JP2014513938A5 - - Google Patents

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本明細書で提供される組換えまたは改変LIVPウイルス株の例において、異種遺伝子産物は、ホルモン、成長因子、サイトカイン、ケモカイン、共刺激分子、リボザイム、輸送タンパク質、一本鎖抗体、アンチセンスRNA、プロドラッグ変換酵素、siRNA、マイクロRNA、毒素、抗腫瘍オリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がんポリペプチド抗生物質、血管新生阻害剤、腫瘍抑制因子、細胞傷害性タンパク質、細胞増殖抑制タンパク質および組織因子から選択される治療剤である。例えば、異種遺伝子産物は、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、単球走化性タンパク質−1(MCP−1)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−24(IL−24)、インターフェロンγ誘導性タンパク質10(IP−10)、Tリンパ球上で発現される受容体であるHVEMについてHSV糖タンパク質と競合するリンホトキシン誘導性発現物(LIGHT)、p60スーパー抗原、OspF、OspG、シグナル伝達兼転写活性化因子(STAT1α)、STAT1β、プラスミノゲンk5ドメイン(hK5)、色素上皮分化因子(PEDF)、一本鎖抗VEGF抗体、一本鎖抗DLL4抗体、一本鎖抗線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、NM23、カドヘリン1(ECADまたはcdh1)、リラキシン(relaxin)1(RLN1)、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、エリスロポエチン(EPO)、マイクロRNA126(miR−126)、マイクロRNA181、マイクロRNA335、マンガナーゼスーパーオキシドジスムターゼ(MnSOD)、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ1(HACE1)、ナトリウム利尿ペプチド前駆体A(nppa1)、カルボキシペプチダーゼG2(CPG2)、アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)、CDC6、または骨形成タンパク質4(BMP4)である。例えば、一本鎖抗VEGF抗体は、G6と命名される。
クローン株を選択する本明細書に記載の方法のいずれかにより製造または選択されたクローン株が本明細書で提供される。
本発明には、以下の実施態様が挙げられる:
(1)ゲノムが配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含むクローン株以外の単離されたLIVPクローン株;
(2)GLV−1h68と比較してより高い抗腫瘍形成性および/または低下した毒性を有する、(1)に記載の単離されたLIVPクローン株であって、ここでGLV−1h68は配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有するものである、単離されたLIVPクローン株;
(3)そのゲノム中に、非ウイルス異種核酸またはオープンリーディングフレームの欠失をさらに含む、(1)または(2)に記載の単離されたLIVPクローン株;
(4)配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有するGLV−1h68と命名されたウイルスと比較して低下した毒性を有する、(1)から(3)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株;
(5)配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有するGLV−1h68と命名されたウイルス株と比較してより高い抗腫瘍形成性を有する、(1)から(3)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株;
(6)配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有するGLV−1h68と命名されたウイルスと比較して低下した毒性およびより高い抗腫瘍形成性を有する、(1)から(3)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株;
(7)配列番号10に記載のヌクレオチド配列と少なくとも85%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むが、配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含まない、(1)から(6)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株;
(8)配列番号10に記載のヌクレオチド配列と少なくとも86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%または99.9%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、(7)に記載の単離されたLIVPクローン株;
(9)配列同一性が、逆位末端反復(ITR)に対応するヌクレオチドを含有するヌクレオチド配列のアラインメント、および末端ギャップがペナルティを受けないGAP配列アラインメントプログラムにより決定される全体的アラインメントの使用により決定される、(7)または(8)に記載の単離されたクローン株;
(10)a)配列番号1のヌクレオチド10,073〜180,095、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870;または
b)配列番号1のヌクレオチド10,073〜180,095、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870の配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
から選択されるヌクレオチド配列を含む、(1)から(9)のいずれかに記載の単離されたクローン株;
(11)左および/または右の逆位末端反復を含む、(10)に記載の単離されたクローン株;
(12)配列番号1、2、4、5、6、7または8に記載のヌクレオチド配列、配列番号1、2、4、5、6、7または8に記載のヌクレオチド配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、(1)から(11)のいずれかに記載の単離されたクローン株;
(13)(1)から(12)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株を増殖させることにより製造されたLIVP調製物;
(14)(1)から(12)のいずれかに記載のクローン株を含む細胞培養物または単離された細胞;
(15)(14)に記載の細胞または細胞培養物を増殖させること;および
得られた細胞からLIVPクローンを単離すること
により製造された単離されたクローン株;
(16)(1)から(12)または(15)のいずれかに記載のLIVPクローン株のゲノム;および前記ゲノム中の異種遺伝子産物をコードする核酸
を含む、組換えLIVPウイルス株;
(17)異種遺伝子産物をコードする核酸が、ウイルスのゲノム中の非必須遺伝子もしくは領域に挿入されるか、またはウイルスのゲノム中の非必須遺伝子もしくは領域の代わりに挿入される、(16)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(18)異種遺伝子産物をコードする核酸が、ウイルスのゲノム中のヘマグルチニン(HA)、チミジンキナーゼ(TK)、F14.5L、ワクシニア成長因子(VGF)、A35R、N1L、E2L/E3L、K1L/K2L、スーパーオキシドジスムターゼ遺伝子座、7.5K、C7−K1L、B13R+B14R、A26Lまたは14L遺伝子座に挿入される、(16)または(17)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(19)異種遺伝子産物が治療剤または診断剤である、(16)から(18)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(20)異種遺伝子産物が、抗がん剤、抗転移剤、抗血管新生剤、免疫調節分子、抗原、細胞マトリックス分解遺伝子、組織再生およびヒト体細胞の多能性細胞への再プログラミングに関する遺伝子、検出可能な生成物もしくはシグナルを生成するように基質を改変するかまたは抗体により検出可能である酵素、造影剤に結合することができるタンパク質、光学画像化または検出のための遺伝子、PET画像化のための遺伝子ならびにMRI画像化のための遺伝子から選択される、(16)から(19)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(21)抗転移剤が、転移定着を阻害するか、またはインビトロ(in vitro)細胞浸潤アッセイにおいて細胞浸潤を阻害する、(20)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(22)抗血管新生剤が腫瘍における血管形成を阻害する、(20)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(23)異種遺伝子産物が、ホルモン、成長因子、サイトカイン、ケモカイン、共刺激分子、リボザイム、輸送タンパク質、一本鎖抗体、アンチセンスRNA、プロドラッグ変換酵素、siRNA、マイクロRNA、毒素、抗腫瘍オリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がんポリペプチド抗生物質、血管新生阻害剤、腫瘍抑制因子、細胞傷害性タンパク質、細胞増殖抑制タンパク質および組織因子から選択される治療剤である、(16)から(22)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(24)異種遺伝子産物が、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、単球走化性タンパク質−1(MCP−1)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−24(IL−24)、インターフェロンγ誘導性タンパク質10(IP−10)、Tリンパ球上で発現される受容体であるHVEMについてHSV糖タンパク質Dと競合するリンホトキシン誘導性発現物(LIGHT)、p60スーパー抗原、OspF、OspG、シグナル伝達兼転写活性化因子(STAT1α)、STAT1β、プラスミノゲンk5ドメイン(hK5)、色素上皮分化因子(PEDF)、一本鎖抗VEGF抗体、一本鎖抗DLL4抗体、一本鎖抗線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、NM23、カドヘリン1(ECADまたはcdh1)、リラキシン1(RLN1)、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、エリスロポエチン(EPO)、マイクロRNA126(miR−126)、マイクロRNA181、マイクロRNA335、マンガナーゼスーパーオキシドジスムターゼ(MnSOD)、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ1(HACE1)、ナトリウム利尿ペプチド前駆体A(nppa1)、カルボキシペプチダーゼG2(CPG2)、アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)、CDC6、および骨形成タンパク質4(BMP4)から選択される治療剤である、(16)から(23)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(25)一本鎖抗VEGF抗体がG6と命名される、(24)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(26)異種遺伝子産物が、検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質である診断剤である、(16)から(20)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(27)異種遺伝子産物が、ルシフェラーゼ;蛍光タンパク質;生物発光タンパク質;検出することができる造影剤、発色団、化合物もしくはリガンドに結合する、および/またはそれを輸送する受容体または輸送タンパク質から選択される診断剤である、(16)から(20)または(26)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(28)造影剤に結合する、および/またはそれを輸送する受容体または輸送タンパク質が鉄受容体、鉄輸送体、銅取込み輸送体である、(27)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(29)異種遺伝子産物が、ヒカリコメツキムシ(geen click beetle)ルシフェラーゼ、luxオペロン、赤外蛍光タンパク質、フラビンリダクターゼタンパク質、mNeptune近赤外蛍光タンパク質、緑色蛍光タンパク質(GFP)、赤色蛍光タンパク質(RFP)、セレンテラジン結合タンパク質(CBP)、ヒトエピネフリン受容体(hNET)、ヨウ化ナトリウム共輸送体(NIS)タンパク質、シトクロムp450ファミリー酵素、アロスタチンA受容体(AlstR)、Pep1受容体(PEPR−1)、LAT−4、ステロール14α−デメチラーゼ(Cyp51)、トランスフェリン受容体(TR)、フェリチン、二価金属輸送体(DMT)、マグネトタクティックA(MagA)およびシスプラチン流入輸送体(CTR1)から選択される診断剤である、(27)または(28)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(30)組織再生およびヒト体細胞の多能性細胞への再プログラミングに関する遺伝子が、newtAG(nAG)、Oct4、NANOG、Ngn3、Pdx1およびMafaから選択される、(20)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(31)異種遺伝子産物をコードする核酸が、プロモーターに作動可能に連結される、(16)から(30)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(32)プロモーターが哺乳動物プロモーターまたはウイルスプロモーターである、(31)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(33)プロモーターが、P 7.5K 、P 11K 、P SE 、P SEL 、P SL 、H5R、TK、P28、C11R、G8R、F17R、I3L、I8R、A1L、A2L、A3L、H1L、H3L、H5L、H6R、H8R、D1R、D4R、D5R、D9R、D11L、D12L、D13L、M1L、N2L、P4bまたはK1プロモーターから選択される、(31)または(32)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(34)(1)から(33)のいずれかに記載のウイルス株を含む組成物;
(35)(1)から(33)のいずれかに記載のウイルス株を含む医薬組成物;
(36)薬学的に許容される担体をさらに含む、(35)に記載の医薬組成物;
(37)局部または全身投与のために製剤化された、(35)または(36)に記載の医薬組成物;
(38)1つまたは複数の異なるウイルス株を含む、(34)から(37)のいずれかに記載の組成物または医薬組成物;
(39)抗ウイルスまたは抗がんワクチンとしての投与のために製剤化された、(35)から(38)のいずれかに記載の医薬組成物;
(40)(35)から(39)のいずれかに記載の医薬組成物を投与することを含む、対象における増殖性障害を処置する方法;
(41)増殖性障害の処置のための第2の治療剤を投与することをさらに含む、(40)に記載の方法;
(42)増殖性障害ががんである、(40)または(41)に記載の方法;
(43)がんが、乳がん、前立腺がん、卵巣がん、肺がん、結腸がんまたは膵がんである、(42)に記載の方法;;
(44)増殖性障害が腫瘍または転移である、(40)から(42)のいずれかに記載の方法;
(45)対象がヒトまたは非ヒト動物である、(40)から(44)のいずれかに記載の方法;
(46)非ヒト動物がウマ、ネコ、イヌ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、マウス、ウサギ、ニワトリ、ラット、およびモルモットから選択される、(45)に記載の方法;
(47)ウイルスが、投与の1サイクルにわたって少なくとも1回、少なくとも1x10 pfuまたは約1x10 pfuまたは1x10 pfuである量で投与される、(40)から(46)のいずれかに記載の方法;
(48)ウイルスが、投与の1サイクルにわたって少なくとも1回、少なくとも1x10 pfu、少なくとも1x10 pfu、少なくとも1x10 pfu、少なくとも1x10 pfu、少なくとも1x10 pfu、少なくとも1x10 10 pfu、少なくとも1x10 11 pfu、少なくとも1x10 12 pfu、少なくとも1x10 13 pfuもしくは少なくとも1x10 14 pfu、または約1x10 pfu、約1x10 pfu、約1x10 pfu、約1x10 pfu、約1x10 pfu、約1x10 10 pfu、約1x10 11 pfu、約1x10 12 pfu、約1x10 13 pfuもしくは約1x10 14 pfu、または1x10 pfu、1x10 pfu、1x10 pfu、1x10 pfu、1x10 pfu、1x10 10 pfu、1x10 11 pfu、1x10 12 pfu、1x10 13 pfuもしくは1x10 14 pfuである量で投与される、(40)から(47)のいずれかに記載の方法;
(49)ウイルスの量が、投与のサイクルにわたって、2回、3回、4回、5回、6回または7回投与される、(47)または(48)に記載の方法;
(50)ウイルスの量が、サイクルの1日目、サイクルの1および2日目、サイクルの最初の連続する3日間のそれぞれ、サイクルの最初の連続する4日間のそれぞれ、サイクルの最初の連続する5日間のそれぞれ、サイクルの最初の連続する6日間のそれぞれ、またはサイクルの最初の連続する7日間のそれぞれに投与される、(47)から(49)のいずれかに記載の方法;
(51)投与のサイクルが7日間、14日間、21日間または28日間である、(47)から(50)のいずれかに記載の方法;
(52)投与のサイクルが複数回反復される、(47)から(51)のいずれかに記載の方法;
(53)手術、放射線療法、免疫抑制療法および抗がん剤の投与から選択される他の処置をさらに含み、さらなる処置がウイルスを用いる前に、後に、同時に、または間欠的に行われる、(40)から(52)のいずれかに記載の方法;
(54)さらなる処置が、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、光感作剤、毒素、抗がん抗生物質、化学療法化合物、放射性核種、血管新生阻害剤、シグナリング調節剤、代謝拮抗物質、抗がんワクチン、抗がんオリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がん抗体、抗がん抗生物質、免疫療法剤およびそれらの任意の組合せから選択される抗がん剤の投与である、(53)に記載の方法;
(55)抗がん剤がシスプラチン、カルボプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン、抗EGFR抗体および抗VEGF抗体から選択される、(53)または(54)に記載の方法;
(56)ウイルスと抗がん剤が連続的、同時的、または間欠的に投与される、(54)または(55)に記載の方法;
(57)ウイルスが、全身的、静脈内的、動脈内的、腫瘍内的、内視鏡的、病変内的、筋肉内的、皮内的、腹腔内的、膀胱内的、関節内的、胸膜内的、経皮的、皮下的、経口的、非経口的、鼻内的、気管内的、吸入的、頭蓋内的、前立腺内的、硝子体内的、局所的、眼内的、経膣的、または直腸的に投与される、(40)から(56)のいずれかに記載の方法;
(58)ウイルスが静脈内投与される、(40)から(57)のいずれかに記載の方法;
(59)ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、(1)から(33)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を対象に投与すること;および
検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質を検出すること
を含み、それによって検出が対象における腫瘍または転移の存在を示す、対象における腫瘍または転移を検出する方法;
(60)検出が、対象を画像化することにより行われる、(59)に記載の方法;
(61)検出が、組織または体液試料中の前記タンパク質またはシグナルを検出することにより行われる、(59)に記載の方法;
(62)検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質が、ルシフェラーゼ;蛍光タンパク質;生物発光タンパク質;検出することができる造影剤、発色団、化合物もしくはリガンドに結合する、および/もしくはそれを輸送する受容体または輸送タンパク質から選択される、(59)から(61)のいずれかに記載の方法;
(63)検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質が、緑色蛍光タンパク質(GFP)、赤色蛍光タンパク質(RFP)、鉄受容体、鉄輸送体、ヒトエピネフリン受容体(hNET)およびヨウ化ナトリウム共輸送体(NIS)タンパク質から選択される、(62)に記載の方法;
(64)検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルが、高感度画像化、蛍光分光法、X線画像化、磁気共鳴画像化(MRI)、磁気共鳴分光法(MRS)、ポジトロン放出断層撮影(PET)または単光子放出コンピューター断層撮影(SPECT)により検出される、(59)から(63)のいずれかに記載の方法;
(65)ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、(1)から(33)のいずれかに記載のウイルスを対象に投与すること;および
検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質を検出すること
を含み、検出が、ウイルスが対象において複製していることを示す、宿主におけるウイルス複製を検出する方法;
(66)対象が腫瘍またはがんを有する、(65)に記載の方法;
(67)ウイルスの投与後に、対象から体液試料を取得すること;および体液中の検出可能なタンパク質またはシグナルを検出することを含む、(65)または(66)に記載の方法;
(68)体液が尿、血液、涙または脳脊髄液から選択される、(67)に記載の方法;
(69)(1)から(33)のいずれかに記載のLIVPウイルス株を含む、単離された宿主細胞または細胞培養物;
(70)(1)から(33)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含む、対象における増殖性疾患を処置するための使用のための組成物;
(71)対象における増殖性障害の処置のための医薬組成物の調製のための(1)から(33)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用;
(72)ウイルス株の濃度が1x10 〜1x10 16 pfu/mlであるか、または少なくとも1x10 pfu/ml、少なくとも1x10 pfu/ml、少なくとも1x10 pfu/ml、少なくとも1x10 pfu/ml、少なくとも1x10 10 pfu/ml、少なくとも1x10 11 pfu/ml、少なくとも1x10 12 pfu/ml、少なくとも1x10 13 pfu/ml、少なくとも1x10 14 pfu/ml、少なくとも1x10 15 pfu/mlもしくは少なくとも1x10 16 pfu/mlである、または約1x10 pfu/ml、約1x10 pfu/ml、約1x10 pfu/ml、約1x10 pfu/ml、約1x10 10 pfu/ml、約1x10 11 pfu/ml、約1x10 12 pfu/ml、約1x10 13 pfu/ml、約1x10 14 pfu/ml、約1x10 15 pfu/mlもしくは約1x10 16 pfu/mlである、または1x10 pfu/ml、1x10 pfu/ml、1x10 pfu/ml、1x10 pfu/ml、1x10 10 pfu/ml、1x10 11 pfu/ml、1x10 12 pfu/ml、1x10 13 pfu/ml、1x10 14 pfu/ml、1x10 15 pfu/ml、もしくは1x10 16 pfu/mlである、(70)または(71)に記載の組成物または使用;
(73)組成物が抗がん剤をさらに含む、(70)から(72)のいずれかに記載の組成物または使用;
(74)抗がん剤がサイトカイン、ケモカイン、成長因子、光感作剤、毒素、抗がん抗生物質、化学療法化合物、放射性核種、血管形成阻害剤、シグナリング調節剤、代謝拮抗物質、抗がんワクチン、抗がんオリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がん抗体、抗がん抗生物質、免疫療法剤およびそれらの任意の組合せから選択される、(73)に記載の組成物または使用;
(75)抗がん剤がシスプラチン、カルボプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン、ならびに抗EGFR抗体および抗VEGF抗体から選択される、(73)または(74)に記載の組成物または使用;
(76)増殖性障害ががんである、(70)から(75)のいずれかに記載の組成物または使用;
(77)がんが乳がん、前立腺がん、卵巣がん、肺がん、結腸がんまたは膵がんである、(76)に記載の組成物または使用;
(78)がんが固形腫瘍がんまたは転移がんである、(70)から(77)のいずれかに記載の組成物または使用;
(79)腫瘍または転移が乳房腫瘍、前立腺腫瘍、卵巣腫瘍、肺腫瘍、結腸腫瘍、または膵腫瘍である、(78)に記載の組成物または使用;
(80)組成物が全身または局部投与のために製剤化される、(70)から(79)のいずれかに記載の組成物または使用;
(81)組成物が静脈内投与のために製剤化される、(70)から(80)のいずれかに記載の組成物または使用;
(82)(i)異なるゲノム配列を有するウイルス粒子の混合物を含有する第1のLIVPウイルス試料を用意すること;
(ii)試料から単一のクローン単離物を選択および単離すること;
(iii)毒性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;
(iv)抗腫瘍形成性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;ならびに
(v)参照LIVPウイルス株と比較してより高い抗腫瘍形成性および低下した毒性を示すクローン株を選択すること
を含み、それによって低下した毒性およびより高い抗腫瘍形成性を示すクローン単離物が、がんの治療または診断のためのLIVPクローン株であると同定される、がん療法およびがん診断のためのLIVPクローン株を選択する方法;
(83)参照LIVPウイルスが弱毒化組換えLIVPウイルスである、(82)に記載の方法;
(84)参照LIVPウイルスが、ゲノムが配列番号9に記載のヌクレオチド配列を含むGLV−1h68と命名されたウイルス(GLV−1h68)である、(82)または(83)に記載の方法;
(85)第1のLIVPウイルス試料が、配列番号10に記載のゲノムまたは配列番号10と少なくとも99%同一であるゲノムを有するLIVPを含むLIVPウイルス株である、(82)から(84)のいずれかに記載の方法;
(86)第1のLIVPウイルス試料が、LIVP株および他のウイルス株、ゲノムDNAまたはクローニングされたDNAに感染した細胞の増殖、次いで、培養物からのウイルス試料の単離により得られた混合物であり、前記試料が前記感染により生成された子孫ウイルスを含む、(82)から(85)のいずれかに記載の方法;
(87)他のウイルス株が、DNAウイルス、二本鎖RNAウイルス、一本鎖プラスセンスRNAウイルスおよび一本鎖マイナスセンスRNAウイルスから選択される、(86)に記載の方法;
(88)DNAウイルスが、アビポックスウイルス、粘液腫ウイルスまたはワクシニアウイルスなどのポックスウイルス;単純ヘルペスウイルス(HSV)、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン−バーウイルス(EBV)、ヘパドナウイルス、ポリオーマウイルス、パピローマウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルスなどのヘルペスウイルス;ならびにパルボウイルスなどの一本鎖DNAウイルスから選択される、(87)に記載の方法;
(89)他のウイルス株がワクシニア株である、(86)から(88)のいずれかに記載の方法;
(90)二本鎖RNAウイルスが、ロタウイルスなどのレオウイルスである、(87)に記載の方法;
(91)一本鎖プラスセンスRNAウイルスが、セネカバレーウイルス、コクサッキーウイルスまたはポリオウイルス、エンテロウイルスなどのピコルナウイルス;セムリキ森林熱ウイルスなどのトガウイルス;ならびにヒト免疫不全ウイルス(HIV)、マウスモロニー白血病ウイルス(MMLV)およびレンチウイルスなどのレトロウイルスから選択される、(87)に記載の方法;
(92)一本鎖マイナスセンスRNAウイルスが、インフルエンザウイルスなどのオルトミクソウイルス;ニューカッスル病ウイルス、麻疹ウイルスまたはムンプスウイルスなどのパラミクソウイルス;および水疱性口内炎ウイルス(VSV)などのラブドウイルスから選択される、(91)に記載の方法;
(93)試料からの単一クローン単離物がプラークアッセイにより選択される、(82)から(92)のいずれかに記載の方法;
(94)プラークアッセイにおける最大のプラークが選択される、(93)に記載の方法;
(95)少なくとも最大の2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個のプラークがクローン単離物として選択および単離され、それぞれがステップ(iii)および(iv)で毒性および抗腫瘍形成性についてアッセイされる、(94)に記載の方法;
(96)選択されるプラークがLIVPウイルス試料により生成されるプラークの平均プラークサイズよりも大きい、(93)から(95)のいずれかに記載の方法;ならびに
(97)(82)から(96)のいずれかに記載の方法により製造されるクローン株。
本発明には、さらに、以下の実施態様が挙げられる。
(1’)ゲノムが配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含むクローン株以外の単離されたLIVPクローン株であって、
クローン株が非ウイルス異種タンパク質をコードするオープンリーディングフレームを含有する非ウイルス異種核酸を含有するように改変されず;かつ
クローン株がGLV−1h68と比較してより高い抗腫瘍形成性および/または低下した毒性を有し、ここでGLV−1h68は配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有する、
単離されたLIVPクローン株;
(2’)配列番号10に記載のヌクレオチド配列と少なくとも85%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むが、配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含まない、(1’)に記載の単離されたLIVPクローン株;
(3’)a)配列番号1のヌクレオチド2256〜181,114、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870;または
b)配列番号1のヌクレオチド10,073〜180,095、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870の配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
から選択されるヌクレオチド配列を含む、(1’)または(2’)に記載の単離されたクローン株;
(4’)配列番号1、2、4、5、6、7もしくは8に記載のヌクレオチド配列、または配列番号1、2、4、5、6、7もしくは8に記載のヌクレオチド配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、(1’)から(3’)のいずれかに記載の単離されたクローン株;
(5’)(1’)から(4’)のいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株を増殖させることにより製造された、LIVP調製物;
(6’)(1’)から(4’)のいずれかに記載のクローン株を含む、細胞培養物または単離された細胞;
(7’)(6’)に記載の細胞または細胞培養物を増殖させること;および
得られた細胞からLIVPクローンを単離すること
により製造された、単離されたクローン株;
(8’)(1’)から(4’)または(7’)のいずれかに記載のLIVPクローン株のゲノム;および
前記ゲノムにおいて異種遺伝子産物をコードする核酸
を含む、組換えLIVPウイルス株;
(9’)異種遺伝子産物が治療剤または診断剤である、(8’)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(10’)異種遺伝子産物が、抗がん剤、抗転移剤、抗血管新生剤、免疫調節分子、抗原、細胞マトリックス分解遺伝子、組織再生およびヒト体細胞の多能性細胞への再プログラミングに関する遺伝子、検出可能な生成物もしくはシグナルを生成するように基質を改変する、あるいは抗体により検出可能である酵素、造影剤に結合することができるタンパク質、光学画像化または検出のための遺伝子、PET画像化のための遺伝子ならびにMRI画像化のための遺伝子から選択される、(8’)または(9’)に記載の組換えLIVPウイルス株;
(11’)異種遺伝子産物が、ホルモン、成長因子、サイトカイン、ケモカイン、共刺激分子、リボザイム、輸送タンパク質、一本鎖抗体、アンチセンスRNA、プロドラッグ変換酵素、siRNA、マイクロRNA、毒素、抗腫瘍オリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がんポリペプチド抗生物質、血管新生阻害剤、腫瘍抑制因子、細胞傷害性タンパク質、細胞増殖抑制タンパク質および組織因子から選択される治療剤である、(8’)から(10’)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(12’)異種遺伝子産物が、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、単球走化性タンパク質−1(MCP−1)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−24(IL−24)、インターフェロンγ誘導性タンパク質10(IP−10)、Tリンパ球上で発現される受容体であるHVEMについてHSV糖タンパク質Dと競合するリンホトキシン誘導性発現物(LIGHT)、p60スーパー抗原、OspF、OspG、シグナル伝達兼転写活性化因子(STAT1α)、STAT1β、プラスミノゲンk5ドメイン(hK5)、色素上皮分化因子(PEDF)、一本鎖抗VEGF抗体、一本鎖抗DLL4抗体、一本鎖抗線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、NM23、カドヘリン1(ECADまたはcdh1)、リラキシン1(RLN1)、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、エリスロポエチン(EPO)、マイクロRNA126(miR−126)、マイクロRNA181、マイクロRNA335、マンガナーゼスーパーオキシドジスムターゼ(MnSOD)、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ1(HACE1)、ナトリウム利尿ペプチド前駆体A(nppa1)、カルボキシペプチダーゼG2(CPG2)、アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)、CDC6、および骨形成タンパク質4(BMP4)から選択される治療剤である、(8’)から(11’)のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株;
(13’)薬学的に許容される担体において(1’)から(5’)または(7’)から(12’)のいずれかに記載のウイルス株を含む、医薬組成物;
(14’)(8’)から(12’)のいずれかに記載のLIVPウイルス株を含む、単離された宿主細胞または細胞培養物;
(15’)対象における腫瘍または転移の検出において使用するための組成物であって、
組成物が(8’)から(10’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含み;かつ
ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、
組成物;
(16’)対象における腫瘍または転移を検出するための医薬組成物の調製における使用のための(8’)から(10’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用であって、ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、使用;
(17’)宿主におけるウイルス複製の検出において使用するための組成物であって、
組成物が(8’)から(10’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含み;かつ
ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、
組成物;
(18’)宿主におけるウイルス複製を検出するための医薬組成物の調製における使用のための(8’)から(10’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用であって、ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、使用;
(19’)(1’)から(5’)または(7’)から(12’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含む、対象における増殖性疾患を処置するための使用のための組成物;
(20’)対象における増殖性障害の処置のための医薬組成物の調製のための、(1’)から(5’)または(7’)から(12’)のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用;
(21’)増殖性障害ががんである、(19’)に記載の組成物または(20’)に記載の使用;
(22’)がんが乳がん、前立腺がん、卵巣がん、肺がん、結腸がんまたは膵がんである、(21’)に記載の組成物または使用;
(23’)がんが固形腫瘍がんまたは転移がんである、(21’)または(22’)に記載の組成物または使用;
(24’)腫瘍または転移が乳房腫瘍、前立腺腫瘍、卵巣腫瘍、肺腫瘍、結腸腫瘍、または膵腫瘍である、(23’)に記載の組成物または使用;
(25’)(i)異なるゲノム配列を有するウイルス粒子の混合物を含有する第1のLIVPウイルス試料を用意すること;
(ii)試料から単一のクローン単離物を選択および単離すること;
(iii)毒性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;
(iv)抗腫瘍形成性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;ならびに
(v)参照LIVPウイルス株と比較してより高い抗腫瘍形成性および低下した毒性を示すクローン株を選択すること
を含み、それによって低下した毒性およびより高い抗腫瘍形成性を示すクローン単離物が、がん療法またはがん診断のためのLIVPクローン株であると同定される、がん療法およびがん診断のためのLIVPクローン株を選択する方法;
(26’)参照LIVPウイルスが弱毒化組換えLIVPウイルスである、(25’)に記載の方法;
(27’)参照LIVPウイルスが、ゲノムが配列番号9に記載のヌクレオチド配列を含むGLV−1h68と命名されたウイルス(GLV−1h68)である、(25’)または(26’)に記載の方法;
(28’)試料からの単一クローン単離物がプラークアッセイにより選択され、プラークアッセイにおける最大のプラークが選択される、(25’)から(27’)のいずれかに記載の方法;ならびに
(29’)(25’)から(28’)のいずれかに記載の方法により製造される、クローン株。

Claims (29)

  1. ゲノムが配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含むクローン株以外の単離されたLIVPクローン株であって、
    クローン株が非ウイルス異種タンパク質をコードするオープンリーディングフレームを含有する非ウイルス異種核酸を含有するように改変されず;かつ
    クローン株がGLV−1h68と比較してより高い抗腫瘍形成性および/または低下した毒性を有し、ここでGLV−1h68は配列番号9に記載のヌクレオチド配列を有する、
    単離されたLIVPクローン株
  2. 配列番号10に記載のヌクレオチド配列と少なくとも85%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むが、配列番号10に記載のヌクレオチド配列を含まない、請求項1に記載の単離されたLIVPクローン株。
  3. a)配列番号1のヌクレオチド2256〜181,114、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870;または
    b)配列番号1のヌクレオチド10,073〜180,095、配列番号2のヌクレオチド11,243〜182,721、配列番号4のヌクレオチド6,264〜181,390、配列番号5のヌクレオチド7,044〜181,820、配列番号6のヌクレオチド6,674〜181,409、配列番号7のヌクレオチド6,716〜181,367もしくは配列番号8のヌクレオチド6,899〜181,870の配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
    から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項1または2に記載の単離されたクローン株。
  4. 配列番号1、2、4、5、6、7もしくは8に記載のヌクレオチド配列、または配列番号1、2、4、5、6、7もしくは8に記載のヌクレオチド配列に対して少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項1からのいずれかに記載の単離されたクローン株。
  5. 請求項1からのいずれかに記載の単離されたLIVPクローン株を増殖させることにより製造されたLIVP調製物。
  6. 請求項1からのいずれかに記載のクローン株を含む細胞培養物または単離された細胞。
  7. 請求項に記載の細胞または細胞培養物を増殖させること;および
    得られた細胞からLIVPクローンを単離すること
    により製造された単離されたクローン株。
  8. 請求項1からまたはのいずれかに記載のLIVPクローン株のゲノム;および
    前記ゲノムにおいて異種遺伝子産物をコードする核酸
    を含む、組換えLIVPウイルス株。
  9. 異種遺伝子産物が治療剤または診断剤である、請求項に記載の組換えLIVPウイルス株。
  10. 異種遺伝子産物が、抗がん剤、抗転移剤、抗血管新生剤、免疫調節分子、抗原、細胞マトリックス分解遺伝子、組織再生およびヒト体細胞の多能性細胞への再プログラミングに関する遺伝子、検出可能な生成物もしくはシグナルを生成するように基質を改変する、あるいは抗体により検出可能である酵素、造影剤に結合することができるタンパク質、光学画像化または検出のための遺伝子、PET画像化のための遺伝子ならびにMRI画像化のための遺伝子から選択される、請求項8または9に記載の組換えLIVPウイルス株。
  11. 異種遺伝子産物が、ホルモン、成長因子、サイトカイン、ケモカイン、共刺激分子、リボザイム、輸送タンパク質、一本鎖抗体、アンチセンスRNA、プロドラッグ変換酵素、siRNA、マイクロRNA、毒素、抗腫瘍オリゴペプチド、有糸分裂阻害タンパク質、抗有糸分裂オリゴペプチド、抗がんポリペプチド抗生物質、血管新生阻害剤、腫瘍抑制因子、細胞傷害性タンパク質、細胞増殖抑制タンパク質および組織因子から選択される治療剤である、請求項から10のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株。
  12. 異種遺伝子産物が、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、単球走化性タンパク質−1(MCP−1)、インターロイキン−6(IL−6)、インターロイキン−24(IL−24)、インターフェロンγ誘導性タンパク質10(IP−10)、Tリンパ球上で発現される受容体であるHVEMについてHSV糖タンパク質と競合するリンホトキシン誘導性発現物(LIGHT)、p60スーパー抗原、OspF、OspG、シグナル伝達兼転写活性化因子(STAT1α)、STAT1β、プラスミノゲンk5ドメイン(hK5)、色素上皮分化因子(PEDF)、一本鎖抗VEGF抗体、一本鎖抗DLL4抗体、一本鎖抗線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、NM23、カドヘリン1(ECADまたはcdh1)、リラキシン1(RLN1)、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、エリスロポエチン(EPO)、マイクロRNA126(miR−126)、マイクロRNA181、マイクロRNA335、マンガナーゼスーパーオキシドジスムターゼ(MnSOD)、E3ユビキチンタンパク質リガーゼ1(HACE1)、ナトリウム利尿ペプチド前駆体A(nppa1)、カルボキシペプチダーゼG2(CPG2)、アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)、CDC6、および骨形成タンパク質4(BMP4)から選択される治療剤である、請求項から11のいずれかに記載の組換えLIVPウイルス株。
  13. 薬学的に許容される担体において請求項1から5または7から12のいずれかに記載のウイルス株を含む医薬組成物。
  14. 請求項から12のいずれかに記載のLIVPウイルス株を含む、単離された宿主細胞または細胞培養物。
  15. 対象における腫瘍または転移の検出において使用するための組成物であって、
    組成物が請求項8から10のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含み;かつ
    ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、
    組成物
  16. 対象における腫瘍または転移を検出するための医薬組成物の調製における使用のための請求項8から10のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用であって、ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、使用。
  17. 宿主におけるウイルス複製の検出において使用するための組成物であって、
    組成物が請求項8から10のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含み;かつ
    ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、
    組成物
  18. 宿主におけるウイルス複製を検出するための医薬組成物の調製における使用のための請求項8から10のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用であって、ウイルスが検出可能なタンパク質または検出可能なシグナルを誘導するタンパク質をコードする核酸を含む、使用。
  19. 請求項1から5または7から12のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株を含む、対象における増殖性疾患を処置するための使用のための組成物。
  20. 対象における増殖性障害の処置のための医薬組成物の調製のための請求項1から5または7から12のいずれかに記載のLIVPウイルスまたはクローン株の使用。
  21. 増殖性障害ががんである、請求項19に記載の組成物または請求項20に記載の使用。
  22. がんが乳がん、前立腺がん、卵巣がん、肺がん、結腸がんまたは膵がんである、請求項21に記載の組成物または使用。
  23. がんが固形腫瘍がんまたは転移がんである、請求項21または22に記載の組成物または使用。
  24. 腫瘍または転移が乳房腫瘍、前立腺腫瘍、卵巣腫瘍、肺腫瘍、結腸腫瘍、または膵腫瘍である、請求項23に記載の組成物または使用。
  25. (i)異なるゲノム配列を有するウイルス粒子の混合物を含有する第1のLIVPウイルス試料を用意すること;
    (ii)試料から単一のクローン単離物を選択および単離すること;
    (iii)毒性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;
    (iv)抗腫瘍形成性についてそれぞれのクローン単離物をアッセイすること;ならびに
    (v)参照LIVPウイルス株と比較してより高い抗腫瘍形成性および低下した毒性を示すクローン株を選択すること
    を含み、それによって低下した毒性およびより高い抗腫瘍形成性を示すクローン単離物が、がん療法またはがん診断のためのLIVPクローン株であると同定される、がん療法およびがん診断のためのLIVPクローン株を選択する方法。
  26. 参照LIVPウイルスが弱毒化組換えLIVPウイルスである、請求項25に記載の方法。
  27. 参照LIVPウイルスが、ゲノムが配列番号9に記載のヌクレオチド配列を含むGLV−1h68と命名されたウイルス(GLV−1h68)である、請求項25または26に記載の方法。
  28. 試料からの単一クローン単離物がプラークアッセイにより選択され、プラークアッセイにおける最大のプラークが選択される、請求項25から27のいずれかに記載の方法。
  29. 請求項25から28のいずれかに記載の方法により製造されるクローン株。
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