FI95135B - Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi - Google Patents

Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi Download PDF

Info

Publication number
FI95135B
FI95135B FI885045A FI885045A FI95135B FI 95135 B FI95135 B FI 95135B FI 885045 A FI885045 A FI 885045A FI 885045 A FI885045 A FI 885045A FI 95135 B FI95135 B FI 95135B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
polymer
nucleotide
poly
solution
case
Prior art date
Application number
FI885045A
Other languages
English (en)
Swedish (sv)
Other versions
FI885045A0 (fi
FI95135C (fi
FI885045A (fi
Inventor
De Lassauniere Pierre Chabrier
Acaye Soudhir Colote
Original Assignee
Sod Conseils Rech Applic
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Sod Conseils Rech Applic filed Critical Sod Conseils Rech Applic
Publication of FI885045A0 publication Critical patent/FI885045A0/fi
Publication of FI885045A publication Critical patent/FI885045A/fi
Publication of FI95135B publication Critical patent/FI95135B/fi
Application granted granted Critical
Publication of FI95135C publication Critical patent/FI95135C/fi

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • C12P19/28N-glycosides
    • C12P19/30Nucleotides
    • C12P19/34Polynucleotides, e.g. nucleic acids, oligoribonucleotides
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10STECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S435/00Chemistry: molecular biology and microbiology
    • Y10S435/814Enzyme separation or purification
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10STECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S435/00Chemistry: molecular biology and microbiology
    • Y10S435/814Enzyme separation or purification
    • Y10S435/815Enzyme separation or purification by sorption

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Description

95135
Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi Förfarande för framställning av polynukleotider
Kyseinen keksintö koskee parannettua menetelmää polynukleotidien (homo- ja kopolynukleotidien) saamiseksi sekä mainittujen komplekseja. Eri polynukleotidejä on valmistettu olemassa olevien menettelyiden mukaan, mutta toistaiseksi useimmat saaduista tuotteista ovat yleensä ollet pyrogeenisiä tai enemmän tai vähemmän myrkyllisiä johtuen tiettyjen epäpuhtauksien tai aineiden ilmaantumisesta mukaan haluttuihin tuotteisiin johtavissa valmistusvaiheissa. Nämä yhdisteet soveltuvat apuaineiksi eri terapeuttisiin sovellutuksiin sekä eritoten syövän hoitoon, tiettyjen bakteeri- tai virusperäisten sairauksien hoitoon sekä rokotteissa käytettäväksi.
Yleensä ottaen polynukleotidejä saadaan jonkin polynukleotidi-fosforylaasin vaikuttaessa tarkoituksenmukaiseen polynukleoti-dimonomeeriin. Mahdolliset eri monomeerit, kuten ADP, CDP, GCP, IDP ja UDP, saadaan myös tunnettujen menettelyiden mukaan. Polynukleotidifosforylaasi saadaan myös tunnettujen menettelyiden avulla jostain bakteeriviljelmästä lähtien, jolloin kasvatusta seuraten sanotun viljelmän bakteereihin tuotetaan lyysi, jota seuraa lyysissä saadun polynukleotidi-fosforylaasin uuttaminen mutkikkaasta kasvualustasta, jossa saattaa esiintyä eri entsyymejä, kuten kinaaseja, fosfataase-ja, nukleaaseja, diesteraaseja jne., jotka kaikki ovat kilpailevia tekijöitä, kun jatkovaiheena valittuna nukleotidimono-meeriä polymeroidaan polynukleotidifosforylaasilla. Erilaisten epätoivottavien entsyymien läsnäolo johtaa epätoivottaviin rinnakkaisreaktioihin sekä polymeroitavan monomeerin että tuotetun polymeerin osittaiseen hajoamiseen.
Näistä syistä molemmat täten saaduista polynukleotideistä ovat ominaisuuksissaan puutteellisia joko myrkyllisyytensä tai pyrogeenisten ominaisuuksiensa tai molempien osalta. Vaikka saattaa olla mahdollista valmistaa hyväksyttävän puhtausasteen omaava polynukleotidifosforylaasi pienessä mittakaavassa 2 95135 analyysitarkoituksiin tai rajoitettujen tieteellisiä kokeita varten, tähän ei päästä helposti hyväksyttävin kustannuksin teollisia prosessointimenettelyitä käytettäessä.
Tämän keksinnön mukaan on todettu mahdolliseksi saada teollisesti hyväksyttävissä olosuhteissa oleellisesti puhtaita homopolymeerejä tai kopolymeerejä tai polynukleotidi- tai sukulaisanalogikomplekseja käyttämällä polymeroivana aineena erilaisilla aiemmin julkistetuilla menetelmillä saatujen polynukleotidifosforylaasivalmisteiden menetelmillä saatujen polynukleotidifosforylaasivalmisteiden asemesta erittäin puhdasta entsyymiä, joka ei sisällä epätoivottaviin reaktioihin johtavia epäpuhtauksia. Nukleotidien sukulaisanalogeja ovat esimerkiksi ADP:n 6-hydroksialkyylijohdannaiset tai UDP:n 5-halogeeni- tai 5-hydroksyyli- tai 5-metyylijohdannaiset.
Erityisesti on todettu, että jotain bakteerikantaa viljelemällä ja tuottamalla lyysi näin saatuun viljelmään saatu kasvu-alustaseos tulisi käyttää toisiaan seuraten kolmessa kolonnissa, jolloin niistä ensimmäinen sisältää ioninvaihtohartsia kuten DEAE-Sephacel®-hartsia tai vastaavaa, toinen kolonnin sisältää hydrofobista hartsia kuten fenyyli-Sepharose®-hartsia tai vastaavaa ja kolmas kolonni sisältää molekyyliseulan kuten Sephacryl R® S300 tai Sephadex®200 tai muu vastaava.
Sanotusta kolmannesta kolonnista saatava tuote käsittää oleellisesti vain - mutta ei yksinomaan - polynukleotidifosforylaa-sia sekä hivenmääriä aineita, joilla ei ole vaikutusta polyme-rointiprosessin jatkovaiheisiin.
Haluttaessa valmistaa homopolymeeri saatu polynukleotidifosfo-rylaasia käytetään valitun monomeerin polymerointiin tavallisten lisäaineiden läsnäollessa.
Haluttaessa valmistaa kopolymeeri valittu monomeeri korvataan seoksella, jossa on sopivassa suhteessa valittuja monomeerejä. Sanottu kopolymeeri merkitään lyhenteellä Poly A/Poly U.
li 3 95135
Haluttaessa valmistaa kompleksi kyseinen polymerointi suoritetaan kullakin sopivista monomeereistä ja saatavat homopolymee-rit sekoitetaan sopivassa suhteessa natriumkloridin läsnäollessa ja saostetaan etanolilla.
Keksinnön erään keskeisen piirteen mukaan valitun monomeerin tai valitun monomeeriseoksen polymerointi suoritetaan tavanomaisista poikkeavista olosuhteissa. Nimenomaan käytettävät pitoisuudet ovat huomattavasti korkeammat kuin tavanomaiset arvot (noin 30 - - noin 100-kertaiset, edullisesti 50-kertai-set) ja polymerointi suoritetaan lisäämällä kontrolloidulla tavalla magnesiumkloridia, jolloin pH-arvo pidetään välillä 7,4 - 8,6 ja polymerointi kestää noin 3-6 päivää.
Saatavien polymeerien tai kopolymeerien molekyylipaino sijoittuu alueella, jolta saadaan noin 250 000 - noin 1 500 000 molekyylipainon omaavia komplekseja, jolloin polymeroitumisno-peus on tasainen ja polymerointituotteen saanto jopa 90-95 %.
Keksintö on paremmin ymmärrettävissä seuraavan, viittä perättäistä vaihetta koskevan kuvauksen avulla, jolloin lähdetään alkuperäisestä bakteeriviljelmästä (tässä E.coli. jolloin muutkin bakteerit soveltuvat käytettäviksi) ja saadaan Poly A/ Poly U-kompleksi.
Vaihe 1: E.coli-kannan B 1/5 kasvatus.
Viljelmää säilytetään vinopinnoilla ympäristön lämpötilassa. Kasvualusta sisältää litraa kohden 10 g natriumkloridia, 10 g Trypicase-valmistetta ja 5 g hiivauutetta. Alustaa steriloidaan 45 minuutin ajan 110°C:ssa, minkä jälkeen lisätään erik-• seen steriloitua glukoosiliuosta pitoisuuteen 2 g/litra. Esi-viljelmät valmistetaan 10 ml:aan kasvualustaa, minkä jälkeen valmistetaan 200 ml:n kasvualustaerä 10 litran viljelmää varten.
95135 4
Viljelmän sekoitusnopeus on 470 kierr./min ja sitä ilmaistaan 8 litralla ilmaa/min. Soluluvun kahdentumisaika on 600 nm:n aallonpituudella mitattuna 30 minuuttia ja bakteerit kerätään talteen, kun optinen tiheys 600 nm:ssä on 6. Saadaan noin 8 g bakteereita litrasta viljelmää. Fermentaatio-pH pidetään arvossa 6,5 - 6,8 2 N ammoniumhydroksidiliuosta lisäämällä. Ellei viljelmää käytetä välittömästi edelleen, sitä säilytetään -20°C:ssa.
Vaihe 2: bakteerilyysi.
puskuri A 5 x 10~2 M Tris-HCl, pH 7,9 (25°C), joka sisältää 2 x 10"3 M EDTA, 0,233 M NaCl (13,63 g/litra) ja 5 % glyserolia (50 ml/litra) puskuri B 10“2 M Tris-HCl, pH 7,9, joka sisältää 10“4 M EDTA, 0,2 M NaCl ja 5 % glyserolia - 165 g bakteereita varten (20 litran viljelmä)
Juuri ennen käyttöä 400 ml:aan puskuria A lisätään 0,4 ml di-tiotreitolia (DTTrtä) 0,1 m (15,4 mg/ml) huoneen lämpötilassa ja sitten 28 μΐ merkaptoetanolia, 45 mg lysotsyymiä ja 14 mg fenyylimetyylisulfonyylifluoridia (PMSF) liuotettuna 4 ml:aan . etanolia. Jäähdytetyt bakteerit (165 g) lietetään tähän kasvu alustaan sekoittimessa (loppulämpötila noin 10°C), minkä jälkeen saadun suspension annetaan lämmetä 15°C:seen samalla silloin tällöin sekoittaen (kesto noin 20 minuuttia), ja tämän jälkeen lisätään 272 mg natriumdeoksikolaattia samalla sekoittaen ja sitten 4 mg deoksiribonukleaasia (DNA-aasia). Lyysi-seos jätetään seisomaan 20 minuutiksi, jon aikana sitä sekoitetaan silloin tällöin ja lämpötila pidetään 20°C:ssa. Seokseen lisätään 400 ml puskuria B sekä 0,4 ml 0,1 M DDT-liuosta samalla sekoittaen, minkä jälkeen suspensiota sentrifugoidaan 16 000 x g:ssa (10 000 kierr./min Sorvall-sentrifugissa) tunnin ajan 5°C:ssa.
Il 5 95135 DNA-aasi 50 679 Dornase-yksikköä/mg. lysotsyymi 25 000 yksikköä/mg.
Sentrifugoinnista saatu supernatantti (noin 900 ml) laimennettiin litraksi lisäämällä tislattua vettä ja proteiini saostettiin lisäämällä 4°C:ssa 280 g ammoniumsulfaattia (45 %:n kyllästysaste) samalla sekoittaen ja jättämällä seos sitten seisomaan 4°C:seen 2 tunniksi. Proteiini otettiin talteen sentrifugoimalla 16 000 x g:ssa 5°C:ssa 30 minuutin ajan. Saostuma (supematantit heitettiin pois) liuotettiin 150 ml:aan 10"2 M Tris-HCl-puskuria, pH 7,8, minkä jälkeen liuosta sentrifugoitiin 20 minuutin ajan 16 000 x g:ssa ei-liukoisen aineksen poistamiseksi. Supernatantteja dialysoi-tiin 4 vaihtoerää liuosta vastaan, joka käsitti 2 litran erinä 5 x 10"2 M Tris-HCl-puskuria, pH 7,8, yli 18 tunnin ajan 4°C lämpötilassa, minkä jälkeen liuosta sentrifugoitiin tunnin ajan 16 000 x g:ssä ei-liukoisen aineksen poistamiseksi.
300 ml, pH 7,8, johtokyky < 7,0 ms.
Vaihe 3: E.coli B 1/5 polynukleotidifosforylaasin (PNP-aasin) puhdistus 1. Edellä saadut supematantit käytettiin kolonnissa, jossa oli 280 ml DEAE-Sephacel-valmistetta, ja jonka mitat olivat 40 x 3 cm ja jota oli tasapainotettu 0,1 M Tris-HCl-puskuril-la, pH 7,4, 4°C:ssa, jolloin kolonnia eluoitiin gradientilla 1 litrassa 0,1 M Tris-HCl-puskuria, pH 7,4, 1 litraan 0,1 M Tris-HCl-puskuria, pH 7,4, jossa 0,4 M natriumkloridia, keräten 10 ml:n fraktioita. Eluoitava diesteraasiaktiivisuuden tuottama piikki edeltää polynukleotidifosforylaasiaktiivisuu-' den toista piikkiä, jonka tuottavat fraktiot 105-125 eluentti-pitoisuudessa 0,21 M NaCl, 0,1 M Tris-HCl.
Tilavuus 210 ml, 107 yksikköä/ml, kokonaisaktiivisuus 22 470.
6 95135 2. Tähän liuokseen lisättiin samalla sekoittaen 28 g ammonium-sulfaattia, jolloin pitoisuudeksi sen suhteen tuli 0,5 M, minkä jälkeen liuos panostettiin kolonniin, joka sisälsi 60 ml fenyyli-Sepharose-valmistetta, ja jonka mitat olivat 19 x 2 cm ja jota oli tasapainostettu liuoksella, jossa oli 0,5 M ammo-niumsulfaattia ja 0,05 M Tris-HCl:ää, pH 7,4. Kolonnia pestiin noin 20 ml :11a liuosta, jossa oli 0,5 M ammoniumsulfaattia ja 0,1 M Tris-HCl:ää, pH 7,4, minkä jälkeen sitä eluoitiin 4°C:ssa käänteisgradientilla 250 ml:sta 0,4 M Tris-HCl:ää, pH 7,8, ja 0,1 M ammoniumsulfaattia, pitoisuuteen 3 x 10-3 M Tris-HCl:ää, pH 7,8. Kerättiin noin 10 ml:n fraktioita, ja aktiivisuutta sisältävät fraktiot yhdistettiin.
Tilavuus 55 ml, 355 yksikköä/ml, kokonaisaktiivisuus 19 525.
3. Proteiinin saostamiseksi lisättiin ammoniumsulfaattia (20 g) (55 %:n kyllästysaste) samalla sekoittaen, minkä jälkeen saostunut proteiini jätettiin seisomaan 4°C:een tunniksi ja sentrifugoitiin sitten 15 minuutin ajan 16 000 x g:ssä.
Saatu saostuma liuotettiin minimimäärään liuosta, jossa oli 0,1 M natriumkloridia ja 0,05 M Tris-HCl:ää, pH 7,4 (noin 10 ml), ja liuos panostettiin kolonniin, jossa oli 350 ml Sephacryl S300-valmistetta, ja jonka mitat olivat 50 x 3 cm ja jota oli tasapainotettu liuoksella, jossa oli 0,1 M natriumkloridia ja 0,05 M Tris-HCl:ää, pH 7,4, minkä jälkeen entsyymi eluoitiin samaa puskuria käyttäen (noin 10 ml:n fraktioita), ja yhdistettiin aktiivisuutta sisältävät fraktiot (13-17).
Tilavuus 60 ml, 312,5 yksikköä/ml, kokonaisaktiivisuus 18 750. 540 yksikköä, aallonpituudessa 280 nm.
Entsyymi saostettiin lisäämällä 26 g ammoniumsulfaattia (65 %:n kyllästysaste) ja saatua suspensiota säilytettiin -30°C:ssa.
11 v 95135
Vaihe 4 ·. Polymeerien valmistaminen.
100 g ADP-NA2:ta (tai 100 g UDP-Na3:a) liuotetaan noin 600 ml:aan vettä, ja saatu liuos lisätään seu-raaviin: 200 ml M Tris-HCl, pH 8,3 250 ml M ammoniumasetaatti 20 ml O, IM EDTA, pH 8,0 100 ml M magnesiumkloridi 2 litran reaktiokolvissa. Tilavuus täytettiin 2 litraksi vedellä ja pH säädettiin 8,6:ksi huoneen lämpötilassa lisäämällä 5 N ammoniumhydroksidiliuosta. Liuospinta peitettiin tolueenikerroksella. Käytettävien nukleosididifosfaattien ei tule sisältää kontaminoituvia metalleja kuten Fe3+ tai Cu2+.
Erä edeltävää seosta (80 ml) lisättiin 200 yksikköön entsyymiä ja 2 ml:aan aiemmin valmistettua Poly-A:ta (tai Poly-U:ta) pohjusteena, ja inkuboitiin liuosta 37°C:ssa 2 tunnin ajan, minkä jälkeen se siirrettiin 37°C:ssa pidettyyn pääkasvatus-erään. Neljän tunnin kuluttua lisättiin vielä 300 yksikköä entsyymiä ja jatkettiin inkubointia. pH laski 24 tunnin kuluessa noin 8,3 reen ja sitä pidettiin mainitusta ajankohdasta eteenpäin arvossa 8,0 - 8,3 5N ammoniumhydroksidiliuosta lisäämällä.
Entsyymin kokonaismäärä oli 500 yksikköä, eli 5 yksikköä/g.
Jos polymeroituminen on edennyt alle 15 %:n polymeroitumisas-tetta vastaavasti, entsyymiä voidaan lisätä sopivina ajankohtina nopeuden kasvattamiseksi.
Magnesiumkloridia lisätään 25 ml:aan erinä lisää samalla kiivaasti sekoittaen, kun polymeroitumisaste on noin 30 %, 55 % ja 75 % (kaikkiaan 175 mmol magnesium-ioneja 200 nmol ADP:tä tai UDP:tä kohden), jolloin pH pidetään arvossa 8,0 - 8,3 (37°C:ssa mitattuna). Kolmen, neljän päivän kuluttua polymeroitumisasteen tulisi olla 80 - 90 %.
95135 8
Lisäämällä magnesiumkloridia pienissä erissä vapaan ADP:n (tai UDP:n) ja magnesium-ionin välinen suhde pysyy noin arvossa 2 edellä mainituissa polymeroitumisasteissa.
Inkuboinnin päätyttyä seos sentrifugoidaan saostuneen ammo-nium-magnesiumfosfaatin poistamiseksi ja saatu sakka pestään pienellä määrällä vettä, jolloin yhdistettyjä supernatantti-eriä käytetään kompleksin Poly A/Poly U valmistuksessa.
Polymeroinnin optimiolosuhteet ovat pH 8,0 - pH 8,3, magne-siumkloridin vaiheittainen lisääminen ja riittävä määrä entsyymiä, jotta polymeroitumisnopeus on noin 30 % päivässä.
Inkuboinnin korkeampi pH (8,3 - 8,6) tuottaa pienikokoisempia polymeerejä. Samoin käytettävän magnesium-ionimäärän lisääminen kokonaisuudessaan inkubointia aloitettaessa tuottaa pienikokoisempia polymeerejä.
Vaihe 5: Poly A/Poly U-kompleksin valmistus.
Liuoksien kokonaisnukleotidipitoisuus määritetään hydrolysoimalla inkubointiseos 0,1 N natriumhydroksidiliuoksessa 100°C:ssa 5 minuutin aikana, jolloin käytetään Poly-A:n lOOOx ja Poly-U:n 500x laimennosta (esim. 10 μΐ Poly-A:ta tai 20 μΐ Poly-U:ta 10 ml:ssa 0,1 N natriumhydroksidiliuosta tai suuremmassa tarkassa määrässä, jos välilaimennokset ovat 100 μΐ Poly-A:ta ja 200 μΐ poly-U:ta). Absorbanssit mitataan 260 nm:n aallonpituudella ja molaarisuudet arvioidaan seuraavia arvoja käyttäen.
A260 nm x 10'3 1 M-liuokselle pH 7,0 0,1 N NaOH (hydrolyysi)
Ap 15,0 15,3
Poly A 9,8 15,3
Up 10,0 -7,7
Poly U 9,5 7,7
II
9 95135
Polymeeripitoisuudet määritetään kokonaisnukleotidipitoisuu-desta ja polymeroitumis-%:sta. Sitten lasketaan tilavuudet soikiometriselle suhteella A/U = 1:1. Poly-U:hun lisätään 10 litran reaktiokolvissa 200 ml natriumkloridin 25 % vesi-liuosta ja sitten Poly-A-liuos, minkä jälkeen liuokset sekoitetaan perusteellisesti keskenään (natriumkloridin loppupitoi-suus noin 0,18 M) ja jätetään 4°C:seen vähintään 3 tunniksi.
Sitten lisätään vastaava tilavuus etanolia samalla sekoittaen Poly-A/Poly-U-kompleksin saostamiseksi ja seos jätetään 4^C:een tunniksi. Kompleksi otetaan talteen sentrifugoimal-la Sorvali 3 B-sentrifugissa (1 litran sentrifugipullot) 5000 kierr./min kierrosnopeudella 3 minuutin ajan, minkä jälkeen saostuma pestään 2 litralla 55 %:sta etanolia. Saostuma liuotetaan noin 4 litraan puhdasta vettä ja liuos sentrifugoi-daan mahdollisten ammoniummagnesiumfosfaattijäämien poistamiseksi. Kirkkaisiin supernatanttieriin lisätään 200 ml 25 %:sta natriumkloridiliuosta ja saatu seos jätetään 4°C:seen vähintään 3 tunniksi.
Kompleksi saostetaan toistamiseen lisäämällä vastaava tilavuus etanolia samalla sekoittaen, saostuma otetaan sentrifugoimalla talteen, pestään 55 %:lla etanolilla (noin 2 litraa), 75 %:lla etanolilla ja kahdesta 95 %lla etanolilla minkä jälkeen se kuivataan tyhjössä.
Saanto noin 110 - 120 g.
Yleensä ottaen kompleksin saostamiseksi 50 %:lla etanoliliuok-sella läsnä on oltava natriumkloridia (0,15 - 0,02 M). Pesussa ei ole syytä käyttää etanolia, jonka pitoisuus alittaa 55 % (saostunut kompleksi liukenee 50 %:seen etanoliin).
MYRKYLLISYYS
LD50-arvomääritykset suoritettiin käyttäen hiiriä ja rottia sekä i.p- ja i.v.-antoteitä.
10 95135
Kuolemia ei esiintynyt i.v. maksimiannoksella hiirissä eikä rotissa.
Samoin i.p.-annostelu ei aiheuttanut kuolemia rotissa, mutta hiirille todettiin i,p. noin 3 g:n/kg LDS0-arvo.
Tavanomaiset pyrogeenikokeet antoivat kokonaisuudessaan negatiivisen tuloksen.
FARMAKOLOGIA
Koska keksinnön mukaiset polymeerit ja kopolymeerit ovat yleisesti tunnettuja, joskaan niitä ei ole tähän mennessä koskaan saatu teollisessa mittakaavassa riittävän puhtaina, erilaisia farmakologisia kokeita on suoritettu jo useiden vuosien aikana, jolloin tuotenäytteet on otettu erikoistarkoituksiin puhdistetuista tuotteista, joita ei ole ollut todella saatavissa kaupallisesti hyväksyttävin ehdoin.
Keksinnön kiinnostavuuden todentamiseksi viitataan olemassa olevaan kirjallisuuteen sekä esimerkiksi seuraaviin artikkeleihin: 'Immuunijärjestelmän modulointi synteettisten polynukleotidin avulla', A.G.Johnson, Springer-seminaari, Immunopathol. 2 (1979) 149-168, 'Immuunijärjestelmän säätely synteettisten polynukleotidien avulla - I. Apuainevaikutuksen karakterisointi vasta-ainesyn-teesissä', J.R.Schidtke ja A.G.Johnson, J.Immunol. 106 (1971) 1191-1200, 'Muutokset imusolualapopulaatioissa hiirissä, jotka saavat yhden ruiskeen Poly A/Poly U-kompleksia', M.Donner, D.Vallier ja F.Lacour, Ann.Immunol. (Inst pasteur) 128C (1977) 1039-1052, 'Poly A/Poly U-kompleksin vaikutusskaala ja -tapa immuunivas-testimulaatiossa', V.Braun, M.Ishizuka, U.Yajima, D.Webb ja F.Winchurch julkaisussa: Beers, R.F., Braun, W. "Biological Effects of Polynecleotides", New York, Springer-Verlag, 1971, ss. 139-156, 11 95135 * 'Spontaanien rintarauhaskasvaimien alentunut esiintyminen C3H/He-hiirissä niiden hoitoa polyadenylaatti-polyuridylaatilia seuraten', F.Lacour, G.Delage ja C.Chianale, Science 187 (1975) 256-257, 'Poly A/Poly U leikkauksen tukiaineena hoidettaessa spontaania hiiren rintarauhassyöpää', F.Lacour, J.Lacour ja A.Spira Recent Results in Cancer Research. 47 352-256, 'Polyadenyyli-polyuridyylihappo: biologista vastetta muuntavat vaikutukset hiirissä. Jakaantuminen eri elimiin in vivo sekä farmakokinetiikka kaneissa'. F.Lacour, J.Biol. Resp. Modif. 4 (1985) 490-494, 'Faasi-I:n mukainen kliininen toleranssitutkimus polyadenyyli-polyuridyylihaposta syöpäpotilaassa', J.P.Ducret, P.Gaille, H.Sancho-Garnier, J.L.Amiel, M.Michelson, R.G.Hovanessian, J.K.Youn ja F.Lacour J.Biol.Resp.Modif. 4 (1985) 129-133.
ANNOSTELUMUOTO JA -MÄÄRÄ
Edullinen antotapa on i.v. isotoonista liuosta, joka sisältää 0,01 - 0,1 g vaikuttavaa ainesosaa. Viikottainen ruiske annetaan 6 viikon ajan.

Claims (1)

  1. 95135 Patenttivaatimus Menetelmä nukleotidipolymeerien valmistamiseksi, tunnettu siitä, että a) valmistetaan polynukleotidifosforylaasiliuos, joka ei oleellisesti sisällä polymerointiprosessin jatkovaiheisiin vaikuttavia aineita seuraavasti (i) Escherichia coli -bakteerikannan viljelmässä tuotetaan lyysi ja (ii) saatu kasvualustaseos käytetään toisiaan seuraten kolmessa kolonnissa: - ensimmäisessä, jossa ioninvaihtohartsina on N,N-dietyy-liaminoetyyliselluloosaa, - toisessa, joka sisältää hydrofobisen hartsin, joka on fenyyli-Sepharose R, ja - kolmannessa, joka sisältää molekyyliseulana Sephacryl R S300 tai Sephadex R 200 valmistetta, b) valittua nukleotidia käsitellään näin saadulla fosforylaa-silla, mikä käsittää 200 - 750 fosforylaasiyksikön saattamisen reagoimaan liuoksen kanssa, joka sisältää tavanomaiset puskurit sekä pitoisuuden 0,06 - 0,2 mmol/ml valittua mononukleo-tidiä magnesiumkloridin (MgCl2) läsnäollessa, jolloin viimemainittua lisätään polymeroitumisasteen kontrolloimiseksi vaiheittain, 3 päivästä 6 päivään ajan, jona aikana pH pidetään välillä 7,4 - 8,6, ja c) näin saatu polymeeri erotetaan ja pestään, jolloin valinnaisesti niin ikään polymeroidaan jokin toinen valittu nukleotidi edeltävän mukaisissa olosuhteissa, jossa tapauksessa kumpaakin valittua polymeeriä sekoitetaan veteen natriumklo-ridin (NaCl) läsnäollessa, jolloin lopuksi saatu kompleksi saostetaan etanolia lisäämällä. 11 95135 Förfarande för framställning av nukleotidpolymerer, k ä n -netecknat därav, att a) en polynukleotidfosforylaslösning framställs, som inte väsentligen innehäller ämnen som päverkar polymeriseringpro-cessens fortsatta steg (i) i en Echerichia coli-bakteriestams kultur produceras en lys och (ii) den erhällna växtmedieblandningen används successivt i tre kolonner: - i en första, där jonbytarhartsen är N,N-dietylamino-etylcellulosa, - i en andra, som innehäller en hydrofob harts, som är fenyl-Sepharose R, och - i en tredje, som innehäller som molekylscreen en Sephacryl R S300 eller Sephadex R 200 produkt, b) den valda nukleotiden behandlas med den sä erhällna fos-forylasen, som omfattar omsättningen av 200 - 750 fosforyla-senheter med en lösning, som innehäller de sedvanliga buffer-tarna samt en koncentration pä 0,06 - 0,2 mmol/ml av den valda mononukleotiden i närvaro av magnesiumklorid (MgCl2), varvid den sistnämnda tillsätts för att kontrollera polymerisätions-graden stegvis, under en tid av 3 dagar till 6 dagar, under vilken tid pH hälles vid mellan 7,4 - 8,6, och c) den sä erhällna polymeren separeras och tvättas, varvid eventuellt ocksä nägon annan vald nukleotid polymeriseras under ovan nämnda förhällanden, i vilket fall de bäda valda polymererna blandas i vatten i närvaro av natriumklorid (NaCl), varvid slutligen det erhällna komplexet utfälls genom att tillsätta etanol.
FI885045A 1987-11-02 1988-11-02 Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi FI95135C (fi)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB8725606 1987-11-02
GB878725606A GB8725606D0 (en) 1987-11-02 1987-11-02 Preparation polynucleotides

Publications (4)

Publication Number Publication Date
FI885045A0 FI885045A0 (fi) 1988-11-02
FI885045A FI885045A (fi) 1989-05-03
FI95135B true FI95135B (fi) 1995-09-15
FI95135C FI95135C (fi) 1995-12-27

Family

ID=10626275

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI885045A FI95135C (fi) 1987-11-02 1988-11-02 Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi

Country Status (29)

Country Link
US (1) US4927755A (fi)
JP (1) JPH0712316B2 (fi)
KR (1) KR0134624B1 (fi)
AR (1) AR244342A1 (fi)
AT (1) AT396251B (fi)
AU (1) AU610792B2 (fi)
BE (1) BE1001938A4 (fi)
CA (1) CA1339911C (fi)
CH (1) CH676248A5 (fi)
DE (1) DE3837203A1 (fi)
DK (1) DK607388A (fi)
ES (1) ES2009099A6 (fi)
FI (1) FI95135C (fi)
FR (2) FR2622586B1 (fi)
GB (2) GB8725606D0 (fi)
GR (1) GR1000715B (fi)
HK (1) HK47692A (fi)
IE (1) IE61610B1 (fi)
IT (1) IT1227447B (fi)
MY (1) MY103445A (fi)
NL (1) NL194949C (fi)
NO (1) NO172902C (fi)
NZ (1) NZ226643A (fi)
OA (1) OA10206A (fi)
PT (1) PT88903B (fi)
SE (1) SE503401C2 (fi)
SG (1) SG40792G (fi)
TN (1) TNSN88113A1 (fi)
ZA (1) ZA888180B (fi)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9108085D0 (en) * 1991-04-16 1991-06-05 Scras Complexes of polyadenylic acid with polyuridylic acid
AR013269A1 (es) * 1997-08-04 2000-12-13 Scras Producto que contiene por lo menos un rna de doble filamento combinado con por lo menos un agente anti-viral, para la utilizacion terapeutica en eltratamiento de una enfermedad viral, en especial de la hepatitis viral
EP2258712A3 (en) * 2002-03-15 2011-05-04 Multicell Immunotherapeutics, Inc. Compositions and Methods to Initiate or Enhance Antibody and Major-histocompatibility Class I or Class II-restricted T Cell Responses by Using Immunomodulatory, Non-coding RNA Motifs
US20060166315A1 (en) * 2002-12-26 2006-07-27 Masatoshi Murai Process for producing pnpase
EP1709197A4 (en) * 2003-12-30 2007-07-04 Sigma Aldrich Co RAPID PREPARATION OF NUCLEIC ACIDS BY ENZYMATIC DEPENDENCE
EP2281043B1 (en) 2008-04-25 2013-03-13 Innate Pharma Improved tlr3 agonist compositions
US20120171729A1 (en) * 2010-12-30 2012-07-05 Ibis Biosciences, Inc. Methods for the synthesis of polyadenylic acid

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU6012A1 (ru) * 1927-04-04 1928-07-31 Л.С. Кравцов Горизонтальный вод ной двигатель с поворотными лопаст ми
JPS4940954B1 (fi) * 1970-02-16 1974-11-06
DE2056081A1 (en) * 1970-11-14 1972-06-22 Pabst Brewing Company, Milwaukee, Wis. (V.StA.) Poly nucleotides prepn
IL37076A (en) * 1971-06-16 1974-05-16 Littauer U A method for stepwise synthesis of oligoribonucleotides of defined sequence using 2'(3')-o-acyl-nucleoside diphosphates and polynucleotide phosphorylase
JPS524633B2 (fi) * 1972-07-21 1977-02-05
GB1435571A (en) * 1973-04-02 1976-05-12 Searle & Co Polynucleotides
DE2319495C2 (de) * 1973-04-17 1985-01-10 Yeda Research And Development Co., Ltd., Rehovot Verfahren zum selektiven, reversiblen Binden von Biomolekülen an ein Adsorbens in einer chromatographischen Säule
FR2252350A1 (en) * 1973-11-22 1975-06-20 Choay Sa Polynucleotide phosphorylase - extraction from E coli, fixation on sepharose, and use in preparing polynucleotides
JPS50107187A (fi) * 1974-02-08 1975-08-23
US4006059A (en) * 1974-07-29 1977-02-01 Purdue Research Foundation Hydrophobic noncovalent binding of proteins to support materials
US4000098A (en) * 1974-08-16 1976-12-28 Palo Alto Medical Research Foundation Separation of proteins by hydrophobic adsorption
SU601287A1 (ru) * 1976-05-12 1978-04-05 Предприятие П/Я М-5043 Способ получени полирибонуклеотидов
US4075195A (en) * 1976-08-31 1978-02-21 Kraft, Inc. Debittered protein product and method for manufacture
SU619508A1 (ru) * 1976-12-07 1978-08-15 Предприятие П/Я Г-4740 Способ получени полинуклеотидов, обладающих полирибонуклеотидфосфорилазной активностью
JPS5922518B2 (ja) * 1977-03-09 1984-05-26 三菱化学株式会社 ポリグアニル酸の製造方法
JPS5618597A (en) * 1979-07-23 1981-02-21 Mitsubishi Chem Ind Ltd Production of oligonucleotide
US4379843A (en) * 1981-01-26 1983-04-12 Peter Cashion Immobilization of polynucleotides and polypeptides with tritylated polysaccharides
US4617376A (en) * 1985-07-01 1986-10-14 Eli Lilly And Company Process for recovering glucagon from pancreas glands
US4771128A (en) * 1986-10-10 1988-09-13 Cetus Corporation Method of purifying toxin conjugates using hydrophobic interaction chromatography

Also Published As

Publication number Publication date
GB8725606D0 (en) 1987-12-09
BE1001938A4 (fr) 1990-04-17
GB2211847B (en) 1992-01-22
JPH0712316B2 (ja) 1995-02-15
NO884865L (no) 1989-05-03
MY103445A (en) 1993-06-30
KR0134624B1 (ko) 1998-04-20
FR2622451B1 (fr) 1992-02-21
AU2442988A (en) 1989-05-04
GB2211847A (en) 1989-07-12
FR2622586A1 (fr) 1989-05-05
TNSN88113A1 (fr) 1990-07-10
GR1000715B (el) 1992-11-23
AU610792B2 (en) 1991-05-23
IE61610B1 (en) 1994-11-16
DK607388A (da) 1989-05-03
FI885045A0 (fi) 1988-11-02
DK607388D0 (da) 1988-11-01
ZA888180B (en) 1989-07-26
PT88903A (pt) 1988-11-01
NL194949C (nl) 2003-08-04
NL194949B (nl) 2003-04-01
NZ226643A (en) 1990-11-27
GB8825399D0 (en) 1988-11-30
IT8822471A0 (it) 1988-10-31
FI95135C (fi) 1995-12-27
KR890008163A (ko) 1989-07-10
JPH01148196A (ja) 1989-06-09
IT1227447B (it) 1991-04-11
AT396251B (de) 1993-07-26
SE8803930D0 (sv) 1988-10-31
IE883290L (en) 1989-05-02
DE3837203A1 (de) 1989-05-11
SE8803930L (sv) 1989-05-03
HK47692A (en) 1992-07-10
DE3837203C2 (fi) 1991-08-08
CA1339911C (en) 1998-06-16
FR2622586B1 (fr) 1992-02-21
FI885045A (fi) 1989-05-03
CH676248A5 (fi) 1990-12-28
ATA267788A (de) 1992-11-15
SG40792G (en) 1992-06-12
NO172902C (no) 1993-09-22
NO884865D0 (no) 1988-11-01
AR244342A1 (es) 1993-10-29
SE503401C2 (sv) 1996-06-10
FR2622451A1 (fr) 1989-05-05
NL8802617A (nl) 1989-06-01
PT88903B (pt) 1993-02-26
NO172902B (no) 1993-06-14
OA10206A (fr) 1997-01-16
ES2009099A6 (es) 1989-08-16
US4927755A (en) 1990-05-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2545078B2 (ja) 核酸関連物質の製造法
Bernardi et al. Studies on acid hydrolases: IV. Isolation and characterization of spleen exonuclease
FI95135B (fi) Menetelmä polynukleotidien valmistamiseksi
US4210746A (en) Nucleotide inhibitor of protein synthesis
JPH0357760B2 (fi)
Mahmoudian et al. A versatile procedure for the generation of nucleoside 5′-carboxylic acids using nucleoside oxidase
US4141972A (en) Purine nucleoside 5&#39;-phosphate (mono, di or tri) 3&#39;(2&#39;)-diphosphates and processes for their preparation
JPS60156388A (ja) Dνaおよびその用途
Levin The polymerization of 8-azaguanosine 5′-diphosphate by polynucleotide phosphorylase
JPH08168383A (ja) 核酸関連物質の製造法
Simantov et al. Induction of polyadenylate polymerase and differentiation in neuroblastoma cells
JPS5928470A (ja) バチルス・ズブチリス
JPS58158197A (ja) 発酵法によるイノシンの製造法
Fedoroff et al. Properties of the phage f2 replicase: I. Optimal conditions for replicase activity and analysis of the polynucleotide product synthesized in vitro
CA1297058C (en) High temperature method for the production of ribavirin
EP0320807A2 (en) Novel polynucleotide analogs, methods for inhibiting nucleic acid polymerases and methods for inducing synthesis of interferon
JPH09502881A (ja) アラビノヌクレオチドの製造方法
JPH0698014B2 (ja) アデノシン−5′−三リン酸の製造法
Walker Nucleic acids
Müller et al. DNA‐Replication Complex from Cells Infected with Herpes Virus
Sen Role of modified nucleosides in transfer RNA
JPH05219978A (ja) 核酸関連物質の酵素的製造法及びそれに使用する酵素調製物
Tada et al. Purification of DNA-dependent RNA Polymerase from Escherichia coli
JPH0559055A (ja) 抗ウイルス剤の製造方法
JPH07242695A (ja) 新規rk−75物質、その製造方法及び用途

Legal Events

Date Code Title Description
BB Publication of examined application
FG Patent granted

Owner name: SOCIETE DE CONSEILS DE RECHERCHES ET D APPLICATION

MA Patent expired