BRPI0712392A2 - molécula de ácido nucléico isolada, amplicon, par de iniciadores de polinucleotìdeos, método e kit para detecção, planta de milho transgênico, semente de milho, amostra biológica, extrato, método para produção de uma planta de milho resistente e de sementes de milho hìbridas, semente hìbrida, proteìna inseticida isolada, vetor, célula hospedeira transgênica, sìtio alvo, método para fazer uma planta transgênica de milho - Google Patents

molécula de ácido nucléico isolada, amplicon, par de iniciadores de polinucleotìdeos, método e kit para detecção, planta de milho transgênico, semente de milho, amostra biológica, extrato, método para produção de uma planta de milho resistente e de sementes de milho hìbridas, semente hìbrida, proteìna inseticida isolada, vetor, célula hospedeira transgênica, sìtio alvo, método para fazer uma planta transgênica de milho Download PDF

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Abstract

MOLéCULA DE áCIDO NUCLéICO ISOLADA, AMPLICON, PAR DE INICIADORES DE POLINUCLEOTìDEOS, MéTODO E KIT PARA DETECçãO, PLANTA DE MILHO TRANSGêNICO, SEMENTE DE MILHO, AMOSTRA BIOLóGICA, EXTRATO, MéTODO PARA PRODUçãO DE UMA PLANTA DE MILHO RESISTENTE E DE SEMENTES DE MILHO HìBRIDAS, SEMENTE HìBRIDA, PROTEìNA INSETICIDA ISOLADA, VETOR, CéLULA HOSPEDEIRA TRANSGêNICA, SìTIO ALVO, MéTODO PARA FAZER UMA PLANTA TRANSGêNICA DE MILHO. Um novo milho transgênico designado evento MIR162 é exposto. A invenção relata os ácidos nucléicos que são únicos ao evento MIR162 e os métodos para detectar a presença de evento MIR162 baseados em sequências de DNA dos recombinantes planejados inseridos dentro do genoma do milho que resultaram no enento MIR162, e das sequências genómicas pareando o sítio de inserção. A invenção também se refere a plantas de milho abrangendo o genótipo transgênico do MIR162 e aos métodos para produção de uma planta de milho pelo cruzamento com uma planta de milho contendo o genótipo MIR162 com ela mesma ou com outra variedade de milho. Sementes de plantas de milho contendo o genótipo MIR162 também são objetos da presente invenção. A invenção também relata os métodos de controle de insetos usando as plantas de milho MIR162.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "MOLÉCULA DE ÁCIDO NUCLÉICO ISOLADA, AMPLICON, PAR DE INICIADORES DE POLINUCLEOTÍDEOS, MÉTODO E KIT PARA DETECÇÃO, PLANTA DE MILHO TRANSGÊNICO, SEMENTE DE MILHO, AMOSTRA BIOLÓGICA, EXTRATO, MÉTODO PARA PRODUÇÃO DE UMA PLANTA DE MILHO RESISTENTE E DE SEMENTES DE MILHO HÍBRIDAS, SEMENTE HÍBRI- DA, PROTEÍNA INSETICIDA ISOLADA, VETOR, CÉLULA HOSPEDEIRA TRANSGÊNICA, SÍTIO ALVO, MÉTODO PARA FAZER UMA PLANTA TRANSGÊNICA DE MILHO".
ANTECEDENTES
A presente invenção refere-se ao campo da biologia molecular de plantas, transformação de plantas, e reprodução de plantas. Mais especi- ficamente, a invenção relaciona-se a plantas de milho transgênicas resisten- tes a insetos compreendendo um novo genótipo transgênico e a métodos de detecção da presença de ácidos nucléicos que são únicos às plantas de mi- lho transgênicas em uma amostra e composições desta.
As pragas de plantas é um fator principal na perda de importantes colheitas agrícolas do mundo. Aproximadamente USD $8 bilhões são perdidos a cada ano somente nos EUA devido a infestações de pragas não-mamíferas incluindo insetos. Em adição às perdas na colheita do campo, as pragas de insetos são também um fardo para os cultivadores de frutas e vegetais, para os produtores de flores ornamentais e para os jardineiros caseiros.
Pragas de insetos são principalmente controladas pelas aplica- ções intensas de pesticidas químicos, que são ativos através da inibição do crescimento dos insetos, a prevenção da alimentação ou reprodução dos insetos, ou causam a morte. Desta forma um bom controle dos insetos pode ser alcançado, mas estes químicos algumas vezes podem também afetar outros insetos benéficos. Outro problema resultante do grande uso de pesti- cidas químicos é o aparecimento das variedades às quais resistem a inse- tos. Isto tem sido parcialmente suavizado pelas várias práticas de gerencia- mento de resistência, mas há uma necessidade crescente por agentes alter- nativos de controle de pragas. Agentes de controle de pragas biológicas, tais como amostras de Bacillus thuringiensis (Bt) expressando toxinas pesticidas como δ-endotoxinas, também têm sido aplicados às culturas agrícolas de plantação com resultados satisfatórios, oferecendo uma alternativa ou com- plemento aos pesticidas químicos. A codificação de genes para algumas destas δ-endotoxinas foi isolada e suas expressões em hospedeiros heteró- Iogos têm demonstrado que fornecem outra ferramenta para o controle de pragas de insetos economicamente importantes. Em particular, a expressão da Bt δ-endotoxinas tem fornecido proteção eficiente contra pragas de inse- tos selecionadas, e plantas transgênicas expressando tais toxinas têm sido comercializadas, permitindo que fazendeiros reduzam as aplicações de a- gentes químicos de controle de insetos.
Outra família de proteínas inseticidas produzidas por espécies de Bacillus durante o estágio vegetativo de crescimento (proteínas insetici- das vegetativas (Vip)) também foi identificada. As Patentes dos EUA - US 5,877,012, 6,107,279, e US 6,137,033, incorporadas neste pedido por refe- rência, descrevem uma nova classe de proteínas inseticidas chamadas de Vip3. Outras descrições, incluindo o WO 98/18932, WO 98/33991, WO 98/00546, e WO 99/57282, também homólogos já identificaram a classe Vip3 de proteínas. As seqüências de codificação da Vip3 codificam aproxi- madamente 88 proteínas kDa que possuem atividade inseticida contra um grande espectro de pragas de lepidópteros, incluindo, mas não limitado a, lagarta-rosca (BCW, Agrotis ipsilon), lagarta-do-cartucho (FAW, Spodoptera frugiperda), lagarta-da-maçã-do-algodoeiro (TBW, Heliothis virescens), broca da cana-de-açúcar, (SCB, Diatraea saccharalis), lagarta elasmo (LCB, Elas- mopalpus lignosellus) e lagarta da espiga (CEW, Helicoverpa zea), e quando expressadas em plantas transgênicas, por exemplo milho (Zea mays), elas conferem proteção à planta contra os danos causados pela alimentação dos insetos.
Os atuais métodos de transformação das plantas geralmente levam à integração aleatória de transgênicos como vip3 dentro de um geno- ma de planta hospedeira. Esta inserção aleatória do DNA introduzido dentro do genoma da planta pode ser letal se o DNA estrangeiro for introduzido dentro de um gene nativo criticamente importante e desta forma causar a mutação do mesmo. Além disso, ainda se um evento de inserção aleatória não danificar o funcionamento de um gene da célula hospedeira, a expres- são de um gene estrangeiro inserido pode ser influenciada por "efeitos de posição" causados pelo DNA genômico ao redor. Em alguns casos, o gene é introduzido dentro dos sítios onde os efeitos de posição são fortes o suficien- te para evitar a síntese de uma quantidade eficaz do produto do gene intro- duzido. Por exemplo, foi observado nas plantas que podem haver grandes variações nos níveis de expressão de um gene heterólogo introduzido dentro de um cromossomo da planta entre os eventos selecionados individualmen- te. Também pode haver diferenças nos padrões temporais ou espaciais da expressão, por exemplo, diferenças na expressão relativa de um transgene nos vários tecidos das plantas, que podem não corresponder aos padrões esperados dos elementos regulatórios transcricionais presentes na construc- to do gene introduzido. Em outros exemplos, a produção exagerada do pro- duto do gene possui efeitos danosos na célula. Devido a estes problemas potenciais, é comum a produção de centenas de eventos diferentes e fazer a filtragem daqueles eventos para um único evento que possui os padrões e níveis de expressão transgênica desejados para fins comerciais. Contudo, uma vez identificado um sítio viável comercialmente dentro do genoma da planta, seria vantajoso direcionar genes de interesse para aqueles sítios não prejudiciais.
Foram descritos diversos métodos para a inserção direcionada de uma seqüência de nucleotídeos de interesse, num sítio de cromossomo específico, dentro de uma célula de planta. Sistemas de recombinação es- pecíficos do sítio foram identificados nos diversos organismos procarióticos e eucarióticos inferiores. Tais sistemas compreendem tipicamente uma ou mais proteínas que reconhecem duas cópias de uma seqüência de nucleotí- deos específicos, separam e ligam aquelas seqüências de nucleotídeos, e desta forma fornecem uma troca de informações genéticas específicas do sítio numa forma precisa. Diversas recombinases específicas do sítio são conhecidas na técnica. Estas incluem, mas não estão limitadas a, por exem- pio, o sistema de bacteriófagos P1 Cre/lox (Austin e outros (1981) Cell 25: 729-736), o sistema de recombinase R/RS do plasmídeo pSR1 do Ievedo Zygosaccharomyces rouxii (Araki e outros (1985) J. Mol. Biol. 182: 191-203), o sistema Gin/gix do fago Mu (Maeser e Kahlmann (1991) Mol. Gen. Genet.
230: 170-176), o sistema de recombinase FLP/FRT do plasmídeo 2 .mu.m do Ievedo Saccharomyees eerevisiae (Broach e outros (1982) Cell 29: 227- 234), e a recombinase Int do bacteriófago Lambda (Landy (1989) Annu. Rev. Biochem. 58: 912-949; Landy (1993) Curr. Opin. Genet. Dev. 3: 699-707; Lorbach e outros (2000) J. Mol. Biol. 296: 1175-1181; e WO 01/16345). Uma aproximação direcionada específica do sítio particularmente útil é revelada na publicação do pedido de Patente Norte-Americana sob número: US 2006/0130179, incorporada neste por referência, usa recombinação mediada pela integrase lambda. O método compreende a introdução, dentro de uma célula de planta de uma seqüência de nucleotídeos direcionada compreen- dendo um primeiro sítio de reconhecimento Integrase; introdução de dentro da célula da planta de uma seqüência de nucleotídeos doadores compreendendo um segundo sítio de Reconhecimento Integrase; e a introdução dentro da célu- la da planta, uma Integrase ou de um complexo de Integrases. Outra apro- ximação direcionada específica do sítio útil está revelada na Publicação do pedido de Patente Americana sob o número sob US 2006/0253918, incorpo- rada neste por referência, e usa recombinação homóloga para integrar um ou mais genes (piramidação de genes) em sítios específicos no genoma.
Um evento que possui níveis ou padrões desejados de expres- são transgênica é útil para introduzir o transgene dentro de outros antece- dentes genéticos pelo cruzamento sexual usando métodos de reprodução convencionais. A progenitura de tais cruzamentos mantém as características de expressão transgênica do transformante original. Esta estratégia é usada para assegurar uma expressão do gene confiável num número de varieda- des que são bem adaptadas para as condições de crescimento locais. Seria também uma vantagem de ser capaz de detectar a presença de um evento particular a fim de determinar se a progenitura de um cruzamento sexual contém um transgênico de interesse. Além disso, um método para detectar um evento particular seria útil para cumprir com os regulamentos que exigem a aprovação do pré-mercado e rotulação dos alimentos derivados das plan- tas de plantações recombinantes, por exemplo. É possível detectar a pre- sença de um transgene por qualquer método de detecção do ácido nucléico bem conhecido incluindo, mas não limitado, a amplificação térmica (Reação em Cadeia da Polimerase (PCR)) usando iniciadores de polinucleotídeos ao a hibridização do DNA usando sondas de ácido nucléico. Tipicamente, para o bem da simplicidade e uniformidade dos reagentes e metodologias para uso na detecção de uma constructo de DNA específica que foi usada para transformar várias variedades de plantas, estes métodos de detecção geral- mente focam nos elementos genéticos freqüentemente usados, por exemplo, promotores, terminadores, e genes marcadores, porque para muitas cons- truções de DNA, a região da seqüência de codificação é intercambiável. Como resultado, tais métodos podem não ser úteis para descriminar entre os constructos que diferem somente com referência para as seqüências de co- dificação. Além disso, tais métodos podem não ser úteis para discriminar entre diferentes eventos, particularmente aqueles produzidos usando a mesma construção de DNA a menos que a seqüência cromossomal DNA adjacente ao DNA heterólogo inserido ("pareamento de DNA") seja conheci- da.
Pelas razões mencionadas acima, há uma necessidade de even- tos de milho transgênico resistente a insetos compreendendo seqüências novas de ácido nucléico que são únicas ao evento de milho transgênico, ú- teis para identificar o evento de milho transgênico e para detectar ácidos nu- cléicos do evento de milho transgênico numa amostra biológica, bem como de kits compreendendo os reagentes necessários para o uso na detecção destes ácidos nucléicos numa amostra biológica. Ainda há uma outra neces- sidade em fornecer sítios alvos específicos dentro do genoma de milho para permitir o direcionamento e controle da inserção de seqüências de nucleotí- deos a serem integradas dentro do genoma do milho.
SUMÁRIO
A presente invenção refere-se a um evento de milho transforma- do (Zea mays), designado MIR162 compreendendo um novo genótipo trans- gênico que compreende uma seqüência de codificação vip3Aa20, que é úni- ca para o evento MIR162. A seqüência de codificação vip3Aa20 codifica uma proteína inseticida Vip3Aa20 que confere resistência aos insetos para as plantas de milho MIR162. O evento MIR162 também compreende uma seqüência de codificação pm/'codificando uma proteína PMI que confere nas células do milho a habilidade para utilizar manose como uma fonte de car- bono. Em adição à seqüência de codificação vip3A20, a presente invenção também fornece outros ácidos nucléicos que são únicos ao MIR162. A in- venção também fornece plantas de milho transgênico compreendendo os ácidos nucléicos únicos ao MIR162, semente das plantas de milho transgê- nico, e métodos para produzir uma planta de milho transgênico compreen- dendo os ácidos nucléicos únicos da invenção pelo cruzamento de um milho reproduzido com si próprio compreendendo os ácidos nucléicos únicos para o MIR162 ou outra linhagem de milho de um genótipo diferente. Uma amos- tra da semente, e consequentemente plantas de milho cultivado da semente, compreendendo ácidos nucléicos únicos para o MIR162, foi depositada na American Type Culture Collection (ATCC) com número de acesso PTA-8166. As plantas do milho transgênico da invenção podem ter essencialmen- te todas as características morfológicas e fisiológicas correspondentes das plantas de milho não-transgênicos isogênicos em adição àquelas conferidas nas plantas de milho pelo novo genótipo da invenção. Amostras biológicas e extratos das plantas de milho MIR162, tecidos e sementes também são for- necidos pela presente invenção. A presente invenção também fornece com- posições e métodos para detectar a presença de ácidos nucléicos únicos para o MIR162 em amostras biológicas baseadas na seqüência de DNA dos cassettes de expressão recombinante dentro do genoma do milho que resul- tou no evento MIR162, e das seqüências genômicas pareando o sítio de in- serção. A presente invenção também fornece um sítio alvo de inserção não- prejudicial num cromossomo do milho útil para introduzir genes de interesse para um local específico no cromossomo, e métodos de alterar um genoma de milho pela introdução de ácidos nucléicos heterólogos no sítio de inser- ção revelado ou na vizinhança do sítio de inserção revelado. O evento MIR162 pode ainda ser caracterizado pela análise dos níveis de expressão das proteínas Vip3Aa20 e PMI, bem como pelo teste do MIR162 para eficá- cia contra pragas de insetos lepidópteros. A presente invenção também for- nece métodos de produzir plantas de milho transgênico resistentes a um es- pectro mais amplo de pragas de insetos pela piramidação da característica de resistência ao inseto Vip3Aa20 com características de resistência ao in- seto diferente do Vip3Aa20.
Estes e outros aspectos da invenção ficarão mais aparentes a partir da descrição detalhada a seguir.
DESCRIÇÃO DAS SEQÜÊNCIAS NA LISTAGEM DE SEQÜÊNCIAS
SEQ ID NO: 1 é a seqüência de codificação Vip3Aa20 no MIR162.
SEQ ID NO: 2 é a seqüência de aminoácido Vip3Aa20.
SEQ ID NO: 3 é a seqüência de plasmídeo pNOV1300.
SEQ ID Nos: 4-12 são iniciadores e sondas úteis num ensaio TAQMAN.
SEQ ID NO: 13 é a seqüência de uma sonda vip3Aa20.
SEQ ID NO: 14 é a seqüência de uma sonda pmi.
SEQ ID Nos: 15-37 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID No: 38 é a seqüência de um amplicon vip3Aa20.
SEQ ID Nos: 39-40 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID No: 41 é a seqüência de um amplicon CJ134/179 5'.
SEQ ID Nos: 42-43 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID NO: 44 é um amplicon vip3Aa20 3'.
SEQ ID NO: 45 é a junção de inserção do genoma 5'.
SEQ ID NO: 46 é a seqüência flanqueadora do genoma do milho 5' para inserção.
SEQ ID NO: 47 é a junção de inserção do genoma 3'.
SEQ ID NO: 48 é a seqüência flanqueadora do genoma do milho 3' para inserção.
SEQ ID NO: 49 é a inserção do MIR162 e seqüências flanquea- doras.
SEQ ID Nos. 50-54 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID NO: 55 é uma amplicon 5' PCR.
SEQ ID Nos. 56-58 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID NO: 59 é uma amplicon 3' PCR.
SEQ ID Nos. 60-105 são iniciadores úteis na presente invenção.
SEQ ID NO: 106 é a seqüência da região do cromossomo do milho 5 compreendendo o local alvo do cromossomo revelado.
SEQ ID NO: 107 é a seqüência genômica do milho que foi des- locada pela inserção do DNA heterólogo no MIR162.
DESCRIÇÃO DETALHADA
As seguintes definições e métodos a seguir são fornecidos para definir melhor a presente invenção e para guiar aqueles com habilidades comuns na técnica na prática da presente invenção. A menos que seja ob- servado de outra forma, os termos usados neste documento devem ser en- tendidos conforme o uso convencional para aqueles com habilidades co- muns na técnica em questão. As definições dos termos comuns da biologia molecular também podem ser encontradas no Rieger et a!., Glossário de Genética: Clássica e Molecular, 5â edição, Springer-Verlag: New York, 1994.
A nomenclatura das bases do DNA e dos aminoácidos conforme disposto no 37 C.F.R. § 1.822 é usada neste documento.
Como usado neste documento, o termo "amplificado" significa a construção de cópias múltiplas de uma molécula de ácido nucléico ou cópias múltiplas complementares à molécula de ácido nucléico usando pelo menos uma das moléculas de ácido nucléico como um padrão. Sistemas de amplifi- cação incluem, mas não estão limitados ao sistema de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), sistema da reação em cadeia da Iigase (LCR), amplifi- cação baseada em seqüência de ácido nucléico (NASBA, Cangene, Missis- sauga, Ontário), sistemas de Q-Beta Replicase, sistema de amplificação ba- seada na transcrição (TAS), e amplificação pelo deslocamento da fita (SDA). Ver, por exemplo:Diagnostic Molecular Microbiology: Principies and Applica- tions, D. H. Persing, e outros, Ed., American Societyfor Microbiology, Wash- ington, D.C. (1993). O produto da amplificação é descrito como um amplicon.
Uma "seqüência de codificação" é uma seqüência de ácido nu- cléico que é transcrita dentro do RNA tal como mRNA, rRNA, tRNA, snRNA, "sentido" RNA ou "antissentido" RNA. Preferencialmente o RNA é então tra- duzido num organismo para produzir uma proteína.
Conforme usado neste, o termo milho significa Zea mays ou mi- lho e inclui todas as variedades de plantas que podem ser reproduzidas com milho, incluindo espécies selvagens de milho.
"Kit de Detecção" conforme usado neste refere-se a um kit de partes úteis na detecção da presença ou ausência do DNA único para plan- tas MIR162 numa amostra, onde o kit compreende sondas de ácido nucléico e/ou iniciadores da presente invenção, que formam híbridos especificamente sob condições de alta estringência para uma seqüência alvo de DNA, e ou- tros materiais necessários para possibilitar métodos de amplificação ou hi- bridização do ácido nucléico.
Conforme usado neste o termo "evento" transgênico refere-se a uma planta recombinante produzida pela transformação e regeneração de um tecido ou célula da planta com DNA heterólogo, por exemplo, um casse- te de expressão que inclui um gene de interesse. O termo "evento" refere-se ao transformante original e/ou progenitura do transformante que inclui o DNA heterólogo. O termo "evento" também refere-se à progenitura produzida por um cruzamento sexual entre o transformante e outra linhagem de milho. Ain- da depois do retrocruzamento repetido para um parente recorrente, o DNA introduzido e o flanqueador DNA dos parentes transformados estão presen- tes na progenitura do cruzamento no mesmo local do cromossomo. O termo "evento" também refere-se ao DNA do transformante original compreenden- do o DNA inserido e a seqüência genômica flanqueadora imediatamente ad- jacente ao DNA inserido que esperaria-se ser transferido para uma progeni- tura que recebe o DNA inserido incluindo o transgene de interesse como resultado de um cruzamento sexual de uma linhagem progenitora que inclui o DNA inserido (por exemplo: o transformante original e a progenitura resul- tante da auto-fecundação) e uma linhagem progenitora que não contém o DNA inserido. Normalmente, a transformação do tecido da planta produz múltiplos eventos, cada um representa a inserção de uma construção de DNA dentro de uma localização diferente no genoma de uma célula de plan- ta. Baseado na expressão do transgene ou outras características desejáveis, um evento particular é selecionado. Desta forma, "evento MIR162" ou "even- to MIR162" podem ser usados intercambiavelmente.
Uma planta do milho MIR162 resistente aos insetos pode ser reproduzida primeiramente pelo cruzamento sexual de uma primeira planta de milho progenitora consistindo em uma planta de milho cultivada a partir de uma planta de milho MIR162 transgênico, tal como uma planta de milho MIR162 cultivada a partir da semente depositada no ATCC sob número de acesso: PTA-6188, e progenitura desta derivada da transformação com o cassete de expressão dos meios de execução da presente invenção que conferem resistência aos insetos, com uma segunda planta de milho proge- nitora que falta resistência aos insetos, desta forma produzindo uma plurali- dade de primeiras plantas da progenitura; e depois pela seleção de uma primeira planta da progenitura que é resistente aos insetos; e autofecunda- ção da primeira planta da progenitura, desta forma produzindo uma plurali- dade de segunda planta da progenitura; e finalmente pela seleção das se- gundas plantas da progenitura uma planta resistente a insetos. Estas etapas podem ainda incluir o retrocruzamento da primeira planta da progenitura re- sistente a insetos ou a segunda planta da progenitura resistente a insetos com a segunda planta de milho progenitora ou uma terceira planta de milho progenitora, desta forma produzindo uma planta de milho que seja resistente aos insetos.
"Cassete de Expressão " conforme usado neste documento sig- nifica uma molécula de ácido nucléico capaz de direcionar a expressão de uma seqüência de nucleotídeos específicos numa célula hospedeira apropri- ada, compreendendo um promotor ligado operavelmente à seqüência de nucleotídeos de interesse que é ligada operavelmente aos sinais de termina- ção. Isto também compreende tipicamente seqüências necessárias para tra- dução apropriada da seqüência de nucleotídeos. O cassete de expressão também pode compreender seqüências não necessárias na expressão direta de uma seqüência de nucleotídeos de interesse, mas que estão presentes devido aos sítios de restrição convenientes para remoção do cassete de um vetor de expressão. O cassete de expressão compreendendo a seqüência de nucleotídeos de interesse pode ser quimérico, significando que pelo me- nos um dos seus componentes é heterólogo com relação a pelo menos um dos seus outros componentes. O cassete de expressão também pode ser um que esteja naturalmente ocorrendo mas que foi obtido numa forma re- combinante útil para a expressão heteróloga. Tipicamente, contudo, a ex- pressão cassete é heterólogo com relação ao hospedeiro, isto é, a seqüên- cia de ácido nucléico particular do cassete de expressão não ocorre natu- ralmente na célula do hospedeiro e deve ser introduzida dentro da célula do hospedeiro ou um antepassado da célula hospedeira por um processo de transformação conhecido na técnica. A expressão da seqüência de nucleotí- deo no cassete de expressão pode ser sob o controle de um promotor cons- titutivo ou de um promotor induzível que inicia a transcrição somente quando a célula hospedeira é exposta a alguns estímulos externos particulares. No caso de um organismo multicelular, tal como uma planta, o promotor tam- bém pode ser específico para um tecido em particular, ou orgão, ou estágio de desenvolvimento. Um cassete de expressão, ou fragmento deste, tam- bém pode ser referido como "seqüência inserida" ou "seqüência de inserção" quando transformada numa planta.
Um "gene" é uma região definida que está localizada dentro de um genoma e que, apesar da seqüência de codificação mencionada acima, pode compreender outras, primariamente regulatória, seqüências de ácido nucléico responsáveis para o controle da expressão, que quer dizer a trans- crição e tradução, da porção de codificação. Um gene também pode conter outras seqüências não traduzidas 5' e 3' e seqüências de terminação. Outros elementos que podem estar presentes são, por exemplo, íntrons.
"Gene de interesse" refere-se a qualquer gene que, quando transferido para uma planta, confere na planta uma característica desejada como resistência a antibióticos, resistência a vírus, resistência a insetos, re- sistência a doenças, ou resistência a outras pragas, tolerância a herbicidas, valor nutricional melhorado, melhora do desempenho num processo industri- al ou capacidade reprodutiva alterada.
"Genótipo" conforme usado neste documento é o material genético herdado das plantas do milho de origem, nem todas que são necessariamente expressadas nas plantas de milho descendentes. O genótipo MIR162 refere-se ao material genético heterólogo transformado dentro do genoma de uma planta bem como o material genético flanqueando a seqüência inserida.
Uma seqüência de ácido nucléico "heteróloga" é uma seqüência de ácido nucléico não naturalmente associada com uma célula hospedeira na qual esta é introduzida, incluindo a ocorrência não natural de cópias múl- tiplas de uma seqüência de ácido nucléico
Uma seqüência de ácido nucléico "homóloga" é uma seqüência de ácido nucléico naturalmente associada com uma célula hospedeira na qual esta é introduzida.
"Operavelmente-ligada" refere-se à associação das seqüências de ácido nucléico num fragmento de ácido nucléico único para que a função de uma afete a função da outra. Por exemplo, um promotor é operavelmente - ligado com uma seqüência de codificação ou RNA funcional quando este é capaz de afetar a expressão da seqüência de codificação ou RNA funcional (isto é, quando a seqüência de codificação ou RNA funcional está sob o con- trole transcricional do promotor). As seqüências de codificação em orienta- ção de senso ou antisenso podem ser operavelmente-ligadas às seqüências regulatórias.
"Iniciadores" conforme usados neste documento são ácidos nu- cléicos isolados que são fortalecidos para uma fita de DNA alvo complemen- tar pela hibridização do ácido nucléico para formar um híbrido entre o inicia- dor e a fita de DNA alvo, e então estendido ao longo da fita de DNA alvo por uma polimerase, tal como polimerase de DNA. Pares ou conjuntos de inicia- 30 dores podem ser usados para amplificação de uma molécula de ácido nu- cléico, por exemplo, pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) ou outros métodos convencionais de amplificação do ácido nucléico. Uma "sonda" é um ácido nucléico isolado ao qual é ligado um rótulo detectável convencional ou molécula repórter, tal como um isótopo radioativo, ligante, agente quimioluminescente ou enzima. Tal sonda é com- plementar a uma fita de um ácido nucléico alvo, no caso da presente inven- ção, para uma fita de DNA genômico do milho evento MIR162. O DNA do MIR162 pode ser de uma planta de milho ou de uma amostra que inclui DNA do MIR162. As sondas de acordo com a presente invenção incluem não so- mente ácidos ribonucléicos ou desoxirribonucléico, mas também poliamidas e outros materiais de sonda que se unem especificamente a uma seqüência de DNA alvo e podem ser usados para detectar a presença daquela seqüên- cia de DNA alvo.
Iniciadores e sondas são geralmente entre 10 e 15 nucleotídeos ou mais em comprimento. Iniciadores e sondas também podem ser pelo me- nos 20 nucleotídeos ou mais em comprimento, ou pelo menos 25 nucleotí- deos ou mais, ou pelo menos 30 nucleotídeos ou mais em comprimento. Tais iniciadores e sondas hibridizam especificamente para uma seqüência alvo sob condições de hibridização de alta estringência. Iniciadores e sondas de acordo com a presente invenção podem ter seqüência completa comple- mentar com a seqüência alvo, embora as sondas diferem da seqüência alvo e que retêm a habilidade para hibridizar as seqüências alvo podem ser proje- tadas por métodos convencionais.
Conforme usado neste documento "piramidação" (empilhamen- to) do gene ou de característica combina características desejadas dentro de uma linhagem transgênica. Reprodutores de plantas empilham característi- cas transgênicas ao fazer cruzamentos entre parentes que cada um têm uma característica desejada e então identifica a descendência que ambas têm destas características desejadas. Outra forma de empilhar genes é pela transferência de dois ou mais genes dentro do núcleo da célula de uma plan- ta ao mesmo tempo durante a transformação. Outra forma de empilhar ge- nes é pela retransformação de uma planta transgênica com outro gene de interesse. Por exemplo, empilhamento de gene pode ser usado para combi- nar duas características de resistência a insetos diferentes, uma característi- ca resiste a insetos e uma característica resiste a doenças, ou uma caracte- rística de resistência a herbicida. O uso de um marcador selecionável além de um gene de interesse também seria considerado empilhamento de gene.
"Condições estringentes" ou "condições de hibridização estrin- gentes" incluem referências a condições sob as quais uma sonda irá hibridi- zar para sua seqüência alvo, para um grau maior detectável do que para outras seqüências. Condições de estringência são dependentes da seqüên- cia alvo e irão diferir dependendo da estrutura do polinucleotídeo. Pelo con- trole da estringência da hibridização e/ou condições de lavagem, as seqüên- cias alvo que serão 100% complementares à sonda (sonda homóloga) po- dem ser identificadas. Alternativamente, condições estringentes podem ser ajustadas para permitir alguma inadequação nas seqüências de forma que graus mais baixos de similaridade sejam detectados (sondagem heteróloga). Seqüências mais longas hibridizam especificamente em temperaturas mais altas. Um guia extensivo para a hibridização dos ácidos nucléicos é encon- trado em Tijssen (1993) Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hibridization with Nucleic Acid Probes, Parte I, Capítulo 2 "Overview of principies of hibridization and the strategy of nucleic acid sonda assays", El- sevier: New York; e Current Protocols in Molecular Biology, Capítulo 2, Ausubel e outros, Eds., Greene Publishing and Wiley-lnterscience: New York (1995), e também Sambrook e outros (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manu- al (5a Ed. Cols Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY).
Especificidade é tipicamente a função das lavagens pós-hibridi- zação, os fatores críticos sendo a força iônica e a temperatura da solução de lavagem final. Geralmente, hibridização de alta resistência e condições de lavagem são selecionadas a estarem aproximadamente a 5QC abaixo do ponto de fusão térmica (Tm) para a seqüência específica numa força iônica e pH definidos. A Tm é a temperatura (sob força iônica e pH definidos) na qual .50% da seqüência alvo hibridiza para uma sonda perfeitamente compatível. Tipicamente, sob condições de alta estringência uma sonda irá hibridizar para sua seqüência alvo, mas não para outras seqüências.
Um exemplo de condições de hibridização de alta estringência para a hibridização dos ácidos nucléicos complementares que possuem mais de 100 resíduos complementares num filtro em "Southern Blot" ou "Northern Blot" é 50% formamida com 1 mg de heparina a 42SC, a hibridiza- ção sendo executada durante a noite. Um exemplo de condições de lavagem de estringência muito alta é 0,15M NaCI a 72SC por aproximadamente 15 minutos. Um exemplo de condições de lavagem de estringência alta é uma lavagem 0,2x SSC a 659C por 15 minutos (ver, Sambrook, infra, para uma descrição do buffer SSC).
Um bom exemplo de condições de hibridização para a presente invenção incluem hibridização em 7% SDS1 0,25 M NaPO4 pH 7,2 a 67°C durante a noite, seguida por duas lavagens em 5% SDS, 0,20 M NaPO4 pH .7,2 a 65°C por 30 minutos em cada lavagem, e duas lavagens em 1% SDS,0,20 M NaPO4 pH 7,2 a 65°C por 30 minutos em cada lavagem. Um bom exemplo de lavagem de estringência média para um duplex de, por exemplo, mais de 100 nucleotídeos, é 1x SSC a 45SC por 15 minutos. Um bom exem- plo de lavagem de estringência baixa para um duplex de, por exemplo, mais de 100 nucleotídeos, é 4-6x SSC a 40-C por 15 minutos.
Para sondas de aproximadamente 10 a 50 nucleotídeos, condi- ções de alta estringência tipicamente envolvem concentrações de sal de menos de aproximadamente 1,0 M Na íon, tipicamente concentrações de aproximadamente 0,01 a 1,0 M Na íons (ou outros sais) num pH 7,0 a 8,3, e a temperatura é tipicamente de pelo menos de aproximadamente 30SC. Condições de alta estringência também podem ser alcançadas com a adição de agentes destabilizantes como a formamida. Geralmente, um sinal para taxa de ruído de 2x (ou superior) do que o observado para uma sonda não relacionada no ensaio específico de hibridização indica a detecção de uma hibridização específica. Ácidos nucléicos que não hibridizam entre si sob condições de alta estringência são ainda substancialmente idênticos se as proteínas que eles codificarem forem substancialmente idênticas. Isto ocor- re, por exemplo, quando uma cópia de um ácido nucléico é criada usando a máxima degeneração do códon permitida pelo código genético.
A seguir alguns bons exemplos de conjuntos de condições de hibridização/lavagem que podem ser usadas para hibridizar as seqüências de nucleotídeos que são substancialmente idênticas às seqüências de nu- cleotídeos de referência da presente invenção: uma seqüência de nucleotí- deos de referência preferencialmente hibridiza para a seqüência de nucleotí- deos de referência em 7% de Dodecil sulfato de sódio (SDS), 0,5 M NaPO4,1 mM EDTA a 50°C com lavagem em 2X SSC1 0,1% SDS a 50°C, mais pre- ferencialmente em 7% de dodecil sulfato de sódio (SDS), 0,5 M NaPO4, 1 mM EDTA a 50°C com lavagem em 1X SSC, 0,1% SDS a 50°C, mais prefe- rencialmente ainda em 7% de dodecil sulfato de sódio (SDS), 0,5 M NaPO4,1 mM EDTA a 50°C com lavagem em 0,5X SSC, 0,1% SDS a 50°C, prefe- rencialmente em 7% de dodecil sulfato de sódio (SDS), 0,5 M NaPO4, 1 mM EDTA a 50°C com lavagem em 0,1 X SSC, 0,1% SDS a 50°C, mais prefe- rencialmente em 7% de dodecil sulfato de sódio (SDS), 0,5 M NaPO4, 1 mM EDTA a 50°C com lavagem em 0,1 X SSC, 0,1% SDS a 65°C. As seqüências da presente invenção podem ser detectadas usando todas as condições a- cima. Para fins de definir a invenção, são usadas as condições de alta es- tringência.
"Transformação" é um processo para a introdução do ácido nu- cléico heterólogo dentro de uma célula hospedeira ou organismo. Particu- larmente, "transformação" significa a integração estável de uma molécula de DNA dentro do genoma de um organismo de interesse.
"Transformado / transgênico / recombinante" refere-se a um or- ganismo hospedeiro como uma bactéria ou uma planta no qual uma molécu- la de ácido nucléico heteróloga foi introduzida. A molécula de ácido nucléico pode ser estavelmente integrada dentro do genoma do hospedeiro ou a mo- lécula de ácido nucléico também pode estar presente como uma molécula extracromossômica. Tal molécula extracromossômica pode ser auto- replicadora. Células transformadas, tecidos ou plantas são entendidas para conter não somente o produto final de um processo de transformação, mas também a progenitura transgênica deste. Um hospedeiro "não-transforma- do", "não-transgênico", ou "não-recombinante" refere-se a um organismo do tipo selvagem, por exemplo, uma bactéria ou planta, que não contém a mo- lécula de ácido nucléico heteróloga. Como usado neste documento, "trans- gênico" refere-se a uma planta, célula de planta, ou grande quantidade de células de planta estruturadas ou não-estruturadas tendo integrado, através de técnicas bem conhecidas de manipulação genética e inserção de genes, uma seqüência de ácidos nucléicos representando um gene de interesse dentro do genoma da planta, e tipicamente dentro de um cromossomo de um núcleo da célula, mitocôndria ou outra organela contendo cromossomos, resultam da manipulação e inserção de tais seqüências de ácido nucléico, ao contrário das mutações que ocorrem naturalmente, para produzir uma planta que ocorre de forma não natural ou uma planta com um genótipo que ocorre de forma não natural.
Técnicas para a transformação das plantas e células das plantas são bem conhecidas no estado da técnica e podem compreender, por exemplo, ele- troporação, microinjeção, transformação mediada por Agrobactéria, e trans- formação balística.
Conforme usado neste documento, o termo "único" para MIR162 significa características distintivas de MIR162. Desta forma, ácidos nucléicos únicos para o evento MIR162 não são encontrados em outras plantas de milho que não sejam MIR162.
A classe "Vip3" de proteínas compreende, por exemplo, Vip3Aa, Vip3Ab, Vip3Ac, Vip3Ad, Vip3Ae, VipAf, Vip3Ag, Vip3Ba, e Vip3Bb, e seus homólogos. "Homólogo" significa que a proteína indicada ou polipeptídeo sustentam uma relação definida para outros membros da classe Vip3 de pro- teínas. "Vip3Aa20" é um homólogo Vip3 único para o evento MIR162. Foi gerado por mutações espontâneas introduzidas dentro do gene vip3Aa19 otimizado por milho contido no pNOV1300 (SEQ ID NO: 3) durante o pro- cesso de transformação da planta.
Esta invenção refere-se a uma linhagem geneticamente melho- rada de milho que produz uma proteína de controle de insetos, Vip3Aa20, e a uma enzima fosfomanose-isomerase (PMI) que permite que a planta utilize a manose como uma fonte de carbono. A invenção é particularmente proje- tada para um evento de milho transgênico designado MIR162 compreen- dendo um novo genótipo, bem como para composições e métodos para de- tectar ácidos nucléicos únicos ao MIR162 numa amostra biológica. A inven- ção é ainda projetada para plantas de milho compreendendo o genótipo MIR162, para sementes transgênicas das plantas de milho, e para métodos para produzir uma planta de milho compreendendo o genótipo MIR162 pelo cruzamento de um milho cruzado com si mesmo compreendendo o genótipo MIR162 ou outra linhagem de milho. Plantas de milho compreendendo o ge- nótipo MIR162 da invenção são úteis no controle de pragas de insetos Iepi- dópteros incluindo, mas não limitado a, lagarta-rosca (BCW, Agrotis ipsilon), lagarta-do-cartucho (FAW, Spodoptera frugiperdá), lagarta-da-maçã-do- algodoeiro (TBW, Heliothis virescens), broca da cana-de-açúcar, (SCB, Dia- traea saccharaiis), lagarta elasmo (LCB, Elasmopalpus lignosellus), e lagarta da espiga (CEW, Helicoverpa zea), e larva do feijão ocidental (WBCW, Stria- costa albicosta). A invenção é ainda projetada para um método de proteger o milho transgênico do dano causado pela alimentação dos insetos, pelo qual o empilhamento do traço de resistência do inseto do MIR162 com uma ca- racterística diferente de resistência ao inseto na mesma planta transgênica uma planta de milho que é protegida do dano causado pela alimentação dos insetos para um grau maior que as características de resistência do inseto por si só.
Numa modalidade, a presente invenção abrange uma molécula de ácido nucléico isolada compreendendo uma seqüência de nucleotídeos que é única ao evento MIR162.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba uma molé- cula de ácido nucléico isolada que liga uma molécula de DNA heteróloga introduzida dentro do genoma do MIR162 para o genoma do DNA no MIR162 compreendendo pelo menos 10 ou mais (por exemplo 15, 20, 25, 50 ou mais) nucleotídeos contíguos da molécula do DNA heteróloga e pelo me- nos 10 ou mais (por exemplo 15,20, 25, 50, ou mais) nucleotídeos contíguos do DNA do genoma flanqueando o ponto de inserção da molécula do DNA heteróloga. Estão também incluídas as seqüências de nucleotídeos que compreendem 10 ou mais nucleotídeos da seqüência de inserção contígua do evento MIR162 e pelo menos um nucleotídeo do DNA flanqueador do evento MIR162 adjacente à seqüência de inserção. Tais seqüências de nu- cleotídeos são únicas, e diagnosticar o evento MIR162. A hibridização ou amplificação do ácido nucléico do DNA genômico do MIR162 produz um amplicon compreendendo tais seqüências únicas permite diagnosticar para o evento MIR162. Em um aspecto desta modalidade, a seqüência de nucleotí- deos é selecionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, e os complementos destas.
Em outra modalidade, a invenção engloba uma molécula de áci- do nucléico isolada compreendendo uma seqüência de nucleotídeos que compreende pelo menos uma seqüência de junção do evento MIR162, na qual uma seqüência de junção transpõe a junção entre um cassete de ex- pressão heteróloga inserido dentro do genoma do milho e o DNA do genoma do milho pareando o local de inserção e é diagnosticado para o evento. Num aspecto desta modalidade, a seqüência de junção é selecionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, e os complemento desta.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba uma molé- cula de ácido nucléico isolada unindo uma molécula de DNA heteróloga o genoma da planta do milho no evento MIR162 compreendendo uma se- qüência de aproximadamente 11 a aproximadamente 20 nucleotídeos contí- guos selecionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, e os complementos desta.
Em outra modalidade, a invenção engloba uma molécula de áci- do nucléico isolada compreendendo uma seqüência de nucleotídeos sele- cionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, e os complementos destas. Num aspecto desta modalidade, a molécula de ácido nucléico isolada é contida numa semente de milho de- positada na "American Type Culture Collection" sob o número de acesso PTA-8166, ou em plantas cultivadas da semente.
Numa modalidade da presente invenção, uma amplicon compre- endendo uma seqüência de nucleotídeos única para o evento MIR162 é for- necida. Num aspecto desta modalidade, a seqüência de nucleotídeos é se- lecionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, e os complementos destas.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba os iniciado- res da seqüência flanqueadora para detectar o evento MIR162. Tais iniciado- res da seqüência flanqueadora compreendem uma seqüência de nucleotí- deos de pelo menos 10-15 nucleotídeos contíguos de 5' ou a seqüência flanqueadora de 3'. Num aspecto desta modalidade, os nucleotídeos contí- guos são selecionados dos nucleotídeos 1-1088 (inclusive) da SEQ ID NO: 49 (arbitrariamente designado neste como a seqüência flanqueadora 5'), ou os complementos desta. Em outro aspecto desta modalidade, os iniciadores da seqüência flanqueadora 5' são selecionados do grupo consistindo na SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NOs: 68-80, e os complementos destas. Em outro aspecto desta modalidade, os nucleotídeos contíguos são selecionados dos nucleotídeos 9391-10579 (inclusive) da SEQ ID NO: 49 (arbitrariamente designada neste como a seqüência flan- queadora 3'), ou os complementos desta. Ainda num outro aspecto desta modalidade, iniciadores da seqüência flanqueadora 3' são selecionados do grupo consistindo em SEQ ID NO: 58, SEQ ID NOs: 97-105, e os comple- mentos destas.
Ainda em outra modalidade, a presente invenção engloba um par de iniciadores de polinucleotídeos compreendendo um primeiro iniciador de polinucleotídeo e um segundo iniciador de polinucleotídeo que funcionam juntos na presença de um modelo de evento MIR162 DNA numa amostra para produzir um diagnóstico do amplicon para o evento MIR162. Num as- pecto desta modalidade, o primeiro iniciador e/ou o segundo iniciador é es- colhido da SEQ ID NO: 1 ou o complemento desta. Em outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador e/ou o segundo iniciador é selecionado do grupo consistindo na SEQ ID NOs: 15-35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 42, e os complementos destas. Ainda em outro aspecto desta modalidade, a am- plicon que é produzida pelo par de iniciadores compreende SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 44, ou os complementos destas.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba um par de iniciadores de polinucleotídeos compreendendo um primeiro iniciador de po- linucleotídeo e um segundo iniciador de polinucleotídeo que funcionam jun- tos na presença de um modelo de evento MIR162 DNA numa amostra para produzir um diagnóstico do amplicon para o evento MIR162. Onde o primeiro iniciador é ou está complementar para uma seqüência de genoma da planta do milho pareando o ponto de inserção de uma seqüência de DNA heterólo- ga inserida dentro do genoma do evento MIR162, e o segunda seqüência de iniciador de polinucleotídeos é ou está complementar à seqüência de DNA heteróloga inserida dentro do genoma do evento MIR162.
Num aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador de polinu- cleotídeo compreende pelo menos 10 nucleotídeos contíguos de uma se- qüência de nucleotídeos selecionados do grupo consistindo em nucleotídeos 1-1088 de SEQ ID NO: 49, nucleotídeos 9391-10579 da SEQ ID NO: 49, e os complementos destas. Num outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador é selecionado do grupo consistindo na SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NOs: 68-72, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NOs: 97-105, e os complementos destas. Em outro aspecto desta modalidade, o segundo iniciador do polinucleotídeo compre- ende pelo menos 10 nucleotídeos contíguos da posição 1089-9390 da SEQ ID NO: 49, ou complementos desta. Ainda num outro aspecto desta modali- dade, o segundo iniciador do polinucleotídeo é selecionado do grupo consis- tindo nas SEQ ID NOs: 15-35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NOs: 50-52, SEQ ID NOs: 54, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 96, e os complementos destas.
Em outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador do poli- nucleotídeo, que é disposto na SEQ ID NO: 36, e o segundo iniciador do po- linucleotídeo que é disposto na SEQ ID NO: 37 funcionam juntos na presen- ça de um modelo de evento MIR162 DNA numa amostra para produzir um diagnóstico do amplicon para o evento MIR162 conforme descrito no Exem- plo 4. Numa modalidade deste aspecto, o amplicon compreende a seqüência de nucleotídeos disposta na SEQ ID NO: 38.
Ainda em outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador do polinucleotídeo, que é disposto na SEQ ID NO: 39, e o segundo iniciador do polinucleotídeo que é disposto na SEQ ID NO: 40 funcionam juntos na presença de um padrão de evento MIR162 DNA numa amostra para produzir um diagnóstico do amplicon para o evento de milho MIR162 conforme des- crito no Exemplo 4. Numa modalidade deste aspecto, o amplicon compreen- de a seqüência de nucleotídeos disposta na SEQ ID NO: 41.
Ainda em outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador do polinucleotídeo, que é disposto na SEQ ID NO: 53, e o segundo iniciador do polinucleotídeo que é disposto na SEQ ID NO: 54 funcionam juntos na presença de um padrão de evento de milho MIR162 DNA numa amostra pa- ra produzir um diagnóstico do amplicon para o evento de milho MIR162 con- forme descrito no Exemplo 5. Numa modalidade, o amplicon compreende a seqüência de nucleotídeos dispostas na SEQ ID NO: 55.
Ainda em outro aspecto desta modalidade, o primeiro iniciador do polinucleotídeo, que é disposto na SEQ ID NO: 58, e o segundo iniciador do polinucleotídeo que é disposto na SEQ ID NO: 56, funcionam juntos na presença de um padrão de evento de milho MIR162 DNA numa amostra pa- ra produzir um diagnóstico do amplicon para o evento de milho MIR162 con- forme descrito no Exemplo 5. Numa modalidade, o amplicon compreende a seqüência de nucleotídeos dispostos na SEQ ID NO: 59.
Naturalmente, está bem dentro do conhecimento da técnica a obtenção da seqüência adicional ainda dentro da seqüência do genoma pa- reando qualquer lado das seqüências de DNA heteróloga inseridas para uso como uma seqüência de iniciadores que pode ser usada em tais pares de iniciadores para amplificar as seqüências que são diagnosticadas para o e- vento MIR162. Com o propósito desta descrição, a frase "ainda dentro da seqüência do genoma pareando qualquer lado das seqüências de DNA hete- rólogas inseridas" refere-se especificamente a um movimento seqüencial longe das extremidades das seqüências de DNA heterólogas inseridas, os pontos pelos quais as seqüências de DNA inseridas são adjacentes à se- quência de DNA genômica nativa, e fora para dentro do DNA genômico do cromossomo particular dentro do qual as seqüências de DNA heterólogas foram introduzidas. Preferencialmente, uma seqüência de iniciadores cor- respondente a ou complementar a uma parte da seqüência de inserção de- veria fazer o prime da extensão transcricional de uma tira nascente do DNA ou RNA em direção da junção de seqüência flanqueadora mais próxima. Consequentemente, uma seqüência de iniciadores correspondendo a ou complementar a uma parte da seqüência flanqueadora genômica deveria fazer o prime da extensão transcricional de uma tira nascente de DNA ou RNA na direção da junção de seqüência flanqueadora mais próxima. Uma seqüência de iniciadores pode ser, ou pode ser complementar a, uma se- qüência de DNA heteróloga inserida dentro do cromossomo de uma planta, ou uma seqüência flanqueadora genômica. Um técnico com conhecimentos na técnica reconheceria prontamente o benefício se uma seqüência de inici- adores necessitaria, ou necessitaria ser complementar a, a seqüência dis- posta dentro da seqüência de DNA heteróloga inserida ou conforme disposta na SEQ ID NO: 38 dependendo da natureza do produto desejado para ser obtido através do uso do conjunto alojado de iniciadores destinados para uso na amplificação de uma seqüência de pareamento particular contendo a jun- ção entre a seqüência de DNA genômica e a seqüência de DNA heteróloga inserida.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba uma proteí- na inseticida isolada compreendendo SEQ ID NO: 2 e uma molécula de áci- do nucléico codificando a SEQ ID NO: 2. Em outro aspecto desta modalida- de, a molécula de ácido nucléico é SEQ ID NO: 1. A presente invenção tam- bém engloba um gene quimérico compreendendo um promoter heterólogo operavelmente ligado à molécula de ácido nucléico, e aos vetores recombi- nantes e células hospedeiras compreendendo o gene quimérico. Ainda em outra modalidade, a presente invenção engloba um método de detecção da presença de uma molécula de ácido nucléico que é única ao evento MIR162 em numa amostra compreendendo ácidos nucléi- cos de milho, onde o método compreende: (a) colocar a amostra em contato com um par de iniciadores de polinucleotídeos que, quando usado numa reação de amplificação de ácidos nucléicos com DNA genômico do evento MIR162 produz um amplicon que é diagnosticado para o evento MIR162; (b) realização de uma reação de amplificação do ácido nucléico, por meio desta forma produzindo o amplicon; e (c) detectando o amplicon. Num aspecto desta modalidade, o amplicon compreende uma seqüência de nucleotídeos selecionada do grupo consistindo da SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, e os complementos destas.
Numa outra modalidade, a presente invenção engloba um méto- do de detecção da presença de uma molécula de ácido nucléico que é única ao evento MIR162 numa amostra compreendendo ácido nucléico do milho, onde o método compreende: (a) contatando a amostra com uma sonda que hibridiza sob condições de alta estringência com DNA genômico do evento MIR162 e não hibridiza sob condições de alta estringência com DNA de uma planta de milho controle; (b) sujeitando a amostra e a sonda a condições de hibridização de alta estringência; e (c) detectando a hibridização da sonda para o DNA. A detecção pode ser feita por qualquer meio bem conhecido na técnica incluindo fluorescência, quimiluminescência, radiológica, imunológi- ca, e outros. No caso em que a hibridização destinar-se a ser usada como um meio para a amplificação de uma seqüência particular para produzir um amplicon que é diagnosticada para o evento MIR162, a produção e detecção por qualquer meio bem conhecido na técnica da amplicon destinam-se a ser um indicativo da hibridização destinada à seqüência alvo onde uma sonda ou iniciador é utilizado, ou seqüências onde duas ou mais sondas ou inicia- dores são utilizados. O termo "amostra biológica" destina-se a compreender uma amostra que contém ou é suspeita de conter um ácido nucléico com- preendendo entre cinco e dez nucleotídeos em qualquer lado do ponto no qual um ou outro dos dois pontos terminais da seqüência de DNA heteróloga inserida contacta a seqüência de DNA genômico dentro do cromossomo no qual a seqüência de DNA heteróloga foi inserida, neste documento também conhecido como seqüências de junção. Além disso, a seqüência de junção compreende tão pouco quanto dois nucleotídeos: aqueles sendo o primeiro nucleotídeo dentro do flanqueador DNA ou genômico adjacente ao covalen- temente unido ao primeiro nucleotídeo dentro da seqüência de DNA heteró- loga inserida. Em um aspecto desta modalidade, a sonda compreende uma seqüência de nucleotídeos selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, e os complementos destas.
Ainda em outra modalidade, a presente invenção engloba um kit para a detecção dos ácidos nucléicos que são únicos ao evento MIR162 na amostra biológica. Kit inclui pelo menos uma molécula de ácido nucléico de comprimento suficiente de polinucleotídeos contíguos para funcionar como um iniciador ou sonda num método de detecção do ácido nucléico, que de- pois da amplificação ou hibridização para uma seqüência de ácido nucléico alvo numa amostra seguida pela detecção do amplicon ou hibridização para a seqüência alvo, são diagnosticados para a presença de seqüências de ácido nucléico únicas ao evento MIR162 na amostra. Kit ainda inclui outros materiais necessários para permitir a hibridização do ácido nucléico ou os métodos de amplificação. Num aspecto desta modalidade, uma molécula de ácido nucléico contida no kit compreende uma seqüência de nucleotídeos da SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 49. Em outro aspecto desta modalidade, a molécula de ácido nucléico é um iniciador selecionado do grupo consistindo na SEQ ID NOs: 15-37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NOs: 50-54, SEQ ID NOs: 56-58, SEQ ID NOs: 60- 105, e os complementos destas. Ainda em outro aspecto desta modalidade, o amplicon compreende SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, ou os complementos destas. Uma variedade de métodos de detec- ção podem ser usados incluindo, mas não limitados a TAQMAN (Perkin El- mer), amplificação térmica, reação em cadeia por ligase, hibridização de Southern, métodos ELISA, e métodos de detecção colorimétrica e fluores- cente. Em particular a presente invenção fornece kits para detectar a pre- sença da seqüência alvo, isto é, pelo menos a seqüência vip3Aa20 ou uma seqüência de junção, numa amostra contendo ácido nucléico genômico do MIR162. Kit é compreendido por pelo menos um polinucleotídeo capaz de ligar ao sítio alvo ou substancialmente adjacente ao sítio alvo e pelo menos um meio para detectar a ligação do polinucleotídeo para o sítio alvo. Os meios de detecção podem ser fluorescente, quimioluminescência, colorimé- trica, ou isotópico e podem ser acoplados pelo menos com métodos imuno- lógicos para detectar a ligação. Kit também é visionado que pode detectar a presença do sítio alvo numa amostra, isto é, pelo menos a seqüência vip3Aa20 ou uma seqüência de junção do MIR162, levando vantagem de duas ou mais seqüências de polinucleotídeos que juntas são capazes de ligar às seqüências de nucleotídeo adjacentes a ou dentro de aproximada- mente 100 pares de base, ou dentro de aproximadamente 200 pares de ba- se ou dentro de aproximadamente 500 pares de base ou dentro de aproxi- madamente 1000 pares de base da seqüência alvo e que podem ser esten- didas entre si para formar um amplicon que contém pelo menos o sítio alvo.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba um método de detectar a proteína Vip3Aa20 numa amostra biológica, o método compre- ende: (a) extrair proteína do tecido do evento MIR162; (b) ensaiar a proteína extraída usando um método imunológico compreendendo anticorpos especí- ficos para a proteína Vip3Aa20 produzida pelo evento MIR162; e (c) detectar a ligação do anticorpo mencionado para a proteína Vip3Aa20.
Ainda em outra modalidade, a presente invenção engloba uma amostra biológica derivada de uma planta de milho do evento MIR162, teci- do, ou semente, onde a amostra compreende uma seqüência de nucleotí- deos que é ou está complementar para a seqüência que é única ao evento MIR162, e onde a seqüência é detectável na amostra usando uma amplifica- ção de ácido nucléico ou um método de hibridização de ácido nucléico. Em um aspecto desta modalidade, a seqüência de nucleotídeos é ou está com- plementar à SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: 59. Num outro aspecto desta modalidade, a amostra é selecionada do grupo consistindo em farinha de milho, fubá, xarope do milho, óleo de milho, mai- sena e cereias fabricados no todo ou em parte que contenham produtos a base de milho.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba um extrato de uma amostra biológica derivada de uma planta de milho MIR162, tecido ou semente compreendendo uma seqüência de nucleotídeos que é ou está complementar a uma seqüência que é única ao MIR162. Em um aspecto desta modalidade, a seqüência é detectável no extrato usando uma amplifi- cação do ácido nucléico ou método de hibridização do ácido nucléico. Em outro aspecto desta modalidade, a seqüência é ou está complementar para SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: 59. Ainda em outro aspecto desta modalidade, a amostra é selecionada do grupo consistindo em farinha de milho, fubá, xarope do milho, óleo de milho, maisena, e cerei- as fabricados no todo ou em parte que contenham produtos a base de milho.
Outra modalidade da presente invenção engloba uma planta de milho, ou partes desta, e semente de uma planta de milho compreendendo o genótipo do evento transgênico MIR162, onde o genótipo compreende uma seqüência de nucleotídeos disposta nas SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, ou os complementos destas. Um exemplo de se- mente de milho compreende as moléculas de ácido nucléico da invenção que foram depositadas no dia 23 de janeiro de 2007 e atribuídas o número de acesso ATCC: PTA-8166. Em um aspecto desta modalidade, a planta de milho é das linhagens de milho reproduzidas CG5NA58, CG5NA58A, CG3ND97, CG5NA01, CG5NF22, CG4NU15, CG00685, CG00526, CG00716, NP904, NP911, NP948, NP934, NP982, NP991, NP993, NP2010, NP2013, NP2015, NP2017, NP2029, NP2031, NP2034, NP2045, NP2052, NP2138, NP2151, NP2166, NP2161, NP2171, NP2174, NP2208, NP2213, ΝΡ2222, ΝΡ2275, ΝΡ2276, ΝΡ2316, BCTT609, AF031, ΝΡΗ8431, 894, BUTT201, R327H, 2044ΒΤ, e 2070ΒΤ. Contudo um técnico com conheci- mentos na técnica reconhecerá que o genótipo MIR162 pode ser introduzido dentro de qualquer variedade de planta que possa ser reproduzida com mi- lho, incluindo espécies selvagens de milho, e desta forma, a lista de linha- gens reproduzidas desta modalidade não deve ser limitada.
Em outra modalidade, a presente invenção engloba uma planta de milho compreendendo pelo menos uma primeira e uma segunda seqüên- cia de DNA ligadas juntas para formar uma seqüência de nucleotídeos con- tíguos, onde a primeira seqüência de DNA está dentro de uma seqüência de junção e compreende pelo menos aproximadamente 11 nucleotídeos contí- guos selecionados do grupo consistindo em nucleotídeos 1079-1098 da SEQ ID NO: 49, nucleotídeos 9381-9400, e os complementos desta, onde a se- gunda seqüência de DNA está dentro da seqüência de DNA inserida heteró- loga disposta na SEQ ID NO: 49, e os complementos desta; e onde a primei- ra e segunda seqüência de DNA forem úteis como sondas ou iniciadores do nucleotídeo para detectar a presença das seqüências de ácido nucléico do evento de milho MIR162 numa amostra biológica. Num aspecto desta moda- lidade, os iniciadores do nucleotídeo são usados num método de amplifica- ção do DNA para amplificar uma seqüência de DNA alvo do DNA padrão extraído da planta de milho e a planta de milho é identificável de outras plan- tas de milho pela produção de uma amplicon correspondendo a uma se- qüência de DNA compreendendo SEQ ID NO: 45 ou SEQ ID NO: 47.
Plantas de milho da invenção podem ainda ser caracterizadas em que digerir simultaneamente o DNA genômico da planta com as endonu- cleases de restrição Kpnl, EcoRV ou Ncol resulta em aproximadamente uma banda de hibridização de 8 kb, de 13 kb ou 4.6 kb vip3Aa20 respectivamen- te, usando uma sonda vip3Aa20 sob condições de alta estringência. Exem- plificada neste documento está uma sonda vip3Aa20 compreendendo a se- quência de nucleotídeos disposta na SEQ ID NO: 13.
Plantas de milho da invenção podem ainda ser caracterizadas em que digerir o DNA genômico da planta com as endonucleases de restri- ção Acc65l ou BamHI resulta em uma única banda de hibridização pmi u- sando uma sonda pmi sob condições de alta estringência. Exemplificada neste documento está uma sonda pmi compreendendo a seqüência de nu- cleotídeos disposta na SEQ ID NO: 14.
Em uma modalidade, a presente invenção engloba uma planta de milho, onde o genótipo MIR162 confere a resistência ao inseto à planta de milho ou habilidade para utilizar manose como uma fonte de carbono, ou ambos, a resistência ao inseto e a habilidade para utilizar manose como uma fonte de carbono. Em um aspecto desta modalidade, o genótipo transgênico conferindo resistência ao inseto à planta de milho da invenção compreende um gene vip3Aa20 e o genótipo transgênico conferindo a habilidade para utilizar manose como uma fonte de carbono à planta de milho da invenção compreende um gene pmi.
Ainda em outra modalidade, a presente invenção fornece um método para produzir uma planta de milho resistente às pragas dos lepidóp- teros compreendendo: (a) sexualmente cruzando uma primeira planta de milho parente com uma segunda planta de milho parente, onde a primeira ou segunda planta de milho parente mencionadas compreendem o evento MIR162 DNA, desta forma produzindo uma pluralidade da primeira geração de plantas de progenitura; (b) selecionando uma primeira geração de planta da progenitura que é resistente a uma ou mais pragas dos lepidópteros; (c) purificando a primeira geração de planta da progenitura, desta forma produ- zindo uma pluralidade de plantas da progenitura de segunda geração; e (d) selecionado da segunda geração de plantas de progenitura, uma planta que seja resistente a uma ou mais pragas dos lepidópteros; onde as plantas da progenitura de segunda geração compreendem uma seqüência de nucleotí- deos selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, e SEQ ID NO: 59.
Em outra modalidade, a presente invenção fornece um método de produção de sementes de milho híbridas compreendendo: (a) plantando sementes de uma primeira linhagem de milho reproduzida compreendendo uma seqüência de nucleotídeos selecionada do grupo consistindo na SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, e SEQ ID NO: 59, e sementes de uma segunda linhagem reproduzida tendo um genótipo diferente; (b) cultivando plantas de milho resultantes da planta- ção mencionada até a hora da florescência; (c) castrando tais flores das plantas de uma das linhagens reproduzidas do milho; (d) cruzando sexual- mente as duas linhagens diferentes de reprodução entre si; e (e) colhendo a semente híbrida produzida deste. Num aspecto desta modalidade, a primeira linhagem de milho reproduzida fornece os parentes femininos. Em outro as- pecto desta modalidade, a primeira linhagem de milho reproduzida fornece os parentes masculinos. A presente invenção também engloba a semente híbrida produzida pelo método incorporado e as plantas híbridas cultivadas da semente.
Um técnico com conhecimentos na técnica reconhecerá que o genótipo transgênico do MIR162 pode ser introduzido pela reprodução den- tro de outras linhagens do milho compreendendo diferentes genótipos trans- gênicos. Por exemplo, um milho MIR162 reproduzido com milho pode ser cruzado com um milho reproduzido compreendendo o genótipo transgênico do evento Bt11 resistente ao lepidóptero (Patente dos EUA Nq 6.114.608 e 6.342.660, incorporada neste por referência). A semente e as plantas da progenitura resultantes possuem as características empilhadas de resistên- cia ao inseto e o espectro combinado de atividade do CryIAb e Vip3Aa20. Outra característica de empilhamento englobada pela presente invenção inclui a combinação da característica de resistência a insetos MIR162 e a característica de resistência a insetos MIR604 (Publicação do Pedido de Pa- tente dos EUA N2 2005/0216970, publicada em 29 de setembro de 2005, incorporadas neste por referência). As características empilhadas na semen- te resultante e progenitura conferem nas plantas um aumento do espectro de atividade; isto é, as plantas são ativas contra ambas as pragas de insetos lepidópteras e coleópteros.
Desta forma, a presente invenção engloba um método de prote- ger uma planta de milho transgênica dos danos causados pela alimentação de uma ou mais pragas de insetos onde o método compreende o empilha- mento na mesma planta de milho transgênica de uma característica resisten- te a insetos Vip3Aa20 com outra característica resistente a insetos que é diferente do Vip3Aa20, onde as características empilhadas protegem a plan- ta de milho contra danos causados pela alimentação de uma ou mais pragas de insetos para um grau superior do que seria esperado devido às caracte- rísticas de resistência a insetos por si só. Em um aspecto desta modalidade, a característica resistente a insetos Vip3Aa20 compreende um evento MIR162 que é empilhado com a característica resistente a insetos Cry3A055 compreendida no evento MIR604 na mesma planta de milho transgênica pelo cruzamento sexual do evento MIR162 com o evento MIR604 ou pela transformação das características juntamente dentro da mesma planta.
Exemplos de outros eventos transgênicos que podem ser cruza- dos com um MIR162 reproduzido incluem o evento GA21 tolerante a glifosa- to, o evento MON8O2 resistente a insetos lepidópteros/tolerante a glifosato, o evento DBT418 resistente a lepidópteros, o evento MS3 de esterilidade masculina, o evento B16 tolerante a fosfinotricina, o evento MON 80100 re- sistente a insetos lepidópteros, os eventos T14 e T25 tolerantes à fosfinotri- cina, o evento 176 resistente a insetos lepidópteros, e o evento MON863 resistente a coleópteros, todos estes são bem conhecidos na técnica. Será ainda reconhecido que outras combinações ou empilhamentos podem ser feitos com o genótipo transgênico da invenção e desta forma estes exemplos não devem ser vistos como limitadores.
Um técnico na técnica também reconhecerá que a semente do milho transgênica compreendendo o genótipo MIR162 pode ser tratada com vários tratamentos químicos da semente, incluindo inseticidas, para aumen- tar ou sinergizar a atividade inseticida da proteína Vip3Aa20.
A invenção descrita neste documento revela um sítio específico no cromossomo 5 no genoma do milho que é excelente para a introdução dos ácidos nucléicos heterólogos. Também é revelado um marcador molecu- lar 5' (opie2; nucleotídeos 1680-3338 da SEQ ID NO: 106) e um marcador molecular 3' (gag; nucleotídeos 43,275-45,086 da SEQ ID NO: 106) úteis na identificação.da localização de um local alvo no cromossomo 5. Desta forma, a invenção descrita fornece métodos para introduzir ácidos nucléicos heteró- Iogos de interesse dentro deste sítio alvo preestabelecido ou na vizinhança deste local alvo. A invenção descrita também engloba uma semente de mi- lho e/ou uma planta de milho compreendendo qualquer seqüência de nu- cleotídeos heteróloga inserida no local alvo revelado ou na vizinhança geral de tal local. Uma opção para executar tal integração alvo é substituir uma inserção diferente no lugar do cassete de expressão vip3Aa20 exemplificado neste documento. Com relação a isto, recombinação homóloga alvo, por e- xemplo sem limitações, pode ser usada de acordo com a invenção descrita. "Recombinação homóloga" refere-se a uma reação entre qualquer par de seqüência de nucleotídeos tendo sítios correspondentes contendo uma se- qüência de nucleotídeos similar (isto é, seqüências homólogas) através da qual as duas moléculas podem interagir (recombinar) para formar uma nova seqüência de DNA recombinante. Os sítios da seqüência de nucleotídeos similares são referidos neste como uma "seqüência de homologia". Geral- mente, a freqüência da recombinação homóloga aumenta conforme o com- primento da seqüência de homologia aumenta. Desta forma, enquanto a re- combinação homóloga pode ocorrer entre duas seqüências de nucleotídeos que são menos do que idênticas, a freqüência de recombinação (ou eficiên- cia) declina conforme a divergência entre as duas seqüências aumenta. A recombinação pode ser conquistada usando uma seqüência de homologia em cada uma das moléculas alvo e doadora, desta forma gerando um produ- to de recombinação "cruzamento único". Alternativamente, duas seqüências de homologia podem ser posicionadas em cada uma das seqüências de nu- cleotídeos doadores e alvo. A recombinação entre duas seqüências de ho- mologia no doador com duas seqüências de homologia no alvo gera um pro- duto de recombinação "cruzamento duplo". Se as seqüências de homologia na molécula do doador parear uma seqüência que deve ser manipulada (por exemplo, uma seqüência de interesse), a recombinação de cruzamento du- pio com a molécula alvo resultará num produto de recombinação onde a se- qüência de interesse substitui uma seqüência de DNA que estava original- mente entre as seqüências de homologia na molécula alvo. A troca da se- quência de DNA entre o alvo e o doador através de um evento de recombi- nação com cruzamento duplo é chamada de "substituição de seqüência." Este tipo de tecnologia é o assunto, por exemplo, da Publicação do Pedido de Patente dos EUA Ns 2006/0253918, incorporado neste por referência. Com o sítio alvo revelado agora sendo identificado e com as seqüências em volta do local alvo identificadas, o técnico com conhecimentos na técnica reconhecerá que outros métodos para a integração alvo dos ácidos nucléicos heterólogos podem ser usados. Tais métodos, por exemplo, sem limitações, são revela- dos na Publicação do Pedido de Patente dos EUA Nq 2007/0039074 e na Publicação do Pedido de Patente dos EUA Nq 2006/0130179.
Em uma modalidade, a presente invenção engloba um local alvo do cromossomo de milho localizado no cromossomo 5 entre um marcador molecular opie2 disposto como nucleotídeos 1680-3338 da SEQ ID NO: 106 e um marcador molecular gag disposto como nucleotídeos 43,275-45,086 da SEQ ID NO: 106, onde o sítio alvo compreende um ácido nucléico heterólo- go. Em outra modalidade, o sítio alvo do cromossomo de milho está locali- zado no cromossomo 5 entre os nucleotídeos 25,454 e 25,513 da SEQ ID NO: 106. Ainda em outra modalidade, o local alvo do cromossomo está pa- reado 5' pelos nucleotídeos 5,454 to 25,454 da SEQ ID NO: 106 e pareado 3' pelos nucleotídeos 25,513 a 45,513 da SEQ ID NO: 106.
Em uma modalidade, a presente invenção engloba um método de fazer uma planta de milho transgênico compreendendo a inserção de um ácido nucléico heterólogo numa posição no cromossomo 5 localizado entre um marcador molecular opie2 disposto como nucleotídeos 1680-3338 da SEQ ID NO: 106 e um marcador molecular gag disposto como nucleotídeos 43,275-45,086 da SEQ ID NO: 106. Em outra modalidade, o ácido nucléico heterólogo é inserido no cromossomo 5 entre os nucleotídeos 25,454 e 25,513 da SEQ ID NO: 106. Ainda em outra modalidade, o ácido nucléico heterólogo é pareado 5' pelos nucleotídeos 5,454 a 25,454 da SEQ ID NO: 106 e pareados 3' pelos nucleotídeos 25,513 a 45,513 da SEQ ID NO: 106.
O genótipo transgênico da presente invenção pode ser introdu- zido em qualquer milho reproduzido ou híbrido usando técnicas de reprodu- ção reconhecidas na técnica. O objetivo da reprodução da planta é combinar numa variedade única ou híbrida várias características desejáveis. Para co- lheitas do campo, estas características podem incluir resistência a insetos e doenças, tolerância a herbicidas, tolerâncias a aquecimento e seca, reduzin- do o tempo para maturidade da colheita, maior produção, e melhor qualidade agronômica. Com a colheita mecânica de muitas culturas, a uniformidade das características da planta tal como germinação, o estabelecimento das culturas, taxa de crescimento, maturidade, e altura da planta e da parte su- perior, é importante.
Colheitas do campo são reproduzidas através de técnicas que levam vantagem do método de polinização da planta. Planta é auto-polini- zada se o pólen de uma flor for transferido para a mesma ou outra flor da mesma planta. Planta tem polinização cruzada se o pólen vier de uma flor de planta diferente.
Plantas que foram autopolinizadas e selecionadas por tipo por muitas gerações tornam-se homozigotas em quase todos genes de Ioci e produzem uma população uniforme de progenitura de cruzamento verdadei- ra. Um cruzamento entre duas linhagens homozigotas diferentes produz uma população uniforme de plantas híbridas que podem ser heterozigotas para muitos genes de loci. Um cruzamento de duas plantas cada uma heterozigo- ta num número de gene de Ioci produzirá uma população de plantas híbridas que diferem geneticamente e não serão uniformes.
Milho (Zea mays L.), pode ser reproduzido por ambas as técni- cas de autopolinização e polinização cruzada. Milho possui flores femininas e masculinas separadas na mesma planta, localizadas no pendão e na espi- ga, respectivamente. A polinização natural ocorre no milho quando o vento sopra o pólen da franja para o cabelo do milho que sai do topo das espigas.
Um método confiável de controle da fertilidade masculina nas plantas oferece a oportunidade para a reprodução melhorada da planta. Isto é especialmente verdadeiro para o desenvolvimento dos híbridos do milho, que dependem de algum tipo de sistema de esterilidade masculina. Existem diversas opções para o controle da fertilidade masculina disponíveis para os reprodutores, tais como: castração manual ou mecânica (ou despendoamen- to), esterilidade masculina citoplasmática, esterilidade masculina genética, gametócitos e similares.
A semente do milho híbrido é produzida tipicamente por um sis- tema de esterilidade masculina incorporando o despendoamento manual ou mecânico. Tiras alternadas de duas linhagens de milho são plantadas no campo, e as franjas produzindo pólen são removidas de uma das linhagens (feminina). Contanto que haja isolação suficiente das fontes do pólen de mi- lho estrangeiras, as espigas das linhagens despendoadas serão fertilizadas somente da outra linhagem (masculino), e a semente resultante é desta for- ma híbrida e formará plantas híbridas.
O processo de despendoamento geralmente laboroso, e ocasio- nalmente não confiável, pode ser evitado pelo uso de um dos muitos méto- dos de conferir esterilidade masculina genética conhecido na técnica, cada um com seus próprios benefícios e desvantagens. Estes métodos usam uma variedade de aproximações tais como depositar dentro da planta um gene codificando uma substância citotóxica associada com um promotor específi- co de tecido masculino ou um sistema antissentido no qual um gene crítico para fertilidade é identificado e um antissentido para aquele gene é inserido na planta (ver: Fabinjanski, e outros EPO 89/3010153.8, publicação número 329,308 e pedido PCT PCT/CA90/00037 publicado como WO 90/08828).
O uso das linhagens estéreis masculinas é assim um fator na produção dos híbridos de milho. Técnicas de reprodução de plantas conhe- cidas na técnica e usadas num programa de reprodução de planta de milho incluem, mas não estão limitadas a, seleção recorrente, retrocruzamento, reprodução pedigree, seleção melhorada do polimorfismo do comprimento de restrição, transformação e seleção melhorada do marcador genético. O desenvolvimento dos híbridos de milho num programa de reprodução de planta de milho exige, geralmente, o desenvolvimento das linhagens de re- produção homozigotas, o cruzamento destas linhagens, e a avaliação dos cruzamentos. Métodos de reprodução por seleção recorrente e reprodução pedigree são usados para desenvolver linhagens de reprodução das popula- ções para reprodução. Programas de reprodução de planta de milho combi- nam os antecedentes genéticos de duas ou mais linhagens de reprodução ou várias outras fontes de germoplasma dentro de pools de reprodução a partir dos quais novas linhagens de reprodução são desenvolvidas e é feita a seleção dos fenótipos desejados. As novas linhagens são cruzadas com ou- tras linhagens reproduzidas e os híbridos destes cruzamentos são avaliados para determinar quais destes têm potencial comercial. Reprodução de plan- tas e o desenvolvimento de híbridos, conforme praticado num programa de reprodução de planta de milho, são processos caros e consomem tempo. Reprodução pedigree inicia com o cruzamento de dois genóti- pos, cada qual pode ter uma ou mais características desejáveis que está faltando no outro ou que complementa o outro. Se os dois parentes originais não proverem todas as características desejáveis, outras fontes podem ser incluídas na população de reprodução. No método pedigree, plantas superio- res são autofecundadas e selecionadas nas gerações sucessivas. Nas gera- ções sucessivas a condição heterozigótica dá lugar às linhagens homogê- neas como um resultado da autopolinização e seleção. Tipicamente no mé- todo pedigree de reprodução de cinco ou mais gerações de autofecundação e seleção é praticada: Fi F2; F2 F3; F3 ->F4; F4 ->F.5; etc.
Reprodução de seleção recorrente, retrocruzamento, por exem- plo, pode ser usado para melhorar uma linhagem de reprodução e um híbri- do que é feito usando aquelas linhagens. Retrocruzamento pode ser usado para transferir uma característica específica desejável de uma linhagem ou fonte para uma linhagem em que falta aquela característica. Isto pode ser conquistado, por exemplo, pelo primeiro cruzamento de uma linhagem supe- rior (parente recorrente) com uma linhagem doadora (parente não- recorrente), que carrega o(s) gene(s) apropriado(s) em questão. A progenitu- ra deste cruzamento é então acasalada novamente ao parente recorrente superior seguido pela seleção na progenitura resultante para a característica desejada para ser transferida do parente não- recorrente. Depois de cinco ou mais gerações de retrocruzamento com seleção para a característica dese- jada, a progenitura será homozigota para Ioci controlando a característica sendo transferida, mas será como o parente superior para essencialmente todos os outros genes. A última geração retrocruzada é então autofecunda- da para dar reprodução de progenitura pura para o(s) gene(s) sendo transfe- rida. Um híbrido desenvolvido das linhagens contendo o(s) gene(s) transferi- do(s) é essencialmente o mesmo como um híbrido desenvolvido das mes- mas linhagens sem o(s) gene(s) transferidos.
Linhagens de reprodução de elite, que é, puras, linhagens de reprodução homozigota, também podem ser usadas como materiais de início para reprodução ou populações fonte a partir das quais podem desenvolver outras linhagens de reprodução. Estas linhagens de reprodução derivadas das linhagens de reprodução da elite podem ser desenvolvidas usando os métodos de reprodução de seleção recorrente e reprodução pedigree men- cionados anteriormente. Como um exemplo, quando a reprodução de retro- cruzamento é usada para criar estas linhagens derivadas num programa de reprodução de planta de milho, a reprodução de elite pode ser usada como uma linhagem progenitora ou material de início ou população fonte e pode servir como parente recorrente ou doador.
Um híbrido do milho simples resulta do cruzamento de duas li- nhagens de reprodução, cada uma das quais possui um genótipo que com- plementa o genótipo da outra. A progenitura híbrida da primeira geração é designada Fi. No desenvolvimento dos híbridos comerciais num programa de reprodução de planta de milho, somente as plantas do híbrido Fi são pro- curadas. Híbridos Fi preferidos são mais vigorosos que seus parentes repro- duzidos. Este vigor híbrido, ou heterose, pode ser manifestado em muitas características poligênicas, incluindo aumento do crescimento vegetativo e da produção.
O desenvolvimento de um híbrido de milho num programa de reprodução de planta de milho envolve três etapas: (1) a seleção das plantas dos vários pools de germoplasma para cruzamentos para reprodução inicial; (2) a autofecundação das plantas selecionadas dos cruzamentos para re- produção para diversas gerações para produzir uma série de linhagens de reprodução, que embora diferentes uma da outra, reproduzem verdadeira- mente e são altamente uniformes; e (3) cruzamento das linhagens de repro- dução selecionadas com linhagens reproduzidas diferentes para produzir a progenitura híbrida (F1). Durante o processo de reprodução no milho, o vigor das linhagens diminui. O vigor é restaurado quando duas linhagens diferen- tes de reprodução são cruzadas para produzir a progenitura híbrida (Fi). Uma importante conseqüência da homozigosidade e homogeneidade das linhagens de reprodução é que o híbrido entre um par definido de reprodu- ções sempre será o mesmo. Uma vez que as reproduções que dão um hí- brido superior tenham sido identificadas, a semente do híbrido pode ser re- produzida indefinitamente enquanto a homogeneidade dos parentes repro- duzidos seja mantida.
Um híbrido simples é produzido quando duas linhagens de re- produção são cruzadas para produzir a progenitura F1. Um híbrido duplo é produzido de quatro linhagens reproduzidas cruzadas em pares (A X B e C X D) e então os dois híbridos F-i são cruzados novamente (A X Β) X (C X D). Um híbrido triplo é produzido de três linhagens reproduzidas onde duas li- nhagens reproduzidas são cruzadas (A X B) e então o híbrido Fi resultante é cruzado com o terceiro reproduzido (A X Β) X C. Muito do vigor híbrido exibi- do pelos híbridos F1 é perdido na próxima geração (F2). Consequentemente, a semente dos híbridos não é usada para estoque de plantas.
A produção de semente híbrida requer a eliminação ou inativa- ção do pólen produzido pelo parente feminino. A remoção incompleta ou ina- tivação do pólen fornece o potencial para autopolinização. Esta semente au- topolinizada inadvertidamente pode ser colhida acidentalmente e embalada com a semente híbrida.
Uma vez que as sementes são plantadas, é possível identificar e selecionar aquelas "autopolinizadas". Essas plantas "autopolinizadas" serão geneticamente equivalentes à linhagem de fêmeas congênitas utilizadas pa- ra produzir o híbrido.
Tipicamente essas plantas "autopolinizadas" podem ser identifi-
cadas e selecionadas de acordo com seu declínio no vigor. Fêmeas puras são identificadas pela sua aparência menos vigorosa para características vegetativas e/ou reprodutivas, incluindo plantas de baixa estatura, pequeno tamanho de espiga, formatos da espiga e do grão, cor do sabugo ou outras características.
A identificação dessas linhagens "autopolinizadas" também pode ser efetuada através de análises com marcadores moleculares. Ver, "The Identification of Femaie Selfs in Hybrid Maize: A Comparison Using Electro- phoresis and Morphoiogy", Smith, J. S. C. and Wych, R. D., Seed Science and Technology 14, pp. 1-8 (1995), cujas divulgações estão expressamente incorporadas neste por referência. Através dessas tecnologias, a homozigo- sidade da linhagem de "auto-polinizadas" pode ser verificada analisando a composição alélica em vários Ioci ao longo do genoma. Estes métodos per- mitem a rápida identificação da invenção descrita por referência. Ver tam- bém, "Identification of Atypical Plants in Hybrid Maize Seed by Postcontrol and Electrophoresis" Sarca, V. et al., Probleme de Genetica Teoritica si Apli- cata Vol. 20 (1) pp. 29-42.
Como é prontamente aparente para alguém conhecedor da ci- ência, os antecedentes são apenas alguma das várias maneiras inerentes pelas quais a presente invenção pode ser concebida por aqueles interessa- dos no desenvolvimento de genótipos transgênicos da invenção dentro de outras linhagens de milho. Outras maneiras estão disponíveis, e os exem- plos acima são meramente ilustrativos.
Os exemplos subsequentes têm unicamente o propósito de ilus- trar uma ou mais incorporações preferenciais da invenção e não são para serem construídos como limitador do escopo da invenção.
EXEMPLOS
Exemplo 1. Transformação e Seleção do Evento MIR162
O evento MIR604 foi produzido por uma transformação mediada pelo Agrobacterium de uma linhagem de milho (Zea mays) patenteada. Em- briões imaturos foram transformados essencialmente como descrito por Ne- grotto et al. (Plant Cell Reports 19: 798-803, 2000), referência incorporada por referência, usando um fragmento de DNA do plasmídeo pNOV1300 (SEQ ID NO: 3). pNQV1300 contém uma seqüência de nucleotídeos incluin- do cassetes de expressão arranjados. O primeiro cassete de expressão in- clui uma região promotora ZmUbiInt de um gene poliumbiquitina de Zea mays o qual contém o primeiro íntron (GenBank® Número de Acesso S94464) Έ operavelmente ligado a uma seqüência codificadora posterior vip3Aa19 E operavelmente ligada ao íntron PEPC #9 do gene fosfoenolpiru- vato carboxilase (GenBank® Número de acesso X15239) de Zea mays (Mat- suoka and Minami, 1989. European J. Of Biochem. 181:593-598) e um finali- zador de seqüência 35S do RNA 35S do mosaico de vírus genoma da cou- ve-flor (Similar ao GenBank® Número de Acesso AF140604). Sua função é promover a seqüência de poliadenilação (Franck et ai, 1980. Cell 21:285- 294). O gene vip3Aa19 em pNOV1300 inclui uma seqüência codificadora sintética/otimizada por milho, vip3Aa (Estruch, etal., 1999.) a qual foi sinteti- zada para acomodar o códon preferencial, habitual para o milho (Murray et ai, 1989). A seqüência codificadora sintética vip3Aa19 usada em transfor- mações de plantas, codifica uma seqüência de aminoácidos idêntica à se- qüência codificadora do vip3Aa1 nativo, encontrado nas bactérias do solo Bacillus thuringiensis cepa AB88 (patente US 5,877,012), com exceção de um único aminoácido diferente na posição 284; a seqüência codificadora do vip3Aa1 nativo codifica a lisina, enquanto que a seqüência codificadora do vip3Aa19 sintético codifica a glutamina nesta posição. A seqüência codifica- dora vip3Aa 19 codifica uma proteína de controle de insetos, a Vip3Aa19 que promove resistência aos insetos lepidópteros. O segundo cassete de ex- pressão é compreendido pelo promotor ZmUbiInt operavelmente ligado a uma seqüência codificadora pmi (também conhecido como E.coli manA), codificando a fosfomanose isomerase (GenBank® Número de Acesso M15380), a qual catalisa a isomerização da manose-6-fosfato para frutose-6- fosfato (Negrotto etal., 2000). A seqüência codificadora pmié posteriormen- te ligada a uma terminação da transcrição final da nopalina sintase 3' e à seqüência de poliadenilação.
Embriões imaturos foram extirpados entre 8-12 dias de idade e enxaguados em meio de cultura recém preparado para a transformação. Os embriões foram agitados com a suspensão de células de Agrobacterium a- brigando o vetor de transformação pNOV1300, agitando em vortex durante 30 segundos, seguido por mais 5 minutos de incubação. A solução em ex- cesso contendo Agrobacterium foi aspirada e os embriões foram movidos para placas contendo um meio de cultura não seletivo. Embriões foram co- cultivados com o Agrobacterium remanescente a 22 □ C por 2-3 dias ao abri- go da luz. Embriões foram transferidos para um meio de cultura suplementa- do com ticarcilina (100 mg/ml) e nitrato de prata (1,6 mg/l) sendo incubados ao abrigo da luz por 10 dias. Embriões produzindo o calo embriogênico fo- ram transferidos para o meio de cultura celular contendo manose. As plântulas regeneradas foram testadas pela análise TAQMAN® PCR (ver Exemplo 2) para a presença de ambos os genes pmi e vip3Aa19, tão bem como pela ausência do gene de resistência ao antibiótico especti- nomicina {spec). Foi descoberto posteriormente (ver abaixo Exemplo 4) que durante o processo de transformação duas mutações foram introduzidas dentro da seqüência codificadora vip3Aa19, uma das quais resultou em uma mudança no aminoácido da proteína Vip3Aa19. Consequentemente essa nova seqüência codificadora vip3Aa o qual é única para o evento MIR162, foi designada vip3Aa20. A seqüência codificadora vip3Aa20 codifica a iso- Ieucina na posição 129 no local de um resíduo de metionina codificado pelo gene vip3Aa19.
Plantas positivas para ambos transgenes, e negativas para o gene spec, foram transferidas para uma estufa para propagação posterior. Os eventos positivos foram identificados e triados usando bioensaios com insetos contra a lagarta de cereais. Os eventos inseticidas foram caracteri- zados como número de transcrição pela análise TAQMAN. MIR162 foi esco- lhido para análise posterior por ter uma seqüência única de transcrição dos transgenes, boa expressão da proteína identificada por ELISA, e boa ativi- dade inseticida contra a lagarta de cereais.
O pedigree da produção do evento MIR162 foi como segue: T0 MIR162 planta (χ NPH8431)-» -» NPH8431 (MIR162) Fi (χ NP2161) NP2161(MIR162) F1 (χ NP2161) -> NP2161 (MIR162) BC1 Fi (x B9620)^Fi (χ B9620) BCIF1 (χ B9620) BC2F! (x B9620)JBC3Fi (x B9620) BC4Fi (χ B9620). O material vegetal da geração BC4 foi usado para a análi- se Southern, determinação da transcrição e seqüência do DNA inserido. Controles negativos para os experimentos consistem de 10 plantas segrega- das da geração BC4.
Exemplo 2. Detecção de MIR162 por TAQMAN PCR
A análise TAQMAN foi essencialmente conduzida como descrita em Ingham et aí. (Biotechniques, 31:132-140, 2001), referência incorporada por referência. DNA genômico foi isolado de folhas de plantas de milho poços. Para o controle do gene endógeno do milho, "iniciadores" e as son- das foram projetados especificamente para a seqüência codificadora de ál- cool/desidrogenase (adhl) de Zea mays (Genbank N0 de Acesso AF044295). Será reconhecido por uma pessoa habilidosa que outros genes do milho po- dem ser usados como controles endógenos. Reações foram multiplicadas 20 para amplificação simultânea de vip3Aa e adhl ou pmi e adhl. Para cada amostra, uma mistura principal foi gerada pela combinação de 20 μΙ_ do ex- trato de DNA genômico com 35 μΙ_ 2x TAQMAN Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems) suplementado com "iniciadores" para uma concentra- ção final de 900 nM cada, sondas para uma concentração final de 100 nM cada, e água para completar um volume final de 70μΙ_. Esta mistura foi dis- tribuída dentro de três replicatas de 20 μΐ_ cada uma em placas de amplifica- ção de 96-poços seladas com filme termosselante e transparente (Marsh Bio Products). PCR foi executado em um instrumento ABI Prism 7700 usando os seguintes parâmetros de amplificação: 2 min a 50°C e 10 min a 95°C, segui- dos de 35 ciclos de 15 s a 95°C e 1 min a 60°C.
Resultados da análise TAQMAN demonstraram que o evento MIR162 possuía uma cópia do gene vip3Aa20 e uma cópia do gene pmi. Os iniciadores e as sondas que foram utilizados nas reações TAQMAN PCR, são mostrados na Tabela 1. Tabela 1. "Iniciadores" usados no ensaio TAQMAN.
<table>table see original document page 44</column></row><table> Exemplo 3. Detecção de MIR162 por blot Southern
O DNA genômico utilizado para a análise Southern foi separado do tecido de folha empoçado de 10 plantas representando a geração BC4 de MIR162 usando essencialmente o método de Thomas et al. (Theor. Appl. Genet. 86:173-180, 1993), referência incorporada por referência. Todas as plantas usadas para isolamento do DNA foram individualmente analisadas usando TAQMAN PCR (como descrito no Exemplo 2) para confirmar a pre- sença de uma única cópia do gene vip3Aa20 e do gene pmi. Para os contro- les negativos segregados, o DNA foi separado do tecido de folha empoçado dos segregados negativos da geração BC4. Essas plantas negativas segre- gadas foram individualmente analisadas usando TAQMAN PCR para confir- mar a ausência dos genes vip3Aa20 e pmi, mas foram, como esperado, po- sitivas para o gene de milho endógeno adhl.
A análise Southern foi conduzida usando técnicas convencionais de biologia molecular (Ver Chomczynski, P. 1992. Analytical Biochemistry 201:34-139). O DNA genômico (7.5 pg) foi digerido com enzimas restritoras que digerem dentro do suplemento do evento MIR162, mas não dentro da seqüência codificadora que corresponde a uma sonda específica usada no experimento. Esse avanço permitiu a determinação de um número de cópias de cada gene, correspondendo a uma sonda específica usada para cada análise Southern, o qual foi incorporado dentro do evento MIR162.
Outras séries de digestões restritoras foram conduzidas nas quais o suplemento foi digerido com enzimas de restrição que poderiam libe- rar um fragmento de um tamanho conhecido do suplemento. Esse avanço fornece evidência adicional para a presença de uma única cópia de cada seqüência codificadora presente no MIR162 e permitiu uma detecção de có- pias parciais do suplemento, que podem estar intimamente ligadas ao su- plemento MIR162. Dando seqüência a uma eletroforese em gel de agarose e uma transferência alcalina para uma Zeta-Sonda® de membrana GT (Bio- Rad, Cat. N2 162-0195), as hibridizações foram conduzidas usando as son- das PCR de elementos geradas em comprimento total. As sondas foram marcadas com 32P via impregnação aleatória usando o sistema MegaPrime® (Amersham Biosciences, Cat. N- RPN1607). A hibridização foi conduzida a 65°C, seguida de enxágues múltiplos em 2X SSC,0,1% SDS e depois 0,1 X SSC e 0.1% SDS. As membranas foram submetidas à auto-radiografia. Inclusas em cada análise Southern estão três amostras controle:
(1) DNA de um segregado negativo (não-transformado) usado para identifi- car quaisquer seqüências endógenas Zea mays que possam hibridizar- cruzado com a sonda específica-elemento; (2) DNA de um segregado nega- tivo interno o qual é introduzido em uma quantidade de pNOV1300 digerido que é equivalente a um número de cópias no tamanho do plasmídeo intro- duzido, para demonstrar a sensibilidade do experimento em detectar uma única cópia contendo o genoma de Zea mays e (3) Plasmídeo pNOV130O digerido análogo a um número de cópia baseado no tamanho do plasmídeo, para agir como controle positivo para hibridização tão bem como para de- monstrar a sensibilidade do experimento.
Os resultados da análise Southern demonstraram que o suple- mento MIR162 contém uma única cópia dos genes vip3Aa20 e pmi e não contém as seqüências determinadoras de pNOV1300. Uma sonda vip3Aa19 (SEQ ID NO: 13) foi utilizada para a análise Southern de vip3Aa20. As se- qüências dos nucleotídeos vip3Aa19 e vip3Aa20 diferem por dois nucleotí- deos e são 99,9 % idênticas. Por esta razão a sonda vip3Aa19 hibridizada para a seqüência presente em MIR162 sob condições precisas. Usando a sonda vip3Aa19, uma digestão de Kpn\ e EcoRV resultou em bandas sim- ples de hibridização com aproximadamente 8 kb e 13 kb de tamanho, res- pectivamente. Além do mais, uma dupla digestão Nco\ resultou em uma úni- ca banda de hibridização coerente com o tamanho esperado de 4.6 kb. U- sando uma sonda pmi (SEQ ID NO: 14), uma digestão Acc65\ e uma SamHI resultaram em únicas bandas de hibridizações com tamanho aproximado de 4 kb e 6 kb, respectivamente. Além disso, uma dupla digestão Xma\ + HindlW resultou em uma única banda de hibridização coerente com o tamanho es- perado de 8.1 kb. A banda 8.1 kb Xma\ + HZndllI pNOV1300 (controle positi- vo) também hibridizou com as sondas vip3Aa19e pmi conforme o esperado. Alguma hibridização cruzada no caminho do "plasmídeo-único" com a esca- da de sonda do DNA foi detectada. Tipicamente escadas de DNA disponí- veis comercialmente, podem conter algumas seqüências de vetor que po- dem cruzar hibridizadamente com as seqüências do plasmídeo controle con- forme observado nesses experimentos, porém não impactam as descobertas deste estudo. Finalmente, a sonda determinante não hibridizou demonstran- do a ausência de qualquer incorporação de seqüências do vetor pNOV1300 dentro do MIR162 durante os processos de transformação.
Exemplo 4. Seguenciamento do suplemento do DNA Heteróloqo
A seqüência de nucleotídeos do vip3Aa e pmi das seqüências codificadoras na molécula de DNA heteróloga inserida em MIR162 foi de- terminada por demonstrar integridade total do suplemento, contiguidade dos elementos funcionais e por detectar quaisquer mudanças individuais no par de bases. As seqüências codificadoras foram amplificadas do DNA derivado da geração BC4. A amplificação PCR foi conduzida usando um dos sistemas Expand High Fidelity PCR (Roche, Cat. N2 1732650) ou PhAJItra® Hotstart High-Fidelity DNA polimerase (Stratagene, Cat. N2 600390). Cada um dos produtos da PCR foi clonado individualmente dentro seja pelo vetor pCR®- XL-TOPO (Invitrogen, Cat. N2 K4700-20), ou pelo vetor pCR®-Bluntll-TOPO (Invitrogen, Cat. N2 K2800-20) e, três clones separados para cada produto da PCR foram identificados e sequenciados. Sequenciamento foi conduzido usando um analisador ABI3730XL baseado em ABI BigDye® 1.1 ou química Big Dye 3.1 dGTP (para padrões enriquecidos para CG). A análise seqüen- cial foi feita usando o Phred1 Phrap, e pacote Consed da Universidade de Washington e conduzida em uma taxa de erro inferior a 1 em 10.000 bases (Ewing & Green, 1998. Genome Research 8:186-194). O consenso final da seqüência de cada gene foi determinado pela combinação dos dados se- qüenciais de cada um dos três clones individuais para gerar um consenso para seqüência de cada gene. O alinhamento seqüencial foi conduzido u- sando o programa CIustaIW utilizando os seguintes parâmetros: scoring ma- trix blosum55, gap opening penalty 15, gap extension penalty 6.66 (Thomp- son etal, 1994. Nucleic Acids Research 22:4673-4680).
PCR usando os "iniciadores" MOV3Aa-01-5': 5'ATGAACAAGAACAACACCAA3' (SEQ ID NO: 15) e MOV3Aa-01-3': 5'CTACTTGATGCTCACGTCGTAG3' (SEQ ID NO: 16) e enzima PfuUItra Hotstart gerando um produto 2370bp. O "amplicon" PCR foi sequenciado usando os "iniciadores" mostrados na Ta- bela 2.
A seqüência codificadora completa do vip3Aa20 foi amplificada por
Tabela 2.
<table>table see original document page 47</column></row><table> <table>table see original document page 48</column></row><table>
Duas outras reações PCR se sobrepuseram à seqüência codificadora completa do vip3Aa20. O final 5' de vip3Aa20io\ coberto com uma amplificação PCR usando os "iniciadores" 162INSERT-F2: 5'ACACCAATGATGCAAATAGGC3' (SEQ ID NO: 36) e VIP_R4 5'GAAGGTGTTCAGGTAGAACTCGAAG3' (SEQ ID NO: 37) e enzima "Expansora de Alta Fidelidade". A segunda reação cobriu o final 3' de vi'p3Aa20, o produto foi amplificado com os "iniciadores" VIP-F3: 5'GGTGCTGTTCGAGAAGAGGT3' (SEQ ID NO: 42) e PMI_REV1: 5'CGATTTATCACTCTCAATCACAT3' (SEQ ID NO: 43) e enzima "Expanso- ra de Alta Fidelidade". Os "amplicons" gerados por estas reações compreen- dem uma seqüência de nucleotídeos 2946 bp (SEQ ID NO: 38) e uma se- qüência de nucleotídeos 2577 bp (SEQ ID NO: 44), respectivamente.
O consenso dos dados seqüenciais revelaram duas mudanças nos nucleotídeos na seqüência codificadora de vip3Aa em MIR162 (desig- nada vip3Aa20) comparada à seqüência codificadora do vip3Aa em pNOV1300 (designada vip3Aa19), a qual foi usada para transformar MIR162. A primeira mudança de nucleotídeos, uma mutação de G para T, ocorreu na posição 387 da seqüência codificadora do vip3Aa19 (SEQ ID NO: 3). Essa mutação resultou na metionina na posição 129 de Vip3Aa19 sendo trocada por uma isoleucina em Vip3Aa20 (M129I). A segunda mudança de nucleotí- deos ocorreu na posição 1683 da seqüência codificadora ocasionando uma mutação de G para C, porém não resultou em uma mudança de aminoáci- dos. Consequentemente, a seqüência codificadora de vip3Aa20 e da proteí- na Vip3Aa20 são únicas para o evento MIR162 e podem ser usadas para identificar qualquer planta compreendendo o genótipo transgênico MIR162. A seqüência codificadora pmi, MIR162 foi idêntica àquela na transformação do plasmídeo pNOV13(X). Um alinhamento das proteínas inseticidas Vip3Aa20 e Vip3Aa19 é mostrado na Tabela 3.
Tabela 3. Comparação das seqüências de aminoácidos de Vip3Aa20 e Vip3Aa19.
<table>table see original document page 49</column></row><table> <table>table see original document page 50</column></row><table> A caixa sombreada indica a mudança no aminoácido. Exemplo 5. Análise da Seqüência de Pareamento do DNA
Um número de métodos é conhecido por aqueles com habilidade na técnica de amplificar seqüências de DNA desconhecido adjacentes a uma região nuclear de seqüência conhecida. Esses métodos incluem, mas não são limitados por PCR inverso (iPCR) [Ochman et. al., Genetics 120:621-623 (1988); Triglia et. al., Nucleic Acids Res. 16:8186 (1988)], PCR "cabo de ca- çarola" [Jones e Winistorfer, Nucleic Acids Res. 20:595-600 (1992); Jones e Winistorfer, Biotechniques 23:132-138 (1997)], PCR ligação-ancorada casse- te [Mueller e Wold, Science 246:780-786 (1989)], PCR-vetorette [Riley et. al., Nucleic Acids Res. 18:2887-2890 (1990)], novo-Alu-PCR [Puskas et. al., Nu- cleic Acids Res. 22:3251-3252 (1994)] e PCR Interlaceamento Termo- Assimétrico (TAIL-PCR) [Liu e Whittier, Genomics 25:673-681 (1995)].
Um método utilizado pra amplificar o genoma do DNA do milho, seqüência de pareamento do DNA heterólogo dentro do evento MIR162, foi PCR vetorette essencialmente como descrito por Riley et al., Nucleic Acids Res. 18:2887-2890 (1990), referência incorporada por referência.
A seqüência de pareamento 5' e a seqüência de junção foram confirmadas usando procedimentos PCR padrão. Os pares do "iniciador" sequentes, ou complementos dele, foram usados para confirmar a seqüên- cia: 162INSERT-F2: 5'ACACCAATGATGCAAATAGGC3' (SEQ ID NO: 36)/ VIP_R4: 5'GAAGGTGTTCAGGTAGAACTCGAAG3' (SEQ ID NO: 37) e CJB179: 5'ATGCAAATAGGCTGGGAATAGTC3' (SEQ ID NO: 39)/ CJB134 .5'GTACCAGCTTGCTGAGTGGCT3' (SEQ ID NO: 40). O "amplicon" resul- tante teve a seqüência mostrada em SEQ ID NO: 41 e compreende a se- qüência de junção 5' do SEQ ID NO: 45. Será reconhecido que outras se- quências de "iniciador" podem seu utilizadas para confirmar as seqüências de pareamento e de junção. Usando este método, o suplemento MIR162 foi encontrado como sendo pareado a 5' pelos nucleotídeos 1040-1088 da se- qüência genômica do milho mostrada em SEQ ID NO: 46.
Uma região mais ampla da seqüência de pareamento 5' do e- vento MIR162 foi gerada usando o kit Seegene DNA Walking SpeedUp® Premix seguindo as instruções do fabricante.
Uma primeira reação PCR foi conduzida independentemente em quarto tubos individuais usando "iniciador" FE1002:
.5'CGTGACTCCCTTAATTCTCCGCT3' (SEQ ID NO: 50) com uma dos "inici- adores" DW-ACP 1, 2, 3, ou 4 fornecidos pelo fabricante. Os seguintes rea- gentes foram misturados em um tubo PCR em gelo: 100 pg DNA genômico MIR162, 4 μΙ 2,5 μΜ DW-ACP (um de cada com o DW-ACP 1, 2, 3, ou 4), 4 μΙ 2,5 μΜ FE1002, 19 μΙ água destilada, e 25 μΙ 2X SeeAmpTM ACPTM Master Mix II. Os tubos foram submetidos à preaquecimento num ciclador térmico (94°C). PCR foi completado usando o seguinte protocolo: um ciclo a .94°C por cinco minutos, 42°C por um minuto e, 72°C por dois minutos, 30 ciclos de 94°C por 40 segundos, 55°C por 40 segundos, e 72°C por 90 se- gundos, e um ciclo a 72°C por sete minutos. Os produtos do PCR foram puri- ficados usando exonuclease I e fosfatase alcalina de camarão.
Uma segunda reação PCR foi conduzida em quatro tubos indivi- duais usando "iniciador" FE1003: 5'GATCAGATTGTCGTTTCCCGCCTT3' (SEQ ID NO: 51) com o "iniciador" DW-ACPN fornecido pelo fabricante do kit. Os seguintes reagentes foram misturados em um tubo PCR em gelo: 3 μΙ do produto PCR purificado, 1 μΙ 10 μΜ DW-ACPN, 1 μΙ 10 μΜ FE1003, 5 μΙ água destilada, e 10 μΙ 2X SeeAmpTM ACPTM Master Mix II. Os tubos fo- ram submetidos à pré-aquecimento (94°C) em ciclador térmico. PCR foi completado adotando o seguinte protocolo: um ciclo a 94°C por cinco minu- tos, 35 ciclos a 94°C por 40 segundos, 60°C por 40 segundos, e 72°C por 90 segundos, e um ciclo a 72°C por sete minutos.
Uma terceira reação PCR foi conduzida independentemente em quatro tubos individuais usando o "iniciador" FE1004:5'GATTGTCGTTTCCCGCCTTCAGTT3' (SEQ ID NO: 52) com o "iniciador Universal" fornecido pelo fabricante. Os seguintes reagentes foram mistura- dos em tubo PCR em gelo: 2 μΙ de produto PCR purificado, 1 μΙ 10 μΜ "inici- ador Universal", 1 μΙ 10 μΜ FE1004, 6 μΙ água destilada, e 10 μΙ 2X See- AmpTM ACPTM Master Mix II. Os tubos foram submetidos à pré- aquecimento (94°C) em ciclador térmico. PCR foi completado adotando o seguinte protocolo: um ciclo a 94°C por cinco minutos, 35 ciclos a 94°C por .40 segundos, 60°C por 40 segundos, e 72°C por 90 segundos, e um ciclo a .72°C por sete minutos.
Dez μΙ dos produtos do PCR foram corridos em gel de agarose contendo 1% brometo de etídio. A banda apropriada foi extraída do gel de agarose e purificada usando um kit de extração Qiagen Qiaquick Gel de a- cordo com as instruções do fabricante. O DNA extraído foi clonado em um vetor de clonagem Invitrogen TOPO-XL de acordo com as instruções do fa- bricante. Este clone foi transformado dentro de E. coli, e o DNA do plasmí- deo foi extraído das células após uma noite crescendo com um kit Qiagen Miniprep de acordo com as instruções do fabricante. Este plasmídeo foi utili- zado para eluir o sequenciamento.
Um novo "iniciador" foi projetado contendo uma nova seqüência previamente conhecida, para ser usada com um "iniciador" no suplemento do DNA heterólogo para amplificar a completa seqüência de pareamento 1 kb fora da seqüência de pareamento do "iniciador" do DNA genômico. A se- qüência de pareamento do "iniciador" 162DWConf3: .5'CCTGTGTTGTTGGAACAGACTTCTGTC3' (SEQ ID NO: 53) e suplemento do DNA "iniciador" FE0900: 5'GGCTCCTTCAACGTTGCGGTTCTGTC3' (SEQ ID NO: 54) foram usados para amplificar a molécula de ácido nucléico contendo a seqüência de pareamento 5' para confirmação. A seqüência do "amplicon" resultante é publicada em SEQ ID NO: 55. Este "amplicon" 5' compreende a seqüência de junção 5' publicada em SEQ ID NO: 45. Dez μΙ do produto PCR ("amplicon") foram corridos em gel de agarose contendo 1% de brometo de etídio. A banda apropriada foi extraída do gel de agarose e purificada usando um kit de extração Qiagen Qiaquick Gel de acordo com as informações do fabricante. O DNA extraído foi clonado dentro de um vetor de clonagem Invitrogen TOPO-XL de acordo com as instruções do fabricante. Este clone foi transformado dentro de uma E. coli. O DNA do plasmídeo foi extraído das células após crescimento noturno em meio de cultura com um kit Qiagen Miniprep seguindo as instruções do fabricante. Três plasmídeos foram comple- tamente sequenciados usando os "iniciadores" mostrados na Tabela 4. As seqüências dos plasmídeos foram alinhadas para gerar a confirmação com- pleta da seqüência de pareamento 5'. Usando este método aproximadamen- te, 1 kb da seqüência de pareamento 5' (SEQ ID NO: 46) foi determinada.
Tabela 4. Seqüências do "Iniciador".
<table>table see original document page 53</column></row><table> A seqüência de pareamento 3' do evento MIR162 foi gerada u- sando um "kit Universal" Clonetech GenomeWalker™ (Clonetech Laboratori- es, Inc.) seguindo as instruções do fabricante.
Primeiro, poços de adaptador-ligado aos fragmentos de DNA genômico não clonado, conhecidos como "bibliotecas" GenomeWalker foram construídas. Cada biblioteca foi construída pela digestão do DNA genômico MIR162 com uma enzima restritora (Dra\, EcoRV1 PviAl, Stu\, and Xmn\) como se segue: por exemplo, 25 μΙ de DNA genômico MIR162 (0.1 Mg/μΙ), 8 μ da enzima restritora (10 unids/μΙ), 10 μΙ do tampão para enzima restritora (10X), e 57 μΙ H2O destilada foram misturados em um tubo e incubados a 37°C por uma noite.
DNA foi então purificado realizando várias series de extração de fenol/ clorofórmio. Finalmente, o DNA foi precipitado e lavado com etanol, seco e dissolvido em 20 μΙ de tampão TE.
Para ligar o adaptador GenomeWalker no final do DNA genômi- co do MIR162, 4μΙ do DNA genômico purificado e digerido, foi misturado com 1,9 μΙ do adaptador GenomeWalker (25 μΜ), 1,6 μΙ 10X Tampão de Li- gação, e 0,5 μΙ T4 DNA Ligase (6 unids/μΙ). Essas reações foram incubadas por uma noite a 16°C. As reações foram paralisadas com incubação a 70°C por cinco minutos. Após a parada da reação, 72 μΙ de TE foram adicionados em cada tubo, e os conteúdos foram agitados completamente.
Uma primeira reação PCR foi conduzida usando "iniciador" AP1, fornecido pelo fabricante, com "iniciadores" diferentes projetados contendo seqüência conhecida do suplemento de DNA heterólogo (Ciclo 1 "iniciadores específicos do gene" ou "GSP1"). Os seguintes reagentes foram misturados em um tubo PCR em gelo: 1 μΙ do DNA MIR162 apropriado da biblioteca, 1 μΙ 10 μΜ AP1, 1 μ110 μΜ GSP1, 1 μΙ 10 mM dNTPs, 5 μΙ 10Χ Tampão Advantage 2 PCR, 1 μΙ of BD Advantage 2 polimerase, e 40 μΙ água destilada. PCR foi completado adotando o seguinte protocolo: sete ciclos a 94°C por 25 segundos e 72°C por quatro minutos, 32 ciclos a 94°C por 25 segundos e 67°C por quatro minutos e, um ciclo a 67°C por quatro minutos. Cada reação PCR primária foi diluída 50 vezes pela adição de 1 μΙ do produto PCR primário, com .49 μΙ de água destilada. As reações que funcionaram foram (1) as bibliotecas Dral e Xmnl com o iniciador GSP1 162GW3F1:
5'TCTCTTGCTAAGCTGGGAGCTCGATCCG3' (SEQ ID NO: 56) e "inicia- dor" AP1.
Uma segunda reação PCR foi conduzida independentemente usando "iniciador" AP2, fornecido pelo fabricante, com diferentes "iniciado- res" projetados contendo a seqüência conhecida do suplemento DNA hete- rólogo (Ciclo 2 "iniciadores específicos do gene" ou "GSP2"). Os seguintes reagentes foram misturados em um tubo PCR em gelo: 1 μΙ do produto PCR primário apropriado, 1 μΙ 10 μΜ AP2, 1 μΙ 10 μΜ GSP2, 1 μΙ 10 mM dNTPs, 5 μΙ 10Χ Tampão Advantage 2 PCR, 1 μΙ of BD Advantage 2 polimerase, e 40 μΙ água destilada. PCR foi completado adotando o seguinte protocolo: cinco ciclos a 94°C por 25 segundos e 72°C por quatro minutos, 20 ciclos a 94°C por 25 segundos e 67°C por quatro minutos, e um ciclo a 67°C por quatro minutos. As reações que funcionaram foram (1) as bibliotecas Dral e Xmnl com o "iniciador" GSP2, 162GW3F2:
.5'AAGATTGAATCCTGTTGCCGGTCTTGCG3' (SEQ ID NO: 57) e "iniciador" AP2.
Dez μΙ dos produtos do PCR foram corridos em um gel de aga- rose contendo 1 % de brometo de etídio. A banda apropriada foi extraída do gel de agarose e purificada usando um kit de extração Qiagen Qiaquick Gel de acordo com as instruções do fabricante. O DNA extraído foi clonado den- tro de um vetor de clonagem Invitrogen TOPO-XL de acordo com as instru- ções do fabricante. Esse clone foi transformado dentro de uma E. coli, e o DNA do plasmídeo foi extraído das células após uma noite de crescimento, usando um kit Qiagen Miniprep seguindo as instruções do fabricante. Esse plasmídeo foi sequenciado usando sequenciamento final de eluição.
Um novo "iniciador" foi projetado contendo uma nova seqüência previamente conhecida, para ser usada com um iniciador no DNA suplemen- tar para amplificar aproximadamente 1 kb da seqüência de pareamento de 3' fora do DNA genômico. O "iniciador" de DNA suplementar 162GW3F1: 5'TCTCTTGCTAAGCTGGGAGCTCGATCCG3' (SEQ ID NO: 56) e um "inici- ador" de seqüência de pareamento 3' 1623'GWR1: 5CTGGTGAACCGA Illll ACGGAGG3' (SEQ ID NO: 58) foram usados pa- ra amplificar uma molécula de ácido nucléico compreendendo a seqüência de pareamento 3' para confirmação. A seqüência do "amplicon" resultante é publicada em SEQ ID NO: 59. Esse "amplicon" 3' compreende a seqüência de junção 3' publicado em SEQ ID NO: 47. Dez μΙ do "amplicon" PCR foi elu- ído em gel de agarose contendo 1 % de brometo de etídio. A banda apropri- ada foi extraída do gel de agarose e purificada, usando um kit de extração Qiagen Qiaquick Gel de acordo com as instruções do fabricante. O DNA ex- traído foi clonado dentro de um vetor de clonagem Invitrogen TOPO-XL de acordo com as instruções do fabricante. Esse clone foi transformado dentro de E. coli. DNA do plasmídeo foi extraído das células após crescimento em meio de cultura durante a noite, com um kit Qiagen Miniprep, de acordo com as instruções do fabricante. Três plasmídeos foram completamente sequen- ciados usando os "iniciadores" mostrados na Tabela 5. As seqüências dos plasmídeos foram alinhadas para gerar a confirmação completa da seqüên- cia de pareamento 3' (SEQ ID NO: 48).
Tabela 5. Seqüência do "Iniciador".
Nome do "Iniciador" Seqüência (5'—>3') N0 da seqüência b00106a GATTGAATCCTGTTGCC SEQ ID NO: 81 b00106b TCTCAT AAAT AACGTCATGC SEQ ID NO: 82 b00108a TCTGTGGATAACCGTATTAC SEQ ID NO: 83 b00201h TTCACGGGAGACTTT ATCTG SEQ ID NO: 60 b00605a CCGATTCATT AATGCAG SEQ ID NO: 61 b00704h AATAATATCACTCTGTACATCC SEQ ID NO: 64 b00712e AGTAACATAGATGACACCGC SEQ ID NO: 84 b01106a CCAGTGTGCTGGAATTCG SEQ ID NO: 85 b01106f GTTGTAAAACGACGG SEQ ID NO: 65 b01107h CCAGTGTGATGGAT ATCTGC SEQ ID NO: 86 b01108e CCAGTGTGCTGGAATTCG SEQ ID NO: 87 b01111f CCAGTGTGATGGAT ATCTGC SEQ ID NO: 88 b01709f TAG G C ACCCC AG G CTTTA SEQ ID NO: 66 b02701a GTGTGCTGGAATTCGCCCTT SEQ ID NO: 89 b02701e TATCTGCAGAATTCGCCCTT SEQ ID NO: 90 b02702a GTGTGCTGGAATTCGCCCTT SEQ ID NO: 91 <table>table see original document page 57</column></row><table>
Exemplo 6. Detecção da proteína Vip3Aa20 em MIR162 por ELISA
Os extratos foram preparados das folhas, raízes, cerne, caroço, seda, pólen e das plantas completas MIR162. Elas foram quantitativamente analisadas para Vip3Aa20 por ELISA usando imunoafinidade, anti-Vip3A purificada de cabra, proteína Α-purificada de coelho e anticorpos policlonais anti-Vip3A usando método conhecido como procedimento ELISA. Vip3Aa20 foi detectado em todos os tecidos analisados para todos os estágios de cres- cimento. O significado do nível de proteína Vip3Aa20 detectado em planta inteira durante a florescência e maturidade da semente foi 10 μg/g peso fresco e 16 μg/g peso fresco, respectivamente. O significado dos níveis de proteína Vip3Aa20 nas folhas durante a florescência foi 22 μg/g peso fresco. Exemplo 7. Eficácia do MIR162 em campo.
O evento MIR162 foi testado em campo para a eficácia contra lagarta de cereais (FAW, Spodoptera frugiperda), lagarta do milho (CEW, Helicoverpa zea), lagarta rosca (BCW, Agrotis ipsilon), e broca do milho Eu- ropeu (ECB, Ostrinia nubilalis). Performance do evento MIR162 foi compara- da àquela do Warrior® (Syngenta, Inc.), um inseticida convencional padrão aplicado em uma taxa de 11,2 g a.i./acre, evento milho transgênico Bt11, compreendendo um gene crylAb, e um híbrido Bt11 X MIR162, produzido pelo cruzamento de uma linhagem inata Bt11 com uma linhagem inata MIR162.
Vinte e oito provas foram plantadas em 13 estados que repre- sentam as maiores regiões de cultivo de milho dos Estados Unidos continen- tal. Provas foram plantadas randomicamente em blocos completos projeta- dos com quatro canteiros replicados em cada bloco. Os canteiros possuíam .5,334 metros (17,5 pés) por fileira por tratamento por replicação. A densida- de de plantio objetivada era de aproximadamente 30.000 plantas/acre. Fai- xas do Immunodiagnóstico foram utilizadas para confirmar a presença ou a ausência das proteínas Vip3Aa20 e CryIAb em diferentes grupos de trata- mento.
Pestes de infestações naturais que foram utilizadas nas provas onde as populações eram suficientemente altas; onde não o eram, infesta- ções artificiais foram induzidas. Infestação artificial com dois, 2o - ao 3o "ins- tar" Iarval a V1-V2, foi utilizado nas provas BCW. Os canteiros foram avalia- dos a 3, 7, e 14 dias pós-infestação. Os danos em BCW foram relatados como plantas parcialmente danificadas e plantas completamente cortadas. Os canteiros FAW foram avaliados 7 e 14 dias pós-infestação ou após o 3o estágio Iarval foram observados nas plantas controle. A seguinte escala foi usada para avaliar os danos nas folhas em FAW e CEW:
- Nenhum dano visível à folha
- Dano buraco-de-alfinete em poucas folhas
- Pequena quantidade de buraco-de-tiro em poucas folhas
- Dano buraco-de-tiro em várias folhas
- Dano buraco-de-tiro e lesões em poucas folhas
- Lesões em várias folhas
- Lesões amplas em várias folhas
- Lesões amplas e porções devoradas em poucas folhas
- Lesões amplas e porções devoradas em várias folhas
- Lesões amplas e porções devoradas na maioria das folhas
Danos nas plantas foram estimados para ambos, primeira e se- gunda geração ECB. A seguinte escala foi usada para classificar danos da primeira geração, tipicamente quando as larvas do 3o ao 4o "instar": .1 - Nenhum dano visível às folhas
.2 - Pequena quantidade de feridas buraco-de-tiro em poucas
folhas
.3 - Feridas buraco-de-bala comuns em várias folhas
.4 - Várias folhas com buracos-de-tiro e lesões alongadas
.5 - Várias folhas com lesões alongadas
.6 - Várias folhas com lesões alongadas cerca de 2,5 cm
.7 - Lesões longas comuns em cerca de metade das folhas
.8 - Lesões longas comuns em cerca de dois terços das folhas
- Maioria das folhas com lesões longas
Danos à segunda geração ECB foram estimados de três a qua- tro semanas após infestação artificial ou ao final do período de postura de ovos. As seguintes medições foram tomadas: número de larvas vivas/talo, número de larvas vivas/pé, Número de larvas vivas/espiga, Número de tú- neis/talo, comprimento cumulativo do túnel (cm)/talo, comprimento cumulati- vo do túnel(cm)/pé, Número de túneis/espiga, comprimento cumulativo túnel dano no caroço (cm)/espiga, e % de plantas infestadas.
As provas CEW foram geralmente plantadas tardiamente para aumentar os níveis de infestação natural. O dano por alimentação das espi- gas foi avaliado quando larvas CEW nas plantas controle estavam em está- gio de crescimento L5-L6. Espigas avaliadas incluíram o registro do número de larvas observado por espiga e o comprimento visível do túnel por alimen- tação do caroço, medindo da ponta da espiga até a média do caroço mais baixo destruído.
Os resultados do teste de BCW em campo são mostrados na Tabela 6. Menos que 3% das plantas MIR162 e plantas Bt11 X MIR162 fo- ram cortadas pelas larvas BCW. Números significantes de Bt11 e das plan- tas controle foram cortadas. Plantas contendo o genótipo MIR162 tiveram menos danos de alimentação por BCW que as plantas tratadas com insetici- das convencionais. Tabela 6. Danos aos talos das cinco provas com BCW 21 dias após infesta- ção. Os danos foram avaliados com o percentual total de plantas cortadas.
Tratamento % Plantas cortadas
<table>table see original document page 60</column></row><table>
Os resultados da prova FAW em campo são mostrados na Tabe- la 7. Dano por alimentação de FAW foi avaliado em uma escala de 0,01 a 9. O significado do dano por alimentação nos híbridos de MIR162 foi muito bai- xo (< 1) e significantemente mais baixo que os danos médios observados em Bt11 e com tratamentos por inseticidas convencionais. A opressão de insetos nessas provas foi muito forte com aproximadamente 50 a 100 larvas recém-nascidas/planta. Bt11 promoveu alguma proteção contra danos, con- siderando que o tratamento convencional com inseticida não promoveu pro- teção, apresentando a mesma quantidade de danos que o controle. Tabela 7. Taxa de danos por alimentação das folhas de cinco provas para FAW. O significado da taxa de danos 14 dias após a infestação é apresenta- do para cada tratamento.
Tratamento Classificação significado (0.01-9)
<table>table see original document page 60</column></row><table>
Os resultados das provas estimados para a primeira geração ECB são apresentados na Tabela 8. Dano por alimentação por ECB foi clas- sificado em uma escala de1-9. Nessas provas, MIR162 conferiu mínima pro- teção contra danos for alimentação contra ECB. Bt11 protegeu completa- mente as plantas dos danos contra alimentação de ECB. As plantas Bt11 X MIR162 possuíram o mesmo nível de proteção que as plantas Bt11. O tra- tamento com inseticida convencional promoveu melhor proteção que o traço de MIR162, porém significantemente menos proteção que àquela promovida por Bt11.
Tabela 8. Danos por alimentação das folhas teste em campo. O significado das taxas de danos 14 dias após a infestação.
Tratamento Taxa de Danos às folhas (1-9)
<table>table see original document page 61</column></row><table>
Os resultados dos danos provocados por ECB à segunda gera- ção são apresentados na Tabela 9. Os danos por alimentação foram medi- dos como comprimento cumulativo do túnel em cada talo de milho (se mais de um túnel fossem encontrados, os comprimentos seriam somados). Os tratamentos Bt11 e Bt11 χ MIR162 promoveram forte proteção contra a per- furação dos talos, considerando não existir proteção contra o tunelamento que foi promovido somente pelo MIR162 ou com o tratamento pelo inseticida. Tabela 9. Taxas de danos de sete provas da segunda geração larvas ECB medidos em comprimento de túnel (cm) por talo. As medidas foram tomadas de três a quatro dias após a infestação artificial.
Tratamento Significado comprimento de túnel (cm)
<table>table see original document page 61</column></row><table>
Resultados das provas para os danos estimados CEW são apre- sentados na Tabela 10. Danos por alimentação foram classificados pelo comprimento do túnel por espiga, medidos da ponta da espiga até a média do caroço mais baixo destruído. Danos significantes das espigas foram ob- servados em Bt11, inseticida, e canteiros de controle. Bt11 promoveu algum nível de proteção comparado ao controle não tratado e foi comparado à pro- teção promovida pelo tratamento convencional com inseticida. MIR162 e Bt11 X MIR162 promoveram proteção quase completa para as espigas do dano por alimentação das larvas CEW.
Tabela 10. Taxas de danos às espigas de seis provas para CEW medidos como médias do comprimento dos danos de alimentação. As medidas foram tomadas quando larvas CEW estavam L5-L6 em plantas controle.
<table>table see original document page 62</column></row><table>
Exemplo 8. Eficácia de MIR162 contra a lagarta do feijão ocidental (WBCW).
Os eventos transgênicos comerciais produtores da proteína CryIAb não promoveram níveis aceitáveis de proteção contra a lagarta do feijão ocidental (WBCW, Striacosta albicosta). Por esta razão, o MIR162 so- 10 zinho e combinado com outros genótipos transgênicos foi testado para eficá- cia contra WBCW.
Os ovos de WBCW foram coletados de uma mariposa fêmea selvagem, capturada. As larvas foram alimentadas com uma dieta "meridic" para larvas cortadoras até serem utilizadas nos experimentos. Plantas de milho foram desenvolvidas em campo. Os seguintes tratamentos foram tes- tados: MIR162, Bt11, MIR604, MIR162 X Bt11, MIR162 X MIR604, MIR604 X Bt11, Force® (Syngenta, Inc.), um inseticida convencional aplicado ao plantio para uma isolinhagem negativa, e dois controles isolinhagens negati- vos. MIR604 é um novo evento milho transgênico que compreende um gene cry3A055 codificador da proteína que é ativa contra a larva da praga do mi- lho (Diabrotica spp.) e é revelado em um pedido de patente nos EUA número de publicação N°. 2005/0216970, publicada em 29 de Setembro de 2005, referência incorporada por referência.
Para os experimentos, um pedaço de duas polegadas das sedas verdes e da casca foi cortado das espigas de um campo de crescimento de plantas de milho em cada tratamento e réplica. As terminações finais mar- rons das sedas foram removidas e as cascas, descartadas. Aproximadamen- te 3,81 cm (1,5 polegadas) das sedas foram colocadas em copos plásticos individuais de 14 ml. Uma larva foi colocada em cada copo e os copos foram selados. Vários estágios diferentes de larvas foram testados variando do 3o ao 6o "instars". Copos contendo sedas e as larvas foram mantidos a um pe- ríodo de dia natural a temperatura ambiente durante a permanência dos ex- perimentos. A sobrevivência das larvas foi registrada após oito dias. Os tra- tamentos foram realizados em quatro replicatas por experimento.
Os resultados dos experimentos com WBCW são apresentados na Tabela 11. Sobrevivência de WBCW nas sedas das isolinhagens negati- vas e do tratamento convencional com inseticida foi próximo de 100%. So- brevivência das larvas WBCW nas sedas Btll e MIR604, testadas quer sejam sozinhas, ou em combinação na mesma planta, não foi diferente dos sobre- viventes das isolinhagens negativas. Sobrevivência das larvas WBCW foi reduzida quando as larvas foram alimentadas com as sedas de MIR162. A combinação de MIR162 X Bt11 na mesma planta não promoveu a redução da sobrevivência que o MIR162 sozinho. Entretanto, surpreendentemente, quando o genótipo transgênico de MIR162 foi combinado com o genótipo transgênico de MIR604 na mesma planta, a mortalidade Iarval aumentou significativamente quando comparado ao MIR162 ou ao MIR604 sozinhos.
Tabela 11. Percentual (±SE) sobrevivência de larvas WBCW nas sedas de milho.
Número do Experimento
<table>table see original document page 63</column></row><table>
Exemplo 9. Uso do sítio de inserção do evento MIR162 para integração obie- tivada no milho.
As seqüências de pareamento do MIR162 reveladas em SEQ ID NO: 46 e SEQ ID NO: 48 Foram usadas para busca de "milhos" em bases de dados genômicos. Pares idênticos para ambas as seqüências de parea- mento foram encontradas em um clone BAC, CH201-307P5, do cromosso- mo (NCBI N0 acesso. AC185313) em Contig 13 (SEQ ID NO: 106). Mais es- pecificamente, o suplemento MIR162 está no cromossomo 5 entre um mar- cador molecular 5', designado por referência como marcador Opie2 (nucleo- tídeos 1680-3338 do SEQ ID NO: 106), e um marcador molecular 3', desig- nado por referência como marcador gag (nucleotídeos 43.275-45.086 do SEQ ID NO: 106). Usando esta informação, foi determinado que o DNA he- terólogo inserido dentro de MIR162 desordenou 58 nucleotídeos do milho DNA genômico, nucleotídeos 25.455 para 25.512 do SEQ ID NO: 106 (tam- bém mostrado como SEQ ID NO: 107), o qual está entre a seqüência de pa- reamento 5' (nucleotídeos 1-25.454 do SEQ ID NO: 106) e a seqüência de pareamento 3' (nucleotídeos 25.513-51.328 do SEQ ID NO: 106).
Considerando a performance agronômica do transgene do even- to MIR162 sobre várias gerações sob condições de campo, sugere que es- sas regiões identificadas ao redor do sítio de inserção em MIR162 fornece- ram boas posições genômicas para a integração desejada dos outros genes transgênicos de interesse. Tal integração desejada supera os problemas com o que chamamos de "efeitos de posição", e o risco de criar uma muta- ção no genoma sobre integração do transgene dentro do hospedeiro. Outras vantagens de tal integração desejada incluem, mas não se limitam a, redu- ção do amplo número de eventos de transformação que precisam ser rastre- ados e testados antes da obtenção de uma planta transgênica que exiba o nível desejado da expressão do transgene sem que também exiba anormali- dades resultantes da inserção indevida do transgene dentro de um lócus importante no genoma do hospedeiro. Além disso, tal integração desejada permite abundância da execução e criação de transgenes de linhagens de plantas de elite com ambos os genes mais eficientes.
Usando o preceito acima descrito, a pessoa habilidosa é apta a usar métodos conhecidos na ciência para atingir ácidos nucléicos heterólo- gos de interesse para o mesmo sítio de inserção no cromossomo 5 como aquele no MIR162 ou para um sítio em justa proximidade ao sítio de inser- ção em MIR162. Um desses métodos é descrito em Publicação de Pedido Patente Aplicação EUA N°. 20060253918, incorporada na íntegra por refe- rência para referência. Brevemente, acima de 20 Kb de seqüência genômica de pareamento 5' para o sítio de inserção (nucleotídeos 5.454 a 25.454 de SEQ ID NO: 106) e acima de 20 Kb de seqüência genômica de pareamento .3' para o sítio de inserção (nucleotídeos 25.513 a 45.513 de SEQ ID NO:106) são usados para parear o gene ou os genes de interesse que são pre- tendidos a serem inseridos dentro de uma locação gênica no Cromossomo 5 via recombinação homóloga. Essas seqüências podem ser promovidas pa- reando a margem do T-DNA repetidamente tal como a borda esquerda (LB) e a borda direita (RB) seqüências repetidas e outras seqüência incentivado- ras para aumentar a eficiência de livramento de T-DNA. O gene ou os genes de interesse podem ser colocados exatamente como no sítio de inserção do MIR162 ou podem ser colocadas em qualquer lugar contendo as regiões 20 Kb ao redor dos sítios de inserção MIR162 para conferir níveis consistentes de expressão do transgene sem efeitos prejudiciais à planta. Os vetores de DNA contendo o gene ou os genes de interesse e as seqüências de parea- mento podem ser liberados dentro das células das plantas via um dos vários métodos conhecidos por aqueles especialistas na área, incluindo, porém não limitando a transformação mediada pelo Agrobacterium. A inserção do vetor DNA dentro do sítio alvo do MIR162 pode ser acentuada por um dos vários métodos, incluindo, mas não limitando à co-expressão ou a super-regulação da recombinação dos genes intensificados ou a sub-regulação da recombi- nação endógena dos genes de supressão. Além disso, é conhecida na ciên- cia que a clivagem de seqüências específicas do genoma, pode ser usada para aumentar a freqüência de recombinação homóloga, por esta razão a inserção dentro do sítio de inserção em MIR162 e suas regiões de parea- mento podem ser acrescidas pela expressão da sequência-específica de endonucleases natural ou projetada para clivar essas seqüências. Contudo usando o preceito fornecido por referência, qualquer ácido nucléico heteró- Iogo pode ser inserido no cromossomo milho 5 em um sítio alvo localizado entre os nucleotídeos 25.454 e 45.513 de SEQ ID NO: 106 ou em um sítio alvo na vizinhança deste sítio.
Exemplo 10. Uso do sítio de inserção do evento MIR162 e seqüências de pareamento para estabilização da expressão do gene.
As seguências genômicas de pareamento do sítio de inserção do MIR162 também podem ser usadas para estabilizar a expressão de ou- tro(s) gene(s) de interesse guando inseridos como um transgene em outras posições genômicas no milho e em outros cultivos. Especificamente, acima de 20 Kb da seguência genômica de pareamento 5' para o sítio de inserção (nucleotídeos 5.454 a 25.454 de SEQ ID NO: 106) e acima de 20 Kb da se- qüência genômica de pareamento 3' para o sítio de inserção (nucleotídeos 25.513 a 45.513 de SEQ ID NO: 106) são usados para parear o gene ou os genes de interesse gue são pretendidos a serem inseridos dentro do geno- ma das plantas. Essas seguências podem ser promovidas pareando a mar- gem do T-DNA repetidamente tal como a borda esguerda (LB) e a borda di- reita (RB) seqüências repetidas e outras seqüência incentivadoras para au- mentar a eficiência de livramento de T-DNA. O gene ou os genes de interes- se podem ser colocados exatamente como no sítio de inserção em MIR162 ou podem ser colocadas em qualquer lugar interiormente as regiões 20 Kb ao redor dos sítios de inserção em MIR162 para conferir níveis consistentes de expressão do transgene. Os vetores de DNA contendo o gene ou os ge- nes de interesse e a seqüência de pareamento do sítio de inserção de MIR162 podem ser liberados dentro das células da planta via um dos vários métodos conhecidos àqueles habilidosos na ciência, incluindo, mas não limi- tando a transformação "protoplat", bombardeamento biolítico e a transforma- ção mediada via Agrobacterium. O DNA liberado pode se integrar randomi- camente dentro de um genoma da planta ou também se fazer presente co- mo parte das unidades genéticas independentemente segregadas tais como um cromossomo ou um minicromossomo. Os vetores de DNA contendo o(s) gene(s) de interesse e as seqüências de pareamento do sítio de inserção de MIR162 podem ser liberados dentro das células da planta. Deste modo, cir- cundando um gene ou genes de interesse com a seqüência genômica de pareamento o sítio de inserção de MIR162, a expressão de tais genes é es- tabilizada em plantas transgênicas hospedeiras tais como planta dicotiledô- nea ou uma planta monocotiledônea como a planta de milho.
DEPÓSITO
Peticionários fizeram um depósito das sementes de milho do evento MIR162 revelado acima anteriormente a 23 de Janeiro de 2007 de acordo com o Tratado de Budapeste na American Type Culture Colection (ATCC), 1801 Universidade de Boulevard1 Manassas1 VA 20110 sob N0 de acesso ATCC N°. PTA-8166. O depósito será mantido no depositário por um período de 30 anos, ou 5 anos após o ultimo pedido, ou o tempo de vida efe- tivo da patente, o qual for mais tardio, e será substituído se necessário du- rante aquele período. Peticionários não impõem restrições sobre a disponibi- lidade do material depositado do ATCC; contudo, peticionários não têm auto- ridade para protelar qualquer uma das restrições impostas pela lei posto à transferência de material biológico ou sua transportação em comércio. Peti- cionários não protelam qualquer violação de seus direitos garantidos sob esta patente ou sob a Proteção de Variedade de Plantas (Plant Variety Pro- tection) decreto 7 USC 2321 et seq.
Todas as publicações e documentos da patente publicados, ci- tados neste relatório são incorporados para referência na mesma extensão que cada publicação individual ou documento de patente foi especificamente e individualmente indicado a serem incorporados segundo referência. LISTAGEM DE SEQYÊNCIA <110> Syngenta Participations AG Long, NyKoll Pulliam, Derrick Hart, Hope Bottoms, Jeff Meghj i, Moez Que, Qiudeng
<120> Corn Event MIR162
<130> 71133WOPCT
<160> 107
<170> Patente em versão 3.3
<210> 1
<211> 2370
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Seqüência que codifica vip3Aa20
<400> 1
atgaacaaga acaacaccaa gctgagcacc cgcgccctgc cgagcttcat cgactacttc 60
aacggcatct acggcttcgc caccggcatc aaggacatca tgaacatgat cttcaagacc 120
gacaccggcg gcgacctgac cctggacgag atcctgaaga accagcagct gctgaacgac 180
atcagcggca agctggacgg cgtgaacggc agcctgaacg acctgatcgc ccagggcaac 240
ctgaacaccg agctgagcaa ggagatcctt aagatcgcca acgagcagaa ccaggtgctg 300
aacgacgtga acaacaagct ggacgccatc aacaccatgc tgcgcgtgta cctgccgaag 360
atcaccagca tgctgagcga cgtgattaag cagaactacg ccctgagcct gcagatcgag 42 0
tacctgagca agcagctgca ggagatcagc gacaagctgg acatcatcaa cgtgaacgtc 480
ctgatcaaca gcaccctgac cgagatcacc ccggcctacc agcgcatcaa gtacgtgaac 540
gagaagttcg aagagctgac cttcgccacc gagaccagca gcaaggtgaa gaaggacggc 600
agcccggccg acatcctgga cgagctgacc gagctgaccg agctggcgaa gagcgtgacc 660
aagaacgacg tggacggctt cgagttctac ctgaacacct tccacgacgt gatggtgggc 720
aacaacctgt tcggccgcag cgccctgaag accgccagcg agctgatcac caaggagaac 780 gtgaagacca gcggcagcga ggtgggcaac gtgtacaact tcctgatcgt gctgaccgcc 840
ctgcaggccc aggccttcct gaccctgacc acctgtcgca agctgctggg cctggccgac 900
atcgactaca ccagcatcat gaacgagcac ttgaacaagg agaaggagga gttccgcgtg 960
aacatcctgc cgaccctgag caacaccttc agcaacccga actacgccaa ggtgaagggc 1020
agcgacgagg acgccaagat gatcgtggag gctaagccgg gccacgcgtt gatcggcttc 1080
gagatcagca acgacagcat caccgtgctg aaggtgtacg aggccaagct gaagcagaac 1140
taccaggtgg acaaggacag cttgagcgag gtgatctacg gcgacatgga caagctgctg 12 00
tgtccggacc agagcgagca aatctactac accaacaaca tcgtgttccc gaacgagtac 12 60
gtgatcacca agatcgactt caccaagaag atgaagaccc tgcgctacga ggtgaccgcc 132 0
aacttctacg acagcagcac cggcgagatc gacctgaaca agaagaaggt ggagagcagc 13 80
gaggccgagt accgcaccct gagcgcgaac gacgacggcg tctacatgcc actgggcgtg 1440
atcagcgaga ccttcctgac cccgatcaac ggctttggcc tgcaggccga cgagaacagc 1500
cgcctgatca ccctgacctg taagagctac ctgcgcgagc tgctgctagc caccgacctg 1560
agcaacaagg agaccaagct gatcgtgcca ccgagcggct tcatcagcaa catcgtggag 162 0
aacggcagca tcgaggagga caacctggag ccgtggaagg ccaacaacaa gaacgcctac 1680
gtcgaccaca ccggcggcgt gaacggcacc aaggccctgt acgtgcacaa ggacggcggc 1740
atcagccagt tcatcggcga caagctgaag ccgaagaccg agtacgtgat ccagtacacc 1800
gtgaagggca agccatcgat tcacctgaag gacgagaaca ccggctacat ccactacgag 1860
gacaccaaca acaacctgga ggactaccag accatcaaca agcgcttcac caccggcacc 1920
gacctgaagg gcgtgtacct gatcctgaag agccagaacg gcgacgaggc ctggggcgac 1980
aacttcatca tcctggagat cagcccgagc gagaagctgc tgagcccgga gctgatcaac 2040
accaacaact ggaccagcac cggcagcacc aacatcagcg gcaacaccct gaccctgtac 2100
cagggcggcc gcggcatcct gaagcagaac ctgcagctgg acagcttcag cacctaccgc 2160
gtgtacttca gcgtgagcgg cgacgccaac gtgcgcatcc gcaactcccg cgaggtgctg 222 0
ttcgagaaga ggtacatgag cggcgccaag gacgtgagcg agatgttcac caccaagttc 22 80
gagaaggaca acttctacat cgagctgagc cagggcaaca acctgtacgg cggcccgatc 2340
gtgcacttct acgacgtgag catcaagtag 2370
<210> 2 <211> 789 <212> PRT
<213> Seqüência artificial
<220> <223> Toxina Vip3Aa
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1) . . (789)
<223> Proteína Vip3Aa20 produzido por MIR162
<400> 2
Met Asn Lys Asn Asn Thr Lys Leu Ser Thr Arg Ala Leu Pro Ser Phe 1 5 10 15
Ile Asp Tyr Phe Asn Gly Ile Tyr Gly Phe Ala Thr Gly Ile Lys Asp
20 25 30
Ile Met Asn Met Ile Phe Lys Thr Asp Thr Gly Gly Asp Leu Thr Leu
35 40 45
Asp Glu Ile Leu Lys Asn Gln Gln Leu Leu Asn Asp Ile Ser Gly Lys
50 55 60
Leu Asp Gly Val Asn Gly Ser Leu Asn Asp Leu Ile Ala Gln Gly Asn 65 70 75 80
Leu Asn Thr Glu Leu Ser Lys Glu Ile Leu Lys Ile Ala Asn Glu Gln
85 90 95
Asn Gln Val Leu Asn Asp Val Asn Asn Lys Leu Asp Ala Ile Asn Thr
100 105 110
Met Leu Arg Val Tyr Leu Pro Lys Ile Thr Ser Met Leu Ser Asp Val
115 120 125
Ile Lys Gln Asn Tyr Ala Leu Ser Leu Gln Ile Glu Tyr Leu Ser Lys
130 135 140
Gln Leu Gln Glu Ile Ser Asp Lys Leu Asp Ile Ile Asn Val Asn Val 145 150 155 160
Leu Ile Asn Ser Thr Leu Thr Glu Ile Thr Pro Ala Tyr Gln Arg Ile
165 170 175
Lys Tyr Val Asn Glu Lys Phe Glu Glu Leu Thr Phe Ala Thr Glu Thr
180 185 190
Ser Ser Lys Val Lys Lys Asp Gly Ser Pro Ala Asp Ile Leu Asp Glu 195 200 205 Leu Thr Glu Leu Thr Glu Leu Ala Lys Ser Val Thr Lys Asn Asp Val
210 215 220
Asp Gly Phe Glu Phe Tyr Leu Asn Thr Phe His Asp Val Met Val Gly 225 230 235 240
Asn Asn Leu Phe Gly Arg Ser Ala Leu Lys Thr Ala Ser Glu Leu Ile
245 250 255
Thr Lys Glu Asn Val Lys Thr Ser Gly Ser Glu Val Gly Asn Val Tyr
260 265 270
Asn Phe Leu Ile Val Leu Thr Ala Leu Gln Ala Gln Ala Phe Leu Thr
275 280 285
Leu Thr Thr Cys Arg Lys Leu Leu Gly Leu Ala Asp Ile Asp Tyr Thr
290 295 300
Ser Ile Met Asn Glu His Leu Asn Lys Glu Lys Glu Glu Phe Arg Val 305 310 315 320
Asn Ile Leu Pro Thr Leu Ser Asn Thr Phe Ser Asn Pro Asn Tyr Ala
325 330 335
Lys Val Lys Gly Ser Asp Glu Asp Ala Lys Met Ile Val Glu Ala Lys
340 345 350
Pro Gly His Ala Leu Ile Gly Phe Glu Ile Ser Asn Asp Ser Ile Thr
355 360 365
Val Leu Lys Val Tyr Glu Ala Lys Leu Lys Gln Asn Tyr Gln Val Asp
370 375 380
Lys Asp Ser Leu Ser Glu Val Ile Tyr Gly Asp Met Asp Lys Leu Leu 385 390 395 400
Cys Pro Asp Gln Ser Glu Gln Ile Tyr Tyr Thr Asn Asn Ile Val Phe
405 410 415
Pro Asn Glu Tyr Val Ile Thr Lys Ile Asp Phe Thr Lys Lys Met Lys
420 425 430
Thr Leu Arg Tyr Glu Val Thr Ala Asn Phe Tyr Asp Ser Ser Thr Gly
435 440 445
Glu Ile Asp Leu Asn Lys Lys Lys Val Glu Ser Ser Glu Ala Glu Tyr 450 455 460 Arg Thr Leu Ser Ala Asn Asp Asp Gly Val Tyr Met Pro Leu Gly Val 465 470 475 480
Ile Ser Glu Thr Phe Leu Thr Pro Ile Asn Gly Phe Gly Leu Gln Ala
485 490 495
Asp Glu Asn Ser Arg Leu Ile Thr Leu Thr Cys Lys Ser Tyr Leu Arg
500 505 510
Glu Leu Leu Leu Ala Thr Asp Leu Ser Asn Lys Glu Thr Lys Leu Ile
515 520 525
Val Pro Pro Ser Gly Phe Ile Ser Asn Ile Val Glu Asn Gly Ser Ile
530 535 540
Glu Glu Asp Asn Leu Glu Pro Trp Lys Ala Asn Asn Lys Asn Ala Tyr 545 550 555 560
Val Asp His Thr Gly Gly Val Asn Gly Thr Lys Ala Leu Tyr Val His
565 570 575
Lys Asp Gly Gly Ile Ser Gln Phe Ile Gly Asp Lys Leu Lys Pro Lys
580 585 590
Thr Glu Tyr Val Ile Gln Tyr Thr Val Lys Gly Lys Pro Ser Ile His
595 600 605
Leu Lys Asp Glu Asn Thr Gly Tyr Ile His Tyr Glu Asp Thr Asn Asn
610 615 620
Asn Leu Glu Asp Tyr Gln Thr Ile Asn Lys Arg Phe Thr Thr Gly Thr 625 630 635 640
Asp Leu Lys Gly Val Tyr Leu Ile Leu Lys Ser Gln Asn Gly Asp Glu
645 650 655
Ala Trp Gly Asp Asn Phe Ile Ile Leu Glu Ile Ser Pro Ser Glu Lys
660 665 670
Leu Leu Ser Pro Glu Leu Ile Asn Thr Asn Asn Trp Thr Ser Thr Gly
675 680 685
Ser Thr Asn Ile Ser Gly Asn Thr Leu Thr Leu Tyr Gln Gly Gly Arg
690 695 700
Gly Ile Leu Lys Gln Asn Leu Gln Leu Asp Ser Phe Ser Thr Tyr Arg 705 710 715 720 Val Tyr Phe Ser Val Ser Gly Asp Ala Asn Val Arg Ile Arg Asn Ser 725 730 735 Arg Glu Val Leu Phe Glu Lys Arg Tyr Met Ser Gly Ala Lys Asp Val 740 745 750 Ser Glu Met Phe Thr Thr Lys Phe Glu Lys Asp Asn Phe Tyr Ile Glu 755 760 765 Leu Ser Gln Gly Asn Asn Leu Tyr Gly Gly Pro Ile Val His Phe Tyr 770 775 780 Asp Val Ser Ile Lys 785
<210> 3
<211> 14405
<212> DNA
<220>
<223> Plasmídeo pNOV1300
<400> 3
atgaacaaga acaacaccaa gctgagcacc cgcgccctgc cgagcttcat cgactacttc 60
aacggcatct acggcttcgc caccggcatc aaggacatca tgaacatgat cttcaagacc 120
gacaccggcg gcgacctgac cctggacgag atcctgaaga accagcagct gctgaacgac 180
atcagcggca agctggacgg cgtgaacggc agcctgaacg acctgatcgc ccagggcaac 240
ctgaacaccg agctgagcaa ggagatcctt aagatcgcca acgagcagaa ccaggtgctg 300
aacgacgtga acaacaagct ggacgccatc aacaccatgc tgcgcgtgta cctgccgaag 360
atcaccagca tgctgagcga cgtgatgaag cagaactacg ccctgagcct gcagatcgag 42 0
tacctgagca agcagctgca ggagatcagc gacaagctgg acatcatcaa cgtgaacgtc 480
ctgatcaaca gcaccctgac cgagatcacc ccggcctacc agcgcatcaa gtacgtgaac 540
gagaagttcg aagagctgac cttcgccacc gagaccagca gcaaggtgaa gaaggacggc 600
agcccggccg acatcctgga cgagctgacc gagctgaccg agctggcgaa gagcgtgacc 660
aagaacgacg tggacggctt cgagttctac ctgaacacct tccacgacgt gatggtgggc 72 0
aacaacctgt tcggccgcag cgccctgaag accgccagcg agctgatcac caaggagaac 780
gtgaagacca gcggcagcga ggtgggcaac gtgtacaact tcctgatcgt gctgaccgcc 840
ctgcaggccc aggccttcct gaccctgacc acctgtcgca agctgctggg cctggccgac 900 atcgactaca ccagcatcat gaacgagcac ttgaacaagg agaaggagga gttccgcgtg 960
aacatcctgc cgaccctgag caacaccttc agcaacccga actacgccaa ggtgaagggc 1020
agcgacgagg acgccaagat gatcgtggag gctaagccgg gccacgcgtt gatcggcttc 1080
gagatcagca acgacagcat caccgtgctg aaggtgtacg aggccaagct gaagcagaac 1140
taccaggtgg acaaggacag cttgagcgag gtgatctacg gcgacatgga caagctgctg 1200
tgtccggacc agagcgagca aatctactac accaacaaca tcgtgttccc gaacgagtac 1260
gtgatcacca agatcgactt caccaagaag atgaagaccc tgcgctacga ggtgaccgcc 1320
aacttctacg acagcagcac cggcgagatc gacctgaaca agaagaaggt ggagagcagc 1380
gaggccgagt accgcaccct gagcgcgaac gacgacggcg tctacatgcc actgggcgtg 1440
atcagcgaga ccttcctgac cccgatcaac ggctttggcc tgcaggccga cgagaacagc 1500
cgcctgatca ccctgacctg taagagctac ctgcgcgagc tgctgctagc caccgacctg 1560
agcaacaagg agaccaagct gatcgtgcca ccgagcggct tcatcagcaa catcgtggag 1620
aacggcagca tcgaggagga caacctggag ccgtggaagg ccaacaacaa gaacgcctac 1680
gtggaccaca ccggcggcgt gaacggcacc aaggccctgt acgtgcacaa ggacggcggc 1740
atcagccagt tcatcggcga caagctgaag ccgaagaccg agtacgtgat ccagtacacc 1800
gtgaagggca agccatcgat tcacctgaag gacgagaaca ccggctacat ccactacgag 1860
gacaccaaca acaacctgga ggactaccag accatcaaca agcgcttcac caccggcacc 1920
gacctgaagg gcgtgtacct gatcctgaag agccagaacg gcgacgaggc ctggggcgac 1980
aacttcatca tcctggagat cagcccgagc gagaagctgc tgagcccgga gctgatcaac 2040
accaacaact ggaccagcac cggcagcacc aacatcagcg gcaacaccct gaccctgtac 2100
cagggcggcc gcggcatcct gaagcagaac ctgcagctgg acagcttcag cacctaccgc 2160
gtgtacttca gcgtgagcgg cgacgccaac gtgcgcatcc gcaactcccg cgaggtgctg 2220
ttcgagaaga ggtacatgag cggcgccaag gacgtgagcg agatgttcac caccaagttc 22 80
gagaaggaca acttctacat cgagctgagc cagggcaaca acctgtacgg cggcccgatc 2340
gtgcacttct acgacgtgag catcaagtag gagctctaga tctgttctgc acaaagtgga 2400
gtagtcagtc atcgatcagg aaccagacac cagactttta ttcatacagt gaagtgaagt 2460
gaagtgcagt gcagtgagtt gctggttttt gtacaactta gtatgtattt gtatttgtaa 2520
aatacttcta tcaataaaat ttctaattcc taaaaccaaa atccaggggt accagcttgc 2580
atgcctgcag tgcagcgtga cccggtcgtg cccctctcta gagataatga gcattgcatg 2 640
tctaagttat aaaaaattac cacatatttt ttttgtcaca cttgtttgaa gtgcagttta 2700
tctatcttta tacatatatt taaactttac tctacgaata atataatcta tagtactaca 2760
ataatatcag tgttttagag aatcatataa atgaacagtt agacatggtc taaaggacaa 2820 ttgagtattt tgacaacagg actctacagt tttatctttt tagtgtgcat gtgttctcct 2880
ttttttttgc aaatagcttc acctatataa tacttcatcc attttattag tacatccatt 2940
tagggtttag ggttaatggt ttttatagac taattttttt agtacatcta ttttattcta 3000
ttttagcctc taaattaaga aaactaaaac tctattttag tttttttatt taataattta 3060
gatataaaat agaataaaat aaagtgacta aaaattaaac aaataccctt taagaaatta 3120
aaaaaactaa ggaaacattt ttcttgtttc gagtagataa tgccagcctg ttaaacgccg 3180
tcgacgagtc taacggacac caaccagcga accagcagcg tcgcgtcggg ccaagcgaag 3240
cagacggcac ggcatctctg tcgctgcctc tggacccctc tcgagagttc cgctccaccg 3300
ttggacttgc tccgctgtcg gcatccagaa attgcgtggc ggagcggcag acgtgagccg 3360
gcacggcagg cggcctcctc ctcctctcac ggcaccggca gctacggggg attcctttcc 3420
caccgctcct tcgctttccc ttcctcgccc gccgtaataa atagacaccc cctccacacc 3480
ctctttcccc aacctcgtgt tgttcggagc gcacacacac acaaccagat ctcccccaaa 3540
tccacccgtc ggcacctccg cttcaaggta cgccgctcgt cctccccccc cccccctctc 3600
taccttctct agatcggcgt tccggtccat ggttagggcc cggtagttct acttctgttc 3660
atgtttgtgt tagatccgtg tttgtgttag atccgtgctg ctagcgttcg tacacggatg 3720
cgacctgtac gtcagacacg ttctgattgc taacttgcca gtgtttctct ttggggaatc 3780
ctgggatggc tctagccgtt ccgcagacgg gatcgatttc atgatttttt ttgtttcgtt 3840
gcatagggtt tggtttgccc ttttccttta tttcaatata tgccgtgcac ttgtttgtcg 3900
ggtcatcttt tcatgctttt ttttgtcttg gttgtgatga tgtggtctgg ttgggcggtc 3960
gttctagatc ggagtagaat tctgtttcaa actacctggt ggatttatta attttggatc 4020
tgtatgtgtg tgccatacat attcatagtt acgaattgaa gatgatggat ggaaatatcg 4080
atctaggata ggtatacatg ttgatgcggg ttttactgat gcatatacag agatgctttt 4140
tgttcgcttg gttgtgatga tgtggtgtgg ttgggcggtc gttcattcgt tctagatcgg 4200
agtagaatac tgtttcaaac tacctggtgt atttattaat tttggaactg tatgtgtgtg 4260
tcatacatct tcatagttac gagtttaaga tggatggaaa tatcgatcta ggataggtat 4320
acatgttgat gtgggtttta ctgatgcata tacatgatgg catatgcagc atctattcat 43 80
atgctctaac cttgagtacc tatctattat aataaacaag tatgttttat aattattttg 4440
atcttgatat acttggatga tggcatatgc agcagctata tgtggatttt tttagccctg 4500
ccttcatacg ctatttattt gcttggtact gtttcttttg tcgatgctca ccctgttgtt 4560
tggtgttact tctgcaggga tccccgatca tgcaaaaact cattaactca gtgcaaaact 462 0
atgcctgggg cagcaaaacg gcgttgactg aactttatgg tatggaaaat ccgtccagcc 4680
agccgatggc cgagctgtgg atgggcgcac atccgaaaag cagttcacga gtgcagaatg 4740 ccgccggaga tatcgtttca ctgcgtgatg tgattgagag tgataaatcg actctgctcg 4800
gagaggccgt tgccaaacgc tttggcgaac tgcctttcct gttcaaagta ttatgcgcag 4860
cacagccact ctccattcag gttcatccaa acaaacacaa ttctgaaatc ggttttgcca 4920
aagaaaatgc cgcaggtatc ccgatggatg ccgccgagcg taactataaa gatcctaacc 4980
acaagccgga gctggttttt gcgctgacgc ctttccttgc gatgaacgcg tttcgtgaat 5040
tttccgagat tgtctcccta ctccagccgg tcgcaggtgc acatccggcg attgctcact 5100
ttttacaaca gcctgatgcc gaacgtttaa gcgaactgtt cgccagcctg ttgaatatgc 5160
agggtgaaga aaaatcccgc gcgctggcga ttttaaaatc ggccctcgat agccagcagg 5220
gtgaaccgtg gcaaacgatt cgtttaattt ctgaatttta cccggaagac agcggtctgt 52 80
tctccccgct attgctgaat gtggtgaaat tgaaccctgg cgaagcgatg ttcctgttcg 5340
ctgaaacacc gcacgcttac ctgcaaggcg tggcgctgga agtgatggca aactccgata 5400
acgtgctgcg tgcgggtctg acgcctaaat acattgatat tccggaactg gttgccaatg 5460
tgaaattcga agccaaaccg gctaaccagt tgttgaccca gccggtgaaa caaggtgcag 552 0
aactggactt cccgattcca gtggatgatt ttgccttctc gctgcatgac cttagtgata 5580
aagaaaccac cattagccag cagagtgccg ccattttgtt ctgcgtcgaa ggcgatgcaa 5640
cgttgtggaa aggttctcag cagttacagc ttaaaccggg tgaatcagcg tttattgccg 5700
ccaacgaatc accggtgact gtcaaaggcc acggccgttt agcgcgtgtt tacaacaagc 5760
tgtaagagct tactgaaaaa attaacatct cttgctaagc tgggagctcg atccgtcgac 5820
ctgcagatcg ttcaaacatt tggcaataaa gtttcttaag attgaatcct gttgccggtc 5880
ttgcgatgat tatcatataa tttctgttga attacgttaa gcatgtaata attaacatgt 5940
aatgcatgac gttatttatg agatgggttt ttatgattag agtcccgcaa ttatacattt 6000
aatacgcgat agaaaacaaa atatagcgcg caaactagga taaattatcg cgcgcggtgt 6060
catctatgtt actagatccc cgggtctaga caattcagta cattaaaaac gtccgcaatg 6120
tgttattaag ttgtctaagc gtcaatttgt ttacaccaca atatatcctg ccaccagcca 6180
gccaacagct ccccgaccgg cagctcggca caaaatcacc actcgataca ggcagcccat 6240
cagtccggga cggcgtcagc gggagagccg ttgtaaggcg gcagactttg ctcatgttac 63 00
cgatgctatt cggaagaacg gcaactaagc tgccgggttt gaaacacgga tgatctcgcg 6360
gagggtagca tgttgattgt aacgatgaca gagcgttgct gcctgtgatc aaatatcatc 6420
tccctcgcag agatccgaat tatcagcctt cttattcatt tctcgcttaa ccgtgacagg 6480
ctgtcgatct tgagaactat gccgacataa taggaaatcg ctggataaag ccgctgagga 6540
agctgagtgg cgctatttct ttagaagtga acgttgacga tcgtcgaccg taccccgatg 6600
aattaattcg gacgtacgtt ctgaacacag ctggatactt acttgggcga ttgtcataca 6660 tgacatcaac aatgtacccg tttgtgtaac cgtctcttgg aggttcgtat gacactagtg 6720
gttcccctca gcttgcgact agatgttgag gcctaacatt ttattagaga gcaggctagt 6780
tgcttagata catgatcttc aggccgttat ctgtcagggc aagcgaaaat tggccattta 6840
tgacgaccaa tgccccgcag aagctcccat ctttgccgcc atagacgccg cgcccccctt 6900
ttggggtgta gaacatcctt ttgccagatg tggaaaagaa gttcgttgtc ccattgttgg 6960
caatgacgta gtagccggcg aaagtgcgag acccatttgc gctatatata agcctacgat 7020
ttccgttgcg actattgtcg taattggatg aactattatc gtagttgctc tcagagttgt 7080
cgtaatttga tggactattg tcgtaattgc ttatggagtt gtcgtagttg cttggagaaa 7140
tgtcgtagtt ggatggggag tagtcatagg gaagacgagc ttcatccact aaaacaattg 72 00
gcaggtcagc aagtgcctgc cccgatgcca tcgcaagtac gaggcttaga accaccttca 7260
acagatcgcg catagtcttc cccagctctc taacgcttga gttaagccgc gccgcgaagc 7320
ggcgtcggct tgaacgaatt gttagacatt atttgccgac taccttggtg atctcgcctt 7380
tcacgtagtg aacaaattct tccaactgat ctgcgcgcga ggccaagcga tcttcttgtc 7440
caagataagc ctgcctagct tcaagtatga cgggctgata ctgggccggc aggcgctcca 7500
ttgcccagtc ggcagcgaca tccttcggcg cgattttgcc ggttactgcg ctgtaccaaa 7560
tgcgggacaa cgtaagcact acatttcgct catcgccagc ccagtcgggc ggcgagttcc 7 62 0
atagcgttaa ggtttcattt agcgcctcaa atagatcctg ttcaggaacc ggatcaaaga 7680
gttcctccgc cgctggacct accaaggcaa cgctatgttc tcttgctttt gtcagcaaga 7740
tagccagatc aatgtcgatc gtggctggct cgaagatacc tgcaagaatg tcattgcgct 7 800
gccattctcc aaattgcagt tcgcgcttag ctggataacg ccacggaatg atgtcgtcgt 7860
gcacaacaat ggtgacttct acagcgcgga gaatctcgct ctctccaggg gaagccgaag 7920
tttccaaaag gtcgttgatc aaagctcgcc gcgttgtttc atcaagcctt acggtcaccg 7980
taaccagcaa atcaatatca ctgtgtggct tcaggccgcc atccactgcg gagccgtaca 8040
aatgtacggc cagcaacgtc ggttcgagat ggcgctcgat gacgccaact acctctgata 8100
gttgagtcga tacttcggcg atcaccgctt ccctcatgat gtttaactcc tgaattaagc 8160
cgcgccgcga agcggtgtcg gcttgaatga attgttaggc gtcatcctgt gctcccgaga 822 0
accagtacca gtacatcgct gtttcgttcg agacttgagg tctagtttta tacgtgaaca 82 80
ggtcaatgcc gccgagagta aagccacatt ttgcgtacaa attgcaggca ggtacattgt 8340
tcgtttgtgt ctctaatcgt atgccaagga gctgtctgct tagtgcccac tttttcgcaa 8400
attcgatgag actgtgcgcg actcctttgc ctcggtgcgt gtgcgacaca acaatgtgtt 8460
cgatagaggc tagatcgttc catgttgagt tgagttcaat cttcccgaca agctcttggt 8520
cgatgaatgc gccatagcaa gcagagtctt catcagagtc atcatccgag atgtaatcct 8580 tccggtaggg gctcacactt ctggtagata gttcaaagcc ttggtcggat aggtgcacat 8640 cgaacacttc acgaacaatg aaatggttct cagcatccaa tgtttccgcc acctgctcag 8700 ggatcaccga aatcttcata tgacgcctaa cgcctggcac agcggatcgc aaacctggcg 8760 cggcttttgg cacaaaaggc gtgacaggtt tgcgaatccg ttgctgccac ttgttaaccc 8820 ttttgccaga tttggtaact ataatttatg ttagaggcga agtcttgggt aaaaactggc 8880 ctaaaattgc tggggatttc aggaaagtaa acatcacctt ccggctcgat gtctattgta 8940 gatatatgta gtgtatctac ttgatcgggg gatctgctgc ctcgcgcgtt tcggtgatga 9000 cggtgaaaac ctctgacaca tgcagctccc ggagacggtc acagcttgtc tgtaagcgga 9060 tgccgggagc agacaagccc gtcagggcgc gtcagcgggt gttggcgggt gtcggggcgc 9120 agccatgacc cagtcacgta gcgatagcgg agtgtatact ggcttaacta tgcggcatca 9180 gagcagattg tactgagagt gcaccatatg cggtgtgaaa taccgcacag atgcgtaagg 9240 agaaaatacc gcatcaggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct gcgctcggtc 9300 gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa 9360 tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt 9420 aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa 9480 aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt 9540 ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg 9600 tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg taggtatctc 9660 agttcggtgt aggtcgttcg ctccaàgctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc 9720 gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta 9780 tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct 9840 acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaaggacagt atttggtatc 9900 tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa 9960 caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa 10020 aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca gtggaacgaa 10080 aactcacgtt aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac ctagatcctt 10140 ttaaattaaa aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac ttggtctgac 10200 agttaccaat gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt tcgttcatcc 10260 atagttgcct gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt accatctggc 10320 cccagtgctg caatgatacc gcgagaccca cgctcaccgg ctccagattt atcagcaata 10380 aaccagccag ccggaagggc cgagcgcaga agtggtcctg caactttatc cgcctccatc 10440 cagtctatta attgttgccg ggaagctaga gtaagtagtt cgccagttaa tagtttgcgc 10500 aacgttgttg ccattgctgc aggggggggg gggggggggt tccattgttc attccacgga 10560
caaaaacaga gaaaggaaac gacagaggcc aaaaagctcg ctttcagcac ctgtcgtttc 10620
ctttcttttc agagggtatt ttaaataaaa acattaagtt atgacgaaga agaacggaaa 10680
cgccttaaac cggaaaattt tcataaatag cgaaaacccg cgaggtcgcc gccccgtaac 10740
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cccatgttgt gcaaaaaagc ggttagctcc ttcggtcctc cgatcgttgt cagaagtaag 11100
ttggccgcag tgttatcact catggttatg gcagcactgc ataattctct tactgtcatg 11160
ccatccgtaa gatgcttttc tgtgactggt gagtactcaa ccaagtcatt ctgagaatag 1122 0
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agcagaactt taaaagtgct catcattgga aaacgttctt cggggcgaaa actctcaagg 11340
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tattgaagca tttatcaggg ttattgtctc atgagcggat acatatttga atgtatttag 11580
aaaaataaac aaataggggt tccgcgcaca tttccccgaa aagtgccacc tgacgtctaa 11640
gaaaccatta ttatcatgac attaacctat aaaaataggc gtatcacgag gccctttcgt 11700
cttcaagaat tggtcgacga tcttgctgcg ttcggatatt ttcgtggagt tcccgccaca 11760
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gcgcgtgatg actggccagg acgtcggccg aaagagcgac aagcagatca cgcttttcga 11880
cagcgtcgga tttgcgatcg aggatttttc ggcgctgcgc tacgtccgcg accgcgttga 11940
gggatcaagc cacagcagcc cactcgacct tctagccgac ccagacgagc caagggatct 12000
ttttggaatg ctgctccgtc gtcaggcttt ccgacgtttg ggtggttgaa cagaagtcat 12060
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cttttctctt aggtttaccc gccaatatat cctgtcaaac actgatagtt taaactgaag 12240
gcgggaaacg acaatctgat catgagcgga gaattaaggg agtcacgtta tgacccccgc 12 3 00
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ccactcagca agctggtaca agcttgcatg cctgcagtgc agcgtgaccc ggtcgtgccc 12420 ctctctagag ataatgagca ttgcatgtct aagttataaa aaattaccac atattttttt 12480
tgtcacactt gtttgaagtg cagtttatct atctttatac atatatttaa actttactct 12540
acgaataata taatctatag tactacaata atatcagtgt tttagagaat catataaatg 12600
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tttttttagt acatctattt tattctattt tagcctctaa attaagaaaa ctaaaactct 12840
attttagttt ttttatttaa taatttagat ataaaataga ataaaataaa gtgactaaaa 12900
attaaacaaa taccctttaa gaaattaaaa aaactaagga aacatttttc ttgtttcgag 12960
tagataatgc cagcctgtta aacgccgtcg acgagtctaa cggacaccaa ccagcgaacc 13020
agcagcgtcg cgtcgggcca agcgaagcag acggcacggc atctctgtcg ctgcctctgg 13080
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gtaataaata gacaccccct ccacaccctc tttccccaac ctcgtgttgt tcggagcgca 13320
cacacacaca accagatctc ccccaaatcc acccgtcggc acctccgctt caaggtacgc 13380
cgctcgtcct cccccccccc ccctctctac cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt 13440
tagggcccgg tagttctact tctgttcatg tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc 13500
cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa 13560
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caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt 13740
gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact 13800
acctggtgga tttattaatt ttggatctgt atgtgtgtgc catacatatt catagttacg 13860
aattgaagat gatggatgga aatatcgatc taggataggt atacatgttg atgcgggttt 13 92 0
tactgatgca tatacagaga tgctttttgt tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg 13980
ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt 14040
tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca tacatcttca tagttacgag tttaagatgg 14100
atggaaatat cgatctagga taggtataca tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac 14160
atgatggcat atgcagcatc tattcatatg ctctaacctt gagtacctat ctattataat 14220
aaacaagtat gttttataat tattttgatc ttgatatact tggatgatgg catatgcagc 14280
agctatatgt ggattttttt agccctgcct tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt 14340 tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg tgttacttct gcaggtcgac tctagaggat 14400 ccacc 14405
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador TAQMAN vip3Aa sintetizado quimicamente
<400> 4
caccttcagc aacccgaact a 21
<210> 5
<211> 22
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Iniciador rev TAQMAN vip3Aa sintetizado
<400> 5
gcttagcctc cacgatcatc tt 22
<210> 6
<211> 23
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sonda TAQMAN vip3Aa sintetizado quimicamente
<400> 6
gtcctcgtcg ctgcccttca cct 23
<210> 7
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador para TAQMAN pmi sintetizado quimicamente <400> 7
ccgggtgaat cagcgttt 18
<210> 8
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador rev TAQMAN pmi sintetizado quimicamente
<400> 8
gccgtggcct ttgacagt 18
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sonda TAQMAN pmi sintetizado quimicamente
<400> 9
tgccgccaac gaatcaccgg 20
<210> 10
<211> 21
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador para TAQMAN ZmADH-267 - Sintetizado quimicamente
<400> 10
gaacgtgtgt tgggtttgca t 21
<210> 11
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador rev TAQMAN ZmADH-267 - Sintetizado quimicamente <400> 11
tccagcaatc cttgcacctt 20
<210> 12 <211> 24
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sonda TAQMAN ZmADH-267 - Sintetizado quimicamente
<400> 12
tgcagcctaa ccatgcgcag ggta 24
<210> 13
<211> 2370
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sonda vip3Aa20 - Sintetizado quimicamente
<400> 13
atgaacaaga acaacaccaa gctgagcacc cgcgccctgc cgagcttcat cgactacttc 60 aacggcatct acggcttcgc caccggcatc aaggacatca tgaacatgat cttcaagacc 120 gacaccggcg gcgacctgac cctggacgag atcctgaaga accagcagct gctgaacgac 180 atcagcggca agctggacgg cgtgaacggc agcctgaacg acctgatcgc ccagggcaac 240 ctgaacaccg agctgagcaa ggagatcctt aagatcgcca acgagcagaa ccaggtgctg 300 aacgacgtga acaacaagct ggacgccatc aacaccatgc tgcgcgtgta cctgccgaag 360 atcaccagca tgctgagcga cgtgatgaag cagaactacg ccctgagcct gcagatcgag 420 tacctgagca agcagctgca ggagatcagc gacaagctgg acatcatcaa cgtgaacgtc 480 ctgatcaaca gcaccctgac cgagatcacc ccggcctacc agcgcatcaa gtacgtgaac 540 gagaagttcg aagagctgac cttcgccacc gagaccagca gcaaggtgaa gaaggacggc 600 agcccggccg acatcctgga cgagctgacc gagctgaccg agctggcgaa gagcgtgacc 660 aagaacgacg tggacggctt cgagttctac ctgaacacct tccacgacgt gatggtgggc 720 aacaacctgt tcggccgcag cgccctgaag accgccagcg agctgatcac caaggagaac 780 gtgaagacca gcggcagcga ggtgggcaac gtgtacaact tcctgatcgt gctgaccgcc 840 ctgcaggccc aggccttcct gaccctgacc acctgtcgca agctgctggg cctggccgac 900 atcgactaca ccagcatcat gaacgagcac ttgaacaagg agaaggagga gttccgcgtg aacatcctgc cgaccctgag caacaccttc agcaacccga actacgccaa ggtgaagggc agcgacgagg acgccaagat gatcgtggag gctaagccgg gccacgcgtt gatcggcttc gagatcagca acgacagcat caccgtgctg aaggtgtacg aggccaagct gaagcagaac taccaggtgg acaaggacag cttgagcgag gtgatctacg gcgacatgga caagctgctg tgtccggacc agagcgagca aatctactac accaacaaca tcgtgttccc gaacgagtac gtgatcacca agatcgactt caccaagaag atgaagaccc tgcgctacga ggtgaccgcc aacttctacg acagcagcac cggcgagatc gacctgaaca agaagaaggt ggagagcagc gaggccgagt accgcaccct gagcgcgaac gacgacggcg tctacatgcc actgggcgtg atcagcgaga ccttcctgac cccgatcaac ggctttggcc tgcaggccga cgagaacagc cgcctgatca ccctgacctg taagagctac ctgcgcgagc tgctgctagc caccgacctg agcaacaagg agaccaagct gatcgtgcca ccgagcggct tcatcagcaa catcgtggag aacggcagca tcgaggagga caacctggag ccgtggaagg ccaacaacaa gaacgcctac gtggaccaca ccggcggcgt gaacggcacc aaggccctgt acgtgcacaa ggacggcggc atcagccagt tcatcggcga caagctgaag ccgaagaccg agtacgtgat ccagtacacc gtgaagggca agccatcgat tcacctgaag gacgagaaca ccggctacat ccactacgag gacaccaaca acaacctgga ggactaccag accatcaaca agcgcttcac caccggcacc gacctgaagg gcgtgtacct gatcctgaag agccagaacg gcgacgaggc ctggggcgac aacttcatca tcctggagat cagcccgagc gagaagctgc tgagcccgga gctgatcaac accaacaact ggaccagcac cggcagcacc aacatcagcg gcaacaccct gaccctgtac cagggcggcc gcggcatcct gaagcagaac ctgcagctgg acagcttcag cacctaccgc gtgtacttca gcgtgagcgg cgacgccaac gtgcgcatcc gcaactcccg cgaggtgctg ttcgagaaga ggtacatgag cggcgccaag gacgtgagcg agatgttcac caccaagttc gagaaggaca acttctacat cgagctgagc cagggcaaca acctgtacgg cggcccgatc gtgcacttct acgacgtgag catcaagtag <210> 14
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<211>
1176
<212>
DNA
<213>
Seqüência artificial
<220>
<223>
Sonda pmi - Sintetizado quimicamente
<400>
14 atgcaaaaac tcattaactc agtgcaaaac tatgcctggg gcagcaaaac ggcgttgact 60
gaactttatg gtatggaaaa tccgtccagc cagccgatgg ccgagctgtg gatgggcgca 120 catccgaaaa gcagttcacg agtgcagaat gccgccggag atatcgtttc actgcgtgat 180 gtgattgaga gtgataaatc gactctgctc ggagaggccg ttgccaaacg ctttggcgaa 240 ctgcctttcc tgttcaaagt attatgcgca gcacagccac tctccattca ggttcatcca 300 aacaaacaca attctgaaat cggttttgcc aaagaaaatg ccgcaggtat cccgatggat 3 60 gccgccgagc gtaactataa agatcctaac cacaagccgg agctggtttt tgcgctgacg 420 cctttccttg cgatgaacgc gtttcgtgaa ttttccgaga ttgtctccct actccagccg 480 gtcgcaggtg cacatccggc gattgctcac tttttacaac agcctgatgc cgaacgttta 540 agcgaactgt tcgccagcct gttgaatatg cagggtgaag aaaaatcccg cgcgctggcg 600 attttaaaat cggccctcga tagccagcag ggtgaaccgt ggcaaacgat tcgtttaatt 660 tctgaatttt acccggaaga cagcggtctg ttctccccgc tattgctgaa tgtggtgaaa 720 ttgaaccctg gcgaagcgat gttcctgttc gctgaaacac cgcacgctta cctgcaaggc 780 gtggcgctgg aagtgatggc aaactccgat aacgtgctgc gtgcgggtct gacgcctaaa 840 tacattgata ttccggaact ggttgccaat gtgaaattcg aagccaaacc ggctaaccag 900 ttgttgaccc agccggtgaa acaaggtgca gaactggact tcccgattcc agtggatgat 960 tttgccttct cgctgcatga ccttagtgat aaagaaacca ccattagcca gcagagtgcc 102 0 gccattttgt tctgcgtcga aggcgatgca acgttgtgga aaggttctca gcagttacag 1080 cttaaaccgg gtgaatcagc gtttattgcc gccaacgaat caccggtgac tgtcaaaggc 1140 cacggccgtt tagcgcgtgt ttacaacaag ctgtaa 1176
<210> 15
<211> 20 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Iniciador MOV3Aa-01-5' - Sintetizado quimicamente
<400> 15
atgaacaaga acaacaccaa 2 0
<210> 16 <211> 22 <212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador MOV3Aa-01-3' - Sintetizado quimicamente
<400> 16
ctacttgatg ctcacgtcgt ag 22
<210> 17
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 17
acgagcagaa ccaggtgc 18
<210> 18
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 18
ggtgaagaag gacggcag 18
<210> 19
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 19
acctgtcgca agctgctggg 2 0
<210> 20
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 20
tggacaagct gctgtgtc
<210> 21
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 21
tgcaggccga cgagaacag
<210> 22
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 22
tgatccagta caccgtgaa
<210> 23
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 23
accctgaccc tgtaccag
<210> 24
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 24 gtgttgccgc tgatgttg
<210> 25
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 25 cgtactcggt cttcggct
<210> 26
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 26
ctgcaggcca aagccgtt
<210> 27
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 27 tcgccgtaga tcacctcg
<210> 28
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 28
gcttgcgaca ggtggtca
<210> 29
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 29
ttgctgctgg tctcggtgg
<210> 30
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 30
cgttggcgat cttaaggat
<210> 31
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 31
gcaagccatc gattcac
<210> 32
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 32 gcaacaccct gaccctg
<210> 33
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 33
tctacgacgt gagcatcaag
<210> 34
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 34
gtagaagtgc acgatcggg
<210> 35
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 35
cggtgctggt ccagttg
<210> 36
<211> 21
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador 162INSERT-F2 - sintetizado quimicamente
<400> 36
acaccaatga tgcaaatagg c 21
<210> 37
<211> 25
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador VIP_R4 - sintetizado quimicamente
<400> 37
gaaggtgttc aggtagaact cgaag 2 5
<210> 38
<211> 2946
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Amplicon vip3Aa20 5' - sintetizado quimicamente
<400> 38
acaccaatga tgcaaatagg ctgggaatag tctgtctaat agtttgagtg aatcatgtca 60
ctgatagttt aaactgaagg cgggaaacga caatctgatc atgagcggag aattaaggga 12 0
gtcacgttat gacccccgcc gatgacgcgg gacaagccgt tttacgtttg gaactgacag 180
aaccgcaacg ttgaaggagc cactcagcaa gctggtacaa gcttgcatgc ctgcagtgca 240
gcgtgacccg gtcgtgcccc tctctagaga taatgagcat tgcatgtcta agttataaaa 300
aattaccaca tatttttttt gtcacacttg tttgaagtgc agtttatcta tctttataca 360
tatatttaaa ctttactcta cgaataatat aatctatagt actacaataa tatcagtgtt 420
ttagagaatc atataaatga acagttagac atggtctaaa ggacaattga gtattttgac 480
aacaggactc tacagtttta tctttttagt gtgcatgtgt tctccttttt ttttgcaaat 540
agcttcacct atataatact tcatccattt tattagtaca tccatttagg gtttagggtt 600
aatggttttt atagactaat ttttttagta catctatttt attctatttt agcctctaaa 660
ttaagaaaac taaaactcta ttttagtttt tttatttaat aatttagata taaaatagaa 720
taaaataaag tgactaaaaa ttaaacaaat accctttaag aaattaaaaa aactaaggaa 780 acatttttct tgtttcgagt agataatgcc agcctgttaa acgccgtcga cgagtctaac 840
ggacaccaac cagcgaacca gcagcgtcgc gtcgggccaa gcgaagcaga cggcacggca 900
tctctgtcgc tgcctctgga cccctctcga gagttccgct ccaccgttgg acttgctccg 960
ctgtcggcat ccagaaattg cgtggcggag cggcagacgt gagccggcac ggcaggcggc 1020
ctcctcctcc tctcacggca ccggcagcta cgggggattc ctttcccacc gctccttcgc 1080
tttcccttcc tcgcccgccg taataaatag acaccccctc cacaccctct ttccccaacc 1140
tcgtgttgtt cggagcgcac acacacacaa ccagatctcc cccaaatcca cccgtcggca 1200
cctccgcttc aaggtacgcc gctcgtcctc cccccccccc cctctctacc ttctctagat 1260
cggcgttccg gtccatggtt agggcccggt agttctactt ctgttcatgt ttgtgttaga 1320
tccgtgtttg tgttagatcc gtgctgctag cgttcgtaca cggatgcgac ctgtacgtca 1380
gacacgttct gattgctaac ttgccagtgt ttctctttgg ggaatcctgg gatggctcta 1440
gccgttccgc agacgggatc gatttcatga ttttttttgt ttcgttgcat agggtttggt 1500
ttgccctttt cctttatttc aatatatgcc gtgcacttgt ttgtcgggtc atcttttcat 1560
gctttttttt gtcttggttg tgatgatgtg gtctggttgg gcggtcgttc tagatcggag 1620
tagaattctg tttcaaacta cctggtggat ttattaattt tggatctgta tgtgtgtgcc 1680
atacatattc atagttacga attgaagatg atggatggaa atatcgatct aggataggta 1740
tacatgttga tgcgggtttt actgatgcat atacagagat gctttttgtt cgcttggttg 1800
tgatgatgtg gtgtggttgg gcggtcgttc attcgttcta gatcggagta gaatactgtt 1860
tcaaactacc tggtgtattt attaattttg gaactgtatg tgtgtgtcat acatcttcat 1920
agttacgagt ttaagatgga tggaaatatc gatctaggat aggtatacat gttgatgtgg 1980
gttttactga tgcatataca tgatggcata tgcagcatct attcatatgc tctaaccttg 2040
agtacctatc tattataata aacaagtatg ttttataatt attttgatct tgatatactt 2100
ggatgatggc atatgcagca gctatatgtg gattttttta gccctgcctt catacgctat 2160
ttatttgctt ggtactgttt cttttgtcga tgctcaccct gttgtttggt gttacttctg 2220
caggtcgact ctagaggatc caccatgaac aagaacaaca ccaagctgag cacccgcgcc 22 80
ctgccgagct tcatcgacta cttcaacggc atctacggct tcgccaccgg catcaaggac 2340
atcatgaaca tgatcttcaa gaccgacacc ggcggcgacc tgaccctgga cgagatcctg 2400
aagaaccagc agctgctgaa cgacatcagc ggcaagctgg acggcgtgaa cggcagcctg 2460
aacgacctga tcgcccaggg caacctgaac accgagctga gcaaggagat ccttaagatc 2520
gccaacgagc agaaccaggt gctgaacgac gtgaacaaca agctggacgc catcaacacc 2580
atgctgcgcg tgtacctgcc gaagatcacc agcatgctga gcgacgtgat taagcagaac 2640
tacgccctga gcctgcagat cgagtacctg agcaagcagc tgcaggagat cagcgacaag 2700 ctggacatca tcaacgtgaa cgtcctgatc aacagcaccc tgaccgagat caccccggcc 2760 taccagcgca tcaagtacgt gaacgagaag ttcgaagagc tgaccttcgc caccgagacc 2820 agcagcaagg tgaagaagga cggcagcccg gccgacatcc tggacgagct gaccgagctg 2880 accgagctgg cgaagagcgt gaccaagaac gacgtggacg gcttcgagtt ctacctgaac 2940 accttc 2946
<210> 39
<211> 23
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Iniciador CJB179 - Sintetizado quimicamente
<400> 39
atgcaaatag gctgggaata gtc 23
<210> 40 <211> 21 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Iniciador reverso CTRB3116 - Sintetizado quimicamente
<400> 40
gtaccagctt gctgagtggc t 21
<210> 41
<211> 209
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Amplicon CJB134/179 5' - Sintetizado quimicamente
<400> 41
atgcaaatag gctgggaata gtctgtctaa tagtttgagt gaatcatgtc actgatagtt 60 taaactgaag gcgggaaacg acaatctgat catgagcgga gaattaaggg agtcacgtta 120 tgacccccgc cgatgacgcg ggacaagccg ttttacgttt ggaactgaca gaaccgcaac 180 gttgaaggag ccactcagca agctggtac 209 <210> 42
<211> 20 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Iniciador VIP-F3 - Sintetizado quimicamente
<400> 42
ggtgctgttc gagaagaggt 2 0
<210> 43
<211> 23
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador PMI_REV1 - Sintetizado quimicamente
<400> 43
cgatttatca ctctcaatca cat 23
<210> 44
<211> 2577
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Amplicon vip3Aa20 3' - Sintetizado quimicamente
<400> 44
ggtgctgttc gagaagaggt acatgagcgg cgccaaggac gtgagcgaga tgttcaccac 60
caagttcgag aaggacaact tctacatcga gctgagccag ggcaacaacc tgtacggcgg 12 0 cccgatcgtg cacttctacg acgtgagcat caagtaggag ctctagatct gttctgcaca 180 aagtggagta gtcagtcatc gatcaggaac cagacaccag acttttattc atacagtgaa 240 gtgaagtgaa gtgcagtgca gtgagttgct ggtttttgta caacttagta tgtatttgta 300 tttgtaaaat acttctatca ataaaatttc taattcctaa aaccaaaatc caggggtacc 360 agcttgcatg cctgcagtgc agcgtgaccc ggtcgtgccc ctctctagag ataatgagca 420 ttgcatgtct aagttataaa aaattaccac atattttttt tgtcacactt gtttgaagtg 480 cagtttatct atctttatac atatatttaa actttactct acgaataata taatctatag 540 tactacaata atatcagtgt tttagagaat catataaatg aacagttaga catggtctaa 600
aggacaattg agtattttga caacaggact ctacagtttt atctttttag tgtgcatgtg 660
ttctcctttt tttttgcaaa tagcttcacc tatataatac ttcatccatt ttattagtac 720
atccatttag ggtttagggt taatggtttt tatagactaa tttttttagt acatctattt 780
tattctattt tagcctctaa attaagaaaa ctaaaactct attttagttt ttttatttaa 840
taatttagat ataaaataga ataaaataaa gtgactaaaa attaaacaaa taccctttaa 900
gaaattaaaa aaactaagga aacatttttc ttgtttcgag tagataatgc cagcctgtta 960
aacgccgtcg acgagtctaa cggacaccaa ccagcgaacc agcagcgtcg cgtcgggcca 102 0
agcgaagcag acggcacggc atctctgtcg ctgcctctgg acccctctcg agagttccgc 1080
tccaccgttg gacttgctcc gctgtcggca tccagaaatt gcgtggcgga gcggcagacg 1140
tgagccggca cggcaggcgg cctcctcctc ctctcacggc accggcagct acgggggatt 1200
cctttcccac cgctccttcg ctttcccttc ctcgcccgcc gtaataaata gacaccccct 1260
ccacaccctc tttccccaac ctcgtgttgt tcggagcgca cacacacaca accagatctc 1320
ccccaaatcc acccgtcggc acctccgctt caaggtacgc cgctcgtcct cccccccccc 1380
ccctctctac cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact 1440
tctgttcatg tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac 1500
acggatgcga cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg 1560
gggaatcctg ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg 1620
tttcgttgca tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg 1680
tttgtcgggt catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg 1740
ggcggtcgtt ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt 1800
ttggatctgt atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga 1860
aatatcgatc taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga 1920
tgctttttgt tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct 1980
agatcggagt agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat 2040
gtgtgtgtca tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga 2100
taggtataca tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc 2160
tattcatatg ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat 2220
tattttgatc ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt 2280
agccctgcct tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc 2340
tgttgtttgg tgttacttct gcagggatcc ccgatcatgc aaaaactcat taactcagtg 2400
caaaactatg cctggggcag caaaacggcg ttgactgaac tttatggtat ggaaaatccg 2460 tccagccagc cgatggccga gctgtggatg ggcgcacatc cgaaaagcag ttcacgagtg 2520 cagaatgccg ccggagatat cgtttcactg cgtgatgtga ttgagagtga taaatcg 2577
<210> 45
<211> 20 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Seqüência de junção 5' entre genoma de milho e inserto de DNA
<400> 45
tgaatcatgt cactgatagt 20
<210> 46 <211> 1088 <212> DNA <213> Seqüência artificial
<220>
<223> Seqüência de flanqueamento 5'
<220>
<221> misc_feature
<222> (1) .. (236)
<223> Seqüência de flanqueamento 5'
<400> 46
tcctgtgttg ttggaacaga cttctgtctc ttctggtgat cataaatatt agttgtgttg gaaaatgttg ttttcttttg tctctagact ggaaagcgga acacggttct ttcaactagg gatgaaagtg gtaatccgaa ttgttagtac ttttaaaata gatatgtata aaattttatg ttgatctttt ttatgttatc gtataaatta gtataaatat gaataaaata ttacataaaa tgttttatgt ccctacaaca taaatagttg aaaaaattac taaatttgtt ttcgaatcta tatatctatt atttaagaaa aatataggat gaaaaggttt atcttttatg agctggatct tataaacaag aaaataaatt tatattgtag attttatatc gcaatcaaag aaaagcgact aaaaaactga ttaccgagta aatactgttt tcgtccctac tatcaacgcc ttctcccaac cgcagtcgat ctgtccgtct cagcggcacc cctgctgttc gactatctag accatagaat attttaggta
taaatgaacc 60
gttctcgtca 120
aaatttaata 180
aagcacatta 240
attatttggt 300
tatcgaagtt 360
aatctttaca 420
ctatttattc 480
ccaaccgttt 540
gtatcaggcg 600
tacaataatt 660 ttagttccac gctagaacat tttagttaga ataataacaa gatttgctat tgatgtagga 720 ctcgcccgtc actgtctaaa aaagcattct gtcggtctta ttctttaggc atcagcgggt 780 gtactatctc atttttccta tcatattcct cagtactctg ttaagtataa atggtctatt 840 ttacatgatg aactaataaa actaattaag gatcctaact ttttgtgaag gtaatttgga 900 tcattatgca ttaccatcct acgtatacct gctgcagcag catctgcgta agcacagcct 960 agatatatgc ttctgtgtgg actgaaagga gactttgttt atcaattagt atactcccaa 102 0 aaaactgatg acaccaatga tgcaaatagg ctgggaatag tctgtctaat agtttgagtg 1080 aatcatgt 1088
<210> 47
<211> 20 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> 31 junction sequence between insert DNA and corn genome
<400> 47
aaacgtccgc catggtctga 20
<210> 48
<211> 1189
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Seqüência de flanqueamento 3'
<400> 48
catggtctga aggcaacaga taaggcatac tgggccttgt ggtagttgtt ttactgggcc 60
tttttgtatg atctataaaa ttcactggga tcaacccgga gaggaatggc agcagatgca 120 gtccccaggg tcctccgtcg ccgcctgagc acccggcacc cgcgctgaac cggagaggga 180 cgcgcggacg ccgtgcagct ggtgcggagg gggctgtggc agatgaggat gagacgcgta 240 cgtggctggg aaggccagca ggccaccggg tcttcgtcca gcccggcgcg agtggacagg 300 actagagatg gcaacggtta caaacccgct gggttttacc gtcccaaacc cgtacccgtg 360 aaaaatatct atgcccatta aaaaacccgt acccatgacg ggtttgagat tttgcccaaa 42 0 cccgtaccca tcgggttaac gggtacccat gggttacccg cgggtttcat ctccaatata 480 cctgttcttc tcataatcaa taagtatcgt aatgattaat gatatcatga tccaaaatct 540 atgtaatgaa caacgagttc atgatttggt ataaaaatta ttagtagaga gaatgaaata 600
caaataataa gttgtataat taagtgacct tgcactaagt tatccatcca tcacatatat 660
aacgctagta aaaactataa tatcaagcaa gcaacactct caccgactac tgatacattc 720
accaattgat aaaaaatatg aagtaaataa ggaataacaa gtttgttgtt cgtttataaa 780
ataaaatgac aatatgcact aggtttggtc gggtttaaaa aacccacggg ttcacgggtt 840
tgggtactat aggaacaaac ccgtacccat aaacccattg ggtacagatt tatgcccgtt 900
aacaaaccca tgggtatgaa aattgaccca aacctatacc ctaatggggt aaaaacccat 960
cgggtttcgg atttcgggta cccattgcca tctctagaca ggacaacctc ggccggtcct 102 0
gtatgtaggc caccagcatc ggccagttgg tacatccagc cggggtcagg tcacttttac 1080
tcgtctcaat cagacaatca ccgtccacca acgaacgcca acgttgtcac ttgtcaggtc 1140
ggttgagact tgtatttttt tttgtcctcc gtaaaaatcg gttcaccag 1189
<210> 49
<211> 10579
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Vip3Aa20 seqüências de flanqueamento e inserto do evento MIR162
<220>
<221> misc_feature
<222> (1) . . (1088)
<223> Seqüência de flanqueamento 5' do evento MIR162
<400> 49
tcctgtgttg ttggaacaga cttctgtctc ttctggtgat cataaatatt taaatgaacc 60
agttgtgttg gaaaatgttg ttttcttttg tctctagact ggaaagcgga gttctcgtca 120
acacggttct ttcaactagg gatgaaagtg gtaatccgaa ttgttagtac aaatttaata 180
ttttaaaata gatatgtata aaattttatg ttgatctttt ttatgttatc aagcacatta 240
gtataaatta gtataaatat gaataaaata ttacataaaa tgttttatgt attatttggt 300
ccctacaaca taaatagttg aaaaaattac taaatttgtt ttcgaatcta tatcgaagtt 360
tatatctatt atttaagaaa aatataggat gaaaaggttt atcttttatg aatctttaca 42 0
agctggatct tataaacaag aaaataaatt tatattgtag attttatatc ctatttattc 480
gcaatcaaag aaaagcgact aaaaaactga ttaccgagta aatactgttt ccaaccgttt 540
tcgtccctac tatcaacgcc ttctcccaac cgcagtcgat ctgtccgtct gtatcaggcg 600 cagcggcacc cctgctgttc gactatctag accatagaat attttaggta tacaataatt 660
ttagttccac gctagaacat tttagttaga ataataacaa gatttgctat tgatgtagga 720
ctcgcccgtc actgtctaaa aaagcattct gtcggtctta ttctttaggc atcagcgggt 780
gtactatctc atttttccta tcatattcct cagtactctg ttaagtataa atggtctatt 840
ttacatgatg aactaataaa actaattaag gatcctaact ttttgtgaag gtaatttgga 900
tcattatgca ttaccatcct acgtatacct gctgcagcag catctgcgta agcacagcct 960
agatatatgc ttctgtgtgg actgaaagga gactttgttt atcaattagt atactcccaa 102 0
aaaactgatg acaccaatga tgcaaatagg ctgggaatag tctgtctaat agtttgagtg 1080
aatcatgtca ctgatagttt aaactgaagg cgggaaacga caatctgatc atgagcggag 1140
aattaaggga gtcacgttat gacccccgcc gatgacgcgg gacaagccgt tttacgtttg 1200
gaactgacag aaccgcaacg ttgaaggagc cactcagcaa gctggtacaa gcttgcatgc 1260
ctgcagtgca gcgtgacccg gtcgtgcccc tctctagaga taatgagcat tgcatgtcta 1320
agttataaaa aattaccaca tatttttttt gtcacacttg tttgaagtgc agtttatcta 1380
tctttataca tatatttaaa ctttactcta cgaataatat aatctatagt actacaataa 1440
tatcagtgtt ttagagaatc atataaatga acagttagac atggtctaaa ggacaattga 1500
gtattttgac aacaggactc tacagtttta tctttttagt gtgcatgtgt tctccttttt 1560
ttttgcaaat agcttcacct atataatact tcatccattt tattagtaca tccatttagg 1620
gtttagggtt aatggttttt atagactaat ttttttagta catctatttt attctatttt 1680
agcctctaaa ttaagaaaac taaaactcta ttttagtttt tttatttaat aatttagata 1740
taaaatagaa taaaataaag tgactaaaaa ttaaacaaat accctttaag aaattaaaaa 1800
aactaaggaa acatttttct tgtttcgagt agataatgcc agcctgttaa acgccgtcga 1860
cgagtctaac ggacaccaac cagcgaacca gcagcgtcgc gtcgggccaa gcgaagcaga 1920
cggcacggca tctctgtcgc tgcctctgga cccctctcga gagttccgct ccaccgttgg 1980
acttgctccg ctgtcggcat ccagaaattg cgtggcggag cggcagacgt gagccggcac 2040
ggcaggcggc ctcctcctcc tctcacggca ccggcagcta cgggggattc ctttcccacc 2100
gctccttcgc tttcccttcc tcgcccgccg taataaatag acaccccctc cacaccctct 2160
ttccccaacc tcgtgttgtt cggagcgcac acacacacaa ccagatctcc cccaaatcca 2220
cccgtcggca cctccgcttc aaggtacgcc gctcgtcctc cccccccccc cctctctacc 2280
ttctctagat cggcgttccg gtccatggtt agggcccggt agttctactt ctgttcatgt 2340
ttgtgttaga tccgtgtttg tgttagatcc gtgctgctag cgttcgtaca cggatgcgac 2400
ctgtacgtca gacacgttct gattgctaac ttgccagtgt ttctctttgg ggaatcctgg 2460
gatggctcta gccgttccgc agacgggatc gatttcatga ttttttttgt ttcgttgcat 2520 agggtttggt ttgccctttt cctttatttc aatatatgcc gtgcacttgt ttgtcgggtc 2580
atcttttcat gctttttttt gtcttggttg tgatgatgtg gtctggttgg gcggtcgttc 2640
tagatcggag tagaattctg tttcaaacta cctggtggat ttattaattt tggatctgta 2700
tgtgtgtgcc atacatattc atagttacga attgaagatg atggatggaa atatcgatct 27 60
aggataggta tacatgttga tgcgggtttt actgatgcat atacagagat gctttttgtt 2820
cgcttggttg tgatgatgtg gtgtggttgg gcggtcgttc attcgttcta gatcggagta 2 880
gaatactgtt tcaaactacc tggtgtattt attaattttg gaactgtatg tgtgtgtcat 2940
acatcttcat agttacgagt ttaagatgga tggaaatatc gatctaggat aggtatacat 3 000
gttgatgtgg gttttactga tgcatataca tgatggcata tgcagcatct attcatatgc 3060
tctaaccttg agtacctatc tattataata aacaagtatg ttttataatt attttgatct 3120
tgatatactt ggatgatggc atatgcagca gctatatgtg gattttttta gccctgcctt 3180
catacgctat ttatttgctt ggtactgttt cttttgtcga tgctcaccct gttgtttggt 3240
gttacttctg caggtcgact ctagaggatc caccatgaac aagaacaaca ccaagctgag 3300
cacccgcgcc ctgccgagct tcatcgacta cttcaacggc atctacggct tcgccaccgg 3360
catcaaggac atcatgaaca tgatcttcaa gaccgacacc ggcggcgacc tgaccctgga 342 0
cgagatcctg aagaaccagc agctgctgaa cgacatcagc ggcaagctgg acggcgtgaa 3480
cggcagcctg aacgacctga tcgcccaggg caacctgaac accgagctga gcaaggagat 3540
ccttaagatc gccaacgagc agaaccaggt gctgaacgac gtgaacaaca agctggacgc 3 600
catcaacacc atgctgcgcg tgtacctgcc gaagatcacc agcatgctga gcgacgtgat 3660
gaagcagaac tacgccctga gcctgcagat cgagtacctg agcaagcagc tgcaggagat 3720
cagcgacaag ctggacatca tcaacgtgaa cgtcctgatc aacagcaccc tgaccgagat 3780
caccccggcc taccagcgca tcaagtacgt gaacgagaag ttcgaagagc tgaccttcgc 3 840
caccgagacc agcagcaagg tgaagaagga cggcagcccg gccgacatcc tggacgagct 3900
gaccgagctg accgagctgg cgaagagcgt gaccaagaac gacgtggacg gcttcgagtt 3960
ctacctgaac accttccacg acgtgatggt gggcaacaac ctgttcggcc gcagcgccct 4020
gaagaccgcc agcgagctga tcaccaagga gaacgtgaag accagcggca gcgaggtggg 4080
caacgtgtac aacttcctga tcgtgctgac cgccctgcag gcccaggcct tcctgaccct 4140
gaccacctgt cgcaagctgc tgggcctggc cgacatcgac tacaccagca tcatgaacga 4200
gcacttgaac aaggagaagg aggagttccg cgtgaacatc ctgccgaccc tgagcaacac 4260
cttcagcaac ccgaactacg ccaaggtgaa gggcagcgac gaggacgcca agatgatcgt 432 0
ggaggctaag ccgggccacg cgttgatcgg cttcgagatc agcaacgaca gcatcaccgt 4380
gctgaaggtg tacgaggcca agctgaagca gaactaccag gtggacaagg acagcttgag 4440 cgaggtgatc tacggcgaca tggacaagct ctacaccaac aacatcgtgt tcccgaacga gaagatgaag accctgcgct acgaggtgac gatcgacctg aacaagaaga aggtggagag gaacgacgac ggcgtctaca tgccactggg caacggcttt ggcctgcagg ccgacgagaa ctacctgcgc gagctgctgc tagccaccga gccaccgagc ggcttcatca gcaacatcgt ggagccgtgg aaggccaaca acaagaacgc caccaaggcc ctgtacgtgc acaaggacgg gaagccgaag accgagtacg tgatccagta gaaggacgag aacaccggct acatccacta ccagaccatc aacaagcgct tcaccaccgg gaagagccag aacggcgacg aggcctgggg gagcgagaag ctgctgagcc cggagctgat caccaacatc agcggcaaca ccctgaccct gaacctgcag ctggacagct tcagcaccta caacgtgcgc atccgcaact cccgcgaggt caaggacgtg agcgagatgt tcaccaccaa gagccagggc aacaacctgt acggcggccc gtaggagctc tagatctgtt ctgcacaaag acaccagact tttattcata cagtgaagtg ttttgtacaa cttagtatgt atttgtattt ttcctaaaac caaaatccag gggtaccagc cgtgcccctc tctagagata atgagcattg ttttttttgt cacacttgtt tgaagtgcag ttactctacg aataatataa tctatagtac ataaatgaac agttagacat ggtctaaagg cagttttatc tttttagtgt gcatgtgttc ataatacttc atccatttta ttagtacatc agactaattt ttttagtaca tctattttat aaactctatt ttagtttttt tatttaataa
gctgtgtccg gaccagagcg agcaaatcta 4500 gtacgtgatc accaagatcg acttcaccaa 4560 cgccaacttc tacgacagca gcaccggcga 4620 cagcgaggcc gagtaccgca ccctgagcgc 4680 cgtgatcagc gagaccttcc tgaccccgat 4740 cagccgcctg atcaccctga cctgtaagag 4800 cctgagcaac aaggagacca agctgatcgt 4860 ggagaacggc agcatcgagg aggacaacct 4920 ctacgtggac cacaccggcg gcgtgaacgg 4980 cggcatcagc cagttcatcg gcgacaagct 5040 caccgtgaag ggcaagccat cgattcacct 5100 cgaggacacc aacaacaacc tggaggacta 5160 caccgacctg aagggcgtgt acctgatcct 5220 cgacaacttc atcatcctgg agatcagccc 52 80 caacaccaac aactggacca gcaccggcag 5340 gtaccagggc ggccgcggca tcctgaagca 5400 ccgcgtgtac ttcagcgtga gcggcgacgc 5460 gctgttcgag aagaggtaca tgagcggcgc 5520 gttcgagaag gacaacttct acatcgagct 5580 gatcgtgcac ttctacgacg tgagcatcaa 5640 tggagtagtc agtcatcgat caggaaccag 5700 aagtgaagtg cagtgcagtg agttgctggt 5760 gtaaaatact tctatcaata aaatttctaa 5820 ttgcatgcct gcagtgcagc gtgacccggt 5880 catgtctaag ttataaaaaa ttaccacata 5940 tttatctatc tttatacata tatttaaact 6000 tacaataata tcagtgtttt agagaatcat 6060 acaattgagt attttgacaa caggactcta 6120 tccttttttt ttgcaaatag cttcacctat 6180 catttagggt ttagggttaa tggtttttat 6240 tctattttag cctctaaatt aagaaaacta 6300 tttagatata aaatagaata aaataaagtg 6360 actaaaaatt aaacaaatac cctttaagaa attaaaaaaa ctaaggaaac atttttcttg 6420 tttcgagtag ataatgccag cctgttaaac gccgtcgacg agtctaacgg acaccaacca 6480 gcgaaccagc agcgtcgcgt cgggccaagc gaagcagacg gcacggcatc tctgtcgctg 6540
cctctggacc cctctcgaga gttccgctcc accgttggac ttgctccgct gtcggcatcc 6600
agaaattgcg tggcggagcg gcagacgtga gccggcacgg caggcggcct cctcctcctc 6660
tcacggcacc ggcagctacg ggggattcct ttcccaccgc tccttcgctt tcccttcctc 6720 gcccgccgta ataaatagac accccctcca caccctcttt ccccaacctc gtgttgttcg 6780
gagcgcacac acacacaacc agatctcccc caaatccacc cgtcggcacc tccgcttcaa 6840
ggtacgccgc tcgtcctccc cccccccccc tctctacctt ctctagatcg gcgttccggt 6900
ccatggttag ggcccggtag ttctacttct gttcatgttt gtgttagatc cgtgtttgtg 6960
ttagatccgt gctgctagcg ttcgtacacg gatgcgacct gtacgtcaga cacgttctga 7020
ttgctaactt gccagtgttt ctctttgggg aatcctggga tggctctagc cgttccgcag 7080
acgggatcga tttcatgatt ttttttgttt cgttgcatag ggtttggttt gcccttttcc 7140
tttatttcaa tatatgccgt gcacttgttt gtcgggtcat cttttcatgc ttttttttgt 7200
cttggttgtg atgatgtggt ctggttgggc ggtcgttcta gatcggagta gaattctgtt 7260
tcaaactacc tggtggattt attaattttg gatctgtatg tgtgtgccat acatattcat 7320
agttacgaat tgaagatgat ggatggaaat atcgatctag gataggtata catgttgatg 7380
cgggttttac tgatgcatat acagagatgc tttttgttcg cttggttgtg atgatgtggt 7440
gtggttgggc ggtcgttcat tcgttctaga tcggagtaga atactgtttc aaactacctg 7500
gtgtatttat taattttgga actgtatgtg tgtgtcatac atcttcatag ttacgagttt 7560
aagatggatg gaaatatcga tctaggatag gtatacatgt tgatgtgggt tttactgatg 7620
catatacatg atggcatatg cagcatctat tcatatgctc taaccttgag tacctatcta 7680
ttataataaa caagtatgtt ttataattat tttgatcttg atatacttgg atgatggcat 7740
atgcagcagc tatatgtgga tttttttagc cctgccttca tacgctattt atttgcttgg 7800
tactgtttct tttgtcgatg ctcaccctgt tgtttggtgt tacttctgca gggatccccg 7860
atcatgcaaa aactcattaa ctcagtgcaa aactatgcct ggggcagcaa aacggcgttg 7920
actgaacttt atggtatgga aaatccgtcc agccagccga tggccgagct gtggatgggc 7980
gcacatccga aaagcagttc acgagtgcag aatgccgccg gagatatcgt ttcactgcgt 8040
gatgtgattg agagtgataa atcgactctg ctcggagagg ccgttgccaa acgctttggc 8100
gaactgcctt tcctgttcaa agtattatgc gcagcacagc cactctccat tcaggttcat 8160
ccaaacaaac acaattctga aatcggtttt gccaaagaaa atgccgcagg tatcccgatg 8220
gatgccgccg agcgtaacta taaagatcct aaccacaagc cggagctggt ttttgcgctg 8280 acgcctttcc ttgcgatgaa cgcgtttcgt gaattttccg agattgtctc cctactccag 8340 ccggtcgcag gtgcacatcc ggcgattgct cactttttac aacagcctga tgccgaacgt 8400 ttaagcgaac tgttcgccag cctgttgaat atgcagggtg aagaaaaatc ccgcgcgctg 8460 gcgattttaa aatcggccct cgatagccag cagggtgaac cgtggcaaac gattcgttta 8520 atttctgaat tttacccgga agacagcggt ctgttctccc cgctattgct gaatgtggtg 8580 aaattgaacc ctggcgaagc gatgttcctg ttcgctgaaa caccgcacgc ttacctgcaa 8640 ggcgtggcgc tggaagtgat ggcaaactcc gataacgtgc tgcgtgcggg tctgacgcct 8700 aaatacattg atattccgga actggttgcc aatgtgaaat tcgaagccaa accggctaac 8760 cagttgttga cccagccggt gaaacaaggt gcagaactgg acttcccgat tccagtggat 8820 gattttgcct tctcgctgca tgaccttagt gataaagaaa ccaccattag ccagcagagt 8880 gccgccattt tgttctgcgt cgaaggcgat gcaacgttgt ggaaaggttc tcagcagtta 8940 cagcttaaac cgggtgaatc agcgtttatt gccgccaacg aatcaccggt gactgtcaaa 9000 ggccacggcc gtttagcgcg tgtttacaac aagctgtaag agcttactga aaaaattaac 9060 atctcttgct aagctgggag ctcgatccgt cgacctgcag atcgttcaaa catttggcaa 9120 taaagtttct taagattgaa tcctgttgcc ggtcttgcga tgattatcat ataatttctg 9180 ttgaattacg ttaagcatgt aataattaac atgtaatgca tgacgttatt tatgagatgg 9240 gtttttatga ttagagtccc gcaattatac atttaatacg cgatagaaaa caaaatatag 9300 cgcgcaaact aggataaatt atcgcgcgcg gtgtcatcta tgttactaga tccccgggtc 9360 tagacaattc agtacattaa aaacgtccgc catggtctga aggcaacaga taaggcatac 9420 tgggccttgt ggtagttgtt ttactgggcc tttttgtatg atctataaaa ttcactggga 9480 tcaacccgga gaggaatggc agcagatgca gtccccaggg tcctccgtcg ccgcctgagc 9540 acccggcacc cgcgctgaac cggagaggga cgcgcggacg ccgtgcagct ggtgcggagg 9600 gggctgtggc agatgaggat gagacgcgta cgtggctggg aaggccagca ggccaccggg 9660 tcttcgtcca gcccggcgcg agtggacagg actagagatg gcaacggtta caaacccgct 9720 gggttttacc gtcccaaacc cgtacccgtg aaaaatatct atgcccatta aaaaacccgt 9780 acccatgacg ggtttgagat tttgcccaaa cccgtaccca tcgggttaac gggtacccat 9840 gggttacccg cgggtttcat ctccaatata cctgttcttc tcataatcaa taagtatcgt 9900 aatgattaat gatatcatga tccaaaatct atgtaatgaa caacgagttc atgatttggt 9960 ataaaaatta ttagtagaga gaatgaaata caaataataa gttgtataat taagtgacct 10020 tgcactaagt tatccatcca tcacatatat aacgctagta aaaactataa tatcaagcaa 10080 gcaacactct caccgactac tgatacattc accaattgat aaaaaatatg aagtaaataa 10140 ggaataacaa gtttgttgtt cgtttataaa ataaaatgac aatatgcact aggtttggtc 10200 gggtttaaaa aacccacggg ttcacgggtt tgggtactat aggaacaaac ccgtacccat 10260 aaacccattg ggtacagatt tatgcccgtt aacaaaccca tgggtatgaa aattgaccca 10320 aacctatacc ctaatggggt aaaaacccat cgggtttcgg atttcgggta cccattgcca 10380 tctctagaca ggacaacctc ggccggtcct gtatgtaggc caccagcatc ggccagttgg 10440 tacatccagc cggggtcagg tcacttttac tcgtctcaat cagacaatca ccgtccacca 10500 acgaacgcca acgttgtcac ttgtcaggtc ggttgagact tgtatttttt tttgtcctcc 10560 gtaaaaatcg gttcaccag 10579
<210> 50
<211> 23
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador FE1002 - Sintetizado quimicamente
<400> 50
cgtgactccc ttaattctcc gct 23
<210> 51
<211> 24
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Iniciador FE1003 - Sintetizado quimicamente
<400> 51
gatcagattg tcgtttcccg cctt 24
<210> 52
<211> 24
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Iniciador FE1004 - Sintetizado quimicamente
<400> 52
gattgtcgtt tcccgccttc agtt 24
<210> 53 <211> 27
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador 162_DW_Conf3 - Sintetizado quimicamente
<400> 53
cctgtgttgt tggaacagac ttctgtc 27
<210> 54
<211> 26
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> iniciador FE0900- Sintetizado quimicamente
<400> 54
ggctccttca acgttgcggt tctgtc 26
<210> 55
<211> 1230
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Amplicon 5' PCR - Sintetizado quimicamente
<400> 55
cctgtgttgt tggaacagac ttctgtctct tctggtgatc ataaatattt aaatgaacca 60
gttgtgttgg aaaatgttgt tttcttttgt ctctagactg gaaagcggag ttctcgtcaa 120
cacggttctt tcaactaggg atgaaagtgg taatccgaat tgttagtaca aatttaatat 180
tttaaaatag atatgtataa aattttatgt tgatcttttt tatgttatca agcacattag 240
tataaattag tataaatatg aataaaatat tacataaaat gttttatgta ttatttggtc 300
cctacaacat aaatagttga aaaaattact aaatttgttt tcgaatctat atcgaagttt 360
atatctatta tttaagaaaa atataggatg aaaaggttta tcttttatga atctttacaa 420
gctggatctt ataaacaaga aaataaattt atattgtaga ttttatatcc tatttattcg 480
caatcaaaga aaagcgacta aaaaactgat taccgagtaa atactgtttc caaccgtttt 540
cgtccctact atcaacgcct tctcccaacc gcagtcgatc tgtccgtctg tatcaggcgc 600 agcggcaccc ctgctgttcg actatctaga ccatagaata ttttaggtat acaataattt 660 tagttccacg ctagaacatt ttagttagaa taataacaag atttgctatt gatgtaggac 720 tcgcccgtca ctgtctaaaa aagcattctg tcggtcttat tctttaggca tcagcgggtg 780 tactatctca tttttcctat catattcctc agtactctgt taagtataaa tggtctattt 840 tacatgatga actaataaaa ctaattaagg atcctaactt tttgtgaagg taatttggat 900 cattatgcat taccatccta cgtatacctg ctgcagcagc atctgcgtaa gcacagccta 960 gatatatgct tctgtgtgga ctgaaaggag actttgttta tcaattagta tactcccaaa 1020 aaactgatga caccaatgat gcaaataggc tgggaatagt ctgtctaata gtttgagtga 1080 atcatgtcac tgatagttta aactgaaggc gggaaacgac aatctgatca tgagcggaga 1140 attaagggag tcacgttatg acccccgccg atgacgcggg acaagccgtt ttacgtttgg 1200 aactgacaga accgcaacgt tgaaggagcc 1230
<210> 56
<211> 28
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Iniciador 162_GW_3_F1 - Sintetizado quimicamente
<400> 56 tctcttgcta agctgggagc tcgatccg 28
<210> 57
<211> 28
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Iniciador 162_GW_3_F2 - Sintetizado quimicamente
<400> 57 aagattgaat cctgttgccg gtcttgcg 2 8
<210> 58
<211> 24
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0> <223> Iniciador 162_3'GW_R1 - Sintetizado quimicamente
<400> 58
ctggtgaacc gatttttacg gagg 24 <210> 59 <211> 1518 <212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Amplicon 3' PCR - Sintetizado quimicamente
<400> 59
tctcttgcta agctgggagc tcgatccgtc gacctgcaga tcgttcaaac atttggcaat 60
aaagtttctt aagattgaat cctgttgccg gtcttgcgat gattatcata taatttctgt 120
tgaattacgt taagcatgta ataattaaca tgtaatgcat gacgttattt atgagatggg 180
tttttatgat tagagtcccg caattataca tttaatacgc gatagaaaac aaaatatagc 240
gcgcaaacta ggataaatta tcgcgcgcgg tgtcatctat gttactagat ccccgggtct 300
agacaattca gtacattaaa aacgtccgcc atggtctgaa ggcaacagat aaggcatact 360
gggccttgtg gtagttgttt tactgggcct ttttgtatga tctataaaat tcactgggat 420
caacccggag aggaatggca gcagatgcag tccccagggt cctccgtcgc cgcctgagca 480
cccggcaccc gcgctgaacc ggagagggac gcgcggacgc cgtgcagctg gtgcggaggg 540
ggctgtggca gatgaggatg agacgcgtac gtggctggga aggccagcag gccaccgggt 600
cttcgtccag cccggcgcga gtggacagga ctagagatgg caacggttac aaacccgctg 660
ggttttaccg tcccaaaccc gtacccgtga aaaatatcta tgcccattaa aaaacccgta 720
cccatgacgg gtttgagatt ttgcccaaac ccgtacccat cgggttaacg ggtacccatg 780
ggttacccgc gggtttcatc tccaatatac ctgttcttct cataatcaat aagtatcgta 840
atgattaatg atatcatgat ccaaaatcta tgtaatgaac aacgagttca tgatttggta 900
taaaaattat tagtagagag aatgaaatac aaataataag ttgtataatt aagtgacctt 960
gcactaagtt atccatccat cacatatata acgctagtaa aaactataat atcaagcaag 1020
caacactctc accgactact gatacattca ccaattgata aaaaatatga agtaaataag 1080
gaataacaag tttgttgttc gtttataaaa taaaatgaca atatgcacta ggtttggtcg 1140
ggtttaaaaa acccacgggt tcacgggttt gggtactata ggaacaaacc cgtacccata 1200
aacccattgg gtacagattt atgcccgtta acaaacccat gggtatgaaa attgacccaa 1260
acctataccc taatggggta aaaacccatc gggtttcgga tttcgggtac ccattgccat 1320 ctctagacag gacaacctcg gccggtcctg tatgtaggcc accagcatcg gccagttggt 13 80 acatccagccggggtcaggt cacttttact cgtctcaatc agacaatcac cgtccaccaa 1440 cgaacgccaa cgttgtcact tgtcaggtcg gttgagactt gtattttttt ttgtcctccg 1500 taaaaatcgg ttcaccag 1518
<210> 60
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 60
ttcacgggag actttatctg 20
<210> 61
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 61
ccgattcatt aatgcag 17
<210> 62
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 62
acgtaaaacg gcttgtc 17
<210> 63
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 63
gtttaaactg aaggcgg
<210> 64
<211> 22
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 64
aataatatca ctctgtacat cc
<210> 65
<211> 15
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 65
gttgtaaaac gacgg
<210> 66
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 66
taggcacccc aggcttta
<210> 67
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 67
aattgaattt agcggccg
<210> 68
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 68 ggtccctaca acataaatag
<210> 69
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 69
ttcgtcccta ctatcaacgc
<210> 70
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 70 ctttaggcat cagcgggt
<210> 71
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 71 agcatctgcg taagcaca
<210> 72
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 72 ctgatgacac caatgatgc
<210> 73
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 73
gatcagattg tcgtttccc
<210> 74
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 74 gcatcattgg tgtcatcag
<210> 75
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 75
tgtgcttacg cagatgct
<210> 76
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 76
acccgctgat gcctaaag
<210> 77
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 77 gcgttgatag tagggacgaa
<210> 78
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 78
ctatttatgt tgtagggacc
<210> 79
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 79
ctagactgga aagcggag
<210> 80
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 80 ccactttcat ccctagttg
<210> 81
<211> 17
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 81 gattgaatcc tgttgcc
<210> 82
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 82 tctcataaat aacgtcatgc
<210> 83
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 83
tctgtggata accgtattac
<210> 84
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 84
agtaacatag atgacaccgc
<210> 85
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 85 ccagtgtgct ggaattcg
<210> 86
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 86 ccagtgtgat ggatatctgc
<210> 87
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 87 ccagtgtgct ggaattcg
<210> 88
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 88 ccagtgtgat ggatatctgc
<210> 89
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 89 gtgtgctgga attcgccctt
<210> 90
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 90
tatctgcaga attcgccctt
<210> 91
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado guimicamente
<400> 91
gtgtgctgga attcgccctt
<210> 92
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado guimicamente
<400> 92 tatctgcaga attcgccctt
<210> 93
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 93 gtgtgctgga attcgccctt
<210> 94
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 94 tatctgcaga attcgccctt
<210> 95
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 95
gtgtgctgga attcgccctt
<210> 96
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 96 ggtcttgcga tgattatc
<210> 97
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <22 0>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 97 gagaggaatg gcagcaga
<210> 98
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 98 catgacgggt ttgagatt
<210> 99
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 99
aatctcaaac ccgtcatg 18
<210> 100
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 100 tctgctgcca ttcctctc 18
<210> 101
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial
<220>
<223> Sintetizado quimicamente
<400> 101 gatcaacccg gagaggaat 19
<210> 102
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador de sequênciamento b05104h-Sintetizado quimicamente
<400> 102
ccatgacggg tttgagat 18
<210> 103
<211> 20
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador de sequênciamento b05105c - Sintetizado guimicamente
<400> 103
caaccgacct gacaagtgac 20
<210> 104
<211> 18
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador de sequênciamento b05105e - Sintetizado quimicamente
<400> 104
atctcaaacc cgtcatgg 18
<210> 105
<211> 19
<212> DNA
<213> Seqüência artificial <220>
<223> Iniciador de sequênciamento b05105f - Sintetizado quimicamente
<400> 105
attcctctcc gggttgatc 19
<210> 106
<211> 51328
<212> DNA
<213> Zea mays <22 0>
<221> misc_feature
<222> (1680)..(3338)
<223> Marcador opie2 <22 0>
<221> misc_feature
<222> (25455) . . (25512)
<223> Seqüência genômica de milho substituído por DNA Heterólogo. <220>
<221>
misc_feature
<222>
(43275) . . (45086)
<223>
Marcador gag
<400>
106
agatctagag attcgtcatt tgtagaaagg atagaaaggt gattgctagg aagttagggg caaaatgcaa gggtgataaa acttgcattt ggatccctaa ggaaattgtg actaaccttg taggacccaa caagagttgg gtacctaagt cccaagccta aatttgcctt gcaggtttat gcatccgggg gttcaagctg gattattgat agcggatgca caaaccatat gacgggggag aagaagatgt tcacctccta tgtcaagaat aaggattccc aagattcaat tatattcggt gatgggaatc aaggcaaggt aaaagggtta ggtaaaattg caatttctaa tgagcactcc atatctaatg tgtttttagt agagtctctc agatataatt tgctatctgt tagtcaatta tgcaacatgg ggtataactg tctatttacc aatgtagatg tgtctgtctt tagaagaagt gatggttcac tagcttttaa gggtgtatta gacggcaaac tttatttagt tgattttgca aaagaagagg ccggtctaga tgcatgctta atagctaaga ctagcatggg ctggctgtgg catcgccgct tagcacatgt ggggatgaag aaccttcaca agcttctaaa gggagaacac gtgataggtt tgactaatgt gcaattcgaa aaagatagac cttgtgcagc ttgtcaagca gggaaacagg tgggaagcgc tcatcacacc aaaaatgtga tgacaacatc aagacccctg gagctgctac atatggacct cttcggaccc gtcgcctatc tgagcatagg aggaagtaag tatggtctag ttatcgttga tgacttttcc cgcttcactt gggtgttctt tttgcaggat aaatctgaaa cccaagggac cctcaagcgc ttcctcagga gatctcaaaa tgagtttgag ctcaaggtga agaagataag gagcgacaac gggtccgagt tcaagaacct tcaagtggag gagttccttg aggaggaagg gatcaagcac gagttctccg ctccctacac accacagcaa aatggtgtgg tagagaggaa gaacatgacg ctaatcgata tggcgagaac gatgcttgga gaattcaaga cccccgagtg tttctggtcg gaagccgtga acacggcttg ccacgccatc aacagggtct accttcaccg cctcctcaag aagacgtcgt atgagcttct aaccggtaac aaacccaatg tatcttactt tcgtgtattt gggagcaaat gctacattct agtgaagaag ggtagaaatt ctaagtttgc tcccaaagct gtagaagggt ttttgttagg ttatgactca aatacaaagg cgtatagagt cttcaacaaa tcatcgggtt tggttgaaat ctctagcgac gttgtatttg atgagactaa tggctctcca agagagcaag ttgttgattg tgatgatgta gatgaagaag atgttccaac ggctgctata cgaaccatgg cgattggaga agtgcggcca caggaacaag atgaacgaga tcaaccttct tcctcaacaa cggtgcatcc cccaactcaa
60 120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 gacgatgaac aggttcatca acaggaggca tgtgatcaag gggagcacaa gatgatcatg 1680
tgatggagga agaagcgcaa ccggcacctc caacccaagt tcgagcgatg attcaaagga 1740
atcatcccgt cgatcaaatt ctgggtgata ttagcaaggg agtaactact cgatctcgat 1800
tagttaattt ttgtgagcat tactcctttg tctcttctat tgagcctttc agggtagaag 1860
aggccttgct agatccggac tgggtgttag ccatgcagga ggaactcaac aacttcaagc 1920
gcaatgaagt ttggacactg gtgcctcgtc ccaagcaaaa tgttgtggga accaagtggg 1980
tgttccgcaa caaacaggac gagcacgggg tggtgacgag gaacaaggct cgacttgtgg 2040
caaaaggtta tgcccaagtc gcaggtttgg actttgagga gacgtttgct cctgtggcta 2100
ggctagagtc aattcgcatc ttgctagcat atgccgctca ccactctttc aggttgtacc 2160
aaatggatgt gaagagcgct ttcctcaacg ggccgatcaa ggaagaggtg tacgtggagc 2220
aaccccctgg cttcgaggat gaacggtacc ccgaccacgt gtgtaagctc tctaaggcgc 2280
tctatggact taagcaagcc ccaagagcat ggtatgaatg ccttagagac tttttacttg 2340
ctaatgcttt caaggttggg aaagccgatc caactctgtt cactaagaca tgtgatggtg 2400
atttgtttgt gtgccaaatt tatgtcgacg acataatatt tggttctact aaccaaaagt 2460
cttgtgaaga gtttagcagg gtaatggcgc agaaattcga gatgtcaatg atgggcgagt 2520
tgaactactt ccttgggttc caagtgaagc aactcaagga tggcaccttc atctcccaaa 2580
cgaagtacac gcaagatcta ctaaagcggt ttgggatgaa ggacgccaag cccgcaaaga 2640
ctccgatggg gaccgacgga cacaccgacc tcaacaaagg aggtaagtcc gttgatcaaa 2700
aagcataccg gtcaatgata ggttctttac tttacttatg tgctagtaga ccggatatta 2760
tgcttagcgt atgcatgtgt gctagatttc aatccgatcc taaggagtgt cacttagtgg 2820
cggtgaagcg aattattaga tatttggttg ctacgccttg cttcgggctc tggtatccaa 2880
aggggtctac ctttgacctg gttggatact cagattccga ctatgttgga tgtaaggtcg 2940
ataggaagag tacatcgggg acgtgccaat tcttaggaag gtccctggtg tcgtggaact 3000
ctaagaaaca aacctccgtt gccctatcca ccgctgaggc cgagtatgtt gccgcaggac 3060
agtgttgcgc gcaactactt tggatgaggc aaaccctccg ggactttggc tacaatctga 3120
gcaaagtccc actcctatgt gacaatgaga gtgctatccg catggcggaa aatcctgttg 3180
aacacagccg cacaaagcac atagacatcc ggcatcactt tttgagagac caccagcaaa 3240
agggagatat cgaagtgttt catgttagca ccgagaacca gctagctgat atcgaagtgt 3300
ttcatgttag caccgagaac cttttgcagg ctgcgtagta agctaaatgt cttagattcg 3360
cggaacttgg attgaattgt agcatacatg tgtttatgcc tttgatcatg ttcattctgc 3420
attttgttgc ttattgtggt gctcaagttg tacaaacact ccctggatct cacaagtccg 3480
ttgcaaagtg atgctgagag cacctagagg gggggtgaat aggtgatcct gtaaaaactt 3540 aacttatagc cacaaaaact tgttaaaggt tagcacaata attgccaagt ggctaaagag 3600
gagatcttgc acaatacgat tatcacagag aattcaacac agaggagaca tagtgattta 3660
tcccgtggtt cggccaagta caaaacttgc ctacttccac gttgtggcgt cccaacggac 372 0
gagggttgca atcaaccctt ctcaagcggt ccaaagaccc acttgaatac cacggtgttt 3780
ttgccttgct tatctttatc ccacttacga ggaatctcca cagattggag tctctcgccc 3840
ttacacttaa gattcacaaa gaagcacgga gtaagggagg gaagcaacac acacaaatcc 3900
acagcgaaat gcgcacacac acggccaaga atcgagctca aagactatct cacagtttct 3960
cacaagaaca gagctcgaat cacttagaat cacaaacgga tgcgcaaaga ctgagtgtgg 4020
atgatcaaga atgctcaaag gttgcttggt gtctccctcc atgcgtctag gggtcccttt 4080
tatagcccca aggcagctag gagccgttga gaacaaatct ggaaggccat ctttgccttc 4140
tgtcgtcggg cgcaccggac agtccggtgc ccgattcctt tccttaattg gcgaagccga 4200
ccgttgcaga tgcgggagcc gttggcgcac cggacatgtc cggtgcacac cggacagtcc 42 60
ggtgccccct tccgaccgtt ggctcggcca cgtgtcccgc gcagatcgcg cggtcgaccg 4320
ttggctcagc cgaccgttgg ctcaccggac agtccggtgc acaccggaca gtccggtgca 4380
caccggacag tccggtgaat tttagccgta cgccgtcagc aaattcccga gagcggcctc 4440
ttcggccaag gcagcctggc gcaccggaca ctgtccggtg caccaccgga cagtccggtg 4500
ccccagaccg aaacagcctc ttggctgtac acagccaagt cttctcttct cttcttcttt 4560
ctgtttctaa cacttagaca aatatattag tacacaaaac caatgtacta aggcttagaa 4620
acataccttt gctctagatt ttcactttgt tcatccatgg gcattgattc acatttaagc 4680
acttgtgttg acactcaatc accaaaatac ttagaaatgg cccaagggca catttccctt 4740
tcagatgcac agtttgaggg ggagatgtgt tacaacttga ccctttgaga ctaaccgtat 4800
gcttgagttt gcttgtttta gtctcaaagg agaattaaaa gggaaaaggt ggacttggac 4860
catgaaagac ttccactgca ctccgatgag agggtagctt attccaagtt catctcatgt 4920
actcttattg cctttgtatt cttattgaag attttggtga ggcaatgggg ttcttgggcc 4980
aagattgatc ctgttttggt gcttgatgcc aaagggggag aaaataaggg ccaaagcaat 5040
aaatggatca gctaccactt gagaaatttt gaaaacagta gaatagagct tttggtttgt 5100
caaatctctt ttgttgtctc ttttgtcaaa agttggcctc ttgtggggag aagtgttgat 5160
tatgggaaaa agggggagtt tttgaaatct ttcctttgga atgactctcc ttatgcttca 5220
acatgtgtgt ttgacttaga gatagagatt tgagtttgat ttgcaaaaac aaaccaagtg 5280
gtggcaaagg atgatccata tatgccaaat tgaatcaaaa taaatttgag tttttatttg 5340
aagtaatatt gcacttgttc tagttgcttt atgtagtgtt ggcataaatc accaaaaagg 5400
gggagattga aagggaaatg tgcccttggg ccatttctaa gtattttggt gattgagtgc 5460 caacacaagt gcttaaatgt gaattcatgt ttatggatga ataaagtgaa aatcaagagc 552 0
aaaggtatgt ttctaagtct tagtacattg gttttgtgta ctaatatact tgtctaagta 5580
ttggaaacag gaagaaaaag aaaagaaaag agttggctgt gtacagccaa gaggctgttt 5640
cggtctgggg caccggactg tccggtggtg caccggacag tgtccggtgg tgcaccggac 5700
agtgtccggt gcgccaggct gcctcggccg aagtagccgc tctcgggaat tcgctgacgg 5760
cgtacgacta taattcaccg gactgtccgg tgtgcaccgg actgtccggt gtgcaccgga 5820
ctgtccggtg agccaacggt cggccgggcc aacggtcggc cgcgcgatct gcgcgtgaca 5880
cgtggccgag ccaacggcta gaagggggca ccggactgtc cggtgtgcac cggacatgtc 5940
cggtgcgcca acggctctct ggcgggcaac gggcggctgc gccattttag gaaggaaatc 6000
gggcaccgga cagtgtccgg tgtgcaccgg actgtccggt gcgcccgacg acagaaggca 6060
aggatggcct tccagatttg ttctcaacgg ctcctagctg tcttggggct ataaaaggga 6120
cccctaggcg catggaggag tacaccaagc attcctacaa cattcctaag caccaagaca 6180
tcgatctcac gcattcgttt cattgtgata gcatctagag ctcttgttga gttgcgaact 6240
ctttgagttg tgttgcgagc tcttgttgcg acttgtgtgc gtgttgttgc tctgatcttt 6300
tgaagtcttg tgtgcgttgc tcattccccc tttgctctgt gttctttgtg aacttcaatt 6360
gtaagggcga gaggctccaa gttgtggaga ttcctcgcaa acgggattga gaaaaaaagc 6420
aagcaaaaca ccgtggtatt caagtgggtc tttggaccgc ttgagagggg ttgattgcaa 6480
ccctcgtccg ttgggacgcc acaacatgga gtaggcaagc gttggtcttg gccgaaccac 6540
gggataaacc actgtgtcgt ctctgtgatt gatctcttgt ggtattgtgt tttgttgaga 6600
ctcctttcta gccacttggc atttattgtg ctaacactta acaagttttt gtggctataa 6660
gtttaagttt tacaggatca cctattcacc ccccccccct ctaggtgttc tcacctatgc 6720
acccgtagct aggcttgagt caattcgcat attattggcc tatgctactt accatggctt 6780
taagctttat caaatggacg tgaaaagtgc cttcctcaac ggaccaatca aggaagaggt 6840
ctatgttgag caacctcccg gctttgaaga cagtgagtat cctaaccatg tttataggct 6900
ctctaaggcg ctttatgggc tcaagcaagc cccaagagca tggtatgaat gccttagaga 6960
tttccttatc gctaatggct tcaaagtcgg caaggccgat cctactctat ccactaaaac 7020
tcttgacaat gatttgtttg tatgccaaat ttatgttgat gatatcatat ttgggtctac 7080
taacgaatct acttgtgagg aatttagtag gatcatgaca cagaaattcg agatgtctat 7140
gatgggggag ttgaaatatt tcttaggatt tcaagtgaag caactccaag agggcacctt 7200
cattagccaa acgaagtaca ctcaagacat tctaaacaag tttggaatga aggatgccaa 7260
gcccatcaaa acacccatgg gaacaaatgg gcatctcggc ctcgacacgg gaggtaagtc 7320
cgtggatcaa aaggtatacc ggtcgatgat tggttcattg ctttatttat gtgcatctcg 73 80 accggacatt atgctttccg tatgcatgtg tgcaagattc caatccgacc ctaaggaatc 7440
ccaccttacg gccgtaaaac gaatcttgag atatttggct tatactccta agtttgggct 7500
ttggtaccct cggggatcca cttttgattt aattggttat tccgatgctg attgggcggg 7560
gtgtaagatt aataggaaga gcacatcggg gacttgccag ttcttgggaa gatccttggt 7620
gtcttgggct tcaaagaagc aaaattcggt tgctctttcc accgccgaag ccgagtacat 7680
tgccgcaggt cattgttgcg cgcaattgct ttggatgagg caaaccctgc gggactatgg 7740
ttacaaatta accaaagtcc ctttgctatg tgataatgag agtgcaatca aaatggccga 7800
caatcccgtc gagcatagcc gcactaagca catagccatt cggtatcatt ttcttaggga 7860
tcaccaacaa aagggagata tcgagatttc ttatattaac actaaagatc aattagccga 7920
tatctttacc aagcctcttg atgaacaaac ttttaccaaa cttaggcatg agctcaatat 7980
tcttgattcg cgcaattttt tttgctagat tgcacacgta gctcatttat atacctttga 8040
tcatatctct ttcatatgct atgactaatg tgtttttcaa gtccatttca caccaagtca 8100
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catcctttgc catcgctcca agaaaaggac cttgtctttg ggggagagag taaaagccca 8220
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gggaagatag tacttctatg ggctctaatg attccgtttt tggcgattca tgccaaaggg 8340
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actcggtcag tcggtgcggc gatttagtca ggcgagccgg agatgcgtcc gccgttaaaa gaggtcggct gcccttggcc gaggctaggc ggactgatcc ctgacttaat cgcacccatc taccagctga gaattaggcg tcttgagggt accccaaagg gttgttttag aagtctaggt ttagaaattt attttagtgt gtgatttctc taataataaa ataaacatct atgatggagt cttcaaaact gtattagaat ttgaaacttg aaaaacaaaa ccactgtcgg gccactatct tcagtcgagt gggtcagttg gccggcccaa cgcctggttg gtttcacagg cgaccatgcg cctatggacg gtagtcggca gacaccaatc ctcgtcgtcg tacgcatggg tcactgttag agaggaaggg caacttggag cagaagaaga tttgttattt cgttcatatc ctcagcagcc actggactgc cacaatacgg cttacacggt cttcctggtc ctcagcacgc gaggctgcat gtcttgattc ccacttgctg ccagcttctt cccctgtcct cgagcgccag cttggtccca tgcctcaacg tcctcccagg tagccagatc ctgcgcgatt aactcaccac cacggtcaat ctggataggg ccaacatctt ggggcagctg ccgtttgagc tgtgacacat gaaaaattgg acggtaagcc acggaaccca gacgatcgta aacttgtgat tggagcgtgt agcaaccgaa acccaatcac ccaccaaaaa cacgcgttca cggtcttgag ctcgatgcag atgcaattta aaccaagttt cgagctctgg ctgtggcacc ggagtgtggc catataacac ttcaaagggt ttgtaccagt attcagcaac tgacagccaa tagcaacgaa gaaaagtttc caagcattga
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atcagacaat cttgtatttt gcggacagcg gcatatgcaa tggtgccacg aatgcttcgg atgacggatt cttgctgctg gctccttgtc gccaacaaca aacgacagat caaatgagcc gcaaaggcac ttttttccct cttgagttct caatgccccc cttcccttga tcgaagctcg cagatatttt aacactcggc gaggcggtcg catggcgcgg ctcggcgccg cacgggcagc caccccgatg gatctgcgtg agtttagagg accaccgaca tgattcatgt aggattccac gacttcgcgg gcgacagtgt
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ttgtattcgt acatttccac cacaaagaaa agcctacaca atttttaaat catttacgat gaatcatgat cgaggatggt cgagcacaaa tattgggagt agtatatttg ctacattatt tggataccta actaggtaac ctgaagacat ctaatactcc gtcaaataaa ctaacaatgt tgacctgcat atgcagccat ttgtccgtgt tttatttaaa tttaaattat atactggtta aggctgcgtt agggtgtgtt aaggttgttt tccctcgaaa tatgtgtacc agggttgcaa aaacctgtga atgtctgtaa
gttcctactc ctttcccaaa gggaaagcag cacatctgtg tacgttaact aaagttcaat cggttgtttt gaattcattt ctcgatggca gacaaacaac gatatctcat tttagggcct attagttgtt taagggggtg ccaaacactt ctccgatttt taaaaatgga ttagccaact gtggtatgac cgtcctagag gtgctagggt cacgatctaa ttgtatatat gagactcttt ggacgcacgg tggttgtaat agtttagggt ttagagagac gcaaccaaac ccttaactac agatttactg accgaagaaa
acgtagaaca ctctaatcct acgttaggaa aaactgtatt cgtcttttct aatcattatc tctctaaatg tttacgcatc tgtaagtgat tcctcaagtc ttaaaaaccc gttttgggaa gactaatctt ttggattaca tagctaatag tttatttgac ggtagtagtt aactattagt ttaagtcact ttaattggtc ttctttatac actcatagat atttacaata gttttgtctc ccgcgagagt gatgggaatg caagggttgg gagaggggac gcaccataaa agcactaacc ttgtattaca aatagttggt
agcaaaaggg aaggcagtcc agcagccatg aaattgttaa agttattact cttctcttga tttgggtgag tcatattatt tttagggtgt taaggactaa attgaagctt ctagagatgt gattagttgg ctagagataa ttaaactatt gtttgttagt aggtagacat tctagtgcat tggcctcatt actagttagt catatagata tctcatatcg tcaattctta tcactgagtg tagacgatcc agacagaatg aacaagactg gcgaggaaac ttaatgatga gccttatcca taattacaag tccaaacatc
gagaaagaaa ataatctgag tgctatatat atatttttag tatagcttca ttactatttt taatctttag taaagtgcat gattgacaca ataagaatat gatttttggt tctaagggct atgacagaaa tagttagctg agctattttt gaaaatctga ttgttaggta taaaacatcc agcctaattt tgctaactgg ggctttatcg cacaattata ggcacaaatg agcaggattt acgataaaac aaatgtgatg tcccagtatt gtctctgacc tgatgcttat aggatcaaac attaccctgg ccaggtacta
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<211> 58
<212> DNA
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<400> 107
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Claims (61)

1. Molécula de ácido nucléico isolada, caracterizada pelo fato de que compreende uma seqüência de nucleotídeos que é única ao evento MIR162.
2. Molécula isolada de ácido nucléico de acordo com a reivindi- cação 1, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido nucléico une uma molécula do DNA heterólogo inserida dentro do genoma do evento MIR162 ao DNA genômico no evento MIR162 abrangendo pelo menos 10 nucleotídeos contíguos da molécula de DNA heterólogo e pelo menos 10 nucleotídeos contíguos do DNA genômico que flanqueiam o ponto de inser- ção da molécula de DNA heterólogo.
3. Molécula isolada de ácido nucléico de acordo com a reivindi- cação 1, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido nucléico une uma molécula do DNA heterólogo inserida dentro do genoma do evento MIR162 ao DNA genômico no evento MIR162 abrangendo pelo menos 20 nucleotídeos contíguos da molécula de DNA heterólogo e pelo menos 20 nucleotídeos contíguos do DNA genômico que flanqueiam o ponto de inser- ção da molécula de DNA heterólogo.
4. Molécula isolada de ácido nucléico de acordo com a reivindi- cação 1, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido nucléico une uma molécula do DNA heterólogo inserida dentro do genoma do evento MIR162 ao DNA genômico no evento MIR162 abrangendo pelo menos 50 nucleotídeos contíguos da molécula de DNA heterólogo e pelo menos 50 nucleotídeos contíguos do DNA genômico que flanqueiam o ponto de inser- ção da molécula de DNA heterólogo.
5. Molécula de ácido nucléico isolada de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 4, caracterizada pelo fato de que a seqüência de nucleotídeos é selecionada a partir do grupo consistindo na SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, e de seus complementos.
6. Molécula de ácido nucléico isolada de acordo com a reivindi- cação 5, caracterizada pelo fato de que a seqüência de nucleotídeos codifica uma proteína compreendendo a seqüência de aminoácidos da SEQ ID NO: 2.
7. Molécula de ácido nucléico isolada de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizada pelo fato de que a molécula de ácido nucléico é compreendida numa semente de milho depositada na Ame- rican Type Culture Collection sob número de acesso N°. PTA-8166.
8. Amplicon, caracterizado pelo fato de que compreende a molécula de ácido nucléico como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 7.
9. Par de iniciadores de polinucleotídeos, caracterizado pelo fato de que compreende o primeiro iniciador de polinucleotídeo e um segundo iniciador de polinucleotídeo os quais funcionam juntos na presença de um DNA modelo do evento MIR162 em uma amostra para produzir um diagnós- tico do amplicon para o evento MIR162.
10. Par de iniciadores de acordo com a reivindicação 9, caracte- rizado pelo fato de que a primeira seqüência do iniciador e/ou a segunda seqüência do iniciador é escolhida a partir da SEQ ID NO: 1.
11. Par de iniciadores de acordo com a reivindicação 10, carac- terizado pelo fato de que o amplicon compreende a SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, ou seus complementos.
12. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 9, caracterizado pelo fato de que a primeira seqüência do inicia- dor é ou está complementar à seqüência genômica da planta de milho que flanqueia o ponto de inserção de uma seqüência do DNA heterólogo inserida dentro do genoma da planta de milho do evento MIR162, e a segunda se- qüência do iniciador de polinucleotídeo é ou está complementar à seqüência de DNA heterólogo inserida dentro do genoma do evento MIR162.
13. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 12, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador de polinu- cleotídeo compreende pelo menos 10 nucleotídeos contíguos de uma se- qüência de nucleotídeos selecionada de um grupo consistindo nos nucleotí- deos 1-1088 da SEQ ID NO: 49, nucleotídeos 9391-10579 da SEQ ID NO: .49, e seus complementos.
14. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 13, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador de polinu- cleotídeos compreende uma seqüência de nucleotídeos selecionada a partir do grupo consistindo na SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NOs: 68-72, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NOs: 97-105, e seus complementos.
15. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 12, caracterizado pelo fato de que o segundo iniciador de polinu- cleotídeos compreende pelo menos 10 nucleotídeos contíguos dos nucleotí- deos 1089-9390 da SEQ ID NO: 49, ou seus complementos.
16. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 15, caracterizado pelo fato de que o segundo iniciador de polinu- cleotídeos compreende a seqüência de nucleotídeos selecionada a aprtir do grupo consistindo em SEQ ID NO: 15-35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NOs: 50-52, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 96, e seus com- plementos.
17. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 12, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador de polinu- cleotídeo consiste da SEQ ID NO: 36 e o segundo iniciador de polinucleotí- deos consiste na SEQ ID NO: 37.
18. Par dos iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 17, caracterizado pelo fato de que o amplicon consiste na SEQ ID NO: 38.
19. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 12, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador de polinu- cleotídeo consiste na SEQ ID NO: 39 e o segundo iniciador de polinucleotí- deo consiste na SEQ ID NO: 40.
20. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 19, caracterizado pelo fato de que o amplicon consiste na SEQ ID NO: 41.
21. Par de iniciadores polinucleotídeos de acordo com a reivindi- cação 12, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador de polinucleotí- deo consiste na SEQ ID NO: 53 e o segundo iniciador de polinucleotídeo consiste na SEQ ID NO: 54.
22. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 21, caracterizado pelo fato de que o amplicon consiste na SEQ ID NO: 55.
23. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 12, caracterizado pelo fato de que o primeiro iniciador do polinu- cleotídeo consiste na SEQ ID NO: 58 e o segundo iniciador de polinucleotí- deo consiste na SEQ ID NO: 56.
24. Par de iniciadores de polinucleotídeos de acordo com a rei- vindicação 23, caracterizado pelo fato de que o amplicon consiste na SEQ ID NO: 59.
25. Método de detecção da presença de uma molécula de ácido nucléico que é única ao evento MIR162 em uma amostra compreendendo ácidos nucléicos de milho, caracterizado pelo fato de que compreende: (a) colocar a amostra em contato com um par de "iniciadores" que, quando usado em uma reação de amplificação de ácidos nucléicos com DNA genômico do evento MIR162 produz um amplicon que é diagnosticado para o evento MIR162; (b) executar uma reação de amplificação de ácido nucléico, por meio desta produzindo o amplicon; e (c) detectar o amplicon.
26. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pe- lo fato de que o amplicon compreende a seqüência de nucleotídeos da SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59, ou seus complementos.
27. Método de detecção da presença de uma molécula de ácido nucléico que é única ao evento MIR162 em uma amostra compreendendo ácidos nucléicos do milho, caracterizado pelo fato de que compreende: (a) colocar a amostra em contato com uma sonda que hibridiza sob condições de alta estringência com DNA genômico do evento MIR162 e não hibridiza sob condições de alta estringência com DNA de uma planta de milho controle; (b) submeter a amostra e a sonda a condições de hibridização de alta estringência; e (c) detectar hibridização da sonda para a molécula de ácido nu- cléico.
28. Método de acordo com a reivindicação 27, caracterizado pe- lo fato de que a sonda compreende uma seqüência de nucleotídeos selecio- nada a aprtir do grupo consistindo da SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: .55, SEQ ID NO: 59, e de seus complementos.
29. Kit para detecção de ácidos nucléicos que são únicos ao e- vento MIR162, caracterizado pelo fato de que compreende pelo menos uma molécula de ácido nucléico de comprimento suficiente dos polinucleotídeos contíguos para funcionarem como um iniciador ou sonda num método de detecção de ácidos nucléicos, e nos quais, de amplificação ou hibridização de uma seqüência de ácidos nucléicos alvo numa amostra seguida pela de- tecção do "amplicon" ou hibridização para a seqüência alvo, são diagnosti- cados para a presença das seqüências de ácidos nucléicos únicas ao evento MIR162 na amostra.
30. Kit de acordo de acordo com a reivindicação 29, caracteriza- do pelo fato de que a molécula de ácido nucléico compreende uma seqüên- cia de nucleotídeos da SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 49.
31. Kit de acordo com a reivindicação 30, caracterizado pelo fato de que a molécula de ácido nucléico é um "iniciador" selecionado a partir do grupo consistindo na SEQ ID NOs: 15-37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NOs: 50-54, SEQ ID NOS: 56-58, SEQ ID NOs: 60-105, e os complementos deste.
32. Planta de milho transgênico, ou suas células ou seus teci- dos, caracterizada pelo fato de que cada um compreende uma molécula de ácido nucléico como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 7.
33. Planta de milho de acordo com a reivindicação 32, caracteri- zada pelo fato de que o digesto do DNA genômico da planta com a endonu- clease de restrição Kpn\, EcoRV ou Ncol resultar em uma única banda de hibridização vip3Aa20 usando uma sonda vip3Aa20 sob condições de alta estringência.
34. Planta de milho de acordo com a reivindicação 33, caracteri- zada pelo fato de que a sonda compreende a seqüência de nucleotídeos da SEQ ID NO: 13, ou o seus complementos.
35. Planta de milho de acordo com a reivindicação 32, caracteri- zada pelo fato de que a planta planta de milho é resistente aos insetos.
36. Planta de milho de acordo com a reivindicação 35, caracteri- zada pelo fato de que a planta resistência a insetos é devido à expressão do gene vip3Aa20.
37. Semente de milho, caracterizada pelo fato de que compre- ende uma molécula de ácido nucléico como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6.
38. Semente de milho, caracterizada pelo fato de que está depo- sitada na American Type Culture Collection sob o número de acesso PTA- .8166.
39. Planta de milho transgênica, caracterizada ppelo fato de que é produzida a partir das sementes, como definidas na reivindicação 37 ou 38.
40. Amostra biológica derivada de uma planta de milho evento MIR162, tecido, ou semente, caracterizada pelo fato de que compreende uma seqüência de nucleotídeos a qual é ou é complementar à SEQ ID NO: .1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: 59 e na qual a seqüência é detec- tável na amostra usando uma amplificação do ácido nucléico ou método de hibridização do ácido nucléico.
41. Amostra biológica de acordo com a reivindicação 40, caracte- rizada pelo fato de que é selecionada a partir do grupo consistindo em farinha de milho, polvilho de milho, xarope de milho, óleo de milho, amido de milho, e cereais fabricados no todo ou em parte com produtos derivados de milho.
42. Extrato derivado de uma amostra biológica de uma planta de milho do evento MIR162, tecidos, ou sementes, caracterizado pelo fato de que compreende uma seqüência de nucleotídeos a qual é ou está comple- mentar à SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: 59.
43. Extrato de acordo com a reivindicação 42, caracterizado pelo fato de que a seqüência é detectável no extrato usando uma amplificação de ácido nucléico ou método de hibridização de ácidos nucléicos.
44. Extrato de acordo com a reivindicação 42 ou 43, caracteriza- do pelo fato de que a planta amostra é selecionada a partir do grupo consis- tindo em farinha de milho, polvilho de milho, xarope de milho, óleo de milho, amido de milho, e cereais fabricados no todo ou em parte contendo produtos derivados de milho.
45. Método para produção de uma planta de milho resistente às pestes lepidópteras caracterizado pelo fato de que compreende: (a) cruzar sexualmente uma primeira planta de milho progenitora com uma segunda planta de milho progenitora, caracterizado pelo fato de que a primeira ou segunda planta de milho progenitora mencionada compre- ende o DNA evento MIR162, por meio disso produzindo uma pluralidade de primeira geração de plantas descendentes; (b) selecionar uma primeira geração de plantas descendentes que sejam resistentes à infestação pelos insetos lepidópteros; (c) autopolinizar a primeira geração de plantas descendentes, por meio da produção de uma pluralidade de segunda geração de plantas descendentes; (d) selecionar a partir da segunda geração de plantas descen- dentes, uma planta que seja resistente às pestes lepidópteras; no qual a segunda geração de plantas descendentes compreen- dem SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: 59.
46. Método de produção de sementes de milho híbridas, caracte- rizado pelo fato de que compreende: (a) plantar sementes de uma primeira linhagem de milho congê- nita compreendendo uma seqüência de nucleotídeos selecionada a partir do grupo consistindo em SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 55, ou SEQ ID NO: -59 e sementes de uma segunda linhagem congênita tendo um genótipo dife- rente; (b) cultivar plantas de milho resultantes das ditas plantadas até a época de floração; (c) emascular as flores mencionadas das plantas de uma das linhagens congênitas de milho; (d) cruzar sexualmente as duas diferentes linhagens congênitas uma com a outra; e (e) ceifar a semente híbrida produzida desta maneira.
47. Método de acordo com a reivindicação 46, caracterizado pe- lo fato de que a plantas da primeira linhagem de milho congênita são os pro- genitores femininos.
48. Método de acordo com a reivindicação 46, caracterizado pe- lo fato de que a plantas da primeira linhagem de milho congênita são os pro- genitores masculinos.
49. Semente híbrida, caracterizada pelo fato de que é produzida pelo método como definido na reivindicação 46.
50. Planta de milho, caracterizada pelo fato de que é produzida pelo crescimento da semente de milho híbrido como definida na reivindica- ção 44.
51. Proteína inseticida isolada, caracterizada pelo fato de que compreende a SEQ ID NO: 2.
52. Molécula de ácido nucléico isolada, caracterizada pelo fato de que é codificadora da proteína como definida na reivindicação 51.
53. Gene quimérico, caracterizado pelo fato de que compreende uma seqüência heteróloga promotora operativamente unida à molécula de ácido nucléico como definida na reivindicação 52.
54. Vetor recombinante, caracterizado pelo fato de que compre- ende o gene quimérico como definido na reivindicação 53.
55. Célula hospedeira transgênica, caracterizada pelo fato de que compreende um gene quimérico como definido na reivindicação 53.
56. Sítio alvo do milho cromossomal, caracterizado pelo fato de que está localizado no cromossomo 5 entre um marcador molecular opie2 publicados como nucleotídeos 1680-3338 da SEQ ID NO: 106 e um marca- dor molecular gag publicado como nucleotídeos 43.275-45.086 da SEQ ID NO: 106, no qual o sítio alvo compreende um ácido nucléico heterólogo.
57. Sítio alvo do milho comossomal de acordo com a reivindica- ção 56, caracterizado pelo fato de que o sítio alvo mencionado está localiza- do entre os nucleotídeos 25.454 e 25.513 da SEQ ID NO: 106.
58. Sítio alvo do milho cromossomal de acordo com a reivindica- ção 56, caracterizado pelo fato de que o sítio alvo mencionado é pareado 5' pelos nucleotídeos 5.454 a 25.454 da SEQ ID NO: 106 e pareado 3' pelos nucleotídeos 25.513 a 45.513 da SEQ ID NO: 106.
59. Método de fazer uma planta transgênica de milho, caracteri- zado pelo fato de que compreende uma inserção de ácido nucléico heterólo- go em uma posição no cromossomo 5 localizada entre um marcador molecu- lar opie2 publicado como nucleotídeos 1680-3338 da SEQ ID NO: 106 e um marcador molecular gag publicado como nucleotídeos 43.275-45.086 da SEQ ID NO: 106.
60. Método de acordo com a reivindicação 59, caracterizado pe- lo fato de que o ácido nucléico heterólogo é inserido no cromossomo 5 entre os nucleotídeos 25.454 e 25.513 da SEQ ID NO: 106.
61. Método de acordo com a reivindicação 59, caracterizado pe- lo fato de que o mencionado ácido nucléico heterólogo inserido é pareado 5' pelos nucleotídeos 5.454 a 25.454 da SEQ ID NO: 106 e pareamento 3' pe- los nucleotídeos 25.513 a 45.513 da SEQ ID NO: 106.
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