JP2012533558A5 - - Google Patents

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JP2012533558A5
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他の態様では、本発明は、本発明の方法を用いて作製される組成物、例えば、免疫原性組成物を提供する。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
アミノ酸１００〜１５０が配列番号９、配列番号１２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７；配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３、配列番号９１または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられている１つ以上のＲＳウイルスＦ（ＲＳＶ Ｆ）ポリペプチドを含む免疫原性組成物。
（項目２）
前記ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が配列番号１２のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１に記載の免疫原性組成物。
（項目３）
前記ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が、配列番号９、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７；配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１に記載の免疫原性組成物。
（項目４）
アミノ酸１００〜１５０が配列番号９のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１に記載の免疫原性組成物。
（項目５）
前記ＲＳＶ Ｆが単量体、三量体、または単量体と三量体の組合せの形態である、項目１または項目２に記載の免疫原性組成物。
（項目６）
ＲＳＶ Ｆが単量体、三量体、ロゼットまたはその任意の組合せの形態である、項目３または４に記載の免疫原性組成物。
（項目７）
前記ＲＳＶ Ｆポリペプチドが、ＲＳＶ−Ｆエクトドメインを含む可溶性ポリペプチドである、項目１〜６のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。
（項目８）
前記ＲＳＶ Ｆが、配列番号１または配列番号２のアミノ酸２３〜９９および１５１〜５２４を含む、項目１〜６のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。
（項目９）
配列番号４９、配列番号６８、配列番号７１、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７０、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９３、シグナルペプチドおよび／またはＨＩＳタグが削除されている前述のいずれかの配列、ならびにその組合せからなる群より選択されるポリペプチドを含む免疫原性組成物。
（項目１０）
前記ポリペプチドが、シグナルペプチドおよび任意選択でＨＩＳタグが削除されている配列番号６８または配列番号６８である、項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１１）
前記ポリペプチドが、配列番号４９、配列番号７１、ならびにシグナルペプチドおよび任意選択でＨＩＳタグが削除されている前述のいずれかの配列からなる群より選択される、項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１２）
アジュバントをさらに含む、項目１〜１１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。
（項目１３）
前記アジュバントが、アルミニウム塩、水中スクアレン型エマルジョン、ベンゾナフチリジン化合物、リン脂質化合物、小分子免疫増強物質および前述のものの任意の組合せからなる群より選択される、項目１２に記載の免疫原性組成物。
（項目１４）
アミノ酸１００〜１５０が、配列番号９、配列番号１２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３、配列番号９１または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられている、組換えＲＳウイルスＦポリペプチド（ＲＳＶ Ｆ）。
（項目１５）
前記ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が配列番号１２のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１４に記載の組換えＲＳＶ Ｆ。
（項目１６）
前記ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が、配列番号９、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７；配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１５に記載の組換えＲＳＶ Ｆ。
（項目１７）
アミノ酸１００〜１５０が配列番号９のアミノ酸配列で置き換えられている、項目１４に記載の組換えＲＳＶ Ｆ。
（項目１８）
単量体、三量体、または単量体と三量体の組合せの形態である、項目１４または１５に記載の組換えＲＳＶ Ｆ。
（項目１９）
単量体、三量体、三量体のロゼットまたはその組合せの形態である、項目１６または１７に記載の組換えＲＳＶ Ｆ。
（項目２０）
配列番号４９、配列番号６８、配列番号７１、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７０、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９３、シグナルペプチドおよび／またはＨＩＳタグが削除されている前述のいずれかの配列、ならびにその組合せからなる群より選択される組換えポリペプチド。
（項目２１）
異種オリゴマー化ドメイン、エピトープ、またはシグナルペプチドをさらに含む、項目１４〜２０のいずれか１項に記載の組換えポリペプチド。
（項目２２）
前記異種オリゴマー化ドメインが、インフルエンザ血球凝集素由来の三量体化ドメイン、ＳＡＲＳスパイク由来の三量体化ドメイン、またはＨＩＶ ｇｐ４１、ＮａｄＡ、修飾ＧＣＮ４もしくはＡＴＣａｓｅ由来の三量体化ドメインを含む群から選択される、項目２１に記載の組換えポリペプチド。
（項目２３）
項目１４〜２１のいずれかに記載のポリペプチドをコードする単離された核酸。
（項目２４）
自己複製ＲＮＡ分子である、項目２３に記載の単離された核酸。
（項目２５）
項目２４に記載の自己複製ＲＮＡ分子を含む免疫原性組成物。
（項目２６）
送達系をさらに含む、項目２５に記載の免疫原性組成物。
（項目２７）
項目１〜１４のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を被験体に投与する工程を含む、被験体においてＲＳＶ Ｆに対する免疫応答を誘導する方法。
（項目２８）
項目２５に記載の免疫原性組成物を被験体に投与する工程を含む、被験体においてＲＳＶ Ｆに対する免疫応答を誘導する方法。
（項目２９）
切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）切断されるとＦ １ およびＦ ２ サブユニットが生成されるプロテアーゼ切断部位を含む非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを準備する工程であって、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は、改変型フリン切断部位を１０６〜１０９位および１３３〜１３６位に含み、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ポリペプチドを非切断型で産生する細胞から得られる、工程；ならびに
ｂ）準備した該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、該プロテアーゼ切断部位で切断するプロテアーゼで切断し、それにより、切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を生成させる工程
を含む、方法。
（項目３０）
工程ｂ）において、準備した前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、１０１位付近〜１６１位付近の１つ以上の位置で切断する、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
準備した前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、１０６位付近〜１４２位付近の１つ以上の位置で切断する、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを精製する、項目２９〜３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３３）
ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドがインタクトな融合ペプチドを含むものである、項目２９〜３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３４）
工程ｂ）での切断により、三量体のロゼットの形成がもたらされる、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
ｃ）前記三量体のロゼットを精製する工程をさらに含む、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記三量体のロゼットの精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが改変型融合ペプチドを含むものである、項目２９〜３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３８）
前記融合ペプチドの少なくとも一部分が、前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドにおいて欠失している、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
アミノ酸１３７〜１５３、アミノ酸１３７〜１４６、アミノ酸１３７〜１４５、またはアミノ酸１３７〜１４２が前記融合ペプチドから欠失している、項目３７に記載の方法。
（項目４０）
工程ｂ）での切断により、三量体の形成がもたらされる、項目３７〜３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目４１）
ｃ）前記三量体を精製する工程をさらに含む、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
前記三量体の精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞、哺乳動物細胞、鳥類細胞、酵母細胞、テトラヒメナ細胞またはその組合せにおいて発現させる、項目２９〜４２のいずれか１項に記載の方法。
（項目４４）
ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを細胞馴化培養培地中で準備する、項目２９〜４３に記載の方法。
（項目４５）
前記細胞馴化培養培地が、昆虫細胞馴化培養培地、哺乳動物細胞馴化培養培地およびその組合せからなる群より選択される、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記三量体のロゼットが、ＦｕｒｄｅｌおよびＤｅｌｐ２３ ｆｕｒｄｅｌからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドのＦ １ およびＦ ２ 断片を含む、項目２９〜３６および４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目４７）
前記切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドに実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目２９〜４６のいずれか１項に記載の方法。
（項目４８）
項目２９〜４７のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物。
（項目４９）
免疫原性組成物である、項目４８に記載の組成物。
（項目５０）
非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は改変型フリン切断部位を１０６〜１０９位および１３３〜１３６位に含み、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは該ポリペプチドを非切断型で産生する細胞から分泌される、工程；ならびに
ｂ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体または三量体を該生物学的材料から精製し、それにより該組成物を生成させる工程
を含む、方法。
（項目５１）
前記生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する、項目５０または５１に記載の方法。
（項目５３）
ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体を精製する、項目５０または５１に記載の方法。
（項目５４）
ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目５０に記載の方法。
（項目５５）
前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、改変型融合ペプチドをさらに含むものである、項目５０〜５４のいずれか１項に記載の方法。
（項目５６）
前記可溶性の非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、ｆｕｒｍｔ、ｆｕｒｄｅｌ、Ｄｅｌｐ２１ ｆｕｒｘ、Ｄｅｌｐ２３ ｆｕｒｘ、Ｄｅｌｐ２１
ｆｕｒｄｅｌ、Ｄｅｌｐ２３ ｆｕｒｄｅｌ、および第Ｘａ因子構築物からなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドを含む、項目５０に記載の方法。
（項目５７）
非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む前記組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目５０〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目５８）
項目５０〜５７のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された可溶性の非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体または三量体を含む組成物。
（項目５９）
免疫原性組成物である、項目５８に記載の組成物。
（項目６０）
非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は改変型フリン切断部位を含み、１０１位付近と１６１位付近との間に存在するリジン残基とアルギニン残基は欠失しているか、あるいはリジンもしくはアルギニンではないアミノ酸で置き換えられており、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ポリペプチドを１０１位付近と１６１位付近との間を非切断の状態で産生する宿主細胞から得られ、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは１０１位付近と１６１位付近との間が切断されていない、工程；ならびに
ｂ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを、該生物学的材料から精製する工程
を含む、方法。
（項目６１）
前記生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される、項目６０に記載の方法。
（項目６２）
ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する、項目６０または６１に記載の方法。
（項目６３）
ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体を精製する、項目６０または６１に記載の方法。
（項目６４）
ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体と非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する、項目６０または６１に記載の方法。
（項目６５）
ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目６０〜６４のいずれか１項に記載の方法。
（項目６６）
前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、改変型融合ペプチドをさらに含むものである、項目６０〜６４のいずれか１項に記載の方法。
（項目６７）
前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、Ｆｕｒｘ、Ｆｕｒｘ Ｒ１１３Ｑ Ｋ１２３Ｎ Ｋ１２４Ｎ、Ｄｅｌｐ２１ ｆｕｒｘおよびＤｅｌｐ２３ ｆｕｒｘからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドを含む、項目６０に記載の方法。
（項目６８）
非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む前記組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目６０〜６７のいずれか１項に記載の方法。
（項目６９）
項目６０〜６８のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された可溶性の非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物。
（項目７０）
免疫原性組成物である、項目６９に記載の組成物。
（項目７１）
切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）改変型融合ペプチドを含む切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程；および
ｂ）切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを該生物学的材料から精製する工程
を含む、方法。
（項目７２）
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、アミノ酸１３７〜１５２付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１５３付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１４５付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１４６付近が欠失しているか、またはアミノ酸１３７〜１４２付近が欠失しているアミノ酸配列を含む、項目７１に記載の方法。
（項目７３）
前記生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される、項目７１または７２に記載の方法。
（項目７４）
ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する、項目７１〜７３のいずれか１項に記載の方法。
（項目７５）
ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体を精製する、項目７１〜７３のいずれか１項に記載の方法。
（項目７６）
ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体と切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する、項目７１〜７３のいずれか１項に記載の方法。
（項目７７）
ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目７１〜７３のいずれか１項に記載の方法。
（項目７８）
前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、少なくとも融合ペプチド欠失ポリペプチドを含むものである、項目７１に記載の方法。
（項目７９）
非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む前記組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目７１〜７８のいずれか１項に記載の方法。
（項目８０）
項目７１〜７９のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された可溶性の非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物。
（項目８１）
免疫原性組成物である、項目８０に記載の組成物。
（項目８２）
ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）改変型フリン切断部位を１３３〜１３６位に含むＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを準備する工程であって、該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ペプチドを、１３６／１３７位が切断されていないがＦ １ を含むサブユニットと会合しているＦ ２ 断片の形態で産生する細胞から分泌される、工程；ならびに
ｂ）準備した該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインを１０１位と１６１位との間の部位で切断するプロテアーゼで切断し、それにより該組成物を生成させる工程
を含む、方法。
（項目８３）
ａ）において準備する前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを精製する、項目８２に記載の方法。
（項目８４）
ａ）において準備する前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞、哺乳動物細胞、鳥類細胞、酵母細胞、テトラヒメナ細胞またはその組合せにおいて発現させる、項目８２または８３に記載の方法。
（項目８５）
ａ）において準備する前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、細胞馴化培養培地、細胞抽出物またはその組合せにおいて準備する、項目８２〜８４のいずれか１項に記載の方法。
（項目８６）
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞馴化培養培地、哺乳動物細胞馴化培養培地、鳥類細胞馴化培養培地、酵母細胞馴化培養培地、テトラヒメナ細胞馴化培養培地およびその組合せからなる群より選択される細胞馴化培養培地において準備する、項目８５に記載の方法。
（項目８７）
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが少なくともＣ末端フリンポリペプチドを含む、項目８２〜８６のいずれか１項に記載の方法。
（項目８８）
ｂ）において作製される前記切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドに実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目８２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目８９）
項目８２〜８８のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物。
（項目９０）
免疫原性組成物である、項目８９に記載の組成物。
（項目９１）
ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
ａ）改変型フリン切断部位を１３３〜１３６位に含むＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ペプチドを、１３６／１３７位が切断されていないがＦ １ を含むサブユニットと会合しているＦ ２ 断片の形態で産生する細胞から分泌され、ただし、該改変型フリン切断部位はアミノ酸１３１〜１３４の欠失ではないものとする、工程；ならびに
ｂ）該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを該生物学的材料から精製し、それにより該組成物を生成させる工程
を含む、方法。
（項目９２）
前記生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される、項目９１に記載の方法。
（項目９３）
ｂ）において、ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを精製する、項目９１または９２に記載の方法。
（項目９４）
ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが少なくともＣ末端フリンポリペプチドを含む、項目９１〜９４のいずれか１項に記載の方法。
（項目９６）
ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む前記組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、項目９１〜９５のいずれか１項に記載の方法。
（項目９７）
項目９２〜９６のいずれか１項に記載の方法を用いて作製されたＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物。
（項目９８）
免疫原性組成物である、項目９７に記載の組成物。

Claims (15)

  1. アミノ酸１００〜１５０が、配列番号９、配列番号１２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３、配列番号９１または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられている、組換えＲＳウイルスＦポリペプチド（ＲＳＶ Ｆ）であって、ここで、好ましくは、
    （ａ）該ＲＳＶ Ｆは、単量体、三量体、三量体のロゼットまたはそれらの組合せの形態である；
    （ｂ）アミノ酸１００〜１５０が配列番号９のアミノ酸配列で置き換えられており、ここで好ましくは、該ＲＳＶ Ｆは、単量体、三量体、三量体のロゼットまたはそれらの組合せの形態である；あるいは
    （ｃ）（ｉ）該ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が配列番号１２のアミノ酸配列で置き換えられており；好ましくはここで、該ＲＳＶ Ｆは、単量体、三量体、または単量体と三量体との組合せの形態である；または好ましくは（ｉｉ）該ＲＳＶ Ｆのアミノ酸１００〜１５０が、配列番号９、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７；配列番号８、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１３または配列番号９２のアミノ酸配列で置き換えられており；好ましくはここで、該ＲＳＶ Ｆは、単量体、三量体、または三量体のロゼットまたはそれらの組合せの形態である、
    組換えＲＳウイルスＦポリペプチド。
  2. 配列番号４９、配列番号６８、配列番号７１、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７０、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９３、シグナルペプチドおよび／またはＨＩＳタグが削除されている前述のいずれかの配列、ならびにその組合せからなる群より選択される組換えポリペプチド。
  3. 異種オリゴマー化ドメイン、エピトープ、またはシグナルペプチドをさらに含む、請求項１または請求項２に記載の組換えポリペプチドであって、好ましくはここで、該異種オリゴマー化ドメインが、インフルエンザ血球凝集素由来の三量体化ドメイン、ＳＡＲＳスパイク由来の三量体化ドメイン、またはＨＩＶ ｇｐ４１、ＮａｄＡ、修飾ＧＣＮ４もしくはＡＴＣａｓｅ由来の三量体化ドメインを含む群から選択される、組換えポリペプチド。
  4. 請求項１〜３のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする単離された核酸であって；好ましくはここで、該単離された核酸は、自己複製ＲＮＡ分子である、核酸。
  5. 免疫原性組成物であって、該免疫原性組成物は、
    （ａ）請求項１に記載の１つ以上のＲＳウイルスＦ（ＲＳＶ Ｆ）ポリペプチドであって；好ましくはここで：
    （ｉ）該ＲＳＶ Ｆポリペプチドが、ＲＳＶ−Ｆエクトドメインを含む可溶性ポリペプチドであるか；または
    （ｉｉ）該ＲＳＶ Ｆが、配列番号１もしくは配列番号２のアミノ酸２３〜９９および１５１〜５２４を含む；
    ＲＳＶ Ｆポリペプチド；あるいは
    （ｂ）請求項２に記載のポリペプチドであって；好ましくはここで：
    （ｉ）該ポリペプチドが、配列番号６８であるか、もしくはシグナルペプチドおよび任意選択でＨＩＳタグ、が削除されている配列番号６８であるか、または
    （ｉｉ）該ポリペプチドが、配列番号４９、配列番号７１、ならびにシグナルペプチドおよび任意選択でＨＩＳタグ、が削除されている前述のいずれかの配列からなる群より選択される；
    ポリペプチド；
    を含み、該免疫原性組成物は、アジュバントを任意選択でさらに含み；好ましくはここで、該アジュバントが、アルミニウム塩、水中スクアレン型エマルジョン、ベンゾナフチリジン化合物、リン脂質化合物、小分子免疫増強物質および前述のものの任意の組合せからなる群より選択される、免疫原性組成物。
  6. 請求項４に記載の自己複製ＲＮＡ分子を含む免疫原性組成物であって、好ましくは送達系をさらに含む、免疫原性組成物。
  7. 被験体においてＲＳＶ Ｆに対する免疫応答を誘導するための請求項５または請求項６に記載の免疫原性組成物。
  8. 切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）切断されるとＦ１およびＦ２サブユニットが生成されるプロテアーゼ切断部位を含む非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを準備する工程であって、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は、改変型フリン切断部位を１０６〜１０９位および１３３〜１３６位に含み、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ポリペプチドを非切断型で産生する細胞から得られる、工程；ならびに
    ｂ）準備した該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、該プロテアーゼ切断部位を切断するプロテアーゼで切断し、それにより、切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を生成させる工程
    を含み；
    好ましくはここで、工程ｂ）において、準備した該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、１０１位付近〜１６１位付近の１つ以上の位置で切断し；より好ましくはここで、準備した該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、１０６位付近〜１４２位付近の１つ以上の位置で切断する、方法。
  9. ａ）において準備する前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを精製する；
    および／または
    （ａ）ここで、ａ）において準備する該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドがインタクトな融合ペプチドを含むものであり；好ましくはここで、工程ｂ）での切断により、三量体のロゼットの形成がもたらされ、より好ましくはｃ）該三量体のロゼットを精製する工程をさらに含み；最も好ましくはここで、該三量体のロゼットの精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む；
    および／または
    ここで、該三量体のロゼットが、ＦｕｒｄｅｌおよびＤｅｌｐ２３ ｆｕｒｄｅｌからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドのＦ １ およびＦ ２ 断片を含む；
    あるいは
    （ｂ）ここで、ａ）において準備する該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが改変型融合ペプチドを含むものであり；好ましくはここで、（ｉ）該融合ペプチドの少なくとも一部分が、該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドにおいて欠失しているか、または（ｉｉ）アミノ酸１３７〜１５３、アミノ酸１３７〜１４６、アミノ酸１３７〜１４５、もしくはアミノ酸１３７〜１４２が該融合ペプチドから欠失している；
    および／または
    ここで、工程ｂ）での切断により、三量体の形成がもたらされる；好ましくは、ｃ）該三量体を精製する工程をさらに含み；より好ましくはここで、（ｉ）該三量体の精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む；または（ｉｉ）該三量体のロゼットが、ＦｕｒｄｅｌおよびＤｅｌｐ２３ ｆｕｒｄｅｌからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドのＦ １ およびＦ ２ 断片を含む；
    および／または
    ここで、ａ）において準備する該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞、哺乳動物細胞、鳥類細胞、酵母細胞、テトラヒメナ細胞またはその組合せにおいて発現させる；
    および／または
    ここで、ａ）において準備する該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが細胞馴化培養培地中で準備され；好ましくはここで該細胞馴化培養培地が、昆虫細胞馴化培養培地、哺乳動物細胞馴化培養培地およびその組合せからなる群より選択される；
    および／または
    ここで、該切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドに実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、請求項８に記載の方法。
  10. 非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体との組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は改変型フリン切断部位を１０６〜１０９位および１３３〜１３６位に含み、該非切断型の可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは該ポリペプチドを非切断型で産生する細胞から分泌される、工程；ならびに
    ｂ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体または三量体を該生物学的材料から精製し、それにより該組成物を生成させる工程
    を含み、ここで好ましくは：
    （ｉ）該生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される；
    および／または
    ここで、ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体もしくは単量体を精製する；
    あるいは
    （ｉｉ）ここで、ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む；
    および／または
    ここで、該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、改変型融合ペプチドをさらに含むものである；
    あるいは
    （ｉｉｉ）ここで、該可溶性の非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、ｆｕｒｍｔ、ｆｕｒｄｅｌ、Ｄｅｌｐ２１ ｆｕｒｘ、Ｄｅｌｐ２３ ｆｕｒｘ、Ｄｅｌｐ２１ ｆｕｒｄｅｌ、Ｄｅｌｐ２３ ｆｕｒｄｅｌ、および第Ｘａ因子構築物からなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドを含むか；
    および／または
    ここで、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む該組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、方法。
  11. 非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体との組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドのアミノ酸配列は改変型フリン切断部位を含み、１０１位付近と１６１位付近との間に存在するリジン残基とアルギニン残基は欠失しているか、あるいはリジンもしくはアルギニンではないアミノ酸で置き換えられており、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ポリペプチドを１０１位付近と１６１位付近との間を非切断の状態で産生する宿主細胞から得られ、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは１０１位付近と１６１位付近との間が切断されていない、工程；ならびに
    ｂ）非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体の組合せを、該生物学的材料から精製する工程
    を含み、
    好ましくはここで：
    （Ａ）該生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される；および／または
    （ｉ）ここで、ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する；
    （ｉｉ）ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体を精製する；または
    （ｉｉｉ）ｂ）において、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体と非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する；および／または
    ここで、ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含むか；または該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、改変型融合ペプチドをさらに含むものである；
    あるいは
    （Ｂ）該非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、Ｆｕｒｘ、Ｆｕｒｘ Ｒ１１３Ｑ Ｋ１２３Ｎ Ｋ１２４Ｎ、Ｄｅｌｐ２１ ｆｕｒｘおよびＤｅｌｐ２３ ｆｕｒｘからなる群より選択される少なくとも１つのポリペプチドを含むか；
    および／または
    ここで、非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む該組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、方法。
  12. 切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体または単量体と三量体との組合せを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）改変型融合ペプチドを含む切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程；および
    ｂ）切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを該生物学的材料から精製する工程
    を含み；
    好ましくはここで：
    （Ａ）該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、アミノ酸１３７〜１５２付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１５３付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１４５付近が欠失しているか、アミノ酸１３７〜１４６付近が欠失しているか、またはアミノ酸１３７〜１４２付近が欠失しているアミノ酸配列を含む；
    および／または
    該生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される；
    および／または
    （ｉ）ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する；
    （ｉｉ）ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体を精製する；
    （ｉｉｉ）ｂ）において、切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド単量体と切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド三量体を精製する；または
    （ｉｖ）ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む；
    あるいは
    （Ｂ）前記非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが、少なくとも融合ペプチド欠失ポリペプチドを含むものであるか；
    および／または
    非切断型のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む前記組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、方法。
  13. ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）改変型フリン切断部位を１３３〜１３６位に含むＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを準備する工程であって、該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ペプチドを、１３６／１３７位が切断されていないがＦ１を含むサブユニットと会合しているＦ２断片の形態で産生する細胞から分泌される、工程；ならびに
    ｂ）準備した該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインを１０１位と１６１位との間の部位で切断するプロテアーゼで切断し、それにより該組成物を生成させる工程
    を含み；
    好ましくはここで：
    （ｉ）ａ）において準備する該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを精製する；
    および／または
    （ｉｉ）ａ）において準備する該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞、哺乳動物細胞、鳥類細胞、酵母細胞、テトラヒメナ細胞もしくはその組合せにおいて発現させる；
    および／または
    （ｉｉｉ）ａ）において準備する該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、細胞馴化培養培地、細胞抽出物またはその組合せにおいて準備する；好ましくはここで、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを、昆虫細胞馴化培養培地、哺乳動物細胞馴化培養培地、鳥類細胞馴化培養培地、酵母細胞馴化培養培地、テトラヒメナ細胞馴化培養培地およびその組合せからなる群より選択される細胞馴化培養培地において準備する；
    および／または
    ここで、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが少なくともＣ末端フリンポリペプチドを含む；
    および／または
    ここで、ｂ）において作製される該切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドに実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、方法。
  14. ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む組成物を作製するための方法であって、
    ａ）改変型フリン切断部位を１３３〜１３６位に含むＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む生物学的材料を準備する工程であって、該可溶性のＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドは、該ペプチドを、１３６／１３７位が切断されていないがＦ１を含むサブユニットと会合しているＦ２断片の形態で産生する細胞から分泌され、ただし、該改変型フリン切断部位はアミノ酸１３１〜１３４の欠失ではないものとする、工程；ならびに
    ｂ）該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを該生物学的材料から精製し、それにより該組成物を生成させる工程
    を含み；
    好ましくは、ここで、前記生物学的材料が、昆虫細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、哺乳動物細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、鳥類細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、酵母細胞の馴化培地または細胞溶解物、テトラヒメナ細胞の馴化培養培地または細胞溶解物、およびその組合せからなる群より選択される；
    および／または
    ｂ）において、ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体、三量体もしくは単量体と三量体との組合せを精製する；好ましくは、ｂ）での精製がサイズ排除クロマトグラフィーを含む；
    および／または
    ここで、該ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドが少なくともＣ末端フリンポリペプチドを含む；
    および／または
    ここで、ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドを含む該組成物に実質的に脂質とリポタンパク質が含まれていない、方法。
  15. 組成物であって、
    （ａ）請求項８〜９のいずれか１項に記載の方法を用いて作製された切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド；
    （ｂ）請求項１０に記載の方法を用いて作製された可溶性切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチドの単量体もしくは三量体；
    （ｃ）請求項１１もしくは請求項１２に記載の方法を用いて作製された可溶性の非切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド；
    （ｄ）請求項１３に記載の方法を用いて作製された切断型ＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド；または
    （ｅ）請求項１４に記載の方法を用いて作製されたＲＳＶ Ｆタンパク質のエクトドメインポリペプチド；
    を含む組成物であって、好ましくは、該組成物が免疫原性組成物である、組成物。
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