SK62593A3 - Method of constructing synthetic leader sequences - Google Patents
Method of constructing synthetic leader sequences Download PDFInfo
- Publication number
- SK62593A3 SK62593A3 SK62593A SK62593A SK62593A3 SK 62593 A3 SK62593 A3 SK 62593A3 SK 62593 A SK62593 A SK 62593A SK 62593 A SK62593 A SK 62593A SK 62593 A3 SK62593 A3 SK 62593A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- sequence encoding
- dna sequence
- amino acids
- yeast
- dna
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
- C12N15/625—DNA sequences coding for fusion proteins containing a sequence coding for a signal sequence
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/036—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif targeting to the medium outside of the cell, e.g. type III secretion
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
- C07K2319/75—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones
Description
Kvasinkové organizmy produkujú mnohé bielkoviny, ktoré sa syntetizujú intracelulárne. ktoré však majú funkciu mimo bunku. Takéto extracelulárne bielkoviny sa označujú ako sekretované bielkoviny. Tieto sekretované bielkoviny sa vylučujú spočiatku vo vnútri bunky v prekurzorovej alebo predbielkovinovej forme obsahujúcej presekvenciu zaisťujúcu účinné riadenie vylučovaného produktu membránou endoplazmického retikula (ER). Presekvencia, spravidla označovaná ako signálny peptid, sa všeobecne odštepuje od žiadaného produktu v priebehu translokácie. Len čo vstúpi na vylučovaciu cestu. prenáša sa bielkovina do jednotky GolgiZ Golgi môže bielkovina pokračovať rôznymi cestami, ktoré vedú do úsekov, ako sú bunečná vakuola alebo bunečná membrána alebo môžu opustiť bunku a vylučovať sa do vonkajšieho prostredia CS.R. Pfeffer a J. Ľ. Rothman, Ann. Rev. Bioch. 56, str. 829, 1987).
Boli navrhnuté rôzne spôsoby expresie a vylučovania v kvasinkách bielkovín heterologických ku kvasinkám. V európskej uverejnenej prihláške vynálezu číslo 88 632 sa popisuje spôsob, ktorým dochádza v prípade bielkovín heterologických ku kvasinkám, k expresil. spracovaniu a vylučovaniu transformáciou kvasinkového organizmu expresívnym spojivom kotviacim DNA kódujúcu žiadanú bielkovinu a signálny peptid, k príprave kultúry transformovaného organizmu, k rastu kultúry a k získaniu bielkoviny z kultivačného prostredia. Signálny peptid môže byť signálnym peptidom samotného žiadaného peptidu, heterologickým signálnym peptidom alebo hybridom natívneho a heterológového signálneho peptidu.
Problémom pri použití signálnych peptidov, heterologických ku kvasinkám, môže byť skutočnosť, že heterologický signálny peptid nezaisťuje účinnú translokáciu a/alebo odštiepenie po signálnom peptide.
S. cerevisiae MF 1 ((X -faktor) sa syntetizuje ako preprofonna 165 aminokyselín obsahujúci signálny alebo prepeptid s 19 aminokyselinami nasledovaný vedúcim alebo propeptidom so 64 amínokyselinami majúcim tri V-viazané glykozylačné miesta nasledované (LysArg(Asp/Glu.Ala)2-3 -faktor)^ (J- Kurjan a I. Herskovitz, Celí 30, str. 933 až 943, 1982). Signálny vedúci podiel preproMf 1 sa v širokej miere používa na dosiahnutie syntézy a sekréciu heterologickéj bielkoviny v S. cerevisiae.
Použitie signálnych/vedúcich peptidov horaologických ku kvasinkám je známe napríklad z amerického patentového spisu číslo 4 546082, z európskej uverejnenej prihlášky vynálezu číslo 116201, 123294, 123544, 163529 a 123289 a z dánskej uverejnenej prihlášky vynálezu číslo 3614/83.
Podľa európskej prihlášky vynálezu číslo 123289 sa používa
S. cerevisiae (X -faktorového prekurzoru, pričom podľa svetového patentového spisu WO 84/01153 sa naznačuje použitie Saccharomyces cerevisiae invertázového signálneho peptidu a podľa uverejnenej dánskej prihlášky vynálezu číslo 3614/83 sa používa Saccharomyces cerevisiae PHO5 signálneho peptidu na sekréciu cudzích bielkovín.
V americkom patentovom spise číslo 4 546082 a v európskych patentových spisoch číslo 16201, 123294, 123544 a 163529 sa popisuje spôsob, podľa ktorého sa IX-faktorový signálny vedúci prvok C'signal-leader) zo Saccharomyces cerevisiae (MF*K1 alebo MF C(2) používa v sekrečnom procese vytlačených heterologických bielkovín v kvasinkách. Popisuje sa fúzia DNA sekvencie kódujúca Saccharomyces cerevisiae MF1 signálnej vedúcej sekvencie na ukončení 5' génu pre žiadanú sekréciu bielkoviny a spracovanie žiadanej bielkoviny.
Európsky patentový spis číslo 206783 popisuje systém pre sekréciu polypeptidov zo Saccharomyces cerevisiae, pričom c( -faktorová vedúca sekvencia je zrezaná na eliminácii štyroch W -faktorových peptidov obsiahnutých na natívnej vedúcej sekvencii, takže sa uvoľňuje vedúci peptid sám arielovaný na heterologický polypeptid prostredníctvom -faktorového spracovateľského miesta LysArgGluAlaGluAlaľ Uvádza sa, že táto konštrukcia vedie k účinnému spôsobu prípravy menších peptidov (obsahujúcich menej , ako 50 aminokyselín). Na sekréciu a spracovanie väčších polypeptidov sa natívna -faktorová vedúca sekvencia zreže kvôli uvoľ. neniu jedného alebo dvoch -faktorových peptidov medzi vedúcim peptidom a polypeptidom.
Počet sekretovaných bielkovín sa smeruje tak, aby boli vystavené proteolytickému spracovateľskému systému, ktorý môže odštiepiť peptidovú väzbu na karboxylovom ukončení dvoch nasledujúcich bázických aminokyselín. Táto enzymatická aktivita je v Saccharomyces cerevisiae zakódovaná KEX 2 génom (D- A. Julius a kol.. Celí 37, str. 1075, 1984b). Spracovanie produktu KEX 2 génovým produktom je nutné pre sekréciu aktívneho Saccharomyces cerevisiae faktoru 1 (MF (Á 1 alebo -faktor) , nie je však zahrnutý v sekrécii aktívneho S.cerevisiae faktoru*.
Sekrécia a správne spracovanie polypeptidu, ktorý má byť výsledkom sekrécie, sa v niektorých prípadoch dosahuje, ak sa kultivujú kvasinkové organizmy, ktoré sú transformované vektorom , konštruovaným ako je hore uvedené. V mnohých prípadoch však hladina sekrécie je veľmi nízka alebo k sekrécii vôbec nedochádza « alebo próteolytické spracovanie môže byť nesprávne alebo nekompletné. Zámerom vynálezu je preto vytvoriť vedúce peptidy, ktoré zaisťujú účinnejšiu expresiu a/alebo spracovanie heterológových polypeptidov.
Podstata vynálezu
Podstata spôsobu konštrukcie syntetickej vedúcej peptidovej sekvencie na sekréciu heterológových polypeptidov v kvasinkách podľa vynálezu spočíva v tom, že sa
a) vnáša štatistický DNA fragment do kvasinkového expresného < vektora zahrňujúceho sekvenciu
5' -SP-Xn-3’ -RS-5' -Xm-(NZT)p-Xq-PS-,'gen’t-3’ *
kde znamená
SP DNA sekvenciu kódujúcu signálny peptid,
Xn DNA sekvenciu kódujúcu n aminokyselín, pričom n znamená alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín.
RS reštrikčné endonukleázové rekognizačné miesto pre včlenenie štatistických DNA fragmentov, ktoré miesto je na spojení Xn a Xm,
Xm DNA sekvenciu kódujúcu m aminokyselín, pričom m znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín, (NZT)p DNA sekvenciu kódujúcu Asn-Xaa-Thr, pričom m znamená 0 alebo číslo 1,
Xq DNA sekvenciu kódujúcu q aminokyselín, pričom q znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
PS DNA sekvenciu kódujúcu peptid definujúcu kvasinkové , spracovateľské miesto a geťi’' sekvenciu kódujúcu heterologický polypeptid.
ť b) transformuje sa kvasinková hostiteľská bunka expresným j vektorom podľa stupňa (a),
Í! * i c) kultivuje sa transformovaná hostiteľská bunka podľa stupňa (b) za vhodných podmienok a
d) vytriedi sa kultúra podľa stupňa (c) pre sekréciu heterológového polypeptidu.
'í ; j i
S prekvapením sa totiž zistilo, že je možné presunúť (X -faktorový vedúci peptid mnohými rôznymi DNA sekvenciami, čím sa dosiahne sekrécia heterolocfického polypeptidu v kvasinkách. Na základe tohto objavu bol vyvinutý spôsob, ktorým sa štatistické DNA fragmenty klonujú do kvasinkových vektorov v smere DNA sekvencie kódujúcej pre signálny peptid a proti smeru DNA sekvencie kódujúcej pre heterológový polypeptid. Po transformácii vektormi sa kvasinkové bunky vytriedia pre sekréciu žiadaného heterologického polypeptidu.
Vynález sa preto týka predovšetkým hore definovaného spôsobu konštrukcie syntetickej vedúcej peptidovej sekvencie pre sekréciu heterologických polypeptidov v kvasinkách.
Výrazom vedúci peptid sa tu vždy mieni peptid, ktorého úlohou je umožniť riadenie heterologického polypeptidu z endoplazmového retikula na Golgi aparatúru a ďalej k sekretačnému spojidlu pre sekréciu do prostredia (to znamená export vytlačeného polypeptidu cez bunečnú stenu alebo aspoň cez celulárnu membránu do periplazmovej oblasti bunky). Výrazom syntetický v súvislosti s vedúcimi peptidmi sa tu vždy mieni, že vedúci peptid, konštruovaný podľa vynálezu, nebol v prírode nájdený.
Výrazom signálny peptid sa tu vždy mieni presekvencia, ktorá je prevažne hydrofóbnej povahy a je obsiahnutá ako N-zakonČujúca sekvencia v kvasinkách. Funkciou signálneho peptidu je umožniť sekréciu heterologickej bielkoviny do endoplazmového retikula. Signálny peptid sa spravidla v priebehu tohto procesu odštiepi. Signálny peptid môže byť heterologický alebo homologický s kvasinkovým organizmom produkujúcim bielkovinu, ako je hore vysvetlené. Oveľa účinnejšie odštiepenie signálneho peptidu sa však dosiahne, ak je homologický s príslušným kvasinkovým organ i zrnom.
Výrazom heterologický polypeptid sa mieni polypeptid, ktorý sa neprodukuje prírodným hostiteľským kvasinkovým organizmom. Pri spôsobe podľa vynálezu je heterologickým polypeptidom s výho dou polypeptid, ktorého sekrécia transformovanými kvasinkovými bunkami sa môže ľahko zistiť, napríklad ustanovením štandardných spôsobov, ako je imunologické vytriedenie použitím protilátok reaktívnych s príslušným polypeptidom (viď napríklad Sambrook, Fritsch a Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Molekulárne klonovanie: Laboratórna príručka). Cold Spring Harbor, New York, 1989) alebo vytriedením pre špecifickú biologickú účinnosť heterologického peptidu. Pozitívny výsledok vytriedenia Indikuje, že bol konštruovaný vedúci peptid, užitočný pre sekréciu heterologického polypeptidu v kvasinkách.
Výrazom “štatistický DNA fragment sa mieni akákoľvek sekvencia DNA o dĺžke aspoň troch nukleotidov, napríklad získaná digesciou genómovej DNA (akéhokoľvek organizmu) s reštrikčnou endonukleázou alebo s reštrikčnými endonukleázami alebo prípravou syntetickej DNA, napríklad fosíoaraidátovým spôsobom, ktorý popísal S.L- Beaucage a H.H.Caruthers, Tetrahedron Letters 22. str. 1859 až 1860, 1981.
Peptid Asn-Xaa-Thr kódovaný “(NZT)p je asparagínom viazané glykozylačné miesto. Xaa znamená ktorúkoľvek zo známych aminokyselín okrem prolínu.
Vynález sa tiež týka kvasinkového expresného klonovacieho vektora zahrňujúceho nasledujúcu sekvenciu
5’ -SP-Xn-3' -RS-5' -Xm-(NZT)P-X<1-PS-geii~3’ kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam.
Tento vektor sa môže používať na spôsob konštrukcie syntetickej vedúcej peptidovej sekvencie hore popísaným spôsobom.
Vynález sa tiež týka kvasinkového expresného vektoru zahrňujúceho nasledujúcu sekvenciu
5' -SP-Xn-štatistická DNA-Xin-(NZT)p-Xq-PS-^gen”-3‘ kde znamená výraz štatistická DNA” fragment včlenený do reštrikčného endonukleázového rekognizačného miesta v spojení Xn a Xm a ostatné symboly majú hore uvedený význam.
' V tomto vektore vedúca peptidová sekvencia (identifikovaná j spôsobom podľa vynálezu) je zložená zo sekvencie ' Xn-štatistická DNA-Xní-(NZT)P-Xq »
kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam. Takýto vektor sa môže používať pre produkty žiadaného heterologického polypeptidu.
Vynález sa tiež týka spôsobu prípravy heterologického polypeptidu v kvasinkách, pričom sa kultivuje kvasinková bunka, ktorá je schopná expresie heterologického polypeptidu a ktorá sa > transformuje kvasinkovým expresným vektorom, ako je hore uvedené, včítane vedúcej peptidovej sekvencie konštruovanej spôsobom podľa vynálezu vo vhodnom prostredí na získanie expresie a sekrécie heterologického polypeptidu, pričom sa nakoniec heterologický peptid získa z prostredia.
Dĺžka štatistického DNA fragmentu včleneného do expresného vektora nemá rozhodujúci význam. Aby však bola dĺžka vhodná na manipuláciu, má fragment s výhodou dĺžku 16 až 600 párov báz. Predovšetkým má fragment dĺžku približne 15 až približne 300 páί rov báz. V súčasnej dobe sa mieni, že vhodná dĺžka fragmentu je približne 30 až približne 150 párov báz.
! Štatistický DNA fragment s výhodou kóduje vysoký podiel polárnych aminokyselín. Tieto aminokyseliny sú volené zo súboru zahrnujúceho Glu, Asp, Arg, His, Thr, Ser. Asn a Gin. V tejto súvislosti sa výrazom vysoký podiel” mieni, že DNA fragment kóduje väčší počet polárnych aminokyselín ako majú schopnosť iné j ' DNA sekvencie zodpovedajúcej dĺžky. Nezávisle na tom alebo nad to •í môže byť výhodné, aby fragment kódoval aspoň jeden prolín.
V sekvenc i 1
5’ -Sp-Xn-3' -RS-5’ -Xm-(NZT)p-Xc,-PS-^gen^-S' znamená n a/alebo m a/alebo q s výhodou 1 alebo väčšie číslo ako
1. Predovšetkým všetky symboly n, m. a q znamenajú 1 alebo väčšie číslo ako 1 a ostatné symboly majú hore uvedený význam.
* Sú niektoré skutočnosti (viď svetový patentový spis
VO 89/02463), ktoré potvrdzujú, že prítomnosť na asparagín viazaného glykozylačného miesta vo vedúcej sekvencii môže podporovať ; sekrečnú účinnosť vedúceho peptidu. V sekvencii
i.
5' -SP-Xn-3' -RS-5' -Xin-(NZT)p-Xq-PS-Ägenx<-3' znamená proste symbol p s výhodou 1, pričom ostatné symboly majú hore uvedený význam.
j Signálna peptidová sekvencia (SP) môže kódovať akýkoľvek ; signálny peptid, ktorý zaisťuje účinné riadenie vytlačovaného heí terologického polypeptidu do sekrečnej cesty bunky. Signálnym peptidom môže byť prírodné sa vyskytujúci signálny peptid alebo jeho funkčný podiel, alebo to môže byť syntetický peptid. Vhodnýt.’·;
mi signálnymi peptidmi sú (Á faktorové signálne peptidy, signálny ‘ , peptid myších slinných žliaz. modifikovaný karboxypeptidázový ! signálny peptid. signálny peptid kvasiniek BAR1 alebo lipázový signálny peptid Humicola lanuginosa alebo jeho derivát. Amylázová ,· signálna sekvencia myších slinných žliaz je popísaná v publikácii
O. Hagenbuchle a kol., Náture 289. str. 643 až 646, 1981. Karboxypeptidázová signálna sekvencia je popísaná v publikácii
L-A. Valls a kol.. Celí 48, str. 887 až 897, 1987- Signálny t
r peptid kvasiniek BAK1 je popísaný vo svetovom patentovom spise
VO 87/02670. Lipázový signálny peptid Humicola lanuginosa je popísaný v európskom patentovom spise číslo EP 305 216.
Kvasinkovým spracovateľským miestom. kódovaným DNA sekvenciou PS môže byt vhodná akákoľvek párová kombinácia Lys a Arg, napríklad Lys-Arg. Arg-Lys. Lys-Lys alebo Arg-Arg. ktorá umožňuje výrobu heterologického polypeptidu KEX2 proteázou Saccharorayces cerevisiae alebo ekvivalentnou proteázou iného druhu kvasiniek (D.A. Julius a kol., Celí 37, od str. 1075, 1984). Pokiaľ nie je KEX2 proces vhodný, napríklad sa má dosiahnuť štiepenie polypeptidového produktu, má sa voliť spracovateľské miesto pre inú proteázu miesto zahrnutia amínokyselinovej kombinácie, ktorá nie je zistená v polypeptidovom produkte. napríklad procesné miesto pre FXa. Ile-Glu-Cly-Arg (ako popisuje Sambrook, Eritscli a Maniatis. Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Molekulárne klonovanie; Laboratórna príručka). Cold Spring Harbor, New York, 1989).
Heterologickou bielkovinou produkovanou spôsobom podľa vynálezu môže byť akákoľvek bielkovina, ktorá sa výhodne produkuje kvasinkami. Ako príklady takých bielkovín sa uvádzajú aprotinín, tkanivový faktorový inhibítor alebo iné proteázové inhibítory, inzulín alebo inzulínové prekurzory, ľudský alebo hovädzí rastový faktor interleukín, glukagón, tkanivový plazminogénový aktivátor, transformačný rastový faktor alebo β, rastový faktor odvodený od krvných doštičiek, enzýmy alebo ich funkčné analógy. Výrazom funkčný analóg” sa vždy mieni polypeptid a podobnú funkciu ako má natívna bielkovina (mieni sa vzťah k prírode skôr ako hladina biologickej účinnosti natívnej bielkoviny). Polypeptid môže byť štrukturálne podobný natívnej bielkovine a môže byť odvodený od natívnej bielkoviny pridaním jednej alebo niekoľkých aminokyselín buď na jedno alebo na obe C a N-ukončenia natívnej bielkoviny, náhradou jednej alebo niekoľkých aminokyselín na jednom alebo na mnohých odlišných miestach v natívnej amínokyselinovej sekvencii. vypustením jednej alebo niekoľkých aminokyselín na jednom alebo na oboch ukončeniach natívnej bielkoviny na jednom alebo na niekoľkých miestach v amínokyselinovej sekvencii alebo vložením jednej alebo niekoľkých aminokyselín na jednom alebo na niekoľkých miestach natívnej amínokyselinovej sekvencie. Takéto modifikácie sú dobre známe pre mnohé hore uvedené bielkoviny.
Štatistický DNA fragment a sekvencia
5’-SP-Xn-3·-RS-5’-Xm-<NZT)p-Xq-PS-xgenx-3· kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, sa môžu pripravovať synteticky známymi spôsobmi, napríklad fosfoamidátovým spôsobôm. ktorý popísali S.L. Beaucage a M. H. Caruthers. Tetrahedron Letters 22, str. 1859 až 1869, 1981 alebo spôsobom, ktorý popísal Matthes a kol-, EMBO Journal 3, str. 801 až 805, 1984. Fosfoamidátovým spôsobom sa syntetizujú oligonukleotidy, napríklad v automatickom DNA syntetizére, čistia sa, tepelne sa hybrldizujú, ligatujú a klonujú dó kvasinkového expresného vektora. Pripomína sa, že sekvencia
5’-SP-Xn-3’-RS-5'-Xm-<NZT)p-Xq-PS-xgenx-3' kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, sa nemusí pripravovať jedinou operáciou, ale môže sa vytvárať z dvoch alebo z niekoľkých oligonukleotídov, pripravených synteticky takým spôsobom.
Štatistický DNA fragment alebo jedna alebo niekoľko častí sekvencie
5'-SP-Xn-3'-RS-5’-Xm-CNZT)p-Xq-PS-xgenx-3’ kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, môžu byť tiež genomického alebo cDNA pôvodu, napríklad získané prípravou genomického alebo cDNA súboru (library) s vytriedením pre DNA sekvencie kódujúce pre uvedené páry (spravidla SP alebo xgenx) hybridizáciou s použitím syntetických oligonukleotídových sond spolu so štandardnými spôsobmi (Sambrook, Fritsch a Maniatis.
Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Molekulárne klonovanie: Laboratórna príručka) Cold Spring Harbor, Nev York, 1989). V takom prípade génomická alebo cDNA sekvencia, kódujúca signálny peptid, sa môže viazať na genomickú alebo cDNA sekvenciu kódujúcu heterologickú bielkovinu, načo sa DNA sekvencia môže modifikovať včlenením syntetických oligonukleotídov kódujúcich známym spôsobom sekvenciu
Xn-3’-RS-5'-Xm-(NZT)p-Xq-PS kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam.
Štatistický DNA fragment a/alebo sekvencia
5’ -SP-Xn-3' -RS-5' -Xni-(NZT)P-Xq-PS-xgenx-3' kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, môže byť zmesného pôvodu syntetického a genomického. zmesného pôvodu syntetického a cDNA alebo zmesného pôvodu genomického a cDNA, pričom sa príprava vykonáva známym spôsobom tepelnou hybridizáciou fragmentov syntetického, genomického alebo cDNA pôvodu (podľa vhodnosti), pričom fragmenty zodpovedajú rôznym častiam DNA sekvencie ako celku.
Preto je možno mať predstavu.
že DNA sekvencia, kódujúca signálny peptid alebo heterologický polypeptid môže byt genomického alebo cDNA pôvodu.
zatiaľ čo sekvencia
Xn-3’-RS-5'-Xm-(NZT)p-Xq-PS môže byť pripravená synteticky.
Výhodná konštrukcia DNA, kódujúcej inzulínové prekurzory. je objasnená na sekvenčnom zozname ID číslo 1-13 (Sequence Listing ID Nos. 1-13) alebo na jeho modifikáciách. Príklady vhodných modifikácií DNA sekvencie sú nukleotídové substitúcie, ktorá nevedú k rastu na inú amínokyselinovú sekvenciu bielkoviny, ktoré však môžu zodpovedať kodomovému použitiu kvasinkového organizmu.
do ktorého sa vkladá DNA konštrukcia alebo nukleotídové substitúcie. ktoré umožňujú rast do odlišnej amínokyselinovej sekvencie. a tak možnú odlišnú štruktúru bielkoviny. Ako iný prípad možnej modifikácie sa uvádza včlenenie troch alebo násobku troch nukleotídov do sekvencie, adícia troch alebo násobku troch nukleotídov na jeho ukončenie sekvencie a vyústenie troch alebo násobku troch nukleotídov buď z ukončenia alebo zvnútra sekvencie.
Rekombinantným expresným vektorom nesúcim sekvenciu
5' -SP-Xn-3' -RS-5' -Xin-(NZT)P-Xq-PS-xgenx-3· alebo
5’-SP-Xn-štatistická DNÄ-Xm-(NZT)p-Xq-PS-xgenx-3· kde jednotlivé symboly majú vždy hore uvedený význam. môže byt akýkoľvek vektor, ktorý je schopný replikácie v kvasinkovom organizme. Vo vektore ktorákoľvek DNA sekvencia môže byt operatívne napojená na vhodný promótor sekvencie. Promótorom môže byt akákoľvek DNA sekvencia, ktorá vykazuje transkripčnú aktivitu v kvasinkách a môže byt odvodená od génov kódujúcich bielkoviny buď homologickej alebo heterologickej ku kvasinkám. Promótor je s výhodou odvodený od génu kódujúceho bielkovinový homológ ku kvasinkám. Ako príklady vhodných promótorov sa uvádzajú promótory Saccharomycetes cerevisiae MFX.1, TPI, ADII alebo PGK.
Hore uvedené sekvencie majú byt tiež operatívne spojené s vhodným terminátorom. ako je napríklad TPI terminátor (viď T. Alber a G. Kawasaki, J. Mol. Appl. Genet. 1, str. 419 až 434, 1982).
Rekombinantný expresný vektor podľa vynálezu ďalej zahrňuje DNA sekvenciu. umožňujúcu replikáciu vektoru v kvasinkách. Ako príklady takých sekvencií sa uvádzajú kvasinkové plazmidové 2/v replikačné gény REP 1-3 a začiatok replikácie. Vektor tiež môže zahrňovať selektovateľný signálny znak, napríklad Schizosaccharomyces pombe TPI gén. ako popisuje P.R.Russell, Gene 40. str. 125 až 130, 1985,
Procesy, používané na ligáciu sekvencie
5*-SP-Xn-3'-RS-5'-Xm-(NZT)P-Xq-PS-xgenx-3' kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, štatistický DNA fragment, promótor a terminátor a ich včleňovanie do vhodných kvasinkových vektorov obsahujúcich informáciu nutnú pre replikáciu kvasiniek sú pracovníkom v odbore dobre známe (viď napríklad
Sambrook, Fritsch a Maniatís, Molecular Cloning: A Laboratory
Manual (Molekulárne klonovanie: Laboratórna príručka) Cold Spring
Harbor, New York. 1989). Je jasné, že sa vektor môže konštruovať buď najskôr prípravou DNA konštrukcie obsahujúcej celú sekvenciu
5*-SP'Xn-3'-RS-5’-Xm-(NZT)P-Xq-PS-xgenx-3’ kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam a následne včlenením tohto fragmentu do vhodného expresného vektoru alebo následným včlenením DNA fragmentov obsahujúcich genetickú informáciu pre jednotlivé prvky (ako napríklad signálny peptid, sekvencie
Xn-3'-RS-5’-Xm-(NZT)P-Xq-PS kde jednotlivé symboly majú hore uvedený význam, alebo heterologický polypeptid) s následnou ligáciou.
Kvasinkový organizmus, používaný pri spôsobe podľa vynálezu môže byt akýkoľvek vhodný kvasinkový organizmus, ktorý pri kultivovaní produkuje veľké množstvá heterologického žiadaného polypeptidu- Ako príklady takých kvasinkových organizmov sa môžu uviest kmene kvasiniek druhu Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces kluyveri, Schizosaccharomyces porobe a Saccharomyces uvarum. Transformácia kvasinkových buniek sa môže napríklad realizovať protoplastovou formáciou nasledovanou transformáciou známym spôsobom. Použitým prostredím ku kultivácii buniek môže byť akékoľvek prostredie pre rast kvasinkového organizmu. Sekretovaná heterologická bielkovina, ktorej značný podiel je obsiahnutý v prostredí v správne produkovanej forme, sa môže získať známym spôsobom včítane oddelenia kvasinkových buniek z prostredia odstredením alebo filtráciou. vyzrážaním bielkovinových zložiek supernatantu alebo odfiltrovaním pri použití soli napríklad síranu amonného a následným čistením rôznymi chromatografickými procesmi, ako je napríklad ionexová chromatografia s afinitnou chromatograf iou.
Vynález bližšie objasňujú pripojené výkresy: na obr. 1 je schéma konštrukcie mPT7426m, na obr. 2 je schéma konštrukcie pLaC202.
na obr. 3 je DNA sekvencia a odvodená amínokyselinová sekvencia na klonovacom mieste v pLaC202 pre štatistické DNA fragmenty (pripomína sa, že sekvencia sa štiepi v Clal mieste a že ligácia bez včlenenia štatistickej DNA vedie k zmene v čítacom rámci) na obr.
je schéma konštrukcie pLSC6315D=.
Vynález tiež objasňujú nasledujúce príklady praktického uskutočnenia, ktoré však nie sú mienené ako obmedzenia vynálezu.
Príklady uskutočnenia vynálezu
Plazmidové a DNA materiály
Všetky expresné plazmidy sú C-POT typu. Všetky plastimidy sú popísané v uverejnenej európskej prihláške vynálezu číslo 171142 a sú charakterizované obsahom Schizosaccharomyces pombe triózovým fosfátovým izomerázovým génom (POT) pre účely plazmidovej selekcie a stabilizácie. Plazmid, obsahujúci POT gén, je dostupný ako uložený E. coli kmeň (ATCĽ 39685). Plazmidy ďalej obsahujú S. cerevisiae triózový fosfátový izomerázový promótor a terminátor (Ptpi a Ttpx)- Sú identické s pMT742 (M. Ľngel-Mitani a koi.. Gene 73, str. 113 až 120, 1988)(vid’ obr. 1) s výnimkou pre oblasť definovanú Sph-Xbal reštrikčnými miestami zahrňujúcimi PTPI a kódujúcimi oblasť pre signál/vedúci prvok/produkt.
Ptpi sa modifikuje so zreteľom na sekvenciu nájdenú v pMT742 jedine na uľahčenie konštrukčnej operácie. Vnútorné Sphl reštrikčné miesto sa eliminuje Sphl štiepením. odstránením chvostov a religáciou. Okrem toho DNA sekvencia v smere proti promótoru a bez akéhokoľvek napadania promótora sa odstraňuje ’ Bal31 exonukleázovým spracovaním a následnou adíciou SpHI reštrikčného miestového spojovníka. Táto promótorová konštrukcia na 373 bp Sphl-EcoRI fragmentu sa označuje pMT7426 (obr. 1).
Súbor rôznych DNA fragmentov zaujíma prípadné miesto v menšom E. coli plazmide typu p'1’7 hore popísaného (viď svetový patentový spis VO 89/02463) len modifikovaného so zreteľom na hore popísaný PTPI, to jest pT7 6. Pre štatistické klonovanie, ďalej popísané, sa používajú genómové DNA rôznych pôvodov. S. cerevisiae DNA sa izoluje z kmeňa MT633 (deponovaný 7. decembra 1990 v Nemeckej zbierke mikroorganizmov a bunkových kultúr podľa ustanovenia Budapeštianskej dohody na Medzinárodnom zhromaždení o deponovaní mikroorganizmov na účely patentových postupov pod číslom DSM 6278). A. oryzae DNA sa izoluje z kmeňa A1560 (IFO 4177).
Konečne sa používajú početné syntetické DNA fragmenty, ktoré sú všetky syntetizované na automatickom DNA syntetizéri (Applied Blosystems model 380A) s použitím fosforamiditovej chémie a obchodne dostupných reakčných činidiel (S-L.Beaucage a M.H.Caruthers, Tetrahedrom Letters 22, str. 1859 až 1869). 01igonukleotídy sa čistia polyakrylamidovou gelovou elektroforézou za denaturačných podmienok. Pred tepelnou hydridizáciou sa kinázujú komplementárne páry takých DNA jednoduchých reťazcov í s použitím T4 polynukleotídovej kinázy a ATP.
i
Všetky iné spôsoby a materiály sú všeobecne známe (viď napríklad J. Sambrook a kol-. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. (Molekulárne klonovanie: Laboratórna príručka), Cold i
.·!
I
Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, Nev York. 1989).
Príklad 1
Konštrukcia pLaC202
490 bp Sphl-Apal pT7 1966 (viď svetový patentový spis VO 89/02463, obr. 5) a 179 bp Hinfl-Xbal fragment pT7. <^M13 (viď svetový patentový spis VO 89/02463. obr. 1) spojený v 11 kbXbal-Sphl fragment pMT742 cez syntetický adaptor;
NOR367/373 CAACCATCGATAACACCACTTTGGCTAAGAG CCGGGTTGGTAGCTATTGTGGTGAAACCGATTCTCTAA rezultujú v plazmide pLaC202 (obr. 2 a 3. ako tiež sekvencie ID No. 1).
Tento vektor, obsahujúci špecifické Clal miesto, tvorí jedno prevedenie štatistického DNA klonovacieho vektoru, v ktorom produkovaný gén kóduje pre inzulínový prekurzor MI3 (B(1-29)-Ala-Ala-Lys-A(1-21)). Nasledujúce príklady a týkajú vedúcich prvkov klonovaných touto konštrukciou.
Príklad 2
Konštrukcia pLSC6315 a pLSC5210
Celá DNA sa izoluje z S.cerevisiae kmeňa MT663 a digeruje sa s Taql, HinPI alebo Taql + HinPI- Produkty sa oddelia podľa veľkosti na 1 % agarózovom geli a fragmenty menšie akp 600 bp sa izolujú z každej z troch digescií.
pLaC202, vopred digerovaný s Clyl. u ktorého sa predišlo samoligácii s teľacou črevnou alkalickou fosfatázou (CIAP) defosforyláciou sa mieša s fragmentovými fondami hore popísanými a liguje sa. Kmeň E. coli MT172 (MT172 = MC 1000 m+r-ara+ leuB-6; MC 1000 (viď M. Casadaban a S. Cohen, J. Mol. Biol. 138, str. 179, 1980)) sa transformuje s hore uvedenou ligačnou zmesou a získajú sa vhodné 5000 ApR transformanty pre každú zmes. Pripravia sa rekombinantné plazmidy z každého z troch typov vo fondoch zahrňujúcich všetkých 5000 transformantov. Tieto plazmldové fondy sa používajú na transformáciu S. cerevislae kmeňa MT663 a rezultujúce T0I transformanty sa imunotriedia na sekréciu MI3.
•J
Z prekvapivo veľkého počtu pozitívnych transformantov sa reizoluje osem zjavne najúčinnejších a z nich izolovaný plazmidový obsah.
Ako výsledok tejto operácie sa očakáva, že väčšina kvasinkových získaných transformantov má heterofénnu populáciu plazmidov a na získanie pravých klonov sa preto vykonáva stupeň plazmidovej reizolácie. Plazmidové preparácie z každého z ôsmich reizolovených kvasinkových transformantov sa používajú na transformáciu Ľ. coli kmeňa MT172 až ApR. Plazmidy z 12 E. coli transformantov pre l
každý z ôsmich kvasinkových izolátov sa individuálne používa na transformáciu kvasinkového kmeňa MT663, TPI a MI3 sekretačné transformanty sa identifikujú imunotriedením.
Sekventovanie ínzertov ôsmich izolovaných derivátov pLaC202 vykazuje tri odlišné sekvencie. dve z nich pLSC6315 a pLSC5210 sú najúčinnejšími nosičmi M13 sekrécie. Sekvencie kionované DNA a lemovacie oblasti sú ukázané na sekvenčnom zozname ID číslo 2 a 4.
I
Príklad 3
Modifikácia pLSC6315 i
j PLSC6315 sa volí na ďalšiu modifikáciu klonovanej syntetic; kej vedúcej sekvencie.
í í
j PLSC6315 sa digeruje s Apal endonukleázou s následným spracovaním endonukleázovou Béil31. Po fenolovej extrakcii sa rezul.tujúca DNA digeruje s Xbal a izolujú sa DNA fragmenty menšie ako originálne 367 bp ApaI-Xbal fragment.
pLaC202 sa digerujú s Clal a jednoretazcové CG generované chvosty sa odstránia s následnou digesciou Xbal a izoláciou 11 kb XbaI-]ClaI[ fragmentu (][ znamená, že sú jednoretazcové chvosty odrezané). Tento fragment sa mieša s pLSC6415 fragmentmi izolovanými hore a ligatovanými (obr. 6).
Proces transformácie a triedenia. popísaný v príklade 2, sa opakuje s pLSC6315D3 a PLSC6315D7 sa izoluje ako plazmldy podporujúce MI3 sekréciu oveľa účinnejšie ako originálny pLSC6315 (viď sekvenčný zoznam ID číslo 6 alebo 8).
Príklad 4
Konštrukcia pLAOl - 5
Celá DNA z mikroorganizmov Aspergillus oryzae kmeň A1560 sa spracováva ako hore popísané pre mikroorganizmus S.cerevisiae DNA v príklade 2 a klonovariie a reklonovanie sa vykonáva presne, ako je popísané v príklade 2, s tou výnimkou, že počet E. coli transformantov v prvom klonovaní sa zníži na približne 3000 na 1igačnú zmes. Tento pokus vedie k izolácii piatich klonov A. oryzae DNA, ktoré v pLaC202 kontexte sprostredkovávajú sekréciu inzulínového prekurzoru MI3 z S. cerevisiae.
Sekventovanie inzertov vykazuje pät odlišných sekvencií, dve z nich (pLAG2 a pLA05) sú oveľa účinnejšie, pokiaľ je zámerom sekrécie M13. Sekvencia DNA inzertov v pLA02 a pLA05 sú ukázané spolu s lemovacími oblastami v sekvenčnom zozname ID číslo 10 alebo 12.
Príklad 5
Kvasinkové kmene, kotviace plazmldy. ako je hore popísané.
sa nechávajú rásť v prostredí YP1) (F. Sherman a kol., Methods in Yeast Genetics (Spôsoby v genetike kvasiniek), Cold Spring Harbor Laboratory 1981). Pre každý kmeň sa 6 individuálnych 5 ml kultúr pretrepáva pri teplote 30 °C počas 60 hodín s konečným QD600 približne 15. Po dostredení sa supernatant odstráni na analýzu HPLC, čím sa meria koncentrácia sekretovaného inzulínového prekurzoru spôsobom, ktorý popísal Leo Snel a kol., Chromatographia 24, str. 329 až 332, 1987).
V tabuľke 1 sú uvedené expresné hladiny inzulínového prekurzoru, MI3, použitím vedúcich sekvencií izolovaných spôsobom podľa vynálezu, ako percento hladiny získané s transformantmi pMT742j, pri použi tí MF (1) vedúceho prvku S. cerevisiae.
Tabuľka I
ΡΜΤ742 PLSĽ6315 PLSC5210 PĽSC6315D3 PĽSC6315D7 pLA02 PLAO5
100 % 100 % % 175 % 120 % 120 % %
Priemyselná využiteľnosť
Kvasinkový expresný vektor zahrňujúci sekvenciu pre konštrukciu syntetických vedúcich peptidových sekvencií.
Sekvenčný zoznam
Cl) Všeobecná informácia
Ci) Prihlasovateľ: Novo Nordisk A/S
Cii) Názov vynálezu: Spôsob konštrukcie syntetickej vedúcej peptidovej sekvencie
Cii i) Počet sekvencif: 13
C i v) Korešpondenčná adresa:
(A) adresa: Novo Nordisk A/S, patentové oddelenie (B) ulica: Novo AÍle (C) mesto: Bagsvaerd (E) krajina^ Dánsko (F) ZIP: DK-2880
Cv) Počítačom čitateľná forma:
(A) typ prostredia: floppy disk (B) počítač: IBM PC kompatibilný (C) operačný systém: PC-D0S/MS-D0S
CD) software: PatentlnRelease # 1,0, verzia # 1,25
Cvi) Súčasné údaje o prihláške vynálezu:
CA) číslo prihlášky vynálezu (B) dátum podania (C) medzinárodná klasifikácia
Cviii) Informácie o zástupcovi (A) meno: Tlialsoe-Madsen. Birgit
CB) číslo-- 3540.204-VO
Cix) Telekomunikačné informácia:
CA) telefón: + 45 4444 8888
CB) telefax: + 45 4449 3256
CC) telex: 37304
C2) Informácie pre SEQ ID N0:1
Ci) Charakteristiky sekvencie:
CA) dĺžka: 335 párov báz
CB) typ: nukleová kyselina
CC) retazovitost: jeden reťazec
CD) topológia: lineárna
Cii) Typ molekuly: cDNA
Cxi) Popis sekvencie: SĽQ ID N0:l:
GAAITCATTC AAGAATAGIT CAAACAAGAA G^TTACAAAC TATCAATTTC ATACACAATA60
TAAAOGATTA AAAGAATGAA AGTOTÓČIG CIGCTITCCC TCATIGGATr CIGCIGGGCC .120
CAACCATOGA TAACACCACT TIGGCTAAGA GATTCGTIAA CCAACACTIG TGCGGTTCCC180
ACTIGGTTGA AGdTTGTAC TTGGTTIGOG GTGAAAGAGG TITCTTCTAC ACTCCTAAGG240
CTCCTAAGGG TATIGTOGAA CAATCCTGTA CCTCCATCIG CTCCTIGTAC CAATIGGAAA300
ACTACIGCAA CTAGAOGCAG CCOGCAGGCT CTAGAlis
C2) Informácie pre SEQ ID NQ:2:
Ci) Charakteristiky sekvencie:
(A) dížka: 492 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) retazovitost: jeden retazec
CD) topológia: lineárna
Cii) Typ molekuly: cDNA
Cix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: CDS (B) lokácia: 76..468 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: sig peptid
CB) lokácia: 76..309
Clx) Charakteristiky
CA) meno/kľúč: mat peptid (B) lokácia: 310..468
Cxi) Popis sekvencie: SEQ ID N0:2:
GAAITCATTC AAGAATAGIT CAAACAAGAA GATIACAAAC TATCAA'i'ľiC ATACACAATA
TAAAOGATTA AAAGA ATG AAA GTC TTC CIG CIG CIT TCC CTC ATT GGA ΊΤ0 Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -78 -75 -70
TGC TGG GCC CAA CCA TOG ΆΤΑ GAT GGA ACA CAT ΊΤΤ COG AAC AAC AAT cys Trp Ala Gin Pro Ser íle Asp Gly Ihr His Phe Pro Asn Asn Asn -65 -60 -55
111
159
GTC CCA ΑΤΑ GAC ACA AGA AAA GAA GGA CIA CAG CAT GAT TAC GAT ACA
Val Pro íle Asp Thr Arg Lys Glu Gly Leu GLn His Asp lyr Asp ihr ”50 -45 _4q-35
GAA ATT TTC GAG CAC ΑΊΤ GGA AGC GAT GAG ΊΤΑ ATT TTC AAT GAAGAG
Glu íle Leu Glu His íle Gly Ser Asp Glu Leu íle Leu Asn GluGlu
-30 . -25-20
TAT GTT ATT GAA AGA ACT TTC CAA GCC ATC GAT AAC ACC ACT TTCGCT
Tyr Val íle Glu Arg Thr Leu Gin Ala íle Asp Asn Thr Ihr LeuAla
-15 -10-5
AAG AGA TTC GTT AAC CAA CAC TTC TGC GCT TCC CAC TTC CTT GAA GCT Lys Arg Phe Val Asn Gin His Leu Cys Gly Ser His Leu Val Glu Ala 1 510
TTC TAC TTG GIT TGC GGT GAA AGA GGT TTC TTC TAC ACT CCT AAG GCT Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe Phe Tyr Thr Pro Lys Ala
20 2530
GCT AAG GCT ATT GTC GAA CAA TCC TCT ACC TCC ATC TCC TCC TTC TAC Ala Lys Gly íle Val Glu Gin Cys cys Thr Ser íle Cys Ser Leu Tyr
4045
CAA TTC GAA AAC TAC TCC AAC TAGAOGCAGC COGCAGGCTC TAGA
Gin Leu Glu Asn Tyr Cys Asn
207
255
303
351
399
447
492 (2) Informácie pre SEQ ID NO = 3:
(i) (x i )
Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 131 aminokyselín (B) typ: aminokyselina (D) topológia: lineárna
Typ molekuly: bielkovina
Popis sekvencie: SEQ ID NQ:3=
Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe Cys Trp Ala Gin
-78 -75 -70“
Pro Ser íle Asp Gly Ihr His Phe Pro Asn Asn Asn Val Pro íleAsp
-60 -55-50
Thr Arg Lys Glu Gly Leu Gin His Asp Tyr Asp Ihr Glu íle Leu Glu -45 -40“35
His íle Gly Ser Asp Glu Leu íle Leu Asn Glu Glu Tyr Val I-le Glu -30 -25 -20-15 i
Arg | Ihr | Leu | Gin | Ala | íle | Asp | Asn | Ihr | Ihr | Leu | Ala | Lys | Arg | Phe | Val |
-10 | -5 | 1 | |||||||||||||
Asn | Gin | His | Leu | Cys | Gly | Ser | His | Leu | Val | Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu | Val |
5 | 10 | 15 | |||||||||||||
cys | Gly | Glu | Arg | Gly | Phe | Phe | Tyr | Thr | Pro | Lys | Ala | Ala | Lys | Gly | íle |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Val | Glu | Gin | Cys | Cys | Thr | Ser | íle | Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | Leu | Glu | Asn |
35 | 40 | 45 | 50 |
Tyr Cys Asn (2) Informácie pre SEQ ID Ν0 = 4:
(i) Charakteristiky sekvencie: (A) dĺžka: 420 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) reťazovitosť: jeden reťazec (D) topológia: lineárna (i i) Typ molekuly: cDNA (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: CDS (B) lokácia: 76..396 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: sig peptid (B) lokácia: 76..237 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: mat peptid (B) lokácia: 238..396 (xi) Popis sekvencie: SEQ ID N0=4:
GAATTCAITC AAGAATAGIT CAAACAAGAA GATĽACAAAC TATCAATCTC ATACACAÄTA
TAAACGAITA AAAGA ATG AAA GTC TTC CTC CTC CIT TCC CIC ATT GGA TTC Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -54 -50-45
TCC TCG GCC CAA CCA TOG CIA TTC GAG TCA CIT AOG CTC GIT GATGIT
Cys Trp Ala Gin Pro Ser Leu Leu Glu Ser leu Ihr Leu Val AspVal
-40 -35-30
GAC GCA CTC TCG GAT ΑΊΤ GAT GCA CIT GIT GAG TCT GAA ACG CITGTC
Asp Ala Leu Ser Asp íle Asp Val Leu Val Glu Ser Glu Ihr LeuVal
-25 -20-15
111
159
207
CIT GTC Leu Val -10 | GAT AAC ACC | ACT TIG GCT AAG AGA TTC GTT AAC CAA CAC TTG | 255 | |||||||||||||
Asp | Asn Ihr | Ihr Leu -5 | Ala | Lys | Arg Phe Val Asn Gin His Leu | |||||||||||
1 | 5 | |||||||||||||||
TGC | GGT | TCC | CAC | TTC | GIT | GAA | GCT | TTC | TAC | TIG | GTT | TCC | GGT | GAA | AGA | 303 |
Cys | Gly | Ser | His | Leu | Val | Glu Ala | Leu | iyr | Leu | Val | Cys | Gly | Glu | Arg | ||
10 | 15 | 20 | ||||||||||||||
GGT | TTC | TTC | TAC | ACT | CCT | AAG | GCT | GCT | AAG | GGT | AIT | GTC | GAA | CAA | TCC | 351 |
Gly | Phe | Phe | Tyr | Ihr | Pro | Lys | Ala | Ala | Lys Gly | íle | Val | Glu | Gin | Cys | ||
25 | 30 | 35 | ||||||||||||||
TGT | ACC | TCC | ATC | TGC | TCC | TIG | TAC | CAA | TTG | GAA | AAC | TAC | TCC | AAC | 396 | |
Cys | Ihr | Ser | íle | Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | Leu Glu | Asn | Tyr Cys | Asn | ||||
40 | 45 | 50 |
TAGAOGCAGC COGCAGGCTC TAGA 420 (2) Informácie pre SEQ ID N0=5:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 107 aminokyselín (B) typ: aminokyselina (D), topológia: lineárna
C i i) Typ molekuly: bielkovina (xi) Popis sekvencie: SEQ ID N0=5:
Met -54 | Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe Cys Trp Ala Gin | |||
-50 | -45 | -40 | ||
Pro | Ser Leu Leu Glu | Ser Leu Ihr Leu Val | Asp Val Asp Ala Leu Ser | |
-35 | -30 | -25 | ||
f | Asp | íle Asp Val Leu | Val Glu Ser Glu Ihr | Leu Val Leu Val Asp Asn |
j | -20 | -15 | -10 | |
* | Thr | Ihr Leu Ala Lys | Arg Phe Val Asn Gin | His Leu Cys Gly Ser His |
í | -5 | 1 | 5 10 | |
i i | Leu | Val Glu Ala Leu | Tyr Leu Val Cys Gly | Glu Arg Gly Phe Phe Tyr |
i i | 15 | 20 | 25 | |
* | Ihr | Pro Lys Ala Ala | Lys Gly íle Val Glu | Gin Cys Cys Ihr Ser íle |
v | 30 | 35 | 40 |
Cys Ser Leu Tyr Gin Leu Glu Asn Tyr Cys Asn 45 50 ’i
(2) Informácie pre SEQ ID 110 = 6 = | ||
(i) | Charakteristiky sekvencie: (A) dĺžka: 453 párov báz (B) typ= nukleová kyselina (C) reťazovitosť= jeden reťazec (D) topológia= lineárna | |
( i i ) | Typ molekuly: cDNA | |
(ix) | Charakteristiky (A) meno/kľúč= CDS | |
í | (B) lokácia: 76..420 | |
• | (ix) | Charakteristiky |
(A) meno/kľúč: sig peptid | ||
Λ | (B) lokácia: 76..270 | |
(ix) | Charakteristiky | |
(A) meno/kľúč: mat peptid | ||
(B) lokácia: 271..420 | ||
(xi) | Popis sekvencie: SEQ ID N0=6: |
GAATTCAITC AAGAATAGIT CAÄACAAGAA GÄTTACAAAC TATCAÄTITC ATACACAATA60
TAAAOGÄTTA AAAGA ATC ÄÄÄ GTC TTC CTC CTC CIT TCC CTC ΑΊΤ GGA TTC111
Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -65 -60“55
TGC TGG cys Trp | GCC CAA | CCA ATA | GAC ACA | AGA AAA | GAA Glu | GGA CLA CAG CAT GAT | 159 | ||||||||
Ala | Gin -50 | Pro | íle | Asp | Ihr | Arg -45 | Lys | Gly Leu | Gin His Asp -40 | ||||||
TAC GAT | ACA | GAA | ATT | TTC | GAG | CAC | AIT | GGA | AGC | GAT | GAG | ΤΓΑ | ACC | CCG | 207 |
Tyr Asp | Ihr | Glu | íle | Leu | Glu | His | íle | Gly | Ser | Asp | Glu | Leu | Ihr | Pro | |
-35 | -30 | -25 | |||||||||||||
AAT GAA | GAG | TAT | GIT | ATT | GAA | AGA | ACT | TTC | CAA | GCC | ATC | GAT | AAC | ACC | 255 |
Asn Glu | Glu | Tyr | val | íle | Glu | Arg | Ihr | Leu | Gin | Ala | íle | Asp | Asn | Ihr | |
-20 | -15 | -10 | |||||||||||||
ACT TTC | GCT | AAG | AGA | TTC | GIT | AAC | CAA | CAC | TTC | TCC | GGT | TCC | CAC | TTC | 303 |
Thr Leu | Ala | Lys | Arg | Phe | Val | Asn | Gin | His | Leu | Cys | Gly | Ser | His | Leu | |
-5 | 1 | 5 | 10 | ||||||||||||
GIT GAA | GCT | TTC | TAC | TTG | GIT | TGC | GGT | GAA | AGA | GGT | TTC | TTC | TAC | ACT | 351 |
Val Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu | Val | Cys | Gly | Glu | Arg Gly | Phe | Phe | Tyr | Ihr |
20 25
CCT AAG GCT GCT AAG Pro Lys Ala Ala Lys 30
GGT ATT GTC GAA CAA TGC TCT ACC TCC ATC TGC
Gly íle Val Glu Gin Cys cys Ihr Ser íle Cys 35 40
399
TCC Ser
TTC TAC CAA TTC GAA AAC TACTGCAACT AGACGCAGCC CGCAGGCICT Leu. Tyr Gin Leu Glu Asn
50
450
AGA
453 (2) Informácie pre SEQ ID N0=7:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 115 aminokyselín (B) typ: aminokyselina <D> topológia: lineárna (i i) Typ molekuly: bielkovina (xi) Popis sekvencie: SEQ ID N0:7;
Met | Lys Val | Phe | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | íle | Gly | Phe | Cys | Trp . | Ala | Gin |
-65 | -60 | -55 | -50 | |||||||||||
Pro | íle Asp | Thr | Arg | Lys | Glu | Gly | Leu | Gin | His | Asp | Tyr | Asp | Ihr | Glu |
-45 | -40 | -35 | ||||||||||||
íle | Leu Glu | His | íle | Gly | Ser | Asp | Glu | Leu | Thr | Pro | Asn | Glu | Glu | Tyr |
-30 | -25 | -20 | ||||||||||||
Val | íle Glu | Arg | Ihr | Leu | Gin | Ala | íle | Asp | Asn | Ihr | Ihr | Leu | Ala | Lys |
-15 | -10 | -5 | ||||||||||||
Arg | Fhe Val | Asn | Gin | His | Leu | Cys | Gly | Ser | His | Leu | Val | Glu | Ala | Leu |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
Tyr | Leu Val | Cys | Gly 20 | Glu | Arg | Gly | Ehe | Phe 25 | Tyr | Ihr | Pro | Lys | Ala 30 | Ala |
Lys | Gly íle | Val | G1U | Gin | Cys | Cys | Ihr | Ser | íle | cys | Ser | Leu | Tyr | • Gin |
35 | 40 | 45 |
Leu Glu Asn <2) Informácie pre SEQ ID N0;8:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 459 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) reťazovítosť: jeden reťazec (D) topológia: lineárna (i i) Typ molekuly: cDNA <ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: CDS ( ix) (ix) (xi) (B) lokácia: 76..435 Charakteristiky (A) meno/kľúč: sig peptid (B) lokácia: 76..276 Charakteristiky (A) meno/kľúč-· mat peptid (B) lokácia: 277..435
Popis sekvencie: SEQ ID N0=8:
GAAITCATTC AAGAATAGIT CAAACAAGAA GATTACAAAC TATCAATTTC ATACACAATA
TAAAOGATIA AAAGA ATG AAA GTC TTC CTG CTG CIT TCC CTC ATT GGA TTC Met Lys Val Phe leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -67 -65 -60
TGC Cys -55 | TGG GCC | CAA Gin | CCT GTC CCA ATA GAC ACA AGA AAA GAA GGA CLA CAG | ||||||||||||
Trp | Ala | Pro Val Pro -50 | íle | Asp | Thr Arg Lys Glu Gly Leu Gin | ||||||||||
-45 | -40 | ||||||||||||||
CAT | GAT | TAC | GAT | ACA | GAA | ATT | TTG | GAG | CAC | ATT | GGA | AGC | GAT | GAG | ΊΤΑ |
His | Asp | Tyr | Asp | Thr | Glu | íle | Leu | Glu | His | íle | Gly | Ser | Asp | Glu | Leu |
-35 | -30 | -25 | |||||||||||||
ACC | CCG | AAT | GAA | GAG | TAT | GIT | ATT | GAA | AGA | ACT | TTC | CAA | GCC | ATC | GAT |
Thr | Pro | Asn | Glu | Glu | Tyr | Val | íle | G1U | Arg | Thr | Leu | Gin | Ala | íle | Asp |
-20 | -15 | -10 | |||||||||||||
AAC | ACC | ACT | TTG | GCT | AAG | AGA | TTC | GIT | AAC | CAA | CAC | TTC | TGC | GGT | TCC |
Asn | Thr | Thr | Leu | Ala | Lys Arg | Phe Val | Asn | Gin | His | Leu | Cys Gly | Ser | |||
-5 | 1 | 5 | |||||||||||||
CAC | TTG | GIT | GAA | GCT TTG | TAC ' | TTG < | GIT ' | TGC < | GGT GAA AGA GGT TTC TTC | ||||||
His | Leu | Val | Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu ' | Val | Cys < | Gly Glu Arg Gly Phe Phe | |||||
10 | 15 | 20 | 25 | ||||||||||||
TAC | ACT | cer | AAG | GCT | GCT | AAG | GGT . | ATT | GTC | GAA ' | CAA TGC TCT ACC TCC | ||||
Tyr | Thr | Pro | Lys | Ala | Ala | Lys | Gly | íle | Val | Glu < | Gin Cys Cys Thr Ser | ||||
30 | 35 | 40 | |||||||||||||
ATC | TGC | TCC | TTG | TAC | CAA | TTG | GAA | AAC | TAC | TGC | AAC TAGAOGCAGC | ||||
íle | Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | leu | Glu | Asn | Tyr | Cys | Asn | ||||
45 | 50 |
COGCAGGCTC TAGA
111
159
207
255
303
351
399
445
459
C2) Informácie pre SEQ ID N0=9:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 120 aminokyselín (B) typ: aminokyselina
CD) topológia: lineárna
Cii) Typ molekuly: bielkovina
Pop | i s sekv | ’enc | ie: | SEQ | ID | NO: | 9 = | ||||||||
Met | Lys | Val | Fhe | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | íle | Gly | Phe | Cýs | Trp | Ala | Gin |
-67 | -65 | -60 | -55 | ||||||||||||
Pro | Val | Pro | íle | Asp | Thr | Arg | Lys | Glu | Gly | Leu | Gin | His | Asp | Tyr | Asp |
-50 | -45 | -40 | |||||||||||||
Ihr | Glu | íle | Leu | Glu | His | íle | Gly | Ser | Asp | Glu | Leu | Thr | Pro | Asn | Glu |
-35 | -30 | -25 | -20 | ||||||||||||
Glu | iyr | Val | íle | Glu | Arg | Ihr | Leu | Gin | Ala | íle | Asp | Asn | Ihr | Ihr | Leu |
-15 | -10 | -5 | |||||||||||||
Ala | Lys | Arg | Phe | Val | Asn | Gin | His | Leu | cys | Gly | Ser | His | Leu | Val | Glu |
1 | 5 | 10 | |||||||||||||
Ala | Leu | Tyr | Leu | Val | cys | Gly | Glu | Arg | Gly | Phe | Phe | iyr | Ihr | Pro | Lys |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
Ala | Ala | Lys | Gly | íle | Val | Glu | Gin | Cys | Cys | Ihr | Ser | íle | Cys | Ser | Leu |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
Tyr | Gin | Leu | Glu | Asn | iyr | cys | Asn |
C2) Informácie pre SEQ ID NO-IO:
: Charakteristiky sekvencie:
j (A) dĺžka: 408 párov báz | (B) typ: nukleová kyselina
I CC) reťazovítosť: jeden reťazec
CD) topológia: lineárna
Cii) Typ molekuly: cDNA ' Cix) Charakteristiky i
·< CA) meno/kľúč: CDS ?
(B) lokácia: 76-.384 (ix) Charakteristiky (A) ineno/kľúč: sig peptid (B) lokácia: 76-.225 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúc: mat peptid (B) lokácia: 226..384 (xi) Popis sekvencie1 SEQ ID N0:10:
GAATTCAITC AAGAATAGIT CAAACAAGAA GATTACAAAC TATCAATITC ATACACAATA60
TAAAOGATTA AAAGA ATG AAA GTC TTG CIC CTG CIT TCC CIC ATT GGA TTC111
Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -50 -45-40
TGC TGG GCC CAA | CCA TOG ATC | TTG Leu | GAT TAT GIT GAC TTG GGT GCG GAA | 159 | ||||||||||||
Cys Trp Ala | Gin -35 | Pro | Ser íle | Asp Tyr Val Asp Leu Gly | Ala Glu | |||||||||||
-30 | -25 | |||||||||||||||
CTG | ATC | TCC | ATT | OGT | GGG | TAT | GAT | AAC | CIC | AAC | GAC | GOG | ATC | GAT | AAC | 207 |
Leu | íle | Ser | íle | Arg | Gly | Tyr Asp | Asn | Leu | Asn | Asp | Ala | íle | Asp | Asn | ||
-20 | -15 | -10 | ||||||||||||||
ACC | ACT | TTG | GCT | AAG | AGA | TTC GIT | AAC | CAA | CAC | TTG | TGC | GGT | TCC | CAC | 255 | |
Thr | Thr | Leu | Ala | Lys | Arg | Rie Val | Asn | Gin His | Leu | Cys | Gly | Ser | His | |||
-5 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||
TTC | GIT | GAA | GCT | TTG | TAC | TTG | GIT | TGC | GGT | GAA | AGA | GGT | TTC | TTC | TAC | 303 |
Leu | Val | Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu | Val | Cys | Gly | Glu | Arg | Gly | Phe | Phe | Tyr | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
ACT | CCT | AAG | GCT | GCT AAG | GGT | ATT | GTC | GAA | CAA | TGC | TGT | ACC | TCC | ATC | 351 | |
Thr | Pro | Lys | Ala | Ala | Lys | Gly | íle | Val | Glu | Gin | Cys Cys | Thr | Ser | íle | ||
30 | 35 | 40 | ||||||||||||||
TGC | TCC | TTG | TAC | CAA | TTG | GAA | AAC | TAC | TGC | AAC | TAGACGCAGC COGCAGGCTC | 404 | ||||
Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | Leu | Glu | Asn | Tyr Cys | Asn | |||||||
45 | 50 | |||||||||||||||
TAGA | 408 |
(2) Informácie pre SEQ ID NO:11:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 103 aminokyselín (B) typ: aminokyselina (D) topológia: lineárna
Typ molekuly: bielkovina
Popis sekvencie: SEQ ID N0=ll:
(ii) (xi)
Met | Lys | Val | Phe | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | íle | Gly | Phe | Cys | Trp | Ala | Gin |
-50 | -45 | -40 | -35 | ||||||||||||
Pro | Ser | íle | Leu | Asp | iyr | Val | Asp | Leu | Gly | Ala | Glu | Leu | íle | Ser | íle |
-30 | -25 | -20 | |||||||||||||
Arg | Gly | Tyr | Asp | Asn | Leu | Asn | Asp | Ala | íle | Asp | Asn | Thr | Thr | Leu | Ala |
-15 | -10 | -5 | |||||||||||||
Lys | Arg | Phe | Val | Asn | Gin | His | Leu | Cys | Gly | Ser | His | Leu | Val | Glu | Ala |
1 | 5 | 10 | |||||||||||||
Leu | Tyr | Leu | Val | Cys | Gly | G1U | Arg | Gly | Phe | Phe | Tyr | Thr | Pro | Lys | Ala |
15 | 20 | 25 | 30 | ||||||||||||
Ala | Lys | Gly | íle | Val | Glu | Gin | Cys | Cys | Thr | Ser | íle | Cys | Ser | Leu | Tyr |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Gin | Leu | Glu | Asn | Tyr | Cys | Asn |
(2) Informácie pre SEQ ID N0=12:
(i) Charakteristiky sekvencie:
(A) dĺžka: 372 párov báz (B) typ: nukleová kyselina (C) reťazovitosC: jeden reťazec (D) topológia: lineárna (i i) Typ molekuly: cDNA (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: qds (B) lokácia: 76..348 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: sig peptid (B) lokácia: 76..189 (ix) Charakteristiky (A) meno/kľúč: mat peptid (B) lokácia: 190..348 (xi) Popis sekvencie: SEQ ID N0=12:
•GknITCATTC AAGAATAGIT CAAACAAGAA GAITACAAAC TATCAATITC ATACACAAIA
TAAACGATTA AAAGA ATG AAA GTC TTC CTC CTC CIT TCC CTC ATT GGA TTC Met Lys Val Phe Leu Leu Leu Ser Leu íle Gly Phe -33
111
TCC TGG GCC CAA CCA TOG | CAC | ACT ACC | ATC | GGC | ACC | GCA | ACT | GAC | AAA | ||||
Cys Trp Ala Gin Pro Ser | His | Thr Thr | íle | C-ly | Thr | Ala Thr | Asp Lvs | ||||||
-25 | -20 | -15 | |||||||||||
AAC ATC CAT | AAC | ACC | ACT | TTC | GCT | AAG | AGA | TTC | GIT | AAC | CAA | CAC | TTC |
Asn íle Asp | Asn | Thr | Thr | Leu | Ala | Lys Arg | Phe | Val | Asn | Gin | His | Leu | |
-10 | -5 | 1 | 5 | ||||||||||
TCC GGT TCC | CAC | TTC | GIT | GAA | GCT | TTC | TAC | TTC | GTT | TCC | GGT | GAA | AGA |
Cys C-ly Ser | His | Leu | Val | Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu | Val | cys | Gly | Glu | Arg |
10 | 15 | 20 | |||||||||||
GGT TTC TTC | TAC | ACT | CCT | AAG | GCT | GCT | AAG | GGT | ATT | GTC | GAA | CAA | TGC |
Gly Phe Phe | Tyr | Thr | Pro | Lys | Ala | Ala | Lys | c-ly | íle | Val | Glu | Gin | Cys |
25 | 30 | 35 | |||||||||||
TCT ACC TCC | ATC | TCC | TCC | TTC | TAC | CAA | TTG | CAA | AAC | TAC | TCC | AAC | |
Cys Thr Ser | íle | Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | Leu | Glu | Asn | Tyr Cys | Asn | ||
40 | 45 | 50 |
TAGAOGCAGC COGCAGGCTC TAGA
159
207
255
303
343
372 (2) Informácie pre SEQ ID NO-13-Charakteristiky sekvencie:
(A) (i) (B) (D) (11)
Typ dĺžka: 91 aminokyselín typ: aminokyselina topológia: lineárna molekuly: bielkovina
Popis (xi) sekvencie; SEQ ID N0=13:
Met | Lys | Val | Phe | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | íle | Gly | Phe | Cys | Trp | Ala | Gin |
-38 | -35 | -30 | -25 | ||||||||||||
Pro | Ser | His | Tnr | Thr | íle | Gly | Thr | Ala | Thr | Asp | Lys | Asn | íle | Asp | Asn |
-20 | -15 | -10 | |||||||||||||
Thr | Thr | Leu | Ala | Lys | Arg | Phe | Val | Asn | Gin | His | Leu | Cys | Gly | Ser | His |
-5 | 1 | 5 | 10 | ||||||||||||
Leu | Val | Glu | Ala | Leu | Tyr | Leu | Val | Cys | Gly | Glu | Arg | Gly | Phe | Fhe | Tyr |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
Pro | Lys | Ala | Ala | Lys | c-ly | íle | Val | C-lu | Gin | Cys | Cys | Thr | Ser | íle | |
30 | 35 | 40 | |||||||||||||
Cys | Ser | Leu | Tyr | Gin | Leu | C-lu | Asn | Tyr | Cys | Asn |
50 fl/ č’zs'-yz
Claims (25)
1. Spôsob konštrukcie syntetickej vedúcej peptidovej sekvencie pre sekréciu heterologických polypeptidov v kvasinkách, vyznačujúci sa tým, že sa:
a) vnáša štatistický DNA fragment do kvasinkového expresného vektora zahrnú júceho sekvenciu
5’-SP-Xn-3'-RS-5'-Xm-CNZT)P-Xg-PS-xgenx-3 kde znamená
SP DNA sekvenciu kódujúcu signálny peptid,
Xn DNA sekvenciu kódujúcu n aminokyselín, pričom n znamená
0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
RS reštrikčné endonukleázové rekognizačné miesto pre včlenenie štatistických DNA fragmentov, ktoré miesto je na spojení Xn a Xm,
Xm DNA sekvenciu kódujúcu m amínokyselín, pričom m znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín, (NZT)p DNA sekvenciu kódujúcu Asn-Xaa-Thr, pričom m znamená 0 alebo číslo 1,
Xq DNA sekvenciu kódujúcu g aminokyselín, pričom q znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
PS DNA sekvenciu kódujúcu peptid definujúcu kvasinkové spracovateľské miesto a xgenx sekvenciu kódujúcu heterologický polypeptid.
b) transformuje sa kvasinková hostiteľská bunka expresným vektorom podľa stupňa (a),
c) kultivuje sa transformovaná hostiteľská bunka podľa stupňa (b) za vhodných podmienok a
d) vytriedi sa kultúra podľa stupňa (c) pre sekréciu heterológového polypeptidu-
2. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým» že štatistický DNA fragment. začleňovaný do vektora, je génomického alebo syntetického pôvodu.
3. Sposob podlá nároku 1 az 2, vyznačujúci sa tým, že štatistický DNA fragment má dĺžku až približne 600 párov báz.
4. Spôsob podľa nároku štatistický DNA fragment am í nokyse1 í n.
5. Spôsob podľa nároku štatistický DNA fragment kóduj
6. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým. že a/alebo m a/alebo q znamená 1 alebo číslo väčšie ako 1.
7. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým. že P znamená 1.
8. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým. že SP znamená DNA sekvenciu kódujúcu (Á -faktorový signálny peptid, signálny peptid myších slinných žliaz, karboxypeptidázový signálny peptid, signálny peptid kvasiniek BAR1 alebo lipázový signálny peptid Humicola lanuginosa alebo jeho derivát.
9. Spôsob podľa nároku 1. vyznačujúci sa tým. že PS je DNA sekvencie kódujúcej Lys-Arg, Arg-Lys, Lys-Lys, Arg-Arg alebo Ile-Glu-Gly-Arg.
10. Spôsob podľa nároku 1. vyznačujúci sa tým. že heterologický peptid je volený zo súboru zahrnujúceho aprotinín, tkanivový faktorový inhibítor alebo iné proteázové inhibítory. inzulín alebo inzulínové prekurzory, ľudský alebo hovädzí rastový faktor, interleukín, glukagón, tkanivový plazminogénový aktivátor, transformačný rastový faktor alebo β, rastový faktor odvodený od krvných doštičiek, enzýmy alebo ich funkčné analógy.
11. Kvasinkový expresný klonujúci vektor.vyznačujúci sa tým. že zahrňuje sekvenciu
5’-SP-Xn-3’-RS-5’-Xm-(NZT)p-Xq-PS-xgenx-3’ amená
DNA sekvenciu kódujúcu signálny peptid,
DNA sekvenciu kódujúcu n aminokyselín, pričom n znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín, reštrikčné endonukleázové rekognizačné miesto pre včlenenie štatistických DNA fragmentov, ktoré miesto je na spojení Xn a Xm,
DNA sekvenciu kódujúcu m aminokyselín, pričom m znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
DNA sekvenciu kódujúcu Asn-Xaa-Thr, pričom m znamená 0 alebo číslo 1,
DNA sekvenciu kódujúcu q aminokyselín, pričom q znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
DNA sekvenciu kódujúcu peptid definujúcu kvasinkové spracovateľské miesto a sekvenciu kódujúcu heterologický polypeptid.
Kvasinkový expresný klonujúci vektor podľa nároku 11, vyznačujúci sa tým, že n a/alebo m a/alebo q znamená 1 alebo číslo väčšie ako 1.
13. Kvasinkový expresný klonujúci vektor podľa nároku 11, vyznačujúci sa tým, že p znamená 1.
14. Spôsob podľa nároku 11, vyznačujúci sa tým, že SP znamená DNA sekvencií kódujúce -faktorový signálny peptid, signálny peptid myších slinných žliaz, karboxypeptidázový signálny peptid alebo signálny peptid kvasiniek BAR1.
kde z:
SP
Xn
RS
Xin (NZT)p
Xq
PS xgenx 12.
15. Spôsob podľa nároku 11, vyznačujúci sa tým. že PS je DNA sekvencia kódujúca Lys-Arg. Arg-Lys, Lys-Lys, Arg-Arg alebo Ile-Glu-Gly-Arg.
16- Spôsob podľa nároku 11. vyznačujúci sa tým. že heterologický peptid je volený zo súboru zahrňujúceho aprotinín, tkanivový inhibítor alebo iné proteázové inhibítory, inzulín alebo inzulínové prekurzory, ľudský alebo hovädzí rastový faktor, interleukín, glukagón. tkanivový plazminogénový aktivátor. transformačný rastový faktor alebo β , rastový faktor odvodený od krvných doštičiek, enzýmy alebo ich funkčné analógy.
17- Kvasinkový expresný vektor, vyznačujúci sa tým. že zahrňuje sekvenciu
5’-SP-Xn-štatistická DNA-Xm-(NZT)P-Xq-PS-xgenx-3’ kde znamená
SP DNA sekvenciu kódujúcu signálny peptid.
Xn DNA sekvenciu kódujúcu n aminokyselín, pričom n znamená
0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín, štatistický DNA fragment včlenený do reštrikčného endo nukleázového rekognizačného miesta v spojení Xn a Xm a
RS reštrikčné endonukleázové rekognizačné miesto pre včlenenie štatistických DNA fragmentov, ktoré miesto je na spojení Xn a Xm.
Xm DNA sekvenciu kódujúcu in aminokyselín, pričom m znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín, (NZT)p DNA sekvenciu kódujúcu Asn-Xaa-Thr, pričom m znamená 0 alebo číslo 1,
Xq DNA sekvenciu kódujúcu q aminokyselín, pričom q znamená 0 alebo celé číslo 1 až približne 10 aminokyselín,
PS DNA sekvenciu kódujúcu peptid definujúcu kvasinkové spracovateľské miesto a xgenx sekvenciu kódujúcu heterologický polypeptid.
pričom sekvencia X-X kóduje vedúcu peptidovú sekvenciu.
18. Spôsob podľa nároku 17, vyznačujúci sa tým. že štatistický DNA fragment, začleňovaný do vektoru, je genomlckého alebo syntetického pôvodu -
19. Spôsob podľa nároku 17 alebo 18, vyznačujúci sa tým. že štatistický DNA fragment má dĺžku 6 až približne 600 párov báz.
20. Spôsob podľa nároku 17 až 19, vyznačujúci sa tým, že • štatistický DNA fragment kóduje vysoký podiel polárnych aminokyselín.
21- Spôsob podľa nároku 17 až 20, vyznačujúci sa tým, že štatistický DNA fragment kóduje aspoň jeden prolín.
22. Spôsob podľa nároku 17, vyznačujúci sa tým, že a/alebo
ná DNA sekvenciu kódujúcu 0(-faktorový signálny peptid. signálny peptid myších slinných žliaz, karboxypeptidázový signálny peptid. signálny peptid kvasiniek BAR1 alebo lipázový signálny peptid Humicola lanuginosa alebo jeho derivát.
25. Spôsob podľa nároku 17, vyznačujúci sa tým. že PS je DNA sekvencia kódujúca Lys-Arg, Arg-Lys, Lys-Lys, Arg-Arg alebo Ile-Glu-Gly-Arg.
26. Spôsob podľa nároku 17, vyznačujúci sa tým, že heterologický peptid je volený zo súboru zahrňujúceho aprotinín, inzulín alebo inzulínové prekurzory, ľudský alebo hovädzí rastový faktor, interleukín, glukagón, tkanivový plazminogénový aktivátor, transformačný rastový faktor alebo β, rastový faktor odvodený od krvných doštičiek, enzýmy alebo ich funkčné analógy.
27. Kvasinková bunka schopná expresie heterologického polypeptidu a transformovaná kvasInkovým expresným vektorom podľa nároku 17 až 26.
28. Spôsob produkcie heterologického polypeptidu v kvasinkách, vyznačujúci sa tým, že sa kultivuje kvasničná bunka, schopná expres ie heterologického polypeptidu a transformovaná kvasinkovým expresným vektorom podľa nároku 17 až 26 za včlenenia vedúcej peptidovej sekvencie konštruovanej spôsobom podľa nároku 1, vo vhodnom prostredí k expresii a sekrécii heterologického polypeptidu, načo sa heterologický peptid izoluje z prostredia.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DK300090A DK300090D0 (da) | 1990-12-19 | 1990-12-19 | Fremgangsmaade til fremstilling af leadersekvenser |
PCT/DK1991/000396 WO1992011378A1 (en) | 1990-12-19 | 1991-12-18 | A method of constructing synthetic leader sequences |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK62593A3 true SK62593A3 (en) | 1993-10-06 |
Family
ID=8118017
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK62593A SK62593A3 (en) | 1990-12-19 | 1991-12-18 | Method of constructing synthetic leader sequences |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0563175A1 (sk) |
JP (1) | JPH06503957A (sk) |
KR (1) | KR930703450A (sk) |
AU (1) | AU660161B2 (sk) |
CA (1) | CA2098731A1 (sk) |
CZ (1) | CZ119293A3 (sk) |
DK (1) | DK300090D0 (sk) |
FI (1) | FI932831A (sk) |
HU (1) | HUT68751A (sk) |
IE (1) | IE914433A1 (sk) |
IL (1) | IL100408A0 (sk) |
MX (1) | MX9102684A (sk) |
NZ (1) | NZ241011A (sk) |
PT (1) | PT99848A (sk) |
SK (1) | SK62593A3 (sk) |
WO (1) | WO1992011378A1 (sk) |
ZA (1) | ZA919932B (sk) |
Families Citing this family (38)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FI92601C (fi) * | 1992-03-11 | 1994-12-12 | Marja Makarow | Menetelmä hyötyproteiinien erittämiseksi hiivoista |
US5538863A (en) * | 1993-07-01 | 1996-07-23 | Immunex Corporation | Expression system comprising mutant yeast strain and expression vector encoding synthetic signal peptide |
US5639642A (en) * | 1994-06-16 | 1997-06-17 | Novo Nordisk A/S | Synthetic leader peptide sequences |
IL114160A (en) * | 1994-06-17 | 2006-12-31 | Novo Nordisk As | Dna constructs encoding heterologous proteins and processes for the heterologous protein production in yeast |
US6500645B1 (en) | 1994-06-17 | 2002-12-31 | Novo Nordisk A/S | N-terminally extended proteins expressed in yeast |
HRP940432B1 (en) * | 1994-08-05 | 2003-10-31 | Pliva Pharm & Chem Works | Dna sequences encoding biosynthetic insulin precursors and process for preparation of insulin |
NZ303162A (en) | 1995-03-17 | 2000-01-28 | Novo Nordisk As | Enzyme preparations comprising an enzyme exhibiting endoglucanase activity appropriate for laundry compositions for textiles |
BR9707807A (pt) | 1996-03-01 | 1999-07-27 | Novo Nordisk As | Uso de uma composição farmacêutica composição farmacêutica processo de tratar doenças ou distúrbios associados com a regulação do apetite prejudicado e uso de um peptideo |
DE69739319D1 (de) | 1996-12-13 | 2009-04-30 | Novartis Vaccines & Diagnostic | Verfahren zur Expression von PDGF oder IGR Proteinen in Hefe |
JP2003525570A (ja) | 1998-01-23 | 2003-09-02 | ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ | 酵母において所望のポリペプチドを産生する方法 |
DE60044728D1 (de) | 1999-12-29 | 2010-09-02 | Novo Nordisk As | VERFAHREN ZUR HERSTELLUNG VON INSULINVORLäUFERN UND ANALOGEN VON INSULINVORLÄUFERN MIT VERBESSERTER FERMENTATIONSAUSBEUTE IN HEFE |
AT410217B (de) * | 2000-06-15 | 2003-03-25 | Cistem Biotechnologies Gmbh | Vektor und ein verfahren zur expression und selektion randomisierter peptid-sequenzen |
ES2432967T3 (es) | 2001-03-22 | 2013-12-05 | Novo Nordisk Health Care Ag | Derivados del Factor VII de coagulación |
ATE532858T1 (de) | 2001-09-27 | 2011-11-15 | Novo Nordisk Healthcare Ag | Menschliche gerinnungsfaktor-vii-polypeptide |
ES2381110T3 (es) | 2003-09-09 | 2012-05-23 | Novo Nordisk Health Care Ag | Polipéptidos de factor VII de coagulación |
JP2007532096A (ja) | 2003-11-14 | 2007-11-15 | ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ | アシル化されたインスリンの製造方法 |
ES2369895T3 (es) | 2003-12-03 | 2011-12-07 | Novo Nordisk A/S | Insulina monocatenaria. |
WO2005078116A1 (fr) * | 2004-01-16 | 2005-08-25 | Qiuyun Liu | Methode permettant d'isoler de peptides antibacteriens et peptides isoles |
ES2357550T3 (es) | 2005-04-18 | 2011-04-27 | Novo Nordisk A/S | Variantes de la il-21. |
CN102660614A (zh) | 2005-08-16 | 2012-09-12 | 诺沃-诺迪斯克有限公司 | 制备成熟胰岛素多肽的方法 |
US20090055942A1 (en) | 2005-09-14 | 2009-02-26 | Novo Nordisk Healthcare A/G | Human Coagulation Factor VII Polypeptides |
ATE482977T1 (de) | 2006-02-27 | 2010-10-15 | Novo Nordisk As | Insulinderivate |
EP2069502B1 (en) | 2006-09-27 | 2014-02-26 | Novo Nordisk A/S | Method for making maturated insulin polypeptides |
WO2009021955A1 (en) | 2007-08-13 | 2009-02-19 | Novo Nordisk A/S | Rapid acting insulin analogues |
ES2526924T3 (es) | 2007-08-15 | 2015-01-16 | Novo Nordisk A/S | Insulinas con una fracción acilo que comprende unidades repetitivas de aminoácidos que contienen alquilenglicol |
EP2178912B1 (en) | 2007-08-15 | 2015-07-08 | Novo Nordisk A/S | Insulin analogues with an acyl and aklylene glycol moiety |
EP2406282A1 (en) | 2009-03-11 | 2012-01-18 | Novo Nordisk A/S | Interleukin-21 variants having antagonistic binding to the il-21 receptor |
AU2010272483B2 (en) | 2009-07-17 | 2016-07-21 | Omeros Corporation | MASP isoforms as inhibitors of complement activation |
EP2504355B1 (en) | 2009-11-25 | 2015-07-22 | Novo Nordisk A/S | Method for making polypeptides |
WO2011067283A1 (en) | 2009-12-01 | 2011-06-09 | Novo Nordisk A/S | Novel peptidyl alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyases |
ES2543634T3 (es) | 2010-01-22 | 2015-08-20 | Novo Nordisk A/S | Proceso para preparación de FGF-21 con grado de O-glicosilación bajo |
JP6148013B2 (ja) | 2010-03-05 | 2017-06-14 | リグショスピタレト | 補体活性化のキメラ抑制分子 |
AU2011282988A1 (en) * | 2010-07-28 | 2013-01-31 | Smartcells, Inc. | Recombinantly expressed insulin polypeptides and uses thereof |
US11787844B2 (en) | 2012-02-09 | 2023-10-17 | Var2 Pharmaceuticals Aps | Targeting of chondroitin sulfate glycans |
JP2015532307A (ja) | 2012-10-15 | 2015-11-09 | ノヴォ・ノルディスク・ヘルス・ケア・アーゲー | 凝固因子viiポリペプチド |
EP3004156A1 (en) | 2013-06-07 | 2016-04-13 | Novo Nordisk A/S | Method for making mature insulin polypeptides |
US20160376330A1 (en) * | 2014-02-28 | 2016-12-29 | Novo Nordisk A/S | Mating factor alpha pro-peptide variants |
CN112789504A (zh) | 2018-07-13 | 2021-05-11 | 瓦克特诊断有限责任公司 | 使用重组疟疾蛋白var2csa分离胎儿来源的循环细胞 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK463887D0 (da) * | 1987-09-07 | 1987-09-07 | Novo Industri As | Gaerleader |
CA1340772C (en) * | 1987-12-30 | 1999-09-28 | Patricia Tekamp-Olson | Expression and secretion of heterologous protiens in yeast employing truncated alpha-factor leader sequences |
JP3092811B2 (ja) * | 1988-07-23 | 2000-09-25 | デルタ バイオテクノロジー リミテッド | ペプチドおよびdna配列 |
DK105489D0 (da) * | 1989-03-03 | 1989-03-03 | Novo Nordisk As | Polypeptid |
-
1990
- 1990-12-19 DK DK300090A patent/DK300090D0/da not_active Application Discontinuation
-
1991
- 1991-12-17 NZ NZ241011A patent/NZ241011A/en unknown
- 1991-12-18 JP JP4502056A patent/JPH06503957A/ja not_active Expired - Lifetime
- 1991-12-18 CA CA002098731A patent/CA2098731A1/en not_active Abandoned
- 1991-12-18 WO PCT/DK1991/000396 patent/WO1992011378A1/en not_active Application Discontinuation
- 1991-12-18 IL IL100408A patent/IL100408A0/xx unknown
- 1991-12-18 IE IE443391A patent/IE914433A1/en not_active Application Discontinuation
- 1991-12-18 SK SK62593A patent/SK62593A3/sk unknown
- 1991-12-18 CZ CS931192A patent/CZ119293A3/cs unknown
- 1991-12-18 AU AU91348/91A patent/AU660161B2/en not_active Ceased
- 1991-12-18 KR KR1019930701890A patent/KR930703450A/ko not_active Application Discontinuation
- 1991-12-18 EP EP92901668A patent/EP0563175A1/en not_active Ceased
- 1991-12-18 ZA ZA919932A patent/ZA919932B/xx unknown
- 1991-12-18 HU HU9301801A patent/HUT68751A/hu unknown
- 1991-12-18 PT PT99848A patent/PT99848A/pt not_active Application Discontinuation
- 1991-12-19 MX MX9102684A patent/MX9102684A/es unknown
-
1993
- 1993-06-18 FI FI932831A patent/FI932831A/fi not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU660161B2 (en) | 1995-06-15 |
CZ119293A3 (en) | 1994-02-16 |
ZA919932B (en) | 1992-08-26 |
FI932831A0 (fi) | 1993-06-18 |
WO1992011378A1 (en) | 1992-07-09 |
CA2098731A1 (en) | 1992-06-19 |
PT99848A (pt) | 1993-06-30 |
IE914433A1 (en) | 1992-07-01 |
HUT68751A (en) | 1995-07-28 |
NZ241011A (en) | 1993-04-28 |
DK300090D0 (da) | 1990-12-19 |
AU9134891A (en) | 1992-07-22 |
MX9102684A (es) | 1992-06-01 |
FI932831A (fi) | 1993-06-18 |
EP0563175A1 (en) | 1993-10-06 |
IL100408A0 (en) | 1992-09-06 |
JPH06503957A (ja) | 1994-05-12 |
HU9301801D0 (en) | 1993-10-28 |
KR930703450A (ko) | 1993-11-30 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
SK62593A3 (en) | Method of constructing synthetic leader sequences | |
JP3676369B2 (ja) | 合成リーダーペプチド配列類 | |
JP3542604B2 (ja) | Yap3シグナルペプチドをコードするdna構築体 | |
JP3730255B2 (ja) | イーストにおいて発現されたn末端に伸長した蛋白質 | |
US4546082A (en) | E. coli/Saccharomyces cerevisiae plasmid cloning vector containing the alpha-factor gene for secretion and processing of hybrid proteins | |
EP0387319B1 (en) | Secretory leader sequences | |
JPH06197787A (ja) | 新規なるdna分子及び宿主 | |
US4940661A (en) | Metallothionein transcription control sequences and use thereof | |
JP4180112B2 (ja) | 酵母細胞におけるn末端を伸長されたタンパクの発現のためのベクター | |
JP4668414B2 (ja) | 形質転換した酵母細胞におけるタンパク質の製造方法 | |
RU2167939C2 (ru) | Способ продуцирования полипептида в дрожжах | |
CA2192942C (en) | Synthetic leader peptide sequences | |
CZ20015A3 (cs) | Rekombinantní exprimovaný kvasinkový vektor, způsob jeho získávání a transformovaná kvasinková buňka |