CN1248295A - 用于病原体及相关抗生素抗性基因检测以进行诊断的种、属特异性和通用的探针及引物 - Google Patents

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Abstract

公开了基于DNA的、利用扩增引物或探针检测、鉴定和定量测定测试样品中下述来源的DNA的方法:(i)任何细菌,(ii)无乳链球菌、腐生葡萄球菌、屎肠球菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、单核细胞增生利斯特氏菌和白假丝酵母,为(iii)链球菌、葡萄球菌、肠球菌、奈瑟氏球菌和假丝酵母各属的任何种类。也公开了基于DNA的、利用扩增引物或探针检测、鉴定和定量测定测试样品中选自下述的抗生素抗性基因的方法:blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aac6’－IIa、aacA4、aad(6’)、vanA、vanB、vanC、msrA、satA、aac(6’)－aph(2”)、vat、vga、ermA、ermB、ermC、mecA、int和sul。上述微生物种、属和抗性基因均是多种临床标本中临床相关的和常见的,这些基于DNA的检测法比较快速、准确,可以用于临床微生物为实验室中进行常规诊断。这些新型方法应可用于提高微生物感染诊断的速度和准确度,因此可以达到更有效的治疗。也要求了用于(i)细菌的通用检测和定量测定,和/或(ii)上述细菌和真菌种和/或属的检测,鉴定和定量测定,和/或(iii)上述抗生素抗性基因的检测,鉴定和定量测定的诊断试剂盒。

Description

用于病原体及相关抗生素抗性基因检测 以进行诊断的种、属特异性和通用的探针及引物
发明背景
用于细菌鉴定和敏感性试验的传统方法
在过去，通常是使用例如API20ETM系统(bioMe′rieux)等生物测试方法，根据细菌利用不同的底物作为碳和氮源的能力来鉴定细菌的。就敏感性试验来说，临床微生物学实验室使用的方法包括平板扩散、琼脂稀释和肉汤微量稀释法。虽然基于生物化学试验和抗菌敏感性试验的鉴定方法是有效的，但由于需要鉴定临床样品中的细菌及确定其对抗微生物药剂的敏感性而必须经过连续两次过夜培养，所以至少要用两天时间才能得到初步鉴定结果。为进行快速微生物鉴定和敏感性试验，已有一些市售的使用高级和贵重装置的自动检测系统(即Dade DiagnoticsCorp.的MicroScan系统和bioMe′rieux的Vitek系统)(Stager andDavis，临床微生物综述，5：302-327)。这些系统需要较短的保温时间，因而可在不到6小时的时间内完成大多数细菌鉴定和敏感性试验。然而，这些快速系统总是需要首先将细菌分离成纯培养物，这一过程对于纯培养物要花费至少18小时，对于混合培养物则需2天时间。最快的鉴定系统是auto SCAN-Walk-AwayTM系统(Date DiganosticsCorp.)，其可在2小时内从标准化接种物中鉴定出革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌，并在5.5小时内得到对大多数抗生素的敏感性模式。然而，该系统对肠细菌以外菌种的非确定性鉴定的比例特别高(即3.3至40.5％)。对肠细菌的非确定性鉴定比例为2.7至11.4％(CroizeJ.，1995，Lett.Infectiol.，10：109-113；York等，1992，临床微生物学杂志，30：2903-2910)。
在微生物学实验室中可常规分离并鉴定临床样品中的各种细菌和真菌。表1和2中列出了各种类型临床样品中最常分离到的细菌和真菌病原体的出现率。这些病原体常常与人们在医院和公共场所获得的感染有关，因而被认为是最具临床重要性的。在临床微生物学实验室中检测的临床样品
临床微生物学实验室中收到的大多数样品是尿样和血样。在I′Universite′Laval中心医院(CHUL)的微生物学实验室中，尿样和血样分别占收到样品的大约55％和30％(表3)。剩下15％的临床样品包括各种生物液体，包括痰、脓、脑脊液、滑液等(表3)。尿道、呼吸道和血流感染通常是由细菌所致，需要抗微生物治疗。事实上，对临床微生物学实验室中收到的所有临床样品的检测通常是鉴定细菌和敏感性测试。临床样品中常规病原体的鉴定尿样
对尿样中病原体的检查在常规微生物学实验室中非常普遍，已经开发出了许多测试方法。然而，通用的标准仍然是经典的半定量性平板培养物方法，其中将1μl尿液在平板上划线，并培养18-24小时。然后对菌落计数以确定每升尿液中菌落形成单位(CFU)的总数。细菌尿道感染(UTI)通常与尿液中细菌数为107CFU/L或更高有关。然而，尿液中细菌数为107CFU/L以下时也有可能造成感染，对于易患病或插入了导管的那些患者尤为如此(Stark和Maki，1984，新英格兰医学杂志，311：560-564)。重要的是，临床微生物学实验室中检测的约80％的尿样被视为是阴性的(即细菌计数小于107CFU/L；表3)。利用标准生化测试方法对经培养物鉴定为阳性的尿样进一步鉴定以鉴别细菌病原体，还检测其对抗生素的敏感性。这种生化和敏感性测试通常需要18-24小时的培养时间。
细菌病原体的准确和快速尿液筛选方法可使得更快速地鉴定出阴性样品，并更有效地治疗和护理患者。已将数种快速鉴别方法(UriscreenTM，UTIscreenTM，Flash TrackTMDNA探针等)与基于细菌病原体培养物的更慢的标准生化方法进行了比较。这些快速测试方法虽然更为快速，但灵敏度较低，特异性也较差，而且假阴性和假阳性结果也很多(Koening等，1992，临床微生物学杂志，30：342-345；Pezzlo等，1992，临床微生物学杂志，30：640-684)。血样
对微生物学实验室中收到的血样常常进行培养。血液培养物系统可以是人工的、半自动的或完全自动的。BACTEC系统(BectonDickinson)和BacTALert系统(Organon Teknika公司)是最为广泛使用的两种自动化血液培养系统。这些系统将血液培养瓶置于细菌生长最佳条件下培养。利用高灵敏性细菌生长检测仪连续地监测细菌的生长，以便检测出早期阳性。一旦检测到细菌生长，即直接对血液培养物进行革兰氏染色，然后用于接种营养琼脂平板。随后，用前述的自动化系统，对分离的细菌菌落进行细菌鉴定和敏感性测试。如果培养6-7天后未检测到病原体生长，通常将这种培养瓶报告为阴性。正常情况下，绝大部分血液培养物报道为阴性。例如，CHUL的微生物学实验室在1994年2月至1995年1月期间阴性血液培养物的比例为93.1％(表3)。
其他临床样品
在由临床微生物学实验室接受后，处理除血液和尿液以外的正常情况下得自无菌部位的所有其他体液(即脑脊液、滑液、胸腔液、心包液等)以进行直接显微镜检查和继后培养。同样，大多数临床样品都是培养阴性的(表3)。
对于那些并非得自无菌部位的临床样品，如痰和粪便样品来说，由于有正常菌群污染，所以用培养法进行实验诊断的问题较多。从污染物中纯化出可能与感染相关的细菌病原体，然后按以前描述的方法进行鉴定。当然，细菌的常用检测法并不适用于诊断这些非无菌部位的细菌感染。另一方面，用于这些样品的种或属的检测和鉴定及抗生素抗性基因检测的基于DNA的试验应是很有用的，并且相比于传统的细菌鉴定和敏感性试验方法有多个优点。用任何临床样品进行的基于DNA的检测法
显然需要建立由临床样品直接检测和鉴定细菌的快速和准确的诊断试验。基于DNA的技术迅速而且准确，并且可能大大改善对传染性疾病的诊断(Persing et al.，1993，诊断分子生物学：原理与应用，American Society for Microbiology，Washington，D.C.)。作为本发明主题的DNA探针和扩增引物适用于直接从血液培养物、血液、尿液、痰、脑脊液、脓及其他标本(表3)等任何一种临床标本检测并鉴定细菌或真菌。从迅速和准确的角度看，本发明中提出的基于DNA的试验优于目前微生物学实验室用于由任何临床样品进行常规诊断的标准生化方法。因为这些试验只在大约1小时内完成，所以它们为临床医生提供了新的诊断工具，从而有利于提高抗微生物剂的治疗效率。也可用这些检测法测试得自人以外生物体(例如其它灵长类、鸟类、植物、哺乳动物、农场动物、家畜等)的临床标本。高百分比的培养阴性标本
在所接受的用于常规诊断的所有临床标本中，大约80％的尿样和更多(约95％)的其他类型临床标本都是细菌病原体阴性的(表3)。除了在种或属水平上鉴定给定标本中的细菌外，还希望用检测任何细菌存在的试验(即通用细菌检测)筛选出高比例的阴性临床标本。这样一种筛选试验可以是基于对所有细菌中的高保守的基因靶进行的DNA的PCR扩增。细菌阴性的标本不会被此检测法扩增。另一方面，细菌阳性的那些标本用此检测法检测会得到阳性扩增信号。发展基于DNA的快速诊断试验
快速诊断试验对处理感染将具有重要影响。DNA探针和DNA扩增技术比鉴定临床样品中的病原体和抗生素抗性基因的常规方法表现有几个方面的优点(Rersing et al.，1993，诊断分子微生物学原理与应用，American Society for Microbiology，Washington，D.C.；Ehrlich和Greenberg，1994，感染性疾病基于PCR的诊断，Blackwell Scientific Publications，Boston，MA)。由于可直接检测临床标本中的生物体，故没有必要培养细菌病原体，从而减少了分离和鉴定病原体的时间。此外，就鉴定细菌来说，基于DNA的检测法比目前使用的基于生化试验的表型鉴定系统更为准确。目前市场上可得到的基于DNA的技术在临床微生物实验室中主要用于检测和鉴定结核杆菌、沙眼衣原体、淋病奈瑟氏球菌等难养菌以及检测各种病毒(Podzorski and Persing，微生物的分子检测与鉴定，P.Murray etal.，1995，《临床微生物学手册》，ASM press，Washington D.C.)。还有一些进行培养物证实检测的其他市场可得到的基于DNA的检测法。
其他一些人已建立了基于DNA的用于细菌病原体检测和鉴定的方法(作为本发明的主题)：葡萄球菌属种(美国专利申请系列号US5437978)、奈瑟氏球菌属种(美国专利申请系列号US5162199和欧洲专利申请系列号EP 0337896131)以及单核细胞增生利斯特氏菌(美国专利申请系列号US5389513和US5089386)。但这些专利中描述的诊断试验是基于rRNA基因或与本发明所述者不同的遗传靶的试验。
虽然有一些诊断试剂盒或方法已被用于临床微生物学实验室，但为了改善常规细菌感染诊断的准确性和速度，仍需要更先进的试验以替代常规培养鉴定法。由于细菌基因型(如DNA水平)比细菌表型更加稳定(例如代谢水平)，所以基于DNA的诊断试验除了比目前使用的标准生化诊断试验更快速外，而且还更加准确。
如根据得自数据库的序列数目所证实的，有关细菌和真菌基因组序列的知识不断增加。基于可很容易得自数据库的序列，并不能指示将其用于诊断目的的能力。为了确定适用于诊断目的的好的候选序列，可选择那些适于进行下列基于DNA的检测法的序列：(i)对常见细菌或真菌病原体进行种特异性检测和鉴定，(ii)对常见细菌或真菌病原体进行属特异性检测和鉴定，(iii)对细菌或真菌病原体进行一般检测，和/或(iv)对抗生素抗性基因进行特异性检测和鉴定。可对各种临床标本或微生物培养物直接完成上述基于DNA的所有试验类型。
在我们的共同未决的专利申请US08/526840和PCT/CA/95/00528中，我们描述了适于进行下列检测的DNA序列：(i)12种临床上重要的细菌病原体的种特异性检测和鉴定，(ii)细菌常规检测和(iii)17种抗生素抗性基因的检测。该共同待批专利申请描述了有优先权的DNA序列和选自数据库的DNA序列(两种情况下，片段均至少100个碱基对)，以及由这些序列衍生的寡核苷酸探针与扩增引物。本专利申请中描述的所有核酸序列均加入能进行下述检测的诊断试剂盒和方法的组合物中：(a)检测细菌的存在，(b)特异性检测12种细菌和17种抗生素抗性基因。然而，由于理想的试剂盒和方法应能够诊断近100％的微生物病原体和抗生素抗性基因，所以仍需对这些方法和试剂盒进行改进。例如，因为屎肠球菌对许多抗生素具有抗性，所以由之引起的感染已逐渐成为一个临床难题。最好是能够检测这些细菌并估计其抗性特征。此外，还希望得到能够识别相同及其他微生物病原体或同一及其他抗生素抗性基因的新的DNA序列(探针和引物)，以有助于检测更多的靶基因并充实我们的早期专利申请。
发明的要点
本发明的目的是提供一种使用探针和/或扩增引物，在估计含有下列来源核酸的任何样品中检测所述核酸的存在和/或其量的特异性的、普遍适用的并且灵敏的方法：
-选自链球菌属种、无乳链球菌、葡萄球菌属种、腐生葡萄球菌、肠球菌属种、屎肠球菌、奈瑟氏球菌属种、脑膜类奈瑟氏球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、假丝酵母属种和白假丝酵母的特定微生物种或属；
-选自blatem、blarob、blashv、blaoxa、blaZ、aadB、aacCl、aacC2、aacC3、aacA4、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、mecA、vanA、vanB、vanC、satA、aac(6′)-aph(2″)、aad(6′)、vat、vga、msrA、sul和int的抗生素抗性基因，以及任选地
-任何菌种，
其中每种所说的核酸或其变体或部分均包括可与所说的探针或引物杂交的选择性靶区域；
所说的方法包括使所说的样品与所说的探针或引物接触，并检测作为所说的任何菌种、特定微生物种或属及抗生素抗性基因的存在和/或量之指征的杂交探针或扩增产物的存在和/或量。
在一特定实施方案中，分别提供了涉及每个特定微生物种或属检测与鉴定、抗生素抗性基因检测，及通用细菌检测的相似方法。
在一更特定的实施方案中，该方法使用根据其灵敏地、特异地和普遍适用地检测靶细菌或真菌核酸的能力而选择的DNA片段(有优先权的片段和得自数据库的片段)。
在一特别优选的实施方案中，已从较长的DNA片段得到了长度至少有12个核苷酸的寡核苷酸，并将其作为探针或扩增引物用于本方法。
有优先权的寡核苷酸(探针和引物)也是本发明的另一个主题。
包含用于检测选自下列一组中的微生物种或属的探针或扩增引物的诊断试剂盒也是本发明的主题：链球菌属种、无乳链球菌、葡萄球菌属种、腐生葡萄球菌、肠球菌属种、屎肠球菌、奈瑟氏球菌属种、脑膜炎奈瑟氏球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、假丝酵母属种和白假丝酵母。
还包括用于检测选自下列一组中的抗生素抗性基因之探针或扩增引物的诊断试剂盒也是本发明的主题：blatem、blarob、blashv、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aacA4、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、mecA、vanA、vanB、vanC、satA、aac(6′)-aph(2″)、aad(6′)、vat、vga、msrA，sul和int。
进一步包括用于检测任何细菌或真菌菌种之探针或扩增引物的诊断试剂盒-其中包括或不包括用于检测上列特定微生物种或属的那些探针或扩增引物，并且进一步包括或不包括用于检测上列抗生素抗性基因的探针和引物-也是本发明的主题。
在一优选实施方案中，这样的试剂盒可用于分离或同时检测与鉴定上列微生物种或属、抗生素抗性基因及检测任何细菌。
在上述方法和试剂盒中，扩增反应可包括a)聚合酶链反应(PCR)，b)连接酶链反应，c)基于核酸序列的扩增，d)自动维持的序列复制，e)链置换扩增，f)分支DNA信号扩增，g)转录介导的扩增，h)循环探针技术(CPT)，i)嵌套PCR，或j)多重PCR。
在一优选实施方案中，使用PCR方法进行扩增反应。
在一特别优选的实施方案中，提供每次扩增循环都包括以下步骤的PCR程序：于45-55℃进行30秒的退火步骤和于95℃仅进行1秒钟的变性步骤，延伸步骤不设置特别的时间。已实现了该PCR方法的标准化，以使之适于用所有选定的引物对进行PCR反应，从而大大有利于测试，因为这样即可在相同循环条件下用通用的、种特异性的、属特异性的引物及抗生素抗性基因PCR引物测试各种临床样品。此外，亦可在多重PCR试验中使用各种不同的引物对组合。
我们意欲发展一种快速试验或试剂盒，以迅速排除细胞阴性的所有样品，然后检测并鉴定上述细菌和/或真菌菌种和属，并迅速确定细菌对抗生素的抗性。虽然可从数据库中得到选定抗生素抗性基因的序列，并已将其用于发展基于DNA的检测试验，但我们的研究工作代表了对当前的基于细菌培养的全方位诊断方法的重要改进，因而是独特的。由于使用可同时进行细菌检测与鉴定和抗生素抗性基因检测的扩增方法，故不需要在试验前培养临床样品。此外，已发展了改良的PCR试验程序，从而可在相同的扩增条件下大约1小时内检测所有的靶DNA序列。这一程序将通过使治疗最佳化而拯救生命，因为投用较少的抗生素而减小抗生素抗性，减少贵重的广谱抗生素的使用，因不用住医院或缩短住医院时间而降低保健医疗费用，并且减少与临床实验室检查相关的时间和花费。
在本文下述的方法和试剂盒中，已从较大序列(即至少有100个碱基对的DNA片段)衍生得到了寡核苷酸探针及扩增引物，所有DNA片段都是从有优先权的诸片段或数据库中得到的。由于是根据其诊断能力而选择的，所以这些从数据库中选出的DNA片段都是最新用于本发明的检测方法中的。
本领域技术人员可以清楚地理解到，也可从有优先权的诸片段或选定数据库序列中推导出除附录VI中列出者以外的适用于(i)通用细菌检测，(ii)检测和鉴定上述微生物种或属，以及(iii)检测抗生素抗性基因的其它寡核苷酸序列。例如，寡核苷酸引物或探针可以比我们已选择的更短或更长；也可以从有优先权的DNA片段或选定数据库序列的其它地方选择；它们也可以是同一寡核苷酸的变体。如果靶DNA或其变体可与给定的寡核苷酸杂交，或者可由给定的寡核苷酸PCR引物对扩增出靶DNA或其变体，则反过来也是成立的；给定的靶DNA可与变体寡核苷酸探针杂交，或可由变体寡核苷酸PCR引物扩增出来。或者，可从任何DNA片段序列设计寡核苷酸，以用于除PCR外的其它扩增方法中。因此，本发明的核心是鉴定通用的、种特异性的、属特异性的和抗性基因特异性的基因组或非基因组DNA片段，以将它们用作特异的和普遍适用的寡核苷酸探针和/或扩增引物的来源。虽然选择和评定适于诊断目的的寡核苷酸需要作许多工作，但本领域技术人员完全有可能由选定DNA片段设计出适于诊断目的的、附录VI中所列者以外的寡核苷酸。如果基于其特异性和普遍适用性选择有优先权的片段或数据库序列，即可增加其亚组亦将是特异的和普遍适用的这种可能性。
因为高比例的临床样品是细菌阴性的(表3)，所以从有优先权的序列和数据库序列中选择那些极适于作为通用寡核苷酸探针或引物来源的DNA片段。从细菌和真菌中高度保守的基因中选择扩增引物，并用于检测临床标本中任何细菌病原体的存在，以迅速(约1小时)确定被检物是细菌阳性还是阴性。称为tuf的选定基因编码一种在蛋白质合成期间参与翻译过程的蛋白质(EF-Tu)。用于衍生通用引物的tuf基因序列对比分析包括有优先权的序列和数据库中的序列(实施例1和附录1)。这一策略使得可以迅速筛选出交付细菌学试验的大量阴性临床标本(约为所收到的标本的80％，参见表3)。表4、5和6中列出了用于试验PCR引物和DNA探针之特异性的细菌或真菌菌种。表7中给出了对作为本发明的主题的每种种特异性、属特异性和通用扩增试验的简要描述。表8、9和10提供了为诊断目的而选择的有优先权的序列和数据库中的序列的某些相关信息。发明的详细描述用于微生物的种特异性、属特异性、通用和抗生素抗性基因特异性DNA探针及扩增引物的产生
从数据库序列中选择适于诊断目的的序列
为了选择适于对细菌或真菌进行种特异性或属特异性检测与鉴定、或者适于对细菌进行通用检测的序列，根据数据库序列的序列信息和对这些序列进行的计算机分析结果，基于其用于诊断目的的能力而选择数据库序列(GenBank，EMBL和Swiss-Port)。首先，仔细分析可为靶微生物种或属所利用的所有序列数据。依据基因序列信息和由Genetics Computer Group(GCG，Wisconsin)程序完成的与其他种或属的微生物中相应基因的序列比较，选择出最有希望用于诊断目的的基因序列，以用于PCR试验。借助OligoTM40引物分析软件(NationalBiosciences Inc.，P1ymouth，Minn，)，从经选择的数据库序列中选出最宜用的PCR扩增引物。在PCR试验中测试所选出的引物对靶微生物种或属的特异性及普遍适用性。一般说来，在得到对靶微生物种或属特异的和普遍适用的引物对之前，须对几个首选基因序列进行计算机分析和PCR试验，以鉴定那些从中得到适于种特异性或属特异性检测与鉴定之扩增引物的数据库序列。附录VI列出了选出的特异的和普遍适用的PCR引物对。附录I至V和实施例1至4举例说明了用于从tuf基因中或从recA基因中选择种特异性、属特异性及通用PCR引物的策略。
寡核苷酸引物和探针的设计与合成
使用我们测序的DNA片段或从数据库(GenBank and EMBL)中选择的DNA片段作为用于诊断目的的寡核苷酸的来源。以PCR法和本文后述的杂交法测试从选自数据库的各种基因组DNA片段(大小在100个碱基对以上)衍生的一系列适当寡核苷酸引物或探针的特异性和通用性。值得注意的是，数据库序列是基于可得到的序列信息及深入分析的结果，根据其对细菌或真菌进行种特异性、属特异性或通用检测的潜在能力而选择的，并且一般说来，为获得预期的特异性、普遍适用性及灵敏性，须测试几个候选数据库序列。
使用自动DNA合成仪(Perkin-Elmer Corp.，AppliedBiosystems Division)合成由选自数据库序列的种特异性片段衍生的寡核苷酸探针及扩增引物。在合成之前，使用标准程序(即GeneticsComputer Group(GCG)程序和引物分析软件OligoTM4.0)进行计算机分析，估计所有寡核苷酸(杂交探针和DNA扩增引物)是否适用于杂交或通过聚合酶链反应(PCR)的DNA扩增。也可在合成之前通过证实有无一种核苷酸的长分支及在3′末端的高比例G或C残基等不希望存在的特征估计PCR引物对的潜在适用性(Persing et al.，1993，诊断分子生物学：原理及应用，American Society for Microbiology，Washington，D.C.)。
可由双股DNA的任一条链衍生得到寡核苷酸引物或探针。引物或探针可由碱基A、G、C或T或类似物组成，它们可在一个或多个选定的寡核苷酸位置上发生简并。引物或探针可以有任何适当长度，并且可在得自有优先权的片段或选定的数据库序列的DNA序列内任何地方选择，DNA序列应适用于(i)对细菌进行通用检测，(ii)对屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌和白假丝酵母进行种特异性检测和鉴定，(iii)对链球菌属、肠球菌属、葡萄球菌属和奈瑟氏球菌属种进行属特异性检测，或(iv)检测上文提到的26种临床上重要的抗生素抗性基因。
给定的靶细菌基因的变体是天然存在的，其产生是由于在进化期间基因内发生序列变异的结果(Watson et al.，1987，基因的分子生物学；第4版，The Benjamin/Cummings Publishing Company，MenloPark，CA；Lewin，1989，Genes N，John Wiley & Sons，New York，NY)。例如，同一细菌种的不同菌株可在寡核苷酸杂交位点上有一个或多个核苷酸变异。本领域技术人员都知道特定基因存在细菌或真菌变体DNA序列，而且知道序列变异的发生频率取决于进化期间给定基因产物受到的选择压力。可通过测定扩增产物的序列而证实对两个PCR引物间的区域内变体序列的检测。为了显示引物杂交处序列变体的存在，必须用位于杂交位点外面的PCR引物扩增较大的DNA靶。测定该较大片段的序列将得以确定该位点上的序列变异。相似的策略也适用于显示探针杂交位点处的变体。既然靶序列或其部分的差异并不影响扩增引物或探针的特异性及普遍适用性，因此变异的细菌DNA均属于本发明的范围。也可使用选定引物或探针的变体扩增变体DNA，或与之杂交。
测定各种细菌和真菌的tuf基因的序列
测定各种细菌和真菌之部分tuf基因的核苷酸序列。使用可扩增约890bp之部分tuf基因的扩增引物SEQ ID NO：107和108测定细菌tuf基因的核苷酸序列。使用可扩增约830bp之部分tuf基因的扩增引物SEQ ID NO：109和172测定真菌tuf基因的核苷酸序列。两对引物均可扩增tuf A和tuf B基因。这并不难理解，因为这两个基因几乎完全相同。例如，大肠杆菌的完整tuf A和tuf B基因只在13个核苷酸位置处有所不同(Neidhardt et al.，1996大肠杆菌和沙门氏菌：细胞与分子生物学，第2版，American Society for MicrobiologyPress，Washington，D.C.)。这些扩增引物在几个核苷酸位置处具有简并，并含有次黄苷，从而得以扩增更大范围的tuf序列。用于选择这些扩增引物的策略相似于如附录1所举例说明的用于选择通用引物的策略。可使用扩增引物SEQ ID NO：107和108扩增任何细菌菌种的tuf基因。可使用扩增引物SEQ ID NO：109和172扩增任何真菌菌种的tuf基因。
使用下述扩增程序直接从细菌或酵母培养物扩增tuf基因：将1μl细菌悬液直接移入19μl含有50mM KCl、10mM Tris-HCl(pH9.0)、0.1％Triton X-100、2.5mM MgCl2、各1μM的两种引物、各200μM的四种dNTP、0.5单位TaqDNA聚合酶(Promega Corp.，Madison，WI)的PCR反应混合物中。使用MJ Research PTC-200热循环仪(MJRearch Inc.，Watertown，Mass.)按下述步骤进行PCR反应：96℃3分钟，随后是95℃变性1分钟，于30-50℃退火1分钟，并于72℃延伸1分钟，共进行30-35个循环。然后，在1.5％琼脂糖凝胶中电泳分辨20μl经PCR扩增的混合物。然后用亚甲基兰染色以显现凝胶分离物(Flores et al.，1992，Biotechniques，13：203-205)。经与100bp分子量梯度进行比较以估计扩增产物的大小。从琼脂糖凝胶上切下相当于特异性扩增产物的条带(即分别为890或830bp的细菌或真菌tuf序列)，并使用QIAquickTM凝胶提取试剂盒(QIAGEN Inc.，Chatsworth，CA)纯化之。然后将经凝胶纯化的DNA片段直接用于测序步骤。使用Applied Biosystems自动DNA序列仪(373A型)，连用其PRISMTM Sequenase终止区双链DNA测序试剂盒(Perkin-ElmerCorp.，Applied Biosystems Division，Foster City，CA)，以双脱氧核苷酸链终止测序法测定tuf基因扩增产物两条链的序列。测序反应均使用扩增引物(SEQ ID NO：107至109和172)和各100ng经凝胶纯化的扩增产物完成。为了确保所测定的序列不含有因PCR伪象造成的错误，我们测定了从两次独立PCR扩增得到的经凝胶纯化的tuf扩增产物两份制剂的序列。对于所有靶微生物种来说，就两种扩增产物制剂所确定的序列是完全相同的。此外，两条链的序列是100％互补的，从而证实所确定的序列是高度准确的。使用上述策略确定的tuf序列均列于序列表中(即SEQ ID NO：118至146)。表13中给出了原微生物种和序列表中各tuf序列的来源。
将我们确定的tuf序列或从数据库中选择的tuf序列进行对比，可以清楚地看出测序部分的tuf基因的长度是可变的。其中可以有几个氨基酸的插入和缺失。这一现象说明了为什么不同细菌和真菌菌种的已测序之tuf扩增产物的大小是有所变化。我们发现，在我们研究小组确定的tuf序列中可插入和缺失多达5个氨基酸或15个核苷酸。因此，附录I至V上列出的核苷酸位置与具有插入或缺失的tuf序列并不符合。
还应提到的是，我们测定的各种tuf序列偶尔表现有简并现象。由于扩增引物可扩增两种tuf基因，所以这些简并的核苷酸相当于tuf A和tuf B基因之间的序列变异。因为两条链的序列是完全相同的，并且用凝胶纯化的两份tuf扩增产物制剂测得的序列也是相同的，所以这些核苷酸变异并不是由于taq DNA聚合酶造成的核苷酸错误掺入。
从tuf序列选择扩增引物
使用由我们测定的或从数据库选择的tuf序列选择用于下列目的的PCR引物：(i)细菌的通用检测，(ii)肠球菌属种和葡萄球菌属种的属特异性检测和鉴定，以及(iii)白假丝酵母的种特异性检测和鉴定。用于选择这些PCR引物的策略是基于对各个tuf序列的多重序列对比分析。有关从tuf序列中选择PCR引物的更详细的说明请参见实施例1至3和附录I至IV。
从recA中选择扩增引物
比较得自各种细菌(包括5种链球菌)之recA基因的核苷酸序列后得以选择出链球菌属特异性PCR引物。有关从rec中选择PCR引物的详细说明请参见实施例4和附录V。
用任意引物PCR法从腐生葡萄球菌中分离DNA片段
用任意引物PCR法(AP-PCR)得到用于种特异性检测和鉴定腐生葡萄球菌的未知编码能力的DNA序列。
AP-PCR是一种可用于产生微生物特异性DNA探针的方法(Faniet al.，1993 Mol.Ecol，2：243-250)。对用于从腐生葡萄球菌中分离种特异性基因组DNA片段的AP-PCR步骤的描述如下。用得自3个腐生葡萄球菌菌株(均得自美国典型培养物保藏中心(ATCC)：No：15305、35552和43867)的DNA和得自4个其他葡萄球菌菌种(金黄色葡萄球菌ATCC 25923、表皮葡萄球菌ATCC 14990、溶血葡萄球菌ATCC 29970和人葡萄球菌ATCC 35982)的DNA系统地试验20种长度为10个核苷酸的不同寡核苷酸引物。对所有细菌菌种来说，均从调整到标准0.5McFarland的细菌悬液(相当于大约1.5×108个细菌/ml)进行扩增。将1μl标准化细菌悬液直接转移到19μl含有50mM KCl、10mMTris-HCl(pH9.0)、0.1％Triton X-100、2.5mM MgCl2、1.2μM 20种不同的AP-PCR引物OPAD中的仅一种)、各200μM的四种dNTP和0.5单位Taq DNA聚合酶(Promega Crop.，Madison，WI)的PCR反应混合物中。使用MJ Research PTC-200热循环仪(MJ Reasearch Inc.)按下述热循环步骤进行PCR反应：96℃3分钟，随后95℃变性1分钟，32℃退火1分钟和72℃延伸1分钟，共进行35个循环。35轮循环后进行72℃7分钟的最后延伸步骤，以确保PCR产物的完整延伸。然后，在含有0.25μg/ml溴乙锭的2％琼脂糖凝胶中电泳分辨20μl PCR扩增产物。经与50bp分子量梯度比较而估计扩增产物的大小。
用AP-PCR引物OPAD-9(SEQ ID NO：25)观察到腐生葡萄球菌特异的扩增模式。用该引物扩增，所有腐生葡萄球菌菌株都总是显示一条相当于约450bp DNA片段的带，但试验的所有四种其他葡萄球菌则都不显示这样一条带。试验选自CHUL微生物实验室培养物保藏库的10种以上腐生葡萄球菌临床分离物及选自表5中所列革兰氏阳性菌的菌株，进一步证实了这一种特异性模式。
从琼脂糖凝胶中切下相当于大约450bp扩增产物(基于AP-PCR证实其为腐生葡萄球菌特异的和普遍存在的)的带，并使用QIAquickTM凝胶提取试剂盒(QIAGEN Inc.)纯化之。使用T4 DNA连接酶(NewEngland BioLabs)将经凝胶纯化的DNA片段克隆到pCR2.1TM质粒载体(Invitrogen Inc.)的T/A克隆位点中。使用标准方法将重组质粒转入大肠杆菌DH5α感受态细胞内。按Birnboim和Doly(核酸研究，7：1513-1523)的小批量制备方法分离质粒DNA。用EcoRI限制性核酸内切酶消化所有质粒DNA制剂，以确保重组质粒中存在有约450bp的AP-PCR插入物。然后，使用QIAGEN质粒纯化试剂盒从选出的显示携带有AP-PCR插入物的两个克隆大批量制备高度纯化的质粒DNA制剂。使用这些质粒制剂进行自动DNA测序。
使用前述Applied Biosytems自动DNA测序，用SP6和T7测序引物，通过双脱氧核苷酸链终止测序法测定两个选定克隆的AP-PCR插入物的双链序列。分析所得序列，揭示出从各克隆所得两条链的DNA序列是100％互补的。此外，还显示所测得的各克隆的完整序列都是相同的。这些测序数据证实所测得的438bp序列(SEQ ID NO：29)有100％的准确性。已借助引物分析软件OligoTM 4.0从测序的AP-PCR腐生葡萄球菌DNA片段选择出了最适扩增引物。为证实其特异性和普遍适用性，已用PCR检测法试验了选出的引物序列(表7)。因为用从表4和5中选择的除腐生葡萄球菌外的细菌的DNA没有发生扩增，所以这些PCR引物是特异的。此外，由于用这一PCR检测法有效地扩增了260个腐生葡萄球菌菌株中的245个菌株，所以这一检测法是普遍适用的。当与其他腐生葡萄球菌特异性PCR检测法(其为我们的共同待批美国(N.S.08/526,840)和PCT(PCT/CA/95/00528)专利申请的主题)合用时，对260个菌株的普遍适用性即达到100％。
DNA扩增
为了用广泛使用的PCR(聚合酶链反应)方法进行DNA扩增，从有优先权的DNA片段或数据库序列得到引物时。合成之前，使用OligoTM4.0软件分析可能适用的引物对，以证实它们是用于PCR扩增的较好候选引物。
在用PCR法扩增DNA期间，使用分别与得自细菌基因组之热变性靶DNA的每条链结合的两个寡核苷酸引物，经连续热循环使每次循环时DNA变性、引物退火并合成新的靶，从而以指数形式体外扩增靶DNA(Persing et al.，1983，诊断分子微生物学：原理及应用，AmericanSociety for Microbiology，Washington，D.C.)。
简单地说，PCR程序如下：在含有50mM KCl、10mM Tris-HCl(pH9.0)、2.5mM MgCl2、各0.4μM的每种引物、各200μM的四种dNTP和0.5单位与TaqStartTM抗体(Clontech Laboratories Inc.，PaloAlto，CA)结合的0.5单位Taq DNA聚合酶(Promega)的20μl PCR反应混合物中扩增经过处理的临床标本或者标准化的细菌或真菌悬液(详见下文)。向所有PCR反应中加入针对Taq DNA聚合酶的中和性单克隆抗体Taq StartTM抗体，以提高扩增的特异性和灵敏性(Kellogg etal.，1994，Biotechniques 16：1134-1137)。由于各种不同类型标本所需的组合物和灵敏性水平不同，因此对临床标本的方法随所试验的标本的类型而异。在快速方法中，包括裂解细菌细胞并消除PCR抑制作用(有关尿标本的制备参见实施例11)。为了从细菌或真菌培养物扩增，可不作任何预处理而直接将样品加到PCR扩增混合物中(参见实施例10)。使用由细菌16S核糖体RNA基因的高保守区域衍生的引物序列，以作为所有PCR反应的内部对照。另外，也可由不见于微生物中或人基因组中的序列得到内部对照。将内部对照加到所有扩增反应中以证实PCR试验法的效率，并确保没有明显的PCR抑制。也可使用衍生于rRNA的内部对照监测细菌裂解步骤的效率。
然后使用PTC-200热循环仪(MJ Research Inc.)对PCR反应混合物进行热循环(95℃3分钟，然后是95℃1秒钟的变性步骤和55℃30秒的退火-延伸步骤，共30个循环)，并用标准溴乙锭染色的琼脂糖凝胶电泳法进行分析。PCR试验中进行的循环数根据所需的灵敏度水平而有所不同。例如，直接从临床标本检测微生物时，血液标本所需的灵敏度水平要比尿标本高，这是因为与败血病相关的微生物浓度比与尿路感染相关的微生物浓度低得多。因此，对于直接检测血液标本来说，需要使用有更多次热循环的更为灵敏的PCR检测法。同样，直接从细菌或真菌培养物进行PCR检测可能比直接从临床标本进行PCR检测的灵敏性低些，因为正常情况下临床标本中靶微生物的数目要比微生物培养物中靶微生物的数目低得多。
很显然，可以使用更快速而且更适用于常规诊断的其他特异性扩增产物检测方法。这种方法可能是基于检测扩增后的荧光(例如使用Perkin Elmer公司的TaqManTM系统或Biotronics公司的AmphisensorTM)。因为基于检测荧光的方法十分快速、可定量并且可以自动化(实施例14)，所以特别适用于进行常规诊断。
也可以使用能与扩增产物杂交的种特异性内部DNA探针，通过固相载体或液相杂交法检测和鉴定微生物病原体。这样的探针可从作为本发明主题的任何种特异性或属特异性DNA扩增产物得到。或者，也可从由通用扩增检测法产生的扩增子得到用于种或属检测与鉴定的内部探针。可用生物素或洋地黄毒苷或任何其他报道分子标记寡核苷酸探针。
为确保PCR效率，可使用甘油、二甲基亚砜(DMSO)或其他相关溶剂，以增加PCR灵敏性，并克服扩增有高GC含量或形成强二级结构的靶DNA时出现的问题(Dieffenbach and Dveksler，1995，PCR引物：实验室手册，Cold Spring Harbor Laboratory Press，Plainview，New York)。甘油和DMSO的浓度范围分别为5-15％(V/V)和3-10％(V/V)。对于PCR反应混合物，扩增引物和MgCl2的浓度范围分别为0.1-1.5μM和1.5-3.5mM。也可以使用改良的标准PCR检测程序，其中使用外部和嵌套引物(即嵌套PCR)或使用一个以上的引物对(即多重PCR)(Persing et al.，1993，诊断分子微生物学：原理与应用，American Society for Microbiology，Washington，D.C.)。有关PCR方法和扩增产物检测方法的更详细说明参见实施例9-14。
其他一些快速扩增法，例如连接酶链反应(LCR)、转录介导的扩增法(TMA)、自身维持的序列复制(3SR)、基于核酸序列的扩增(NASBA)。链置换扩增(SDA)、分支DNA(bDNA)和循环探针技术(CPT)等都是DNA扩增领域中的技术人员已知的(Lec et al.，1997，核酸扩增技术：疾病诊断中的应用，Eaton Publishing，Boston，MA；Pevsing et al.，1993，诊断分子微生物学：原理与应用，AmericanSociety for Microbiology，Washington，D.C.)。本发明的范围并不限于使用PCR扩增法，而且还包括使用任何其他快速核酸扩增方法或者可用于提高试验速度及灵敏度的任何其他方法。本说明书中所包括的任何适于通过PCR以外的方法扩增核酸的任何寡核苷酸，和衍生于种特异性、属特异性与通用DNA片段和选自抗生素抗性基因序列的任何寡核苷酸均属于本发明的范围。
用寡核苷酸探针进行的杂交检测法
在杂交实验中，单链寡核苷酸(小于100个核苷酸)在检测细菌方面优于DNA片段探针，例如容易大量合成、批次间的结果恒定，并且有好的化学稳定性。简单地说，为了进行杂交，利用T4多核苷酸激酶(Pharmacia)用γ-32P(dATP)这种放射性核苷酸标记寡核苷酸的5′末端(Sambrook et al.，1989，分子克隆：实施室手册，第2版，ColdSpring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，NY)。使标记的寡核苷酸通过Sephadex G-50TM柱以除去未掺入的放射性核苷酸。或者，也可用生物素或洋地黄毒苷标记寡核苷酸，可以在其3′末端经酶促标记或在合成期间在其5′末端直接掺入。本领域技术人员可以意识到，也可使用上述三种方法以外的其他标记方法。
然后使各个寡核苷酸探针与得自选自于表4，5，和6的各种细菌和真菌菌种的DNA杂交，以测试其特异性。试验的所有细菌或真菌均可能是与常见感染或分离自临床标本的潜在污染物相关的病原体。使用标准化学处理方法裂解细菌细胞，以从中释放出靶DNA(Sambrook et al.，1989，分子克隆：实验室手册，第2版，Cold Spring HarborLaboratory Press，Cold Spring Harbor，NY)。然后，用常规方法使DNA变性并不可逆地固定于固相载体(如尼龙或硝酸纤维素膜)上或游离于溶液中。然后使固定的单链靶DNA与寡核苷酸探针杂交(Sambrook et al.，文献同上)。预杂交条件是在1M NaCl+10％葡聚糖硫酸酯+1％SDS+100μg/μl鲑精DNA中65℃15分钟。在含有标记探针的新鲜预杂交溶液中于65℃杂交过夜。杂交后的洗涤条件是在含1％SDS的3×SSC中洗两次，在含1％SDS的2×SSC中洗两次，在含1％SDS的1×SSC中洗两次(全部三种洗涤均是在65℃下15分钟)，最后在含1％SDS的0.1×SSC中洗一次(25℃，15分钟)。对洗过的滤膜进行放射自显影，以检测选择性杂交的探针。由于使用高严格性的洗涤条件，所以探针与特异靶DNA杂交即表明这两种DNA的核苷酸序列间有高度相似性。
只有当寡核苷酸探针只与其来源的种或属微生物的DNA杂交时才认为它是特异的。然后将已发现为特异的寡核苷酸探针与得自感兴趣之种或属的临床分离物(包括ATCC菌株)的微生物DNA杂交以试验其普遍性(即识别大多数或所有靶微生物种或属的分离物的普遍性探针)。变性处理靶种或属菌株的DNA，固定在尼龙膜上并按上述方法杂交。如果探针与至少80％的靶种或属分离物的DNA特异性杂交，即认为该探针是普遍适用的。
寡核苷酸引物和探针的特异性和普遍适用性
按前两部分中所述方法，通过扩增DNA或与选自表4、5和6中所列的细菌或真菌菌种杂交，测试衍生于我们测序的或选自数据库的DNA片段的寡核苷酸引物和探针的特异性。然后再扩增(引物)或与靶微生物种或属之分离物的细菌DNA杂交(探针)，测试发现为特异的寡核苷酸的普遍适用性。表7中总结了寡核苷酸引物的特异性和普遍适用性测试的结果。从细菌或真菌菌种的培养物(见实施例9和10)直接测试使用选定扩增引物对之PCR测试的特异性和普遍适用性。
作为本发明的主题的各个种特异性和属特异性PCR检测法都是特异的。对于细菌种或属特异的PCR检测法来说，这意味着从靶种或属以及选自表4和5以外的多种细菌分离的DNA不能被扩增。对于对白假丝酵母特异的PCR检测法来说，则意味着表6所列真菌菌种及选自表4和5之各种细菌的基因组DNA不能被扩增。
作为本发明主题的各个种特异性和属特异性PCR检测法也都是普遍适用的(表7)。(i)屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌和白假丝酵母的种特异性PCR检测法扩增了得自各种来源并代表测试靶种内之差异性的所有或大多数菌株的基因组DNA(表7)。所有这些菌株的种鉴定均是基于临床微生物学实验室中常规使用的传统生化方法。(ii)肠球菌、葡萄球菌、链球菌和奈瑟氏球菌属种特异的属特异性PCR试验扩增了被试靶属内代表每个靶属的临床上重要的所有菌种的全部或大多数菌株。这些菌株得自各种来源，是每个靶属内多样性的代表。同样，对所有这些菌株的菌种鉴定是基于临床微生物学实验室中常规使用的传统生化方法。更具体地说，四种属特异性的PCR试验扩增下列菌种的DNA：(1)肠球菌属特异性试验有效地扩增所试验的包括鸟肠球菌、铅黄肠球菌，殊异肠球菌，耐久肠球菌，粪肠球菌，屎肠球菌，黄色肠球菌，鹑鸡肠球菌，海氏肠球菌，蒙氏肠球菌和棉子糖肠球菌在内的所有11种肠球菌的DNA。(2)奈瑟氏球菌属特异性试验有效地扩增所试验的包括狗奈瑟氏球菌，灰色奈瑟氏球菌，长奈瑟氏球菌，浅黄奈瑟氏球菌，淋病奈瑟氏球菌，乳糖奈瑟氏球菌，脑膜炎奈瑟氏球菌，粘液奈瑟氏球菌，多糖奈瑟氏球菌，干燥奈瑟氏球菌，微黄奈瑟氏球菌和N.Weaveri在内所有12种奈瑟氏球菌的DNA。(3)葡萄球菌属特异性试验有效地扩增所试验的包括金黄色葡萄球菌，耳葡萄球菌，头壮葡萄球菌，科氏葡萄球菌，表皮葡萄球菌，溶血葡萄球菌，人葡萄球菌，路邓葡萄球菌，腐生葡萄球菌，施氏葡萄球菌，模仿葡萄球菌，沃氏葡萄球菌和木糖葡萄球菌在内的14种葡萄球菌中13种的DNA。不能被扩增的葡萄球菌菌种是松鼠葡萄球菌。(4)最后，链球菌属特异性试验有效地扩增所试验的包括无乳链球菌，咽峡炎链球菌，牛链球菌，咽峡炎链球菌，嵴链球菌，停乳链球菌，马链球菌，格氏链球菌，中间链球菌，缓症链球菌，变异链球菌，口腔链球菌，副血链球菌，肺炎链球菌，酿脓链球菌，唾液链球菌，血链球菌，表兄链球菌，猪链球菌，乳房链球菌，前庭链球菌和绿色链球菌在内的所有22种链球菌的DNA。另一方面，链球菌属特异性试验并不扩增9个变异链球菌菌株中的3个，和23个唾液链球菌菌株中的1个菌株，因而显示对于这两种链球菌的普遍适用性稍差一些。
附录VI中列出了所研究的每个靶微生物种或属或抗生素抗性基因的所有特异性和普遍适用性扩增引物。测序的DNA片段中可以存在一些差异性，因为这些序列或其部分的差异性并不影响探针或扩增引物的特异性。变种的细菌DNA也属于本发明的范围。
使用参考菌株及得自各种不同地理位置的临床分离物试验附录VI中所列的所有PCR扩增引物的特异性和普遍适用性。用于测试扩增和杂交检验法的351个参考菌株(表4、5和6)得自：(i)美国典型培养物保藏中心(ATCC)：85％，(ii)Laboratoire de sant’epublique du Quebec(LSPQ)：10％，(iii)疾病控制和预防中心(CDC)：3％，(iv)国家典型培养物保藏中心(NCTC)：1％和(v)世界各地的几个其他参考实验室：1％。这些参考菌株代表了(i)90种革兰氏阴性细菌(169个菌株；表4)(ii)97种革兰氏阳性细菌(154个菌株；表5)(iii)12种真菌(28个菌株；表6)。
抗生素抗性基因
抗微生物抗性扰乱治疗过程并常常导致治疗失败。此外，滥用抗生素必然会导致细菌抗性的出现。我们的目的是在1个小时内为临床医生提供开具最佳治疗方案所需的信息。除了用基于DNA的通用细菌检测试验迅速鉴定阴性的临床标本，并用种特异性和/或属特异性的基于DNA的试验鉴定阳性标本中特异性病原体的存在之外，临床医生还定时需要关于细菌病原体对抗生素治疗之耐受能力的信息。我们感到，迅速估计细菌对抗微生物剂之耐受能力的最有效策略就是直接检测临床标本中最常见的和临床上最重要的抗生素抗性基因(即基于DNA的检测抗生素抗性基因的试验)。由于可从数据库中得到最重要和最常见的细菌抗生素抗性基因的序列，所以我们的策略是使用部分或整个抗性基因的序列设计可用作建立基于DNA的快速试验之基础的特异性寡核苷酸引物或探针。序列表中给出了基于其临床相关性(即高发生率和重要性)而选择的各个细菌抗生素抗性基因的序列。表9和10总结了所选择的抗生素抗性基因的某些特征。因为可在同一PCR扩增条件下以多重检测法同时进行抗生素抗性基因检测和细菌检测与鉴定(实施例13)，所以我们的方法是独特的。
附录IV列出了在PCR检测法中试验的选自26种临床上重要的抗生素抗性基因的所有扩增引物。试验几种已知携带靶基因并得自不同国家的抗性细菌分离物，以确认用于抗生素抗性基因检测和鉴定的各种PCR检测法。还测试了许多不携带靶抗性基因的菌株，以确保所有试验都是特异的。至此，已知所有抗生素抗性基因的PCR检测法都是高度特异的，并检测出了已知携带靶基因的所有对照抗性菌株。表11和12中给出了用于检测和鉴定抗生素抗性基因的一系列PCR检测法的某些临床研究结果，以及这些基于DNA的检测法与标准抗微生物剂敏感性试验方法的相互关系。
通用细菌检测
在常规微生物学实验室中，很大比例的细菌鉴定送检临床标本都是培养阴性的(表4)。在进行特异性鉴定并筛选出大量阴性标本之前用通用扩增引物或通用探针测试临床样品，以检测细菌的存在是有用的。因为这样可以节省费用并有可能迅速修正对病人的临床治疗方案。因此从细菌tuf基因序列的高保守部分合成了多个扩增引物和探针。通用引物的选择是基于用实施例1和附录1中所述的由我们测定的序列或选自数据库的序列构成的多重序列对比。
为了鉴定适于细菌通用检测的数据库序列，我们利用了可得到两种相隔较远的微生物(即屈曲支原体(Mycoplasma genitalium)和流感嗜血菌的完整基因组序列这一事实。比较由这两种不同微生物的基因组编码的所有蛋白质的氨基酸序列，即可鉴定出高度同源的蛋白质。分析这些同源蛋白质即可选择出某些可用于检测细菌的基于DNA的通用检测法的有希望的首选序列。由于从数据库中可得到几种其他微生物基因组的完整核苷酸序列，所以本领域技术人员在比较屈曲支原体和流感嗜血菌以外微生物的基因组序列后可得出同样的结论。选择的tuf基因编码在蛋白质合成期间参予翻译过程的一种蛋白质(EF-Tu)。最后，用数据库中可得到的tuf基因序列以及如前所述我们已确定的新的tuf序列进行深入的核苷酸序列分析。利用GCG程序进行氨基酸和核苷酸序列的所有计算机分析。然后借助OligoTM程序选择出对细菌进行通用扩增的最佳PCR引物。使所选择的引物在几个核苷酸位置上发生简并，并含有几个次黄苷以便扩增所有临床相关菌种(附录1)的DNA。次黄苷是能够与四种核苷酸A、C、G或T中的任何一种特异结合的一种核苷酸类似物。简并的寡核苷酸是由在错配位置上具有四种核苷酸A、C、G或T中两种或多种的寡核苷酸混合物组成的。在扩增引物中包括次黄苷和/或简并可耐受错配，从而得以扩增较宽系列的靶核苷酸序列(Dieffenbach and Dveksler，1995，PCR引物：实验室手册，ColdSpring Harbor Laboratory Press，Plainview，N Y)。
用通用引物进行扩增的条件与用于种和属特异性扩增试验的条件基本相同，只是退火温度为50℃而不是55℃。该通用PCR检测对于检测细菌是特异的，并且几乎是普遍适用的。经扩增分离自表6中所列12种真菌菌种的基因组DNA和得自Leishmania donovani、酿酒酵母及人淋巴细胞的基因组DNA，进一步证实了其对细菌的特异性。上述真核细胞DNA制剂均不能用通用检测法扩增，从而提示该试验是细菌特异的。对代表95种临床上最相关菌种之共116个参照菌株的基因组DNA的扩增证实了通用检测法的普遍适用性。这些菌种是从表4和表5中所列细菌菌种中选择出来的。我们发现，这116个菌株中有104个可以得到扩增。不能被扩增的细菌菌种属于棒杆菌属(11种)和寡养单胞菌属(1种)。最近已测定了得自这些菌种的tuf基因。已利用此测序数据选择可能更为普遍适用的新的通用引物。这些引物正在受测试。我们还观察到，为了获得有效的扩增，对几个菌种必须将退火温度降低到45℃。这些细菌种类包括麻疹孪生球菌(Gemella morbilbrum)、利斯特氏菌(3种)和阴道加德纳氏菌。特别值得提到的是，从表4和5中选择出来用于试验通用检测法之普遍适用性的95种细菌包括与人在公共场所或医院内获得的各种感染(鼻粘膜感染)有关的所有临床最相关的菌种。表1和2中列出了临床上最重要的细菌和真菌病原体。
实施例和附录
下列实施例和附录旨在举例说明本发明的各种方法和化合物，而不是限制其范围。
各附录显示用于从tuf序列或recA基因挑选扩增引物的策略：(i)附录1说明用于从tuf序列中选择通用扩增引物的策略。(ii)附录II显示用于从tuf序列选择肠球菌属特异的扩增引物的策略。(iii)附录III说明用于从tuf序列选择葡萄球菌属特异的扩增引物的策略。(iv)附录IV显示用于从tuf序列中选择对白假丝酵母特异的扩增引物的策略。(v)附录V举例说明用于从recA序列中选择对链球菌属特异的扩增引物的策略。(vi)附录VI给出所选择的所有引物对。如这些附录中所示，选出的扩增引物可含有次黄苷和/或简并核苷酸。次黄苷是一种能够与四种核苷酸A、C、G或T中任何一种特异结合的核苷酸类似物。或者，亦可使用由在错配位点上具有A、C、G或T中两种或多种核苷酸的寡核苷酸混合物组成的简并寡核苷酸。扩增引物中包括次黄苷和/或简并核苷酸使之得以耐受错配，从而允许扩增更宽系列的靶核苷酸序列(Dieffenbach and Dveksler，1995，PCR引物：实验室手册，Cold Spring Harbor Laboratory Press，Plainview，New York)。
实施例
实施例1：从tuf序列中选择通用PCR引物
如附录I中所示，比较各种细菌和真核物种的tuf序列得以选择检测细菌所通用的PCR引物。用于设计PCR引物的策略是基于对各种tuf序列的多重序列对比分析。该多重序列对比包括由我们确定的或选自数据库的38种细菌和3种真核生物(表13)的tuf序列。仔细分析此多重序列对比即可以选出在真细菌内保守但与真核生物的序列不同的引物序列，从而使得可以对细菌进行通用检测。如附录I中所示，选出的引物含有几个次黄苷和简并核苷酸。这是必要的，因为尽管tuf基因是高度保守的，但细菌tuf序列间有相对较高的多态性。事实上，我们发现由我们确定的tuf序列中有许多核苷酸变异使一些氨基酸缺失和/或插入。所选出的通用引物对细菌是特异的和普遍适用的(表7)。试验了95种临床上最重要的细菌，其中12未被扩增。这些种属于棒杆菌属(11种)和寡养单胞菌属(15种)。这些通用引物并不扩增非细菌来源的DNA(包括人和其他类型的真核DNA)。
实施例2：从tuf序列中选择属特异性PCR引物
如附录2和3中所示，比较多种细菌的tuf序列得以选择出对肠球菌或葡萄球菌属特异的PCR引物。用于设计PCR引物的策略是基于对各种tuf序列的多重序列对比的分析。这些多重序列对比包括选自各个靶属的4种有代表性的细菌的tuf序列及选自其他密切相关细菌属之细菌种的tuf序列，仔细分析那些序列即可选择出在靶属内保守但可以区分其他密切相关属的序列的寡核苷酸序列，从而可以对靶细菌属进行属特异性和普遍存在性检测与鉴定。
为了选择对肠球菌属特异的引物(附录II)，我们测定了鸟肠球菌、粪肠球菌、屎肠球菌和鹑鸡肠球菌的tuf基因约890bp的部分序列。序列对比中所使用的所有其他tuf序列都是由我们测序的或选自数据库的。分析该序列对比即可选择出对肠球菌属种特异的和普遍适用的引物对(表7)。所有11种被试验的肠球菌均得到有效扩增，而对其他属的细菌种的基因组DNA没有扩增。
为了选择对葡萄球菌属特异的引物(附录III)，我们还测定了金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、腐生葡萄球菌和模仿葡萄球菌之tuf基因约890bp的部分序列。序列对比中使用的所有其他tuf序列都是由我们测序的或选自数据库的。分析该序列对比即可选择出对葡萄球菌属特异和普遍适用的两对引物(表7)。附录III显示用于选择这两个PCR引物对之一的策略。利用同一策略选择另一引物对。在所试验的14种葡萄球菌中，有1种(松鼠葡萄球菌)不能使用这两对引物中任何一对通过葡萄球菌属特异性PCR法进行扩增。使用两引物对中任何一对进行PCR试验时，对其他细菌属中各菌种的DNA均未见具有扩增。
实施例3：从tuf序列中选择对白假丝酵母特异的PCR引物
如附录IV中所示，比较得自多种细菌和真核生物物种的tuf序列，即可选择出对白假丝酵母特异的PCR引物。用于设计PCR引物的策略是基于对各种tuf序列之多重序列对比的分析。该多重序列对比包括由我们研究组确定的选自假丝酵母属的5种有代表性真菌(即白假丝酵母、C.glabrata、克鲁斯假丝酵母、近平滑假丝酵母和热带假丝酵母)的tuf序列以及得自其他密切相关真菌菌种的tuf序列。还包括各种细菌菌种的tuf序列。仔细分析该序列对比即可从白假丝酵母的tuf序列中选出引物；这些引物可以区分其他密切相关的假丝酵母和其他真菌菌种，从而可以对白假丝酵母进行种特异性和普遍适用性检测与鉴定(表7)。试验的所有88个白假丝酵母菌株均得到有效扩增，而对其他种真菌或细菌和基因组DNA没有扩增。
实施例4：从recA中选择链球菌属特异的PCR引物
如附录V中所示，依据对可从数据库(GenBank和EMBL)得到的各种细菌recA基因序列的比较选择对链球菌属特异和普遍适用的PCR引物。由于可得到包括5种链球菌在内的许多种细菌的recA基因序列，故有可能选择出在链球菌属内保守但不同于其他细菌属的recA序列的序列。当这5种链球菌的recA基因序列间有错配时，即将一个次黄苷掺入引物中(附录V)。经选择的各包括1个次黄苷并且没有简并核苷酸的引物是链球菌属种特异的和普遍适用的(表7)。该PCR法扩增了所试验的所有22种链球菌。然而，链球菌特异性检测法并没有扩增9个变异链球菌菌株中的3个和3个唾液链球菌菌株中的1个菌株的DNA。对其他属细菌的基因组DNA没有扩增(表7)。
实施例5：DNA片段的核苷酸测序
使用双脱氧核苷酸链终止测序方法(Sanger et al.，1997，美国国家科学院院报，74：5463-5467)测定各种细菌或真菌的tuf基因的部分核苷酸序列。使用Applied Biosystems自动DNA测序仪(373A型)及其PRISMTM Squenase终止子双链DNA测序试剂盒(Perkin-Elmer Corp.，Applied Biosystems Division，FosterCity，CA)进行序列测定。由于测序引物可与两种细菌tuf基因(tufA和tuf B)杂交，所以测序策略并不能区分tuf A和tuf B基因。序列表中给出了这些DNA序列(SEQ ID NO.118至146)。由我们的研究小组确定的各种tuf基因序列中几个简并核苷酸的存在(表13)与tufA和tuf B之间的序列差异一致。
寡核苷酸引物和探针选择。使用OligoTM程序，从给定的有优先权的DNA片段或数据库序列中选择寡核苷酸探针和扩增引物，并使用自动ABI DNA合成仪(391型，Perkin-Elmer Corp.，Appliedbiosystems Diviosn)以亚磷酰胺化学法合成之。
实施例6：标记寡核苷酸以用于杂交试验。如前所述，通过T4多核苷酸激酶(Pharmacia)用γ-32P(dATP)5′末端标记每个寡核苷酸。标记物也可以是非放射活性的。
寡核苷酸探针的特异性试验。将所有标记的寡核苷酸探针与前述表4、5和6中选出的各种细菌和真菌的DNA杂交，以试验其特异性。种特异性或属特异性探针是只与它们来源的微生物种或属的DNA杂交的那些探针。按下述方法对发现为特异的寡核苷酸探针进行普遍适用性试验。
寡核苷酸探针的普遍适用性试验。然后用得自各个不同国家并代表各靶种或属内多样性的、包括参考菌株及其他菌株的靶种或属内菌株对特异性寡核苷酸探针进行普遍适用性试验。将各分离物的染色体DNA转移到尼龙膜上，并用特异性试验中所述的标记的寡核苷酸探针杂交。构成每个靶种或属的分离物组包括参考的ATCC菌株以及得自各种来源的多种临床分离物。普遍适用的探针是与靶种或属的这组临床分离物中至少80％的DNA杂交的探针。
实施例7：
基本上与实施例6相同，但使用特异性寡核苷酸探针群进行微生物鉴定，以便(i)提高灵敏度并保证有100％的普遍适用性，或(ii)同时鉴定一个以上的微生物种和/或属。可从微生物培养物或直接从任何临床标本鉴定微生物。
实施例8：
基本上按照实施例6所述的方法直接检测临床样品中的细菌或真菌。将生物学样品直接上样到点印迹装置上，在原位裂解细胞，以进行细菌或真菌检测与鉴定。应对血液样品作肝素化处理，以避免因凝血而干扰其在点印迹装置上的上样。
实施例9：
PCR扩增。利用PCR技术增加检测法的灵敏度和速度。通过PCR检测法直接由细菌菌落或标准化细菌悬液试验各组引物(见实施例10)，以确定其特异性和普遍适用性(表7)。附录VI中列出了特异并普遍适用的PCR引物对的实例。
扩增引物的特异性和普遍适用性试验。对如前所述选自表4、5和6的多种细菌和真菌的DNA试验选出的所有PCR引物对的特异性。然后试验那些发现对每个种或属特异的引物对的普遍适用性，以确保每组引物都能扩增靶种或属的一批分离物中至少90％的DNA。构成每个种的分离物组包括参考的ATCC菌株和代表各个种或属内多样性的采自世界各地的各种临床分离物。
应采取标准预防措施以避免假阳性PCR结果(Kwok andHiguchi，1989，自然，239：237-238)。可使用失活PCR扩增产物的方法(例如用尿嘧啶-N-糖基化酶失活)来控制PCR样品遗留。
实施例10：
直接从细菌或酵母培养物扩增。直接对细菌菌落或细菌悬液进行PCR扩增，后者调整到标准McFarland 0.5(相当于大约1.5×108个细菌/ml)。在直接从菌落扩增的情况下，使用塑料棒将一部分菌落直接转移到含有50mM KCl、10mM Tris-HCl(pH9.0)、0.1％TritonX-100、2.5mM MgCl2、各0.4μm的每一引物、各200μm的四种dNTP和与TaqStartTM抗体(Clontch Laboratories Inc.)联用的0.5单位TaqDNA聚合酶(Promega)的20μl PCR反应混合物内。对于细菌悬液来说，将1μl细胞悬液加到19μl同样的PCR反应混合物中。为了由酵母培养物进行鉴定，将经离心浓缩100倍的1μl标准McFarland1.0(相当于大约3.0×108菌体/ml)直接加到PCR反应中。对酵母细胞进行这种浓缩处理是因为酵母细胞的McFarland 0.5的细胞数大约比细菌细胞的McFarland 0.5低200倍。
使用PGC-200热循环仪对PCR反应混合物进行热循环(95℃3分钟，然后进行95℃1秒种的变性步骤和55℃30秒钟的退火-延伸步骤，共进行30个循环)。然后用标准琼脂糖凝胶(2％)电泳法分析PCR扩增产物。在紫外灯(254nm)下肉眼观察含有0.25μg/ml溴化乙锭的琼脂糖凝胶中的扩增产物。在大约1小时内完成整个PCR检测法。
使用衍生于细菌16S核糖体RNA基因之高度保守区域的引物序列作为所有PCR反应的内部对照。或者，内部对照也可衍生自未见于微生物中或人类基因组中的其他序列。将内部对照掺入所有扩增反应中，以证实PCR检测法的效率并确保不存在明显的PCR抑制。衍生于rRNA的内部对照亦可用于监测细菌裂解步骤的效率。多重PCR检测法同时完成内部对照和种特异性或属特异性扩增。
实施例11：
直接从尿标本扩增。为了直接从尿标本进行PCR扩增，将1μl尿液与4μl含有500mM KCl、100mM Tris-HCl(pH9.0)、1％TritonX-100的裂解溶液混合。室温保温至少15分钟后，将1μl经处理的尿液样品直接加到19μl PCR反应混合物中。PCR试剂的终浓度为50mMKCl、10mM Tris-HCl(pH9.0)、0.1％Triton X-100、2.5mMMgCl2、各0.4μM的每一引物、各200μM的四种dNTP。此外，每20μl反应混合物中含有与TaqStartTM抗体(Clontech Laboratory Inc.)结合的0.5单位TaqDNA聚合酶(Promega)。
内部对照、PCR扩增及扩增产物的琼脂糖凝胶检测的策略如上文实施例10所述。
实施例12：
抗生素抗性基因的检测。使用以前所述的PCR扩增或杂交方法鉴定常见的和临床上相关的特异性抗生素抗性基因的存在。从抗生素抗性基因序列中选择用作基于DNA的试验之基础的特异性寡核苷酸。可直接从临床标本、标准化细菌悬液或细菌菌落进行这些迅速估计细菌对抗抗微生物剂之抗性的试验，这种试验应能对细菌通用检测及种特异性和属特异性微生物检测与鉴定的诊断试验进行补充。
实施例13：
基本上与实施例10和11相同，但这里使用多重PCR方法(即在一个PCR反应中使用几对引物)以达到对特异性靶病原体的100％普遍适用性。对于更异源的微生物种或属来说，可能需要PCR引物对组合，以检测和鉴定靶种或属的所有代表。
可使用多重PCR检测法，以(i)同时检测几个种或属的微生物，或者(ii)直接从临床标本或从细菌培养物检测和鉴定细菌和/或真菌病原体，并同对检测特异性抗生素抗性基因。
为了进行这些检测，应调整扩增子检测方法以区分所产生的各种扩增子。可使用标准琼脂糖凝胶电泳法，因为它能够基于大小来分辨扩增子。为此目的所采用的另一个有用的策略是使用以不同波长发光的多种荧光染料进行检测。荧光染料可与连接到荧光猝灭剂上的特异性寡核苷酸偶联，而猝灭剂则在扩增期间发生降解而释放荧光染料(如TaqManTM，Perkin Elmer)。
实施例14：
扩增产物的检测。本领域技术人员应该认识到，也可使用标准琼脂糖凝胶电泳(实施例10)以外的可代用方法显示扩增产物。这样的方法可以是基于荧光偏振或基于扩增后的荧光检测(如AmplisensorTM，Biotronics；TaqManTM，Perkin-Elmer Corp.)或其他标记如生物素(SHARP SignalTM系统，Digene Diagnistics)。这些方法是定量的，并且可以自动化。将扩增引物之一或衍生于种特异性、属特异性或通用DNA片段的对扩增子特异的内部寡核苷酸探针与荧光染料或任何其他标记物偶联。因为基于检测荧光的方法快速而且可以变通(因可利用在不同波长发射荧光的荧光染料)，所以这些方法特别适用于诊断试验。
实施例15：
可以在连接酶链反应(LCR)、转录介导的扩增(TMA)、自身维持的序列复制(3SR)、基于核酸序列的扩增(NASBA)、链置换扩增(SDA)、循环探针技术(CPT)和分支DNA(bDNA)等其他快速扩增方法或其它方法中使用种特异性、属特异性、通用及抗生素抗性基因扩增引物以提高试验的灵敏度。可以从分离的细菌培养物或直接从任何临床标本进行扩增。因此本发明的范围不只限于使用公开序列表中的DNA序列进行PCR反应，而且包括使用能够提高试验之快速性和灵敏度的任何方法来特异地检测细菌DNA。
实施例16：
试验试剂盒应包括若干组对各个种或属微生物特异的探针，以及一组通用探针。试剂盒为试验组分形式的，包括用于检测特定类型临床样品中各种病原体的以非放射活性标记物标记的一套通用探针及标记的种或属特异性探针。试剂盒也包括完成预杂交、杂交、洗涤步骤和杂交体检测所必需的试验试剂。最后，还应包括用于检测已知抗生素抗性基因(或其衍生物)的试验成分。当然，试剂盒也应包括用作各杂交试验之阴性和阳性对照的标准样品。
试验盒中的成分应能适于每一种标本类型，以检测该类标本中的常见病原体。还包括对细菌进行通用检测的试剂。根据感染的部位，可开发出下列病原体特异性检测试剂盒：
-常规检测所有临床标本中的细菌或真菌病原体的试剂盒，其包括有几套对微生物基因组高保守区特异的探针。
-用于检测尿样品中微生物病原体的试剂盒，其含有5种特异性试验成分(即用来检测屎肠球菌、肠球菌属种、腐生葡萄球菌、葡萄球菌属种和白假丝酵母的探针组)。
-用于检测呼吸道病原体的试剂盒，其含有3种特异性试验成分(即用于检测葡萄球菌属种、肠球菌属种和白假丝酵母的探针组)。
-用于检测血液样品中的病原体的试剂盒，其含有10种特异性试验成分(即用于检测链球菌属种、无乳链球菌、葡萄球菌属种、腐生葡萄球菌、肠球菌属种、屎肠球菌、奈瑟氏球菌属种、脑膜炎奈瑟氏球菌、单核细菌增生利斯特氏菌和白假丝酵母的探针组)。该试剂盒也可用直接检测和鉴定血液培养物中的病原体。
-用于检测脑膜炎病原体的试剂盒，其含有5种特异性试验成分(即用于检测链球菌属种、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、奈瑟氏球菌属种和葡萄球菌属种的探针组)。
-用于检测临床上重要的抗生素抗性基因的试剂盒，其含有特异检测下列26种抗生素抗性相关基因中至少一种的探针组：blatem、blarob、blashv、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aacA4、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、mecA、vanA、vanB、vanC、satA、aac(6′)-aph(2″)、aad(6′)、vat、vga、msrA、sul和int。
-还可开发适于检测皮肤、腹部伤口或任何其他临床相关感染的其他试剂盒。
实施例17：
基本上与实施例16相同，所不同的是试验试剂盒含有完成DNA扩增检测所需的所有试剂及对照物。诊断试剂盒适于以PCR(或其他扩增方法)直接从临床样品或微生物培养物完成扩增。其中将包括完成(i)通用细菌检测、(ii)种特异性和属性异性细菌和/或真菌检测与鉴定，以及(iii)抗生素抗性基因检测所需的成分。
可在试管中或有多个孔的微量滴定板中进行扩增试验。为在平板中检测，小孔内应含有特异扩增引物和对照DNA，并且应实现扩增产物检测的自动化。直接从临床标本进行试验的试剂盒中将包括用于通用细菌检测的试剂及扩增引物。直接检验细菌或真菌培养物的试剂盒及直接检验任何类型临床标本的试剂盒中，将包括进行种特异性和属特异性细菌和/或真菌检测与鉴定，以及同时进行抗生素抗性基因检测所需的成分。
试剂盒将适用于如实施例16中所述基于杂交的诊断试剂盒所检测的各种类型标本。
实施例18：
应明确的是，使用如本发明所述的探针和扩增引物进行细菌和/或真菌检测与鉴定不只限于应用在临床微生物学方面。事实上，我们觉得其他一些方面也可得益于这一新技术。例如，这些试验可在工业上用于食品、水、空气、医药产品及需要进行微生物学监控的其他产品的质量控制中。这些试验也可用于检测与鉴定人以外的其他生物体(例如其他灵长类、鸟类、植物、哺乳动物、农场动物、家畜等)的生物学样品中的细菌或真菌。这些诊断工具对于包括临床试验和流行病学研究在内的研究工作也是很有用的。
虽然上文已详细描述了本发明，但显然可以在不背离本发明精神的前提下对本发明作出各种改动，而这些改动仍将包括在如待批权利要求所限定的本发明的范围之内。
表1在美国引起各种人类感染的鼻粘膜病原体的分配(％)1病原体                             UTI2 SSI3 BSI4 肺炎  CSF5大肠杆菌                            27     9     5    4      2金黄色葡萄球菌                      2      21    17   21     2表皮葡萄球菌                        2      6     20   0      1粪肠球菌                            16     12    9    20     0屎肠球菌                            1      10    0    0      0铜绿假单胞菌                        12     9     3    18     0肺炎克雷伯氏菌                      7      3     4    9      0奇异变形菌                          5      3     1    2      0肺炎链球菌                          0      0     3    1      18B组链球菌                           1      1     2    1      6其他链球菌                          3      5     2    1      3流感嗜血菌                          0      0     0    6      45脑膜炎奈瑟氏球菌                    0      0     0    0      14单核细胞增生利斯特氏菌              0      0     0    0      3其他肠球菌                          1      1     0    0      0其他葡萄球菌                        2            8    13     20白假丝酵母                          9      3     5    5      0其他假丝酵母                        2            1    3      10肠球菌属种                5    7     4     12    2不动杆菌属种              1    1     2     4     2柠檬酸杆菌属种            2    1     1     1     0粘质沙雷氏菌              1    1     1     3     1其他克雷伯氏菌            1    1     1     2     1其他                      0    6     4     5     0
1.数据是由美国鼻粘膜感染监测中心(NNIS)从80家医院记录的(Emori和Gaynes，1993，临床微生物学综述，6：428-442)。
2.尿路感染
3.手术部位感染
4.血流感染
5.脑脊髓液
表2在魁北克(1995)、加拿大(1992)、英国(1969-1988)和美国(1990-1992)血流感染病原体的分配(％)
                                          英国3           美国4生物体            魁北克1  加拿大2
                                从社区获得的 从医院获得的  从医院获得的大肠杆菌           15.6      53.8        24.8         20.3      5.0表皮葡萄球菌       25.8      NI6        0.5          7.2       31.0及其他CoNS5金黄色葡萄球菌     9.6       NI          9.7          19.4      16.0肺炎葡萄球菌       6.3       NI          22.5         2.2       NR7粪肠球菌           3.0       NI          1.0          4.2       NR屎肠球菌           2.6       NI          0.2          0.5       NR肠球菌属种         NR        NI          NR           NR        9.0流感嗜血杆菌       1.5       NR          3.4          0.4       NR铜绿假单胞菌       1.5       8.2         1.0          8.2       3.0肺炎克雷伯氏菌     3.0       11.2        3.0          9.2       4.0奇异变形菌         NR        3.9         2.8          5.3       1.0酿脓链球菌         NR     NI     1.9    0.9    NR肠球菌属种         4.1    5.5    0.5    2.3    4.0假丝酵母属种       8.5    NI     NR     1.0    8.0其他               18.5   17.48 28.7   18.9   19.0
1. 5个月期间内(1995年5月至10月)在Laval大学中心医院(Centre Hospitalier de I’Universit′e Laval(CHUL))收集的270个分离物得出的数据。
2.从加拿大10所医院得到的代表941个革兰氏阴性菌分离物的数据。(Chamberland等，1992，临床感染疾病，15：615-628)。
3.20年来(1969-1998)对大约4000个分离物的研究数据(Eykyn等，1990，J.Antimicrob Chemother.，Suppl.C，25：41-58)。
4.国家鼻粘膜感染监测中心(NNIS)从80家医院记录的数据(Emori和Gaynes，1993，临床微生物学综述，6：428-442)。
5.凝固酶阴性葡萄球菌。
6.NI：未包括在内。该研究只包括革兰氏阴性菌。
7.NR：未报导这些种或属感染的发生率。
8.在这种情况下，17.4代表其他革兰氏阴性菌种。
表3在CHUL的微生物学实验室试验的阳性和阴性临床样品的百分分配(1994年2月-1995年1月)临床标本和/或位置     被试样品数(％)  阳性标本的百分率  阴性标本的百分率尿                     17,981(54.5)        19.4             80.6血培养物/骨髓          10,010(30.4)        6.9              93.1痰                     1,266(3.8)          68.4             31.6浅表脓汁               1,136(3.5)          72.3             27.7脑脊液                 553(1.7)            1.0              99.0滑液                   523(1.6)            2.7              97.3呼吸道          502(1.5)       56.6      43.4深部脓汁        473(1.4)       56.8      43.2耳部            289(0.9)       47.1      52.9胸膜和心包液    132(0.4)       1.0       99.0腹膜液          101(0.3)       28.6      71.4总计：          32,966(100.0)  20.0      80.0
表4  用于试验PCR引物和DNA探针之特异性的革兰氏阴性细菌种(90种)(接下页)
                    被试的参                 被试的参细菌菌种                        细菌菌种
                    考菌株数                 考菌株数鲍氏不动杆菌                1   苯丙酮酸莫拉氏菌     1鲁氏不动杆菌                3   摩氏摩根氏菌         1李氏放线杆菌                1   动物奈瑟氏球菌       1粪产碱菌                    1   狗奈瑟氏球菌         1Alcaligenes odorans         1   豚鼠奈瑟氏球菌       1木糖氧化产碱菌反硝化亚种    1   灰色奈瑟氏球菌       1吉氏拟杆菌                  1   兔奈瑟氏球菌         1脆弱拟杆菌                  1   长奈瑟氏球菌长亚种   1卵形假杆菌                  1   长奈瑟氏球菌解糖亚种 1多形拟杆菌                  1   浅黄奈瑟氏球菌       1
                            Neisseria  flavescens普通拟杆菌                  1
                            Branham              1支气管炎博德特氏菌          1   淋病奈瑟氏球菌       18副百日咳博德特氏菌          1   乳糖奈瑟氏球菌       1百日咳博德特氏菌            2   脑膜炎奈瑟氏球菌     4洋葱伯克霍尔德氏菌          1   粘液奈瑟氏球菌       2无丙二酸柠檬酸杆菌          1   多糖奈瑟氏球菌       1Citrobacter diversus
                      2    干燥奈瑟氏球菌     3subsp.koseri弗氏柠檬酸杆菌            1    微黄奈瑟氏球菌     3食酸丛毛单胞菌            1    Neisseria weaveri  1产气肠杆菌                1    人苍白杆菌         1成团肠杆菌                1    产气巴斯德氏菌     1阴沟肠杆菌                1    多杀巴斯德氏菌     1大肠杆菌                  9    产黑素普雷沃氏菌   1弗格森埃希氏菌            1    奇异变形菌         3赫氏埃希氏菌              1    普通变形菌         1伤口埃希氏菌              1    产碱普罗威登斯菌   1脑膜脓毒性黄杆菌          1    雷氏普罗威登斯菌   1产吲哚黄杆菌              1    拉氏普罗威登斯菌   1气味黄杆菌                1    斯氏普罗威登斯菌   1坏死梭杆菌                2    铜绿假单胞菌       14阴道加德纳氏菌            1    荧光假单胞菌       2溶血嗜血菌                1    施氏假单胞菌       1流感嗜血菌                12   利桑那沙门氏菌     1副溶血嗜血菌              1    猪霍乱沙门氏菌     1副流感嗜血菌              2    鸡沙门氏菌         1蜂房哈夫尼菌              1    鼠伤寒沙门氏菌     3Kingella indologenes
                      1    液化沙雷氏菌       1subsp.suttonella金氏金氏菌                1    粘质沙雷氏菌       1解鸟氨酸克雷伯氏菌        1    Shewanella putida  1产酸克雷伯氏菌            1    鲍氏志贺氏菌       1肺炎克雷伯氏菌            8    痢疾志贺氏菌       1亚特兰大莫拉氏菌          1    弗氏志贺氏菌       1粘膜炎莫拉氏菌            5    索氏志贺氏菌       1腔隙莫拉氏菌              1    嗜麦芽糖寡养单胞菌 1奥斯陆莫拉氏菌     1     小肠结肠炎耶尔森氏菌    1
a.大多数参考菌株得自美国典型培养物保藏中心(ATCC)。其他参考菌株得自(i)魁北克州公众实验室(LSPQ)，(ii)病病控制与预防中心(CDC)和(iii)国家典型培养物保藏中心(NCTC)。
表5用于试验PCR引物和DNA探针之特异性的革兰氏阳性细菌种(97种)(接下页)
                    被试参考                    被试参考细菌菌种                菌株数目  细菌菌种          菌株数目Abiotrophia adiacens        1     克氏微球菌           1Abiotrophia defectiva       1     藤黄微球菌           1衣氏放线菌                  1     里拉微球菌           1产气荚膜梭菌                1     玫瑰色微球菌         1拥挤棒杆菌                  1     变异微球菌           1水生棒杆菌                  1     黑色消化球菌         1牛棒杆菌                    1     厌氧消化链球菌       1Corynebacterium cervicis    1     不解糖消化链球菌     1白喉棒杆菌                  6     金黄色葡萄球菌       10微黄棒杆菌                  1     耳葡萄球菌           1Corynebacterium genitalium  6     头状葡萄球菌解脲亚种 1杰氏棒杆菌                  1     科氏葡萄球菌         1库氏棒杆菌                  1     表皮葡萄球菌         2马氏棒杆菌                  1     溶血葡萄球菌         2极小棒杆菌                  1     人葡萄球菌           2类真菌棒杆菌                1     路邓葡萄球菌         1假白喉棒杆菌          1    腐生葡萄球菌          3Corynebacterium       6    施氏葡萄球菌          1pseudogenitalium牛肾盂炎棒杆菌        1    松鼠葡萄球菌          1纹带棒杆菌            1    模仿葡萄球菌          1溃疡棒杆菌            1    沃氏葡萄球菌          1解脲棒杆菌            1    木糖葡萄球菌          1干燥棒杆菌            1    无乳链球菌            6鸟肠球菌              1    咽峡炎链球菌          2铅黄肠球菌            1    牛链球菌              2盲肠肠球菌            1    Streptococcus         1
                       constellatus殊异肠球菌            1    嵴链球菌              1耐久肠球菌            1    停乳链球菌            1粪肠球菌              6    马链球菌              1屎肠球菌              3    格氏链球菌            1黄色肠球菌            1    C组链球菌             1鹑鸡肠球菌            3    D组链球菌             1海氏肠球菌            1    E组链球菌             1蒙氏肠球菌            1    F组链球菌             1类鸟肠球菌            1    G组链球菌             1棉子糖肠球菌          1    中间链球菌            1解糖肠球菌            1    缓症链球菌            2孤立肠球菌            1    变异链球菌            1迟缓真杆菌            1    口腔链球菌            1溶血孪生球菌          1    副血链球菌            1麻疹孪生球菌          1    肺炎链球菌            6嗜酸乳杆菌            1    酿脓链球菌            3无害利斯特氏菌        1    唾液链球菌            2伊氏利斯特氏菌          1     血链球菌      2格氏利斯特氏菌          1     表兄链球菌    1单核细胞增生利斯特氏菌  3     猪链球菌      1默氏利斯特氏菌          1     乳房链球菌    1斯氏利斯特氏菌          1     前庭链球菌    1威氏利斯特氏菌          1
a.大多数参考菌株得自美国典型培养物保藏中心(ATCC)。其他参考菌株得自(i)魁北克州公众实验室(LSPQ)，(ii)疾病控制与预防中心(CDC)和(iii)国家典型培养物保藏中心(NCTC)。
表6用来测试PCR引物和DNA探针特异性的真菌种类(12)真菌种类                   测试的参考菌株数a白假丝酵母                 12Candida glabrata           1季也蒙假丝酵母             1乳酒假丝酵母               3克鲁斯假丝酵母             2葡萄牙假丝酵母             1近平滑假丝酵母             2热带假丝酵母               3红酵母                     1小红酵母                   1深红酵母                   1酿酒酵母                   1
a.大多数参考菌株得自(i)美国典型培养物保藏中心(ATCC)和(ii)Laboratoire de Sante Publique du Quebec(LSPQ)。
表7开发用于数种临床重要的细菌或真菌病原体的PCR试验(接下页)
                    引物对a扩增片段大小             DNA扩增来源于生物体                                     普遍适用性b
                   SEQ ID NO    (bp)               培养物c   标本d屎肠球菌                  1-2        216       79/80      +         +单核细胞增生利斯特氏菌    3-4        130       164/168e  +         +脑膜炎奈瑟氏球菌          5-6        177       258/258    +         +腐生葡萄球菌              7-8        149       245/260    +         NT无乳链球菌                9-10       154       29/29      +         +白假丝酵母                11-12      149       88/88      +         NT肠球菌属种(11种)f        13-14      112       87/87      +         NT奈瑟氏球菌属种(12种)f    15-16      103       321/321    +         +葡萄球菌属种(14种)        17-18      192       13/14      +         NT
                      19-20      221       13/14      +         NT链球菌属种(22种)f        21-22      153       210/214g  +         +通用检测h(95种)i        23-24      309       104/116i  +         +
a.PCR试验中的所有引物都是特异的，因为用表4、5和6中所列感兴趣菌种外的细菌和真菌种类的DNA未观察到扩增。
b.使用参考菌株及得自世界各地代表各个靶种或属内多样性的菌株测试普遍适用性。
c.对于所有引物对来说，直接从标准化微生物悬液(Ma cFarland)或菌落完成的PCR扩增都是特异的和普遍适用的。
d.直接从血液培养物、尿标本或脑脊液进行PCR试验。NT代表未试验。
e.未检测到的四种单核细胞增生利斯特氏菌菌株不是临床分离物。这些菌株是从食物中分离的，并且与人类感染无关。
f.所试验的细菌菌种包括各菌属的所有那些临床相关菌种(表4和5)。除了并不扩增松鼠葡萄球菌的葡萄球菌属特异性试验外，所有这些菌种均可由其各自的属特异性PCR法得到有效地扩增。
g.链球菌属特异性PCR检测法不扩增变异链球菌9个菌株中的3个，和唾液链球菌3个菌种中的一个。
h.为通用细菌检测所选择的引物并不扩增非细菌来源的DNA，包括人和其他类型的真核基因组DNA。
i.为进行通用扩增所试验的95种细菌种类代表表4和5中所列出的临床上最重要的细菌菌种。未被扩增的12个菌株是棒杆菌属(11种)和寡养单胞菌属(1种)的有代表性的菌株。
  表8  各种种特异性、属特异性和通用扩增试验的靶基因
    微生物            基因          所编码的蛋白质白假丝酵母                tuf        翻译延伸因子EF-Tu屎肠球菌                  ddl        D-丙氨酸：D-丙氨酸连接酶单核细胞增生利斯特氏菌    actA       肌动蛋白组装诱导蛋白质脑膜炎奈瑟氏球菌          omp        外膜蛋白无乳链球菌                cAMP       cAMP因子腐生葡萄球菌              未知       未知肠球菌属种                tuf        翻译延伸因子EF-Tu奈瑟氏球菌属种            asd        ASA-脱氢酶葡萄球菌属种              tuf        翻译延伸因子EF-Tu链球菌属种                recA       RecA蛋白质通用检测                  tuf        翻译延伸因子EF-Tu
  表9为诊断目的而选择的抗生素抗性基因
                 SEQ ID No
 基因                                抗生素       细菌a
         所选择的引物     原始片段
blaoxa      49-50          110     β-内酰胺  肠杆菌科，假单胞菌科
blaZ         51-52          111     β-内酰胺  肠球菌属种aac6′-IIa       61-64          112     氨基糖苷   假单胞菌科
ermA     91-92    113    大环内脂    葡萄球菌属种
ermB     93-94    114    大环内脂    葡萄球菌属种
ermC     95-96    115    大环内脂    葡萄球菌属种
vanB     71-74    116    万古霉素    肠球菌属种
vanC     75-76    117    万古霉素    肠球菌属种
aad(6′) 173-174  -      链霉素      肠球菌属种
a特定抗生素抗性基因发生率较高的细菌。不排除这些抗生素抗性基因在其他细菌中的存在。
表10  我们共同待批美国(N.S.08/52684)和PCT(PCT/CA/95/00528)专利申请中用来选择PCR引物对的抗生素抗性基因
基因    选择的引物的SEQ ID NO    抗生素         细菌a
blatem        37-40            β-内酰胺    肠杆菌科
                                             假单胞菌科
                                             嗜血菌属种
                                             奈瑟氏球菌属种
blarob        45-48            β-内酰胺    嗜血菌属种
                                             巴斯德氏菌属种
blashv        41-44            β-内酰胺    克雷伯氏菌属种及其他
                                             肠杆菌科
aadB           53-54            氨基糖苷     肠杆菌科
aacC1          55-56                         假单胞菌科
aacC2          57-58
aacC3          59-60
aacA4          65-66
mecA           97-98            β-内酰胺    葡萄球菌属种
vanA           67-70            万古霉素     肠球菌属种
satA           81-82            大环内酯     肠球菌属种aac(6′)-aph(2″)  83-86            氨基糖苷     肠球菌属种
                                葡萄球菌属种
vat    87-88    大环内酯        葡萄球菌属种
vga    89-90    大环内酯        葡萄球菌属种
msrA   77-80    红霉素          葡萄球菌属种
int    99-102   β-内酰胺       肠杆菌科属种
                三甲氧苄二氨嘧啶
sul    103-106  氨基糖苷        假单胞菌科
                防腐剂
                氯霉素
a特定抗生素抗性基因发生率高的细菌。不排除这些抗生素抗性基因在其他细菌中的存在。
表11葡萄球菌属种中平板扩散和抗生素抗性基因的PCR扩增间的相互关系
                                   平板反应(Kirby-Bauer)b抗生素        表型      PCR
                             抗性株    中等株    敏感株青霉素           blaZ      +       165       0          0
                       -       0         0          31Oxacillin        mecA      +       51        11         4
                       -       2         0          128庆大霉素   aac(6′)aph(2″ +       24        18         6
               )
                       -       0         0          148红霉素           ermA      +       15        0          0
             ermB      +       0         0          0
             ermC      +       43        0          0
             msrA      +       4         0          0
                       -       0         1          136
a.所研究的葡萄球菌菌株包括金黄色葡萄球菌(82个菌株)、表皮葡萄球菌(83个菌株)、人葡萄球菌(2个菌株)、头状葡萄球菌(3个菌株)、溶血葡萄球菌(9个菌株)、模仿葡萄球菌(12个菌株)和沃氏葡萄球菌(54个菌株)，共196个菌株。
b.按照国家临床实验室标准委员会(NCCLS)推荐的Kirby-Bauer方法进行敏感性试验。
表12肠球菌属种中平板扩散与抗生素抗性基因的PCR扩增之间的相互关系
                                  平板扩散(Kirby-Bauer)b
抗生素        表型         PCR
                                  抗性株           敏感株氨苄青霉素       blaZ         +       0                2
                            -       1                30庆大霉素    aac(6′)aph(2″)  +       51               1
                            -       3                38链霉素           aad(6′)     +       26               15
                            -       6                27万古霉素         vanA         +       36               0
               vanB         +       26               0
                            -       0                40a 所研究的肠球菌菌株包括粪肠球菌(33个菌株)和屎肠球菌(69个菌株)，共102个菌株。b 按照国家临床实验室标准委员会(NCCLS)推荐的Kirby-Bauer方法进行敏感性试验。
表13序列表中tuf序列的来源(接下页)
SEQ ID NO      细菌或真菌菌种          来源
   118      Abiotrophia adiacens       本专利
   119      Abotrophia defectiva       本专利
   120      白假丝酵母                 本专利
   121      Candida glabrata           本专利
122         克鲁斯假丝酵母             本专利
123         近平滑假丝酵母             本专利
124         热带假丝酵母               本专利
125         拥挤棒杆菌                 本专利
126         白喉棒杆菌                 本专利
127         Corynebacterium genitalium 本专利
128         杰氏棒杆菌                 本专利
129         假结核棒杆菌               本专利
130         纹带棒杆菌                 本专利
131         鸟肠球菌                   本专利
132         粪肠球菌                   本专利
133         屎肠球菌                   本专利
134         鹑鸡肠球菌                 本专利
135         阴道加德纳氏菌             本专利
136         无害利斯特氏菌             本专利
137         伊氏利斯特氏菌             本专利
138         单核细胞增生利斯特氏菌     本专利
139         斯氏利斯特氏菌             本专利
140         金黄色葡萄球菌             本专利
141         表皮葡萄球菌               本专利
142         腐生葡萄球菌               本专利
143         模仿葡萄球菌               本专利
144         无乳链球菌                 本专利
145         肺炎链球菌                 本专利
146         唾液链球菌                 本专利
147         根癌土壤杆菌               数据库
148         枯草芽孢杆菌               数据库
149         脆弱拟杆菌                 数据库
150         布氏疏螺旋体               数据库
151     扩展短杆菌                 数据库
152     洋葱伯克霍尔德氏菌         数据库
153     砂眼衣原体                 数据库
154     大肠杆菌                   数据库
155     产琥珀酸丝状杆菌           数据库
156     铁色黄杆菌                 数据库
157     流感嗜血菌                 数据库
158     幽门螺杆菌                 数据库
159     藤黄微球菌                 数据库
160     结核分枝杆菌               数据库
161     生殖道枝原体               数据库
162     淋病奈瑟氏球菌             数据库
163     普氏立克次氏体             数据库
164     鼠伤寒沙门氏菌             数据库
165     Shewanella putida          数据库
166     橙色标桩菌                 数据库
167     酿脓链球菌                 数据库
168     Thiobacillus cuprinus      数据库
169     苍白密螺旋体               数据库
170     解脲尿枝原体               数据库
171     产琥珀酸沃林氏菌           数据库  附录I：从tuf序列中选择通用扩增引物的策略(下接第49页至第51页)
                                                                          SEQ ID
           491                       517...776                       802    NOAbiotrophia    CAACTGTAAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCTGGT GATAACGTAA    118adiacensAbiotrophia    CTACCGTTAC CGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCAGGC GACAACGTAC    119defectiva根癌土壤杆菌   CGACTGTTAC CGGCGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGC GACAACGTCA    147枯草芽胞杆菌   CAACTGTTAC AGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGA GATAACACTG    148脆弱拟杆菌     CAGTTGTAAC AGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCGGGT GATAACGTAA    149布氏疏螺旋体   CTACTGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGT GATAATGTTG    150扩展短杆菌     CGACTGTCAC CGCTATCGAG ATGTTCC...AGATGGT CATGCCCGGC GACACCACCG    151洋葱伯克霍尔   CGACCTGCAC GGGCGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT CATGCCGGGC GACAACGTGT    152德氏菌砂眼衣原体     CGATTGTTAC TGGGGTTGAA ATGTTCA...AGATGGT CATGCCTGGG GATAACGTTG    153白喉棒杆菌     CCACCGTTAC CGGTATCGAG ATGTTCC...AGATGGT CATGCCTGGC GACAACGTCG    126Corynebacterium  CCACCGTTAC CTCCATCGAG ATGTTCA...AGATGGT TATGCCGGGC GACAACGTTG    127genitalium杰氏棒杆菌       CCACCGTTAC CTCCATCGAG ATGTTCA...AGATGGT TATGCCGGGC GACAACGTTG    128粪肠球菌         CAACYGTTAC AGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCTGGT GATAACGTTG    132屎肠球菌         CAACAGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT CATGCCCGGT GACAACGT..    133大肠杆菌         CTACCTGTAC TGGCGTTGAA ATGTTCC...AGATGGT AATGCCGGGC GACAACATCA    154产琥珀酸丝状     ACGTCATCAC CGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TACTCCGGGT GACACGGTCA    155杆菌锈色黄杆菌       CTACCGTTAC AGGTGTTGAG ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGT GATAACACCA    156阴道加德纳氏菌   CCACCGTCAC CTCTATCGAG ACCTTCC...AAATGGT TCAGCCAGGC GATCACGCAA    135流感嗜血菌       CTACTGTAAC GGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCAGGC GATAACATCA    157幽门螺杆菌       CGACTGTAAC CGGTGTAGAA ATGTTTA...AAATGGT TATGCCTGGC GATAATGTGA    158单核细胞增生利   TAGTAGTAAC TGGAGTAGAA ATGTTCC...AAATGGT AAYGCCTGGT GATAACATTG    138斯特氏菌藤黄微球菌       CCACTGTCAC CGGCATCGAG ATGTTCC...AGATGGT CATGCCCGGC GACAACACCG    159结核分枝杆菌     CCACCGTCAC CGGTGTGGAG ATGTTCC...AGATGGT GATGCCCGGT GACAACACCA    160生殖道枝原体    CAGTTGTTAC TGGAATTGAA ATGTTCA...AAATGGT TCTACCTGGT GATAATGCTT    161淋病奈瑟氏球菌  CCACCTGTAC CGGCGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCGGGT GAGAACGTAA    162普氏立克次氏体  CGACTTGTAC AGGTGTAGAA ATGTTCA...AGATGGT TATGCCTGGA GATAATGCTA    163鼠伤寒沙门氏菌  CTACCTGTAC TGGCGTTGAA ATGTTCC...AGATGGT AATGCCGGGC GACAACATCA    164Shewanella      CAACGTGTAC TGGTGTAGAA ATGTTCC...AGATGGT AATGCCAGGC GATAACATCA    165putida橙色标桩菌      CGGTCATCAC GGGGGTGGAG ATGTTCC...AGATGGT GATGCCGGGA GACAACATCG    166金黄色葡萄球菌  CAACTGTTAC AGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCTGGT GATAACGTTG    140表皮葡萄球菌    CAACTGTTAC TGGTGTAGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGC GACAACGTTG    141无乳链球菌      CAGTTGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGT GATAACGTTA    144肺炎链球菌      CAGTTGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT AATGCCTGGT GATAACGTGA    145酿脓链球菌      CTGTTGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCC...AAATGGT TATGCCTGGT GATAACGTGA    167Thiobacillus    CCACCTGCAC CGGCGTGGAA ATGTTCA...AAATGGT CATGCCCGGC GATAATGTGA    168cuprinus苍白密螺旋体    CAGTGGTTAC TGGCATTGAG ATGTTTA...ACATGGT GAAGCCGGGG GATAACACCA    169解脲尿枝原体     CTGTTGTTAC AGGAATTGAA ATGTTTA...ATTTGGT TATGCCAGGT GATGACGTTG    170产琥珀酸沃林氏菌 CAACCGTAAC TGGCGTTGAG ATGTTCC...AGATGGT TATGCCTGGT GACAACGTTA    171白假丝酵母       GTGTTACCAC TGAAGTCAAR TCCGTTG...AGRAATT GGAAGAAAAT CCAAAATTCG    120粟酒裂殖酵母     GTGTCACTAC CGAAGTCAAG TCTGTTG...AGAAGAT TGAGGAGTCC CCTAAGTTTG人               TGACAGGCAT TGAGATGTTC CACAAGA...AGAAGGAGCTTGCCATG CCCGGGGAGG选出的序列a       ACIKKIAC IGGIGTIGAR ATGTT       ATGGT IATGCCIGGI GAIAAYRT选出的通用              SEQ ID NO：23                       SEQ ID NO：24b引物序列a
               ACIKKIAC IGGIGTIGAR ATGTT         AYRTT ITCICCIGGC ATIACCAT序列编号涉及大肠杆菌tuf基因片段。下划线的核苷酸与选定的序列相同或与之匹配。a  “I”代表次黄苷，它是可与四种核苷酸A、C、T、G中任何一种结合的核苷酸类似物。“K”、“R”、“Y”指示发生简并的核苷酸位置。“K”代表T或G，“R”代表A或G，“Y”代表C或T。b 该序列是上述tuf序列的反向互补序列。附录II：从tuf序列中选择对肠球菌属特异的扩增引物的策略(下接第53页至第54页)
            314                                348   401                                435    SEQ
                                                                                              ID NO枯草芽胞杆菌    CGCGACACTG AAAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGCGG ACAAGTTAAA GTCGGTGACG AAGTTGAAAT    148脆弱拟杆菌      CGCGATGTTG ATAAACCTTT CTTGATGCCG GTAGA...ACTGG TGTTATCCAT GTAGGTGATG AAATCGAAAT    149洋葱伯克霍尔    CGTGCAGTTG ACGGCGCGTT CCTGATGCCG GTGGA...CGCGG CATCGTGAAG GTCGGCGAAG AAATCGAAAT    152德氏菌砂眼衣原体      AGAGAAATTG ACAAGCCTTT CTTAATGCCT ATTGA...CGTGG AATTGTTAAA GTTTCCGATA AAGTTCAGTT    153白喉棒杆菌      CGTGAGACCG ACAAGCCATT CCTCATGCCT ATCGA...CGTGG CTCCCTGAAG GTCAACGAGG ACGTCGAGAT    126鸟肠球菌        CGTGATACTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTCGA...CGTGG ACAAGTTCGC GTTGGTGACG AAGTTGAAAT    131粪肠球菌        CGTGATACTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTCGA...CGTGG TGAAGTTCGC GTTGGTGACG AAGTTGAAAT    132屎肠球菌        CGTGACAACG ACAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGTGG ACAAGTTCGC GTTGGTGACG AAGTTGAAGT    133鹑鸡肠球菌      CGTGATACTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTCGA...CGTGG ACAAGTTCGC GTTGGTGATG AAGTAGAAAT    134大肠杆菌        CGTGCGATTG ACAAGCCGTT CCTGCTGCCG ATCGA...CGCGG TATCATCAAA GTTGGTGAAG AAGTTGAAAT    154阴道加德纳氏菌  CACGATCTTG ACAAGCCATT CTTGATGCCA ATCGA...CGTGG TAAGCTCCCA ATCAACACCC CAGTTGAGAT    135流感嗜血菌      CGTGCGATTG ACCAACCGTT CCTTCTTCCA ATCGA...CGAGG TATTATCCGT ACAGGTGATG AAGTAGAAAT    157幽门螺杆菌      AGAGACACTG AAAAAACTTT CTTGATGCCG GTTGA...AGAGG CGTGGTGAAA GTAGGCGATG AAGTGGAAAT    158单核细胞增生利  CGTGATACTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGTGG ACAAGTTAAA GTTGGTGACG AAGTAGAAGT    138斯特氏菌藤黄微球菌      CGCGACAAGG ACAAGCCGTT CCTGATGCCG ATCGA...CGCGG CACCCTGAAG ATCAACTCCG AGGTCGAGAT    159结核分枝杆菌    CGCGAGACCG ACAAGCCGTT CCTGATGCCG GTCGA...CGCGG CGTGATCAAC GTGAACGAGG AAGTTGAGAT    160生殖道枝原体    CGTGAAGTAG ATAAACCTTT CTTATTAGCA ATTGA...AGAGG TGAACTCAAA GTAGGTCAAG AAGTTGAAAT    161淋病奈瑟氏球菌  CGTGCCGTGG ACAAACCATT CCTGCTGCCT ATCGA...CGAGG TATCATCCAC GTTGGTGACG AGATTGAAAT    162鼠伤寒沙门氏菌  CGTGCGATTG ACAAGCCGTT CCTGCTGCCG ATCGA...CGCGG TATCATCAAA GTGGGCGAAG AAGTTGAAAT    164Shewanella      CGTGACATCG ATAAGCCGTT CCTACTGCCA ATCGA...CGTGG TATTGTACGC GTAGGCGACG AAGTTGAAAT    165putida金黄色葡萄球菌  CGTGATTCTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGTGG TCAAATCAAA GTTGGTGAAG AAGTTGAAAT    140表皮葡萄球菌    CGTGATTCTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGTGG TCAAATCAAA GTWGGTGAAG AAGTTGAAAT    141腐生葡萄球菌    CGTGATTCTG ACAAACCATT CATGATGCCA GTTGA...CGTGG TCAAATCAAA GTCGGTGAAG AAATCGARAT    142无乳链球菌    CGTGATACTG ACAAACCTTT ACTTCTTCCA GTTGA...CGTGG TACTGTTCGT GTCAACGACG AAGTTGAAAT  144肺炎链球菌    CGTGACACTG ACAAACCATT GCTTCTTCCA GTCGA...CGTGG TATCGTTAAA GTCAACGACG AAATCGAAAT  145酿脓链球菌    CGCGACACTG ACAAACCATT GCTTCTTCCA GTCGA...CGTGG TACTGTTCGT GTCAACGACG AAATCGAAAT  167解脲尿枝原体  CGTAGTACTG ACAAACCATT CTTATTAGCA ATTGA...CGTGG TGTATTAAAA GTTAATGATG AGGTTGAAAT  170选出的序列         TACTG ACAAACCATT CATGATG                      GTTCGC GTTGGTGACG AAGTT选出的属特异           SEQ ID NO：13                                SEQ ID NO：14a性引物序列
               TACTG ACAAACCATT CATGATG                      AACTTC GTCACCAACG CGAAC
序列编号指的是粪肠球菌tuf基因片段。下划线的核苷酸与选定的序列相同或与之匹配。
a该序列是上述tuf序列的反向互补序列。
注：上述引物也扩增Abiotrophia属各种的tuf序列；最近已通过16S rRNA分析证明了此属与肠
    球菌属有关。附录III：从tuf序列中选择葡萄球菌特异的扩增引物的策略(下接第56页至第57页)
           385                              420.....579                              611 SEQ ID
                                                                                            NO枯草芽胞杆菌   TGGCCGTGTA GAACGCGGAC AAGTTAAAGT CGG.....TTG CTAAACCAGG TACAATCACT CCACACAGCA   148脆弱拟杆菌     AGGTCGTATC GAAACTGGTG TTATCCATGT AGG.....TTT GTAAACCGGG TCAGATTAAA CCTCACTCTA   149洋葱伯克霍尔   GGGTCGTGTC GAGCGCGGCA TCGTGAAGGT CGG.....TGG CGAAGCCGGG TTCGATCACG CCGCACACGC   152德氏菌砂眼衣原体     TGGACGTATT GAGCGTGGAA TTGTTAAAGT TTC.....TTT GCTTGCCAAA CAGTGTTAAA CCTCATACAC   153白喉棒杆菌     CGGCCGTGTT GAGCGTGGCT CCCTGAAGGT CAA.....TTG TTAAGCCAGG CGCTTACACC CCTCACACCG   126粪肠球菌       AGGACGTGTT GAACGTGGTG AAGTTCGCGT TGG.....TAG CTAAACGAGC TACAATCACT CCACACACAA   132屎肠球菌       AGGTCGTGTT GAACGTGGAC AAGTTCGCGT TGG.....TAG CTAAACCAGG TACAATCACA CCTCRTACAA   133大肠杆菌       CGGTCGTGTA GAACGCGGTA TCATCAAAGT TGG.....TGG CTAAGCCGGG CACCATCAAG CCGCACACCA   154阴道加德纳氏菌 CGGTCGTGTT GAGCGTGGTA AGCTCCCAAT CAA.....TGG CTGCTCCAGG TTCTGTGACT CCACACACCA   135流感嗜血菌      AGGTCGTGTA GAACGAGGTA TTATCCGTAC AGG.....TAG CGAAACCAGG TTCAATCACA CCACACACTG  157幽门螺杆菌      AGGTAGGATT GAAAGAGGCG TGGTGAAAGT AGG.....TAT GCAAACCAGG TTCTATCACT CCGCACAAGA  158单核细胞增生利  TGGACGTGTT GAACGTGGAC AAGTTAAAGT TGG.....TAG CTAAACCAGG TTCGATTACT CCACACACTA  138斯特氏菌藤黄微球菌      CGGTCGCGCC GAGCGCGGCA CCCTGAAGAT CAA.....TGG TGGAGCCGGG CTCCATCACC CCGCACACCA  159结核分枝杆菌    CGGACGTGTG GAGCGCGGCG TGATCAACGT GAA.....TCA CCAAGCCCGG CACCACCACG CCGCACACCG  160生殖道枝原体    AGGAAGAGTT GAAAGAGGTG AACTCAAAGT AGG.....TAG CAAAACCAGG CTCTATTAAA CCGCACAAGA  161淋病奈瑟氏球菌  CGGCCGTGTA GAGCGAGGTA TCATCCACGT TGG.....TGG CCAAACGGGG TACTATCACT CCTCACACCA  162鼠伤寒沙门氏菌  CGGTCGTGTA GAGCGCGGTA TCATCAAAGT GGG.....TGG CTAAGCCGGG CACCATCAAG CCGCACACCA  164Shewanella      AGGTCGTGTT GAGCGTGGTA TTGTACGCGT AGG.....TAG CGAAGCCAGG TTCAATCAAC CCACACACTA  165putida金黄色葡萄球菌  AGGCCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAAGT TGG.....TAG CTGCTCCTGG TTCAATTACA CCACATACTG  140表皮葡萄球菌    AGGCCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAAGT WGG.....TAG CTGCTCCTGG TTCTATTACA CCACACACAA  141腐生葡萄球菌    AGGCCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAAGT CGG.....TAG CTGCTCCTGG TACTATCACA CCACATACAA  142模仿葡萄球菌    AGGCCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAAGT CGG.....TAG CAGCTCCTGG CTCTATTACT CCACACACAA  143无乳链球菌       AGGACGTATC GACCGTGGTA CTGTTCGTGT CAA.....TTG CTAAACCAGG TTCAATCAAC CCACACACTA  144肺炎链球菌       AGGACGTATC GACCGTGGTA TCGTTAAAGT CAA.....TCG CTAAACCAGG TTCAATCAAC CCACACACTA  145解脲尿枝原体     TGGACGTGTT GAACGTGGTG TATTAAAAGT TAA.....TTG TAAAACCAGG ATCAATTAAA CCTCACCGTA  170
                 CCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAA                GCTCCTGG YWCWATYACA CCACAYA选出的序列a
                        SEQ ID NO：17                               SEQ ID NO：18b选出的属特异
                 CCGTGTT GAACGTGGTC AAATCAAA                TRTGTGGT GTRATWGWRC CAGGAGC性引物序列a序列编号指的是金黄色葡萄球菌tuf基因片段。下划线的核苷酸与选定的序列相同或与之匹配。a “R”、“W”、“Y”指示发生简并的核苷酸位置。“R”代表A或G，  “W”代表A或T，
“Y”代表C或T。b 该序列是上述tuf序列的反向互补序列。附录IV：从tuf序列中选择白假丝酵母特异的扩增引物的策略(下接第59页至第60页)
            58                                90   181                              213 SEQ ID NO白假丝酵母      CGTCAAGAAG GTTGGTTACA ACCCAAAGAC TGT...CAA ATCCGGTAAA GTTACTGGTA AGACCTTGTT    120Candida         CATCAAGAAG GTCGGTTACA ACCCAAAGAC TGT...CAA GGCTGGTGTC GTCAAGGGTA AGAYCTTGTT    121glabrata克鲁斯假丝酵母  CATCAAGAAG GTTGGTTACA ACCCAAAGAC TGT...CAA GGCAGGTGTT GTTAAGGGTA AGACCTTATT    122近平滑假丝酵母  CGTCAAGAAG GTTGGTTACA ACCCTAAAGC TGT...TAA AGCTGGTAAG GTTACCGGTA AGACCTTGTT    123热带假丝酵母    CGTCAAGAAG GTTGGTTACA ACCCTAAGGC TGT...CAA GGCTGGTAAG GTTACCGGTA AGACTTTGTT    124粟酒裂殖酵母    CATCAAGAAG GTCGGTTTCA ACCCCAAGAC CGT...CAA GGCTGGTGTC GTCAAGGGTA AGACTCTTTT人              GGAGATCCGG GAGCTGCTCA CCGAGTTTGG CTA...GTT AGGCCTGAAG TCTGTGCAGA AGCTACTGGA砂眼衣原体      GGAGCTGCGC GAGCTGCTCA GCAAGTACGG CTT...CAA ATG....... ..TATTCTGG AGCTGATGAA    153白喉棒杆菌      GGAGATCCRT GAGCTGCTCG CTGAGCAGGA TTA...GAA GTGGACCCAG TCCATCATCG ACCTCATGCA    126粪肠球菌        GGAAGTTCGT GACTTATTAT CAGAATACGA TTT...... ...TGAAGAA AAAATCTTAG AATTAATGGC    132大肠杆菌        GGAAGTTCGT GAACTTCTGT CTCAGTACGA CTT...... ..GGGAAGCG AAAATCCTGG AACTGGCTGG    154锈色黄杆菌        CGAGGTTCGC GAAGAACTGA CTAAACGCGG TTT...... ..GGGTTAAA GAAATTGAAA ACCTGATGGA    156阴道加德纳氏菌    AGAGGTCCGT GACCTCCTCG AAGAAAACGG CTT...CAA GTGGGTAGAG ACCGTCAAGG AACTCATGAA    135流感嗜血菌        GGAAGTTCGT GAACTTCTAT CTCAATATGA CTT...... ..GGGAAGAA AAAATCCTTG AGTTAGCAAA    157单核细胞增生利    GGAAATTCGT GATCTATTAA CTGAATATGA ATT...... ..GGGAAGCT AAAATTGACG AGTTAATGGA    138斯特氏菌藤黄微球菌        GGAAGTCCGT GAGTTGCTGG CTGCCCAGGA ATT...CAA GTGGGTCGAG TCTGTCACAC AGTTGATGGA    159淋病奈瑟氏球菌    GGAAATCCGC GACCTGCTGT CCAGCTACGA CTT...... ..ACGAAGAA AAAATCTTCG AACTGGCTAC    162鼠伤寒沙门氏菌    GGAAGTTCGC GAACTGCTGT CTCAGTACGA CTT...... ..GGGAAGCG AAAATCATCG AACTGGCTGG    164金黄色葡萄球菌    GGAAGTTCGT GACTTATTAA GCGAATATGA CTT...... ...CGAAGAA AAAATCTTAG AATTAATGGA    140肺炎链球菌        GGAAATCCGT GACCTATTGT CAGAATACGA CTT...... ...CGAAGAC ATCGTTATGG AATTGATGAA    145苍白密螺旋体      AGAGGTGCGT GATGCGCTTG CTGGATATGG GTT...GGA GGATGCAGCT TGTATTGAGG AACTGCTTGC    169选出的序列      CAAGAAG GTTGGTTACA ACCCAAAGA   ATCCGGTAAA GTTACTGGTA AGACCT选出的种特异             SEQ ID NO：11                 SEQ ID NO：12a性引物序列      CAAGAAG GTTGGTTACA ACCCAAAGA   AGGTCTTACC AGTAACTTTAC CGGAT序列编号指的是白假丝酵母tuf基因片段。下划线的核苷酸与选定的序列相同或与之匹配。a 该序列是上述tuf序列的反向互补序列。附录V：从recA序列中选择链球菌属特异的扩增引物的策略(下接第62页至第63页)
          415                                449...540                                574   SEQ
                                                                                          ID NOBordetella    CTCGAGATCA CCGACGCGCT GGTGCGCTCG GGCTC...GGCCC GCCTGATGAG CCAGGCGCTG CGCAAGCTGApertussisBurkholderia  CTCGAAATCA CCGATGCGCT GGTGCGCTCG GGCTC...GGCCC GCCTGATGTC GCAGGCGCTG CGCAAGCTGAcepacia弯曲空肠杆菌  TTAGAAATTG TAGAAACTAT AGCAAGAAGT GGCGC...AGCAA GACTTATGTC TCAAGCTCTA AGAAAACTTAChlamydia     TTGAGTATTG CAGAGCTCTT AGCGCGTTCT GGAGC...AGCTC GCATGATGTC GCAGGCTCTA CGCAAATTAAtrachomatis产气荚膜梭菌  TTAGAAATAA CAGAAGCTTT AGTTAGATCA GGAGC...AGCTA GATTAATGTC ACAAGCCTTA AGAAAGTTAA假结核棒杆菌  CTGGAGATTG CAGATATGCT TGTTCGCTCT GGAGC...AGCGC GTTTGATGAG TCAGGCGCTG CGTAAGATGA成团肠杆菌    CTGGAAATCT GTGATGCGCT GACCCGTTCA GGCGC...AGCTC GTATGATGAG CCAGGCGATG CGTAAGCTTG屎肠球菌      TTAGAGATTG CCGATGCCTT AGTTTCAAGT GGTGC...AGCTC GACTAATGTC TCAAGCACTA CGTAAATTAT大肠杆菌      CTGGAAATCT GTGACGCCCT GGCGCGTTCT GGCGC...GGCAC GTATGATGAG CCAGGCGATG CGTAAGCTGG流感嗜血菌     GCGAACAGAA GAATAGAATT TTAATGCATT ACCGC...GACCT GTGAGTTTAC GCAAAGCTTG AGACATTAAA幽门螺杆菌     TTAGAAATTT TAGAAACGAT CACCAGAAGC GGAGG...AGCAA GGCTTATGAG CCATGCGTTA AGAAAAATCA乳酸乳球菌     CTTCAAATTG CTGAAAAATT GATTACTTCT GGAGC...AGCAC GTATGATGTC ACAAGCCATG CGTAAACTTG侵肺军团菌     CTGGAAATTA CTGATATGCT GGTGCGTTCT GCAGC...GGCAA GATTGATGTC GCAAGCCCTG CGTAAATTGA生殖道枝原体   TTTGCTCTTA TCGAATCATT AATTAAAACA AACAA...TGCAA GAATGATGTC AAAAGGTTTG CGAAGAATAC淋病奈瑟氏球菌 TTGGAAATCT GCGACACGCT CGTCCGTTCG GGCGG...GGCGC GCCTGATGAG TCAGGCTTTG CGCAAACTGA奇异变形菌     CTGGAAATTT GTGATGCATT ATCTCGCTCT GGTGC...CGCAC GTATGATGAG CCAAGCTATG CGTAAACTAG铜绿假单胞菌   CTGGAAATCA CCGACATGCT GGTGCGCTCC AACGC...GGCAC GCCTGATGTC CCAGGCGCTG CGCAAGATCA粘质沙雷氏菌   CTGGAAATCT GTGATGCGCT GACCCGCTCC GGCGC...GGCGC GCATGATGAG CCAGGCGATG CGTAAGCTGG弗氏志贺氏菌   CTGGAAATCT GTGACGCCCT GGCGCGTTCT GGCGC...GGCAC GTATGATGAG CCAGGCGATG CGTAAGCTGG金黄色葡萄球菌 CTTGAAATCG CCGAAGCATT TGTTAGAAGT GGTGC...AGCTC GTTTAATGTC ACAAGCGTTA CGTAAACTTT格氏链球菌     TTAGAAATTG CAGGAAAATT GATTGACTCT GGGGC........ .......... .......... .......... 32变异链球菌     CTTGAAATTG CAGGGAAATT GATTGATTCT GGCGC...AGCAC GCATGATGAG TCAAGCGATG CGTAAATTAT 33肺炎链球菌     CTTGAGATTG CGGGAAAATT GATTGACTCA GGTGC...GGCTC GTATGATGAG CCAGGCCATG CGTAAACTTG  34酿脓链球菌     CTTGAAATTG CAGGTAAATT GATTGATTCT GGTGC...AGCAC GTATGATGAG TCAGGCCATG CGTAAATTAT  35唾液链球菌     CTCGAAATTG CAGGTAAGCT GATTGACTCT GGTGC...AGCGC GTATGATGAG TCAAGCCATG CGTAAACTTT  36霍乱弧菌       CTGGAAATTT GTGATGCACT GGCTCGCTCT GGTGC...AGCGC GTATGTTGTC GCAAGCAATG CGTAAACTGA鼠疫耶尔森氏菌 CTGGAAATTT GTGATGCGCT GACTCGCTCT GGTGC...CGCGC GTATGATGAG CCAGGCTATG CGTAAGCTGG选出的序列a      GAAATTG GAGGIAAATT GATTGA                     ATGATGAG TCAIGCCATG CGTAA选出的属特异             SEQ ID NO：21                                  SEQ ID NO：22b性引物序列a      GAAATTG CAGGIAAATT GATTGA                     TTACGCAT GGCITGACTC ATCAT序列编号指的是肺炎链球菌recA序列。下划线的核苷酸与选定的序列相同或与之匹配。a “I”代表次黄苷，它是可与四种核苷酸A、C、T、G中任何一种结合的核苷酸类似物。b该序列是上述recA序列的反向互补序列。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO核苷酸序列                               原始DNA片段
                                          SEQ ID NO  核苷酸位置细菌种类：    屎肠球菌1   5′-TGC TTT AGC AAC AGC CTA TCA G            26a      273-2942b 5′-TAA ACT TCT TCC GGC ACT TCG              26a      468-488细菌种类：    单核细胞增生利斯特氏菌3   5′-TGC GGC TAT AAA TGA AGA GGC              27a      339-3594b 5′-ATC CGA TGA TGC TAT GGC TTT              27a      448-468
  细菌种类：脑膜炎奈瑟氏球菌5   5′-CCA GCG GTA TTG TTT GGT GGT              28a      56-766b 5′-CAG GCG GCC TTT AAT AAT TTC              28a      212-232
  细菌种类：腐生葡萄球菌7   5′-AGA TCG AAT TCC ACA TGA AGG TTA TTA TGA  29c      290-3198b 5′-TCG CTT CTC CCT CAA CAA TCA AAC TAT CCT  29c      409-438
  细菌种类：无乳链球菌9   5′-TTT CAC CAG CTG TAT TAG AAG TA           30a      59-8110b5′-GTT CCC TGA ACA TTA TCT TTG AT           30a      190-212
  真菌种类：白假丝酵母11  5′-CAA GAA GGT TGG TTA CAA CCC AAA GA       120c     61-8612b5′-AGG TCT TAC CAG TAA CTT TAC CGG AT       120c     184-209a 得自数据库的序列。b 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。c 由我们的研究小组确定的序列。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO  核苷酸序列                             原始DNA片段
                                           SEQ ID NO    核苷酸位置
    细菌属：肠球菌属13   5′-TAC TGA CAA ACC ATT CAT GAT G          131-134a，b  319-340c14d 5′-AAC TTC GTC ACC AAC GCG AAC            131-134a，b  410-430c
    细菌属：奈瑟氏球菌属15   5′-CTG GCG CGG TAT GGT CGG TT             31e          21-40f16d 5′-GCC GAC GTT GGA AGT GGT AAA G          31e         102-123f
    细菌属：葡萄球菌属17   5′-CCG TGT TGA ACG TGG TCA AAT CAA A      140-143a，b   391-415g18d 5′-TRT GTG GTG TRA TWG WRC CAG GAG C      140-143a，b   584-608g19   5′-ACA ACG TGG WCA AGT WTT AGC WGC T      140-143a，b   562-583g20d 5′-ACC ATT TCW GTA CCT TCT GGT AAG T      140-143a，b   729-753g
    细菌属：链球菌属21   5′-GAA ATT GCA GGIAAA TTG ATT GA          32-36e       418-440h22d 5′-TTA CGC ATG GCI TGA CTC ATC AT         32-36e       547-569h
            通用引物23   5′-ACI KKI ACI GGI GTI GAR ARG TT         118-146a，b   493-515i
                                            147-171a，e24d 5′-AYR TTI TCI CCI GGC ATI ACC AT         118-146a，b   778-800i
                                            147-171a，ea 将这些序列进行对比以衍生相应的引物。b 由我们的研究小组确定的序列。c 核苷酸位置指的是粪肠球菌tuf基因片段(SEQ ID NO：132)。d 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。e 得自数据库的序列。f 核苷酸位置指的是脑膜炎奈瑟氏球菌asd基因片段(SEQ ID NO：31)。g 核苷酸位置指的是金黄色葡萄球菌tuf基因片段(SEQ ID NO：140)。h 核苷酸位置指的是肺炎链球菌recA基因(SEQ ID NO：34)。i 核苷酸位置指的是大肠杆菌tuf基因片段(SEQ ID NO：154)。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO核苷酸序列                             原始DNA片段
                                        SEQ ID NO  核苷酸位置抗生素抗性基因：blatem37  5′-CTA TGT GGC GCG GTA TTA TC             -           -38  5′-CGC AGT GTT ATC ACT CAT GG             -           -39  5′-CTG AAT GAA GCC ATA CCA AA             -           -40  5′-ATC AGC AAT AAA CCA GCC AG             -           -抗生素抗性基因：blashv41  5′-TTA CCA TGA GCG ATA ACA GC             -           -42  5′-CTC ATT CAG TTC CGT TTC CC             -           -43  5′-CAG CTG CTG CAG TGG ATG GT             -           -44  5′-CGC TCT GCT TTG TTA TTC GG             -           -抗生素抗性基因：blarob45  5′-TAC GCC AAC ATC GTG GAA AG             -           -46  5′-TTG AAT TTG GCT TCT TCG GT             -           -47  5′-GGG ATA CAG AAA CGG GAC AT             -           -48  5′-TAA ATC TTT TTC AGG CAG CG             -           -抗生素抗性基因：blaoxa49  5′-GAT GGT TTG AAG GGT TTA TTA TAA G     110a       686-71050b5′-AAT TTA GTG TGT TTA GAA TGG TGA T     110a       802-826抗生素抗性基因：blaZ51  5′-ACT TCA ACA CCT GCT GCT TTC           111a       511-53152b5′-TGA CCA CTT TTA TCA GCA ACC           111a       663-683抗生素抗性基因：aadB53  5′-GGC AAT AGT TGA AAT GCT CG            -            -54  5′-CAG CTG TTA CAA CGG ACT GG            -            -抗生素抗性基因：aacC155  5′-TCT ATG ATC TCG CAG TCT CC            -            -56  5′-ATC GTC ACC GTA ATC TGC TT            -            -a 得自数据库的序列。b 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO核苷酸序列                           原始DNA片段
                                     SEQ ID NO  核苷酸位置抗生素抗性基因：aacC257   5′-CAT TCT CGA TTG CTT TGC TA          -         -58   5′-CCG AAA TGC TTC TCA AGA TA          -         -抗生素抗性基因：aacC359   5 ′-CTG GAT TAT GGC TAC GGA GT         -         -60   5′-AGC AGT GTG ATG GTA TCC AG          -         -抗生素抗性基因：aac6’-IIa61   5′-GAC TCT TGA TGA AGT GCT GG          112a     123-14262b 5′-CTG GTC TAT TCC TCG CAC TC          112a     284-30363   5′-TAT GAG AAG GCA GGA TTC GT          112a     445-46464b 5′-GCT TTC TCT CGA AGG CTT GT          112a     522-541抗生素抗性基因：aacA465   5′-GAG TTG CTG TTC AAT GAT CC          -         -66   5′-GTG TTT GAA CCA TGT ACA CG          -         -抗生素抗性基因：aad(6’)173  5′-TCT TTA GCA GAA CAG GAT GAA         -         -174  5′-GAA TAA TTC ATA TCC TCC G           -         -抗生素抗性基因：vanA67   5′-TGT AGA GGT CTA GCC CGT GT          -         -68   5′-ACG GGG ATA ACG ACT GTA TG          -         -69   5′-ATA AAG ATG ATA GGC CGG TG          -         -70   5′-TGC TGT CAT ATT GTC TTG CC          -         -抗生素抗性基因：vanB71   5′-ATT ATC TTC GGC GGT TGC TC          116a    22-4172b 5′-GAC TAT CGG CTT CCC ATT CC          116a    171-19073   5′-CGA TAG AAG CAG CAG GAC AA          116a    575-59474b 5′-CTG ATG GAT GCG GAA GAT AC          116a    713-732a 得自数据库的序列。b 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO  核苷酸序列                      原始DNA片段
                                     SEQ ID NO   核苷酸位置抗生素抗性基因：vanC75   5′-GCC TTA TGT ATG AAC AAA TGG        117a     373-39376b 5′-GTG ACT TTW GTG ATC CCT TTT GA     117a     541-563抗生素抗性基因：msrA77   5′-TCC AAT CAT TGC ACA AAA TC          -         -78   5′-AAT TCC CTC TAT TTG GTG GT          -         -79   5′-TCC CAA GCC AGT AAA GCT AA          -         -80   5′-TGG TTT TTC AAC TTC TTC CA          -         -抗生素抗性基因：satA81   5′-TCA TAG AAT GGA TGG CTC AA          -         -82   5′-AGC TAC TAT TGC ACC ATC CC          -         -抗生素抗性基因：aac(6’)-aph(2”)83   5′-CAA TAA GGG CAT ACC AAA AAT C       -         -84   5′-CCT TAA CAT TTG TGG CAT TAT C       -         -85   5′-TTG GGA AGA TGA AGT TTT TAG A       -         -86   5′-CCT TTA CTC CAA TAA TTT GGC T       -         -抗生素抗性基因：vat87   5′-TTT CAT CTA TTC AGG ATG GG          -         -88   5′-GGA GCA ACA TTC TTT GTG AC          -         -抗生素抗性基因：vga89   5′-TGT GCC TGA AGA AGG TAT TG          -         -90   5′-CGT GTT ACT TCA CCA CCA CT          -         -抗生素抗性基因：ermA91   5′-TAT CTT ATC GTT GAG AAG GGA TT     113a     370-39292b 5′-CTA CAC TTG GCT TAG GAT GAA A      113a     487-508a 得自数据库的序列。b 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。附录VI：用于DNA扩增的特异性和普遍适用性引物SEQ ID NO核苷酸序列                          原始DNA片段
                                      SEQ ID NO  核苷酸位置抗生素抗性基因：ermB93  5′-CTA TCT GAT TGT TGA AGA AGG ATT      114a    366-38994b5′-GTT TAC TCT TGG TTT AGG ATG AAA      114a    484-507抗生素抗性基因：ermC95  5′-CTT GTT GAT CAC GAT AAT TTC C        115a    214-23596b 5′-ATC TTT TAG CAA ACC CGT ATT C       115a    382-403抗生素抗性基因：mecA97  5′-AAC AGG TGA ATT ATT AGC ACT TGT AAG   -        -98  5′-ATT GCT GTT AAT ATT TTT TGA GTT GAA   -        -抗生素抗性基因：int99  5′-GTG ATC GAA ATC CAG ATC C             -        -100 5′-ATC CTC GGT TTT CTG GAA G             -        -101 5′-CTG GTC ATA CAT GTG ATG G             -        -102 5′-GAT GTT ACC CGA GAG CTT G             -        -抗生素抗性基因：sul103 5′-TTA AGC GTG CAT AAT AAG CC            -        -104 5′-TTG CGA TTA CTT CGC CAA CT            -        -105 5′-TTT ACT AAG CTT GCC CCT TC            -        -106 5′-AAA AGG CAG CAA TTA TGA GC            -        -a 得自数据库的序列。b 这些序列得自序列表中给出的原始片段的序列的相反DNA链。
                    序列表(1)基本信息(i)申请人：
(A)名称：INFECTIO DIAGNOSTIC(I.D.I.)INC.
(B)街道：2050，BOELEVARD RENE LEVESQUE OUEST，4E
         ETAGE
(C)城市：STE-FOY
(D)州：QUEBEC
(E)国家：加拿大
(F)邮政编码：G1V 2K8
(G)电话：(418)681-4343
(H)传真：(418)681-5254
(A)名称：BERGERON，MICHEL G.
(B)街道：2069 RUE BRULARD
(C)城市：SILLERY
(D)州：QUEBEC
(E)国家：加拿大
(F)邮政编码：G1T 1G2
(A)名称：PICARD，FRANCOIS J.
(B)街道：1245，RUE DE LA SAPINIERE
(C)城市：CAP-ROUGE
(D)州：QUEBEC
(E)国家：加拿大
(F)邮政编码：G1Y 1A1
(A)名称：OUELLETTE，MARC
(B)街道：1035 DE PLOERMEL
(C)城市：SILLERY
(D)州：QUEBEC
(E)国家：加拿大
(F)邮政编码：G1S 3S1
(A)名称：ROY，PAUL H.
(B)街道：28，RUE CHARLES GARNIER
(C)城市：LORETTEVILLE
(D)州：QUEBEC
(E)国家：加拿大
(F)邮政编码：G2A 3S1(ii)发明名称：快速检测和鉴定临床样品中常见细菌和真菌病
            原体及相关抗生素抗性基因，以进行微生物学
            实验室诊断的种特异性、属特异性和通用DNA
            探针及扩增引物(iii)序列数：174(iv)计算机可读形式
(A)介质类型：软盘
(B)计算机：IBM PC兼容机
(C)操作系统：PC-DOS/MS-DOS
(D)软件：PatentIn Release #1.0，版本#1.30(EPO)(vi)在先申请信息：
(A)申请号：US 08/743,637
(B)申请日：1996年11月4日(2)关于SEQ ID NO：1的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性  (ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：屎肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：1：TGCTTTAGCA ACAGCCTATC AG                                             22(2)关于SEQ ID NO：2的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：屎肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：2：TAAACTTCTT CCGGCACTTC G                                                21(2)关于SEQ ID NO：3的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：单核细胞增生利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：3：TGCGGCTATA AATGAAGAGG C                                              21(2)关于SEQ ID NO：4的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性
(ii)分子类型：DNA(基因组)
(vi)来源：
(A)生物：单核细胞增生利斯特氏菌
(xi)序列描述：SEQ ID NO：4：ATCCGATGAT GCTATGGCTT T                                              21(2)关于SEQ ID NO：5的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性
(ii)分子类型：DNA(基因组)
(vi)来源：
(A)生物：脑膜炎奈瑟氏球菌
(xi)序列描述：SEQ ID NO：5：CCAGCGGTAT TGTTTGGTGG T                                              21(2)关于SEQ ID NO：6的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：脑膜炎奈瑟氏球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：6：CAGGCGGCCT TTAATAATTT C                                                21(2)关于SEQ ID NO：7的信息(i)序列特征
(A)长度：30个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：腐生葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：7：AGATCGAATT CCACATGAAG GTTATTATGA                                       30(2)关于SEQ ID NO：8的信息(i)序列特征
(A)长度：30个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：腐生葡萄球菌  (xi)序列描述：SEQ ID NO：8：TCGCTTCTCC CTCAACAATC AAACTATCCT                                     30(2)关于SEQ ID NO：9的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：无乳链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：9：TTTCACCAGC TGTATTAGAA GTA                                            23(2)关于SEQ ID NO：10的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：无乳链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：10：GTTCCCTGAA CATTATCTTT GAT                                            23(2)关于SEQ ID NO：11的信息(i)序列特征
(A)长度：26个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：白假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：11：CAAGAAGGTT GGTTACAACC CAAAGA
                                                      26(2)关于SEQ ID NO：12的信息(i)序列特征
(A)长度：26个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：白假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：12：AGGTCTTACC AGTAACTTTA CCGGAT                                           26(2)关于SEQ ID NO：13的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)  (xi)序列描述：SEQ ID NO：13：TACTGACAAA CCATTCATGA TG                                             22(2)关于SEQ ID NO：14的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：14：AACTTCGTCA CCAACGCGAA C                                              21(2)关于SEQ ID NO：15的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：15：CTGGCGCGGT ATGGTCGGTT                                                20(2)关于SEQ ID NO：16的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性  (ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：16：GCCGACGTTG GAAGTGGTAA AG                                               22(2)关于SEQ ID NO：17的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：17：CCGTGTTGAA CGTGGTCAAA TCAAA                                            25(2)关于SEQ ID NO：18的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：18：TRTGTGGTGT RATWGWRCCA GGAGC                                          25(2)关于SEQ ID NO：19的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：19：ACAACGTGGW CAAGTWTTAG CWGCT                                          25(2)关于SEQ ID NO：20的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：20：ACCATTTCWG TACCTTCTGG TAAGT                                          25(2)关于SEQ ID NO：21的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：12
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：21：GAAATTGCAG GNAAATTGAT TGA                                            23(2)关于SEQ ID NO：22的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：12
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：22：TTACGCATGG CNTGACTCAT CAT                                            23(2)关于SEQ ID NO：23的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性
(ii)分子类型：DNA(基因组)
(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：3
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：6
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”  (ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：9
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：12
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：15
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：23：ACNKKNACNG GNGTNGARAT GTT                                              23(2)关于SEQ ID NO：24的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：6
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：9
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：12
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：18
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：24：AYRTTNTCNC CNGGCATNAC CAT                                            23(2)关于SEQ ID NO：25的信息(i)序列特征
(A)长度：10个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：25：TCGCTTCTCC                                                           10(2)关于SEQ ID NO：26的信息(i)序列特征
(A)长度：600个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)  (vi)来源：
(A)生物：屎肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：26：TTCTTAGAGA CATTGAATAT GCCTTATGTC GGCGCAGGCG TATTGACCAG TGCATGTGCC     60ATGGATAAAA TCATGACCAA GTATATTTTA CAAGCTGCTG GTGTGCCGCA AGTTCCTTAT    120GTACCAGTAC TTAAGAATCA ATGGAAAGAA AATCCTAAAA AAGTATTTGA TCAATGTGAA    180GGTTCTTTGC TTTATCCGAT GTTTGTCAAA CCTGCGAATA TGGGTTCTAG TGTCGGCATT    240ACAAAGGCAG AAAACCGAGA AGAGCTGCAA AATGCTTTAG CAACAGCCTA TCAGTATGAT    300TCTCGAGCAA TCGTTGAACA AGGAATTGAA GCGCGCGAAA TCGAAGTTGC TGTATTAGGA    360AATGAAGATG TTCGGACGAC TTTGCCTGGC GAAGTCGTAA AAGACGTAGC ATTCTATGAT    420TATGAAGCCA AATATATCAA TAATAAAATC GAAATGCAGA TTCCAGCCGA AGTGCCGGAA    480GAAGTTTATC AAAAAGCGCA AGAGTACGCG AAGTTAGCTT ACACGATGTT AGGTGGAAGC    540GGATTGAGCC GGTGCGATTT CTTTTTGACA AATAAAAATG AATTATTCCT GAATGAATTA    600(2)关于SEQ ID NO：27的信息(i)序列特征
(A)长度：1920个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：单核细胞增生利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：27：GTGGGATTAA ACAGATTTAT GCGTGCGATG ATGGTGGTTT TCATTACTGC CAATTGCATT     60ACGATTAACC CCGACATAAT ATTTGCAGCG ACAGATAGCG AAGATTCTAG TCTAAACACA    120GATGAATGGG AAGAAGAAAA AACAGAAGAG CAACCAAGCG AGGTAAATAC GGGACCAAGA    180TACGAAACTG CACGTGAAGT AAGTTCACGT GATATTAAAG AACTAGAAAA ATCGAATAAA    240GTGAGAAATA CGAACAAAGC AGACCTAATA GCAATGTTGA AAGAAAAAGC AGAAAAAGGT    300CCAAATATCA ATAATAACAA CAGTGAACAA ACTGAGAATG CGGCTATAAA TGAAGAGGCT    360TCAGGAGCCG ACCGACCAGC TATACAAGTG GAGCGTCGTC ATCCAGGATT GCCATCGGAT       420AGCGCAGCGG AAATTAAAAA AAGAAGGAAA GCCATAGCAT CATCGGATAG TGAGCTTGAA       480AGCCTTACTT ATCCGGATAA ACCAACAAAA GTAAATAAGA AAAAAGTGGC GAAAGAGTCA       540GTTGCGGATG CTTCTGAAAG TGACTTAGAT TCTAGCATGC AGTCAGCAGA TGAGTCTTCA       600CCACAACCTT TAAAAGCAAA CCAACAACCA TTTTTCCCTA AAGTATTTAA AAAAATAAAA       660GATGCGGGGA AATGGGTACG TGATAAAATC GACGAAAATC CTGAAGTAAA GAAAGCGATT       720GTTGATAAAA GTGCAGGGTT AATTGACCAA TTATTAACCA AAAAGAAAAG TGAAGAGGTA       780AATGCTTCGG ACTTCCCGCC ACCACCTACG GATGAAGAGT TAAGACTTGC TTTGCCAGAG       840ACACCAATGC TTCTTGGTTT TAATGCTCCT GCTACATCAG AACCGAGCTC ATTCGAATTT       900CCACCACCAC CTACGGATGA AGAGTTAAGA CTTGCTTTGC CAGAGACGCC AATGCTTCTT       960GGTTTTAATG CTCCTGCTAC ATCGGAACCG AGCTCGTTCG AATTTCCACC GCCTCCAACA      1020GAAGATGAAC TAGAAATCAT CCGGGAAACA GCATCCTCGC TAGATTCTAG TTTTACAAGA      1080GGGGATTTAG CTAGTTTGAG AAATGCTATT AATCGCCATA GTCAAAATTT CTCTGATTTC      1140CCACCAATCC CAACAGAAGA AGAGTTGAAC GGGAGAGGCG GTAGACCAAC ATCTGAAGAA      1200TTTAGTTCGC TGAATAGTGG TGATTTTACA GATGACGAAA ACAGCGAGAC AACAGAAGAA      1260GAAATTGATC GCCTAGCTGA TTTAAGAGAT AGAGGAACAG GAAAACACTC AAGAAATGCG      1320GGTTTTTTAC CATTAAATCC GTTTGCTAGC AGCCCGGTTC CTTCGTTAAG TCCAAAGGTA      1380TCGAAAATAA GCGACCGGGC TCTGATAAGT GACATAACTA AAAAAACGCC ATTTAAGAAT      1440CCATCACAGC CATTAAATGT GTTTAATAAA AAAACTACAA CGAAAACAGT GACTAAAAAA      1500CCAACCCCTG TAAAGACCGC ACCAAAGCTA GCAGAACTTC CTGCCACAAA ACCACAAGAA      1560ACCGTACTTA GGGAAAATAA AACACCCTTT ATAGAAAAAC AAGCAGAAAC AAACAAGCAG      1620TCAATTAATA TGCCGAGCCT ACCAGTAATC CAAAAAGAAG CTACAGAGAG CGATAAAGAG      1680GAAATGAAAC CACAAACCGA GGAAAAAATG GTAGAGGAAA GCGAATCAGC TAATAACGCA      1740AACGGAAAAA ATCGTTCTGC TGGCATTGAA GAAGGAAAAC TAATTGCTAA AAGTGCAGAA      1800GACGAAAAAG CGAAGGAAGA ACCAGGGAAC CATACGACGT TAATTCTTGC AATGTTAGCT      1860ATTGGCGTGT TCTCTTTAGG GGCGTTTATC AAAATTATTC AATTAAGAAA AAATAATTAA      1920(2)关于SEQ ID NO：28的信息(i)序列特征
(A)长度：415个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：脑膜炎奈瑟氏球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：28：TACCGGTACG CTAAATATTG GTGATGTATT GGATATTATG ATTTGGGAAG CGCCGCCAGC     60GGTATTGTTT GGTGGTGGCC TTTCTTCGAT GGGCTCGGGT AGTGCGCAAC AAACCAAGTT    120GCCGGAGCAA CTGGTGACGG CACGTGGTAC GGTTTCTGTG CCGTTTGTTG GCGATATTTC    180GGTGGTCGGT AAAACGCCTG GTCAGGTTCA GGAAATTATT AAAGGCCGCC TGAAAAAAAT    240GGCCAATCAG CCGCAAGTGA TGGTGCGCTT GGTGCAGAAT AATGCGGCAA ATGTATCGGT    300GATTCGCGCA GGCAATAGTG TGCGTATGCC GTTGACGGCA GCCGGTGAGC GTGTGTTGGA    360TGCGGTGGCT GCGGTAGGTG GTTCAACGGC AAATGTGCAG GATACGAATG TGCAG         415(2)关于SEQ ID NO：29的信息(i)序列特征
(A)长度：438个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：腐生葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：29：TCGCTTCTCC AGAAGAAATT TTAGAAACAT ATCTAGAAAA TCCCAAATTA GATAAACCGT     60TTATATTATG TGAATACGCA CATGCAATGG GAAATTCACC AGGAGATCTT AATGCATATC    120AAACATTAAT TGAAAAATAT GATAGTTTTA TTGGCGGTTT TGTTTGGGAA TGGTGTGATC    180ATAGCATTCA GGTTGGGATA AAGGAAGGTA AACCAATTTT TAGATATGGT GGAGATTTTG    240GTGAGGCCTT ACATGACGGT AATTTTTGTG TTGATGGTAT TGTTTCGCCA GATCGAATTC    300CACATGAAGG TTATTATGAG TTTAAACATG AACATAGACC TTTGAGATTG GTTAACGAAG    360AGGATTATCG GTTTACATTG AAGAATCAAT TTGATTTTAC AAATGCGGAG GATAGTTTGA    420TTGTTGAGGG AGAAGCGA                                                  438(2)关于SEQ ID NO：30的信息(i)序列特征
(A)长度：768个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：无乳链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：30：ATGAACGTTA CACATATGAT GTATCTATCT GGAACTCTAG TGGCTGGTGC ATTGTTATTT     60TCACCAGCTG TATTAGAAGT ACATGCTGAT CAAGTGACAA CTCCACAAGT GGTAAATCAT    120GTAAATAGTA ATAATCAAGC CCAGCAAATG GCTCAAAAGC TTGATCAAGA TAGCATTCAG    180TTGAGAAATA TCAAAGATAA TGTTCAGGGA ACAGATTATG AAAAACCGGT TAATGAGGCT    240ATTACTAGCG TGGAAAAATT AAAGACTTCA TTGCGTGCCA ACCCTGAGAC AGTTTATGAT    300TTGAATTCTA TTGGTAGTCG TGTAGAAGCC TTAACAGATG TGATTGAAGC AATCACTTTT    360TCAACTCAAC ATTTAACAAA TAAGGTTAGT CAAGCAAATA TTGATATGGG ATTTGGGATA    420ACTAAGCTAG TTATTCGCAT TTTAGATCCA TTTGCTTCAG TTGATTCAAT TAAAGCTCAA    480GTTAACGATG TAAAGGCATT AGAACAAAAA GTTTTAACTT ATCCTGATTT AAAACCAACT    540GATAGAGCTA CCATCTATAC AAAATCAAAA CTTGATAAGG AAATCTGGAA TACACGCTTT    600ACTAGAGATA AAAAAGTACT TAACGTCAAA GAATTTAAAG TTTACAATAC TTTAAATAAA    660GCAATCACAC ATGCTGTTGG AGTTCAGTTG AATCCAAATG TTACGGTACA ACAAGTTGAT    720CAAGAGATTG TAACATTACA AGCAGCACTT CAAACAGCAT TAAAATAA                 768(2)关于SEQ ID NO：31的信息(i)序列特征
(A)长度：421个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：脑膜炎奈瑟氏球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：31：ATGAAAGTAG GTTTCGTCGG CTGGCGCGGT ATGGTCGGTT CGGTTTTGAT GCAGCGTATG     60AAAGAAGAAA ACGACTTCGC CCACATTCCC GAAGCGTTTT TCTTTACCAC TTCCAACGTC    120GGCGGCGCAC GCCCTGATTT CGGTCAGGCG GCTAAAACAT TATTGGACGC GAACAACGTT    180GCCGAGCTGG CAAAAATGGA CATCATCGTT ACCTGCCAAG GCGGCGACTA CACCAAATCC    240GTCTTCCAAG CCCTGCGCGA CAGCGGCTGG AACGGCTACT GGATTGACGC GGCATCCTCG    300CTGCGTATGA AAGACGACGC GATTATCGTC CTCGACCCCG TCAACCGCAA CGTCATCGAC    360AACGGCCTCA AAAACGGCGT GAAAAACTAC ATCGGCGGCA ACTGTACCGT TTCCCTGATG    420C                                                                    421(2)关于SEQ ID NO：32的信息(i)序列特征
(A)长度：213个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：格氏链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：32：TTCATAGACG CTGAGCACGC TTTGGATCCA TCTTACGCGG CTGCTCTAGG TGTAAATATT     60GATGAGCTGT TGCTATCTCA ACCAGATTCT GGTGAGCAAG GTTTAGAAAT TGCAGGAAAA    120TTGATTGACT CTGGGGCAGT TGATTTAGTT GTCATCGACT CTGTTGCAGC TCTTGTACCA    180CGTGCGGAAA TCGATGGAGA TATCGGTGAT AGC                                 213(2)关于SEQ ID NO：33的信息(i)序列特征
(A)长度：692个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：变异链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：33：GGGCCGGAAT CTTCTGGTAA GACAACTGTC GCTCTTCATG CTGCTGCTCA GGCGCAAAAA         60GATGGCGGTA TTGCCGCTTT CATTGATGCA GAACATGCCC TTGATCCAGC CTATGCTGCT        120GCTCTTGGCG TTAATATTGA TGAGCTTTTG CTTTCACAAC CAGATTCAGG AGAACAGGGT        180CTTGAAATTG CAGGGAAATT GATTGATTCT GGCGCTGTTG ATTTAGTTGT TGTTGACTCA        240GTGGCAGCTT TAGTACCACG TGCGGAGATT GACGGAGATA TTGGTAATAG TCATGTTGGC        300TTACAAGCAC GCATGATGAG TCAAGCGATG CGTAAATTAT CAGCTTCAAT CAATAAAACA        360AAAACCATTG CTATTTTTAT TAATCAATTG CGGGAAAAAG TTGGTATTAT GTTTGGTAAT        420CCAGAAACAA CCCCTGGCGG GCGTGCCTTG AAGTTTTATT CTTCTGTGCG TCTTGATGTC        480CGCGGCAATA CTCAAATTAA AGGAACCGGG GAACAAAAAG ACAGCAATAT TGGTAAAGAG        540ACCAAAATTA AAGTTGTTAA AAATAAAGTT GCTCCACCAT TTAAGGAAGC TTTTGTAGAA        600ATTATATATG GTGAAGGCAT TTCTCGTACA GGTGAATTAG TTAAGATTGC CAGTGATTTG        660GGAATTATCC AAAAAGCTGG AGCTTGGTAC TC                                      692(2)关于SEQ ID NO：34的信息(i)序列特征
(A)长度：1204个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性  (ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：肺炎链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：34：ATGGCGAAAA AACCAAAAAA ATTAGAAGAA ATTTCAAAAA AATTTGGGGC AGAACGTGAA        60AAGGCCTTGA ATGACGCTCT TAAATTGATT GAGAAAGACT TTGGTAAAGG ATCAATCATG       120CGTTTGGGTG AACGTGCGGA GCAAAAGGTG CAAGTGATGA GCTCAGGTTC TTTAGCTCTT       180GACATTGCCC TTGGCTCAGG TGGTTATCCT AAGGGACGTA TCATCGAAAT CTATGGCCCA       240GAGTCATCTG GTAAGACAAC GGTTGCCCTT CATGCAGTTG CACAAGCGCA AAAAGAAGGT       300GGGATTGCTG CCTTTATCGA TGCGGAACAT GCCCTTGATC CAGCTTATGC TGCGGCCCTT       360GGTGTCAATA TTGACGAATT GCTCTTGTCT CAACCAGACT CAGGAGAGCA AGGTCTTGAG       420ATTGCGGGAA AATTGATTGA CTCAGGTGCA GTTGATCTTG TCGTAGTCGA CTCAGTTGCT       480GCCCTTGTTC CTCGTGCGGA AATTGATGGA GATATCGGAG ATAGCCATGT TGGTTTGCAG       540GCTCGTATGA TGAGCCAGGC CATGCGTAAA CTTGGCGCCT CTATCAATAA AACCAAAACA       600ATTGCCATTT TTATCAACCA ATTGCGTGAA AAAGTTGGAG TGATGTTTGG AAATCCAGAA       660ACAACACCGG GCGGACGTGC TTTGAAATTC TATGCTTCAG TCCGCTTGGA TGTTCGTGGT       720AATACACAAA TTAAGGGAAC TGGTGATCAA AAAGAAACCA ATGTCGGTAA AGAAACTAAG       780ATTAAGGTTG TAAAAAATAA GGTAGCTCCA CCGTTTAAGG AAGCCGTAGT TGAAATTATG       840TACGGAGAAG GAATTTCTAA GACTGGTGAG CTTTTGAAGA TTGCAAGCGA TTTGGATATT       900ATCAAAAAAG CAGGGGCTTG GTATTCTTAC AAAGATGAAA AAATTGGGCA AGGTTCTGAG       960AATGCTAAGA AATACTTGGC AGAGCACCCA GAAATCTTTG ATGAAATTGA TAAGCAAGTC      1020CGTTCTAAAT TTGGCTTGAT TGATGGAGAA GAAGTTTCAG AACAAGATAC TGAAAACAAA      1080AAAGATGAGC CAAAGAAAGA AGAAGCAGTG AATGAAGAAG TTCCGCTTGA CTTAGGCGAT      1140GAACTTGAAA TCGAAATTGA AGAATAAGCT GTTAAAGCAG TGGAGAAATC CGCTACTTTT      1200TCGA                                                                   1204(2)关于SEQ ID NO：35的信息(i)序列特征
(A)长度：981个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：  酿脓链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：35：ATGCGTTCAG GAAGTCTAGC TCTTGATATT GCTTGGATAG CTGGTGGTTA TCCTAAAGGA        60CGTATCATCG AAATCTATGG TCCAGAGTCT TCCGGTAAAA CGACTGTGGC TTTACATGCT       120GTAGCACAAG CTCAAAAAGA AGGTGGAATC GCAGCCTTTA TCGATGCCGA GCATGCGCTT       180GATCCAGCTT ATGCTGCTGC GCTTGGGGTT AATATTGATG AACTTCTCTT GTCTCAACCA       240GATTCTGGAG AACAAGGACT TGAAATTGCA GGTAAATTGA TTGATTCTGG TGCGGTTGAC       300CTGGTTGTTG TCGATTCAGT AGCAGCTTTA GTGCCACGTG CTGAAATTGA TGGTGATATT       360GGCGATAGCC ATGTCGGATT GCAAGCACGT ATGATGAGTC AGGCCATGCG TAAATTATCA       420GCTTCTATTA ATAAAACAAA AACTATCGCA ATCTTTATCA ACCAATTGCG TGAAAAAGTT       480GGTGTGATGT TTGGAAATCC TGAAACAACA CCAGGTGGTC GAGCTTTGAA ATTCTATGCT       540TCTGTTCGGC TGGATGTGCG TGGAAACAAC CAAATTAAAG GAACTGGTGA CCAAAAGATA       600GCCAGCATTG GTAAGGAGAC CAAAATCAAG GTTGTTAAAA ACAAGGTCGC TCCGCCATTT       660AAGGTAGCAG AAGTTGAAAT CATGTATGGG GAAGGTATTT CTCGTACAGG GGAGCTTGTG       720AAAATTGCTT CTGATTTGGA CATTATCCAA AAAGCAGGTG CTTGGTTCTC TTATAATGGT       780GAGAAGATTG GCCAAGGTTC TGAAAATGCT AAGCGTTATT TGGCCGATCA TCCACAATTG       840TTTGATGAAA TCGACCGTAA AGTACGTGTT AAATTTGGTT TGCTTGAAGA AAGCGAAGAA       900GAATCTGCTA TGGCAGTAGC ATCAGAAGAA ACCGATGATC TTGCTTTAGA TTTAGATAAT       960GGTATTGAAA TTGAAGATTA A                                                 981(2)关于SEQ ID NO：36的信息(i)序列特征
(A)长度：312个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性  (ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：唾液链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：36：GCGTATGCAC GAGCTCTAGG TGTTAATATC GATGAGCTTC TTTTGTCGCA GCCTGATTCT     60GGTGAGCAAG GTCTCGAAAT TGCAGGTAAG CTGATTGACT CTGGTGCAGT GGATTTAGTT    120GTTGTTGACT CAGTTGCGGC CTTCGTACCA CGTGCAGAAA TTGATGGAGA TAGTGGTGAC    180AGTCATGTAG GACTTCAAGC GCGTATGATG AGTCAAGCCA TGCGTAAACT TTCTGCATCT    240ATTAATAAAA CAAAAACGAT TGCTATCTTT ATTAACCAGT TGCGTGAAAA AGTTGGTATC    300ATGTTTGGTA AC                                                        312(2)关于SEQ ID NO：37的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：37：CTATGTGGCG CGGTATTATC                                                20(2)关于SEQ ID NO：38的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：38：CGCAGTGTTA TCACTCATGG                                                20(2)关于SEQ ID NO：39的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性
(ii)分子类型：DNA(基因组)
(xi)序列描述：SEQ ID NO：39：CTGAATGAAG CCATACCAAA                                                20(2)关于SEQ ID NO：40的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：40：ATCAGCAATA AACCAGCCAG                                                  20(2)关于SEQ ID NO：41的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：41：TTACCATGAG CGATAACAGC                                                20(2)关于SEQ ID NO：42的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：42：CTCATTCAGT TCCGTTTCCC                                              20(2)关于SEQ ID NO：43的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：43：CAGCTGCTGC AGTGGATGGT                                                  20(2)关于SEQ ID NO：44的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：44：CGCTCTGCTT TGTTATTCGG                                                20(2)关于SEQ ID NO：45的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：45：TACGCCAACA TCGTGGAAAG                                              20(2)关于SEQ ID NO：46的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：46：TTGAATTTGG CTTCTTCGGT                                                20(2)关于SEQ ID NO：47的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：47：GGGATACAGA  AACGGGACAT                                               20(2)关于SEQ ID NO：48的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：48：TAAATCTTTT TCAGGCAGCG                                                20(2)关于SEQ ID NO：49的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：49：GATGGTTTGA AGGGTTTATT ATAAG                                          25(2)关于SEQ ID NO：50的信息(i)序列特征
(A)长度：25个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：50：AATTTAGTGT GTTTAGAATG GTGAT                                          25(2)关于SEQ ID NO：51的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：51：ACTTCAACAC CTGCTGCTTT C                                              21(2)关于SEQ ID NO：52的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：52：TGACCACTTT TATCAGCAAC C                                              21(2)关于SEQ ID NO：53的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：53：GGCAATAGTT GAAATGCTCG                                              20(2)关于SEQ ID NO：54的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：54：CAGCTGTTAC AACGGACTGG                                                20(2)关于SEQ ID NO：55的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：55：TCTATGATCT CGCAGTCTCC                                                20(2)关于SEQ ID NO：56的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：56：ATCGTCACCG TAATCTGCTT                                                20(2)关于SEQ ID NO：57的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：57：CATTCTCGAT TGCTTTGCTA                                                20(2)关于SEQ ID NO：58的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：58：CCGAAATGCT TCTCAAGATA                                                20(2)关于SEQ ID NO：59的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：59：CTGGATTATG GCTACGGAGT                                                20(2)关于SEQ ID NO：60的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：60：AGCAGTGTGA TGGTATCCAG                                                20(2)关于SEQ ID NO：61的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：61：GACTCTTGAT GAAGTGCTGG                                                20(2)关于SEQ ID NO：62的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：62：CTGGTCTATT CCTCGCACTC                                              20(2)关于SEQ ID NO：63的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：63：TATGAGAAGG CAGGATTCGT                                                20(2)关于SEQ ID NO：64的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：64：GCTTTCTCTC GAAGGCTTGT                                                20(2)关于SEQ ID NO：65的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：65：GAGTTGCTGT TCAATGATCC                                                20(2)关于SEQ ID NO：66的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：66：GTGTTTGAAC CATGTACACG                                                  20(2)关于SEQ ID NO：67的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：67：TGTAGAGGTC TAGCCCGTGT                                                  20(2)关于SEQ ID NO：68的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：68：ACGGGGATAA CGACTGTATG                                                  20(2)关于SEQ ID NO：69的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：69：ATAAAGATGA TAGGCCGGTG                                                  20(2)关于SEQ ID NO：70的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：70：TGCTGTCATA TTGTCTTGCC                                                  20(2)关于SEQ ID NO：71的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：71：ATTATCTTCG GCGGTTGCTC                                                20(2)关于SEQ ID NO：72的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：72：GACTATCGGC TTCCCATTCC                                                  20(2)关于SEQ ID NO：73的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：73：CGATAGAAGC AGCAGGACAA                                                  20(2)关于SEQ ID NO：74的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：74：CTGATGGATG CGGAAGATAC                                                  20(2)关于SEQ ID NO：75的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：75：GCCTTATGTA TGAACAAATG G                                           21(2)关于SEQ ID NO：76的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：76：GTGACTTTWG TGATCCCTTT TGA                                              23(2)关于SEQ ID NO：77的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：77：TCCAATCATT GCACAAAATC                                                  20(2)关于SEQ ID NO：78的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：78：AATTCCCTCT ATTTGGTGGT                                                  20(2)关于SEQ ID NO：79的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：79：TCCCAAGCCA GTAAAGCTAA                                                  20(2)关于SEQ ID NO：80的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：80：TGGTTTTTCA ACTTCTTCCA                                                  20(2)关于SEQ ID NO：81的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：81：TCATAGAATG GATGGCTCAA                                            20(2)关于SEQ ID NO：82的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：82：AGCTACTATT GCACCATCCC                                              20(2)关于SEQ ID NO：83的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：83：CAATAAGGGC ATACCAAAAA TC                                         22(2)关于SEQ ID NO：84的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：84：CCTTAACATT TGTGGCATTA TC                                           22(2)关于SEQ ID NO：85的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：85：TTGGGAAGAT GAAGTTTTTA GA                                           22(2)关于SEQ ID NO：86的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：86：CCTTTACTCC AATAATTTGG CT                                         22(2)关于SEQ ID NO：87的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：87：TTTCATCTAT TCAGGATGGG                                              20(2)关于SEQ ID NO：88的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：88：GGAGCAACAT TCTTTGTGAC                                            20(2)关于SEQ ID NO：89的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：89：TGTGCCTGAA GAAGGTATTG                                            20(2)关于SEQ ID NO：90的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：90：CGTGTTACTT CACCACCACT                                              20(2)关于SEQ ID NO：91的信息(i)序列特征
(A)长度：23个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：91：TATCTTATCG TTGAGAAGGG ATT                                          23(2)关于SEQ ID NO：92的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：92：CTACACTTGG CTTAGGATGA AA                                         22(2)关于SEQ ID NO：93的信息(i)序列特征
(A)长度：24个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：93：CTATCTGATT GTTGAAGAAG GATT                                         24(2)关于SEQ ID NO：94的信息(i)序列特征
(A)长度：24个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：94：GTTTACTCTT GGTTTAGGAT GAAA                                         24(2)关于SEQ ID NO：95的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：95：CTTGTTGATC ACGATAATTT CC                                         22(2)关于SEQ ID NO：96的信息(i)序列特征
(A)长度：22个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：96：ATCTTTTAGC AAACCCGTAT TC                                         22(2)关于SEQ ID NO：97的信息(i)序列特征
(A)长度：27个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：97：AACAGGTGAA TTATTAGCAC TTGTAAG                                      27(2)关于SEQ ID NO：98的信息(i)序列特征
(A)长度：27个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：98：ATTGCTGTTA ATATTTTTTG AGTTGAA                                    27(2)关于SEQ ID NO：99的信息(i)序列特征
(A)长度：19个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：99：GTGATCGAAA TCCAGATCC                                               19(2)关于SEQ ID NO：100的信息(i)序列特征
(A)长度：19个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：100：ATCCTCGGTT TTCTGGAAG                                               19(2)关于SEQ ID NO：101的信息(i)序列特征
(A)长度：19个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：101：CTGGTCATAC ATGTGATGG                                               19(2)关于SEQ ID NO：102的信息(i)序列特征
(A)长度：19个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：102：GATGTTACCC GAGAGCTTG                                               19(2)关于SEQ ID NO：103的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
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(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
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(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
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(A)长度：20个碱基对
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(A)名称/关键词：misc-feature
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(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：107：AAYATGATNA CNGGNGCNGC NCARATGGA                                    29(2)关于SEQ ID NO：108的信息(i)序列特征
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(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：108：CCNACNGTNC KNCCRCCYTC RCG                                          23(2)关于SEQ ID NO：109的信息(i)序列特征
(A)长度：29个碱基对
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(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：109：CARYTNATHG TNGCNGTNAA YAARATGGA                                  29(2)关于SEQ ID NO：110的信息(i)序列特征
(A)长度：831个碱基对
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(A)长度：846个碱基对
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(A)长度：555个碱基对
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(A)长度：732个碱基对
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(A)长度：735个碱基对
(B)类型：核酸
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(A)长度：1029个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：116：ATGAATAAAA TAAAAGTCGC AATTATCTTC GGCGGTTGCT CGGAGGAACA TGATGTGTCG     60GTAAAATCCG CAATAGAAAT TGCTGCGAAC ATTAATACTG AAAAATTCGA TCCGCACTAC    120ATCGGAATTA CAAAAAACGG CGTATGGAAG CTATGCAAGA AGCCATGTAC GGAATGGGAA    180GCCGATAGTC TCCCCGCCAT ATTCTCCCCG GATAGGAAAA CGCATGGTCT GCTTGTCATG    240AAAGAAAGAG AATACGAAAC TCGGCGTATT GACGTGGCTT TCCCGGTTTT GCATGGCAAA    300TGCGGGGAGG ATGGTGCGAT ACAGGGTCTG TTTGAATTGT CTGGTATCCC CTATGTAGGC    360TGCGATATTC AAAGCTCCGC AGCTTGCATG GACAAATCAC TGGCCTACAT TCTTACAAAA    420AATGCGGGCA TCGCCGTCCC CGAATTTCAA ATGATTGAAA AAGGTGACAA ACCGGAGGCG    480AGGACGCTTA CCTACCCTGT CTTTGTGAAG CCGGCACGGT CAGGTTCGTC CTTTGGCGTA    540ACCAAAGTAA ACAGTACGGA AGAACTAAAC GCTGCGATAG AAGCAGCAGG ACAATATGAT    600GGAAAAATCT TAATTGAGCA AGCGATTTCG GGCTGTGAGG TCGGCTGCGC GGTCATGGGA    660AACGAGGATG ATTTGATTGT CGGCGAAGTG GATCAAATCC GGTTGAGCCA CGGTATCTTC    720CGCATCCATC AGGAAAACGA GCCGGAAAAA GGCTCAGAGA ATGCGATGAT TATCGTTCCA    780GCAGACATTC CGGTCGAGGA ACGAAATCGG GTGCAAGAAA CGGCAAAGAA AGTATATCGG    840GTGCTTGGAT GCAGAGGGCT TGCTCGTGTT GATCTTTTTT TGCAGGAGGA TGGCGGCATC    900GTTCTAAACG AGGTCAATAC CCTGCCCGGT TTTACATCGT ACAGCCGCTA TCCACGCATG    960GCGGCTGCCG CAGGAATCAC GCTTCCCGCA CTAATTGACA GCCTGATTAC ATTGGCGATA   1020GAGAGGTGA                                                           1029(2)关于SEQ ID NO：117的信息(i)序列特征
(A)长度：1031个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：117：ATGAAAAAAA TTGCCGTTTT ATTTGGAGGG AATTCTCCAG AATACTCAGT GTCACTAACC      60TCAGCAGCAA GTGTGATCCA AGCTATTGAC CCGCTGAAAT ATGAAGTAAT GACCATTGGC     120ATCGCACCAA CAATGGATTG GTATTGGTAT CAAGGAAACC TCGCGAATGT TCGCAATGAT     180ACTTGGCTAG AAGATCACAA AAACTGTCAC CAGCTGACTT TTTCTAGCCA AGGATTTATA     240TTAGGAGAAA AACGAATCGT CCCTGATGTC CTCTTTCCAG TCTTGCATGG GAAGTATGGC     300GAGGATGGCT GTATCCAAGG ACTGCTTGAA CTAATGAACC TGCCTTATGT TGGTTGCCAT     360GTCGCTGCCT CCGCATTATG TATGAACAAA TGGCTCTTGC ATCAACTTGC TGATACCATG     420GGAATCGCTA GTGCTCCCAC TTTGCTTTTA TCCCGCTATG AAAACGATCC TGCCACAATC     480GATCGTTTTA TTCAAGACCA TGGATTCCCG ATCTTTATCA AGCCGAATGA AGCCGGTTCT     540TCAAAAGGGA TCACAAAAGT AACTGACAAA ACAGCGCTCC AATCTGCATT AACGACTGCT     600TTTGCTTACG GTTCTACTGT GTTGATCCAA AAGGCGATAG CGGGTATTGA AATTGGCTGC     660GGCATCTTAG GAAATGAGCA ATTGACGATT GGTGCTTGTG ATGCGATTTC TCTTGTCGAC     720GGTTTTTTTG ATTTTGAAGA GAAATACCAA TTAATCAGCG CCACGATCAC TGTCCCAGCA     780CCATTGCCTC TCGCGCTTGA ATCACAGATC AAGGAGCAGG CACAGCTGCT TTATCGAAAC     840TTGGGATTGA CGGGTCTGGC TCGAATCGAT TTTTTCGTCA CCAATCAAGG AGCGATTTAT     900TTAAACGAAA TCAACACCAT GCCGGGATTT ACTGGGCACT CCCGCTACCC AGCTATGATG     960GCGGAAGTCG GGTTATCCTA CGAAATATTA GTAGAGCAAT TGATTGCACT GGCAGAGGAG    1020GACAAACGAT G                                                         1031(2)关于SEQ ID NO：118的信息(i)序列特征
(A)长度：809个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Abiotrophia adiacens(xi)序列描述：SEQ ID NO：118：TGGTGCTATC TTAGTAGTAT CTGCAGCTGA TGGTCCAATG CCTCAAACAC GTGAACACAT    60CTTATTATCA CGTCAAGTAG GTGTTCCTTA CATCGTTGTA TTCTTAAACA AAGTTGACAT   120GGTTGACGAT GAAGAATTAT TAGAATTAGT AGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTATCAGA   180ATACGATTTC CCAGGCGATG ACACTCCAGT TGTTGCAGGT TCTGCTTTAC GCGCTTTAGA   240AGGCGACGCT TCATACRAAG AAAAAATCTT AGAATTAATG GCTGCTGTTG ACGAATACAT   300TCCAACTCCA GAACGYGACG TTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAAG ACGTGTTCTC   360AATCACAGGT CGTGGTACTG TTGCTACAGG TCGTGTTGAA CGTGGACAAG TTCGTGTTGG   420TGACGAAGTT GAAATCGTTG GTATTTCAGA AGAAACTTCA AAAACAACTG TAACTGGTGT   480TGAAATGTTC CGTAAATTGT TAGACTACGC TGAAGCAGGG GATAACATTG GTACATTATT   540ACGTGGTGTT ACACGTGACA ACATCGAACG TGGACAAGTT CTTGCTAAAC CAGGAACAAT   600CACTCCACAT ACTAAATTCA AAGCTGAAGT TTACGTATTA ACTAAAGAAG AAGGTGGACG   660TCATACTCCA TTCTTCTCTA ACTACCGTCC TCAATTCTAC TTCCGTACAA CAGACATCAC   720TGGTGTTTGT GTGTTACCAG AAGGCGTTGA AATGGTAATG CCTGGTGATA ACGTAACTAT   780GGAAGTTGAA TTAATTCACC CAGTAGCGA                                     809(2)关于SEQ ID NO：119的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Abiotrophia defectiva(xi)序列描述：SEQ ID NO：119：CGGCGCGATC CTCGTTGTAT CTGCTGCTGA CGGCCCAATG CCACAAACTC GTGAACACAT       60CCTCTTGTCT CGTCAAGTTG GTGTTCCTTA CATCGTAGTA TTCTTGAACA AAGTTGACAT      120GGTTGACGAC GAAGAATTGC TCGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACC TCTTGTCTGA      180ATACGACTTC CCAGGCGACG ACACTCCAGT TATCGCTGGT TCAGCTTTGA AAGCTTTAGA      240AGGCGACGCT AACTACGAAG CTAAAGTTTT AGAATTGATG GAACAAGTTG ATGCTTACAT      300TCCAGAACCA GAACGTGACA CTGACAAGCC ATTCATGATG CCAGTCGAAG ACGTATTCTC      360TATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCAACTGG TCGTGTTGAA CGTGGTCAAG TTCGCGTTGG      420TGACGAAGTT GAAATCGTTG GTATCGAAGA AGAAACTTCT AAGACTACCG TTACCGGTGT      480TGAAATGTTC CGTAAGTTAT TGGATTACGC TGAAGCTGGG GACAACGTTG GTACCTTGTT      540ACGTGGTGTA ACTCGTGACC AAATCCAACG TGGTCAAGTA TTATCTAAAC CAGGTTCAAT      600CACTCCGYAC ACTAAGTTCG AAGCTGAAGT GTACGTATTG TCTAAAGAAG AAGGTGGTCG      660TCACACTCCA TTCTTCTCTA ACTACCGTCC ACAATTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC      720TGGTGTTGTT ACTTTACCAG AAGGTACTGA AATGGTTATG CCAGGCGACA ACGTACAAAT      780GGTTGTTGAA TTGATCCACC CAATCGCGAT CGAAGAA                               817(2)关于SEQ ID NO：120的信息(i)序列特征
(A)长度：754个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：白假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：120：CTCTGTCAAA TGGGACAAAA ACAGATTTGA AGAAATCATC AAGGAAACCT CCAACTTCGT        60CAAGAAGGTT GGTTACAACC CAAAGACTGT TCCATTCGTT CCAATCTCTG GTTGGAATGG       120TGACAACWTG ATTGAASCAT CCACCAACTG TCCATGGTAC AAGGGTTGGG AAAAGGAAAC       180CAAATCCGGT AAAGTTACTG GTAAGACCTT GTTAGAAGCT ATTGACGCTA TTGAACCACC       240AACCAGACCA ACCGACAAAC CATTGAGATT GCCATTRCAA GATGTTTACA AGATCGGTGG       300TATTGGTACT GTGCCAGTCG GTAGAGTTGA AACTGGTATC ATCAAAGCCG GTATGGTWGT       360TACTTTCGCC CCAGCTGGTG TTACCACTGA AGTCAARTCC GTTGAAATGC ATCACGAACA       420ATTGGCTGAA GGTGTTCCAG GTGACAATGT TRGTTTCAAC GTTAAGAACR TTTCCGTTAA       480AGAAATTAGA AGAGGTAACG TTTGTGGTGA CTCCAAGAAC GATCCACCAA AGGGTTGTGA       540CTCTTTCAAT GCCCAAGTCA TTGTTTTGAA CCATCCAGGT CAAATCTCTG CTGGTTACTC     600TCCAGTCTTG GATTGTCACR CTGCCCACAT TGCTTGTAAA TTCGACRCTT TGGTTGAAAA     660GATTGACAGA AGAACTGGTA AGRAATTGGA AGAAAATCCA AAATTCGTCA AATCCGGTGA     720TGCTGCTATC GTCAAGATGG TCCCAACCAA ACCA                                 754(2)关于SEQ ID NO：121的信息(i)序列特征
(A)长度：753个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Candida glabrata(xi)序列描述：SEQ ID NO：121：TCTGTCAAGT GGGATGAATC CAGATTCGCT GAAATCGTTA AGGAAACCTC CAACTTCATC         60AAGAAGGTCG GTTACAACCC AAAGACTGTT CCATTCGTCC CAATCTCTGG TTGGAACGGT        120GACAACATGA TTGAAGCCAC CACCAACGCT TCCTGGTACA AGGGTTGGGA AAAGGAAACC        180AAGGCTGGTG TCGTCAAGGG TAAGACCTTG TTGGAAGCCA TTGACGCTAT CGAACCACCA        240ACCAGACCAA CTGACAAGCC ATTGAGATTG CCATTGCAAG ATGTCTACAA GATCGGTGGT        300ATCGGTACGG TGCCAGTCGG TAGAGTCGAA ACCGGTGTCA TCAAGCCAGG TATGGTTGTT        360ACCTTCGCCC CAGCTGGTGT TACCACTGAA GTCAAGTCCG TTGAAATGCA CCACGAACAA        420TTGACTGAAG GTTTGCCAGG TGACAACGTT GGTTTCAACG TTAAGAACGT TTCCGTTAAG        480GAAATCAGAA GAGGTAATGT CTGTGGTGAC TCCAAGAACG ACCCACCAAA GGCTGCTGCT        540TCTTTCAACG CTACCGTCAT TGTCTTGAAC CACCCAGGTC AAATCTCTGC TGGTTACTCT        600CCAGTTTTGG ACTGTCACAC CGCCCACATT GCTTGTAAGT TCGAAGAATT GTTGGAAAAG        660AACGACAGAA GATCCGGTAA GAAGTTGGAA GACTCTCCAA AGTTCTTGAA GTCCGGTGAC        720GCTGCTTTGG TTAAGTTCGT TCCATCCAAG CCA                                     753(2)关于SEQ ID NO：122的信息  (i)序列特征
(A)长度：752个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：克鲁斯假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：122：CCGTTAAGTG GGATGAAAAC AGATTTGAAG AAATTGTCAA GGAAACCCAA AACTTCATCA     60AGAAGGTTGG TTACAACCCA AAGACTGTTC CATTCGTTCC AATCTCTGGT TGGAATGGTG    120ACAACATGAT TGAAGCATCC ACCAACTGTC CATGGTACAA GGGTTGGACT AAGGAAACCA    180AGGCAGGTGT TGTTAAGGGT AAGACCTTAT TAGAAGCAAT CGATGCTATT GAACCACCTG    240TCAGACCAAC CGAAAAGCCA TTAAGATTAC CATTACAAGA TGTTTACAAG ATTGGTGGTA    300TTGGTACTGT GCCAGTCGGT AGAGTCGAAA CCGGTGTCAT TAAGCCAGGT ATGGTTGTCA    360CTTTTGCTCC AGCAGGTGTC ACCACCGAAG TCAAATCCGT TGAAATGCAC CATGAACAAT    420TAGAACAAGG TGTTCCAGGT GATAACGTTG GTTTCAACGT TAAGAACGTY TCTGTCAAGG    480ATATCAAGAG AGGTAACGTT TGTGGTGACT CCAAGAACGA CCCACCAATG GGTGCAGCTT    540CTTTCAATGC TCAAGTCATT GTCTTGAACC ACCCTGGTCA AATTTCCGCT GGTTACTCTC    600CAGTCTTGGA TTGTCACACT GCCCACATTG CATGTAAGTT CGACGAATTA ATCGAAAAGA    660TTGACAGAAG AACTGGTAAG TCTGTTGAAG ACCATCCAAA GTCYGTCAAG TCTGGTGATG    720CAGCTATCGT CAAGATGGTC CCAACCAAGC CA                                  752(2)关于SEQ ID NO：123的信息(i)序列特征
(A)长度：754个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)  (vi)来源：
(A)生物：近平滑假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：123：CTCAGTCAAA TGGGACAAGA RCAGATACGA AGAAATTGTC AAGGAAACTT CCAACTTCGT     60CAAGAAGGTT GGTTACAACC CTAAAGCTGT CCCATTCGTC CCAATCTCTG GTTGGAACGG    120TGACAATATG ATTGAACCAT CAACCAACTG TCCATGGTAC AAGGGTTGGG AAAAGGAAAC    180TAAAGCTGGT AAGGTTACCG GTAAGACCTT GTTGGAAGCT ATCGATGCTA TCGARCCACC    240AACCAGACCA ACTGACAAGC CATTGAGATT GCCATTGCAA GATGTCTACA AGATTGGTGG    300TATTGGAACT GTGCCAGTTG GTAGAGTTGA AACCGGTATC ATCAAGGCTG GTATGGTTGT    360TACTTTTGCC CCAGCTGGTG TTACCACTGA AGTCAAGTCC GTTGAAATGC ACCACGAACA    420ATTGACTGAA GGTGTCCCAG GTGACAATGT TGGTTTCAAC GTCAAGAACG TTTCAGTTAA    480GGAAATCAGA AGAGGTAACG TYTGTGGTGA CTCCAAGAAC GATCCACCAA AGGGATGTGA    540YTCCTTCAAT GCTCAAGTTA TTGTCTTGAA CCACCCAGGT CAAATCTCTG CTGGTTACTC    600ACCAGTCTTG GATTGTCACA CTGCCCACAT TGCTTGTAAA TTCGACACTT TGATTGAAAA    660GATTGACAGA AGAACCGGTA AGAAATTGGA AGWTGAACCA AAATTCATCA AGTCCGGTGA    720TGCTGCYATC GTCAAGATGG TCCCAACCAA GCCA                                754(2)关于SEQ ID NO：124的信息(i)序列特征
(A)长度：753个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：热带假丝酵母(xi)序列描述：SEQ ID NO：124：TCTGTTAAAT GGGACAARAA CAGATTTGAA GAAATTATCA AGGAAACYTC TAACTTCGTC         60AAGAAGGTTG GTTACAACCC TAAGGCTGTT CCATTCGTTC CAATCTCWGG TTGGAATGGT        120GACAACATGA TTGAAGCTTC TACCAACTGT CCATGGTACA AGGGTTGGGA AAAAGAAACC        180AAGGCTGGTA AGGTTACCGG TAAGACTTTG TTGGAAGCCA TTGATGCTAT TGAACCACCT        240TCAAGACCAA CTGACAAGCC ATTGAGATTG CCATTGCAAG ATGTTTACAA GATTGGTGGT      300ATTGGTACTG TGCCAGTCGG TAGAGTTGAA ACTGGTGTCA TCAAAGCCGG TATGGTTGTT      360ACTTTYGCCC CAGCTGGTGT TACCACTGAA GTCAAATCCG TYGAAATGCA CCACGAACAA      420TTGGCTGAAG GTGTCCCAGG TGACAATGTT GGTTTCAACG TTAAGAACGT TTCTGTTAAA      480GAAATTAGAA GAGGTAACGT TTGTGGTGAC TCCAAGAACG ATCCACCAAA GGGTTGTGAC      540TCTTTCAACG CTCAAGTTAT TGTCTTGAAC CACCCAGGTC AAATYTCTGC TGGTTACTCT      600CCAGTCTTGG ATTGTCACAC TGCTCATATT GCTTGTAAAT TCGACACCTT GGTTGAAAAG      660ATTGACAGAA GAACTGGTAA GAAATTGGAA GAAAATCCAA AATTCGTCAA ATCCGGTGAT      720GCTGCTATTG TCAAGATGGT TCCAACCAAA CCA                                   753(2)关于SEQ ID NO：125的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：拥挤棒杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：125：CGGCGCTATC CTGGTTGTTG CTGCAACCGA TGGCCCGATG CCGCAGACCC GCGAGCACGT     60TCTGCTTGCT CGCCAGGTTG GCGTTCCTTA CATCCTCGTT GCACTGAACA AGTGCGACAT    120GGTTGATGAT GAGGAAATCA TCGAGCTCGT GGAGATGGAG ATCTCCGAGC TGCTCGCAGA    180GCAGGACTAC GATGAGGAAG CTCCTATCGT TCACATCTCC GCTCTGAAGG CACTCGAGGG    240TGACGAGAAG TGGGTACAGT CCATCGTTGA CCTGATGGAT GCCTGCGACA ACTCCATCCC    300TGATCCGGAG CGCGCTACCG ATCAGCCGTT CTTGATGCCT ATCGAGGACA TCTTCACCAT    360TACCGGCCGC GGTACCGTTG TTACCGGCCG TGTTGAGCGT GGTCGTCTGA ACGTCAACGA    420GGACGTTGAG ATCATCGGTA TCCAGGAGAA GTCCCAGAAC ACCACCGTTA CCGGTATCGA    480GATGTTCCGC AAGATGATGG ACTACACCGA GGCTGGCGAC AACTGTGGTC TGCTTCTGCG    540TGGTACCAAG CGTGAGGACG TTGAGCGTGG CCAGGTTGTT ATCAAGCCGG GCGCTTACAC     600CCCTCACACC AAGTTCGAGG GTTCCGTCTA CGTCCTGAAG AAGGAAGAGG GCGGCCGCCA     660CACCCCGYTC ATGAACAACT ACCGTCCTCA GTTCTACTTC CGCACCACCG ACGTTACCGG     720TGTTGTGAAC CTGCCTGAGG GCACCGAGAT GGTTATGCCT GGCGACAACG TTGAGATGTC     780TGTTGAGCTC ATCCAGCCTG TTGCTATGGA CGAG                                 814(2)关于SEQ ID NO：126的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：白喉棒杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：126：CGGCGCAATC CTCGTTGTTG CTGCCACCGA CGGCCCAATG CCTCAGACCC GTGAGCACGT     60TCTGCTCGCT CGCCAGGTCG GCGTTCCTTA CATCCTCGTT GCTCTGAACA AGTGCGACAT    120GGTTGATGAT GAGGAAATCA TCGAGCTCGT CGAGATGGAG ATCCRTGAGC TGCTCGCTGA    180GCAGGATTAC GACGAAGAGG CTCCAATCAT CCACATCTCC GCACTGAAGG CTCTTGAGGG    240CGACGAGAAG TGGACCCAGT CCATCATCGA CCTCATGCAG GCTTGCKATG ATTCCATCCC    300AGACCCAGAG CGTGAGACCG ACAAGCCATT CCTCATGCCT ATCGAGGACA TCTTCACCAT    360CACCGGCCGC GGTACCGTTG TTACCGGCCG TGTTGAGCGT GGCTCCCTGA AGGTCAACGA    420GGACGTCGAG ATCATCGGTA TCCGCGAGAA KGCTACCACC ACCACCGTTA CCGGTATCGA    480GATGTTCCGT AAGCTTCTCG ACTACACCGA GGCTGGCGAC AACTGTGGTC TGCTTCTCCG    540TGGCGTTAAG CGCGAAGACG TTGAGCGTGG CCAGGTTGTT GTTAAGCCAG GCGCTTACAC    600CCCTCACACC GAGTTCGAGG GCTCTGTCTA CGTTCTGTCC AAGGACGAGG GTGGCCGCCA    660CACCCCATTC TTCGACAACT ACCGCCCACA GTTCTACTTC CGCACCACCG ACGTTACCGG    720TGTTGTGAAG CTTCCTGAGG GCACCGAGAT GGTCATGCCT GGCGACAACG TCGACATGTC    780CGTCACCCTG ATCCAGCCTG TCGCTATGGA TGAG                                814(2)关于SEQ ID NO：127的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Corynebacterium genitalium(xi)序列描述：SEQ ID NO：127：CGGCGCCATC CTGGTTGTTG CTGCAACCGA TGGCCCGATG CCGCAGACCC GTGAGCACGT      60TCTGCTGGCT CGCCAGGTTG GCGTTCCGTA CATCCTAGTT GCACTGAACA AGTGCGACAT     120GGTTGATGAT GAGGAGCTGC TGGAGCTCGT CGAGATGGAG GTCCGCGAGC TGCTGGCTGA     180GCAGGACTTC GACGAGGAAG CACCTGTTGT TCACATCTCC GCACTGAAGG CCCTGGAGGG     240CGACGAGAAG TGGGCTAAGC AGATCCTGGA GCTCATGGAG GCTTGCGACA ACTCCATCCC     300GGATCCGGAG CGCGAGACCG ACAAGCCGTT CCTGATGCCG GTTGRGGACA TCTTCACCAT     360TACCGGCCGC GGTACCGTTG TTACCGGCCG TGTTGAGCGT GGCGTCCTGA ACCTGAACGA     420CGAGGTCGAG ATCCTGGGCA TCCGCGAGAA GTCCACCAAG ACCACCGTTA CCTCCATCGA     480GATGTTCAAC AAGCTGCTGG ACACCGCAGA GGCTGGCGAC AACGCCGCAC TGCTGCTGCG     540TGGCCTGAAG CGCGAAGATG TTGAGCGTGG TCAGATCGTT GCTAAGCCGG GCGAGTACAC     600CCCGCACACC GAGTTCGAGG GCTCCGTCTA CGTTCTGTCC AAGGACGAGG GTGGCCGCCA     660CACCCCGTTC TTCGACAACT ACCGTCCGCA GTTCTATTTC CGCACCACCG ACGTTACCGG     720TGTTGTGAAG CTGCCGGAGG GCACCGAGAT GGTTATGCCG GGCGACAACG TTGACATGTC     780CGTCACCCTG ATCCAGCCGG TTGCTATGGA CGAG                                 814(2)关于SEQ ID NO：128的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：杰氏棒杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：128：CGGCGCCATC CTGGTTGTTG CCGCAACCGA TGGCCCGATG CCGCAGACCC GCGAGCACGT     60TCTGCTGGCY CGCCAGGTTG GCGTTCCGTA CATCCTGGTT GCACTGAACA AGTGTGACAT    120GGTTGACGAT GAGGAGCTGC TGGAGCTCGT CGAGATGGAG GTCCGCGAGC TGCTGGCTGA    180GCAGGACTTC GACGAGGAAG CTCCGGTTGT TCACATCTCC GCACTGAAGG CCCTGGAGGG    240CGACGAGAAG TGGGCTAACC AGATTCTCGA GCTGATGCAG GCTTGCGACG AGTCTATCCC    300GGATCCGGAG CGCGAGACCG ACAAGCCGTT CCTGATGCCG GTTGWGGACA TCTTCACCAT    360TACCGGTCGC GGTACCGTTG TTACCGGCCG TGTTGAGCGT GGCATCCTGA ACCTGAACGA    420CGAGGTTGAG ATCCTGGGTA TCCGCGAGAA GTCCCAGAAG ACCACCGTTA CCTCCATCGA    480GATGTTCAAC AAGCTGCTGG ACACCGCAGA GGCTGGCRAC AACGCTGCAC TGCTGCTGCG    540TGGTCTGAAG CGCGAGGACG TTGAGCGTGG CCAGATCATC GCTAAGCCGG GCGAGTACAC    600CCCGCACACC GAGTTCGAGG GCTCCGTCTA CGTTCTGTCC AAGGACGAGG GCGGCCGCCA    660CACCCCGTTC TTCGACAACT ACCGTCCGCA GTTCTACTTC CGCACCACCG ACGTTACCGG    720TGTTGTGAAG CTGCCTGAGG GCACCGAGAT GGTTATGCCG GGCGACAACG TYGACATGTC    780CGTCACCCTG ATCCAGCCGG TTGCTATGGA CGAG                                814(2)关于SEQ ID NO：129的信息(i)序列特征
(A)长度：748个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：假结核棒杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：129：CGGCGCTATC TTGGTTGTTG CAGCTACCGA CGGCCCAATG CCACAGACTC GCGAGCACGT        60TCTGCTGGCT CGCCAGGTTG GCGTTCCTTA CATCCTGGTT GCACTAAACA AGTGCGACAT       120GGTTGACGAC GAGGAAATCC TCGAGCTCGT CGAGATGGAG ATCCGCGAAT TGCTGGCTGA       180CCAGGAATTC GACGAAGAAG CTCCAATCGT TCACATCTCC GCAGTCGGCG CCTTGGAAGG       240CGAAGAGAGG TGGGTTAACG CCATCGTTGA ACTGATGGAT GCTTGTGACG AGTCGATCCC       300TGATCCAGAC CGTGCTACCG ACAAGCCATT CCTGATGCCT ATCGAGGACA TCTTCACCAT       360TACCGGTCGT GGCACCGTTG TTACGGGTCG TGTTGAGCGT GGTTCCCTGA AGGTCAACGA       420AGAAGTCGAG ATCATCGGCA TCAAGGAAAA GTCCCAGAAG ACCACCATCA CCGGTATCGA       480AATGTTCCGC AAGATGCTGG ACTACACCGA GGCCGGCGAC AACGCTGGTC TGCTGCTTCG       540CGGTACCAAG CGTGAAGACG TTGAGCGTGG ACAGGTTATC GTTGCTCCAG GTGCTTACAG       600CACCCACAAG AAGTTCGAAG GTTCCGTCTA CGTTCTTTCC AAGGACGAGG GCGGCCGCCA       660CACCCCGTTC TTCGACAACT ACCGTCCTCA GTTCTACTTC CGCACCACCG ACGTTACCGG       720TGTTGTTACC CTGCCTGAGG GCACCGAG                                          748(2)关于SEQ ID NO：130的信息(i)序列特征
(A)长度：813个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：纹带棒杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：130：GGCGCTATCT TGGTTGTTGC TGCAACCGAT GGCCCGRTGC CGCAGACCCG CGAGCACGTT      60CTTCTGGCTC GCCAGGTTGG CGTTCCTTAC ATCCTCGTTG CACTGAACAA GTGCGACATG     120GTTGACGACG AGGAAATTAT CGAGCTCGTC GAGATGGAGA TCCGCGAACT GCTCGCAGAG     180CAGGACTACG ATGAGGAAGC TCCGATCGTT CACATCTCTG CTCTGAAGGC TCTTGAGGGC     240GRCGAGAAGT GGGTACAGGC TATCGTTGAC CTGATGCAGG CTTGCGATGA CTCCATCCCG     300GATCCGGAGC GCGAGCTGGA CAAGCCGTTC CTGATGCCAA TCGAGGACAT CTTCACCATC     360ACCGGCCGCG GTACCGTTGT TACTGGCCGT GTTGAGCGTG GCTCCCTGAA CGTCAACGAG       420GACGTTGAGA TCATCGGTAT CCAGGACARG TCCATCTCCA CCACCGTTAC CGGTATCGAG       480ATGYTCCGCA AGATGATGGA CTACACCGAG GCTGGCGACA ACTGTGGTCT GCTTCTGCGT       540GGTACCAAGC GTGAAGAGGT TGAGCGCGGC CAGGTTGTTA TTAAGCCGGG CGCTTACACC       600CCTCACACCC AGTTCGAGGG TTCCGTCTAC GTCCTGAAGA AGGAAGAGGG CGGCCGCCAC       660ACCCCGTTCA TGGACAACTA CCGTCCGCAG TTCTACTTCC GCACCACCGA CGTTACCGGC       720GTCATCAAGC TGCCTGAGGG CACCGAGATG GTTATGCCTG GCGACAACGT CGAGATGTCY       780GTCGAGCTGA TCCAGCCGGT CGCTATGGAC GAG                                    813(2)关于SEQ ID NO：131的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：鸟肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：131：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGCCCTATG CCTCAAACTC GTGAACACAT      60CTTGTTATCT CGTAACGTTG GTGTTCCTTA CATCGTTGTA TTCTTAAACA AAATGGATAT     120GGTTGACGAT GAAGAATTAC TTGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTAACTGA     180ATACGACTTC CCAGGCGACG ACACTCCAGT TATCGCAGGT TCAGCGTTGA AAGCTTTAGA     240AGGCGACGCT TCATACGAAG AAAAAATCTT AGAATTAATG GCTGCTGTTG ACGAATATAT     300CCCAACACCA GTTCGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTCGAAG ACGTATTCTC     360AATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCAACTGG TCGTGTTGAA CGTGGACAAG TTCGCGTTGG     420TGACGAAGTT GAAATCGTAG GTATCGCTGA CGAAACTGCT AAAACAACTG TTACAGGTGT     480TGAAATGTTC CGTAAATTGT TAGACTACGC TGAAGCAGGT GACAACATCG GTGCTTTGTT     540ACGTGGTGTT GCACGTGAAG ATATCCAACG TGGACAAGTA TTGGCTAAAC CAGCTTCAAT     600CACTCCACAT ACAAAATTCT CTGCAGAAGT TTATGTTCTA ACTAAAGAAG AAGGTGGACG     660TCATACTCCA TTCTTCACTA ACTACCGTCC TCAGTTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC    720TGGTGTAGTT GATCTACCAG AAGGTACTGA AATGGTWATG CCTGGGGATA ACGTAACTAT    780GGAAGTTGAA TTGATYCACC CAATYGCGGT AGAAGAC                             817(2)关于SEQ ID NO：132的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：粪肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：132：CGGAGCTATC TTAGTAGTTT CTGCTGCTGA TGGTCCTATG CCTCAAACAC GTGAACATAT        60CTTATTATCA CGTAACGTTG GTGTACCATA CATCGTTGTA TTCTTAAACA AAATGGATAT       120GGTTGATGAC GAAGAATTAT TAGAATTAGT AGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTATCAGA       180ATACGATTTC CCAGGCGATG ATGTTCCAGT TATCGCAGGT TCTGCTTTGA AAGCTTTAGA       240AGGCGACGAG TCTTATGAAG AAAAAATCTT AGAATTAATG GCTGCAGTTG ACGAATATAT       300CCCAACTCCA GAACGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTCGAAG ACGTATTCTC       360AATCACTGGA CGTGGTACTG TTGCTACAGG ACGTGTTGAA CGTGGTGAAG TTCGCGTTGG       420TGACGAAGTT GAAATCGTTG GTATTAAAGA CGAAACATCT AAAACAACYG TTACAGGTGT       480TGAAATGTTC CGTAAATTAT TAGACTACGC TGAAGCAGGC GACAACMTCG GTGCTTTATT       540ACGTGGTGTA GCACGTGAAG ATATCGAACG TGGACAAGTA TTAGCTAAAC CAGCTACAAT       600CACTCCACAC ACAAAATTCA AAGCTGAAGT ATACGTATTA TCAAAAGAAG AAGGCGGACG       660TCACACTCCA TTCTTCACTA ACTACCGTCC TCAATTCTAC TTCCGTACAA CAGACGTTAC       720TGGTGTTGTA GAATTGCCAG AAGGTACTGA AATGGTAATG CCTGGTGATA ACGTTGCTAT       780GGACGTTGAA TTAATTCACC CAATCGCTAT CGAAGAC                                817(2)关于SEQ ID NO：133的信息(i)序列特征
(A)长度：774个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：屎肠球菌
(xi)序列描述：SEQ ID NO：133：CGGAGCTATC TTGGTAGTTT CTGCTGCTGA CGGCCCAATG CCTCAAACTC GTGAACACAT        60CCTATTGTCT CGTCAAGTTG GTGTTCCTTA CATCGTTGTA TTCTTGAACA AAGTAGACAT       120GGTTGATGAC GAAGAATTAC TAGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACC TATTAACAGA       180ATACRAATTC CCTGGTGRCG ATGTTCCTGT AGTTGCTGGA TCAGCTTTGA AAGCTCTAGA       240AGGCGACGCT TCATACGAAG AAAAAATTCT TGAATTAATG GCTGCAGTTG ACGAATACAT       300CCCAACTCCA GAACGTGACA ACGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAAG ACGTGTTCTC       360AATTACTGGA CGTGGTACTG TTGCTACAGG TCGTGTTGAA CGTGGACAAG TTCGCGTTGG       420TGACGAAGTT GAAGTTGTTG GTATTGCTGA AGAAACTTCA AAAACAACAG TTACTGGTGT       480TGAAATGTTC CGTAAATTGT TAGACYACGC TGAAGCTGGA GACRACATTG GTGCTTTACT       540ACGTGGTGTT GCACGTGAAG ACATCCAACG TGGACAAGTT TTAGCTAAAC CAGGTACAAT       600CACACCTCRT ACAAAATTCT CTGCAGAAGT ATACGTGTTG ACAAAAGAAG AAGGTGGACG       660TCATACTCCA TTCTTCACTA ACTACCGTCC ACAATTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC       720AGGTGTTGTT GAATTACCAG AAGGAACTGA AATGGTCATG CCCGGTGACA ACGT             774(2)关于SEQ ID NO：134的信息(i)序列特征
(A)长度：809个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：鹑鸡肠球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：134：CGGTGCGATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA CGGTCCTATG CCTCAAACTC GTGAACACAT        60CTTGTTATCA CGTAACGTTG GCGTACCATA CATCGTTGTT TTCTTGAACA AAATGGATAT       120GGTTGAYGAC GAAGAATTGC TAGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACC TATTGTCTGA       180ATATGACTTC CCAGGCGACG ATGTTCCTGT AATCGCCGGT TCTGCTTTGA AAGCTCTTGA       240AGGAGATCCT TCATACGAAG AAAAAATCAT GGAATTGATG GCTGCAGTTG ACGAATACGT       300TCCAACTCCA GAACGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTCGAAG ACGTATTCTC       360AATCACTGGA CGTGGTACTG TTGCTACAGG CCGTGTTGAA CGTGGACAAG TTCGCGTTGG       420TGATGAAGTA GAAATCGTTG GTATTGCTGA CGAAACTGCT AAAACAACTG TAACAGGTGT       480TGAAATGTTC CGTAAATTGT TAGACTATGC TGAAGCAGGG GATAACATTG GTGCATTGCT       540ACGTGGGGTT GCTCGTGAAG ACATCCAACG TGGACAAGTA TTGGCTAAAG CTGGTACAAT       600CACACCTCAT ACAAAATTCA AAGCTGAAGT TTATGTTTTG ACAAAAGAAG AAGGTGGACG       660TCACACTCCA TTCTTCACTA ACTACCGTCC TCAGTTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC       720TGGTGTTGTT GAATTACCAG AAGGAACTGA AATGGTGATG CCTGGCGACA ACGTGACCAT       780CGACGTTGAA TTGATRCACC CAATCGCTC                                         809(2)关于SEQ ID NO：135的信息(i)序列特征
(A)长度：823个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：阴道加德纳氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：135：TGGCGCAATC CTCGTGGTTG CTGCTACCGA CGGTCCAATG GCTCAGACCC GTGAACACGT     60CTTGCTTGCT AAGCAGGTCG GCGTTCCAAA AATTCTTGTT GCTTTGAACA AGTGCGATAT    120GGTTGACGAC GAAGAGCTTA TCGATCTCGT TGAAGAAGAG GTCCGTGACC TCCTCGAAGA    180AAACGGCTTC GATCGCGATT GCCCAGTCYT CCGTACTTCC GCTTACGGCG CTTTGCATGA    240TGACGCTCCA GACCACGACA AGTGGGTAGA GACCGTCAAG GAACTCATGA AGGCTGTTGA    300CGAGTACATC CCAACCCCAA CTCACGATCT TGACAAGCCA TTCTTGATGC CAATCGAAGA    360TGTGTTCACC ATCTCCGGTC GTGGTYCCGT TGTCACCGGT CGTGTTGAGC GTGGTAAGCT    420CCCAATCAAC ACCCCAGTTG AGATCGTTGG TTTGCGCGAT ACCCAGACCA CCACCGTCAC    480CTCTATCGAG ACCTTCCACA AGCAGATGGA TGAGGCAGAG GCTGGCGATA ACACTGGTCT    540TCTTCTCCGC GGTATCAACC GTACCGACGT TGAGCGTGGT CAGGTTGTGG CTGCTCCAGG    600TTCTGTGACT CCACACACCA AGTTCGAAGG CGAAGTTTAC GTCTTGACCA AGGACGAAGG    660TGGCCGTCAC TCGCCATTCT TCTCCAACTA CCGTCCACAG TTCTACTTCC GTACCACCGA    720TGTTACTGGC GTTATCACCT TGCCAGACGG CATCGAAATG GTTCAGCCAG GCGATCACGC    780AACCTTCACT GTTGAGTTGA TCCAGGCTAT CGCAATGGAA GAG                      823(2)关于SEQ ID NO：136的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：无害利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：136：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGCCCAATG CCACAAACTC GTGAACATAT     60CTTACTTTCA CGTCAAGTTG GTGTTCCATA CATCGTTGTA TTCATGAACA AATGTGACAT    120GGTTGACGAT GAAGAATTAC TAGAATTAGT TGAAATGGAA ATTCGTGATC TATTAACTGA    180ATATGAATTC CCTGGCGATG ACATTCCTGT AATCAAAGGT TCAGCTCTTA AAGCACTTCA    240AGGTGAAGCT GACTGGGAAG CTAAAATTGA CGAGTTAATG GAAGCTGTAG ATTCTTACAT    300TCCAACTCCA GAACGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ATGTATTCTC    360AATCACTGGT CGTGGAACAG TTGCAACTGG ACGTGTTGAA CGTGGACAAG TTAAAGTTGG    420TGACGAAGTA GAAGTTATCG GTATTGAAGA AGAAAGCAAA AAAGTAGTAG TAACTGGAGT    480AGAAATGTTC CGTAAATTAC TAGACTACGC TGAAGCTGGC GACAACATTG GCGCACTTCT    540ACGTGGTGTT GCTCGTGAAG ATATCCAACG TGGTCAAGTA TTAGCTAAAC CAGGTTCGAT    600TACTCCACAC ACTAACTTCA AAGCTGAAAC TTATGTTTTA ACTAAAGAAG AAGGTGGACG    660TCACACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGCCC ACAATTCTAT TTCCGTACTA CTGACGTAAC    720TGGTATTGTT ACACTTCCAG AAGGTACTGA AATGGTAATG CCTGGTGATA ACATTGAGCT    780TGCAGTTGAA CTAATTGCAC CAATCGCTAT CGAAGAC                             817(2)关于SEQ ID NO：137的信息(i)序列特征
(A)长度：818个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：伊氏利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：137：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGTCCAATG CCACAAACTC GTGAACATAT     60TCTTACTTTC ACGTCAAGTT GGTGTTCCAT ACATCGTTGT ATTCATGAAC AAATGTGACA    120TGGTTGACGA TGAAGAATTA CTTGAATTAG TTGAAATGGAAATTCGTGAT CTATTAACTG     180AATATGAATT CCCTGGCGAC GACATTCCTG TAATCAAAGG TTCAGCTCTT AAAGCACTTC    240AAGGTGAAGC TGATTGGGAA GCTAAAATTG ACGAGTTAAT GGAAGCTGTA GATTCTTACA    300TTCCAACTCC AGAACGTGAT ACTGACAAAC CATTCATGAT GCCAGTTGAG GATGTATTCT    360CAATCACTGG TCGTGGAACA GTTGCAACTG GACGTGTTGA ACGTGGACAA GTTAAAGTTG    420GTGACGAAGT AGAAGTTATC GGTATTGAAG AAGAAAGCAA AAAAGTAGTA GTAACTGGAG    480TAGAAATGTT CCGTAAATTA CTAGACTACG CTGAAGCTGG CGACAACATT GGCGCACTTC    540TACGTGGTGT TGCTCGTGAA GATATCCAAC GTGGTCAAGT ATTAGCTAAA CCAGGTTCGA    600TTACTCCACA TACTAACTTC AAAGCTGAAA CTTATGTTTT AACTAAAGAA GAAGGTGGAC    660GTCATACTCC ATTCTTCAAC AACTACCGCC CACAATTCTA TTTCCGTACT ACTGACGTAA    720CTGGTATTGT TACACTTCCA GAAGGTACTG AAATGGTAAT GCCTGGTGAT AACATTGAGC    780TTGCAGTTGA ACTAATTGCA CCAATCGCTA TCGAAGAC                            818(2)关于SEQ ID NO：138的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：单核细胞增生利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：138：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGCCCAATG CCACAAACTC GTGAACATAT     60CTTACTTTCA CGTCAAGTTG GTGTTCCATA CATCGTTGTA TTCATGAACA AATGTGACAT    120GGTTGACGAT GAAGAATTAC TAGAATTAGT TGAAATGGAA ATTCGTGATC TATTAACTGA    180ATATGAATTC CCTGGCGATG ACATTCCTGT AATCAAAGGT TCAGCTCTTA AAGCACTTCA    240AGGTGAAGCT GACTGGGAAG CTAAAATTGA CGAGTTAATG GAAGCTGTAG ATTCTTACAT    300TCCAACTCCW GAACGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ATGTATTCTC    360AATCACTGGT CGTGGAACAG TTGCAACTGG ACGTGTTGAA CGTGGACAAG TTAAAGTTGG    420TGACGAAGTA GAAGTTATCG GTATCGAAGA AGAAAGCAAA AAAGTAGTAG TAACTGGAGT    480AGAAATGTTC CGTAAATTAC TAGACTACGC TGAAGCTGGC GACAACATTG GCGCACTTCT    540ACGTGGTGTT GCTCGTGAAG ATATCCAACR TGGTCAAGTA TTAGCTAAAC CAGGTTCGAT    600TACTCCACAC ACTAACTTCA AAGCTGAAAC TTATGTTTTA ACTAAAGAAG AAGGTGGACG    660TCACACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGCCC ACAATTCTAT TTCCGTACTA CTGACGTAAC    720TGGTATTGTT ACACTTCCAG AAGGTACTGA AATGGTAAYG CCTGGTGATA ACATTGAGCT    780TGCAGTTGAA CTAATTGCAC CAATCGCTAT CGAAGAC                             817(2)关于SEQ ID NO：139的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：斯氏利斯特氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：139：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGCCCAATG CCACAAACTC GTGAACATAT     60CTTACTTTCA CGTCAAGTTG GTGTTCCATA CATCGTTGTA TTCATGAACA AATGTGACAT    120GGTTGACGAT GAAGAATTAC TTGAATTAGT TGAAATGGAA ATTCGTGATC TATTAACTGA    180ATATGAATTC CCTGGTGATG ACATTCCTGT AATCAAAGGT TCAGCTCTTA AAGCACTTCA    240AGGTGAAGCT GACTGGGAAG CTAAAATTGA CGAGTTAATG GAAGCTGTAG ATTCTTACAT    300TCCAACTCCA GAACGTGATA CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ATGTATTCTC    360AATCACTGGT CGTGGAACTG TTGCAACTGG ACGTGTTGAA CGTGGACAAG TTAAAGTTGG    420TGACGAAGTA GAAGTTATCG GTATTGAAGA AGAAAGCAAA AAAGTAATAG TAACTGGAGT    480AGAAATGTTC CGTAAATTAC TAGACTACGC TGAAGCTGGC GACAACATTG GCGCACTTCT    540ACGTGGTGTT GCTCGTGAAG ATATCCAACG TGGTCAAGTA TTAGCTAAAC CAGGTTCGAT    600TACTCCACAT ACTAACTTCA AAGCTGAAAC TTATGTTTTA ACTAAAGAAG AAGGTGGACG    660TCACACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGCCC ACAATTCTAT TTCCGTACTA CTGACGTAAC    720TGGTATTGTT ACACTTCCAG AAGGTACTGA AATGGTAATG CCTGGTGATA ACATTGAGCT    780TGCAGTTGAA CTAATTGCAC CAATCGCTAT CGAAGAC                             817(2)关于SEQ ID NO：140的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：金黄色葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：140：CGGTGGTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA CGGTCCAATG CCACAAACTC GTGAACACAT    60TCTTTTATCA CGTAACGTTG GTGTACCAGC ATTAGTAGTA TTCTTAAACA AAGTTGACAT   120GGTTGACGAT GAAGAATTAT TAGAATTAGT AGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTAAGCGA   180ATATGACTTC CCAGGTGACG ATGTACCTGT AATCGCTGGT TCAGCATTAR AAGCTTTAGA   240AGGCGATGCT CAATACGAAG AAAAAATCTT AGAATTARTG GAAGCTGTAG ATACTTACAT   300TCCAACTCCA GAACGTGATT CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ACGTATTCTC   360AATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCTACAGG CCGTGTTGAA CGTGGTCAAA TCAAAGTTGG   420TGAAGAAGTT GAAATCATCG GTTTACATGA CACATCTAAA ACAACTGTTA CAGGTGTTGA   480AATGTTCCGT AAATTATTAG ACTACGCTGA AGCTGGTGAC AACATTGGTG CATTATTACG   540TGGTGTTGCT CGTGAAGACG TACAACGTGG TCAAGTATTA GCTGCTCCTG GTTCAATTAC   600ACCACATACT GAATTCAAAG CAGAAGTATA CGTATTATCA AAAGACGAAG GTGGACGTCA   660CACTCCATTC TTCTCAAACT ATCGTCCACA ATTCTATTTC CGTACTACTG ACGTAACTGG   720TGTTGTTCAC TTACCAGAAG GTACTGAAAT GGTAATGCCT GGTGATAACG TTGAAATGAC   780AGTAGAATTA ATCGCTCCAA TCGCGATTGA AGAC                               814(2)关于SEQ ID NO：141的信息(i)序列特征
(A)长度：814个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：表皮葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：141：CGGCGGTATC TTAGTTGTAT CTGCTGCTGA CGGTCCAATG CCACAAACTC GTGAACACAT   60CTTATTATCA CGTAACGTTG GTGTACCAGC ATTAGTTGTA TTCTTAAACA AAGTTGACAT  120GGTAGACGAC GAAGAATTAT TAGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTAAGCGA  180ATATGACTTC CCAGGTGACG ATGTACCTGT AATCGCTGGT TCTGCATTAA AAGCATTAGA  240AGGCGATGCT GAATACGAAC AAAAAATCTT AGACTTAATG CAAGCAGTTG ATGATTACAT  300TCCAACTCCA GAACGTGATT CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ACGTATTCTC  360AATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCTACAGG CCGTGTTGAA CGTGGTCAAA TCAAAGTWGG  420TGAAGAAGTT GAAATCATCG GTATGCACGA AACTTCTAAA ACAACTGTTA CTGGTGTAGA  480AATGTTCCGT AAATTATTAG ACTACGCTGA AGCTGGTGAC AACATCGGTG CTTTATTACG  540TGGTGTTGCA CGTGAAGACG TACAACGTGG TCAAGTATTA GCTGCTCCTG GTTCTATTAC  600ACCACACACA AAATTCAAAG CTGAAGTATA CGTATTATCT AAAGATGAAG GTGGACGTCA  660CACTCCATTC TTCACTAACT ATCGCCCACA ATTCTATTTC CRTACTACTG ACGTAACTGG  720TGTTGTAAAC TTACCAGAAG GTACAGAAAT GGTTATGCCT GGCGACAACG TTGAAATGAC  780AGTTGAATTA ATCGCTCCAA TCGCTATCGA AGAC                              814(2)关于SEQ ID NO：142的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：腐生葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：142：CGGAGCTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCTGA TGGCCCAATG CCACAAACTC GTGAACACAT     60TCTTTTATCA CGTRACGTTG GTGYTCCAGC ATTAGTTGTA TTCTTAAACA AAGTTGACAT    120GGTTGACGAY GAAGAATTAT TAGAATTRGT AGAAATGGAA GTTCGTGRCT TATTAAGCGA    180ATATGACTTC CCAGGTGACG ATGTACCTGT AATCTCTGGT TCTGCATTAA AAGCTTTAGA    240AGGCGACGCT GACTATGAGC AAAAAATCTT AGACTTAATG CAAGCTGTTG ATGACTYCAT    300TCCAACACCA GAACGTGATT CTGACAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ACGTATTCTC    360AATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCTACAGG CCGTGTTGAA CGTGGTCAAA TCAAAGTCGG    420TGAAGAAATC GARATCATCG GTATGCAAGA AGAATCAAGC AAAACAACTG TTACTGGTGT    480AGAAATGTTC CGTAAATTAT TAGACTACGC TGAAGCTGGT GACAACATTG GTGCATTATT    540ACGTGGTGTT TCACGTGATG ATGTACAACG TGGTCAAGTT TTAGCTGCTC CTGGTACTAT    600CACACCACAT ACAAAATTCA AAGCGGATGT TTACGTTTTA TCTAAAGATG AAGGTGGTCG    660TCATACGCCA TTCTTCACTA ACTACCGCCC ACAATTCTAT TTCCGTACTA CTGACGTAAC    720TGGTGTTGTT AACTTACCAG AAGGTACTGA AATGGTTATG CCTGGCGATA ACGTTGAAAT    780GGATGTTGAA TTAATTTCTC CAATCGCTAT TGAAGAC                             817(2)关于SEQ ID NO：143的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：模仿葡萄球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：143：CGGCGGTATC TTAGTAGTAT CTGCTGCAGA TGGTCCAATG CCACAAACTC GTGAACACAT      60CTTATTATCA CGTAACGTTG GTGTACCAGC TTTAGTTGTA TTCTTAAACA AAGCTGACAT     120GGTTGACGAC GAAGAATTAT TAGAATTAGT TGAAATGGAA GTTCGTGACT TATTATCTGA     180ATACGACTTC CCTGGTGACG ATGTACCAGT TATCGTTGGT TCTGCATTAA AAGCTTTAGA     240AGGCGACCCA GAATACGAAC AAAAAATCTT AGACTTAATG CAAGCTGTAG ATGACTACAT     300CCCAACTCCA GAACGTGACT CTGATAAACC ATTCATGATG CCAGTTGAGG ACGTATTCTC     360AATCACTGGT CGTGGTACTG TAGCAACAGG CCGTGTTGAA CGTGGTCAAA TCAAAGTCGG     420TGAAGAAGTT GAAATCATCG GTATCACTGA AGAAAGCAAG AAAACAACAG TTACAGGTGT     480AGAAATGTTC CGTAAATTAT TAGACTACGC TGAAGCTGGT GACAACATCG GTGCTTTATT     540ACGTGGTGTT GCACGTGAAG ACGTACAACG TGGACAAGTA TTAGCAGCTC CTGGCTCTAT     600TACTCCACAC ACAAAATTCA AAGCTGATGT TTACGTTTTA TCTAAAGAAG AAGGTGGACG     660TCATACTCCA TTCTTCACTA ACTACCGCCC ACAATTCTAC TTCCGTACTA CTGACGTAAC     720TGGCGTTGTT CACTTACCAG AAGGTACTGA AATGGTTATG CCTGGCGATA ACGTAGAAAT     780GACTGTTGAA TTGATCGCTC CAATCGCGAT TGAAGAC                              817(2)关于SEQ ID NO：144的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：无乳链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：144：CGGAGCTATC CTTGTAGTTG CTTCAACTGA TGGACCAATG CCACAAACTC GTGAGCACAT     60CCTTCTTTCA CGTCAAGTTG GTGTTAAACA CCTTATCGTA TTCATGAACA AAGTTGACCT    120TGTTGATGAT GAAGAATTGC TTGAATTGGT TGAAATGGAA ATTCGTGACC TTCTTTCAGA    180ATACGACTTC CCAGGTGATG ACCTTCCAGT TATCCAAGGT TCAGCTCTTA AAGCACTTGA    240AGGCGACGAA AAATACGAAG ACATCATCAT GGAATTGATG AGCACTGTTG ATGAGTACAT    300TCCAGAACCA GAACGTGATA CTGACAAACC TTTACTTCTT CCAGTTGAAG ATGTATTCTC    360AATCACTGGA CGTGGTACAG TTGCTTCAGG ACGTATCGAC CGTGGTACTG TTCGTGTCAA    420CGACGAAGTT GAAATCGTTG GTATTAAAGA AGATATCCAA AAAGCAGTTG TTACTGGTGT    480TGAAATGTTC CGTAAACAAC TTGACGAAGG TCTTGCAGGG GACAACGTTG GTGTTCTTCT    540TCGTGGTGTT CAACGTGATG AAATCGAACG TGGTCAAGTT CTTGCTAAAC CAGGTTCAAT    600CAACCCACAC ACTAAATTTA AAGGTGAAGT TTACATCCTT TCTAAAGAAG AAGGTGGACG    660TCATACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGTCC ACAATTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC    720AGGTTCAATC GAACTTCCAG CAGGAACAGA AATGGTTATG CCTGGTGATA ACGTTACTAT    780CGAAGTTGAA TTGATTCACC CAATCGCCGT AGAACAA                             817(2)关于SEQ ID NO：145的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：肺炎链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：145：CGGAGCTATC CTTGTAGTAG CTTCAACTGA CGGACCAATG CCACAAACTC GTGAGCACAT      60CCTTCTTTCA CGTCAGGTTG GTGTTAAACA CCTTATCGTC TTCATGAACA AAGTTGACTT     120GGTTGACGAC GAAGAATTGC TTGAATTGGT TGAAATGGAA ATCCGTGACC TATTGTCAGA     180ATACGACTTC CCAGGTGACG ATCTTCCAGT TATCCAAGGT TCAGCACTTA AAGCTCTTGA     240AGGTGACTCT AAATACGAAG ACATCGTTAT GGAATTGATG AACACAGTTG ATGAGTATAT     300CCCAGAACCA GAACGTGACA CTGACAAACC ATTGCTTCTT CCAGTCGAGG ACGTATTCTC     360AATCACTGGA CGTGGTACAG TTGCTTCAGG ACGTATCGAC CGTGGTATCG TTAAAGTCAA     420CGACGAAATC GAAATCGTTG GTATCAAAGA AGAAACTCRA AAAGCAGTTG TTACTGGTGT     480TGAAATGTTC CGTAAACAAC TTGACGAAGG TCTTGCTGGA GATAACGTAG GTGTCCTTCT     540TCGTGGTGTT CAACGTGATG AAATCGAACG TGGACAAGTT ATCGCTAAAC CAGGTTCAAT     600CAACCCACAC ACTAAATTCA AAGGTGAAGT CTACATCCTT ACTAAAGAAG AAGGTGGACG     660TCACACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGTCC ACAATTCTAC TTCCGTACTA CTGACGTTAC     720AGGTTCAATC GAACTTCCAG CAGGTACTGA AATGGTAATG CCTGGTGATA ACGTGACAAT     780CGACGTTGAG TTGATTCACC CAATCGCCGT AGAACAA                              817(2)关于SEQ ID NO：146的信息(i)序列特征
(A)长度：817个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：唾液链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：146：CGGTGCGATC CTTGTAGTAG CATCTACTGA CGGACCAATG CCACAAACTC GTGAGCACAT          60CCTTCTTTCA CGTCAGGTTG GTGTTAAACA CCTTATCGTC TTCATGAACA AAGTTGACTT         120GGTTGACGAT GAAGAATTGC TTGAATTGGT TGAAATGGAA ATCCGTGACC TTCTTTCAGA         180ATACGATTTC CCAGGTGATG ACATTCCAGT TATCCAAGGT TCAGCTCTTA AAGCTCTTGA         240AGGTGATTCT AAATACGAAG ACATCATCAT GGACTTGATG AACACTGTTG ACGAATACAT         300CCCAGAACCA GAACGTGACA CTGACAAACC ATTGTTGCTT CCAGTCGAAG ACGTATTCTC         360AATCACTGGT CGTGGTACTG TTGCTTCAGG ACGTATCGAC CGTGGTGTTG TTCGTGTCAA         420TGACGAAGTT GAAATCGTTG GTCTTAAAGA AGACATCCAA AAAGCAGTTG TTACTGGTGT         480TGAAATGTTC CGTAAACAAC TTGACGRAGG TATTGCCGGA GATAACGTCG GTGTTCTTCT         540TCGTGGTATC CAACGTGATG AAATCGAACG TGGTCAAGTA TTGGCTGCAC CTGGTTCAAT         600CAACCCACAC ACTAAATTCA AAGGTGAAGT TTACATCCTT TCTAAAGAAG AAGGTGGACG         660TCACACTCCA TTCTTCAACA ACTACCGTCC ACAGTTCTAC TTCCGTACAA CTGACGTAAC         720AGGTTCAATC GAACTTCCTG CAGGTACTGA AATGGTTATG CCTGGTGATA ACGTGACTAT         780CGACGTTGAG TTGATCCACC CAATCGCCGT TGAACAA                                  817(2)关于SEQ ID NO：147的信息(i)序列特征
(A)长度：897个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：根癌土壤杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：147：AACATGATCA CCGGTGCTGC CGAGATGGAC GGCGCGATCC TGGTTTGCTC GGCTGCCGAC     60GGCCCGATGC CACAGACCCG CGAGCACATC CTGCTTGCCC GTCAGGTGGG CGTTCCGGCC    120ATCGTCGTGT TCCTCAACAA GGTCGACCAG GTTGACGACG CCGAGCTTCT CGAGCTCGTC    180GAGCTTGAAG TTCGCGAACT TCTGTCGTCC TACGACTTCC CGGGCGACGA TATCCCGATC    240ATCAAGGGTT CGGCACTTGC TGCTCTTGAA GATTCTGACA AGAAGATCGG TGAAGACGCG    300ATCCGCGAGC TGATGGCTGC TGTCGACGCC TACATCCCGA CGCCTGAGCG TCCGATCGAC    360CAGCCGTTCC TGATGCCGAT CGAAGACGTG TTCTCGATCT CGGGTCGTGG TACGGTTGTG    420ACGGGTCGCG TTGAGCGCGG TATCGTCAAG GTTGGTGAAG AAGTCGAAAT CGTCGGCATC    480CGTCCGACCT CGAAGACGAC TGTTACCGGC GTTGAAATGT TCCGCAAGCT GCTCGACCAG    540GGCCAGGCCG GCGACAACAT CGGTGCACTC GTTCGCGGCG TTACCCGTGA CGGCGTCGAG    600CGTGGTCAGA TCCTGTGCAA GCCGGGTTCG GTCAAGCCGC ACAAGAAGTT CATGGCAGAA    660GCCTACATCC TGACGAAGGA AGAAGGCGGC CGTCATACGC CGTTCTTCAC GAACTACCGT    720CCGCAGTTCT ACTTCCGTAC GACTGACGTT ACCGGTATCG TTTCGCTTCC TGAAGGCACG    780GAAATGGTTA TGCCTGGCGA CAACGTCACT GTTGAAGTCG AGCTGATCGT TCCGATCGCG    840ATGGAAGAAA AGCTGCGCTT CGCTATCCGC GAAGGCGGCC GTACCGTCGG CGCCGGC       897(2)关于SEQ ID NO：148的信息(i)序列特征
(A)长度：885个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：枯草芽孢杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：148：ATGATCACTG GTGCTGCGCA AATGGACGGA GCTATCCTTG TAGTATCTGC TGCTGATGGC     60CCAATGCCAC AAACTCGTGA GCACATCCTT CTTTCTAAAA ACGTTGGTGT ACCATACATC    120GTTGTATTCT TAAACAAATG CGACATGGTA GACGACGAAG AGCTTCTTGA ACTAGTTGAA    180ATGGAAGTTC GCGATCTTCT TAGCGAATAC GACTTCCCTG GTGATGATGT ACCAGTTGTT    240AAAGGTTCTG CTCTTAAAGC TCTTGAAGGA GACGCTGAGT GGGAAGCTAA AATCTTCGAA    300CTTATGGATG CGGTTGATGA GTACATCCCA ACTCCAGAAC GCGACACTGA AAAACCATTC    360ATGATGCCAG TTGAGGACGT ATTCTCAATC ACTGGTCGTG GTACAGTTGC TACTGGCCGT    420GTAGAACGCG GACAAGTTAA AGTCGGTGAC GAAGTTGAAA TCATCGGTCT TCAAGAAGAG    480AACAAGAAAA CAACTGTTAC AGGTGTTGAA ATGTTCCGTA AGCTTCTTGA TTACGCTGAA    540GCTGGTGACA ACATTGGTGC CCTTCTTCGC GGTGTATCTC GTGAAGAAAT CCAACGTGGT    600CAAGTACTTG CTAAACCAGG TACAATCACT CCACACAGCA AATTCAAAGC TGAAGTTTAC    660GTTCTTTCTA AAGAAGAGGG TGGACGTCAT ACTCCATTCT TCTCTAACTA CCGTCCTCAG    720TTCTACTTCC GTACAACTGA CGTAACTGGT ATCATCCATC TTCCAGAAGG CGTAGAAATG    780GTTATGCCTG GAGATAACAC TGAAATGAAC GTTGAACTTA TTTCTACAAT CGCTATCGAA    840GAAGGAACTC GTTTCTCTAT TCGTGAAGGC GGACGTACTG TTGGT                    885(2)关于SEQ ID NO：149的信息(i)序列特征
(A)长度：882个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：脆弱拟杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：149：ATGGTTACTG GTGCTGCTCA GATGGACGGT GCTATCATTG TAGTTGCTGC TACTGATGGT         60CCGATGCCTC AGACTCGTGA GCACATCCTT TTGGCTCGTC AGGTAAACGT TCCGAAGCTG        120GTTGTATTCA TGAACAAGTG CGATATGGTT GAAGATGCTG AGATGTTGGA ACTTGTTGAA        180ATGGAAATGA GAGAATTGCT TTCATTCTAT GATTTCGACG GTGACAATAC TCCGATCATT        240CAGGGTTCTG CTCTTGGTGC ATTGAACGGC GTAGAAAAAT GGGAAGACAA AGTAATGGAA        300CTGATGGAAG CTGTTGATAC TTGGATTCCA CTGCCTCCGC GCGATGTTGA TAAACCTTTC        360TTGATGCCGG TAGAAGACGT GTTCTCTATC ACAGGTCGTG GTACTGTAGC TACAGGTCGT        420ATCGAAACTG GTGTTATCCA TGTAGGTGAT GAAATCGAAA TCCTCGGTTT GGGTGAAGAT        480AAGAAATCAG TTGTAACAGG TGTTGAAATG TTCCGCAAAC TTCTGGATCA GGGTGAAGCT        540GGTGACAACG TAGGTCTGTT GCTTCGTGGT GTTGACAAGA ACGAAATCAA ACGTGGTATG        600GTTCTTTGTA AACCGGGTCA GATTAAACCT CACTCTAAAT TCAAAGCAGA GGTTTATATC        660CTGAAGAAAG AAGAAGGTGG TCGTCACACT CCATTCCATA ACAAATATCG TCCTCAGTTC        720TACCTGCGTA CTATGGACTG TACAGGTGAA ATCACTCTTC CGGAAGGAAC TGAAATGGTA        780ATGCCGGGTG ATAACGTAAC TATCACTGTA GAGTTGATCT ATCCGGTTGC ACTGAACATC        840GGTCTTCGTT TCGCTATCCG CGAAGGTGGA CGTACAGTAG GT                           882(2)关于SEQ ID NO：150的信息(i)序列特征
(A)长度：888个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：布氏疏螺旋体(xi)序列描述：SEQ ID NO：150：AATATGATTA CAGGAGCAGC TCAAATGGAT GCAGCGATAC TTTTAGTTGC TGCTGATAGT     60GGTGCTGAGC CTCAAACAAA AGAGCATTTG CTTCTTGCTC AAAGAATGGG AATAAAGAAA    120ATAATAGTTT TTTTAAATAA ATTGGACTTA GCAGATCCTG AACTTGTTGA GCTTGTTGAA    180GTTGAAGTTT TAGAACTTGT TGAAAAATAT GGCTTTTCAG CTGATACTCC AATAATCAAA    240GGTTCAGCTT TTGGGGCTAT GTCAAATCCA GAAGATCCTG AATCTACAAA ATGCGTTAAA    300GAACTTCTTG AATCTATGGA TAATTATTTT GATCTTCCAG AAAGAGATAT TGACAAGCCA    360TTTTTGCTTG CTGTTGAAGA TGTATTTTCT ATTTCAGGAA GAGGCACTGT TGCTACTGGG    420CGTATTGAAA GAGGTATTAT TAAAGTTGGT CAAGAAGTTG AAATAGTTGG AATTAAAGAA    480ACCAGAAAAA CTACTGTTAC TGGTGTTGAA ATGTTCCAGA AAATTCTTGA GCAAGGTCAA    540GCAGGGGATA ATGTTGGTCT TCTTTTGAGA GGCGTTGATA AAAAAGACAT TGAGAGGGGG    600CAAGTTTTGT CAGCTCCAGG TACAATTACT CCACACAAGA AATTTAAAGC TTCAATTTAT    660TGTTTGACTA AAGAAGAAGG CGGTAGGCAC AAGCCATTTT TCCCAGGGTA TAGACCACAG    720TTCTTTTTTA GAACAACCGA TGTTACTGGA GTTGTTGCTT TAGAGGGCAA AGAAATGGTT    780ATGCCTGGTG ATAATGTTGA TATTATTGTT GAGCTGATCT CTTCAATAGC TATGGATAAG    840AATGTAGAAT TTGCTGTTCG AGAAGGTGGA AGAACCGTTG CTTCAGGA                 888(2)关于SEQ ID NO：151的信息(i)序列特征
(A)长度：894个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：扩展短杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：151：AACATGATCA CCGGTGCCGC TCAGATGGAC GGTGCGATCC TCGTCGTCGC CGCTACCGAC      60GGACCGATGC CCCAGACCCG TGAGCACGTG CTGCTCGCGC GTCAGGTCGG CGTTCCCTAC     120ATCGTCGTGG CTCTGAACAA GTCCGACATG GTCGATGACG AGGAGCTCCT CGAGCTCGTC     180GAATTCGAGG TCCGCGACCT GCTCTCGAGC CAGGACTTCG ACGGAGACAA CGCTCCGGTC     240ATTCCGGTGT CCGCTCTCAA GGCGCTGGAA GGCGACGAGA AGTGGGTCAA GAGCGTTCAG     300GATCTCATGG CTGCCGTCGA TGACAACGTT CCGGAGCCGG AGCGCGATGT CGACAAGCCG     360TTCCTCATGC CCGTCGAGGA CGTCTTCACG ATCACCGGTC GTGGAACCGT CGTCACCGGT     420CGTGTCGAGC GCGGCGTGCT CCTGCCTAAC GACGAAATCG AAATCGTCGG CATCAAGGAG     480AAGTCGTCCA AGACGACTGT CACCGCTATC GAGATGTTCC GCAAGACCCT GCCGGATGCC     540CGTGCAGGTG AGAACGTCGG TCTGCTCCTC CGCGGCACCA AGCGCGAGGA TGTTGAGCGC     600GGTCAGGTCA TCGTGAAGCC GGGTTCGATC ACCCCGCACA CCAAGTTCGA GGCTCAGGTC     660TACATCCTGA GCAAGGACGA GGGCGGACGT CACAACCCGT TCTACTCGAA CTACCGTCCG     720CAGTTCTACT TCCGGACCAC GGACGTCACC GGTGTCATCA CGCTGCCCGA GGGCACCGAG     780ATGGTCATGC CCGGCGACAA CACCGATATG TCGGTCGAGC TCATCCAGCC GATCGCTATG     840GAGGACCGCC TCCGCTTCGC AATCCGCGAA GGTGGCCGCA CCGTCGGCGC CGGT           894(2)关于SEQ ID NO：152的信息(i)序列特征
(A)长度：888个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：洋葱伯克霍尔德氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：152：ATGATCACGG GCGCAGCGCA GATGGACGGC GCGATCCTGG TTTGCTCGGC AGCAGACGGC        60CCGATGCCGC AAACGCGTGA GCACATCCTG CTGGCGCGTC AGGTTGGTGT TCCGTACATC       120ATCGTGTTCC TGAACAAGTG CGACAGTGTG GACGACGCTG AACTGCTCGA GCTGGTCGAG       180ATGGAAGTTC GCGAACTCCT GTCGAAGTAC GACTTCCCGG GCGACGACAC GCCGATCGTG       240AAGGGTTCGG CCAAGCTGGC GCTGGAAGGC GACACGGGCG AGCTGGGCGA AGTGGCGATC       300ATGAGCCTGG CAGACGCGCT GGACACGTAC ATCCCGACGC CGGAGCGTGC AGTTGACGGC       360GCGTTCCTGA TGCCGGTGGA AGACGTGTTC TCGATCTCGG GCCGTGGTAC GGTGGTGACG       420GGTCGTGTCG AGCGCGGCAT CGTGAAGGTC GGCGAAGAAA TCGAAATCGT CGGTATCAAG       480CCGACGGTGA AGACGACCTG CACGGGCGTT GAAATGTTCC GCAAGCTGCT GGACCAAGGT       540CAGGCAGGCG ACAACGTCGG TATCCTGCTG CGCGGCACGA AGCGTGAAGA CGTGGAGCGT       600GGCCAGGTTC TGGCGAAGCC GGGTTCGATC ACGCCGCACA CGCACTTCAC GGCTGAAGTG       660TACGTGCTGA GCAAGGACGA AGGCGGCCGT CACACGCCGT TCTTCAACAA CTACCGTCCG       720CAGTTCTACT TCCGTACGAC GGACGTGACG GGCTCGATCG AGCTGCCGAA GGACAAGGAA       780ATGGTGATGC CGGGCGACAA CGTGTCGATC ACGGTGAAGC TGATTGCTCC GATCGCGATG       840GAAGAAGGTC TGCGCTTCGC AATCCGTGAA GGCGGCCGTA CGGTCGGC                    888(2)关于SEQ ID NO：153的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：砂眼衣原体(xi)序列描述：SEQ ID NO：153：AACATGATCA CCGGTGCGGC TCAAATGGAC GGGGCTATTC TAGTAGTTTC TGCAACAGAC      60GGAGCTATGC CTCAAACTAA AGAGCATATT CTTTTGGCAA GACAAGTTGG GGTTCCTTAC     120ATCGTTGTTT TTCTCAATAA AATTGACATG ATTTCCGAAG AAGACGCTGA ATTGGTCGAC     180TTGGTTGAGA TGGAGTTGGC TGAGCTTCTT GAAGAGAAAG GATACAAAGG GTGTCCAATC     240ATCAGAGGTT CTGCTCTGAA AGCTTTGGAA GGAGATGCTG CATACATAGA GAAAGTTCGA     300GAGCTAATGC AAGCCGTCGA TGATAATATC CCTACTCCAG AAAGAGAAAT TGACAAGCCT     360TTCTTAATGC CTATTGAGGA CGTGTTCTCT ATCTCCGGAC GAGGAACTGT AGTAACTGGA     420CGTATTGAGC GTGGAATTGT TAAAGTTTCC GATAAAGTTC AGTTGGTCGG TCTTAGAGAT     480ACTAAAGAAA CGATTGTTAC TGGGGTTGAA ATGTTCAGAA AAGAACTCCC AGAAGGTCGT     540GCAGGAGAGA ACGTTGGATT GCTCCTCAGA GGTATTGGTA AGAACGATGT GGAAAGAGGA     600ATGGTTGTTT GCTTGCCAAA CAGTGTTAAA CCTCATACAC AGTTTAAGTG TGCTGTTTAC     660GTTCTGCAAA AAGAAGAAGG TGGACGACAT AAGCCTTTCT TCACAGGATA TAGACCTCAA     720TTCTTCTTCC GTACAACAGA CGTTACAGGT GTGGTAACTC TGCCTGAGGG AGTTGAGATG     780GTCATGCCTG GGGATAACGT TGAGTTTGAA GTGCAATTGA TTAGCCCTGT GGCTTTAGAA     840GAAGGTATGA GATTTGCGAT TCGTGAAGGT GGTCGTACAA TCGGTGCTGG A              891(2)关于SEQ ID NO：154的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：大肠杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：154：AACATGATCA CCGGTGCTGC GCAGATGGAC GGCGCGATCC TGGTAGTTGC TGCGACTGAC        60GGCCCGATGC CGCAGACTCG TGAGCACATC CTGCTGGGTC GTCAGGTAGG CGTTCCGTAC       120ATCATCGTGT TCCTGAACAA ATGCGACATG GTTGATGACG AAGAGCTGCT GGAACTGGTT       180GAAATGGAAG TTCGTGAACT TCTGTCTCAG TACGACTTCC CGGGCGACGA CACTCCGATC       240GTTCGTGGTT CTGCTCTGAA AGCGCTGGAA GGCGACGCAG AGTGGGAAGC GAAAATCCTG       300GAACTGGCTG GCTTCCTGGA TTCTTACATT CCGGAACCAG AGCGTGCGAT TGACAAGCCG       360TTCCTGCTGC CGATCGAAGA CGTATTCTCC ATCTCCGGTC GTGGTACCGT TGTTACCGGT       420CGTGTAGAAC GCGGTATCAT CAAAGTTGGT GAAGAAGTTG AAATCGTTGG TATCAAAGAG       480ACTCAGAAGT CTACCTGTAC TGGCGTTGAA ATGTTCCGCA AACTGCTGGA CGAAGGCCGT       540GCTGGTGAGA ACGTAGGTGT TCTGCTGCGT GGTATCAAAC GTGAAGAAAT CGAACGTGGT       600CAGGTACTGG CTAAGCCGGG CACCATCAAG CCGCACACCA AGTTCGAATC TGAAGTGTAC       660ATTCTGTCCA AAGATGAAGG CGGCCGTCAT ACTCCGTTCT TCAAAGGCTA CCGTCCGCAG       720TTCTACTTCC GTACTACTGA CGTGACTGGT ACCATCGAAC TGCCGGAAGG CGTAGAGATG       780GTAATGCCGG GCGACAACAT CAAAATGGTT GTTACCCTGA TCCACCCGAT CGCGATGGAC       840GACGGTCTGC GTTTCGCAAT CCGTGAAGGC GGCCGTACCG TTGGCGCGGG C                891(2)关于SEQ ID NO：155的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：产琥珀酸丝状杆菌
(xi)序列描述：SEQ ID NO：155：AACATGGTGA CTGGTGCTGC TCAGATGGAC GGCGCTATCC TCGTTGTTGC CGCTACTGAC      60GGTCCGATGC CGCAGACTCG CGAACACATC CTTCTCGCTC ACCAGGTTGG CGTGCCGAAG     120ATCGTCGTGT TCATGAACAA GTGCGACATG GTTGACGATG CTGAAATTCT CGACCTCGTC     180GAAATGGAAG TTCGCGAACT CCTCTCCAAG TATGACTTCG ACGGTGACAA CACCCCGATC     240ATCCGTGGTT CCGCTCTCAA GGCCCTCGAA GGCGATCCGG AATACCAGGA CAAGGTCATG     300GAACTCATGA ACGCTTGCGA CGAATACATC CCGCTCCCGC AGCGCGATAC CGACAAGCCG     360TTCCTCATGC CGATCGAAGA CGTGTTCACG ATTACTGGCC GCGGCACTGT CGCTACTGGC     420CGTATCGAAC GCGGTGTCGT TCGCTTGAAC GACAAGGTTG AACGTATCGG TCTCGGTGAA     480ACCACCGAAT ACGTCATCAC CGGTGTTGAA ATGTTCCGTA AGCTCCTCGA CGACGCTCAG     540GCAGGTGACA ACGTTGGTCT CCTCCTCCGT GGTGCTGAAA AGAAGGACAT CGTCCGTGGC     600ATGGTTCTCG CAGCTCCGAA GTCTGTCACT CCGCACACCG AATTTAAGGC TGAAATCTAC     660GTTCTCACGA AGGACGAAGG TGGCCGTCAC ACGCCGTTCA TGAATGGCTA CCGTCCGCAG     720TTCTACTTCC GCACCACCGA CGTTACTGGT ACGATCCAGC TCCCGGAAGG TGTCGAAATG     780GTTACTCCGG GTGACACGGT CACGATCCAC GTGAACCTCA TCGCTCCGAT CGCTATGGAA     840AAGCAGCTCC GCTTCGCTAT CCGTGAAGGT GGACGTACTG TTGGTGCTGG C              891(2)关于SEQ ID NO：156的信息(i)序列特征
(A)长度：894个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：铁色黄杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：156：AACATGATCA CCGGTGCTGC CCAGATGGAC GGTGCTATCT TAGTTGTGGC TGCATCAGAC       60GGTCCTATGC CTCAAACAAA AGAACACATC CTGCTTGCTG CCCAGGTAGG TGTACCTAAA      120ATGGTTGTGT TTCTGAATAA AGTTGACCTC GTTGACGACG AAGAGCTCCT GGAGCTGGTT      180GAGATCGAGG TTCGCGAAGA ACTGACTAAA CGCGGTTTCG ACGGCGACAA CACTCCAATC      240ATCAAAGGTT CCGCTACAGG CGCCCTCGCT GGTGAAGAAA AGTGGGTTAA AGAAATTGAA      300AACCTGATGG ACGCTGTTGA CAGCTACATC CCACTGCCTC CTCGTCCGGT TGATCTGCCG      360TTCCTGATGA GCGTAGAGGA CGTATTCTCT ATCACTGGTC GTGGTACTGT TGCTACCGGT      420CGTATCGAGC GTGGCCGTAT CAAAGTTGGT GAGCCTGTTG AGATCGTAGG TCTGCAGGAG      480TCTCCCCTGA ACTCTACCGT TACAGGTGTT GAGATGTTCC GCAAACTCCT CGACGAAGGT      540GAAGCTGGTG ATAACGCCGG TCTCCTCCTC CGTGGTGTTG AAAAAACACA GATCCGTCGC      600GGTATGGTAA TCGTTAAACC CGGTTCCATC ACTCCGCACA CGGACTTCAA AGGCGAAGTT      660TACGTACTGA GCAAAGACGA AGGTGGCCGT CACACTCCAT TCTTCAACAA ATACCGTCCT      720CAATTCTACT TCCGTACAAC TGACGTTACA GGTGAAGTAG AACTGAACGC AGGAACAGAA      780ATGGTTATGC CTGGTGATAA CACCAACCTG ACCGTTAAAC TGATCCAACC GATCGCTATG      840GAAAAAGGTC TGAAATTCGC GATCCGCGAA GGTGGCCGTA CCGTAGGTGC AGGA            894(2)关于SEQ ID NO：157的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：流感嗜血菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：157：AATATGATTA CTGGTGCGGC ACAAATGGAT GGTGCTATTT TAGTAGTAGC AGCAACAGAT        60GGTCCTATGC CACAAACTCG TGAACACATC TTATTAGGTC GCCAAGTAGG TGTTCCATAC       120ATCATCGTAT TCTTAAACAA ATGCGACATG GTAGATGACG AAGAGTTATT AGAATTAGTC       180GAAATGGAAG TTCGTGAACT TCTATCTCAA TATGACTTCC CAGGTGACGA TACACCAATC       240GTACGTGGTT CAGCATTACA AGCGTTAAAC GGCGTAGCAG AATGGGAAGA AAAAATCCTT       300GAGTTAGCAA ACCACTTAGA TACTTACATC CCAGAACCAG AACGTGCGAT TGACCAACCG       360TTCCTTCTTC CAATCGAAGA TGTGTTCTCA ATCTCAGGTC GTGGTACTGT AGTAACAGGT       420CGTGTAGAAC GAGGTATTAT CCGTACAGGT GATGAAGTAG AAATCGTCGG TATCAAAGAT       480ACAGCGAAAA CTACTGTAAC GGGTGTTGAA ATGTTCCGTA AATTACTTGA CGAAGGTCGT       540GCAGGTGAAA ACATCGGTGC ATTATTACGT GGTACCAAAC GTGAAGAAAT CGAACGTGGT       600CAAGTATTAG CGAAACCAGG TTCAATCACA CCACACACTG ACTTCGAATC AGAAGTGTAC       660GTATTATCAA AAGATGAAGG TGGTCGTCAT ACTCCATTCT TCAAAGGTTA CCGTCCACAA       720TTCTATTTCC GTACAACAGA CGTGACTGGT ACAATCGAAT TACCAGAAGG CGTGGAAATG       780GTAATGCCAG GCGATAACAT CAAGATGACA GTAAGCTTAA TCCACCCAAT TGCGATGGAT       840CAAGGTTTAC GTTTCGCAAT CCGTGAAGGT GGCCGTACAG TAGGTGCAGG C                891(2)关于SEQ ID NO：158的信息(i)序列特征
(A)长度：906个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：幽门螺杆菌
(xi)序列描述：SEQ ID NO：158：AACATGATCA CCGGTGCGGC GCAAATGGAC GGAGCGATTT TGGTTGTTTC TGCAGCTGAT    60GGCCCTATGC CTCAAACTAG GGAGCATATC TTATTGTCTC GTCAAGTAGG CGTGCCTCAC   120ATCGTTGTTT TCTTAAACAA ACAAGACATG GTAGATGACC AAGAATTGTT AGAACTTGTA   180GAAATGGAAG TGCGCGAATT GTTGAGCGCG TATGAATTTC CTGGCGATGA CACTCCTATC   240GTAGCGGGTT CAGCTTTAAG AGCTTTAGAA GAAGCAAAGG CTGGTAATGT GGGTGAATGG   300GGTGAAAAAG TGCTTAAACT TATGGCTGAA GTGGATGCCT ATATCCCTAC TCCAGAAAGA   360GACACTGAAA AAACTTTCTT GATGCCGGTT GAAGATGTGT TCTCTATTGC GGGTAGAGGG   420ACTGTGGTTA CAGGTAGGAT TGAAAGAGGC GTGGTGAAAG TAGGCGATGA AGTGGAAATC   480GTTGGTATCA GACCTACACA AAAAACGACT GTAACCGGTG TAGAAATGTT TAGGAAAGAG   540TTGGAAAAAG GTGAAGCCGG CGATAATGTG GGCGTGCTTT TGAGAGGAAC TAAAAAAGAA   600GAAGTGGAAC GCGGTATGGT TCTATGCAAA CCAGGTTCTA TCACTCCGCA CAAGAAATTT   660GAGGGAGAAA TTTATGTCCT TTCTAAAGAA GAAGGCGGGA GACACACTCC ATTCTTCACC   720AATTACCGCC CGCAATTCTA TGTGCGCACA ACTGATGTGA CTGGCTCTAT CACCCTTCCT   780GAAGGCGTAG AAATGGTTAT GCCTGGCGAT AATGTGAAAA TCACTGTAGA GTTGATTAGC   840CCTGTTGCGT TAGAGTTGGG AACTAAATTT GCGATTCGTG AAGGCGGTAG GACCGTTGGT   900GCTGGT                                                              906(2)关于SEQ ID NO：159的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
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(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：结核分枝杆菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：160：AACATGATCA CCGGCGCCGC GCAGATGGAC GGTGCGATCC TGGTGGTCGC CGCCACCGAC      60GGCCCGATGC CCCAGACCCG CGAGCACGTT CTGCTGGCGC GTCAAGTGGG TGTGCCCTAC     120ATCCTGGTAG CGCTGAACAA GGCCGACGCA GTGGACGACG AGGAGCTGCT CGAACTCGTC     180GAGATGGAGG TCCGCGAGCT GCTGGCTGCC CAGGAATTCG ACGAGGACGC CCCGGTTGTG     240CGGGTCTCGG CGCTCAAGGC GCTCGAGGGT GACGCGAAGT GGGTTGCCTC TGTCGAGGAA     300CTGATGAACG CGGTCGACGA GTCGATTCCG GACCCGGTCC GCGAGACCGA CAAGCCGTTC     360CTGATGCCGG TCGAGGACGT CTTCACCATT ACCGGCCGCG GAACCGTGGT CACCGGACGT     420GTGGAGCGCG GCGTGATCAA CGTGAACGAG GAAGTTGAGA TCGTCGGCAT TCGCCCATCG     480ACCACCAAGA CCACCGTCAC CGGTGTGGAG ATGTTCCGCA AGCTGCTCGA CCAGGGCCAG     540GCGGGCGACA ACGTTGGTTT GCTGCTGCGG GGCGTCAAGC GCGAGGACGT CGAGCGTGGC     600CAGGTTGTCA CCAAGCCCGG CACCACCACG CCGCACACCG AGTTCGAAGG CCAGGTCTAC     660ATCCTGTCCA AGGACGAGGG CGGCCGGCAC ACGCCGTTCT TCAACAACTA CCGTCCGCAG     720TTCTACTTCC GCACCACCGA CGTGACCGGT GTGGTGACAC TGCCGGAGGG CACCGAGATG     780GTGATGCCCG GTGACAACAC CAACATCTCG GTGAAGTTGA TCCAGCCCGT CGCCATGGAC     840GAAGGTCTGC GTTTCGCGAT CCGCGAGGGT GGCCGCACCG TGGGCGCCGG C              891(2)关于SEQ ID NO：161的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：生殖道枝原体(xi)序列描述：SEQ ID NO：161：AATATGATCA CAGGTGCTGC ACAAATGGAT GGAGCTATTC TAGTTGTTTC AGCAACTGAT     60AGTGTGATGC CCCAAACCCG CGAGCACATC TTACTTGCCC GCCAAGTAGG GGTTCCTAAA    120ATGGTAGTTT TTCTAAACAA GTGTGATATT GCTAGTGATG AAGAGGTACA AGAACTTGTT    180GCTGAAGAAG TACGTGATCT GTTAACTTCC TATGGTTTTG ATGGTAAGAA CACTCCTATT    240ATTTATGGCT CAGCTTTAAA AGCATTGGAA GGTGATCCAA AGTGGGAGGC TAAGATCCAT    300GATTTGATTA AAGCAGTTGA TGAATGGATT CCAACTCCTA CACGTGAAGT AGATAAACCT    360TTCTTATTAG CAATTGAAGA TACGATGACC ATTACTGGTA GAGGTACAGT TGTTACAGGA    420AGAGTTGAAA GAGGTGAACT CAAAGTAGGT CAAGAAGTTG AAATTGTTGG TTTAAAACCA    480ATTAGAAAAG CAGTTGTTAC TGGAATTGAA ATGTTCAAAA AGGAACTTGA TTCAGCAATG    540GCTGGTGACA ATGCTGGGGT ATTATTACGT GGTGTTGAAC GTAAAGAAGT TGAAAGAGGT    600CAAGTTTTAG CAAAACCAGG CTCTATTAAA CCGCACAAGA AATTTAAAGC TGAGATCTAT    660GCTTTAAAGA AAGAAGAAGG TGGTAGACAC ACTGGTTTTT TAAACGGTTA CCGTCCTCAA    720TTCTATTTCC GTACCACTGA TGTAACTGGT TCTATTGCTT TAGCTGAAAA TACTGAAATG    780GTTCTACCTG GTGATAATGC TTCTATTACT GTTGAGTTAA TTGCTCCTAT CGCTTGTGAA    840AAAGGTAGTA AGTTCTCAAT TCGTGAAGGT GGTAGAACTG TAGGGGCAGG C             891(2)关于SEQ ID NO：162的信息(i)序列特征
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(B)类型：核酸
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(A)生物：淋病奈瑟氏球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：162：AACATGATTA CCGGCGCCGC ACAAATGGAC GGTGCAATCC TGGTATGTTC TGCTGCCGAC   60GGCCCTATGC CGCAAACCCG CGAACACATC CTGCTGGCCC GTCAAGTAGG CGTACCTTAC  120ATCATCGTGT TCATGAACAA ATGCGACATG GTCGACGATG CCGAGCTGTT CCAACTGGTT  180GAAATGGAAA TCCGCGACCT GCTGTCCAGC TACGACTTCC CCGGCGACGA CTGCCCGATC  240GTACAAGGTT CCGCACTGAA AGCCTTGGAA GGCGATGCCG CTTACGAAGA AAAAATCTTC  300GAACTGGCTA CCGCATTGGA CAGATACATC CCGACTCCCG AGCGTGCCGT GGACAAACCA  360TTCCTGCTGC CTATCGAAGA CGTGTTCTCC ATTTCCGGCC GCGGTACCGT AGTCACCGGC  420CGTGTAGAGC GAGGTATCAT CCACGTTGGT GACGAGATTG AAATCGTCGG TCTGAAAGAA  480ACCCAAAAAA CCACCTGTAC CGGCGTTGAA ATGTTCCGCA AACTGCTGGA CGAAGGTCAG  540GCGGGCGACA ACGTAGGCGT ATTGCTGCGC GGTACCAAAC GTGAAGACGT AGAACGCGGT  600CAGGTATTGG CCAAACGGGG TACTATCACT CCTCACACCA AGTTCAAAGC AGAAGTGTAC  660GTATTGAGCA AAGAAGAGGG CGGCCCCCAT ACCCCGTTTT TCGCCAACTA CCGTCCCCAA  720TTCTACTTCC GTACCACTGA CGTAACCGGC ACGATTACTT TGGAAAAAGG TGTGGAAATG  780GTAATGCCGG GTGAGAACGT AACCATTACT GTAGAACTGA TTGCGCCTAT CGCTATGGAA  840GAAGGTCTGC GCTTTGCGAT TCGCGAAGGC GGCCGTACCG TGGGTGCCGG C           891(2)关于SEQ ID NO：163的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：普氏立克次氏体(xi)序列描述：SEQ ID NO：163：AATATGATAA CTGGTGCCGC TCAGATGGAT GGTGCTATAT TAGTAGTTTC TGCTGCTGAT    60GGTCCTATGC CTCAAACTAG AGAACATATA TTACTGGCAA AACAGGTAGG TGTACCTGCT   120ATGGTAGTAT TTTTGAATAA AGTAGATATG GTAGATGATC CTGACCTATT AGAATTAGTT   180GAGATGGAAG TAAGAGAATT ATTATCAAAA TATGGTTTCC CTGGTAATGA AATACCTATT   240ATTAAAGGTT CTGCACTTCA AGCTTTAGAA GGAAAACCTG AAGGTGAAAA AGCTATTAAT   300GAGTTAATGA ATGCAGTAGA TACGTATATA CCTCAGCCTA TAGAGCTACA AGATAAACCT   360TTTTTAATGC CAATAGAGGA TGTATTTTCT ATTTCAGGCA GAGGTACCGT TGTAACTGGT   420AGAGTGGAGT CAGGCATAAT TAAGGTGGGT GAAGAAATTG AAATAGTAGG TCTAAAAAAT   480ACGCAAAAAA CGACTTGTAC AGGTGTAGAA ATGTTCAGAA AATTACTTGA TGAAGGACAA   540TCTGGAGATA ATGTCGGTAT ATTACTACGT GGTACAAAAA GAGAAGAAGT AGAAAGAGGA   600CAAGTACTTG CAAAACCTGG GAGCATAAAA CCGCATGATA AATTTGAAGC TGAAGTGTAT   660GTGCTTAGTA AAGAGGAAGG TGGACGTCAT ACCCCATTTA CTAATGATTA TCGCCCACAG   720TTCTATTTTA GAACAACAGA TGTTACCGGC ACAATAAAAT TGCCTTCTGA TAAGCAGATG   780GTTATGCCTG GAGATAATGC TACTTTTTCA GTAGAATTAA TTAAGCCGAT TGCTATGCAA   840GAAGGGTTAA AATTCTCTAT ACGTGAAGGT GGTAGAACAG TAGGAGCCGG T            891(2)关于SEQ ID NO：164的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：鼠伤寒沙门氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：164：AACATGATCA CCGGTGCTGC TCAGATGGAC GGCGCGATCC TGGTTGTTGC TGCGACTGAC   60GGCCCGATGC CGCAGACCCG TGAGCACATC CTGCTGGGTC GTCAGGTAGG CGTTCCGTAC  120ATCATCGTGT TCCTGAACAA ATGCGACATG GTTGATGACG AAGAGCTGCT GGAACTGGTT  180GAGATGGAAG TTCGCGAACT GCTGTCTCAG TACGACTTCC CGGGCGACGA CACTCCGATC  240GTTCGTGGTT CTGCTCTGAA AGCGCTGGAA GGCGACGCAG AGTGGGAAGC GAAAATCATC  300GAACTGGCTG GCTTCCTGGA TTCTTATATT CCGGAACCAG AGCGTGCGAT TGACAAGCCG  360TTCCTGCTGC CGATCGAAGA CGTATTCTCC ATCTCCGGTC GTGGTACCGT TGTTACCGGT  420CGTGTAGAGC GCGGTATCAT CAAAGTGGGC GAAGAAGTTG AAATCGTTGG TATCAAAGAG  480ACTCAGAAGT CTACCTGTAC TGGCGTTGAA ATGTTCCGCA AACTGCTGGA CGAAGGCCGT  540GCCGGTGAGA ACGTAGGTGT TCTGCTGCGT GGTATCAAAC GTGAAGAAAT CGAACGTGGT  600CAGGTACTGG CTAAGCCGGG CACCATCAAG CCGCACACCA AGTTCGAATC TGAAGTGTAC  660ATTCTGTCCA AAGATGAAGG CGGCCGTCAT ACTCCGTTCT TCAAAGGCTA CCGTCCGCAG  720TTCTACTTCC GTACTACTGA CGTGACTGGT ACCATCGAAC TGCCGGAAGG CGTAGAGATG  780GTAATGCCGG GCGACAACAT CAAAATGGTT GTTACCCTGA TCCACCCGAT CGCGATGGAC  840GACGGTCTGC GTTTCGCAAT CCGTGAAGGC GGCCGTACCG TTGGCGCGGG C           891(2)关于SEQ ID NO：165的信息(i)序列特征
(A)长度：881个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Shewanella putida(xi)序列描述：SEQ ID NO：165：ATGATCACTG GTGCTGCACA GATGGACGGC GCGATTCTGG TAGTCGCTTC AACAGACGGT    60CCAATGCCAC AGACTCGTGA GCACATCCTG CTTTCTCGTC AGGTTGGCGT ACCATTCATC   120ATCGTATTCA TGAACAAATG TGACATGGTA GATGACGAAG AGCTGTTAGA GCTAGTTGAG   180ATGGAAGTGC GTGAACTGTT ATCAGAATAC GATTTCCCAG GTGATGACTT ACCGGTAATC   240CAAGGTTCAG CTCTGAAAGC GCTAGAAGGC GAGCCAGAGT GGGAAGCAAA AATCCTTGAA   300TTAGCAGCGG CGCTGGATTC TTACATTCCA GAACCACAAC GTGACATCGA TAAGCCGTTC   360CTACTGCCAA TCGAAGACGT ATTCTCAATT TCAGGCCGTG GTACAGTAGT AACAGGTCGT   420GTTGAGCGTG GTATTGTACG CGTAGGCGAC GAAGTTGAAA TCGTTGGTGT ACGTGCGACA   480ACTAAGACAA CGTGTACTGG TGTAGAAATG TTCCGTAAAC TGCTTGACGA AGGTCGTGCA   540GGTGAGAACT GTGGTATTTT GTTACGTGGT ACTAAGCGTG ATGACGTAGA ACGTGGTCAA   600GTATTAGCGA AGCCAGGTTC AATCAACCCA CACACTACTT TTGAATCAGA AGTTTACGTA   660CTGTCAAAAG AAGAAGGTGG TCGTCACACG CCATTCTTCA AAGGCTACCG TCCACAGTTC   720TACTTCCGTA CAACTGACGT AACCGGTACT ATCGAACTGC CAGAAGGCGT AGAGATGGTA   780ATGCCAGGCG ATAACATCAA GATGGTAGTG ACACTGATTT GCCCAATCGC GATGGACGAA   840GGTTTACGCT TCGCAATCCG TGAAGGCGGT CGTACAGTGG T                       881(2)关于SEQ ID NO：166的信息(i)序列特征
(A)长度：897个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：橙色标桩菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：166：AACATGATCA CGGGCGCGGC GCAGATGGAC GGAGCGATTC TGGTGGTGTC CGCGGCCGAC     60GGCCCGATGC CCCAGACGCG TGAGCACATC CTGCTGGCCA GGCAGGTGGG CGTGCCCTAC    120ATCGTCGTCT TCCTGAACAA GGTGGACATG CTGGACGATC CGGAGCTGCG CGAGCTGGTG    180GAGATGGAGG TGCGCGACCT GCTCAAGAAG TACGAGTTCC CGGGCGACAG CATCCCCATC    240ATCCCTGGCA GCGCGCTCAA GGCGCTGGAG GGAGACACCA GCGACATCGG CGAGGGAGCG    300ATCCTGAAGC TGATGGCGGC GGTGGACGAG TACATCCCGA CGCCGCAGCG TGCGACGGAC    360AAGCCGTTCC TGATGCCGGT GGAAGACGTG TTCTCCATCG CAGGCCGAGG AACGGTGGCG    420ACGGGCCGAG TGGAGCGCGG CAAGATCAAG GTGGGCGAGG AAGTGGAGAT CGTGGGGATC    480CGTCCGACGC AGAAGACGGT CATCACGGGG GTGGAGATGT TCCGCAAGCT GCTGGACGAG    540GGCATGGCGG GAGACAACAT CGGAGCGCTG CTGCGAGGCC TGAAGCGCGA GGACCTGGAG    600CGTGGGCAGG TGCTGGCGAA CTGGGGGAGC ATCAACCCGC ACACGAAGTT CAAGGCGCAG    660GTGTACGTGC TGTCGAAGGA AGAGGGAGGG CGGCACACGC CGTTCTTCAA GGGATACCGG    720CCGCAGTTCT ACTTCCGGAC GACGGACGTG ACCGGAACGG TGAAGCTGCC GGACAACGTG    780GAGATGGTGA TGCCGGGAGA CAACATCGCC ATCGAGGTGG AGCTCATTAC TCCGGTCGCC    840ATGGAGAAGG AGCTGCCGTT CGCCATCCGT GAGGGTGGCC GCACGGTGGG CGCCGGC       897(2)关于SEQ ID NO：167的信息(i)序列特征
(A)长度：894个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：酿脓链球菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：167：AACATGATCA CTGGTGCCGC TCAAATGGAC GGAGCTATCC TTGTAGTTGC TTCAACTGAT      60GGACCAATGC CACAAACTCG TGAGCACATC CTTCTTTCAC GTCAGGTTGG TGTTAAACAC     120CTTATCGTGT TCATGAACAA AGTTGACCTT GTTGATGACG AAGAGTTGCT TGAATTAGTT     180GAGATGGAAA TTCGTGACCT TCTTTCAGAA TACGATTTCC CAGGTGATGA CCTTCCAGTT     240ATCCAAGGTT CAGCTCTTAA AGCTCTTGAA GGCGACACTA AATTTGAAGA CATCATCATG     300GAATTGATGG ATACTGTTGA TTCATACATT CCAGAACCAG AACGCGACAC TGACAAACCA     360TTGCTTCTTC CAGTCGAAGA CGTATTCTCA ATTACAGGTC GTGGTACAGT TGCTTCAGGA     420CGTATCGACC GTGGTACTGT TCGTGTCAAC GACGAAATCG AAATCGTTGG TATCAAAGAA     480GAAACTAAAA AAGCTGTTGT TACTGGTGTT GAAATGTTCC GTAAACAACT TGACGAAGGT     540CTTGCAGGAG ACAACGTAGG TATCCTTCTT CGTGGTGTTC AACGTGACGA AATCGAACGT     600GGTCAAGTTA TTGCTAAACC AAGTTCAATC AACCCACACA CTAAATTCAA AGGTGAAGTA     660TATATCCTTT CTAAAGACGA AGGTGGACGT CACACTCCAT TCTTCAACAA CTACCGTCCA     720CAATTCTACT TCCGTACAAC TGACGTAACA GGTTCAATCG AACTTCCAGC AGGTACAGAA     780ATGGTTATGC CTGGTGATAA CGTGACAATC AACGTTGAGT TGATCCACCC AATCGCCGTA     840GAACAAGGTA CTACTTTCTC AATCCGTGAA GGTGGACGTA CTGTTGGTTC AGGT           894(2)关于SEQ ID NO：168的信息(i)序列特征
(A)长度：897个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：Thiobacillus cuprinus(xi)序列描述：SEQ ID NO：168：AACATGATCA CCGGTGCGGC CCAGATGGAC GGCGCCATCC TGGTCGTGTC CGCCGCCGAC    60GGCCCCATGC CCCAAACCCG CGAGCACATC CTGCTGGCGC GTCAGGTGGG CGTGCCCTAC   120ATCATCGTGT TCCTCAACAA GTGCGACATG GTCGACGACG CCGAGCTGCT CGAACTCGTC   180GAGATGGAAG TGCGCGAGCT GCTGTCCAAG TACGACTTCC CCGGTGACGA CACCCCCATC   240ATCAAGGGCT CGGCCAAGCT GGCCCTCGAA GGCGACAAGG GCGAACTGGG CGAAGGCGCC   300ATTCTCAAGC TGGCCGAGGC CCTGGACACC TACATCCCCA CGCCCGAGCG GGCCGTCGAC   360GGCGCGTTCC TCATGCCCGT GGAAGACGTG TTCTCCATCT CCGGGCGCGG CACGGTGGTC   420ACCGGGCGTG TGGAGCGCGG CATCATCAAG GTCGGCGAGG AAATCGAGAT TGTCGGCCTC   480AAGCCCACCC TCAAGACCAC CTGCACCGGC GTGGAAATGT TCAGGAAGCT GCTCGACCAG   540GGCCAGGCCG GCGACAACGT CGGCATCTTG CTGCGCGGCA CCAAGCGCGA GGAAGTCGAG   600CGCGGCCAGG TGCTGTGCAA ACCCGGCTCG ATCAAGCCCC ACACCCACTT CACCGCCGAG   660GTGTACGTGC TGAGCAAGGA CGAGGGCGGC CGCCACACCC CCTTCTTCAA CAACTACCGC   720CCGCAGTTCT ACTTCCGCAC CACCGACGTC ACCGGCGCCA TCGAACTGCC CAAGGACAAG   780GAAATGGTCA TGCCCGGCGA TAATGTGAGC ATCACCGTCA AGCTCATCGC CCCCATCGCC   840ATGGAAGAAG GCCTGCGCTT CGCCATCCGC GAAGGCGGCC GCACCGTCGG CGCCGGC      897(2)关于SEQ ID NO：169的信息(i)序列特征
(A)长度：894个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：苍白密螺旋体(xi)序列描述：SEQ ID NO：169：AATATGATCA CGGGTGCTGC GCAGATGGAC GGTGGTATTC TCGTCGTGTC TGCGCCTGAC       60GGCGTTATGC CACAGACGAA GGAGCATCTT CTGCTCGCCC GTCAGGTTGG TGTTCCCTCC      120ATCATTGTTT TTTTGAACAA GGTTGATTTG GTTGATGATC CTGAGTTGCT AGAGCTGGTG      180GAAGAAGAGG TGCGTGATGC GCTTGCTGGA TATGGGTTTT CGCGTGAGAC GCCTATCGTC      240AAGGGGTCTG CGTTTAAAGC TCTGCAGGAT GGCGCTTCCC CGGAGGATGC AGCTTGTATT      300GAGGAACTGC TTGCGGCCAT GGATTCCTAC TTTGAAGACC CAGTGCGTGA CGACGCAAGA      360CCTTTCTTGC TCTCTATCGA GGATGTGTAC ACTATTTCTG GGCGTGGTAC CGTTGTCACG      420GGGCGCATCG AATGTGGGGT AATTAGTCTG AATGAAGAGG TCGAGATCGT CGGGATTAAG      480CCCACTAAGA AAACAGTGGT TACTGGCATT GAGATGTTTA ATAAGTTGCT TGATCAGGGA      540ATTGCAGGTG ATAACGTGGG GCTGCTTTTG CGCGGGGTGG ATAAAAAAGA GGTTGAGCGC      600GGTCAGGTGC TTTCTAAGCC CGGTTCTATT AAGCCACACA CCAAGTTTGA GGCGCAGATC      660TACGTGCTCT CTAAGGAAGA GGGTGGCCGT CACAGTCCTT TTTTTCAAGG TTATCGTCCG      720CAGTTTTATT TTAGAACTAC TGACATTACC GGTACGATTT CTCTTCCTGA AGGGGTAGAC      780ATGGTGAAGC CGGGGGATAA CACCAAGATT ATAGGTGAGC TCATCCACCC GATAGCTATG      840GACAAGGGTC TGAAGCTTGC GATTCGTGAA GGGGGGCGCA CTATTGCTTC TGGT            894(2)关于SEQ ID NO：170的信息(i)序列特征
(A)长度：891个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：解脲尿支原体(xi)序列描述：SEQ ID NO：170：AATATGATTA CAGGGGCAGC ACAAATGGAT GGAGCAATTT TAGTTATTGC TGCATCTGAT      60GGGGTTATGG CTCAAACTAA AGAACATATT TTATTAGCAC GTCAAGTTGG TGTTCCAAAA     120ATCGTTGTTT TCTTAAACAA ATGTGATTTC ATGACAGATC CAGATATGCA AGATCTTGTT     180GAAATGGAAG TTCGTGAATT ATTATCTAAA TATGGATTTG ATGGCGATAA CACACCAGTT     240ATTCGTGGTT CAGGTCTTAA GGCTTTAGAA GGAGATCCAG TTTGAGAAGC AAAAATTGAT     300GAATTAATGG ACGCAGTTGA TTCATGAATT CCATTACCAG AACGTAGTAC TGACAAACCA     360TTCTTATTAG CAATTGAAGA TGTATTCACA ATTTCAGGAC GTGGTACAGT AGTAACTGGA     420CGTGTTGAAC GTGGTGTATT AAAAGTTAAT GATGAGGTTG AAATTGTTGG TCTAAAAGAC     480ACTCAAAAAAC TGTTGTTAC AGGAATTGAA ATGTTTAGAA AATCATTAGA TCAAGCTGAA     540GCTGGTGATA ATGCTGGTAT TTTATTACGT GGTATTAAAA AAGAAGATGT TGAACGTGGT     600CAAGTACTTG TAAAACCAGG ATCAATTAAA CCTCACCGTA CTTTTACTGC TAAAGTTTAT     660ATTCTTAAAA AAGAAGAAGG TGGACGTCAT ACACCTATTG TTTCAGGATA CCGTCCACAA     720TTCTATTTTA GAACAACAGA TGTAACAGGT GCTATTTCAT TACCTGCTGG TGTTGATTTG     780GTTATGCCAG GTGATGACGT TGAAATGACT GTAGAATTAA TTGCTCCAGT TGCGATTGAA     840GATGGATCTA AATTCTCAAT CCGTGAAGGT GGTAAAACTG TAGGTCATGG T              891(2)关于SEQ ID NO：171的信息(i)序列特征
(A)长度：909个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：双链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(vi)来源：
(A)生物：产琥珀酸沃林氏菌(xi)序列描述：SEQ ID NO：171：AACATGATTA CAGGTGCTGC TCAAATGGAT GGCGCGATTC TTGTTGTTTC TGCGGCGGAT     60GGCCCCATGC CCCAAACTAG GGAGCACATT CTTCTTTCTC GACAAGTAGG CGTTCCTTAC    120ATCGTGGTTT TCTTGAACAA AGAAGATATG GTTGATGACG CTGAGCTTCT TGAGCTTGTT    180GAAATGGAAG TTAGAGAACT TCTTAGCAAC TACGACTTCC CTGGAGATGA CACTCCTATC    240GTTGCAGGTT CCGCTCTTAA AGCTCTTGAA GAGGCTAACG ACCAGGAAAA TGTTGGCGAG    300TGGGGCGAGA AAGTATTGAA GCTTATGGCT GAGGTTGACC GATATATTCC TACGCCTGAG    360CGAGATGTGG ATAAGCCTTT CCTTATGCCT GTTGAAGACG TATTCTCCAT CGCGGGTCGT    420GGAACCGTTG TGACAGGAAG AATTGAAAGA GGCGTGGTTA AAGTCGGTGA CGAAGTAGAA    480ATCGTTGGTA TCCGAAACAC ACAAAAAACA ACCGTAACTG GCGTTGAGAT GTTCCGAAAA    540GAGCTCGACA AGGGTGAGGC GGGTGACAAC GTTGGTGTTC TTTTGAGAGG CACCAAGAAA    600GAAGATGTTG AGAGAGGTAT GGTTCTTTGT AAAATAGGTT CTATCACTCC TCACACTAAC    660TTTGAAGGTG AAGTTTACGT TCTTTCCAAA GAGGAAGGCG GACGACACAC TCCATTCTTC    720AATGGATACC GACCTCAGTT CTATGTTAGA ACTACAGACG TTACCGGTTC TATCTCTCTT    780CCTGAGGGCG TAGAGATGGT TATGCCTGGT GACAACGTTA AGATCAATGT TGAGCTTATC    840GCTCCTGTAG CCCTCGAAGA GGGAACACGA TTCGCGATCC GTGAAGGTGG TCGAACCGTT    900GGTGCGGGT                                                            909(2)关于SEQ ID NO：172的信息(i)序列特征
(A)长度：26个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：6
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：12
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(ix)特征：
(A)名称/关键词：misc-feature
(B)位置：18
(D)其它信息：注“n＝次黄苷”(xi)序列描述：SEQ ID NO：172：TARTCNGTRA ANGCYTCNAC RCACAT                                        26(2)关于SEQ ID NO：173的信息(i)序列特征
(A)长度：21个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)  (xi)序列描述：SEQ ID NO：173：TCTTTAGCAG AACAGGATGA A                                           21(2)关于SEQ ID NO：174的信息(i)序列特征
(A)长度：20个碱基对
(B)类型：核酸
(C)链型：单链
(D)拓扑结构：线性(ii)分子类型：DNA(基因组)(xi)序列描述：SEQ ID NO：174：GAATAATTCC ATATCCTCCG                                             20

Claims (47)

1.使用特异性、普遍适用并灵敏的探针和/或扩增引物从怀疑含有下述细菌和/或真菌核酸的任何样品中确定下列来源的核酸的存在和/或量的方法：
-选自下列组中的抗生素抗性基因：blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aac6′-IIa、aacA4、aad(6′)、vanA、vanB、vanC、msrA、satA、aac(6′)-aph(2″)、vat、vga、ermA、ermB、ermC、mecA、int和sul，以及
-选自下列组中的特定细菌和真菌菌种：屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属、奈瑟氏球菌属、葡萄球菌属、链球菌属和假丝酵母属，
其中所述每一种核酸或其变体或其部分包含可与所述探针或引物杂交的选定靶区域；
所述方法包括下列步骤：在杂交或扩增的相同条件下使所述样品与所述探针或引物接触，并检测已杂交的探针或扩增产物的存在和/或量，以作为所述特定细菌和/或真菌菌种或属，同时还有所述细菌抗生素抗性基因的存在和/或量的指征。
2.根据权利要求1的方法，其中还使用特异的、普遍适用并灵敏的探针和/或引物以同时确定任何细菌或真菌的核酸的存在和/或量。
3.根据权利要求1的方法，其为直接对试验样品进行。
4.权利要求1的方法，其是直接对由细菌和/或真菌培养物或悬液组成的试验样品进行的。
5.权利要求1的方法，其中所述核酸均是在相同的杂交或扩增条件下进行检测的。
6.权利要求1的方法，其中所述核酸是用选自下列组中的方法扩增的：
a)聚合酶链反应(PCR)，
b)连接酶链反应(LCR)，
c)基于核酸序列的扩增(NASBA)
d)自身维持的序列复制(3SR)，
e)链置换扩增(SDA)，
f)分支DNA信号扩增(bDNA)，
g)转录介导的扩增(TMA)，
h)循环探针技术(CPT)，
i)嵌套PCR，和
j)多重PCR。
7.权利要求6的方法，其中所述核酸是用PCR法扩增的。
8.权利要求7的方法，其中PCR方法在同样扩增条件下，以每扩增循环为45-55℃30秒钟的退火步骤和95℃1秒钟的变性步骤，而没有特别用于延伸步骤的任何时间的程序进行，在1小时内完成对所述核酸存在情况的检测。
9.直接从试验样品或从细菌和/或真菌培养物检测、鉴定和/或定量测定选自下列一组中的微生物的方法：屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种、链球菌种和假丝酵母属种，该方法包括以下步骤：
a)使所述样品或从该样品中分离的所述微生物的基本均质的群体的微生物DNA沉积并固定在惰性载体上或留在溶液中，或者
将所述样品或所述从该样品分离的基本均质的微生物群体接种在惰性载体上，并在原位裂解该接种样品或分离微生物，以释放微生物DNA，
所述微生物DNA基本上制成单链形式；
b)在所述探针的核酸能够选择性地与所述微生物DNA杂交的条件下，使所述单链DNA与探针接触，从而形成杂交复合物，其中所述探针至少包括一种单链核酸，该单链核酸的核苷酸序列选自SEQ IDNO：26、27、28、29、30、120、131至134、31、140至143、32至36、120至124，其互补序列、其至少有12个核苷酸长的部分及其变体，并可特异地和普遍适用地相应与屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、腐生葡萄球菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种、链球菌属种和假丝酵母属种的菌株或典型代表一起退火；以及
c)检测所述惰性载体上或所述溶液中所述杂交复合物的存在作为所述试验样品中所述微生物的存在和/或量之指征。
10.检测试验样品中选自屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种、链球菌属种和假丝酵母属种的微生物的存在和/或量的方法，该方法包括以下步骤：
a)用含有至少一对长度至少有12个核苷酸的寡核苷酸引物的水溶液处理所述样品，所述引物之一能够与含有靶序列的所述微生物DNA的两条互补链之一选择性地杂交，并且所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板的靶序列的延伸产物，所述至少一对引物是针对所述微生物而相应选自SEQ ID NO：26、27、28、29、30、120、131至134、31、140至143、32至36、120至124中的核苷酸序列，其互补序列及其变体；
b)合成各个所述引物的延伸产物，所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增到可检测的水平：
c)检测所述试验样品中所述扩增靶序列的存在和/或量作为所述微生物的存在和/或量的指征。
11.权利要求10的方法，其中适用于检测屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种和链球菌属种的所述引物对分别由SEQ ID NO：1和2、3和4、5和6、7和8、9和10、11和12、13和14，15和16、17至20、21和22限定。
12.直接从试验样品或细菌培养物中检测任何细菌的存在和/或量的方法，该方法包括以下步骤：
a)将样品或分离自该样品中的基本均质的细菌群体的细菌DNA沉积和固定在惰性载体上或者留在溶液中，或者
将所述样品或分离自该样品的所述基本均质的细菌群体接种在惰性载体上，并原位裂解所述接种样品或分离的细菌以释放细菌DNA，
所述细菌DNA基本上制成单链形式；
b)在探针的核酸能够选择性地与所述细菌DNA杂交的条件下，使所述单链DNA与所述探针接触，从而形成杂交复合物，其中所述探针包括至少一种单链核酸，该单链核酸的核苷酸序列选自SEQ IDNO：118、119、125至171，与之互补的序列、其长度至少有12个核苷酸的部分及其变体，并且能与任何细菌种类的菌株或典型样品特异并普遍适用地退火；和
c)检测所述惰性载体上或所述溶液中所述杂交复合物的存在作为所述试验样品中任何细菌的存在和/或量之指征。
13.检测试验样品中任何细菌的存在和/或量的方法，该方法包括以下步骤：
a)用含有至少一对长度至少有12个核苷酸的寡核苷酸引物的水溶液处理所述样品，所述引物之一能够与含有靶序列的任何细菌DNA的两条互补链之一选择性地杂交，并且所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物，所述至少一对引物选自SEQ ID NO：118、119、125至171内的核苷酸序列、其互补序列和其变体：
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增至可检测水平；而且
c)检测所述已扩增的靶序列的存在和/或量，作为所述样品中任何细菌的存在和/或量的指征。
14.权利要求13的方法，其中所述引物对限定于SEQ ID NO 23和24中。
15.直接从试验样品或细菌培养物中得到任何细菌的tuf序列的方法，其包括以下步骤：
a)用含有一对引物的水溶液处理所述样品，所述引物具有从选自SEQ ID NO：107和108、其至少有12个核苷酸长的部分、其互补序列及其变体的核苷酸序列中选出的序列，并且所述引物之一能够与含有靶序列的所述细菌tuf基因的两条互补链之一选择性地杂交，而所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物；
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增到可检测水平，和
c)检测所述扩增的靶序列的存在和/或量，以及
d)使用任何DNA测序方法确定所述扩增的靶序列的核苷酸序列。
16.直接从试验样品或真菌培养物中检测任何真菌的存在和/或量的方法，该方法包括以下步骤：
a)将样品或分离自该样品的基本均质的真菌群体的真菌DNA沉积和固定在惰性载体上或者留在溶液中，或者
将所述样品或分离自该样品的所述基本均质的真菌群体接种在惰性载体上，并原位裂解所述接种样品或分离的真菌以释放真菌DNA，
所述真菌DNA基本上制成单链形式；
b)在探针的核酸能够选择性地与所述真菌DNA杂交的条件下，使所述单链DNA与所述探针接触，从而形成杂交复合物，其中所述探针包含至少一种单链核苷酸序列，该核苷酸序列选自SEQ ID NO：120至124，与之互补的序列、其长度至少有12个核苷酸的部分及其变体，并且能与任何真菌的菌株或代表特异并普遍地退火；和
c)检测所述惰性载体上或所述溶液中所述杂交复合物的存在作为所述试验样品中任何真菌的存在和/或量之指征。
17.检测试验样品中任何真菌的存在和/或量的方法，该方法包括以下步骤：
a)用含有至少一对长度至少有12个核苷酸的寡核苷酸引物的水溶液处理所述样品，所述引物之一能够与含有靶序列的任何真菌DNA的两条互补链之一选择性地杂交，并且所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物，所述至少一对引物是从选自SEQ ID NO：120至124内、其互补序列和其变体的核苷酸序列中选出的；
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增至可检测水平；和
c)检测所述扩增之靶序列的存在和/或量作为所述样品中任何真菌的存在和/或量的指征。
18.直接从试验样品或真菌培养物中得到任何真菌的tuf序列的方法，其包括以下步骤：
a)用含有一对引物的水溶液处理所述样品，所述引物具有从选自SEQ ID NO：109和172、其至少有12个核苷酸长的部分、其互补序列及其变体的一种核苷酸序列中选出的序列，并且所述引物之一能够与含有靶序列的所述真菌tuf基因的两条互补链之一选择性地杂交，而所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物；
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增到可检测水平，和
c)检测所述扩增的靶序的存在和/或量，以及
d)使用任何DNA测序方法确定所述扩增的靶序列的核苷酸序列。
19.权利要求1限定的方法，其包括直接从试验样品或细菌培养物估计由选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanB、vanC的细菌抗生素抗性基因介导的细菌抗性的存在，该方法包括以下步骤：
a)将样品或分离自该样品中的基本均质的细菌群体的细菌DNA沉积和固定在惰性载体上或者留在溶液中，或者
将所述样品或分离自该样品的所述基本均质的细菌群体接种在惰性载体上，并原位裂解所述接种样品或分离的细菌以释放细菌DNA，
所述细菌DNA基本上制成单链形式；
b)使所述单链DNA与探针接触，所述探针包含至少一个选自SEQ ID NO：110、111、112、113、114、115、116、117、其互补序列及变体的长度至少有12个核苷酸的单链核苷酸序列，它能够与所述相应细菌抗生素抗性基因特异杂交；并且
c)检测杂交复合物的存在，作为由所述细菌抗生素抗性基因之一介导的细菌抗性的指征。
20.权利要求1限定的方法，其包括直接从试验样品或细菌培养物内评估选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanB、vanC的细菌抗生素抗性基因介导的细菌抗性的存在情况，该方法包括以下步骤：
a)用含有至少1对长度至少有12个核苷酸的引物的水溶液处理所述样品，所述引物之一能够与含有靶序列之所述细菌抗生素抗性基因的两条互补链之一选择性地杂交，而所述引物的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物，针对所述细菌抗生素抗性基因，所述至少1对引物是从SEQ ID NO：110、111、112、113、114、115、116、117，其互补序列及其变体的核苷酸序列内选出的；
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增至可检测的水平；以及
c)检测所述扩增的靶序列的存在和/或量，作为由所述细菌抗生素抗性基因之一介导的细菌抗性之指征。
21.权利要求1限定的方法，其包括直接从试验样品或细菌培养物估计选自blatcm、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aac6′-IIa、aacA4、aad(6′)、vanA、vanB、vanC、msrA、satA、aac(6′)-aph(2″)、vat、vga、ermA、ermB、ermC、mecA、int和sul的细菌抗性基因的存在，该方法包括以下步骤：
a)用含有至少1对具有选自SEQ ID NO：37至40、41至44、45至48、49和50、51和52、53和54、55和56、57和58、59和60、61至64、65和66、173和174、67至70、71至74、75和76、77至80、81和82、83至86、87和88、89和90、91和92、93和94、95和96、97和98、99至102、103至106、其长度至少有12个核苷酸的部分、其互补序列、其变体及其混合物之序列的引物的水溶液处理所述样品，所述引物对之一能够与含有靶序列的相应细菌抗生素抗性基因的两条互补链之一选择性地杂交，而所述引物对的另一个能够与所述链的另一条杂交，从而形成含有作为模板之靶序列的延伸产物；
b)合成各个所述引物的延伸产物，其中所述延伸产物含有靶序列，并在有所述靶序列时将其扩增到可检测的水平；以及
c)检测所述扩增的靶序列的存在和/或量，作为由所述细菌抗生素抗性基因之一介导的细菌抗性之指征。
22.具有SEQ ID NO：26至36、110至117之一的核苷酸序列、其部分、其互补序列及其变体的一种核酸，当其以单链形式存在时可作为探针或作为引物普遍适用地并特异地与靶细菌或真菌DNA杂交。
23.具有SEQ ID NO：1至25、37至109和172至174之一的核苷酸序列、其部分、其互补序列及其变体的一种寡核苷酸，它可作为探针或作为引物普遍适用地并特异地与靶细菌或真菌DNA杂交。
24.含有如权利要求22中限定的核酸的重组质粒。
25.已被权利要求24的重组质粒转化了的重组体宿主。
26.根据权利要求25的重组体宿主，其中所述宿主是大肠杆菌。
27.检测和/或定量测定选自屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种、链球菌属种和假丝酵母属种的微生物种和/或属之任何组合的核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：26至36、120至124、131至134、140至143、其互补序列及其变体的长度至少有12个核苷酸的探针的任何适当组合。
28.检测和/或定量测定选自屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种、链球菌属种和假丝酵母属种的微生物种和/或属之任何组合的核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：26至36，120至124，131至134，140至143，其互补序列及其变体的长度至少为12个核苷酸的引物的任何适当组合。
29.检测和/或定量测定选自屎肠球菌、单核细胞增生利斯特氏菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、白假丝酵母、肠球菌属种、奈瑟氏球菌属种、葡萄球菌属种和链球菌属种的微生物种和/或属之任何组合的核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：1至22、其长度至少有12个核苷酸的部分、其互补序列及其变体的引物的任何适当组合。
30.检测和/或定量测定选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanC的细菌抗性基因的任何组合之核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：110至117、其互补序列及其变体的长度至少为12个核苷酸的探针的任何适当组合。
31.检测和/或定量测定选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanC的细菌抗性基因的任何组合之核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：110至117、其互补序列及其变体的长度至少为12个核苷酸的引物的任何适当组合。
32.检测和/或定量测定选自blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aacA4、aac6′-IIa、aad(6′)、ermA、ermB、ermC、mecA、vanA、vanB、vanC、satA、aac(6′)-aph(2″)、vat、vga、msrA、int和sul的细菌抗性基因的任何组合之核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：370至106、173和174的引物，其具有至少为12个核苷酸长的部分，其互补序列及其变体的任何适当组合。
33.检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌的核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：118至171，其互补序列及其变体的长度至少为12个核苷酸的探针的任何组合。
34.检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌的核酸的诊断试剂盒，其包括选自SEQ ID NO：118至171，其互补序列及其变体的长度至少为12个核苷酸的引物的任何组合。
35.检测和/或定量测定任何细菌的核酸的诊断试剂盒，其包括具有从SEQ ID NO：23和24限定的核苷酸序列，其长度至少有12个核苷酸的部分，其互补序列及其变体内选择出的序列的引物对。
36.如权利要求27中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：118至171的核苷酸序列，其互补序列及其变体内选择的长度至少为12个核苷酸的探针的任何组合，用以同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌之核酸。
37.如权利要求28中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：118至171的核苷酸序列，其互补序列及其变体内选出的长度至少12个核苷酸的引物的任何适当组合，用以同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌之核酸。
38.如权利要求29中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：23和24限定的核苷酸序列，其具有至少12个核苷酸长的部分，其互补序列及其变体内选择的序列的引物对，用以同时检测和/或定量测定任何细菌的核酸。
39.如权利要求27中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：110至117的核苷酸序列、其互补序列及其变体内选择的长度至少为12个核苷酸的探针的任何组合，用于同时检测和/或定量测定选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanB、vanC的任何细菌抗生素抗性基因的核酸。
40.如权利要求28中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：110至117的核苷酸序列、其互补序列及其变体内选择的长度至少为12个核苷酸的引物的任何适当组合，用于同时检测和/或定量测定选自blaoxa、blaZ、aac6′-IIa、ermA、ermB、ermC、vanB、vanC的任何细菌抗生素抗性基因的核酸。
41.如权利要求30中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从SEQID NO：37至106、173和174的核苷酸序列、其互补序列及其变体内选择的长度至少为12个核苷酸的引物的任何适当组合，用于同时检测和/或定量测定选自blatem、blashv、blarob、blaoxa、blaZ、aadB、aacC1、aacC2、aacC3、aacA4、aac6′-IIa、aad(6′)、ermA、ermB、ermC、mecA、vanA、vanB、vanC、satA、aac(6′)-aph(2″)、vat、vga、msrA、int和sul的任何细菌抗生素抗性基因的核酸。
42.如权利要求29中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从选自SEQ ID NO：118至171，其互补序列及其变体的核苷酸序列内选择出的长度至少为12个核苷酸的探针的任何组合，以同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌之核酸。
43.如权利要求31中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从选自SEQ ID NO：118至171，其互补序列及其变体的核苷酸序列内选择出的长度至少为12个核苷酸的引物的任何组合，以同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌之核酸。
44.如权利要求32中限定的的诊断试剂盒，其包括具有从选自SEQ ID NO：23和24、其具有至少12个核苷酸长的部分、其互补序列及其变体的核苷酸序列内选出的序列的一对引物，以用于同时检测和/或定量测定任何细菌的核酸。
45.如权利要求39中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从选自SEQ ID NO：118至171、其互补序列及其变体的核苷酸序列中选出的长度至少12个核苷酸的探针的任何组合，以用于同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌的核酸。
46.如权利要求40中限定的诊断试剂盒，其进一步包括从选自SEQ ID NO：118至171、其互补序列及其变体的核苷酸序列中选出的长度至少12个核苷酸的引物的任何适当组合，以用于同时检测和/或定量测定任何细菌和/或真菌的核酸。
47.如权利要求41中限定的诊断试剂盒，其进一步包括具有从选自SEQ ID NO：23和24的核苷酸序列、其长度至少有12个核苷酸的部分、其互补序列及其变体内选出的序列的一对引物，以用于同时检测和/或定量测定任何细菌的核酸。
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