DE10035190A1 - Verfahren und Vorrichtung zur 2-Photonen-Fluoreszenz-Koinzidenzanalyse - Google Patents
Verfahren und Vorrichtung zur 2-Photonen-Fluoreszenz-KoinzidenzanalyseInfo
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Abstract
Es wird ein Verfahren zur Fluoreszenzmessung an mit unterschiedlichen, spektral verschiedene Fluoreszenzemissionen aufweisenden Fluoreszenzmarkern markierten Analyten in einer Probe mit den folgenden Schritten beschrieben: Beleuchtung der Probe (11) in einem Messvolumen mit einem Laser (20) zur Anregung der Fluoreszenzemission der mindestens zwei Fluoreszenzmarker, wobei die Beleuchtung der Probe im Messvolumen mit maximal einer einzelnen Laserlinie mit einer derart hohen Anregungsintensität erfolgt, dass die Fluoreszenzmarker gemeinsam durch 2-Photonen-Absorptionen angeregt werden, Detektion der Fluoreszenzemission mit mindestens zwei Detektoreinrichtungen (31, 32), die zur Lichtdetektion in verschiedenen Spektralbereichen entsprechend den spektralen Fluoreszenzeigenschaften der Fluoreszenzmarker ausgelegt sind, und Durchführung einer Kreuzkorrelations- und/oder eine Koinzidenzanalyse von Detektorsignalen der Detektoreinrichtungen (31, 32). Es wird auch eine Messvorrichtung zur Durchführung des Verfahrens beschrieben.
Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Fluoreszenz-
Korrelationsanalyse, insbesondere Verfahren zur Koinzidenz-
oder Kreuzkorrelationsanalyse an mit mindestens zwei unter
schiedlichen Fluoreszenzmarkern markierten Analyten in einer
Probe, und Messeinrichtungen zur Durchführung der genannten
Verfahren.
Die Fluoreszenz-Korrelationsspektroskopie (FCS) ist als
höchstempfindliches optisches Verfahren zum Nachweis von dyna
mischen Eigenschaften einzelner Moleküle oder Molekülverbin
dungen oder von geringsten Konzentrationen fluoreszierender
Substanzen allgemein bekannt. Bei einem herkömmlichen Fluores
zenz-Korrelationsspektrometer wird mit einem Mikroskop ein La
serstrahl in die Probe eingekoppelt und auf ein Messvolumen
von ca. 10-15 l (1 fl) fokussiert. Das Messvolumen ist so
klein, dass sich im zeitlichen Mittel weniger als ein fluores
zierendes Molekül darin befindet. Die Fluoreszenz der interes
sierenden Probenmoleküle wird durch eine Korrelationsanalyse
der Detektorsignale erfasst. Das Mikroskop ist zur dreidimen
sionalen Positionierung des Messvolumens ausgelegt, wie dies
z. B. mit einem Konfokalmikroskop möglich ist.
Bei der Konfokalspektroskopie wird ein Laserstrahl zur Fluo
reszenzanregung auf einen beugungsbegrenzten Punkt in der Pro
be fokussiert. Eine Punktblende (sog. "Pinhole") in der Bild
ebene, in der der Anregungspunkt abgebildet ist, dient als
Feldblende, mit der Fluoreszenz und Streulicht, das von Orten
außerhalb des Fokus ausgeht, ausgeblendet wird. Die Beobach
tung einzelner Moleküle im Messvolumen wird durch die dynami
schen Moleküleigenschaften (Diffusionkoeffizient) in der Probe
bestimmt. Um in der zur Verfügung stehenden kurzen Messzeit
für ein annehmbares Signal-Rausch-Verhältnis genügend Photonen
zu detektieren, müssen bei der herkömmlichen Konofkalspektros
kopie relativ hohe Anregungsintensitäten (im Bereich von ca.
100 kW/cm2) verwendet werden. Dies ist jedoch problematisch, da
die Stabilität der üblicherweise verwendeten Markierungsfarb
stoffe (z. B. Fluorescein-, Rhodamin- und Cyanin-Derivate) be
schränkt ist.
Eine Weiterentwicklung des FCS-Verfahrens für heterogene Sys
teme, in denen molekulare Wechselwirkungen zwischen verschie
denen Analyten beobachtet werden sollen, wird in WO 99/34195
mit der Zweifarben-Kreuzkorrelationsanalyse beschrieben. Bei
diesem Verfahren werden mindestens zwei Fluoreszenzfarbstoffe
an einen oder mehrere Analyten als Marker gebunden. Die Fluo
reszenzfarbstoffe sind so gewählt, dass sie spektral verschie
dene Fluoreszenzmaxima besitzen. In einem Messaufbau, der
schematisch in Fig. 9 illustriert ist, werden die Farbstoffe
mit zwei Lasern 21', 22', die auf die jeweiligen Farbstoffab
sorptionen abgestimmt sind, angeregt. Mit zwei spektral auf
die verschiedenen Fluoreszenzmaxima abgestimmten Detektoren
31', 32' wird die Fluoreszenzemission aus der Probenkammer 10'
erfasst. Die Detektorsignale werden einer Kreuzkorrelations-
oder Koinzidenzanalyse unterzogen. Die Konzentration der Probe
und die Größe des Messvolumens sind so gewählt, dass zu einem
Messzeitpunkt im Messvolumen höchstens ein Molekül vorhanden
ist. Durch Auswertung von zeitlichen Korrelationen oder Koin
zidenzen in den Detektorsignalen kann erfasst werden, ob sich
zum Messzeitpunkt ein Analyt mit dem einen oder anderen oder
beiden Markierungsfarbstoffen im Messvolumen befunden hat. Mit
der Zweifarben-Korrelationsanalyse können molekulare Assozia
tions- oder Dissoziationsvorgänge, wie z. B. die Bildung oder
das Aufbrechen von chemischen Bindungen, in Echtzeit gemessen
werden.
Die Zweifarben-Technik gemäß WO 99/34195 besitzt aber auch
Nachteile, die die Anwendbarkeit und die Genauigkeit des Ver
fahrens einschränken. Zur Anregung der Fluoreszenzemissionen
der Markierungsfarbstoffe sind gewöhnlich verschiedene Laser
21', 22' erforderlich, deren Foci zeitlich stabil und mit ei
ner Genauigkeit von Bruchteilen eines Femtoliters an einem
Messpunkt gebildet werden müssen. Es ist ein erheblicher expe
rimenteller Aufwand zur Justierung und Stabilisierung der An
regungslaser erforderlich. Des Weiteren muss das Abbildungs
system zur Erzielung einer genügenden Ortsauflösung in Be
strahlungsrichtung (z-Richtung) abbildungsseitig ein Pinhole
vorgesehen sein, auf das das Messvolumen abgebildet wird. Eine
weitere Beschränkung betrifft die verfügbaren Farbstoffsyste
me. Die Markierungsfarbstoffe müssen bei allen Anregungswel
lenlängen eine hohe Lichtstabilität besitzen. Außerdem müssen
die verwendeten Markierungsfarbstoffe hohe Quantenausbeuten
aufweisen.
Von W. Denk et al. wird in "Science", 1990, Band 248, Seite 73
ff. ein Verfahren zur Scanning-Fluoreszenzmikroskopie mit
2-Photonen-Laseranregung beschrieben. Es wurde festgestellt,
dass bei 2-Photonen-Anregung Lichtschäden an den Markierungs
farbstoffen und auch lichtinduzierte Zerstörungen der Zellum
gebung in biologischen Proben vermieden werden. Allerdings er
fordert die 2-Photonen-Anregung extrem hohe Photonen-
Flussdichten der Größenordnung von 1031 Photonen/cm2, um die
gleichzeitige Absorption von zwei Photonen innerhalb des Wir
kungsquerschnittes der Farbstoffmoleküle zu bewirken. Die 2-
Photonen-Anregung war bisher auf die Scanning-Mikroskopie be
schränkt.
Die Aufgabe der Erfindung ist es, ein verbessertes Verfahren
zur Fluoreszenzmessung auf der Basis einer Kreuzkorrelations-
und/oder Koinzidenzanalyse anzugeben, mit dem die Nachteile
insbesondere der herkömmlichen Zweifarben-Technik vermieden
werden. Das erfindungsgemäße Verfahren soll mit einem verein
fachten Messaufbau realisiert werden, ohne dass Einschränkun
gen in Bezug auf die Genauigkeit und Stabilität hingenommen
werden müssen. Die Aufgabe der Erfindung ist es auch, verbes
serte Korrelations- und/oder Koinzidenzmessvorrichtungen zur
Fluoreszenzmessung mit einem vereinfachten Aufbau anzugeben.
Diese Aufgaben werden mit einem Verfahren und einer Vorrich
tung zur Fluoreszenzmessung mit den Merkmalen gemäß dem Pa
tentansprüchen 1 bzw. 8 gelöst. Vorteilhafte Ausführungsformen
und Anwendungen der Erfindung ergeben sich aus den abhängigen
Ansprüchen.
Die Grundidee der Erfindung ist es, zur Korrelations-
Fluoreszenzmessung an Analyten mit mindestens zwei Fluores
zenzmarkern auf einem oder mehreren zu analysierenden Stoffen
die Probe mit einer derart hohen Anregungsintensität (Photo
nenflussdichte) zu beleuchten, dass die Fluoreszenzanregung
der Fluoreszenzmarker durch 2-Photonen-Absorptionen erfolgt.
Die Probe wird vorzugsweise mit einer einzigen Laserlinie be
leuchtet. Der Laserstrahl wird in die Probe an dem gewünschten
Ort des Messvolumens fokussiert. Die Fluoreszenzmarker werden
simultan bei einer gemeinsamen Anregungswellenlänge angeregt,
besitzen aber spektral getrennte Fluoreszenzemissionen, die
mit verschiedenen Detektoren erfasst werden. Die Signale der
Detektoren werden einer Korrelationsanalyse (Koinzidenz- oder
Kreuzkorrelationsanalyse) unterzogen. Die 2-Photonen-Anregung
von Fluoreszenzmarkern besitzt den Vorteil, dass Fluoreszenz
marker verwendet werden können, die ähnliche Maxima in den An
regungsspektren der 2-Photonen-Anregung besitzen, sich jedoch
durch verschieden starke Stokes-Verschiebungen der Emission
auszeichnen.
Die Fluoreszenzmessung ist auf eine einzelmolekülbasierende
Analyse gerichtet, bei der das Mess- oder Beobachtungsvolumen
so klein ist, dass Fluoreszenzfluktuationen von einzelnen Mo
lekülen detektiert und ausgewertet werden können.
Erfindungsgemäß ergibt sich eine erhebliche Vereinfachung des
Messaufbaus. Die Vereinfachung besteht erstens darin, dass nur
ein Laser zur Anregung benutzt werden muss. Eine weitere Ver
einfachung des experimentellen Aufbaus ist gegeben, da das An
regungsvolumen der 2-Photonen-Anregung in Ausbreitungsrichtung
des Laserstrahls (z-Richtung) gegenüber dem Anregungsvolumen
bei 1-Photon-Anregung verkleinert wird. Die Wahrscheinlichkeit
der 2-Photonen-Absorption ist vom Quadrat der Anregungsinten
sität abhängig. Der Absorptionsquerschnitt verringert sich
deshalb für 2-Photonen-Absorptionsprozesse außerhalb der Fo
kalebene in z-Richtung proportional zu z-4. Es ergibt sich eine
inhärente Konzentration der Anregung auf die Fokalebene. Es
ist nicht zwingend erforderlich, das Messvolumen auf ein Pin
hole abzubilden, da außerhalb der Fokalebene ohnehin kein Flu
oreszenzlicht in den interessierenden Spektralbereichen emi
tiert wird.
Ein weiterer wichtiger Vorteil der 2-Photonen-Anregung gemäß
der Erfindung besteht in der hohen Toleranz biologischer Mate
rialen (Zellen, Zellbestandteile oder Zellverbunde) gegenüber
Infrarotstrahlung. Zur Anregung einer Fluoreszenzemission im
sichtbaren Spektralbereich durch 2-Photonen-Absorption ist es
ausreichend, wenn mit Laserlicht im roten oder nahen infraro
ten Spektralbereich angeregt wird. Aufgrund der langwelligen
Anregung ergibt sich ein weiterer Vorteil für das Signal-
Rausch-Verhältnis, da Anregungs- und Emissionslicht spektral
weit voneinander getrennt sind, so dass störendes Streulicht
weitestgehend durch optische Filter unterdrückt werden kann,
ohne einen Teil des zu detektierenden Emissionslichts einzubü
ßen. Ein weiterer Vorteil hierbei ist die Reduktion von
Falschlicht, was hauptsächlich die Fluoreszenz von Verunreini
gungen ("Schmutz") betrifft. Diese Fluoreszenz ist im wesentlichen
im kurzwelligen sichtbaren Bereich, also im Fall von 1-
Photonen-Anregung kritisch. Bei einer langwelligen 2-Photonen-
Anregung werden solche Verunreinigungen mit deutlich geringe
rer Effizienz angeregt, so dass hierdurch das Signal-zu-
Rausch-Verhältniss - verglichen zur 1-Photonen-Anregung -
deutlich höher liegt.
Gegenstand der Erfindung ist auch eine Messvorrichtung zur
Fluoreszenzmessung an Analyten mit mindestens zwei unter
schiedlichen Fluoreszenzmarkern, bei der die Beleuchtungsein
richtung durch eine einzelne Laserlinie gebildet wird, die zur
Anregung von 2-Photonen-Absorptionen der Fluoreszenzmarker
ausgelegt ist. Ein weiteres wichtiges Merkmal der erfindungs
gemäßen Vorrichtung besteht in der Bereitstellung von zwei De
tektoreinrichtungen, die zur Detektion der Fluoreszenzemission
in verschiedenen Spektralbereichen eingerichtet sind und auf
die das gesamte, von der Probe (insbesondere vom Anregungsvo
lumen und auch aus der Umgebung des Anregungsvolumens) ausge
hende Fluoreszenzlicht abgebildet wird. Die Detektion erfolgt
blendenfrei, eine Pinhole-Blende ist nicht vorgesehen. Es ist
eine nicht-konfokale Abbildung des Anregungsvolumens auf die
Detektoren vorgesehen.
Durch die 2-Photonen-Anregung mit einem einzelnen Laser wird
nicht nur der Geräteaufwand reduziert. Es ergeben sich auch
Vorteile für die optische Justierung. Das Problem von Größe
und Überlappung von Anregungsvolumen ist ausgeschlossen. Zu
sätzliche Detektionsblenden sind nicht erforderlich. Werden
Fluoreszenzfarbstoffe als Marker verwendet, so ergibt sich als
weiterer Vorteil die Tatsache, dass nach der 2-Photonen-
Anregung praktisch keine Triplett-Zustände eingenommen werden,
so dass keine Signalverluste über die Triplett-Bildung erfol
gen.
Das Anregungsvolumen ist beim erfindungsgemäßen Messverfahren
kleiner als bei der herkömmlichen 1-Photon-Anregung. Dies er
möglicht, Messungen bei höheren Probenkonzentrationen von un
gefähr 100 nM durchzuführen, was Vorteile für die weitere Be
wertung der Ergebnisse besitzt. Es können aber auch Konzentra
tionen im nM-Bereich ermittelt werden. Es werden kurze Analy
sezeiten im Bereich von einer oder wenigen Sekunden ermög
licht. Es werden Messungen in lebenden Zellen ermöglicht, die
die genaue Bestimmung von Kinetiken und Konzentrationen dop
pelt markierter Moleküle oder Komplexe erlaubt.
Wichtige Merkmale der Erfindung bestehen darin, dass nur ein
Anregungsvolumenelement gegeben ist, da zwei verschiedene Flu
orophore monochromatisch mittels 2-Photonenanregung auf Ein
zelmolekülbasis angeregt werden. Die 2-Photonenanregung bietet
insbesondere die folgenden Vorteile: es ist ein physikalisch
perfektes Überlappen der Anregungsvolumenelemente für beide
Fluorophore gegeben. Das Anregungsvolumenelement kann gegen
über herkömmlichen Verfahren verkleinert werden, d. h. es sind
Messung von höheren Konzentrationen (100 nM und höher) ist
möglich. Es erfolgt eine Detektion ohne Pinhole (Anregungsvo
lumenelement ist durch 2-Photonenanregung klein genug). Es
wird eine Multi-Color-Detektion von drei oder mehr Fluoropho
ren auf Einzelmolekülbasis möglich, d. h. es kann eine mono
chromatische Anregung über 2-Photonen bei z. B. < 800 nm und
eine Detektion von verschiedenen Fluorophoren von 300 bis <
800 nm erfolgen, ohne das in diesem Bereich störende Anre
gungswellenlängen liegen, wie es bei der CW-Anregung notwendig
ist. Es werden Messungen von Molekülen, insbesondere von Mole
külkomplexen mit drei oder mehr Komponenten, ermöglicht.
Weitere Vorteile und Einzelheiten der Erfindung werden aus der
folgenden Beschreibung der beigefügten Zeichnungen ersicht
lich. Es zeigen:
Fig. 1 eine schematische Übersichtsdarstellung einer
erfindungsgemäßen Messvorrichtung,
Fig. 2 eine Illustration von molekularen Vorgängen,
die mit Vorteil mit der erfindungsgemäße Kor
relationsmessung erfassbar sind,
Fig. 3 Kurvendarstellungen der spektralen Eigenschaf
ten von Markierungsfarbstoffen,
Fig. 4, 5 Messergebnisse zur Illustration der Quanten
ausbeute von Markierungsfarbstoffen in Abhän
gigkeit von der Anregungswellenlänge und der
Anregungsleistung,
Fig. 6, 7 Kurvendarstellungen zur Illustration der Ge
nauigkeit und Selektivität der erfindungsgemä
ßen Korrelationsmessung,
Fig. 8 Kurvendarstellungen eines erfindungsgemäß beo
bachteten enzymatischen Abbaus einer Substanz,
und
Fig. 9 eine schematische Übersichtsdarstellung einer
herkömmlichen Messvorrichtung zur Zweifarben-
Korrelationsmessung (Stand der Technik)
Die Erfindung wird im Folgenden unter Bezug auf 2-Photonen-
Anregungen in Testsystemen mit zwei Fluoreszenzmarkern be
schrieben. Entsprechende Umsetzungen der Erfindung ergeben
sich bei Mehr-Farben-Anwendungen. Es können drei oder mehr ge
eignete Fluorophore mit einer einfarbigen 2-Photonen-Anregung
zur Emission angeregt werden. Dies erlaubt die Vermessung kom
plexer molekularer und zellulärer Prozesse, an denen mehr als
zwei Analyte beteiligt sind.
Der optische Aufbau eines 2-Photonen-Fluoreszenzkorrelations
spektrometers gemäß der Erfindung ist schematisch in Fig. 1
illustriert. Das Spektrometer 100 umfasst eine Probenkammer
10, eine Beleuchtungseinrichtung 20, eine Detektoreinrichtung
30, einen Korrelator 40 und ein Abbildungssystem 50. Das Ab
bildungssystem 50 wird vorzugsweise durch einen invertierten
Mikroskopaufbau (z. B. mit einem Olympus IX70-Mikroskop) ge
bildet. Die Probenkammer 10 ist ein anwendungsabhängig gewähl
tes Behältnis, in dem die Probe 11 ruhend oder strömend ange
ordnet ist. Die Probe 11 ist eine Lösung oder Suspension der
zu untersuchenden Substanzen oder Partikel. Es kann vorgesehen
sein, dass die Probenkammer 10 in einer oder mehreren Raum
richtungen beweglich angeordnet ist. Die Beweglichkeit der
Probenkammer kann sich erstens auf eine Scan-Bewegung relativ
zum Abbildungssystem 50 zur Aufnahme dreidimensionaler Abbil
dungen, z. B. dreidimensionaler Konzentrationsverteilungen in
der Probe, beziehen. Ferner ist es möglich, der Probenkammer
10 eine periodische Modulationsbewegung aufzuprägen, wie es in
WO 99/34195 beschrieben ist. Die zum Abbildungssystem 50 wei
sende Wand der Probenkammer 10 besitzt eine derart geringe Di
cke, dass der Fokus 12 des Anregungslichts mit einem geringen
Abstand von ca. 400 bis 500 µm vom Objektiv 51 gebildet werden
kann. Die entsprechende Wand besitzt vorzugsweise die Dicke
eines Deckglases, wie es in der Mikroskopie verwendet wird.
Die Dicke beträgt bspw. ca.. 150 bis 190 µm.
Die Beleuchtungseinrichtung 20 ist ein einzelner Laser, der
für die 2-Photonen-Anregung der jeweils verwendeten Fluores
zenzmarker ausgelegt ist. Bei der Markierung mit Fluoreszenz
farbstoffen wird vorzugsweise ein durchstimmbarer Pulslaser
verwendet, wie z. B. ein modengekoppelter Tsunami Ti: Saphier-
Laser (Hersteller: Spectra Physics, Mountain View, CA, Puls
frequenz 80 mHz, Pulsbreite 100 fs, Durchstimmbarkeit zwischen
700 und 1000 nm). Das parallele Laserlicht wird über den dichroitischen
Spiegel 52 (z. B. vom Typ 710 DCSPXR, ABF Analysen
technik, Tübingen, Deutschland) in das Objektiv 51 gelenkt (z. B.
60 × 1.2-Objektiv UplanApo Olympus) und in der Probenkammer
10 fokussiert. Aus Kalibrierungsmessungen sind die Dimensionen
des Anregungsvolumens r0 und z0 in der Fokalebene bekannt. Der
Durchmesser des Fokus in der Fokalebene beträgt z. B.
r0 = 0.48 µm. Mit einem Verhältnis r0/z0 = 2.8 ergibt sich ein
wirksames Anregungs-Volumenelement von ungefähr 0.4 fl.
In diesem Anregungsvolumen wird je nach Anwesenheit von Fluo
reszenzmarkern eine Fluoreszenzemission angeregt, die über das
Objektiv 51, den dichroitischen Spiegel 52, einen Emissions
filter 53 (z. B. vom Typ 600 DF 200, AHF Analysentechnik) zur
Unterdrückung des Anregungslichts und eine Optik 54 auf einen
zweiten dichroitischen Spiegel 55 (z. B. vom Typ 595 DCLP, AHF
Analysentechnik) gerichtet wird. Am zweiten dichroitischen
Spiegel 55 wird der kurzwellige Teil des Fluoreszenzlichtes
reflektiert und durch einen Bandpassfilter 56 auf den langwel
ligen Detektor 31 der Detektoreinrichtung gerichtet. Das am
dichroitischen Spiegel durchgelassene Fluoreszenzlicht wird
ebenfalls gefiltert (Kantenfilter 57) und auf den kürzerwelli
gen Detektor 32 gerichtet. Die Einkopplung in die Detektoren
erfolgt mit Lichtleitfasern 58 bzw. 59. Die Detektoren sind
bspw. Avalanche-Photodioden (Typ: SPCM-200, EG & G Optoe
lectronics, Kanada). Die optischen Einkoppelfasern besitzen
einen Durchmesser von 100 µm und sind einzelnen in allen drei
Raumrichtungen justierbar. Die Detektoren 31, 32 sind mit ei
nem Korrelator 40 verbunden. Als Korrelator wird bspw. eine
Korrelatorkarte (Typ: ALV-5000, Hersteller LAV Langen,
Deutschland) verwendet. Abweichend vom in Fig. 1 gezeigten
Aufbau kann auch auf die Einkoppelfasern verzichtet und das
Fluoreszenzlicht direkt auf die Detektoren abgebildet werden.
Der optische Aufbau kann zusätzlich zur Aufnahme von konfoka
len Spektren mit einem fasergekoppelten Spektrometer (Herstel
ler Ocean Optics, USA) ausgestattet sein.
Die Probe 11 in der Probenkammer 10 enthält mindestens zwei
mit unterschiedlichen Fluoreszenzmarkern markierte Analyte
und/oder mindestens einen mit mindestens zwei Fluoreszenzmar
kern markierten Analyten. Gegenstand der erfindungsgemäßen
Fluoreszenzmessung ist bspw. eine Koinzidenzanalyse der mit
den Detektoren 31, 32 erfassten Fluoreszenzemissionen der ver
schiedenen Fluoreszenzmarker. Dies ist schematisch in Fig. 2
illustriert. In der Probe sind bspw. die Analyten A1 und A2
enhalten, die jeweils mit Fluoreszenzmarkern M1 und M2 mar
kiert sind. Die Analyten sind bspw. Paare von Antikörpern und
Antigenen, deren Bindungsverhalten untersucht werden soll. So
lange die Analyten A1 und A2 nicht aneinander gebunden sind,
passieren sie getrennt zu verschiedenen Zeiten das Anregungs
volumen. Die Detektoren 31, 32 liefern zeitlich getrennt Fluo
reszenzsignale, die in Fig. 2 (links, Mitte) schematisch
durch Pfeile P1, P2 symbolisiert werden. Die Fluoreszenzsigna
le werden unkorreliert zu beliebigen Zeiten gemessen, ein Kor
relations- oder Koinzidenzsignal G ist nicht ableitbar. Nach
dem die Bindung zu einem Analyten A3 erfolgt ist, der die Flu
oreszenzmarker M1 und M2 gemeinsam trägt, wird an beiden De
tektoren 31, 32 gleichzeitig die Fluoreszenzemission erfasst.
Entsprechend ist ein Korrelations- oder Koinzidenzsignal
ableitbar (Fig. 2, rechts unten).
Umgekehrt kann auch die Zerlegung des Analyten A3 in Teilkom
ponenten detektiert werden, wie dies bspw. bei der Beobachtung
des enzymatischen Abbaus eines zweifach mit Fluoreszenzmarkern
gelabelten Substrats von Interesse ist. Allgemein werden mit
dem erfindungsgemäßen Messverfahren vorzugsweise alle chemi
schen Reaktionen oder physikalischen Abläufe erfasst, bei de
nen eine chemische Bindung zwischen getrennten Analyten herge
stellt oder eine vorhandene Bindung aufgeschnitten oder ent
sprechend eine physikalische Assoziation oder Dissoziation
durchgeführt wird. Dem Messverfahren sind alle Analyten (Substanzen)
zugänglich, die auf den verschiedenen Seiten der je
weils herzustellenden oder zu trennenden Verbindung mit Fluo
reszenzmarkern markierbar sind.
Die Signalerfassung mit den Detektoren und die Korrelations
analyse erfolgen in an sich von den FCS-Techniken bekannter
Weise. Mit den Detektoren erfolgt eine Fluoreszenzmessung in
vorbestimmten Zeitfenstern. Die Breite der Zeitfenster wird
anwendungsabhängig gewählt. Sie wird vorzugsweise auf die
mittlere Aufenthaltsdauer der Analyten im Messvolumen einge
stellt. Die Aufenthaltsdauer ist insbesondere von der Molekül-
oder Teilchengröße und -beweglichkeit abhängig und kann gemes
sen oder theoretisch abgeschätzt werden. Die in den Zeitfens
tern erfassten Photonenzahlen werden in den beiden Detekti
onskanälen verglichen. Zur Koinzidenzanalyse erfolgt der Ver
gleich gleichzeitiger Zeitverläufe. Die Kreuzkorrelationsana
lyse ist auf den Vergleich zeitlich versetzter Abläufe gerich
tet. Die Korrelationanalysen werden mit an sich bekannten Al
gorithmen zur Verarbeitung der Signale der verschiedenen De
tektionskanäle durchgeführt.
Auf der Grundlage der Koinzidenzanalyse ist eine Konzentrati
onsmessung möglich. Aus der Stärke der erfassten Koinzidenzen
(Amplitude von Koinzidenzsignalen) wird ein Maß für die Zahl
der doppelt markierten Moleküle oder Teilchen in der Probe
abgeleitet.
Die mit dem Korrelator 40 durchgeführte Kreuzkorrelations-
oder Koinzidenzanalyse der Detektorsignale erfolgt vorzugswei
se in bekannter Weise, wie es in WO 99/34195 beschrieben ist.
Die in dieser Patentanmeldung offenbarten Einzelheiten zur
Signalanalyse werden vollständig durch Bezugnahme in die vor
liegende Beschreibung einbezogen.
Es kann insbesondere analog zu dem in WO 99/34195 beschriebe
nen Verfahren vorgesehen sein, dass während der Fluoreszenz
analyse mittels eines Strahlscanners und/oder eines Probensan
triebs zwischen der Probe und der Beleuchtungseinrichtung eine
Relativbewegung eingestellt wird. Es erfolgt eine Erhöhung der
Fluktuationsbewegungen, die Diffusionszeiten werden niedriger.
Das Messvolumenelement kann durch die Probe gescannt werden.
Bei Einstellung dieser Relativbewegung ist gegebenenfalls das
Zeitfenster der Koinzidenanalyse anzupassen.
Als Fluoreszenzmarker M1, M2 werden vorzugsweise Fluoreszenz
farbstoffe verwendet, wie sie bspw. aus der Fluoreszenzmikro
skopie bekannt sind. Es werden Farbstoffpaare ausgewählt, die
bei einer ausgewählten Wellenlänge ähnliche Absorptionsquer
schnitte aufweisen und spektral separierbare Fluoreszenzspekt
ren bei hoher Photostabilität besitzen. Als Markerpaare werden
bspw. die Farbstoffe Rhodamin Grün/Texas Rot, Fluoreszein-
Derivate (z. B. Alexa 488/Alexa 594) oder molekular
biologische Farbstoffe wie grün fluoreszierende Proteine
(GFP)/rot fluoreszierende Proteine (RFP) verwendet. Anstelle
von Farbstoffen oder fluoreszierenden Proteinen können auch
andere fluoreszierende Substanzen oder Partikel, z. B. sog.
Quantum Dots, als Fluoreszenzmarker eingesetzt werden. Es kön
nen auch autofluoreszierende Proteine, wie z. B. GFP, dsRED,
autofluoreszierende Biomolekülen, z. B. Tryptophan, Tyrosin,
oder Flavine, oder autofluoreszierende organische Molekülen
verwendet werden. Das erfindungsgemäße Verfahren kann auch zur
Erfassung von Ramanstreuung oder oberflächenverstärkter Ra
manstreuung (surface enhanced raman scattering, SERS) ausge
legt sein.
Fig. 3 zeigt die spektralen Eigenschaften des Markersystems
Rhodamin Grün/Texas Rot. Beide Farbstoffe zeigen eine ähnlich
hohe Fluoreszenzquantenausbeute und eine genügende Lichtstabi
lität, um die erfindungsgemäß verwendeten Anregungsintensitäten
zu tolerieren. Die Spektren (1) und (2) zeigen die Fluo
reszenzemissionen von Rhodamin Grün bzw. Texas Rot (µM-Lösun
gen) bei einer Anregungswellenlänge von 830 nm. Die Kurve (3)
zeigt den Transmissionsverlauf des dichroitischen Spiegels 55.
Im Bereich der kürzerwelligen Fluoreszenz (1) erfolgt die Re
flektion zum Detektor 31. Die Kurven (4) und (5) zeigen die
Transmissionscharakteristik der Filter 56 bzw. 57, die zur
weiteren Verbesserung des Signal-Rausch-Verhältnisses vorgese
hen, jedoch kein zwingendes Merkmal der Erfindung sind.
Die Fig. 4 und 5 illustrieren weitere spektrale Eigenschaf
ten des Markerpaars Rhodamin Grün/Texas Rot. Zur Ermittlung
der optimalen Anregungswellenlänge zur 2-Photonen-Anregung
wird für jeden Farbstoff ein Anregungsspektrum im Bereich 740 nm
bis 900 nm aufgenommen. Die Kurvenverläufe in Fig. 4 zei
gen ein Anregungsmximum bei 780 nm für Texas Rot (Kreuze) und
bei 850 nm für Rhodamin Grün (Dreiecke). Für die erfindungsge
mäßen Fluoreszenzmessungen wird eine Anregungswellenlänge ge
wählt, bei der beide Farbstoffe mit nahezu gleicher Effizienz
anregbar sind und/oder bei der beide Farbstoffe vergleichbar
starke Fluoreszenzemissionen zeigen. Die Anregungswellenlänge
beträgt beim dargestellten Beispiel 830 nm. Fig. 5 zeigt,
dass die Anregung bei 830 nm tatsächlich eine 2-Photonen-
Absorption bewirkt. Für beide Farbstoffe wurde getrennt die
Fluoreszenzintensität in Abhängigkeit von der Anregungsleis
tung gemessen. Für beide Farbstoffe ergibt sich unterhalb der
Sättingungsgrenze die für 2-Photonen-Prozesse zu erwartende
quadratische Abhängigkeit der Fluoreszenzintensität von der
eingestrahlten Leistung. Die doppelt logarithmische Darstel
lung liefert die entsprechende linearisierte Form mit Steigung
2.
Fig. 6 zeigt den Verlauf von Autokorrelationskurven, die mit
einer Testlösung von Rhodamin Grün in den beiden Detektionka
nälen aufgenommen wurden und eine entsprechende Kreuzkorrelationskurve
zwischen beiden Detektionskanälen. Alle drei Kurven
verlaufen im Wesentlichen gleich. Dies zeigt, dass die Detek
tionsvolumen identisch bzw. die Detektionsstrahlengänge genau
auf das Anregungsvolumen justiert sind. Kreuzkorrelationsmes
sungen an doppelt markierten (obere Kurve) und einfach mar
kierten (untere Kurve) DNA-Proben sind in Fig. 7 illustriert.
Als Vorteil des Messverfahrens zeigt sich, dass sich für die
nicht-korrelierten Proben Kreuzkorrelationssignale G ergeben,
die weniger als 10% der entsprechenden korrelierten Signale
betragen. Damit ist der erfindungsgemäße Aufbau den herkömmli
chen 1-Photon-Messungen überlegen.
Fig. 8 illustriert eine bevorzugte Anwendung des erfindungs
gemäßen Messverfahrens zur Ermittlung von Konzentrationen in
der Probe. Es wird die Echtzeitmessung von Enzymkinetiken dar
gestellt. Ein zweifach markiertes Substrat (DNA-Probe) wird
enzymatisch in einzeln markierte Produkte zerlegt. Dementspre
chend sinkt die Zahl der erfassten doppelt markierten Moleküle
im Zeitverlauf. Mit zunehmender Konzentration des zugesetzten
Enzyms (Endonuklease EcoRI) wird der Abfall der Substratkon
zentration beschleunigt.
Die in der vorstehenden Beschreibung, den Zeichnungen und den
Ansprüchen offenbarten Merkmale der Erfindung können sowohl
einzeln als auch in beliebiger Kombination für die Verwirkli
chung der Erfindung in ihren verschiedenen Ausgestaltungen von
Bedeutung sein.
Claims (11)
1. Verfahren zur Fluoreszenzmessung an Analyten in einer
Probe, wobei die Probe mindestens zwei mit unterschiedlichen
Fluoreszenzmarkern markierte Analyte und/oder mindestens ei
nen mit mindestens zwei unterschiedlichen Fluoreszenzmarkern
markierten Analyten enthält, wobei die Fluoreszenzmarker
spektral verschiedene Fluoreszenzemissionen besitzen, mit den
Schritten:
die Beleuchtung der Probe im Messvolumen mit maximal einer einzelnen Laserlinie mit einer derart hohen Anregungsintensi tät erfolgt, dass die Fluoreszenzmarker gemeinsam durch 2- Photonen-Absorptionen angeregt werden.
- - Beleuchtung der Probe (11) in einem Messvolumen mit einem Laser (20) zur Anregung der Fluoreszenzemission der mindes tens zwei Fluoreszenzmarker,
- - Detektion der Fluoreszenzemission mit mindestens zwei De tektoreinrichtungen (31, 32), die zur Lichtdetektion in ver schiedenen Spektralbereichen entsprechend den spektralen Flu oreszenzeigenschaften der Fluoreszenzmarker ausgelegt sind, und
- - Durchführung einer Kreuzkorrelations- und/oder eine Koinzi denzanalyse von Detektorsignalen der Detektoreinrichtungen (31, 32),
die Beleuchtung der Probe im Messvolumen mit maximal einer einzelnen Laserlinie mit einer derart hohen Anregungsintensi tät erfolgt, dass die Fluoreszenzmarker gemeinsam durch 2- Photonen-Absorptionen angeregt werden.
2. Verfahren gemäß Anspruch 1, bei dem zur Detektion der
Fluoreszenzemission eine blendenfreie Abbildung des Lichtes,
das vom Messvolumen und von der Umgebung des Messvolumens
ausgeht, auf die Detektoreinrichtungen erfolgt.
3. Verfahren gemäß Anspruch 1 oder 2, bei dem als Fluores
zenzmarker Fluoreszenzfarbstoffe, fluoreszierende Proteine,
Biomoleküle, organische Moleküle, Quantum Dots oder Marker,
die zur Erfassung von Ramanstreuung ausgelegt sind, verwendet
werden.
4. Verfahren gemäß Anspruch 3, bei dem als Fluoreszenzmar
ker Fluoreszenzfarbstoffe verwendet werden, die sich überlap
pende 2-Photonen-Anregungsspektren und unterschiedliche Fluo
reszenzemissionsspektren besitzen.
5. Verfahren gemäß Anspruch 1, bei dem eine Koinzidenzana
lyse der Detektorsignale erfolgt und aus dem Ergebnis der Ko
inzidenzanalyse die Konzentration von mehrfach markierten
Analyten in der Probe abgeleitet wird.
6. Verfahren gemäß Anspruch 5, bei dem mittels eines
Strahlscanners und/oder eines Probensantriebs zwischen der
Probe und der Beleuchtungseinrichtung eine Relativbewegung
eingestellt wird.
7. Verfahren gemäß Anspruch 5 oder 6, bei dem die Koinzi
denzanalyse durch Vergleich der in bestimmten Zeitfenstern
erfassten Fluoreszenzsignale der verschiedenen Detektorein
richtungen (31, 32) erfolgt, wobei die Breite des Zeitfens
ters im Bereich der mittleren Aufenthaltsdauer der Analyten
im Messvolumen eingestellt ist.
8. Vorrichtung (100) zur Fluoreszenzmessung an Analyten in
einer Probe, wobei die Probe mindestens zwei mit unterschied
lichen Fluoreszenzmarkern markierte Analyte und/oder mindes
tens einen mit mindestens zwei Fluoreszenzmarkern markierten
Analyten enthält, die umfasst:
eine Probenkammer (10), in der die Probe angeordnet ist,
eine Beleuchtungseinrichtung (20), die zur Anregung von Fluoreszenzemission der mindestens zwei Fluoreszenzmarker mit einer einzigen Laserlinie eingerichtet ist,
mindestens zwei Detektoreinrichtungen (31, 32), die zur De tektion der Fluoreszenzemission in verschiedenen Spektralbereichen ausgelegt sind, und
ein Korrelator (40) zur Kreuzkorrelations- und/oder Koinzi denzanalyse von Detektorsignalen der Detektoreinrichtungen,
dadurch gekennzeichnet, dass
die Beleuchtungseinrichtung einen Laser umfasst, der zur Be leuchtung der Probe im Messvolumen mit maximal einer einzel nen Laserlinie mit einer derart hohen Anregungsintensität ausgelegt ist, dass die Fluoreszenzmarker gemeinsam durch 2- Photonen-Absorptionen angeregt werden.
eine Probenkammer (10), in der die Probe angeordnet ist,
eine Beleuchtungseinrichtung (20), die zur Anregung von Fluoreszenzemission der mindestens zwei Fluoreszenzmarker mit einer einzigen Laserlinie eingerichtet ist,
mindestens zwei Detektoreinrichtungen (31, 32), die zur De tektion der Fluoreszenzemission in verschiedenen Spektralbereichen ausgelegt sind, und
ein Korrelator (40) zur Kreuzkorrelations- und/oder Koinzi denzanalyse von Detektorsignalen der Detektoreinrichtungen,
dadurch gekennzeichnet, dass
die Beleuchtungseinrichtung einen Laser umfasst, der zur Be leuchtung der Probe im Messvolumen mit maximal einer einzel nen Laserlinie mit einer derart hohen Anregungsintensität ausgelegt ist, dass die Fluoreszenzmarker gemeinsam durch 2- Photonen-Absorptionen angeregt werden.
9. Vorrichtung gemäß Anspruch 8, bei dem der Laser bei ei
ner Anregungslinie emittiert, die im roten oder nah
infraroten Spektralbereich liegt.
10. Vorrichtung gemäß Anspruch 8 oder 9, bei der ein Abbil
dungssystem (50) mit Pinhole-freiem Aufbau vorgesehen ist.
11. Verwendung eines Verfahrens oder einer Vorrichtung gemäß
einem der vorhergehenden Ansprüche zur Messung von Konzentra
tionen in Probenlösungen oder -supensionen zur
- - Erfassung von molekularen Vorgänge in biologischen Zellen, physikalischen oder chemischen Vorgängen zur Verbindung oder Trennung von Substanzen oder Partikeln, oder molekularen Ei genschaften, wie physikalischen oder chemischen Assoziation oder Bindungen bzw. Spaltungen oder Dissoziationen durch Kon zentrationsbestimmung der Analyten,
- - Diffusionsanalyse,
- - Triplettanalyse mittels Kreuzkorrelation,
- - molekularen Helligkeits- und Polarisationsanalyse der Fluo rophore, oder
- - Analyse- oder Bewertung beim High-Throughput-Screening oder beim Selektionsschritt bei der evolutiven Optimierung von Biomolekülen.
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