮＷ＿７」抗原は、「ブドウ球菌補体インヒビターＳＣＩＮ」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿７はＮＷＭＮ＿１８７６であり、配列番号１４５のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２２０８８）を有する。
有用なＮＷ＿７抗原は、配列番号１４５を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿７タンパク質は、配列番号１４５の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４５の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４５の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿８）
「ＮＷ＿８」抗原は、「走化性阻害タンパク質ＣＨＩＰＳ」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿８はＮＷＭＮ＿１８７７であり、配列番号１４６のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２２０８９）を有する。
有用なＮＷ＿８抗原は、配列番号１４６を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４６と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４６の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿８タンパク質は、配列番号１４６の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４６からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４６のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４６の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４６の最初の１９のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿２）
「ＮＷ＿２」抗原は、「エンテロトキシンＡ型前駆体」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿２はＮＷＭＮ＿１８８３であり、配列番号１４７のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２２０９５）を有する。
有用なＮＷ＿２抗原は、配列番号１４７を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４７と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４７の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿２タンパク質は、配列番号１４７の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４７からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４７のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４７の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４７の最初の１６のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿１）
「ＮＷ＿１」抗原は、「リポタンパク質」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿１はＮＷＭＮ＿１９２４であり、配列番号１４８のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２２１３６）を有する。
有用なＮＷ＿１抗原は、配列番号１４８を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４８と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４８の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿１タンパク質は、配列番号１４８の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４８からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４８のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４８の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４８の最初の１７のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ＮＷ＿５）
「ＮＷ＿５」抗原は、「細胞壁表面アンカーファミリータンパク質」としてアノテートされている。Ｎｅｗｍａｎ株において、ＮＷ＿５はＮＷＭＮ＿２３９２であり、配列番号１４９のアミノ酸配列（ＧＩ：１５１２２２６０４）を有する。
有用なＮＷ＿５抗原は、配列番号１４９を認識する抗体を（例えばヒトに投与した場合に）惹起でき、かつ／または（ａ）配列番号１４９と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号１４９の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含み得る。これらのＮＷ＿５タンパク質は、配列番号１４９の改変体を含む。（ｂ）の好ましい断片は、配列番号１４９からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号１４９のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号１４９の少なくとも１つのエピトープを保持している。配列番号１４９の最初の５２のＮ末端アミノ酸は、有用に取り除くことができる。その他の断片は、１または複数のタンパク質ドメインが取り除かれている。
（ハイブリッドポリペプチド）
本発明で用いられる抗原は、個別のポリペプチドとして組成物に存在してよい。１より多い抗原を用いる場合、しかし、これらは、分離したポリペプチドである必要はない。代わりに、少なくとも２（例えば２、３、４、５以上）の抗原は、単一ポリペプチド鎖として発現され得る（「ハイブリッド」ポリペプチド）。ハイブリッドポリペプチドは、２つの主な利点を提供する。第１に、それ自体では不安定または発現が乏しいことがあるポリペプチドが、この問題を克服する適切なハイブリッドパートナーを付加することにより援助され得る。第２に、商業的な製造は、ともに抗原的に有用な２つのポリペプチドを生成するために１回の発現および精製だけを用いることを必要とするように単純化される。
ハイブリッドポリペプチドは、第１抗原群からの２以上のポリペプチド配列を含んでよい。ハイブリッドポリペプチドは、第１抗原群からの１または複数のポリペプチド配列と、第２抗原群からの１または複数のポリペプチド配列とを含んでよい。さらに、ハイブリッドポリペプチドは、上に列挙した抗原のそれぞれからの２以上のポリペプチド配列、または配列が株間で部分的に変動している場合は同じ抗原の２以上の改変体を含んでよい。
２、３、４、５、６、７、８、９または１０の抗原からのアミノ酸配列からなるハイブリッドが有用である。特に、２または３の抗原のような２、３、４または５の抗原からのアミノ酸配列からなるハイブリッドが好ましい。
異なるハイブリッドポリペプチドを、単一処方物中で一緒に混合してよい。ハイブリッドは、第１、第２または第３抗原群から選択される非ハイブリッド抗原と組み合わせてよい。このような組み合わせのうち、抗原は、１より多いハイブリッドポリペプチド中におよび／または非ハイブリッドポリペプチドとして存在してよい。しかし、抗原が、ハイブリッドまたは非ハイブリッドのいずれかとして存在し、これらの両方として存在するのではないことが好ましい。
ハイブリッドポリペプチドは、上記のような結合体または非Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗原と組み合わせることもできる。
ハイブリッドポリペプチドは、式ＮＨ２−Ａ−｛−Ｘ−Ｌ−｝ｎ−Ｂ−ＣＯＯＨ（式中、Ｘは、上で論じたように、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗原のアミノ酸配列であり、Ｌは、任意選択のリンカーアミノ酸配列であり、Ａは、任意選択のＮ末端アミノ酸配列であり、Ｂは、任意選択のＣ末端アミノ酸配列であり、ｎは、２以上の整数である（例えば２、３、４、５、６など））で表すことができる。通常、ｎは、２または３である。
−Ｘ−部分が、その野生型形においてリーダーペプチド配列を有する場合、これは、ハイブリッドタンパク質に含めても、またはハイブリッドタンパク質から省いてよい。いくつかの実施形態において、リーダーペプチドは、ハイブリッドタンパク質のＮ末端にある−Ｘ−部分のもの以外は削除され、すなわち、Ｘ１のリーダーペプチドが保持されるが、Ｘ２・・・Ｘｎのリーダーペプチドは省かれる。このことは、全てのリーダーペプチドを削除し、Ｘ１のリーダーペプチドを−Ａ−部分として用いることと等しい。
｛−Ｘ−Ｌ−｝の各ｎの場合について、リンカーアミノ酸配列−Ｌ−は、存在しても、または存在しなくてもよい。例えば、ｎ＝２である場合、ハイブリッドは、ＮＨ２−Ｘ１−Ｌ１−Ｘ２−Ｌ２−ＣＯＯＨ、ＮＨ２−Ｘ１−Ｘ２−ＣＯＯＨ、ＮＨ２−Ｘ１−Ｌ１−Ｘ２−ＣＯＯＨ、ＮＨ２−Ｘ１−Ｘ２−Ｌ２−ＣＯＯＨなどであってよい。リンカーアミノ酸配列（複数可）−Ｌ−は、典型的には短い（例えば２０以下のアミノ酸、すなわち２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、１）。例としては、クローニングを容易にする短いペプチド配列、ポリグリシンリンカー（すなわちＧｌｙｎ（ｎ＝２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多い）を含む）およびヒスチジンタグ（すなわちＨｉｓｎ（ｎ＝３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多い））が含まれる。その他の適切なリンカーアミノ酸配列は、当業者に明らかである。有用なリンカーは、ＧＳＧＧＧＧ（配列番号１７１）またはＧＳＧＳＧＧＧＧ（配列番号１７２）であり、Ｇｌｙ−ＳｅｒジペプチドがＢａｍＨＩ制限部位（または、配列番号２３０のテトラペプチドを形成するための２つのＢａｍＨＩ制限部位）から形成されるので、クローニングおよび操作の助けとなり、（Ｇｌｙ）４テトラペプチド（配列番号２２７）が、典型的なポリグリシンリンカーである。特に最後のＬｎとして用いるためのその他の適切なリンカーは、ＡＳＧＧＧＳ（例えば配列番号１７４によりコードされる配列番号１７３）またはＬｅｕ−Ｇｌｕジペプチドである。
−Ａ−は、任意選択のＮ末端アミノ酸配列である。これは、典型的には短い（例えば４０以下のアミノ酸、すなわち４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、１）。例としては、タンパク質輸送を駆動するリーダー配列、またはクローニングもしくは精製を容易にする短いペプチド配列（例えばヒスチジンタグ、すなわちＨｉｓｎ（ｎ＝３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多い））が含まれる。その他の適切なＮ末端アミノ酸配列は、当業者に明らかである。Ｘ１がそれ自体のＮ末端メチオニンを欠失している場合、−Ａ−は、Ｎ末端メチオニン、例えばＭｅｔ−Ａｌａ−Ｓｅｒ、または単一Ｍｅｔ残基を提供するオリゴペプチド（例えば、１、２、３、４、５、６、７または８アミノ酸を有する）であることが好ましい。
−Ｂ−は、任意選択のＣ末端アミノ酸配列である。これは、典型的には短い（例えば４０以下のアミノ酸、すなわち３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、１）。例としては、タンパク質輸送を駆動する配列、クローニングもしくは精製を容易にする短いペプチド配列（例えばヒスチジンタグ、すなわちＨｉｓｎ（ｎ＝３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多い）を含む、例えば配列番号２２６）、またはタンパク質安定性を増進する配列が含まれる。その他の適切なＣ末端アミノ酸配列は、当業者に明らかである。
本発明のあるハイブリッドポリペプチドは、ＥｓｘＡ抗原およびＥｓｘＢ抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号１５１（「ＥｓｘＡＢ」；配列番号１６９によりコードされる）および１５２（「ＥｓｘＢＡ」）は、このようなハイブリッドの例であり、これらはともにヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を有する。別の「ＥｓｘＡＢ」ハイブリッドは、配列番号２４１を含み、これは、Ｎ末端メチオニンと共に提供され得る（例えば配列番号２５０）。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ＳｄｒＤ抗原およびＳｄｒＥ抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号１６８（「ＳｄｒＥＤ」）は、ヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を有するこのようなハイブリッドの例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ＣｌｆＢ抗原およびＳｄｒＤ抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２０２（「ＣｌｆＢ−ＳｄｒＤ」）は、ヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を有するこのようなハイブリッドの例である。配列番号２０３（「ＳｄｒＤ−ＣｌｆＢ」）は、ヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を有するこのようなハイブリッドの別の例である。配列番号２１１（「ＣｌｆＢ−Ｎ３−ｓｄｒＤ−Ｎ３」）は、ＣｌｆＢのＮ３断片およびＳｄｒＤのＮ３断片がヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）により接合されているこのようなハイブリッドの別の例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ＩｓｄＡ抗原およびＥｓｘＡ抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２０４（「ＩｓｄＡ−ＥｓｘＡ」）は、ヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を有するこのようなハイブリッドの例である。配列番号２０９（「ｉｓｄＡ４０−１８４−ｅｓｘＡ」）は、ＩｓｄＡ４０−１８４がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＡに接合されているこのようなハイブリッドの別の例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ＩｓｄＡ抗原およびｓｔａ００６抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２２１（「ｉｓｄＡ４０−１８４−ｓｔａ００６」）は、ＩｓｄＡ４０−１８４がヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＳｔａ００６に接合されているこのようなハイブリッドの例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、Ｈｌａ抗原およびｓｔａ００６抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２２２（「ＨｌａＨ３５Ｌ−ｓｔａ００６」）は、ＨｌａのＨ３５Ｌ変異体がヘキサペプチドリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＳｔａ００６に接合されているこのようなハイブリッドの例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、Ｈｌａ抗原およびＥｍｐ抗原をともに含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２０５（「ＨｌａＨ３５Ｌ−Ｅｍｐ」）は、Ｈ３５Ｌ変異体ＨｌａがリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｍｐに接合されているこのようなハイブリッドの例である。配列番号２０６（「Ｈｌａ２７−７６−Ｅｍｐ」）は、Ｈｌａ断片がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｍｐに接合されているこのようなハイブリッドの別の例である。配列番号２０７は、配列番号２０６のＨ３５Ｌ変異体である。配列番号２０８（「ＨｌａＰＳＧＳ−Ｅｍｐ」）は、Ｈｌａ変異体がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｍｐに接合されているこのようなハイブリッドの別の例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ＩｓｄＡ抗原とＥｓｘＡ抗原とＥｓｘＢ抗原を含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２１０（「ｉｓｄＡ４０−１８４−ｅｓｘＡＢ」）は、ＩｓｄＡ４０−１８４がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＡＢに接合されているこのような３重ハイブリッドの例である。ＥｓｘＡＢは、既に同じリンカーを含むので、配列番号２１０は、２つのこれらのリンカーを含む。配列番号２１２（「ＩｓｄＡ−ｅｓｘＡＢ」）は、ＩｓｄＡがリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＡＢに接合されているこのような３重ハイブリッドの別の例である。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、Ｈｌａ抗原とＥｓｘＡ抗原とＥｓｘＢ抗原を含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２２０（「ＨｌａＨ３５Ｌ−ｅｓｘＡＢ」）は、ＨｌａのＨ３５Ｌ変異体がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＡＢに接合されているこのような３重ハイブリッドの例である。ＥｓｘＡＢは、既に同じリンカーを含むので、配列番号２２０は、２つのこれらのリンカーを含む。Ｈｌａ抗原とＥｓｘＡ抗原とＥｓｘＢ抗原を含むハイブリッドポリペプチドの別の例は、ＨｌａのＨ３５Ｌ変異体がリンカーＡＰＴＡＲＧ（配列番号２３９）を介してＥｓｘＡに接合されて、そのＮ末端が置き換えられ、次いで、リンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＢに接合されて、そのＮ末端が置き換えられている配列番号２３７（実施例で用いる「ＨｌａＨ３５Ｌ−ｅｓｘＡＢ」）である。このハイブリッドは、配列番号２４０のような適切なＮ末端配列と共に提供されることができる。
本発明の別のハイブリッドポリペプチドは、ｓｔａ００６抗原とＥｓｘＡ抗原とＥｓｘＢ抗原を含んでよい。これらは、Ｎ末端からＣ末端に向かっていずれの順序でもよい。配列番号２２３（「ｓｔａ００６−ｅｓｘＡＢ」）は、ｓｔａ００６がリンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＡＢに接合されているこのような３重ハイブリッドの例である。ＥｓｘＡＢは、既に同じリンカーを含むので、配列番号２２３は、２つのこれらのリンカーを含む。ｓｔａ００６抗原とＥｓｘＡ抗原とＥｓｘＢ抗原を含むハイブリッドポリペプチドの別の例は、ｓｔａ００６がリンカーＡＰＴＡＲＧ（配列番号２３９）を介してＥｓｘＡに接合されて、そのＮ末端が置き換えられ、次いで、リンカーＡＳＧＧＧＳ（配列番号１７３）を介してＥｓｘＢに接合されて、そのＮ末端が置き換えられている配列番号２３８（実施例で用いる「ｓｔａ００６−ｅｓｘＡＢ」）である。このハイブリッドは、配列番号２４０のような適切なＮ末端配列と共に提供されることができる。
有用には、これらのハイブリッドポリペプチドは、ハイブリッド中にある野生型ブドウ球菌タンパク質（例えば配列表に示すような）のそれぞれを認識する、例えば、野生型ＥｓｘＡと野生型ＥｓｘＢをともに認識するか、または野生型ＳｄｒＤと野生型ＳｄｒＥをともに認識するか、または野生型ＳｄｒＤと野生型ＣｌｆＢをともに認識するか、または野生型ＩｓｄＡと野生型ＥｓｘＡをともに認識するか、または野生型ＩｓｄＡと野生型ｓｔａ００６をともに認識するか、または野生型Ｈｌａと野生型ｓｔａ００６をともに認識するか、または野生型Ｈｌａと野生型Ｅｍｐをともに認識するか、または野生型ＩｓｄＡと野生型ＥｓｘＡと野生型ＥｓｘＢを認識するか、または野生型Ｈｌａと野生型ＥｓｘＡと野生型ＥｓｘＢを認識するか、または野生型ｓｔａ００６と野生型ＥｓｘＡと野生型ＥｓｘＢを認識する抗体（例えばヒトに投与した場合に）を惹起できる。
（本発明で用いるポリペプチド）
本発明で用いるポリペプチドは、種々の形態をとることができる（例えば天然、融合、グリコシル化、非グリコシル化、脂質付加、非脂質付加、リン酸化、非リン酸化、ミリストイル化、非ミリストイル化、モノマー、マルチマー、粒子状、変性など）。
本発明で用いるポリペプチドは、種々の手段で調製できる（例えば組換え発現、細胞培養物からの精製、化学合成など）。組換え発現されたタンパク質が、特にハイブリッドポリペプチドについて好ましい。
本発明で用いるポリペプチドは、精製または実質的に精製された形態、すなわちその他のポリペプチドを実質的に含まない（例えば天然に存在するポリペプチドを含まない）形態、特にその他のブドウ球菌ポリペプチドまたは宿主細胞ポリペプチドを実質的に含まない形態で提供されることが好ましく、一般的に、少なくとも約５０％純粋（重量）、通常少なくとも約９０％純粋であり、すなわち組成物の約５０％未満、より好ましくは約１０％未満（例えば５％）が、その他の発現されたポリペプチドで構成される。よって、組成物中の抗原は、分子が発現される生体全体から分離される。
本発明で用いるポリペプチドは、好ましくは、ブドウ球菌ポリペプチドである。
「ポリペプチド」との用語は、任意の長さのアミノ酸ポリマーのことをいう。ポリマーは、直鎖状または分岐状であってよく、これは、改変アミノ酸を含んでよく、これは、非アミノ酸により中断されてよい。この用語は、天然で改変されたか、または介在、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質付加、アセチル化、リン酸化または標識成分との結合体化のような任意のその他の操作もしくは改変により改変されたアミノ酸ポリマーも包含する。例えば、アミノ酸の１または複数の類似体（例えば非天然アミノ酸などを含む）および当該技術分野において公知のその他の改変を含有するポリペプチドも含まれる。ポリペプチドは、単一鎖または会合した鎖として生じることができる。
本発明は、配列−Ｐ−Ｑ−または−Ｑ−Ｐ−（ここで、−Ｐ−は、上記で規定されるアミノ酸配列であり、−Ｑ−は、上記で規定される配列でない）を含むポリペプチドを提供し、すなわち本発明は、融合タンパク質を提供する。−Ｐ−のＮ末端コドンがＡＴＧではなく、このコドンがポリペプチドのＮ末端に存在しない場合、これは、Ｍｅｔとしてではなくそのコドンについての標準的なアミノ酸として翻訳される。このコドンがポリペプチドのＮ末端にある場合、しかし、これはＭｅｔとして翻訳される。−Ｑ−部分の例は、それらに限定されないが、ヒスチジンタグ（すなわちＨｉｓｎ（ここで、ｎ＝３、４、５、６、７、８、９、１０以上））、マルトース結合タンパク質、またはグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）を含む。
本発明は、本発明の核酸で形質転換された宿主細胞を、ポリペプチド発現を誘導する条件下で培養するステップを含む、本発明のポリペプチドを生成するプロセスも提供する。
本発明のポリペプチドの発現はＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓにおいて生じ得るが、本発明は、発現のための異種宿主を通常用いる（組換え発現）。異種宿主は、原核生物（例えば細菌）または真核生物であり得る。これは、Ｅ．ｃｏｌｉであってよいが、その他の適切な宿主は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｖｉｂｒｉｏ ｃｈｏｌｅｒａｅ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｌａｃｔａｍｉｃａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ（例えばＭ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、酵母などを含む。本発明のポリペプチドをコードする野生型Ｓ．ａｕｒｅｕｓ遺伝子と比較して、コドンを変更して、コードされたアミノ酸に影響することなくこのような宿主における発現効率を最適化することが役に立つ。
本発明は、ポリペプチドの少なくとも一部分を化学的手段により合成するステップを含む、本発明のポリペプチドを生成するプロセスを提供する。
（核酸）
本発明は、本発明のポリペプチドおよびハイブリッドポリペプチドをコードする核酸も提供する。本発明は、本発明の１または複数のポリペプチドまたはハイブリッドポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸も提供する。
本発明は、このようなヌクレオチド配列と配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む核酸も提供する。配列間の同一性は、好ましくは、上記のようなＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムにより決定される。このような核酸は、同じアミノ酸をコードするように代替コドンを用いるものを含む。
本発明は、これらの核酸とハイブリダイズできる核酸も提供する。ハイブリダイゼーション反応は、異なる「ストリンジェンシー」の条件下で行うことができる。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーを増加させる条件は、当該技術分野において広く公知であり、発表されている（例えば参考文献２７６の第７．５２頁）。適当な条件の例は（ストリンジェンシーを増加させる順に）、２５℃、３７℃、５０℃、５５℃および６８℃のインキュベーション温度；１０×ＳＳＣ、６×ＳＳＣ、１×ＳＳＣ、０．１×ＳＳＣの緩衝液濃度（ここで、ＳＳＣは０．１５Ｍ ＮａＣｌおよび１５ｍＭクエン酸緩衝液である）およびその他の緩衝液系を用いるそれらの等価物；０％、２５％、５０％および７５％のホルムアミド濃度；５分〜２４時間のインキュベーション時間；１、２回以上の洗浄ステップ；１、２または１５分の洗浄インキュベーション時間；ならびに６×ＳＳＣ、１×ＳＳＣ、０．１×ＳＳＣまたは脱イオン水の洗浄溶液を含む。ハイブリダイゼーション法およびそれらの最適化は、当該技術分野において周知である（例えば参考文献７５、７６、２７６、２７８などを参照されたい）。
いくつかの実施形態において、本発明の核酸は、低ストリンジェンシー条件下で標的とハイブリダイズする。その他の実施形態において、これは、中程度のストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする。好ましい実施形態において、これは、高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする。低ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の例示的なセットは、５０℃および１０×ＳＳＣである。中程度のストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の例示的なセットは、５５℃および１×ＳＳＣである。高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の例示的なセットは、６８℃および０．１×ＳＳＣである。
本発明は、これらの配列に相補的な配列を含む核酸を含む（例えばアンチセンスもしくはプローブのため、またはプライマーとして用いるため）。
本発明の核酸は、ハイブリダイゼーション反応（例えばノザンもしくはサザンブロット、または核酸マイクロアレイもしくは「遺伝子チップ」において）および増幅反応（例えばＰＣＲ、ＳＤＡ、ＳＳＳＲ、ＬＣＲ、ＴＭＡ、ＮＡＳＢＡなど）およびその他の核酸技術において用いることができる。
本発明による核酸は、種々の形態をとることができる（例えば１本鎖、２本鎖、ベクター、プライマー、プローブ、標識されたなど）。本発明の核酸は、環状または分岐状であってよいが、一般的に直鎖状である。そうでないと明記しない限り、またはそうでないことが要求されない限り、核酸を利用する本発明の任意の実施形態は、２本鎖の形態と、２本鎖の形態を構成する２つの相補的１本鎖の形態のそれぞれとの両方を利用し得る。プライマーおよびプローブは、アンチセンス核酸と同様に、一般的に１本鎖である。
本発明の核酸は、精製または実質的に精製された形態、すなわちその他の核酸を実質的に含まない形態（例えば天然に存在する核酸を含まない）、特にその他のブドウ球菌の核酸または宿主細胞の核酸を実質的に含まない形態で提供されることが好ましく、一般的に、少なくとも約５０％純粋（重量）、通常少なくとも約９０％純粋である。本発明の核酸は、好ましくは、ブドウ球菌の核酸である。
本発明の核酸は、例えば全体的もしくは部分的化学合成（例えばＤＮＡのホスホラミダイト合成）によって、ヌクレアーゼ（例えば制限酵素）を用いてより長い核酸を消化することによって、ゲノムもしくはｃＤＮＡライブラリーからのより短い核酸もしくはヌクレオチドを（例えばリガーゼまたはポリメラーゼを用いて）接合することによって、などの多くの方法により調製し得る。
本発明の核酸は、固体支持体（例えばビーズ、プレート、フィルタ、フィルム、スライド、マイクロアレイ支持体、樹脂など）に付着してよい。本発明の核酸は、例えば放射活性もしくは蛍光標識またはビオチン標識で標識されてよい。このことは、検出法において核酸を用いる場合、例えば核酸がプライマーであるかまたはプローブとしてである場合は特に有用である。
「核酸」との用語は、一般的に、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチドおよび／またはそれらの類似体を含む任意の長さのヌクレオチドのポリマーの形態の意味を含む。これは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッドを含む。これは、改変骨格（例えばペプチド核酸（ＰＮＡ）またはホスホロチオエート）または改変塩基を含有するもののようなＤＮＡまたはＲＮＡ類似体も含む。よって、本発明は、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡ、リボザイム、ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、組換え核酸、分岐核酸、プラスミド、ベクター、プローブ、プライマーなどを含む。本発明の核酸がＲＮＡの形態をとる場合、これは、５’キャップを有しても有さなくてもよい。
本発明の核酸は、ベクターの一部分、すなわち１または複数の型の細胞の形質導入／トランスフェクションのために設計された核酸構築物の一部分であってよい。ベクターは、例えば挿入ヌクレオチドの単離、増幅（ｐｒｏｐａｇａｔｉｏｎ）および複製のために設計された「クローニングベクター」、宿主細胞中のヌクレオチド配列の発現のために設計された「発現ベクター」、組換えウイルスもしくはウイルス様粒子の生成をもたらすために設計された「ウイルスベクター」または１より多い型のベクターの属性を含む「シャトルベクター」であり得る。好ましいベクターは、プラスミドである。「宿主細胞」は、外来核酸を受容できるかまたは受容した個別の細胞または細胞培養物を含む。宿主細胞は、単一宿主細胞の子孫を含み、子孫は、天然の、偶然のまたは故意の変異および／または変更のために元の親の細胞と完全に同一（形態的にまたは全体のＤＮＡ相補体において）である必要はない。宿主細胞は、本発明の核酸にインビボもしくはインビトロにてトランスフェクトまたは感染した細胞を含む。
核酸がＤＮＡである場合、ＲＮＡ配列中の「Ｕ」がＤＮＡにおいて「Ｔ」に置き換わることが認識される。同様に、核酸がＲＮＡである場合、ＤＮＡ配列中の「Ｔ」は、ＲＮＡにおいて「Ｕ」に置き換わることが認識されている。
核酸に関連して用いる場合の「相補体」または「相補」との用語は、ワトソン−クリック塩基対形成のことをいう。つまり、Ｃの相補体はＧであり、Ｇの相補体はＣであり、Ａの相補体はＴ（またはＵ）であり、Ｔ（またはＵ）の相補体はＡである。Ｉ（プリンイノシン）のような塩基を用いて、例えばピリミジン（ＣまたはＴ）を相補することも可能である。
本発明の核酸は、例えば、ポリペプチドを生成するため；生体試料中の核酸の検出のためのハイブリダイゼーションプローブとして；核酸のさらなるコピーを作製するため；リボザイムもしくはアンチセンスオリゴヌクレオチドを作製するため；１本鎖ＤＮＡプライマーもしくはプローブとして；または３重鎖形成オリゴヌクレオチドとして用いることができる。
本発明は、核酸が、部分的または全体的に化学的手段を用いて合成される、本発明の核酸を生成するプロセスを提供する。
本発明は、本発明のヌクレオチド配列を含むベクター（例えばクローニングまたは発現ベクター）およびこのようなベクターで形質転換された宿主細胞を提供する。
本発明による核酸増幅は、定量的および／またはリアルタイムであってよい。
本発明のあるいくつかの実施形態について、核酸は、好ましくは、少なくとも７ヌクレオチドの長さである（例えば８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２２５、２５０、２７５、３００ヌクレオチド以上）。
本発明のあるいくつかの実施形態について、核酸は、好ましくは、多くて５００ヌクレオチドの長さである（例えば４５０、４００、３５０、３００、２５０、２００、１５０、１４０、１３０、１２０、１１０、１００、９０、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、２０、１９、１８、１７、１６、１５ヌクレオチド以下）。
本発明のプライマーおよびプローブ、ならびにハイブリダイゼーションのために用いられるその他の核酸は、好ましくは、１０〜３０ヌクレオチドの長さである（例えば１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０ヌクレオチド）。
（株および改変体）
抗原は、既存の命名法（例えば「ＣｌｆＡ」）、「ｓｔａ」番号または「ＮＷ＿」番号を参照することにより上記のように規定される。本明細書中の表１は、これらの３つの命名／番号付けシステムを、既存のＳＡＯＵＨＳＣ番号付けおよび／またはＮＷＭＮ番号付けと関連させる。ＳＡＯＵＨＳＣ番号付けは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ ＮＣＴＣ８３２５株（Ｏｋｌａｈｏｍａ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｃｅｎｔｅｒにより配列決定され、ＧｅｎＢａｎｋにおいてＣＰ０００２５３．１；ＧＩ：８７２０１３８１として開示されている）のゲノムを参照し、個別のＳＡＯＵＨＳＣ番号は、ゲノム配列の「特徴」セクションにおける「遺伝子座＿タグ」エントリーとして与えられる。同様に、ＮＷＭＮ番号付けは、ＧｅｎＢａｎｋにおいてＡＰ００９３５１．１（ＧＩ：１５０３７３０１２）として開示されているＳ．ａｕｒｅｕｓ Ｎｅｗｍａｎ株（１９５２年にヒト感染から単離され、堅調な病毒性表現型を有する）のゲノムを参照し、個別のＮＷＭＮ番号は、ゲノム配列の「特徴」セクションにおける「遺伝子座＿タグ」エントリーとして与えられる。それぞれの抗原についての機能的アノテーションも、データベースにある。
表１は、本発明のそれぞれの抗原についてのＧＩ番号も含む。つまり、これらの抗原のいずれかについての例示的なアミノ酸およびヌクレオチド配列は、ＮＣＴＣ８３２５および／またはＮｅｗｍａｎ株からの公共の配列データベースにおいて容易に見出すことができるが、本発明は、ＮＣＴＣ８３２５およびＮｅｗｍａｎ株からの配列に限定されない。Ｓ．ａｕｒｅｕｓのいくつかのその他の株のゲノム配列が入手可能であり、これらは、ＭＲＳＡ株であるＮ３１５およびＭｕ５０［７７］、ＭＷ２、Ｎ３１５、ＣＯＬ、ＭＲＳＡ２５２、ＭＳＳＡ４７６、ＲＦ１２２、ＵＳＡ３００（非常に病毒性が高い）、ＪＨ１およびＪＨ９のものを含む。標準的な検索およびアラインメント技術を用いて、これらの（またはその他の）さらなるゲノム配列のいずれかにおいて、ＮｅｗｍａｎまたはＮＣＴＣ８３２５株からの任意の具体的な配列の相同体を同定できる。さらに、ＮｅｗｍａｎおよびＮＣＴＣ８３２５株からの入手可能な配列を用いて、その他の株からの相同配列の増幅のためのプライマーを設計できる。よって、本発明は、これらの２つの株に限定されず、むしろ、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのその他の株からのこのような改変体および相同体、ならびに非天然改変体を包含する。一般的に、具体的な配列番号の適切な改変体は、その対立遺伝子改変体、その多形、その相同体、そのオルソログ、そのパラログ、その変異体などを含む。
よって、例えば、本発明で用いるポリペプチドは、本明細書中の配列番号と比較して、保存置換（すなわちあるアミノ酸の、関連する側鎖を有する別のアミノ酸での置換）のような１または複数の（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９など）アミノ酸置換を含んでよい。遺伝子によりコードされるアミノ酸は、一般的に４つのファミリーに分けられる：（１）酸性、すなわちアスパラギン酸、グルタミン酸；（２）塩基性、すなわちリジン、アルギニン、ヒスチジン；（３）非極性、すなわちアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン；および（４）非荷電極性、すなわちグリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、スレオニン、チロシン。フェニルアラニン、トリプトファンおよびチロシンは、時折、一緒に芳香族アミノ酸として分類される。一般的に、これらのファミリー内での単一アミノ酸の置換は、生物活性に対して大きな影響を有さない。ポリペプチドは、配列番号の配列に対して１または複数（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９など）の単一アミノ酸欠失も含んでよい。ポリペプチドはまた、配列番号の配列に対して１または複数（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９など）の挿入（例えば１、２、３、４または５アミノ酸のそれぞれ）を含んでもよい。
同様に、本発明で用いるポリペプチドは、
配列表に開示されている配列と同一である（すなわち１００％同一）；
配列表に開示されている配列と配列同一性を有する（例えば８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）；
（ａ）または（ｂ）の配列と比較して、離れた位置にあり得るかまたは連続的であり得る１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０（またはそれより多く）の単一アミノ酸変化（欠失、挿入、置換）を有する；およびペアワイズアラインメントアルゴリズムを用いて配列表からの具体的な配列とアラインメントさせた場合に、Ｎ末端からＣ末端までのｘアミノ酸のそれぞれの移動ウィンドウ（ｐアミノ酸まで伸長するアラインメントについて、ｐ＞ｘの場合、ｐ−ｘ＋１のこのようなウィンドウが存在するように）が、少なくともｘ・ｙの同一のアラインメントされたアミノ酸（ここで、ｘは、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００から選択され；ｙは、０．５０、０．６０、０．７０、０．７５、０．８０、０．８５、０．９０、０．９１、０．９２、０．９３、０．９４、０．９５、０．９６、０．９７、０．９８、０．９９から選択され；ｘ・ｙが整数でない場合、最も近い整数まで端数を切り上げる）を有するアミノ酸配列を含み得る。好ましいペアワイズアラインメントアルゴリズムは、デフォルトパラメータ（例えばＥＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックスを用いてギャップオープニングペナルティ＝１０．０およびギャップ伸長ペナルティ＝０．５）を用いるＮｅｅｄｌｅｍａｎ−Ｗｕｎｓｃｈグローバルアラインメントアルゴリズム［７８］である。このアルゴリズムは、ＥＭＢＯＳＳパッケージのｎｅｅｄｌｅツールに簡便に実装されている［７９］。
ハイブリッドポリペプチドを用いる場合、ハイブリッド中の個別の抗原（すなわち個別の−Ｘ−部分）は、１または複数の株からであってよい。ｎ＝２である場合、例えば、Ｘ２は、Ｘ１と同じ株または異なる株からであってよい。ｎ＝３である場合、株は、（ｉ）Ｘ１＝Ｘ２＝Ｘ３、（ｉｉ）Ｘ１＝Ｘ２≠Ｘ３、（ｉｉｉ）Ｘ１≠Ｘ２＝Ｘ３、（ｉｖ）Ｘ１≠Ｘ２≠Ｘ３または（ｖ）Ｘ１＝Ｘ３≠Ｘ２などであり得る。
群（ｃ）のうち、欠失または置換は、Ｎ末端および／またはＣ末端にあっても、または２つの末端の間にあってよい。よって、切断は、欠失の例である。切断は、Ｎ末端および／またはＣ末端での４０（またはそれより多く）アミノ酸までの欠失を含み得る。Ｎ末端切断は、リーダーペプチドを除去して、例えば異種宿主における組換え発現を促進できる。Ｃ末端切断は、アンカー配列を除去して、例えば異種宿主における組換え発現を促進できる。
一般的に、抗原が、配列表からの完全Ｓ．ａｕｒｅｕｓ配列と同一でない配列を含む場合（例えば抗原が、完全Ｓ．ａｕｒｅｕｓ配列に対して＜１００％の配列同一性を有する配列の一覧（ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｌｉｓｔｉｎｇ）を含むか、またはその断片を含む場合）、それぞれの個別の場合において、抗原が、それぞれの完全Ｓ．ａｕｒｅｕｓ配列を認識する抗体を惹起できることが好ましい。
（変異体細菌）
本発明は、本発明の種々の抗原群からの抗原の１または複数がノックアウトされているＳ．ａｕｒｅｕｓ細菌も提供する。ノックアウト細菌を生成する技術は周知であり、ノックアウトＳ．ａｕｒｅｕｓ株は、報告されている。ノックアウト変異は、遺伝子のコード領域に位置しても、またはその転写制御領域（例えばそのプロモーター内）にあってもよい。ノックアウト変異は、抗原をコードするｍＲＮＡのレベルを、野生型細菌により生成されるものの＜１％、好ましくは＜０．５％、より好ましくは＜０．１％および最も好ましくは０％まで低減させる。
本発明は、本発明の種々の抗原群からの抗原の１または複数が、その活性を阻害する変異を有するＳ．ａｕｒｅｕｓも提供する。抗原をコードする遺伝子は、コードされたアミノ酸配列を変更する変異を有する。変異は、欠失、置換および／または挿入を含んでよく、これらのいずれも、１または複数のアミノ酸に関与し得る。
本発明は、本発明の抗原を過剰発現する、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ細菌のような細菌も提供する。
本発明は、本発明の抗原を構成的に発現する、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ細菌のような細菌も提供する。本発明は、本発明の抗原をコードする遺伝子を含む髄膜炎菌であって、前記遺伝子が、誘導性のプロモーターの制御下にある髄膜炎菌も提供する。
（免疫原性組成物および医薬品）
本発明の免疫原性組成物は、ワクチンとして有用であり得る。本発明によるワクチンは、予防的（すなわち感染を防ぐ）または治療的（すなわち感染を処置する）のいずれかであってよいが、典型的には予防的である。
組成物は、よって、薬学的に許容され得る。これらは、通常、抗原に加えて成分を含み、例えば、これらは、典型的には、１または複数の薬学的キャリアおよび／または賦形剤を含む。このような成分の詳細な考察は、参考文献２７３で入手可能である。
組成物は、一般的に、哺乳動物に水性形態で投与される。しかし、投与の前に、組成物は非水性形態であってよい。例えば、いくつかのワクチンは水性形態で製造され、次いで充填および配送され、同じく水性形態で投与されるが、その他のワクチンは製造中に凍結乾燥され、使用時に水性形態に再構成される。よって、本発明の組成物は、凍結乾燥処方物のように乾燥され得る。
組成物は、チオメルサールまたは２−フェノキシエタノールのような防腐剤を含んでよい。しかし、好ましくは、ワクチンは、水銀性物質を実質的に含まない（すなわち５μｇ／ｍｌ未満）、例えばチオメルサールを含まないようにすべきである。水銀を含まないワクチンがより好ましい。防腐剤を含まないワクチンが特に好ましい。
熱安定性を改善するために、組成物は、温度保護剤を含んでよい。このような剤のさらなる詳細は、以下に記載する。
張度を制御するために、ナトリウム塩のような生理的な塩を含むことが好ましい。塩化ナトリウム（ＮａＣｌ）が好ましく、これは、１〜２０ｍｇ／ｍｌ、例えば約１０±２ｍｇ／ｍｌ ＮａＣｌで存在してよい。存在し得るその他の塩は、塩化カリウム、リン酸二水素カリウム、リン酸二ナトリウム無水物、塩化マグネシウム、塩化カルシウムなどを含む。
組成物は、一般的に、２００ｍＯｓｍ／ｋｇ〜４００ｍＯｓｍ／ｋｇ、好ましくは２４０〜３６０ｍＯｓｍ／ｋｇの重量オスモル濃度を有し、より好ましくは、２９０〜３１０ｍＯｓｍ／ｋｇの範囲内にある。
組成物は、１または複数の緩衝剤を含んでよい。典型的な緩衝剤は、リン酸緩衝剤、Ｔｒｉｓ緩衝剤、ホウ酸緩衝剤、コハク酸緩衝剤、ヒスチジン緩衝剤（特に水酸化アルミニウムアジュバントとともに）またはクエン酸緩衝剤を含む。緩衝剤は、典型的には、５〜２０ｍＭの範囲で含まれる。
組成物のｐＨは、一般的に、５．０〜８．１であり、より典型的には６．０〜８．０、例えば６．５および７．５、または７．０〜７．８である。
組成物は、好ましくは滅菌されている。組成物は、好ましくは発熱物質を含まず、例えば用量あたり＜１ＥＵ（内毒素単位、標準的な尺度）、好ましくは用量あたり＜０．１ＥＵを含有する。組成物は、好ましくは、グルテンを含まない。
組成物は、単回の免疫化のための物質を含んでも、複数回の免疫化（すなわち「複数回用量」キット）のための物質を含んでもよい。複数回用量の構成において、防腐剤を含むことが好ましい。複数回用量組成物に防腐剤を含める代わり（またはそれに加えて）に、組成物を、物質を取り出すための無菌アダプタを有する容器中に入れてよい。
ヒトワクチンは、典型的には、約０．５ｍｌの投与容積で投与されるが、小児には半分の用量（すなわち約０．２５ｍｌ）を投与してよい。
本発明の免疫原性組成物は、１または複数の免疫調節剤も含んでよい。好ましくは、免疫調節剤の１または複数は、１または複数のアジュバントを含む。アジュバントは、以下でさらに論じるＴＨ１アジュバントおよび／またはＴＨ２アジュバントを含んでよい。
よって、本発明は、
（１）第１、第２、第３および第４抗原群（上記で定義されるとおり）から選択される１または複数の抗原と、
（２）水酸化アルミニウムアジュバントのようなアジュバント（例えば、１または複数の抗原は、水酸化アルミニウムに吸着されてよい）と
の組み合わせを含む免疫原性組成物を提供する。
例えば、本発明は、ｓｔａ００６抗原と、水酸化アルミニウムアジュバントのようなアジュバントとの組み合わせを含む免疫原性組成物を提供する。同様に、本発明は、ｓｔａ０１１抗原と、水酸化アルミニウムアジュバントのようなアジュバントとの組み合わせを含む免疫原性組成物を提供する。これらの組成物は、例えばヒスチジン緩衝液を用いて理想的に緩衝化される。
本発明の組成物において用い得るアジュバントは、それらに限定されないが、以下のものを含む。
（Ａ．無機質含有組成物）
本発明においてアジュバントとして用いるために適切な無機質含有組成物は、アルミニウム塩およびカルシウム塩（またはそれらの混合物）のような無機塩を含む。カルシウム塩は、リン酸カルシウム（例えば参考文献８０に開示されている「ＣＡＰ」粒子）を含む。アルミニウム塩は、水酸化物、リン酸塩、硫酸塩などを含み、これらの塩は任意の適切な形態（例えばゲル、結晶、非晶質など）をとる。これらの塩に吸着されることが好ましい（例えば全ての抗原が吸着されてよい）。無機質含有組成物はまた、金属塩の粒子として処方されてもよい［８１］。
水酸化アルミニウムおよびリン酸アルミニウムとして公知のアジュバントを用いてよい。これらの名称は、一般的であるが、簡便さのためにのみ用いられる。なぜなら、これらはいずれも、存在する実際の化学物質を正確に記載していないからである（例えば参考文献８２の第９章を参照されたい）。本発明は、アジュバントとして一般的に用いられる「水酸化物」または「リン酸塩」アジュバントのいずれも用いることができる。「水酸化アルミニウム」として公知のアジュバントは、典型的にはオキシ水酸化アルミニウム塩であり、これは、通常、少なくとも部分的に結晶性である。「リン酸アルミニウム」として公知のアジュバントは、典型的には、少量の硫酸塩も頻繁に含有しているヒドロキシリン酸アルミニウムである（すなわち、アルミニウムヒドロキシホスフェートサルフェート（ａｌｕｍｉｎｉｕｍ ｈｙｄｒｏｘｙｐｈｏｓｐｈａｔｅ ｓｕｌｆａｔｅ））。これらは、沈殿により得ることができ、沈殿中の反応条件および濃度は、塩中のヒドロキシルに対するホスフェートの置換の程度に影響する。
水酸化アルミニウムアジュバントについて、繊維状の形態（例えば透過型電子顕微鏡写真で観察されるような）が典型的である。水酸化アルミニウムアジュバントのｐＩは、典型的には約１１であり、すなわちアジュバント自体が生理的ｐＨにおいて正の表面電荷を有する。ｐＨ７．４にてＡｌ＋＋＋１ｍｇあたり１．８〜２．６ｍｇのタンパク質吸着能が、水酸化アルミニウムアジュバントについて報告されている。
リン酸アルミニウムアジュバントは、一般的に、０．３〜１．２、好ましくは０．８〜１．２、より好ましくは０．９５±０．１のＰＯ４／Ａｌモル比を有する。リン酸アルミニウムは、ヒドロキシリン酸塩については特に、一般的に非晶質である。典型的なアジュバントは、０．８４〜０．９２のＰＯ４／Ａｌモル比を有する非晶質ヒドロキシリン酸アルミニウムであり、０．６ｍｇ Ａｌ３＋／ｍｌで含まれる。リン酸アルミニウムは、一般的に粒子状である（例えば透過型電子顕微鏡写真で観察されるようなプレート様の形態）。粒子の典型的な直径は、任意の抗原吸着後に、０．５〜２０μｍの範囲（例えば約５〜１０μｍ）である。ｐＨ７．４にてＡｌ＋＋＋１ｍｇあたり０．７〜１．５ｍｇのタンパク質吸着能が、リン酸アルミニウムアジュバントについて報告されている。
リン酸アルミニウムのゼロ電荷点（ＰＺＣ）は、ヒドロキシルに対するホスフェートの置換の程度と反比例し、この置換の程度は、沈殿により塩を調製するために用いる反応条件および反応物の濃度に依存して変動できる。ＰＺＣは、溶液中の遊離リン酸イオンの濃度を変化させること（より多いホスフェート＝より酸性側のＰＺＣ）、またはヒスチジン緩衝剤のような緩衝剤を加えること（ＰＺＣをより塩基性にする）によっても変更される。本発明に従って用いられるリン酸アルミニウムは、一般的に、４．０〜７．０、より好ましくは５．０〜６．５、例えば約５．７のＰＺＣを有する。
以下に示すように、水酸化アルミニウムアジュバントへのＳ．ａｕｒｅｕｓタンパク質抗原（ＩｓｄＡ、Ｓｔａ０１９およびＳｔａ０７３を除く）の吸着が、複数のタンパク質の組み合わせ（全ての抗原が吸着されてよい）において特に有利である。ヒスチジン緩衝剤を、このようなアジュバント添加された組成物において有用に含むことができる。
本発明の組成物を調製するために用いられるアルミニウム塩の懸濁物は、緩衝剤（例えばリン酸緩衝剤またはヒスチジン緩衝剤またはＴｒｉｓ緩衝剤）を含有してよいが、このことは常に必要というわけではない。懸濁物は、好ましくは、滅菌されており、発熱物質を含まない。懸濁物は、例えば１．０〜２０ｍＭ、好ましくは５〜１５ｍＭ、より好ましくは約１０ｍＭの濃度で存在する遊離の水性リン酸イオンを含んでよい。懸濁物は、塩化ナトリウムも含んでよい。
本発明は、水酸化アルミニウムとリン酸アルミニウムの両方の混合物を使用することができる。この場合、水酸化アルミニウムよりも多くのリン酸アルミニウムが存在し得、例えば、少なくとも２：１、例えば≧５：１、≧６：１、≧７：１、≧８：１、≧９：１などの重量比であってよい。
患者に投与するための組成物中のＡｌ＋＋＋の濃度は、好ましくは１０ｍｇ／ｍｌ未満、例えば≦５ｍｇ／ｍｌ、≦４ｍｇ／ｍｌ、≦３ｍｇ／ｍｌ、≦２ｍｇ／ｍｌ、≦１ｍｇ／ｍｌなどである。好ましい範囲は、０．３〜１ｍｇ／ｍｌである。最大０．８５ｍｇ／用量が好ましい。
（Ｂ．油性エマルジョン）
本発明においてアジュバントとして用いるために適切な油性エマルジョン組成物は、ＭＦ５９［参考文献８２の第１０章；参考文献８３も参照されたい］（マイクロフルイダイザーを用いてサブミクロンの粒子に処方された５％スクアレン、０．５％Ｔｗｅｅｎ８０および０．５％Ｓｐａｎ８５）のようなスクアレン−水エマルジョンを含む。完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）および不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）も用いてよい。
種々の水中油型エマルジョンアジュバントが公知であり、これらは、典型的には、少なくとも１種の油と少なくとも１種の界面活性剤とを含み、油（複数可）および界面活性剤（複数可）は、生分解性（代謝可能）であり、生体適合性である。エマルジョン中の油滴は、通常、直径５μｍ未満であり、理想的にはサブミクロンの直径を有し、これらの小さいサイズは、マイクロフルイダイザーを用いて達成され、安定なエマルジョンを提供する。２２０ｎｍ未満のサイズの液滴は、フィルタ滅菌に供することができるので好ましい。
エマルジョンは、動物（例えば魚類）または植物供給源からのもののような油を含むことができる。植物油の供給源は、堅果、種子および穀粒を含む。ピーナツ油、大豆油、ココナツ油およびオリーブ油が、最も一般的に入手可能な堅果油の例である。例えばホホバ豆から得られるホホバ油を用いることができる。種子油は、紅花油、綿実油、ひまわり種子油、ごま油などを含む。穀粒の群において、コーン油が最も容易に入手可能であるが、コムギ、オート麦、ライムギ、コメ、テフ、ライコムギなどのようなその他の穀類の穀粒の油も用いてよい。グリセロールおよび１，２−プロパンジオールの６〜１０炭素脂肪酸エステルは、種子油中に天然には存在しないが、堅果油および種子油から出発する適切な材料の加水分解、分離およびエステル化により調製し得る。哺乳動物の乳からの脂肪および油は代謝可能であり、よって、本発明の実施において用いてよい。動物供給源から純粋な油を得るために必要な分離、精製、けん化およびその他の手段の手順は、当該技術分野において周知である。ほとんどの魚類は、容易に収集し得る代謝可能な油を含有する。例えば、タラ肝油、サメ肝油および鯨ろうのような鯨油は、本明細書において用い得る魚油のいくつかの例である。いくつかの分岐鎖油が、５炭素イソプレン単位で生化学的に合成され、通常、テルペノイドと呼ばれる。サメ肝油は、スクアレン、２，６，１０，１５，１９，２３−ヘキサメチル−２，６，１０，１４，１８，２２−テトラコサヘキサエンとして公知の分岐不飽和テルペノイドを含有し、これは、本明細書において特に好ましい。スクアレンの飽和類似体であるスクアランも好ましい油である。スクアレンおよびスクアランを含む魚油は、商業的な供給源から容易に入手可能であるか、または当該技術分野において公知の方法により得ることができる。その他の好ましい油は、トコフェロールである（下記参照）。混合油を用いることができる。
界面活性剤は、それらの「ＨＬＢ」（親水性／親油性バランス）により分類できる。本発明の好ましい界面活性剤は、少なくとも１０、好ましくは少なくとも１５、より好ましくは少なくとも１６のＨＬＢを有する。本発明は、それらに限定されないが、ポリオキシエチレンソルビタンエステル界面活性剤（一般的にＴｗｅｅｎと呼ばれる）、特にポリソルベート２０およびポリソルベート８０；直鎖状ＥＯ／ＰＯブロックコポリマーのようなＤＯＷＦＡＸＴＭの商品名の下で販売されるエチレンオキシド（ＥＯ）、プロピレンオキシド（ＰＯ）および／またはブチレンオキシド（ＢＯ）のコポリマー；反復エトキシ（オキシ−１，２−エタンジイル）基の数が変動し得るオクトキシノール、特にオクトキシノール−９（ＴｒｉｔｏｎＸ−１００またはｔ−オクチルフェノキシポリエトキシエタノール）が興味深い；（オクチルフェノキシ）ポリエトキシエタノール（ＩＧＥＰＡＬ ＣＡ−６３０／ＮＰ−４０）；ホスファチジルコリン（レシチン）のようなリン脂質；ＴｅｒｇｉｔｏｌＴＭＮＰシリーズのようなノニルフェノールエトキシレート；トリエチレングリコールモノラウリルエーテル（Ｂｒｉｊ３０）のようなラウリル、セチル、ステアリルおよびオレイルアルコールに由来するポリオキシエチレン脂肪エーテル（Ｂｒｉｊ界面活性剤として公知である）；ならびにソルビタントリオレエート（Ｓｐａｎ８５）およびソルビタンモノラウレートのようなソルビタンエステル（一般的にＳＰＡＮとして公知である）を含む界面活性剤を用いることができる。非イオン界面活性剤が好ましい。エマルジョンに含めるために好ましい界面活性剤は、Ｔｗｅｅｎ８０（ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート）、Ｓｐａｎ８５（ソルビタントリオレエート）、レシチンおよびＴｒｉｔｏｎＸ−１００である。
界面活性剤の混合物、例えばＴｗｅｅｎ８０／Ｓｐａｎ８５混合物を用いることができる。ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート（Ｔｗｅｅｎ８０）のようなポリオキシエチレンソルビタンエステルと、ｔ−オクチルフェノキシポリエトキシエタノール（ＴｒｉｔｏｎＸ−１００）のようなオクトキシノールとの組み合わせも適切である。別の有用な組み合わせは、ラウレス−９とポリオキシエチレンソルビタンエステルおよび／またはオクトキシノールとを含む。
界面活性剤の好ましい量（重量％）は、ポリオキシエチレンソルビタンエステル（例えばＴｗｅｅｎ８０）０．０１〜１％、特に約０．１％；オクチル−またはノニルフェノキシポリオキシエタノール（例えばＴｒｉｔｏｎＸ−１００またはＴｒｉｔｏｎシリーズのその他の洗浄剤）０．００１〜０．１％、特に０．００５〜０．０２％；ポリオキシエチレンエーテル（例えばラウレス９）０．１〜２０％、好ましくは０．１〜１０％、特に０．１〜１％または約０．５％である。
好ましいエマルジョンアジュバントは、＜１μｍ、例えば≦７５０ｎｍ、≦５００ｎｍ、≦４００ｎｍ、≦３００ｎｍ、≦２５０ｎｍ、≦２２０ｎｍ、≦２００ｎｍまたはそれより小さい平均液滴サイズを有する。これらの液滴サイズは、マイクロフルイダイゼーションのような技術により簡便に達成できる。
本発明で有用な具体的な水中油型エマルジョンアジュバントは、それらに限定されないが、以下のものを含む。
・スクアレン、Ｔｗｅｅｎ８０およびＳｐａｎ８５のサブミクロンのエマルジョン。エマルジョンの容積での組成は、約５％スクアレン、約０．５％ポリソルベート８０および約０．５％Ｓｐａｎ８５であり得る。重量の点において、これらの比率は、４．３％スクアレン、０．５％ポリソルベート８０および０．４８％Ｓｐａｎ８５になる。このアジュバントは、参考文献８７の第１０章および参考文献８８の第１２章により詳細に記載されるように、「ＭＦ５９」［８４〜８６］として公知である。有利には、ＭＦ５９エマルジョンは、クエン酸イオン、例えば１０ｍＭクエン酸ナトリウム緩衝剤を含む。
・スクアレン、トコフェロールおよびポリソルベート８０（Ｔｗｅｅｎ８０）のエマルジョン。エマルジョンは、リン酸緩衝食塩水を含んでよい。これは、Ｓｐａｎ８５（例えば１％で）および／またはレシチンも含んでよい。これらのエマルジョンは、２〜１０％スクアレン、２〜１０％トコフェロールおよび０．３〜３％Ｔｗｅｅｎ８０を有してよく、スクアレン：トコフェロールの重量比は、より安定なエマルジョンが得られるので、好ましくは≦１である。スクアレンとＴｗｅｅｎ８０とは、約５：２の容積比または約１１：５の重量比で存在してよい。あるこのようなエマルジョンは、Ｔｗｅｅｎ８０をＰＢＳ中に溶解して２％溶液を得て、次いで９０ｍｌのこの溶液を、（５ｇのＤＬ−α−トコフェロールおよび５ｍｌスクアレン）の混合物と混合し、次いで混合物をマイクロフルイダイズすることにより作製できる。得られるエマルジョンは、例えば、１００〜２５０ｎｍ、好ましくは約１８０ｎｍの平均直径のサブミクロンの油滴を有し得る。エマルジョンは、３−脱−Ｏ−アセチル化モノホスホリルリピドＡ（３ｄ−ＭＰＬ）も含んでよい。この型の別の有用なエマルジョンは、１ヒト用量あたりに０．５〜１０ｍｇスクアレン、０．５〜１１ｍｇトコフェロールおよび０．１〜４ｍｇポリソルベート８０を含んでよい［８９］。
・スクアレン、トコフェロールおよびＴｒｉｔｏｎ洗浄剤（例えばＴｒｉｔｏｎＸ−１００）のエマルジョン。エマルジョンは、３ｄ−ＭＰＬも含んでよい（下記参照）。エマルジョンは、リン酸緩衝剤を含有してよい。
・ポリソルベート（例えばポリソルベート８０）、Ｔｒｉｔｏｎ洗浄剤（例えばＴｒｉｔｏｎＸ−１００）およびトコフェロール（例えばα−コハク酸トコフェロール）を含むエマルジョン。エマルジョンは、これらの３成分を、約７５：１１：１０の質量比で含んでよく（例えば７５０μｇ／ｍｌポリソルベート８０、１１０μｇ／ｍｌ ＴｒｉｔｏｎＸ−１００および１００μｇ／ｍｌ α−コハク酸トコフェロール）、これらの濃度は、抗原からのこれらの成分のいずれの寄与も含むべきである。エマルジョンは、スクアレンも含んでよい。エマルジョンは、３ｄ−ＭＰＬも含んでよい（下記参照）。水相は、リン酸緩衝剤を含有してよい。
・スクアラン、ポリソルベート８０およびポロキサマー４０１（「ＰｌｕｒｏｎｉｃＴＭＬ１２１」）のエマルジョン。エマルジョンは、リン酸緩衝食塩水、ｐＨ７．４中で処方できる。このエマルジョンは、ムラミルジペプチドについての有用な送達ビヒクルであり、スレオニル−ＭＤＰとともに「ＳＡＦ−１」アジュバント中で用いられている［９０］（０．０５〜１％Ｔｈｒ−ＭＤＰ、５％スクアラン、２．５％ＰｌｕｒｏｎｉｃＬ１２１および０．２％ポリソルベート８０）。これは、「ＡＦ」アジュバントでのようにＴｈｒ−ＭＤＰなしで用いることもできる［９１］（５％スクアラン、１．２５％ＰｌｕｒｏｎｉｃＬ１２１および０．２％ポリソルベート８０）。マイクロフルイダイゼーションが好ましい。
・スクアレン、水性溶媒、ポリオキシエチレンアルキルエーテル親水性非イオン界面活性剤（例えばポリオキシエチレン（１２）セトステアリルエーテル）および疎水性非イオン界面活性剤（例えばソルビタンモノオレエートまたは「Ｓｐａｎ８０」のようなソルビタンエステルまたはマンニドエステル）を含むエマルジョン。エマルジョンは、好ましくは、熱可逆性であり、かつ／または少なくとも９０％の油滴（容積による）が２００ｎｍ未満のサイズである［９２］。エマルジョンは、アルジトール、凍結保護剤（例えばドデシルマルトシドおよび／またはスクロースのような糖）、および／またはアルキルポリグリコシドの１または複数も含んでよい。エマルジョンは、ＴＬＲ４アゴニストを含んでよい［９３］。このようなエマルジョンは、凍結乾燥してよい。
・スクアレン、ポロキサマー１０５およびＡｂｉｌ−Ｃａｒｅ［９４］のエマルジョン。アジュバント添加されたワクチンにおけるこれらの成分の最終濃度（重量）は、５％スクアレン、４％ポロキサマー１０５（プルロニックポリオール）および２％Ａｂｉｌ−Ｃａｒｅ８５（ビス−ＰＥＧ／ＰＰＧ−１６／１６ ＰＥＧ／ＰＰＧ−１６／１６ジメチコン；カプリル酸／カプリン酸トリグリセリド）である。
・０．５〜５０％の油、０．１〜１０％のリン脂質および０．０５〜５％の非イオン界面活性剤を含むエマルジョン。参考文献９５に記載されるように、好ましいリン脂質成分は、ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジン酸、スフィンゴミエリンおよびカルジオリピンである。サブミクロンの液滴サイズが有利である。
・代謝不可能油（例えば軽油）および少なくとも１種の界面活性剤（例えばレシチン、Ｔｗｅｅｎ８０またはＳｐａｎ８０）のサブミクロンの水中油型エマルジョン。ＱｕｉｌＡサポニン、コレステロール、サポニン親油性結合体（例えば脂肪族アミンをデスアシルサポニンに、グルクロン酸のカルボキシル基を介して付加することにより生成される、参考文献９６に記載されるＧＰＩ−０１００）、ジメチルジオクタデシルアンモニウム（ｄｉｍｅｔｈｙｉｄｉｏｃｔａｄｅｃｙｌａｍｍｏｎｉｕｍ）ブロミドおよび／またはＮ，Ｎ−ジオクタデシル−Ｎ，Ｎ−ビス（２−ヒドロキシエチル）プロパンジアミンのような添加物を含んでよい。
・サポニン（例えばＱｕｉｌＡまたはＱＳ２１）およびステロール（例えばコレステロール）が、らせん状ミセルとして会合しているエマルジョン［９７］。
・鉱油、非イオン親油性エトキシル化脂肪アルコールおよび非イオン親水性界面活性剤（例えばエトキシル化脂肪アルコールおよび／またはポリオキシエチレン−ポリオキシプロピレンブロックコポリマー）を含むエマルジョン［９８］。
・鉱油、非イオン親水性エトキシル化脂肪アルコールおよび非イオン親油性界面活性剤（例えばエトキシル化脂肪アルコールおよび／またはポリオキシエチレン−ポリオキシプロピレンブロックコポリマー）を含むエマルジョン［９８］。
いくつかの実施形態において、エマルジョンは、送達時に抗原と即席に混合してよく、よって、アジュバントおよび抗原は、使用時の最終的な処方のために準備された、パッケージまたは分配されたワクチンにおいて別々に保存され得る。その他の実施形態において、エマルジョンは、製造中に抗原と混合され、よって、組成物は、液体アジュバント添加形態でパッケージされる。抗原は、一般的に、ワクチンが２つの液体を混合することにより最終的に調製されるように水性の形態にある。混合するための２つの液体の容積比は変動し得る（例えば５：１〜１：５）が、一般的には約１：１である。成分の濃度が具体的なエマルジョンの上記の記載において示されている場合、これらの濃度は、典型的に、希釈されていない組成物についてのものであり、抗原溶液と混合した後の濃度は、よって、減少する。
組成物がトコフェロールを含む場合、α、β、γ、δ、εまたはξトコフェロールのいずれを用いることもできるが、α−トコフェロールが好ましい。トコフェロールは、いくつかの形態、例えば異なる塩および／または異性体をとることができる。塩は、コハク酸塩、酢酸塩、ニコチン酸塩などのような有機塩を含む。Ｄ−α−トコフェロールおよびＤＬ−α−トコフェロールの両方を用いることができる。トコフェロールは、有利には、高齢患者（例えば６０歳以上の年齢）用のワクチンに有利に含まれる。なぜなら、ビタミンＥは、この患者群における免疫応答に対して正の効果を有することが報告されているからである［９９］。これらは、エマルジョンを安定化する助けになり得る抗酸化特性も有する［１００］。好ましいα−トコフェロールは、ＤＬ−α−トコフェロールであり、このトコフェロールの好ましい塩は、コハク酸塩である。コハク酸塩は、インビボにおいてＴＮＦ関連リガンドと一緒に働くことが見出されている。
（Ｃ．サポニン処方物［参考文献８２の第２２章］）
サポニン処方物を、本発明においてアジュバントとして用いてもよい。サポニンは、広範囲の種の植物の樹皮、葉、茎、根および花でさえも見出されるステロールグリコシドおよびトリテルペノイドグリコシドの異質性の群である。Ｑｕｉｌｌａｉａ ｓａｐｏｎａｒｉａ Ｍｏｌｉｎａの木の樹皮からのサポニンは、アジュバントとして広く研究されている。サポニンは、Ｓｍｉｌａｘ ｏｒｎａｔａ（サルサパリラ（ｓａｒｓａｐｒｉｌｌａ））、Ｇｙｐｓｏｐｈｉｌｌａ ｐａｎｉｃｕｌａｔａ（ブライズヴェイル）およびＳａｐｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉａｎａｌｉｓ（ソープルート）から商業的に得ることもできる。サポニンアジュバント処方物は、ＱＳ２１のような精製処方物およびＩＳＣＯＭのような脂質処方物を含む。ＱＳ２１は、ＳｔｉｍｕｌｏｎＴＭとして市販されている。
サポニン組成物は、ＨＰＬＣおよびＲＰ−ＨＰＬＣを用いて精製されている。ＱＳ７、ＱＳ１７、ＱＳ１８、ＱＳ２１、ＱＨ−Ａ、ＱＨ−ＢおよびＱＨ−Ｃを含む、これらの技術を用いた具体的な精製画分が同定されている。好ましくは、サポニンはＱＳ２１である。ＱＳ２１の生成方法は、参考文献１０１に開示されている。サポニン処方物は、コレステロールのようなステロールも含んでよい［１０２］。
サポニンとコレステロールとの組み合わせを用いて、免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）と呼ばれる独特の粒子を形成できる［参考文献８２の第２３章］。ＩＳＣＯＭは、典型的には、ホスファチジルエタノールアミンまたはホスファチジルコリンのようなリン脂質も含む。任意の公知のサポニンを、ＩＳＣＯＭで用いることができる。好ましくは、ＩＳＣＯＭは、ＱｕｉｌＡ、ＱＨＡおよびＱＨＣの１または複数を含む。ＩＳＣＯＭは、参考文献１０２〜１０４にさらに記載されている。所望により、ＩＳＣＯＭＳは、さらなる洗浄剤を欠いていてよい［１０５］。
サポニンに基づくアジュバントの開発の概説は、参考文献１０６および１０７で見出すことができる。
（Ｄ．ビロソームおよびウイルス様粒子）
ビロソームおよびウイルス様粒子（ＶＬＰ）を、本発明においてアジュバントとして用いることもできる。これらの構造は、一般的に、所望によりリン脂質と組み合わされたかもしくはそれとともに処方されたウイルスからの１または複数のタンパク質を含有する。これらは、一般的に、非病原性で、非複製性であり、一般的に、いずれの天然ウイルスゲノムも含有しない。ウイルスタンパク質は、組換え生成されても、またはウイルス全体から単離されてもよい。ビロソームまたはＶＬＰで用いるために適切なこれらのウイルスタンパク質は、インフルエンザウイルス（例えばＨＡまたはＮＡ）、Ｂ型肝炎ウイルス（例えばコアまたはカプシドタンパク質）、Ｅ型肝炎ウイルス、麻疹ウイルス、シンドビスウイルス、ロタウイルス、口蹄疫ウイルス、レトロウイルス、ノーウォークウイルス、ヒトパピローマウイルス、ＨＩＶ、ＲＮＡファージ、Ｑβファージ（例えばコートタンパク質）、ＧＡファージ、ｆｒファージ、ＡＰ２０５ファージおよびＴｙ（例えばレトロトランスポゾンＴｙタンパク質ｐ１）に由来するタンパク質を含む。ＶＬＰは、参考文献１０８〜１１３においてさらに論じられている。ビロソームは、例えば参考文献１１４においてさらに論じられている。
（Ｅ．細菌または微生物誘導体）
本発明で用いるために適切なアジュバントは、腸内細菌リポ多糖（ＬＰＳ）の非毒性誘導体、リピドＡ誘導体、免疫刺激オリゴヌクレオチドならびにＡＤＰ−リボシル化毒素およびその解毒化誘導体のような細菌または微生物誘導体を含む。
ＬＰＳの非毒性誘導体は、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）および３−Ｏ−脱アシル化ＭＰＬ（３ｄＭＰＬ）を含む。３ｄＭＰＬは、４、５または６のアシル化された鎖を有する３脱−Ｏ−アシル化モノホスホリルリピドＡの混合物である。３脱−Ｏ−アシル化モノホスホリルリピドＡの好ましい「小粒子」の形態は、参考文献１１５に開示されている。３ｄＭＰＬのこのような「小粒子」は、０．２２μｍの膜を通して滅菌ろ過されるために十分小さい［１１５］。その他の非毒性ＬＰＳ誘導体は、アミノアルキルグルコサミニドホスフェート誘導体、例えばＲＣ−５２９のようなモノホスホリルリピドＡ模倣物を含む［１１６、１１７］。
リピドＡ誘導体は、ＯＭ−１７４のようなＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉからのリピドＡの誘導体を含む。ＯＭ−１７４は、例えば参考文献１１８および１１９に記載されている。
本発明においてアジュバントとして用いるために適切な免疫刺激オリゴヌクレオチドは、ＣｐＧモチーフ（リン酸結合によりグアノシンと連結された非メチル化シトシンを含有するジヌクレオチド配列）を含有するヌクレオチド配列を含む。２本鎖ＲＮＡおよびパリンドロームまたはポリ（ｄＧ）配列を含有するオリゴヌクレオチドも、免疫刺激性であることが示されている。
ＣｐＧは、ホスホロチオエート改変のようなヌクレオチド改変／類似体を含むことができ、２本鎖または１本鎖であり得る。参考文献１２０、１２１および１２２は、可能性のある類似体置換、例えば２’−デオキシ−７−デアザグアノシンでのグアノシンの置き換えを開示している。ＣｐＧオリゴヌクレオチドのアジュバント効果は、参考文献１２３〜１２８においてさらに論じられている。
ＣｐＧ配列は、モチーフＧＴＣＧＴＴまたはＴＴＣＧＴＴ［１２９］のようにＴＬＲ９に向けられることがある。ＣｐＧ配列は、ＣｐＧ−Ａ ＯＤＮのようにＴｈ１免疫応答を誘導するために特異的であり得るか、またはＣｐＧ−Ｂ ＯＤＮのようにＢ細胞応答を誘導するためにより特異的であり得る。ＣｐＧ−ＡおよびＣｐＧ−Ｂ ＯＤＮは、参考文献１３０〜１３２において論じられている。好ましくは、ＣｐＧは、ＣｐＧ−Ａ ＯＤＮである。
好ましくは、ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、受容体認識のために５’端が近付くことができるように構築されている。所望により、２つのＣｐＧオリゴヌクレオチド配列をそれらの３’端で付着させて、「イムノマー」を形成してよい。例えば、参考文献１２９および１３３〜１３５を参照されたい。
有用なＣｐＧアジュバントは、ＰｒｏＭｕｎｅＴＭ（Ｃｏｌｅｙ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｇｒｏｕｐ，Ｉｎｃ．）としても公知のＣｐＧ７９０９である。別のものは、ＣｐＧ１８２６である。ＣｐＧ配列を用いる代わりにまたはそれに加えて、ＴｐＧ配列を用いることができ［１３６］、これらのオリゴヌクレオチドは、非メチル化ＣｐＧモチーフを含まないことがある。免疫刺激オリゴヌクレオチドは、ピリミジンリッチであってよい。例えば、これは、１より多い連続チミジンヌクレオチド（例えば参考文献１３６に開示されるようなＴＴＴＴ）を含んでよく、かつ／またはこれは、＞２５％チミジン（例えば＞３５％、＞４０％、＞５０％、＞６０％、＞８０％など）を有するヌクレオチド組成を有してよい。例えば、これは、１より多い連続シトシンヌクレオチド（例えば参考文献１３６に開示されるようなＣＣＣＣ）を含んでよく、かつ／またはこれは、＞２５％シトシン（例えば＞３５％、＞４０％、＞５０％、＞６０％、＞８０％など）を有するヌクレオチド組成を有してよい。これらのオリゴヌクレオチドは、非メチル化ＣｐＧモチーフを含まないことがある。免疫刺激オリゴヌクレオチドは、典型的には、少なくとも２０ヌクレオチドを含む。これらは、１００未満のヌクレオチドを含んでよい。
免疫刺激オリゴヌクレオチドに基づく特に有用なアジュバントは、ＩＣ−３１ＴＭとして公知である［１３７］。よって、本発明で用いられるアジュバントは、（ｉ）少なくとも１つ（好ましくは複数）のＣｐＩモチーフ（すなわち、イノシンと連結されてジヌクレオチドを形成するシトシン）を含むオリゴヌクレオチド（例えば１５〜４０のヌクレオチド）と、（ｉｉ）少なくとも１つ（好ましくは複数）のＬｙｓ−Ａｒｇ−Ｌｙｓトリペプチド配列を含むオリゴペプチド（例えば５〜２０のアミノ酸）のようなポリカチオンポリマーとの混合物を含んでよい。オリゴヌクレオチドは、２６マーの配列５’−（ＩＣ）１３−３’（配列番号１７５）を含むデオキシヌクレオチドであってよい。ポリカチオンポリマーは、１１マーのアミノ酸配列ＫＬＫＬＬＬＬＬＫＬＫ（配列番号１７６）を含むペプチドであってよい。オリゴヌクレオチドおよびポリマーは、例えば参考文献１３８および１３９に開示されるように複合体を形成できる。
細菌ＡＤＰリボシル化毒素およびその解毒化誘導体は、本発明においてアジュバントとして用いてよい。好ましくは、タンパク質は、Ｅ．ｃｏｌｉ（Ｅ．ｃｏｌｉ熱不安定性エンテロトキシン「ＬＴ」）、コレラ（「ＣＴ」）または百日咳（「ＰＴ」）に由来する。解毒化ＡＤＰリボシル化毒素を粘膜アジュバントとして用いることは、参考文献１４０に記載され、非経口アジュバントとして用いることは、参考文献１４１に記載されている。毒素またはトキソイドは、好ましくは、ＡおよびＢのサブユニットをともに含むホロ毒素の形態にある。好ましくは、Ａサブユニットは解毒化変異を含有し、好ましくは、Ｂサブユニットは変異されていない。好ましくは、アジュバントは、ＬＴ−Ｋ６３、ＬＴ−Ｒ７２およびＬＴ−Ｇ１９２のような解毒化ＬＴ変異体である。アジュバントとしてＡＤＰリボシル化毒素およびその解毒化誘導体、特にＬＴ−Ｋ６３およびＬＴ−Ｒ７２を用いることは、参考文献１４２〜１４９で見出すことができる。有用なＣＴ変異体は、ＣＴ−Ｅ２９Ｈである［１５０］。アミノ酸置換についての数字の参照は、好ましくは、参考文献１５１（その全体が参照により本明細書に具体的に組み込まれている）に示されるＡＤＰリボシル化毒素のＡおよびＢサブユニットのアラインメントに基づく。
（Ｆ．ヒト免疫調節物質）
本発明においてアジュバントとして用いるために適切なヒト免疫調節物質は、インターロイキン（例えばＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−１２［１５２］など）［１５３］、インターフェロン（例えばインターフェロン−γ）、マクロファージコロニー刺激因子、および腫瘍壊死因子のようなサイトカインを含む。好ましい免疫調節物質は、ＩＬ−１２である。
（Ｇ．生体付着性物質（ｂｉｏａｄｈｅｓｉｖｅ）および粘膜付着性物質（ｍｕｃｏａｄｈｅｓｉｖｅ））
生体付着性物質および粘膜付着性物質も、本発明においてアジュバントとして用いてよい。適切な生体付着性物質は、エステル化ヒアルロン酸マイクロスフェア［１５４］、またはポリ（アクリル酸）、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、多糖類およびカルボキシメチルセルロースの架橋誘導体のような粘膜付着性物質を含む。キトサンおよびその誘導体も、本発明においてアジュバントとして用いてよい［１５５］。
（Ｈ．微小粒子）
微小粒子も、本発明においてアジュバントとして用いてよい。ポリ（ラクチド−ｃｏ−グリコリド）に加えて、生分解性で非毒性の物質（例えばポリ（α−ヒドロキシ酸）、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリ無水物、ポリカプロラクトンなど）で形成された微小粒子（すなわち直径約１００ｎｍ〜約１５０μｍ、より好ましくは直径約２００ｎｍ〜約３０μｍ、最も好ましくは直径約５００ｎｍ〜約１０μｍの粒子）が好ましく、これらは、所望により、負に荷電された表面（例えばＳＤＳで）または正に荷電された表面（例えばＣＴＡＢのようなカチオン洗浄剤で）を有するように処理される。
（Ｉ．リポソーム（参考文献８２の第１３および１４章））
アジュバントとして用いるために適切なリポソーム処方物の例は、参考文献１５６〜１５８に記載されている。
（Ｊ．ポリオキシエチレンエーテルおよびポリオキシエチレンエステル処方物）
本発明で用いるために適切なアジュバントは、ポリオキシエチレンエーテルおよびポリオキシエチレンエステルを含む［１５９］。このような処方物は、さらに、オクトキシノールと組み合わせたポリオキシエチレンソルビタンエステル界面活性剤［１６０］、およびオクトキシノールのような少なくとも１つの追加の非イオン界面活性剤と組み合わせたポリオキシエチレンアルキルエーテルまたはエステル界面活性剤［１６１］を含む。好ましいポリオキシエチレンエーテルは、以下の群から選択される：ポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル（ラウレス９）、ポリオキシエチレン−９−ステアリル（ｓｔｅｏｒｙｌ）エーテル、ポリオキシエチレン（ｐｏｌｙｏｘｙｔｈｅｙｌｅｎｅ）−８−ステアリルエーテル、ポリオキシエチレン−４−ラウリルエーテル、ポリオキシエチレン−３５−ラウリルエーテル、およびポリオキシエチレン−２３−ラウリルエーテル。
（Ｋ．ホスファゼン）
例えば参考文献１６２および１６３に記載されるようなポリ［ジ（カルボキシラトフェノキシ）ホスファゼン］（「ＰＣＰＰ」）のようなホスファゼンを用いてよい。
（Ｌ．ムラミルペプチド）
本発明においてアジュバントとして用いるために適切なムラミルペプチドの例は、Ｎ−アセチル−ムラミル−Ｌ−スレオニル−Ｄ−イソグルタミン（ｔｈｒ−ＭＤＰ）、Ｎ−アセチル−ノルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ｎｏｒ−ＭＤＰ）、およびＮ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミニル−Ｌ−アラニン−２−（１’−２’−ジパルミトイル−ｓｎ−グリセロ−３−ヒドロキシホスホリルオキシ）−エチルアミン（ＭＴＰ−ＰＥ）を含む。
（Ｍ．イミダゾキノロン化合物）
本発明においてアジュバントとして用いるために適切なイミダゾキノロン化合物の例は、イミキモド（「Ｒ−８３７」）［１６４、１６５］、レシキモド（「Ｒ−８４８」）［１６６］およびそれらの類似体、ならびにそれらの塩（例えば塩酸塩）を含む。免疫刺激イミダゾキノリンについてのさらなる詳細は、参考文献１６７〜１７１で見出すことができる。
（Ｎ．置換尿素）
アジュバントとして有用な置換尿素は、参考文献１７２に定義されるような式Ｉ、ＩＩもしくはＩＩＩの化合物、またはそれらの塩：
例えば「ＥＲ８０３０５８」、「ＥＲ８０３７３２」、「ＥＲ８０４０５３」、「ＥＲ８０４０５８」、「ＥＲ８０４０５９」、「ＥＲ８０４４４２」、「ＥＲ８０４６８０」、「ＥＲ８０４７６４」、「ＥＲ８０３０２２」または「ＥＲ８０４０５７」、例えば：
を含む。
（Ｏ．さらなるアジュバント）
本発明で用い得るさらなるアジュバントは、以下のものを含む。
・ＲＣ−５２９のようなアミノアルキルグルコサミニドリン酸誘導体［１７３、１７４］。
Ｓ．ａｕｒｅｕｓワクチン用の有用なアジュバントとして報告されている環状ジグアニル酸（「ｃ−ジ−ＧＭＰ」）［１７５］。
参考文献１７６に開示されているもののようなチオセミカルバゾン化合物。活性化合物についての処方、製造およびスクリーニングの方法も、参考文献１７６に記載される。チオセミカルバゾンは、ＴＮＦ−αのようなサイトカインの生成のためのヒト末梢血単核細胞の刺激において特に効果的である。
参考文献１７７に開示されているもののようなトリプタントリン化合物。活性化合物についての処方、製造およびスクリーニングの方法も、参考文献１７７に記載される。チオセミカルバゾンは、ＴＮＦ−αのようなサイトカインの生成のためのヒト末梢血単核細胞の刺激において特に効果的である。
・（ａ）イサトラビン（ＡＮＡ−２４５；７−チア−８−オキソグアノシン）：
およびそのプロドラッグ；（ｂ）ＡＮＡ９７５；（ｃ）ＡＮＡ−０２５−１；（ｄ）ＡＮＡ３８０；（ｅ）参考文献１７８〜１８０に開示されている化合物ロキソリビン（７−アリル−８−オキソグアノシン）［１８１］のようなヌクレオシド類似体。
・アシルピペラジン化合物、インドールジオン化合物、テトラヒドロイソキノリン（Ｔｅｔｒａｈｙｄｒａｉｓｏｑｕｉｎｏｌｉｎｅ）（ＴＨＩＱ）化合物、ベンゾシクロジオン化合物、アミノアザビニル化合物、アミノベンズイミダゾールキノリノン（ＡＢＩＱ）化合物［１８３、１８４］、ヒドラプタラミド（Ｈｙｄｒａｐｔｈａｌａｍｉｄｅ）化合物、ベンゾフェノン化合物、イソキサゾール化合物、ステロール化合物、キナジリノン（Ｑｕｉｎａｚｉｌｉｎｏｎｅ）化合物、ピロール化合物［１８５］、アントラキノン化合物、キノキサリン化合物、トリアジン化合物、ピラザロピリミジン（Ｐｙｒａｚａｌｏｐｙｒｉｍｉｄｉｎｅ）化合物およびベンザゾール化合物［１８６］を含む、参考文献１８２に開示されている化合物。
・ＴＬＲ４アンタゴニストＥ５５６４［１８７、１８８］のようなリン酸含有非環式骨格に連結された脂質を含有する化合物。
・ポリオキシドニウムポリマー［１８９、１９０］またはその他のＮ酸化ポリエチレン−ピペラジン誘導体。
・メチルイノシン５’−１リン酸（「ＭＩＭＰ」）［１９１］。
・式：
（式中、Ｒは、水素、直鎖もしくは分岐鎖で、非置換もしくは置換され、飽和もしくは不飽和のアシル、アルキル（例えばシクロアルキル）、アルケニル、アルキニルおよびアリール基を含む群から選択される）を有するもののようなポリヒドロキシル化ピロリジジン化合物［１９２］、またはその薬学的に許容される塩もしくは誘導体。その例は、それらに限定されないが、カスアリン、カスアリン−６−α−Ｄ−グルコピラノース、３−ｅｐｉ−カスアリン、７−ｅｐｉ−カスアリン、３，７−ジｅｐｉ−カスアリンなどを含む。
・α−グリコシルセラミド［１９３〜２００］（例えばα−ガラクトシルセラミド）、フィトスフィンゴシン含有α−グリコシルセラミド、ＯＣＨ、ＫＲＮ７０００［（２Ｓ，３Ｓ，４Ｒ）−１−Ｏ−（α−Ｄ−ガラクトピラノシル）−２−（Ｎ−ヘキサコサノイルアミノ）−１，３，４−オクタデカントリオール］、ＣＲＯＮＹ−１０１、３’’−Ｏ−スルホ−ガラクトシルセラミドなどのようなＣＤ１ｄリガンド。
・アルガムリンのようなガンマイヌリン［２０１］またはその誘導体。
（アジュバントの組み合わせ）
本発明は、上記で同定されるアジュバントの１または複数の組み合わせも含んでよい。例えば、以下のアジュバント組成物を、本発明において用いてよい：（１）サポニンと水中油型エマルジョン［２０２］；（２）サポニン（例えばＱＳ２１）＋非毒性ＬＰＳ誘導体（例えば３ｄＭＰＬ）［２０３］；（３）サポニン（例えばＱＳ２１）＋非毒性ＬＰＳ誘導体（例えば３ｄＭＰＬ）＋コレステロール；（４）サポニン（例えばＱＳ２１）＋３ｄＭＰＬ＋ＩＬ−１２（所望により＋ステロール）［２０４］；（５）３ｄＭＰＬと、例えばＱＳ２１および／または水中油型エマルジョンとの組み合わせ［２０５］；（６）サブミクロンのエマルジョンになるようにマイクロフルイダイズされたかまたはより大きい粒子サイズのエマルジョンを生じるようにボルテックスされた１０％スクアレン、０．４％Ｔｗｅｅｎ８０ＴＭ、５％プルロニック−ブロックポリマーＬ１２１およびｔｈｒ−ＭＤＰを含有するＳＡＦ、（７）２％スクアレン、０．２％Ｔｗｅｅｎ８０ならびにモノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、トレハロースジミコール酸（ＴＤＭ）および細胞壁骨格（ＣＷＳ）からなる群由来の１または複数の細菌細胞壁成分、好ましくはＭＰＬ＋ＣＷＳ（ＤｅｔｏｘＴＭ）を含有するＲｉｂｉＴＭアジュバント系（ＲＡＳ）（Ｒｉｂｉ Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍ）；ならびに（８）１または複数の無機塩（例えばアルミニウム塩）＋ＬＰＳの非毒性誘導体（例えば３ｄＭＰＬ）。
免疫刺激剤として作用するその他の物質は、参考文献８２の第７章に開示される。
水酸化アルミニウムおよび／またはリン酸アルミニウムアジュバントの使用は、特に好ましく、抗原は、一般的に、これらの塩に吸着される。リン酸カルシウムは、別の好ましいアジュバントである。その他の好ましいアジュバントの組み合わせは、ＣｐＧおよびａｌｕｍ、またはレシキモドおよびａｌｕｍのようなＴｈ１アジュバントおよびＴｈ２アジュバントの組み合わせを含む。リン酸アルミニウムと３ｄＭＰＬとの組み合わせを用いてよい。
本発明の組成物は、細胞媒介性免疫応答と体液性免疫応答をともに惹起し得る。この免疫応答は、好ましくは、長期持続性（例えば中和）抗体と、肺炎球菌への曝露に際して迅速に応答できる細胞媒介性免疫とを誘導する。
２つの型のＴ細胞、すなわちＣＤ４およびＣＤ８細胞は、一般的に、細胞媒介性免疫および体液性免疫を開始および／または増進するために必要であると考えられている。ＣＤ８ Ｔ細胞は、ＣＤ８共受容体を発現でき、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）と一般に呼ばれる。ＣＤ８ Ｔ細胞は、ＭＨＣクラスＩ分子上に提示される抗原を認識でき、またはそれと相互作用できる。
ＣＤ４ Ｔ細胞は、ＣＤ４共受容体を発現でき、Ｔヘルパー細胞と一般に呼ばれる。ＣＤ４ Ｔ細胞は、ＭＨＣクラスＩＩ分子と結合した抗原性ペプチドを認識できる。ＭＨＣクラスＩＩ分子との相互作用により、ＣＤ４細胞は、サイトカインのような因子を分泌できる。これらの分泌されたサイトカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、マクロファージおよび免疫応答に参加するその他の細胞を活性化できる。ヘルパーＴ細胞またはＣＤ４＋細胞は、２つの機能的に異なるサブセット、すなわちそれらのサイトカインおよびエフェクター機能が異なるＴＨ１表現型およびＴＨ２表現型にさらに分けることができる。
活性化ＴＨ１細胞は、細胞性免疫を増進し（抗原特異的ＣＴＬの生成の増加を含む）、よって、細胞内感染に対する応答において特に価値がある。活性化ＴＨ１細胞は、ＩＬ−２、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−βの１または複数を分泌し得る。ＴＨ１免疫応答は、マクロファージ、ＮＫ（ナチュラルキラー）細胞およびＣＤ８細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）を活性化することにより局所的炎症反応をもたらし得る。ＴＨ１免疫応答は、ＢおよびＴ細胞の増殖を、ＩＬ−１２を用いて刺激することにより免疫応答を拡大するように作用することもある。ＴＨ１刺激Ｂ細胞は、ＩｇＧ２ａを分泌し得る。
活性化ＴＨ２細胞は、抗体生成を増進し、よって、細胞外感染に対する応答において価値がある。活性化ＴＨ２細胞は、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６およびＩＬ−１０の１または複数を分泌し得る。ＴＨ２免疫応答は、ＩｇＧ１、ＩｇＥ、ＩｇＡおよび将来の防御のためのメモリーＢ細胞の生成をもたらし得る。
免疫応答の増進は、ＴＨ１免疫応答の増進およびＴＨ２免疫応答の増進の１または複数を含み得る。
ＴＨ１免疫応答は、ＣＴＬの増加、ＴＨ１免疫応答と関連するサイトカインの１もしくは複数（例えばＩＬ−２、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−β）の増加、活性化マクロファージの増加、ＮＫ活性の増加、またはＩｇＧ２ａの生成の増加の１または複数を含み得る。好ましくは、ＴＨ１免疫応答の増進は、ＩｇＧ２ａ生成の増加を含む。
ＴＨ１免疫応答は、ＴＨ１アジュバントを用いて惹起し得る。ＴＨ１アジュバントは、一般的に、アジュバントなしの抗原での免疫化と比べて、増加したレベルのＩｇＧ２ａ生成を惹起する。本発明で用いるために適切なＴＨ１アジュバントは、例えばサポニン処方物、ビロソームおよびウイルス様粒子、腸内細菌リポ多糖（ＬＰＳ）の非毒性誘導体、免疫刺激オリゴヌクレオチドを含んでよい。ＣｐＧモチーフを含有するオリゴヌクレオチドのような免疫刺激オリゴヌクレオチドは、本発明で用いるために好ましいＴＨ１アジュバントである。
ＴＨ２免疫応答は、ＴＨ２免疫応答と関連するサイトカインの１もしくは複数（例えばＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６およびＩＬ−１０）の増加、またはＩｇＧ１、ＩｇＥ、ＩｇＡおよびメモリーＢ細胞の生成の増加の１または複数を含み得る。好ましくは、ＴＨ２免疫応答の増進は、ＩｇＧ１生成の増加を含む。
ＴＨ２免疫応答は、ＴＨ２アジュバントを用いて惹起し得る。ＴＨ２アジュバントは、一般的に、アジュバントなしの抗原での免疫化と比べて、増加したレベルのＩｇＧ１生成を惹起する。本発明で用いるために適切なＴＨ２アジュバントは、例えば無機質含有組成物、油性エマルジョンならびにＡＤＰリボシル化毒素およびその解毒化誘導体を含む。アルミニウム塩のような無機質含有組成物は、本発明で用いるために好ましいＴＨ２アジュバントである。
好ましくは、本発明は、ＴＨ１アジュバントとＴＨ２アジュバントとの組み合わせを含む組成物を含む。好ましくは、このような組成物は、増進されたＴＨ１応答および増進されたＴＨ２応答を惹起し、すなわちアジュバントなしでの免疫化と比べて、ＩｇＧ１生成およびＩｇＧ２ａ生成の両方の生成の増加を惹起する。さらにより好ましくは、ＴＨ１アジュバントとＴＨ２アジュバントとの組み合わせを含む組成物は、単一アジュバントを用いる免疫化と比べて（すなわち、ＴＨ１アジュバントのみでの免疫化またはＴＨ２アジュバントのみでの免疫化と比べて）、ＴＨ１免疫応答の増加および／またはＴＨ２免疫応答の増加を惹起する。
免疫応答は、ＴＨ１免疫応答およびＴＨ２応答の一方または両方であってよい。好ましくは、免疫応答は、ＴＨ１応答の増進およびＴＨ２応答の増進の一方または両方をもたらす。
免疫応答の増進は、全身免疫応答および粘膜免疫応答の一方または両方であり得る。好ましくは、免疫応答は、全身免疫応答の増進および粘膜免疫応答の増進の一方または両方をもたらす。好ましくは、粘膜免疫応答は、ＴＨ２免疫応答である。好ましくは、粘膜免疫応答は、ＩｇＡの生成の増加を含む。
Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染は、体の種々の領域に影響でき、よって、本発明の組成物は、種々の形態で調製してよい。例えば、組成物は、液体溶液または懸濁物のいずれかとしての注射剤（ｉｎｊｅｃｔａｂｌｅ）として調製してよい。注射前に液体ビヒクルに溶解または懸濁するために適切な固体の形態も調製できる（例えば凍結乾燥組成物または噴霧凍結乾燥組成物）。組成物は、表面投与用に、例えば軟膏剤、クリームまたは粉末として調製してよい。組成物は、経口投与用に、例えば錠剤もしくはカプセル剤として、噴霧剤として、またはシロップ剤（所望により矯味矯臭して）として調製してよい。組成物は、肺投与用に、例えば微細粉末または噴霧剤を用いる吸入剤として調製してよい。組成物は、坐剤または膣坐剤として調製してよい。組成物は、鼻、耳または眼の投与用に、例えば滴剤として調製してよい。組成物は、組み合わせ組成物が、患者への投与の直前に再構成されるように設計されたキットの形態であってよい。このようなキットは、液体の形態の１または複数の抗原と、凍結乾燥された１または複数の抗原とを含んでよい。
組成物が使用前に即席で調製され（例えば成分が凍結乾燥された形態である場合）、かつキットである場合、キットは２つのバイアルを含んでも、１つの充填済み（ｒｅａｄｙ−ｆｉｌｌｅｄ）シリンジと１つのバイアルとを含んでもよく、シリンジの内容物は、注射前にバイアルの内容物を再活性化するために用いられる。
ワクチンとして用いられる免疫原性組成物は、免疫学的有効量の抗原（複数可）と、必要に応じて任意のその他の成分とを含む。「免疫学的有効量」により、単回用量または一連のものの一部のいずれかとしてその量を個体に投与することが、処置または予防のために効果的であることを意味する。この量は、処置される個体の健康および身体の状態、年齢、処置される個体の分類群（例えば非ヒト霊長類、霊長類など）、抗体を合成する個体の免疫系の能力、所望される防御の程度、ワクチンの処方、医学的状態についての処置医師の評価、およびその他の関連する因子に依存して変動する。この量は、日常的な試験により決定できる比較的広い範囲内にあると予測される。１より多い抗原が組成物に含まれる場合、２つの抗原は、互いに同じ用量または異なる用量で存在してよい。
上記のように、組成物は、温度保護剤を含んでよく、この成分は、アジュバント添加組成物（特にアルミニウム塩のような無機質アジュバントを含有するもの）において特に有用であり得る。参考文献２０６に記載されるように、液体の温度保護剤は、水性ワクチン組成物に加えて、その凝固点を低下させ、例えば凝固点を０℃未満に低減させてよい。よって、組成物は０℃未満であるがその凝固点より上で貯蔵でき、温度による分解を阻害できる。温度保護剤は、無機塩アジュバントを凍結および解凍の後の凝集または沈降から保護しながら組成物の凍結を可能にすることもでき、上昇した温度、例えば４０℃を超える温度にて組成物を保護することもできる。開始水性ワクチンおよび液体の温度保護剤は、液体の温度保護剤が、最終混合物の１〜８０容積％を形成するように混合してよい。適切な温度保護剤は、ヒトの投与について安全であり、水に容易に混和／可溶性であり、組成物中のその他の成分（例えば抗原およびアジュバント）に損傷を与えないものであるべきである。例として、グリセリン、プロピレングリコールおよび／またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）が含まれる。適切なＰＥＧは、２００〜２０，０００Ｄａの範囲の平均分子量を有してよい。好ましい実施形態において、ポリエチレングリコールは、約３００Ｄａの平均分子量を有し得る（「ＰＥＧ−３００」）。
本発明は、（ｉ）第１、第２、第３または第４抗原群から選択される１または複数の抗原と、（ｉｉ）温度保護剤とを含む免疫原性組成物を提供する。この組成物は、（ｉ）第１、第２、第３または第４抗原群から選択される１または複数の抗原を含む水性組成物を、（ｉｉ）温度保護剤と混合することにより形成してよい。混合物は、次いで、例えば０℃未満、０〜２０℃、２０〜３５℃、３５〜５５℃またはそれより高くで貯蔵してよい。これは、液体または凍結した形態で貯蔵してよい。混合物は、凍結乾燥してよい。組成物は、代わりに、（ｉ）第１、第２、第３または第４抗原群から選択される１または複数の抗原を含む乾燥組成物を、（ｉｉ）温度保護剤を含む液体組成物と混合することにより形成してよい。よって、成分（ｉｉ）は、成分（ｉ）を再構成するために用いることができる。
（処置方法およびワクチンの投与）
本発明は、本発明の組成物の有効量を投与するステップを含む、哺乳動物における免疫応答を高める方法も提供する。免疫応答は、好ましくは防御的であり、好ましくは、抗体および／または細胞媒介性免疫を伴う。方法は、追加免疫応答を高め得る。
本発明は、例えば哺乳動物における免疫応答を高めることにおいて用いるための医薬品として組み合わせて使用するための本発明の少なくとも２つの抗原も提供する。
本発明は、哺乳動物における免疫応答を高めるための医薬品の製造における、本発明の少なくとも２つの抗原の使用も提供する。
これらの使用および方法により哺乳動物において免疫応答を高めることにより、哺乳動物を、院内感染を含むＳ．ａｕｒｅｕｓ感染に対して防御することができる。より具体的には、哺乳動物を、皮膚感染、肺炎、髄膜炎、骨髄炎、心内膜炎、毒素ショック症候群および／または敗血症に対して防御できる。
本発明は、第１成分と第２成分とを含むキットであって、第１成分も第２成分も上記の本発明の組成物ではないが、第１成分と第２成分とを組み合わせて上記の本発明の組成物を提供できるキットも提供する。キットは、以下の１または複数を含む第３成分をさらに含んでよい：使用説明書、シリンジもしくはその他の送達デバイス、アジュバントまたは薬学的に許容される処方溶液。
本発明は、本発明の免疫原性組成物が予め充填された送達デバイスも提供する。
哺乳動物は、好ましくはヒトである。ワクチンが予防用である場合、ヒトは、好ましくは、小児（例えば幼児または乳児）または１０代の若者であり、ワクチンが治療用である場合、ヒトは好ましくは１０代の若者または成人である。小児用を意図するワクチンは、例えば安全性、投与量、免疫原性などを評価するために、成人に投与してもよい。本発明に従って有用に免疫化できるその他の哺乳動物は、ウシ、イヌ、ウマおよびブタである。
治療処置の効力を確認するためのある方法は、本発明の組成物の投与後のＳ．ａｕｒｅｕｓ感染をモニタリングすることである。予防処置の効力を確認するためのある方法は、本発明の組成物中の抗原に対する全身（例えばＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａ生成のレベルをモニタリングする）および／または粘膜（例えばＩｇＡ生成のレベルをモニタリングする）の免疫応答を、組成物の投与後にモニタリングすることを含む。典型的には、抗原特異的血清抗体応答は、免疫化後であるがチャレンジ前に決定され、一方、抗原特異的粘膜抗体応答は、免疫化後であってチャレンジ後に決定される。
本発明の組成物の免疫原性を評価するための別の方法は、患者の血清もしくは粘膜分泌物をイムノブロットおよび／またはマイクロアレイによりスクリーニングするためにタンパク質を組換え発現させることである。タンパク質と患者試料との間の陽性の反応は、患者が、問題のタンパク質に対する免疫応答を開始したことを示す。この方法は、免疫優性抗原および／または抗原内のエピトープを同定するために用いてもよい。
ワクチン組成物の効力は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染の動物モデル、例えばモルモットまたはマウスを、ワクチン組成物を用いてチャレンジすることによりインビボで決定することもできる。特に、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染症の研究のための３つの有用な動物モデルが存在し、すなわちこれらは、（ｉ）マウス膿瘍モデル［２０７］、（ｉｉ）マウス致死感染モデル［２０７］および（ｉｉｉ）マウス肺炎モデル［２０８］である。膿瘍モデルは、静脈内チャレンジ後のマウス腎臓における膿瘍を観察する。致死感染モデルは、通常致死量のＳ．ａｕｒｅｕｓを静脈内または腹腔内経路により感染させた後に生存するマウスの数を観察する。肺炎モデルも生存率を観察するが、鼻内感染を用いる。有用なワクチンは、これらのモデルの１または複数において効果があることがある。例えば、いくつかの臨床状況において、血液による拡散を防ぐかまたはオプソニン作用を促進する必要なく、肺炎に対して防御することが望まれることがある。別の状況において、血液による拡散を防ぐことが主に望まれることがある。様々な抗原および様々な抗原の組み合わせは、効果的なワクチンの様々な態様に寄与し得る。
本発明の組成物は、一般的に、患者に直接投与される。直接送達は、非経口注射（例えば皮下、腹腔内、静脈内、筋肉内または組織の間質腔へ）、または直腸、経口（例えば錠剤、噴霧剤）、膣、表面、経皮（ｔｒａｎｓｄｅｒｍａｌ）もしくは経皮（ｔｒａｎｓｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、鼻内、眼、耳、肺もしくはその他の粘膜投与のような粘膜投与により達成してよい。
本発明は、全身および／または粘膜免疫を惹起するため、好ましくは増進された全身および／または粘膜免疫を惹起するために用いてよい。
好ましくは、全身および／または粘膜免疫の増進は、ＴＨ１および／またはＴＨ２免疫応答の増進に反映される。好ましくは、免疫応答の増進は、ＩｇＧ１および／またはＩｇＧ２ａおよび／またはＩｇＡの生成の増加を含む。
投薬は、単回用量計画または複数回用量計画によるものであり得る。複数回用量は、一次免疫化計画および／または追加免疫化計画で用い得る。複数回用量計画において、種々の用量を、同じまたは異なる経路により与えてよく、例えば非経口による一次免疫と粘膜による追加免疫、粘膜による一次免疫と非経口による追加免疫などである。複数回用量は、典型的には、少なくとも１週間隔てて投与される（例えば約２週間、約３週間、約４週間、約６週間、約８週間、約１０週間、約１２週間、約１６週間など）。
本発明に従って調製されるワクチンは、小児および成人の両方を処置するために用いてよい。よって、ヒト患者は、１歳未満、１〜５歳、５〜１５歳、１５〜５５歳または少なくとも５５歳であってよい。ワクチンを受ける好ましい患者は、老人（例えば≧５０歳、≧６０歳、好ましくは≧６５歳）、年少者（例えば≦５歳）、入院患者、医療従事者、軍隊および軍人、妊娠している女性、慢性の病人または免疫不全患者である。しかし、ワクチンは、これらの群にのみ適するのではなく、集団においてより一般的に用いられることがある。
本発明により製造されるワクチンは、その他のワクチンと実質的に同時に（例えば医療専門家またはワクチン接種センターへの同じ医療相談または訪問中に）、例えば、インフルエンザワクチン、麻疹ワクチン、流行性耳下腺炎ワクチン、風疹ワクチン、ＭＭＲワクチン、水痘ワクチン、ＭＭＲＶワクチン、ジフテリアワクチン、破傷風ワクチン、百日咳ワクチン、ＤＴＰワクチン、結合体型Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ ｂ型ワクチン、不活化ポリオウイルスワクチン、Ｂ型肝炎ウイルスワクチン、髄膜炎菌結合体ワクチン（例えば４価Ａ−Ｃ−Ｗ１３５−Ｙワクチン）、ＲＳウイルスワクチンなどと実質的に同時に患者に投与してよい。共投与（ｃｏ−ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）のために適切なさらなる非ブドウ球菌ワクチンは、参考文献５１の第３３〜４６頁に列挙される１または複数の抗原を含み得る。
（核酸免疫化）
上記の免疫原性組成物は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓからのポリペプチド抗原を含む。しかし、全ての場合において、ポリペプチド抗原は、これらのポリペプチドをコードする核酸（典型的にはＤＮＡ）で置き換えて、核酸免疫化に基づく組成物、方法および使用をもたらすことができる。核酸免疫化は、現在では、発展した分野である（例えば参考文献２０９〜２１６などを参照されたい）。
免疫原をコードする核酸は、患者に送達された後にインビボにおいて発現し、発現した免疫原が、次いで、免疫系を刺激する。活性成分は、典型的には、（ｉ）プロモーターと、（ｉｉ）プロモーターに作動可能に連結した免疫原をコードする配列と、所望により（ｉｉｉ）選択マーカーとを含む核酸ベクターの形態をとる。好ましいベクターは、（ｉｖ）複製起点と、（ｖ）（ｉｉ）の下流であって（ｉｉ）に作動可能に連結した転写ターミネーターとをさらに含んでよい。一般的に、（ｉ）および（ｖ）は真核生物のものであり、（ｉｉｉ）および（ｉｖ）は原核生物のものである。
好ましいプロモーターは、例えばサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）からのウイルスプロモーターである。ベクターは、プロモーターに加えて転写調節配列（例えばエンハンサー）も含んでよく、これは、プロモーターと機能的に相互作用する。好ましいベクターは、前初期ＣＭＶエンハンサー／プロモーターを含み、より好ましいベクターは、ＣＭＶイントロンＡも含む。プロモーターは、免疫原をコードする下流配列に作動可能に連結して、免疫原をコードする配列の発現がプロモーターの制御下になるようにする。
マーカーを用いる場合、これは、好ましくは、微生物宿主内（例えば原核生物内、細菌内、酵母内）で機能する。マーカーは、好ましくは、原核生物選択マーカー（例えば原核生物プロモーターの制御下で転写される）である。簡便のために、典型的なマーカーは、抗生物質耐性遺伝子である。
本発明のベクターは、好ましくは、プラスミドのような自己複製エピソームまたは染色体外ベクターである。
本発明のベクターは、好ましくは、複製起点を含む。複製起点は、原核生物内で活性であるが、真核生物内で活性でないことが好ましい。
よって、好ましいベクターは、ベクターの選択のための原核生物マーカーと、原核生物の複製起点と、免疫原をコードする配列の転写を駆動する真核生物のプロモーターとを含む。ベクターは、よって、（ａ）ポリペプチドを発現することなく原核生物宿主において増幅されて選択されるが、（ｂ）増幅されることなく真核生物宿主において発現される。この構成は、核酸免疫化ベクターについて理想的である。
本発明のベクターは、コード配列の下流に真核生物の転写ターミネーター配列を含んでよい。これは、転写レベルを増進できる。コード配列がそれ自体のものを有さない場合、本発明のベクターは、好ましくは、ポリアデニル化配列を含む。好ましいポリアデニル化配列は、ウシ増殖ホルモンからである。
本発明のベクターは、マルチクローニング部位を含んでよい。
免疫原およびマーカーをコードする配列に加えて、ベクターは、第２真核生物コード配列を含んでよい。ベクターは、上記の第２配列の上流にＩＲＥＳも含むことにより、免疫原と同じ転写産物からの第２真核生物ポリペプチドの翻訳を許容することもできる。代わりに、免疫原コード配列が、ＩＲＥＳの下流にあってよい。
本発明のベクターは、非メチル化ＣｐＧモチーフ、例えば２つの５’プリンと２つの３’ピリミジンとに挟まれた、グアノシンの前にシトシンを共通して有する非メチル化ＤＮＡ配列を含んでよい。これらの非メチル化形態において、これらのＤＮＡモチーフは、いくつかの型の免疫細胞の効力のある刺激物質であることが証明されている。
ベクターは、標的化様式で送達してよい。受容体媒介ＤＮＡ送達技術が、例えば参考文献２１７〜２２２に記載されている。核酸を含有する治療組成物は、遺伝子治療プロトコールにおける局所投与のために約１００ｎｇ〜約２００ｍｇの範囲のＤＮＡで投与される。約５００ｎｇ〜約５０ｍｇ、約１μｇ〜約２ｍｇ、約５μｇ〜約５００μｇ、および約２０μｇ〜約１００μｇのＤＮＡの濃度範囲を、遺伝子治療プロトコール中に用いることもできる。作用の方法（例えばコードされる遺伝子産物のレベルを増進または阻害するための）ならびに形質転換および発現の効力のような因子は、最終的な効力のために要求される投与量に影響する、考慮すべき事項である。組織のより大きい領域にわたってより高い発現が所望される場合、ベクターのより多い量、または連続的投与プロトコールにおいて再投与される同じ量、または様々な近接もしくは近い組織部分への数回の投与が、正の治療転帰をもたらすために要求され得る。全ての場合において、臨床試験における日常的な実験が、最適な治療効果の特定の範囲を決定する。
ベクターは、遺伝子送達ビヒクルを用いて送達できる。遺伝子送達ビヒクルは、ウイルスまたは非ウイルスの起源のものであり得る（一般的に、参考文献２２３〜２２６を参照されたい）。
所望の核酸の送達および所望の細胞における発現のためのウイルスに基づくベクターは、当該技術分野において周知である。例示的なウイルスに基づくビヒクルは、それらに限定されないが、組換えレトロウイルス（例えば参考文献２２７〜２３７）、アルファウイルスに基づくベクター（例えばシンドビスウイルスベクター、セムリキ森林ウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−６７；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２４７）、ロスリバーウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−３７３；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２４６）およびベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＡＴＣＣ
ＶＲ−９２３；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２５０；ＡＴＣＣ ＶＲ１２４９；ＡＴＣＣ ＶＲ−５３２）；これらのウイルスのハイブリッドまたはキメラも用いてよい）、ポックスウイルスベクター（例えばワクシニア、鶏痘、カナリアポックス、改変ワクシニアＡｎｋａｒａなど）、アデノウイルスベクター、およびアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターを含む（例えば参考文献２３８〜２４３を参照されたい）。不活化（ｋｉｌｌｅｄ）アデノウイルスと連結されたＤＮＡ［２４４］の投与も用いることができる。
それらに限定されないが、不活化アデノウイルスのみに連結されたかまたは連結されていないポリカチオン凝縮ＤＮＡ［例えば２４４］、リガンド連結ＤＮＡ［２４５］、真核細胞送達ビヒクル細胞［例えば参考文献２４６〜２５０］および核電荷中和または細胞膜との融合を含む非ウイルス送達ビヒクルおよび方法も用いることができる。裸のＤＮＡも用いることができる。例示的な裸のＤＮＡ導入方法は、参考文献２５１および２５２に記載されている。遺伝子送達ビヒクルとして作用できるリポソーム（例えばイムノリポソーム）は、参考文献２５３〜２５７に記載されている。さらなるアプローチは、参考文献２５８および２５９に記載されている。
用いるために適切なさらなる非ウイルス送達は、参考文献２５９に記載されているアプローチのような機械的送達系を含む。さらに、コード配列およびその発現の生成物は、光重合されたヒドロゲル物質の堆積または電離放射線の使用により送達できる［例えば参考文献２６０および２６１］。コード配列を送達するために用いることができる遺伝子送達のためのその他の従来の方法は、例えば、手持ち式遺伝子移入粒子銃（ｈａｎｄ−ｈｅｌｄ ｇｅｎｅ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｐａｒｔｉｃｌｅ ｇｕｎ）の使用［２６２］または移入された遺伝子を活性化するための電離放射線の使用［２６０および２６１］を含む。
ＰＬＧ｛ポリ（ラクチド−ｃｏ−グリコリド）｝微小粒子を用いる送達ＤＮＡは、例えば微小粒子への吸着による特に好ましい方法であり、これらの微小粒子は、所望により、負に荷電された表面（例えばＳＤＳで処理される）または正に荷電された表面（例えばＣＴＡＢのようなカチオン洗浄剤で処理される）を有するように処理される。
（Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）
本発明はＳ．ａｕｒｅｕｓに焦点を当てるが、本発明者らは、ｓｔａ００６およびｓｔａ０１１抗原が、Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓに相同体を有することも認識している。例えば、配列番号２３４は、配列番号４２（ｓｔａ００６）と７３％の同一性を有する、Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ Ｍ２３８６４：Ｗ１株からの「鉄（Ｆｅ＋３）ＡＢＣスーパーファミリーＡＴＰ結合カセットトランスポーター、結合タンパク質」であり、配列番号２３５は、配列番号４７（ｓｔａ０１１）と６７％の同一性を有する、Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ ＲＰ６２Ａ株からの「推定リポタンパク質」である。
Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓは、ヒトの皮膚上に通常存在し、時折病気の原因となり得る。感染は、通常、カテーテルのような医療デバイスと関連し、院内感染の原因である。Ｓ．ａｕｒｅｕｓに対するｓｔａ００６およびｓｔａ０１１についての本明細書に開示する結果は、Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓにおける相同タンパク質が、この病原体に対する免疫化のために有用であり得ることを示唆する。
本発明は、
（ｉ）（ａ）配列番号２３４と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２３４の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド、および／または
（ｉｉ）（ａ）配列番号２３５と５０％以上の同一性（例えば６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％以上）を有し、かつ／もしくは（ｂ）配列番号２３５の少なくとも「ｎ」連続アミノ酸の断片（ここで、「ｎ」は、７以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０以上）である）を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド
を含む免疫原性組成物を提供する。
組成物は、アジュバントも含んでよい。これらの組成物は、Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ感染に対して哺乳動物（ヒトを含む）を免疫化するために特に有用である。
（ｂ）の好ましい断片は、それぞれ配列番号２３４または２３５からのエピトープを含む。その他の好ましい断片は、配列番号２３４／２３５のＣ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）および／またはＮ末端から１または複数のアミノ酸（例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５以上）を欠失しているが、配列番号２３４／２３５の少なくとも１つのエピトープを保持している。
より一般的には、本発明は、任意のＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ種からのｓｔａ００６および／またはｓｔａ０１１相同体の、その種に対して哺乳動物を免疫化するための使用を提供する。
（抗体）
Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗原に対する抗体は、受動免疫のために用いることができる。よって、本発明は、第１、第２、第３または第４抗原群の抗原に特異的である抗体を提供する。本発明は、治療におけるこのような抗体の使用も提供する。本発明は、医薬品の製造におけるこのような抗体の使用も提供する。本発明は、有効量の本発明の抗体を投与するステップを含む、哺乳動物を処置する方法も提供する。免疫原性組成物について上で述べたように、これらの方法および使用は、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染に対して哺乳動物を防御することを可能にする。
「抗体」との用語は、インタクトな免疫グロブリン分子、および抗原と結合できるその断片を含む。これらは、ハイブリッド（キメラ）抗体分子［２６３、２６４］；Ｆ（ａｂ’）２およびＦ（ａｂ）断片ならびにＦｖ分子；非共有結合ヘテロダイマー［２６５、２６６］；単鎖Ｆｖ分子（ｓＦｖ）［２６７］；ダイマーおよびトリマー抗体断片構築物；ミニボディ［２６８、２６９］；ヒト化抗体分子［２７０〜２７２］；ならびにこのような分子から得られる任意の機能的断片、ならびにファージディスプレイのような慣用的ではないプロセスにより得られる抗体を含む。好ましくは、抗体は、モノクローナル抗体である。モノクローナル抗体を得る方法は、当該技術分野において周知である。ヒト化または完全ヒト抗体が好ましい。
（全般）
本発明の実施は、そうでないと記載しない限り、当該技術分野の範囲内である化学、生化学、分子生物学、免疫学および薬理学の従来の方法を用いる。このような技術は、文献に詳細に説明されている。例えば参考文献２７３〜２８０などを参照されたい。
「ＧＩ」番号付けを上記で用いている。ＧＩ番号または「ＧｅｎＩｎｆｏ識別子」は、そのデータベースに配列が加えられた場合に、ＮＣＢＩにより処理されるそれぞれの記録された配列に連続的に割り当てられる一連の数字である。ＧＩ番号は、記録された配列のアクセッション番号に対して類似性はない。配列がアップデートされたとき（例えば修正のため、またはさらなるアノテーションもしくは情報を加えるため）に、新しいＧＩ番号が与えられる。よって、与えられたＧＩ番号に付随する配列は、決して変更されない。
本発明が「エピトープ」に関する場合、このエピトープは、Ｂ細胞エピトープおよび／またはＴ細胞エピトープであってよい。このようなエピトープは、経験的に同定できる（例えばＰＥＰＳＣＡＮ［２８１、２８２］または類似の方法を用いて）か、またはこれは予想できる（例えばＪａｍｅｓｏｎ−Ｗｏｌｆ抗原インデックス［２８３］、マトリックスに基づくアプローチ［２８４］、ＭＡＰＩＴＯＰＥ［２８５］、ＴＥＰＩＴＯＰＥ［２８６、２８７］、ニューラルネットワーク［２８８］、ＯｐｔｉＭｅｒ＆ＥｐｉＭｅｒ［２８９、２９０］、ＡＤＥＰＴ［２９１］、Ｔｓｉｔｅｓ［２９２］、親水性［２９３］、抗原インデックス［２９４］または参考文献２９５〜２９９に開示される方法などを用いて）。エピトープは、抗体またはＴ細胞受容体の抗原結合部位により認識され、それと結合する抗原の部分であり、これらは、「抗原決定基」と呼ぶこともできる。
抗原「ドメイン」が取り除かれる場合、このことは、シグナルペプチド、細胞質ドメイン、膜貫通ドメイン、細胞外ドメインなどが取り除かれることを含み得る。
用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」および「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ）」を包含し、例えばＸを「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」組成物は、Ｘのみからなり得るか、または何か追加のもの、例えばＸ＋Ｙを含み得る。
数値ｘに関する「約」との用語は、任意選択であり、例えばｘ±１０％を意味する。
２つのアミノ酸配列間のパーセンテージ配列同一性についての言及は、アラインメントさせたときに、アミノ酸のそのパーセンテージが、２つの配列の比較において同じであることを意味する。このアラインメントおよびパーセント相同性または配列同一性は、当該技術分野において公知のソフトウェアプログラム、例えば参考文献３００の７．７．１８節に記載されるものを用いて決定できる。好ましいアラインメントは、１２のギャップオープンペナルティおよび２のギャップ伸長ペナルティ、６２のＢＬＯＳＵＭマトリックスでのアフィンギャップ検索を用いるＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムにより決定される。Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムは、参考文献３０１に開示されている。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
抗原の組み合わせを含む免疫原性組成物であって、上記組み合わせは、（１）ｓｔａ００６抗原；（２）ｓｔａ０１１抗原；（３）ｅｓｘＡ抗原；（４）ｅｓｘＢ抗原；（５）ｈｌａ抗原；（６）ｅｂｐＳ抗原；（７）ｅｆｂ抗原；（８）ｅｍｐ抗原；（９）ｅｓａＣ抗原；（１０）ｃｏＡ抗原；（１１）ｅａｐ抗原；（１２）ＦｎＢＡ抗原；（１３）ＦｎＢＢ抗原；（１４）ｅｂｈＡ抗原；（１５）ｈｌｇＢ抗原；（１６）ｈｌｇＣ抗原；（１７）ｉｓｄＡ抗原；（１８）ｉｓｄＢ抗原；（１９）ｉｓｄＣ抗原；（２０）ｉｓｄＧ抗原；（２１）ｉｓｄＨ抗原；（２２）ｉｓｄＩ抗原；（２３）ｌｕｋＤ抗原；（２４）ｌｕｋＥ抗原；（２５）ｌｕｋＦ抗原；（２６）ｌｕｋＳ抗原；（２７）ｎｕｃ抗原；（２８）ｓａｓＡ抗原；（２９）ｓａｓＢ抗原；（３０）ｓａｓＣ抗原；（３１）ｓａｓＤ抗原；（３２）ｓａｓＦ抗原；（３３）ｓｄｒＣ抗原；（３４）ｓｄｒＤ抗原；（３５）ｓｄｒＥ２抗原；（３６）ｓｐａ抗原；（３７）ｃｌｆＡ抗原；（３８）ｃｌｆＢ抗原；（３９）ｓｔａ００１抗原；（４０）ｓｔａ００２抗原；（４１）ｓｔａ００３抗原；（４２）ｓｔａ００４抗原；（４３）ｓｔａ００５抗原；（４４）ｓｔａ００７抗原；（４５）ｓｔａ００８抗原；（４６）ｓｔａ００９抗原；（４７）ｓｔａ０１０抗原；（４８）ｓｔａ０１２抗原；（４９）ｓｔａ０１３抗原；（５０）ｓｔａ０１４抗原；（５１）ｓｔａ０１５抗原；（５２）ｓｔａ０１６抗原；（５３）ｓｔａ０１７抗原；（５４）ｓｔａ０１８抗原；（５５）ｓｔａ０１９抗原；（５６）ｓｔａ０２０抗原；（５７）ｓｔａ０２１抗原；（５８）ｓｔａ０２２抗原；（５９）ｓｔａ０２３抗原；（６０）ｓｔａ０２４抗原；（６１）ｓｔａ０２５抗原；（６２）ｓｔａ０２６抗原；（６３）ｓｔａ０２７抗原；（６４）ｓｔａ０２８抗原；（６５）ｓｔａ０２９抗原；（６６）ｓｔａ０３０抗原；（６７）ｓｔａ０３１抗原；（６８）ｓｔａ０３２抗原；（６９）ｓｔａ０３３抗原；（７０）ｓｔａ０３４抗原；（７１）ｓｔａ０３５抗原；（７２）ｓｔａ０３６抗原；（７３）ｓｔａ０３７抗原；（７４）ｓｔａ０３８抗原；（７５）ｓｔａ０３９抗原；（７６）ｓｔａ０４０抗原；（７７）ｓｔａ０４１抗原；（７８）ｓｔａ０４２抗原；（７９）ｓｔａ０４３抗原；（８０）ｓｔａ０４４抗原；（８１）ｓｔａ０４５抗原；（８２）ｓｔａ０４６抗原；（８３）ｓｔａ０４７抗原；（８４）ｓｔａ０４８抗原；（８５）ｓｔａ０４９抗原；（８６）ｓｔａ０５０抗原；（８７）ｓｔａ０５１抗原；（８８）ｓｔａ０５２抗原；（８９）ｓｔａ０５３抗原；（９０）ｓｔａ０５４抗原；（９１）ｓｔａ０５５抗原；（９２）ｓｔａ０５６抗原；（９３）ｓｔａ０５７抗原；（９４）ｓｔａ０５８抗原；（９５）ｓｔａ０５９抗原；（９６）ｓｔａ０６０抗原；（９７）ｓｔａ０６１抗原；（９８）ｓｔａ０６２抗原；（９９）ｓｔａ０６３抗原；（１００）ｓｔａ０６４抗原；（１０１）ｓｔａ０６５抗原；（１０２）ｓｔａ０６６抗原；（１０３）ｓｔａ０６７抗原；（１０４）ｓｔａ０６８抗原；（１０５）ｓｔａ０６９抗原；（１０６）ｓｔａ０７０抗原；（１０７）ｓｔａ０７１抗原；（１０８）ｓｔａ０７２抗原；（１０９）ｓｔａ０７３抗原；（１１０）ｓｔａ０７４抗原；（１１１）ｓｔａ０７５抗原；（１１２）ｓｔａ０７６抗原；（１１３）ｓｔａ０７７抗原；（１１４）ｓｔａ０７８抗原；（１１５）ｓｔａ０７９抗原；（１１６）ｓｔａ０８０抗原；（１１７）ｓｔａ０８２抗原；（１１８）ｓｔａ０８３抗原；（１１９）ｓｔａ０８４抗原；（１２０）ｓｔａ０８５抗原；（１２１）ｓｔａ０８６抗原；（１２２）ｓｔａ０８７抗原；（１２３）ｓｔａ０８８抗原；（１２４）ｓｔａ０８９抗原；（１２５）ｓｔａ０９０抗原；（１２６）ｓｔａ０９１抗原；（１２７）ｓｔａ０９２抗原；（１２８）ｓｔａ０９３抗原；（１２９）ｓｔａ０９４抗原；（１３０）ｓｔａ０９５抗原；（１３１）ｓｔａ０９６抗原；（１３２）ｓｔａ０９７抗原；（１３３）ｓｔａ０９８抗原；（１３４）ｓｔａ０９９抗原；（１３５）ｓｔａ１００抗原；（１３６）ｓｔａ１０１抗原；（１３７）ｓｔａ１０２抗原；（１３８）ｓｔａ１０３抗原；（１３９）ｓｔａ１０４抗原；（１４０）ｓｔａ１０５抗原；（１４１）ｓｔａ１０６抗原；（１４２）ｓｔａ１０７抗原；（１４３）ｓｔａ１０８抗原；（１４４）ｓｔａ１０９抗原；（１４５）ｓｔａ１１０抗原；（１４６）ｓｔａ１１１抗原；（１４７）ｓｔａ１１２抗原；（１４８）ｓｔａ１１３抗原；（１４９）ｓｔａ１１４抗原；（１５０）ｓｔａ１１５抗原；（１５１）ｓｔａ１１６抗原；（１５２）ｓｔａ１１７抗原；（１５３）ｓｔａ１１８抗原；（１５４）ｓｔａ１１９抗原；（１５５）ｓｔａ１２０抗原；（１５６）ＮＷ＿６抗原；（１５７）ＮＷ＿９抗原；（１５８）ＮＷ＿１０抗原；（１５９）ＮＷ＿７抗原；（１６０）ＮＷ＿８抗原；（１６１）ＮＷ＿２抗原；（１６２）ＮＷ＿１抗原；（１６３）ｓｔａ０８１抗原；および（１６４）ＮＷ＿５抗原からなる群より選択される２以上の抗原を含む、組成物。
（項目２）
番号（３）〜（３８）から選択される少なくとも１つの抗原、ならびに、番号（１）、（２）および（３７）〜（１４９）から選択される少なくとも１つの抗原を含む、項目１に記載の組成物。
（項目３）
番号（３７）、（３８）、（８）、（９）、（３）、（４）、（５）、（１７）、（１８）、（１９）、（３１）、（３２）、（３３）、（３４）、（３５）および（３６）から選択される少なくとも１つの抗原、ならびに、（４０）、（１）、（４３）、（２）、（６４）、（９６）、（１３３）および（１４７）から選択される少なくとも１つの抗原を含む、項目２に記載の組成物。
（項目４）
（１）ｃｌｆＡ抗原；（２）ｃｌｆＢ抗原；（３）ｓｄｒＥ２抗原；（４）ｓｄｒＣ抗原；（５）ＳａｓＦ抗原；（６）ｅｍｐ抗原；（７）ｓｄｒＤ抗原；（８）ｓｐａ抗原；（９）ｅｓａＣ抗原；（１０）ｅｓｘＡ抗原；（１１）ｅｓｘＢ抗原；（１２）ｓｔａ００６抗原；（１３）ｉｓｄＣ抗原；（１４）ｈｌａ抗原；（１５）ｓｔａ０１１抗原；（１６）ｉｓｄＡ抗原；（１７）ｉｓｄＢ抗原；（１８）ｓａｓＦ抗原からなる群より選択される２以上の抗原を含む、項目１に記載の組成物。
（項目５）
（１）ｅｓｘＡ抗原；（２）ｅｓｘＢ抗原；（３）ｓｔａ００６抗原；（４）ｈｌａ抗原；（５）ｓｔａ０１１抗原からなる群より選択される２以上の抗原を含む、項目１に記載の組成物。
（項目６）
前述の項目のいずれかに記載の組成物であって、上記抗原の１または複数が、水酸化アルミニウムアジュバントに吸着され、所望により、上記組成物が、ヒスチジン緩衝剤を含む、組成物。
（項目７）
（ｉ）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ菌体外多糖と（ｉｉ）キャリアタンパク質との１または複数の結合体をさらに含む、前述の項目のいずれかに記載の組成物。
（項目８）
（ｉ）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ莢膜多糖と（ｉｉ）キャリアタンパク質との１または複数の結合体をさらに含む、前述の項目のいずれかに記載の組成物。
（項目９）
式ＮＨ２−Ａ−｛−Ｘ−Ｌ−｝ｎ−Ｂ−ＣＯＯＨ
（式中、Ｘは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ抗原
からなる群より選択されるブドウ球菌抗原のアミノ酸配列であり、
Ｌは、任意選択のリンカーアミノ酸配列であり、
Ａは、任意選択のＮ末端アミノ酸配列であり、
Ｂは、任意選択のＣ末端アミノ酸配列であり、
ｎは、２以上の整数である）
のポリペプチド。
（項目１０）
項目９に記載のポリペプチドを含み、
（Ａ）（ｉ）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ菌体外多糖と（ｉｉ）キャリアタンパク質との１または複数の結合体、および／または、
（Ｂ）（ｉ）Ｓ．ａｕｒｅｕｓ莢膜多糖と（ｉｉ）キャリアタンパク質との１または複数の結合体
をさらに含む、免疫原性組成物。
（項目１１）
上記ｃｌｆＡ抗原が、
配列番号１を認識する抗体を惹起でき、
（ａ）配列番号１と８０％以上の同一性を有し、および／または
（ｂ）配列番号１の少なくとも７連続アミノ酸の断片を含む
アミノ酸配列を含み、
上記断片が、配列番号１からのエピトープを含む、前述の項目のいずれかに記載の組成物またはポリペプチド。
（項目１２）
（ａ）配列番号１５１と８０％以上の同一性を有し、および／または
（ｂ）配列番号１５１のアミノ酸１〜９７からの少なくとも７連続アミノ酸と、配列番号１５１のアミノ酸１０４〜２０７からの少なくとも７連続アミノ酸との断片を含む
アミノ酸配列を含むポリペプチドであって、上記ポリペプチドが、配列番号１０を含む野生型ブドウ球菌タンパク質と、配列番号１１を含む野生型ブドウ球菌タンパク質とをともに認識する抗体を惹起できる、ポリペプチド。
（項目１３）
項目１２に記載のポリペプチド、ならびに、（ｉ）ｓｔａ００６抗原；（ｉｉ）ｈｌａ抗原；および／または（ｉｉｉ）ｓｔａ０１１抗原の１または複数を含む、免疫原性組成物。
（項目１４）
アジュバントを含む、項目１３に記載の組成物。
（項目１５）
配列番号１５１、１５２、１６８、２０２、２０３、２０４、２０５、２０６、２０７、２０８、２０９、２１０、２１１、２１２、２２０、２２１、２２２、２２３、２２４、２３７、２３８、２４１から選択されるアミノ酸配列と８０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド。
（項目１６）
配列番号１５１、１５２、１６８、２０２、２０３、２０４、２０５、２０６、２０７、２０８、２０９、２１０、２１１、２１２、２２０、２２１、２２２、２２３、２２４、２３７、２３８、２４１、２４２、２４３、２４４、２４５から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチド。
（項目１７）
（ａ）配列番号２１８と９０％以上の同一性を有する第１配列と、（ｂ）配列番号２１９と９０％以上の同一性を有する第２配列とを含むポリペプチドであって、上記第１配列と上記第２配列とが、直接接合されているか、または１０未満のアミノ酸を有する介在アミノ酸配列により接合されているかのいずれかである、ポリペプチド。
（項目１８）
項目１２、１５、１６または１７のいずれか１項に記載のポリペプチドを含む医薬組成物。
（項目１９）
前述の項目のいずれかに記載のポリペプチドまたは組成物の有効量を哺乳動物に投与するステップを含む、哺乳動物における免疫応答を高める方法。
（項目２０）
項目９、１２、１５、１６または１７のポリペプチドをコードする核酸。
図１は、記載される抗原で予め免疫化されたマウスのチャレンジ後の細菌数（Ｌｏｇ ｃｆｕ／ｍｌ）を示す。 図２〜４は、１４日間にわたる、抗原の種々の混合物で予め免疫化されたマウスのチャレンジ後の生存（％）を示す。図２において、ＳＡ−１０−ａからの６群は、第１４日目において上から下に、群（ｉ）、群（ｉｉｉ）と群（ｉｖ）、群（ｉｉ）、ＩｓｄＢ、そして陰性対照である。 図３において、ＳＡ−１０−ａからの６群は、第１４日目において上から下に、群（ｉ）、群（ｉｉｉ）と群（ｉｖ）、群（ｉｉ）、ＩｓｄＢ、そして陰性対照である。図３において、ＳＡ−１０−ｂからの６群は、第１４日目において上から下に、群（ｉｉｉ）、群（ｉ）、群（ｉｖ）、群（ｉｉ）とＩｓｄＢ、そして陰性対照である。 図４において、ＳＡ−１４からの６群は、第１４日目において上から下に、群（ｉｖ）、群（ｉｉ）、群（ｉ）、群（ｉｉｉ）、陰性対照およびＩｓｄＢである。 図５は、種々の組成物（ＰＢＳ陰性対照；ＩｓｄＢ抗原；ならびに本発明の「Ｃｏｍｂｏ−１」および「Ｃｏｍｂｏ−２」抗原の組み合わせ）で予め免疫化したマウスのチャレンジ後の、４回の異なる実験からのマウス生存に対する収集されたデータを示す。個別の印は、個別のマウスの生存持続期間を示し、各群の水平のバーは、生存持続期間中央値を示し、パーセンテージの数字はチャレンジ後１４日間の生存であり、上部のｐ値は、群間の生存持続期間中央値のｔ検定比較である。 図６は、膿瘍モデルにおける９×１０６ｃｆｕのＮｅｗｍａｎ株の感染後のマウス腎臓におけるコロニー形成単位（ｃｆｕ）数を示す。水平のバーは群あたりの平均であり、各群の下の数字は、ＰＢＳ対照群に対するｌｏｇ低減である。 図７は、膿瘍モデル実験におけるマウスの腎臓での細菌数（ｌｏｇ ＣＦＵ／ｍｌ）を示す。マウスを、以下の株でチャレンジした：（Ａ）ＭＷ２；（Ｂ）ＬＡＣ；（Ｃ）Ｓｔａｐｈ１９；または（Ｄ）ＭＵ５０。各点は、個別の動物であり、バーは、群あたりの計数の中央値を示す。マウスは、ｘ軸ラベルに示すように免疫化した。 図７は、膿瘍モデル実験におけるマウスの腎臓での細菌数（ｌｏｇ ＣＦＵ／ｍｌ）を示す。マウスを、以下の株でチャレンジした：（Ａ）ＭＷ２；（Ｂ）ＬＡＣ；（Ｃ）Ｓｔａｐｈ１９；または（Ｄ）ＭＵ５０。各点は、個別の動物であり、バーは、群あたりの計数の中央値を示す。マウスは、ｘ軸ラベルに示すように免疫化した。 図７は、膿瘍モデル実験におけるマウスの腎臓での細菌数（ｌｏｇ ＣＦＵ／ｍｌ）を示す。マウスを、以下の株でチャレンジした：（Ａ）ＭＷ２；（Ｂ）ＬＡＣ；（Ｃ）Ｓｔａｐｈ１９；または（Ｄ）ＭＵ５０。各点は、個別の動物であり、バーは、群あたりの計数の中央値を示す。マウスは、ｘ軸ラベルに示すように免疫化した。 図７は、膿瘍モデル実験におけるマウスの腎臓での細菌数（ｌｏｇ ＣＦＵ／ｍｌ）を示す。マウスを、以下の株でチャレンジした：（Ａ）ＭＷ２；（Ｂ）ＬＡＣ；（Ｃ）Ｓｔａｐｈ１９；または（Ｄ）ＭＵ５０。各点は、個別の動物であり、バーは、群あたりの計数の中央値を示す。マウスは、ｘ軸ラベルに示すように免疫化した。 図８は、漸増濃度のＣａ＋＋イオンの存在下でのＳｔａ０１１オリゴマーの形成を示す。数はｍＭ濃度を示し、＊は、５０ｍＭ ＥＤＴＡの存在を示す。 図９は、（Ａ）ＥｓｘＡＢ、（Ｂ）Ｓｔａ００６、（Ｃ）Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、（Ｄ）Ｓｔａ０１１に対するＩｇＧ力価を示す。各グラフは３群を有し、各群には１対のバーがある。対のうちの右側のバーは免疫前ＩｇＧを示し、左側のバーは免疫後ＩｇＧを示す。３群は、免疫化に用いた組成物であり、左から右に、アジュバントのみの陰性対照；Ｃｏｍｂｏ１組み合わせ；および関連する抗原のみである。 図９は、（Ａ）ＥｓｘＡＢ、（Ｂ）Ｓｔａ００６、（Ｃ）Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、（Ｄ）Ｓｔａ０１１に対するＩｇＧ力価を示す。各グラフは３群を有し、各群には１対のバーがある。対のうちの右側のバーは免疫前ＩｇＧを示し、左側のバーは免疫後ＩｇＧを示す。３群は、免疫化に用いた組成物であり、左から右に、アジュバントのみの陰性対照；Ｃｏｍｂｏ１組み合わせ；および関連する抗原のみである。 図１０は、記載する株でのチャレンジ後のマウスにおける細菌数の値（ｌｏｇ ＣＦＵ／ｍｌ）を示す。各点は、個別の動物であり、バーは、ＣＦＵの中央値を示す。ＩｓｄＢおよびＣｏｍｂｏの列の下のＰ値は、アジュバントのみの対照に対する比較である。 図１１は、Ｎｅｗｍａｎ株でのチャレンジ後のマウスにおける膿瘍の面積（ｍｍ２）を示す。 図１２は、４つの異なる株、Ｎｅｗｍａｎ（○）、ＳＴ−８０（□）、ＵＳＡ３００−ＦＰＲ３７５７（△）またはＵＳＡ３００−Ｌａｃ（×）株でのチャレンジ後のマウスの生存日数を示す。各点は、個別の動物であり、バーは、生存中央値を示し、上部の数は、１５日後に生存する動物の％を示す。マウスは、水酸化アルミニウムアジュバントのみ、ＩｓｄＢまたはＣｏｍｂｏ１を受けた。 図１３は、チャレンジ後のマウスの生存中央値（日）を示す。マウスを、Ｘ軸に記載する抗原で免疫化した。各点は、個別の動物であり、バーは、生存中央値を示す。上部の数は、１５日後に生存する動物の％を示す。
（発明を実施するための様式）
（抗原の選択）
Ｓ．ａｕｒｅｕｓタンパク質を、種々の基準に基づいてワクチン成分として用いるために選択した。
ＩｓｄＡは、鉄取り込みに関与する表面タンパク質である。これは、Ｓ．ａｕｒｅｕｓの全細胞溶解産物および細胞壁画分のイムノブロットにおいて高分子量（＞２５０ｋＤａ）で検出可能である。さらに、標識された抗ＩｓｄＡ抗体は、細胞外構造を明らかにした。これらの構造は、鉄陽性条件（ＩｓｄＡ発現が抑制されると報告されている）を含む種々の増殖および感染条件において観察された。構造は、４μｍまでの長さのテイルを有し、哺乳動物細胞表面に平行な典型的な配向を有する。外れたＩｓｄＡ陽性構造は、上皮細胞の表面上に接着するが、細胞接合部局在は失うことが観察された。上皮／細菌相互作用は、この構造の発現を刺激し得る。さらに、本発明者らは、ＩｓｄＡが、異なる株間で良好に保存され（試験した３６株のうちの３６に存在；以下を参照されたい）、よって、循環している株の広い集団にわたって防御をもたらすことを見出した。鉄取り込みは病毒性にとって重要であるので、このタンパク質は、細菌の生活環の病的段階での免疫攻撃のために有益であるとみられる。本発明者らは、このタンパク質がヒト細胞にとって細胞傷害性でないことを見出した（以下を参照されたい）。このタンパク質はまた、水酸化アルミニウムに適度に良好に吸着でき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。これは、免疫応答を提供して、細菌の血液による拡散を防ぐために有用である。
ＥｓｘＡおよびＥｓｘＢは、小さい酸性ダイマー分泌タンパク質である。本発明者らは、ＥｓｘＡが、異なる株間で高度に保存されていること（試験した３６株のうちの３６に存在；以下を参照されたい）、一方、ＥｓｘＢは、３６株のうち２５に存在することを見出した。このタンパク質は、感染を持続させることに関与するので、細菌の生活環の病的段階での免疫攻撃のために有益であるとみられる。本発明者らは、ＥｓｘＡとＥｓｘＢとの融合体（「ＥｓｘＡＢ」）が、ヒト細胞にとって細胞傷害性でないことを見出した（以下を参照されたい）。これはまた、水酸化アルミニウムに良好に吸着でき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。よって、この抗原は、免疫応答を提供して、細菌の血液による拡散を防ぐために有用である。
Ｈｌａは、孔形成性分泌型毒素である。このタンパク質は、異なる株間で良好に保存され（試験した３６株のうちの３６に存在；以下を参照されたい）、よって、循環している株の広い集団にわたって防御をもたらす。これは、重要な病毒性因子であるので、細菌の生活環の病的段階での免疫攻撃のために有益であるとみられる。これは、ヒト細胞にとって細胞傷害性でない（以下を参照されたい）。このタンパク質は、水酸化アルミニウムに適度に良好に吸着でき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。これは、免疫応答を提供して、肺炎を防ぐために有用である。
Ｓｐａは、Ｆｃ結合に関与する表面タンパク質である。本発明者らは、このタンパク質が、異なる株間で良好に保存され（試験した３６株のうちの３６に存在）、よって、循環している株の広い集団にわたって防御をもたらすことを見出した。これは、病毒性にとって重要であるので、細菌の生活環の病的段階での免疫攻撃のために有益であるとみられる。このタンパク質は、水酸化アルミニウムに適度に良好に吸着することもでき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。これは、免疫応答を提供して、細菌の血液による拡散を防ぐために有用である。
Ｓｔａ００６（ＦｈｕＤ２としても公知）は、鉄取り込みに関与する表面タンパク質である。本発明者らは、このタンパク質が、異なる株間で良好に保存され（試験した３６株のうちの３６に存在；以下を参照されたい）、よって、循環している株の広い集団にわたって防御をもたらすことを見出した。本発明者らは、タンパク質が、ヒト細胞にとって細胞傷害性でないことを見出した（以下を参照されたい）。このタンパク質は、水酸化アルミニウムに良好に吸着することもでき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。これは、免疫応答を提供して、細菌の血液による拡散を防ぐために有用である。
Ｓｔａ０１１は、表面リポタンパク質である。本発明者らは、このタンパク質が、異なる株間で良好に保存され（試験した３６株のうちの３６に存在；以下を参照されたい）、よって、循環している株の広い集団にわたって防御をもたらすことを見出した。本発明者らは、このタンパク質が、ヒト細胞にとって細胞傷害性でないことを見出した（以下を参照されたい）。このタンパク質は、水酸化アルミニウムに適度に良好に吸着することもでき（以下を参照されたい）、このことは、ヒトへの送達のための安定な処方のために有用である。これは、免疫応答を提供して、細菌の血液による拡散を防ぐために有用である。このタンパク質は、Ｃａ＋＋イオンの存在下ではオリゴマーへとアッセンブルされるが、Ｍｇ＋＋イオンの存在下ではそうでないことが示された（図８を参照されたい）。これらの実験は、５μｇの組換えタグ無しＳｔａ０１１を用い、３７℃にて２５分間、０．５から５０ｍＭまでの漸増ＣａＣｌ２濃度でインキュベートし、次いで、清澄な非変性ゲルでのゲル電気泳動により分析した。移動度のシフト（オリゴマー形成を示す）が、２ｍＭのＣａ＋＋、特に＞５ｍＭから明確であった。これらのレベルは、約１．２ｍＭの血液Ｃａ＋＋濃度、約１１ｍＭの血清濃度および約３２ｍＭの乳濃度と匹敵する。ＥＤＴＡは、シフトを逆転させた。
表面消化［３０２］および／または分泌タンパク質の分析により、
からのペプチド断片が明らかになり、例えば配列番号２２８および２２９は、ｓｔａ０１９の断片として同定された。
結合体型莢膜糖は、オプソニン免疫をもたらすために有用である。血清型５および８は、約８５％の臨床単離株に及ぶ。
（株適用範囲）
３６の臨床単離株のパネルを用いて、世界的に循環しているＣＡ−ＭＲＳＡ（市中感染型（ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ）メチシリン耐性Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）の大多数を表す５つのクローン系統に属する株を含む、循環している株を代表した。ＨＡ−ＭＲＳＡ（院内感染型ＭＲＳＡ）および非ＭＲＳＡ株も含めた。パネル全体は、９のＨＡ−ＭＲＳＡ株、７のＣＡ−ＭＲＳＡ株、２のＭＲＳＡ株および１８のその他の株を含んだ。
ＩｓｄＡ、Ｈｌａ、ＥｓｘＡ、Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１、ＳｐａおよびＣｌｆＢをコードする遺伝子は、３６株全てに存在した。ＥｓｘＢについての遺伝子は、３６株のうち１１に存在せず、ＳｄｒＤについての遺伝子は、３６株のうち６に存在しなかった。
コードされたＩｓｄＡ配列は、パネルにわたって９５〜１００％同一であり、タンパク質は、定常増殖期の鉄制限条件下で発現された。コードされたＳｄｒＤ配列は、３６のうち３０のＳｄｒＤ＋ｖｅパネルメンバーにおいて９５〜１００％同一であった。コードされたＥｓｘＡ配列は、パネルにわたって１００％同一であった。コードされたＥｓｘＢ配列は、２５のＥｓｘＢ＋ｖｅ株において９５〜１００％同一であった。コードされたＣｌｆＢ配列は、パネルにわたって９３〜１００％同一であり、このタンパク質は、対数増殖期の初期に高度に表面露出されていることも見出された。
コードされたアミノ酸配列における保存は、次のとおりであった（％同一性）。
６１株のより大きいパネルを、ＨｌａおよびＳｔａ００６をコードする遺伝子の存在、ならびにそれらの発現についてスクリーニングした。このパネルは、種々の地理的起源ならびに種々のＳＴおよびクローン複合型の、ＭＲＳＡ株およびＭＳＳＡ株の両方に及んだ。６１株のうち９はＨｌａを発現しなかったが、１株以外は全てＳｔａ００６を発現した（６１番目の株についてのデータは、決定的でなかった）。よって、Ｈｌａ単独に基づくワクチンは、普遍的ワクチンのための適切な保護範囲を与えないとみられるが、この問題は、Ｓｔａ００６を加えることにより克服できる。
（細胞傷害性および細胞結合研究）
Ｓ．ａｕｒｅｕｓ組換え抗原Ｈｌａ、Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、ＩｓｄＡ、ＩｓｄＢ、ｓｔａ００６、ｓｔａ０１１およびＥｓｘＡＢによる可能性のある細胞での細胞傷害性の分析を、ＨＢＭＥＣおよびＡ５４９細胞について行った。アネキシンＶおよびヨウ化プロピジウム染色を用いて、フローサイトメトリーにより初期および後期のアポトーシス細胞のパーセンテージを測定した。内皮細胞を、完全コンフルエントまで２４ウェルプレートにおいて増殖させた。細胞を、次いで、３つの異なる濃度の組換え抗原（１０μｇ／ｍｌ、１μｇ／ｍｌ、０．１μｇ／ｍｌ）と２４時間インキュベートした。内皮細胞においてアポトーシスを誘導すると報告されているＴＮＦ−αとシクロヘキシミド（ＣＨＸ）との組み合わせを、陽性対照として用いた。ＰＢＳ緩衝液単独とのインキュベーションを、陰性対照とした。分析を、次いで、ＦＡＣＳにより行った。
いずれの抗原も、ＨＢＭＥＣまたはＡ５４９細胞に対して細胞傷害性の効果を誘導しなかった。実際に、対照細胞と比較した生細胞集団のパーセンテージは、２４時間のインキュベーションまで本質的に一定のままであった。対照的に、ＴＮＦ−αとＣＨＸとの組み合わせは、アポトーシス細胞の数の２５％の増加を誘導した。
ＨＢＭＥＣも、ヒト内皮細胞とのＳ．ａｕｒｅｕｓ組換え抗原の結合を試験するためのインビトロモデルとして用いた。ＨＢＭＥＣを、コンフルエンスまで３７℃にて加湿雰囲気で、１０％熱不活化胎仔ウシ血清、１０％ ＮｕＳｅｒｕｍ、２ｍＭグルタミン、１ｍＭピルビン酸、１％非必須アミノ酸、１％ ＭＥＭビタミン、１００単位／ｍｌペニシリンおよび１００μｇ／ｍｌストレプトマイシンを補ったＲＰＭＩ１６４０培地中で増殖させた。細胞との組換え抗原の結合は、間接的免疫蛍光により試験し、ＦＡＣＳにより分析した。結合が陽性の細胞を、非特異的抗体認識として同定された陰性対照に対する蛍光の正味の平均強度として測定した。結合実験は、４℃にて行った。組換え抗原のそれぞれに特異的なマウスポリクローナル抗体を１次抗体として用い、結合を、Ｒ−フィコエリスリン結合体化ヤギ抗マウスＩｇＧ ２次抗体により検出した。陰性対照として、ＨＢＭＥＣを、蛍光標識２次抗体で検出する１次ポリクローナル抗体とインキュベートしたか、または蛍光標識２次抗体のみとインキュベートした。既知の表面露出ＧＢＳ抗原の結合を、陽性対照として用いた。
ＨｌａおよびＨｌａ−Ｈ３５Ｌだけが、内皮細胞と強く結合できる抗原であった。これらの２つの抗原の溶血活性も試験した。
ヒツジおよびウサギの線維素除去血液を用いて、分光学的アッセイによりそれらの溶血活性を測定した。血液を、３７℃にて３０分間、２つのタンパク質の１：４連続希釈物とインキュベートした。浸透圧による溶解を引き起こす水とのインキュベーションと、Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓタンパク質とのインキュベーションとを陽性対照として用い、陰性対照として、血液をＰＢＳ＋ＢＳＡ０．５％とインキュベートした。
組換えの天然Ｈｌａは、そのＨ３５Ｌ変異体の形態と違って、ウサギ赤血球に対して溶血活性を示した。変異体の溶血性は、野生型よりも少なくとも１／１５０低かった。これらのタンパク質はともに、ヒツジ血液に対して溶血活性を有さなかった。
よって、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ組換えワクチンの候補は、Ａ５４９上皮細胞系およびＨＢＭＥＣ内皮細胞系の両方に対していずれの細胞傷害性も示さない。重要なことに、宿主細胞の細胞膜に孔を形成することが公知の分泌毒素であるＨｌａは、Ａ５４９細胞と結合できたが、それらに対する細胞傷害性を誘導しなかった。これは、ウサギ赤血球の溶血も誘導できた。対照的に、細胞溶解性の孔を形成できない単一アミノ酸置換を有する改変体毒素である組換えＨｌａ−Ｈ３５Ｌは、ヒト細胞系およびウサギ赤血球の両方において細胞損傷を誘導しなかった。これらの知見は、Ｈｌａのこの変異体の形態を、ワクチン組成物においてより安全に用い得ることを示す。その他の抗原のいずれも、宿主細胞と結合する能力を示さなかった。
（アジュバント処方物）
選択されたＳ．ａｕｒｅｕｓタンパク質抗原候補を、個別にもしくはタンパク質の組み合わせとして、莢膜多糖結合体（複数可）とともにまたはそれなしで、水酸化アルミニウムとともに処方した。処方物は、ｐＨおよび容量オスモル濃度について最適化した。
抗原は、ＥｓｘＡ−Ｂ、Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１、Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、ＳｄｒＤ、ＩｓｄＡ、ＩｓｄＡ４０−１８４、Ｓｔａ０１９、Ｓｔａ０２１、Ｓｔａ０７３、ＣｌｆＢ４５−５５２、ＳｄｒＤ５３−５９２、ＳａｓＦおよびＩｓｄＢであった。これらは、１価抗原として１００μｇ／ｍｌで、または組み合わせとしてそれぞれ５０μｇ／ｍｌで処方する。５型または８型の株からの莢膜糖結合体は、５μｇ／ｍｌ、１０μｇ／ｍｌまたは２５μｇ／ｍｌで加える。水酸化アルミニウムは、１０ｍＭヒスチジン緩衝液（ｐＨ６．５）中で９ｍｇ／ｍｌ ＮａＣｌとともに２ｍｇ／ｍｌで用いた。
結合体を含むかまたは含まない全ての１価および組み合わせ処方物は、所望のｐＨおよび重量オスモル濃度に対して調整できた。処方物は、６．２〜７．３の範囲のｐＨと、２４８〜３６０ｍＯｓｍ／ｋｇの範囲の重量オスモル濃度を有した。グリセロールは、重量オスモル濃度に対して負の影響を有したので、処方物から除外した。
種々の１価および組み合わせ処方物において試験した全てのタンパク質は、ＩｓｄＡ、ＩｓｄＡ４０−１８４、Ｓｔａ０１９およびＳｔａ０７３以外は、水酸化アルミニウムアジュバントに良好に吸着された。
個別のＳｔａ００６、Ｓｔａ０１１、ＥｓｘＡ−ＢおよびＨｌａ−Ｈ３５Ｌタンパク質は、完全に吸着され、それらの吸着前電気泳動プロファイルを変更することなく脱着できた。
Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１、ＥｓｘＡ−ＢおよびＨｌａ−Ｈ３５Ｌの組み合わせにおけるそれぞれの抗原は、アジュバントについての抗原間の競合なく完全に吸着された。Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１、ＥｓｘＡ−ＢおよびＩｓｄＡ４０−１８４の組み合わせにおける抗原も、１価タンパク質と同じ様式で挙動したＩｓｄＡ４０−１８４以外は、完全に吸着された。両方の組み合わせについて、抗原は、それらの吸着前電気泳動プロファイルを変更することなく脱着できた。
５型および／または８型結合体がさらに存在することも、例えばＳｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋ＥｓｘＡ−Ｂの組み合わせにおいて抗原の吸着または脱着の特徴を変更しなかった。
短い安定性の研究（４℃にて２週間）を行って、１価処方物の安定性を評価し、抗原の完全性を評価した。全ての試験した処方物は、それらのｐＨおよび重量オスモル濃度について安定であった。全ての抗原は、アジュバントに完全に吸着したままであった。全ての抗原は、それらの脱着特性を維持した。脱着後の抗原の分解または凝集の増加の証拠はなかった。
（効力試験）
個別の抗原ｓｔａ００６、ｓｔａ０１１、ｓｔａ０１２、ｓｔａ０１７、ｓｔａ０１９、ｓｔａ０２１およびｓｔａ０２８を、１．２×１０７ｃｆｕのＮｅｗｍａｎ株（５型）によるＩＶチャレンジに対して防御するそれらの能力について試験した。結果を図１に示す。全ての抗原は、対照と比較して細菌の数を低減させ、最良の結果は、ｓｔａ００６、ｓｔａ０１１およびｓｔａ０１９を用いて観察された。
さらなる個別の抗原を試験した：（ｉ）ＮＷ＿１０；（ｉｉ）ＩｓｄＡ４０−１８４；（ｉｉｉ）Ｓｔａ００２；（ｉｖ）Ｓｔａ００３；（ｖ）Ｓｔａ０７３；（ｖｉ）Ｓｔａ１０１；（ｖｉｉ）Ｓｔａ０１４；（ｖｉｉｉ）Ｈｌａ−ＰＳＧＳ；（ｉｘ）ＳｄｒＤＣｎａＢ。陰性対照群と比較した生存の増加は、チャレンジの１５日後に（ｉ）５０％；（ｉｉ）１９％；（ｉｉｉ）３７％；（ｉｖ）４３％；（ｖ）２５％；（ｖｉ）１２％；（ｖｉｉ）２５％；（ｖｉｉｉ）５６％；（ｉｘ）３９％であった。
２つのハイブリッドポリペプチドも試験した：（ｉ）ＨｌａＨ３５Ｌ−ＥｓｘＡＢ；（ｉｉ）Ｓｔａ００６−ＥｓｘＡＢ。陰性対照群と比較したチャレンジ後の生存の増加は、（ｉ）２５％；（ｉｉ）２５％であった。
表２は、膿瘍モデルにおいて種々の抗原を用いて得られた結果をまとめる。
実験ＳＡ−１０−ａでは、抗原の組み合わせの効力を試験した。１２匹のＣＤ−１マウスの６群に、陰性対照（ＰＢＳ）、ＩｓｄＢまたは水酸化アルミニウムをアジュバントとして添加した以下の組み合わせの１つを与えた：（ｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ；（ｉｉ）Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋ＥｓｘＡＢ；（ｉｉｉ）Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ；または（ｉｖ）Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋ＥｓｘＡＢ。第０日および第１４日に２回の投与を与えた。第２４日に、マウスに３×１０８ｃｆｕのＮｅｗｍａｎ株ブドウ球菌を与え、各群における生存を２週間にわたって２４時間ごとに評価した。結果を、図２に示す。１４日後に、陽性対照群の動物の２５％が生存したが、群（ｉｉｉ）および（ｉｖ）の動物の５８％および群（ｉ）の７５％が生存したのと同様に、群（ｉｉ）の動物の５０％が生存した。
実験ＳＡ−１０−ｂでは、同じ方法を用いて、（ｉ）ＣｌｆＢ４５−５５２＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋ＥｓｘＡＢ；（ｉｉ）ＣｌｆＢ４５−５５２＋Ｓｔａ０１１＋Ｓｔａ００６＋ＥｓｘＡＢ；（ｉｉｉ）ＣｌｆＢ４５−５５２＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋ＥｓｘＡＢ；または（ｉｖ）ＳｄｒＤ５３−５９２＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋ＥｓｘＡＢを試験した。結果を、図３に示す。１４日後に、陽性対照群および群（ｉｉ）の動物の２５％が生存したが、群（ｉｖ）の動物の３３％、群（ｉ）の動物の７５％、および群（ｉｉｉ）の動物の８３％が生存した。
さらなる組み合わせも用いてマウスを免疫化した。組み合わせには、典型的に、水酸化アルミニウムがアジュバントとして添加され（上記を参照されたい）、第０日および第１４日に投与された。免疫化は、群あたり１２匹のＣＤ１マウスで行った。第２４日に、致死量の生細菌でマウスをチャレンジし、その後さらに１４日間生存を追跡した。比較のために、ＰＢＳを陰性対照として、そしてＩｓｄＢを陽性対照として［２］用いた。
実験ＳＡ−１１では、（ｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１と組み合わせた５型結合体；（ｉｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ０１９＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｉｉ）５型結合体＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｖ）ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；または（ｖ）ＥｓｘＡＢ＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１を試験した。チャレンジの１４日後に、陰性対照動物は全て死亡したが、陽性対照動物の４２％が生存した。試験群における生存の結果は、次のとおりであった：（ｉ）６７％；（ｉｉ）４２％；（ｉｉｉ）７５％；（ｉｖ）３３％；および（ｖ）２５％。
実験ＳＡ−１２では、（ｉ）Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｉ）Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｉｉ）ＥｓｘＡＢ＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｖ）ＥｓｘＡＢ＋ＩｓｄＡ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１を試験した。チャレンジの１４日後に、陰性対照動物の８％および陽性対照動物の１７％が生存した。試験群における生存の結果は、次のとおりであった：（ｉ）５０％；（ｉｉ）５０％；（ｉｉｉ）２５％；（ｉｖ）３３％。
実験ＳＡ−１４では、（ｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｉ）ＥｓｘＡＢ＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｉｉｉ）Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋Ｓｔａ０１９＋ＥｓｘＡＢ；（ｉｖ）Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋Ｓｔａ０１９＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌを試験した。５×１０８ＣＦＵのＮｅｗｍａｎ株でのチャレンジの１４日後に、陰性対照動物の１８％および陽性対照動物の９％が生存した。試験群における生存の結果は、次のとおりであった：（ｉ）５８％；（ｉｉ）６７％；（ｉｉｉ）４２％；（ｉｖ）８３％。１４日間にわたる生存数を図４に示し、これは、全ての組み合わせが、チャレンジ後の全ての日において２つの対照群よりも良好に機能したことを示す。
実験ＳＡ−１７ａでは、（ｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１＋血清型５結合体＋血清型８結合体；（ｉｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ０７３＋Ｓｔａ０１１＋血清型５結合体＋血清型８結合体；（ｉｉｉ）ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ０１１＋Ｓｔａ０７３を試験した。陰性対照と比較すると、Ｎｅｗｍａｎ株でのチャレンジの１５日後の生存の増加は、（ｉ）１７％；（ｉｉ）４２％；（ｉｉｉ）３４％であった。群（ｉｉ）および（ｉｉｉ）における生存の中央値は、満了の１５日であり、群（ｉ）においては１２日であった。
さらなる抗原の組み合わせの実験では、（ａ）血清型５結合体＋血清型８結合体＋ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１；（ｂ）Ｓｔａ００２＋Ｓｔａ００３＋Ｓｔａ０２１＋ＮＷ−１０；（ｃ）ＥｓｘＡＢ＋ＨｌａＨ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１９；および（ｄ）ＥｓｘＡＢ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１９を試験した。陰性対照と比較すると、Ｎｅｗｍａｎ株でのチャレンジ後の生存の増加は、（ａ）３７％；（ｂ）３６％；（ｃ）１３％；および（ｄ）０％であった。
研究ＳＡ−１０、ＳＡ−１１、ＳＡ−１２およびＳＡ−１４からの生存データを組み合わせて、ＰＢＳまたはＩｓｄＢと比較した場合の２つの組み合わせの効力を評価した。「Ｃｏｍｂｏ−１」は、ＥｓｘＡＢ＋Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１（配列番号２４１、１５０、２４６および２４７を含むポリペプチドを用いる）であった。「Ｃｏｍｂｏ−２」は、ＥｓｘＡＢ＋ＩｓｄＡ４０−１８４＋Ｓｔａ００６＋Ｓｔａ０１１であった。１４日後の４８匹のマウスの各群についての生存時間の中央値を比較した。ＰＢＳおよびＩｓｄＢ群の生存時間の中央値は１日であったが、「Ｃｏｍｂｏ−１」群および「Ｃｏｍｂｏ−２」群のマウスの生存時間の中央値は１４日であった。生存期間中央値の差を、ｔ検定により比較した。「Ｃｏｍｂｏ−１」群の生存は、ＰＢＳ群（ｐ＜０．０００１）およびＩｓｄＢ群（ｐ＜０．０００１）の両方よりも統計学的に優れ、「Ｃｏｍｂｏ−２」群の生存は、ＰＢＳ群（ｐ＜０．０００１）およびＩｓｄＢ群（ｐ＝０．００４９）の両方よりも統計学的に優れていた。これらのデータを図５に示す。
図６は、膿瘍モデルにおいてＣｏｍｂｏ−１およびＣｏｍｂｏ−２を用いたデータを示す。マウスの腎臓をチャレンジ後に単離し、ホモジナイズしてプレートに入れた。ｃｆｕ数は、膿瘍形成のレベルを示す。図６は、単独の実験からのデータを示す。データの下の数字は、ＰＢＳ群に対するｌｏｇ低減を示す。低減は、２つの組み合わせ群において、ＩｓｄＢのみを用いるよりも大きく、Ｕ検定（片側）の値は、Ｃｏｍｂｏ−１について０．０００１、そしてＣｏｍｂｏ−２について０．０００５である。同じ効果が、ＩｓｄＢ群を含まない２回目の実験において、２つの組み合わせ群で観察された。
さらなる実験において、３つの異なる株：Ｓｔａｐｈ−１９、ＦＰＲ３７５７（ＵＳＡ３００）およびＬａｃ（ＵＳＡ３００）でのチャレンジに対する、Ｃｏｍｂｏ−１、ＩｓｄＢまたはＰＢＳを用いて達成される防御を比較した。１群あたり４４匹のマウスが存在し、結果は、生存割合についての片側ｐ値（ここで、Ｐ１はＣｏｍｂｏ−１をＰＢＳと比較し、Ｐ２はＣｏｍｂｏ−１をＩｓｄＢと比較し、Ｐ３は、ＰＢＳをＩｓｄＢと比較する）を含んで、次のとおりであった（図１２も参照されたい）。
さらなる実験は、アジュバント添加したＣｏｍｂｏ１が、アジュバントのみ（水酸化アルミニウム）またはＩｓｄＢでの免疫化と比較した場合に、Ｎｅｗｍａｎ、ＵＳＡ１００、ＣＣ３０およびＵＳＡ３００株でのチャレンジ後のＣＦＵ数を低減させたことを示した。図１０は、４つのチャレンジ株についてのＣＦＵ値（ｌｏｇ／ｍｌ）を示す。それぞれの場合においてｐ＜０．０１５の最低計数は、Ｃｏｍｂｏ１を用いて達成された。膿瘍の面積も評価し、これもまたＣｏｍｂｏ１免疫化マウスにおいてより低かった（例えば図１１）。
さらなる実験は、Ｃｏｍｂｏ１が、敗血症モデルにおいて臨床関連株に対して高く防御的であり、ＩｓｄＢよりも高い生存％を常に達成したことを示した。図１２は、Ｃｏｍｂｏ１免疫化マウスでの生存中央値（群あたり４０匹、３回の実験）が、Ｎｅｗｍａｎ、ＳＴ−８０、ＦＰＲ３７５７またはＬａｃ株でチャレンジした場合に、満了の１５日であり、生存したマウスの割合が≧７５％であったことを示す。対照的に、ＩｓｄＢ免疫化マウスにおける生存中央値は、ＮｅｗｍａｎおよびＳＴ−８０チャレンジを用いて１日だけであり、４つのチャレンジ株全てについて＜６５％の生存であった。
（Ｃｏｍｂｏ１とその個別のポリペプチドとの比較）
種々の試験を行って、Ｃｏｍｂｏ１を、その４つの個別のポリペプチド（すなわち、ＥｓｘＡＢ、Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１）およびＩｓｄＢまたは抗原を含まない陰性対照と比較した。
免疫化動物からの血清のオプソニン作用活性を試験した。血清は、（ｉ）４つの個別のポリペプチド、（ｉｉ）ポリペプチドの全ての対、（ｉｉｉ）３重のもの全て、または（ｉｖ）完全なＣｏｍｂｏ１の組み合わせを用いて得た。比較のために、抗ＩｓｄＢ血清を用いた。免疫前および陰性対照の血清は、このアッセイにおいてＮｅｗｍａｎ株の死滅を示さなかった。１回目の実験において、抗ＩｓｄＢ血清は２７％の死滅を示し、４つの個別のポリペプチドのそれぞれに対する血清は、２６〜３４％の死滅を示し、全ての複数のポリペプチドの組み合わせは、少なくとも３４％の死滅を示し、Ｃｏｍｂｏ−１を用いて生成された血清は、３９％の死滅を示した。２回目の実験においてＣｏｍｂｏ−１を用いた血清は４３％の死滅を示したが、抗ＩｓｄＢ血清はわずかによりよく機能し、Ｃｏｍｂｏ−１ポリペプチドを用いる全ての単独または複数のポリペプチドの血清は、少なくとも２６％の死滅を示した。
さらなる実験では、マウス（群あたり２０匹、８週齢のＣＤ１マウス）に免疫化ウサギからの抗血清を移すことにより達成される受動防御を観察した。４つの群に、ＥｓｘＡＢ、Ｈｌａ−Ｈ３５Ｌ、Ｓｔａ００６、Ｓｔａ０１１のうちの１つで免疫化したウサギからの血清２００μｌを与えた。第５群には、５０μｌの各血清（合計２００μｌ）を与えた。その他の２つの群には、ＩｓｄＢ免疫化ウサギからの血清、または生理食塩水＋アジュバントで免疫化したウサギからの血清を与えた。１５分後に、マウスを腹腔内チャレンジし（１０８ＣＦＵのＮｅｗｍａｎ株）、次いで、死亡率を１４日後に評価した。結果は、次のとおりであった。
さらなる実験において、ＣＤ１マウスにおいて誘導される特異的抗体のレベルを調べて、Ｃｏｍｂｏ１中の４つのポリペプチドの免疫原性を評価した。組成物は、４つの単独ポリペプチドのそれぞれ２０μｇ、または組み合わせでの４×１０μｇのいずれかを含んだ。組成物は、水酸化アルミニウムアジュバントを含んだ。抗原特異的ＩｇＧの血清レベルを、Ｌｕｍｉｎｅｘ ４Ｐｌｅｘアッセイにより決定した。図９に示すように、４つのポリペプチドは全て、それら自体でおよび組み合わせで、ＣＤ１マウスにおいて高度に免疫原性であった。それぞれの場合において、ポリペプチドに対する力価は、単独で投与した場合よりも組み合わせで投与した場合において、より高かった（中央の対と右の対とを比較されたい）。
さらなる実験では、Ｃｏｍｂｏ−１またはその４つの個別のポリペプチドのいずれかを用いて達成される防御を比較した。ＩｓｄＢも比較のために含めた。Ｎｅｗｍａｎ株でのチャレンジの１５日後に生存する動物（群あたり４０匹の動物）の割合、および日数での平均（中央値）生存は、ＰＢＳ＋アジュバント陰性対照と比較した生存割合の片側ｐ値を含んで、次のとおりであった。
マウス膿瘍モデルを用いて、４つの個別のポリペプチドをＣｏｍｂｏ１組み合わせと比較した。いくつかの実験において、マウスを比較のためにＩｓｄＢで免疫化した。抗原には、水酸化アルミニウムをアジュバントとして加え、アジュバントのみを陰性対照として用いた。図７は、４つの異なる株でのチャレンジ後の動物の腎臓における細菌の数を示す。最低の平均計数は、Ｃｏｍｂｏ１組み合わせで観察された。
チャレンジ実験は、（ｉ）４つの個別のポリペプチド、（ｉｉ）全ての対、（ｉｉｉ）３重のもの全て、または（ｉｖ）完全なＣｏｍｂｏ１組み合わせで免疫化した後に行った。ＩｓｄＢまたは緩衝剤のみを比較のために用いた。５×１０８ＣＦＵのＮｅｗｍａｎ株でのチャレンジ後の群あたり２４匹のマウスからの生存の結果（３回の実験）を、図１３に示す。ＩｓｄＢについての生存中央値は、２日だけであった。個別のＣｏｍｂｏ１ポリペプチドについての生存中央値は、１〜６日の範囲であった。ポリペプチドの対の生存中央値は、２〜１１日であった。３重のものの生存中央値は、８〜１５日であった。完全なＣｏｍｂｏ１組み合わせの生存中央値は、満了の１５日間であり、マウスの５９％がこの長さで生存した（ＩｓｄＢを用いて３５％だけであったことを参照されたい）。
本発明は、例としてのみ記載され、本発明の範囲および精神内に留まったまま改変を行うことができることが理解される。
（参考文献）

Claims (1)

  1. 本明細書に記載の発明。
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