CN110753693A - Egfr蛋白水解靶向嵌合分子和相关使用方法 - Google Patents

Egfr蛋白水解靶向嵌合分子和相关使用方法 Download PDF

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Abstract

本公开涉及双官能化合物，所述双官能化合物可用作受体酪氨酸激酶(RTK)蛋白的调节剂。具体地，本公开涉及双官能化合物，所述双官能化合物在一端上含有结合E3泛素连接酶的配体，并且在另一端上含有结合靶蛋白的部分，使得所述靶蛋白被置于所述泛素连接酶附近，以实现所述靶蛋白的泛素化和降解(和抑制)。本公开展现出与所述靶蛋白的降解/抑制相关的广泛范围的药理学活性。用本公开的化合物和组合物治疗或预防起因于所述靶蛋白的聚集或累积的疾病或病症。

Description

EGFR蛋白水解靶向嵌合分子和相关使用方法
相关申请的引证
本申请要求2016年12月23日提交的标题为EGFR蛋白水解靶向嵌合分子和相关使用方法(EGFR Proteolysis Targeting Chimeric Molecules and Associated Methodsof Use)的美国临时专利申请序列号62/438,901以及2017年9月26日提交的标题为EGFR蛋白水解靶向嵌合分子和相关使用方法(EGFR Proteolysis Targeting ChimericMolecules and Associated Methods of Use)的美国临时专利申请序列号62/563,494的优先权，所述专利申请全文以引证方式并入本文。
联邦支持声明
本发明是在政府支持下根据美国国立卫生研究院的授权号R35CA197589完成的。政府对本发明拥有某些权利。
技术领域
本说明书提供了包含靶蛋白结合部分和E3泛素连接酶结合部分的双官能化合物，以及相关的使用方法。双官能化合物可用作靶向多肽、尤其是EGFR的泛素化和后续降解的调节剂，所述靶向多肽被根据本发明的双官能化合物降解和/或以其他方式抑制。
背景技术
大多数小分子药物在紧密和明确界定的口袋中结合酶或受体。另一方面，由于其大接触表面以及所牵涉的浅沟或平坦界面，蛋白质-蛋白质相互作用众所周知难以使用小分子靶向。E3泛素连接酶(其中数百种在人中已知)赋予关于泛素化的底物特异性，并且因此，由于其对于某些蛋白质底物的特异性，是比一般蛋白酶体抑制剂更有吸引力的治疗靶。E3连接酶配体的开发已证明是挑战性的，部分是由于它们必须破坏蛋白质-蛋白质相互作用的事实。然而，最近的发展已提供了与这些连接酶结合的特异性配体。例如，自从发现第一个小分子E3连接酶抑制剂nutlin以来，已报道了靶向E3连接酶的另外化合物，但该领域仍是发展不完全的。
具有令人兴奋的治疗潜力的一种E3连接酶是希佩尔-林道(von Hippel-Lindau,VHL)肿瘤抑制因子，E3连接酶复合物VCB的底物识别亚基，其也由延伸蛋白B和C、Cul2和Rbx1组成。VHL的主要底物是缺氧诱导因子1α(HIF-1α)，其是响应低氧水平上调基因例如促血管生成生长因子VEGF和红血细胞诱导细胞因子促红细胞生成素的转录因子。生成针对E3连接酶的底物识别亚基的希佩尔-林道(VHL)的第一个小分子配体，并且获得晶体结构，证实该化合物模拟转录因子HIF-1α(VHL的主要底物)的结合模式。
人小脑蛋白(cereblon)是人中由CRBN基因编码的蛋白质。CRBN直向同源物从植物到人都是高度保守的，这强调了它的生理重要性。人小脑蛋白与受损的DNA结合蛋白1(DDB1)、Cullin-4A(CUL4A)和cullin调节剂1(ROC1)形成E3泛素连接酶复合物。这种复合物使许多其他蛋白质泛素化。通过尚未完全阐明的机制，靶蛋白的人小脑蛋白泛素化导致成纤维细胞生长因子8(FGF8)和成纤维细胞生长因子10(FGF10)的水平增加。FGF8依次又调节许多发育过程，例如肢体和听泡形成。净结果是这种泛素连接酶复合物对于胚胎中的肢体生长是重要的。在不存在人小脑蛋白的情况下，DDB1与DDB2形成复合物，所述DDB2充当DNA损伤结合蛋白。
凋亡抑制蛋白(IAP)是参与抑制细胞凋亡(即细胞死亡)的蛋白质家族。人类IAP家族包括8名成员，许多其他生物具有IAP同源物。IAP包含E3连接酶特异性结构域以及识别底物并促进其泛素化的杆状病毒IAP重复(BIR)结构域。IAP促进泛素化并且可以直接结合和抑制半胱天冬酶。半胱天冬酶是实施细胞凋亡的蛋白酶(例如半胱天冬酶-3、半胱天冬酶-7和半胱天冬酶-9)。因此，通过半胱天冬酶的结合，IAP抑制细胞死亡。
小分子受体酪氨酸激酶(RTK)抑制剂的发现极大地促进了这些关键蛋白在正常和致癌信号传导中的研究。真核细胞增殖是由同源生长因子结合后的RTK激活驱动的，并且由于蛋白质过度表达至超生理水平，或由于赋予不依赖于生长因子的激活的突变，许多形式的癌症由特定RTK的过度激活驱动。例如，表皮生长因子受体(EGFR)涉及癌症和炎性疾病。活化的EGFR通过其他若干种蛋白质引发下游激活和信号传导，导致DNA合成和细胞增殖。
为了在延长的时间内获得RTK抑制，需要在持续的饱和浓度下暴露于小分子激酶抑制剂。研究表明，癌细胞可以共同选择其他现有的RTK信号传导途径，以允许抑制的RTK继续作为节点存在，从而恢复下游的致癌信号传导。
与抑制激酶活性不同，RTK的降解是一种策略，有可能产生更完全和持久的下游信号传导失效并避免“激酶组重新布线”的问题，从而抑制受体信号传导会导致经由备用激酶激活代偿反馈。实际上，RTK消除将阻止无活性激酶作为致癌信号传导的支架节点持续存在。例如，小分子介导的蛋白质本身的降解而不是激酶结构域的抑制可以提供优势，例如抑制信号传导所需的药物暴露时间减少和靶向激酶非依赖性功能的能力。
双官能化合物(诸如美国专利申请公布2015-0291562和2014-0356322(以引用方式并入本文)中描述的那些)用于将内源蛋白质募集到E3泛素连接酶上以进行降解。确切地说，本公布描述了双官能或蛋白分解靶向嵌合(PROTAC)化合物，其适用作多种多肽和蛋白质的靶向泛素化调节剂，所述多肽和蛋白质在靶向泛素化之后被双官能化合物降解和/或以其他方式抑制。双官能化合物通过靶蛋白的特异性降解来提供治疗效果。
然而，考虑到跨膜蛋白的细胞定位受限并且膜结合受体通过细胞溶质机制进行泛素化的可及性不确定，一个突出的问题是PROTAC方法是否能够诱导跨膜蛋白的降解。PROTAC可以提供关键优势，例如改善的物理化学性质、降低的毒性、简便的模块化设计和确定的降解机制。
本领域存在对于与RTK(例如EGFR、IGFR和HGFR)过表达或过度活跃相关的疾病的有效治疗的持续需求。因此，靶向RTK的小分子治疗剂对于治疗RTK相关疾病是非常理想的。
发明内容
本公开描述了双官能化合物及其使用方法，所述双官能化合物用于将内源RTK蛋白募集到E3泛素连接酶上以进行泛素化和后续降解。RTK功能的持续丧失可使用蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)(一种用于翻译后蛋白质降解的技术)来实现。通过化学束缚两种不同蛋白质(E3泛素连接酶和目的蛋白质)的配体，产生了一种新的药理学实体，它能促进目的蛋白质的泛素化和蛋白酶体降解。它对靶蛋白水平的净效应类似于使用RNAi技术可实现的效果；然而，PROTAC的小分子方法不具有所提出的基于核酸的方式的固有缺陷。实际上，PROTAC与RTK抑制剂相当，因为它们都适于可调节的剂量并且可提供时间控制以实现所需的信号失活水平，也不需要对细胞进行任何遗传操纵/修饰以便起作用。
因此，本公开提供了双官能蛋白水解靶向嵌合(PROTAC)化合物，其可用作靶向蛋白质泛素化和后续降解的调节剂。本文所提供的PROTAC化合物的优势在于，与来自几乎任何蛋白质类别或家族的靶向多肽的降解/抑制一致，可以存在广谱药理学活性。此外，本说明书提供了使用有效量的如本文所述化合物治疗或改善疾病病状如癌症的方法。
在一个方面，本公开提供了双官能或PROTAC化合物，该化合物包含E3泛素连接酶结合部分(即，E3泛素连接酶的配体或“ULM”基团)和结合RTK的部分如表皮生长因子受体(EGFR)蛋白(即，蛋白质/多肽靶向部分或“PTM”基团)，使得RTK蛋白被置于泛素连接酶附近以实现该蛋白的降解(和抑制)。
在一个优选的实施方案中，ULM(泛素化连接酶调节剂)可以是希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)，或人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分(CLM)，或小鼠双微体2同源物(MDM2)E3泛素连接酶结合部分(MLM)，或IAP E3泛素连接酶结合部分(即“ILM”)。例如，双官能化合物的结构可以描绘为：
[PTM]–[ULM]，
其中PTM是RTK(例如，EGFR)结合部分，并且ULM是E3泛素连接酶结合部分。
如本文所示的PTM和ULM部分(例如，VLM、CLM、MLM或ILM)的相应位置以及其数目仅为了举例而提供，并非旨在以任何方式限制所述化合物。如本领域技术人员所理解的，可以合成如本文所述的双官能化合物，使得各个官能部分的数目和位置可以根据需要而变。
在某些实施方案中，双官能化合物还包含化学接头(“L”)。在该实例中，双官能化合物的结构可以描绘为：
[PTM]-L-[ULM]，
其中PTM是RTK(例如，EGFR)结合部分，L是接头，例如将PTM偶联至ULM的键或化学基团，并且ULM是IAP E3泛素连接酶结合部分，或希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)，或人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分(CLM)，或小鼠双微体2同源物(MDM2)E3泛素连接酶结合部分(MLM)。
例如，双官能化合物的结构可以描绘为：
[PTM]-L-[VLM或CLM或MLM或ILM]
其中PTM是RTK(例如，EGFR)结合部分，L是偶联PTM和VLM、CLM、MLM、ILM或它们的组合中的至少一种的接头(例如键或化学接头基团)；VLM是与VHL E3连接酶结合的希佩尔-林道E3泛素连接酶结合部分；CLM是与人小脑蛋白结合的人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分；MLM是MDM2 E3泛素连接酶结合部分；并且ILM是与IAP结合的IAP结合部分。
在某些优选的实施方案中，ILM是AVPI四肽片段。因此，在某些另外的实施方案中，双官能化合物的ILM分别包含氨基酸丙氨酸(A)、缬氨酸(V)、脯氨酸(P)和异亮氨酸(I)或它们的非天然模拟物。在另外的实施方案中，AVPI四肽片段的氨基酸通过酰胺键(即，–C(O)NH–或–NHC(O)–))彼此连接。
在某些实施方案中，如本文所述的化合物包含多个独立选择的ULM、多个PTM、多个化学接头或它们的组合。
在某些实施方案中，ILM包含化学部分，例如本文所述的那些。
在另外的实施方案中，VLM可以是羟脯氨酸或其衍生物。此外，其他设想的VLM包含在美国专利申请公布号2014/03022523中，如上所述，该申请公布全文并入本文。
在一个实施方案中，CLM包含衍生自酰亚胺、硫代酰亚胺、酰胺或硫代酰胺的化学基团。在一个具体实施方案中，化学基团是邻苯二甲酰亚胺基团或其类似物或衍生物。在某些实施方案中，CLM是沙利度胺、来那度胺、泊马度胺、其类似物、其电子等排物或其衍生物。其他设想的CLM在美国专利申请公布号2015/0291562中有所描述，该申请公布全文并入本文。
在某些实施方案中，MLM可以是nutlin或其衍生物。此外，其他设想的MLM包含在2016年7月11日提交的美国专利申请15/206,497中，如上所述，该专利申请全文并入本文。在某些另外的实施方案中，双官能化合物的MLM包含化学部分，例如取代的咪唑啉、取代的螺-吲哚酮、取代的吡咯烷、取代的哌啶酮、取代的吗啉酮、取代的吡咯并嘧啶、取代的咪唑并吡啶、取代的噻唑并咪唑啉、取代的吡咯并吡咯烷酮和取代的异喹啉酮。在另外的实施方案中，MLM包含上述核心结构，其中相邻的双芳基取代以顺式或反式构型定位。
在某些实施方案中，“L”是键。在另外的实施方案中，接头“L”是具有1至20范围内的线性非氢原子数的连接子。连接子“L”可包含但不限于官能团，例如醚、酰胺、烷烃、烯烃、炔烃、酮、羟基、羧酸、硫醚、亚砜和砜。接头可包含芳族、杂芳族、环状、双环和三环部分。卤素如Cl、F、Br和I的取代可包含在接头中。在氟取代的情况下，可包含单个或多个氟。
在某些实施方案中，VLM是反式-3-羟脯氨酸的衍生物，其中反式-3-羟脯氨酸中的氮和羧酸都被官能化为酰胺。
在某些实施方案中，CLM是哌啶-2,6-二酮的衍生物，其中哌啶-2,6-二酮可以在3-位被取代，并且3-取代可以是具有C-N键或C-C键的双环杂芳族。CLM的实例可以是但不限于泊马度胺、来那度胺和沙利度胺以及它们的衍生物。
在某些实施方案中，本说明书提供了具有选自如图2所述的化合物1-351的结构的化合物。在某些实施方案中，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的至少一种选自如图2所述的化合物1-351的化合物以及药学上可接受的载体或赋形剂。在某些实施方案中，本说明书提供了用于共同施用(例如，单独地或以单一剂型)的组合，其包含有效量的至少一种如本文所述的化合物、至少一种另外的生物活性剂和药学上可接受的载体或赋形剂。在某些实施方案中，另外的生物活性剂是抗肿瘤剂。
在另一方面，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式和药学上可接受的载体。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物，例如人)中的蛋白质降解，并且可以用于治疗或改善通过降解的蛋白质调节的疾病状态或状况。在某些实施方案中，如本文所述的治疗组合物可用于实现所关注蛋白质的降解，以治疗或改善疾病，例如癌症。
在又一方面，本公开提供了泛素化/降解细胞中的RTK靶蛋白(例如EGFR)的方法。在某些实施方案中，该方法包括施用如本文所述的双官能化合物，该双官能化合物包含优选通过接头部分连接的ILM和PTM、PTM和VLM、或PTM和CLM、或PTM和MLM，如本文其他地方所述，其中VLM/ILM/CLM/MLM通过接头偶联至PTM以靶向与PTM结合的蛋白质以进行降解。类似地，PTM可通过接头偶联至VLM或CLM或MLM或ILM以靶向蛋白质或多肽进行降解。当靶蛋白被置于E3泛素连接酶附近时，将发生靶蛋白的降解，从而导致靶蛋白的作用的降解/抑制和蛋白质水平的控制。通过本公开提供的蛋白质水平的控制提供了疾病状态或状况的治疗，其通过降低患者细胞中该蛋白质的水平而通过靶蛋白调节。
在另一方面，本说明书提供了用于治疗或改善受试者或患者(例如动物，例如人类)的疾病、病症或其症状的方法，该方法包括向有需要的受试者施用组合物，该组合物包含有效量(例如治疗有效量)的本文所述化合物或其盐形式，和药学上可接受的载体，其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。
在另一方面，本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的所关注蛋白质降解的影响的方法。
前述一般实用领域仅为了举例而给出，并且不希望对本公开的范围和所附权利要求书构成限制。根据本权利要求、说明书和实例，本领域普通技术人员将了解与本公开的组合物、方法和方法相关的另外目的和优点。例如，本公开的各个方面和实施方案可以众多组合利用，所有这些组合都由本说明书明确地加以考虑。这些另外的方面和实施方案明确地包含在本公开的范围内。本文用于阐明本发明的背景并且在特定情况下提供关于实践的另外细节的出版物和其他材料以引用方式并入。
附图说明
并入本说明书中且构成本说明书的一部分的附图示出了本公开的若干实施方案，并且连同本说明书一起用于解释本发明的原理。附图仅用于示出本发明的实施方案的目的，并且不应理解为对本发明的限制。根据与附图结合的下述详细描述，本发明的另外的目的、特征和优点将变得显而易见，所述附图示出了本发明的例示性实施方案，其中：
图1A和图1B。PROTAC功能的一般原理的图示。(A)示例性PROTAC包含蛋白质靶向部分(PTM；深色阴影矩形)、泛素连接酶结合部分(ULM；浅色阴影三角形)和任选的将PTM偶联或束缚至ULM的接头部分(L；黑线)。(B)示出了如本文所述的PROTAC的功能用途。简而言之，ULM识别并结合特定的E3泛素连接酶，并且PTM结合并募集靶蛋白，使其紧密接近E3泛素连接酶。典型地，E3泛素连接酶与E2泛素结合的蛋白质复合，且单独或通过E2蛋白质催化泛素(深色圆圈)连接到靶蛋白上的赖氨酸，此连接是通过异肽键达成。然后靶向聚泛素化蛋白质(最右侧)以便细胞的蛋白酶体机器使其降解。
图2.如本文所述的示例性PROTAC化合物的表。
图3.如本文所述的示例性PROTAC化合物的结构。(tPSA＝总表面积)。1-基于拉帕替尼的PROTAC(2PEG接头)；2-基于拉帕替尼的PROTAC非对映体(2PEG接头)；3-基于吉非替尼的PROTAC；4-基于阿法替尼的PROTAC；5-基于拉帕替尼的PROTAC(3PEG接头)；6-基于拉帕替尼的PROTAC非对映体(3PEG接头)；7-基于佛瑞替尼(Foretinib)的PROTAC；8-基于佛瑞替尼的PROTAC非对映体。
图4A-G.图3的PROTAC对EGFR和突变体的降解活性。图4A-F–用递增剂量的指定化合物处理24小时的表达不同EGFR变体的细胞的免疫印迹。图4A–用基于拉帕替尼的PROTAC1处理过的OVCAR8细胞。图4B–用化合物2(基于拉帕替尼的PROTAC 1的无活性非对映体)处理过的OVCAR8细胞。图4C–表达用基于拉帕替尼的PROTAC 1处理的FLAG标记的外显子20插入(ASV复制)EGFR的HeLa细胞。图4D–用基于吉非替尼的PROTAC 2处理过的表达外显子19缺失EGFR的HCC827细胞。图4E–用基于吉非替尼的PROTAC 3处理过的表达L858R EGFR的H3255细胞。图4F–用基于阿法替尼的PROTAC 4处理过的表达双重突变体(L858R/T790M)EGFR的H1975细胞。图4G–DC50(达到半最大降解的浓度)和Dmax(最大降解百分比)值的汇总表。
图5A-D.通过图3的化合物进行PROTAC介导的选择性HER2降解。图5–采用不同的接头长度赋予EGFR对HER2的PROTAC选择性。将OVCAR8细胞用PROTAC 1或5处理24小时，然后裂解并探测EGFR、HER2和微管蛋白(作为上样对照)。图5B–用指定化合物浓度处理72小时后SKBr3细胞中的细胞增殖测定。图5C–在48小时内用亚致死浓度(500nM)的PROTAC 1或非对映体2处理SKBr3细胞显示出下游信号传导逐渐增加，这与先前在用非对映体而不是PROTAC的SKBr3细胞中观察到的激酶组重新布线一致。图5D–在用500nM PROTAC 1或非对映体2处理48小时后c-Met磷酸化的免疫印迹分析。
图6A-C.图6A–基于吉非替尼的PROTAC 3保留了野生型EGFR。在免疫印迹之前，用递增剂量的PROTAC 3或DMSO对照处理OVCAR8细胞24小时。图6B/C–PROTAC1(B)和非对映体2(C)在SKBr3细胞中的表征。在免疫印迹之前，在全血清中用递增剂量的PROTAC 1或非对映体2处理细胞24小时。
图7A-F.基于佛瑞替尼的PROTAC在GTL16细胞中的表征。图7A/B–在免疫印迹分析之前，在含有全血清的培养基中用递增浓度的PROTAC 7(A)或非对映体8(B)处理GTL16细胞24小时。图7C–在免疫印迹分析之前，用500nM PROTAC 7或500nM非对映体8处理48小时的细胞的代表性印迹图。7D–洗脱实验的定量。在指定时间点用指定化合物处理后归一化为微管蛋白的c-MET水平。3个独立重复样和误差条的平均值表示S.E.M。图7E–竞争实验中使用的VHL配体9的结构。图7F–PROTAC 7与VHL配体9在MDA-MB-231细胞中24小时的共处理竞争。
图8A-E.PROTAC介导的c-Met降解。图8A和B–用递增浓度的基于佛瑞替尼的PROTAC7(A)或非对映体8(B)处理24小时的MDA-MB-231细胞。图8C和D–GTL16细胞中的细胞增殖测定(PROTAC 7 IC50＝66.7nM，非对映体8IC50＝156nM)(C)和通过基于佛瑞替尼的PROTAC(500nM)7进行的c-Met降解的时间进程(D)。(E)PROTAC效应在细胞培养中持续时间更长。将细胞用500nM PROTAC 7或非对映体8处理24小时，然后重新铺在新塑料上的新鲜培养基中并保持24或48小时。将过量的VHL(25mM)配体添加到指定孔中。
图9A-C.PROTAC介导的内化。图9A和图9B–将细胞表面蛋白质用不可渗透细胞膜的生物素试剂标记，然后用500nM基于佛瑞替尼的PROTAC7(A)或100ng/mL HGF(B)处理指定时间并裂解。通过链霉亲和素pull-down富集生物素化蛋白质并对c-Met进行免疫印迹。生物素化蛋白质代表细胞表面部分。还显示了对应的全细胞裂解物。(C)响应于指定时间的PROTAC 7(500nM)处理(蓝色DAPI核染色)的c-Met(绿色)内化的代表性共聚焦显微镜图像。
图10A-I.外显子14缺失的c-Met具有增加的稳定性和对HGF介导的降解的抗性，所述降解可通过基于佛瑞替尼的PROTAC 7来对抗。图10A–在环己酰亚胺(CHX)的存在下用HGF、PROTAC 7或DMSO对照处理后野生型c-Met或外显子14缺失的c-Met降解的定量。图10B–计算的半衰期表。图10C–用HGF处理的MDA-MB-231细胞中野生型c-Met降解和信号传导的代表性CHX时间进程。图10D–用HGF处理的Hs746T细胞中外显子14缺失的c-Met降解和信号传导的代表性CHX时间进程。图10E–用PROTAC 7处理的Hs746T细胞中外显子14缺失的c-Met降解的代表性CHX时间进程。图10F和10G–将MDA-MB-231(F)和Hs746T(G)细胞用DMSO或PROTAC处理18小时，然后在刺激后的指定时间点添加HGF并裂解。图10H–来自经PROTAC 7处理(1mM)或DMSO处理的Hs746T细胞的c-Met的免疫沉淀，然后对泛素进行免疫印迹。图10I–来自经PROTAC 7(1mM)或DMSO处理的Hs746T细胞的串联泛素结合实体1(TUBE1)pull-down，然后对c-Met进行免疫印迹。
图11A-D.在PROTAC处理(500nM)后的指定时间点进行定量实时PCR。将数据归一化为β微管蛋白。图11B-D代表性Western印迹和共处理实验的定量。图11B–在MDA-MB-231细胞中用蛋白酶体抑制剂环氧酶素(500nM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。图11C–在MDA-MB-231细胞中用Neddylation抑制剂MLN-4924(1μM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。图11D–在MDA-MB-231细胞中用HSP90抑制剂17-AAG(1μM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。
图12A-E.HGF介导的c-Met内化的代表性共聚焦显微镜图像。图12A–在c-Met的固定、透化和免疫染色之前用100ng/ml HGF处理MDA-MB-231细胞达指定时间。图12B–显示PROTAC介导的与早期内体抗原1(EEA1)的共定位的代表性共聚焦显微镜图像。在c-Met和EEA1的固定、透化和免疫染色之前，用500nM PROTAC 7处理MDA-MB-231细胞达指定时间。图12C–显示c-Met与p230(反式高尔基体标志物)的共定位的代表性共聚焦显微镜图像。图12D–来自图12C的图像的定量。c-Met免疫荧光和平均细胞像素强度占据的细胞像素的百分比用作斑点形成和细胞表面c-Met减少的代表。图12E–网格蛋白重链(CHC)siRNA实验。用CHC siRNA转染MDA-MB-231细胞，再用PROTAC 7处理24小时，然后进行裂解和免疫印迹。
图13A-E.环己酰亚胺脉冲追踪western印迹。图13A–将MDA-MB-231细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC 7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解–第1组。图13B–将MDA-MB231细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC 7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解–第2组。图13C–将Hs746T细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解。图13D–c-Met免疫沉淀实验。用2μM环氧酶素处理Hs746T细胞30分钟，再添加PROTAC7并保持4小时，然后进行c-Met免疫沉淀。(WCL＝全细胞裂解物)。图13E–如在D中一样处理Hs746T细胞，然后进行TUBE1免疫沉淀实验。
图14.如本文所述的示例性PROTAC化合物的结构(基于拉帕替尼(呋喃)的PROTAC)。
图15A-B.图14的示例性PROTAC化合物的降解活性。图15A–示出1μM的HER1和HER2蛋白降解百分比、接头原子、接头长度(以埃为单位)、接头类型和E3连接酶结合部分(ULM)。图15B–示出指定的基于拉帕替尼的PROTAC对OVCAR8细胞中HER1的降解活性(剂量-反应)。
图16A-B.示例性PROTAC化合物的降解活性。图16A–示出基于拉帕替尼(呋喃)的示例性PROTAC的结构。图16B–示出图13A化合物的降解活性的Western印迹。用OVCAR8处理细胞24小时。最后5分钟进行NRG(5ng/mL)刺激。使用抗EGFR兔(CST)、抗HER2(Santa CruzBiotechnologies)和抗微管蛋白(Sigma-Aldrich)检测蛋白质。
图17A-B.示例性PROTAC化合物的降解活性。图17A–示出基于拉帕替尼(苯基)的示例性PROTAC的结构。图17B–示出图17A化合物的降解活性的Western印迹。用OVCAR8处理细胞24小时。最后5分钟进行NRG(5ng/mL)刺激。使用抗EGFR兔(CST)、抗HER2(Santa CruzBiotechnologies)和抗微管蛋白(Sigma-Aldrich)检测蛋白质。
具体实施方式
以下是为了帮助本领域的普通技术人员实施本发明而提供的具体实施方式。本领域普通技术人员可以在本文描述的实施方案中进行修改和变化，而不脱离本公开的实质或范围。本文提及的所有出版物、专利申请、专利、附图和其他参考文献均全文以引用方式明确并入。
本发明描述了组合物和方法，所述组合物和方法涉及E3泛素连接酶蛋白(例如，凋亡抑制蛋白(IAP)、希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)、人小脑蛋白E3泛素连接酶或小鼠双微体2同源物(MDM2)E3泛素连接酶)一旦与靶蛋白通过结合E3泛素连接酶蛋白和靶蛋白的双官能或嵌合构建体邻近定位就会使靶蛋白泛素化的惊人和意外发现。因此，本公开提供了此类化合物和组合物，其包含偶联至蛋白质靶标结合部分(“PTM”)的E3泛素连接酶靶向部分(“ULM”)，这将引起所选靶蛋白的泛素化，从而导致靶蛋白被蛋白酶体降解(参见图1)。本公开还提供了组合物文库及其用途。
在某些方面，本公开提供了包含配体诸如小分子配体(即，分子量低于2,000、1,000、500或200道尔顿)的化合物，所述配体能够与泛素连接酶诸如IAP、VHL、MDM2或人小脑蛋白结合。该化合物还包含能够与靶蛋白结合的部分(例如，小分子)，以这样的方式使得靶蛋白置于泛素连接酶附近，以实现该蛋白的降解(和/或抑制)。除上述之外，小分子还可以意指该分子是非肽基的，即，它一般不视为肽，例如包含少于4、3或2个氨基酸。根据本说明书，PTM、ULM或PROTAC分子可以是小分子。
2016年8月5日提交的美国专利申请序列号15/230,354；2016年7月11日提交的美国专利申请15/206,497；2016年7月13日提交的美国专利申请15/209,648，2016年10月11日提交的美国专利申请序列号62/406,888；作为美国专利申请公布号2015/0291562公布的2015年4月14日提交的美国专利申请序列号14/686,640；以及作为美国专利申请公布号2016/0058872公布的2015年7月6日提交的美国专利申请序列号14/792,414；作为美国专利申请公布号2014/0356322公布的2014年7月11日提交的美国专利申请序列号14/371,956；以及作为美国专利申请公布号2016/0272639公布的2016年3月18日提交的美国专利申请序列号15/074,820以引用的方式整体并入本文。此外，本文引用的所有参考文献都以引用的方式整体并入本文。
除非另外定义，否则本文所用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。本说明书中所用的术语仅用于描述特定实施方案，并非旨在限制本发明。
在提供值范围时，应当理解，在本发明内涵盖了每个中间值，至下限单位的十分之一，除非上下文另有明确规定(例如在含有多个碳原子的基团的情况下，在这种情况下，提供了落入该范围内的每个碳原子数)，在该范围的上限和下限之间，以及在该所述范围内的任何其他所述值或中间值。这些较小范围的上限和下限可以独立地包含在更小范围内并且也涵盖于本发明内，从属于所述范围内的任何具体排除限值。在所述范围包含一个或两个限值的情况下，本发明中还包括排除所包括的那些限值中的任两个的范围。
下述术语用于描述本发明。在本文中未具体定义一个术语的情况下，那个术语是所属领域的一般技术人员在其用于描述本发明的上下文中应用那个术语时作为领域公认的含义给出。
如本文和所附权利要求中使用的冠词“一个”和“一种”在本文中用于指冠词的一个或多于一个(即，至少一个)语法对象，除非上下文另有明确说明。例如，“要素”意指一个要素或多于一个要素。
如本文在说明书和权利要求中所用，短语“和/或”应理解为意指如此结合的要素中的“任一者或两者”，即在某些情况下结合地存在且在其他情况下分离地存在的要素。用“和/或”列出的多个要素应该以相同的方式加以解释，即，如此结合的“一个或多个”要素。除了由“和/或”子句具体鉴定的要素之外，可以任选地存在其他要素，无论与具体鉴定的那些要素相关还是不相关。因此，作为非限制性实例，当与开放式语言例如“包含”结合使用时，对“A和/或B”的提及可以在一个实施方案中仅指A(任选地包括除了B之外的要素)；在另一个实施方案中仅指B(任选地包括除了A之外的要素)；在再一个实施方案中指A和B两者(任选地包括其他要素)；等。
如本文在说明书和权利要求中使用的，“或”应该理解为具有与如上定义的“和/或”相同的含义。例如，当分开列表中的项目时，“或”或“和/或”应该解释为包含性的，即包含至少一个，但也包括许多要素或要素列表的多于一个，以及任选地，另外未列出的项目。只有明确指出相反的术语，例如“仅一个”或“恰好一个”，或者，当在权利要求中使用时，“由……组成”指许多要素或要素列表的恰好一个要素。一般而言，当之前为排他性术语例如“任一”、“之一”、“仅一个”或“恰好一个”时，如本文使用的，术语“或”应该仅解释为指示排他性替代物(即“一个或另一个但不是两者”)。
在权利要求以及上文说明书中，所有过渡短语、例如“包含”、“包括”、“携带”、“具有”、“含有”、“涉及”、“持有”、“组成”等等应理解为开放式的，即，意指包括但不限于。仅过渡短语“由……组成”和“基本上由……组成”应该分别为闭合式或半闭合式过渡短语，如美国专利局专利审查程序手册(United States Patent Office Manual of PatentExamining Procedures)第2111.03节中所述。
如本文在说明书和权利要求中使用的，提及一个或多个要素的列表，短语“至少一个”应该理解为意指选自要素列表中的任何一个或多个要素的至少一个要素，但不一定包括要素列表中具体列出的每个和每一个要素中的至少一个，并且不排除要素列表中的任何要素组合。该定义还允许除了在短语“至少一个”所指的要素列表内具体鉴定的要素之外，可以任选地存在无论与具体鉴定的那些要素相关还是不相关的要素。因此，作为非限制性实例，“A和B中的至少一个”(或等价地，“A或B中的至少一个”，或等价地“A和/或B中的至少一个”)在一个实施方案中，可以指至少一个，任选地包括多于一个A，而不存在B(并且任选地包括除了B之外的要素)；在另一个实施方案中，指至少一个，任选地包括多于一个B，而不存在A(并且任选地包括除了A之外的要素)；在再一个实施方案中，指至少一个，任选地包括多于一个A，以及至少一个，任选地包括多于一个B(以及任选地包括其他要素)；等。
还应该理解，在本文描述的包括多于一个步骤或动作的某些方法中，该方法的步骤或动作的次序不一定限于其中叙述该方法的步骤或动作的次序，除非上下文另有说明。
术语“共同施用”或“联合疗法”指并行施用(同时施用两种或更多种治疗剂)和不同时间施用(一种或多种治疗剂的施用时间不同于其他治疗剂或药剂的施用时间)，只要治疗剂在一定程度上，优选按照有效量同时存在于患者中。在某些优选方面，本文所述的一种或多种本发明化合物与至少一种其他生物活性剂(尤其包括抗癌剂)联合共同施用。在特别优选的方面，化合物的共同施用产生协同活性和/或治疗(包括抗癌)活性。
除非另外说明，否则如本文所用，术语“化合物”是指本文所公开的任何具体化合物，并且包括其互变异构体、区域异构体、几何异构体和适用的立体异构体，包括光学异构体(对映体)和其他立体异构体(非对映体)，以及在上下文中，适用的可药用盐及其衍生物(包括前药形式)。设想的氘代小分子是其中药物分子中包含的一个或多个氢原子已被氘取代的那些。
在其在上下文中的使用内，术语化合物一般指单一化合物，但也可包括其他化合物，例如立体异构体、区域异构体和/或光学异构体(包括外消旋混合物)以及所公开化合物的特定对映体或富含对映体的混合物。在上下文中，该术语还指已进行修饰以促进化合物对活性部位的施用和递送的化合物的前药形式。应注意，在描述本文化合物中，尤其描述了许多取代基以及与其相关的变量。普通技术人员应理解，本文所述的分子是如下文一般描述的稳定化合物。示出键时，双键和单键均在所示化合物和众所周知的价态相互作用规则的背景内表示或理解。
术语“泛素连接酶”是指促进泛素向特定底物蛋白质的转移以靶向底物蛋白质从而进行降解的蛋白质家族。例如，IAP是E3泛素连接酶蛋白，其单独或与E2泛素缀合酶组合引起泛素与靶蛋白上的赖氨酸的附接，并且随后靶向特定蛋白质底物以被蛋白酶体降解。因此，单独或与E2泛素缀合酶复合的E3泛素连接酶负责泛素至靶蛋白的转移。一般而言，泛素连接酶涉及多泛素化，使得第二泛素附接于第一泛素；第三泛素附接于第二泛素，如此等等。多泛素化将蛋白质标记用于被蛋白酶体降解。然而，存在一些泛素化事件，其限于单泛素化，其中仅单个泛素通过泛素连接酶加入底物分子。单泛素化蛋白质不被靶向蛋白酶体进行降解，而是可以在其细胞位置或功能方面改变，例如，经由结合具有能够结合泛素的结构域的其他蛋白质。更复杂的是，泛素的不同赖氨酸可被E3靶向以制备链。最常见的赖氨酸是泛素链上的Lys48。这是用于制备被蛋白酶体识别的聚泛素的赖氨酸。
术语“患者”或“受试者”在说明书自始至终用于描述用根据本公开的组合物对其提供治疗，包括预防性治疗的动物，优选人或驯养动物。对于特定动物(例如人患者)特异性的那些感染、状况或疾病状态的治疗，术语患者指该特定动物，包括驯养动物如犬或猫或者农场动物如马、牛、绵羊等。一般而言，在本公开中，除非另有说明或由该术语使用的上下文暗示，否则术语患者指人类患者。
术语“有效”用于描述化合物、组合物或组分的量，当在其预期用途的上下文内使用时，所述量实现预期结果。术语有效包含在本申请中另外描述或使用的所有其他有效量或有效浓度项。
由于一些最引人注目的抗癌靶标是RTK，因此证明它们对PROTAC介导的降解的易感性仍然是一个重要的问题。鉴于它们在人类癌症中明确定义的作用以及对其调节和下游信号传导途径的广泛理解，EGFR、HER2和c-Met代表了感兴趣的潜在PROTAC靶标。
在本文中，我们展示了这些RTK的由PROTAC介导的有效降解，包括许多相关的致癌突变同种型。所描述的结果表明RTK不仅是翻译后降解的有效底物，而且PROTAC实现的信号传导失活和生长抑制比经由RTK抑制实现的更有效、更持久且更不易受激酶组重新布线的影响。
化合物和组合物
在一个方面，本说明书提供了包含E3泛素连接酶结合部分(“ULM”)的化合物，该ULM是IAP E3泛素连接酶结合部分(“ILM”)、人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分(“CLM”)、希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)和/或小鼠双微体2同源物(MDM2)E3泛素连接酶结合部分(MLM)。在一个示例性实施方案中，根据以下结构，ULM经由化学接头(L)偶联至RTK靶蛋白结合部分(PTM)：
(A)PTM-L-ULM
其中L是键或化学接头基团，ULM是E3泛素连接酶结合部分，并且PTM是靶蛋白结合部分。本文示出的化合物中的部分的数目和/或相对位置仅为了举例而提供。如技术人员将理解的那样，本文所述的化合物可以按照各个官能部分的任何所需数目和/或相对位置来合成。
除非上下文另外说明，否则术语ULM、ILM、VLM、MLM和CLM以其包含性意义使用。例如，术语ULM包含所有ULM，包括结合IAP(即ILM)、MDM2(即MLM)、人小脑蛋白(即CLM)和VHL(即VLM)的那些。另外，术语ILM包含所有可能的IAP E3泛素连接酶结合部分，术语MLM包含所有可能的MDM2 E3泛素连接酶结合部分，术语VLM包含所有可能的VHL结合部分，并且术语CLM包含所有人小脑蛋白结合部分。
在另一方面，本公开提供了可用于通过诱导靶蛋白的降解来调节蛋白质活性的双官能或多官能化合物(例如PROTAC)。在某些实施方案中，化合物包含偶联(例如，共价、直接或间接连接)至结合靶蛋白的部分(即，蛋白质靶向部分或“PTM”)的ILM或VLM或CLM或MLM。在某些实施方案中，ILM/VLM/CLM/MLM和PTM经由化学接头(L)接合或偶联。ILM结合IAP E3泛素连接酶，VLM结合VHL，CLM结合人小脑蛋白E3泛素连接酶，MLM结合MDM2 E3泛素连接酶，并且PTM识别靶蛋白，各个部分与其靶标的相互作用有利于通过将靶蛋白置于泛素连接酶蛋白附近来降解靶蛋白。示例性双官能化合物可以描绘为：
(B)PTM—ILM
(C)PTM—CLM
(D)PTM—VLM
(E)PTM—MLM
在某些实施方案中，双官能化合物还包含化学接头(“L”)。例如，双官能化合物可以描绘为：
(F)PTM—L—ILM
(G)PTM—L—CLM
(H)PTM—L—VLM
(I)PTM—L—MLM
其中PTM是蛋白质/多肽靶向部分，L是化学接头，ILM是IAP E3泛素连接酶结合部分，CLM是人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分，VLM是VHL结合部分，并且MLM是MDM2 E3泛素连接酶结合部分。
在某些实施方案中，ULM(例如，ILM、CLM、VLM或MLM)显示出活性或者以小于约200μM的IC50结合至E3泛素连接酶(例如，IAP E3泛素连接酶、人小脑蛋白E3泛素连接酶、VHL或MDM2 E3泛素连接酶)。IC50可根据本领域已知的任何方法测定，例如荧光偏振分析。
在某些另外的实施方案中，本文所述的双官能化合物显示出IC50小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001mM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001μM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001nM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001pM的活性。
在某些实施方案中，如本文所述的化合物包含多个PTM(靶向相同或不同的蛋白质靶标)、多个ULM、一个或多个ULM(即，特异性地结合至多个/不同E3泛素连接酶的部分，例如VHL、IAP、人小脑蛋白和/或MDM2)或它们的组合。在本文所述的任何方面或实施方案中，PTM和ULM(例如，ILM、VLM、CLM和/或MLM)可以直接偶联或经由一个或多个化学接头偶联或它们的组合。在其中化合物具有多个ULM的另外的实施方案中，ULM可以用于相同的E3泛素连接酶，或者每个相应的ULM可以特异性地结合至不同的E3泛素连接酶。在其中化合物具有多个PTM的另外的实施方案中，PTM可以结合相同靶蛋白，或者每个相应的PTM可以特异性地结合至不同靶蛋白。
在其中化合物包含多个ULM的某些实施方案中，ULM是相同的。在化合物包含多个ULM(例如，ULM、ULM’等)的另外的实施方案中，至少一个PTM直接或经由化学接头(L)或这两者偶联至ULM。在某些另外的实施方案中，包含多个ULM的化合物还包含多个PTM。在另外的实施方案中，PTM是相同的或任选地不同的。在其中PTM不同的另外的实施方案中，各个PTM可以结合相同的蛋白质靶标或特异性地结合至不同的蛋白质靶标。
在某些实施方案中，化合物可包含多个ULM和/或多个ULM'。在化合物包含至少两个不同ULM的另外的实施方案中，多个ULM和/或多个ULM’还包含直接偶联或经由化学接头偶联或以这两种方式偶联至ULM或ULM’的至少一个PTM。在本文所述的任何实施方案中，包含至少两个不同ILM的化合物还可包含多个PTM。在另外的实施方案中，PTM是相同的或任选地不同的。在其中PTM不同的另外的实施方案中，各个PTM可以结合相同的蛋白质靶标或特异性地结合至不同的蛋白质靶标。在另外的实施方案中，PTM本身是ULM(或ULM’)，诸如ILM、VLM、CLM、MLM、ILM’、VLM’、CLM’和/或MLM’。
在另外的实施方案中，本说明书提供了如本文所述的化合物，包括其对映体、非对映体、溶剂化物和多晶型物，包括其药学上可接受的盐形式，例如酸和碱盐形式。
示例性ILM
AVPI四肽片段
在本文所述的任何化合物中，ILM可包含丙氨酸-缬氨酸-脯氨酸-异亮氨酸(AVPI)四肽片段或其非天然模拟物。在某些实施方案中，ILM选自由式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)表示的化学结构：
其中：
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R1选自H或烷基；
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R2选自H或烷基；
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R3选自H、烷基、环烷基和杂环烷基；
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R5和R6独立地选自H、烷基、环烷基、杂环烷基，或者更优选地，式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R5和R6合在一起形成吡咯烷或哌啶环，其进一步任选地稠合至1–2个环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基环，然后每个环可进一步稠合至另一个环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基环；
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R3和R5合在一起可形成5-8元环，其进一步任选地稠合至1–2个环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基环；
式(I)、(II)、(III)、(IV)和(V)的R7选自环烷基、环烷基烷基、杂环烷基、杂环烷基烷基、芳基、芳烷基、杂芳基或杂芳基烷基，每一者进一步任选地被选自卤素、烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基、氰基、(杂)环烷基或(杂)芳基的1–3个取代基取代，或者R7是–C(O)NH–R4；并且
R4选自烷基、环烷基、杂环烷基、环烷基烷基、杂环烷基烷基、芳基、芳烷基、杂芳基、杂芳基烷基，进一步任选地被1–3个如上所述的取代基取代。
如上所示，式(II)的P1、P2、P3和P4分别与AVPI四肽片段或其非天然模拟物的A、V、P和I相关。类似地，式(I)和(III)至(V)中的每一者具有与AVPI四肽片段或其非天然模拟物的A、V、P和I相关的部分。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(VI)的结构，其是WO公布号2008/014236中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000181
其中：
式(VI)的R1独立地选自H、未取代或取代的C1-C4-烷基、C1-C4-烯基、C1-C4-炔基或C3-C1O-环烷基；
式(VI)的R2独立地选自H、未取代或取代的C1-C4-烷基、C1-C4-烯基、C1-C4-炔基或C3-C1O-环烷基；
式(VI)的R3独立地选自H、-CF3、-C2H5、C1-C4-烷基、C1-C4-烯基、C1-C4-炔基、-CH2-Z，或者任何R2和R3一起形成杂环；
式(VI)中的每个Z独立地选自H、-OH、F、Cl、-CH3、-CF3、-CH2Cl、-CH2F或-CH2OH；
式(VI)的R4独立地选自C1-C16直链或支链烷基、C1-C16-烯基、C1-C16-炔基、C3-C10-环烷基、-(CH2)0-6-Z1、-(CH2)0-6-芳基和-(CH2)0-6-het，其中烷基、环烷基和苯基是未取代或取代的；
式(VI)的R5独立地选自H、C1-10-烷基、芳基、苯基、C3-7-环烷基、-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-C1-10-烷基-芳基、-(CH2)0-6-C3-7-环烷基-(CH2)0-6-苯基、-(CH2)0-4-CH[(CH2)1-4-苯基]2,茚满基、-C(O)-C1-10-烷基、-C(O)-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-C(O)-(CH2)0-6-苯基、-(CH2)0-6-C(O)-苯基、-(CH2)0-6-het、-C(O)-(CH2)1-6-het，或者R5选自氨基酸残基，其中烷基、环烷基、苯基和芳基取代基是未取代或取代的；
式(VI)的Z1独立地选自-N(R10)-C(O)-C1-10-烷基、-N(R1O)-C(O)-(CH2)0-6-C3-7-环烷基、-N(R10)-C(O)-(CH2)0-6-苯基、-N(R10)-C(O)(CH2)1-6-het、-C(O)-N(R11)(R12)、-C(O)-O-C1-10-烷基、-C(O)-O-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-C(O)-O-(CH2)0-6-苯基、-C(O)-O-(CH2)1-6-het、-O-C(O)-C1-10-烷基、-O-C(O)-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-O-C(O)-(CH2)0-6-苯基、-O-C(O)-(CH2)1-6-het，其中烷基、环烷基和苯基是未取代或取代的；
式(VI)的het独立地选自含有选自N、O和S的1-4个杂原子的5-7元杂环，或包含含有选自N、O和S的1、2或3个杂原子的至少一个5-7元杂环的8-12元稠合环系，该杂环或稠合环系是未取代的或在碳或氮原子上取代的；
式(VI)的R10选自H、-CH3、-CF3、-CH2OH或-CH2Cl；
式(VI)的R11和R12独立地选自H、C1-4-烷基、C3-7-环烷基、-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、(CH2)0-6-苯基，其中烷基、环烷基和苯基是未取代或取代的；或者R11和R12与氮一起形成het，并且
如式(VII)中所示，式(VI)的U独立地是：
Figure BDA0002176933830000191
其中：
式(VII)中的每个n独立地选自0至5；
式(VII)的X选自-CH和N；
式(VII)的Ra和Rb独立地选自O、S或N原子或者C0-8-烷基，其中烷基链中的一个或多个碳原子任选被选自O、S或N的杂原子取代，并且其中每个烷基独立地是未取代或取代的；
式(VII)的Rd选自Re-Q-(Rf)p(Rg)q和Ar1-D-Ar2；
式(VII)的Rc选自H或者任何Rc和Rd一起形成环烷基或het；其中如果Rc和Rd形成环烷基或het，则R5在C或N原子处附接至所形成的环；
式(VII)的p和q独立地选自0或1；
式(VII)的Re选自C1-8-烷基和亚烷基，并且每个Re是未取代或取代的；
Q选自N、O、S、S(O)和S(O)2；
式(VII)的Ar1和Ar2独立地选自取代或未取代的芳基和het；
式(VII)的Rf和Rg独立地选自H、-C1-10-烷基、C1-10-烷芳基、-OH、-O-C1-10-烷基、-(CH2)0-6-C3-7-环烷基、-O-(CH2)0-6-芳基、苯基、芳基、苯基–苯基、-(CH2)1-6-het、-O-(CH2)1-6-het、-OR13、-C(0)-R13、-C(O)-N(R13)(R14)、-N(R13)(R14)、-S-R13、-S(O)-R13、-S(O)2-R13、-S(O)2-NR13R14、-NR13-S(O)2-R14、-S-Ct-10-烷基、芳基-C1-4-烷基或het-C1-4-烷基，其中烷基、环烷基、het和芳基是未取代或取代的-SO2-C1-2-烷基、-SO2-C1-2-烷基苯基、-O-C1-4-烷基，或者任何Rg和Rf一起形成选自het或芳基的环；
式(VII)的D选自-CO-、-C(O)-C1-7-亚烷基或亚芳基、-CF2-、-O-、-S(O)r(其中r是0-2)、1,3-二氧杂环戊烷或C1-7-烷基-OH；其中烷基、亚烷基或亚芳基是未取代的或被一个或多个卤素、OH、-O-C1-6-烷基、-S-C1-6-烷基或-CF3取代；或者每个D独立地选自N(Rh)；
Rh选自H、未取代或取代的C1-7-烷基、芳基、未取代或取代的-O-(C1-7-环烷基)、-C(O)-C1-10-烷基、-C(O)-C0-10-烷基-芳基、-C-O-C01-10-烷基、-C-O-C0-10-烷基-芳基、-SO2-C1-10-烷基或-SO2-(C0-10-烷芳基)；
式(VII)的R6、R7、R8和R9独立地选自H、-C1-10-烷基、-C1-10-烷氧基、芳基-C1-10-烷氧基、-OH、-O-C1-10-烷基、-(CH2)0-6-C3-7-环烷基、-O-(CH2)0-6-芳基、苯基、-(CH2)1-6-het、-O-(CH2)1-6-het、-OR13、-C(O)-R13、-C(O)-N(R13)(R14)、-N(R13)(R14)、-S-R13、-S(O)-R13、-S(O)2-R13、-S(O)2-NR13R14或-NR13-S(O)2-R14；其中每个烷基、环烷基和芳基是未取代或取代的；并且任何R6、R7、R8和R9任选地一起形成环系；
式(VII)的R13和R14独立地选自H、C1-10-烷基、-(CH2)0-6-C3-7-环烷基、-(CH2)0-6-(CH)0-1-(芳基)1-2、-C(O)-C1-10-烷基、-C(O)-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-C(O)-O-(CH2)0-6-芳基、-C(O)-(CH2)0-6-O-芴基、-C(O)-NH-(CH2)0-6-芳基、-C(O)-(CH2)0-6-芳基、-C(O)-(CH2)0.6-het、-C(S)-C1-10-烷基、-C(S)-(CH2)1-6-C3-7-环烷基、-C(S)-O-(CH2)0-6-芳基、-C(S)-(CH2)0-6-O-芴基、-C(S)-NH-(CH2)0-6-芳基、-C(S)-(CH2)0-6-芳基或-C(S)-(CH2)1-6-het，其中每个烷基、环烷基和芳基是未取代或取代的：或者任何R13和R14与氮原子一起形成het；
其中式(VII)的R13和R14的烷基取代基是未取代或取代的，并且当被取代时，被选自C1-10-烷基、卤素、OH、-O-C1-6-烷基、-S-C1-6-烷基和-CF3的一个或多个取代基取代；并且R13和R14的取代的苯基或芳基被选自卤素、羟基、C1-4-烷基、C1-4-烷氧基、硝基、-CN、-O-C(O)-C1-4-烷基和-C(O)-O-C1-4-芳基的一个或多个取代基取代；或其药学上可接受的盐或水合物。
在某些实施方案中，化合物还包含独立选择的第二ILM，该第二ILM通过至少一个另外的独立选择的接头基团附接至式(VI)的ILM或其非天然模拟物。在一个实施方案中，第二ILM是式(VI)的衍生物，或其非天然模拟物。在某个实施方案中，所述至少一个另外的独立选择的接头基团包括化学连接ILM和第二ILM的两个另外的独立选择的接头基团。在一个实施方案中，式(VI)的ILM或其非天然模拟物的至少一个另外的接头基团化学连接选自R4和R5的基团。例如，式(VI)的ILM和式(VI)的第二ILM或其非天然模拟物可以如下所示连接：
Figure BDA0002176933830000211
在某些实施方案中，ILM、至少一个另外的独立选择的接头基团L和第二ILM具有选自以下的结构：
Figure BDA0002176933830000221
Figure BDA0002176933830000231
它们是WO公布号2008/014236中描述的IAP拮抗剂的衍生物。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(VIII)的结构，其基于Ndubaku,C.等人，Antagonism of c-IAP and XIAP proteins is required for efficient inductionof cell death by small-molecule IAP antagonists,ACS Chem.Biol.,557-566,4(7)(2009)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000232
其中式(VIII)的A1和A2中的每一者独立地选自任选被取代的单环稠环、芳基和杂芳基；并且
式(VIII)的R选自H或Me。
在一个具体实施方案中，接头基团L附接至式(VIII)的A1。在另一个实施方案中，接头基团L附接至式(VIII)的A2。
在一个具体实施方案中，ILM选自
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(IX)的结构，其衍生自Mannhold,R.等人，IAP antagonists:promising candidates for cancer therapy,Drug Discov.Today,15(5-6),210-9(2010)中交叉引用的化学型，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000242
其中R1选自烷基、环烷基和杂环烷基，最优选地选自异丙基、叔丁基、环己基和四氢吡喃基，并且式(IX)的R2选自–OPh或H。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(X)的结构，其衍生自Mannhold,R.等人，IAP antagonists:promising candidates for cancer therapy,Drug Discov.Today,15(5-6),210-9(2010)中交叉引用的化学型，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000251
其中：
式(X)的R1选自H、–CH2OH、--CH2CH2OH、--CH2NH2、--CH2CH2NH2；
式(X)的X选自S或CH2；
式(X)的R2选自：
Figure BDA0002176933830000252
式(X)的R3和R4独立地选自H或Me
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XI)的结构，其衍生自Mannhold,R.等人，IAP antagonists:promising candidates for cancer therapy,Drug Discov.Today,15(5-6),210-9(2010)中交叉引用的化学型，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000253
其中式(XI)的R1选自H或Me，式(XI)的R2选自H或
Figure BDA0002176933830000261
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XII)的结构，其衍生自Mannhold,R.等人，IAP antagonists:promising candidates for cancer therapy,Drug Discov.Today,15(5-6),210-9(2010)中交叉引用的化学型，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000262
其中：
式(XII)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000263
并且
式(XII)的R2选自：
Figure BDA0002176933830000264
在本文所述的任何化合物中，IAP E3泛素连接酶结合部分选自：
Figure BDA0002176933830000271
Figure BDA0002176933830000281
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XIII)的结构，其基于Flygare,J.A.等人，Small-molecule pan-IAP antagonists:a patent review,Expert Opin.Ther.Pat.,20(2),251-67(2010)中汇总的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000282
其中：
式(XIII)的Z不存在或是O；
式(XIII)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000283
Figure BDA0002176933830000284
的R10选自H、烷基或芳基；
X选自CH2和O；并且
Figure BDA0002176933830000291
是含氮杂芳基。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XIV)的结构，其基于Flygare,J.A.等人，Small-molecule pan-IAP antagonists:a patent review,Expert Opin.Ther.Pat.,20(2),251-67(2010)中汇总的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000292
其中：
式(XIV)的Z不存在或是O；
式(XIV)的R3和R4独立地选自H或Me；
式(XIV)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000294
的R10选自H、烷基或芳基；
Figure BDA0002176933830000295
的X选自CH2和O；并且
Figure BDA0002176933830000301
的
Figure BDA0002176933830000302
是含氮杂芳基。
在本文所述的任何化合物中，ILM选自：
Figure BDA0002176933830000303
它们是美国专利公布号2008/0269140和美国专利号7,244,851中公开的配体的衍生物。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XV)的结构，其是WO公布号2008/128171中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000304
其中：
式(XV)的Z不存在或是O；
式(XV)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000305
的R10选自H、烷基或芳基；
Figure BDA0002176933830000312
的X选自CH2和O；并且
Figure BDA0002176933830000313
的
Figure BDA0002176933830000314
是含氮杂芳基；并且
式(XV)的R2选自H、烷基或酰基；
在一个具体实施方案中，ILM具有以下结构：
Figure BDA0002176933830000315
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XVI)的结构，其基于WO公布号2006/069063中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000316
其中：
式(XVI)的R2选自烷基、环烷基和杂环烷基；更优选地选自异丙基、叔丁基、环己基和四氢吡喃基，最优选地选自环己基；
式(XVI)的
Figure BDA0002176933830000321
是5元或6元含氮杂芳基；更优选地是5元含氮杂芳基，最优选地是噻唑；并且
式(XVI)的Ar是芳基或杂芳基。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XVII)的结构，其基于Cohen,F.等人，Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amideisosteres,Bioorg.Med.Chem.Lett.,20(7),2229-33(2010)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000322
其中：
式(XVII)的R1选自te族卤素(例如氟)、氰基、
Figure BDA0002176933830000323
式(XVII)的X选自O或CH2。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XVIII)的结构，其基于Cohen,F.等人，Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amideisosteres,Bioorg.Med.Chem.Lett.,20(7),2229-33(2010)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000324
其中式(XVIII)的R选自烷基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳基烷基或卤素(在可变取代位置中)。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XIX)的结构，其基于Cohen,F.等人，Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amideisosteres,Bioorg.Med.Chem.Lett.,20(7),2229-33(2010)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000331
其中
Figure BDA0002176933830000332
是6元氮杂芳基。
在某个实施方案中，组合物的ILM选自：
Figure BDA0002176933830000333
在某些实施方案中，组合物的ILM选自：
Figure BDA0002176933830000334
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XX)的结构，其基于WO公布号2007/101347中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000341
其中式(XX)的X选自CH2、O、NH或S。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXI)的结构，其基于美国专利号7,345,081和美国专利号7,419,975中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000342
其中：
式(XXI)的R2选自：
Figure BDA0002176933830000343
式(XXI)的R5选自：
Figure BDA0002176933830000344
并且
式(XXI)的W选自CH或N；并且
Figure BDA0002176933830000345
的R6独立地是单环或双环稠合的芳基或杂芳基。
在某些实施方案中，化合物的ILM选自：
Figure BDA0002176933830000346
在某些实施方案中，化合物的ILM选自：
Figure BDA0002176933830000351
它们在WO公布号2009/060292、美国专利号7,517,906、WO公布号2008/134679、WO公布号2007/130626和WO公布号2008/128121中描述的IAP拮抗剂的衍生物。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXII)或(XXIII)的结构，它们衍生自WO公布号2015/006524和Perez HL,Discovery of potent heterodimeric antagonistsof inhibitor of apoptosis proteins(IAPs)with sustained antitumoractivity.J.Med.Chem.58(3),1556-62(2015)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000361
其中：
式(XXII)或(XXIII)的R1是任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXII)或(XXIII)的R2是任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
或者可替代地，式(XXII)或(XXIII)的R1和R2独立地是任选被取代的硫代烷基，其中附接至硫代烷基的S原子的取代基是任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的杂环基、-(CH2)vCOR20、-CH2CHR21COR22或-CH2R23；
其中：
v是1-3的整数；
–(CH2)vCOR20和-CH2R23的R20和R22独立地选自OH、NR24R25或OR26；
-CH2CHR21COR2的R21选自基团NR24R25；
-CH2R23的R23选自任选被取代的芳基或任选被取代的杂环基，其中任选的取代基包括烷基和卤素；
NR24R25的R24选自氢或任选被取代的烷基；
NR24R25的R25选自氢、任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂环基、-CH2(OCH2CH2O)mCH3或多胺链，诸如精胺或亚精胺；
OR26的R26选自任选被取代的烷基，其中任选的取代基是OH、卤素或NH2；并且
m是1-8的整数；
式(XXII)或(XXIII)的R3和R4独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的芳基烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基、任选被取代的杂芳基烷基或任选被取代的杂环烷基，其中取代基是烷基、卤素或OH；
式(XXII)或(XXIII)的R5、R6、R7和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；并且
X选自键或化学接头基团，和/或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在某些实施方案中，X为键或选自：
其中“*”是PTM、L或ULM诸如ILM的附接点。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXIV)或(XXVI)的结构，它们衍生自WO公布号2015/006524和Perez HL,Discovery of potent heterodimeric antagonists ofinhibitor of apoptosis proteins(IAPs)with sustained antitumoractivity.J.Med.Chem.58(3),1556-62(2015)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物，并且接头基团L的化学接头如图所示：
Figure BDA0002176933830000382
Figure BDA0002176933830000391
其中：
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R1选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R2选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
或者可替代地，
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R1和R2独立地选自任选被取代的硫代烷基，其中附接至硫代烷基的S原子的取代基是任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的杂环基、-(CH2)vCOR20、-CH2CHR21COR22或-CH2R23，
其中：
v是1-3的整数；
–(CH2)vCOR20和-CH2R23的R20和R22独立地选自OH、NR24R25或OR26；
-CH2CHR21COR2的R21选自NR24R25；
-CH2R23的R23选自任选被取代的芳基或任选被取代的杂环基，其中任选的取代基包括烷基和卤素；
NR24R25的R24选自氢或任选被取代的烷基；
NR24R25的R25选自氢、任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂环基、-CH2(OCH2CH2O)mCH3或多胺链，诸如精胺或亚精胺；
OR26的R26选自任选被取代的烷基，其中任选的取代基是OH、卤素或NH2；并且
m是1-8的整数；
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R3和R4独立地是任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的芳基烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基、任选被取代的杂芳基烷基或任选被取代的杂环烷基，其中取代基是烷基、卤素或OH；
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R5、R6、R7和R8独立地是氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；和/或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在一个具体实施方案中，根据式(XXII)至(XXVI)的ILM：
R7和R8选自H或Me；
R5和R6选自：
Figure BDA0002176933830000401
R3和R4选自：
Figure BDA0002176933830000402
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXVII)或(XXVII)的结构，它们衍生自WO公布号2014/055461和Kim,KS,Discovery of tetrahydroisoquinoline-basedbivalent heterodimeric IAP antagonists.Bioorg.Med.Chem.Lett.24(21),5022-9(2014)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000411
其中：
R35是选自烷基、卤素、烷氧基、氰基和卤代烷氧基的1-2个取代基；
式(XXVII)或(XXVIII)的R1选自H或任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXVII)或(XXVIII)的R2选自H或任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
或者可替代地，
式(XXVII)和(XXVIII)的R1和R2独立地选自任选被取代的硫代烷基–CR60R61SR70，其中R60和R61选自H或甲基，并且R70选自任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的杂环基、-(CH2)vCOR20、-CH2CHR21COR22或-CH2R23，
其中：
v是1-3的整数；
–(CH2)vCOR20和-CH2CHR21COR22的R20和R22独立地选自OH、NR24R25或OR26；
-CH2CHR21COR22的R21选自NR24R25；
-CH2R23的R23选自任选被取代的芳基或任选被取代的杂环基，其中任选的取代基包括烷基和卤素；
NR24R25的R24选自氢或任选被取代的烷基；
NR24R25的R25选自氢、任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂环基、-CH2CH2(OCH2CH2)mCH3或
Figure BDA0002176933830000424
诸如精胺或亚精胺；
其中δ＝0-2，ψ＝1-3，
Figure BDA0002176933830000423
OR26的R26是任选被取代的烷基，其中任选的取代基是OH、卤素或NH2；并且
m是1-8的整数，
式(XXVII)和(XXVIII)的R3和R4独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的芳基烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基、任选被取代的杂芳基烷基或任选被取代的杂环烷基，其中取代基是烷基、卤素或OH；
式(XXVII)和(XXVIII)的R5、R6、R7和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
式(XXVII)和(XXVIII)的R31选自任选进一步被取代的烷基、芳基、芳烷基、杂芳基或杂芳基烷基，优选地选自：
Figure BDA0002176933830000421
式(XXVII)和(XXVIII)的X选自–(CR81R82)m-、任选被取代的杂芳基或杂环基，
Figure BDA0002176933830000431
式(XXVII)的Z选自C＝O、-O-、-NR、-CONH-、-NHCO-，或者可以不存在；
–(CR81R82)m-的R81和R82独立地选自氢、卤素、烷基或环烷基，或者R81和R82可以合在一起形成碳环；
Figure BDA0002176933830000432
的R10和R11独立地选自氢、卤素或烷基；
Figure BDA0002176933830000433
的R12、R13、R14、R15和R16独立地选自氢、卤素或任选被取代的烷基或OR17；
R17选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
–(CR21R22)m-和
Figure BDA0002176933830000435
的m和n独立地是0、1、2、3或4；
Figure BDA0002176933830000436
的o和p独立地是0、1、2或3；
Figure BDA0002176933830000441
Figure BDA0002176933830000442
的q和t独立地是0、1、2、3或4；
的r是0或1；
和/或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXIX)、(XXX)、(XXXI)或(XXXII)的结构，它们衍生自WO公布号2014/055461和Kim,KS,Discovery of tetrahydroisoquinoline-based bivalent heterodimeric IAP antagonists.Bioorg.Med.Chem.Lett.24(21),5022-9(2014)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物，并且接头基团L的化学接头如图所示：
Figure BDA0002176933830000444
Figure BDA0002176933830000451
其中：
式(XXIX)至(XXXII)的R2选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
或者可替代地；
式(XXVII)和(XXVIII)的R1和R2独立地选自H、任选被取代的硫代烷基–CR60R61SR70，其中R60和R61选自H或甲基，并且R70是任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的杂环基、-(CH2)vCOR20、-CH2CHR21COR22或-CH2R23；
其中：
v是1-3的整数；
–(CH2)vCOR20和-CH2CHR21COR22的R20和R22独立地选自OH、NR24R25或OR26；
-CH2CHR21COR22的R21选自NR24R25；
-CH2R23的R23选自任选被取代的芳基或任选被取代的杂环基，其中任选的取代基包括烷基和卤素；
NR24R25的R24选自氢或任选被取代的烷基；
NR24R25的R25选自氢、任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂环基、-CH2CH2(OCH2CH2)mCH3或
Figure BDA0002176933830000463
Figure BDA0002176933830000464
诸如精胺或亚精胺；
其中δ＝0-2，ψ＝1-3，
Figure BDA0002176933830000465
OR26的R26是任选被取代的烷基，其中任选的取代基是OH、卤素或NH2；
m是1-8的整数；
式(XXIX)至(XXXII)的R6和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；并且
式(XXIX)至(XXXII)的R31选自任选进一步被取代的烷基、芳基、芳烷基、杂芳基或杂芳基烷基，优选地选自：
Figure BDA0002176933830000461
在某些实施方案中，化合物的ILM是：
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXXIII)的结构，其衍生自WO公布号2014/074658和WO公布号2013/071035中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000471
其中：
式(XXXIII)的R2选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXXIII)的R6和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
式(XXXIII)的R32选自(C1-C4亚烷基)-R33，其中R33选自氢、芳基、杂芳基或任选进一步被取代的环烷基；
式(XXXIII)的X选自：
Figure BDA0002176933830000472
式(XXXIII)的Z和Z'独立地选自：
Figure BDA0002176933830000481
Figure BDA0002176933830000482
其中每个表示与化合物的附接点，并且Z和Z’不能在任何给定的化合物中同时是
Figure BDA0002176933830000484
式(XXXIII)的Y选自：
Figure BDA0002176933830000485
Figure BDA0002176933830000486
其中式(XXXIII)的Z和Z’相同并且Z是
Figure BDA0002176933830000487
其中每个
Figure BDA0002176933830000488
表示与化合物的附接点，X选自：
Figure BDA0002176933830000491
Figure BDA0002176933830000492
并且式(XXXIII)的Y独立地选自：
其中：
Figure BDA0002176933830000511
表示与化合物的-C＝O部分的附接点；
Figure BDA0002176933830000512
表示与化合物的-NH部分的附接点；
Figure BDA0002176933830000513
表示与Z的第一附接点；
Figure BDA0002176933830000514
表示与Z的第二附接点；
m是0-3的整数；
n是1-3的整数；
p是0-4的整数；并且
A是–C(O)R3；
R3选自–C(O)R3是OH、NHCN、NHSO2R10、NHOR11或N(R12)(R13)；
NHSO2R10和NHOR11的R10和F11独立地选自氢、任选被取代的-C1-C4烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基或杂环烷基；
N(R12)(R13)的R12和R13独立地选自氢、-C1-C4烷基、-(C1-C4)亚烷基)-NH-(C1-C4烷基)和–(C1-C4亚烷基)-O-(C1-C4羟烷基)，或者R12和R13与它们通常结合的氮原子合在一起形成任选地包含选自N、O和S的一个另外的杂原子的饱和杂环基，并且其中饱和杂环任选地被甲基取代。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXXIV)或(XXXV)的结构，它们衍生自WO公布号2014/047024中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000515
Figure BDA0002176933830000521
其中：
式(XXXIV)或(XXXV)的X不存在或选自-(CR10R11)m-、任选被取代的杂芳基或任选被取代的杂环基、
Figure BDA0002176933830000522
式(XXXIV)或(XXXV)的Y和Z独立地选自C＝0、-0-、-NR9-、-CONH-、-NHCO-或可以不存在；
式(XXXIV)或(XXXV)的R1和R2独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的芳基，或者
式(XXXIV)或(XXXV)的R1和R2独立地选自任选被取代的硫代烷基，其中附接至硫代烷基的S原子的取代基是任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的杂环基、-(CH2)vCOR20、-CH2CHR21COR22或-CH2R23；其中
v是1-3的整数；
-(CH2)vCOR20和-CH2CHR21COR22的R20和R22独立地选自OH、NR24R25或OR26；
-CH2CHR21COR22的R21选自NR24R25；
-CH2R23的R23选自任选被取代的芳基或任选被取代的杂环基，其中任选的取代基包括烷基和卤素；
NR24R25的R24选自氢或任选被取代的烷基；
NR24R25的R25选自氢、任选被取代的烷基、任选被取代的支链烷基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂环基、-CH2(OCH2CH20)mCH3或多胺链；
R26是任选被取代的烷基，其中任选的取代基是OH、卤素或NH2；
-(CR10R11)m-的m是1-8的整数；
式(XXXIV)或(XXXV)的R3和R4独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的芳基烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基、任选被取代的杂芳基烷基或任选被取代的杂环烷基，其中取代基是烷基、卤素或OH；
式(XXXIV)或(XXXV)的R5、R6、R7和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
-(CR10R11)m-的R10和R11独立地选自氢、卤素或任选被取代的烷基；
Figure BDA0002176933830000531
的R12和R13独立地选自氢、卤素或任选被取代的烷基，或者
R12和R13可以合在一起形成碳环；
Figure BDA0002176933830000532
Figure BDA0002176933830000533
的R14、R15、R16、R17和R18独立地选自氢、卤素、任选被取代的烷基或OR19；
OR19的R19选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
-(CR10R11)m-的m和n独立地是0、1、2、3或4；
-(CR10R11)m-的o和p独立地是0、1、2或3；
-(CR10R11)m-的q是0、1、2、3或4；r是0或1；
-(CR10R11)m-的t是1、2或3；和/或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXXVI)的结构，其衍生自WO公布号2014/025759中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000541
其中：
式(XXXVI)的A选自：
Figure BDA0002176933830000542
其中虚线表示任选的双键；
式(XXXVI)的X选自：-(CR21R22)m-，
Figure BDA0002176933830000543
式(XXXVI)的Y和Z独立地选自-0-、-NR6-或不存在；
式(XXXVI)的V选自-N-或-CH-；
式(XXXVI)的W选自-CH-或-N-；
式(XXXVI)的R1选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXXVI)的R3和R4独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳烷基、任选被取代的杂芳基烷基或任选被取代的杂环烷基；
式(XXIV)、(XXV)或(XXVI)的R5、R6、R7和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基，或优选地甲基；
Figure BDA0002176933830000551
的R9和R10独立地选自氢、卤素或任选被取代的烷基，或者R9和R10可以合在一起形成环；
Figure BDA0002176933830000552
的R11、R12、R13和R14独立地选自氢、卤素、任选被取代的烷基或OR15；
OR15的R15选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
-(CR21R22)m-和
Figure BDA0002176933830000553
的m和n独立地选自0、1、2、3或4；
Figure BDA0002176933830000554
的o和p独立地选自0、1、2或3；
Figure BDA0002176933830000555
的q选自0、1、2、3或4；
的r选自0或1，和/或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXXVII)或(XXXVIII)的结构，它们衍生自WO公布号2014/011712中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000562
其中：
式(XXXVII)和(XXXVIII)的X是–(CR16R17)m-，
Figure BDA0002176933830000571
或不存在；
式(XXXVII)和(XXXVIII)的Y和Z独立地选自-0-、C＝0、NR6或不存在；
式(XXXVII)和(XXXVIII)的R1和R2选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的烷芳基或任选被取代的芳基；
式(XXXVII)或(XXXVIII)的R3和R4独立地选自任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的环烷基烷基、任选被取代的芳烷基或任选被取代的芳基；
式(XXXVII)和(XXXVIII)的R5和R6独立地选自任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
式(XXXVII)和(XXXVIII)的R7和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基，或优选地甲基；
Figure BDA0002176933830000572
的R9和R10独立地选自氢、任选被取代的烷基，或者R9和R10可以合在一起形成环；
Figure BDA0002176933830000573
的R11至R14独立地选自氢、卤素、任选被取代的烷基或
OR15；
OR15的R15选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基；
–(CR16R17)m-的R16和R17独立地选自氢、卤素或任选被取代的烷基；
式(XXXVII)和(XXXVIII)的R50和R51独立地选自任选被取代的烷基，或者R50和R51合在一起形成环；
–(CR16R17)m-和
Figure BDA0002176933830000574
的m和n独立地是0-4的整数；
的o和p独立地是0-3的整数；
的q是0-4的整数；并且
Figure BDA0002176933830000583
的r是0-1的整数；
或其药学上可接受的盐、互变异构体或立体异构体。
在一个实施方案中，式(XXXVII)或(XXXVIII)的ILM的R1和R2是叔丁基，并且式(XXXVII)或(XXXVIII)的ILM的R3和R4是四氢化萘。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XXXIX)或(XL)的结构，它们衍生自WO公布号2013/071039中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000584
其中：
式(XXXIX)和(XL)的R43和R44独立地选自氢、烷基、芳基、芳烷基、杂芳基、杂芳基烷基、环烷基、进一步任选被取代的环烷基烷基，并且
式(XXXIX)和(XL)的R6和R8独立地选自氢、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基。
式(XXXIX)和(XL)的每个X独立地选自：
Figure BDA0002176933830000591
式(XXXIX)和(XL)的每个Z选自
Figure BDA0002176933830000592
其中每个
Figure BDA0002176933830000593
表示与化合物的附接点；并且
每个Y选自：
Figure BDA0002176933830000601
Figure BDA0002176933830000611
Figure BDA0002176933830000612
其中：
Figure BDA0002176933830000613
表示与化合物的-C＝O部分的附接点；
表示与化合物的氨基部分的附接点；
Figure BDA0002176933830000615
表示与Z的第一附接点；
Figure BDA0002176933830000616
表示与Z的第二个附接点；并且
A选自-C(O)R3或
Figure BDA0002176933830000617
或前述任一者的互变异构体形式，其中：
-C(O)R3的R3选自OH、NHCN、NHS02R10、NHOR11或N(R12)(R13)；
NHS02R10和NHOR11的R10和R11独立地选自-C1-C4烷基、环烷基、芳基、杂芳基或杂环烷基(其中任一者是任选被取代的)，以及氢；
N(R12)(R13)的R12和R13中的每一者独立地选自氢、-C1-C4烷基、-(C1-C4亚烷基)-NH-(C1-C4烷基)、苄基、-(C1-C4亚烷基)-C(O)OH、
-(C1-C4亚烷基)-C(O)CH3、-CH(苄基)-COOH、-C1-C4烷氧基和
-(C1-C4亚烷基)-O-(C1-C4羟烷基)；或者N(R12)(R13)的R12和R13与它们通常结合的氮原子合在一起形成任选地包含选自N、O和S的一个另外的杂原子的饱和杂环基，并且其中饱和杂环任选地被甲基取代。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XLI)的结构，其衍生自WO公布号2013/071039中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000618
其中：
式(XLI)的W1选自O、S、N-RA或C(R8a)(R8b)；
式(XLI)的W2选自O、S、N-RA或C(R8c)(R8d)；前提条件是W1和W2均不为O或均不为S；
式(XLI)的R1选自H、C1-C6烷基、C3-C6环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
当X1选自O、N-RA、S、S(O)或S(O)2时，X2是C(R2aR2b)；
或者：
式(XLI)的X1选自CR2cR2d，X2是CR2aR2b，并且R2c和R2a一起形成键；
或者：
式(XLI)的X1和X2独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员；
或者：
式(XLI)的X1选自CH2，X2是C＝0、C＝C(RC)2或C＝NRC；其中每个Rc独立地选自H、-CN、-OH、烷氧基、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
N-RA的RA选自H、C1-C6烷基、-C(＝O)C1-C2烷基、取代或未取代的芳基或者取代或未取代的杂芳基；
CR2cR2d和CR2aR2b的R2a、R2b、R2c、R2d独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)和-C(＝O)RB；
-C(＝O)RB的RB选自取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)或-NRDRE；
NRDRE的RD和RE独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
式(XLI)的m选自0、1或2；
式(XLI)的-U-选自-NHC(＝O)-、-C(＝O)NH-、-NHS(＝O)2-、-S(＝O)2NH-、-NHC(＝O)NH-、-NH(C＝O)O-、-O(C＝O)NH-或-NHS(＝O)2NH-；
式(XLI)的R3选自C1-C3烷基或C1-C3氟代烷基；
式(XLI)的R4选自-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3或-OR5；
-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3和-OR5的每个R5独立地选自H、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基、C1-C3杂烷基和–C1-C3烷基-(C3-C5环烷基)；
或者：
式(XLI)的R3和R5与它们所附接的原子一起形成取代或未取代的5-7元环；
或者：
式(XLI)的R3结合至U的氮原子，形成取代或未取代的5-7元环；
式(XLI)的R6选自-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7、取代或未取代的C2-C10杂环烷基或者取代或未取代的杂芳基；
-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7的每个R7独立地选自C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C10环烷基、取代或未取代的C2-C10杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C10环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C10杂环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)、-(CH2)p-CH(取代或未取代的芳基)2、-(CH2)p-CH(取代或未取代的杂芳基)2、-(CH2)P-CH(取代或未取代的芳基)(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的芳基)或-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的杂芳基)；
R7的p选自0、1或2；
C(R8a)(R8b)和C(R8c)(R8d)的R8a、R8b、R8c和R8d独立地选自H、C1-C6烷基、C1-C6氟代烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6杂烷基和取代或未取代的芳基；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c一起形成键；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-7元饱和或部分饱和的碳环或杂环、取代或未取代的稠合5-10元芳基环或者包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-10元杂芳基环；
或者：
R8c和R8d如上文所定义，并且R8a和R8b与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
R8a和R8b如上文所定义，并且R8c和R8d与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
其中每个取代的烷基、杂烷基、稠环、螺环、杂螺环、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基被1-3个R9取代；并且
R8a、R8b、R8c和R8d的每个R9独立地选自卤素、-OH、-SH、(C＝O)、CN、C1-C4烷基、C1-C4氟代烷基、C1-C4烷氧基、C1-C4氟代烷氧基、-NH2、-NH(C1-C4烷基)、-NH(C1-C4烷基)2、-C(＝O)OH、-C(＝0)NH2、-C(＝O)C1-C3烷基、-S(＝O)2CH3、-NH(C1-C4烷基)-OH、-NH(C1-C4烷基)-O-(C-C4烷基)、-O(C1-C4烷基)-NH2；-O(C1-C4烷基)-NH-(C1-C4烷基)和-O(C1-C4烷基)-N-(C1-C4烷基)2，或者两个R9与它们所附接的原子一起形成被卤素、-OH或C1-C3烷基取代或未取代的亚甲二氧基或亚乙二氧基环。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XLII)的结构，其衍生自WO公布号2013/071039中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000641
其中：
式(XLII)的W1是O、S、N-RA或C(R8a)(R8b)；
式(XLII)的W2是O、S、N-RA或C(R8c)(R8d)；前提条件是W1和W2均不为O或均不为S；
式(XLII)的R1选自H、C1-C6烷基、C3-C6环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
当式(XLII)的X1是N-RA时，X2是C＝O或CR2cR2d，并且X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLII)的X1选自S、S(O)或S(O)2时，X2是CR2cR2d，并且X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLII)的1是O时，X2是CR2cR2d和N-RA，并且X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLII)的X1是CH3时，X2选自O、N-RA、S、S(O)或S(O)2，并且X3是CR2aR2b；
当式(XLII)的X1是CR2eR2f且X2是CR2cR2d，并且R2e和R2c一起形成键时，式(VLII)的X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLII)的X1和X3均为CH2，式(XLII)的X2是C＝0、C＝C(RC)2或C＝NRC；其中每个RC独立地选自H、-CN、-OH、烷氧基、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
或者：
式(XLII)的X1和X2独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLII)的X2和X3独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且式(VLII)的X1是CR2eR2f；
N-RA的RA选自H、C1-C6烷基、-C(＝O)C1-C2烷基、取代或未取代的芳基或者取代或未取代的杂芳基；
CR2cR2d、CR2aR2b和CR2eR2f的R2a、R2b、R2c、R2d、R2e和R2f独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)和-C(＝O)RB；
-C(＝O)RB的RB选自取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)或-NRDRE；
NRDRE的RD和RE独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
式(XLII)的m选自0、1或2；
式(XLII)的-U-选自-NHC(＝O)-、-C(＝O)NH-、-NHS(＝O)2-、-S(＝O)2NH-、-NHC(＝O)NH-、-NH(C＝O)O-、-O(C＝O)NH-或-NHS(＝O)2NH-；
式(XLII)的R3选自C1-C3烷基或C1-C3氟代烷基；
式(XLII)的R4选自-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3或-OR5；
-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3和-OR5的每个R5独立地选自H、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基、C1-C3杂烷基和–C1-C3烷基-(C3-C5环烷基)；
或者：
式(XLII)的R3和R5与它们所附接的原子一起形成取代或未取代的5-7元环；
或者：
式(XLII)的R3结合至U的氮原子，形成取代或未取代的5-7元环；
式(XLII)的R6选自-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7、取代或未取代的C2-C10杂环烷基或者取代或未取代的杂芳基；
-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7的每个R7独立地选自C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C10环烷基、取代或未取代的C2-C10杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C10环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C10杂环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)、-(CH2)p-CH(取代或未取代的芳基)2、-(CH2)p-CH(取代或未取代的杂芳基)2、-(CH2)P-CH(取代或未取代的芳基)(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的芳基)或-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的杂芳基)；
R7的p选自0、1或2；
C(R8a)(R8b)和C(R8c)(R8d)的R8a、R8b、R8c和R8d独立地选自H、C1-C6烷基、C1-C6氟代烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6杂烷基和取代或未取代的芳基；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c一起形成键；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-7元饱和或部分饱和的碳环或杂环、取代或未取代的稠合5-10元芳基环或者包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-10元杂芳基环；
或者：
R8c和R8d如上文所定义，并且R8a和R8b与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
R8a和R8b如上文所定义，并且R8c和R8d与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
其中每个取代的烷基、杂烷基、稠环、螺环、杂螺环、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基被1-3个R9取代；并且
R8a、R8b、R8c和R8d的每个R9独立地选自卤素、-OH、-SH、(C＝O)、CN、C1-C4烷基、C1-C4氟代烷基、C1-C4烷氧基、C1-C4氟代烷氧基、-NH2、-NH(C1-C4烷基)、-NH(C1-C4烷基)2、-C(＝O)OH、-C(＝0)NH2、-C(＝O)C1-C3烷基、-S(＝O)2CH3、-NH(C1-C4烷基)-OH、-NH(C1-C4烷基)-O-(C-C4烷基)、-O(C1-C4烷基)-NH2；-O(C1-C4烷基)-NH-(C1-C4烷基)和-O(C1-C4烷基)-N-(C1-C4烷基)2，或者两个R9与它们所附接的原子一起形成被卤素、-OH或C1-C3烷基取代或未取代的亚甲二氧基或亚乙二氧基环。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XLIII)的结构，其衍生自WO公布号2013/071039中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000681
其中：
式(XLIII)的W1选自O、S、N-RA或C(R8a)(R8b)；
式(XLIII)的W2选自O、S、N-RA或C(R8c)(R8d)；前提条件是W1和W2均不为O或均不为S；
式(XLIII)的R1选自H、C1-C6烷基、C3-C6环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
当式(XLIII)的X1选自N-RA、S、S(O)或S(O)2时，式(XLIII)的X2是CR2cR2d，并且式(XLIII)的X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLIII)的X1是O时，式(XLIII)的X2选自O、N-RA、S、S(O)或S(O)2，并且式(XLIII)的X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLIII)的X1是CR2eR2f且式(XLIII)的X2是CR2cR2d，并且R2e和R2c一起形成键时，式(XLIII)的X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLIII)的X1和X2独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且式(XLIII)的X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLIII)的X2和X3独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且式(VLII)的X1是CR2eR2f；
N-RA的RA是H、C1-C6烷基、-C(＝O)C1-C2烷基、取代或未取代的芳基或者取代或未取代的杂芳基；
CR2cR2d、CR2aR2b和CR2eR2f的R2a、R2b、R2c、R2d、R2e和R2f独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)和-C(＝O)RB；
-C(＝O)RB的RB是取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)或-NRDRE；
NRDRE的RD和RE独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
式(XLIII)的m是0、1或2；
式(XLIII)的-U-是-NHC(＝O)-、-C(＝O)NH-、-NHS(＝O)2-、-S(＝O)2NH-、-NHC(＝O)NH-、-NH(C＝O)O-、-O(C＝O)NH-或-NHS(＝O)2NH-；
式(XLIII)的R3是C1-C3烷基或C1-C3氟代烷基；
式(XLIII)的R4是-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3或-OR5；
-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3和-OR5的每个R5独立地选自H、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基、C1-C3杂烷基和–C1-C3烷基-(C3-C5环烷基)；
或者：
式(XLIII)的R3和R5与它们所附接的原子一起形成取代或未取代的5-7元环；
或者：
式(XLIII)的R3结合至U的氮原子，形成取代或未取代的5-7元环；
式(XLIII)的R6选自-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7、取代或未取代的C2-C10杂环烷基或者取代或未取代的杂芳基；
-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7的每个R7独立地选自C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C10环烷基、取代或未取代的C2-C10杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C10环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C10杂环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)、-(CH2)p-CH(取代或未取代的芳基)2、-(CH2)p-CH(取代或未取代的杂芳基)2、-(CH2)P-CH(取代或未取代的芳基)(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的芳基)或-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的杂芳基)；
R7的p是0、1或2；
C(R8a)(R8b)和C(R8c)(R8d)的R8a、R8b、R8c和R8d独立地选自H、C1-C6烷基、C1-C6氟代烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6杂烷基和取代或未取代的芳基；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c一起形成键；
或者：
R8a和R8d如上文所定义，并且R8b和R8c与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-7元饱和或部分饱和的碳环或杂环、取代或未取代的稠合5-10元芳基环或者包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-10元杂芳基环；
或者：
R8c和R8d如上文所定义，并且R8a和R8b与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
R8a和R8b如上文所定义，并且R8c和R8d与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
其中每个取代的烷基、杂烷基、稠环、螺环、杂螺环、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基被1-3个R9取代；并且
R8a、R8b、R8c和R8d的每个R9独立地选自卤素、-OH、-SH、(C＝O)、CN、C1-C4烷基、C1-C4氟代烷基、C1-C4烷氧基、C1-C4氟代烷氧基、-NH2、-NH(C1-C4烷基)、-NH(C1-C4烷基)2、-C(＝O)OH、-C(＝0)NH2、-C(＝O)C1-C3烷基、-S(＝O)2CH3、-NH(C1-C4烷基)-OH、-NH(C1-C4烷基)-O-(C-C4烷基)、-O(C1-C4烷基)-NH2；-O(C1-C4烷基)-NH-(C1-C4烷基)和-O(C1-C4烷基)-N-(C1-C4烷基)2，或者两个R9与它们所附接的原子一起形成被卤素、-OH或C1-C3烷基取代或未取代的亚甲二氧基或亚乙二氧基环。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XLIV)的结构，其衍生自WO公布号2013/071039中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000711
其中：
式(XLIV)的W1选自O、S、N-RA或C(R8a)(R8b)；
式(XLIV)的W2选自O、S、N-RA或C(R8c)(R8d)；前提条件是W1和W2均不为O或均不为S；
式(XLIV)的W3选自O、S、N-RA或C(R8e)(R8f)，前提条件是包含W1、W2和W3的环不含两个相邻的氧原子或硫原子；
式(XLIV)的R1选自H、C1-C6烷基、C3-C6环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
当式(XLIV)的X1是O时，式(XLIV)的X2选自CR2cR2d和N-RA，并且式(XLIV)的X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLIV)的X1是CH2时，式(XLIV)的X2选自O、N-RA、S、S(O)或S(O)2，并且式(XLIV)的X3是CR2aR2b；
或者：
当式(XLIV)的X1是CR2eR2f且式(XLIV)的X2是CR2cR2d，并且R2e和R2c一起形成键时，式(VLIV)的X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLIV)的X1和X3均为CH2，并且式(XLII)的X2是C＝0、C＝C(RC)2或C＝NRC；其中每个RC独立地选自H、-CN、-OH、烷氧基、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
或者：
式(XLIV)的X1和X2独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且式(XLIV)的X3是CR2aR2b；
或者：
式(XLIV)的X2和X3独立地选自C和N，并且是稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元环烷基环、稠合的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-10元杂环烷基环、稠合的取代或未取代的5-10元芳基环或者稠合的取代或未取代的5-10元杂芳基环的成员，并且式(VLIV)的X1是CR2eR2f；
N-RA的RA选自H、C1-C6烷基、-C(＝O)C1-C2烷基、取代或未取代的芳基或者取代或未取代的杂芳基；
CR2cR2d、CR2aR2b和CR2eR2f的R2a、R2b、R2c、R2d、R2e和R2f独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)和-C(＝O)RB；
-C(＝O)RB的RB选自取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)或-NRDRE；
NRDRE的RD和RE独立地选自H、取代或未取代的C1-C6烷基、取代或未取代的C3-C6环烷基、取代或未取代的C2-C5杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C6环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C5杂环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)或–C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)；
式(XLIV)的m选自0、1或2；
式(XLIV)的-U-选自-NHC(＝O)-、-C(＝O)NH-、-NHS(＝O)2-、-S(＝O)2NH-、-NHC(＝O)NH-、-NH(C＝O)O-、-O(C＝O)NH-或-NHS(＝O)2NH-；
式(XLIV)的R3选自C1-C3烷基或C1-C3氟代烷基；
式(XLIV)的R4选自-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3或-OR5；
-NHR5、-N(R5)2、-N+(R5)3和-OR5的每个R5独立地选自H、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基、C1-C3杂烷基和–C1-C3烷基-(C3-C5环烷基)；
或者：
式(XLIV)的R3和R5与它们所附接的原子一起形成取代或未取代的5-7元环；
或者：
式(XLIII)的R3结合至U的氮原子，形成取代或未取代的5-7元环；
式(XLIII)的R6选自-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7、取代或未取代的C2-C10杂环烷基或者取代或未取代的杂芳基；
-NHC(＝O)R7、-C(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2R7、-S(＝O)2NHR7；-NHC(＝O)NHR7、-NHS(＝O)2NHR7、-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)R7、-(C1-C3烷基)-C(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2R7、-(C1-C3烷基)-S(＝O)2NHR7；-(C1-C3烷基)-NHC(＝O)NHR7、-(C1-C3烷基)-NHS(＝O)2NHR7的每个R7独立地选自C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、取代或未取代的C3-C10环烷基、取代或未取代的C2-C10杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C3-C10环烷基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的C2-C10杂环烷基、-C1-C6烷基-(取代或未取代的芳基)、-C1-C6烷基-(取代或未取代的杂芳基)、-(CH2)p-CH(取代或未取代的芳基)2、-(CH2)p-CH(取代或未取代的杂芳基)2、-(CH2)P-CH(取代或未取代的芳基)(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的芳基)、-(取代或未取代的芳基)-(取代或未取代的杂芳基)、-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的芳基)或-(取代或未取代的杂芳基)-(取代或未取代的杂芳基)；
R7的p选自0、1或2；
C(R8a)(R8b)、C(R8c)(R8d)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8b、R8c、R8d、R8e和R8f独立地选自H、C1-C6烷基、C1-C6氟代烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6杂烷基和取代或未取代的芳基；
或者：
C(R8a)(R8d)、C(R8c)(R8e)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8b、R8d和R8f如上文所定义，并且R8b和R8c一起形成键；
或者：
C(R8a)(R8b)、C(R8c)(R8d)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8b、R8d和R8f如上文所定义，并且R8c和R8e一起形成键；
或者：
C(R8a)(R8b)、C(R8c)(R8d)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8d、R8e和R8f如上文所定义，并且R8b和R8c与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-7元饱和或部分饱和的碳环或杂环、取代或未取代的稠合5-10元芳基环或者包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-10元杂芳基环；
或者：
C(R8a)(R8b)、C(R8c)(R8d)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8b、R8d和R8f如上文所定义，并且R8c和R8e与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-7元饱和或部分饱和的碳环或杂环、取代或未取代的稠合5-10元芳基环或者包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的稠合5-10元杂芳基环；
或者：
C(R8c)(R8d)和C(R8e)(R8f)的R8c、R8d、R8e和R8f如上文所定义，并且R8a和R8b与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
C(R8a)(R8b)和C(R8e)(R8f)的R8a、R8b、R8e和R8f如上文所定义，并且R8c和R8d与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
C(R8a)(R8b)和C(R8c)(R8d)的R8a、R8b、R8c和R8d如上文所定义，并且R8e和R8f与它们所附接的原子一起形成包含选自S、O和N的1-3个杂原子的取代或未取代的饱和或部分饱和的3-7元螺环或杂螺环；
或者：
其中每个取代的烷基、杂烷基、稠环、螺环、杂螺环、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基被1-3个R9取代；并且
R8a、R8b、R8c、R8d、R8e和R8f的每个R9独立地选自卤素、-OH、-SH、(C＝O)、CN、C1-C4烷基、C1-C4氟代烷基、C1-C4烷氧基、C1-C4氟代烷氧基、-NH2、-NH(C1-C4烷基)、-NH(C1-C4烷基)2、-C(＝O)OH、-C(＝0)NH2、-C(＝O)C1-C3烷基、-S(＝O)2CH3、-NH(C1-C4烷基)-OH、-NH(C1-C4烷基)-O-(C-C4烷基)、-O(C1-C4烷基)-NH2；-O(C1-C4烷基)-NH-(C1-C4烷基)和-O(C1-C4烷基)-N-(C1-C4烷基)2，或者两个R9与它们所附接的原子一起形成被卤素、-OH或C1-C3烷基取代或未取代的亚甲二氧基或亚乙二氧基环。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(XLV)、(XLVI)或(XLVII)的结构，其衍生自Vamos,M.等人，Expedient synthesis of highly potent antagonists ofinhibitor of apoptosis proteins(IAPs)with unique selectivity for ML-IAP,ACSChem.Biol.,8(4),725-32(2013)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000751
其中：
式(XLV)的R2、R3和R4独立地选自H或Me；
式(XLV)的X独立地选自O或S；并且
式(XLV)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000761
在一个具体实施方案中，ILM具有根据式(XLVIII)的结构：
Figure BDA0002176933830000762
其中式(XLVIII)的R3和R4独立地选自H或ME；
是选自以下的5元杂环：
Figure BDA0002176933830000764
在一个具体实施方案中，式XLVIII)的
Figure BDA0002176933830000765
是
Figure BDA0002176933830000766
在一个具体实施方案中，ILM具有结构并附接至接头基团L，如下所示：
Figure BDA0002176933830000771
在一个具体实施方案中，ILM具有根据式(XLIX)、(L)或(LI)的结构：
Figure BDA0002176933830000772
Figure BDA0002176933830000781
其中：
式(XLIX)、(L)或(LI)的R3独立地选自H或ME；
Figure BDA0002176933830000782
是选自以下的5元杂环：
Figure BDA0002176933830000783
并且
式(XLIX)、(L)或(LI)的L选自：
Figure BDA0002176933830000784
在一个具体实施方案中，式(XLIX)、(L)或(LI)的L
在一个具体实施方案中，ILM具有根据式(LII)的结构：
Figure BDA0002176933830000791
在一个具体实施方案中，根据式(LII)的ILM化学连接至用
Figure BDA0002176933830000792
表示的区域中的接头基团L，如下所示：
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(LIII)或(LIV)的结构，其基于Hennessy,EJ等人，Discovery of aminopiperidine-based Smac mimetics as IAPantagonists,Bioorg.Med.Chem.Lett.,22(4),1960-4(2012)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000801
其中：
式(LIII)的R1选自：
式(LIII)和(LIV)的R2选自H或Me；
式(LIII)的R3选自：
Figure BDA0002176933830000803
的X选自H、卤素、甲基、甲氧基、羟基、硝基或三氟甲基。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有如式(LV)或(LVI)所示的结构并如式所示化学连接至接头，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000811
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(LVII)的结构，其基于Cohen,F等人，Orally bioavailable antagonists of inhibitor of apoptosis proteins based onan azabicyclooctane scaffold,J.Med.Chem.,52(6),1723-30(2009)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000812
其中：
式(LVII)的R1选自：
Figure BDA0002176933830000813
Figure BDA0002176933830000821
的X选自H、氟、甲基或甲氧基。
在一个具体实施方案中，ILM由以下结构表示：
Figure BDA0002176933830000822
在一个具体实施方案中，ILM选自以下结构，并且ILM与接头基团L之间的化学连接如下所示：
Figure BDA0002176933830000823
在本文所述的任何化合物中，ILM选自以下结构，其基于Asano,M等人，Design,sterioselective synthesis,and biological evaluation of novel tri-cycliccompounds as inhibitor of apoptosis proteins(IAP)antagonists,Bioorg.Med.Chem.,21(18):5725-37(2013)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000831
在一个具体实施方案中，ILM选自以下结构，并且ILM与接头基团L之间的化学连接如下所示：
Figure BDA0002176933830000832
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(LVIII)的结构，其基于Asano,M等人，Design,sterioselective synthesis,and biological evaluation of novel tri-cyclic compounds as inhibitor of apoptosis proteins(IAP)antagonists,Bioorg.Med.Chem.,21(18):5725-37(2013)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000841
其中式(LVIII)的X是独立地选自H、卤素或氰基的一个或两个取代基。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有如式(LIX)或(LX)所示的结构并如式所示化学连接至接头基团L，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000842
其中式(LIX)和(LX)的X是独立地选自H、卤素或氰基的一个或两个取代基，并且；式(LIX)和(LX)的L是如本文所述的接头基团。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有式(LXI)的结构，其基于Ardecky,RJ等人，Design,sysnthesis and evaluation of inhibitor of apoptosis(IAP)antagoniststhat are highly selective for the BIR2 domain of XIAP,Bioorg.Med.Chem.,23(14):4253-7(2013)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000851
其中：
式(LXI)的是天然或非天然氨基酸；并且
式(LXI)的R2选自：
Figure BDA0002176933830000853
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有如式(LXII)或(LLXIII)所示的结构并如式所示化学连接至接头基团L，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000854
式(LXI)的
Figure BDA0002176933830000855
是天然或非天然氨基酸；并且
式(LXI)的L是如本文所述的接头基团。
在本文所述的任何化合物中，ILM可具有选自以下的结构，其基于Wang,J等人，Discovery of novel second mitochondrial-derived activator of caspase mimeticsas selective inhibitor or apoptosis protein inhibitors,J.Pharmacol.Exp.Ther.,349(2):319-29(2014)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000861
在本文所述的任何化合物中，ILM具有根据式(LXIX)的结构，其基于Hird,AW等人，Structure-based design and synthesis of tricyclic IAP(Inhibitors of ApoptosisProteins)inhibitors,Bioorg.Med.Chem.Lett.,24(7):1820-4(2014)中描述的IAP配体，或其非天然模拟物：
Figure BDA0002176933830000862
其中式LIX的R选自：
Figure BDA0002176933830000863
的R1选自H或Me；
Figure BDA0002176933830000872
的R2选自烷基或环烷基；
Figure BDA0002176933830000873
的X是独立地选自卤素、羟基、甲氧基、硝基和三氟甲基的1-2个取代基
Figure BDA0002176933830000874
的Z是O或NH；
的HET是单环或稠合双环杂芳基；并且
式(LIX)的---是任选的双键。
在一个具体实施方案中，化合物的ILM具有如下所示的化学结构：
Figure BDA0002176933830000876
在一个具体实施方案中，化合物的ILM具有选自以下的化学结构：
Figure BDA0002176933830000881
术语“独立地”在本文中用于指示独立应用的变量因应用不同而独立地改变。
术语“烷基”在其上下文中应该意指直链、支链或环状完全饱和的烃原子团或烷基，优选C1-C10，更优选C1-C6，可替代地C1-C3烷基，其可以是任选被取代的。烷基的实例尤其是甲基、乙基、正丁基、仲丁基、正己基、正庚基、正辛基、正壬基、正癸基、异丙基、2-甲基丙基、环丙基、环丙基-甲基、环丁基、环戊基、环戊基乙基、环己基乙基和环己基。在某些实施方案中，烷基用卤素基团(At、Br、Cl、F或I)封端。在某些优选的实施方案中，根据本公开的化合物可用于共价结合到脱卤素酶。这些化合物一般含有烷基封端的侧链(通常通过聚乙二醇基团连接)，所述烷基的远端具有卤素取代基(通常为氯或溴)，从而使含有此类部分的化合物共价结合到蛋白质。
术语“烯基”是指含有至少一个C＝C键的直链、分支链或环状C2-C10(优选C2-C6)烃基。
术语“炔基”是指含有至少一个C≡C键的直链、分支链或环状C2-C10(优选C2-C6)烃基。
术语“亚烷基”在使用时是指可以任选地被取代的-(CH2)n-基团(n一般是整数0-6)。被取代时，亚烷基优选地在一个或多个亚甲基上被C1-C6烷基(包括环丙基或叔丁基)取代，而且可以被一个或多个卤基(优选1到3个卤基)或一个或两个羟基、O-(C1到C6烷基)或如本文另外公开的氨基酸侧链取代。在某些实施方案中，亚烷基可以被氨基甲酸酯或烷氧基(或其他基团)取代，所述氨基甲酸酯或烷氧基(或其他基团)进一步被聚乙二醇链(1至10个，优选1至6个，通常1至4个乙二醇单元的聚乙二醇链)取代，所述聚乙二醇链被取代(优选地，但非排他性地在聚乙二醇链的远端被取代)；被单个卤素基团(优选氯基团)取代的烷基链。在其他实施方案中，亚烷基(通常为亚甲基)基团可以被氨基酸侧链基团取代，例如天然或非天然氨基酸的侧链基团，例如丙氨酸、β-丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、苯丙氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸或酪氨酸。
术语“未取代的”应该意指仅被氢原子取代。包括C0的碳原子范围意指碳不存在且替换为H。因此，C0-C6的碳原子范围包括1、2、3、4、5和6个碳原子，并且对于C0，H代替碳。
术语“取代的”或“任选被取代的”应该独立地(即，当存在多于一个取代基时，每个取代基独立于另一个取代基)意指在上下文内的分子上的任何地方的碳(或氮)位置处的一个或多个取代基(根据本公开的化合物中的部分上的独立地至多五个取代基，优选至多三个取代基，通常1或2个取代基，并且可以包括其自身可以进一步被取代的取代基)，并且包括羟基、硫醇、羧基、氰基(C≡N)、硝基(NO2)、卤素(优选1、2或3个卤素，尤其是在烷基上，尤其是在甲基如三氟甲基上)、烷基(优选C1-C10，更优选C1-C6)、芳基(尤其是苯基和取代的苯基，例如苄基或苯甲酰基)、烷氧基(优选C1-C6烷基或芳基，包括苯基和取代的苯基)、硫醚(C1-C6烷基或芳基)、酰基(优选C1-C6酰基)、酯或硫酯(优选C1-C6烷基或芳基)，包括亚烷基酯(使得附接在亚烷基上，而不是在酯官能团处，所述酯官能团优选地被C1-C6烷基或芳基取代)，优选C1-C6烷基或芳基、卤素(优选F或Cl)、胺(包括五或六元环状亚烷基胺，还包括C1-C6烷基胺或C1-C6二烷基胺，所述烷基可以被一个或两个羟基取代)或任选被取代的–N(C0-C6烷基)C(O)(O-C1-C6烷基)基团(其可以任选被聚乙二醇链取代，含有单个卤素，优选氯取代基的烷基与所述聚乙二醇链进一步结合)、肼、酰胺基，其优选被一个或两个C1-C6烷基取代(包括任选被一个或两个C1-C6烷基取代的甲酰胺)、链烷醇(优选C1-C6烷基或芳基)或链烷酸(优选C1-C6烷基或芳基)作为取代基。根据本公开的取代基可包括例如–SiR1R2R3基团，其中R1和R2各自如本文其他地方描述的，且R3是H或C1-C6烷基，在本上下文中优选R1、R2、R3是C1-C3烷基(包括异丙基或叔丁基)。上述基团中的每一个可以直接连接到被取代的部分，或者可替代地，取代基可通过任选被取代的-(CH2)m-或可替代地任选被取代的-(OCH2)m-、-(OCH2CH2)m-或-(CH2CH2O)m-基团(其可被任一个或多个上述取代基取代)连接到被取代的部分(优选在芳基或杂芳基部分的情况下)。如上文所识别的亚烷基-(CH2)m-或-(CH2)n-基团或其他链(例如乙二醇链)可以在链上的任何地方被取代。亚烷基上的优选取代基包括卤素或C1-C6(优选C1-C3)烷基，其可以任选被一个或两个羟基、一个或两个醚基(O-C1-C6基团)、至多三个卤素基团(优选F)或如本文其他地方描述的氨基酸的侧链和任选被取代的酰胺(优选如上所述取代的甲酰胺)或氨基甲酸酯基团(经常具有一个或两个C0-C6烷基取代基，所述基团可以进一步被取代)取代。在某些实施方案中，亚烷基(通常为单个亚甲基)被一个或两个任选被取代的C1-C6烷基，优选C1-C4烷基、最通常为甲基或O-甲基或者如本文其他地方描述的氨基酸的侧链取代。在本公开中，分子中的部分可以任选被至多五个取代基，优选至多三个取代基取代。最经常地，在本公开中，被取代的部分被一个或两个取代基取代。
术语“取代的”(每个取代基独立于任何其他取代基)在其使用的上下文中还应该意指C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、卤素、酰胺基、甲酰胺基、砜包括磺酰胺、酮基、羧基、C1-C6酯(氧基酯或羰基酯)、C1-C6酮基、氨基甲酸酯-O-C(O)-NR1R2或–N(R1)-C(O)-O-R1、硝基、氰基和胺(尤其包括C1-C6亚烷基-NR1R2、单-或二-C1-C6烷基取代的胺，其可以任选被一个或两个羟基取代)。在上下文内，除非另有说明，否则这些基团中的每一个都含有1至6个碳原子。在某些实施方案中，优选的取代基将包括例如-NH-、-NHC(O)-、-O-、＝O、-(CH2)m-(在此，m和n在上下文中是1、2、3、4、5或6)、-S-、-S(O)-、SO2-或–NH-C(O)-NH-、-(CH2)nOH、-(CH2)nSH、-(CH2)nCOOH、C1-C6烷基、-(CH2)nO-(C1-C6烷基)、-(CH2)nC(O)-(C1-C6烷基)、-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)、-(CH2)nC(O)O-(C1-C6烷基)、-(CH2)nNHC(O)-R1、-(CH2)nC(O)-NR1R2、-(OCH2)nOH、-(CH2O)nCOOH、C1-C6烷基、-(OCH2)nO-(C1-C6烷基)、-(CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、-(OCH2)nNHC(O)-R1、-(CH2O)nC(O)-NR1R2、-S(O)2-RS、-S(O)-RS(RS是C1-C6烷基或–(CH2)m-NR1R2基团)、NO2、CN或卤素(F、Cl、Br、I，优选F或Cl)，具体取决于取代基的使用背景。在上下文内，R1和R2各自是H或C1-C6烷基(其可以任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团，优选氟取代)。在所定义的化合物和所使用的取代基的化学上下文内，术语“取代的”还应该意指任选被取代的芳基或杂芳基或者如本文其他地方描述的任选被取代的杂环基。如本文其他地方所公开，亚烷基也可以被取代，优选具有任选被取代的C1-C6烷基(甲基、乙基或羟甲基或羟乙基是优选的，因此提供手性中心)、如本文其他地方描述的氨基酸基团的侧链、如上所述的酰胺基、或氨基甲酸酯基O-C(O)-NR1R2基团，其中R1和R2如本文其他地方所述，但许多其他基团也可用作取代基。各种任选被取代的部分可以被3个或更多个取代基取代，优选不超过3个取代基，优选1或2个取代基。应注意，在其中需要在分子取代的特定位置处的化合物(主要是由于效价)但未指出取代的情况下，该取代基被解释或理解是H，除非取代的上下文提示并非如此。
在上下文中，术语“芳基”或“芳香族”是指具有单环(例如苯、苯基、苯甲基)或稠环(例如萘基、蒽基、菲基等)的被取代(如本文另外所述)或未被取代的单价芳香族基团，并且能够在环上的任何可用稳定位置或如所呈现的化学结构中另外指示结合到根据本公开的化合物。在上下文中，芳基的其他实例可包括杂环芳香族环系，在环(单环)中具有一个或多个氮、氧或硫原子的“杂芳基”，例如咪唑、呋喃基、吡咯、呋喃基、噻吩、噻唑、吡啶、嘧啶、吡嗪、三唑、噁唑或稠环系统，例如吲哚、喹啉、吲哚嗪、氮杂吲哚嗪、苯并呋呫等，其可以任选地如上文所述被取代。可以提及的杂芳基包括含氮杂芳基，例如吡咯、吡啶、吡啶酮、哒嗪、嘧啶、吡嗪、吡唑、咪唑、三唑、三嗪、四唑、吲哚、异吲哚、吲哚嗪、氮杂吲哚嗪、嘌呤、吲唑、喹啉、二氢喹啉、四氢喹啉、异喹啉、二氢异喹啉、四氢异喹啉、喹嗪、酞嗪、萘啶、喹喏啉、喹唑啉、噌啉、喋啶、咪唑并吡啶、咪唑并三嗪、吡嗪并哒嗪、吖啶、啡啶、咔唑、咔唑啉、嘧啶、啡啉、菲烯、噁二唑、苯并咪唑、吡咯并吡啶、吡咯并嘧啶和吡啶并嘧啶；含硫芳香族杂环，例如噻吩和苯并噻吩；含氧芳香族杂环，例如呋喃、吡喃、环戊二烯并吡喃、苯并呋喃和异苯并呋喃；和包含2个或更多个选自氮、硫和氧的杂原子的芳香族杂环，例如噻唑、噻二唑、异噻唑、苯并噁唑、苯并噻唑、苯并噻二唑、吩噻嗪、异噁唑、呋呫、啡噁嗪、吡唑并噁唑、咪唑并噻唑、噻吩并呋喃、呋喃并吡咯、吡啶并噁嗪、呋喃并吡啶、呋喃并嘧啶、噻吩并嘧啶和噁唑等，所有这些可以任选地被取代。
术语“被取代的芳基”是指包含至少一个芳环或多个稠环的芳香族碳环基，所述多个稠环中的至少一个是芳香族，其中所述环被一个或多个取代基取代。例如，芳基可包含选自以下的取代基：-(CH2)nOH、-(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)(C0-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)O(C0-C6)烷基、-(CH2)n-OC(O)(C0-C6)烷基、胺；单-或二-(C1-C6烷基)胺，其中胺上的烷基任选地被1或2个羟基或至多三个卤基(优选F、Cl)基团取代；OH、COOH、C1-C6烷基，优选CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团(其中每一个可以在苯环的邻位、间位和/或对位被取代，优选对位)、任选被取代的苯基(所述苯基本身优选被附接至PTM基团(包括ULM基团)的接头基团取代)，和/或F、Cl、OH、COOH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团中的至少一个(位于苯环的邻位、间位和/或对位，优选对位)、可任选被取代的萘基、任选被取代的杂芳基，优选任选被取代的异噁唑(包括被甲基取代的异噁唑)、任选被取代的噁唑(包括被甲基取代的噁唑)、任选被取代的噻唑(包括被甲基取代的噻唑)、任选被取代的异噻唑(包括被甲基取代的异噻唑)、任选被取代的吡咯(包括被甲基取代的吡咯)、任选被取代的咪唑(包括甲基咪唑)、任选被取代的苯并咪唑或甲氧基苯并咪唑、任选被取代的氧杂咪唑或甲基氧杂咪唑、任选被取代的二唑基团(包括甲基二唑基团)、任选被取代的三唑基团(包括被甲基取代的三唑基团)、任选被取代的吡啶基团(包括被卤基(优选F)或甲基取代的吡啶基团或氧杂吡啶基团，其中吡啶基团通过氧连接到苯基)、任选被取代的呋喃、任选被取代的苯并呋喃、任选被取代的二氢苯并呋喃、任选被取代的吲哚、吲哚嗪或氮杂吲哚嗪(2-氮杂吲哚嗪、3-氮杂吲哚嗪或4-氮杂吲哚嗪)、任选被取代的喹啉，以及它们的组合。
“羧基”表示基团--C(O)OR，其中R是氢、烷基、被取代的烷基、芳基、被取代的芳基、杂芳基或被取代的杂芳基，然而这些通用取代基的含义与本文所定义的相应基团的定义相同。
术语“杂芳基(heteroaryl)”或“杂芳基(hetaryl)”可以指(但决不限于)任选地被取代的喹啉(其可以连接到药效团或在喹啉环内的任何碳原子上被取代)、任选地被取代的吲哚(包括二氢吲哚)、任选地被取代的吲哚嗪、任选地被取代的氮杂吲哚嗪(2-氮杂吲哚嗪、3-氮杂吲哚嗪或4-氮杂吲哚嗪)、任选地被取代的苯并咪唑、苯并二唑、苯并呋喃、任选地被取代的咪唑、任选地被取代的异噁唑、任选地被取代的噁唑(优选被甲基取代)、任选地被取代的二唑、任选地被取代的三唑、四唑、任选地被取代的苯并呋喃、任选地被取代的噻吩、任选地被取代的噻唑(优选被甲基和/或硫醇取代)、任选地被取代的异噻唑、任选地被取代的三唑(优选被以下取代的1,2,3-三唑：甲基、三异丙基硅烷基、任选地被取代的-(CH2)m-O-C1-C6烷基或任选地被取代的-(CH2)m-C(O)-O-C1-C6烷基)、任选地被取代的吡啶(2-吡啶、3-吡啶或4-吡啶)，或符合以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830000931
其中：
Sc是CHRSS、NRURE或O；
RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基–C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
RSS是H、CN、NO2、卤基(优选F或Cl)、任选地被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤基取代)、任选地被取代的O-(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤基取代)或任选地被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤基取代)；
RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基)，所述基团中的每一个任选地被一个或两个羟基或至多三个卤素(优选氟基团)取代，或任选地被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯啶、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其中的每一个任选地被取代，并且
YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤基(优选Cl或F)、任选地被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤基取代(例如CF3)、任选地被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤基取代)或任选地被取代的炔系基团-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)。
术语“芳烷基”和“杂芳基烷基”是指分别包含芳基或杂芳基的基团，以及符合上述定义的烷基和/或杂烷基和/或碳环和/或杂环烷基环系统。
如本文所用，术语“芳烷基”是指附接到上文所定义的烷基的如上文所定义的芳基。芳烷基通过烷基连接到母体部分，其中所述烷基具有一到六个碳原子。芳烷基中的芳基可以如上文所定义被取代。
术语“杂环”是指含有至少一个杂原子(例如N、O或S)的环基，且可以是芳香族(杂芳基)或非芳香族。因此，取决于其使用的上下文，杂芳基部分包含在杂环的定义下。示例性的杂芳基如上所述。
示范性杂环包括：氮杂环丁烷基、苯并咪唑基、1,4-苯并二噁烷基、1,3-苯并间二氧杂环戊烯基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并噻吩基、二氢咪唑基、二氢吡喃基、二氢呋喃基、二噁烷基、二氧杂环戊烷基、亚乙基脲、1,3-二氧杂环戊烷、1,3-二噁烷、1,4-二噁烷、呋喃基、高哌啶基、咪唑基、咪唑啉基、咪唑啶基、吲哚啉基、吲哚基、异喹啉基、异噻唑啶基、异噻唑基、异噁唑啶基、异噁唑基、吗啉基、萘啶基、噁唑啶基、噁唑基、吡啶酮、2-吡咯烷酮、吡啶、哌嗪基、N-甲基哌嗪基、哌啶基、邻苯二甲酰亚胺、丁二酰亚胺、吡嗪基、吡唑啉基、吡啶基、嘧啶基、吡咯啶基、吡咯啉基、吡咯基、喹啉基、四氢呋喃基、四氢吡喃基、四氢喹啉、噻唑啶基、噻唑基、噻吩基、四氢噻吩、噁烷、氧杂环丁烷基、氧硫杂环戊烷基、噻烷等等。
杂环基团可以任选地被选自由以下组成的组的成员取代：烷氧基、被取代的烷氧基、环烷基、被取代的环烷基、环烯基、被取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、被取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧基氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、酮基、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫代杂芳氧基、硫代杂环氧基、硫醇、硫代烷氧基、被取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环、杂环氧基、羟胺基、烷氧基胺基、硝基、-SO-烷基、被-SO-取代的烷基、-SO芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、被-SO2-取代的烷基、-SO2-芳基、氧代(═O)和-SO2-杂芳基。此类杂环基可以具有单个环或多个稠环。氮杂环和杂芳基的实例包括(但不限于)吡咯、咪唑、吡唑、吡啶、吡嗪、嘧啶、哒嗪、吲哚嗪、异吲哚、吲哚、吲唑、嘌呤、喹嗪、异喹啉、喹啉、酞嗪、萘基吡啶、喹喏啉、喹唑啉、噌啉、喋啶、咔唑、咔啉、啡啶、吖啶、啡啉、异噻唑、吩嗪、异噁唑、啡噁嗪、吩噻嗪、咪唑啶、咪唑啉、哌啶、哌嗪、吲哚啉、N-吗啉基、哌啶基、四氢呋喃基和其类似基团，以及N-烷氧基-含氮杂环。术语“杂环”还包括双环基团，其中杂环中的任一个与苯环或环己烷环或另一杂环(例如吲哚基、喹啉基、异喹啉基、四氢喹啉基等)稠合。
术语“环烷基”可以指(但决不限于)衍生自如本文中所定义的单环或多环烷基或环烷烃的单价基团，例如环中具有三个至二十个碳原子的饱和单环烃基，包括(但不限于)环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基等。术语“被取代的环烷基”可以指(但决不限于)单环或多环烷基，且被一个或多个取代基取代，例如氨基、卤素、烷基、被取代的烷基、碳氧基、碳基巯基、芳基、硝基、巯基或磺酸基，而这些通用取代基具有与如此图例中所定义的相应基团的定义相同的含义。
“杂环烷基”是指单环或多环烷基，其中其环状结构中的至少一个环碳原子被选自N、O、S或P组成的组的杂原子置换。“被取代的杂环烷基”是指单环或多环烷基，其中其环状结构中的至少一个环碳原子被选自N、O、S或P组成的组的杂原子置换且所述基团含有一个或多个选自以下组成的组的取代基：卤素、烷基、被取代的烷基、碳基氧基、羰基巯基、芳基、硝基、巯基或磺酸基，而这些通用取代基的含义与此图例所定义的相应基团的定义相同。
术语“烃基”应该意指含有碳和氢且可以是完全饱和的、部分不饱和的或芳族的化合物，并且包括芳基、烷基、烯基和炔基。
术语“独立地”在本文中用于指示独立应用的变量因应用不同而独立地改变。
术语“低级烷基”是指甲基、乙基或丙基。
术语“低级烷氧基”是指甲氧基、乙氧基或丙氧基。
在本文所述的任何实施方案中，W、X、Y、Z、G、G’、R、R’、R”、Q1-Q4、A和Rn可以独立地与接头和/或附接有一个或多个PTM、ULM、ILM或ILM’基团的接头共价偶联。
示例性MLM
在某些另外的实施方案中，双官能化合物的MLM包含化学部分，例如取代的咪唑啉、取代的螺-吲哚酮、取代的吡咯烷、取代的哌啶酮、取代的吗啉酮、取代的吡咯并嘧啶、取代的咪唑并吡啶、取代的噻唑并咪唑啉、取代的吡咯并吡咯烷酮和取代的异喹啉酮。
在另外的实施方案中，MLM包含上述核心结构，其中相邻的双芳基取代以顺式或反式构型定位。
在另外的实施方案中，MLM包含如RG7112、RG7388、SAR405838、AMG-232、AM-7209、DS-5272、MK-8242和NVP-CGM-097中的部分结构特征，及其类似物或衍生物。
在某些优选的实施方案中，MLM是表示为式(A-1)的被取代的咪唑啉的衍生物，或表示为式(A-2)的噻唑并咪唑啉，或表示为式(A-3)的螺吲哚酮，或表示为式(A-4)的吡咯烷，或表示为式(A-5)的哌啶酮/吗啉酮，或表示为式(A-6)表示的异喹啉酮，或表示为式(A-7)的吡咯并嘧啶/咪唑并吡啶，或表示为式(A-8)的吡咯并吡咯烷酮/咪唑并吡咯烷酮。
Figure BDA0002176933830000961
其中，上述式(A-1)至式(A-8)，
式(A-1)至式(A-8)的X选自碳、氧、硫、亚砜、砜和N-Ra；
Ra独立地是H或碳数目为1至6的烷基；
式(A-1)至式(A-8)的Y和Z独立地是碳或氮；
式(A-1)至式(A-8)的A、A’和A”独立地选自C、N、O或S，也可以是形成稠合双环或者6,5-和5,5-稠合芳族双环基团的一个或两个原子；
式(A-1)至式(A-8)的R1、R2独立地选自芳基或杂芳基、具有独立地选自硫或氮的一个或两个杂原子的杂芳基，其中芳基或杂芳基可以是单环或双环的，或者未取代的或被一至三个取代基取代，所述取代基独立地选自：
卤素、-CN、C1至C6烷基、C3至C6环烷基、-OH、具有1至6个碳的烷氧基、具有1至6个碳的氟取代的烷氧基、具有1至6个碳的亚砜、具有1至6个碳的砜、具有2至6个碳的酮、具有2至6个碳的酰胺和具有2至6个碳的二烷基胺；
式(A-1)至式(A-8)的R3、R4独立地选自H、甲基和C1至C6烷基；
式(A-1)至式(A-8)的R5选自芳基或杂芳基、具有独立地选自硫或氮的一个或两个杂原子的杂芳基，其中芳基或杂芳基可以是单环或双环的，或者未取代的或被一至三个取代基取代，所述取代基独立地选自：
卤素、-CN、C1至C6烷基、C3至C6环烷基、-OH、具有1至6个碳的烷氧基、具有1至6个碳的氟取代的烷氧基、具有1至6个碳的亚砜、具有1至6个碳的砜、具有2至6个碳的酮、具有2至6个碳的酰胺、具有2至6个碳的二烷基胺、烷基醚(C2至C6)、烷基酮(C3至C6)、吗啉基、烷基酯(C3至C6)、烷基氰(C3至C6)；
式(A-1)至式(A-8)的R6是H或–C(＝O)Rb，其中
式(A-1)至式(A-8)的Rb选自烷基、环烷基、单取代、二取代或三取代的芳基或杂芳基、4-吗啉基、1-(3-氧代哌嗪基)、1-哌啶基、4-N-Rc-吗啉基、4-Rc-1-哌啶基和3-Rc-1-哌啶基，其中
式(A-1)至式(A-8)的Rc选自烷基、氟取代的烷基、氰基烷基、羟基取代的烷基、环烷基、烷氧基烷基、酰胺烷基、烷基砜、烷基亚砜、烷基酰胺、芳基、杂芳基、单取代、双取代或三取代的芳基或杂芳基、CH2CH2Rd和CH2CH2CH2Rd，其中
式(A-1)至式(A-8)的Rd选自烷氧基、烷基砜、烷基亚砜、N-取代的甲酰胺、-NHC(O)-烷基、-NH-SO2-烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基；
式(A-1)至式(A-8)的R7选自H、C1至C6烷基、环烷基、氟取代的烷基、氰基取代的烷基、5元或6元杂芳基或芳基、取代的5元或6元杂芳基或芳基；
式(A-1)至式(A-8)的R8选自–Re-C(O)-Rf、-Re-烷氧基、-Re-芳基、-Re-杂芳基和-Re-C(O)-Rf-C(O)-Rg，其中：
式(A-1)至式(A-8)的Re是具有1至6个碳的亚烷基或键；
式(A-1)至式(A-8)的Rf是取代的4元至7元杂环；
式(A-1)至式(A-8)的Rg选自芳基、杂芳基、取代的芳基或杂芳基，以及4元至7元杂环；
式(A-1)至式(A-8)的R9选自式(A-3)中稠合双环芳环上的单取代基、双取代基或三取代基，其中取代基独立地选自卤素、未取代的或被Cl或F取代的烯烃、炔烃、烷基；
式(A-1)至式(A-8)的R10选自芳基或杂芳基，其中杂芳基可含有一个或两个杂原子，如硫或氮，芳基或杂芳基可以是单环或双环的，芳基或杂芳基可以是未取代的或被一至三个取代基取代，所述取代基包括卤素、F、Cl、-CN、烯烃、炔烃、C1至C6烷基、C1至C6环烷基、-OH、具有1至6个碳的烷氧基、具有1至6个碳的氟取代的烷氧基、具有1至6个碳的亚砜、具有1至6个碳的砜、具有2至6个碳的酮；
式(A-1)至式(A-8)的R11是-C(O)-N(Rh)(Ri)，其中Rh和Ri选自：
H、C1至C6烷基、烷氧基取代的烷基、砜取代的烷基、芳基、杂芳基、单取代、双取代或三取代的芳基或杂芳基、烷基羧酸、杂芳基羧酸、烷基羧酸、氟取代的烷基羧酸、芳基取代的环烷基、杂芳基取代的环烷基；其中
式(A-1)至式(A-8)的Rh和Ri独立地选自H(被连接形成环)、4-羟基环己烷；单羟基和二羟基取代的烷基(C3至C6)；3-羟基环丁烷；苯基-4-羧酸和取代的苯基-4-羧酸；
式(A-1)至式(A-8)的R12和R13独立地选自H、低级烷基(C1至C6)、低级烯基(C2至C6)、低级炔基(C2至C6)、环烷基(4、5和6元环)、取代的环烷基、环烯基、取代的环烯基、5元和6元芳基和杂芳基，R12和R13可连接以形成在环上有或没有取代的5元和6元环；
式(A-1)至式(A-8)的R14选自烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、杂环、取代的杂环、环烷基、取代的环烷基、环烯基和取代的环烯基；
式(A-1)至式(A-8)的R15是CN；
式(A-1)至式(A-8)的R16选自C1-6烷基、C1-6环烷基、C2-6烯基、其中一个或多个氢被氟取代的C1-6烷基或C3-6环烷基、其中一个CH2被S(＝O)、-S或-S(＝O)2取代的烷基或环烷基、其中末端CH3被S(＝O)2N(烷基)(烷基)、-C(＝O)N(烷基)(烷基)、-N(烷基)S(＝O)2(烷基)、-C(＝O)2(烷基)、-O(烷基)取代的烷基或环烷基、其中氢被羟基取代的C1-6烷基或烷基-环烷基、任选包含-(C＝0)-基团的3至7元环烷基或杂环烷基，或者5元至6元芳基或杂芳基，所述杂环烷基或杂芳基可含有独立地选自O、N或S的一至三个杂原子，并且环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基可以是未取代的或被独立地选自卤素、C1-6烷基、羟基化C1-6烷基、含有硫醚、醚、砜、亚砜、氟取代醚或氰基的C1-6烷基的一至三个取代基取代；
式(A-1)至式(A-8)的R17选自(CH2)nC(O)NRkRl，其中Rk和Rl独立地选自H、C1-6烷基、羟基化C1-6烷基、C1-6烷氧基烷基、其中一个或多个氢被氟取代的C1-6烷基、其中一个碳被S(O)、S(O)(O)取代的C1-6烷基、其中一个或多个氢被氟取代的C1-6烷氧基烷基、其中氢被氰基取代的C1-6烷基、5元和6元芳基或杂芳基、其中烷基含有1-6个碳的烷基芳基以及其中烷基含有1-6个碳的烷基杂芳基，其中芳基或杂芳基可以进一步被取代；
式(A-1)至式(A-8)的R18选自取代的芳基、杂芳基、烷基、环烷基，取代基优选地是-N(C1-4烷基)(环烷基)、-N(C1-4烷基)烷基-环烷基和-N(C1-4烷基)[(烷基)-(杂环取代的)-环烷基]；
式(A-1)至式(A-8)的R19选自芳基、杂芳基、双环杂芳基，并且这些芳基或杂芳基可被卤素、C1-6烷基、C1-6环烷基、CF3、F、CN、炔烃、烷基砜取代，卤素取代可以是单取代、双取代或三取代的；
式(A-1)至式(A-8)的R20和R21独立地选自C1-6烷基、C1-6环烷基、C1-6烷氧基、羟基化C1-6烷氧基和氟取代的C1-6烷氧基，其中R20和R21可进一步连接以形成可进一步被取代的5元、6元和7元环或杂环；
式(A-1)至式(A-8)的R22选自H、C1-6烷基、C1-6环烷基、羧酸、羧酸酯、酰胺、反式酰胺、磺酰胺、反式磺酰胺、N-酰基脲、含氮5元杂环，所述5元杂环可进一步被C1-6烷基、烷氧基、氟取代的烷基、CN和烷基砜取代；
式(A-1)至式(A-8)的R23选自芳基、杂芳基、-O-芳基、-O-杂芳基、-O-烷基、-O-烷基-环烷基、-NH-烷基、-NH-烷基-环烷基、-N(H)-芳基、-N(H)-杂芳基、-N(烷基)-芳基、-N(烷基)-杂芳基，所述芳基或杂芳基可被卤素、C1-6烷基、羟基化C1-6烷基、环烷基、氟取代的C1-6烷基、CN、烷氧基、烷基砜、酰胺和磺酰胺取代；
式(A-1)至式(A-8)的R24选自–CH2-(C1-6烷基)、-CH2-环烷基、-CH2-芳基、CH2-杂芳基，其中烷基、环烷基、芳基和杂芳基可被卤素、烷氧基、羟基化烷基、氰基取代的烷基、环烷基和取代的环烷基取代；
式(A-1)至式(A-8)的R25选自C1-6烷基、C1-6烷基-环烷基、烷氧基取代的烷基、羟基化烷基、芳基、杂芳基、取代的芳基或杂芳基、5元、6元和7元含氮饱和杂环、5,6-稠合和6,6-稠合的含氮饱和杂环，这些饱和杂环可被C1-6烷基、氟取代的C1-6烷基、烷氧基、芳基和杂芳基取代；
式(A-1)至式(A-8)的R26选自C1-6烷基、C3-6环烷基，所述烷基或环烷基可被-OH、烷氧基、氟取代的烷氧基、氟取代的烷基、-NH2、-NH-烷基、NH-C(O)烷基、-NH-S(O)2-烷基和-S(O)2烷基取代；
式(A-1)至式(A-8)的R27选自芳基、杂芳基、双环杂芳基，其中所述芳基或杂芳基可被C1-6烷基、烷氧基、NH2、NH-烷基、卤素或-CN取代，并且所述取代可以独立地是单取代、双取代和三取代；
式(A-1)至式(A-8)的R28选自芳基、5元和6元杂芳基、双环杂芳基、环烷基、饱和杂环，例如哌啶、哌啶酮、四氢吡喃、N-酰基-哌啶，其中环烷基、饱和杂环、芳基或杂芳基可进一步被-OH、烷氧基、单取代基、双取代基或三取代基取代，包括卤素、-CN、烷基砜和氟取代的烷基；并且
式(A-1)至式(A-8)的R1”选自烷基、芳基取代的烷基、烷氧基取代的烷基、环烷基、芳基取代的环烷基和烷氧基取代的环烷基。
在某些实施方案中，式(A-1)至式(A-8)的Rf和Rg中的杂环是取代的吡咯烷、取代的哌啶、取代的哌嗪。
更具体地讲，MLM的非限制性实例包括下文所示的那些以及起于下文分子中所示的1种或多种不同特征的组合的那些“杂合”分子。
使用式A-1至A-8中的MLM，可制备以下PROTAC以靶向特定蛋白质进行降解，其中‘L”是连接子(即接头基团)，并且“PTM”是与靶蛋白结合的配体。
在某些实施方案中，本说明书提供了一种双官能分子，其包含选自以下的结构：
Figure BDA0002176933830001011
其中X、Ra、Y、Z、A、A’、A”、R1、R2、R3、R4、R5、R6、Rb、Rc、Rd、R7、Re、Rf、Rg、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、Rk、Rl、R18、R19、R20、R21、R22、R23、R24、R25、R26、R27、R28和R1”如本文关于式(A-1)至(A-8)所定义。
在某些实施方案中，本说明书提供了具有以下结构的双官能或嵌合分子：PTM-L-MLM，其中PTM是通过L偶联至MLM的蛋白质靶标结合部分，其中L是键(即，不存在)或化学接头。在某些实施方案中，MLM具有选自A-1-1、A-1-2、A-1-3和A-1-4的结构：
其中：
式A-1-1至A-1-4(即，A-1-1、A-1-2、A-1-3和A-1-4)的R1’和R2’独立地选自F、Cl、Br、I、乙炔、CN、CF3和NO2；
R3’选自-OCH3、-OCH2CH3、-OCH2CH2F、-OCH2CH2OCH3和-OCH(CH3)2；
式A-1-1至A-1-4的R4’选自H、卤素、-CH3、-CF3、-OCH3、-C(CH3)3、-CH(CH3)2、-环丙基、-CN、-C(CH3)2OH、-C(CH3)2OCH2CH3、-C(CH3)2CH2OH、-C(CH3)2CH2OCH2CH3、-C(CH3)2CH2OCH2CH2OH、-C(CH3)2CH2OCH2CH3、-C(CH3)2CN、-C(CH3)2C(O)CH3、-C(CH3)2C(O)NHCH3、-C(CH3)2C(O)N(CH3)2、-SCH3、-SCH2CH3、-S(O)2CH3、-S(O2)CH2CH3、-NHC(CH3)3、-N(CH3)2、吡咯烷基和4-吗啉基；
式A-1-1至A-1-4的R5’选自卤素、-环丙基、-S(O)2CH3、-S(O)2CH2CH3、1-吡咯烷基、-NH2、-N(CH3)2和-NHC(CH3)3；并且
式A-1-1至A-1-4的R6'选自下面给出的结构，其中接头连接点表示为“*”。
除了作为接头附接点的R6’之外，R4’也可用作接头附接位置。在R4’是接头连接位点的情况下，接头将连接至上面所示的R4’基团的末端原子。
在某些实施方案中，式A-1-1至A-1-4的接头连接位置是R4’或R6’中的至少一者或两者。
在某些实施方案中，式A-1-1至A-1-4的R6’独立地选自H、
Figure BDA0002176933830001021
Figure BDA0002176933830001032
其中“*”表示接头的附接点。
在某些实施方案中，式A-4-1至A-4-6的接头附接至R1’、R2’、R3’、R4’、R5’、R6’中的至少一者或它们的组合。
在某些实施方案中，本说明书提供了具有以下结构的双官能或嵌合分子：PTM-L-MLM，其中PTM是通过L偶联至MLM的蛋白质靶标结合部分，其中L是键(即，不存在)或化学接头。在某些实施方案中，MLM具有选自A-4-1、A-4-2、A-4-3、A-4-4、A-4-5和A-4-6的结构：
Figure BDA0002176933830001041
其中：
式A-4-1至A-4-6(即，A-4-1、A-4-2、A-4-3、A-4-4、A-4-5和A-4-6)的R7’是选自卤素、单取代、二取代或三取代的卤素的成员；
式A-4-1至A-4-6的R8’选自H、-F、-Cl、-Br、-I、-CN、-NO2、乙炔基、环丙基、甲基、乙基、异丙基、乙烯基、甲氧基、乙氧基、异丙氧基、-OH、其他C1-6烷基、其他C1-6烯基和C1-6炔基、单取代、二取代或三取代的；
式A-4-1至A-4-6的R9’选自烷基、取代的烷基、烯基、取代的烯基、炔基、取代的炔基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、环烷基、取代的环烷基、烯基和取代的环烯基；
式A-4-1至A-4-6的Z选自H、-OCH3、-OCH2CH3和卤素；
式A-4-1至A-4-6的R10’和R11’各自独立地选自H、(CH2)n-R’、(CH2)n-NR’R”、(CH2)n-NR’COR”、(CH2)n-NR’SO2R”、(CH2)n-COOH、(CH2)n-COOR'、(CH)n-CONR'R”、(CH2)n-OR'、(CH2)n-SR'、(CH2)n-SOR'、(CH2)n-CH(OH)-R'、(CH2)n-COR'、(CH2)n-SO2R’、(CH2)n-SONR'R”、(CH2)n-SO2NR'R”、(CH2CH2O)m-(CH2)n-R'、(CH2CH2O)m-(CH2)n-OH、(CH2CH2O)m-(CH2)n-OR'、(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'R”、(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'COR”、(CH2CH2O)m(CH2)n-NR'SO2R”、(CH2CH2O)m(CH2)n-COOH、(CH2CH2O)m(CH2)n-COOR'、(CH2CH2O)m-(CH2)n-CONR'R”、(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2R'、(CH2CH2O)m-(CH2)n-COR'、(CH2CH2O)m-(CH2)n-SONR'R”、(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2NR'R”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)nR'、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-OH、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-OR'、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'R”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'COR”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'SO2R”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COOH、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COOR'、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-CONR'R”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2R'、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COR'、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SONR'R”、(CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2NR'R”、芳基-(CH2)n-COOH和杂芳基-烷基-CO-烷基-NR'R”m(其中烷基可以被OR'取代)，以及杂芳基-(CH2)n-杂环(其中杂环可以任选地被烷基、羟基、COOR'和COR'取代)；其中R'和R”选自H、烷基、被卤素取代的烷基、羟基、NH2、NH(烷基)、N(烷基)2、氧基、羧基、环烷基和杂芳基；
m、n和p独立地是0至6；
式A-4-1至A-4-6的R12’选自-O-(烷基)、-O-(烷基)-烷氧基、-C(O)-(烷基)、-C(OH)-烷基-烷氧基、-C(O)-NH-(烷基)、-C(O)-N-(烷基)2、-S(O)-(烷基)、S(O)2-(烷基)、-C(O)-(环胺)和-O-芳基-(烷基)、-O-芳基-(烷氧基)；
式A-4-1至A-4-6的R1”选自烷基、芳基取代的烷基、烷氧基取代的烷基、环烷基、芳基取代的环烷基和烷氧基取代的环烷基。
在本文所述的任何方面或实施方案中，烷基、烷氧基等可以是低级烷基或低级烷氧基。
在某些实施方案中，式A-4-1至A-4-6的接头连接位置是Z、R8’、R9’、R10’、R11’、R12”或R1”中的至少一者。
用于设计如A-1-1至A-1-4、A-4-1至A-4-6中所示的嵌合分子的方法可应用于具有式A-2、A-3、A-5、A-6、A-7和A-8的MLM，其中MLM中的溶剂暴露区域可连接到接头“L”，该接头将附接到靶蛋白配体“PTM”以构建PROTAC。
示例性MDM2结合部分包括但不限于以下：
Vassilev等人，In vivo activation of the p53 pathway by small-moleculeantagonists of MDM2,SCIENCE vol:303,pag:844-848(2004)和Schneekloth等人，Targeted intracellular protein degradation induced by a small molecule:Enroute to chemical proteomics,Bioorg.Med.Chem.Lett.18(2008)5904–5908中鉴定的HDM2/MDM2抑制剂包含(或附加)如下所述的化合物nutlin-3、nutlin-2和nutlin-1(衍生化)，以及其所有衍生物和类似物：
(衍生化，其中接头基团L或–(L-MLM)基团附接在例如甲氧基处或作为羟基)；
Figure BDA0002176933830001062
(衍生化，其中接头基团L或–(L-MLM)基团附接在例如甲氧基或羟基处)；以及
Figure BDA0002176933830001063
(衍生化，其中接头基团L或–(L-MLM)基团例如经由甲氧基或作为羟基附接)。
示例性CLM
新酰亚胺化合物
在一个方面，本说明书提供了可用于结合和/或抑制人小脑蛋白的化合物。在某些实施方案中，化合物选自以下化学结构：
Figure BDA0002176933830001071
其中：
式(a)至(e)的W独立地选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
式(a)至(e)的X独立地选自O、S和H2；
式(a)至(e)的Y独立地选自CH2、-C＝CR’、NH、N-烷基、N-芳基、N-杂芳基、N-环烷基、N-杂环基、O和S；
式(a)至(e)的Z独立地选自O和S或H2，不同的是X和Z均不可为H2；
式(a)至(e)的G和G’独立地选自H、烷基(直链、支链、任选被取代的)、OH、R’OCOOR、R’OCONRR”、任选地被R’取代的CH2-杂环基和任选地被R’取代的苄基；
式(a)至(e)的Q1–Q4表示被独立地选自R'、N或N-氧化物的基团取代的碳C；
式(a)至(e)的A独立地选自H、烷基(直链、支链、任选被取代的)、环烷基、Cl和F；
式(a)至(e)的R包括但不限于：-CONR’R”、-OR’、-NR’R”、-SR’、-SO2R’、-SO2NR’R”、-CR’R”-、-CR’NR’R”-、(-CR’O)nR”、-芳基、-杂芳基、-烷基(直链、支链、任选被取代的)、-环烷基、-杂环基、-P(O)(OR’)R”、-P(O)R’R”、-OP(O)(OR’)R”、-OP(O)R’R”、-Cl、-F、-Br、-I、-CF3、-CN、-NR’SO2NR’R”、-NR’CONR’R”、-CONR’COR”、-NR’C(＝N-CN)NR’R”、-C(＝N-CN)NR’R”、-NR’C(＝N-CN)R”、-NR’C(＝C-NO2)NR’R”、-SO2NR’COR”、-NO2、-CO2R’、-C(C＝N-OR’)R”、-CR’＝CR’R”、-CCR’、-S(C＝O)(C＝N-R’)R”、-SF5和-OCF3
式(a)至(e)的R’和R”独立地选自键、H、烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环、-C(＝O)R、杂环基，其中每一者是任选被取代的；
式(a)至(e)的n是1-10的整数(例如，1-4、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10)；
式(a)至(e)的
Figure BDA0002176933830001081
表示可以是立体特异性((R)或(S))或非立体特异性的键；并且
式(a)至(e)的Rn包含1-4个独立的官能团或原子。
示例性CLM
在本文所述的任何化合物中，CLM包含选自以下的化学结构：
Figure BDA0002176933830001082
Figure BDA0002176933830001091
其中：
式(a)至(e)的W独立地选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
式(a)至(e)的X独立地选自O、S和H2；
式(a)至(e)的Y独立地选自CH2、-C＝CR’、NH、N-烷基、N-芳基、N-杂芳基、N-环烷基、N-杂环基、O和S；
式(a)至(e)的Z独立地选自O和S或H2，不同的是X和Z均不可为H2；
式(a)至(e)的G和G’独立地选自H、烷基(直链、支链、任选被取代的)、OH、R’OCOOR、R’OCONRR”、任选地被R’取代的CH2-杂环基和任选地被R’取代的苄基；
式(a)至(e)的Q1–Q4表示被独立地选自R'、N或N-氧化物的基团取代的碳C；
式(a)至(e)的A独立地选自H、烷基(直链、支链、任选被取代的)、环烷基、Cl和F；
式(a)至(e)的R包括但不限于：-CONR’R”、-OR’、-NR’R”、-SR’、-SO2R’、-SO2NR’R”、-CR’R”-、-CR’NR’R”-、-芳基、-杂芳基、-烷基、-环烷基、-杂环基、-P(O)(OR’)R”、-P(O)R’R”、-OP(O)(OR’)R”、-OP(O)R’R”、-Cl、-F、-Br、-I、-CF3、-CN、-NR’SO2NR’R”、-NR’CONR’R”、-CONR’COR”、-NR’C(＝N-CN)NR’R”、-C(＝N-CN)NR’R”、-NR’C(＝N-CN)R”、-NR’C(＝C-NO2)NR’R”、-SO2NR’COR”、-NO2、-CO2R’、-C(C＝N-OR’)R”、-CR’＝CR’R”、-CCR’、-S(C＝O)(C＝N-R’)R”、-SF5和-OCF3
式(a)至(e)的R’和R”独立地选自键、H、烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环、-C(＝O)R、杂环基，其中每一者是任选被取代的；
式(a)至(e)的n是1-10的整数；
式(a)至(e)的
Figure BDA0002176933830001092
表示可以是立体特异性((R)或(S))或非立体特异性的键；
并且
式(a)至(e)的Rn包含1-4个独立的官能团或原子，例如O、N或S，并且任选地，其中之一被修饰以共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM(或CLM’)或它们的组合。
在本文所述的某些实施方案中，CLM或ULM包含选自以下的化学结构：
其中：
式(g)的W独立地选自CH2、C＝O、NH和N-烷基；
式(g)的R独立地选自H、甲基或任选被取代的烷基(例如，C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的))；
式(g)的
Figure BDA0002176933830001102
表示可以是立体特异性((R)或(S))或非立体特异性的键；并且
式(g)的Rn包含1-4个独立选择的官能团或原子，并且任选地，其中之一被修饰以共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM(或CLM’)或它们的组合。
在本文所述的任何实施方案中，式(a)至(g)的W、X、Y、Z、G、G’、R、R’、R”、Q1-Q4、A和Rn可以独立地与接头和/或附接有一个或多个PTM、ULM、CLM或CLM’基团的接头共价偶联。
在本文所述的任何方面或实施方案中，Rn包含1至4个官能团或原子，例如O、OH、N、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、胺、酰胺或羧基，并且任选地，其中之一被修饰以共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM(或CLM’)或它们的组合。
更具体地讲，CLM的非限制性实例包括下文所示的那些以及起于下文分子中所示的1种或多种不同特征的组合的那些“杂合”分子。
Figure BDA0002176933830001111
Figure BDA0002176933830001121
Figure BDA0002176933830001141
Figure BDA0002176933830001161
Figure BDA0002176933830001171
Figure BDA0002176933830001181
Figure BDA0002176933830001191
Figure BDA0002176933830001201
在本文所述的任何化合物中，CLM包含选自以下的化学结构：
Figure BDA0002176933830001211
Figure BDA0002176933830001221
其中：
式(h)至(ab)的W独立地选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
式(h)至(ab)的Q1、Q2、Q3、Q4、Q5独立地表示被独立地选自R'、N或N-氧化物的基团取代的碳C；
式(h)至(ab)的R1选自H、CN、C1-C3烷基；
式(h)至(ab)的R2选自H、CN、C1-C3烷基、CHF2、CF3、CHO；
式(h)至(ab)的R3选自H、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基；
式(h)至(ab)的R4选自H、烷基、取代的烷基；
式(h)至(ab)的R5是H或低级烷基；
式(h)至(ab)的X是C、CH或N；
式(h)至(ab)的R'选自H、卤素、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基；
式(h)至(ab)的R是H、OH、低级烷基、低级烷氧基、氰基、卤代低级烷氧基或卤代低级烷基
式(h)至(ab)的
Figure BDA0002176933830001231
是单键或双键；并且
CLM共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM(或CLM’)或它们的组合。
在本文所述的任何方面或实施方案中，CLM或CLM’经由式(h)至(ab)的R基团(例如，R、R1、R2、R3、R4或R’)、W、X或Q基团(例如，Q1、Q2、Q3、Q4或Q5)共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM、CLM’或它们的组合。
在本文所述的任何实施方案中，CLM或CLM’经由式(h)至(ab)的W、X、R、R1、R2、R3、R4、R5、R’、Q1、Q2、Q3、Q4和Q5共价接合至PTM、化学接头基团(L)、ULM、CLM、CLM’或它们的组合。
在本文所述的任何实施方案中，式(h)至(ab)的W、X、R1、R2、R3、R4、R’、Q1、Q2、Q3、Q4和Q5可以独立地共价偶联至接头和/或与一个或多个PTM、ULM、ULM'、CLM或CLM'基团附接的接头。
更具体地讲，CLM的非限制性实例包括下文所示的那些以及起于组合下述化合物的1种或多种不同特征的“杂合”分子或化合物：
Figure BDA0002176933830001241
Figure BDA0002176933830001251
其中：
式(ac)至(an)的W独立地选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
式(ac)至(an)的R1选自H、CN、C1-C3烷基；
式(ac)至(an)的R3选自H、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基；
式(ac)至(an)的R是H；
Figure BDA0002176933830001252
是单键或双键；并且
式(ac)至(an)的Rn包含官能团或原子。
在本文所述的任何实施方案中，式(ac)至(an)的W、R1、R2、Q1、Q2、Q3、Q4和Rn可以独立地共价偶联至接头和/或与一个或多个PTM、ULM、ULM'、CLM或CLM'基团附接的接头。
在本文所述的任何实施方案中，式(ac)至(an)的R1、R2、Q1、Q2、Q3、Q4和Rn可以独立地共价偶联至接头和/或与一个或多个PTM、ULM、ULM'、CLM或CLM'基团附接的接头。
在本文所述的任何实施方案中，式(ac)至(an)的Q1、Q2、Q3、Q4和Rn可以独立地共价偶联至接头和/或与一个或多个PTM、ULM、ULM'、CLM或CLM'基团附接的接头。
在本文所述的任何方面或实施方案中，式(ac)至(an)的Rn被修饰为共价接合至接头基团(L)、PTM、ULM、具有与CLM相同的化学结构的第二CLM、CLM'、第二接头或者其中任何多个或组合。
在本文描述的任何方面或实施方案中，CLM选自：
其中R'是卤素，并且R1如上文关于式(h)至(ab)或(ac)至(a)所述。
在某些情况下，CLM可以是与人小脑蛋白E3连接酶结合的酰亚胺。这些酰亚胺和接头附接点可以是但不限于下述结构：
Figure BDA0002176933830001291
其中R’是卤素。
示例性VLM
在如本文所述的化合物的某些实施方案中，ULM是VLM并且包含选自ULM-a的化学结构：
Figure BDA0002176933830001301
其中：
虚线指示至少一个PTM、另一个ULM或VLM或MLM或ILM或CLM(即ULM’或VLM’或CLM’或ILM’或MLM’)或者将至少一个PTM、ULM’或VLM’或CLM’或ILM’或MLM’与接头的另一端偶联的化学接头部分的附接；
式ULM-a的X1、X2各自独立地选自键、O、NRY3、CRY3RY4、C＝O、C＝S、SO和SO2；
式ULM-a的RY3、RY4各自独立地选自H、任选被1个或多个卤素取代的直链或支链C1-6烷基、任选被取代的C1-6烷氧基(例如，任选地被0-3个RP基团取代)；
式ULM-a的RP是0、1、2或3个基团，各自独立地选自H、卤素、-OH、C1-3烷基、C＝O；
式ULM-a的W3选自任选被取代的–T-N(R1aR1b)X3、任选被取代的–T-N(R1aR1b)、任选被取代的–T-芳基、任选被取代的–T-杂芳基、任选被取代的–T-杂环、任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环；
式ULM-a的X3是C＝O、R1、R1a、R1b；
每个R1、R1a、R1b独立地选自H、任选地被1个或多个卤素或-OH基团取代的直链或支链C1-C6烷基、RY3C＝O、RY3C＝S、RY3SO、RY3SO2、N(RY3RY4)C＝O、N(RY3RY4)C＝S、N(RY3RY4)SO和N(RY3RY4)SO2；
式ULM-a的T共价结合至X1；
式ULM-a的W4是任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环，其中-NR1与X2共价键合，并且R1是H或CH3，优选H。
在本文所述的任何实施方案中，T选自任选被取代的烷基、–(CH2)n-基团，其中亚甲基基团中的每一个任选被选自以下的一个或两个取代基取代：卤素、甲基、任选被1个或多个卤素或-OH基团取代的直链或支链C1-C6烷基、或者任选被取代的氨基酸侧链；并且
n是0至6，通常为0、1、2或3，优选为0或1。
在某些实施方案中，式ULM-a的W4是
Figure BDA0002176933830001311
其中
R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基或任选被取代的烷基。
在任何实施方案中，式ULM-a的W5选自苯基或5-10元杂芳基，
式ULM-a的R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、NR14aR14b、OR14a、CONR14aR14b、NR14aCOR14b、SO2NR14aR14b、NR14aSO2R14b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基；任选被取代的芳基；任选被取代的杂芳基；任选被取代的环烷基；或任选被取代的环杂烷基；
在另外的实施方案中，用于本公开中的W4取代基还具体地包括(并且不限于所公开的具体化合物)W4取代基，其在本文公开的鉴定的化合物中发现。这些W4取代基中的每一个可以与也在本文公开的任何数目的W3取代基结合使用。
在某些另外的实施方案中，ULM-a任选地被吡咯烷部分中的0-3个RP基团取代。每个RP独立地是H、卤素、-OH、C1-3烷基、C＝O。
在本文所述的任何实施方案中，式ULM-a的W3、W4可以独立地共价偶联至附接一个或多个PTM基团的接头。
并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM'或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中，ULM是VHL，并且由以下结构表示：
Figure BDA0002176933830001321
其中
式ULM-b的W3选自任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure BDA0002176933830001322
式ULM-b的R9和R10独立地是氢、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基，或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基；
式ULM-b的R11选自任选被取代的杂环、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、
Figure BDA0002176933830001323
Figure BDA0002176933830001324
式ULM-b的R12选自H或任选被取代的烷基；
式ULM-b的R13选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基；
式ULM-b的R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基或任选被取代的烷基；
式ULM-b的W5选自苯基或5-10元杂芳基，
式ULM-b的R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、NR14aR14b、OR14a、CONR14aR14b、NR14aCOR14b、SO2NR14aR14b、NR14aSO2R14b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基；芳基、杂芳基、环烷基或环杂烷基(各自任选被取代)；
式ULM-b的R16独立地选自H、卤素、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或任选被取代的卤代烷氧基；
式ULM-b的o是0、1、2、3或4；
式ULM-b的R18独立地选自卤素、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头；并且
式ULM-b的p是0、1、2、3或4，并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM'或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中，式ULM-b的R15是
Figure BDA0002176933830001331
其中R17是H、卤素、任选被取代的C3-6环烷基、任选被取代的C1-6烷基、任选被取代的C1-6烯基和C1-6卤代烷基；并且Xa是S或O。
在某些实施方案中，式ULM-b的R17选自甲基、乙基、异丙基和环丙基。
在某些另外的实施方案中，式ULM-b的R15选自：
Figure BDA0002176933830001332
在某些实施方案中，式ULM-b的R11选自：
Figure BDA0002176933830001342
在某些实施方案中，ULM具有选自以下的化学结构：
Figure BDA0002176933830001343
Figure BDA0002176933830001351
其中：
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R1是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基；任选被取代的烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基；
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基；
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基；任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、环烷基或环杂烷基(各自任选被取代)；
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的X是C、CH2或C＝O
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R3不存在或者是任选被取代的5元或6元杂芳基；并且
其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM'或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中，ULM包含根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001352
其中
式ULM-f的R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基；
式ULM-f的R9是H；
式ULM-f的R10是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基；
式ULM-f的R11是
Figure BDA0002176933830001361
Figure BDA0002176933830001362
或任选被取代的杂芳基；
式ULM-f的p是0、1、2、3或4；
式ULM-f的每个R18独立地是卤素、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头；
式ULM-f的R12是H、C＝O；
式ULM-f的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基，
式ULM-f的R15选自H、卤素、Cl、CN、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基；
Figure BDA0002176933830001363
Figure BDA0002176933830001364
并且
其中式ULM-f的虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM'或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中，ULM选自下述结构：
Figure BDA0002176933830001371
其中n是0或1。
在某些实施方案中，ULM选自下述结构：
Figure BDA0002176933830001381
Figure BDA0002176933830001401
其中ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9中的苯环任选被氟、低级烷基和烷氧基取代，并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM'或两者与ULM-a偶联的化学接头部分的附接位点。
在一个实施方案中，ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9中的苯环可以被官能化为酯，以使得其成为前药的部分。
在某些实施方案中，ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9的吡咯烷环上的羟基分别包含酯连接的前药部分。
在本文所述的任何方面或实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001411
其中：
ULM-g的R1’是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的-(CH2)nOH、任选被取代的-(CH2)nSH、任选被取代的(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、含有环氧化物部分WCOCW的任选被取代的(CH2)n-WCOCW-(C0-C6)烷基，其中每个W独立地是H或C1-C3烷基、任选被取代的-(CH2)nCOOH、任选被取代的-(CH2)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nNHC(O)-R1、任选被取代的-(CH2)nC(O)-NR1R2、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-NR1R2、-(CH2O)nH、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nC(O)-O-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2)nNHC(O)-R1、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-NR1R2、-(CH2CH2O)nH、任选被取代的-(CH2CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2CH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2CH2)nNHC(O)-R1、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-NR1R2、任选被取代的-SO2RS、任选被取代的S(O)RS、NO2、CN或卤素(F、Cl、Br、I，优选F或Cl)；
ULM-g的R1和R2各自独立地是H或可任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(优选氟)取代的C1-C6烷基；
ULM-g的RS是C1-C6烷基、任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基或-(CH2)mNR1R2基团；
ULM-g的X和X'各自独立地是C＝O、C＝S、-S(O)、S(O)2，(优选地X和X'均为C＝O)；
ULM-g的R2’是任选被取代的–(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w烷基基团、任选被取代的–(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)wNR1NR2N基团、任选被取代的–(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-芳基、任选被取代的–(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的–(CH2)n-(C＝O)vNR1(SO2)w-杂环、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N、、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N、任选被取代的-NR1-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-NR1-(CH2)n-(C＝O)vNR1(SO2)w-杂环、任选被取代的-XR2’-烷基基团；任选被取代的-XR2’-芳基基团；任选被取代的-XR2’-杂芳基基团；任选被取代的-XR2’-杂环基团；任选被取代的；
ULM-g的R3’是任选被取代的烷基、任选被取代的–(CH2)n-(O)u(NR1)v(SO2)w-烷基、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-C(O)NR1R2、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-芳基、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的–(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-杂环、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-杂环、任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-O-(CH2)n-(C＝O)u(NR1)v(SO2)w-杂环；–(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-烷基基团、任选被取代的–(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-芳基基团、任选被取代的–(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂芳基基团、任选被取代的–(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂环’基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C＝O)m’-(V)n’-烷基基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C＝O)m’-(V)n’-芳基基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C＝O)m’-(V)n’-杂芳基基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C＝O)m’-(V)n’-杂环基团、任选被取代的-XR3’-烷基基团；任选被取代的-XR3’-芳基基团；任选被取代的-XR3’-杂芳基基团；任选被取代的-XR3’-杂环基团；任选被取代的；
ULM-g的R1N和R2N各自独立地是H、任选被一个或两个羟基和至多三个卤素基团取代的C1-C6烷基、或任选被取代的–(CH2)n-芳基、–(CH2)n-杂芳基或–(CH2)n-杂环基；
ULM-g的V是O、S或NR1；
ULM-g的R1与上文相同；
ULM-g的R1和R1'各自独立地是H或C1-C3烷基；
ULM-g的XR2’和XR3’各自独立地是任选被取代的–CH2)n-、–CH2)n-CH(Xv)＝CH(Xv)-(顺式或反式)、–CH2)n-CH≡CH-、-(CH2CH2O)n-或C3-C6环烷基，其中Xv是H、卤素或任选被取代的C1-C3烷基；
ULM-g的每个m独立地是0、1、2、3、4、5、6；
ULM-g的每个m'独立地是0或1；
ULM-g的每个n独立地是0、1、2、3、4、5、6；
ULM-g的每个n'独立地是0或1；
ULM-g的每个u独立地是0或1；
ULM-g的每个v独立地是0或1；
ULM-g的每个w独立地是0或1；并且
当PTM不是ULM’时，ULM-g的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为通过接头基团共价结合至PTM基团，或当PTM是ULM’时，ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合，或者其药学上可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在本文所述的任何方面或实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
其中：
ULM-h的R1’、R2’和R3’中的每一者与上文相同，并且X是C＝O、C＝S、-S(O)基团或S(O)2基团，更优选C＝O基团，并且
当PTM不是ULM’时，ULM-h的R1’、R2’和R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为结合与PTM基团进一步共价结合的接头基团，或者当PTM是ULM’时，ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合，或者
其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。
在本文所述的任何方面或实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地根据化学结构：
Figure BDA0002176933830001442
其中：
当PTM不是ULM’时，ULM-I的R1’、R2’和R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为结合与PTM基团进一步共价结合的接头基团，或者当PTM是ULM’时，ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合，或者
其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。
在本公开的其他优选方面，ULM-g至ULM-i的R1’优选地是羟基或者可代谢为羟基或羧基的基团，使得该化合物表示活性化合物的前药形式。示例性的优选R1’基团包括例如-(CH2)nOH、(CH2)n-O-(C1-C6)烷基基团、-(CH2)nCOOH、-(CH2O)nH、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)、或任选被取代的-(CH2)nC(O)-O-(C1-C6烷基)，其中n是0或1。当R1'是或含有羧酸基团时，可以进一步化学修饰羟基或胺基、羟基、羧酸基或胺(其各自可以是任选被取代的)，以提供与PTM基团(包括ULM)和之键合的接头基团的共价连接；
当存在时，ULM-g和ULM-h的X和X’优选地是C＝O、C＝S、-S(O)基团或S(O)2基团，更优选地是C＝O基团；
ULM-g至ULM-i的R2’优选地是任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环，其中R1是H或CH3，优选H和T是任选被取代的–(CH2)n-基团，其中所述亚甲基中的每一个可以任选地被一个或两个取代基取代，所述取代基优选选自卤素、如本文其他地方所述的氨基酸侧链或C1-C3烷基，优选一个或两个甲基，其可以是任选被取代的；并且n是0至6，通常是0、1、2或3，优选0或1。可替代地，T也可以是–(CH2O)n-基团、–(OCH2)n-基团、–(CH2CH2O)n-基团、–(OCH2CH2)n-基团，所有这些基团都是任选被取代的。
ULM-g至ULM-i的R2’的优选芳基包括任选被取代的苯基或萘基，优选苯基，其中所述苯基或萘基通过接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)，并且/或者任选地被卤素(优选F或Cl)、胺、单烷基胺或二烷基胺(优选二甲基胺)、F、Cl、OH、COOH、C1-C6烷基，优选CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团(其中每一者可以在苯环的邻位、间位和/或对位，优选对位中被取代)、任选被取代的苯基(苯基本身任选地通过接头基团连接至PTM基团，包括ULM’基团)取代，并且/或者任选地被F、Cl、OH、COOH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团中的至少一者(在苯环的邻位、间位和/或对位中，优选对位)、可任选被取代的萘基、任选被取代的杂芳基，优选任选被取代的异噁唑(包括被甲基取代的异噁唑)、任选被取代的噁唑(包括被甲基取代的噁唑)、任选被取代的噻唑(包括被甲基取代的噻唑)、任选被取代的异噻唑(包括被甲基取代的异噻唑)、任选被取代的吡咯(包括被甲基取代的吡咯)、任选被取代的咪唑(包括甲基咪唑)、任选被取代的苯并咪唑或甲氧基苯并咪唑、任选被取代的氧杂咪唑或甲基氧杂咪唑、任选被取代的二唑基团(包括甲基二唑基团)、任选被取代的三唑基团(包括被甲基取代的三唑基团)、任选被取代的吡啶基团(包括被卤基(优选F)或甲基取代的吡啶基团或氧杂吡啶基团，其中吡啶基团通过氧连接到苯基)、任选被取代的呋喃、任选被取代的苯并呋喃、任选被取代的二氢苯并呋喃、任选被取代的吲哚、吲哚嗪或氮杂吲哚嗪(2-氮杂吲哚嗪、3-氮杂吲哚嗪或4-氮杂吲哚嗪)、任选被取代的喹啉、根据以下化学结构的任选被取代的基团取代：
Figure BDA0002176933830001461
其中：
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的苯基、任选被取代的杂芳基、或任选被取代的杂环，优选例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃)；
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基)，选自以下的杂芳基或杂环基：噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、oximidazole、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基；并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)，或任选被取代的杂环，优选四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪或吗啉(当被取代时，所述基团各自优选被甲基或卤素(F、Br、Cl)取代，所述基团各自可以任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
在某些优选的方面，ULM-g至ULM-i的
Figure BDA0002176933830001471
是基团，
其中ULM-g至ULM-i的RPRO和n与上文相同。
关于ULM-g至ULM-i的R2’的优选杂芳基包括任选被取代的喹啉(其可以附接至药效团或在喹啉环内的任何碳原子上被取代)，任选被取代的吲哚，任选被取代的吲嗪，任选被取代的氮杂吲嗪，任选被取代的苯并呋喃，包括任选被取代的苯并呋喃，任选被取代的异噁唑，任选被取代的噻唑，任选被取代的异噻唑，任选被取代的噻吩，任选被取代的吡啶(2-、3或4-吡啶)，任选被取代的咪唑，任选被取代的吡咯，任选被取代的二唑，任选被取代的三唑、四唑，任选被取代的oximidazole，或根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001481
其中：
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中ULM-g至ULM-i的Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的，和
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基–C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)，所述基团各自可任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
ULM-g至ULM-i的R2’的优选杂环基包括四氢呋喃、四氢噻吩、四氢喹啉、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、噁烷或噻烷，所述基团各自可以是任选被取代的，或者根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001491
优选地，
Figure BDA0002176933830001492
基团，
其中：
ULM-g至ULM-i的RPRO是H，任选被取代的C1-C6烷基或者任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基，和
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(通常是0或1)，所述基团中的每一个可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
ULM-g至ULM-i的优选R2'取代基还特别地(并且不限于所公开的具体化合物)R2'取代基，其在本文公开的鉴定的化合物(其包括在本说明书以及与其附着的附图中公开的具体化合物)中发现。这些R2'取代基中的每一个可以与也在本文中公开的任何数目的R3'取代基结合使用。
ULM-g至ULM-i的R3’优选为任选被取代的-T-芳基、任选被取代的-T-杂芳基、任选被取代的-T-杂环，任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环，其中R1是H或C1-C3烷基，优选H或CH3，T是任选被取代的-(CH2)n-基团，其中所述亚甲基中的每一个可以任选被一个或两个取代基取代，所述取代基优选选自卤素、C1-C3烷基或如本文其它地方描述的氨基酸的侧链，优选甲基，其可以是任选被取代的；并且n是0至6，经常为0、1、2或3，优选为0或1。可替代地，T也可以是–(CH2O)n-基团、–(OCH2)n-基团、–(CH2CH2O)n-基团、–(OCH2CH2)n-基团，所述基团各自是任选被取代的。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选芳基包括任选被取代的苯基或萘基，优选苯基，其中所述苯基或萘基任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)，并且/或者任选地被卤素(优选F或Cl)、胺、单烷基胺或二烷基胺(优选二甲基胺)、酰胺基(优选–(CH2)m-NR1C(O)R2基团，其中m、R1和R2与上文相同)、卤素(通常是F或Cl)、OH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2、CN或S(O)2RS基团(RS是C1-C6烷基、任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基或者-(CH2)mNR1R2基团，其中每一者可以在苯环的邻位、间位和/或对位，优选对位中被取代)、或芳基(优选苯基)、杂芳基或杂环取代。优选地，所述取代基苯基是任选被取代的苯基(即，取代基苯基本身优选被F、Cl、OH、SH、COOH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2、CN或PTM基团(包括ULM'基团)与之附接的接头基团中的至少一种取代，其中所述取代在苯环的邻位、间位和/或对位中发生，优选对位)，可以任选被取代的包括如上所述的萘基，任选被取代的杂芳基(优选任选被取代的异噁唑包括甲基取代的异噁唑，任选被取代的噁唑包括甲基取代的噁唑，任选被取代的噻唑包括甲基取代的噻唑，任选被取代的吡咯包括甲基取代的吡咯，任选被取代的咪唑包括甲基咪唑、苄基咪唑或甲氧基苄基咪唑、oximidazole或methyloximidazole，任选被取代的二唑基包括甲基二唑基，任选被取代的三唑基包括甲基取代的三唑基，吡啶基包括卤素-(优选F)或甲基取代的吡啶基或氧杂吡啶基(其中吡啶基团通过氧与苯基连接)或任选被取代的杂环(四氢呋喃、四氢噻吩、吡咯烷、哌啶、吗啉、哌嗪、四氢喹啉、噁烷或噻烷。芳基、杂芳基或杂环基中的每一个可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选杂芳基包括任选被取代的喹啉(其可以附接至药效团或在喹啉环内的任何碳原子上被取代)，任选被取代的吲哚(包括二氢吲哚)，任选被取代的吲哚嗪，任选被取代的氮杂吲哚嗪(2、3或4-氮杂吲哚嗪)，任选被取代的苯并咪唑、苯并二唑、苯并呋喃，任选被取代的咪唑，任选被取代的异噁唑，任选被取代的噁唑(优选被甲基取代)，任选被取代的二唑，任选被取代的三唑、四唑，任选被取代的苯并呋喃，任选被取代的噻吩，任选被取代的噻唑(优选被甲基和/或硫醇取代的)，任选被取代的异噻唑，任选被取代的三唑(优选地被甲基、三异丙基甲硅烷基、任选被取代的-(CH2)m-O-C1-C6烷基或任选被取代的-(CH2)m-C(O)-O-C1-C6烷基取代的1,2,3-三唑)，任选被取代的吡啶(2-吡啶、3-吡啶或4-吡啶)或根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001511
其中：
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的，和
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)。所述杂芳基基团中的每一个可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM'基团)。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选杂环基包括四氢喹啉、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、四氢呋喃、四氢噻吩、噁烷和噻烷，所述基团中的每一个可以是任选被取代的，或者根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001521
优选地
Figure BDA0002176933830001522
Figure BDA0002176933830001523
基团，
其中：
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基)，选自以下的杂芳基或杂环基：噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、oximidazole、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基，并且
ULM-g至ULM-i的每个n是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)，其中所述杂环基团各自可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
ULM-g至ULM-i的优选R3’取代基还具体地包括(并且不限于所公开的具体化合物)R3’取代基，其在本文公开的鉴定的化合物(其包括在本说明书以及与其所附的附图中公开的具体化合物)中发现。这些R3’取代基中的每一个可以与也在本文中公开的任何数目的R2’取代基结合使用。
在某些替代的优选实施方案中，ULM-g至ULM-i的R2’是任选被取代的-NR1-XR2’-烷基基团、-NR1-XR2’-芳基基团；任选被取代的-NR1-XR2’-HET、任选被取代的-NR1-XR2’-芳基-HET或任选被取代的-NR1-XR2’-HET-芳基，
其中：
ULM-g至ULM-i的R1是H或C1-C3烷基(优选H)；
ULM-g至ULM-i的XR2'是任选被取代的–CH2)n-、–CH2)n-CH(Xv)＝CH(Xv)(顺式或反式)、–(CH2)n-CH≡CH-、-(CH2CH2O)n-或C3-C6环烷基；和
ULM-g至ULM-i的Xv是H、卤素或者任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代的C1-C3烷基；
ULM-g至ULM-i的烷基是任选被取代的C1-C10烷基(优选C1-C6烷基)基团(在某些优选的实施方案中，烷基用卤素基团(通常是Cl或Br)封端)；
ULM-g至ULM-i的芳基是任选被取代的苯基或萘基(优选苯基)；并且
ULM-g至ULM-i的HET是任选被取代的噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、喹啉(当被取代时，各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)或根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001531
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的；
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基)，选自以下的杂芳基或杂环基：噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、oximidazole、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基，并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)。
所述基团中的每一个可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM'基团)。
在本公开的某些替代的优选实施方案中，ULM-g至ULM-i的R3’是任选被取代的–(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-RS3’基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C＝O)m’-(V)n’-RS3’基团、任选被取代的-XR3’-烷基基团、任选被取代的-XR3’-芳基基团；任选被取代的-XR3’-HET基团、任选被取代的-XR3’-芳基-HET基团或任选被取代的-XR3’-HET-芳基基团，
其中：
RS3’是任选被取代的烷基(C1-C10，优选C1-C6烷基)、任选被取代的芳基或HET基团；
R1'是H或C1-C3烷基(优选H)；
V是O、S或NR1’；
XR3’是–(CH2)n-、-(CH2CH2O)n-、–CH2)n-CH(Xv)＝CH(Xv)-(顺式或反式)、–CH2)n-CH≡CH-或C3-C6环烷基，全都是任选被取代的；
XV是H、卤素或C1-C3烷基，其任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代；
烷基是任选被取代的C1-C10烷基(优选C1-C6烷基)基团(在某些优选的实施方案中，烷基用卤素基团(通常是Cl或Br)封端)；
芳基是任选被取代的苯基或萘基(优选苯基)；并且
HET是任选被取代的噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、喹啉(当被取代时，各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)或根据以下化学结构的基团：
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的；
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基)，选自以下的杂芳基或杂环基：噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、oximidazole、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基；
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)；
ULM-g至ULM-i的每个m’是0或1；并且
ULM-g至ULM-i的每个n’是0或1；
其中所述化合物各自，优选在烷基、芳基或Het基团上，任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
在替代的实施方案中，ULM-g至ULM-i的R3’是–(CH2)n-芳基、–(CH2CH2O)n-芳基、–(CH2)n-HET或–(CH2CH2O)n-HET，
其中：
ULM-g至ULM-i的所述芳基是任选被一个或两个取代基取代的苯基，其中所述取代基优选选自-(CH2)nOH、其本身进一步任选被CN取代的C1-C6烷基、卤素(至多三个卤素基团)、OH、-(CH2)nO(C1-C6)烷基、胺、单-或二-(C1-C6烷基)胺，其中所述胺上的烷基任选被1或2个羟基或者至多三个卤素(优选F、Cl)基团取代，或
ULM-g至ULM-i的所述芳基基团被以下取代：-(CH2)nOH、-(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)(C0-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)O(C0-C6)烷基、-(CH2)n-OC(O)(C0-C6)烷基、胺、单-或二-(C1-C6烷基)胺(其中所述胺上的烷基任选被1或2个羟基或者至多三个卤素(优选F、Cl)基团取代)CN、NO2、任选被取代的-(CH2)n-(V)m’-CH2)n-(V)m’-(C1-C6)烷基、–(V)m’-(CH2CH2O)n-RPEG基团，其中V是O、S或NR1'，R1'是H或C1-C3烷基(优选是H)，并且RPEG是H或任选取代(包括任选被羧基取代)的C1-C6烷基，或
ULM-g至ULM-i的所述芳基基团任选被杂环取代，所述杂环包括杂芳基，选自噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪(当取代时，各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、或根据以下化学结构的基团：
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的；
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基)，选自以下的杂芳基或杂环基：噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、oximidazole、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基；
ULM-g至ULM-i的HET优选为噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基，优选甲基或卤素基团，优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、或根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001591
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O；
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤素(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)；
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基)，所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代，优选氟基团，或任选被取代的杂环，例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪，其各自是任选被取代的；
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC，其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤素(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或者至多三个卤素基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra，其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基)；
ULM-g至ULM-i的RPRO是H，任选被取代的C1-C6烷基或者任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基；
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基；
ULM-g至ULM-i的每个m’独立地是0或1；并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)，
其中所述化合物各自，优选在所述芳基或Het基团上，任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
在另外的实施方案中，优选的化合物包括根据以下化学结构的化合物：
Figure BDA0002176933830001601
其中：
ULM-i的R1’是OH或在患者或受试者中代谢为OH的基团；
ULM-i的R2'是-NH-CH2-芳基-HET(优选地，与甲基取代的噻唑直接连接的苯基)；
ULM-i的R3’是–CHRCR3’-NH-C(O)-R3P1基团或–CHRCR3’-R3P2基团；
ULM-i的RCR3'是C1-C4烷基，优选甲基、异丙基或叔丁基；
ULM-i的R3P1是C1-C3烷基(优选甲基)、任选被取代的氧杂环丁烷基团(优选甲基取代的，–(CH2)nOCH3基团，其中n是1或2(优选2)、
或
Figure BDA0002176933830001602
基团(乙基醚基团优选在苯基部分上被取代)、吗啉代基团(在2-或3-位处与羰基连接；
ULM-i的R3P2是
Figure BDA0002176933830001603
基团；
ULM-i的芳基是苯基；
ULM-i的HET是任选被取代的噻唑或异噻唑；和
ULM-i的RHET是H或卤素基团(优选H)；
或其药学上可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物，其中所述化合物中的每一种任选经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
在某些方面，双官能化合物包含泛素E3连接酶结合部分(ULM)，其中ULM是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001611
其中：
ULM-j的每个R5和R6独立地是OH、SH或任选被取代的烷基，或者R5、R6和它们所附接的碳原子形成羰基；
ULM-j的R7是H或任选被取代的烷基；
ULM-j的E是键、C＝O或C＝S；
ULM-j的G是键、任选被取代的烷基、-COOH或C＝J；
ULM-j的J是O或N-R8；
ULM-j的R8是H、CN、任选被取代的烷基或任选被取代的烷氧基；
ULM-j的M是任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基或
Figure BDA0002176933830001612
ULM-j的每个R9和R10独立地是H；任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的硫代烷基、二硫化物连接的ULM、任选被取代的杂芳基或卤代烷基；或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基；
ULM-j的R11是任选被取代的杂环、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基或
Figure BDA0002176933830001613
ULM-j的R12是H或任选被取代的烷基；
ULM-j的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基；任选被取代的(氧代烷基)氨基甲酸酯，
ULM-j的每个R14独立地是H、卤代烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的烷基或任选被取代的杂环烷基；
ULM-j的R15是H、任选被取代的杂芳基、卤代烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的烷氧基或任选被取代的杂环基；
ULM-j的每个R16独立地是卤素、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、CN或任选被取代的卤代烷氧基；
ULM-j的每个R25独立地是H或任选被取代的烷基；或两个R25基团可以一起形成氧代或任选被取代的环烷基；
ULM-j的R23是H或OH；
ULM-j的Z1、Z2、Z3和Z4独立地是C或N；和
ULM-j的o是0、1、2、3或4，或者其药学可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在某些实施方案中，其中ULM-j的G是C＝J，J是O，R7是H，每个R14是H，并且o是0。
在某些实施方案中，其中ULM-j的G是C＝J，J是O，R7是H，每个R14是H，R15是任选被取代的杂芳基，并且o是0。在其他情况下，E是C＝O且M是
在某些实施方案中，其中ULM-j的E是C＝O，R11是任选被取代的杂环或
Figure BDA0002176933830001622
并且M是
在某些实施方案中，其中ULM-j的E是C＝O，M是
Figure BDA0002176933830001624
并且R11是每个R18独立地是卤素、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基或卤代烷氧基；并且p是0、1、2、3或4。
在某些实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001631
其中：
ULM-k的G是C＝J，J是O；
ULM-k的R7是H；
ULM-k的每个R14是H；
ULM-k的o是0；
ULM-k的R15是
Figure BDA0002176933830001632
并且
ULM-k的R17是H、卤素、任选被取代的环烷基、任选被取代的烷基、任选被取代的烯基和卤代烷基。
在其他情况下，ULM-k的R17是烷基(例如甲基)或环烷基(例如环丙基)。
在其他实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001633
其中：
ULM-k的G是C＝J，J是O；
ULM-k的R7是H；
ULM-k的每个R14是H；
ULM-k的o是0；并且
ULM-k的R15选自：
Figure BDA0002176933830001641
其中ULM-k的R30是H或任选被取代的烷基。
在其他实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001643
其中：
ULM-k的E是C＝O；
ULM-k的M是
Figure BDA0002176933830001644
并且
ULM-k的R11选自：
Figure BDA0002176933830001651
在另外其他实施方案中，具有以下化学结构的化合物，
Figure BDA0002176933830001652
其中ULM-k的E是C＝O；
ULM-k的R11是
Figure BDA0002176933830001653
并且
ULM-k的M是
Figure BDA0002176933830001654
ULM-k的q是1或2；
ULM-k的R20是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基或
ULM-k的R21是H或任选被取代的烷基；并且
ULM-k的R22是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基或卤代烷基。
在本文所述的任何实施方案中，ULM-j或ULM-k的R11选自：
Figure BDA0002176933830001671
Figure BDA0002176933830001681
在某些实施方案中，ULM-j或ULM-k的R11选自：
Figure BDA0002176933830001682
Figure BDA0002176933830001691
在某些实施方案中，ULM(或存在的ULM')是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001701
其中：
ULM-l的X是O或S；
ULM-l的Y是H、甲基或乙基；
ULM-l的R17是H、甲基、乙基、羟甲基或环丙基；
ULM-l的M是任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure BDA0002176933830001702
ULM-l的R9是H；
ULM-l的R10是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的硫代烷基或环烷基；
ULM-l的R11是任选被取代的杂芳族、任选被取代的杂环、任选被取代的芳基或
Figure BDA0002176933830001703
ULM-l的R12是H或任选被取代的烷基；并且
ULM-l的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基；任选被取代的(氧代烷基)氨基甲酸酯。
在一些实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001711
其中：
ULM-m的Y是H、甲基或乙基
ULM-m的R9是H；
R10是异丙基、叔丁基、仲丁基、环戊基或环己基；
ULM-m的R11是任选被取代的酰胺、任选被取代的异吲哚啉酮、任选被取代的异噁唑、任选被取代的杂环。
在本公开的其他优选实施方案中，ULM和存在的ULM'各自独立地是根据以下化学结构的基团：
Figure BDA0002176933830001712
其中：
ULM-n的R17是甲基、乙基或环丙基；并且
ULM-n的R9、R10和R11如上文所定义。在其他情况下，R9是H；并且
ULM-n的R10是H、烷基或环烷基(优选异丙基、叔丁基、仲丁基、环戊基或环己基)。
在本文所述的任何方面或实施方案中，如本文所述的ULM(或存在的ULM’)可以是其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。另外，在本文所述的任何方面或实施方案中，如本文所述的ULM(或存在的ULM’)可经由键或化学接头直接偶联至PTM。
在本公开的某些方面，ULM部分选自：
Figure BDA0002176933830001731
Figure BDA0002176933830001741
Figure BDA0002176933830001751
Figure BDA0002176933830001761
Figure BDA0002176933830001771
Figure BDA0002176933830001781
Figure BDA0002176933830001791
Figure BDA0002176933830001801
Figure BDA0002176933830001811
Figure BDA0002176933830001821
Figure BDA0002176933830001831
Figure BDA0002176933830001841
Figure BDA0002176933830001851
Figure BDA0002176933830001861
Figure BDA0002176933830001871
Figure BDA0002176933830001881
Figure BDA0002176933830001891
Figure BDA0002176933830001901
Figure BDA0002176933830001911
Figure BDA0002176933830001921
Figure BDA0002176933830001931
Figure BDA0002176933830001941
其中VLM可以经由如本文所述的接头在任何适当的位置处连接至PTM，包括例如吲哚基团的芳基、杂芳基、苯基或苯基，任选地经由任何适当的官能团，例如胺、酯、醚、烷基或烷氧基。
示例性接头
在某些实施方案中，如本文所述的化合物包含经由化学接头(L)化学连接或偶联至一个或多个ULM(例如，CLM、VLM、MLM、ILM或它们的组合中的至少一者)的一个或多个PTM。在某些实施方案中，接头基团L是包含一个或多个共价连接的结构单元(例如，-AL 1...(AL)q-或–(AL)q-)的基团，其中A1是偶联至PTM的基团，并且(AL)q是偶联至ULM的基团。
在某些实施方案中，接头基团L选自–(AL)q-：
(AL)q是连接至ULM、PTM部分或它们的组合中的至少一者的基团；
接头的q是大于或等于1的整数，
每个AL q独立地选自：键、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1＝CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(＝NCN)NRL4、NRL3C(＝NCN)、NRL3C(＝CNO2)NRL4、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11环烷基、任选地被0-9个RL1和/或RL2基团取代的C5-13螺环烷基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11杂环基、任选地被0-8个RL1和/或RL2基团取代的C5-13螺杂环烷基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的芳基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的杂芳基，其中RL1或RL2各自独立地任选地连接至其他基团以形成环烷基和/或杂环基部分，任选地被0-4个RL5基团取代；并且
RL1、RL2、RL3、RL4和RL5各自独立地是H、卤素、C1-8烷基、OC1-8烷基、SC1-8烷基、NHC1-8烷基、N(C1-8烷基)2、C3-11环烷基、芳基、杂芳基、C3-11杂环基、OC1-8环烷基、SC1-8环烷基、NHC1-8环烷基、N(C1-8环烷基)2、N(C1-8环烷基)(C1-8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1-8烷基、P(O)(OC1-8烷基)(C1-8烷基)、P(O)(OC1-8烷基)2、CC-C1-8烷基、CCH、CH＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝C(C1-8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1-8烷基)3、Si(OH)(C1-8烷基)2、COC1-8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1-8烷基、SO2N(C1-8烷基)2、SONHC1-8烷基、SON(C1-8烷基)2、CONHC1-8烷基、CON(C1-8烷基)2、N(C1-8烷基)CONH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)CON(C1-8烷基)2、NHCONH(C1-8烷基)、NHCON(C1-8烷基)2、NHCONH2、N(C1-8烷基)SO2NH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH(C1-8烷基)、NH SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH2。
在某些实施方案中，接头的q是大于或等于0的整数。在某些实施方案中，q是大于或等于1的整数。
在某些实施方案(例如其中接头的q大于2)中，(AL)q是连接至ULM的基团，并且AL 1和(AL)q经由接头(L)的结构单元连接。
在某些实施方案(例如其中接头的q是2)中，(AL)q是连接至AL 1和ULM的基团。
在某些实施方案(例如其中接头的q是1)中，接头基团L的结构是–AL 1–，并且AL 1是连接至ULM部分和PTM部分的基团。
在某些实施方案中，接头(L)包含由选自以下的一般结构表示的基团：
-NR(CH2)n-(低级烷基)-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-(低级烷基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(环烷基)-(低级烷基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(杂环烷基)-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(杂环烷基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(杂芳基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(环烷基)-O-(杂芳基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(环烷基)-O-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-NH-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-O-芳基-CH2、-NR(CH2CH2O)n-环烷基-O-芳基-、-NR(CH2CH2O)n-环烷基-O-(杂芳基)l-、-NR(CH2CH2)n-(环烷基)-O-(杂环)-CH2、-NR(CH2CH2)n-(杂环)-(杂环)-CH2、-N(R1R2)-(杂环)-CH2；其中
接头的n可以是0至10；
接头的R可以是H、低级烷基；
接头的R1和R2可通过连接的N形成环。
在某些实施方案中，接头(L)包含由选自以下的一般结构表示的基团：
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-，
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-，
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-；
Figure BDA0002176933830001961
Figure BDA0002176933830001971
Figure BDA0002176933830001981
其中
接头的m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20；
当数目为零时，不存在N-O或O-O键
接头的R是H、甲基和乙基；
接头的X是H和F
Figure BDA0002176933830001983
其中接头的m可以是2、3、4、5
Figure BDA0002176933830001984
Figure BDA0002176933830002011
Figure BDA0002176933830002021
Figure BDA0002176933830002031
Figure BDA0002176933830002041
Figure BDA0002176933830002051
Figure BDA0002176933830002061
在本文所述的任何方面或实施方案中，接头(L)选自：
Figure BDA0002176933830002081
Figure BDA0002176933830002091
Figure BDA0002176933830002101
其中每个n和m独立地选自0、1、2、3、4、5或6。
在本文所述的任何方面或实施方案中，接头(L)选自：
Figure BDA0002176933830002102
Figure BDA0002176933830002111
Figure BDA0002176933830002121
Figure BDA0002176933830002131
Figure BDA0002176933830002141
Figure BDA0002176933830002151
Figure BDA0002176933830002171
Figure BDA0002176933830002181
Figure BDA0002176933830002191
Figure BDA0002176933830002211
Figure BDA0002176933830002221
Figure BDA0002176933830002261
Figure BDA0002176933830002271
Figure BDA0002176933830002291
Figure BDA0002176933830002301
Figure BDA0002176933830002321
Figure BDA0002176933830002341
Figure BDA0002176933830002351
Figure BDA0002176933830002352
其中每个m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在本文所述的任何方面或实施方案中，L选自：
Figure BDA0002176933830002353
Figure BDA0002176933830002361
Figure BDA0002176933830002381
Figure BDA0002176933830002401
Figure BDA0002176933830002411
Figure BDA0002176933830002421
Figure BDA0002176933830002431
Figure BDA0002176933830002441
Figure BDA0002176933830002451
Figure BDA0002176933830002461
在某些实施方案中，接头(L)包含选自但不限于下文所示结构的结构，其中虚线指示与PTM或ULM部分的附接点：
其中：
WL1和WL2各自独立地是具有0-4个杂原子的4-8元环，任选被RQ取代，每个RQ独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)、C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系；
YL1各自独立地是键、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子替换为O；或C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)；
n是0-10；并且虚线指示与PTM或ULM部分的附接点。
在某些实施方案中，接头(L)包含选自但不限于下文所示结构的结构，其中虚线指示与PTM或ULM部分的附接点：
其中：
WL1和WL2各自独立地是芳基、杂芳基、环基、杂环基、C1-6烷基、双环、双芳基、双杂芳基或双杂环基，各自任选被RQ取代，每个RQ独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、羟基、硝基、C≡CH、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)、C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)、OC1-3烷基(任选被1个或多个-F取代)、OH、NH2、NRY1RY2、CN，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系；
YL1各自独立地是键、NRYL1、O、S、NRYL2、CRYL1RYL2、C＝O、C＝S、SO、SO2、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子替换为O；C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)；
QL是具有0-4个杂原子的3-6元脂环族或芳族环，任选桥连，任选被0-6个RQ取代，每个RQ独立地是H、C1-6烷基(直链、支链、任选被1个或多个卤素取代、C1-6烷氧基)，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系)；
RYL1、RYL2各自独立地是H、OH、C1-6烷基(直链、支链、任选被1个或多个卤素取代、C1-6烷氧基)，或者R1、R2与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系)；
n是0-10；并且虚线指示与PTM或ULM部分的附接点。
在其他实施方案中，接头基团是任选被取代的(聚)乙二醇，其具有1到约100个乙二醇单元，约1到约50个乙二醇单元，1到约25个乙二醇单元，约1到10个乙二醇单元，1到约8个乙二醇单元和1到6个乙二醇单元，2到4个乙二醇单元；或任选被取代的烷基，其内散杂有任选被取代的O、N、S、P或Si原子。在某些实施方案中，接头被芳基、苯基、苯甲基、烷基、亚烷基或杂环基取代。在某些实施方案中，接头可以是不对称或对称的。
在本文所述化合物的任何实施方案中，接头基团可以是如本文所述的任何合适部分。在一个实施方案中，接头是取代或未取代的聚乙二醇基团，其大小范围是约1到约12个乙二醇单元、1到约10个乙二醇单元、约2到约6个乙二醇单元、约2到5个乙二醇单元、约2到4个乙二醇单元。
在另一个实施方案中，本公开涉及一种化合物，其包含结合到靶蛋白(例如EGFR)或由其衍生的多肽的如本文所述的PTM基团，所述PTM基团通过泛素连接酶发生泛素化并且在直接化学连接到或通过接头部分L连接到ULM基团，或者PTM替代地是ULM’基团，所述ULM’基团也是泛素连接酶结合部分，可以与如上文所述的ULM基团相同或不同并且直接连接到ULM基团或通过接头部分连接到ULM基团；并且L是如上文所述的接头部分，可以存在或不存在并且使ULM化学(共价)连接至PTM；或其药学上可接受的盐、对映异构体、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在某些实施方案中，接头基团L是包含一个或多个共价连接的结构单元的基团，所述结构单元独立地选自：
Figure BDA0002176933830002491
X选自O、N、S、S(O)和SO2；n是1-5、5的整数；RL1是氢或烷基，
Figure BDA0002176933830002492
是任选地被选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基或氰基的1-3个取代基取代的单环或双环芳基或杂芳基；
Figure BDA0002176933830002493
是任选地被选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基或氰基的1-3个取代基取代的单环或双环环烷基或杂环烷基；并且苯环片段可以任选地被选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基和氰基的1、2或3个取代基取代。在一个实施方案中，接头基团L包含多至10个共价连接的结构单元，如上所述。
不受任何特定理论的限制，发明人认为接头的组成和结构虽然原则上不受限，但可对本文所述的双官能化合物的功效和效力具有显著影响；这可能是由于ULM和PTM之间的相互作用的调制。然而，可根据本教导内容优化接头，而无需过多的实验。
尽管ULM基团和PTM基团可通过对于接头化学性质来说适当且稳定的任何基团共价连接至接头基团，但在本公开的优选方面，接头独立地共价结合至ULM基团和PTM基团，优选地通过酰胺、酯、硫酯、酮基、氨基甲酸酯(氨甲酸酯)、碳或醚共价结合，所述基团中的每一个可插入到ULM基团和PTM基团上的任何地方，以使得泛素连接酶上的ULM基团与待降解的靶蛋白上的PTM基团达成最大的结合。(需注意，在其中PTM基团是ULM基团的某些方面，用于降解的靶蛋白可以是泛素连接酶本身)。在某些优选方面，接头可连接到ULM和/或PTM基团上的任选被取代的烷基、亚烷基、烯基或炔基、芳基或杂环基。
示例性PTM
在本公开的优选方面，PTM基团是结合至感兴趣的靶蛋白的部分。PTM基团的靶标具有多种类型，并且选自在细胞中表达的蛋白质，使得序列的至少一部分存在于细胞中并且可结合至PTM基团。术语“蛋白质”包括足够长度的寡肽和多肽序列，使得它们可结合至根据本公开的PTM基团。如本文其他地方所述，真核系统或微生物系统中的任何蛋白质(包括病毒、细菌或真菌)是由根据本公开的化合物介导的泛素化的靶标。优选地，靶蛋白是真核蛋白质。
根据本公开的PTM基团包括例如与RTK靶蛋白(作为非限制性实例，包括EGFR、HER2、c-MET、IGFR)结合的任何部分。下文所述的组合物举例说明了小分子靶蛋白结合部分的一些成员。此类小分子靶蛋白结合部分还包括化合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物、前药和氘代形式。这些结合部分优选通过如本文所述的接头连接至泛素连接酶结合部分，以便在泛素连接酶附近呈递RTK(蛋白质靶标部分与之结合)以进行泛素化和降解。
本公开可用于治疗多种疾病状态和/或状况，包括其中RTK蛋白失调(例如，癌症和/或炎性病症)并且患者将从蛋白质降解中受益的任何疾病状态和/或状况。
在另一方面，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式，以及药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂，和任选地另外的生物活性剂。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物，例如人)中的蛋白质降解，并且可以用于治疗或改善通过降解的蛋白质调节的疾病状态或状况。在某些实施方案中，如本文所述的治疗组合物可用于实现所关注蛋白质的降解，以治疗或改善疾病，例如癌症。在某些另外的实施方案中，疾病是炎性病症。
在替代的方面，本公开涉及一种通过降解用以调节疾病状态或状况的蛋白质或多肽来治疗有需要的受试者的疾病状态或者改善疾病或病症的症状的方法，该方法包括向所述患者或受试者施用有效量例如治疗有效量的至少一种如上所述的化合物，任选地与药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂和任选地另外的生物活性剂组合，其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。根据本公开的方法可用于通过施用有效量的至少一种本文所述化合物来治疗多种疾病状态或状况，包括癌症和/或炎性病症。疾病状态或状况可以是由微生物剂或其他外源性剂(例如病毒、细菌、真菌、原生动物或其他微生物)引起的疾病，或者可以是由蛋白质的过表达引起的疾病状态，其导致疾病状态和/或状况。
在另一方面，本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的所关注蛋白质降解的影响的方法。
除非上下文另外说明，否则如本文所用，术语“靶蛋白”用于描述蛋白质或多肽(例如RTK，如EGFR、HER2、c-MET、IGFR)，其是用于结合根据本公开的化合物和通过下文的泛素连接酶降解的靶标。此类小分子靶蛋白结合部分还包括这些组合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物、前药和氘代形式，以及可靶向目的蛋白质的其他小分子。这些结合部分通过至少一个接头基团L连接到至少一个ULM基团(例如VLM、CLM、ILM和/或MLM)。在某些方面，可与蛋白质靶标部分结合并被与泛素连接酶结合部分结合的连接酶降解的靶蛋白包括任何蛋白质或肽，包括其片段、其类似物和/或其同源物。
表皮生长因子受体(EGFR)存在于细胞表面，并通过结合其特异性配体(包括表皮生长因子和转化生长因子α(TGFα))而被激活。在通过其生长因子配体激活后，EGFR经历从无活性单体形式到活性同源二聚体的转变，但有一些证据表明在配体结合之前也可能存在预先形成的无活性二聚体。除了在配体结合后形成同源二聚体之外，EGFR还可以与ErbB受体家族的另一成员(例如ErbB2/Her2/neu)配对，以产生活化的异二聚体。还有证据表明形成了活化的EGFR簇，但尚不清楚这种聚集对于激活本身是重要的还是在激活单个二聚体后发生。
EGFR二聚化刺激其固有的细胞内蛋白质-酪氨酸激酶活性。结果，发生EGFR的C末端结构域中的若干酪氨酸(Y)残基的自磷酸化。这些包括Y992、Y1045、Y1068、Y1148和Y1173，如相邻图所示。这种自磷酸化通过若干其他蛋白质引发下游激活和信号传导，这些蛋白质通过自身的结合磷酸化酪氨酸的SH2结构域与磷酸化酪氨酸相关。这些下游信号传导蛋白启动若干信号转导级联，主要是MAPK、Akt和JNK途径，引起DNA合成和细胞增殖。这些蛋白质调节表型，例如细胞迁移、粘附和增殖。受体的激活对于人皮肤中的先天免疫应答很重要。EGFR的激酶结构域还可以与其聚集的其他受体的酪氨酸残基进行交叉磷酸化，并且其本身可通过这种方式被激活。
导致EGFR过表达(称为上调)或过度活跃的突变与许多癌症相关，包括肺鳞状细胞癌、肛门癌、成胶质细胞瘤和头颈部上皮细胞瘤。这些涉及EGFR的体细胞突变导致其不断激活，从而产生不受控制的细胞分裂。在成胶质细胞瘤中，常常观察到EGFR的或多或少的特异性突变，称为EGFRvIII。EGFR或家族成员的突变、扩增或错误调节涉及所有上皮癌中的约30％。异常EGFR信号传导涉及炎性病症，例如牛皮癣、湿疹和动脉粥样硬化。
在某些实施方案中，本说明书提供了用于治疗EGFR相关疾病或病症的组合物和方法。在某些实施方案中，EGFR相关疾病或病症是肺鳞状细胞癌、结肠癌和肛门癌、成胶质细胞瘤、头颈部上皮细胞瘤、牛皮癣、湿疹和动脉粥样硬化中的至少一种或它们的组合。
对EGFR作为致癌基因的鉴定已导致针对EGFR的抗癌治疗剂(称为“EGFR抑制剂”)的开发，包括用于肺癌的吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、布格替尼和埃克替尼，以及用于结肠癌的西妥昔单抗。最近，AstraZeneca开发了第三代酪氨酸激酶抑制剂Osimertinib。
许多治疗方法针对EGFR。西妥昔单抗和帕尼单抗是单克隆抗体抑制剂的实例。然而，前者是IgG1型，后者是IgG2型。临床开发中的其他单克隆抗体是扎鲁木单抗、尼妥珠单抗和马妥珠单抗。单克隆抗体阻断细胞外配体结合结构域。随着结合位点被阻断，信号分子不再能够附着在此并激活酪氨酸激酶。
另一种方法是使用小分子抑制EGFR酪氨酸激酶，该激酶位于受体的细胞质侧。在没有激酶活性的情况下，EGFR不能激活自身，这是下游衔接蛋白结合的先决条件。通过停止细胞中依赖于该生长途径的信号传导级联，肿瘤增殖和迁移被减少或抑制。吉非替尼、埃罗替尼、布格替尼和拉帕替尼(混合的EGFR和ERBB2抑制剂)是小分子激酶抑制剂的实例。
CimaVax-EGF是一种靶向作为EGFR主要配体的EGF的活性疫苗，它使用不同的方法，产生针对EGF本身的抗体，从而抑制增殖刺激的EGFR依赖性癌症；它被用作治疗非小细胞肺癌(最常见的肺癌形式)的癌症疗法。
所述蛋白质靶标可用于鉴定与蛋白质结合的化合物部分的筛查中，并且通过将该部分掺入根据本公开的化合物内，可以改变蛋白质的活性水平以实现治疗最终结果。
下文描述的组合物举例说明了可掺入如本文所述的PROTAC化合物中的EGFR结合PTM的一些成员。此类小分子靶蛋白结合部分还包括这些组合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物、前药和氘代形式，以及可靶向目的蛋白质的其他小分子。
在某些示例性实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM(蛋白质靶向部分)选自EAI045、阿法替尼、布格替尼、卡博替尼、克唑替尼、达克替尼、埃罗替尼、佛瑞替尼、吉非替尼、埃克替尼、伊马替尼、拉帕替尼、乐伐替尼、莫特塞尼、来那替尼、奥希替尼、帕唑帕尼、舒尼替尼、替万替尼、凡德他尼、INCB28060、AMG-458、PF-04217903、PF-02341066、E7050、MK-2461、MBS-777607、JNJ-38877605、ARQ197、GSK/1363089/XL880、XL184、其类似物、衍生物、多晶型物或溶剂化物。
在某些示例性实施方案中，如本文所述的PROTAC化合物的PTM(蛋白质靶向部分)由通式I至XVII和所述实施方案表示。如本文所述，PTM经由接头部分偶联至ULM。可以设想，接头部分可以在PTM上所需的任何位置缀合。在某些优选的实施方案中，接头部分缀合至如下所示和所述的结构的至少一个R基团。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式I表示的部分：
Figure BDA0002176933830002531
其中Z选自N、CH或C-CN；
X是N-烷基、酰胺基、NH或O；
R21是1至3个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳氧基(例如，C5-C10芳氧基)和杂芳氧基(例如，C5-C10杂芳氧基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基、杂芳基烷基、芳烷氧基和杂芳烷氧基，其中所述芳基、杂芳基、芳氧基和杂芳氧基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
R22是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、呋喃基、被烷基或烷基氨基取代的呋喃基或杂环烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基或R99SO2(CH2)sNHCH2–(其中R99是烷基(例如，C1-C6烷基)，并且s是介于0和3之间的整数)的取代基取代，或者R22取代基中的一个或两个可进一步选自–OR23或–NHC(O)R24，其中R23选自羟烷基(例如，C1-C6羟烷基)、烷氧基烷基(例如，C1-C6烷氧基烷基)、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基(例如，C5-C10芳基)、任选地被烷基或卤素取代的甲苯、杂芳基(例如，C5-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳基烷基(例如，C5-C10芳基烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳基烷基(例如，C5-C10芳基烷基)、环烷基烷基或杂环烷基烷基，如本文所述，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R24选自烷基或以下基团：
Figure BDA0002176933830002541
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基(例如，C1-C6烷基)，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些实施方案中，式I的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式I的R基团中的一个或多个包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式I的R21、R22、R23、R24、R25或R26基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式I具有以下结构：
Figure BDA0002176933830002551
其中每个R21独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、炔基(例如，C1-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基甲氧基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1-2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代；并且
每个R22独立地选自H、N、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、甲氧基、乙氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自N、O和S的杂原子的C5-C10杂芳基)、呋喃、吡咯、咪唑、噁唑、异噁唑、噻唑、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自N、O和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基、氰基或R99SO2(CH2)sNHCH2–(其中R99是烷基(例如，C1-C6烷基)，并且s是介于0和3之间的整数)、–OR23或–NHC(O)R24的取代基取代，其中R23选自羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基或二烷基氨基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002552
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些实施方案中，式I的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式I的R基团中的一个或多个包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式I的R21、R22、R23、R24、R25或R26基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式I具有以下结构：
Figure BDA0002176933830002561
其中每个R21独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、炔基(例如，C1-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基甲氧基(例如，C5-C10芳基甲氧基)、杂芳基甲氧基(例如，C5-C10杂芳基甲氧基，其中杂芳基包含1个或多个选自N、O和S的杂原子)或
Figure BDA0002176933830002562
其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代；并且
每个R22独立地选自H、N、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基、烷氧基、甲氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、呋喃、吡咯、咪唑、噁唑、异噁唑、噻唑、环烷基、杂环烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、氰基或R99SO2(CH2)sNHCH2–(其中R99是烷基，并且s是介于0和3之间的整数)、–OR23或–NHC(O)R24的取代基取代，其中R23选自羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基或二烷基氨基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002563
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些另外的实施方案中，式I的R21、R22、R23、R24、R25或R26基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由上面式I表示的部分：
其中Z是N或C–CN，最优选N；
R21是1至2个独立地选自H、卤素、烷基、卤代烷基、炔基、烷氧基、芳基甲氧基和杂芳基甲氧基的取代基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代。
R22是1或2个各自独立地选自H、卤素、烷基、卤代烷基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、氰基或R99SO2(CH2)sNHCH2–(其中R99是烷基，并且s是介于0和3之间的整数)的取代基取代，或者R22是1至2个选自–OR23或–NHC(O)R24的取代基，其中R23选自羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基或二烷基氨基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002571
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些实施方案中，式I的PTM包含以下结构：
其中每个R21独立地选自H、卤素、Cl或F；并且
每个R22独立地选自H、O、N、C1-C6烷氧基或甲氧基、胺、酰胺基或
Figure BDA0002176933830002573
O-连接的5或7元环如噁唑、异噁唑、咪唑、吡咯、吡咯烷基、吡唑、呋喃或噻唑，并且其中至少一个R22基团偶联至接头基团，其中该接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式I的R21、R22、R23、R24、R25或R26基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式I的PTM具有以下结构：
Figure BDA0002176933830002581
其中接头(L)是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式I的PTM包含选自以下的结构：
Figure BDA0002176933830002583
其中接头(L)是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式II表示的部分：
其中R21是1至3个独立地选自以下的取代基：H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳氧基和杂芳氧基、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷氧基和杂芳烷氧基，其中所述芳基、杂芳基、芳氧基和杂芳氧基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
R27选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、羟烷基和烷氧基烷基；
A是芳基(例如，C5-C10芳基)、苯基或杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)；并且
R28是1至2个独立地选自以下的取代基：H、O、N、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代。
在某些实施方案中，式II的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式II的R基团中的一个或多个包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式II的R21、R27或R28基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由上面式II表示的部分：
其中R21是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、炔基(例如，C1-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基甲氧基(例如，5-7元环芳基甲氧基)、氰基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素和卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R27选自H、甲基、乙基、羟甲基和甲氧基甲基；
A是苯基或吡啶基，最优选苯基；并且
R28是1至2个独立地选自以下的取代基：H、O、N、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)和氰基。
在式II的某些实施方案中，PTM具有以下结构：
其中R21是H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基、炔基、烷氧基、芳基甲氧基、氰基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代；
R27选自H、甲基、乙基、羟甲基和甲氧基甲基；
R28选自H、O、N、卤素、C1-C6烷基、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，如上文所定义。
在某些实施方案中，R28偶联至接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式II的R21、R27或R28基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式III表示的部分：
Figure BDA0002176933830002611
其中R21如上文所述；
R29是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、芳基、烷基、卤代烷基、烷氧基和氰基；并且
R30选自H、羟烷基(例如，C1-C6羟烷基)、烷氧基烷基(例如，C1-C6烷氧基烷基)、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基(例如，C5-C10芳基烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基或杂环烷基烷基，其中所述烷基可任选地被–NHC(O)–或–C(O)NH–基团中断，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子。
在某些实施方案中，式III的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式III的R基团中的一个或多个包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式III的R21、R29或R30基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式III表示的部分：
其中R21是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、炔基(例如，C1-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基甲氧基和杂芳基甲氧基，如本文所述，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素和卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R29是1个选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)；并且
R30选自H、羟烷基(例如，C1-C6羟烷基)、烷氧基烷基(例如，C1-C6烷氧基烷基)、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基，其中所述烷基可任选地被–NHC(O)–或–C(O)NH–基团中断，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子。
在式III的某些实施方案中，PTM具有以下结构：
Figure BDA0002176933830002621
其中每个R21独立地是H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基甲氧基、氰基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
Z是C或N；并且
R28如上文所定义。
在某些另外的实施方案中，式III的R21或R28基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式IV表示的部分：
其中R31选自H、卤素、Cl、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、CF3、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、吲哚、吡唑、咪唑、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)或氰基的取代基取代；
R32选自H、5元或6元芳基或杂芳基、双环稠合芳基或杂芳基以及另外任选地与环烷基(例如，C3-C10环烷基)或杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)稠合的双环稠合芳基或杂芳基，其中所述芳基或杂芳基任选地被1-2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R34选自H、O、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、卤素、氨基、酰胺基、炔烃(例如，C2-C6炔烃)、烷氧基、氰基或–NHC(O)R24，其中R24是R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002631
并且
R25和R26独立地选自H、N、N(CH2)1-3或烷基(C1-C6烷基)，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R35选自–OR36和–NR37R38，其中R36选自羟烷基(例如，C1-C6羟烷基)、烷氧基烷基(例如，C1-C6烷氧基烷基)、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳基烷基(例如，C5-C10芳基烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基或杂环烷基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)、–NR37R38，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，其中R35、R37或R38进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、杂环烷基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基。
在某些实施方案中，式IV的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式IV的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式IV的R24、R25、R26、R31、R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38或R39基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，R32选自：
Figure BDA0002176933830002641
在某个实施方案中，R32基团包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。例如，在某些实施方案中，R32是：
Figure BDA0002176933830002642
在某些实施方案中，R33选自C1-C6烷氧基。
在某些实施方案中，R35选自：
Figure BDA0002176933830002643
Figure BDA0002176933830002651
在某些实施方案中，R35基团偶联至接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由上面式IV表示的部分：
其中R31选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、5元或6元杂芳基，其中所述杂芳基可进一步被1个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R32选自H、5元或6元芳基或杂芳基、双环稠合芳基或杂芳基(例如，每个环具有4至6个成员)或者另外与环烷基或杂环烷基稠合的双环稠合芳基或杂芳基，其中所述芳基或杂芳基任选地被1-2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R33选自甲氧基或乙氧基；
R34选自H或–NHC(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002652
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基(例如，C1-C6烷基)，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基。
在另一个实施方案中，式IV的R32是吲哚或者通过吲哚环的1位和7位进一步与环己烷或哌啶环稠合的吲哚，条件是N原子不附接至同一C原子。
在某些实施方案中，式IV的PTM具有以下结构：
其中R37和R38如所述。
在某些另外的实施方案中，式IV的R37或R38基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式IV的PTM具有以下结构：
Figure BDA0002176933830002661
在某些实施方案中，式IV的PTM具有选自以下的结构：
Figure BDA0002176933830002662
其中接头(L)是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式V表示的部分：
Figure BDA0002176933830002664
其中R31、R33和R35如上文所述；
B选自芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，条件是在后一种情况下，所述杂环烷基的杂原子与X分开至少两个碳原子；
X是O、S或NH；并且
如果附接至B的环氮，则R40是–NHC(O)R24或–C(O)R24，其中R24如上文所述。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由上面式V表示的部分：
其中R31选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)或者5元或6元杂芳基，其中所述杂芳基可进一步被1个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基取代；
R33选自甲氧基或乙氧基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基；
B是苯基或吡啶基，最优选苯基；
X是O或NH，最优选NH；
R40是H或–NHC(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002671
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基(例如，C1-C6烷基)，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些实施方案中，式V的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式V的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式V的R24、R25、R26、R31、R33、R35、R37、R38、R39或R40基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VI表示的部分：
Figure BDA0002176933830002672
R41选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)和氰基；
R42是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、咪唑、吡唑、吡咯、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基、杂环烷基烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
C是芳基或杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)；
D是芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基或杂环烷基(例如，包含至少一个选自S、O或N的杂原子的3-8元芳基或杂芳基)；
Y是键、O、S或NH；
n选自0、1或2；
R43是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，或者如果附接至D的环氮，则R43取代基中的一个可以是–NHC(O)R24或–C(O)R24；并且
R24如上文所述。
在某些实施方案中，式VI的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式VI的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式VI的R24、R25、R26、R41、R42或R43基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VI表示的部分：
其中R41选自H、卤素或烷基(例如，C1-C6烷基)；
R42是1个独立地选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基；
C是5元或6元杂芳基，最优选5元杂芳基；
D是杂环烷基，最优选吡咯烷；
Y是键、O或NH，最优选O；
n是1或2；
R43是1至2个取代基，其中如果附接至D的环氮，则一个取代基是–NHC(O)R24或–C(O)R24，另一个取代基任选地选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)或烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)；
R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002691
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基。
在某些实施方案中，至少一个R基团包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VII表示的部分：
Figure BDA0002176933830002692
其中R42是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基和杂环烷基烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
C是芳基或杂芳基，例如咪唑、吡唑、吡咯；
D是芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基，例如吡咯烷基；
Y是键、O、S或NH；
n选自0、1或2；
R43是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、酰胺基、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，或者如果附接至D的环氮，则R43取代基中的一个可以是–NHC(O)R24或–C(O)R24；
R24如上文所述；并且
R88是氢或烷基，例如C1-C6烷基。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VII表示的部分：
其中R42是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)和烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)；
C是5元或6元杂芳基，最优选5元杂芳基；
D是杂环烷基，最优选吡咯烷；
Y是键；
n是0；
R43是1至2个取代基，其中如果附接至D的环氮，则一个取代基是–NHC(O)R24或–C(O)R24，另一个取代基任选地选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)；
R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002711
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R88是甲基或乙基。
在某些实施方案中，式VII的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式VII的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式VII的R24、R25、R26、R42、R43或R88基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VIII表示的部分：
其中R33、R35、R40和B如上文所述；并且
R46选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、羟烷基(例如，C1-C6羟烷基)、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基或杂环烷基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)和氰基的取代基取代。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式VIII表示的部分：
其中R33选自甲氧基或乙氧基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基；
B是苯基或吡啶基，最优选苯基；
R40是H或–NHC(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002721
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R46选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)和卤素的取代基取代。
在某些实施方案中，式VIII的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式VIII的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，
式VIII的R24、R25、R26、R33、R35、R37、R38、R39、R40或R46基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式IX表示的部分：
Figure BDA0002176933830002731
其中R33、R35、R40和B如上文所述；并且
R47选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)。
在某些实施方案中，至少一个R基团包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式IX表示的部分：
其中R33选自甲氧基或乙氧基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基；
B是苯基或吡啶基，最优选苯基；
R40是H或–NHC(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002732
并且R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N
原子合在一起可形成杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基)，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子；并且
R47选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)。
在某些实施方案中，式IX的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式IX的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式IX的R24、R25、R26、R33、R35、R37、R38、R39、R40或R47基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式X表示的部分：
Figure BDA0002176933830002741
其中R33、R35、R40和B如上文所述；
R48选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)；并且
R49选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中所述杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、芳烷基(例如，C5-C10芳烷基)、杂芳基烷基(例如，C5-C10杂芳基烷基，其中杂芳基包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)、环烷基烷基或杂环烷基烷基。
在一个更优选的实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式X表示的部分：
其中R33选自甲氧基或乙氧基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基(例如，C1-C6烷基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基，例如C1-C6烷基；
B是苯基或吡啶基，最优选苯基；
R40是H或–NHC(O)R24，其中R24选自以下基团：
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；
R48选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)；并且
R49选自H或烷基(例如，C1-C6烷基)。
在某些实施方案中，式X的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式X的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式X的R24、R25、R26、R33、R35、R37、R38、R39、R40、R48或R49基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XI表示的部分：
Figure BDA0002176933830002751
其中R50是烷基(例如，C1-C6烷基)、烷基氨基、二烷基氨基、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述环烷基或杂环烷基进一步任选地被卤素、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基或氰基取代，条件是任何两个杂原子被至少两个碳原子隔开；并且
R51是氢，R52是–NHC(O)R53，其中R53是任选地被1-2个独立地选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)和氰基的取代基取代的芳基或杂芳基，或者R51和R52合在一起构成5-6元芳基或杂芳基环，其进一步任选地被1-2个独立地选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、芳基(例如，C5-C10芳基)或杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)的取代基取代。
在某些实施方案中，式XI的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XI的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XI的R50、R51或R52基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XII表示的部分：
Figure BDA0002176933830002761
其中G是环烷基(例如，C3-C10环烷基)或杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)；
H是芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)；
R43如上文所述；并且
R53和R54各自独立地是1–2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、Cl、F、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基(例如，C1-C6烷基氨基)、二烷基氨基、氰基、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、杂环烷基(例如，C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子)，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代。
在某些实施方案中，式XII的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XII的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XII表示的部分：
其中G是杂环烷基，例如C3-C10杂环烷基，其中杂环包含1个或多个选自O、N和S的杂原子，最优选6元或7元杂环烷基，最优选六氢氮杂卓；
H是苯基或吡啶基；
R43是1至2个取代基，其中如果附接至D的环氮，则一个取代基是–NHC(O)R24或–C(O)R24，另一个取代基任选地选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)，其中R24选自以下基团：
Figure BDA0002176933830002771
R25和R26独立地选自氢或烷基(例如，C1-C6烷基)，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R53和R54各自独立地是1–2个独立地选自H、卤素、烷基(例如，C1-C6烷基)和卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)的取代基。
在某些另外的实施方案中，式XII的R24、R25、R26、R43、R53或R54基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XIII表示的部分：
Figure BDA0002176933830002772
其中A是含有1-7个杂原子(例如，O、S或N)的饱和或不饱和的4-8个原子的碳环或杂环；
Rk1选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk2选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk3和Rk4独立地选自H、羟基、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、-SO2Rk2或卤素，其中所述羟基、烷基、芳基或烷氧基可进一步被1至2个选自以下的取代基取代：
烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
X是与环中的相邻原子具有双键的N或CH或C。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XIII的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk1、Rk2、Rk3或Rk4基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在式XIII的某些实施方案中，A被烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)取代。
在式XIII的某些实施方案中，A是吡唑、咪唑、吡咯、噁唑或噻唑。
在式XIII的某些实施方案中，A是吡唑，并且Rk3或Rk4中的至少一个是：
Figure BDA0002176933830002781
在某些实施方案中，式XIII的R基团包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002791
其中X、Rk1、Rk2、Rk3、Rk4和Rk1如上文所述；并且
n＝0、1或2；
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk1、Rk2、Rk3或Rk4基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002792
其中X、Rk1、Rk2、Rk3和Rk4如上文所述。
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk1、Rk2、Rk3或Rk4基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
其中Rk18选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk19是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基
Rk20是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基Rk21是H、CN、卤素或烷基(直链或支链)或具有1-3个C原子的卤素取代的烷基；并且
X＝CH或N。
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk18、Rk19、Rk20或Rk21基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002801
其中Rk19是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；
Rk20是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；
Rk21是H、卤素或烷基(直链或支链)或具有1-3个C原子的卤素取代的烷基；并且
接头(L)是将PTM偶联至ULM的键或化学接头。
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk19、Rk20或Rk21基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002811
其中Rk20和Rk21如上文所述；
Rk22是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；并且接头(L)是将PTM偶联到ULM的键或化学接头。
在某些另外的实施方案中，式XIII的Rk20、Rk21或Rk22基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002812
其中Rk22是H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；
Rk23是H、具有至多6个碳原子且任选地被卤素取代的烷基(直链、支链或环状)；
Rk24是H、卤素、氰基或烷基(直链或支链)或具有1-3个C原子的卤素取代的烷基；
Rk25是H、烷基(直链或支链)、烷氧基(直链或支链)或羟基；并且
接头(L)是将PTM偶联至ULM的键或化学接头。
在式XIII的某些实施方案中，接头部分缀合至式XIII的Rk1、Rk2、Rk3和Rk4基团中的至少一个，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002821
其中Rk22和Rk23如上文所定义；并且
R是1-3个独立地选自H、卤素、C1-C6烷基、氰基或卤代烷基的取代基，其中接头(L)是将PTM偶联至ULM的键或化学接头。
在某些另外的实施方案中，式XIII的R、Rk22或Rk33基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002822
在某些实施方案中，PTM包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XIV表示的部分：
Figure BDA0002176933830002823
其中Rka是H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)；
Rkb是芳基(例如C5-C10芳基)，或包含一个或两个5-7元环和1-4个选自N、O和S的杂原子的杂芳基，其中芳基和杂芳基各自任选地被一个或多个选自以下的基团取代：烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、卤代烷氧基(例如，C1-C6卤代烷氧基)、卤素、NO2、OH、CN、C(O)Y1、C(O)OY1、C(O)NY1Y2、NY1Y2、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、包含5-7元环和1-3个选自N、O和S的杂原子的杂环、C6-C10芳基以及包含一个或两个5-7元环和1-4个选自N、O和S的杂原子的杂芳基，其中烷基、环烷基、杂环基、芳基或杂芳基各自任选地被一个或多个Y1取代；
每个Y1和Y2独立地选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、卤代烷氧基(例如，C1-C6卤代烷氧基)、卤素、NO2、OH或CN；
其中Rk5、Rk6和Rk7独立地选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、炔烃(例如，C1-C6炔烃)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氰基、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、卤代烷氧基(例如，C1-C6卤代烷氧基)、NO2或卤素、Cl、F，其中所述烷基或烷氧基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N、CH、C(C1-C6烷基)、C(C1-C6)卤代烷基、C(C1-6)烷氧基、C(C1-6)卤代烷基、卤素、C(NO2)、C(NH2)、C(OH)或C(CN)。
在某些实施方案中，式XIV的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XIV的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XIV的Rka、Rkb、Rk5、Rk6或Rk7基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在式XIV的一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由下式表示的部分：
Figure BDA0002176933830002841
其中Rk5、Rk6和Rk7独立地选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、炔烃(例如，C1-C6炔烃)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氰基、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、卤代烷氧基(例如，C1-C6卤代烷氧基)、NO2或卤素、Cl、F，其中所述烷基或烷氧基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N、CH、C(C1-C6烷基)、C(C1-C6)卤代烷基、C(C1-6)烷氧基、C(C1-6)卤代烷基、卤素、C(NO2)、C(NH2)、C(OH)或C(CN)。
在某些另外的实施方案中，式XIV的Rk5、Rk6或Rk7基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIV的PTM经由不饱和化学接头连接至ULM。在某些实施方案中，不饱和接头是取代的。
在某些实施方案中，式XIV的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002842
其中Rk26和Rk27独立地选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氰基或卤素，其中所述烷基或烷氧基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代。
在某些另外的实施方案中，式XIV的Rk26或Rk27基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIV的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002851
其中Rk27选自H、氰基或卤素，其中接头(L)是将PTM偶联到ULM的键或化学接头。
在某些实施方案中，式XIV的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002852
其中Rk27选自H、氰基或卤素，其中接头(L)是将PTM偶联到ULM的键或化学接头。
在某些另外的实施方案中，式XIV的Rk27偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XIV的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002853
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XV表示的部分：
Figure BDA0002176933830002861
其中Rk8选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk9选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)或环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基或环烷基可进一步被1至3个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
Rk10选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷基砜、烷基甲酰胺或芳基，其中所述烷基或芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代。
在某些实施方案中，式XV的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XV的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XV的Rk8、Rk9或Rk10基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在式XV的某些实施方案中，Rk10是：
Figure BDA0002176933830002862
在某些实施方案中，式XV的PTM包含以下结构：
其中Rk28选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烯基(例如，C2-C6烯基)、炔基(例如，C2-C6炔基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk29选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)或环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基或环烷基可进一步被1-3个卤素取代基取代；并且
Rk30选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)、烷基砜、环烷基砜或-COR，其中所述烷基或芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代。
在某些另外的实施方案中，式XV的Rk28、Rk29或Rk30基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XVI表示的部分：
Figure BDA0002176933830002872
其中Rk11选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、C(O)NHR(其中R选自H、烷基如C1-C6烷基、环烷基如C3-C10环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环)；
Rk12选自H、烷基(直链或支链，例如，C1-C6烷基)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk13选自H、烷基、-C(O)NHR、C(O)R、S(O)2R，其中R是H、烷基(例如，C1-C6烷基)或环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N或CH。
在某些实施方案中，式XVI的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XVI的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XVI的Rk11、Rk12或Rk13基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在式XVI的某些实施方案中，Rk13是：
Figure BDA0002176933830002881
在某些实施方案中，式XVI的R基团包含接头，其中接头是将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XVI的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002882
其中Rk31选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基、C(O)NHR(其中R选自H、烷基如C1-C6烷基、环烷基如C3-C10环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环)；
Rk32选自H、烷基(直链或支链，例如，C1-C6烷基)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；
Rk33选自H、烷基、-C(O)NHR、C(O)R、S(O)2R，其中R是H、烷基(例如，C1-C6烷基)或环烷基，其可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、羟基、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N或CH。
在某些另外的实施方案中，式XVI的Rk31、Rk32或Rk33基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在式XVI的某些实施方案中，Rk33是：
Figure BDA0002176933830002891
在一个实施方案中，如本文所述的PROTAC的PTM包含由式XVII表示的部分：
Figure BDA0002176933830002892
其中Rk14选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、C(O)NHR(其中R选自H、烷基如C1-C6烷基、环烷基如C3-C10环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环)；
Rk15选自H、烷基(直链或支链)、芳基(例如，C5-C10芳基)、杂芳基(例如，包含1个或多个选自O、N和S的杂原子的C3-C10杂芳基)、环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素或卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk16选自H、烷基(例如，C1-C6烷基)或环烷基(例如，C3-C10环烷基)，其可进一步被1至2个选自烷基(例如，C1-C6烷基)、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基(例如，C1-C6卤代烷基)、烷氧基(例如，C1-C6烷氧基)、羟基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
Rk17选自H、卤素、CN。
在某些实施方案中，式XVII的PTM包含接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。在某些另外的实施方案中，式XVII的R基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些另外的实施方案中，式XVII的Rk14、Rk15、Rk16或Rk17基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XVII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002901
其中Rk31选自H、烷基、烷氧基、C(O)NHR(其中R选自H、烷基、环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环)；
Rk32选自H、烷基(直链或支链)或具有1-6个C原子的卤素取代的烷基；
Rk34选自H、烷基(直链或支链)或具有1-3个C原子的卤素取代的烷基；并且
Rk35选自H、F、Cl、Br或氰基。
在某些另外的实施方案中，式XVII的Rk31、Rk32、Rk34或Rk35基团中的一个或多个偶联至接头，其中接头是如本文所述的将PTM偶联至ULM基团的化学部分。
在某些实施方案中，式XVII的PTM包含以下结构：
Figure BDA0002176933830002911
如本文所述，PTM经由接头部分偶联至ULM。可以设想，接头部分可以在PTM上所需的任何位置缀合。在某些实施方案中，PTM包含选自以下的结构：
Figure BDA0002176933830002912
在某些实施方案中，本说明书提供了具有选自如图2所述的化合物1-351的结构的化合物。
治疗组合物
药物组合物代表本公开的另外方面，所述药物组合物包含与药学有效量的载体、添加剂或赋形剂组合的、有效量的如本文所述的至少一种双官能化合物和本文其他地方所述的一种或多种化合物的组合。
在某些实施方案中，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的至少一种选自如图2所述的化合物1-351的化合物以及药学上可接受的载体或赋形剂。在某些实施方案中，本说明书提供了用于共同施用(例如，单独地或以单一剂型)的组合，其包含有效量的至少一种如本文所述的化合物、至少一种另外的生物活性剂和药学上可接受的载体或赋形剂。在某些实施方案中，另外的生物活性剂是抗肿瘤剂。
适用时，本公开包括包含药学上可接受的盐，特别是如本文所述的化合物的酸或碱加成盐的组合物。用于制备可根据此方面使用的上述基础化合物的药学上可接受的酸加成盐的酸是形成无毒酸加成盐的那些酸，即含有药学上可接受的阴离子的盐，例如盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、硝酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、磷酸盐、酸式磷酸盐、乙酸盐、乳酸盐、柠檬酸盐、酸式柠檬酸盐、酒石酸盐、酒石酸氢盐、琥珀酸盐、马来酸盐、富马酸盐、葡糖酸盐、蔗糖酸盐、苯甲酸盐、甲磺酸盐、乙磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐和双羟萘酸盐[即1,1'-亚甲基-双-(2-羟基-3萘甲酸)]盐等等。
药学上可接受的碱加成盐也可以用于制备根据本公开的化合物或衍生物的药学上可接受的盐形式。在性质中为酸性的、可以用作制备本文化合物的药学可接受的碱性盐的试剂的化学碱是与此类化合物形成无毒碱性盐的那些化学碱。此类无毒碱性盐包括但不限于源自此类药学上可接受的阳离子的那些，所述阳离子例如碱金属阳离子(例如钾和钠)和碱土金属阳离子(例如钙、锌和镁)、铵或水溶性胺加成盐如N-甲基葡糖胺-(葡甲胺)，以及低级烷醇铵和药学上可接受的有机胺的其他碱性盐等等。
如本文所述的化合物可根据本公开通过经口、肠胃外或局部途径以单一剂量或分份剂量施用。活性化合物的施用范围可以从连续(静脉内滴注)到每天几次经口施用(例如，Q.I.D.)，并且可以包括经口、局部、肠胃外、肌内、静脉内、皮下、透皮(其可以包括渗透增强剂)、经颊、舌下和栓剂施用，以及其他施用途径。肠溶衣经口片剂也可以用于增强来自经口施用途径的化合物的生物利用度。最有效的剂型取决于所选择的特定药剂的药代动力学以及患者中的疾病的严重程度。也可以使用作为用于鼻内、气管内或肺部施用的喷雾剂、薄雾或气溶胶的根据本公开的化合物施用。因此，本公开还涉及药物组合物，其包含有效量的如本文所述的化合物，任选地与药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂组合。根据本公开的化合物可以立即释放、中间释放或持续或控制释放形式施用。持续或控制释放形式优选经口施用，也可以栓剂和透皮或其他局部形式施用。以脂质体形式的肌内注射也可以用于控制或维持化合物在注射部位处的释放。
在另一方面，本公开提供了治疗组合物，其包含有效量和/或协同量的如本文所述的化合物，和至少一种另外的生物活性剂(即，治疗组合)如本文所述的另一种EGFRPROTAC，抗癌剂，和抗炎剂，和/或EGFR抑制剂。在某些实施方案中，EGFR抑制剂包括吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、布格替尼、埃克替尼、拉帕替尼、西妥昔单抗、帕尼单抗、奥希替尼、扎鲁木单抗、尼妥珠单抗、马妥珠单抗中的至少一种或它们的组合。在某些实施方案中，联合治疗组合物包含有效量的EGFR抑制剂。
如本文所述的组合物可使用一种或多种药学上可接受的载体以常规方式配制，并且还可以在控制释放制剂中施用。可以用于这些药物组合物中的药学可接受的载体包括但不限于离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白例如人血清白蛋白、缓冲物质例如磷酸盐、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的偏甘油酯混合物、水、盐或电解质例如硫酸醇溶蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素基物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯嵌段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂。
如本文所述的组合物可以经口、肠胃外、吸入喷雾、局部、直肠、鼻腔、口腔、阴道或经由植入的储库施用。如本文所用的术语“肠胃外”包括皮下、静脉内、肌内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内和颅内注射或输注技术。优选地，组合物经口、腹膜内或静脉内施用。
如本文所述的组合物的无菌可注射形式可以是水性或油性悬浮液。可以根据本领域已知的技术，使用合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂配制这些悬浮液。无菌可注射制剂还可以是在无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液，例如作为在1,3-丁二醇中的溶液。在可以采用的可接受的媒介物和溶剂有水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。另外，无菌的不挥发性油照常规用作溶剂或悬浮介质。为此目的，可以采用任何温和的不挥发性油，包括合成的甘油单酯或甘油二酯。脂肪酸，例如油酸及其甘油酯衍生物可用于制备注射剂，如天然的药学可接受的油，例如橄榄油或蓖麻油一样，尤其以其聚氧乙基化形式。这些油溶液或悬浮液也可以含有长链醇稀释剂或分散剂，例如Ph.Helv或类似的醇。
如本文所述的药物组合物可以以任何经口可接受的剂型经口施用，包括但不限于胶囊、片剂、水性悬浮液或溶液。在用于经口使用的片剂的情况下，常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。通常还添加润滑剂，如硬脂酸镁。对于以胶囊形式的经口施用，有用的稀释剂包括乳糖和干玉米淀粉。当需要水性悬浮液用于经口使用时，将活性成分与乳化剂和悬浮剂混合。需要时，还可以加入某些甜味剂、调味剂或着色剂。
可替代地，如本文所述的药物组合物可以以栓剂的形式施用，用于直肠施用。这些可以通过将试剂与合适的非刺激性赋形剂混合来制备，所述赋形剂在室温下为固体但在直肠温度下为液体，并且因此将在直肠中融化以释放药物。此类材料包括可可脂、蜂蜡和聚乙二醇。
如本文所述的药物组合物也可以局部施用。对于这些区域或器官中的每一个，容易制备合适的局部制剂。对于下肠道的局部施用可以以直肠栓剂制剂(参见上文)或以合适的灌肠剂制剂实现。也可以使用局部可接受的透皮贴剂。
对于局部应用，药物组合物可以配制成合适的软膏，所述软膏含有悬浮或溶解于一种或多种载体中的活性组分。用于局部施用本公开的化合物的载体包括但不限于矿物油、液体凡士林、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。在本公开的某些优选方面，可以将化合物涂布到支架上，所述支架将要手术植入患者体内，以便抑制或减少支架在患者中发生阻塞的可能性。
可替代地，可以将药物组合物配制成合适的洗剂或乳膏，所述洗剂或乳膏含有悬浮或溶解于一种或多种药学可接受的载体中的活性组分。合适的载体包括但不限于矿物油、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、十六烷基酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二烷醇、苯甲醇和水。
对于眼部使用，药物组合物可以配制为在等渗、pH调节的无菌盐水中的微粉化悬浮液，或者优选地，配制为在等渗、pH调节的无菌盐水中的溶液，使用或不使用防腐剂如苯扎氯铵。可替代地，对于眼部使用，可以将药物组合物配制成软膏例如凡士林。
如本文所述的药物组合物还可通过鼻气溶胶或吸入施用。此类组合物根据药物制剂领域众所周知的技术制备，并且可以制备为在盐水中的溶液，采用苯甲醇或其他合适的防腐剂、增强生物利用度的吸收促进剂、碳氟化合物和/或其他常规增溶剂或分散剂。
可以与载体材料组合以制备单一剂型的如本文所述的药物组合物中化合物的量将根据所治疗的宿主和疾病、特定的施用模式而变。优选地，组合物应配制成包含约0.05毫克至约750毫克或更多、更优选地约1毫克至约600毫克、甚至更优选地约10毫克至约500毫克的活性成分，该活性成分单独存在或与至少一种根据本公开的其他化合物组合。
还应该理解，用于任何特定患者的具体剂量和治疗方案将取决于各种因素，包括所采用的特定化合物的活性、年龄、体重、一般健康、性别、饮食、施用时间、排泄率、药物组合、以及治疗医师的判断和待治疗的特定疾病或状况的严重程度。
需要根据本文所述的方法使用化合物治疗的患者或受试者可通过向患者(受试者)施用单独或与如本文其他地方鉴定的其他已知红血球生成刺激剂组合的有效量的根据本公开的化合物来治疗，所述化合物包括其药学上可接受的盐、溶剂化物或多晶型物，任选地在药学上可接受的载体或稀释剂中。
这些化合物可通过任何适当的途径施用，例如经口、肠胃外、静脉内、皮内、皮下或局部，包括透皮、在液体中、乳膏、凝胶或固体形式或通过气溶胶形式。
活性化合物包括在药学可接受的载体或稀释剂中，其量足以向患者递送对于所需适应症的治疗有效量，而不在所治疗的患者中引起严重的毒性效应。用于所有本文提及状况的活性化合物的优选剂量在约10ng/kg至300mg/kg的范围内，优选地0.1至100mg/kg/天，更一般地0.5至约25mg/千克接受者/患者的体重/天。典型的局部剂量范围为在合适的载体中0.01-5重量％。
该化合物方便地以任何合适的单位剂型施用，包括但不限于每单位剂型含有小于1mg、1mg至3000mg，优选5至500mg的活性成分的单位剂型。约25-250mg的经口剂量通常是方便的。
优选施用活性成分以达到约0.00001-30mM，优选约0.1-30μM的活性化合物的峰值血浆浓度。这可以例如通过任选地在盐水或含水介质中的活性成分溶液或制剂的静脉内注射来实现，或作为活性成分的推注来施用。经口施用也适合于生成活性剂的有效血浆浓度。
药物组合物中活性化合物的浓度将取决于药物的吸收、分布、失活和排泄速率，以及本领域技术人员已知的其他因素。应注意，剂量值也将随着待缓解的状况的严重程度而变。还应理解，对于任何特定受试者，应该根据个体需要和施用或监督组合物施用的个人的专业判断，随着时间过去调整特定剂量方案，并且本文所述的浓度范围仅为示例性的，并且不预期限制请求保护的组合物的范围或实践。活性成分可以一次施用，或者可以分成许多较小的剂量，以不同的时间间隔施用。
经口组合物通常将包含惰性稀释剂或可食用载体。它们可以包封在明胶胶囊中或压制成片剂。为了经口治疗施用的目的，可以将活性化合物或其前药衍生物与赋形剂混合，并且以片剂、锭剂或胶囊的形式使用。可包含药学上相容的粘合剂和/或佐剂材料作为组合物的一部分。
片剂、丸剂、胶囊、锭剂等等可以含有下述成分或类似性质的化合物中的任一种：粘合剂如微晶纤维素、黄蓍胶或明胶；赋形剂如淀粉或乳糖，分散剂如海藻酸、Primogel或玉米淀粉；润滑剂如硬脂酸镁或Sterotes；助流剂如胶体二氧化硅；甜味剂如蔗糖或糖精；或调味剂如薄荷、水杨酸甲酯或橙子调味料。当剂量单位形式是胶囊时，除上述类型的材料之外，它还可以含有液体载体如脂肪油。另外，剂量单位形式可以含有修改剂量单位的物理形式的各种其他物质，例如糖包衣、虫胶或肠溶剂。
活性化合物或其药学可接受的盐可以作为酏剂、悬浮液、糖浆剂、晶片、口香糖等等的组分施用。除活性化合物之外，糖浆剂还可以含有蔗糖作为甜味剂与某些防腐剂、染料以及着色剂和调味料。
活性化合物或其药学上可接受的盐也可以与不损害所需作用的其他活性物质混合，或与补充所需作用的物质混合，例如红细胞生成刺激剂，包括EPO和达依泊汀α等。在本公开的某些优选方面，根据本公开的一种或多种化合物与另一种生物活性剂共同施用，例如红细胞生成刺激剂或伤口愈合剂，包括抗生素，如本文其他地方所述。
用于肠胃外、皮内、皮下或局部施用的溶液或悬浮液可包含下列组分：无菌稀释剂如注射用水、盐水溶液、不挥发性油、聚乙二醇、丙三醇、丙二醇或其他合成溶剂；抗菌剂如苯甲醇或对羟基苯甲酸甲酯；抗氧化剂如抗坏血酸或亚硫酸氢钠；螯合剂如乙二胺四乙酸；缓冲剂如乙酸盐、柠檬酸盐或磷酸盐和用于调节张力的试剂如氯化钠或葡萄糖。肠胃外制剂可以包封在由玻璃或塑料制成的安瓿、一次性注射器或多剂量小瓶中。
如果静脉内施用，则优选的载体是生理盐水或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。
在一个实施方案中，活性化合物与载体一起制备，所述载体将保护化合物免于从体内快速消除，例如控制释放制剂，包括植入物和微囊化递送系统。可以使用可生物降解的、生物相容的聚合物，例如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯和聚乳酸。用于制备此类制剂的方法对于本领域技术人员是显而易见的。
脂质体悬浮液也可以是药学可接受的载体。这些可以根据本领域技术人员已知的方法制备，例如，如美国专利号4,522,811中所述(其以引用的方式整体并入本文)。例如，脂质体制剂可以通过将适当的脂质(例如硬脂酰磷脂酰乙醇胺、硬脂酰磷脂酰胆碱、arachadoyl磷脂酰胆碱和胆固醇)溶解于有机溶剂中来制备，然后蒸发所述有机溶剂，在容器的表面上留下干燥脂质的薄膜。然后将活性化合物的水溶液引入容器内。然后用手旋转容器，以从容器的侧面释放脂质材料且分散脂质聚集体，从而形成脂质体悬浮液。
治疗方法
在另一方面，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式和药学上可接受的载体。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物，例如人)中的蛋白质降解，并且可以用于治疗或改善通过降解的蛋白质调节的疾病状态或状况。
如本文使用的，术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”等指对患者提供益处的任何动作，对于所述患者可以施用本文化合物，所述益处包括通过本文化合物与之结合的蛋白质调节的任何疾病状态或状况的治疗。可以设想可使用根据本公开的化合物治疗的疾病状态或状况，例如EGFR相关的疾病或病症。
本说明书提供了如本文所述的用于实现目的蛋白质的降解的治疗组合物，该治疗组合物用于治疗或改善EGFR相关疾病例如癌症和/或炎性病症和/或毛发生长。因此，在另一方面，本说明书提供了泛素化/降解细胞中的靶蛋白的方法。
在某些实施方案中，本说明书提供了用于治疗EGFR相关疾病或病症的组合物和方法。在某些实施方案中，EGFR相关疾病或病症是癌症和/或炎性病症中的至少一种。在某些实施方案中，EGFR相关疾病或病症是肺鳞状细胞癌、结肠癌和肛门癌、成胶质细胞瘤、头颈部上皮细胞瘤、牛皮癣、湿疹和动脉粥样硬化中的至少一种或它们的组合。
在某些实施方案中，该方法包括施用如本文中所述的双官能化合物，该双官能化合物包含例如优选通过如本文另外所述的接头部分连接的ULM和PTM，其中ULM与PTM偶联且其中ULM识别泛素路径蛋白质(例如，泛素连接酶，如E3泛素连接酶，包括人小脑蛋白、VHL、IAP和/或MDM2)并且PTM识别靶蛋白，使得当靶蛋白邻近泛素连接酶定位时，将发生靶蛋白的降解，从而实现靶蛋白的降解/靶蛋白效应的抑制及蛋白质水平的控制。通过本公开提供的蛋白质水平的控制提供了疾病状态或状况的治疗，其通过降低细胞(例如，患者的细胞)中该蛋白质的水平而通过靶蛋白调节。在某些实施方案中，该方法包括施用有效量的如本文所述的化合物，任选地包含药学上可接受的赋形剂、载体、佐剂、另一种生物活性剂或它们的组合。
在另外的实施方案中，本说明书提供了用于治疗或改善受试者或患者(例如动物，例如人类)的疾病、病症或其症状的方法，该方法包括向有需要的受试者施用组合物，该组合物包含有效量(例如治疗有效量)的本文所述化合物或其盐形式，和药学上可接受的赋形剂、载体、助剂、另一种生物活性剂或它们的组合，其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。
在另一方面，本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的所关注蛋白质降解的影响的方法。
在另一个实施方案中，本公开涉及治疗需要治疗通过EGFR蛋白调节的疾病状态或状况治疗的人类患者的方法，其中该蛋白质的降解在该患者中产生治疗效果，所述方法包括向有需要的患者施用有效量的根据本公开的化合物。在某些实施方案中，如本文所述的化合物与如本文所述的另一种生物活性剂(例如EGFR抑制剂)联合施用。
术语“疾病状态或状况”用于描述任何疾病状态或状况，其中发生EGFR蛋白失调(即，患者中表达的EGFR蛋白的量升高)，并且其中患者中EGFR蛋白的降解可以为对此有需要的患者提供有益疗法或症状的缓解。在某些情况下，疾病状态或状况可以被治愈。
术语“生物活性剂”用于描述除了根据本公开的化合物之外的试剂，其与本发明化合物组合用作具有生物活性的试剂，以帮助实现对于其使用本发明化合物的预期疗法、抑制和/或防止/预防。本文使用的优选生物活性剂包括药理学活性与所用或所施用的本发明化合物类似的那些试剂，并且包括例如抗癌剂、抗病毒剂，尤其包括抗HIV剂和抗HCV剂、抗微生物剂、抗真菌剂等。
术语“另外的抗癌剂”用于描述可以与根据本公开的化合物组合以治疗癌症的抗癌剂。这些剂包括例如依维莫司、曲贝替定、阿布拉生、TLK 286、AV-299、DN-101、帕唑帕尼、GSK690693、RTA 744、ON 0910.Na、AZD 6244(ARRY-142886)、AMN-107、TKI-258、GSK461364、AZD 1152、恩扎妥林、凡德他尼、ARQ-197、MK-0457、MLN8054、PHA-739358、R-763、AT-9263、FLT-3抑制剂、VEGFR抑制剂、EGFR TK抑制剂、极光激酶抑制剂、PIK-1调节剂、Bcl-2抑制剂、HDAC抑制剂、c-MET抑制剂、PARP抑制剂、Cdk抑制剂、EGFR TK抑制剂、IGFR-TK抑制剂、抗HGF抗体、PI3激酶抑制剂、AKT抑制剂、mTORC1/2抑制剂、JAK/STAT抑制剂、检查点-1或2抑制剂、病灶粘附激酶抑制剂、Map激酶(mek)抑制剂、VEGF截获抗体、培美曲塞、埃罗替尼、达沙替尼、尼罗替尼、德卡坦尼、帕尼单抗、氨柔比星、奥戈伏单抗、Lep-etu、诺拉曲特、azd2171、巴他布林、奥法木单抗、扎木单抗、艾特咔林(edotecarin)、汉防己碱、鲁比替康、替米利芬、奥利默森、替西木单抗、伊匹单抗、棉子酚、Bio 111、131-I-TM-601、ALT-110、BIO 140、CC8490、西仑吉肽、吉马替康、IL13-PE38QQR、INO 1001、IPdR1 KRX-0402、甲硫恩酮、LY317615、纽迪(neuradiab)、维特斯潘(vitespan)、Rta 744、Sdx 102、他仑帕奈、阿曲生坦、Xr 311、罗米地辛、ADS-100380、舒尼替尼、5-氟尿嘧啶、伏立诺他、依托泊苷、吉西他滨、多柔比星、多柔比星脂质体、5’-脱氧-5-氟尿苷、长春新碱、替莫唑胺、ZK-304709、塞利西利；PD0325901、AZD-6244、卡培他滨、L-谷氨酸、N-[4-[2-(2-氨基-4,7-二氢-4-氧代-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-5-基)乙基]苯甲酰基]-、二钠盐七水合物、喜树碱、PEG标记的伊立替康、他莫昔芬、柠檬酸托瑞米芬、阿那曲唑、依西美坦、来曲唑、DES(己烯雌酚)、雌二醇、雌激素、结合雌激素、贝伐单抗、IMC-1C11、CHIR-258)；3-[5-(甲基磺酰基哌啶甲基)-吲哚基-喹诺酮、瓦他拉尼、AG-013736、AVE-0005、醋酸戈舍瑞林、醋酸亮丙瑞林、双羟萘酸曲普瑞林、醋酸甲羟孕酮、羟基孕酮己酸盐、醋酸甲地孕酮、雷洛昔芬、比卡鲁胺、氟他胺、尼鲁米特、醋酸甲地孕酮、CP-724714；TAK-165、HKI-272、埃罗替尼、拉帕替尼、卡奈替尼、ABX-EGF抗体、爱必妥、EKB-569、PKI-166、GW-572016、洛那法尼、BMS-214662、替吡法尼；阿米福汀、NVP-LAQ824、辛二酰苯胺异羟肟酸、丙戊酸、曲古抑菌素A、FK-228、SU11248、索拉非尼、KRN951、胺鲁米特、安沙可林(arnsacrine)、阿那格雷、L-天冬酰胺酶、芽孢杆菌卡介苗(BCG)疫苗、阿霉素、博来霉素、布舍瑞林、白消安、卡铂、卡莫司汀、苯丁酸氮芥、顺铂、克拉屈滨、氯屈膦酸盐、环丙孕酮、阿糖胞苷、达卡巴嗪、放线菌素D、道诺霉素、己烯雌酚、表柔比星、氟达拉滨、氟氢可的松、氟甲睾酮、氟他胺、格列卫、吉西他滨、羟脲、伊达比星、异环磷酰胺、伊马替尼、亮丙瑞林、左旋咪唑、洛莫司汀、二氯甲基二乙胺、美法仑、6-巯基嘌呤、美司钠、甲氨蝶呤、丝裂霉素、米托坦、米托蒽醌、尼鲁米特、奥曲肽、奥沙利铂、帕米膦酸、喷司他丁、普卡霉素、卟吩姆(porfimer)、丙卡巴肼、雷替曲塞、利妥昔单抗、链脲霉素、替尼泊苷、睾酮、沙利度胺、硫鸟嘌呤、噻替派、维甲酸、长春地辛、13-顺-视黄酸、苯丙氨酸氮芥、尿嘧啶氮芥、雌氮芥、六甲蜜胺、氟尿苷、5-脱氧尿苷、胞嘧啶阿拉伯糖苷、6-巯基嘌呤、脱氧柯福霉素、骨化三醇、戊柔比星、光神霉素、长春花碱、长春瑞滨、拓朴替康、雷佐生、马立马司他、COL-3、新伐司他、BMS-275291、角鲨胺、内皮他丁、SU5416、SU6668、EMD121974、白介素-12、IM862、血管抑素、维他欣、屈洛昔芬、艾多昔芬(idoxyfene)、螺内酯、非那雄胺、西咪替丁、曲妥单抗、地尼白介素、吉非替尼、硼替佐米、紫杉醇、不含氢化蓖麻油的紫杉醇、多西他赛、埃博霉素B、BMS-247550、BMS-310705、屈洛昔芬、4-羟基他莫昔芬、哌喷昔芬、ERA-923、阿佐昔芬、氟维司群、阿考比芬、拉索昔芬、艾多昔芬、TSE-424、HMR-3339、ZK186619、拓朴替康、PTK787/ZK 222584、VX-745、PD 184352、雷帕霉素、40-O-(2-羟基乙基)-雷帕霉素、坦西莫司、AP-23573、RAD001、ABT-578、BC-210、LY294002、LY292223、LY292696、LY293684、LY293646、渥曼青霉素、ZM336372、L-779,450、PEG-非格司亭、达贝泊汀、红细胞生成素、粒细胞集落刺激因子、唑仑膦酸(zolendronate)、泼尼松、西妥昔单抗、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、组氨瑞林、聚乙二醇干扰素α-2a、干扰素α-2a、聚乙二醇干扰素α-2b、干扰素α-2b、阿扎胞苷、PEG-L-天冬酰胺酶、来那度胺、吉妥珠单抗、氢化可的松、白介素-11、右雷佐生、阿仑单抗、全反式维甲酸、酮康唑、白介素-2、甲地孕酮、免疫球蛋白、氮芥、甲基泼尼松龙、替伊莫单抗(ibritgumomab tiuxetan)、雄激素、地西他滨、六甲三聚氰胺、贝沙罗汀、托西莫单抗、三氧化二砷、可的松、依替膦酸盐(editronate)、米托坦、环孢霉素、柔红霉素脂质体、Edwina天冬酰胺酶、锶89、卡索匹坦、奈妥匹坦、NK-1受体拮抗剂、帕洛诺司琼、阿瑞匹坦、苯海拉明、羟嗪、甲氧氯普胺、劳拉西泮、阿普唑仑、氟哌啶醇、氟哌利多、屈大麻酚、地塞米松、甲基泼尼松龙、普鲁氯嗪、格拉司琼、昂丹司琼、多拉司琼、托烷司琼、聚乙二醇非格司亭、红细胞生成素、阿法依伯汀、阿法达贝泊汀以及它们的混合物。
术语“抗HIV剂”或“另外的抗HIV剂”包括例如核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、其他非核苷类逆转录酶抑制剂(即不能代表本公开的那些)、蛋白酶抑制剂、融合抑制剂等，其示例性化合物可包括例如3TC(拉米夫定)、AZT(齐多夫定)，(-)-FTC、ddI(地达诺新)、ddC(扎西他滨)、阿巴卡韦(ABC)、替诺福韦(PMPA)、D-D4FC(Reverset)、D4T(司他夫定)、Racivir、L-FddC、L-FD4C、NVP(奈韦拉平)、DLV(地拉夫定)、EFV(依法韦仑)、SQVM(甲磺酸沙奎那韦)、RTV(利托那韦)、IDV(茚地那韦)、SQV(沙奎那韦)、NFV(奈非那韦)、APV(安普那韦)、LPV(洛匹那韦)、融合抑制剂如T20等、其融合物和混合物，包括目前正处于临床试验或开发阶段的抗HIV化合物。
可与根据本公开的化合物共同施用的其他抗HIV剂包括例如其他NNRTI(即，除了根据本公开的NNRTI之外)，可选自奈韦拉平(BI-R6-587)、地拉夫定(U-90152S/T)、依法韦仑(DMP-266)、UC-781(N-[4-氯-3-(3-甲基-2-丁烯基氧基)苯基]-2-甲基-3-呋喃甲酰胺、依曲韦林(TMC125)、曲韦定(Ly300046.HCl)、MKC-442(依米韦林，coactinon)、HI-236、HI-240、HI-280、HI-281、利匹韦林(TMC-278)、MSC-127、HBY 097、DMP266、黄芩苷(TJN-151)ADAM-II(3’,3’-二氯-4’,4”-二甲氧基-5’,5”-双(甲氧基羰基)-6,6-二苯基己烯酸甲酯)、3-溴-5-(1-5-溴-4-甲氧基-3-(甲氧基羰基)苯基)庚-1-烯基)-2-甲氧基苯甲酸甲酯(Alkenyldiarylmethane类似物，Adam类似物)、(5-氯-3-(苯亚磺酰基)-2’-吲哚甲酰胺)、AAP-BHAP(U-104489或PNU-104489)、卡普韦林(AG-1549、S-1153)、阿替韦啶(U-87201E)、金精三羧酸(SD-095345)、1-[(6-氰基-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[5-[[N]-(甲基)甲基磺酰基氨基]-2-吲哚基羰基-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[3-(乙基氨基)-2-[吡啶基]-4-[(5-羟基-2-吲哚基)羰基]哌嗪、1-[(6-甲酰基-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[[5-(甲基磺酰基氧基)-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、U88204E、双(2-硝基苯基)砜(NSC 633001)、卡拉内酯A(NSC675451)、卡拉内酯B、6-苄基-5-甲基-2-(环己基氧基)嘧啶-4-酮(DABO-546)、DPC 961、E-EBU、E-EBU-dm、E-EPSeU、E-EPU、膦甲酸(Foscavir)、HEPT(1-[(2-羟乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)胸腺嘧啶)、HEPT-M(1-[(2-羟乙氧基)甲基]-6-(3-甲基苯基)硫代)胸腺嘧啶)、HEPT-S(1-[(2-羟乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)-2-硫代胸腺嘧啶)、海棠果素P、L-737,126、米歇尔胺A(NSC650898)、米歇尔胺B(NSC649324)、米歇尔胺F、6-(3,5-二甲基苄基)-1-[(2-羟乙氧基)甲基]-5-异丙基尿嘧啶、6-(3,5-二甲基苄基)-1-(乙氧基甲基)-5-异丙基尿嘧啶、NPPS、E-BPTU(NSC 648400)、奥替普拉(4-甲基-5-(吡嗪基)-3H-1,2-二硫杂环戊烯-3-硫酮)、N-{2-(2-氯-6-氟苯乙基)-N’-(2-噻唑基)硫脲(PETT Cl，F衍生物)、N-{2-(2,6-二氟苯乙基)-N’-[2-(5-溴吡啶基)]硫脲(PETT衍生物)、N-{2-(2,6-二氟苯乙基)-N’-[2-(5-甲基吡啶基)]硫脲{PETT吡啶基衍生物]、N-[2-(3-氟呋喃基)乙基]-N’-[2-(5-氯吡啶基)]硫脲、N-[2-(2-氟-6-乙氧基苯乙基)]-N’-[2-(5-溴吡啶基)]硫脲、N-(2-苯乙基)-N’-(2-噻唑基)硫脲(LY-73497)、L-697,639、L-697,593、L-697,661、3-[2-(4,7-二氟苯并噁唑-2-基)乙基}-5-乙基-6-甲基(吡啶-2(1H)-硫酮(2-吡啶酮衍生物)、3-[[(2-甲氧基-5,6-二甲基-3-吡啶基)甲基]胺]-5-乙基-6-甲基(吡啶-2(1H)-硫酮、R82150、R82913、R87232、R88703、R89439(洛韦胺)、R90385、S-2720、舒拉明钠、TBZ(噻唑并苯并咪唑，NSC625487)、噻唑并异吲哚-5-酮、(+)(R)-9b-(3,5-二甲基苯基-2,3-二氢噻唑并[2,3-a]异吲哚-5(9bH)-酮、替韦拉平(R86183)、UC-38和UC-84等。
适用时，术语“药学上可接受的盐”在本说明书中通篇用于描述本文所述的一种或多种化合物的盐形式，其用于增加化合物在患者的胃肠道的胃液中的溶解度，以便促进化合物的溶出度和生物利用度。适用时，药学上可接受的盐包括源自药学上可接受的无机或有机碱和酸的盐。合适的盐包括源自碱金属如钾和钠的盐，碱土金属如钙、镁和铵盐，以及制药领域中众所周知的众多其他酸和碱。钠盐和钾盐作为根据本公开的磷酸盐的中和盐是特别优选的。
术语“药学上可接受的衍生物”在本说明书中通篇用于描述任何药学上可接受的前药形式(例如酯、酰胺、其他前药基团)，在施用于患者时，其直接或间接提供本发明化合物或本发明化合物的活性代谢产物。
实施例
一般合成方法
如本文所述的双官能分子的合成实现和优化可以逐步或模块化的方式进行。例如，如果不能立即获得合适的配体，则鉴定与靶分子结合的化合物可涉及高通量或中通量的筛查活动。初始配体需要迭代设计和优化循环来改善次优方面并不罕见，如通过合适的体外和药理学和/或ADMET测定所确定的那样。优化/SAR活动的一部分将是探测配体的耐受取代的位置，并且可能是附接本文先前提到的化学接头的合适位置。在可获得晶体学或NMR结构数据的情况下，这些可用于集中这样的合成任务。
以非常类似的方式，可以鉴定和优化E3连接酶的配体，即ULM/ILM/VLM/CLM/ILM。
利用PTM和ULM(例如ILM、VLM、CLM和/或ILM)，本领域技术人员可以使用已知的合成方法将它们在有或没有接头部分的情况下进行组合。接头部分可以合成为具有一系列组成、长度和柔韧性，并且被官能化，使得PTM和ULM基团可以顺序地附接至接头的远端。因此，可以在体外和体内药理学和ADMET/PK研究中实现和分析双官能分子文库。与PTM和ULM基团一样，最终的双官能分子可以进行迭代设计和优化循环，以鉴定具有期望特性的分子。
在一些情况下，为了促进所需材料的制备，可能需要保护基团策略和/或官能团相互转化(FGI)。此类化学工艺是有机合成化学工作者众所周知的并且其中许多可见于教材中，例如“Greene’s Protective Groups in Organic Synthesis”，Peter G.M.Wuts和Theodora W.Greene(Wiley)，以及“Organic Synthesis:The Disconnection Approach”，Stuart Warren和Paul Wyatt(Wiley)。
本发明的PTM实施方案可根据先前在文献中描述和/或在下面的方案1–6中详述的合成途径进行制备。这些途径可以使用本领域技术人员已知的一般方法修改且适于特定PTM实施方案的合成。具体地讲，由通式I表示的PTM的合成方法先前已有所描述(参见例如Barker,A.J.等人，WO199730034和Barker,A.J.等人，Bioorganic and MedicinalChemistry Letters 2001,11(14),1911–1914)，并且可以如方案1和2所示进行概括，其中R22’是可使用本领域技术人员已知的一般合成方法转化的靶向取代R22的合成前体。
实验工序
实施例1的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003031
合成方案：
Figure BDA0002176933830003041
1.步骤–2-(2-(2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
在0℃下，向2-(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(300.0mg，1.13mmol)和TEA(344.5mg，3.40mmol)的DCM(5mL)溶液中添加MsCl(195.8mg，1.70mmol)。将该溶液在室温下搅拌1小时。将该混合物用水淬灭，然后用DCM(10mL x 3)进行萃取。用盐水(15mL×3)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黄色油状物的粗制标题化合物2-(2-(2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(350.2mg，90.1％收率)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤至4.步骤–N-(2-氯苄基)-6-(4-(氯甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺的合成，遵循与Cai,X.等人在WO 2008033747中描述的那些类似的工序。
Figure BDA0002176933830003051
5.步骤–4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003052
向N-(2-氯苄基)-6-(4-(氯甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(3.93g，10.3mmol)的二氧杂环己烷(80mL)溶液中添加哌嗪-1-羧酸叔丁酯(3.92g，21.0mmol)。将该溶液在90℃下搅拌7小时。减压浓缩该混合物。将残余物用CH3OH重结晶，得到呈浅黄色固体的4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(4.08g，91.9％收率)。
6.步骤–N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺的合成
Figure BDA0002176933830003053
向4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(3.98g，7.5mmol)的DCM(30mL)溶液中添加三氟乙酸(9.0mL)。将混合物在室温下搅拌3小时。减压去除溶剂。将残余物溶解于水(50mL)中。用固体NaHCO3将溶液pH值调节至9。用DCM(50mL×3)萃取混合物。用盐水洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压蒸发，得到粗产物N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(2.0g，61.9％收率)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
7.步骤–2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003061
向2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(136.2mg，0.20mmol)的二氧杂环己烷(2.0mL)溶液中添加二氧杂环己烷/HCl(0.5mL)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。真空去除溶剂，得到粗制标题产物2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(121.5mg)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
8.步骤–(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003062
向2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(121.5mg，0.19mmol)和(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(87.9mg，0.19mmol)的无水DMF(6.0mL)溶液中添加DIEA(76.7mg，0.57mmol)和PyBop(197.8mg，0.38mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。将该溶液用水(20mL)淬灭，然后用EA(20mL x 3)进行萃取。用盐水洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空蒸发。通过硅胶柱色谱(二氯甲烷/甲醇＝25/1)纯化残余物，得到粗制标题产物(60.2mg)。然后将其通过制备型HPLC进一步纯化，得到标题产物(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(19.0mg，9.5％收率)。
1H NMR(400MHz,MeOD)：δ8.85(s,1H),8.10(s,1H),7.74(d,J＝8.0Hz,2H),7.37–7.44(m,8H),7.23–7.25(m,2H),6.92(s,1H),4.69(s,1H),4.48–4.59(m,5H),4.30(s,1H),4.00(d,J＝5.60Hz,2H),3.87(d,J＝11.08Hz,1H),3.80(d,J＝3.80Hz,1H),3.63–3.68(m,12H),2.90(s,4H),2.65(s,3H),2.45(s,3H),2.22(m,1H),2.21(m,1H),1.03(s,9H)。
实施例8的合成
4-((17-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003071
合成方案：
Figure BDA0002176933830003072
1.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-4-((17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003081
向17-氨基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷-1-醇盐酸盐(2.00g，7.1mmol)和2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-4-氟异吲哚啉-1,3-二酮(2.94g，10.65mmol)的NMP(10mL)溶液中添加DIEA(3.67g，28.4mmol)。将该溶液在90℃下搅拌2.5小时。然后将其冷却至室温并用水(20mL)淬灭。用DCM(50mL×3)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱(DCM/MeOH＝25/1)纯化残余物，得到标题化合物2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-4-((17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮(300.2mg，9.9％收率)。
2.步骤–17-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氨基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷醛的合成
Figure BDA0002176933830003082
向2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-4-((17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮(300.0mg，0.56mmol)的CH3CN(15.0mL)溶液中添加IBX(234.4mg，0.84mmol)。将该混合物在80℃下搅拌2小时。然后将其通过硅藻土过滤，并将滤液减压浓缩，得到粗制标题产物17-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氨基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷醛(230.6mg，77.2％收率)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。
3.步骤–4-((17-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003091
向17-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氨基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷醛(150.0mg，0.33mmol)和N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(145.0mg，0.33mmol)的MeOH(10mL)溶液中添加NaCNBH3(98.0mg，1.0mmol)和两滴AcOH。将混合物在室温下搅拌16小时。然后真空去除溶剂。通过制备型HPLC纯化残余物，得到标题化合物4-((17-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(45.9mg，17.2％收率)。
1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ8.26(s,1H),7.77(d,J＝7.6Hz,2H),7.47–7.51(m,5H),7.36–7.39(m,2H),7.15(s,1H),6.99–7.02(m,2H),5.00–5.04(m,1H),4.93(s,2H),3.81(s,4H),3.42–3.69(m,24H),2.69–3.00(m,8H),2.03–2.09(m,1H),1.25–1.32(m,1H)。
实施例10的合成
Figure BDA0002176933830003092
4-((2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮
合成方案：
1.步骤–6-(4-(2-(2-(2-(2-(N,N-二叔丁氧基羰基-氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-N-(2-氯苄基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺的合成
Figure BDA0002176933830003102
在25℃下，向2-(2-(2-(2-(N,N-二叔丁氧基羰基-氨基)氨基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基甲磺酸酯(490mg，1.04mmol)的DMF(10mL)溶液和4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯酚(364mg，1.04mmol)中添加K2CO3(430mg，3.12mmol)。将所得溶液在70℃下搅拌16小时。将所得溶液冷却至20℃。用H2O(40mL)稀释混合物。用EtOAc(40mL x2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，得到标题化合物6-(4-(2-(2-(2-(2-(N,N-二叔丁氧基羰基-氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-N-(2-氯苄基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(280mg，37.1％收率)。
2.步骤和3.步骤–4-((2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003103
在0℃下，向6-(4-(2-(2-(2-(2-(N,N-二叔丁氧基羰基-氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-N-(2-氯苄基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(280mg，0.38mmol)的二氧杂环己烷(5mL)溶液中添加HCl(g)/二氧杂环己烷(2mL)，然后将反应在25℃下搅拌2小时。真空去除溶剂。将残余物溶解于NMP(5mL)中。在25℃下，向上述混合物中添加2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-4-氟异吲哚啉-1,3-二酮(334.6mg，1.16mmol)和DIPEA(245mg，1.9mmol)。将反应微波照射至150℃并保持20分钟。然后将其冷却至室温并通过添加水(20mL)淬灭。用DCM(50mL x 3)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，得到粗产物，并将其通过制备型HPLC再次纯化，得到标题化合物4-((2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(28mg，9.2％收率)。
1HNMR(400MHz,CDCl3)：δ11.38(br,1H),10.29(s,1H),8.34(s,1H),7.49－7.53(m,3H),7.39－7.44(m,2H),7.22－7.24(m,2H),7.05(d,J＝7.2Hz,1H),6.95(d,J＝8.4Hz,1H),6.88(d,J＝8.8Hz,2H),6.47(s,1H),6.39－6.42(m,1H),4.95－4.98(m,3H),4.12(t,J＝5.2Hz,2H),3.85(t,J＝5.2Hz,2H),3.67－3.73(m,10H),3.42－3.46(m,2H),2.65－2.91(m,3H),2.09－2.15(m,2H)。
实施例14的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003111
合成方案：
Figure BDA0002176933830003121
1.步骤至2.步骤–从4-氯-6-(4-甲氧基苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶开始合成4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯酚，使用与Kaspersen,S.等人在Bioorganic Chemistry 2012,44,35-41中描述的那些类似的工序。
3.步骤–2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003122
向4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯酚(500mg，1.16mmol)的DMF(10mL)溶液中添加2-(2-(2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(515mg，1.5mmol)和K2CO3(480mg，3.48mmol)。将该溶液在80℃下搅拌20小时。用EtOAc(20mL×3)萃取混合物。用盐水洗涤合并的有机层。将有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱(PE/EA＝1/1)纯化残余物，得到呈黄色固体的标题化合物2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(320mg)。
4.步骤和5.步骤–(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003131
按照如上文关于实施例1所述，将2-(2-(2-(2-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯转化为最终化合物(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯氧基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺。
实施例17的合成
5-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮
合成方案：
Figure BDA0002176933830003141
1.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003142
在25℃下，向2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-羟基异吲哚啉-1,3-二酮(500mg，1.82mmol)的DMF(10mL)溶液中添加K2CO3(756mg，5.47mmol)和2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基-苯磺酸酯(832mg，2.73mmol)。将所得溶液在70℃下搅拌5小时。冷却至室温后，用H2O(10mL)淬灭反应，并用EtOAc(10mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，得到标题产物2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮(95mg，13％收率)。
2.步骤–2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙醛的合成
Figure BDA0002176933830003143
在25℃下，向2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮(95mg，0.23mmol)的CH3CN(5mL)溶液中添加IBX(130mg，0.46mmol)。将该反应在80℃下搅拌2小时。冷却至室温后，通过硅藻土过滤混合物，并浓缩滤液，得到标题产物2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙醛(90mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
3.步骤–5-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003151
在10℃下，向2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙醛(90mg，0.15mmol)和N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(79.2mg，0.18mmol)的DMSO/MeOH(2mL/2mL)溶液中添加NaBH3CN(47.9mg，0.76mmol)。将所得混合物在15℃下搅拌0.5小时。用H2O(10mL)淬灭该混合物，并用EtOAc(10mL x 2)萃取该混合物。将合并的有机层用盐水(10mL x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱和制备型HPLC纯化残余物，得到标题化合物5-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(21mg，11％收率)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ12.09(s,1H),11.14(s,1H),8.06-8.11(m,2H),7.74-7.85(m,3H),7.30-7.46(m,8H),7.01(s,1H),5.13(d,J＝7.6Hz,1H),4.79(d,J＝4.4Hz,2H),4.43(s,2H),3.79(s,2H),3.38-3.59(m,10H),2.06-2.62(m,10H),1.91(s,2H)。
实施例18的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-20-((4-((3-氯-4-氟苯基)氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)氧基)-4-氧代-6,9,12,15,18-五氧杂-3-氮杂二十烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003152
反应方案–第1部分
Figure BDA0002176933830003161
实验细节
1.步骤–5-羟基-4-甲氧基-2-硝基苯甲酸的合成
在3L圆底烧瓶中置入4,5-二甲氧基-2-硝基苯甲酸甲酯(45g，186.57mmol，1.00当量)在水(800mL)和DME(200mL)中的溶液、氢氧化钾(72g，1.28mol，7.00当量)。将所得溶液回流1天。用2x200mL己烷洗涤所得混合物。用氯化氢(6mol/L)将溶液的pH值调节至5。过滤收集固体。真空浓缩所得混合物。这得到40g的5-羟基-4-甲氧基-2-硝基苯甲酸，呈黄色固体。LC-MS：(ES,m/z):214[M+H]+保留时间：0.217分钟
2.步骤–2-氨基-5-羟基-4-甲氧基苯甲酸的合成
Figure BDA0002176933830003163
在1L圆底烧瓶中置入5-羟基-4-甲氧基-2-硝基苯甲酸(41.2g，193.30mmol，1.00当量)、10％钯碳(5g，0.10当量)、甲醇(500mL)。将H2引入反应混合物中。在H2气氛下，将所得溶液在室温下搅拌过夜。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到21.3g(60％)的2-氨基-5-羟基-4-甲氧基苯甲酸，呈黄色固体。LC-MS：(ES,m/z):184[M+H]+保留时间：0.356分钟
3.步骤–7-甲氧基喹唑啉-4,6-二醇的合成
Figure BDA0002176933830003164
在500mL圆底烧瓶中置入2-氨基-5-羟基-4-甲氧基苯甲酸(21.3g，116.29mmol，1.00当量)的MeO(CH2)2OH(200mL)溶液和甲基亚氦酸酰胺单乙酸酯(12.6g，122.33mmol，1.10当量)。将所得溶液在140℃下搅拌30分钟。真空浓缩所得混合物。这得到20g(89％)的7-甲氧基喹唑啉-4,6-二醇，呈黑色固体。
LC-MS：(ES,m/z):193[M+H]+保留时间：0.959分钟
4.步骤–4-羟基-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯的合成
Figure BDA0002176933830003171
在500mL圆底烧瓶中置入7-甲氧基喹唑啉-4,6-二醇(12g，62.44mmol，1.00当量)、Ac2O(200mL)、吡啶(20mL)。将所得溶液在100℃下搅拌3小时。真空浓缩所得混合物。将残余物通过与MeOH/DCM(1:100-1:10)合并闪蒸进行纯化。这得到8.5g(58％)的4-羟基-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯，呈棕色固体。LC-MS：(ES,m/z):235[M+H]+保留时间：1.251分钟
5.步骤–4-氯-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯的合成
Figure BDA0002176933830003172
在250mL圆底烧瓶中置入4-羟基-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯(8.5g，36.29mmol，1.00当量)、亚硫酰氯(100mL)、N,N-二甲基甲酰胺(1mL)。将所得溶液在85℃下搅拌1.5小时。将所得溶液真空蒸发，用3x100mL乙酸乙酯萃取，合并有机层并在烘箱中减压干燥，然后真空浓缩。将残余物通过与MeOH/DCM(1:100-1:10)合并闪蒸进行纯化。这得到9.1g(99％)的4-氯-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯，呈棕色固体。LC-MS：(ES,m/z):253[M+H]+保留时间：0.744分钟
6.步骤–4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯的合成
在500mL圆底烧瓶中置入4-氯-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯(9.1g，36.02mmol，1.00当量)、3-氯-4-氟苯胺(5.23g，35.93mmol，1.00当量)的丙-2-醇(200mL)溶液。将所得溶液回流3小时。将反应混合物冷却至室温。过滤收集固体。这得到10.1g(78％)的4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯，呈棕色固体。LC-MS：(ES,m/z):362[M+H]+保留时间：0.681分钟
7.步骤–4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-醇的合成
Figure BDA0002176933830003181
在500mL圆底烧瓶中置入4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基乙酸酯(10.1g，27.92mmol，1.00当量)的甲醇(200mL)溶液、NaOH(4g，100.01mmol，5.00当量)的水(20mL)溶液。将所得溶液在室温下搅拌过夜。用氯化氢(1mol/L)将溶液的pH值调节至5。过滤收集固体。这得到7.5g(84％)的4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-醇，呈棕色固体。LC-MS：(ES,m/z):320[M+H]+保留时间：0.904分钟
1H-NMR:(DMSO,ppm)：δ＝11.15-11.12(s,1H),10.59-10.51(s,1H),9.88-9.82(s,1H),8.25-7.99(m,2H),7.86-7.69(m,1H),7.58-7.47(m,1H),7.37-7.33(s,1H),4.06-3.99(s,3H)。
反应方案–第2部分
Figure BDA0002176933830003191
实验细节
8.步骤–17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯的合成
Figure BDA0002176933830003192
在500mL3颈圆底烧瓶中置入二氯甲烷(150mL)、3,6,9,12-四氧杂十四烷-1,14-二醇(18g，75.54mmol，2.00当量)、BF3-Et2O(1mL)。然后在0℃下，在1小时内一边搅拌一边逐滴添加2-二氮烯基乙酸乙酯(4.3g，37.03mmol，1.00当量)。将所得溶液在25℃下搅拌2小时。然后通过添加200mL水来淬灭反应。用150mL二氯甲烷萃取所得溶液，合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(50:1)的硅胶柱上。这得到1.5g的17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯，呈白色油状物。LC-MS：(ES,m/z):325[M+H]+保留时间：1.285分钟
9.步骤–17-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯的合成
Figure BDA0002176933830003201
在100mL圆底烧瓶中置入17-羟基-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯(3.2g，9.87mmol，1.00当量)、二氯甲烷(50mL)、三乙胺(1.52g，15.02mmol，1.50当量)、4-二甲基氨基吡啶(183mg，1.50mmol，0.10当量)。然后分批添加TsCl(2.09g，10.96mmol，1.10当量)。将所得溶液在25℃下搅拌过夜。然后通过添加20mL水来淬灭反应。用2x30mL二氯甲烷萃取所得溶液，并且将有机层合并、在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(40:1)的硅胶柱上。这得到1g(21％)的17-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯，呈浅黄色油状物。LC-MS：(ES,m/z):479[M+H]+保留时间：1.480分钟
10.步骤–1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸乙酯的合成
Figure BDA0002176933830003202
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-醇(100mg，0.31mmol，1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(10mL)、碳酸钾(86.4mg，0.63mmol，2.00当量)、17-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸乙酯(224mg，0.47mmol，1.50当量)。将所得溶液在80℃下搅拌过夜。然后通过添加10mL水来淬灭反应。用2x10mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并、在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:1)的硅胶柱上。这得到157mg(80％)的1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸乙酯，呈浅黄色油状物。LC-MS：(ES,m/z):626[M+H]+保留时间：1.279分钟
11.步骤–1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸的合成
Figure BDA0002176933830003211
在50mL圆底烧瓶中置入1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸乙酯(158mg，0.25mmol，1.00当量)的甲醇(10mL)溶液、氢氧化钠(50.3mg，1.26mmol，5.00当量)的水(1mL)溶液。将所得溶液在25℃下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。用氯化氢(1mol/L)将溶液的pH值调节至5。过滤收集固体。这得到67mg(44％)的1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸，呈白色固体。LC-MS：(ES,m/z):598[M+H]+保留时间：1.192分钟
12.步骤–(2S,4R)-4-(叔丁氧基)-1-[(2S)-2-(1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
在50mL圆底烧瓶中置入1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酸(67mg，0.11mmol，1.00当量)的N,N-二甲基甲酰胺(3mL)溶液、DIEA(28.4mg，0.22mmol，2.00当量)、HATU(55.4mg，0.15mmol，1.30当量)、(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-(叔丁氧基)-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(54.5mg，0.11mmol，1.00当量)。将所得溶液在25℃下搅拌过夜。然后通过添加20mL水来淬灭反应。用2x50mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并、在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(20:1)的硅胶柱上。这得到84mg(70％)的(2S,4R)-4-(叔丁氧基)-1-[(2S)-2-(1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺，呈浅黄色固体。LC-MS：(ES,m/z):1066[M+H]+保留时间：1.409分钟
13.步骤–(2S,4R)-1-[(2S)-2-(1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003221
在25mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-(叔丁氧基)-1-[(2S)-2-(1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(81mg，0.08mmol，1.00当量)的二氯甲烷(5mL)溶液。然后在0℃下，一边搅拌一边逐滴添加CF3COOH(0.5mL)。将所得溶液在25℃下搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。通过制备型HPLC纯化粗产物，条件如下(Prep-HPLC-043)：色谱柱，XBridge Prep C18 OBD色谱柱，30*50mm 5um13nm；流动相，含0.05％TFA的水和MeCN(在8分钟内，35.0％MeCN升至65.0％)；检测器，Waters 2489 254和220nm。这得到20mg(23％)的(2S,4R)-1-[(2S)-2-(1-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]-1,4,7,10,13,16-六氧杂十八烷-18-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺；三氟乙酸，呈白色固体。LC-MS：(ES,m/z):1010[M+H]+保留时间：3.344分钟
1H-NMR:(CD3OD,ppm)：δ＝8.89(s,1H),8.46(s,1H),8.02-7.99(dd,J＝4.0Hz,5.6Hz,1H),7.75(s,1H),7.69-7.65(m,1H),7.41-7.18(m,6H),4.87(s,1H),4.68-4.49(m,3H),4.36-4.31(m,3H),4.10(m,9H),3.80-3.73(m,3H),3.68-3.60(m,13H),3.30(s,3H),.2.47-2.21(m,1H),2.11-2.07(m,1H),1.56-1.54(m,1H),1.29(s,1H),1.02-1.00(t,J＝8.8Hz,9H)。
实施例39的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(2-((5-((4-((3-氯-4-氟苯基)氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)氧基)戊基)氧基)乙氧基)丙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
合成方案：
Figure BDA0002176933830003231
1.步骤–5-(苄氧基)戊-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003232
在1000mL圆底烧瓶中置入戊烷-1,5-二醇(30g，288.05mmol，1.00当量)、四氢呋喃(500mL)。然后分数批添加氢化钠(13.8g，575.00mmol，2.00当量)。将该混合物在25℃下搅拌1小时。一边搅拌，一边向其中逐滴添加BnBr(58g，339.12mmol，1.20当量)。将所得溶液在25℃下搅拌过夜。然后通过添加50mL水来淬灭反应。用3x500mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并，再在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:5)洗脱的硅胶柱上。这得到28g(50％)的5-(苄氧基)戊-1-醇，呈无色油状物。
LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝195；保留时间：1.01分钟；
1H NMR(300MHz,CDCl3,25℃)：7.35(s,5H),4.52(s,2H),3.65(t,2H),3.51(t,2H),1.69-1.40(m,6H)。
2.步骤–2-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)噁烷的合成
Figure BDA0002176933830003233
在100mL圆底烧瓶中置入5-(苄氧基)戊-1-醇(3g，15.44mmol，1.00当量)、50％氢氧化钠溶液(20mL)、2-(2-溴乙氧基)噁烷(12.8g，61.22mmol，4.00当量)、Bu4NHSO4(0.5g，0.10当量)。将所得溶液在65℃下搅拌12小时。冷却反应混合物。用20mL水和20mL盐水洗涤所得混合物。将该混合物在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到4g(80％)的2-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)噁烷，呈红色油状物。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝323；保留时间：1.25分钟。
3.步骤–2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003241
在100mL圆底烧瓶中置入2-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)噁烷(4g，12.41mmol，1.00当量)、甲醇(40mL)、氯化氢(2mL)。将所得溶液在50℃下搅拌过夜。冷却反应混合物。用水和盐水洗涤所得混合物。将该混合物在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:2)洗脱的硅胶柱上。这得到3g(100％)的2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙-1-醇，呈无色油状物。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝239；保留时间：1.12分钟。
4.步骤–2-(3-溴丙氧基)噁烷的合成
Figure BDA0002176933830003242
在250mL圆底烧瓶中置入3-溴丙-1-醇(4.75g，34.17mmol，1.00当量)、二氯甲烷(100mL)、PPT(10mg，0.04mmol，0.10当量)、3,4-二氢-2H-吡喃(3.32g，39.47mmol，1.16当量)。将所得溶液在室温下搅拌5小时。将该混合物在无水硫酸镁上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:5)洗脱的硅胶柱上。这得到5g(66％)的2-(3-溴丙氧基)噁烷，呈无色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3,25℃)：4.62(t,1H),3.95-3.85(m,2H),3.59-3.48(m,4H),2.18-2.10(m,2H),1.90-1.45(m,6H)。
5.步骤–2-[3-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)丙氧基]噁烷的合成
在50mL圆底烧瓶中置入2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙-1-醇(150mg，0.63mmol，1.00当量)、2mL 50％NaOH溶液、4当量的2-(3-溴丙氧基)噁烷和催化量的Bu4NHSO4(0.1当量)。将所得溶液在65℃下搅拌过夜。冷却反应混合物。用3x50mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并、在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:2)洗脱的硅胶柱上。这得到200mg(84％)的2-[3-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)丙氧基]噁烷，呈无色油状物。LC-MS m/z：(ES+)+＝403；保留时间：1.53分钟；1H NMR(300MHz,CDCl3,25℃)：7.35(s,5H),4.62(t,1H),4.52(s,2H),3.95-3.85(m,4H),3.59-3.48(m,10H),1.90-1.45(m,14H)。
6.步骤–5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003251
在50mL圆底烧瓶中置入2-[3-(2-[[5-(苄氧基)戊基]氧基]乙氧基)丙氧基]噁烷(80mg，0.21mmol，1.00当量)、甲醇(5mL)、钯碳(200mg，0.20当量)。向该混合物中引入H2(g)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到64mg(粗制物)5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊-1-醇，呈无色油状物。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝291；保留时间：1.32分钟；1H NMR(300MHz,CDCl3,25℃)：4.62(t,1H),3.98-3.79(m,2H),3.65-3.47(m,8H),1.90-1.45(m,14H)。
7.步骤–5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊基-4-甲基苯-1-磺酸酯的合成
Figure BDA0002176933830003252
在50mL圆底烧瓶中置入5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊-1-醇(60mg，0.21mmol，1.00当量)、二氯甲烷(2mL)、三乙胺(47mg，0.46mmol，3.00当量)、TsCl(30mg，0.16mmol，1.50当量)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。用水和盐水洗涤所得混合物。将该混合物在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到90mg(98％)的5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊基-4-甲基苯-1-磺酸酯，呈无色油状物。LC-MSm/z：(ES+)[M+H]+＝445，保留时间：1.25分钟。
8.步骤–3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003253
在50mL圆底烧瓶中置入5-[2-[3-(噁烷-2-基氧基)丙氧基]乙氧基]戊基-4-甲基苯-1-磺酸酯(90mg，0.20mmol，1.00当量)、甲醇(2mL)、氯化氢(0.5mL)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。用3x20mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并，再在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到45mg(62％)的3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙-1-醇，呈无色油状物。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝291；保留时间：0.93分钟；1H NMR(400MHz,CDCl3,25℃)：7.83(d,2H),7.35(d,2H),4.05(t,2H),3.80(t,2H),3.70(t,2H),3.64(d,2H),3.58(d,2H),3.45(t,2H),2.92(brs,1H),2.47(s,3H),1.91-1.82(m,2H),1.73-1.65(m,2H),1.58-1.52(m,2H),1.45-1.35(m,2H)。
9.步骤–3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙酸的合成
Figure BDA0002176933830003261
在50mL圆底烧瓶中置入3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙-1-醇(100mg，0.28mmol，1.00当量)、丙酮(2mL)。在冰浴下向其中添加CrO3(55mg，2.00当量)、硫酸(0.1mL)、水(0.6mL)。将所得溶液在5-10℃下搅拌2小时。然后，通过添加异丙醇来淬灭该反应。用2x10mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且将有机层合并，再在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到90mg(87％)的3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙酸，呈无色油状物。
LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝375；保留时间：0.92分钟。
10.步骤–(2S,4R)-1-[(2S)-3,3-二甲基-2-(3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)-磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙酰胺基)丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003262
在50mL圆底烧瓶中置入3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙酸(112mg，0.30mmol，1.00当量)、(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，0.21mmol，1.00当量)、HATU(137mg，0.36mmol，1.50当量)、N,N-二甲基甲酰胺(2mL)、DIEA(124mg，0.96mmol，4.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。用2x10mL乙酸乙酯萃取所得溶液，并且合并有机层。用4x5mL水洗涤所得混合物。将该混合物在无水硫酸钠上干燥。滤出固体。真空浓缩所得混合物。这得到110mg(47％)的(2S,4R)-1-[(2S)-3,3-二甲基-2-(3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)-磺酰基]氧基]戊基)氧基]乙氧基]丙酰胺基)丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺，呈无色油状物。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝787；保留时间：1.03分钟。
11.步骤–(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(2-[[5-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]氧基)戊基]氧基]乙氧基)丙酰胺基]-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003271
在50mL圆底烧瓶中置入4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-醇(45mg，0.14mmol，1.00当量)、(2S,4R)-1-[(2S)-3,3-二甲基-2-(3-[2-[(5-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]-戊基)氧基]乙氧基]丙酰胺基)丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(110mg，0.14mmol，1.00当量)、碳酸钾(58mg，0.42mmol，3.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(2mL)。将所得溶液在80℃下搅拌4小时。滤出固体。通过制备型HPLC纯化粗产物，条件如下：XBridge Prep C18 OBD色谱柱，19x 100mm，5微米；流动相，含0.1％TFA的水和MeCN(在10分钟内25.0％MeCN升至45.0％)；检测器，UV 254nm。HPLC纯化得到16.3mg(12％)的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(2-[[5-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-甲氧基喹唑啉-6-基]氧基)戊基]氧基]乙氧基)丙酰胺基]-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺，呈白色固体。LC-MS m/z：(ES+)[M+H]+＝934；保留时间：1.97分钟；1H NMR(300MHz,CD3OD,25℃)：8.89(s,1H),8.45(s,1H),7.95-8.05(d,1H),7.65-7.74(m,2H),7.36-7.49(m,3H),7.17-7.31(m,2H),4.68-4.34(m,5H),4.15-4.23(m,2H),4.02(s,3H),3.91-3.72(m,4H),3.62(s,4H),3.52-3.54(m,2H),2.58-2.45(m,4H),2.25-1.52(m,8H),1.05(s,9H)。
实施例41的合成
(2S,4R)-1-((S,E)-2-(叔丁基)-16-((4-((4-氯-3-氟苯基)氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)氨基)-12-甲基-4,16-二氧代-6,9-二氧杂-3,12-二氮杂十六烷-14-酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003272
反应方案第1部分
1.步骤–(E)-4-溴丁-2-烯酸的合成
在N2下，向(E)-丁-2-烯酸(20g，0.23mol)的CCl4溶液中添加NBS(43g，0.24mol)和过氧化苯甲酰(5.6g，0.023mol)。然后，将该混合物在80℃下搅拌3小时。TLC分析显示(E)-丁-2-烯酸完全消耗。将其冷却至室温。通过硅藻土过滤该混合物，并真空浓缩滤液。经由柱(PE:EA＝5:1)纯化残余物，得到呈黄白色固体的所需产物(E)-4-溴丁-2-烯酸(10g，26％收率)。1H-NMR(400MHz,CDCl3)：δ7.01-7.09(m,1H),5.98(d,J＝15.2Hz,1H),3.96(d,J＝7.2Hz,2H)。
2.步骤–(E)-4-溴丁-2-烯酰氯的合成
在冰浴中向化合物(E)-4-溴丁-2-烯酸(5.2g，0.03mol)的DCM溶液中逐滴添加SOCl2(10mL，0.16mol)。然后，将该混合物在室温下搅拌过夜。真空去除溶剂，得到呈黄色油状物的所需产物(E)-4-溴丁-2-烯酰氯，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。
3.步骤–N-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基-6-硝基喹唑啉-4-胺的合成
Figure BDA0002176933830003284
在室温下，向N-(3-氯-4-氟苯基)-7-氟-6-硝基喹唑啉-4-胺(15g，44.56mmol)的MeOH 150mL溶液中添加50％KOH(5g，89mmol)。将该反应混合物在70℃下搅拌2小时。然后将其冷却至室温并用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，并在Na2SO4上干燥。真空浓缩有机相，得到N-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基-6-硝基喹唑啉-4-胺(20g，96.7％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ10.16(s,1H),9.21(s,1H),8.67(s,1H),8.15(dd,J＝2.4,6.8Hz,1H),7.79-7.81(m,1H),7.48(t,J＝7.2Hz,2H),4.07(s,3H)。
4.步骤–N4-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基喹唑啉-4,6-二胺的合成
Figure BDA0002176933830003291
在室温下，向N-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基-6-硝基喹唑啉-4-胺(10g，28.6mmol)在乙醇(200mL)、THF(100mL)、H2O(50mL)和NH4Cl饱和溶液(50mL)的混合物中的溶液中添加铁粉(6.5g，116mmol)。然后，将该混合物加热至80℃并保持3小时。通过硅藻土过滤该混合物，并用乙醇洗涤滤饼。向滤液中添加水(100mL)，形成黄白色固体。过滤固体并干燥，得到呈黄色固体的所需化合物N4-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基喹唑啉-4,6-二胺(8g，88％收率)。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ9.41(s,1H),8.38(s,1H),8.20－8.17(m,1H),7.82－7.80(m,1H),7.41－7.37(m,2H),5.36(s,2H),3.97(s,3H)。
5.步骤–(E)-4-溴-N-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)丁-2-烯酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003292
在0℃下，向N4-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基喹唑啉-4,6-二胺(10g，31.4mmol)的THF溶液中添加(E)-4-溴丁-2-烯酰氯(8.6g，47.1mmol)和TEA(8g，78.4mmol)。然后将该混合物在室温下搅拌2小时。用水淬灭反应混合物。用EA萃取该混合物。用NaHCO3溶液和盐水洗涤合并的有机层。将有机相在Na2SO4上干燥并浓缩，得到呈棕色固体的所需化合物(E)-4-溴-N-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)丁-2-烯酰胺(7.6g，52％收率)。1H-NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.95(s,1H),8.65(s,1H),8.25(s,1H),7.93－7.91(m,1H),7.72(s,1H),7.54－7.51(m,1H),7.14－7.10(m,1H),6.56－6.48(m,2H),4.06(s,3H),3.46(d,J＝6.8Hz,2H)。LCMS：465[M+H]；tR＝1.38
合成方案第2部分：
Figure BDA0002176933830003301
步骤6–2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003302
在0℃下，向2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(2.0g，9.08mmol)、三乙胺(3.2g，31.78mmol)和4-二甲基氨基吡啶(111mg，0.91mmol)在无水二氯甲烷(20ml)中的搅拌溶液中逐滴添加4-甲苯磺酰氯(1.9g，3.12mmol)的无水二氯甲烷(10ml)溶液。然后，使所得混合物加温至室温，并在室温下搅拌10小时。TLC显示所需产物的形成。将反应混合物用二氯甲烷(250ml)稀释，用水(50ml x 3)和盐水(50ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用20-30％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈无色油状物的2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.7g，50％收率)。LC_MS：(ES+):m/z397.10[M+Na+]。tR＝2.799分钟。
步骤7–(E)-2-(2-(2-((4-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基氨基)-4-氧代丁-2-烯基)(甲基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003311
将2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(250mg，0.67mmol)在甲胺甲醇溶液(30％，5ml)中的混合物在室温下搅拌5小时。TLC显示所需产物的形成。减压去除挥发物；将残余物在二氯甲烷(120ml)和水(30ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(30ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩。将残余物重新溶解于无水N-甲基-2-吡咯烷酮(3ml)中，然后在室温下依次添加N,N-二异丙基乙胺(30mg，0.23mmol)和(E)-4-溴-N-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基)丁-2-烯酰胺(100mg，0.21mmol)。将所得混合物在室温下搅拌5小时。TLC显示所需产物的形成。将反应混合物在乙酸乙酯(150ml)和水(40ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(30ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC纯化，得到呈黄色油状物的(E)-2-(2-(2-((4-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基氨基)-4-氧代丁-2-烯基)(甲基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(60mg，收率45％)。LC_MS：(ES+):m/z 618.30[M+H+]。tR＝1.696分钟。
步骤8–(2S,4R)-1-((S,E)-17-(4-(4-氯-3-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基氨基)-2,2,13-三甲基-5,17-二氧代-7,10-二氧杂-4,13-二氮杂十七烷-15-烯羰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003312
将(E)-2-(2-(2-((4-(4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基氨基)-4-氧代丁-2-烯基)(甲基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(60mg，0.097mmol)在2,2,2-三氟乙酸(1ml)和无水二氯甲烷(1ml)中的混合物在室温下搅拌2小时。TLC显示所需产物的形成。减压蒸发挥发物；将残余物重新溶解于无水N,N-二甲基甲酰胺(2ml)中，然后在0℃下依次添加(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(46mg，0.098mmol)、N,N-二异丙基乙胺(51mg，0.388mmol)和HATU(2-(7-氮杂-1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸酯)(74mg，0.194mmol)。使所得混合物加温至室温并在室温下搅拌20分钟，LC-MS显示所需产物的形成。将反应混合物在乙酸乙酯(150ml)和水(30ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC纯化，得到呈浅黄色固体的(2S,4R)-1-((S,E)-17-(4-(4-氯-3-氟苯基氨基)-7-甲氧基喹唑啉-6-基氨基)-2,2,13-三甲基-5,17-二氧代-7,10-二氧杂-4,13-二氮杂十七烷-15-烯羰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(26.9mg，收率28％)。LC_MS：(ES+):m/z 974.20[M+H+]。tR＝1.630分钟。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ1.04,1.06(two singles,9H),2.06-2.11(m,1H),2.25-2.30(m,1H),2.44(s,3H),2.83,2.85(two singles,3H),3.77-4.16(m,15H),4.42-4.63(m,4H),4.76-4.81(m,1H),6.76(d,J＝15.2Hz,1H),7.04-7.08(m,1H),7.24-7.28(m,2H),7.36-7.40(m,4H),7.67-7.68(m,1H),7.99(br,1H),8.37(br,1H),8.49(s,1H),8.85(s,1H),8.93(s,1H)。
实施例59的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(6-(2-((4-((3-氯-4-氟苯基)氨基)-6-((E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基)喹唑啉-7-基)氧基)乙氧基)己酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003321
反应方案
Figure BDA0002176933830003331
实验细节
1.步骤–4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-硝基喹唑啉-7-醇的合成
Figure BDA0002176933830003341
在250mL圆底烧瓶中置入N-(3-氯-4-氟苯基)-7-氟-6-硝基喹唑啉-4-胺(5.0g，14.85mmol，1.00当量)的二氧杂环己烷/50％氢氧化钠(水溶液)(80/15mL)溶液。将所得溶液加热至回流2小时。冷却反应混合物。用水(1000mL)稀释所得溶液。用氯化氢(c)将溶液的pH值调节至3。用乙酸乙酯(500mL x 4)萃取所得溶液，再合并有机层。用盐水(500mL x 1)洗涤所得混合物。将混合物在无水硫酸钠上干燥，并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:2)的硅胶柱上。这得到1.92g(39％)的4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-硝基喹唑啉-7-醇，呈橙色固体。1H NMR(300MHz,DMSO)δ11.94-11.81(b,1H),10.17(s,1H),9.22(s,1H),8.60(s,1H),8.16-8.15(d,J＝4.5Hz,1H),7.81-7.78(d,J＝8.1Hz,1H),7.53-7.44(m,2H),7.26(s,1H)；LC-MS(ES+)：m/z 335.05[MH+]，tR＝0.95分钟(1.9分钟运行)。
2.步骤–6-氨基-4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]喹唑啉-7-醇的合成
Figure BDA0002176933830003342
在250mL圆底烧瓶中置入4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-硝基喹唑啉-7-醇(4.0g，11.95mmol，1.00当量)的四氢呋喃(100mL)溶液，并在氮气气氛下向该溶液中添加雷尼镍(2.0g)。真空去除氮气，在氢气气氛下引入氢气。将所得溶液在室温下搅拌2小时。滤出固体。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10:1)的硅胶柱上。这得到2.3g(63％)的6-氨基-4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]喹唑啉-7-醇，呈蓝绿色固体。1H NMR(300MHz,DMSO)δ10.80-10.50(b,1H),9.33(s,1H),8.37(s,1H),8.19-8.18(d,J＝4.5Hz,1H),7.81-7.78(d,J＝8.1Hz,1H),7.41-7.35(m,2H),7.00(s,1H),5.30-5.22(b,2H)；LC-MS(ES+)：m/z 305.20[MH+]，tR＝0.85分钟(1.9分钟运行)。
3.步骤–(2E)-N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-羟基喹唑啉-6-基]-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003351
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酸氯化氢(1.27g，9.83mmol，2.00当量)的乙腈(25mL)溶液。在室温下逐滴添加N,N-二甲基甲酰胺(3滴)(催化剂)和乙二酰氯(10mL)。将所得溶液在55℃下搅拌30分钟。真空浓缩该溶液。将该黑色油状物溶解于1-甲基-2-吡咯烷酮(10mL)中，并在0℃下，将其滴加到另一个用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中，该烧瓶中装有6-氨基-4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]喹唑啉-7-醇(1.5g，4.92mmol，1.00当量)的1-甲基-2-吡咯烷酮(40mL)溶液和碳酸氢钠(4.0g，37.74mmol，7.00当量)。在搅拌条件下，使所得溶液在室温下反应2小时。然后通过添加30mL水来淬灭反应。过滤去除固体。真空浓缩所得混合物。在90分钟内，将残余物施加到使用水/甲醇(10％-70％)的C18柱(330g)上。这得到2.03g(80％纯度)的(2E)-N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-羟基喹唑啉-6-基]-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺，呈棕色固体。LC-MS(ES+)：m/z 416.05[MH+]，tR＝1.05分钟(2.6分钟运行)。
4.步骤–6-(2-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]乙氧基)己酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003352
在100mL圆底烧瓶中置入6-(2-羟基乙氧基)己酸叔丁酯(500.0mg，2.15mmol，1.00当量)、三乙胺(653.0mg，6.45mmol，3.00当量)、4-甲基苯-1-磺酰氯(614.0mg，3.22mmol，1.50当量)、4-二甲基氨基吡啶(26mg，0.21mmol，0.10当量)、二氯甲烷(25mL)。将所得溶液在室温下搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:2)的硅胶柱上。这得到650.0mg(78％)的6-(2-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]乙氧基)己酸叔丁酯，呈无色油状物。
5.步骤–6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸叔丁酯的合成
在50mL圆底烧瓶中置入(2E)-N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-羟基喹唑啉-6-基]-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺(160.0mg，0.38mmol，1.00当量)的N,N-二甲基甲酰胺(15.0mL)、Cs2CO3(251.0mg，0.77mmol，2.00当量)、6-(2-[(4-甲基苯)磺酰基]氧基乙氧基)己酸叔丁酯(148.0mg，0.38mmol，1.00当量)。将所得溶液在80℃下搅拌3小时。然后，通过添加水(10mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x 2)萃取所得溶液，再合并有机层。用盐水(30mL x1)洗涤所得混合物。将混合物在无水硫酸钠上干燥，并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:2)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。这得到130.0mg(54％)的6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸叔丁酯，呈黄色油状物。LC-MS(ES+)：m/z 630.35[MH+]，tR＝1.33分钟(1.9分钟运行)。
6.步骤–6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸的合成
Figure BDA0002176933830003362
在50mL圆底烧瓶中置入6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸叔丁酯(130.0mg，0.21mmol，1.00当量)的二氯甲烷/三氟乙酸(10/3mL)溶液。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。这得到100.0mg(84％)的6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸，呈黄色油状物。LC-MS(ES+)：m/z574.15[MH+]，tR＝0.53分钟(1.9分钟运行)。
7.步骤–(2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酰胺基]-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003371
在50mL圆底烧瓶中置入6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酸(100.0mg，0.17mmol，1.00当量)的N,N-二甲基甲酰胺(10.0mL)溶液、N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(90.0mg，0.70mmol，4.00当量)。然后添加邻-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸酯(80.0mg，0.21mmol，1.20当量)。在室温下将其搅拌5分钟。向其中添加(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(98.0mg，0.21mmol，1.20当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后，通过添加水(20mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x 3)萃取所得溶液，再合并有机层。用盐水(10mLx 1)洗涤所得混合物。将固体在烘箱中减压干燥。通过制备型HPLC纯化粗产物，条件如下：色谱柱：X Bridge C18,19*150mm，5um；流动相A：水/10mmol/碳酸氢铵；流动相B：乙腈；流速：20mL/min；梯度：在8分钟内30％B升至65％B；254nm。这得到12.5mg(7％)的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[2-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)乙氧基]己酰胺基]-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺，呈黄色固体。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ8.92(s,1H),8.83(s,1H),8.45(s,1H),8.01-7.99(d,J＝8.4Hz,1H),7.70-7.60(m,1H),7.43-7.36(m,4H),7.25-7.19(m,2H),7.02-6.97(m,1H),6.50-6.45(d,J＝15.3Hz,1H),4.58(s,1H),4.52-4.47(m,3H),4.39-4.33(m,3H),3.93-3.92(m,2H),3.90-3.83(m,1H),3.82-3.70(m,1H),3.60-3.56(m,2H),3.20-3.18(m,2H),2.42(s,3H),2.29(s,6H),2.29-2.12(m,3H),2.10-2.00(m,1H),1.65-1.60(m,4H),1.38-1.29(m,2H),0.97(s,9H)；LC-MS(ES+)：m/z986.40[MH+]，tR＝0.82分钟(3.0分钟运行)。化学式：C50H61ClFN9O7S[985.41]
实施例66的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(6-(4-(4-((4-((3-氯-4-氟苯基)氨基)-6-((E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基)喹唑啉-7-基)氧基)丁氧基)丁氧基)己酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003381
合成方案：
Figure BDA0002176933830003382
1.步骤–6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003383
在25mL圆底烧瓶中置入(2E)-N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-羟基喹唑啉-6-基]-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺(200.0mg，0.48mmol，1.00当量)的N,N-二甲基甲酰胺(10mL)溶液、碳酸铯(314.0mg，0.96mmol，2.00当量)、6-(4-(4-(甲苯磺酰氧基)丁氧基)丁氧基)己酸叔丁酯(281.0mg，1.20当量)。将所得溶液在80℃下在油浴中搅拌12小时。然后，通过添加水(20mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(10mL x 3)萃取所得混合物，再合并有机层。用盐水(10mL)洗涤所得混合物。将混合物在无水硫酸钠上干燥，并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10:1)洗脱的硅胶柱上。这得到77.0mg(22％)的6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸叔丁酯，呈棕色固体。LC-MS(ES+)：m/z 730.31[M+H]+
.2.步骤–6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸的合成
Figure BDA0002176933830003384
在25mL圆底烧瓶中置入6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸叔丁酯(77.0mg，0.11mmol，1.00当量)的二氯甲烷/三氟乙酸(10/2mL)溶液。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。这得到71.0mg(100％)的6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸，呈棕色油状物。LC-MS(ES+)：m/z674.30[M+H]+
3.步骤–(2S,4R)-1-[(2S)-2-(6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003391
在冰浴下，在25mL圆底烧瓶中置入6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酸(71.0mg，0.11mmol，1.00当量)的N,N-二甲基甲酰胺(10mL)溶液、N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(68.0mg，0.53mmol，5.00当量)、邻-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸酯(52.0mg，0.14mmol，1.30当量)。将该混合物搅拌20分钟。在0℃下，向其中添加(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(64.0mg，1.30当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。用乙酸乙酯(10mL x 3)萃取所得溶液，再合并有机层。用盐水(10mL)洗涤后，将该混合物在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。在以下条件下，通过制备型HPLC纯化残余物：X Bridge RP18柱，19x 150mm，5微米；流动相A：水/0.05％碳酸氢铵；流动相B：乙腈；流速：20mL/min；梯度：在15分钟内38％B升至52％B；检测器：254nm。这得到27.0mg(24％)的(2S,4R)-1-[(2S)-2-(6-[4-[4-([4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-6-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基]喹唑啉-7-基]氧基)丁氧基]丁氧基]己酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺，呈白色固体。1H NMR(300MHz,CD3OD)：δ8.88(s,1H),8.49(s,1H),8.04-8.02(d,J＝6.9Hz,1H),7.75-7.65(m,1H),7.47-7.41(m,4H),7.38-7.26(m,2H),7.05-7.00(m,1H),6.55-6.50(d,J＝15.3Hz,1H),4.63(s,1H),4.56-4.49(m,3H),4.37-4.30(m,3H),3.92-3.78(m,2H),3.57-3.53(m,2H),3.47-3.46(m,2H),3.46-3.40(m,4H),3.24-3.21(m,2H),2.47(s,3H),2.32(s,6H),2.30-2.23(m,3H),2.08-2.01(m,3H),1.84-1.82(m,2H),1.61-1.52(m,8H),1.38-1.25(m,2H),1.00(s,9H)；LC-MS(ES+)：m/z544.25[(M+2H+)/2]。
实施例70的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003401
合成方案：
Figure BDA0002176933830003402
1.步骤–1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-醇的合成
Figure BDA0002176933830003403
在0℃下，向3,6,9,12-四氧杂十四烷-1,14-二醇(45g，234mmol)的DMF(100mL)溶液中添加NaH(60％，2.34g，58.5mmol)。在室温下搅拌1小时后，添加BnBr(10g，58.5mmol)，将该混合物加热至60℃并保持3小时。然后用水(100mL)淬灭反应混合物，并用EtOAc(2x200mL)萃取所得反应混合物。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过柱色谱(己烷:EtOAc 1:3)纯化残余物，得到所需产物1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-醇(15g，52.8mmol，90％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ7.27－7.34(m,5H),4.57(s,2H),3.59－3.73(m,16H)，化学式：C15H24O5；分子量：284.35
2.步骤–1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酸的合成
Figure BDA0002176933830003411
在0℃下，向1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-醇(6.3g，22.1mmol)在DCM(60mL)和H2O(30mL)中的溶液中添加PhI(OAc)2(21.3g，66.3mmol)和TEMPO(689mg，4.42mmol)。将该混合物在室温下搅拌3小时。将反应混合物用水(200mL)稀释并用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤，在MgSO4上干燥，并真空浓缩。通过柱色谱(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到所需产物1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酸(4.0g，13.4mmol，60.6％)。1HNMR(400MHz,CDCl3)：δ7.27－7.35(m,5H),4.57(s,2H),4.13(s,2H),3.63－3.75(m,12H)。化学式：C15H22O6；分子量：298.34
3.步骤–N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003412
在室温下，向1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酸(1.05g，3.53mmol)、N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺(1.05g，2.94mmol，J.Med.Chem.2015,58,8877-8895)、Et3N(742mg，7.35mmol)和HOBt(595mg，4.41)的DCM(60mL)溶液中添加EDCI(842mg，4.41mol)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。然后用水(20mL)稀释反应混合物，并用DCM(2x50mL)萃取所得反应混合物。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过柱色谱(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到所需化合物N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酰胺(1.4g，2.19mmol，74.8％)。LC-MS：(ES+):m/z 638.3[M+H]。tR＝3.46分钟。化学式：C33H47N7O6；分子量：637.78
4.步骤–1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(12-苯基-2,5,8,11-四氧杂十二烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830003421
在150℃下，将N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酰胺(1.4g，2.19mmol)的HOAc(5mL)溶液用微波照射6小时。真空去除溶剂，得到粗制的所需产物1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(12-苯基-2,5,8,11-四氧杂十二烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(1.4g，粗制物)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。LC-MS：(ES+):m/z 620.3[M+H]。tR＝3.24分钟。化学式：C33H45N7O5；分子量：619.77。
5.步骤–2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003422
向1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(12-苯基-2,5,8,11-四氧杂十二烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(1.2g，粗制物)在甲醇(50mL)中的搅拌溶液中添加Pd(OH)2/C(10％，0.5g)和催化剂浓HCl(0.1mL)。在H21atm下，将该混合物搅拌2小时。通过硅藻土垫过滤混合物，并浓缩滤液。用DCM溶解残余物，并且将该混合物用NaHCO3水溶液、盐水洗涤并用Na2SO4干燥。真空去除溶剂，得到所需化合物2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(1.0g，粗制物)。LC-MS：(ES+):m/z 530.3[M+H]。tR＝2.59分钟。化学式：C26H39N7O5；分子量：529.64
6.步骤–5-氨基-4-(5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003431
在0℃和N2下，向2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(265mg，0.50mmol)、PPh3(655mg，2.5mmol)和5-氨基-4-(5-羟基-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(175mg，0.50mmol)的无水THF(10mL)中逐滴添加DIAD(505mg，2.5mmol)。将该混合物在室温下搅拌1小时。然后将反应混合物用水(50mL)稀释并用DCM萃取。将有机相用盐水洗涤，在MgSO4上干燥，并浓缩。通过色谱(硅胶，DCM:MeOH(50:1，v:v))纯化残余物，得到所需化合物5-氨基-4-(5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(90mg，粗制物)。化学式：C43H57N9O10；分子量：859.98
7.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003432
向5-氨基-4-(5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(80mg，0.093mmol)的CH3CN(5mL)溶液中添加TsOH(62mg，0.36mmol)。将该溶液在80℃下搅拌3小时。然后将其冷却至室温并用NaHCO3水溶液淬灭。用DCM溶解该混合物。用水(10mL×2)和盐水(10mL)洗涤有机相。将有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱(DCM/MeOH＝20/1)纯化残余物，得到2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(2-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮(12mg，0.015mmol，16％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ12.59(s,1H),8.65－8.71(m,3H),8.12(s,1H),7.72(d,J＝8.0Hz,1H),7.32(s,1H),7.17(d,J＝8.0Hz,1H),6.60(s,1H),5.30－5.31(m,1H),4.94－4.96(m,2H),4.24(s,2H),3.87－4.03(m,2H),3.72－3.85(m,4H),3.60－3.82(m,10H),3.39(s,3H),2.71－2.92(m,3H),2.09－2.11(m,1H),1.86－2.00(m,2H),1.75－1.86(m,2H),1.66－1.68(m,6H)。LC-MS：(ES+):m/z 786.2[M+H]。tR＝3.10分钟。化学式：C39H47N9O9；分子量：785.86
实施例71的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003441
反应方案–第1部分：
Figure BDA0002176933830003442
实验部分：
N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺按照J.Med.Chem.2015,58,8877-8895中所述进行合成。
Figure BDA0002176933830003443
1H NMR(400MHz,MeOD)：δ8.56(s,1H),8.06(d,J＝5.6Hz,1H),7.36(s,1H),6.50(s,1H),6.13(d,J＝5.6Hz,1H),4.08–4.13(m,2H),3.80–3.83(m,1H),3.41–3.53(m,3H),3.40(s,3H),1.94–1.99(m,2H),1.55–1.60(m,2H),1.34(d,J＝6.4Hz,6H)。化学式：C18H27N7O；分子量：357.46LC-MS：(ES+):m/z 358.2[M+H+]。tR＝2.61分钟。
反应方案–第2部分：
Figure BDA0002176933830003451
1.步骤–4-(2-(2-羟基乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯的合成
Figure BDA0002176933830003452
向2-(2-羟基乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(2.7g，10.4mmol)和哌嗪-1-羧酸苄酯(2.3g，10.4mmol)的DMF(10mL)溶液中添加K2CO3(2.86g，20.8mmol)。将该溶液在80℃下搅拌过夜。用乙酸乙酯(50mL×2)萃取混合物。用水(10mL)和盐水(8mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4)，过滤并减压浓缩，得到粗制物4-(2-(2-羟基乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(4.5g)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。
2.步骤–2-(2-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003453
向4-(2-(2-羟基乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(3.5g，11.4mmol)和(二乙酰氧基碘)苯(11.0g，34.2mmol)在DCM(70mL)和水(35ml)中的溶液中添加TEMPO(350mg，2.2mmol)。将该溶液在室温下搅拌4小时。将该混合物用饱和Na2S2O3淬灭并搅拌20分钟。用DCM(50mL×2)萃取该混合物。用水(10mL)和盐水(8mL)洗涤合并的有机相。将有机相干燥N(Na2SO4)，过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物，得到2-(2-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸(300mg，0.93mmol，8.2％收率)。
3.步骤–4-(2-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯的合成
Figure BDA0002176933830003461
向2-(2-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸(300mg，0.93mmol)和N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺(365mg，1.02mmol)[J.Med.Chem.2015,58,8877-8895]的DCM(15mL)溶液中添加EDCI(231mg，1.2mmol)、HOBt(162mg，1.2mmol)和Et3N(151mg，1.5mmol)。将该溶液在室温下搅拌过夜，然后用DCM(50mL)稀释。用水(10ml)和盐水(8ml)洗涤该混合物。将有机层干燥N(Na2SO4)，过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物，得到4-(2-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(380mg，0.57mmol，61.3％收率)。化学式：C34H47N9O5；分子量：661.81LC-MS：(ES+):m/z 662.3[M+H+]。tR＝2.74分钟
4.步骤–4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯的合成
Figure BDA0002176933830003462
在氮气气氛下，将4-(2-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基-2-氧代乙氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(380mg，0.57mmol)的CH3COOH(8mL)溶液在150℃下用微波照射6小时。减压浓缩混合物，得到粗制物4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(400mg)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。化学式：C34H45N9O4；分子量：643.79LC-MS：(ES+):m/z 645.3[M+H+]。tR＝2.75分钟。
5.步骤–1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-((2-(哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830003463
向粗制物4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(150mg，粗制物)的甲醇(12mL)溶液中添加Pd(OH)2(10％，70mg)和浓HCl(0.01mL)。在H2气氛下，将该混合物搅拌2小时。通过硅藻土过滤该混合物，并减压浓缩滤液，得到粗制物1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-((2-(哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(120mg)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。LC-MS：(ES+):m/z 510.3[M+H]+。tR＝2.31分钟。化学式：C26H39N9O2；分子量：509.66
6.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003471
向1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-((2-(哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(110mg，0.21mmol)和2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-氟异吲哚啉-1,3-二酮(80mg，0.65mmol)的NMP(8mL)溶液中添加DIPEA(140mg，0.11mmol)。在氮气气氛下，将该溶液在150℃下用微波照射15分钟。减压浓缩该混合物。通过硅胶柱色谱纯化残余物，得到粗制的所需产物，并将其通过制备型TLC进一步纯化，得到2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪1-基)异吲哚啉-1,3-二酮(20mg，0.026mmol，12.4％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO)：δ11.06(s,1H),9.77(s,1H),8.64(s,1H),8.45(s,1H),7.97(d,J＝6.4Hz,1H),7.67(d,J＝8.4Hz,1H),7.33(s,1H),7.22(d,J＝8.4Hz,1H),6.42(d,J＝6.0Hz,1H),5.05–5.09(m,1H),4.90–4.93(m,1H),4.79(s,2H),4.21–4.24(m,1H),3.65(s,2H),3.30–3.50(m,11H),2.82–2.92(m,1H),2.51–2.55(m,7H),2.00–2.09(m,1H),1.85–1.95(m,2H),1.60(d,J＝6.8Hz,6H),1.44–1.46(m,2H)。化学式：C39H47N11O6；分子量：765.88LC-MS：(ES+):m/z 766.3[M+H]+。tR＝2.67分钟
实施例76的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003481
合成方案：
实验部分：
1.步骤–2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
向2-(苄氧基)乙醇(10.0g，0.07mol)的DCM(150mL)溶液中添加2-溴乙酸叔丁酯(51.0g，0.26mol)、TBACl(18.4g，0.07mol)和37％NaOH(15mL)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。用水(200mL)淬灭反应后，用DCM(2x 200mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压去除溶剂。通过柱色谱(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到呈无色油状物的所需产物2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.5g，5.60mmol，9％)。
化学式：C15H22O4；分子量：266.33
2.步骤–2-(2-羟基乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003491
向产物2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.50g，5.60mmol)的MeOH(10mL)溶液中添加Pd(OH)2/C(20％，0.50g)。在H2 1atm下，将该混合物在室温下搅拌4小时。将反应混合物过滤并真空浓缩，得到呈无色油状物的所需产物2-(2-羟基乙氧基)乙酸叔丁酯(1.65g，粗制物)。化学式：C8H16O4；分子量：176.21
3.步骤–2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003492
在0℃下，向2-(2-羟基乙氧基)乙酸叔丁酯(1g，5.68mmol)的DCM溶液和Et3N(1.15g，11.36mmol)中添加MsCl(0.98g，8.52mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后用20mL水稀释反应混合物，并用DCM(2x50mL)萃取所得反应混合物。将合并的有机层用盐水(1x 100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压去除溶剂，得到呈无色油状物的所需产物2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.46g，5.75mmol，粗制物)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ4.44(t,J＝4.4Hz,2H),4.05(s,2H),3.85(t,J＝4.4Hz,2H),3.12(s,3H),1.50(s,9H)。化学式：C9H18O6S；分子量：254.30
4.步骤–2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003493
将2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.46g，5.68mmol)、1-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪(1.62g，7.38mmol)和K2CO3(3.14g，22.70mmol)在DMF(10mL)中的混合物加热至80℃并保持过夜。冷却至室温后，用水(20mL)淬灭反应，并用DCM(2x 50mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压去除溶剂，得到呈无色油状物的所需化合物2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.0g，2.65mmol，粗制物)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ7.35-7.28(m,5H),4.55(s,2H),4.00(s,2H),3.68(t,J＝5.6Hz,2H),3.61(t,J＝5.6Hz,2H),2.65-2.58(m,12H),1.50(s,9H)。化学式：C21H34N2O4；分子量：378.51
5.步骤–2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003501
将2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1g，2.65mmol)的HCl/二氧杂环己烷(4.0M，5mL)溶液在室温下搅拌3小时。减压去除溶剂，得到呈无色油状物的所需化合物2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸(0.97g，3.01mmol，粗制物)。
化学式：C17H26N2O4；分子量：322.40
6.步骤–2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003502
向2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙酸(0.97g，3.01mmol)、N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺[J.Med.Chem.2015,58,8877-8895](0.9g，2.50mmol)和DIPEA(0.65g，5.01mmol)的DCM(60mL)溶液中添加HATU(1.9g，5.01mmol)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。用水(20mL)淬灭反应混合物，并用DCM(2x50mL)萃取该混合物。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过柱色谱(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到呈红色固体的所需化合物2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)乙酰胺(0.63g，0.95mmol，粗制物)。
7.步骤–2-((2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830003503
将2-(2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)乙酰胺(0.63g，0.95mmol)的AcOH(5mL)溶液用微波照射至150℃并保持6小时。冷却至室温后，真空去除溶剂，得到呈红色油状物的所需产物2-((2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(1.0g，1.56mmol，粗制物)。LC-MS：(ES+):m/z644.4[M+H]。tR＝2.749分钟。化学式：C35H49N9O3；分子量：643.82
8.步骤–2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙醇的合成
Figure BDA0002176933830003511
在室温下，向2-((2-(4-(2-(苄氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)甲基)-1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(1g，1.56mmol)的甲醇(20mL)溶液中添加Pd(OH)2/C(20％，0.50g)和浓HCl(0.1ml)。在H2 1atm下，将该混合物搅拌2小时。过滤反应混合物，真空浓缩滤液，得到呈红色油状物的所需产物2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙醇(0.31g，0.56mmol，粗制物)。LC-MS：(ES+):m/z 554.3[M+H]。tR＝2.342分钟。化学式：C28H43N9O3；分子量：553.70
9.步骤–5-氨基-4-(5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003512
在0℃和N2下，向2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙醇(55mg，0.10mmol)、PPh3(131mg，0.51mmol)和5-氨基-4-(5-羟基-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(70mg，0.21mmol)的无水THF(5mL)溶液中逐滴添加DIAD(101mg，0.51mmol)。将该混合物在室温下搅拌1小时。用水(50mL)淬灭所得溶液，并用DCM(20mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层在MgSO4上干燥，并真空浓缩。通过色谱(硅胶，DCM/MeOH＝1/1)纯化残余物，得到呈黄色固体的所需产物5-氨基-4-(5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(90mg，0.10mmol，粗制物)。化学式：C45H61N11O8；分子量：884.03
10.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003521
在室温下，向5-氨基-4-(5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)-5-氧代戊酸叔丁酯(90mg，0.10mmol)的CH3CN(10mL)溶液中添加TsOH(172mg，1.01mmol)。将所得溶液在80℃下搅拌3小时。冷却至0℃后，用NaHCO3,水溶液淬灭反应，并用DCM(10mL x 3)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱(DCM/MeOH＝20/1)纯化残余物，得到呈白色固体的2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮(14mg，0.02mmol，17％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.73(br,1H),8.71(s,1H),8.47(s,1H),8.04(d,J＝5.6Hz,1H),7.78(d,J＝8.4Hz,1H),7.66(s,1H),7.35(s,1H),7.20-7.18(m,1H),6.06(d,J＝5.6Hz,1H),4.97-4.93(m,2H),4.79(s,2H),4.39-4.36(m,2H),4.21-4.19(m,2H),3.64-3.61(m,2H),3.50-3.48(m,3H),3.41(s,3H),2.88-2.82(m,5H),2.61-2.52(m,10H),2.14-2.11(m,1H),2.09-1.96(m,2H),1.67-1.65(m,8H)。LC-MS：(ES+):m/z 811.3[M+H]。tR＝2.639分钟。化学式：C41H51N11O7；分子量：809.91
实施例78的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003531
合成方案–第1部分：
2-(4-甲氧基哌啶-4-基)乙-1-醇的合成，遵循Monatshefte fuer Chemie,2004,135(7),899–909中描述的途径
实验部分：
1.步骤–6-溴-N4-异丙基吡啶-3,4-二胺的合成
Figure BDA0002176933830003533
向2-溴-N-异丙基-5-硝基吡啶-4-胺(1g，3.85mmol)的乙醇(30mL)溶液中添加NH4Cl溶液(0.57g，在10mL水中，105.6mmol)和Fe粉(645mg，11.55mmol)。将所得反应在70℃下搅拌3小时。冷却至室温后，通过硅藻土过滤该混合物，并真空浓缩滤液。将残余物溶解于饱和碳酸氢钠溶液中，并用乙酸乙酯(20mL x 3)萃取水相。将合并的有机层在硫酸钠上干燥并浓缩，得到所需化合物6-溴-N4-异丙基吡啶-3,4-二胺(920mg，92％)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ7.62(s,1H),6.57(s,1H),4.19(br,1H),3.59-3.64(m,1H),3.00(br,2H),1.26(d,J＝6.4Hz,6H)。化学式：C8H12BrN3；分子量：230.11
2.步骤–6-溴-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶的合成
在室温下，将6-溴-N4-异丙基吡啶-3,4-二胺(900mg，3.913mmol)、CH3COOH(235mg，3.913mmol)、EDCI(897mg，4.696mmol)、HOBt(634mg，4.696mmol)和Et3N(593mg，5.870mmol)的DCM(15mL)溶液搅拌过夜。用水(10mL)淬灭反应后，用DCM(20mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层干燥(Na2SO4)，过滤并减压浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，得到所需的乙酰胺中间产物(1.1g，粗制物，100％)。
将乙酰胺中间产物(1.0g，3.67mmol)的CH3COOH(10mL)溶液用微波照射至150℃并保持6小时。冷却至室温后，真空去除溶剂，得到粗制的所需产物6-溴-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶(475mg，48％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.70(s,1H),7.57(s,1H),4.62-4.65(m,1H),2.64(s,3H),1.63(d,J＝6.8Hz,6H)。化学式：C10H12BrN3；分子量：254.13
3.步骤–N-(2-氯嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830003542
将6-溴-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶(467mg，1.85mmol)、2-氯嘧啶-4-胺(266mg，2.04mmol)、Pd2(dba)3(213mg，0.37mmol)、xantphos(429mg，0.74mmol)和Cs2CO3(1.8g，5.55mmol)在二氧杂环己烷(10mL)中的混合物在装有沙浴的密封管中加热至100℃并保持过夜。冷却至室温后，通过硅藻土过滤该混合物，并用EtOAc洗涤滤饼。真空浓缩滤液。通过制备型HPLC纯化残余物，得到所需产物N-(2-氯嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(150mg，27％)。
1H NMR(400MHz,DMSO)：δ8.57(s,1H),8.25(d,J＝5.6Hz,1H),8.12(br s,1H),7.48(br s,1H),4.71-4.75(m,1H),2.58(s,3H),1.58(d,J＝7.2Hz,6H)。
化学式：C14H15ClN6；分子量：302.77
4.步骤–2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003551
在N2下，将N-(2-氯嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(103mg，0.341mmol)、2-(4-甲氧基哌啶-4-基)乙-1-醇(49mg，0.31mmol)、Et3N(157mg，1.55mmol)的异丙醇溶液用微波照射150℃并保持20分钟。通过硅藻土过滤该混合物，并真空浓缩滤液。通过色谱柱(PE/EA＝10/1至EA)纯化残余物，得到呈白色固体的所需产物2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙-1-醇(66mg，50％)。
1H NMR(400MHz,MeOD)：δ8.52(s,1H),8.37(s,1H),7.91(d,J＝6.0Hz,1H),6.36(d,J＝6.0Hz,1H),4.33(d,J＝13.2Hz,2H),3.67(t,J＝7.2Hz,2H),3.30-3.35(m,3H),3.26(s,3H),2.64(s,3H),1.89-1.92(d,J＝13.2Hz,2H),1.82(t,J＝7.2Hz,2H),1.67(d,J＝6.8Hz,6H),1.61-1.64(m,2H)。
化学式：C22H31N7O2；分子量：425.54
LC-MS(ES+)：m/z 426.3[MH+]；tR＝2.51分钟
合成方案–第2部分
5.步骤–2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙醛的合成
向2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙-1-醇(180mg，0.391mmol)的DCM(10mL)溶液中添加Dess-Martin高价碘化物(332mg，0.782mmol)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。将所得溶液过滤并蒸发，得到所需产物2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙醛(75mg，粗制物)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。
6.步骤–4-(2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成，遵循实施例307中所述的还原胺化工序。
Figure BDA0002176933830003562
7.步骤–1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基-4-(2-(哌嗪-1-基)乙基)哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成，使用HCl的甲醇溶液裂解BOC保护基团。粗产物无需进一步纯化即可使用。
Figure BDA0002176933830003563
8.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成，遵循实施例71中所述的SNAr反应条件。
Figure BDA0002176933830003564
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)：δ:11.08(s,1H),9.69(s,1H),8.50(s,1H),8.40(s,1H),7.95(d,J＝5.6Hz,1H),7.67(d,J＝7.2Hz,1H),7.33(s,1H),7.25(d,J＝7.2Hz,1H),6.39(d,J＝4.0Hz,1H),5.04-5.09(m,1H),4.71(t,J＝6.4Hz,1H),4.34(d,J＝12.4Hz,2H),3.42(s,4H),3.21-3.24(m,3H),3.15(s,3H),3.31(s,3H),2.55(s,3H),2.37(s,3H),1.98-2.02(m,2H),1.71-1.78(m,4H),1.51(s,6H)。
LCMS：m/e＝375.8＝[M+2H]2+，tR＝2.60分钟。
化学式：C39H47N11O5；分子量：749.9
实施例80的合成
Figure BDA0002176933830003571
(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
合成方案–第1部分
Figure BDA0002176933830003572
实验：
1.步骤–2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙腈的合成
Figure BDA0002176933830003573
将2-(苄氧基)-5-氟苯甲醛(80g，347mmol)在氨溶液(7.0M的甲醇溶液，500ml)中的混合物在0℃下搅拌0.5小时，然后在相同温度下逐滴添加三甲基氰硅烷(37.2g，375mmol)。将所得反应混合物在45℃下搅拌3小时。TLC显示反应完成。减压蒸发挥发物，得到呈黄色油状物的2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙腈(粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤–2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙酸甲酯盐酸盐的合成
Figure BDA0002176933830003581
在0℃下，将亚硫酰氯(60ml)逐滴添加到甲醇(400ml)中，并在相同温度下将所得反应混合物搅拌10分钟，得到氯化氢在甲醇中的粗溶液。将氯化氢的甲醇(400ml)溶液和2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙腈(粗制物，347mmol)的混合物在65℃下搅拌过夜。TLC显示反应完成。减压去除挥发物。将残余物溶解于甲醇(50ml)中，并添加乙酸乙酯(500ml)。将所得混合物在室温下搅拌0.5小时，沉淀出白色固体。过滤收集固体并真空干燥，得到呈白色固体的2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙酸甲酯盐酸盐(82g，2步收率：72％)。LC_MS：(ES+):m/z 290.2[M+H]+。tR＝1.852分钟。1H NMR(400Hz,CD3OD)：δ3.73(s,3H),5.22-5.24(m,2H),5.35(s,1H),7.19-7.26(m,3H),7.36-7.48(m,5H)。化学式：C16H17ClFNO3；分子量：289.30；
3.步骤–2-碘-6-甲基苯甲酸的合成
在氮气气氛下，将2-甲基苯甲酸(10.0g，73.5mmol)、N-碘代琥珀酰亚胺(16.0g，73.5mmol)和二乙酸钯(1.6g，7.35mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(160ml)中的混合物在100℃下搅拌2小时。TLC显示反应完成。使反应混合物冷却至室温，并在乙酸乙酯(300ml)和水(500ml)之间分配。收集有机层，并用乙酸乙酯(100ml x2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到呈黄色固体的2-碘-6-甲基苯甲酸(16g，收率84％)，将其直接用于下一步骤，无需进一步纯化。1H NMR(400Hz,CDCl3)：δ2.29(s,3H),7.06(t,J＝8.0Hz,1H),7.27(d,J＝7.6Hz,1H),7.67(d,J＝8.0Hz,1H)。化学式：C8H7IO2；分子量：262.04；
4.步骤–2-碘-6-甲基苯甲酸甲酯的合成
将2-碘-6-甲基苯甲酸(5.6g，21.4mmol)、碘甲烷(2.5ml，40.1mmol)和碳酸钾(5.0g，35.9mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(40ml)中的混合物在室温下搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(50ml)之间分配。收集有机层，并用乙酸乙酯(100ml x2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(200ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速色谱(用5％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈白色固体的2-碘-6-甲基苯甲酸甲酯(3.8g，收率63％)。LC_MS：(ES+):m/z 277.0[M+H]+。tR＝2.863分钟。1H NMR(400Hz,CDCl3)：δ2.35(s,3H),3.97(s,3H),7.01(t,J＝8.0Hz,1H),7.20(d,J＝7.6Hz,1H),7.67(d,J＝8.0Hz,1H)。化学式：C9H9IO2；分子量：276.07；
5.步骤–2-(溴甲基)-6-碘苯甲酸甲酯的合成
将5-碘-2-甲基苯甲酸甲酯(3.8g，13.7mmol)、AIBN(2,2’-二甲基-2,2’-偶氮二丙腈)(1g，6.16mmol)和N-溴代琥珀酰亚胺(2.9g，16.5mmol)在四氯化碳(40ml)中的混合物回流过夜。TLC显示反应完成。将冷却的反应混合物在二氯甲烷(30ml)和水(20ml)之间分配。收集有机层，并用二氯甲烷(30ml x2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速色谱(用5％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈白色固体的2-(溴甲基)-6-碘苯甲酸甲酯(2.4g，收率50％)。1H NMR(400Hz,CDCl3)：δ3.99(s,3H),4.78(s,2H),7.09(t,J＝8.0Hz,1H),7.40(d,J＝7.6Hz,1H),7.80(d,J＝8.0Hz,1H)。化学式：C9H8BrIO2；分子量：354.97；
6.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-碘-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯的合成
在氮气气氛下，将2-氨基-2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)乙酸甲酯(1.2g，4.1mmol)、2-(溴甲基)-6-碘苯甲酸甲酯(1.5g，4.1mmol)和三乙胺(0.9ml，6.2mmol)在甲苯(10mL)中的混合物在110℃下搅拌过夜。TLC显示反应完成。将冷却的反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(30ml)之间分配。收集有机层，并用乙酸乙酯(30ml x 2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(30ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速色谱(用10％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈白色固体的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-碘-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(1.3g，收率：59％)。LC_MS：(ES+):m/z532.1[M+H]+。tR＝3.137分钟。1H NMR(400Hz,CD3OD)：δ3.62(s,3H),3.86(d,J＝17.2Hz,1H),4.58(d,J＝16.2Hz,1H),5.04-5.15(m,2H),6.43(s,1H),6.93-6.97(m,1H),7.00-7.05(m,1H),7.06-7.09(m,1H),7.19(t,J＝7.6Hz,1H),7.27-7.39(m,6H),7.89(d,J＝7.6Hz,1H)。化学式：C24H19FINO4；分子量：531.31；另请参见实施例307的密切相关的合成。
合成方案–第2部分：
Figure BDA0002176933830003601
7.步骤–4-(戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
向戊-4-炔-1-基4-甲基苯磺酸酯(2.88mg，12.09mmol)、N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(3.12g，24.17mmol)和碘化钾(201mg，1.21mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(30ml)中的搅拌溶液中添加哌嗪-1-羧酸叔丁酯(2.25mg，12.09mmol)，并在氮气下，将该混合物在50℃下搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(50ml)之间分配，将有机层用盐水(50ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用20-40％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈黄色油状物的4-(戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(1.7g，收率56％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ1.46(s,9H),1.68-1.75(m,2H),1.95(t,J＝2.6Hz,1H),2.22-2.26(m,2H),2.38(t,J＝4.8Hz,4H),2.42-2.46(m,2H),3.42(t,J＝5.0Hz,4H)。化学式：C14H24N2O2；分子量：252.35；
8.步骤–4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003611
在室温和氮气气氛下，向2-(5-(苄氧基)-2-氟苯基)-2-(7-碘-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(468mg，0.78mmol)、1-甲基-4-(戊-4-炔-1-基)哌嗪(296mg，1.17mmol)和三乙胺(474mg，4.68mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(8ml)溶液中添加碘化亚铜(30mg，0.16mmol)和[1,1’-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯(II)(109mg，0.16mmol)；将该混合物用氮气脱气三次。将所得混合物回流2小时。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(30ml)和水(20ml)之间分配；收集有机层，并用乙酸乙酯(20ml x 2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(40ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用5-10％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)进行纯化，得到呈黑色固体的4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(348mg，收率62％)。LC_MS：(ES+):m/z 724.3[M+H]+。tR＝2.483分钟。化学式：C40H42FN5O5S；分子量：723.86；
9.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(5-(哌嗪-1-基)戊-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺TFA盐的合成
Figure BDA0002176933830003612
在0℃下，向4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(348mg，0.48mmol)的二氯甲烷(3ml)溶液中添加的2,2,2-三氟乙酸(2mL)，将该混合物溶液在该温度下搅拌2小时。TLC显示反应完成。减压蒸发挥发物，得到呈黄色油状物的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(5-(哌嗪-1-基)戊-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺TFA盐(粗制物)。LC_MS：(ES+):m/z 624.3[M+H]+。tR＝1.958分钟。化学式：C35H34FN5O3S；分子量：623.74；
10.步骤–(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003621
向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(5-(哌嗪-1-基)戊-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(粗制物，<＝0.48mmol)、N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(124mg，0.96mmol)和碘化钾(8mg，0.05mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(3ml)中的搅拌溶液中添加(2S,4R)-1-((S)-2-(2-氯乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(250mg，0.48mmol)，并在氮气下，将该混合物在50℃下搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(20mL)和水(20mL)之间分配，将有机层用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用2-10％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色油状物的(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，收率17％)。LC_MS：(ES+):m/z 1108.4[M+H]+。tR＝2.458分钟。化学式：C60H66FN9O7S2；分子量：1108.35；
11.步骤–(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(2-氟-5-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003622
在-40℃和氮气下，向(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，0.08mmol)在无水二氯甲烷(5ml)中的搅拌溶液中逐滴添加三溴化硼(102mg，0.41mmol)的二氯甲烷(1ml)溶液。将该混合物溶液在该温度下搅拌2小时。TLC显示反应完成。在-60℃下用水(3ml)淬灭反应混合物，添加碳酸氢钠水溶液至pH7-8。用二氯甲烷(20ml)稀释该混合物，将有机层用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)戊-4-炔-1-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(5.6mg，两步收率13％)。LC_MS：(ES+):m/z 1018.4[M+H]+。tR＝2.402分钟。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ0.96(s,9H),1.34-1.36(m,3H),1.45-1.51(m,1H),1.74-1.83(m,1H),1.96-2.06(m,2H),2.11-2.21(m,2H),2.44-2.45(m,3H),3.00-3.16(m,6H),3.61-3.62(m,1H),3.67-3.73(m,2H),3.81-3.98(m,4H),4.23-4.29(m,1H),4.42-4.46(m,1H),4.52-4.65(m,2H),4.88-4.93(m,1H),5.14(s,1H),6.32(s,1H),6.84-6.87(m,1H),6.99-7.02(m,1H),7.13(s,2H),7.26(s,2H),7.36-7.42(m,4H),7.47-7.49(m,1H),7.52-7.54(m,1H),7.59-7.61(m,1H),7.66-7.70(m,1H),7.81-7.83(m,1H),8.18(s,1H),8.39-8.40(m,1H),8.98(s,1H),10.13(s,1H),12.64(s,1H)。化学式：C53H60FN9O7S2；分子量：1018.23；
实施例81的合成
(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003631
合成方案：
Figure BDA0002176933830003641
实验部分：
1.步骤–N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003642
在10℃下，向N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺[J.Med.Chem.2015,58,8877-8895](580mg，1.62mmol)的DCM(10mL)溶液中添加1-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-酸(689.7mg，1.78mmol，参见实施例70)、TEA(328.4mg，3.25mmol)、EDCI(465.8mg，2.43mmol)和HOBt(328.4mg，2.43mmol)。将所得溶液在20℃下搅拌16小时。用H2O(40mL)溶液稀释反应，并用DCM(20mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱纯化残余物，得到所需产物N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-酰胺(480mg，41％收率)。化学式：C37H55N7O8；分子量：725.87
2.步骤–1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(18-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十八烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830003643
在120℃下，将N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)-1-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-酰胺(480mg，0.66mmol)的CH3COOH(5mL)溶液用微波照射10小时。冷却至室温后，真空去除溶剂，得到粗制的所需产物1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(18-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十八烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(900mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。化学式：C37H53N7O7；分子量：707.86
3.步骤–1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-醇的合成
Figure BDA0002176933830003651
在15℃下，向1-异丙基-N-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)-2-(18-苯基-2,5,8,11,14,17-六氧杂十八烷基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(900mg，粗制物)的MeOH(50mL)溶液中添加Pd(OH)2/C(180mg)。在H2 1atm下，将该混合物在15℃下搅拌2小时。然后通过硅藻土过滤该混合物，并浓缩滤液，得到所需产物1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-醇(350mg，粗制物)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。化学式：C30H47N7O7；分子量：617.74
4.步骤–1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-酸的合成
Figure BDA0002176933830003652
在0℃和N2 1atm下，向1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-醇(130mg，粗制物)的DMF(5mL)溶液中添加Jones试剂(2.0mL)。将该混合物在15℃下搅拌2小时。然后通过硅藻土过滤该混合物，并浓缩滤液，得到所需产物1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-酸(210mg粗制物)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。化学式：C30H45N7O8；分子量：631.72
5.步骤–(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
在15℃下，向1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-酸(210mg粗制物，约0.25mmol)和(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(110mg，0.25mmol)的DMF(15mL)溶液中添加DIPEA(85mg，0.66mmol)和HATU(251mg，0.66mmol)。在15℃下搅拌16小时后，用H2O(30mL)稀释该反应混合物。用DCM(20mL x 2)萃取所得混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱和制备型HPLC纯化残余物，得到呈白色固体的所需产物(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(4.3mg)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ:8.77(s,1H),8.60(s,1H),8.45(s,1H),8.24(br.s,1H),7.77(d,J＝4.0Hz,1H),7.52(d,J＝12.0Hz,1H),7.28-7.33(m,4H),4.88-4.94(m,3H),4.76(d,J＝12.0Hz,1H),4.56-4.59(m,1H),4.47(s,1H),3.91-4.00(m,2H),3.51-3.66(m,20H),3.31(s,3H),2.37(s,3H),2.09-2.16(m,2H),1.86-1.89(m,3H),1.60(s,1H),1.58(s,1H),1.39(d,J＝8.0Hz,3H),0.93(s,9H)。LCMS：m/e＝529.8[M+2H]2+，tR＝3.35分钟。化学式：C53H75N11O10S；分子量：1058.3
实施例82的合成
2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺
Figure BDA0002176933830003671
合成方案：
Figure BDA0002176933830003672
实验：
1.步骤–2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙醇的合成
Figure BDA0002176933830003673
在室温下，向叔丁醇钾(38ml，38mmol，1M的四氢呋喃溶液)的四氢呋喃(100ml)溶液中缓慢添加2,2’-(乙烷-1,2-二基双(氧))二乙醇(10.6g，100mmol)，并将该反应混合物在室温下搅拌30分钟。使该反应混合物冷却至0℃，然后逐滴添加3-溴丙-1-炔(3.6g，30mmol)的四氢呋喃(25ml)溶液，并且使所得反应混合物加温至室温并搅拌过夜。TLC显示反应完成。在0℃下用水(50ml)淬灭反应混合物，并用乙酸乙酯(100ml x 2)萃取。将合并的有机层用盐水(50ml x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到残余物，将其通过硅胶快速色谱(用30％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)纯化，得到呈无色油状物的2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙醇(4g，收率70％)。1H NMR(400Hz,CDCl3)：δ2.44(d,J＝2.0Hz,1H),2.56-2.86(m,1H),3.60-3.63(m,2H),3.66-3.75(m,10H),4.21(d,J＝2.4Hz,2H)。化学式：C9H16O4；分子量：188.22；
2.步骤–2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯的合成
Figure BDA0002176933830003681
在0℃下，向2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙醇(1.0g，5.3mmol)、三乙胺(1.5ml，10mmol)在二氯甲烷(10ml)中的搅拌溶液中添加甲苯磺酰氯(1.1g，5.8mmol)和4-二甲基氨基吡啶(64mg，0.53mmol)。使所得溶液加温至室温并搅拌2小时。TLC显示反应完成。将该混合物倒入水(20mL)中，并用二氯甲烷(20mL x 2)进行萃取。将合并的有机层用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用30％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)纯化，得到呈无色油状物的2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(1g，收率55％)。
3.步骤–N,N-双-Boc 2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-胺的合成
Figure BDA0002176933830003682
在90℃和氮气气氛下，将亚氨基二羧酸二叔丁酯(0.7g，3.2mmol)、2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(1.0g，2.9mmol)和碳酸铯(1.15g，3.5mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的混合物搅拌过夜。TLC显示反应完成。将该混合物在乙酸乙酯(30ml)和水(30ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速色谱(用25％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色油状物的N,N-双-Boc 2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-胺(550mg，收率48％)。1H NMR(400Hz,CDCl3)：δ1.50(s,18H),2.42(d,J＝2.0Hz,1H),2.59-3.62(m,6H),3.65-3.71(m,4H),3.79(t,J＝6.0Hz,2H),4.20(d,J＝2.4Hz,2H)。化学式：C19H33NO7；分子量：387.47；
4.步骤–2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙胺的合成
Figure BDA0002176933830003683
将N,N-双-Boc 2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-胺(220mg，0.56mmol)和2,2,2-三氟乙酸(3ml)在二氯甲烷(5mL)中的混合物在室温下搅拌1小时。TLC显示反应完成。减压蒸发挥发物。将残余物溶解于乙酸乙酯(10ml)中，并用碳酸氢钠水溶液(饱和，10ml)洗涤。将有机层收集，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到残余物，将其通过硅胶快速色谱(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色油状物的2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙胺(120mg，收率85％)。
5.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-((2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003691
在90℃和氮气下，将2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙胺(120mg，0.31mmol)、2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-氟异吲哚啉-1,3-二酮(86mg，0.31mmol)和N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(0.09ml，0.5mmol)在1-甲基吡咯烷-2-酮(2ml)中的混合物搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(30ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(30ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速色谱(用50％乙酸乙酯的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色固体的2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-((2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮(55mg，收率20％)。LC_MS：(ES+):m/z 444.2[M+H]+。tR＝2.135分钟。
6.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003692
在室温和氮气气氛下，向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-碘-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(61mg，0.10mmol)、2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-((2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基)异吲哚啉-1,3-二酮(46mg，0.10mmol)和三乙胺(61mg，0.6mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2mL)溶液中添加碘化亚铜(4mg，0.02mmol)和[1,1’-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯(II)(14mg，0.02mmol)；将该混合物用氮气脱气三次。将所得混合物回流2小时。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(20ml)和水(10ml)之间分配。将有机层用盐水(10ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色固体的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(25mg，收率：22％)。LC_MS：(ES+):m/z 915.3[M+H]+。tR＝2.840分钟。
7.步骤–2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003701
在-60℃和氮气下，向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(25mg，0.027mmol)在无水二氯甲烷(5ml)中的搅拌溶液中逐滴添加三溴化硼(67mg，0.27mmol的无水二氯甲烷(1ml))。将该混合物溶液在-60℃下搅拌2小时。TLC显示反应完成。在-60℃下用水(3ml)淬灭反应混合物，添加碳酸氢钠水溶液至pH7-8。用二氯甲烷(20ml)稀释该混合物，将有机层用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC(用10％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈黄色固体的2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(6.5mg，收率28％)。LC_MS：(ES+):m/z 825.5[M+H]+。tR＝2.580分钟。1H NMR(400Hz,DMSO-d6)：δ1.41-1.47(m,1H)1.92-2.00(m,4H),2.33(s,1H),2.58-2.68(m,1H),2.83-2.91(m,1H),3.55-3.58(m,6H),3.66-3.76(m,2H),3.91(d,J＝17.6Hz,1H),4.43(s,2H),4.56(d,J＝18.0Hz,1H),5.00-5.05(m,1H),5.31-5.33(m,1H),6.27(s,1H),6.83-6.92(m,2H),6.99(s,1H),7.10-7.41(m,4H),7.47-7.58(m,4H),9.97(s,1H),11.06(s,1H),12.60(s,1H)。化学式：C41H37FN6O10S；分子量：824.83；
实施例85的合成
(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830003711
合成方案
Figure BDA0002176933830003721
实验部分：
1.步骤–2,2’-((哌嗪-1,4-二基双(丙烷-3,1-二基))双(氧基))二乙酸二叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003722
向哌嗪(86mg，1.0mmol)的CH3CN(10mL)溶液中添加2-(3-氯丙氧基)乙酸叔丁酯(628mg，3.0mmol)、DBU(456mg，3.0mmol)和KI(33mg，0.2mmol)。将该混合物在100℃下搅拌过夜。将该混合物冷却至室温后，将其用水(10mL)淬灭，并用乙酸乙酯(10mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(3mL)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，并真空浓缩。通过使用乙酸乙酯/石油醚(1:1)作为洗脱剂的硅胶柱色谱纯化残余物，得到呈无色油状物的所需产物2,2’-((哌嗪-1,4-二基双(丙烷-3,1-二基))双(氧基))二乙酸二叔丁酯(200mg，46.5％收率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ3.94(s,4H),3.56(t,J＝6.4Hz,4H),2.42-2.47(m,12H),1.79-1.83(m,4H),1.48(s,18H)。化学式：C22H42N2O6；分子量：430.59
2.步骤–2-(3-(4-(3-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003723
在室温下，向2-2’-((哌嗪-1,4-二基双(丙烷-3,1-二基))双(氧基))二乙酸二叔丁酯(1.5g，4.01mmol)在MeOH(30mL)和水(10mL)中的溶液中添加NaOH(160mg，4.01mmol)。将所得混合物在室温下搅拌过夜。用2N HCl将pH调节至6，并用DCM(30ml x 2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩，得到呈无色油状物的粗化合物2-(3-(4-(3-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸(1.0g)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。化学式：C18H34N2O6；分子量：374.48
3.步骤–2-(3-(4-(3-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830003731
向2-(3-(4-(3-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸(53mg，0.14mmol)、N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺(50mg，0.14mmol)和DIPEA(72mg，0.56mmol)的DMF(5mL)溶液中添加HATU(106mg，0.28mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后用10mL水稀释反应混合物，并用DCM(2x30mL)萃取所得反应混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过柱色谱(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到粗制的所需化合物2-(3-(4-(3-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸叔丁酯，呈无色油状物(50mg，0.07mmol，50.1％)。LC-MS：(ES+):m/z 714.3[M+H]。tR＝2.98分钟。化学式：C36H59N9O6；分子量：713.92
4.步骤–2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003732
将2-(3-(4-(3-(2-((4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)氨基)-2-氧代乙氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸叔丁酯(200mg，0.28mmol)的HOAc(5mL)溶液在微波下加热至150℃并保持6小时。然后将其真空浓缩，得到粗制的所需产物2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸(200mg，粗制物)。LC-MS：(ES+):m/z 640.3[M+H]。tR＝2.37分钟。化学式：C32H49N9O5；分子量：639.80
5.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
向2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酸(100mg，粗制物)、(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(45mg，0.10mmol)和DIPEA(48mg，0.37mmol)的DCM(5mL)溶液中添加HATU(80mg，0.21mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后用水(10mL)稀释反应混合物，并用DCM(30mL x 2)萃取所得反应混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过制备型TLC(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到呈白色固体的所需化合物(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(4-(3-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)丙基)哌嗪-1-基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(10mg，0.0094mmol，9.4％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.67(d,J＝4.4Hz,2H),8.45(s,1H),8.04(d,J＝5.6Hz,1H),7.46(d,J＝7.6Hz,1H),7.37-7.42(m,6H),7.18(d,J＝8.4Hz,1H),6.04(d,J＝5.2Hz,1H),5.34-5.35(m,1H),5.02-5.12(m,1H),4.85-4.95(m,1H),4.75(s,3H),4.51-4.53(m,2H),4.36-4.39(m,2H),4.12-4.15(m,1H),3.93-3.95(m,2H),3.46-3.56(m,8H),3.42(s,3H),2.53(s,3H),2.41-2.45(m,12H),2.20-2.22(m,1H),1.65-1.67(m,5H),1.64(s,9H),1.47(d,J＝4.8Hz,3H),1.06(s,9H)。LC-MS：(ES+):m/z1066.6[M+H]。tR＝2.88分钟。化学式：C55H79N13O7S；分子量：1066.38
实施例97、98、99和100的合成
Figure BDA0002176933830003751
4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯酚：N-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯基]-6-碘-喹唑啉-4-胺(300mg，0.59mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(12ml)和乙醇(8ml)的混合物中的悬浮液真空抽空并用氩气(5x)吹扫，然后添加2M Na2CO3水(6.5ml)溶液，再次真空抽空反应混合物并用氩气(5x)吹扫，然后添加[4-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基苯基]硼酸(209mg，0.831mmol)和[(Ph)3P]2PdCl2(70mg，0.08mmol)。将该反应混合物加热至60℃并保持3小时。将反应混合物冷却至室温，将反应混合物倒入NaHCO3(30mL)的饱和水溶液中，用AcOEt(2x30mL)萃取产物。合并有机萃取物，干燥(Na2SO4)，通过硅藻土垫过滤，并真空蒸发。通过快速色谱(SiO2-25g，干燥二氧化硅-分散负载，在15分钟内梯度Hex:AcOEt，9:1至100％AcOEt)纯化粗产物，得到210mg产物4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯酚(75％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.85(s,1H),9.68(s,1H),8.69(s,1H),8.56(s,1H),8.12(d,J＝8.7Hz,1H),8.03(s,1H),7.87–7.67(m,4H),7.48(td,J＝8.0,6.0Hz,1H),7.39–7.25(m,3H),7.19(tt,J＝7.8,1.4Hz,1H),6.93(d,J＝8.6Hz,2H),5.27(s,2H)。13C NMR(151MHz,dmso)δ163.06,161.44,157.66,157.59,154.07,149.69,148.44,139.73,139.69,138.23,133.18,131.45,130.69,130.64,129.86,128.36,128.32,124.20,123.45,123.43,122.38,121.01,118.95,115.88,115.33,114.87,114.73,114.28,114.21,114.07,69.37。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C27H20ClFN3O2计算值：472.1228。
实测值：472.1283。
Figure BDA0002176933830003761
2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯：向4-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]-喹唑啉-6-基]苯酚(10.4mg，0.022mmol)和2-[2-[2-(对甲苯磺酰氧基)乙氧基]乙氧基]-乙酸叔丁酯(10.8mg，0.03mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(2mL)中的混合物中添加Cs2CO3(21.7mg，0.067mmol)。将反应混合物在50℃下加热6小时。将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，在Na2SO4上干燥并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，92:7:1)纯化粗产物，得到8mg纯产物2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(53％收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.88(s,1H),8.74(s,1H),8.57(s,1H),8.16(d,J＝8.7Hz,1H),8.03(s,1H),7.83(dd,J＝8.7,6.6Hz,3H),7.76(dd,J＝8.9,2.6Hz,1H),7.52–7.40(m,1H),7.38–7.25(m,3H),7.21–7.15(m,1H),7.13(d,J＝8.8Hz,2H),5.26(s,2H),4.26–4.12(m,2H),4.01(s,2H),3.83–3.71(m,2H),3.63(s,4H),1.42(s,9H)。13C NMR(151MHz,dmso)δ169.37,163.01,161.39,158.54,157.60,154.15,149.70,148.58,139.69,139.64,137.71,133.15,131.46,131.44,130.60,130.55,128.33,128.25,124.19,123.36,123.34,122.36,121.03,119.29,115.29,115.00,114.78,114.64,114.30,114.12,113.98,80.66,69.88,69.40,69.38,68.91,68.12,67.28,27.77。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C37H38ClFN3O6计算值：674.2433。实测值：674.2411。
2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯：向4-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]-喹唑啉-6-基]苯酚(7.2mg，0.015mmol)和2-[2-[2-[2-(对甲苯磺酰氧基)乙氧基]乙氧基]-乙氧基]-乙酸叔丁酯(8.3mg，0.02mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(2mL)中的混合物中添加Cs2CO3(14.91mg，0.05mmol)。将反应混合物在50℃下加热2小时。将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，在Na2SO4上干燥并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，92:7:1)纯化粗产物，得到10mg产物2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(91％收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.87(s,1H),8.74(d,J＝2.1Hz,1H),8.57(s,1H),8.16(dd,J＝8.8,1.9Hz,1H),8.03(s,1H),7.83(dd,J＝8.6,5.7Hz,3H),7.76(dd,J＝9.0,2.6Hz,1H),7.47(td,J＝8.0,6.1Hz,1H),7.38–7.25(m,3H),7.22–7.14(m,1H),7.13(d,J＝8.8Hz,2H),5.27(s,2H),4.23–4.13(m,2H),3.98(s,2H),3.84–3.74(m,2H),3.68–3.46(m,8H),1.41(s,9H)。13C NMR(151MHz,DMSO-d6)δ169.36,163.01,161.39,158.54,157.60,154.15,149.70,148.57,139.69,139.64,137.72,133.14,131.44,130.61,130.55,128.32,128.25,124.19,123.36,123.34,122.37,121.03,119.29,115.28,115.02,114.78,114.64,114.30,114.13,113.98,80.64,69.95,69.86,69.78,69.72,69.38,68.95,68.09,67.29,27.76。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C39H42ClFN3O7计算值：718.2695。实测值：718.3026。
Figure BDA0002176933830003771
实施例97和98的合成
Figure BDA0002176933830003781
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(实施例97)。
将2-[2-[2-[4-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-苯氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸叔丁酯(8mg，0.01mmol)在TFA(1ml，13.46mmol)和二氯甲烷(3ml)的混合物中的溶液搅拌2小时。然后真空去除溶剂，并将粗产物在高真空下干燥2小时。将粗产物用于下一步骤，无需任何进一步纯化(7.3mg，定量收率)。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C33H30ClFN3O6计算值：618.1807。实测值：618.1917。
在室温下，向2-[2-[2-[4-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]苯氧基]-乙氧基]乙氧基]乙酸(7.3mg，0.01mmol)和(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(8.27mg，0.02mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2ml)溶液中添加DIPEA(0.2ml，1.14mmol)和HATU(8.98mg，0.02mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌12小时(过夜)。将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，干燥(Na2SO4)并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，92:7:1)纯化粗产物，得到12mg预期产物(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(98％收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.87(s,1H),8.95(s,1H),8.72(s,1H),8.57(d,J＝2.6Hz,2H),8.13(dd,J＝8.7,1.9Hz,1H),8.02(d,J＝2.4Hz,1H),7.81(dd,J＝8.6,4.9Hz,3H),7.76(dd,J＝9.0,2.6Hz,1H),7.55–7.24(m,9H),7.18(t,J＝8.6Hz,1H),7.10(d,J＝8.7Hz,2H),5.26(s,2H),5.15(d,J＝3.4Hz,1H),4.58(d,J＝9.6Hz,1H),4.50–4.22(m,5H),4.19(t,J＝4.6Hz,2H),4.00(s,2H),3.89–3.77(m,2H),3.75–3.54(m,6H),2.41(s,3H),2.11–2.01(m,1H),1.95–1.87(m,1H),0.95(s,9H)。13C NMR(151MHz,DMSO-d6)δ171.75,169.16,168.62,163.01,161.40,158.51,157.60,154.15,151.43,149.70,148.58,147.72,139.69,139.64,139.40,137.73,133.15,131.43,131.12,130.61,130.56,129.69,128.67,128.32,128.24,128.15,127.43,124.18,123.37,123.35,122.35,121.04,119.28,115.29,114.99,114.79,114.65,114.30,114.13,113.99,70.48,69.79,69.63,69.40,69.02,68.89,67.21,58.76,56.62,55.73,41.69,37.96,35.74,26.21,15.92。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C55H58ClFN7O8S计算值：1030.3740。实测值：1030.4004。
(2R,4S)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(实施例98)。
它由(2R,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐制备，并遵循与上文针对实施例97所述相同的工序。1HNMR(500MHz,CDCl3)δ8.67(s,1H),8.62(s,1H),8.54(s,1H),7.96(dd,J＝8.7,1.7Hz,1H),7.91(d,J＝8.6Hz,1H),7.84(dd,J＝8.8,2.6Hz,1H),7.71(d,J＝2.5Hz,1H),7.56(t,J＝6.8Hz,3H),7.34(dd,J＝8.0,6.2Hz,2H),7.22(t,J＝9.3Hz,2H),7.14(t,J＝8.3Hz,4H),7.07–6.99(m,3H),6.96(d,J＝8.9Hz,1H),5.14(s,2H),4.88(dd,J＝8.7,5.0Hz,1H),4.62(p,J＝5.4Hz,1H),4.36(dt,J＝15.4,7.3Hz,2H),4.29(d,J＝6.6Hz,1H),4.17–4.06(m,5H),3.91–3.81(m,3H),3.73–3.58(m,4H),3.47–3.36(m,2H),2.41(s,3H),2.38(t,J＝5.3Hz,1H),2.27(ddd,J＝13.8,8.7,5.9Hz,1H),1.12(s,9H)。13C NMR(151MHz,CDCl3)δ171.85,171.65,170.60,163.79,162.16,158.70,158.07,154.36,150.50,150.20,148.29,139.19,139.14,139.01,137.91,133.24,132.47,131.70,131.65,130.41,130.18,130.12,129.14,128.38,127.54,124.48,122.92,122.45,122.44,122.00,119.24,115.69,115.55,114.94,114.80,114.24,114.04,113.89,71.39,70.69,70.44,70.43,70.17,69.68,67.94,59.67,58.55,54.89,42.89,38.16,33.85,26.66,16.10。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+：C55H58ClFN7O8S计算值：1030.3740。实测值：1030.3821。
Figure BDA0002176933830003801
实施例99和100的合成
Figure BDA0002176933830003811
(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺。它由(2R,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(8)和2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)-喹唑啉-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯制备，遵循与上文针对实施例97所述相同的工序(93％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.87(s,1H),8.95(s,1H),8.72(s,1H),8.59(t,J＝6.0Hz,1H),8.55(s,1H),8.13(dd,J＝8.7,1.9Hz,1H),8.00(d,J＝2.5Hz,1H),7.89–7.76(m,3H),7.73(dd,J＝9.0,2.6Hz,1H),7.54–7.23(m,8H),7.22–7.12(m,1H),7.09(d,J＝8.8Hz,2H),5.24(s,2H),5.15(d,J＝3.5Hz,1H),4.55(d,J＝9.6Hz,1H),4.48–4.18(m,5H),4.18–4.06(m,2H),3.95(s,2H),3.80–3.69(m,2H),3.69–3.51(m,8H),2.41(s,3H),2.08–2.00(m,1H),1.93–1.82(m,1H),0.92(s,9H)。13C NMR(151MHz,DMSO-d6)δ171.76,169.12,168.59,163.01,161.39,158.53,157.60,154.15,151.45,149.70,148.57,147.73,139.68,139.63,139.42,137.72,133.14,131.44,131.42,131.13,130.60,130.55,129.68,128.68,128.32,128.24,127.44,124.19,123.36,123.34,122.36,121.03,119.27,115.28,114.99,114.78,114.64,114.29,114.13,113.98,70.48,69.97,69.90,69.63,69.59,69.38,68.95,68.88,67.26,58.75,56.60,55.69,41.68,37.94,35.73,26.19,15.93。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+：C57H62ClFN7O9S计算值：1074.4002。实测值：1074.4285。
(2S,4S)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)苯氧基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(实施例100)。它由(2S,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(10)和2-(2-(2-(2-(4-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)-喹唑啉-6-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯制备，遵循与上文针对实施例97所报告相同的工序(63％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.95(s,1H),9.04(s,1H),8.84–8.77(m,1H),8.73(t,J＝6.0Hz,1H),8.64(s,1H),8.22(dd,J＝8.8,1.8Hz,1H),8.10(d,J＝2.6Hz,1H),7.89(dd,J＝8.8,1.8Hz,3H),7.83(dd,J＝9.0,2.6Hz,1H),7.65–7.30(m,9H),7.25(td,J＝8.8,8.3,2.6Hz,1H),7.18(d,J＝8.8Hz,2H),5.51(d,J＝7.2Hz,1H),5.33(s,2H),4.59(d,J＝9.2Hz,1H),4.52–4.41(m,2H),4.40–4.25(m,2H),4.26–4.19(m,2H),4.03(s,2H),3.99–3.91(m,1H),3.88–3.80(m,2H),3.68(ddt,J＝6.7,5.2,3.3Hz,8H),3.59–3.44(m,1H),2.50(s,3H),2.44–2.35(m,1H),1.81(dt,J＝12.4,6.1Hz,1H),1.03(s,9H)。13C NMR(151MHz,dmso)δ172.26,169.38,168.91,163.02,161.40,158.53,157.61,154.16,151.48,149.71,148.58,147.76,139.69,139.64,139.14,137.72,133.15,131.45,131.11,130.61,130.56,129.77,128.70,128.34,128.25,127.47,124.20,123.37,123.35,122.38,121.04,119.29,115.29,115.00,114.79,114.65,114.31,114.13,113.99,70.46,69.96,69.88,69.64,69.52,69.40,69.03,68.97,67.27,58.59,55.84,55.62,41.82,36.92,35.19,26.18,15.94。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+：C57H62ClFN7O9S计算值：1074.4002。实测值：1074.3920。
实施例102的合成
5-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830003821
合成方案：
Figure BDA0002176933830003831
1.步骤–2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830003832
将N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(300mg，0.693mmol)、2-(2-羟基乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(900mg，3.464mmol)和K2CO3(478mg，3.464mmol)的DMF(8mL)溶液在75℃下搅拌过夜。冷却至室温后，用水淬灭反应，并用乙酸乙酯(20mLx 3)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩，得到粗标题化合物2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙-1-醇(250mg)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤–5-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830003841
在0℃和N2下，向2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙-1-醇(50mg，粗制物，0.096mmol)、PPh3(126mg，0.480mmol)和2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-羟基异吲哚啉-1,3-二酮(26mg，0.096mmol)的无水THF(10mL)溶液中滴加DIAD(97mg，0.480mmol)。将该混合物在室温下搅拌1小时。用水(50mL)淬灭反应混合物，并用EA溶解该混合物。将合并的有机层用盐水洗涤，在MgSO4上干燥，并浓缩。通过色谱(硅胶，DCM:MeOH(10:1，v:v))纯化残余物，得到标题化合物5-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)-2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(6mg，0.008mmol)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ12.09(s,1H),8.18(s,1H),8.10(s,1H),8.05(s,1H),7.74(d,J＝7.2Hz,3H),7.46(d,J＝3.6Hz,1H),7.35(d,J＝8.0Hz,3H),7.28-7.30(m,2H),7.15-7.18(m,2H),7.00(s,1H),5.13-5.18(m,1H),4.78(d,J＝5.2Hz,2H),3.86-3.89(m,2H),3.75-3.79(m,2H),2.72-3.04(m,3H),2.35-2.48(m,9H),2.08-2.13(m,1H)。
实施例106的合成
(2S,4R)-N-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺
合成方案：
Figure BDA0002176933830003851
1.步骤–(2S,4R)-N-(2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003852
在25℃下，向(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(100mg，0.18mmol)的DMF(5mL)溶液中添加K2CO3(75.6mg，0.55mmol)和2-溴-1,1-二乙氧基乙烷(53.9mg，0.27mmol)。将所得溶液在110℃下搅拌16小时。冷却至室温后，用H2O(10mL)淬灭反应，并用EtOAc(10mLx 2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并浓缩，得到标题产物(2S,4R)-N-(2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)-2-(2-氧代乙氧基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003861
在25℃下，向(2S,4R)-N-(2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，0.14mmol)的CH3CN/H2O(5mL/2mL)溶液中添加1N HCl(2mL)。将该反应在80℃下搅拌2小时。冷却至25℃后，用NaHCO3(10mL)淬灭反应，并用EtOAc(10mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并浓缩，得到标题产物(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)-2-(2-氧代乙氧基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
3.步骤–(2S,4R)-N-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003862
在10℃下，向(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)-2-(2-氧代乙氧基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(90mg，0.15mmol)和N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(79.2mg，0.18mmol)的DMSO/MeOH(2mL/2mL)溶液中添加NaBH3CN(47.9mg，0.76mmol)。将所得混合物在40℃下搅拌3小时。冷却至20℃后，用H2O(10mL)淬灭反应，并用EtOAc(10mL x2)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并浓缩。通过硅胶柱和制备型HPLC纯化残余物，得到标题产物(2S,4R)-N-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(3mg：99％纯度和6.5mg：86％纯度，3步7.6％)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ8.88(s,1H),8.09(s,1H),7.73-7.76(m,3H),7.37-7.57(m,9H),7.22-7.24(m,2H),7.03-7.05(m,2H),6.93(s,1H),4.95(s,2H),4.39-4.60(m,7H),4.24(s,2H),3.82-3.96(m,2H),3.57(s,1H),2.96(s,2H),2.60-2.77(m,8H),2.49(s,3H),2.01-2.33(m,3H),0.98(d,J＝6.4Hz,3H),0.78(d,J＝6.4Hz,3H)。化学式：C55H59ClN10O5S；分子量：1007.64LCMS：m/e+＝504.3[M+2H]2+；tR＝3.33分钟
实施例108的合成
合成途径：
Figure BDA0002176933830003872
1.步骤–2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇的合成
将N-(2-氯苄基)-6-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(300mg，0.693mmol)、2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(900mg，3.464mmol)和K2CO3(478mg，3.464mmol)的无水DMF(8mL)溶液在80℃下搅拌过夜。冷却至室温后，用水(20mL)淬灭反应，并用乙酸乙酯(20mL x 3)萃取混合物。将合并的有机层在无水Na2SO4上干燥并浓缩，得到呈浅黄色固体的标题产物2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(300mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤–2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基甲磺酸酯的合成
Figure BDA0002176933830003881
在室温下，向2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(300mg，粗制物，0.531mmol)的DCM(10mL)溶液中添加TEA(265mg，2.653mmol)和MsCl(182mg，1.593mmol)。搅拌20分钟后，用水淬灭反应，并用DCM(30mL x 3)萃取混合物。将合并的有机层在无水Na2SO4上干燥并浓缩，得到呈浅黄色固体的标题产物2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基甲磺酸酯(350mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。
2.步骤–(2S,4R)-N-(2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003882
向2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基甲磺酸酯(250mg，粗制物，0.39mmol)的无水DMF(5ml)溶液中添加K2CO3(108mg，0.78mmol)和(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(215mg，0.39mmol)。将所得溶液在75℃下搅拌过夜。冷却至室温后，用水淬灭反应混合物，并用EA(30mL x 2)萃取混合物。将合并的有机层在无水硫酸钠上干燥并真空浓缩。通过柱色谱纯化残余物，得到标题产物(2S,4R)-N-(2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-((2-氯苄基)氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(17mg)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.64(s,1H),8.31(s,1H),7.67(d,J＝7.2Hz,3H),7.46-7.47(m,1H),7.30-7.41(m,8H),7.20(s,2H),6.94(d,J＝5.6Hz,1H),6.84(s,1H),6.63(s,1H),6.04(s,1H),4.95(d,J＝4.4Hz,2H),4.14-4.79(m,10H),3.46-3.85(m,13H),2.48-2.65(m,16H),1.99(d,J＝6.0Hz,3H),0.82(d,J＝6.4Hz,3H)。
实施例256和257的合成
Figure BDA0002176933830003891
(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-((R)-1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺和(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-((R)-1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺
合成方案–第1部分
Figure BDA0002176933830003901
实验工序：
1.步骤–2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯甲腈的合成
Figure BDA0002176933830003902
向装有氮气惰性气氛的500ml 3颈圆底烧瓶中装入4-溴-2-羟基苯甲腈(26g，131.3mmol，1.00当量)、DMA(300ml)、4-甲基噻唑(26g，262.6mmol，2.00当量)、KOAc(26g，262.6mmol，2.00当量)，Pd(OAc)2(884.3mg，3.94mmol，0.03当量)。将所得溶液在150℃下搅拌5小时。然后通过添加1000mL水来淬灭反应。将所得混合物用3x500mL乙酸乙酯洗涤，合并有机层并用3x500mL H2O洗涤。将混合物在无水硫酸钠上干燥，并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1:1)的硅胶柱上。这得到14.4g(66.66mmol，50.77％)的2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯甲腈，呈黄色固体。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)：δ2.49(s,3H),7.08(d,J＝8.0Hz,1H),7.13(s,1H),7.71(d,J＝8.0Hz,1H),9.07(s,1H),11.35(s,1H)。
2.步骤–2-(氨基甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯酚的合成
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的1000ml 3颈圆底烧瓶中置入2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯甲腈(14.4g，66.66mmol)的THF 400ml溶液。然后在0℃下，分数批添加LiAlH4(6.34g，166.67mmol，2.50当量)。将所得混合物加热至回流过夜，然后冷却至室温。过滤该混合物，并用10％MeOH的DCM溶液洗涤滤饼四次。浓缩合并的滤液，得到10.4g粗产物2-(氨基甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯酚(47.27mmol，71％收率)。将其用于下一步骤，无需进一步纯化。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ2.40(s,3H),3.62(br,1H),6.33(d,J＝6.0Hz,1H),6.56(s,1H),6.96(d,J＝7.6Hz,1H),8.82(s,1H)。
3.步骤–(S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酸的合成
Figure BDA0002176933830003911
将(S)-2-氨基-3-甲基丁酸(43.7g，373mmol)添加到苯二醛(50g，373mmol)的乙腈(1000mL)溶液中。将所得混合物回流过夜。使反应混合物冷却至室温，然后过滤并干燥，得到所需化合物(S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酸(72g，83％)。
4.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830003912
在0℃下，向(S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酸(5g，21.44mmol)、(2S,4R)-4-羟基吡咯烷-2-羧酸甲酯HCl(4.67g，25.7mmol)、DIPEA(8.98ml，51.4mmol)的DMF(体积：30ml)溶液中添加HATU(9.78g，25.7mmol)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。将该混合物在EtoAc和水之间分配。将有机相用水、盐水洗涤，并在无水Na2SO4上干燥。通过柱色谱纯化残余物，得到所需化合物(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸甲酯(5.41g，70％)。1H-NMR(400MHz,CDCl3)：δ0.84(d,J＝5.6Hz,3H),1.09(d,J＝5.2Hz,3H),2.00(m,1H),2.31-2.41(m,2H),3.76(s,3H),3.84(d,J＝11.2Hz,1H),4.30-4.38(m,2H),4.56-4.71(m,3H),4.78(m,1H),7.27-7.42(m,3H),7.69(d,J＝7.2Hz,1H)。
5.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸的合成
Figure BDA0002176933830003921
在0℃下，向(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸甲酯(5g，13.87mmol)在水(体积：50ml)、THF(体积：100ml)的溶液中添加氢氧化锂H2O(1.164g，27.7mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。将反应混合物用1N HCl酸化至pH1-2，并用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，在Na2SO4上干燥并浓缩，得到所需化合物(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸(4.42g，92％)。1HNMR(400MHz,CDCl3)：δ0.87(d,J＝6.4Hz,3H),1.05(d,J＝5.6Hz,3H),2.21(m,1H),2.31(m,1H),2.43(m,1H),3.80(d,J＝6.4Hz,1H),4.37-4.44(m,2H),4.55(s,1H),4.64(t,J＝8.0Hz,7.6Hz,1H),4.73(d,J＝17.6Hz,1H),4.83(d,J＝10.8Hz,1H),7.38-7.42(m,2H),7.49(d,J＝7.2Hz,1H),7.74(d,J＝7.6Hz,1H)。
6.步骤–(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003922
向2-(氨基甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯酚(6.00g，27.3mmol，1.10当量)、(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酸(8.58g，24.79mmol，1.00当量)、EDCI(5.70g，29.75mmol，1.20当量)、HOBT(4.02g，29.75mmol，1.20当量)的CH2Cl2(100mL)溶液中添加Et3N(6.0g，10.75mmol)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。将该混合物在CH2Cl2和水之间分配。将有机相用水、盐水洗涤，并在无水Na2SO4上干燥。通过柱色谱纯化残余物，得到标题化合物(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(6.3g，11.49mmol，46.3％收率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)：δ0.81(d,J＝6.4Hz,3H),0.86(d,J＝6.8Hz,3H),1.96-2.01(m,1H),2.34-2.40(m,1H),2.44-2.53(m,4H),3.63(dd,J＝3.6,12.0Hz 1H),4.27-4.2(m,1H),4.38-4.43(m,2H),4.53(s,2H),4.68-4.71(m,3H),6.91(d,J＝8.0Hz,1H),7.01(s,1H),7.13(d,J＝7.6Hz,1H),7.42-7.44(m,2H),7.52(d,J＝7.2Hz,1H),7.78(d,J＝7.2Hz,1H),8.01(s,1H),8.66(s,1H),9.20(br,H)。LC-MS(ESI)：计算值，548.21；实测值，549.3(M+H)；
合成方案–第2部分：
Figure BDA0002176933830003931
7.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830003932
在氮气气氛下，向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-碘-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(531mg，1.0mmol)、2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙醇(288mg，2.0mmol)和三乙胺(607mg，6.00mmol)在乙腈(5mL)中的搅拌溶液中添加碘化铜(I)(38mg，0.20mmol)和双(三苯基膦)氯化钯(II)(140mg，0.20mmol)；将该混合物用氮气脱气三次。将该混合物在65℃下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(20ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用4％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈棕色油状物的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(450mg，收率82％)。LC_MS：(ES+):m/z 548.3[M+H]+。tR＝2.848分钟。
8.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(3-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830003941
在室温下，将2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(450mg，0.82mmol)、4-甲苯磺酰氯(235mg，1.23mmol)、N,N-二甲基吡啶-4-胺(10mg，0.08mmol)和三乙胺(166mg，1.64mmol)在二氯甲烷(15ml)中的混合物搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物用二氯甲烷(40ml)稀释，用盐水(40ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用4％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(3-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(360mg，收率61％)。LC_MS：(ES+):m/z 702.5[M+H]+。tR＝3.282分钟。
9.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830003951
在80℃和氮气下，将2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(1-氧代-7-(3-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(383mg，0.55mmol)、(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(250mg，0.46mmol)和碳酸钾(127mg，0.92mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(8ml)中的混合物搅拌过夜。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(50ml)和水(30ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用3％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(360mg，收率73％)。LC_MS：(ES+):m/z 1078.4[M+H]+。tR＝3.027分钟。
10.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830003952
将2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(360mg，0.33mmol)和氢氧化锂一水合物(28mg，0.67mmol)在四氢呋喃(8ml)-甲醇(2ml)-水(2ml)中的混合物在室温下搅拌16小时。TLC显示反应完成。将反应混合物用稀盐酸(1N)酸化至pH5-6，并用乙酸乙酯(30ml×2)萃取。将合并的有机层在硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到呈白色固体的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸(400mg，粗制物)，将其直接用于下一步骤，无需进一步纯化。LC_MS：(ES+):m/z 1064.6[M+H]+。tR＝2.882分钟。
11.步骤–(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003961
在0℃下，向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)丙1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)乙酸(400mg，粗制物)、N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(85mg，0.66mmol)和噻唑-2-胺(33mg，0.33mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(5ml)中的搅拌溶液中添加2-(7-氮杂-1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸酯(HATU)(250mg，0.66mmol)，使所得混合物加温至室温并搅拌20分钟。TLC显示反应完成。将反应混合物在乙酸乙酯(30ml)和水(20ml)之间分配。将有机层收集，用盐水(20ml×2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过硅胶快速柱色谱(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(200mg，收率53％)。LC_MS：(ES+):m/z 1146.5[(M+1)/2+H]+。tR＝3.010分钟。
12.步骤–(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-(1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830003971
在30分钟内，在-70℃下，向(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-(1-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(100mg，0.09mmol)在二氯甲烷(8ml)中的搅拌溶液中添加三溴化硼(131mg，0.52mmol)的二氯甲烷(1ml)溶液。将所得混合物在-70℃下搅拌1小时。TLC显示反应完成。将反应混合物用二氯甲烷(15ml)稀释，并在-70℃下用饱和碳酸氢钠溶液(8ml)淬灭。收集有机层，并用二氯甲烷(15ml x 2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的(2S,4R)-N-(2-(2-(2-((3-(2-(1-(5-氟-2-羟基苯基)-2-氧代-2-(噻唑-2-基氨基)乙基)-3-氧代异吲哚啉-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)乙氧基)乙氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(8.5mg，收率9％)。LC_MS：(ES+):m/z 1056.5[M+H]+。tR＝2.790分钟。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ0.72(d,J＝6.8Hz,3H),0.95(d,J＝6.4Hz,3H),1.88-1.95(m,1H),2.01-2.07(m,1H),2.29-2.35(m,1H),2.46(s,3H),3.69-3.71(m,3H),3.75-3.77(m,3H),3.80-3.82(m,2H),3.95(d,J＝18.4Hz,1H),4.18(t,J＝4.0Hz,2H),4.25-4.33(m,3H),4.38-4.47(m,4H),4.52-4.59(m,2H),4.70(d,J＝10.8Hz,1H),6.26(s,1H),6.84-6.91(m,2H),7.00(d,J＝4.0Hz,1H),7.04(s,1H),7.07-7.12(m,1H),7.23(d,J＝3.2Hz,1H),7.33(d,J＝7.6Hz,1H),7.46-7.53(m,3H),7.55-7.57(m,2H),7.60-7.62(m,2H),7.70(d,J＝7.6Hz,1H),8.38(t,J＝6.0Hz,1H),8.98(s,1H)。化学式：C56H54FN7O10S2；分子量：1055.34；
两种非对映异构体化合物实施例256和实施例257可通过反相制备型HPLC分离。
实施例268-271和273的合成
一般工序：
Figure BDA0002176933830003981
3-(2-氯嘧啶-4-基)-1-甲基吲哚
Figure BDA0002176933830003991
将2,4-二氯嘧啶(3g，20.1mmol)溶解于DME(50mL)中并加热至60℃。添加FeCl3(2953mg，22.1mmol)，然后添加1-甲基吲哚(2642mg，20.1mmol)，并将反应在60℃下搅拌过夜。冷却至室温，倒入冰水中，搅拌30分钟，并过滤收集所得沉淀。通过用DCM洗脱的柱色谱纯化，得到2.4g(49％)的3-(2-氯嘧啶-4-基)-1-甲基-吲哚。NMR和LC-MS符合结构且匹配文献报道。
N-(4-氟-2-甲氧基-5-硝基-苯基)-4-(1-甲基吲哚-3-基)嘧啶-2-胺
将3-(2-氯嘧啶-4-基)-1-甲基-吲哚(2g，8.21mmol)和4-氟-2-甲氧基-5-硝基-苯胺(1833mg，9.85mmol)悬浮于2-戊醇中。添加对甲苯磺酸(1873mg，9.85mmol)，并将反应在微波条件下加热至110℃，保持2小时。使反应混合物冷却至室温，将所得沉淀过滤收集，用2-戊醇洗涤，用乙腈研磨并真空干燥，得到黄色固体(2453mg，76％)。NMR和LC-MS符合结构且匹配文献报道。
2-甲氧基-N4-甲基-N4-[2-(甲基氨基)乙基]-N1-[4-(1-甲基吲哚-3-基)嘧啶-2-基]-5-硝基-苯-1,4-二胺
Figure BDA0002176933830003993
将N-(4-氟-2-甲氧基-5-硝基-苯基)-4-(1-甲基吲哚-3-基)嘧啶-2-胺(1300mg，3.3mmol)溶解于DMA(10ml)中，添加N-(4-氟-2-甲氧基-5-硝基-苯基)-4-(1-甲基吲哚-3-基)嘧啶-2-胺(1.07ml，9.91mmol)，然后添加TEA(0.92ml，6.61mmol)，将反应在微波条件下加热至140℃并保持30分钟，并且用水(20ml)淬灭。用乙酸乙酯(3x 20ml)萃取反应混合物。将合并的有机层用水洗涤，在MgSO4上干燥，并真空浓缩为红色固体。用于后续步骤，无需进一步纯化。
经由还原胺化引入接头的一般工序
Figure BDA0002176933830004001
将2-甲氧基-N4-甲基-N4-[2-(甲基氨基)乙基]-N1-[4-(1-甲基吲哚-3-基)嘧啶-2-基]-5-硝基-苯-1,4-二胺(1当量)溶解于DCM中，添加醛-叔丁酯(2.2当量)，然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(1.2当量)，并在室温下搅拌反应1小时。将反应混合物真空浓缩，并通过用0-10％甲醇的DCM溶液洗脱的柱色谱进行纯化。
硝基还原的一般工序
Figure BDA0002176933830004002
将含硝基的化合物(1当量)悬浮于1:1乙醇/水和铁(6当量)中，然后添加氯化铵(0.75当量)。将反应加热至回流2小时，使其冷却至室温，通过硅藻土过滤，用10％甲醇/DCM洗脱。将滤液用DCM(3x)萃取，在MgSO4上干燥并真空浓缩。如果需要，通过用0-10％甲醇的DCM溶液洗脱的柱色谱纯化化合物。
苯胺酰化的一般工序
Figure BDA0002176933830004003
将丙烯酰氯(1.1当量)逐滴添加到苯胺化合物(1当量)和TEA(5当量)在DCM中的经剧烈搅拌的溶液中。将反应在室温下搅拌1小时。用甲醇(过量)淬灭过量的丙烯酰氯，并将反应混合物真空浓缩。通过用0-10％甲醇的DCM溶液洗脱的柱色谱纯化残余物。
叔丁酯脱保护的一般工序
Figure BDA0002176933830004011
将叔丁酯(1当量)溶解于20％TFA的DCM溶液中并在室温下搅拌1小时。将反应混合物真空浓缩，并立即用于下一步骤。
偶联E3募集元件的一般工序
Figure BDA0002176933830004012
将粗酸组分(1当量)溶解于DMF中。添加HATU(1.1当量)，然后添加TEA(5当量)并搅拌反应10分钟。添加胺偶联组分(VHL配体，(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺或5-(2-氨基乙基氨基)-2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)异吲哚啉-1,3-二酮)(1.1当量)，并将反应在室温下搅拌过夜。将反应混合物用水稀释，并用乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层，用水、盐水和10％LiCl(水溶液)洗涤，在MgSO4上干燥，并真空浓缩。通过用0-10％甲醇的DCM溶液洗脱的色谱纯化。
实施例276的合成
Figure BDA0002176933830004013
(2R,4S)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
合成方案
Figure BDA0002176933830004021
1.步骤–2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004022
在70℃下，将3-(2-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸叔丁酯(275mg，0.88mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯酚(194mg，0.88mmol)和Cs2CO3(574mg，1.76mmol)在DMF中搅拌1小时，然后在冷却至室温后，添加水。用EA萃取该混合物。将有机层干燥并浓缩。通过硅胶垫(PE:EA＝5:1)过滤，得到2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(282mg，0.67mmol，76％收率)。
2.步骤–2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸的合成
将2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(282mg，0.67mmol)在DCM(8mL)中搅拌。添加TFA(2mL)并在室温(18℃)下继续搅拌1小时。然后浓缩，得到282mg粗产物2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸。
3.步骤–(2R,4S)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004032
在室温(18℃)下，向(粗制物)2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸的溶液(157mg，<＝0.43mmol)的DCM溶液中添加(2R,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(150mg，0.35mmol)、DIPEA(135mg，1.04mmol)和PyBOP(217mg，0.42mmol)。将该混合物在室温(18℃)下搅拌1小时。添加水。用DCM萃取该混合物。通过硅胶垫(DCM:MeOH＝20:1)过滤，得到(2R,4S)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(189mg，0.24mmol，68％收率)。
4.步骤–(2R,4S)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004041
在N2下，将N-(2-氯嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(28.7mg，0.095mol)、(2R,4S)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(75.0mg，0.095mol)、Pd(dppf)Cl2(13.9mg，0.019mol)和CsF(57.7mg，0.380mol)的CH3CN/H2O(v/v＝5/1，3mL)溶液在微波反应器中加热至120℃并保持30分钟。冷却至室温后，用水(5mL)稀释反应，并用DCM溶解该混合物。将有机相用盐水洗涤，在MgSO4上干燥，并真空浓缩。通过色谱(硅胶，DCM:MeOH(10:1，v:v))纯化残余物，得到所需化合物(2R,4S)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)苯氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(7.6mg，9％，呈白色固体)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.63(s,3H),8.42-8.39(m,4H),7.46(d,J＝8.0Hz,1H),7.35-7.31(m,5H),6.99(d,J＝8.0Hz,2H),6.81(d,J＝8.0Hz,1H),5.09-5.05(m,1H),4.71-4.67(m,2H),4.49-4.48(m,1H),4.31-4.30(m,1H),4.18(s,2H),4.08-4.07(m,1H),4.01(s,1H),3.96(s,1H),3.81-3.79(m,2H),3.75-3.73(m,4H),3.62(dd,J＝5.6Hz,1H),2.65(s,3H),2.42-2.40(m,4H),2.09-2.06(t,J＝8.0Hz,1H),1.73(d,J＝8.0Hz,6H),1.38(d,J＝8.0Hz,3H),1.08(s,9H)。LC-MS：(ES+):m/z 933.4[M+H]。tR＝3.389分钟。化学式：C49H60N10O7S；分子量：933.13
实施例282的合成
(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004051
合成方案
Figure BDA0002176933830004052
实验部分：
1.步骤–9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004053
将N-(2-氯嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(150mg，0.47mmol)、3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羧酸叔丁酯(125mg，0.49mmol)和Et3N(142mg，1.4mmol)的iPrOH(5mL)溶液在150℃下搅拌1小时。冷却至室温后，真空去除溶剂。通过用MeOH/DCM(1:20)作为洗脱剂的硅胶柱色谱纯化残余物，得到呈黄色固体的所需产物9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羧酸叔丁酯(200mg，0.38mmol，80.8％收率)。化学式：C28H40N8O2；分子量：520.68。LC-MS：(ES+):m/z 521.3[M+H]。tR＝3.33分钟
2.步骤–N-(2-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺盐酸盐的合成
Figure BDA0002176933830004061
在室温下，向9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羧酸叔丁酯(200mg，0.38mmol)的MeOH(8mL)溶液中添加6N HCl的二氧杂环己烷(4ml，24mmol)溶液。搅拌30分钟后，真空浓缩该混合物，得到呈黄色固体的粗制物N-(2-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺盐酸盐(200mg)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。化学式：C23H33ClN8；分子量：457.02LC-MS：(ES+):m/z 421.3[M+H]。tR＝2.19分钟
3.步骤–2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004062
向N-(2-(3，9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)嘧啶-4-基)-1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺盐酸盐(190mg粗制物，<＝0.38mmol)、2-(3-(3-((甲基磺酰基)氧基)丙氧基)丙氧基)乙酸叔丁酯(186mg，0.57mmol)在DMF(10ml)中的混合物中添加K2CO3(209mg，1.51mmol)。将所得溶液在80℃下搅拌1小时。冷却至室温后，用10mL水稀释反应，并用乙酸乙酯(2x30mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，并过滤。减压蒸发溶剂。通过制备型TLC(DCM:MeOH＝20:1)纯化残余物，得到呈白色固体的所需化合物2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸叔丁酯(65mg，0.10mmol，26.3％收率)。LC-MS：(ES+):m/z 651.4[M+H]。tR＝2.79分钟。化学式：C35H54N8O4；分子量：650.87
4.步骤–2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830004071
向2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸叔丁酯(65mg，0.10mmol)的DCM(2mL)溶液中添加TFA(2ml)。搅拌1小时后，真空去除溶剂，得到粗制的所需产物2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸(100mg，粗制物)，将其用于下一反应中，无需进一步纯化。LC-MS：(ES+):m/z 595.4[M+H]。tR＝2.36分钟。化学式：C31H46N8O4；分子量：594.76
5.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004072
向2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酸(100mg，粗制物，<＝0.10mmol)、(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(72mg，0.15mmol)、DIPEA(77mg，0.60mmol)的DCM(5mL)溶液中添加PyBop(78mg，0.15mmol)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。用水(10mL)淬灭后，用DCM(2x 30mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，在Na2SO4上干燥，过滤并真空浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物，得到呈白色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(3-(9-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)丙氧基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺(45mg，0.044mmol，44.0％收率，2步)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ13.15(bs,1H),11.30(s,1H),8.88(s,1H),8.65(s,1H),8.54(s,1H),7.99(s,1H),7.44(d,J＝7.2Hz,1H),7.42(s,4H),8.67(d,J＝8.7Hz,1H),6.69(s,1H),5.08-5.10(m,1H),4.71-4.77(m,2H),4.60-4.62(m,1H),4.51(s,1H),3.91-4.02(m,6H),3.53-3.64(m,9H),3.10-3.13(m,2H),2.85-2.88(m,2H),2.88(s,3H),2.55(m,3H),2.33-2.34(m,1H),2.10-2.12(m,1H),1.86-2.00(m,11H),1.69(d,J＝6.8Hz,6H),1.59-1.61(m,2H),1.48(d,J＝6.8Hz,3H),1.06(s,9H)。LC-MS：(ES+):m/z 1021.5[M+H]。tR＝2.84分钟。化学式：C54H76N12O6S；分子量：1021.34
实施例283的合成
2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺
Figure BDA0002176933830004081
合成方案：
Figure BDA0002176933830004082
1.步骤–2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004083
在氢气气氛(氢气球)下，将钯碳(10％，40mg)和2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙-1-炔-1-基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(80mg，0.087mmol)的甲醇(20ml)溶液在室温下搅拌过夜。TLC显示反应完成。通过过滤去除钯碳并用甲醇(5ml x 2)洗涤。减压浓缩合并的滤液，得到呈黄色油状物的2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(70mg，粗制物)。LC_MS：(ES+):m/z 920.5[M+H]+。tR＝3.010分钟。
2.步骤–2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004091
在-70℃下，向2-(2-(苄氧基)-5-氟苯基)-2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(70mg，0.076mmol)在二氯甲烷(8ml)中的搅拌溶液中滴加三溴化硼(95mg，0.38mmol)的二氯甲烷(1ml)溶液。将所得混合物在-70℃下搅拌1小时。TLC显示反应完成。将反应混合物用二氯甲烷(15ml)稀释，并在-40℃下用饱和碳酸氢钠溶液(8ml)淬灭。收集有机层，并用二氯甲烷(15ml x 2)萃取水层。将合并的有机层用盐水(20ml)洗涤，在无水硫酸钠上干燥并减压浓缩，得到粗残余物，将其通过制备型TLC(用5％甲醇的二氯甲烷溶液洗脱)纯化，得到呈白色固体的2-(7-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺(25mg，收率27％)。LC_MS：(ES+):m/z 830.4[M+H]+。tR＝2.645分钟。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)：δ1.97-2.03(m,4H),2.54-2.68(m,1H),3.07(t,J＝7.2H,1H),3.38-3.41(m,4H),3.47-3.48(m,2H),3.52-3.56(m,4H),3.58-3.60(m,2H),3.78(t,J＝4.0Hz,2H),3.89-3.93(m,1H),4.29(t,J＝4.0Hz,2H),4.52-4.56(m,1H),5.09-5.14(m,1H),5.36(d,J＝4.8Hz,1H),6.26(s,1H),6.82-6.85(m,1H),6.88-6.91(m,1H),7.07-7.12(m,1H),7.24-7.26(m,2H),7.34-7.37(m,2H),,7.43-7.48(m,3H),7.80(d,J＝12.0Hz,1H),8.32(s,1H),11.14(s,1H)。化学式：C41H40FN5O11S；分子量：829.85；
实施例286的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830004101
合成途径：
Figure BDA0002176933830004102
实验部分：
1.步骤–4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)苯甲酸的合成
Figure BDA0002176933830004103
向1-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪(500mg，2.00mmol)的MeOH(10mL)溶液中添加4-甲酰基苯甲酸(300mg，2.00mmol)和NaBH3CN(151mg，2.4mmol)。将该溶液在室温下搅拌3小时。用水(10mL)稀释该溶液。用DCM(2×30mL)萃取所得混合物。用盐水(20mL)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱(DCM:MeOH＝10:1)纯化残余物，得到呈白色固体的4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)苯甲酸(120mg，0.31mmol，15.8％收率)。化学式：C20H34N2O3Si；分子量：378.59。
2.步骤–4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)苯甲酰胺的合成
在室温下，向N4-异丙基-N2-(2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)吡啶-2,4,5-三胺(400mg，1.12mmol)和4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)苯甲酸(677mg，1.80mmol)的DCM(20mL)溶液中添加DIPEA(578mg，4.48mmol)和HATU(851mg，2.24mmol)。将该溶液在室温下搅拌过夜。用水(5mL)稀释溶液，并用DCM(2×20mL)萃取所得混合物。用盐水(10mL)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱(DCM:MeOH＝10:1)纯化残余物，得到呈白色固体的4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)苯甲酰胺(100mg，0.14mmol，12.4％收率)。化学式：C38H59N9O3Si；分子量：718.03
3.步骤–2-(4-(2-(1-异丙基-6-((4-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙酸乙酯的合成
Figure BDA0002176933830004112
在微波下，将4-((4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-N-(4-(异丙基氨基)-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)吡啶-3-基)苯甲酰胺(150mg，0.21mmol)的CH3COOH(5ml)溶液在150℃下搅拌10小时。然后减压蒸发反应混合物。用饱和NaHCO3将溶液的pH调节至8。用DCM(2×10mL)萃取所得混合物。用盐水(5mL)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过制备型TLC(DCM:MeOH＝10:1)纯化残余物，得到呈白色固体的2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙酸乙酯(42mg，0.064mmol，31.8％收率)。化学式：C34H45N9O3；分子量：627.79
4.步骤–2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙-1-醇的合成
向2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙酸乙酯(40mg，0.064mmol)在THF(2mL)和H2O(1ml)中的溶液中添加LiOH·H2O(16mg，0.38mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。用EA(2×5mL)萃取所得反应混合物。用盐水(5mL)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩，得到2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙-1-醇(40mg，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。LC-MS：(ES+):m/z 586.3[M+H]+。tR＝2.51分钟。化学式：C32H43N9O2；分子量：585.76
5.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830004122
在45℃下，向2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙-1-醇(30mg，0.051mmol)、2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-羟基异吲哚啉-1,3-二酮(18mg，0.066mmol)和PPh3(78mg，0.31mmol)的THF(5mL)溶液中逐滴添加DIAD(60mg，0.31mmol)。将该溶液在45℃下搅拌10分钟。然后用水(10mL)稀释反应混合物。用DCM(2×10mL)萃取该混合物。用盐水(5mL)洗涤合并的有机层。将有机相在无水硫酸钠上干燥，过滤并真空浓缩。通过制备型TLC纯化残余物，得到呈白色固体的2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(2-(4-(4-(1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)苄基)哌嗪-1-基)乙氧基)异吲哚啉-1,3-二酮(4.5mg，0.0053mmol，10.0％收率)。1H NMR(400MHz,CD3OD)：δ8.65(s,1H),8.57(s,1H),7.95(d,J＝6.0Hz,1H),7.80(d,J＝8.0Hz,1H),7.65(d,J＝8.0Hz,2H),7.59(d,J＝8.0Hz,2H),7.58(s,1H),7.43(d,J＝2.0Hz,1H),6.32(d,J＝5.6Hz,1H),5.31–5.34(m,2H),5.05–5.15(m,1H),4.29–4.32(m,4H),3.67(s,2H),3.34–3.36(m,4H),3.30(m,3H),2.82–2.83(m,3H),2.65–2.80(m,4H),2.15–2.20(m,2H),2.10–2.12(m,1H),1.95–1.98(m,6H),1.68(d,J＝6.8Hz,6H)。LC-MS：(ES+):m/z 842.4[M+H]+。tR＝2.71分钟。化学式：C45H51N11O6；分子量：841.97
实施例291的合成
(2S,4R)-1-((S)-2-(叔丁基)-14-(4-((1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)哌啶-4-基)氧基)苯基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004131
实施例291的合成遵循针对实施例282所述的途径和方法，使用以下方案中所示的构建块。
1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.66(s,1H),8.61(s,1H),8.30(s,1H),8.03(d,J＝5.6Hz,1H),7.32–7.41(m,7H),7.14(d,J＝8.4Hz,2H),6.87(d,J＝8.4Hz,2H),6.09(d,J＝5.6Hz,1H),5.10(t,J＝7.2Hz,1H),4.73–4.76(m,1H),4.62–4.66(m,1H),4.50–4.52(m,3H),4.22–4.28(m,2H),4.12–4.15(m,1H),3.95–4.10(m,2H),3.63–3.75(m,13H),2.84(t,J＝7.2Hz,2H),2.61(s,3H),2.60–2.62(m,1H),2.52(m,3H),1.98–2.04(m,4H),1.80–1.85(m,2H),1.63(d,J＝6.8Hz,6H),1.53(d,J＝6.4Hz,3H),1.07(s,9H)。
LC-MS：(ES+):m/z 1060.5[M+H]。tR＝3.42分钟。化学式：C56H73N11O8S；分子量：1060.33。
实施例292的合成
(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(3-(4-(2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙基)哌嗪-1-基)丙氧基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004141
实施例292的合成遵循针对实施例78和282使用的一般策略和方法，使用以下方案中所示的构建块。
Figure BDA0002176933830004142
(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-(3-(3-(4-(2-(1-(4-((1-异丙基-2-甲基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-6-基)氨基)嘧啶-2-基)-4-甲氧基哌啶-4-基)乙基)哌嗪-1-基)丙氧基)丙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004143
1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ8.59(s,1H),8.53(s,1H),8.31(s,1H),7.94(d,J＝5.6Hz,1H),7.69(s,1H),7.35–7.36(m,1H),7.29–7.33(m,4H),7.15–7.17(m,1H),5.98(d,J＝5.2Hz,1H),4.95–5.05(m,1H),4.36–4.38(m,2H),4.32–4.35(m,4H),3.95–4.02(m,1H),3.86(d,J＝4.0Hz,2H),3.51–3.54(m,3H),3.42–3.43(m,4H),3.25–3.27(m,2H),3.16(s,3H),2.54(s,3H),2.43–2.46(m,9H),2.35–2.38(m,6H),1.98–2.02(m,2H),1.76–1.78(m,5H),1.67–1.69(m,3H),1.65(d,J＝6.8Hz,6H),1.48–1.51(m,3H),1.40(d,J＝6.8Hz,3H),0.98(s,9H)。LC-MS：(ES+):m/z 1094.3[M+H]+。tR＝2.98分钟。化学式：C57H83N13O7S；分子量：1094.43
实施例301的合成
2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(3-(4-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)苯氧基)丙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮
Figure BDA0002176933830004151
合成途径：
Figure BDA0002176933830004152
1.步骤–2-氯-N-异丙基-5-硝基-吡啶-4-胺的合成
Figure BDA0002176933830004161
向2,4-二氯-5-硝基-吡啶(14g，72.5mmol，1当量)和丙-2-胺(4.29g，72.5mmol，1当量)的四氢呋喃(100mL)溶液中添加三乙胺(14.68g，145.09mmol，2当量)，将该混合物在25℃下搅拌6小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有较高极性的主要新斑点。将该混合物用水(200mL)稀释，然后用乙酸乙酯(100mLx 3)萃取，将有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黄色固体的2-氯-N-异丙基-5-硝基-吡啶-4-胺(15.5g，71.88mmol，99％收率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ：9.02(s,1H),8.08(s,1H),6.74(s,1H),3.79-3.87(m,1H),1.37(d,J＝6.4Hz,6H)。化学式：C8H10ClN3O2，分子量：215.64
2.步骤–6-氯-N-4-异丙基-吡啶-3,4-二胺的合成
Figure BDA0002176933830004162
向2-氯-N-异丙基-5-硝基-吡啶-4-胺(10g，46.37mmol，1当量)和铁(6.47g，115.94mmol，2.5当量)在甲醇(80mL)中的混合物中添加氯化铵(6.20g，115.94mmol，2.5当量)的水(20mL)溶液。将混合物在65℃下搅拌12小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝1/1)显示起始材料被完全消耗，并且形成一个主要新斑点。减压浓缩该混合物，得到残余物。将残余物用乙酸乙酯(30mL)稀释、过滤，并减压浓缩滤液，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至1/1)纯化残余物，得到呈灰色固体的6-氯-N-4-异丙基-吡啶-3,4-二胺(5.6g，30.16mmol，65％收率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ：7.62(s,1H),6.43(s,1H),4.23(s,1H),3.56-3.67(m,1H),3.02(s,2H),1.25(d,J＝6.4Hz,6H)。化学式：C8H12ClN3，分子量：185.65
3.步骤–6-氯-2-(氯甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶的合成
Figure BDA0002176933830004163
向6-氯-N4-异丙基-吡啶-3,4-二胺(1.3g，7.00mmol，1当量)的2-氯-1,1,1-三甲氧基乙烷(4.60g，29.76mmol，4.0mL，4.25当量)溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(133mg，0.70mmol，0.1当量)，将该混合物在100℃下搅拌1小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示，检测到一个具有较低极性的主要新斑点。减压浓缩该混合物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)纯化残余物，得到呈浅黄色固体的6-氯-2-(氯甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶(0.82g，3.36mmol，48％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.76(s,1H),7.98(s,1H),5.14(s,2H),4.85-4.93(m,1H),1.58(d,J＝6.8Hz,6H)。化学式：C10H11Cl2N3，分子量：244.12
4.步骤–6-氯-2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶的合成
Figure BDA0002176933830004171
向2,2-二甲氧基乙醇(469mg，4.42mmol，1.5当量)的N,N-二甲基甲酰胺(20mL)溶液中添加氢化钠(177mg，4.42mmol，60％纯度，1.5当量)，将该混合物在50℃下搅拌1小时，然后添加6-氯-2-(氯甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶(0.72g，2.95mmol，1当量)，将该混合物在50℃下搅拌2小时。通过LCMS检测所需MS。将该混合物用水(100mL)稀释，然后用乙酸乙酯(50mL x 3)萃取，将有机层用盐水(100mL x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至1/1)纯化残余物，得到呈浅黄色油状物的6-氯-2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶(0.7g，2.23mmol，75％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:314.1[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.80(d,J＝0.8Hz,1H),7.49(d,J＝0.8Hz,1H),4.90-4.97(m,1H),4.85(s,2H),4.51(t,J＝5.2Hz,1H),3.57(d,J＝5.2Hz,2H),3.37(s,6H),1.64(d,J＝6.8Hz,6H)。化学式：C14H20ClN3O3，分子量：313.78
5.步骤–2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-N-[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺的合成
Figure BDA0002176933830004172
向6-氯-2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-咪唑并[4,5-c]吡啶(500mg，1.59mmol，1当量)和2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-胺(331mg，1.59mmol，1当量)的1,4-二氧杂环己烷(10mL)溶液中添加2-(二环己基膦基)-2’,4’,6’-三异丙基联苯(152mg，0.32mmol，0.2当量)、三(二亚苄基丙酮)二钯(146mg，0.16mmol，0.1当量)和碳酸铯(1.04g，3.19mmol，2当量)，将该混合物用氮气脱气并吹扫若干次，然后在氮气气氛下于100℃下搅拌3小时。通过LCMS检测所需MS。减压浓缩该混合物。通过硅胶色谱(二氯甲烷/甲醇＝20/1)纯化残余物，得到呈浅黄色油状物的2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-N-[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(0.7g，1.44mmol，90％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:486.2[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.70(s,1H),8.46(s,1H),8.05(d,J＝5.6Hz,1H),7.37(s,1H),6.04(d,J＝5.6Hz,1H),4.93-4.98(m,1H),4.84(s,2H),4.51(t,J＝5.2Hz,1H),4.36-4.41(m,1H),3.57(d,J＝5.2Hz,2H),3.44-3.54(m,4H),3.42(s,3H),3.38(s,6H),1.95-2.03(m,2H),1.68(d,J＝7.2Hz,6H),1.64-1.66(m,2H)。化学式：C24H35N7O4，分子量：485.58
6.步骤–2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙醛的合成
Figure BDA0002176933830004181
向2-(2,2-二甲氧基乙氧基甲基)-1-异丙基-N-[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]咪唑并[4,5-c]吡啶-6-胺(0.6g，1.24mmol，1当量)的四氢呋喃(20mL)溶液中添加硫酸(2摩尔，水溶液，20mL，40mmol，32当量)，将该混合物在100℃下搅拌30分钟。薄层色谱(二氯甲烷/甲醇＝20/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有较大极性的主要新斑点。使用碳酸钠饱和溶液将混合物的pH调节至8，然后用乙酸乙酯(30mL x 3)萃取，将有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩。通过硅胶色谱(二氯甲烷/甲醇＝50/1至20/1)纯化残余物，得到呈浅黄色油状物的2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙醛(0.5g，1.14mmol，92％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：9.68(s,1H),8.70(s,1H),8.49(s,1H),8.06(d,J＝5.6Hz,1H),7.50-7.53(m,1H),6.05(d,J＝5.6Hz,1H),4.98-5.05(m,1H),4.90(s,2H),4.38-4.40(m,2H),4.27(s,2H),3.51-3.54(m,2H),3.47-3.49(m,1H),3.42(s,3H),1.96-2.00(m,2H),1.70(d,J＝7.2Hz,6H),1.65-1.67(m,2H)。化学式：C22H29N7O3，分子量：439.51
7.步骤–4-[4-(3-溴丙氧基)苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
向4-(4-羟基苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(500mg，1.80mmol，1当量)的丙酮(10mL)溶液中添加碳酸钾(745mg，5.39mmol，3当量)和1,3-二溴丙烷(1.09g，5.39mmol，3当量)。将混合物在80℃下搅拌12小时。LCMS显示反应完成。将反应混合物用水(30mL)稀释，并用乙酸乙酯(10mL x 2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(10mL x 2)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝30:1至10:1)纯化残余物，得到呈白色固体的4-[4-(3-溴丙氧基)苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(620mg，1.55mmol，86％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:399.0[M+1]+。化学式：C17H27N2O3Br，分子量：398.12
8.步骤–4-[4-[3-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]丙氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004191
向4-[4-(3-溴丙氧基)苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(400mg，1.00mmol，1当量)和2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-哌嗪-1-基-异吲哚啉-1,3-二酮(379mg，1.00mmol，1当量，HCl)的乙腈(10mL)溶液中添加碘化钾(17mg，0.10mmol，0.1当量)和二异丙基乙胺(518mg，4.01mmol，0.7mL，4当量)。将混合物在100℃下搅拌12小时。LCMS显示反应完成。将反应混合物用水(30mL)稀释，并用乙酸乙酯(20mL x 2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(20mL x2)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱(二氯甲烷:甲醇＝1:0至50:1)纯化残余物。得到呈黄色固体的4-[4-[3-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]丙氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(480mg，0.73mmol，72％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:661.2[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CHLOROFORM-d)δ8.26(s,1H),7.70(d,J＝8.4Hz,1H),7.29(d,J＝2.0Hz,1H),7.07-7.05(m,1H),6.91-6.81(m,4H),4.94(dd,J＝12.0,6.2Hz,1H),4.02-3.99(m,2H),3.59-3.56(m,4H),3.45-3.43(m,4H),3.02-3.00(m,4H),2.87-2.86(m,4H),2.62-2.59(m,4H),2.15-2.05(m,1H),2.01-1.98(m,2H),1.56-1.54(m,1H),1.48(s,9H)。化学式：C35H44N6O7，分子量：660.76
9.步骤–2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(4-(3-(4-(哌嗪-1-基)苯氧基)丙基)哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮HCl盐的合成
Figure BDA0002176933830004201
将4-[4-[3-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]丙氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(480mg，0.73mmol，1当量)在盐酸/二氧杂环己烷(8mL，4M)中的混合物在25℃下搅拌1小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需质量数的主峰。减压浓缩该混合物。得到呈黄色固体的粗制化合物2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-[3-(4-哌嗪-1-基苯氧基)丙基]哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮(500mg，粗制物，盐酸盐)，通过HNMR对其进行确认。LCMS：MS(ESI)m/z:561.3[M+1]+。1H NMR:(400MHz,MeOD)δ7.80(d,J＝8.8Hz,1H),7.51(d,J＝2.4Hz,1H),7.39(dd,J＝8.4,2.4Hz,1H),7.12(d,J＝9.2Hz,2H),6.99-6.97(m,2H),5.14-5.09(m,1H),4.22-4.15(m,2H),4.14-4.13(m,4H),3.75-3.73(m,4H),3.48-3.45(m,1H),3.44-3.41(m,8H),3.40-3.26(m,1H),2.79-2.78(m,1H),2.75-2.76(m,2H),2.35-2.34(m,2H),2.33-2.12(m,1H)。化学式：C30H36N6O5，分子量：560.64
10.步骤–2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-[3-[4-[4-[2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙基]哌嗪-1-基]苯氧基]丙基]哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830004202
向2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-[3-(4-哌嗪-1-基苯氧基)丙基]哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮(136mg，0.23mmol，1当量，盐酸盐)和2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙醛(100mg，0.23mmol，1当量)在二氯乙烷(5mL)中的混合物中添加三乙胺(46mg，0.46mmol，2当量)。将混合物在25℃下搅拌2小时。然后将三乙酰氧基硼氢化钠(96mg，0.46mmol，2当量)添加到该混合物中，并在25℃下搅拌10小时。LCMS显示形成具有所需质量数的新峰。减压浓缩该混合物。通过制备型薄层色谱(二氯甲烷:甲醇＝10:1，Rf＝0.15)纯化残余物。然后通过制备型HPLC[FA]纯化。得到呈黄色固体的2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-[3-[4-[4-[2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙基]哌嗪-1-基]苯氧基]丙基]哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮(13.7mg，0.01mmol，5％收率，93％纯度)，通过HNMR和LCMS对其进行确认。LCMS：MS(ESI)m/z:984.4[M+1]+。1H NMR:(400MHz,MeOD)δ8.67(s,1H),8.50(s,1H),7.96(d,J＝6.0Hz,1H),7.73(d,J＝8.8Hz,1H),7.43(d,J＝2.0Hz,1H),7.30(d,J＝8.4,2.4Hz,1H),6.98(d,J＝9.2Hz,2H),6.89(d,J＝8.8Hz,2H),6.42-6.38(m,1H),5.10-5.08(m,1H),4.94(s,2H),4.31-4.26(m,2H),4.07-4.04(m,2H),3.94-3.85(m,2H),3.60-3.58(m,4H),3.43-3.42(m,1H),3.42(s,3H),3.25-3.24(m,4H),3.23-3.20(m,6H),2.96-2.95(m,4H),2.89-2.87(m,3H),2.82-2.75(m,2H),2.12-2.10(m,3H),2.05-1.95(m,2H),1.73(d,J＝6.8Hz,6H),1.61-1.51(m,2H)。化学式：C52H65N13O7，分子量：984.16
实施例302的合成
(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004211
合成途径：
Figure BDA0002176933830004221
1.步骤–4-(4-((1r,3r)-3-(苄氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004222
向4-(4-羟基苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(1.5g，5.39mmol，1当量)和顺-3-苄氧基环丁醇(1.44g，8.08mmol，1.5当量)的甲苯(15mL)溶液中添加1,1’-(偶氮二羰基)二哌啶(2.72g，10.78mmol，2当量)和三丁基膦(2.18g，10.78mmol，2.66mL，2当量)。将该混合物在100℃下搅拌12小时。LCMS显示反应完成。将反应混合物用水(50mL)稀释，并用乙酸乙酯(30mL x 2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(30mL x 2)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤并真空浓缩。通过制备型高效液相色谱(甲酸缓冲洗脱液)纯化残余物，得到呈棕色固体的4-(4-((1r,3r)-3-(苄氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(750mg，1.71mmol，31％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:439.2[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：7.28-7.36(m,5H),6.89(d,J＝7.2Hz,2H),6.73(d,J＝7.2Hz,2H),4.80-4.83(m,1H),4.45(s,2H),4.32-4.35(m,1H),3.57-3.60(m,4H),3.00-3.03(m,4H),2.42-2.49(m,4H),1.49(s,9H)。化学式：C26H34N2O4，分子量：438.56
2.步骤–4-(4-((1r,3r)-3-羟基环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004223
向4-(4-((1r,3r)-3-(苄氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.9g，2.05mmol，1当量)在甲醇(20mL)和四氢呋喃(20mL)中的溶液中添加活性炭载钯催化剂(0.2g，10％纯度)，将该混合物用氢气脱气并吹扫若干次，然后在氢气(15psi)气氛下，在25℃下搅拌12小时。通过LCMS观察所需MS，薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示检测到一个主要新斑点。过滤混合物；减压浓缩滤液。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至3/1)纯化残余物，得到呈浅黄色固体的4-(4-((1r,3r)-3-羟基环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.62g，1.78mmol，86％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:349.1[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：6.86-6.91(m,2H),6.71-6.76(m,2H),4.80-4.88(m,1H),4.58-4.69(m,1H),3.54-3.62(m,4H),2.97-3.05(m,4H),2.46-2.55(m,2H),2.34-2.44(m,2H),1.49(s,9H)。化学式：C19H28N2O4，分子量：348.44
3.步骤–4-(4-((1r,3r)-3-(2-乙氧基-2-氧代乙氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004231
向4-(4-((1r,3r)-3-羟基环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.56g，1.61mmol，1当量)和2-二偶氮乙酸乙酯(733mg，6.43mmol，4当量)的二氯甲烷(20mL)溶液中添加乙酸铑(II)(18mg，0.08mmol，0.05当量)，将该混合物在25℃下搅拌2小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个主要新斑点。减压浓缩该混合物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)纯化残余物，得到呈浅黄色固体的4-(4-((1r,3r)-3-(2-乙氧基-2-氧代乙氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.42g，0.96mmol，60％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：6.85-6.92(m,2H),6.67-6.76(m,2H),4.76-4.85(m,1H),4.32-4.37(m,1H),4.24(q,J＝7.2Hz,1H),4.02(s,2H),3.57(t,J＝4.8Hz,4H),3.00(t,J＝4.8Hz,4H),2.40-2.56(m,4H),1.49(s,9H),1.30(t,J＝7.2Hz,3H)。化学式：C23H34N2O6，分子量：434.53
4.步骤–2-((1r,3r)-3-(4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酸的合成
Figure BDA0002176933830004232
向4-(4-((1r,3r)-3-(2-乙氧基-2-氧代乙氧基)环丁氧基)苯基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.42g，0.96mmol，1当量)在四氢呋喃(10mL)和水(1mL)中的溶液中添加氢氧化锂(69mg，2.90mmol，3当量)，将该混合物在50℃下搅拌2小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示起始材料被完全消耗，并且通过LCMS检测到所需MS。减压浓缩该混合物，用水(20mL)稀释残余物，用盐酸(1M)将水相的pH调节至6，然后用乙酸乙酯(20mL x 3)萃取，将有机层在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到呈浅黄色油状物的2-((1r,3r)-3-(4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酸(0.32g，0.79mmol，81％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:407.1[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：6.89(d,J＝8.8Hz,2H),6.71(d,J＝8.8Hz,2H),4.69-4.79(m,1H),4.19-4.29(m,1H),3.94(s,2H),3.41-3.45(m,4H),2.74-3.00(m,4H),2.37-2.42(m,2H),2.21-2.29(m,2H),1.41(s,9H)。化学式：C21H30N2O6，分子量：406.47
5.步骤–4-[4-[(1s,3r)-3-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2,2-二甲基-丙基]氨基]-2-氧代-乙氧基]环丁氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯的合成
Figure BDA0002176933830004241
向2-[(1r,3r)-3-[4-(4-叔丁氧基羰基哌嗪-1-基)苯氧基]环丁氧基]乙酸(0.31g，0.76mmol，1当量)和(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(328mg，0.76mmol，1当量)的N,N-二甲基甲酰胺(5mL)溶液中添加1-羟基苯并三唑(154mg，1.14mmol，1.5当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(219mg，1.14mmol，1.5当量)和N,N-二异丙基乙胺(295mg，2.29mmol，0.4mL，3当量)，将该混合物在25℃下搅拌4小时。通过LCMS观察所需MS。将该混合物用水(50mL)稀释，然后用乙酸乙酯(30mL x 3)萃取，将有机层用盐水(50mL x 2)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩。通过硅胶色谱(乙酸乙酯/甲醇＝10/1)纯化残余物，得到呈浅黄色油状物的4-[4-[(1s,3r)-3-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2,2-二甲基-丙基]氨基]-2-氧代-乙氧基]环丁氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.4g，0.49mmol，64％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:819.3[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.68(s,1H),7.31-7.40(m,5H),6.87(d,J＝8.8Hz,2H),6.72(d,J＝8.8Hz,2H),4.71-4.83(m,2H),4.52-4.56(m,2H),4.24-4.38(m,2H),4.07-4.12(m,1H),3.80-3.90(m,2H),3.56(t,J＝5.2Hz,4H),2.99(t,J＝5.2Hz,4H),2.55-2.59(m,1H),2.52(s,3H),2.42-2.47(m,4H),2.08-2.17(m,2H),2.05(d,J＝4.8Hz,1H),1.48(s,9H),0.95(s,9H)。化学式：C43H58N6O8S，分子量：819.02
6.步骤–(2S,4R)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐的合成
将4-[4-[(1s,3r)-3-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2,2-二甲基-丙基]氨基]-2-氧代-乙氧基]环丁氧基]苯基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.4g，0.49mmol，1当量)的盐酸/二氧杂环己烷(4M，5mL)溶液在25℃下搅拌1小时。通过LCMS观察所需MS。减压浓缩该混合物。通过制备型高效液相色谱(色谱柱：Phenomenex Synergi C18 150*25*10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：15％-42％，9分钟)纯化残余物，得到呈无色油状物的(2S,4R)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(200mg，0.26mmol，54％收率，盐酸盐)。LCMS：MS(ESI)m/z:719.1[M+1]+。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：9.01(s,3H),8.61(s,1H),7.37-7.48(m,5H),6.93(d,J＝7.8Hz,2H),6.75(d,J＝8.8Hz,2H),4.73-4.82(m,1H),4.56(d,J＝9.6Hz,1H),4.33-4.49(m,3H),4.24-4.29(m,2H),3.85-3.92(m,2H),3.59-3.65(m,4H),3.16-3.25(m,8H),2.44(s,3H),2.22-2.30(m,2H),2.03-2.10(m,1H),1.85-1.92(m,1H),0.94(s,9H)。化学式：C38H51ClN6O6S，分子量：755.37
7.步骤–(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004252
向(2S,4R)-1-((S)-3,3-二甲基-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(50mg，0.07mmol，1当量，盐酸盐)在甲醇(1mL)和二氯甲烷(1mL)中的溶液中添加乙酸钠(22mg，0.26mmol，4当量)，将该混合物在25℃下搅拌0.5小时，然后添加2-[[1-异丙基-6-[[2-(4-甲氧基-1-哌啶基)嘧啶-4-基]氨基]咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基]甲氧基]乙醛(29mg，0.07mmol，1当量)，将该混合物在25℃下搅拌1小时，然后添加氰基硼氢化钠(8mg，0.13mmol，2当量)，将该混合物在25℃下搅拌0.5小时。通过LCMS观察所需MS。减压浓缩该混合物。通过制备型高效液相色谱(色谱柱：Boston Green ODS 150*30 5u；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：18％-45％，10分钟)纯化残余物，得到呈灰白色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-2-(2-((1r,3s)-3-(4-(4-(2-((1-异丙基-6-((2-(4-甲氧基哌啶-1-基)嘧啶-4-基)氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)甲氧基)乙基)哌嗪-1-基)苯氧基)环丁氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(29.6mg，0.02mmol，37％收率，98.8％纯度，甲酸盐)。LCMS：MS(ESI)m/z:1142.6[M+1]+。1HNMR:(400MHz,MeOD)δ：8.84(m,1H),8.64(s,1H),8.47(s,1H),8.37(brs,1H),7.94(d,J＝6.0Hz,1H),7.38-7.48(m,4H),6.88-6.94(m,2H),6.70-6.76(m,2H),6.36(d,J＝6.0Hz,1H),4.90-4.95(m,3H),4.70-4.82(m,2H),4.46-4.62(m,3H),4.21-4.39(m,4H),3.79-4.02(m,6H),3.43-3.57(m,3H),3.38(s,3H),3.08-3.20(m,9H),2.66(s,1H),2.43-2.55(m,5H),2.32-2.41(m,2H),2.18-2.28(m,1H),2.04-2.15(m,1H),1.93-2.01(m,2H),1.69(d,J＝6.8Hz,6H),1.51-1.62(m,2H),1.04(m,9H)。化学式：C60H79N13O8S，分子量：1142.42
实施例307的合成
2-(7-((4-(3-(4-(4-(2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-5-基)哌嗪-1-基)哌啶-1-基)丙氧基)丁基)氨基)-1-氧代异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基苯基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺
Figure BDA0002176933830004261
合成途径：
Figure BDA0002176933830004271
1.步骤–2-(溴甲基)-6-硝基-苯甲酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004272
向2-甲基-6-硝基-苯甲酸甲酯(2.6g，13.32mmol，1当量)的四氯化碳(25mL)溶液中添加过氧化苯甲酰(322mg，1.33mmol，0.1当量)和NBS(2.49g，13.99mmol，1.05当量)。将混合物在80℃下搅拌10小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝10/1)显示起始材料被完全消耗。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(20mL)稀释，然后用乙酸乙酯(50mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝30/1)纯化残余物，得到呈白色固体的产物2-(溴甲基)-6-硝基-苯甲酸甲酯(2.2g，8.03mmol，60％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.08(d,J＝8.0Hz,1H),7.77(d,J＝8.0Hz,1H),7.60(t,J＝8.0Hz,1H),4.58(s,2H),3.99(s,3H)。化学式：C9H8BrNO4，分子量：274.07
2.步骤–4-(3-苄氧基丙氧基)丁-1-醇的合成
Figure BDA0002176933830004273
将丁烷-1,4-二醇(2.36g，26.19mmol，2.3mL，1.2当量)、氢化钠(960mg，24.01mmol，60％的矿物油溶液，1.1当量)在四氢呋喃(50mL)中的混合物用氮气脱气并吹扫3次，并且在25℃下搅拌2小时，然后向该混合物中添加3-溴丙氧基甲基苯(5g，21.82mmol，3.8mL，1当量)，并在氮气气氛下，在70℃下搅拌10小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示起始材料被完全消耗，并且形成一个新斑点。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(40mL)稀释，然后用乙酸乙酯(100mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)纯化残余物，得到呈无色油状物的4-(3-苄氧基丙氧基)丁-1-醇(1.2g，5.04mmol，23％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：7.30-7.40(m,5H),4.51(s,2H),3.64(t,J＝5.6Hz,2H),3.54-3.57(m,4H),3.47(t,J＝5.6Hz,2H),1.88-1.91(m,2H),1.65-1.70(m,4H)。化学式：C14H22O3，分子量：238.32
3.步骤–4-(3-苄氧基丙氧基)丁醛的合成
Figure BDA0002176933830004281
向4-(3-苄氧基丙氧基)丁-1-醇(1.2g，5.04mmol，1当量)的二氯甲烷(50mL)溶液中添加1,1,1-三乙酰氧基-1,1-二氢-1,2-苯碘酰-3(1H)-酮(3.20g，7.55mmol，1.5当量)。将混合物在25℃下搅拌1小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个新斑点。过滤混合物，减压浓缩滤液，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)纯化残余物，得到呈黄色油状物的4-(3-苄氧基丙氧基)丁醛(0.9g，3.81mmol，75％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：9.76(s,1H),7.28-7.38(m,5H),4.51(s,2H),3.53(dt,J＝16.4,6.4Hz,4H),3.44(t,J＝6.4Hz,2H),2.47-2.51(m,2H),1.81-1.94(m,4H)。化学式：C14H20O3，分子量：236.31
4.步骤–2-(苄氧基)-5-氟苯甲醛的合成
Figure BDA0002176933830004282
向5-氟-2-羟基-苯甲醛(25g，178.43mmol，1当量)的N,N-二甲基甲酰胺(250mL)溶液中添加碳酸钾(49.32g，356.86mmol，2当量)和溴甲基苯(36.62g，214.12mmol，25.4mL，1.2当量)。将混合物在50℃下搅拌2小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)显示起始材料被完全消耗，并且形成一个新斑点。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(500mL)稀释，然后用乙酸乙酯(400mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(500mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)纯化残余物，得到呈白色固体的产物2-苄氧基-5-氟-苯甲醛(40g，173.74mmol，97％收率)。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)δ：10.37(s,1H),7.49-7.57(m,3H),7.35-7.44(m,5H),5.29(s,2H)。化学式：C14H11FO2，分子量：230.07
5.步骤–2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙腈的合成
Figure BDA0002176933830004291
向氯化铵(18.59g，347.47mmol，2当量)的甲醇(200mL)溶液中添加三甲基甲硅烷基氰化物(25.85g，260.60mmol，32.6mL，1.5当量)和氢氧化铵(1.95mol，300mL，25％纯度，11.21当量)，在30分钟后，将该溶液添加到2-苄氧基-5-氟-苯甲醛(40g，173.74mmol，1当量)的甲醇(400mL)溶液中。将混合物在25℃下搅拌20小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个新斑点。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(200mL)稀释，然后用乙酸乙酯(400mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(300mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黑色油状物的2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙腈(50g，粗制物)。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)δ：7.52(d,J＝7.2Hz,2H),7.31-7.43(m,4H),7.13-7.20(m,2H),5.20(s,2H),5.08(s,1H),2.89(brs,2H)。化学式：C15H13N2FO，分子量：256.27
6.步骤–2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004292
将2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙腈(50g，195.10mmol，1当量)的盐酸/甲醇(4M，500mL)溶液在25℃下搅拌10小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩反应混合物。用水(400mL)稀释残余物，用氢氧化铵(25％)将水相的pH调节至7-8，然后用乙酸乙酯(500mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(400mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝5/1)纯化残余物，得到呈棕色油状物的产物2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙酸甲酯(45g，155.55mmol，79％收率)。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)δ：7.38-7.46(m,4H),7.31-7.36(m,1H),7.22-7.27(m,1H),7.05-7.10(m,2H),5.10(s,2H),4.71(s,1H),3.52(s,3H),3.34(brs,2H)。化学式：C16H16FNO3，分子量：289.30。
7.步骤–2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)-2-(7-硝基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004293
向2-氨基-2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)乙酸甲酯(3.2g，11.06mmol，1当量)的N,N-二甲基甲酰胺(20mL)溶液中添加二异丙基乙胺(2.86g，22.12mmol，3.8mL，2.0当量)和2-(溴甲基)-6-硝基-苯甲酸甲酯(3.03g，11.06mmol，1当量)，将该混合物在50℃下搅拌5小时。然后将该混合物在100℃下搅拌10小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(20mL)稀释，然后用乙酸乙酯(50mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝3/1)纯化残余物，得到呈白色固体的2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)-2-(7-硝基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(4g，8.88mmol，80％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:451.1[M+1]+1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)δ：7.91-7.95(m,1H),7.81-7.87(m,2H),7.36-7.41(m,2H),7.26-7.34(m,5H),7.23(d,J＝8.4Hz,1H),6.20(s,1H),5.17(q,J＝12.0Hz,2H),4.64(d,J＝18.0Hz,1H),4.12(d,J＝18.0Hz,1H),3.60(s,3H)。化学式：C24H19FN2O6，分子量：450.42
8.步骤–2-(7-氨基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004301
向2-(2-苄氧基-5-氟-苯基)-2-(7-硝基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)乙酸甲酯(4g，8.88mmol，1当量)的四氢呋喃(150mL)溶液中添加活性炭载钯催化剂(0.5g，10％纯度)，并用氢气吹扫3次，然后在氢气(15Psi)下，将该混合物在25℃下搅拌10小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需m/z的主峰。将反应混合物通过硅藻土过滤并减压浓缩，得到呈黄色油状物的2-(7-氨基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯(3.8g，粗制物)，将其用于下一步骤，无需进一步纯化。LCMS：MS(ESI)m/z:331.2[M+1]+。1H NMR:EW8426-36-P1A,(400MHz,DMSO-d6)δ：9.99(s,1H),7.21(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-7.10(m,2H),6.83-6.90(m,1H),6.59(t,J＝8.0Hz,2H),6.04-6.07(m,3H),4.49(d,J＝17.6Hz,1H),3.87(d,J＝17.6Hz,1H),3.70(s,3H)。化学式：C17H15FN2O4，分子量：330.31。
9.步骤–2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004302
向2-(7-氨基-1-氧代-异吲哚啉-2-基)-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯(1.40g，4.23mmol，1当量)在乙酸(2mL)和甲醇(20mL)中的溶液中添加4-(3-苄氧基丙氧基)丁醛(1.0g，4.23mmol，1当量)，将该混合物在25℃下搅拌1小时。然后添加硼烷；2-甲基吡啶(905mg，8.46mmol，2当量)，将该混合物在25℃下搅拌1小时。LCMS显示检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩该混合物。将残余物用水(20mL)稀释，然后用乙酸乙酯(50mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过制备型高效液相色谱(甲酸条件)纯化残余物，得到呈黄色油状物的2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯(1.5g，2.72mmol，64％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:551.2[M+1]+1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：10.00(s,1H),7.23-7.37(m,6H),6.99-7.10(m,2H),6.88(dd,J＝8.8,4.8Hz,1H),6.52-6.66(m,3H),6.04(s,1H),4.50(d,J＝17.6Hz,1H),4.43(s,2H),3.88(d,J＝17.6Hz,1H),3.68(s,3H),3.36-3.49(m,6H),3.06-3.25(m,2H),1.74-1.77(m,2H),1.51-1.63(m,4H)。化学式：C31H35FN2O6，分子量：550.62。
10.步骤–2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004311
向2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-羟基-苯基)乙酸甲酯(1.2g，2.18mmol，1当量)的四氢呋喃(12mL)溶液中添加3,4-二氢-2H-吡喃(366mg，4.36mmol，0.4mL，2当量)和对甲苯磺酸(41mg，0.22mmol，0.1当量)，将该混合物在25℃下搅拌4小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝2/1)显示起始材料残留；检测到一个具有较低极性的主要新斑点。减压浓缩该混合物。通过硅胶色谱(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至3/1)纯化残余物，得到呈浅黄色油状物的2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)乙酸甲酯(0.8g，1.26mmol，57％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：7.28-7.34(m,4H),7.11-7.25(m,2H),6.91-7.08(m,2H),6.43-6.74(m,3H),6.31-6.36(m,1H),5.19-5.55(m,1H),4.88-4.96(m,1H),4.57-4.73(m,1H),4.51(s,2H),4.01-4.05(m,1H),3.92-3.95(m,1H),3.76-3.80(m,3H),3.51-3.59(m,6H),3.20-3.29(m,2H),1.86-1.91(m,2H),1.68-1.75(m,4H),1.60-1.65(m,4H),1.53-1.57(m,2H)。化学式：C36H43FN2O7，分子量：634.73。
11.步骤–2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]乙酸甲酯的合成
Figure BDA0002176933830004321
将2-[7-[4-(3-苄氧基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基苯基)乙酸甲酯(0.8g，1.26mmol，1当量)、活性炭载钯催化剂(0.1g，10％纯度)在四氢呋喃(10mL)中的混合物用氢气脱气并吹扫3次，然后在氢气(15Psi)气氛下，将该混合物在25℃下搅拌3小时。薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝1/1)显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个新斑点。过滤该混合物，减压浓缩滤液，得到呈黄色油状物的2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]乙酸甲酯(0.5g，0.92mmol，72％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：7.28-7.31(m,1H),7.12-7.23(m,1H),6.97-7.03(m,2H),6.64(s,1H),6.48-6.57(m,2H),6.32(s,1H),5.23-5.51(m,1H),4.54-4.71(m,1H),3.92-4.01(m,1H),3.76-3.81(m,5H),3.66-3.72(m,1H),3.61-3.64(m,2H),3.45-3.57(m,3H),3.24-3.26(m,2H),1.82-1.94(m,3H),1.61-1.80(m,9H)。化学式：C29H37FN2O7，分子量：544.61
12.步骤–2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]乙酸的合成
Figure BDA0002176933830004322
向2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代异吲哚啉-2-基]乙酸甲酯(0.5g，0.92mmol，1当量)在四氢呋喃(10mL)和水(2mL)中的溶液中添加氢氧化锂(24mg，1.01mmol，1.1当量)。将混合物在25℃下搅拌1小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需质量数的峰。减压浓缩反应混合物。用水(10mL)稀释残余物，用盐酸(1M)将水相的pH调节至5-6，然后用乙酸乙酯(20mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黄色油状物的化合物2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]乙酸(0.35g，0.65mmol，70％收率，98％纯度)。LCMS：MS(ESI)m/z:531.3[M+1]+1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)δ：7.28-7.31(m,1H),7.07-7.24(m,3H),6.59-6.63(m,3H),6.07-6.09(m,1H),5.38-5.67(m,1H),4.50-4.57(m,1H),4.38(t,J＝5.2Hz,1H),3.73-3.95(m,2H),3.40-3.47(m,6H),3.17-3.25(m,2H),1.57-1.81(m,12H)。化学式：C28H35FN2O7，分子量：530.59
13.步骤–2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004331
向2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]乙酸(0.35g，0.65mmol，1当量)的N,N-二甲基甲酰胺(5mL)溶液中添加二异丙基乙胺(167mg，1.29mmol，2当量)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸酯(491mg，1.29mmol，2当量)，然后添加噻唑-2-胺(97mg，0.97mmol，1.5当量)，将该混合物在25℃下搅拌1小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(20mL)稀释，然后用乙酸乙酯(20mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过制备型薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝1/1，Rf＝0.24)纯化残余物，得到呈黄色油状物的2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺(0.3g，0.49mmol，75％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:613.1[M+1]+1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：7.42-7.46(m,1H),7.30-7.35(m,1H),7.12-7.26(m,2H),6.93-7.09(m,2H),6.42-6.71(m,4H),5.17-5.52(m,1H),4.59-4.82(m,1H),4.07-4.15(m,1H),3.77-3.79(m,2H),3.61-3.64(m,2H),3.39-3.54(m,4H),3.25-3.29(m,2H),1.74-1.89(m,12H)。化学式：C31H37FN4O6S，分子量：612.71
14.步骤–2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[1-氧代-7-[4-(3-氧代丙氧基)丁基氨基]异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004332
向2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[7-[4-(3-羟基丙氧基)丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺(300mg，0.49mmol，1当量)的二氯甲烷(50mL)溶液中添加1,1,1-三乙酰氧基-1,1-二氢-1,2-苯碘酰-3(1H)-酮(311mg，0.73mmol，1.5当量)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。高效液相色谱显示起始材料被完全消耗。将反应混合物过滤并减压浓缩，得到残余物。通过制备型薄层色谱(石油醚/乙酸乙酯＝1/1，Rf＝0.14)纯化残余物，得到呈黄色固体的2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[1-氧代-7-[4-(3-氧代丙氧基)丁基氨基]异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺(160mg，0.26mmol，53％收率)。1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：9.81(s,1H),7.43-7.47(m,1H),7.30-7.35(m,1H),7.13-7.25(m,2H),7.02-7.10(m,1H),6.97-7.00(m,1H),6.53-6.63(m,4H),5.15-5.52(m,1H),4.58-4.84(m,1H),4.04-4.16(m,1H),3.78(t,J＝6.4Hz,2H),3.42-3.50(m,4H),3.24-3.28(m,2H),2.68(t,J＝6.4Hz,2H),1.66-1.85(m,10H)。化学式：C31H35FN4O6S，分子量：610.70
15.步骤–4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯的合成
向2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-哌嗪-1-基-异吲哚啉-1,3-二酮(1g，2.64mmol，1当量，盐酸盐)在二氯甲烷溶液(5mL)和甲醇(5mL)中的溶液中添加乙酸钠(866mg，10.56mmol，4当量)，将该混合物在25℃下搅拌1小时，然后添加4-氧代哌啶-1-羧酸叔丁酯(526mg，2.64mmol，1当量)，将该混合物在25℃下搅拌4小时，然后添加氰基硼氢化钠(331mg，5.28mmol，2当量)，将该混合物在25℃下再搅拌7小时。通过LCMS观察所需MS。减压浓缩该混合物。通过制备型高效液相色谱(色谱柱：Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：20ACN％-50ACN％，30分钟，87％min)纯化残余物，得到呈黄色固体的4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(0.68g，1.29mmol，49.01％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:526.3[M+1]+。1H NMR:(400MHz,MeOD)δ：8.24(s,1H),7.71(d,J＝8.4Hz,1H),7.40(d,J＝2.4Hz,1H),7.27(dd,J＝8.4,2.4Hz,1H),5.05-5.10(m,1H),4.15-4.20(m,2H),3.50-3.61(m,4H),2.95-3.05(m,4H),2.63-2.88(m,6H),2.06-2.17(m,1H),1.98-2.05(m,2H),1.47-1.53(m,2H),1.46(s,9H)。化学式：C27H35N5O6，分子量：525.60
16.步骤–2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-(4-哌啶基)哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮的合成
Figure BDA0002176933830004342
将4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(0.54g，1.03mmol，1当量)的盐酸/1,4-二氧杂环己烷(4M，10mL)溶液在25℃下搅拌1小时。通过LCMS观察所需MS。减压浓缩混合物，得到呈黄色固体的2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-(4-哌啶基)哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮(0.48g，0.96mmol，94％收率，93％纯度，盐酸盐)。LCMS：MS(ESI)m/z:426.2[M+1]+。化学式：C22H27N5O4，分子量：425.48
17.步骤–2-[7-[4-[3-[4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]-1-哌啶基]丙氧基]丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-N-噻唑-2-基-乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004351
向2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-5-[4-(4-哌啶基)哌嗪-1-基]异吲哚啉-1,3-二酮的溶液(83mg，0.18mmol，1当量)在二氯甲烷(0.5mL)和甲醇(0.5mL)中的溶液中添加乙酸钠(59mg，0.72mmol，4当量)，将该混合物在25℃下搅拌0.5小时，然后添加2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-2-[1-氧代-7-[4-(3-氧代丙氧基)丁基氨基]异吲哚啉-2-基]-N-噻唑-2-基-乙酰胺(110mg，0.18mmol，1当量)，将该混合物搅拌0.5小时，然后添加氰基硼氢化钠(22mg，0.36mmol，2当量)，将该混合物在25℃下搅拌0.5小时。LCMS显示起始材料被完全消耗，并且检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(20mL)稀释，然后用乙酸乙酯(10mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL x 3)洗涤，在无水硫酸钠上干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。通过制备型薄层色谱(二氯甲烷/甲醇＝10/1，Rf＝0.24)纯化残余物，得到呈黄色固体的2-[7-[4-[3-[4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]-1-哌啶基]丙氧基]丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-N-噻唑-2-基-乙酰胺(40mg，0.04mmol，21％收率)。LCMS：MS(ESI)m/z:1020.2[M+1]+。化学式：C53H62FN9O9S，分子量：1020.18
18.步骤–2-[7-[4-[3-[4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]-1-哌啶基]丙氧基]丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-羟基-苯基)-N-噻唑-2-基-乙酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004352
向2-[7-[4-[3-[4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]-1-哌啶基]丙氧基]丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-四氢吡喃-2-基氧基-苯基)-N-噻唑-2-基-乙酰胺(0.04g，0.04mmol，1当量)的乙酸乙酯(0.5mL)溶液中添加盐酸/乙酸乙酯(4M，0.5mL)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。LCMS显示检测到一个具有所需m/z的主峰。减压浓缩反应混合物。通过制备型高效液相色谱(甲酸作为添加剂)纯化残余物，得到呈黄色固体的2-[7-[4-[3-[4-[4-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1,3-二氧代-异吲哚啉-5-基]哌嗪-1-基]-1-哌啶基]丙氧基]丁基氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]-2-(5-氟-2-羟基-苯基)-N-噻唑-2-基-乙酰胺(19.2mg，0.02mmol，49％收率，98％纯度，甲酸盐)。LCMS：MS(ESI)m/z:936.2[M+1]+1H NMR:(400MHz,CDCl3)δ：8.64(s,1H),7.70(d,J＝8.8Hz,1H),7.42(d,J＝3.6Hz,1H),7.28-7.33(m,1H),7.10-7.15(m,1H),7.02-7.05(m,1H),6.98(d,J＝3.6Hz,1H),6.90-6.94(m,2H),6.72(s,1H),6.53-6.60(m,2H),6.48(d,J＝8.4Hz,1H),4.86-4.98(m,2H),4.13(d,J＝17.2Hz,1H),3.45-3.55(m,5H),3.35-3.42(m,4H),3.22-3.28(m,2H),3.10-3.18(m,2H),2.67-2.94(m,6H),2.62-2.66(m,4H),2.42-2.47(m,2H),1.95-2.11(m,8H),1.68-1.75(m,2H)。化学式：C48H54FN9O8S，分子量：936.06
实施例320的合成
(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0002176933830004361
合成方案：
Figure BDA0002176933830004362
1.步骤–2-[2-[2-[2-[2-[[5-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-2-呋喃基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸的合成
在室温下，向[5-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-2-呋喃基]甲醇(1)(47.59mg，0.1mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(1.5ml)溶液中添加NaH(60％，13mg，0.32mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌30分钟。然后添加2-[2-[2-[2-[2-(对甲苯磺酰氧基)-乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸叔丁酯(69.38mg，0.15mmol)，并将反应混合物在室温下搅拌20分钟，然后在70℃外部温度(油浴)下搅拌12小时(过夜)。在高真空下去除溶剂，并通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)纯化粗产物，得到15mg产物2-[2-[2-[2-[2-[[5-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-2-呋喃基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.71(s,1H),8.94(s,1H),8.54(s,1H),8.15(dd,J＝8.7,1.6Hz,1H),8.08(d,J＝2.4Hz,1H),7.84–7.74(m,2H),7.47(td,J＝8.0,6.0Hz,1H),7.37–7.28(m,3H),7.25(d,J＝9.1Hz,1H),7.18(td,J＝8.7,2.2Hz,1H),7.11(d,J＝3.3Hz,1H),6.64(d,J＝3.3Hz,1H),5.25(s,2H),4.55(s,2H),3.76(s,2H),3.70–3.39(m,16H)。LC-MS(ESI)；m/z[M+H]+：C36H38ClFN3O9计算值：710.2280。实测值：710.2403。
2.步骤–(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺的合成
Figure BDA0002176933830004372
在室温下，向2-[2-[2-[2-[2-[[5-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-2-呋喃基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸(3)(10mg，0.01mmol)和(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(5)(7mg，0.015mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2mL)溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.1ml，0.6mmol)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’酯-四甲基脲六氟磷酸酯(8mg，0.021mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌12小时(过夜)。TLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)显示无起始材料。将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，干燥(Na2SO4)并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)纯化粗产物，得到7mg产物(2S,4R)-1-((S)-18-(叔丁基)-1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-16-氧代-2,5,8,11,14-五氧杂-17-氮杂十九烷-19-酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(44％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.98(s,1H),8.97(s,1H),8.76(s,1H),8.67–8.57(m,1H),8.55(s,1H),8.17(d,J＝8.5Hz,1H),8.00(s,1H),7.80(d,J＝8.7Hz,1H),7.74(d,J＝10.3Hz,1H),7.64–7.24(m,9H),7.19(t,J＝8.2Hz,1H),7.09(d,J＝2.8Hz,1H),6.65(d,J＝2.7Hz,1H),5.26(s,2H),5.15(d,1H),4.61–4.54(m,1H),4.54(s,2H),4.49–4.15(m,6H),3.94(s,2H),3.73–3.40(m,17H),2.43(s,3H),2.11–2.01(m,1H),1.95–1.84(m,1H),0.93(s,9H)。LC-MS(ESI)；m/z[M+H]+：C58H66ClFN7O11S计算值：1122.4213。实测值：1122.0。
实施例349的合成
1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-N-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氧基)乙基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-酰胺
Figure BDA0002176933830004381
合成方案：
Figure BDA0002176933830004382
1.步骤–1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-N-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氧基)乙基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-酰胺的合成
在室温下，向2-[2-[2-[2-[2-[[5-[4-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯胺基]喹唑啉-6-基]-2-呋喃基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙酸(7mg，0.01mmol)和4-(2-氨基乙氧基)-2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)异吲哚啉-1,3-二酮2,2,2-三氟乙酸盐(6.38mg，0.01mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2ml)溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.1ml，0.6mmol)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲六氟磷酸酯(5.62mg，0.01mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌12小时(过夜)。TLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)显示无起始材料。将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，干燥(Na2SO4)并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)纯化粗产物，得到7.2mg产物1-(5-(4-((3-氯-4-((3-氟苄基)氧基)苯基)氨基)喹唑啉-6-基)呋喃-2-基)-N-(2-((2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-1,3-二氧代异吲哚啉-4-基)氧基)乙基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-1,6-酰胺(72％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.27(s,1H),9.14(s,1H),7.93(s,1H),7.72(s,1H),7.34(dd,J＝8.8,1.7Hz,1H),7.18(d,J＝2.6Hz,1H),7.08–6.87(m,4H),6.76–6.56(m,3H),6.56–6.42(m,3H),6.36(td,J＝8.8,2.3Hz,1H),6.26(d,J＝3.3Hz,1H),5.82(d,J＝3.3Hz,1H),4.44(s,2H),4.25(dd,J＝12.7,5.4Hz,1H),3.71(s,2H),3.43(t,J＝6.0Hz,2H),2.87–2.58(m,16H),2.12–1.99(m,1H),1.80–1.60(m,2H),1.23–1.13(m,1H)。13C NMR(151MHz,DMSO-d6)δ172.76,169.89,169.70,166.76,165.19,163.00,161.39,157.63,155.56,154.37,152.52,152.30,149.79,149.03,139.68,139.63,136.97,133.23,133.03,130.60,130.54,128.82,128.52,128.05,124.42,123.35,123.33,122.62,121.00,119.98,116.70,116.48,115.52,115.32,114.77,114.63,114.25,114.11,113.97,112.24,107.89,70.21,69.86,69.77,69.74,69.72,69.50,69.39,69.38,68.89,67.09,64.17,48.74,37.35,30.94,22.00。LC-MS(ESI)；m/z[M+H]+：C51H51ClFN6O13计算值：1009.3186。实测值：1009.3224。
实施例350和351的合成
Figure BDA0002176933830004391
3-(3-(3-氯丙氧基)丙氧基)丙酸叔丁酯(1)。向3-(3-氯丙氧基)丙-1-醇(66mg，0.43mmol)的乙腈(3mL)溶液中添加丙-2-烯酸叔丁酯(0.31ml，2.16mmol)，然后添加TritonB(54mg，0.1mmol，40重量％水溶液)。将该混合物在室温下搅拌72小时。真空浓缩该混合物，并通过柱色谱(iO2，梯度Hex:EtOAc，95:5至9:1)纯化粗产物，得到115mg产物(1)，呈油状物(94％收率)。1H NMR(500MHz,Chloroform-d)δ3.70–3.59(m,4H),3.59–3.42(m,6H),2.47(t,J＝6.5Hz,2H),2.04–1.96(m,2H),1.82(p,J＝6.3Hz,2H),1.45(s,9H)。13C NMR(151MHz,氯仿-d)δ171.13,80.63,68.02,67.97,67.27,66.64,42.17,36.50,32.88,30.09,28.25。LC-MS(ESI)；m/z[M+Na]+：C13H25ClO4Na计算值：303.1339。实测值：303.1381。
3-(3-(3-碘丙氧基)丙氧基)丙酸叔丁酯(2)。向3-[3-(3-氯丙氧基)丙氧基]丙酸叔丁酯(161mg，0.57mmol)的丙酮(5ml)溶液中添加NaI(429mg，2.87mmol)。将反应混合物在回流温度下搅拌24小时，然后真空去除溶剂，将粗产物溶解于EtOAc(15mL)中，用水(10mL)洗涤，并用Na2SO3水溶液(10％，10mL)洗涤。将有机层分离，用水(10mL)洗涤，干燥(Na2SO4)并真空蒸发。通过NMR纯化粗产物(>98％纯度，186mg，87％收率)，将产物(2)用于下一步骤，无需任何进一步纯化。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ3.66(t,J＝6.5Hz,2H),3.57–3.40(m,6H),3.27(t,J＝6.8Hz,2H),2.48(t,J＝6.5Hz,2H),2.08–1.99(m,2H),1.82(p,J＝6.4Hz,2H),1.45(s,9H)。13C NMR(151MHz,氯仿-d)δ171.13,80.64,70.18,68.01,67.98,66.65,36.50,33.57,30.10,28.26,3.72。LC-MS(ESI)：m/z[M+Na]+C13H25IO4Na计算值：395.0695，实测值：395.0719。
Figure BDA0002176933830004401
3-(3-(3-((4-(2-氟-4-(1-((4-氟苯基)氨基甲酰基)环丙烷-1-甲酰胺基)-苯氧基)-6-甲氧基喹啉-7-基)氧基)丙氧基)丙氧基)丙酸叔丁酯(12)。向N1’-[3-氟-4-[(7-羟基-6-甲氧基-4-喹啉基)氧基]苯基]-N1-(4-氟苯基)环丙烷-1,1-二甲酰胺(11)(15mg，0.03mmol)和3-[3-(3-碘丙氧基)丙氧基]丙酸叔丁酯(2)(16.57mg，0.04mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(1mL)中的混合物中添加Cs2CO3(29.01mg，0.09mmol)。在室温下搅拌12小时(过夜)后，将反应混合物用AcOEt(20mL)稀释并用水(5x10mL)洗涤，真空蒸发有机相。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，92:7:1)纯化粗产物，得到15mg产物(12)(67％收率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.39(s,1H),10.01(s,1H),8.46(d,J＝5.2Hz,1H),7.90(d,J＝13.2Hz,1H),7.71–7.58(m,2H),7.51(d,J＝7.4Hz,2H),7.46–7.35(m,2H),7.15(t,J＝8.9Hz,2H),6.41(d,J＝5.1Hz,1H),4.21(t,J＝6.2Hz,2H),3.95(s,3H),3.60–3.37(m,8H),2.37(d,J＝12.2Hz,2H),2.04(p,J＝6.4Hz,2H),1.71(p,J＝6.4Hz,2H),1.47(s,4H),1.37(s,9H)。13CNMR(151MHz,DMSO-d6)δ170.45,168.27,167.87,159.29,159.07,157.48,154.07,152.44,151.89,149.56,148.82,146.37,138.05,137.98,135.70,135.61,135.20,135.19,123.82,122.46,122.41,116.90,115.11,115.09,114.96,114.47,109.04,108.88,108.50,101.95,99.01,79.64,67.07,66.55,65.92,65.45,55.79,35.87,31.93,29.53,28.90,27.76,27.73,15.31。LC-MS(ESI)：m/z [M+H]+C40H46F2N3O9计算值：750.3202。实测值：750.3509。
Figure BDA0002176933830004411
N-(3-氟-4-((7-(3-(3-(3-(((S)-1-((2S,4R)-4-羟基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲酰基)-吡咯烷-1-基)-3,3-二甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-氧代丙氧基)丙氧基)丙氧基)-6-甲氧基喹啉-4-基)氧基)苯基)-N-(4-氟苯基)环丙烷-1,1-二甲酰胺(SJF-8240，PROTAC 7)。3-[3-[3-[[4-[2-氟-4-[[1-[(4-氟苯基)氨基甲酰基]环丙烷羰基]氨基]苯氧基]-6-甲氧基-7-喹啉基]氧基]丙氧基]丙氧基]丙酸叔丁酯(12)(15mg，0.02mmol)在TFA(1ml，13.46mmol)和二氯甲烷(3ml)的混合物中的溶液搅拌2小时。然后真空去除溶剂，并将粗产物在高真空下干燥2小时。将粗产物用于下一步骤，无需任何进一步纯化(13.8mg，定量收率)。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C36H38F2N3O9计算值：694.2576。实测值：694.2324。在室温下，向上述粗产物(13.8mg，0.02mmol)和(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]-吡咯烷-2-甲酰胺；盐酸盐(8)(11.15mg，0.02mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2ml)溶液中添加DIPEA(0.17ml，0.99mmol)和HATU(11.35mg，0.03mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌12小时(过夜)。将反应混合物用ACOEt(20mL)稀释，用水(4x15mL)洗涤，干燥(Na2SO4)并真空蒸发。通过PTLC(DCM:MeOH:NH4OH，90:9:1)纯化粗产物，得到18mg产物(82％收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.38(s,1H),10.00(s,1H),8.97(s,1H),8.56(t,J＝6.1Hz,1H),8.46(d,J＝5.2Hz,1H),7.96–7.85(m,2H),7.69–7.59(m,2H),7.51(d,J＝8.8Hz,2H),7.45–7.33(m,5H),7.15(t,J＝8.9Hz,2H),6.41(d,J＝5.1Hz,1H),5.12(d,J＝3.3Hz,1H),4.55(d,J＝9.4Hz,1H),4.43(ddd,J＝10.9,6.7,3.3Hz,2H),4.27–4.16(m,3H),3.94(s,3H),3.76–3.33(m,10H),2.58–2.51(m,1H),2.43(s,3H),2.35–2.25(m,1H),2.03(p,J＝5.7Hz,3H),1.95–1.83(m,1H),1.72(p,J＝6.4Hz,2H),1.48(d,J＝3.9Hz,4H),0.92(s,9H)。13C NMR(126MHz,DMSO-d6)δ171.89,169.97,169.51,168.26,167.88,159.31,159.22,157.31,154.21,152.26,151.90,151.39,149.56,148.75,147.69,146.29,139.47,138.01,137.94,135.70,135.60,135.17,135.15,131.13,129.61,128.81,128.61,127.40,123.77,122.46,122.40,116.90,115.09,114.92,114.47,109.53,109.05,108.87,108.45,101.94,99.03,68.85,67.16,67.09,66.62,66.54,65.47,58.69,56.35,56.24,55.77,41.64,37.92,35.69,35.36,31.87,29.60,28.89,26.28,15.91,15.31。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C58H66F2N7O11S计算值：1106.4509。实测值：1106.4510。
N-(3-氟-4-((7-(3-(3-(3-(((S)-1-((2S,4S)-4-羟基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲酰基)-吡咯烷-1-基)-3,3-二甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-氧代丙氧基)丙氧基)丙氧基)-6-甲氧基喹啉-4-基)氧基)苯基)-N-(4-氟苯基)环丙烷-1,1-二甲酰胺(SJF-8240差向异构体，PROTAC 8)。它由(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺；盐酸盐(10)(10.42mg，0.022mmol)制备，并遵循与上述相同的工序。通过PTLC(DCM:MEOH:NH4OH，90:9:1)纯化粗产物，得到9.7mg预期产物(47％收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.38(s,1H),10.00(s,1H),8.97(s,1H),8.63(t,J＝6.0Hz,1H),8.46(d,J＝5.2Hz,1H),7.90(d,J＝9.7Hz,2H),7.71–7.57(m,2H),7.51(d,J＝8.7Hz,2H),7.44–7.28(m,5H),7.15(t,J＝8.9Hz,2H),6.41(d,J＝5.1Hz,1H),5.43(d,J＝7.2Hz,1H),4.56–4.38(m,2H),4.36(dd,J＝8.6,6.1Hz,1H),4.32–4.13(m,4H),3.94(s,3H),3.97–3.82(m,1H),3.64–3.46(m,4H),3.48–3.35(m,4H),2.57–2.45(m,2H),2.43(s,3H),2.36–2.26(m,2H),2.03(p,J＝6.3Hz,2H),1.73(dp,J＝13.0,6.2Hz,3H),1.55–1.38(m,4H),0.93(s,9H)。13C NMR(126MHz,DMSO-d6)δ171.89,169.97,169.51,168.26,167.88,159.31,159.22,157.31,154.21,152.26,151.90,151.39,149.56,148.75,147.69,146.29,139.47,138.01,137.94,135.70,135.60,135.17,135.15,131.13,129.61,128.81,128.61,127.40,123.77,122.46,122.40,116.90,115.09,114.92,114.47,109.53,109.05,108.87,108.45,101.94,99.03,68.85,67.16,67.09,66.62,66.54,65.47,58.69,56.35,56.24,55.77,41.64,37.92,35.69,35.36,31.87,29.60,28.89,26.28,15.91,15.31。LC-MS(ESI)：m/z[M+H]+C58H66F2N7O11S计算值：1106.4509。实测值：1106.5096。
蛋白质水平控制
本说明书还提供了通过细胞控制蛋白质水平的方法。这基于使用如本文所述的化合物，已知所述化合物与特定靶蛋白相互作用，使得体内靶蛋白的降解将导致控制生物系统中蛋白质的量，优选地实现特定目标蛋白质治疗有益效果。
以下实施例用于帮助描述本发明，但不应视为以任何方式限制本发明。
实施例
参考附图和随附的描述。
图1提供了PROTAC功能的一般原理的图示。图1A提供了示例性PROTAC，其包含蛋白质靶向部分(PTM；深色阴影矩形)、泛素连接酶结合部分(ULM；浅色阴影三角形)和任选的将PTM偶联或束缚至ULM的接头部分(L；黑线)。图1B示出了如本文所述的PROTAC的功能用途。简而言之，ULM识别并结合特定的E3泛素连接酶，并且PTM结合并募集靶蛋白，使其紧密接近E3泛素连接酶。典型地，E3泛素连接酶与E2泛素结合的蛋白质复合，且单独或通过E2蛋白质催化泛素(深色圆圈)连接到靶蛋白上的赖氨酸，此连接是通过异肽键达成。然后靶向聚泛素化蛋白质(最右侧)以便细胞的蛋白酶体机器使其降解。
图2提供了如本文所述的示例性PROTAC化合物(化合物1-351)的表格。所述化合物是示例性的，并且本说明书明确地旨在涵盖所例示化合物各自的PTM、接头和ULM组成部分的组合。例如，化合物实施例1的PTM可以与实施例2-351中举例说明的任何接头和/或实施例2-351中的任何ULM组合，以此类推。
小分子诱导EGFR和突变体的降解。表皮生长因子受体(EGFR)也称为ErbB1/HER1，是一种原癌基因，涉及多种癌症，包括多形性成胶质细胞瘤、头颈部和非小细胞肺癌。EGFR的过表达和/或活化突变与不良预后相关，因此重点集中于用基于小分子和抗体的疗法靶向EGFR。小分子激酶抑制剂竞争性地结合激酶结构域，从而阻止信号传导，而抗体能够优先结合同源配体识别位点，从而阻止激酶活化。此外，FDA批准的抗体对EGFR的降解与其临床成功有关，这表明降解可能是有利的。考虑到这一基本原理，开发了能够诱导EGFR降解的小分子(即，靶向EGFR的PROTAC)。
通过将EGFR结合元件(例如激酶抑制剂，如拉帕替尼(图3))与结合E3连接酶VHL的配体缀合，合成了能够穿透细胞膜并在低纳摩尔浓度下诱导EGFR降解的示例性分子(图4-6)。有趣的是，PROTAC的VHL募集部分上的羟脯氨酸立体化学的转化可以影响其降解EGFR的能力(图4B)。PROTAC的这种非对映体型式(PROTAC非对映体2)提供了具有几乎相同的物理化学性质的优异对照化合物(参见图6)，但仅能抑制EGFR；它是一种理想的工具，可直接评估EGFR降解优于激酶抑制的优势，而不会影响探针溶解度、膜渗透性或化学稳定性，从而模糊头对头比较(如果直接用拉帕替尼本身进行比较，则会出现这种情况)。
已证明经由基于拉帕替尼的PROTAC将VHL募集到EGFR能够有效诱导受体酪氨酸激酶(RTK)的降解，使用不同的EGFR结合元件来降解不同的临床相关形式的EGFR。如图4C所示，基于拉帕替尼的PROTAC 1也能够降解外显子-20插入突变形式的EGFR(ASV复制)。切换到基于突变型EGFR选择性吉非替尼(PROTAC 3)的关键成分能够降解外显子19缺失EGFR以及含有L858R活化点突变的突变体同种型(图4D/E)，同时保留野生型EGFR(参见图5)。最后使用第二代抑制剂阿法替尼产生能够降解吉非替尼抗性双重突变体(L858R/T790M)EGFR的PROTAC 4(图4F)。
关键成分的选择对于成功的靶标降解至关重要；此处证明了仔细选择募集元件还可以使蛋白质以不同的突变状态降解。对于上述PROTAC中的一些，在底物降解中观察到“钩状效应”，这已经在先前报道过，并且是由于在较高浓度下形成非生产性二聚体(而不是生产性“三聚体”)而导致的。其他PROTAC中缺乏这种“钩状效应”可能是因为添加剂靶标：它们诱导的E3连接酶蛋白质-蛋白质相互作用。
PROTAC介导的选择性HER2降解和对激酶组重新布线的影响。由于拉帕替尼也是其他HER家族RTK的有效结合物，因此研究了基于拉帕替尼的PROTAC对于HER2降解的可能性。与EGFR相似，HER2过表达是许多癌症形式(包括卵巢癌、乳腺癌和胃癌)的致癌驱动因素。免疫印迹分析表明，利用二乙二醇接头将拉帕替尼束缚至VHL募集元件的PROTAC 1,可同时降解EGFR和HER2(图5A)。然而，通过另外的乙二醇单元延伸接头以产生PROTAC 5使得能够选择性降解EGFR，同时保留HER2。该观察结果表明，对靶蛋白和E3连接酶的亲和力不足以开发成功的PROTAC，并且可能是由于更复杂的动态过程而导致的。
当比较对细胞增殖的影响时，PROTAC介导的降解相比于激酶抑制的优势变得明显(图5B)。SKBr3细胞是一种HER2驱动的乳腺癌细胞系，对PROTAC 1的反应比对同源非对映体对照2的反应更强，后者具有相当的细胞渗透性和激酶抑制性质，但不能诱导HER2降解(图6B/C)。PROTAC 1治疗在抗增殖功效方面比非对映体2诱导更大的反应，并且具有更大的效力(PROTAC 1IC50＝102nM，非对映体2IC50＝171nM)。
PROTAC 1与非对映异构体2的比较还显示出在长时间的处理后降解相对于抑制的额外优势。先前已证明SKBr3细胞中EGFR/HER2的抑制能快速诱导激酶组“重新布线”，其中替代的未抑制的激酶被募集为异二聚化配偶体，导致相同下游效应子的磷酸化以经由RTK交联恢复致癌信号传导。
为了研究这种现象，用相同的饱和浓度(图6B/C)的PROTAC 1或非对映体2处理SKBr3细胞，这提供了降解与抑制的直接的头对头比较，因为它们具有相似的物理化学性质。有趣的是，降解似乎对激酶组重新布线具有保护作用，特别是在ERK1/2磷酸化以及特异性HER3和AKT磷酸化位点的情况下。用抑制剂(非对映体)2处理的细胞导致瞬时抑制ERK1/2的活化、Akt(Thr308)、c-Met和HER3的磷酸化，后者是防止细胞凋亡和促进存活的主要节点(图5C)。然而，在24至48小时内，尽管持续存在抑制剂，但这种抑制作用仍被逆转。
非常引人注意的是，使用等效浓度的PROTAC 1本身进行处理会持续抑制下游信号传导，这表明靶标RTK的去除阻碍了激酶组重新布线并允许更长时间的持续生长抑制。抑制瞬时阻止下游信号传导，但降解也可能影响RTK表现出的支架作用，特别是在通过受体交联重新布线的情况下。例如，EGFR与c-Met的异二聚化和经由c-Met激酶结构域的信号传导涉及对一些抑制剂/抗体的抗性。在PROTAC 1或非对映体2处理48小时后，c-Met磷酸化状态的分析显示，与经PROTAC处理的细胞相比，经非对映体处理的细胞中经由c-Met激酶结构域的信号传导显著增加，可能是由于反式激活(图5D)。这些结果证明了与激酶抑制相比，RTK降解所获得的优势在于阻止下游信号传导和延迟启动激酶组重新布线。
由于PROTAC被证明能够成功降解EGFR和HER2，因此PROTAC被制成不同的RTK家族。C-Met是肝细胞生长因子(HGF)的受体，由于其促进肿瘤转移的能力，也被称为“分散因子”。在结合HGF后，c-Met在其激酶结构域(Y1234和Y1235)内的酪氨酸残基以及其独特的c末端多功能对接结构域(Y1313、Y1349、Y1356和Y1365)上二聚化和转磷酸化。对接结构域包含多种细胞效应物(例如Src、Gab1、Crk、Grb2、SHC和PI-3激酶)的识别位点，能有效激活下游促有丝分裂途径。抑制剂如佛瑞替尼竞争性地从c-Met激酶结构域取代ATP，它阻断HGF刺激的ERK和Akt的激活，是c-Met信号传导的主要下游效应物。然而尽管如此，但小分子c-Met抑制剂在临床试验中表现令人失望，表明激酶依赖性功能驱动肿瘤发生的可能性，并突出了c-Met降解相对于抑制的潜在优势。
图6示出了基于吉非替尼的PROTAC(PROTAC 3)保留了野生型EGFR(图6A)。在免疫印迹之前，用递增剂量的PROTAC 3或DMSO对照处理OVCAR8细胞24小时。图6B/C–PROTAC1(B)和非对映体2(C)在SKBr3细胞中的表征。在免疫印迹之前，在全血清中用递增剂量的PROTAC1或非对映体2处理细胞24小时。基于佛瑞替尼的PROTAC在GTL16细胞中的表征如图7所示。在免疫印迹分析之前，在含有全血清的培养基中用递增浓度的PROTAC 7(A)或非对映体8(B)处理GTL16细胞24小时。图7C–在免疫印迹分析之前用500nM PROTAC 7或500nM非对映体8处理48小时的细胞的代表性印迹。图7D示出了洗脱实验的定量。在指定的时间点用指定化合物处理后，c-MET水平归一化为微管蛋白。3个独立重复样和误差条的平均值表示S.E.M。竞争实验中使用的VHL配体9的结构如图7E所示。图7F示出PROTAC 7与VHL配体9在MDA-MB-231细胞中24小时的共处理竞争。
使用c-Met抑制剂佛瑞替尼作为募集元件，我们开发了PROTAC化合物7，它能够募集VHL，从而以剂量和时间依赖性方式诱导c-Met的降解。在存在或不存在HGF脉冲的情况下，用递增浓度的基于佛瑞替尼的PROTAC 7(参见图3和图8A)或其同源非对映体8(参见图3和图8B)处理的MDA-MB-231细胞证实需要用约10倍高浓度的非对映体处理以完全抑制激动剂驱动的AKT磷酸化。当用PROTAC 7和非对映体8在全血清中生长和处理时，我们观察到GTL16细胞(一种c-Met过表达细胞系)中Akt磷酸化的相似水平的抑制。PROTAC 7和非对映体8对Akt磷酸化的抑制的效力差异降低可能是由两种细胞系(分别为GTL16和MDA-MB-231)之间的信号传导级联的稳态与激动剂激发的激活引起的。基于佛瑞替尼的PROTAC 7在抑制GTL16细胞增殖方面也比其相应的非对映异构体8的效力高2倍以上(图8C)，再次强调了开发能够进行蛋白质降解的探针的优势，尤其是在致癌基因成瘾的情况下。此外，野生型c-Met从细胞中清除相对较快，仅需6小时的处理即可显著降低MDA-MB-231细胞中的蛋白质水平(图8D)，提供了超过RNA介导的敲除技术的时间优势，并且消除了对于可能干扰其他正常细胞活动的转染试剂或外源选择压力的要求。
在证实PROTAC的催化性质之后，研究了它们的效应持续时间。将细胞用DMSO对照、基于佛瑞替尼的PROTAC 7或其相应的非对映体8处理24小时，然后从培养皿中解离，用PBS冲洗以洗去细胞外处理化合物，再重新铺入新鲜培养基和新培养皿中并保持24或48小时，然后裂解。经PROTAC处理的细胞在洗脱后48小时表现出持续的c-Met水平降低。至关重要的是，在用PROTAC 7处理的细胞中，可通过在洗脱后用50倍过量的游离VHL配体处理来拯救c-Met水平。游离VHL配体阻止PROTAC 7向RTK募集E3连接酶，表明经PROTAC处理的细胞中的持续敲除是通过破坏细胞中剩余的PROTAC 7:Met:VHL复合物而在翻译后介导的(催化作用模式)，而不是如在其他小分子中观察到的那样在翻译水平上反应。此外，当MDA-MB-231细胞用PROTAC 7和递增剂量的游离VHL配体共同处理时，PROTAC降解c-Met的能力受到阻碍，进一步证明了VHL募集的必要性和特异性。另外，基于佛瑞替尼的PROTAC 7还能够以与上述基于拉帕替尼的PROTAC类似的方式防止抑制剂诱导的代偿信号传导。GTL16细胞在48小时后显示出深刻的激酶组重新布线，如经非对映体8处理的细胞中的ERK1/2磷酸化所证明，但在经PROTAC 7处理的细胞中不是这样。
已证明经由PROTAC技术可降低RTK，评估了降解机制。最初，随时间进行实时qPCR以证实所观察到的响应于PROTAC处理的c-Met蛋白水平降低发生在转录后水平。此外，与抑制蛋白酶体(环氧酶素)或泛素化级联反应(NEDD8激活酶E1抑制剂，MLN-4924)的药理学试剂共同处理能够将蛋白质水平恢复到未处理水平，这表明泛素化不仅对c-Met降解很重要，还通过蛋白酶体继续进行。此外，已知RTK依赖于热休克蛋白90(HSP90)分子伴侣进行适当折叠以及以HSP90依赖性方式在质膜与早期内体之间循环。
因此，探索了HSP90抑制剂17-AAG(17-N-烯丙基氨基-17-去甲氧基格尔德霉素)对PROTAC介导的降解的影响。用PROTAC 7和17-AAG的共同处理对MDA-MB-231细胞系中的c-Met蛋白降解具有累加效应，表明HSP90可能在与PROTAC 7分开的隔室中拦截c-Met，从而增强细胞内的总c-Met的降解。先前的研究表明c-Met是HSP90的客户蛋白质，格尔德霉素和17-AAG可以促进其泛素化和蛋白酶体依赖性降解。
然后确定PROTAC靶向的RTK是直接从细胞表面去除还是在分泌途径中的某些点被截获到膜上。采用细胞表面生物素化降解测定，证实PROTAC7诱导细胞表面的c-Met成熟形式(145kDa)的降解，表明VHL募集能够直接或间接地诱导RTK内化(图9A和图9B)。我们通过共聚焦免疫荧光显微术证实了PROTAC 7介导的RTK内化：未处理的细胞表现出细胞表面c-Met免疫荧光，但用PROTAC 7(图9C)或HGF处理显示出如前所述的内化和定位到核周室。该核周室还对早期内体抗原1(EEA1)染色呈阳性，并且似乎与高尔基体不同，后者在未处理的细胞中是c-Met阳性的(图12)。先前已在MDA-MB-231细胞中报道了这些大的EEA1阳性囊泡样结构。据我们所知，这提供了小分子诱导的内源性RTK内化的第一个证据，并进一步表明在经由蛋白酶体降解之前分选到内体中。有趣的是，初步的小干扰RNA实验表明该过程不依赖于网格蛋白(图12E)。
接下来，在Hs746T胃癌细胞系中评估降解相对于抑制的优势，其表达c-Met的外显子14剪接变体。外显子14跳跃导致c-Met的表达缺乏对于Cbl的近膜结构域募集位点(Y1003)，Cbl是促进HGF依赖性内化和随后c-Met降解的内源性E3连接酶。这种临床相关的突变导致持续的下游信号传导，因为HGF诱导的信号传导的天然发生的“断开”不再存在。在没有任何其他降解信号的情况下，缺乏该调节结构域也会增加c-Met蛋白的内在稳定性。环己酰亚胺追踪实验(图10A)揭示了野生型c-Met的基础半衰期为4.4小时，而外显子14突变体c-Met的基础半衰期>8小时。HGF处理导致野生型c-Met的快速降解(图10A和图10C)，但不导致外显子14缺失的c-Met的快速降解(图10A、图10B和图10D)；这种内化/降解的缺乏导致持续的下游信号传导(图10C和图10D)，从而增强外显子14突变体c-Met表达细胞的细胞增殖和肿瘤发生。
有趣的是，PROTAC 7处理可以诱导外显子14缺失的c-Met的降解(图10A和图10E)，但它没有被主要的天然机制(即HGF)降解。经PROTAC 7处理的外显子14缺失的c-Met的降解半衰期仅略长于经PROTAC 7处理的野生型c-Met(分别为4.2小时和2.5小时)，相比之下，它们各自的HGF诱导的天然降解速率相差较大(分别为>8小时和1.66小时)(图10B)。PROTAC 7能够降解外显子14缺失的c-Met的事实表明该过程与Cbl无关，也与网格蛋白无关。
这提供了另一个实例，其中PROTAC的靶标降解可能证明相比于单独的抑制的优势，因为抑制可以暂时阻断激酶活性水平的信号传导，但是只有降解才能为受体本身提供持久的“断开”，如图10F和图10G所示。用PROTAC 7预处理表达外显子14突变体c-Met的Hs746T细胞减少了HGF诱导的Akt激活。在HGF处理后0.5小时，这些细胞中的磷酸化Akt仍然短暂提升；然而，更重要的是，在经PROTAC 7处理的细胞中未观察到在经DMSO处理的细胞中观察到的持续信号传导(长达6小时)(图10G)。这样经由PROTAC将野生型表型恢复为突变蛋白是有趣的，并且该方法可证明在携带c-Met的外显子14剪接变体的癌症患者中具有潜在的优势。由于通过用PROTAC处理将野生型表型明显恢复为突变蛋白，我们试图通过外显子14突变细胞中的免疫沉淀实验研究PROTAC 7诱导的c-Met泛素化状态。用PROTAC 7处理4小时后，免疫沉淀的c-Met比载体对照样品更广泛地泛素化(图10H)。
此外，对Hs746T裂解物进行串联泛素结合实体1(TUBE1)免疫沉淀，以努力富集细胞内的多聚泛素化底物。与用载体对照处理的细胞相比，经PROTAC 7处理的Hs746T细胞显示出显著的TUBE1富集c-Met(图10I)。这些实验提供了PROTAC 7诱导c-Met的多聚泛素化的证据，即使在缺乏天然磷酸化降解决定子的外显子14跳过的情况下也是如此。尽管PROTAC介导的降解对RTK的普遍适用性可能超出本研究中描述的具体实例，但我们仍在继续研究这一广泛的蛋白质超家族的其他实例，以及将PROTAC方法应用于整个蛋白质组的更大考虑因素。此外，从该“案例研究”中收集的诱导靶蛋白的降解相比于抑制的优势为未来基于PROTAC的范例提供了坚实的基础。
图11A-D.在PROTAC处理(500nM)后的指定时间点进行定量实时PCR。将数据归一化为β微管蛋白。图11B-D代表性Western印迹和共处理实验的定量。图11B–在MDA-MB-231细胞中用蛋白酶体抑制剂环氧酶素(500nM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。图11C–在MDA-MB-231细胞中用Neddylation抑制剂MLN-4924(1μM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。图11D–在MDA-MB-231细胞中用HSP90抑制剂17-AAG(1μM)共处理PROTAC 7(500nM)6小时。定量数据代表2个重复样的平均值。
图12A-E.HGF介导的c-Met内化的代表性共聚焦显微镜图像。图12A–在c-Met的固定、透化和免疫染色之前用100ng/ml HGF处理MDA-MB-231细胞达指定时间。图12B–显示PROTAC介导的与早期内体抗原1(EEA1)的共定位的代表性共聚焦显微镜图像。在c-Met和EEA1的固定、透化和免疫染色之前，用500nM PROTAC 7处理MDA-MB-231细胞达指定时间。图12C–显示c-Met与p230(反式高尔基体标志物)的共定位的代表性共聚焦显微镜图像。图12D–来自图9C的图像的定量。c-Met免疫荧光和平均细胞像素强度占据的细胞像素的百分比用作斑点形成和细胞表面c-Met减少的代表。图12E–网格蛋白重链(CHC)siRNA实验。用CHC siRNA转染MDA-MB-231细胞，再用PROTAC 7处理24小时，然后进行裂解和免疫印迹。
环己酰亚胺脉冲追踪western印迹。图13A–将MDA-MB-231细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC 7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解–第1组。图13B–将MDA-MB231细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC 7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解–第2组。图13C–将Hs746T细胞用环己酰亚胺处理，然后用DMSO、PROTAC 7或HGF处理，并在指定的孵育时间裂解。图13D–c-Met免疫沉淀实验。用2μM环氧酶素处理Hs746T细胞30分钟，再添加PROTAC7并保持4小时，然后进行c-Met免疫沉淀。(WCL＝全细胞裂解物)。图13E–如在D中一样处理Hs746T细胞，然后进行TUBE1免疫沉淀实验。
如本文所述的示例性PROTAC化合物(基于拉帕替尼(呋喃)的PROTAC)的结构示于图14中。图14的示例性PROTAC化合物的降解活性。图15示出图14的示例性PROTAC化合物的降解活性。图15A–示出1μM的HER1和HER2蛋白降解百分比、接头原子、接头长度(以埃为单位)、接头类型和E3连接酶结合部分(ULM)。图15B–示出指定的基于拉帕替尼的PROTAC对OVCAR8细胞中HER1的降解活性(剂量-反应)。
图16示出基于拉帕替尼(呋喃)的示例性PROTAC的结构(图16A)。图16B–示出图16A化合物的降解活性的Western印迹。用OVCAR8处理细胞24小时。最后5分钟进行NRG(5ng/mL)刺激。使用抗EGFR兔(CST)、抗HER2(Santa Cruz Biotechnologies)和抗微管蛋白(Sigma-Aldrich)检测蛋白质。
示例性PROTAC化合物的降解活性。图17A–示出基于拉帕替尼(苯基)的示例性PROTAC的结构。图17B–示出图14A化合物的降解活性的Western印迹。用OVCAR8处理细胞24小时。最后5分钟进行NRG(5ng/mL)刺激。使用抗EGFR兔(CST)、抗HER2(Santa CruzBiotechnologies)和抗微管蛋白(Sigma-Aldrich)检测蛋白质。
表1和表2分别提供了如本文所述的指定示例性EGFR-PROTAC的IC50和蛋白质降解数据(参见图2)。数据证明了在多种细胞类型中抑制和降解野生型(WT)和突变型EGFR的能力，包括在临床相关浓度下。
表1.图2的示例性EGFR PROTAC的时间分辨(TR)-FRET结果。较低的IC50值(较低的IC50值(测试化合物的对相应激酶活性的最大抑制的50％)指示对相应蛋白质的较高亲和力。如果测量多于一次，则以微摩尔为单位的几何平均值表示。
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表2.EGFR蛋白在各种细胞系中的降解。示例性化合物(参见图2)的降解数据分类如下：A：以介于300nM和10nM之间的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余≤50％的EGFR蛋白；B：以介于300nM和10nM之间的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余≤80％且>50％的EGFR蛋白；C：以300nM的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余>80％的EGFR蛋白。
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Figure BDA0002176933830004561
Figure BDA0002176933830004571
在某些实施方案中，或与本文所述的任何实施方案组合，如本文所述的化合物对RTK活性(例如，EGFR活性)具有小于约1pM、从约1pM至约1nM、从约1nM至约1μM或从约1μM至约1mM的IC50(半数最大抑制浓度)。在某些另外的实施方案中，如本文所述的化合物具有约1pM至约100μM、约10pM至约100μM或约100pM至约100μM的IC50。在某些实施方案中，如本文所述的化合物具有约1pM至约1μM、约10pM至约1μM或约100pM至约1μM的IC50。在另外的实施方案中，如本文所述的化合物具有约1nM至约1μM、约10nM至约1μM或约100nM至约1μM的IC50。在某些实施方案中，IC50通过如本文所述的TR-FRET方法测定。
在某些另外的实施方案中，或与本文所述的任何实施方案组合，如本文所述的化合物表现出在以介于约300nM和约10nM之间的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余约≤50％的RTK蛋白的降解活性，在以介于约300nM和约10nM之间的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余约≤80％至约>50％的RTK蛋白，或者在以300nM的浓度与测试化合物一起孵育72小时后剩余约>80％的RTK蛋白。在某些实施方案中，在如本文所述的体外降解测定中测定降解。在某些实施方案中，在选自OVCAR8、HCC827、HeLa、H1975或H520细胞的细胞系中测定体外降解测定。
如本文所述，首次证实PROTAC能够诱导活性受体酪氨酸激酶的降解，并提供三种单独RTK(EGFR、HER2和c-Met，包括EGFR和c-Met的多种突变体)成功降解的实例。在若干种关键方式中，降解可以提供优于抑制的优势。在大多数情况下，能够降解的化合物在比仅仅抑制的类似化合物更低的浓度下抑制下游信号传导和细胞增殖。此外，降解提供了更持续的信号传导减少，如通过先前用EGFR、HER2和c-Met抑制剂观察到的激酶组重新布线的减少以及甚至在洗脱后持久的反应持续时间所证明。另外，PROTAC能够处置发生突变的蛋白质以避免其天然“断开”。这项研究显著扩展了PROTAC的潜在蛋白质靶标，包括跨膜蛋白质，并确定VHL向RTK的募集能够以与它们对生长因子的反应相似的方式有效地从膜上去除这类蛋白质靶标。使用具有相同物理化学性质的非活性非对映体化合物进行对照实验，证明降解优于仅抑制，突出了这种药理学方式的潜在优势。
示例性方法
EGFR蛋白降解测定
筛选出用flag标记的EGFR(外显子20插入)、亲本HeLa细胞(野生型EGFR)、NCI-H1975细胞(EGFR：L858R、T790M双重突变体)和A549细胞(野生型EGFR)稳定转染的HeLa细胞或H520细胞。
将表达适当形式的EGFR的细胞接种到6孔板(每孔300,000个细胞)中并使其粘附在板上过夜。将化合物(2x浓度)与DMSO对照添加到与每个孔中的培养基相同体积的培养基中，得到3μM、1μM、0.3μM、0.1μM、0.03μM的最终浓度。将细胞与化合物一起孵育24小时。为了收获细胞，去除培养基，用冰冷的磷酸盐缓冲盐水(PBS)洗涤细胞一次，然后添加400μl补充有蛋白酶抑制剂混合物(Thermo Scientific)的裂解缓冲液(Cell SignalingTechnology)。从平板上刮下细胞，将细胞裂解物转移到Eppendorf管中，然后通过单次旋转以10000rpm澄清10分钟。在添加上样缓冲液(Invitrogen)和还原剂(Invitrogen)之前，测定每种裂解物的蛋白质浓度(BCA试剂盒，Thermo Scientific)。将每种裂解物的10μg蛋白质上样到SDS/PAGE凝胶上，并在165V下跑电泳2小时。转移至PVDF膜(iBlot2，ThermoFisher Scientific)后，将膜在补充有5％奶粉的含0.1％Tween-20的Tris缓冲盐水(TBS-T)中阻断1小时。然后在4℃下，用含有3％牛血清白蛋白(BSA)的TBS-T中的EGFR和微管蛋白(上样对照)一抗探测膜。将膜用TBS-T洗涤三次，然后与含有3％牛血清白蛋白(BSA)的TBS-T中的二抗一起孵育，并在室温下孵育1小时。在用TBS进一步洗涤3次后，使用Chemidoc(Bio-Rad)通过酶联化学发光(ECL)检测目的膜蛋白。
将稳定表达EGFR三重突变体(L858R、T790M、C797S)的H520细胞(ATCC：#HTB-182)以每孔100000个细胞的密度接种在12孔板内的1ml培养基中。在添加化合物之前，将细胞在37℃、5％CO2下孵育过夜。将DMSO中的10mM化合物储液在DMSO中连续稀释，得到以下储液浓度：1、0.3、0.1、0.03和0.01mM。将相应体积的每种化合物稀释液与DMSO载体对照一起添加到培养基中，从而得到2x化合物溶液。然后将1ml每种化合物溶液添加到12孔板内的相应孔中，在细胞上进行以下最终化合物滴定：DMSO，1、0.3、0.1、0.03和0.01μM。添加化合物之后，将细胞在37℃、5％CO2下孵育72小时。在化合物处理结束时，用冰冷的磷酸盐缓冲盐水(PBS)洗涤细胞一次，并用裂解溶液(1x裂解缓冲液，Cell Signaling Technologies(CST#9803)，补充有PiarceTM蛋白酶抑制剂，#A32953，Thermo Fisher Scientific，TFS)处理。通过以10K rpm旋转10分钟，收集裂解物并澄清细胞碎片。取特定体积的上清液用于蛋白质定量(PierceTM BCA试剂盒，TFS#23225)和Western分析。向每种上清液中添加补充有EDTA和还原剂的上样缓冲液。将特定体积的上清液(通过蛋白质测定法测定：每个样品上样1-5μg蛋白质)加载到NuPAGETM 4-12％Bis-Tris凝胶(TFS)中。将样品在165V下在MOPS运行缓冲液中跑电泳2小时，然后使用干印迹系统(iBlot2，TFS)转移至PVDF印迹膜。将膜在含有5％脱脂奶粉(AmericanBio)的补充有0.1％Tween的Tris缓冲盐水(TBST)中阻断。阻断后，用TBST洗涤膜一次。切割每个膜以允许对EGFR和微管蛋白单独染色，然后添加用含有3％BSA的TBST分别以1:1000和1:5000稀释的相应一抗(EGFR，L858R突变体CST，#3197；β微管蛋白，CST#2128)，并将膜在摇床上于4℃下孵育过夜。将膜用TBST洗涤3次，再在含有3％BSA的TBST中添加二抗(1:10000，抗兔HRP连接抗体，CST#7074)，然后在室温下孵育一小时。然后用TBS洗涤膜3次，并通过暴露于显影剂(SuperSignal West Femto，TFS)5分钟而显影。接着，立即使用BioRad Chemidoc对膜进行成像。
将稳定表达EGFR三重突变体(L858R、T790M、C797S)的H520细胞以每孔100000个细胞的密度接种在12孔板内的1ml培养基中。在添加化合物之前，将细胞在37℃、5％CO2下孵育过夜。制备工作储液浓度，如同降解测定一样。将1ml相应化合物溶液或DMSO载体对照添加到12孔板的相应孔中的1ml培养基中。将细胞在37℃、5％CO2下孵育2小时。在化合物处理之后，使用与降解测定相同的方法收获细胞。完全按照降解测定进行Western分析，不同的是所用一抗是用含3％BSA的TBST以1:1000和1:5000稀释的磷酸化EGFR Y1068(CST#2234)和β微管蛋白(CST#2128)。
抑制细胞增殖测定
将表达适当形式的EGFR的细胞接种到96孔板(每孔2000个细胞)中并使其粘附在板上过夜。将化合物(2x浓度)添加到与每个孔中的培养基相同体积的培养基中，得到9点浓度反应曲线，顶部浓度为10μM，并与DMSO对照一起稀释3倍。将细胞与化合物一起孵育72小时。向每个孔中添加Cell-titre 试剂(Promega)并孵育30分钟，然后使用Cytation读板器(BioTek)读取发光信号。将每种化合物浓度的发光值归一化为DMSO载体对照，并使用GraphPad Prism绘制数据并进行曲线拟合。
ERBB激酶的TR-FRET测定
使用100％DMSO将所有化合物和PROTAC以三倍增量连续稀释，然后使用缓冲液A(50mM HEPES，pH 7.5，50mM NaCl，10mM MgCl2，1mM DTT和0.1％Pluronic F-68)进行中间10倍稀释。然后使用Integra Viaflo96将两微升连续稀释的化合物或PROTAC转移至黑色384孔Proxiplates(PerkinElmer，#6008260)。接下来，将10uL蛋白激酶的缓冲液A溶液添加到测定板的每个孔中，并与化合物预温育10分钟。然后通过在缓冲液A中添加含有3mM ATP和30uM荧光素标记的Poly-GluTyr(Thermo Fisher，#PV3610)的5uL底物混合物引发激酶反应，并使其在室温下进行10分钟。通过在缓冲液A中添加含有5nM
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Tb-pY20抗体(Thermo Fisher，#PV3552)和40mM EDTA的5μL混合物来淬灭反应。然后使用Synergy2(Biotek Instruments，Winooski，VT)经由通过340/20nm带通滤波器的激发和通过490/10nm(供体)和520/25nm(受体)带通滤波器收集的发射读取测定板。每个15uL反应使用的最终激酶浓度如下：0.2nm EGFR Exon20NPG(SignalChem，#E10-132GG)，0.1nm野生型EGFR(BPS Bioscience，#40187)，0.3nm EGFR L858R/T790M/C797S(BPS Bioscience，#40351)，0.1nM EGFR L858R(BPS Bioscience，#40189)，0.4nm L858R/T790M(BPS Bioscience，#40350)，1nm EGFR Del19(SignalChem，#E10-122JG)，10nM EGFR Del19 T790M(SignalChem，#E10-122KG)，0.3nm Her2(BPS Bioscience，#40230)，15nM Her2InsYVMA(SignalChem，#E27-13BG)。
实验模型和主题细节
MDA-MB-231、SKBr-3、HCC-827和H1975细胞得自美国典型培养物保藏中心(ATCC)。OVCAR8细胞由Joyce Liu(Dana Farber)赠予。H3255细胞由Katerina Politi(耶鲁大学)赠予。将所有上述细胞系在含有10％胎牛血清(FBS)和1％青霉素-链霉素的RPMI-1640(1X)培养基中培养，并在37℃、5％CO2的潮湿培养箱中生长。GTL-16细胞由F.Maina(Marseille-Luminy发育生物学研究所)赠予，并且类似地在含有10％FBS和1％青霉素-链霉素的RPMI-1640培养基中生长。为生成外显子20插入EGFR稳定细胞系，将HeLa细胞(ATCC)用慢病毒的哺乳动物表达载体pD2119-EFs-3xFLAG-EGFR-Exon20ins(购自DNA 2.0)转导，并在含有10％FBS的Dulbecco改良Eagle’s培养基(DMEM)中用2ug/ml嘌呤霉素进行选择。该载体包含外显子20的767 ASV复制。
免疫印迹。
用指定浓度的PROTAC或相应抑制非对映体处理细胞达指定时间，然后在裂解缓冲液(25mM Tris.HCl pH 7.5，含1％NP-40和0.25％脱氧胆酸盐，补充有10mM焦磷酸钠、20mMβ-甘油磷酸盐、10mM氟化钠、1mM原钒酸钠、0.1mM氧化苯胂、10μg/ml亮抑酶肽、10μg/ml胃蛋白酶抑制剂A、30μg/ml苯丁抑制素、0.3胰蛋白酶抑制剂单位/ml抑肽酶和1mM PMSF)中收获细胞。在4℃下以16,000x g离心10分钟以沉淀不溶物质后，通过BCA测定(Thermo FisherScientific)定量上清液的蛋白质浓度。将蛋白质样品通过8％SDS-PAGE分离，通过电泳转移至硝酸纤维素膜并用上面列出的抗体探测。使用增强的化学发光开发免疫印迹，使用Bio-Rad Chemi-Doc MP成像系统可视化，并用Image Lab v.5.2.1软件(Bio-RadLaboratories)定量。
细胞增殖测定
在所指定的细胞的PROTAC或非对映异构体处理后，向培养基补充330μg/ml MTS(Promega Corp.，Madison，WI)和25μM吩嗪硫酸甲酯(Sigma，St.Louis，MO)并在37℃次下孵育。通过使用Wallac Victor2读板器(Perkin-Elmer Life Sciences，Waltham，MA)在490nm处测量培养基的吸光度，监测MTS向甲瓒衍生物的线粒体还原。使用Prism v7.0软件(GraphPad软件)进行数据分析和统计。
细胞表面生物素化降解测定
协议由Joffre等人改编，以测量c-Met从MDA-MB-231细胞的细胞表面的去除(Joffre等人，2011)。将细胞接种于全血清中，使其粘附，并转换至无血清RPMI-1640，保持16小时。此后，将细胞置于冰上，用冰冷的1X PBS-CM(0.1mM CaCl2，1mM MgCl2)冲洗两次，并在4℃下用PBS-CM孵育5分钟。抽出PBS-CM，此时在4℃下，一边轻轻摇动，一边用不可渗透细胞膜的试剂EZ-link Sulfo-NHS-SS-生物素以0.5mg/ml标记细胞30分钟。该步骤使得能够共价标记所有细胞表面蛋白。以下所有步骤均在4℃下进行以防止所述蛋白质的运输。随后用冰冷的PBS-CM冲洗细胞两次，并在4℃下，一边轻轻摇动，一边用Tris-甘氨酸缓冲液(100mM Tris pH 8.0，150mM NaCl，0.1mM CaCl2，1mM MgCl2，10mM甘氨酸，1％BSA)淬灭过量的生物素15分钟。然后用冰冷的PBS-CM冲洗细胞三次，再用含有HGF(100ng/ml)或PROTAC(500nM)的温热无血清RPMI-1640培养基追踪，并置于37℃的潮湿培养箱中达指定时间，此时用补充有1X蛋白酶抑制剂(Roche)的裂解缓冲液(50mM Tris，pH7.5，100mM NaCl，10％甘油，1％NP-40，1mM EDTA)裂解细胞。将裂解物在4℃下以14,000x g离心10分钟，并通过BCA测定法测量蛋白质含量。将蛋白质裂解物标准化并在4℃下一边轻轻旋转一边等分到预平衡的NeutrAvidin琼脂糖微珠上2小时。将琼脂糖微珠用洗涤缓冲液(100mM Tris，pH 7.5，300mM NaCl和1％Triton X-100)洗涤三次，并重悬于2X洗脱缓冲液(62.5mM Tris，pH 6.8，3％SDS，10％甘油，0.02％溴酚蓝，160mM DTT)中。通过在95℃下加热5分钟从琼脂糖微珠上洗脱蛋白质，并且将上清液在SDS-PAGE凝胶上跑电泳并评估细胞表面c-Met蛋白的存在。全细胞裂解物是指加载到NeutrAvidin微珠上的裂解物，从而代表总c-Met蛋白。
环己酰亚胺追踪测定
将MDA-MB-231细胞以每孔3x105个细胞接种在6孔培养皿中，使其粘附，并转换至无血清RPMI-1640中保持16小时。然后将细胞用环己酰亚胺(Sigma)以100ug/ml预处理1小时，再添加HGF(100ng/ml)、PROTAC(500nM)或载体。在指定时间点处，将细胞立即置于冰上，用PBS冲洗，裂解并煮沸。
免疫荧光显微镜检查
将MDA-MB-231细胞以1x105个细胞/ml的密度接种到12mm圆形盖玻片上，培养过夜，转换至无血清培养基>12小时，然后用500nM PROTAC 7或100ng/ml HGF处理指定时间，再用PBS洗涤。将细胞用4％甲醛在室温下固定20分钟，用冰冷的PBS洗涤，透化并用0.25％Triton X-100/1％BSA的PBS溶液阻断30分钟。将固定的细胞与c-Met抗体(1:3000稀释，Cell Signaling#8198)一起孵育1小时，用PBS洗涤三次，每次5分钟，再与Alexa Fluor-488缀合的抗兔抗体(1:1000稀释，ThermoFisher A-11008)一起孵育1小时，用PBS洗涤三次，每次5分钟，并置于含有DAPI的vectashield中。在Zeiss Axio Observer Z1倒置显微镜上成像。
siRNA实验
用Opti-MEM培养基(150μL)稀释siRNA(4μL的10μM储备溶液，40pMol)，然后添加到Lipofectamine RNAiMAX溶液(9μL，在150μL Opti-MEM中)，孵育10分钟，再以约80％汇合度添加到MDA-MB-231细胞中。第二天，将转染的细胞铺板并用于如上所述的实验。
免疫沉淀实验
将Hs746T细胞(2.5x 106)接种到10cm培养皿中，使其粘附，转换至无血清DMEM培养基并保持16小时。此后，将细胞用2μM环氧酶素在37℃下预处理30分钟。在该预处理后，将10cm平板用1μM化合物7或载体在37℃下处理4小时，之后将它们置于冰上，用冰冷的1X PBS冲洗两次，并用500uL含有5mM 1,10-菲咯啉一水合物、10mM N-乙马来酰亚胺、20μM PR-619和1X完全蛋白酶抑制剂混合物(Roche)的改良1X RIPA缓冲液(25mM Tris-HCl pH 7.6，150mM NaCl，1％NP-40，1％脱氧胆酸钠，0.1％SDS)裂解。将裂解物在4℃下以14,000x g离心10分钟，并通过BCA测定法测量蛋白质含量。将蛋白质裂解物标准化，将500μg裂解物等分到裸蛋白A-Sepharose 4B微珠(Sigma)上，并在4℃下一边轻轻旋转一边预清除1小时。这样孵育1小时后，将样品在4℃下以3,000x g离心2分钟，然后将标准化的预清除裂解物加载到与5ug Met(CST，#8198)抗体偶联的蛋白A-Sepharose 4B微珠上。在4℃下一边轻轻旋转，一边用Hs746T裂解物将MET免疫沉淀2小时，此后将样品在4℃下以3,000x g离心2分钟，收集流穿液以评估pulldown效率(参见图S6D)，将微珠用冰冷的裂解缓冲液洗涤一次，并用冰冷的1X TBS-T(137mM NaCl，2.7mM KCl，19mM Tris-HCl pH 7.5，0.02％Tween-20)洗涤三次。将微珠重悬于含有5％BME的1X LDS样品缓冲液中。通过在95℃下加热5分钟从琼脂糖微珠上洗脱免疫沉淀的蛋白质，并且将上清液在SDS-PAGE凝胶上跑电泳并评估免疫沉淀的总Met(CST，#3127)以及泛素化Met(CST，#3936)的存在。全细胞裂解物是指加载到蛋白A-Sepharose微珠上的标准化输入裂解物。
TUBE1免疫沉淀实验
完全按照前面部分(免疫沉淀实验)中所述进行TUBE1免疫沉淀，不同的是使用1mgHs746T裂解物并将其加载到每个样品20uL TUBE1琼脂糖(LifeSensors)树脂上。
本公开的实施方案
本公开涵盖以下具体实施方案。如所指出的那些，以下这些实施方案可包括前述实施方案中所述的所有特征。适用时，以下实施方案还可包括任何前述实施方案中包含的或替代方案所述的特征。
在某些方面，本说明书提供了一种具有以下化学结构的双官能化合物：PTM―接头―ULM，或者其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药，其中：ULM是结合E3泛素连接酶的小分子E3泛素连接酶结合部分；PTM是小分子受体酪氨酸激酶(RTK)蛋白质靶向部分，其中PTM是中的至少一种；并且接头(L)是共价偶联ULM和PTM的键或化学连接部分。
在本文所述的任何方面或实施方案中，ULM是结合E3连接酶蛋白的部分，所述连接酶蛋白选自希佩尔-林道蛋白、人小脑蛋白、小鼠双微体同源物2，以及如本文所述和示例的IAP。在本文所述的任何方面或实施方案中，所述化合物包含PTM，该PTM包含如本文所述的任何式I-XVII的结构，包括所述的所有变化。在本文所述的任何方面或实施方案中，PTM经由接头偶联至ULM，其中接头(L)是如本文所述的键或化学接头部分。在本文所述的任何方面或实施方案中，如针对式I-XVII所述，接头经由R基团偶联至PTM。
在本文所述的任何方面或实施方案中，化合物包含接头(L)部分，该接头部分具有如本文所述的将PTM偶联至ULM的结构。例如，在任何方面或实施方案中，接头(L)包含由下式表示的化学结构单元：-(AL)q-，其中：(AL)q是连接至ULM、PTM部分或它们的组合中的至少一种的基团；q是大于或等于1的整数；每个AL独立地选自键、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1＝CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(＝NCN)NRL4、NRL3C(＝NCN)、NRL3C(＝CNO2)NRL4、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11环烷基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11杂环基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的芳基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的杂芳基，其中RL1或RL2各自独立地任选连接至其他基团以形成环烷基和/或杂环基部分，任选地被0-4个RL5基团取代；并且RL1、RL2、RL3、RL4和RL5各自独立地是H、卤素、C1-8烷基、OC1-8烷基、SC1-8烷基、NHC1-8烷基、N(C1-8烷基)2、C3-11环烷基、芳基、杂芳基、C3-11杂环基、OC1-8环烷基、SC1-8环烷基、NHC1-8环烷基、N(C1-8环烷基)2、N(C1-8环烷基)(C1-8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1-8烷基、P(O)(OC1-8烷基)(C1-8烷基)、P(O)(OC1-8烷基)2、CC-C1-8烷基、CCH、CH＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝C(C1-8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1-8烷基)3、Si(OH)(C1-8烷基)2、COC1-8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1-8烷基、SO2N(C1-8烷基)2、SONHC1-8烷基、SON(C1-8烷基)2、CONHC1-8烷基、CON(C1-8烷基)2、N(C1-8烷基)CONH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)CON(C1-8烷基)2、NHCONH(C1-8烷基)、NHCON(C1-8烷基)2、NHCONH2、N(C1-8烷基)SO2NH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)SO2N(C1-8烷基)2、NHSO2NH(C1-8烷基)、NHSO2N(C1-8烷基)2、NHSO2NH2。
在任何方面或实施方案中，接头(L)具有选自以下的化学结构：
其中WL1和WL2各自独立地为具有0-4个杂原子的4-8元环，任选地被RQ取代，每个RQ独立地为H、卤素、OH、CN、CF3、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)、C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)，或者2个RQ基团与它们所附连的原子合在一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系；YL1各自独立地为键、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子置换为O；或C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)；n是0-10；并且虚线指示与PTM或ULM部分的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中，化合物包含接头(L)，该接头(L)是包含1至10个乙二醇单元的任选被芳基或苯基取代的聚乙烯氧基基团。
在本文所述的任何方面或实施方案中，化合物具有选自化合物1-351(图2)的结构，包括其类似物、衍生物、盐、前药、多晶型物、类似物、衍生物和氘代形式。在另一方面，本说明书提供了治疗组合物，其包含有效量的化合物1-351(图2)中的至少一种，以及药学上可接受的载体。在本文所述的任何方面或实施方案中，该组合物还包含另外的生物活性剂或如本文所述和/或所例示的另一种PROTAC化合物中的至少一种。在任何方面或实施方案中，所述另外的生物活性剂是抗癌(即，抗肿瘤)或抗炎剂。在任何方面或实施方案中，如本文所述的PROTAC化合物与抗肿瘤剂共同施用(一起或分开)。在本文所述的任何方面或实施方案中，抗肿瘤剂是抗PD1或抗PD-L1抗体。在一个方面，本说明书提供了用于共同施用的治疗组合物，其包含有效量的如本文所述的化合物和有效量的另外的生物活性剂，例如抗肿瘤剂。在某些实施方案中，有效量的如本文所述的化合物和有效量的另外的生物活性剂包含在单独的容器中。
在一个方面，本说明书提供了一种组合物，其包含药学上可接受的载体和有效量的至少一种如本文所述的化合物，用于治疗受试者的疾病或病症。在任何方面或实施方案中，所述疾病或病症与受体酪氨酸激酶(例如，EGFR、c-MET、HER1-3或VEGFR)的过表达或过度活跃相关。在任何方面或实施方案中，所述疾病或病症是癌症。在任何方面或实施方案中，所述疾病或病症是肺鳞状细胞癌、结肠癌和肛门癌、成胶质细胞瘤、头颈部上皮细胞瘤、牛皮癣、湿疹和动脉粥样硬化中的至少一种或它们的组合。
在另外的方面，本说明书提供了治疗受试者的与受体酪氨酸激酶(RTK)相关的疾病或病症的方法，该方法包括向有此需要的受试者施用有效量的至少一种如本文所述的化合物或包含该化合物的治疗组合物，其中所述至少一种化合物或组合物能够有效改善RTK相关疾病或病症的至少一种症状。在本文所述的任何方面或实施方案中，RTK相关疾病或病症是癌症、炎性疾病或减少的毛发生长，其与RTK过表达或过度活跃相关。在本文所述的任何方面或实施方案中，所述疾病或病症与EGFR过表达或过度活跃有关。

Claims (47)

1.一种具有以下化学结构的双官能化合物：
PTM―接头―ULM，
或者其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药，
其中ULM是结合选自希佩尔-林道蛋白、人小脑蛋白、小鼠双微体同源物2或IAP的E3泛素连接酶的小分子E3泛素连接酶结合部分；
PTM是选自EAI045、阿法替尼、布格替尼、卡博替尼、克唑替尼、达克替尼、埃罗替尼、佛瑞替尼、吉非替尼、埃克替尼、伊马替尼、拉帕替尼、乐伐替尼、莫特塞尼、来那替尼、奥希替尼、帕唑帕尼、舒尼替尼、替万替尼、凡德他尼、INCB28060、AMG-458、PF-04217903、PF-02341066、E7050、MK-2461、MBS-777607、JNJ-38877605、ARQ197、GSK/1363089/XL880、XL184、其类似物、衍生物、多晶型物或溶剂化物的小分子受体酪氨酸激酶(RTK)蛋白质靶向部分；并且
接头(L)是共价偶联所述ULM和所述PTM的键或化学连接部分。
2.一种具有以下化学结构的双官能化合物：
PTM―接头―ULM，
或者其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药，
其中ULM是结合选自希佩尔-林道蛋白、人小脑蛋白、小鼠双微体同源物2或IAP的E3泛素连接酶的小分子E3泛素连接酶结合部分；
PTM是小分子受体酪氨酸激酶(RTK)蛋白质靶向部分；并且
接头(L)是共价偶联所述ULM和所述PTM的键或化学连接部分。
3.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式I的一般结构：
Figure FDA0002176933820000011
其中每个R21独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基、卤代烷基、炔基、烷氧基、芳基甲氧基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代；
每个R22独立地选自H、N、卤素、烷基、卤代烷基、烷氧基、甲氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、呋喃、吡咯、咪唑、噁唑、异噁唑、噻唑、环烷基、杂环烷基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、氰基或R99SO2(CH2)sNHCH2–其中R99是烷基并且s是介于0和3之间的整数、–OR23或–NHC(O)R24的取代基取代，其中R23选自羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基或二烷基氨基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000021
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
4.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式II的一般结构：
Figure FDA0002176933820000022
其中R21是1至3个独立地选自H、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳氧基和杂芳氧基、芳烷基、杂芳基烷基、芳基烷氧基和杂芳基烷氧基的取代基，其中所述芳基、杂芳基、芳氧基和杂芳氧基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
R27选自H、烷基、羟烷基和烷氧基烷基；
A是芳基、苯基或杂芳基；并且
R28是1至2个独立地选自H、O、N、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基的取代基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
5.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式III的一般结构：
Figure FDA0002176933820000031
其中R21选自H、卤素、Cl、F、C1-C6烷基、卤代烷基、炔基、烷氧基、芳基甲氧基、氰基和杂芳基甲氧基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素和卤代烷基的取代基取代；
R29是1至2个独立地选自以下的取代基：H、卤素、芳基、烷基、卤代烷基、烷氧基和氰基；并且
R30选自H、羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基或杂环烷基烷基，其中所述烷基可任选地被–NHC(O)–或–C(O)NH–基团中断，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
6.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式IV的一般结构：
Figure FDA0002176933820000032
其中R31选自H、卤素、Cl、烷基、卤代烷基、CF3、烷氧基、羟基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、芳基、杂芳基、吲哚、吡唑、咪唑、环烷基、杂环烷基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基和氰基的取代基取代；
R32选自H、5元或6元芳基或杂芳基、双环稠合芳基或杂芳基或者另外任选地与环烷基或杂环烷基稠合的双环稠合芳基或杂芳基，其中所述芳基或杂芳基任选地被1–2个选自烷基、卤素或卤代烷基的取代基取代；
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R34选自H、O、烷基、卤代烷基、卤素、氨基、酰胺基、C2-C6炔烃、烷氧基、氰基或–NHC(O)R24，其中R24是R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000041
R25和R26独立地选自H、N、N(CH2)1-3或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起任选地形成杂环烷基；并且
R35选自任选被取代的–OR36和–NR37R38，其中R36选自羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基或杂环烷基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且R37和R38独立地选自H、烷基、–NR37R38，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
7.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式V的一般结构：
Figure FDA0002176933820000042
其中R31选自H、卤素、Cl、烷基、卤代烷基、CF3、烷氧基、羟基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、芳基、杂芳基、吲哚、吡唑、咪唑、环烷基、杂环烷基，其中所述芳基和杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基和氰基的取代基取代；
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基；
B选自芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基，条件是在后一种情况下，所述杂环烷基的杂原子与X分开至少两个碳原子；
X是O、S或NH；并且
如果附接至B的环氮，则R40是–NHC(O)R24或–C(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000051
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
8.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式VI的一般结构：
Figure FDA0002176933820000052
其中R41选自H、卤素、烷基、卤代烷基、烷氧基和氰基；
R42是1至2个独立地选自H、卤素、烷基、烷氧基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、咪唑、吡唑、吡咯、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基或杂环烷基烷基的取代基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
C是芳基或杂芳基；
D是芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基，例如包含至少一个选自S、O或N的杂原子的3-8元芳基或杂芳基；
Y是键、O、S或NH；
n选自0、1或2；
R43是1至2个独立地选自H、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基的取代基，其中如果附接至D的环氮，则所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基、–NHC(O)R24或–C(O)R24的取代基取代；并且
R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000053
并且
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
9.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式VII的一般结构：
Figure FDA0002176933820000061
其中R42是1至2个独立地选自H、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基烷基的取代基，其中所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
C是芳基或杂芳基，例如咪唑、吡唑、吡咯；
D是芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基；
Y是键、O、S或NH；
n选自0、1或2；
R43是1至2个独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基的取代基，其中如果附接至D的环氮，则所述芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，或者如果附接至D的环氮，则R43取代基中的一个可以是–NHC(O)R24或–C(O)R24；
R24如上文所述；并且
R88是氢或烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
10.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式VIII的一般结构：
Figure FDA0002176933820000071
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基；
B选自芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基；
如果附接至B的环氮，则R40是–NHC(O)R24或–C(O)R24，其中R24选自以下基团：
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R46选自H、烷基、羟烷基、烷氧基烷基、氨基烷基、烷基氨基烷基、二烷基氨基烷基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基或杂环烷基烷基，条件是两个杂原子不附接至同一碳原子，并且其中所述芳基和杂芳基可进一步被1–2个选自烷基、卤素、烷氧基和氰基的取代基取代，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
11.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式IX的一般结构：
Figure FDA0002176933820000073
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基；
B选自芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基；
如果附接至B的环氮，则R40是–NHC(O)R24或–C(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000081
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；并且
R47选自H或烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
12.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式X的一般结构：
R33选自H、烷基、卤代烷基、卤素、烷氧基、羟基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基；
R35是–NR37R38，其中R37和R38独立地选自H或烷基，或者–NR37R38合在一起表示杂环烷基环，最优选哌嗪，进一步任选地被烷基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基或–C(O)R39取代，其中R39是烷基；
B选自芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基；
如果附接至B的环氮，则R40是–NHC(O)R24或–C(O)R24，其中R24选自以下基团：
Figure FDA0002176933820000083
R25和R26独立地选自氢或烷基，条件是R25和R26与它们所连接的N原子合在一起可形成杂环烷基；
R48选自H或烷基；并且
R49选自H、烷基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、芳烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基或杂环烷基烷基，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
13.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XI的一般结构：
Figure FDA0002176933820000091
其中R50是烷基、烷基氨基、二烷基氨基、环烷基或杂环烷基，其中所述环烷基或杂环烷基进一步任选地被卤素、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基或氰基取代，条件是任何两个杂原子被至少两个碳原子隔开；并且
R51是氢，R52是–NHC(O)R53，其中R53是任选地被1–2个独立地选自烷基、卤素、烷氧基和氰基的取代基取代的芳基或杂芳基，或者R51和R52合在一起构成5–6元芳基或杂芳基环，其任选地被1–2个独立地选自烷基、卤素、卤代烷基、烷氧基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、芳基或杂芳基的取代基取代，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
14.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XII的一般结构：
Figure FDA0002176933820000092
其中G是环烷基或杂环烷基；
H是芳基或杂芳基；
R43是1至2个独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基的取代基，其中所述芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，或者如果附接至G的环氮，则R43取代基中的一个可以是–NHC(O)R24或–C(O)R24；并且
R53和R54各自独立地是1–2个独立地选自H、卤素、Cl、F、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氰基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基的取代基，其中所述芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
15.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XIII的一般结构：
Figure FDA0002176933820000101
其中A是含有1-7个杂原子的饱和或不饱和的4-8个原子的碳环或杂环；
Rk1选自H、烷基如C1-C6烷基、环烷基、烯基、炔基、芳基或杂芳基，其中所述烷基、芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk2选自H、烷基、环烷基、芳基或杂芳基，其中所述烷基、芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk3和Rk4独立地选自H、羟基、烷基如C1-C6烷基、烷氧基如C1-C6烷氧基、芳基、-SO2Rk2或卤素，其中所述羟基、烷基、芳基或烷氧基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是与环中的相邻原子具有双键的N或CH或C，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
16.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XIV的一般结构：
Figure FDA0002176933820000111
其中Rk5、Rk6和Rk7独立地选自H、烷基、炔烃、烷氧基、羟基、氰基或卤素Cl或F，其中所述烷基或烷氧基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N或CH，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
17.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XV的一般结构：
Figure FDA0002176933820000112
其中Rk8选自H、烷基、烯基、炔基、芳基或杂芳基，其中所述烷基、芳基或杂芳基可进一步被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk9选自H、烷基或环烷基，其中所述烷基或环烷基任选地被1至3个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
Rk10选自H、烷基、烷基砜、烷基甲酰胺或芳基，其中所述烷基或芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
18.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XVI的一般结构：
其中Rk11选自H、烷基、烷氧基、-C(O)NHR，其中R选自H、烷基、环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环；
Rk12选自H、烷基(直链或支链)、芳基、环烷基或杂芳基，其中所述烷基、芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk13选自H、烷基、-C(O)NHR、-C(O)R、-S(O)2R，其中R是H、烷基或环烷基，其可进一步被1至2个选自烷基、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
X是N或CH，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
19.根据权利要求1或2所述的化合物，其中PTM包含式XVII的一般结构：
Figure FDA0002176933820000122
其中Rk14选自H、N、烷基、烷氧基、-C(O)NHR，其中R选自H、烷基、环烷基或具有4-6个环原子的饱和杂环；
Rk15选自H、烷基(直链或支链)、芳基、环烷基或杂芳基，其中所述烷基、芳基或杂芳基任选地被1至2个选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；
Rk16选自H、烷基或环烷基，其任选地被1至2个选自烷基、卤素、烷基砜、烷基磺酰胺、酰胺基、甲酰胺、卤代烷基、羟基、烷氧基、氨基、酰胺基、烷基氨基、二烷基氨基和氰基的取代基取代；并且
Rk17选自H、卤素、CN，
其中所述PTM经由接头(L)偶联至所述ULM。
20.根据权利要求3-19中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)偶联至R基团。
21.根据权利要求1或2所述的化合物，其中所述PTM是选自图2的实施例1-351的化合物的PTM，并且其中所述PTM共价偶联至所述接头(L)或ULM。
22.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM是具有由以下表示的化学结构的希佩尔-林道(VHL)连接酶结合部分(VLM)：
Figure FDA0002176933820000131
其中：
X1、X2各自独立地选自键、O、NRY3、CRY3RY4、C＝O、C＝S、SO和SO2；
RY3、RY4各自独立地选自H、任选地被1个或多个卤素取代的直链或支链C1-6烷基、任选地被0-3个RP基团取代的C1-6烷氧基；
RP是0、1、2或3个基团，各自独立地选自H、卤素、-OH、C1-3烷基、C＝O；
W3选自任选被取代的–T-N(R1aR1b)X3、任选被取代的–T-N(R1aR1b)、任选被取代的–T-芳基、任选被取代的–T-杂芳基、任选被取代的–T-杂环、任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环；
X3是C＝O、R1、R1a、R1b；
每个R1、R1a、R1b独立地选自H、任选地被1个或多个卤素或-OH基团取代的直链或支链C1-C6烷基、RY3C＝O、RY3C＝S、RY3SO、RY3SO2、N(RY3RY4)C＝O、N(RY3RY4)C＝S、N(RY3RY4)SO和N(RY3RY4)SO2；
T选自任选被取代的烷基、–(CH2)n-基团，其中亚甲基基团中的每一个任选地被选自以下的一个或两个取代基取代：卤素、甲基、任选地被1个或多个卤素或-OH基团取代的直链或支链C1-C6烷基，或者任选被取代的氨基酸侧链；并且
n是0至6；
W4是
Figure FDA0002176933820000141
R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基或任选被取代的烷基；
W5选自苯基或5-10元杂芳基，
R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、NR14aR14b、OR14a、CONR14aR14b、NR14aCOR14b、SO2NR14aR14b、NR14aSO2R14b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基；任选被取代的芳基；任选被取代的杂芳基；任选被取代的环烷基；或任选被取代的环杂烷基；并且
虚线指示PTM的附接位点或将所述PTM偶联至所述ULM的化学接头部分。
23.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM是具有由以下表示的化学结构的希佩尔-林道(VHL)连接酶结合部分(VLM)：
Figure FDA0002176933820000142
其中：
W3选自任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure FDA0002176933820000143
R9和R10独立地是氢、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基，或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基；
R11选自任选被取代的杂环、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、
Figure FDA0002176933820000144
Figure FDA0002176933820000145
R12选自H或任选被取代的烷基；
R13选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基；
R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基或任选被取代的烷基；
W5选自苯基或5-10元杂芳基，
R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、NR14aR14b、OR14a、CONR14aR14b、NR14aCOR14b、SO2NR14aR14b、NR14aSO2R14b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基；任选被取代的芳基；任选被取代的杂芳基；任选被取代的环烷基；或任选被取代的环杂烷基；
R16独立地选自卤素、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或任选被取代的卤代烷氧基；
o是0、1、2、3或4；
R18独立地选自H、卤素、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头；并且
p是0、1、2、3或4，并且其中虚线指示PTM的附接位点或将PTM偶联至ULM的化学接头部分。
24.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM具有选自以下的化学结构：
Figure FDA0002176933820000151
其中：
R1是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基；任选被取代的烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基；
R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基；
R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基；任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、环烷基或环杂烷基；
X是C或C＝O
R3是任选被取代的5或6元杂芳基；并且
其中虚线指示至少一个PTM的附接位点或将所述PTM偶联至所述ULM的化学接头部分。
25.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM包含根据以下化学结构的基团：
Figure FDA0002176933820000161
其中：
R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基；
R9是H；
R10是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基；
R11是
Figure FDA0002176933820000162
任选被取代的杂芳基，
p是0、1、2、3或4；并且
每个R18独立地是卤素、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头；
R12是H、C＝O
R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基，
R15选自H、卤素、Cl、CN、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基；
Figure FDA0002176933820000171
并且其中虚线指示至少一个PTM的附接位点或将至少一个PTM偶联至所述ULM的化学接头部分。
26.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM是选自沙利度胺、来那度胺、泊马度胺、其类似物、其等排物或其衍生物的人小脑蛋白E3连接酶结合部分(CLM)，并且其中ULM经由接头(L)偶联至所述PTM。
27.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述CLM具有由以下表示的化学结构：
Figure FDA0002176933820000172
Figure FDA0002176933820000181
其中：
W选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
每个X独立地选自O、S和H2；
Y选自CH2、-C＝CR’、NH、N-烷基、N-芳基、N-杂芳基、N-环烷基、N-杂环基、O和S；
Z选自O、S和H2；
G和G’各自独立地选自H、任选被取代的烷基、OH、R’OCOOR、R’OCONRR”、任选地被R’取代的CH2-杂环基和任选地被R’取代的苄基；
Q1、Q2、Q3和Q4表示被独立地选自R’、N或N-氧化物的基团取代的碳C；
A独立地选自H、烷基、环烷基、Cl和F；
R包含-CONR’R”、-OR’、-NR’R”、-SR’、-SO2R’、-SO2NR’R”、-CR’R”-、-CR’NR’R”-、(-CR’O)nR”、-芳基、-杂芳基、-烷基、-环烷基、-杂环基、-P(O)(OR’)R”、-P(O)R’R”、-OP(O)(OR’)R”、-OP(O)R’R”、-Cl、-F、-Br、-I、-CF3、-CN、-NR’SO2NR’R”、-NR’CONR’R”、-CONR’COR”、-NR’C(＝N-CN)NR’R”、-C(＝N-CN)NR’R”、-NR’C(＝N-CN)R”、-NR’C(＝C-NO2)NR’R”、-SO2NR’COR”、-NO2、-CO2R’、-C(C＝N-OR’)R”、-CR’＝CR’R”、-CCR’、-S(C＝O)(C＝N-R’)R”、-SF5和-OCF3；
R’和R”独立地选自键、H、任选被取代的烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环、-C(＝O)R、杂环基，其中每一者是任选被取代的；
Figure FDA0002176933820000183
表示可以是立体特异性((R)或(S))或非立体特异性的键；并且
Rn包含官能团或原子，
其中n是1-10的整数，并且其中
当n是1时，Rn被修饰为共价接合至所述接头基团(L)，并且
当n是2、3或4时，一个Rn被修饰为共价接合至所述接头基团(L)或所述PTM。
28.根据权利要求26或27所述的化合物，其中所述CLM具有由以下表示的化学结构：
其中：
W独立地选自CH2、C＝O、NH和N-烷基；
R独立地选自H、甲基、任选被取代的烷基；
Figure FDA0002176933820000191
表示可以是立体特异性((R)或(S))或非立体特异性的键；并且Rn包含1-4个独立选择的官能团或原子，并且任选地，其中之一被修饰为共价接合至所述PTM或化学接头基团(L)。
29.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述CLM具有由以下表示的化学结构：
Figure FDA0002176933820000201
其中：
式(h)至(ab)的W独立地选自CH2、CHR、C＝O、SO2、NH和N-烷基；
式(h)至(ab)的Q1、Q2、Q3、Q4、Q5独立地表示被独立地选自R’、N或N-氧化物的基团取代的碳C；
式(h)至(ab)的R1选自H、CN、C1-C3烷基；
式(h)至(ab)的R2选自H、CN、C1-C3烷基、CHF2、CF3、CHO；
式(h)至(ab)的R3选自H、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基；
式(h)至(ab)的R4选自H、烷基、取代的烷基；
式(h)至(ab)的R5是H或低级烷基；
式(h)至(ab)的X是C、CH或N；
式(h)至(ab)的R’选自H、卤素、烷基、取代的烷基、烷氧基、取代的烷氧基；
式(h)至(ab)的R是H、OH、低级烷基、低级烷氧基、氰基、卤代低级烷氧基或卤代低级烷基
式(h)至(ab)的
Figure FDA0002176933820000211
是单键或双键；并且
所述CLM共价接合至所述PTM或化学接头基团(L)。
30.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM是小鼠双微体2 E3泛素连接酶(MDM2)结合部分(MLM)，其具有选自取代的咪唑啉、取代的螺-吲哚酮、取代的吡咯烷、取代的哌啶酮、取代的吗啉酮、取代的吡咯并嘧啶、取代的咪唑并吡啶、取代的噻唑并咪唑啉、取代的吡咯并吡咯烷酮或取代的异喹啉酮的化学部分，其中所述MLM共价接合至所述PTM或化学接头基团(L)。
31.根据权利要求1-21中任一项所述的化合物，其中所述ULM是包含氨基酸丙氨酸(A)、缬氨酸(V)、脯氨酸(P)和异亮氨酸(I)或它们的非天然模拟物的凋亡抑制剂E3泛素连接酶(IAP)结合部分(ILM)，其中所述ILM共价接合至所述PTM或化学接头基团(L)。
32.根据权利要求31所述的化合物，其中所述ULM是包含AVPI四肽片段或其衍生物的IAP E3泛素连接酶结合部分(ILM)。
33.根据权利要求1-32中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)包含由下式表示的化学结构单元：
-(AL)q-，
其中：
(AL)q是连接至ULM、PTM部分或它们的组合中的至少一者的基团；
q是大于或等于1的整数；
每个AL独立地选自键、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1＝CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(＝NCN)NRL4、NRL3C(＝NCN)、NRL3C(＝CNO2)NRL4、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11环烷基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11杂环基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的芳基、任选地被0-6个RL1和/或RL2基团取代的杂芳基，其中RL1或RL2各自独立地任选与其他基团连接，以形成任选地被0-4个RL5基团取代的环烷基和/或杂环基部分；并且
RL1、RL2、RL3、RL4和RL5各自独立地是H、卤素、C1-8烷基、OC1-8烷基、SC1-8烷基、NHC1-8烷基、N(C1-8烷基)2、C3-11环烷基、芳基、杂芳基、C3-11杂环基、OC1-8环烷基、SC1-8环烷基、NHC1-8环烷基、N(C1-8环烷基)2、N(C1-8环烷基)(C1-8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1-8烷基、P(O)(OC1-8烷基)(C1-8烷基)、P(O)(OC1-8烷基)2、CC-C1-8烷基、CCH、CH＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)＝C(C1-8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1-8烷基)3、Si(OH)(C1-8烷基)2、COC1-8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1-8烷基、SO2N(C1-8烷基)2、SONHC1-8烷基、SON(C1-8烷基)2、CONHC1-8烷基、CON(C1-8烷基)2、N(C1-8烷基)CONH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)CON(C1-8烷基)2、NHCONH(C1-8烷基)、NHCON(C1-8烷基)2、NHCONH2、N(C1-8烷基)SO2NH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH(C1-8烷基)、NH SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH2。
34.根据权利要求1-32中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)包含由选自以下的一般结构表示的基团：
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-，
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-，
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-；
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-；
Figure FDA0002176933820000241
其中m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20，条件是当数目是零时，不存在N-O或O-O键，R选自H、甲基或乙基，并且X选自H和F；
Figure FDA0002176933820000242
Figure FDA0002176933820000251
Figure FDA0002176933820000261
Figure FDA0002176933820000271
Figure FDA0002176933820000291
Figure FDA0002176933820000301
Figure FDA0002176933820000311
35.根据权利要求1-32中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)选自：
Figure FDA0002176933820000321
Figure FDA0002176933820000341
Figure FDA0002176933820000342
其中每个m和n独立地选自0、1、2、3、4、5或6。
36.根据权利要求1-32中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)选自：
Figure FDA0002176933820000343
Figure FDA0002176933820000351
Figure FDA0002176933820000361
Figure FDA0002176933820000381
Figure FDA0002176933820000391
Figure FDA0002176933820000401
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Figure FDA0002176933820000421
Figure FDA0002176933820000441
Figure FDA0002176933820000451
Figure FDA0002176933820000461
Figure FDA0002176933820000471
Figure FDA0002176933820000481
Figure FDA0002176933820000491
Figure FDA0002176933820000501
Figure FDA0002176933820000511
Figure FDA0002176933820000521
Figure FDA0002176933820000531
Figure FDA0002176933820000541
Figure FDA0002176933820000551
Figure FDA0002176933820000561
Figure FDA0002176933820000571
其中每个m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
37.根据权利要求1-33中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)选自：
Figure FDA0002176933820000582
Figure FDA0002176933820000591
Figure FDA0002176933820000601
Figure FDA0002176933820000611
Figure FDA0002176933820000621
Figure FDA0002176933820000631
Figure FDA0002176933820000641
Figure FDA0002176933820000651
Figure FDA0002176933820000661
38.根据权利要求1-33中任一项所述的化合物，所述接头(L)具有选自以下的化学结构：
Figure FDA0002176933820000671
其中：
WL1和WL2各自独立地是具有0-4个杂原子的4-8元环，任选被RQ取代，每个RQ独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)、C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系；
YL1各自独立地是键、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子替换为O；或C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)；
n是0-10；并且
虚线指示与所述PTM或ULM部分的附接点。
39.根据权利要求1-33中任一项所述的化合物，所述接头(L)具有选自以下的化学结构：
Figure FDA0002176933820000672
其中：
WL1和WL2各自独立地是芳基、杂芳基、环基、杂环基、C1-6烷基、双环、双芳基、双杂芳基或双杂环基，各自任选被RQ取代，每个RQ独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、羟基、硝基、C≡CH、C2-6烯基、C2-6炔基、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)、C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)、OC1-3烷基(任选被1个或多个-F取代)、OH、NH2、NRY1RY2、CN，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系；
YL1各自独立地是键、NRYL1、O、S、NRYL2、CRYL1RYL2、C＝O、C＝S、SO、SO2、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子替换为O；C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的)；
QL是具有0-4个杂原子的3-6元脂环族或芳族环，任选桥连，任选被0-6个RQ取代，每个RQ独立地是H、C1-6烷基(直链、支链、任选被1个或多个卤素取代、C1-6烷氧基)，或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系)；
RYL1、RYL2各自独立地是H、OH、C1-6烷基(直链、支链、任选被1个或多个卤素取代、C1-6烷氧基)，或者R1、R2与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系)；
n是0-10；并且
虚线指示与所述PTM或ULM部分的附接点。
40.根据权利要求1-33中任一项所述的化合物，其中所述接头(L)是包含1至10个乙二醇单元的任选被芳基或苯基取代的聚乙烯氧基基团。
41.一种组合物，包含有效量的根据权利要求1-40中任一项所述的化合物，以及药学上可接受的载体或赋形剂。
42.根据权利要求41所述的组合物，其中所述组合物还包含另外的生物活性剂或根据权利要求1-39中任一项所述的另外的化合物中的至少一种。
43.根据权利要求42所述的组合物，其中所述另外的生物活性剂是抗癌剂或抗炎剂。
44.一种组合物，所述组合物包含药学上可接受的载体和有效量的至少一种根据权利要求1-40中任一项所述的化合物，所述组合物用于治疗受试者的受体酪氨酸激酶(RTK)相关的疾病或病症。
45.根据权利要求44所述的组合物，其中所述疾病或病症是与EGFR、HER2、c-MET或IGFR过表达或过度活跃相关的癌症或炎性疾病。
46.根据权利要求45所述的组合物，其中所述RTK相关疾病或病症与EGFR过表达或过度活跃相关。
47.根据权利要求44-46中任一项所述的组合物，其中所述疾病或病症是肺鳞状细胞癌、结肠癌和肛门癌、成胶质细胞瘤、头颈部上皮细胞瘤、牛皮癣、湿疹和动脉粥样硬化中的至少一种或它们的组合。
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