KR20120034612A - 황색 포도상구균에 대한 면역화를 위한 조성물 - Google Patents
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Abstract
효과적인 Staphylococcus aureus 백신에는 몇 가지 항원성 성분이 필요할 수 있으며, 따라서 면역화에 사용하기 위한 S. aureus 항원들의 다양한 조합이 확인된다. 이들 폴리펩티드는 선택적으로 S. aureus 당류와 조합하여 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 S. aureus로부터 유래된 항원 및 면역화에 있어서 이들의 용도에 관한 것이다.
황색 포도상구균(Staphylococcus aureus)은 구형의 그램-양성 박테리아이다. 이로 인한 미국내 연간 사망률은 HIV/AIDS를 포함하는 다른 감염성 질환의 사망률을 초과하며, S. aureus는 혈류, 하부호흡기, 피부 및 연조직 감염의 주요 원인이다. 현재 공인된 백신은 없는 상황이다. 박테리아 타입 5 및 8로부터 얻은 표면 다당류들의 혼합물에 기초한 백신인 StaphVAX™은 2005년에 행해진 3기 임상시험에서 위약군에 비해 감염을 감소시키지 못했다.
참고문헌 1은 Merck 및 Intercell의 "V710" 백신에 대해 심장외과 수술을 받은 환자를 대상으로 2/3기 시험이 진행되고 있음을 보고하고 있다. V710 백신은 보존된 철-격리 세포-표면 단백질인 단일 항원 IsdB[2]에 기초한다.
S. aureus는 사소한 피부 감염에서부터 폐렴, 수막염, 골수염, 균혈증, 심장내막염, 독성쇼크 증후군, 장기 농양 및 패혈증과 같은 생명을 위협하는 질환들까지 여러 가지 질병들을 일으킨다. 이 박테리아는 수명 주기 동안 상이한 시기들에서 다수의 독성 요인들이 차별적으로 발현되기 때문에, 한 가지 질환을 예방할 수 있는 백신이라도 다른 질환은 예방하지 못할 수 있다. 예를 들어, V710 백신은 S. aureus가 혈액에 퍼지는 것에는 효과를 가질 수 있지만, 폐렴에는 효과가 없을 수 있고, 옵소닌(opsonic) 활성을 도출하지 못할 수 있다. 본 발명의 한 가지 목표는 혈액 전파 및 폐렴으로부터 보호할 수 있고, 또한 옵소닌 반응을 도출할 수 있는 백신을 제공하는 것이다.
따라서, S. aureus 백신에 사용하기 위한, 특히 다수의 S. aureus 병리현상에 대해 유용한 백신을 위한 추가의 개선된 항원들을 확인해야 할 필요성이 여전히 남아 있다.
본 발명자들은 면역화에 유용한 다양한 S. aureus 폴리펩티드들을 확인했으며, 이들은 단독으로도 또는 조합으로도 유용하다. 이들 폴리펩티드는 S. aureus 당류들이나 그외 다른 S. aureus 폴리펩티드들과 조합될 수 있다. 이 항원들은 S. aureus 백신에 유용하며, 다수의 병원균에 대한 면역화를 위한 백신의 성분으로서 사용될 수도 있다.
본 발명자들은 다음 36개의 폴리펩티드를 확인했다: clfA, clfB, coA, eap, ebhA, ebpS, efb, emp, esaC, esxA, esxB, FnBA, FnBB, HIa, hlgB, hlgC, isdA, isdB, isdC, isdG, isdH, isdl, lukD, lukE, lukF, lukS, nuc, sasA, sasB, sasC, sasD, sasF, sdrC, sdrD, spa 및 sdrE2. 이 항원들의 세트는 본원에서 "제 1 항원 그룹"이라고 언급된다. 따라서, 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 (1) clfA 항원; (2) clfB 항원; (3) coA 항원; (4) eap 항원; (5) ebhA 항원; (6) ebpS 항원; (7) efb; (8) emp 항원; (9) esaC 항원; (10) esxA 항원; (11) esxB 항원; (12) FnBA 항원; (13) FnBB 항원; (14) Hla 항원; (15) hlgB 항원; (16) hlgC 항원; (17) isdA 항원; (18) isdB 항원; (19) isdC 항원; (20) isdG 항원; (21) isdH 항원; (22) isdI 항원; (23) lukD 항원; (24) lukE 항원; (25) lukF 항원; (26) lukS 항원; (27) nuc 항원; (28) sasA 항원; (29) sasB 항원; (30) sasC 항원; (31) sasD 항원; (32) sasF 항원; (33) sdrC 항원; (34) sdrD 항원; (35) spa 항원; (36) sdrE2 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의) 항원을 포함한다.
제 1 항원 그룹 내에서, 항원은 바람직하게는 36개의 폴리펩티드 중 16개 폴리펩티드의 하위그룹, 즉 clfA, clfB, emp, esaC, esxA, esxB, hla, isdA, isdB, isdC, sasD, sasF, sdrC, sdrD, spa, 및 sdrE2로부터 선택된다. 이와 같이, 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 이들 16개 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의) 항원을 포함한다.
또한, 본 발명자들은 다음의 128개의 폴리펩티드를 확인했다:
sta001, sta002, sta003, sta004, sta005, sta006, sta007, sta008, sta009, sta010, sta011, sta012, sta013, sta014, sta015, sta016, sta017, sta018, sta019, sta020, sta021, sta022, sta023, sta024, sta025, sta026, sta027, sta028, sta029, sta030, sta031, sta032, sta033, sta034, sta035, sta036, sta037, sta038, sta039, sta040, sta041, sta042, sta043, sta044, sta045, sta046, sta047, sta048, sta049, sta050, sta051, sta052, sta053, sta054, sta055, sta056, sta057, sta058, sta059, sta060, sta061, sta062, sta063, sta064, sta065, sta066, sta067, sta068, sta069, sta070, sta071, sta072, sta073, sta074, sta075, sta076, sta077, sta078, sta079, sta080, sta081, sta082, sta083, sta084, sta085, sta086, sta087, sta088, sta089, sta090, sta091, sta092, sta093, sta094, sta095, sta096, sta097, sta098, sta099, sta100, sta101, sta102, sta103, sta104, sta105, sta106, sta107, sta108, sta109, sta110, sta111, sta112, sta113, sta114, sta115, sta116, sta117, sta118, sta119, sta120, NW_6, NW_9, NW_10, NW_7, NW_8, NW_2, NW_1, 및 NW_5. 이 항원들의 세트를 본원에서 '제 2 항원 그룹'이라고 한다. 이와 같이, 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 (1) sta001 항원; (2) sta002 항원; (3) sta003 항원; (4) sta004 항원; (5) sta005 항원; (6) sta006 항원; (7) sta007 항원; (8) sta008 항원; (9) sta009 항원; (10) sta010 항원; (11) sta011 항원; (12) sta012 항원; (13) sta013 항원; (14) sta014 항원; (15) sta015 항원; (16) sta016 항원; (17) sta017 항원; (18) sta018 항원; (19) sta019 항원; (20) sta020 항원; (21) sta021 항원; (22) sta022 항원; (23) sta023 항원; (24) sta024 항원; (25) sta025 항원; (26) sta026 항원; (27) sta027 항원; (28) sta028 항원; (29) sta029 항원; (30) sta030 항원; (31) sta031 항원; (32) sta032 항원; (33) sta033 항원; (34) sta034 항원; (35) sta035 항원; (36) sta036 항원; (37) a sta037 항원; (38) sta038 항원; (39) sta039 항원; (40) sta040 항원; (41) sta041 항원; (42) sta042 항원; (43) sta043 항원; (44) sta044 항원; (45) sta045 항원; (46) sta046 항원; (47) sta047 항원; (48) sta048 항원; (49) sta049 항원; (50) sta050 항원; (51) sta051 항원; (52) sta052 항원; (53) sta053 항원; (54) sta054 항원; (55) sta055 항원; (56) sta056 항원; (57) sta057 항원; (58) sta058 항원; (59) sta059 항원; (60) sta060 항원; (61) sta061 항원; (62) sta062 항원; (63) sta063 항원; (64) sta064 항원; (65) sta065 항원; (66) sta066 항원; (67) sta067 항원; (68) sta068 항원; (69) sta069 항원; (70) sta070 항원; (71) sta071 항원; (72) sta072 항원; (73) sta073 항원; (74) sta074 항원; (75) sta075 항원; (76) sta076 항원; (77) sta077 항원; (78) sta078 항원; (79) sta079 항원; (80) sta080 항원; (81) sta081 항원; (82) sta082 항원; (83) sta083 항원; (84) sta084 항원; (85) sta085 항원; (86) sta086 항원; (87) sta087 항원; (88) sta088 항원; (89) sta089 항원; (90) sta090 항원; (91) sta091 항원; (92) sta092 항원; (93) sta093 항원; (94) sta094 항원; (95) sta095 항원; (96) sta096 항원; (97) sta097 항원; (98) sta098 항원; (99) sta099 항원; (100) sta100 항원; (101) sta101 항원; (102) sta102 항원; (103) sta103 항원; (104) sta104 항원; (105) sta105 항원; (106) sta106 항원; (107) sta107 항원; (108) sta108 항원; (109) sta109 항원; (110) sta110 항원; (111) sta111 항원; (112) sta112 항원; (113) sta113 항원; (114) sta114 항원; (115) sta115 항원; (116) sta116 항원; (117) sta117 항원; (118) sta118 항원; (119) sta119 항원; (120) sta120 항원; (121) NW_6 항원; (122) NW_9 항원; (123) NW_10 항원; (124) NW_7 항원; (125) NW_8 항원; (126) NW_2 항원; (127) NW_1 항원; 및 (128) NW_5 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의) 항원을 포함한다.
128개의 항원으로 이루어진 제 2 항원 그룹 내에서, 이 리스트로부터 (81)번과 (107)번에서 (120)번이 제외되어 113개 항원으로 이루어진 바람직한 하위그룹이 구성된다.
제 2 항원 그룹 내에서, 128개의 폴리펩티드 중 27개 폴리펩티드의 하위그룹을 본원에서 '제 3 항원 그룹'이라고 하는데, 즉 sta001, sta002, sta003, sta004, sta005, sta006, sta007, sta008, sta009, sta010, sta019, sta028, sta040, sta049, sta057, sta064, sta073, sta095, sta098, sta101, sta105, NW_1, NW_6, NW_7, NW_8, NW_9, 및 NW_10이다. 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 제 3 항원 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의) 항원을 포함한다.
제 2 항원 그룹에는 속하지만 제 3 항원 그룹에는 속하지 않는 101개의 항원을 본원에서 '제 4 항원 그룹'이라고 한다. 101개의 항원으로 이루어진 제 4 항원 그룹 내에서, 상기 리스트로부터 (81)번과 (107)번에서 (120)번이 제외되어 86개 항원으로 이루어진 바람직한 하위그룹이 구성된다. 제 2 항원 그룹은 이와 같이 제 3 항원 그룹과 제 4 항원 그룹의 조합으로 구성된다.
제 2 항원 그룹 내에서, 128개 폴리펩티드 중 8개 폴리펩티드의 하위그룹을 본원에서 '제 5 항원 그룹'이라고 하는데, 즉 sta004, sta006, sta007, sta011, sta028, sta060, sta098 및 sta112이다. 본 발명의 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 제 5 항원 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상의) 항원을 포함한다.
제 1 항원 그룹의 36개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 630개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 630개 쌍들 중 하나이다.
제 2 항원 그룹의 128개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 8128개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 8128개 쌍들 중 하나이다.
제 2 항원 그룹의 113개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 6328개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 6328개 쌍들 중 하나이다.
제 3 항원 그룹의 27개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 351개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 351개 쌍들 중 하나이다.
제 4 항원 그룹의 101개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 5050개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 5050개 쌍들 중 하나이다.
제 4 항원 그룹의 86개의 항원들 내에서 상이한 항원들의 3655개의 가능한 쌍이 존재한다. 이러한 쌍들은 모두 본원에 개시되며 본 발명의 일부이다. 이와 같이, 본 발명은 한 쌍의 항원을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 쌍은 상기 3655개 쌍들 중 하나이다.
한 구체예에서, 조성물은 제 1 항원 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 항원(즉, 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상)과 제 2 항원 그룹으로부터 선택된 적어도 하나의 항원(즉, 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상)을 포함한다. 제 1 항원 그룹으로부터의 항원은 16개 항원의 바람직한 하위그룹으로부터 선택될 수 있고, 제 2 항원 그룹으로부터의 항원은 제 3 항원 그룹 또는 제 5 항원 그룹으로부터 선택될 수 있다.
또한, 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 (1) clfA 항원; (2) clfB 항원; (3) sdrE2 항원; (4) sdrC 항원; (5) SasF 항원; (6) emp 항원; (7) sdrD 항원; (8) spa 항원; (9) esaC 항원; (10) esxA 항원; (11) esxB 항원; (12) sta006 항원; (13) isdC 항원; (14) hla 항원; (15) sta011 항원; (16) isdA 항원; (17) isdB 항원; (18) sasF 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 이상) 항원을 포함한다. 이 18개의 항원으로 이루어진 그룹을 때로 본원에서 "제 6 항원 그룹'이라고 한다.
또한, 본 발명은 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공하며, 상기 조합은 (1) esxA 항원; (2) esxB 항원; (3) sta006 항원; (4) hla 항원; 및/또는 (5) sta011 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의(즉, 2, 3, 4 또는 5) 항원을 포함한다. 또한, 조성물은 애쥬번트, 예를 들어 수산화 알루미늄 애쥬번트를 포함할 수 있다.
본 발명에서 유익한 조합들은 둘 이상의 항원이 시너지 작용하는 것들이다. 따라서, 이들의 조합된 투여에 의해 달성되는 S. aureus 질환에 대한 보호는 이들의 개별적 보호 효능의 단순한 부가에 의해서 예상된 것을 뛰어넘는다.
제한은 아니지만, 관심의 특정 조합들은 다음을 포함한다:
(1) sdrD 항원, sdrE2 항원 및 isdC 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다.
(2) sasD 항원, clfB 항원 및 sdrC 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(3) sasD 항원, clfB 항원, sdrC 및 clfA 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(4) sdrD 항원, sdrE2 항원, isdC 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다.
(5) sdsD 항원, clfB 항원, sdrC 항원 및 sta006 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(6) sdrD 항원, sdrE2 항원, isdC 항원 및 hla 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다. hla 항원은 무독화된 돌연변이체(detoxified mutant)일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(7) sasD 항원, clfB 항원, sdrC 항원 및 esxA 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(8) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원 및 hla 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(9) sdrD 항원, sdrE2 항원, isdC 항원 및 esxA 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다.
(10) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서, 예를 들어 EsxAB 하이브리드로서 조합될 수 있다.
(11) esxA 항원, esxB 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다.
(12) sasD 항원, clfB 항원, sdrC 항원 및 spa 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(13) esxA 항원, esxB 항원, isdA 항원, sta0006 항원, sta011 항원 및 spa 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서, 예를 들어 EsxAB 하이브리드로서 조합될 수 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다. spa 항원은 전장 spa 항원의 단편, 예를 들어 IgG Fc와의 결합을 교란하거나 감소시키도록 돌연변이된 Spa(D) 도메인일 수 있다.
(14) esxA 항원, esxB 항원, Hla 항원, sta0006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서, 예를 들어 EsxAB 하이브리드로서 조합될 수 있다. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(15) sdrD 항원, sdrE2 항원, isdC 항원 및 sdrE2 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다.
(16) esxA 항원, esxB 항원 및 hla 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(17) hla 항원, isdA 항원, sta0006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(18) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원 및 isdA 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다.
(19) sasD 항원, clfB 항원, sdrC 항원 및 hla 항원을 포함하는 면역원성 조성물. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(20) Hla 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(21) esxA 항원 및 esxB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다.
(22) esxA 항원, esxB 항원 및 sta006 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다.
(23) spa 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. spa 항원은 전장 spa 항원의 단편, 예를 들어 IgG Fc와의 결합을 교란하거나 감소시키도록 돌연변이된 Spa(D) 도메인일 수 있다.
(24) esxA 항원, esxB 항원, isdA 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서, 예를 들어 EsxAB 하이브리드로서 조합될 수 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다.
(25) sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(26) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원, isdA 항원 및 clfB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다. clfB 항원은 전장 clfB 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 163일 수 있다.
(27) sta006 항원, sta011 항원 및 sta019 항원을 포함하는 면역원성 조성물.
(28) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원, hla 항원 및 clfB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. clfB 항원은 전장 clfB 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 163일 수 있다. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(29) sta006 항원, sta011 항원, sta019 항원 및 hla 항원을 포함하는 면역원성 조성물. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다.
(30) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원, sta011 항원 및 clfB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. clfB 항원은 전장 clfB 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 163일 수 있다.
(31) spa 항원, esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. spa 항원은 전장 spa 항원의 단편, 예를 들어 IgG Fc와의 결합을 교란하거나 감소시키도록 돌연변이된 Spa(D) 도메인일 수 있다. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서, 예를 들어 EsxAB 하이브리드로서 조합될 수 있다.
(32) sdrD 항원, sdrE2 항원, isdC 항원 및 esxB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. sdrD 항원과 sdrE2 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 sdrD 항원의 하류에 sdrE2 항원이 있는 SdrDE 하이브리드가 있다.
(33) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원, sta011 항원 및 sta019 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다.
(34) esxA 항원, esxB 항원, sta006 항원, isdA 항원 및 sdrD 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다. sdrD 항원은 전장 sdrD 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 156일 수 있다.
(35) esxA 항원, esxB 항원 및 isdA 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다. isdA 항원은 전장 isdA 항원의 단편, 예를 들어 SEQ ID NO: 157일 수 있다.
(36) sasD 항원, clfB 항원, sdrC 항원, esxA 항원 및 esxB 항원을 포함하는 면역원성 조성물. esxA 항원과 esxB 항원은 하기 논의되는 하이브리드 폴리펩티드로서 유용하게 조합될 수 있으며, 예를 들어 esxA 항원의 하류에 esxB 항원이 있는 EsxAB 하이브리드가 있다.
(37) Hla 항원, spa 항원, sta006 항원 및 sta011 항원을 포함하는 면역원성 조성물. Hla 항원은 무독화된 돌연변이체일 수 있으며, 예를 들어 H35L 돌연변이를 포함한다. spa 항원은 전장 spa 항원의 단편, 예를 들어 IgG Fc와의 결합을 교란하거나 감소시키도록 돌연변이된 Spa(D) 도메인일 수 있다.
어떤 구체예에서, 이들 37개의 조성물은 어느 것이든 추가의 포도상구균 항원을 포함할 수 있으며, 이러한 추가 항원은 폴리펩티드 및/또는 당(saccharide)일 수 있다. 예를 들어, 이들은 또한, 예를 들어 항원형 5 및/또는 항원형 8 균주에 대한 하나 이상의 S. aureus 캡슐형 당 콘쥬게이트(들)를 유용하게 포함할 수 있다. 이러한 콘쥬게이트의 하나 또는 양자의 포함은 조합 (8), (10), (20), (23), (25), (31) 및 (37)에 특히 유용하다.
다른 구체예에서, 이들 37개의 조성물은 추가의 포도상구균 폴리펩티드 항원을 포함하지 않는다. 다른 구체예에서, 이들 37개의 조성물은 추가의 포도상구균 항원을 포함하지 않는다. 다른 구체예에서, 이들 37개의 조성물은 추가의 항원을 포함하지 않는다.
또한, 본 발명은 (a) SEQ ID NO: 151과 80% 이상의 동일성(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 151의 아미노산 1-97로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산 및 SEQ ID NO: 151의 아미노산 104-207로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산으로 이루어진 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 또한, 본 발명은 (a) SEQ ID NO: 152와 80% 이상의 동일성(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 152의 아미노산 1-104로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산 및 SEQ ID NO: 152의 아미노산 111-207로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산으로 이루어진 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이들 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 10의 야생형 포도상구균 단백질 및 SEQ ID NO: 11의 야생형 포도상구균 단백질을 모두 인식하는 항체를 도출할 수 있다(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때). 따라서, 면역반응은 항원 esxA와 esxB를 모두 인식할 것이다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 10의 에피토프와 SEQ ID NO: 11의 에피토프를 제공한다. 또한, 본 발명은 이러한 단백질과 수산화 알루미늄 애쥬번트와 같은 애쥬번트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 (a) SEQ ID NO: 241와 80% 이상의 동일성(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 241의 아미노산 1-96로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편과 SEQ ID NO: 241의 아미노산 103-205로부터의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 모두 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이들 폴리펩티드(예를 들어, SEQ ID NO: 250)는 SEQ ID NO: 10의 야생형 포도상구균 단백질 및 SEQ ID NO: 11의 야생형 포도상구균 단백질을 모두 인식하는 항체를 도출할 수 있다(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때). 따라서, 면역반응은 항원 esxA와 esxB를 모두 인식할 것이다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 10의 에피토프와 SEQ ID NO: 11의 에피토프를 제공한다. 또한, 본 발명은 이러한 단백질과 수산화 알루미늄 애쥬번트와 같은 애쥬번트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 포도상구균 용혈소 서열을 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 이 서열은 SEQ ID NO: 217과 적어도 90%의 동일성을 갖는 서열은 포함하지 않지만, 포도상구균을 죽일 수 있는 항체를 도출할 수 있다. 이 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 218과 80% 이상의 동일성(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖는 제 1 서열 및 SEQ ID NO: 219와 80% 이상의 동일성(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖는 제 2 서열을 가질 수 있으며, 여기서 제 1 서열과 제 2 서열은 직접 연결되거나, 또는 40개 미만의 아미노산(예를 들어, ≤35 아미노산, ≤30 아미노산, ≤25 아미노산, ≤20 아미노산, ≤15 아미노산, ≤10 아미노산, ≤5 아미노산)을 갖는 중재 아미노산 서열에 의해서 연결된다. SEQ ID NO: 189 및 216이 이러한 폴리펩티드의 예이며, 이때 제 1 서열과 제 2 서열은 테트라펩티드 PSGS 서열(SEQ ID NO: 225)에 의해서 연결된다.
또한, 본 발명은 sta011 항원과 Ca++ 이온을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 항원과 Ca++ 이온은 착물을 형성할 수 있는데, 예를 들어 항원에 있는 원자들이 Ca++ 이온과 배위될 수 있다. 면역원성 조성물은 또한 애쥬번트를 포함할 수 있다.
또한, 본 발명은 sta011 항원의 올리고머를 제공하며, 또한 이러한 올리고머를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 올리고머는 다이머, 트라이머, 테트라머, 펜타머, 헥사머, 헵타머, 옥타머 또는 그 이상의 올리고머일 수 있다. 올리고머는 Ca++ 이온을 포함할 수 있고, sta011 올리고머를 포함하는 조성물은 5-500 mM의 Ca++ 이온을 포함할 수 있다.
다른 폴리펩티드 항원들
본 발명의 다양한 항원 그룹의 항원들에 더하여, 면역원성 조성물은 조성물에 의해서 도출되는 면역반응의 S. aureus에 대한 효능을 증진시키기 위해서 다음의 S. aureus 항원들(또는 그것의 면역원성 단편(들)을 포함하는 항원) 중 한 가지 이상을 포함할 수 있다[예를 들어, 참고문헌 3-10]:
- AhpC
- AhpF
- 오토리신 아미다제
- 오토리신 글루코스아미니다제
- 콜라겐 결합 단백질 CAN
- EbhB
- GehD 리파제
- 헤파린 결합 단백질 HBP (17kDa)
- 라미닌 수용체
- MAP
- MntC (SitC라고도 한다)
- MRPII
- Npase
- ORF0594
- ORF0657n
- ORF0826
- PBP4
- RAP (RNA III 활성화 단백질)
- Sai-1
- SasK
- SBI
- SdrG
- SdrH
- SSP-1
- SSP-2
- 비트로넥틴-결합 단백질
당과의 조합
본 발명의 항원 그룹에서 확인되는 각 항원들은 콘쥬게이트된 당 항원과 조합하여 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹(상기 정의된)으로부터 선택되는 하나 이상의 항원(들); 및 (2) S. aureus 엑소폴리사카라이드(exopolysaccharide)와 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
이 조합의 성분 (2)에 사용되는 콘쥬게이트는 당 부분과 캐리어 부분을 포함한다. 당 부분은 S. aureus의 엑소폴리사카라이드로부터 유래하며, 폴리-N-아세틸글루코사민(PNAG)이다. 당은 박테리아로부터 엑소폴리사카라이드를 정제하는 동안 생기는 크기를 가진 다당일 수 있거나, 또는 이러한 다당의 단편화에 의해서 얻어지는 올리고당일 수 있으며, 예를 들어 크기는 400 kDa를 넘어서부터 75 kDa 내지 400 kDa까지, 또는 10 kDa 내지 75 kDa까지, 또는 30개 이하의 반복부 유닛까지 다양할 수 있다. 참고문헌 11에 설명된 대로, 당 부분은 다양한 정도로 N-아세틸화될 수 있으며, PNAG는 40% 미만 N-아세틸화될 수 있다(예를 들어, 35, 30, 20, 15, 10 또는 5% 미만의 N-아세틸화; 탈아세틸화된 PNAG는 dPNAG라고도 한다). PNAG의 탈아세틸화된 에피토프는 옵소닌 사멸을 매개할 수 있는 항체들을 도출할 수 있다. PNAG는 O-숙시닐화될 수도 있고 되지 않을 수도 있으며, 예를 들어 잔기의 25, 20, 15, 10, 5, 2, 1 또는 0.1% 미만이 O-숙시닐화될 수 있다.
또한, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택되는 하나 이상의 항원(들); 및 (2) S. aureus 캡슐형 당과 캐리어 단백질의 하나 이상의 컨쥬게이트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
이 조합의 성분 (2)에 사용되는 콘쥬게이트는 당 부분과 캐리어 부분을 포함한다. 당 부분은 S. aureus의 캡슐형 당으로부터 유래한다. 당은 박테리아로부터 캡슐형 다당을 정제하는 동안 생기는 크기를 가진 다당일 수 있거나, 또는 이러한 다당의 단편화에 의해서 얻어지는 올리고당일 수 있다. 캡슐형 당은 S. aureus(또는 유사한 또는 동일한 당을 갖는 박테리아)의 적합한 균주로부터, 예를 들어 타입 5 및/또는 타입 8 S. aureus 균주 및/또는 타입 336 S. aureus 균주로부터 얻어질 수 있다. 감염성 S. aureus의 균주는 대부분 타입 5 또는 타입 8 캡슐형 당 중 어느 하나를 함유한다. 이들은 모두 자신의 반복부 단위에 FucNAcp를 가질 뿐만 아니라, 결합을 위한 술프히드릴기를 도입하는데 사용될 수 있는 ManNAcA를 가진다. 타입 5 당의 반복 단위는 →4)-β-D-ManNAcA-(1→4)-α-L-FucNAc(3OAc)-(1→3)-β-D-FucNAc-(1→이고, 타입 8 당의 반복 단위는 →3)-β-D-ManNAcA(4OAc)-(1→3)-α-L-FucNAc(1→3)-α-D-FucNAc(1→이다. 타입 336 당은 O-아세틸화를 갖지 않는 β-연결된 헥속사민으로서[12,13], 336 균주(ATCC 55804)에 대해 생기는 항체들과 교차 반응한다. 타입 5 당과 타입 8 당의 조합이 전형적이며, 타입 336 당이 이 쌍에 부가될 수 있다[14].
또한, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들); (2) S. aureus 엑소폴리사카라이드와 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트; 및 (3) S. aureus 캡슐형 당과 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
이들 콘쥬게이트에서 캐리어 부분은 일반적으로 단백질이지만, 일반적으로는 (1)의 항원들 중 하나는 아니다. 전형적인 캐리어 단백질은 박테리아 독소, 예를 들어 디프테리아 또는 파상풍 독소, 또는 톡소이드 또는 그것의 돌연변이체나 단편이다. CRM197 디프테리아 독소 돌연변이체[15]가 유용하다. 다른 적합한 캐리어 단백질들은 N. meningitidis 외부 막 단백질 복합체[16], 합성 펩티드[17,18], 열 충격 단백질[19,20], 백일해 단백질[21,22], 사이토카인[23], 림포카인[23], 호르몬[23], 성장인자[23], N19[25]와 같은 다양한 병원균-유래 항원[24]으로부터의 다수의 사람 CD4+ T 세포 에피토프를 포함하는 인공 단백질, H. influenzae로부터의 단백질 D[26-28], 뉴모리신[29] 또는 그것의 비독성 유도체[30], 폐렴구균 표면 단백질 PspA[31], 철-흡수 단백질[32], C. difficile로부터의 독소 A 또는 B[33], 재조합 P. aeruginosa 외독소 A(rEPA)[34] 등을 포함한다. 어떤 구체예에서, 캐리어 단백질은 S. aureus 단백질이며, 예를 들어 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 항원이다.
조성물이 둘 이상의 콘쥬게이트를 포함하는 경우에 각 콘쥬게이트는 동일한 캐리어 단백질을 사용할 수도 있고 상이한 캐리어 단백질을 사용할 수도 있다.
콘쥬게이트는 과량의 캐리어(w/w) 또는 과량의 당(w/w)을 가질 수 있다. 어떤 구체예에서, 콘쥬게이트는 실질적으로 각각 동일한 중량을 포함할 수 있다.
캐리어 분자는 캐리어에 직접 공유 결합으로 콘쥬게이트되거나 링커를 통해 캐리어에 공유 결합으로 콘쥬게이트될 수 있다. 단백질과 캐리어의 직접 결합은, 예를 들어 당과 캐리어 사이의 환원성 아민화에 의해서 달성될 수 있으며, 이것에 관해서는 예를 들어 참고문헌 35 및 36에 설명된다. 먼저 당이, 예를 들어 산화에 의해서 활성화될 필요가 있을 수 있다. 링커기를 통한 결합은 공지의 과정, 예를 들어 참고문헌 37 및 38에 설명된 과정을 이용해서 이루어질 수 있다. 바람직한 타입의 결합은 아디프산 링커이며, 이것은 자유 -NH2 기(예를 들어, 아민화에 의해서 글루칸에 도입된)와 아디프산을 커플링시킨 다음(예를 들어, 디이미드 활성화를 이용해서), 결과의 당-아디프산 중간체에 단백질을 커플링시킴으로써 형성될 수 있다[39,40]. 다른 바람직한 타입의 결합은 카르보닐 링커이며, 이것은 당 CDI의 자유 히드록실기의 반응 후에[41,42], 단백질과 반응시켜서 카르바메이트 결합을 형성함으로써 형성될 수 있다. 다른 링커들은 β-프로피오아미도[43], 니트로페닐-에틸아민[44], 할로아실 할로겐화물[45], 글리코시드 결합[46], 6-아미노카프로익산[47], ADH[48], C4-C12 부분[49] 등을 포함한다. 또한, 카르보디이미드 축합이 사용될 수 있다[50].
PNAG 콘쥬게이트는 다양한 방식으로 제조될 수 있는데, 예를 들어 a) 말레이미드기를 포함하는 링커를 부가하여 PNAG를 활성화함으로써 활성화된 PNAG를 형성하는 단계; b) 술프히드릴기를 포함하는 링커를 부가하여 캐리어 단백질을 활성화시킴으로써 활성화된 캐리어 단백질을 형성하는 단계; 및 c) 활성화된 PNAG와 활성화된 캐리어 단백질을 반응시켜서 PNAG-캐리어 단백질 콘쥬게이트를 형성하는 단계를 포함하는 과정에 의해, 또는 a) 술프히드릴기를 포함하는 링커를 부가하여 PNAG를 활성화함으로써 활성화된 PNAG를 형성하는 단계; b) 말레이미드기를 포함하는 링커를 부가하여 캐리어 단백질을 활성화시킴으로써 활성화된 캐리어 단백질을 형성하는 단계; 및 c) 활성화된 PNAG와 활성화된 캐리어 단백질을 반응시켜서 PNAG-캐리어 단백질 콘쥬게이트를 형성하는 단계를 포함하는 과정에 의해, 또는 a) 술프히드릴기를 포함하는 링커를 부가하여 PNAG를 활성화함으로써 활성화된 PNAG를 형성하는 단계; b) 술프히드릴기를 포함하는 링커를 부가하여 캐리어 단백질을 활성화시킴으로써 활성화된 캐리어 단백질을 형성하는 단계; 및 c) 활성화된 PNAG와 활성화된 캐리어 단백질을 반응시켜서 PNAG-캐리어 단백질 콘쥬게이트를 형성하는 단계를 포함하는 과정에 의해 제조될 수 있다.
본 발명의 항원 그룹에서 확인되는 각 항원은 엑소폴리사카라이드에 대한 캐리어 단백질로서 사용될 수 있으며, 이로써 공유 결합 콘쥬게이트가 형성된다. 이와 같이, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 및 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 항원과 (2) S. aureus 엑소폴리사카라이드의 콘쥬게이트를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 또한, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 및 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 항원과 (2) S. aureus 캡슐형 당의 콘쥬게이트를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 이러한 콘쥬게이트들의 추가의 특징들은 상기 설명된다. 이들 콘쥬게이트는 본원에 개시된 항원들 중 어느 것과도 조합될 수 있다.
비-포도상구균 항원과의 조합
본 발명의 항원 그룹에서 확인되는 각 항원은 비-포도상구균 항원과의 조합에, 특히 병원감염과 관련된 박테리아로부터의 항원들과의 조합에 사용될 수 있다. 이와 같이, 본 발명은 (1) 제 1, 제 2, 제 3 및 제 4 항원 그룹(상기 정의된)으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들); 및 (2) Clostridium difficile ; Pseudomonas aeruginosa; Candida albicans ; 및 장외 병원성 Escherichia coli로 구성되는 그룹으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들)의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 본 발명의 포도상구균 항원들과의 조합에 사용되는 추가의 적합한 항원들은 참고문헌 51의 33-46 페이지에 기재되어 있다.
제 1 항원 그룹
clfA
'clfA' 항원은 '응집(clumping) 인자 A'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 clfA는 SAOUHSC_00812이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 1을 가진다(GI:88194572). Newman 균주에서는 nwmn_0756이다(GI:151220968).
유용한 clfA 항원은 SEQ ID NO: 1을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 1과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 1의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 clfA 단백질은 SEQ ID NO: 1의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 1의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 1의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 1의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 1의 마지막 368개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 1의 처음 39개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
SEQ ID NO: 224가 SEQ ID NO: 1의 유용한 단편이다('ClfA40 -559'). 이 단편은 SEQ ID NO: 1의 C-말단 쪽에서 긴 반복 영역이 제외된다.
clfB
'clfB' 항원은 '응집(clumping) 인자 B'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 clfB는 SAOUHSC_02963이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 2를 가진다(GI:88196585). Newman 균주에서는 nwmn_2529이다(GI:151222741).
유용한 clfB 항원은 SEQ ID NO: 2를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 2와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 2의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 clfB 단백질은 SEQ ID NO: 2의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 2의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 2의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 2의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 2의 마지막 40개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 2의 처음 44개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. ClfB는 본래 긴 단백질이기 때문에 단편을 사용하는 것이, 예를 들어 정제, 취급, 융합, 발현 등에 도움이 된다.
SEQ ID NO: 163이 SEQ ID NO: 2의 유용한 단편이다('ClfB45 -552'). 이 단편은 ClfB의 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다. ClfB의 3-도메인 모델에 기초한 다른 유용한 단편들은 ClfB45 -360(CLfB-N12라고 알려짐; SEQ ID NO: 196); ClfB212 -542(CLfB-N23라고 알려짐; SEQ ID NO: 197); 및 ClfB360 -542(CLfB-N3라고 알려짐; SEQ ID NO: 198)를 포함한다.
coA
'coA' 항원은 '코아귤라제 Coa'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 coA는 SAOUHSC_00192이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 3을 가진다(GI:88194002). Newman 균주에서는 nwmn_0166이다(GI:151220378).
유용한 coA 항원은 SEQ ID NO: 3을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 3과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 3의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 coA 단백질은 SEQ ID NO: 3의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 3의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 3의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 3의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 3의 처음 14개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
eap
'eap' 항원은 'NHC II형 유사체 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 eap는 SAOUHSC_02161이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 4를 가진다(GI:88195840). Newman 균주에서는 nwmn_1872이다(GI:151222084).
유용한 eap 항원은 SEQ ID NO: 4를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 4와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 4의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 eap 단백질은 SEQ ID NO: 4의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 4의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 4의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 4의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 4의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
ebhA
'ebhA' 항원은 'EbhA'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 ebhA는 SAOUHSC _01447이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 5를 가진다(GI:88195168).
유용한 ebhA 항원은 SEQ ID NO: 5를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 5와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 5의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 ebhA 단백질은 SEQ ID NO: 5의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 5의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 5의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 5의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 5의 처음 39개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
ebpS
'ebpS' 항원은 '엘라스틴 결합 단백질 EbpS'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 ebpS는 SAOUHSC_01501이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 6이다(GI:88195217). Newman 균주에서는 nwmn_1389이다(GI:151221601).
유용한 ebpS 항원은 SEQ ID NO: 6을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 6과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 6의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 ebpS 단백질은 SEQ ID NO: 6의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 6의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 6의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 6의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
SEQ ID NO: 165가 SEQ ID NO: 6의 유용한 단편이다('EbpS1 -198'). 이 단편은 EbpS의 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다.
efb
'efb' 항원은 '피브리노겐 결합 단백질 절단형(truncated)'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 efb는 SAOUHSC_01114이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 7을 가진다(GI:88194860). Newman 균주에서는 nwmn_1069이다(GI:151221281).
유용한 efb 항원은 SEQ ID NO: 7을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 7과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 7의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 efb 단백질은 SEQ ID NO: 7의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 7의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 7의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 7의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 7의 처음 14개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
emp
'emp' 항원은 '세포외 바탕질 및 혈장 결합 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 emp는 SAOUHSC_00816이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 8이다(GI: 88194575). Newman 균주에서는 nwmn_0758이다(GI:151220970).
유용한 emp 항원은 SEQ ID NO: 8을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 8과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 8의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 emp 단백질은 SEQ ID NO: 8의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 8의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 8의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 8의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 8의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
SEQ ID NO: 190, 191, 192 및 193이 SEQ ID NO: 8의 유용한 단편들이다(각각 'Emp35-340', 'Emp27 -334, 'Emp35 -334', 및 'Emp27 -147').
esaC
'esaC' 항원은 'esaC'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 esaC는 SAOUHSC_ 00264이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 9를 가진다(GI:88194069).
유용한 esaC 항원은 SEQ ID NO: 9를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 9와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 9의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 esaC 단백질은 SEQ ID NO: 9의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 9의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 9의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 9의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
esxA
'esxA' 항원은 '단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 esxA는 SAOUHSC_ 00257이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 10을 가진다(GI:88194063).
유용한 esxA 항원은 SEQ ID NO: 10을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 10과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 10의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90 또는 그 이상). 이러한 esxA 단백질은 SEQ ID NO: 10의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 10의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 10의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 10의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
esxB
'esxB' 항원은 'esxB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 esxB는 SAOUHSC_ 00265이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 11을 가진다(GI:88194070).
유용한 esxB 항원은 SEQ ID NO: 11을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 11과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 11의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 esxB 단백질은 SEQ ID NO: 11의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 11의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 11의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 11의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
FnBA
'FnBA' 항원은 '피브로넥틴 결합 단백질 A 전구체 FnBPA'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 FnBA는 SAOUHSC_02803이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 12를 가진다(GI:88196438). Newman 균주에서는 nwmn_2399이다(GI:151222611). 단백질체 분석(proteomic analysis)에서 이 단백질은 분비되거나 표면 노출되는 것으로 드러났다.
유용한 FnBA 항원은 SEQ ID NO: 12를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 12와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 12의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 FnBA 단백질은 SEQ ID NO: 12의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 12의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 12의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 12의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 12의 마지막 37개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 2의 처음 44개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. FnBA는 본래 긴 단백질이기 때문에 단편을 사용하는 것이, 예를 들어 정제, 취급, 융합, 발현 등에 도움이 된다.
SEQ ID NO: 166('FnBA1 -511') 및 167('FnBA512 -953')이 SEQ ID NO: 12의 유용한 단편들이다. 이들 단편은 EbpS의 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다.
FnBB
'FnBB' 항원은 '피브로넥틴 결합 단백질 B FnBPB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 FnBB는 SAOUHSC_02802이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 13을 가진다(GI: 88196437). Newman 균주에서는 nwmn_2397이다(GI:151222609).
유용한 FnBB 항원은 SEQ ID NO: 13을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 13과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 13의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 FnBB 단백질은 SEQ ID NO: 13의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 13의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 13의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 13의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 13의 마지막 37개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 2의 처음 44개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
Hla
'Hla' 항원은 '알파-헤몰리신 전구체'로서, '알파 독소' 또는 간단하게 '헤몰리신'이라고도 알려져 있다. NCTC 8325 균주에서 Hla는 SAOUHSC_01121이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 14를 가진다(GI:88194865). Newman 균주에서는 nwmn_1073이다(GI:151221285). Hla는 S. aureus의 대부분의 균주들에 의해 생산되는 중요한 병독성 결정소이며, 기공-형성 및 용혈 활성을 가진다. 항-Hla 항체들은 동물 모델에서 이 독소의 유해한 효과를 중화할 수 있었으며, Hla는 폐렴을 방어하는데 특히 유용하다.
유용한 Hla 항원은 SEQ ID NO: 14를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 14와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 14의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 Hla 단백질은 SEQ ID NO: 14의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 14의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 14의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 14의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 14의 처음 26개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 2의 처음 44개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다(예를 들어, SEQ ID NO: 231을 얻기 위해서). 또한, C-말단에서의 절단(Truncation)을 이용하여, 예를 들어 단지 50개의 아미노산만을 남길 수 있다(SEQ ID NO: 14의 잔기 27-76)[52]. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
Hla의 독성은 화학적 불활성화에 의해서 본 발명의 조성물에서 회피될 수 있다(예를 들어, 포름알데히드, 글루타르알데히드 또는 다른 가교결합 시약을 사용하여). 그러나, 대신에 면역원성을 보유한 채로 독성 활성만을 제거한 Hla의 돌연변이체 형태를 사용하는 것이 바람직하다. 이러한 무독화된 돌연변이체들은 본 분야에 이미 공지되어 있다. 한 유용한 Hla 항원은 성숙한 항원의 잔기 35에 해당하는, SEQ ID NO: 14의 잔기 61에 돌연변이를 가진다(즉, 처음 26개의 N-말단 아미노산이 제외된 후 = SEQ ID NO: 231의 잔기 35). 따라서, 잔기 61은 히스티딘이 아닐 수 있으며, 대신에 예를 들어 Ile, Val 또는 바람직하게는 Leu일 수 있다. 이 위치에서 His-Arg 돌연변이가 또한 사용될 수 있다. 예를 들어, SEQ ID NO: 150은 성숙 돌연변이체 Hla-H35L 서열(즉, H35L 돌연변이를 가진 SEQ ID NO: 231)이고, 유용한 Hla 항원은 SEQ ID NO: 150을 포함한다. 다른 유용한 돌연변이는 긴 루프를 짧은 서열로 치환한 것으로서, 예를 들어 SEQ ID NO: 14의 잔기 136-174의 39mer가 SEQ ID NO: 189(이것은 H35L 돌연변이를 포함한다) 및 SEQ ID NO: 216(이것은 H35L 돌연변이를 포함하지 않는다)에서와 같이 PSGS와 같은 테트라머로 치환될 수 있다(SEQ ID NO:225). 다른 유용한 돌연변이는 잔기 Y101이, 예를 들어 로이신으로 치환된 것이다(SEQ ID NO: 242). 다른 유용한 돌연변이는 잔기 D152가, 예를 들어 로이신으로 치환된 것이다(SEQ ID NO: 243). 다른 유용한 돌연변이체는 잔기 H35와 Y101이, 예를 들어 로이신으로 치환된 것이다(SEQ ID NO: 244). 다른 유용한 돌연변이체는 잔기 H35와 D152가, 예를 들어 로이신으로 치환된 것이다(SEQ ID NO: 245). 추가의 유용한 Hla 항원들이 참고문헌 53 및 55에 개시된다.
SEQ ID NO: 160, 161 및 194가 SEQ ID NO: 14의 3개의 유용한 단편들이다(각각 'Hla27 -76', 'Hla27 -59' 및 'Hla27 -79'). SEQ ID NO: 158, 159 및 195는 SEQ ID NO: 150의 상응하는 단편들이다.
한 유용한 Hla 서열은 SEQ ID NO: 232이며, 이것이 실시예에 사용된다. 이것은 N-말단 Met, 다음에 발현 벡터로부터의 Ala-Ser 디펩티드, 다음에 SEQ ID NO: 150(NCTC8325 균주 유래의)을 가진다, 이것은 SEQ ID NO: 233에 의해 암호화된다.
hlgB
'hlgB' 항원은 '류코시딘 f 서브유닛 전구체 HlgB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 hlgB는 SAOUHSC_02710이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 15을 가진다(GI:88196350).
유용한 hlgB 항원은 SEQ ID NO: 15를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 15와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 15의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 hlgB 단백질은 SEQ ID NO: 15의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 15의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 15의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 15의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 15의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
hlgC
'hlgC' 항원은 '류코시딘 s 서브유닛 전구체 HlgC'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 clfB는 SAOUHSC_02709이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 16을 가진다(GI:88196349).
유용한 hlgC 항원은 SEQ ID NO: 16을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 16과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 16의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 hlgC 단백질은 SEQ ID NO: 16의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 16의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 16의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 16의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 16의 처음 29개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
isdA
'isdA' 항원은 'IsdA 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdA는 SAOUHSC_01081이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 17을 가진다(GI:88194829). Newman 균주에서는 nwmn_1041이다(GI:151221253).
유용한 isdA 항원은 SEQ ID NO: 17을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 17과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 17의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 isdA 단백질은 SEQ ID NO: 17의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 17의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 17의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 17의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 17의 마지막 38개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 17의 처음 46개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 또한, SEQ ID NO: 17의 C-말단 38mer를 제외시키기 위한 절단이 유용하다(LPKTG 모티프에서 시작하는). 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
SEQ ID NO: 157이 SEQ ID NO: 17의 유용한 단편이며(SEQ ID NO: 17의 아미노산 40-184; 'IsdA40 -184'), 이것은 천연 단백질의 헴(heme) 결합 부위를 포함하고, 항원의 가장 노출된 도메인을 포함한다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다. 다른 유용한 단편들이 참고문헌 55 및 56에 개시된다.
IsdA는 수산화 알루미늄 애쥬번트에 잘 흡착하지 않기 때문에 조성물에 존재하는 IdsA는 흡착되지 않은 상태일 수 있거나, 또는 다른 애쥬번트, 예를 들어 인산 알루미늄에 흡착될 수 있다.
항-IsdA 항체는 S. aureus 농양 형성 및 치사량의 시험감염으로부터 쥐를 보호한다[57].
isdB
'isdB' 항원은 '뉴로필라멘트(neurofilament) 단백질 isdB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdB는 SAOUHSC_01079이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 18을 가진다(GI:88194828). IsdB는 단독으로 백신 항원으로서의 사용이 제안되었지만[2], 이것은 폐렴을 예방하지 못할 수 있다.
유용한 isdB 항원은 SEQ ID NO: 18을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 18과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 18의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 isdB 단백질은 SEQ ID NO: 18의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 8의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 18의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 18의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 18의 마지막 36개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 18의 처음 40개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. IsdB의 유용한 단편들이 참고문헌 56 및 58에 개시되며, 예를 들어 SEQ ID NO: 18의 37개 내부 아미노산을 결여한 것이 있다.
항-IsdB 항체는 S. aureus 농양 형성 및 치사량의 시험감염으로부터 쥐를 보호한다[57].
어떤 구체예에서, 본 발명의 조성물은 isdB 항원을 포함하지 않는다.
isdC
'isdC' 항원은 '단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdC는 SAOUHSC _01082이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 19를 가진다(GI:88194830).
유용한 isdC 항원은 SEQ ID NO: 19를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 19와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 19의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 isdC 단백질은 SEQ ID NO: 19의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 19의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 19의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 19의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 19의 마지막 39개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 19의 처음 28개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. IsdB의 유용한 단편들이 참고문헌 56에 개시된다.
참고문헌 59에 IsdB와 IsdH 양자로부터의 에피토프를 유용하게 포함하는 항원들이 개시된다.
isdG
'isdG' 항원은 '헴-변성 모노옥시게나제 IsdG'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdG는 SAOUHSC_01089이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:20이다(GI:88194836).
유용한 isdG 항원은 SEQ ID NO: 20을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 20과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 20의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 isdG 단백질은 SEQ ID NO: 20의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 20의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 20의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 20의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
isdH
'isdH' 항원은 'isdH'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdH는 SAOUHSC_ 01843이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 21을 가진다(GI:88195542). Newman 균주에서는 nwmn_1624이다(GI:151221836). 이것은 또한 HarA라고도 한다.
유용한 isdH 항원은 SEQ ID NO: 21을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 21과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 21의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 isdH 단백질은 SEQ ID NO: 21의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 21의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 21의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 21의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 21의 마지막 35개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 21의 처음 40개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
참고문헌 59에 IsdB와 IsdH 양자로부터의 에피토프를 유용하게 포함하는 항원들이 개시된다.
isdI
'isdI' 항원은 '헴-변성 모노옥시게나제 IsdI'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 isdI는 SAOUHSC_00130이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:22이다(GI:88193943).
유용한 isdI 항원은 SEQ ID NO: 22를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 22와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 22의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 isdI 단백질은 SEQ ID NO: 22의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 22의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 22의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 22의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
lukD
'lukD' 항원은 '류코톡신 LukD'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 lukD는 SAOUHSC_01954이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 23를 가진다(GI:88195647). Newman 균주에서는 nwmn_1781(GI:151221930)이다.
유용한 lukD 항원은 SEQ ID NO: 23을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 23과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 23의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 lukD 단백질은 SEQ ID NO: 23의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 23의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 23의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 23의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 23의 마지막 43개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 23의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
lukE
'lukE' 항원은 '류코톡신 LukE'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 lukE는 SAOUHSC_01955이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 24를 가진다(GI:88195648).
유용한 lukE 항원은 SEQ ID NO: 24를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 24와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 24의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 lukE 단백질은 SEQ ID NO: 24의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 24의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 24의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 24의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
lukF
'lukF' 항원은 '류코시딘/헤몰리신 독소 패밀리 LukF'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 lukF는 SAOUHSC_02241이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 25를 가진다(GI:88195914).
유용한 lukF 항원은 SEQ ID NO: 25를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 25와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 25의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 lukF 단백질은 SEQ ID NO: 25의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 25의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 25의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 25의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
lukS
'lukS' 항원은 '유망한 류코시딘 S 서브유닛 LukS'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 lukS는 SAOUHSC_02243이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 26을 가진다(GI: 88195915). Newman 균주에서는 nwmn_1928이다(GI:151222140).
유용한 lukS 항원은 SEQ ID NO: 26을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 26과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 26의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 lukS 단백질은 SEQ ID NO: 26의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 26의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 26의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 26의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 26의 처음 22개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
nuc
'nuc' 항원은 '서모뉴클레아제 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 nuc는 SAOUHSC_01316이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 27을 가진다(GI:88195046).
유용한 nuc 항원은 SEQ ID NO: 27을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 27과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 27의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 nuc 단백질은 SEQ ID NO: 27의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 27의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 27의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 27의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 27의 마지막 39개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 27의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sasA
'sasA' 항원은 'SasA'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sasA는 SAOUHSC_ 02990이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 28을 가진다(GI:88196609).
유용한 sasA 항원은 SEQ ID NO: 28을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 28과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 28의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sasA 단백질은 SEQ ID NO: 28의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 28의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 28의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 28의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 28의 마지막 43개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 28의 처음 90개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sasB
'sasB' 항원은 'fmtB 단백질; SasB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sasB는 SAOUHSC_02404이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 29를 가진다(GI:88196065).
유용한 sasB 항원은 SEQ ID NO: 29를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 29와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 29의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sasB 단백질은 SEQ ID NO: 29의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 29의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 29의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 29의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 29의 마지막 39개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 29의 처음 39개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sasC
'sasC' 항원은 'Mrp 단백질; SasC'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sasC는 SAOUHSC_01873이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 30을 가진다(GI:88195570).
유용한 sasC 항원은 SEQ ID NO: 30을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 30과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 30의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sasC 단백질은 SEQ ID NO: 30의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 30의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 30의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 30의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 30의 마지막 36개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 30의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sasD
'sasD' 항원은 'SasD 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sasD는 SAOUHSC_00094이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 31을 가진다(GI:88193909).
유용한 sasD 항원은 SEQ ID NO: 31을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 31과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 31의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sasD 단백질은 SEQ ID NO: 31의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 31의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 31의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 31의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 31의 처음 28개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sasF
'sasF' 항원은 'SasF 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sasF는 SAOUHSC_02982이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 32를 가진다(GI:88196601).
유용한 sasB 항원은 SEQ ID NO: 32를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 32와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 32의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sasF 단백질은 SEQ ID NO: 32의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 32의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 32의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 32의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 32의 마지막 39개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 32의 처음 37개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sdrC
'sdrC' 항원은 'sdrC 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sdrC는 SAOUHSC_00544이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 33을 가진다(GI:88194324).
유용한 sdrC 항원은 SEQ ID NO: 33을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 33과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 33의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sdrC 단백질은 SEQ ID NO: 33의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 33의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 33의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 33의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 33의 마지막 38개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 33의 처음 50개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. sdrC는 본래 긴 단백질이기 때문에 단편을 사용하는 것이, 예를 들어 정제, 취급, 융합, 발현 등에 도움이 된다.
SEQ ID NO: 164가 SEQ ID NO: 33의 유용한 단편이다('SdrC51 -518'). 이 단편은 SdrC의 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다.
sdrD
'sdrD' 항원은 'sdrD 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sdrD는 SAOUHSC_00545이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 34를 가진다(GI:88194325).
유용한 sdrD 항원은 SEQ ID NO: 34를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 34와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 34의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sdrD 단백질은 SEQ ID NO: 34의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 34의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 34의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 34의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 34의 마지막 38개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 34의 처음 52개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. sdrD는 본래 긴 단백질이기 때문에 단편을 사용하는 것이, 예를 들어 정제, 취급, 융합, 발현 등에 도움이 된다.
SEQ ID NO: 156이 SEQ ID NO: 34의 유용한 단편이다('SdrD53 -592'). 이 단편은 SdrD 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다. 동일한 C-말단 잔기를 가진 다른 유용한 단편은 SdrD394 -592이다(SdrD-N3이라고도 한다; SEQ ID NO: 199). 다른 유용한 단편은 SEQ ID NO: 236(SEQ ID NO: 34의 아미노산 593-1123)이며, 본원에서는 'SdrDCnaB'라고 한다.
sdrE2
'sdrE2' 항원은 'Ser-Asp 부화 피브리노겐/뼈 시알로프로테인 결합 단백질 SdrE'라고 설명된다. Newman 균주에서 sdrE2는 NWMN_0525이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 35를 가진다(GI:151220737).
유용한 sdrE2 항원은 SEQ ID NO: 35를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 35와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 35의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sdrE2 단백질은 SEQ ID NO: 35의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 35의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 35의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 35의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 35의 마지막 38개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 35의 처음 52개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. sdrE2는 본래 긴 단백질이기 때문에 단편을 사용하는 것이, 예를 들어 정제, 취급, 융합, 발현 등에 도움이 된다.
SEQ ID NO: 155가 SEQ ID NO: 35의 유용한 단편이다('SdrE53 -632'). 이 단편은 SdrE2 가장 노출된 도메인을 포함하며, 산업적 규모로 더 쉽게 사용된다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다.
spa
'spa' 항원은 '단백질 A' 또는 'Spa'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 spa는 SAOUHSC_00069이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 36을 가진다(GI:88193885). Newman 균주에서는 nwmn_0055(GI:151220267)이다. 모든 S. aureus 균주는 spa에 대한 구조적 유전자와 잘 특정된 병독성 인자를 발현하며, 병독성 인자의 세포벽-고정된 표면 단백질 산물은 E, D, A, B 및 C로 지정된 5개의 고도로 상동성인 면역글로불린 결합 도메일을 가진다[60]. 이들 도메인은 아미노산 수준에서는 약 80%의 동일성을 나타내고, 길이에 있어서는 56 내지 61개 잔기 길이이며, 탠덤 반복부로서 조직된다[61]. SpA는 N-말단 신호 펩티드와 C-말단 정렬 신호를 가진 전구체 단백질로서 합성된다[62,63]. 세포벽-고정된 spa는 포도상구균 표면에 매우 풍부하게 나타난다[64,65]. 그것의 면역글로불린 결합 도메인은 각각 역평행 α-나선들로 이루어져 3개의 나선 번들로 조립되고, 면역글로불린 G(IgG)의 Fc 도메인[66, 67], IgM(즉, B 세포 수용체)의 VH3 중쇄(Fab)[68], A1 도메인에 있는 본 윌레브란트(von willebrand) 인자[69] 및/또는 기도 상피의 표면에 나타나는 TNF-수용체 I(TNFRI)[70]과 결합할 수 있다.
유용한 spa 항원은 SEQ ID NO: 36을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 36과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 36의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sap 단백질은 SEQ ID NO: 36의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 36의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 36의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 36의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 36의 마지막 35개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 36의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. 참고문헌 71에는 각 IgG-결합 도메인이 단독으로 또는 조합으로 유용한 면역원일 수 있다는 것이 제시된다.
SEQ ID NO: 162가 SEQ ID NO: 36의 유용한 단편이다('Spa37-325'). 이 단편은 5개의 SpA Ig-결합 도메인(이들은 자연적으로 N-말단에서 C-말단으로 E, D, A, B, C의 순서로 배열된다)을 모두 함유하고, SpA의 가장 노출된 도메인을 포함한다. 이것은 또한 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다. 다른 유용한 단편들은 천연 A, B, C, D 및/또는 E 중 1, 2, 3 또는 4개가 제외될 수 있으며, 이로써 과잉의 B 세포 확장 및 다음으로 spa가 B 세포 수퍼항원(superantigen)으로서 기능할 경우 일어날 수 있는 세포자살(apoptosis)이 방지될 수 있다. 참고문헌 71에 보고된 대로, 다른 유용한 단편들은 천연 A, B, C, D 및/또는 E 도메인 중 단지 1, 2, 3 또는 4개만을 포함할 수 있으며, 예를 들어 B 내지 E는 포함하지 않고 SpA(A) 도메인만을 포함하거나, 또는 A, B, C 또는 E는 포함하지 않고 SpA(D) 도메인만을 포함하거나 하는 등이다. 이와 같이, 본 발명에서 유용한 spa 항원은 1, 2, 3, 4 또는 5개의 IgG-결합 도메인을 포함할 수 있으며, 이상적인 것은 4개 이하를 갖는 것이다.
항원이 spa 도메인들 중 한 가지 타입만을 포함하는 경우(예를 들어, SpA(A) 또는 SpA(D) 도메인만), 항원은 이 도메인의 둘 이상의 카피를 포함할 수 있는데, 예를 들어 단일 폴리펩티드 사슬에 다수의 SpA(D) 도메인을 포함할 수 있다.
항원 내의 각 도메인은 SEQ ID NO: 36에 비하여 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상의 아미노산에서 돌연변이될 수 있다(예를 들어, 참고문헌 71을 참조하며, 여기에는 도메인 D의 잔기 3 및/또는 24에 있는 돌연변이와 도메인 A의 잔기 46 및/또는 53에 있는 돌연변이 등이 개시된다). 이러한 돌연변이체는 SEQ ID NO: 36을 인식하는 항체를 도출하는 항원의 능력을 없애서는 안되지만, 항원이 IgG 및/또는 다른 인간 단백질(인간 혈액 단백질과 같은)과 결합하는 능력은 없앨 수 있다.
어떤 양태에서, spa 항원은 (a) SpA 도메인 A, B, C, D 및/또는 E의 IgG Fc 결합 서브-도메인에 IgG Fc와의 결합을 교란시키거나 감소시키는 하나 이상의 아미노산 치환, 및 (b) SpA 도메인 A, B, C, D 및/또는 E의 VH3 결합 서브-도메인에 VH3와의 결합을 교란시키거나 감소시키는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 어떤 구체예에서, 변이체 SpA는 최소한 또는 최대한 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상의 변이체 SpA 도메인 D 펩티드를 포함한다.
제 2 항원 그룹
sta001
'sta001' 항원은 '5'-뉴클레오디다제 패밀리 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta001은 SAOUHSC_00025이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 37을 가진다(GI:88193846). Newman 균주에서는 nwmn_0022이다(GI:151220234). 이것은 또한 AdsA 및 SasH 및 SA0024라고도 언급되었다.
유용한 sta001 항원은 SEQ ID NO: 37을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 37과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 37의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta001 단백질은 SEQ ID NO: 37의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 37의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 37의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 37의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 37의 마지막 34개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 37의 처음 38개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta002
'sta002' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta002는 SAOUHSC_00356이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 38이다(GI:88194155). Newman 균주에서는 nwmn_0364이다(GI:151220576).
유용한 sta002 항원은 SEQ ID NO: 38을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 38과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 38의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta002 단백질은 SEQ ID NO: 38의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 38의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 38의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 38의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 38의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
SEQ ID NO: 153('sta00219 -187') 및 154('sta00219 -124')가 SEQ ID NO: 38의 2개의 유용한 단편이며, 이들은 항원의 인간 단백질과의 유사성을 감소시킨다.
sta003
'sta003' 항원은 '표면 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta003은 SAOUHSC_00400이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 39이다(GI:88194195). Newman 균주에서는 nwmn_0401이다(GI:151220613).
유용한 sta003 항원은 SEQ ID NO: 39를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 39와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 39의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta003 단백질은 SEQ ID NO: 39의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 39의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 39의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 39의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 39의 처음 32개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta004
'sta004' 항원은 '사이드로포어(siderophore) 결합 단백질 FatB'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta004는 SAOUHSC_00749이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 40을 가진다(GI:88194514). Newman 균주에서는 nwmn_0705이다(GI:151220917).
유용한 sta004 항원은 SEQ ID NO: 40을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 40과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 40의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta004 단백질은 SEQ ID NO: 40의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 40의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 40의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 40의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 40의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta005
'sta005' 항원은 '수퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta005는 SAOUHSC_01127이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 41이다(GI:88194870). Newman 균주에서는 nwmn_1077이다(GI:151221289)
유용한 sta005 항원은 SEQ ID NO: 41을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 41과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 41의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta005 단백질은 SEQ ID NO: 41의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 41의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 41의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 41의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 41의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta006
'sta006' 항원은 '페리크롬(ferrichrome) 결합 단백질'이라고 설명되며, 문헌에서는 'FhuD2'라고도 언급된다[72]. NCTC 8325 균주에서 sta006은 SAOUHSC_ 02554이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 42이다(GI:88196199). Newman 균주에서는 nwmn_2185이다(GI:151222397).
유용한 sta006 항원은 SEQ ID NO: 42를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 42와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 42의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta006 단백질은 SEQ ID NO: 42의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 42의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 42의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 42의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 42의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다(SEQ ID NO: 246을 제공하기 위해서). 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. sta006의 돌연변이체 형태들이 참고문헌 73에 보고된다. sta006 항원은, 예를 들어 아실화된 N-말단 시스테인으로 리피드화될 수 있다. 한 유용한 sta006 서열은 SEQ ID NO: 248이며, 이것은 N-말단에 Met-Ala-Ser- 서열을 가진다.
sta007
'sta007' 항원은 '분비형 항원 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta007은 SAOUHSC_02571이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:43을 가진다(GI:88196215). Newman 균주에서는 nwmn_2199이다(GI:151222411). 단백질체 분석에서 이 단백질은 분비되거나 또는 표면 노출되는 것으로 드러났다.
유용한 sta007 항원은 SEQ ID NO: 43을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 43과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 43의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta007 단백질은 SEQ ID NO: 43의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 43의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 43의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 43의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 43의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta008
'sta008' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta007은 SAOUHSC_02650이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 44이다(GI:88196290). Newman 균주에서는 nwmn_2270이다(GI:151222482).
유용한 sta008 항원은 SEQ ID NO: 44를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 44와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 44의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta008 단백질은 SEQ ID NO: 44의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 44의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 44의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 44의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 44의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta009
'sta009' 항원은 '면역글로불린 G-결합 단백질 Sbi'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta009는 SAOUHSC_02706이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 45를 가진다(GI:88196346). Newman 균주에서는 nwmn_2317이다(GI:151222529).
유용한 sta009 항원은 SEQ ID NO: 45를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 45와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 45의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta009 단백질은 SEQ ID NO: 45의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 45의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 45의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 45의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 45의 처음 29개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta010
'sta010' 항원은 '면역우성 항원 A'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta010은 SAOUHSC_02887이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 46이다(GI:88196515). Newman 균주에서는 nwmn_2469이다(GI:151222681). 단백질체 분석에서 이 단백질은 분비되거나 표면 노출되는 것으로 드러났다.
유용한 sta010 항원은 SEQ ID NO: 46을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 46과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 46의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta010 단백질은 SEQ ID NO: 46의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 46의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 46의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 46의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 46의 처음 29개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta011
'sta011' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta011은 SAOUHSC_00052이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 47을 가진다(GI:88193872).
유용한 sta011 항원은 SEQ ID NO: 47을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 47과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 47의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta011 단백질은 SEQ ID NO: 47의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 47의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 47의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 47의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 47의 처음 23개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다(SEQ ID NO: 247을 제공하기 위해서). 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. sta011 항원은, 예를 들어 아실화된 N-말단 시스테인으로 리피드화될 수 있다. 한 유용한 sta011 서열은 SEQ ID NO: 249이며, 이것은 N-말단에 메티오닌을 가진다.
sta012
'sta012' 항원은 '리더를 가진 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta012는 SAOUHSC_00106이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:48이다(GI:88193919).
유용한 sta012 항원은 SEQ ID NO: 48을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 48과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 48의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta012 단백질은 SEQ ID NO: 48의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 48의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 48의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 48의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 48의 처음 21개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta013
'sta013' 항원은 '폴리-감마-글루타메이트 캡슐 생합성 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta013은 SAOUHSC_00107이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 49이다(GI:88193920).
유용한 sta013 항원은 SEQ ID NO: 49를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 49와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 49의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta013 단백질은 SEQ ID NO: 49의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 49의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 49의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 49의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta014
'sta014' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta014는 SAOUHSC_00137이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 50을 가진다(GI:88193950).
유용한 sta014 항원은 SEQ ID NO: 50을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 50과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 50의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta014 단백질은 SEQ ID NO: 50의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 50의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 50의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 50의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 50의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta015
'sta015' 항원은 '세포외 용질 결합 단백질; RGD 함유 리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta015는 SAOUHSC_00170이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 51이다(GI:88193980).
유용한 sta015 항원은 SEQ ID NO: 51을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 51과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 51의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta015 단백질은 SEQ ID NO: 51의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 51의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 51의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 51의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 51의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta016
'sta016' 항원은 '감마-글루타밀트랜스펩티다제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta016은 SAOUHSC_00171이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 52을 가진다(GI: 88193981).
유용한 sta016 항원은 SEQ ID NO: 52를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 52와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 52의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta016 단백질은 SEQ ID NO: 52의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 52의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 52의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 52의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta017
'sta017' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta017은 SAOUHSC_00186이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 53을 가진다(GI:88193996).
유용한 sta017 항원은 SEQ ID NO: 53을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 53과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 53의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta017 단백질은 SEQ ID NO: 53의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 53의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 53의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 53의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 53의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta018
'sta018' 항원은 '세포외 용질 결합 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta018은 SAOUHSC_00201이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:54이다(GI:88194011).
유용한 sta018 항원은 SEQ ID NO: 54를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 54와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 54의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta018 단백질은 SEQ ID NO: 54의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 54의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 54의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 54의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta019
'sta019' 항원은 '펩티도글리칸 히드롤라제'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta019는 SAOUHSC_00248이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:55이다(GI:88194055). Newman 균주에서는 nwmn_0210이다(GI:151220422).
유용한 sta019 항원은 SEQ ID NO: 55를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 55와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 55의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta019 단백질은 SEQ ID NO: 55의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 55의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 55의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 55의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 55의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다. 유용한 단편들은 SEQ ID NO: 228 및 229이다.
sta019는 수산화 알루미늄 애쥬번트에 잘 흡착하지 않기 때문에 조성물에 존재하는 sta019는 흡착되지 않은 상태일 수 있거나, 또는 다른 애쥬번트, 예를 들어 인산 알루미늄에 흡착될 수 있다.
sta020
'sta020' 항원은 '수출형 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta020은 SAOUHSC_00253이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 56을 가진다(GI:88194059).
유용한 sta020 항원은 SEQ ID NO: 56을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 56과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 56의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta020 단백질은 SEQ ID NO: 56의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 56의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 56의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 56의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 56의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta021
'sta021' 항원은 '분비형 항원 SsaA-유사 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta021은 SAOUHSC_00256이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 57을 가진다(GI: 88194062).
유용한 sta021 항원은 SEQ ID NO: 57을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 27과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 57의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta021 단백질은 SEQ ID NO: 57의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 57의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 57의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 57의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 57의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta022
'sta022' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta022는 SAOUHSC_00279이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 58을 가진다(GI:88194083).
유용한 sta022 항원은 SEQ ID NO: 58을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 58과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 58의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta022 단백질은 SEQ ID NO: 58의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 58의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 58의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 58의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 58의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta023
'sta023' 항원은 '5'-뉴클레오티다제; 리포단백질 e(P4) 패밀리'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta023은 SAOUHSC_00284이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 59이다(GI:88194087).
유용한 sta023 항원은 SEQ ID NO: 59를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 59와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 59의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta023 단백질은 SEQ ID NO: 59의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 59의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 59의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 59의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 59의 처음 31개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta024
'sta024' 항원은 '리파제 전구체'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta024는 SAOUHSC_00300이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 60을 가진다(GI:88194101).
유용한 sta024 항원은 SEQ ID NO: 60을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 60과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 60의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta024 단백질은 SEQ ID NO: 60의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 60의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 60의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 60의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 60의 처음 37개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta025
'sta025' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta025는 SAOUHSC_00362이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 61이다(GI:88194160).
유용한 sta025 항원은 SEQ ID NO: 61을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 61과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 61의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta025 단백질은 SEQ ID NO: 61의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 61의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 61의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 61의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 61의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta026
'sta026' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta026은 SAOUHSC_00404이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 62이다(GI:88194198).
유용한 sta026 항원은 SEQ ID NO: 62를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 62와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 62의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta026 단백질은 SEQ ID NO: 62의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 62의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 62의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 62의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 62의 처음 22개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta027
'sta027' 항원은 '유망한 리파제'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta027은 SAOUHSC_00661이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 63을 가진다(GI:88194426).
유용한 sta027 항원은 SEQ ID NO: 63을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 63과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 63의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta027 단백질은 SEQ ID NO: 63의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 63의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 63의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 63의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 63의 처음 23개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta028
'sta028' 항원은 '분비형 항원 SsaA-유사 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta028은 SAOUHSC_00671이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 64를 가진다(GI: 88194436). Newman 균주에서는 nwmn_0634이다(GI:151220846).
유용한 sta028 항원은 SEQ ID NO: 64를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 64와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 64의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta028 단백질은 SEQ ID NO: 64의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 64의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 64의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 64의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 64의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta029
'sta029' 항원은 '페리크롬 결합 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta029는 SAOUHSC_00754이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 65이다(GI:88194518).
유용한 sta029 항원은 SEQ ID NO: 65를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 65와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 65의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta029 단백질은 SEQ ID NO: 65의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 65의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 65의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 65의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 65의 마지막 25개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 65의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta030
'sta030' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta030은 SAOUHSC_00808이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 66을 가진다(GI:88194568).
유용한 sta030 항원은 SEQ ID NO: 66을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 66과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 66의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta030 단백질은 SEQ ID NO: 66의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 66의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 66의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 66의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 66의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta031
'sta031' 항원은 '5'-뉴클레오티다제 패밀리 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta031는 SAOUHSC_00860이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 67을 가진다(GI:88194617).
유용한 sta031 항원은 SEQ ID NO: 67을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 67과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 67의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta031 단백질은 SEQ ID NO: 67의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 67의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 67의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 67의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta032
'sta032' 항원은 '세린 프로테아제 HtrA'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta032는 SAOUHSC_00958이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:68이다(GI:88194715).
유용한 sta032 항원은 SEQ ID NO: 68을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 68과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 68의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta032 단백질은 SEQ ID NO: 68의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 68의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 68의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 68의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta033
'sta033' 항원은 '시스테인 프로테아제 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta033은 SAOUHSC_00987이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:69를 가진다(GI: 88194744).
유용한 sta033 항원은 SEQ ID NO: 69를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 69와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 69의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta033 단백질은 SEQ ID NO: 69의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 69의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 69의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 69의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 69의 처음 29개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta034
'sta034' 항원은 '글루타밀 엔도펩티다제 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta034는 SAOUHSC_00988이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 70을 가진다(GI: 88194745).
유용한 sta034 항원은 SEQ ID NO: 70을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 70과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 70의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta034 단백질은 SEQ ID NO: 70의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 70의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 70의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 70의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 70의 처음 29개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta035
'sta035' 항원은 'fmt 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta035는 SAOUHSC_00998이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 71을 가진다(GI:88194754).
유용한 sta035 항원은 SEQ ID NO: 71을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 71과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 71의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta035 단백질은 SEQ ID NO: 71의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 71의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 71의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 71의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 71의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta036
'sta036' 항원은 '리더를 가진 철-조절 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta036은 SAOUHSC_01084이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 72를 가진다(GI: 88194831).
유용한 sta036 항원은 SEQ ID NO: 72를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 72와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 72의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta036 단백질은 SEQ ID NO: 72의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 72의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 72의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 72의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 72의 마지막 27개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 72의 처음 32개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta037
'sta037' 항원은 '철 ABC 트랜스포터; 철-결합 단백질 IsdE'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta037은 SAOUHSC_01085이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 73을 가진다(GI:88194832).
유용한 sta037 항원은 SEQ ID NO: 73을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 73과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 73의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta037 단백질은 SEQ ID NO: 73의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 73의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 73의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 73의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 73의 처음 9개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다(SEQ ID NO: 247을 제공하기 위해서). 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta038
'sta038' 항원은 'NPQTN 특이적 소르타제(sortase) B'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta038은 SAOUHSC_01088이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 74를 가진다(GI:88194835).
유용한 sta038 항원은 SEQ ID NO: 74를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 74와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 74의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta038 단백질은 SEQ ID NO: 74의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 74의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 74의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 74의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 74의 처음 21개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta039
'sta039' 항원은 '수퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta039는 SAOUHSC_01124이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 75이다(GI:88194868).
유용한 sta039 항원은 SEQ ID NO: 75를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 75와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 75의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta039 단백질은 SEQ ID NO: 75의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 75의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 75의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 75의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 75의 처음 22개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta040
'sta040' 항원은 '수퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta040은 SAOUHSC_01125이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:76을 가진다(GI:88194869). Newman 균주에서는 nwmn_1076이다(GI:151221288).
유용한 sta040 항원은 SEQ ID NO: 76을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 76과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 76의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta040 단백질은 SEQ ID NO: 76의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 76의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 76의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 76의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 76의 처음 21개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta041
'sta041' 항원은 '피브로넥틴 결합 단백질 A-관련'으로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta041은 SAOUHSC_01175이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 77을 가진다(GI: 88194914).
유용한 sta041 항원은 SEQ ID NO: 77을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 77과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 77의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta041 단백질은 SEQ ID NO: 77의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 77의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 77의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 77의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta042
'sta042' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta042는 SAOUHSC_01180이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 78을 가진다(GI: 88194919).
유용한 sta042 항원은 SEQ ID NO: 78을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 78과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 78의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta042 단백질은 SEQ ID NO: 78의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 78의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 78의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 78의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 78의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta043
'sta043' 항원은 '세포벽 히드롤라제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta043은 SAOUHSC_01219이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:79를 가진다(GI:88194955).
유용한 sta043 항원은 SEQ ID NO: 79를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 79와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 79의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta043 단백질은 SEQ ID NO: 79의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 79의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 79의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 79의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 79의 처음 38개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta044
'sta044' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta044는 SAOUHSC_01508이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 80이다(GI:88195223).
유용한 sta044 항원은 SEQ ID NO: 80을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 80과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 80의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta044 단백질은 SEQ ID NO: 80의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 80의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 80의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 80의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 80의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta045
'sta045' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta045는 SAOUHSC_01627이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 81이다(GI:88195337).
유용한 sta045 항원은 SEQ ID NO: 81을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 81과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 81의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta045 단백질은 SEQ ID NO: 81의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 81의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 81의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 81의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 81의 처음 16개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta046
'sta046' 항원은 '엑스칼리버(excalibur) 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta046은 SAOUHSC_01918이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 82를 가진다(GI: 88195613).
유용한 sta046 항원은 SEQ ID NO: 82를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 82와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 82의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta046 단백질은 SEQ ID NO: 82의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 82의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 82의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 82의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 82의 처음 53개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta047
'sta047' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta047은 SAOUHSC_01920이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 83을 가진다(GI: 88195615).
유용한 sta047 항원은 SEQ ID NO: 83을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 83과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 83의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta047 단백질은 SEQ ID NO: 83의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 83의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 83의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 83의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 83의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta048
'sta048' 항원은 '세포내 세린 프로테아제'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta048은 SAOUHSC_01949이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:84이다(GI:88194083).
유용한 sta048 항원은 SEQ ID NO: 84를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 84와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 84의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta048 단백질은 SEQ ID NO: 84의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 84의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 84의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 84의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 84의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta049
'sta049' 항원은 '단백질 수출 단백질 PrsA'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta049는 SAOUHSC_01972이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:85이다(GI:88195663). Newman 균주에서는 nwmn_1733이다(GI:151221945).
유용한 sta049 항원은 SEQ ID NO: 85를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 85와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 85의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta049 단백질은 SEQ ID NO: 85의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 85의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 85의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 85의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 85의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta050
'sta050' 항원은 '스타포페인(stphopain) 티올 프로테이나제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta050은 SAOUHSC_02127이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 86을 가진다(GI:88195808).
유용한 sta050 항원은 SEQ ID NO: 86을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 86과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 86의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta050 단백질은 SEQ ID NO: 86의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 86의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 86의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 86의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 86의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta051
'sta051' 항원은 '리더를 가진 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta051은 SAOUHSC_02147이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:87이다(GI:88195827).
유용한 sta051 항원은 SEQ ID NO: 87을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 87과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 87의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta051 단백질은 SEQ ID NO: 87의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 87의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 87의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 87의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 87의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta052
'sta052' 항원은 '페릭(ferric) 히드록사메이트 수용체 1'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta052는 SAOUHSC_02246이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 88이다(GI:88195918).
유용한 sta052 항원은 SEQ ID NO: 88을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 88과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 88의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta052 단백질은 SEQ ID NO: 88의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 88의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 88의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 88의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 88의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta053
'sta053' 항원은 'srdH 패밀리 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta053은 SAOUHSC_02257이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:89이다(GI:88195928).
유용한 sta053 항원은 SEQ ID NO: 89를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 89와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 89의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta053 단백질은 SEQ ID NO: 89의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 89의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 89의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 89의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 89의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta054
'sta054' 항원은 '유망한 트랜스글리코실라제 isaA 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta054는 SAOUHSC_02333이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 90이다(GI:88195999).
유용한 sta054 항원은 SEQ ID NO: 90을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 90과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 90의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta054 단백질은 SEQ ID NO: 90의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 90의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 90의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 90의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 90의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta055
'sta055' 항원은 '표면 히드롤라제'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta055는 SAOUHSC_02448이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 91이다(GI:88196100).
유용한 sta055 항원은 SEQ ID NO: 91을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 91과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 91의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta055 단백질은 SEQ ID NO: 91의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 91의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 91의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 91의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 91의 처음 31개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta056
'sta056' 항원은 '히알루로네이트 리아제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta056은 SAOUHSC_02463이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:92이다(GI:88196115).
유용한 sta056 항원은 SEQ ID NO: 92를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 92와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 92의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta056 단백질은 SEQ ID NO: 92의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 92의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 92의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 92의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 92의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta057
'sta057' 항원은 '분비형 항원 전구체 SsaA'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta057은 SAOUHSC_02576이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:93이다(GI:88194870). Newman 균주에서는 nwmn_2203이다(GI:151222415)
유용한 sta057 항원은 SEQ ID NO: 93을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 93과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 93의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta057 단백질은 SEQ ID NO: 93의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 93의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 93의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 93의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 93의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta058
'sta058' 항원은 'Zn-결합 리포단백질 adcA-형'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta058은 SAOUHSC_02690이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 94를 가진다(GI: 88196330).
유용한 sta058 항원은 SEQ ID NO: 94를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 94와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 94의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta058 단백질은 SEQ ID NO: 94의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 94의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 94의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 94의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 94의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta059
'sta059' 항원은 '감마-헤몰리신 h-감마-ii 서브유닛'으로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta059는 SAOUHSC_02708이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 95를 가진다(GI:88196348).
유용한 sta059 항원은 SEQ ID NO: 95를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 95와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 95의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta059 단백질은 SEQ ID NO: 95의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 95의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 95의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 95의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 95의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta060
'sta060' 항원은 '펩티드 ACB 트랜스포터; 펩티드-결합 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta060은 SAOUHSC_02767이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 96이다(GI:88196403).
유용한 sta060 항원은 SEQ ID NO: 96을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 96과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 96의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta060 단백질은 SEQ ID NO: 96의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 96의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 96의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 96의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 96의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta061
'sta061' 항원은 '리더를 가진 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta061은 SAOUHSC_02783이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:97이다(GI:88196419).
유용한 sta061 항원은 SEQ ID NO: 97을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 97과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 97의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta061 단백질은 SEQ ID NO: 97의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 97의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 97의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 97의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 97의 처음 21개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta062
'sta062' 항원은 '리더를 가진 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta062는 SAOUHSC_02788이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:98이다(GI:88196424).
유용한 sta062 항원은 SEQ ID NO: 98을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 98과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 98의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta062 단백질은 SEQ ID NO: 98의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 98의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 98의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 98의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 98의 처음 22개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta063
'sta063' 항원은 '아우레오리신(aureolysin)'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta063은 SAOUHSC_02971이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 99를 가진다(GI: 88196592).
유용한 sta063 항원은 SEQ ID NO: 99를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 99와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 99의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta063 단백질은 SEQ ID NO: 99의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 99의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 99의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 99의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 99의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta064
'sta064' 항원은 '리파제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta064는 SAOUHSC_03006이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 100이다(GI:88196625). Newman 균주에서는 nwmn_2569이다(GI:151222781).
유용한 sta064 항원은 SEQ ID NO: 100을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 100과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 100의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta064 단백질은 SEQ ID NO: 100의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 100의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 100의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 100의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 100의 처음 34개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta065
'sta065' 항원은 'l-포스파티딜이노시톨 포스포디에스테라제 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta065는 SAOUHSC_00051이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 101을 가진다(GI:88193871).
유용한 sta065 항원은 SEQ ID NO: 101을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 101과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 101의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta065 단백질은 SEQ ID NO: 101의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 101의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 101의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 101의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 101의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta066
'sta066' 항원은 '단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta066은 SAOUHSC_00172이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 102를 가진다(GI:88193982).
유용한 sta066 항원은 SEQ ID NO: 102를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 102와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 102의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta066 단백질은 SEQ ID NO: 102의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 102의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 102의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 102의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 102의 처음 21개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta067
'sta067' 항원은 '박테리아 세포외 용질 결합 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta067은 SAOUHSC_00176이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 103을 가진다(GI:88193986).
유용한 sta067 항원은 SEQ ID NO: 103을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 103과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 103의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta067 단백질은 SEQ ID NO: 103의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 103의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 103의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 103의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 103의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta068
'sta068' 항원은 '철 퍼미아제(permease) FTR1'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta068은 SAOUHSC_00327이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:104를 가진다(GI: 88194127).
유용한 sta068 항원은 SEQ ID NO: 104를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 104와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 104의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta068 단백질은 SEQ ID NO: 104의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 104의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 104의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 104의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 104의 마지막 20개의 C-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. SEQ ID NO: 104의 처음 14개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta069
'sta069' 항원은 '오토리신(autolysin) 전구체'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta069는 SAOUHSC_00427이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 105를 가진다(GI: 88194219).
유용한 sta069 항원은 SEQ ID NO: 105를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 105와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 105의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta069 단백질은 SEQ ID NO: 105의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 105의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 105의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 105의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 105의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta070
'sta070' 항원은 '면역원성 분비된 전구체형 단백질(절단형)'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta070은 SAOUHSC_00773이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 106을 가진다(GI:88194535).
유용한 sta070 항원은 SEQ ID NO: 106을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 106과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 106의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta070 단백질은 SEQ ID NO: 106의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 106의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 106의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 106의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 106의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta071
'sta071' 항원은 '헤몰리신'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta071은 SAOUHSC_00854이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 107을 가진다(GI:88194612).
유용한 sta071 항원은 SEQ ID NO: 107을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 107과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 107의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta071 단백질은 SEQ ID NO: 107의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 107의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 107의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 107의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 107의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta072
'sta072' 항원은 '막외(extramembranal) 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta072는 SAOUHSC_00872이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 108을 가진다(GI: 88194059).
유용한 sta072 항원은 SEQ ID NO: 108을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 108과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 108의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta072 단백질은 SEQ ID NO: 108의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 108의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 108의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 108의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 108의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta073
'sta073' 항원은 '2-관능성 오토리신 전구체'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta073은 SAOUHSC_00994이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 109를 가진다(GI: 88194062). Newman 균주에서는 nwmn_0922이다(GI:151221134). 단백질체 분석에서 이 단백질은 분비되거나 표면 노출되는 것으로 드러났다.
유용한 sta073 항원은 SEQ ID NO: 109를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 109와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 109의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta073 단백질은 SEQ ID NO: 109의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 109의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 109의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 109의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 109의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
Sta073 항원은 Sta112와 조합하여 조성물에 유용하게 포함될 수 있다[74].
sta073은 수산화 알루미늄 애쥬번트에 잘 흡착하지 않기 때문에 조성물에 존재하는 sta073은 흡착되지 않은 상태일 수 있거나, 또는 다른 애쥬번트, 예를 들어 인산 알루미늄에 흡착될 수 있다.
sta074
'sta074' 항원은 '메티실린 내성에 필수적인 인자'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta074는 SAOUHSC_01220이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO:110을 가진다(GI: 88194956).
유용한 sta074 항원은 SEQ ID NO: 110을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 110과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 110의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta074 단백질은 SEQ ID NO: 110의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 110의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 110의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 110의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta075
'sta075' 항원은 '인슐리신(insulysin); 펩티다제 패밀리 M16'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta075는 SAOUHSC_01256이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 111을 가진다(GI:88194989).
유용한 sta075 항원은 SEQ ID NO: 111을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 111과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 111의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta075 단백질은 SEQ ID NO: 111의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 111의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 111의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 111의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta076
'sta076' 항원은 '히드롤라제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta076는 SAOUHSC_01263이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 112를 가진다(GI:88194996).
유용한 sta076 항원은 SEQ ID NO: 112를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 112와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 112의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta076 단백질은 SEQ ID NO: 112의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 112의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 112의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 112의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 112의 처음 24개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta077
'sta077' 항원은 '단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta077은 SAOUHSC_01317이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 113을 가진다(GI:88195047). 단백질체 분석에서 이 단백질은 분비되거나 표면 노출되는 것으로 드러났다.
유용한 sta077 항원은 SEQ ID NO: 113을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 113과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 113의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta077 단백질은 SEQ ID NO: 113의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 113의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 113의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 113의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 113의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta078
'sta078' 항원은 'FtsK/SpoIIIE 패밀리 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta078은 SAOUHSC_01857이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO:114를 가진다(GI: 88195555).
유용한 sta078 항원은 SEQ ID NO: 114를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 114와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 114의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta078 단백질은 SEQ ID NO: 114의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 114의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 114의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 114의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta079
'sta079' 항원은 '세린 프로테아제 SplF'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta079는 SAOUHSC_01935이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 115이다(GI:88195630).
유용한 sta079 항원은 SEQ ID NO: 115를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 115와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 115의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta079 단백질은 SEQ ID NO: 115의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 115의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 115의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 115의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 115의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta080
'sta080' 항원은 '세린 프로테아제 SplE'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta080은 SAOUHSC_01936이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 116이다(GI: 88195631).
유용한 sta080 항원은 SEQ ID NO: 116를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 116과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 116의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta080 단백질은 SEQ ID NO: 116의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 116의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 116의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 116의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 116의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta081
'sta081' 항원은 '세린 프로테아제 SplD(EC:3.4.1.19)'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta081은 SAOUHSC_01938이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 170을 가진다(GI:88195633).
유용한 sta081 항원은 SEQ ID NO: 170을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 170과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 170의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta081 단백질은 SEQ ID NO: 170의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 170의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 170의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 170의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 170의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta082
'sta082' 항원은 '세린 프로테아제 SplC'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta082은 SAOUHSC_01939이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 117이다(GI:88195634).
유용한 sta082 항원은 SEQ ID NO: 117을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 117과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 117의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta082 단백질은 SEQ ID NO: 117의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 117의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 117의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 117의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 117의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta083
'sta083' 항원은 '세린 프로테아제 SplB'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta083는 SAOUHSC_01941이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 118이다(GI:88195635).
유용한 sta083 항원은 SEQ ID NO: 118을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 118과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 118의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta083 단백질은 SEQ ID NO: 118의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 118의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 118의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 118의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 118의 처음 36개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta084
'sta084' 항원은 '세린 프로테아제 SplA'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta084는 SAOUHSC_01942이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 119이다(GI:88195636).
유용한 sta084 항원은 SEQ ID NO: 119를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 119와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 119의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta084 단백질은 SEQ ID NO: 119의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 119의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 119의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 119의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 119의 처음 35개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta085
'sta085' 항원은 '스타필로키나제 전구체'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta085은 SAOUHSC_02171이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 120이다(GI:88195848).
유용한 sta085 항원은 SEQ ID NO: 120을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 120과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 120의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta085 단백질은 SEQ ID NO: 120의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 120의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 120의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 120의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 120의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta086
'sta086' 항원은 'OxaA-유사 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta086은 SAOUHSC_02327이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 121이다(GI:88195993).
유용한 sta086 항원은 SEQ ID NO: 121을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 121과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 121의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta086 단백질은 SEQ ID NO: 121의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 121의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 121의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 121의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 121의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta087
'sta087' 항원은 '테이코플라닌(teicoplanin) 내성 단백질 TcaA'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta087은 SAOUHSC_02635이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 122를 가진다(GI:88196276).
유용한 sta087 항원은 SEQ ID NO: 122를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 122와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 122의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta087 단백질은 SEQ ID NO: 122의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 122의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 122의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 122의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta088
'sta088' 항원은 '에스테라제'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta088은 SAOUHSC_02844이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 123을 가진다(GI: 88196477).
유용한 sta088 항원은 SEQ ID NO: 123을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 123과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 123의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta088 단백질은 SEQ ID NO: 123의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 123의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 123의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 123의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 123의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta089
'sta089' 항원은 'LysM 도메인 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta089는 SAOUHSC_02855이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO:124이다(GI:88196468).
유용한 sta089 항원은 SEQ ID NO: 124를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 124와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 124의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta089 단백질은 SEQ ID NO: 124의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 124의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 124의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 124의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 124의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta090
'sta090' 항원은 'LysM 도메인 단백질'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta090은 SAOUHSC_02883이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 125이다(GI:88196512).
유용한 sta090 항원은 SEQ ID NO: 125를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 125와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 125의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta090 단백질은 SEQ ID NO: 125의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 125의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 125의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 125의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 125의 처음 26개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta091
'sta091' 항원은 '리포단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta091은 SAOUHSC_00685이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 126이다(GI:88194450).
유용한 sta091 항원은 SEQ ID NO: 126을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 126과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 126의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta091 단백질은 SEQ ID NO: 126의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 126의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 126의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 126의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 126의 처음 15개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta092
'sta092' 항원은 'M23/M37 펩티다제 도메인 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta092는 SAOUHSC_00174이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 127을 가진다(GI:88193984).
유용한 sta092 항원은 SEQ ID NO: 127을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 127과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 127의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta092 단백질은 SEQ ID NO: 127의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 127의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 127의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 127의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 127의 처음 25개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta093
'sta093' 항원은 '단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta093은 SAOUHSC_01854이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 128을 가진다(GI: 88195552).
유용한 sta093 항원은 SEQ ID NO: 128을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 128과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 128의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta093 단백질은 SEQ ID NO: 128의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 128의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 128의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 128의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta094
'sta094' 항원은 '단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta094는 SAOUHSC_01512이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 129를 가진다(GI: 88195226).
유용한 sta094 항원은 SEQ ID NO: 129를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 129와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 129의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta094 단백질은 SEQ ID NO: 129의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 129의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 129의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 129의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 129의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta095
'sta095' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta095는 SAOUHSC_00383이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 130이다(GI:88194180). Newman 균주에서는 nwmn_0388이다(GI:151220600).
유용한 sta095 항원은 SEQ ID NO: 130을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 130과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 130의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta095 단백질은 SEQ ID NO: 130의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 130의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 130의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 130의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 130의 처음 32개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta096
'sta096' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta096은 SAOUHSC_00384이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 131이다(GI:88194181).
유용한 sta096 항원은 SEQ ID NO: 131을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 131과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 131의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta096 단백질은 SEQ ID NO: 131의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 131의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 131의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 131의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 131의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta097
'sta097' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta097은 SAOUHSC_00386이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 132이다(GI:88194182).
유용한 sta097 항원은 SEQ ID NO: 132를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 132와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 132의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta097 단백질은 SEQ ID NO: 132의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 132의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 132의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 132의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 132의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta098
'sta098' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta098은 SAOUHSC_00389이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 133이다(GI: 88194184). Newman 균주에서는 nwmn_0391이다(GI:151220603).
유용한 sta098 항원은 SEQ ID NO: 133을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 133과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 133의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta098 단백질은 SEQ ID NO: 133의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 133의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 133의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 133의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 133의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta099
'sta099' 항원은 '슈퍼항원형 단백질 5'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta099는 SAOUHSC_00390이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 134이다(GI: 88194185).
유용한 sta099 항원은 SEQ ID NO: 134를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 134와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 134의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta099 단백질은 SEQ ID NO: 134의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 134의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 134의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 134의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 134의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta100
'sta100' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta100은 SAOUHSC_00391이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 135이다(GI:88194186).
유용한 sta100 항원은 SEQ ID NO: 135를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 135와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 135의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta100 단백질은 SEQ ID NO: 135의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 135의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 135의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 135의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 135의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta101
'sta101' 항원은 '슈퍼항원형 단백질 7'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta101은 SAOUHSC_00392이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 136이다(GI:88194187). Newman 균주에서는 nwmn_0394이다(GI:151220606).
유용한 sta101 항원은 SEQ ID NO: 136을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 136과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 136의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta101 단백질은 SEQ ID NO: 136의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 136의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 136의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 136의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 136의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta102
'sta102' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta102는 SAOUHSC_00393이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 137이다(GI:88194188).
유용한 sta102 항원은 SEQ ID NO: 137을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 137과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 137의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta102 단백질은 SEQ ID NO: 137의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 137의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 137의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 137의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 137의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta103
'sta103' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta103은 SAOUHSC_00394이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 138이다(GI:88194189).
유용한 sta103 항원은 SEQ ID NO: 138을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 138과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 138의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta103 단백질은 SEQ ID NO: 138의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 138의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 138의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 138의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 138의 처음 23개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta104
'sta104' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta104는 SAOUHSC_00395이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 139이다(GI:88194190).
유용한 sta104 항원은 SEQ ID NO: 139를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 139와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 139의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta104 단백질은 SEQ ID NO: 139의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 139의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 139의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 139의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta105
'sta105' 항원은 '슈퍼항원형 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta105는 SAOUHSC_00399이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 140이다(GI:88194194).
유용한 sta105 항원은 SEQ ID NO: 140을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 140과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 140의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta105 단백질은 SEQ ID NO: 140의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 140의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 140의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 140의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 140의 처음 30개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta106
'sta106' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta106은 SAOUHSC_01115이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 141이다(GI:88194861).
유용한 sta106 항원은 SEQ ID NO: 141을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 141과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 141의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta106 단백질은 SEQ ID NO: 141의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 141의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 141의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 141의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 141의 처음 16개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta107
'sta107' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta107은 SAOUHSC_00354이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 177이다(GI:88194153).
유용한 sta107 항원은 SEQ ID NO: 177을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 177과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 177의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta107 단백질은 SEQ ID NO: 177의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 177의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 177의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 177의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 177의 처음 35개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta108
'sta108' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta108은 SAOUHSC_00717이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 178이다(GI:88194482).
유용한 sta108 항원은 SEQ ID NO: 178을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 178과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 178의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta108 단백질은 SEQ ID NO: 178의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 178의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 178의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 178의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 178의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta109
'sta109' 항원은 'N-아세틸뮤라모일-L-알라닌 아미다제'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta109은 SAOUHSC_02979이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 179를 가진다(GI:88196599).
유용한 sta109 항원은 SEQ ID NO: 179를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 179와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 179의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta109 단백질은 SEQ ID NO: 179의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 179의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 179의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 179의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 179의 처음 27개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta110
'sta110' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta110은 SAOUHSC_01039이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 180이다(GI:88194791).
유용한 sta110 항원은 SEQ ID NO: 180을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 180과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 180의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 sta110 단백질은 SEQ ID NO: 180의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 180의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 180의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 180의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 180의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta111
'sta111' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta111은 SAOUHSC_01005이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 181이다(GI:88194760).
유용한 sta111 항원은 SEQ ID NO: 181을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 181과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 181의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta111 단백질은 SEQ ID NO: 181의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 181의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 181의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 181의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 181의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta112
'sta112' 항원은 잠정적 'ABC 트랜스포터, 기질-결합 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta112는 SAOUHSC_00634이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 182를 가진다(GI:88194402).
유용한 sta112 항원은 SEQ ID NO: 182를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 182와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 182의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta112 단백질은 SEQ ID NO: 182의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 182의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 182의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 182의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 182의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
Sta112 항원은 Sta073과 조합하여 조성물에 유용하게 포함될 수 있다[74].
sta113
'sta113' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta113은 SAOUHSC_00728이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 183이다(GI:88194493).
유용한 sta113 항원은 SEQ ID NO: 183을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 183과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 183의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta113 단백질은 SEQ ID NO: 183의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 183의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 183의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 183의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 183의 처음 173개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta114
'sta114' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta114는 SAOUHSC_00810이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 184이다(GI:88194570).
유용한 sta114 항원은 SEQ ID NO: 184를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 184와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 184의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta114 단백질은 SEQ ID NO: 184의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 184의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 184의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 184의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta115
'sta115' 항원은 '가설상의 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta115는 SAOUHSC_00817이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 185이다(GI:88194576).
유용한 sta115 항원은 SEQ ID NO: 185를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 185와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 185의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta115 단백질은 SEQ ID NO: 185의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 185의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 185의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 185의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 185의 처음 18개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta116
'sta116' 항원은 '포르밀 펩티드 수용체-유사 1 억제성 단백질'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta116은 SAOUHSC_01112이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 186이다(GI:88194858).
유용한 sta116 항원은 SEQ ID NO: 186을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 186과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 186의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta116 단백질은 SEQ ID NO: 186의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 186의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 186의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 186의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 186의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta117
'sta117' 항원은 '절단형 베타-헤몰리신'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta117은 SAOUHSC_02240이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 187이다(GI:88195913).
유용한 sta117 항원은 SEQ ID NO: 187을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 187과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 187의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta117 단백질은 SEQ ID NO: 187의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 187의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 187의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 187의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta118
'sta118' 항원은 '세포분할 단백질 FtsZ'로 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta118은 SAOUHSC_01150이며, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 188이다(GI: 88194892).
유용한 sta118 항원은 SEQ ID NO: 188을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 188과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 188의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 sta118 단백질은 SEQ ID NO: 188의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 188의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 188의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 188의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta119
'sta119' 항원은 '티오레독신'이라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta119는 SAOUHSC_01100이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 200을 가진다(GI:88194846).
유용한 sta119 항원은 SEQ ID NO: 200을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 200과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 200의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 sta119 단백질은 SEQ ID NO: 200의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 200의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 200의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 200의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
sta120
'sta120' 항원은 '알킬 히드로퍼옥시드 리덕타제 서브유닛 C'라고 설명된다. NCTC 8325 균주에서 sta120은 SAOUHSC_00365이며, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 201을 가진다(GI:88194163).
유용한 sta120 항원은 SEQ ID NO: 201을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 201과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 201의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 sta120 단백질은 SEQ ID NO: 201의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 201의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 201의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 201의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_6
'NW_6' 항원은 '분비형 본 윌레브란트 인자-결합 단백질 전구체'라고 설명된다. Newman 균주에서 NW_6은 NWMN_0757이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 142를 가진다(GI:151220969).
유용한 NW_6 항원은 SEQ ID NO: 142를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 142와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 142의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 NW_6 단백질은 SEQ ID NO: 142의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 142의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 142의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 142의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 142의 처음 13개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_9
'NW_9' 항원은 '리포단백질'로 설명된다. Newman 균주에서 NW_9는 NWMN_0958이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 143을 가진다(GI:151221170).
유용한 NW_9 항원은 SEQ ID NO: 143을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 143과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 143의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 또는 그 이상). 이러한 NW_9 단백질은 SEQ ID NO: 143의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 143의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 143의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 143의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 143의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_10
'NW_10' 항원은 '피브리노겐 결합-관련 단백질'로 설명된다. Newman 균주에서 NW_10은 NWMN_1066이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 144이다(GI:151221278).
유용한 NW_10 항원은 SEQ ID NO: 144를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 144와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 144의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 NW_10 단백질은 SEQ ID NO: 144의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 144의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 144의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 144의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 144의 처음 20개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_7
'NW_7' 항원은 '포도상구균 보체 억제성 SCIN'로 설명된다. Newman 균주에서 NW_7은 NWMN_1876이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 145를 가진다(GI:151222088).
유용한 NW_7 항원은 SEQ ID NO: 145를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 145와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 145의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 NW_7 단백질은 SEQ ID NO: 145의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 145의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 145의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 145의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 145의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_8
'NW_8' 항원은 '케모탁시스(chemotaxis)-억제 단백질 CHIPS'라고 설명된다. Newman 균주에서 NW_8은 NWMN_1877이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 146이다(GI: 151222089).
유용한 NW_8 항원은 SEQ ID NO: 146을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 146과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 146의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100 또는 그 이상). 이러한 NW_8 단백질은 SEQ ID NO: 146의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 146의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 146의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 146의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 146의 처음 19개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_2
'NW_2' 항원은 '엔테로톡시 타입 A 전구체'라고 설명된다. Newman 균주에서 NW_2는 NWMN_1883이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 147을 가진다(GI:151222095).
유용한 NW_2 항원은 SEQ ID NO: 147을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 147과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 147의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 NW_2 단백질은 SEQ ID NO: 147의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 147의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 147의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 147의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 147의 처음 16개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_1
'NW_1' 항원은 '리포단백질'로 설명된다. Newman 균주에서 NW_1은 NWMN_1924이고, 아미노산 서열 SEQ ID NO: 148을 가진다(GI:151222136).
유용한 NW_1 항원은 SEQ ID NO: 148을 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 148과 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 148의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 또는 그 이상). 이러한 NW_1 단백질은 SEQ ID NO: 148의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 148의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 148의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 148의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 148의 처음 17개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
NW
_5
'NW_5' 항원은 '세포벽 표면 고정 패밀리 단백질'로 설명된다. Newman 균주에서 NW_5는 NWMN_2392이고, 아미노산 서열은 SEQ ID NO: 149이다(GI:151222604).
유용한 NW_5 항원은 SEQ ID NO: 149를 인식하는 항체를 도출할 수 있고(예를 들어, 사람에게 투여되었을 때), 및/또는 (a) SEQ ID NO: 149와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 149의 적어도 'n'개의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 여기서 'n'은 7 이상이다(예를 들어, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상). 이러한 NW_5 단백질은 SEQ ID NO: 149의 변이체들을 포함한다. (b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 149의 에피토프를 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 149의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하고, SEQ ID NO: 149의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다. SEQ ID NO: 149의 처음 52개의 N-말단 아미노산이 유용하게 제외될 수 있다. 다른 단편들은 하나 이상의 단백질 도메인이 제외된다.
하이브리드
폴리펩티드
본 발명에서 사용된 항원들은 각각 개별적 폴리펩티드로서 조성물에 존재할 수 있다. 그러나, 둘 이상의 항원이 사용된 경우 이들이 개별적 폴리펩티드로서 존재해야되는 것은 아니다. 대신에, 적어도 2개(예를 들어, 2, 3, 4, 5 또는 그 이상)의 항원이 단일 폴리펩티드 사슬로서 발현될 수 있다('하이브리드' 폴리펩티드). 하이브리드 폴리펩티드는 두 가지의 주요한 이점을 제공하는데, 첫 번째는 단독으로는 불안정하거나 빈약하게 발현될 수 있는 폴리펩티드가 적합한 하이브리드 파트너를 부가함으로써 원조될 수 있어 이 문제가 극복된다는 것이고, 두 번째는 모두 항원적으로 유용한 2개의 폴리펩티드를 생산하는데 단지 한 번의 발현 및 정제만 사용되면 되므로 상업적 제조가 간단하게 된다는 것이다.
하이브리드 폴리펩티드는 제 1 항원 그룹에서 유래하는 둘 이상의 폴리펩티드 서열을 포함할 수 있다. 하이브리드 폴리펩티드는 제 1 항원 그룹에서 유래하는 하나 이상의 폴리펩티드 서열과 제 2 항원 그룹에서 유래하는 하나 이상의 폴리펩티드 서열을 포함할 수 있다. 또한, 하이브리드 폴리펩티드는 상기 열거된 항원들 각각으로부터 둘 이상의 폴리펩티드 서열, 또는 해당 서열이 균주 전체에서 부분적 변이성을 갖는 경우에는 동일한 항원의 둘 이상의 변이체로부터 둘 이상의 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 항원으로부터 얻은 아미노산 서열들로 구성된 하이브리드가 유용하다. 특히, 2, 3, 4, 또는 5개의 항원으로부터 얻은 아미노산 서열들로 구성된 하이브리드가 바람직하며, 예를 들어 2 또는 3개의 항원으로부터 얻은 아미노산 서열들로 구성된 하이브리드가 바람직하다.
상이한 하이브리드 폴리펩티드들이 단일 제제에 함께 혼합될 수 있다. 하이브리드는 제 1, 제 2 또는 제 3 항원 그룹으로부터 선택된 비-하이브리드 항원들과 조합될 수 있다. 이러한 조합 안에서 항원은 둘 이상의 하이브리드 폴리펩티드에 존재할 수 있고 및/또는 비-하이브리드 폴리펩티드로서 존재할 수 있다. 그러나, 항원은 하이브리드나 비-하이브리드 중 하나로 존재하는 것이 바람직하며, 둘 다로서 존재하지는 않는다. 또한, 하이브리드 폴리펩티드는 상기 설명된 콘쥬게이트 또는 비-S. aureus 항원들과 조합될 수 있다.
하이브리드 폴리펩티드는 식 -NH2-A-{-X-L-}n-B-COOH로 표시될 수 있고, 여기서 X는 상기 설명된 S. aureus 항원의 아미노산 서열이고, L은 선택적 링커 아미노산 서열이고, A는 선택적 N-말단 아미노산 서열이고, B는 선택적 C-말단 아미노산 서열이고, n은 2 이상의 정수이다(예를 들어, 2, 3, 4, 5, 6,등). 일반적으로 n은 2 또는 3이다.
-X- 부분이 야생형 형태의 리더 펩티드 서열을 가진다면, 이것은 하이브리드 단백질에 포함될 수도 있고 제외될 수도 있다. 어떤 구체예에서, 리더 펩티드는 -X- 부분이 하이브리드 단백질의 N-말단에 위치된 경우를 제외하고는 결실되는데, 즉 X1의 리더 펩티드는 보유되지만, X2...Xn의 리더 펩티드는 제외될 것이다. 이것은 모든 리더 펩티드를 결실시키고 -A- 부분으로서 X1의 리더 펩티드를 사용하는 것에 상응한다.
{-X-L-}의 각 n의 예에서, 링커 아미노산 서열 -L-은 존재할 수도 있고 부재할 수도 있다. 예를 들어, n=2일 때 하이브리드는 NH2-X1-L1-X2-L2-COOH, NH2-X1-X2-COOH, NH2-X1-L1-X2-COOH, NH2-X1-X2-L2-COOH 등일 수 있다. 링커 아미노산 서열(들)인 -L-은 전형적으로 짧은 길이이다(예를 들어, 20개 이하의 아미노산, 즉 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1). 예들은 클로닝을 촉진하는 짧은 펩티드 서열, 폴리-글리신 링커(즉, Glyn를 포함하는; n= 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상), 및 히스티딘 태그(즉, Hisn; n= 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상)를 포함한다. 다른 적합한 링커 아미노산 서열들도 당업자에게 자명하다. 유용한 링커는 GSGGGG(SEQ ID NO: 171) 또는 GSGSGGGG(SEQ ID NO: 172)이며, 이때 Gly-Ser 디펩티드가 BamHI 제한 부위로부터 형성되고(또는 이들 중 2 이상, SEQ ID NO: 230의 테트라펩티드가 형성된다), 이로써 클로닝과 조작이 쉬워지며, 전형적인 폴리-글리신 링커는 (Gly)4 테트라펩티드(SEQ ID NO: 227)이다. 특히 최종 Ln -으로 사용하기 위한 다른 적합한 링커는 ASGGGS(SEQ ID NO: 173, 예를 들어 SEQ ID NO: 174에 의해 암호화된다) 또는 Leu-Glu 디펩티드이다.
-A-는 선택적 N-말단 아미노산 서열이다. 이것은 전형적으로 짧은 길이이다(예를 들어, 40개 이하의 아미노산, 즉 40, 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1). 예들은 단백질 통행(trafficking)을 지시하는 리더 서열, 또는 클로닝이나 정제를 촉진하는 짧은 펩티드 서열(예를 들어, 히스티딘 태그, 즉 Hisn; n = 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상)을 포함한다. 다른 적합한 N-말단 아미노산 서열들도 당업자에게 자명하다. X1이 자신의 N-말단 메티오닌을 결여한 경우, -A-는 N-말단 메티오닌을 제공하는 올리고펩티드(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8개 아미노산을 가진), 예를 들어 Met-Ala-Ser이거나, 또는 단일 Met 잔기인 것이 바람직하다.
-B-는 선택적 C-말단 아미노산 서열이다. 이것은 전형적으로 짧은 길이이다(예를 들어, 40개 이하의 아미노산, 즉 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1). 예들은 단백질 교통을 지시하는 서열, 클로닝이나 정제를 촉진하는 짧은 펩티드 서열(예를 들어, 히스티딘 태그를 포함하는, 즉 Hisn; n = 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상, 예를 들어 SEQ ID NO: 226), 또는 단백질 안정성을 높이는 서열을 포함한다. 다른 적합한 C-말단 아미노산 서열들도 당업자에게 자명하다.
본 발명의 한 하이브리드 폴리펩티드는 EsxA와 EsxB 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 151('EsxAB'; SEQ ID NO: 169에 의해 암호화된다) 및 152('EsxBA')가 이러한 하이브리드의 예들이며, 이들은 모두 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 가진다. 다른 'EsxAB' 하이브리드는 SEQ ID NO: 241을 포함하는데, 이것은 N-말단 메티오닌과 함께 제공될 수 있다(예를 들어, SEQ ID NO: 250).
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 SdrD와 SdrE 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 168('SdrED')가 이러한 하이브리드의 예인데, 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 가진다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 ClfB와 SdrD 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 202('ClfB-SdrED')가 이러한 하이브리드의 예인데, 이것은 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 가진다. SEQ ID NO: 203('SdrD-ClfB')가 이러한 하이브리드의 또 다른 예인데, 이것은 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO:173)을 가진다. SEQ ID NO: 211('ClfB-N3-sdrD-N3')가 이러한 하이브리드의 또 다른 예이며, 여기서 ClfB와 SdrD의 N3 단편이 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)에 의해 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 IsdA와 EsxA 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 204('IsdA-EsxA')가 이러한 하이브리드의 예인데, 이것은 헥사펩티드 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 가진다. SEQ ID NO: 209('IsdA40-184-esxA')가 이러한 하이브리드의 또 다른 예인데, 여기서 IsdA40 -184가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxA와 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 IsdA와 sta006 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO:221('IsdA40-184-sta006')이 이러한 하이브리드의 예인데, IsdA40 -154가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 sta006과 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 Hla와 sta006 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 222('HlaH35L-sta006')이 이러한 하이브리드의 예인데, 여기서 Hla의 H35L 돌연변이가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 sta006과 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 Hla와 Emp 항원을 모두 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 205('HlaH35L-Emp')가 이러한 하이브리드의 예인데, 여기서 Hla의 H35L 돌연변이가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO:173)를 통해 Emp와 연결된다. SEQ ID NO:205('Hla27-76-Emp')가 이러한 하이브리드의 또 다른 예인데, 여기서 Hla 단편이 링커 ASGGGS (SEQ ID NO: 173)를 통해 Emp와 연결된다. SEQ ID NO:207은 SEQ ID NO:206의 H35L 돌연변이이다. SEQ ID NO: 208('HlaPSGS-Emp')이 이러한 하이브리드의 또 다른 예인데, 여기서 Hla 돌연변이가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO:173)를 통해 Emp와 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 IsdA와 EsxA와 EsxB 항원을 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 210('isdA40-184-esxAB')이 이러한 트리플 하이브리드의 예이며, 여기서 ISdA40 -184가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxAB와 연결된다. EsxAB는 이미 동일한 링커를 포함하고 있으므로, SEQ ID NO: 210은 이 링커를 2개 포함한다. SEQ ID NO: 212('IsdA-esxAB')가 이러한 트리플 하이브리드의 또 다른 예이며, 여기서 IsdA가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxAB와 연결된다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 Hla와 EsxA와 EsxB 항원을 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 220('HlaH35L-esxAB')이 이러한 트리플 하이브리드의 예이며, 여기서 Hla의 H35L 돌연변이가 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxAB와 연결된다. EsxAB는 이미 동일한 링커를 포함하고 있으므로, SEQ ID NO: 220은 이 링커를 2개 포함한다. Hla와 EsxA와 EsxB 항원을 포함하는 하이브리드 폴리펩티드의 또 다른 예는 SEQ ID NO: 237('HlaH35L-esxAB', 실시예에서 사용된다)이며, 여기서 Hla의 H35L 돌연변이가 링커 APTARG(SEQ ID NO: 239)를 통해 EsxA와 연결되어 그것의 N-말단이 치환되고, 이어서 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxB와 연결되어 그것의 N-말단이 치환된다. 이 하이브리드에는 SEQ ID NO: 240과 같은 적합한 N-말단 서열이 제공될 수 있다.
본 발명의 또 다른 하이브리드 폴리펩티드는 sta006과 EsxA와 EsxB 항원을 포함할 수 있다. 이들은 N-말단에서 C-말단을 향해 어떤 순서로도 있을 수 있다. SEQ ID NO: 223('sta006-esxAB')이 이러한 트리플 하이브리드의 예이며, sta006이 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxAB와 연결된다. EsxAB는 이미 동일한 링커를 포함하고 있으므로, SEQ ID NO: 223은 이 링커를 2개 포함한다. sta006과 EsxA와 EsxB 항원을 포함하는 하이브리드 폴리펩티드의 또 다른 예는 SEQ ID NO: 238('sta006-esxAB', 실시예에서 사용된다)이며, 여기서 sta006이 링커 APTARG(SEQ ID NO: 239)를 통해 EsxA와 연결되어 그것의 N-말단이 치환되고, 이어서 링커 ASGGGS(SEQ ID NO: 173)를 통해 EsxB와 연결되어 그것의 N-말단이 치환된다. 이 하이브리드에는 SEQ ID NO: 240과 같은 적합한 N-말단 서열이 제공될 수 있다.
유용하게, 이들 하이브리드 폴리펩티드는 하이브리드에 있는 야생형 포도상구균 단백질(예를 들어, 서열목록에 나타낸 것과 같은)을 각각 인식하는, 예를 들어 야생형 EsxA와 야생형 EsxB를 모두 인식하는, 또는 야생형 sdrD와 야생형 sdrE를 모두 인식하는, 또는 야생형 IsdA와 야생형 EsxA를 모두 인식하는, 또는 야생형 IsdA와 야생형 sta006을 모두 인식하는, 또는 야생형 Hla와 야생형 sta006을 모두 인식하는, 또는 야생형 Hla와 야생형 Emp를 모두 인식하는, 또는 야생형 IsdA와 야생형 EsxA와 야생형 EsxB를 인식하는, 또는 야생형 Hla와 야생형 EsxA와 야생형 EsxB를 인식하는, 또는 야생형 sta006과 야생형 EsxA와 야생형 EsxB를 인식하는 항체를 도출할 수 있다(예를 들어, 인체에 투여되었을 때).
본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드
본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는 다양한 형태를 가질 수 있다(예를 들어, 천연, 융합체, 글리코실화, 비-글리코실화, 지질화, 비-지질화, 포스포릴화, 비-포스포릴화, 미리스토일화, 비-미리스토일화, 단량체, 다량체, 미립자, 변성체 등).
본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는 다양한 수단에 의해 제조될 수 있다(예를 들어, 재조합 발현, 세포 배양물로부터 정제, 화학적 합성 등). 재조합 발현된 단백질이 바람직하며, 특히 하이브리드 폴리펩티드에 바람직하다. 본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는 바람직하게 정제된 형태 또는 실질적으로 순수한 형태로 제공되는데, 즉 실질적으로 다른 폴리펩티드를 갖지 않고(예를 들어, 자연발생 폴리펩티드를 갖지 않고), 특히 실질적으로 다른 포도상구균 핵산 또는 숙주 세포 핵산을 갖지 않으며, 일반적으로는 적어도 약 50%(중량%) 순도, 통상 적어도 약 90% 순도를 가지는데, 즉 조성물 중 약 50% 미만, 더 바람직하게는 약 10% 미만(예를 들어, 5%)이 다른 발현된 폴리펩티드로 이루어진다. 따라서, 조성물 중의 항원은 해당 분자가 발현되는 생물 전체에서 분리된다.
본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는 포도상구균 폴리펩티드인 것이 바람직하다.
용어 "폴리펩티드"는 어떤 길이의 아미노산 폴리머를 말한다. 폴리머는 선형일 수도 있고 분지형일 수도 있고, 변형된 아미노산을 포함할 수 있고, 비-아미노산이 개재되어 있을 수 있다. 이 용어는 또한 자연적으로 변형되거나 개입에 의해서 변형된 아미노산 폴리머도 포함하는데, 이러한 개입은, 예를 들어 이황화 결합 형성, 글리코실화, 지질화, 아세틸화, 인산화, 또는 표지화 성분과의 콘쥬게이션 같은 어떤 다른 조작 또는 변형이 있다. 또한, 예를 들어 아미노산의 하나 이상의 유사체를 함유하는 폴리펩티드(예를 들어, 비천연 아미노산 등을 포함해서)와 본 분야에 공지된 다른 변형들도 포함된다. 폴리펩티드는 단쇄나 연합쇄로서 발생할 수 있다.
본 발명은 서열 -P-Q- 또는 -Q-P-를 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 -P-는 상기 정의된 아미노산 서열이고 -Q-는 상기 정의된 서열이 아니다. 즉, 본 발명은 융합 단백질을 제공한다. -P-의 N-말단 코돈이 ATG이 아니고, 이 코돈이 폴리펩티드의 N-말단에 존재하지 않는 경우, Met라고 번역되지 않고 해당 코돈의 표준 아미노산으로 번역될 것이다. 이 코돈이 폴리펩티드의 N-말단에 존재하는 경우에는 Met라고 번역될 것이다. -Q- 부분의 예는 제한은 아니지만 히스티딘 태그(즉, Hisn; n = 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 그 이상), 말토스-결합 단백질, 또는 글루타티온-S-트랜스페라제(GST)를 포함한다.
또한, 본 발명은 본 발명의 폴리펩티드의 제조 방법을 제공하며, 이 방법은 폴리펩티드 발현을 유도하는 조건에서 본 발명의 핵산으로 형질전환된 숙주세포를 배양하는 단계를 포함한다.
본 발명의 폴리펩티드의 발현은 Staphylococcus에서 일어날 수 있지만, 본 발명은 통상적으로 발현(재조합 발현)에 이종성 숙주를 사용한다. 이종성 숙주는 원핵생물(예를 들어, 박테리아)이나 진핵생물일 수 있다. 그것은 E. coli일 수 있고, 다른 적합한 숙주는 Bacillus subtilis , Vibrio cholerae , Salmonella typhi , Salmonella typhimurium , Neisseria lactamica , Neisseria cinerea , Mycobacteria (예를 들어, M. tuberculosis), 효모 등을 포함한다. 본 발명의 폴리펩티드를 암호화하는 야생형 S. aureus 유전자와 비교하여, 암호화된 아미노산에 아무 영향 없이 이러한 숙주에서 발현 효율이 최적화되도록 코돈을 변화시키는 것이 유리하다.
본 발명은 화학적 수단에 의해서 폴리펩티드의 적어도 일부분을 합성하는 단계를 포함하는, 본 발명의 폴리펩티드의 제조 방법을 제공한다.
핵산
또한, 본 발명은 본 발명의 폴리펩티드 및 하이브리드 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 제공한다. 또한, 본 발명은 본 발명의 하나 이상의 폴리펩티드 또는 하이브리드 폴리펩티드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산을 제공한다.
또한, 본 발명은 이러한 뉴클레오티드 서열과 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산을 제공한다. 서열 간 동일성은 바람직하게는 상기 설명된 스미스-워터만 상동성 탐색 알고리즘에 의해 결정된다. 이러한 핵산은 동일한 아미노산을 암호화하는 대안적 코돈을 이용한 것들을 포함한다.
또한, 본 발명은 이러한 핵산과 혼성화될 수 있는 핵산을 제공한다. 혼성화 반응은 상이한 '긴축도' 조건에서 수행될 수 있다. 혼성화 반응의 긴축도를 증가시키는 조건들은 본 분야에 광범위하게 공지 및 공개되어 있다(예를 들어, 참고문헌 276의 7.52페이지). 관련 조건의 예들은 (긴축도를 증가시키는 순서대로) 25℃, 37℃, 50℃, 55℃ 및 68℃의 인큐베이션 온도; 10 x SSC, 6 x SSC, 1 x SSC, 0.1 x SSC의 버퍼 농도(여기서 SSC는 0.15M NaCl과 15mM 시트레이트 버퍼이다) 및 다른 버퍼 시스템을 이용한 동등물; 0%, 25%, 50%, 및 75%의 포름아미드 농도; 5분에서 24시간까지의 인큐베이션 시간; 1, 2, 또는 그 이상의 세척 단계; 1, 2, 또는 15분의 세척 인큐베이션 시간; 및 6 x SSC, 1 x SSC, 0.1 x SSC, 또는 탈이온수의 세척 용액을 포함한다. 혼성화 기술과 그것의 최적화는 본 분야에 잘 공지되어 있다(예를 들어, 참고문헌 75, 76, 276, 278 등 참조)
어떤 구체예에서, 본 발명의 핵산은 낮은 긴축도 조건에서 표적과 혼성화되고, 다른 구체예에서, 본 발명의 핵산은 중간 긴축도 조건에서 표적과 혼성화되고, 바람직한 구체예에서, 본 발명의 핵산은 높은 긴축도 조건에서 표적과 혼성화된다. 낮은 긴축도 혼성화 조건의 전형적인 세트는 50℃ 및 10 x SSC이다. 중간 긴축도 혼성화 조건의 전형적인 세트는 55℃ 및 1 x SSC이다. 높은 긴축도 혼성화 조건의 전형적인 세트는 68℃ 및 0.1 x SSC이다. 본 발명은 이들 서열에 상보적인 서열을 포함하는 핵산을 포함한다(예를 들어, 안티센스 또는 프로빙을 위해서, 또는 프라이머로서의 사용을 위해서).
본 발명의 핵산은 혼성화 반응(예를 들어, 노던 또는 서던 블롯, 핵산 마이크로어레이 또는 '유전자 칩'에서) 및 증폭 반응(예를 들어, PCR, SDA, SSSR, LCR, TMA, NASBA 등) 및 다른 핵산 기술에서 사용될 수 있다.
본 발명에 따른 핵산은 다양한 형태를 가질 수 있다(예를 들어, 단일가닥, 이중가닥, 벡터, 프라이머, 프로브, 표지된 형태 등). 본 발명의 핵산은 원형이거나 분지형일 수 있으며, 일반적으로는 선형이다. 달리 명시되거나 요구되지 않는다면, 핵산을 이용하는 본 발명의 구체예는 어느 것이라도 이중가닥 형태와 이중가닥 형태를 구성하는 2개의 상보적 단일가닥 형태의 각각을 모두 이용할 수 있다. 프라이머 및 프로브는 일반적으로 단일가닥이고, 안티센스 핵산도 마찬가지다. 본 발명의 핵산은 바람직하게 정제된 형태나 실질적으로 순수한 형태로 제공되며, 즉 실질적으로 다른 핵산을 갖지 않고(예를 들어, 자연발생 핵산을 갖지 않고), 특히 실질적으로 다른 포도상구균 핵산 또는 숙주 세포 핵산을 갖지 않으며, 일반적으로는 적어도 약 50%(중량%) 순도, 통상 적어도 약 90% 순도를 가진다. 본 발명의 핵산은 바람직하게 포도상구균 핵산이다. 본 발명의 핵산은 여러 가지 방식으로 제조될 수 있는데, 예를 들어 화학적 합성(예를 들어, DNA의 포스포라미다이트 합성)에 의해 전체적으로 또는 부분적으로 제조될 수 있거나, 게놈 또는 cDNA 라이브러리로부터 긴 핵산을 뉴클레아제(예를 들어, 제한 효소)를 이용하여 절단하거나, 뉴클레오티드나 짧은 핵산과 연결함으로써(예를 들어, 리가제 또는 폴리머라제 사용) 제조될 수 있거나, 여러 방법이 사용될 수 있다.
본 발명의 핵산은 고체 지지체(예를 들어, 비드, 플레이트, 필터, 필름, 슬라이드, 마이크로어레이 지지체, 수지 등)에 부착될 수 있다. 본 발명의 핵산은, 예를 들어 방사성 표지나 형광 표지, 또는 바이오틴 표지로 표지될 수 있다. 이것은 핵산이 검출 기술에서 사용될 예정일 때, 예를 들어 핵산이 프라이머 또는 프로브일 때 특히 유용하다.
용어 "핵산"은 일반적으로 어떤 길이의 뉴클레오티드들의 폴리머 형태를 의미하며, 이것은 데옥시리보뉴클레오티드, 리보뉴클레오티드 및/또는 이들의 유사체를 함유한다. 핵산은 DNA, RNA, DNA/RNA 하이브리드를 포함한다. 핵산은 또한 DNA 또는 RNA 유사체를 포함하며, 예를 들어 변형된 백본(예를 들어, 펩티드 핵산(PNA) 또는 포스포로티오에이트)이나 변형된 염기를 함유하는 것들이 포함된다. 따라서, 본 발명은 mRNA, tRNA, rRNA, 리보자임, DNA, cDNA, 재조합 핵산, 분지형 핵산, 플라스미드, 벡터, 프로브, 프라이머 등을 포함한다. 본 발명의 핵산이 RNA의 형태를 취하는 경우, 그것은 5' 캡을 가질 수도 있고 그렇지 않을 수도 있다.
본 발명의 핵산은 벡터의 일부분, 즉 하나 이상의 세포 타입을 트랜스덕션/트랜스펙션하도록 디자인된 핵산 구성물의 일부분일 수 있다. 벡터는, 예를 들어 삽입된 뉴클레오티드의 분리, 증식 및 복제를 위해 디자인된 "클로닝 벡터", 숙주세포에서 뉴클레오티드 서열의 발현을 위해 디자인된 "발현 벡터", 재조합 바이러스 또는 바이러스-유사 입자가 생산되도록 디자인된 "바이러스 벡터", 또는 벡터의 두 가지 이상의 타입의 특질을 포함하는 "셔틀 벡터"일 수 있다. 바람직한 벡터는 플라스미드이다. "숙주 세포"는 개별 세포 또는 세포 배양물을 포함하며, 이것은 외인성 핵산의 수용자일 수 있거나 또는 수용자였을 수 있다. 숙주 세포는 단일 숙주 세포의 자손을 포함하며, 자손은 자연적, 우연적 또는 계획적 돌연변이 및/또는 변화로 인하여 본래의 모 세포와 완전히 동일하지 않을 수 있다(형태 또는 전체 DNA 보체에서). 숙주 세포는 본 발명의 핵산으로 생체내 또는 시험관내 트랜스펙션되거나 또는 감염된 세포를 포함한다.
핵산이 DNA인 경우, RNA 서열의 "U"가 DNA에서는 "T"로 치환된다는 것은 당연한 사실이다. 유사하게, 핵산이 RNA인 경우, DNA 서열의 "T"가 RNA에서는 "U"로 치환된다는 사실은 당연하다.
핵산과 관련하여 사용될 때 용어 "보체" 또는 "상보적인"은 왓슨-크릭 염기쌍을 말한다. 따라서, C의 보체는 G이고, G의 보체는 C이고, A의 보체는 T(또는 U)이고, T(또는 U)의 보체는 A이다. 또한, 예를 들어 피리미딘(C 또는 T)의 보체로서 I(퓨린 이노신)와 같은 염기를 사용하는 것도 가능하다.
본 발명의 핵산은, 예를 들어 폴리펩이렇티드의 제조에, 생물학적 샘플에서 핵산을 검출하기 위한 혼성화 프로브로서, 핵산의 추가 카피를 생성하는데, 리보자임 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드를 생성하는데, 단일가닥 DNA 프라이머 또는 프로브로서, 또는 삼중가닥 형성 올리고뉴클레오티드로서 사용될 수 있다.
본 발명은 본 발명의 핵산의 제조 방법을 제공하며, 여기서 핵산은 부분적으로 또는 전체적으로 화학적 수단을 이용하여 합성된다.
본 발명은 본 발명의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 벡터(예를 들어, 클로닝 또는 발현 벡터), 및 이러한 벡터로 형질전환된 숙주 세포를 제공한다. 본 발명에 따른 핵산 증폭은 정량적이며 및/또는 실시간일 수 있다.
본 발명의 특정 구체예에서, 핵산은 바람직하게 적어도 7개 뉴클레오티드 길이이다(예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 225, 250, 275, 300개 뉴클레오티드 또는 그 이상의 길이). 본 발명의 어떤 구체예에서, 핵산은 바람직하게 최대 500개 뉴클레오티드 길이이다(예를 들어, 450, 400, 350, 300, 250, 200, 150, 140, 130, 120, 110, 100, 90, 80, 75, 70, 65, 60, 55, 50, 45, 40, 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15개 뉴클레오티드 또는 더 짧은 길이).
본 발명의 프라이머 및 프로브와 혼성화에 사용되는 다른 핵산들은 바람직하게 10개 내지 30개 뉴클레오티드 길이이다(예를 들어, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30개 뉴클레오티드).
균주 및
변이체
항원은 기존 명명법(예를 들어, "ClfA")에 따라, "sta" 넘버 또는 "NW" 넘버에 따라 상기 정의된다. 표 1에 기존 SAOUHSC 넘버링 및/또는 NWMN 넘버링에 따른 이들 3가지 명명법/넘버링 시스템을 기재한다. SAOUHSC 넘버링은 S. aureus 균주 NCTC8325의 게놈을 말하고(오클라호마 대학 보건과학센터에서 서열화되어 GenBank에 CP000253.1로 개시된다; GI:87201381), 각 SAOUHSC 넘버는 게놈 서열의 "특징" 섹션에 "locus_tag" 엔트리로서 주어진다. 유사하게, NWMN 넘버링은 Genbank에 AP009351.1(GI:150373012)로서 개시된 S. aureus 균주 Newman의 게놈을 말하며(인체 감염으로부터 1952년에 분리됨, 강한 병독성 표현형을 가진다), 각 NWMN 넘버는 게놈 서열의 "특징" 섹션에 "locus_tag" 엔트리로서 주어진다. 각 항원에 대한 기능적 명칭도 데이터베이스에 주어진다.
표 1은 또한 본 발명의 각 항원에 대한 GI 넘버를 포함한다. 따라서, 이들 항원의 어느 것에 대해서도 전형적인 아미노산 및 뉴클레오티드 서열을 NCTC 8325 및/또는 Newman 균주로부터 공개된 서열 데이터베이스에서 쉽게 찾을 수 있으며, 그러나 본 발명은 NCTC 8325 및 Newman 균주에만 제한되지는 않는다. S. aureus의 몇 가지 다른 균주의 게놈 서열도 이용할 수 있으며, 여기에는 MRSA 균주 N315 및 Mu50[77], MW2, N315, COL, MRSA252, MSSA476, RF122, USA300(매우 병독성), JH1 및 JH9의 것들이 포함된다. 표준 탐색 및 정렬 기술을 사용하여 이들(또는 다른) 추가의 게놈 서열에서 Newman 또는 NCTC8325 균주로부터의 어떤 특정 서열의 호모로그를 확인할 수 있다. 또한, Newman 및 NCTC8325 균주로부터의 이용가능한 서열을 사용하여 다른 균주로부터의 상동성 서열의 증폭을 위한 프라이머를 디자인할 수 있다. 따라서, 본 발명은 이들 두 균주에 제한되지 않으며, S. aureus의 다른 균주로부터의 이러한 변이체와 상동체를 포함할 뿐만 아니라, 비-천연 변이체들도 포함한다. 일반적으로, 특정 SEQ ID NO의 적합한 변이체는 그것의 대립형질 변이체, 다형체 형태, 호모로그, 오르토로그, 파라로그, 돌연변이체 등을 포함한다.
따라서, 예를 들어, 본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는, 본원의 SEQ ID NO와 비교하여, 하나 이상의(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 등) 아미노산 치환, 예를 들어 보존적 치환(즉, 한 아미노산의 관련된 측쇄를 가진 다른 아미노산으로의 치환)을 포함할 수 있다. 유전자-암호화된 아미노산들은 일반적으로 4가지 그룹으로 나눠진다: (1) 산성, 즉 아스파르테이트, 글루타메이트; (2) 염기성, 즉 리신, 아르기닌, 히스티딘; (3) 비극성, 즉 알라닌, 발린, 로이신, 이소로이신, 프롤릴, 페닐알라닌, 메티오닌, 트립토판; 및 (4) 하전되지 않은 극성, 즉 글리신, 아스파라긴, 글루타민, 시스테인, 세린, 트레오닌, 티로신. 페닐알라닌, 트립토판 및 티로신은 함께 방향족 아미노산으로서 분류되기도 한다. 일반적으로, 이들 그룹 내에서 단일 아미노산의 치환은 생물학적 활성에 중요한 효과를 갖지 않는다. 폴리펩티드는 또한 SEQ ID NO 서열에 비하여 하나 이상의(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 등) 단일 아미노산 결실을 포함할 수 있다. 폴리펩티드는 또한 SEQ ID NO 서열에 비하여 하나 이상의(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 등) 삽입(예를 들어, 각각 1, 2, 3, 4 또는 5개 아미노산)을 포함할 수 있다.
유사하게, 본 발명과 함께 사용되는 폴리펩티드는 서열목록에 개시된 서열과 동일한(즉, 100% 동일) 아미노산 서열; 서열목록에 개시된 서열과의 서열 동일성을 공유하는(예를 들어, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상) 아미노산 서열; 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개의(또는 그 이상의) 단일 아미노산 변경(결실, 삽입, 치환)을 가지며, 이것이 (a) 또는 (b)의 서열과 비교하여 다른 위치에 있거나 또는 연속하여 있을 수 있는 아미노산 서열을 포함할 수 있고; 그리고 페어와이즈 정렬 알고리즘을 사용하여 서열목록으로부터의 특정 서열과 정렬시켰을 때, N-말단에서 C-말단까지 x 아미노산의 각 이동창(p 아미노산까지 연장된 정렬에서 p>x일 때 p-x+1이 되는 이러한 창)이 적어도 x?y 동일성 정렬된 아미노산을 가지며, 여기서 x는 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200로부터 선택되고, y는 0.50, 0.60, 0.70, 0.75, 0.80, 0.85, 0.90, 0.91, 0.92, 0.93, 0.94, 0.95, 0.96, 0.97, 0.98, 0.99로부터 선택되고, x?y가 정수가 아닐 때는 최근접 정수까지 어림된다. 바람직한 페이와이즈 정렬 알고리즘은 Needleman-Wunsch 글로벌 정렬 알고리즘(78]이며, 이것은 디폴트 파라미터(예를 들어, 갭 오프닝 패널티 = 10.0, 갭 익스텐젼 패널티 = 0.5이고, EBLOSUM62 스코어링 매트릭스를 사용한다)를 사용한다. 이 알고리즘은 EMBOSS 패키지의 니들 툴에서 편리하게 실시된다[79].
하이브리드 폴리펩티드가 사용되는 경우, 하이브리드 내의 각 항원(즉, 각 -X- 부분)은 하나 이상의 균주로부터 유래할 수 있다. n=2인 경우, 예를 들어 X2는 X1과 동일한 균주로부터 유래하거나, 또는 상이한 균주로부터 유래할 수 있다. n=3일 때 균주는 등일 수 있다.
그룹 (c) 내에서 결실 또는 치환은 N-말단 및/또는 C-말단에 있을 수 있거나, 또는 두 말단 사이에 있을 수 있다. 따라서, 트렁케이션(truncation)이 절단의 한 예가 된다. 트렁케이션은 N-말단 및/또는 C-말단에서 40개까지의(또는 그 이상의) 아미노산의 결실을 포함할 수 있다. N-말단 트렁케이션은, 예를 들어 이종성 숙주에서의 재조합 발현을 촉진하기 위해 리더 펩티드를 제거할 수 있다. C-말단 트렁케이션은, 예를 들어 이종성 숙주에서의 재조합 발현을 촉진하기 위해 앵커 서열을 제거할 수 있다.
일반적으로, 항원이 서열목록의 완전한 S. aureus 서열과 동일하지 않은 서열을 포함할 때(예를 들어, 항원이 완전한 S. aureus 서열과 100% 미만의 서열 동일성을 가진 서열을 포함할 때, 또는 항원이 그것의 단편을 포함할 때), 각 개별적 예에서 항원은 각각의 완전한 S. aureus 서열을 인식하는 항체를 도출할 수 있는 것이 바람직하다.
돌연변이체 박테리아
또한, 본 발명은 본 발명의 다양한 항원 그룹에 속한 항원들 중 하나 이상이 녹아웃된 S. aureus 박테리아를 제공한다. 녹아웃 박테리아를 제조하는 기술은 잘 공지되어 있으며, 녹아웃 S. aureus 균주도 보고되었다. 녹아웃 돌연변이는 유전자의 코딩 영역에 놓일 수 있거나, 또는 그것의 전사 제어 영역 내에 있을 수 있다(예를 들어, 프로모터 내에). 녹아웃 돌연변이는 항원을 암호화하는 mRNA의 수준이 야생형 박테리아에 의해 생산되는 것의 1% 미만, 바람직하게는 0.5% 미만, 더 바람직하게는 0.1% 미만, 가장 바람직하게는 0%까지 감소된다.
또한, 본 발명은 본 발명의 다양한 항원 그룹에 속한 항원들 중 하나 이상이 항원의 활성을 억제하는 돌연변이를 가진 S. aureus를 제공한다. 항원을 암호화하는 유전자가 암호화된 아미노산 서열을 변화시키는 돌연변이를 가진다. 돌연변이는 결실, 치환, 및/또는 삽입을 포함할 수 있고, 이들 중 어느 것은 하나 이상의 아미노산을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명은 본 발명의 항원을 초발현하는 박테리아, 예를 들어 S. aureus 박테리아를 제공한다.
또한, 본 발명은 본 발명의 항원을 구성적으로 발현하는 박테리아, 예를 들어 S. aureus 박테리아를 제공한다. 또한, 본 발명은 본 발명의 항원을 암호화하는 유전자를 포함하는 meningococcus를 제공하며, 여기서 유전자는 유도성 프로모터의 제어하에 있다.
면역원성 조성물 및 약제
본 발명의 면역원성 조성물은 백신으로서 유용할 수 있다. 본 발명에 따른 백신은 예방적 백신(즉, 감염을 예방하기 위한)이거나 치료적 백신(예를 들어, 감염을 치료하기 위한)일 수 있으며, 전형적으로는 예방적 백신이다.
따라서, 조성물은 제약학적으로 허용될 수 있다. 조성물은 통상 항원에 더해서 추가 성분들을 포함하는데, 예를 들어 전형적으로 하나 이상의 제약학적 담체(들) 및/또는 부형제(들)을 포함한다. 이러한 성분들에 대한 충분한 논의는 참고문헌 273에서 얻을 수 있다.
조성물은 일반적으로 수성 형태로서 포유동물에 투여된다. 그러나, 투여 전에는 조성물은 비수성 형태일 수 있다. 예를 들어, 어떤 백신은 수성 형태로 제조되어 수성 형태로 포장되어 유통되고 투여되지만, 다른 백신은 제조 과정에서 동결건조되고, 사용할 때에 수성 형태로 복원된다. 따라서, 본 발명의 조성물은, 예를 들어 동결건조된 제제로 건조될 수 있다.
조성물은 티오메살 또는 2-페녹시에탄올과 같은 보존제를 포함할 수 있다. 그러나, 백신은 실질적으로 수은 물질을 갖지 않아야 하며(즉, 5μg/ml 미만), 예를 들어 티오메살을 갖지 않아야 한다. 수은을 함유하지 않는 백신이 더 바람직하다. 보존제를 함유하지 않는 백신이 특히 바람직하다.
열 안정성을 개선하기 위해 조성물은 내온제를 포함할 수 있다. 이러한 제제에 대한 추가적인 내용이 하기 제공된다.
독성을 조절하기 위해서는 생리적 염, 예를 들어 나트륨염을 포함하는 것이 바람직하다. 염화나트륨(NaCl)이 바람직하며, 이것은 1-20mg/ml, 예를 들어 약 10±2mg/ml NaCl로 존재할 수 있다. 다른 염들도 존재할 수 있으며, 다른 염들은 염화칼륨, 인산이수소칼륨, 무수 인산이나트륨, 염화마그네슘, 염화칼슘 등을 포함한다.
조성물은 일반적으로 200-400mOsm/kg, 바람직하게는 240-360mOsm/kg의 삼투 농도를 가지며, 290-310mOsm/kg의 범위인 것이 더 바람직하다.
조성물은 하나 이상의 버퍼를 포함할 수 있다. 전형적인 버퍼는 포스페이트 버퍼, 트리스 버퍼, 보레이트 버퍼, 숙시네이트 버퍼, 히스티딘 버퍼(특히 수산화 알루미늄 애쥬번트를 가진), 또는 시트레이트 버퍼를 포함한다. 버퍼는 전형적으로 5-29mM 범위로 포함된다.
조성물의 pH는 일반적으로 5.0-8.1, 더 전형적으로는 6.0-8.0, 예를 들어 6.5-7.5, 또는 7.0-7.8이다.
조성물은 바람직하게 멸균된다. 조성물은 바람직하게 비-열원성이며, 예를 들어 용량당 < 1 EU(내독소 유닛, 표준 척도), 바람직하게는 용량당 < 0.1 EU를 함유한다. 조성물은 바람직하게 글루텐을 함유하지 않는다.
조성물은 1회의 면역화를 위한 물질을 포함할 수 있거나, 또는 다수의 면역화를 위한 물질을 포함할 수 있다(즉, '멀티도즈' 키트). 멀티도즈 구성에서는 보존제가 포함되는 것이 바람직하다. 멀티도즈 조성물에 보존제를 포함시키는 것의 대안으로서(또는 추가로), 조성물은 물질을 꺼내기 위한 무균 어댑터를 구비한 용기에 넣어질 수 있다.
인체용 백신은 전형적으로 약 0.5ml의 투약 부피로 투여되지만, 소아에게는 그 반의 용량(즉, 약 0.25ml)이 투여될 수 있다.
본 발명의 면역원성 조성물은 또한 하나 이상의 면역조절제를 포함할 수 있다. 바람직하게, 면역조절제 중 하나 이상의 하나 이상의 애쥬번트를 포함한다. 애쥬번트는 TH1 애쥬번트 및/또는 TH2 애쥬번트를 포함할 수 있으며, 이것은 하기 더 논의된다.
따라서, 본 발명은 다음 (1)과 (2)의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다:
(1) 제 1, 제 2, 제 3 및 제 4 항원 그룹(상기 정의된)으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들); 및 (2) 수산화 알루미늄 애쥬번트와 같은 애쥬번트(예를 들어, 하나 이상의 항원이 수산화 알루미늄에 흡착될 수 있다).
예를 들어, 본 발명은 sta006 항원과 애쥬번트, 예를 들어 수산화 알루미늄 애쥬번트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 유사하게, 본 발명은 sta001 항원과 애쥬번트, 예를 들어 수산화 알루미늄 애쥬번트의 조합을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 이들 조성물은, 예를 들어 히스티딘 버퍼로 완충되는 것이 이상적이다.
본 발명의 조성물에 사용될 수 있는 애쥬번트들은 제한은 없지만 다음의 것들을 포함한다:
A. 미네랄-함유 조성물
본 발명에서 애쥬번트로서 사용되기에 적합한 미네랄 함유 조성물은 미네랄 염, 예를 들어 알루미늄염 및 칼슘염(또는 이들의 혼합물)을 포함한다. 칼슘염은 인산칼슘(예를 들어, 참고문헌 80에 개시된 "CAP" 입자)를 포함한다. 알루미늄염은 수산화물, 인산염, 황산염 등을 포함하며, 이 염들은 어떤 적합한 형태를 가진다(예를 들어, 겔, 결정, 비정질 등). 이들 염에 흡착되는 것이 바람직하다(즉, 모든 항원이 흡착될 수 있다). 미네랄 함유 조성물은 또한 금속염의 입자로서 조제될 수 있다[81].
수산화 알루미늄 및 인산알루미늄으로서 알려진 애쥬번트가 사용될 수 있다. 이러한 이름은 종래에 사용되는 것으로서, 단지 편의를 위해서 사용되며, 존재하는 실제 화학적 화합물을 정확히 설명하는 것은 아니다(예를 들어, 참고문헌 82의 챕터 9 참조). 본 발명은 "수산화물" 또는 "인산염" 애쥬번트 중 어느 것을 사용할 수 있으며, 이들은 애쥬번트로서 일반적으로 사용되는 것들이다. "수산화 알루미늄"이라고 알려진 애쥬번트는 전형적으로 알루미늄 옥시히드록시드 염이며, 이것은 통상 적어도 부분적으로 결정질이다. "인산알루미늄"이라고 알려진 애쥬번트는 전형적으로 알루미늄 히드록시포스페이트이며, 이것은 주로 소량의 황산염도 함유한다(즉, 알루미늄 히드록시포스페이트 술페이트). 이들은 침전에 의해서 얻어질 수 있으며, 침전 과정의 반응 조건과 농도가 염에서 포스페이트의 히드록실로의 치환도에 영향을 미친다.
섬유 형태(예를 들어, 투과전자현미경에서 관찰된 대로)도 수산화 알루미늄 애쥬번트의 전형적인 형태이다. 수산화 알루미늄 애쥬번트의 pI는 전형적으로 약 11이며, 즉 애쥬번트 자체가 생리학적 pH에서 양의 표면 전하를 가진다. pH 7.4에서 mg Al+++ 당 1.8-2.6mg 단백질의 흡착 용량이 수산화 알루미늄 애쥬번트에 대해 보고되었다.
인산알루미늄 애쥬번트는 일반적으로 0.3-1.2, 바람직하게 0.8-1.2, 더 바람직하게 0.95±0.1의 PO4/Al 몰비를 가진다. 인산알루미늄은 일반적으로 비정질이며 특히 히드록시포스페이트 염에서 비정질이다. 전형적인 애쥬번트는 비정질 알루미늄 히드록시포스페이트이고, 이때 PO4/Al 몰비는 0.84-0.92이며, 이것은 0.6mg Al3+/ml에서 포함된다. 인산알루미늄은 일반적으로 미립자이다(즉, 투과전자현미경에서 관찰된 대로 판-유사 형태). 입자의 전형적인 직경은 항원 흡착 후 0.5-20μm 범위이다(예를 들어, 약 5-10μm). pH 7.4에서 mg Al+++ 당 0.7-1.5mg 단백질의 흡착 용량이 인산알루미늄 애쥬번트에 대해 보고되었다. 인산알루미늄의 제로 전하 포인트(PZC)는 포스페이트의 히드록실로의 치환도와 역관계에 있으며, 이 치환도는 침전에 의해 염을 제조할 때 사용된 반응 조건 및 반응물 농도에 따라서 변할 수 있다. 또한, PZC는 용액 중의 자유 포스페이트 이온의 농도를 바꾸거나(더 많은 포스페이트 = 더 산성의 PZC), 또는 히스티딘 버퍼와 같은 버퍼를 첨가함으로써(PZC를 더 염기성으로 만든다) 변경된다. 본 발명에 따라서 사용된 인산알루미늄은 일반적으로 4.0-7.0, 더 바람직하게는 5.0-6.5, 예를 들어 약 5.7의 PZC를 가진다.
하기 나타낸 대로, 수산화알루미늄 애쥬번트에 S. aureus 단백질 항원(IsdA, sta019 및 sta073은 제외)이 흡착되는 것이 유리하며, 특히 다수 단백질 조합에서 유리하다(모든 항원이 흡착될 수 있다). 히스티딘 버퍼가 이러한 애쥬번트 첨가된 조성물에 유용하게 포함될 수 있다.
본 발명의 조성물을 제조하는데 사용된 알루미늄 염의 현탁액은 버퍼(예를 들어, 포스페이트 또는 히스티딘 또는 트리스 버퍼)를 함유할 수 있지만, 그것이 항상 필요한 것은 아니다. 현탁액은 멸균되고 발열원을 갖지 않는 것이 바람직하다. 현탁액은 자유 수성 포스페이트 이온을 포함할 수 있는데, 예를 들어 1.0-20 mM, 바람직하게는 5-15mM, 더 바람직하게는 약 10mM의 농도로 존재할 수 있다. 현탁액은 또한 염화나트륨을 포함할 수 있다.
본 발명은 수산화 알루미늄과 인산알루미늄의 혼합물을 사용할 수 있다. 이 경우, 히드록시보다는 인산알루미늄이 더 많이 존재할 수 있는데, 예를 들어 적어도 2:1의 중량비, 예를 들어 ≥5:1, ≥6:1, ≥7:1, ≥8:1, ≥9:1 등의 중량비를 가질 수 있다.
환자에 투여하기 위한 조성물에서 Al+++의 농도는 바람직하게 10mg/ml 미만, 예를 들어 ≤5mg/ml, ≤4mg/ml, ≤3mg/ml, ≤2mg/ml, ≤1mg/ml 등이다. 바람직한 범위는 0.3-1mg/ml이다. 최대 0.85mg/용량이 바람직하다.
B. 오일 에멀젼
본 발명에서 애쥬번트로서 사용되기에 적합한 유성 에멀젼 조성물은 스쿠알렌-물 에멀젼, 예를 들어 MF59(참고문헌 82의 챕터 10; 참고문헌 83도 참조)(5% 스쿠알렌, 0.5% Tween 80, 및 0.5% Span 85, 마이크로플루이다이저에서 서브마이크론 입자로 조제됨)을 포함한다. 완전 프레운츠 애쥬번트(CFA) 및 불완전 프레운츠 애쥬번트(IFA)도 사용될 수 있다.
다양한 수중유 에멀젼 애쥬번트가 알려져 있으며, 이들은 전형적으로 적어도 하나의 오일과 적어도 하나의 계면활성제를 포함하고, 오일(들)과 계면활성제(들)은 생분해성(대사가능) 생체적합성인 것들이다. 에멀젼 중의 오일 소적들은 일반적으로 직경 5μm 미만이고, 서브마이크론 직경을 갖는 것이 이상적이며, 이러한 작은 크기는 마이크로플루이다이저에서 달성되어 안정한 에멀젼이 제공될 수 있다. 필터 멸균될 수 있기 때문에 200nm 미만의 크기를 갖는 소적들이 바람직하다.
에멀젼은 오일, 예를 들어 동물 공급원(예를 들어, 어류) 또는 식물 공급원으로부터 얻은 오일을 포함할 수 있다. 식물 오일의 공급원은 너트류, 종자류 및 곡물류를 포함한다. 너트류 오일의 예로서는 가장 일반적으로 이용되는 낙화생유, 대두유, 코코넛유 및 올리브유가 있다. 호호바유, 예를 들어 호호바 열매로부터 얻어진 것이 사용될 수 있다. 종자유는 잇꽃유, 면실유, 해바라기씨유, 참깨씨유 등을 포함한다. 곡물 그룹에서는 옥수수유가 가장 쉽게 이용되지만, 밀, 귀리, 호밀, 쌀, 테프, 트리티케일 등과 같은 다른 시리얼류의 오일도 사용될 수 있다. 글리세롤 및 1,2-프로판디올의 6-10개 탄소 지방산 에스테르는 종자류 오일에서는 자연 발생되지 않지만, 너트류 오일 및 종자류 오일로부터 출발한 적합한 재료의 가수분해, 분리 및 에스테르화에 의해서 제조될 수 있다. 포유동물의 젖으로부터 얻은 지방 및 오일은 대사가능하며, 따라서 본 발명의 실시에서 사용될 수 있다. 분리, 정제, 비누화 및 동물 공급원으로부터 순수한 오일을 얻기 위해 필요한 다른 수단들은 본 분야에 잘 공지되어 있다. 대부분의 어류는 쉽게 회수될 수 있는 대사가능한 오일을 함유한다. 예를 들어, 대구 간 오일, 상어 간 오일, 및 고래 오일, 예를 들어 경랍이 본원에서 사용될 수 있는 몇 가지 어류 오일의 예이다. 다수의 분지쇄 오일이 5-탄소 이소프렌 유닛으로 생화학적으로 합성되며, 이들은 일반적으로 테르페노이드라고 한다. 상어 간 오일은 분지형 불포화 테르페노이드를 함유하며, 이것은 스쿠알렌, 즉 2,6,10,15,19,23-헥사메틸-2,6,10,14,18,22-테트라코사헥산이라고 알려져 있는데, 본원에서 특히 바람직하다. 스쿠알렌의 포화 유사체인 스쿠알란도 바람직한 오일이다. 스쿠알렌 및 스쿠알란을 포함하는 어류 오일은 상업적 공급체로부터 쉽게 입수할 수 있거나, 또는 본 분야에 공지된 방법에 의해 얻어질 수 있다. 다른 바람직한 오일은 토코페롤이다(하기 참조). 오일의 혼합물이 사용될 수 있다.
계면활성제는 'HLB'(친수성/소수성 균형)에 의해 분류될 수 있다. 본 발명에서 바람직한 계면활성제는 적어도 10, 바람직하게는 적어도 15, 더 바람직하게는 적어도 16의 HLB를 가진다. 본 발명은 계면활성제와 함께 사용될 수 있으며, 계면활성제는 제한은 아니지만 폴리옥시에틸렌 소르비탄 에스테르 계면활성제(통상적으로 Tween이라고 한다), 특히 폴리소르베이트 20 및 폴리소르베이트 80; 에틸렌옥시드(EO), 프로필렌옥시드(PO) 및/또는 부틸렌옥시드(BO)의 공중합체(상표명 DOWF AX™으로 판매됨), 예를 들어 선형 EO/PO 블록 공중합체; 옥톡시놀류(이것은 반복된는 에톡시(옥시-1,2-에탄디일)기의 수가 다양할 수 있으며, 옥톡시놀-9(Triton X-100 또는 t-옥틸페녹시폴리에톡시에탄올)이 특히 흥미롭다); (옥틸페녹시)폴리에톡시에탄올(IGEPAL CA-630/NP-40); 포스포리피드류, 예를 들어 포스파티딜콜린(레시틴); 노닐페놀 에톡실레이트, 예를 들어 Tergitol™ NP 시리즈; 라우릴, 세틸, 스테아릴 및 올레일 알코올로부터 유래된 폴리옥시에틸렌 지방 에테르(Brij 계면활성제라고 알려져 있음), 예를 들어 트리에틸렌글리콜 모노라우릴 에테르(Brij 30); 및 소르비탄 에스테르(통상적으로 SPAN이라고 알려져 있다), 예를 들어 소르비탄 트리올레에이트(Span 85) 및 소르비탄 모노올레에이트를 포함한다.
비이온성 계면활성제가 바람직하다. 에멀젼에 포함시키기 위한 바람직한 계면활성제는 Tween 80(폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노올레에이트), Span 85(소르비탄 트리올레에이트), 레시틴 및 Triton X-100이다.
계면활성제들의 혼합물, 예를 들어 Tween 80/Span 85 혼합물이 사용될 수 있다. 또한, 폴리옥시에틸렌 소르비탄 에스테르, 예를 들어 폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노올레에이트(Tween 80)과 옥톡시놀, 예를 들어 t-옥틸페녹시폴리에톡시에탄올(Triton X-100)의 조합이 적합하다. 다른 유용한 조합은 Laureth 9와 폴리옥시에틸렌 소르비탄 에스테르 및/또는 옥톡시놀의 조합을 포함한다.
바람직한 계면활성제 양(중량%)은 폴리옥시에틸렌 소르비탄 에스테르(예를 들어, Tween 80)는 0.01-1%, 특히 약 0.1%; 옥틸- 또는 노닐페녹시 폴리옥시에탄올(예를 들어, Triton X-100, 또는 Triton 시리즈의 다른 세제)은 0.001-0.1%, 특히 0.005-0.02%; 폴리옥시에틸렌 에테르(예를 들어, Laureth 9)는 0.1-20%, 바람직하게 0.1-10%, 특히 0.1-1% 또는 약 0.5%이다.
바람직한 에멀젼 애쥬번트는 < 1μm의 평균 소적 크기, 예를 들어 ≤750nm, ≤500nm, ≤400nm, ≤300nm, ≤250nm, ≤220nm, ≤200nm 또는 이 이하의 크기를 가진다. 이런 소적 크기는 미소유체화와 같은 기술에 의해서 편리하게 달성될 수 있다.
본 발명에서 유용한 구체적인 수중유 에멀젼 애쥬번트는 제한은 아니지만 다음의 것들을 포함한다:
- 스쿠알렌, Tween 80 및 Span 85의 서브마이크론 에멀젼, 에멀젼의 조성은 부피 기준으로 약 5% 스쿠알렌, 약 0.5% 폴리소르베이트 80 및 약 0.5% Span 85일 수 있다. 중량으로 환산하면 이 비율은 4.3% 스쿠알렌, 0.5% 폴리소르베이트 80 및 0.48% Span 85가 된다. 이 애쥬번트는 'MF59'[84-86]로 알려져 있으며, 참고문헌 87의 챕터 10과 참고문헌 88의 챕터 12에 더 상세히 설명된다. MF59 에멀젼은 시트레이트 이온, 예를 들어 10mM 나트륨 시트레이트 버퍼를 유리하게 포함한다.
- 스쿠알렌, 토코페롤 및 폴리소르베이트 80(Tween 80)의 에멀젼, 이 에멀젼은 포스페이트 완충 식염수를 포함할 수 있다. 이것은 또한 Span 85(예를 들어, 1%로) 및/또는 레시틴을 포함할 수 있다. 이들 에멀젼은 2 내지 10% 스쿠알렌, 2 내지 10% 토코페롤 및 0.3 내지 3% Tween 80을 가질 수 있으며, 스쿠알렌:토코페롤의 중량비는 바람직하게 ≤1이고, 이 비율에서 더 안정한 에멀젼이 제공된다. 스쿠알렌과 Tween 80은 약 5:2의 부피비로 또는 약 11:5의 중량비로 존재할 수 있다. 한 이러한 에멀젼은 PBS에 Tween 80을 용해하여 2% 용액을 얻은 후, 이 용액 90ml를 (DL-α-토코페롤 5g과 5ml 스쿠알렌)의 혼합물과 혼합하고, 이어서 이 혼합물을 미소유체화함으로써 제조될 수 있다. 결과의 에멀젼은 서브마이크론 오일 소적을 가질 수 있으며, 예를 들어 소적의 평균 직경은 100 내지 250nm, 바람직하게는 약 180nm이다. 이 에멀젼은 또한 3-de-O-아실화 모노포스포릴 리피드 A(3d-MPL)를 포함할 수 있다. 이 타입의 또 다른 유용한 에멀젼은 인체용 용량당 0.5-10mg 스쿠알렌, 0.5-11mg 토코페롤 및 0.1-4mg 폴리소르베이트 80을 포함할 수 있다[89].
- 스쿠알렌, 토코페롤 및 Triton 세제(예를 들어, Triton X-100)의 에멀젼, 이 에멀젼은 또한 3d-MPL(하기 참조)을 포함할 수 있다. 이 에멀젼은 포스페이트 버퍼를 함유할 수 있다.
- 폴리소르베이트(예를 들어, 폴리소르베이트 80), Triton 세제(예를 들어, Triton X-100) 및 토코페롤(예를 들어, α-토코페롤 숙시네이트)를 포함하는 에멀젼. 이 에멀젼은 이들 세 성분을 약 75:11:10의 질량비(예를 들어, 750μg/ml 폴리소르베이트 80, 110μg/ml Triton X-100 및 1OOμg/ml α-토코페롤 숙시네이트)로 포함할 수 있으며, 이 농도는 항원에서 유래하는 이들 성분을 포함해야 한다. 이 에멀젼은 또한 수쿠알렌을 포함할 수 있다. 이 에멀젼은 또한 3d-MPL을 포함할 수 있다(하기 참조). 수성 상은 포스페이트 버퍼를 함유할 수 있다.
- 스쿠알란, 폴리소르베이트 80, 폴록사머 401("Pluronic™ L121")의 에멀젼. 이 에멀젼은 포스페이트 완충 식염수 pH 7.4 중에 조제될 수 있다. 이 에멀젼은 뮤라밀 디펩티드의 유용한 송달 비히클이며, "SAF-1" 애쥬번트에서 트레오닐-MDP와 함께 사용되었다[90](0.05-1% Thr-MDP, 5% 스쿠알란, 2.5% Pluronic L121 및 0.2% 폴리소르베이트 80). 이것은 "AF" 애쥬번트에서처럼 Thr-MDP 없이도 사용될 수 있다[91](5% 스쿠알란, 1.25% Pluronic L121 및 0.2% 폴리소르베이트 80). 미소유체화가 바람직하다.
- 스쿠알렌, 수성 용매, 폴리옥시에틸렌 알킬에테르 친수성 비이온성 계면활성제(예를 들어, 폴리옥시에틸렌(12) 세토스테아릴 에테르) 및 소수성 비이온성 계면활성제(예를 들어, 소르비탄 에스테르 또는 만니드 에스테르, 예를 들어 소르비탄 모노올레에이트 또는 'Span 80')을 포함하는 에멀젼. 이 에멀젼은 바람직하게는 열가역성이며, 및/또는 오일 소적의 적어도 90%(부피%)가 200nm 미만의 크기를 가진다[92]. 이 에멀젼은 또한 알디톨, 냉동보호제(예를 들어, 도데실말토시드 및/또는 수크로스와 같은 당), 및/또는 알킬폴리글리코시드 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 이 에멀젼은 TLR4 아고니스트를 포함할 수 있다[93]. 이러한 에멀젼은 동결건조될 수 있다.
- 스쿠알렌, 폴록사머 105 및 Abil-Care의 에멀젼[94]. 애쥬번트 첨가된 백신 중에서 이들 성분의 최종 농도(중량)는 5% 스쿠알렌, 4% 폴록사머 105(Pluronic 폴리올) 및 2% Abil-Care 85(비스-PEG/PPG-16/16 PEG/PPG-16/16 디메티콘; 카프릴/카프르 트리글리세리드)이다.
- 0.5-50%의 오일, 0.1-10%의 포스포리피드 및 0.05-5%의 비이온성 계면활성제를 갖는 에멀젼. 참고문헌 95에 설명된 대로, 바람직한 포스포리피드 성분은 포스파티딜콜린, 포스파티딜에탄올아민, 포스파티딜세린, 포스파티딜이노시톨, 포스파티딜글리세롤, 포스파티드산, 스핑고미엘린 및 카르디올리핀이다. 서브마이크론 소적 크기가 유리하다.
- 비-대사성 오일(예를 들어, 경질 미네랄 오일)과 적어도 하나의 계면활성제(예를 들어, 레시틴, Tween 80 또는 Span 80)의 서브마이크론 수중유 에멀젼. QuilA 사포닌, 콜레스테롤, 사포닌-리포필 콘쥬게이트(예를 들어, GPI-0100, 참고문헌 96에 설명됨, 글루쿠론산의 카르복실기를 통해 데스아실사포닌에 지방족 아민을 첨가하여 제조됨), 디메틸디옥타데실암모늄 브로마이드 및/또는 N,N-디옥타데실-N,N-비스(2-히드록시에틸)프로판디아민과 같은 첨가제들이 포함될 수 있다.
- 사포닌(예를 들어, QuilA 또는 QS21)과 스테롤(예를 들어, 콜레스테롤)이 나선형 미셀로서 회합된 에멀젼[97].
- 미네랄 오일, 비이온성 친유성 에톡시화 지방 알코올 및 비이온성 친수성 계면활성제를 포함하는 에멀젼(예를 들어, 에톡시화 지방 알코올 및/또는 폴리옥시에틸렌-폴리옥시프로필렌 블록 공중합체)[98].
- 미네랄 오일, 비이온성 친수성 에톡시화 지방 알코올 및 비이온성 친유성 계면활성제를 포함하는 에멀젼(예를 들어, 에톡시화 지방 알코올 및/또는 폴리옥시에틸렌-폴리옥시프로필렌 블록 공중합체)[98].
어떤 구체예에서, 에멀젼은 송달시에 항원과 즉석에서 혼합될 수 있으며, 이 경우 애쥬번트와 항원은 사용시에 최종 제제가 될 준비가 된 포장되거나 유통되는 백신에서 별도로 보유될 수 있다. 다른 구체예에서, 에멀젼은 제조 과정에서 항원과 혼합될 수 있으며, 이 경우 조성물은 액체의 애쥬번트 첨가된 형태로 포장된다. 항원은 일반적으로 수성 형태이며, 이로써 백신은 최종적으로 두 가지 액체를 혼합하여 제조된다. 혼합되는 두 액체의 부피비는 다양할 수 있으며(5:1 내지 1:5), 일반적으로는 약 1:1이다. 성분들의 농도가 특정 에멀젼에 대한 상기 설명에 주어진 경우, 이들 농도는 전형적으로는 희석되지 않은 조성물에서의 농도이고, 따라서 항원 용액과 혼합된 후에는 그 농도가 감소될 것이다.
조성물이 토코페롤을 포함하는 경우, α, β, γ, δ, ε 또는 ξ 토코페롤 중 어느 것이라도 사용될 수 있으며, α-토코페롤이 바람직하다. 토코페롤은 몇 가지 형태를 가질 수 있는데, 예를 들어 상이한 염 및/또는 이성질체의 형태를 가질 수 있다. 염은 유기염, 예를 들어 숙시네이트, 아세테이트, 니코티네이트 등을 포함한다. D-α-토코페롤 및 DL-α-토코페롤이 모두 사용될 수 있다. 토코페롤은 노인 환자(예를 들어, 연령 60세 이상)에서 사용되는 백신에 포함되는 것이 유익한데, 왜냐하면 비타민 E가 노인 환자군에서 면역반응에 긍정적인 효과를 가진다고 보고되었기 때문이다[99]. 토코페롤에는 또한 항산화 특성이 있는데, 이런 특성은 에멀젼의 안정화에 도움이 될 수 있다[100]. 바람직한 α-토코페롤은 DL-α-토코페롤이고, 이 토코페롤의 바람직한 염은 숙시네이트이다. 숙시네이트염은 생체내에서 TNF-관련 리간드와 협동한다는 것이 판명되었다.
C. 사포닌 제제[참고문헌 82의 챕터 22]
또한, 사포닌 제제가 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다. 사포닌은 광위한 식물 종들의 목피, 잎, 줄기, 뿌리 및 심지어 꽃에서도 발견되는 스테롤 글리코시드 및 트리테르페노이드 글리코시드의 이종성 그룹이다. Quillaia saponaria Molina 나무의 껍질로부터 얻어진 사포닌이 애쥬번트로서 널리 연구되었다. 또한, 사포닌은 Smilax ornata(sarsaprilla), Gypsophilla paniculata(brides veil) 및 Saponaria officianalis(soap root)로부터 상업적으로 입수될 수 있다. 사포닌 애쥬번트 제제는 QS21과 같은 정제된 제제뿐만 아니라 ISCOM과 같은 액체 제제도 포함한다. QS21은 Stimulon™로서 시판된다.
사포닌 조성물은 HPLC 및 RP-HPLC를 사용하여 정제되었다. 이런 기술을 사용하여 특별히 정제된 분획들이 확인되었으며, QS7, QS17, QS18, QS21, QH-A, QH-B 및 QH-C를 포함한다. 바람직하게, 사포닌은 QS21이다. QS21의 제조 방법이 참고문헌 101에서 논의된다. 사포닌 제제는 또한 스테롤, 예를 들어 콜레스테롤을 포함할 수 있다[102].
사포닌과 콜레스테롤의 조합을 사용하여 면역자극 복합체(ISCOM)이라고 불리는 특유한 입자를 형성할 수 있다[참고문헌 82의 챕터 23]. ISCOM은 또한 전형적으로 포스포리피드, 예를 들어 포스파티딜에탄올아민 또는 포스파티딜콜린을 포함한다. 공지된 사포닌은 모두 ISCOM에서 사용될 수 있다. 바람직하게, ISCOM은 QuilA, QHA & QHC 중 하나 이상을 포함한다. ISCOM은 참고문헌 102-104에 더 설명된다. 선택적으로, ISCOMS는 추가의 세제를 갖지 않을 수 있다[105]. 사포닌 기반 애쥬번트의 개발에 관한 리뷰는 참고문헌 106 & 107에서 찾을 수 있다.
D. 비로솜 및 바이러스-유사 입자
비로솜 및 바이러스-유사 입자(VLP)가 또한 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다. 이러한 구조들은 일반적으로 바이러스로부터의 하나 이상의 단백질을 함유하며, 포스포리피드와 선택적으로 조합되거나 배합된다. 이들은 일반적으로 비병원성, 비복제성이고, 일반적으로 어떤 천연 바이러스 게놈도 함유하지 않는다. 바이러스 단백질은 전체 바이러스로부터 재조합 생산되거나 분리된다. 비로솜 또는 VLP에서 사용하기에 적합한 이러한 바이러스 단백질은 인플루엔자 바이러스(예를 들어, HA 또는 NA), B형 간염 바이러스(예를 들어, 코어 또는 캡시드 단백질), E형 간염 바이러스, 홍역 바이러스, 신드비스 바이러스, 로타바이러스, 수족구병 바이러스, 레트로바이러스, 노워크 바이러스, 인간 유두종 바이러스, HIV, RNA-파지, Qβ-파지(예를 들어, 피복 단백질), GA-파지, fr-파지, AP205 파지, 및 Ty(예를 들어, 레트로트랜스포존 Ty 단백질 p1)으로부터 유래된 단백질들을 포함한다. VLP는 참고문헌 108-113에서 더 논의된다. 비로솜은, 예를 들어 참고문헌 114에서 더 논의된다.
E. 박테리아 또는 미생물 유도체
본 발명에서 사용하기에 적합한 애쥬번트는 박테리아 또는 미생물 유도체, 예를 들어 엔테로박테리아 리포폴리사카라이드(LPS)의 비독성 유도체, 리피드 A 유도체, 면역자극성 올리고뉴클레오티드 및 ADP-리보실화 독소 및 그것의 무독화된 유도체를 포함한다. LPS의 비독성 유도체는 모노포스포릴 리피드 A(MPL) 및 3-O-데아실화 MPL(3dMPL)을 포함한다. 3dMPL은 3 de-O-아실화 모노포스포릴 리피드 A와 4, 5 또는 6개 아실화 사슬의 혼합물이다. 3 de-O-아실화 모노포스포릴 리피드 A의 바람직한 "작은 입자" 형태가 참고문헌 115에 개시된다. 3dMPL의 이러한 "작은 입자"는 0.22μm 막을 통해 멸균 여과될 수 있을 만큼 충분히 작다[115]. 다른 비독성 LPS 유도체는 모노포스포릴 리피드 A 의태체, 예를 들어 아미노알킬 글루코사미니드 포스페이트 유도체, 예를 들어 RC-529를 포함한다[116,117] .
리피드 A 유도체는 OM-174와 같은 E. coli로부터의 리피드 A의 유도체를 포함한다. OM-174는, 예를 들어 참고문헌 118 & 119에 설명된다.
본 발명에서 애쥬번트로서 사용하기에 적합한 면역자극성 올리고뉴클레오티드는 CpG 모티프(구아노신에 포스페이트 결합에 의해 연결된 비메틸화된 시토신을 함유하는 디뉴클레오티드 서열)를 함유하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 팔린드롬 또는 폴리(dG) 서열을 함유하는 이중-가닥 RNA 및 올리고뉴클레오티드도 면역자극성인 것으로 알려져 있다.
CpG는 포스포로티오에이트 변형과 같은 뉴클레오티드 변형/유사체를 포함할 수 있고, 이중-가닥이거나 단일-가닥일 수 있다. 참고문헌 120, 121 및 122에 가능한 유사체 치환이 개시되며, 예를 들어 구아노신이 2'-데옥시-7-데아자구아노신으로 치환된다. CpG 올리고뉴클레오티드의 애쥬번트 효과가 참고문헌 123-128에 더 논의된다.
CpG 서열은 TLR9, 예를 들어 모티프 GTCGTT 또는 TTCGTT로 지정될 수 있다 [129]. CpG 서열, 예를 들어 CpG-A ODN은 Th1 면역반응을 유도하는데 특이적일 수 있거나, 또는 CpG 서열, 예를 들어 CpG-B ODN은 B 세포 반응을 유도하는데 더욱 특이적일 수 있다. CpG-A 및 CpG-B ODN은 참고문헌 130-132에서 논의된다. 바람직하게, CpG는 CpG-A ODN이다. 바람직하게, CpG 올리고뉴클레오티드는 5' 단부가 수용체를 인식할 수 있도록 구성된다. 선택적으로, 2개의 CpG 올리고뉴클레오티드 서열이 이들의 3' 단부에 부착되어 "이뮤노머"가 형성될 수 있다. 예를 들어, 참고문헌 129 & 133-135를 참조한다.
유용한 CpG 애쥬번트는 CpG7909이고, 이건 ProMune™(Coley Pharmaceutical Group, Inc.)로서 알려져 있다. 또 다른 것은 CpG1826이다. CpG 서열을 사용하는 것에 대한 대안으로서 또는 추가하여, TpG 서열이 사용될 수 있으며[136], 이들 올리고뉴클레오티드는 비메틸화된 CpG 모티프를 갖지 않을 수 있다. 면역자극성 올리고뉴클레오티드는 피리미딘이 풍부할 수 있다. 예를 들어, 면역자극성 올리고뉴클레오티드는 둘 이상의 연속된 티미딘 뉴클레오티드(예를 들어, TTTT, 참고문헌 136에 개시된다)를 포함할 수 있고, 및/또는 티미딘이 25%를 초과하는 뉴클레오티드 조성을 가질 수 있다(예를 들어, >35%, >40%, >50%, >60%, >80% 등). 예를 들어, 면역자극성 올리고뉴클레오티드는 둘 이상의 연속된 시토신 뉴클레오티드(예를 들어, CCCC, 참고문헌 136에 개시된다)를 포함할 수 있고, 및/또는 시토신이 25%를 초과하는 뉴클레오티드 조성을 가질 수 있다(예를 들어, >35%, >40%, >50%, >60%, >80% 등). 이들 올리고뉴클레오티드는 비메틸화된 CpG 모티프를 갖지 않을 수 있다. 면역자극성 올리고뉴클레오티드는 전형적으로 20개 이상의 뉴클레오티드를 포함한다. 이들은 100개 미만의 뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
면역자극성 올리고뉴클레오티드에 기초한 특히 유용한 애쥬번트는 IC-31™라고 알려져 있다[137]. 따라서, 본 발명에서 사용되는 애쥬번트는 (i) 적어도 하나의(바람직하게는 다수의) CpI 모티프(즉, 이노신에 연결된 시토신, 디뉴클레오티드를 형성한다)를 포함하는 올리고뉴클레오티드(예를 들어, 15-40개 뉴클레오티드)와 (ii) 폴리양이온성 폴리머, 예를 들어 적어도 하나의(바람직하게는 다수의) Lys-Arg-Lys 트리펩티드 서열(들)을 포함하는 올리고펩티드(예를 들어, 5-20개 아미노산)의 혼합물을 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 26-mer 서열 5'-(IC)13-3' (SEQ ID NO: 175)를 포함하는 데옥시뉴클레오티드일 수 있다. 폴리양이온성 폴리머는 11-mer 아미노산 서열 KLKLLLLLKLK(SEQ ID NO: 176)을 포함하는 펩티드일 수 있다. 올리고뉴클레오티드와 폴리머는 복합체, 예를 들어 참고문헌 138 & 139에 개시된 것을 형성할 수 있다.
박테리아 ADP-리보실화 독소 및 그것의 무독화된 유도체가 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다. 바람직하게, 이 단백질은 E. coli(E. coli 열 불안정성 엔테로톡신 "LT"), 콜레라("CT"), 또는 백일해("PT")로부터 유래된다. 점막 애쥬번트로서 무독화된 ADP-리보실화 독소의 사용이 참고문헌 140에 설명되며, 비경구 애쥬번트로서의 사용은 참고문헌 141에 설명된다. 독소 또는 톡소이드는 A 및 B 서브유닛을 모두 포함하는 완전독소의 형태인 것이 바람직하다. 바람직하게, A 서브유닛이 무독화 돌연변이를 함유하며, B 서브유닛은 돌연변이되지 않는 것이 바람직하다. 바람직하게, 애쥬번트는 무독화된 LT 돌연변이, 예를 들어 LT-K63, LT-R72 및 LT-G192이다. 애쥬번트로서 ADP-리보실화 독소 및 그것의 무독화된 유도체, 특히 LT-K63 및 LT-R72의 사용은 참고문헌 142-149에서 찾을 수 있다. 유용한 CT 돌연변이체는 CT-E29H이다[150]. 아미노산 치환에 대한 번호 기준은 바람직하게 참고문헌 151에 제시된 ADP-리보실화 독소의 A 및 B 서브유닛의 정렬에 기초하며, 이 참고문헌은 그 전체가 본원에 참고자료로 특별히 포함된다.
F. 인체 면역조절제
본 발명에서 애쥬번트로서 사용하기에 적합한 인체 면역조절제는 사이토카인, 예를 들어 인터류킨(예를 들어, IL-I, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-12 [152] 등)[153], 인터페론(예를 들어, 인터페론-γ), 대식세포 콜로니 자극인자 및 종양괴사인자를 포함한다. 바람직한 면역조절제는 IL-12이다.
G. 생체부착제 및 점막부착제
또한, 생체부착제 및 점막부착제가 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다. 적합한 생체부착제는 에스테르화 히알루론산 마이크로스피어[154] 또는 점막부착제, 예를 들어 폴리(아크릴산), 폴리비닐알코올, 폴리비닐피롤리돈, 다당류 및 카르복시메틸셀룰로오스의 가교된 유도체들을 포함한다. 키토산 및 그것의 유도체가 또한 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다[155].
H. 마이크로입자
또한, 마이크로입자가 본 발명에서 애쥬번트로서 사용될 수 있다. 마이크로입자(즉, 직경 약 100nm 내지 약 150μm, 더 바람직하게는 직경 약 200nm 내지 약 30μm, 가장 바람직하게는 직경 약 500nm 내지 약 10μm의 입자)는 생분해성이며 비독성인 물질(예를 들어, 폴리(α-히드록시산), 폴리히드록시부티르산, 폴리오르토에스테르, 폴리앤하이드라이드, 폴리카프로락톤 등)로부터 형성되며, 폴리(락티드-코-글리콜리드)가 바람직하고, 선택적으로 음으로 하전된 표면(예를 들어, SDS에 의해) 또는 양으로 하전된 표면(예를 들어, CTAB와 같은 양이온성 세제에 의해)을 갖도록 처리된다.
I. 리포솜(참고문헌 82의 챕터 13 & 14)
애쥬번트로서 사용하기에 적합한 리포솜 제제의 예들이 참고문헌 156-158에 설명된다.
J. 폴리옥시에틸렌 에테르 및 폴리옥시에틸렌 에스테르 제제
본 발명에서 사용하기에 적합한 애쥬번트는 폴리옥시에틸렌 에테르 및 폴리옥시에틸렌 에스테르를 포함한다[159]. 이러한 제제는 옥톡시놀과 조합된 폴리옥시에틸렌 소르비탄 에스테르 계면활성제[160] 및 옥톡시놀과 같은 적어도 하나의 추가의 비이온성 계면활성제와 조합된 폴리옥시에틸렌 알킬 에테르 또는 에스테르 계면활성제[161]를 더 포함한다. 바람직한 폴리옥시에틸렌 에테르는 폴리옥시에틸렌-9-라우릴 에테르(Laureth 9), 폴리옥시에틸렌-9-스테오릴 에테르, 폴리옥시에틸렌-8-스테오릴 에테르, 폴리옥시에틸렌-4-라우릴 에테르, 폴리옥시에틸렌-35-라우릴 에테르, 및 폴리옥시에틸렌-23-라우릴 에테르의 군으로부터 선택된다.
K. 포스파젠
예를 들어, 참고문헌 162 및 163에 설명된 포스파젠, 예를 들어 폴리[디(카르복실라토페녹시)포스파젠]("PCPP")이 사용될 수 있다.
L. 뮤라밀 펩티드
본 발명에서 애쥬번트로서 사용하기에 적합한 뮤라밀 펩티드의 예들은 N-아세틸-뮤라밀-L-트레오닐-D-이소글루타민(thr-MDP), N-아세틸-노르뮤라밀-L-알라닌-D-이소글루타민(nor-MDP), 및 N-아세틸뮤라밀-L-알라닌-D-이소글루미닐-L-알라닌-2-(1'-2'-디팔미토일-sn-글리세로-3-히드록시포스포릴옥시)-에틸아민(MTP-PE)을 포함한다.
M. 이미다조퀴놀론 화합물
본 발명에서 애쥬번트로서 사용하기에 적합한 이미다조퀴놀론 화합물의 예들은 이미퀴모드("R-837")[164,165], 레시퀴모드("R-848")[166], 및 이들의 유사체; 및 이들의 염(예를 들어, 염산염)을 포함한다. 면역자극성 이미다조퀴놀린에 대한 더 자세한 내용은 참고문헌 167-171에서 찾을 수 있다.
N. 치환된 요소
애쥬번트로서 유용한 치환된 요소는 식 I, II 또는 III의 화합물, 또는 그것의 염을 포함한다:
참고문헌 172에 정의된 대로이며, 예를 들어 'ER 803058', 'ER 803732', 'ER 804053', ER 804058', 'ER 804059', 'ER 804442', 'ER 804680', 'ER 804764', ER 803022 또는 'ER 804057', 예를 들어 다음과 같다:
O. 추가 애쥬번트들
본 발명에서 사용될 수 있는 추가의 애쥬번트들은 다음의 것들을 포함한다:
- 아미노알킬글루코사미니드포스페이트 유도체, 예를 들어 RC-529[173,174].
고리형 디구아닐레이트('c-di-GMP'), 이것은 S. aureus 백신을 위한 유용한 애쥬번트로서 보고되었다[175].
티오세미카르바존 화합물, 예를 들어 참고문헌 176에 개시된 것들. 활성 화합물의 배합, 제조 및 선별 방법도 참고문헌 176에 설명된다. 티오세미카르바존이 TNF-α와 같은 사이토카인의 생산에 있어서 인체 말초혈 단핵세포의 자극에 특히 효과적이다.
트립탄트린 화합물, 예를 들어 참고문헌 177에 개시된 것들. 활성 화합물의 배합, 제조 및 선별 방법도 참고문헌 177에 설명된다. 티오세미카르바존이 TNF-α와 같은 사이토카인의 생산에 있어서 인체 말초혈 단핵세포의 자극에 특히 효과적이다.
- 뉴클레오시드 유사체, 예를 들어 (a) 이사토라빈(ANA-245; 7-티아-8-옥소구아노신):
및 그것의 프로드러그; (b) ANA975; (c) ANA-025-1; (d) ANA380; (e) 참고문헌 178-180에 개시된 화합물, 록소리빈(7-알릴-8-옥소구아노신)[181].
- 참고문헌 182에 개시된 화합물, 아실피페라진 화합물, 인돌디온 화합물, 테트라히드라이소퀴놀린(THIQ) 화합물, 벤조시클로디온 화합물, 아미노아자비닐 화합물, 아미노벤즈아미다졸 퀴놀리논(ABIQ) 화합물[183,184], 히드라프탈아미드 화합물, 벤조페논 화합물, 이속사졸 화합물, 스테롤 화합물, 퀴나질리논 화합물, 피롤 화합물[185], 안트라퀴논 화합물, 퀴녹살린 화합물, 트리아진 화합물, 피라잘로피리미딘 화합물, 및 벤자졸 화합물[186]을 포함한다.
- 포스페이트-함유 비-고리형 백본에 연결된 리피드를 함유하는 화합물, 예를 들어 TLR4 길항제 E5564[187,188]:
- 폴리옥시도늄 폴리머[189,190] 또는 다른 N-옥시드화 폴리에틸렌-피페라진 유도체
- 메틸 이노신 5'-모노포스페이트("MIMP")[191].
- 폴리히드록실화 피롤리지딘 화합물[192], 예를 들어 하기 식을 갖는 것, 또는 그것의 제약학적으로 허용되는 염 또는 유도체:
여기서, R은 수소, 직쇄 또는 분지쇄, 비치환 또는 치환, 포화 또는 불포화 아실, 알킬(예를 들어, 시클로알킬), 알케닐, 알키닐 및 아실 기를 포함하는 군으로부터 선택된다. 예들은 제한은 아니지만 카수아린, 카수아린-6-α-D-글루코피라노스, 3-에피-카수아린, 7-에피-카수아린, 3,7-디에피-카수아린 등을 포함한다.
- CDld 리간드, 예를 들어 α-글리코실세라마이드[193-200](예를 들어, α-갈락토실세라마이드), 피토스핑고신-함유 α-글리코실세라마이드, OCH, KRN7000[(2S,3S,4R)-1-O-(α-D-갈락토피라노실)-2-(N-헥사코사노일아미노)-1,3,4-옥타데칸트리올], CRONY-101, 3"-O-술포-갈락토실세라마이드 등.
- 감마 이눌린[201] 또는 그것의 유도체, 예를 들어 알가뮬린.
애쥬번트
조합
또한, 본 발명은 상기 확인된 애쥬번트들 중 하나 이상의 조합을 포함할 수 있다. 예를 들어, 다음의 애쥬번트 조성물이 본 발명에서 사용될 수 있다: (1) 사포닌과 수중유 에멀젼[202]; (2) 사포닌(예를 들어, QS21) + 비독성 LPS 유도체(예를 들어, 3dMPL)[203]; (3) 사포닌(예를 들어, QS21) + 비독성 LPS 유도체(예를 들어, 3dMPL) + 콜레스테롤; (4) 사포닌(예를 들어, QS21) + 3dMPL + IL-12(선택적으로 + 스테롤)[204]; 3dMPL과 예를 들어 QS21 및/또는 수중유 에멀젼의 조합[205]; (6) 10% 스쿠알란, 0.4% Tween 80™, 5% pluronic-블록 중합체 L121, 및 thr-MDP를 함유하는 SAF, 서브마이크론 에멀젼으로 미소유체화되거나 또는 교반되어 입자 크기가 큰 에멀젼이 생성된다; (7) Ribi™ 애쥬번트 시스템(RAS)(Ribi Immunochem), 2% 스쿠알렌, 0.2% Tween 80, 및 모노포스포릴리피드 A(MPL), 트레할로스 디미콜레이트(TDM), 및 세포벽 스켈레톤(CWS), 바람직하게는 MPL + CWS(Detox™)로 구성되는 군으로부터의 하나 이상의 세포벽 성분을 함유한다; 및 (8) 하나 이상의 미네랄 염(예를 들어, 알루미늄염) + LPS의 비독성 유도체(예를 들어, 3dMPL).
면역자극제로서 작용하는 다른 물질들이 참고문헌 82의 챕터 7에 개시된다.
수산화 알루미늄 및/또는 인산알루미늄 애쥬번트의 사용이 특히 바람직하며, 항원은 일반적으로 이들 염에 흡착된다. 인산칼슘이 또 다른 바람직한 애쥬번트이다. 다른 바람직한 애쥬번트 조합은 Th1과 Th2 애쥬번트의 조합, 예를 들어 CpG & 알럼 또는 레시퀴모드 & 알럼을 포함한다. 인산알루미늄과 3dMPL의 조합이 사용될 수 있다.
본 발명의 조성물은 세포 매개된 면역반응과 체액성 면역반응을 모두 도출할 수 있다. 이 면역반응은 바람직하게 장기적으로 지속되는(예를 들어, 중화) 항체와 pnuemococcus에의 노출시 빠르게 대응할 수 있는 세포 매개 면역성을 유도한다.
T 세포의 두 가지 타입인 CD4 세포와 CD8 세포는 일반적으로 세포 매개된 면역성 및 체액성 면역성을 개시하고 및/또는 증진시키는데 필수적이라고 생각된다. CD8 T 세포는 CD8 공-수용체를 발현할 수 있고, 통상 세포독성 T 림프구(CTL)라고 한다. CD8 T 세포는 MHC I형 분자에 나타난 항원을 인식하거나 그것과 상호작용할 수 있다.
CD4 T 세포는 CD4 공-수용체를 발현할 수 있고, 통상 T 헬퍼 세포라고 한다. CD4 T 세포는 MHC II형 분자에 결합된 항원성 펩티드를 인식할 수 있다. MHC II형 분자와의 상호작용시에 CD4 세포는 사이토카인과 같은 인자들을 분비할 수 있다. 이런 분비된 사이토카인들은 B 세포, 세포독성 T 세포, 대식세포 및 면역반응에 참여하는 다른 세포들을 활성화할 수 있다. 헬퍼 T 세포 또는 CD4+ 세포는 두 가지 기능적으로 다른 서브셋으로 더 분류될 수 있는데, 사이토카인 및 이펙터 기능에 있어서 차이가 있는 TH1 표현형과 TH2 표현형으로 분류된다.
활성화된 TH1 세포는 세포 면역성을 증진시키고(항원-특이적 CTL 생산 증가를 포함해서), 따라서 세포내 감염에 대응하는데 있어서 가치를 지닌다. 활성화된 TH1 세포는 IL-2, IFN-γ 및 TNF-β 중 하나 이상을 분비할 수 있다. TH1 면역반응은 대식세포, NK(자연 킬러) 세포, 및 CD8 세포독성 T 세포(CTL)을 활성화함으로써 국소 염증성 반응을 가져올 수 있다 TH1 면역반응은 또한 IL-12에 의해 B 세포와 T 세포의 성장을 자극함으로써 면역반응을 확장하는 작용을 할 수 있다. TH1 자극된 B 세포는 IgG2a를 분비할 수 있다.
활성화된 TH2 세포는 항체 생산을 증진시키고, 따라서 세포외 감염에 대응하는데 있어서 가치를 지닌다. 활성화된 TH2 세포는 IL-4, IL-5, IL-6, 및 IL-1O 중 하나 이상을 분비할 수 있다. TH2 면역반응은 미래의 보호를 위해 IgGl, IgE, IgA 및 기억 B 세포를 생산할 수 있다.
증진된 면역반응은 증진된 TH1 면역반응 및 TH2 면역반응 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
TH1 면역반응은 CTL의 증가, TH1 면역반응에 관련된 사이토카인들(예를 들어, IL-2, IFN-γ 및 TNF-β) 중 하나 이상의 증가, 활성화된 대식세포의 증가, NK 활성의 증가, 또는 IgG2a 생산의 증가 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게, 증진된 TH1 면역반응은 IgG2a 생산의 증가를 포함한다.
TH1 면역반응은 TH1 애쥬번트를 사용하여 도출될 수 있다. TH1 애쥬번트는 일반적으로 애쥬번트를 사용하지 않은 항원 면역화에 비해서 IgG2a 생산 수준을 증가시킨다. 본 발명에서 사용하기에 적합한 TH1 애쥬번트는, 예를 들어 사포닌 제제, 비로솜 및 바이러스 유사 입자, 엔테로박테리아 리포폴리사카라이드(LPS)의 비독성 유도체, 면역조절성 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 면역조절성 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 CpG 모티프를 함유하는 올리고뉴클레오티드가 본 발명에서 사용되는 바람직한 TH1 애쥬번트이다.
TH2 면역반응은 TH2 면역반응에 관련된 사이토카인들(예를 들어, IL-4, IL-5, IL-6 및 IL-10) 중 하나 이상의 증가, 또는 IgG1, IgE, IgA 및 기억 B 세포의 생산 증가 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게, 증진된 TH2 면역반응은 IgG1 생산의 증가를 포함한다.
TH2 면역반응은 TH2 애쥬번트를 사용하여 도출될 수 있다. TH2 애쥬번트는 일반적으로 애쥬번트를 사용하지 않은 항원 면역화에 비해서 IgG1 생산 수준을 증가시킨다. 본 발명에서 사용하기에 적합한 TH2 애쥬번트는, 예를 들어 미네랄 함유 조성물, 오일 에멀젼, 및 ADP-리보실화 독소 및 그것의 무독화된 유도체를 포함한다. 미네랄 함유 조성물, 예를 들어 알루미늄염이 본 발명에서 사용되는 바람직한 TH2 애쥬번트이다.
바람직하게, 본 발명은 TH1 애쥬번트와 TH2 애쥬번트의 조합을 포함하는 조성물을 포함한다. 바람직하게, 이러한 조성물은 증진된 TH1 반응과 증진된 TH2 반응을 도출하는데, 즉 IgG1과 IgG2a 생산이 애쥬번트를 사용하지 않은 면역화에 비해서 증가된다. 더욱 바람직하게, TH1과 TH2 애쥬번트의 조합을 포함하는 조성물은 단일 애쥬번트를 사용한 면역화에 비해서(즉, TH1 애쥬번트를 단독 사용한 면역화 또는 TH2 애쥬번트를 단독 사용한 면역화에 비해서) 증가된 TH1 및/또는 증가된 TH2 면역반응을 도출한다.
면역반응은 TH1 면역반응 및 TH2 면역반응 중 하나 또는 둘 다일 수 있다. 바람직하게, 면역반응은 증진된 TH1 반응 및 증진된 TH2 반응 중 하나 또는 둘 다를 제공한다.
증진된 면역반응은 전신 면역반응 및 점막 면역반응 중 하나 또는 둘 다일 수 있다. 바람직하게, 면역반응은 증진된 전신 면역반응 및 증진된 점막 면역반응 중 하나 또는 둘 다를 제공한다. 바람직하게, 점막 면역반응은 TH2 면역반응이다. 바람직하게, 점막 면역반응은 IgA의 생산 증가를 포함한다.
S. aureus 감염은 체내의 여러 부위에 영향을 미칠 수 있고, 따라서 본 발명의 조성물은 다양한 형태로 제조될 수 있다. 예를 들어, 조성물은 액체 용액 또는 현탁액의 주사제로서 제조될 수 있다. 또한, 주사 전에 액체 비히클에서 용액이나 현탁액으로 하기에 적합한 고체 형태로도 제조될 수 있다(예를 들어, 동결건조된 조성물 또는 분무-냉동 건조된 조성물). 조성물은 국소 투여에 적합하게, 예를 들어 연고, 크림 또는 분말로서 제조될 수 있다. 조성물은 경구 투여에 적합하게, 예를 들어 정제 또는 캡슐로서, 스프레이로서, 또는 시럽(선택적으로 향미가 가해진다)으로서 제조될 수 있다. 조성물은 폐 투여에 적합하게, 예를 들어 미분 또는 스프레이를 이용하는 흡입제로서 제조될 수 있다. 조성물은 좌약이나 페서리로서 제조될 수 있다. 조성물은 코, 귀 또는 눈에 투여하기에 적합하게, 예를 들어 점적제로서 제조될 수 있다. 조성물은 키트 형태일 수 있으며, 키트는 조합된 조성물이 환자에게 투여하기 직전에 복원되도록 설계될 수 있다. 이러한 키트는 액체 형태의 하나 이상의 항원과 하나 이상의 동결건조된 항원을 포함할 수 있다.
조성물이 사용 직전에 즉석에서 준비되고(예를 들어, 성분이 동결건조된 형태로 존재하는 경우), 키트로서 존재하는 경우, 키트는 2개의 바이알을 포함할 수 있거나, 또는 바로 충전되는 주사기 1개와 바이알 1개를 포함할 수 있으며, 주사기의 내용물을 사용해서 주사 전에 바이알의 내용물을 재활성화할 수 있다.
백신으로서 사용되는 면역원성 조성물은 면역학적으로 효과적인 양의 항원(들)과 필요에 따라 어떤 다른 성분들을 포함한다. '면역학적으로 효과적인 양'이란 해당 양을 단일 용량으로 또는 연속 용량의 일부로서 개체에 투여했을 때 치료 또는 예방에 효과적인 것을 의미한다. 이 양은 치료될 개체의 건강 및 신체 상태, 연령, 치료될 개체의 분류학적 그룹(예를 들어, 사람 이외의 영장류, 영장류 등), 항체를 합성하는 개체의 면역 시스템의 능력, 원하는 보호 정도, 백신 제제, 주치의에 의한 의학적 상태의 평가, 및 다른 관련 요인들에 따라서 변한다. 이 양은 통상의 시험을 통해 결정될 수 있는 비교적 넓은 범위에 들어갈 것으로 예상된다. 둘 이상의 항원이 조성물에 포함된 경우, 두 항원은 서로 동일한 용량으로 또는 상이한 용량으로 존재할 수 있다.
상기 언급된 대로, 조성물은 내온제를 포함할 수 있으며, 이 성분은 애쥬번트가 첨가되는 조성물(특히, 알루미늄염과 같은 미네랄 애쥬번트를 함유하는 것들)에서 특히 유용할 수 있다. 참고문헌 206에 설명된 대로, 액체 내온제는 백신 조성물의 동결점을 저하시키기 위해서, 예를 들어 동결점을 0℃ 이하로 낮추기 위해서 수성 백신 조성물에 첨가될 수 있다. 따라서, 조성물은 0℃ 이하이지만 조성물의 동결점보다는 높은 온도에 저장됨으로써 열분해가 억제될 수 있다. 또한, 내온제를 사용하면 냉동 및 해동 후의 응집이나 침전에 대해 미네랄 염 애쥬번트를 보호하면서 조성물을 냉동할 수 있으며, 또한 예를 들어 400℃ 이상의 고온에서 조성물을 보호할 수 있다. 출발 수성 백신과 액체 내온제는 액체 내온제가 최종 혼합물 중 1-80부피%를 형성하도록 혼합될 수 있다. 적합한 내온제는 인체 투여에 안전하고, 물과 쉽게 혼화될 수 있고/가용성이며, 조성물 중의 다른 성분(예를 들어, 항원 및 애쥬번트)을 손상시키지 않아야 한다. 예들은 글리세린, 프로필렌글리콜 및/또는 폴리에틸렌글리콜(PEG)을 포함한다. 적합한 PEG는 200-20,000 Da 범위의 평균 분자량을 가질 수 있다. 바람직한 구체예에서, 폴리에틸렌글리콜은 약 300 Da의 평균 분자량을 가질 수 있다('PEG-300').
본 발명은 (i) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들); 및 (ii) 내온제를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다. 이 조성물은 (i) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들)을 포함하는 수성 조성물을 (ii) 내온제와 혼합함으로써 형성될 수 있다. 다음에, 혼합물이, 예를 들어 0℃ 이하, 0-20℃, 20-35℃, 35-55℃ 또는 더 높은 온도에서 저장될 수 있다. 혼합물은 액체 형태나 냉동된 형태로 저장될 수 있다. 혼합물은 동결건조될 수 있다. 대안으로서, 조성물은 (i) 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹으로부터 선택된 하나 이상의 항원(들)을 포함하는 건조된 조성물을 (ii) 내온제를 포함하는 액체 조성물과 혼합함으로써 형성될 수 있다. 따라서, 성분 (ii)는 성분 (i)를 복원하는데 사용될 수 있다.
치료 방법 및 백신 투여
또한, 본 발명은 본 발명의 조성물의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 포유동물에서 면역반응을 일으키는 방법을 제공한다. 면역반응은 바람직하게는 보호적 반응이며, 바람직하게 항체 및/또는 세포-매개 면역성이 수반된다. 이 방법은부스터 반응을 일으킬 수 있다.
또한, 본 발명은, 예를 들어 포유동물에서 면역반응을 일으키는데 사용하기 위한, 약제로서 조합 사용되는 본 발명의 적어도 2개의 항원을 제공한다.
또한, 본 발명은 포유동물에서 면역반응을 일으키기 위한 약제의 제조에서 본 발명의 적어도 2개의 항원의 사용을 제공한다.
이러한 사용 및 방법에 의해서 포유동물에서 면역반응을 일으킴으로써 포유동물은 병원내 감염을 포함해서 S. aureus 감염으로부터 보호될 수 있다. 더 구체적으로, 포유동물은 피부 감염, 폐렴, 뇌막염, 골수염, 심장내막염, 독성쇼크 증후군, 및/또는 패혈증으로부터 보호될 수 있다.
또한, 본 발명은 제 1 성분과 제 2 성분을 포함하는 키트를 제공하며, 여기서 제 1 성분이나 제 2 성분은 모두 상기 설명된 본 발명의 조성물이 아니지만, 제 1 성분과 제 2 성분이 조합되면 설명된 본 발명의 조성물이 제공될 수 있다. 키트는 설명서, 주사기 또는 다른 송달 장치, 애쥬번트, 또는 제약학적으로 허용되는 조제액 중 하나 이상을 포함하는 제 3 성분을 더 포함할 수 있다.
또한, 본 발명은 본 발명의 면역원성 조성물로 미리 충전된 송달 장치를 제공한다.
포유동물은 바람직하게는 사람이다. 백신이 예방적 용도인 경우, 사람은 바람직하게는 소아(예를 들어, 영아 또는 유아) 또는 청소년이고, 백신이 치료적 용도인 경우, 사람은 바람직하게는 청소년 또는 성인이다. 소아용 백신은, 예를 들어 안전성, 투약량, 면역원성 등을 평가하기 위해서 성인에게도 투여될 수 있다. 본 발명에 따라서 유용하게 면역화될 수 있는 다른 포유동물은 소, 개, 말 및 돼지이다.
치료를 위한 치료의 효능을 점검하는 한 방식은 본 발명의 조성물의 투여 후 S. aureus 감염을 모니터링하는 것을 포함한다. 예방을 위한 치료의 효능을 점검하는 한 방식은 조성물의 투여 후 본 발명의 조성물 중의 항원에 대해 생긴 전신성(예를 들어, IgG1 및 IgG2 생산 수준 모니터링) 및/또는 점막성(예를 들어, IaA 생산 수준 모니터링) 면역반응을 모니터링하는 것을 포함한다. 전형적으로, 항원-특이적 혈청 항체 반응은 면역화 후 시험감염 전에 측정되고, 항원-특이적 점막 항체 반응은 면역화 후 시험감염 후에 측정된다.
본 발명의 조성물의 면역원성을 평가하는 또 다른 방식은 단백질을 재조합적으로 발현시켜 면역블롯 및/또는 마이크로어레이에 의해 환자의 혈청이나 점막 분비물을 스크리닝하는 것이다. 단백질과 환자 샘플 사이의 명확한 반응은 환자에게 해당 단백질에 대한 면역반응이 생겼다는 것을 나타낸다. 이 방법을 사용해서 면역우성 항원 및/또는 항원 내의 에피토프를 확인할 수도 있다.
또한, 백신 조성물의 효능은 S. aureus 감염의 동물 모델, 예를 들어 기니피그나 마우스를 백신 조성물로 시험감염함으로써 측정될 수 있다. 특히, S. aureus 감염성 질환의 연구에는 3가지 유용한 동물 모델이 있는데, 즉 (i) 뮤린 농양 모델 [207], (ii) 뮤린 치명적 감염 모델[207] 및 (iii) 뮤린 폐렴 모델[208]이다. 농양 모델의 경우 정맥내 시험감염 후 마우스 신장의 농양이 조사된다. 치명적 감염 모델의 경우 정맥내 또는 복강내 경로에 의해 S. aureus의 정규 치사 용량으로 감염시킨 후 생존한 마우스의 수가 조사된다. 폐렴 모델의 경우에는 비내 감염 후에 생존율이 조사된다. 유용한 백신은 이들 모델 중 한 가지 이상에서 효과적일 수 있다. 예를 들어, 어떤 임상 환경에서는 혈액 전파를 예방하거나 옵소닌화를 촉진할 필요 없이 폐렴에 대해서만 보호하는 것이 바람직할 수 있고, 다른 환경에서는 혈액 전파를 방지하는 것이 가장 중요할 수 있다. 상이한 항원들, 및 상이한 항원 조합들이 상이한 양태의 효과적인 백신들에 기여할 수 있다.
본 발명의 조성물은 일반적으로 환자에게 직접 투여된다. 직접 송달은 비경구 주사(예를 들어, 피하, 복강내, 정맥내, 근육내 또는 조직 사이의 공간에)에 의해서, 또는 점막성 경로로, 예를 들어 직장, 경구(예를 들어, 정제, 시럽), 질, 국소, 경진피 또는 경피, 비내, 안구, 귀, 폐 또는 다른 점막성 경로 투여에 의해서 달성될 수 있다.
본 발명은 전신 및/또는 점막 면역성을 도출하기 위해서, 바람직하게는 증진된 전신 및/또는 점막 면역성을 도출하기 위해서 사용될 수 있다.
바람직하게, 증진된 전신 및/또는 점막 면역성은 증진된 TH1 및/또는 TH2 면역반응에 반영된다. 바람직하게, 증진된 면역반응은 IgG1 및/또는 IgG2a 및/또는 IgA의 생산 증가를 포함한다.
투약량은 1회 용량 일정 또는 다수 용량 일정에 따를 수 있다. 다수 용량은 1차 면역화 일정 및/또는 추가 면역화 일정에서 사용될 수 있다. 다수 용량 일정에서는 다양한 용량이 동일한 또는 상이한 경로로 제공될 수 있으며, 예를 들어 초회는 비경구로 추가 투약은 점막 경로로 하거나, 초회는 점막 경로로 추가 투약은 비경구로 하거나 할 수 있다. 다수 용량은 전형적으로 적어도 1주 간격으로 투여된다(예를 들어, 약 2주, 약 3주, 약 4주, 약 6주, 약 8주, 약 10주, 약 12주, 약 16주 등).
본 발명에 따라서 제조된 백신은 소아와 성인을 치료하는데 모두 사용될 수 있다. 따라서, 사람 환자는 1세 미만, 1-5세, 5-15세, 15-55세, 또는 55세 이상일 수 있다. 백신을 투약받는 바람직한 환자는 노인층(예를 들어, ≥50세, ≥60세, 바람직하게는 ≥65세), 소아(예를 들어, ≤5세), 입원환자, 건강관리 종사자, 군대 및 군인, 임산부, 만성질환자, 또는 면역결핍 환자이다. 백신은 이러한 그룹에만 적합한 것은 아니며, 사람들에게 더 일반적으로 사용될 수 있다.
본 발명에 의해 제조된 백신은 다른 백신들과 실질적으로 동시에(예를 들어, 동일한 의료 상담 도중에 또는 건강관리 전문가나 예방접종 센터를 방문한 동안에) 환자에게 투여될 수 있으며, 예를 들어 인플루엔자 백신, 홍역 백신, 유행성 이하선염 백신, 루벨라 백신, MMR 백신, 바리셀라 백신, MMRV 백신, 디프테리아 백신, 파상풍 백신, 백일해 백신, DTP 백신, 콘쥬게이트된 H. influenzae 타입 b 백신, 비활성화된 폴리오바이러스 백신, B형 간염 백신, meningococcus 콘쥬게이트 백신(예를 들어, 4가 A-C-W135-Y 백신), 호흡기 세포융합 바이러스 백신 등과 실질적으로 동시에 투여될 수 있다. 또한, 동시-투여에 적합한 비-포도상구균 백신은 참고문헌 51의 33-46페이지에 열거된 하나 이상의 항원을 포함할 수 있다.
핵산 면역화
상기 설명된 면역원성 조성물은 S. aureus로부터의 폴리펩티드 항원을 포함한다. 그러나, 모든 경우에 폴리펩티드 항원은 이들 폴리펩티드를 암호화하는 핵산(전형적으로 DNA)로 치환될 수 있고, 이로써 핵산 면역화에 기초한 조성물, 방법 및 사용이 제공된다. 핵산 면역화는 현재 개발중인 분야이다(예를 들어, 참고문헌 209-216 등 참조).
면역원을 암호화하는 핵산은 환자에게의 송달 후 생체내에서 발현되고, 다음에 발현된 면역원이 면역 시스템을 자극한다. 활성 성분은 전형적으로 (i) 프로모터; (ii) 프로모터에 작동 가능하게 연결된 면역원을 암호화하는 서열; 및 선택적으로 (iii) 선택성 마커를 포함하는 핵산 벡터의 형태를 가진다. 바람직한 벡터는 (iv) 복제 기원; 및 (v) (ii)의 하류에 작동 가능하게 연결된 전사 터미네이터를 더 포함할 수 있다. 일반적으로 (i)와 (v)는 진핵세포성이고, (iii)과 (iv)는 원핵세포성이다.
바람직한 프로모터는 바이러스 프로모터이며, 예를 들어 시토메갈로바이러스(CMV) 유래의 프로모터이다. 벡터는 또한 프로모터에 더하여 전사 조절 서열(예를 들어, 인핸서)를 포함할 수 있으며, 이것은 프로모터와 기능적으로 상호작용한다. 바람직한 벡터는 즉시-조기 CMV 인핸서/프로모터를 포함하고, 더 바람직한 벡터는 CMV 인트론 A를 또한 포함한다. 프로모터가 면역원을 암호화하는 하류 서열에 작동 가능하게 연결되어, 면역원-암호화 서열의 발현이 프로모터의 제어하에 있게 된다.
마커가 사용된 경우, 그것은 바람직하게 미생물 숙주에서 기능한다(예를 들어, 원핵생물, 박테리아, 효모에서). 마커는 원핵세포 선택성 마커인 것이 바람직하다(예를 들어, 원핵세포 프로모터의 제어하에 전사되는 것). 편의상 전형적인 마커는 항생물질 내성 유전자이다.
본 발명의 벡터는 바람직하게 자가 복제하는 에피솜 또는 염색체외 벡터, 예를 들어 플라스미드이다.
본 발명의 벡터는 바람직하게 복제 기원을 포함한다. 복제 기원은 원핵세포에서는 활성이고 진핵세포에서는 활성이 아닌 것이 바람직하다.
따라서, 바람직한 벡터는 벡터의 선택을 위한 원핵세포 마커, 복제의 원핵세포 기원, 및 면역원-암호화 서열의 전사를 추진하기 위한 진핵세포 프로모터를 포함한다. 따라서, 벡터는 (a) 폴리펩티드 발현 없이 원핵세포 숙주에서 증폭되어 선택되고, (b) 증폭 없이 진핵세포 숙주에서 발현될 것이다. 이런 구성은 핵산 면역화 벡터에 이상적이다.
본 발명의 벡터는 코딩 서열의 하류의 진핵세포 전사 터미네이터 서열을 포함할 수 있다. 이것은 전사 수준을 증진시킬 수 있다. 코딩 서열이 자신의 것을 갖지 않는 경우, 본 발명의 벡터는 바람직하게 폴리아데닐화 서열을 포함한다. 바람직한 폴리아데닐화 서열은 소과의 성장 호르몬에서 얻은 것이다.
본 발명의 벡터는 다중 클로닝 부위를 포함할 수 있다.
면역원 및 마커를 암호화하는 서열에 더하여, 벡터는 제 2 진핵세포 코딩 서열을 포함할 수 있다. 벡터는 또한 상기 제 2 서열의 상류에 IRES를 포함할 수 있으며, 이로써 동일한 전사체로부터 제 2 진핵세포 폴리펩티드의 면역원으로서의 번역이 가능해진다. 대안으로서, 면역원-코딩 서열이 IRES의 하류일 수 있다.
본 발명의 벡터는 비메틸화된 CpG 모티프, 예를 들어 일반적으로 구아노신 앞에 시토신이 있고, 2개의 5' 퓨린과 2개의 3' 피리미딘이 측면에 있는 비메틸화된 DNA 서열을 포함할 수 있다. 이러한 비메틸화된 형태에서 이들 DNA 모티프는 몇 가지 타입의 면역세포의 강력한 자극제인 것으로 증명되었다.
벡터는 표적화된 방식으로 송달될 수 있다. 수용체-매개 DNA 송달 기술이, 예를 들어 참고문헌 217-222에 설명된다. 핵산을 함유하는 치료적 조성물은 유전자 요법 프로토콜에서 국소 투여를 위해 약 100ng 내지 약 200mg DNA 범위에서 투여된다. DNA의 약 500ng 내지 약 50mg, 약 1μg 내지 약 2mg, dir 5μg 내지 약 500μg, 및 약 20μg 내지 약 100μg의 농도 범위가 또한 유전자 요법 프로토콜에서 사용될 수 있다. 작용 방법(예를 들어, 암호화된 유전자 산물 수준의 증진 또는 억제) 및 형질전환 및 발현 효능과 같은 요인들이 최종 효능을 위해 필요한 투약량에 영향을 미치는 고려요인이다. 더 넓은 조직 부위에 걸쳐 더 많이 발현되는 것이 바람직한 경우, 더 많은 양의 백터, 또는 연속 투여 프로토콜로 동일한 양의 재투여, 또는 상이한 인접 또는 근접 조직 부위에 수회 투여가 확실한 치료 성과를 내기 위해 필요할 수 있다. 모든 경우, 임상 시험에서의 통상적인 실험에 의해서 최적의 치료 효과를 위한 특정 범위가 결정될 것이다.
벡터는 유전자 송달 비히클을 사용하여 송달될 수 있다. 유전자 송달 비히클은 바이러스 기원이거나 비-바이러스 기원일 수 있다(일반적으로 참고문헌 223-226 참조).
원하는 핵산의 송달 및 원하는 세포에서의 발현을 위한 바이러스-기반 벡터는 본 분야에 잘 공지되어 있다. 전형적인 바이러스-기반 비히클은 제한은 아니지만 재조합 레트로바이러스(예를 들어, 참고문헌 227-237), 알파바이러스-기반 벡터(예를 들어, 신드비스 바이러스 벡터, 셈리키 포레스트 바이러스(ATCC VR-67; ATCC VR-1247), 로스 리버 바이러스(ATCC VR-373; ATCC VR-1246) 및 베네수엘라 말 뇌염 바이러스(ATCC VR-923; ATCC VR-1250; ATCC VR-1249; ATCC VR-532; 이들 바이러스의 하이브리드 또는 키메라도 사용될 수 있다). 폭스바이러스 벡터(예를 들어, 우두, 조류수두, 카나리아수두, 변형된 우수 앙카라 등), 아데노바이러스 벡터, 및 아데노-관련 바이러스(AAV) 벡터(예를 들어, 참고문헌 238-243 참조)를 포함한다. 죽은 아데노바이러스에 연결된 DNA의 투여[244]도 사용될 수 있다.
또한, 비-바이러스 송달 비히클 및 방법이 사용될 수 있으며, 제한은 아니지만 죽은 아데노바이러스에만 연결된 또는 연결되지 않은 폴리양이온 축합 DNA[예를 들어, 244], 리간드-연결된 DNA[245], 진핵세포 송달 비히클 세포[예를 들어, 참고문헌 246-250] 및 핵산 전하 중화 또는 세포막과의 융합을 포함한다. 네이키드 DNA도 사용될 수 있다. 전형적인 네이키드 DNA 도입 방법이 참고문헌 251 및 252에 설명된다. 유전자 송달 비히클로서 작용할 수 있는 리포솜(예를 들어, 면역리포솜)이 참고문헌 253-257에 설명된다. 추가의 접근법들이 참고문헌 258 & 259에 설명된다.
사용하기에 적합한 추가의 비-바이러스 송달은 참고문헌 259에 설명된 접근법과 같은 기계적 송달 시스템을 포함한다. 또한, 코딩 서열과 이러한 코딩 서열의 발현 산물은 광중합된 하이드로겔 물질의 부착 또는 이온화선의 사용을 통해 송달될 수 있다[예를 들어, 참고문헌 260 & 261]. 코딩 서열의 송달에 사용될 수 있는 유전자 송달을 위한 다른 종래의 방법은, 예를 들어 핸드-헬드 유전자 전달 입자의 사용[262] 또는 전달된 유전자의 활성화를 위한 이온화선[260 & 261]의 사용을 포함한다.
PLG(폴리(락티드-코-글리콜리드)) 마이크로입자를 이용한 DNA 송달, 예를 들어 마이크로입자에의 흡착에 의한 DNA 송달이 특히 바람직한 방법이며, 마이크로입자는 선택적으로 음으로 하전된 표면(예를 들어, SDS로 처리) 또는 양으로 하전된 표면(예를 들어, CTAB와 같은 양이온성 세제로 처리)을 갖도록 처리된다.
S.
epidermidis
본 발명은 S. aureus에 중점을 두고 있지만, 본 발명자들은 또한 sta006 및 sta011 항원이 S. epidermidis에 호모로그를 가진다는 것을 깨달았다. 예를 들어, SEQ ID NO: 234는 S. epidermidis 균주 M23864:W1로부터의 '철 (Fe+3) ABC 초과 ATP 결합 카세트 수송인자, 결합 단백질'이며, SEQ ID NO:42(sta006)과의 동일성은 73%이고, SEQ ID NO: 235는 S. epidermidis 균주 RP62A로부터의 '잠정적 리포단백질'이며, SEQ ID NO: 47(sta011)과의 동일성은 67%이다.
S. epidermidis는 인간의 피부에 흔히 존재하며, 때로 질병을 일으킬 수 있다. 감염은 일반적으로 의료 장치, 예를 들어 카테테르와 관련되며, 병원내 감염의 원인이 된다. S. aureus에 대한 sta006 및 sta011에 대한 본원에 개시된 결과는 S. epidermidis의 상동성 단백질들이 이 병원균에 대한 면역화에 유용할 수 있었음을 제시한다.
본 발명은
(i) (a) SEQ ID NO: 234와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 234의 적어도 'n' 연속 아미노산의 단편('n'은 7 이상, 예를 들어 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상이다)을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드; 및/또는
(ii) (a) SEQ ID NO: 235와 50% 이상의 동일성(예를 들어, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% 또는 그 이상)을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 235의 적어도 'n' 연속 아미노산의 단편('n'은 7 이상, 예를 들어 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250 또는 그 이상이다)을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드
를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
조성물은 또한 애쥬번트를 포함할 수 있다. 이들 조성물은 S. epidermidis 감염에 대해 포유동물(인간을 포함하는)을 면역화하는데 특히 유용하다.
(b)의 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 234 또는 235로부터의 에피토프를 각각 포함한다. 다른 바람직한 단편은 SEQ ID NO: 234/235의 C-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상) 및/또는 N-말단으로부터 하나 이상의 아미노산(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 또는 그 이상)을 결여하며, SEQ ID NO: 234/235의 적어도 하나의 에피토프를 보유한다.
더 일반적으로, 본 발명은 해당 종에 대해 포유동물을 면역화하기 위한 어떤 포도상구균 종으로부터 유래하는 sta006 및/또는 sta011의 사용을 제공한다.
항체
S. aureus 항원에 대한 항체가 수동적 면역화에 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명은 제 1, 제 2, 제 3 또는 제 4 항원 그룹에 속한 항원에 특이적인 항체를 제공한다. 또한, 본 발명은 치료법에서 이러한 항체의 사용을 제공한다. 또한, 본 발명은 약제의 제조에서 이러한 항체의 사용을 제공한다. 또한, 본 발명은 본 발명의 항체의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 포유동물을 치료하는 방법을 제공한다. 면역원성 조성물에 대해 상기 설명된 대로, 이러한 방법 및 사용은 포유동물을 S. aureus 감염에 대해 보호할 수 있다.
용어 "항체"는 온전한 면역글로불린 분자뿐만 아니라 항원과 결합할 수 있는 단편들을 포함한다. 이들은 하이브리드(키메라) 항체 분자[263,264]; F(ab')2 및 F(ab) 단편 및 Fv 분자; 비-공유 헤테로다이머[265,266]; 단쇄 Fv 분자(sFv)[267]; 다이머 및 트라이머 항체 단편 구성물; 미니바디[268,269]; 인간화 항체 분자[270-272]; 및 이러한 분자들로부터 얻어진 어떤 기능적 단편, 뿐만 아니라 파지 디스플레이와 같은 종래와는 다른 과정을 통해 얻어진 항체들을 포함한다. 바람직하게, 항체는 단클론성 항체이다. 단클론성 항체를 얻는 방법은 본 분야에 잘 공지되어 있다. 인간화된 항체나 완전 인간 항체가 바람직하다.
일반적 사항
본 발명의 실시에는 달리 정해지지 않는다면 본 분야의 기술 범위 내에서 화학, 생화학, 분자생물학, 면역학 및 약물학의 종래 방법들을 이용할 수 있다. 이러한 기술은 문헌에 충분히 설명된다. 예를 들어, 참고문헌 273-280 등을 참조한다.
"GI" 넘버링이 상기 사용된다. GI 번호 또는 "Genlnfo Identifier"는 서열이 데이터베이스에 넣어질 때 NCBI에 의해 처리되는 각 서열 기록에 연속적으로 배정되는 일련의 숫자들이다. GI 번호는 서열 기록의 수탁 번호와는 유사성이 없다. 서열이 갱신될 때(예를 들어, 정정을 위해, 또는 추가의 주석이나 정보를 추가하기 위해), 그것은 새로운 GI 번호를 받는다. 따라서, 주어진 GI 번호와 연계된 서열은 절대 변하지 않는다.
본 발명이 "에피토프"와 관련된 경우, 이 에피토프는 B 세포 에피토프 및/또는 T 세포 에피토프일 수 있다. 이러한 에피토프는 경험적으로 확인될 수 있거나(예를 들어, PEPSCAN[281,282] 또는 유사한 방법에 의해), 또는 예측될 수 있다(예를 들어, Jameson-Wolf 항원성 지수[283], 매트릭스-기반 접근법[284], MAPITOPE [285], TEPITOPE[286,287], 신경망[288], OptiMer & EpiMer[289,290], ADEPT[291], T 부위[292], 소수성[293], 항원성 지수[294] 또는 참고문헌 295-299에 개시된 방법 등에 의해). 에피토프는 항원의 일부분으로서, 항체 또는 T 세포 수용체에 의해서 인식되고, 이들의 항원 결합 부위와 결합하며, "항원성 결정소"라고도 한다.
항원 "도메인"이 제외된 경우, 이것은 신호 펩티드, 세포질 도메인, 막통과 도메인, 세포외 도메인 등의 제외를 포함할 수 있다.
용어 "포함하는"은 "포함하는"과 "구성되는"을 포괄하며, 예를 들어 X를 "포함하는" 조성물은 X로만 구성될 수 있거나, 또는 X + Y와 같이 추가의 어떤 것을 포함할 수 있다.
수치 값 x와 관련하여 용어 "약"은 선택적이며, 예를 들어 x±10%를 의미한다.
두 아미노산 서열 간 서열 동일성 퍼센트에 대한 언급은 정렬되었을 때 해당 퍼센트의 아미노산이 두 서열을 비교했을 때 동일하다는 의미이다. 이 정렬 및 상동성 또는 서열 동일성 퍼센트는 본 분야에 공지된 소프트웨어 프로그램을 이용하여 결정될 수 있으며, 예를 들어 참고문헌 300의 섹션 7.7.18에 설명된 것들을 이용할 수 있다. 바람직한 정렬은 스미스-워터먼 상동성 탐색 알고리즘에 의해 결정되며, 이것은 갭 오픈 패널티 12 및 갭 익스텐젼 패널티 2, BLOSUM 매트릭스 62의 친화성 갭 탐색을 이용한다. 스미스-워터먼 상동성 탐색 알고리즘은 참고문헌 301에 개시된다.
도 1은 나타낸 항원으로 먼저 면역화된 마우스의 시험감염 후 박테리아 수 (log cfu/ml)를 나타낸다.
도 2-4는 14일에 걸쳐서 다양한 항원 혼합물로 먼저 면역화된 마우스의 시험감염 후 생존율(%)을 나타낸다. 도 2에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (i)와 (iii)와 (iv)가 함께 있고, (ii), IsdB가 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 3에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (i)와 (iii)와 (iv)가 함께 있고, (ii), IsdB가 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 3에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (iii), (i), (iv), (ii) 및 IsdB가 함께 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 4에서, SA-14에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (iv), (ii), (i), (iii), 음성 대조군, 및 IsdB의 순서이다.
도 5는 다양한 조성물로 먼저 면역화된 마우스의 시험감염 후 4번의 상이한 실험에서 마우스의 생존율에 대해 수집한 데이터이다(PBS 음성 대조군; IsdB 항원; 및 본 발명의 "Combo-1" 및 "Combo-2" 항원 조합). 각 기호는 각 마우스의 생존기간을 나타낸다; 각 그룹에서 수평 막대는 중간 생존기간을 나타내고, 퍼센트 값은 시험감염 후 14일째의 생존율이고, 위쪽의 p 값은 군별 중간 생존기간의 T-테스트 비교이다.
도 6은 농양 모델에서 Newman 균주 9 x 106 cfu로 감염시킨 후 마우스 신장에 있는 콜로니 형성 유닛(cfu)의 수를 나타낸다. 수평 막대는 군별 평균이고, 각 군 아래에 나타낸 숫자는 PBS 대조군과 대비된 log 감소도이다.
도 7은 농양 모델 실험에서 마우스 신장에 있는 박테리아 수(log CFU/ml)를 나타낸다. 마우스는 (A) MW2; (B) LAC; (C) Staphl9; 또는 (D) MU50 균주로 시험감염되었다. 각 포인트는 개별 동물이며, 막대는 군별 중간 수를 나타낸다. 마우스는 x-축 라벨에 나타낸 대로 면역화되었다.
도 8은 Ca++ 이온의 농도가 증가하는 환경에서 Sta011 올리고머의 형성을 나타낸다. 숫자는 mM 농도를 표시하고, *은 50mM EDTA의 존재를 나타낸다.
도 9는 (A) EsxAB, (B) Sta006, (C) Hla-H35L, (D) StaO11에 대한 IgG 역가를 나타낸다. 각 그래프는 3개 군을 나타내며, 군별로 한 쌍의 막대가 사용된다. 오른쪽의 막대는 면역화 전 IgG를 나타내고, 왼쪽의 막대는 면역화 후 IgG를 나타낸다. 3개 군은 면역화에 사용된 조성물이며, 왼쪽에서 오른쪽으로 애쥬번트 단독 음성 대조군, Combo 1 조합, 그리고 관련 단독 항원이다.
도 10은 나타낸 균주로 시험감염된 후 마우스에서 박테리아 수(log CFU/ml)를 나타낸다. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 CFU를 나타낸다. IsdB 및 Combo 칼럼 아래의 p 값은 애쥬번트 단독 대조군에 대한 비교이다.
도 11은 Newman 균주로 시험감염된 후 마우스의 농양 면적(㎟)을 나타낸다.
도 12는 4가지 상이한 균주로 시험감염된 후 마우스의 생존일수를 나타낸다: Newman(○), ST-80(□), USA300-FPR3757(Δ) 또는 USA300-Lac(×) 균주. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 생존일수를 나타내고, 위쪽의 숫자는 15일 후 생존한 동물의 퍼센트를 나타낸다. 마우스는 수산화 알루미늄 애쥬번트만을 받거나, IsdB 또는 Combo 1을 받았다.
도 13은 시험감염 후 마우스의 중간 생존일수를 나타낸다. 마우스는 X-축에 나타낸 항원으로 면역화되었다. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 생존일 수를 나타낸다. 위쪽의 숫자는 15일 후 생존한 동물의 퍼센트를 나타낸다.
도 2-4는 14일에 걸쳐서 다양한 항원 혼합물로 먼저 면역화된 마우스의 시험감염 후 생존율(%)을 나타낸다. 도 2에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (i)와 (iii)와 (iv)가 함께 있고, (ii), IsdB가 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 3에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (i)와 (iii)와 (iv)가 함께 있고, (ii), IsdB가 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 3에서, SA-10-a에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (iii), (i), (iv), (ii) 및 IsdB가 함께 있고, 다음에 음성 대조군이 있다. 도 4에서, SA-14에 속한 6개 그룹이 14일째에 위에서 아래까지 분포되는데, 그룹 (iv), (ii), (i), (iii), 음성 대조군, 및 IsdB의 순서이다.
도 5는 다양한 조성물로 먼저 면역화된 마우스의 시험감염 후 4번의 상이한 실험에서 마우스의 생존율에 대해 수집한 데이터이다(PBS 음성 대조군; IsdB 항원; 및 본 발명의 "Combo-1" 및 "Combo-2" 항원 조합). 각 기호는 각 마우스의 생존기간을 나타낸다; 각 그룹에서 수평 막대는 중간 생존기간을 나타내고, 퍼센트 값은 시험감염 후 14일째의 생존율이고, 위쪽의 p 값은 군별 중간 생존기간의 T-테스트 비교이다.
도 6은 농양 모델에서 Newman 균주 9 x 106 cfu로 감염시킨 후 마우스 신장에 있는 콜로니 형성 유닛(cfu)의 수를 나타낸다. 수평 막대는 군별 평균이고, 각 군 아래에 나타낸 숫자는 PBS 대조군과 대비된 log 감소도이다.
도 7은 농양 모델 실험에서 마우스 신장에 있는 박테리아 수(log CFU/ml)를 나타낸다. 마우스는 (A) MW2; (B) LAC; (C) Staphl9; 또는 (D) MU50 균주로 시험감염되었다. 각 포인트는 개별 동물이며, 막대는 군별 중간 수를 나타낸다. 마우스는 x-축 라벨에 나타낸 대로 면역화되었다.
도 8은 Ca++ 이온의 농도가 증가하는 환경에서 Sta011 올리고머의 형성을 나타낸다. 숫자는 mM 농도를 표시하고, *은 50mM EDTA의 존재를 나타낸다.
도 9는 (A) EsxAB, (B) Sta006, (C) Hla-H35L, (D) StaO11에 대한 IgG 역가를 나타낸다. 각 그래프는 3개 군을 나타내며, 군별로 한 쌍의 막대가 사용된다. 오른쪽의 막대는 면역화 전 IgG를 나타내고, 왼쪽의 막대는 면역화 후 IgG를 나타낸다. 3개 군은 면역화에 사용된 조성물이며, 왼쪽에서 오른쪽으로 애쥬번트 단독 음성 대조군, Combo 1 조합, 그리고 관련 단독 항원이다.
도 10은 나타낸 균주로 시험감염된 후 마우스에서 박테리아 수(log CFU/ml)를 나타낸다. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 CFU를 나타낸다. IsdB 및 Combo 칼럼 아래의 p 값은 애쥬번트 단독 대조군에 대한 비교이다.
도 11은 Newman 균주로 시험감염된 후 마우스의 농양 면적(㎟)을 나타낸다.
도 12는 4가지 상이한 균주로 시험감염된 후 마우스의 생존일수를 나타낸다: Newman(○), ST-80(□), USA300-FPR3757(Δ) 또는 USA300-Lac(×) 균주. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 생존일수를 나타내고, 위쪽의 숫자는 15일 후 생존한 동물의 퍼센트를 나타낸다. 마우스는 수산화 알루미늄 애쥬번트만을 받거나, IsdB 또는 Combo 1을 받았다.
도 13은 시험감염 후 마우스의 중간 생존일수를 나타낸다. 마우스는 X-축에 나타낸 항원으로 면역화되었다. 각 포인트는 개별 동물이고, 막대는 중간 생존일 수를 나타낸다. 위쪽의 숫자는 15일 후 생존한 동물의 퍼센트를 나타낸다.
항원 선택
다양한 기준에 기초하여 백신 성분으로서 사용하기 위한 S. aureus 단백질들이 선택되었다.
IsdA는 철 흡수에 관련되는 표면 단백질이다. 이것은 S. aureus의 전체 세포 용해물과 세포벽 분획의 면역블롯에서 높은 분자량(> 250kDa)으로 검출될 수 있다. 또한, 표지된 항-IsdA 항체는 세포외 구조를 드러냈다. 이러한 구조는 철 양성 조건(IsdA 발현이 억제되는 것으로 보고된다)을 포함하는 다양한 성장 및 감염 조건에서 보였다. 이 구조들은 최댈 4μm 길이의 꼬리를 가지고, 전형적인 배향은 포유동물 세포 표면에 평행하다. 분리된 IsdA-양성 구조는 상피세포의 표면에 부착되고, 세포 접합부 국소화 성질은 상실되는 것으로 관찰되었다. 상피/박테리아 상호작용은 이 구조들의 발현을 자극할 수 있다. 또한, 본 발명자들은 IsdA가 상이한 균주들에서 잘 보존된다는 것을 발견했으며(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음; 하기 참조), 따라서 광범한 집단의 순환 균주에 걸쳐서 보호를 제공한다. 철 흡수는 병독성에 중요하므로, 이 단백질은 박테리아 생명주기의 병원성 단계에서 면역공격에 이용될 수 있을 것 같다. 본 발명자들은 이 단백질이 인체 세포에 대해서는 세포독성이 아니라는 것을 발견했다(하기 참조). 또한, 이 단백질은 수산화 알루미늄에 상당히 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 이것은 또한 박테리아의 혈액 전파를 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다.
EsxA와 EsxB는 작은 산성 다이머로서 분비된 단백질이다. 본 발명자들은 EsxA는 상이한 균주들에서 고도로 보존되지만(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음; 하기 참조), EsxB는 36개 균주들 중 25개에만 존재한다는 것을 발견했다. 이 단백질은 감염이 지속되는데 관련되므로, 이것은 박테리아 생명주기의 병원성 단계에서 면역공격에 이용될 수 있을 것 같다. 본 발명자들은 EsxA와 EsxB의 융합체("EsxAB")가 인체 세포에 대해서는 세포독성이 아니라는 것을 발견했다(하기 참조). 또한, 이 단백질은 수산화 알루미늄에 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 따라서, 이 항원은 박테리아의 혈액 전파를 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다.
Hla는 공극-형성 분비 독소이다. 이 단백질은 상이한 균주들에서 잘 보존되며(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음; 하기 참조), 따라서 광범한 집단의 순환 균주에 걸쳐서 보호를 제공한다. 이것은 중요한 병독성 인자이므로, 박테리아 생명주기의 병원성 단계에서 면역공격에 이용될 수 있을 것 같다. 이것은 인체 세포에 대해서는 세포독성이 아니다(하기 참조). 이 단백질은 수산화 알루미늄에 상당히 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 이것은 폐렴을 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다.
Spa는 Fc 결합에 관련되는 표면 단백질이다. 본 발명자들은 이 단백질이 상이한 균주들에서 잘 보존된다는 것을 발견했으며(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음), 따라서 광범한 집단의 순환 균주에 걸쳐서 보호를 제공한다. 이것은 병독성에 중요하므로, 박테리아 생명주기의 병원성 단계에서 면역공격에 이용될 수 있을 것 같다. 또한, 이 단백질은 수산화 알루미늄에 상당히 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 이것은 박테리아의 혈액 전파를 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다.
Sta006(FhuD2라고도 알려져 있음)은 철 흡수에 관련되는 표면 단백질이다. 본 발명자들은 sta006이 상이한 균주들에서 잘 보존된다는 것을 발견했으며(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음; 하기 참조), 따라서 광범한 집단의 순환 균주에 걸쳐서 보호를 제공한다. 본 발명자들은 이 단백질이 인체 세포에 대해서는 세포독성이 아니라는 것을 발견했다(하기 참조). 또한, 이 단백질은 수산화 알루미늄에 상당히 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 이것은 또한 박테리아의 혈액 전파를 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다.
Sta011은 표면 리포단백질이다. 본 발명자들은 sta011이 상이한 균주들에서 잘 보존된다는 것을 발견했으며(시험된 36개 균주들 중 36개 균주 전부에 존재했음; 하기 참조), 따라서 광범한 집단의 순환 균주에 걸쳐서 보호를 제공한다. 본 발명자들은 이 단백질이 인체 세포에 대해서는 세포독성이 아니라는 것을 발견했다(하기 참조). 또한, 이 단백질은 수산화 알루미늄에 상당히 잘 흡착할 수 있으며(하기 참조), 이것은 인체 송달을 위한 안정한 제제에 유용하다. 이것은 또한 박테리아의 혈액 전파를 방지하기 위한 면역반응을 제공하는데 유용하다. 이 단백질은 Ca++ 이온이 존재하면 올리고머로 회합되지만, Mg++ 이온이 존재할 때는 그렇지 않은 것으로 알려져 있다(도 8 참조). 이 실험들에는 5μg 재조합 태그-프리 Sta011이 사용되었고, CaCl2 농도를 0.5-50mM로 증가시키면서 25분 동안 37℃에서 인큐베이션한 다음, 투명한 천연 겔 상에서 겔 전기영동으로 분석되었다. 이동도 이동(올리고머화를 나타냄)은 2mM Ca++부터 분명히 나타났고, 특히 > 5mM에서 분명했다. 이들 수준을 약 1.2mM의 혈액 Ca++ 농도, 약 11mM의 혈청 농도, 및 약 32mM의 젖 농도와 비교한다. EDTA는 이동을 역전시켰다.
분비된 단백질의 표면절단[302] 및/또는 분석에 의해 ClfA, ClfB, coA, eap, ebhA, ebpS, efb, emp, FnBA, FnBB, hla, IsdA, IsdB, IsdH, ukD, lukS, sdrD, sdrE, sasB, sasD, sasF, spa, sta00l, sta002, staOO3, staOO4, sta005, staOO6, sta007, sta008, sta009, staOlO, staO11, staO19, staO23, staO24, staO28, staO36, sta040, staO49, staO5O, staO54, staO57, staO64, staO65, staO73, staO95, staO96, staO98, stalOO, sta101, stalO2, sta1O3, sta1O5, sta1O7, sta1O8, sta1O9, sta111, sta112, sta113, sta115, sta116, sta117, sta118, sta120, NW_06, NW_07, NW_08, NW_09 and NW_10으로부터의 펩티드 단편들이 드러났으며, 예를 들어 SEQ ID NO: 228 및 229가 sta019의 단편들로서 확인되었다.
콘쥬게이트된 캡슐형 당류는 옵소닌 면역성을 제공하는데 유용하다. 혈청형 5 및 8이 임상 분리주의 약 85%를 커버한다.
균주 적용범위
순환 균주를 대표해서 36개의 임상 분리주 집단이 사용되었고, 여기에는 전 세계적으로 순환되는 CA-MRSA(지역사회-관련 메티실린 내성 S. aureus)의 거의 대부분인 5가지 클론 계통에 속하는 균주들이 포함된다. HA-MRSA(병원-관련 MRSA)와 비-MRSA 균주들도 또한 포함되었다. 전체적으로 이 집단에는 9개의 HA-MRSA 균주, 7개의 CA-MRSA 균주, 2개의 MRSA 균주, 그리고 18개의 다른 균주들이 포함되었다.
IsdA, Hla, EsxA, StaOO6, StaO11, Spa 및 ClfB를 암호화하는 유전자들은 36개 균주 모두에 존재했다. EsxB의 유전자는 36개 균주 중 11개 균주에는 존재하지 않았고, SdrD의 유전자는 36개 균주 중 6개 균주에는 존재하지 않았다.
암호화된 IsdA 서열은 집단 전체적으로 95-100% 동일했고, 이 단백질은 고정 성장 단계에서 철-제한 조건에서 발현되었다. 암호화된 SdrD 서열은 36개 중 30개의 SdrD+ ve 집단 구성원에서 동일했다. 암호화된 EsxA 서열은 집단 전체에서 100% 동일했다. 암호화된 EsxB 서열은 25개의 EsxB+ ve 균주에서 95-100% 동일했다. 암호화된 ClfB 서열은 집단 전체적으로 93-100% 동일했고, 이 단백질은 또한 초기의 급격한 성장 단계에서 상당히 표면-노출되는 것으로 판명되었다.
암호화된 아미노산 서열들에 있는 보존적 특성은 다음과 같았다(동일성 %):
61개 균주의 대형 집단이 Hla 및 Sta006을 암호화하는 유전자의 존재와 이들의 발현에 대해서 스크리닝되었다. 이 집단은 MRSA와 MSSA 균주를 모두 커버하며, 다양한 지형적 기원과 다양한 ST 및 클론 복합체 타입을 커버한다. 61개 균주 중 9개는 Hla를 발현하지 않았고, 1개 균주를 제외한 전부가 Sta006을 발현했다(61번째 균주의 데이터는 아직 확정되지 않았다). 따라서, Hla에만 기초한 백신은 광범위 백신을 위한 충분한 적용범위를 제공하지 못할 것 같았는데, 이 문제는 Sta006의 첨가에 의해서 극복될 수 있었다.
세포독성 및 세포 결합 연구
S. aureus 재조합 항원들 Hla, Hla-H35L, IsdA, IsdB, staOO6, sta011 및 EsxAB에 의한 잠재적 세포성 세포독성의 분석이 HBMEC 및 A549 세포를 대상으로 수행되었다. 아넥신 V와 요오드 프로피듐 염색을 이용하여 유세포분석에 의해 초기 및 후기 세포자살성 세포의 퍼센트를 측정했다. 내피세포는 완전히 합류될 때까지 24웰 플레이트에서 성장되었다. 다음에, 세포는 3가지 상이한 농도의 재조합 항원과 함께 24시간 동안 인큐베이션되었다(1Oμg/ml, 1μg/ml, O.1μg/ml). 내피세포에서 세포자살을 유도한다고 보고된 TNF-α와 시클로헥시미드(CHX)의 조합이 양성 대조군으로 사용되었다. PBS 버퍼와만 인큐베이션한 것이 음성 대조군으로 사용되었다. 다음에, 분석이 FACS에 의해 수행되었다.
어떤 항원도 HBMEC 또는 A549 세포에 대해서 세포독성 효과를 유도하지 않았다. 실제로 대조군 세포와 비교하여 살아 있는 세포 집단의 퍼센트가 최대 24시간의 인큐베이션 동안 본질적으로 일정하에 유지되었다. 반면에, TNF-α와 CHX의 조합은 세포자살성 세포의 수에 있어서 25% 증가를 유도했다.
또한, HBMEC가 사람 내피세포와 S. aureus 재조합 항원의 결합을 시험하기 위한 시험관내 모델로서 사용되었다. HBMEC는 10% 열 불활성화된 소 태아 혈청, 10% NuSerum, 2mM 글루타민, 1mM 피루베이트, 1% 비필수 아미노산, 1% MEM 비타민, 100 유닛/ml 페니실린, 및 100μg/ml 스트렙토마이신으로 보충된 RPMI1640 배지에서 가습 분위기에서 37℃에서 합류점까지 성장되었다. 재조합 항원의 세포에의 결합이 간접 면역형광에 의해 시험되고 FACS로 분석되었다. 결합에 양성인 세포들은 비특이적 항체 인식으로서 확인되는, 음성 대조군에 상대적인 형광의 순 평균 강도로서 측정되었다. 결합 실험은 4℃에서 수행되었다. 각 재조합 항원에 특이적인 마우스 다클론성 항체들이 1차 항체로서 사용되었고, R-피코에리트린-콘쥬게이트된 염소 항-마우스 IgG 2차 항체로 결합이 검출되었다. 음성 대조군으로서 HBMEC가 형광-표지된 2차 항체에 의해 검출되는 1차 다클론성 항체와 또는 형광-표지된 2차 항체와만 인큐베이션되었다. 공지된 표면-노출된 GBS 항원의 결합이 양성 대조군으로 사용되었다.
Hla와 Hla-H35L은 내피세포와 강력히 결합할 수 있는 유일한 항원들이었다. 이들 두 항원의 용혈 활성이 또한 시험되었다.
피브린 제거된 양과 토끼의 혈액을 사용하여 분광광도 분석에 의해서 이들의 용혈 활성을 측정했다. 혈액은 두 단백질의 1:4의 연속 희석물과 함께 30분 동안 37℃에서 인큐베이션되었다. 삼투 용해를 유도하기 위한 물과의 인큐베이션과 S. pyogenes 단백질과의 인큐베이션이 양성 대조군이었고, 음성 대조군으로서 혈액을 PBS + BSA 0.5%와 함께 인큐베이션했다.
재조합 천연 Hla로서 H35L 돌연변이체 형태가 아닌 것은 토끼 적혈구에 대해 용혈 활성을 나타냈다. 이 돌연변이체는 야생형에 비해서 용혈성이 적어도 150배 적었다. 두 단백질 모두 양의 혈액에 대해서는 용혈 활성을 갖지 않았다.
이와 같이, S. aureus 재조합 백신 후보들은 A549 상피 셀라인과 HBMEC 내피 셀라인에 대해 모두 어떤 세포독성도 나타내지 않는다. 중요한 점은 숙주 세포의 원형질 막에 공극을 형성한다고 알려진 분비 독소인 Hla가 A549와 결합할 수는 있었지만 이들에 대한 세포독성을 유도하지는 못했다는 것이다. 이것 역시 토끼 적혈구의 용혈반응을 유도할 수 있었다. 반면에, 세포용해성 공극을 형성할 수 없는 단일 아미노산 치환을 가진 변이체 독소인 재조합 Hla-H35L은 사람 셀라인과 토끼 적혈구에서 모두 세포성 손상을 유도하지 않았다. 이러한 발견은 Hla의 이 돌연변이체가 백신 조성물에서 더욱 안전하게 사용될 수 있음을 시사한다. 나머지 항원들 중에서 숙주 세포와 결합할 수 있는 능력을 나타내는 것은 없었다.
애쥬번트
제제
선택된 S. aureus 단백질 항원 후보들이 수산화 알루미늄과 함께 개별적으로 또는 단백질들의 조합으로서 캡슐형 다당 콘쥬게이트(들)를 사용하거나 사용하지 않고 조제되었다. 이 제제들은 pH 및 삼투농도에 대해 최적화되었다.
항원은 EsxA-B, StaOO6, StaO1l, Hla-H35L, SdrD, IsdA, ISdA40 -184, StaO19, StaO21, StaO73, ClfB45 -552, SdrD53 -592, SasF, 및 IsdB였다. 이들은 100μg/ml로 1가 항원으로서, 또는 각 50μg/ml씩으로 조합으로서 조제된다. 타입 5 또는 타입 8 균주로부터의 캡슐형 당 콘쥬게이트가 5μg/ml, lOμg/ml 또는 25μg/ml로 첨가된다. 수산화 알루미늄은 2mg/ml로 사용되며, 10mM 히스티딘 버퍼(pH 6.5) 중에서 9 mg/ml NaCl을 함유한다.
모든 1가 및 조합 제제는 콘쥬게이트가 있든 없든 바람직한 pH 및 삼투농도에 관해서 조정될 수 있었다. 제제들은 6.2-7.3 범위의 pH와 248-360mOsm/kg 범위의 삼투농도를 가졌다. 글리세롤은 삼투농도에 좋지 않은 영향을 미치므로 제제에서 빠졌다.
시험된 모든 단백질은 다양한 1가 및 조합 제제의 형태에서 IsdA, ISdA40 -184, StaO19, 및 StaO73을 제외하고는 수산화 알루미늄 애쥬번트에 잘 흡착되었다.
개별 StaOO6, StaO11, EsxAB 및 Hla-H35L 단백질은 완전히 흡착되었고, 탈착 후에도 흡착 전의 전기영동 프로파일을 그대로 유지할 수 있었다.
StaOO6, StaO11, EsxAB 및 Hla-H35L 조합에서 각 항원은 완전히 흡착되었고, 애쥬번트에 대해 항원간 경쟁은 없었다. 또한, StaOO6, StaO11, EsxAB 및 ISdA40 -184의 조합에 있는 항원들도 IsdA40 -184만 제외하고 완전히 흡착되었으며, IsdA40 -184는 1가 단백질과 동일한 방식으로 행동했다. 두 조합에서 모두 항원들은 탈착 후에도 흡착 전의 전기영동 프로파일을 그대로 유지할 수 있었다.
타입 5 및/또는 타입 8 콘쥬게이트가 추가로 존재해도, 예를 들어 StaOO6 + StaO11 + EsxAB의 조합에서 항원들의 흡착 또는 탈착 특성은 변하지 않았다.
단기 안정성 연구(4℃에서 2주)를 수행하여 1가 제제의 안정성과 항원 완전성을 평가했다. 모든 시험된 제제는 그들의 pH 및 삼투농도에서 안정하였다. 모든 항원은 애쥬번트에 완전히 흡착된 채로 있었다. 모든 항원의 탈착 특성을 유지했다. 탈착 후 항원의 변성 및 응집이 증가한다는 증거는 없었다.
효능 시험
개별 항원들 staOO6, staO11, staO12, staO17, staO19, staO21 및 staO28이 1.2 x 107 cfu의 Newman 균주(타입 5)에 의한 정맥내 시험감염에 대해 보호 효과를 도출하는 능력에 대해 시험되었다. 결과는 도 1에 제시된다. 모든 항원이 대조군에 비하여 박테리아 수를 감소시켰고, 최상의 결과는 staOO6, staO11 및 staO19에서 나타났다.
추가의 개별 항원들이 시험되었다: (i) NW_1O; (ii) ISdA40-184; (iii) Sta 002;(iv) Sta003; (v) Sta073; (vi) Sta1O1; (vii) StaO14; (viii) Hla-PSGS; (ix) SdrDCnaB. 음성 대조군과 비교하여 생존율의 증가는 시험감염 후 15일째에 (i) 50%; (ii) 19%; (iii) 37%; (iv) 43%; (v) 25%; (vi) 12%; (vii) 25%; (viii) 56%; (ix) 39%였다.
또한, 2개의 하이브리드 폴리펩티드가 시험되었다: (i) HlaH35L-EsxAB; (ii) Sta006-EsxAB. 음성 대조군과 비교하여 시험감염 후 생존율의 증가는 (i) 25%; (ii) 25%였다.
표 2는 농양 모델에서 다양한 항원을 사용하여 얻어진 결과의 요약을 제공한다.
실험 SA-10-a에서 항원 조합들의 효능이 시험되었다. 12마리의 CD1 마우스로 구성된 6개 그룹에 음성 대조군(PBS), IsdB, 또는 수산화 알루미늄의 애쥬번트가 첨가된 다음 조합들 중 하나가 투약되었다: (i) EsxAB + Hla-H35L; (ii) StaOO6 + StaO11 + EsxAB; (iii) StaOO6 + StaO11 + EsxAB + Hla-H35L; 또는 (iv) StaOO6 + StaO11 + ISdA4O-184 + EsxAB. 투여는 제0일과 제14일에 2회 이루어졌다. 24일째에 마우스에 3 x 108 cfu의 Newman 균주 포도상구균을 투여했고, 각 그룹에서 생존율을 2주 동안 24시간마다 평가했다. 결과가 도 2에 제시된다. 14일 후에 양성 대조군에 속한 동물은 25%가 생존했지만, (ii) 그룹에 속한 동물의 50%, (iii) 및 (iv) 그룹에 속한 동물의 58%, 그리고 (i) 그룹에 속한 동물의 75%가 생존했다.
실험 SA-10-b에는 동일한 방법이 사용되었고, (i) ClfB45-552 + Hla-H35L + StaOO6 + EsxAB; (ii) ClfB45-552 + StaO11 + StaOO6 + EsxAB; (iii) ClfB45-552 + ISdA40-184 + StaOO6 + EsxAB; 또는 (iv) SdrD53-592 + ISdA4O-184 + StaOO6 + EsxAB가 시험되었다. 결과가 도 3에 제시된다. 14일 후에 양성 대조군과 (ii) 그룹에 속한 동물의 25%가 생존했고, (iv) 그룹에 속한 동물의 33%가 생존했고, (i) 그룹에 속한 동물의 75%와 (iii) 그룹에 속한 동물의 83%가 생존했다.
또한, 추가의 조합을 사용하여 마우스가 면역화되었다. 이 조합들은 전형적으로 수산화 알루미늄(상기 참조)의 애쥬번트가 첨가되었고, 제0일과 제14일에 투여되었다. 면역화는 CD1 마우스를 대상으로 했으며, 그룹당 12마리였다. 24일째 마우스가 치사량의 간 박테리아로 시험감염되었고, 이후 14일 동안 생존율이 추적되었다. 비교를 위해 음성 대조군으로 PBS가 사용되었고, 양성 대조군으로 IsdB가 사용되었다[2].
실험 SA-11에서는 (i) EsxB와 조합된 타입 5 콘쥬게이트 + StaOO6 + StaO11; (ii) EsxAB + StaO19 + StaOO6 + StaO11; (iii) 타입 5 콘쥬게이트 + Hla-H35L + StaOO6 + StaO11; (iv) EsxAB + Hla-H35L + StaOO6 + StaO11; 또는 (v) EsxAB + ISdA40-184 + StaOO6 + StaO11을 시험했다. 시험감염 후 14일째에 음성 대조군 동물은 전부 죽었고, 양성 대조군 동물의 42%가 생존했다. 시험 그룹별 생존율 결과는 다음과 같았다: (i) 67%; (ii) 42%; (iii) 75%; (iv) 33%; 및 (v) 25%.
실험 SA-12에서는 (i) Hla-H35L + ISdA40-184 + StaOO6 + StaO11; (ii) Hla-H35L + EsxAB + StaOO6 + StaO11; (iii) EsxAB + ISdA4O-184 + StaOO6 + StaO11; (iv) EsxAB + IsdA+ StaOO6 + StaO11을 시험했다. 시험감염 후 14일째에 음성 대조군 동물의 8%와 양성 대조군 동물의 17%가 생존했다. 시험 그룹별 생존율 결과는 다음과 같았다: (i) 50%; (ii) 50%; (iii) 25%; (iv) 33%.
실험 SA-14에서는 (i) EsxAB + Hla-H35L + StaOO6 + StaO11; (ii) EsxAB + ISdA40-184 + StaOO6 + StaO11; (iii) StaOO6 + StaO11 + StaO19 + EsxAB; (iv) StaOO6 + StaO11 + StaO19 + Hla-H35L을 시험했다. Newman 균주 5 x 108 CFU로 시험감염 후 14일째에 음성 대조군 동물의 18%와 양성 대조군 동물의 9%가 생존했다. 시험 그룹별 생존율 결과는 다음과 같았다: (i) 58%; (ii) 67%; (iii) 42%; (iv) 83%. 14일에 걸친 생존 개체수가 도 4에 표시되며, 모든 조합은 시험감염 후 매일마다 두 대조군보다 월등히 잘 기능했다는 것이 나타난다.
실험 SA-17a에서는 (i) EsxAB + StaOO6 + StaO11 + 혈청형 5 콘쥬게이트 + 혈청형 8 콘쥬게이트; (ii) EsxAB + StaO73 + StaO11 + 혈청형 5 콘쥬게이트 + 혈청형 8 콘쥬게이트; (iii) EsxAB + Hla-H35L + StaO11 + StaO73를 시험했다. 음성 대조군과 비교해서, Newman 균주로의 시험감염 후 15일 생존율의 증가는 (i) 17%; (ii) 42%; (iii) 34%였다. (ii) 및 (iii) 그룹에서 중간 생존일수는 15일을 꽉 채웠고, (i) 그룹에서는 12일이었다.
추가의 항원 조합 실험에서 (a) 혈청형 5 콘쥬게이트 + 혈청형 8 콘쥬게이트 + EsxAB + StaOO6 + StaO11; (b) Sta002 + Sta003 + Sta021 + NW-10; (c) EsxAB + HlaH35L + StaOO6 + StaO19; 및 (d) EsxAB + Sta006 + Sta019를 시험했다. 음성 대조군과 비교해서, Newman 균주로의 시험감염 후 생존율의 증가는 (a) 37%; (b) 36%; (c) 13%; 및 (d) 0%였다.
SA-10, SA-11, SA-12 및 SA-14 연구로부터의 생존 데이터를 조합하여 두 조합의 효능이 PBS 또는 IsdB와 비교 평가되었다. "Combo-1"은 EsxAB + Hla-H35L + Sta006 + Sta011(폴리펩티드들은 SEQ ID NO: 241, 150, 246 & 247을 포함한다)이다. "Combo-2"는 EsxAB + IsdA40-184 + StaOO6 + StaO11이다. 14일 후 48마리의 마우스로 이루어진 각 그룹에서 중간 생존 시간이 비교되었다. PBS 및 IsdB 그룹에서 중간 생존 시간은 1일이었지만, "Combo-1" 및 "Combo-2" 그룹에 속한 마우스들은 14일의 중간 생존 시간을 나타냈다. 중간 생존기간의 차이가 t-테스트에 의해 비교되었다: "Combo-1" 그룹에서의 생존은 PBS 그룹(p<0.0001) 및 IsdB 그룹(p< 0.0001) 모두에 비해 실질적으로 우수했다; "Combo-2" 그룹에서의 생존은 PBS 그룹(p<0.0001) 및 IsdB 그룹(p=0.0049) 모두에 비해 실질적으로 우수했다. 이들 데이터는 도 5에 제시된다.
도 6은 농양 모델에서 Combo-1 및 Combo-2를 사용한 데이터를 나타낸다. 시험감염 후 마우스의 신장이 분리되고, 이어서 균질화되어 평판된다. cfu 카운트는 농양 형성 수준을 나타낸다. 도 6은 1회 실험의 데이터이다. 데이터 아래의 숫자는 PBS 그룹에 상대적인 log 감소도를 나타낸다. IsdB만을 사용한 경우보다 두 조합 그룹에서 감소 효과가 더 크며, U-테스트(원 테일) 값은 Combo-1에서 0.0001이고, Combo-2에서 0.0005이다. IsdB 그룹이 포함되지 않은 2차 실험에서도 두 조합 그룹에서 동일한 효과가 보였다.
추가의 실험에서 3개의 상이한 균주들, Staph-19, FPR3757(USA300) 및 Lac (USA300)에 의한 시험감염에 대한 Combo-1, IsdB 또는 PBS를 사용하여 달성된 보호를 비교했다. 그룹당 마우스는 44마리였고, 생존 비율에 대한 원-테일드 p-값을 포함하여 결과는 다음과 같았다(또한 도 12 참조). 결과에서 P1은 PBS 함유 Combo 1과 비교하고, P2는 IsdB 함유 Combo-1과 비교하고, P3은 IsdB 함유 PBS와 비교한 것이다:
추가의 실험에서는 애쥬번트 첨가된 Combo 1이 애쥬번트(수산화알루미늄)로만 면역화되거나 또는 IsdB로 면역화된 경우와 비교했을 때 Newman, USA1OO, CC30 및 US A300으로 시험감염 후 CFU 수를 감소시킨 것으로 나타났다. 도 10은 4개의 시험감염 균주에 대한 CFU 값(log/ml)을 나타낸다. 각 경우 p<0.015의 최저 카운트가 Combo 1에서 달성되었다. 또한, 농양 면적이 평가되었고, 이것 역시 Combo 1로 면역화된 마우스에서 더 적었다(예를 들어, 도 11).
추가의 실험에서는 Combo 1이 패혈증 모델에서 임상적으로 관련 있는 균주들에 대해 고도로 보호성이며, 항상 IsdB보다 높은 생존율이 달성되는 것으로 나타났다. 도 12는 Newman, ST-80, FPR3757 또는 Lac 균주로 시험감염되었을 때 Combo-1로 면역화된 마우스에서 중간 생존일수(그룹 당 40마리, 3회 실험)가 15일을 꽉 채웠다는 것과, 생존한 마우스의 비율이 75% 이상이었다는 것을 나타낸다. 반면에, IsdB로 면역화된 마우스에서 중간 생존일수는 Newman 및 ST-80 시험감염되었을 때 단지 1일이었고, 4개 시험감염 균주에서 생존율은 모두 65% 이하였다.
Combo
1과 그것의 개별 폴리펩티드의 비교
Combo 1과 그것의 4개의 개별 폴리펩티드(즉, EsxAB, Hla-H35L, StaOO6, Sta O11)을 비교하고, 또한 IsdB 또는 항원 무함유 음성 대조군과 비교하기 위한 다양한 시험이 수행되었다.
면역화된 동물에서 채취한 혈청의 옵소노파고사이트 활성이 시험되었다. 혈청은 (i) 4개의 개별 폴리펩티드, (ii) 모든 폴리펩티드 쌍, (ii) 모든 3성분 쌍, 또는 (iv) 전체 Combo 1 조합을 사용하여 얻어졌다. 비교를 위해 항-IsdB 혈청이 사용되었다. 면역화 전의 혈청과 음성 대조군 혈청은 이 분석에서 Newman 균주가 죽지 않은 것으로 나타났다. 1차 실험에서 항-IsdB 혈청은 27% 사멸률을 나타냈고, 4개의 개별 폴리펩티드 각각에 대한 혈청은 26-34% 사멸률을 나타냈고, 다중-폴리펩티드 조합은 전부 적어도 34% 사멸률을 나타냈고, Combo-1에 의해 생긴 혈청은 39% 사멸률을 나타냈다. 2차 실험에서는 Combo-1에 의한 혈청이 43%의 사멸률을 나타냈지만, 항-IsdB 혈청은 약간 개선되었을 뿐이었고, Combo-1 폴리펩티드를 이용한 모든 단일 또는 다중-폴리펩티드 혈청은 적어도 26%의 사멸률을 나타냈다.
추가의 실험에서 면역화된 토끼로부터 마우스(그룹당 20마리, 8주령 CD1 마우스) 항혈청으로 전달함으로써 달성된 수동적 보호가 조사되었다. 4개 그룹에는 EsxAB, Hla-H35L, StaOO6, StaO11 중 하나로 면역화된 토끼의 혈청 200μl를 투여했고, 15개 그룹에는 각 혈청 50μl를 투여했다(총 200μl). 다른 2개 그룹에는 IsdB로 면역화된 토끼의 혈청 또는 식염수 + 애쥬번트로 면역화된 토끼의 혈청을 투여했다. 15분 후 마우스가 복강내 시험감염되었고(108 CFU의 Newman 균주), 14일 후에 사망률이 평가되었다. 결과는 다음과 같았다:
추가의 실험에서 Combo 1의 4개 폴리펩티드의 면역원성을 평가하기 위해 CD1 마우스에서 유도된 특이적 항체들의 수준이 시험되었다. 조성물은 4개의 폴리펩티드를 각각 20μg씩 포함했거나, 또는 조합에서는 4 x 10μg을 포함했다. 조성물은 수산화 알루미늄 애쥬번트를 포함했다. 항원-특이적 IgG의 혈청 수준이 4Plex 분석에 의해서 측정되었다. 도 9에 나타낸 대로, 4개의 폴리펩티드는 모두 단독으로도 조합으로도 CD1 마우스에서 고도로 면원원성이었다. 각 경우 폴리펩티드에 대한 역가는 단독 투여되었을 때보다 조합으로 투여되었을 때 더 높았다(중간 우측 쌍을 비교한다).
추가의 실험에서 Combo 1을 사용하여 달성된 보호 효과와 4개의 개별 폴리펩티드를 사용하여 달성된 보호 효과가 비교되었다. 비교에는 IsdB도 포함되었다. Newman 균주로 시험감염 후 15일 뒤에 생존한 동물의 비율(그룹당 40마리), 및 평균(중간) 생존일수는 다음과 같았으며, 여기에는 PBS + 애쥬번트 음성 대조군과 비교된 생존 비율의 원-테일드 p 값이 포함된다:
뮤린 농양 모델을 사용하여 4개의 개별 폴리펩티드와 Combo 1 조합을 비교했다. 어떤 실험에서 마우스는 비교를 위해 IsdB로 면역화되었다. 항원에는 수산화 알루미늄의 애쥬번트가 첨가되었고, 애쥬번트만 사용한 것을 음성 대조군으로 하였다. 도 7은 4개의 상이한 균주로 시험감염 후 동물의 신장에 존재하는 박테리아의 수를 나타낸다. Combo 1 조합에서 최저 평균 수가 관찰되었다.
(i) 4개의 개별 폴리펩티드, (ii) 모든 쌍, (ii) 모든 3성분 쌍, 또는 (iv) 전체 Combo 1 조합으로 면연화한 후 시험감염 실험이 수행되었다. IsdB나 버퍼만 사용한 것이 비교로서 사용되었다. 5 x 108 CFU의 Newman 균주로 시험감염 후 그룹당 24마리의 마우스로부터 얻어진 생존율(3회 실험)이 도 13에 제시된다. IsdB에서 중간 생존일수는 단지 2일이었다. Combo 1의 각 폴리펩티드에 대한 중간 생존일수는 1-6일 범위였다. 폴리펩티드의 쌍들에서는 2-11일의 중간 생존일수가 얻어졌다. 3성분 쌍들에서는 8-15일의 중간 생존일수가 얻어졌다. 전체 Combo 1 조합에서는 15일을 꽉 채운 중간 생존일수가 얻어졌고, 마우스의 59%가 이렇게 오랜 기간 동안 생존했다(IsdB의 경우 단지 35%).
본 발명이 단지 예시의 방식으로 설명되었으며, 본 발명의 범위 및 사상 안에서 변형이 이루어질 수 있다는 것이 이해될 것이다.
참고문헌
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<170> SeqWin2010, version 1.0
<210> 1
<211> 927
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Ala Thr Gly Ile Gly Ser Thr Thr Ala Asn Lys Thr Val Leu Val Asp
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Tyr Glu Lys Tyr Gly Lys Phe Tyr Asn Leu Ser Ile Lys Gly Thr Ile
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Ile Lys Val Tyr Lys Val Asp Asn Ala Ala Asp Leu Ser Glu Ser Tyr
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Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp
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<213> Staphylococcus aureus
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Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Glu Ser
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Asp Ser Asp Ser Glu Ser Asp Ser Glu Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser
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Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser
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Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser
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Gly Thr Glu Ser Thr Leu Lys Gly Thr Gln Gly Glu Ser Ser Asp Ile
435 440 445
Glu Val Lys Pro Gln Ala Thr Glu Thr Thr Glu Ala Ser Gln Tyr Gly
450 455 460
Pro Arg Pro Gln Phe Asn Lys Thr Pro Lys Tyr Val Lys Tyr Arg Asp
465 470 475 480
Ala Gly Thr Gly Ile Arg Glu Tyr Asn Asp Gly Thr Phe Gly Tyr Glu
485 490 495
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515 520 525
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<213> Staphylococcus aureus
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65 70 75 80
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Lys Ala Lys Ala Asp Arg Tyr Val Pro Tyr Thr Ile Ala Val Asn Gly
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Thr Ser Thr Pro Ile Leu Ser Asp Leu Lys Phe Thr Gly Asp Pro Arg
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Asp Arg Gly Ile Gly Glu Arg Glu Leu Lys Tyr Ala Lys Lys Ala Thr
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Tyr Thr Val His Phe Lys Asn Gly Thr Lys Lys Val Ile Asn Ile Asn
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Ile Asp Ile Asp Val Lys Thr Gly Thr Lys Ala Lys Ala Asp Ser Tyr
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 11
Met Gly Gly Tyr Lys Gly Ile Lys Ala Asp Gly Gly Lys Val Asp Gln
1 5 10 15
Ala Lys Gln Leu Ala Ala Lys Thr Ala Lys Asp Ile Glu Ala Cys Gln
20 25 30
Lys Gln Thr Gln Gln Leu Ala Glu Tyr Ile Glu Gly Ser Asp Trp Glu
35 40 45
Gly Gln Phe Ala Asn Lys Val Lys Asp Val Leu Leu Ile Met Ala Lys
50 55 60
Phe Gln Glu Glu Leu Val Gln Pro Met Ala Asp His Gln Lys Ala Ile
65 70 75 80
Asp Asn Leu Ser Gln Asn Leu Ala Lys Tyr Asp Thr Leu Ser Ile Lys
85 90 95
Gln Gly Leu Asp Arg Val Asn Pro
100
<210> 12
<211> 990
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 12
Met Gly Gln Asp Lys Glu Ala Ala Ala Ser Glu Gln Lys Thr Thr Thr
1 5 10 15
Val Glu Glu Asn Gly Asn Ser Ala Thr Asp Asn Lys Thr Ser Glu Thr
20 25 30
Gln Thr Thr Ala Thr Asn Val Asn His Ile Glu Glu Thr Gln Ser Tyr
35 40 45
Asn Ala Thr Val Thr Glu Gln Pro Ser Asn Ala Thr Gln Val Thr Thr
50 55 60
Glu Glu Ala Pro Lys Ala Val Gln Ala Pro Gln Thr Ala Gln Pro Ala
65 70 75 80
Asn Ile Glu Thr Val Lys Glu Glu Val Val Lys Glu Glu Ala Lys Pro
85 90 95
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Asn Gly Ser Ile Glu Thr Phe Asn Lys Ala Asn Asn Arg Phe Ser His
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 13
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 14
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 15
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 16
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 17
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 18
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565 570 575
Asp Ser Ala Pro Leu Gln Lys Ala Asn Ile Lys Asn Thr Asn Asp Gly
580 585 590
His Thr Gln Ser Gln Asn Asn Lys Asn Thr Gln Glu Asn Lys Ala Lys
595 600 605
Ser Leu Pro Gln Thr Gly Glu Glu Ser Asn Lys Asp Met Thr Leu Pro
610 615 620
Leu Met Ala Leu Leu Ala Leu Ser Ser Ile Val Ala Phe Val Leu Pro
625 630 635 640
Arg Lys Arg Lys Asn
645
<210> 19
<211> 227
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 19
Met Lys Asn Ile Leu Lys Val Phe Asn Thr Thr Ile Leu Ala Leu Ile
1 5 10 15
Ile Ile Ile Ala Thr Phe Ser Asn Ser Ala Asn Ala Ala Asp Ser Gly
20 25 30
Thr Leu Asn Tyr Glu Val Tyr Lys Tyr Asn Thr Asn Asp Thr Ser Ile
35 40 45
Ala Asn Asp Tyr Phe Asn Lys Pro Ala Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Gly
50 55 60
Lys Leu Tyr Val Gln Ile Thr Val Asn His Ser His Trp Ile Thr Gly
65 70 75 80
Met Ser Ile Glu Gly His Lys Glu Asn Ile Ile Ser Lys Asn Thr Ala
85 90 95
Lys Asp Glu Arg Thr Ser Glu Phe Glu Val Ser Lys Leu Asn Gly Lys
100 105 110
Ile Asp Gly Lys Ile Asp Val Tyr Ile Asp Glu Lys Val Asn Gly Lys
115 120 125
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130 135 140
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Asn Val Glu
225
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 20
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1 5 10 15
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65 70 75 80
Arg Ser Lys Asn Glu Asp Glu Ser Ser Pro Ile Ile Asn Asn Lys Val
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 21
Met Asn Lys His His Pro Lys Leu Arg Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Pro Ala Leu Glu Asn Lys Glu His Asp Ile Gly Pro Arg Glu Gln Val
100 105 110
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115 120 125
Phe Ser Ile Lys Asp Pro Ala Asp Val Tyr Tyr Thr Lys Lys Lys Ala
130 135 140
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165 170 175
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195 200 205
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210 215 220
Asn Asp Pro Ser Leu Val Lys Ser Asp Thr Asn Asp Ala Val Val Thr
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245 250 255
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305 310 315 320
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370 375 380
Ile Ile Glu Leu Gly Leu Lys Thr Ala Ser Thr Trp Lys Lys Phe Glu
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565 570 575
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580 585 590
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Val Ile Glu Pro Glu Ser Asp Val Val Lys Asp Ala Asp Asn Asn Ile
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Gly Met Leu Ala Leu Phe Ile Pro Lys Phe Arg Lys Glu Ser Lys
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 22
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 23
Met Lys Met Lys Lys Leu Val Lys Ser Ser Val Ala Ser Ser Ile Ala
1 5 10 15
Leu Leu Leu Leu Ser Asn Thr Val Asp Ala Ala Gln His Ile Thr Pro
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 25
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115 120 125
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245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
Ile Asp Trp Asn Arg His Gly Phe Trp Gly Tyr Trp Ser Gly Glu Asn
290 295 300
His Val Asp Lys Lys Glu Glu Lys Leu Ser Ala Leu Tyr Glu Val Asp
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325 330 335
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 26
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Ile Leu Leu Leu Ser Ala Ala Thr Thr Gln Ala Asn Ser Ala His Lys
20 25 30
Asp Ser Gln Asp Gln Asn Lys Lys Glu His Val Asp Lys Ser Gln Gln
35 40 45
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Ser Asn Trp Leu Lys Tyr Pro Ser Glu Tyr His Val Asp Phe Gln Val
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Ile Ser Thr Ala Lys Val Asp Ser Thr Phe Ser Tyr Ser Ser Gly Gly
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 27
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Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 28
Met Ser Lys Arg Gln Lys Ala Phe His Asp Ser Leu Ala Asn Glu Lys
1 5 10 15
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50 55 60
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65 70 75 80
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245 250 255
Asn Thr Ile Thr Val Asn Lys Asp Asn Leu Lys Gln Tyr Met Thr Thr
260 265 270
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275 280 285
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305 310 315 320
Lys Tyr Glu Gly His Gly Asn Gly Gly Asp Gly Ile Gly Phe Ala Phe
325 330 335
Ser Pro Gly Val Leu Gly Glu Thr Gly Leu Asn Gly Ala Ala Val Gly
340 345 350
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355 360 365
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595 600 605
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Leu Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Leu Arg Thr Ser Thr Ser Leu Ser
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Asp Ser Thr Ser Asn Ala Ile Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Glu Ser
915 920 925
Ala Ser Thr Ser Asp Ser Ile Ser Ile Ser Asn Ser Ile Ala Asn Ser
930 935 940
Gln Ser Ala Ser Thr Ser Lys Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ile Ser
945 950 955 960
Leu Ser Thr Ser Asp Ser Lys Ser Met Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser
965 970 975
Asp Ser Thr Ser Thr Ser Gly Ser Val Ser Gly Ser Leu Ser Ile Ala
980 985 990
Ala Ser Gln Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Met Ser Thr Ser
995 1000 1005
Glu Ile Val Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Ala Ser
1010 1015 1020
Asp Ser Lys Ser Met Ser Val Ser Ser Ser Met Ser Thr Ser Gln Ser
1025 1030 1035 1040
Gly Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Asp Ser
1045 1050 1055
Asp Ser Lys Ser Leu Ser Gln Ser Thr Ser Gln Ser Gly Ser Thr Ser
1060 1065 1070
Thr Ser Thr Ser Thr Ser Ala Ser Val Arg Thr Ser Glu Ser Gln Ser
1075 1080 1085
Thr Ser Gly Ser Met Ser Ala Ser Gln Ser Asp Ser Met Ser Ile Ser
1090 1095 1100
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Ser Ser Glu Ser Ile Ser Gln Ser Ala Ser Thr Ser Thr Ser Gly Ser
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Glu Ser Ala Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Asn Ser
1490 1495 1500
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1540 1545 1550
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1555 1560 1565
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1570 1575 1580
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1650 1655 1660
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1685 1690 1695
Met Ser Ala Ser Ile Ser Asp Ser Gln Ser Met Ser Glu Ser Val Asn
1700 1705 1710
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1715 1720 1725
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1730 1735 1740
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1765 1770 1775
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1985 1990 1995 2000
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2005 2010 2015
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2020 2025 2030
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2035 2040 2045
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2050 2055 2060
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2085 2090 2095
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2100 2105 2110
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Arg Lys Lys Lys Lys Asp Glu Asn Asp Gln Asp Asp Ser Gln Ala
2260 2265 2270
<210> 29
<211> 2478
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 29
Met Asn Leu Phe Arg Gln Gln Lys Phe Ser Ile Arg Lys Phe Asn Val
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Gly Ile Phe Ser Ala Leu Ile Ala Thr Val Thr Phe Ile Ser Thr Asn
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Thr Lys Ser Lys Val Leu Asp Lys Ile Asn Ala Ile Gln Thr Gln Ala
900 905 910
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Asn Ser Ile Ala Ala Ile Asn Gln Val Gln Ala Ala Thr Thr Lys Lys
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1140 1145 1150
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Lys Glu Ala Ala Ile Gln Gln Leu Ala Thr Ala Val Thr Asp Ala Lys
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1540 1545 1550
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1570 1575 1580
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1650 1655 1660
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1700 1705 1710
Glu Ile Ala Glu Ala Lys Gln Lys Leu Ala Glu Leu Lys Gln Thr Ala
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2050 2055 2060
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Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser
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465 470 475 480
Val Thr Asn Gly Gly Gly Ile Arg Ala Ser Ile Ala Lys Gly Lys Val
485 490 495
Thr Arg Tyr Asp Leu Ile Ser Val Leu Pro Phe Gly Asn Thr Ile Ala
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Gln Ile Asp Val Lys Gly Ser Asp Val Trp Thr Ala Phe Glu His Ser
515 520 525
Leu Gly Ala Pro Thr Thr Gln Lys Asp Gly Lys Thr Val Leu Thr Ala
530 535 540
Asn Gly Gly Leu Leu His Ile Ser Asp Ser Ile Arg Val Tyr Tyr Asp
545 550 555 560
Ile Asn Lys Pro Ser Gly Lys Arg Ile Asn Ala Ile Gln Ile Leu Asn
565 570 575
Lys Glu Thr Gly Lys Phe Glu Asn Ile Asp Leu Lys Arg Val Tyr His
580 585 590
Val Thr Met Asn Asp Phe Thr Ala Ser Gly Gly Asp Gly Tyr Ser Met
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610 615 620
Ser Tyr Leu Lys Thr Ala Asn Leu Ala Lys Tyr Asp Thr Thr Glu Pro
625 630 635 640
Gln Arg Met Leu Leu Gly Lys Pro Ala Val Ser Glu Gln Pro Ala Lys
645 650 655
Gly Gln Gln Gly Ser Lys Gly Ser Lys Ser Gly Lys Asp Thr Gln Pro
660 665 670
Ile Gly Asp Asp Lys Val Met Asp Pro Ala Lys Lys Pro Ala Pro Gly
675 680 685
Lys Val Val Leu Leu Leu Ala His Arg Gly Thr Val Ser Ser Gly Thr
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Glu Gly Ser Gly Arg Thr Ile Glu Gly Ala Thr Val Ser Ser Lys Ser
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Gly Lys Gln Leu Ala Arg Met Ser Val Pro Lys Gly Ser Ala His Glu
725 730 735
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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1 5 10 15
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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275 280 285
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305 310 315 320
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340 345 350
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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Gln
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<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 46
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 48
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 49
Met Ser Asn Ile Ala Phe Tyr Val Val Ser Asp Val His Gly Tyr Ile
1 5 10 15
Phe Pro Thr Asp Phe Thr Ser Arg Asn Gln Tyr Gln Pro Met Gly Leu
20 25 30
Leu Leu Ala Asn His Val Ile Glu Gln Asp Arg Arg Gln Tyr Asp Gln
35 40 45
Ser Phe Lys Ile Asp Asn Gly Asp Phe Leu Gln Gly Ser Pro Phe Cys
50 55 60
Asn Tyr Leu Ile Ala His Ser Gly Ser Ser Gln Pro Leu Val Asp Phe
65 70 75 80
Tyr Asn Arg Met Ala Phe Asp Phe Gly Thr Leu Gly Asn His Glu Phe
85 90 95
Asn Tyr Gly Leu Pro Tyr Leu Lys Asp Thr Leu Arg Arg Leu Asn Tyr
100 105 110
Pro Val Leu Cys Ala Asn Ile Tyr Glu Asn Asp Ser Thr Leu Thr Asp
115 120 125
Asn Gly Val Lys Tyr Phe Gln Val Gly Asp Gln Thr Val Gly Val Ile
130 135 140
Gly Leu Thr Thr Gln Phe Ile Pro His Trp Glu Gln Pro Glu His Ile
145 150 155 160
Gln Ser Leu Thr Phe His Ser Ala Phe Glu Ile Leu Gln Gln Tyr Leu
165 170 175
Pro Glu Met Lys Arg His Ala Asp Ile Ile Val Val Cys Tyr His Gly
180 185 190
Gly Phe Glu Lys Asp Leu Glu Ser Gly Thr Pro Thr Glu Val Leu Thr
195 200 205
Gly Glu Asn Glu Gly Tyr Ala Met Leu Glu Ala Phe Ser Lys Asp Ile
210 215 220
Asp Ile Phe Ile Thr Gly His Gln His Arg Gln Ile Ala Glu Arg Phe
225 230 235 240
Lys Gln Thr Ala Val Ile Gln Pro Gly Thr Arg Gly Thr Thr Val Gly
245 250 255
Arg Val Val Leu Ser Thr Asp Glu Tyr Glu Asn Leu Ser Val Glu Ser
260 265 270
Cys Glu Leu Leu Pro Val Ile Asp Asp Ser Thr Phe Thr Ile Asp Glu
275 280 285
Asp Asp Gln His Leu Arg Lys Gln Leu Glu Asp Trp Leu Asp Tyr Glu
290 295 300
Ile Thr Thr Leu Pro Tyr Asp Met Thr Ile Asn His Ala Phe Glu Ala
305 310 315 320
Arg Val Ala Pro His Pro Phe Thr Asn Phe Met Asn Tyr Ala Leu Leu
325 330 335
Glu Lys Ser Asp Ala Asp Val Ala Cys Thr Ala Leu Phe Asp Ser Ala
340 345 350
Ser Gly Phe Lys Gln Val Val Thr Met Arg Asp Val Ile Asn Asn Tyr
355 360 365
Pro Phe Pro Asn Thr Phe Lys Val Leu Ala Val Ser Gly Ala Lys Leu
370 375 380
Lys Glu Ala Ile Glu Arg Ser Ala Glu Tyr Phe Asp Val Lys Asn Asp
385 390 395 400
Glu Val Ser Val Ser Ala Asp Phe Leu Glu Pro Lys Pro Gln His Phe
405 410 415
Asn Tyr Asp Ile Tyr Gly Gly Val Ser Tyr Thr Ile His Val Gly Arg
420 425 430
Pro Lys Gly Gln Arg Val Ser Asn Met Met Ile Gln Gly His Ala Val
435 440 445
Asp Leu Lys Gln Thr Tyr Thr Ile Cys Val Asn Asn Tyr Arg Ala Val
450 455 460
Gly Gly Gly Gln Tyr Asp Met Tyr Ile Asp Ala Pro Val Val Lys Asp
465 470 475 480
Ile Gln Val Glu Gly Ala Gln Leu Leu Ile Asp Phe Leu Ser Asn Asn
485 490 495
Asn Leu Met Arg Ile Pro Gln Val Val Asp Phe Lys Val Glu Lys
500 505 510
<210> 50
<211> 324
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 50
Met Lys Arg Leu Ser Ile Ile Val Ile Ile Gly Ile Phe Ile Ile Thr
1 5 10 15
Gly Cys Asp Trp Gln Arg Thr Ser Lys Glu Arg Ser Lys Asn Ala Gln
20 25 30
Asn Gln Gln Val Ile Lys Ile Gly Tyr Leu Pro Ile Thr His Ser Ala
35 40 45
Asn Leu Met Met Thr Lys Lys Leu Leu Ser Gln Tyr Asn His Pro Lys
50 55 60
Tyr Lys Leu Glu Leu Val Lys Phe Asn Asn Trp Pro Asp Leu Met Asp
65 70 75 80
Ala Leu Asn Ser Gly Arg Ile Asp Gly Ala Ser Thr Leu Ile Glu Leu
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Arg Tyr Ser Thr His Tyr Leu Leu Leu Glu Glu Leu Arg Lys Gln Leu
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Lys Ile Lys Pro Gly His Phe Ser Tyr His Glu Met Ser Pro Ala Glu
165 170 175
Met Pro Ala Ala Leu Ser Glu His Arg Ile Thr Gly Tyr Ser Val Ala
180 185 190
Glu Pro Phe Gly Ala Leu Gly Glu Lys Leu Gly Lys Gly Lys Thr Leu
195 200 205
Lys His Gly Asp Asp Val Ile Pro Asp Ala Tyr Cys Cys Val Leu Val
210 215 220
Leu Arg Gly Glu Leu Leu Asp Gln His Lys Asp Val Ala Gln Ala Phe
225 230 235 240
Val Gln Asp Tyr Lys Lys Ser Gly Phe Lys Met Asn Asp Arg Lys Gln
245 250 255
Ser Val Asp Ile Met Thr His His Phe Lys Gln Ser Arg Asp Val Leu
260 265 270
Thr Gln Ser Ala Ala Trp Thr Ser Tyr Gly Asp Leu Thr Ile Lys Pro
275 280 285
Ser Gly Tyr Gln Glu Ile Thr Thr Leu Val Lys Gln His His Leu Phe
290 295 300
Asn Pro Pro Ala Tyr Asp Asp Phe Val Glu Pro Ser Leu Tyr Lys Glu
305 310 315 320
Ala Ser Arg Ser
<210> 51
<211> 591
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 51
Met Lys Lys Ile Ile Ser Ile Ala Ile Ile Val Leu Ala Leu Val Leu
1 5 10 15
Ser Gly Cys Gly Val Pro Thr Lys Ser Glu Val Ala Gln Lys Ser Ser
20 25 30
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100 105 110
Ser Thr Gly Ser Asn Ser Leu Leu Lys Asp Lys His Val Asp Gln Leu
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Leu Tyr Gly Ser Lys Lys Asn Leu Val Tyr Asp Asn Lys Val Leu Asp
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Lys Asn Ser Val Gly Leu Pro Asn Ser Arg Ala Leu Ile Trp Gln Gln
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Phe Asp Tyr Asn Asn Ser Arg Glu Arg Asp Thr Arg Pro Leu Val Met
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Leu Leu Asp Glu Asn Asp His Leu Thr Thr Lys Gly Ser Leu Ser His
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 52
Met Val Ile Asn Leu Asn Asp Lys Gln Thr Lys Thr Ser Lys Glu Gly
1 5 10 15
Leu Ile Ser Val Ser His Pro Leu Ala Ala Lys Ile Gly Lys Asp Val
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50 55 60
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305 310 315 320
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325 330 335
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Ala Tyr Tyr Arg Tyr Asp Arg Asp Ser Ile Thr Arg
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<210> 53
<211> 322
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 53
Met Lys Ser Lys Ile Tyr Ile Leu Leu Leu Phe Leu Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ala Cys Ala Asn Thr Arg His Ser Glu Ser Asp Lys Asn Val Leu Thr
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195 200 205
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260 265 270
Arg Leu Val Ala Glu Phe Asp Ala Lys Ser Ile Arg Lys Asp Val Ser
275 280 285
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290 295 300
Pro Lys Ser Lys Leu Pro Asp Ile Pro His His Lys Phe Leu Glu Met
305 310 315 320
Ile Gln
<210> 54
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 54
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1 5 10 15
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20 25 30
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Lys Val Lys Ser Ser Leu Glu Asn Ser Met Lys Lys Ser Asp Leu Val
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Ser Arg Lys Ile Ser Leu Ser Asn Phe Lys Asp Tyr Trp Gln Gly Lys
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Pro Lys Leu Asp His Ile Thr Val Thr Tyr Gln Glu Asp Gly Asn Asn
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195 200 205
Pro Val Asn Lys Val Gln Asp Ile Glu Asn Asn Gln Asn Leu Lys Val
210 215 220
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260 265 270
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355 360 365
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Asn Ser Tyr Ile Ala Tyr Asn Asp Gln Ile Val Ala Ala Asn Ser Lys
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 55
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275 280 285
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Tyr Ala Val Asp Pro Thr Ser Tyr Leu Gln Ser Arg
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<210> 56
<211> 507
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 56
Met Ser Lys Lys Leu Lys Ile Ile Ile Pro Ile Ile Ile Val Leu Leu
1 5 10 15
Leu Ile Gly Gly Ile Ala Trp Gly Val Tyr Ala Phe Phe Ala Asn Thr
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165 170 175
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180 185 190
Ala Gln Gln Ser Asp Tyr Ser Lys Ile Ala Glu Lys Tyr Ser Glu Leu
195 200 205
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225 230 235 240
Thr Leu Ser Arg Ala Asp Thr Lys Lys Ile Thr Leu Ala Val Leu Glu
245 250 255
Glu Ala Lys Lys Asp Lys Asp Leu Lys Lys Leu Met Glu Glu Gln Gly
260 265 270
Ala Thr Lys Asp Phe Glu Lys Asp Ile Lys Lys Ala Ile Asp Asp Val
275 280 285
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305 310 315 320
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405 410 415
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420 425 430
Asn Asn Thr Gln Lys Ser Thr Leu Asn Ile Gly Ile Lys Tyr Ala Glu
435 440 445
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450 455 460
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485 490 495
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500 505
<210> 57
<211> 297
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 57
Met Lys Lys Thr Ile Leu Leu Thr Met Thr Thr Leu Thr Leu Phe Ser
1 5 10 15
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Glu Phe Asn Asp Lys Ala Lys Thr Ala Asp Gly Lys Pro Leu Ala Leu
165 170 175
Gly Asn Gly Lys Ile Ile Asp Gln Pro Leu Ile Thr Ser Lys Asn Asn
180 185 190
Leu Tyr Thr Ala Gly Gln Cys Thr Trp Tyr Val Phe Asp Lys Arg Ala
195 200 205
Lys Asp Gly His Thr Ile Ser Thr Phe Trp Gly Asp Ala Lys Asn Trp
210 215 220
Ala Gly Gln Ala Ser Ser Asn Gly Phe Lys Val Asp Arg His Pro Thr
225 230 235 240
Arg Gly Ser Ile Leu Gln Thr Val Asn Gly Pro Phe Gly His Val Ala
245 250 255
Tyr Val Glu Lys Val Asn Ile Asp Gly Ser Ile Leu Ile Ser Glu Met
260 265 270
Asn Trp Ile Gly Glu Tyr Ile Val Ser Ser Arg Thr Ile Ser Ala Ser
275 280 285
Glu Val Ser Ser Tyr Asn Tyr Ile His
290 295
<210> 58
<211> 124
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 58
Met Lys Arg Ile Leu Val Val Phe Leu Met Leu Ala Ile Ile Leu Ala
1 5 10 15
Gly Cys Ser Asn Lys Gly Glu Lys Tyr Gln Lys Asp Ile Asp Lys Val
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Tyr Lys Glu Gln Asn Gln Met Asn Lys Ile Ala Ser Lys Val Gln Asn
35 40 45
Thr Ile Lys Thr Asp Ile Lys Gln Glu Asp Ser Asn Thr His Val Tyr
50 55 60
Lys Asp Gly Lys Val Ile Val Ile Gly Ile Gln Leu Tyr Lys Asp Arg
65 70 75 80
Glu Lys Met Tyr Tyr Phe Ala Tyr Glu Ile Lys Asp Gly Lys Ala Glu
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Ile Asn Arg Glu Ile Asp Pro Ile Lys Tyr Met Lys Asp His Lys Ala
100 105 110
Asp Tyr Glu Asp Glu Asn Val Glu Val Glu Lys Asp
115 120
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 59
Met Asn Lys Ile Ser Lys Tyr Ile Ala Ile Ala Ser Leu Ser Val Ala
1 5 10 15
Val Thr Val Ser Ala Pro Gln Thr Thr Asn Ser Thr Ala Phe Ala Lys
20 25 30
Ser Ser Ala Glu Val Gln Gln Thr Gln Gln Ala Ser Ile Pro Ala Ser
35 40 45
Gln Lys Ala Asn Leu Gly Asn Gln Asn Ile Met Ala Val Ala Trp Tyr
50 55 60
Gln Asn Ser Ala Glu Ala Lys Ala Leu Tyr Leu Gln Gly Tyr Asn Ser
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Lys Glu Phe Leu Lys Tyr Ala Asp Lys Lys Gly Val Asp Ile Tyr Tyr
145 150 155 160
Ile Ser Asp Arg Asp Lys Glu Lys Asp Leu Lys Ala Thr Gln Lys Asn
165 170 175
Leu Lys Gln Gln Gly Ile Pro Gln Ala Lys Lys Ser His Ile Leu Leu
180 185 190
Lys Gly Lys Asp Asp Lys Ser Lys Glu Ser Arg Arg Gln Met Val Gln
195 200 205
Lys Asp His Lys Leu Val Met Leu Phe Gly Asp Asn Leu Leu Asp Phe
210 215 220
Thr Asp Pro Lys Glu Ala Thr Ala Glu Ser Arg Glu Ala Leu Ile Glu
225 230 235 240
Lys His Lys Asp Asp Phe Gly Lys Lys Tyr Ile Ile Phe Pro Asn Pro
245 250 255
Met Tyr Gly Ser Trp Glu Ala Thr Ile Tyr Asn Asn Asn Tyr Lys Ala
260 265 270
Ser Asp Lys Ala Lys Asp Lys Leu Arg Lys Asn Ala Ile Lys Gln Phe
275 280 285
Asp Pro Lys Thr Gly Glu Val Lys
290 295
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 60
Met Leu Arg Gly Gln Glu Glu Arg Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Tyr Ser
1 5 10 15
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20 25 30
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85 90 95
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100 105 110
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Gln Val Gly Asp Leu Ser Lys His Ile Asp Gly Gln Asn Ser Pro Glu
245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
Lys Lys Val Arg Pro Leu Lys Ala Asn Gln Val Gln Pro Leu Asn Lys
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660 665 670
Asp Leu Leu Arg Val Glu Ala Thr Glu Ser Lys Gly Thr Gln Leu Lys
675 680 685
Ala Ser
690
<210> 61
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 61
Met Lys Lys Arg Leu Leu Leu Ser Thr Phe Leu Ala Ser Thr Leu Ile
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195 200 205
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Met Lys Ser Ile Lys Arg Ile Gly Leu Cys Ile Ser Leu Leu Ile Leu
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Met Lys Lys Ile Val Ile Ile Ala Val Leu Ala Ile Leu Phe Val Val
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Ile Ser Ala Cys Gly Asn Lys Glu Lys Glu Ala Gln His Gln Phe Thr
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50 55 60
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 67
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 68
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Ser Gln Tyr Arg Arg Lys Arg Arg Glu Phe Phe His Asn Glu Asp Arg
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515 520 525
Gly Lys Val Leu Gly Lys Asp Lys Trp Ser Asp Leu Ala Val Val Lys
530 535 540
Ala Thr Ser Ser Asp Ser Ser Val Lys Glu Ile Ala Ile Gly Asp Ser
545 550 555 560
Asn Asn Leu Val Leu Gly Glu Pro Ile Leu Val Val Gly Asn Pro Leu
565 570 575
Gly Val Asp Phe Lys Gly Thr Val Thr Glu Gly Ile Ile Ser Gly Leu
580 585 590
Asn Arg Asn Val Pro Ile Asp Phe Asp Lys Asp Asn Lys Tyr Asp Met
595 600 605
Leu Met Lys Ala Phe Gln Ile Asp Ala Ser Val Asn Pro Gly Asn Ser
610 615 620
Gly Gly Ala Val Val Asn Arg Glu Gly Lys Leu Ile Gly Val Val Ala
625 630 635 640
Ala Lys Ile Ser Met Pro Asn Val Glu Asn Met Ser Phe Ala Ile Pro
645 650 655
Val Asn Glu Val Gln Lys Ile Val Lys Asp Leu Glu Thr Lys Gly Lys
660 665 670
Ile Asp Tyr Pro Asp Val Gly Val Lys Met Lys Asn Ile Val Ser Leu
675 680 685
Asn Ser Phe Glu Arg Gln Ala Val Lys Leu Pro Gly Lys Val Lys Asn
690 695 700
Gly Val Val Val Asp Gln Val Asp Asn Asn Gly Leu Ala Asp Gln Ser
705 710 715 720
Gly Leu Lys Lys Gly Asp Val Ile Thr Glu Leu Asp Gly Lys Leu Leu
725 730 735
Glu Asp Asp Leu Arg Phe Arg Gln Ile Ile Phe Ser His Lys Asp Asp
740 745 750
Leu Lys Ser Ile Thr Ala Lys Ile Tyr Arg Asp Gly Lys Glu Lys Glu
755 760 765
Ile Asn Ile Lys Leu Lys
770
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 69
Met Asn Ser Ser Cys Lys Ser Arg Val Phe Asn Ile Ile Ser Ile Ile
1 5 10 15
Met Val Ser Met Leu Ile Leu Ser Leu Gly Ala Phe Ala Asn Asn Asn
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Lys Ala Lys Ala Asp Ser His Ser Lys Gln Leu Glu Ile Asn Val Lys
35 40 45
Ser Asp Lys Val Pro Gln Lys Val Lys Asp Leu Ala Gln Gln Gln Phe
50 55 60
Ala Gly Tyr Ala Lys Ala Leu Asp Lys Gln Ser Asn Ala Lys Thr Gly
65 70 75 80
Lys Tyr Glu Leu Gly Glu Ala Phe Lys Ile Tyr Lys Phe Asn Gly Glu
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Glu Asp Asn Ser Tyr Tyr Tyr Pro Val Ile Lys Asp Gly Lys Ile Val
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Tyr Thr Leu Thr Leu Ser Pro Lys Asn Lys Asp Asp Leu Asn Lys Ser
115 120 125
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130 135 140
Asp Leu Asp Gln Ile Lys Asp Lys Asn Ser Asn Ile Thr Val Leu Thr
145 150 155 160
Asp Glu Lys Gly Phe Tyr Phe Glu Glu Asp Gly Lys Val Arg Leu Val
165 170 175
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Asn Thr Asp Thr Tyr Asn Ala His Asp Ile Met Arg Thr Leu Tyr Pro
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275 280 285
Met Ile Glu Tyr Gly Lys Ser Gln Gly Arg Asp Ile His Tyr Gln Glu
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Gly Val Pro Ser Tyr Glu Gln Val Asp Gln Leu Thr Lys Asp Asn Val
305 310 315 320
Gly Ile Met Ile Leu Ala Gln Ser Val Ser Gln Asn Pro Asn Asp Pro
325 330 335
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340 345 350
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Gln Asp Ala Asp Ser Ser Leu Leu His Leu Ser Phe Asn Arg Asp Tyr
370 375 380
Asn Trp Tyr Gly Ser Met Ile Gly Tyr
385 390
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 70
Met Lys Gly Lys Phe Leu Lys Val Ser Ser Leu Phe Val Ala Thr Leu
1 5 10 15
Thr Thr Ala Thr Leu Val Ser Ser Pro Ala Ala Asn Ala Leu Ser Ser
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Leu Thr Asn Lys His Val Val Asp Ala Thr His Gly Asp Pro
115 120 125
His Ala Leu Lys Ala Phe Pro Ser Ala Ile Asn Gln Asp Asn Tyr Pro
130 135 140
Asn Gly Gly Phe Thr Ala Glu Gln Ile Thr Lys Tyr Ser Gly Glu Gly
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165 170 175
Gly Glu Val Val Lys Pro Ala Thr Met Ser Asn Asn Ala Glu Thr Gln
180 185 190
Val Asn Gln Asn Ile Thr Val Thr Gly Tyr Pro Gly Asp Lys Pro Val
195 200 205
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210 215 220
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Asn Pro Asp Asn Gly Asp Asn Asn Asn Ser Asp Asn Pro Asp Ala Ala
325 330 335
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Met Lys Phe Asn Lys Val Lys Leu Val Ile His Ala Cys Val Leu Leu
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Phe Ile Ile Ile Ser Ile Ala Leu Ile Phe His Arg Leu Gln Thr Lys
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Gly Asn Asn Glu Val Arg Ile Lys His Ile Tyr Asn Asp Ile Leu Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 73
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Leu Tyr Asp Leu Phe Tyr Lys Asp Lys Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Met Arg Met Lys Arg Phe Leu Thr Ile Val Gln Ile Leu Leu Val Val
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Ile Ile Ile Ile Phe Gly Tyr Lys Ile Val Gln Thr Tyr Ile Glu Asp
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 75
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Asn Arg Asn Lys Gly Lys Leu Lys Ile Thr Gly Gly Gly Asn Asn Tyr
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Thr Ile Asp Leu Ser Lys Arg Leu His Ser Asp Leu Ala Asn Val Tyr
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Val Lys Asn Pro Asn Lys Ile Thr Val Asp Val Leu Phe Asp
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 76
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Asn
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 77
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 78
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Lys Gly Ile Lys Arg Lys Val Ile Glu Thr His Asp Asp Val Lys Gln
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195 200 205
Gln Leu Thr Lys Leu Asp His Pro Lys Pro Val Pro Tyr Ser Val Ala
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Gln Ile Lys Ser Phe Gly Val Pro Leu Thr Ser Val Ser Phe Met Thr
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Phe Gly Asn Ala His Phe Val Val Leu Ser Lys Tyr Ile Lys Glu Tyr
290 295 300
Glu Ser Asn Tyr Glu Thr Ala Ser Asp Asp Ser Leu Lys
305 310 315
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<211> 372
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 79
Met Asn Lys Gln Gln Ser Lys Val Arg Tyr Ser Ile Arg Lys Val Ser
1 5 10 15
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180 185 190
Asn Ile Ala Asn Pro Asn Leu Ile Phe Ile Gly Gln Lys Leu Lys Val
195 200 205
Pro Met Thr Pro Leu Val Glu Pro Lys Pro Lys Thr Val Ser Ser Asn
210 215 220
Asn Lys Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Leu Asn Tyr Leu Lys Thr Leu
225 230 235 240
Glu Asn Arg Gly Trp Asp Phe Asp Gly Ser Tyr Gly Trp Gln Cys Phe
245 250 255
Asp Leu Val Asn Val Tyr Trp Asn His Leu Tyr Gly His Gly Leu Lys
260 265 270
Gly Tyr Gly Ala Lys Asp Ile Pro Tyr Ala Asn Asn Phe Asn Ser Glu
275 280 285
Ala Lys Ile Tyr His Asn Thr Pro Thr Phe Lys Ala Glu Pro Gly Asp
290 295 300
Leu Val Val Phe Ser Gly Arg Phe Gly Gly Gly Tyr Gly His Thr Ala
305 310 315 320
Ile Val Leu Asn Gly Asp Tyr Asp Gly Lys Leu Met Lys Phe Gln Ser
325 330 335
Leu Asp Gln Asn Trp Asn Asn Gly Gly Trp Arg Lys Ala Glu Val Ala
340 345 350
His Lys Val Val His Asn Tyr Glu Asn Asp Met Ile Phe Ile Arg Pro
355 360 365
Phe Lys Lys Ala
370
<210> 80
<211> 304
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 80
Met Leu Lys Lys Ala Lys Phe Ile Leu Met Ala Thr Ile Leu Leu Ser
1 5 10 15
Gly Cys Ser Thr Thr Asn Asn Glu Ser Asn Lys Glu Thr Lys Ser Val
20 25 30
Pro Glu Glu Met Asp Ala Ser Lys Tyr Val Gly Gln Gly Phe Gln Pro
35 40 45
Pro Ala Glu Lys Asp Ala Ile Glu Phe Ala Lys Lys His Lys Asp Lys
50 55 60
Ile Ala Lys Arg Gly Glu Gln Phe Phe Met Asp Asn Phe Gly Leu Lys
65 70 75 80
Val Lys Ala Thr Asn Val Ile Gly Ser Gly Asp Gly Val Glu Val Phe
85 90 95
Val His Cys Asp Asp His Asp Ile Val Phe Asn Ala Ser Ile Pro Phe
100 105 110
Asp Lys Ser Ile Ile Asp Ser Asp Ser Ser Leu Arg Ser Lys Asp Lys
115 120 125
Gly Asp Asp Met Ser Thr Leu Val Gly Ala Val Leu Ser Gly Phe Glu
130 135 140
Tyr Arg Ala Gln Lys Glu Lys Tyr Asp Lys Leu Tyr Lys Phe Phe Lys
145 150 155 160
Asp Asn Glu Glu Lys Tyr Gln Tyr Thr Gly Phe Thr Lys Glu Ala Ile
165 170 175
Asn Lys Thr Gln Asn Ser Gly Tyr Glu Asn Glu Tyr Phe Tyr Ile Ser
180 185 190
Ala Ile Pro Tyr Asn Leu Ala Glu Tyr Arg Asp Tyr Phe Glu Pro Leu
195 200 205
Leu Asn Lys Ser Asp Ser Glu Phe Ser Lys Glu Leu Ser Asn Val Lys
210 215 220
Lys Gln Leu Lys Asp Lys Ser Lys Val Ser Val Thr Thr Thr Leu Phe
225 230 235 240
Ser Lys Lys Lys Asn Tyr Thr Lys Lys Ser Asn Ser Glu Asn Val Ile
245 250 255
Lys Met Ala Glu Glu Ile Lys Lys Asp Lys Glu Ile Pro Asn Gly Ile
260 265 270
Glu Leu Ser Ile Lys Phe Ser Asp Asn Lys Ile Asn Thr Val Lys Pro
275 280 285
Asn Phe Asn Gly Glu Ser Thr Ser Glu Tyr Gly Val Phe Asp Gln Glu
290 295 300
<210> 81
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 81
Met Lys Lys Leu Val Ser Ile Val Gly Ala Thr Leu Leu Leu Ala Gly
1 5 10 15
Cys Gly Ser Gln Asn Leu Ala Pro Leu Glu Glu Lys Thr Thr Asp Leu
20 25 30
Arg Glu Asp Asn His Gln Leu Lys Leu Asp Ile Gln Glu Leu Asn Gln
35 40 45
Gln Ile Ser Asp Ser Lys Ser Lys Ile Lys Gly Leu Glu Lys Asp Lys
50 55 60
Glu Asn Ser Lys Lys Thr Ala Ser Asn Asn Thr Lys Ile Lys Leu Met
65 70 75 80
Asn Val Thr Ser Thr Tyr Tyr Asp Lys Val Ala Lys Ala Leu Lys Ser
85 90 95
Tyr Asn Asp Ile Glu Lys Asp Val Ser Lys Asn Lys Gly Asp Lys Asn
100 105 110
Val Gln Ser Lys Leu Asn Gln Ile Ser Asn Asp Ile Gln Ser Ala His
115 120 125
Thr Ser Tyr Lys Asp Ala Ile Asp Gly Leu Ser Leu Ser Asp Asp Asp
130 135 140
Lys Lys Thr Ser Lys Asn Ile Asp Lys Leu Asn Ser Asp Leu Asn His
145 150 155 160
Ala Phe Asp Asp Ile Lys Asn Gly Tyr Gln Asn Lys Asp Lys Lys Gln
165 170 175
Leu Thr Lys Gly Gln Gln Ala Leu Ser Lys Leu Asn Leu Asn Ala Lys
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Ser
<210> 82
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 82
Met Lys Ile Thr Tyr Lys Tyr Arg Gly Asp Leu Pro Leu Asn Thr Glu
1 5 10 15
Asn Asn Lys Asn Gln Asn Gln Ser Val Lys Asn Ser Glu Arg Arg Gly
20 25 30
Met Leu Lys Gly Cys Gly Gly Cys Leu Ile Ser Phe Ile Leu Leu Ile
35 40 45
Ile Leu Leu Ser Ala Cys Ser Met Met Phe Ser Asn Asn Asp Asn Ser
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Asn Gln His Glu Ile Asp Glu Ile Thr Thr Lys Asp Gln Ser Asp Asp
115 120 125
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130 135 140
Lys Asp Asp Leu Lys Glu Lys Gln Gln Ser Ser Asn His His Gln Ser
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Ala Asp His Pro Ala Tyr Arg Pro His Leu Asp Arg Asp Lys Asp Lys
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Arg Ala Cys Glu Pro Asp Lys Tyr
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 83
Met Lys Phe Lys Ala Ile Val Ala Ile Thr Leu Ser Leu Ser Leu Leu
1 5 10 15
Thr Ala Cys Gly Ala Asn Gln His Lys Glu Asn Ser Ser Lys Ser Asn
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50 55 60
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115 120 125
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195 200 205
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 84
Met Lys Ile Ile Lys Arg Ala Ile Ile Ser Leu Ile Ile Leu Ser Leu
1 5 10 15
Leu Ile Ser Ile Thr Met Ser Asn Ala Ser Ala Ser Glu Glu Leu Tyr
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Ile Asn Ile Ser Val Gly Ser Tyr Ile Ile Leu Asp Lys Asn Asp His
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Gln Thr Phe Arg Lys Asp Glu Lys Val Glu Tyr Asp Ala Leu Gln Lys
260 265 270
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Gly Asn Asp Gly Ile Asp Val Asn Asp Lys Gln Lys Leu Lys Leu Gln
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305 310 315 320
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340 345 350
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 85
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Leu Leu Gly Ala Cys Gly Ala Ser Ala Thr Asp Ser Lys Glu Asn Thr
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Leu Ile Ser Ser Lys Ala Gly Asp Val Thr Val Ala Asp Thr Met Lys
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65 70 75 80
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Ser His Ile Leu Ile Lys Val Lys Ser Lys Lys Ser Asp Lys Glu Gly
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Leu Asp Asp Lys Glu Ala Lys Gln Lys Ala Glu Glu Ile Gln Lys Glu
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180 185 190
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Ile Lys Ala Asp Lys Pro Thr Asp Phe Asn Ser Glu Lys Gln Ser Leu
245 250 255
Lys Glu Lys Leu Val Asp Gln Lys Val Gln Lys Asn Pro Lys Leu Leu
260 265 270
Thr Asp Ala Tyr Lys Asp Leu Leu Lys Glu Tyr Asp Val Asp Phe Lys
275 280 285
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Lys Leu Lys Gln Gly Gly Ala Gln Gly Gly Gln Ser Gly Met Ser Gln
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 86
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Leu Ser Val Thr Pro Ile Ala Asn Ala Glu Ser Asn Ser Asn Ile Lys
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Ala Lys Asp Lys Lys His Val Gln Val Asn Val Glu Asp Lys Ser Val
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Gly Ser Arg Val Glu Ser Arg Asn Gly Met His Ala Gly His Ala Met
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355 360 365
Asn Val Ile Pro Val Ser Asn Gly Asp His Tyr Arg Trp Tyr Ser Ser
370 375 380
Ile Tyr Gly Tyr
385
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 87
Met Lys Lys Phe Phe Phe Ile Gly Leu Leu Val Phe Val Val Phe Phe
1 5 10 15
Thr Ala Ala Thr Ile Ile Trp Phe Ser Tyr Asp Lys Asn Lys Tyr Gly
20 25 30
Thr Lys Gln Tyr Asp Lys Thr Phe Lys Asp Asp Ala Phe Asp Asn Val
35 40 45
Ser Ile Asn Leu Asp Ser Thr Glu Leu Arg Ile Lys Arg Gly Asn Gln
50 55 60
Phe Arg Val Lys Tyr Asp Gly Asp Asn Asp Ile Leu Ile Asn Ile Val
65 70 75 80
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130 135 140
Ser Ile Asn Gly Glu Val Val Ile Lys Asn Ser Asn Leu Asp Ala Leu
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Lys Asn Ser Asn Ile Lys Val Val Ile Gly Thr Leu Gln Ile Asp Lys
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Ser Gln Ile Lys Gln Ser Ile Phe Leu Asn Asp His Gly Asp Ile Glu
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Gly Asp Ile Arg Phe Lys Tyr Asp Ser Lys Pro Glu Asp Thr Ile Leu
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Lys Leu Asn Pro Gly Thr Gly Asp Ser Val Val Lys Asn Lys Thr Phe
245 250 255
Thr Asn Gly Lys Val Gly Lys Ser Asp Asn Val Leu Glu Phe Tyr Thr
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Ile Asp Gly Asn Ile Lys Val Glu
275 280
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 88
Met Lys Arg Leu Ile Gly Ile Leu Leu Cys Asn Leu Phe Ile Leu Thr
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Ala Cys Ser Ala Ser Val Asp Lys Thr Ser Asn Ser Thr Lys Thr Thr
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Asp Tyr Lys Ile Glu Asn Gly Glu Thr Leu Lys Val Pro Glu Lys Pro
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Lys Arg Val Ala Val Leu Thr Gly Phe Tyr Val Gly Asp Phe Ile Lys
50 55 60
Leu Gly Ile Lys Pro Ile Ala Val Ser Asp Ile Thr Lys Asp Ser Ser
65 70 75 80
Ile Leu Lys Pro Tyr Leu Lys Gly Val Asp Tyr Ile Gly Glu Asn Asp
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100 105 110
Met Asp Lys Asn Ile Lys Lys Tyr Gln Lys Ile Ala Pro Thr Ile Pro
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Asp Asp Lys Thr Arg Lys Asp Lys Lys Glu Ile Gln Ser Lys Ile Gly
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Lys Gly Tyr Ala Ser Ile Ser Lys Glu Asn Ile Ser Lys Tyr Ala Gly
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Asp Tyr Ile Phe Leu Ser Lys Pro Ser Tyr Gly Lys Phe Asp Phe Glu
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Lys Thr His Thr Trp Gln Asn Ile Glu Ala Val Lys Lys Gly His Val
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Ile Ser Tyr Lys Ala Glu Asp Tyr Trp Phe Thr Asp Pro Ile Thr Leu
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Glu His Leu Arg Ser Lys Leu Lys Lys Glu Ile Leu Asn Lys Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 89
Met Ser Tyr His Trp Phe Lys Lys Met Leu Leu Ser Thr Ser Ile Leu
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Ile Leu Ser Ser Ser Ser Leu Gly Leu Ala Thr His Thr Val Glu Ala
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Pro Ser Pro Asp Pro Asp Gln Pro Gly Asp Ser Asn His Ser Gly Gly
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Lys Asp Tyr Gly Glu Val Thr Asp Glu Asp Ile Tyr Asn Ile Ile Arg
275 280 285
Lys Gln Asn Phe Ser Gly Asn Ala Tyr Leu Asn Gly Leu Gln Gln Gln
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Ser Asn Tyr Phe Arg Phe Gln Tyr Phe Asn Pro Leu Lys Ser Glu Arg
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Tyr Tyr Arg Asn Leu Asp Glu Gln Val Leu Ala Leu Ile Thr Gly Glu
325 330 335
Ile Gly Ser Met Pro Asp Leu Lys Lys Pro Glu Asp Lys Pro Asp Ser
340 345 350
Lys Gln Arg Ser Phe Glu Pro His Glu Lys Asp Asp Phe Thr Val Val
355 360 365
Lys Lys Gln Glu Asp Asn Lys Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Ser Lys
370 375 380
Ser Trp Leu Ala Ile Val Cys Ser Met Met Val Val Phe Ser Ile Met
385 390 395 400
Leu Phe Leu Phe Val Lys Arg Asn Lys Lys Lys Asn Lys Asn Glu Ser
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Gln Arg Arg
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 90
Met Lys Lys Thr Leu Leu Ala Ser Ser Leu Ala Val Gly Leu Gly Ile
1 5 10 15
Val Ala Gly Asn Ala Gly His Glu Ala His Ala Ser Glu Ala Asp Leu
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Asn Lys Ala Ser Leu Ala Gln Met Ala Gln Ser Asn Asp Gln Thr Leu
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Asn Gln Lys Pro Ile Glu Ala Gly Ala Tyr Asn Tyr Thr Phe Asp Tyr
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65 70 75 80
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130 135 140
Ser Lys Ser Ser Glu Gly Ser Ser Val Asn Val Asn Ala His Leu Lys
145 150 155 160
Gln Ile Ala Gln Arg Glu Ser Gly Gly Asn Ile His Ala Val Asn Pro
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Ser Val Ala Pro Ala Lys Tyr Lys Gly Val Ser Pro Ala Asn Ala Pro
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Ala Gly His Trp Val Thr Ala
225 230
<210> 91
<211> 294
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 91
Met Gly Val Lys Ser Val Lys Lys Ile Phe Val Ile Ile Thr Thr Leu
1 5 10 15
Leu Ala Val Ala Ile Ile Ile Gly Ser Ile Ile Met Val Val Phe Ser
20 25 30
Gln Arg Gln Ala Gln Thr Phe Lys Ile Gln Gln Gln Gln Phe Val Lys
35 40 45
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50 55 60
Ser Glu Lys Phe Met Val Lys Gln Ala Glu Lys Arg Gly Val Thr Lys
65 70 75 80
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85 90 95
Gly Lys Leu Arg Lys Asp Ala Val Asn Pro Ile Val Lys Ile Glu Leu
100 105 110
Glu Asn Asn Arg Gln Gly Tyr Leu Asp Lys Asn Ala Ala Trp Phe Lys
115 120 125
Asn Val Leu Thr Lys Leu Gln Ser Glu Tyr Asn Phe Asp Lys Phe Asn
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Phe Val Gly His Ser Met Gly Asn Leu Thr Phe Ala Gln Tyr Met Met
145 150 155 160
Thr Tyr Gly Asn Asp Lys Ser Leu Pro Gln Leu Asn Lys Gln Val Asn
165 170 175
Ile Ala Gly Thr Phe Asn Gly Val Leu Asn Met Asn Glu Asp Val Asn
180 185 190
Glu Ile Thr Val Asp Lys Asp Gly Lys Pro Ser Arg Met Asn Gln Pro
195 200 205
Tyr Gln Gln Leu Arg Val Leu Lys Asp Ile Tyr Lys Gly Lys Gly Ile
210 215 220
Glu Val Leu Asn Ile Tyr Gly Asp Leu Lys Asp Gly Thr His Ser Asp
225 230 235 240
Gly Arg Val Ser Asn Ser Ser Ser Lys Ser Leu Lys Tyr Leu Leu Gly
245 250 255
Asn Ser Pro Lys Ser Tyr Arg Glu Ser Lys Tyr Glu Gly Glu Pro Ala
260 265 270
Gln His Ser Gln Leu His Glu Asn Glu Asn Val Ala Asn Glu Leu Ile
275 280 285
Asp Phe Leu Trp Lys Lys
290
<210> 92
<211> 807
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 92
Met Thr Tyr Arg Ile Lys Lys Trp Gln Lys Leu Ser Thr Ile Thr Leu
1 5 10 15
Leu Met Ala Gly Val Ile Thr Leu Asn Gly Gly Glu Phe Arg Ser Val
20 25 30
Asp Lys His Gln Ile Ala Val Ala Asp Thr Asn Val Gln Thr Pro Asp
35 40 45
Tyr Glu Lys Leu Arg Asn Thr Trp Leu Asp Val Asn Tyr Gly Tyr Asp
50 55 60
Lys Tyr Asp Glu Asn Asn Pro Asp Met Lys Lys Lys Phe Asp Ala Thr
65 70 75 80
Glu Lys Glu Ala Thr Asn Leu Leu Lys Glu Met Lys Thr Glu Ser Gly
85 90 95
Arg Lys Tyr Leu Trp Ser Gly Ala Glu Thr Leu Glu Thr Asn Ser Ser
100 105 110
His Met Thr Arg Thr Tyr Arg Asn Ile Glu Lys Ile Ala Glu Ala Met
115 120 125
Arg Asn Pro Lys Thr Thr Leu Asn Thr Asp Glu Asn Lys Lys Lys Val
130 135 140
Lys Asp Ala Leu Glu Trp Leu His Lys Asn Ala Tyr Gly Lys Glu Pro
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Asp Lys Lys Val Lys Glu Leu Ser Glu Asn Phe Thr Lys Thr Thr Gly
165 170 175
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Ser Leu Thr Asn Thr Leu Ile Leu Leu Asn Asp Gln Phe Ser Asn Glu
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Glu Lys Lys Lys Phe Thr Ala Pro Ile Lys Thr Phe Ala Pro Asp Ser
210 215 220
Asp Lys Ile Leu Ser Ser Val Gly Lys Ala Glu Leu Ala Lys Gly Gly
225 230 235 240
Asn Leu Val Asp Ile Ser Lys Val Lys Leu Leu Glu Cys Ile Ile Glu
245 250 255
Glu Asp Lys Asp Met Met Lys Lys Ser Ile Asp Ser Phe Asn Lys Val
260 265 270
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305 310 315 320
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 93
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 94
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Leu Lys Asp Gly Thr Leu Asp Glu Val Met Glu His Lys Ala Glu Asn
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<212> PRT
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 97
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 98
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 99
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275 280 285
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500 505 510
Asp Tyr Val Lys Arg Val Lys Gln Ser Asn Leu Trp Lys Ser Lys Asp
515 520 525
Asn Gly Phe Tyr Asp Leu Thr Arg Glu Gly Ala Thr Asp Leu Asn Arg
530 535 540
Lys Thr Ser Leu Asn Pro Asn Ile Val Tyr Lys Thr Tyr Thr Gly Glu
545 550 555 560
Ala Thr His Lys Ala Leu Asn Ser Asp Arg Gln Lys Ala Asp Leu Asn
565 570 575
Met Phe Phe Pro Phe Val Ile Thr Gly Asn Leu Ile Gly Lys Ala Thr
580 585 590
Glu Lys Glu Trp Arg Glu Asn Asp Gly Leu Val Ser Val Ile Ser Ser
595 600 605
Gln His Pro Phe Asn Gln Ala Tyr Thr Lys Ala Thr Asp Lys Ile Gln
610 615 620
Lys Gly Ile Trp Gln Val Thr Pro Thr Lys His Asp Trp Asp His Val
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Asp Phe Val Gly Gln Asp Ser Ser Asp Thr Val Arg Thr Arg Glu Glu
645 650 655
Leu Gln Asp Phe Trp His His Leu Ala Asp Asp Leu Val Lys Thr Glu
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Lys Leu Thr Asp Thr Lys Gln Ala
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 101
Met Lys Lys Cys Ile Lys Thr Leu Phe Leu Ser Ile Ile Leu Val Val
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Met Ser Gly Trp Tyr His Ser Ala His Ala Ser Asp Ser Leu Ser Lys
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Ser Pro Glu Asn Trp Met Ser Lys Leu Asp Asp Gly Lys His Leu Thr
35 40 45
Glu Ile Asn Ile Pro Gly Ser His Asp Ser Gly Ser Phe Thr Leu Lys
50 55 60
Asp Pro Val Lys Ser Val Trp Ala Lys Thr Gln Asp Lys Asp Tyr Leu
65 70 75 80
Thr Gln Met Lys Ser Gly Val Arg Phe Phe Asp Ile Arg Gly Arg Ala
85 90 95
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100 105 110
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Lys Val Glu Ala Val Lys Asn Leu Leu Ala Lys Ala Lys Thr Asp Ser
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Asn Lys Asp Asn Val Tyr Val Asn Phe Leu Ser Val Ala Ser Gly Gly
260 265 270
Ser Ala Phe Asn Ser Thr Tyr Asn Tyr Ala Ser His Ile Asn Pro Glu
275 280 285
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Ser Glu Ile Ile Asp Ser Asn Lys
325
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 102
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Ile Ser Ile Val Val Ser Gly Asp Met Phe Leu Ala Met Lys Trp Glu
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Asn His Gln Asp Gln Lys Leu Tyr Phe Tyr Phe Ser Ser Pro Gly Lys
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Asp Gln Ile Ile Tyr Lys Glu Ser Leu Thr Tyr Asn Lys Ile Ser Glu
245 250 255
His
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 103
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Gly Leu Asn Ser Lys His Val Val Lys Asn Ala Glu Arg Leu Gln Lys
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Leu Ile Ser Val Leu Arg Glu Gly Val Glu Val Ile Ile Phe Tyr Met
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Gly Met Ile Gly Glu Leu Ala Thr Lys Asp Phe Ile Ile Gly Ile Ala
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Leu Ala Ile Val Ile Leu Ile Ile Phe Ala Leu Leu Phe Arg Phe Ile
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Ile Phe Ile Met Gly Phe Lys Met Leu Gly Val Ser Ile Gln Lys Leu
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Gln Leu Leu Gly Ala Met Pro Arg His Val Ile Glu Gly Phe Pro Thr
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Gly Ala Tyr Ile Met Val Val Ala Ile Leu Ile Phe Lys Phe Lys Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Ser Asn Ser Ser Arg Pro Ser Thr Asn Ser Gly Gly Gly Ser Tyr Tyr
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195 200 205
Asn Tyr Ala Ala Lys Val Ala Gly Phe Lys Val Asp Lys Thr Pro Glu
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225 230 235 240
Val Val Glu Ser Val Asn Pro Asn Gly Thr Ile Thr Val Ser Glu Met
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Asn Tyr Ala Gly Phe Asn Val Lys Ser Ser Arg Thr Ile Leu Asn Pro
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Gly Lys Tyr Asn Tyr Ile His
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 107
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Asn Lys Ala Glu Trp Val Leu Arg Lys Met Thr Ile Ser Arg Lys His
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Gln Gln Arg Lys Asn Arg Asn Val Ser Ile
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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275 280 285
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340 345 350
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355 360 365
Thr His Tyr Ala Val Ser Lys Tyr Leu Gly Gly Thr Asp His Ala Asp
370 375 380
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385 390 395 400
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610 615 620
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Lys Ser Ile Tyr Leu Phe Gly Thr Val Asn Gly Lys Ser Gly Trp Val
740 745 750
Ser Lys Ala Tyr Leu Ala Val Pro Ala Ala Pro Lys Lys Ala Val Ala
755 760 765
Gln Pro Lys Thr Ala Val Lys Ala Tyr Thr Val Thr Lys Pro Gln Thr
770 775 780
Thr Gln Thr Val Ser Lys Ile Ala Gln Val Lys Pro Asn Asn Thr Gly
785 790 795 800
Ile Arg Ala Ser Val Tyr Glu Lys Thr Ala Lys Asn Gly Ala Lys Tyr
805 810 815
Ala Asp Arg Thr Phe Tyr Val Thr Lys Glu Arg Ala His Gly Asn Glu
820 825 830
Thr Tyr Val Leu Leu Asn Asn Thr Ser His Asn Ile Pro Leu Gly Trp
835 840 845
Phe Asn Val Lys Asp Leu Asn Val Gln Asn Leu Gly Lys Glu Val Lys
850 855 860
Thr Thr Gln Lys Tyr Thr Val Asn Lys Ser Asn Asn Gly Leu Ser Met
865 870 875 880
Val Pro Trp Gly Thr Lys Asn Gln Val Ile Leu Thr Gly Asn Asn Ile
885 890 895
Ala Gln Gly Thr Phe Asn Ala Thr Lys Gln Val Ser Val Gly Lys Asp
900 905 910
Val Tyr Leu Tyr Gly Thr Ile Asn Asn Arg Thr Gly Trp Val Asn Ala
915 920 925
Lys Asp Leu Thr Ala Pro Thr Ala Val Lys Pro Thr Thr Ser Ala Ala
930 935 940
Lys Asp Tyr Asn Tyr Thr Tyr Val Ile Lys Asn Gly Asn Gly Tyr Tyr
945 950 955 960
Tyr Val Thr Pro Asn Ser Asp Thr Ala Lys Tyr Ser Leu Lys Ala Phe
965 970 975
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980 985 990
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Ser Lys Ala Ile Val Gly Gly Ala Lys Phe Ile Gly Asn Ser Tyr Val
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<210> 110
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 110
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Asn Lys Ile Asn His Glu Ala His Ile Val Gly Val Lys Asn Asp Lys
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Asn Glu Val Ile Ala Ala Cys Leu Leu Thr Glu Ala Arg Ile Phe Lys
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Asp Ala Lys Leu Val Cys Tyr Phe Phe Lys Glu Leu Ser Lys Phe Ile
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100 105 110
Asn Leu Arg Asp Ala Asn Gly Arg Ile Ile Lys Asn Tyr Asn Asn Ser
115 120 125
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130 135 140
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 111
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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Met Asn Leu Leu Ser Leu Leu Leu Ile Leu Leu Gly Ile Ile Leu Gly
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355 360 365
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370 375 380
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 113
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 114
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Asp Leu Ile His Arg Lys Lys Lys Arg Arg Gln Glu Ser Gln Asn Ile
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275 280 285
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Tyr Val Gly Asp Ser Ser Leu Asn Asp Asp Ser Asp Leu Thr Asp Asn
340 345 350
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355 360 365
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Asn Asp Thr His Val Asp Glu Ser Pro Tyr Asn Tyr Glu Glu Val Ser
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465 470 475 480
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1140 1145 1150
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1155 1160 1165
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Lys Thr Gln Thr Gln Ser Gln Asp Glu Leu Phe Asp Asp Val Cys Ala
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<211> 239
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 116
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145 150 155 160
Asn Lys Phe Gln Met Tyr Glu Ser Thr Gly Lys Val Leu Ser Val Lys
165 170 175
Gly Asn Met Ile Ile Thr Asp Ala Phe Val Glu Pro Gly Asn Ser Gly
180 185 190
Ser Ala Val Phe Asn Ser Lys Tyr Glu Val Val Gly Val His Phe Gly
195 200 205
Gly Asn Gly Pro Gly Asn Lys Ser Thr Lys Gly Tyr Gly Val Tyr Phe
210 215 220
Ser Pro Glu Ile Lys Lys Phe Ile Ala Asp Asn Thr Asp Lys
225 230 235
<210> 117
<211> 239
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 117
Met Asn Lys Asn Ile Val Ile Lys Ser Met Ala Ala Leu Ala Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ser Val Thr Gly Ile Asn Ala Ala Val Val Glu Glu Thr Gln Gln
20 25 30
Ile Ala Asn Ala Glu Lys Asn Val Thr Gln Val Lys Asp Thr Asn Ile
35 40 45
Phe Pro Tyr Asn Gly Val Val Ser Phe Lys Asp Ala Thr Gly Phe Val
50 55 60
Ile Gly Lys Asn Thr Ile Ile Thr Asn Lys His Val Ser Lys Asp Tyr
65 70 75 80
Lys Val Gly Asp Arg Ile Thr Ala His Pro Asn Gly Asp Lys Gly Asn
85 90 95
Gly Gly Ile Tyr Lys Ile Lys Ser Ile Ser Asp Tyr Pro Gly Asp Glu
100 105 110
Asp Ile Ser Val Met Asn Ile Glu Glu Gln Ala Val Glu Arg Gly Pro
115 120 125
Lys Gly Phe Asn Phe Asn Glu Asn Val Gln Ala Phe Asn Phe Ala Lys
130 135 140
Asp Ala Lys Val Asp Asp Lys Ile Lys Val Ile Gly Tyr Pro Leu Pro
145 150 155 160
Ala Gln Asn Ser Phe Lys Gln Phe Glu Ser Thr Gly Thr Ile Lys Arg
165 170 175
Ile Lys Asp Asn Ile Leu Asn Phe Asp Ala Tyr Ile Glu Pro Gly Asn
180 185 190
Ser Gly Ser Pro Val Leu Asn Ser Asn Asn Glu Val Ile Gly Val Val
195 200 205
Tyr Gly Gly Ile Gly Lys Ile Gly Ser Glu Tyr Asn Gly Ala Val Tyr
210 215 220
Phe Thr Pro Gln Ile Lys Asp Phe Ile Gln Lys His Ile Glu Gln
225 230 235
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<211> 240
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 118
Met Asn Lys Asn Val Val Ile Lys Ser Leu Ala Ala Leu Thr Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ser Val Thr Gly Ile Gly Thr Thr Leu Val Glu Glu Val Gln Gln
20 25 30
Thr Ala Lys Ala Glu Asn Asn Val Thr Lys Val Lys Asp Thr Asn Ile
35 40 45
Phe Pro Tyr Thr Gly Val Val Ala Phe Lys Ser Ala Thr Gly Phe Val
50 55 60
Val Gly Lys Asn Thr Ile Leu Thr Asn Lys His Val Ser Lys Asn Tyr
65 70 75 80
Lys Val Gly Asp Arg Ile Thr Ala His Pro Asn Ser Asp Lys Gly Asn
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Gly Gly Ile Tyr Ser Ile Lys Lys Ile Ile Asn Tyr Pro Gly Lys Glu
100 105 110
Asp Val Ser Val Ile Gln Val Glu Glu Arg Ala Ile Glu Arg Gly Pro
115 120 125
Lys Gly Phe Asn Phe Asn Asp Asn Val Thr Pro Phe Lys Tyr Ala Ala
130 135 140
Gly Ala Lys Ala Gly Glu Arg Ile Lys Val Ile Gly Tyr Pro His Pro
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Tyr Lys Asn Lys Tyr Val Leu Tyr Glu Ser Thr Gly Pro Val Met Ser
165 170 175
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180 185 190
Ser Gly Ser Pro Val Leu Asn Ser Asn Asn Glu Leu Val Gly Ile His
195 200 205
Phe Ala Ser Asp Val Lys Asn Asp Asp Asn Arg Asn Ala Tyr Gly Val
210 215 220
Tyr Phe Thr Pro Glu Ile Lys Lys Phe Ile Ala Glu Asn Ile Asp Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 119
Met Asn Lys Asn Val Met Val Lys Gly Leu Thr Ala Leu Thr Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ser Leu Gly Phe Ala Glu Asn Ile Ser Asn Gln Pro His Ser Ile
20 25 30
Ala Lys Ala Glu Lys Asn Val Lys Glu Ile Thr Asp Ala Thr Lys Glu
35 40 45
Pro Tyr Asn Ser Val Val Ala Phe Val Gly Gly Thr Gly Val Val Val
50 55 60
Gly Lys Asn Thr Ile Val Thr Asn Lys His Ile Ala Lys Ser Asn Asp
65 70 75 80
Ile Phe Lys Asn Arg Val Ser Ala His His Ser Ser Lys Gly Lys Gly
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Lys Asp Arg Ile Ser Val Ile Gly Tyr Pro Lys Gly Ala Gln Thr Lys
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Tyr Lys Met Phe Glu Ser Thr Gly Thr Ile Asn His Ile Ser Gly Thr
165 170 175
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195 200 205
Gly Lys Asp Glu Ser Glu Lys Asn Phe Gly Val Tyr Phe Thr Pro Gln
210 215 220
Leu Lys Glu Phe Ile Gln Asn Asn Ile Glu Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 120
Met Leu Lys Arg Ser Leu Leu Phe Leu Thr Val Leu Leu Leu Leu Phe
1 5 10 15
Ser Phe Ser Ser Ile Thr Asn Glu Val Ser Ala Ser Ser Ser Phe Asp
20 25 30
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35 40 45
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Lys Ser Phe Pro Ile Thr Glu Lys Gly Phe Val Val Pro Asp Leu Ser
130 135 140
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Glu Lys Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 121
Met Lys Lys Lys Ala Leu Leu Pro Leu Phe Leu Gly Ile Met Val Phe
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Leu Ala Gly Cys Asp Tyr Ser Lys Pro Glu Lys Arg Ser Gly Phe Phe
20 25 30
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35 40 45
Asn Asn Leu Leu Asn Asp Asn Tyr Gly Leu Ala Ile Ile Ile Leu Val
50 55 60
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Asn Ser His Met Met Arg Gln Lys Met Lys Val Ala Lys Pro Glu Val
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100 105 110
Met Ala Ala Asn Gln Glu Leu Met Gln Val Tyr Lys Lys Tyr Asp Met
115 120 125
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130 135 140
Pro Ile Ile Met Gly Leu Tyr Phe Val Leu Lys Asp Gln Leu Val Asp
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Gly Leu Phe Lys Tyr Pro His Phe Leu Trp Phe Asp Leu Gly Arg Pro
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Tyr Val Ser Ser Lys Thr Met Pro Asp Glu Gln Arg Gln Met Gly Tyr
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Met Met Met Val Ile Ser Pro Ile Met Ile Ile Trp Ile Ser Leu Ser
210 215 220
Ser Ala Ser Ala Leu Gly Leu Tyr Trp Ser Val Ser Ala Ala Phe Leu
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Val Val Gln Thr His Phe Ala Asn Ile Tyr Tyr Glu Lys Val Ala Lys
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Gly Ser Asn Lys Lys Gly Lys Asn Thr Gln Val Val Ser Lys Lys Lys
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290
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 122
Met Lys Ser Cys Pro Lys Cys Gly Gln Gln Ala Gln Asp Asp Val Gln
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Lys Met Val Pro Trp Ala Ile Gly Phe Phe Ile Leu Ile Leu Ile Ile
50 55 60
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65 70 75 80
Lys Ile Leu Val Asn Ala Ile Glu Asn Asn Asp Lys Gln Lys Val Ala
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Glu Asn Ser Leu Lys Asn Lys Leu Ile Glu Phe Phe Ala Gly Tyr Ser
355 360 365
Leu Ala Asn Asn Ala Ala Phe Asn Gln Ser Asp Phe Asp Phe Val Ser
370 375 380
Ser Tyr Ile Lys Lys Gly Ser Ser Phe Tyr Asp Asp Val Lys Lys Arg
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450 455 460
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 123
Met Arg Lys Lys Trp Ser Thr Leu Ala Phe Gly Phe Leu Val Ala Ala
1 5 10 15
Tyr Ala His Ile Arg Ile Lys Glu Lys Arg Ser Val Lys Ser Tyr Met
20 25 30
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35 40 45
Lys Glu Glu Ala Met Lys Ala Leu Glu Lys Met Ala Pro Gln Thr Ala
50 55 60
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65 70 75 80
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Leu Asn Ala Lys Val Ile Met Pro Val Tyr Pro Lys Ile Pro His Gln
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Leu Asn Gln Val Ala Asp Ser Lys Gln Ile Val Val Met Gly Asp Ser
165 170 175
Ala Gly Gly Gln Ile Ala Leu Ser Phe Ala Gln Leu Leu Lys Glu Lys
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Met Val Gly Val Asp Gly Ser Val Phe Leu Ala Glu Gln Trp Ala Gly
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305 310 315 320
Ile Asn
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 124
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Gly Asn Ala Lys Asn Trp Tyr Tyr Asn Ala Arg Lys Ser Lys Tyr Ala
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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<211> 255
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 125
Met Lys Lys Ile Val Thr Ala Thr Ile Ala Thr Ala Gly Leu Ala Thr
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Tyr Ser Tyr Asn Asn Ala Ser Tyr Asn Asn Tyr Tyr Asn His Ser Tyr
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100 105 110
Tyr Thr Gly Gly Ser Gly Ala Ser Tyr Ser Thr Thr Ser Asn Asn Val
115 120 125
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130 135 140
Asn Gly Tyr Ala Ser Gly Ser Asn Leu Tyr Thr Ser Gly Gln Cys Thr
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Tyr Tyr Val Phe Asp Arg Val Gly Gly Lys Ile Gly Ser Thr Trp Gly
165 170 175
Asn Ala Ser Asn Trp Ala Asn Ala Ala Ala Ser Ser Gly Tyr Thr Val
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195 200 205
Tyr Gly His Val Ala Tyr Val Glu Gly Val Asn Ser Asn Gly Ser Val
210 215 220
Arg Val Ser Glu Met Asn Tyr Gly His Gly Ala Gly Val Val Thr Ser
225 230 235 240
Arg Thr Ile Ser Ala Asn Gln Ala Gly Ser Tyr Asn Phe Ile His
245 250 255
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<211> 131
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 126
Met Lys Lys Leu Ile Ile Ser Ile Met Ala Val Met Leu Phe Leu Thr
1 5 10 15
Gly Cys Gly Lys Ser Gln Glu Lys Ala Thr Leu Glu Lys Asp Ile Asp
20 25 30
Asn Leu Gln Lys Glu Asn Lys Glu Leu Lys Asp Lys Lys Glu Lys Leu
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Lys Asp Glu Asp Lys Asn Lys Asp Lys Asp Lys Asp Lys Glu Ala Ser
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Gln Asp Lys Gln Ser Lys Asp Gln Thr Lys Ser Ser Asp Lys Asp Asn
100 105 110
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115 120 125
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130
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 127
Met Thr Lys Arg Pro Lys Arg Ile Leu Ala Thr Ile Ile Ile Phe Leu
1 5 10 15
Ser Leu Leu Phe Thr Ile Ile Tyr Ile Asp Asp Ile Gln Lys Trp Phe
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Ser Lys Trp Glu Asp Phe Phe Arg Gly Ser Arg Ile Thr Glu Thr Phe
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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Tyr Asn Val Lys Val Gly Asp Arg Val Lys Ala Gly Asp Ile Ile Ala
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Tyr Ser Gly Asn Thr Gly Ile Gln Thr Thr Gly Ala His Leu His Phe
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Gln Arg Met Lys Gly Gly Val Gly Asn Ala Tyr Ala Glu Asp Pro Lys
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Pro Phe Ile Asp Gln Leu Pro Asp Gly Glu Arg Ser Leu Tyr Asp Leu
180 185 190
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 128
Met Thr Gln Gln Gln Asn Asp Lys Arg Thr Leu Lys Asn Lys His Thr
1 5 10 15
Tyr Gln Asn Glu Pro Leu Pro Asn Arg Lys Asp Phe Val Val Ser Phe
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100 105 110
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195 200 205
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Arg Leu Ala Asn Ala Ala Lys Gln Lys Gln Ala Lys Leu Thr Pro Gly
325 330 335
Ser Lys Glu Ser Gln Leu Thr Glu Ala Leu Phe Ala Glu Lys Pro Val
340 345 350
Ala Lys Asn Asp Leu Lys Glu Ile Pro Gln Leu Val Thr Lys Lys Asn
355 360 365
Asp Val Ser Glu Thr Glu Thr Val Asn Ile Asp Asn Lys Asp Thr Val
370 375 380
Lys Gln Lys Glu Ala Lys Phe Glu Asn Gly Val Ile Thr Arg Lys Ala
385 390 395 400
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405 410 415
Gln Ser Lys Lys Thr Thr Pro Ser Asn Lys Arg Asn Ala Ser Lys Ala
420 425 430
Ser Thr Asn Lys Thr Ser Gly Gln Lys Lys Gln His Asn Lys Lys Ser
435 440 445
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450 455 460
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 129
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1 5 10 15
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245 250 255
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260 265 270
Thr Ile Thr Ile Gln Ile Gly Lys Pro Thr Ile Asn Thr Lys Lys Ala
275 280 285
Phe Tyr Asp Asp Asn Asp Pro Ile Glu Tyr Gly Val Tyr Arg Lys Asp
290 295 300
Glu
305
<210> 130
<211> 226
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 130
Met Lys Phe Lys Ala Ile Ala Lys Ala Ser Leu Ala Leu Gly Met Leu
1 5 10 15
Ala Thr Gly Val Ile Thr Ser Asn Val Gln Ser Val Gln Ala Lys Ala
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35 40 45
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130 135 140
Val Leu Lys Asp Phe Tyr Tyr Ile Ser Lys Glu Asp Ile Ser Leu Lys
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180 185 190
Gly Thr Thr His Thr Ile Asp Leu Ser Gln Lys Leu Glu Lys Glu Arg
195 200 205
Met Gly Glu Ser Ile Asp Gly Thr Lys Ile Asn Lys Ile Leu Val Glu
210 215 220
Met Lys
225
<210> 131
<211> 231
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 131
Met Lys Met Lys Asn Ile Ala Lys Ile Ser Leu Leu Leu Gly Ile Leu
1 5 10 15
Ala Thr Gly Val Asn Thr Thr Thr Glu Lys Pro Val His Ala Glu Lys
20 25 30
Lys Pro Ile Val Ile Ser Glu Asn Ser Lys Lys Leu Lys Ala Tyr Tyr
35 40 45
Asn Gln Pro Ser Ile Glu Tyr Lys Asn Val Thr Gly Tyr Ile Ser Phe
50 55 60
Ile Gln Pro Ser Ile Lys Phe Met Asn Ile Ile Asp Gly Asn Ser Val
65 70 75 80
Asn Asn Ile Ala Leu Ile Gly Lys Asp Lys Gln His Tyr His Thr Gly
85 90 95
Val His Arg Asn Leu Asn Ile Phe Tyr Val Asn Glu Asp Lys Arg Phe
100 105 110
Glu Gly Ala Lys Tyr Ser Ile Gly Gly Ile Thr Ser Ala Asn Asp Lys
115 120 125
Ala Val Asp Leu Ile Ala Glu Ala Arg Val Ile Lys Glu Asp His Thr
130 135 140
Gly Glu Tyr Asp Tyr Asp Phe Phe Pro Phe Lys Ile Asp Lys Glu Ala
145 150 155 160
Met Ser Leu Lys Glu Ile Asp Phe Lys Leu Arg Lys Tyr Leu Ile Asp
165 170 175
Asn Tyr Gly Leu Tyr Gly Glu Met Ser Thr Gly Lys Ile Thr Val Lys
180 185 190
Lys Lys Tyr Tyr Gly Lys Tyr Thr Phe Glu Leu Asp Lys Lys Leu Gln
195 200 205
Glu Asp Arg Met Ser Asp Val Ile Asn Val Thr Asp Ile Asp Arg Ile
210 215 220
Glu Ile Lys Val Ile Lys Ala
225 230
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 132
Met Lys Met Arg Thr Ile Ala Lys Thr Ser Leu Ala Leu Gly Leu Leu
1 5 10 15
Thr Thr Gly Ala Ile Thr Val Thr Thr Gln Ser Val Lys Ala Glu Lys
20 25 30
Ile Gln Ser Thr Lys Val Asp Lys Val Pro Thr Leu Lys Ala Glu Arg
35 40 45
Leu Ala Met Ile Asn Ile Thr Ala Gly Ala Asn Ser Ala Thr Thr Gln
50 55 60
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65 70 75 80
Asn Thr Asn Glu Glu Lys Thr Ser Ala Ser Lys Ile Glu Lys Ile Ser
85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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165 170 175
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Met Ile Ser Arg Asp Val Ser Glu Tyr Met Ile Thr Lys Glu Glu Ile
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His Arg Met Ala Asp Val Ile Asp Gly Thr Asn Ile Asp Asn Ile Glu
340 345 350
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355
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 133
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Lys Ile Ala Leu Val Gly Lys Asp Asp Lys Lys Tyr Gly Glu Gly Val
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Ser Leu Lys Glu Leu Asp Phe Lys Leu Arg Lys Gln Leu Ile Glu Lys
245 250 255
Asn Asn Leu Tyr Gly Asn Val Gly Ser Gly Lys Ile Val Ile Lys Met
260 265 270
Lys Asn Gly Gly Lys Tyr Thr Phe Glu Leu His Lys Lys Leu Gln Glu
275 280 285
Asn Arg Met Ala Asp Val Ile Asp Gly Thr Asn Ile Asp Asn Ile Glu
290 295 300
Val Asn Ile Lys
305
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 134
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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Lys Asn Ile Glu Val Asn Leu Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 138
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 139
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Gly Lys Asn Asn Leu Arg Phe Lys Phe Arg Gly Ile Lys Ile Gln Val
65 70 75 80
Leu Leu Pro Gly Asn Asp Lys Ser Lys Phe Gln Gln Arg Ser Tyr Glu
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115 120 125
Val Ser Ala Pro Ile Leu Asn Ile Ser Lys Glu Lys Gly Glu Asp Ala
130 135 140
Phe Val Lys Gly Tyr Pro Tyr Tyr Ile Lys Lys Glu Lys Ile Thr Leu
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Asn Leu Lys
225
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<211> 225
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 140
Met Lys Leu Lys Asn Ile Ala Lys Ala Ser Leu Ala Leu Gly Ile Leu
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50 55 60
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100 105 110
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Leu
225
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 141
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115
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 142
Met Lys Asn Lys Leu Leu Val Leu Ser Leu Gly Ala Leu Cys Val Ser
1 5 10 15
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Asp Ile Lys Lys Asp Asn Pro Glu Leu Lys Asp Phe Asn Glu Glu Glu
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Arg Pro Asn Asn Ile Pro Val Leu Glu Asp Glu Lys Gln Glu Glu Lys
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Asn His Lys Asn Met Ala Gln Leu Lys Ser Asp Thr Glu Ala Ala Lys
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Ser Asp Glu Ser Lys Arg Ser Lys Arg Ser Lys Arg Ser Leu Asn Thr
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Gln Lys Ile Lys Lys Thr Pro Val Val Ser Leu Glu Tyr Asp Phe Glu
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<211> 208
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 143
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1 5 10 15
Leu Ala Gly Cys Thr Thr Asp Lys Lys Glu Ile Lys Ala Tyr Leu Lys
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Asp Val Leu Lys Glu Lys Tyr Lys Leu His Ser Asp Tyr Ala Lys Ala
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165 170 175
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Val Leu Asn Lys Val Gly Lys Glu Lys Gln Asp Val Asp Gln Phe Lys
195 200 205
<210> 144
<211> 109
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 144
Met Lys Lys Asn Phe Ile Gly Lys Ser Ile Leu Ser Ile Ala Ala Ile
1 5 10 15
Ser Leu Thr Val Ser Thr Phe Ala Gly Glu Ser His Ala Gln Thr Lys
20 25 30
Asn Val Glu Ala Ala Lys Lys Tyr Asp Gln Tyr Gln Thr Asn Phe Lys
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105
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<211> 116
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 145
Met Lys Ile Arg Lys Ser Ile Leu Ala Gly Thr Leu Ala Ile Val Leu
1 5 10 15
Ala Ser Pro Leu Val Thr Asn Leu Asp Lys Asn Glu Ala Gln Ala Ser
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<211> 149
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 146
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100 105 110
Lys Asn Val Glu Leu Leu Gly Lys Met Tyr Lys Thr Tyr Phe Phe Lys
115 120 125
Lys Gly Glu Ser Lys Ser Ser Tyr Val Ile Asn Gly Pro Gly Lys Thr
130 135 140
Asn Glu Tyr Ala Tyr
145
<210> 147
<211> 257
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 147
Met Lys Lys Thr Ala Phe Ile Leu Leu Leu Phe Ile Ala Leu Thr Trp
1 5 10 15
Thr Thr Ser Pro Leu Val Asn Gly Ser Glu Lys Ser Glu Glu Ile Asn
20 25 30
Glu Lys Asp Leu Arg Lys Lys Ser Glu Leu Gln Gly Ala Ala Leu Gly
35 40 45
Asn Leu Lys Gln Ile Tyr Tyr Tyr Asn Glu Lys Ala Lys Thr Glu Asn
50 55 60
Lys Glu Ser His Asp Gln Phe Leu Gln His Thr Ile Leu Phe Lys Gly
65 70 75 80
Phe Phe Thr Asn His Ser Trp Tyr Asn Asp Leu Leu Val Asp Phe Asp
85 90 95
Ser Lys Asp Ile Val Asp Lys Tyr Lys Gly Lys Lys Val Asp Leu Tyr
100 105 110
Gly Ala Tyr Tyr Gly Tyr Gln Cys Ala Gly Gly Thr Pro Asn Lys Thr
115 120 125
Ala Cys Met Tyr Gly Gly Val Thr Leu His Asp Asn Asn Arg Leu Thr
130 135 140
Glu Glu Lys Lys Val Pro Ile Asn Leu Trp Leu Asp Gly Lys Gln Asn
145 150 155 160
Thr Val Pro Leu Glu Thr Val Lys Thr Asn Lys Lys Asn Val Thr Val
165 170 175
Gln Glu Leu Asp Leu Gln Ala Arg Arg Tyr Leu Gln Glu Lys Tyr Asn
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Leu Tyr Asn Ser Asp Val Phe Asp Gly Lys Val Gln Arg Gly Leu Ile
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Val Phe His Thr Ser Thr Glu Pro Ser Val Asn Tyr Asp Leu Phe Gly
210 215 220
Ala Gln Gly Gln Asn Ser Asn Thr Leu Leu Arg Ile Tyr Arg Asp Asn
225 230 235 240
Lys Thr Ile Asn Ser Glu Asn Met His Ile Asp Ile Tyr Leu Tyr Thr
245 250 255
Ser
<210> 148
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 148
Met Lys Arg Leu Leu Gly Leu Leu Leu Val Ser Thr Leu Val Leu Ser
1 5 10 15
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20 25 30
Ser Lys Glu Lys Lys Ile Glu Lys Glu Lys Glu Asn Lys Ser Lys Lys
35 40 45
Asp Lys Glu Lys Glu Val Ala Thr Gln Gln Gln Pro Asp Asn Gln Thr
50 55 60
Val Glu Gln Pro Gln Ser Gln Glu Gln Ser Val Gln Gln Pro Gln Gln
65 70 75 80
Gln Ile Pro Gln Asn Ser Val Pro Gln Gln Asn Val Gln Val Gln Gln
85 90 95
Asn Lys Lys Gln Lys Val Asp Leu Asn Asn Met Pro Pro Thr Asp Phe
100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Arg Val Ser Glu Ile Ile Asn Asn Asp Asn
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 149
Met Gln Met Arg Asp Lys Lys Gly Pro Val Asn Lys Arg Val Asp Phe
1 5 10 15
Leu Ser Asn Lys Leu Asn Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Phe Thr Val Gly
20 25 30
Thr Ala Ser Ile Leu Ile Gly Ser Leu Met Tyr Leu Gly Thr Gln Gln
35 40 45
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100 105 110
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115 120 125
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Ala Arg Ser Val Asp Glu Gly Ser Phe Asp Ile Thr Arg Asp Ser Lys
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Asn Val Val Glu Ser Thr Pro Ile Thr Ile Gln Gly Lys Glu His Phe
165 170 175
Glu Gly Tyr Gly Ser Val Asp Ile Gln Lys Lys Pro Thr Asp Leu Gly
180 185 190
Val Ser Glu Val Thr Arg Phe Asn Val Gly Asn Glu Ser Asn Gly Leu
195 200 205
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210 215 220
Asn Phe Lys Val Arg Val Ala Asn Asn His Gln Ser Asn Thr Thr Gly
225 230 235 240
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340 345 350
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 150
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<213> Staphylococcus aureus
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Tyr Asp Thr Leu Ser Ile Lys Gln Gly Leu Asp Arg Val Asn Pro
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<211> 207
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 152
Met Gly Gly Tyr Lys Gly Ile Lys Ala Asp Gly Gly Lys Val Asp Gln
1 5 10 15
Ala Lys Gln Leu Ala Ala Lys Thr Ala Lys Asp Ile Glu Ala Cys Gln
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Lys Gln Thr Gln Gln Leu Ala Glu Tyr Ile Glu Gly Ser Asp Trp Glu
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Gly Gln Phe Ala Asn Lys Val Lys Asp Val Leu Leu Ile Met Ala Lys
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65 70 75 80
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Phe Glu Glu Gln Phe Gln Gln Leu Ser Pro Lys Val Glu Lys Phe Ala
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 153
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<211> 106
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 154
Cys Gly Asn Asp Thr Pro Lys Asp Glu Thr Lys Ser Thr Glu Ser Asn
1 5 10 15
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Glu Asp Thr Met Asn Glu Asn Asp Asn Phe
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<211> 580
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 155
Ala Glu Asn Thr Ser Thr Glu Asn Ala Lys Gln Asp Asp Ala Thr Thr
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Ser Asn Asn Val Asn Asp Leu Ile Lys Val Thr Lys Gln Thr Ile Lys
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245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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<400> 156
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100 105 110
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130 135 140
Ser Asn Asp Glu Thr Leu Val Asp Asn Asn Ser Asn Ser Asn Asn Glu
145 150 155 160
Asn Asn Ala Asp Ile Ile Leu Pro Lys Ser Thr Ala Pro Lys Arg Leu
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Lys Asn Val Asn Asp Leu Ile Thr Ser Asn Thr Thr Leu Thr Val Val
195 200 205
Asp Ala Asp Lys Asn Asn Lys Ile Val Pro Ala Gln Asp Tyr Leu Ser
210 215 220
Leu Lys Ser Gln Ile Thr Val Asp Asp Lys Val Lys Ser Gly Asp Tyr
225 230 235 240
Phe Thr Ile Lys Tyr Ser Asp Thr Val Gln Val Tyr Gly Leu Asn Pro
245 250 255
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Asn Tyr Ser Ile Tyr Met Asp Ala Asp Thr Ile Pro Val Ser Lys Asn
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aaagtagaaa aatttgcaca attattagaa gaaattaaac aacaattgaa tagcactgct 240
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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Asp Gly Gly Pro Arg Asp Tyr Tyr Thr Phe Asp Leu Thr Arg Pro Leu
100 105 110
Glu Glu Asn Arg Lys Asn Ile Lys Val Val Lys Asn Gly Glu Ile Asp
115 120 125
Ser Ile Thr Trp Tyr
130
<210> 187
<211> 274
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 187
Met Tyr Pro Asn Trp Gly Gln Tyr Lys Arg Ala Asp Leu Ile Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ser Tyr Ile Lys Asn Asn Asp Val Val Ile Phe Asn Glu Ala Phe
20 25 30
Asp Asn Gly Ala Ser Asp Lys Leu Leu Ser Asn Val Lys Lys Glu Tyr
35 40 45
Pro Tyr Gln Thr Pro Val Leu Gly Arg Ser Gln Ser Gly Trp Asp Lys
50 55 60
Thr Glu Gly Ser Tyr Ser Ser Thr Val Ala Glu Asp Gly Gly Val Ala
65 70 75 80
Ile Val Ser Lys Tyr Pro Ile Lys Glu Lys Ile Gln His Val Phe Lys
85 90 95
Ser Gly Cys Gly Phe Asp Asn Asp Ser Asn Lys Gly Phe Val Tyr Thr
100 105 110
Lys Ile Glu Lys Asn Gly Lys Asn Val His Val Ile Gly Thr His Thr
115 120 125
Gln Ser Glu Asp Ser Arg Cys Gly Ala Gly His Asp Arg Lys Ile Arg
130 135 140
Ala Glu Gln Met Lys Glu Ile Ser Asp Phe Val Lys Lys Lys Asn Ile
145 150 155 160
Pro Lys Asp Glu Thr Val Tyr Ile Gly Gly Asp Leu Asn Val Asn Lys
165 170 175
Gly Thr Pro Glu Phe Lys Asp Met Leu Lys Asn Leu Asn Val Asn Asp
180 185 190
Val Leu Tyr Ala Gly His Asn Ser Thr Trp Asp Pro Gln Ser Asn Ser
195 200 205
Ile Ala Lys Tyr Asn Tyr Pro Asn Gly Lys Pro Glu His Leu Asp Tyr
210 215 220
Ile Phe Thr Asp Lys Asp His Lys Gln Pro Lys Gln Leu Val Asn Glu
225 230 235 240
Val Val Thr Glu Lys Pro Lys Pro Trp Asp Val Tyr Ala Phe Pro Tyr
245 250 255
Tyr Tyr Val Tyr Asn Asp Phe Ser Asp His Tyr Pro Ile Lys Ala Tyr
260 265 270
Ser Lys
<210> 188
<211> 390
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 188
Met Leu Glu Phe Glu Gln Gly Phe Asn His Leu Ala Thr Leu Lys Val
1 5 10 15
Ile Gly Val Gly Gly Gly Gly Asn Asn Ala Val Asn Arg Met Ile Asp
20 25 30
His Gly Met Asn Asn Val Glu Phe Ile Ala Ile Asn Thr Asp Gly Gln
35 40 45
Ala Leu Asn Leu Ser Lys Ala Glu Ser Lys Ile Gln Ile Gly Glu Lys
50 55 60
Leu Thr Arg Gly Leu Gly Ala Gly Ala Asn Pro Glu Ile Gly Lys Lys
65 70 75 80
Ala Ala Glu Glu Ser Arg Glu Gln Ile Glu Asp Ala Ile Gln Gly Ala
85 90 95
Asp Met Val Phe Val Thr Ser Gly Met Gly Gly Gly Thr Gly Thr Gly
100 105 110
Ala Ala Pro Val Val Ala Lys Ile Ala Lys Glu Met Gly Ala Leu Thr
115 120 125
Val Gly Val Val Thr Arg Pro Phe Ser Phe Glu Gly Arg Lys Arg Gln
130 135 140
Thr Gln Ala Ala Ala Gly Val Glu Ala Met Lys Ala Ala Val Asp Thr
145 150 155 160
Leu Ile Val Ile Pro Asn Asp Arg Leu Leu Asp Ile Val Asp Lys Ser
165 170 175
Thr Pro Met Met Glu Ala Phe Lys Glu Ala Asp Asn Val Leu Arg Gln
180 185 190
Gly Val Gln Gly Ile Ser Asp Leu Ile Ala Val Ser Gly Glu Val Asn
195 200 205
Leu Asp Phe Ala Asp Val Lys Thr Ile Met Ser Asn Gln Gly Ser Ala
210 215 220
Leu Met Gly Ile Gly Val Ser Ser Gly Glu Asn Arg Ala Val Glu Ala
225 230 235 240
Ala Lys Lys Ala Ile Ser Ser Pro Leu Leu Glu Thr Ser Ile Val Gly
245 250 255
Ala Gln Gly Val Leu Met Asn Ile Thr Gly Gly Glu Ser Leu Ser Leu
260 265 270
Phe Glu Ala Gln Glu Ala Ala Asp Ile Val Gln Asp Ala Ala Asp Glu
275 280 285
Asp Val Asn Met Ile Phe Gly Thr Val Ile Asn Pro Glu Leu Gln Asp
290 295 300
Glu Ile Val Val Thr Val Ile Ala Thr Gly Phe Asp Asp Lys Pro Thr
305 310 315 320
Ser His Gly Arg Lys Ser Gly Ser Thr Gly Phe Gly Thr Ser Val Asn
325 330 335
Thr Ser Ser Asn Ala Thr Ser Lys Asp Glu Ser Phe Thr Ser Asn Ser
340 345 350
Ser Asn Ala Gln Ala Thr Asp Ser Val Ser Glu Arg Thr His Thr Thr
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Lys Glu Asp Asp Ile Pro Ser Phe Ile Arg Asn Arg Glu Glu Arg Arg
370 375 380
Ser Arg Arg Thr Arg Arg
385 390
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 189
Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser
1 5 10 15
Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn
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Gly Met Leu Lys Lys Val Phe Tyr Ser Phe Ile Asp Asp Lys Asn His
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Asn Lys Lys Leu Leu Val Ile Arg Thr Lys Gly Thr Ile Ala Gly Gln
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Pro Ser Ala Phe Lys Val Gln Leu Gln Leu Pro Asp Asn Glu Val Ala
85 90 95
Gln Ile Ser Asp Tyr Tyr Pro Arg Asn Ser Ile Asp Thr Pro Ser Gly
100 105 110
Ser Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro Thr Asp Lys
115 120 125
Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn Gln Asn Trp
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Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly Asn Gln Leu
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Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp Asn Phe Leu
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Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe Ser Pro Asp
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Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys Gln Gln Thr
195 200 205
Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr Gln Leu His
210 215 220
Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp Lys Trp Ile
225 230 235 240
Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys Glu Glu Met
245 250 255
Thr Asn
<210> 190
<211> 306
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 190
Lys Phe Val Val Pro Glu Ser Gly Ile Asn Lys Ile Ile Pro Ala Tyr
1 5 10 15
Asp Glu Phe Lys Asn Ser Pro Lys Val Asn Val Ser Asn Leu Thr Asp
20 25 30
Asn Lys Asn Phe Val Ala Ser Glu Asp Lys Leu Asn Lys Ile Ala Asp
35 40 45
Ser Ser Ala Ala Ser Lys Ile Val Asp Lys Asn Phe Val Val Pro Glu
50 55 60
Ser Lys Leu Gly Asn Ile Val Pro Glu Tyr Lys Glu Ile Asn Asn Arg
65 70 75 80
Val Asn Val Ala Thr Asn Asn Pro Ala Ser Gln Gln Val Asp Lys His
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Phe Val Ala Lys Gly Pro Glu Val Asn Arg Phe Ile Thr Gln Asn Lys
100 105 110
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115 120 125
Thr Ser Tyr Lys Ser Thr His Val His Lys His Val Asn His Ala Lys
130 135 140
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145 150 155 160
Tyr Thr His Pro Ser Gln Ser Leu Ile Ile Lys His His Phe Ala Val
165 170 175
Pro Gly Tyr His Ala His Lys Phe Val Thr Pro Gly His Ala Ser Ile
180 185 190
Lys Ile Asn His Phe Cys Val Val Pro Gln Ile Asn Ser Phe Lys Val
195 200 205
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Tyr Asp Tyr Lys Tyr Phe Tyr Ser Tyr Lys Val Val Lys Gly Val Lys
245 250 255
Lys Tyr Phe Ser Phe Ser Gln Ser Asn Gly Tyr Lys Ile Gly Lys Pro
260 265 270
Ser Leu Asn Ile Lys Asn Val Asn Tyr Gln Tyr Ala Val Pro Ser Tyr
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Arg Val
305
<210> 191
<211> 308
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 191
Ser Val Thr Glu Ser Val Asp Lys Lys Phe Val Val Pro Glu Ser Gly
1 5 10 15
Ile Asn Lys Ile Ile Pro Ala Tyr Asp Glu Phe Lys Asn Ser Pro Lys
20 25 30
Val Asn Val Ser Asn Leu Thr Asp Asn Lys Asn Phe Val Ala Ser Glu
35 40 45
Asp Lys Leu Asn Lys Ile Ala Asp Ser Ser Ala Ala Ser Lys Ile Val
50 55 60
Asp Lys Asn Phe Val Val Pro Glu Ser Lys Leu Gly Asn Ile Val Pro
65 70 75 80
Glu Tyr Lys Glu Ile Asn Asn Arg Val Asn Val Ala Thr Asn Asn Pro
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115 120 125
Gln Thr His Tyr Lys Lys Val Ile Thr Ser Tyr Lys Ser Thr His Val
130 135 140
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Val Lys Pro Ser Glu Ser Pro Arg Tyr Thr His Pro Ser Gln Ser Leu
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Ile Ile Lys His His Phe Ala Val Pro Gly Tyr His Ala His Lys Phe
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Val Thr Pro Gly His Ala Ser Ile Lys Ile Asn His Phe Cys Val Val
195 200 205
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210 215 220
His Arg Met His Val Pro Ser Phe Gln Asn Asn Thr Thr Ala Thr His
225 230 235 240
Gln Asn Ala Lys Val Asn Lys Ala Tyr Asp Tyr Lys Tyr Phe Tyr Ser
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Tyr Lys Val Val Lys Gly Val Lys Lys Tyr Phe Ser Phe Ser Gln Ser
260 265 270
Asn Gly Tyr Lys Ile Gly Lys Pro Ser Leu Asn Ile Lys Asn Val Asn
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Tyr Gln Tyr Ala Val Pro Ser Tyr Ser Pro Thr His Tyr Val Pro Glu
290 295 300
Phe Lys Gly Ser
305
<210> 192
<211> 300
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 192
Lys Phe Val Val Pro Glu Ser Gly Ile Asn Lys Ile Ile Pro Ala Tyr
1 5 10 15
Asp Glu Phe Lys Asn Ser Pro Lys Val Asn Val Ser Asn Leu Thr Asp
20 25 30
Asn Lys Asn Phe Val Ala Ser Glu Asp Lys Leu Asn Lys Ile Ala Asp
35 40 45
Ser Ser Ala Ala Ser Lys Ile Val Asp Lys Asn Phe Val Val Pro Glu
50 55 60
Ser Lys Leu Gly Asn Ile Val Pro Glu Tyr Lys Glu Ile Asn Asn Arg
65 70 75 80
Val Asn Val Ala Thr Asn Asn Pro Ala Ser Gln Gln Val Asp Lys His
85 90 95
Phe Val Ala Lys Gly Pro Glu Val Asn Arg Phe Ile Thr Gln Asn Lys
100 105 110
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115 120 125
Thr Ser Tyr Lys Ser Thr His Val His Lys His Val Asn His Ala Lys
130 135 140
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Tyr Thr His Pro Ser Gln Ser Leu Ile Ile Lys His His Phe Ala Val
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Pro Gly Tyr His Ala His Lys Phe Val Thr Pro Gly His Ala Ser Ile
180 185 190
Lys Ile Asn His Phe Cys Val Val Pro Gln Ile Asn Ser Phe Lys Val
195 200 205
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210 215 220
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Lys Tyr Phe Ser Phe Ser Gln Ser Asn Gly Tyr Lys Ile Gly Lys Pro
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 193
Ser Val Thr Glu Ser Val Asp Lys Lys Phe Val Val Pro Glu Ser Gly
1 5 10 15
Ile Asn Lys Ile Ile Pro Ala Tyr Asp Glu Phe Lys Asn Ser Pro Lys
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Val Asn Val Ser Asn Leu Thr Asp Asn Lys Asn Phe Val Ala Ser Glu
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Asp Lys Asn Phe Val Val Pro Glu Ser Lys Leu Gly Asn Ile Val Pro
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<210> 194
<211> 53
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 194
Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser
1 5 10 15
Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn
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<210> 195
<211> 53
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 195
Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp Ile Gly Ser
1 5 10 15
Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp Lys Glu Asn
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50
<210> 196
<211> 316
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 196
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Ser Val Arg Thr Arg Ala Val Arg Ser Leu Ala Val Ala Glu Pro Val
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Val Asn Ala Ala Asp Ala Lys Gly Thr Asn Val Asn Asp Lys Val Thr
165 170 175
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180 185 190
Gly Asn Thr Phe Met Ala Ala Asn Phe Thr Val Thr Asp Lys Val Lys
195 200 205
Ser Gly Asp Tyr Phe Thr Ala Lys Leu Pro Asp Ser Leu Thr Gly Asn
210 215 220
Gly Asp Val Asp Tyr Ser Asn Ser Asn Asn Thr Met Pro Ile Ala Asp
225 230 235 240
Ile Lys Ser Thr Asn Gly Asp Val Val Ala Lys Ala Thr Tyr Asp Ile
245 250 255
Leu Thr Lys Thr Tyr Thr Phe Val Phe Thr Asp Tyr Val Asn Asn Lys
260 265 270
Glu Asn Ile Asn Gly Gln Phe Ser Leu Pro Leu Phe Thr Asp Arg Ala
275 280 285
Lys Ala Pro Lys Ser Gly Thr Tyr Asp Ala Asn Ile Asn Ile Ala Asp
290 295 300
Glu Met Phe Asn Asn Lys Ile Thr Tyr Asn Tyr Ser
305 310 315
<210> 197
<211> 331
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 197
Gly Thr Asn Val Asn Asp Lys Val Thr Ala Ser Asn Phe Lys Leu Glu
1 5 10 15
Lys Thr Thr Phe Asp Pro Asn Gln Ser Gly Asn Thr Phe Met Ala Ala
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Asn Phe Thr Val Thr Asp Lys Val Lys Ser Gly Asp Tyr Phe Thr Ala
35 40 45
Lys Leu Pro Asp Ser Leu Thr Gly Asn Gly Asp Val Asp Tyr Ser Asn
50 55 60
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65 70 75 80
Val Val Ala Lys Ala Thr Tyr Asp Ile Leu Thr Lys Thr Tyr Thr Phe
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Val Phe Thr Asp Tyr Val Asn Asn Lys Glu Asn Ile Asn Gly Gln Phe
100 105 110
Ser Leu Pro Leu Phe Thr Asp Arg Ala Lys Ala Pro Lys Ser Gly Thr
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Thr Tyr Asn Tyr Ser Ser Pro Ile Ala Gly Ile Asp Lys Pro Asn Gly
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Ala Asn Ile Ser Ser Gln Ile Ile Gly Val Asp Thr Ala Ser Gly Gln
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Gly Asn Thr Trp Val Tyr Ile Lys Gly Tyr Gln Asp Lys Ile Glu Glu
195 200 205
Ser Ser Gly Lys Val Ser Ala Thr Asp Thr Lys Leu Arg Ile Phe Glu
210 215 220
Val Asn Asp Thr Ser Lys Leu Ser Asp Ser Tyr Tyr Ala Asp Pro Asn
225 230 235 240
Asp Ser Asn Leu Lys Glu Val Thr Asp Gln Phe Lys Asn Arg Ile Tyr
245 250 255
Tyr Glu His Pro Asn Val Ala Ser Ile Lys Phe Gly Asp Ile Thr Lys
260 265 270
Thr Tyr Val Val Leu Val Glu Gly His Tyr Asp Asn Thr Gly Lys Asn
275 280 285
Leu Lys Thr Gln Val Ile Gln Glu Asn Val Asp Pro Val Thr Asn Arg
290 295 300
Asp Tyr Ser Ile Phe Gly Trp Asn Asn Glu Asn Val Val Arg Tyr Gly
305 310 315 320
Gly Gly Ser Ala Asp Gly Asp Ser Ala Val Asn
325 330
<210> 198
<211> 183
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 198
Ser Ser Pro Ile Ala Gly Ile Asp Lys Pro Asn Gly Ala Asn Ile Ser
1 5 10 15
Ser Gln Ile Ile Gly Val Asp Thr Ala Ser Gly Gln Asn Thr Tyr Lys
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<211> 199
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 199
Pro Asp Tyr Val Val Asn Glu Lys Asn Ser Ile Gly Ser Ala Phe Thr
1 5 10 15
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65 70 75 80
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115 120 125
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130 135 140
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165 170 175
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180 185 190
Gln Glu Leu Gly Glu Lys Gly
195
<210> 200
<211> 104
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 200
Met Ala Ile Val Lys Val Thr Asp Ala Asp Phe Asp Ser Lys Val Glu
1 5 10 15
Ser Gly Val Gln Leu Val Asp Phe Trp Ala Thr Trp Cys Gly Pro Cys
20 25 30
Lys Met Ile Ala Pro Val Leu Glu Glu Leu Ala Ala Asp Tyr Glu Gly
35 40 45
Lys Ala Asp Ile Leu Lys Leu Asp Val Asp Glu Asn Pro Ser Thr Ala
50 55 60
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100
<210> 201
<211> 189
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 201
Met Ser Leu Ile Asn Lys Glu Ile Leu Pro Phe Thr Ala Gln Ala Phe
1 5 10 15
Asp Pro Lys Lys Asp Gln Phe Lys Glu Val Thr Gln Glu Asp Leu Lys
20 25 30
Gly Ser Trp Ser Val Val Cys Phe Tyr Pro Ala Asp Phe Ser Phe Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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145 150 155 160
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<210> 202
<211> 1054
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 202
Ser Glu Gln Ser Asn Asp Thr Thr Gln Ser Ser Lys Asn Asn Ala Ser
1 5 10 15
Ala Asp Ser Glu Lys Asn Asn Met Ile Glu Thr Pro Gln Leu Asn Thr
20 25 30
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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195 200 205
Ser Gly Asp Tyr Phe Thr Ala Lys Leu Pro Asp Ser Leu Thr Gly Asn
210 215 220
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225 230 235 240
Ile Lys Ser Thr Asn Gly Asp Val Val Ala Lys Ala Thr Tyr Asp Ile
245 250 255
Leu Thr Lys Thr Tyr Thr Phe Val Phe Thr Asp Tyr Val Asn Asn Lys
260 265 270
Glu Asn Ile Asn Gly Gln Phe Ser Leu Pro Leu Phe Thr Asp Arg Ala
275 280 285
Lys Ala Pro Lys Ser Gly Thr Tyr Asp Ala Asn Ile Asn Ile Ala Asp
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Glu Met Phe Asn Asn Lys Ile Thr Tyr Asn Tyr Ser Ser Pro Ile Ala
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Gly Ile Asp Lys Pro Asn Gly Ala Asn Ile Ser Ser Gln Ile Ile Gly
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Val Asp Thr Ala Ser Gly Gln Asn Thr Tyr Lys Gln Thr Val Phe Val
340 345 350
Asn Pro Lys Gln Arg Val Leu Gly Asn Thr Trp Val Tyr Ile Lys Gly
355 360 365
Tyr Gln Asp Lys Ile Glu Glu Ser Ser Gly Lys Val Ser Ala Thr Asp
370 375 380
Thr Lys Leu Arg Ile Phe Glu Val Asn Asp Thr Ser Lys Leu Ser Asp
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Lys Phe Gly Asp Ile Thr Lys Thr Tyr Val Val Leu Val Glu Gly His
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500 505 510
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 203
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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325 330 335
Ser Lys Leu Gly Asn Ile Val Pro Glu Tyr Lys Glu Ile Asn Asn Arg
340 345 350
Val Asn Val Ala Thr Asn Asn Pro Ala Ser Gln Gln Val Asp Lys His
355 360 365
Phe Val Ala Lys Gly Pro Glu Val Asn Arg Phe Ile Thr Gln Asn Lys
370 375 380
Val Asn His His Phe Ile Thr Thr Gln Thr His Tyr Lys Lys Val Ile
385 390 395 400
Thr Ser Tyr Lys Ser Thr His Val His Lys His Val Asn His Ala Lys
405 410 415
Asp Ser Ile Asn Lys His Phe Ile Val Lys Pro Ser Glu Ser Pro Arg
420 425 430
Tyr Thr His Pro Ser Gln Ser Leu Ile Ile Lys His His Phe Ala Val
435 440 445
Pro Gly Tyr His Ala His Lys Phe Val Thr Pro Gly His Ala Ser Ile
450 455 460
Lys Ile Asn His Phe Cys Val Val Pro Gln Ile Asn Ser Phe Lys Val
465 470 475 480
Ile Pro Pro Tyr Gly His Asn Ser His Arg Met His Val Pro Ser Phe
485 490 495
Gln Asn Asn Thr Thr Ala Thr His Gln Asn Ala Lys Val Asn Lys Ala
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Tyr Asp Tyr Lys Tyr Phe Tyr Ser Tyr Lys Val Val Lys Gly Val Lys
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Lys Tyr Phe Ser Phe Ser Gln Ser Asn Gly Tyr Lys Ile Gly Lys Pro
530 535 540
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545 550 555 560
Ser Pro Thr His Tyr Val Pro Glu Phe Lys Gly Ser Leu Pro Ala Pro
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Arg Val
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 209
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Leu Ser Asn Asn Phe Gly Leu Gln
245
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 210
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1 5 10 15
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195 200 205
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225 230 235 240
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 219
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<213> Staphylococcus aureus
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Gly Gly Leu Lys Lys Leu Gly Ala Asn Ile Val Ala Val Asn Gln Gln
195 200 205
Val Asp Gln Ser Lys Val Leu Lys Asp Lys Phe Lys Gly Val Thr Lys
210 215 220
Ile Gly Asp Gly Asp Val Glu Lys Val Ala Lys Glu Lys Pro Asp Leu
225 230 235 240
Ile Ile Val Tyr Ser Thr Asp Lys Asp Ile Lys Lys Tyr Gln Lys Val
245 250 255
Ala Pro Thr Val Val Val Asp Tyr Asn Lys His Lys Tyr Leu Glu Gln
260 265 270
Gln Glu Met Leu Gly Lys Ile Val Gly Lys Glu Asp Lys Val Lys Ala
275 280 285
Trp Lys Lys Asp Trp Glu Glu Thr Thr Ala Lys Asp Gly Lys Glu Ile
290 295 300
Lys Lys Ala Ile Gly Gln Asp Ala Thr Val Ser Leu Phe Asp Glu Phe
305 310 315 320
Asp Lys Lys Leu Tyr Thr Tyr Gly Asp Asn Trp Gly Arg Gly Gly Glu
325 330 335
Val Leu Tyr Gln Ala Phe Gly Leu Lys Met Gln Pro Glu Gln Gln Lys
340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
Glu Gly His Ile Val Lys Val Asp Ala Gly Thr Tyr Trp Tyr Asn Asp
405 410 415
Pro Tyr Thr Leu Asp Phe Met Arg Lys Asp Leu Lys Glu Lys Leu Ile
420 425 430
Lys Ala Ala Lys
435
<210> 222
<211> 584
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 222
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1 5 10 15
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20 25 30
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50 55 60
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85 90 95
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130 135 140
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Thr Asp Lys Lys Val Gly Trp Lys Val Ile Phe Asn Asn Met Val Asn
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Gln Asn Trp Gly Pro Tyr Asp Arg Asp Ser Trp Asn Pro Val Tyr Gly
180 185 190
Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp
195 200 205
Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser Ser Gly Phe
210 215 220
Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys Ala Ser Lys
225 230 235 240
Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr
245 250 255
Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp
260 265 270
Lys Trp Ile Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp Trp Glu Lys
275 280 285
Glu Glu Met Thr Asn Ala Ser Gly Gly Gly Ser Cys Gly Asn Gln Gly
290 295 300
Glu Lys Asn Asn Lys Ala Glu Thr Lys Ser Tyr Lys Met Asp Asp Gly
305 310 315 320
Lys Thr Val Asp Ile Pro Lys Asp Pro Lys Arg Ile Ala Val Val Ala
325 330 335
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340 345 350
Val Asn Gln Gln Val Asp Gln Ser Lys Val Leu Lys Asp Lys Phe Lys
355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
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405 410 415
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435 440 445
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Glu Lys Leu Ile Lys Ala Ala Lys
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 223
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100 105 110
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 224
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275 280 285
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325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
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420 425 430
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435 440 445
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450 455 460
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485 490 495
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<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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1
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Hexahistidine tag
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<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Poly-glycine linker
<400> 227
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
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<211> 23
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<213> Staphylococcus aureus
<400> 229
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1 5 10 15
Pro His Val His Phe Gln Arg
20
<210> 230
<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> tetrapeptide fragment of SEQ ID NO: 172
<400> 230
Gly Ser Gly Ser
1
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<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 231
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1 5 10 15
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65 70 75 80
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100 105 110
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130 135 140
Thr Leu Lys Tyr Val Gln Pro Asp Phe Lys Thr Ile Leu Glu Ser Pro
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165 170 175
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Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys Ala Ala Asp
195 200 205
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Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg Asp Asp Tyr
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Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn Thr Lys Asp
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275 280 285
Glu Glu Met Thr Asn
290
<210> 232
<211> 296
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 232
Met Ala Ser Ala Asp Ser Asp Ile Asn Ile Lys Thr Gly Thr Thr Asp
1 5 10 15
Ile Gly Ser Asn Thr Thr Val Lys Thr Gly Asp Leu Val Thr Tyr Asp
20 25 30
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50 55 60
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65 70 75 80
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Gly Asp Asp Thr Gly Lys Ile Gly Gly Leu Ile Gly Ala Asn Val Ser
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165 170 175
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Val Tyr Gly Asn Gln Leu Phe Met Lys Thr Arg Asn Gly Ser Met Lys
195 200 205
Ala Ala Asp Asn Phe Leu Asp Pro Asn Lys Ala Ser Ser Leu Leu Ser
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Ser Gly Phe Ser Pro Asp Phe Ala Thr Val Ile Thr Met Asp Arg Lys
225 230 235 240
Ala Ser Lys Gln Gln Thr Asn Ile Asp Val Ile Tyr Glu Arg Val Arg
245 250 255
Asp Asp Tyr Gln Leu His Trp Thr Ser Thr Asn Trp Lys Gly Thr Asn
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Thr Lys Asp Lys Trp Ile Asp Arg Ser Ser Glu Arg Tyr Lys Ile Asp
275 280 285
Trp Glu Lys Glu Glu Met Thr Asn
290 295
<210> 233
<211> 888
<212> DNA
<213> Staphylococcus aureus
<400> 233
atggctagcg cagattctga tattaatatt aaaaccggta ctacagatat tggaagcaat 60
actacagtaa aaacaggtga tttagtcact tatgataaag aaaatggcat gttaaaaaaa 120
gtattttata gttttatcga tgataaaaat cataataaaa aactgctagt tattagaacg 180
aaaggtacca ttgctggtca atatagagtt tatagcgaag aaggtgctaa caaaagtggt 240
ttagcctggc cttcagcctt taaggtacag ttgcaactac ctgataatga agtagctcaa 300
atatctgatt actatccaag aaattcgatt gatacaaaag agtatatgag tactttaact 360
tatggattca acggtaatgt tactggtgat gatacaggaa aaattggcgg ccttattggt 420
gcaaatgttt cgattggtca tacactgaaa tatgttcaac ctgatttcaa aacaatttta 480
gagagcccaa ctgataaaaa agtaggctgg aaagtgatat ttaacaatat ggtgaatcaa 540
aattggggac catatgatag agattcttgg aacccggtat atggcaatca acttttcatg 600
aaaactagaa atggctctat gaaagcagca gataacttcc ttgatcctaa caaagcaagt 660
tctctattat cttcagggtt ttcaccagac ttcgctacag ttattactat ggatagaaaa 720
gcatccaaac aacaaacaaa tatagatgta atatacgaac gagttcgtga tgactaccaa 780
ttgcactgga cttcaacaaa ttggaaaggt accaatacta aagataaatg gatagatcgt 840
tcttcagaaa gatataaaat cgattgggaa aaagaagaaa tgacaaat 888
<210> 234
<211> 306
<212> PRT
<213> Staphylococcus epidermidis
<400> 234
Met Lys Lys Leu Leu Leu Pro Leu Ile Ala Leu Ile Leu Val Leu Ala
1 5 10 15
Ala Cys Gly Asn Asn Ser Asp Ser Gly Ser Lys Asp Ser Asp Lys Lys
20 25 30
Ala Glu Thr Lys Ser Tyr Lys Thr Asp Asp Gly Lys Thr Ile Lys Val
35 40 45
Pro Lys Asn Pro Lys Arg Ile Ala Val Val Ala Pro Ser Tyr Ala Gly
50 55 60
Gly Ile Lys Lys Leu Gly Gly Asn Val Val Ala Val Ser Asn Gln Val
65 70 75 80
Asp Gln Ser Ser Ile Leu Lys Asp Lys Phe Lys Gly Val Thr Lys Val
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Gly Asp Asp Asp Val Glu Lys Val Ala Lys Gln Lys Pro Asp Leu Ile
100 105 110
Ile Val Leu Asp Gln Asn Lys Asn Ile Lys Lys Tyr Lys Lys Ile Ala
115 120 125
Ala Thr Val Pro Phe Asn Tyr Gln Lys His Lys Tyr Leu Glu Gln Gln
130 135 140
Glu Glu Leu Gly Lys Leu Leu Gly Lys Glu Asp Glu Val Lys Lys Trp
145 150 155 160
Glu Lys Gln Trp Lys Asp Gln Thr Ala Lys Asp Gly Lys Glu Ile Lys
165 170 175
Asn Lys Ile Gly Ala Asp Ser Thr Val Ser Ile Phe Asp Glu Phe Asp
180 185 190
Lys Lys Leu Tyr Thr Tyr Gly Asp Asn Trp Gly Arg Gly Gly Glu Val
195 200 205
Leu Tyr Gln Ala Phe Gly Leu Lys Met Ser Lys Gly Gln His Asp Leu
210 215 220
Thr Lys Lys Ala Gly Trp Ala Glu Val Asn Gln Glu Gln Ile Glu Lys
225 230 235 240
Val Ala Gly Asp Tyr Ile Val Ser Thr Ser Ala Gly Lys Ser Thr Pro
245 250 255
Gly Tyr Glu Lys Thr Asn Ile Trp Lys Asn Leu Pro Ala Val Lys Lys
260 265 270
Gly His Val Ile Lys Val Lys Ala Glu Thr Phe Trp Tyr Asn Asp Pro
275 280 285
Tyr Thr Leu Asp Phe Met Arg Lys Asp Leu Lys Lys Lys Leu Met Asp
290 295 300
Ala Lys
305
<210> 235
<211> 253
<212> PRT
<213> Staphylococcus epidermidis
<400> 235
Met Arg Tyr Leu Lys Lys Val Thr Ile Tyr Ile Ser Leu Leu Ile Leu
1 5 10 15
Val Ser Gly Cys Gly Asn Gly Lys Glu Thr Glu Ile Lys Gln Asn Phe
20 25 30
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Thr Trp Ile Val Gly Ser Thr Met Thr Ile Glu Pro Lys Gly Lys Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
Thr Lys Gly Tyr Tyr Tyr Val Arg Lys Thr Thr Asp Asp Ser Lys Gly
100 105 110
Arg Leu Lys Asp Asp Glu Lys Arg Tyr Pro Val Lys Met Glu His Asn
115 120 125
Lys Ile Ile Pro Thr Lys Pro Ile Pro Asn Asp Lys Leu Lys Lys Glu
130 135 140
Ile Glu Asn Phe Lys Phe Phe Val Gln Tyr Gly Asp Phe Lys Asn Leu
145 150 155 160
Lys Asp Tyr Lys Asp Gly Asp Ile Ser Tyr Asn Pro Asn Val Pro Ser
165 170 175
Tyr Ser Ala Lys Tyr Gln Leu Ser Asn Asn Asp Tyr Asn Val Lys Gln
180 185 190
Leu Arg Lys Arg Tyr Asp Ile Pro Thr Asn Gln Ala Pro Lys Leu Leu
195 200 205
Leu Lys Gly Asp Gly Asp Leu Lys Gly Ser Ser Ile Gly Ser Lys Ser
210 215 220
Leu Glu Phe Thr Phe Ile Glu Asn Lys Glu Glu Asn Ile Phe Phe Ser
225 230 235 240
Asp Gly Val Gln Phe Thr Pro Ser Glu Asp Ser Glu Ser
245 250
<210> 236
<211> 531
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 236
Val Gly Asn Val Thr Val Thr Val Phe Asp Asn Asn Thr Asn Thr Lys
1 5 10 15
Val Gly Glu Ala Val Thr Lys Glu Asp Gly Ser Tyr Leu Ile Pro Asn
20 25 30
Leu Pro Asn Gly Asp Tyr Arg Val Glu Phe Ser Asn Leu Pro Lys Gly
35 40 45
Tyr Glu Val Thr Pro Ser Lys Gln Gly Asn Asn Glu Glu Leu Asp Ser
50 55 60
Asn Gly Leu Ser Ser Val Ile Thr Val Asn Gly Lys Asp Asn Leu Ser
65 70 75 80
Ala Asp Leu Gly Ile Tyr Lys Pro Lys Tyr Asn Leu Gly Asp Tyr Val
85 90 95
Trp Glu Asp Thr Asn Lys Asn Gly Ile Gln Asp Gln Asp Glu Lys Gly
100 105 110
Ile Ser Gly Val Thr Val Thr Leu Lys Asp Glu Asn Gly Asn Val Leu
115 120 125
Lys Thr Val Thr Thr Asp Ala Asp Gly Lys Tyr Lys Phe Thr Asp Leu
130 135 140
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145 150 155 160
Pro Thr Thr Val Thr Ser Gly Ser Asp Ile Glu Lys Asp Ser Asn Gly
165 170 175
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180 185 190
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195 200 205
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225 230 235 240
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245 250 255
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260 265 270
Thr Gln Val Gly Ser Gly Thr Asp Glu Gly Ile Asp Ser Asn Gly Thr
275 280 285
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290 295 300
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305 310 315 320
Thr Asn Lys Asn Gly Val Gln Asp Lys Asp Glu Lys Gly Ile Ser Gly
325 330 335
Val Thr Val Thr Leu Lys Asp Glu Asn Asp Lys Val Leu Lys Thr Val
340 345 350
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355 360 365
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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<213> Staphylococcus aureus
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Gly Gly Lys Val Asp Gln Ala Lys Gln Leu Ala Ala Lys Thr Ala Lys
115 120 125
Asp Ile Glu Ala Cys Gln Lys Gln Thr Gln Gln Leu Ala Glu Tyr Ile
130 135 140
Glu Gly Ser Asp Trp Glu Gly Gln Phe Ala Asn Lys Val Lys Asp Val
145 150 155 160
Leu Leu Ile Met Ala Lys Phe Gln Glu Glu Leu Val Gln Pro Met Ala
165 170 175
Asp His Gln Lys Ala Ile Asp Asn Leu Ser Gln Asn Leu Ala Lys Tyr
180 185 190
Asp Thr Leu Ser Ile Lys Gln Gly Leu Asp Arg Val Asn Pro
195 200 205
Claims (20)
- 항원들의 조합을 포함하는 면역원성 조성물로서, 상기 조합이 하기 (1) 내지 (164)로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의 항원을 포함하는 면역원성 조성물: (1) staOO6 항원; (2) staO11 항원; (3) esxA 항원; (4) esxB 항원; (5) hla 항원; (6) ebpS 항원; (7) efb 항원; (8) emp 항원; (9) esaC 항원; (10) coA 항원; (11) eap 항원; (12) FnBA 항원; (13) FnBB 항원; (14) ebhA 항원; (15) hlgB 항원; (16) hlgC 항원; (17) isdA 항원; (18) isdB 항원; (19) isdC 항원; (20) isdG 항원; (21) isdH 항원; (22) isdI 항원; (23) lukD 항원; (24) lukE 항원; (25) lukF 항원; (26) lukS 항원; (27) nuc 항원; (28) sasA 항원; (29) sasB 항원; (30) sasC 항원; (31) sasD 항원; (32) sasF 항원; (33) sdrC 항원; (34) sdrD 항원; (35) sdrE2 항원; (36) spa 항원; (37) clfA 항원; (38) clfB 항원; (39) sta001 항원; (40) sta002 항원; (41) sta003 항원; (42) sta004 항원; (43) sta005 항원; (44) sta007 항원; (45) sta008 항원; (46) sta009 항원; (47) sta010 항원; (48) sta012 항원; (49) sta013 항원; (50) sta014 항원; (51) sta015 항원; (52) sta016 항원; (53) sta017 항원; (54) sta018 항원; (55) sta019 항원; (56) sta020 항원; (57) sta021 항원; (58) sta022 항원; (59) sta023 항원; (60) sta024 항원; (61) sta025 항원; (62) sta026 항원; (63) sta027 항원; (64) sta028 항원; (65) sta029 항원; (66) sta030 항원; (67) sta031 항원; (68) sta032 항원; (69) sta033 항원; (70) sta034 항원; (71) sta035 항원; (72) sta036 항원; (73) sta037 항원; (74) sta038 항원; (75) sta039 항원; (76) sta040 항원; (77) sta041 항원; (78) sta042 항원; (79) sta043 항원; (80) sta044 항원; (81) sta045 항원; (82) sta046 항원; (83) sta047 항원; (84) sta048 항원; (85) sta049 항원; (86) sta050 항원; (87) sta051 항원; (88) sta052 항원; (89) sta053 항원; (90) sta054 항원; (91) sta055 항원; (92) sta056 항원; (93) sta057 항원; (94) sta058 항원; (95) sta059 항원; (96) sta060 항원; (97) sta061 항원; (98) sta062 항원; (99) sta063 항원; (100) sta064 항원; (101) sta065 항원; (102) sta066 항원; (103) sta067 항원; (104) sta068 항원; (105) sta069 항원; (106) sta070 항원; (107) sta071 항원; (108) sta072 항원; (109) sta073 항원; (110) sta074 항원; (111) sta075 항원; (112) sta076 항원; (113) sta077 항원; (114) sta078 항원; (115) sta079 항원; (116) sta080 항원; (117) sta082 항원; (118) sta083 항원; (119) sta084 항원; (120) sta085 항원; (121) sta086 항원; (122) sta087 항원; (123) sta088 항원; (124) sta089 항원; (125) sta090 항원; (126) sta091 항원; (127) sta092 항원; (128) sta093 항원; (129) sta094 항원; (130) sta095 항원; (131) sta096 항원; (132) sta097 항원; (133) sta098 항원; (134) sta099 항원; (135) sta100 항원; (136) sta101 항원; (137) sta102 항원; (138) sta103 항원; (139) sta104 항원; (140) sta105 항원; (141) sta106 항원; (142) sta107 항원; (143) sta108 항원; (144) sta109 항원; (145) sta11O 항원; (146) sta111 항원; (147) sta112 항원; (148) sta113 항원; (149) sta114 항원; (150) sta115 항원; (151) sta116 항원; (152) sta117 항원; (153) sta118 항원; (154) sta119 항원; (155) sta120 항원; (156) NW_6 항원; (157) NW_9 항원; (158) NW_1O 항원; (159) NW_7 항원; (160) NW_8 항원; (161) NW_2 항원; (162) NW_1 항원; (163) staO81 항원; 및 (164) NW_5 항원.
- 제 1 항에 있어서, (3)번 내지 (38)번에서 선택된 1개 이상의 항원과 (1)번, (2)번 및 (37)번 내지 (149)번에서 선택된 1개 이상의 항원을 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 2 항에 있어서, (37)번, (38)번, (8)번, (9)번, (3)번, (4)번, (5)번, (17)번, (18)번, (19)번, (31)번, (32)번, (33)번, (34)번, (35)번 및 (36)번에서 선택된 1개 이상의 항원과 (40)번, (1)번, (43)번, (2)번, (64)번, (96)번, (133)번 및 (147)번에서 선택된 1개 이상의 항원을 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 1 항에 있어서, (1) clfA 항원; (2) clfB 항원; (3) sdrE2 항원; (4) sdrC 항원; (5) SasF 항원; (6) emp 항원; (7) sdrD 항원; (8) spa 항원; (9) esaC 항원; (10) esxA 항원; (11) esxB 항원; (12) sta006 항원; (13) isdC 항원; (14) hla 항원; (15) sta011 항원; (16) isdA 항원; (17) isdB 항원; (18) sasF 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의 항원을 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 1 항에 있어서, (1) esxA 항원; (2) esxB 항원; (3) sta006 항원; (4) hla 항원; (5) sta011 항원으로 구성되는 그룹으로부터 선택된 둘 이상의 항원인 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항원들 중 하나 이상이 수산화 알루미늄 애쥬번트에 흡착되고, 선택적으로 조성물은 히스티딘 버퍼를 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, (i) S. aureus 엑소폴리사카라이드와 (ii) 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 있어서, (i) S. aureus 캡슐형 다당과 (ii) 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- 식 NH2-A-{-X-L-}n-B-COOH의 폴리펩티드, 여기서
X는 S. aureus 항원들인 sta006, sta011, esxA, esxB, hla, clfA, clfB, coA, eap, ebhA, ebpS, efb, emp, esaC, FnBA, FnBB, hlgB, hlgC, isdA, isdB, isdC, isdG, isdH, isdI, lukD, lukE, lukF, lukS, nuc, sasA, sasB, sasC, sasD, sasF, sdrC, sdrD, sdrE2, spa, sta001, sta002, sta003, sta004, sta005, sta007, sta008, sta009, sta010, sta012, sta013, sta014, sta015, sta016, sta017, sta018, sta019, sta020, sta021, sta022, sta023, sta024, sta025, sta026, sta027, sta028, sta029, sta030, sta031, sta032, sta033, sta034, sta035, sta036, sta037, sta038, sta039, sta040, sta041, sta042, sta043, sta044, sta045, sta046, sta047, sta048, sta049, sta050, sta051, sta052, sta053, sta054, sta055, sta056, sta057, sta058, sta059, sta060, sta061, sta062, sta063, sta064, sta065, sta066, sta067, sta068, sta069, sta070, sta071, sta072, sta073, sta074, sta075, sta076, sta077, sta078, sta079, sta080, sta081, sta082, sta083, sta084, sta085, sta086, sta087, sta088, sta089, sta090, sta091, sta092, sta093, sta094, sta095, sta096, sta097, sta098, sta099, sta100, sta101, sta102, sta103, sta104, sta105, sta106, sta107, sta108, sta109, sta110, sta111, sta112, sta113, sta114, sta115, sta116, sta117, sta118, NW_6, NW_9, NW_10, NW_7, NW_8, NW_2, NW_1, 및 NW_5로 구성되는 그룹으로부터 선택된 포도상구균(staphylococcus) 항원의 아미노산 서열이고;
L은 선택적 링커 아미노산 서열이고;
A는 선택적 N-말단 아미노산 서열이고;
B는 선택적 C-말단 아미노산 서열이고;
n은 2 이상의 정수이다. - 제 9 항의 폴리펩티드를 포함하고,
(A) (i) S. aureus 엑소폴리사카라이드와 (ii) 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트; 및/또는
(B) (i) S. aureus 캡슐형 다당과 (ii) 캐리어 단백질의 하나 이상의 콘쥬게이트를 더 포함하는 면역원성 조성물. - 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, clfA 항원은 SEQ ID NO:1을 인식하는 항체를 도출할 수 있고, (a) SEQ ID NO:1과 80% 이상의 동일성을 갖고; 및/또는 SEQ ID NO: 1의 7개 이상의 연속 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함하며, 단편은 SEQ ID NO: 1의 에피토프를 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물 또는 폴리펩티드.
- (a) SEQ ID NO: 151과 80% 이상의 동일성을 갖고; 및/또는 (b) SEQ ID NO: 151의 아미노산 1-97로부터의 7개 이상의 연속 아미노산과 SEQ ID NO:151의 아미노산 104-207로부터의 7개 이상의 아미노산의 단편을 포함하는 아미노산 서열을 포함하고, SEQ ID NO:10을 포함하는 야생형 포도상구균 단백질과 SEQ ID NO: 11을 포함하는 야생형 포도상구균 단백질을 모두 인식하는 항체를 도출할 수 있는 폴리펩티드.
- 제 12 항의 폴리펩티드와 (i) sta006 항원; (ii) hla 항원; 및/또는 (iii) sta011 항원 중 하나 이상을 포함하는 면역원성 조성물.
- 제 13 항에 있어서, 애쥬번트를 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
- SEQ ID NO: 151, 152, 168, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 220, 221, 222, 223, 224, 237, 238, 241로부터 선택된 아미노산 서열과 80% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
- SEQ ID NO: 151, 152, 168, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 220, 221, 222, 223, 224, 237, 238, 241, 242, 243, 244, 245로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
- (a) SEQ ID NO: 218과 90% 이상의 동일성을 갖는 제 1 서열; 및
(b) SEQ ID NO: 219와 90% 이상의 동일성을 갖는 제 2 서열을 포함하며,
제 1 서열과 제 2 서열이 직접 연결되거나, 또는 10개 미만의 아미노산을 갖는 개재된 아미노산 서열에 의해 연결된 폴리펩티드. - 제 12 항, 제 15 항, 제 16 항 또는 제 17 항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 포함하는 제약 조성물.
- 제 1 항 내지 제 18 항 중 어느 한 항의 폴리펩티드 또는 조성물의 유효량을 포유동물에게 투여하는 단계를 포함하는, 포유동물에서 면역반응을 일으키는 방법.
- 제 9 항, 제 12 항, 제 15 항, 제 16 항 또는 제 17 항의 폴리펩티드를 암호화하는 핵산.
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