JP2022062140A - 常染色体優性精神遅滞－５とドラベ症候群の処置のためのアンチセンスオリゴマー - Google Patents

常染色体優性精神遅滞－５とドラベ症候群の処置のためのアンチセンスオリゴマー Download PDF

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Abstract

【課題】ＳＹＮＧＡＰ１タンパク質またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現が不足している被験体、あるいはＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群の被験体などの被験体を処置するための、方法と組成物を提供する。【解決手段】被験体の細胞を、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、それによって、保持されたイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞内で、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させる、方法である。【選択図】図１

Description

＜相互参照＞
本出願は、２０１５年１２月１４日に出願された米国仮特許出願第６２／２６７，２５
１号の利益を主張し、該仮出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
配列リストへの言及
本出願は配列表を包含しており、これは、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に出願され
、その全体を参照することで本明細書に組み込まれる。２０１６年１２月１２日に作成さ
れたＡＳＣＩＩのコピーは、４７９９１＿７０８＿６０１＿ＳＬ．ｔｘｔのファイル名で
あり、１，４６０，０６３バイトのサイズである。
精神遅滞は、集団の１～３％に影響を与える小児の最も蔓延しているハンディキャップ
である。常染色体優性精神遅滞－５（ＭＲＤ５）は、関連する形態の特徴、放射線学的特
徴、および代謝の特徴の不足を特徴とする障害の万円している非症候群型である。事例研
究は、説明のつかない非症候群の精神遅滞の患者のおよそ３％において切断されたタンパ
ク質の生成を結果としてもたらす、ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子中の新たに遺伝学的な病変を特
定した。ＳＹＮＧＡＰ１は、脳で選択的に表され、正常な発育のために必要とされる、Ｇ
ＴＰアーゼ活性化酵素である（Ｈａｍｄｅｎ， ｅｔ ａｌ．， ２００９， ＮＥＪＭ
３６０： ５９９－６０５）。
乳児期またはＳＭＥＩの重症のミオクローヌス性てんかんとしても知られているドラベ
症候群（ＤＳ）は、１９７８年にドラベによって最初に記載された。ドラベ症候群は、寛
解しない生命の最初の年の間の発作の開始を特徴とする小児期癲癇である。ニューロン電
位依存性ナトリウムチャネルのサブユニットを形成するα孔をコードするＳＣＮ１Ａ－Ｓ
ＣＮ２Ａ－ＳＣＮ３Ａ遺伝子群の一部であるＳＣＮ１Ａ遺伝子中の変異は、この疾患の発
現に関連している（Ｍｉｌｌｅｒ， ｅｔ ａｌ．， １９９３－２０１５， Ｇｅｎｅ
Ｒｅｖｉｅｗｓ， Ｅｄｓ． Ｐａｇｏｎ ＲＡ， ｅｔ ａｌ． Ｓｅａｔｔｌｅ （
ＷＡ）： Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ， Ｓｅａｔｔｌｅ，
Ｂｏｏｋｓｈｅｌｆ ＩＤ： ＮＢＫ１３１８， ａｎｄ Ｍｕｌｌｅｙ， ｅｔ ａｌ
．， ２００５， Ｈｕｍ． Ｍｕｔａｔ． ２５： ５３５－５４２）。
本明細書には、いくつかの実施形態において、被験体の細胞により標的タンパク質また
は機能的ＲＮＡの発現を増加させることによって必要としている被験体の常染色体優性精
神遅滞－５（ＭＲＤ５）またはドラベ症候群（ＤＳ）を処置する方法が開示され、ここで
該細胞は、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有し
、該ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接して
いるエクソン、および３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ここでＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードし、該方法は、被験体
の細胞を、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標
的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、それによ
って、保持されたイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞内で、標
的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標的タンパ
ク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させる。
本明細書には、いくつかの実施形態において、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆
体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有している細胞によってＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１
Ａである標的タンパク質の発現を増加させる方法が記載され、該ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接している
エクソン、および保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンを
含み、ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコ
ードし、該方法は、細胞を、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触さ
せる工程を含み、それによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ
１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、
それにより、細胞内で、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮ
Ａのレベルを増加させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させる
。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、方法はＭＲＤ５を処置する方法
であり、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１であり、あるいは、方法はＤＳを処置する方法
であり、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである。いくつかの実施形態において、標的タンパ
ク質または機能的ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足している標的タンパク
質あるいは機能的ＲＮＡを機能的に増大させるか、これに取って代わる、補償タンパク質
あるいは補償機能的ＲＮＡである。いくつかの実施形態では、細胞は、ＳＹＮＧＡＰ１ま
たはＳＣＮ１Ａタンパク質の量または活性の不足によって引き起こされた疾病を有する被
験体内にあるか又は被験体に由来する。いくつかの実施形態では、標的タンパク質の量の
不足は、標的タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、ここで被験体は、機能的な
標的タンパク質をコードする第１の対立遺伝子、標的タンパク質が生成されない第２の対
立遺伝子、または非機能的な標的タンパク質をコードする第２の対立遺伝子を有し、アン
チセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的
部分に結合する。いくつかの実施形態において、被験体は、標的タンパク質の量または機
能の不足に起因する障害により引き起こされた疾病を抱えており、ここで、被験体は、（
ａ）（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで
生成され、（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した
形態で生成され、あるいは、（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、第１の変異対立
遺伝子と、（ｂ）（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少
したレベルで生成され、（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機
能が低下した形態で生成され、あるいは、（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、第
２の変異対立遺伝子とを有し、ここで、被験体が第１の変異対立遺伝子（ａ）（ｉｉｉ）
を有するとき、第２の変異対立遺伝子は（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）であり、こ
こで、被験体が第２の変異対立遺伝子（ｂ）（ｉｉｉ）を有するとき、第１の変異対立遺
伝子は（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）（ｉｉ）であり、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は
、（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）（ｉｉ）である第１の変異対立遺伝子、および／または、
（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）である第２の変異対立遺伝子から転写される。いく
つかの実施形態において、標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、機能
が低下した形態で生成される。いくつかの実施形態において、標的タンパク質は、同等の
野性型タンパク質と比較して、十分に機能的な形態で生成される。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的
部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～保持されたイントロ
ンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の保持されたイントロンにある。い
くつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、以下の内部の保持さ
れたイントロンにある：（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６
～＋４９９の領域；あるいは（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して
－１６～－４９６の領域。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的
部分は、以下の内部にある：（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接す
るエクソン中の＋２ｅ～－４ｅの領域；あるいは（ｂ）保持されたイントロンの３’スプ
ライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４ｅの領域。いくつかの実施形態において
、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、以下の内部にある：（ａ）保持されたイントロ
ンの５’スプライス部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領域；（ｂ）保持されたイン
トロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域；（ｃ）保持されたイントロ
ンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域；あるいは、（ｄ）保持された
イントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領域。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａで
ある。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
４－７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるい
は１００％の配列同一性を備えた配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５
％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる。
いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ Ｎ
Ｏ：２５９３の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、
９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む。いくつか
の実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つに
少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列
を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持され
たイントロン２１の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あ
るいは保持されたイントロン２１の３’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領
域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６
６または５２４－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５
％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部位に対
して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥ
Ｑ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３３のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持さ
れたイントロン２１の５’スプライス部位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持された
イントロン２１にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９３２のいずれか１つに少なくとも約
８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いく
つかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン
２１の３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２
１にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２５
８、６７６－７７２、あるいは９３３－１０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％、
８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実
施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３
’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある。いくつかの実施形態におい
て、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０３
０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、
あるいは１００％相補的な配列を含む。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａで
ある。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持された
イントロン２３の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、ある
いは保持されたイントロン２３の３’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域
内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２
３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１
００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標
的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～－４ｅ
の領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７
－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
いは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部位に対して＋６～＋４９
６の領域内の保持されたイントロン２３にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは
、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、
９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態に
おいて、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプラ
イス部位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある。いくつ
かの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持さ
れたイントロン２３の３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある。い
くつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれか
１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的
な配列を含む。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ
１である。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ Ｎ
Ｏ：８または９に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１０
０％の配列同一性を備えた配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９
５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる
。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：２５９２、２５９４、または２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域
に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性
を備えた配列を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１
０３８－２５９１のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７
％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部位に対して－７
３ｅ～＋４９９までの領域内、あるいは保持されたイントロン１９の３’スプライス部位
に対して－４９６～＋１９１２ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯ
は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９または１８１５－２２８６のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持さ
れたイントロン１８の５’スプライス部位に対して－７３ｅ～－４ｅの領域内にある。い
くつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１０５０または
１８１５－１８２７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９
７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部位に対して＋
６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にある。いくつかの実施形態において
、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６または１８２８－１９１３のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は
、保持されたイントロン１９の３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域内の
保持されたイントロン１９にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ Ｉ
Ｄ ＮＯ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいずれか１つに少なくとも約
８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いく
つかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン
１９の３’スプライス部位に対して＋１７ｅ～＋１９１２ｅの領域内にある。いくつかの
実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２９－１５０９または２００６
－２２８６のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％相補的な配列を含む。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ
１である。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持さ
れたイントロン１５の５’スプライス部位に対して－１０５４ｅ～＋２５１までの領域内
、あるいは保持されたイントロン１５の３’スプライス部位に対して－２５６～＋１５７
ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５
１０－１８１４または２２８７－２５９１のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％
、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態
において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプ
ライス部位に対して－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において
、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は
、保持されたイントロン１５の５’スプライス部位に対して＋６～＋２５１の領域内の保
持されたイントロン１５にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：１６８７－１７３６または２４６４－２５１３のいずれか１つに少なくとも約８
０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつ
かの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１
５の３’スプライス部位に対して－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５
にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７
８５または２５１４－２５６２のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、
９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部位
に対して＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいずれか１つに少
なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を
含む。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーは、機
能的ＲＮＡまたは標的タンパク質をコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選
択的スプライシングを調節することにより、標的タンパク質または機能的ＲＮＡの量を増
加させない。いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質
または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の突然変異に起因する異常なスプライシングを調
節することにより、標的タンパク質または機能的ＲＮＡの量を増加させない。いくつかの
実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、野生型のｍＲＮＡ前駆体の全長のｍＲＮ
Ａ前駆体の部分的なスプライシング、または部分的なスプライシングによって生成された
。いくつかの実施形態において、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮ
Ａは、全長の成熟ｍＲＮＡ、あるいは野生型の成熟ｍＲＮＡである。いくつかの実施形態
において、生成された標的タンパク質は全長のタンパク質あるいは野生型のタンパク質で
ある。いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞において
生成された標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量は、対照細胞
において生成された標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量の比
較して、約１．１～約１０倍、約１．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、
約４～約１０倍、約１．１～約５倍、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～
約８倍、約１．１～約９倍、約２～約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍
、約２～約９倍、約３～約６倍、約３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約
７倍、約４～約８倍、約４～約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少
なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少
なくとも約４倍、少なくとも約５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する。いくつかの
実施形態において、アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞によって生成された標的タ
ンパク質の総量は、対照細胞によって生成された標的タンパク質の総量と比較して、約１
．１～約１０倍、約１．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、約４～約１０
倍、約１．１～約５倍、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～約８倍、約１
．１～約９倍、約２～約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍、約２～約９
倍、約３～約６倍、約３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約７倍、約４～
約８倍、約４～約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２
倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４
倍、少なくとも約５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーは、ホ
スホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む。いくつか
の実施形態において、アンチセンスオリゴマーはホスホロジアミデートモルホリノ、ロッ
クド核酸、ペプチド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、あるいは２’－Ｏ－メト
キシエチル部分を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーは少なく
とも１つの修飾された糖部を含む。いくつかの実施形態において、それぞれの糖部は修飾
された糖部である。いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマーは、８～５０
の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５
の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０
の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０
の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０
～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩
基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５
の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１
１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸
塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸塩基、１２～２０の核酸塩基、あるいは
１２～１５の核酸塩基からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴマー
は、タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に少なくとも８０％、少
なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも
９９％、あるいは１００％相補的である。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態において、細胞は、標的タンパク質または
機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、
ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保持されたイントロンを含み、およ
び、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団で最も豊富な保
持されたイントロンに結合する。いくつかの実施形態において、最も豊富な保持されたイ
ントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡ
をコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団からの２つ以上の保持さ
れたイントロンのスプライシングアウトを誘発する。いくつかの実施形態において、細胞
は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保持され
たイントロンを含み、および、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の集団で２番目に豊富な保持されたイントロンに結合する。いくつかの実施形態にお
いて、２番目に豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、
標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する。
いくつかの実施形態において、当該方法はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発
現を評価する工程をさらに含む。
前述の方法のいずれかのいくつかの実施形態では、ＭＲＤ５は処置され、および、アン
チセンスオリゴマーはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分へ結合し、標
的部分はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１から選択される配列内にあり、あるい
は、ＤＳが処置され、および、アンチセンスオリゴマーはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の標的部分へ結合し、標的部分はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７から選択さ
れる配列内にある。いくつかの実施形態では、被験体はヒトである。いくつかの実施形態
では、被験体はヒト以外の動物である。いくつかの実施形態において、被験体は胎児、胚
、あるいは子供である。いくつかの実施形態では、細胞はエクスビボである。いくつかの
実施形態において、アンチセンスオリゴマーは、被験体のくも膜下腔内注射、脳室内注射
、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって投与される。いくつ
かの実施形態において、５’スプライス部位に隣接するエクソンの－３ｅ～－１ｅと、保
持されたイントロンの＋１～＋６にある９つのヌクレオチドは、対応する野性型配列と同
一である。いくつかの実施形態において、保持されたイントロンの－１５～－１と３’ス
プライス部位に隣接するエクソンの＋１ｅにある１６のヌクレオチドは、対応する野性型
配列と同一である。いくつかの実施形態では、前述の方法のいずれかに記載されるような
アンチセンスオリゴマーが本明細書に開示される。
いくつかの実施形態では、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対し
て少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一
性を備えた配列を含むアンチセンスオリゴマーが本明細書で開示される。
さらに、いくつかの実施形態において、請求項９０または９１のアンチセンスオリゴマ
ー、および薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、あるいは担体を含む医薬組成物が本明細
書で開示される。
いくつかの実施形態では、くも膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、
皮下注射、あるいは静脈内注射によって請求項９２の医薬組成物を投与することにより、
必要としている被験体を処置する方法が本明細書で開示される。
本明細書では、いくつかの実施形態において、不足しているタンパク質または不足して
いる機能的ＲＮＡに関係する被験体のＭＲＤＤ５またはＤＳを処置するために細胞によっ
て標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させる方法で使用するためのアンチセ
ンスオリゴマーを含む組成物が開示され、ここで、不足しているタンパク質または機能的
ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足しており、ここで、アンチセンスオリゴ
マーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする、保持されたイントロン含有ｍ
ＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）の構成的のスプライシングを増強し、ここで、
標的タンパク質は：（ａ）不足しているタンパク質；あるいは（ｂ）被験体において不足
しているタンパク質を機能的に増大させるか、これに取って代わる、補償タンパク質であ
り、ここで、機能的ＲＮＡは：（ｃ）不足しているＲＮＡ；あるいは（ｄ）被験体の不足
している機能的ＲＮＡを機能的に増大するか、これに取って代わる、補償機能的ＲＮＡで
あり、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位
に隣接するエクソン、および３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、ここで、保
持されたイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮ
Ａ前駆体からスプライシングされ、それによって、被験体の標的タンパク質あるいは機能
的ＲＮＡの生成あるいは活性を増加させる。
いくつかの実施形態において、被験体においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパ
ク質に関連した疾病を処置する方法で使用されるアンチセンスオリゴマーを含む組成物が
本明細書で開示され、当該方法は、被験体の細胞によるＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ
タンパク質の発現を増加させる工程を含み、ここで、細胞は、保持されたイントロン、保
持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの
３’スプライス部位に隣接するエクソンを含む、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆
体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有し、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ
１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードし、当該方法は、アンチセンスオリゴマーに細胞
を接触させる工程を含み、これによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１また
はＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体転写産物から構成的にスプ
ライシングされ、それにより、被験体の細胞においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタ
ンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタ
ンパク質の発現を増加させる。いくつかの実施形態では、疾病は疾患または障害である。
いくつかの実施形態において、疾患または障害はＡＤ精神遅滞５あるいはドラベ症候群で
ある。いくつかの実施形態において、標的タンパク質とＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮ
ＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ遺伝子によってコードされる。いくつかの実施形態において、
アンチセンスオリゴマーは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６か
ら、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の保持され
たイントロンにあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする。いくつかの実施形態に
おいて、アンチセンスオリゴマーはＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とし、これは、
以下の内部の保持されたイントロンにある：（ａ）保持されたイントロンの５’スプライ
ス部位に対して＋６～＋４９９の領域；あるいは（ｂ）保持されたイントロンの３’スプ
ライス部位に対して－１６～－４９６の領域。いくつかの実施形態において、アンチセン
スオリゴマーは、少なくとも１つの保持されたイントロンの５’スプライス部位の約１０
０ヌクレオチド下流から、少なくとも１つの保持されたイントロンの３’スプライス部位
の約１００ヌクレオチド上流までの領域内にあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的と
する。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、以下の内部
にある：（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２
ｅ～－４ｅの領域；あるいは（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接す
るエクソン中の＋２ｅ～－４ｅの領域。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の標的部分は、以下の内部にある：（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス
部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領域；（ｂ）保持されたイントロンの５’スプラ
イス部位に対して＋６～＋４９９の領域；（ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス
部位に対して－１６～－４９６の領域；あるいは、（ｄ）保持されたイントロンの３’ス
プライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領域。
前述の組成物のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａ
である。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ
：４－７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
いは１００％の配列同一性を備えた配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９
５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる
。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：２５９３の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％
、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む。いくつ
かの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持さ
れたイントロン２１の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、
あるいは保持されたイントロン２１の３’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの
領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２
６６または５２４－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９
５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部位に
対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、Ｓ
ＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３３のいずれか１
つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な
配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持
されたイントロン２１の５’スプライス部位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持され
たイントロン２１にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ
：６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９３２のいずれか１つに少なくとも
約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。い
くつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロ
ン２１の３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン
２１にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２
５８、６７６－７７２、あるいは９３３－１０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの
実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の
３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある。いくつかの実施形態にお
いて、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０
３０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％
、あるいは１００％相補的な配列を含む。
前述の組成物のいずれかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａ
である。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持され
たイントロン２３の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あ
るいは保持されたイントロン２３の３’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領
域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５
２３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは
１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の
標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部位に対して－２６４ｅ～－４
ｅの領域内にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６
７－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部位に対して＋６～＋４
９６の領域内の保持されたイントロン２３にある。いくつかの実施形態において、ＡＳＯ
は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％
、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む。いくつかの実施形態
において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプ
ライス部位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある。いく
つかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１
つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な
配列を含む。いくつかの実施形態において、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持
されたイントロン２３の３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある。
いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれ
か１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補
的な配列を含む。
前述の組成物の何れかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ
１である。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
８または９に対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１０
０％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、
９５％、９７％、または１００％の配列同一性を有する遺伝子配列によってコードされる
。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ
：２５９２、２５９４、または２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に対
して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性
を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３
８－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９
７％、または１００％の相補的（ｃｏｍｐｌｉｍｅｎｔａｒｙ）である配列を含む。いく
つかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８
の５’スプライス部位に対する－７３ｅ～＋４９９の領域内、或いは保持されたイントロ
ン１９の３’スプライス部位に対する－４９６～＋１９１２ｅの領域内に存在する。いく
つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９又は１８１５
－２２８６のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７
％、または１００％の相補性である配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部位に対する－７
３ｅ～－４ｅの領域内にある。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ
：１０３８－１０５０又は１８１５－１８２７のいずれか１つに対して少なくとも約８０
％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。いく
つかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８
の５’スプライス部位に対する＋６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にあ
る。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６又は
１８２８－１９１３のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５
％、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部位に対
する－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン１９にある。いくつかの実施形態
では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１３７－１２２８又は１９１４－２００５のい
ずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１０
０％の相補性である配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標
的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部位に対する＋１７ｅ～＋１９１
２ｅの領域内にある。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２
９－１５０９又は２００６－２２８６のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５
％、９０％、９５％、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。
前述の組成物の何れかのいくつかの実施形態において、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ
１である。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持された
イントロン１５の５’スプライス部位に対する－１０５４ｅ～＋２５１の領域内、或いは
保持されたイントロン１５の３’スプライス部位に対する－２５６～＋１５７ｅの領域内
に存在する。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１８
１４又は２２８７－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０
％、９５％、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。いくつかの実施形態で
は、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス
部位に対する－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは
、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６又は２２８７－２４６３のいずれか１つに対
して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の相補性で
ある配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持
されたイントロン１５の５’スプライス部位に対する＋６～＋２５１の領域内の保持され
たイントロン１５にある。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１
６８７－１７３６又は２４６４－２５１３のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、
８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。いくつか
の実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３
’スプライス部位に対する－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５にある
。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７８５又は２
５１４－２５６２のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％
、９７％、または１００％の相補性である配列を含む。いくつかの実施形態では、ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部位に対す
る＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ Ｉ
Ｄ ＮＯ：１７８６－１８１４又は２５６３－２５９１のいずれか１つに対して少なくと
も約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の相補性である配列を含
む。
前述の組成物の何れかのいくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、標的タ
ンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的
スプライシングを調節することにより標的タンパク質または機能的ＲＮＡの量を増加させ
ない。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能
的ＲＮＡをコードする遺伝子の変異から結果として生じる異常スプライシングを調節する
ことにより標的タンパク質または機能的ＲＮＡの量を増加させない。いくつかの実施形態
では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長ｍＲＮＡ前駆体または野生型ｍＲＮＡ前駆体から
の部分的スプライシングによって産生された。いくつかの実施形態では、標的タンパク質
または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長成熟ｍＲＮＡまたは野生型成熟ｍＲＮ
Ａである。いくつかの実施形態では、産生される標的タンパク質は、全長タンパク質また
は野生型タンパク質である。いくつかの実施形態では、保持されたイントロンは、律速イ
ントロンである。いくつかの実施形態では、保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体において最も豊富な保持されたイントロンである。いくつかの実施形態では、
保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において２番目に豊富な保持され
たイントロンである。
前述の組成物の何れかのいくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、ホスホ
ロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む。いくつかの実
施形態では、アンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。いく
つかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロ
ックド核酸、ペプチド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メト
キシエチル部分を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、少なくと
も１つの修飾された糖部を含む。いくつかの実施形態では、各糖部は、修飾された糖部で
ある。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～
４０の核酸塩基、８～３５の核酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～
２０の核酸塩基、８～１５の核酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～
３５の核酸塩基、９～３０の核酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～
１５の核酸塩基、１０～５０の核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基
、１０～３０の核酸塩基、１０～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の
核酸塩基、１１～５０の核酸塩基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１
～３０の核酸塩基、１１～２５の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩
基、１２～５０の核酸塩基、１２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０
の核酸塩基、１２～２５の核酸塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩
基から成る。
本明細書には、いくつかの実施形態では、請求項９４乃至１６７の組成物の何れかのア
ンチセンスオリゴマーと薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、又は担体とを含む医薬組成
物が開示される。本明細書にはまた、いくつかの実施形態では、髄腔内注射、脳室内注射
、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射によって請求項１６８の医薬組成
物を投与することにより、必要とする被験体を処置する方法が開示される。
本明細書には、いくつかの実施形態では、医薬組成物が開示され、該医薬組成物は、Ｓ
ＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物の標的配列にハイブリダイズするア
ンチセンスオリゴマーであって、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物
は保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーは、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧ
ＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物からの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発
する、アンチセンスオリゴマー；及び薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、または担体を
含む。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物
は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である。いくつかの実
施形態では、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は
、保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する
領域＋５００から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する領域－５００内
にある。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の転写産物は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１－３のいずれか１に対して少なくとも約８
０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配
列同一性を有する遺伝子配列によりコードされる。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ１Ａ
またはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４－９のい
ずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９
８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態で
は、アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結
合を含む骨格修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、アンチ
センスオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは
、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’－Ｏ－メチル、
２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含む。いくつかの実施形態では
、アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの修飾された糖部を含む。いくつかの実施
形態では、アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～
３５の核酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～
１５の核酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～
３０の核酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０
～５０の核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩
基、１０～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０
の核酸塩基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１
１～２５の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸
塩基、１２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２
５の核酸塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩基を含む。いくつかの
実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なく
とも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％
相補的である。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２－２５９５から選
択される配列内にある。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱ
ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０
％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％
配列同一性であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリ
ゴマーは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１から選択されるヌクレオチド配列を含む
。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉
内注射、皮下注射または静脈内注射のために製剤される。
本明細書には、いくつかの実施形態では、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質
の機能形態をコードする十分に処理されたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの
転写産物を産生するために、保持されたイントロンの除去を促進するように、不足したＳ
ＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物の処理を誘発する方法が開示され、
該方法は、（ａ）アンチセンスオリゴマーを被験体の標的細胞と接触させる工程；（ｂ）
不足したＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物にアンチセンスオリゴマ
ーをハイブリダイズする工程であって、ここで、不足したＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ
１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコ
ードすることができ、且つ少なくとも１つの保持されたイントロンを含む、工程；（ｃ）
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコードする十分に処理されたＳ
ＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物を産生するために、不足したＳＣＮ
１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物から少なくとも１つの保持されたイント
ロンを除去する工程；および（ｄ）十分に処理されたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１
ｍＲＮＡの転写産物からＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態を翻訳す
る工程を含む。いくつかの実施形態では、保持されたイントロンは、保持されたイントロ
ン全体である。いくつかの実施形態では、不足したＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍ
ＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物であ
る。
本明細書には、いくつかの実施形態では、不足した量または活性のＳＣＮ１ＡまたはＳ
ＹＮＧＡＰ１タンパク質により引き起こされる疾病を患う被験体を処置する方法が開示さ
れ、該方法は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも
約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％
、９８％、または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリ
ゴマーを被験体に投与する工程を含む。
＜引用による組み込み＞
本明細書で言及される全ての刊行物、特許、および特許出願は、あたかも個々の刊行物
、特許、または特許出願が参照により組み込まれるように具体的かつ個々に指示される程
度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明の新規な特徴は、特に、添付の特許請求の範囲内に明記される。本発明の諸原則
が利用される例示的な実施形態について説明する以下の詳細な記載と、添付の図面を参照
することで、本発明の特徴および利点についてのよりよい理解が得られるであろう。
図１は、典型的な保持されたイントロン含有（ＲＩＣ）ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の概略図を示す。５’スプライス部位コンセンサス配列は、－３ｅから－１ｅおよび＋１から＋６（「ｅ」と標識された数字はエクソンであり、標識されていない数字はイントロンである）まで下線を引かれた文字（文字はヌクレオチドである；大文字：エクソン部分、および小文字：イントロン部分）で示されている。３’スプライス部位コンセンサス配列は、－１５から－１および＋１ｅ（「ｅ」と標識された数字はエクソンであり、標識されていない数字はイントロンである）まで下線を引かれた文字（文字はヌクレオチドである；大文字：エクソン部分、および小文字：イントロン部分）で示されている。ＡＳＯスクリ－ニングのためのイントロン標的領域は、保持されたイントロンの５’スプライス部位（左の矢印）に対するヌクレオチド＋６から、保持されたイントロンの３’スプライス部位（右の矢印）に対するヌクレオチド－１６までを含む。実施形態では、ＡＳＯスクリ－ニングのためのイントロン標的領域は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対するヌクレオチド＋６から＋１００、および保持されたイントロンの３’スプライス部位に対するヌクレオチド－１６から－１００を含む。エクソン標的部位は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから－４ｅ、および保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから－４ｅのヌクレオチドを含む。「ｎ」または「Ｎ」はヌクレオチドを表し、「ｙ」はピリミジンを表す。図示された配列は、哺乳動物のスプライス部位に対するコンセンサス配列を表わし、個々のイントロンおよびエクソンは、すべての位置でコンセンサス配列に一致する必要はなない。 核内遺伝子出力の標的とされた増強（ＴＡＮＧＯ）方法の概略図を表わす。図２Ａは、核と細胞質区画に分割された細胞を示す。核では、エクソン（長方形）およびイントロン（接続線）からなる標的遺伝子のｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ｍＲＮＡを生成するためにスプライシングを受け、このｍＲＮＡは細胞質に輸送され、標的タンパク質へと翻訳される。この標的遺伝子については、イントロン１のスプライシングは非効率的であり、保持されたイントロン含有（ＲＩＣ）ｍＲＮＡ前駆体は、主として核内に蓄積し、細胞質に輸送された場合は劣化し、標的タンパク質の産生にはつながらない。 核内遺伝子出力の標的とされた増強（ＴＡＮＧＯ）方法の概略図を表わす。図２Ｂは、核と細胞質区画に分割された同様の細胞の例を示す。アンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）での処置は、イントロン１のスプライシングを促進し、かつｍＲＮＡの増加をもたらし、これは順に、高レベルの標的タンパク質へと翻訳される。 図３は、示されるイントロン１５をもつＳＹＮＧＡＰ１遺伝子中のイントロン保持を詳細に表わす。ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡｓｅｑ）を用いた、ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子中のイントロン保持事象の特定は、ＵＣＳＣゲノムブラウザで視覚化され示される。上のパネルは、ＨＣＮ（ヒトの皮質ニューロン）において発現され、且つ細胞質（上）または核分画（下）のいずれかにおいて局在化されたＳＹＮＧＡＰ１転写産物に対応する読み取り密度を示す。このパネルの底部には、ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子のグラフ表現が、目盛に合わせて示される。読み取り密度は、ピークとして示される。最も高い読み取り密度は、エクソン（ブラックボックス）に相当し、一方、いずれの細胞分画においてもイントロンの大半（矢印頭部を有する線）について読み取りは観察されない。細胞質分画と比較してより高い読み取り密度は、核分画のイントロン１５および１８／１９（矢印により示される）で検出され、これはイントロン１５および１８／１９のスプライシング効率が低く、結果としてイントロン保持をもたらすことを示している。保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、核に保持され、細胞質には輸送されない。ＨＣＮのイントロン１５についての読み取り密度は、生物情報学的な分析によって計算されるとおり２５％のイントロン保持を示す下のパネルで詳細に示される。 図４は、典型的なＳＹＮＧＡＰ１遺伝子イントロン１５（ＩＶＳ１５）ＡＳＯ ｗａｌｋを表す。２’－Ｏ－Ｍｅ ＡＳＯ（ＰＳ骨格）を使用して、５’スプライス部位のすぐ下流、または３’スプライス部位の上流の配列を標的とするＳＹＮＧＡＰ１ ＩＶＳ １５に対して行われたＡＳＯ ｗａｌｋのグラフ表現が示される。ＡＳＯは、一度に５つのヌクレオチドの位置を変えることにより、これらの領域をカバーするように設計された。ＳＹＮＧＡＰ１エクソン－イントロン構造は目盛に合わせて示される。 図５は、示されるイントロン１８と１９をもつＳＹＮＧＡＰ１遺伝子中のイントロン保持を詳細に表わす。ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子中のイントロン保持は、本明細書中の実施例において述べられているように、ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡｓｅｑ）によって特定され、ＵＣＳＣゲノムブラウザ中で視覚化された。ＨＣＮのイントロン１８と１９の読み取り密度は、下のパネルで詳細に示される。イントロン１８と１９は、代替的にスプライシングされたエクソンであるエクソン１９に隣接している。たとえエクソン１９が注釈されなくとも、その存在の証拠はＲＮＡｓｅｑデータにより示され、そのため明瞭なピークが細胞質分画に観察される。しかし、細胞質分画におけるエクソン１９に対応する読み取り密度は、ＳＹＮＧＡＰ１における構成的にスプライシングされたエクソンよりも低い。ＨＣＮのイントロン１８／１９についての読み取り密度は、生物情報学的な分析によって計算されるとおり４２％のイントロン保持を示す下のパネルで詳細に示される。 図６は、典型的なＳＹＮＧＡＰ１遺伝子イントロン１８（ＩＶＳ１８）およびイントロン１９（ＩＶＳ１９）ＡＳＯ ｗａｌｋを表す。２’－Ｏ－Ｍｅ ＡＳＯ（ＰＳ骨格）を使用して、イントロン１８の５’スプライス部位のすぐ下流、またはイントロン１９の３’スプライス部位の上流の配列を標的とするＳＹＮＧＡＰ１ ＩＶＳ １８と１９に対して行われたＡＳＯ ｗａｌｋのグラフ表現が示される。代替的なエクソン１９に隣接しているスプライス部位のイントロン部位は、エクソン１９の含有レベルに影響を及ぼすのを回避するために標的とされない。ＡＳＯは、一度に５つのヌクレオチドの位置を変えることにより、これらの領域をカバーするように設計された。ＳＹＮＧＡＰ１エクソン－イントロン構造は目盛に合わせて示される。 図７Ａは、ＮＭ＿００６７７２に対応するＳＹＮＧＡＰ１のＲｅｆＳｅｑ遺伝子の模式図を表す。 図７Ｂは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＡＲＰＥ－１９細胞にイントロン１５が無いＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝３）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図７Ｃは、ＮＭ＿００６７７２に対応するＳＹＮＧＡＰ１のＲｅｆＳｅｑ遺伝子の模式図を表す。 図７Ｄは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＡＲＰＥ－１９細胞にイントロン１８が無いＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝３）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図７Ｅは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＡＲＰＥ－１９細胞にイントロン１８が無いＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝３）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図８Ａは、ＮＭ＿００６９２０に対応するＳＣＮ１ＡのＲｅｆＳｅｑ遺伝子の一部の模式図を表す。図８Ｂと図８ＣにおいてＲＴ－ＰＣＲアッセイのために使用されるプライマーが示される。 図８Ｂは、示された細胞においてＲＴ－ＰＣＲにより測定されるようなＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡの発現レベルを示すアガロースゲルを表す（ＶＭおよびＣＸ：ＲｅＮｃｅｌｌ神経前駆細胞；ＳＫ－Ｎ－ＡＳ：神経芽腫細胞；Ｃ：細胞質分画；Ｎ：核分画）。 図８Ｃは、ＲＴ－ＰＣＲにより測定されるようなＳＫ－Ｎ－ＡＳ細胞（左）とＶＭ細胞（右）のイントロン２１保持レベルを示すアガロースゲルを表す（ＶＭおよびＣＸ：ＲｅＮｃｅｌｌ神経前駆細胞；ＳＫ－Ｎ－ＡＳ：神経芽腫細胞；Ｃ：細胞質分画；Ｎ：核分画）。 図８Ｄは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＳＫ－Ｎ－ＡＳ細胞にイントロン２１が無いＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝２）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図８Ｅは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＳＫ－Ｎ－ＡＳ細胞にイントロン２１が無いＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝２）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図８Ｆは、偽処理した細胞上で４０ｎＭ、８０ｎＭ、または１２０ｎＭの示されたＡＳＯ（エクソン２１－エクソン２２のスプライス結合に及ぶ）で２４時間処置したＳＫ－Ｎ－ＡＳ細胞にイントロン２１が無いＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝２）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図８Ｇは、偽処理した細胞上で８０ｎＭの示されたＡＳＯで２４時間処置したＳＫ－Ｎ－ＡＳ細胞にイントロン２１が無いＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡの発現レベルにおける平均（ｎ＝２）の倍率変化を示す、典型的なグラフを表す。データはＲＰＬ３２発現に正規化される。 図８Ｈは、図８Ｄと図８Ｅに示される実験で使用されるＡＳＯの配列を表す。 図８Ｉは、図８Ｇに示される実験で使用されるＡＳＯの配列を表す。
２つ以上のイントロンを有するタンパク質コード遺伝子の一次転写産物中の個々のイン
トロンは、異なる効率性をもつ一次転写産物からスプライシングされる。ほとんどの場合
、完全にスプライシングされたｍＲＮＡだけが、続く細胞質での翻訳のために核膜孔を通
じて輸送される。スプライシングされていない、または部分的にスプライシングされた転
写産物は、核内で検出可能である。完全にスプライシングされていない転写産物の核内蓄
積は、タンパク質に翻訳され得る細胞質中での潜在的に有害なｍＲＮＡの蓄積を防止する
メカニズムであると一般的に考えられる。いくつかの遺伝子については、最も効率性の低
いイントロンのスプライシングは、細胞質中での翻訳に先立つ、遺伝子発現における律速
的な転写後の工程である。
ＡＤ精神遅滞５を欠いたＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする部分的にスプライシングされ
た転写産物、及びドラベ症候群を欠いたＳＹＮＧＡＰ１タンパク質をコードする部分的に
スプライシングされた転写産物の実質的なレベルは、ヒトの細胞の核の中に発見された。
これらのＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の種は少なくとも１つの保持
されたイントロンを含む。本発明は、完全にスプライシングされた成熟ｍＲＮＡの安定し
た状態の産生を増加させる、およびそれ故、翻訳されたタンパク質レベルを増加させるた
めに、遺伝子発現の核段階に対して律速的である１つ以上の保持されたＳＹＮＧＡＰ１ま
たはＳＣＮ１Ａイントロンのスプライシングをアップレギュレートするための組成物およ
び方法を提供する。これらの組成物および方法は、核に蓄積する保持されたイントロン含
有ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）のイン
トロンスプライス部位において構成的スプライシングを促進するアンチセンスオリゴマー
（ＡＳＯ）を活用する。したがって、実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａそ
れぞれの不足に起因する疾病を処置するために、本発明の方法を用いて、ＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａタンパク質を増加させる。
他の実施形態では、本発明の方法は、必要とする被験体の疾病を処置するために、ＳＹ
ＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａの産生を増加させるために使用される。実施形態では、被験
体は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａが野性型に対して必ずしも不足していないが、そ
れにも関わらずＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａの増加により緩和される疾病を示す。実
施形態では、疾病はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａハプロ不全によって引き起こされる
。
常染色体優性精神遅滞５
精神遅滞は、小児の最も頻繁に生じる重篤なハンディキャップである。この障害の非症
候性の形態は、異形成の特徴の欠如を特徴とする最も一般的なものである。単一対立遺伝
子性病変は、進行の全体的な遅延、筋緊張低下、及び中程度から重度の精神遅滞を特徴と
する障害を引き起こすのに十分なものである。非症候性の精神遅滞に関係する遺伝因子は
、十分に理解されていないままである。結合及び細胞遺伝学的解析は、２９のＸ結合、及
び非症候性精神遅滞に関連した５つの常染色体上の劣性遺伝子の特定へとつながり、これ
らは共に症例の１０％未満を占める（参照により本明細書に組み込まれる、Ｈａｍｄｅｎ
， ｅｔ ａｌ．， ２００９）。更に、常染色体上の優性遺伝子は未だに特定されてお
らず、これは結合分析に従順なファミリーを特定する尤度を次々に減少させる。しかし、
ゲノム領域のコピー数の変化に通常関係するデノボ染色体再配置が精神遅滞の最も一般的
に認識される原因を表すという事実は、単一対立遺伝子性病変がこの障害を引き起こすの
に十分であることを示す。これは、点突然変異などのより小さなデノボ遺伝子病変が障害
の病因にも寄与する可能性を高める。症例の研究は、説明されていない非症候群性精神遅
滞の患者のおよそ３％に短縮化されたタンパク質の産生を結果としてもたらす、ＳＹＮＧ
ＡＰ１遺伝子におけるデノボ遺伝子病変を特定した。研究において特定された患者は、２
つのナンセンス突然変異および１つの欠失を含んでいたタンパク質短縮型変異に対しヘテ
ロ接合であった（Ｈａｍｄａｎ， ｅｔ ａｌ．， ２００９）。この疾病は例えば、参
照により本明細書に組み込まれるＯＭＩＭ ＃６１２６２１（Ｏｎｌｉｎｅ Ｍｅｎｄｅ
ｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ ｉｎ Ｍａｎ， Ｊｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕ
ｎｉｖｅｒｓｉｔｙ， １９６６－２０１５）に記載されている。
ＳＹＮＧＡＰ１は、脳の中で選択的に発現されるＧＴＰアーゼ活性化酵素である。グル
タミン酸塩のシグナル伝達を媒介するＮ－メチル－Ｄ－アスパルタート（ＮＭＤＡ）－受
容体の複合体の成分である、ＳＹＮＧＡＰ１は、受容体の下流に作用し、ＲＡＳ－ＥＲＫ
シグナル伝達経路を阻害することによりシナプス後膜にてα－アミノ－３－ヒドロキシ－
５－メチル－４－イソオキサゾール・プロピオン酸（ＡＭＰＡ）受容体の挿入を遮断する
。ＳＹＮＧＡＰ１は通常の発達に必要とされ；遺伝子のヌル対立遺伝子に対しホモ接合の
マウスは誕生の直後に死亡する。対照的に、ヌル対立遺伝子に対しヘテロ接合のマウスは
、シナプス可塑性および学習を損ない、ＮＭＤＡ受容体複合体の成分としてＳＹＮＧＡＰ
１の役割と一致している（Ｈａｍｄａｎ， ｅｔ ａｌ．， ２００９）。
ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子の選択的スプライシングは、ＳＹＮＧＡＰ１の３つのアイソフォ
ームの発現を結果としてもたらす（Ｈａｍｄａｎ， ｅｔ ａｌ．， ２００９）。ＳＹ
ＮＧＡＰ１は、Ｒａｓ ＧＴＰアーゼを活性化するＲＡＳＧＡＰドメインを持つ。ＰＤＺ
結合モチーフであるＱＴＲＶは、ＮＭＤＡ受容体の複合体の他の成分との相互作用を媒介
するアイソフォーム２に存在する。ＲＡＳＧＡＰとＱＲＴＶのドメインは、学習と発達に
必要なシナプス可塑性および樹状突起スパイン形成を調節する。精神遅滞に関連したタン
パク質短縮型変異は、完全なＲＡＳＧＡＰドメインまたはＱＴＲＶモチーフの何れかを欠
いており、精神遅滞の病因におけるそれらの役割と一致している。
ドラベ症候群
幼児期の重度のミオクローヌス性てんかん（ＳＭＥＩ）としても知られるドラベ症候群
（ＤＳ）は、生命の最初の年に提示する癲癇性脳症である。ドラベ症候群は、臨床診断が
患者のおよそ７０－８０％におけるナトリウムチャネル遺伝子突然変異の発見によって支
持されている、徐々に認識された癲癇性脳症である。イオンチャネル遺伝子の突然変異は
、さまざまな癲癇症候群の病因において主な役割を果たし、チャネロパチーと見なされて
いる一部の癲癇を結果としてもたらす。電位依存性ナトリウムチャネル（ＶＧＳＣ）は神
経細胞の興奮性において必須の役割を果たし；それ故、ＤＳに関連した多くの突然変異が
ＶＧＳＣサブユニットをコードする遺伝子の中で特定されたことは驚くべきことではない
。この疾病は例えば、共に参照により本明細書に組み込まれる、Ｍｕｌｌｅｙ， ｅｔ
ａｌ．， ２００５、及びＯＭＩＭ ＃６０７２０８での疾患の記載（Ｏｎｌｉｎｅ Ｍ
ｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ ｉｎ Ｍａｎ， Ｊｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉ
ｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ， １９６６－２０１５）に記載されている。
患者の７０％～８０％は、ナトリウムチャネルα１サブユニット遺伝子（ＳＣＮ１Ａ）
異常を持ち（ｃａｒｒｙ）、短縮型変異が約４０％を占めており、発作開始の初期の年齢
との重要な相関性を有している。配列決定突然変異は症例の約７０％に見出され、短縮化
（４０％）及びミスセンス変異（４０％）を含んでおり、残りはスプライス部位変化であ
る。大半の突然変異はデノボであるが、家族性の突然変異は症例の５－１０％に生じ、通
常は事実上ミスセンスである。残りのＳＣＮ１Ａ突然変異は、スプライス部位とミスセン
ス突然変異を含み、それらの大部分はナトリウムチャネルの細孔形成領域にある。現在、
５００以上の突然変異がＤＳに関連しており、遺伝子に沿って無作為に分布している（Ｍ
ｕｌｌｅｙ， ｅｔ ａｌ．， Ｎｅｕｒｏｌ． ２００６， ６７， １０９４－１０
９５）。
ＳＣＮ１Ａ遺伝子は、ヒト染色体２ｑ２４上のナトリウムチャネル遺伝子のクラスタに
位置し、神経細胞の電位依存性ナトリウムチャネルのＮａｖ１．１として知られるα－細
孔形成サブユニットをコードする。ＳＣＮ１Ａ遺伝子は、およそ１００ｋｂのゲノムＤＮ
Ａにおよび、２６のエクソンを含む。ＳＣＮ１Ａタンパク質は４つのドメインから成り、
各々が６つの膜貫通性部分を有している。２つのスプライス変異体は、エクソン１１にお
いてドメイン１と２の間の細胞質ループに１１のアミノ酸が存在するまたは存在しないと
いう点で異なる、長い及び短いアイソフォームを結果としてもたらすことが、特定された
（参照により本明細書に組み込まれる、Ｍｉｌｌｅｒ， ｅｔ ａｌ．， １９９３－２
０１５及びＭｕｌｌｅｙ， ｅｔ ａｌ．， ２００５， ２５， ５３５－５４２）。
十分に特徴付けられたシナプス経路においてタンパク質をコードする、非症候群性精神
遅滞及びドラベ症候群に関連した遺伝子の特定は、障害を標的とし且つそれらの随伴症状
を少なくするために薬理学的治療を発達させる可能性を提示する。
保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）
実施形態では、本発明の方法は、細胞核中で、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａから転
写され、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする、保持されたイントロ
ン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）の存在を活用する。成熟し、完全にス
プライシングされたＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡを産出するための、特定
のＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡ前駆体の種のスプライシングは、保持され
たイントロンのスプライシングアウトを刺激するＡＳＯを用いて誘導される。結果として
生じる成熟したＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡは細胞質へ輸送されて翻訳さ
れ、それにより、患者の細胞中のＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量を増加
させ、ＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群の症状を和らげることができる。この方法は以
下で更に説明される、核内遺伝子出力の標的とされた増強（ＴＡＮＧＯ）として知られる
。
ＳＹＮＧＡＰ１核の転写産物
実施例に記載されるように、ＳＹＮＧＡＰ１遺伝子はイントロン保持事象について分析
され、イントロン１５および１８／１９の保持が観察された。ＵＣＳＣゲノムブラウザに
よって視覚化されたＲＮＡ配列決定（ＲＮＡｓｅｑ）は、ヒト皮質ニューロンに発現した
ＳＹＮＧＡＰ１転写産物を示し、細胞質分画あるいは核分画のいずれかに局在した。どち
らの分画においても、読み取りは大多数のイントロンにおいて観察されなかった。しかし
ながら、細胞質分画と比較して、より高い読取密度が核分画のイントロン１５、および１
８／１９において検出され、これはイントロン１５、および１８／１９のスプライシング
効率が低く、結果としてイントロン保持をもたらすことを示している。保持されたイント
ロン含有ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、核に保持され、細胞質には輸送されない。イント
ロン１８／１９の読取密度は４２％のイントロン保持を示した。イントロン１８／１９の
イントロン保持率（ＰＩＲ）の値は、４つの値（５４、５０、３５および２９）を平均す
ることにより得られ、それぞれの値は、４つの異なるアルゴリズムのうちの１つを使用し
、ＨＣＮ細胞において判定された。イントロン１５の読取密度は、２５％のイントロン保
持を示した。イントロン１５のイントロン保持率（ＰＩＲ）の値は、４つの値（４９、０
、２６および２３）を平均することにより得られ、それぞれの値は、４つの異なるアルゴ
リズムのうちの１つを使用し、ＨＣＮ細胞において判定された。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａゲノム配列から
転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、
保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａゲノム配列からのＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の
転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３
を含むＳＣＮ１Ａゲノム配列からのＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。い
くつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の
転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１
を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いく
つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
１のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、本明細
書に開示されるＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。い
くつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含む、ＳＣＮ１Ａ ＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持され
たイントロン２３を含む、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。い
くつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４－７のいずれか一つに係る
、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、
ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含む、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４、６または７の
いずれか一つに係る、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつ
かの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含む、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
５に係るＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形
態では、本明細書において開示されるＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９３を標的と
する。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１０－１０３７のい
ずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のエクソン２１を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは
、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプライ
ス部位よりも上流（または５’）のエクソン２１配列を標的とする。いくつかの実施形態
では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
の５’スプライス部位よりも約４から約２６４ヌクレオチド上流（または５’）のエクソ
ン配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１０
－６２、５２４－５７６または７８１－８３３のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体中のイントロン２１を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプ
ライス部位よりも下流（または３’）のイントロン２１配列を標的とする。いくつかの実
施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の５’スプライス部位よりも約６から約４９６ヌクレオチド下流（または３’）の
イントロン２１配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯｓ：６３－１６１、５７７－６７５または８３４－９３２のいずれか１つにかかる配
列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも上流（または５’）のイントロン２１
配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含
むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも約１６から約４９６
ヌクレオチド上流（または５’）のイントロン２１配列を標的とする。いくつかの実施形
態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１６２－２５８、６７６－７７２または９３
３－１０２９のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体中のエクソン２２を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯ
は、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプラ
イス部位よりも下流（または３’）のエクソン２２配列を標的とする。いくつかの実施形
態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２１を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の３’スプライス部位よりも約２から約３７ヌクレオチド下流（または３’）のエクソ
ン２２配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：
２５９－２６６、７７３－７８０または１０３０－１０３７のいずれか１つに係る配列を
有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のエクソン２３を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは
、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプライ
ス部位よりも上流（または５’）のエクソン２３配列を標的とする。いくつかの実施形態
では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
の５’スプライス部位よりも約４から約２６４ヌクレオチド上流（または５’）のエクソ
ン配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：２６
７－３１９のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体中のイントロン２３を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプ
ライス部位よりも下流（または３’）のイントロン２３配列を標的とする。いくつかの実
施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の５’スプライス部位よりも約６から約４９６ヌクレオチド下流（または３’）の
イントロン２３配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯｓ：３２０－４１９のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも上流（または５’）のイントロン２３
配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含
むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも約１６から約４９６
ヌクレオチド上流（または５’）のイントロン２３配列を標的とする。いくつかの実施形
態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４２０－５１５のいずれか１つにかかる配列
を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体中のエクソン２４を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯ
は、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプラ
イス部位よりも下流（または３’）のエクソン２４配列を標的とする。いくつかの実施形
態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン２３を含むＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の３’スプライス部位よりも約２から約３７ヌクレオチド下流（または３’）の、エク
ソン２４配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ
：５１６－５２３のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ゲノム配列
から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯ
は、保持されたイントロン１８を含むＳＹＮＧＡＰ１ゲノム配列からのＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイント
ロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１ゲノム配列からのＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標
的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮ
ＧＡＰ１ゲノム配列からのＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの
実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物
を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３のＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持され
たイントロン１８を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を
標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１９を含むＳＥ
Ｑ ＩＤ ＮＯ：２のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施
形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持さ
れたイントロン１８を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物
を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１９を含むＳ
ＥＱ ＩＤ ＮＯ：３のＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実
施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３のＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物を標的とする。いくつかの実施形態では、本明細書に開示
されるＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつ
かの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８を含む、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持され
たイントロン１９を含む、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする
。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含む、ＳＹＮＧＡＰ
１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：８－９のいずれか一つに係る、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮ
Ａ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロ
ン１８を含む、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：８－９のいずれか一つに係る、ＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持
されたイントロン１９を含む、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：８－９のいずれか一つに係る、Ｓ
ＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列を標的とする。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含む、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯｓ：８－９のいずれか一つに係る、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の配列
を標的とする。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されたＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯｓ：２５９２、２５９４または２５９５のいずれか１つを標的とする。いくつかの
実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１０３８－２５９１のいずれか一つに
かかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９
を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のエクソン配列を標的とする。いくつか
の実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９を含むＳＹ
ＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプライス部位よりも上流（または５’）の
エクソン配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン
１８またはイントロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプラ
イス部位よりも約４から約７３ヌクレオチド上流（または５’）のエクソン配列を標的と
する。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１０３０－１０５０
または１８１５－１８２７のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９
を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体におけるイントロン１８またはイントロ
ン１９を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８ま
たはイントロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプライス部
位よりも下流（または３’）の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、
保持されたイントロン１８またはイントロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮ
Ａ前駆体の５’スプライス部位よりも約６から約４９９ヌクレオチド下流（または３’）
の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１０
５１－１１３６または１８２８－１９１３のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９
を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも上流（また
は５’）のイントロン１８またはイントロン１９配列を標的とする。いくつかの実施形態
では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも約１６から約４９６ヌクレオチド
上流（または５’）の配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ
ＩＤ ＮＯｓ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいずれか１つにかかる配
列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９
を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のエクソン配列を標的とする。いくつ
かの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１８またはイントロン１９を含むＳ
ＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも下流（または３’）
のエクソン配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロ
ン１８またはイントロン１９を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプ
ライス部位よりも約１７から約１９１２ヌクレオチド下流（または３’）のエクソン配列
を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１２２９－
１５０９または２００６－２２８６のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のエクソン１５を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’
スプライス部位よりも上流（または５’）のエクソン１５配列を標的とする。いくつかの
実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の５’スプライス部位よりも約４から約１０５４ヌクレオチド上流（または
５’）のエクソン配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯｓ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいずれか１つにかかる配列を
有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体におけるイントロン１５を標的とする。いくつかの実施形態で
は、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の５’スプライス部位よりも下流（または３’）のイントロン１５配列を標的とする。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の５’スプライス部位よりも約６から約２５１ヌクレオチド下流
（または３’）のイントロン１５配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは
、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１６８７－１７３６または２６４４－２５１３のいずれか１つ
にかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも上流（または５’）のイントロン
１５配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５
を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも約１６から
約２５６ヌクレオチド上流（または５’）のイントロン１５配列を標的とする。いくつか
の実施形態では、ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１７３７－１７８５または２５１４
－２５６２のいずれか１つにかかる配列を有する。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体におけるエクソン１６を標的とする。いくつかの実施形態では
、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
の３’スプライス部位よりも下流（または３’）のエクソン１６配列を標的とする。いく
つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロン１５を含むＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の３’スプライス部位よりも約２から約１５７ヌクレオチド下流（ま
たは３’）の、エクソン１６配列を標的とする。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、Ｓ
ＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいずれか１つにか
かる配列を有する。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部位はイントロン１５
、１８または１９にある。本明細書で使用されるＳＹＮＧＡＰ１イントロンの番号付けは
、ＮＭ＿００６７７２．２でのｍＲＮＡ配列に相当する。実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮ
Ａ前駆体の標的部位へのＡＳＯのハイブリダイゼーションは、結果として、保持されたイ
ントロン１５、１８または１９の少なくとも１つのスプライス部位（５’スプライス部位
あるいは３’スプライス部位）におけるスプライシングの増強と、その後のＳＹＮＧＡＰ
１タンパク質産生の増大をもたらした。イントロンの番号付けは異なるＳＹＮＧＡＰ１ア
イソフォーム配列に関して変化しうると解される。当業者であれば、本明細書で提供され
るイントロン配列に基づき、またはＮＭ＿００６７７２．２におけるｍＲＮＡ配列に関し
て得られるイントロン番号を使用することで、任意のアイソフォームにおける対応するイ
ントロン番号を判定することができる。当業者はさらに、本明細書で提供されるイントロ
ン配列に基づき、またはＮＭ＿００６７７２．２におけるｍＲＮＡ配列に関して得られる
イントロン番号を使用することで、本発明の方法を使用して標的化のための任意のＳＹＮ
ＧＡＰ１アイソフォームにおける隣接するエクソンの配列を判定することができる。
実施形態では、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、イントロン１、２
、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１
８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または、２５にある（イントロンの番号付けは
、ＮＭ＿００１２０２４３５．１でのｍＲＮＡ配列に対応する）。実施形態では、ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の標的部位へのＡＳＯのハイブリダイゼーションは、結果として、保持
されたイントロン１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４
、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５の少なくと
も１つのスプライス部位（５’スプライス部位あるいは３’スプライス部位）におけるス
プライシングの増強と、その後のＳＣＮ１Ａタンパク質産生の増大をもたらした。実施形
態では、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部位はイントロン２１または２３に
ある。当業者であれば、本明細書で提供されるイントロン配列に基づき、またはＮＭ＿０
０６９２０、ＮＭ＿００１２０２４３５、ＮＭ＿００１１６５９６４、またはＮＭ＿００
１１６５９６３におけるｍＲＮＡ配列に関して得られるイントロン番号を使用することで
、任意のアイソフォームにおける対応するイントロン番号を判定することができる。当業
者はさらに、本明細書で提供されるイントロン配列に基づき、または、ＮＭ＿００６９２
０、ＮＭ＿００１２０２４３５、ＮＭ＿００１１６５９６４、またはＮＭ＿００１１６５
９６３におけるｍＲＮＡ配列に関して得られるイントロン番号を使用することで、本発明
の方法を使用して標的化のための任意のＳＣＮ１Ａアイソフォームにおける隣接するエク
ソンの配列を判定することができる。
イントロン保持の程度は、イントロン保持率（ＰＩＲ）、すなわち、所与のイントロン
が保持される転写産物のパーセンテージとして表現することができる。要約すると、ＰＩ
Ｒは、エクソン－イントロンジャンクションの読み取りとエクソン－エクソンジャンクシ
ョンの読み取りとの平均の合計に対し、エクソン－イントロンジャンクションにマッピン
グする平均読み取り数のパーセンテージとして計算することができる。
ＳＣＮ１ＡのＰＩＲ値は、例えばＢｒａｕｎｓｃｈｗｅｉｇ、ｅｔ ａｌ．、２０１４
（例えば補足の表Ｓ９参照）により報告されており、その全体が参照により本明細書に組
み込まれる。実施形態では、本発明の方法および組成物は、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣｍＲＮＡ
前駆体の保持されたイントロンの構成的スプライシングを誘導することにより、ＳＣＮ１
Ａの発現を増加させるために使用される。実施形態では、保持されたイントロンはイント
ロン１－２５のいずれかである。実施形態では、保持されたイントロンはイントロン２、
４、６、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２０、２１、２２、２３、２４、および
、２５のいずれかである。実施形態では、保持されたイントロンはイントロン１５、１８
および１９のいずれかである。実施形態では、保持されたイントロンは任意のＳＣＮ１Ａ
イントロンである可能性がある。実施形態では、保持されたイントロンはイントロン２１
である。実施形態では、保持されたイントロンはイントロン２３である。本明細書で使用
されるＳＣＮ１Ａイントロンの番号付けは、ＮＭ＿００１２０２４３５．１におけるｍＲ
ＮＡ配列に相当する。異なるＳＣＮ１Ａアイソフォーム配列に関連して、イントロンの番
号付けは変化しうると解される。
ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現
上述されるように、ＡＤ非症候性精神遅滞（ＡＤ ｎｏｎｓｙｎｄｒｏｍｉｃ ｍｅｎ
ｔａｌ ｒｅｔａｒｄａｔｉｏｎ）におけるＳＹＮＧＡＰ１突然変異は全タンパク質に拡
大し、かつ、高いデノボ突然変異率がある。連鎖および細胞遺伝学的な解析により、症例
の１０％未満を占める、ＡＤ非症候性精神遅滞に関連する２９のＸ連鎖および５常染色体
劣性遺伝子が特定された。これは、点突然変異（ｐｏｉｎｔ ｍｕｔａｔｉｏｎ）のよう
な、より小さなデノボ遺伝病変が疾患の病因に寄与し得ることを示唆している。
上述されるように、ドラベ症候群におけるＳＣＮ１Ａ突然変異は全タンパク質に広がる
。１００を超える新規な突然変異が、遺伝子全体にわたり特定され、より消耗性のものが
デノボで生じる。これらは、短縮型変異（４７％）、ミスセンス変異（４３％）、欠失（
３％）およびスプライス部位の変異（７％）から構成される。ＳＣＮ１Ａ突然変異を保持
する被験体のパーセンテージは３３から１００％の間で変動する。大多数の突然変異は新
規な変化である（８８％）。
実施形態では、本明細書において記載される方法は、機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣ
Ｎ１Ａタンパク質の産生を増大させるために使用される。本明細書において使用されるよ
うに、「機能的」という用語は、例えばＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群などの、処置
される疾病の１つ以上の症状を除去するのに必要なＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタン
パク質の活性または機能の量を指す。実施形態では、部分的機能的ＳＹＮＧＡＰ１または
ＳＣＮ１Ａタンパク質の産生を増大させるために、前記方法が使用される。本明細書にお
いて使用されるように、「部分的機能的」という用語は、疾患または疾病の１つ以上の症
状を除去または予防するために必要な、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の活
性または機能の任意の量を指す。いくつかの実施形態では、部分的機能的タンパク質また
はＲＮＡは、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０
％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少な
くとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％の、完全
な機能的タンパク質またはＲＮＡに比してより小さな活性を持つだろう。
実施形態では、前記方法は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を有する被験体の細胞により、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ
タンパク質の発現を増大させる方法であり、ここで、該被験体は、ＳＹＮＧＡＰ１または
ＳＣＮ１Ａタンパク質活性量の不足に起因するＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群を有し
、そのＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質量の不足は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａタンパク質のハプロ不全に起因する。そのような実施形態では、被験体は、機能
的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする第１の対立遺伝子と、ＳＹＮ
ＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を産生しない第２の対立遺伝子とを有する。別のそ
のような実施形態では、被験体は、機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を
コードする第１の対立遺伝子と、非機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を
コードする第２の対立遺伝子を有する。別のそのような実施形態では、被験体は、機能的
ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする第１の対立遺伝子と、部分的機
能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする第２の対立遺伝子を有する
。これらの実施形態のいずれの場合でも、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子
（機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする）から転写されたＲＩ
Ｃ ｍＲＮＡ前駆体の標的部位に結合し、それによって、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から保
持されたイントロンの構成的スプライシングを誘導し、かつ、機能的ＳＹＮＧＡＰ１また
はＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする成熟ｍＲＮＡ量の増加と、被検体の細胞中のＳＹＮ
ＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現の増大をもたらす。
実施形態では、被験体は、機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコード
する第１の対立遺伝子と、部分的機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコ
ードする第２の対立遺伝子を有し、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子（機能
的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする）から転写されたＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的部位、または、第２の対立遺伝子（部分的機能的ＳＹＮＧＡＰ１また
はＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする）から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部
位に結合し、それによって、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から保持されたイントロンの構成的
スプライシングを誘導し、機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードす
る成熟ｍＲＮＡ量の増加と、被検体の細胞中の機能的または部分的機能的ＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現の増大をもたらす。
関連する実施形態では、前記方法は、タンパク質あるいは機能ＲＮＡの発現を増大させ
るためにＡＳＯを用いる方法である。実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタ
ンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を有する被験体の細胞中のＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させるために、ＡＳＯを使用し、ここで、該被
験体は、例えばＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群など、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１
Ａタンパク質の量または機能の不足を有する。
実施形態では、疾患または疾病を引き起こすタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の転写産物は、本明細書に記載されるＡＳＯによって標的化される。いくつかの実
施形態では、疾患の原因ではないタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写
産物は、ＡＳＯによって標的化される。例えば、特定の経路における第１のタンパク質の
突然変異または不足がもたらす疾患は、第２のタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体を標的とし、それによって第２のタンパク質産生が増加することで、改善しうる。
いくつかの実施形態では、第２のタンパク質の機能は、第１のタンパク質の突然変異また
は不足（それは疾患または疾病の原因である）を補うことができる。
実施形態では、被験体は、
（ａ）第１の変異対立遺伝子であって、
（ｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質が、野生型対立遺伝子からの生成と比
較して低下したレベルで産生され、
（ｉｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較
して低下した機能を有する形態で産生され、または、
（ｉｉｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質または機能的ＲＮＡが産生されな
い、第１の変異対立遺伝子と、
（ｂ）第２の変異対立遺伝子であって、
（ｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質が、野生型対立遺伝子からの生成と比
較して低下したレベルで産生され、
（ｉｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較
して、低下した機能を有する形態で生成され、または、
（ｉｉｉ）ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質は産生されない、第２の変異対立
遺伝子と、を有し、
ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は第１の対立遺伝子および／または第２の対立遺伝子か
ら転写される。
これらの実施形態では、ＡＳＯは、第１の対立遺伝子または第２の対立遺伝子から転写
されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部位に結合し、これにより、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体から保持されたイントロンの構成的スプライシングを誘導し、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡ量の増加を引き起こし、被験体の細胞の標的タ
ンパク質または機能的ＲＮＡの発現の増加をもたらす。これらの実施形態では、ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体からの保持されたイントロンの構成的スプライシングの結果として、発現
量の増加した標的タンパク質または機能的ＲＮＡは、同等の野性型タンパク質（部分的機
能的）と比較して機能性が低い、または、同等の野性型タンパク質（完全機能性）と比較
して十分な機能性を有する、いずれの形態もありうる。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡの量
は、例えば、アンチセンスオリゴマーで処置されない、または、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部位と結合しないアンチセンスオリゴマーで処
置される、制御セル中で産生されるＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコード
するｍＲＮＡの量と比較すると、１．１から１０倍に増加する。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量あるいは活性の不足に
起因する疾病は、ＡＳＯが標的とする保持されたイントロンの選択的スプライシングまた
は異常スプライシングに起因する疾病ではない。実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａタンパク質の量あるいは活性の不足に起因する疾病は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体中の保持されたイントロンの選
択的スプライシングまたは異常スプライシングに起因する疾病ではない。実施形態では、
選択的スプライシングまたは異常スプライシングが、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ遺
伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体において生じうるが、しかし、本発明の組成物および
方法は、この選択的スプライシングまたは異常スプライシングを予防しないし、修正する
こともない。
実施形態では、本発明の方法を使用して処置された被験体は、１つの対立遺伝子から部
分的機能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を発現し、ここで、その部分的機
能的ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質は、フレームシフト変異、ナンセンス変
異、ミスセンス変異、または部分的な遺伝子欠失によってもたらされる。実施形態では、
本発明の方法を使用して処置された被験体は、１つの対立遺伝子から非機能的ＳＹＮＧＡ
Ｐ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を発現し、ここで、その非機能的ＳＹＮＧＡＰ１または
ＳＣＮ１Ａタンパク質は、１つの対立遺伝子中のフレームシフト変異、ナンセンス変異、
ミスセンス変異、あるいは部分的な遺伝子欠失によってもたらされる。実施形態では、本
発明の方法を使用して処置された被験体は、１つの対立遺伝子にＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａ全体の遺伝子欠失を有する。
実施形態では、被験体にはＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａのミスセンス変異がある。
被験体はＳＹＮＧＡＰ１およびＳＣＮ１Ａ突然変異を有する可能性がある。場合によって
は、ＳＹＮＧＡＰ１突然変異は短縮型変異（ｔｒｕｎｃａｔｉｎｇ ｍｕｔａｔｉｏｎ）
である可能性がある。ＳＹＮＧＡＰ１短縮型変異はＫ１３８Ｘ、Ｒ５７９ＸまたはＬ８１
３ＲｆｓＸ２２の突然変異である可能性がある。Ｋ１３８Ｘ突然変異は、ＲＡＳＧＡＰド
メインを欠くことがある切断型ＳＹＮＧＡＰ１タンパク質をもたらす可能性がある。前記
Ｋ１３８Ｘ突然変異はｃ．４１２Ａ→Ｔ突然変異をコードすることができる。場合によっ
ては、Ｒ５７９Ｘ突然変異が、ＲＡＳＧＡＰドメインに続く領域中のＳＹＮＧＡＰ１を切
断しうる。実施形態では、ｃ．２４３８ｄｅｌＴはまた、ＲＡＳＧＡＰドメインに続く領
域中のＳＹＮＧＡＰ１を切断しうる。場合によっては、Ｌ８１３ＲｆｓＸ２２突然変異が
、突然変異のｃ．２４３８ｄｅｌＴ配列をコードしうる。前記突然変異が、選択的にスプ
ライスされることができるＳＹＮＧＡＰ１遺伝子の３’末端の上流で生じる場合がある。
実施形態では、前記３’末端における突然変異は、ＳＹＮＧＡＰ１タンパク質のＣ末端部
分のコーディングを変更しうる。
本発明はまた、前記ＳＹＮＧＡＰ１の少なくとも３つのアイソフォームを産生すること
ができるスプライシングプロセスを開示する。本発明のアイソフォームはまた、突然変異
することがある。場合によっては、ＳＹＮＧＡＰ１アイソフォームは少なくとも１３４３
アミノ酸からなる可能性がある。アイソフォームは機能的ドメインを含んでもよい。第１
のＳＹＮＧＡＰ１アイソフォームは、突然変異する機能的ドメインを含むことができる。
ＳＹＮＧＡＰ１アイソフォームは、プレクストリン相同ドメイン、Ｃ２ドメイン、ＲＡＳ
ＧＡＰ、ＳＨ３、ＣＣドメインおよびＣａｍＫＩＩ結合ドメイン（ＣａｍＫＩＩ ｂｉｎ
ｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ）を有する可能性がある。Ｋ１３８Ｘ突然変異はプレクストリン
相同ドメインの上流にある場合がある。Ｋ１３８Ｘ突然変異はプレクストリン相同ドメイ
ン内にある場合がある。Ｋ１３８Ｘ突然変異はプレクストリン相同ドメインの下流にある
場合がある。Ｒ５７９Ｘ突然変異はＲＡＳＧＡＰドメインの領域にある場合がある。Ｒ５
７９Ｘ突然変異はまた、ＲＡＳＧＡＰドメインに隣接している場合がある。同様に、Ｌ８
１３ＲｆｓＸ２２突然変異はＳＨ３ ＳＹＮＧＡＰ１ドメインに隣接している場合がある
。Ｌ８１３ＲｆｓＸ２２突然変異はまた、ＳＨ３ ＳＹＮＧＡＰ１ドメイン内にある場合
がある。
実施形態では、突然変異はまた、前記ＳＹＮＧＡＰ１の第２または第３のアイソフォー
ムに存在することができる。
実施形態では、被験体は判定されない突然変異を有することがある。判定されない突然
変異はＳＹＮＧＡＰ１突然変異またはＳＣＮ１Ａ突然変異である場合がある。判定されな
い突然変異はＳＹＮＧＡＰ１突然変異である場合がある。場合によっては、ＳＹＮＧＡＰ
１突然変異はＩ１１１５Ｔである場合がある。前記Ｉ１１１５Ｔ突然変異はｃ．３３４４
Ｔ→Ｃ突然変異をコードすることがある。特定の実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１における
突然変異は、非症候性精神遅滞でない疾患に関連する場合がある。ＳＹＮＧＡＰ１におけ
る突然変異は自閉症障害および統合失調症に関連しうる。場合によっては、ＳＹＮＧＡＰ
１に関連する突然変異は多型である場合がある。
本発明の実施形態では、被験体はＳＣＮ１Ａにおける突然変異を有する可能性がある。
ＳＣＮ１Ａにおける変化は前記遺伝子の全体にわたって広がりうる。ＳＣＮ１Ａタンパク
質は４つのドメインからなる場合がある。前記ＳＣＮ１Ａドメインには膜貫通セグメント
を有する場合がある。前記ＳＣＮ１Ａタンパク質における突然変異は前記タンパク質の全
体にわたって生じることがある。前記ＳＣＮ１Ａタンパク質は少なくとも２つのアイソフ
ォームからなることがある。ＳＣＮ１Ａにおける突然変異はＲ９３１Ｃ、Ｒ９４６Ｃ、Ｍ
９３４Ｉ、Ｒ１６４８ＣまたはＲ１６４８Ｈから構成されることがある。場合によっては
、突然変異がＳＣＮ１Ａタンパク質のＣ末端で観察されることがある。ＳＣＮ１Ａタンパ
ク質における突然変異はまた、前記ＳＣＮ１Ａタンパク質の最初の３つのドメインのセグ
メント５と６の間のループで見つかることがある。場合によっては、突然変異はＳＣＮ１
Ａタンパク質のＮ－末端で観察されることがある。ＳＣＮ１Ａにおける突然変異はＲ２２
２Ｘ、Ｒ７１２Ｘ、Ｉ２２７Ｓ、Ｒ１８９２Ｘ、Ｗ９５２Ｘ、Ｒ１２４５Ｘ、Ｒ１４０７
Ｘ、Ｗ１４３４Ｒ、ｃ．４３３８＋１ＧＡ、Ｓ１５１６Ｘ、Ｌ１６７０ｆｓＸ１６７８ま
たはＫ１８４６ｆｓＸ１８５６である場合がある。本発明で標的とすることができる突然
変異はまた、イオンチャネルのポアをコードしてもよい。
実施形態では、本発明はドラベ症候群を処置するために使用することができる。他の実
施形態では、本発明は、乳児重症ミオクロニーてんかん（ＳＭＥＩ）を処置するために使
用することができる。他の実施形態では、本発明は境界型ドラベ症候群を処置することが
できる。本発明はまた境界型ＳＭＥＩを処置することができる。さらに、本発明は、全般
てんかん熱性痙攣プラス（ＧＦＥＳ＋）を処置することができる。ＧＥＦＳ＋は、ＳＣＮ
１ＢまたはＧＡＢＲＧ２のようなてんかん関連イオンチャネルサブユニットの突然変異と
関連している可能性がある。本発明はまたナトリウムチャネル病（ｓｏｄｉｕｍ ｃｈａ
ｎｎｅｌｏｐａｔｈｉｅｓ）を処置することができる。ナトリウムチャネル病は、ＳＣＮ
１Ａにおける突然変異に関連しうる。ナトリウムチャネル病も、ベータサブユニット、Ｓ
ＣＮ１Ｂなどの前記ＳＣＮ１Ａのサブユニットに関連しうる。場合によっては、ＳＣＮ１
Ａ突然変異に関する付加的な疾病も、本発明で治療されてもよい。ＳＣＮ１Ａ突然変異に
関する関連ＳＣＮ１Ａ疾患は、非定型筋萎縮症、高カリウム血症性周期性麻痺、または先
天性筋緊張症である可能性がある。
実施形態では、当技術分野において既知であり、かつ、上述した文献（例えば、Ｈａｍ
ｄａｎ， ｅｔ ａｌ．， ２００９， Ｍｕｌｌｅｙ， ｅｔ ａｌ．， ２００５）
に記載されたＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａの突然変異を有する被験体が、本発明の方
法および組成物を用いて処置される。実施形態では、突然変異が任意のＳＹＮＧＡＰ１ま
たはＳＣＮ１Ａのイントロン内にある可能性がある。
ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現を増加させるためのＴＡＮＧＯの使用
前述したように、実施形態では、核内遺伝子出力の標的とされた増強（ＴＡＮＧＯ）は
、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させるために、本発明の方法
において使用される。これらの実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク
質をコードする保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）は
、細胞の核内にある。ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする、保持さ
れたイントロン、５’スプライス部位に隣接するエクソン、および３’スプライス部位に
隣接するエクソンを含むＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を有
する細胞は、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（Ａ
ＳＯ）と接触させられる。ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分へのＡＳＯのハイブリダイ
ゼーションは、保持されたイントロンのスプライス部位（５’スプライス部位あるいは３
’スプライス部位）のスプライシングを増強し、その後の標的タンパク質産生を増加させ
る。
用語「ｍＲＮＡ前駆体」および「ｍＲＮＡ前駆体の転写産物」は、交換可能に使用され
、少なくとも１つのイントロンを含むｍＲＮＡ前駆体種を指すこともある。実施形態では
、ｍＲＮＡ前駆体またはｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、５’－７－メチルグアノシンキャ
ップ、および／またはポリＡ末端を含む。実施形態では、ｍＲＮＡ前駆体またはｍＲＮＡ
前駆体の転写産物は、５’－７－メチルグアノシンキャップおよびポリＡ末端の両方を含
む。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、５’－７－メチルグアノシ
ンキャップ、および／またはポリＡ末端を含まない。タンパク質に翻訳されない場合（あ
るいは核から細胞質へと輸送された場合）、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は非生産的メッセ
ンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）分子である。
本明細書において使用されるように、「保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体」（
「ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体」）は、少なくとも１つの保持されたイントロンを含むｍＲＮ
Ａ前駆体の転写産物である。ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持さ
れたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの３’
スプライス部位に隣接するエクソンを含み、標的タンパク質をコードする。「標的タンパ
ク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体」は、完全にスプライシングされた場合に、標
的タンパク質をコードすると解される。「保持されたイントロン」は、同じ遺伝子によっ
てコードされた、隣接するイントロン等の１つ以上の他のイントロンが、同じｍＲＮＡ前
駆体の転写産物からスプライシングアウトされた場合に、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物に存
在するイントロンである。いくつかの実施形態では、保持されたイントロンは、標的タン
パク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において最も豊富なイントロンである。実施
形態では、保持されたイントロンは、細胞内の標的タンパク質をコードする遺伝子から転
写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団において最も豊富なイントロンであり、該ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保持されたイントロンを含む。実施形態では、標的
タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団において最も豊富なイントロンに
標的とされたアンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴマーが標的とされた、ある
いは結合する保持されたイントロンを含む集団内の、２つ以上の保持されたイントロンの
スプライシングアウトを誘発する。実施形態では、標的タンパク質をコードする成熟ｍＲ
ＮＡは、それによって産生される。「成熟ｍＲＮＡ」および「完全にスプライシングされ
たｍＲＮＡ」の用語は、標的タンパク質をコードする完全に処理されたｍＲＮＡ（例えば
、核から細胞質へと輸送され、標的タンパク質に翻訳されたｍＲＮＡ）、あるいは完全に
処理された機能的ＲＮＡを記載するように、本明細書において交換可能に使用される。用
語「生産的ｍＲＮＡ」もまた、標的タンパク質をコードする完全に処理されたｍＲＮＡに
ついて記載するように使用することができる。実施形態では、標的領域は、ＳＹＮＧＡＰ
１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体に最も豊富に存在す
るイントロンである、保持されたイントロンにある。実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１タン
パク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体に最も保持されたイントロンは、イントロン
１８／１９である。実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体に最も保持されたイントロンは、イントロン１５である。
実施形態では、保持されたイントロンは、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少
なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少
なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、あるいは少なくとも約５
０％の保定の保持率に基づき、保持されたイントロンとして特定されたイントロンである
。実施形態では、保持されたイントロンはすなわち、約５％から約１００％、約５％から
約９５％、約５％から約９０％、約５％から約８５％、約５％から約８０％、約５％から
約７５％、約５％から約７０％、約５％から約６５％、約５％から約６０％、約５％から
約５５％、約５％から約５０％、約５％から約４５％、約５％から約４０％、約５％から
約３５％、約５％から約３０％、約５％から約２５％、約５％から約２０％、約５％から
約１５％、約１０％から約１００％、約１０％から約９５％、約１０％から約９０％、約
１０％から約８５％、約１０％から約８０％、約１０％から約７５％、約１０％から約７
０％、約１０％から約６５％、約１０％から約６０％、約１０％から約５５％、約１０％
から約５０％、約１０％から約４５％、約１０％から約４０％、約１０％から約３５％、
約１０％から約３０％、約１０％から約２５％、約１０％から約２０％、約１５％から約
１００％、約１５％から約９５％、約１５％から約９０％、約１５％から約８５％、約１
５％から約８０％、約１５％から約７５％、約１５％から約７０％、約１５％から約６５
％、約１５％から約６０％、約１５％から約５５％、約１５％から約５０％、約１５％か
ら約４５％、約１５％から約４０％、約１５％から約３５％、約１５％から約３０％、約
１５％から約２５％、約２０％から約１００％、約２０％から約９５％、約２０％から約
９０％、約２０％から約８５％、約２０％から約８０％、約２０％から約７５％、約２０
％から約７０％、約２０％から約６５％、約２０％から約６０％、約２０％から約５５％
、約２０％から約５０％、約２０％から約４５％、約２０％から約４０％、約２０％から
約３５％、約２０％から約３０％、約２５％から約１００％、約２５％から約９５％、約
２５％から約９０％、約２５％から約８５％、約２５％から約８０％、約２５％から約７
５％、約２５％から約７０％、約２５％から約６５％、約２５％から約６０％、約２５％
から約５５％、約２５％から約５０％、約２５％から約４５％、約２５％から約４０％、
または約２５％から約３５％の、保定の保持率に基づき、保持されたイントロンとして特
定されたイントロンである。保持されたイントロンを特定する手助けとして、ＥＮＣＯＤ
Ｅデータ（例えば、Ｔｉｌｇｎｅｒ，ｅｔ ａｌ．，２０１２，「Ｄｅｅｐ ｓｅｑｕｅ
ｎｃｉｎｇ ｏｆ ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ＲＮＡ ｆｒａｃｔｉｏｎｓ ｓｈｏｗｓ
ｓｐｌｉｃｉｎｇ ｔｏ ｂｅ ｐｒｅｄｏｍｉｎａｎｔｌｙ ｃｏ－ｔｒａｎｓｃｒ
ｉｐｔｉｏｎａｌ ｉｎ ｔｈｅ ｈｕｍａｎ ｇｅｎｏｍｅ ｂｕｔ ｉｎｅｆｆｉｃ
ｉｅｎｔ ｆｏｒ ＩｎｃＲＮＡｓ」Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２２（９）：１
６１６－２５に記載）を用いることができる。
本明細書において使用されるように、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、あるいは「
含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」または「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」等の変化形は、
列挙された特徴（例えば、アンチセンスオリゴマーの場合、定義された核酸塩基配列）を
含むが、他のいかなる特徴をも除外しないことを示すと解されるべきである。したがって
、本明細書において使用されるように、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は包含的
で、追加の列挙されていない特徴（例えば、アンチセンスオリゴマーの場合、追加の列挙
されていない核酸塩基の存在）を除外しない。
本明細書において提供される組成物および方法のいずれかの実施形態において、「含む
（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は「から本質的に成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎ
ｔｉａｌｌｙ）」または「から成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」と置換可能である
。「から本質的に成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ）」という句は
、特定された特徴（例えば核酸塩基配列）と共に、請求される本発明の性質または機能に
実質的に影響しない特徴も必要とするために本明細書で使用される。本明細書で使用され
るように、用語「成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ）」は、列挙された特徴（例えば核酸塩基
配列）単独の存在を示すために使用される（その結果、特定された核酸塩基配列から成る
アンチセンスオリゴマーの場合には、追加の列挙されていない核酸塩基の存在は除外され
る）。
実施形態では、標的領域は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体に２番目に豊富なイントロンである保持されたイントロンにある
。例えば、２番目に豊富な保持されたイントロンは、最も豊富な保持されたイントロンよ
りもむしろ標的とされ得る。その要因は、２番目に豊富な保持されたイントロンのヌクレ
オチド配列の独自性、特定のヌクレオチド配列を標的とするＡＳＯ設計の容易さ、および
／またはＡＳＯによりイントロンを標的とすることから生じるタンパク質産生量の増加で
ある。実施形態では、保持されたイントロンは、細胞内の標的タンパク質をコードする遺
伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体集団において２番目に豊富なイントロンであ
り、そのＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体集団は、２つ以上の保持されたイントロンを含む。実施
形態では、標的タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体集団における２番目に豊
富なイントロンを標的とするアンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴマーが標的
とする、または結合する保持されたイントロンを含む集団において、２つ以上の保持され
たイントロンのスプライシングアウトを誘発する。それによって、実施形態では、標的タ
ンパク質をコードする完全にスプライシングされた（成熟）ＲＮＡが産生される。実施形
態では、ＳＹＮＧＡＰ１タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体に２番目に多く
保持されたイントロンは、イントロン１５である。実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１タンパ
ク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体に２番目に多く保持されたイントロンは、イン
トロン１８／１９である。
実施形態では、ＡＳＯは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の保持されていないイントロン内に
ある標的領域に相補的である。実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は：保
持されていないイントロンの５’スプライス部位に対する＋６から＋１００の領域；また
は保持されていないイントロンの３’スプライス部位に対する－１６から－１００の領域
内にある。実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されていないイン
トロンの５’スプライス部位に対する＋１００の領域から、保持されていないイントロン
の３’スプライス部位に対する－１００の領域内にある。領域または配列の場所を特定す
るために使用されるように、「内（ｗｉｔｈｉｎ）」は、列挙される位置で残基を含むよ
うに理解される。例えば、＋６から＋１００の領域は、＋６および＋１００の位置に残基
を含む。それによって、実施形態では、標的タンパク質をコードする完全にスプライシン
グされた（成熟）ＲＮＡが産生される。
実施形態では、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の保持されたイントロンは、非効率的にスプラ
イシングされたイントロンである。本明細書で使用されるように、「非効率的にスプライ
シングされた」は、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体における別のスプライス部位でのスプライシ
ングの頻度と比較して、保持されたイントロンに隣接するスプライス部位（５’スプライ
ス部位または３’スプライス部位）でのスプライシングの頻度が比較的低いことを指し得
る。用語「非効率的にスプライシングされた」はまた、スプライス部位でのスプライシン
グの相対速度または動態（ｋｉｎｅｔｉｃｓ）を指し得る。この「非効率的にスプライシ
ングされた」イントロンは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体における別のイントロンと比較して
、より遅い速度でスプライシングあるいは除去され得る。
実施形態では、５’スプライス部位に隣接するエクソンの－３ｅから－１ｅ、および保
持されたイントロンの＋１から＋６の９－ヌクレオチド配列は、対応する野生型配列と同
一である。実施形態では、保持されたイントロンの－１５から－１および３’スプライス
部位に隣接するエクソンの＋１ｅの１６ヌクレオチド配列は、対応する野生型配列と同一
である。本明細書で使用されるように、「野生型配列」は、生体および科学の情報のＮＣ
ＢＩリポジトリ（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇ
ｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ， Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｌｉｂｒａｒｙ ｏｆ Ｍｅｄｉｃ
ｉｎｅ，８６００ Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ Ｐｉｋｅ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ ＵＳＡ
２０８９４によって運営される）に寄託された公開された参照ゲノムのＳＹＮＧＡＰ１ま
たはＳＣＮ１Ａに対するヌクレオチド配列を指す。さらに本明細書で使用されるように、
「ｅ」で示されたヌクレオチド位置は、ヌクレオチドがエクソン（例えば、５’スプライ
ス部位に隣接するエクソン、または３’スプライス部位に隣接するエクソン）の配列中に
存在することを示す。本明細書で使用されるように、「野生型配列」は、ＳＹＮＧＡＰの
ＮＣＢＩ ＧＥＮＥ ＩＤ８８３１、およびＳＣＮ１ＡのＮＣＢＩ ＧＥＮＥ ＩＤ６３
２３で得られる標準配列を指す。
該方法では、細胞を、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮ
Ａ前駆体の一部に相補的であるＡＳＯと接触させ、結果としてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣ
Ｎ１Ａの発現が増加する。本明細書で使用されるように、細胞に「接触させる」または投
与することは、ＡＳＯと細胞が相互作用するように、ＡＳＯを細胞に即座に近接させる方
法を指す。ＡＳＯと接触させられる細胞は、ＡＳＯを細胞へと取り込む又は輸送する。該
方法は、疾病または疾患に関係する又は疾病または疾患に関連する細胞を、本明細書に記
載されるＡＳＯのいずれかと接触させる工程を含む。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは
、ＡＳＯを細胞型に対して標的とする、ＡＳＯと疾病または疾患に関係する又は疾病また
は疾患に関連する細胞との間の接触を増強する、またはＡＳＯの取り込みを増強するため
に、さらに修飾され得るかまたは別の分子に結合され得る（例えば、共有結合される）。
本明細書で使用されるように、用語「タンパク質産生を増加させる」または「標的タン
パク質の発現を増加させる」は、細胞中のｍＲＮＡから翻訳されるタンパク質の量を増加
させることを意味する。「標的タンパク質」は、発現／産生の増加が望まれるタンパク質
で有り得る。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物
の標的部分に相補的であるＡＳＯに、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮ
Ａ前駆体を発現する細胞を接触させることにより、ｍＲＮＡ前駆体によってコードされた
ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質（例えば標的タンパク質）の量の測定可能な
増加をもたらす。タンパク質の産生を測定または検出する方法は、当業者に明白となり、
あらゆる既知の方法、例えば、ウェスタンブロッティング、フローサイトメトリー、免疫
蛍光顕微鏡検査法、およびＥＬＩＳＡを含む。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物
の標的部分に相補的であるＡＳＯに、細胞を接触させることにより、ＡＳＯの欠如／処置
の欠如下における細胞によって産生されたタンパク質の量と比較して、少なくとも１０、
２０、３０、４０、５０、６０、８０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５
０、４００、４５０、５００、または１０００％の、産生されたＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａタンパク質の量の増加をもたらす。実施形態では、アンチセンスオリゴマーと接
触させられた細胞によって産生されたＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の総量
は、対照細胞において産生された標的タンパク質の総量と比較して、約１．１倍から約１
０倍、約１．５倍から約１０倍、約２倍から約１０倍、約３倍から約１０倍、約４倍から
約１０倍、約１．１倍から約５倍、約１．１倍から約６倍、約１．１倍から約７倍、約１
．１倍から約８倍、約１．１倍から約９倍、約２倍から約５倍、約２倍から約６倍、約２
倍から約７倍、約２倍から約８倍、約２倍から約９倍、約３倍から約６倍、約３倍から約
７倍、約３倍から約８倍、約３倍から約９倍、約４倍から約７倍、約４倍から約８倍、約
４倍から約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少
なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも４倍、少な
くとも約５倍、または少なくとも約１０倍増加する。対照化合物は、例えば、ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的でないオリゴヌクレオチドでもよい。
幾つかの実施形態では、細胞を、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体の転写産物の標的部分に相補的であるＡＳＯと接触させることで、標的タンパク質
をコードする成熟ｍＲＮＡを含む、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１ＡをコードするｍＲＮ
Ａ量の増加がもたらされる。幾つかの実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタ
ンパク質をコードするｍＲＮＡ、またはＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコ
ードする成熟ｍＲＮＡの量は、ＡＳＯの欠如／処置の欠如下における細胞によって産生さ
れたタンパク質の量と比較して、少なくとも１０、２０、３０、４０、５０、６０、８０
、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、または
１０００％増加する。実施形態では、アンチセンスオリゴマーが接触させられた細胞で産
生された、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡ、またはＳ
ＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする成熟ｍＲＮＡの総量は、処置され
ていない細胞、例えば処置されていない細胞または対照化合物により処置された細胞、に
おいて産生された成熟ＲＮＡの量と比較して、約１．１から約１０倍、約１．５から約１
０倍、約２から約１０倍、約３から約１０倍、約４から約１０倍、約１．１から約５倍、
約１．１から約６倍、約１．１倍から約７倍、約１．１倍から約８倍、約１．１倍から約
９倍、約２倍から約５倍、約２倍から約６倍、約２倍から約７倍、約２倍から約８倍、約
２倍から約９倍、約３倍から約６倍、約３倍から約７倍、約３倍から約８倍、約３倍から
約９倍、約４倍から約７倍、約４倍から約８倍、約４倍から約９倍、少なくとも約１．１
倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３
倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、または少なくとも約
１０倍増加する。対照化合物は、例えば、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的でないオリゴヌクレオチドでもよい。
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体からの保持されたイントロンの構成的スプライシング
本明細書において提供される方法およびアンチセンスオリゴヌクレオチドの組成物は、
例えば、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量または活性の不足によって引き
起こされるＡＤ精神遅滞５またはドラベ症候群を有する被験体において、ＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡ、または、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣ
Ｎ１Ａタンパク質をコードする成熟ｍＲＮＡのレベルを増加させることによって、細胞内
のＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させるのに有用である。特に
、本明細書に記載されるような方法および組成物は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタ
ンパク質をコードするＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写
産物からの保持されたイントロンの構成的スプライシングを誘発し、それによって、ＳＹ
ＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡ、またはＳＹＮＧＡＰ１ま
たはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードする成熟ｍＲＮＡのレベルが増加し、ＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現が増加する。
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体からの保持されたイントロンの構成的スプライシングは、保持
されたイントロンをＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から正しく除去し、ここで保持されたイント
ロンは、野生型スプライス配列を有する。構成的スプライシングは、本明細書で使用され
るように、遺伝子または対立遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシン
グまたは異常スプライシングを引き起こす突然変異を有する遺伝子または対立遺伝子から
転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体からの保持されたイントロンのスプライシングを包含
しない。例えば、本明細書で提供される方法およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを使
用して誘発された、保持されたイントロンの構成的スプライシングは、ｍＲＮＡ前駆体に
おける異常スプライシングを訂正しない、またはｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシング
に影響せず、結果的に標的タンパク質または機能性ＲＮＡの発現が増加する。
実施形態では、構成的スプライシングは、保持されたイントロンをＳＹＮＧＡＰ１また
はＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から正しく除去し、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ
１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、野生型の遺伝子または対立遺伝子、あるいは多形性の
遺伝子または対立遺伝子から転写され、完全に機能的な標的タンパク質または機能的ＲＮ
Ａをコードし、および遺伝子または対立遺伝子は、保持されたイントロンの選択的スプラ
イシングまたは異常スプライシングを引き起こす突然変異を有さない。
幾つかの実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＳＹ
ＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体からの保持されたイントロンの構
成的スプライシングは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＳＹＮ
ＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から、保持されたイントロンを正し
く除去し、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、野生型対立遺
伝子からの産生と比較して減少したレベルで標的遺伝子あるいは機能的ＲＮＡを産生する
遺伝子または対立遺伝子から転写され、および遺伝子または対立遺伝子は、保持されたイ
ントロンの選択的スプライシングまたは異常スプライシングを引き起こす突然変異を有さ
ない。これらの実施形態では、構成的にスプライシングされた保持されたイントロンの正
しい除去は、結果として、同等の野生型タンパク質または機能的ＲＮＡと比較したときに
機能的である標的タンパク質または機能的ＲＮＡの産生をもたらす。
他の実施形態では、構成的スプライシングは、保持されたイントロンをＳＹＮＧＡＰ１
またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から正しく除去し、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、同等の野生型タンパク質または機能的ＲＮＡと比
較して、機能の低下した形態で産生された標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードす
る遺伝子または対立遺伝子から転写され、遺伝子または対立遺伝子は、保持されたイント
ロンの選択的スプライシングまたは異常スプライシングを引き起こす突然変異を有さない
。これらの実施形態では、構成的にスプライシングされた保持されたイントロンの正しい
除去は、結果として、部分的に機能的な標的タンパク質、または同等の野生型タンパク質
または機能的ＲＮＡと比較したときに部分的に機能的である機能的ＲＮＡの産生をもたら
す。
構成的スプライシングによる保持されたイントロンの「正しい除去」は、エクソンのい
かなる部分も除去することのない、全イントロンの除去を指す。
実施形態では、本明細書に記載されるような、あるいは本明細書に記載の方法に使用さ
れるアンチセンスオリゴマーは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａから転写されたｍＲＮ
Ａ前駆体の選択的スプライシングまたは異常スプライシングを調節することによって、Ｓ
ＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡの量、またはＳＹＮＧＡ
Ｐ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量を増加させない。選択的スプライシングまたは異常
スプライシングの調節は、ＲＮＡ種の配列および長さを解析する既知の方法を使用して、
例えば、ＲＴ－ＰＣＲによって、および本明細書および文献中で別記される方法を使用し
て測定することができる。実施形態では、選択的スプライシングまたは異常スプライシン
グの調節は、対象となるスプライシングされた種の量の、少なくとも１０％または１．１
倍の増加または減少に基づいて判定される。実施形態では、調節は、本発明の方法におい
て、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡの増加の判定に関
連して本明細書に記載されるように、少なくとも１０％から１００％または１．１倍から
１０倍のレベルでの増加または減少に基づいて判定される。
実施形態では、該方法は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
が、野生型ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡ前駆体の部分的スプライシングに
よって産生された方法である。実施形態では、該方法は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１
Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、全長の野生型ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮ
Ａ前駆体の部分的スプライシングによって産生された方法である。実施形態では、ＳＹＮ
ＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長のＳＹＮＧＡＰ１またはＳ
ＣＮ１Ａ ｍＲＮＡ前駆体の部分的スプライシングによって産生された。これらの実施形
態では、全長のＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ｍＲＮＡ前駆体は、野生型スプライス
部位配列を有する保持されたイントロンのスプライシングと比較して、保持されたイント
ロンの正しいスプライシングを損なわない保持されたイントロンのスプライス部位に多型
性を有し得る。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡは、
全長の成熟ｍＲＮＡまたは野生型成熟ｍＲＮＡである。これらの実施形態では、全長の成
熟ｍＲＮＡは、野生型成熟ｍＲＮＡによってコードされたＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１
Ａタンパク質の活性と比較して、成熟ｍＲＮＡによってコードされた標的タンパク質また
は機能的ＲＮＡの活性に影響しない多型性を有し得る。
アンチセンスオリゴマー
本開示の一態様は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的
部分に結合することによってスプライシングを増強するアンチセンスオリゴマーを含む組
成物である。本明細書で使用されるように、用語「ＡＳＯ」および「アンチセンスオリゴ
マー」は、交換可能に使用され、ワトソン・クリック塩基対またはゆらぎ塩基対（Ｇ－Ｕ
）によって標的核酸（例えば、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体）配列にハイブリダイズする核酸塩基を含む、ポリヌクレオチドなどのオリゴマーを指
す。ＡＳＯは、標的配列に相補的な、またはほぼ相補的（例えば、標的配列に結合し、ス
プライス部位でスプライシングを増強させるのに十分な相補性）である正確な配列を有し
得る。ＡＳＯは、標的核酸（例えば、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的とされた部分）に
結合し（ハイブリダイズし）、生理学的条件下でハイブリダイズされたままであるように
設計されている。典型的に、ＡＳＯは、意図した（標的とされた）核酸配列以外の部位に
ハイブリダイズする場合、標的核酸でない限られた数の配列に（標的核酸以外の少数の部
位に）ハイブリダイズする。ＡＳＯの設計は、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的とされた
部分の核酸配列、あるいはゲノムまたは細胞のｍＲＮＡ前駆体またはトランスクリプトー
ムにおける他の場所での十分に類似した核酸配列の発生を考慮に入れることができ、その
結果、ＡＳＯが他の部位に結合し「オフターゲット」効果を引き起こす可能性は限定され
る。例えば、引用により本明細書に組み込まれた、発明の名称「Ｒｅｄｕｃｉｎｇ Ｎｏ
ｎｓｅｎｓｅ－Ｍｅｄｉａｔｅｄ ｍＲＮＡ Ｄｅｃａｙ」のＷＯ２０１５／０３５０９
１として公開されたＰＣＴ国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０５４１５１におけるも
のなどの、当業者に既知のアンチセンスオリゴマーは、本明細書に記載される方法を実施
するために使用され得る。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、標的核酸またはＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的と
された部分に「特異的にハイブリダイズする」または「特異的である」。典型的に、その
ようなハイブリダイゼーションは、３７℃より実質的に高い融解温度（Ｔｍ）で、好まし
くは少なくとも５０℃で、および典型的に６０℃からおよそ９０℃の間で生じる。そのよ
うなハイブリダイゼーションは、好ましくは、厳しいハイブリダイゼーション条件に対応
している。与えられたイオン強度およびｐＨで、Ｔｍは、標的配列の５０％が相補的オリ
ゴヌクレオチドにハイブリダイズする温度である。
オリゴヌクレオチドなどのオリゴマーは、ハイブリダイゼーションが２つの一本鎖ポリ
ヌクレオチド間の逆平行構成で生じるときに、互いに「相補的」である。二本鎖ポリヌク
レオチドは、ハイブリダイゼーションが第１のポリヌクレオチドの鎖の１つと第２のポリ
ヌクレオチドの鎖の１つとの間に生じる場合に、別のポリヌクレオチドに「相補的」であ
り得る。相補性（１つのポリヌクレオチドが別のポリヌクレオチドと相補的である程度）
は、一般に容認された塩基対合則に従って、互いに水素結合を形成すると予期される対向
する鎖における塩基の割合（例えばパーセンテージ）の点から数量化できる。アンチセン
スオリゴマー（ＡＳＯ）の配列は、ハイブリダイズするその標的核酸の配列に１００％相
補的である必要はない。特定の実施形態では、ＡＳＯは、標的とされる標的核酸配列内の
標的部分に対する、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくと
も８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％
、少なくとも９８％、または少なくとも９９％の配列相補性を含むことができる。例えば
、オリゴマー化合物の２０の核酸塩基のうちの１８が標的領域に相補的であり、それゆえ
に特異的にハイブリダイズするＡＳＯは、９０パーセントの相補性を表わす。この例にお
いて、残りの相補的でない核酸塩基は、ともにクラスター化され得るか、または相補的な
核酸塩基と分散され（ｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄ）、互いに又は相補的な核酸塩基に隣接
している必要はない。ＡＳＯの標的核酸の領域とのパーセント相補性は、当該技術分野で
既知のＢＬＡＳＴプログラム（基礎的なローカルアライメント検索ツール）およびＰｏｗ
ｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．
，１９９０，２１５，４０３－４１０；Ｚｈａｎｇ ａｎｄ Ｍａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍ
ｅ Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９－６５６）を慣例的に使用して判定され得る。
ＡＳＯは、標的配列におけるすべての核酸塩基にハイブリダイズする必要はなく、それ
がハイブリダイズする核酸塩基は、隣接しているか又は隣接していない場合もある。ＡＳ
Ｏは、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の１つ以上のセグメントにわたってハイブリダイズし得
、その結果、介在する又は隣接するセグメントは、ハイブリダイゼーション事象に関係し
ない（例えば、ループ構造またはヘアピン構造が形成され得る）。特定の実施形態では、
ＡＳＯは、標的ｍＲＮＡ前駆体の転写産物において隣接していない核酸塩基にハイブリダ
イズする。例えば、ＡＳＯは、ＡＳＯがハイブリダイズしない１つ以上の核酸塩基によっ
て分離される、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物における核酸塩基にハイブリダイズすることが
できる。
本明細書に記載されるＡＳＯは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に存在する核酸塩
基に相補的である核酸塩基を含む。用語「ＡＳＯ」は、オリゴヌクレオチド、および標的
ｍＲＮＡ上の相補的な核酸塩基にハイブリダイズすることができる核酸塩基を含むが、ペ
プチド核酸（ＰＮＡ）などの糖部を含まない、他のオリゴマー分子を具体化する。ＡＳＯ
は、自然発生のヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ、修飾されたヌクレオチド、または
それらの２つ又は３つの任意の組み合わせを含み得る。用語「自然発生のヌクレオチド」
は、デオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドを含む。用語「修飾されたヌクレ
オチド」は、修飾された又は置換された糖類及び／又は修飾された骨格を有するヌクレオ
チドを含む。いくつかの実施形態では、ＡＳＯのヌクレオチドのすべてが、修飾されたヌ
クレオチドである。本明細書に記載される方法および組成物と適合性のあるＡＳＯの化学
修飾およびＡＳＯの成分は、当業者に明白となり、例えば、米国特許第８，２５８，１０
９号 Ｂ２、米国特許第５，６５６，６１２号、米国特許公開番号２０１２／０１９０７
２８、およびＤｉａｓ ａｎｄ Ｓｔｅｉｎ，Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．２００
２，３４７－３５５に見出すことができ、それら全体が引用によって本明細書に組み込ま
れる。
ＡＳＯの核酸塩基は、アデニン、グアニン、シトシン、チミンおよびウラシルなどの自
然発生の未修飾の核酸塩基、または標的ｍＲＮＡ前駆体上に存在する核酸塩基との水素結
合が可能であるように未修飾の核酸塩基に十分に類似している合成または修飾された核酸
塩基であり得る。修飾された核酸塩基の例としては、限定されないが、ヒポキサンチン、
キサンチン、７－メチルグアニン、５，６－ジヒドロウラシル、５－メチルシトシン、お
よび５－ヒドロキシメチルシトシンが挙げられる。
本明細書に記載されるＡＳＯはまた、オリゴマーの成分に結合する骨格構造を含む。用
語「骨格構造」および「オリゴマー結合」は、交換可能に使用され、ＡＳＯの単量体間の
結合を指し得る。自然発生のオリゴヌクレオチドでは、骨格は、オリゴマーの糖部を結合
する３’－５’ホスホジエステル結合を含む。本明細書に記載されるＡＳＯの骨格構造ま
たはオリゴマー結合は、（限定されないが）ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート
、ホスホロセレノエート、ホスホロジセレノエート、ホスホロアニロチオエート、ホスホ
ラニラデート（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｎｉｌａｄａｔｅ）、ホスホラミデート（ｐｈｏｓｐ
ｈｏｒａｍｉｄａｔｅ）などを含む。例えば、ＬａＰｌａｎｃｈｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕ
ｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１４：９０８１（１９８６）；Ｓｔｅｃ，ｅｔ ａｌ
．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０６：６０７７（１９８４），Ｓｔｅｉｎ，ｅｔ
ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１６：３２０９（１９８８），Ｚｏｎ，
ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓｉｇｎ ６：５３９（１９９
１）；Ｚｏｎ，ｅｔ ａｌ．，Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏ
ｇｕｅｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，ｐｐ．８７－１０８（Ｆ．Ｅｃ
ｋｓｔｅｉｎ，Ｅｄ．，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒ
ｄ Ｅｎｇｌａｎｄ（１９９１））；Ｓｔｅｃ，ｅｔ ａｌ．，米国特許第５，１５１，
５１０号；Ｕｈｌｍａｎｎ ａｎｄ Ｐｅｙｍａｎ，Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ
９０：５４３（１９９０）を参照されたい。幾つかの実施形態では、ＡＳＯの骨格構造
は、亜リン酸を含有していないが、例えば、ペプチド核酸（ＰＮＡ）、またはカルバミン
酸塩、アミド、および直鎖および環式の炭化水素基を含む連結基において、ペプチド結合
を含有している。幾つかの実施形態では、骨格修飾は、ホスホチオエート結合である。幾
つかの実施形態では、骨格修飾は、ホスホラミデート結合である。
実施形態では、ＡＳＯ骨格のリンヌクレオチド間の結合の各々での立体化学は、ランダ
ムである。実施形態では、ＡＳＯ骨格のリンヌクレオチド間の結合の各々での立体化学は
、制御され、ランダムではない。例えば、引用によって本明細書に組み込まれた米国特許
出願公開番号２０１４／０１９４６１０、「Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｓｙｎｔ
ｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｉｚｅｄ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ」は、
核酸オリゴマーにおいて各リン原子でキラリティーの掌性（ｈａｎｄｅｄｎｅｓｓ）を独
立して選択する方法について記載している。実施形態では、限定されないが、本明細書で
表１に明記されるＡＳＯのいずれかを含む、本発明の方法に使用されるＡＳＯは、ランダ
ムでないリンヌクレオチド間の結合を有するＡＳＯを含む。実施形態では、本発明の方法
に使用される組成物は、純粋なジアステレオマーＡＳＯを含む。実施形態では、本発明の
方法に使用される組成物は、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９
２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９
６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、約１００％、約
９０％から約１００％、約９１％から約１００％、約９２％から約１００％、約９３％か
ら約１００％、約９４％から約１００％、約９５％から約１００％、約９６％から約１０
０％、約９７％から約１００％、約９８％から約１００％、または約９９％から約１００
％のジアステレオマー純度を有するＡＳＯを含む。
実施形態では、ＡＳＯは、そのリンヌクレオチド間の連鎖でＲｐおよびＳｐの構成のラ
ンダムでない混合物を有している。例えば、ＲｐとＳｐの混合物が、アンチセンスオリゴ
ヌクレオチドにおいて、優れた活性とヌクレアーゼ安定性との間のバランスを達成するた
めに必要であることが示唆されてきた（Ｗａｎ，ｅｔ ａｌ．，２０１４，「Ｓｙｎｔｈ
ｅｓｉｓ，ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ａｎｄ ｂｉｏｌｏｇｉｃ
ａｌ ａｃｔｉｖｉｔｙ ｏｆ ｓｅｃｏｎｄ ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ａｎｔｉｓｅｎ
ｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｃｈｉｒａｌ ｐｈ
ｏｓｐｈｏｒｏｔｈｉｏａｔｅ ｌｉｎｋａｇｅｓ」Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅ
ｓｅａｒｃｈ ４２（２２）：１３４５６－１３４６８、引用によって本明細書に組み込
まれる）。実施形態では、限定されないが、本明細書で表１に明記されるＡＳＯのいずれ
かを含む、本発明の方法に使用されるＡＳＯは、約５～１００％のＲｐ、少なくとも約５
％のＲｐ、少なくとも約１０％のＲｐ、少なくとも約１５％のＲｐ、少なくとも約２０％
のＲｐ、少なくとも約２５％のＲｐ、少なくとも約３０％のＲｐ、少なくとも約３５％の
Ｒｐ、少なくとも約４０％のＲｐ、少なくとも約４５％のＲｐ、少なくとも約５０％のＲ
ｐ、少なくとも約５５％のＲｐ、少なくとも約６０％のＲｐ、少なくとも約６５％のＲｐ
、少なくとも約７０％のＲｐ、少なくとも約７５％のＲｐ、少なくとも約８０％のＲｐ、
少なくとも約８５％のＲｐ、少なくとも約９０％のＲｐ、または少なくとも約９５％のＲ
ｐと、残りのＳｐまたは１００％のＲｐを含む。実施形態では、限定されないが、本明細
書で表１に明記されるＡＳＯのいずれかを含む、本発明の方法に使用されるＡＳＯは、約
１０％から約１００％のＲｐ、約１５％から約１００％のＲｐ、約２０％から約１００％
のＲｐ、約２５％から約１００％のＲｐ、約３０％から約１００％のＲｐ、約３５％から
約１００％のＲｐ、約４０％から約１００％のＲｐ、約４５％から約１００％のＲｐ、約
５０％から約１００％のＲｐ、約５５％から約１００％のＲｐ、約６０％から約１００％
のＲｐ、約６５％から約１００％のＲｐ、約７０％から約１００％のＲｐ、約７５％から
約１００％のＲｐ、約８０％から約１００％のＲｐ、約８５％から約１００％のＲｐ、約
９０％から約１００％のＲｐ、約９５％から約１００％のＲｐ、約２０％から約８０％の
Ｒｐ、約２５％から約７５％のＲｐ、約３０％から約７０％のＲｐ、約４０％から約６０
％のＲｐ、または約４５％から約５５％Ｒｐと、残りのＳｐを含む。
実施形態では、限定されないが、本明細書で表１に明記されるＡＳＯのいずれかを含む
、本発明の方法の使用されるＡＳＯは、約５－１００％のＳｐ、少なくとも約５％のＳｐ
、少なくとも約１０％含のＳｐ、少なくとも約１５％のＳｐ、少なくとも約２０％のＳｐ
、少なくとも約２５％のＳｐ、少なくとも約３０％のＳｐ、少なくとも約３５％のＳｐ、
少なくとも約４０％のＳｐ、少なくとも約４５％のＳｐ、少なくとも約５０％のＳｐ、少
なくとも約５５％のＳｐ、少なくとも約６０％のＳｐ、少なくとも約６５％のＳｐ、少な
くとも約７０％のＳｐ、少なくとも約７５％のＳｐ、少なくとも約８０％のＳｐ、少なく
とも約８５％のＳｐ、少なくとも約９０％のＳｐ、または少なくとも約９５％のＳｐと、
残りのＲｐ、あるいは約１００％のＳｐを含む。実施形態では、限定されないが、本明細
書で表１に明記されるＡＳＯのいずれかを含む、本発明の方法に使用されるＡＳＯは、約
１０％から約１００％のＳｐ、約１５％から約１００％のＳｐ、約２０％から約１００％
のＳｐ、約２５％から約１００％のＳｐ、約３０％から約１００％のＳｐ、約３５％から
約１００％のＳｐ、約４０％から約１００％のＳｐ、約４５％から約１００％のＳｐ、約
５０％から約１００％のＳｐ、約５５％から約１００％のＳｐ、約６０％から約１００％
のＳｐ、約６５％から約１００％のＳｐ、約７０％から約１００％のＳｐ、約７５％から
約１００％のＳｐ、約８０％から約１００％のＳｐ、約８５％から約１００％のＳｐ、約
９０％から約１００％のＳｐ、または約９５％から約１００％のＳｐ、約２０％から約８
０％のＳｐ、約２５％から約７５％のＳｐ、約３０％から約７０％のＳｐ、約４０％から
約６０％のＳｐ、または約４５％から約５５％のＳｐと、残りのＲｐを含む。
本明細書に記載されるＡＳＯのいずれかは、自然発生のヌクレオチド中に存在する、リ
ボースまたはデオキシリボースを含む糖部、あるいはモルホリン環を含む、修飾された糖
部または糖アナログを含有し得る。修飾された糖部の限定しない例としては、２’－Ｏ－
メチル（２’－Ｏ－Ｍｅ）、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＭＯＥ）、２’－Ｏ－アミ
ノエチル、２’Ｆ；Ｎ３’－＞Ｐ５’ホスホラミデート、２’ジメチルアミノオキシエト
キシ、２’ジメチルアミノエトキシエトキシ、２’－グアニジニウム（ｇｕａｎｉｄｉｎ
ｉｄｉｕｍ）、２’－Ｏ－グアニジニウムエチル、カルバミン酸塩修飾した糖、および二
環式修飾した糖などの、２’置換基が挙げられる。幾つかの実施形態では、糖部修飾は、
２’－Ｏ－Ｍｅ、２’Ｆ、および２’ＭＯＥから選択される。幾つかの実施形態では、糖
部修飾は、ロックド核酸（ＬＮＡ）におけるような追加の架橋結合である。幾つかの実施
形態では、糖アナログは、ホスホロジアミデートモルホリノ（ＰＭＯ）などのモルホリン
環を含有している。幾つかの実施形態では、糖部は、リボフラノシルまたは２’デオキシ
リボフラノシルの修飾を含む。幾つかの実施形態では、糖部は、２’４’抑制された（ｃ
ｏｎｓｔｒａｉｎｅｄ）２’Ｏ－メチルオキシエチル（ｃＭＯＥ）修飾を含む。幾つかの
実施形態では、糖部は、ｃＥｔ ２’，４’抑制された２’－ＯエチルＢＮＡ修飾を含む
。幾つかの実施形態では、糖部は、トリシクロＤＮＡ（ｔｃＤＮＡ）修飾を含む。幾つか
の実施形態では、糖部は、エチレン核酸（ＥＮＡ）修飾を含む。幾つかの実施形態では、
糖部は、ＭＣＥ修飾を含む。修飾は当該技術分野で既知であり、文献、例えば、Ｊａｒｖ
ｅｒ， ｅｔ ａｌ．， ２０１４，「Ａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｖｉｅｗ ｏｆ Ｏｌｉｇｏｎ
ｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ｆｏｒ Ｅｘｏｎ Ｓｋｉｐｐｉｎｇ ａｎｄ Ｒｅｌａｔｅｄ Ｄｒ
ｕｇ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，」Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ
ｓ ２４（１）： ３７－４７に記載され、これは、この目的のための引用によって本明細
書に組み込まれる。
幾つかの例では、ＡＳＯの各単量体は、同じ方法で修飾され、例えば、ＡＳＯの骨格の
各連鎖は、ホスホロチオエート連鎖を含むか、または各リボース糖部は２’Ｏ－メチル修
飾を含む。ＡＳＯの単量体成分の各々の上に存在する、そのような修飾は、「均一な修飾
」と呼ばれる。幾つかの例では、異なる修飾の組み合わせが望まれ、例えば、ＡＳＯは、
ホスホロジアミデート連鎖とモルホリン環を含む糖部（モルホリノ）との組み合わせを含
み得る。ＡＳＯへの異なる修飾の組み合わせは、「混合修飾」または「混合化学作用」と
呼ばれる。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、１つ以上の骨格修飾を含む。幾つかの実施形態では
、ＡＳＯは、１つ以上の糖部修飾を含む。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、１つ以上の
骨格修飾および１つ以上の糖部修飾を含む。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、２’ＭＯ
Ｅ修飾およびホスホロチオエート骨格を含む。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ホスホ
ロジアミデートモルホリノ（ＰＭＯ）を含む。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ペプチ
ド核酸（ＰＮＡ）を含む。本明細書に記載されるＡＳＯのいずれか又はＡＳＯの成分（例
えば、核酸塩基、糖部、骨格）は、ＡＳＯの望ましい特性または活性を達成するために又
はＡＳＯの望ましくない特性または活性を減少させるために修飾され得る。例えば、ＡＳ
Ｏまたは任意のＡＳＯの１つ以上の成分は、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物上の標的配列への
結合親和性を増強する；非標的配列への結合を減少させる；細胞のヌクレアーゼ（つまり
、ＲＮａｓｅ Ｈ）による分解を減少させる；細胞及び／又は細胞の核へのＡＳＯの取り
込みを改善する；ＡＳＯの薬物動態（ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ）または薬力（
ｐｈａｒｍａｃｏｄｙｎａｍｉｃｓ）を変更する；およびＡＳＯの半減期を調節するため
に修飾され得る。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、２’－Ｏ－（２－メトキシエチル）（ＭＯＥ）のホ
スホロチオエート修飾されたヌクレオチドで構成される。そのようなヌクレオチドで構成
されたＡＳＯは、特に、本明細書で開示される方法によく適しており、そのような修飾を
有しているオリゴマーは、ヌクレアーゼ分解に対する著しく増強された耐性および増大し
たバイオアベイラビリティを有すると示されており、これによって、例えば、本明細書に
記載される幾つかの実施形態における経口送達に適するようになる。例えば、Ｇｅａｒｙ
， ｅｔ ａｌ．， Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ． ２００１； ２９６（３）
：８９０－７； Ｇｅａｒｙ， ｅｔ ａｌ．， Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ
． ２００１； ２９６（３）：８９８－９０４を参照。
ＡＳＯを合成する方法は、当業者に既知となる。代替的に又は加えて、ＡＳＯは商用源
から得られ得る。
他に明記されない限り、一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ前駆体の転写産物、オリゴヌク
レオチド、ＡＳＯなど）配列の左端は、５’末端であり、一本鎖または二本鎖の核酸配列
の左方向は、５’方向と呼ばれる。同様に、核酸配列（一本鎖または二本鎖）の右端また
は右方向は、３’末端または３’方向である。一般に、核酸中の基準点に対して５’にあ
る領域または配列は「上流」として言及され、核酸中の基準点に対して３’にある領域ま
たは配列は「下流」として言及される。一般に、ｍＲＮＡの５’方向または５’末端は、
開始コドン（ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｏｒ ｓｔａｒｔ ｃｏｄｏｎ）が位置する場所であ
り、一方で３’末端または３’方向は、終止コドンが位置する場所である。幾つかの態様
では、核酸中の基準点の上流にあるヌクレオチドは、負の数によって指定され、基準点の
下流にあるヌクレオチドは、正の数によって指定され得る。例えば、基準点（例えば、ｍ
ＲＮＡ中のエクソン－エクソン連結）は「ゼロ」部位として指定され得、基準点に直接隣
接しその上流にあるヌクレオチドは、「マイナス１」、例えば「－１」と指定され、一方
で基準点に直接隣接しその下流にあるヌクレオチドは、「プラス１」、例えば「＋１」と
指定される。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保持さ
れたイントロンの５’スプライス部位の下流（３’方向）であるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分（例えば５’スプライス部位に対して正の数で示された方向）に対
して相補的である（およびそれに結合する）（図１）。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは
、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して約＋６から約＋５００の領域内に
あるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である。幾つかの実施
形態では、ＡＳＯは、５’スプライス部位に対して＋１から＋５までのヌクレオチド（５
’スプライス部位の下流に位置付けられた最初の５つのヌクレオチド）に対して相補的で
ない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に
対して約＋６から約＋４９６の間の領域内にあるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標
的部分に対して相補的であり得る。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持されたイントロン
の５’スプライス部位に対して、約＋６から約＋５００、約＋６から約＋４９０、約＋６
から約＋４８０、約＋６から約＋４７０、約＋６から約＋４６０、約＋６から約＋４５０
、約＋６から約＋４４０、約＋６から約＋４３０、約＋６から約＋４２０、約＋６から約
＋４１０、約＋６から約＋４００、約＋６から約＋３９０、約＋６から約＋３８０、約＋
６から約＋３７０、約＋６から約＋３６０、約＋６から約＋３５０、約＋６から約＋３４
０、約＋６から約＋３３０、約＋６から約＋３２０、約＋６から約＋３１０、約＋６から
約＋３００、約＋６から約＋２９０、約＋６から約＋２８０、約＋６から約＋２７０、約
＋６から約＋２６０、約＋６から約＋２５０、約＋６から約＋２４０、約＋６から約＋２
３０、約＋６から約＋２２０、約＋６から約＋２１０、約＋６から約＋２００、約＋６か
ら約＋１９０、約＋６から約＋１８０、約＋６から約＋１７０、約＋６から約＋１６０、
約＋６から約＋１５０、約＋６から約＋１４０、約＋６から約＋１３０、約＋６から約＋
１２０、約＋６から約＋１１０、約＋６から約＋１００、約＋６から約＋９０、約＋６か
ら約＋８０、約＋６から約＋７０、約＋６から約＋６０、約＋６から約＋５０、約＋６か
ら約＋４０、約＋６から約＋３０、または約＋６から約＋２０の領域内にある標的部分に
相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保持さ
れたイントロンの５’スプライス部位の上流（５’方向）であるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分（例えば５’スプライス部位に対して負の数で示された方向）に対
して相補的である（およびそれに結合する）（図１）。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは
、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して約－４ｅから約－２７０ｅの領域
内にあるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である。幾つかの
実施形態では、ＡＳＯは、５’スプライス部位に対して－１ｅから－３ｅまでのヌクレオ
チド（５’スプライス部位の上流に位置付けられた最初の３つのヌクレオチド）に対して
相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライ
ス部位に対して－４ｅから－２６４ｅの間の領域内にあるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の標的部分に対して相補的であり得る。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持されたイ
ントロンの５’スプライス部位に対して、約－４ｅから約－２７０ｅ、約－４ｅから約－
２６０ｅ、約－４ｅから約－２５０ｅ、約－４ｅから約－２４０ｅ、約－４ｅから約－２
３０ｅ、約－４ｅから約－２２０ｅ、約－４ｅから約－２１０ｅ、約－４ｅから約－２０
０ｅ、約－４ｅから約－１９０ｅ、約－４ｅから約－１８０ｅ、約－４ｅから約－１７０
ｅ、約－４ｅから約－１６０ｅ、約－４ｅから約－１５０ｅ、約－４ｅから約－１４０ｅ
、約－４ｅから約－１３０ｅ、約－４ｅから約－１２０ｅ、約－４ｅから約－１１０ｅ、
約－４ｅから約－１００ｅ、約－４ｅから約－９０ｅ、約－４ｅから約－８０ｅ、約－４
ｅから約－７０ｅ、約－４ｅから約－６０ｅ、約－４ｅから約－５０ｅ、約－４ｅから約
－４０ｅ、約－４ｅから約－３０ｅ、または約－４ｅから約－２０ｅの領域内にある標的
部分に相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保持さ
れたイントロンの３’スプライス部位の上流（５’方向）であるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的領域（例えば、負の数で示された方向）に対して相補的である（図１）
。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対し
て約－１６から約－５００の領域内にあるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分
に対して相補的である。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、３’スプライス部位に対して
－１から－１５までのヌクレオチド（３’スプライス部位の上流に位置付けられた最初の
１５のヌクレオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持さ
れたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６から－４９６の領域内にあるＳＣＮ
１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である。幾つかの態様では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して、約－１６から約－５００、
約－１６から約－４９０、約－１６から約－４８０、約－１６から約－４７０、約－１６
から約－４６０、約－１６から約－４５０、約－１６から約－４４０、約－１６から約－
４３０、約－１６から約－４２０、約－１６から約－４１０、約－１６から約－４００、
約－１６から約－３９０、約－１６から約－３８０、約－１６から約－３７０、約－１６
から約－３６０、約－１６から約－３５０、約－１６から約－３４０、約－１６から約－
３３０、約－１６から約－３２０、約－１６から約－３１０、約－１６から約－３００、
約－１６から約－２９０、約－１６から約－２８０、約－１６から約－２７０、約－１６
から約－２６０、約－１６から約－２５０、約－１６から約－２４０、約－１６から約－
２３０、約－１６から約－２２０、約－１６から約－２１０、約－１６から約－２００、
約－１６から約－１９０、約－１６から約－１８０、約－１６から約－１７０、約－１６
から約－１６０、約－１６から約－１５０、約－１６から約－１４０、約－１６から約－
１３０、約－１６から約－１２０、約－１６から約－１１０、約－１６から約－１００、
約－１６から約－９０、約－１６から約－８０、約－１６から約－７０、約－１６から約
－６０、約－１６から約－５０、約－１６から約－４０、または３約－１６から約－３０
の領域内にある標的部分に相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保持さ
れたイントロンの３’スプライス部位の下流（３’方向）であるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的領域（例えば、正の数で示された方向）に対して相補的である（図１）
。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対し
て、約＋２ｅから約＋４０ｅの領域内にあるＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部
分に対して相補的である。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、３’スプライス部位に対し
て＋１ｅのヌクレオチド（３’スプライス部位の下流に位置付けられた最初の５つのヌク
レオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイント
ロンの３’スプライス部位に対して約＋２ｅから約＋３７ｅの間の領域内にあるＳＣＮ１
Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であり得る。幾つかの態様では、Ａ
ＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して、約＋２ｅから約＋４０ｅ
、約＋２ｅから約＋３０ｅ、約＋２ｅから約＋２０ｅ、または＋２ｅから約＋１０ｅの領
域内にある標的部分に相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保
持されたイントロンの５’スプライス部位の下流（３’方向）であるＳＹＮＧＡＰ１ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分（例えば５’スプライス部位に対して正の数で示された
方向）に対して相補的である（およびそれに結合する）（図１）。幾つかの実施形態では
、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して約＋６から約＋５００
の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である
。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、５’スプライス部位に対して＋１から＋５までのヌ
クレオチド（５’スプライス部位の下流に位置付けられた最初の５つのヌクレオチド）に
対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’ス
プライス部位に対して約＋６から約＋４９６の間の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であり得る。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは
、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して、約＋６から約＋２５１の間の領
域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であり得る
。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して、
約＋６から約＋５００、約＋６から約＋４９０、約＋６から約＋４８０、約＋６から約＋
４７０、約＋６から約＋４６０、約＋６から約＋４５０、約＋６から約＋４４０、約＋６
から約＋４３０、約＋６から約＋４２０、約＋６から約＋４１０、約＋６から約＋４００
、約＋６から約＋３９０、約＋６から約＋３８０、約＋６から約＋３７０、約＋６から約
＋３６０、約＋６から約＋３５０、約＋６から約＋３４０、約＋６から約＋３３０、約＋
６から約＋３２０、約＋６から約＋３１０、約＋６から約＋３００、約＋６から約＋２９
０、約＋６から約＋２８０、約＋６から約＋２７０、約＋６から約＋２６０、約＋６から
約＋２５０、約＋６から約＋２４０、約＋６から約＋２３０、約＋６から約＋２２０、約
＋６から約＋２１０、約＋６から約＋２００、約＋６から約＋１９０、約＋６から約＋１
８０、約＋６から約＋１７０、約＋６から約＋１６０、約＋６から約＋１５０、約＋６か
ら約＋１４０、約＋６から約＋１３０、約＋６から約＋１２０、約＋６から約＋１１０、
約＋６から約＋１００、約＋６から約＋９０、約＋６から約＋８０、約＋６から約＋７０
、約＋６から約＋６０、約＋６から約＋５０、約＋６から約＋４０、約＋６から約＋３０
、または約＋６から約＋２０の領域内にある標的部分に相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保
持されたイントロンの５’スプライス部位の上流（５’方向）であるＳＹＮＧＡＰ１ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分（例えば５’スプライス部位に対して負の数で示された
方向）に対して相補的である（およびそれに結合する）（図１）。幾つかの実施形態では
、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して約－４ｅから約－１，
０６０ｅの領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補
的である。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、５’スプライス部位に対して－１ｅから－
３ｅまでのヌクレオチド（５’スプライス部位の上流に位置付けられた最初の３つのヌク
レオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイント
ロンの５’スプライス部位に対して、－４ｅから－１０５４ｅの間の領域内にあるＳＹＮ
ＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であり得る。幾つかの実施形
態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して、－４ｅから－
７３ｅの間の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相
補的であり得る。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライス
部位に対して、約－４ｅから約－１，０６０ｅ、約－４ｅから約－１，０５０ｅ、約－４
ｅから約－１，０４０ｅ、約－４ｅから約－１，０３０ｅ、約－４ｅから約－１，０２０
ｅ、約－４ｅから約－１，０１０ｅ、約－４ｅから約－１，０００ｅ、約－４ｅから約－
９９０ｅ、約－４ｅから約－９８０ｅ、約－４ｅから約－９７０ｅ、約－４ｅから約－９
６０ｅ、約－４ｅから約－９５０ｅ、約－４ｅから約－９４０ｅ、約－４ｅから約－９３
０ｅ、約－４ｅから約－９２０ｅ、約－４ｅから約－９１０ｅ、約－４ｅから約－９００
ｅ、約－４ｅから約－８９０ｅ、約－４ｅから約－８８０ｅ、約－４ｅから約－８７０ｅ
、約－４ｅから約－８６０ｅ、約－４ｅから約－８５０ｅ、約－４ｅから約－８４０ｅ、
約－４ｅから約－８３０ｅ、約－４ｅから約－８２０ｅ、約－４ｅから約－８１０ｅ、約
－４ｅから約－８００ｅ、約－４ｅから約－７９０ｅ、約－４ｅから約－７８０ｅ、約－
４ｅから約－７７０ｅ、約－４ｅから約－７６０ｅ、約－４ｅから約－７５０ｅ、約－４
ｅから約－７４０ｅ、約－４ｅから約－７３０ｅ、約－４ｅから約－７２０ｅ、約－４ｅ
から約－７１０ｅ、約－４ｅから約－７００ｅ、約－４ｅから約－６９０ｅ、約－４ｅか
ら約－６８０ｅ、約－４ｅから約－６７０ｅ、約－４ｅから約－６６０ｅ、約－４ｅから
約－６５０ｅ、約－４ｅから約－６４０ｅ、約－４ｅから約－６３０ｅ、約－４ｅから約
－６２０ｅ、約－４ｅから約－６１０ｅ、約－４ｅから約－６００ｅ、約－４ｅから約－
５９０ｅ、約－４ｅから約－５８０ｅ、約－４ｅから約－５７０ｅ、約－４ｅから約－５
６０ｅ、約－４ｅから約－５５０ｅ、約－４ｅから約－５４０ｅ、約－４ｅから約－５３
０ｅ、約－４ｅから約－５２０ｅ、約－４ｅから約－５１０ｅ、約－４ｅから約－５００
ｅ、約－４ｅから約－４９０ｅ、約－４ｅから約－４８０ｅ、約－４ｅから約－４７０ｅ
、約－４ｅから約－４６０ｅ、約－４ｅから約－４５０ｅ、約－４ｅから約－４４０ｅ、
約－４ｅから約－４３０ｅ、約－４ｅから約－４２０ｅ、約－４ｅから約－４１０ｅ、約
－４ｅから約－４００ｅ、約－４ｅから約－３９０ｅ、約－４ｅから約－３８０ｅ、約－
４ｅから約－３７０ｅ、約－４ｅから約－３６０ｅ、約－４ｅから約－３５０ｅ、約－４
ｅから約－３４０ｅ、約－４ｅから約－３３０ｅ、約－４ｅから約－３２０ｅ、約－４ｅ
から約－３１０ｅ、約－４ｅから約－３００ｅ、約－４ｅから約－２９０ｅ、約－４ｅか
ら約－２８０ｅ、約－４ｅから約－２７０ｅ、約－４ｅから約－２６０ｅ、約－４ｅから
約－２５０ｅ、約－４ｅから約－２４０ｅ、約－４ｅから約－２３０ｅ、約－４ｅから約
－２２０ｅ、約－４ｅから約－２１０ｅ、約－４ｅから約－２００ｅ、約－４ｅから約－
１９０ｅ、約－４ｅから約－１８０ｅ、約－４ｅから約－１７０ｅ、約－４ｅから約－１
６０ｅ、約－４ｅから約－１５０ｅ、約－４ｅから約－１４０ｅ、約－４ｅから約－１３
０ｅ、約－４ｅから約－１２０ｅ、約－４ｅから約－１１０ｅ、約－４ｅから約－１００
ｅ、約－４ｅから約－９０ｅ、約－４ｅから約－８０ｅ、約－４ｅから約－７０ｅ、約－
４ｅから約－６０ｅ、約－４ｅから約－５０ｅ、約－４ｅから約－４０ｅ、約－４ｅから
約－３０ｅ、または約－４ｅから約－２０ｅの領域内にある標的部分に相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保
持されたイントロンの３’スプライス部位の上流（５’方向）であるＳＹＮＧＡＰ１ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的領域（例えば負の数で示された方向）に対して相補的である
（図１）。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部
位に対して約－１６から約－５００の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の標的部分に対して相補的である。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、３’スプライス
部位に対して－１から－１５までのヌクレオチド（３’スプライス部位の上流に位置付け
られた最初の１５のヌクレオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６から－２５６の領域内
にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である。幾つか
の実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６
から－４９６の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して
相補的である。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部
位に対して、約－１６から約－５００、約－１６から約－４９０、約－１６から約－４８
０、約－１６から約－４７０、約－１６から約－４６０、約－１６から約－４５０、約－
１６から約－４４０、約－１６から約－４３０、約－１６から約－４２０、約－１６から
約－４１０、約－１６から約－４００、約－１６から約－３９０、約－１６から約－３８
０、約－１６から約－３７０、約－１６から約－３６０、約－１６から約－３５０、約－
１６から約－３４０、約－１６から約－３３０、約－１６から約－３２０、約－１６から
約－３１０、約－１６から約－３００、約－１６から約－２９０、約－１６から約－２８
０、約－１６から約－２７０、約－１６から約－２６０、約－１６から約－２５０、約－
１６から約－２４０、約－１６から約－２３０、約－１６から約－２２０、約－１６から
約－２１０、約－１６から約－２００、約－１６から約－１９０、約－１６から約－１８
０、約－１６から約－１７０、約－１６から約－１６０、約－１６から約－１５０、約－
１６から約－１４０、約－１６から約－１３０、約－１６から約－１２０、約－１６から
約－１１０、約－１６から約－１００、約－１６から約－９０、約－１６から約－８０、
約－１６から約－７０、約－１６から約－６０、約－１６から約－５０、約－１６から約
－４０、または約－１６から約－３０の領域内にある標的部分に対して相補的である。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において保
持されたイントロンの３’スプライス部位の下流（３’方向）であるＳＹＮＧＡＰ１ Ｒ
ＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的領域（例えば正の数で示された方向）に対して相補的である
（図１）。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部
位に対して、約＋２ｅから約＋１，９２０ｅの領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的である。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、３’ス
プライス部位に対して＋１ｅのヌクレオチド（３’スプライス部位の下流に位置付けられ
た最初のヌクレオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、３’
スプライス部位に対して＋１６ｅのヌクレオチド（３’スプライス部位の下流に位置付け
られた最初の１６のヌクレオチド）に対して相補的でない。幾つかの実施形態では、ＡＳ
Ｏは、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して約＋２ｅから約＋１５７ｅの
間の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であ
り得る。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、保持されたイントロンの３’スプライス部位
に対して約＋２ｅから約＋１，９１２ｅの間の領域内にあるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の標的部分に対して相補的であり得る。幾つかの態様では、ＡＳＯは、保持さ
れたイントロンの３’スプライス部位に対して、約＋２ｅから約＋１，９２０ｅ、約＋２
ｅから約＋１，９１０ｅ、ら約＋２ｅから約＋１，９００ｅ、約＋２ｅから約＋１，８９
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８７０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，８６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８５０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８４０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，８３０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８１
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，８００ｅ、約＋２ｅから約＋１，７９０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，７８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７７０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７６０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，７５０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７３
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，７１０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，７００ｅ、約＋２ｅから約＋１，６９０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６８０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，６７０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６５
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６３０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，６２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６１０ｅ、約＋２ｅから約＋１，６００ｅ、約＋
２ｅから約＋１，５９０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５７
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５５０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，５４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５３０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５２０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，５１０ｅ、約＋２ｅから約＋１，５００ｅ、約＋２ｅから約＋１，４９
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４７０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，４６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４５０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４４０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，４３０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４１
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，４００ｅ、約＋２ｅから約＋１，３９０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，３８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３７０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３６０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，３５０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３３
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，３１０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，３００ｅ、約＋２ｅから約＋１，２９０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２８０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，２７０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２５
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２３０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，２２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２１０ｅ、約＋２ｅから約＋１，２００ｅ、約＋
２ｅから約＋１，１９０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１７
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１５０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，１４０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１３０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１２０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，１１０ｅ、約＋２ｅから約＋１，１００ｅ、約＋２ｅから約＋１，０９
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０８０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０７０ｅ、約＋２ｅから約
＋１，０６０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０５０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０４０ｅ、約＋
２ｅから約＋１，０３０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０２０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０１
０ｅ、約＋２ｅから約＋１，０００ｅ、約＋２ｅから約＋９９０ｅ、約＋２ｅから約＋９
８０ｅ、約＋２ｅから約＋９７０ｅ、約＋２ｅから約＋９６０ｅ、約＋２ｅから約＋９５
０ｅ、約＋２ｅから約＋９４０ｅ、約＋２ｅから約＋９３０ｅ、約＋２ｅから約＋９２０
ｅ、約＋２ｅから約＋９１０ｅ、約＋２ｅから約＋９００ｅ、約＋２ｅから約＋８９０ｅ
、約＋２ｅから約＋８８０ｅ、約＋２ｅから約＋８７０ｅ、約＋２ｅから約＋８６０ｅ、
約＋２ｅから約＋８５０ｅ、約＋２ｅから約＋８４０ｅ、約＋２ｅから約＋８３０ｅ、約
＋２ｅから約＋８２０ｅ、約＋２ｅから約＋８１０ｅ、約＋２ｅから約＋８００ｅ、約＋
２ｅから約＋７９０ｅ、約＋２ｅから約＋７８０ｅ、約＋２ｅから約＋７７０ｅ、約＋２
ｅから約＋７６０ｅ、約＋２ｅから約＋７５０ｅ、約＋２ｅから約＋７４０ｅ、約＋２ｅ
から約＋７３０ｅ、約＋２ｅから約＋７２０ｅ、約＋２ｅから約＋７１０ｅ、約＋２ｅか
ら約＋７００ｅ、約＋２ｅから約＋６９０ｅ、約＋２ｅから約＋６８０ｅ、約＋２ｅから
約＋６７０ｅ、約＋２ｅから約＋６６０ｅ、約＋２ｅから約＋６５０ｅ、約＋２ｅから約
＋６４０ｅ、約＋２ｅから約＋６３０ｅ、約＋２ｅから約＋６２０ｅ、約＋２ｅから約＋
６１０ｅ、約＋２ｅから約＋６００ｅ、約＋２ｅから約＋５９０ｅ、約＋２ｅから約＋５
８０ｅ、約＋２ｅから約＋５７０ｅ、約＋２ｅから約＋５６０ｅ、約＋２ｅから約＋５５
０ｅ、約＋２ｅから約＋５４０ｅ、約＋２ｅから約＋５３０ｅ、約＋２ｅから約＋５２０
ｅ、約＋２ｅから約＋５１０ｅ、約＋２ｅから約＋５００ｅ、約＋２ｅから約＋４９０ｅ
、約＋２ｅから約＋４８０ｅ、約＋２ｅから約＋４７０ｅ、約＋２ｅから約＋４６０ｅ、
約＋２ｅから約＋４５０ｅ、約＋２ｅから約＋４４０ｅ、約＋２ｅから約＋４３０ｅ、約
＋２ｅから約＋４２０ｅ、約＋２ｅから約＋４１０ｅ、約＋２ｅから約＋４００ｅ、約＋
２ｅから約＋３９０ｅ、約＋２ｅから約＋３８０ｅ、約＋２ｅから約＋３７０ｅ、約＋２
ｅから約＋３６０ｅ、約＋２ｅから約＋３５０ｅ、約＋２ｅから約＋３４０ｅ、約＋２ｅ
から約＋３３０ｅ、約＋２ｅから約＋３２０ｅ、約＋２ｅから約＋３１０ｅ、約＋２ｅか
ら約＋３００ｅ、約＋２ｅから約＋２９０ｅ、約＋２ｅから約＋２８０ｅ、約＋２ｅから
約＋２７０ｅ、約＋２ｅから約＋２６０ｅ、約＋２ｅから約＋２５０ｅ、約＋２ｅから約
＋２４０ｅ、約＋２ｅから約＋２３０ｅ、約＋２ｅから約＋２２０ｅ、約＋２ｅから約＋
２１０ｅ、約＋２ｅから約＋２００ｅ、約＋２ｅから約＋１９０ｅ、約＋２ｅから約＋１
８０ｅ、約＋２ｅから約＋１７０ｅ、約＋２ｅから約＋１６０ｅ、約＋２ｅから約＋１５
０ｅ、約＋２ｅから約＋１４０ｅ、約＋２ｅから約＋１３０ｅ、約＋２ｅから約＋１２０
ｅ、約＋２ｅから約＋１１０ｅ、約＋２ｅから約＋１００ｅ、約＋２ｅから約＋９０ｅ、
約＋２ｅから約＋８０ｅ、約＋２ｅから約＋７０ｅ、約＋２ｅから約＋６０ｅ、約＋２ｅ
から約＋５０ｅ、約＋２ｅから約＋４０ｅ、約＋２ｅ＋から約３０ｅ、または約＋２ｅ＋
から約＋２０ｅの領域内にある標的部分に相補的である。
実施形態では、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は
、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋１００の領域から、保持された
イントロンの３’スプライス部位に対する－１００の領域内にある。ＡＳＯは、スプライ
シングの特異的結合および有効な増強に適した長さであり得る。幾つかの実施形態では、
ＡＳＯは、８から５０の核酸塩基から成る。例えば、ＡＳＯは、長さが８、９、１０、１
１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４
、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、４５、または
５０の核酸塩基であり得る。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、５０よりも多い核酸塩基
から成る。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基
、８～３５の核酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基
、８～１５の核酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基
、９～３０の核酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基
、１０、５０の核酸塩基、１０、４０の核酸塩基、１０、３５の核酸塩基、１０、３０の
核酸塩基、１０、２５の核酸塩基、１０、２０の核酸塩基、１０、１５の核酸塩基、１１
～５０の核酸塩基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩
基、１１～２５の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０
の核酸塩基、１２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１
２～２５の核酸塩基、１２～２０の核酸塩基、１２～１５の核酸塩基、１３～５０の核酸
塩基、１３～４０の核酸塩基、１３～３５の核酸塩基、１３～３０の核酸塩基、１３～２
５の核酸塩基、１３～２０の核酸塩基、１４～５０の核酸塩基、１４～３５の核酸塩基、
１４～３０の核酸塩基、１４～２５の核酸塩基、１４～２０の核酸塩基、１５～５０の核
酸塩基、１５～４０核酸塩基、１５～３５核酸塩基、１５～３０核酸塩基、１５～２５核
酸塩基、１５～２０核酸塩基、２０、５０の核酸塩基、２０、４０の核酸塩基、２０、３
５の核酸塩基、２０、３０の核酸塩基、２０、２５の核酸塩基、２５～５０の核酸塩基、
２５～４０の核酸塩基、２５～３５の核酸塩基、または２５～３０の核酸塩基の長さであ
る。幾つかの実施形態では、ＡＳＯは、長さが１８のヌクレオチドである。幾つかの実施
形態では、ＡＳＯは、長さが１５のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、ＡＳＯ
は、長さが２５のヌクレオチドである。
幾つかの実施形態では、異なる化学作用を有するがＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の同じ標的
部分に相補的である２つ以上のＡＳＯが使用される。幾つかの実施形態では、ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の異なる標的部分に対して相補的である２つ以上のＡＳＯが使用される。
実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、１つ以上の部分または抱
合体、例えば、オリゴヌクレオチドの活性または細胞取り込みを増強する標的とする部分
または他の抱合体に化学的に連結される。そのような部分は、限定されないが、例えば、
コレステロール部分、コレステリル部分のような脂質部分、脂肪鎖、例えば、ドデカンジ
オールもしくはウンデシルの残留物、ポリアミン鎖もしくはポリエチレングリコール鎖、
あるいはアダマンタン酢酸を含む。親油性部分を含むオリゴヌクレオチドおよび調製方法
は、公開された文献に記載されている。実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチド
は、限定されないが、脱塩基ヌクレオチド、ポリエーテル、ポリアミン、ポリアミド、ペ
プチド、炭水化物、例えば、Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ－Ａｃ－
グルコサミン（ＧｕｌＮＡｃ）、またはマンノース（例えば、マンノース－６－リン酸塩
）、脂質、またはポリ炭化水素化合物を含む部分で抱合される。抱合体は、例えばリンカ
ーを使用して、当技術分野において理解され、文献中に記載されるように、糖、塩基また
はリン酸基上の幾つかの位置のいずれかでアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むヌクレ
オチドの１つ以上に連結され得る。リンカーは、二価または三価の分枝したリンカーを含
むことができる。実施形態では、抱合体は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの３’末端
に結合される。オリゴヌクレオチド抱合体を調製する方法は、例えば、米国特許第８，４
５０，４６７号「Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ ａｓ ｄｅｌｉｖｅ
ｒｙ ａｇｅｎｔｓ ｆｏｒ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ」に記載され、これは引
用によって本明細書に組み込まれる。
幾つかの実施形態では、ＡＳＯによって標的とされる核酸は、真核細胞などの細胞にお
いて発現されたＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体である。幾つか
の実施形態では、用語「細胞」は、細胞の集団を指し得る。幾つかの実施形態では、細胞
は被験体内に存在する。幾つかの実施形態では、細胞は被験体から分離されている。幾つ
かの実施形態では、細胞はエクスビボにある。幾つかの実施形態では、細胞は、疾病また
は疾患関連の細胞または細胞株である。幾つかの実施形態では、細胞はインビトロに（例
えば、細胞培養液中に）ある。
＜医薬組成物＞
記載された組成物のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む及び記載された方法のいず
れかにおいて使用するための医薬組成物または製剤は、製薬産業において周知の及び公開
された文献に記載された従来の技術に従って調製され得る。実施形態では、被験体を処置
するための医薬組成物または製剤は、上記されるような有効量のアンチセンスオリゴマー
、あるいはその薬学的に許容可能な塩、溶媒和物、水和物、またはエステル、および薬学
的に許容可能な希釈剤を含む。医薬製剤のアンチセンスオリゴマーはさらに、薬学的に許
容可能な賦形剤、希釈剤または担体を含み得る。
薬学的に許容可能な塩は、過度の毒性、刺激、アレルギー反応などがない、ヒトおよび
下等動物の組織と接触させる使用に適しており、合理的なベネフィット・リスク比に相応
している（例えば、Ｓ． Ｍ． Ｂｅｒｇｅ， ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔ
ｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， ６６： １－１９ （１９７７）を参照し、これは、この目
的のための参照によって本明細書に組み込まれる）。その塩は、化合物の最終的な分離お
よび精製中に、または別に遊離塩基の官能基を適切な有機酸と反応させることによって、
インサイチュで調製され得る。薬学的に許容可能で無毒な酸付加塩の例は、塩酸、臭化水
素酸、リン酸、硫酸、および過塩素酸などの無機酸か、酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒
石酸、クエン酸、コハク酸もしくはマロン酸などの有機酸か、またはイオン交換などの他
の文書で立証された方法を用いることによって形成されたアミノ基の塩である。他の薬学
的に許容可能な塩は、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸
塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、樟脳
スルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル
硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン
酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、２－
ヒドロキシ－エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル
硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２－ナフタレン
スルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パ
モ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、３－フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸
塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸、チオ
シアン酸塩、ｐ－トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などを含む。代表的
なアルカリまたはアルカリ土類金属の塩は、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウ
ム、マグネシウムなどを含む。さらに薬学的に許容可能な塩は、適切な場合、ハロゲン化
物、水酸化物、カルボン酸塩、硫酸塩、リン酸塩、硝酸塩、低級アルキルのスルホン酸塩
、およびアリールスルホン酸塩などの対イオンを使用して形成された、無毒なアンモニウ
ム、第四級アンモニウム、およびアミンのカチオンを含む。
実施形態において、組成物は、限定されないが、錠剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、
液体シロップ剤、ソフトゲル、坐剤、および浣腸剤などの多くの考えられる剤形のいずれ
かへと製剤される。実施形態において、組成物は、水性培地、非水性培地、または混合培
地状の懸濁液として製剤化される。水性懸濁液は、例えば、カルボキシメチルセルロース
ナトリウム（ソルビトールおよび／またはデキストラン）を含む懸濁液の粘度を増加させ
る物質をさらに含むこともある。その懸濁液は、安定化剤も含むこともある。実施形態に
おいて、本発明の医薬製剤または医薬組成物は、限定されないが、溶液、エマルジョン、
マイクロエマルジョン、発泡体またはリポソーム含有製剤（例えばカチオンリポソームま
たは非カチオンリポソーム）を含む。
本発明の医薬組成物または医薬製剤は、必要に応じて当業者に周知されたように、また
は公開文献において記載されているように、１つ以上の透過促進剤、担体、賦形剤、また
は他の活性成分もしくは非活性成分を含むこともある。実施形態において、リポソームは
立体的に安定したリポソーム、例えば１つ以上の特定の脂質を含むリポソームも含む。こ
れらの特定の脂質は、循環寿命が増強されたリポソームを結果としてもたらす。実施形態
において、立体的に安定したリポソームは、１つ以上の糖脂質を含むか、またはポリエチ
レングリコール（ＰＥＧ）部分などの１つ以上の親油性ポリマーを用いて誘導される。実
施形態において、界面活性剤は医薬製剤または医薬組成物中に含まれる。薬物製品、製剤
およびエマルジョンにおける界面活性剤の使用は、当技術分野においてよく知られている
。実施形態では、本発明は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの効率的な送達を達成する
、例えば、細胞膜にわたる拡散を助ける及び／又は脂溶性薬物の浸透性を増強するために
、浸透促進剤を利用する。実施形態では、浸透促進剤は、界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩
、キレート剤、または非キレート性の非界面活性剤である。
実施形態において、医薬製剤は複数のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。実施形
態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは他の薬物または治療剤と組み合わせて投
与される。
＜被験体の処置＞
本明細書に提供される組成物のうちのいずれかが個体に投与されうる。「個体」は、「
被験体」または「患者」と互換的に使用されてもよい。個体は、哺乳動物、例えば、ヒト
、またはヒト以外の霊長類、げっ歯類、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ロバ、ヤギ、ネ
コ、イヌ、ウシ、ブタ、またはヒツジなどの動物であってもよい。実施形態では、個体は
ヒトである。実施形態では、個体は胎児、胚、または小児である。他の実施形態では、個
体は植物などの別の真核生物かもしれない。いくつかの実施形態では、本明細書で提供さ
れる化合物は細胞にエクスビボで投与される。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される組成物は、疾病または障害を処置する
方法として個体に投与される。いくつかの実施形態では、個体は、本明細書に記述された
いずれかの疾病などの遺伝病を有する。いくつかの実施形態では、個体は、本明細書に記
述されたいずれかの疾病などの疾病を有するリスクがある。いくつかの実施形態では、個
体は、不十分な量のタンパク質または不十分な活性のタンパク質により引き起こされる疾
病または障害を有するリスクが増大している。個体が、不十分な量のタンパク質または不
十分な活性のタンパク質により引き起こされる疾病または障害を有するリスクが増大して
いる場合、方法は防止的または予防的な処置を含む。例えば、個体は、その疾病の家族歴
のために、そのような疾病または障害を有するリスクが増大している場合がある。典型的
には、そのような疾病または障害を有するリスクが増大している個体は、予防的処置（例
えば、疾病または障害の発症または悪化を予防するかまたは遅らせることによる）から利
益を受ける。実施形態では、胎児は、例えばＡＳＯ組成物を胎児に対して直接または間接
的（例えば母を介して）に投与することにより、子宮内で処置される。
本発明のＡＳＯの投与に適切な経路は、ＡＳＯの送達が所望される細胞型に応じて変わ
りうる。多数の組織および器官はアラジールＡＤ知的障害５およびドラベ症候群によって
影響を受け、脳が最も著しく影響を受ける組織である。本発明のＡＳＯは、例えば、くも
膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射によ
り、患者に非経口的に投与されてもよい。
実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、当技術分野において知られて
いる任意の方法によって、血液脳関門を介する主題のアンチセンスオリゴヌクレオチドの
浸透を促進することができる１つ以上の薬剤と共に投与される。例えば、筋組織内の運動
ニューロンへアデノウイルスベクターを投与することによる薬剤の送達は、引用によって
本明細書に組み込まれる米国特許第６，６３２，４２７号「Ａｄｅｎｏｖｉｒａｌ－ｖｅ
ｃｔｏｒ－ｍｅｄｉａｔｅｄ ｇｅｎｅ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｉｎｔｏ ｍｅｄｕｌｌａｒｙ
ｍｏｔｏｒ ｎｅｕｒｏｎｓ」に記載されている。脳、例えば、線条体、視床、海馬、ま
たは黒質への直接のベクターの送達は、例えば、引用によって本明細書に組み込まれる米
国特許第６，７５６，５２３号「Ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ ｖｅｃｔｏｒｓ ｆｏｒ ｔｈｅ
ｔｒａｎｓｆｅｒ ｏｆ ｆｏｒｅｉｇｎ ｇｅｎｅｓ ｉｎｔｏ ｃｅｌｌｓ ｏｆ ｔｈｅ
ｃｅｎｔｒａｌ ｎｅｒｖｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ ｐａｒｔｉｃｕｌａｒｌｙ ｉｎ ｂｒａ
ｉｎ」に記載される。
実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、望ましい薬理学的性質または
薬力学的性質を提供する薬剤に結合されるか抱合される。実施形態において、アンチセン
スオリゴヌクレオチドは、血液脳関門を介する浸透または輸送を促進すると当技術分野に
おいて知られている物質、例えばトランスフェリン受容体の抗体に結合される。実施形態
において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、アンチセンス化合物をより効果
的にするために、または血液脳関門を介する輸送を増加させるためにウイルスベクターに
結合される。実施形態において、浸透性の血液脳関門の破壊は、砂糖、例えばメソエリス
リトール、キシリトール、Ｄ（＋）ガラクトース、Ｄ（＋）ラクトース、Ｄ（＋）キシロ
ース、ズルシトール、ミオ－イノシトール、Ｌ（－）フルクトース、Ｄ（－）マンニトー
ル、Ｄ（＋）グルコース、Ｄ（＋）アラビノース、Ｄ（－）アラビノース、セロビオース
、Ｄ（＋）マルトース、Ｄ（＋）ラフィノース、Ｌ（＋）ラムノース、Ｄ（＋）メリビオ
ース、Ｄ（－） リボース、アドニトール、Ｄ（＋）アラビトール、Ｌ（－）アラビトー
ル、Ｄ（＋）フコース、Ｌ（－）フコース、Ｄ（－）リキソース、Ｌ（＋）リキソース、
およびＬ（－）リキソース、または アミノ酸、例えばグルタミン、リジン、アルギニン
、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、
ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、セリン、トレオニン、チロシン、
バリン、およびタウリンを注入することにより促進される。血液脳関門の浸透性を増強す
るための方法および物質は、例えば、米国特許第９，１９３，９６９号「Ｃｏｍｐｏｓｉ
ｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｏｆ
ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ｔｏ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｎｅｕ
ｒｏｎ ｔｙｐｅｓ」、米国特許第４，８６６，０４２号「Ｍｅｔｈｏｄ ｆｏｒ ｔｈｅ
ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｍａｔｅｒｉａｌ ａｃｒｏｓｓ ｔｈｅ ｂｌｏ
ｏｄ ｂｒａｉｎ ｂａｒｒｉｅｒ」、米国特許第６，２９４，５２０号「Ｍａｔｅｒｉａ
ｌ ｆｏｒ ｐａｓｓａｇｅ ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｈｅ ｂｌｏｏｄ－ｂｒａｉｎ ｂａｒｒｉ
ｅｒ，” ａｎｄ Ｕ．Ｓ． Ｐａｔ． Ｎｏ． ６，９３６，５８９， ”Ｐａｒｅｎｔｅｒ
ａｌ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｓｙｓｔｅｍｓ」に記載されており、それぞれが引用によって本
明細書に取り込まれる。
実施形態では、本発明のＡＳＯは、例えば引用に本明細書に取り込まれる米国特許第９
，１９３，９６９号に記載されている方法を用いて、ドーパミン再取り込み阻害剤（ＤＲ
Ｉ）、選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）、ノルアドレナリン再取り込み阻
害剤（ＮＲＩ）、ノルエピネフリンドーパミン再取り込み阻害剤（ＮＤＲＩ）、およびセ
ロトニンノルエピネフリンドーパミン再取り込み阻害剤（ＳＮＤＲＩ）に結合される。
実施形態では、方法および組成物を用いて処置された被験体は、当技術分野において既
知であり記載されている任意の方法を使用して、状態の向上に関して評価される。
＜スプライシングを増強する追加のＡＳＯを識別する方法＞
本発明の範囲内にはまた、特に標的イントロンにおけるＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣまたは
ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体のスプライシングを増強する追加のＡＳＯを識別する
（判定する）方法が存在する。ｍＲＮＡ前駆体の標的領域内で様々なヌクレオチドを特異
的にハイブリダイズさせるＡＳＯは、標的イントロンのスプライシングの速度および／ま
たは程度を改善するＡＳＯを識別する（判定する）ためにスクリーニングされてもよい。
いくつかの実施形態では、ＡＳＯはスプライシング抑制因子／サイレンサーの結合部位で
ブロックまたは妨害することもある。当該技術分野において既知の任意の方法は、イント
ロンの標的領域にハイブリダイズされた時に所望の効果（例えばスプライシング、タンパ
ク質または機能性ＲＮＡの産生の向上）をもたらすＡＳＯを識別する（判定する）ために
使用されてもよい。これらの方法はまた、保持されたイントロンに隣接するエクソン中、
または保持されていないイントロン中の標的領域へ結合することにより、保持されたイン
トロンのスプライシングを増強するＡＳＯを識別するために使用することができる。使用
されうる方法の一例が下記に提供される。
ｍＲＮＡ前駆体の標的領域にハイブリダイズするように設計されたＡＳＯを用いて、Ａ
ＳＯ「ウォーク」（ｗａｌｋ）と呼ばれる１ラウンドのスクリーニングを行うこともある
。例えば、ＡＳＯウォークに使用されるＡＳＯは、保持されたイントロンの５’スプライ
ス部位の上流のおよそ１００ヌクレオチド（例えば、標的とされた／保持されたイントロ
ンの上流に位置するエクソンの配列の一部）から標的とされた／保持されたイントロンの
５’スプライス部位の下流のおよそ１００ヌクレオチドまで、および／または、保持され
たイントロンの３’スプライス部位の上流のおよそ１００ヌクレオチドから標的とされた
／保持されたイントロンの３’スプライス部位の下流のおよそ１００ヌクレオチド（例え
ば、標的とされた／保持されたイントロンの下流に位置するエクソンの配列の一部）まで
、５つのヌクレオチドごとに敷き詰められうる。例えば、長さが１５ヌクレオチドの第１
のＡＳＯは、標的とされた／保持されたイントロンの５’スプライス部位に対するヌクレ
オチド＋６から＋２０まで特異的にハイブリダイズするように設計されうる。第２のＡＳ
Ｏは、標的とされた／保持されたイントロンの５’スプライス部位に対するヌクレオチド
＋１１から＋２５まで特異的にハイブリダイズするように設計されている。ＡＳＯは、ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的領域に及ぶように設計されている。実施形態では、ＡＳＯは、より密
に、例えば、１、２、３、または４つのヌクレオチドごとに敷き詰められうる。さらに、
ＡＳＯは、５’スプライス部位の下流の１００ヌクレオチドから３’スプライス部位の上
流の１００ヌクレオチドまで敷き詰められうる。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、５
’スプライス部位の上流の約１，１６０ヌクレオチドから５’スプライス部位の下流の約
５００ヌクレオチドまで敷き詰められ得る。いくつかの実施形態では、ＡＳＯは、３’ス
プライス部位の上流の約５００ヌクレオチドから３’スプライス部位の下流の約１，９２
０ヌクレオチドまで敷き詰められ得る。
１つ以上のＡＳＯ、または１つの対照ＡＳＯ（標的領域にハイブリダイズするとは予期
されていない配列である、スクランブル配列を有するＡＳＯ）は、例えばトランスフェク
ションによって、標的ｍＲＮＡ前駆体（例えば、本明細書で別記されるＲＩＣ ｍＲＮＡ
前駆体）を発現する疾患関連の細胞株へと送達される。ＡＳＯの各々のスプライシングを
誘発する効果は、本明細書で記載されるように、当該技術分野で既知の方法、例えば、ス
プライスジャンクションに及ぶプライマーを使用する逆転写酵素（ＲＴ）－ＰＣＲによっ
て評価されうる（例えば実施例１を参照）。対照ＡＳＯ処理された細胞と比較して、ＡＳ
Ｏ処理された細胞におけるスプライスジャンクションに及ぶプライマーを使用して生成さ
れたＲＴ－ＰＣＲ産物が減少または欠如しているということは、標的イントロンのスプラ
イシングが増強されたことを示している。いくつかの実施形態では、スプライシング効率
、スプライシングされていないｍＲＮＡ前駆体に対するスプライシングされたｍＲＮＡ前
駆体の比率、スプライシングの速度、またはスプライシングの程度は、本明細書に記載の
ＡＳＯを使用して改善されうる。標的ｍＲＮＡ前駆体によってコード化されるタンパク質
または機能性ＲＮＡの量も、各ＡＳＯが所望の効果（例えば、タンパク質産生の増強）を
達成したかどうかを判定するために評価されうる。ウェスタンブロッティング、フローサ
イトメトリー、免疫蛍光顕微鏡検査法、およびＥＬＩＳＡなどの、タンパク質産生を評価
および／または定量するための当該技術分野で既知の方法も使用することができる。
ＡＳＯ「ミクロウォーク」（ｍｉｃｒｏ－ｗａｌｋ）と呼ばれる第２ラウンドのスクリ
ーニングは、ｍＲＮＡ前駆体の標的領域にハイブリダイズするように設計されたＡＳＯを
使用して実行されうる。ＡＳＯミクロウォークに使用されるＡＳＯは、ＡＳＯでハイブリ
ダイズされたときに結果的にスプライシングを増強させるｍＲＮＡ前駆体のヌクレオチド
酸配列をさらに改良する（ｒｅｆｉｎｅ）ために、１つのヌクレオチドごとに敷き詰めら
れる。
標的イントロンのスプライシングを促進するＡＳＯによって定義される領域は、１－ｎ
ｔのステップで間隔を置かれたＡＳＯ、ならびに典型的には１８－２５ｎｔであるより長
いＡＳＯを含む、ＡＳＯ「ミクロウォーク」によって、より詳細に調査される。
上記にＡＳＯウォークに関して記載されたように、１つ以上のＡＳＯ、または対照ＡＳ
Ｏ（標的領域にハイブリダイズすると予期されていない配列である、スクランブル配列を
有するＡＳＯ）を、例えばトランスフェクションによって、標的ｍＲＮＡ前駆体を発現す
る疾患関連細胞株へと送達することによって、ＡＳＯミクロウォークが実行される。ＡＳ
Ｏの各々のスプライシングを誘発する効果は、本明細書で記載されるように、当該技術分
野で既知の方法、例えば、スプライスジャンクションに及ぶプライマーを使用する逆転写
酵素（ＲＴ）－ＰＣＲによって評価されうる（例えば実施例１を参照）。対照ＡＳＯ処理
された細胞と比較して、ＡＳＯ処理された細胞におけるスプライスジャンクションに及ぶ
プライマーを使用して生成されたＲＴ－ＰＣＲ産物が減少または欠如しているということ
は、標的イントロンのスプライシングが増強されたことを示している。いくつかの実施形
態では、スプライシング効率、スプライシングされていないｍＲＮＡ前駆体に対するスプ
ライシングされたｍＲＮＡ前駆体の比率、スプライシングの速度、またはスプライシング
の程度は、本明細書に記載のＡＳＯを使用して改善されうる。標的ｍＲＮＡ前駆体によっ
てコード化されるタンパク質または機能性ＲＮＡの量も、各ＡＳＯが所望の効果（例えば
、タンパク質産生の増強）を達成したかどうかを判定するために評価されうる。ウェスタ
ンブロッティング、フローサイトメトリー、免疫蛍光顕微鏡検査法、およびＥＬＩＳＡな
どの、タンパク質産生を評価および／または定量するための当該技術分野で既知の方法も
使用することができる。
ｍＲＮＡ前駆体の領域にハイブリダイズされたときに、結果的にスプライシングを増強
させ、タンパク質産生を増加させるＡＳＯは、動物モデル、例えば、全長ヒト遺伝子がノ
ックインされたトランスジェニックマウスモデルまたは疾患のヒト化マウスモデルを使用
して、インビボで試験されうる。ＡＳＯの投与に適した経路は、ＡＳＯの送達が望まれる
疾患及び／又は細胞型に応じて変化しうる。ＡＳＯは、例えばくも膜下腔内注射、脳室内
注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射により投与されてもよい。
投与後に、モデル動物の細胞、組織、及び／又は臓器は、当該技術分野に既知の方法およ
び本明細書に記載される方法によって、例えば、スプライシング（効率、速度、程度）お
よびタンパク質産生を評価することにより、ＡＳＯ処置の効果を判定するために評価され
うる。動物モデルはまた、疾患または疾患重症度の表現型または行動的徴候でありうる。
本発明の好ましい実施形態が本明細書中に示され記述された一方、そのような実施形態
が一例としてしか提供されていないことは当業者にとって明白だろう。多くの変更、変化
、および置換が、本発明から逸脱することなく当業者に想到されるであろう。本明細書に
記載される本発明の実施形態の様々な代案が、本発明の実施において利用されることもあ
ることを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義するものであり、こ
の特許請求の範囲内の方法および構造およびそれらの同等物がそれによって包含されるこ
とが意図されている。
本発明は、以下の実施例によってより具体的に例証されるだろう。しかしながら、本発
明がいかなる方法においてもこれらの実施例によって限定されないことが理解されるべき
である。
＜実施例１：次世代配列決定を用いたＲＮＡｓｅｑによるＳＹＮＧＡＰ１転写産物のイン
トロン保持事象の特定＞
イントロン保持事象を特定するためにＳＹＮＧＡＰ１遺伝子によって生成された転写産
物のスナップショットを明らかにするために、次世代配列決定を使用して、全トランスク
リプトームショットガン配列決定を実行した。このために、ＨＣＮ（ヒト皮質ニューロン
）の核および細胞質の画分からのｐｏｌｙＡ＋ ＲＮＡを分離し、ＩｌｌｕｍｉｎａのＴ
ｒｕＳｅｑ Ｓｔｒａｎｄｅｄ ｍＲＮＡライブラリＰｒｅｐキットを用いてｃＤＮＡライ
ブラリを構築した。ライブラリに対してペア－エンド配列決定（ｐａｉｒ－ｅｎｄ ｓｅ
ｑｕｅｎｃｅ）を行い、結果として、ヒトゲノム（２００９年２月、ＧＲＣｈ３７／ｈｇ
１９アセンブリ）にマッピングされた１００ヌクレオチドの読み取りをもたらした。ＳＹ
ＮＧＡＰ１に対する配列決定の結果を、図３に示す。簡潔に言うと、図３は、ＵＣＳＣ
Ｇｅｎｏｍｅ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｇｒｏｕｐ （Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｍｏ
ｌｅｃｕｌａｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ ＆ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ， Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ
ｏｆ Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ， Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ， １１５６ Ｈｉｇｈ Ｓｔｒｅｅｔ
， Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ， ＣＡ ９５０６４）によって操作され、かつ、例えばＲｏｓｅ
ｎｂｌｏｏｍ， ｅｔ ａｌ．， ２０１５，”Ｔｈｅ ＵＣＳＣ Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｒｏｗｓ
ｅｒ ｄａｔａｂａｓｅ： ２０１５年アップデート，”Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅ
ｓｅａｒｃｈ ４３， Ｄａｔａｂａｓｅ Ｉｓｓｕｅ （ｄｏｉ： １０．１０９３／ｎａ
ｒ／ｇｋｕ１１７７）に記載された、ＵＣＳＣのゲノムブラウザを使用して視覚化されマ
ッピングされた読み取りを示し、読み取りの範囲および数はピーク信号によって推論され
うる。ピークの高さは、特定の領域における読取密度によって与えられた発現のレベルを
示している。ピークがＳＹＮＧＡＰ１エクソン領域およびイントロン領域に適合されるよ
うに、（読み取りシグナルの下の）ＵＣＳＣゲノムブラウザによってＳＹＮＧＡＰ１の模
式図（縮尺通りに描かれている）が提供される。このディスプレイに基づいて、ＨＣＮの
核分画において高い読み取り密度を持つが、これらの（図３の下のチャート中のイントロ
ン１５、および図５の下のチャート中のイントロン１８および１９に対して示されるよう
な）細胞の細胞質分画においては非常に低い読み取りしか持たないか、全く読み取りを持
たない、３つのイントロン（矢印により示される１５、１８および１９；それぞれ、ＮＭ
＿００６７７２イントロン１５、ＮＭ＿００６７７２イントロン１８、およびＮＭ＿００
６７７２イントロン１９に対応する）を識別した。このことは、これらのイントロンが保
持されること、および イントロン－１５、イントロン－１８およびイントロン－１９含
有転写産物は細胞核中に残存し、かつそれらが細胞質へと運び出されないため、これらの
保持されたＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は非産生的であることが示唆されるこ
とを示す。
＜実施例２：ＳＹＮＧＡＰ１のイントロン１５を標的とするＡＳＯウォークの設計＞
ＡＳＯウォークを、本明細書中（図４；表１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ： １５１０から１８
１４および２２８７から２５９１）に記載された方法を使用して、イントロン１５を標的
とするよう設計した。ヌクレオチド＋２５１から－１，０５４ｅに及ぶ、イントロン１５
の５’スプライス部位のすぐ上流および下流の領域、およびヌクレオチド－２５６から＋
１５７ｅに及ぶイントロン１５の３’スプライス部位のすぐ上流および下流の領域が、保
持されたイントロン１５ ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的とするようにＡ
ＳＯを設計するために利用される。表１は、設計された例示的なＡＳＯおよびそれらの標
的配列を列挙する。この設計から、５ヌクレオチド間隔だけシフトした２’－Ｏ－ＭｅＲ
ＮＡ、ＰＳ骨格、１８－ｍｅｒ ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１－タンパク質産生を増加させ
るためにＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的化するよう産生され、利用される
（図４および図７Ｂを参照）。
Figure 2022062140000002
＜実施例３：ＳＹＮＧＡＰ１のイントロン１８および１９を標的とするＡＳＯウォークの
設計＞
ＡＳＯウォークを、本明細書中（図６；表１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８１５から２２８
６および１０３８から１５０９）に記載された方法を使用して、イントロン１８および１
９を標的とするよう設計した。ヌクレオチド＋４９９から－７３ｅに及ぶ、イントロン１
８の５’スプライス部位のすぐ上流および下流の領域、およびヌクレオチド－４９６から
＋１，９１２ｅに及ぶイントロン１９の３’スプライス部位のすぐ上流および下流の領域
を、保持されたイントロン１８または１９ ＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標
的とするようにＡＳＯを設計するために利用した。表１は、設計された例示的なＡＳＯお
よびそれらの標的配列を列挙する。この設計から、５ヌクレオチド間隔だけシフトした２
’－Ｏ－ＭｅＲＮＡ、ＰＳ骨格、１８－ｍｅｒ ＡＳＯは、ＳＹＮＧＡＰ１－タンパク質
産生を増加させるためにＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的化するよう産生さ
れ、利用される（図６および図７Ｄ－Ｅを参照）。代替的なエクソン１９に隣接するスプ
ライス部位のイントロン領域は、エクソン１９の包含レベルに影響を与えることを回避す
るために標的としない。
＜実施例４：ＳＹＮＧＡＰ１イントロン１５、１８、または１９のＡＳＯ標的による改善
されたスプライシング効率は、転写産物のレベルを増加させる＞
ＡＳＯを用いた標的遺伝子のイントロンのスプライシング効率の増加を測定するために
、本明細書において記載される方法を使用した。ヒト網膜上皮細胞株であるＡＲＰＥ－１
９細胞（アメリカ培養細胞系統保存機関（ＡＴＣＣ）（ＵＳＡ））を、偽トランスフェク
トするか、または実施例２および３に記載される標的ＡＳＯを用いてトランスフェクトし
た。細胞を、供給業者の仕様書に従って、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭａｘ
トランスフェクション試薬（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）を用いてトランスフェクトし
た。簡潔に述べると、ＡＳＯを９６ウェル組織培養プレートに播種し、Ｏｐｔｉ－ＭＥＭ
で希釈したＲＮＡｉＭａｘと組み合わせた。トリプシンを用いて細胞を剥離し、完全培地
中で再懸濁し、約２５，０００個の細胞をＡＳＯトランスフェクション混合物に加えた。
トランスフェクション実験は３通りのプレート複製において実行された。最終的なＡＳＯ
濃度は８０ｎＭであった。供給業者の仕様書に従って、培地をトランスフェクションの６
時間後に交換し、ＤＮＡｓｅ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）を補充したＣｅｌｌｓ－ｔ
ｏ－Ｃｔ溶解試薬を用いて、細胞を２４時間で回収した。供給業者の仕様書に従い、ｃＤ
ＮＡをＣｅｌｌｓ－ｔｏ－Ｃｔ ＲＴ試薬（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で生成した。対
象のイントロンでスプライシングする量を定量化するために、対応するエクソン－エクソ
ン連結（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）に及ぶプローブでＴａｑｍａｎアッセイを用いて
、定量ＰＣＲを実施した。Ｔａｑｍａｎアッセイを、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ ７Ｆｌｅ
ｘ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲシステム（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）上の供給業者の
仕様書に従い実行した。標的遺伝子アッセイ値を、ＲＰＬ３２（ΔＣｔ）およびプレート
適合偽トランスフェクションサンプル（ΔΔＣｔ）に対して正規化し、モック定量（２＾
－（ΔΔＣｔ）に対して倍数変化を生成した。保持されたイントロン１５を標的とするＡ
ＳＯに関する３通りのプレート複製のモックに対する平均倍率変化は、図７Ｂにプロット
されている。位置－３１および－３６に対して標的とされたＡＳＯにより、＞１．５倍増
加した標的遺伝子発現が示され、これによりこの標的イントロンにおけるスプライシング
の増加が示唆された。保持されたイントロン１８を標的とするＡＳＯに関する３通りのプ
レート複製のモックに対する平均倍率変化は、図７Ｄにプロットされている。位置－３６
および－４１に対して標的とされたＡＳＯにより、＞～２倍増加した標的遺伝子発現が示
され、これによりこの標的イントロンにおけるスプライシングの増加が示唆された。保持
されたイントロン１９を標的とするＡＳＯに関する３通りのプレート複製のモックに対す
る平均倍率変化は、図７Ｅにプロットされている。位置－５５および－６０に対して標的
とされたＡＳＯにより、＞２倍増加した標的遺伝子発現が示され、これによりこの標的イ
ントロンにおけるスプライシングの増大が示唆された。標的イントロン（実施例１）の保
持を確認する全トランスクリプトームデータと共に、これらの結果は、ＡＳＯが比率制限
イントロンのスプライシング効率を改善し得ることを確認する。
＜実施例５：次世代配列を使用するＲＮＡｓｅｑによるＳＣＮ１Ａ転写産物におけるイン
トロン保持事象の特定＞
ＳＣＮ１Ａイントロン２１の保持を、図８Ｃに記載のＲＴ－ＰＣＲアッセイを使用して
確認した。イントロン２１は、核分画におけるバンドの存在により示されるＳＫＮ－ＡＳ
細胞およびＲｅｎＣｅｌｌ ＶＭ細胞において保持される。
＜実施例６：ＳＹＮＧＡＰ１のイントロン２１を標的とするＡＳＯウォークの設計＞
ＡＳＯウォークを、本明細書中（表２、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６６および５２４
－１０３７）に記載された方法を使用して、イントロン２１を標的とするよう設計した。
ヌクレオチド－２６４ｅから＋４９６に及ぶイントロン２１の５’スプライス部位のすぐ
上流および下流の領域、およびヌクレオチド－４９６から＋３７ｅに及ぶイントロン２１
の３’スプライス部位のすぐ上流および下流の領域を、保持されたイントロン２１ ＳＣ
Ｎ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的とするようにＡＳＯを設計するために利用した。表
２は、設計された例示的なＡＳＯおよびそれらの標的配列を列挙する。この設計から、５
ヌクレオチド間隔だけシフトした２’－Ｏ－ＭｅＲＮＡ、ＰＳ骨格、１８－ｍｅｒ ＡＳ
Ｏは、ＳＣＮ１Ａ－タンパク質産生を増加させるためにＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体を標的化するよう産生され、利用される（図８Ｄ－Ｅおよび表３－４を参照）。
Figure 2022062140000003
Figure 2022062140000004
Figure 2022062140000005
＜実施例７：ＳＣＮ１ＡのＡＳＯウォーク標的イントロン２３の設計＞
ＡＳＯウォークは、本明細書中（表２、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２３）に記載さ
れた方法を使用して、イントロン２３を標的とするよう設計されうる。ヌクレオチド－２
６４ｅから＋４９６に及ぶイントロン２３の５’スプライス部位のすぐ上流および下流の
領域、およびヌクレオチド－４９６から＋３７ｅに及ぶイントロン２３の３’スプライス
部位のすぐ上流および下流の領域を、保持されたイントロン２３ ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体を標的とするようにＡＳＯを設計するために利用する。表２は、設計された
例示的なＡＳＯおよびそれらの標的配列を列挙する。この設計から、５ヌクレオチド間隔
だけシフトした２’－Ｏ－ＭｅＲＮＡ、ＰＳ骨格、１８－ｍｅｒ ＡＳＯを産生し、ＳＣ
Ｎ１Ａタンパク質産生を増加させるために、ＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体を標的化
するよう利用することができる。
＜実施例８：ＳＣＮ１Ａ保持イントロンのＡＳＯ標的による改善したスプライシング効率
のは、転写レベルを増加させる＞
ＡＳＯを使用してＳＣＮ１Ａイントロン２１のスプライシング効率を向上させることに
よってＳＣＮ１Ａ発現の増大を達成することができるかを判定するために、ＲＴ－ＰＣＲ
製品をＴａｑｍａｎ ＲＴ－ｑＰＣＲにより評価する。その目的のために、ＲＮＡｉＭＡ
Ｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）送達試薬を独立して使用し、細胞を偽トランスフェクトする
か、または表３のイントロン２１に関して記載されるＡＳＯを用いてトランスフェクトす
る。実験を、２４時間にわたって８０ｎＭのＡＳＯを使用して実施される。対象のイント
ロンでスプライシングする量を定量化するために、対応するエクソン－エクソン連結（Ｔ
ｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）に及ぶプローブでＴａｑｍａｎアッセイを用いて、定量ＰＣ
Ｒを実施した。Ｔａｑｍａｎアッセイを、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ ７Ｆｌｅｘ Ｒｅａｌ
－Ｔｉｍｅ ＰＣＲシステム（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）上の供給業者の仕様書に従い
実行した。標的遺伝子アッセイ値を、ＲＰＬ３２（ΔＣｔ）およびプレート適合偽トラン
スフェクションサンプル（ΔΔＣｔ）に対して正規化し、モック定量（２＾－（ΔΔＣｔ
））に対して倍数変化を生成した。３通りのプレート複製のモック（ｍｏｃｋ）に対する
平均倍数変化を図８Ｄ－Ｅにプロットする。いくつかのＡＳＯは、標的遺伝子発現を＞～
１．２５倍増加させると識別され、それによって、その標的イントロンにおけるスプライ
シングの増加が示唆された。
本発明の好ましい実施形態が本明細書中に示され記述された一方、そのような実施形態
が一例としてしか提供されていないことは当業者にとって明白だろう。多くの変更、変化
、および置換が、本発明から逸脱することなく当業者に想到されるであろう。本明細書に
記載される本発明の実施形態の様々な代案が、本発明の実施において利用されることもあ
ることを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義するものであり、こ
の特許請求の範囲内の方法および構造およびそれらの同等物がそれによって包含されるこ
とが意図されている。
本明細書は以下の発明の態様を包含する。
［１］
被験体の細胞により標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させることによっ
て被験体の常染色体優性精神遅滞－５（ＭＲＤ５）またはドラベ症候群（ＤＳ）を処置す
る方法であって、
ここで、細胞は、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
）を有し、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣
接しているエクソン、および３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードし、
前記方法は、
被験体の細胞を、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、
それによって、保持されたイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードす
るＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞
内で、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標
的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させる、方法。
［２］
保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有している細
胞によってＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａである標的タンパク質の発現を増加させる方
法であって、
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプ
ライス部位に隣接しているエクソン、および保持されたイントロンの３’スプライス部位
に隣接しているエクソンを含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ１また
はＳＣＮ１Ａタンパク質をコードし、
前記方法は、
細胞を、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、
それによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を
コードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、細胞
内で、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加
させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させる、方法。
［３］
前記方法はＭＲＤ５を処置する方法であり、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１であり、
あるいは、前記方法はＤＳを処置する方法であり、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、
［１］に記載の方法。
［４］
標的タンパク質または機能的ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足している
標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡを機能的に増大させるか、これに取って代わる、補
償タンパク質あるいは補償機能的ＲＮＡである、［１］に記載の方法。
［５］
細胞は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量または活性の不足によって引
き起こされた疾病を有する被験体内にあるかまたは被験体に由来する、［２］に記載の方
法。
［６］
標的タンパク質の量の不足は、標的タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、こ
こで被験体は、機能的な標的タンパク質をコードする第１の対立遺伝子、標的タンパク質
が生成されない第２の対立遺伝子、または非機能的な標的タンパク質をコードする第２の
対立遺伝子を有し、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合する、［１］－［５］のいずれか１つに記載の方法。
［７］
被験体は、標的タンパク質の量または機能の不足に起因する障害により引き起こされた
疾病を抱えており、
ここで、被験体は、
（ａ）
（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生
成され、
（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生
成され、あるいは、
（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
第１の変異対立遺伝子と、
（ｂ）
（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生
成され、
（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生
成され、あるいは、
（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
第２の変異対立遺伝子とを有し、
ここで、被験体が第１の変異対立遺伝子（ａ）（ｉｉｉ）を有するとき、第２の変異対立
遺伝子は（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）であり、ここで、被験体が第２の変異対立
遺伝子（ｂ）（ｉｉｉ）を有するとき、第１の変異対立遺伝子は（ａ）（ｉ）あるいは（
ａ）（ｉｉ）であり、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）
（ｉｉ）である第１の変異対立遺伝子、および／または、（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（
ｉｉ）である第２の変異対立遺伝子から転写される、［１］－［５］のいずれか１つに記
載の方法。
［８］
標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、機能が低下した形態で生成さ
れる、［７］に記載の方法。
［９］
標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、十分に機能的な形態で生成さ
れる、［７］に記載の方法。
［１０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に
対して＋６～保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の
保持されたイントロンにある、［１］－［９］のいずれか１つに記載の方法。
［１１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、ある
いは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、
の内部の保持されたイントロンにある、［１］－［９］のいずれか１つに記載の方法。
［１２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
ｅの領域、あるいは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
ｅの領域、
の内部にある、［１］－［９］のいずれか１つに記載の方法。
［１３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領
域、
（ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、
（ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、あ
るいは、
（ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領
域、
の内部にある、［１］－［９］のいずれか１つに記載の方法。
［１４］
標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、［１］－［１３］のいずれか１つに記載の方法。
［１５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４－７のいずれか１つに少なくとも
約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配
列を含む、［１４］に記載の方法。
［１６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、
９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコ
ードされる、［１４］に記載の方法。
［１７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９３の少なくとも８
つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、［１４］に記載の方法。
［１８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１４］に
記載の方法。
［１９］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２１の３
’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［２０］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６６または５２４－１０３７のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む、［１９］に記載の方法。
［２１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［２２］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３
３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１
００％相補的な配列を含む、［２１］に記載の方法。
［２３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、［１４］に記載
の方法。
［２４］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９
３２のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは
１００％相補的な配列を含む、［２３］に記載の方法。
［２５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、［１４］に記
載の方法。
［２６］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２５８、６７６－７７２、あるいは９３３－
１０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
いは１００％相補的な配列を含む、［２５］に記載の方法。
［２７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［２８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０３０
－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％相補的な配列を含む、［２７］に記載の方法。
［２９］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２３の３
’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［３０］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［２９］に
記載の方法。
［３１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［３２］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［３１］に
記載の方法。
［３３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、［１４］に記載
の方法。
［３４］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［３３］に
記載の方法。
［３５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、［１４］に記
載の方法。
［３６］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［３５］に
記載の方法。
［３７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、［１４］に記載の方法。
［３８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［３７］に
記載の方法。
［３９］
標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１である、［１］－［１３］のいずれか１つに記載の方
法。
［４０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８または９に少なくとも約８０％、
８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、
［３９］に記載の方法。
［４１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に少なくとも約８０％、
８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列に
よってコードされる、［３９］に記載の方法。
［４２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２、２５９４、ま
たは２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、
９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、［３９］
に記載の方法。
［４３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１のいずれか１つに少なくとも約８
０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［３９
］に記載の方法。
［４４］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して－７３ｅ～＋４９９までの領域内、あるいは保持されたイントロン１９の３’
スプライス部位に対して－４９６～＋１９１２ｅの領域内にある、［３９］に記載の方法
。
［４５］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９または１８１５－２２８６のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［４４］に記載の方法。
［４６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して－７３ｅ～－４ｅの領域内にある、［３９］に記載の方法。
［４７］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１０５０または１８１５－１８２７のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［４４］に記載の方法。
［４８］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にある、［３９］に記載
の方法。
［４９］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６または１８２８－１９１３のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［４８］に記載の方法。
［５０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン１９にある、［３９］に記
載の方法。
［５１］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［５０］に記載の方法。
［５２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
位に対して＋１７ｅ～＋１９１２ｅの領域内にある、［３９］に記載の方法。
［５３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２９－１５０９または２００６－２２８６のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［５２］に記載の方法。
［５４］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して－１０５４ｅ～＋２５１までの領域内、あるいは保持されたイントロン１５の
３’スプライス部位に対して－２５６～＋１５７ｅの領域内にある、［３９］に記載の方
法。
［５５］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１８１４または２２８７－２５９１のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［５４］に記載の方法。
［５６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある、［３９］に記載の方法。
［５７］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［５６］に記載の方法。
［５８］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して＋６～＋２５１の領域内の保持されたイントロン１５にある、［３９］に記載
の方法。
［５９］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６８７－１７３６または２４６４－２５１３のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［５８］に記載の方法。
［６０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
位に対して－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５にある、［３９］に記
載の方法。
［６１］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７８５または２５１４－２５６２のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［６０］に記載の方法。
［６２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある、［３９］に記載の方法。
［６３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいず
れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
補的な配列を含む、［６２］に記載の方法。
［６４］
アンチセンスオリゴマーは、機能的ＲＮＡまたは標的タンパク質をコードする遺伝子か
ら転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより、標的タンパ
ク質または機能的ＲＮＡの量を増加させない、［１］－［６３］のいずれか１つに記載の
方法。
［６５］
アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の
突然変異に起因する異常なスプライシングを調節することにより、標的タンパク質または
機能的ＲＮＡの量を増加させない、［１］－［６４］のいずれか１つに記載の方法。
［６６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシング、または
野生型のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシングによって生成された、［１］－［６５
］のいずれか１つに記載の方法。
［６７］
標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長の成熟ｍＲＮＡ、あ
るいは野生型の成熟ｍＲＮＡである、［１］－［６６］のいずれか１つに記載の方法。
［６８］
生成された標的タンパク質は全長のタンパク質あるいは野生型のタンパク質である、［
１］－［６７］のいずれか１つに記載の方法。
［６９］
アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞において生成された標的タンパク質または機
能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量は、対照細胞において生成された標的タンパク質
または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量と比較して、約１．１～約１０倍、約１
．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、約４～約１０倍、約１．１～約５倍
、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～約８倍、約１．１～約９倍、約２～
約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍、約２～約９倍、約３～約６倍、約
３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約７倍、約４～約８倍、約４～約９倍
、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．
５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍
、あるいは少なくとも約１０倍増加する、［１］－［６８］のいずれか１つに記載の方法
。
［７０］
アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞によって生成された標的タンパク質の総量は
、対照細胞によって生成された標的タンパク質の総量と比較して、約１．１～約１０倍、
約１．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、約４～約１０倍、約１．１～約
５倍、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～約８倍、約１．１～約９倍、約
２～約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍、約２～約９倍、約３～約６倍
、約３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約７倍、約４～約８倍、約４～約
９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約
２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約
５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する、［１］－［６９］のいずれか１つに記載の
方法。
［７１］
アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
を含む骨格修飾を含む、［１］－［７０］のいずれか１つに記載の方法。
［７２］
アンチセンスオリゴマーはホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド
核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、あるいは２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
む、［１］－［７１］のいずれか１つに記載の方法。
［７３］
アンチセンスオリゴマーは少なくとも１つの修飾された糖部を含む、［１］－［７２］
のいずれか１つに記載の方法。
［７４］
それぞれの糖部は修飾された糖部である、［７３］に記載の方法。
［７５］
アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
塩基、１２～２０の核酸塩基、あるいは１２～１５の核酸塩基からなる、［１］－［７４
］のいずれか１つに記載の方法。
［７６］
アンチセンスオリゴマーは、タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部
分に少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少な
くとも９８％、少なくとも９９％、あるいは１００％相補的である、［１］－［７５］の
いずれか１つに記載の方法。
［７７］
細胞は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保
持されたイントロンを含み、および、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の集団で最も豊富な保持されたイントロンに結合する、［１］－［７６］のい
ずれか１つに記載の方法。
［７８］
最も豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的タン
パク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集
団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、［７７］
に記載の方法。
［７９］
細胞は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ
ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保
持されたイントロンを含み、および、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲ
ＮＡ前駆体の集団で２番目に豊富な保持されたイントロンに結合する、［１］－［７８］
のいずれか１つに記載の方法。
［８０］
２番目に豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的
タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、［７
９］に記載の方法。
［８１］
前記方法はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現を評価する工程をさらに含
む、［１］－［８０］のいずれか１つに記載の方法。
［８２］
ＭＲＤ５は処置され、および、アンチセンスオリゴマーはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍ
ＲＮＡ前駆体の標的部分へ結合し、標的部分はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１
から選択される配列内にあり、あるいは、ＤＳが処置され、および、アンチセンスオリゴ
マーはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分へ結合し、標的部分はＳＥＱ Ｉ
Ｄ ＮＯ：１０－１０３７から選択される配列内にある、［１］－［８１］のいずれか１
つに記載の方法。
［８３］
被験体はヒトである、［１］－［８２］のいずれか１つに記載の方法。
［８４］
被験体はヒト以外の動物である、［１］－［８２］のいずれか１つに記載の方法。
［８５］
被験体は胎児、胚、あるいは子供である、［１］－［８３］のいずれか１つに記載の方
法。
［８６］
細胞はエクスビボである、［１］－［８５］のいずれか１つに記載の方法。
［８７］
アンチセンスオリゴマーは、被験体のくも膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋
肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって投与される、［１］－［８６］のいず
れか１つに記載の方法。
［８８］
５’スプライス部位に隣接するエクソンの－３ｅ～－１ｅと、保持されたイントロンの
＋１～＋６にある９つのヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、［１］－［
８７］のいずれか１つに記載の方法。
［８９］
保持されたイントロンの－１５～－１と３’スプライス部位に隣接するエクソンの＋１
ｅにある１６のヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、［１］－［８８］の
いずれか１つに記載の方法。
［９０］
［１］－［８９］のいずれか１つの方法で使用されるアンチセンスオリゴマー。
［９１］
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８
５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含むアン
チセンスオリゴマー。
［９２］
［９０］または［９１］のアンチセンスオリゴマー、および薬学的に許容可能な賦形剤
、希釈剤、あるいは担体を含む医薬組成物。
［９３］
くも膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内
注射によって［９２］の医薬組成物を投与することにより被験体を処置する方法。
［９４］
不足しているタンパク質または不足している機能的ＲＮＡに関係する被験体のＭＲＤＤ
５またはＤＳを処置するために細胞によって標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を
増加させる方法で使用するためのアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
ここで、不足しているタンパク質または不足している機能的ＲＮＡは、被験体において
量あるいは活性が不足しており、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能
的ＲＮＡをコードする、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前
駆体）の構成的のスプライシングを増強し、
ここで、標的タンパク質は、
（ａ）不足しているタンパク質、あるいは、
（ｂ）被験体において不足しているタンパク質を機能的に増大させるか、これに取って代
わる、補償タンパク質であり、
ここで、機能的ＲＮＡは、
（ｃ）不足しているＲＮＡ、あるいは、
（ｄ）被験体の不足している機能的ＲＮＡを機能的に増大するか、これに取って代わる、
補償機能的ＲＮＡであり、
ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接
するエクソン、および３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、ここで、保持され
たイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体からスプライシングされ、それによって、被験体の標的タンパク質あるいは機能的ＲＮ
Ａの生成あるいは活性を増加させる、組成物。
［９５］
被験体においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質に関連した疾病を処置する
方法で使用されるアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
当該方法は、被験体の細胞によりＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を
増加させる工程であって、細胞が保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’ス
プライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接す
るエクソンを含む、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
）を有し、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体がＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク
質をコードする、工程と、アンチセンスオリゴマーに細胞を接触させる工程であって、こ
れによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコ
ードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体転写産物から構成的にスプライシングされ、それにより
、被験体の細胞においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮ
Ａのレベルを増加させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させる
、工程とを含む、組成物。
［９６］
疾病は疾患または障害である、［９５］に記載の組成物。
［９７］
疾患または障害はＡＤ精神遅滞５あるいはドラベ症候群である、［９６］に記載の組成
物。
［９８］
標的タンパク質とＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ遺伝子に
よってコードされる、［９７］に記載の組成物。
［９９］
アンチセンスオリゴマーは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６
から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の保持さ
れたイントロンにあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、［９４］－［９８］
のいずれか１つに記載の組成物。
［１００］
アンチセンスオリゴマーはＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とし、これは、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、ある
いは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、
の内部の保持されたイントロンにある、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の組成
物。
［１０１］
アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの保持されたイントロンの５’スプライス
部位の約１００ヌクレオチド下流から、少なくとも１つの保持されたイントロンの３’ス
プライス部位の約１００ヌクレオチド上流までの領域内にあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の
一部を標的とする、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の組成物。
［１０２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
ｅの領域、あるいは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
ｅの領域、
の内部にある、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の組成物。
［１０３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領
域、
（ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、
（ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、あ
るいは、
（ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領
域、
の内部にある、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の組成物。
［１０４］
標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の組成
物。
［１０５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４－７のいずれか１つに少なくとも
約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配
列を含む、［１０４］に記載の組成物。
［１０６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、
９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコ
ードされる、［１０４］に記載の組成物。
［１０７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９３の少なくとも８
つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、［１０４］に記載の組成物。
［１０８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１０４］
に記載の組成物。
［１０９］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２１の３
’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成
物。
［１１０］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６６または５２４－１０３７のいずれか１つ
に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
列を含む、［１０９］に記載の組成物。
［１１１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成物。
［１１２］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３
３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１
００％相補的な配列を含む、［１１１］に記載の組成物。
［１１３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、［１０４］に記
載の組成物。
［１１４］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９
３２のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは
１００％相補的な配列を含む、［１１３］に記載の組成物。
［１１５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、［１０４］に
記載の組成物。
［１１６］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２５８、６７６－７７２、あるいは９３３－
１０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
いは１００％相補的な配列を含む、［１１５］に記載の組成物。
［１１７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成物。
［１１８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０３０
－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
るいは１００％相補的な配列を含む、［１１７］に記載の組成物。
［１１９］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２３の３
’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成
物。
［１２０］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１１９］
に記載の組成物。
［１２１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成物。
［１２２］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１２１］
に記載の組成物。
［１２３］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、［１０４］に記
載の組成物。
［１２４］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１２３］
に記載の組成物。
［１２５］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、［１０４］に
記載の組成物。
［１２６］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１２５］
に記載の組成物。
［１２７］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、［１０４］に記載の組成物。
［１２８］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、［１２７］
に記載の組成物。
［１２９］
標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１である、［９４］－［９８］のいずれか１つに記載の
組成物。
［１３０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８または９に対して少なくとも約８
０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含
む、［１２９］に記載の組成物。
［１３１］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に対して少なくとも約８
０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた遺伝子配
列によってコードされる、［１２９］に記載の組成物。
［１３２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２、２５９４、ま
たは２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に対して少なくとも８０％、８
５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含む、［１
２９］に記載の組成物。
［１３３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１のいずれか１つに対して少なくと
も約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％相補的な配列を含む、［
１２９］に記載の組成物。
［１３４］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して－７３ｅ～＋４９９の領域内、あるいは保持されたイントロン１９の３’スプ
ライス部位に対して－４９６～＋１９１２ｅの領域内に存在する、［１２９］に記載の組
成物。
［１３５］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９または１８１５－２２８６のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１３４］に記載の組成物。
［１３６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して－７３ｅ～－４ｅの領域内にある、［１２９］に記載の組成物。
［１３７］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１０５０または１８１５－１８２７のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１３６］に記載の組成物。
［１３８］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
位に対して＋６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にある、［１２９］に記
載の組成物。
［１３９］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６または１８２８－１９１３のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１３８］に記載の組成物。
［１４０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン１９にある、［１２９］に
記載の組成物。
［１４１］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１４０］に記載の組成物。
［１４２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
位に対して＋１７ｅ～＋１９１２ｅの領域内にある、［１２９］に記載の組成物。
［１４３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２９－１５０９または２００６－２２８６のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１４２］に記載の組成物。
［１４４］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して－１０５４ｅ～＋２５１の領域内、あるいは保持されたイントロン１５の３’
スプライス部位に対して－２５６～＋１５７ｅの領域内に存在する、［１２９］に記載の
組成物。
［１４５］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１８１４または２２８７－２５９１のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１４４］に記載の組成物。
［１４６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある、［１２９］に記載の組成物。
［１４７］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１４６］に記載の組成物。
［１４８］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
位に対して＋６～＋２５１の領域内の保持されたイントロン１５にある、［１２９］に記
載の組成物。
［１４９］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６８７－１７３６または２４６４－２５１３のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１４８］に記載の組成物。
［１５０］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
位に対して－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５にある、［１２９］に
記載の組成物。
［１５１］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７８５または２５１４－２５６２のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１５０］に記載の組成物。
［１５２］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
位に対して＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある、［１２９］に記載の組成物。
［１５３］
ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいず
れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
％相補的な配列を含む、［１５２］に記載の組成物。
［１５４］
アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子か
ら転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより標的タンパク
質または機能的ＲＮＡの量を増加させない、［９４］－［１５３］のいずれか１つに記載
の組成物。
［１５５］
アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の
突然変異から結果として生じる異常スプライシングを調節することにより標的タンパク質
または機能的ＲＮＡの量を増加させない、［９４］－［１５４］のいずれか１つに記載の
組成物。
［１５６］
ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長ｍＲＮＡ前駆体または野生型ｍＲＮＡ前駆体からの部
分的スプライシングによって生成された、［９４］－［１５５］のいずれか１つに記載の
組成物。
［１５７］
標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長成熟ｍＲＮＡまたは
野生型成熟ｍＲＮＡである、［９４］－［１５６］のいずれか１つに記載の組成物。
［１５８］
生成される標的タンパク質は、全長タンパク質または野生型タンパク質である、［９４
］－［１５７］のいずれか１つに記載の組成物。
［１５９］
保持されたイントロンは、律速イントロンである、［９４］－［１５８］のいずれか１
つに記載の組成物。
［１６０］
前記保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において最も豊富な保持さ
れたイントロンである、［９４］－［１５８］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６１］
保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において２番目に豊富な保持さ
れたイントロンである、［９４］－［１５９］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６２］
アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
を含む骨格修飾を含む、［９４］－［１６１］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６３］
アンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、［９４］－［１
６２］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６４］
アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチ
ド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
む、［９４］－［１６３］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６５］
アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、［９４］－［１
６４］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６６］
それぞれの糖部は、修飾された糖部である、［１６５］に記載の組成物。
［１６７］
アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩基からなる、［９４］－［１６
６］のいずれか１つに記載の組成物。
［１６８］
［９４］－［１６７］の組成物のいずれかのアンチセンスオリゴマーと、薬学的に許容
可能な賦形剤、希釈剤、または担体とを含む医薬組成物。
［１６９］
髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射によ
って［１６８］の医薬組成物を投与することにより、被験体を処置する方法。
［１７０］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物の標的配列にハイブリダイズす
るアンチセンスオリゴマーであって、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写
産物が保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーがＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮ
ＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物からの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘
発する、アンチセンスオリゴマーと、
薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、または担体と、
を含む、医薬組成物。
［１７１］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧ
ＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、［１７０］に記載の医薬組成物。
［１７２］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、
保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋
５００から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－５００の領域内にあ
る、［１７０］または［１７１］に記載の医薬組成物。
［１７３］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ＳＥＱ Ｉ
Ｄ ＮＯ：１－３のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％
、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列に
よりコードされる、［１７０］または［１７１］に記載の医薬組成物。
［１７４］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ＳＥＱ Ｉ
Ｄ ＮＯ：４－９のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％
、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含む、
［１７０］または［１７１］に記載の医薬組成物。
［１７５］
アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
を含む骨格修飾を含む、［１７０］に記載の医薬組成物。
［１７６］
アンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、［１７０］に記
載の医薬組成物。
［１７７］
アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチ
ド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
む、［１７０］に記載の医薬組成物。
［１７８］
アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、［１７０］に記
載の医薬組成物。
［１７９］
アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩基を含む、［１７０］に記載の
医薬組成物。
［１８０］
アンチセンスオリゴマーは、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
体の転写産物の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、
少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％相補的である
、［１７０］または［１７１］に記載の医薬組成物。
［１８１］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２－２５９５から選択される配列内にある、［１７０］また
は［１７１］に記載の医薬組成物。
［１８２］
アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対
して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、
９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、［
１７０］に記載の医薬組成物。
［１８３］
アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１から選択されるヌク
レオチド配列を含む、［１７０］に記載の医薬組成物。
［１８４］
医薬組成物は、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射または静
脈内注射のために製剤される、［１７０］－［１８３］のいずれか１つに記載の医薬組成
物。
［１８５］
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコードする十分に処理された
ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物を生成するために、保持されたイ
ントロンの除去を促進するように、不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲ
ＮＡの転写産物の処理を誘発する方法であって、
前記方法は、
（ａ）アンチセンスオリゴマーを被験体の標的細胞と接触させる工程、
（ｂ）不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物にアンチセン
スオリゴマーをハイブリダイズする工程であって、ここで、不足しているＳＣＮ１Ａまた
はＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質
の機能形態をコードすることができ、かつ少なくとも１つの保持されたイントロンを含む
、工程、
（ｃ）ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコードする十分に処理さ
れたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物を生成するために、不足して
いるＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物から少なくとも１つの保持さ
れたイントロンを除去する工程、および、
（ｄ）十分に処理されたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物からＳＣ
Ｎ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態を翻訳する工程を含む、方法。
［１８６］
保持されたイントロンは、保持されたイントロン全体である、［１８５］に記載の方法
。
［１８７］
不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１Ａま
たはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、［１８５］に記載の方法。
［１８８］
不足している量または活性のＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質により引き起
こされる疾病を患う被験体を処置する方法であって、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８
５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、ま
たは９９％の配列同一性を備えたヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴマーを被験
体に投与する工程を含む、方法。

Claims (188)

  1. 被験体の細胞により標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させることによっ
    て被験体の常染色体優性精神遅滞－５（ＭＲＤ５）またはドラベ症候群（ＤＳ）を処置す
    る方法であって、
    ここで、細胞は、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
    ）を有し、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣
    接しているエクソン、および３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ＲＩＣ
    ｍＲＮＡ前駆体は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードし、
    前記方法は、
    被験体の細胞を、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前
    駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、
    それによって、保持されたイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードす
    るＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞
    内で、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標
    的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を増加させる、方法。
  2. 保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有している細
    胞によってＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａである標的タンパク質の発現を増加させる方
    法であって、
    ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプ
    ライス部位に隣接しているエクソン、および保持されたイントロンの３’スプライス部位
    に隣接しているエクソンを含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ１また
    はＳＣＮ１Ａタンパク質をコードし、
    前記方法は、
    細胞を、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前
    駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、
    それによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質を
    コードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、細胞
    内で、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加
    させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させる、方法。
  3. 前記方法はＭＲＤ５を処置する方法であり、標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１であり、
    あるいは、前記方法はＤＳを処置する方法であり、標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、
    請求項１に記載の方法。
  4. 標的タンパク質または機能的ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足している
    標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡを機能的に増大させるか、これに取って代わる、補
    償タンパク質あるいは補償機能的ＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
  5. 細胞は、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の量または活性の不足によって引
    き起こされた疾病を有する被験体内にあるかまたは被験体に由来する、請求項２に記載の
    方法。
  6. 標的タンパク質の量の不足は、標的タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、こ
    こで被験体は、機能的な標的タンパク質をコードする第１の対立遺伝子、標的タンパク質
    が生成されない第２の対立遺伝子、または非機能的な標的タンパク質をコードする第２の
    対立遺伝子を有し、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣ
    ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合する、請求項１－５のいずれか１つに記載の方法。
  7. 被験体は、標的タンパク質の量または機能の不足に起因する障害により引き起こされた
    疾病を抱えており、
    ここで、被験体は、
    （ａ）
    （ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生
    成され、
    （ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生
    成され、あるいは、
    （ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
    第１の変異対立遺伝子と、
    （ｂ）
    （ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生
    成され、
    （ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生
    成され、あるいは、
    （ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
    第２の変異対立遺伝子とを有し、
    ここで、被験体が第１の変異対立遺伝子（ａ）（ｉｉｉ）を有するとき、第２の変異対立
    遺伝子は（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）であり、ここで、被験体が第２の変異対立
    遺伝子（ｂ）（ｉｉｉ）を有するとき、第１の変異対立遺伝子は（ａ）（ｉ）あるいは（
    ａ）（ｉｉ）であり、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）
    （ｉｉ）である第１の変異対立遺伝子、および／または、（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（
    ｉｉ）である第２の変異対立遺伝子から転写される、請求項１－５のいずれか１つに記載
    の方法。
  8. 標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、機能が低下した形態で生成さ
    れる、請求項７に記載の方法。
  9. 標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、十分に機能的な形態で生成さ
    れる、請求項７に記載の方法。
  10. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に
    対して＋６～保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の
    保持されたイントロンにある、請求項１－９のいずれか１つに記載の方法。
  11. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、ある
    いは、
    （ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、
    の内部の保持されたイントロンにある、請求項１－９のいずれか１つに記載の方法。
  12. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
    ｅの領域、あるいは、
    （ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
    ｅの領域、
    の内部にある、請求項１－９のいずれか１つに記載の方法。
  13. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領
    域、
    （ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、
    （ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、あ
    るいは、
    （ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領
    域、
    の内部にある、請求項１－９のいずれか１つに記載の方法。
  14. 標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、請求項１－１３のいずれか１つに記載の方法。
  15. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４－７のいずれか１つに少なくとも
    約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配
    列を含む、請求項１４に記載の方法。
  16. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、
    ９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコ
    ードされる、請求項１４に記載の方法。
  17. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９３の少なくとも８
    つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
    るいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、請求項１４に記載の方法。
  18. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１４
    に記載の方法。
  19. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２１の３
    ’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法
    。
  20. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６６または５２４－１０３７のいずれか１つ
    に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
    列を含む、請求項１９に記載の方法。
  21. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法。
  22. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３
    ３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１
    ００％相補的な配列を含む、請求項２１に記載の方法。
  23. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、請求項１４に記
    載の方法。
  24. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９
    ３２のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは
    １００％相補的な配列を含む、請求項２３に記載の方法。
  25. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、請求項１４に
    記載の方法。
  26. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２５８、６７６－７７２、あるいは９３３－
    １０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
    いは１００％相補的な配列を含む、請求項２５に記載の方法。
  27. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法。
  28. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０３０
    －１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
    るいは１００％相補的な配列を含む、請求項２７に記載の方法。
  29. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２３の３
    ’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法
    。
  30. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項２９
    に記載の方法。
  31. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法。
  32. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項３１
    に記載の方法。
  33. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、請求項１４に記
    載の方法。
  34. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項３３
    に記載の方法。
  35. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、請求項１４に
    記載の方法。
  36. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項３５
    に記載の方法。
  37. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、請求項１４に記載の方法。
  38. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項３７
    に記載の方法。
  39. 標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１である、請求項１－１３のいずれか１つに記載の方法
    。
  40. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８または９に少なくとも約８０％、
    ８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、
    請求項３９に記載の方法。
  41. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に少なくとも約８０％、
    ８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列に
    よってコードされる、請求項３９に記載の方法。
  42. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２、２５９４、ま
    たは２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、
    ９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、請求項３
    ９に記載の方法。
  43. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１のいずれか１つに少なくとも約８
    ０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項
    ３９に記載の方法。
  44. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して－７３ｅ～＋４９９までの領域内、あるいは保持されたイントロン１９の３’
    スプライス部位に対して－４９６～＋１９１２ｅの領域内にある、請求項３９に記載の方
    法。
  45. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９または１８１５－２２８６のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項４４に記載の方法。
  46. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して－７３ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項３９に記載の方法。
  47. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１０５０または１８１５－１８２７のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項４４に記載の方法。
  48. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にある、請求項３９に記
    載の方法。
  49. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６または１８２８－１９１３のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項４８に記載の方法。
  50. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン１９にある、請求項３９に
    記載の方法。
  51. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項５０に記載の方法。
  52. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
    位に対して＋１７ｅ～＋１９１２ｅの領域内にある、請求項３９に記載の方法。
  53. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２９－１５０９または２００６－２２８６のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項５２に記載の方法。
  54. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して－１０５４ｅ～＋２５１までの領域内、あるいは保持されたイントロン１５の
    ３’スプライス部位に対して－２５６～＋１５７ｅの領域内にある、請求項３９に記載の
    方法。
  55. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１８１４または２２８７－２５９１のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項５４に記載の方法。
  56. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある、請求項３９に記載の方法。
  57. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項５６に記載の方法。
  58. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋２５１の領域内の保持されたイントロン１５にある、請求項３９に記
    載の方法。
  59. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６８７－１７３６または２４６４－２５１３のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項５８に記載の方法。
  60. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
    位に対して－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５にある、請求項３９に
    記載の方法。
  61. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７８５または２５１４－２５６２のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項６０に記載の方法。
  62. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある、請求項３９に記載の方法。
  63. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいず
    れか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相
    補的な配列を含む、請求項６２に記載の方法。
  64. アンチセンスオリゴマーは、機能的ＲＮＡまたは標的タンパク質をコードする遺伝子か
    ら転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより、標的タンパ
    ク質または機能的ＲＮＡの量を増加させない、請求項１－６３のいずれか１つに記載の方
    法。
  65. アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の
    突然変異に起因する異常なスプライシングを調節することにより、標的タンパク質または
    機能的ＲＮＡの量を増加させない、請求項１－６４のいずれか１つに記載の方法。
  66. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシング、または
    野生型のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシングによって生成された、請求項１－６５
    のいずれか１つに記載の方法。
  67. 標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長の成熟ｍＲＮＡ、あ
    るいは野生型の成熟ｍＲＮＡである、請求項１－６６のいずれか１つに記載の方法。
  68. 生成された標的タンパク質は全長のタンパク質あるいは野生型のタンパク質である、請
    求項１－６７のいずれか１つに記載の方法。
  69. アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞において生成された標的タンパク質または機
    能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量は、対照細胞において生成された標的タンパク質
    または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量と比較して、約１．１～約１０倍、約１
    ．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、約４～約１０倍、約１．１～約５倍
    、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～約８倍、約１．１～約９倍、約２～
    約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍、約２～約９倍、約３～約６倍、約
    ３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約７倍、約４～約８倍、約４～約９倍
    、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．
    ５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍
    、あるいは少なくとも約１０倍増加する、請求項１－６８のいずれか１つに記載の方法。
  70. アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞によって生成された標的タンパク質の総量は
    、対照細胞によって生成された標的タンパク質の総量と比較して、約１．１～約１０倍、
    約１．５～約１０倍、約２～約１０倍、約３～約１０倍、約４～約１０倍、約１．１～約
    ５倍、約１．１～約６倍、約１．１～約７倍、約１．１～約８倍、約１．１～約９倍、約
    ２～約５倍、約２～約６倍、約２～約７倍、約２～約８倍、約２～約９倍、約３～約６倍
    、約３～約７倍、約３～約８倍、約３～約９倍、約４～約７倍、約４～約８倍、約４～約
    ９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約
    ２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約
    ５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する、請求項１－６９のいずれか１つに記載の方
    法。
  71. アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
    を含む骨格修飾を含む、請求項１－７０のいずれか１つに記載の方法。
  72. アンチセンスオリゴマーはホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド
    核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、あるいは２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
    む、請求項１－７１のいずれか１つに記載の方法。
  73. アンチセンスオリゴマーは少なくとも１つの修飾された糖部を含む、請求項１－７２の
    いずれか１つに記載の方法。
  74. それぞれの糖部は修飾された糖部である、請求項７３に記載の方法。
  75. アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
    酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
    酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
    酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
    核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
    ～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
    基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
    の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
    ２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
    塩基、１２～２０の核酸塩基、あるいは１２～１５の核酸塩基からなる、請求項１－７４
    のいずれか１つに記載の方法。
  76. アンチセンスオリゴマーは、タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部
    分に少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少な
    くとも９８％、少なくとも９９％、あるいは１００％相補的である、請求項１－７５のい
    ずれか１つに記載の方法。
  77. 細胞は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ
    ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保
    持されたイントロンを含み、および、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲ
    ＮＡ前駆体の集団で最も豊富な保持されたイントロンに結合する、請求項１－７６のいず
    れか１つに記載の方法。
  78. 最も豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的タン
    パク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集
    団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、請求項７
    ７に記載の方法。
  79. 細胞は、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ
    ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保
    持されたイントロンを含み、および、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲ
    ＮＡ前駆体の集団で２番目に豊富な保持されたイントロンに結合する、請求項１－７８の
    いずれか１つに記載の方法。
  80. ２番目に豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的
    タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
    の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、請求
    項７９に記載の方法。
  81. 前記方法はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質発現を評価する工程をさらに含
    む、請求項１－８０のいずれか１つに記載の方法。
  82. ＭＲＤ５は処置され、および、アンチセンスオリゴマーはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍ
    ＲＮＡ前駆体の標的部分へ結合し、標的部分はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１
    から選択される配列内にあり、あるいは、ＤＳが処置され、および、アンチセンスオリゴ
    マーはＳＣＮ１Ａ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分へ結合し、標的部分はＳＥＱ Ｉ
    Ｄ ＮＯ：１０－１０３７から選択される配列内にある、請求項１－８１のいずれか１つ
    に記載の方法。
  83. 被験体はヒトである、請求項１－８２のいずれか１つに記載の方法。
  84. 被験体はヒト以外の動物である、請求項１－８２のいずれか１つに記載の方法。
  85. 被験体は胎児、胚、あるいは子供である、請求項１－８３のいずれか１つに記載の方法
    。
  86. 細胞はエクスビボである、請求項１－８５のいずれか１つに記載の方法。
  87. アンチセンスオリゴマーは、被験体のくも膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋
    肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって投与される、請求項１－８６のいずれ
    か１つに記載の方法。
  88. ５’スプライス部位に隣接するエクソンの－３ｅ～－１ｅと、保持されたイントロンの
    ＋１～＋６にある９つのヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、請求項１－
    ８７のいずれか１つに記載の方法。
  89. 保持されたイントロンの－１５～－１と３’スプライス部位に隣接するエクソンの＋１
    ｅにある１６のヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、請求項１－８８のい
    ずれか１つに記載の方法。
  90. 請求項１－８９のいずれか１つの方法で使用されるアンチセンスオリゴマー。
  91. ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８
    ５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含むアン
    チセンスオリゴマー。
  92. 請求項９０または９１のアンチセンスオリゴマー、および薬学的に許容可能な賦形剤、
    希釈剤、あるいは担体を含む医薬組成物。
  93. くも膜下腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内
    注射によって請求項９２の医薬組成物を投与することにより被験体を処置する方法。
  94. 不足しているタンパク質または不足している機能的ＲＮＡに関係する被験体のＭＲＤＤ
    ５またはＤＳを処置するために細胞によって標的タンパク質または機能的ＲＮＡの発現を
    増加させる方法で使用するためのアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
    ここで、不足しているタンパク質または不足している機能的ＲＮＡは、被験体において
    量あるいは活性が不足しており、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能
    的ＲＮＡをコードする、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前
    駆体）の構成的のスプライシングを増強し、
    ここで、標的タンパク質は、
    （ａ）不足しているタンパク質、あるいは、
    （ｂ）被験体において不足しているタンパク質を機能的に増大させるか、これに取って代
    わる、補償タンパク質であり、
    ここで、機能的ＲＮＡは、
    （ｃ）不足しているＲＮＡ、あるいは、
    （ｄ）被験体の不足している機能的ＲＮＡを機能的に増大するか、これに取って代わる、
    補償機能的ＲＮＡであり、
    ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接
    するエクソン、および３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、ここで、保持され
    たイントロンは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
    体からスプライシングされ、それによって、被験体の標的タンパク質あるいは機能的ＲＮ
    Ａの生成あるいは活性を増加させる、組成物。
  95. 被験体においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質に関連した疾病を処置する
    方法で使用されるアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
    当該方法は、被験体の細胞によりＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を
    増加させる工程であって、細胞が保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’ス
    プライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接す
    るエクソンを含む、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体
    ）を有し、ここで、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体がＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク
    質をコードする、工程と、アンチセンスオリゴマーに細胞を接触させる工程であって、こ
    れによって、保持されたイントロンは、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコ
    ードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体転写産物から構成的にスプライシングされ、それにより
    、被験体の細胞においてＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮ
    Ａのレベルを増加させ、ＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａタンパク質の発現を増加させる
    、工程とを含む、組成物。
  96. 疾病は疾患または障害である、請求項９５に記載の組成物。
  97. 疾患または障害はＡＤ精神遅滞５あるいはドラベ症候群である、請求項９６に記載の組
    成物。
  98. 標的タンパク質とＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＳＹＮＧＡＰ１またはＳＣＮ１Ａ遺伝子に
    よってコードされる、請求項９７に記載の組成物。
  99. アンチセンスオリゴマーは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６
    から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６までの領域内の保持さ
    れたイントロンにあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、請求項９４－９８の
    いずれか１つに記載の組成物。
  100. アンチセンスオリゴマーはＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とし、これは、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、ある
    いは、
    （ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、
    の内部の保持されたイントロンにある、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組成物
    。
  101. アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの保持されたイントロンの５’スプライス
    部位の約１００ヌクレオチド下流から、少なくとも１つの保持されたイントロンの３’ス
    プライス部位の約１００ヌクレオチド上流までの領域内にあるＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の
    一部を標的とする、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組成物。
  102. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
    ｅの領域、あるいは、
    （ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ～－４
    ｅの領域、
    の内部にある、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組成物。
  103. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
    （ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して－４ｅ～－１，０５４ｅの領
    域、
    （ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６～＋４９９の領域、
    （ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－１６～－４９６の領域、あ
    るいは、
    （ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ～＋１，９１２ｅの領
    域、
    の内部にある、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組成物。
  104. 標的タンパク質はＳＣＮ１Ａである、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組成物
    。
  105. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４－７のいずれか１つに少なくとも
    約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配
    列を含む、請求項１０４に記載の組成物。
  106. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、
    ９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコ
    ードされる、請求項１０４に記載の組成物。
  107. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９３の少なくとも８
    つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
    るいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、請求項１０４に記載の組成物。
  108. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１０
    ４に記載の組成物。
  109. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２１の３
    ’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組
    成物。
  110. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２６６または５２４－１０３７のいずれか１つ
    に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配
    列を含む、請求項１０９に記載の組成物。
  111. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組成物。
  112. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－６２、５２４－５７６、あるいは７８１－８３
    ３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１
    ００％相補的な配列を含む、請求項１１１に記載の組成物。
  113. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、請求項１０４に
    記載の組成物。
  114. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３－１６２、５７７－６７５、あるいは８３４－９
    ３２のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは
    １００％相補的な配列を含む、請求項１１３に記載の組成物。
  115. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２１にある、請求項１０４
    に記載の組成物。
  116. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６３－２５８、６７６－７７２、あるいは９３３－
    １０２９のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、ある
    いは１００％相補的な配列を含む、請求項１１５に記載の組成物。
  117. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２１の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組成物。
  118. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９－２６６、７７３－７８０、あるいは１０３０
    －１０３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あ
    るいは１００％相補的な配列を含む、請求項１１７に記載の組成物。
  119. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～＋４９６までの領域内、あるいは保持されたイントロン２３の３
    ’スプライス部位に対して－４９６～＋３７ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組
    成物。
  120. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１１
    ９に記載の組成物。
  121. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して－２６４ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組成物。
  122. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６７－３１９のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１２
    １に記載の組成物。
  123. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、請求項１０４に
    記載の組成物。
  124. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２０－４１８のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１２
    ３に記載の組成物。
  125. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン２３にある、請求項１０４
    に記載の組成物。
  126. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１９－５１５のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１２
    ５に記載の組成物。
  127. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン２３の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋３７ｅの領域内にある、請求項１０４に記載の組成物。
  128. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６－５２３のいずれか１つに少なくとも約８０％
    、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、請求項１２
    ７に記載の組成物。
  129. 標的タンパク質はＳＹＮＧＡＰ１である、請求項９４－９８のいずれか１つに記載の組
    成物。
  130. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８または９に対して少なくとも約８
    ０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含
    む、請求項１２９に記載の組成物。
  131. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２または３に対して少なくとも約８
    ０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた遺伝子配
    列によってコードされる、請求項１２９に記載の組成物。
  132. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２、２５９４、ま
    たは２５９５の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に対して少なくとも８０％、８
    ５％、９０％、９５％、９７％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含む、請求
    項１２９に記載の組成物。
  133. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－２５９１のいずれか１つに対して少なくと
    も約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００％相補的な配列を含む、請
    求項１２９に記載の組成物。
  134. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して－７３ｅ～＋４９９の領域内、あるいは保持されたイントロン１９の３’スプ
    ライス部位に対して－４９６～＋１９１２ｅの領域内に存在する、請求項１２９に記載の
    組成物。
  135. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１５０９または１８１５－２２８６のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１３４に記載の組成物。
  136. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して－７３ｅ～－４ｅの領域内にある、請求項１２９に記載の組成物。
  137. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０３８－１０５０または１８１５－１８２７のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１３６に記載の組成物。
  138. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１８の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋４９９の領域内の保持されたイントロン１８にある、請求項１２９に
    記載の組成物。
  139. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０５１－１１３６または１８２８－１９１３のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１３８に記載の組成物。
  140. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
    位に対して－１６～－４９６の領域内の保持されたイントロン１９にある、請求項１２９
    に記載の組成物。
  141. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１３７－１２２８または１９１４－２００５のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１４０に記載の組成物。
  142. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１９の３’スプライス部
    位に対して＋１７ｅ～＋１９１２ｅの領域内にある、請求項１２９に記載の組成物。
  143. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２２９－１５０９または２００６－２２８６のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１４２に記載の組成物。
  144. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して－１０５４ｅ～＋２５１の領域内、あるいは保持されたイントロン１５の３’
    スプライス部位に対して－２５６～＋１５７ｅの領域内に存在する、請求項１２９に記載
    の組成物。
  145. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１８１４または２２８７－２５９１のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１４４に記載の組成物。
  146. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して－４ｅ～－１０５４ｅの領域内にある、請求項１２９に記載の組成物。
  147. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５１０－１６８６または２２８７－２４６３のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１４６に記載の組成物。
  148. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の５’スプライス部
    位に対して＋６～＋２５１の領域内の保持されたイントロン１５にある、請求項１２９に
    記載の組成物。
  149. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６８７－１７３６または２４６４－２５１３のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１４８に記載の組成物。
  150. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
    位に対して－１６～－２５６の領域内の保持されたイントロン１５にある、請求項１２９
    に記載の組成物。
  151. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３７－１７８５または２５１４－２５６２のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１５０に記載の組成物。
  152. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン１５の３’スプライス部
    位に対して＋２ｅ～＋１５７ｅの領域内にある、請求項１２９に記載の組成物。
  153. ＡＳＯは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７８６－１８１４または２５６３－２５９１のいず
    れか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または１００
    ％相補的な配列を含む、請求項１５２に記載の組成物。
  154. アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子か
    ら転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより標的タンパク
    質または機能的ＲＮＡの量を増加させない、請求項９４－１５３のいずれか１つに記載の
    組成物。
  155. アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の
    突然変異から結果として生じる異常スプライシングを調節することにより標的タンパク質
    または機能的ＲＮＡの量を増加させない、請求項９４－１５４のいずれか１つに記載の組
    成物。
  156. ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、全長ｍＲＮＡ前駆体または野生型ｍＲＮＡ前駆体からの部
    分的スプライシングによって生成された、請求項９４－１５５のいずれか１つに記載の組
    成物。
  157. 標的タンパク質または機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長成熟ｍＲＮＡまたは
    野生型成熟ｍＲＮＡである、請求項９４－１５６のいずれか１つに記載の組成物。
  158. 生成される標的タンパク質は、全長タンパク質または野生型タンパク質である、請求項
    ９４－１５７のいずれか１つに記載の組成物。
  159. 保持されたイントロンは、律速イントロンである、請求項９４－１５８のいずれか１つ
    に記載の組成物。
  160. 前記保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において最も豊富な保持さ
    れたイントロンである、請求項９４－１５８のいずれか１つに記載の組成物。
  161. 保持されたイントロンは、前記ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において２番目に豊富な保持さ
    れたイントロンである、請求項９４－１５９のいずれか１つに記載の組成物。
  162. アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
    を含む骨格修飾を含む、請求項９４－１６１のいずれか１つに記載の組成物。
  163. アンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項９４－１
    ６２のいずれか１つに記載の組成物。
  164. アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチ
    ド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
    む、請求項９４－１６３のいずれか１つに記載の組成物。
  165. アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、請求項９４－１
    ６４のいずれか１つに記載の組成物。
  166. それぞれの糖部は、修飾された糖部である、請求項１６５に記載の組成物。
  167. アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
    酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
    酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
    酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
    核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
    ～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
    基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
    の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
    ２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
    塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩基からなる、請求項９４－１６
    ６のいずれか１つに記載の組成物。
  168. 請求項９４－１６７の組成物のいずれかのアンチセンスオリゴマーと、薬学的に許容可
    能な賦形剤、希釈剤、または担体とを含む医薬組成物。
  169. 髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、または静脈内注射によ
    って請求項１６８の医薬組成物を投与することにより、被験体を処置する方法。
  170. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物の標的配列にハイブリダイズす
    るアンチセンスオリゴマーであって、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写
    産物が保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーがＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮ
    ＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物からの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘
    発する、アンチセンスオリゴマーと、
    薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、または担体と、
    を含む、医薬組成物。
  171. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧ
    ＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、請求項１７０に記載の医薬組成物。
  172. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、
    保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋
    ５００から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して－５００の領域内にあ
    る、請求項１７０または１７１に記載の医薬組成物。
  173. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ＳＥＱ Ｉ
    Ｄ ＮＯ：１－３のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％
    、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列に
    よりコードされる、請求項１７０または１７１に記載の医薬組成物。
  174. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物は、ＳＥＱ Ｉ
    Ｄ ＮＯ：４－９のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％
    、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を備えた配列を含む、
    請求項１７０または１７１に記載の医薬組成物。
  175. アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合またはホスホロジアミデート結合
    を含む骨格修飾を含む、請求項１７０に記載の医薬組成物。
  176. アンチセンスオリゴマーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項１７０に
    記載の医薬組成物。
  177. アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチ
    ド核酸、２’－Ｏ－メチル、２’－フルオロ、または２’－Ｏ－メトキシエチル部分を含
    む、請求項１７０に記載の医薬組成物。
  178. アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、請求項１７０に
    記載の医薬組成物。
  179. アンチセンスオリゴマーは、８～５０の核酸塩基、８～４０の核酸塩基、８～３５の核
    酸塩基、８～３０の核酸塩基、８～２５の核酸塩基、８～２０の核酸塩基、８～１５の核
    酸塩基、９～５０の核酸塩基、９～４０の核酸塩基、９～３５の核酸塩基、９～３０の核
    酸塩基、９～２５の核酸塩基、９～２０の核酸塩基、９～１５の核酸塩基、１０～５０の
    核酸塩基、１０～４０の核酸塩基、１０～３５の核酸塩基、１０～３０の核酸塩基、１０
    ～２５の核酸塩基、１０～２０の核酸塩基、１０～１５の核酸塩基、１１～５０の核酸塩
    基、１１～４０の核酸塩基、１１～３５の核酸塩基、１１～３０の核酸塩基、１１～２５
    の核酸塩基、１１～２０の核酸塩基、１１～１５の核酸塩基、１２～５０の核酸塩基、１
    ２～４０の核酸塩基、１２～３５の核酸塩基、１２～３０の核酸塩基、１２～２５の核酸
    塩基、１２～２０の核酸塩基、または１２～１５の核酸塩基を含む、請求項１７０に記載
    の医薬組成物。
  180. アンチセンスオリゴマーは、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆
    体の転写産物の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、
    少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％相補的である
    、請求項１７０または１７１に記載の医薬組成物。
  181. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、
    ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５９２－２５９５から選択される配列内にある、請求項１７０ま
    たは１７１に記載の医薬組成物。
  182. アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対
    して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、
    ９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、請
    求項１７０に記載の医薬組成物。
  183. アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１から選択されるヌク
    レオチド配列を含む、請求項１７０に記載の医薬組成物。
  184. 医薬組成物は、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射または静
    脈内注射のために製剤される、請求項１７０－１８３のいずれか１つに記載の医薬組成物
    。
  185. ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコードする十分に処理された
    ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物を生成するために、保持されたイ
    ントロンの除去を促進するように、不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲ
    ＮＡの転写産物の処理を誘発する方法であって、
    前記方法は、
    （ａ）アンチセンスオリゴマーを被験体の標的細胞と接触させる工程、
    （ｂ）不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物にアンチセン
    スオリゴマーをハイブリダイズする工程であって、ここで、不足しているＳＣＮ１Ａまた
    はＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質
    の機能形態をコードすることができ、かつ少なくとも１つの保持されたイントロンを含む
    、工程、
    （ｃ）ＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態をコードする十分に処理さ
    れたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物を生成するために、不足して
    いるＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物から少なくとも１つの保持さ
    れたイントロンを除去する工程、および、
    （ｄ）十分に処理されたＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物からＳＣ
    Ｎ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質の機能形態を翻訳する工程を含む、方法。
  186. 保持されたイントロンは、保持されたイントロン全体である、請求項１８５に記載の方
    法。
  187. 不足しているＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡの転写産物は、ＳＣＮ１Ａま
    たはＳＹＮＧＡＰ１ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、請求項１８５に記載の方法。
  188. 不足している量または活性のＳＣＮ１ＡまたはＳＹＮＧＡＰ１タンパク質により引き起
    こされる疾病を患う被験体を処置する方法であって、
    ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０－２５９１のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８
    ５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、ま
    たは９９％の配列同一性を備えたヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴマーを被験
    体に投与する工程を含む、方法。
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