EA031178B1 - Гены резистентности - Google Patents

Гены резистентности Download PDF

Info

Publication number
EA031178B1
EA031178B1 EA201170372A EA201170372A EA031178B1 EA 031178 B1 EA031178 B1 EA 031178B1 EA 201170372 A EA201170372 A EA 201170372A EA 201170372 A EA201170372 A EA 201170372A EA 031178 B1 EA031178 B1 EA 031178B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
plant
seq
cell
polynucleotide
polypeptide
Prior art date
Application number
EA201170372A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201170372A1 (ru
Inventor
Эванс Лагуда
Вольфганг Шпильмейер
Беат Келлер
Симон Краттингер
Original Assignee
Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн
Грейнз Рисерч Энд Дивелопмент Корпорейшн
Юниверсити Оф Цюрих
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from AU2008904364A external-priority patent/AU2008904364A0/en
Application filed by Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн, Грейнз Рисерч Энд Дивелопмент Корпорейшн, Юниверсити Оф Цюрих filed Critical Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн
Publication of EA201170372A1 publication Critical patent/EA201170372A1/ru
Publication of EA031178B1 publication Critical patent/EA031178B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8282Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for fungal resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • C12N5/12Fused cells, e.g. hybridomas
    • C12N5/14Plant cells

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)

Abstract

Изобретение относится к полинуклеотидам, кодирующим белки резистентности взрослых растений по отношению к патогенам. Также обеспечиваются трансгенные растения, экспрессирующие эти полинуклеотиды для усиления резистентности растений к патогенам.

Description

Изобретение относится к полинуклеотидам, кодирующим белки резистентности взрослых растений по отношению к патогенам. Также обеспечиваются трансгенные растения, экспрессирующие эти полинуклеотиды для усиления резистентности растений к патогенам.
Область техники
Настоящее изобретение относится к полинуклеотидам, кодирующим белки резистентности взрослых растений по отношению к патогенам. Также обеспечиваются трансгенные растения, экспрессирующие эти полинуклеотиды для повышения резистентности растений к патогенам.
Предпосылки создания изобретения
Многочисленные гены, придающие резистентность к патогенам, были идентифицированы и использованы при селекции растений. Однако обусловленная единственным геном резистентность к патогену у растений часто становится неэффективной вследствие появления новых вирулентных рас возбудителя болезни. В отличие от этого полагают, что стойкая резистентность к болезни у растений, как правило, контролируется множеством генов.
Локус полигенного признака у пшеницы (Triticum aestivum), Lr34, обеспечивает стойкую резистентность взрослых растений к биотрофным грибам, вызывающим болезни: листовую ржавчину, желтую ржавчину злаков, стеблевую ржавчину пшеницы и настоящую мучнистую росу (Dyck, 1977 и 1987; German and Kolmer, 1992; Bossolini et al., 2006; Spielmeyer et al., 2008). И это несмотря на ограничение, заключающееся в том, что он не эффективен на стадии всходов в нормальных полевых условиях. Сорта с локусом резистентности Lr34, такие как Frontana, имели эффективную стойкую резистентность к вызывающему листовую ржавчину грибу Puccinia triticina Eriks (Dyck et al., 1966; Singh and Rajaram, 1994). До настоящего времени не были выявлены изоляты Р. triticina с полной степенью способности заражать имеющие Lr34 растения (Kolmer et al., 2003).
Резистентность на основе Lr34 оставалась генетически неотделимой от Yr18, который придает резистентность к желтой ржавчине злаков (P. striiformis) (Singh, 1992a; McIntosh, 1992). Была подтверждена косегрегация Lr34/Yr18 с другими признаками, такими как некроз верхушки листа (Ltn1), настоящая мучнистая роса (недавно названная Pm38), устойчивость к вызывающему желтую карликовость ячменя вирусу (Bdv1) и гельминтоспориозу корней злаковых (Bipolaris sorokiniana) (Singh, 1992 a,b; McIntosh, 1992; Joshi et al., 2004; Spielmeyer et al., 2005; Liang et al., 2006). Эти признаки резистентности к множеству патогенов сделали локус Lr34/Yr18 одним из самых полезных участков генов для селекции резистентности к болезням у пшеницы.
Были выделены и клонированы немногочисленные гены резистентности к ржавчинным грибам из пшеницы (Feuillet et al., 2003; Huang et al., 2003; Cloutier et al., 2007) и других хлебных злаков (Collins et al., 1999; Brueggeman et al., 2002) и, главным образом, класса основных генов резистентности (R) нуклеотидсвязывающих богатых лейцином повторов (NB-LRR). Единственным известным исключением является ген резистентности к ржавчинным грибам Rpg1 у ячменя, который кодирует протеинкиназу. Эти гены кодируют обусловленную взаимоотношением ген-на-ген резистентность к единственным патогенам и обычно влекут за собой реакции гиперчувствительности после инфицирования в тканях растений. Напротив, Lr34 придает резистентность широкого спектра к облигатным биотрофным патогенам, включающим грибы из Ascomycetes и Basidiomycetes. Rubiales и Niks (1995) представили данные о том, что имеется связь Lr34 с уменьшением роста межклеточных гифов, но не с реакцией гиперчувствительности или образованием сосочков.
Следовательно, остается неизвестной молекулярная основа типа полигенной, не специфичной для расы резистентности к патогенам у взрослых растений или частичной резистентности, кодируемой генетическими системами, такими как, например, Lr34.
Краткое изложение сущности изобретения
Авторами настоящего изобретения идентифицированы гены и полипептиды, которые придают взрослым растениям повышенную резистентность к патогену растений.
Соответственно настоящим изобретением обеспечивается трансгенное растение, в геном которого был интегрирован экзогенный полинуклеотид, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений, и/или экзогенный полинуклеотид, который повышает транскрипцию эндогенного гена, кодирующего полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
В предпочтительном варианте осуществления растение характеризуется ускоренным старением верхушек кроющих листьев по сравнению с изогенным растением, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид.
В другом предпочтительном варианте осуществления растение имеет повышенную резистентность к патогену растений по сравнению с изогенным растением, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид.
В еще другом предпочтительном варианте осуществления полипептид включает аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 40%, более предпочтительно по крайней мере на 80%, более предпочтительно по крайней мере на 90% и еще более предпочтительно по крайней мере на 95%. Более предпочтительно полипептид включает аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1.
В другом предпочтительном варианте осуществления полинуклеотид включает нуклеотиды, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 2, последовательность, которая идентична SEQ
- 1 031178
ID NO: 2 по крайней мере на 40%, и/или последовательность, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2.
В другом варианте осуществления экзогенным полинуклеотидом, который повышает транскрипцию эндогенного гена, кодирующего полипептид резистентности к патогену взрослых растений, является генетический элемент, такой как промотор, который усиливает функционирование промотора эндогенного гена. Альтернативно, экзогенный полинуклеотид, который повышает транскрипцию эндогенного гена, кодирующего полипептид резистентности к патогену взрослых растений, кодирует транскрипционный фактор, который усиливает экспрессию эндогенного гена.
Предпочтительно растением является хлебный злак. Примеры трансгенных хлебных злаков по настоящему изобретению включают, но не ограничиваются ими, пшеницу, ячмень, кукурузу, рис, овес и тритикале. В особенно предпочтительном варианте осуществления растением является пшеница.
Примеры патогенов растений включают, но не ограничиваются ими, вирусы, бактерии и грибы.
В предпочтительном варианте осуществления патогеном является биотрофный гриб. Примеры биотрофных грибов включают, но не ограничиваются ими, Fusarium graminearum (который вызывает фузариоз колосьев), Erysiphe graminis f. sp. tritici (который вызывает настоящую мучнистую росу), Bipolaris sorokiniana (который вызывает гельминтоспориоз корней злаковых), Puccinia graminis f. sp. tritici (который вызывает стеблевую ржавчину пшеницы), Puccinia striifbrmis (который вызывает желтую ржавчину злаков) и Puccinia recondite f. sp. tritici (который вызывает листовую ржавчину).
В варианте осуществления патогеном является вирус, вызывающий желтую карликовость ячменя (BYDV).
В варианте осуществления растение включает один или более дополнительных экзогенных полинуклеотидов, кодирующих полипептид резистентности к патогену растений. Примеры таких генов включают, но не ограничиваются ими, Lr1, Lr3, Lr2a, Lr3ka, Lr11, Lr13, Lr16, Lr17, Lr18, Lr21 и LrB.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ идентификации полинуклеотида, кодирующего полипептид резистентности к патогену растений, включающий:
(i) получение функционально связанного с промотором полинуклеотида, кодирующего полипептид, включающий аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 40%, (ii) введение полинуклеотида в растение, (iii) определение того, изменен ли уровень резистентности к патогену растений относительно такового у изогенного растения, у которого отсутствует полинуклеотид, и (iv) необязательно отбор полинуклеотида, который при его экспрессии усиливает резистентность к патогену растений.
Предпочтительно полинуклеотид включает нуклеотиды, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 2, последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 40%, и/или последовательность, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2.
Предпочтительно растением является хлебный злак.
Предпочтительно хлебным злаком является пшеница.
В предпочтительном варианте осуществления полипептидом является полипептид растения или его мутантная форма.
В другом варианте осуществления стадия (ii) дополнительно включает устойчивую интеграцию функционально связанного с промотором полинуклеотида в геном растения.
В еще одном аспекте настоящим изобретением обеспечивается, по существу, очищенный и/или рекомбинантный полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
В предпочтительном варианте осуществления полипептид включает аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 40%, более предпочтительно по крайней мере на 80%, более предпочтительно по крайней мере на 90% и еще более предпочтительно по крайней мере на 95%.
В предпочтительном варианте осуществления в полипептиде отсутствует остаток фенилаланина или любая аминокислота в положении, соответствующем номеру аминокислоты 546 в SEQ ID NO: 4.
В другом предпочтительном варианте осуществления полипептид имеет аминокислоту, отличную от остатка тирозина в положении, соответствующем номеру аминокислоты 634 в SEQ ID NO: 4. Более предпочтительно полипептид включает остаток гистидина в положении, соответствующем номеру аминокислоты 634 в SEQ ID NO: 4.
Также обеспечивается слитый белок, дополнительно включающий последовательность по крайней мере одного отличного полипептида. По крайней мере одним отличным полипептидом может быть, например, полипептид, который повышает стабильность полипептида по настоящему изобретению, или полипептид, который содействует очистке или выявлению слитого белка.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается выделенный и/или экзогенный полинуклеотид, включающий нуклеотиды, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 2, последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 40%, последовательность, ко
- 2 031178 дирующую полипептид по настоящему изобретению, и/или последовательность, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2.
Предпочтительно полинуклеотид включает последовательность нуклеотидов, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2 в жестких условиях.
Предпочтительно полинуклеотид гибридизуется по всей длине полинуклеотида, состоящего из нуклеотидов, имеющих последовательность SEQ ID NO: 2.
Предпочтительно полинуклеотид кодирует полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается химерный вектор, включающий полинуклеотид по настоящему изобретению.
Предпочтительно полинуклеотид функционально связан с промотором.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается рекомбинантная клетка, включающая экзогенный полинуклеотид по настоящему изобретению и/или вектор по настоящему изобретению.
Клеткой может быть любой тип клетки, такой как, но без ограничения, клетка растения, бактериальная клетка, клетка животного или дрожжевая клетка.
Предпочтительно клеткой является клетка растения. Более предпочтительно клеткой растения является клетка хлебного злака. Еще более предпочтительно клеткой хлебного злака является клетка пшеницы.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ получения полипептида по настоящему изобретению, включающий экспрессию в клетке или бесклеточной экспрессионной системе полинуклеотида по настоящему изобретению.
Предпочтительно способ дополнительно включает выделение полипептида.
В еще одном аспекте настоящим изобретением обеспечивается трансгенный не принадлежащий человеку организм, включающий экзогенный полинуклеотид по настоящему изобретению, вектор по настоящему изобретению и/или рекомбинантную клетку по настоящему изобретению.
Предпочтительно трансгенным не принадлежащим человеку организмом является растение.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ получения клетки по настоящему изобретению, включающий стадию введения полинуклеотида по настоящему изобретению или вектора по настоящему изобретению в клетку.
Предпочтительно клеткой является клетка растения.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ получения трансгенного растения, включающий регенерацию трансгенного растения из клетки по настоящему изобретению.
Также обеспечивается применение полинуклеотида по настоящему изобретению или вектора по настоящему изобретению для получения рекомбинантной клетки.
Кроме того, обеспечивается применение полинуклеотида по настоящему изобретению или вектора по настоящему изобретению для получения трансгенного растения.
Предпочтительно трансгенное растение характеризуется ускоренным старением верхушек кроющих листьев по сравнению с изогенным растением, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид и/или вектор, и/или имеет повышенную резистентность к патогену растения по сравнению с изогенным растением, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид и/или вектор.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается трансгенное растение или его потомство, полученное с использованием способа по настоящему изобретению.
В дополнительном аспекте настоящим изобретением обеспечивается часть растения по настоящему изобретению.
Примеры таких частей включают, но не ограничиваются ими, листья, корни, стебли и/или семена. В предпочтительном варианте осуществления частью растения является семя, которое включает экзогенный полинуклеотид, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ получения части растения, включающий:
a) выращивание растения по настоящему изобретению и
b) сбор части растения.
В еще одном аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ получения муки, непросеянной муки, крахмала или другого продукта, получаемого из семени, включающий:
a) получение семени по настоящему изобретению и
b) получение муки, непросеянной муки, крахмала или другого продукта.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается продукт, получаемый из растения по настоящему изобретению и/или части растения по настоящему изобретению.
В одном варианте осуществления продуктом является пищевой продукт. Примеры включают, но не ограничиваются ими, муку, крахмал, хлеб из теста на опаре или хлеб из теста, приготовленного безопарным способом, пасту, лапшу, зоокорма, блюда из зернового продукта для завтрака, закусочные пищевые продукты, торты, солод, пиво, кондитерские изделия и пищевые продукты, содержащие соусы на мучной основе.
- 3 031178
В другом варианте осуществления продуктом является непищевой продукт. Примеры включают, но не ограничиваются ими, пленки, покрытия, клеи, строительные материалы и упаковочные материалы.
В дополнительном аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ приготовления пищевого продукта по настоящему изобретению, включающий смешивание семени или муки, непросеянной муки или крахмала из указанного семени с другим ингредиентом.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ приготовления солода, включающий стадию проращивания семени по настоящему изобретению.
В другом варианте осуществления настоящим изобретением обеспечивается композиция, включающая полипептид по настоящему изобретению, полинуклеотид по настоящему изобретению, вектор по настоящему изобретению и/или рекомбинантную клетку по настоящему изобретению и один или более приемлемых носителей.
В другом аспекте настоящим изобретением обеспечивается, по существу, очищенное антитело или его фрагмент, которое специфически связывается с полипептидом по настоящему изобретению.
Также обеспечивается способ идентификации соединения, которое связывается с полипептидом, включающим аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 4, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 4 по крайней мере на 40%, включающий:
i) приведение полипептида в контакт с соединением-кандидатом и ii) определение того, связывается ли соединение с полипептидом.
Кроме того, обеспечивается способ идентификации соединения, которое переносится через клеточную мембрану полипептидом, включающим аминокислоты, имеющие последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 4, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 4 по крайней мере на 40%, включающий:
i) приведение полипептида, присутствующего в клеточной мембране, в контакт с соединениемкандидатом, ii) определение того, переносит ли полипептид соединение через клеточную мембрану.
Предпочтительно полипептид экспрессируется в клетке.
Предпочтительно клеткой является клетка растения.
В варианте осуществления способ дополнительно включает сравнение связывания, и/или переноса, соединения с первым полипептидом, включающим аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, с таковым со вторым полипептидом, включающим аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 4.
В дополнительном аспекте настоящим изобретением обеспечивается выделенный и/или экзогенный полинуклеотид, который в случае его присутствия в клетке растения снижает экспрессию по крайней мере одного гена, который гибридизуется в жестких условиях с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, включающий аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 4, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 4 по крайней мере на 40%, при этом указанная экспрессия является пониженной относительно экспрессии в другой изогенной клетке растения, у которой отсутствует указанный полинуклеотид.
В варианте осуществления полинуклеотид кодирует полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
Предпочтительно полинуклеотид по этому аспекту функционально связан с промотором, способным управлять экспрессией полинуклеотида в клетке растения.
Предпочтительно полинуклеотид по этому аспекту является антисмысловым полинуклеотидом, смысловым полинуклеотидом, каталитическим полинуклеотидом, искусственной микроРНК или молекулой двуспиральной РНК.
В дополнительном аспекте настоящим изобретением обеспечивается способ идентификации растения, включающего ген, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений, включающий:
i) амплификацию и/или секвенирование на основе образца растения, по крайней мере части полинуклеотида, который кодирует полипептид, включающий аминокислоты, имеющие последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 4, его биологически активный фрагмент или аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 4 по крайней мере на 40%, ii) определение того, включает ли растение полинуклеотид, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
Как это будет очевидно, предпочтительные признаки и характеристики одного аспекта настоящего изобретения применимы ко многим другим аспектам настоящего изобретения.
Подразумевается, что по всему описанию данного изобретения слово включать или его вариации, такие как включает или включающий, предполагает включение указанного элемента, целого числа
- 4 031178 или стадии, или группы элементов, целых чисел или стадий, а не исключение любого другого элемента, целого числа или стадии, или группы элементов, целых чисел или стадий.
Ниже настоящее изобретение описано посредством следующих не ограничивающих примеров и с использованием ссылки на прилагаемые фигуры.
Краткое описание прилагаемых чертежей
Фиг. 1. Консенсусная генетическая карта хромосомы 7D, включающей Lr34, основанная на трех популяциях для картирования с высокой разрешающей способностью, установила целевую зону, составляющую 0,15 сМ (сантиморганид), для Lr34 между XSWSNP3 и XcsLVE17. Относительные положения молекулярных маркеров показаны вместе с наблюдаемыми рекомбинационными расстояниями в сМ.
Фиг. 2. Схема в развернутом виде части хромосомы 7DS пшеницы между XSWSNP3 и XcsLVE17, демонстрирующая относительные положения открытых рамок считывания. Секвенированная в +Lr34 сорте Chinese Spring соответствующая физическая зона содержала десять генов-кандидатов, девять из которых представлены на этой фигуре стрелками. Числа относятся к соответствующим положениям нуклеотидов в подвергнутой секвенированию зоне размером 420 т.п.о. Сокращения: Gly - гликозилтрансфераза; Cyst - цистеинпротеиназа, Cyt - цитохром Р450; LecK - киназа рецепторов лектинов; ABC - ABCтранспортер; Hex - переносчик гексоз.
Фиг. 3. Структура гена Lr34. Незаполненные прямоугольники означают экзоны, тогда как интроны показаны как прилежащие линии. Маркировками отмечены положения сайтов мутаций в мутантах, обозначенных 2В, 2F, 2G, ЗЕ, 4С, 4D, m19 и m21. Указаны три различия в последовательности между чувствительным и резистентным аллелями Lr34: +Lr34 резистентный аллель из сорта Chinese Spring, -Lr34 чувствительный аллель из сорта Renan.
Фиг. 4. Последовательность белка Lr34 и полиморфизмы между резистентными и чувствительными сортами. Аминокислотная последовательность белка Lr34 (чувствительный аллель) из сорта Renan. Выделены две аминокислоты, измененные в резистентном аллеле. Другие прямоугольники указывают на положения высококонсервативных мотивов в нуклеотидсвязывающих доменах. Мотивы: мотив Уокера типа A GPPGCGKS (аминокислоты 168-175) (SEQ ID NO: 50) и GVSGAGKT (аминокислоты 847-854) (SEQ ID NO: 51); ABC-опознавательный мотив ISGGQKKRLTTA (аминокислоты 307-318) (SEQ ID NO: 52) и LSMEQRKRLTIA (аминокислоты 954-965) (SEQ ID NO: 53); мотив Уокера типа В AYFMD (аминокислоты 327-331) (SEQ ID NO: 54) и IILMD (аминокислоты 974-978) (SEQ ID NO: 55). Аминокислотными изменениями в резистентном аллеле Lr34 в озимом сорте пшеницы Chinese Spring является делеция аминокислоты в положении 546 (Phe (F)) и замена аминокислоты в положении 634 (тирозина (Y)) на гистидин. Подчеркнутыми частями являются два трансмембранных домена (аминокислоты 502-750 и 1152-1392).
Фиг. 5. Представление в схематическом виде белка Lr34, демонстрирующее два нуклеотидсвязывающих домена (NBD) и два трансмембранных домена. Два диагностических полиморфизма между резистентным и чувствительным аллелями в первом трансмембранном домене показаны звездочками.
Фиг. 6. Совмещение с аминокислотной последовательностью Lr34. Совмещение Lr34 сорта Renan с PDR23 риса (Os12g0512700) (SEQ ID NO: 47), PDR5 (At3g53480) (SEQ ID NO: 48) и PDR9 (At2g37280) (SEQ ID NO: 49) Arabidopsis. Отмечены остатки, идентичные во всех четырех транспортерах. PDR23 риса был недавно аннотирован в соответствии с кДНК Lr34 пшеницы.
Фиг. 7. Анализ экспрессии Lr34. Полуколичественная ОТ-ПЦР с использованием зонда из 5'-конца гена. Листья почти изогенных линий Thatcher и Thatcher Lr34 собирали на стадии всходов спустя 14 дней, а кроющие листья взрослых растений - на растениях возрастом 53 и 63 дня. Листья взрослых растений делили пополам для отдельного исследования уровней экспрессии в основании листа и верхушке листа. Обозначения: ТН - Thatcher; ТН Lr34 - Thatcher Lr34; GAPDH - глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа.
Фиг. 8. Lr34 регулирует старение кроющих листьев. Нозерн-блоттинг с использованием HvS40 на кроющих листьях растений возрастом 63 дня почти изогенных линий Thatcher и Thatcher Lr34 и индуцированных азидом мутантах Lr34: 2В, 2F, 2G, ЗЕ, 4С и 4Е. ТН - Thatcher; TH Lr34 - Thatcher Lr34.
Разъяснение к списку последовательностей
SEQ ID NO: 1 - аминокислотная последовательность белка Lr34 (резистентного аллеля) из Triticum aestivum (мягкой пшеницы) сорта Chinese spring.
SEQ ID NO: 2 - нуклеотидная кодирующая последовательность для Lr34 из Triticum aestivum сорта Chinese spring.
SEQ ID NO: 3 - нуклеотидная последовательность гена Lr34 (геномная последовательность) из Triticum aestivum сорта Chinese spring. Присутствуют 24 экзона, которые кодируют белок Lr34:
экзон 1 начинается за нуклеотидом 3042 и заканчивается на нуклеотиде 3316;
экзон 2 начинается за нуклеотидом 3416 и заканчивается на нуклеотиде 3539; экзон 3 начинается за нуклеотидом 3693 и заканчивается на нуклеотиде 3778; экзон 4 начинается за нуклеотидом 3934 и заканчивается на нуклеотиде 4018; экзон 5 начинается за нуклеотидом 6527 и заканчивается на нуклеотиде 6686; экзон 6 начинается за нуклеотидом 6784 и заканчивается на нуклеотиде 6860;
- 5 031178 экзон 7 начинается за нуклеотидом 7119 и заканчивается на нуклеотиде 7172;
экзон 8 начинается за нуклеотидом 7271 и заканчивается на нуклеотиде 7361;
экзон 9 начинается за нуклеотидом 7439 и заканчивается на нуклеотиде 7740;
экзон 10 начинается за нуклеотидом 7833 и заканчивается на нуклеотиде 8108;
экзон 11 начинается за нуклеотидом 8187 и заканчивается на нуклеотиде 8497;
экзон 12 начинается за нуклеотидом 8583 и заканчивается на нуклеотиде 8743;
экзон 13 начинается за нуклеотидом 8825 и заканчивается на нуклеотиде 8928;
экзон 14 начинается за нуклеотидом 9015 и заканчивается на нуклеотиде 9168;
экзон 15 начинается за нуклеотидом 9606 и заканчивается на нуклеотиде 9513;
экзон 16 начинается за нуклеотидом 9808 и заканчивается на нуклеотиде 9581;
экзон 17 начинается за нуклеотидом 9985 и заканчивается на нуклеотиде 10317;
экзон 18 начинается за нуклеотидом 10427 и заканчивается на нуклеотиде 10717;
экзон 19 начинается за нуклеотидом 12159 и заканчивается на нуклеотиде 12242;
экзон 20 начинается за нуклеотидом 12711 и заканчивается на нуклеотиде 12844;
экзон 21 начинается за нуклеотидом 12995 и заканчивается на нуклеотиде 13222;
экзон 22 начинается за нуклеотидом 13318 и заканчивается на нуклеотиде 13489;
экзон 23 начинается за нуклеотидом 13569 и заканчивается на нуклеотиде 13823; и экзон 24 начинается за нуклеотидом 14613 и заканчивается на нуклеотиде 14939.
SEQ ID NO: 4 - аминокислотная последовательность белка Lr34 (чувствительного аллеля) из Triticum aestivum Renan.
SEQ ID NO: 5 - нуклеотидная кодирующая последовательность для Lr34 (чувствительного аллеля) из Triticum aestivum Renan.
SEQ ID NO: 6 - геномная ДНК для эквивалента Lr34 из Aegilops tauschii. Кодирующая область начинается за нуклеотидом 2426 и заканчивается на нуклеотиде 14212.
SEQ ID NO: 7 - EST (маркерная экспрессируемая последовательность) Lr34 Triticum aestivum (№ доступа в GenBank - CJ669561).
SEQ ID NO: 8 - EST Lr34 Triticum aestivum (№ доступа в GenBank - DR733734).
SEQ ID NO: 9 - EST Lr34 Triticum aestivum (№ доступа в GenBank - CJ562397).
SEQ ID NO: 10 - EST Lr34 Triticum aestivum (№ доступа в GenBank - CV773074).
SEQ ID NO: 11 - EST Lr34 Triticum aestivum (№ доступа в GenBank - BU991506).
SEQ ID NO: 12-46 - олигонуклеотидные праймеры.
SEQ ID NO: 47 - ABC-транспортер PDR23 риса.
SEQ ID NO: 48 - ABC-транспортер PDR5 Arabidopsis thaliana.
SEQ ID NO: 49 - ABC-транспортер PDR9 Arabidopsis thaliana.
SEQ ID NO: 50 - последовательность N-концевого бокса Уокера типа A Lr34.
SEQ ID NO: 51 - последовательность С-концевого бокса Уокера типа A Lr34.
SEQ ID NO: 52 - последовательность N-концевого ABC-опознавательного мотива Lr34.
SEQ ID NO: 53 - последовательность С-концевого ABC-опознавательного мотива Lr34.
SEQ ID NO: 54 - последовательность N-концевого бокса Уокера типа В Lr34.
SEQ ID NO: 55 - последовательность С-концевого бокса Уокера типа В Lr34.
SEQ ID NO: 56 - консенсусная последовательность бокса Уокера типа А ABC-транспортеров.
SEQ ID NO: 57 - консенсусная последовательность бокса Уокера типа В ABC-транспортеров.
SEQ ID NO: 58 - консенсусная последовательность АВС-опознавательного мотива ABCтранспортеров.
SEQ ID NO: 59 - PDR-опознавательная последовательность 1.
SEQ ID NO: 60 - PDR-опознавательная последовательность 2.
SEQ ID NO: 61 - PDR-опознавательная последовательность 3.
SEQ ID NO: 62 - PDR-опознавательная последовательность 4.
SEQ ID NO: 63 - полипептид, кодируемый гомологом Lr34 на хромосоме 7В пшеницы.
SEQ ID NO: 64 - открытая рамка считывания, кодирующая гомолог Lr34 на хромосоме 7В пшеницы.
Подробное описание изобретения
Общие методы.
Если конкретно не определено иное, то следует считать, что все используемые в описании технические и научные термины имеют такое же значение, как и значение, в котором они понимаются специалистом со средним уровнем компетентности в данной области техники (например, в культивировании клеток, молекулярной генетике, молекулярной биологии растений, химии белков и биохимии).
Если не указано иное, то получение рекомбинантного белка, культивирование клеток и иммунологические методы, используемые в настоящем изобретении, являются стандартными процедурами, хорошо известными специалистам в данной области. Такие методы описаны и объяснены по всей литературе в таких источниках, как
- 6 031178
J. Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning, John Wiley and Sons (1984), J. Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbour Laboratory Press (1989), T.A. Brown (editor), Essential Molecular Biology: A Practical Approach, Volumes 1 and 2, IRL Press (1991), D.M. Glover and B.D. Hames (editors), DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes 1-4, IRL Press (1995 and 1996), и F.M. Ausubel et al.
(editors), Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates and Wiley-Interscience (1988, включая все изменения в соответствии с новыми данными до настоящего времени),
Ed
Harlow and David Lane (editors) Antibodies: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbour Laboratory, (1988), и J.E. Coligan et al. (editors) Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons (включая все изменения в соответствии с новыми данными до настоящего времени). Полипептиды/пептиды.
Под выражением по существу, очищенный полипептид или очищенный полипептид в настоящем описании подразумевается полипептид, который обычно отделен от липидов, нуклеиновых кислот, других пептидов и других загрязняющих молекул, с которыми он связан в своем природном состоянии.
Предпочтительно, по существу, очищенный полипептид лишен по крайней мере на 90% других компонентов, с которыми он связан в природе.
Термин рекомбинантный в отношении полипептида относится к полипептиду, когда он продуцируется клеткой или в бесклеточной экспрессионной системе, в измененном количестве или в измененной степени по сравнению с его природным состоянием. В одном варианте осуществления клеткой является клетка, которая не продуцирует полипептид в природе. Однако клеткой может быть клетка, которая включает неэндогенный ген, который приводит к измененному количеству продуцируемого полипептида. Рекомбинантный полипептид по настоящему изобретению включает полипептиды, которые не были отделены от других компонентов трансгенной (рекомбинантной) клетки или бесклеточной экспрессионной системы, в которой он продуцируется, и продуцируемые в таких клетках или бесклеточных системах полипептиды, которые, по существу, очищены, по крайней мере, от некоторых других компонентов. В варианте осуществления рекомбинантным полипептидом является полипептид, полученный при экспрессии рекомбинантного полинуклеотида в клетке, предпочтительно в клетке растения и более предпочтительно в клетке хлебного злака.
Термины полипептид и белок обычно используются взаимозаменяемо.
Используемый в описании термин полипептид резистентности к патогену взрослых растений относится к белку, кодируемому геном, который обычно придает взрослому растению повышенную резистентность к патогену растений по сравнению с изогенным растением, в котором этот ген отсутствует, и который придает всходам того же растения значительно меньшую резистентность к тому же патогену или не придает такую резистентность, когда растение выращивают в нормальных полевых условиях. Этот термин также относится к продуцируемому в природе белку (или белку дикого типа, из которого происходит мутантный белок), кодируемому геном, придающим взрослому растению (например, сорту пшеницы Frontana), но не всходам, при выращивании в нормальных полевых условия, повышенную резистентность к патогену растений. Обычно полипептиды резистентности к патогену взрослых растений не обеспечивают реакцию гиперчувствительности у растений в присутствии патогена, и резистентность является стойкой в полевых условиях в течение продолжительного периода. Как используется в описании, взрослое растение относится к растению, которое вошло в репродуктивную фазу роста и развития. В варианте осуществления менее половины белка продуцируется на грамм сухого веса в листьях всходов по сравнению с листьями взрослого растения. Примеры патогенов растений, к которым повышается резистентность, включают, но не ограничиваются ими,
Fusarium graminearum, Erysiphe graminis f. sp. tritici,
Bipolaris sorokiniana, . Puccinia graminis f. sp. tritici,
Puccinia striiformis и Puccinia recondite f. sp. tritici .
Процент идентичности полипептида определяют посредством анализа GAP (Needleman and Wunsch, 1970) (программы GCG) с использованием штрафа за включение пропуска=5 и штрафа за удлинение пропуска=0,3. Длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 150 аминокислот, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 150 аминокислот. Более предпочтительно длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 500 аминокислот, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 500 аминокислот. Более предпочтительно длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 1000 аминокислот, и в анализе GAP совмещаются две последовательно
- 7 031178 сти по участку, составляющему по крайней мере 1000 аминокислот. Еще более предпочтительно длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 1250 аминокислот, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 1250 аминокислот. Еще более предпочтительно в анализе GAP совмещаются две последовательности по всей их длине.
Как используется в описании, биологически активный фрагмент представляет собой часть полипептида по настоящему изобретению, которая сохраняет определенную активность полноразмерного полипептида. Биологически активные фрагменты могут быть любого размера при условии, что они сохраняют определенную активность, но предпочтительно их размер составляет по крайней мере 1000 или по крайней мере 1200 аминокислотных остатков. Предпочтительно биологически активный фрагмент сохраняет по крайней мере 10% активности полноразмерного белка.
Выражение повышенная резистентность к патогену растений используется в описании как относительный термин, так что растение по настоящему изобретению имеет повышенный уровень резистентности к патогену растений по сравнению с генетически идентичным растением, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид. Повышенную резистентность можно определить с использованием ряда известных в данной области способов, таких как исследование растений в отношении степени патогена и/или исследование роста растений или степени повреждения, наносимого растению в присутствии патогена.
Используемый в описании термин характеризуется ускоренным старением верхушек кроющих листьев относится к старению с ранним началом края самого нижнего листа на стебле растения. В описании он используется как относительный термин, так что растение по настоящему изобретению характеризуется ускоренным старением верхушек кроющих листьев по сравнению с генетически идентичным кроющим листом, в котором отсутствует экзогенный полинуклеотид. Ускоренное старение верхушек кроющих листьев можно определить любым способом, известным в данной области, таким как способ, который описан в примере 5.
В отношении определенного полипептида будет понятно, что цифровые данные процента идентичности, превышающие приведенные выше цифровые данные, будут включены в предпочтительные варианты осуществления. Таким образом, где применимо с учетом цифровых данных минимального процента идентичности предпочтительно, когда полипептид включает аминокислотную последовательность, которая идентична соответствующей SEQ ID NO с определенным названием по крайней мере на 60%, более предпочтительно по крайней мере на 65%, более предпочтительно по крайней мере на 70%, более предпочтительно по крайней мере на 75%, более предпочтительно по крайней мере на 76%, более предпочтительно по крайней мере на 80%, более предпочтительно по крайней мере на 85%, более предпочтительно по крайней мере на 90%, более предпочтительно по крайней мере на 91%, более предпочтительно по крайней мере на 92%, более предпочтительно по крайней мере на 93%, более предпочтительно по крайней мере на 94%, более предпочтительно по крайней мере на 95%, более предпочтительно по крайней мере на 96%, более предпочтительно по крайней мере на 97%, более предпочтительно по крайней мере на 98%, более предпочтительно по крайней мере на 99%, более предпочтительно по крайней мере на 99,1%, более предпочтительно по крайней мере на 99,2%, более предпочтительно по крайней мере на 99,3%, более предпочтительно по крайней мере на 99,4%, более предпочтительно по крайней мере на 99,5%, более предпочтительно по крайней мере на 99,6%, более предпочтительно по крайней мере на 99,7%, более предпочтительно по крайней мере на 99,8% и еще более предпочтительно по крайней мере на 99,9%.
Используемое в описании выражение в положении, соответствующем номеру аминокислоты или его вариации относится к положению аминокислоты относительно окружающих аминокислот. В этом отношении в некоторых вариантах осуществления полипептид по настоящему изобретению может иметь делеционные мутации или мутации с замещением, которые изменяют относительное положение аминокислоты при совмещении, например с SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 4. Например, полипептид с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 1, имеет делецию одной аминокислоты по сравнению с полипептидом с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 4, а именно фенилаланин в положении 546 SEQ ID NO: 4 отсутствует в SEQ ID NO: 1 и не заменен другой аминокислотой. Вследствие этого квалифицированному специалисту будет понятно, что номер 634 аминокислоты в SEQ ID NO: 4 (Y) соответствует номеру 633 аминокислоты в SEQ ID NO: 4 (H).
Мутанты по аминокислотной последовательности полипептидов по настоящему изобретению можно получить путем введения подходящих изменений нуклеотидов в нуклеиновой кислоте по настоящему изобретению или путем in vitro синтеза желаемого полипептида. Такие мутанты включают, например, делеции, инсерции или замены остатков внутри аминокислотной последовательности. Для достижения конечной конструкции можно выполнить комбинацию из делеции, инсерции и замены при условии, что конечный пептидный продукт обладает желаемыми характеристиками. Предпочтительные мутанты по аминокислотной последовательности имеют только одно, два, три, четыре или менее 10 изменений аминокислот относительно исходного полипептида дикого типа.
Мутантные (измененные) пептиды можно получить, используя любой метод, известный в данной области техники. Например, полинуклеотид по настоящему изобретению можно подвергнуть in vitro му
- 8 031178 тагенезу. Методы такого in vitro мутагенеза включают субклонирование полинуклеотида в подходящий вектор, трансформацию вектора в штамм мутатора, такой как Е. coli XL-1 red (Stratagene), и размножение трансформированных бактерий, повторяемое в течение подходящего ряда поколений. В другом примере полинуклеотиды по настоящему изобретению подвергают методам перетасовки ДНК, широко описанным Harayama (1998). Продукты, полученные из мутированной/измененной ДНК, можно без труда подвергнуть скринингу, используя описанные в настоящем документе методы для определения того, обладают ли они резистентностью к патогену и/или активностью ABC-транспортера.
При создании мутантов по аминокислотной последовательности местонахождение точки мутации и природа мутации будут зависеть от подвергаемой изменению характеристики (характеристик). Точки мутации можно изменить по отдельности или одну за другой, например, посредством (1) замещения сначала консервативными аминокислотными вариантами, а затем более радикальными выбранными элементами, исходя из полученных результатов, (2) делеции целевого остатка или (3) инсерции других остатков рядом с определенным сайтом.
Делеции в аминокислотной последовательности обычно находятся в пределах от приблизительно 1 до 15 остатков, более предпочтительно от приблизительно 1 до 10 остатков и обычно от приблизительно 1 до 5 последовательных остатков.
Мутанты с замещением характеризуются удалением по крайней мере одного аминокислотного остатка в молекуле полипептида и вставкой на его место иного остатка. Представляющие наибольший интерес сайты для мутагенеза с замещением включают сайты, идентифицированные как активный(е) сайт(ы). Другими представляющими интерес сайтами являются сайты, в которых специфические остатки, существующие в различных штаммах или видах, являются идентичными. Эти положения могут быть важны для биологической активности. Эти сайты, особенно те, которые встречаются внутри последовательности по крайней мере трех отличных в равной степени консервативных сайтов, предпочтительно замещают относительно консервативным образом. Такие консервативные замены представлены в табл. 1 под заголовком приводимые в качестве примеров замены.
В предпочтительном варианте осуществления мутант/вариант полипептида имеет одну, или две, или три, или четыре консервативные аминокислотные замены по сравнению с природным полипептидом. Сведения о консервативных аминокислотных заменах приведены в табл. 1. В предпочтительном варианте осуществления замены не находятся в одном или более мотивах, которые являются высококонсервативными между различными полипептидами, обеспечиваемых этим изобретением. Как, возможно, известно квалифицированному специалисту, с достаточным основанием можно ожидать, что такие незначительные изменения не приведут к изменению активности полипептида при экспрессии в рекомбинантной клетке.
Таблица 1 Приводимые в качестве примеров замены
Исходный остаток Приводимые в качестве примеров замены
Ala (А) val; leu; ile; gly
Arg (R) lys
Asn (N) gin; his
Asp (D) glu
Cys(C) ser
Gin (Q) asn; his
Glu (E) asp
Gly(G) pro, ala
His (H) asn; gin
He (I) leu; val; ala
Leu (L) ile; val; met; ala; phe
Lys (K) arg
Met (M) leu; phe
Phe (F) leu; val; ala
Pro (P) gly
Ser (S) thr
Thr (T) ser
Trp (W) tyr
Tyr(Y) trp; phe
Vai (V) ile; leu; met; phe, ala
В варианте осуществления белок по настоящему изобретению представляет собой ABCтранспортер - PDR (гомолог плейотропной лекарственной резистентности) и включает два нуклеотидсвязываюших домена (NBD) и два трансмембранных домена, скомпонованных, как продемонстрировано на фиг. 5.
Первичную аминокислотную последовательность Lr34 можно использовать для создания ее вари
- 9 031178 антов/мутантов на основе сравнений с близкородственными ABC-транспортерами. Как это будет понятно квалифицированному специалисту, высококонсервативные среди близкородственных АВСтранспортеров PDR остатки с меньшей вероятностью могут быть изменены, особенно с использованием неконсервативных замен, с сохранением активности, чем менее консервативные остатки. Такие консервативные участки и возможные замены описаны Rae (2007), van den Brule and Smart (2002) и Verrier et al. (2008). Полипептид обычно включает два бокса Уокера типа A (GX4GK[ST]) (SEQ ID NO: 56) (которая соответствует SEQ ID NO: 50 и 51 Lr34), два бокса Уокера типа В ((гидрофобный участок)4[DE]) (SEQ ID NO: 57) (которая соответствует SEQ ID NO: 54 и 55 Lr34) и два ABC-опознавательных мотива ( [LIVMFY]S[SGM] [GE]X3[RKA] [LIVMYA]X[LIVFMT] [AG] ) (SEQ ID NO : 5 8 ) (которая соответствует SEQ ID NO: 52 и 53 Lr34), при этом каждый NBD включает по порядку от N-конца бокс Уокера типа А, АВС-опознавательный мотив и бокс Уокера типа В (см., например, фиг. 4). В вышеприведенных последовательностях X может быть любой аминокислотой и может быть независимо одинаковой или различной.
Кроме того, полипептид обычно включает PDR-опознавательный мотив 1 (lllgpp) (seq id N0:59), который является непосредственно N-концевым по отношению к Nконцевому боксу Уокера типа А и слегка перекрывается с ним; PDR-опознавательный мотив 2 (GLDSST) (SEQ ID N0:60), который начинается за четырьмя остатками, являющимися С-концевыми по отношению к N-концевому боксу Уокера типа В; PDR-опознавательный мотив 3 (gld [AT] r [AS] aaiv [mi ] R) (seq id N0:61), КОторый начинается за четырьмя остатками, являющимися С-концевыми по отношению к С-концевому боксу Уокера типа В; и PDR-опознавательный мотив 4 (vctihqps) (seq id N0:62), который начинается за 86 остатками, являющимися С-концевыми по отношению к PDR-опознавательному мотиву 3.
В варианте осуществления полипептид по настоящему изобретению включает один или более аминокислотных мотивов, представленных в SEQ ID NO: 56-58, предпочтительно две копии всех трех последовательностей. Более предпочтительно полипептид по настоящему изобретению включает один или более аминокислотных мотивов, представленных в SEQ ID NO: 50-55, предпочтительно все шесть последовательностей.
Кроме того, в еще другом варианте осуществления полипептид по настоящему изобретению включает один или более аминокислотных мотивов, представленных в SEQ ID NO: 59-62, предпочтительно все четыре последовательности.
Источники природных вариантов SEQ ID NO: 1, которые придают описываемую в настоящем документе резистентность, перечислены в табл. 5. На основе предоставленной в описании информации квалифицированный специалист может легко определить аминокислотную последовательность этих природных вариантов, а также кодирующих их полинуклеотидов.
В объем настоящего изобретения также включены полипептиды по настоящему изобретению, которые дифференциально модифицированы во время или после синтеза, например, путем биотинилирования, бензилирования, гликозилирования, ацетилирования, фосфорилирования, амидирования, дериватизации с использованием известных защитных/блокирующих групп, протеолитического расщепления, соединения с молекулой антитела или другим клеточным лигандом и т.д. Полипептиды могут быть посттрансляционно модифицированы в клетке, например, путем фосфорилирования, которое может модулировать их активность. Эти модификации могут служить для увеличения стабильности и/или биоактивности полипептида по настоящему изобретению.
Полипептиды по настоящему изобретению можно получить различными способами, включающими продукцию и извлечение природных полипептидов, продукцию и извлечение рекомбинантных полипептидов и химический синтез полипептидов. В одном варианте осуществления выделенный полипептид по настоящему изобретению получают путем культивирования клетки, способной экспрессировать полипептид, в условиях, эффективных для продукции полипептида, и извлечения полипептида.
Предпочтительной для культивирования клеткой является рекомбинантная клетка по настоящему изобретению. Эффективные условия культивирования включают, но не ограничиваются ими, эффективные среды, биореактор, температурные условия, условия pH и насыщения кислородом, которые делают возможной продукцию полипептида. Эффективная среда относится к любой среде, в которой культивируют клетку для продуцирования полипептида по настоящему изобретению. Такая среда обычно включает водную среду, содержащую источники усвояемого углерода, азота и фосфата, и соответствующие соли, минеральные вещества, металлы и другие питательные вещества, такие как витамины. Клетки по настоящему изобретению можно культивировать в обычных ферментационных биореакторах, встряхиваемых колбах, пробирках, микротитровальных планшетах и чашках Петри. Культивирование можно осуществлять при температуре, pH и содержании кислорода, подходящих для рекомбинантной клетки. Следование таким условиям культивирования находится в пределах компетентности обычного специалиста в данной области техники. Предпочтительным средством для продуцирования полипептидов является трансгенное растение, предпочтительно трансгенный хлебный злак.
Полинуклеотиды и гены.
- 10 031178
Настоящее изобретение относится к различным полинуклеотидам. Как используется в данном описании, полинуклеотид, или нуклеиновая кислота, или молекула нуклеиновой кислоты означает полимер из нуклеотидов, который может представлять собой ДНК или РНК, или их сочетание и включает мРНК, кРНК, кДНК, тРНК, миРНК (siRNA) (малую (короткую) интерферирующую РНК), мшРНК (shRNA) (малую (короткую) шпилечную РНК) и шРНК (hpRNA) (шпилечную РНК). Он может представлять собой ДНК или РНК клеточного, геномного или синтетического происхождения, например, может быть получен на автоматизированном синтезаторе, и может быть объединен с углеводом, липидами, белком или другими материалами, меченными флуоресцентными или другими группами, или прикреплен к твердой подложке для выполнения конкретного определенного в описании действия, или включать один или более модифицированных нуклеотидов, не встречающихся в природе, которые хорошо известны специалистам в данной области. Полимер может быть одноцепочечным, в основном двухцепочечным или частично двухцепочечным. Примером молекулы частично двухцепочечной РНК является шпилечная РНК (hpRNA), короткая шпилечная РНК (shRNA) или самокомплементарная РНК, которые включают двухцепочечную ножку, образованную в результате спаривания оснований между нуклеотидной последовательностью и ее комплементом, и последовательность петли, которая ковалентно соединяет нуклеотидную последовательность и ее комплемент. Как используется в данном описании, спаривание оснований относится к обычному спариванию оснований между нуклеотидами, включающему пары оснований G:U. Под комплементарными подразумеваются два полинуклеотида, способные к спариванию оснований (гибридизации) по части их длин или по всей длине одного или обоих полинуклеотидов. Под гибридизованным полинуклеотидом подразумевается полинуклеотид, который действительно подвергся спариванию оснований со своим комплементом. Термин полинуклеотид используется в описании взаимозаменяемо с термином нуклеиновая кислота.
Под выделенным полинуклеотидом понимается полинуклеотид, который обычно отделен от полинуклеотидных последовательностей, с которыми он связан в своем природном состоянии. Предпочтительно выделенный полинуклеотид лишен по крайней мере на 90% других компонентов, с которыми он связан в природе.
Настоящее изобретение включает модифицирование активности гена и конструирование и использование химерных генов. Используемый в описании термин ген включает любую дезоксирибонуклеотидную последовательность, которая включает кодирующую белок область или которая транскрибируется в клетке, но не подвергается трансляции, а также связанные некодирующие и регуляторные области. Такие связанные области обычно находятся вблизи кодирующей области или транскрибируемой области как на 5'-конце, так и на З'-конце на расстоянии, составляющем приблизительно 2 т.п.о., с обеих сторон. В этом отношении ген может включать регулирующие сигналы, такие как промоторы, энхансеры, сигналы терминации и/или полиаденилирования, которые в природе связаны с конкретным геном, или гетерологичные регулирующие сигналы, в случае присутствия которых ген называют химерным геном. Последовательности, которые расположены в направлении 5' от кодирующей области и которые присутствуют на мРНК, называют 5' нетранслируемыми последовательностями. Последовательности, которые расположены по ходу транскрипции кодирующей области или находятся в направлении 3' от него и которые присутствуют на мРНК, называются 3' нетранслируемыми последовательностями. Термин ген охватывает как кДНК, так и геномные формы гена.
Как используется в данном описании, ген Lr34 относится к нуклеотидной последовательности, которая гомологична выделенному гену Lr34 (SEQ ID NO: 3) или кДНК Lr34 (SEQ ID NO: 2), описываемой в данном документе, который(ая) кодирует белок, придающий резистентность к патогену, предпочтительно грибному патогену, растению, предпочтительно хлебному злаку и более предпочтительно пшенице. Предпочтительно белок придает резистентность к более чем одному грибному патогену. Гены Lr34 включают природные аллели или варианты, существующие в хлебных злаках, таких как пшеница, включая те, которые кодируются D-геномами гексаплоидной пшеницы и диплоидными прародителями Dгенома или его родственниками, а также не встречающиеся в природе варианты, которые могут быть получены специалистами в области генной модификации. Молекулы нуклеиновых кислот, имеющие нуклеотидную последовательность, представленную в описании как SEQ ID NO: 2 (кДНК) или SEQ ID NO: 3 (геномная последовательность), кодирующие белок с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1, являются примерами гена Lr34. В предпочтительном варианте осуществления ген Lr34 относится к молекуле нуклеиновой кислоты, включающей нуклеотиды, имеющие последовательность, идентичную SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 90%.
Геномная форма или клон гена, содержащая транскрибируемую область, может быть прервана некодирующими последовательностями, называемыми интронами или находящимися между экзонами участками или последовательностями. Как используется в данном описании, интрон представляет собой сегмент гена, который транскрибируется в виде части первичного РНК-транскрипта, но не присутствует в молекуле зрелой мРНК. Интроны удаляются или вырезаются из ядерного или первичного транскрипта; следовательно, интроны отсутствуют в информационной РНК (мРНК). Интроны могут содержать регуляторные элементы, такие как энхансеры. Как используется в данном описании, экзоны относятся к областям ДНК, соответствующим последовательностям РНК, которые присутствуют в зрелой
- 11 031178 мРНК или молекуле зрелой РНК в тех случаях, когда молекула РНК не подвергается трансляции. Во время трансляции мРНК функционирует для определения последовательности или порядка аминокислот в возникающем полипептиде. Термин ген включает синтетическую или слитую молекулу, кодирующую белки по настоящему изобретению, описываемые в данном документе, целиком или их часть, и нуклеотидную последовательность, комплементарную любой из указанных выше молекул. Ген можно встроить в соответствующий вектор для внехромосомного поддержания в клетке или для интеграции в геном хозяина.
Как используется в данном описании, химерный ген относится к любому гену, который не является нативным геном в своем природном местонахождении. Обычно химерный ген включает регуляторные и транскрибируемые или кодирующие белок последовательности, которые не встречаются вместе в природе. Соответственно химерный ген может включать регуляторные последовательности и кодирующие последовательности, которые происходят из различных источников, или регуляторные последовательности и кодирующие последовательности, происходящие из одного и того же источника, но с расположением, отличным от расположения, которое встречается в природе. Термин эндогенный используется в описании для ссылки на вещество, которое обычно присутствует или продуцируется в немодифицированном растении в той же стадии развития, что и исследуемое растение. Эндогенный ген относится к нативному гену в его природном местонахождении в геноме организма. Как используется в данном описании, рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты, рекомбинантный полинуклеотид или их вариации относятся к молекуле нуклеиновой кислоты, которая была сконструирована или модифицирована с использованием технологии рекомбинантных ДНК. Термины чужеродный полинуклеотид, или экзогенный полинуклеотид, или гетерологичный полинуклеотид и т.п. относятся к любой нуклеиновой кислоте, которая введена в геном клетки с помощью экспериментальных манипуляций. Например, авторами настоящего изобретения идентифицирован гомолог Lr34 на хромосоме 7В пшеницы (см. SEQ ID NO: 63 и 64). Квалифицированный специалист может использовать эту информацию для мутирования гомолога гена Lr34 в твердой пшенице таким образом, чтобы он кодировал белок по настоящему изобретению, в котором отсутствует остаток фенилаланина или любая аминокислота в положении, соответствующем номеру аминокислоты 546 в SEQ ID NO: 4, и имеется аминокислота, отличная от остатка тирозина, в положении, соответствующем номеру аминокислоты 634 в SEQ ID NO: 4. Такой мутированный ген, а также кодируемую мРНК, можно было бы считать экзогенным полинуклеотидом по настоящему изобретению.
Чужеродными или экзогенными генами могут быть гены, которые введены в ненативный организм, нативные гены, введенные в новое место внутри нативного хозяина, или химерные гены. Трансген представляет собой ген, который был введен в геном с помощью процедуры трансформации. Термин генетически модифицированные включает введение генов в клетки посредством трансформации или трансдукции, мутирование генов в клетках и изменение или модулирование регуляции гена в клетке или организме, в отношении которой(ого) эти действия были осуществлены, или их потомстве.
Кроме того, термин экзогенный в отношении полинуклеотида (нуклеиновой кислоты) относится к полинуклеотиду, если он присутствует в клетке или в бесклеточной экспрессионной системе, в измененной степени по сравнению с его природным состоянием. В варианте осуществления клеткой является клетка, которая в природе не включает полинуклеотид. Однако клеткой может быть клетка, которая включает неэндогенный полинуклеотид, приводящий к измененной степени продукции кодируемого полипептида. Экзогенный полинуклеотид по настоящему изобретению включает полинуклеотиды, которые были отделены от других компонентов трансгенной (рекомбинантной) клетки или бесклеточной экспрессионной системы, в которой он присутствует, и полинуклеотиды, продуцированные в таких клетках или бесклеточных системах, которые, по существу, очищены, по крайней мере, от некоторых других компонентов. Экзогенный полинуклеотид (нуклеиновая кислота) может быть непрерывным участком нуклеотидов, существующим в природе, или включать два или более непрерывных участков нуклеотидов из различных источников (природных и/или синтетических), соединенных с образованием одного полинуклеотида. Обычно такие химерные полинуклеотиды включают, по крайней мере, открытую рамку считывания, кодирующую полипептид по настоящему изобретению, функционально связанный с промотором, подходящим для управления транскрипцией открытой рамки считывания в представляющей интерес клетке.
Процент идентичности полинуклеотида определяют посредством анализа GAP (Needleman and Wunsch, 1970) (программы GCG) с использованием штрафа за включение пропуска=5 и штрафа за удлинение пропуска=0,3. Длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 450 нуклеотидов, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 450 нуклеотидов. Предпочтительно длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 1500 нуклеотидов, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 1500 нуклеотидов. Еще более предпочтительно длина запрашиваемой последовательности составляет по крайней мере 3000 нуклеотидов, и в анализе GAP совмещаются две последовательности по участку, составляющему по крайней мере 3000 нуклеотидов. Еще более предпочтительно в анализе GAP совмещаются две последовательности по всей их длине.
- 12 031178
В отношении определенных полинуклеотидов будет понятно, что цифровые данные % идентичности, превышающие приведенные выше цифровые данные, будут включены в предпочтительные варианты осуществления. Таким образом, где приемлемо с учетом цифровых данных минимального % идентичности предпочтительно, когда полинуклеотид включает полинуклеотидную последовательность, которая идентична соответствующей SEQ ID NO с определенным названием по крайней мере на 60%, более предпочтительно по крайней мере на 65%, более предпочтительно по крайней мере на 70%, более предпочтительно по крайней мере на 75%, более предпочтительно по крайней мере на 80%, более предпочтительно по крайней мере на 85%, более предпочтительно по крайней мере на 90%, более предпочтительно по крайней мере на 91%, более предпочтительно по крайней мере на 92%, более предпочтительно по крайней мере на 93%, более предпочтительно по крайней мере на 94%, более предпочтительно по крайней мере на 95%, более предпочтительно по крайней мере на 96%, более предпочтительно по крайней мере на 97%, более предпочтительно по крайней мере на 98%, более предпочтительно по крайней мере на 99%, более предпочтительно по крайней мере на 99,1%, более предпочтительно по крайней мере на 99,2%, более предпочтительно по крайней мере на 99,3%, более предпочтительно по крайней мере на 99,4%, более предпочтительно по крайней мере на 99,5%, более предпочтительно по крайней мере на 99,6%, более предпочтительно по крайней мере на 99,7%, более предпочтительно по крайней мере на 99,8% и еще более предпочтительно по крайней мере на 99,9%.
В предпочтительном варианте осуществления полинуклеотид по настоящему изобретению не является последовательностью нуклеотидов, представленной в любой из SEQ ID NO: 7-11.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к полинуклеотидам, которые, по существу, идентичны полинуклеотидам, конкретно описанным в данном документе. Используемый в описании термин по существу, идентичный со ссылкой на полинуклеотид означает замещение одного или небольшого числа (например, 2, 3 или 4) нуклеотидов при сохранении по крайней мере одной активности нативного белка, кодируемого полинуклеотидом. Кроме того, этот термин включает добавление или делетирование нуклеотидов, которое приводит к увеличению или уменьшению размера кодируемого нативного белка на одну или небольшое число (например, 2, 3 или 4) аминокислот при сохранении по крайней мере одной активности нативного белка, кодируемого полинуклеотидом.
Настоящее изобретение относится к применению олигонуклеотидов. Используемые в данном описании олигонуклеотиды представляют собой полинуклеотиды длиной вплоть до 50 нуклеотидов. Минимальным размером таких олигонуклеотидов является размер, требуемый для образования стабильного гибрида между олигонуклеотидом и комплементарной последовательностью в молекуле нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению. Они могут представлять собой РНК, ДНК, или их сочетания, или производные любой из них. Олигонуклеотиды обычно представляют собой относительно короткие одноцепочечные молекулы длиной 10-30 нуклеотидов, обычно 15-25 нуклеотидов. При использовании в качестве зонда или в качестве праймера в реакции амплификации минимальным размером такого олигонуклеотида является размер, требуемый для образования стабильного гибрида между олигонуклеотидом и комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты. Предпочтительно длина олигонуклеотидов составляет по крайней мере 15 нуклеотидов, более предпочтительно по крайней мере 18 нуклеотидов, более предпочтительно по крайней мере 19 нуклеотидов, более предпочтительно по крайней мере 20 нуклеотидов, еще более предпочтительно по крайней мере 25 нуклеотидов. Олигонуклеотиды по настоящему изобретению, используемые в качестве зонда, обычно конъюгированы с меткой, такой как радиоактивный изотоп, фермент, биотин, флуоресцентная молекула или хемилюминесцентная молекула.
Настоящее изобретение включает олигонуклеотиды, которые могут быть использованы в качестве, например, зондов для идентификации молекул нуклеиновых кислот или в качестве праймеров для продуцирования молекул нуклеиновых кислот. Зонды и/или праймеры можно использовать для клонирования гомологов полинуклеотидов по настоящему изобретению из других видов. Кроме того, известные в данной области методы гибридизации можно также использовать для скрининга библиотек геномной ДНК или кДНК для таких гомологов.
Полинуклеотиды и олигонуклеотиды по настоящему изобретению включают те, которые гибридизуются в жестких условиях с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 2 и/или 3. Используемыми в данном описании жесткими условиями являются такие условия, при которых (1) используется низкая ионная сила и высокая температура для промывки, например, 0,015М NaCl/0,0015M цитрат натрия/0,1% NaDOdSO4 при 50°C; (2) во время гибридизации используется денатурирующий агент, такой как формамид, например 50%-ный (в объемном отношении) формамид с 0,1% бычьего сывороточного альбумина, 0,1% фиколла, 0,1% поливинилпирролидона, 50 мМ натрий-фосфатным буфером при pH 6,5 с 750 мМ NaCl, 75 мМ цитратом натрия при 42°C; или (3) используется 50%-ный формамид, 5xSSC (0,75М NaCl, 0,075М цитрат натрия), 50 мМ фосфат натрия (pH 6,8), 0,1% фосфата натрия, 5х раствор Денхардта, обработанная ультразвуком ДНК из молок лососевых (50 г/мл), 0,1% SDS и 10% сульфата декстрана при 42°C в 0,2xSSC и 0,1% SDS.
Полинуклеотиды по настоящему изобретению могут иметь по сравнению с природными молекула
- 13 031178 ми одну и несколько мутаций, которые представляют собой делеции, инсерции или замены нуклеотидных остатков. Мутанты могут быть либо природными (то есть выделенными из природного источника) или синтетическими (например, в результате осуществления сайт-направленного мутагенеза на нуклеиновой кислоте). Вариант полинуклеотида или олигонуклеотида по настоящему изобретению включает молекулы, которые имеют размеры, варьирующие вблизи размера исходных молекул полинуклеотидов или олигонуклеотидов, определяемых в описании, и/или способны к гибридизации с геномом пшеницы. Например, варианты могут включать дополнительные нуклеотиды (например, 1, 2, 3, 4 или более) или меньшее число нуклеотидов при условии, что они все еще гибридизуются с участком-мишенью. Кроме того, небольшое число нуклеотидов может быть замещено без оказания влияния на способность олигонуклеотида к гибридизации с участком-мишенью. Кроме того, могут быть легко созданы варианты, которые гибридизуются вблизи, например, в пределах 50 нуклеотидов, участка генома растений, с которым гибридизуются конкретные олигонуклеотиды, определенные в данном описании. В частности, они включают полинуклеотиды, которые кодируют тот же полипептид или аминокислотную последовательность, но которые отличаются по нуклеотидной последовательности благодаря избыточности генетического кода. Термины вариант полинуклеотида и вариант также включают природные аллельные варианты.
Конструкции нуклеиновых кислот.
Настоящее изобретение включает конструкции нуклеиновых кислот, содержащие полинуклеотиды по настоящему изобретению, и содержащие их векторы и клетки-хозяева, способы их получения и использования и области их применения. Настоящее изобретение относится к элементам, которые функционально соединены или связаны. Термины функционально соединенные или функционально связанные и т. п. относятся к соединению полинуклеотидных элементов в функциональном отношении. Обычно функционально соединенные последовательности нуклеиновых кислот являются связанными при соприкосновении и при необходимости соединения двух кодирующих белки областей, соприкасающимися и находящимися в рамке считывания. Кодирующая последовательность функционально соединена с другой кодирующей последовательностью, когда РНК-полимераза будет транскрибировать две кодирующие последовательности в единственную РНК, которая в случае ее трансляции затем транслируется в единственный полипептид, имеющий аминокислоты, происходящие из обеих кодирующих последовательностей. Не требуется, чтобы кодирующие последовательности были соприкасающимися друг с другом при условии, что экспрессируемые последовательности подвергаются в конечном счете процессингу с образованием желаемого белка.
Следует считать, что используемый в описании термин действующая в цис-положении последовательность, действующий в цис-положении элемент, или цис-регуляторная область, или регуляторная область, или аналогичный термин означает любую последовательность нуклеотидов, которая при ее соответствующем расположении и соединении относительно экспрессируемой генетической последовательности способна регулировать, по крайней мере отчасти, экспрессию генетической последовательности. Квалифицированные в данной области техники специалисты знают, что цис-регуляторная область может быть способна к активации, глушению, усилению, подавлению или иному изменению уровня экспрессии и/или специфичности в отношении типа клеток и/или специфичности в отношении стадии развития последовательности гена на транскрипционном или посттранскрипционном уровне. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения действующей в цис-положении последовательностью является последовательность активатора, которая усиливает или стимулирует экспрессию экспрессируемой генетической последовательности.
Функциональное соединение элемента промотора или энхансера с транскрибируемым полинуклеотидом означает помещение транскрибируемого полинуклеотида (например, кодирующего белок полинуклеотида или другого транскрипта) под регуляторный контроль промотора, который в таком случае контролирует транскрипцию этого полинуклеотида. При конструировании сочетаний гетерологичный промотор/структурный ген, как правило, предпочтительным является помещение промотора или его варианта на расстоянии от места начала транскрипции транскрибируемого полинуклеотида, которое является приблизительно одинаковым с расстоянием между этим промотором и кодирующей белок областью, которую он контролирует, в его природной установке; т. е. гене, от которого происходит промотор. Как это известно в данной области техники, некоторое изменение этого расстояния может быть обеспечено без потери функции. Аналогично, предпочтительное расположение элемента регуляторных последовательностей (например, оператора, энхансера и т.д.) относительно транскрибируемого полинуклеотида, помещаемого под его контроль, определяется расположением элемента в его природной установке; т.е. генах, от которых он происходит.
Как используется в данном описании, промотор или промоторная последовательность относится к области гена, обычно расположенной против хода транскрипции (5') РНК-кодирующей области, которая контролирует инициацию и уровень транскрипции в представляющей интерес клетке. Промотор включает регулирующие транскрипцию последовательности классического гена в геноме, такие как последовательности в виде TATA-бокса и CCAAT-бокса, а также дополнительные регуляторные элементы (т.е. расположенные против хода транскрипции активирующие последовательности, энхансеры и сайленсеры), которые изменяют экспрессию гена в ответ на связанные с развитием стимулы и/или стимулы ок
- 14 031178 ружающей среды, или тканеспецифическим или специфичным в отношении типа клеток образом. Промотор обычно, но не обязательно (например, в случае промоторов для полимеразы III) расположен в направлении 5' от структурного гена, экспрессию которого он регулирует. Кроме того, регуляторные элементы, включающие промотор, обычно располагаются в пределах 2 т.п.о. от места начала транскрипции гена. Промоторы могут содержать дополнительные специфические регуляторные элементы, расположенные дистальнее от места начала транскрипции, для дополнительного усиления экспрессии в клетке и/или изменения выбора времени или индуцибельности экспрессии структурного гена, с которым он функционально соединен.
Конститутивный промотор относится к промотору, который управляет экспрессией функционально связанной с ним транскрибируемой последовательности во многих или всех тканях организма, такого как растение. Используемый в описании термин конститутивный необязательно означает, что ген экспрессируется на одинаковом уровне во всех типах клеток, а означает, что ген экспрессируется в широком диапазоне типов клеток, хотя часто выявляется некоторая вариация в уровне экспрессии. Как используется в данном описании, избирательная экспрессия относится к экспрессии почти исключительно в специфических органах, например, растения, таких как, например, эндосперм, зародыш, листья, фрукт, пыльцевые трубки или корень. В предпочтительном варианте осуществления промотор регулирует экспрессию избирательно или предпочтительно в листьях и/или стеблях растения, предпочтительно хлебного злака.
Следовательно, избирательную экспрессию можно сравнить с конститутивной экспрессией, которая относится к экспрессии во многих или всех тканях растения в большей части или во всех условиях, переносимых растением.
Избирательная экспрессия может также приводить к компартментализации продуктов экспрессии генов в специфических тканях, органах растения или на стадиях развития растения. Достичь компартментализации в специфических субклеточных местах, таких как пластид, цитозоль, вакуоль или апопластическое пространство, можно посредством включения в структуру генного продукта соответствующих сигналов, например сигнального пептида, для переноса в требуемый клеточный компартмент, или в случае полуавтономных органелл (пластид и митохондрий) посредством интеграции трансгена с соответствующими регуляторными последовательностями непосредственно в геном органеллы.
Тканеспецифическим промотором или органоспецифическим промотором является промотор, который преимущественно регулирует экспрессию в одной ткани или органе относительно многих других тканей или органов, предпочтительно большей части, если не всех других тканей или органов, например, растения. Обычно экспрессия с промотора в специфической ткани или органе происходит на уровне, превышающем в 10 раз уровень в других тканях или органах.
Предусматриваемые настоящим изобретением промоторы могут быть нативными относительно трансформируемого растения-хозяина или могут происходить из альтернативного источника, причем промоторная область является функциональной в растении-хозяине. Другие источники включают гены T-ДНК Agrobacterium, такие как промоторы генов для биосинтеза нопалина, октапина, маннопина или другие промоторы опинов, тканеспецифические промоторы (см., например, патент США № 5459252 и WO 91/13992); промоторы из вирусов (включая специфичные для хозяина вирусы) или частично или полностью синтетические промоторы. Многочисленные промоторы, которые являются функциональными в однодольных и двудольных растениях, включая различные промоторы, выделенные из растений и вирусов, такие как промотор вируса мозаики цветной капусты (CaMV 35S, 19S), широко известны в данной области техники (см., например, Greve, 1983; Salomon et al., 1984; Garfinkel et al., 1983; Barker et al., 1983). He ограничивающие способы оценки активности промоторов описаны Medberryet al. (1992, 1993), Sambrook et al. (1989, выше) и в патенте США № 5164316.
Альтернативно или дополнительно промотор может быть индуцибельным промотором или регулируемым в процессе развития промотором, который способен к управлению экспрессией введенного полинуклеотида на соответствующей стадии развития, например, растения. Другие действующие в цисположении последовательности, которые могут быть использованы, включают энхансеры транскрипции и/или трансляции. Энхансерные области хорошо известны квалифицированным в данной области техники специалистам и могут включать кодон инициации трансляции - ATG и примыкающие к нему последовательности. При включении кодон инициации должен быть синфазным с рамкой считывания кодирующей последовательности, имеющей отношение к чужеродному или экзогенному полинуклеотиду, для обеспечения трансляции полной последовательности, если она должна быть транслирована. Области инициации трансляции могут быть предоставлены из источника области инициации транскрипции или из чужеродного или экзогенного полинуклеотида. Последовательность может также происходить из источника промотора, выбранного для управления транскрипцией, и может быть специфическим образом модифицирована для увеличения трансляции мРНК.
В варианте осуществления промотор, по крайней мере, способен к экспрессии полипептида в листьях растения, предпочтительно листьях взрослого растения. Примеры специфичных для листьев промоторов, которые могут быть использованы, включают промоторы, которые описаны Yamamoto et al. (1994 and 1997), Kwon et al. (1994), Gotor et al. (1993), Orozco et al. (1993), Matsuoka et al. (1993) и Stock
- 15 031178 haus et al. (1987 and 1989).
Конструкция нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению может включать 3' нетранслируемую последовательность из приблизительно 50-1000 пар нуклеотидных оснований, которая может включать последовательность терминации транскрипции. 3' нетранслируемая последовательность может содержать сигнал терминации транскрипции, который может включать или может не включать сигнал полиаденилирования и любые другие регуляторные сигналы, способные к воздействию на процессирование мРНК. Сигнал полиаденилирования функционирует с целью добавления участков из полиадениловой кислоты к 3'-концу предшественника мРНК. Сигналы полиаденилирования обычно распознаются по наличию гомологии с канонической формой 5'-AATAAA-3', хотя не редкими являются вариации. Последовательности терминации транскрипции, которые не включают сигнал полиаденилирования, включают терминаторы для РНК-полимеразы I или III, которые содержат отрезок из четырех или более тимидинов. Примерами подходящих 3' нетранслируемых последовательностей являются 3' транскрибируемые, нетранслируемые области, содержащие сигнал полиаденилирования, из гена октопинсинтазы (ocs) или гена нопалинсинтазы (nos) Agrobacterium tumefaciens (Bevan et al., 1983). Подходящие 3' нетранслируемые последовательности могут также происходить из генов растений, таких как ген рибулозо-1,5бисфосфаткарбоксилазы (ssRUBISCO), хотя также могут быть использованы другие 3' элементы, известные квалифицированным в данной области техники специалистам.
Так как последовательность ДНК, встроенная между сайтом инициации транскрипции и началом кодирующей последовательности, т.е. нетранслируемая 5' лидерная последовательность (5'UTR), может оказывать влияние на экспрессию гена, если он транслируется, а также транскрибируется, может также использоваться конкретная лидерная последовательность.
Подходящие лидерные последовательности включают те, которые содержат последовательности, выбираемые для приведения в действие оптимальной экспрессии чужеродной или эндогенной последовательности ДНК. Например, такие лидерные последовательности включают предпочтительную консенсусную последовательность, которая может увеличивать или поддерживать стабильность мРНК и предотвращать неприемлемую инициацию трансляции, как, например, описано Joshi (1987).
Векторы.
Настоящее изобретение включает использование векторов для манипуляции с генетическими конструкциями или их переноса. Под химерным вектором подразумевается молекула нуклеиновой кислоты, предпочтительно молекула ДНК, происходящая, например, из плазмиды, бактериофага или вируса растений, в которую была встроена или клонирована последовательность нуклеиновой кислоты. Вектор предпочтительно является двухцепочечной ДНК и содержит один или более уникальных сайтов рестрикции и может быть способным к автономной репликации в заданной клетке-хозяине, включая целевую клетку или ткань, или клетку или ткань, являющуюся ее предшественником, или способным к интеграции в геном заданного хозяина, так что клонированная последовательность репродуцируется. Соответственно вектор может быть автономно реплицирующимся вектором, т.е. вектором, который существует в виде внехромосомной молекулы, репликация которой не зависит от репликации хромосом(ы), например, линейной или замкнутой кольцевой плазмидой, внехромосомным элементом, минихромосомой или искусственной хромосомой. Вектор может содержать любое средство для обеспечения саморепликации. Альтернативно вектором может быть вектор, который после введения в клетку интегрируется в геном реципиентной клетки и реплицируется вместе с хромосомой(ами), в которую он был интегрирован. Векторная система может включать один вектор или плазмиду, два или более векторов или плазмид, которые вместе содержат суммарную ДНК, которую необходимо ввести в геном клетки-хозяина, или транспозон. Выбор вектора будет, как правило, зависеть от совместимости вектора с клеткой, в которую должен быть введен вектор. Вектор может также включать селектируемый маркер, такой как ген резистентности к антибиотику, ген резистентности к гербициду или другие гены, которые можно использовать для отбора подходящих трансформантов. Примеры таких генов хорошо известны квалифицированным в данной области техники специалистам.
Конструкцию нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению можно встроить в такой вектор, как плазмида. Плазмидные векторы обычно включают дополнительные последовательности нуклеиновых кислот, которые обеспечивают легкость отбора, амплификации и трансформации экспрессионной кассеты в прокариотические и эукариотические клетки, например pUC-происходящие векторы, pSKпроисходящие векторы, pGEM-происходящие векторы, pSP-происходящие векторы, pBS-происходящие векторы или бинарные векторы, содержащие одну или более областей Т-ДНК. Дополнительные последовательности нуклеиновых кислот включают ориджины репликации для обеспечения автономной репликации вектора, гены селектируемых маркеров, предпочтительно кодирующие резистентность к антибиотикам или гербицидам, уникальные множественные сайты для клонирования, предусматривающие множество сайтов для встраивания последовательностей нуклеиновых кислот или генов, кодируемых в конструкции нуклеиновой кислоты, и последовательности, которые способствуют трансформации прокариотических и эукариотических клеток (особенно клеток растений).
Под маркерным геном подразумевается ген, который придает экспрессирующим маркерный ген клеткам отличающийся фенотип и, следовательно, позволяет отличить такие трансформированные клет
- 16 031178 ки от клеток, которые не имеют такой маркер. Селектируемый маркерный ген придает характерное свойство, по причине наличия которого можно провести отбор, основываясь на резистентности к селективному агенту (например, гербициду, антибиотику, облучению, нагреву или другой обработке, вредной для ^трансформированных клеток). Селектируемый маркерный ген (или репортерный ген) придает характерное свойство, которое можно идентифицировать посредством наблюдения или исследования, т.е. посредством скрининга (например, β-глюкуронидазную, люциферазную, GFP- или другую ферментативную активность, не присутствующую в ^трансформированных клетках). Маркерный ген и представляющая интерес нуклеотидная последовательность не должны быть связанными.
Для облегчения идентификации трансформантов желательно, чтобы конструкция нуклеиновой кислоты включала селектируемый или поддающийся скринингу маркерный ген в виде, или помимо, чужеродного или экзогенного полинуклеотида. Фактический выбор маркера не является решающим при условии, что он является функциональным (т.е. селектируемым) в сочетании с предпочтительными клетками растения. Маркерный ген и представляющий интерес чужеродный или экзогенный полинуклеотид не должны быть связанными, поскольку котрансформация несвязанных генов, описанная, например, в патенте США № 4399216, также является эффективным способом при трансформации растений.
Примерами бактериальных селектируемых маркеров являются маркеры, которые придают резистентность к антибиотикам, такую как резистентность к ампициллину, эритромицину, хлорамфениколу или тетрациклину, предпочтительно резистентность к канамицину. Приводимые в качестве примеров селектируемые маркеры для отбора трансформантов растений включают, но не ограничиваются ими, ген hyg, который кодирует резистентность к гигромицину В; ген неомицинфосфотрансферазы (nptII), придающий резистентность к канамицину, паромомицину, G418; ген глутатион^-трансферазы из печени крысы, придающий резистентность к гербицидам - производным глутатиона, описанный, например, в EP 256223; ген глутаминсинтетазы, придающий при сверхэкспрессии резистентность к ингибиторам глутаминсинтетазы, таким как фосфинотрицин, описанный, например, в WO 87/05327, ген ацетилтрансферазы из Streptomyces viridochromogenes, придающий резистентность к селективному агенту - фосфинотрицину, описанный, например, в ЕР 275957, ген, кодирующий 5-энолшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), придающий устойчивость к N-фосфонометилглицину, описанный, например, Hincheeet al. (1988), ген bar, придающий резистентность к биалафосу, описанный, например, в WO 91/02071; ген нитрилазы, такой как bxn из Klebsiella ozaenae, который придает резистентность к бромоксинилу (Stalker et al., 1988); ген дигидрофолатредуктазы (DHFR), придающий резистентность к метотрексату (Thillet et al., 1988); мутантный ген ацетолактатсинтазы (ALS), который придает резистентность к имидазолинону, сульфонилмочевине или другим ALS-ингибирующим химическим веществам (EP 154204); мутированный ген антранилатсинтазы, который придает резистентность к 5-метилтриптофану; или ген далапондегалогеназы, который придает резистентность к гербициду.
Предпочтительные поддающиеся отбору маркеры включают, но не ограничиваются ими, ген uidA, кодирующий фермент β-глюкуронидазу (GUS), для которого известны различные хромогенные субстраты, ген β-галактозидазы, кодирующий фермент, для которого известны различные хромогенные субстраты, ген экворина (Prasher et al., 1985), который может использоваться при кальцийчувствительном биолюминесцентном выявлении; ген зеленого флуоресцентного белка (Niedz et al., 1995) или его производные; ген люциферазы (luc) (Ow et al., 1986), который делает возможным биолюминесцентное выявление, и другие, известные в данной области техники. Под репортерной молекулой, как используется в описании настоящего изобретения, подразумевается молекула, которая благодаря своей химической природе обеспечивает аналитически идентифицируемый сигнал, который способствует определению активности промотора на основе белкового продукта.
Предпочтительно конструкция нуклеиновой кислоты устойчиво включена в геном, например, растения. Соответственно нуклеиновая кислота включает соответствующие элементы, которые делают возможным включение молекулы в геном, или конструкцию помещают в подходящий вектор, который может быть включен в хромосому клетки растения.
Один вариант осуществления настоящего изобретения включает рекомбинантный вектор, который включает по крайней мере одну молекулу полинуклеотида по настоящему изобретению, встроенную в любой вектор, способный доставлять молекулу нуклеиновой кислоты в клетку-хозяина. Такой вектор содержит гетерологичные последовательности нуклеиновых кислот, которые являются последовательностями нуклеиновых кислот, которые не встречаются в природе вблизи молекул нуклеиновых кислот по настоящему изобретению и которые предпочтительно происходят от видов, отличных от вида, от которого происходит молекула(ы) нуклеиновой кислоты. Вектором может быть либо РНК, либо ДНК, или прокариотическая, или эукариотическая, и обычно он представляет собой вирус или плазмиду.
Ряд векторов, подходящих для стабильной трансфекции клеток растений или для создания трансгенных растений, описан, например, в Pouwels et al., Cloning Vectors: A Laboratory Manual, 1985, supp. 1987; Weissbach and Weissbach, Methods for Plant Molecular Biology, Academic Press, 1989; и Gelvin et al., Plant Molecular Biology Manual, Kluwer Academic Publishers, 1990. Как правило, векторы для экспрессии в клетках растений включают, например, один или более клонированных генов растений под транскрип
- 17 031178 ционным контролем 5' и 3' регуляторных последовательностей и доминантный селектируемый маркер. Такие векторы для экспрессии в клетках растений также могут содержать регулирующую промотор область (например, регуляторную область, контролирующую индуцибельную или конститутивную, регулируемую факторами окружающей среды или в процессе развития, или клеточно- или тканеспецифическую экспрессию), сайт начала инициации транскрипции, сайт связывания рибосомы, сигнал для процессирования РНК, сайт терминации транскрипции и/или сигнал полиаденилирования.
Уровень белка, например белка Lr34, можно модулировать посредством увеличения уровня экспрессии нуклеотидной последовательности, кодирующей белок в клетке растения, или снижения уровня экспрессии гена, кодирующего белок в растении, что приводит к изменению резистентности к патогену. Уровень экспрессии гена можно модулировать путем изменения числа копий в каждой клетке, например, путем введения синтетической генетической конструкции, включающей кодирующую последовательность и контролирующий транскрипцию элемент, который функционально соединен с ней и который является функционирующим в клетке. Множество трансформантов можно выбрать и подвергнуть скринингу для трансформантов с подходящим уровнем и/или специфичностью экспрессии трансгена, которые обусловлены эффектами эндогенных последовательностей вблизи сайта интеграции трансгена. Подходящим уровнем и картиной экспрессии трансгена являются те, которые приводят к значительному изменению резистентности к патогену или другому фенотипу. Альтернативно совокупность подвергнутых мутагенезу семян или популяцию растений из селекционной программы можно подвергнуть скринингу для отдельных линий с измененной резистентностью к патогену или другим фенотипом, связанным с резистентностью к патогену.
Рекомбинантные клетки.
Другой вариант осуществления настоящего изобретения включает рекомбинантную клетку, содержащую клетку-хозяина, трансформированную одной или более рекомбинантными молекулами по настоящему изобретению, или являющиеся их потомками клетки. Трансформацию молекулы нуклеиновой кислоты в клетку можно выполнить любым способом, с помощью которого молекула нуклеиновой кислоты может быть вставлена в клетку. Методы трансформации включают, но не ограничиваются ими, трансфекцию, электропорацию, микроинъекцию, липофекцию, абсорбцию и слияние протопластов. Рекомбинантная клетка может оставаться одноклеточной или может разрастаться в ткань, орган или многоклеточный организм. Трансформированные молекулы нуклеиновых кислот по настоящему изобретению могут оставаться внехромосомными или могут интегрироваться в один или более сайтов внутри хромосомы трансформированной (т. е. рекомбинантной) клетки таким образом, что их способность быть экспрессированными сохраняется. Предпочтительными клетками-хозяевами являются клетки растения, более предпочтительно клетки хлебного злака, более предпочтительно клетки ячменя или пшеницы и еще более предпочтительно клетка пшеницы.
Трансгенные растения.
Термин растение, используемый в описании как имя существительное, относится к цельным растениям и относится к любому члену царства растений, но при использовании в качестве прилагательного относится к любому веществу, которое присутствует в растении, получено из него, происходит от него или относится к нему, такому как, например, органы растения (например, листья, стебли, корни, цветы), одиночные клетки (например, пыльца), семена, клетки растения и т.п. Проростки и проросшие семена, из которых вышли корешки и ростки, также включены в значение растение. Используемый в описании термин части растения относится к одной или более тканям или органам растения, которые получены из растения и которые содержат геномную ДНК растения. Части растения включают вегетативные структуры (например, листья, стебли), корни, цветковые органы/структуры, семя (включая зародыш, семядоли и семенную оболочку), ткань растения (например, сосудистую ткань, основную паренхиму и т.п.), клетки и их потомство. Используемый в описании термин клетка растения относится к клетке, полученной из растения или находящейся в растении, и включает протопласты или другие клетки, происходящие от растений, продуцирующие гаметы клетки и клетки, которые регенерируются в цельные растения. Клетками растений могут быть клетки в культуре. Под тканью растения подразумевается дифференцированная ткань, присутствующая в растении или полученная из растения (эксплант), или недифференцированная ткань, происходящая от незрелых или зрелых зародышей, семян, корней, проростков, фруктов, пыльцевых трубок, пыльцы, опухолевой ткани, такой как корневая опухоль, и различные формы агрегации клеток растения в культуре, такие как каллюсы. Приводимыми в качестве примеров тканями растений в семенах или из них являются семядоля, зародыш и рубчик. Соответственно настоящее изобретение включает растения и части растений и содержащие их продукты, в частности семя, содержащее модифицированную масляную композицию.
Используемый в описании термин семя относится к зрелому семени растения, которое либо готово для сбора, либо было собрано с растения, например семя, которое обычно собирают с коммерческой целью в поле, или развивающееся семя, которое встречается у растения после опыления и до установления покоя семени, а также после его сбора.
Как используется в данном описании, трансгенное растение относится к растению, которое содержит конструкцию нуклеиновой кислоты, не встречающуюся у растения дикого типа того же вида,
- 18 031178 разновидности или сорта. То есть трансгенные растения (трансформированные растения) содержат генетический материал (трансген), который они не содержали до трансформации. Трансген может включать генетические последовательности, полученные из клетки растения или происходящие от него или другой клетки растения, или нерастительного источника, или синтетическую последовательность. Как правило, трансген введен в растение с помощью производимой человеком манипуляции, такой как, например, трансформация, но может быть использован любой способ, как это понятно квалифицированному в данной области техники специалисту. Генетический материал предпочтительно устойчиво интегрирован в геном растения. Вводимый генетический материал может включать последовательности, которые встречаются в природе у того же вида, но в порядке с перестановками или в различном расположении элементов, например антисмысловую последовательность. Содержащие такие последовательности растения включены в описании в термин трансгенные растения. Нетрансгенное растение представляет собой растение, которое не было генетически модифицировано посредством введения генетического материала с использованием методов рекомбинантных ДНК. В предпочтительном варианте осуществления трансгенные растения являются гомозиготными по каждому и всякому гену, который был введен (трансгену), так что их потомство не расщепляется в отношении желаемого фенотипа.
Как используется в данном описании, термин по сравнению с изогенным растением относится к растению, которое является изогенным относительно трансгенного растения, но без представляющего интерес трансгена. Предпочтительно соответствующее нетрансгенное растение является растением того же сорта или разновидности, что и прародитель представляющего интерес трансгенного растения, или родственной линией растений, в которой отсутствует конструкция, часто называемой сегрегантом, или растением того же сорта или разновидности, трансформированным конструкцией - пустым вектором, и может быть нетрансгенным растением. Как используется в данном описании, дикий тип относится к клетке, ткани или растению, которые не были модифицированы в соответствии с настоящим изобретением. Клетки, ткань или растения дикого типа могут быть использованы в качестве контролей для сравнения уровней экспрессии экзогенной нуклеиновой кислоты или степени и природы модификации признака с клетками, тканью или растениями, модифицированными, как описывается в данном документе.
Трансгенные растения, определяемые в связи с настоящим изобретением, включают потомство растений, которые были генетически модифицированы с использованием рекомбинантных методов, причем потомство включает представляющий интерес трансген. Такое потомство может быть получено посредством самоопыления первичного трансгенного растения или посредством скрещивания таких растений с другим растением того же вида. Обычно это должно было бы приводить к модуляции продукции по крайней мере одного описываемого здесь белка в желаемом растении или органе растения. Части трансгенных растений включают все части и клетки указанных растений, содержащие трансген, такие как, например, подвергнутые культивированию ткани, каллюс и протопласты.
Растения, предназначенные для применения на практике настоящего изобретения, включают как однодольные, так и двудольные растения. Целевые растения включают, но не ограничиваются ими, следующие растения: хлебные злаки (например, пшеницу, ячмень, рожь, овес, рис, кукурузу, сорго и родственные зерновые культуры); свеклу (сахарную свеклу и кормовую свеклу); плод семечковых, косточковый плод и ягоду (яблоки, груши, сливы, персики, миндаль, вишню, клубнику, малину и ежевику); растения семейства бобовых (бобы, чечевицу, горох, сою); масличные культуры (рапс или другие Brassicas, горчицу, мак, маслину, подсолнечник, сафлор, лен, кокосовую пальму, растения, из которых получают касторовое масло, бобы какао, арахис); растения семейства тыквенных (кабачок, огурец, дыню); волокнистые растения (хлопок, лен, коноплю, джут); цитрусовые (апельсины, лимоны, грейпфрут, мандарины); овощи (шпинат, салат-латук, спаржу, капусту, морковь, лук, помидоры, картофель, паприку); лавровые (авокадо, корицу, камфорный лавр); или такие растения, как кукуруза, табак, орех, кофейное дерево, сахарный тростник, чай, виноград, хмель обыкновенный, дерн, банан и каучуконосные растения, а также декоративные растения (цветы, кустарники, широколистые деревья и вечнозеленые растения, такие как хвойные деревья).
Предпочтительно растение представляет собой хлебный злак, более предпочтительно пшеницу, рис, кукурузу, тритикале, овес или ячмень, еще более предпочтительно пшеницу.
Используемый в описании термин пшеница относится к любым видам рода Triticum, включая их прародителей, а также к их потомству, полученному при скрещиваниях с другими видами. Пшеница включает гексаплоидную пшеницу, которая характеризуется геномной организацией AABBDD, составленной из 42 хромосом, и тетраплоидную пшеницу, которая характеризуется геномной организацией ААВВ, составленной из 28 хромосом. Гексаплоидная пшеница включает T. aestivum, T. spelta, T. macha, T. compactum, T. sphaerococcum, T. vavilovii и их межвидовые гибриды. Предпочтительным видом гексаплоидной пшеницы является T. aestivum ssp aestivum (также называемый пшеницей обыкновенной). Тетраплоидная пшеница включает T. durum (также упоминаемый в описании как твердая пшеница или Triticum turgidum ssp. durum), T. dicoccoides, T. dicoccum, T. polonicum и их межвидовые гибриды. Кроме того, термин пшеница включает возможных прародителей гексаплоидного или тетраплоидного Triticum sp., таких как Т. uartu, Т. топососсит или Т. boeoticum, в отношении А-генома, Aegilops speltoides в отношении B-генома и Т. tauschii (также известного как Aegilops squarrosa или Aegilops tauschii) в от
- 19 031178 ношении D-генома. Особенно предпочтительными прародителями являются источники A-генома, еще более предпочтительно источником A-генома является Т. топососсит. Сорт пшеницы для применения в настоящем изобретении может относиться, но этим не ограничиваясь, к любому из вышеперечисленных видов. Также охватываются растения, которые получают общепринятыми методами с использованием Triticum sp. в качестве родителя при половом скрещивании с не являющимся Triticum видом (таким как рожь [Secale cereale]), включая, но этим не ограничиваясь, Triticale.
Используемый в описании термин ячмень относится к любым видам рода Hordeum, в том числе их прародителям, а также их потомству, полученному при скрещиваниях с другими видами. Предпочтительно, когда растением является растение вида Hordeum, которое возделывают с коммерческой целью, такое как, например, линия или сорт, или разновидность Hordeum vulgare, или подходящее для промышленного производства зерна.
Трансгенные растения, определяемые в связи с настоящим изобретением, включают растения (а также части и клетки указанных растений) и потомство растений, которые были генетически модифицированы с использованием рекомбинантных методов, что вызывает продукцию по крайней мере одного полипептида по настоящему изобретению в желаемом растении или органе растения. Трансгенные растения можно получить, используя известные в данной области методы, такие как те, которые в общем описаны в публикации A. Slater et al., Plant Biotechnology - The Genetic Manipulation of Plants, Oxford University Press (2003), и Р. Christou and H. Klee, Handbook of Plant Biotechnology, John Wiley and Sons (2004).
В предпочтительном варианте осуществления трансгенные растения являются гомозиготными по каждому и всякому гену, который был введен (трансгену), так что их потомство не расщепляется в отношении желаемого фенотипа. Трансгенные растения могут также быть гетерозиготными по введенному трансгену(ам), такими как, например, в потомстве F1, которое было выращено из гибридного семени. Такие растения могут дать преимущества, такие как гибридная сила, что хорошо известно в данной области техники.
Были описаны четыре основных способа непосредственной доставки гена в клетки: (1) химические способы (Graham et al., 1973); (2) физические способы, такие как микроинъекция (Capecchi, 1980); электропорация (см., например, WO 87/06614, патент США № 5472869, патент США № 5384253, WO 92/09696 и WO 93/21335) и генная пушка (см., например, патент США № 4945050 и патент США № 5141131); (3) вирусные векторы (Clapp, 1993; Lu et al., 1993; Eglitis et al., 1988) и (4) рецепторопосредованные механизмы (Curiel et al., 1992; Wagner et al., 1992).
Способы увеличения скорости, которые могут быть использованы, включают, например, бомбардировку микрочастицами и т.п. Одним из примеров способа доставки трансформирующих молекул нуклеиновых кислот в клетки растения является бомбардировка микрочастицами. Обзор этого способа был представлен Yang et al., Particle Bombardment Technology for Gene Transfer, Oxford Press, Oxford, England (1994). Небиологические частицы (микрочастицы) могут быть покрыты нуклеиновыми кислотами и доставлены в клетки посредством реактивной силы. Приводимые в качестве примеров частицы включают частицы, составленные из вольфрама, золота, платины и т. п. Особым преимуществом бомбардировки микрочастицами, помимо того, что она является эффективным способом воспроизводимой трансформации однодольных растений, является то, что не требуется ни выделения протопластов, ни чувствительности к инфицированию Agrobacterium. Системой доставки частиц, подходящей для применения в настоящем изобретении, является гелевая пушка для увеличения скорости PDS-1000/He, доступная от Bio-Rad Laboratories. Для бомбардировки незрелые зародыши или производные клетки-мишени, такие как щиток зародыша или каллюс из незрелых зародышей, можно разместить на твердой культуральной среде.
В другом альтернативном варианте осуществления можно стабильно трансформировать пластиды. Описанные способы трансформации пластид у высших растений включают доставку с использованием пушки для частиц ДНК, содержащей селектируемый маркер, и направление ДНК в геном пластиды посредством гомологичной рекомбинации (патенты США №№ 5451513, 5545818, 5877402, 5932479 и WO 99/05265).
Agrobacterium-опосредованный перенос является широко применимой системой для введения генов в клетки растений, поскольку ДНК можно ввести в ткани цельных растений, обходя тем самым необходимость в регенерации интактного растения из протопласта. Использование Agrobacteriumопосредованной интеграции в растения векторов для введения ДНК в клетки растений хорошо известно в данной области техники (см., например, патенты США №№ 5177010, 5104310, 5004863, 5159135). Кроме того, интеграция Т-ДНК является относительно точным способом, приводящим к небольшому числу перестановок. Область ДНК, подвергаемая переносу, определяется пограничными последовательностями, и находящаяся между ними ДНК обычно встраивается в геном растения.
Векторы для трансформации Agrobacterium способны к репликации в Е. coli, а также Agrobacterium, что позволяет производить подходящие манипуляции, как описано (Klee et al., Plant DNA Infectious Agents, Hohn and Schell, (editors), Springer-Verlag, New York, (1985): 179-203). Кроме того, технологические преимущества в векторах для Agrobacterium-опосредованного переноса генов улучшили расположение генов и сайтов рестрикции в векторах, облегчая конструирование векторов, способных экспрессировать различные гены, кодирующие полипептиды. Описанные векторы имеют удобные многолинкер
- 20 031178 ные области, фланкированные промотором и сайтом полиаденилирования для управления экспрессией встроенных генов, кодирующих полипептиды, и подходят для целей настоящего изобретения. Кроме того, для трансформаций можно использовать Agrobacterium, содержащую как готовые к действию, так и не готовые к действию гены Ti-плазмид. Для сортов растений, в отношении которых Agrobacteriumопосредованный способ трансформации является эффективным, он является предпочтительным способом вследствие легкости выполнения и заданного характера переноса генов.
Трансгенное растение, созданное способами трансформации с использованием Agrobacterium, обычно содержит единственный генетический локус на одной хромосоме. Такие трансгенные растения можно назвать гемизиготными по добавленному гену. Более предпочтительным является трансгенное растение, которое является гомозиготным по добавленному структурному гену; т. е. трансгенное растение, которое содержит два добавленных гена, один ген в одном и том же локусе на каждой хромосоме хромосомной пары. Гомозиготное трансгенное растение можно получить посредством полового скрещивания (самоопыления) представляющего собой независимый сегрегант трансгенного растения, которое содержит единственный добавленный ген, проращивания некоторых из полученных семян и анализа полученных растений на наличие представляющего интерес гена.
Также должно быть понятно, что два различных трансгенных растения можно также скрестить с получением потомства, которое содержит два независимо сегрегирующих экзогенных гена. Самоопыление соответствующего потомства может дать растения, которые являются гомозиготными по обоим экзогенным генам. Также предусматривается возвратное скрещивание с родительской формой растения и ауткроссинг с нетрансгенным растением, как и вегетативное размножение. Описания других способов селекции, которые обычно используются для различных признаков и зерновых культур, можно найти в публикации Fehr, Breeding Methods for Cultivar Development, J. Wilcox (editor) American Society of Agronomy, Madison Wis. (1987).
Трансформации растительных протопластов можно добиться, используя способы, основанные на преципитации фосфатом кальция, обработке полиэтиленгликолем, электропорации и комбинациях этих обработок. Применение этих систем для различных сортов растений зависит от способности к регенерации этой конкретной линии растений из протопластов. Иллюстративные способы регенерации хлебных злаков из протопластов описаны (Fujimura et al., 1985; Toriyama et al., 1986; Abdullah et al., 1986).
Другие способы трансформации клеток могут также использоваться и включают, но не ограничиваются ими, введение ДНК в растения прямым переносом ДНК в пыльцу, прямой инъекцией ДНК в репродуктивные органы растения или прямой инъекцией ДНК в клетки незрелых зародышей с последующей регидратацией обезвоженных зародышей.
Регенерация, развитие и выращивание растений из трансформантов в виде единичных растительных протопластов или из различных трансформированных эксплантов хорошо известно в данной области техники (Weissbach et al., Methods for Plant Molecular Biology, Academic Press, San Diego, (1988)). Этот процесс регенерации и выращивания обычно включает стадии отбора трансформированных клеток, культивирования этих отдельных клеток с прохождением обычных стадий эмбрионального развития через стадии проростка с корнями. Трансгенные зародыши и семена регенерируют аналогично. Впоследствии полученные трансгенные проростки с корнями высаживают в подходящую среду для роста растений, такую как земля.
Развитие или регенерация растений, содержащих чужеродный экзогенный ген, хорошо известны в данной области техники. Предпочтительно регенерированные растения самоопыляются для обеспечения гомозиготных трансгенных растений. В противном случае пыльцу, полученную от регенерированных растений, переправляют в выращенные из семян растения агрономически важных линий. И наоборот, пыльцу от растений этих важных линий используют для опыления регенерированных растений. Трансгенное растение по настоящему изобретению, содержащее желаемую экзогенную нуклеиновую кислоту, выращивают, используя способы, хорошо известные квалифицированному в данной области техники специалисту.
Способы трансформации двудольных растений, главным образом, посредством использования Agrobacterium tumefaciens и получения трансгенных растений были опубликованы для хлопка (патенты США №№ 5004863, 5159135, 5518908); сои (патент США №№ 5569834 и 5416011); Brassica (патент США № 5463174); арахиса (Cheng et al., 1996) и гороха (Grant et al., 1995).
Способы трансформации хлебных злаков, таких как пшеница и ячмень, для внесения генетической вариации в растение посредством введения экзогенной нуклеиновой кислоты и регенерации растений из протопластов или незрелых зародышей растений хорошо известны в данной области техники (см., например, СА 2092588, AU 61781/94, AU 667939, патент США № 6100447, WO 97/048814, патент США № 5589617, патент США № 6541257, а другие способы изложены в WO 99/14314. Предпочтительно трансгенную пшеницу или ячмень получают посредством способов трансформации с использованием Agrobacterium tumefaciens. Векторы, несущие желаемую конструкцию нуклеиновой кислоты, можно вводить в клетки регенерируемой пшеницы - выращиваемых из тканей растений или эксплантов, или в подходящие растительные системы, такие как протопласты. Клетки регенерируемой пшеницы являются предпочтительно клетками из щитка незрелых зародышей, зрелых зародышей, происходящего из них каллю
- 21 031178 са или меристемы.
Для подтверждения присутствия трансгенов в трансгенных клетках и растениях можно выполнить амплификацию с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) или анализ с использованием блоттинга по Саузерну, используя способы, известные квалифицированным в данной области техники специалистам. Продукты экспрессии трансгенов можно выявить любым из множества способов в зависимости от природы продукта, и они включают Вестерн-блоттинг или ферментный анализ. Одним особенно пригодным способом количественного анализа экспрессии белков и обнаружения репликации в различных тканях растений является использование репортерного гена, такого как GUS. После получения трансгенных растений их можно выращивать для получения тканей или частей растений, имеющих желаемый фенотип. Можно собрать ткань растения или части растения и/или собрать семя. Семя может служить в качестве ресурса для выращивания дополнительных растений с тканями или частями, имеющими желаемые характеристики.
Отбор с помощью маркера.
Отбор с помощью маркера является общепризнанным способом отбора гетерозиготных растений, необходимым при возвратном скрещивании с рекуррентным родителем в классической селекционной программе. Популяция растений в каждом поколении беккроссов будет гетерозиготной по представляющему интерес гену, обычно присутствующему в соотношении 1:1 в популяции беккроссов, и молекулярный маркер можно использовать для проведения различий двух аллелей гена. Посредством экстракции ДНК, например, из молодых проростков, и проверки с использованием специфического маркера на интрогрессированный желаемый признак осуществляют ранний отбор растений для дальнейшего возвратного скрещивания при концентрировании энергии и ресурсов на меньшем числе растений. Для дополнительного ускорения выполнения программы возвратного скрещивания зародыши из незрелых семян (через 25 дней после цветения) можно удалить и выращивать на питательной среде в стерильных условиях, вместо того, чтобы дать возможность полного созревания семени. Этот способ, называемый зародышевым спасением, используемый в сочетании с экстракцией ДНК на стадии трех листьев и анализом по крайней мере одного гена или аллеля Lr34, который придает растению повышенную резистентность к патогенам, делает возможным быстрый отбор несущих желаемый признак растений, которые можно выращивать до полного развития в теплице или поле для последующего дополнительного возвратного скрещивания с рекуррентным родителем.
В способах по настоящему изобретению может быть использован любой молекулярнобиологический метод, известный в данной области техники. Такие методы включают, но не ограничиваются ими, использование амплификации нуклеиновых кислот, секвенирование нуклеиновых кислот, гибридизацию нуклеиновых кислот с подходящим образом меченными зондами, анализ одноцепочечного конформационного полиморфизма (SSCA), денатурирующий градиентный гель-электрофорез (DGGE), гетеродуплексный анализ (НЕТ), анализ химического расщепления (ССМ), каталитическое расщепление нуклеиновых кислот или их комбинации (см., например, Lemieux, 2000; Langridge et al., 2001). Настоящее изобретение также включает применение методов с использованием молекулярного маркера для выявления полиморфизмов, сцепленных с аллелями (например) гена Lr34, который придает повышенную резистентность к патогенам растений. Такие способы включают выявление или анализ полиморфизмов длин рестрикционных фрагментов (RFLP), RAPD, полиморфизмов длин амплифицированных фрагментов (AFLP) и полиморфизмов микросателлита (простого повтора последовательности, SSR). Прочно сцепленные маркеры можно без труда получить способами, хорошо известными в данной области техники, такими как анализ сегрегантов повышенной объемности, обзор которого приведен Langridge et al. (2001).
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является реакцией, в которой на основе полинуклеотидамишени создаются идентичные копии с использованием пары праймеров или совокупности праймеров, состоящей из прямого и обратного праймеров, и катализатора полимеризации, такого как ДНКполимераза, и, как правило, фермента термостабильной полимеразы. Способы ПЦР известны в данной области техники и сообщаются, например, в PCR (M.J. McPherson and S.G Moller (editors), BIOS Scientific Publishers Ltd, Oxford, (2000)). ПЦР можно выполнить на кДНК, полученной на основе подвергнутой обратной транскрипции мРНК, выделенной из клеток растений, экспрессирующих ген или аллель Lr34, который придает повышенную резистентность к патогенам растений. Однако, как правило, легче выполнить ПЦР на геномной ДНК, выделенной из растения.
Праймером является последовательность олигонуклеотида, которая способна к гибридизации специфичным в отношении последовательности образом с последовательностью-мишенью и удлинению во время ПЦР. Ампликоны, или продукты ПЦР, или фрагменты ПЦР, или продукты амплификации представляют собой продукты удлинения, которые включают праймер и вновь синтезированные копии последовательностей-мишеней. Системы множественных ПЦР содержат множество наборов праймеров, что приводит к одновременной продукции более одного ампликона. Праймеры могут полностью соответствовать последовательности-мишени или они могут содержать внутренние несовпадающие основания, которые могут привести к введению сайтов распознавания/расщепления рестрикционным ферментом или каталитической нуклеиновой кислотой в специфические последовательности-мишени. Праймеры могут также содержать дополнительные последовательности и/или содержать модифицированные
- 22 031178 или меченые нуклеотиды для облегчения сбора или обнаружения ампликонов. Повторяющиеся циклы термической денатурации ДНК, отжига праймеров к комплементарным им последовательностям и удлинения подвергнутых отжигу праймеров с помощью полимеразы приводят к экспоненциальной амплификации последовательности-мишени. Термины мишень, или последовательность-мишень, или матрица относятся к последовательностям нуклеиновых кислот, подвергаемым амплификации.
Способы прямого секвенирования нуклеотидных последовательностей хорошо известны квалифицированным в данной области техники специалистам и их можно найти, например, в публикации Ausubel et al. (выше) и Sambrook et al. (выше). Секвенирование можно выполнить любым подходящим способом, например дидезоксисеквенированием, химическим секвенированием или их вариантами. Прямое секвенирование обладает преимуществом определения вариации в любой паре оснований конкретной последовательности.
TILLING.
Растения по настоящему изобретению можно получить, используя способ, известный как TILLING (Targeting Induced Local Lesions IN Genomes - выявление индуцированных локальных повреждений в геномах). На первой стадии в популяции растений индуцируют вводимые мутации, такие как новые изменения единственной пары оснований, посредством обработки семян (или пыльцы) химическим мутагеном, а затем развития растений до поколения, у которого мутации будут стабильно наследоваться. ДНК экстрагируют, а семена сохраняют от всех членов популяции для создания ресурса, повторный доступ к которому может быть в течение продолжительного периода.
В случае анализа с использованием TILLING конструируют ПЦР-праймеры для специфической амплификации представляющего интерес одного гена-мишени. Специфичность особенно важна, если мишенью является член семейства генов или часть полиплоидного генома. Еще можно использовать меченные красителем праймеры для амплификации продуктов ПЦР на основе объединенной ДНК от множества индивидуумов. Эти продукты ПЦР подвергают денатурации и повторному отжигу для того, чтобы обеспечить возможность образования несовпадающих пар оснований. Ошибочные спаривания, или гетеродуплексы, представляют как природные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) (т.е. несколько растений из популяции, по-видимому, несут один и тот же полиморфизм), так и индуцированные SNP (т.е. лишь редкие отдельные растения, по-видимому, демонстрируют мутацию). После образования гетеродуплекса использование эндонуклеазы, такой как Cel I, распознающей и расщепляющей ошибочно спаренную ДНК, является ключом к обнаружению новых SNP в подвергнутой TILLING популяции.
Используя этот подход, можно скринировать многие тысячи растений для идентификации любого индивидуума с изменением одного основания, а также небольшими инсерциями или делециями (1-30 п.о.) в любом гене или конкретной области генома. Размер исследуемых геномных фрагментов может находиться в диапазоне где-нибудь от 0,3 до 1,6 т.п.о. При использовании 8-кратного объединения, фрагментов размеров 1,4 т.п.о. (без учета концов фрагментов, на которых выявление однонуклеотидного полиморфизма является проблематичным вследствие шума) и 96 дорожек в каждом исследовании, это сочетание делает возможным скринирование вплоть до миллиона пар оснований геномной ДНК в одном анализе, что делает TILLING способом с высокой пропускной способностью.
TILLING дополнительно описан у Slade и Knauf (2005) и Henikoff et al. (2004).
В дополнение к возможности эффективного выявления мутаций технология TILLING с высокой пропускной способностью является идеальной для обнаружения природных полиморфизмов.
Следовательно, детальное исследование неизвестной гомологичной ДНК по образованию гетеродуплекса с известной последовательностью выявляет число и расположение полиморфных сайтов. Идентифицируют как изменения нуклеотидов, так и небольшие инсерции и делеции, включая, по крайней мере, некоторые полиморфизмы числа повторов. Этот способ был назван Ecotilling (Comai et al., 2004).
Каждый SNP регистрируют в соответствии с его приблизительным расположением внутри небольшого числа нуклеотидов. Таким образом, каждый гаплотип можно заархивировать на основе его изменчивости. Данные о последовательностях можно получить с помощью относительно небольшого пошагового усилия, используя аликвоты той же самой амплифицированной ДНК, что и ДНК, которую используют для анализа расщепления ошибочных спариваний. Прямой или обратный секвенирующий праймер для единственной реакции выбирают в соответствии с его близостью к полиморфизму. Программное обеспечение Sequencher выполняет множественное совмещение и обнаруживает изменение основания, которое в каждом случае подтверждает полоса в геле.
Ecotilling можно выполнить легче, чем полное секвенирование, способ, в настоящее время используемый для обнаружения наибольшей части SNP. Можно скринировать пластинки, содержащие ранжированную экотипическую ДНК, а не пулы ДНК из подвергнутых мутагенезу растений. Поскольку выявление проводят на гелях с разрешением почти на уровне пары оснований, а фоновые картины являются однородными по всем дорожкам, можно сопоставить полосы одинакового размера, выявляя и генотипируя, таким образом, SNP в одну стадию. В этом способе простым и эффективным является окончательное секвенирование SNP, сделанное еще в большей степени таковым тем обстоятельством, что аликвоты тех же самых продуктов ПЦР, которые использовались для скринирования, можно подвергнуть ДНКсеквенированию.
- 23 031178
Антитела.
Используемый в данном изобретении термин антитело включает поликлональные антитела, моноклональные антитела, биспецифические антитела, диатела, триатела, антитела-гетероконъюгаты, химерные антитела, включающие интактные молекулы, а также их фрагменты, такие как Fab, F(ab')2 и Fv, которые способны к связыванию антигенной детерминанты, и другие антителоподобные молекулы.
Термин специфически связывается относится к способности антитела к связыванию по крайней мере с одним полипептидом по настоящему изобретению, но не в значительной степени с известными белками в исследуемом образце/организме.
Используемый в описании термин эпитоп относится к области полипептида по настоящему изобретению, которая связывается антителом. Эпитоп можно ввести животному для выработки антител против эпитопа, однако предпочтительно, когда антитела по настоящему изобретению специфически связываются с областью эпитопа в рамках полного полипептида.
Если требуются поликлональные антитела, то выбранное млекопитающее (например, мышь, кролика, козу, лошадь и т.д.) иммунизируют иммуногенным полипептидом по настоящему изобретению. Сыворотку от иммунизированного животного собирают и обрабатывают в соответствии с известными процедурами. Если содержащая поликлональные антитела сыворотка содержит антитела к другим антигенам, то поликлональные антитела можно очистить методом иммуноаффинной хроматографии. Методы получения и обработки поликлональной антисыворотки известны в данной области техники. Для создания таких антител настоящим изобретением также обеспечиваются полипептиды по настоящему изобретению или их фрагменты, гаптенизированные другим полипептидом, для применения в качестве иммуногенов у животных.
Моноклональные антитела, направленные против полипептидов по настоящему изобретению, могут также быть легко получены квалифицированным в данной области специалистом. Общая методология получения моноклональных антител с помощью гибридом хорошо известна. Иммортализованные антителопродуцирующие линии клеток можно создать путем слияния клеток, а также с помощью других методов, таких как непосредственная трансформация В-лимфоцитов онкогенной ДНК или трансфекция вирусом Эпштейн-Барра. Полученные панели моноклональных антител можно скринировать на различные свойства; т. е. на изотип и сродство к эпитопу.
Альтернативный метод включает скрининг библиотек фагового дисплея, в которых, например, фаги экспрессируют на поверхности своих оболочек scFv-фрагменты с большим множеством гипервариабельных участков (CDR). Этот метод хорошо известен в данной области техники.
В данной области техники известны другие методы продуцирования антител по настоящему изобретению.
Антитела по настоящему изобретению можно связать с твердой подложкой и/или упаковать внутрь наборов в подходящем контейнере вместе с подходящими реагентами, контролями, инструкциями и т. п.
В варианте осуществления антитела по настоящему изобретению являются различимо мечеными. Приводимые в качестве примеров различимые метки, которые позволяют напрямую определить связывание антител, включают радиоактивные метки, флуорофоры, красители, магнитные шарики, хемилюминесцентные вещества, коллоидные частицы и т. п. Примеры меток, которые позволяют напрямую определить связывание антител, включают ферменты, субстраты для которых могут предусматривать окрашенный или флуоресцентный продукт. Дополнительные приводимые в качестве примеров различимые метки включают ковалентно связанные ферменты, способные обеспечить различимый сигнал - продукт после добавления подходящего субстрата. Примеры ферментов, подходящих для использования в конъюгатах, включают пероксидазу хрена, щелочную фосфатазу, малатдегидрогеназу и т.п. Если конъюгаты антитело-фермент не являются коммерчески доступными, то их легко получить с использованием методик, известных квалифицированным в данной области специалистам. Кроме того, приводимые в качестве примеров различимые метки включают биотин, который связывается с высоким сродством с авидином или стрептавидином; флуорохромы (например, фикобилипротеины, фикоэритрин и аллофикоцианины; флуоресцеин и техасский красный), которые могут быть использованы в клеточном сортере с активацией флуоресценции; гаптены и т. п. Предпочтительно различимая метка, например биотин, дает возможность прямого измерения в люминометре для планшетов. Такие меченые антитела можно использовать в методах, известных в данной области, для выявления полипептидов по настоящему изобретению.
Примеры
Пример 1. Материалы и методы.
Микроскопический анализ инфицирования всходов ржавчинным грибом.
Растения выращивали в камере искусственного климата, поддерживаемого при 4-8°C, в 12-часовом режиме света и темноты. Всходы заражали на стадии двух листьев, используя культуру 467 возбудителя листовой ржавчины, переносили во влажную камеру (с температурным диапазоном, составляющим 1620°C) на 24 ч и возвращали в камеру искусственного климата, поддерживаемого при 4-8°C. Для визуализации под микроскопом внутренних инфицированных структур ткань первого листа подвергали автоклавированию в 1М KOH, промывали в 50 мМ KPO4 и окрашивали 50 мМ раствором KPO4 (pH 7,8), содержащим 20 мкг/мл агглютинина зародыша пшеницы (WGA), конъюгированного с флуорофором alexa 488
- 24 031178 (Invitrogen, USA). Всю окрашенную WGA-alexa ткань исследовали при возбуждении синим квантом света.
Выделение РНК для полуколичественной ПЦР и Нозерн-блоттинга.
Общую РНК экстрагировали из листьев, используя раствор тризола (38% фенола, 0,8М тиоцианат гуанидина, 0,4М тиоцианат аммония, 0,1М ацетат натрия, pH 5, и 10% глицерина). Первую цепь кДНК для ОТ-ПЦР синтезировали, используя обратную транскриптазу Superscript II (Invitrogen). Специфический фрагмент в случае полуколичественной ОТ-ПЦР 5'-конца PDR амплифицировали, используя праймеры
Lr34_RT_fl: 5'catcaagatttcaccgcctgtgc-3' (SEQ ID N0:12) и Lr34_RT_r1: 5'gaagcctagcaacttcacgaggc-3' (SEQ ID N0:13) при температуре отжига, составляющей 70°C.
Для гибридизационного анализа с использованием Нозерн-блоттинга 15 мкг общей РНК в каждом образце блоттировали на мембрану (Hybond-XL, Amersham Biosiences). Зонд HvS40 (Spielmeyer et al., 2002) помечали 32P при 65°C, используя набор NEBlot® (New England BioLabs). Мембраны промывали раствором, содержащим 0,5xSSC, 0,1% SDS, при 65°C и экспонировали на гиперчувствительные рентгеновские пленки (BioMax MS film, Kodak).
Быстрая амплификация концов кДНК (RACE).
Для точного определения начала кДНК использовали подход с 5' RACE. Поли-А+ РНК очищали из 300 мкг общей РНК, используя мининабор для мРНК Oligotex® (Qiagen). Обратную транскрипцию проводили, используя набор для амплификации кДНК в случае RACE SMART™ (Clonetech Laboratories), причем адаптер был лигирован к 5'-концу кДНК. Амплификацию 5'-конца проводили, используя специфичный для адаптера праймер и специфичный для гена праймер ABC_5RACE_r2: 5'-gcggggcccacaatcatctcggc-3' (SEQ ID N0:14).
Пример 2. Генетическое картирование Lr34.
Растительные материалы.
Три популяции беккроссов были получены и использованы для генетического картирования Lr34. В табл. 2 суммированы данные, касающиеся родительских форм растений для возвратного скрещивания, оцененных фенотипов, размера популяций и маркеров, каптированных в случае каждой популяции.
Таблица 2 Три популяции беккроссов, которые были использованы для генетического картирования Lr34 с высокой разрешающей способностью
+1.г14 родитель -Lr34 родитель +Ll‘34 линия беккроссов происхождение фенотипическая оценка число растений картированные маркеры
Forno Arina Arina Lr34 (Arina *3/Fomo) Швейцарский озимый сорт пшеницы Некроз верхушки листа, инфицирование возбудителем листовой ржавчины 1728 ВЕ493812, SWSNP1, SWSNP2, SWSNP3, SWDEL1, SWDEL2, SWDEL3, SWM10, csLVMS
PI58548 Thatcher RL6058 (Thatcher*6/PI58548) Китайский местный сорт Листовая, желтая и стеблевая ржавчина; настоящая мучнистая роса 1152 Gwml220,BJ280740, csLVD13,csLVD2, csLVMS, BF473324, csLV34
Parula Avocet Avocet Lr34 (Avocet*5/Parula) CIMMYT Листовая и желтая ржавчина; некроз верхушки листа 1152 Gwml220, csLVDB, csLVD2, csLVEl 7, csLVMS, csLV34
Популяция ArinaxForno с точным картированием была создана посредством скрещивания в высокой степени резистентного швейцарского озимого сорта пшеницы Forno с чувствительным швейцарским озимым сортом пшеницы Arina. Последующее возвратное скрещивание с Arina и несколько поколений, полученных путем самоопыления, дали в результате 103 растения, которые были F4 при использовании двух возвратных скрещиваний (BC2F4), содержащих Lr34 и в среднем 12,5% генома Forno в остальном генетическом фоне Arina. Эти растения анализировали на наличие хромосомного сегмента Lr34 из Forno, используя два фланкирующих RFLP маркера BE493812 и BF473324. Одно из этих растений, содержащее область Lr34, снова скрещивали с Arina, и потомство самоопылялось с получением 1728 растений BC3F2, имеющих в среднем 6,25% генома Forno. Рекомбинанты отбирали, используя два фланкирующих маркера BE493812 и SWM10. Фенотипирование популяции ArinaxForno проводили в Agroscope Reckenholz, Zurich, Швейцария, на протяжении 2006 (BC3F3) и 2007 (BC3F4). Заражение сериями инфекций, содержащими смесь чувствительных сортов, осуществляли с использованием урединиоспор швейцарских изолятов возбудителей листовой ржавчины с № 90035, 91047, 93003, 93012, 94015, 95001, 95012, 95028, 95037, 95039, 95219, 95251, 96002, 96004, 96209 и 96257. Оценку болезни проводили в двух повторах.
Ряд картирований ThatcherxRL6058 (Thatcher Lr34) и AvocetxAvocet Lr34 с высокой разрешающей
- 25 031178 способностью, оценка болезни в Австралии и в CIMMYT, Мексика, были описаны Lagudah и др. (2006) и Spielmeyer и др. (2002). Другие генетические линии, использованные в этой работе, были почти изогенными линиями Thatcher, Thatcher Lr34 (=RL6058, Thatcherx6/PI5848), Arina, Arina Lr34 (Arinax3/Forno).
Разработка маркеров для генетического картирования.
Были созданы новые молекулярные маркеры для картирования посредством использования информации о синтении у риса, модельного дерна Brachypodium sylvaticum и диплоидного источника D-генома Aegilops tauschii, как описано Bossolini и др. (2006).
Для получения физической информации о целевой зоне для Lr34 скринировали подвергнутую частичному фингерпринтингу библиотеку бактериальных искусственных хромосом (ВАС) Aegilops tauschii (J. Dvorak, UC Davis), используя EST (маркерные экспрессируемые последовательности) пшеницы, относящиеся к генам из синтенного участка риса и Brachypodium sylvaticum. Тринадцать клонов ВАС из трех различных контигов (HI 057C6/HD036L7/HDl02К14/Н1056G21/HDO62G18/Н1031F14/HI135В2/RI
004115/RI04214/HI148С23/ВВО45В13/НВО67N4/ВВО62G18) были секвенированы посредством низкопроходного секвенирования, используя секвенатор ABI® 3730 (Applied Biosystems). Последовательности составляли, используя PHRAP, и исследовали на простые повторы последовательностей (SSR). SSR амплифицировали с помощью конструируемых праймеров во фланкирующих областях (табл. 3).
Продукты ПЦР анализировали, используя ДНК-секвенатор 4200 LiCOR®. Полиморфные SSR были идентифицированы и обозначены префиксами SWM или cs. ДНК-маркирующие сайты были созданы посредством конструирования праймеров на низкокопийных последовательностях. Специфичные для локуса зонды были секвенированы и исследованы на однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и инсерции/делеции (InDel). Маркеры на основе полиморфных SNP и InDel были обозначены как Swiss Wheat SNP (SWSNP) (SNP, относящийся к швейцарской пшенице) и Swiss Wheat Deletion (SWDEL) (делеция, относящаяся к швейцарской пшенице) соответственно. В табл. 3 суммирована информация, касающаяся последовательностей праймеров для выявления маркеров на основе ПЦР, картированных в популяциях. Дополнительные низкокопийные зонды, csLVD2, csLVD13, csLVE17, для анализа RFLP были выделены из общих плазмидных библиотек из контигов ВАС Ae tauschii посредством скрининга общей геномной ДНК из Ae tauschii. В качестве возможных низкокопийных зондов были выбраны рекомбинантные плазмиды, в случае, если не были выявлены ДНК-гибридизационные сигналы после экспонирования в течение ночи.
Используя эти генетические маркеры и популяции для картирования Lr34, картирование с высокой разрешающей способностью выявило целевую зону, составляющую 0,15 сМ (сантиморганид), для Lr34, фланкированную генетическими маркерами XSWSNP3 и XcsLVE17 (фиг. 1). Была установлена косегрегация нескольких маркеров (фиг. 1) с Lr34.
Пример 3. Мутагенез и выделение мутантов Lr34.
Семена изолинии Lr34, Lalbahadur Lr34, облучали, используя источник 60Со в дозе, составляющей 20 килорад, и последующие поколения М1-М5 оценивали в CIMMYT, Мексика, и в Австралии, как опубликовано у Spielmeyer et al. (2002). В гамма-облученной популяции было идентифицировано восемь мутантов. Их анализировали, используя некоторые из новых генетических маркеров (пример 2). Из восьми мутантов шесть были интерстициальными делециями, охватывающими локус Lr34/Yr18/Pm38/Ltn1, тогда как два мутанта, обозначенные m19 и m21, не продемонстрировали утрату маркеров в упомянутом выше генетическом локусе. Поэтому мутанты m19 и m21 были подвергнуты дополнительному анализу с использованием вновь идентифицированных маркеров и косегрегирующихся генов.
В случае применения азида натрия были созданы мутанты с использованием семени от одного колоса растения RL6058, выращенного в оранжерее для размножения чистых линий семенных растений для мутагенеза. Семена предварительно замачивали в течение 12 ч при 4°C до обработки зерен в насыщенном кислородом растворе 7 мМ азида натрия, при pH 3,0, в течение 2 ч. Зерна промывали и высаживали в поле. Потомков М2 высаживали в виде рядов отдельных колосьев и оценивали на инфицирование возбудителем желтой, листовой и стеблевой ржавчины в поле в присутствии патогенов.
- 26 031178
Таблица 3
Последовательности праймеров из молекулярных маркеров, используемых в этом исследовании
название маркера прямой праймер обратный праймер тип маркера Tm [°C]
SWSNP1 5'-catctttcgtatacatga gaaac-3' (SEQ ID N0:15) 5'-gtgtcgattcatgtgag atgc-3' (SEQ ID N0:16) SNP c->t 60
SWSNP2 5'-cattatgttagcagct tagcg-3' (SEQ ID N0:17) 5'-ccaaccatcattttggag catg-3' (SEQ ID N0:18) SNP c->t 60
SWSNP3 5'-gta gat cgt gtc gtg ttc aac-3' (SEQ ID N0:19) 5'-ctg eta ate eta agt aac get c-3' (SEQ ID N0:20) SNP t->a 65
SWDEL1 5'-cgt gag caa gac atg ggc g-3' (SEQ ID N0:21) 5'-gct аса get etg aaa eta cac-3' (SEQ ID N0:22) 6 bp InDei 66.2
SWDEL2 5'gat ttg cac gtt gat gaa acc ag-3' (SEQ ID N0:23) 5'-cag aat gaa gtt taa cct ggc ctg-3’ (SEQ ID N0:24) 1 bp InDei 60
SWDEL3 5'- ggc tgg eta eta ega ega cg-3' (SEQ ID N0:25) 5’-atg gtc ttt ttt cct tea gcc-3' (SEQ ID N0:26) 180 bp InDei 65
SWM10 5'-gcc tac ttt gac ggc ata tgg-3' (SEQ ID N0:27) 5'-cca tet tga cat act ttg gcc ttc c-3' (SEQ ID N0:28) SSR (ca)25 60
csLVMS 5’-etc cct ccc gtg agt ata ttc-3’ (SEQ ID N0:29) 5’-ate aaa ate cca ttg cct gac-3’ (SEQ ID N0:30) SSR (at)6tt(at)6 62
csLV34 5'-gtt ggt taa gac tgg tga tgg-3' (SEQ ID N0:31) 5’-tgc ttg eta ttg etg aat agt-3' (SEQ ID N0:32) STS 60
название маркера прямой праймер обратный праймер тип маркера Tm [°C]
SWSNPl_f 5'-cat ett teg tat аса tga gaa ac-3' (SEQ ID N0:33) 5'-gtg teg att cat gtg aga tgc-3' (SEQ ID N0:34) SNP c->t 60
SWSNP2_f 5'-cat tat gtt age age tta gcg-3' (SEQ ID N0:35) 5'-cca acc ate att ttg gag cat g-3' (SEQ ID N0:36) SNP c->t 60
SWSNP3_f 5'-gta gat cgt gtc gtg ttc aac-3' (SEQ ID N0:37) 5'-ctg eta ate eta agt aac get c-3' (SEQ ID N0:38) SNP t->a 65
SWDELlf 5'-cgt gag caa gac atg ggc g-3' (SEQ ID N0:39) 5'-gct аса get etg aaa eta cac-3' (SEQ ID N0:40) 6 bp InDei 66.2
SWDEL2_f 5'gat ttg cac gtt gat gaa acc ag-3' (SEQ ID N0:41) 5'-cag aat gaa gtt taa cct ggc ctg-3’ (SEQ ID N0:42) 1 bp InDei 60
SWDEL3_f 5'- ggc tgg eta eta ega ega cg-3' (SEQ ID N0:43) 5'-atg gtc ttt ttt cct tea gcc-3' (SEQ ID N0:44) 180 bp InDei 65
SWMIOf 5'-gcc tac ttt gac ggc ata tgg-3' (SEQ ID N0:45) 5'-cca tet tga cat act ttg gcc ttc c-3' (SEQ ID N0:46) SSR (ca)25 60
Было выделено шесть чувствительных мутантов, и для них определены степени инфицирования, составляющие от 70 до 90MS, в случае возбудителя желтой ржавчины злаков, от 50 до 80MS - в случае возбудителя листовой ржавчины и 50MS - в случае возбудителя стеблевой ржавчины пшеницы в полевых условиях. Два мутанта 4С (глицин на глутаминовую кислоту в положении 1030 аминокислоты SEQ ID NO: 1) и 2G (глицин на аспарагиновую кислоту в положении 889 аминокислоты SEQ ID NO: 1) были
- 27 031178 результатом транзиций одиночных нуклеотидов с изменением одной аминокислоты в пределах второго предсказанного нуклеотидсвязывающего домена (фиг. 3 и 5). Эти мутанты продемонстрировали лишь частичную утрату резистентности к возбудителю листовой ржавчины при микроскопическом исследовании (пример 1). Мутант 2В включал транзицию одного нуклеотида в экзоне 11 (фиг. 3), которая имела следствием ранний стоп-кодон. Три мутанта 3Е, 4Е и 2F были результатом транзиций одиночных нуклеотидов на границах сплайсинга, имеющих следствием транскрипты без сплайсинга. Сохранение интронов в мутантах 3Е и 4Е вводило ранние стоп-кодоны вблизи 5'-конца, которые в соответствии с предсказаниями приводят к нефункциональному белку. На микроскопическом уровне мутанты 3Е и 4Е были в полной мере чувствительны к возбудителю листовой ржавчины и неотличимы от чувствительной почти изогенной линии Thatcher. Транскрипт мутанта 2F утратил второй последний экзон (фиг. 3), что в соответствии с предсказаниями приводит к делеции 85 аминокислот из второго трансмембранного домена. Мутант 2F был более чувствительным к возбудителю листовой ржавчины, чем чувствительный контрольный сорт Thatcher во время раннего инфекционного процесса.
Отсутствие резистентности, являющейся следствием утраты функционального белка Lr34, наблюдаемое при исследовании мутаций, согласуется с анализом гена Lr34 из сорта Jagger. Jagger имеет Lr34сцепленные аллели маркера csLV34, но является чувствительным к возбудителям листовой ржавчины и желтой ржавчины злаков. С помощью секвенирования гена Lr34 в Jagger была идентифицирована точковая мутация G/T, которая имела следствием преждевременный стоп-кодон. Следовательно, в предсказываемом белке сорта Jagger отсутствуют 185 аминокислот С-конца, и эта аллель, наиболее вероятно, не является функциональной. Эта точковая мутация, вероятно, возникла в резистентном сорте, который нес аллель +Lr34.
Пример 4. Физическая информация о целевой зоне и идентификация гена Lr34.
Две библиотеки ВАС +Lr34 (резистентного) сорта Chinese Spring и -Lr34 (чувствительного) сорта Renan (INRA, Toulouse, Франция) скринировали, используя зонды для ПЦР, охватывающие целевую зону между двумя фланкирующими маркерами SWSNP3 и csLVE17. Простирающаяся на расстоянии 420 т.п.о. физическая зона, содержащая оба фланкирующих маркера, была полностью секвенирована в резистентном гексаплоидном сорте пшеницы Chinese Spring. Для этого четыре клона ВАС Chinese Spring, а именно 345С22, 93N17, 1964С18 и 413N16, и клон 656106 ВАС Renan были отобраны и полностью секвенированы в Genome Sequencing Center, St.Louis, МО, США.
Анализ последовательностей выявил присутствие богатого генами участка, содержащего десять открытых рамок считывания (фиг. 2), кодирующих белки, гомологичные двум гликозилтрансферазам, двум цистеинпротеиназам, двум киназам рецепторов лектинов, двум белкам - цитохромам Р450, переносчику гексоз и транспортеру АТФ-связывающих кассет (АВС-транспортеру). Ни один из этих генов не присутствовал в синтенной области в Brachypodium sylvaticum, и установлено, что лишь переносчик гексоз является консервативным в гомологичной области на хромосоме 6 риса (ген риса Os06g0141000). Существенно и неожиданно, что ни один из генов, по-видимому, не был геном типа LRR-NBS класса, обычно ассоциируемого с резистентностью к патогенам у растений. Соответственно ни одна из кодирующих областей не была очевидным кандидатом на кодирование Lr34.
Для определения того, соответствует ли один из этих генов-кандидатов Lr34, были секвенированы специфичные для локуса амплифицированнные с помощью ПЦР области, соответствующие десяти генам-кандидатам в каждом из восьми мутантов Lr34. Гены-кандидаты были амплифицированы с помощью разработки специфичных для локуса ПЦР-зондов на основе резистентных и чувствительных сортов, а также на основе восьми мутантов Lr34, и секвенированы. Мутантами были индуцированные азидом шесть мутантов в генетическом фоне Thatcher Lr34 и два индуцированных гамма-облучением мутанта в фоне Lalbahadur Lr34 (пример 3).
Все мутантные линии продемонстрировали изменение последовательности в открытой рамке считывания, кодирующей АВС-транспортер (фиг. 3). Все три индуцированных азидом мутанта 2F, 3Е и 4Е имели транзицию G на А на границе интрон - экзон, приводящей к мутациям в сайте сплайсинга (фиг. 7, демонстрирующая оставшиеся интроны). Транзиции в двух индуцированных азидом мутантах 2G и 4С приводили к заменам аминокислот, и линия 2В несла преждевременный стоп-кодон в экзоне 11. Каждый из двух индуцированных гамма-облучением мутантов m19 и m21 продемонстрировал делецию размером 1 п.о. в экзоне 10 и 23 соответственно, ведущую к сдвигам рамки и преждевременным стоп-кодонам (фиг. 3).
Для исключения возможности дополнительных сайтов мутаций в других косегрегирующихся генах были секвенированы ДНК-фрагменты, охватывающие 12,7 т.п.о., других девяти генов-кандидатов и межгенные области в четырех индуцированных азидом мутантах 2В, 3Е, 4С и 4Е, причем какие-либо дополнительные изменения в последовательностях не обнаружены. Аналогично, с помощью секвенирования установлено, что созданные в результате гамма-облучения мутанты m19 и m21 не несут каких-либо изменений в последовательностях кодирующих областей остальных девяти генов-кандидатов. Следовательно, возможность того, что восемь мутаций, обнаруженных в ABC-транспортере, обусловлены очень высокой частотой мутаций в этих линиях, можно было исключить, и авторы настоящего изобретения сделали вывод, что АВС-транспортер является ответственным за придание стойкой резистентности на
- 28 031178 основе Lr34 к болезням.
Была установлена косегрегация Lr34 с частичной резистентностью взрослых растений к желтой ржавчине злаков (Yr18), настоящей мучнистой росе (Pm38), а также некрозу верхушки листа (Ltn1). Все мутанты в виде взрослых растений были более чувствительными к желтой ржавчине злаков и настоящей мучнистой росе, что приписывалось утрате Yr18 и Pm38, а также демонстрировали полную или частичную утрату Ltn1. Эти наблюдения представляли важное открытие, заключающееся в том, что восемь независимых мутаций в пределах единственного гена ABC-транспортера, кодирующего резистентность на основе Lr34, также являются причиной Yr18/Pm38/Ltn1, и показали, что один ген придает резистентность к множеству патогенов.
Кодирующая белок последовательность Lr34 охватывала 11,7 т.п.о. в геноме пшеницы. Секвенирование всей кДНК и сравнение нуклеотидной последовательности с геномной последовательностью (SEQ ID NO: 3) выявили, что Lr34 имеет 24 экзона. Ген содержал 23 интрона, включая большой интрон размером 2,5 т.п.о. между экзонами 4 и 5 (фиг. 3). Белок, кодируемый Lr34 из резистентного сорта Chinese Spring, содержал 1401 аминокислоту (SEQ ID NO: 1), тогда как белок из чувствительного сорта Renan содержал 1402 аминокислоты (SEQ ID NO: 4, фиг. 4). Сравнение аминокислотной последовательности с другими ABC-транспортерами показало, что белки Lr34 относятся к подсемейству ABC-транспортеров белков PDR (плейотропной лекарственной резистентности). Белки PDR имеют общую основную структуру, содержащую два различных домена: цитозольный нуклеотидсвязывающий домен (NBD), который содержит консервативные мотивы Уокера типа А и Уокера типа В, вовлеченные в связывание АТФ и гидролиз, и гидрофобный трансмембранный домен (TMD), вовлеченный в перемещение субстрата. Оба домена присутствуют в двух повторах, поэтому структуру PDR обозначают [NBD-TMD]2 (фиг. 5).
Семейство PDR обнаружено лишь у грибов и растений. Пятнадцать PDR-подобных генов были идентифицированы в геноме Arabidopsis и 23 члена были описаны для риса (Crouzet et al., 2006). Известно, что PDR придают резистентность к различным лекарственным средствам, но мало известно о субстратной специфичности этого класса белков (Rogers et al., 2001). Ранее приводились данные о том, что PEN3/PDR8, PDR из Arabidopsis вносит вклад в резистентность к патогенам у растений, не пораженных микроорганизмами (Stein et al., 2006). Ближайшим гомологом Lr34 в рисе является PDR23, демонстрирующий 88% идентичность на аминокислотном уровне (табл. 4). У Arabidopsis Lr34 демонстрирует наибольшую гомологию с двумя транспортерами PDR5 и PDR9, с 56% идентичностью. Совмещение этих аминокислотных последовательностей представлено на фиг. 6.
Таблица 4
Процент идентичности аминокислот Lr34 пшеницы с гомологами Lr34 из других видов растений
Вид № доступа в GenBank % идентичности
Рис EAZ20654 78
EAY83289 76
CAD59575 55
Табак САН39853 (NtPDR3) 56
Виноград CAN65735 56
Arabidopsis NP 181265 (PDR5) 56
NP 190916 (PDR9) 55
DAA00881 (PDR13) 54
DAA00869 (PDR2) 52
NP 176196 (PDR8/PEN3) 50
Авторы настоящего изобретения затем определили различия в последовательности между аллелями Lr34 в сортах с резистентностью на основе Lr34 или без такой резистентности. Сравнение геномных последовательностей PDR в +Lr34 сорта Chinese Spring и в -Lr34 французского озимого сорта пшеницы Renan выявило, что ген присутствует в обоих сортах пшеницы. Существовало только три полиморфизма в кодирующих последовательностях между этими двумя сортами (фиг. 3). Один SNP локализован в большом интроне 4. Два других изменения в последовательности были локализованы в экзонах 11 и 12. Делеция трех пар оснований TTC, обнаруженная в экзоне 11 в Chinese Spring, приводила к делеции остатка фенилаланина, тогда как второй SNP в экзоне 12 заменял тирозин на гистидин в резистентном сорте. Оба различия в последовательности, локализованные в экзонах, оказывают влияние на первый трансмембранный домен, соединяющий два нуклеотидсвязывающих домена, и они могут изменять структуру и специфичность связывания транспортера (фиг. 4). Сравнение последовательностей размером 2 т. п.о. областей предполагаемых промоторов не выявило каких-либо различий межу аллелями резистентного и чувствительного сортов.
Для выяснения, какое из этих трех различий в последовательности было необходимо для определе
- 29 031178 ния резистентности, было определено диагностическое значение на совокупности из +/-Lr34 генотипов, поставляемых из различных Lr34 селекционных линий (табл. 5). Все +Lr34 линии продемонстрировали такой же гаплотип, как и Chinese Spring, а гаплотипы всех -Lr34 линий были идентичны гаплотипу Renan. Следовательно, все три описанные различия в последовательности могут быть важны для определения резистентности, придаваемой Lr34, хотя нет данных, что SNP в интроне 4 оказывает влияние на эффективность сплайсинга любого из аллелей. Учитывая, что один и тот же гаплотип был установлен в гене PDR-ABC-транспортера Lr34 в случае яровых пшениц из Южно/Североамериканских селекционных программ, озимых пшениц из Европы и азиатских Lr34 генотипов (табл. 5), авторы настоящего изобретения делают вывод, что единственный случай, по-видимому, является ответственным за возникновение Lr34 в местном сорте пшеницы. Доказательство связи американских и европейских пшениц, содержащих Lr34, прослеживается в основополагающих родственных сортах, Mentana и Ardito, созданных в начале прошлого столетия (Kolmer et al., 2008).
При оценке диагностического потенциала SNP, локализованного в интроне 4, был идентифицирован третий аллель. Озимые сорта пшеницы Zinal, Allalin и Galaxie, а также сорта пшеницы спельты (Triticum spelta) Ostro и Rouquin продемонстрировали +Lr34 гаплотип в интроне 4, но имели -Lr34 гаплотип для двух маркеров в экзонах 11 и 12. Следовательно, эти линии образуют третий гаплотип. Интересно, что реципрокный аллель (T, в случае SNP в интроне 4 и +Lr34 в случае обоих экзонных маркеров) никогда не наблюдался. Этот факт говорит о том, что этот гаплотип возник благодаря мутации, а не рекомбинации, и, вероятно, представляет собой источник функционального +Lr34 гаплотипа.
Таблица 5
Полиморфизмы в аллелях Lr34 пшеничных генотипо в
Генотип Происхождение +/Lr34 А/Т SNP TTC/DEL C/T SNP
Chinese Spring Китай + А DEL c
RL6058* Китай + А DEL c
Fukuho Япония + А DEL c
Mentana Италия + DEL c
Frontana Бразилия + А DEL c
Frontierra Бразилия - Т TTC T
Ardito Италия + А DEL c
JupatecoR CIMMYT + А DEL c
JupatecoS CIMMYT - Т TTC T
Glenlea Канада + А DEL c
Thatcher Канада - Т TTC T
Anza США + А DEL c
Chris США + А DEL c
Condor Австралия + А DEL c
Penjamo 62 CIMMYT +
Inia66 CIMMYT -
LalbahadurLr34 CIMMYT + А DEL c
Lalbahadur Индия - Т TTC T
Fomo Швейцария +
Arina Швейцария -
Pegaso Италия + А DEL c
Bezostaja Россия + А DEL c
Kavkaz Россия + А DEL c
Roazon Франция
Capelle Desprez Великобритания - Т TTC T
Maris Huntsman Великобритания Т TTC T
Renan Франция Т TTC T
Synthetic taus Т TTC T
AL8/78 taus Армения Т TTC T
AUS 18913 taus Иран Т TTC T
Пример 5. Экспрессия Lr34.
Lr34 является образцом резистентности у взрослых растений, которая является неэффективной на стадии всходов в нормальных полевых условиях. Для определения того, связано ли это с более низкой экспрессией Lr34 на стадии всходов, использовали полуколичественную ОТ-ПЦР для измерения уровней экспрессии на различных стадиях развития растения, используя почти изогенные линии Thatcher и Thatcher Lr34. PDR экспрессировался на очень низких уровнях у всходов возрастом 14 дней, выращенных при 20°C, в то время как уровень экспрессии был значительно выше в кроющих листьях взрослых растений спустя 53 и 63 дня (фиг. 7). Не было существенного различия в экспрессии между резистентными и чувствительными растениями, что согласовалось с обнаружением отсутствия различий в после
- 30 031178 довательностях промоторных областей резистентного и чувствительного аллелей. Интересно, что по наблюдениям у взрослых растений спустя 63 дня накапливался несплайсированный продукт. Также измененный транскрипт у Thatcher Lr34 имел недостаток 92 нуклеотидов из экзона 10, который в соответствии с предсказаниями нарушает рамку считывания и приводит к усеченному белку.
Было установлено, что Lr34 придает резистентность на стадии всходов к культурам возбудителя листовой ржавчины при низких температурах (Dyck and Samborski, 1982). Анализ мутантов и родительских линий Lr34, выращенных в виде всходов при низких температурах (4-8°C) и инфицированных возбудителем листовой ржавчины, выявил эффект сопротивления в виде медленного поражения ржавчиной с помощью интактного гена Lr34. В первые 2-3 недели после инфицирования различия в колонизированных мезофильных клетках между мутантами m19, m21 и Lalbahadur Lr34 были незначительными. Однако к пятой неделе размер колонизированной области увеличился по крайней мере в четыре раза при использовании мутантов m19 и m21 по сравнению с активным геном Lr34. Внешние признаки образования спор у всходов были очевидны в случае мутантов к пятой неделе, тогда как присутствие активного гена Lr34 отсрочивало видимые признаки, которые появлялись только через шесть недель после инфицирования. Это наблюдение сходно с более длительным латентным периодом, который был характеристикой механизма резистентности на основе Lr34 в виде медленного поражения ржавчиной.
Lr34 придавал резистентность широкого спектра к нескольким облигатным биотрофным патогенам, включающим грибы из Ascomycetes и Basidiomycetes. Rubiales и Nicks (1995) представили данные о том, что имеется связь Lr34 с уменьшением роста межклеточных гифов, но не с реакцией гиперчувствительности или образованием сосочков. У восьми мутантов Lr34 была нарушена резистентность к листовой ржавчине, желтой ржавчине злаков и настоящей мучнистой росе, и они не демонстрировали некроз верхушки листа, как описано выше. Эксперименты по инфицированию выявили, что уровень резистентности связан с развитием некроза верхушки листа, и что искусственное заражение возбудителем листовой ржавчины до возникновения некроза верхушки листа приводит к более тяжелым симптомам болезни, чем инфицирования в более поздних моментах времени. Эти наблюдения наводили на мысль, что механизм резистентности на основе Lr34 обусловлен общим физиологическим эффектом, а не классическими механизмами резистентности, включающими распознавание веществ патогенов, которые вызывают образование защитных фенольных соединений, отсутствующих у здоровых растений и образующихся как ответная реакция на поражение возбудителем, или секрецию противогрибковых соединений.
На основе этого была выдвинута гипотеза, что стойкая резистентность, придаваемая Lr34, была связана с преждевременным старением кроющих листьев, особенно верхушек листьев, и, по крайней мере отчасти, обусловлена им. В противоположность некрозу старение является в высокой степени контролируемым процессом, включающим ремобилизацию питательных веществ и деструкцию хлорофилла. Полагали, что преждевременное старение листьев, начинающееся с верхушки листа, могло бы препятствовать поглощению патогеном питательных веществ из клеток-хозяев и могло бы задерживать его рост и размножение. Поэтому связанные со старением гены были проанализированы у растений пшеницы с или без Lr34.
Было известно, что экспрессия гена HvS40 значительно снижена во время старения в ячмене (Krupinska et al., 2007). На основе кДНК был приготовлен зонд, соответствующий этому гену. Используя этот зонд в гибридизационном анализе посредством Нозерн-блоттинга, было выявлено, что HvS40 пшеницы в высокой степени экспрессировался в верхушках кроющих листьев Thatcher Lr34, но не Thatcher в растениях возрастом 63 дня. Кроме того, экспрессия гена была снижена или он не экспрессировался у шести индуцированных азидом мутантов Lr34 (фиг. 8). Это служило убедительным доказательством того, что Lr34 регулирует старение кроющих листьев у взрослых растений пшеницы. С другой стороны, микроскопические наблюдения показали нарастание сопротивлений клеточных стенок после инфицирования возбудителем листовой ржавчины генотипов Lr34. Поэтому, по-видимому, Lr34опосредованная резистентность мешала развитию патогена более сложным образом.
Клонирование Lr34 является первым опубликованным клонированием резистентности к множеству патогенов QTL из пшеницы, которое включает Lr34, Yr18, Pm38, Ltn1, и продемонстрировало, что она контролируется единственным геном. ABC-транспортер подсемейства PDR был идентифицирован в качестве гена, ответственного за придание этой стойкой резистентности взрослым растениям. Резистентные и чувствительные аллели отличались лишь тремя незначительными изменениями в кодирующей последовательности. Полагали, что резистентный аллель ускоряет старение верхушек кроющих листьев и, следовательно, мешает поглощению питательных веществ облигатными биотрофными патогенами.
Пример 6. Родственные гены из пшеницы и других видов.
Гомологичные гены из А- и В-геномов пшеницы и гены, кодирующие гомологи из других видов, были выделены посредством использования зондов, происходящих из гена Lr34 пшеницы, для исследования библиотек кДНК и геномной ДНК. Были выделены гомологичные гены из А- и В-геномов. Гомологичный ген был выделен из Aegilops tauschii, диплоидного хлебного злака (с D-геномом), относящегося к пшенице (SEQ ID NO: 6). Были идентифицированы другие родственные последовательности из баз данных EST, содержащих частичные последовательности (табл. 6).
- 31 031178
Таблица 6
EST, которые гомологичны Lr34. Представлен процент идентичности последовательности по участку сопоставления
Член родственных генов был также выявлен в ячмене, когда кДНК-зонд, происходящий из 3'половины гена, был подвергнут гибридизации с геномной ДНК ячменя в стандартных условиях.
Авторами настоящего изобретения также определен гомолог Lr34, присутствующий на хромосоме 7В пшеницы. Белковая последовательность этого гомолога представлена в SEQ ID NO: 63, а последовательность кДНК - в SEQ ID NO: 64.
Пример 7. Получение трансгенной пшеницы, экспрессирующей экзогенный ген резистентности взрослых растений к патогенам.
Для получения трансгенной пшеницы полинуклеотид, включающий последовательность нуклеотидов, представленную в SEQ ID NO: 2, субклонировали в вектор pPlex (Schunmann et al., 2003) так, чтобы промотор вируса, вызывающего задержку в росте клевера подземного, был способен к управлению транскрипцией в клетке пшеницы.
Трансформацию зародышей пшеницы сорта Bobwhite 26 выполняли в соответствии со способом Pellegrineschi и др. (2002). Для подтверждения того, что полученные растения содержат конструкцию, проводили анализ с помощью ПЦР на геномной ДНК, экстрагированной из листьев, используя набор FastDNA® (BIO 101 Inc., Vista, California, США) в соответствии с инструкциями поставщика. ДНК элюировали в 100 мкл стерильной деионизированной воды и 1 мкл использовали в ПЦР.
Растения проверяли на повышенную резистентность к патогенам растений, таким как Puccinia graminis f. sp. tritici (который вызывает стеблевую ржавчину пшеницы), Puccinia striiformis (который вызывает желтую ржавчину злаков) и/или Puccinia recondite f. sp. tritici (который вызывает листовую ржавчину).
Квалифицированным в данной области техники специалистам будет понятно, что в настоящее изобретение могут быть внесены многочисленные изменения и/или модификации, как продемонстрировано в конкретных вариантах осуществления, не выходя за пределы существа или объема настоящего изобретения, описанного приблизительно. Поэтому варианты осуществления настоящего изобретения должны считаться во всех отношениях иллюстративными, а не ограничивающими.
Настоящая заявка притязает на приоритет заявки AU 2008904364, поданной 25 августа 2008, полное содержание которой включено в описание посредством ссылки.
Все публикации, обсуждаемые и/или цитируемые в описании, полностью включены в данный документ.
Любое обсуждение документов, действий, материалов, устройств, изделий или т.п., которое включено в описание настоящего изобретения, представлено исключительно с целью обеспечения фона для настоящего изобретения. Оно не должно считаться признанием того, что любой или все из этих предметов обсуждения составляют часть базиса уровня техники или обычные известные знания в области, относящейся к настоящему изобретению, поскольку они существовали до даты приоритета каждого притязания этой заявки.
- 32 031178
Список литературы
Abdullah et al. (1986) Biotechnology 4:1087.
Barker et al. (1983) Plant Mol. Biol. 2: 235-350.
Bevan et al. (1983) Nucl. Acid Res. 11: 369-385.
Bossolini et al. (2006) Theor. Appl. Genet. 113:1049-1062.
Brueggeman et al. (2002) Proc. Natl.Acad. Sci. USA 99:9328-9333. Capecchi (1980) Cell 22:479-488
Cheng et al. (1996) Plant Cell Rep. 15:653-657.
Clapp (1993) Clin. Perinatal. 20:155-168.
Cloutier et al. (2007) Plant Mol. Biol. 65:93-106.
Collins et al. (1999) Plant Cell 11:1365-1376.
Comai et al. (2004) Plant J 37: 778-786.
Crouzet et al. (2006) FEBS Letters 580: 1123-1130.
Curiel et al. (1992) Hum. Gen. Ther. 3:147-154.
Dyck (1977) Can. J. Genet. Cytol. 19:711-716.
Dyck et al. (1987) Genome 29:467-469.
Dyck and Samborski (1982) Can. J. Genet. Cytol. 24: 273-283.
Dyck et al. (1966) Can. J. Genet.Cytol. 8: 665-671.
Eglitis et al. (1988) Biotechniques 6:608-614.
Feuillet et al. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. 100:15253-15258.
Fujimura et al. (1985) Plant Tissue Cultural Letters 2:74.
Garfinkel et al. (1983) Cell 27: 143-153.
German and Kolmer (1992) Theor. Appl. Genet. 84: 97-105.
Gotor et al. (1993) Plant J. 3:509-518.
Graham et al. (1973) Virology 54:536-539.
Grant et al. (1995) Plant Cell Rep. 15:254-258.
Greve (1983) J. Mol. Appl. Genet. 1: 499-511.
Harayama (1998) Trends Biotechnol. 16:76-82.
Henikoff et al. (2004) Plant Physiol 135: 630-636.
Hinchee et al. (1988) Biotech. 6:915.
Huang et al. (2003) Genetics 164:655-664.
Joshi et al. (2004) Crop Science 44:792-796.
Joshi (1987) Nucl. Acid Res. 15: 6643-6653.
Kolmer et al. (2003) Plant Disease 87: 859-866.
Kolmer et al. (2008) Crop Science 48:1037-1047.
Krupinska et al. (2002) Plant Physiol. 130: 1172-1180.
Kwon et al. (1994) Plant Physiol. 105: 357-367.
Lagudah et al. (2006) Theor. and Appl. Genet. 114: 21 - 30.
Langridge et al. (2001) Aust. J. Agric. Res. 52: 1043-1077.
Lemieux (2000) Current Genomics 1: 301-311.
Liang et al. (2006) Phytopathology 96:784-789.
Lu et al. (1993) J. Exp. Med. 178:2089-2096.
Matsuoka et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:9586-9590.
McIntosh (1992) Plant Pathol. 41:523-527.
Medberry et al. (1992) Plant Cell 4: 185-192.
Medberry et al. (1993) Plant J. 3: 619-626.
Needleman and Wunsch (1970) J. Mol Biol. 45:443-453.
Niedz et al. (1995) Plant Cell Reports 14: 403-406.
Orozco et al. (1993) Plant Mol. Biol. 23:1129-1138.
Ow et al. (1986) Science 234: 856-859.
Pellegrineschi et al. (2002) Genome 45:421-430.
Prasher et al. (1985) Biochem. Biophys. Res. Comm. 126: 1259-68.
Rae (2007) Annu. Rev. Plant Biol. 58:347-375.
Rogers et al (2001) J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 3: 207-214.
Rubiales and Niks (1995) Plant Dis. 79:1208-1212.
Salomon et al. (1984) EMBO J. 3: 141-146.
Schunmann et al. (2003) Functional Plant Biology 30:453-460.
Singh (1992a) Phytopathology 82: 835-838.
Singh (1992b) Crop Science 32: 874-878.
Singh and Rajaram (1994) Euphytica 72: 1-7.
Slade and Knauf (2005) Transgenic Res. 14: 109-115.
Spielmeyer et al. (2002) Theor. Appl. Genet. 116, 481-490.
Spielmeyer et al. (2005) Theor. Appl. Genet. 111: 731-735.
Spielmeyer et al. (2008) Theor Appl Genetics 116: 481-490. Stalker et al. (1988) Science 242:419-423.
Stein et al. (2006) The Plant Cell 18: 731-746.
Stockhaus et al. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:7943-7947.
Stockhaus et al. (1989) EMBO J. 8:2445-2451.
Thillet et al. (1988) J. Biol. Chem. 263:12500.
Toriyama et al. (1986) Theor. Appl. Genet. 205:34.
van den Brule and Smart (2002) Planta 216:95-106.
- 33 031178
Verrier et al. (2007) Trends Plant Sei. 13:151-159.
Wagner et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sei. USA 89:6099-6103. Yamamoto et al. (1994) Plant Cell Physiol. 35: 73-778.
Yamamoto et al. (1997) Plant J. 1:255-265.
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
Grains Research and Development Corporation University of Zurich <120> Гены резистентности <130> 508378 <150> AU 2008904364 <151> 2008-08-25 <160>64 <170> Патент в версии 3.5 <210> 1 <211>1401 <212> PRT <213> Triticum aestivum cv Chinese Spring <400>1
Met 1 Glu Gly Leu Ala Arg 5 Glu Thr Asn Pro 10 Ser Ser His His Gln 15 Asp
Phe Thr Ala Cys Ala Ser Asp Glu Arg Pro Asp Glu Ser Glu Leu Glu
20 25 30
Leu Ala Ser Arg Gln Arg Gln Asn Gly Ala Ala Asn Thr Glu His Val
35 40 45
Ser Glu Asn Met Leu Leu Asp Ser Ser Lys Leu Gly Ala Leu Lys Arg
50 55 60
Arg Glu Phe Phe Asp Asn Leu Leu Lys Asn Leu Glu Asp Asp His Leu
65 70 75 80
Arg Phe Leu Arg Gly Gln Lys Glu Arg Ile Asp Arg Val Asp Val Lys
85 90 95
Leu Pro Ala Ile Glu Val Arg Tyr Asn Asn Leu Phe Val Glu Ala Glu
100 105 110
Cys Arg Val Thr Lys Gly Asn His Leu Pro Ser Leu Trp Asn Ser Thr
115 120 125
Lys Gly Ala Phe Ser Gly Leu Val Lys Leu Leu Gly Phe Glu Thr Glu
- 34 031178
130
135
140
Arg Ala 145 Lys Thr Asn Val 150 Leu Glu Asp Val Ser 155 Gly Ile Ile Lys Pro 160
Cys Arg Leu Thr Leu Leu Leu Gly Pro Pro Gly Cys Gly Lys Ser Thr
165 170 175
Leu Leu Arg Ala Leu Ala Gly Lys Leu Asp Lys Ser Leu Lys Val Thr
180 185 190
Gly Asp Ile Ser Tyr Asn Gly Tyr Glu Leu His Glu Phe Val Pro Glu
195 200 205
Lys Thr Ala Val Tyr Ile Asn Gln His Asp Leu His Ile Ala Glu Met
210 215 220
Thr Val Arg Glu Thr Leu Asp Phe Ser Ala Gln Cys Gln Gly Val Gly
225 230 235 240
Arg Arg Pro Lys Ile Leu Lys Glu Val Asn Thr Arg Glu Ser Val Ala
245 250 255
Gly Ile Ile Pro Asp Ala Asp Ile Asp Leu Tyr Met Lys Val Val Ala
260 265 270
Val Glu Ala Ser Glu Arg Ser Leu Gln Thr Asp Tyr Ile Leu Lys Ile
275 280 285
Met Gly Leu Glu Ile Cys Ala Asp Thr Met Val Gly Asp Ala Met Arg
290 295 300
Arg Gly Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr Thr Ala Glu Met
305 310 315 320
Ile Val Gly Pro Ala Ser Ala Tyr Phe Met Asp Glu Ile Ser Asn Gly
325 330 335
Leu Asp Ser Ser Thr Thr Phe Gln Ile Ile Asn Cys Phe Gln Gln Leu
340 345 350
Thr Asn Ile Ser Glu Tyr Thr Met Val Ile Ser Leu Leu Gln Pro Thr
355 360 365
Pro Glu Val Phe Asp Leu Phe Asp Asp Leu Ile Leu Met Ala Glu Gly
370 375 380
- 35 031178
Lys 385 Ile Ile Tyr His Gly 390 Pro Arg Asn Glu Ala 395 Leu Asn Phe Phe Glu 400
Glu Cys Gly Phe Ile Cys Pro Glu Arg Lys Ala Ala Ala Asp Phe Leu
405 410 415
Gln Glu Ile Leu Ser Trp Lys Asp Gln Gln Gln Tyr Trp Leu Gly Pro
420 425 430
His Glu Ser Tyr Arg Tyr Ile Ser Pro His Glu Leu Ser Ser Met Phe
435 440 445
Arg Glu Asn His Arg Gly Arg Lys Leu His Glu Gln Ser Val Pro Pro
450 455 460
Lys Ser Gln Leu Gly Lys Glu Ala Leu Ala Phe Asn Lys Tyr Ser Leu
465 470 475 480
Gln Lys Leu Glu Met Phe Lys Ala Cys Gly Ala Arg Glu Ala Leu Leu
485 490 495
Met Lys Arg Asn Met Phe Val Tyr Val Phe Lys Thr Gly Gln Leu Ala
500 505 510
Ile Ile Ala Leu Val Thr Met Ser Val Phe Leu Arg Thr Arg Met Thr
515 520 525
Ile Ser Phe Thr His Ala Asn Tyr Tyr Met Gly Ala Leu Phe Phe Ser
530 535 540
Ile Met Ile Met Leu Asn Gly Ile Pro Glu Met Ser Met Gln Ile Gly
545 550 555 560
Arg Leu Pro Ser Phe Tyr Lys Gln Lys Ser Tyr Tyr Phe Tyr Ser Ser
565 570 575
Trp Ala Tyr Ala Ile Pro Ala Ser Val Leu Lys Val Pro Ile Ser Ile
580 585 590
Leu Asp Ser Leu Val Trp Ile Ser Ile Thr Tyr Tyr Gly Ile Gly Tyr
595 600 605
Thr Pro Thr Val Ser Arg Phe Phe Cys Gln Phe Leu Ile Leu Cys Leu
610 615 620
Leu His His Ser Val Thr Ser Gln His Arg Phe Ile Ala Ser Tyr Phe
625 630 635 640
- 36 031178
Gln Thr Pro Ile Val 645 Ser Phe Phe Tyr Leu 650 Phe Leu Ala Leu Thr 655 Val
Phe Leu Thr Phe Gly Gly Phe Ile Leu Pro Lys Thr Ser Met Pro Gly
660 665 670
Trp Leu Asn Trp Gly Phe Trp Ile Ser Pro Met Thr Tyr Ala Glu Ile
675 680 685
Ser Ile Val Ile Asn Glu Phe Leu Ala Pro Arg Trp Gln Lys Glu Ser
690 695 700
Ile Gln Asn Ile Thr Ile Gly Asn Gln Ile Leu Val Asn His Gly Leu
705 710 715 720
Tyr Tyr Ser Trp His Tyr Tyr Trp Ile Ser Phe Gly Ala Leu Leu Gly
725 730 735
Ser Ile Leu Leu Phe Tyr Ile Ala Phe Gly Leu Ala Leu Asp Tyr Arg
740 745 750
Thr Pro Thr Glu Glu Tyr His Gly Ser Arg Pro Thr Lys Ser Leu Cys
755 760 765
Gln Gln Gln Glu Lys Asp Tyr Thr Ile Gln Asn Glu Ser Asp Asp Gln
770 775 780
Ser Asn Ile Ser Lys Ala Lys Val Thr Ile Pro Val Met His Leu Pro
785 790 795 800
Ile Thr Phe His Asn Leu Asn Tyr Tyr Ile Asp Thr Pro Pro Glu Met
805 810 815
Leu Lys Gln Gly Tyr Pro Thr Arg Arg Leu Arg Leu Leu Asn Asn Ile
820 825 830
Thr Gly Ala Leu Arg Pro Gly Val Leu Ser Ala Leu Met Gly Val Ser
835 840 845
Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu Ala Gly Arg Lys Thr
850 855 860
Gly Gly Tyr Ile Glu Gly Asp Ile Arg Ile Gly Gly Tyr Pro Lys Val
865 870 875 880
Gln Glu Thr Phe Val Arg Ile Leu Gly Tyr Cys Glu Gln Val Asp Ile
885 890 895
- 37 031178
His Ser Pro Gln 900 Leu Thr Val Glu Glu 905 Ser Val Thr Tyr Ser 910 Ala Trp
Leu Arg Leu Pro Ser His Val Asp Glu Gln Thr Arg Ser Lys Phe Val
915 920 925
Ala Glu Val Leu Glu Thr Val Glu Leu Asp Gln Ile Lys Asp Val Leu
930 935 940
Val Gly Ser Pro Gln Lys Asn Gly Leu Ser Met Glu Gln Arg Lys Arg
945 950 955 960
Leu Thr Ile Ala Val Glu Leu Val Ser Asn Pro Ser Ile Ile Leu Met
965 970 975
Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu Asp Thr Arg Ser Ala Ala Ile Val Ile
980 985 990
Arg Ala Val Lys Asn Ile Cys
995
Glu Thr Gly Arg Thr Val Val Cys Thr 1000 1005
Ile His 1010 Gln Pro Ser Thr Glu 1015 Ile Phe Glu Ala Phe 1020 Asp Glu Leu
Ile Leu Met Lys Ser Gly Gly Lys Thr Ile Tyr Ser Gly Pro Ile
1025 1030 1035
Gly Glu Arg Ser Cys Lys Val Ile Glu Tyr Phe Glu Lys Ile Ser
1040 1045 1050
Gly Val Pro Lys Ile Lys Ser Asn Cys Asn Pro Ala Thr Trp Met
1055 1060 1065
Met Asp Val Thr Ser Thr Ser Met Glu Val Gln His Asn Met Asp
1070 1075 1080
Phe Ala Ile Leu Tyr Glu Glu Ser Ser Leu His Arg Glu Ala Glu
1085 1090 1095
Asp Leu Val Glu Gln Leu Ser Ile Pro Leu Pro Asn Ser Glu Asn
1100 1105 1110
Leu Cys Phe Ser His Ser Phe Ala Gln Asn Gly Trp Ile Gln Leu
1115 1120 1125
Lys Ala Cys Leu Trp Lys Gln Asn Ile Thr Tyr Trp Arg Ser Pro
- 38 031178
1130
1135
1140
Gln Tyr 1145 Asn Leu Arg Arg Ile 1150 Met Met Thr Val Ile 1155 Ser Ala Leu
Ile Tyr Gly Ile Leu Phe Trp Lys His Ala Lys Val Leu Asn Asn
1160 1165 1170
Glu Gln Asp Met Leu Ser Val Phe Gly Ala Met Tyr Leu Gly Phe
1175 1180 1185
Thr Thr Ile Gly Ala Tyr Asn Asp Gln Thr Ile Ile Pro Phe Ser
1190 1195 1200
Thr Thr Glu Arg Ile Val Met Tyr Arg Glu Arg Phe Ala Gly Met
1205 1210 1215
Tyr Ser Ser Trp Ser Tyr Ser Phe Ala Gln Ala Phe Ile Glu Ile
1220 1225 1230
Pro Tyr Val Phe Ile Gln Val Val Leu Tyr Thr Leu Ile Val Tyr
1235 1240 1245
Pro Ser Thr Gly Tyr Tyr Trp Thr Ala His Lys Phe Leu Trp Phe
1250 1255 1260
Phe Tyr Thr Thr Phe Cys Ser Ile Leu Ser Tyr Val Tyr Val Gly
1265 1270 1275
Leu Leu Leu Val Ser Ile Thr Pro Asn Val Gln Val Ala Thr Ile
1280 1285 1290
Leu Ala Ser Phe Phe Asn Thr Met Gln Thr Leu Phe Ser Gly Phe
1295 1300 1305
Ile Leu Pro Ala Pro Gln Ile Pro Lys Trp Trp Thr Trp Leu Tyr
1310 1315 1320
Tyr Leu Thr Pro Thr Ser Trp Ala Leu Asn Ala Leu Leu Thr Ser
1325 1330 1335
Gln Tyr Gly Asn Ile Glu Lys Glu Val Lys Ala Phe Gly Glu Thr
1340 1345 1350
Lys Ser Val Ser Ile Phe Leu Asn Asp Tyr Phe Gly Phe His Gln
1355 1360 1365
- 39 031178
Asp Lys Leu Ser Val Val Ala Ala Val Leu Val 1370 1375
Ala
1380
Phe Pro Phe
Val Leu Ile Ile Leu Phe Ser
1385
1390
Leu Ser Ile Glu Lys Leu Asn Phe 1395
Gln Lys Arg
1400 <210> 2 <211> 4206 <212> ДНК <213> Triticum aestivumn cv Chinese Spring
<400> 2
atggagggcc tcgcaagaga gaccaaccca tcatcccacc atcaagattt caccgcctgt 60
gcgagtgacg agcgcccgga tgagtccgag ttagaattgg catcgcgaca gcgccagaat 120
ggtgctgcaa acaccgagca tgtgagtgag aacatgctgc ttgacagcag caagttggga 180
gctctcaaga ggcgcgagtt cttcgacaac ctgctaaaga acctcgaaga cgaccacctc 240
cgctttctgc gcggacaaaa ggaaagaatt gacagggttg atgtcaagtt gccagcaata 300
gaggtgaggt ataataatct gtttgtggag gcagagtgca gagttactaa aggaaatcac 360
ctgccatctc tatggaatag taccaaaggt gccttctcgg gcctcgtgaa gttgctaggc 420
ttcgaaacgg aaagagcaaa aaccaacgtt cttgaagatg tcagtggaat catcaaaccc 480
tgcagattga ctcttctact gggacctcct ggatgtggca aaagcactct gttgcgagct 540
cttgccggga aactagataa atctctaaag gtaacagggg atatctctta taatggttat 600
gaacttcatg aatttgtacc tgagaaaaca gctgtgtata tcaaccaaca tgatctgcac 660
atagctgaga tgactgtgag ggaaacttta gacttctcag cccagtgcca aggtgttgga 720
agaagaccaa aaatactcaa ggaggtgaac acaagggaga gtgtggctgg gatcatacct 780
gatgcggaca tcgatctata catgaaggta gtagcagttg aagcttcaga gcgaagccta 840
cagacagatt atattttgaa gatcatgggg ctagagatat gcgcagacac gatggttggg 900
gatgcaatga gaagaggaat atcagggggg cagaagaaaa gattaaccac agccgagatg 960
attgtgggcc ccgcaagtgc atactttatg gatgaaatat caaatggtct ggatagctct 1020
accacttttc aaataatcaa ttgtttccag caactgacaa acatcagcga gtacacgatg 1080
gttatttcac ttcttcaacc aacacctgag gtatttgatc tttttgatga cctcatacta 1140
atggcagaag ggaagattat ctaccatggc cctcgaaatg aagctctcaa tttttttgag 1200
gagtgtgggt tcatatgccc agaaagaaaa gcggcagctg actttcttca agagatcttg 1260
tcctggaagg accaacaaca gtactggttg ggtccacatg aatcatacag atatatctca 1320
cctcatgaat tatcaagcat gttcagggag aatcacaggg ggagaaaact acatgaacaa 1380
- 40 031178
agtgtacctc ccaaaagcca gttgggcaag gaagctttag cattcaataa gtattcgcta 1440
caaaaactgg aaatgttcaa agcctgtgga gcaagggaag cactcctaat gaaaaggaat 1500
atgtttgttt atgtcttcaa aacaggccag cttgccatta ttgcactcgt aacaatgtct 1560
gtattccttc gaactcgcat gacaataagt ttcactcatg caaattacta tatgggagca 1620
ttattttttt ccatcatgat tatgttaaat ggcataccag agatgagcat gcagattggg 1680
agactcccaa gtttttacaa gcaaaagagc tactatttct attcatcatg ggcatatgca 1740
ataccagctt cagtcctaaa ggtccctatt tccatactgg attcgcttgt atggatatct 1800
atcacatatt atggtattgg ttatacacct actgtttcaa ggttcttctg ccagtttctg 1860
atactttgtc ttctccatca ttcagtcacc tcgcagcatc gatttattgc ttcatacttc 1920
caaacaccta ttgtgtcttt cttctacctt tttcttgctc taacagtatt ccttacattc 1980
ggaggcttca ttcttcccaa gacctccatg ccaggatggt taaactgggg attttggata 2040
tctccaatga catatgcaga aatcagcata gttattaacg aattcttggc accaagatgg 2100
cagaaggaaa gtattcaaaa cataacaatt gggaaccaaa tcctggttaa tcatggccta 2160
tattacagtt ggcattatta ttggatatcc tttggagcct tgcttggatc tattctctta 2220
ttttatatcg cttttggatt ggcactagat tacagaacac ctacagaaga atatcatgga 2280
agcaggccta caaagagctt atgtcaacag caggaaaaag attacactat tcaaaatgaa 2340
tctgatgatc aatcaaatat ttccaaagca aaggtgacta taccagttat gcatcttcca 2400
attacattcc acaatctgaa ctactacatt gataccccac cggaaatgct gaaacaaggc 2460
tatccaacaa gaagacttcg actgcttaat aacataactg gtgctttacg tcccggtgtt 2520
ctttctgcac taatgggtgt tagtggagct gggaagacaa ctctactaga tgtattagca 2580
ggaaggaaaa caggaggtta tattgaaggg gacataagaa taggtggata tcccaaggtg 2640
caggaaacat ttgtcagaat cttgggttac tgcgaacaag tcgacataca ttccccacag 2700
cttacagttg aagagtctgt aacttattct gcgtggcttc gtctgccttc tcatgtcgac 2760
gaacaaacaa gatctaaatt tgttgctgaa gtccttgaaa ctgttgaact agatcaaata 2820
aaagatgtct tagtggggtc accacagaaa aatggattgt ccatggagca gagaaagagg 2880
ctaacgattg cagtcgagct tgtttcaaac ccatcaatca tactaatgga tgaaccaaca 2940
acaggtttag atacaaggtc agcagccatt gttattcgtg cagtcaaaaa tatttgtgaa 3000
acaggaagga cagtagtctg tacaatccat cagccgagca ctgaaatttt tgaggcattt 3060
gatgagctca tattaatgaa aagcggtggg aaaacaatct acagtggacc aataggagag 3120
cgctcctgca aagtgatcga gtactttgag aaaatttctg gagtcccaaa aataaagagt 3180
aactgcaatc cagctacttg gatgatggat gtaacatcga catcaatgga ggttcaacac 3240
- 41 031178
aatatggact ttgcaatttt gtatgaagag tcgtcactgc atagagaagc tgaagatcta 3300
gtggagcagc taagtatccc attaccaaat tcagaaaatc tatgtttctc ccatagtttt 3360
gcacagaatg gctggattca acttaaagct tgcttgtgga aacaaaacat aacttactgg 3420
agaagtcctc agtataactt gaggcgcatt atgatgactg tcatatctgc cctgatctac 3480
ggaatattgt tctggaagca tgcaaaagta ttaaacaacg agcaggacat gctcagtgtt 3540
tttggtgcaa tgtatttggg tttcaccacc ataggcgctt ataatgatca gacaatcata 3600
ccattcagta caactgagcg tattgtaatg tatcgtgaga gatttgcagg aatgtattca 3660
tcttggtcat attcattcgc acaggctttc attgagatac cctatgtatt tatccaagtg 3720
gtactgtata cgttaattgt ctatccgtca actggttatt attggacagc acacaaattc 3780
ctatggttct tctacaccac attttgttca attctctcct atgtttatgt tgggttgctt 3840
cttgtttcca taacccccaa tgttcaagta gctaccatac tggcttcatt tttcaacacc 3900
atgcaaacac tattctcagg atttatttta cctgcacctc aaatcccgaa gtggtggact 3960
tggctctact atctcactcc tacatcttgg gcactcaatg ccctcttgac atcacaatac 4020
ggaaacatag aaaaagaggt gaaagcattt ggagaaacta aatcagtttc aatcttcttg 4080
aatgactatt ttgggtttca tcaagataag ttgagcgtag tagcagctgt cctcgttgcc 4140
tttccttttg tgttgataat cttgttttcg ttgtccattg agaaacttaa tttccagaag 4200
aggtaa 4206
<210> 3 <211> 18859 <212> ДНК <213> Triticum aestivum cv Chinese Spring <220>
<221> misc_feature <222> (11016)..(11069) <223> n = неизвестное число нуклеотидов <400> 3
agccggcggg gtcggcgagg ttgagaagca gaggccggtc atgtcgctac ggatcagaga 60
ggaggagcgg tgacgcgttc cagatgggtt tgggcaggcc gcggtggcta agggagaggc 120
agcaagactt ggcggcggcg gtttggattg gaacggaaaa caaggaaggt ctatggtggc 180
ggttgcggct ggatcaggga gcatcttgat ggaggaaatg ggtaggggaa gtggcggtgg 240
tgggatgact ttcaggggta tatctagggt tggtccaaaa tagggctagg gggctatata 300
tagggaaata ggtctagatt cgaagccttc gattagatcg gacggtcgag ataaaatgat 360
aagggaggcc aaataagaaa ccaaagatgt ttggggttga tccggaccca ccggtcacga 420
ccgggcggtt cgggttcggg gaagttttcg agctaggatg caagggggtc tatgcaatgt 480
- 42 031178
gcagagagac aaggaagtcg tgcgcaagtg cggttggtct cgaaaccgtc aacgacaaca 540
acagggagaa cggcaactat gaacggatgc aagttttgga aaatgcaatg atgaatgcaa 600
caaacaaata attaacgcgg ccaactcgag atataactag aaggcatctg gagcgtcggt 660
ctcgagttgt tacacactcg ctcaccgggc ccctcccagc gccctcaaca acctttgacc 720
tcccccccaa cggtggtacc agacgccccg gaactagccg cactcccccc ccccctccga 780
atgggggcaa cgaaaacaag gggcacccag gcgccaagaa taagaagaga gggccggtgc 840
gctccgctag gtaccaacag gctcaccctc cctccgcggc cgttgttgcc tccatcgagc 900
cagccgccga ctccgaccac gatggccggc cttgcttcaa ctgtgtgatc cccggttact 960
tccaagtcgc atgccccaat cgtccgatgt gctacttgtg taaggatccc gggcatcccg 1020
ctctgttgtg cttgaaccgg tcggtttcgg aggagttgat gatgtacggg cacggcccag 1080
ggggcatgcg cttcttccac atcaaggtcc cggatgcccc accccctgcg aaaagatcag 1140
atctattata aagattcacc agaagtacaa aacacctcaa aacataataa aatttacatc 1200
aaggtccatg gaggaatgga ccaccgaacg gccattgcct cagccagaac cgagccgccg 1260
acacgccgct atcgacgctc ccataccgga gccggtctga ccttgtcgat gatagccgaa 1320
aagtcttcgt gtgcgtgccc ttaaggatca gcgtcccaga gccgcagtcg tcaccgttga 1380
atccttgaat cagtctaaag aatttgacac caaatatcgc cgttgcgtac gcacggcgag 1440
aaactctaac ctctccgccc tgaggagctg gcagaaatct acgccgaagc tccgtctaat 1500
ccgtcctaga ggacgaactt gaggaggatc ggaacccgaa agactgactc gaagaagaag 1560
cgccgccatc cgtccaaacg ccgcccctgc gagaactaaa actctacctg tctactagcc 1620
ggagacaagg caccagaaat cccctccctg ccaccagccg ccggaacggc aggcggaggg 1680
aaggggaatc cacgggctcg ccgatgaaga tcaaggggag gaaggctttt cacgacaggg 1740
gaaagaaaag caatcttaat cttttatatc tttacaacca aaattccaaa ttgagttttg 1800
gttccatatt catgtttcta ttacaagggc ttttaaataa tatccatttt taatacgatt 1860
tgatgagttt ttaaaacttc attaagttgc agctgctgaa acttggtacc agcaagcgac 1920
aaaatcatga aacttgatgc gagcgaatgg caaaatcgta agtttcaaaa actgaaactt 1980
aaaacttgat gtgccgtcgt gcggaaccat cgagcagccg ggcaggtgcg tgccacgcgc 2040
ctgcgtgccc ctgcgagttt tccgcgcaag agcgcgaaca aacggtactg cacatattgc 2100
agtttcaagt tgccgagtgc gactctgtgg tcaatgtcgt cgaaggctct ttcatcaagt 2160
aattacaata ccatttcaac tttcatgggt ccgtgcctgc caggttcaaa gttccaagat 2220
ggttatgtgc aaccgactgt gtgtcccaca tccacacatc gaagcagagg tctcgtgaag 2280
tctttccaaa cgagcaagag caacatcaag gacgaccagc tgagggggtc tttccaaacg 2340
agtggtttct atcctcccgt agaatgggtg atccacgaca agtctatgag tcgttctgag 2400
- 43 031178
gttgagacta ataaattaat tgtggctaat cgacactagt cgacaccgaa gttgctactc 2460
acagactagt cgacactgaa gtgtagtcgg ccccggagtt gtgacttcta gactagtcta 2520
tagacttgtc cttcgactca taatccatgc tcgtcatcca gcccccatta accccatcca 2580
tgtgactccc tgcgtaacat aacctgttcg gttactcccc ttctaatcca tgactaaaat 2640
tgcacttcaa tctttttccg aagtcccgtt ttgcggtggc atatatccaa tttacaagct 2700
aaaaaaaagt gcggtggggt tctttcccgt cacaaagaaa acccaaaata aggcaaatca 2760
ggtctccgaa tcaggagtac tgtgaagtct tcaccagtac cgtataatac atgacttatg 2820
gctgtcatct tccagaatgt gcgtttccat gctaatagtt agtttgaagt caacacatga 2880
ctggtctttc caactcttct gactgatgat gtccgtatgg gaaaaagcgt gcgtacatgc 2940
tcgccaaaac cttatatatg tactctaaag agaaggaaat gactgcttag agtacggcta 3000
ggcaatagca aagggcgtcg atttaactca cccatcttga gatggagggc ctcgcaagag 3060
agaccaaccc atcatcccac catcaagatt tcaccgcctg tgcgagtgac gagcgcccgg 3120
atgagtccga gttagaattg gcatcgcgac agcgccagaa tggtgctgca aacaccgagc 3180
atgtgagtga gaacatgctg cttgacagca gcaagttggg agctctcaag aggcgcgagt 3240
tcttcgacaa cctgctaaag aacctcgaag acgaccacct ccgctttctg cgcggacaaa 3300
aggaaagaat tgacaggcat gttttctttt tcagaacact gttctaagta actggatgaa 3360
gattagactc tgtttatgca actgtttatt tttcccctgt gatccatttc cacagggttg 3420
atgtcaagtt gccagcaata gaggtgaggt ataataatct gtttgtggag gcagagtgca 3480
gagttactaa aggaaatcac ctgccatctc tatggaatag taccaaaggt gccttctcgg 3540
taagaaacct ctgaaatgat tgatttttat tatgcaccaa atagcagcat ctgaagcaac 3600
tgttttttcg acgaatcata aatggaactg ataagacaca gatatatgtt ggatggtatt 3660
gactaactta cccgttttca tttgagttac agggcctcgt gaagttgcta ggcttcgaaa 3720
cggaaagagc aaaaaccaac gttcttgaag atgtcagtgg aatcatcaaa ccctgcaggt 3780
atgtgccatg tttcatgagt gtttagtata aaaatggaaa agaaaccata aacatacaaa 3840
agaaaacgtg cgaaatttag tgcatcaagt gtctgtagtt cttgctttag agattaaggt 3900
tagttctgat tccatatgtt cccatctttg tagattgact cttctactgg gacctcctgg 3960
atgtggcaaa agcactctgt tgcgagctct tgccgggaaa ctagataaat ctctaaaggt 4020
acaaatactg tcttcctttc ataattaaag aaaaaagcat gtccttgttt tcactgattg 4080
catctgctcc tataaagatc tcaagattac tcaatacttg gccaaatgaa agaacaaaaa 4140
aattaagatc tcaaccagct gcacaccgca gtaaactgct ctctgtcctc tggccgctac 4200
ataatagacc acatatgaag ccagtacaca aataaatgta taacctacaa tcttttctca 4260
- 44 031178
aagtctacat cattcatgaa tagccaaaga gccaaactta agtttttatc aataccccac 4320
aaacaataaa ctcgcgcctc ttgagagctc cgaacttgct gctgtcaagc agcaagttct 4380
cacgcacatg ctcaaatgtt tgcagcacca ttctggcgcc gtcgcactga caattctaac 4440
tcggactcgt cgggaccctc gtggtcatac gccagcgctc ccaaatcctg ataccagaac 4500
agataatgac gctgacgctg ccagaggaga cggcgcaatt gccttaatcc tcggcacata 4560
gtgtcgcaac acatacatgt gcccaactac tcctcggcac cacgcccgcc ggaggacaag 4620
ccggcgctcc tgtcccctaa ccatgacacc gacatcaaga acctccgcct agaactcttg 4680
cacaacctcc tccgacttct ggtgacagaa acgcgccacc ggtgacacaa agccaccgtc 4740
atccgcatat gacccaacct ccagcagcat cctgagattc aacacatgac acctccgctg 4800
ccctctcctc catggcatcc tcggcagcca ggaaagataa tctcaatccg ctggatcccc 4860
ctaaagtagg cgtctaggcg atcactgtgg cggcagggtg agtcaccttc agggcagcgc 4920
tctcatccaa ttcctatgta ggtttgctac tactgcacgg ggacctatca gatgtatctc 4980
acagaccaat tagataaatc gatggtcgaa tttggaagtt ataatgagat acactgttgt 5040
gattaaattt gatcacgcta tattgtagag gaaagtgtaa ttcccttgaa atgaacaaca 5100
tgcaacatag tagtatagaa tcgccgcaaa ttttccttgc gtttggatat aaaactcagg 5160
cccatgttcc atctttttaa ctgtgtatat gccctagcag cgtgaacata ctactggtcc 5220
tgctagaaca agcggcgggt aaagatgggc gcctgcttca tacttgccag taaattagga 5280
tgattgcctt gcagaaaata tggccaatat taccattaag cctatttacc gaaatctaac 5340
acaaactttt gactgtagga aacaaagaat caattctact aacagatttt tcttttgttc 5400
gagaaaatgc ttatgcgtgt gtcgatgcat taaaaggaaa gagaataaca gccattcagg 5460
attacaagcc ctaagaagga ccatggaact cctgaaccaa ggttacacgc caggcaggag 5520
gagctggagt tttgccgcac gggcgaaacc cagcaagtcg cctccgtgct acgctaggtc 5580
tagccatact gaaggataca tcattgtgat gagcaccagg ccgtcatctg aatgagtgtc 5640
agacaactga cagaataaca ttactcacat caaaagcaaa agttgtccat cacctcagag 5700
tctatggttt tcattagttg cacatggtta acgacctctg acaaaggcag aaattcaaga 5760
atgccttgca ctgaacgacg gatatcagta tacttaagtt gcttttttac agcaccaact 5820
gatgctggag ttatcaaatt gaaatgtccc aactccccag caaagccacc tatattgtct 5880
ccaaaacata taattgttgg catggtttcc acctgtatga aaccggcact atttactggc 5940
tcaaatgagt agttcgtcat gaagctagta cttatactga ctgctgaata ctaataaata 6000
acagctttta attattttca gaccaagtac tttcagagaa aactattttc agatcagctt 6060
ctaattaata ctccctcagt tccaaaatat aaggtgtatt agttttttca agaggcattc 6120
atgtttgacc aagtttttag aaaaaaaata tcaatatcta caataccaaa tttgtatgat 6180
- 45 031178
tagatttatc acgaaaagta tttttcatat tttatttatt ttatattgca gaatgttaat 6240
attttattct ataatcttgg tcaaacatac ataagtttga cttgcacgaa cactgatgca 6300
ccttatattc tggaacggag ggagcaaata atagcacaca atagattatg ggtacctgct 6360
gggtattcct gcttagagat acaaccacag aaaagcagag cagaacagca caaatgccct 6420
ttagccattg acactacaat tagtttcaaa gctacaattt tgcaaaatca tgaacaaaag 6480
aagaaaaaaa atggcaaact gaatgtaacg atgcaagctt ttacaggtaa caggggatat 6540
ctcttataat ggttatgaac ttcatgaatt tgtacctgag aaaacagctg tgtatatcaa 6600
ccaacatgat ctgcacatag ctgagatgac tgtgagggaa actttagact tctcagccca 6660
gtgccaaggt gttggaagaa gaccaagtaa gtctattgga cagtcctcac aagaattcat 6720
gatcaaaaat aagttcttaa ataatcacaa catttgttgc tcactaaatt tgtttgccca 6780
aagaaatact caaggaggtg aacacaaggg agagtgtggc tgggatcata cctgatgcgg 6840
acatcgatct atacatgaag gtaaaaaatc gtgtctccta tgtactggct ggcattatcc 6900
tttctcactt tacaattaaa aaaaaaacag acctgcttat ctgagttaca aagaaaaggt 6960
aattcaacgt cgaatgaata ttggaactgc tctagcagaa taatatttgg ttgtattaaa 7020
gctaagctag cttttcaatt tttcattagt caacacttct gtttctgttt ctacaaatta 7080
aacgtaactg tttttcaaaa gtaaagcggc taatgcaggt agtagcagtt gaagcttcag 7140
agcgaagcct acagacagat tatattttga aggtacccct tgccaaaaca tctaagttta 7200
tgcataactt ggtgctgaag gcagatagga acaagatact aacagaatca caatactgat 7260
ttatttgtag atcatggggc tagagatatg cgcagacacg atggttgggg atgcaatgag 7320
aagaggaata tcaggggggc agaagaaaag attaaccaca ggtatagtaa acccaatggg 7380
aaatacatta accaacaagg gatcaccttg tatataatct ttcacctact tgtaccagcc 7440
gagatgattg tgggccccgc aagtgcatac tttatggatg aaatatcaaa tggtctggat 7500
agctctacca cttttcaaat aatcaattgt ttccagcaac tgacaaacat cagcgagtac 7560
acgatggtta tttcacttct tcaaccaaca cctgaggtat ttgatctttt tgatgacctc 7620
atactaatgg cagaagggaa gattatctac catggccctc gaaatgaagc tctcaatttt 7680
tttgaggagt gtgggttcat atgcccagaa agaaaagcgg cagctgactt tcttcaagag 7740
gtaattgttc tcaatcacaa aaataactgc agcaactgag atgatttgca cgttgatgaa 7800
accagttttt tttctaattt tgaaatcatt agatcttgtc ctggaaggac caacaacagt 7860
actggttggg tccacatgaa tcatacagat atatctcacc tcatgaatta tcaagcatgt 7920
tcagggagaa tcacaggggg agaaaactac atgaacaaag tgtacctccc aaaagccagt 7980
tgggcaagga agctttagca ttcaataagt attcgctaca aaaactggaa atgttcaaag 8040
- 46 031178
cctgtggagc aagggaagca ctcctaatga aaaggaatat gtttgtttat gtcttcaaaa 8100
caggccaggt taaacttcat tctgaggcac tctttcctgt acaaagtaaa ttatgagtcc 8160
aaactgagat ttactccttg atgcagcttg ccattattgc actcgtaaca atgtctgtat 8220
tccttcgaac tcgcatgaca ataagtttca ctcatgcaaa ttactatatg ggagcattat 8280
ttttttccat catgattatg ttaaatggca taccagagat gagcatgcag attgggagac 8340
tcccaagttt ttacaagcaa aagagctact atttctattc atcatgggca tatgcaatac 8400
cagcttcagt cctaaaggtc cctatttcca tactggattc gcttgtatgg atatctatca 8460
catattatgg tattggttat acacctactg tttcaaggta aatatggaaa tttctcaacc 8520
ttacaatgat aagaacaaac attgagaaac tcttaacata ttttatttat attcatttct 8580
aggttcttct gccagtttct gatactttgt cttctccatc attcagtcac ctcgcagcat 8640
cgatttattg cttcatactt ccaaacacct attgtgtctt tcttctacct ttttcttgct 8700
ctaacagtat tccttacatt cggaggcttc attcttccca agagtaagat aaccattgct 8760
cattgaatgc atataactta taagcctagc aaatctgaac aaatttgtta ctttattgtc 8820
ccagcctcca tgccaggatg gttaaactgg ggattttgga tatctccaat gacatatgca 8880
gaaatcagca tagttattaa cgaattcttg gcaccaagat ggcagaaggt gaaatgattt 8940
ttttttcaaa taaaatattg agtgataagc tgatgtcaag catctaacat cattgctgct 9000
tgtattattt tcaggaaagt attcaaaaca taacaattgg gaaccaaatc ctggttaatc 9060
atggcctata ttacagttgg cattattatt ggatatcctt tggagccttg cttggatcta 9120
ttctcttatt ttatatcgct tttggattgg cactagatta cagaacacgt aagtttgcta 9180
ctaatgaaca aagtgcatat atattgggct tgggctccat ggtgcccagg caacatgatt 9240
tgaaatacag caaatttggg taatgcattt aggaaattcc tattttggat gatataactg 9300
gttgtcattg ctgggtataa tttcgaaata cctactcgat cccaaatatt tttggtaaac 9360
tcatccatat agcagtttta tatacataca ggtacctaga attcaagcaa taacaaaaca 9420
aagtacagac tgaaaagatc aaacttgttt ggaataaatt agacttcaca aattttcatg 9480
caatatatct agatggatct ggatatagga atatagtgct gaggcactat ggagcaccag 9540
ttaattagac tttatacacg aatgttactt actttagaat cctactataa ttttgccaat 9600
ttcagctaca gaagaatatc atggaagcag gcctacaaag agcttatgtc aacagcagga 9660
aaaagattac actattcaaa atgaatctga tgatcaatca aatatttcca aaggtaaaga 9720
cataaacatc tcaatacgaa ttaatagtaa aaaatatgaa ggtcccataa aagtgcatgc 9780
ttcttcaatg cattcatctt attgcagcaa aggtgactat accagttatg catcttccaa 9840
ttacattcca caatctgaac tactacattg ataccccacc ggtaattaag caagccccct 9900
atgcatttgt tttgtagttt tttatatttc ttgcctggtt cgtatttgat gatgaaggta 9960
- 47 031178
tgtaagaaat gtactctctt gtaggaaatg ctgaaacaag gctatccaac aagaagactt 10020
cgactgctta ataacataac tggtgcttta cgtcccggtg ttctttctgc actaatgggt 10080
gttagtggag ctgggaagac aactctacta gatgtattag caggaaggaa aacaggaggt 10140
tatattgaag gggacataag aataggtgga tatcccaagg tgcaggaaac atttgtcaga 10200
atcttgggtt actgcgaaca agtcgacata cattccccac agcttacagt tgaagagtct 10260
gtaacttatt ctgcgtggct tcgtctgcct tctcatgtcg acgaacaaac aagatctgta 10320
tgtcatcagt ctcagagata tatcgaattt aataagcata gcactagatg gataaataag 10380
aggcttacct aagaaactaa caatattctt cttgttcctc tcgtagaaat ttgttgctga 10440
agtccttgaa actgttgaac tagatcaaat aaaagatgtc ttagtggggt caccacagaa 10500
aaatggattg tccatggagc agagaaagag gctaacgatt gcagtcgagc ttgtttcaaa 10560
cccatcaatc atactaatgg atgaaccaac aacaggttta gatacaaggt cagcagccat 10620
tgttattcgt gcagtcaaaa atatttgtga aacaggaagg acagtagtct gtacaatcca 10680
tcagccgagc actgaaattt ttgaggcatt tgatgaggta atttaacttt ctaaatatat 10740
tagtatatta aacacaatca acacaaatac atttttatta tatatatcaa gcacgatcaa 10800
cacaattttt tttctggaaa aatcaatatg tttagtttca aaactattag gattaattaa 10860
agcccttgcc ttcaacagag cagggctaat cttaatatgc actacctctg taactaaata 10920
taagacgttt ttgcagttca cctgcaaaaa cgtcttatat taagttacag aggtacctcc 10980
gtcccataat gtaagacgtt ttttgacact agtgtnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 11040
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnntt atgggacgga gggagtagta cattattagt 11100
tatttaaaat ttaaaacatg tcctttgtgt ttgcctttct agtaaataat aatgatagga 11160
aataatagta tggaaatttg caatataagc gtgtcaacca tttcactttg cgcaacctag 11220
acctcaaatt gcacttttgt cccctcaaat gatcaattat gtgcaacaaa acccttcaac 11280
ttaaactttg cttatctgaa accttctatt atttggtttg ttagatcaag cattttctac 11340
tgaagatacc tgatcagacc cctttgaata atatatctat gaataaacat tgatttgagc 11400
taagtaggat tggcatctaa attatagtaa gacgcttaac aactatttac tactccctgt 11460
ctcaaaatgt aagacatttt ttgacccttt gaataatata tctatgatat aaacattggt 11520
ttgagctaag taggattggt atctaaatta tagtaagatg cttaacaact atttactact 11580
ccctctgtct caaaatgtaa gacatttttt gacacatgta agacgttttt tgacattatc 11640
agtgtcaaaa aatgtcttac attttgagat agagggagca tctagcatcc tttttctgtt 11700
tcgggagaac atttcttacc ttaaatattt ggcatatact ttttgtacaa aaacaacccc 11760
attatatcag tccgcatgaa gaataaagta taaacatgca atgacatgtt ttgatctctt 11820
- 48 031178
aattatttga acatctatgt gttcgatgtc agttaatttt tatctcttat ttgaactaag 11880
tgtccacact gacacaaatt tgtcatcgca caaaatttgg actttctggg cttgattaca 11940
aaattaaaac aattttgagg gcttatactg gaaagtcacc gaatagaata ttttttggtt 12000
ttctgaacta tatgtttatc acaaatcgac gtgactacgg acagtttata tttgctactt 12060
ctctgtttat aataacaaaa agggtataga ttttctttat tacagggcta gttgtagtcg 12120
aaagttgcct ataatgcatg tagtaaattt tgttgcagct catattaatg aaaagcggtg 12180
ggaaaacaat ctacagtgga ccaataggag agcgctcctg caaagtgatc gagtactttg 12240
aggcaagttt cttgaacata tttccacaaa tgtatttgcc tttttcttga ttattcgttt 12300
tcactgtttt tttctggaat tggaacaata aacgtgagag ttccaaagga acgaacccca 12360
aaaccagtgc tcaaatgttc aacatgccat agcaaaaaca cttaagtcaa ctctagcagt 12420
catttgtgtt caatatgtaa cttggctaac aattcacatg aaatatatag gttaatcaaa 12480
attttgatgt gatcatatgt attttacatg ttgaacttaa aagcaaatgt gacaataaac 12540
gtacagattg gcaatggaaa ctaaaaacat actgaagaac tttgtttgca tatctatgta 12600
tgtgtttcgg tgttttcaga gaggaagcac ggttgtggca tggcactgcc atatttgtga 12660
catgtgtcct ttggttctaa tagattgaat ttttcttgtc cacttgatag aaaatttctg 12720
gagtcccaaa aataaagagt aactgcaatc cagctacttg gatgatggat gtaacatcga 12780
catcaatgga ggttcaacac aatatggact ttgcaatttt gtatgaagag tcgtcactgc 12840
ataggtacat atcttgtgga tttagttagg atatcgagca aaaggcaaca tatatgaata 12900
gcttaagcaa aataaaattc atctagcaaa aaaatttagc caaacaaaat acctccattt 12960
gaagtttgga agaattaaag ttacttttct gcagagaagc tgaagatcta gtggagcagc 13020
taagtatccc attaccaaat tcagaaaatc tatgtttctc ccatagtttt gcacagaatg 13080
gctggattca acttaaagct tgcttgtgga aacaaaacat aacttactgg aggagtcctc 13140
agtataactt gaggcgcatt atgatgactg tcatatctgc cctgatctac ggaatattgt 13200
tctggaagca tgcaaaagta ttgtaagttc actcctttgt tatccacaac attgcacatc 13260
agttgacttc acagactcat tgcaaaatta ttctaacttt ctcttatctc ttctaagaaa 13320
caacgagcag gacatgctca gtgtttttgg tgcaatgtat ttgggtttca ccaccatagg 13380
cgcttataat gatcagacaa tcataccatt cagtacaact gagcgtattg taatgtatcg 13440
tgagagattt gcaggaatgt attcatcttg gtcatattca ttcgcacagg tcagataatg 13500
atcacaagct tgtaagagaa gtaaaatata cattgacact gatgctcata tttattcacc 13560
ttctacaggc tttcattgag ataccctatg tatttatcca agtggtactg tatacgttaa 13620
ttgtctatcc gtcaactggt tattattgga cagcacacaa attcctatgg ttcttctaca 13680
ccacattttg ttcaattctc tcctatgttt atgttgggtt gcttcttgtt tccataaccc 13740
- 49 031178
ccaatgttca agtagctacc atactggctt catttttcaa caccatgcaa acactattct 13800
caggatttat tttacctgca cctgtaagtc tttatctcct cccaatatcg taaactttag 13860
ctctccaaga tgtaactggc acttcttttt gttagcaaaa atatggctgc ccaccttgaa 13920
tatataccaa ctaagaaaat aacaacctac atgagaaatt gtaattgacg agattttgta 13980
gtgtaattat gtaataatat tatggaacta ataaaggtct aatagggcat tatgggcttt 14040
actttattcc agagttcatg ttcgtgcaga agtctcctat tgtactacat ctaggttacc 14100
cttataggca tcctattaat gcattctgcc ttacaaaggt atcaaattag gttttagggt 14160
ttttatcctg gtaaactttt ctttatcttt ttttgtcaat attcaccttt gcaacttccc 14220
caccatgaca cctttttttt ccttctgccc cagatcctca attttactga ttgcttaatt 14280
tttgtgatcg atcaactgat ctatcctcct gatagatctt agttttggga atatttaagt 14340
agtaatatgt caacaataca aggaccaacc gcaactataa ggcatcactg gatgacgata 14400
cacagaacca ctccaatgtt agtttaacat cataatagtt atagacatac catcttcagt 14460
ttcatcatta atacttccat ttctattttc taggttggaa attgataatt attccagcgt 14520
tgctcaatag aataatcatg ttctgttcaa ttgttaggga agaatcatga atagaggaaa 14580
gcactaatat gcattttcaa ttcacgttgc agcaaatccc gaagtggtgg acttggctct 14640
actatctcac tcctacatct tgggcactca atgccctctt gacatcacaa tacggaaaca 14700
tagaaaaaga ggtgaaagca tttggagaaa ctaaatcagt ttcaatcttc ttgaatgact 14760
attttgggtt tcatcaagat aagttgagcg tagtagcagc tgtcctcgtt gcctttcctt 14820
ttgtgttgat aatcttgttt tcgttgtcca ttgagaaact taatttccag aagaggtaag 14880
caagttctga cattccaaca gacatgaatc tgtacatgtt acagatatag ctacttgcct 14940
tttttccaac tgcgaaatgc agaatcagag ctgattgggt ggctattttt ctcaaatctg 15000
atgggtaaac ctcatgaata agtaattgtg tacaataact tgattgtgct aagtacgatt 15060
gtgagttgta atctttttgt ttcaccgttc agaagaattt gatggttaca aatcatgtaa 15120
cctgctttga agaggatttt gcaattgtgt tatgccttag attactgaat gcatcaagag 15180
gaaaatgagc acctaactga atgaacctac gatttaaagc gagcttaagc acagataaca 15240
aaaagctaac ttggattccc gcaccgtcat catcatgcct taatatccgt gcaaggtgtg 15300
tgagtggtgg gtggtttctg aagagaaacg tggccacacg tcacggcatg cggggcgccg 15360
tttggatttc ctttgagcta tataaaacgg gaacggcagc atggaatggt acacttctct 15420
cactttcacc catcttcatc ttgctcatgt gctcactccg ccgttgcaaa caaagcttct 15480
cgcatcaagc ttttctcccc ttcctctatt agacaagttg aagccagaca cacccgatga 15540
gcgcagaggt gcaagccgaa ggagaggatg cagcgcaacc actaggggtg ctaccagcaa 15600
- 50 031178
gaagggtgcc actagcaagg gtgccgccaa cgacacaaaa gggaaatggg tcacttcgtc 15660
ggcgacacaa catcgtcgac acaagatcaa ctgacaaagc tcgccaactg ttgcttcttc 15720
cccaatattg ttcttcccga agcaaatgga agttcactgg cgcgcaccgc cgcgggagca 15780
gatcgtgcca gcgccatgcc cggacgaacg ggtattccta gcccctttct tgatgtgagg 15840
cttctctttg cctctccatg agtttcttcg tgggtagctt ttcttgtacg aggccaataa 15900
tatgtcacat cacgtgagac tggtcgcaaa tcaaactagc gagaggagtc gataccacga 15960
aaatcccatg taggagacgc tccagcaatc ccatgccttc gatgcaagtg attgccatta 16020
gtaaatctgg gaatggctaa tggcccccac aagacactag ttgtcactac acagccaggg 16080
ccgcaataag ccgccacaaa ctccggtgaa catgatccgc aacctagcat cgtcggcact 16140
gcaaccgtgc accaccaccg ccatgccgca atgtagcgat gatcaccgct acccgccagc 16200
acgcaagcaa ccagcgaaat cacaaccaac cacggactcg ccaaccaggc caagctccaa 16260
tataatgccc cgaaggagga acacagacgc cgagcaccgc catcattcga tctgggcaaa 16320
ccggaaccta gggtttccgc taaagcatta tgagagaata gtcaaggact gcatctagac 16380
accttaagca agggaacgac atccgcaggc gccaccgtca ttggcttcga ccgagcgaag 16440
cctagctttc accgacagtc ccatccctcc ttccccaaat cgaacctagc cactctacca 16500
tgcccaccac cgccgccaac atgaccacta gtgaaggaga ccaccaagtc cacagaccct 16560
aggccaagat tcatggctaa ggtgccgcat gccttgttgc aagagaagag catgccatgc 16620
ccccacatcg tcgggatccg ctatcgagga agagtcatcg ttccactaat ccacaacaat 16680
ctactgcacc gcaaagaagg tggtcgcgac cacgacgatg tgtcacatgg acctctgtac 16740
cgagaggtgc cgtcattgtc gggagaaaag gtcgtcctgc caatggacct gatggaaaaa 16800
cgtcatgcga ggagccctgt cggtgcctcc gacaacggtg agaaggtatg ggacgtggag 16860
ggctgctggc ggcgagtcta ggtggtttcg cccatgacgc ctggaagatc atgcgagggt 16920
tagggatggc tggaaggcaa tgcaggggac aatacaatta taacacatta gttcgaagaa 16980
tcggctatga gttgattggc acaaaagaga tggttcttgg catcgagtct catggtggat 17040
gtgttgttag gcatatcagc atgagttgtc gatagtacgt cagtacgtcc cctagagctt 17100
tgtgcactac taggtggagc catgctaaga gcatctccaa cagatgacat ataatagggc 17160
actaaagagt aggttttaag gcaccaaaaa agattctgcc atagcagacg atgtaaaata 17220
ggtcaccgga aaaatttctg ccgtagtagg gcaatattat tgcatatttc gacattttca 17280
aacttctaat tgttcaaagt taaactaaca gtactaagat agatacacta ctcatcatca 17340
ctactacgat agaggtctca agtcaatatc gtcggctttg tcatcgtcca actcaagctt 17400
gatcacctgt gaggggccag cctcatcctc ctccttgaga accttcttgt gttgcacgtc 17460
cctactggca aagaattcgt attccacctg cacaaggtaa ggactttccg ctgcgaacct 17520
- 51 031178
tgccatagcc accgcatcgc tctcatgggc ggtgtgttgc tccacgatga ggcaaccatc 17580
ttctcctcgt gaaacacaat ccccaattca ggagcgagga actccgccac ctctcgctca 17640
tgacgtcagg aaagtgtgct ctgacttggg ccagcggcca cggcatcata cgcgcatgta 17700
gcgagctctg ttgtcttgaa ggtcctgagc cagacttgca tcccatcgca caagatatcg 17760
acagcatagc cgtgggacta caatgccaaa cacagtggaa gaccgtgctc ctcctcgcct 17820
tagcgttgtg gcgcaacatc ttcagctcgg cgatggcggt ggtcgacggc tgagacgaat 17880
gagagcggtg gatctggcgg cagtggcggc caaatggcgt ggtgtggcag acaatttggt 17940
caacgtggtg gtgcagaggc cgattcgaca aaaggggcgg ctgttccgat ggcggtggtg 18000
gccgtattgg gcatcgtcgt cggcaaggca gaggaagcga ctaggggggt tcacgcggcg 18060
gtcgagcaaa gcgcggctga ggtttttgtt ttgcggcaac tacgcggctg ttgtatattt 18120
ggagaacaaa agggctgccc caaaaatatt ctagcacgat atagggatag ggcatctgct 18180
ggagcaccat tttgggtcca aatgccataa aacggttttt taggcagctg cccattttgc 18240
atcatctggt agagatgctc taagagtttt tagcctttta tgggcttctc ttgttctatg 18300
ttttacgaac atgcttttta cctatgttta tgttcataac gtggttaggt ctatttaagc 18360
cccctaaact atacagtaat aaatattttt tcccgaatct tttgttcgga caatcaacac 18420
ccctacaggc ttatacgtga aacggtttgg ttgagtccct aactacgcca catgggcttg 18480
ttttgttgat gtagaaatga ttaaagacaa gactcaaatt gtacatctct ccttttcttt 18540
catgatgttg cccaatgatt taatatacgg tcacacgatg ataagcgacc gcctatacta 18600
aaaagaaatg gattgtgcta tttctcccaa tcgcccaaac cctcgatgaa aggttttcct 18660
tctccaaatc atcaacttgg ccatagtaaa cacaaactca agctctttcg ctagggatat 18720
aaatggccca aataatgtgt ccctttctac actagataat ggcctaatgc cccatttatc 18780
aatgcaagtg ttattcataa catggtatca acaacatctt ttgagttttt ctaaggtttc 18840
tttttggatc atcaaacat 18859
<210> 4
<211> 1402
<212> PRT
<213> Triticum aestivum cv Renan
<400> 4
Met Glu Gly Leu Ala Arg Glu Thr Asn Pro Ser Ser His His Gln Asp
1 5 10 15
Phe Thr Ala Cys Ala Ser Asp Glu Arg Pro Asp Glu Ser Glu Leu Glu
20 25 30
- 52 031178
Leu Ala Ser 35 Arg Gln Arg Gln Asn Gly Ala Ala Asn Thr Glu His Val
40 45
Ser Glu Asn Met Leu Leu Asp Ser Ser Lys Leu Gly Ala Leu Lys Arg
50 55 60
Arg Glu Phe Phe Asp Asn Leu Leu Lys Asn Leu Glu Asp Asp His Leu
65 70 75 80
Arg Phe Leu Arg Gly Gln Lys Glu Arg Ile Asp Arg Val Asp Val Lys
85 90 95
Leu Pro Ala Ile Glu Val Arg Tyr Asn Asn Leu Phe Val Glu Ala Glu
100 105 110
Cys Arg Val Thr Lys Gly Asn His Leu Pro Ser Leu Trp Asn Ser Thr
115 120 125
Lys Gly Ala Phe Ser Gly Leu Val Lys Leu Leu Gly Phe Glu Thr Glu
130 135 140
Arg Ala Lys Thr Asn Val Leu Glu Asp Val Ser Gly Ile Ile Lys Pro
145 150 155 160
Cys Arg Leu Thr Leu Leu Leu Gly Pro Pro Gly Cys Gly Lys Ser Thr
165 170 175
Leu Leu Arg Ala Leu Ala Gly Lys Leu Asp Lys Ser Leu Lys Val Thr
180 185 190
Gly Asp Ile Ser Tyr Asn Gly Tyr Glu Leu His Glu Phe Val Pro Glu
195 200 205
Lys Thr Ala Val Tyr Ile Asn Gln His Asp Leu His Ile Ala Glu Met
210 215 220
Thr Val Arg Glu Thr Leu Asp Phe Ser Ala Gln Cys Gln Gly Val Gly
225 230 235 240
Arg Arg Pro Lys Ile Leu Lys Glu Val Asn Thr Arg Glu Ser Val Ala
245 250 255
Gly Ile Ile Pro Asp Ala Asp Ile Asp Leu Tyr Met Lys Val Val Ala
260 265 270
Val Glu Ala Ser Glu Arg Ser Leu Gln Thr Asp Tyr Ile Leu Lys Ile
275 280 285
- 53 031178
Met Gly 290 Leu Glu Ile Cys Ala 295 Asp Thr Met Val Gly 300 Asp Ala Met Arg
Arg Gly Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr Thr Ala Glu Met
305 310 315 320
Ile Val Gly Pro Ala Ser Ala Tyr Phe Met Asp Glu Ile Ser Asn Gly
325 330 335
Leu Asp Ser Ser Thr Thr Phe Gln Ile Ile Asn Cys Phe Gln Gln Leu
340 345 350
Thr Asn Ile Ser Glu Tyr Thr Met Val Ile Ser Leu Leu Gln Pro Thr
355 360 365
Pro Glu Val Phe Asp Leu Phe Asp Asp Leu Ile Leu Met Ala Glu Gly
370 375 380
Lys Ile Ile Tyr His Gly Pro Arg Asn Glu Ala Leu Asn Phe Phe Glu
385 390 395 400
Glu Cys Gly Phe Ile Cys Pro Glu Arg Lys Ala Ala Ala Asp Phe Leu
405 410 415
Gln Glu Ile Leu Ser Trp Lys Asp Gln Gln Gln Tyr Trp Leu Gly Pro
420 425 430
His Glu Ser Tyr Arg Tyr Ile Ser Pro His Glu Leu Ser Ser Met Phe
435 440 445
Arg Glu Asn His Arg Gly Arg Lys Leu His Glu Gln Ser Val Pro Pro
450 455 460
Lys Ser Gln Leu Gly Lys Glu Ala Leu Ala Phe Asn Lys Tyr Ser Leu
465 470 475 480
Gln Lys Leu Glu Met Phe Lys Ala Cys Gly Ala Arg Glu Ala Leu Leu
485 490 495
Met Lys Arg Asn Met Phe Val Tyr Val Phe Lys Thr Gly Gln Leu Ala
500 505 510
Ile Ile Ala Leu Val Thr Met Ser Val Phe Leu Arg Thr Arg Met Thr
515 520 525
Ile Ser Phe Thr His Ala Asn Tyr Tyr Met Gly Ala Leu Phe Phe Ser
530 535 540
- 54 031178
Ile 545 Phe Met Ile Met Leu 550 Asn Gly Ile Pro Glu 555 Met Ser Met Gln Ile 560
Gly Arg Leu Pro Ser Phe Tyr Lys Gln Lys Ser Tyr Tyr Phe Tyr Ser
565 570 575
Ser Trp Ala Tyr Ala Ile Pro Ala Ser Val Leu Lys Val Pro Ile Ser
580 585 590
Ile Leu Asp Ser Leu Val Trp Ile Ser Ile Thr Tyr Tyr Gly Ile Gly
595 600 605
Tyr Thr Pro Thr Val Ser Arg Phe Phe Cys Gln Phe Leu Ile Leu Cys
610 615 620
Leu Leu His His Ser Val Thr Ser Gln Tyr Arg Phe Ile Ala Ser Tyr
625 630 635 640
Phe Gln Thr Pro Ile Val Ser Phe Phe Tyr Leu Phe Leu Ala Leu Thr
645 650 655
Val Phe Leu Thr Phe Gly Gly Phe Ile Leu Pro Lys Thr Ser Met Pro
660 665 670
Gly Trp Leu Asn Trp Gly Phe Trp Ile Ser Pro Met Thr Tyr Ala Glu
675 680 685
Ile Ser Ile Val Ile Asn Glu Phe Leu Ala Pro Arg Trp Gln Lys Glu
690 695 700
Ser Ile Gln Asn Ile Thr Ile Gly Asn Gln Ile Leu Val Asn His Gly
705 710 715 720
Leu Tyr Tyr Ser Trp His Tyr Tyr Trp Ile Ser Phe Gly Ala Leu Leu
725 730 735
Gly Ser Ile Leu Leu Phe Tyr Ile Ala Phe Gly Leu Ala Leu Asp Tyr
740 745 750
Arg Thr Pro Thr Glu Glu Tyr His Gly Ser Arg Pro Thr Lys Ser Leu
755 760 765
Cys Gln Gln Gln Glu Lys Asp Tyr Thr Ile Gln Asn Glu Ser Asp Asp
770 775 780
Gln Ser Asn Ile Ser Lys Ala Lys Val Thr Ile Pro Val Met His Leu
- 55 031178
785 790 795 800
Pro Ile Thr Phe His Asn Leu Asn Tyr Tyr Ile Asp Thr Pro Pro Glu
805 810 815
Met Leu Lys Gln Gly Tyr Pro Thr Arg Arg Leu Arg Leu Leu Asn Asn
820 825 830
Ile Thr Gly Ala Leu Arg Pro Gly Val Leu Ser Ala Leu Met Gly Val
835 840 845
Ser Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu Ala Gly Arg Lys
850 855 860
Thr Gly Gly Tyr Ile Glu Gly Asp Ile Arg Ile Gly Gly Tyr Pro Lys
865 870 875 880
Val Gln Glu Thr Phe Val Arg Ile Leu Gly Tyr Cys Glu Gln Val Asp
885 890 895
Ile His Ser Pro Gln Leu Thr Val Glu Glu Ser Val Thr Tyr Ser Ala
900 905 910
Trp Leu Arg Leu Pro Ser His Val Asp Glu Gln Thr Arg Ser Lys Phe
915 920 925
Val Ala Glu Val Leu Glu Thr Val Glu Leu Asp Gln Ile Lys Asp Val
930 935 940
Leu Val Gly Ser Pro Gln Lys Asn Gly Leu Ser Met Glu Gln Arg Lys
945 950 955 960
Arg Leu Thr Ile Ala Val Glu Leu Val Ser Asn Pro Ser Ile Ile Leu
965 970 975
Met Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu Asp Thr Arg Ser Ala Ala Ile Val
980 985 990
Ile Arg Ala Val Lys Asn Ile
995
Cys Glu Thr Gly Arg Thr Val Val Cys 10001005
Thr Ile His Gln Pro Ser Thr Glu
10101015
Ile Phe Glu Ala Phe Asp Glu
1020
Leu Ile Leu Met Lys Ser Gly Gly Lys Thr
10251030
Ile Tyr Ser Gly Pro
1035
- 56 031178
Ile Gly 1040 Glu Arg Ser Cys Lys 1045 Val Ile Glu Tyr Phe 1050 Glu Lys Ile
Ser Gly Val Pro Lys Ile Lys Ser Asn Cys Asn Pro Ala Thr Trp
1055 1060 1065
Met Met Asp Val Thr Ser Thr Ser Met Glu Val Gln His Asn Met
1070 1075 1080
Asp Phe Ala Ile Leu Tyr Glu Glu Ser Ser Leu His Arg Glu Ala
1085 1090 1095
Glu Asp Leu Val Glu Gln Leu Ser Ile Pro Leu Pro Asn Ser Glu
1100 1105 1110
Asn Leu Cys Phe Ser His Ser Phe Ala Gln Asn Gly Trp Ile Gln
1115 1120 1125
Leu Lys Ala Cys Leu Trp Lys Gln Asn Ile Thr Tyr Trp Arg Ser
1130 1135 1140
Pro Gln Tyr Asn Leu Arg Arg Ile Met Met Thr Val Ile Ser Ala
1145 1150 1155
Leu Ile Tyr Gly Ile Leu Phe Trp Lys His Ala Lys Val Leu Asn
1160 1165 1170
Asn Glu Gln Asp Met Leu Ser Val Phe Gly Ala Met Tyr Leu Gly
1175 1180 1185
Phe Thr Thr Ile Gly Ala Tyr Asn Asp Gln Thr Ile Ile Pro Phe
1190 1195 1200
Ser Thr Thr Glu Arg Ile Val Met Tyr Arg Glu Arg Phe Ala Gly
1205 1210 1215
Met Tyr Ser Ser Trp Ser Tyr Ser Phe Ala Gln Ala Phe Ile Glu
1220 1225 1230
Ile Pro Tyr Val Phe Ile Gln Val Val Leu Tyr Thr Leu Ile Val
1235 1240 1245
Tyr Pro Ser Thr Gly Tyr Tyr Trp Thr Ala His Lys Phe Leu Trp
1250 1255 1260
Phe Phe Tyr Thr Thr Phe Cys Ser Ile Leu Ser Tyr Val Tyr Val
1265 1270 1275
- 57 031178
Gly Leu 1280 Leu Leu Val Ser Ile 1285 Thr Pro Asn Val Gln 1290 Val Ala Thr
Ile Leu Ala Ser Phe Phe Asn Thr Met Gln Thr Leu Phe Ser Gly
1295 1300 1305
Phe Ile Leu Pro Ala Pro Gln Ile Pro Lys Trp Trp Thr Trp Leu
1310 1315 1320
Tyr Tyr Leu Thr Pro Thr Ser Trp Ala Leu Asn Ala Leu Leu Thr
1325 1330 1335
Ser Gln Tyr Gly Asn Ile Glu Lys Glu Val Lys Ala Phe Gly Glu
1340 1345 1350
Thr Lys Ser Val Ser Ile Phe Leu Asn Asp Tyr Phe Gly Phe His
1355 1360 1365
Gln Asp Lys Leu Ser Val Val Ala Ala Val Leu Val Ala Phe Pro
1370 1375 1380
Phe Val Leu Ile Ile Leu Phe Ser Leu Ser Ile Glu Lys Leu Asn
1385 1390 1395
Phe Gln Lys Arg
1400 <210> 5 <211> 4209 <212> ДНК <213> Triticum aestivum cv Renan <400> 5
atggagggcc tcgcaagaga gaccaaccca tcatcccacc atcaagattt caccgcctgt 60
gcgagtgacg agcgcccgga tgagtccgag ttagaattgg catcgcgaca gcgccagaat 120
ggtgctgcaa acaccgagca tgtgagtgag aacatgctgc ttgacagcag caagttggga 180
gctctcaaga ggcgcgagtt cttcgacaac ctgctaaaga acctcgaaga cgaccacctc 240
cgctttctgc gcggacaaaa ggaaagaatt gacagggttg atgtcaagtt gccagcaata 300
gaggtgaggt ataataatct gtttgtggag gcagagtgca gagttactaa aggaaatcac 360
ctgccatctc tatggaatag taccaaaggt gccttctcgg gcctcgtgaa gttgctaggc 420
ttcgaaacgg aaagagcaaa aaccaacgtt cttgaagatg tcagtggaat catcaaaccc 480
tgcagattga ctcttctact gggacctcct ggatgtggca aaagcactct gttgcgagct 540
cttgccggga aactagataa atctctaaag gtaacagggg atatctctta taatggttat 600
- 58 031178
gaacttcatg aatttgtacc tgagaaaaca gctgtgtata tcaaccaaca tgatctgcac 660
atagctgaga tgactgtgag ggaaacttta gacttctcag cccagtgcca aggtgttgga 720
agaagaccaa aaatactcaa ggaggtgaac acaagggaga gtgtggctgg gatcatacct 780
gatgcggaca tcgatctata catgaaggta gtagcagttg aagcttcaga gcgaagccta 840
cagacagatt atattttgaa gatcatgggg ctagagatat gcgcagacac gatggttggg 900
gatgcaatga gaagaggaat atcagggggg cagaagaaaa gattaaccac agccgagatg 960
attgtgggcc ccgcaagtgc atactttatg gatgaaatat caaatggtct ggatagctct 1020
accacttttc aaataatcaa ttgtttccag caactgacaa acatcagcga gtacacgatg 1080
gttatttcac ttcttcaacc aacacctgag gtatttgatc tttttgatga cctcatacta 1140
atggcagaag ggaagattat ctaccatggc cctcgaaatg aagctctcaa tttttttgag 1200
gagtgtgggt tcatatgccc agaaagaaaa gcggcagctg actttcttca agagatcttg 1260
tcctggaagg accaacaaca gtactggttg ggtccacatg aatcatacag atatatctca 1320
cctcatgaat tatcaagcat gttcagggag aatcacaggg ggagaaaact acatgaacaa 1380
agtgtacctc ccaaaagcca gttgggcaag gaagctttag cattcaataa gtattcgcta 1440
caaaaactgg aaatgttcaa agcctgtgga gcaagggaag cactcctaat gaaaaggaat 1500
atgtttgttt atgtcttcaa aacaggccag cttgccatta ttgcactcgt aacaatgtct 1560
gtattccttc gaactcgcat gacaataagt ttcactcatg caaattacta tatgggagca 1620
ttattttttt ccatcttcat gattatgtta aatggcatac cagagatgag catgcagatt 1680
gggagactcc caagttttta caagcaaaag agctactatt tctattcatc atgggcatat 1740
gcaataccag cttcagtcct aaaggtccct atttccatac tggattcgct tgtatggata 1800
tctatcacat attatggtat tggttataca cctactgttt caaggttctt ctgccagttt 1860
ctgatacttt gtcttctcca tcattcagtc acctcgcagt atcgatttat tgcttcatac 1920
ttccaaacac ctattgtgtc tttcttctac ctttttcttg ctctaacagt attccttaca 1980
ttcggaggct tcattcttcc caagacctcc atgccaggat ggttaaactg gggattttgg 2040
atatctccaa tgacatatgc agaaatcagc atagttatta acgaattctt ggcaccaaga 2100
tggcagaagg aaagtattca aaacataaca attgggaacc aaatcctggt taatcatggc 2160
ctatattaca gttggcatta ttattggata tcctttggag ccttgcttgg atctattctc 2220
ttattttata tcgcttttgg attggcacta gattacagaa cacctacaga agaatatcat 2280
ggaagcaggc ctacaaagag cttatgtcaa cagcaggaaa aagattacac tattcaaaat 2340
gaatctgatg atcaatcaaa tatttccaaa gcaaaggtga ctataccagt tatgcatctt 2400
ccaattacat tccacaatct gaactactac attgataccc caccggaaat gctgaaacaa 2460
ggctatccaa caagaagact tcgactgctt aataacataa ctggtgcttt acgtcccggt 2520
- 59 031178
gttctttctg cactaatggg tgttagtgga gctgggaaga caactctact agatgtatta 2580
gcaggaagga aaacaggagg ttatattgaa ggggacataa gaataggtgg atatcccaag 2640
gtgcaggaaa catttgtcag aatcttgggt tactgcgaac aagtcgacat acattcccca 2700
cagcttacag ttgaagagtc tgtaacttat tctgcgtggc ttcgtctgcc ttctcatgtc 2760
gacgaacaaa caagatctaa atttgttgct gaagtccttg aaactgttga actagatcaa 2820
ataaaagatg tcttagtggg gtcaccacag aaaaatggat tgtccatgga gcagagaaag 2880
aggctaacga ttgcagtcga gcttgtttca aacccatcaa tcatactaat ggatgaacca 2940
acaacaggtt tagatacaag gtcagcagcc attgttattc gtgcagtcaa aaatatttgt 3000
gaaacaggaa ggacagtagt ctgtacaatc catcagccga gcactgaaat ttttgaggca 3060
tttgatgagc tcatattaat gaaaagcggt gggaaaacaa tctacagtgg accaatagga 3120
gagcgctcct gcaaagtgat cgagtacttt gagaaaattt ctggagtccc aaaaataaag 3180
agtaactgca atccagctac ttggatgatg gatgtaacat cgacatcaat ggaggttcaa 3240
cacaatatgg actttgcaat tttgtatgaa gagtcgtcac tgcatagaga agctgaagat 3300
ctagtggagc agctaagtat cccattacca aattcagaaa atctatgttt ctcccatagt 3360
tttgcacaga atggctggat tcaacttaaa gcttgcttgt ggaaacaaaa cataacttac 3420
tggagaagtc ctcagtataa cttgaggcgc attatgatga ctgtcatatc tgccctgatc 3480
tacggaatat tgttctggaa gcatgcaaaa gtattaaaca acgagcagga catgctcagt 3540
gtttttggtg caatgtattt gggtttcacc accataggcg cttataatga tcagacaatc 3600
ataccattca gtacaactga gcgtattgta atgtatcgtg agagatttgc aggaatgtat 3660
tcatcttggt catattcatt cgcacaggct ttcattgaga taccctatgt atttatccaa 3720
gtggtactgt atacgttaat tgtctatccg tcaactggtt attattggac agcacacaaa 3780
ttcctatggt tcttctacac cacattttgt tcaattctct cctatgttta tgttgggttg 3840
cttcttgttt ccataacccc caatgttcaa gtagctacca tactggcttc atttttcaac 3900
accatgcaaa cactattctc aggatttatt ttacctgcac ctcaaatccc gaagtggtgg 3960
acttggctct actatctcac tcctacatct tgggcactca atgccctctt gacatcacaa 4020
tacggaaaca tagaaaaaga ggtgaaagca tttggagaaa ctaaatcagt ttcaatcttc 4080
ttgaatgact attttgggtt tcatcaagat aagttgagcg tagtagcagc tgtcctcgtt 4140
gcctttcctt ttgtgttgat aatcttgttt tcgttgtcca ttgagaaact taatttccag 4200
aagaggtaa 4209 <210> 6 <211> 15120 <212> ДНК
- 60 031178 <213> Aegilops tauschii
<400> 6 gcagccaact cgagatataa ctagaaggca tctggagcgt cggtctcgag ctgttacaca 60
ctcgctcacc gggcccctcc tagcgccctc aacaaccttt gacctccccc ccaacggtgg 120
taccagacgc cccggaacta gccgcactcc cccccccccc tccgaatggg ggcaacgaaa 180
acaaggggca cccaggcgcc aagaataaga agagagggcc ggtgcgctcc gctaggtacc 240
aacaggctca ccctccctcc gcggccgttg ttgcctccat cgagccagcc gccgactccg 300
accacgatgg ccggccttgc ttcaactgtg tgatccccgg ttacttccaa gtcgcatgcc 360
ccaatcgtcc gatgtgctac ttgtgtaagg atcccgggca tcccgctctg ttgtgcttga 420
accggtcggt ttcggaggag ttgatgatgt acgggcacgg cccagggggc atgcgcttct 480
tccacatcaa ggtcccggat gccccacccc ctgcgaaaag atcagatcta ttataaagat 540
tcaccagaag tacaaaacac ctcaaaacat aataaaattt acatcaaggt ccatggagga 600
atggaccacc gaacggccat tgcctcagcc agaaccgagc cgccgacacg ccgctatcga 660
cgctcccata ccggagccgg tctgaccttg tcgatgatag ccgaaaagtc ttcgtgtgcg 720
tgcccttaag gatcagcgtc ccagagccgc agtcgtcacc gttgaatcct tgaatcagtc 780
taaagaattt gacaccaaat atcgccgttg cgtacgcacg gcgagaaact ctaacctctc 840
cgccccgagg agctggcaga aatctacgcc gaagctccgt ctaatccgtc ctagaggacg 900
aacttgagga ggatcggaac ccgaaagact gactcgaaga agaagcgccg ccatccgtcc 960
aaacgccgcc cctgcgagaa ctaaaactct acctgtctac tagccggaga caaggcacca 1020
gaaatcccct ccctgccacc agccgccgga acggcaggcg gagggaaggg gaatccacgg 1080
gctcgccgat gaagatcaag gggaggaagg cttttcacga caggggaaag aaaagcaatc 1140
ttaatctttt atatctttac aaccaaaatt ccaaattgag ttttggttcc atattcatgt 1200
ttctattaca agggctttaa ataatatcca tttttaatac gatttgatga gtttttaaaa 1260
cttcattaag ttgcagctgc tgaaacttgg taccagcaag cgacaaaatc atgaaacttg 1320
atgcgagcga atggcaaaat cgtaagtttc aaaaactgaa acttaaaact tgatgtgccg 1380
tcgtgcggaa ccatcgagca gccgggcagg tgcgtgccac gcgcctgcgt gcccctgcga 1440
gttttccgcg caagagcgcg aacaaacggt actgcacata ttgcagtttc aagttgccga 1500
gtgcgactct gtggtcaatg tcgtcgaagg ctctttcatc aagtaattac aataccattt 1560
caactttcat gggtccgtgc ctgccaggtt caaagttcca agatggttat gtgcaaccga 1620
ctgtgtgtcc cacatccaca catcgaagca gaggtctcgt gaagtctttc caaacgagca 1680
agagcaacat caaggacgac cagcggaggg ggtctttcca aacgagtggt ttctatcctc 1740
ccgtagaatg ggtgatccac gacaagtcta tgagtcgttc tgaggttgag actaataaat 1800
- 61 031178
taattgtggc taatcgacac tagtcgacac cgaagttgct actcacagac tagtcgacac 1860
tgaagtgtag tcggccccgg agttgtgact tctagactag tctatagact tgtccttcga 1920
ctcataatcc atgctcgtca tccagccccc attaacccca tccatgtgac tccctgcgta 1980
acataacctg ttcggttact ccccttctaa tccatgacta aaattgcact tcaatctttt 2040
tccgaagtcc cgttttgcgg tggcatatat ccaatttaca agctaaaaaa aagtgcggtg 2100
gggttctttc ccgtcacaaa gaaaacccaa aataaggcaa atcaggtctc cgaatcagga 2160
gtactgtgaa gtcttcacca gtaccatata atacatgact tatggctgtc atcttccaga 2220
atgtgcgttt ccatgctaat agttagtttg aagtcaacac atgactggtc tttccaactc 2280
ttctgactga tgatgtccgt atgggaaaaa gcgtgcgtac atgctcgcca aaaccttata 2340
tatgtactct aaagagaagg aaatgactgc ttagagtacg gctaggcaat agcaaagggc 2400
gtcgatttaa ctcacccatc ttgagatgga gggcctcgca agagagacca acccatcatc 2460
ccaccatcaa gatttcaccg cctgtgcgag tgacgagcgc ccggatgagt ccgagttaga 2520
attggcatcg cgacagcgcc agaatggtgc tgcaaacacc gagcatgtga gtgagaacat 2580
gctgcttgac agcagcaagt tgggagctct caagaggcgc gagttcttcg acaacctgct 2640
aaagaacctc gaagacgacc acctccgctt tctgcgcgga caaaaggaaa gaattgacag 2700
gcatgttttc tttttcagaa cactgttcta agtaactgga tgaagattag actctgttta 2760
tgcaactgtt tatttttccc ctgtgatcca tttccacagg gttgatgtca agttgccagc 2820
aatagaggtg aggtataata atctgtttgt ggaggcagag tgcagagtta ctaaaggaaa 2880
tcacctgcca tctctatgga atagtaccaa aggtgccttc tcggtaagaa acctctgaaa 2940
tgattgattt ttattatgca ccaaatagca gcatctgaag caactgtttt ttcgacgaat 3000
cataaatgga actgataaga cacagatata tgttggatgg tattgactaa cttacccgtt 3060
ttcatttgag ttacagggcc tcgtgaagtt gctaggcttc gaaacggaaa gagcaaaaac 3120
caacgttctt gaagatgtca gtggaatcat caaaccctgc aggtatgtgc catgtttcat 3180
gagtgtttag tataaaaatg gaaaagaaac cataaacata caaaagaaaa cgtgcgaaat 3240
ttagtgcatc aagtgtctgt agttcttgct ttagagatta aggttagttc tgattccata 3300
tgttcccatc tttgtagatt gactcttcta ctgggacctc ctggatgtgg caaaagcact 3360
ctgttgcgag ctcttgccgg gaaactagat aaatctctaa aggtacaaat actgtcttcc 3420
tttcataatt aaagaaaaaa gcatgtcctt gttttcactg attgcatctg ctcctataaa 3480
gatctcaaga ttactcaata cttggccaaa tgaaagaaca aaaaaattaa gatctcaacc 3540
agctgcacac cgcagtaaac tgctctctgt cctctggccg ctacataata gaccacatat 3600
gaagccagta cacaaataaa tgtataacct acaatctttt ctcaaagtct acatcattca 3660
tgaatagcca aagagccaaa cttaagtttt tatcaatacc ccacaaacaa taaactcgcg 3720
- 62 031178
cctcttgaga gctccgaact tgctgctgtc aagcagcaag ttctcacgca catgctcaaa 3780
tgtttgcagc accattctgg cgccgtcgca ctgacaattc taactcggac tcgtcgggac 3840
cctcgtggtc atacgccagc gctcccaaat cctgatacca gaacagataa tgacgctgac 3900
gctgccagag gagacggcgc aattgcctta atcctcggca catagtgtcg caacacatac 3960
atgtgcccaa ctactcctcg gcaccacgcc cgccggagga caagccggcg ctcctgtccc 4020
ctaaccatga caccgacatc aagaacctcc gcctagaact cttgcacaac ctcctccgtc 4080
ttctggtgac agaaacgcgc caccggtgac acaaagccac cgtcatccgc atatgaccca 4140
acctccagca gcatcctgag attcaacaca tgacacctcc gctgccctct cctccatggc 4200
atcctcggca gccaggaaag ataatctcaa tccgctggat ccccctaaag taggcgtcta 4260
ggcgatcact gtggcggcag ggtgagtcac cttcagggca gcgctctcat ccaattccta 4320
tgtaggtttg ctactactgc acggggacct atcagatgta tctcacagac caattagata 4380
aatcgatggt cgaatttgga agttataatg agatacactg ttgtgattaa atttgatcac 4440
gctatattgt agaggaaagt gtaattccct tgaaatgaac aacatgcaac atagtagtat 4500
agaatcgccg caaattttcc ttgcgtttgg atataaaact caggcccatg ttccatcttt 4560
ttaactgtgt atatgcccta gcagcgtgaa catactactg gtcctgctag aacaagcggc 4620
gggtaaagat gggcgcctgc ttcatacttg ccagtaaatt aggatgattg ccttgcagaa 4680
aatatggcca atattaccat taagcctatt taccgaaatc taacacaaac ttttgactgt 4740
aggaaacaaa gaatcaattc tactaacaga tttttctttt gttcgagaaa atgcttatgc 4800
gtgtgtcgat gcattaaaag gaaagagaat aacagccatt caggattaca agccctaaga 4860
aggaccatgg aactcctgaa ccaaggttac acgccaggca ggaggagctg gagttttgcc 4920
gcacgggcga aacccagcaa gtcgcctccg tgctacgcta ggtctagcca tactgaagga 4980
tacatcattg tgatgagcac caggccgtca tctgaatgag tgtcagacaa ctgacagaat 5040
aacattactc acatcaaaag caaaagttgt ccatcacctc agagtctatg gttttcatta 5100
gttgcacatg gttaacgacc tctgacaaag gcagaaattc aagaatgcct tgcactgaac 5160
gacggatatc agtatactta agttgctttt ttacagcacc aactgatgct ggagttatca 5220
aattgaaatg tcccaactcc ccagcaaagc cacctatatt gtctccaaaa catataattg 5280
ttggcatggt ttccacctgt atgaaaccgg cactatttac tggctcaaat gagtagttcg 5340
tcatgaagct agtacttata ctgactgctg aatactaata aataacagct tttaattatt 5400
ttcagaccaa gtactttcag agaaaactat tttcagatca gcttctaatt aatactccct 5460
cagttccaaa atataaggtg tattagtttt ttcaagaggc attcatgttt gaccaagttt 5520
ttagaaaaaa aatatcaata tctacaatac caaatttgta tgattagatt tatcacgaaa 5580
- 63 031178
agtatttttc atattttatt tattttatat tgcagaatgt taatatttta ttctataatc 5640
ttggtcaaac atacataagt ttgacttgca cgaacactga tgcaccttat attctggaac 5700
ggagggagca aataacagca cacaatagat tatgggtacc tgctgggtat tcctgcttag 5760
agatacaacc acagaaaagc agagcagaac agcacaaatg ccctttagcc attgacacta 5820
caattagttt caaagctaca attttgcaaa atcatgaaca aaagaagaaa aaaaatggca 5880
aactgaatgt aacgatgcaa gcttttacag gtaacagggg atatctctta taatggttat 5940
gaacttcatg aatttgtacc tgagaaaaca gctgtgtata tcaaccaaca tgatctgcac 6000
atagctgaga tgactgtgag ggaaacttta gacttctcag cccagtgcca aggtgttgga 6060
agaagaccaa gtaagtctat tggacagtcc tcacaagaat tcatgatcaa aaataagttc 6120
ttaaataatc acaacatttg ttgctcacta aatttgtttg cccaaagaaa tactcaagga 6180
ggtgaacaca agggagagtg tggctgggat catacctgat gcggacatcg atctatacat 6240
gaaggtaaaa aatcgtgtct cctatgtact ggctggcatt atcctttctc actttacaat 6300
taaaaaaaaa acagacctgc ttatctgagt tacaaagaaa aggtaattca acgtcgaatg 6360
aatattggaa ctgctctagc agaataatat ttggttgtat taaagctaag ctagcttttc 6420
aatttttcat tagtcaacac ttctgtttct gtttctacaa attaaacgta actgtttttc 6480
aaaagtaaag cggctaatgc aggtagtagc agttgaagct tcagagcgaa gcctacagac 6540
agattatatt ttgaaggtac cccttgccaa aacatctaag tttatgcata acttggtgct 6600
gaaggcagat aggaacaaga tactaacaga atcacaatac tgatttattt gtagatcatg 6660
gggctagaga tatgcgcaga cacgatggtt ggggatgcaa tgagaagagg aatatcaggg 6720
gggcagaaga aaagattaac cacaggtata gtaaacccaa tgggaaatac attaaccaac 6780
aagggatcac cttgtatata atctttcacc tacttgtacc agccgagatg attgtgggcc 6840
ccgcaagtgc atactttatg gatgaaatat caaatggtct ggatagctct accacttttc 6900
aaataatcaa ttgtttccag caactgacaa acatcagcga gtacacgatg gttatttcac 6960
ttcttcaacc aacacctgag gtatttgatc tttttgatga cctcatacta atggcagaag 7020
ggaagattat ctaccatggc cctcgaaatg aagctctcaa tttttttgag gagtgtgggt 7080
tcatatgccc agaaagaaaa gcggcagctg actttcttca agaggtaatt gttctcaatc 7140
acaaaaataa ctgcagcaac tgagatgatt tgcacgttga tgaaaccagt ttttttttct 7200
aattttgaaa tcattagatc ttgtcctgga aggaccaaca acagtactgg ttgggtccac 7260
atgaatcata cagatatatc tcacctcatg aattatcaag catgttcagg gagaatcaca 7320
gggggagaaa actacatgaa caaagtgtac ctcccaaaag ccagttgggc aaggaagctt 7380
tagcattcaa taagtattcg ctacaaaaac tggaaatgtt caaagcctgt ggagcaaggg 7440
aagcactcct aatgaaaagg aatatgtttg tttatgtctt caaaacaggc caggttaaac 7500
- 64 031178
ttcattctga ggcactcttt cctgtacaaa gtaaattatg agtccaaact gagatttact 7560
ccttgatgca gcttgccatt attgcactcg taacaatgtc tgtattcctt cgaactcgca 7620
tgacaataag tttcactcat gcaaattact atatgggagc attatttttt tccatcttca 7680
tgattatgtt aaatggcata ccagagatga gcatgcagat tgggagactc ccaagttttt 7740
acaagcaaaa gagctactat ttctattcat catgggcata tgcaatacca gcttcagtcc 7800
taaaggtccc tatttccata ctggattcgc ttgtatggat atctatcaca tattatggta 7860
ttggttatac acctactgtt tcaaggtaaa tatggaaatt tctcaacctt acaatgataa 7920
gaacaaacat tgagaaactc ttaacatatt ttatttatat tcatttctag gttcttctgc 7980
cagtttctga tactttgtct tctccatcat tcagtcacct cgcagtatcg atttattgct 8040
tcatacttcc aaacacctat tgtgtctttc ttctaccttt ttcttgctct aacagtattc 8100
cttacattcg gaggcttcat tcttcccaag agtaagataa ccattgctca ttgaatgcat 8160
ataacttata agcctagcaa atctgaacaa atttgttact ttattgtccc agcctccatg 8220
ccaggatggt taaactgggg attttggata tctccaatga catatgcaga aatcagcata 8280
gttattaacg aattcttggc accaagatgg cagaaggtga aatgattttt ttttcaaata 8340
aaatattgag tgataagctg atgtcaagca tctaacatca ttgctgcttg tattattttc 8400
aggaaagtat tcaaaacata acaattggga accaaatcct ggttaatcat ggcctatatt 8460
acagttggca ttattattgg atatcctttg gagccttgct tggatctatt ctcttatttt 8520
atatcgcttt tggattggca ctagattaca gaacacgtaa gtttgctact aatgaacaaa 8580
gtgcatatat attgggcttg ggctccatgg tgcccaggca acatgatttg aaatacagca 8640
aatttgggta atgcatttag gaaattccta ttttggatga tataactggt tgtcattgct 8700
gggtataatt tcgaaatacc tactcgatcc caaatatttt tggtaaactc atccatatag 8760
cagttttata tacatacagg tacctagaat tcaagcaata acaaaacaaa gtacagactg 8820
aaaagatcaa acttgtttgg aataaattag acttcacaaa ttttcatgca atatatctag 8880
atggatctgg atataggaat atagtgctga ggcactatgg agcaccagtt aattagactt 8940
tatacacgaa tgttacttac tttagaatcc tactataatt ttgccaattt cagctacaga 9000
agaatatcat ggaagcaggc ctacaaagag cttatgtcaa cagcaggaaa aagattacac 9060
tattcaaaat gaatctgatg atcaatcaaa tatttccaaa ggtaaagaca taaacatctc 9120
aatacgaatt aatagtaaaa aatatgaagg tcccataaaa gtgcatgctt cttcaatgca 9180
ttcatcttat tgcagcaaag gtgactatac cagttatgca tcttccaatt acattccaca 9240
atctgaacta ctacattgat accccaccgg taattaagca agccccctat gcatttgttt 9300
tgtagttttt tatatttctt gcctggttcg tatttgatga tgaaggtatg taagaaatgt 9360
- 65 031178
actctcttgt aggaaatgct gaaacaaggc tatccaacaa gaagacttcg actgcttaat 9420
aacataactg gtgctttacg tcccggtgtt ctttctgcac taatgggtgt tagtggagct 9480
gggaagacaa ctctactaga tgtattagca ggaaggaaaa caggaggtta tattgaaggg 9540
gacataagaa taggtggata tcccaaggtg caggaaacat ttgtcagaat cttgggttac 9600
tgcgaacaag tcgacataca ttccccacag cttacagttg aagagtctgt aacttattct 9660
gcgtggcttc gtctgccttc tcatgtcgac gaacaaacaa gatctgtatg tcatcagtct 9720
cagagatata tcgaatttaa taagcatagc actagatgga taaataagag gcttacctaa 9780
gaaactaaca atattcttct tgttcctctc gtagaaattt gttgctgaag tccttgaaac 9840
tgttgaacta gatcaaataa aagatgtctt agtggggtca ccacagaaaa atggattgtc 9900
catggagcag agaaagaggc taacgattgc agtcgagctt gtttcaaacc catcaatcat 9960
actaatggat gaaccaacaa caggtttaga tacaaggtca gcagccattg ttattcgtgc 10020
agtcaaaaat atttgtgaaa caggaaggac agtagtctgt acaatccatc agccgagcac 10080
tgaaattttt gaggcatttg atgaggtaat ttaactttct aaatatatta gtatattaaa 10140
cacaatcaac acaaatacat ttttattata tatatcaagc acgatcaaca caattttttt 10200
tctggaaaaa tcaatatgtt tagtttcaaa actattagga ttaattaaag cccttgcctt 10260
caacagagca gggctaatct taatatgcac tacctctgta actaactccc accgtcccat 10320
aacactcgcg tccaaaaacg tcttatatta agttacagag gtacctccgt cccataatgt 10380
aagacgtttt ttgacactag tgttatggga cggagggagt agtacattat tagttattta 10440
aaatttaaaa catgtccttt gtgtttgcct ttctagtaaa taataatgat aggaaataat 10500
agtatggaaa tttgcaatat aagcgtgtca accatttcac tttgcgcaac ctagacctca 10560
aattgcactt ttgtcccctc aaatgatcaa ttatgtgcaa caaaaccctt caacttaaac 10620
tttgcttatc tgaaaccttc tattatttgg tttgttagat caagcatttt ctactgaaga 10680
tacctgatca gacccctttg aataatatat ctatgaataa acattgattt gagctaagta 10740
ggattggcat ctaaattata gtaagacgct taacaactat ttactactcc ctgtctcaaa 10800
atgtaagaca ttttttgacc ctttgaataa tatatctatg atataaacat tggtttgagc 10860
taagtaggat tggtatctaa attatagtaa gatgcttaac aactatttac tactccctct 10920
gtctcaaaat gtaagacatt ttttgacaca tgtaagacgt tttttgacat tatcagtgtc 10980
aaaaaatgtc ttacattttg agatagaggg agcatctagc atcctttttc tgtttcggga 11040
gaacatttct taccttaaat atttggcata tactttttgt acaaaaacaa ccccattata 11100
tcagtccgca tgaagaataa agtataaaca tgcaatgaca tgttttgatc tcttaattat 11160
ttgaacatct atgtgttcga tgtcagttaa tttttatctc ttatttgaac taagtgtcca 11220
cactgacaca aatttgtcat cgcacaaaat ttggactttc tgggcttgat tacaaaatta 11280
- 66 031178
aaacaatttt gagggcttat actggaaagt caccgaatag aatatttttt ggttttctga 11340
actatatgtt tatcacaaat cgacgtgact acggacagtt tatatttgct acttctctgt 11400
ttataataac aaaaagggta tagattttct ttattacagg gctagttgta gtcgaaagtt 11460
gcctataatg catgtagtaa attttgttgc agctcatatt aatgaaaagc ggtgggaaaa 11520
caatctacag tggaccaata ggagagcgct cctgcaaagt gatcgagtac tttgaggcaa 11580
gtttcttgaa catatttcca caaatgtatt tgcctttttc ttgattattc gttttcactg 11640
tttttttctg gaattggaac aataaacgtg agagttccaa aggaacgaac cccaaaacca 11700
gtgctcaaat gttcaacatg ccatagcaaa aacacttaag tcaactctag cagtcatttg 11760
tgttcaatat gtaacttggc taacaattca catgaaatat ataggttaat caaaattttg 11820
atgtgatcat atgtatttta catgttgaac ttaaaagcaa atgtgacaat aaacgtacag 11880
attggcaatg gaaactaaaa acatactgaa gaactttgtt tgcatatcta tgtatgtgtt 11940
tcggtgtttt cagagaggaa gcacggttgt ggcatggcac tgccatattt gtgacatgtg 12000
tcctttggtt ctaatagatt gaatttttct tgtccacttg atagaaaatt tctggagtcc 12060
caaaaataaa gagtaactgc aatccagcta cttggatgat ggatgtaaca tcgacatcaa 12120
tggaggttca acacaatatg gactttgcaa ttttgtatga agagtcgtca ctgcataggt 12180
acatatcttg tggatttagt taggatatcg agcaaaaggc aacatatatg aatagcttaa 12240
gcaaaataaa attcatctag caaaaaaatt tagccaaaca aaatacctcc atttgaagtt 12300
tggaagaatt aaagttactt ttctgcagag aagctgaaga tctagtggag cagctaagta 12360
tcccattacc aaattcagaa aatctatgtt tctcccatag ttttgcacag aatggctgga 12420
ttcaacttaa agcttgcttg tggaaacaaa acataactta ctggagaagt cctcagtata 12480
acttgaggcg cattatgatg actgtcatat ctgccctgat ctacggaata ttgttctgga 12540
agcatgcaaa agtattgtaa gttcactcct ttgttatcca caacattgca catcagttga 12600
cttcacagac tcattgcaaa attattctaa ctttctctta tctcttctaa gaaacaacga 12660
gcaggacatg ctcagtgttt ttggtgcaat gtatttgggt ttcaccacca taggcgctta 12720
taatgatcag acaatcatac cattcagtac aactgagcgt attgtaatgt atcgtgagag 12780
atttgcagga atgtattcat cttggtcata ttcattcgca caggtcagat aatgatcaca 12840
agcttgtaag agaagtaaaa tatacattga cactgatgct catatttatt caccttctac 12900
aggctttcat tgagataccc tatgtattta tccaagtggt actgtatacg ttaattgtct 12960
atccgtcaac tggttattat tggacagcac acaaattcct atggttcttc tacaccacat 13020
tttgttcaat tctctcctat gtttatgttg ggttgcttct tgtttccata acccccaatg 13080
ttcaagtagc taccatactg gcttcatttt tcaacaccat gcaaacacta ttctcaggat 13140
- 67 031178
ttattttacc tgcacctgta agtctttatc tcctcccaat atcgtaaact ttagctctcc 13200
aagatgtaac tggcacttct ttttgttagc aaaaatatgg ctgcccacct tgaatatata 13260
ccaactaaga aaataacaac ctacatgaga aattgtaatt gacgagattt tgtagtgtaa 13320
ttatgtaata atattatgga actaataaag gtctaatagg gcattatggg ctttacttta 13380
ttccagagtt catgttcgtg cagaagtctc ctattgtact acatctaggt tacccttata 13440
ggcatcctat taatgcattc tgccttacaa aggtatcaaa ttaggtttta gggtttttat 13500
cctggtaaac ttttctttat ctttttttgt caatattcac ctttgcaact tccccaccat 13560
gacacctttt tttccttctg ccccagatcc tcaattttac tgattgctta atttttgtga 13620
tcgatcaact gatctatcct cctgatagat cttagttttg ggaatattta agtagtaata 13680
tgtcaacaat acaaggacca accgcaacta taaggcatca ctggatgacg atacacagaa 13740
ccactccaat gttagtttaa catcataata gttatagaca taccatcttc agtttcatca 13800
ttaatacttc catttctatt ttctaggttg gaaattgata attattccag cgttgctcaa 13860
tagaataatc atgttctgtt caattgttag ggaagaatca tgaatagagg aaagcactaa 13920
tatgcatttt caattcacgt tgcagcaaat cccgaagtgg tggacttggc tctactatct 13980
cactcctaca tcttgggcac tcaatgccct cttgacatca caatacggaa acatagaaaa 14040
agaggtgaaa gcatttggag aaactaaatc agtttcaatc ttcttgaatg actattttgg 14100
gtttcatcaa gataagttga gcgtagtagc agctgtcctc gttgcctttc cttttgtgtt 14160
gataatcttg ttttcgttgt ccattgagaa acttaatttc cagaagaggt aagcaagttc 14220
tgacattcca acagacatga atctgtacat gttacagata tagctacttg ccttttttcc 14280
aactgcgaaa tgcagaatca gagctgattg ggtggctatt tttctcaaat ctgatgggta 14340
aacctcatga ataagtaatt gtgtacaata acttgattgt gctaagtacg attgtgagtt 14400
gtaatctttt tgtttcaccg ttcagaagaa tttgatggtt acaaatcatg taacctgctt 14460
tgaagaggat tttgcaattg tgttatgcct tagattactg aatgcatcaa gaggaaaatg 14520
agcacctaac tgaatgaacc tacgatttaa agcgagctta agcacagata acaaaaagct 14580
aacttggatt cccgcaccgt catcatcatg ccttaatatc cgtgcaaggt gtgtgagtgg 14640
tgggtggttt ctgaagagaa acgtggccac acgtcacggc atgcggggcg ccgtttggat 14700
ttcctttgag ctatataaaa cgggaacggc agcatggaat ggtacacttc tctcactttc 14760
acccatcttc atcttgctca tgtgctcact ccgccgttgc aaacaaagct tctcgcatca 14820
agcttttctc cccttcctct attagacaag ttgaagccag acacacccga tgagcgcaga 14880
ggtgcaagcc gaaggagagg atgcagcgca accactaggg gtgctaccag caagaagggt 14940
gccactagca agggtgccgc caacgacaca aaagggaaat gggtcacttc gtcggcgaca 15000
caacatcgtc gacacaagat caactgacaa agctcgccaa ctgttgcttc ttccccaata 15060
- 68 031178 ttgttcttcc cgaagcaaat ggaagttcac tggcgcgcac cgccgcggga gcagatcgtg
15120 <210> 7 <211> 841 <212> ДНК <213> Triticum aestivum <400> 7
ggaatatgtt tgtttatgtc ttcaaaacag gccagcttgc cattattgca ctcgtaacaa 60
tgtctgtatt ccttcgaact cgcatgacaa taagtttcac tcatgcaaat tactatatgg 120
gagcattatt tttttccatc ttcatgatta tgttaaatgg cataccagag atgagcatgc 180
agattgggag actcccaagt ttttacaagc aaaagagcta ctatttctat tcatcatggg 240
catatgcaat accagcttca gtcctaaagg tccctatttc catactggat tcgcttgtat 300
ggatatctat cacatattat ggtattggtt atacacctac tgtttcaagg ttcttctgcc 360
agtttctgat actttgtctt ctccatcatt cagtcacctc gcagtatcga tttattgctt 420
catacttcca aacacctatt gtgtctttct tctacctttt tcttgctcta acagtattcc 480
ttacattcgg aggcttcatt cttcccaaga cctccatgcc aggatggtta aactggggat 540
tttggatatc tccaatgaca tatgcagaaa tcagcatagt tattaacgaa ttcttggcac 600
caagatggca gaaggaaagt attcaaaaca taacaattgg gaaccaaatc ctggttaatc 660
atggcctata ttacagttgg cattattatt ggatatcctt tggagccttg cttggatcta 720
ttctcttatt ttatatcgct tttggattgg cactagatta cagaacacct acagaagaat 780
atcatggaag caggcctaca aagagcttat gtcaacagca ggaaaaagat tacactattc 840
a 841
<210> 8 <211> 821 <212> ДНК <213> Triticum aestivum <400> 8
acgctatgac cttaggccta tttaggtgac actccagaac aagtttgtac aaaaaagcag 60
gctcgtaccg gtccggaatt cccgggatat cgtcgaccca cgcgtccgga gaacaatcta 120
ccgcggacca ataagagagc gctcctgcaa agtgatccag tactttgaga gaattgcggg 180
agtcccaaaa ataaagagta actgcaatcc acctacttgg atgatggatg taacatccac 240
atcaatggag gttcaacaca atatggactt tgcaattttg tatgaagagt cgtcactgca 300
tatagaagct gaagatctag tggagcagct aagtatccca ttaccaaatt cagaaaatct 360
atgtttctcc cataatgtta cacagaatgg ctggattcaa cttaaagctt gcttgtggaa 420
acaagacata acttactgga ggagtcctca gtataacttg aggcgcatta tgatgactgt 480
- 69 031178
catatctgcc ctgatctacg gaatattggt ctggaagcat gcaaaagtat taaacaacga 540
gcacgacatg ctcagtgttt ttggcgcaat gtatttggga ttcaccacca taggcgctta 600
taatgatcag acaatcatac cattcagtac aactgatcgt attgtaatgt atcgtgagag 660
atttgcagga atgtattcat cttggtcata ttcattcgca caggctttgg ttgacatacc 720
ctatgtattt atccaagtgg tactgtatac gttaattgtc tatcggtcaa ctggttatta 780
ttggacagca cccaaattcc tatggttctt ctacaccaca t 821
<210> 9 <211> 865 <212> ДНК <213> Triticum aestivum <400> 9
attcttctga acggtgaaac aaaaagatta caactcacaa tcgtacttag cacaatcaag 60
ttattgtaca caattactta ttcatgaggt ttacccatca gatttgagaa aaatagccac 120
ccaatcagct ctgattctgc atttcgcagt tggaaaaaag gcaagtagct atatctgtaa 180
catgtacaga ttcatgtctg ttggaatgtc agaacttgct tacctcttct ggaaattaag 240
tttctcaatg gacaacgaaa acaagattat caacacaaaa ggaaaggcaa cgaggacagc 300
tgctactacg ctcaacttat cttgatgaaa cccaaaatag tcattcaaga agattgaaac 360
tgatttagtt tctccaaatg ctttcacctc tttttctatg tttccgtatt gtgatgtcaa 420
gagggcattg agtgcccaag atgtaggagt gagatagtag agccaagtcc accacttcgg 480
gatttgaggt gcaggtaaaa taaatcctga gaatagtgtt tgcatggtgt tgaaaaatga 540
agccagtatg gtagctactt gaacattggg ggttatggaa acaagaagca acccaacata 600
aacataggag agaattgaac aaaatgtggt gtagaagaac cataggaatt tgtgtgctgt 660
ccaataataa ccagttgacg gatagacaat taacgtatac agtaccactt ggataaatac 720
atagggtatc tcaatgaaag cctgtgcgaa tgaatatgac caagatgaat acattcctgc 780
aaatctctca cgatacatta caatacgctc agttgtactg aatggtatga ttgtctgatc 840
attataagcg cctatggggg tgaaa 865
<210> 10 <211> 810 <212> ДНК <213> Triticum aestivum <400> 10
gacattaggc ctatttaggt gatctataga acaagtttgt acaaaaaagc aggctggtac 60
cggtccggaa ttcccgggat atcgtcgacc cacgcgtccg gttaattgtc tatccgtcaa 120
ctggttatta ttggacagca cacaaattcc tatggttctt ctacaccaca ttttgttcaa 180
ttctctccta tgtttatgtt gggttgcttc ttgtttccat aacccccaat gttcaagtag 240
- 70 031178
ctaccatact ggcttcattt ttcaacacca tgcaaacact attctcagga tttattttac 300
ctgcacctca aatcccgaag tggtggactt ggctctacta tctcactcct acatcttggg 360
cactcaatgc cctcttgaca tcacaatacg gaaacataga aaaagaggtg aaagcatttg 420
gagaaactaa atcagtttca atcttcttga atgactattt tgggtttcat caagataagt 480
tgagcgtagt agcagctgtc ctcgttgcct ttccttttgt gttgataatc ttgttttcgt 540
tgtccattga gaaacttaat ttccagaaga ggtaagcaag ttctgacatt ccaacagaca 600
tgaatctgta catgttacag atatagctac ttgccttttt tcaactgcga aatgcagaat 660
cagagctgat tgggtggcta tttttctcaa atctgatggg taaacctcat gaataagtaa 720
ttgtgtacaa taacttgatt gtgctaagta cgattgtgag ttgtaatctt tttgtttcac 780
cgttcagaag aatttgatgg ttacaaatca 810
<210> 11 <211> 571 <212> ДНК <213> Hordeum vulgare <400> 11 cccctgcgga aatgagggag cacggttaca tggaaaagaa actcagctac tcccaatatc 60 acgggagcat tccagccagg ggttctctcg gcactcatgg gggttactgg agcggaaaaa 120 caacactcct tgatgttctt gctggaagga aaactggcgg tgttattgaa ggggatataa 180 gaataggagg gtatcctaaa attcagcaga cttttgctag gatatcaggc tactgtgaac 240 aaactgatgt ccattcccca caaatcacag tgggtgaatc ggttgcatat tcagcctggt 300 tacgccttcc accagaagtt gatgcaaaaa taagaaccga atttgtcaac gaagttcttg 360 aaacaattga gttggacgaa attagagatt ctttggtcgg aatacctggg gtaaatgggc 420 tatcaacaga gcaaaggaaa cggctcacga ttgcagtcga gctcgtgtct aacccctcaa 480 tcatatttat ggacgagcca acgtcaggct tggatgcaag ggccgctgct attgtcatgc 540 gtgcagtgaa gaatgttgca gacacaggcc g 571
<210> 12
<211> 23
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 12
catcaagatt tcaccgcctg tgc 23
<210> 13 <211> 23
- 71 031178 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400> 13 gaagcctagc aacttcacga ggc 23
<210> 14
<211> 23
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 14
gcggggccca caatcatctc ggc 23
<210> 15
<211> 23
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 15
catctttcgt atacatgaga aac 23
<210> 16
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 16
gtgtcgattc atgtgagatg c 21
<210> 17
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 17
cattatgtta gcagcttagc g 21
<210> <211> <212> <213> 18 22 ДНК Искусственная последовательность
- 72 031178 <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400>18 ccaaccatca ttttggagca tg22
<210> 19
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 19
gtagatcgtg tcgtgttcaa c 21
<210> 20
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 20
ctgctaatcc taagtaacgc tc 22
<210> 21
<211> 19
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 21
cgtgagcaag acatgggcg 19
<210> 22
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 22
gctacagctc tgaaactaca c 21
<210>23 <211>23 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
- 73 031178 <400> 23 gatttgcacg ttgatgaaac cag
<210> 24
<211> 24
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 24
cagaatgaag tttaacctgg cctg 24
<210> 25
<211> 20
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 25
ggctggctac tacgacgacg 20
<210> 26
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 26
atggtctttt ttccttcagc c 21
<210> 27
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 27
gcctactttg acggcatatg g 21
<210> 28 <211> 25 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400> 28 ccatcttgac atactttggc cttcc 25
- 74 031178 <210> 29 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400>29 ctccctcccg tgagtatatt c21
<210> 30
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 30
atcaaaatcc cattgcctga c 21
<210> 31
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 31
gttggttaag actggtgatg g 21
<210> 32
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 32
tgcttgctat tgctgaatag t 21
<210> 33
<211> 23
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 33
catctttcgt atacatgaga aac 23
<210>34 <211> 21
- 75 031178 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400> 34 gtgtcgattc atgtgagatg c 21
<210> 35
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 35
cattatgtta gcagcttagc g 21
<210> 36
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 36
ccaaccatca ttttggagca tg 22
<210> 37
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 37
gtagatcgtg tcgtgttcaa c 21
<210> 38
<211> 22
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 38
ctgctaatcc taagtaacgc tc 22
<210> <211> <212> <213> 39 19 ДНК Искусственная последовательность
- 76 031178 <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер <400> 39 cgtgagcaag acatgggcg
<210> 40
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 40
gctacagctc tgaaactaca c 21
<210> 41
<211> 23
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 41
gatttgcacg ttgatgaaac cag 23
<210> 42
<211> 24
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 42
cagaatgaag tttaacctgg cctg 24
<210> 43
<211> 20
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 43
ggctggctac tacgacgacg 20
<210> 44 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
- 77 031178 <400>44 atggtctttt ttccttcagc c
<210> 45
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 45
gcctactttg acggcatatg g 21
<210> 46
<211> 25
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Олигонуклеотидный праймер
<400> 46
ccatcttgac atactttggc cttcc 25
<210>47 <211>1406 <212> PRT <213> Oryza sativa <400>47
Met 1 Ser Ser Ser Ser 5 Ser His His Pro Glu 10 Phe Ala Ser Cys Thr 15 Ala
Asn Asp Asp Glu His His Leu Asp Glu Phe Glu Leu Glu Leu Val Val
20 25 30
Gln Asp Val Gln Arg Gln Gln Asn Asn Gly Ser Ala Asn Thr Asp Gln
35 40 45
His Glu Arg Glu Asn Leu Leu Leu Leu Asp Asp Ser Ser Lys Ser Gly
50 55 60
Ala Leu Lys Glu Arg Leu Phe Phe Asp Asn Leu Leu Lys Asn Val Gln
65 70 75 80
Asp Asp His Ile Arg Phe Leu His Arg Gln Lys Glu Arg Ile Asp Arg
85 90 95
Val Asp Val Lys Leu Pro Ala Ile Glu Val Arg Tyr Asn Asn Leu Ser
100 105 110
- 78 031178
Val Glu Ala 115 Glu Cys Arg Thr Ala 120 Asn Gly Asp His Leu 125 Pro Ser Leu
Trp Asn Ser Thr Lys Gly Ala Phe Ser Gly Leu Val Lys Leu Leu Gly
130 135 140
Leu Glu Thr Glu Arg Ala Lys Ile Asn Val Leu Glu Asp Val Ser Gly
145 150 155 160
Ile Ile Lys Pro Cys Arg Leu Thr Leu Leu Leu Gly Pro Pro Gly Cys
165 170 175
Gly Lys Ser Thr Leu Leu Arg Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asp Lys Ser
180 185 190
Leu Lys Val Thr Gly Asp Ile Ser Tyr Asn Gly Tyr Gln Leu Asp Glu
195 200 205
Phe Val Pro Glu Lys Thr Ala Ala Tyr Ile Ser Gln Tyr Asp Leu His
210 215 220
Ile Pro Glu Met Thr Val Arg Glu Thr Leu Asp Phe Ser Ser Arg Cys
225 230 235 240
Gln Gly Val Gly Arg Arg Pro Lys Ile Leu Lys Glu Val Ser Ala Arg
245 250 255
Glu Ser Ala Ala Gly Ile Ile Pro Asp Ala Asp Ile Asp Ile Tyr Met
260 265 270
Lys Ala Ile Ser Val Glu Ala Ser Lys Arg Ser Leu Gln Thr Asp Tyr
275 280 285
Ile Leu Lys Ile Met Gly Leu Glu Ile Cys Ala Asp Thr Met Val Gly
290 295 300
Asp Ala Met Ile Arg Gly Leu Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr
305 310 315 320
Thr Ala Glu Met Ile Val Gly Pro Ala Arg Ala Tyr Phe Met Asp Glu
325 330 335
Ile Ser Asn Gly Leu Asp Ser Ser Thr Thr Phe Gln Ile Ile Ser Cys
340 345 350
Phe Gln Gln Leu Thr Asn Ile Ser Glu Tyr Thr Met Val Ile Ser Leu
355 360 365
- 79 031178
Leu Gln 370 Pro Thr Pro Glu Val 375 Phe Asp Leu Phe Asp 380 Asp Leu Ile Leu
Met Ala Glu Gly Lys Ile Ile Tyr His Gly Pro Arg Asn Glu Ala Leu
385 390 395 400
Asn Phe Phe Glu Glu Cys Gly Phe Ile Cys Pro Glu Arg Lys Glu Val
405 410 415
Ala Asp Phe Leu Gln Glu Ile Leu Ser Cys Lys Asp Gln Gln Gln Tyr
420 425 430
Trp Ser Gly Pro Asn Glu Ser Tyr Arg Tyr Ile Ser Pro His Glu Leu
435 440 445
Ser Ser Met Phe Lys Glu Asn His Arg Gly Arg Lys Leu Glu Glu Pro
450 455 460
Ile Val Ser Pro Lys Ser Glu Leu Gly Lys Glu Ala Leu Ala Phe Asn
465 470 475 480
Lys Tyr Ser Leu Gln Lys Leu Glu Met Phe Lys Ala Cys Gly Ala Arg
485 490 495
Glu Ala Leu Leu Met Lys Arg Ser Met Phe Val Tyr Val Phe Lys Thr
500 505 510
Gly Gln Leu Ala Ile Ile Ala Leu Val Thr Met Ser Val Phe Leu Arg
515 520 525
Thr Arg Met Thr Thr Asp Phe Thr His Ala Thr Tyr Tyr Met Gly Ala
530 535 540
Leu Phe Phe Ser Ile Leu Met Ile Met Leu Asn Gly Thr Pro Glu Ile
545 550 555 560
Ser Met Gln Ile Arg Arg Leu Pro Ser Phe Tyr Lys Gln Lys Ser Tyr
565 570 575
Tyr Phe Tyr Ser Ser Trp Ala Tyr Ala Ile Pro Ala Ser Val Leu Lys
580 585 590
Val Pro Val Ser Ile Leu Asp Ser Leu Val Trp Ile Cys Ile Thr Tyr
595 600 605
Tyr Gly Ile Gly Tyr Thr Ala Ser Val Ser Arg Phe Phe Cys Gln Phe
610 615 620
- 80 031178
Leu 625 Met Leu Cys Phe Val 630 His Gln Ser Val Thr 635 Ser Leu Tyr Arg Phe 640
Ile Ala Ser Tyr Phe Gln Thr Pro Thr Ala Ser Phe Phe Tyr Leu Phe
645 650 655
Leu Ala Leu Thr Phe Phe Leu Met Phe Gly Gly Phe Thr Leu Pro Lys
660 665 670
Pro Ser Met Pro Gly Trp Leu Asn Trp Gly Phe Trp Ile Ser Pro Met
675 680 685
Thr Tyr Ala Glu Ile Gly Thr Val Ile Asn Glu Phe Gln Ala Pro Arg
690 695 700
Trp Gln Lys Glu Thr Ile Gln Asn Ile Thr Ile Gly Asn Arg Ile Leu
705 710 715 720
Ile Asn His Gly Leu Tyr Tyr Ser Trp His Phe Tyr Trp Ile Ser Ile
725 730 735
Gly Ala Leu Phe Gly Ser Ile Ile Leu Phe Tyr Ile Ala Phe Gly Leu
740 745 750
Ala Leu Asp Tyr Ile Thr Ser Ile Glu Glu Tyr His Gly Ser Arg Pro
755 760 765
Ile Lys Arg Leu Cys Gln Glu Gln Glu Lys Asp Ser Asn Ile Arg Lys
770 775 780
Glu Ser Asp Gly His Ser Asn Ile Ser Arg Ala Lys Met Thr Ile Pro
785 790 795 800
Val Met Glu Leu Pro Ile Thr Phe His Asn Leu Asn Tyr Tyr Ile Asp
805 810 815
Thr Pro Pro Glu Met Leu Lys Gln Gly Tyr Pro Thr Lys Arg Leu Gln
820 825 830
Leu Leu Asn Asn Ile Thr Gly Ala Leu Arg Pro Gly Val Leu Ser Ala
835 840 845
Leu Met Gly Val Ser Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu
850 855 860
Ala Gly Arg Lys Thr Gly Gly Tyr Ile Glu Gly Asp Ile Arg Ile Gly
- 81 031178
865 870 875 880
Gly Tyr Pro Lys Val Gln Glu Thr Phe Val Arg Ile Leu Gly Tyr Cys
885 890 895
Glu Gln Ala Asp Ile His Ser Pro Gln Leu Thr Val Glu Glu Ser Val
900 905 910
Thr Tyr Ser Ala Trp Leu Arg Leu Pro Ser His Val Asp Lys Lys Thr
915 920 925
Arg Ser Glu Phe Val Ala Glu Val Leu Glu Thr Val Glu Leu Asp Gln
930 935 940
Ile Lys Asp Val Leu Val Gly Thr Pro Gln Lys Asn Gly Leu Ser Met
945 950 955 960
Glu Gln Arg Lys Arg Leu Thr Ile Ala Val Glu Leu Val Ser Asn Pro
965 970 975
Ser Val Ile Leu Met Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu Asp Thr Arg Ser
980 985 990
Ala Ala Ile Val Ile Arg Ala Val Lys Asn Ile Cys Lys Thr Gly Arg
995 1000 1005
Thr Val 1010 Val Cys Thr Ile His 1015 Gln Pro Ser Thr Lys 1020 Ile Phe Glu
Ala Phe Asp Glu Leu Ile Leu Met Lys Asn Gly Gly Lys Ile Ile
1025 1030 1035
Tyr Asn Gly Pro Ile Gly Glu Arg Ser Ser Lys Val Ile Glu Tyr
1040 1045 1050
Phe Glu Lys Ile Ser Gly Val Leu Lys Val Lys Ser Asn Cys Asn
1055 1060 1065
Pro Ala Ala Trp Met Met Asp Val Thr Ser Thr Ser Met Glu Val
1070 1075 1080
Gln His Asn Met Asp Phe Ala Ile Leu Tyr Asp Glu Ser Ser Gln
1085 1090 1095
His Arg Asp Ile Val Glu Leu Val Glu Lys Leu Ser Ile Pro Ile
1100 1105 1110
- 82 031178
Pro Asn 1115 Ser Glu Ile Leu Ser 1120 Phe Ser His Arg Phe 1125 Pro Arg Asn
Gly Trp Ile Gln Leu Lys Ala Cys Leu Trp Lys Gln Asn Leu Thr
1130 1135 1140
Tyr Trp Arg Ser Pro Glu Tyr Asn Leu Arg Arg Ile Met Leu Thr
1145 1150 1155
Val Ile Ser Ala Leu Val Tyr Gly Val Leu Phe Trp Lys Arg Ala
1160 1165 1170
Lys Ile Leu Asn Asp Glu Gln Asp Leu Phe Asn Val Phe Gly Ala
1175 1180 1185
Met Tyr Leu Gly Ser Thr Thr Ile Gly Ser Tyr Asn His Gln Ser
1190 1195 1200
Ile Ile Pro Phe Ser Thr Thr Glu Arg Ile Val Met Tyr Arg Glu
1205 1210 1215
Lys Phe Ala Gly Met Tyr Ser Ser Trp Ser Tyr Ser Phe Ala Gln
1220 1225 1230
Ala Ala Ile Glu Ile Pro Tyr Val Phe Ile Gln Val Val Leu Tyr
1235 1240 1245
Thr Leu Ile Ile Tyr Pro Ser Ile Gly Tyr Tyr Trp Thr Thr His
1250 1255 1260
Lys Phe Ile Trp Phe Phe Tyr Thr Thr Phe Cys Ser Ser Leu Ser
1265 1270 1275
Tyr Ile Tyr Val Gly Leu Leu Leu Val Ser Leu Thr Pro Asn Val
1280 1285 1290
Gln Val Ala Thr Ile Leu Ala Ser Phe Phe Asn Thr Met Gln Thr
1295 1300 1305
Leu Phe Ser Gly Phe Ile Leu Pro Ala Pro Gln Ile Pro Lys Trp
1310 1315 1320
Trp Val Trp Leu Tyr Tyr Leu Thr Pro Thr Ser Trp Thr Leu Asp
1325 1330 1335
Ala Leu Leu Thr Ser Gln Tyr Gly Asn Ile Glu Lys Glu Val Arg
1340 1345 1350
- 83 031178
Ala Phe 1355 Gly Glu Thr Lys Ser 1360 Val Ser Ile Phe Leu 1365 Asn Asp Tyr
Phe Gly Phe His Lys Asp Lys Leu Ser Leu Val Ala Ala Val Leu
1370 1375 1380
Ile Ala Phe Pro Phe Val Leu Ile Ile Leu Phe Ser Phe Ser Ile
1385 1390 1395
Glu Lys Phe Asn Phe Gln Lys Arg
1400 1405
<210> <211> <212> <213> 48 1413 PRT Arabidopsis thaliana
<400> 48
Met 1 Gly Ser Ser Phe Arg 5 Ser Ser Ser Ser 10 Arg Asn Glu His Glu 15 Asp
Gly Gly Asp Glu Ala Glu His Ala Leu Gln Trp Ala Glu Ile Gln Arg
20 25 30
Leu Pro Thr Phe Lys Arg Leu Arg Ser Ser Leu Val Asp Lys Tyr Gly
35 40 45
Glu Gly Thr Glu Lys Gly Lys Lys Val Val Asp Val Thr Lys Leu Gly
50 55 60
Ala Met Glu Arg His Leu Met Ile Glu Lys Leu Ile Lys His Ile Glu
65 70 75 80
Asn Asp Asn Leu Lys Leu Leu Lys Lys Ile Arg Arg Arg Met Glu Arg
85 90 95
Val Gly Val Glu Phe Pro Ser Ile Glu Val Arg Tyr Glu His Leu Gly
100 105 110
Val Glu Ala Ala Cys Glu Val Val Glu Gly Lys Ala Leu Pro Thr Leu
115 120 125
Trp Asn Ser Leu Lys His Val Phe Leu Asp Leu Leu Lys Leu Ser Gly
130 135 140
Val Arg Thr Asn Glu Ala Asn Ile Lys Ile Leu Thr Asp Val Ser Gly
145 150 155 160
- 84 031178
Ile Ile Ser Pro Gly 165 Arg Leu Thr Leu Leu 170 Leu Gly Pro Pro Gly 175 Cys
Gly Lys Thr Thr Leu Leu Lys Ala Leu Ser Gly Asn Leu Glu Asn Asn
180 185 190
Leu Lys Cys Tyr Gly Glu Ile Ser Tyr Asn Gly His Gly Leu Asn Glu
195 200 205
Val Val Pro Gln Lys Thr Ser Ala Tyr Ile Ser Gln His Asp Leu His
210 215 220
Ile Ala Glu Met Thr Thr Arg Glu Thr Ile Asp Phe Ser Ala Arg Cys
225 230 235 240
Gln Gly Val Gly Ser Arg Thr Asp Ile Met Met Glu Val Ser Lys Arg
245 250 255
Glu Lys Asp Gly Gly Ile Ile Pro Asp Pro Glu Ile Asp Ala Tyr Met
260 265 270
Lys Ala Ile Ser Val Lys Gly Leu Lys Arg Ser Leu Gln Thr Asp Tyr
275 280 285
Ile Leu Lys Ile Leu Gly Leu Asp Ile Cys Ala Glu Thr Leu Val Gly
290 295 300
Asn Ala Met Lys Arg Gly Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr
305 310 315 320
Thr Ala Glu Met Ile Val Gly Pro Thr Lys Ala Leu Phe Met Asp Glu
325 330 335
Ile Thr Asn Gly Leu Asp Ser Ser Thr Ala Phe Gln Ile Ile Lys Ser
340 345 350
Leu Gln Gln Val Ala His Ile Thr Asn Ala Thr Val Phe Val Ser Leu
355 360 365
Leu Gln Pro Ala Pro Glu Ser Tyr Asp Leu Phe Asp Asp Ile Val Leu
370 375 380
Met Ala Glu Gly Lys Ile Val Tyr His Gly Pro Arg Asp Asp Val Leu
385 390 395 400
Lys Phe Phe Glu Glu Cys Gly Phe Gln Cys Pro Glu Arg Lys Gly Val
405 410 415
- 85 031178
Ala Asp Phe Leu 420 Gln Glu Val Ile Ser 425 Lys Lys Asp Gln Gly 430 Gln Tyr
Trp Leu His Gln Asn Leu Pro His Ser Phe Val Ser Val Asp Thr Leu
435 440 445
Ser Lys Arg Phe Lys Asp Leu Glu Ile Gly Arg Lys Ile Glu Glu Ala
450 455 460
Leu Ser Lys Pro Tyr Asp Ile Ser Lys Thr His Lys Asp Ala Leu Ser
465 470 475 480
Phe Asn Val Tyr Ser Leu Pro Lys Trp Glu Leu Phe Arg Ala Cys Ile
485 490 495
Ser Arg Glu Phe Leu Leu Met Lys Arg Asn Tyr Phe Val Tyr Leu Phe
500 505 510
Lys Thr Phe Gln Leu Val Leu Ala Ala Ile Ile Thr Met Thr Val Phe
515 520 525
Ile Arg Thr Arg Met Asp Ile Asp Ile Ile His Gly Asn Ser Tyr Met
530 535 540
Ser Cys Leu Phe Phe Ala Thr Val Val Leu Leu Val Asp Gly Ile Pro
545 550 555 560
Glu Leu Ser Met Thr Val Gln Arg Leu Ser Val Phe Tyr Lys Gln Lys
565 570 575
Gln Leu Cys Phe Tyr Pro Ala Trp Ala Tyr Ala Ile Pro Ala Thr Val
580 585 590
Leu Lys Ile Pro Leu Ser Phe Phe Glu Ser Leu Val Trp Thr Cys Leu
595 600 605
Thr Tyr Tyr Val Ile Gly Tyr Thr Pro Glu Pro Tyr Arg Phe Phe Arg
610 615 620
Gln Phe Met Ile Leu Phe Ala Val His Phe Thr Ser Ile Ser Met Phe
625 630 635 640
Arg Cys Ile Ala Ala Ile Phe Gln Thr Gly Val Ala Ala Met Thr Ala
645 650 655
Gly Ser Phe Val Met Leu Ile Thr Phe Val Phe Ala Gly Phe Ala Ile
- 86 031178
660
665
670
Pro Tyr Thr 675 Asp Met Pro Gly Trp 680 Leu Lys Trp Gly Phe 685 Trp Val Asn
Pro Ile Ser Tyr Ala Glu Ile Gly Leu Ser Val Asn Glu Phe Leu Ala
690 695 700
Pro Arg Trp Gln Lys Met Gln Pro Thr Asn Val Thr Leu Gly Arg Thr
705 710 715 720
Ile Leu Glu Ser Arg Gly Leu Asn Tyr Asp Asp Tyr Met Tyr Trp Val
725 730 735
Ser Leu Ser Ala Leu Leu Gly Leu Thr Ile Ile Phe Asn Thr Ile Phe
740 745 750
Thr Leu Ala Leu Ser Phe Leu Lys Ser Pro Thr Ser Ser Arg Pro Met
755 760 765
Ile Ser Gln Asp Lys Leu Ser Glu Leu Gln Gly Thr Lys Asp Ser Ser
770 775 780
Val Lys Lys Asn Lys Pro Leu Asp Ser Ser Ile Lys Thr Asn Glu Asp
785 790 795 800
Pro Gly Lys Met Ile Leu Pro Phe Lys Pro Leu Thr Ile Thr Phe Gln
805 810 815
Asp Leu Asn Tyr Tyr Val Asp Val Pro Val Glu Met Lys Gly Gln Gly
820 825 830
Tyr Asn Glu Lys Lys Leu Gln Leu Leu Ser Glu Ile Thr Gly Ala Phe
835 840 845
Arg Pro Gly Val Leu Thr Ala Leu Met Gly Ile Ser Gly Ala Gly Lys
850 855 860
Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu Ala Gly Arg Lys Thr Ser Gly Tyr Ile
865 870 875 880
Glu Gly Glu Ile Arg Ile Ser Gly Phe Leu Lys Val Gln Glu Thr Phe
885 890 895
Ala Arg Val Ser Gly Tyr Cys Glu Gln Thr Asp Ile His Ser Pro Ser
900 905 910
- 87 031178
Ile Thr Val 915 Glu Glu Ser Leu Ile 920 Tyr Ser Ala Trp Leu 925 Arg Leu Val
Pro Glu Ile Asn Pro Gln Thr Lys Ile Arg Phe Val Lys Gln Val Leu
930 935 940
Glu Thr Ile Glu Leu Glu Glu Ile Lys Asp Ala Leu Val Gly Val Ala
945 950 955 960
Gly Val Ser Gly Leu Ser Thr Glu Gln Arg Lys Arg Leu Thr Val Ala
965 970 975
Val Glu Leu Val Ala Asn Pro Ser Ile Ile Phe Met Asp Glu Pro Thr
980 985 990
Thr Gly Leu Asp Ala Arg Ala Ala Ala Ile Val Met Arg Ala Val
995 1000 1005
Lys
Asn Val 1010 Ala Glu Thr Gly Arg 1015 Thr Ile Val Cys Thr 1020 Ile His Gln
Pro Ser Ile His Ile Phe Glu Ala Phe Asp Glu Leu Val Leu Leu
1025 1030 1035
Lys Arg Gly Gly Arg Met Ile Tyr Ser Gly Pro Leu Gly Gln His
1040 1045 1050
Ser Ser Cys Val Ile Glu Tyr Phe Gln Asn Ile Pro Gly Val Ala
1055 1060 1065
Lys Ile Arg Asp Lys Tyr Asn Pro Ala Thr Trp Met Leu Glu Val
1070 1075 1080
Thr Ser Glu Ser Val Glu Thr Glu Leu Asp Met Asp Phe Ala Lys
1085 1090 1095
Ile Tyr Asn Glu Ser Asp Leu Tyr Lys Asn Asn Ser Glu Leu Val
1100 1105 1110
Lys Glu Leu Ser Lys Pro Asp His Gly Ser Ser Asp Leu His Phe
1115 1120 1125
Lys Arg Thr Phe Ala Gln Asn Trp Trp Glu Gln Phe Lys Ser Cys
1130 1135 1140
Leu Trp Lys Met Ser Leu Ser Tyr Trp Arg Ser Pro Ser Tyr Asn
1145 1150 1155
- 88 031178
Leu Met 1160 Arg Ile Gly His Thr 1165 Phe Ile Ser Ser Phe 1170 Ile Phe Gly
Leu Leu Phe Trp Asn Gln Gly Lys Lys Ile Asp Thr Gln Gln Asn
1175 1180 1185
Leu Phe Thr Val Leu Gly Ala Ile Tyr Gly Leu Val Leu Phe Val
1190 1195 1200
Gly Ile Asn Asn Cys Thr Ser Ala Leu Gln Tyr Phe Glu Thr Glu
1205 1210 1215
Arg Asn Val Met Tyr Arg Glu Arg Phe Ala Gly Met Tyr Ser Ala
1220 1225 1230
Phe Ala Tyr Ala Leu Ala Gln Val Val Thr Glu Ile Pro Tyr Ile
1235 1240 1245
Phe Ile Gln Ser Ala Glu Phe Val Ile Val Ile Tyr Pro Met Ile
1250 1255 1260
Gly Phe Tyr Ala Ser Phe Ser Lys Val Phe Trp Ser Leu Tyr Ala
1265 1270 1275
Met Phe Cys Asn Leu Leu Cys Phe Asn Tyr Leu Ala Met Phe Leu
1280 1285 1290
Ile Ser Ile Thr Pro Asn Phe Met Val Ala Ala Ile Leu Gln Ser
1295 1300 1305
Leu Phe Phe Thr Thr Phe Asn Ile Phe Ala Gly Phe Leu Ile Pro
1310 1315 1320
Lys Pro Gln Ile Pro Lys Trp Trp Val Trp Phe Tyr Tyr Ile Thr
1325 1330 1335
Pro Thr Ser Trp Thr Leu Asn Leu Phe Phe Ser Ser Gln Tyr Gly
1340 1345 1350
Asp Ile His Gln Lys Ile Asn Ala Phe Gly Glu Thr Lys Thr Val
1355 1360 1365
Ala Ser Phe Leu Glu Asp Tyr Phe Gly Phe His His Asp Arg Leu
1370 1375 1380
Met Ile Thr Ala Ile Ile Leu Ile Ala Phe Pro Ile Ala Leu Ala
1385 1390 1395
- 89 031178
Thr Met Tyr Ala Phe Phe Val Ala Lys Leu Asn Phe Gln Lys Arg 1400 14051410 <210>49 <211>1450 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400>49
Met 1 Ala His Met Val 5 Gly Ala Asp Asp Ile 10 Glu Ser Leu Arg Val 15 Glu
Leu Ala Glu Ile Gly Arg Ser Ile Arg Ser Ser Phe Arg Arg His Thr
20 25 30
Ser Ser Phe Arg Ser Ser Ser Ser Ile Tyr Glu Val Glu Asn Asp Gly
35 40 45
Asp Val Asn Asp His Asp Ala Glu Tyr Ala Leu Gln Trp Ala Glu Ile
50 55 60
Glu Arg Leu Pro Thr Val Lys Arg Met Arg Ser Thr Leu Leu Asp Asp
65 70 75 80
Gly Asp Glu Ser Met Thr Glu Lys Gly Arg Arg Val Val Asp Val Thr
85 90 95
Lys Leu Gly Ala Val Glu Arg His Leu Met Ile Glu Lys Leu Ile Lys
100 105 110
His Ile Glu Asn Asp Asn Leu Lys Leu Leu Lys Lys Ile Arg Arg Arg
115 120 125
Ile Asp Arg Val Gly Met Glu Leu Pro Thr Ile Glu Val Arg Tyr Glu
130 135 140
Ser Leu Lys Val Val Ala Glu Cys Glu Val Val Glu Gly Lys Ala Leu
145 150 155 160
Pro Thr Leu Trp Asn Thr Ala Lys Arg Val Leu Ser Glu Leu Val Lys
165 170 175
Leu Thr Gly Ala Lys Thr His Glu Ala Lys Ile Asn Ile Ile Asn Asp
180 185 190
Val Asn Gly Ile Ile Lys Pro Gly Arg Leu Thr Leu Leu Leu Gly Pro
195 200 205
- 90 031178
Pro Ser 210 Cys Gly Lys Thr Thr 215 Leu Leu Lys Ala Leu 220 Ser Gly Asn Leu
Glu Asn Asn Leu Lys Cys Ser Gly Glu Ile Ser Tyr Asn Gly His Arg
225 230 235 240
Leu Asp Glu Phe Val Pro Gln Lys Thr Ser Ala Tyr Ile Ser Gln Tyr
245 250 255
Asp Leu His Ile Ala Glu Met Thr Val Arg Glu Thr Val Asp Phe Ser
260 265 270
Ala Arg Cys Gln Gly Val Gly Ser Arg Thr Asp Ile Met Met Glu Val
275 280 285
Ser Lys Arg Glu Lys Glu Lys Gly Ile Ile Pro Asp Thr Glu Val Asp
290 295 300
Ala Tyr Met Lys Ala Ile Ser Val Glu Gly Leu Gln Arg Ser Leu Gln
305 310 315 320
Thr Asp Tyr Ile Leu Lys Ile Leu Gly Leu Asp Ile Cys Ala Glu Ile
325 330 335
Leu Ile Gly Asp Val Met Arg Arg Gly Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys
340 345 350
Arg Leu Thr Thr Ala Glu Met Ile Val Gly Pro Thr Lys Ala Leu Phe
355 360 365
Met Asp Glu Ile Thr Asn Gly Leu Asp Ser Ser Thr Ala Phe Gln Ile
370 375 380
Val Lys Ser Leu Gln Gln Phe Ala His Ile Ser Ser Ala Thr Val Leu
385 390 395 400
Val Ser Leu Leu Gln Pro Ala Pro Glu Ser Tyr Asp Leu Phe Asp Asp
405 410 415
Ile Met Leu Met Ala Lys Gly Arg Ile Val Tyr His Gly Pro Arg Gly
420 425 430
Glu Val Leu Asn Phe Phe Glu Asp Cys Gly Phe Arg Cys Pro Glu Arg
435 440 445
Lys Gly Val Ala Asp Phe Leu Gln Glu Val Ile Ser Lys Lys Asp Gln
- 91 031178
450
455
460
Ala 465 Gln Tyr Trp Trp His 470 Glu Asp Leu Pro Tyr 475 Ser Phe Val Ser Val 480
Glu Met Leu Ser Lys Lys Phe Lys Asp Leu Ser Ile Gly Lys Lys Ile
485 490 495
Glu Asp Thr Leu Ser Lys Pro Tyr Asp Arg Ser Lys Ser His Lys Asp
500 505 510
Ala Leu Ser Phe Ser Val Tyr Ser Leu Pro Asn Trp Glu Leu Phe Ile
515 520 525
Ala Cys Ile Ser Arg Glu Tyr Leu Leu Met Lys Arg Asn Tyr Phe Val
530 535 540
Tyr Ile Phe Lys Thr Ala Gln Leu Val Met Ala Ala Phe Ile Thr Met
545 550 555 560
Thr Val Phe Ile Arg Thr Arg Met Gly Ile Asp Ile Ile His Gly Asn
565 570 575
Ser Tyr Met Ser Ala Leu Phe Phe Ala Leu Ile Ile Leu Leu Val Asp
580 585 590
Gly Phe Pro Glu Leu Ser Met Thr Ala Gln Arg Leu Ala Val Phe Tyr
595 600 605
Lys Gln Lys Gln Leu Cys Phe Tyr Pro Ala Trp Ala Tyr Ala Ile Pro
610 615 620
Ala Thr Val Leu Lys Val Pro Leu Ser Phe Phe Glu Ser Leu Val Trp
625 630 635 640
Thr Cys Leu Ser Tyr Tyr Val Ile Gly Tyr Thr Pro Glu Ala Ser Arg
645 650 655
Phe Phe Lys Gln Phe Ile Leu Leu Phe Ala Val His Phe Thr Ser Ile
660 665 670
Ser Met Phe Arg Cys Leu Ala Ala Ile Phe Gln Thr Val Val Ala Ser
675 680 685
Ile Thr Ala Gly Ser Phe Gly Ile Leu Phe Thr Phe Val Phe Ala Gly
690 695 700
- 92 031178
Phe 705 Val Ile Pro Pro Pro 710 Ser Met Pro Ala Trp 715 Leu Lys Trp Gly Phe 720
Trp Ala Asn Pro Leu Ser Tyr Gly Glu Ile Gly Leu Ser Val Asn Glu
725 730 735
Phe Leu Ala Pro Arg Trp Asn Gln Met Gln Pro Asn Asn Phe Thr Leu
740 745 750
Gly Arg Thr Ile Leu Gln Thr Arg Gly Met Asp Tyr Asn Gly Tyr Met
755 760 765
Tyr Trp Val Ser Leu Cys Ala Leu Leu Gly Phe Thr Val Leu Phe Asn
770 775 780
Ile Ile Phe Thr Leu Ala Leu Thr Phe Leu Lys Ser Pro Thr Ser Ser
785 790 795 800
Arg Ala Met Ile Ser Gln Asp Lys Leu Ser Glu Leu Gln Gly Thr Glu
805 810 815
Lys Ser Thr Glu Asp Ser Ser Val Arg Lys Lys Thr Thr Asp Ser Pro
820 825 830
Val Lys Thr Glu Glu Glu Asp Lys Met Val Leu Pro Phe Lys Pro Leu
835 840 845
Thr Val Thr Phe Gln Asp Leu Asn Tyr Phe Val Asp Met Pro Val Glu
850 855 860
Met Arg Asp Gln Gly Tyr Asp Gln Lys Lys Leu Gln Leu Leu Ser Asp
865 870 875 880
Ile Thr Gly Ala Phe Arg Pro Gly Ile Leu Thr Ala Leu Met Gly Val
885 890 895
Ser Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu Ala Gly Arg Lys
900 905 910
Thr Ser Gly Tyr Ile Glu Gly Asp Ile Arg Ile Ser Gly Phe Pro Lys
915 920 925
Val Gln Glu Thr Phe Ala Arg Val Ser Gly Tyr Cys Glu Gln Thr Asp
930 935 940
Ile His Ser Pro Asn Ile Thr Val Glu Glu Ser Val Ile Tyr Ser Ala
945 950 955 960
- 93 031178
Trp Leu Arg Leu Ala Pro Glu
965
Ile Asp Ala Thr Thr Lys Thr Lys
970 975
Phe
Val Lys Gln Val
Leu Glu Thr
980
Ile Glu Leu Asp Glu Ile Lys
985 990
Asp Ser
Leu Val Gly Val Thr Gly Val
995
Ser Gly Leu Ser Thr Glu Gln Arg Lys
1000 1005
Arg Leu 1010 Thr Ile Ala Val Glu 1015 Leu Val Ala Asn Pro 1020 Ser Ile Ile
Phe Met Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu Asp Ala Arg Ala Ala Ala
1025 1030 1035
Ile Val Met Arg Ala Val Lys Asn Val Ala Asp Thr Gly Arg Thr
1040 1045 1050
Ile Val Cys Thr Ile His Gln Pro Ser Ile Asp Ile Phe Glu Ala
1055 1060 1065
Phe Asp Glu Leu Val Leu Leu Lys Arg Gly Gly Arg Met Ile Tyr
1070 1075 1080
Thr Gly Pro Leu Gly Gln His Ser Arg His Ile Ile Glu Tyr Phe
1085 1090 1095
Glu Ser Val Pro Glu Ile Pro Lys Ile Lys Asp Asn His Asn Pro
1100 1105 1110
Ala Thr Trp Met Leu Asp Val Ser Ser Gln Ser Val Glu Ile Glu
1115 1120 1125
Leu Gly Val Asp Phe Ala Lys Ile Tyr His Asp Ser Ala Leu Tyr
1130 1135 1140
Lys Arg Asn Ser Glu Leu Val Lys Gln Leu Ser Gln Pro Asp Ser
1145 1150 1155
Gly Ser Ser Asp Ile Gln Phe Lys Arg Thr Phe Ala Gln Ser Trp
1160 1165 1170
Trp Gly Gln Phe Lys Ser Ile Leu Trp Lys Met Asn Leu Ser Tyr
1175 1180 1185
Trp Arg Ser Pro Ser Tyr Asn Leu Met Arg Met Met His Thr Leu
1190 1195 1200
- 94 031178
Val Ser 1205 Ser Leu Ile Phe Gly 1210 Ala Leu Phe Trp Lys 1215 Gln Gly Gln
Asn Leu Asp Thr Gln Gln Ser Met Phe Thr Val Phe Gly Ala Ile
1220 1225 1230
Tyr Gly Leu Val Leu Phe Leu Gly Ile Asn Asn Cys Ala Ser Ala
1235 1240 1245
Leu Gln Tyr Phe Glu Thr Glu Arg Asn Val Met Tyr Arg Glu Arg
1250 1255 1260
Phe Ala Gly Met Tyr Ser Ala Thr Ala Tyr Ala Leu Gly Gln Val
1265 1270 1275
Val Thr Glu Ile Pro Tyr Ile Phe Ile Gln Ala Ala Glu Phe Val
1280 1285 1290
Ile Val Thr Tyr Pro Met Ile Gly Phe Tyr Pro Ser Ala Tyr Lys
1295 1300 1305
Val Phe Trp Ser Leu Tyr Ser Met Phe Cys Ser Leu Leu Thr Phe
1310 1315 1320
Asn Tyr Leu Ala Met Phe Leu Val Ser Ile Thr Pro Asn Phe Met
1325 1330 1335
Val Ala Ala Ile Leu Gln Ser Leu Phe Tyr Val Gly Phe Asn Leu
1340 1345 1350
Phe Ser Gly Phe Leu Ile Pro Gln Thr Gln Val Pro Gly Trp Trp
1355 1360 1365
Ile Trp Leu Tyr Tyr Leu Thr Pro Thr Ser Trp Thr Leu Asn Gly
1370 1375 1380
Phe Ile Ser Ser Gln Tyr Gly Asp Ile His Glu Glu Ile Asn Val
1385 1390 1395
Phe Gly Gln Ser Thr Thr Val Ala Arg Phe Leu Lys Asp Tyr Phe
1400 1405 1410
Gly Phe His His Asp Leu Leu Ala Val Thr Ala Val Val Gln Ile
1415 1420 1425
Ala Phe Pro Ile Ala Leu Ala Ser Met Phe Ala Phe Phe Val Gly
- 95 031178
1430
1435
1440
Lys Leu Asn Phe Gln Arg Arg
1445 1450 <210> 50 <211> 8 <212> PRT <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров , присутствующий в Lr34
<400> 50
Gly Pro Pro Gly Cys Gly Lys Ser
1 5
<210> 51
<211> 8
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров, присутствующий в Lr34
<400> 51
Gly Val Ser Gly Ala Gly Lys Thr
1 5
<210> 52
<211> 12
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров , присутствующий в Lr34
<400> 52
Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr Thr Ala
1 5 10
<210> 53
<211> 12
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров, присутствующий в Lr34
<400> 53
Leu Ser Met Glu Gln Arg Lys Arg Leu Thr Ile Ala
1 5 10
- 96 031178
<210> <211> <212> <213> 54 5 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров, присутствующий в Lr34
<400> 54
Ala Tyr Phe Met Asp
1 5
<210> <211> <212> <213> 55 5 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> Консервативный домен PDR-ABC-траспортеров, присутствующий в Lr34
<400> 55
Ile Ile Leu Met Asp
1 5
<210> <211> <212> <213> 56 8 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> Консенсусная последовательность бокса Уокера типа А
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (2)..(2) Хаа = любая аминокислота
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (3)..(3) Хаа = любая аминокислота
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (4)..(4) Хаа = любая аминокислота
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (5)..(5) Хаа = любая аминокислота
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (8)..(8) Xaa = Ser или Thr
<400> 56
- 97 031178
Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Lys Xaa <210>57 <211>5 <212> PRT <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Консенсусная последовательность бокса Уокера типа В <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (1)..(1)
<223> Xaa = Phe, Ile, Trp, Leu, Val, Met, Tyr или Ala
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> Xaa = Phe, Ile, Trp, Leu, Val, Met, Tyr или Ala
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> Xaa = Phe, Ile, Trp, Leu, Val, Met, Tyr или Ala
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa = Phe, Ile, Trp, Leu, Val, Met, Tyr или Ala
<220>
<221> MISC_FEATURE <222> (5)..(5) <223> Xaa = Asp или Glu <400>57
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa <210>58 <211> 12 <212> PRT <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Консенсусная последовательность ABC-опознавательного мотива <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (1)..(1) <223> Xaa = Leu, Ile, Val, Met, Phe или Tyr <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (3)..(3) <223> Xaa = Ser, Gly или Met
- 98 031178 <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (4)..(4) <223> Xaa = Gly или Glu <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (5)..(5) <223> Хаа = любая аминокислота <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (6)..(6) <223> Хаа = любая аминокислота <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (7)..(7) <223> Хаа = любая аминокислота <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (8)..(8) <223> Xaa = Arg, Lys или Ala <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (9)..(9) <223> Xaa = Leu, Ile, Val, Met, Tyr или Ala <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (10)..(10) <223> Хаа = любая аминокислота <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (11)..(11) <223> Xaa = Leu, Ile, Val, Met, Phe или Thr <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (12)..(12) <223> Xaa = Ala или Gly <400>58
Xaa Ser Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
510 <210>59 <211> 6 <212> PRT <213> Искусственная последовательность <220>
<223> PDR-опознавательная последовательность 1 <400> 59
Leu Leu Leu Gly Pro Pro
- 99 031178
1 5
<210> <211> <212> <213> 60 6 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> PDR-опознавательная последовательность 2
<400> 60
Gly Leu Asp Ser Ser Thr
1 5
<210> <211> <212> <213> 61 12 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> PDR-опознавательная последовательность 3
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (4)..(4) Xaa = Ala или Thr
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (6)..(6) Xaa = Ala или Ser
<220> <221> <222> <223> MISC_FEATURE (11)..(11) Xaa = Met или Ile
<400> 61
Gly Leu Asp Xaa Arg Xaa Ala Ala Ile Val Xaa Arg
1 5 10
<210> <211> <212> <213> 62 8 PRT Искусственная последовательность
<220> <223> PDR-опознавательная последовательность 4
<400> 62
Val Cys Thr Ile His Gln Pro Ser
1 5
<210> <211> 63 1405
- 100 031178 <212> PRT <213> Triticum aestivum <400> 63
Met 1 Glu Gly Leu Ala 5 Arg Glu Thr Asn Pro 10 Ser Ser His His Gln 15 Asp
Phe Ala Ser Cys Ala Ser Asp Glu Arg Pro Asp Glu Pro Glu Leu Glu
20 25 30
Leu Ala Ser Arg Arg Arg Gln Asn Gly Ala Gly Asn Asn Glu His Val
35 40 45
Ser Glu Asn Met Leu Leu Asp Ser Ser Lys Phe Gly Ala Leu Lys Arg
50 55 60
Arg Glu Phe Phe Asn Asn Leu Leu Lys Asn Leu Glu Asp Asp His Pro
65 70 75 80
Arg Phe Leu Arg Arg Gln Lys Glu Arg Ile Asp Arg Val Asp Val Lys
85 90 95
Leu Pro Ala Ile Glu Val Arg Tyr Asn Asn Leu Phe Val Glu Ala Glu
100 105 110
Cys Arg Val Thr Lys Gly Asn His Leu Pro Ser Leu Trp Asn Ser Thr
115 120 125
Lys Gly Ala Phe Ser Gly Leu Val Lys Leu Leu Gly Phe Glu Thr Glu
130 135 140
Arg Ala Lys Thr Asn Val Leu Glu Asp Val Ser Gly Ile Ile Lys Pro
145 150 155 160
Cys Arg Leu Thr Leu Leu Leu Gly Pro Pro Gly Cys Gly Lys Ser Thr
165 170 175
Leu Leu Arg Ala Leu Ala Gly Lys Leu Asp Lys Ser Leu Lys Val Thr
180 185 190
Gly Asp Ile Ser Tyr Asn Cys Tyr Glu Leu His Glu Phe Val Pro Glu
195 200 205
Lys Thr Ala Val Tyr Ile Asn Gln His Asp Leu His Ile Ala Glu Met
210 215 220
Thr Val Arg Glu Thr Leu Asp Phe Ser Ala Gln Cys Gln Gly Val Gly
225 230 235 240
- 101 031178
Arg Arg Pro Lys Ile 245 Leu Lys Glu Val Asn 250 Thr Arg Glu Ser Val 255 Ala
Gly Ile Ile Pro Asp Ala Asp Ile Asp Leu Tyr Met Lys Val Val Ala
260 265 270
Val Glu Ala Ser Glu Arg Ser Leu Gln Thr Asp Tyr Ile Leu Lys Ile
275 280 285
Met Gly Leu Glu Thr Cys Ala Asp Thr Met Val Gly Asp Ala Met Arg
290 295 300
Arg Gly Ile Ser Gly Gly Gln Lys Lys Arg Leu Thr Thr Ala Glu Met
305 310 315 320
Ile Val Gly Pro Ala Lys Ala Tyr Phe Met Asp Glu Ile Ser Asn Gly
325 330 335
Leu Asp Ser Ser Thr Thr Phe Gln Ile Ile Asn Cys Phe Gln Gln Leu
340 345 350
Thr Asn Ile Ser Glu Tyr Thr Met Val Ile Ser Leu Leu Gln Pro Thr
355 360 365
Pro Glu Val Phe Asp Leu Phe Asp Asp Leu Ile Leu Met Ala Glu Gly
370 375 380
Lys Ile Ile Tyr His Gly Pro Arg Asn Glu Ala Leu Asn Phe Phe Glu
385 390 395 400
Glu Cys Gly Phe Lys Cys Pro Glu Arg Lys Ala Ala Ala Asp Phe Leu
405 410 415
Gln Glu Ile Leu Ser Arg Lys Asp Gln Glu Gln Tyr Trp Leu Gly Pro
420 425 430
His Glu Ser Tyr Arg Tyr Ile Ser Pro His Glu Leu Ser Ser Met Phe
435 440 445
Lys Glu Asn His Arg Gly Arg Lys Leu His Glu Gln Ser Val Pro Pro
450 455 460
Lys Ser Gln Phe Gly Lys Glu Ala Leu Ala Phe Asn Lys Tyr Ser Leu
465 470 475 480
Arg Lys Leu Glu Met Phe Lys Ala Cys Gly Ala Arg Glu Ala Leu Leu
- 102 031178
485
490
495
Met Lys Arg Asn Met 500 Phe Val Tyr Val 505 Phe Lys Thr Gly Gln 510 Leu Ala
Ile Ile Ala Leu Val Thr Met Ser Val Phe Leu Arg Thr Arg Met Thr
515 520 525
Ile Ser Phe Thr His Ala Asn Tyr Tyr Met Gly Ala Leu Phe Phe Ser
530 535 540
Ile Phe Met Ile Met Leu Asn Gly Ile Pro Glu Met Ser Met Gln Ile
545 550 555 560
Gly Arg Leu Pro Ser Phe Tyr Lys Gln Lys Ser Tyr Tyr Phe Tyr Ser
565 570 575
Ser Trp Ala Tyr Ala Ile Pro Ala Ser Val Leu Lys Val Pro Val Ser
580 585 590
Ile Leu Asp Ser Leu Val Trp Ile Ser Ile Thr Tyr Tyr Gly Ile Gly
595 600 605
Tyr Thr Pro Thr Val Ser Arg Phe Phe Cys Gln Phe Leu Ile Leu Cys
610 615 620
Leu Leu His His Ser Val Thr Ser Gln Tyr Arg Phe Ile Ala Ser Tyr
625 630 635 640
Phe Gln Thr Pro Ile Val Ser Phe Phe Tyr Leu Phe Leu Ala Leu Thr
645 650 655
Val Phe Leu Thr Phe Gly Gly Phe Ile Leu Pro Lys Thr Ser Met Pro
660 665 670
Glu Trp Leu Asn Trp Gly Phe Trp Ile Ser Pro Met Ala Tyr Ala Glu
675 680 685
Ile Ser Ile Val Ile Asn Glu Phe Leu Ala Pro Arg Trp Gln Lys Glu
690 695 700
Ser Ile Gln Asn Ile Thr Ile Gly Asn Gln Ile Leu Val Asn His Gly
705 710 715 720
Leu Tyr Tyr Ser Trp His Phe Tyr Trp Ile Ser Phe Gly Ala Leu Leu
725 730 735
- 103 031178
Gly Ser Ile Leu 740 Leu Phe Tyr Ile Ala 745 Phe Gly Leu Ala Leu 750 Asp Tyr
Arg Thr Pro Thr Glu Glu Tyr His Gly Ser Arg Pro Thr Lys Ser Leu
755 760 765
Cys Gln Gln Gln Glu Lys Asp Ser Thr Ile Gln Asn Glu Ser Asp Asp
770 775 780
Gln Ser Asn Ile Ser Lys Ala Lys Met Thr Ile Pro Thr Met His Leu
785 790 795 800
Pro Ile Thr Phe His Asn Leu Asn Tyr Tyr Ile Asp Thr Pro Pro Glu
805 810 815
Met Leu Lys Gln Gly Tyr Pro Thr Arg Arg Leu Arg Leu Leu Asn Asn
820 825 830
Ile Thr Gly Ala Leu Arg Pro Gly Val Leu Ser Ala Leu Met Gly Val
835 840 845
Ser Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Leu Asp Val Leu Ala Gly Arg Lys
850 855 860
Thr Gly Gly Tyr Ile Glu Gly Asp Ile Arg Ile Gly Gly Tyr Pro Lys
865 870 875 880
Val Gln Glu Thr Phe Val Arg Ile Leu Gly Tyr Cys Glu Gln Val Asp
885 890 895
Ile His Ser Pro Gln Leu Thr Val Glu Glu Ser Val Thr Tyr Ser Ala
900 905 910
Trp Leu Arg Leu Pro Ser His Val Asp Lys Gln Thr Arg Ser Lys Phe
915 920 925
Val Ala Glu Val Leu Glu Thr Val Glu Leu Asp Gln Ile Lys Asp Val
930 935 940
Leu Val Gly Ser Pro Gln Lys Asn Gly Leu Ser Met Glu Gln Arg Lys
945 950 955 960
Arg Leu Thr Ile Ala Val Glu Leu Val Ser Asn Pro Ser Ile Ile Leu
965 970 975
Met Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu Asp Thr Arg Ser Ala Ala Ile Val
980 985 990
- 104 031178
Ile Arg Ala Val Lys Asn Ile Cys Glu Thr Gly Arg Thr Val Val Cys
995 1000 1005
Thr Ile 1010 His Gln Pro Ser Thr 1015 Glu Ile Phe Glu Ala 1020 Phe Asp Glu
Leu Ile Leu Met Lys Thr Gly Gly Lys Thr Ile Tyr Asn Gly Pro
1025 1030 1035
Ile Gly Glu Arg Ser Cys Lys Val Ile Glu Tyr Phe Glu Lys Ile
1040 1045 1050
Ser Gly Val Pro Lys Ile Lys Ser Asn Cys Asn Pro Ala Thr Trp
1055 1060 1065
Met Met Asp Val Thr Ser Thr Ser Met Glu Val Gln His Asn Met
1070 1075 1080
Asp Phe Ala Ile Leu Tyr Glu Glu Ser Ser Leu His Arg Glu Ala
1085 1090 1095
Glu Asp Leu Val Glu Gln Leu Ser Ile Pro Leu Pro Asn Ser Glu
1100 1105 1110
Asn Leu Arg Phe Ser His Ser Phe Ala Gln Asn Gly Trp Ile Gln
1115 1120 1125
Leu Lys Ala Cys Leu Trp Lys Gln Asn Ile Thr Tyr Trp Arg Ser
1130 1135 1140
Pro Gln Tyr Asn Leu Arg Arg Ile Met Met Thr Val Ile Ser Ala
1145 1150 1155
Leu Ile Tyr Gly Val Leu Phe Trp Lys His Ala Lys Val Leu Asn
1160 1165 1170
Asn Glu Gln Asp Met Leu Ser Val Phe Gly Ala Met Tyr Leu Gly
1175 1180 1185
Phe Thr Thr Ile Gly Ala Tyr Asn Asp Gln Thr Ile Ile Pro Phe
1190 1195 1200
Ser Thr Thr Glu Arg Ile Val Met Tyr Arg Glu Lys Phe Ala Gly
1205 1210 1215
Met Tyr Ser Ser Trp Ser Tyr Ser Phe Ala Gln Ala Phe Ile Glu
1220 1225 1230
- 105 031178
Ile Pro 1235 Tyr Val Phe Ile Gln 1240 Val Val Leu Tyr Thr 1245 Leu Ile Val
Tyr Pro Ser Thr Gly Tyr Tyr Trp Thr Ala His Lys Phe Leu Trp
1250 1255 1260
Phe Phe Tyr Thr Thr Phe Cys Ser Ile Leu Ser Tyr Val Tyr Val
1265 1270 1275
Gly Leu Leu Leu Val Ser Ile Thr Pro Asn Val Gln Val Ala Thr
1280 1285 1290
Ile Leu Ala Ser Phe Phe Asn Thr Met Gln Thr Leu Phe Ser Gly
1295 1300 1305
Phe Ile Leu Pro Ala Pro Thr Leu Gln Gln Ile Pro Lys Trp Trp
1310 1315 1320
Thr Trp Leu Tyr Tyr Leu Thr Pro Thr Ser Trp Ala Leu Asn Ala
1325 1330 1335
Leu Leu Thr Ser Gln Tyr Gly Asn Ile Glu Lys Glu Val Lys Ala
1340 1345 1350
Phe Gly Glu Thr Lys Ser Val Ser Ile Phe Leu Asn Asp Tyr Phe
1355 1360 1365
Gly Phe His Gln Asp Lys Leu Ser Ile Val Ala Thr Val Leu Val
1370 1375 1380
Ala Phe Pro Phe Val Leu Ile Ile Leu Phe Ser Leu Ser Ile Glu
1385 1390 1395
Lys Leu Asn Phe Gln Lys Arg
1400 1405 <210> 64 <211> 4218 <212> ДНК <213> Triticum aestivum <400> 64
atggagggcc tcgcgagaga gaccaaccca tcatcccacc atcaagattt cgcctcctgc 60
gcgagtgacg agcgcccgga tgagcccgag ttggaattgg catcgcgacg gcgccagaat 120
ggtgctggaa acaacgagca tgtgagtgag aacatgctgc ttgacagcag caagtttgga 180
gctctcaaga ggcgtgagtt cttcaacaac ctgctaaaga acctcgaaga cgaccacccc 240
- 106 031178
cgctttctgc gcagacaaaa ggaaagaatt gacagggttg atgtcaagtt gccagcaata 300
gaggtgaggt ataataatct gtttgtggaa gcagagtgca gagttactaa aggaaatcac 360
ctgccgtctc tatggaatag taccaaaggt gccttctcgg gcctcgtgaa gttgctaggc 420
ttcgaaacgg aaagagcaaa aaccaacgtt ctagaagatg tcagtggaat catcaaaccc 480
tgcagattga ctcttctact gggacctcct ggatgtggca aaagcactct gttgcgagct 540
cttgccggga aactagataa atctctaaag gtaacagggg atatctctta taattgttat 600
gaacttcatg aatttgtacc tgagaaaaca gctgtgtata tcaaccaaca tgatctgcac 660
atagctgaga tgactgtgag ggaaacttta gacttctcag cccagtgcca aggtgttgga 720
agaagaccaa aaatactcaa ggaggtgaac acaagggaga gtgtggctgg gatcatacct 780
gatgcggaca tcgatctata catgaaggta gtagcagttg aagcttcaga gcgaagccta 840
cagacagatt atattttgaa gatcatgggg ctagagacat gcgcagacac gatggttggg 900
gatgcaatga gaagaggaat atcagggggg cagaagaaaa gattaaccac agccgagatg 960
attgtgggac ccgcaaaagc atactttatg gatgaaatat caaatggtct ggatagctct 1020
accacttttc aaataatcaa ttgtttccag caactgacaa acatcagcga gtacacgatg 1080
gttatttcac ttcttcaacc aacacctgag gtatttgatc ttttcgatga cctcatacta 1140
atggcagaag ggaagattat ctaccatggc cctcgaaatg aagccctcaa tttttttgag 1200
gagtgtgggt tcaaatgccc agaaagaaaa gcggcagctg actttctcca agagatcttg 1260
tccaggaagg accaagaaca gtactggttg ggtccacatg aatcatacag atatatctca 1320
cctcatgaat tatcaagcat gttcaaggag aatcacaggg ggagaaaact acatgaacaa 1380
agtgtacctc ccaaaagcca gttcggcaag gaagctttag cattcaataa gtattcgcta 1440
cgaaaactgg aaatgttcaa agcctgtgga gcaagggaag cactcctaat gaaaaggaat 1500
atgtttgttt atgtcttcaa aacaggccag cttgccatta ttgcactcgt aacaatgtct 1560
gtattccttc gaactcgcat gacaataagt ttcactcatg caaattacta tatgggagca 1620
ttattttttt ccatcttcat gattatgcta aatggcatac cagagatgag catgcagatt 1680
gggagactcc caagttttta caaacaaaag agctactatt tctattcatc atgggcatat 1740
gcaataccag cttcagtcct aaaggtccct gtttccatac tggattcgct tgtatggata 1800
tctatcacat attatggtat tggttataca cctactgttt caaggttctt ctgccagttt 1860
ctgatacttt gtcttctcca tcattcagtc acctcgcagt atcgatttat tgcttcatac 1920
ttccaaacac ctattgtgtc tttcttctac ctttttcttg ctctaacagt attccttaca 1980
ttcggaggct tcattcttcc caagacctcc atgccagaat ggctaaactg gggattttgg 2040
atatctccaa tggcatatgc agaaatcagc atagttatta acgagttctt ggcaccaaga 2100
- 107 031178
tggcagaagg aaagtattca aaacataaca attgggaacc aaatcctggt taatcacggc 2160
ctatattaca gttggcattt ttattggata tcctttggag ccttgcttgg atctattctt 2220
ttattttata tcgcttttgg attggcacta gattacagaa cacctacaga agaatatcat 2280
ggaagcaggc ctacaaagag cttatgtcaa cagcaggaaa aagattccac tattcaaaat 2340
gaatctgatg atcaatcaaa tatttccaaa gcaaagatga ctataccaac tatgcatctt 2400
ccaattacat tccacaatct gaactactac attgataccc caccggaaat gctgaaacaa 2460
ggctatccaa caagaagact tcgactgctt aataacataa ctggagcttt acgtcccggt 2520
gttctttctg cactaatggg tgttagtgga gctgggaaga caactctact agatgtatta 2580
gcaggaagga aaacaggagg ttatattgaa ggggacataa gaataggtgg atatcccaag 2640
gtgcaggaaa catttgtcag aatcttgggt tactgcgaac aagtcgacat acattcccca 2700
cagcttacag ttgaagagtc tgtaacttat tctgcgtggc ttcgtctgcc ttctcatgtc 2760
gacaaacaaa caagatctaa atttgttgct gaagtccttg aaactgttga actagatcaa 2820
ataaaagatg tcttagtggg gtcaccacag aaaaatggat tgtccatgga gcagagaaag 2880
aggctaacga ttgcagtcga gcttgtttca aacccatcaa tcatactaat ggatgaacca 2940
acaacaggtt tagatacaag gtcagcagcc attgttattc gtgcagtcaa aaatatttgt 3000
gaaacaggaa ggacggtagt ctgtacaatc catcagccga gcactgaaat ttttgaggca 3060
tttgatgagc tcatattaat gaaaaccggt gggaaaacaa tctacaatgg accaatagga 3120
gagcgctcct gcaaagtgat tgagtacttt gagaaaattt ctggagtccc aaaaataaag 3180
agtaactgca atccagctac ctggatgatg gatgtaacat cgacatcaat ggaggttcaa 3240
cacaacatgg actttgcaat tttgtatgaa gagtcgtcac tgcatagaga agctgaagat 3300
ctagtggagc agctaagtat cccattacca aattcagaaa atctacgctt ctcccatagt 3360
tttgcacaga atggctggat tcaacttaaa gcttgcttgt ggaaacaaaa cataacttac 3420
tggagaagtc ctcagtataa cttgaggcgc attatgatga ctgtcatatc tgccctgatc 3480
tacggagtat tgttctggaa gcatgcaaaa gtattaaaca acgagcagga catgctcagt 3540
gtttttggtg caatgtattt gggtttcaca accataggcg cttataatga tcagacaatc 3600
ataccattca gtacgactga gcgtattgta atgtatcgtg agaaatttgc aggaatgtat 3660
tcatcttggt catattcatt cgcacaggct ttcattgaga taccctatgt atttatccaa 3720
gtggtactgt atacgttaat tgtctatccg tcaactggtt attattggac agcacacaaa 3780
ttcctatggt tcttctacac tacattttgt tcaattctct cctatgttta tgttgggttg 3840
cttcttgttt caataacccc caatgttcaa gtagctacca tactggcttc atttttcaac 3900
accatgcaaa cactattctc aggatttatt ttacctgcac ctacgttgca gcaaatccca 3960
aagtggtgga cttggctcta ctatctcact cctacatctt gggcactcaa tgccctcttg 4020
- 108 031178
acatcacaat acggaaacat agaaaaagag gtgaaagcat ttggagaaac taaatcagtt 4080
tcaatcttct tgaatgacta ttttgggttt catcaagaca agttgagcat agtagcaact 4140
gtcctcgttg cctttccttt tgtgttgata atcttgtttt cgttgtccat tgagaaactt 4200
aatttccaga agaggtaa 4218

Claims (27)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Трансгенное растение, в геном которого был интегрирован экзогенный полинуклеотид, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений, где:
    i) полипептид включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 60%; и/или ii) полинуклеотид включает нуклеотидную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 60%, или последовательность, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2 в жестких условиях, и где патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici, причем указанное трансгенное растение имеет повышенную резистентность к указанному патогену растений по сравнению с изогенным растением, в геноме которого отсутствует экзогенный полинуклеотид.
  2. 2. Растение по п.1, которое характеризуется ускоренным старением верхушек кроющих листьев по сравнению с изогенным растением, в геноме которого отсутствует экзогенный полинуклеотид.
  3. 3. Растение по п.1 или 2, в котором:
    i) полипептид включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 80%, и/или ii) полинуклеотид включает нуклеотидную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 80%.
  4. 4. Растение по п.1 или 2, в котором:
    i) полипептид включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 90%, и/или ii) полинуклеотид включает нуклеотидную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 90%.
  5. 5. Растение по любому из пп.1-4, которое является хлебным злаком, таким как пшеница.
  6. 6. Очищенный и/или рекомбинантный полипептид резистентности к патогену взрослых растений, который включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 60%, где патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici.
  7. 7. Полипептид по п.6, который включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 80%.
  8. 8. Полипептид по п.6, который включает аминокислотную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 1 по крайней мере на 90%.
  9. 9. Полипептид по любому из пп.6-8:
    i) в котором отсутствует остаток фенилаланина в положении, соответствующем номеру аминокислоты 546 в SEQ ID NO: 4, ii) который имеет делецию остатка фенилаланина, соответствующего номеру аминокислоты 546 SEQ ID NO: 4, и/или iii) который содержит аминокислоту, отличную от остатка тирозина в положении, соответствующем номеру аминокислоты 634 в SEQ ID NO: 4.
  10. 10. Полипептид по п.9, который включает остаток гистидина в положении, соответствующем номеру аминокислоты 634 в SEQ ID NO: 4.
  11. 11. Выделенный и/или экзогенный полинуклеотид, включающий нуклеотидную последовательность, которая идентична SEQ ID NO: 2 по крайней мере на 60%, последовательность, кодирующую полипептид по любому из пп.6-10, или последовательность, которая гибридизуется с SEQ ID NO: 2 в жестких условиях, где указанный полинуклеотид кодирует полипептид резистентности к патогену взрослых растений и где патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici.
  12. 12. Химерный вектор, включающий полинуклеотид по п.11.
  13. 13. Вектор по п.12, в котором полинуклеотид функционально связан с промотором.
  14. 14. Рекомбинантная клетка, включающая экзогенный полинуклеотид по п.11 и/или вектор по п.12
    - 109 031178 или 13.
  15. 15. Клетка по п.14, которая является клеткой растения.
  16. 16. Клетка по п.15, которая является клеткой хлебного злака, такой как клетка пшеницы.
  17. 17. Способ получения полипептида по любому из пп.6-10, включающий экспрессию в клетке или бесклеточной экспрессионной системе полинуклеотида по п.11.
  18. 18. Трансгенное растение, включающее экзогенный полинуклеотид по п.11, вектор по п.12 или 13 или рекомбинантную клетку по любому из пп.14-16, где указанное трансгенное растение имеет повышенную резистентность к патогену растений по сравнению с изогенным растением, в геноме которого отсутствует указанный экзогенный полинуклеотид, вектор или клетка, и где патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici.
  19. 19. Способ получения клетки по любому из пп.14-16, включающий стадию введения полинуклеотида по п.11 или вектора по п.12 или 13 в клетку.
  20. 20. Способ получения трансгенного растения, которое имеет повышенную резистентность к патогену взрослых по сравнению с изогенным растением, в геноме которого отсутствует экзогенный полинуклеотид по п.11, где указанный патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici, где указанный способ включает регенерацию трансгенного растения из клетки по п.19.
  21. 21. Применение полинуклеотида по п.11 для получения трансгенного растения, которое имеет повышенную резистентность к патогену растений по сравнению с изогенным растением, в геноме которого отсутствует указанный полинуклеотид, где патоген представляет собой Puccinia graminis f. sp. tritici, Puccinia striiformis или Puccinia recondite f. sp. tritici.
  22. 22. Трансгенное растение или его потомство, полученные способом по п.20.
  23. 23. Часть растения по любому из пп.1-5, 18 и 22.
  24. 24. Часть растения по п.23, которая является семенем, включающим указанный экзогенный полинуклеотид, кодирующий полипептид резистентности к патогену взрослых растений.
  25. 25. Способ получения части растения по любому из пп.1-5, 18 и 22, включающий:
    a) выращивание растения по любому из пп.1-5, 18 и 22 и
    b) сбор части растения.
  26. 26. Способ по п.25, где часть растения представляет собой семя.
  27. 27. Способ получения муки, непросеянной муки, крахмала или другого продукта из семени, где способ включает:
    a) получение трансгенного семени, содержащего экзогенный полинуклеотид по п.11, и
    b) получение муки, непросеянной муки, крахмала или другого продукта из указанного семени.
    Lr34
    Ops I
    7DL
    XcsLVD2i
    XSWDEL1ί
    XSWDEL2i
    XSWDEL3i
    XSWSNP2 XSWM10
    Lr34 XcsLVE17 XcsLVMS
    Xsfr.BE493812
    Фиг. 1
    XSWSNP1 Xgwm1220
    XcsLVAI XSWSNP3 +Lr34:5-TCGCAGCATCGA-3
    - Lr34:5’-TCG CAGTAT CGA-3’ +Lr34:5-TCCATC
    - Lr34:5’-TCCATCTTCATG-3’ +Lr34:5-CCGACTT-3
    -Lr34:5’-CCGTCTT-3'
    Фиг. 2
    Фиг. 3
    - 110 031178
    MEGLARETNPSSHHQDFTACASDERPDESELELASRQRQNGAANTEHVSENMLLDSSKLGALKRREFFD NLLKNLEDDHLRFLRGQKERIDRVDVKLPAIEVRYNNLFVEAECRVTKGNHLPSLWNSTKGAFSGLVKL· LGFETERAKTNVLEDVSGIIKPCRLTLLLGPPGCGKSTLLRALAGKLDKSLKVTGDISYNGYELHEFVP EKTAVYINQHDLHIAEMTVRETLDFSAQCQGVGRRPKILKEVNTRESVAGIIPDADIDLYMKVVAVEAS erslqtdyilkimgleicadtmvgdamrrg||^^HH||Hemivgpasayfmdeisngldssttfqi INCFQQLTNISEYTMVISLLQPTPEVFDLFDDLILMAEGKIIYHGPRNEALNFFEECGFICPERKAAAD FLQEILSWKDQQQYWLGPHESYRYISPHELSSMFRENHRGRKLHEQSVPPKSQLGKEALAFNKYSLQKL emfkacgareallmkrnmfvyvfktgqlaiialvtmsvflrtrmtisfthanyymgalffsi|mimlwg IPEMSMQIGRLPSFYKQKSYYFYSSWAYAIPASVLKVPISILDSLVWISITYYGIGYTPTVSRFFCQFL TLCLLffiSvfSQ^FIASYFQTPIVSF^LF^LTVFLTFGGFILPKTSMPGWLWGTOSPMTraEIS IVINEFLAPRWQKESIQNITIGNQILVNHGLYYSWHYYWISFGALLGSILLFYIAFGLALDYRTPTEEY Ησ3ΡΡΤΚ5Εθς22ΕΚ0ΥΤΙΏΝΕ5ϋ0Ώ5ΝΙ3ΚΑΚνΊΊΡνΜΗΕΡΙΤΕΗΝΕΝΥΥΙ0ΤΡΡΕΜΙ,Κι26ΥΡΤΡΡΕΡ LLNNITGALRPGVLSALMGVSGAGKTTLLDVLAGRKTGGYIEGDIRIGGYPKVQETFVRILGYCEQVDI HSPOLTVEESVTYSAWLRLPSHVDEOTRSKFVAEVLETVELDOIKDVLVGSPOKNGlMMIHlWMtv ELVSNPSIILMDEPTTGLDTRSAAIVIRAVKNICETGRTWCTIHQPSTEIFEAFDELILMKSGGKTIY SGPIGERSCKVIEYFEKISGVPKIKSNCNPATWMMDVTSTSMEVQHNMDFAILYEESSLHREAEDLVEQ LSIP LPNSENLCFSHSFAQNGtflQLKACLWKQNITYtfRSPQYNLRRIMMTVISALIYGILFtfKHAKVLN NEQDMLSVFGAMYLGFTTIGAY1WQTIIPFSTTERIVMYRERFAGMYSSWSYSFAQAFIEIPYVFIQVV ΕΥΤΕΐνΎΡ3ΤΰΥΥ¥ΤΑΗΚΕΕ¥ΕΕΥΤΤΕΟ3Ιί3ΥνΥν6ΕίΕν5ΙΤΡ^νΑΤΙΙΑ5ΕΕ·ΝΤΜςΤίΕ3ΰΕΙί PAPQIPKimWLYYL7^TSWALNAEETSQYGmEKEVXAFGETKSvSIFL№YFGFEQDKLSVVAAVLV AFPFVLIILFSLSIEKLNFQKRH
    Фиг. 4
    Фиг. 5
    Мембрана
    Lr34 Renan
    Os_PDR23 At_₽DR5
    At_PDR9
    ...............—.......... -MEGLARETNPSSHHaDPTAOASDE - - -RP1 _ _
    .......................-............МЗЗбЗЗНЙРЕРАЗСТАКВПЕННЬВЕВвЬЕЬТУОР^СЙСЮКМаЗА
    ...................MG...........SSFRSSSSRNBHEDGGDE- - - -AEHALOW^iaRLP-TPSLRSSLVD
    MAHWGADDIESLRVEIAEIGRSIRSSFRRHTSSFRSSSSIYEVmX3DVNDBDAEYALQWAjlERLP-TVK||MRSTLLD
    5LELAS----gQRQNGAA
    Lr34_Renan
    Os_PDR2 3
    At_PDR5
    At_PDR9 . : *: NT-EHVSSNMLLD--S! NTDQHS^LLLLDDS! KYGBG-TSKGKKVVDV' DGDBSMT^KGRRVVDV'
    !.j*j ._«..**_;..*.«****, « ίίΚ№ΕΡΡΕ1βΐΑΝ1ΕΙ*Ι>Ε№θΟΚΕ$ΙΐΜηνΚΙ>ΡΑΙΕνΕΥΝΝΕΙ &KSRLFPDl®liNVQBiHIRPiaReKaiieDVKLPAIEVRYNNI.i м™Ш1ЕШ1|Н1Е1«1ЫСШКК1НИМЕадвЧЕЙЙЗЯ«ЙЕ1Л iVEfHIJ4IEaiKHIEN|NLKliKKIRRSXDJgGHSiaTalSiYES|l ?AN|DH
    120
    124
    124
    159
    Lr34_Renan Oe_PDR23 At_PDR5 At_PDR9 ®SEifflST?GAFSG|V5®Li@PEJ!ERSKTNVLSaSl ьгзы®|дтЗкалрз<Ллп№1^ЬЕЖЕвХк11геь»!
    icj
    200
    204
    204
    239
    Lr34_Renan Os_PDR23 At_PDR5 At_PDR9 ял
    SSI apgibMtvvamsi
    IADUHMBaIS^EASI (ряЗЫИлхйкси
    280
    284
    284
    319
    Lr34_Renan
    Os_PDR23 At_PDR5 At_PDR9
    QTDYCLKCVg: B~CA?TMVG'AMRRGISGGQKKRLTTAF’MrVGPA'5A¥FMDEISNGLDSST7FQZ TS.'-QO! TtiT~EY7M ςτυν: LXIMGL-H CADTEVGI5AMI RGLSUGORKRTiTTAEMI VGPARAYPMDEI.-.NG1 USSlTb'QX I S<-rQ3r.TNT=EYTK CTDYXLKILGLjICAinUVGNAMXRGlSGGOKKRtTTAERIVGPlKAr.PMDEITNGLDSSTAPOIlKELQOVAIIITKATV 05®Х1да1хзыжз(Е1ы®счик®в1Й«адййтШ11У«Рт1а1ьий?:1т»аьрЕСТА5а1УК5ь§9₽АИ1д5А9’7
    360
    364
    364
    399
    Dr34_Renan Os__PDR23 At_PDR5 At PDR9
    VI^I^TWPm^LItOB^IjntePm^bl^RtB^XTPBRrAAASJ^IiewROCQiMLGPHESYRYll
    V-4T.tQ?prVFDLFT3· TI,MAEG'<IT''HGP4N^AIIKFPBn:GPTrPFRKEVADPLCETT,?'K3C00YRG7PNFSYRYIi
    PV<JLrOPAP--’Y:>LF3D.vrj«Ab^<:VYrfGPR I'VLKPFE-JCGrCCPRRY ;,’ADFLQEV1SKKDQGQYWI.HQNL₽HSE^ -VgLLCPApiGYDLFGDIMLMAKGRIVYRCI>R'’LVLKPVEs:GPRCi?ERK JVADPLQEV.SbXDCAC’WHEDLFYSFvj
    440
    444
    444
    479
    Lr34_Renan P] ~ ----- ₽]
    V)
    Os_₽DR23 At_₽DR5 At PDR9 kENHI
    IKDLSI |kdls^
    ILHEQSVF»- -IQIX leepivsIk- -fcix lEEALSCTYDliKTl gEDTLSKPYDRgxSl |p] hi hi
    5X8
    522
    524
    559
    Lr34_Renan Os_₽DR23 At_PDR5 At_PBR9
    M'-VP'.RTRI
    RSVTUMSB Ктуупи® «ТУРТЕЗД isinmaM hltMIMLW IMVVLLVa lALIILLVq pi pi
    598
    602
    604
    639
    Lr34_Renan
    Os_PDR23
    At_PDR5
    At_PDR9
    IISITI hciti ItcltI iTCLSl pTV! μ svs ΡΕΡΊ |PEAJ >IVSFFYL?LALTVFIZ >TASFFYLFLALTFPM iVAAMTAGSPVMLITFI rVASITAGSFGILFTF
    678
    682
    684
    719
    I»r34_Renan
    Os_₽DR23 At PDR5 AtPHR9 |ISf№ tista Iraiis isiv:
    (gtv:
    GLSi
    ИМДИодгап g||Q|M|QKETII g|W»QKMQP:
    11Л pYRTPTES IDYITSIEE SFLKSPTS Itflkspts
    758
    762
    764
    799
    Lr34 JRenan O«_₽DR23 At_PDR5 At_PDR9
    YHGSRPTKS|CQ«Eyhgsr£>ikr|cqe|e· srpmisqdeJseiIg· sramisqdk|sei||gi iTEKSTl sisNiRK----e|dghsnisrmmti|vme|p :
    '1®88УК1ИКРЬ1»81КТМЕОР<ЖМ11|РКМТ: EI?SSVRK-KTTDgPVKTEEE-I^MVI^FKP|T’ s l“*i :
    рки₽:
    k<
    |ptki |DQK1
    829
    833
    840
    877
    Lr34_Renan
    Os_PDR23
    At _jDR5
    At__PDR9
    ΕΝΝΙΤβΑίΛοσν'Ι,ΗΛΙΙΚνδβΑσΚΙΤωηνίΑαΗΚΤ^υΐΙΕσηίΒΙιΚνρκνοΕΤΡνΚΙΜΎαΕςνΒΙΗδΡς^ΤνΕΕδνΤ
    LNN 1ТСаЫЖКиЬЛИ1в*8в*<ЯгеТЫДЯПАаКИСОТ1ВС HRI-JGY PKVQETPVRIIaCYaKCADXHSPV^TVEESVT ьс Е1,галркра71.т*тв’:зсй8кттььэ71АвкктЕОТ1Еоп1В1£-а?ыгеоЕТРАн\'сетгсЕотохнбРЕ1ТУгЕзь: LiDITGArRPGTLTAIiMGVSGAGKTTbLDVLAGRKT'GYIEGDZRI'7G77,>KVQETPARVoGYCECTDXHSPKITVEESV3
    909
    913
    920
    957
    - 111 031178
    Lr34_Renan Os__PER23 At_PDR5 At PDR9
    ЬгЗ 4_Renan Osm₽DR23 At_PDR5 At_PDR9
    Lr3 4_Renan Os PDR23
    989
    993
    1000
    1037
    1069
    1073
    1080
    1117
    1229
    1233
    1240
    1277
    1149
    1153
    1160
    1197 , ***♦,**» , i,tt ** *i* : *.;* i*» **. * s *!,ii*s*i***, *»)** *j* ,
    Lr3 4_Renan АУ1ДЖУ»УУЬУТЫ^«дДШП!АМР11Р^ТТ.№5Ш5¥ШУаЫ1^1ШУ(ЖТМЖРШЯТИОТ1ЖзШ1309
    Os_PCR23 AAlij^vmWL¥TLII»SlMWTTilpJgpiTl»3SisyTfvqLlMl»V«TMjl»OQTllJ1313
    At PDR5 VVT^MI»SAEFVIV3^li9tASgSlVPisllAMMNlicg«bAMPili3Mpi«yMcirlFTTFNliAg1320
    AODR9 WTg|Bl№AAEFVIVTMMligiPSAWVFisifsJsiiTPyiLAMmi]»Ft«JM^llYVGFiTrM1357 SJ* ,*·* ** *{**.**#**:*{ j::****:».iti. J · . :*» **{******(* * ·.* . [***:.* s
    Lr34_Renan ХШАР^ХРКЖДьО^Ш^^АЬЬТЖГ^ЕКЕУКАЖЕТКЗУВГОК^^РИОВКЬеУУААУЬУАЖРЙхТЬ1389
    Os_PDR23 11|АР|ДК!|ЙЬ™1ЛШ»ИЖАЬЬ'1такфЯ1ЕКЕУКАЖЕТК^51ЯадЖ^^К^ЗЬ5ШУЬ1ИКУ|11Ь1393
    At_PDR5 ьДкр1т|вШШРУ¥1ТРТВЯСЬКЬРР£^@(5РХаОК1КАИЁ'ГкА5№Ё1>ДЙ№1>к£м1Т1111,ДМ1ЛАТМ1400
    AtPDR$ Ll|QT|v><^I^I^l41^T^NGFIS^^aEEINVgQSTrfAR|§K^O^|H^lXAVTlVVQlKilA|ASM1437
    Lr34_Renan FSLSXEKMjKR-1402
    Os_PDR23 FSPSlEKntF^KR-1406
    At PDR5 ТАРРУАЮЖдеЙ-1413
    At>I>R9 FAPPVGtliM-1450
    Фиг. 6
    Всход
    Кроющий лист спустя 53 дня Кроющий лист спустя 63 дня
    JC со δ s q (D s I (ϋ ώ О X о о л:
    х:
    не сплайсированный сплайсированный не сплайсированный сплайсированный не сплайсированный сплайсированный
    Ши |||||||
    Фиг. 7 <D
    X
    X (ϋ m
    о
    I о о циклов циклов циклов
    GAPDH
    Фиг. 8
EA201170372A 2008-08-25 2009-08-25 Гены резистентности EA031178B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AU2008904364A AU2008904364A0 (en) 2008-08-25 Resistance genes
PCT/AU2009/001090 WO2010022443A1 (en) 2008-08-25 2009-08-25 Resistance genes

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201170372A1 EA201170372A1 (ru) 2011-08-30
EA031178B1 true EA031178B1 (ru) 2018-11-30

Family

ID=41720694

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201170372A EA031178B1 (ru) 2008-08-25 2009-08-25 Гены резистентности

Country Status (9)

Country Link
US (2) US8581038B2 (ru)
EP (1) EP2328404B1 (ru)
CN (1) CN102202496B (ru)
AU (1) AU2009287411B2 (ru)
CA (1) CA2740487C (ru)
EA (1) EA031178B1 (ru)
ES (1) ES2486665T3 (ru)
UA (1) UA106729C2 (ru)
WO (1) WO2010022443A1 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2486665T3 (es) 2008-08-25 2014-08-19 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Genes de resistencia
US9309559B2 (en) * 2013-04-15 2016-04-12 Albert Einstein College Of Medicine, Inc. Simultaneous extraction of DNA and RNA from FFPE tissues
AU2014275050A1 (en) * 2013-06-03 2016-01-07 The Board Of Regents For Oklahoma State University Transgenic cereal plants with increased resistance to rust diseases
US10113180B2 (en) * 2013-06-06 2018-10-30 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Wheat stem rust resistance gene
AU2014308558B2 (en) 2013-08-21 2020-11-12 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Rust resistance gene
EP3436580B1 (en) 2016-03-30 2021-03-17 Life Technologies AS Improved methods and compositions for nucleic acid isolation
CN108004251B (zh) * 2018-02-02 2020-05-12 山东农业大学 小麦条锈菌pstg_11438基因在条锈病防治中的应用和抗条锈菌小麦的培育方法
CN108950053A (zh) * 2018-08-25 2018-12-07 潍坊德诺泰克生物科技有限公司 用于检测皮炎芽生菌的引物探针组及其应用
CN110241131A (zh) * 2019-06-12 2019-09-17 上海大学 拟南芥植保素转运蛋白pdr8基因的应用
DE102022131980B4 (de) 2022-12-02 2024-07-18 Ake Ausseer Kälte- Und Edelstahltechnik Gmbh Warenpräsenter und Verfahren zur Präsentation warm zu haltender Waren

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1999038989A1 (en) * 1998-01-30 1999-08-05 The Regents Of The University Of California Constitutively active plant disease resistance genes and polypeptides
WO2000012736A2 (en) * 1998-08-31 2000-03-09 Monsanto Co. A new method of identifying non-host plant disease resistance genes
WO2001040512A2 (en) * 1999-11-29 2001-06-07 Plant Bioscience Limited Resistance gene
US20040123343A1 (en) * 2000-04-19 2004-06-24 La Rosa Thomas J. Rice nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement
US20060123505A1 (en) * 2002-05-30 2006-06-08 National Institute Of Agrobiological Sciences Full-length plant cDNA and uses thereof
US20070124833A1 (en) * 2005-05-10 2007-05-31 Abad Mark S Genes and uses for plant improvement
US20090100536A1 (en) * 2001-12-04 2009-04-16 Monsanto Company Transgenic plants with enhanced agronomic traits

Family Cites Families (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4399216A (en) * 1980-02-25 1983-08-16 The Trustees Of Columbia University Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
ATE100141T1 (de) 1984-03-06 1994-01-15 Mgi Pharma Inc Herbizide resistenz in pflanzen.
US4945050A (en) * 1984-11-13 1990-07-31 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor
CA1338902C (en) 1986-02-27 1997-02-11 Howard M. Goodman Plant cells resistant to herbicidal glutamine synthetase inhibitors
WO1987006614A1 (en) 1986-04-30 1987-11-05 Boyce Thompson Institute For Plant Research, Inc. Electric field mediated dna transformation of plant cells and organelles
US5188958A (en) * 1986-05-29 1993-02-23 Calgene, Inc. Transformation and foreign gene expression in brassica species
US5177010A (en) * 1986-06-30 1993-01-05 University Of Toledo Process for transforming corn and the products thereof
SE455438B (sv) * 1986-11-24 1988-07-11 Aga Ab Sett att senka en brennares flamtemperatur samt brennare med munstycken for oxygen resp brensle
US5004863B2 (en) * 1986-12-03 2000-10-17 Agracetus Genetic engineering of cotton plants and lines
US5164316A (en) * 1987-01-13 1992-11-17 The University Of British Columbia DNA construct for enhancing the efficiency of transcription
US5416011A (en) * 1988-07-22 1995-05-16 Monsanto Company Method for soybean transformation and regeneration
US5932479A (en) * 1988-09-26 1999-08-03 Auburn University Genetic engineering of plant chloroplasts
US5141131A (en) * 1989-06-30 1992-08-25 Dowelanco Method and apparatus for the acceleration of a propellable matter
JPH05501352A (ja) 1989-08-09 1993-03-18 ディカルブ ジェネティクス コーポレイション 安定な形質転換稔性単子葉植物およびそれらの細胞を製造するための方法および組成物
GB9005945D0 (en) 1990-03-16 1990-05-09 Cambridge Advanced Tech Plant promoter
US5451513A (en) * 1990-05-01 1995-09-19 The State University of New Jersey Rutgers Method for stably transforming plastids of multicellular plants
US5877402A (en) * 1990-05-01 1999-03-02 Rutgers, The State University Of New Jersey DNA constructs and methods for stably transforming plastids of multicellular plants and expressing recombinant proteins therein
EP0558676B1 (en) 1990-11-23 2000-04-19 Plant Genetic Systems, N.V. Process for transforming monocotyledonous plants
US5384253A (en) * 1990-12-28 1995-01-24 Dekalb Genetics Corporation Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes
US5459252A (en) * 1991-01-31 1995-10-17 North Carolina State University Root specific gene promoter
US5518908A (en) * 1991-09-23 1996-05-21 Monsanto Company Method of controlling insects
US5679558A (en) 1992-04-15 1997-10-21 Plant Genetic Systems, N.V. Transformation of monocot cells
AU6178194A (en) 1993-03-11 1994-09-26 National Research Council Of Canada Enhanced regeneration system for cereals
CA2092588C (en) 1993-03-26 2008-07-08 Narender S. Nehra Enhanced regeneration system for cereals
US5545818A (en) * 1994-03-11 1996-08-13 Calgene Inc. Expression of Bacillus thuringiensis cry proteins in plant plastids
WO1997048814A2 (en) 1996-06-21 1997-12-24 Monsanto Company Methods for the production of stably-transformed, fertile wheat employing agrobacterium-mediated transformation and compositions derived therefrom
US6235529B1 (en) * 1997-04-29 2001-05-22 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for plant transformation and regeneration
AU8583798A (en) 1997-07-23 1999-02-16 Centro De Investigacion Y De Estudios Avanzados Del I.P.N. Improved plastid transformation of higher plants and production of trans genic plants with herbicide resistance
CA2303407C (en) 1997-09-12 2011-01-04 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Regulation of gene expression in plants
US6100447A (en) * 1998-02-12 2000-08-08 Applied Phytologics, Inc. Method of barley transformation
US20050108791A1 (en) * 2001-12-04 2005-05-19 Edgerton Michael D. Transgenic plants with improved phenotypes
CN1688694A (zh) * 2002-09-09 2005-10-26 俄亥俄州立大学 广谱抗性基因Pi2的克隆与表征
US7094951B2 (en) 2002-09-09 2006-08-22 The Ohio State University Cloning and characterization of the broad-spectrum resistance gene Pi2
ES2486665T3 (es) 2008-08-25 2014-08-19 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Genes de resistencia

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1999038989A1 (en) * 1998-01-30 1999-08-05 The Regents Of The University Of California Constitutively active plant disease resistance genes and polypeptides
WO2000012736A2 (en) * 1998-08-31 2000-03-09 Monsanto Co. A new method of identifying non-host plant disease resistance genes
WO2001040512A2 (en) * 1999-11-29 2001-06-07 Plant Bioscience Limited Resistance gene
US20040123343A1 (en) * 2000-04-19 2004-06-24 La Rosa Thomas J. Rice nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement
US20090100536A1 (en) * 2001-12-04 2009-04-16 Monsanto Company Transgenic plants with enhanced agronomic traits
US20060123505A1 (en) * 2002-05-30 2006-06-08 National Institute Of Agrobiological Sciences Full-length plant cDNA and uses thereof
US20070124833A1 (en) * 2005-05-10 2007-05-31 Abad Mark S Genes and uses for plant improvement

Non-Patent Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GenBank accession no. ACL36480, 13 January 2009 100% identity to SEQ ID NO: 4 as modified in claim 15(i) and 99% identity to SEQ ID NO: 1 *
GenBank accession no. ACN41354, 04 March 2009 100% identity to SEQ ED NO: 1 and to SEQ ID NO: 4 as modified in claims 15 and 16 *
GenBank accession no. AK102367, 18 July 2003 48.1% identical to SEQ ID NO: 2 *
GenBank accession no. AK103110, 18 July 2003 48.1% identical to SEQ ID NO: 2 *
GenBank accession no. NM_001073407, 02 October 2006. 48.1% identical to SEQ ID NO: 2 *
GenBank accession no. NP_181265, 13 August 2001 54.5% identical to SEQ ID NO: 1 *
GenBank accession no. NP_190916, 13 August 2001 54.2% identical to SEQ ID NO: 1 *
GenBank accession no. Q5W274, 01 February 2005 57.1% identical to SEQ ID NO: 1 *
KIM D.-Y. et al. "AtATM3 Is Involved in Heavy Metal Resistance in Arabidopsis" Plant Physiol., 2006, vol. 140, pages 922-932, page 931, column 1, paragraph 5 *
SUGIYAMA A. et al. "Involvement of a Soybean ATP-Binding Cassette-Type Transporter in the Secretion of Genistein, a Signal Flavonoid in Legume-Rhizobium Symbiosis" Plant Physiol., 2007, vol. 144, pages 2000-2008, page 2006, column 2, paragraph 4 - page 2007, column 1, paragraph 1 *

Also Published As

Publication number Publication date
US20140101791A1 (en) 2014-04-10
EA201170372A1 (ru) 2011-08-30
EP2328404B1 (en) 2014-04-30
UA106729C2 (ru) 2014-10-10
CN102202496B (zh) 2016-04-20
US20110223303A1 (en) 2011-09-15
EP2328404A1 (en) 2011-06-08
CA2740487A1 (en) 2010-03-04
EP2328404A4 (en) 2011-11-30
US9115370B2 (en) 2015-08-25
CA2740487C (en) 2021-05-18
AU2009287411B2 (en) 2013-11-07
ES2486665T3 (es) 2014-08-19
WO2010022443A1 (en) 2010-03-04
US8581038B2 (en) 2013-11-12
CN102202496A (zh) 2011-09-28
AU2009287411A1 (en) 2010-03-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2019276382B2 (en) Use of Yr4DS gene of Aegilops tauschii in stripe rust resistance breeding of Triticeae plants
EA031178B1 (ru) Гены резистентности
US20190330649A1 (en) Plant Grain Trait-Related Protein, Gene, Promoter and SNPS and Haplotypes
US20130019334A1 (en) Corn event mzdt09y
US20140237685A1 (en) SPL16 compositions and methods to increase agronomic performance of plants
UA115768C2 (uk) Спосіб підвищення стійкості рослини до абіотичного стресу
WO2019038417A1 (en) METHODS FOR INCREASING GRAIN YIELD
US11479784B2 (en) Modulation of seed vigor
US20170137838A1 (en) Stress tolerant wheat plants
AU2007291889A1 (en) Salt tolerant plants
US6787687B1 (en) Rin gene compositions and methods for use thereof
CN113874388A (zh) 孤雌生殖基因
US8217228B2 (en) Down-regulation and silencing of allergen genes in transgenic peanut seeds
WO2005012520A1 (ja) 植物の再分化能を付与する遺伝子、並びにその利用
JP2016507240A (ja) 植物における自家不和合性の操作
CN114072512A (zh) 不育基因及其相关构建体和应用
AU1921601A (en) Down-regulation and silencing of allergen genes in transgenic peanut seeds
US20130217019A1 (en) Corn event mzdt09y

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ KG MD TJ TM