JP2010187688A - シロ−イノシトールの製造方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液に、該混合液中の溶解シロ−イノシトールの2モル倍以上のホウ酸及び金属塩を加え、かつ該混合液のpHを8.0〜11.0に調整することにより、シロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成させ、前記複合体を混合液から分離し、分離した複合体を酸に溶解して酸性溶液又は酸性懸濁液を調製し、イオン交換樹脂等を用いた精製法又は水溶性有機溶媒を用いた析出法によって該酸性溶液又は酸性懸濁液からシロ−イノシトールを精製する。
【選択図】 なし
Description
本発明はまた、新規なNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ及びその製造方法に関する。本発明はまた、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標としたシロ−イノソース製造用微生物のスクリーニング方法に関する。本発明はさらに、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ又は該酵素の高活性株を用いたシロ−イノソース及びシロ−イノシトールの製造方法に関する。
本発明はまた、新規酵素シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ及び、当該酵素を利用したシロ−イノシトールの製造方法に関する。更に詳しくは、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する新規酵素シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ及び、当該酵素を利用したシロ−イノシトールの製造方法に関する。
本発明はさらに、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液から、シロ−イノシトールを効率良く製造する方法に関する。
シロ−イノシトールはアルツハイマー病の治療薬や、生理活性物質の合成原料、液晶化合物の合成原料として利用することができる。
一方、アセトバクター属細菌(非特許文献5参照)は、ミオ−イノシトールに作用して、酸素を吸収し、シロ−イノソースへ酸化することが知られているが、詳細なメカニズムは検討されていない。
ールを晶析によって得るという操作が必要であった。そのため、このような方法は多くの操作を要し、シロ−イノシトールの収率という点で改善の余地があった。このような状況のもと、シロ−イノシトールを簡便に効率よく製造するために、シロ−イノソースの還元等によって得られるシロ−イノシトールとミオ−イノシトールの混合物から精製シロ−イノシトールを製造する方法の開発が望まれていた。
本発明はまた、ミオ−イノシトールをシロ−イノソースに変換する反応を触媒する新規な酵素、及びそれを用いたシロ−イノソース及びシロ−イノシトールの新規な製造方法を提供することを課題とする。
本発明はまた、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する新規酵素シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ、及び、当該酵素を利用したシロ−イノシトールの新規な製造方法を提供することを課題とする。
本発明はさらに、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液から、高純度のシロ−イノシトールを効率よく製造する新しい方法を提供することを課題とする。
さらに、AB10253株よりも低い変換能力であるが、ミオ−イノシトールからシロ−イノシトールを生成する能力を有する菌株を自然界から見出し、16SrRNAの塩基配列による同定を試みたところ、アセトバクター・セルビシエ、アセトバクター・マローラム、または、バークホルデリア・アンドロポゴニスに属する微生物が見出された。
これらの微生物を用いることにより、シロ−イノシトールを効率よく製造できることを見出した。
そこで、本発明者らは、ミオ−イノシトールからシロ−イノソースへ変換する反応を触媒することのできる、従来知られていない新しいタイプのNAD+非依存型のミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼがあるという仮説のもと、該酵素を単離すべく、鋭意研究した。その結果、アセトバクター属に属するアセトバクター・エスピーAB10253株においてNAD+非依存型のミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼが存在することを見出した。さらに、本発明者らは、この酵素、又はこの酵素の活性の高い微生物を使用することにより、シロ−イノソースを効率よく製造することができること、及び得られたシロ−イノソースを還元することによって高純度のシロ−イノシトールを効率よく製造することに成功した。
び金属イオンからなるシロ−イノシトール・ホウ酸複合体は、特異な結合を有し、他の中性糖の複合体には見られない溶解度の低い複合体であることを見出した。さらに、混合液中の溶解シロ−イノシトールに対して、2倍モル以上、好ましくは2〜3倍モルのホウ酸と金属塩を加え、かつ、溶液をpH8.0〜11.0、好ましくはpH9.0〜10.0のアルカリ性に保つことにより、シロ−イノシトール・ホウ酸複合体が効率良く形成し、沈殿することを見出した。このような条件の下で、シロ−イノシトール、及びミオ−イノシトールなどの中性糖を含有する混合液からシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成させ、該複合体を酸に溶解させた後、イオン交換樹脂や水溶性有機溶媒などを用いて精製することにより、シロ−イノシトールを効率よく製造することに成功した。
以上によって、本発明を完成させるに至った。
(1) アセトバクター属またはバークホルデリア属に属する微生物であって、ミオ−イノシトールをシロ−イノシトールに変換する能力を有する微生物を、ミオ−イノシトールを含む溶液中でミオ−イノシトールに作用させることにより、シロ−イノシトールを前記溶液中に生成蓄積させ、該溶液中からシロ−イノシトールを採取することを特徴とする、シロ−イノシトールの製造方法。
(2) 前記ミオ−イノシトールを含む溶液がミオ−イノシトールを含有する液体培地であり、前記微生物を、該液体培地中で培養することによりミオ−イノシトールに作用させることを特徴とする、(1)の製造方法。
(3) 培養により得られた前記微生物の菌体を、前記溶液中でミオ−イノシトールに作用させることを特徴とする、(1)の製造方法。
(4) 前記微生物が、アセトバクター・セルビシエ、アセトバクター・マローラム、または、バークホルデリア・アンドロポゴニスに属する微生物である(1)〜(3)のいずれかの製造方法。
(5) 前記微生物が、アセトバクター・エスピーAB10281株(FERM BP-10119)またはその変異株である、(1)〜(3)のいずれかの製造方法。
(6) ミオ−イノシトールをシロ−イノシトールに変換する能力を有する、アセトバクター・エスピーAB10281株(FERM BP-10119)またはその変異株。
(a)作用:電子受容物質の存在下で、ミオ−イノシトールから電子を奪いシロ−イノソースを生成する反応を触媒する、
(b)至適pH:pH4.5〜5.5において活性が極大値を示す、
(c)補因子:1モルの酵素に1モルのヘム鉄を含有する、
(d)阻害剤:1mMのSn2+イオンにより酵素活性が1%以下に阻害される、
(e)サブユニット構造:少なくとも分子量76kダルトンと46kダルトンのタンパク質を含有するヘテロマーである、
(f)基質特異性:D−キロ−イノシトール、ムコ−イノシトール、ミオ−イノシトールに反応し、D−キロ−1−イノソース、L−キロ−2−イノソース、シロ−イノソースへ、それぞれ、変換する。アロ−イノシトール、シロ−イノシトール、L−キロ−イノシトール、グルコースには反応しない。
(8) NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ生産能を有するアセトバクター属に属する微生物を培養し、培養された微生物の菌体から、ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼを分離精製することを特徴とする、ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼの製造方法。
(9) 前記微生物がアセトバクター・エスピーAB10253株 (FERM BP-10136)である、(8)の製造方法。
(10) ミオ−イノシトール及び電子受容体を含有する溶液中で、NAD+非依存型ミオ−
イノシトール2−デヒドロゲナーゼをミオ−イノシトールに作用させてシロ−イノソースを生成せしめ、生成したシロ−イノソースを溶液中から分離精製することを特徴とする、シロ−イノソースの製造方法。
(11) ミオ−イノシトール及び電子受容体を含有する溶液中で、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼをミオ−イノシトールに作用させてシロ−イノソースを生成させる工程、前記シロ−イノソースに還元剤を作用させてシロ−イノシトールを生成させる工程、及び前記シロ−イノシトールを分離精製する工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法。
(12) アセトバクター・エスピーのAB10253株を変異処理し、得られた変異株から、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にして選別することを特徴とする、シロ−イノソース製造用微生物のスクリーニング方法。
(13) 微生物を含む天然試料の中から微生物を単離し、単離された微生物から、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にして選別することを特徴とする、シロ−イノソース製造用微生物のスクリーニング方法。
(14) (12)又は(13)のスクリーニング方法によって得られたシロ−イノソース製造用微生物を、ミオ−イノシトールを含有する培地で培養することにより、ミオ−イノシトールからシロ−イノソースを生成せしめ、生成したシロ−イノソースを培地から分離精製することを特徴とする、シロ−イノソースの製造方法。
(15) (12)又は(13)のスクリーニング方法によって得られたシロ−イノソース製造用微生物を、ミオ−イノシトールを含有する培地で培養することにより、ミオ−イノシトールからシロ−イノソースを生成させる工程、前記シロ−イノソースに還元剤を作用させてシロ−イノシトールを生成させる工程、及び前記シロ−イノシトールを分離精製する工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法。
反応:下記反応式に示すように、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する。
(a)分子量および会合特性 : 38〜46kダルトン、2または3量体を形成する。
(b)補酵素 : NAD+若しくはNADP+又はNADH若しくはNADPHを補酵素とする。
(c)活性化重金属 : Co2+イオンの存在下で活性化される。
(d)阻害重金属 : Sn2+イオンの存在下で阻害される。
(e)至適pH : pH5〜9で活性を有する。
(18) 以下の(A)または(B)のタンパク質。
(A)配列番号28に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(B)配列番号28に記載のアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質。
(19) 以下の(A)または(B)のタンパク質をコードするDNA。
(A)配列番号28に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(B)配列番号28に記載のアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質。
(20) 以下の(a)または(b)のDNA。
(a)配列番号27に記載の塩基配列のコード領域を含むDNA。
(b)配列番号27に記載の塩基配列もしくは同塩基配列に相補的な塩基配列を有するDNAとストリジェントな条件下でハイブリダイズし、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質をコードするDNA。(21) (19)または(20)のDNAを含むベクター。
(22) (19)もしくは(20)のDNA、または(21)のベクターを保持する形質転換微生物。
(23) 形質転換する宿主が大腸菌である(22)の形質転換微生物。
(24) (22)または(23)の形質転換微生物を培養し、培養物からシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼを採取することを特徴とする、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼの製造方法。
(25) (16)のシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼと、NAD+またはNADP+存在下でミオ−イノシトールを酸化しシロ−イノソースを生成する反応を触媒するミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ(EC1.1.1.18)とを共存させた溶液中、pH6.0〜8.5で、かつNAD+ またはNADP+存在下で、ミオーイノシトールを基質として、シロ−イノシトールへ酵素変換反応させることを特徴とする、シローイノシトールの製造方法。
(26) 溶液中に、シロ−イノソースを0.01〜3%になるように添加することを特徴とする、(25)のシローイノシトールの製造方法。
(27) 溶液中に、シロ−イノソースを0.2〜0.5%になるように添加することを特徴とする、(25)のシローイノシトールの製造方法。
(28) 溶液中に、Co塩および/または、Mg塩を0.01〜5.0mMになるように添加することを特徴とする、(25)のシローイノシトールの製造方法。
(29) 溶液中に、Co塩および/または、Mg塩を0.2〜2.0mMになるように添加することを特徴とする、(25)のシローイノシトールの製造方法。
(30) 溶液中のミオ−イノシトール濃度が5〜22%になるように調製し、酵素反応で生成したシロ−イノシトールを反応溶液中で結晶化させ、シロ−イノシトールを系外に結晶として、ろ別することを特徴とする、(25)のシローイノシトールの製造方法。
(31) シロイノシトールデヒドロゲナーゼが以下の(A)または(B)のタンパク質である(25)の製造方法。
(A)配列番号28に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(B)配列番号28に記載のアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH依存下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質。
(32) シロイノシトールデヒドロゲナーゼが以下の(a)または(b)のDNAによってコードされるタンパク質である(25)の製造方法。
(a)配列番号27に記載の塩基配列のコード領域を含むDNA。
(b)配列番号27に記載の塩基配列もしくは同塩基配列に相補的な塩基配列を有するDNAとストリジェントな条件下でハイブリダイズし、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH依存下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質をコードするDNA。
(33) シロイノシトールデヒドロゲナーゼが以下の(C)または(D)のタンパク質である(25)の製造方法。
(C)配列番号2、4、6、8、10、12または14に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(D)配列番号2、4、6、8、10、12または14に記載のアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質。
(34) シロイノシトールデヒドロゲナーゼが以下の(c)または(d)のDNAによってコードされるタンパク質である(25)の製造方法。
(c)配列番号1、3、5、7、9、11または13に記載の塩基配列のコード領域を含むDNA。
(d)配列番号1、3、5、7、9、11または13に記載の塩基配列もしくは同塩基配列に相補的な塩基配列を有するDNAとストリジェントな条件下でハイブリダイズし、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質をコードするDNA。
(36) 前記第1の工程において、加えるホウ酸及び金属塩の量が、前記混合液中に溶解したシロ−イノシトールの2倍モル以上、かつ3倍モル以下であることを特徴とする、(35)の製造方法。
(37) 前記第1の工程において、前記混合液のpHを9.0〜10.0に調整することを特徴とする、(35)の製造方法。
(38) 前記金属塩が、NaCl、NaHCO3、Na2CO3、Na2SO4、NaHSO4、NaH2PO4、Na2HPO4、Na3PO4、硼砂、KCl、KHCO3、K2CO3、K2SO4、KHSO4、KH2PO4、K2HPO4、K3PO4、MgCl2、MgCO3、およびMgSO4からなる群より選ばれる1種または2種類以上の金属塩である、(35)の製造方法。
(39) 前記シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液が、シロ−イノソースを含有する溶液中でシロ−イノソースを還元することにより得られるミオ−イノシトール及びシロ−イノシトールを含有する混合液である、(35)の製造方法。
(40) 前記第3の工程において、前記複合体を酸に溶解させて得られた溶液を0.1規定以上の酸性に調整し、かつ、前記第4の工程において、前記酸性溶液を強酸性イオン交換樹脂、及び強塩基性イオン交換樹脂又はホウ酸選択的吸着樹脂に接触させた後、該酸性溶液からシロ−イノシトールを析出させることを特徴とする、(35)の製造方法。
(41) 前記第4の工程において、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に水溶性有機溶媒を加えてシロ−イノシトールを析出させることを特徴とする、(35)の製造方法。
(42) 前記水溶性有機溶媒がエタノール又はメタノールであり、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に対して、エタノールを0.3〜3倍容、又はメタノールを0.3〜5倍容加えることを特徴とする、(41)の製造方法。
(43) 前記水溶性有機溶媒がエタノール又はメタノールであり、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に対して、エタノールを0.6〜1.5倍容、またはメタノールを0.9容〜2倍容加えることを特徴とする、(41)の製造方法。
(44) シロ−イノソースを含有する溶液中において、シロ−イノソースを水素化ホウ
素金属塩を用いて還元し、ミオ−イノシトール及びシロ−イノシトールを含有する混合液を得る第1の工程、前記混合液に酸を加えて混合液中のシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を溶解させ、かつ溶液を0.01規定以上の酸性溶液に調整する第2の工程、及び前記酸性溶液に、水溶性有機溶媒をミオ−イノシトールが析出しない量で加えて、シロ−イノシトールのみを析出させる第3の工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法。
(45) 前記第3の工程において、加える水溶性有機溶媒がエタノール、メタノール又は1−プロパノールであり、前記酸性溶液に対して、エタノールを0.2〜0.4倍容、メタノールを0.2〜0.8倍容、又は1−プロパノールを0.2〜0.4倍容加えることを特徴とする、(44)の製造方法。
(46) 前記第3の工程において、加える水溶性有機溶媒がエタノール、メタノール又は1−プロパノールであり、前記酸性溶液に対して、エタノールを0.35〜0.45倍容、メタノールを0.45〜0.55倍容、又は1−プロパノールを0.35〜0.45倍容加えることを特徴とする、(44)の製造方法。
本発明の一形態は、アセトバクター属またはバークホルデリア属に属する微生物であって、ミオ−イノシトールをシロ−イノシトールに変換する能力を有する微生物を、ミオ−イノシトールを含む溶液中でミオ−イノシトールに作用させることにより、シロ−イノシトールを前記溶液中に生成蓄積させ、該溶液中からシロ−イノシトールを採取することを特徴とする、シロ−イノシトールの製造方法に関する。
号が付与されている。
なお、アセトバクター・エスピーAB10253株は、2002年5月24日に独立行政法人 産業技術総合研究所 特許生物寄託センター(〒305-8566 日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1中央第6)に受託番号FERM P-18868として寄託され、さらに、ブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され、FERM BP-10136の受託番号で寄託されている。
ロ−イノシトール以外の不純物をほとんど除くことができる。その後、再結晶等の方法を用いることにより、目的物質を単離することができる。
本発明の他の形態は、新規なNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ、ならびに該酵素を用いたシロ−イノソースおよびシロ−イノシトールの製法に関する。
本発明のNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼは、少なくとも以下の理化学的性質を有する。
(a)作用:電子受容物質の存在下で、ミオ−イノシトールから電子を奪いシロ−イノソースを生成する反応を触媒する、
(b)至適pH:pH4.5〜5.5において活性が極大値を示す、
(c)補因子:1モルの酵素に1モルのヘム鉄を含有する、
(d)阻害剤:1mMのSn2+イオンにより酵素活性が1%以下に阻害される、
(e)サブユニット構造:少なくとも分子量76kダルトンと46kダルトンのタンパク質を含有するヘテロマーである、
(f)基質特異性:D−キロ−イノシトール、ムコ−イノシトール、ミオ−イノシトールに反応し、D−キロ−1−イノソース、L−キロ−2−イノソース、シロ−イノソースへ、それぞれ、変換する。アロ−イノシトール、シロ−イノシトール、L−キロ−イノシトール、グルコースには反応しない。
ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性は、例えば、100mMリン酸緩衝液(pH5.0)、ミオ−イノシトール5mg、2、4−ジクロロインドフェノール(酸化型DCIP)0.4mgからなる1mL溶液における600nmの吸収度変化を反応速度に換算して、1分間あたり、1μmolのミオ−イノシトールが酸化される活性を1ユニットとして測定することができる。(b)の至適pHは、各pHにおいてミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を測定し、酵素活性が極大を示すpHの範囲を調べることによって確認することができる。また、(d)の性質は、酵素活性測定系にSn2+イオンを添加して酵素活性を測定し、Sn2+イオン非添加時の活性と比較することによって確認することができる。また、(e)のサブユニット構造は、例えば、SDS−PAGE(ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミド電気泳動)などによって確認することができる。なお、各サブユニットの76kダルトン及び46kダルトンという分子量はそれぞれおおよその値であり、この前後数キロダルトンの値であってもよい。
本発明のNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼの製造法は、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ生産能を有するアセトバクター属に属する微生物を培養し、培養された微生物の菌体から、ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼを分離精製することを特徴とする製造方法である。
01%〜5.0%、好ましくは0.5%〜2.0%添加するのが望ましい。その他必要に応じ、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、コバルト、マンガン、亜鉛、鉄、銅、モリブデン、リン酸、硫酸などのイオンを生成することができる無機塩類を培地中に添加することが好ましい。培養液中の水素イオン濃度はpH3〜10、好ましくはpH5〜7に調整し培養すると、効率よく本酵素の発現を誘導することができる。なお、%で示した値は、w/vの百分率を示すものであり、濃度を%で表示する場合は、以下においても同様とする。
る。NaClの場合0mMから、500mMの濃度勾配、KClの場合、0mMから350mMの濃度勾配が使用される。次に、このカラムを、再度、界面活性剤を含まない20mMの緩衝液(pHはpH6.0〜8.0)を通して、洗浄し、次に界面活性剤を含む20mMの緩衝液(pHはpH6.0〜8.0)に、NaCl、またはKClの直線濃度勾配をかけた溶液を通過させ、タンパク質を溶出させる。NaClの場合0mMから、500mMの濃度勾配、KClの場合、0mMから350mMの濃度勾配が使用される。添加される界面活性剤は、TritonX−100、Tween20、Tween80などが例示でき、その濃度は、0.02%〜1.0%で使用できるが、好ましくはTritonX−100を0.1%の濃度で使用するのが望ましい。このような条件の中で、本酵素は、界面活性剤を含む20mM緩衝液に100〜170mMのNaClを含む溶液によって、カラムから溶出される。この様にして得られた酵素液は、このまま、シロ−イノソースの製造のために使用することもできるが、より高度に精製するためには、さらに処理がなされる。
本発明はまた、アセトバクター・エスピーのAB10253株を変異処理し、得られた変異株から、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にして選別することを特徴とする、シロ−イノソース製造用微生物のスクリーニング方法に関する。
物をスクリーニングする方法を以下に例示する。ただし、スクリーニング方法は、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にして行う限り、この方法に限定されない。
を単離し、単離された微生物から、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にして選別することを特徴とするスクリーニング方法である。ここで、天然の微生物を含む試料とは、例えば、天然の土壌等が挙げられる。天然試料の中から微生物を単離する方法は、例えば、天然試料の懸濁液又はその希釈液を寒天培地に塗布し、天然試料に含まれる微生物を独立のコロニーとして寒天培地上に生育させる方法等が挙げられる。単離された微生物の中からシロ−イノソース製造用微生物をスクリーニング方法は、培地のpHを3〜4、好ましくは3.5にする点を除いて、アセトバクター・エスピーAB10253株を用いる場合と同様の操作が適用できる。
本発明はまた、ミオ−イノシトールに、NAD+非依存ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ又は同酵素の高活性株(シロ−イノソース製造用微生物)を作用させることを特徴とする、シロ−イノソースの製造方法に関する。
本発明の「NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼを用いたシロ−イノソースの製造方法」は、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼをミオ−イノシトール及び電子受容体を含有する溶液中でミオ−イノシトールに作用させてシロ−イノソースを生成せしめ、生成したシロ−イノソースを溶液中から分離精製することを特徴とする製造方法である。ここでNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼは、既述した方法によって得られるものを使用することができる。なお、本酵素はミオ−イノシトールからシロ−イノソースを生成する活性を有する限り、その精製の程度は問わない。
本発明はまた、上記スクリーニング方法によって得られるシロ−イノソース製造用微生物を、ミオ−イノシトールを含有する培地で培養することにより、ミオ−イノシトールから
シロ−イノソースを生成せしめ、生成したシロ−イノソースを培地から分離精製することを特徴とする、微生物を用いたシロ−イノソースの製造方法に関する。
本発明はまた、NAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ又は該酵素の高活性株を用いてミオ−イノシトールからシロ−イノソースを生成させ、得られたシロ−イノソースを還元してシロ−イノシトールを得る事を特徴とする、シロ−イノシトールの製造方法に関する。
素の高活性株(シロ−イノソース製造用微生物)を用いてミオ−イノシトールからシロ−イノソースを生成させる工程は、既述した方法によって行うことができる。この工程によって得られるシロ−イノソースは、単離精製して還元工程に用いてもよいが、単離精製せずに還元工程に用いてもよい。シロ−イノソース製造用微生物を用いてシロ−イノソースを生成させる場合、培養液中にシロ−イノソースを生成蓄積させた後、シロ−イノソースを単離せず、菌体のみを分離して得た培養ろ液を還元工程に用いてもよい。
また、後述するように、得られたシロ−イノシトールを含む溶液に、ホウ酸と、NaClを加えて、シロ−イノシトールホウ酸複合体を作り、これをろ別後に、酸によりホウ酸を遊離させ、メタノールのような有機溶媒を加えることで結晶化させる方法によって、シロ−イノシトールを分離精製してもよい。
本発明の他の形態は、新規酵素シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ、ならびに該酵素を用いたシロ−イノシトールの製法に関する。
本発明のシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼは、以下の反応式に示すように、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する。
い。更に、大腸菌K−12株 ATCC10798(Escherichia coli K-12 ATCC10798)、アセトバクター・エスピー AB10281株 FERM BP-10119(Acetobacter sp.AB10281 FERM BP-10119)、バチルス ズブチリス 168株 ATCC23857(Bacillus subtilis 168 ATCC23857)、アグロバクテリウム チュメファシエンス C58株 ATCC33970(Agrobacterium tumefacience C58 ATCC33970)、アグロバクテリウム・エスピー AB10121株 FERM P-17383(Agrobacterium sp.AB10121 FERM P-17383)、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス ATCC33913(Xanthomonas campestris pv. campestris ATCC33913)であることが特に好ましい。
反応:以下の反応式に示すように、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する。
還元活性の測定は、シローイノソースを基質にして、NADHまたは、NADPHを共存させ、NADHまたはNADPHの340nmの吸収の減少を測定することで成される。また、反応後の溶液を、HPLC、GLCなどの分析装置で、生産物(シロ−イノシトールか、ミオ−イノシトール)の判断でも可能である。
分子量および会合特性: 38〜46kダルトン、2または3量体を形成する。
分子量は、SDS−PAGE(ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミド電気泳動)などの結果から、またはDNAの全長から酵素の推定分子量を算出することができる。また、会合特性は、ゲルろ過カラム(東ソー社:2000SWXL)で分画した画分の活性を測定し、相当する分子量画分から、分子量を計算し、これを、酵素の分子量で割った値を整数化することにより求めることが可能である。
補酵素: NAD+若しくはNADP+又はNADH若しくはNADPHを補酵素とする。
補酵素の選択性は、反応液(200mMトリス緩衝液pH8.0、2% NADPHまたはNADH、1%シロ−イノソース)5μlと、酵素液5μlを混合し、36℃、30min反応後、ただちに、500μlの水を加えて、340nmの吸光度を測定し、酵素液の代わりに水を用いた試験液のブランク値から、340nmの吸光度の減少量を測定することで確認することができる。なお、%で示した値は質量/体積(W/V)の百分率を示すものであり、濃度を%で表示する場合は、以下においても同様とする。
活性化重金属 : Co2+イオンの存在下で活性化される。または、Mn2+、Zn2+、Ca2+イオンの存在下で活性化される場合もあり得る。
阻害重金属 : Sn2+イオンの存在下で阻害される。または、Zn2+イオンの存在下で阻害される場合もあり得る。
当該重金属による効果は、反応液(200mMトリス緩衝液pH8.0、2% NADPH、1%シロ−イノソース、2mM金属塩)5μlと、酵素液5μlを混合し、36℃、30min反応後、ただちに、500μlの水を加えて、340nmの吸光度を測定し、酵素液の代わりに水を用いた試験液のブランク値から、340nmの吸光度の減少量を測定することで確認できる。「活性化されるとは」重金属無添加区の酵素活性を100%としたときに重金属1mM添加区の酵素活性が105%以上を、好ましくは120%以上を示すことを意味する。一方、「阻害されるとは」重金属無添加区の酵素活性を100%としたときに重金属1mM添加区の酵素活性が95%以下に、好ましくは70%以下になることを意味する。
至適pH : 本発明酵素は、pH5〜9で活性を有する。
至適pHは、反応液(200mMリン酸緩衝液pH5.0〜9.0、2% NADPH、1%シロ−イノソース)5μlと、酵素液5μlを混合し、36℃、30min反応後、ただちに、500μlの水を加えて、340nmの吸光度を測定し、酵素液の代わりに水を用いた試験液のブランク値から、340nmの吸光度の減少量を測定することで確認できる。至適pHとは、最大活性の90%以上の活性を有することを意味する。本発明酵素は、例えば、至適pHの範囲により酸性側に至適pHがあるグループ(至適pHがpH5.5〜6.5)、中性域に至適pHがあるグループ(至適pHがpH6.5〜7.5またはpH6.5〜8.5)、アルカリ性側に至適pHがあるグループ(至適pHがpH7.0〜8.5またはpH7.5〜9.0)に分けることも可能である。
熱安定性:本発明のシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼは、60℃まで安定である。
熱安定性は、酵素液を所定の温度で10min間処理した後、冷却し、この酵素液と反応液(200mMリン酸緩衝液pH5.0〜9.0、2% NADPH、1%シロ−イノソース)5μlを混合し、36℃、30min反応後、ただちに、500μlの水を加えて、340nmの吸光度を測定し、酵素液の代わりに水を用いた試験液のブランク値から、340nmの吸光度の減少量を測定することで確認できる。「熱安定であるとは」20℃10min処理区の活性を100%として、上記熱処理した酵素の活性が90%以上残存していることを意味する。
シロ−イノソースに対するKm値: シロ−イノソースに対するKm値は、2〜13mMを示す。
シロ−イノソースに対するKm値は、反応液(200mMトリス緩衝液pH8.0、2% NADPH、0.001〜2.5%シロ−イノソース)5μlと、酵素液5μlを混合し、36℃、30min反応後、ただちに、500μlの水を加えて、340nmの吸光度を測定し、酵素液の代わりに水を用いた試験液のブランク値から、340nmの吸光度の減少量を測定することで確認できる。測定値は定法に
従い、逆数プロットし、Km値を算出する。本発明酵素は、例えば、シロ−イノソースに対するKm値が4mM未満のグループ、4mM以上10mM未満のグループ、10mM以上13mM未満のグループに分けることも可能である。
基質特異性:相対活性が70%以上の基質は、シロ−イノシトール(SI)、ミオ−イノシトール(MI)、D−キロ−イノシトール(DCI)、エピ−イノシトール(EI)、L−キロ−イノシトール(LCI)が挙げられる。相対活性が20%以上70%未満の基質は、L−キロ−イノシトール(LCI)、エピ−イノシトール(EI)、ムコ−イノシトール(MuI)、ミオ−イノシトール(MI)、D−キロ−イノシトール(DCI)、アロ−イノシトール(AI)、ネオ−イノシトール(NI)が挙げられる。相対活性が20%未満の基質は、アロ−イノシトール(AI)、ネオ−イノシトール(NI)、D−キロ−イノシトール(DCI)、L−キロ−イノシトール(LCI)、エピ−イノシトール(EI)、ムコ−イノシトール(MuI)が挙げられる。
基質特異性は、酸化活性を指標にシロ−イノシトールに対する反応性に対する相対活性を測定することで確認できる。イノシトール異性体としては、シロ−イノシトール(SI)、ミオ−イノシトール(MI)、D−キロ−イノシトール(DCI)、L−キロ−イノシトール(LCI)、エピ−イノシトール(EI)、ムコ−イノシトール(MuI)、アロ−イノシトール(AI)、ネオ−イノシトール(NI)等が挙げられる。本発明のシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼの基質特異性は、相対活性が70%以上の区、70%未満20%以上の区、20%未満の区に分けて示すことが可能である。
測定方法として、反応液(各種イノシトール異性体1%(ネオ−イノシトールのみ0.4%))、200mMトリス緩衝液pH8.0、0.002%NADP+、0.002%ジアホラーゼ、0.01%ニトロテトラゾリウムブルー)50μlと、酵素液50μlを混合し、25℃、3min毎に、545nmの吸光度の増加をマイクロプレートリーダーで測定することが可能である。
シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼの製造に使用することのできる微生物としては、該酵素の生産能を有する限り特に限定されないが、例えば、大腸菌K−12株 ATCC10798(Escherichia coli K-12 ATCC10798)(以下、大腸菌K−12株ともいう)、アセトバクター・エスピー AB10281株 FERM BP-10119(Acetobacter sp.AB10281 FERM BP-10119)(以下、AB10281株ともいう)、バチルス ズブチリス 168株 ATCC23857(Bacillus subtilis 168 ATCC23857)(以下、Bucillus sub.168株、B.sub.168株ともいう)、アグロバクテリウム チュメファシエンス C58株 ATCC33970(Agrobacterium tumefacience C58 ATCC33970)(以下、A.tume.C58株ともいう)、アグロバクテリウム・エスピー AB10121株 FERM
P-17383(Agrobacterium sp.AB10121 FERM P-17383)(以下、AB10121株ともいう)、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス ATCC33913(Xanthomonas campestris pv. campestris ATCC33913)(以下、X.camp.ともいう)が挙げられる。
シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼを製造する目的で、これら微生物を培養するために用いる培地は、従来知られる一般的な微生物用培地を使用することが可能である。例えば、アセトバクター・エスピー AB10281株 FERM BP-10119、バチルス ズブチリス 168株 ATCC23857、アグロバクテリウム チュメファシエンス C58株 ATCC33970、アグロバクテリウム・エスピー AB10121株 FERM P-17383、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス ATCC33913を培養するときの培地組成は、目的に達する限り何ら特別の制限はなく、シロ−イノシトールへの変換原料であるミオ−イノシトールに加えて、炭素源、窒素源、有機栄養源、無機塩類等を含有する培地であればよく、合成培地・天然培地のいずれも使用できる。ミオ−イノシトールを0.1〜40%、より好ましくは10〜30%添加し、炭素
源としては、グリセロール、シュークロース、マルトースあるいは澱粉を0.1〜20%、より好ましくは0.3〜5%、窒素源としては、酵母エキス、ペプトン、カザミノ酸、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、硝酸アンモニウムあるいは尿素等を0.01〜5.0%、好ましくは0.5〜2.0%添加するのが望ましい。その他、必要に応じ、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、コバルト、マンガン、亜鉛、鉄、銅、モリブデン、リン酸、硫酸などのイオンを生成することができる無機塩類を培地中に添加することができる。培養液中の水素イオン濃度は特に調製する必要は無いが、好ましくはpH4〜10、より好ましくはpH5〜9に調整し培養すると、効率よくシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ含有する菌体を得ることができる。
GLCなどの分析装置で、生産物(シロ−イノシトールか、ミオ−イノシトール)の判断も可能である。
(a)配列番号2、4、6、8、10、12、14または28に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質。
(b)配列番号2、4、6、8、10、12、14または28に記載のアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質。
この中で配列番号28のアミノ酸配列を有するシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼは、本発明によって提供される新規なタンパク質である。
(a)配列番号1、3、5、7、9、11、13または27に記載の塩基配列のコード領域を含むDNA。
(b)配列番号1、3、5、7、9、11、13または27に記載の塩基配列もしくは同塩基配列に相補的な塩基配列を有するDNAとストリジェントな条件下でハイブリダイズし、シロ−イノシトールとシロ−イノソース間の酸化還元反応を触媒し、NADHまたはNADPH存在下で、シロ−イノソースを立体特異的にシロ−イノシトールへ還元する酵素活性を有するタンパク質をコードするDNA。
この中で配列番号27の塩基配列を有するDNAは、本発明によって提供される新規な、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼをコードするDNAである。
本発明はさらに、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼと、ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼとを共存させた溶液中で、NADHまたはNADPH存在下で、(図1を参照)、安価なミオ−イノシトールを基質として、シロ−イノソースを経由して、シロ−イノシトールへ酵素変換反応させることを特徴とする、シロ−イノシトールの製造方法に関する。
また、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼをコードするDNAは、その相同性から検索されるホモログDNAを単離することによっても得ることが可能である。ここで、ydgJ遺伝子と称される一連の相同性の高い遺伝子は、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼをコードするDNAである可能性が高い。
ートさせることによって、プラスミドを構築できる。
また、プラスミドに組み込まれたDNAを発現させるために使用されるプロモーターは、宿主微生物中で、DNAが発現すれば、特に限定されない。例えばlacプロモーター、tacプロモーターなどが使用できる。
この製造方法では既知のNAD+またはNADP+依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼを使用することができる。例えば、市販の酵素、バチルス ズブチリス、バチルス ハロヂュランスなどの培養菌体から精製することによって製造した酵素、または、遺伝子配列が既知であることから、遺伝子操作によって発現させたリコンビナント酵素を使用してもよい。
既知のミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼのアミノ酸配列としては、例えば、NCBI(National Center for Biotechnology Information)のプロテインデータベースにアクセション番号2636516、17982589、23464076、10174936、17742455、50120397、28853468、または13422633で登録されており、これらのアミノ酸配列をコードする塩基配列情報も上記アクセション番号のCDSを参照することにより得ることができる。
リコンビナント酵素を発現した菌体は、洗浄後に、そのまま反応溶液に加えて、菌体懸濁液として反応させることもできるが、好ましくは、菌体を破砕し、菌体内に存在する酵素を抽出した溶液を用いることが好ましい。また、本抽出液を精製して使用することもできる。精製としては硫安分画処理、または、イオン交換樹脂に吸着後、塩濃度による直線濃度勾配を利用したカラムクロマトグラフィー、温度処理などによって、精製することができる。さらに、本酵素は固定化酵素もしくは固定化菌体としても使用可能である。固定化法としては、ゲル抱埋法、イオン交換樹脂吸着法など、一般の固定化方法が適用できる。
れるCo塩、Mg塩は水に溶解する塩であれば使用することができ、塩酸塩、硫酸塩などが例示される。
ネオ−イノシトールを含まない純品シロ−イノシトールを得る事ができる。
本発明はさらに、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液からシロ−イノシトールを製造する方法に関する。
<4−1>
当該方法の一形態は、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液に、該混合液中に溶解したシロ−イノシトールの2倍モル以上の量のホウ酸及び金属塩を加え、かつ該混合液のpHを8.0〜11.0に調整してシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成させる第1の工程、前記複合体を混合液から分離する第2の工程、分離した複合体を酸に溶解させてシロ−イノシトールとホウ酸に開裂させる第3の工程、第3の工程で得られた酸性溶液又は酸性懸濁液からシロ−イノシトールを単離精製する第4の工程を含む、精製されたシロ−イノシトールの製造方法である。
イノシトール以外の中性糖」以外の物質を含むものであってもよく、予め少量のシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を含むものであってもよい。混合液中に含まれる中性糖としては、4炭糖、5炭糖、6炭糖、7炭糖の中性糖が好ましく、例えば、グルコース、フルクトース、ガラクトースなどのアルドース、ケトース、イノシトールの各種異性体、及びグリセロール、エチレングリコールなどの多価アルコール類を挙げることができる。ここで、イノシトールの異性体としては、例えばミオ−イノシトール、D−キロ−イノシトール、L−キロ−イノシトール、エピ−イノシトール、ムコ−イノシトール、アロ−イノシトール、シス−イノシトール、ネオ−イノシトールを挙げることができる。
て行う。なお、ここで2倍モルとは2倍のモル数をいう。反応液のpHはNaOH、KOH、Na2CO3、K2CO3などの塩基で調整することができる。
年)を用いてもよい。
タノールを加えることが好ましく、0.6〜1.5倍容のエタノールを加えることがより好ましい。メタノールを用いる場合、酸性溶液に対して、0.3〜5倍容のメタノールを加えることが好ましく、0.9〜2倍容のメタノールを加えることがより好ましい。特にシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成させる時に使用した金属塩が、NaCl、NaHCO3、Na2CO3の内の、いずれか一つ、または、2種類以上である場合においては、これらの容量で有機溶媒を加えることが有効である。さらに、水溶性有機溶媒を加えた後の混合液が、0.1規定以上の酸性溶液になるように調整することが好ましい。
次に、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液からシロ−イノシトールを製造する方法のもう一つの形態について説明する。
この方法は、シロ−イノソースを含有する溶液中において、シロ−イノソースを水素化ホウ素金属塩を用いて還元し、ミオ−イノシトール及びシロ−イノシトールを含有する混合液を得る第1の工程、前記混合液に酸を加えて混合液中のシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を溶解させ、かつ溶液を0.01規定以上の酸性溶液に調整する第2の工程、及び前記酸性溶液に、水溶性有機溶媒をミオ−イノシトールが析出しない量で加えて、シロ−イノシトールのみを析出させる第3の工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法である。
元でき、かつ、ホウ素を遊離することのできる還元剤であれば特に限定されないが、例えば、水素化ホウ素ナトリウム、水素化ホウ素リチウム、水素化ホウ素カリウムを例示することができる。
らなるが、必要があれば、再結晶などの方法によって、結晶として得ることもできる。より純度を上げるために、析出したシロ−イノシトールを水に溶解した後、イオン交換樹脂等によってさらに精製してもよい。
以下、実施例を示して本発明を具体的に説明する。
ミオ−イノシトール 10.0%、酵母エキス 1.0%、シュークロース1.0%を含む液体培地3リットルを、1N NaOHを用いてpH7.0に調製し、100mlずつ500ml容のバッフル付き三角フラスコ30本に分注し、オートクレーブ滅菌した。各々の三角フラスコにアセトバクター・エスピーAB10281株(FERM BP-10119)のスラント培養物を1白金耳接種し、27℃で5日間ロータリーシェーカーで培養した。培養後、各々の三角フラスコに、水を250mlづつ加え、1時間ロータリーシェーカーで攪拌し、培養液に存在する結晶性のシロ−イノシトールを溶解した。この培養液を集めて、遠心分離(8,000 rpm 20分間)し、上清を培養上清液(10.2L)とした。
カラム:Wakosil 5NH2 (4.6 × 250 mm)
カラム温度 : 40℃
検出器 : RI DETECTER ERC-7515A (ERMA CR.INC.)
注入量 : 5μl
溶媒 : アセトニトリル−水= 4 : 1
流量 : 2 ml/min
溶出時間 : シロ−イノソース ; 11.6分
ミオ−イノシトール; 17.8分
シロ−イノシトール; 18.2分
なお、上記のシロ−イノシトールの変換率は、次式により求めた。
放置したところ、純粋なシロ−イノシトールの無色結晶をろ過し、乾燥させ、118g得た。この時の精製回収収率は92%で、ミオ−イノシトールからのシロ−イノシトールの全回収率は39%であった。
ミオ−イノシトール 10.0%、酵母エキス 1.0%、シュークロース1.0%を含む液体培地40リットルを50L容ジャーファメンターに導入し、1N NaOHを用いてpH7.0に調製し、オートクレーブ滅菌した。同一組成の培地(三角フラスコ)で培養したアセトバクター・エスピーAB10281株(FERM BP-10119)を400ml接種し、27℃で5日間、通気量1vvm、回転数200rpmで培養した。培養後、取り出された培養液約40Lに、約50℃の温水を60L加え、1時間攪拌し、培養液に存在する結晶性のシロ−イノシトールを溶解した。この培養液を連続遠心分離(8,000 rpm)し、菌体を除去した液を培養除菌液(約100L)とした。
ミオ−イノシトールをシロ−イノシトールに変換する能力を有する3つの自然分離菌株、AB10285株、AB10286株、AB10287株、および、AB10253株より育種されたAB10281株の計4菌株の16SrRNA塩基配列解析は、常法に従って行なった。すなわち、培養後の菌体からゲノムDNAを抽出後、16SrRNAの約1.6kbpが増幅できる様に設計されたプライマーを用いてPCR法により、相当するDNA断片を調製し、約1.3kbp相当のシークエンスを解析(北海道システムサイエンス社)した。その配列結果を元にデータベースと照合し、近縁種を同定した。
率を示した。
500ml容ワッフル付き三角フラスコに、ミオ−イノシトール3g、酵母エキス(FNI205:Lallemand BI社製)1g、グルコース0.5gを加え、100mlになる様に水に溶解し、pH5.0に調整し、オートクレーブにより滅菌した培地を4本作製し、これに、アセトバクター・エスピーAB10253株をスラントから、それぞれ1白金耳加えて、2日間、27℃、ロータリーシェーカーでプレ培養した。
、500mMの直線濃度勾配をかけた溶液(総量1.6リットル)を1分間に10mlの速度で通過させ、タンパク質を溶出させた。溶出液は40mlずつの画分に分画した。
性を有することが判った。さらに、標準的酵素活性測定(100mMリン酸緩衝液(pH5.0))の際に、各種重金属イオン(Sn2+、Mn2+、Mg2+、Cu2+、Fe、Zn2+、Co2+、Pb2+、Ca2+、Cd2+、Ni2+)を加えて測定したところ、本酵素は、Sn2+イオンにより特異的に阻害されることが判った。酵素活性は、1mMのSn2+イオン存在下において、Sn2+イオン非存在下の活性の1%以下まで阻害された。
実施例4と同様にして、40Lジャーファメンターから精製を行ない、途中のヒドロキシアパタイトカラム100mlにより精製、脱塩を行なった5mlの酵素溶液を、酵素液として、以下の変換反応を行なった。
試験管に入れた酵母エキス(Difco社製)1%、グルコース0.5%を含むpH5.0の液体培地5mlを滅菌し、これに、スラントからアセトバクター・エスピーAB10253株を1白金耳加えて、27℃、16時間、振騰培養を行なった。培養液2.5mlを滅菌チューブにとり出し、3000×gの遠心分離を行ない、菌体を集菌した。上清を捨て、200mMリン酸緩衝液(pH8.0)2.5mlに再度懸濁し、3000×gの遠心分離を行ない、菌体を集菌した。上清を捨て、200mMリン酸緩衝液(pH8.0)2.5mlに再度懸濁し、この内、2.0mlを、滅菌した100ml容の三角フラスコに入れ、0.5mlの40%グルコース溶液と、7.5mlの200mMリン酸緩衝液(pH8.0)を加え混ぜ合わせ、これに、20μlのメタンスルホン酸エチルを加えて、30℃、45分間、振とう培養を行なった。処理後、1mlを滅菌チューブにとり出し、3000×gの遠心分離を行ない、菌体を集菌した。上清を捨て、200mMリン酸緩衝液(pH7.0)2.5mlに懸濁し、3000×gの遠心分離を行ない、菌体を集菌する。上清を捨て、200mMリン酸緩衝液(pH7.0)2.5mlに再度懸濁し、変異処理菌液を得た。
ノシトールからシロ−イノソースの変換率は、それぞれ、1.1倍、1.4倍、1.5倍に増加しており、NAD+非依存ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性が1.3倍以下の株のミオ−イノシトールからシロ−イノソースの変換率は、変異前の菌と同等であった。このことから、NAD+非依存ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ活性を指標にしたスクリーニングは、ミオ−イノシトールからシロ−イノソースの変換率の増加と相関性があることがわかった。
500ml容ワッフル付き三角フラスコに、ミオ−イノシトール10g、酵母エキス(FNI205:Lallemand BI社製)1g、グルコース0.5gを加え、100mlになる様に水に溶解し、pH5.0に調整し、オートクレーブにより滅菌した培地を20本(2リットル相当:ミオ−イノシトール200g(1.11mol))作製し、これに、変異菌株(B7-14)をスラントから、それぞれ1白金耳加えて、3日間、27℃、ロータリーシェーカーで培養した。
500ml容ワッフル付き三角フラスコに、ミオ−イノシトール10g、酵母エキス(FNI205:Lallemand BI社製)1g、グルコース0.5gを加え、100mlになる様に水に溶解し、pH5.0に調整し、オートクレーブにより滅菌した培地を20本(2リットル相当:ミオ−イノシトール200g(1.11mol))作製し、これに、変異菌株(B7-14)をスラントから、それぞれ1白金耳加えて、3日間、27℃、ロータリーシェーカーで培養した。
えた。一晩、室温で放置後、得られた結晶をろ過して集め、乾燥後、40.1g(222.8mmol)の結晶を得た(収率20%)。結晶をNMRおよびHPLCにより分析した結果、本物質は、99.9%以上の純度のシロ−イノシトールであった。
ミオ−イノシトール 10.0%、酵母エキス 1.0%、シュークロース1.0%を含む液体培地3リットルを、1N NaOHを用いてpH7.0に調製し、100mlずつ500ml容のバッフル付き三角フラスコ30本に分注し、オートクレーブ滅菌した。各々の三角フラスコにアセトバクター・エスピー AB10281株 FERM BP-10119のスラント培養物を1白金耳接種し、27℃で5日間ロータリーシェーカー(180rpm)を用いて培養した。培養後、各々の三角フラスコに、水を250mlずつ加え、1時間ロータリーシェーカーで攪拌し、培養液に存在する結晶性のシロ−イノシトールを溶解した。この培養液を集めて、遠心分離(8,000 rpm 20分間)し、菌体(湿重量75g)を得た。
KANTO:関東化学社製)で染色後脱色し、青く染まるタンパク質のバンドをデンシトメーター(ATTO社製)で測定し、目的のバンドの純度を測定したところ、いずれも
純度85%以上であった。
L−ソルボース 0.5%を含む、LBブロス培地(1%バクトトリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0)3リットルを、100mlずつ500ml容の坂口フラスコ30本に分注し、オートクレーブ滅菌した。各々の三角フラスコに大腸菌K12株のスラント培養物を1白金耳接種し、36℃で1日間レシプロシェーカー(135rpm)で培養した。培養後、培養液を集めて、遠心分離(8,000 rpm 20分間)し、菌体(湿重量32g)を得た。この菌体を100mlの水に懸濁し、10℃以下で超音波で破砕した。破砕溶液は、pH6.8を示し、この溶液を1NのNaOH溶液で、pH7.0に調製した後に、遠心分離(16,000 rpm 20分間)により、上清液を単離した。次に、上清液が2mM Mg2+になるようにMgSO4を加えて、ブルートヨパールカラム(東ソー社:20ml)にチャージし、2mM Mg2+になるように添加した20mMトリス緩衝液pH7.0 50mlを通過させ、カラムを洗浄した。その後、1M KClになるように添加した20mMトリス緩衝液pH7.0 50mlを通過させ、吸着タンパクを溶出させた。次に、溶出液をMW30000cut offの限外ろ過装置で、濃縮を行ない、濃縮液に、20mMトリス緩衝液pH7.0 50mlを加えて、再度濃縮し、脱塩濃縮液を得た。次に、この脱塩濃縮液を、DEAEトヨパールカラム(東ソー社:20ml)にチャージし、20mMトリス緩衝液pH7.0 から、500mM NaClになるように添加した20mMトリス緩衝液pH7.0 の直線濃度勾配をかけた溶液で溶出し、溶出液をフラクション別に分画した。分画した溶液別に、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ活性を測定したところ、300mMで溶出した画分に活性があった。
本発明酵素をコードしていると思われるydgJ遺伝子を取得するために、まず、鋳型とする大腸菌K12株の全ゲノムを以下の様に抽出した。LBフラスコ培地100ml(1%バクト-トリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0)にLBスラント培地(1%バクト-トリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0、1.5%寒天)で培養した大腸菌K12株を一白金耳接種し、8時間、36℃で好気的に培養し、これを集菌した。この菌体ペレットに、15mlのSaline−EDTA溶液(0.15M NaCl、0.1M EDTA、pH8.0)とリゾチーム50mgを加えて懸濁し、37℃、2時間作用させた。処理後、この溶液に25%SDS溶液を0.5ml加えて完全に溶菌させ、フェノールを3ml加えて、タンパク質を変成させた後に、遠心分離し、上清を取り出し、この溶液に20mlの2−プロパノールを加えて、粗ゲノムDNAを析出させた。析出した粗ゲノムDNAを遠心分離し、沈殿させ、上清を取り除いた後、減圧下で乾燥させた。乾燥した粗ゲノムDNAは、さらに3mlTE液(10mM Tris-HCl、1mM EDTA、pH8.0)に溶解後、0.01mgのRNAaseを加え、36℃、2時間反応させ、RNAを分解させた。さらに、0.01mgのプロテイナーゼKを加えて、36℃、2時間反応させ、タンパク質を分解させた。次に、1mlのフェノール−クロロホルム(1:1)混液を加えて、ゆっくりと攪拌し、RNAaseと、プロテイナーゼKを変成させ、遠心分離し、2相に分離した内の水相である上層を取り出し、これに3M酢酸Na溶液を0.3ml加えて、pH5.2に調製した。これに3mlの2−プロパノールを加えて、ゲノムDNAを析出させた。析出したゲノムDNAを遠心分離し、沈殿させ、上清を取り除いた後、減圧下で乾燥させた。乾燥したゲノムDNAは、3mlTE液に溶解させ、これに1mlのフェノール−クロロホルム(1:1)混液を加える操作から、3mlTE液に溶解させる過程までを、再度繰り返して、遠心分離を行い、同様にpH5.2にて、上清に等量の2−プロパノールを加えて、大腸菌K12株のゲノムDNA溶液を調製した。このようにして得られたゲノムDNAをPCR反応のための鋳型DNA溶液とした。
配列番号15:ydgj-F 5'- cattcaagcttaatgagaggcaatgacatgagcg-3'
配列番号16:ydgj-R 5'- tcggaattcttcatgcaaggcacaaagtcgc-3'
を加え、20μlになるように滅菌水を加え、混合した。この反応液を36℃、2時間反応した。制限酵素反応後、ジーンクリーンを用いて、DNA断片と発現ベクターを単離し、これらをライゲーションさせた。すなわち、制限酵素反応液20μlにキット添付のNaI溶液を300μl加えて混合し、10μlガラスビーズ溶液を加えて混合し、4℃、15分静置した後に、遠心分離し、DNA断片と発現ベクターの吸着したガラスビーズを沈殿させ、上清を除去した。さらに、キット添付のNew wash溶液500μlを加えて、ガラスビーズを懸濁させ、遠心分離し、上清を除去した。このNew wash溶液による洗浄操作は3回繰り返した。次に、ガラスビーズを減圧下で乾燥させ、乾燥後、15μlの滅菌水を加えて、懸濁し、55℃で、15分加温した後、遠心分離を行い、DNA断片と発現ベクターを含む上清12μlを得た。この操作により、制限酵素によって生じた約50bp以下の小さなDNA断片は取り除かれ、目的とするDNA断片と、発現ベクターが得られた。
QIAGEN社)によりプラスミドDNAの分離および精製を行った。こうして得られたプラスミドDNAは、目的とするydgJ遺伝子に相当する約1.0kbpのDNA断片を有することが確認された。
100mMトリス緩衝液(pH8.0)1.0mlで、36℃、4時間反応後、80℃、10minの加熱処理を行ない、冷却後、強塩基性陽イオン交換樹脂100μl、強酸性陰イオン交換樹脂100μl、活性炭10mgを加えて攪拌し、遠心分離後、上清を2倍希釈し、HPLC(Shodex Asahipak NH2P-50
4E φ4.6×250mm:Shodex社)を用いて、カラム温度40℃、移動相流速1.5ml(80%アセトニトリル)の条件下、RI検出器で測定した。その結果、ydgJ遺伝子産物は、高いシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ活性を示し、その生産物は、100%シロ−イノシトールへ還元されたものであり、異性体であるミオ−イノシトールは検出されなかった。結果として、ydgJ遺伝子由来のリコンビナント酵素溶液は、高いシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ活性を有し、この遺伝子産物が、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼであることを確認した。また、シローイノソースからの還元反応物は、シロ−イノシトールのみ検出され、立体特異的に、シロ−イノシトールへ還元する酵素であった。また、ydgJ遺伝子の配列は配列番号1に、相当するアミノ酸配列は配列番号2に記載した。
大腸菌ydgJ遺伝子産物のアミノ酸配列から三次元構造を推定すると、グルコース−フルクトースオキシドレダクターゼのファミリーに属することが推定された。このファミリーにはミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼ(EC1.1.1.18)も含まれ、アミノ酸配列の内、NAD結合に関与する配列は、相同性が高いことが判った。さらに、グルコース−フルクトースオキシドレダクターゼのX線構造解析から、基質結合に関与する個所のアミノ酸配列を特定し、部分的に同じアミノ酸配列を有し、ydgJ遺伝子産物に相同なタンパク質を検索したところ、グラム陰性菌、陽性菌を問わず、多くの細菌に相同なタンパク質があることが判明した。
これらの細菌の中から、大腸菌ydgJ遺伝子の相同性から推定されるホモログDNAを検索した結果、アグロバクテリウム チュメファシエンスC58株 ATCC33970(Agrobacterium tumefacience C58 ATCC33970)ゲノム中のAtu4375遺伝子と、Atu3234遺伝子、バチルス ズブチリス168株 ATCC23857(Bacillus subtilis 168 ATCC23857)ゲノム中のBG14057遺伝子、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株 ATCC33913(Xanthomonas campestris pv. campestris ATCC33913)ゲノム中のXcc3438遺伝子ならびに、ミオ−イノシトールから直接にシロ−イノシトールへ変換する能力のある微生物も知られているアグロバクテリウム・エスピーAB10121株 FERM P-17383(Agrobacterium sp.AB10121 FERM P-17383)ゲノム中のAtu4375遺伝子と、Atu3234遺伝子について大腸菌ydgJ遺伝子との相同性が認められた。従って、それぞれのDNAの単離と発現を行なった。
FERM P-17383の全ゲノムを以下の様に抽出した。アグロバクテリウム チュメファシエンスC58株、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株および、アグロバクテリウム・エスピーAB10121株は、LBフラスコ培地100ml(1%バクト-トリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0)に、LBスラント培地(1%バクト-トリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0、1.5%寒天)で培養したアグロバクテリウム
チュメファシエンスC58株、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株および、アグロバクテリウム・エスピーAB10121株をそれぞれ、一白金耳接種し、18時間、27℃で好気的に培養し、これを集菌した。この菌体ペレットに、15mlのSaline−EDTA溶液(0.15M NaCl、0.1M EDTA、pH8.0)とリゾチーム50mgを加えて懸濁し、37℃、2時間作用させた。処理後、この溶液に25%SDS溶液を0.5ml加えて完全に溶菌させ、フェノールを3ml加えて、タンパク質を変成させた後に、遠心分離し、上清を取り出し、この溶液に20mlの2−プロパノールを加えて、粗ゲノムDNAを析出
させた。析出した粗ゲノムDNAを遠心分離し、沈殿させ、上清を取り除いた後、減圧下で乾燥させた。乾燥した粗ゲノムDNAは、さらに3mlTE液(10mM Tris-HCl、1mM
EDTA、pH8.0)に溶解後、0.01mgのRNAaseを加え、36℃、2時間反応させ、RNAを分解させた。さらに、0.01mgのプロテイナーゼKを加えて、36℃、2時間反応させ、タンパク質を分解させた。次に、1mlのフェノール−クロロホルム(1:1)混液を加えて、ゆっくりと攪拌し、RNAaseと、プロテイナーゼKを変成させ、遠心分離し、2相に分離した内の水相である上層を取り出し、これに3M酢酸Na溶液を0.3ml加えて、pH5.2に調製した。これに3mlの2−プロパノールを加えて、ゲノムDNAを析出させた。析出したゲノムDNAを遠心分離し、沈殿させ、上清を取り除いた後、減圧下で乾燥させた。乾燥したゲノムDNAは、3mlTE液に溶解させ、これに1mlのフェノール−クロロホルム(1:1)混液を加える操作から、3mlTE液に溶解させる過程までを、再度繰り返して、遠心分離を行い、同様にpH5.2にて、上清に等量の2−プロパノールを加えて、アグロバクテリウム チュメファシエンスC58株、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株および、アグロバクテリウム・エスピーAB10121株のゲノムDNA溶液をそれぞれ、調製した。このようにして得られたゲノムDNAをPCR反応のための鋳型DNA溶液とした。
配列番号17:Atu4375-F 5'- ggcggatcctttgaaagggatagtcatgtcct -3'
配列番号18:Atu4375-R 5'- attggaagcttcgattggctgcgacctag -3'
配列番号19:Atu3234-F 5'- ttgggatcctttcaggggaaatattatggc -3'
配列番号20:Atu3234-R 5'- gccgcaagcttgttttacagcttcac -3'
配列番号23:Xcc3438-F 5'- tcggaattcgcgttgcggtgaatcgttttcaatg -3'
配列番号24:Xcc3438-R 5'- ataagaagcttgctcagtcgctgctgttgccttc -3'
配列番号21:BG14057-F 5'- aggaattcgatgataacgcttttaaaggggagaa -3'
配列番号22:BG14057-R 5'- tttctgcagtttagtgctccagcataatggttcg -3'
操作により、制限酵素によって生じた約50bp以下の小さなDNA断片は取り除かれ、目的とするDNA断片と、発現ベクターが得られた。
QIAGEN社)によりプラスミドDNAの分離および精製を行った。こうして得られたプラスミドDNAは、それぞれ、目的とするDNAに相当する約1.0〜1.1kbpのDNA断片を有することが確認された。
4E φ4.6×250mm:Shodex製)にて、カラム温度40℃、移動相流速1.5ml(80%アセトニトリル)、RI検出器で測定した。その結果、アグロバクテリウム チュメファシエンスC58株のAtu4375遺伝子産物と、Atu3234遺伝子産物、バチルス ズブチリス168株のBG14057遺伝子産物、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株のXcc3438遺伝子産物、ならびに、AB10121株のAtu4375遺伝子産物と、Atu3234遺伝子遺伝子産物は、高い酵素活性を示し、その生産物は、すべて、100%シロ−イノシトールへ還元されたものであり、異性体であるミオ−イノシトールは検出されなかった。結果として、上述し
た遺伝子由来のリコンビナント酵素は、全て高いシロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ活性を有し、この遺伝子産物が、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼであることを確認した。また、シローイノソースからの還元反応物は、シロ−イノシトールのみ検出され、立体特異的に、シロ−イノシトールへ還元する酵素であった。
精製された酵素の内、SIDH1を含む酵素液をPVDF膜(イモビロンPSQ:ミリポア社製)を通過させ、PVDF膜に吸着させた。このPVDF膜を取りだし、コマシブリリアントブルー染色液(ラピッドCBB KANTO:関東化学社製)で染色後脱色し、乾燥後、N末端アミノ酸分析装置(Hewlett Packard社)により分析を行なった。その結果、N末端から、メチオニン−リシ゛ン−アルキ゛ニン−リシ゛ン−ロイシン−アルキ゛ニン−イソロイシン−ク゛リシン−ロイシン−イソロイシン−ク゛リシン−セリン−ク゛リシン−フェニルアラニン−メチオニン−ク゛リシン−アルキ゛ニン−スレオニン−ヒスチシ゛ン−アラニン−フェニルアラニン−ク゛リシン−チロシン−セリンの配列が検出され、このアミノ酸配列をコードするDNA配列を想定し、以下の2種類のプライマーを作製した。
配列番号29:SIDH1-F1 atgaarcgnaarytncgiatyggyytiatygg
配列番号30:SIDH1-F2 ggyttyatgggycgnacicaygcittyggyta
配列番号31:SIDH1-B1 ggyttrtcrmmgayracrtgrstrcc
配列番号32: SIDH1-B2 artgwrirtgrttgggigt
また、鋳型となるAB10281株のゲノムDNAは、実施例9で調製した菌体ヘ゜レット(湿重量約400mg)を対象に、実施例12に記載したDNA調製方法と同様の方法で、AB10281株のゲノムDNA溶液を調製した。
PCR反応は宝酒造社のEx taq反応用液を使用し、組成はTakara ExTaq Buffer×10倍液 5μl、dNTP mixture 4μl、鋳型DNA 30ng、10μM プライマー溶液 各1μl(SIDH1-F1と、SIDH1-B1)、Takara ExTaq 0.5μlを50μlになるように水を加え、30μlのミネラルオイルを重層し、調製した。反応条件は、PCR増幅装置(ASTEC社 PC-700)を用い、変成を94℃30秒、ア二―リングを50℃30秒、伸長を72℃1分、の3段階の反応を35回繰返し行った。上記のPCR反応によって、電気泳動後、約0.3kbpの大きさのDNA断片が増幅したことを確認した。さらに、この0.3kbpのバンドをゲルから切りだし、ゲル破砕溶液の一部を鋳型(2μl)として、プライマーの組合せをSIDH1-F2と、SIDH1-B2にした以外は、同様の
PCR反応液組成で反応液を調製し、反応条件は、PCR増幅装置(ASTEC社 PC-700)を用い、変成を94℃30秒、ア二―リングを46℃30秒、伸長を72℃1分、の3段階の反応を35回繰返し行った。このPCR反応によって、電気泳動後、約0.25kbpの大きさのDNA断片が増幅したことを確認した。
約0.25kbpの大きさのDNA断片は、この部分をゲルから切り出し、ジーンクリーン(Bio101社製)を用いてPCR断片を精製した。すなわち、ゲルをNaI溶液に溶解させる以外は、実施例12に記載の精製方法と同様の方法で、DNA断片溶液12μlを得た。
得られたプラスミドを、ユニバーサルプライマー(R-20merと、U-19mer)を用いて、塩基配列解析(北海道システムサイエンス社)したところ、この酵素をコードする遺伝子の塩基配列の前半約1/3が明らかになった。
さらに、完全長の塩基配列を決定するため、AB10281株のゲノムDNAを制限酵素BamHIで完全に消化させ、得られたDNA断片溶液を、ジーンクリーン(Bio101社製)を用いて精製し、この断片をセルフライゲートさせた。すなわち、DNA断片溶液10μlに、Takara Ligation kit−I溶液(宝酒造社)を10μl加え、16℃、1時間反応させた。反応後、ジーンクリーン(Bio101社製)を用いて、このDNAを精製し、インバースPCR用の鋳型DNA溶液とした。
配列番号33:SIDH1-INV-F gctcgtcaacgatcctgaaattgat
配列番号34:SIDH1-INV-B ttcgctgcagcttcatcggaaatat
配列番号35:SIDH1-INVF3 cccttcaatttccgggcgggt
インバースPCR反応は宝酒造社のEx taq反応用液を使用し、組成はTakara ExTaq Buffer×10倍液 5μl、dNTP mixture 4μl、鋳型DNA 30ng、10μM プライマー溶液 各1μl(SIDH1-INV-FとSIDH1-INV-Bの組合せ、SIDH1-INV-FとSIDH1-INV3の組合せ)、Takara ExTaq 0.5μlを50μlになるように水を加え、30μlのミネラルオイルを重層し、調製した。反応条件は、PCR増幅装置(ASTEC社 PC-700)を用い、変成を94℃30秒、アニーリングを50℃1分、伸長を72℃2分、の3段階の反応を35回繰返し行った。上記のPCR反応によって、電気泳動後、約2.7kbpと、約1.8kbpの大きさのDNA断片が増幅した。この約2.7kbpと、約1.8kbpのバンドをゲルから切りだし、ジーンクリーン(Bio101社製)を用いてPCR断片を精製し、DNA断片溶液10μlを得た。得られたDNA断片2種類を、PCRで使用したプライマーを用いて、塩基配列解析(北海道システムサイエンス社)を行ない、この酵素をコードする遺伝子の全塩基配列を決定した。
配列番号36:281SIDH1-F gctggatcccgcccttattgtgaata
配列番号37:281SIDH1-R tatgaattcgttatgccttctcatgctgtcg
PCR反応は宝酒造社のEx taq反応用液を使用し、組成はTakara ExTaq Buffer×10倍液 5μl、dNTP mixture 4μl、鋳型DNA 30ng、10μM プライマー溶液 各1μl、Takara ExTaq 0.5μlを50μlになるように水を加え、30μlのミネラルオイルを重層し、調製した。反応条件は、PCR増幅装置(ASTEC社 PC-700)を用い、変成を94℃30秒、ア二―リングを55℃1分、伸長を72℃1分、の3段階の反応を35回繰返し行った。上記のPCR反応によ
って、約1.2 kbpの大きさのDNA断片が増幅した。
約1.2kbpの大きさのDNA断片は、ジーンクリーン(Bio101社製)を用いて精製され、DNA断片溶液12μlを得た。このDNA断片を発現ベクターに組み込む操作は、DNA断片溶液10μlに、発現用プラスミドを0.5μg(pUC119)、宝酒造社の制限酵素(BamH1、EcoRI)を各1μl、宝酒造社の制限酵素用緩衝液K buffer×10倍液 2μlを加え、20μlになるように滅菌水を加え、混合した。この反応液を36℃、2時間反応した。
反応溶液からのDNA断片の回収、精製、ライゲーション反応、および、コンピテントセル(宝酒造社DH5α)への形質転換は実施例12と同様の方法で行った。さらに、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼ活性を確認するための、酵素の発現と、活性測定方法も実施例12と同様の方法で行い、本遺伝子産物が、シロ−イノシトールデヒドロゲナーゼであることを確認した。
結果として、AB10281株の産出するSIDH1をコードする遺伝子の塩基配列を配列番号27に、また、アミノ酸配列を配列番号28に記載した。
実施例9の酵素精製により得られたAB10281株由来のSIDH1、SIDH2、SIDH3と、実施例11のリコンビナント酵素として得られた大腸菌由来のydgJ遺伝子産物と、実施例12のリコンビナント酵素として得られたアグロバクテリウム チュメファシエンスC58株のAtu4375遺伝子産物と、Atu3234遺伝子産物、バチルス ズブチリス168株のBG14057遺伝子産物、キサントモナス キャンペストリス pv. キャンペストリス株のXcc3438遺伝子産物、ならびに、AB10121株のAtu4375遺伝子産物と、Atu3234遺伝子産物の酵素としての諸性質を以下に示す方法で検討し、その結果を表5に記載した。
範囲を示した。
本製造法で使用する酵素は、ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼと、本発明酵素の2種類が必要である。ここでは、バチルス ズブチリス168株 ATCC23857由来のBG10669遺伝
子産物であるミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼのリコンビナント酵素と、本発明DNAによりコードされる(大腸菌K12株由来ydgJ遺伝子:配列番号1)本発明酵素のリコンビナント酵素を用いた実施例を示す。
配列番号25:BG10669-F 5'- ttgggatccgatgagtttacgtattggcgtaattg -3'
配列番号26:BG10669-R 5'- aaactgcagttagttttgaactgttgtaaaagattgata -3'
dolyl-β-D-Galactoside)、1mM IPTG(チオガラクトピラノシド)を含むLB寒天培地(1%バクトトリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl、pH7.0、1.5%寒天)に塗布した。さらに37℃、16時間培養した。この培養により白色に発色したコロニーとして前記のプラスミドの導入で形質転換された大腸菌が得られるため、これを選択した。こうして分離した形質転換大腸菌コロニーをアンピシリン(50μg/ml)を含むLB液体培地で培養した。増殖した形質転換大腸菌の菌体からプラスミド精製キット(QIA filter Plasmid Midi Kit,
QIAGEN社)によりプラスミドDNAの分離および精製を行った。こうして得られたプラスミドDNAは、目的とするBG10669遺伝子に相当する約1.0kbpのDNA断片を有することが確認された。
炭50mlカラムの順に通過させて溶出させた溶出液を得た後に、カラム洗浄のために500mlの水を順に通過させ溶出させた洗浄液と、溶出液を一緒にして、濃縮した。
粉末のシロ−イノソース100gを500mlの熱水に溶解し、室温まで冷却後、水を加えて900mlになるようにした。この溶液を5規定NaOH水溶液を用いて、pH7.5に合わせ、さらに水を加えて、1リットルになるようにした。
表中の灰色部分は、回収率が90%を超えた試験区を示す。
粉末のシロ−イノソース10g(56mmol)を50mlの熱水に溶解し、室温まで冷却後、水を加えて90mlになるようにした。この溶液を5規定NaOH水溶液を用いて、pH7.5に合わせ、さらに水を加えて、100mlになるようにした。
粉末のシロ−イノソース10g(56mmol)から、実施例17に示す方法と同様の方法で調製した5.71g(20.5mmol)のシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を原料とした。
本発明のNAD+非依存型ミオ−イノシトール2−デヒドロゲナーゼを用いることにより、NAD+を反応液中に添加することなく、シロ−イノソースを製造することができる。さらに得られたシロ−イノソースを還元することにより、簡便かつ高効率で高純度のシロ−イノシトールを得ることができる。
本発明によれば、シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液から、効率良くシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成せることができ、得られたシロ−イノシトール・ホウ酸複合体から高純度のシロ−イノシトールを効率よく簡便な操作で得ることができる。
Claims (12)
- シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液に、該混合液中に溶解したシロ−イノシトールの2倍モル以上の量のホウ酸及び金属塩を加え、かつ該混合液のpHを8.0〜11.0に調整してシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を形成させる第1の工程、前記複合体を混合液から分離する第2の工程、分離した複合体を酸に溶解させてシロ−イノシトールとホウ酸に開裂させる第3の工程、第3の工程で得られた酸性溶液又は酸性懸濁液からシロ−イノシトールを単離精製する第4の工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法。
- 前記第1の工程において、加えるホウ酸及び金属塩の量が、前記混合液中に溶解したシロ−イノシトールの2倍モル以上、かつ3倍モル以下であることを特徴とする、請求項1に記載の製造方法。
- 前記第1の工程において、前記混合液のpHを9.0〜10.0に調整することを特徴とする、請求項1に記載の製造方法。
- 前記金属塩が、NaCl、NaHCO3、Na2CO3、Na2SO4、NaHSO4、NaH2PO4、Na2HPO4、Na3PO4、硼砂、KCl、KHCO3、K2CO3、K2SO4、KHSO4、KH2PO4、K2HPO4、K3PO4、MgCl2、MgCO3、およびMgSO4からなる群より選ばれる1種または2種類以上の金属塩である、請求項1に記載の製造方法。
- 前記シロ−イノシトール及びシロ−イノシトール以外の中性糖を含有する混合液が、シロ−イノソースを含有する溶液中でシロ−イノソースを還元することにより得られるミオ−イノシトール及びシロ−イノシトールを含有する混合液である、請求項1に記載の製造方法。
- 前記第3の工程において、前記複合体を酸に溶解させて得られた溶液を0.1規定以上の酸性に調整し、かつ、前記第4の工程において、前記酸性溶液を強酸性イオン交換樹脂、及び強塩基性イオン交換樹脂又はホウ酸選択的吸着樹脂に接触させた後、該酸性溶液からシロ−イノシトールを析出させることを特徴とする、請求項1に記載の製造方法。
- 前記第4の工程において、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に水溶性有機溶媒を加えてシロ−イノシトールを析出させることを特徴とする、請求項1に記載の製造方法。
- 前記水溶性有機溶媒がエタノール又はメタノールであり、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に対して、エタノールを0.3〜3倍容、又はメタノールを0.3〜5倍容加えることを特徴とする、請求項7に記載の製造方法。
- 前記水溶性有機溶媒がエタノール又はメタノールであり、前記酸性溶液又は酸性懸濁液に対して、エタノールを0.6〜1.5倍容、またはメタノールを0.9容〜2倍容加えることを特徴とする、請求項7に記載の製造方法。
- シロ−イノソースを含有する溶液中において、シロ−イノソースを水素化ホウ素金属塩を用いて還元し、ミオ−イノシトール及びシロ−イノシトールを含有する混合液を得る第1の工程、前記混合液に酸を加えて混合液中のシロ−イノシトール・ホウ酸複合体を溶解させ、かつ溶液を0.01規定以上の酸性溶液に調整する第2の工程、及び前記酸性溶液に、水溶性有機溶媒をミオ−イノシトールが析出しない量で加えて、シロ−イノシトールのみを析出させる第3の工程を含む、シロ−イノシトールの製造方法。
- 前記第3の工程において、加える水溶性有機溶媒がエタノール、メタノール又は1−プロパノールであり、前記酸性溶液に対して、エタノールを0.2〜0.4倍容、メタノールを0.2〜0.8倍容、又は1−プロパノールを0.2〜0.4倍容加えることを特徴とする、請求項10に記載の製造方法。
- 前記第3の工程において、加える水溶性有機溶媒がエタノール、メタノール又は1−プロパノールであり、前記酸性溶液に対して、エタノールを0.35〜0.45倍容、メタノールを0.45〜0.55倍容、又は1−プロパノールを0.35〜0.45倍容加えることを特徴とする、請求項10に記載の製造方法。
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