RU2736725C1 - Пирролобензодиазепиновые конъюгаты антитело-лекарственное средство и способы их применения - Google Patents

Пирролобензодиазепиновые конъюгаты антитело-лекарственное средство и способы их применения Download PDF

Info

Publication number
RU2736725C1
RU2736725C1 RU2018115802A RU2018115802A RU2736725C1 RU 2736725 C1 RU2736725 C1 RU 2736725C1 RU 2018115802 A RU2018115802 A RU 2018115802A RU 2018115802 A RU2018115802 A RU 2018115802A RU 2736725 C1 RU2736725 C1 RU 2736725C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
antibody
seq
hvr
amino acid
acid sequence
Prior art date
Application number
RU2018115802A
Other languages
English (en)
Inventor
Питер Драгович
Томас Пиллоу
Джек САДОВСКИ
Марк Кс. СЛИВКОВСКИ
Биньцин ВЭЙ
Original Assignee
Дженентек, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дженентек, Инк. filed Critical Дженентек, Инк.
Application granted granted Critical
Publication of RU2736725C1 publication Critical patent/RU2736725C1/ru

Links

Images

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/55—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
    • A61K31/551—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole having two nitrogen atoms, e.g. dilazep
    • A61K31/5513—1,4-Benzodiazepines, e.g. diazepam or clozapine
    • A61K31/5517—1,4-Benzodiazepines, e.g. diazepam or clozapine condensed with five-membered rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. imidazobenzodiazepines, triazolam
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6889—Conjugates wherein the antibody being the modifying agent and wherein the linker, binder or spacer confers particular properties to the conjugates, e.g. peptidic enzyme-labile linkers or acid-labile linkers, providing for an acid-labile immuno conjugate wherein the drug may be released from its antibody conjugated part in an acidic, e.g. tumoural or environment
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/55—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
    • A61K31/551—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole having two nitrogen atoms, e.g. dilazep
    • A61K31/5513—1,4-Benzodiazepines, e.g. diazepam or clozapine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6851—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6851—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
    • A61K47/6855—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell the tumour determinant being from breast cancer cell
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04—Ortho-condensed systems
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D519/00—Heterocyclic compounds containing more than one system of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system not provided for in groups C07D453/00 or C07D455/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/40—Immunoglobulins specific features characterized by post-translational modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/52—Constant or Fc region; Isotype
    • C07K2317/522—CH1 domain
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/567—Framework region [FR]

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Reproductive Health (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)

Abstract

В изобретении предложены конъюгаты антитело-лекарственное средство, содеражащие антитело, конъюгированное с лекарственным пирролобензодиазепиновым компонентом через дисульфидный линкер,
Figure 00000122
где X
Figure 00000123
Y представляет собой C(=O)-NH или CH2-NH; A представляет собой пиррол, необязательно замещенный группой =C(R)2, в которой R независимо выбран из H и C1-C6-алкила; R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила или R1 и R2 образуют циклопропил; p равно целому числу от 1 до 8; и Ab представляет собой антитело, которое выбрано из группы, состоящей из анти-HER2, анти-CD22, анти-CD33, анти-Napi2b и анти-CLL-1, а также пирролобензодиазепиновые промежуточные соединения линкера, фармацевтические композиции и способы применения конъюгатов антитело-лекарственное средство для лечения гиперпролиферативных заболеваний. 11 н. и 45 з.п. ф-лы, 15 ил., 9 табл., 15 пр.

Description

ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ
Данная заявка испрашивает приоритет по предварительной заявке США №62/236429, поданной 2 октября 2015 г., которая тем самым включена в данный документ в полном объеме посредством ссылки.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
Данная заявка содержит перечень последовательностей, который был подан в электронном виде в формате ASCII и включен в данный документ в полном объеме посредством ссылки. Указанная копия ASCII, созданная 30 сентября 2016 года, называется P32858-WO_SL.txt и имеет размер 56520 байт.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ
Изобретение относится в целом к антителам, конъюгированным с промежуточными соединениями пирролбензодиазепина для того, чтобы образовать конъюгаты антитело-лекарственное средство для терапевтического или диагностического применений. Антитела могут быть сконструированы со свободными аминокислотами цистеина, являющимися реакционноспособными для конъюгации с промежуточными соединениями пирролобензодиазепина. Изобретение также относится к способам применения соединений конъюгатов антитело-лекарственное средство для лечения гиперпролиферативных патологий, таких как рак, или для in vitro, in situ и in vivo диагностики таких патологий.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) являются целенаправленными химиотерапевтическими молекулами, объединяющими свойства как антител, так и цитотоксических препаратов, за счет нацеливания сильных цитотоксических лекарственных препаратов на антиген-экспрессирующие опухолевые клетки, поглощения клеткой и высвобождения лекарственного средства, тем самым усиливая их противоопухолевую активность (Carter, P. and Senter, P. (2008) The Cancer Jour. 14(3):154-169). Успешная разработка КАЛС (ADC) для данного антигена-мишени зависит от оптимизации выбора антитела, дизайна и стабильности линкера, активности цитотоксического лекарственного средства, и способа соединения лекарственного средства и линкера с антителом (Dosio et al (2011) Toxins, 3:848-883; Polakis, P. (2005) Current Opinion in Pharmacology 5:382-387).
Некоторые соединения пирролбензодиазепина (ПБД (PBD)) обладают способностью распознавать и связываться с конкретными последовательностями ДНК; предпочтительной последовательностью является PuGPu (Pu=пурин, такой как аденин A и гуанин G). Первый антибактериальный антибиотик ПБД (PBD), антрамицин, был обнаружен в 1965 году (Leimgruber, et al., J. Am. Chem. Soc., 87:5793-5795 (1965); Leimgruber, et al., J. Am. Chem. Soc., 87, 5791-5793 (1965)). С тех пор было обнаружено и описано ряд природных ПБД (PBD) и аналогов (Thurston, et al., Chem. Rev. 1994, 433-465 (1994); Antonow, D. and Thurston, D.E., (2011) Chem. Rev. 111 (4):2815-2864). Члены семейства включают аббеймицин (Hochlowski, et al., (1987) J. Antibiotics, 40:145-148), чикамицин (Konishi, et al., (1984) J. Antibiotics, 37:200-206), Thurston, et al., (1990) Chem. Brit., 26:767-772; Bose, et al., (1992) Tetrahedron, 48: 751-758), мазетарамицин (Kuminoto, et al., J. Antibiotics, 33, 665-667 (1980)), неотрамицины A и B (Takeuchi, et al., J. Antibiotics, 29, 93-96 (1976)), поротамицин (Tsunakawa, et al., (1988) J. Antibiotics, 41:1366-1373), протракрацин (Shimizu, et al., J. Antibiotics, (1982)) 29:2492-2503, Langley and Thurston, (1987) J. Org. Chem., 52:91-97), сибаномицин, DC-102 (Hara, et al., (1988) J. Antibiotics, 41:702 -704, Itoh, et al., J. Antibiotics, (1988) 41:1281-1284), сибиромицин (Leber, et al., (1988) J. Am. Chem. Soc., 110:2992-2993) и томамицин (Arima, et al., (1972) J. Antibiotics, 25:437-444).
Пирролобензодиазепины имеют общую структуру:
Figure 00000001
и отличаются по количеству, типу и положению заместителей как в ароматических кольцах А, так и в пирроло C-кольцах и по степени насыщения С-кольца. В B-кольце присутствует или имин (N =C), карбиноламин (NH-CH(OH)), или метиловый эфир карбиноламина (NH-CH(OMe)) в положении N10-C11, электрофильный центр ответственный за алкилирование ДНК. Все известные природные продукты имеют (S)-конфигурацию в хиральной позиции С11а, что придает им правостороннюю закрученость при просмотре от кольца С в направлении кольца А и определяет трехмерную структуру, изоспиральную малой бороздке B-формы ДНК, что приводит к плотному прилеганию в сайте связывания (Kohn, In Antibiotics III. Springer-Verlag, New York, pp. 3-11 (1975); Hurley and Needham-VanDevanter, (1986) Acc. Chem. Res., 19:230-237). Способность ПБД (PBD) образовывать аддукт в малой канавке позволяет им мешать процессингу ДНК, следовательно, делает возможным их применение в качестве противоопухолевых веществ. Димерные соединения пирролобензодиазепина, где две структуры пирролбензодиазепина ковалентно присоединены линкером через позицию С8 колец А, могут диалкилировать и перекрестно сшивать двухцепочечную ДНК (WO 2005/085251).
Соединения пирролобензодиазепина могут быть применены в качестве пролекарств, защищая их в позиции N10 защитной группой азота, такой как карбамат, который является отсоединяемым in vivo (WO 2000/12507, WO 2005/023814). Защитные группы являются отсоединяемыми от позиции N10 компонента ПБД (PBD) для того, чтобы оставить иминовую связь N10-C11. Описывается ряд защитных групп, включая группы, которые могут быть расщеплены действием ферментов.
Конъюгаты антитело-лекарственное средство, где димер пирролобензодиазепина (ПБД (PBD)) связан через позицию N10 с антителом, специфичным к ассоциированному с опухолью антигену, обладают эффективностью in vitro и in vivo против опухолевых клеток (WO 2011/130598). Были описаны конъюгаты антитело-лекарственное средство с димерными компонентами ПБД (PBD) в качестве лекарственного средства, имеющими линкерные группы для присоединения к связывающемуся с клеткой веществу, такому как антитело, через мостиковую связь («привязь»), соединяющую мономерные единицы димера ПБД (PBD) (WO 2007/085930). Были описаны конъюгаты антитело-лекарственное средство с димерными компонентами ПБД (PBD) в качестве лекарственного средства, имеющими амидные группы и аминогруппы в кольце В в позиции N10-C11 (WO 2014/096368; WO 2013/177481; WO 2012/112708). Были описаны конъюгаты антитело-лекарственное средство, содержащие диалкилирующие пирролбензодиазепиновые (ПБД (PBD)) димерные лекарственные компоненты, присоединенные в позиции N10 ПБД (PBD) дисульфидной связью к антителам (WO2013/055987; Gregson et al. (2001) J. Med. Chem. 44:1161-1174).
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Изобретение включает в себя промежуточное соединение линкер-лекарственное средство Формулы I:
Figure 00000002
I
где X
Figure 00000003
Y выбран из CH2-CH2, CH=CH, C(=O)-NH, или CH2-NH;
A представляет собой 5-членное или 6-членное гетероциклическое кольцо, необязательно замещенное группой, выбранной из F, C1-C6-алкила или =C(R)2, где R независимо выбран из H, F, C1-C6-алкила или C1-C6-фторалкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила, или R1 и R2 образуют 3, 4, 5 или 6-членную циклоалкильную или гетероциклильную группу;
R3 независимо выбран из NO2, Cl, F, CN, CO2H или Br; и
m равно 0, 1 или 2.
Изобретение включает в себя моноалкилирующие пирролбензодиазепиновые лекарственные компоненты, ковалентно связанные с антителами дисульфидным линкером с образованием соединений конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) для терапевтического или диагностического применений.
Другим аспектом изобретения является соединение конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II:
Figure 00000004
II
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X
Figure 00000003
Y выбран из CH2-CH2, CH2-C(=O), CH=CH, или CH2-NH;
A представляет собой 5-членное или 6-членное гетероциклическое кольцо, необязательно замещенное группой, выбранной из F, C1-C6-алкила или =C(R)2, где R независимо выбран из H, F, C1-C6-алкила или C1-C6-фторалкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила, или R1 и R2 образуют 3, 4, 5 или 6-членную циклоалкильную или гетероциклильную группу;
p равно целому числу от 1 до 8; и
Ab представляет собой антитело.
В иллюстративном варианте осуществления, антитело связывается с одним или больше ассоциированными с опухолью антигенами, или рецепторами клеточной поверхности, выбранными из 1)-53):
1) BMPR1B (рецептор типа IB костного морфогенетического белка);
2) E16 (LAT1, SLC7A5);
3) STEAP1 (шеститрансмембранный эпителиальный антиген простаты);
4) MUC16 (0772P, CA125);
5) MPF (MPF, MSLN, SMR, потенциирующий мегакариоциты фактор, мезотелин);
6) Napi2b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, cемейство транспортеров растворенных веществ 34 (фосфат натрия), член 2, натрий-зависимый фосфатный транспортер 3b типа II);
7) Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm.42015, SEMA5B, SEMAG, семафорин 5b Hlog, домен sema, семь тромбоспондиновых повторов (тип 1 и подобный типу 1), трансмембранный домен I и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 5B);
8) PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, RIKEN кДНК 2700050C12, RIKEN кДНК 2700050C12 ген);
9) ETBR (рецептор эндотелина типа B);
10) MSG783 (RNF124, гипотетический белок FLJ20315);
11) STEAP2 (HGNC_8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, ассоциированный с раком простаты ген 1, ассоциированный с раком простаты белок 1, шеститрансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы 2, шеститрансмембранный белок простаты);
12) TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, катионный канал, действующий по механизму транзиторного рецепторного потенциала, подсемейство M, элемент 4);
13) CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, фактор роста, полученный из тератокарциномы);
14) CD21 (CR2 (рецептор 2 комплемента) или C3DR (C3d/рецептор вируса Эпштейна-Барр) или Hs 73792);
15) CD79b (CD79B, CD79β, IGb (иммуноглобулин-ассоциированный бета), B29);
(16) FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (якорный фосфатазный белок 1а, содержащий домен SH2), SPAP1B, SPAP1C);
17) HER2;
18) NCA;
19) MDP;
20) IL20Rα;
21) Brevican;
22) EphB2R;
23) ASLG659;
24) PSCA;
25) GEDA;
26) BAFF-R (рецептор фактора активации В-лимфоцитов, BLyS рецептор 3, BR3);
27) CD22 (изоформа CD22-В рецептора В-лимфоцитов);
28) CD79a (CD79A, CD79α, иммуноглобулин-ассоциированный альфа);
29) CXCR5 (рецептор 1 лимфомы Беркитта);
30) HLA-DOB (бета-субъединица молекулы ГКГС класса II (антиген Ia));
31) P2X5 (управляемый лигандом пуринергического рецептора P2X ионный канал 5);
32) CD72 (антиген CD72 дифференциации В-лимфоцитов, Lyb-2);
33) LY64 (антиген 64 (RP105) лимфоцитов, мембранный белок типа I семейства белков, богатых на лейциновые повторы (LRR - leucine rich repeat));
34) FcRH1 (Fc-рецептор-подобный белок 1);
35) FcRH5 (IRTA2, ассоциированный с транслокацией рецепторов суперсемейства иммуноглобулинов 2);
36) TENB2 (предполагаемый трансмембранный протеогликан);
37) PMEL17 (гомолог silver; SILV; D12S53E; PMEL17; SI; SIL);
38) TMEFF1 (трансмембранный белок 1 с EGF-подобным и двумя фолистатино-подобными доменами, Tomoregulin-1);
39) GDNF-Ra1 (рецептор альфа-1 семейства GDNF; GFRA1; GDNFR; GDNFRA; RETL1; TRNR1; RET1L; GDNFR-alpha1; GFR-ALPHA-1);
40) Ly6E (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус E; Ly67, RIG-E, SCA-2, TSA-1);
41) TMEM46 (гомолог shisa 2 (Xenopus laevis); SHISA2);
42) Ly6G6D (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус G6D; Ly6-D, MEGT1);
43) LGR5 (богатый на лейциновые повторы рецептор 5, сопряженный с G белком; GPR49, GPR67);
44) RET (протоонкоген ret; MEN2A; HSCR1; MEN2B; MTC1; PTC; CDHF12; Hs.168114; RET51; RET-ELE1);
45) LY6K (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус K; LY6K; HSJ001348; FLJ35226);
46) GPR19 (рецептор 19, сопряженный с G белком; Mm.4787);
47) GPR54 (рецептор KISS1; KISS1R; GPR54; HOT7T175; AXOR12);
48) ASPHD1 (содержащий домен аспартат-бета-гидроксилазы белок 1; LOC253982);
49) Тирозиназа (TYR; OCAIA; OCA1A; тирозиназа; SHEP3);
50) TMEM118 (белок 2, содержащий трансмембранный домен и домен «палец RING (Really Interesting New Gene)»; RNFT2; FLJ14627);
51) GPR172A (рецептор 172A, сопряженный с G белком; GPCR41; FLJ11856; D15Ertd747e);
52) CD33; или
53) CLL-1.
Другим аспектом изобретения является фармацевтическая композиция, содержащая конъюгат антитело-лекарственное средство Формулы II и фармацевтически приемлемый разбавитель, носитель или вспомогательное вещество.
Другим аспектом изобретения является применение конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II при изготовлении лекарства для лечения рака у млекопитающего.
Другим аспектом изобретения является способ лечения рака путем введения пациенту фармацевтической композиции, содержащей соединение конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II.
Другим аспектом изобретения является способ получения конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II.
Другим аспектом изобретения является изделие, содержащее фармацевтическую композицию, содержащую конъюгат антитело-лекарственное средство Формулы II, контейнер, и листок-вкладыш или этикетку, указывающие, что фармацевтическая композиция может применяться для лечения рака.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
На Фиг. 1А изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток BJAB, обработанных ADC-107, ADC-103 и контролем ADC-108, не нацеленным на мишень.
На Фиг. 1В изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток WSU-DLCL2, обработанных ADC-107, ADC-103 и контролем ADC-108, не нацеленным на мишень.
На Фиг. 1C изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток Jurkat, обработанных ADC-107, ADC-103 и контролем ADC-108, не нацеленным на мишень.
На Фиг. 1D изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток BJAB, обработанных ADC-101, ADC-113, ADC-103, ADC-111 и ADC-112.
На Фиг. 1E изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток WSU-DLCL2, обработанных ADC-101, ADC-113, ADC-103, ADC-111 и ADC-112.
На Фиг. 1F изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток SK-BR-3, обработанных ADC-108, ADC-102, ADC-203, ADC-201 и ADC-107.
На Фиг. 1G изображен график жизнеспособности клеток in vitro для клеток KPL-4, обработанных ADC-108, ADC-102, ADC-203, ADC-201 и ADC-107.
На Фиг. 2 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата WSU-DLCL2 у мышей CB-17 Fox Chase SCID, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8), 100 мкл
2) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-1), ADC-202, 0,5 мг/кг
3) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-1), ADC-202, 2 мг/кг
4) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51), моноамид, ADC-103, 2 мг/кг
5) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51), моноамид, ADC-103, 5 мг/кг
6) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51), моноамид, ADC-103, 10 мг/кг
7) Тио Hu анти-Her2 (hu7C2) LC K149C-(LD-51), моноамид, ADC-102, 10 мг/кг.
На Фиг. 3 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата Bjab-luc у мышей CB-17 Fox Chase SCID, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8 HisAc 20 мМ, сахароза 240 мМ, TW-20 0,02%, pH 5,5), 100 мкл (микролитр)
2) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-1), ADC-202, 0,1 мг/кг
3) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-1), ADC-202, 0,2 мг/кг
4) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(C-LD1), ADC-202, 0,4 мг/кг
5) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 1 мг/кг
6) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 2 мг/кг
7) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 4 мг/кг
8) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 8 мг/кг
9) Тио Hu анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(CLD-1) ADC-201, 0,4 мг/кг
10) Тио Hu анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-104, 8 мг/кг.
На Фиг. 4 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени для клеточной линий человека WSU-DLCL2 в мышиной модели, которой вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8), 100 мкл
2) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 5 мг/кг
3) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-52) моноамин, ADC-107, 0,5 мг/кг
4) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-52) моноамин, ADC-107, 2 мг/кг
5) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C--(LD-52) моноамин, ADC-107, 5 мг/кг
6) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-52) моноамин, ADC-107, 10 мг/кг
7) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4) моноамин, ADC-204, 0,5 мг/кг
8) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4) моноамин, ADC-204, 2 мг/кг
9) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4) моноамин, ADC-204, 5 мг/кг
10) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4) моноамин, ADC-204, 10 мг/кг
11) Тио Hu анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-52) моноамин, ADC-108, 2 мг/кг
12) Тио Hu анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(CLD-4) моноамин, ADC-205, 2 мг/кг.
На Фиг. 5A изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели опухоли HER2 KPL4 у мышей scid beige, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель
2) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 1 мг/кг
3) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 5 мг/кг
4) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52) моноамин, ADC-108, 0,5 мг/кг
5) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52) моноамин, ADC-108, 1 мг/кг
6) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52) моноамин, ADC-108, 2 мг/кг
7) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52) моноамин, ADC-108, 5 мг/кг
8) CD22 LC-K149C-(LD-52) моноамин, ADC-107, 1 мг/кг.
На Фиг. 5B изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели опухоли HER2 KPL4 у мышей scid beige, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель
2) Tmab-DM1, ADC-211, 1 мг/кг
3) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 1 мг/кг
4) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 5 мг/кг
5) Tmab-DM1, ADC-211, 1мг/кг+Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 1 мг/кг
6) Tmab-DM1, ADC-211, 1мг/кг+Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-106, 5 мг/кг.
На Фиг. 6 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели HER2 Fo5 у мышей CRL nu/nu, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8), 100 мкл
2) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(CLD-1), ADC-201, 0,5 мг/кг
3) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(CLD-1), ADC-201, 1 мг/кг
4) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-104, 5 мг/кг
5) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-104, 10 мг/кг
6) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-104, 15 мг/кг
7) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C неконъюгированное антитело 15 мг/кг
8) Тио-CD22 LC-K149C-(CLD-1), ADC-202, 1 мг/кг
9) Тио-CD22 LC-K149C-(LD-51) моноамид ADC-105, 15 мг/кг.
На Фиг. 7 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели опухоли HER2 KPL4 у мышей SCID Beige, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель
2) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(CLD-1), ADC-201, 1 мг/кг
3) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(CLD-1), ADC-201, 3 мг/кг
4) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид ADC-104, 3 мг/кг
5) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид ADC-104, 6 мг/кг
6) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51) моноамид ADC-104, 10 мг/кг
7) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C, неконъюгированное антитело, 3 мг/кг
8) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C, неконъюгированное антитело, 10 мг/кг
9) Тио-CD22 LC-K149C-(CLD-1), ADC-202, 3 мг/кг
10) Тио-CD22 LC-K149C-(LD-51) моноамид, ADC-105, 10 мг/кг.
На Фиг. 8 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели HER2 Fo5 у мышей CRL nu/nu, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель
2) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-106, 5 мг/кг
3) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-106, 10 мг/кг
4) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52), моноамин, ADC-108, 0,5 мг/кг
5) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52), моноамин, ADC-108, 2 мг/кг
6) Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-52), моноамин, ADC-108, 5 мг/кг
7) Контроль CD22 LC-K149C-(LD-52), моноамин, ADC-107, 2 мг/кг.
На Фиг. 9 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата WSU-DLCL2 у мышей CB-17 Fox Chase SCID, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8), 100 мкл
2) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-104, 6 мг/кг
3) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-(LD-51), моноамид, ADC-104, 16,4 мг/кг
4) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-HC-L177C-(LD-51), моноамид, ADC-111, 3,3 мг/кг
5) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-HC-L177C-(LD-51), моноамид, ADC-111, 6 мг/кг
6) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-HC-L177C-(LD-51), моноамид, ADC-111, 9 мг/кг
7) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-HC-L177C-HC-Y376C-(LD-51), моноамид, ADC-112, 2,2 мг/кг
8) Тио Hu анти-CD22 LC-K149C-HC-L177C-HC-Y376C-(LD-51), моноамид, ADC-112, 6 мг/кг
9) Тио Hu анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51), моноамид, ADC-106, 16,2 мг/кг
10) Тио Hu анти-Her2 4D5 LC K149C-HC L177C-(LD-51), моноамид, ADC-113, 8,3 мг/кг.
На Фиг. 10 изображена эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата HCC1569X2 у мышей SCID Beige, которым вводили внутривенно однократно дозу следующего:
1) Наполнитель (гистидиновый буфер № 8), 100 мкл
2) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-1), ADC-212, 1 мг/кг
3) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-1), ADC-212, 3 мг/кг
4) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(LD-51) моноамид, ADC-115, 3 мг/кг
5) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(LD-51) моноамид, ADC-115, 6 мг/кг
6) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(LD-51) моноамид, ADC-115, 12 мг/кг
7) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(LD-51) моноамид, ADC-115, 18 мг/кг
8) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) моноамид, ADC-110, 12 мг/кг
9) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-4), моноамин, ADC-210, 1 мг/кг
10) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-4), моноамин, ADC-210, 3 мг/кг
11) Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-4), моноамин, ADC-210, 6 мг/кг
12) Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4), моноамин, ADC-204, 3 мг/кг.
На Фиг. 11 изображены предполагаемые взаимодействия диалкилирующего пирролбензодиазепинового соединения (ПБД (PBD)) и двух моноалкилирующих пирролбензодиазепиновых соединений с ДНК.
На Фиг. 12 изображены сравнение эффективности для мыши и токсичности для яванского макака HER2 LC K149C LD-51 КАЛС (ADC) в сравнении с HER2 LC K149C CLD-1 КАЛС (ADC).
На Фиг. 13 изображены оценка терапевтического индекса на основе экспозиции HER2 LC K149C LD-51 КАЛС (ADC) по сравнению с HER2 LC K149C CLD-1 КАЛС (ADC).
На Фиг. 14 изображены данные по анализу жизнеспособности клеток с несколькими HER2 hu7C2 LC K149C КАЛС (ADC) с различными линкерами.
На Фиг. 15 изображен объем опухоли с течением временем для различных КАЛС (ADC) в мышиной модели аллотрансплантатной опухоли.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЛЛЮСТРАТИВНЫХ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Здесь будет сделана ссылка на определенные варианты осуществления изобретения, примеры которых проиллюстрированы в прилагаемых структурах и формулах. Хотя изобретение будет описано совокупно с проиллюстрированными вариантами осуществления, следует понимать, что они не предназначены для ограничения изобретения этими вариантами осуществления. Напротив, изобретение предназначено для охвата всех альтернативных вариантов, модификаций и эквивалентов, которые могут быть включены в объем настоящего изобретения, как определено формулой изобретения.
Специалист в данной области техники распознает многие способы и материалы, подобные или эквивалентные описанным в данном документе, которые могут быть применены в практической реализации настоящего изобретения. Настоящее изобретение никоим образом не ограничивается описанными способами и материалами.
Если не указано иное, технические и научные термины, применяемые в данном документе, имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в данной области техники, к которой относится настоящее изобретение, и согласуются с: Singleton et al (1994) Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2nd Ed., J. Wiley & Sons, New York, NY; and Janeway, C., Travers, P., Walport, M., Shlomchik (2001) Immunobiology, 5th Ed., Garland Publishing, New York.
ОПРЕДЕЛЕНИЯ
Если не указано иное, следующие термины и фразы, применяемые в данном документе, имеют следующие значения:
Когда в данном документе используются торговые наименования, заявители намерены самостоятельно включать рецептуру продукта торгового наименования, синоним оригинального препарата (эквивалентный лекарственный препарат без торгового наименования) и активный фармацевтический компонент(ы) продукта товарного наименования.
«Акцепторный каркас человека» в контексте данного документа представляет собой каркас, содержащий аминокислотную последовательность каркаса вариабельного домена легкой цепи (VL) или каркаса вариабельного домена тяжелой цепи (VH), полученного из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусного каркаса человека, как определено ниже. Акцепторный каркас человека, «полученный из» каркаса иммуноглобулина человека или консенсусного каркаса человека, может содержать одну и ту же аминокислотную последовательность вышеупомянутого, или может содержать изменения в аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах осуществления, количество аминокислотных изменений составляет 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, 7 или менее, 6 или менее, 5 или менее, 4 или менее, 3 или менее, или 2 или менее. В некоторых вариантах осуществления, акцепторный каркас VL человека идентичен по последовательности каркасу VL иммуноглобулина человека, или последовательности консенсусного каркаса человека.
«Аффинность» относится к силе совокупности нековалентных взаимодействий между одиночным сайтом связывания молекулы (например, антитело) и ее партнером по связыванию (например, антиген). Если не указано иное, так как используется в настоящем документе, «аффинность связывания» относится к внутренней аффинности связывания, которая отображает 1:1 взаимодействие между членами пары связывания (например, антитело и антиген). Аффинности молекулы X к ее партнеру Y в целом, как правило может быть представлена константой дисоциации (Кд). Аффинность может быть измерена с помощью общепринятых способов, которые известны в данной области техники, включая те, что описаны в данном документе. Конкретные иллюстративные и типичные варианты реализации изобретения, применяемые для измерения аффинности связывания, описаны в тексте, что следует ниже.
В некоторых вариантах осуществления, антитело, как описано в данном документе, имеет константу диссоциации (Кд) ≤1мкM, ≤100 нM, ≤10 нM, ≤5 нМ, ≤4 нM, ≤3 нM, ≤2 нM, ≤1 нM, ≤0,1 нM, ≤0,01 нM, или ≤0,001 нM (например, 10-8 M или меньше, например от 10-8 M до 10-13 M, например от 10-9 M до 10-13 M).
Антитело со «зрелой аффинностью» относится к антителу с одним или несколькими изменениями в одной или более гипервариабельной области (HVR), по сравнению с исходным антителом, которое не имеет таких изменений, например, таких изменений, результатом которых является улучшения аффинности антитела к антигену.
Термин «антитело» в настоящем документе используется в широком смысле и охватывает различные структуры антитела, которые включают, но не ограничиваются моноклональными антителами, поликлональными антителами, полиспецифическими антителами (например, биспецифические антитела), и фрагментами антитела при условии, что они проявляют желаемую антигенсвязывающую активность.
«Фрагмент антитела» относится к молекуле, отличной от интактного антитела, которая содержит часть интактного антитела и которая связывает антиген, с которым связывается интактное антитело. Примеры фрагментов антитела включают, но не ограничиваются Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; диателами; линейными антителами; одноцепочечными молекулами антителами (например, scFv); и полиспецифическими антителами, которые сформированы из фрагментов антитела.
Термины «рак» и «раковый» относятся к или описывают физиологическое состояние у млекопитающих, которое обычно характеризуется неконтролируемым ростом/делением клеток. «Опухоль» содержит одну или больше раковых клеток. Примеры рака включают, но не ограничиваются лишь этими: карциному, лимфому, бластому, саркому и лейкоз или лимфоидные злокачественные новообразования. Более конкретные примеры таких видов рака включают плоскоклеточный рак (например, эпителиальный плоскоклеточный рак), рак легкого, включая мелкоклеточный рак легкого, немелкоклеточный рак легкого («НМРЛ»), аденокарциному легкого и плоскоклеточную карциному легкого, рак брюшины, гепатоцеллюлярный рак, желудочный рак или рак желудка, включая рак желудочно-кишечного тракта, рак поджелудочной железы, глиобластому, рак шейки матки, рак яичников, рак печени, рак мочевого пузыря, гепатому, рак молочной железы, рак толстой кишки, рак прямой кишки, колоректальный рак, карциному эндометрия или матки, карциному слюнной железы, рака почек или почечный рак, рак предстательной железы, рак вульвы, рак щитовидной железы, карциному печени, анальную карциному, карциному полового члена, а также рак головы и шеи.
«HER2-положительный» рак содержит раковые клетки, которые имеют более высокие, по сравнению с нормальными, уровни HER2. Примеры HER2-положительного рака включают HER2-положительный рак молочной железы и HER2-положительный рак желудка. Необязательно HER2-положительный рак характеризуется иммуногистохимическим (ИГХ) баллом 2+ или 3+ и/или коэффициентом амплификации ≥2,0, определенном по гибридизации in situ (ISH - in situ hybridization).
Термин «рак молочной железы на ранней стадии (РРМЖ)» или «ранний рак молочной железы» используется в данном документе для обозначения рака молочной железы, который не распространился за пределы молочной железы или подмышечных лимфатических узлов. Термин включает протоковую карциному in situ и стадию I, стадию IIA, стадию IIB и стадию IIIA рака молочной железы
Отсылка к опухоли или раку как «Стадия 0», «Стадия I», «Стадия II», «Стадия III» или «Стадия IV», а также различные подстадии в рамках этой классификации, указывает на классификацию опухоли или рака с применением известных в данной области техники способов общей группировки по стадиям или стадирования с помощью римских цифр. Хотя фактическая стадия рака зависит от типа рака, как правило, 0 стадия рака представляет собой поражение in situ, I стадия рака представляет собой небольшую локализованную опухоль, II и III стадия рака представляет собой местно распространенную опухоль с вовлечением местных лимфатических узлов, и IV стадия рака представляет собой метастатический рак. Конкретные стадии для каждого типа опухоли известны квалифицированному клиницисту.
Термин «метастатический рак молочной железы» обозначает состояние рака молочной железы, когда раковые клетки переносятся из первоначального места в одно или более мест в других частях тела по кровеносным или лимфатическим сосудам, с образованием одной или более вторичных опухолей в одном или более органов, помимо молочной железы.
«Распространенный» рак представляет собой рак, который распространился за пределы места или органа происхождения либо путем местной инвазии, либо путем метастазирования. Соответственно, термин «распространенный» рак включает как местно-распространенное, так и метастатическое заболевание.
«Рецидивирующий» рак представляет собой рак, который повторно вырос либо на первоначальном месте, либо в удаленном от первоначального месте, после ответа на первоначальное лечение, такое как оперативное вмешательство.
«Местно-рецидивирующий» рак представляет собой рак, который рецидивирует после лечения в том же месте, что и ранее пролеченный рак.
«Операбельный» или «резектабельный» рак представляет собой рак, который ограничивается первичным органом и пригоден для хирургического вмешательства (удаления).
«Нерезектабельный» или «неоперабельный» рак не может быть удален (иссечен) хирургическим путем.
Термин «химерное» антитело относится к антителу, в котором часть тяжелой и/или легкой цепи получена из определенного источника или вида, а оставшаяся часть тяжелой и/или легкой цепи получена из различных источников или видов.
«Класс» антитела относится к типу константного домена или константной области, которые принадлежат его тяжелой цепи. Существует пять основных классов антител: IgA, IgD, IgE, IgG, и IgM, и некоторые из них могут быть дополнительно разделены на подклассы (изотипы), например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам иммуноглобулинов, называются α, δ, ε, γ и μ, соответственно.
Термин «цитотоксическое вещество», который используется в данном документе, относится к веществу, которое ингибирует клеточную функцию или препятствует ей, и/или вызывает клеточную смерть, или разрушение. Цитотоксические вещества включают, но не ограничиваются, радиоактивными изотопами (например, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 и радиоактивный изотоп Lu); хемотерапевтическими веществами или лекарственными веществами (например, метотрексат, адриамицин, винка-алкалоиды (винкристин, винбластин, этопозид), доксорубицин, мелфалан, митомицин С, хлорамбуцил, даунорубицин или другие интеркалирующие вещества); веществами-ингибиторами роста; ферментами и их фрагментами, такими как нуклеолитические ферменты; антибиотиками; токсинами, такими как низкомолекулярные токсины или ферментативно активные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения, включая их фрагменты и/или варианты; и различными противоопухолевыми или противораковыми веществами, которые раскрыты ниже.
«Эффекторные функции» относятся к тем биологическим активностям, которые приписывают Fc области антитела, и которые варьируют в зависимости от изотипа антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают: связывание c C1q и комплемент-зависимую цитотоксичность (КЗЦ); связывания c рецептором Fc; антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (АЗКЦ); фагоцитоз; подавление клеточных поверхностных рецепторов (например, рецептора B-лимфоцита); и активацию В-лимфоцитов.
«Эффективное количество» вещества, например, фармацевтической лекарственной формы, относится к количеству эффективных, в дозировках и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого терапевтического или профилактического результата. Эффективное количество лекарственного средства может уменьшать количество раковых клеток; уменьшать размер опухоли; ингибировать (т.е. замедлять до некоторой степени и предпочтительно останавливать) инфильтрацию раковых клеток в периферические органы; ингибировать (т.е. замедлять до некоторой степени и предпочтительно останавливать) метастазирование опухоли; ингибировать до некоторой степени рост опухоли; и/или ослаблять до некоторой степени один или более симптомов, ассоциированных с раком. В той мере, насколько препарат может предотвратить рост и/или разрушать существующие раковые клетки, он может быть цитостатическим и/или цитотоксическим. Эффективное количество может продлить выживаемость без прогрессирования (например, которая измеряется с помощью Критериев оценки ответа для солидных опухолей (RECIST) или изменений CA-125) и проводить к объективному ответу (включая частичный ответ (ЧО (PR)) или полный ответ (ПО(CR))), продлению времени общей выживаемости и/или ослаблению одного или более симптомов рака (например, по оценке FOSI).
Термин «эпитоп» относится к конкретному сайту на молекуле антигена, с которым связывается антитело.
«Эпитоп 4D5» или «эпитоп 4D5» или «4D5» представляет собой область во внеклеточном домене HER2, с которой связывается антитело 4D5 (АТСС CRL 10463) и трастузумаб. Этот эпитоп примыкает к трансмембранному домену HER2 и находится в пределах домена IV HER2. Для скрининга антител, которые связываются с эпитопом 4D5, может быть выполнен перекресто-блокирующий анализ, как описано в Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow and David Lane (1988). В альтернативном варианте может быть осуществлено картирование эпитопов для оценки того, связывается ли антитело с эпитопом 4D5 HER2 (например, каким-либо одним или больше остатков в области от остатка около 550 до остатка около 610, включительно, HER2 (SEQ ID NO: 39)).
«Эпитоп 2С4» или «2С4 эпитоп» представляет собой область во внеклеточном домене HER2, с которой связывается антитело 2С4. С целью скрининга антител, которые связываются с эпитопом 2C4, может быть выполнен перекресто-блокирующий анализ, как описано в Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow and David Lane (1988). В альтернативном варианте может быть осуществлено картирование эпитопов для оценки того, связывается ли антитело с эпитопом 2C4 HER2. Эпитоп 2C4 содержит остатки из домена II во внеклеточном домене HER2. Антитело 2C4 и пертузумаб связываются с внеклеточным доменом HER2 на стыке доменов I, II и III (Franklin et al. Cancer Cell 5:317-328 (2004)).
Анти-HER2 мышиное антитело 7C2 связывается с эпитопом в домене I HER2. См., например, публикацию PCT № WO 98/17797. Данный эпитоп отличается от эпитопа, связываемого трастузумабом, который связывается с доменом IV HER2, и эпитопа, связываемого пертузумабом, который связывается с доменом II HER2. Трастузумаб, при связывании домена IV, разрушает лиганд-независимые комплексы HER2-HER3, тем самым ингибируя нисходящий сигналинг (например, PI3K/AKT). В противоположность этому, пертузумаб, связывающийся с доменом II, предотвращает лиганд-управляемое взаимодействие HER2 с другими членами семейства HER (например, HER3, HER1 или HER4), что также предотвращает нисходящую передачу сигнала. Связывание MAb 7C2 с доменом I не приводит к препятствованию связывания трастузумаба или пертузумаба с доменами IV и II соответственно, тем самым предполагает возможность объединения КАЛС (ADC) MAb 7C2 с трастузумабом, трастузумабом эмтанзином (Т-DM-1) и/или пертузумабом. Антитело 7C2, 7C2.B9 мыши описано в публикации PCT № WO 98/17797. Анти-HER2 7C2 гуманизированное антитело описано в WO2016/040723A1.
Термин «Fc область» в настоящем документе применяется для определения C-концевой области тяжелой цепи иммуноглобулина, которая содержит по меньшей мере часть константной области. Термин включает в себя нативные последовательности Fc областей и различные Fc области. В одном варианте осуществления, Fc область тяжелой цепи человеческого IgG продолжается от Cys226, или от Pro230, до карбоксильного конца тяжелой цепи. Однако, C-концевой лизин (Lys447) Fc области может присутствовать или отсутствовать. Если в настоящем документе не указано иное, нумерация аминокислотных остатков в Fс области или в константной области соответствует системе нумерации ЕС, также называемый индексом ЕС, как описано в Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.
«Каркас» или «FR» относится к остаткам вариабельного домена, кроме остатков гипервариабельной области (HVR). FR вариабельного домена в целом, как правило состоит из четырех FR доменов: FR1, FR2, FR3, и FR4. Соответственно, HVR и FR последовательности в целом, как правило, появляются в следующей последовательности VH (или VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
Термины «полноразмерное антитело», «интактное антитело», и «целое антитело» используются в настоящем документе взаимозаменяемо для обозначения антитела, которое имеет структуру, что существенно похожа на нативные структуры антитела или имеет тяжелые цепи, которые содержат Fc область как определено в настоящем документе.
Термины «клетка-хозяин», «линия клетки-хозяина», и «культура клетки-хозяина» используются взаимозаменяемо, и относятся к клеткам в которые была введена экзогенная нуклеиновая кислота, включая потомство таких клеток. Клетки-хозяева включают «трансформанты» и «трансформированные клетки», которые включают первично трансформированные клетки и потомство, которое получено от них без учета количества пассажей. Потомство не может быть полностью идентичным по содержанию нуклеиновых кислот относительно материнской клетки, но может содержать мутации. В настоящий документ включено мутантное потомство, которое имеет одну и ту же функцию, или биологическую активность, что и первоначальная трансформированная клетка после скрининга и отбора.
«Человеческое антитело» представляет собой антитело, которое имеет аминокислотную последовательность, что соответствует таковой антитела, которое произведено человеком или человеческой клетка, или получено из нечеловеческого источника, который использует репертуар человеческих антител или другие человеческие антитело-кодирующие последовательности. Это определение человеческого антитела специфически исключает гуманизированные антитела, которые содержат нечеловеческие, антигенсвязывающие остатки.
«Человеческий консенсусный каркас» представляет собой каркас, который представляет наиболее часто встречающиеся аминокислотные остатки в наборе VL или VH каркасных иммуноглобулиновых последовательностей человека. В целом, как правило, набор иммуноглобулиновых VL или VH последовательностей человека представляет собой подгруппу последовательностей вариабельного домена. В целом, как правило, подгруппа последовательностей представляет собой подгруппу, как в Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda MD (1991), vols. 1-3. В одном варианте осуществления, для VL, подгруппа представляет собой подгруппу каппа I, как в Kabat et al., выше. В одном варианте осуществления, для VH, подгруппа представляет собой подгруппу III как в Kabat et al., выше.
«Гуманизированное» антитело относится к химерному антителу, содержащему аминокислотные остатки из нечеловеческих HVR и аминокислотные остатки из FR человека. В некоторых вариантах осуществления, гуманизированное антитело будет содержать в основном все остатки хотя бы одного, и типично двух, вариабельных доменов, в которых все, или в основном все HVR (например, CDR), соответствуют таким же нечеловеческого антитела, и все, или в основном все FR, соответствуют таким же человеческого антитела. Гуманизированное антитело необязательно может содержать по меньшей мере часть константной области антитела, которая получена из человеческого антитела. «Гуманизированная форма» антитела, например, нечеловеческое антитело, относится к антителу которое подверглось гуманизации.
Термин «гипервариабельная область» или «HVR», используемый в настоящем документе, относится к каждой из областей вариабельного домена антитела, которые являются гипервариабельными по последовательности и/или которые формируют структурно определенные петли («гипервариабельные петли»). В целом, как правило, нативные четырецепочечные антитела содержат шесть HVR: три в VH (H1, H2, H3), и три в VL (L1, L2, L3). В целом, как правило, HVR содержат аминокислотные остатки из гипервариабельных петель и/или из «определяющих комплементарность областей» (CDR), последние характеризуются самой высокой вариабельностью последовательностей и/или вовлечены в распознавание антигена. Типичные гипервариабельные петли находятся в области аминокислотных остатков 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2), и 96-101 (H3). (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987).) Типичные CDR (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3) находятся в области аминокислотных остатков 24-34 L1, 50-56 L2, 89-97 L3, 31-35B H1, 50-65 H2 и 95-102 H3. (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991).) За исключением CDR1 в VH, CDR в целом, как правило, содержат аминокислотные остатки, образующие гипервариабельные петли. CDR также содержат «остатки, определяющие специфичность» или «SDR», которые представляют собой остатки, контактирующие с антигеном. SDR содержатся в областях CDR, называемых укороченными CDR или a-CDR. Типичные a-CDR (a-CDR-L1, a-CDR-L2, a-CDR-L3, a-CDR-H1, a-CDR-H2 и a-CDR-H3) находятся в области аминокислотных остатков 31-34 L1, 50-55 L2, 89-96 L3, 31-35B H1, 50-58 H2 и 95-102 H3. (See Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008).) Если не указано иное, остатки HVR и другие остатки в вариабельном домене (например, FR-остатки) в настоящем документе пронумерованы в соответствии с Кабат et al., выше.
«Иммуноконъюгат» представляет собой антитело, конъюгированное с одной или больше гетерологичными молекулами, включая цитотоксическое вещество, но не ограничиваясь лишь им.
«Пациент», или «индивид», или «субъект» представляет собой млекопитающее. Млекопитающие включают, но не ограничиваются лишь этими: одомашненных животных (например, коров, овец, кошек, собак и лошадей), приматов (например, людей и низших приматов, таких как обезьяны), кроликов и грызунов (например, мышей и крыс). В некоторых вариантах осуществления, пациент, индивид или субъект является человеком. В некоторых вариантах осуществления, пациент может быть «пациентом с раком», т.е. таким, который страдает от или подвержен риску развития одного или более симптомов рака, в частности, рака желудка или рака молочной железы.
Термин «популяция пациентов» относится к группе пациентов с раком. Такие популяции могут быть использованы для демонстрации статистически значимой эффективности и/или безопасности лекарственного препарата.
Пациент «с рецидивом» - это тот, кто имеет признаки или симптомы рака после ремиссии. Необязательно, у пациента может быть рецидив после адъювантной или неоадъювантной терапии.
Рак или биологический образец, который «характеризуется экспрессией, амплификацией или активацией HER», является таким, который в диагностическом тесте экспрессирует (в том числе сверхэкспрессирует) рецептор HER, имеет амплифицированный ген HER, и/или иным образом демонстрирует активацию или фосфорилирование рецептора HER.
В настоящем документе термин «неоадъювантная терапия» или «предоперационная терапия» относится к терапии, назначаемой до оперативного вмешательства. Целью неоадъювантной терапии является обеспечение немедленного системного лечения с потенциальной эрадикацией микрометастазов, которые в противном случае начали бы пролиферировать, если бы осуществлялась стандартная последовательность выполнения оперативного вмешательства с последующим назначением системной терапии. Неоадъювантная терапия может также способствовать уменьшению размера опухоли, тем самым позволяя производить полную резекцию первоначально неоперабельных опухолей или сохранить часть органа и его функции. Кроме того, неоадъювантная терапия позволяет оценить in vivo эффективность лекарственного препарата, которая может определять выбор последующих способов лечения.
В настоящем документе термин «адъювантная терапия» относится к терапии, назначаемой после радикального оперативного вмешательства, для того чтобы уменьшить риск рецидива заболевания, при этом никаких признаков остаточной болезни не обнаруживается. Целью адъювантной терапии является предотвращение рецидива рака, и, следовательно, снижение вероятности смерти, связанной с раком. Адъювантная терапия в настоящем изобретении, в частности, исключает неоадъювантную терапию.
Термин «радикальное оперативное вмешательство» используется так, как он используется в медицинском сообществе. Радикальное оперативное вмешательство включает, например, хирургические или другие процедуры, в результате которых осуществляется удаление или резекция опухоли, в том числе те, в результате которых осуществляется удаление или резекция всей видимой невооруженным глазом опухоли. Радикальное оперативное вмешательство включает, например, полную или клинически радикальную резекцию, или резекцию опухоли в полном объеме. Радикальное оперативное вмешательство включает процедуры, которые происходят в один или более этапов, и включает, например, многоэтапные хирургические процедуры, причем одна или больше хирургических или других процедур выполняются до резекции опухоли. Радикальное оперативное вмешательство включает процедуры по удалению или резекции опухоли, включая вовлеченные органы, части органов и тканей, а также окружающие органы, такие как лимфатические узлы, части органов, или ткани. Удаление может быть неполным, вследствие чего опухолевые клетки могли оставаться, даже в том случае, если были незамеченными.
Термин «выживаемость» относится к пациенту, оставшемуся в живых, и включает выживаемость без признаков заболевания (ВБПЗ (DFS)), выживаемость без прогрессирования (ВБП (PFS)) и общую выживаемости (OВ (OS)). Показатели выживаемости могут быть оценены по методу Каплана-Мейера, а какие-либо их различия вычисляются с помощью стратифицированного логрангового критерия.
«Выживаемость без прогрессирования заболевания» (ВБП (PFS)) представляет собой время с первого дня лечения до задокументированного прогрессирования заболевания (включая изолированную прогрессию в ЦНС) или смерти от любой причины в период исследования, в зависимости от того, что произойдет раньше.
Термин «выживаемость без признаков заболевания (ВБПЗ (DFS))» относится к пациенту, оставшемуся в живых, без рецидива рака в течение определенного периода времени, например, около 1 года, около 2 лет, около 3 лет, около 4 лет, около 5 лет, около 10 лет и т.д. от начала лечения или от первой постановки диагноза. В одном из аспектов настоящего изобретения, ВБПЗ (DFS) анализируют согласно назначенному лечению, т.е. пациентов оценивают на основании назначенной им терапии. События, анализируемые в рамках ВБПЗ (DFS), могут включать местные, регионарные и отдаленные рецидивы рака, возникновение вторичного рака и смерти от любой причины у пациентов без предварительного события (например, рецидив рака молочной железы или второй первичный рак).
Термин «общая выживаемость» относится к пациенту, оставшемуся в живых в течение определенного периода времени, например, около 1 года, около 2 лет, около 3 лет, около 4 лет, около 5 лет, около 10 лет и т.д. от начала лечения или от первой постановки диагноза. В исследованиях, лежащих в основе изобретения, событием, которое учитывалось при анализе выживаемости, была смерть от любой причины.
Под термином «увеличение выживаемости» подразумевают увеличение ВБПЗ (DFS) и/или OВ (OS) в пролеченных пациентов по сравнению с пациентами, не получавшими лечения, или по сравнению с контрольным протоколом лечения. Выживание контролируется в течение по меньшей мере около шести месяцев, или по меньшей мере около 1 года, или по меньшей мере около 2 лет, или по меньшей мере около 3 лет, или по меньшей мере около 4 лет, или по меньшей мере около 5 лет, или по меньшей мере около 10 лет и т.д. от начала лечения или от первой постановки диагноза.
Под термином «монотерапия» подразумевается терапевтическая схема, которая включает только одно терапевтическое вещество для лечения рака или опухоли в течение периода лечения.
Под термином «поддерживающая терапия» подразумевается терапевтическая схема, которая назначается с целью снижения вероятности рецидива или прогрессирования заболевания. Поддерживающая терапия может назначаться в течение длительного времени, включая длительные периоды времени вплоть до периода продолжительности жизни субъекта. Поддерживающая терапия может быть назначена после первичной терапии или в сочетании с первичной или дополнительной терапией. Дозы, используемые для поддерживающей терапии, могут изменяться и включать сниженные дозы по сравнению с дозами, используемыми для других видов терапии.
«Выделенное антитело» представляет собой антитело, отделенное от компонента своего природного окружения. В некоторых вариантах осуществления, антитело является очищенным до более чем 95% или 99% чистоты, определяемой, например, посредством электрофореза (например, электрофореза в ДСН-ПААГ, изоэлектрического фокусирования (ИЭФ), капиллярного электрофореза) или хроматографии (например, ионообменной или обращенно-фазной ВЭЖХ). Обзор способов анализа чистоты антител, см., например, Flatman et al., J. Chromatogr. B 848:79-87 (2007).
Термин «выделенная нуклеиновая кислота» относится к молекуле нуклеиновой кислоты, отделенной от компонента своего природного окружения. Выделенная нуклеиновая кислота содержит молекулу нуклеиновой кислоты, содержавшуюся в клетках, обычно содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, однако молекула нуклеиновой кислоты присутствует вне хромосомы или в области хромосомы, отличающейся от ее естественного местоположения в хромосоме.
«Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело» относится к одной или больше молекулам нуклеиновых кислот, кодирующим тяжелые и легкие цепи антитела (или их фрагменты), включая молекулы нуклеиновых кислот в одном векторе или отдельных векторах, и молекулы нуклеиновых кислот, присутствующие в одной или более локациях в клетке-хозяине.
Термин «HER2», как применяется в данном документе, относится к нативному, созревшему HER2, который продуцируется при процессинге белкового предшественника HER2 в клетке. Термин включает HER2 из любого позвоночного животного, включая млекопитающих, таких как приматы (например, люди и яванские макаки) и грызуны (например, мыши и крысы), до тех пор, пока не указано иное. Термин также включает естественно встречающиеся варианты HER2, например сплайс-варианты или аллельные варианты. Аминокислотная последовательность типичного белка предшественника HER2 человека с сигнальной последовательностью (с сигнальной последовательностью, аминокислоты 1-22) показана в SEQ ID NO: 64. Аминокислотная последовательность иллюстративного зрелого белка HER2 человека представляет собой аминокислотные остатки 23-1255 SEQ ID NO: 64.
Термин «HER2-положительная клетка» относится к клетке, которая экспрессирует HER2 на ее поверхности.
Термин «моноклональное антитело», как используется в настоящем документе, относится к антителу, полученному из популяции практически гомогенных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, являются идентичными и/или связывают один и тот же эпитоп, за исключением возможных вариантов антител, например, содержащих встречающиеся в природе мутации или появляющиеся в процессе получения препарата моноклонального антитела, при этом такие варианты в целом, как правило, присутствуют в незначительных количествах. В отличие от препаратов поликлональных антител, которые обычно содержат различные антитела, направленные против различных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело препарата моноклонального антитела направлено против одной детерминанты на антигене. Таким образом, определение «моноклональный» указывает на характеристику антитела, полученного по существу из гомогенной популяции антител, и не должно быть истолковано как необходимость получения антитела каким-либо конкретным способом. Например, моноклональные антитела, которые предполагается применять в соответствии с настоящим изобретением, могут быть получены множеством методик, включая, но не ограничиваясь лишь этими: гибридомный способ, способы с использованием рекомбинантных ДНК, способы фагового дисплея и способы с применением трансгенных животных, содержащих все или часть локусов иммуноглобулинов человека, при этом такие способы, а также другие типичные способы получения моноклональных антител описаны в данном документе.
«Неконъюгированное антитело» обозначает антитело, которое не конъюгировано с гетерологичным компонентом (например, цитотоксическим компонентом) или радиометкой. Неконъюгированное антитело может присутствовать в фармацевтической композиции.
«Нативные антитела» относятся к встречающимся в природе молекулам иммуноглобулинов с различной структурой. Например, нативные антитела IgG обычно представляют собой гетеротетрамерные гликопротеины с молекулярной массой около 150000 дальтон, состоящие из двух идентичных легких цепей и двух идентичных тяжелых цепей, связанных дисульфидными связями. Каждая тяжелая цепь от N-конца к C-концу содержит вариабельную область (VH), также называемую вариабельным тяжелым доменом или вариабельным доменом тяжелой цепи, с последующими тремя константными доменами (CH1, CH2 и CH3). Аналогично, каждая легкая цепь от N-конца к C-концу содержит вариабельную область (VL), также называемую вариабельным легким доменом или вариабельным доменом легкой цепи, с последующим константным легким доменом (CL). Легкую цепь антитела на основании аминокислотной последовательности ее константного домена можно отнести к одному из двух типов, называемых каппа (κ) и лямбда (λ).
«Флакон» представляет собой контейнер, пригодный для наполнения жидким или лиофилизированным препаратом. В одном варианте осуществления, флакон представляет собой одноразовый флакон, например, одноразовый флакон 20 сс с пробкой.
Термин «листок-вкладыш» используется для обозначения инструкций, обычно помещаемых в коммерческие упаковки терапевтических средств, которые содержат информацию о показаниях, применении, дозах, введении, комбинированной терапии, противопоказаниях и/или предупреждениях, касающихся использования таких терапевтических средств.
«Процент (%) идентичности аминокислотной последовательности» по отношению к последовательности эталонного полипептида определяется как процент аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые являются идентичными аминокислотным остаткам в последовательности эталонного полипептида после выравнивания последовательностей и, при необходимости, внесения пробелов, для достижения максимального процента идентичности последовательностей, без учета консервативных замен как части идентичности последовательностей. Выравнивание для целей определения процента идентичности аминокислотных последовательностей можно осуществить различными способами, известными специалистам в данной области техники, например, применяя общедоступное компьютерное программное обеспечение, например, программное обеспечение BLAST, BLAST-2, ALIGN или Megalign (DNASTAR). Специалисты в данной области техники могут определить походящие параметры для выравнивания последовательностей, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине последовательностей, подлежащих сравнению. Однако, в контексте данного документа значения % идентичности аминокислотной последовательности получают применяя компьютерную программу для сравнения последовательностей ALIGN-2. Компьютерная программа для сравнения последовательностей ALIGN-2 была разработана Genentech, Inc., и исходный код был подан с пользовательской документацией в Бюро регистрации авторских прав США (U.S. Copyright Office), Вашингтон, округ Колумбия, 20559, где она была зарегистрирована как объект авторского права США под регистрационным № TXU510087. Программа ALIGN-2 является общедоступной от Genentech, Inc., Южный Сан-Франциско, Калифорния, или может быть скомпилирована с исходной программы. Программа ALIGN-2 требует компиляции для применения в операционной системе UNIX, включая цифровую UNIX V4.0D. Все параметры сравнения последовательностей установлены программой ALIGN-2 и не изменяются.
Когда для сравнения аминокислотных последовательностей применяют ALIGN-2, % идентичности аминокислотных последовательностей заданной аминокислотной последовательности A по отношению к, с или против заданной аминокислотной последовательности B (что в альтернативном варианте можно перефразировать как заданная аминокислотная последовательность А, которая имеет или характеризуется % идентичности аминокислотных последовательностей по отношению к, с или против заданной аминокислотной последовательности B) рассчитывают следующим образом:
100 умножить на соотношение X/Y,
где X - это число аминокислотных остатков, соответствующих идентичным совпадениям согласно программе выравнивания последовательностей ALIGN-2 при выравнивании А и B, осуществленном этой программой, а Y - это общее количество аминокислотных остатков в B. Следует понимать, что если длина аминокислотной последовательности А не равна длине аминокислотной последовательности В, % идентичности аминокислотных последовательностей А к В не равен % идентичности аминокислотных последовательностей В к А. Если четко не указано иное, все значения % идентичности аминокислотных последовательностей, применяемые в данном документе, получены так, как описано в предыдущем параграфе при помощи компьютерной программы ALIGN-2.
Термин «фармацевтический состав» относится к препарату, который находится в такой форме, что позволяет биологической активности содержащегося в нем активного ингредиента быть эффективной, и который не содержит дополнительных компонентов, которые являются неприемлемо токсичными для субъекта, которому вводят состав.
«Фармацевтически приемлемый носитель» относится к ингредиенту в фармацевтическом составе, отличному от активного ингредиента, который является нетоксичным для субъекта. Фармацевтически приемлемые носители включают, но не ограничиваются лишь этими: буфер, вспомогательное вещество, стабилизатор или консервант.
Как применяется в данном документе, «лечение» (и его грамматические варианты, такие как «лечить» или «проводить лечение») относится к клиническому вмешательству при попытке изменить естественное развитие заболевание индивида, подвергаемого лечению, и может осуществляться либо для профилактики, либо в ходе развития клинической патологии. Желательные эффекты лечения включают, но не ограничиваются лишь этими: предупреждение возникновения или возврата заболевания, облегчение симптомов, уменьшение любых прямых или косвенных патологических последствий заболевания, предотвращение метастазов, уменьшение скорости прогрессирования болезни, улучшение или временное облегчение болезненного состояния и достижение ремиссии или улучшенного прогноза. В некоторых вариантах осуществления, антитела по данному изобретению применяются для задержки развития заболевания или замедления прогрессирования заболевания.
Под термином «совместное введение» подразумевают внутривенное введение двух (или больше) препаратов в процессе одного и того же введения, в отличие от последовательных инфузий двух или более препаратов. Как правило, это будет предусматривать комбинирование двух (или более) препаратов в одном и том же ВВ (IV) контейнере перед совместным введением.
Лекарственное средство, которое вводят «одновременно» с одним или больше другими лекарственными средствами, вводится в течение одного и того же цикла лечения, в одни и те же сутки лечения, что и одно или больше других лекарственных средств, и в некоторых случаях - в одно и то же время, что и одно или больше других лекарственных средств. Например, при противораковой терапии, применяемой каждые 3 недели, одновременно вводимые препараты являются теми, которые вводятся в 1 сутки 3-недельного цикла.
«Химиотерапевтическое вещество» представляет собой химическое соединение, применяемое в лечении рака. Примеры химиотерапевтических веществ включают: алкилирующие вещества, такие как тиотепа и циклофосфамид (CYTOXAN®); алкилсульфонаты, такие как бусульфан, импросульфан и пипосульфан; азиридины, такие как бензодопа, карбоквон, метуредопа и уредопа; этиленимины и метиламеламины, включая алтретамин, триэтиленмеламин, триэтиленфосфорамид, триэтилентиофосфорамид и триметилолмеламин; ацетогенины (особенно буллатацин и буллатацинон); дельта-9-тетрагидроканнабинол (дронабинол, MARINOL®); бета-лапакон; лапахол; колхицины; бетулиновая кислота; камптотецин (включая синтетический аналог топотекан (HYCAMTIN®), СРТ-11 (иринотекан, CAMPTOSAR®), ацетилкамптотецин, скополетин, и 9-аминокамптотецин); бриостатин; каллистатин; CC-1065 (включая его синтетические аналоги адозелезин, карзелезин и бизелезин); подофиллотоксин; подофиллиновая кислота; тенипозид; криптофицины (в частности, криптофицин 1 и криптофицин 8); доластатин; дуокармицин (включая синтетические аналоги, KW-2189 и CB1-TM1); элеутеробин; панкратистатин; саркодиктин; спонгистатин; азотистый иприт, такой как хлорамбуцил, хлорнафазин, хлорфосфамид, эстрамустин, ифосфамид, мехлорэтамин, гидрохлорид оксида мехлорэтамина, мелфалан, новембихин, фенэстерин, преднимустин, трофосфамид, урациловый иприт; производные нитрозомочевины, такие как кармустин, хлорозотоцин, фотемустин, ломустин, нимустин и ранимнустин; антибиотики, такие как энедииновые антибиотики (например, калихимицин, особенно калихимицин гамма1I и калихимицин омегаI1 (см., например, Nicolaou et al., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)); CDP323, пероральный ингибитор интегрина альфа-4; динемицин, включая динемицин А; эсперамицин; а также хромофор неокарциностатина и родственные хромопротеиновые эндиеновые антибиотические хромофоры), аклациномизины, актиномицин, аутрамицин, азасерин, блеомицины, кактиномицин, карабицин, карминомицин, карцинофилин, хромомицины, дактиномицином, даунорубицин, деторубицин, 6-диазо-5-оксо-L-норлейцин, доксорубицин (включая ADRIAMYCIN®, морфолинодоксорубицин, цианоморфолинодоксорубицин, 2-пирролинодоксорубицин, инъекции липосом доксорубицин-HCl (DOXIL®), липосомальный доксорубицин TLC D-99 (MYOCET®), пегглизированный липосомальный доксорубицин (CAELYX®) и дезоксидоксорубицин; эпирубицин, эзорубицин, идарубицин, марцеломицин, митомицины, такие как митомицин C, микофеноловая кислота, ногаламицин, оливомицины, пепломицин, порфиромицин, пуромицин, квеламицин, родорубицин, стрептонигрин, стрептозоцин, туберцидин, убенимекс, зиностатин, зорубицин; антиметаболиты, такие как метотрексат, гемцитабин (GEMZAR®), тегафур (UFTORAL®), капецитабин (XELODA®), эпотилона и 5-фторурацил (5-FU); аналоги фолиевой кислоты, такие как деноптерин, метотрексат, птероптерин, триметрексат; пуриновые аналоги, такие как флударабин, 6-меркаптопурин, тиамиприн, тиогуанин; аналоги пиримидина, такие как анцитабин, азацитидин, 6-азауридин, кармофур, цитарабин, ди-деоксиуридин, доксифлуридин, эноцитабин, флоксуридин, андрогены, такие как каластоун, пропионат дромоностанола, эпитиостанол, мепитиостан, тестолактон; средства, угнетающие функции надпочечников, такие как аминоглютетимид, митотан, трилостан; компенсаторы фолиевой кислоты, такие как фолиновая кислота; ацеглатон; гликозид алдофосфамида; аминолевулиновая кислота; энилурацил; амсакрин; бестрабуцил; бизантрен; эдатраксат; дефофамин; демеколицин; диазиквон; эльфорнитин; эллиптиум ацетат; эпотилон; этоглюцид; нитрат галлия; гидроксимочевина; лентинан; лонидайнин; майтанзиноиды, такие как маитанзин и ансамитоцины; митогуазон; митоксантрон; мопиданмол; нитраэрин; пентостатин; фенамет; пирарубицин; лозоксантрон; 2-этилгидразид; прокарбазин; полисахаридный комплекс PSK® (JHS Natural Products, Eugene, OR); разоксан; ризоксин; сизофиран; спирогерманий; тенуазоновая кислота; триазиквон; 2,2',2'-трихлортриэтиламин; трихотецены (особенно токсин Т-2, верракурин А, роридин А и ангуидин); уретан; виндезин (ELDISINE®, FILDESIN®); дакарбазин; манномустин; митобронитол; митолактол; пипоброман; гацитозин; арабинозид («Ara-C»); тиотепа; таксоиды, например, паклитаксел (TAXOL®), препарат альбумин-спроектированных наночастиц паклитаксела (ABRAXANETM), и доцетаксел (TAXOTERE®); хлоранбуцил; 6-тиогуанин; меркаптопурин; метотрексат; аналоги платины, такие как цисплатин, оксалиплатин (например, ELOXATIN®), и карбоплатин; винкас, который предотвращает полимеризацию тубулина в микротрубочки, включая винбластин (VELBAN®); винкристин (ONCOVIN®); виндезин (ELDISINE®, FILDESIN®); винорелбин (NAVELBINE®); этопозид (VP-16); ифосфамид; митоксантрон; лейковорин; новантрон; эдатрексат; дауномицин; аминоптерин; ибандронат; ингибитор топоизомеразы RFS 2000; дифторметилорнитин (DMFO); ретиноиды, такие как ретиноевая кислота, включая бексаротен (TARGRETIN®); бифосфонаты, такие как клодронат (например, BONEFOS® или OSTAC®), этидронат (DIDROCAL®), NE-58095, золедроновую кислоту/золедронат (ZOMETA®), алендронат (FOSAMAX®), памидронат (AREDIA®), тилудронат (SKELID®) или ризедронат (ACTONEL®); троксацитабин (1,3-диокслолановый аналог нуклеозина цитозина); антисмысловые олигонуклеотиды, в частности те, которые ингибируют экспрессию генов сигнальных путей, вовлеченных в пролиферацию аберрантных клеток, таких как, например, PKC-альфа, Raf, H-Ras, и рецептор эпидермального фактора роста (EGF-R); вакцины, такие как вакцины THERATOPE®, и вакцины для генной терапии например, вакцина ALLOVECTIN®, вакцина LEUVECTIN® и вакцина VAXID®; ингибитор топоизомеразы 1(например, LURTOTECAN®); rmRH (например, ABARELIX®); BAY439006 (сорафениба; Bayer); SU-11248 (сунитиниб, SUTENT®, Pfizer); перифозин, ингибитор COX-2 (например, целекоксиб или эторикоксиб), ингибитор протеасом (например, PS341); бортезомиб (VELCADE®); CCI-779; типифарниб (R11577); орафениб, ABT510; ингибитор Bcl-2, такой как облимерсен натрий (GENASENSE®); пиксантрон; ингибиторы EGFR (см. определение ниже); ингибиторы тирозинкиназ; ингибиторы серин-треонин киназ, такой как рапамицин (сиролимус, RAPAMUNE®) ингибиторы фарнезилтрансфераз, такие как лонафарниб (SCH 6636, SARASARTM); и фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные любого из перечисленных выше веществ; а также комбинации из двух или более из перечисленных выше веществ, таких как CHOP, аббревиатура для комбинированной терапии циклофосфамида, доксорубицина, винкристина и преднизолона, и FOLFOX, аббревиатура для схемы лечения с оксалиплатином (ELOXATINTM), комбинированным с 5-ФУ и лейковорином.
Химиотерапевтические вещества, как определенно в настоящем документе, включают «антигормональные вещества» или «эндокринные терапевтические средства», действие которых состоит в регуляции, снижении, блокировании или ингибировании действий гормонов, которые могут стимулировать рост рака. Они могут быть гормонами сами по себе, включая, но не ограничиваясь лишь этими: антиэстрогены со смешанным профилем агонист/антагонист, включая тамоксифен (NOLVADEX®), 4-гидрокситамоксифен, торемифен (FARESTON®); идоксифен, дролоксифен, ралоксифен (EVISTA®), триоксифен, кеоксифен и селективные модуляторы рецепторов эстрогена (SERM) такие как SERM3; чистые антиэстрогены без агонистических свойств, такие как фулвестрант (FASLODEX®), и EM800 (такие вещества могут блокировать димеризацию рецептора эстрогена (ER), ингибировать связывание ДНК, увеличивать оборот ER и/или подавлять уровни ER); ингибиторы ароматазы, включая ингибиторы стероидных ароматаз, такие как форместан и экземестан (AROMASIN®), и нестероидные ингибиторы ароматаз, такие как анастразол (ARIMIDEX®), летрозол (FEMARA®) и аминоглютетимид, и другие ингибиторы ароматаз включают ворозол (RIVISOR®), мегестролацетат (MEGASE®), фадрозол, и 4(5)-имидазолы; агонисты гормонов, высвобождающих лютеинизирующий гормон, включая лейпролид (LUPRON® и ELIGARD®), госерелин, бусерелин и триптерилин; половые стероиды, включая прогестины, такие как мегестролацетат и ацетат медроксипрогестерона, эстрогены, такие как диэтилстильбэстрол и премарин, и андрогены/ретиноиды, такие как флуоксиместерон, полностью транс-ретиноевая кислота и фенретинид; онапристон; анти-прогестероны; супрессоры рецептора эстрогена (ERD); антиандрогены, такие как флутамид, нилутамид и бикалютамид; и фармацевтически приемлемые соли, кислоты или производные любого из вышеуказанных; а также комбинации двух или больше из указанных выше.
Термин «иммунодепрессант», как применяется в данном документе, для дополнительной терапии, относится к веществам, которые действуют путем подавления или маскирования иммунной системы млекопитающего, подлежащего лечению. Это будет включать вещества, которые подавляют продукцию цитокинов, понижают или подавляют экспрессию аутоантигенов или маскируют антигены ГКГС. Примеры таких веществ включают 2-амино-6-арил-5-замещенные пиримидины (см. патент США № 4665077); нестероидные противовоспалительные препараты (NSAID); ганцикловир, такролимус, глюкокортикоиды, такие как кортизол или альдостерон, противовоспалительные вещества, такие как ингибитор циклооксигеназы, ингибитор 5-липоксигеназы или антагонист лейкотриенового рецептора; пуриновые антагонисты, такие как азатиоприн или микофенолят мофетил (ММФ (MMF)); алкилирующие вещества, такие как циклофосфамид; бромокриптин; даназол; дапсон; глутаровый альдегид (который маскирует антигены ГКГС, как описано в патенте США № 4120649); анти-идиотипические антитела к антигенам ГКГС и фрагментам ГКГС; циклоспорин A; стероиды, такие как кортикостероиды или глюкокортикостероиды или аналоги глюкокортикоидов, например преднизон, метилпреднизолон, включая SOLU-MEDROL® метилпреднизолон натрия сукцинат, и дексаметазон; ингибиторы дигидрофолатредуктазы, такие как метотрексат (пероральные или подкожные); противомалярийные вещества, такие как хлорохин и гидроксихлорохин; сульфасалазин; лефлуномид; антитела к цитокинам или цитокиновым рецепторам, включая антитела к интерферону-альфа, -бета или -гама, антитела к фактору некроза опухоли альфа (ФНО) (инфликсимаб (REMICADE®) или адалимумаб), анти-ФНО-альфа иммуноадгезины (этанерцепт), антитела к ФНО-бета, антитела к интерелейкину 2 (ИЛ-2) и антитела к рецептору ИЛ-2, и антагонисты и антитела к рецептору интерлейкина 6 (ИЛ-6) (такое как ACTEMRATM (тоцилизумаб)); антитела к LFA-1, включая антитела к CD11a и CD18; антитела к L3T4; гетерологичный антилимфоцитарный глобулин; pan-T антитела, предпочтительно антитела к CD3 или к CD4/CD4a; растворимый пептид, содержащий домен, связывающий LFA-3 (WO 90/08187 опубликовано 7/26/90); стрептокиназу; трансформирующий ростовой фактор бета (ТРФ-бета(TGF-beta)); стрептодорназу; РНК или ДНК из хозяина; FK506; RS-61443; хлорамбуцил; дезоксиспергуалин; рапамицин; рецептор T-лимфоцитов (Cohen et al., патент США № 5114721); фрагменты рецептора Т-лимфоцитов (Offner et al., Science, 251: 430-432 (1991); WO 90/11294; Ianeway, Nature, 341: 482 (1989); и WO 91/01133); антагонисты BAFF, такие как антитела к BAFF и антитела к BR3 и антагонисты zTNF4 (для обзора см. Mackay and Mackay, Trends Immunol., 23:113-5 (2002) и см. также определение ниже); биологические вещества, которые препятствуют сигналам Т-хелперов, такой как анти-CD40 рецептор или анти-CD40 лиганд (CD154), включая блокирующие антитела к лиганду CD40-CD40 (например, Durie et al., Science, 261: 1328-30 (1993); Mohan et al., J. Immunol., 154: 1470-80 (1995)) и CTLA4-Ig (Finck et al., Science, 265: 1225-7 (1994)); и антитела к рецептору Т-лимфоцитов (EP 340,109), такое как T10B9. Некоторые предпочтительные иммунодепрессанты в данном документе включают циклофосфамид, хлорамбуцил, азатиоприн, лефлуномид, ММФ (MMF) или метотрексат.
Термин «антагонист, связывающийся с компонентом сигнального пути PD-1», представляет собой молекулу, которая ингибирует взаимодействие партнера по связыванию с компонентом сигнального пути PD-1 с любым одним или больше партнером по связыванию, для того чтобы устранить дисфункцию Т-клеток, возникающую из-за передачи сигналов на PD-1 сигнальный путь, что приводит к восстановлению или усилению функции Т-клеток (например, пролиферация, продукция цитокинов, уничтожение клеток-мишеней). Как применяется в данном документе, антагонист, связывающийся с компонентом сигнального пути PD-1, включает PD-1-связывающий антагонист, PD-L1-связывающий антагонист и PD-L2-связывающий антагонист.
Термин «PD-1-связывающий антагонист» относится к молекуле, которая снижает, блокирует, ингибирует, подавляет или препятствует передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-1 с одним или более его партнерами по связыванию, такими как PD-L1, PD-L2. В некоторых вариантах осуществления, PD-1-связывающий антагонист является молекулой, которая ингибирует связывание PD-1 с одним или больше его партнерами по связыванию. В конкретном аспекте, PD-1-связывающий антагонист ингибирует связывание PD-1 с PD-L1 и/или PD-L2. Например, PD-1-связывающие антагонисты включают анти-PD-1 антитела, их антигенсвязывающие фрагменты, иммуноадгезины, гибридные белки, олигопептиды и другие молекулы, которые снижают, блокируют, ингибируют, подавляют или препятствуют передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-1 с PD-L1 и/или PD-L2. В одном варианте осуществления, PD-1-связывающий антагонист снижает отрицательный костимулирующий сигнал, опосредуемый белками клеточной поверхности, экспрессируемыми на Т-лимфоцитах, которые опосредуют передачу сигнала через PD-1, чтобы сделать дисфункциональные Т-клетки менее дисфункциональными (например, повышая эффекторный ответ на распознавание антигена). В некоторых вариантах осуществления, PD-1-связывающий антагонист является анти-PD-1 антителом. В конкретном аспекте, PD-1-связывающий антагонист представляет собой MDX-1106 (ниволумаб), описанный в данном документе. В другом конкретном аспекте, PD-1-связывающий антагонист представляет собой MK-3475 (ламбролизумаб), описанный в данном документе. В другом конкретном аспекте, PD-1-связывающий антагонист представляет собой CT-011 (пидилизумаб), описанный в данном документе. В другом конкретном аспекте, PD-1-связывающий антагонист представляет собой AMP-224, описанный в данном документе.
Термин «PD-L1-связывающий антагонист» относится к молекуле, которая снижает, блокирует, ингибирует, подавляет или препятствует передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-L1 с любым одним или более его партнерами по связыванию, такими как PD-1, B7-1. В некоторых вариантах осуществления, PD-L1-связывающий антагонист является молекулой, которая ингибирует связывание PD-L1 с его партнерами по связыванию. В конкретном аспекте, PD-L1-связывающий антагонист ингибирует связывание PD-L1 с PD-1 и/или B7-1. В некоторых вариантах осуществления, PD-L1-связывающие антагонисты включают анти-PD-L1 антитела, их антигенсвязывающие фрагменты, иммуноадгезины, гибридные белки, олигопептиды и другие молекулы, которые снижают, блокируют, ингибируют, подавляют или препятствуют передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-L1 с его одним или больше партнерами по связыванию, такими как PD-1, B7-1. В одном варианте осуществления, PD-L1-связывающий антагонист снижает отрицательный костимулирующий сигнал, опосредуемый белками клеточной поверхности, экспрессируемыми на Т-лимфоцитах, которые опосредуют передачу сигнала через PD-L1, чтобы сделать дисфункциональные Т-клетки менее дисфункциональными (например, повышая эффекторный ответ на распознавание антигена). В некоторых вариантах осуществления, PD-L1-связывающий антагонист является антителом к PD-L1. В конкретном аспекте, антитело к PD-L1 представляет собой YW243.55.S70, описанное в данном документе. В другом конкретном аспекте, антитело к PD-L1 представляет собой MDX-1105, описанное в данном документе. В еще другом конкретном аспекте, антитело к PD-L1 представляет собой MPDL3280A, описанное в данном документе. В конкретном аспекте, антитело к PD-L1 представляет собой MEDI4736, описанное в данном документе.
Термин «PD-L2-связывающий антагонист» относится к молекуле, которая снижает, блокирует, ингибирует, подавляет или препятствует передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-L2 с любым одним или больше его партнерами по связыванию, такими как PD-1. В некоторых вариантах осуществления, PD-L2-связывающий антагонист является молекулой, которая ингибирует связывание PD-L2 с одним или больше его партнерами по связыванию. В конкретном аспекте, PD-L2-связывающий антагонист ингибирует связывание PD-L2 с PD-1. В некоторых вариантах осуществления, PD-L2-связывающие антагонисты включают анти-PD-L2 антитела, их антигенсвязывающие фрагменты, иммуноадгезины, гибридные белки, олигопептиды и другие молекулы, которые снижают, блокируют, ингибируют, подавляют или препятствуют передаче сигнала вследствие взаимодействия PD-L2 с любым одним или более его партнерами по связыванию, такими как PD-1. В одном варианте осуществления, PD-L2-связывающий антагонист снижает отрицательный костимулирующий сигнал, опосредуемый белками клеточной поверхности, экспрессируемыми на Т-лимфоцитах, которые опосредуют передачу сигнала через PD-L2, чтобы сделать дисфункциональные Т-клетки менее дисфункциональными (например, повышая эффекторный ответ на распознавание антигена). В некоторых вариантах осуществления, PD-L2-связывающий антагонист является иммуноадгезином.
Термин «фиксированная» или «постоянная» доза терапевтического вещества относится к дозе, которая вводится человеку-пациенту, не обращая внимания на вес (массу тела) или площадь поверхности тела (ППТ) пациента. Следовательно, фиксированная или постоянная доза не предоставляется в виде дозы мг/кг или дозы мг/м2, а скорее, как абсолютное количество терапевтического вещества.
В данном документе «ударная» доза, в целом, как правило, содержит начальную дозу терапевтического вещества, которую вводят пациенту, и затем следует одна или более ее поддерживающей(их) дозы (доз). В целом, как правило, вводят разовую ударную дозу, но в данном документе предусматриваются многократные ударные дозы. Как правило, количество вводимой(ых) ударной(ых) дозы (доз) превышает количество вводимой(ых) поддерживающей(их) дозы (доз), и/или ударную(ые) дозу(ы) вводят чаще, чем поддерживающую(ие) дозу(ы), с тем, чтобы достичь желаемой неизменяющейся концентрации терапевтического вещества раньше, чем это может быть достигнуто с помощью поддерживающей(их) дозы (доз).
В данном документе термин «поддерживающая» доза относится к одной или больше дозам терапевтического вещества, которые вводят пациенту в течение периода лечения. Как правило, при лечении поддерживающие дозы вводят через определенные интервалы, например, примерно каждую неделю, примерно каждые 2 недели, примерно через каждые 3 недели или примерно через каждые 4 недели, предпочтительно каждые 3 недели.
«Инфузия» или «вливание» относится к внутривенному введению в организм в терапевтических целях раствора, содержащего лекарственное средство. В целом, как правило, это достигается с помощью внутривенного (ВВ (IV)) пакета.
«Внутривенный пакет» или «ВВ (IV) пакет» представляет собой пакет, который может содержать раствор, который может быть введен пациенту внутривенно. В одном варианте реализации изобретения раствор представляет собой солевой раствор (например, около 0,9% или около 0,45% NaCl). Необязательно, ВВ (IV) мешок изготовлен из полиолефина или поливинилхлорида.
Термин «вариабельная область» или «вариабельный домен» относится к домену тяжелой или легкой цепи антитела, который участвует в связывании антитела с антигеном. Вариабельные домены тяжелой цепи и легкой цепи (VH и VL, соответственно) природного антитела обычно имеют подобные структуры, причем каждый домен содержит четыре консервативные каркасные области (FR) и три гипервариабельных участка (HVR). (См. например, Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., page 91 (2007).) Для обеспечения антигенсвязывающей специфичности может быть достаточно одного домена VH или VL. Кроме того, антитела, которые связываются с конкретным антигеном, можно выделить, используя домен VH или VL из антитела, которое связывается с антигеном, для скрининга библиотеки последовательностей, комплементарных доменам VL или VH, соответственно. См., например, Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).
Термин «вектор», как используется в данном документе, относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной переносить другую нуклеиновую кислоту, с которой она связана. Термин включает вектор в виде самореплицирующейся структуры нуклеиновой кислоты, а также вектор, встраиваемый в геном клетки-хозяина, в которую он введен. Некоторые векторы способны направлять экспрессию нуклеиновых кислот с которыми они функционально связаны. Такие векторы называют в данном документе «векторами экспрессии».
«Свободная аминокислота цистеина» относится к аминокислотному остатку цистеина, который был внесен в исходное антитело, имеет функциональную тиоловую группу (-SH) и не соединяется в внутримолекулярный или межмолекулярный дисульфидный мостик.
«Линкер», «линкерная единица» или «связующее звено» обозначает химический фрагмент, содержащий цепочку атомов, которая ковалентно присоединяет антитело к лекарственному фрагменту.
При указании количества заместителей термин «один или больше» относится к диапазону от одного заместителя до максимально возможного числа замещения, то есть замещения заместителями от одного водорода до замещения всех атомов водорода. Термин «заместитель» обозначает атом или группу атомов, заменяющих атом водорода в исходной молекуле. Термин «замещенный» обозначает, что указанная группа имеет один или несколько заместителей. Если любая группа может содержать множество заместителей и предлагается множество возможных заместителей, заместители выбираются независимо и не обязательно должны быть одинаковыми. Термин «незамещенный» обозначает, что указанная группа не имеет заместителей. Термин «необязательно замещенный» обозначает, что указанная группа является незамещенной или замещенной одним или несколькими заместителями, независимо выбранными из группы возможных заместителей. При указании количества заместителей термин «один или больше» обозначает от одного заместителя до максимально возможного числа замещения, то есть замещения заместителями от одного водорода, до замещения всех атомов водорода.
Термин «алкил», как используется в данном документе, относится к насыщенному линейному или с разветвленной цепью одновалентному углеводородному радикалу любой длины от одного до двенадцати атомов углерода (C1-C12), причем алкильный радикал может быть необязательно замещен независимо одним или несколькими заместителями, описанными ниже. В другом варианте осуществления, алкильный радикал представляет собой от одного до восьми атомов углерода (C1-C8), или от одного до шести атомов углерода (C1-C6). Примеры алкильных групп включают, но не ограничиваются лишь этими: метил (Me, -CH3), этил (Et, -CH2CH3), 1-пропил (n-Pr, n-пропил, -CH2CH2CH3), 2-пропил (i-Pr, i-пропил, -CH(CH3)2), 1-бутил (n-Bu, n-бутил, -CH2CH2CH2CH3), 2-метил-1-пропил (i-Bu, i-бутил, -CH2CH(CH3)2), 2-бутил (s-Bu, втор-бутил, -CH(CH3)CH2CH3), 2-метил-2-пропил (t-Bu, t-бутил, -C(CH3)3), 1-пентил н-пентил, -CH2CH2CH2CH2CH3), 2-пентил (-CH(CH3)CH2CH2CH3), 3-пентил (-CH(CH2CH3)2), 2-метил-2-бутил (-C(CH3)2CH2CH3), 3-метил-2-бутил (-CH(CH3)CH(CH3)2), 3-метил-1-бутил (-CH2CH2CH(CH3)2), 2-метил-1-бутил (-CH2CH(CH3)CH2CH3), 1-гексил (-CH2CH2CH2CH2CH2CH3), 2-гексил (-CH(CH3)CH2CH2CH2CH3), 3-гексил (-CH(CH2CH3)(CH2CH2CH3)), 2-метил-2-пентил (-C(CH3)2CH2CH2CH3), 3-метил-2-пентил (-CH(CH3)CH(CH3)CH2CH3), 4-метил-2-пентил (-CH(CH3)CH2CH(CH3)2), 3-метил-3-пентил (-C(CH3)(CH2CH3)2), 2-метил-3-пентил (-CH(CH2CH3)CH(CH3)2), 2,3-диметил-2-бутил (-C(CH3)2CH(CH3)2), 3,3-диметил-2-бутил (-CH(CH3)C(CH3)3, 1-гептил, 1-октил, и тому подобное.
Термин «алкилен», как используется в данном документе, относится к насыщенному линейному или с разветвленной цепью одновалентному углеводородному радикалу любой длины от одного до двенадцати атомов углерода (C1-C12), причем алкиленовый радикал может быть необязательно замещен независимо одним или большим количеством заместителей, описанных ниже. В другом варианте осуществления, алкиленовый радикал представляет собой от одного до восьми атомов углерода (C1-C8), или от одного до шести атомов углерода (C1-C6). Примеры алкиленовых груп включают, но не ограничиваются лишь этими: метилен (-CH2-), этилен (-CH2CH2-), пропилен (-CH2CH2CH2-), и тому подобное.
Термин «алкенил» относится к линейному или с разветвленной цепью одновалентному углеводородному радикалу любой длины от двух до восьми атомов углерода (C2-C8), с по меньшей мере одним сайтом ненасыщенности, т.е. углерод-углерод, sp2-двойной связью, причем алкенильный радикал может быть необязательно независимо замещен одним или больше заместителем, описанным в данном документе, и включает радикалы, имеющие ориентации «цис» и «транс», или в качестве альтернативы, ориентации «Е» и «Z». Примеры включают, без ограничений, этиленил или винил (-CH=CH2), аллил (-CH2CH=CH2), и т.п.
Термин «алкенилен» относится к линейному или с разветвленной цепью двухвалентному углеводородному радикалу любой длинны от двух до восьми атомов углерода (C2-C8), с по меньшей мере одним сайтом ненасыщенности, т.е. углерод-углерод, sp2-двойной связью, причем алкениленовый радикал может быть необязательно независимо замещен одним или больше заместителем, описанным в данном документе, и включает радикалы, имеющие ориентации «цис» и «транс», или в качестве альтернативы, ориентации «Е» и «Z». Примеры включают, но не ограничиваются лишь этими: этиленинлен или винилен (-CH=CH-), аллил (-CH2CH=CH-), и тому подобное.
Термин «алкинил» относится к линейному или разветвленному одновалентному углеводородному радикалу, любой длинны от двух до двенадцати атомов углерода (C2-C8), c по меньшей мере одной ненасыщенной связью, т.е. углерод-углерод, sp тройной связью, причем алкиниловый радикал может быть необязательно независимо замещен одним или больше заместителем, описанным в данном документе. Примеры включают, но не ограничиваются лишь этими: этинил (C≡CH), пропинил (пропаргил, CH2C≡CH), и тому подобное.
Термин «алкинилен» относится к линейному или разветвленному двухвалентному углеводородному радикалу, любой длинны от двух до восьми атомов углерода (C2-C8), c по меньшей мере одной ненасыщенной связью, т.е. углерод-углерод, sp тройной связью, причем алкиниленовый радикал может быть необязательно независимо замещен одним или больше заместителем, описанным в данном документе. Примеры включают, но не ограничиваются лишь этими: этинилен (-C≡C-), пропинилен (пропаргилен, -CH2C≡C-) и тому подобное.
Термины «карбоцикл», «карбоциклил», «карбоциклическое кольцо» и «циклоалкил» относится к одновалентному неароматическому, насыщенному или частично ненасыщенному циклу, содержащему от 3 до 12 атомов углерода (C3-C12) в виде моноциклического кольца, или от 7 до 12 атомов углерода в виде бициклического кольца. Бициклические карбоциклы, имеющие от 7 до 12 атомов могут быть расположены, например, как бицикло [4,5], [5,5], [5,6] или [6,6] система, а также бициклические карбоциклы, имеющие 9 или 10 кольцевых атомов могут быть организованы в виде бицикло [5,6] или [6,6] систем, или как мостиковые системы, такие, как [2,2,1]гептан, бицикло[2,2,2]октан и бицикло[3,2,2]нонан. Спиральные фрагменты также включены в объем данного определения. Примеры моноциклических карбоциклов включают, но не ограничиваются лишь этими: циклопропил, циклобутил, циклопентил, 1-циклопент-1-енил, 1-циклопент-2-енил, 1-циклопент-3-енил, циклогексил, 1-циклогексен-1-енил, 1-циклогексен-2-енил, 1-циклогексен-3-енил, циклогексадиенил, циклогептил, циклооктил, циклононил, циклодецил, циклоундецил, циклододецил, и тому подобное. Карбоциклильные группы необязательно замещены независимо одним или больше заместителями, описанными в данном документе.
«Арил» обозначает одновалентный ароматический углеводородный радикал, содержащий 6-20 атомов углерода (C6-C20), полученные удалением одного атома водорода от одного атома углерода исходной ароматической кольцевой системы. Некоторые арильные группы представлены в иллюстративных структурах как «Ar». Арил включает в себя бициклические радикалы, содержащие ароматическое кольцо, конденсированное с насыщенным, частично ненасыщенным кольцом или ароматическим карбоциклическим кольцом. Типичные арильные группы включают, но не ограничиваются лишь этими: радикалы, образованные из бензола (фенил), замещенные бензолы, нафталин, антрацен, бифенил, инденил, инданил, 1,2-дигидронафталин, 1,2,3,4-тетрагидронафтил и тому подобное. Арильные группы необязательно замещены независимо одним или больше заместителями, описанными в данном документе.
«Арилен» обозначает двухвалентный ароматический углеводородный радикал, содержащий 6-20 атомов карбона (C6-C20), полученный путем удаления двух атомов водорода из двух атомов углерода исходной ароматической кольцевой системы. Некоторые ариленовые группы представлены в иллюстративных структурах как «Ar». Арилен включает бициклические радикалы, содержащие ароматическое кольцо, слитое с насыщенным, частично ненасыщенным кольцом или ароматическим карбоциклическим кольцом. Типичные ариленовые группы включают, но не ограничиваются ими: радикалы, полученные из бензола (фенилена), замещенные бензолы, нафталин, антрацен, бифенилен, инденилен, инданилен, 1,2-дигидронафталин, 1,2,3,4-тетрагидронафтил и тому подобное. Ариленовые группы необязательно замещены одним или больше заместителями, описанными в данном документе.
Термины «гетероцикл», «гетероциклил» и «гетероциклическое кольцо» используются в данном документе взаимозаменяемо, и относятся к насыщенному или частично ненасыщенному (т.е. имеющему одну или больше двойных и/или тройных связей в кольце) карбоциклическому радикалу от 3 до около 20 кольцевых атомов в которых по меньшей мере один кольцевой атом представляет собой гетероатом, выбранный из азота, кислорода и серы, а остальные кольцевые атомы представляют собой С, где один или больше кольцевых атомов необязательно замещены независимо одним или больше заместителями, описанными ниже. Гетероцикл может быть моноциклом, содержащим от 3 до 7 членов кольца (от 2 до 6 атомов углерода и от 1 до 4 гетероатомов, выбранных из N, O, P и S) или бициклом, содержим от 7 до 10 кольцевых членов (от 4 до 9 атомов углерода, и от 1 до 6 гетероатомов, выбранных из N, О, Р и S), например: бицикло [4,5], [5,5], [5,6], или [6,6] система. Гетероциклы описаны в Paquette, Leo A.; ʺPrinciples of Modern Heterocyclic Chemistryʺ (W.A. Benjamin, New York, 1968), частично в главах 1, 3, 4, 6, 7, и 9; ʺThe Chemistry of Heterocyclic Compounds, A series of Monographsʺ (John Wiley & Sons, New York, с 1950 года по настоящее время), в частности томах 13, 14, 16, 19, и 28; и J. Am. Chem. Soc. (1960) 82:5566. «Гетероциклил» также включает радикалы, где гетероциклические радикалы конденсированы с насыщенным, частично ненасыщенным кольцом или ароматическим карбоциклическим, или гетероциклическим кольцом. Примеры гетероциклических колец включают, но не ограничиваются лишь этими: морфолин-4-ил, пиперидин-1-ил, пиперазинил, пиперазин-4-ил-2-он, пиперазин-4-ил-3-он, пирролидин-1-ил, тиоморфолин-4-ил, S-диоксотиоморфолин-4-ил, азокан-1-ил, азетидин-1-ил, октагидропиридо[1,2-a]пиразин-2-ил, [1,4]диазепан-1-ил, пирролидинил, тетрагидрофуранил, дигидрофуранил, тетрагидротиенил, тетрагидропиранил, дигидропиранил, тетрагидротиопиранил, пиперидино, морфолино, тиоморфолино, тиоксанил, пиперазинил, гомопиперазинил, азетидинил, оксетанил, тиетанил, гомопиперидинил, оксапанил, тиапанил, оксазепинил, диазепинил, тиазепинил, 2- пирролинил, 3-пирролинил, индолинил, 2Н-пиранил, 4Н-пиранил, диоксанил, 1,3-диоксоланил, пиразолинил, дитианил, дитиоланил, дигидропиранил, дигидротиенил, дигидрофуранил, пиразолидинимидазолинил, имидазолидинил, 3-азабицикло[3.1.0]гексанил, 3-азабицикло[4.1.0]гептанил, азабицикло[2.2.2]гексанил, 3H-индолилхинолизинил и N-пиридилмочевину. Спиральные фрагменты также включены в объем данного определения. Примеры гетероциклической группы, в которой 2 атома кольца замещены оксо (=О), представляют собой пиримидинонил и 1,1-диоксотиоморфолинил. Гетероциклические группы в данном документе необязательно замещены независимо друг от друга одним или больше заместителями, описанными в данном документе.
Термин «гетероарил» относится к одновалентному ароматическому радикалу, содержащему 5-, 6- или 7-членные кольца, и включает конденсированные кольцевые системы (по меньшей мере одна из которых является ароматической) из 5-20 атомов, содержащих один или больше гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. Примеры гетероарильных групп представляют собой пиридинил (включая, например, 2-гидроксипиридинил), имидазолил, имидазопиридинил, 1-метил-1Н-бензо[d]имидазол, [1,2,4]триазоло[1,5-а]пиридинил, пиримидинил (включая, например, 4-гидроксипиримидинил), пиразолил, триазолил, пиразинил, тетразолил, фурил, тиенил, изоксазолил, тиазолил, оксадиазолил, оксазолил, изотиазолил, пирролил, хинолинил, изохинолинил, тетрагидроизохинолинил, индолил, бензимидазолил, бензофуранил, цинолинил, индазолил, индолизинил, фталазинил, пиридазинил, триазинил, изоиндолил, птеридинил, пуринил, оксадиазолил, тиадиазолил, тиадиазолил, фуразанил, бензофуразанил, бензотиофенил, бензотиазолил, бензоксазолил, хиназолинил, хиноксалинил, нафтиридинил и фуропиридинил. Гетероарильные группы необязательно замещены независимо одним или больше заместителями, описанными в данном документе.
Гетероциклические или гетероарильные группы могут быть присоединены, где такое возможно, через углерод (углерод-связанные) или азот (азот-связанные). В качестве примера, но не ограничения, присоединенные к углероду гетероциклы или гетероарилы являются присоединенными в положении 2, 3, 4, 5 или 6 пиридина, положение 3, 4, 5 или 6 пиридазина, положении 2, 4, 5 или 6 пиримидина, положении 2, 3, 5 или 6 пиразина, положении 2, 3, 4 или 5 фурана, тетрагидрофурана, тиофурана, тиофена, пиррола или тетрагидропиррола, положении 2, 4 или 5 оксазола, имидазола или тиазола, положении 3, 4 или 5 изоксазола, пиразола или изотиазола, положении 2 или 3 азиридина, положении 2, 3 или 4 азетидина, положении 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 хинолина или положении 1, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 изохинолина.
В качестве неограничивающего примера азотные гетероциклы или гетероарилы соединены в положении 1 азиридина, азетидина, пиррола, пирролидина, 2-пирролина, 3-пирролина, имидазола, имидазолидина, 2-имидазолина, 3-имидазолина, пиразола, пиразолина, 2-пиразолина, 3-пиразолина, пиперидина, пиперазина, индола, индолина, 1H-индазола, положении 2 изоиндола или изоиндолина, положении 4 морфолина и положении 9 карбазола, или β-карболина.
Термин «хиральный» относится к молекулам, которые обладают свойством несопоставимости при наложении их зеркально отображенного изображения, тогда как термин «ахиральний» относится к молекулам, которые совпадают со своим зеркально отображенного изображением при наложении.
Термин «стереоизомеры» относится к соединениям, которые имеют идентичное химическое строение, но отличаются по расположению атомов или групп в пространстве.
«Диастереомер» относится к стереоизомеру с двумя или более центрами хиральности и молекулы которого не являются зеркальными отображениями друг друга. Диастереомеры имеют разные физические свойства, например точки плавления, точки кипения, спектральные свойства и реакционную способность. Смеси диастереомеров могут быть разделены при аналитических процедурах высокого разрешения, таких как электрофорез и хроматография.
«Энантиомеры» относятся к двум стереоизомерам соединения, которые являются не накладываемыми зеркальными изображениями друг друга.
Стереохимические определения и условные обозначения, используемые в данном документе, в целом, как правило, соответствуют S. P. Parker, Ed., McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms (1984) McGraw-Hill Book Company, New York; and Eliel, E. and Wilen, S., Stereochemistry of Organic Compounds (1994) John Wiley & Sons, Inc., New York. Многие органические соединения существуют в оптически активных формах, т. е. они имеют возможность вращать плоскость плоского поляризованного света. При описании оптически активного соединения префиксы D и L, или R и S, применяются для обозначения абсолютного расположение молекулы вокруг ее хирального центра (центров). Префиксы d и l или (+) и (-) применяются для обозначения знака поворота плоского поляризованного света соединением с (-) или 1, обозначающим, что соединение является левовращающим. Соединение с префиксом (+) или d является правовращающим. Для данной химической структуры указанные стереоизомеры идентичны, за исключением того, что они являются зеркальными отображениями друг друга. Конкретный стереоизомер можно также назвать энантиомером, и смесь таких изомеров часто называют смесью энантиомеров. Смесь энантиомеров 50:50 упоминается как рацемическая смесь или рацемат, что может происходить там, где не было стереоселекции или стереоспецифичности в химической реакции или процессе. Термины «рацемическая смесь» и «рацемат» относятся к эквимолярной смеси двух энантиомерных частиц, лишенных оптической активности.
Как применяется в данном документе, фраза «фармацевтически приемлемая соль» относится к фармацевтически приемлемым органическим или неорганическим солям конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)). Иллюстративные соли включают, но не ограничиваются лишь этими: сульфатные, цитратные, ацетатные, оксалатные, хлоридные, бромидные, иодидные, нитратные, бисульфатные, фосфатные, кисло-фосфатные, изоникотинатные, лактатные, салицилатные, кисло-цитратные, тартратные, олеатные, таннатные, пантотенатные, битартратные, аскорбатные, сукцинатные, малеатные, гентизинатные, фумаратные, глюконатные, глюкуронатные, сахаратные, формиатные, бензоатные, глутаматные, метансульфонатные, этансульфонатные, бензолсульфонатные, р-толуолсульфонатные, памоатные (то есть, 1,1'-метилен-бис-(2-гидрокси-3-нафтоат)) соли. Фармацевтически приемлемая соль может включать включение другой молекулы, такой как иона ацетата, иона сукцината или другого противоиона. Противоионом может быть любой органический или неорганический компонент, который стабилизирует заряд на исходном соединении. Кроме того, фармацевтически приемлемая соль может иметь более одного заряженного атома в своей структуре. Случаи, когда несколько заряженных атомов являются частью фармацевтически приемлемой соли, могут иметь несколько противоионов. Следовательно, фармацевтически приемлемая соль может иметь один или больше заряженных атомов, и/или один или больше противоионов.
В данном документе применяются следующие аббревиатуры, имеющие указанные определения: БМЭ (BME) представляет собой бета-меркаптоэтанол, Boc представляет собой N- (трет-бутоксикарбонил), cit представляет собой цитруллин (2-амино-5-уреидо-пентановая кислота), ДЦК (DCC) представляет собой 1,3-дициклогексилкарбодиимид, ДХМ представляет собой дихлорметан, ДЭА (DEA) представляет собой диэтиламин, ДЭАД (DEAD) представляет собой диэтилазодикарбоксилат, ДЭФЦ (DEPC) представляет собой диэтилфосфорицианидат, ДИАД (DIAD) представляет собой диизопропилазодикарбоксилат, ДИЭА (DIEA) представляет собой N,N-диизопропилэтиламин, ДМА (DMA) представляет собой диметилацетамид, ДМАП (DMAP) представляет собой 4-диметиламинопиридин, ДМЭ (DME) представляет собой диметиловый эфир этиленгликоля (или 1,2-диметоксиэтан), ДМФА (DMF) представляет собой N,N-диметилформамид, ДМСО (DMSO) представляет собой диметилсульфоксид, ДТТ (DTT) представляет собой дитиотреитол, ЭДКИ (EDCI) представляет собой 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид, ЭЭДХ (EEDQ) представляет собой 2-этокси-1-этоксикарбонил-1,2-дигидрохинолин, ES-MS представляет собой масс-спектрометрию с электрораспылением, EtOAc представляет собой этилацетат, Fmoc представляет собой N-(9-флуоренилметоксикарбонил), gly представляет собой глицин, HATU представляет собой O-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N' тетраметилуронум гексафторфосфатазу, HOBt представляет собой 1-гидроксибензотриазол, ВЭЖХ (HPLC) представляет собой высокоэффективную жидкостную хроматографию, ile представляет собой изолейцин, lys представляет собой лизин, MeCN (CH3CN) представляет собой ацетонитрил, MeOH представляет собой метанол, Mtr представляет собой 4-анизилдифенилметил (или 4-метокситритил), NHS представляет собой N-гидроксисукцинимид, ФСБ (PBS) представляет собой забуренный фосфатом солевой раствор (pH 7), ПЭГ (PEG) представляет собой полиэтиленгликоль или единицу этиленгликоля (-OCH2CH2-), Ph представляет собой фенил, Pnp представляет собой п-нитрофенил, MC представляет собой 6-малеимидокапроил, phe представляет собой L-фенилаланин, PyBrop представляет собой бромо tris-пирролидино фосфатную гексафторфозсфатазу, ЭХ (SEC) представляет собой эксклюзионная хроматография, Su представляет собой сукцинимид, ТФК (TFA) представляет собой трифтороцтовою кислоту, ТСХ (TLC) представляет собой тонкослойную хроматографию, UV- ультрафиолет, и val представляет собой валин.
ОПУХОЛЬ-АССОЦИИРОВАННЫЕ АНТИГЕНЫ
1) BMPR1B (рецептор костного морфогенетического белка типа IB, идентификационный номер ГенБанка NM_001203)
ten Dijke,P., et al Science 264 (5155):101-104 (1994), Oncogene 14 (11):1377-1382 (1997)); WO2004063362 (пункт формулы № 2); WO2003042661 (пункт формулы № 12); US2003134790-A1 (страницы 38-39); WO2002102235 (пункт формулы № 13; страница 296); WO2003055443 (страницы 91-92); WO200299122 (пример 2; страницы 528-530); WO2003029421 (пункт формулы № 6); WO2003024392 (пункт формулы № 2; фиг. 112); WO200298358 (пункт формулы № 1; страница 183); WO200254940 (страницы 100-101); WO200259377 (страницы 349-350); WO200230268 (пункт формулы № 27; страница 376); WO200148204 (пример; фиг. 4)
NP_001194 рецептор костного морфогенетического белка типа IB /pid=NP_001194.1 -
Перекрестные ссылки: MIM:603248; NP_001194.1; AY065994
2) E16 (LAT1, SLC7A5, идентификационный номер ГенБанка NM_003486)
Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (2), 283-288 (1999), Nature 395 (6699):288-291 (1998), Gaugitsch, H.W., et al (1992) J. Biol. Chem. 267 (16):11267-11273); WO2004048938 (пример 2); WO2004032842 (пример IV); WO2003042661 (пункт формулы № 12); WO2003016475 (пункт формулы № 1); WO200278524 (пример 2); WO200299074 (пункт формулы № 19; страницы 127-129); WO200286443 (пункт формулы № 27; страница 222, 393); WO2003003906 (пункт формулы № 10; страница 293); WO200264798 (пункт формулы № 33; страницы 93-95); WO200014228 (пункт формулы № 5; страницы 133-136); US2003224454 (фиг. 3); WO2003025138 (пункт формулы № 12; страница 150);
NP_003477 семейство 7 транспортеров растворенных веществ (катионный аминокислотный транспортер, y+
система), член 5 /pid=NP_003477.3 - Homo sapiens
Перекрестные ссылки: MIM:600182; NP_003477.3; NM_015923; NM_003486_1
3) STEAP1 (шеститрансмембранный эпителиальный антиген простаты, идентификационный номер ГенБанка NM_012449)
Cancer Res. 61 (15), 5857-5860 (2001), Hubert, R.S., et al (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (25):14523-14528); WO2004065577 (пункт формулы № 6); WO2004027049 (фиг. 1L); EP1394274 (пример 11); WO2004016225 (пункт формулы № 2); WO2003042661 (пункт формулы № 12); US2003157089 (пример 5); US2003185830 (пример 5); US2003064397 (фиг. 2); WO200289747 (пример 5; страницы 618-619); WO2003022995 (пример 9; фиг. 13A, пример 53; страница 173, пример 2; фиг. 2A);
NP_036581 шеститрансмембранный эпителиальный антиген простаты
Перекрестные ссылки: MIM:604415; NP_036581.1; NM_012449_1
4) 0772P (CA125, MUC16, идентификационный номер ГенБанка AF361486)
J. Biol. Chem. 276 (29):27371-27375 (2001)); WO2004045553 (пункт формулы № 14); WO200292836 (пункт формулы № 6; фиг. 12); WO200283866 (пункт формулы № 15; страницы 116-121); US2003124140 (пример 16); US 798959. Перекрестные ссылки: GI:34501467; AAK74120.3; AF361486_1
5) MPF (MPF, MSLN, SMR, фактор активации мегакариоцитов, мезотелин, идентификационный номер ГенБанка NM_005823) Yamaguchi, N., et al Biol. Chem. 269 (2), 805-808 (1994), Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (20):11531-11536 (1999), Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (1):136-140 (1996), J. Biol. Chem. 270 (37):21984-21990 (1995)); WO2003101283 (пункт формулы № 14); (WO2002102235 (пункт формулы № 13; страницы 287-288); WO2002101075 (пункт формулы № 4; страницы 308-309); WO200271928 (страницы 320-321); WO9410312 (страницы 52-57); Перекрестные ссылки: MIM:601051; NP_005814.2; NM_005823_1
6) Napi2b (Napi3b, NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, семейство переносчиков растворенных веществ 34 (фосфат натрия), представитель 2, натрий-зависимый переносчик фосфата 3b типа II, идентификационный номер ГенБанка NM_006424)
J. Biol. Chem. 277 (22):19665-19672 (2002), Genomics 62 (2):281-284 (1999), Feild, J.A., et al (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (3):578-582); WO2004022778 (пункт формулы № 2); EP1394274 (пример 11); WO2002102235 (пункт формулы № 13; страница 326); EP875569 (пункт формулы № 1; страницы 17-19); WO200157188 (пункт формулы № 20; страница 329); WO2004032842 (пример IV); WO200175177 (пункт формулы № 24; страницы 139-140);
Перекрестные ссылки: MIM:604217; NP_006415.1; NM_006424_1
7) Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm.42015, SEMA5B, SEMAG, семафорин 5b Hlog, домен sema, семь тромбоспондиновых повторов (тип 1 и подобный типу 1), трансмембранный домен (TД) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 5B, идентификационный номер ГенБанка AB040878)
Nagase T., et al (2000) DNA Res. 7 (2):143-150); WO2004000997 (пункт формулы № 1); WO2003003984 (пункт формулы № 1); WO200206339 (пункт формулы № 1; страница 50); WO200188133 (пункт формулы № 1; страницы 41-43, 48-58); WO2003054152 (пункт формулы № 20); WO2003101400 (пункт формулы № 11);
Идентификационный номер: Q9P283; EMBL; AB040878; BAA95969.1. Genew; HGNC:10737;
8) PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, кДНК RIKEN 2700050C12, ген кДНК RIKEN 2700050C12, идентификационный номер ГенБанка AY358628); Ross et al (2002) Cancer Res. 62:2546-2553; US2003129192 (пункт формулы № 2); US2004044180 (пункт формулы № 12); US2004044179 (пункт формулы № 11); US2003096961 (пункт формулы № 11); US2003232056 (пример 5); WO2003105758 (пункт формулы № 12); US2003206918 (пример 5); EP1347046 (пункт формулы № 1); WO2003025148 (пункт формулы № 20);
Перекрестные ссылки: GI:37182378; AAQ88991.1; AY358628_1
9) ETBR (рецептор эндотелина типа В, идентификационный номер ГенБанка AY275463);
Nakamuta M., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 177, 34-39, 1991; Ogawa Y., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 178, 248-255, 1991; Arai H., et al Jpn. Circ. J. 56, 1303-1307, 1992; Arai H., et al J. Biol. Chem. 268, 3463-3470, 1993; Sakamoto A., Yanagisawa M., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 178, 656-663, 1991; Elshourbagy N.A., et al J. Biol. Chem. 268, 3873-3879, 1993; Haendler B., et al J. Cardiovasc. Pharmacol. 20, s1-S4, 1992; Tsutsumi M., et al Gene 228, 43-49, 1999; Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 16899-16903, 2002; Bourgeois C., et al J. Clin. Endocrinol. Metab. 82, 3116-3123, 1997; Okamoto Y., et al Biol. Chem. 272, 21589-21596, 1997; Verheij J.B., et al Am. J. Med. Genet. 108, 223-225, 2002; Hofstra R.M.W., et al Eur. J. Hum. Genet. 5, 180-185, 1997; Puffenberger E.G., et al Cell 79, 1257-1266, 1994; Attie T., et al, Hum. Mol. Genet. 4, 2407-2409, 1995; Auricchio A., et al Hum. Mol. Genet. 5:351-354, 1996; Amiel J., et al Hum. Mol. Genet. 5, 355-357, 1996; Hofstra R.M.W., et al Nat. Genet. 12, 445-447, 1996; Svensson P.J., et al Hum. Genet. 103, 145-148, 1998; Fuchs S., et al Mol. Med. 7, 115-124, 2001; Pingault V., et al (2002) Hum. Genet. 111, 198-206; WO2004045516 (пункт формулы № 1); WO2004048938 (пример 2); WO2004040000 (пункт формулы № 151); WO2003087768 (пункт формулы № 1); WO2003016475 (пункт формулы № 1); WO2003016475 (пункт формулы № 1); WO200261087 (фиг. 1); WO2003016494 (фиг. 6); WO2003025138 (пункт формулы № 12; страница 144); WO200198351 (пункт формулы № 1; страницы 124-125); EP522868 (пункт формулы № 8; фиг. 2); WO200177172 (пункт формулы № 1; страницы 297-299); US2003109676; US6518404 (фиг. 3); US5773223 (пункт формулы № 1a; Col 31-34); WO2004001004;
10) MSG783 (RNF124, гипотетический белок FLJ20315, идентификационный номер ГенБанка NM_017763);
WO2003104275 (пункт формулы № 1); WO2004046342 (пример 2); WO2003042661 (пункт формулы № 12); WO2003083074 (пункт формулы № 14; страница 61); WO2003018621 (пункт формулы № 1); WO2003024392 (пункт формулы № 2; фиг. 93); WO200166689 (пример 6);
Перекрестные ссылки: LocusID:54894; NP_060233.2; NM_017763_1
11) STEAP2 (HGNC_8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, ассоциированный с раком простаты ген 1, ассоциированный с раком простаты белок 1, шеститрансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы 2, шеститрансмембранный белок простаты, идентификационный номер ГенБанка AF455138)
Lab. Invest. 82 (11):1573-1582 (2002)); WO2003087306; US2003064397 (пункт формулы № 1; фиг. 1); WO200272596 (пункт формулы № 13; страницы 54-55); WO200172962 (пункт формулы № 1; фиг. 4B); WO2003104270 (пункт формулы № 11); WO2003104270 (пункт формулы № 16); US2004005598 (пункт формулы № 22); WO2003042661 (пункт формулы № 12); US2003060612 (пункт формулы № 12; фиг. 10); WO200226822 (пункт формулы № 23; фиг. 2); WO200216429 (пункт формулы № 12; фиг. 10);
Перекрестные ссылки: GI:22655488; AAN04080.1; AF455138_1
12) TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, катионный канал, действующий по механизму транзиторного рецепторного потенциала, подсемейство M, элемент 4, идентификационный номер ГенБанка NM_017636)
Xu, X.Z., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (19):10692-10697 (2001), Cell 109 (3):397-407 (2002), J. Biol. Chem. 278 (33):30813-30820 (2003)); US2003143557 (пункт формулы № 4); WO200040614 (пункт формулы № 14; страницы 100-103); WO200210382 (пункт формулы № 1; фиг. 9A); WO2003042661 (пункт формулы № 12); WO200230268 (пункт формулы № 27; страница 391); US2003219806 (пункт формулы № 4); WO200162794 (пункт формулы № 14; фиг. 1A-D);
Перекрестные ссылки: MIM:606936; NP_060106.2; NM_017636_1
13) CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, фактор роста, полученный из тератокарциномы, идентификационный номер ГенБанка NP_003203 или NM_003212)
Ciccodicola, A., et al EMBO J. 8 (7):1987-1991 (1989), Am. J. Hum. Genet. 49 (3):555-565 (1991)); US2003224411 (пункт формулы № 1); WO2003083041 (пример 1); WO2003034984 (пункт формулы № 12); WO200288170 (пункт формулы № 2; страницы 52-53); WO2003024392 (пункт формулы № 2; фиг. 58); WO200216413 (пункт формулы № 1; страницы 94-95, 105); WO200222808 (пункт формулы № 2; фиг. 1); US5854399 (пример 2; Col 17-18); US5792616 (фиг. 2);
Перекрестные ссылки: MIM:187395; NP_003203.1; NM_003212_1
14) CD21 (CR2 (рецептор комплемента 2) или C3DR (C3d/рецептор вируса Эпштейна-Барр) или Hs.73792 идентификационный номер ГенБанка M26004)
Fujisaku et al (1989) J. Biol. Chem. 264 (4):2118-2125); Weis J.J., et al J. Exp. Med. 167, 1047-1066, 1988; Moore M., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84, 9194-9198, 1987; Barel M., et al Mol. Immunol. 35, 1025-1031, 1998; Weis J.J., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 5639-5643, 1986; Sinha S.K., et al (1993) J. Immunol. 150, 5311-5320; WO2004045520 (пример 4); US2004005538 (пример 1); WO2003062401 (пункт формулы № 9); WO2004045520 (пример 4); WO9102536 (фиг. 9.1-9.9); WO2004020595 (пункт формулы № 1);
Идентификационный номер: P20023; Q13866; Q14212; EMBL; M26004; AAA35786.1.
15) CD79b (CD79B, CD79β, IGb (иммуноглобулин-ассоциированный бета), B29, идентификационный номер ГенБанка NM_000626 or 11038674)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2003) 100 (7):4126-4131, Blood (2002) 100 (9):3068-3076, Muller et al (1992) Eur. J. Immunol. 22 (6):1621-1625); WO2004016225 (пункт формулы № 2, фиг. 140); WO2003087768, US2004101874 (пункт формулы № 1, страница 102); WO2003062401 (пункт формулы № 9); WO200278524 (пример 2); US2002150573 (пункт формулы № 5, страница 15); US5644033; WO2003048202 (пункт формулы № 1, страницы 306 и 309); WO 99/558658, US6534482 (пункт формулы № 13, фиг. 17A/B); WO200055351 (пункт формулы № 11, страницы 1145-1146);
Перекрестные ссылки: MIM:147245; NP_000617.1; NM_000626_1
16) FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (якорный фосфатазный белок 1а, содержащий домен SH2), SPAP1B, SPAP1C, идентификационный номер ГенБанка NM_030764, AY358130)
Genome Res. 13 (10):2265-2270 (2003), Immunogenetics 54 (2):87-95 (2002), Blood 99 (8):2662-2669 (2002), Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (17):9772-9777 (2001), Xu, M.J., et al (2001) Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (3):768-775; WO2004016225 (пункт формулы № 2); WO2003077836; WO200138490 (пункт формулы № 5; фиг. 18D-1-18D-2); WO2003097803 (пункт формулы № 12); WO2003089624 (пункт формулы № 25);
Перекрестные ссылки: MIM:606509; NP_110391.2; NM_030764_1
17) HER2 (ErbB2, идентификационный номер ГенБанка M11730)
Coussens L., et al Science (1985) 230(4730):1132-1139); Yamamoto T., et al Nature 319, 230-234, 1986; Semba K., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82, 6497-6501, 1985; Swiercz J.M., et al J. Cell Biol. 165, 869-880, 2004; Kuhns J.J., et al J. Biol. Chem. 274, 36422-36427, 1999; Cho H.-S., et al Nature 421, 756-760, 2003; Ehsani A., et al (1993) Genomics 15, 426-429; WO2004048938 (пример 2); WO2004027049 (фиг. 1I); WO2004009622; WO2003081210; WO2003089904 (пункт формулы № 9); WO2003016475 (пункт формулы № 1); US2003118592; WO2003008537 (пункт формулы № 1); WO2003055439 (пункт формулы № 29; фиг. 1A-B); WO2003025228 (пункт формулы № 37; фиг. 5C); WO200222636 (пример 13; страницы 95-107); WO200212341 (пункт формулы № 68; фиг. 7); WO200213847 (страницы 71-74); WO200214503 (страницы 114-117); WO200153463 (пункт формулы № 2; страницы 41-46); WO200141787 (страница 15); WO200044899 (пункт формулы № 52; фиг. 7); WO200020579 (пункт формулы № 3; фиг. 2); US5869445 (пункт формулы № 3; Col 31-38); WO9630514 (пункт формулы № 2; страницы 56-61); EP1439393 (пункт формулы № 7); WO2004043361 (пункт формулы № 7); WO2004022709; WO200100244 (пример 3; фиг. 4);
Идентификационный номер: P04626; EMBL; M11767; AAA35808.1. EMBL; M11761; AAA35808.1.
18) NCA (CEACAM6, идентификационный номер ГенБанка M18728);
Barnett T., et al Genomics 3, 59-66, 1988; Tawaragi Y., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 150, 89-96, 1988; Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:16899-16903, 2002; WO2004063709; EP1439393 (пункт формулы № 7); WO2004044178 (пример 4); WO2004031238; WO2003042661 (пункт формулы № 12); WO200278524 (пример 2); WO200286443 (пункт формулы № 27; страница 427); WO200260317 (пункт формулы № 2);
Идентификационный номер: P40199; Q14920; EMBL; M29541; AAA59915.1. EMBL; M18728;
19) MDP (DPEP1, идентификационный номер ГенБанка BC017023)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26):16899-16903 (2002)); WO2003016475 (пункт формулы № 1); WO200264798 (пункт формулы № 33; страницы 85-87); JP05003790 (фиг. 6-8); WO9946284 (фиг. 9);
Перекрестные ссылки: MIM:179780; AAH17023.1; BC017023_1
20) IL20Rα (IL20Ra, ZCYTOR7, идентификационный номер ГенБанка AF184971);
Clark H.F., et al Genome Res. 13, 2265-2270, 2003; Mungall A.J., et al Nature 425, 805-811, 2003; Blumberg H., et al Cell 104, 9-19, 2001; Dumoutier L., et al J. Immunol. 167, 3545-3549, 2001; Parrish-Novak J., et al J. Biol. Chem. 277, 47517-47523, 2002; Pletnev S., et al (2003) Biochemistry 42:12617-12624; Sheikh F., et al (2004) J. Immunol. 172, 2006-2010; EP1394274 (пример 11); US2004005320 (пример 5); WO2003029262 (страницы 74-75); WO2003002717 (пункт формулы № 2; страница 63); WO200222153 (страницы 45-47); US2002042366 (страницы 20-21); WO200146261 (страницы 57-59); WO200146232 (страницы 63-65); WO9837193 (пункт формулы № 1; страницы 55-59);
Идентификационный номер: Q9UHF4; Q6UWA9; Q96SH8; EMBL; AF184971; AAF01320.1.
21) Brevican (BCAN, BEHAB, идентификационный номер ГенБанка AF229053)
Gary S.C., et al Gene 256, 139-147, 2000; Clark H.F., et al Genome Res. 13, 2265-2270, 2003; Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 16899-16903, 2002; US2003186372 (пункт формулы № 11); US2003186373 (пункт формулы № 11); US2003119131 (пункт формулы № 1; фиг. 52); US2003119122 (пункт формулы № 1; фиг. 52); US2003119126 (пункт формулы № 1); US2003119121 (пункт формулы № 1; фиг. 52); US2003119129 (пункт формулы № 1); US2003119130 (пункт формулы № 1); US2003119128 (пункт формулы № 1; фиг. 52); US2003119125 (пункт формулы № 1); WO2003016475 (пункт формулы № 1); WO200202634 (пункт формулы № 1);
22) EphB2R (DRT, ERK, Hek5, EPHT3, Tyro5, идентификационный номер ГенБанка NM_004442)
Chan,J. and Watt, V.M., Oncogene 6 (6), 1057-1061 (1991) Oncogene 10 (5):897-905 (1995), Annu. Rev. Neurosci. 21:309-345 (1998), Int. Rev. Cytol. 196:177-244 (2000)); WO2003042661 (пункт формулы № 12); WO200053216 (пункт формулы № 1; страница 41); WO2004065576 (пункт формулы № 1); WO2004020583 (пункт формулы № 9); WO2003004529 (страницы 128-132); WO200053216 (пункт формулы № 1; страница 42);
Перекрестные ссылки: MIM:600997; NP_004433.2; NM_004442_1
23) ASLG659 (B7h, идентификационный номер ГенБанка AX092328)
US20040101899 (пункт формулы № 2); WO2003104399 (пункт формулы № 11); WO2004000221 (фиг. 3); US2003165504 (пункт формулы № 1); US2003124140 (пример 2); US2003065143 (фиг. 60); WO2002102235 (пункт формулы № 13; страница 299); US2003091580 (пример 2); WO200210187 (пункт формулы № 6; фиг. 10); WO200194641 (пункт формулы № 12; фиг. 7b); WO200202624 (пункт формулы № 13; фиг. 1A-1B); US2002034749 (пункт формулы № 54; страницы 45-46); WO200206317 (пример 2; страницы 320-321, пункт формулы № 34; страницы 321-322); WO200271928 (страницы 468-469); WO200202587 (пример 1; фиг. 1); WO200140269 (пример 3; страницы 190-192); WO200036107 (пример 2; страницы 205-207); WO2004053079 (пункт формулы № 12); WO2003004989 (пункт формулы № 1); WO200271928 (страницы 233-234, 452-453); WO 0116318;
24) PSCA (предшественник антигена стволовых клеток простаты, идентификационный номер ГенБанка AJ297436)
Reiter R.E., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 1735-1740, 1998; Gu Z., et al Oncogene 19, 1288-1296, 2000; Biochem. Biophys. Res. Commun. (2000) 275(3):783-788; WO2004022709; EP1394274 (пример 11); US2004018553 (пункт формулы № 17); WO2003008537 (пункт формулы № 1); WO200281646 (пункт формулы № 1; страница 164); WO2003003906 (пункт формулы № 10; страница 288); WO200140309 (пример 1; фиг. 17); US2001055751 (пример 1; фиг. 1b); WO200032752 (пункт формулы № 18; фиг. 1); WO9851805 (пункт формулы № 17; страница 97); WO9851824 (пункт формулы № 10; страница 94); WO9840403 (пункт формулы № 2; фиг. 1B);
Идентификационный номер: O43653; EMBL; AF043498; AAC39607.1.
25) GEDA (идентификационный номер ГенБанка AY260763);
AAP14954 белок подобный гибридному партнеру HMGIC липомы /pid=AAP14954.1 - Homo sapiens
Виды: Homo sapiens (human)
WO2003054152 (пункт формулы № 20); WO2003000842 (пункт формулы № 1); WO2003023013 (пример 3, пункт формулы № 20); US2003194704 (пункт формулы № 45);
Перекрестные ссылки: GI:30102449; AAP14954.1; AY260763_1
26) BAFF-R (рецептор фактора активации В-лимфоцитов, BlyS рецептор 3, BR3, идентификационный номер ГенБанка AF116456); рецептор BAFF /pid=NP_443177.1 - Homo sapiens
Thompson, J.S., et al Science 293 (5537), 2108-2111 (2001); WO2004058309; WO2004011611; WO2003045422 (пример; страницы 32-33); WO2003014294 (пункт формулы № 35; фиг. 6B); WO2003035846 (пункт формулы № 70; страницы 615-616); WO200294852 (Col 136-137); WO200238766 (пункт формулы № 3; страница 133); WO200224909 (пример 3; фиг. 3);
Перекрестные ссылки: MIM:606269; NP_443177.1; NM_052945_1; AF132600
27) CD22 (изоформа CD22-В рецептора В-лимфоцитов, BL-CAM, Lyb-8, Lyb8, SIGLEC-2, FLJ22814, идентификационный номер ГенБанка AK026467);
Wilson et al (1991) J. Exp. Med. 173:137-146; WO2003072036 (пункт формулы № 1; фиг. 1);
Перекрестные ссылки: MIM:107266; NP_001762.1; NM_001771_1
28) CD79a (CD79A, CD79α, иммуноглобулин-ассоциированный альфа, специфический к В-клеткам белок, который ковалентно взаимодействует с Ig бета (CD79B) и образует комплекс на поверхности с молекулами Ig M, передает сигнал, связанный с дифференцировкой В-клеток), pI: 4,84, MW: 25028 TM: 2 [P] хромосома гена: 19q13.2, идентификационный номер ГенБанка NP_001774.10)
WO2003088808, US20030228319; WO2003062401 (пункт формулы № 9); US2002150573 (пункт формулы № 4, страницы 13-14); WO9958658 (пункт формулы № 13, фиг. 16); WO9207574 (фиг. 1); US5644033; Ha et al (1992) J. Immunol. 148(5):1526-1531; Mueller et al (1992) Eur. J. Biochem. 22:1621-1625; Hashimoto et al (1994) Immunogenetics 40(4):287-295; Preud'homme et al (1992) Clin. Exp. Immunol. 90(1):141-146; Yu et al (1992) J. Immunol. 148(2) 633-637; Sakaguchi et al (1988) EMBO J. 7(11):3457-3464;
29) CXCR5 (рецептор лимфомы Беркитта 1, сопряженный с протеином G рецептор, который активируется хемокином CXCL13, принимает участие в миграции лимфоцитов и гуморальной защите, играет роль в инфицировании ВИЧ-2 и, возможно, развитии СПИДа, лимфомы, миеломы и лейкоза); 372 aa, pI: 8,54 MW: 41959 TM: 7 [P] хромосома гена: 11q23.3, идентификационный номер ГенБанка NP_001707.1)
WO2004040000; WO2004015426; US2003105292 (пример 2); US6555339 (пример 2); WO200261087 (фиг. 1); WO200157188 (пункт формулы № 20, страница 269); WO200172830 (страницы 12-13); WO200022129 (пример 1, страницы 152-153, пример 2, страницы 254-256); WO9928468 (пункт формулы № 1, страница 38); US5440021 (пример 2, col 49-52); WO9428931 (страницы 56-58); WO9217497 (пункт формулы № 7, фиг. 5); Dobner et al (1992) Eur. J. Immunol. 22:2795-2799; Barella et al (1995) Biochem. J. 309:773-779;
30) HLA-DOB (бета-субъединица молекулы ГКГС класса II (антиген Ia), которая связывает пептиды и представляет их CD4+ Т-лимфоцитам); 273 aa, pI: 6,56 MW: 30820 TM: 1 [P] хромосома гена: 6p21.3, идентификационный номер ГенБанка NP_002111.1)
Tonnelle et al (1985) EMBO J. 4(11):2839-2847; Jonsson et al (1989) Immunogenetics 29(6):411-413; Beck et al (1992) J. Mol. Biol. 228:433-441; Strausberg et al (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903; Servenius et al (1987) J. Biol. Chem. 262:8759-8766; Beck et al (1996) J. Mol. Biol. 255:1-13; Naruse et al (2002) Tissue Antigens 59:512-519; WO9958658 (пункт формулы № 13, фиг. 15); US6153408 (Col 35-38); US5976551 (col 168-170); US6011146 (col 145-146); Kasahara et al (1989) Immunogenetics 30(1):66-68; Larhammar et al (1985) J. Biol. Chem. 260(26):14111-14119;
31) P2X5 (управляемый лигандом пуринергического рецептора P2X ионный канал 5, ионный канал, управляемый внеклеточной АТФ, может быть вовлечен в синаптическую передачу и нейрогенез, его дефицит может влиять на патофизиологию идиопатической нестабильности детрузора); 422 aa), pI: 7,63, MW: 47206 TM: 1 [P] хромосома гена: 17p13.3, идентификационный номер ГенБанка NP_002552.2)
Le et al (1997) FEBS Lett. 418(1-2):195-199; WO2004047749; WO2003072035 (пункт формулы № 10); Touchman et al (2000) Genome Res. 10:165-173; WO200222660 (пункт формулы № 20); WO2003093444 (пункт формулы № 1); WO2003087768 (пункт формулы № 1); WO2003029277 (страница 82);
32) CD72 (антиген дифференцировки В-клеток CD72, Lyb-2) PROTEIN SEQUENCE Full maeaity...tafrfpd (1..359; 359 aa), pI: 8,66, MW: 40225 TM: 1 [P] хромосома гена: 9p13.3, идентификационный номер ГенБанка NP_001773.1)
WO2004042346 (пункт формулы № 65); WO2003026493 (страницы 51-52, 57-58); WO200075655 (страницы 105-106); Von Hoegen et al (1990) J. Immunol. 144(12):4870-4877; Strausberg et al (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903;
33) LY64 (лимфоцитарный антиген 64 (RP105), мембранный белок типа I из семейства богатых лейцином повторов (LRR), регулирует активацию В-клеток и апоптоз, потеря его функциональности связана с повышенной активностью заболевания у пациентов с системной красной волчанкой); 661 aa, pI: 6,20, MW: 74147 TM: 1 [P] хромосома гена: 5q12, идентификационный номер ГенБанка NP_005573.1)
US2002193567; WO9707198 (пункт формулы № 11, страницы 39-42); Miura et al (1996) Genomics 38(3):299-304; Miura et al (1998) Blood 92:2815-2822; WO2003083047; WO9744452 (пункт формулы № 8, страницы 57-61); WO200012130 (страницы 24-26);
34) FcRH1 (Fc-рецептор-подобный белок 1, предполагаемый рецептор для домена Fc иммуноглобулина, который содержит Ig-подобный и ITAM домены типа C2, может играть роль в дифференциации B-лимфоцитов); 429 aa, pI: 5,28, MW: 46925 TM: 1 [P] хромосома гена: 1q21-1q22, идентификационный номер ГенБанка NP_443170.1)
WO2003077836; WO200138490 (пункт формулы № 6, фиг. 18E-1-18-E-2); Davis et al (2001) Proc. Natl. Acad. Sci USA 98(17):9772-9777; WO2003089624 (пункт формулы № 8); EP1347046 (пункт формулы № 1); WO2003089624 (пункт формулы № 7);
35) IRTA2 (ассоциированный с транслокацией рецептор 2 суперсемейства иммуноглобулинов, предполагаемый иммунорецептор с возможным участием в развитии В-лимфоцитов и лимфомагенеза; дисрегуляция гена путем транслокации происходит в некоторых злокачественных новообразованиях В-лимфоцитов); 977 aa, pI: 6,88 MW: 106468 TM: 1 [P] хромосома гена: 1q21, идентификационный номер ГенБанка Human:AF343662, AF343663, AF343664, AF343665, AF369794, AF397453, AK090423, AK090475, AL834187, AY358085; Mouse:AK089756, AY158090, AY506558; NP_112571.1
WO2003024392 (пункт формулы № 2, фиг. 97); Nakayama et al (2000) Biochem. Biophys. Res. Commun. 277(1):124-127; WO2003077836; WO200138490 (пункт формулы № 3, фиг. 18B-1-18B-2);
(36) TENB2 (TMEFF2, томорегулин, TPEF, HPP1, TR, предполагаемый трансмембранный протеогликан, связанный с семейством факторов роста EGF/херегулина и фоллистатином); 374 aa, NCBI Идентификационный номер: AAD55776, AAF91397, AAG49451, NCBI RefSeq: NP_057276; NCBI Gene: 23671; OMIM: 605734; SwissProt Q9UIK5; идентификационный номер ГенБанка AF179274; AY358907, CAF85723, CQ782436
WO2004074320 (SEQ ID NO 810); JP2004113151 (SEQ ID NOS 2, 4, 8); WO2003042661 (SEQ ID NO 580); WO2003009814 (SEQ ID NO 411); EP1295944 (страницы 69-70); WO200230268 (страница 329); WO200190304 (SEQ ID NO 2706); US2004249130; US2004022727; WO2004063355; US2004197325; US2003232350; US2004005563; US2003124579; Horie et al (2000) Genomics 67:146-152; Uchida et al (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 266:593-602; Liang et al (2000) Cancer Res. 60:4907-12; Glynne-Jones et al (2001) Int J Cancer. Oct 15;94(2):178-84;
37) PMEL17 (гомолог silver; SILV; D12S53E; PMEL17; SI; SIL); ME20; gp100) BC001414; BT007202; M32295; M77348; NM_006928; McGlinchey, R.P. et al (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (33), 13731-13736; Kummer, M.P. et al (2009) J. Biol. Chem. 284 (4), 2296-2306;
(38) TMEFF1 (трансмембранный белок 1 с EGF-подобным и двумя фолистатино-подобными доменами; Tomoregulin-1); H7365; C9orf2; C9ORF2; U19878; X83961; NM_080655; NM_003692; Harms, P.W. (2003) Genes Dev. 17 (21), 2624-2629; Gery, S. et al (2003) Oncogene 22 (18):2723-2727;
39) GDNF-Ra1 (рецептор альфа-1 семейства GDNF; GFRA1; GDNFR; GDNFRA; RETL1; TRNR1; RET1L; GDNFR-alpha1; GFR-ALPHA-1); U95847; BC014962; NM_145793 NM_005264; Kim, M.H. et al (2009) Mol. Cell. Biol. 29 (8), 2264-2277; Treanor, J.J. et al (1996) Nature 382 (6586):80-83;
(40) Ly6E (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус E; Ly67,RIG-E,SCA-2,TSA-1); NP_002337.1; NM_002346.2; de Nooij-van Dalen, A.G. et al (2003) Int. J. Cancer 103 (6), 768-774; Zammit, D.J. et al (2002) Mol. Cell. Biol. 22 (3):946-952; WO 2013/17705;
(41) TMEM46 (гомолог 2 shisa (Xenopus laevis); SHISA2); NP_001007539.1; NM_001007538.1; Furushima, K. et al (2007) Dev. Biol. 306 (2), 480-492; Clark, H.F. et al (2003) Genome Res. 13 (10):2265-2270;
(42) Ly6G6D (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус G6D; Ly6-D, MEGT1); NP_067079.2; NM_021246.2; Mallya, M. et al (2002) Genomics 80 (1):113-123; Ribas, G. et al (1999) J. Immunol. 163 (1):278-287;
(43) LGR5 (богатый на лейциновые повторы рецептор 5, сопряженный с G белком; GPR49, GPR67); NP_003658.1; NM_003667.2; Salanti, G. et al (2009) Am. J. Epidemiol. 170 (5):537-545; Yamamoto, Y. et al (2003) Hepatology 37 (3):528-533;
(44) RET (протоонкоген ret; MEN2A; HSCR1; MEN2B; MTC1; PTC; CDHF12; Hs.168114; RET51; RET-ELE1); NP_066124.1; NM_020975.4; Tsukamoto, H. et al (2009) Cancer Sci. 100 (10):1895-1901; Narita, N. et al (2009) Oncogene 28 (34):3058-3068;
(45) LY6K (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус K; LY6K; HSJ001348; FLJ35226); NP_059997.3; NM_017527.3; Ishikawa, N. et al (2007) Cancer Res. 67 (24):11601-11611; de Nooij-van Dalen, A.G. et al (2003) Int. J. Cancer 103 (6):768-774;
(46) GPR19 (рецептор 19, сопряженный с G белком; Mm.4787); NP_006134.1; NM_006143.2; Montpetit, A. and Sinnett, D. (1999) Hum. Genet. 105 (1-2):162-164; O'Dowd, B.F. et al (1996) FEBS Lett. 394 (3):325-329;
(47) GPR54 (рецептор KISS1; KISS1R; GPR54; HOT7T175; AXOR12); NP_115940.2; NM_032551.4; Navenot, J.M. et al (2009) Mol. Pharmacol. 75 (6):1300-1306; Hata, K. et al (2009) Anticancer Res. 29 (2):617-623;
(48) ASPHD1 (содержащий домен аспартат-бета-гидроксилазы 1; LOC253982); NP_859069.2; NM_181718.3; Gerhard, D.S. et al (2004) Genome Res. 14 (10B):2121-2127;
(49) Тирозиназа (TYR; OCAIA; OCA1A; тирозина; SHEP3); NP_000363.1; NM_000372.4; Bishop, D.T. et al (2009) Nat. Genet. 41 (8):920-925; Nan, H. et al (2009) Int. J. Cancer 125 (4):909-917;
(50) TMEM118 (белок 2, содержащий трансмембранный домен и домен «палец RING (Really Interesting New Gene)»; RNFT2; FLJ14627); NP_001103373.1; NM_001109903.1; Clark, H.F. et al (2003) Genome Res. 13 (10):2265-2270; Scherer, S.E. et al (2006) Nature 440 (7082):346-351
51) GPR172A (рецептор 172A, сопряженный с G белком; GPCR41; FLJ11856; D15Ertd747e); NP_078807.1; NM_024531.3; Ericsson, T.A. et al (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (11):6759-6764; Takeda, S. et al (2002) FEBS Lett. 520 (1-3):97-101.
52) CD33, член семейства иммуноглобулин-подобных лектинов, связывающих сиаловую кислоту, является 67-кДа гликозилированным трансмембранным белком. CD33 экспрессируется на большинстве миелоидных и моноцитарных лейкозных клеток в дополнение к коммитированным клеткам-предшественникам миеломоноцитов и эритроидов. Его не наблюдают на самых ранних плюрипотентных стволовых клетках, зрелых гранулоцитах, лимфоцитах или негематопоэтических клетках (Sabbath et al., (1985) J. Clin. Invest. 75:756-56; Andrews et al., (1986) Blood 68:1030-5). CD33 содержит два остатка тирозина на цитоплазматическом конце, после каждого из которых идут гидрофобные остатки, что подобно ингибирующему мотиву на основе тирозина иммунорецепторов на (ITIM), наблюдаемому во многих ингибиторных рецепторах.
53) CLL-1 (CLEC12A, MICL и DCAL2), кодирует члена суперсемейства лектинов С-типа/доменов, подобных лектинам С-типа (CTL/CTLD). Представители этого семейства характеризуются одинаковым типом сворачивания белка и имеют разнообразные функции, такие как клеточная адгезия, передача сигнала от клетки к клетке, обмен гликопротеинов, и играют роль в воспалительных и иммунных ответах. Белок, кодируемый этим геном является отрицательным регулятором функции гранулоцитов и моноцитов. Было описано несколько альтернативных сплайс-вариантов транскрипта этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов определена не была. Этот ген тесно связан с другими представителями суперсемейства CTL/CTLD в области комплекса генов естественных киллеров в хромосоме 12p13 (Drickamer K (1999) Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5):585-90; van Rhenen A, et al., (2007) Blood 110 (7):2659-66; Chen CH, et al. (2006) Blood 107 (4):1459-67; Marshall AS, et al. (2006) Eur. J. Immunol. 36 (8):2159-69; Bakker AB, et al (2005) Cancer Res. 64 (22):8443-50; Marshall AS, et al (2004) J. Biol. Chem. 279 (15):14792-802). Было показано, что CLL-1 является трансмембранным рецептором типа II, содержащим один домен, подобный лектинам С-типа (который предполагаемо не связывает кальций или сахар), стеблеобразную область, трансмембранный домен и короткий цитоплазматический хвост, содержащий мотив ITIM).
Антитела анти-CD22
В некоторых вариантах осуществления, антитела анти-CD22 КАЛС (ADC) в таблицах 3А и 3В содержат три гипервариабельные области легкой цепи (HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3) и три гипервариабельные области тяжелой цепи (HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3), согласно US 8226945:
HVR-L1 RSSQSIVHSVGNTFLE (SEQ ID NO:1)
HVR-L2 KVSNRFS (SEQ ID NO:2)
HVR-L3 FQGSQFPYT (SEQ ID NO:3)
HVR-H1 GYEFSRSWMN (SEQ ID NO:4)
HVR-H2 GRIYPGDGDTNYSGKFKG (SEQ ID NO:5)
HVR-H3 DGSSWDWYFDV (SEQ ID NO:6)
Антитела анти-Ly6E
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В включают в себя антитела против Ly6E. Комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус E (Ly6E), также известный как ген E (RIG-E), индуцированный ретиноевой кислотой, и антиген 2 стволовых клеток (SCA-2). Это связанный с GPI, длинной в 131 аминокислоту, около 8,4 кДа белок неизвестной функции без каких-либо известных партнеров по связыванию. Первоначально он был идентифицирован как транскрипт, экспрессированный в незрелых тимоцитах, тимусных медулярных эпителиальных клетках у мышей (Mao, et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93:5910-5914). В некоторых вариантах осуществления, в изобретении предложено иммуноконъюгат, содержащий антитело против Ly6E, описанное в публикации PCT № WO 2013/177055.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к Ly6E, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; b) HVR-H2 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; c) HVR-H3 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; d) HVR-L1 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; e) HVR-L2 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; и f) HVR-L3 содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к Ly6E конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления, антитело к Ly6E содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к Ly6E конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности аминокислотной последовательности SEQ ID NO:8 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к Ly6E, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с Ly6E человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к Ly6E содержит последовательность VH SEQ ID NO: 8, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14.
В другом аспекте, предлагается антитело к Ly6E конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности аминокислотной последовательности SEQ ID NO:7 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к Ly6E, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с Ly6E. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к Ly6E содержит последовательность VL SEQ ID NO: 7, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к Ly6E, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 7, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к Ly6E, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против Ly6E, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 8 и последовательность VL SEQ ID NO: 7, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело против Ly6E конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело против Ly6E конъюгата антитело-лекарственное средство представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело, или фрагмент F(ab')2. В другом варианте осуществления, антитело представляет собой, по существу, полноразмерное антитело, например антитело IgG1, антитело IgG2a или другой класс антител или изотип, как определено в данном документе. В некоторых вариантах осуществления, иммуноконъюгат (КАЛС (ADC)) содержит антитело против Ly6E, содержащее тяжелую цепь и легкую цепь, содержащие аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 16 и 15 соответственно.
Таблица последовательностей антитела против Ly6E
SEQ ID NO Описание Последовательность
7 вариабельная область легкой цепи антитела hu9B12 v12 против Ly6E DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCSASQGIS NYLNWYQQKP
GKTVKLLIYY TSNLHSGVPS RFSGSGSGTD YTLTISSLQP
EDFATYYCQQ YSELPWTFGQ GTKVEIK
8 вариабельная область тяжелой цепи антитела hu9B12 v12 против Ly6E EVQLVESGPA LVKPTQTLTL TCTVSGFSLT GYSVNWIRQPPGKAL EWLGMIWGDG STDYNSALKS RLTISKDTSK NQVVLTMTNM DPVDTATYYC ARDYYFNYAS WFAYWGQGTL VTVSS
9 HVR-L1 антитела hu9B12 v12 против Ly6E SASQGISNYLN
10 HVR-L2 антитела hu9B12 v12 против Ly6E YTSNLHS
11 HVR-L3 антитела hu9B12 v12 против Ly6E QQYSELPWT
12 HVR-H1 антитела hu9B12 v12 против Ly6E GFSLTGYSVN
13 HVR-H2 антитела hu9B12 v12 против Ly6E MIWGDGSTDY NSALKS
14 HVR-H3 антитела hu9B12 v12 против Ly6E DYYVNYASWFAY
15 каппа легкая цепь антитела hu9B12 v12 K149C Ly6E DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCSASQGIS NYLNWYQQKP
GKTVKLLIYY TSNLHSGVPS RFSGSGSGTD YTLTISSLQP
EDFATYYCQQ YSELPWTFGQ GTKVEIK RTVAAPSVFIF
PPSDEQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW CVDNALQSGN
SQESVTEQDS KDSTYSLSST LTLSKADYEK HKVYACEVTH
QGLSSPVTKS FNRGEC
16 тяжелая цепь антитела hu9B12 v12 IgG1 против Ly6E EVQLVESGPA LVKPTQTLTL TCTVSGFSLT GYSVNWIRQP
PGKALEWLGM IWGDGSTDYN SALKSRLTIS KDTSKNQVVL
TMTNMDPVDT ATYYCARDYY FNYASWFAYW GQGTLVTVSS
ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS
WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT
YICNVNHKPS NTKVDKKVEP KSCDKTHTCP PCPAPELLGG
PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVVVDVS HEDPEVKFNW
YVDGVEVHNA KTKPREEQYN STYRVVSVLT VLHQDWLNGK
EYKCKVSNKA LPAPIEKTIS KAKGQPREPQ VYTLPPSREE
MTKNQVSLTC LVKGFYPSDI AVEWESNGQP ENNYKTTPPV
LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW QQGNVFSCSV MHEALHNHYT
QKSLSLSPGK
Антитела к HER2
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В включают в себя антитела против HER2. В одном варианте осуществления изобретения, антитело против HER2 КАЛС (ADC) по изобретению включает в себя гуманизированное антитело против HER2, например huMAb4D5-1, huMAb4D5-2, huMAb4D5-3, huMAb4D5-4, huMAb4D5-5, huMAb4D5- 6, huMAb4D5-7 и huMAb4D5-8, как описано в таблице 3 US 5821337, которая специально включена в посредством ссылки в данный документ. Данные антитела содержат каркасные области человека с определяющими комплементарность областями мышиного антитела (4D5), которое связывается с HER2. Гуманизированное антитело huMAb4D5-8 также упоминается как трастузумаб, коммерчески доступный под торговой маркой HERCEPTIN.® В другом варианте осуществления изобретения, антитело против HER2 КАЛС (ADC) по изобретению включает в себя гуманизированное антитело против HER2, например гуманизированное 2C4, как описано в US7862817. Примером гуманизированного антитела 2C4 является пертузумаб, коммерчески доступный под торговым наименованием PERJETA.®
В другом варианте осуществления изобретения, антитело против HER2 КАЛС (ADC) по изобретению включает в себя гуманизированное антитело 7C2 против HER2. Гуманизированное антитело 7C2 представляет собой антитело против HER2.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к HER2, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, 27 или 28; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24 или 29; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21. В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к HER2, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23 c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, 27 или 28; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24 или 29. В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, 27 или 28; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24 или 29. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, 27 или 28, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24 или 29; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21. В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, 27 или 28; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24 или 29; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21. В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к HER2 конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном варианте осуществления, антитело к HER2 содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к HER2 конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности c аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 18 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к HER2, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с HER2 человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к HER2 содержит последовательность VH SEQ ID NO: 18, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24.
В другом аспекте, предлагается антитело к HER2 конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 17 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или деле по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к HER2, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с HER2. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к HER2 содержит последовательность VL SEQ ID NO: 17, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к HER2, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 18 и SEQ ID NO: 17, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащее антитело, причем антитело содержит гуманизированную последовательность легкой цепи каппа 7C2.v2.2.LA (hu7C2) K149C SEQ ID NO: 30
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащее антитело, причем антитело содержит последовательность тяжелой цепи IgG1 Hu7C2 A118C SEQ ID NO: 31
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к HER2, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против HER2, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 18 и последовательность VL SEQ ID NO: 17, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело к HER2 конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело к HER2 иммуноконъюгата представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело или F(ab')2. В другом варианте осуществления, иммуноконъюгат содержит антитело, которое является, по существу, полноразмерным антителом, например антителом IgG1, антителом IgG2a или другим классом или изотипом антитела, как определено в данном документе.
Таблица гуманизированных последовательностей 7C2 анти-HER2 антитела
SEQ ID NO Описание Последовательность
17 Гуманизированная вариабельная область легкой цепи 7C2.v2.2.LA («hu7C2») DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASQSVS GSRFTYMHWY QQKPGQPPKL LIKYASILES GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY YCQHSWEIPP WTFGQGTKVE IK
18 Гуманизированная вариабельная область тяжелой цепи 7C2.v2.2.LA («hu7C2») EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYSFT GYWMNWVRQA PGQGLEWIGM IHPLDAEIRA NQKFRDRVTI TVDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCARGT YDGGFEYWGQ GTLVTVSS
19 hu7C2 HVR-L1 RASQSVSGSRFTYMH
20 hu7C2 HVR-L2 YASILES
21 hu7C2 HVR-L3 QHSWEIPPWT
22 hu7C2 HVR-H1 GYWMN
23 hu7C2 HVR-H2 MIHPLDAEIRANQKFRD
24 hu7C2 HVR-H3 GTYDGGFEY
25 Гуманизированная легкая цепь каппа 7C2.v2.2.LA (hu7C2) DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASQSVS GSRFTYMHWY QQKPGQPPKL LIKYASILES GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY YCQHSWEIPP WTFGQGTKVE IKRTVAAPSV FIFPPSDEQL KSGTASVVCL LNNFYPREAK VQWKVDNALQ SGNSQESVTE QDSKDSTYSL SSTLTLSKAD YEKHKVYACE VTHQGLSSPV TKSFNRGEC
26 Гуманизированная тяжелая цепь IgG1 7C2.v2.2.LA (hu7C2) EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYSFT GYWMNWVRQA PGQGLEWIGM IHPLDAEIRA NQKFRDRVTI TVDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCARGT YDGGFEYWGQ GTLVTVSSAS TKGPSVFPLA PSSKSTSGGT AALGCLVKDY FPEPVTVSWN SGALTSGVHT FPAVLQSSGL YSLSSVVTVP SSSLGTQTYI CNVNHKPSNT KVDKKVEPKS CDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSHE DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSREEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK
27 Hu7C2. v2.1.S53M HVR-H2 MIHPMDSEIRANQKFRD
28 Hu7C2. v2.1.S53L HVR-H2 MIHPLDSEIRANQKFRD
29 Hu7C2. v2.1.E101K HVR-H3 GTYDGGFKY
30 Гуманизированная 7C2.v2.2.LA (hu7C2) K149C легкая цепь каппа DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASQSVS GSRFTYMHWY QQKPGQPPKL LIKYASILES GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY YCQHSWEIPP WTFGQGTKVE IKRTVAAPSV FIFPPSDEQL KSGTASVVCL LNNFYPREAK VQWCVDNALQ SGNSQESVTE QDSKDSTYSL SSTLTLSKAD YEKHKVYACE VTHQGLSSPV TKSFNRGEC
31 Гуманизированная тяжелая цепь A118C IgG1 7C2.v2.2.LA (hu7C2) EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYSFT GYWMNWVRQA PGQGLEWIGM IHPLDAEIRA NQKFRDRVTI TVDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCARGT YDGGFEYWGQ GTLVTVSSCS TKGPSVFPLA PSSKSTSGGT AALGCLVKDY FPEPVTVSWN SGALTSGVHT FPAVLQSSGL YSLSSVVTVP SSSLGTQTYI CNVNHKPSNT KVDKKVEPKS CDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSHE DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSREEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK
64 иллюстративный белок-предшественник человеческого HER2, с сигнальной последовательностью MELAALCRWG LLLALLPPGA ASTQVCTGTD MKLRLPASPE THLDMLRHLY QGCQVVQGNL ELTYLPTNAS LSFLQDIQEV QGYVLIAHNQ VRQVPLQRLR IVRGTQLFED NYALAVLDNG DPLNNTTPVT GASPGGLREL QLRSLTEILK GGVLIQRNPQ LCYQDTILWK DIFHKNNQLA LTLIDTNRSR ACHPCSPMCK GSRCWGESSE DCQSLTRTVC AGGCARCKGP LPTDCCHEQC AAGCTGPKHS DCLACLHFNH SGICELHCPA LVTYNTDTFE SMPNPEGRYT FGASCVTACP YNYLSTDVGS CTLVCPLHNQ EVTAEDGTQR CEKCSKPCAR VCYGLGMEHL REVRAVTSAN IQEFAGCKKI FGSLAFLPES FDGDPASNTA PLQPEQLQVF ETLEEITGYL YISAWPDSLP DLSVFQNLQV IRGRILHNGA YSLTLQGLGI SWLGLRSLRE LGSGLALIHH NTHLCFVHTV PWDQLFRNPH QALLHTANRP EDECVGEGLA CHQLCARGHC WGPGPTQCVN CSQFLRGQEC VEECRVLQGL PREYVNARHC LPCHPECQPQ NGSVTCFGPE ADQCVACAHY KDPPFCVARC PSGVKPDLSY MPIWKFPDEE GACQPCPINC THSCVDLDDK GCPAEQRASP LTSIISAVVG ILLVVVLGVV FGILIKRRQQ KIRKYTMRRL LQETELVEPL TPSGAMPNQA QMRILKETEL RKVKVLGSGA FGTVYKGIWI PDGENVKIPV AIKVLRENTS PKANKEILDE AYVMAGVGSP YVSRLLGICL TSTVQLVTQL MPYGCLLDHV RENRGRLGSQ DLLNWCMQIA KGMSYLEDVR LVHRDLAARN VLVKSPNHVK ITDFGLARLL DIDETEYHAD GGKVPIKWMA LESILRRRFT HQSDVWSYGV TVWELMTFGA KPYDGIPARE IPDLLEKGER LPQPPICTID VYMIMVKCWM IDSECRPRFR ELVSEFSRMA RDPQRFVVIQ NEDLGPASPL DSTFYRSLLE DDDMGDLVDA EEYLVPQQGF FCPDPAPGAG GMVHHRHRSS STRSGGGDLT LGLEPSEEEA PRSPLAPSEG AGSDVFDGDL GMGAAKGLQS LPTHDPSPLQ RYSEDPTVPL PSETDGYVAP LTCSPQPEYV NQPDVRPQPP SPREGPLPAA RPAGATLERP KTLSPGKNGV VKDVFAFGGA VENPEYLTPQ GGAAPQPHPP PAFSPAFDNL YYWDQDPPER GAPPSTFKGT PTAENPEYLG LDVPV
Антитела к MUC16
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В содержат антитела к MUC16.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к MUC16, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36 c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к MUC16 конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления, антитело к MUC16 содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к MUC16 конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности c аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 39 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к MUC16, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с MUC16 человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к MUC16 содержит последовательность VH SEQ ID NO: 39, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37.
В другом аспекте, предлагается антитело к MUC16 конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 38. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 38 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к MUC16, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с MUC16 человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 38. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 38. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к MUC16 содержит последовательность VL SEQ ID NO: 38, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к MUC16, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 39 и SEQ ID NO: 38, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к MUC16, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против MUC16, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 39 и последовательность VL SEQ ID NO: 38, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело к MUC16 конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело против MUC16 конъюгата антитело-лекарственное средство представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело, или F(ab')2. В другом варианте осуществления, антитело представляет собой, по существу, полноразмерное антитело, например антитело IgG1, антитело IgG2a или другой класс антител или изотип, как определено в данном документе.
Таблица последовательностей антитела к MUC16
SEQ ID NO: Описание Последовательность
32 HVR-L1 антитела к Muc16 KASDLIHNWL A
33 HVR-L2 антитела к Muc16 YGATSLET
34 HVR-L3 антитела к Muc16 QQYWTTPFT
35 HVR-H1 антитела к Muc16 GYSITNDYAW N
36 HVR-H2 антитела к Muc16 GYISYSGYTT YNPSLKS
37 HVR-H3 антитела к Muc16 ARWASGLDY
38 Вариабельная область легкой цепи антитела к Muc16 DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASDLIH NWLAWYQQKP GKAPKLLIYG ATSLETGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQQ YWTTPFTFGQ GTKVEIKR
39 Вариабельная область тяжелой цепи антитела к Muc16 EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGYSIT NDYAWNWVRQ APGKGLEWVG YISYSGYTTY NPSLKSRFTI SRDTSKNTLY LQMNSLRAED TAVYYCARWA SGLDYWGQGT LVTVSS
Антитела к STEAP-1
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В содержат антитела к STEAP-1.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к STEAP-1, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41 c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41, и iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к STEAP-1 конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления, антитело к STEAP-1 содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к STEAP-1 конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности c аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 46. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 46 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к STEAP-1, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с STEAP-1 человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 46. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 46. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к STEAP-1 содержит последовательность VH SEQ ID NO: 46, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.
В другом аспекте, предлагается антитело к STEAP-1 конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 47. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 47 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к STEAP-1, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с STEAP-1 человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 47. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 47. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к STEAP-1 содержит последовательность VL SEQ ID NO: 47, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к STEAP-1, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 46 и SEQ ID NO: 47, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к STEAP-1, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против STEAP-1, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 46 и последовательность VL SEQ ID NO: 47, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело к STEAP-1 конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело против STEAP-1 конъюгата антитело-лекарственное средство представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело, или F(ab')2. В другом варианте осуществления, антитело представляет собой, по существу, полноразмерное антитело, например антитело IgG1, антитело IgG2a или другой класс антител или изотип, как определено в данном документе.
Таблица последовательностей антитела к STEAP
SEQ ID NO: Описание Последовательность
40 HVR-H1 антитела к STEAP-1 GYSITSDYAW N
41 HVR-H2 антитела к STEAP-1 GYISNSGSTS YNPSLKS
42 HVR-H3 антитела к STEAP-1 ERNYDYDDYY YAMDY
43 HVR-L1 антитела к STEAP-1 KSSQSLLYRS NQKNYLA
44 HVR-L2 антитела к STEAP-1 WASTRES
45 HVR-L3 антитела к STEAP-1 QQYYNYPRT
46 Вариабельная область тяжелой цепи антитела к STEAP-1 EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAVSGYSIT SDYAWNWVRQ APGKGLEWVG YISNSGSTSY NPSLKSRFTI SRDTSKNTLY LQMNSLRAED TAVYYCARER NYDYDDYYYA MDYWGQGTLV TVSS
47 Вариабельная область легкой цепи антитела к STEAP-1 DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKSSQSLL YRSNQKNYLA WYQQKPGKAP KLLIYWASTR ESGVPSRFSG SGSGTDFTLT ISSLQPEDFA TYYCQQYYNY PRTFGQGTKV EIK
Антитела к NaPi2b
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В содержат антитела к NaPi2b.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к NaPi2b, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49 c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к NaPi2b конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления, антитело к NaPi2b содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к NaPi2b конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности c аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к NaPi2b, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с NaPi2b человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к NaPi2b содержит последовательность VH SEQ ID NO: 54, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50.
В другом аспекте, предлагается антитело к NaPi2b конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 55 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к NaPi2b, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с NaPi2b человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к NaPi2b содержит последовательность VL SEQ ID NO: 55, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к NaPi2b, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 54 и SEQ ID NO: 55, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к NaPi2b, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против NaPi2b, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 54 и последовательность VL SEQ ID NO: 55, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело к NaPi2b конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело против NaPi2b конъюгата антитело-лекарственное средство представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело, или F(ab')2. В другом варианте осуществления, антитело представляет собой, по существу, полноразмерное антитело, например антитело IgG1, антитело IgG2a или другой класс антител или изотип, как определено в данном документе.
Таблица последовательностей антитела к NaPi2b
SEQ ID NO: Описание Последовательность
48 HVR-H1 антитела к NaPi2b GFSFSDFAMS
49 HVR-H2 антитела к NaPi2b ATIGRVAFHTYYPDSMKG
50 HVR-H3 антитела к NaPi2b ARHRGFDVGHFDF
51 HVR-L1 антитела к NaPi2b RSSETLVHSSGNTYLE
52 HVR-L2 антитела к NaPi2b RVSNRFS
53 HVR-L3 антитела к NaPi2b FQGSFNPLT
54 Вариабельная область тяжелой цепи антитела к NaPi2b EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSFSDFAMSWVRQAPGKGLEWVATIGRVAFHTYYPDSMKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHRGFDVGHFDFWGQGTLVTVSS
55 Вариабельная область легкой цепи антитела к NaPi2b DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSETLVHSSGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYRVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCFQGSFNPLTFGQGTKVEIKR
Антитела к CD79b
В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) таблиц 3А и 3В содержат антитела к CD79b.
В некоторых вариантах осуществления, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к CD79b, содержащее по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть HVR выбранных из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59 c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; d) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; e) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; и f) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.
В одном аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, две или все три последовательности HVR VH, выбранные из: a) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59; и c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60. В дополнительном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59; и c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности HVR VL, выбранные из: a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63. В одном варианте осуществления, антитело содержит: a) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; b) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; и c) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.
В другом аспекте, конъюгат антитело-лекарственное средство по изобретению содержит антитело, содержащее: a) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VH, выбранные из: (i) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, (ii) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и (iii) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и b) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две, или все три последовательности HVR VL, выбранные из: (i) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61, (ii) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62, и c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.
В другом аспекте, согласно настоящему изобретению предложено конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело, которое содержит: a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59; c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; и f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, антитело к CD79b конъюгата антитело-лекарственное средство является гуманизированным. В одном из вариантов осуществления, антитело к CD79b содержит HVR, как в любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркас, например, каркас человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркас.
В другом аспекте, антитело к CD79b конъюгата антитело-лекарственное средство содержит последовательность вариабельного домена (VH) тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности c аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 56. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VH, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 56 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к CD79b, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с CD79b человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 56. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 56. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к CD79b содержит последовательность VH SEQ ID NO: 8, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VH содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; b) HVR-H2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59; c) HVR-H3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60.
В другом аспекте, предлагается антитело к CD79b конъюгата антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), имеющий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 57. В некоторых вариантах осуществления, последовательность VL, имеющая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 57 содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, но антитело к Ly6E, содержащее эту последовательность, сохраняет способность связываться с CD79b человека. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 10 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 57. В некоторых вариантах осуществления, в общей сложности от 1 до 5 аминокислот были замещены, вставлены и/или удалены в SEQ ID NO: 57. В некоторых вариантах осуществления, замены, вставки или делеции происходят в областях вне HVR (то есть, в FR). Необязательно, антитело к CD79b содержит последовательность VL SEQ ID NO: 57, включая пост-трансляционные модификации этой последовательности. В конкретном варианте осуществление, VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: а) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; b) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; c) HVR-L3, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.
В другом аспекте, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитело к CD79b, причем антитело содержит VH как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше, и VL как в любом из вариантов осуществления изобретения, приведенных выше.
В одном варианте осуществления, предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, причем антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO: 56 и SEQ ID NO: 57, соответственно, включая пост-трансляционные модификации этих последовательностей.
В дополнительном аспекте, в данном документе предлагается конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий антитела, которые связываются с тем же самым эпитопом, что и антитело к CD79b, предложенное в данном документе. Например, в некоторых вариантах осуществления предлагается иммуноконъюгат, содержащий антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело против CD79b, содержащее последовательность VH SEQ ID NO: 56 и последовательность VL SEQ ID NO: 57, соответственно.
В дополнительном аспекте изобретения, антитело к CD79b конъюгата антитело-лекарственное средство в соответствии с любым из вышеуказанных вариантов осуществления представляет собой моноклональное антитело, включая человеческое антитело. В одном варианте осуществления, антитело против CD79b конъюгата антитело-лекарственное средство представляет собой фрагмент антитела, например фрагмент Fv, Fab, Fab', scFv, диатело, или F(ab')2. В другом варианте осуществления, антитело представляет собой, по существу, полноразмерное антитело, например антитело IgG1, антитело IgG2a или другой класс антител или изотип, как определено в данном документе.
Таблица последовательностей антитела к CD79b
SEQ ID NO: Описание Последовательность
56 Вариабельная область тяжелой цепи антитела huMA79bv28 к CD79b EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGYTFS SYWIEWVRQA PGKGLEWIGE ILPGGGDTNY NEIFKGRATF SADTSKNTAY LQMNSLRAED TAVYYCTRRV PIRLDYWGQG TLVTVSS
57 Вариабельная область легкой цепи антитела huMA79bv28 к CD79b DIQLTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASQSVD YEGDSFLNWY QQKPGKAPKL LIYAASNLES GVPSRFSGSG SGTDFTLTIS SLQPEDFATY YCQQSNEDPL TFGQGTKVEI KR
58 HVR H1 антитела huMA79bv28 к CD79b GYTFSSYWIE
59 HVR H2 антитела huMA79bv28 к CD79b GEILPGGGDTNYNEIFKG
60 HVR H3 антитела huMA79bv28 к CD79b TRRVPIRLDY
61 HVR L1 антитела huMA79bv28 к CD79b KASQSVDYEGDSFLN
62 HVR L2 антитела huMA79bv28 к CD79b AASNLES
63 HVR L3 антитела huMA79bv28 к CD79b QQSNEDPLT
Аффинность антител
В определенных вариантах осуществления, предложенное в данном документе антитело характеризуется константой диссоциации, составляющей (Kд) ≤1 мкM, ≤100 нМ, ≤50 нМ, ≤10 нМ, ≤ 5 нМ, ≤1 нМ, ≤0,1 нМ, ≤0,01 нМ или ≤0,001 нМ и, необязательно, ≥10-13 M (например, 10-8 M или меньше, например, от 10-8 M до 10-13 M, например, от 10-9 M до 10-13 M).
В одном варианте осуществления, Kд измеряют методом анализа связывания радиоактивно меченого антигена (РИА), выполненного с Fab-версией представляющего интерес антитела и его антигеном, как описано в следующем анализе. Аффинность связывания Fab в растворе в отношении антигена измеряют, уравновешивая Fab минимальной концентрацией (125I)-меченого антигена в присутствии ряда титров немеченого антигена, затем иммобилизируя связанный антиген на покрытой анти-Fab антителом плашке (смотрите, например, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881(1999)). Чтобы установить условия для анализа, многолуночные плашки MICROTITER® (Thermo Scientific) покрывают на ночь 5 мкг/мл захватывающего анти-Fab антитела (Cappel Labs) в 50 мM карбонате натрия (pH 9,6), а после этого блокируют 2% (м/об) бычьим сывороточным альбумином в ФСБ (PBS) в течение от двух до пяти часов при комнатной температуре (около 23°C). В неадсорбирующей плашке (Nunc №269620) смешивают 100 пM или 26 пM [125I]-антигена с серийными разведениями представляющего интерес Fab (например, в соответствии с оценкой анти-VEGF антитела Fab-12 в Presta et al., Cancer Res. 57:4593-4599 (1997)). Затем представляющий интерес Fab инкубируют в течение ночи; при этом инкубация может длиться более долгий период (например, около 65 часов), чтобы гарантировать, что равновесие достигнуто. После этого смеси переносят на плашку для захвата для инкубации при комнатной температуре (например, в течение одного часа). Затем раствор удаляют, а плашку промывают восемь раз 0,1% полисорбатом 20 (TWEEN-20®) в ФСБ (PBS). Когда плашки высыхают, добавляют 150 мкл/лунка сцинтиллятора (MICROSCINT-20 TM; Packard), а плашки считывают на гамма-счетчике TOPCOUNT TM (Packard) в течение десяти минут. Концентрации каждого Fab, которые дают результаты, составляющие 20% или меньше от максимального связывания, отбирают для применения в конкурентном анализе связывания.
В соответствии с другим вариантом осуществления, Kд измеряют методом поверхностного плазмонного резонанса BIACORE®. Например, анализ с применением BIACORE®-2000 или BIACORE®-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ) проводят при 25°C с иммобилизованными антигенными чипами CM5 при около 10 единицах ответа (ЕО). Кратко, биосенсорные чипы с карбоксиметилированным декстраном (CM5, BIACORE, Inc.) активируют N-этил-N'-(3-диметиламинопропил)-карбодиимид гидрохлоридом (ЭДК) и N-гидроксисукцинимидом (NHS) в соответствии с инструкциями поставщика. Антиген разводят 10 мM ацетатом натрия, pH 4,8, до 5 мкг/мл (около 0,2 мкM) перед внесением при скорости потока 5 мкл/минута для достижения около 10 единиц ответа (ЕО) сопряженного белка. После внесения антигена, вносят 1 М этаноламина, чтобы блокировать непрореагировавшие группы. Для кинетических измерений двукратные серийные разведения Fab (от 0,78 нM до 500 нM) вносят в ФСБ (PBS) с 0,05% сурфактантом полисорбатом 20 (TWEEN-20TM) (PBSТ) при 25°C при скорости потока приблизительно 25 мкл/мин. Скорости ассоциации (kасс) и скорости диссоциации (kдисс) рассчитывают, применяя простую взаимно однозначную модель связывания Лэнгмюра (программное обеспечение для оценки BIACORE® версия 3.2), путем одновременной подгонки сенсограмм ассоциации и диссоциации. Равновесную константу диссоциации (Kд) рассчитывают как соотношение kасс/kдисс. См., например, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999). Если скорость ассоциации превышает 106 M-1с-1 согласно данным вышеописанного поверхностного плазмонного резонанса, то скорость ассоциации можно определить при помощи метода гашения флуоресценции, в котором измеряют повышение или снижение интенсивности флуоресценции (возбуждение=295 нм; излучение=340 нм, 16 нм полоса пропускания) при 25°C для 20 нM антитела к антигену (Fab-формы) в ФСБ (PBS), pH 7,2, в присутствии увеличивающихся концентраций антигена, измеряемое при помощи спектрометра, такого как спектрофотометр с возможностью остановки потока (Aviv Instruments) или спектрофотометр серии 8000 SLM-AMINCO TM (ThermoSpectronic) с кюветой с перемешиванием.
Фрагменты антител
В определенных вариантах осуществления, предложенное в данном документе антитело представляет собой фрагмент антитела. Фрагменты антител включают, но не ограничиваются лишь этими: фрагменты Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv и scFv, а также другие фрагменты, описанные ниже. Обзор некоторых фрагментов антител смотрите в Hudson et al. Nat. Med. 9:129-134 (2003). Обзор фрагментов scFv смотрите, например, в Pluckthün, в The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York), pp. 269-315 (1994); также смотрите WO 93/16185; и патенты США № 5571894 и 5587458. Обсуждение фрагментов Fab и F(ab')2, содержащих остатки эпитопа связывания рецептора реутилизации и имеющих увеличенное in vivo время полужизни, смотрите в патенте США № 5869046.
Диатела представляют собой фрагменты антител с двумя антигенсвязывающими участками, которые могут быть бивалентными или биспецифическими. Смотрите, например, EP 404,097; WO 1993/01161; Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003); и Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993). Триатела и тетратела также описаны в Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003).
Однодоменные антитела представляют собой фрагменты антител, содержащие весь или часть вариабельного домена тяжелой цепи, или весь или часть вариабельного домена легкой цепи антитела. В определенных вариантах осуществления, однодоменное антитело является человеческим однодоменным антителом (Domantis, Inc., Waltham, MA; смотрите, например, патент США № 6248516 B1).
Фрагменты антител можно получать различными методами, включая, но не ограничиваясь лишь этими: протеолитическое расщепление интактного антитела, а также получение рекомбинантных клеток-хозяев (например, E. coli или фага), как описано в данном документе.
Химерные и гуманизированные антитела
В определенных вариантах осуществления, предложенное в данном документе антитело представляет собой химерное антитело. Некоторые химерные антитела описаны, например, в патенте США № 4816567; и Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)). В одном примере, химерное антитело содержит нечеловеческую вариабельную область (например, вариабельную область, полученную от мыши, крысы, хомяка, кролика или низшего примата, такого как обезьяна) и человеческую константную область. В дополнительном примере, химерное антитело является антителом с «переключенным классом», у которого класс или подкласс был изменен по сравнению с исходным антителом. Химерные антитела включают их антигенсвязывающие фрагменты.
В определенных вариантах осуществления, химерное антитело является гуманизированным антителом. Как правило, нечеловеческое антитело гуманизируют для снижения иммуногенности для человека, сохраняя при этом специфичность и аффинность исходного нечеловеческого антитела. В целом, как правило, гуманизированное антитело содержит один или больше вариабельных доменов, в которых HVR, например, CDR (или их часть), получены из нечеловеческого антитела, а FR (или их часть) получены из последовательностей человеческого антитела. Необязательно, гуманизированное антитело содержит также по меньшей мере часть человеческой константной области. В некоторых вариантах осуществления, некоторые остатки FR в гуманизированном антителе замещены соответствующими остатками из нечеловеческого антитела (например, антитела, из которого получены остатки HVR), например, для восстановления или улучшения специфичности или аффинности антитела.
Гуманизированные антитела и способы их получения описаны, например, в Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008), и дополнительно описаны, например, в Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988); Queen et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 86:10029-10033 (1989); патентах США № 5821337, 7527791, 6982321 и 7087409; Kashmiri et al., Methods 36:25-34 (2005) (описывается прививание определяющей специфичность области (SDR (a-CDR))); Padlan, Mol. Immunol. 28:489-498 (1991) (описывается «изменение поверхности»); Dall'Acqua et al., Methods 36:43-60 (2005) (описывается «перетасовка FR»); и Osbourn et al., Methods 36:61-68 (2005) и Klimka et al., Br. J. Cancer, 83:252-260 (2000) (описывается подход «управляемая селекция» для перетасовки FR).
Человеческие каркасные области, которые можно применять для гуманизации, включают, но не ограничиваются лишь этими: каркасные области, выбранные методом «наилучшего соответствия» (смотрите, например, Sims et al. J. Immunol. 151:2296 (1993)); каркасные области, полученные из консенсусной последовательности человеческих антител конкретной подгруппы вариабельных областей легкой или тяжелой цепей (смотрите, например, Carter et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992); и Presta et al. J. Immunol., 151:2623 (1993)); человеческие зрелые (соматически мутированные) каркасные области или каркасные области человеческой зародышевой линии (смотрите, например, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)); и каркасные области, полученные путем скрининга библиотек FR (смотрите, например, Baca et al., J. Biol. Chem. 272:10678-10684 (1997) и Rosok et al., J. Biol. Chem. 271:22611-22618 (1996)).
Человеческие антитела
В определенных вариантах осуществления, предложенное в данном документе антитело представляет собой человеческое антитело. Человеческие антитела можно получать различными известными в данной области техники методами. Общее описание человеческих антител приведено в van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5: 368-74 (2001) и Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008).
Человеческие антитела можно получать путем введения антигена трансгенному животному, которое было модифицировано для выработки интактных человеческих антител или интактных антител с человеческими вариабельными областями в ответ на стимуляцию антигеном. Такие животные, как правило, содержат все или часть локусов человеческого иммуноглобулина, которые замещают эндогенные локусы иммуноглобулина или которые находятся во внехромосомном пространстве или случайным образом интегрированы в хромосомы животного. У таких трансгенных мышей эндогенные локусы иммуноглобулина в целом, как правило, инактивированы. Обзор способов получения человеческих антител от трансгенных животных смотрите в Lonberg, Nat. Biotech. 23:1117-1125 (2005). Также смотрите, например, патенты США № 6075181 и 6150584, описывающие технологию XENOMOUSETM; патент США № 5770429, описывающий технологию HUMAB®; патент США № 7041870, описывающий технологию K-M MOUSE®, и заявку на патент США № US 2007/0061900, описывающую технологию VelociMouse®). Человеческие вариабельные области из интактных анитител, вырабатываемые такими животными, можно дополнительно модифицировать, например, комбинируя с разными человеческими константными областями.
Человеческие антитела также можно получать способами на основе гибридом. Были описаны клеточные линии человеческой миеломы и мышино-человеческой гетеромиеломы для получения человеческих моноклональных антител. (Смотрите, например, Kozbor J. Immunol., 133: 3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987); и Boerner et al., J. Immunol., 147: 86 (1991).) Человеческие антитела, полученные с использованием технологии человеческой В-клеточной гибридомы, описаны в Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:3557-3562 (2006). Дополнительные способы включают описанные, например, в патенте США № 7189826 (описывающем получение моноклональных человеческих антител IgM из гибридомных клеточных линий) и Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4):265-268 (2006) (описывающей человек-человеческие гибридомы). Технология человеческих гибридом (технология триом) также описана в Vollmers and Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3):927-937 (2005) и Vollmers and Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3):185-91 (2005).
Человеческие антитела также можно получать путем выделения последовательностей вариабельного домена Fv-клона из библиотек фагового дисплея человеческого происхождения. Затем такие последовательности вариабельного домена можно комбинировать с желаемым человеческим константным доменом. Методы отбора человеческих антител из библиотек антител описаны ниже.
Полученные из библиотек антитела
Антитела согласно изобретению можно выделять путем скрининга комбинаторных библиотек для антител с необходимой активностью или необходимыми активностями. Например, в данной области техники известно множество способов создания библиотек фагового дисплея и скрининга таких библиотек в отношении антител, обладающих необходимыми характеристиками связывания. Обзор таких способов приведен, например, в Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001) и дополнительно описан, например, в McCafferty et al., Nature 348:552-554; Clackson et al., Nature 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992); Marks and Bradbury, in Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004); и Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132(2004).
В некоторых способах фагового дисплея наборы генов VH и VL отдельно клонируют при помощи полимеразной цепной реакции (ПЦР) и повторно комбинируют случайным образом в фаговых библиотеках, которые затем можно исследовать в отношении антигенсвязывающего фага, как описано в Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 (1994). Фаг, как правило, представляет фрагменты антител, как одноцепочечные фрагменты Fv (scFv), так и фрагменты Fab. Библиотеки из иммунизированных источников обеспечивают высокоаффинные антитела к иммуногену, не требуя конструирования гибридом. В альтернативном варианте, можно клонировать первичный набор (например, из человека), чтобы обеспечить единый источник антител к широкому диапазону чужих, а также своих антигенов без какой-либо иммунизации, как описано в Griffiths et al., EMBO J, 12: 725-734 (1993). И наконец, первичные библиотеки также можно создавать синтетически, клонируя неперестроенные V-генные сегменты из стволовых клеток и используя ПЦР-праймеры, содержащие случайную последовательность, для кодирования высоковариабельных областей CDR3 и для осуществления перестройки in vitro, как описано Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 (1992). Патентные публикации, описывающие фаговые библиотеки человеческих антител, включают, например: патент США № 5750373 и публикации патентов США № 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 и 2009/0002360.
Антитела или фрагменты антител, выделенные из библиотек человеческих антител, считаются в данном документе человеческими антителами или фрагментами человеческих антител.
Мультиспецифические антитела
В некоторых вариантах осуществления, антитело является мультиспецифическим антителом, например, биспецифическим антителом. Мультиспецифические антитела представляют собой моноклональные антитела, которые обладают специфичностью связывания в отношении по меньшей мере двух разных участков. В некоторых вариантах осуществления, биспецифические антитела могут связываться с двумя разными эпитопами одной и той же цели. Биспецифические антитела могут также быть применены для переноса цитотоксических средств к клеткам, который экспрессируют мишень. Биспецифические антитела могут быть приготовлены как полноразмерные антитела или фрагменты антитела.
Методы получения мультиспецифических антител включают, но не ограничиваются лишь этими: рекомбинантную коэкспрессию двух пар «тяжелой цепи-легкой цепи» иммуноглобулина, имеющих различные специфичности (см. Milstein and Cuello, Nature 305: 537 (1983)), WO 93/08829, and Traunecker et al., EMBO J. 10: 3655 (1991)), и принцип «выступ-во-впадину» (см., например, патент США № 5731168). Упоминаемый в данном документе термин технология «выступ-во-впадину» или «KnH» относится к технологии управления спариванием двух полипептидов in vitro или in vivo путем внесения выпуклости (выступа) в один полипептид и углубления (впадины) в другой полипептид на поверхности контакта, где происходит их взаимодействие. Например, KnH вносили в поверхность связывания Fc:Fc, поверхности контакта CL:CH1 или поверхности контакта VH/VL антител (например, US 2011/0287009, US2007/0178552, WO 96/027011, WO 98/050431, Zhu et al., 1997, Protein Science 6:781-788, and WO2012/106587). В некоторых вариантах осуществления, KnH управляет спариванием двух разных тяжелых цепей во время получения мультиспецифических антител. Например, мультиспецифические антитела, содержащие KnH в Fc-областях, могут дополнительно содержать одиночные вариабельные домены, связанные с каждой Fc-областью, или дополнительно содержать разные вариабельные домены тяжелой цепи, которые спариваются со сходными или разными вариабельными доменами легкой цепи. Технологию KnH также можно применять для спаривания внеклеточных доменов двух разных рецепторов или каких-либо других полипептидных последовательностей, которые содержат разные распознающие мишень последовательности (например, включая аффитела, пептитела и другие продукты гибридные Fc).
Как используется в данном документе, термин «мутация выступа» относится к мутации, которая вносит выпуклость (выступ) в полипептид в области взаимодействия, в которой полипептид взаимодействует с другим полипептидом. В некоторых вариантах осуществления, другой полипептид имеет мутацию с углублением.
Как используется в данном документе, термин «мутация впадины» относится к мутации, которая вносит углубление (впадину) в полипептид в области взаимодействия, в которой полипептид взаимодействует с другим полипептидом. В некоторых вариантах осуществления, другой полипептид имеет мутацию в выступе.
Ниже приводится краткое неограничивающее обсуждение.
«Выпуклостью» называется по меньшей мере одна аминокислотная боковая цепь, которая выступает с поверхности области взаимодействия первого полипептида и, следовательно, может размещаться в компенсирующем углублении смежной поверхности области взаимодействия (т.е. поверхности области взаимодействия второго полипептида) так, чтобы стабилизировать гетеромультимер и тем самым способствовать, например, образованию гетеромультимера но не образованию гомомультимера. Выпуклость может находиться на исходной поверхности области взаимодействия или может быть привнесена синтетически (например, путем изменения нуклеиновой кислоты, кодирующей поверхность области взаимодействия). В некоторых вариантах осуществления, чтобы кодировать выпуклость, изменяют нуклеиновую кислоту, кодирующую поверхность области взаимодействия первого полипептида. Для достижения этого нуклеиновую кислоту, кодирующую по меньшей мере один «исходный» аминокислотный остаток на поверхности области взаимодействия первого полипептида, заменяют нуклеиновой кислотой, кодирующей по меньшей мере один «вносимый» аминокислотный остаток, который имеет больший объем боковой цепи, чем исходный аминокислотный остаток. Понятно, что может быть больше одного исходного и соответствующего вносимого остатка. Объемы боковых цепей разных аминокислотных остатков показаны например в таблице 1 US2011/0287009. Мутация для внесения «выпуклости» может быть названа как «мутация выступа».
В некоторых вариантах осуществления, вносимыми остатками для образования выпуклости являются аминокислотные остатки природного происхождения, которые выбраны из аргинина (R), фенилаланина (F), тирозина (Y) и триптофана (W). В некоторых вариантах осуществления, вносимыми остатками являются триптофан и тирозин. В некоторых вариантах осуществления, исходный остаток для образования выпуклости имеет небольшой объем боковой цепи, например аланин, аспарагин, аспарагиновая кислота, глицин, серин, треонин или валин.
«Углубление» относится по меньшей мере к одной аминокислотной боковой цепи, которая утоплена в поверхность области взаимодействия второго полипептида и, следовательно, она является совместимой с выпуклостью на смежной поверхности области взаимодействия первого полипептида. Углубление может находиться на исходной поверхности области взаимодействия или может быть привнесено синтетически (например, путем изменения нуклеиновой кислоты, кодирующей поверхность области взаимодействия). В некоторых вариантах осуществления, чтобы кодировать углубление, изменяют нуклеиновую кислоту, кодирующую поверхность области взаимодействия второго полипептида. Для достижения этого нуклеиновую кислоту, кодирующую по меньшей мере один «исходный» аминокислотный остаток на поверхности области взаимодействия второго полипептида, заменяют ДНК, кодирующей по меньшей мере один «вносимый» аминокислотный остаток, который имеет меньший объем боковой цепи, чем исходный аминокислотный остаток. Понятно, что может быть больше одного исходного и соответствующего вносимого остатка. В некоторых вариантах осуществления, вносимыми остатками для образования углубления являются аминокислотные остатки природного происхождения, которые выбраны из аланина (А), серина (S), треонина (Т) и валина (V). В некоторых вариантах осуществления, вносимыми остатками являются серин, аланин или треонин. В некоторых вариантах осуществления, исходный остаток для образования углубления имеет большой объем боковой цепи, например тирозин, аргинин, фенилаланин или триптофан. Мутация для внесения «углубления» может быть названа как «мутация впадины».
Выпуклость является «размещаемой» в углублении обозначает то, что пространственное расположение выпуклости и углубления на поверхности области взаимодействия первого полипептида и второго полипептида, соответственно, совпадает, а размеры выпуклости и углубления являются такими, что выпуклость может расположиться в углублении без существенного нарушения нормальной связи на поверхности области взаимодействия первого и второго полипептидов. Так как выпуклости, такие как Tyr, Phe и Trp, как правило, не перпендикулярны оси поверхности области взаимодействия и имеют предпочтительные конформации, выравнивание выпуклости с соответствующим углублением основано на моделировании пары выпуклость/углубление на основании трехмерной структуры, которую получают методами рентгеновской кристаллографии или ядерного магнитного резонанса (ЯМР). Этого можно достичь, используя широко применяемые в данной области техники методы.
В некоторых вариантах осуществления, мутация выпуклости в константной области IgG1 представляет собой T366W (нумерация по ЕС). В некоторых вариантах осуществления, мутация углубления в константной области IgG1 включает одну или несколько мутаций, выбранных из T366S, L368A и Y407V (нумерация по ЕС). В некоторых вариантах осуществления, мутация углубления в константной области IgG1 представляет собой T366S, L368A и Y407V (нумерация по ЕС).
В некоторых вариантах осуществления, мутация выпуклости в константной области IgG4 представляет собой T366W (нумерация по ЕС). В некоторых вариантах осуществления, мутация углубления в константной области IgG4 включает одну или несколько мутаций, выбранных из T366S, L368A и Y407V (нумерация по ЕС). В некоторых вариантах осуществления, мутация углубления в константной области IgG4 представляет собой T366S, L368A и Y407V (нумерация по ЕС).
Мультиспецифические антитела могут быть также получены с помощью метода конструирования с использованием эффекта электростатического взаимодействия для получения Fc-гетеродимерных молекул антител (WO 2009/089004A1); с помощью сшивания двух или больше антител или их фрагментов (см., например, патент США № 4676980 и Brennan et al., Science, 229: 81 (1985)); с помощью лейциновых молний для продукции биспецифических антител (см., например, Kostelny et al., J. Immunol., 148(5):1547-1553 (1992)); с помощью технологии «диатела» для получения биспецифических фрагментов антител (см., например, Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)); и с использованием одноцепочечных Fv (SFV)-димеров (см., например, Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 (1994)); и путем приготовления триспецифичных антител, как описано, например, в Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991).
В данный документ также включены сконструированные антитела с тремя или больше функциональными сайтами связывания антигена, включая «антитела Octopus» (см., например, US 2006/0025576A1).
В данном документе антитела или фрагменты антител также могут включать «FAb двойного действия» или «DAF», содержащий антигенсвязывающий сайт, который связывается с мишенью, а также с другим, отличным антигеном (смотрите, например, US 2008/0069820).
Варианты антител
В некоторых вариантах осуществления, предложены варианты аминокислотной последовательности антител, которые предоставлены в настоящем документе. Например, это может быть желательным для улучшения аффинности связывания и/или других биологических свойств антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела могут быть подготовлены с помощью внесения подходящих модификаций в нуклеотидную последовательность, которая кодирует антитело, или с помощью пептидного синтеза. Такие модификации включают, например, делеции, и/или инсерции и/или замены остатков в аминокислотной последовательности антитела. Может быть сделано любое сочетание делеции, вставки и замены, чтобы достичь конечной конструкции, при условии, что конечная конструкция обладает нужными характеристиками, например, связыванием антигена.
Варианты замены, вставки и делеции
В некоторых вариантах осуществления, предлагаются варианты антитела, которые имеют одну или более аминокислотных замен. Сайты интереса для замещающего мутагенеза включают HVR и FR. Консервативные замены показаны в таблице 1 под заголовком «предпочитаемые замены». Больше существенных изменений предлагается в таблице 1 под заголовком «типичные замены», и как дополнительно описано ниже со ссылкой на классы аминокислотных боковых цепей. Аминокислотные замены могут быть внесены в антитело интереса, и продукты проскринированы на наличие желаемой активности, например, сохраненное/улучшенное связывания антигена, сниженная иммуногенность, или улучшенный АЗКЦ или КЗЦ.
Таблица 1
Исходный
остаток		 Типичные
замены		 Предпочтительные
замены
Ala (A) Val; Leu; Ile Val
Arg (R) Lys; Gln; Asn Lys
Asn (N) Gln; His; Asp, Lys; Arg Gln
Asp (D) Glu; Asn Glu
Cys (C) Ser; Ala Ser
Gln (Q) Asn; Glu Asn
Glu (E) Asp; Gln Asp
Gly (G) Ala Ala
His (H) Asn; Gln; Lys; Arg Arg
Ile (I) Leu; Val; Met; Ala; Phe; Norleucine Leu
Leu (L) Norleucine; Ile; Val; Met; Ala; Phe Ile
Lys (K) Arg; Gln; Asn Arg
Met (M) Leu; Phe; Ile Leu
Phe (F) Trp; Leu; Val; Ile; Ala; Tyr Tyr
Pro (P) Ala Ala
Ser (S) Thr Thr
Thr (T) Val; Ser Ser
Trp (W) Tyr; Phe Tyr
Tyr (Y) Trp; Phe; Thr; Ser Phe
Val (V) Ile; Leu; Met; Phe; Ala; Norleucine Leu
Аминокислоты могут быть сгруппированы в соответствии со свойствами общей боковой цепи:
1) гидрофобные: Norleucine, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
2) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
3) кислые: Asp, Glu;
4) основные: His, Lys, Arg;
5) остатки которые влияют на ориентацию цепи: Gly, Pro;
6) ароматические: Trp, Tyr, Phe.
Неконсервативные замены повлекут за собой замену члена одного из этих классов на другой класс.
Один тип варианта замещения предполагает замены одного или более остатков гипервариабельной области исходного антитела (например гуманизированное или человеческое антитело). В целом, как правило, полученный вариант(ы), выбранный(е) для дополнительного исследования, будет(ут) иметь модификации (например, улучшения) определенных биологических свойств (например, повышенное сродство, сниженная иммуногенность) относительно исходного антитела, и/или будет(ут) иметь существенно сохраненные определенные биологические свойства исходного антитела. Типичный вариант замещения представляет собой антитело с созревшей аффинностью, которое может быть произведено удобным способом, например, применяя технологии созревания аффинности основанные на фаг-дисплее, такие как те, что были описаны в настоящем документе. Кратко, один или более HVR остатков мутируют, а вариант антитела выставляют на фаге, и проводят скрининг для конкретной биологической активности (например, аффинность связывания).
Изменения (например, замены) могут быть сделаны в HVR, например, чтобы улучшить аффинность антитела. Такие изменения могут быть сделаны в «горячих точках» HVR, например, остатках, которые кодируются кодонами, что подвергаются мутации с высокой частотой во время процесса соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)), и/или остатках, которые контактируют с антигеном (SDRs (a-CDRs)), с проведением тестирования аффинности связывания полученных вариантов VH или VL. Созревание аффинности, с помощью конструирования и повторного отбора из вторичных библиотек было описано, например, в Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001).) В некоторых вариантах осуществления созревания аффинности, вносится разнообразие в вариабельные гены, которые выбраны для созревания с помощью любого из множества способов (например, вносящая ошибки ПЦР, перетасовывание цепей, или олигонуклеотид-направленный мутагенез). Затем создается вторичная библиотека. Затем проводят скрининг библиотеки чтобы идентифицировать варианты антитела с желаемой аффинностью. Другие способы внесения разнообразия предполагают HVR-направленные подходы, в которых несколько HVR остатков (например, 4-6 остатков за раз) подвергаются рандомизации. HVR остатки, которые вовлечены в антигенное связывание, могут быть специфически идентифицированы, например, используя сканирование с помощью аланинового мутагенеза, или моделирование. CDR-H3, и CDR-L3 в частности, часто становятся мишенями.
В некоторых вариантах осуществления, замены, инсерции, или делеции могут случатся в одном или более HVR до тех пор пока такие изменения существенно не снижают способность антитела связывать антиген. Например, могут быть произведены консервативные изменения в HVR (например, консервативные замены, как указано в настоящем документе), которые существенно не снижают аффинность связывания. Такие изменения могут быть вне HVR «горячих точек» или SDR. В некоторых вариантах осуществления вариантов последовательностей VH и VL, которые представлены выше, каждый HVR, или является неизменяемым, или содержит не больше чем одну, две или три аминокислотных замены.
Полезным способом для идентификации остатков, или областей антитела, которые могут быть целями для мутагенеза, называется «аланин-сканирующий мутагенез», как описано Cunningham and Wells (1989) Science, 244:1081-1085. В этом способе, остаток или группа целевых остатков (например, заряженные остатки такие как Аrg, Аsp, His, Lys, и Glu) определяется и заменяется на нейтральные или негативно заряженные аминокислоты (например, аланин или полиаланин), чтобы определить затрагивается ли взаимодействие антитела с антигеном. Дополнительные замены могут быть введены в аминокислотные местоположения, которые демонстрируют функциональную чувствительность к начальным заменам. В альтернативном варианте, или дополнительно, может быть определена кристаллическая структура комплекса антиген-антитело для идентификации точек контакта между антителом и антигеном. Такие контактные остатки и соседние остатки могут быть сделаны мишенями, или исключены в качестве кандидатов для замены. Могут быть проскринированы варианты, чтобы определить, содержат ли они нужные свойства.
Аминокислотная последовательность вставок включают амино- и/или карбоксильные-концевые объединения, колеблясь в длине от одного остатка до полипептидов, которые содержат сто или больше остатков, также как и инсерции одного или нескольких аминокислотных остатков внутри последовательности. Примеры концевых вставок включают антитело с N-концевым метионильным остатком. Другие инсерционные варианты молекулы антитела включают слияние N- или C-конца антитела с ферментом (например, для ADEPT) или полипептидом, который увеличивает сывороточный период полувыведения антитела.
Варианты гликозилирования
В некоторых вариантах осуществления, антитело, которое предлагается в настоящем документе изменяют, чтобы увеличить или уменьшить степень, до которой антитело гликозилировано. Добавление или удаление сайтов гликозилирования антитела может быть удобно сделано изменением аминокислотной последовательности, таким образом, что создается или удаляется один или больше сайтов гликозилирования.
Может быть изменен карбогидрат, который прикреплен к Fc-области, которую содержит антитело. Нативные антитела, которые произведены клетками млекопитающего, как правило, содержат разветвленный, двухантенный олигосахарид, который в целом, как правило прикреплен N-связью к Asn297 CH2 домена Fc области. См., например, Wright et al., TIBTECH 15:26-32 (1997). Олигосахарид может включать различные карбогидраты, например, маннозу, N-ацетил глюкозамин (GlcNAc), галактозу, и сиаловую кислоту, так же как и фукозу, которая прикреплена к GlcNAc в «стебель» двухантенной олигосахаридной структуры. В некоторых вариантах осуществления, модификации олигосахарида в антителе, согласно данному изобретению, могут быть сделаны для того, чтобы создать варианты антител с определенными улучшенными свойствами.
В одном варианте осуществления, предлагаемые варианты антитела имеют карбогидратную структуру, что не имеет фукозы, и эта структура прикреплена (прямо или непрямо) к Fc области. Например, количество фукозы в таком антителе может быть от 1% до 80%, од 1% до 65%, от 5% до 65% или от 20% до 40%. Количество фукозы определяется из расчета среднего количества фукозы в цепи сахара в Asn297, относительно суммы глюкоструктур, которые прикреплены к Asn 297 (например, комплексные, гибридные и высоко манозные структуры) как измерено с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии, как описано, например, в WO 2008/077546. Asn297 относится к аспарагиновому остатку, который размещен около в положении 297 в Fc области (ЕС нумерация остатков Fc области); однако, Asn297 может также быть расположен около ±3 аминокислоты выше или ниже позиции 297, например, между позициями 294 и 300, из-за незначительных вариаций последовательности в антителах. Такие варианты фукозилирования могут иметь улучшенную функцию АЗКЦ. См., например, публикации патентных заявок США № US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примеры публикаций, которые связаны с «дефукозилироваными» или «фукоз-лишенными» вариантами антитела включают: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO2005/053742; WO2002/031140; Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004). Примеры клеточных линий, способных продуцировать дефукозилированые антитела, включают Lec13 CHO клетки, которые лишены фуколизирования белков (Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986); US Pat Appl No US 2003/0157108 A1, Presta, L; и WO 2004/056312 A1, Adams et al., особенно в примере 11), и нокаутные клеточные лини, такие как альфа-1,6-фукозилтрансферазный ген, FUT8, нокаутные CHO клетки (см., например, Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004); Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006); и WO2003/085107).
Дополнительно предлагаются варианты антител с разделенными олигосахаридами, например, в которых двухантенный олигосахарид, который прикреплен к Fc области антитела, разделен GlcNAc. Такие варианты антитела могут уменьшить фукозилирование и/или улучшить АЗКЦ функцию. Примеры таких вариантов антитела описаны, например, в WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.); US Patent No. 6,602,684 (Umana et al.); и US 2005/0123546 (Umana et al.). Предлагаются также варианты антитела по меньшей мере с одним галактозным остатком в олигосахариде, который прикреплен к Fc области. Такие варианты антитела могут улучшить функции КЗЦ. Такие варианты антитела описаны, например, в WO 1997/30087 (Patel et al.); WO 1998/58964 (Raju, S.); и WO 1999/22764 (Raju, S.).
Варианты Fc области
В некоторых вариантах осуществления, может быть введена одна или более аминокислотных модификаций в Fc область антитела, которое предлагается в настоящем документе, тем самым порождая варианты Fc области. Вариант Fc области может содержать последовательность человеческой Fc области (например, человеческую IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 Fc область), которая содержит аминокислотные модификации (например, замены) в одной, или больше аминокислотных позициях.
В некоторых вариантах осуществления, изобретение предусматривает вариант антитела, которое обладает некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, которые делают его желательным кандидатом для приложений, в которых важен период полувыведения антитела in vivo, тем не менее определенные эффекторные функции (такие как комплемент и АЗКЦ) являются ненужными или вредными. Может быть проведен анализ цитотоксичности in vitro и/или in vivo, чтобы подтвердить уменьшение/истощение КЗЦ и/или АЗКЦ активностей. Например, могут быть проведены анализы связывания Fc рецептора (FcR), чтобы гарантировать, что антитело утратило FcγR связывания (отсюда, скорее всего, не хватает активность АЗКЦ), но сохраняет способность связываться с FcRn. Первичные клетки для опосредования АЗКЦ, NK клетки, экспрессируют только FcγRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcγRI, FcγRII и FcγRIII. FcR экспрессия на гематопоетических клетках резюмирована в таблице 3 на странице 464 Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991). Неограничивающие примеры in vitro анализа для оценки АЗКЦ активности молекулы интереса описаны в патенте США № 5500362 (см., например, Hellstrom, I. et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83:7059-7063 (1986)) and Hellstrom, I et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82:1499-1502 (1985); 5,821,337 (смотрите Bruggemann, M. et al., J. Exp. Med. 166:1351-1361 (1987)). В альтернативном варианте, могут быть использованы нерадиоактивные способы анализа (см., например, ACTI™ нерадиоактивный анализ цитотоксичности для проточной цитометрии (CellTechnology, Inc. Маунтин Вью Калифорния; и CytoTox 96® нерадиоактивный анализ цитотоксичности (Promega, Мэдиссон, Висконсин). Полезные эффекторные клетки для таких анализов включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК (PBMC)), и клетки естественные киллеры (NK). В альтернативном варианте, или дополнительно может быть оценена АЗКЦ активность молекулы интереса in vivo, например, в животной модели, так как раскрыто в Clynes et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95:652-656 (1998). Анализы связывания C1q могут также проводиться для подтверждения того, что антитело не может связываться с C1q и, следовательно, лишено КЗЦ активности. См., например, C1q и C3c связывания ИФА в WO 2006/029879 и WO 2005/100402. Для оценки активации комплемента может быть выполнен анализ КЗЦ (см., например, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996); Cragg, M.S. et al., Blood 101:1045-1052 (2003); и Cragg, M.S. and M.J. Glennie, Blood 103:2738-2743 (2004)). FcRn связывание и in vivo определение клиренса/полужизни также может быть произведено способами, которые известные в данной области техники (см., например, Petkova, S.B. et al., Int'l. Immunol. 18(12):1759-1769 (2006)).
В некоторых вариантах осуществления, одна или несколько модификаций аминокислот могут быть введены в Fc-часть антитела, представленного в данном документе, для увеличения связывания IgG с неонатальным Fc-рецептором. В некоторых вариантах осуществления, антитело содержит следующие три мутации в соответствии с нумерацией ЕС: M252Y, S254T и T256E («мутация YTE») (патент США № 8697650, см. также Dall'Acqua et al., Journal of Biological Chemistry 281(33):23514-23524 (2006). В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE не влияет на способность антитела связываться с узнаваемым им антигеном. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке в 3 раза по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке в 2 раза по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке в 4 раза по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке по меньшей мере в 5 раз по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. В некоторых вариантах осуществления, мутация YTE увеличивает период полувыведения антитела в сыворотке по меньшей мере в 10 раз по сравнению с нативным (т.е. не-YTE-мутантом) антителом. См., например, патент США № 8697650; см. также Dall'Acqua et al., Journal of Biological Chemistry 281(33):23514-23524 (2006).
В некоторых вариантах осуществления, мутант YTE обеспечивает средство для модуляции активности антитело-зависимой клеточно-опосредованной цитотоксичности (АЗКЦ) антитела. В некоторых вариантах осуществления, мутант YTEO обеспечивает средство для модуляции активности АЗКЦ гуманизированного IgG-антитела, направленного против человеческого антигена. См., например, патент США № 8697650; см. также Dall'Acqua et al., Journal of Biological Chemistry 281(33):23514-23524 (2006).
В некоторых вариантах осуществления, мутант YTE позволяет одновременно модулировать период полувыведения в сыворотке, распределение в тканях и активность антитела (например, активность АЗКЦ IgG-антитела). См., например, патент США № 8697650; см. также Dall'Acqua et al., Journal of Biological Chemistry 281(33):23514-23524 (2006).
Антитела с уменьшенной эффекторной функцией включают те, что имеют в области Fc замены остатков 238, 265, 269, 270, 297, 327 и 329 (патент США № 6737056). Такие Fc-мутанты включают Fc-мутанты с заменами двух или больше аминокислотных остатков в позициях 265, 269, 270, 297 и 327, включая так называемый «DANA» Fc-мутант с заменой аминокислотных остатков 265 и 297 на аланин (патент США № 7332581).
В некоторых вариантах осуществления, пролин в позиции 329 (нумерация ЕС) (P329) человеческой области Fc дикого типа замещен глицином или аргинином, или аминокислотным остатком, достаточно большим для разрушения пролинового стека в пределах области взаимодействия Fc/Fc гамма-рецептора, который образуется между P329 Fc и остатками триптофана W87 и W110 FcgRIII (Sondermann et al.: Nature 406, 267-273 (20 July 2000)). В дополнительном варианте осуществления, по меньшей мере одна дополнительная аминокислотная замена в варианте Fc представляет собой S228P, E233P, L234A, L235A, L235E, N297A, N297D или P331S, и еще в другом варианте осуществления упомянутая, по меньшей мере одна дополнительная аминокислотная замена представляет собой L234A и L235A области Fc IgG1 человека, или S228P и L235E области Fc IgG4 человека, все согласно нумерации ЕС (патент США № 8969526, который включен посредством ссылки в полном объеме).
В некоторых вариантах осуществления, полипептид содержит вариант Fc человеческой области Fc IgG дикого типа, причем полипептид имеет P329 в области Fc человеческого IgG, замещенный глицином, и при этом вариант Fc содержит по меньшей мере две дополнительные аминокислотные замены в L234A и L235A области Fc IgG1 человека, или S228P и L235E области Fc IgG4 человека, и при этом остатки нумеруются в соответствии с нумерацией ЕС (патент США № 8969526, который включен посредством ссылки в полном объеме). В некоторых вариантах осуществления, полипептид, содержащий замены P329G, L234A и L235A (нумерация по ЕС), имеет сниженную аффинность к FcγRIIIA и FcγRIIA человека для понижающей модуляции АЗКЦ до по меньшей мере 20% АЗКЦ, индуцированной полипептидом, содержащим Fc-область дикого типа IgG человека, и/или для понижающей модуляции ADCP (патент США № 8969526, который включен посредством ссылки в полном объеме).
В конкретном варианте осуществления, полипептид, содержащий Fc-вариант полипептида Fc дикого типа человека, содержит тройную мутацию: аминокислотную замену в позиции Pro329, L234A, и мутацию L235A в соответствии с нумерацией ЕС (P329/LALA) (патент США № 8969526 который включен посредством ссылки в полном объеме). В конкретных вариантах осуществления, полипептид содержит следующие аминокислотные замены: P329G, L234A и L235A в соответствии с нумерацией ЕС.
Описаны некоторые варианты антитела с улучшенным или уменьшенным связыванием с FcR. (См., например, патент США № 6737056, WO 2004/056312, и Shields et al., J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001).)
В некоторых вариантах осуществления, вариант антитела содержит область Fc с одной или больше аминокислотными заменами, которые улучшают АЗКЦ, например, заменами в позициях 298, 333 и/или 334 в области Fc (нумерация остатков по ЕС).
В некоторых вариантах осуществления, изменения сделаны в Fc области, которые приводят к измененному (т. е., либо улучшенному, либо уменьшенному) связыванию C1q и/или комплемент-зависимой цитотоксичности (КЗЦ), например, как описано в патенте США № 6194551, WO 99/51642, и Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000).
Антитела с увеличенным временем полувыведения и улучшенным связыванием с неонатальным рецептором Fc (FcRn), который отвечает за перенос материнских IgG к плоду (Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976) и Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)), описаны в US2005/0014934A1 (Hinton et al.). Такие антитела содержат область Fc с одной или больше заменами в них, которые улучшают связывание области Fc с FcRn. Такие варианты Fc включают те, где есть замены по одному или больше остаткам в области Fc: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434, например, замена остатка 434 в области Fc (патент США № 7371826).
Относительно других примеров вариантов области Fc смотрите также Duncan & Winter, Nature 322:738-40 (1988); патент США № 5648260; патент США № 5624821; и WO 94/29351.
Варианты антител с внесенным цистеином
В некоторых вариантах осуществления, может быть желательно создать антитела с введенным цистеином, например, «THIOMAB™» или TDC, в которых один или больше остатков антитела замещены остатками цистеина. В конкретных вариантах реализации изобретения, замещенные остатки встречаются в сайтах антитела, которые доступны для соединения. Таким образом, в результате замены таких остатков на цистеин, реактивные тиольные группы располагаются в доступных местах антитела и могут быть применены для конъюгации антитела с другими компонентами, такими как лекарственные компоненты или линкер-лекарственные компоненты, для создания иммуноконъюгата, как дополнительно описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления, любой один или больше из следующих остатков могут быть замещены цистеином: K149 (нумерация Кабата) легкой цепи; V205 (нумерация Кабата) легкой цепи; A118 (нумерация ЕС) тяжелой цепи; A140 (нумерация ЕС) тяжелой цепи; L174 (нумерация ЕС) тяжелой цепи; Y373 (нумерация ЕС) тяжелой цепи; и S400 (нумерация ЕС) области Fc тяжелой цепи. В конкретных вариантах осуществления, описанные в данном документе антитела содержат замену на цистеин HC-A140C (ЕС). В конкретных вариантах осуществления, описанные в данном документе антитела содержат замену на цистеин LC-K149C (нумерация по Кабату). В конкретных вариантах осуществления, описанные в данном документе антитела содержат замену на цистеин HC-A118C (нумерация по ЕС). Цистеин-внесенные антитела могут быть получены, как описано, например, в патенте США № 7521541.
В некоторых вариантах осуществления, антитело содержит одну из следующих замен на цистеин в тяжелой цепи:
Цепь (HC/LC) Остаток Мутация по ЕС Номер сайта Мутация по Кабату Номер сайта
HC T 114 110
HC A 140 136
HC L 174 170
HC L 179 175
HC T 187 183
HC T 209 205
HC V 262 258
HC G 371 367
HC Y 373 369
HC E 382 378
HC S 424 420
HC N 434 430
HC Q 438 434
В некоторых вариантах осуществления, антитело содержит одну из следующих замен на цистеин легкой цепи:
Цепь (HC/LC) Остаток Мутация по ЕС Номер сайта Мутация по Кабату Номер сайта
LC I 106 106
LC R 108 108
LC R 142 142
LC K 149 149
LC V 205 205
Неограничивающая иллюстративная легкая цепь (LC) K149C hu7C2.v2.2.LA THIOMAB™ имеет аминокислотные последовательности тяжелой цепи и легкой цепи SEQ ID NO: 26 и 30, соответственно. Неограничивающая иллюстративная тяжелая цепь (HC) A118C hu7C2.v2.2.LA THIOMAB™ имеет аминокислотные последовательности тяжелой цепи и легкой цепи SEQ ID NO: 31 и 25, соответственно.
Производные антител
В некоторых вариантах осуществления, антитело, предложенное в данном документе, может быть дополнительно модифицировано для включения дополнительных непротеиногенных компонентов, которые известны в данной области техники и общедоступны. Компоненты, пригодные для получения производных антитела, включают, но не ограничиваются лишь этими: водорастворимые полимеры. Неограничивающие примеры водорастворимых полимеров включают, но не ограничиваются лишь этими: полиэтиленгликоль (ПЭГ (PEG)), сополимеры этиленгликоля/ пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлозу, декстран, поливиниловый спирт, поливинилпирролидон, поли-1,3-диоксолан, поли-1,3,6-триоксан, сополимер этилена с малеиновым ангидридом, полиаминокислоты (либо гомополимеры, либо статистические сополимеры) и декстран или поли(n-винилпирролидон)полиэтиленгликоль, гомополимеры пропиленгликоля, сополимеры полипропиленоксида с этиленоксидом, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их комбинации. Полиэтиленгликоль пропиональдегид может иметь преимущества в производстве благодаря его стабильности в воде. Полимер может быть любой молекулярной массы и может быть разветвленным или неразветвленным. Количество полимеров, присоединенных к антителу может варьировать, и в случае присоединения больше чем одного полимера, молекулы могут быть одинаковыми или разными. В целом, как правило, количество и/или тип полимеров, которые применяются для получения производных, могут быть определены учитывая особенности, включающие, но не ограничивающихся лишь этими: улучшение конкретных свойств или функций антитела, возможное использование производного антитела в терапии при определенных условиях и т. д.
В другом варианте осуществления, предлагаются конъюгаты антитела и непротеиногенного компонента, который может селективно нагреваться путем воздействия радиации. В одном варианте осуществления, непротеиногенный компонент представляет собой углеродную нанотрубку (Kam et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102: 11600-11605 (2005)). Радиация может быть любой длины волны и включает в себя, но не ограничивается лишь этими: длины волн, которые не вредят обычным клеткам, но которые нагревают непротеиногенные компоненты до температуры, при которой клетки проксимальные по отношению к антитело-непротеиногенному компоненту погибают.
Рекомбинантные способы и композиции
Антитела могут быть получены с использованием рекомбинантных способов и композиций, например, как описано в патенте США № 4816567. В одном варианте осуществления, предлагается изолированная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело, описанное в данном документе. Такая нуклеиновая кислота может кодировать аминокислотную последовательность, которая содержит VL, и/или аминокислотную последовательность, которая содержит VH антитела (например, легкие и/или тяжелые цепи антитела). В дополнительном варианте осуществления, предлагается один или больше векторов (например, экспрессионные векторы), которые содержат такую нуклеиновую кислоту. В дополнительном варианте осуществления, предлагается клетка-хозяин, которая содержит такую нуклеиновую кислоту. В одном таком варианте осуществления, клетка-хозяин содержит (например, трансформирована): 1) вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела; или 2) первый вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и второй вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела. В одном варианте осуществления, клетка-хозяин представляет собой эукариотическую клетку, например, клетку яичников китайского хомячка (CHO) или лимфоидную клетку (например, Y0, NS0, Sp20 клетку). В одном варианте осуществления, предложен способ получения антитела, в котором способ включает культивирование клетки-хозяина, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, как предложено выше, в условиях, подходящих для экспрессии антитела, и при необходимости восстановления антитела из клетки-хозяина (или среды для культивирования клетки-хозяина).
Для рекомбинантного получения антитела, нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, например, как описано выше, выделяют и встраивают в один или больше векторов для дальнейшего клонирования и/или экспрессии в клетке-хозяине. Такая нуклеиновая кислота может быть легко выделена и секвенирована с использованием обычных процедур (например, с использованием олигонуклеотидных зондов, которые способны к специфическому связыванию с генами, кодирующими тяжелую и легкую цепи антитела).
Клетки-хозяева, подходящие для клонирования или экспрессии кодирующих антитела векторов, включают прокариотические или эукариотические клетки, описанные в данном документе. Например, антитела могут быть получены в бактериях, в частности, когда гликозилирование и эффекторная функция Fc не требуются. Для экспрессии фрагментов антител и полипептидов в бактериях см., например, патенты США № 5648237, 5789199, и 5840523. (См. также Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 2003), pp. 245-254, описывающие экспрессию фрагментов антител в E. coli.). После экспрессии антитело может быть выделено из массы бактериальных клеток в растворимой фракции и может быть в дальнейшем очищено.
В дополнение к прокариотам, эукариотические микроорганизмы, такие как мицелиальные грибы или дрожжи, являются подходящими хозяевами для клонирования или экспрессии кодирующих антитела векторов, включая штаммы грибов и дрожжей, чьи пути гликозилирования были «гуманизированы», приводя к получению антитела с частично или полностью человеческим профилем гликозилирования. См. Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004), and Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006).
Клетки-хозяева, подходящие для экспрессии гликозилированного антитела, также получены от многоклеточных организмов (беспозвоночных и позвоночных). Примеры клеток беспозвоночных включают клетки растений и насекомых. Были идентифицированы многочисленные штаммы бакуловирусов, которые могут применяться совместно с клетками насекомых, в частности, для трансфекции клеток Spodoptera frugiperda.
Культуры клеток растений могут также применяться в качестве хозяев. См., например, патенты США № 5959177, 6040498, 6420548, 7125978, и 6417429 (описывающие технологию PLANTIBODIESTM для получения антител в трансгенных растениях).
Клетки позвоночных могут также использоваться в качестве хозяев. Например, могут быть полезны линии клеток млекопитающих, которые адаптированы к росту в суспензии. Другими примерами используемых линий клеток-хозяев млекопитающих являются: линия CV1 почки обезьяны, трансформированная SV40 (COS-7); линия клеток эмбриональной почки человека (293 или 293 клетки, как описано, например, в Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977)); клетки почки детеныша хомячка (BHK); клетки Сертоли мыши (клетки TM4, описанные, например, в Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980); клетки почки обезьяны (CV1); клетки почки африканской зеленой мартышки (VERO-76); клетки карциномы шейки матки человека (HELA); клетки почки собаки (MDCK); клетки печени крысы линии buffalo (BRL 3A); клетки легкого человека (W138); клетки печени человека (Hep G2); опухоль молочной железы мыши (MMT 060562); клетки TRI, описанные, например, в Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982); клетки MRC 5; и клетки FS4. Другие полезные линии клеток-хозяев млекопитающих включают клетки яичника китайского хомячка (CHO), включающие DHFR- CHO клетки (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); и линии клеток миеломы, такие как Y0, NS0 и Sp2/0. Для обзора некоторых линий клеток-хозяев млекопитающих, подходящих для получения антител, см., например, Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003).
Моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые лекарственные компоненты
Конъюгат антитело-лекарственное средство согласно настоящему изобретению содержит моноалкилирующий пирролбензодиазепиновый лекарственный компонент, дериватизированный по группе N10 дисульфидным линкером к антителу.
Были подготовлены иллюстративные моноалкилирующие пирролбензодиазепиновые (ПБД (PBD)) компоненты, представленные в таблице 1а.
Таблица 1а. Моноалкилирующие пирролбензодиазепиновые лекарственные компоненты
Номер Структура Название IUPAC ЖХ/МС
М+Н
DM-1
Figure 00000005
 (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[е]пирроло[1,2-а][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-2,3-дигидро-1Н-бензо[е]пирроло[1,2-а][1,4] диазепин-5(11aH)-он 587
DM-2
Figure 00000006
 (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-2,3-дигидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5,11(10H,11aH)-дион 601
DM-3
Figure 00000007
 (S)-8-метокси-9-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-1,3,4,12a-тетрагидро-6H-бензо[e][1,4]оксазино[4,3-a][1,4]диазепин-6,12(11H)-дион 605
DM-4
Figure 00000008
 (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-один 584
DM-5
Figure 00000009
 (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-один 572
Таблица 1b. Компараторные лекарственные компоненты
соединение
Номер		 Структура Название IUPAC
C-1
Figure 00000010
 (11aS,11a'S)-8,8'-(пентан-1,5-диилбис(окси))бис(7-метокси-2-метилен-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-он)
C-2
Figure 00000011
 (S)-7,8-диметокси-2-метилен-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-он
C-3
Figure 00000012
 (11aS,11a'S)-8,8'-(пентан-1,5-диилбис(окси))бис(7-метокси-2-метилен-1,2,3,10,11,11a-гексагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-он)
Моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые линкер-лекарственные промежуточные соединения
Конъюгат антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) по изобретению может быть получен путем конъюгации моноалкилирующего пирролбензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения с антителом. Тиопиридильную группу линкер-лекарственного промежуточного соединения вытесняют тиолом цистеина антитела с образованием дисульфид-связанного КАЛС (ADC).
Моноалкилирующее пирролобензодиазепиновое линкер-лекарственное промежуточное соединение имеет формулу I:
Figure 00000013
I
где X
Figure 00000003
Y выбраны из CH2-CH2, CH=CH, C(=O)-NH, и CH2-NH;
A представляет собой 5-членное или 6-членное гетероциклическое кольцо, необязательно замещенное группой, выбранной из F, C1-C6 алкила, и =C(R)2, где R независимо выбран из H, F, C1-C6 алкила, и C1-C6 фторалкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H и C1-C6-алкила, или R1 и R2 образуют 3, 4, 5 или 6-членную циклоалкильную или гетероциклильную группу;
R3 независимо выбран из NO2, Cl, F, CN, CO2H и Br; и
m равно 0, 1 или 2.
В иллюстративном варианте осуществления, А представляет собой 5-членное кольцо.
В иллюстративном варианте осуществления, А представляет собой 5-членное кольцо с экзоциклической метиленовой группой, =CH2.
В иллюстративном варианте осуществления, А представляет собой 6-членное кольцо.
В иллюстративном варианте осуществления, А представляет собой морфолинильное кольцо.
В иллюстративном варианте осуществления, R1 представляет собой -CH3, и R2 представляет собой H.
В иллюстративном варианте осуществления, R1 и R2 образуют циклопропил или циклобутил.
В иллюстративном варианте осуществления, R3 представляет собой -NO2 и m равно 1.
В иллюстративном варианте осуществления, X
Figure 00000003
Y представляет собой CH2-CH2 или CH=CH.
В иллюстративном варианте осуществления, X
Figure 00000003
Y представляет собой C(=O)-NH или CH2-NH.
Типичным вариантом реализации моноалкилирующего пирролобензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения является формула Ia:
Figure 00000014
Ia
В иллюстративном варианте осуществления, R4 и R5 каждый представляют собой H.
В иллюстративном варианте осуществления, R4 и R5 представляют собой =O.
Типичным вариантом реализации моноалкилирующего пирролобензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения является формула Ib:
Figure 00000015
Ib.
Типичным вариантом реализации моноалкилирующего пирролобензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения является формула Ic:
Figure 00000016
Ic.
Типичным вариантом реализации моноалкилирующего пирролобензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения является формула Id:
Figure 00000017
Id.
Не ограничиваясь конкретным механизмом или эффектом, присутствие электроноакцепторной группы R3, такой как NO2, Cl, F, CN, CO2H или Br на пиридильном кольце моноалкилирующего пирролобензодиазепинового линкерного промежуточного соединения ускоряет реакцию с цистеиновым тиолом антитела с внесенным цистеином. Когда цистеиновый тиол вносили в утрудняющий или менее реактивный сайт антитела, такое моноалкилирующее пирролобензодиазепиновое линкерное промежуточное соединение может давать более эффективную реакцию конъюгации с антителом относительно соответствующего незамещенного пиридилового аналога (R3=H).
Иллюстративные моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые линкер-лекарственные промежуточные соединения показаны в таблице 2А. Компараторные (старый препарат из установленного класса, с которым сравнивается другое вещество) диалкилирующие пирролобензодиазепиновые линкер-лекарственные промежуточные соединения показаны в таблице 2В. Синтез линкер-лекарственных промежуточных соединений и компараторных лекарственных веществ описан в примерах.
Таблица 2А Моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые линкер-лекарственные промежуточные соединения
LD
Номер		 Структура Название IUPAC
LD-51
Figure 00000018
 (11S,11aS)-(R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5,11-диоксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
LD-52
Figure 00000019
 (11S,11aS)-(R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
Таблица 2В. Компараторные пирролобензодиазепиновые линкер-лекарственные промежуточные соединения
Номер Структура Название IUPAC
CLD-1
Figure 00000020
 (11S,11aS)-I-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
CLD-2
Figure 00000021
 2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)этил (11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
CLD-3
Figure 00000022
 (11S,11aS)-I-3-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)бутил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
CLD-4
Figure 00000023
 4-((S)-2-((S)-2-(6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексанамидо)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил (11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
CLD-5
Figure 00000024
 (R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил (11S,11aS)-11-гидрокси-7,8-диметокси-5-оксо-2-(хинолин-6-ил)-11,11a-дигидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
CLD-6
Figure 00000025
 2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)этил (11S,11aS)-11-гидрокси-7,8-диметокси-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
Конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC))
Соединения конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) согласно настоящему изобретению включает антитело, специфичное к опухоль-ассоциированному антигену, ковалентно присоединенное к моноалкилирующему пирролбензодиазепиновому лекарственному компоненту, дериватизированному по группе N10 с помощью дисульфидного линкера, и включает те, что имеют биологическую активность. КАЛС (ADC) по изобретению может иметь терапевтическую активность и быть эффективным против ряда гиперпролиферативных патологий, включая рак. Биологическая активность моноалкилирующего пирролбензодиазепинового лекарственного компонента модулируется путем конъюгации с антителом. КАЛС (ADC) согласно изобретению выборочно доставляет эффективную дозу моноалкилирующего пирролбензодиазепинового лекарственного средства или токсина в опухолевую клетку или сайт, благодаря чему может быть достигнута большая селективность, т.е. более низкая эффективная доза, при увеличении терапевтического индекса («терапевтическое окно»). В иллюстративном варианте осуществления, соединения КАЛС (ADC) включают модифицированное цистеином антитело, конъюгированное, т.е. ковалентно присоединенное линкером, с моноалкилирующим пирролбензодиазепиновым лекарственным компонентом.
Следует понимать, что когда более чем одна нуклеофильная цистеиновая тиоловая группа антитела реагирует с линкер-лекарственным промежуточным соединением или линкерным веществом, то полученный продукт представляет собой смесь соединений КАЛС (ADC) с размещением одного или нескольких лекарственных компонентов, присоединенных к антителу. Среднее количество лекарственных средств на антитело (ОЛА (DAR)) может быть вычислено из смеси с помощью анализа ELISA c двумя антителами, который специфичен для антитела и специфичен для лекарственного средства. Отдельные молекулы КАЛС (ADC) можно идентифицировать в смеси с помощью масс-спектроскопии и разделить с помощью ВЭЖХ, например хроматографией гидрофобного взаимодействия (см., например, McDonagh et al (2006) Prot. Engr. Design & Selection 19(7):299-307; Hamblett et al (2004) Clin. Cancer Res. 10:7063-7070; Hamblett, K.J., et al. ʺEffect of drug loading on the pharmacology, pharmacokinetics, and toxicity of an anti-CD30 antibody-drug conjugate,ʺ Abstract No. 624, American Association for Cancer Research, 2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004; Alley, S.C., et al. ʺControlling the location of drug attachment in antibody-drug conjugates,ʺ Abstract No. 627, American Association for Cancer Research, 2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004). В некоторых вариантах осуществления, гомогенный КАЛС (ADC) с одним значением нагрузки может быть выделен из конъюгационной смеси электрофорезом или хроматографией.
Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по настоящему изобретению имеет структуру формулы II:
Figure 00000026
II
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
где:
X
Figure 00000003
Y выбран из CH2-CH2, CH2-C(=O), CH=CH или CH2-NH;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила, или R1 и R2 образуют 3, 4, 5 или 6-членную циклоалкильную или гетероциклильную группу;
p равно целому числу от 1 до 8; и
Ab представляет собой антитело.
В иллюстративном варианте осуществления, антитело связывается с одним или больше ассоциированными с опухолью антигенами, или рецепторами клеточной поверхности, выбранными из 1)-53):
1) BMPR1B (рецептор типа IB костного морфогенетического белка);
2) E16 (LAT1, SLC7A5);
3) STEAP1 (шеститрансмембранный эпителиальный антиген простаты);
4) MUC16 (0772P, CA125);
5) MPF (MPF, MSLN, SMR, потенциирующий мегакариоциты фактор, мезотелин);
6) Napi2b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, cемейство транспортеров растворенных веществ 34 (фосфат натрия), член 2, натрий-зависимый фосфатный транспортер 3b типа II);
(7) Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm.42015, SEMA5B, SEMAG, семафорин 5b Hlog, домен sema, семь тромбоспондиновых повторов (тип 1 и подобный типу 1), трансмембранный домен I (TД) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 5B);
8) PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, RIKEN кДНК 2700050C12, RIKEN кДНК 2700050C12 ген);
9) ETBR (рецептор эндотелина типа B);
10) MSG783 (RNF124, гипотетический белок FLJ20315);
11) STEAP2 (HGNC_8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, ассоциированный с раком простаты ген 1, ассоциированный с раком простаты белок 1, шеститрансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы 2, шеститрансмембранный белок простаты);
12) TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, катионный канал, действующий по механизму транзиторного рецепторного потенциала, подсемейство M, элемент 4);
13) CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, фактор роста, полученный из тератокарциномы);
14) CD21 (CR2 (рецептор 2 комплемента) или C3DR (C3d/рецептор вируса Эпштейна-Барр) или Hs 73792);
15) CD79b (CD79B, CD79β, Igb (иммуноглобулин-ассоциированный бета), B29);
(16) FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (якорный фосфатазный белок 1а, содержащий домен SH2), SPAP1B, SPAP1C);
17) HER2;
18) NCA;
19) MDP;
20) IL20Rα;
21) Brevican;
22) EphB2R;
23) ASLG659;
24) PSCA;
25) GEDA;
26) BAFF-R (рецептор фактора активации В-лимфоцитов, BlyS рецептор 3, BR3);
27) CD22 (изоформа CD22-В рецептора В-лимфоцитов);
28) CD79a (CD79A, CD79α, иммуноглобулин-ассоциированный альфа);
29) CXCR5 (рецептор 1 лимфомы Беркитта);
30) HLA-DOB (бета-субъединица молекулы ГКГС класса II (антиген Ia));
31) P2X5 (управляемый лигандом пуринергического рецептора P2X ионный канал 5);
32) CD72 (антиген CD72 дифференциации В-лимфоцитов, Lyb-2);
33) LY64 (антиген 64 (RP105) лимфоцитов, мембранный белок типа I семейства белков, богатых на лейциновые повторы (LRR - leucine rich repeat));
34) FcRH1 (Fc-рецептор-подобный белок 1);
35) FcRH5 (IRTA2, ассоциированный с транслокацией рецепторов суперсемейства иммуноглобулинов 2);
36) TENB2 (предполагаемый трансмембранный протеогликан);
37) PMEL17 (гомолог silver; SILV; D12S53E; PMEL17; SI; SIL);
38) TMEFF1 (трансмембранный белок 1 с EGF-подобным и двумя фолистатино-подобными доменами, Tomoregulin-1);
39) GDNF-Ra1 (рецептор альфа-1 семейства GDNF; GFRA1; GDNFR; GDNFRA; RETL1; TRNR1; RET1L; GDNFR-alpha1; GFR-ALPHA-1);
40) Ly6E (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус E; Ly67,RIG-E,SCA-2,TSA-1);
41) TMEM46 (гомолог shisa 2 (Xenopus laevis); SHISA2);
42) Ly6G6D (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус G6D; Ly6-D, MEGT1);
43) LGR5 (богатый на лейциновые повторы рецептор 5, сопряженный с G белком; GPR49, GPR67);
44) RET (протоонкоген ret; MEN2A; HSCR1; MEN2B; MTC1; PTC; CDHF12; Hs.168114; RET51; RET-ELE1);
45) LY6K (комплекс лимфоцитарного антигена 6, локус K; LY6K; HSJ001348; FLJ35226);
46) GPR19 (рецептор 19, сопряженный с G белком; Mm.4787);
47) GPR54 (рецептор KISS1; KISS1R; GPR54; HOT7T175; AXOR12);
48) ASPHD1 (содержащий домен аспартат-бета-гидроксилазы белок 1; LOC253982);
49) Тирозиназа (TYR; OCAIA; OCA1A; тирозиназа; SHEP3);
50) TMEM118 (белок 2, содержащий трансмембранный домен и домен «палец RING (Really Interesting New Gene)»; RNFT2; FLJ14627);
51) GPR172A (рецептор 172A, сопряженный с G белком; GPCR41; FLJ11856; D15Ertd747e);
52) CD33; или
53) CLL-1.
Иллюстративные соединения конъюгата антитело-лекарственное средство включают формулу IIa:
Figure 00000027
IIa
Иллюстративные соединения конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы IIa включают причем R4 и R5 каждый представляет собой H, или R4 и R5 представляют собой =O.
Иллюстративные соединения конъюгата антитело-лекарственное средство включают формулу IIb:
Figure 00000028
IIb.
Конъюгаты антитело-лекарственное средство ADC-101-ADC-119 Таблицы 3А были получены путем конъюгирования моноалкилирующего пирролбензодиазепинового линкер-лекарственного промежуточного соединения LD-51 или LD-52 таблицы 2А с антителом, включая модифицированное цистеином антитело. Компараторные конъюгаты антитело-лекарственное средство ADC-201-ADC-211 таблицы 3В были получены путем конъюгирования компараторных пирролбензодиазепиновых линкер-лекарственных промежуточных соединений CLD-1-6 таблицы 2В с антителом, включая модифицированное цистеином антитело.
Таблица 3A Моноалкилирующие дисульфидные конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC))
КАЛС (ADC) Формула КАЛС (ADC) линкер-лекарственное средство
Номер LD
(таблица 2А)		 ОЛА (DAR)*
ADC-101 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51) 51 1,9
ADC-102 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51) 51 1,9
ADC-103 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) 51 2,0
ADC-104 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51) 51 1,9
ADC-105 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) 51 2,0
ADC-106 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(LD-51) 51 2,0
ADC-107 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-52) 52 1,95
ADC-108 Тио Hu-анти-Her2 hu7C2 LC K149C- (LD-52) 52 1,99
ADC-109 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C - (LD-51) 51 2,0
ADC-110 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51) 51 1,98
ADC-111 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C HC L177C - (LD-51) 51 3,6
ADC-112 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C HC L177C HC Y376C-(LD-51) 51 5,4
ADC-113 Тио Hu анти-HER2 4D5 LC K149C HC L177C-(LD-51) 51 3,9
ADC-114 Тио Hu анти-HER2 4D5 LC K149C HC L177C HC Y376C-(LD-51) 51
ADC-115 Тио Hu анти-Ly6E 9B12.v12 LC K149C-(LD-51) 51 2,0
ADC-116 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 HC L177C-(LD-51) 51
ADC-117 Тио Hu анти-HER2 hu7C2 HC L177C-(LD-51) 51
ADC-118 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 HC Y376C-(LD-51) 51
ADC-119 Тио Hu анти-HER2 hu7C2 HC Y376C-(LD-51) 51
Таблица 3В Компараторные конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC))
КАЛС (ADC) Формула КАЛС (ADC) линкер-лекарственное средство
(таблица 2В)		 ОЛА (DAR)*
ADC-201 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(CLD-1) CLD-1 1,84
ADC-202 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 -(CLD-1) CLD-1 1,8
ADC-203 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-(CLD-3) CLD-3 2,0
ADC-204 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-MC-vc-PAB-PBD моно-амин-(CLD-4) CLD-4 2,0
ADC-205 Тио анти-Her2 hu7C2 LC K149C-MC-vc-PAB-PBD моно-амин-(CLD-4) CLD-4 1,9
ADC-206 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-4) CLD-4 2,0
ADC-207 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(CLD-2) CLD-2 1,96
ADC-208 Тио Hu анти-NaPi2b 10H1.11.4B LC K149C-(CLD-2) CLD-2 1,96
ADC-209 Тио Hu анти-gD 5B6 LC K149C-(CLD-4) CLD-4
ADC-210 Тио Hu анти-Ly6E 9B12.v12 LC K149C-(CLD-4) CLD-4 2,0
ADC-211 Tmab-DM1 (трастузумаб эммансин) DM1 3,8
ADC-212 Тио Hu анти-Ly6E LC K149C-(CLD-1) CLD-1
A118C (нумерация ЕС)=A121C (Последовательная нумерация)=A114C (нумерация Кабата)
K149C (нумерация Кабата) легкой цепи
Дикий тип («WT»), мутантное модифицированное цистеином антитело («тио»), легкая цепь («LC»), тяжелая цепь («HC»), 6-малеимидокапроил («MC»), малеимидопропаноил («MP»), валин-цитруллин («val-cit» или «vc»), аланин-фенилаланин («ala-phe»), p-аминобензил («PAB») и p-аминобензилоксикарбонил («PABC»)
Компараторное соединение ADC-211, трастузумаб эмманзин (KADCYLA®, трастузумаб-MCC-DM1 (T-DM1, Tmab-DM1), представляет собой конъюгат антитело-лекарственное средство (CAS Reg. No. 139504-50-0; Phillips G. et al. (2008) Cancer Res. 68:9280-90; US 8142784), и имеет следующую структуру:
Figure 00000029
в котором Tr является анти-HER2-антителом трастузумаб.
АНАЛИЗЫ КЛЕТОЧНОЙ ПРОЛИФЕРАЦИИ IN VITRO
В целом, как правило, цитотоксическую или цитостатическую активность конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) измеряют путем: экспонирования клеток млекопитающих имеющих рецепторные белки, например HER2, антителу КАЛС (ADC) в клеточной культуральной среде; культивирования клеток в течение периода от около 6 часов до около 5 дней; и измерения жизнеспособности клеток. Клеточные анализы in vitro применяли для измерения жизнеспособности (пролиферации), цитотоксичности и индукции апоптоза (активации каспазы) КАЛС (ADC) по изобретению.
Активность in vitro конъюгатов антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) измеряли с помощью анализа пролиферации клеток (пример 6). КАЛС (ADC) по изобретению продемонстрировали удивительную и неожиданную активность в ингибировании пролиферации опухолевых клеток. Активность КАЛС (ADC) коррелировала с экспрессией клетками антигена-мишени. Тестируемые конъюгаты способны связываться с определенным антигеном, экспрессируемым на поверхности клеток и вызывать гибель этих клеток in vitro.
Анализ жизнеспособности люминесцентных клеток CellTiter-Glo® является коммерчески доступным (Promega Corp., Мэдисон, Висконсин), это одношаговый способ анализа, основанный на рекомбинантной экспрессии люциферазы Coleoptera (US 5583024, US5674713, US5700670). Анализ пролиферации клеток определяет количество жизнеспособных клеток в культуре на основе количественного анализа присутствующего АТФ, который является индикатором метаболически активных клеток (Crouch et al (1993) J. Immunol. Meth. 160:81-88; US 6602677). Анализ CellTiter-Glo® можно выполнять в 96-луночном формате, что делает его доступным для автоматизированного высокопроизводительного скрининга (HTS) (Cree et al (1995) AntiCancer Drugs 6:398-404). Способ одношагового анализа включает добавление одного реагента (реагента CellTiter-Glo®) непосредственно к культивируемым клеткам в клеточную культуральную среду дополненную сывороткой. Промывание клеток, удаление среды и несколько этапов пипетирования не требуются. Система способна обнаруживать малые количества клеток - 15 клеток/лунка в 384-луночном формате через 10 минут после добавления реагента и смешивания. Клетки могут непрерывно обрабатываться КАЛС (ADC), или они могут обрабатываться и отделяться от КАЛС (ADC). В целом, как правило, клетки, обработанные кратковременно, т.е. 3 часа, проявляли те же самые эффекты активности, что и непрерывно обработанные клетки.
Одношаговый формат «измерение добавленной смеси» приводит к лизису клеток и появлению люминесцентного сигнала, пропорционального количеству присутствующего АТФ. Количество АТФ прямо пропорционально количеству клеток, присутствующих в культуре. Анализ CellTiter-Glo® производит люминесцентный сигнал по типу «накаливающегося свечения», вырабатываемый реакцией люциферазы, который имеет период полужизни, обычно более пяти часов, в зависимости от используемого типа клеток и среды. Жизнеспособные клетки отображаются в относительных единицах люминесценции (ОЕЛ(RLU)). Субстрат Beetle Luciferin окислительно декарбоксилируется рекомбинантной люциферазой светлячков с сопутствующим преобразованием АТФ в AMP и образованием фотонов.
Клеточные анализы in vitro применяются для измерения жизнеспособности (пролиферации), цитотоксичности и индукции апоптоза (активации каспазы) КАЛС (ADC) по изобретению. В целом, как правило, цитотоксическую или цитостатическую активность конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) измеряют путем: экспонирования клеток млекопитающих, экспрессирующих антиген, такой как полипептид Her2 или MUC16, соединению КАЛС (ADC) в клеточной культуральной среде; культивирования клеток в течение периода от около 6 часов до около 5 дней; и измерения жизнеспособности клеток. Клетки млекопитающих, пригодные для анализа пролиферации клеток для анти-MUC16 КАЛС (ADC), включают: (1) экспрессирующую полипептид MUC16 клеточную линию OVCAR-3; 2) клеточную линию, полученную на основе PC3, сконструированную для стабильной экспрессии части полипептида MUC16 на клеточной поверхности (PC3/MUC16); 3) исходную клеточную линию PC3, которая не экспрессирует полипептид MUC16; и 4) клеточную линию PC3, которая не экспрессирует полипептид MUC16, но несет вектор, используемый для управления экзогенной экспрессией MUC16 (PC3/neo).
Фиг. 1А, 1В, 1С иллюстрируют, что моноамин Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-52) ADC-107 проявляет нМ активность в числовом выражении меньше 10, с примерно 4-кратной разницей по сравнению с не нацеленным на мишень контролем ADC-108, в BJAB (фиг. 1А), примерно 7-кратной разницей по сравнению с не нацеленным на мишень контролем в WSU-DLCL2 (фиг. 1B), примерно в 5 раз большей активностью по сравнению с не нацеленным на мишень контролем ADC-108, в Jurkat (фиг. 1C). Моноамин ADC-107 примерно в 10 раз более активный, чем моноамин ADC-103 Тио Hu анти-CD22 10F4v3 LC K149C-(LD-51), и примерно в 22 раза более активный чем не нацеленный на мишень контроль ADC-108 в BJAB и в WSU-DLCL2 (фиг. 1A-C).
Таблица 4 Анализ конъюгатов антитело-лекарственное средство по пролиферации клеток in vitro (фиг. 1F, 1G)
КАЛС (ADC) Линкер-лекарственное средство Мишень % агрегации ОЛА (DAR) SK-BR-3
IC50 (нг/мл)		 KPL-4
IC50 (нг/мл)
108 LD-52
LD-52		 HER2 (hu7C2) 2,28 1,99 0,6 1,0
107 CD22 2,24 1,95 44,5 57,4
102 LD-52 HER2 (hu7C2) 2,9 1,9 3,3 103
203 CLD-3 HER2 (hu7C2) 3,2 2,0 >1000 >1000
201 CLD-1 HER2 (hu7C2) 3,6 1,84 0,1 0,3
Таблица 5 Активность in vitro (фиг. 1А, 1В, 1С)
КАЛС (ADC) ОЛА (DAR) BJAB IC50 WSU-DLCL2 IC50 Jurkat IC50
нМ нг/мл нМ нг/мл нМ нг/мл
103 2 17,68 2650,34 34,39 5156,08 42,92 6434,14
107 1,95 1,70 254,20 1,56 234,11 8,70 1303,63
108 1,99 8,46 1268,70 11,27 1689,31 8,96 1342,60
ЭФФЕКТИВНОСТЬ IN VIVO
Эффективность in vivo конъюгатов антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) измеряли через ингибирование роста опухоли у мышей (пример 7). КАЛС (ADC) по изобретению продемонстрировали удивительную и неожиданную активность в ингибировании опухолевого роста. Эффективность КАЛС (ADC) коррелировала с экспрессией опухолевыми клетками антигена-мишени.
Эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство измеряли in vivo путем имплантации аллотрансплантатов или ксенотрансплантатов раковых клеток в грызунов и лечения опухолей с помощью КАЛС (ADC). Ожидаются разные результаты в зависимости от клеточной линии, специфичности связывания антитела КАЛС (ADC) с рецепторами, присутствующими на раковых клетках, режимов дозирования и других факторов. Эффективность КАЛС (ADC) in vivo измеряли с применением модели трансгенной эксплантной мыши, экспрессирующей от умеренного до высокого уровня ассоциированного с опухолью антигена, такого как Her2, CD22 и Ly6E. Субъектов обрабатывали один раз с помощью КАЛС (ADC) и наблюдали в течение 3-6 недель, чтобы измерить время увеличения вдвое опухоли, log гибель клеток и уменьшение опухоли. Проводились эксперименты после ответа на дозу и эксперименты с множественными дозами.
Например, эффективность in vivo анти-HER2 КАЛС (ADC) по изобретению может быть измерена с помощью высоко экспрессирующей HER2 эксплантационной трансгенной мышиной модели (Phillips et al (2008) Cancer Res. 68:9280-90). Аллотрансплантат получен от трансгенной мыши Fo5 mmtv, которая не реагирует, или плохо реагирует на терапию HERCEPTIN®. Субъектов лечили один раз КАЛС (ADC) при определенных уровнях дозы (мг/кг) и контрольного плацебо-буфера (наполнителя) и наблюдали в течение двух недель или больше для измерения времени увеличения вдвое опухоли, log гибель клеток и уменьшение опухоли.
Фиг. 2 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство, ADC-202, ADC-103 и ADC-102 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата WSU-DLCL2 в модели CB-17 Fox Chase SCID мыши.
Фиг. 3 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата Bjab-luc в модели CB-17 Fox Chase SCID мыши. Дозы 0,2 и 0,4 мг/кг компаратора ADC-202 приводят к регрессии опухоли, с дозой 0,1 мг/кг, что приводит к 62% ингибированию роста опухоли (ИРО(TGI)). Диапазон ИРО от 40-58% для доз 1, 2 и 4 мг/кг моноамида ADC-105 показывает, что эти уровни доз имеют аналогичный ответ, когда только самая высокая доза 8 мг/кг показывает значительную активность, 89% ИРО(TGI). Дополнительно, активность при дозе 8 мг/кг попадает между 0,1 и 0,2 мг/кг дозы компаратора диалкилирующего ADC-202, что дает в результате в примерно 50 раз меньшую активность. Не нацеленный на мишень контроль анти-Her2 hu7C2 ADC-104 -моноамид при 8 мг/кг показал в 2 раза меньшую активность чем не нацеленный на мишень контроль компаратор анти-Her2 hu7C2 ADC-201 при 0,4 мг/кг, 18 против 36% ИРО (TGI). При оценке безопасного веса тела все группы демонстрировали увеличение веса.
Фиг. 4 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в мышиной модели с клеточной линией WSU-DLCL2 человека. Эффективность для мишеней, анти-CD22 моноамина ADC-107 и ADC-204 с val-cit связью оценивали при дозах от 0,5 до 10 мг/кг. Для сравнения был включен моноамид ADC-105. Не нацеленные на мишень анти-Her2 моноамин ADC-108 и ADC-205 были применены в качестве контролей. Активность как для моноамина ADC-107, так и для ADC-204 оказалась аналогичной. Минимальная эффективная доза (МЭД) для обоих составляет от 0,5 до 2 мг/кг. При максимальной дозе 10 мг/кг оба препарата приводили к полному отклику у 5/5 животных, что не наблюдалось с моноамидным КАЛС (ADC). Дополнительно, моноаминовые КАЛС (ADC) имели больше чем 10-кратную активность по сравнению с моноамидными КАЛС (ADC) (сравните ответ на дозу 0,5 мг/кг моноамина и на дозу 5 мг/кг моноамида). Оба Her2 контроля с дозировкой 2 мг/кг имеют похожий ответ (около 30% ИРО(TGI)). Не наблюдалось никакой значительной потери веса для всех групп.
Фиг. 5A иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство ADC-106, ADC-108 и ADC-107 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели опухоли HER2 KPL4 у мышей SCID Beige.
Фиг. 5B иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели опухоли HER2 KPL4 у мышей SCID Beige. Измеряли эффективность моноамида Тио-Her2 hu7C2 LC-K149C-(LD-51), ADC-106 и ADC-106 в комбинации с Tmab-DM1.
Фиг. 6 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство ADC-201, ADC-104, ADC-202 и ADC-105 и неконъюгированного антитела hu7C2 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в HER2 Fo5 модели у CRL nu/nu мышей, дозированных один раз внутривенно (ВВ (IV)). Нацеленные на мишень ADC-201 и ADC-104 показывают ингибирование опухоли и дозозависимые эффекты. Не нацеленные на мишень ADC-202 и ADC-105, и неконъюгированное антитело hu7C2 не проявляют ингибирования опухоли.
Фиг. 7 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство ADC-201, ADC-104, ADC-202 и ADC-105, и неконъюгированного антитела hu7C2 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в HER2 KPL4 модели опухоли у мышей SCID Beige. Нацеленные на мишень ADC-201 и ADC-104 показывают ингибирование опухоли и дозозависимые эффекты. Не нацеленные на мишень ADC-202 и ADC-105, и неконъюгированное антитело hu7C2 проявляют слабое ингибирования опухоли или его отсутствие.
Фиг. 8 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство ADC-106, ADC-18 и ADC-17 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в HER2 Fo5 модели у CRL nu/nu мышей. Нацеленные на мишень ADC-106 и ADC-108 показывают ингибирование опухоли и дозозависимые эффекты. Не нацеленный на мишень ADC-107 проявляет слабое ингибирования опухоли или его отсутствие.
Фиг. 9 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство ADC-104, ADC-111, ADC-112, ADC-106 и ADC-113 на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в CD22-экспрессирующей модели ксенотрансплантата WSU-DLCL2 у CB-17 Fox Chase SCID мыши. Нацеленные на мишень ADC-104, ADC-111 и ADC-112 показывают ингибирование опухоли и дозозависимые эффекты. Не нацеленные на мишень ADC-106 и ADC-133 показывают отсутствие ингибирования опухоли.
Фиг. 10 иллюстрирует эффективность конъюгатов антитело-лекарственное средство на графике изменения объема опухоли in vivo с течением времени в модели ксенотрансплантата HCC1569X2. Ly6E-SG3451-моноамид обладает дозозависимой активностью, наблюдается задержка роста при 6 и 12 мг/кг и остановка роста опухолей при дозировке 18 мг/кг. Наблюдается регрессия опухоли с Ly6E-SG3451, дозированном в количестве 1 и 3 мг/кг, и с Ly6E-SG3203-моноамином, дозированном в количестве 1, 3 и 6 мг/кг. Группы Ly6E SG3451 и SG3203-моноамин группируются вместе.
Анализ олигонуклеотидного связывания/алкилирования
Известно, что соединения пирролобензодиазепина (ПБД (PBD)) образуют зависимые от последовательности, внутрицепочечные ДНК поперечные связи и моноалкилированные аддукты в дополнение к межцепочечным перекрестным связям (Rahman KM, et al (2009) J Am Chem Soc 131:13756-13766). ПБД (PBD) имеют хиральную C11a(S)-позицию, которая обеспечивает им соответствующую форму, которая надежно закрепляется в малой канавке ДНК. Кроме того, электрофильный фрагмент N10-C11 (т.е. взаимопревращаемый имин, карбиноламин или карбиноламин-метиловый эфир) может образовывать ковалентную аминальную связь между их C11-положением и нуклеофильной группой C2-NH2 гуанинового нуклеотидного основания. Изучали взаимодействие соединений пирролбензодиазепина с дуплекс-образующими олигонуклеотидами различной длины и различных последовательностей с последовательностями Pu-GAATG-Py> Pu-GATC-Py>>Pu-GATG-Py или Pu-GAATC-Py для образования внутрицепочечных и межцепочечных связей, обнаруженных ранее (пример 8). Анализ олигонуклеотидного связывания и алкилирования представляет собой простую модель для оценки потенциала связывания лекарственных пирролбензодиазепиновых компонентов в КАЛС (ADC) с нуклеиновыми кислотами с помощью разделения ВЭЖХ и обнаружения МС (MS) (Narayanaswamy M. et al (2008) Anal. Biochem. 374:173-181). Таким образом, активность и эффективность КАЛС (ADC) могут быть сопоставлены и предсказаны. Моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые лекарственные компоненты могут быть дифференцированы, например моноамид DM-3 от моноамина DM-1, и моноалкилирующие из таблицы 1а от компараторных диалкилирующих пирролбензодиазепиновых лекарственных компонентов в таблице 1b, например C-1 (пример 8).
Частота появления выбранных олигонуклеотидных последовательностей, которые могли бы связывать/алкилировать пирролбензодиазепиновые соединения, очень велика и не прямо пропорциональна размеру хромосом, в которой они встречаются. Соединения пирролбензодиазепина в настоящем исследовании включают моноалкилирующие пирролобензодиазепиновые лекарственные компоненты из таблицы 1а и компараторные лекарственные компоненты из таблицы 1b. В исследовании были показаны отличимые уровни лекарственных средств, алкилирующих двухцепочечных олигонуклеотиды, и активность алкилирования может быть точно оценена путем исчезновения начальных дуплексных олигонуклеотидов, Pu-GAAATC-Py и Pu-GAAATG-Py, где Pu представляет собой пуриновый нуклеотид A или G, и Py представляет собой пиримидиновый нуклеотид С или Т. Моноамид ПБД (PBD) DM-2 (таблица 1а) был примерно в 8 раз менее эффективен для связывания/алкилирования дуплексных олигонуклеотидов, чем моноамин ПБД (PBD) DM-1. Компараторное диалкилирующее соединение C-1 (таблица 1b) показывает в 2-3 раза большую эффективность для ковалентного алкилирования дуплексных олигонуклеотидов, чем моноамин DM-1. ПБД-мономер C-2 показывает большую чем в 50 раз меньшую эффективность ковалентного алкилирования дуплексных олигонуклеотидов, чем димер C-1. Восстановление иминновых связей С-1 для формирования С-3 полностью исключает связывание ДНК. Различные олиго-ПБД-аддукты были сформированы с различными алкилирующими соединениями, разделенными ВЭЖХ, и были охарактеризованы по массе с помощью анализа МС.
Фиг. 11 иллюстрирует предполагаемые аддукты после реакций диалкилирующего пирролбензодиазепинового (ПБД (PBD)) димерного соединения CLD-1 (сверху) и двух моноалкилирующих пирролбензодиазепиновых димерных соединений, моноамина DM-1 (средний) и моноамида DM-2 (снизу) с ДНК (Rahman KM, et al (2009) J Am Chem Soc 131:13756-13766). Димерные соединения диалкилирующего ПБД (PBD) могут образовывать два ковалентных соединения (сшивки) с группой C2-NH2 гуаниновой нуклеотидной основы на противоположных цепях ДНК-дуплекса. Моноалкилирующие димерные соединения ПБД (PBD) могут образовывать только одну ковалентную связь с гуаниновой нуклеотидной основой, что влияет на кинетику асс./диссоц. связывания и разрушение делящихся клеток.
Моноамид DM-2 демонстрирует в 8-10 раз меньшее связывание/алкилирование, чем моноамин DM-1, с дуплексными олигонуклеотидам, что коррелирует с активности и эффективностью их КАЛС (ADC) в линиях раковых клеток и моделях ксенотрансплантата опухоли in vivo. Более низкий уровень алкилирования ДНК для моноамида поддерживает эффективность с пониженной токсичностью и может демонстрировать лучший терапевтический индекс. В целом степень связывания/алкилирования ДНК коррелирует с эффективностью аналогов ПБД (PBD) и отличает ПБД (PBD) моноамид от моноамина, и от диалкилирующего ПБД (PBD). Оптимизированные терапевтические индексы (TИ) для ПБД-КАЛС (ADC) могут быть достигнуты путем модуляции активности связывания/алкилирования моноалкилирующих ДНК соединений, а способ олигосвязывания/алкилирования можно использовать для управления дизайном и оценки аналогов ПБД (PBD) с оптимальной противоопухолевой эффективностью с приемлемой безопасностью.
СВОЙСТВА БЕЗОПАСНОСТИ/ТОКСИЧНОСТИ
Конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) по изобретению и компараторные КАЛС (ADC) были изучены с учетом их свойств, связанных с безопасностью и токсичностью.
Анти-HER2 hu7C2 антитело ADC-108 с моноалкилирующим моноамином (LD-52) показало улучшенную толерантность у мышей CD-1 и улучшенный терапевтический индекс (ТИ) относительно соответствующего анти-HER2 hu7C2 антитела ADC-201 с диалкилирующим имином (C-1) при расчете по процентному изменению массы тела в течение 45 дней после дозирования (50, 75, 125 мкг (мкг) на кг в дни 0, 7, 14. Максимальная переносимая доза (МПД) для ADC-108 составляет 200 мкг/кг, тогда как МПД для ADC-201 составляет 75 мкг/кг. Сигналы токсичности у крыс (Sprague-Dawley) и яванских макак могут включать в себя кратковременное снижение количества ретикулоцитов, незначительные изменения цвета кожи и шелушение вблизи места инъекции, пропотевание жидкости из сосудов, повышенные количества печеночных ферментов, дегенерацию нервов, истощение костного мозга/лимфоидной ткани, показания почек, глаз и легких и клинические проявления.
Предварительные данные безопасности указывают на значительное преимущество КАЛС (ADC) по изобретению относительно компараторных КАЛС (ADC).
ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИЕ СОСТАВЫ
Фармацевтические составы терапевтических конъюгатов антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) по изобретению обычно готовят для парентерального введения, то есть болюсной, внутривенной, внутриопухолевой инъекции с фармацевтически приемлемым парентеральным носителем и в стандартной дозе для инъекций. Конъюгат антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)), имеющий желаемую степень чистоты, необязательно смешивают с фармацевтически приемлемыми разбавителями, носителями, вспомогательными веществами или стабилизаторами (Remington's Pharmaceutical Sciences (1980) 16th edition, Osol, A. Ed.), в форме лиофилизированного препарата или водного раствора.
СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ КОНЪЮГАТАМИ АНТИТЕЛО-ЛЕКАРСТВЕННОЕ СРЕДСТВО
Предполагается, что конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) по настоящему изобретению могут быть использованы для лечения различных заболеваний или патологий, например, характеризующихся сверхэкспрессией опухолевого антигена. Иллюстративные заболевания или гиперпролиферативные патологии включают доброкачественные или злокачественные солидные опухоли и гематологические патологии, такие как лейкемия и лимфоидные злокачественные опухоли. Другие включают в себя нейрональные, глиальные, астроцитальные, гипоталамичесике, железистые, макрофагальные, эпителиальные, стромальные, бластоцельные, воспалительные, ангиогенные и иммунологические, включая аутоиммунные, патологии.
Конъюгаты антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) по изобретению можно вводить любым способом, подходящим для состояния, подлежащего лечению. КАЛС (ADC) обычно вводят парентерально, то есть инфузией, подкожно, внутримышечно, внутривенно, внутрикожно, интратекально и эпидурально.
В целом, как правило, заболевание или патология, подлежащая лечению, представляет собой гиперпролиферативное заболевание, такое как рак. Примеры рака, подлежащего лечению, в данном документе включают, но не ограничиваются лишь этими: карциному, лимфому, бластому, саркому и лейкемию, или лимфоидные злокачественные опухоли. Более конкретные примеры таких видов рака включают плоскоклеточный рак (например, эпителиальный плоскоклеточный рак), рак легкого, включая мелкоклеточный рак легкого, немелкоклеточный рак легкого, аденокарциному легкого и плоскоклеточную карциному легкого, рак брюшины, гепатоцеллюлярный рак, рак желудка или желудочный рак, включая рак желудочно-кишечного тракта, рак поджелудочной железы, глиобластому, рак шейки матки, рак яичников, рак печени, рак мочевого пузыря, гепатому, рак молочной железы, рак толстой кишки, рак прямой кишки, колоректальный рак, карциному эндометрия или матки, карциному слюнной железы, рака почек или почечный рак, рак предстательной железы, рак вульвы, рак щитовидной железы, карциному печени, анальную карциному, карциному полового члена, а также рак головы и шеи.
Аутоиммунные заболевания, для которых соединения КАЛС (ADC) могут применяться в лечении, включают: ревматологические патологии (такие как, например, ревматоидный артрит, синдром Шегрена, склеродермия, волчанка, такая как системная красная волчанка (СКВ) и волчаночный нефрит, полимиозит/дерматомиозит, криоглобулинемия, синдромом с антифосфолипидными антителами и псориатический артрит), остеоартрит, аутоиммунные заболевания желудочно-кишечного тракта и печени (такие как, например, воспалительные заболевания кишечника (например, язвенный колит и болезнь Крона), аутоиммунный гастрит и пернициозная анемия, аутоиммунный гепатит, первичный билиарный цирроз, первичный склерозирующий холангит и глютеиновую болезнь), васкулит (например, ассоциированный с АНЦА васкулит, в том числе васкулит Чарга-Страуса, гранулематоз Вегенера и полиартериит), аутоиммунные неврологические расстройства (такие как, например, рассеянный склероз, опсо-миоклональный синдром, миастения гравис, болезнь Девика, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера и аутоиммунные полинейропатии), почечные расстройства (такие как, например, гломерулонефрит, синдром Гудпасчера, и болезнь Бергера), аутоиммунные дерматологические патологии (такие как, например, псориаз, крапивница, крапивница, обыкновенная пузырчатка, буллезный пемфигоид и кожная красная волчанка), гематологические патологии (такие как, например, тромбоцитопеническая пурпура, тромботическая тромбоцитопеническая пурпура, пост -трансфузионная пурпура и аутоиммунная гемолитическая анемия), атеросклероз, увеит, аутоиммунные заболевания слуха (такие как, например, заболевание внутреннего уха и потеря слуха), Болезнь Бехчета, синдром Рейно, трансплантацию органов и аутоиммунные эндокринные патологии (такие как, например, связанные с диабетом аутоиммунные заболевания, такие как инсулинзависимый сахарный диабет (ИЗСД), болезнь Аддисона и аутоиммунная болезнь щитовидной железы (например, болезнь Грейвса и тиреоидит)). Более предпочтительными такими заболеваниями являются, например, ревматоидный артрит, язвенный колит, ассоциированный с АНЦА васкулит, волчанка, рассеянный склероз, синдром Шегрена, болезнь Грейвса, инсулино-зависимый сахарный диабет, пернициозная анемия, тиреоидит и гломерулонефрит.
Для профилактики или лечения заболевания, соответствующая дозировка КАЛС (ADC) будет зависеть от типа заболевания, которое подлежит лечению, как определено выше, тяжести и течения заболевания, вводят ли молекулу в профилактических или лечебных целях, предыдущей терапии, клинической истории пациента и его реакции на антитело, и усмотрение лечащего врача. Молекулу соответствующим образом вводят пациенту за один раз, или в течение ряда процедур. В зависимости от типа и тяжести заболевания, от около 1 мкг/кг до 15 мг/кг (например, 0,1-20 мг/кг) молекулы составляет начальная потенциальная доза для введения пациенту, будь то, например, одно или нескольких отдельных введений, или непрерывная инфузия. Типичная суточная дозировка может находится в диапазоне от около 1 мкг/кг до 100 мг/кг или больше, в зависимости от вышеуказанных факторов. Типичная доза КАЛС (ADC) для введения пациенту находится в диапазоне от около 0,1 до около 10 мг/кг веса пациента.
В терапии антитела или иммуноконъюгаты по изобретению могут применятся как самостоятельно, так и в сочетании с другими веществами. Например, антитело или иммуноконъюгат по изобретению может быть введен совместно, по меньшей мере, с одним дополнительным терапевтическим веществом.
В некоторых вариантах осуществления, конъюгат hu7C2.v.2.2.LA антитело-лекарственное средство (hu7C2 КАЛС (ADC)) совместно вводят с дополнительным терапевтическим веществом, которое является другим антителом или иммуноконъюгатом, что связывается с HER2. В некоторых вариантах осуществления, дополнительным терапевтическим веществом является i) антитело или иммуноконъюгат, которое(ый) связывается с доменом II HER2, и/или ii) антитело или иммуноконъюгат, которое(ый) связывается с доменом IV или HER2. В некоторых вариантах осуществления, дополнительным терапевтическим веществом является i) антитело или иммуноконъюгат, которое(ый) связывается с эпитопом 2C4, и/или ii) антитело или иммуноконъюгат, которое(ый) связывается с эпитопом 4D5.
В некоторых вариантах осуществления, конъюгат hu7C2.v.2.2.LA антитело-лекарственное средство (hu7C2 КАЛС (ADC)) совместно вводят с одним или больше дополнительными терапевтическими веществами, выбранными из трастузумаба (Herceptin®), T-DM1 (Kadcyla®) и пертузумаба (Perjeta®). В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) hu7C2 вводится совместно с трастузумабом. В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) hu7C2 вводится совместно с T-DM1. В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) hu7C2 вводится совместно с пертузумабом. В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) hu7C2 вводится совместно с трастузумабом и пертузумабом. В некоторых вариантах осуществления, КАЛС (ADC) hu7C2 вводится совместно с T-DM1 и пертузумабом.
В некоторых вариантах осуществления, дополнительное терапевтическое вещество представляет собой антагонист, связывающийся с компонентом сигнального пути PD-1, такое как связывающийся с PD-L1 антагонист.
Такие комбинированные виды терапии, как отмеченные выше, охватывают комбинированное введение (когда два или больше терапевтических вещества включены в те же или отдельные составы), а также раздельное введение, в последнем случае введение антитела или иммуноконъюгата по настоящему изобретению может осуществляться до, одновременно и/или после введения дополнительного терапевтического вещества и/или адъюванта. Антитела или иммуноконъюгаты по настоящему изобретению также могут быть использованы в комбинации с лучевой терапией.
Антитело или иммуноконъюгат по изобретению (и любое дополнительное терапевтическое вещество) может быть введено любыми подходящими способами, включая парентеральное, внутрилегочное и интраназальное, и, при желании для местного лечения, внутривенное введение. Парентеральные инфузии включают внутримышечное, внутривенное, внутриартериальное, внутрибрюшинное или подкожное введение. Дозирование может быть выполнено любым подходящим путем, например, путем инъекций, таких как внутривенные или подкожные инъекции, в зависимости от того, является ли введение кратковременным или продолжительным. В настоящем документе рассматриваются различные графики дозирования, включая, но не ограничиваясь лишь этими: однократное или множественное введение в различные моменты времени, болюсное введение и прерывистую инфузию.
Антитела или иммуноконъюгаты по изобретению будут приготовлены в состав, дозированы и введены в соответствии с надлежащей медицинской практикой. Факторы, которые следует учитывать в данном контексте, включают конкретную патологию, подлежащую лечению, конкретное млекопитающее, подвергаемое лечению, клиническое состояние отдельно взятого пациента, причину патологии, место доставки вещества, способ введения, схему введения и другие факторы, известные практикующим врачам. Необязательно, но в некоторых случаях антитело или иммуноконъюгат могут быть приготовлены в виде состава с одним или больше веществами, используемыми в настоящее время для предотвращения или лечения рассматриваемой патологии. Эффективное количество таких других веществ зависит от количества антитела или иммуноконъюгата, присутствующего в составе, вида патологии или лечения и других факторов, описанных выше. Такие вещества, как правило, вводятся в тех же дозах и с помощью тех же путей, которые описаны в настоящем документе, или в дозе, составляющей от около 1 до 99% дозы, описанной в настоящем документе, или в любой дозе и с помощью любого пути, который эмпирически/клинически определен как пригодный.
Для профилактики или лечения заболевания соответствующая доза антитела или иммуноконъюгата по изобретению (при использовании отдельно или в комбинации с одним или больше другими дополнительными терапевтическими веществами), будет зависеть от типа заболевания, подлежащего лечению, типа антитела или иммуноконъюгата, тяжести и течения заболевания, от того, применяется антитело или иммуноконъюгат в профилактических либо в терапевтических целях, предшествующей терапии, истории болезни пациента и реакции на антитело или иммуноконъюгат, и усмотрения лечащего врача. Антитело или иммуноконъюгат соответствующим образом вводят пациенту однократно или в ходе курса лечения. В зависимости от типа и тяжести заболевания, первоначальная предполагаемая доза антитела или иммуноконъюгата для введения пациенту например, посредством одного или более раздельных введений или непрерывной инфузии, может составлять от около 1 мкг/кг до 15 мг/кг (например, 0,1 мг/кг - 10 мг/кг). Типичная ежедневная доза может находиться в диапазоне от около 1 мкг/кг до 100 мг/кг или больше в зависимости от вышеупомянутых факторов. При повторных введениях в течение нескольких дней или дольше, в зависимости от состояния, лечение, как правило, должно поддерживаться до тех пор, пока не произойдет желаемое подавление симптомов болезни. Одна типичная доза антитела или иммуноконъюгата находится в диапазоне от около 0,05 мг/кг до около 10 мг/кг. Так, пациенту может быть введена одна или больше доз, составляющих около 0,5 мг/кг, 2,0 мг/кг, 4,0 мг/кг или 10 мг/кг (или любые их комбинации). Такие дозы можно вводить с перерывами, например, каждую неделю или каждые три недели (например, таким образом, что пациент получает от около двух до около двадцати, или, например, около шести доз антитела). Можно вводить начальную повышенную нагрузочную дозу, за которой следует одна или больше пониженные дозы. Тем не менее, могут применяться и другие схемы приема. Эффективность данной терапии легко контролировать с помощью обычных методик и анализов.
ГОТОВЫЕ ИЗДЕЛИЯ
В другом аспекте осуществления настоящего изобретения, предлагается изделие, или «набор», содержащее(ий) материалы, пригодные для лечения патологий как описано выше. Готовое изделие содержит контейнер и этикетку или листок-вкладыш, которая(ый) находится на контейнере или идет вместе с ним. Подходящие контейнеры включают, например, бутылки, флаконы, шприцы, блистерные упаковки и т.д. Контейнеры могут быть изготовлены из различных материалов, таких как стекло или пластик. Контейнер содержит композицию конъюгата антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)), которая является эффективной для лечения патологии и может иметь стерильный порт доступа (например, контейнер может представлять собой пакет с раствором или флакон с пробкой, прокалываемой иглой для подкожной инъекции). По меньшей мере одно активное вещество в композиции представляет собой КАЛС (ADC). Этикетка или листок-вкладыш указывает на то, что композиция применяется для лечения патологии по выбору, такой как рак. В альтернативном или дополнительном варианте изделие может дополнительно содержать второй (или третий) контейнер, содержащий фармацевтически приемлемый буфер, такой как бактериостатическая вода для инъекций (БВДИ (BWFI)), фосфатно-буферный солевой раствор, раствор Рингера или раствор декстрозы. Изделие может дополнительно включать в себя другие материалы, желательные с коммерческой и потребительской точки зрения, в том числе другие буферы, разбавители, фильтры, иглы и шприцы.
ПРИМЕРЫ
Пример 1. Получение моноалкилирующих пирролбензодиазепиновых лекарственных компонентов (таблица 1а)
Синтез (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-2,3-дигидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5(11aH)-она DM-1
Figure 00000030
К раствору трет-бутил (5-((5-(5-амино-4-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-2-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метоксифенил)карбамат 1 (0,50 г, 0,524 ммоль) в ДХМ (5,0 мл) добавляли пиридин (83 мг, 1,05 ммоль), с последующим добавлением аллилхлорформиата, Alloc-Cl (95 мг, 0,786 ммоль, Sigma Aldrich, номер ХРС(CAS - Chemical Abstracts Service) 2937-50-0) при 16 oC. Смесь перемешивали в течение 12 часов. Смесь разбавляли ДХМ (30 мл) и промывали водным HCl (1 н., 5,0 мл ×2), а затем водным NaHCO3 (5 мл ×2). Органический слой концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали колонкой для отгона легких фракции (20% EtOAc в петролейном эфире) с получением третбутил (5-((5-(5-(((аллилокси)карбонил)амино)-4-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-2-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метоксифенил)карбамата 2 (500 мг, 92%) в виде бесцветного масла. ЖХМС: (ИЭР(ионизация электрораспылением, ESI - Electrospray ionization), 10-80, AB, 1,5 мин), ВУ (время удержания, ВУ - retention time)=1,200 мин, масса/заряд=1037 [M+1]+.
Раствор соединения 2 (500 мг, 0,48 ммоль) в HOAc/ТГФ(тетрагидрофуран,)/H2O (6 мл/3 мл/2 мл) перемешивали при комнатной температуре в течение 1 дня. Раствор разбавляли EtOAc (60 мл), промывали H2O (20 мл × 4), водным раствором NaHCO3 (20 мл × 2), и H2O (20 мл). Органический слой сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом, чтобы получить трет-бутил (5-((5-(5-(((аллилокси)карбонил)амино)-4-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-2-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метоксифенил)карбамат 3 (390 g, 100%) в виде масла.
К перемешиваемому раствору соединения 3 (200 мг, 0,247 ммоль) в безводном ДХМ (15 мл) добавляли перйодат Десса-Мартина (419 мг, 0,988 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 часов. Реакцию гасили (деактивация любых непрореагировавших реагентов) с помощью водного раствора Na2SO3 (30 мл) при 0°C и экстрагировали ДХМ (20 мл × 3). Объединенный органический слой промывали насыщенным водным раствором хлорида натрия (20 мл), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали с помощью предварительной ТСХ (ДХМ /MeOH=20:1) чтобы получить аллил (11S,11aS)-8-((5-(((11S,11aS)-10-(трет-бутоксикарбонил)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 4 (80 мг, 40,2%) в виде бесцветного твердого вещества. ЖХМС (ИЭР(ESI)): ВУ=0,709 мин, M-Boc-H2O+H+=687,1. Способ=5-95AB/1,5 мин.
Раствор соединения 4 (80 мг, 0,099 ммоль) в ТФК (2,0 мл) перемешивали при 0°C в течение 0,5 часа. Раствор добавляли по каплям в насыщенный раствор NaHCO3 (120 мл) при 0°C. Смесь экстрагировали ДХМ (20 мл ×3) и объединенный органический слой сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали с получением неочищенного аллил (11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата 5 (50 мг, 73,5%).
К перемешиваемому раствору соединения 5 (50 мг, 0,073 ммоль) в безводном ДХМ (4,0 мл) добавляли HOAc (13 мг, 0,219 ммоль), а затем NaBH3CN (23 мг, 0,365 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Затем смесь концентрировали под вакуумом и очищали предварительной ТСХ (ДХМ /MeOH=9:1), чтобы получить аллил-(11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 6 (40 мг, 80,0%) в виде бесцветного твердого вещества. ЖХМС (ИЭР (ESI)): ВУ=3,085 мин, M+H+=689,1. способ=10-80AB /7 мин.
К перемешиваемому раствору соединения 6 (40 мг, 0,058 ммоль) в безводном ДХМ (3,0 мл) добавляли пирролидин (21 мг, 0,29 ммоль), а затем Pd(PPh3)4 (7,0 мг, 0,006 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в атмосфере N2 в течение 2 часов. Затем смесь концентрировали под вакуумом и очищали предварительной ТСХ (ДХМ /MeOH=1:1) с получением DM-1 (12 мг, 35,3%) в виде не совсем белого твердого вещества. ЖХМС (ИЭР (ESI)): ВУ=0,651 мин, M+H+=587,1. способ=5-95AB /1,5 мин 1H ЯМР (400 MГц, DCCl3) δ 7,67 (d, J=4,4 Гц, 1H), 7,57 (s, 1H), 7,49 (s, 1H), 6,79 (s, 1H), 6,04 (s, 1H), 5,18 (d, J=11,6 Гц, 2H), 5,04 (d, J=11,2 Гц, 2H), 4,41-4,37 (m, 1H), 4,28-4,25 (m, 3H), 4,13-4,00 (m, 3H), 3,98-3,95 (m, 2H), 3,93 (s, 3H), 3,89-3,85 (m, 1H), 3,82 (s, 3H), 3,54 (d, J=30 Гц, 1H), 3,34-3,28 (dd, J=12,4, 9,2 Гц, 1H), 3,15-3,08 (m, 1H), 2,96-2,86 (m, 2H), 2,44-2,39 (dd, J=15,2, 6,0 Гц, 1H), 1,95-1,90 (m, 4H), 1,67-1,62 (m, 2H).
Синтез (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-2,3-дигидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5,11(10H,11aH)-диона DM-2
Figure 00000031
К перемешиваемому раствору ди-трет-бутил ((pentane-1,5-диилбис(окси))бис(6-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метокси-3,1-фенилен))дикарбамата 7 (200 мг, 0,24 ммоль) в безводном ДХМ (20 мл) был добавлен ДМП (перйодат Десса-Мартина, DMP) (610 мг, 1,44 ммоль) при 0°C. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 3 часов. Смесь разбавляли EtOAc (100 мл) и гасили водным раствором Na2SO3 (30 мл) при 0°C. Органический слой промывали H2O (30 мл ×3), водным раствором NaHCO3 (30 мл), и H2O (30 мл), затем сушили над (Na2SO4), фильтровали и концентрировали. Остаток очищали с помощью предварительной ВЭЖХ, чтобы получить третбутил (S)-8-((5-(((11S,11aS)-10-(трет-бутоксикарбонил)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-7-метокси-2-метилен-5,11-диоксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 8 (58 мг, 30,0%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (ИЭР (ESI)): ВУ=0,748 мин, M+Na+=841,4. способ=5-95AB /1,5 мин.
Раствор соединения 8 (58 мг, 0,07 ммоль) в 95% ТФК/H2O (2,0 мл) перемешивали при 0°C в течение 2 часов. Затем раствор добавляли по каплям в насыщенный раствор NaHCO3 (120 мл) при 0°C. Смесь экстрагировали ДХМ (20 мл ×3). Объединенный органический слой сушили над Na2SO4, фильтровали, концентрировали и очищали подготавливающей ВЭЖХ с получением DM-2 (15,7 мг, 38%) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ м.д. 1,65-1,73 (m, 2 H) 1,89-2,00 (m, 4 H) 2,77-2,89 (m, 1 H) 2,91-3,00 (m, 1 H) 3,08-3,19 (m, 1 H) 3,46 (d, J=16,6 Гц, 1 H) 3,91 (s, 3 H) 3,94 (s, 3 H) 4,02 (t, J=6,5 Гц, 2 H) 4,06-4,19 (m, 2 H) 4,20-4,26 (m, 2 H) 4,30 (s, 2 H) 4,43 (d, J=15,6 Гц, 1 H) 5,09-5,26 (m, 4 H) 6,41 (s, 1 H) 6,80 (s, 1 H) 7,43 (s, 1 H) 7,51 (s, 1 H) 7,71 (d, J=4,5 Гц, 1 H) 7,83 (s, 1 H).
Синтез (S)-8-метокси-9-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-1,3,4,12a-тетрагидро-6H-бензо[e][1,4]оксазино[4,3-a][1,4]диазепин-6,12(11H)-диона DM-3
Figure 00000032
Раствор метил-4-гидрокси-3-метоксибензоата 38 (3,0 г, 16,5 ммоль) в ДМФА (DMF) (100 мл) добавляли бензилбромид (4,22 г, 24,7 ммоль) и K2CO3 (4,56 г, 32,9 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 100°C в течение 3 часов. Смесь концентрировали под вакуумом и растворяли в воде (50 мл), экстрагировали EtOAC (30 мл ×2), промывали NaCl (30 мл), сушили над Na2SO4. Ее концентрировали и очищали хроматографией на силикагеле (0-30% EtOAc в петролейном эфире) с получением метил 4-(бензилокси)-3-метоксибензоата 39 (3,8 г, 13,5 ммоль, выход 82,2%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): КТ=0,787 мин, [M+H]+272,9.
Раствор 39 (2,0 г, 7,34 ммоль) в HOAc (5,0 мл) добавляли к смеси HOAc (5,0 мл) и HNO3 (20,6 мл, 441 ммоль) при 0 °C. Реакционную смесь перемешивали при 20 °С в течение 30 мин. Смесь выливали в ледяную воду (100 мл) и доводили рН до 5-6. Смесь фильтровали и фильтраты концентрировали с получением метил-4-(бензилокси)-5-метокси-2-нитробензоата 40 (2,3 г, 7,25 ммоль, выход 98,7%) в виде желтого твердого вещества.
Раствор 40 (2,3 г, 7,25 ммоль) в МеОН (20 мл) добавляли к раствору LiOH (2,25 мл, 36,24 ммоль) в воде (5 мл). Реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 2 часов. Смесь выливали в воду (50 мл) и промывали EtOAc (50 мл). pH водной фазы доводили до 3-4 с помощью 2 М HCl и экстрагировали EtOAc (50 мл ×3). Промывали NaCl (25 мл), сушили над Na2SO4 и концентрировали под вакуумом с получением неочищенной 4-(бензилокси)-5-метокси-2-нитробензойной кислоты 41 (2,0 г, 6,59 ммоль, выход 91%) в виде белого твердого вещества.
Смесь 41 (460,0 мг, 1,52 ммоль) и метил (S)-морфолин-3-карбоксилата 42, регистрационный ХРС(CAS) № 741288-31-3, Hicks, F. et al, (2013) Organic Process Research & Development, 17(5):829-837, (330 мг, 2,28 ммоль) и диизопропилэтиламина, ДИЭА (DIEA) (392 мг, 3,03 ммоль) в ДХМ (30 мл) добавляли HATU (865 мг, 2,28 ммоль). Реакционный раствор перемешивали при 20°C в течение 8 часов. Раствор концентрировали под вакуумом и очищали хроматографией на силикагеле (0-50% EtOAC в петролейном эфире) с получением метил(S)-4-(4-(бензилокси)-5-метокси-2-нитробензоил)морфолин-3-карбоксилата 43 (520 мг, 1,21 ммоль, выход 79,7%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,731мин, [M+Na]+453,0.
Раствор NH4Cl (646 мг, 12,1 ммоль) в EtOH (20 мл) и воде (15 мл) добавляли 43 (520 мг, 1,21 ммоль) и железо (539 мг, 9,67 ммоль). После того как реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 12 часов, ее фильтровали и фильтраты экстрагировали EtOAc (50 мл ×3), промывали NaCl (20 мл), сушили над Na2SO4 и концентрировали под вакуумом. Реакционную смесь очищали хроматографией на силикагеле (0-30% EtOAc в петролейном эфире) с получением (S)-9-(бензилокси)-8-метокси-1,3,4,12a-тетрагидро-6H-бензо[e][1,4]оксазино[4,3-a][1,4]диазепин-6,12(11H)-диона 44 (320 мг, 0,84 ммоль, выход 69,7%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,638 мин, [M+H]+368,9.
Раствор 44 (260 мг, 0,71 ммоль) в ДХМ (10 мл) и МеОН (1,0 мл) добавляли 10% палладия на угле (26,0 мг, 0,020 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 18°C в течение 1 часа при H2 (15 фунтов на квадратный дюйм). Реакционную смесь фильтровали и концентрировали под вакуумом, получая (S)-9-гидрокси-8-метокси-1,3,4,12a-тетрагидро-6H-бензо[e][1,4]оксазино[4,3-a][1,4]диазепин-6,12(11H)-дион 45 (100 мг, 0,359 ммоль, 50,9%) в виде белого твердого вещества.
Раствор трет-бутил (11S,11aS)-8-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-11-((тетрагидро-2H-пиран-2-ил)окси)-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 46 (200 мг, 0,43 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл) добавляли K2CO3 (60 мг, 0,43 ммоль) и 1,5-дииодопентан (703 мг, 2,17 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 12 часов. Реакционную смесь концентрировали и очищали с помощью хроматографии на силикагеле (0-50% EtOAc в петролейном эфире) с получением трет-бутил (11S,11aS)-8-((5-иодпентил)окси)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-11-((тетрагидро-2H-пиран-2-ил)окси)-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата 47 (129 мг, 0,191 ммоль, 43,9%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,907 мин, [M+H]+657,1.
Смесь 47 (100 мг, 0,150 ммоль), 45 (50,9 мг, 0,18 ммоль) и K2CO3 (31,6 мг, 0,23 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл). Смесь перемешивали при 90°C в течение 3 часов. Смесь концентрировали под вакуумом и очищали хроматографией (0-5% MeOH в ДХМ Rf=0,4), получая трет-бутил (11S,11aS)-7-метокси-8-((5-(((S)-8-метокси-6,12-диоксо-3,4,6,11,12,12a-гексагидро-1H-бензо[e][1,4]оксазино[4,3-a][1,4]диазепин-9-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-11-((тетрагидро-2H-пиран-2-ил)окси)-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 48 (75 мг, 0,093 ммоль, выход 61%) в виде бесцветного масла.
Соединение 48 (75,0 мг, 0,090 ммоль) добавляли ТФК (1,9 мл) и воду (0,10 мл) при 0°С. Смесь перемешивали при 17°C в течение 1 часа. Реакционную смесь выливали в насыщенный раствор NaHCO3 (200 мл) и экстрагировали ДХМ (100 мл × 3), промывали насыщенным раствором соли (50 мл), сушили и очищали с помощью подготавливающей ТСХ (4% метанола в ДХМ Rf=0,5), получая DM-3 (18,9 мг, 0,030 ммоль, выход 32,3%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,633 мин, [M+H]+ 605,2, 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 8,16 (s, 1H), 7,64 (d, J=4,4 Гц, 1H), 7,43 (s, 1H), 7,22 (d, J=23,2 Гц, 1H), 6,73 (d, J=2,4 Гц, 1H), 6,35(d, J=2,8 Гц, 1H), 5,11 (d, J=10,8 Гц, 2H), 4,41 (s, 3H), 4,38 (s, 2H), 4,22 (s, 3H), 4,05 (s, 3H), 4,04 (s, 3H), 4,02 (s, 3H), 3,95-3,92 (m, 1H), 3,86 (s, 1H), 3,83-3,62 (m, 1H), 3,18 (s, 1H), 2,88 (d, J=30,8 Гц, 1H), 1,86 (s, 4H) 1,79-1,62 (m, 2H).
Синтез (S)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-5-он DM-5
Figure 00000033
К раствору трет-бутил (S)-2-(гидроксиметил)пирролидин-1-карбоксилат 25 (3,0 г, 14,9 ммоль) в ДХМ (80 мл) добавляли перйодат Десса-Мартина, ПДМ (9,48 г, 22,4 ммоль). После перемешивания смеси при 0°C в течение 1 часа добавляли Na2S2O3 (50 мл)/NaHCO3 (50 мл) и МТБЭ (метил-трет-бутиловый эфир, MTBE) (130 мл). Органическую фазу промывали водой (60 мл × 3) и концентрировали с получением трет-бутил-(S)-2-формилпирролидин-1-карбоксилата 26 (2,9 г, 14,6 ммоль, выход 97,6%) в виде бесцветного масла.
К раствору соединения 26 (2,9 г, 14,6 ммоль) и диметил (1-диазо-2-оксопропил) фосфоната в MeOH (20 мл) добавляли K2CO3 (6,03 г, 43,7 ммоль). После того как реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 1 часа, ее концентрировали под вакуумом, остаток очищали колоночной хроматографией (10% EtOAc в РЕ) с получением трет-бутил (S)-2-этинилпирролидин-1-карбоксилата 27 (2,0 г, 10,24 ммоль, выход 70,4%) в виде бесцветного масла.
К раствору соединения 27 (2,0 г, 10,2 ммоль) и метил-4- (бензилокси)-2-бром-5-метоксибензоата 28 (5,4 г, 15,4 ммоль) в ДМФА (DMF) (50 мл) добавляли Cs2CO3 (3,97 г, 20,5 ммоль) и Pd(PPh3)4 (785 мг, 1,54 ммоль). Смесь перемешивали при 95°C в атмосфере азота в течение 1 часа. Смесь концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией (20% EtOAc в РЕ) с получением трет-бутил (S)-2-((5-(бензилокси)-4-метокси-2-(метоксикарбонил)фенил) этинил)пирролидин-1-карбоксилата 29 (1,60 г, 2,44 ммоль, выход 23,8%) в виде бесцветного масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,994 мин, [M+H-56]+410,0.
К раствору соединения 29 (2,0 г, 4,3 ммоль) в MeOH (10 мл) добавляли Pd/CaCO3 (200,0 мг, 21,5 ммоль). Смесь перемешивали при 30°C в течение 1 часа в атмосфере водорода (1 атм). Смесь фильтровали и фильтрат концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной флэш-хроматографией (10% EtOAc в РЕ), чтобы получить трет-бутил (S,Z)-2-(5-(бензилокси)-4-метокси-2-(метоксикарбонил)стирил)пирролидин-1-карбоксилат 30 (1,0 г, 2,14 ммоль, выход 49,8%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,983 мин, [M+Na]+490,1.
К раствору соединения 30 (0,9 г, 1,92 ммоль) в EtOAc (10 мл) добавляли HCl/EtOAc (6,0 мл). После перемешивания смеси при 25°C в течение 1 часа ее концентрировали, получая метил (S,Z)-4-(бензилокси)-5-метокси-2-(2-(пирролидин-2-ил)винил)бензоат 31 (0,77 г, 1,90 ммоль, выход 99%) в виде белого твердого вещества.
К раствору соединения 31 (0,77 г, 1,91 ммоль) в MeOH (30 мл) добавляли NaOMe (1,03 г, 19,06 ммоль). Смесь перемешивали при 30°C в течение 2 часов. Смесь концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией (25-75% EtOAc в РЕ), получая (S)-8-(бензилокси)-7-метокси-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-5-он 32 (0,60 г, 1,79 ммоль, выход 93,8%) в виде желтого масла. 1H ЯМР (400 MГц, CDCl3)δ м.д. 1,89-2,11 (m, 3 H) 2,18-2,33 (m, 1 H) 3,59 (dt, J=12,0, 7,6 Гц, 1 H) 3,80 (dt, J=11,5, 5,8 Гц, 1 H) 3,90-3,96 (m, 1 H) 3,97 (s, 3 H) 5,19 (s, 2 H) 5,86 (dd, J=10,0, 4,8 Гц, 1 H) 6,53 (dd, J=10,0, 2,0 Гц, 1 H) 6,69 (s, 1 H) 7,29-7,35 (m, 1 H) 7,36-7,41 (m, 2 H) 7,42-7,48 (m, 2 H) 7,62 (s, 1 H).
К раствору соединения 32 (580 мг, 1,73 ммоль) в ДХМ (50 мл) добавляли TiCl4 (656 мг, 3,46 ммоль). Смесь перемешивали при 30°C в течение 12 часов. Смесь добавляли 1 М HCl (20 мл) и EtOAc (100 мл). Органический слой промывали водой (50 мл ×3) и концентрировали с получением (S)-8-гидрокси-7-метокси-1,2,3,11a-тетрагидро-5H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-5-он 33 (250 мг, 0,44 ммоль, выход 25,3%) в виде желтого твердого вещества.
Раствор соединения 33 (50,0 мг, 0,20 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл) добавляли K2CO3 (42,26 мг, 0,31 ммоль) и 1,5-дииопентан (333 мг, 1,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 3 часов. Реакционную смесь очищали хроматографией на силикагеле (0-50% EtOAC в петролейном эфире) с получением (S)-8-((5-гидроксипентил)окси)-7-метокси-1,2,3,11а-тетрагидро-5Н-бензо[е]пирроло[1,2-а]азепин-5-он 34 (60 мг, 0,178 ммоль, выход 87,6%) в виде масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,765 мин, [M+H]+332,0.
К раствору соединения 34 (60,0 мг, 0,18 ммоль) в ДХМ (6,0 мл) добавляли триэтиламин (55 мг, 0,54 ммоль) и метансульфонилхлорид, MsCl (41 мг, 0,36 ммоль). После перемешивания смеси при 35°C в течение 1 часа EtOAc (80 мл) и промывали водой (50 мл × 3). Органический слой концентрировали, получая (S)-5-((7-метокси-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пи рроло[1,2-a]азепин-8-ил)окси)пентил метансульфонат 35 (70 мг) в виде бесцветного масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,679 мин, [M+H]+410,0.
К раствору соединения 35 (70 мг, 0,17 ммоль) и трет-бутил (11S,11aS)-8-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-11-((тетрагидро-2H-пиран-2-ил)окси)-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата 36 (87 мг, 0,19 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл) добавляли K2CO3 (47 мг, 0,34 ммоль) и KI (5,68 мг, 0,030 ммоль). Смесь перемешивали при 90°C в течение 3 часов и очищали подготавливающей ВЭЖХ (HCOOH), получая трет-бутил (11aR)-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a]азепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-11a-((тетрагидро-2H-пиран-2-ил)окси)-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 37 (70 мг, 0,084 ммоль, выход 49,2%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,845 мин, [M+H]+774,4.
Раствор соединения 37 (50 мг, 0,060 ммоль) в ТФК (1,9 мл) и воде (0,10 мл) перемешивали при 35°C в течение 1 часа. Смесь распределяли между насыщенным NaHCO3 (30 мл) и EtOAc (50 мл). Органический слой промывали водой (30 мл ×2) и насыщенным раствором соли (30 мл) и сушили над Na2SO4. Его концентрировали и очищали подготавливающей ТСХ (5% МеОН в ДХМ, Rf=0,5) с получением DM-5 (20 мг, 0,034 ммоль, выход 53,1%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,825 мин, [M+H]+572,1. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3)δ м.д. 1,65-1,75 (m, 3 H) 1,88-2,10 (m, 8 H) 2,19-2,31 (m, 1 H) 2,82-3,29 (m, 2 H) 3,60 (dt, J=11,9, 7,5 Гц, 1 H) 3,81 (dt, J=11,6, 5,9 Гц, 1 H) 3,86-3,91 (m, 1 H) 3,94 (s, 6 H) 3,97 (br. s., 1 H) 4,01-4,18 (m, 4 H) 4,30 (s, 2 H) 5,19 (d, J=10,6 Гц, 2 H) 5,89 (dd, J=9,9, 5,1 Гц, 1 H) 6,53-6,63 (m, 1 H) 6,66 (s, 1 H) 6,81 (s, 1 H) 7,51 (s, 1 H) 7,59 (s, 1 H) 7,68 (d, J=4,4 Гц, 1 H).
Пример 2. Получение моноалкилирующих пирролбензодиазепиновых линкер-лекарственных промежуточных соединений (таблица 2А)
Figure 00000034
1,2-ди(пиридин-2-ил)дисульфан и 2-меркаптоэтанол приводили в контакт в пиридине и метаноле при комнатной температуре с получением 2-(пиридин-2-илдисульфанил)этанола. Ацилирование с 4-нитрофенилкарбонохлоридатом в триэтиламине и ацетонитриле давало 4-нитрофенил-2- (пиридин-2-илдисульфанил)этилкарбонат 9.
К смеси 1,2-бис(5-нитропиридин-2-ил)дисульфана 10 (1,0 г, 3,22 ммоль) в безводном ДМФА (DMF)/МеОН (25 мл/25 мл) добавляли HOAc (0,1 мл), а затем 2-аминоэтантиол гидрохлорид 11 (183 мг, 1,61 ммоль). После того, как реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи, ее концентрировали под вакуумом для удаления растворителя и остаток промывали ДХМ (30 мл ×4) с получением 2-((5-нитропиридин-2-ил) дисульфанил)этанамин гидрохлорида 12 в виде бледно-желтого твердого вещества (300 мг, 69,6%). 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО (DMSO)-d 6 ) δ 9,28 (d, J=2,4 Гц, 1H), 8,56 (dd, J=8,8, 2,4 Гц, 1H), 8,24 (s, 4H), 8,03 (d, J=8,8 Гц, 1H), 3,15-3,13 (m, 2H), 3,08-3,06 (m, 2H).
Figure 00000035
Раствор 1,2-бис(5-нитропиридин-2-ил)дисульфана 10 (9,6 г, 30,97 ммоль) и 2-меркаптоэтанола (1,21 г, 15,49 ммоль) в безводном ДХМ /CH3OH (250 мл/250 мл) перемешивали при комнатной температуре в атмосфере азота в течение 24 часов. После концентрирования смеси под вакуумом, остаток разбавляли ДХМ (300 мл). Добавляли MnO2 (10 г) и смесь перемешивали при комнатной температуре в течение еще 0,5 часа. Смесь очищали колоночной хроматографией на силикагеле (ДХМ /MeOH=100/1 до 100/1) с получением 2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)этанола 13 (2,2 г, 61,1%) в виде коричневого масла. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,33 (d, J=2,8 Гц, 1H), 8,38-8,35 (dd, J=9,2, 2,8 Гц, 1H), 7,67 (d, J=9,2 Гц, 1H), 4,10 (t, J=7,2 Гц, 1H), 3,81-3,76 (q, 2H), 3,01 (t, J=5,2 Гц, 2H).
К раствору 13 (500 мг, 2,15 ммоль) в безводном ДМФА (DMF) (10 мл) добавляли ДИЭА (DIEA) (834 мг, 6,45 ммоль), после чего следовал PNP карбонат (бис(4-нитрофенил)карбонат, 1,31 г, 4,31 ммоль). Реакционный раствор перемешивали при комнатной температуре в течение 4 часов и смесь очищали подготовительной ВЭЖХ (FA) с получением 4-нитрофенил 2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)этилкарбоната 14 (270 мг, 33,1%) в виде светло-коричневого масла. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,30 (d, J=2,4 Гц, 1H), 8,43-8,40 (dd, J=8,8, 2,4 Гц, 1H), 8,30-8,28 (m, 2H), 7,87 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,39-7,37 (m, 2H), 4,56 (t, J=6,4 Гц, 2H), 3,21 (t, J=6,4 Гц, 2H).
Figure 00000036
Синтез (11S,11aS)-(R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5,11-диоксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата (LD-51)
Figure 00000037
В перемешиваемую суспензию 5-нитропиридин-2-тиола (334 мг, 2,14 ммоль) в сухом ДХМ (7,5 мл) при 0°С (лед/ацетон) в атмосфере аргона добавляли по каплям сульфурилхлорид (2,35 мл 1,0 М раствора в ДХМ, 2,35 ммоль). Реакционную смесь превращали из желтой суспензии в желтый раствор и оставляли нагреваться до комнатной температуры, затем перемешивали в течение 2 часов, после чего растворитель удаляли выпариванием под вакуумом с получением желтого твердого вещества. Твердое вещество повторно растворяли в ДХМ (15 мл) и обрабатывали по каплям раствором (R)-2-меркаптопропан-1-ола (213 мг, 2,31 ммоль) в сухом ДХМ (7,5 мл) при 0°С в атмосфере аргона. Реакционной смеси давали нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение 20 часов, после чего анализ методом ЖХ/МС показал значительное образование продукта во время удерживания 1,41 мин (ES+) масса/заряд 247 ([M+ H]+, около 100% относительная интенсивность). Осадок удаляли фильтрованием и фильтрат выпаривали под вакуумом, получая оранжевое твердое вещество, которое обрабатывали H2O (20 мл) и подщелачивали раствором гидроксида аммония. Смесь экстрагировали ДХМ (3×25 мл) и объединенные экстракты промывали H2O (20 мл), насыщенным раствором соли (20 мл), сушили (MgSO4), фильтровали и выпаривали под вакуумом с получением неочищенного продукта. Очистка флеш-хроматографией (градиентное элюирование с шагом увеличения 1%: 100% ДХМ до 98:2 об./об. ДХМ /MeOH) давала (R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропан-1-ол 15 в виде масла (111 мг, выход 21%).
К раствору трифосгена Cl3COCOOCCl3, Sigma Aldrich, регистрационный ХРС(CAS) № 32315-10-9 (241 мг, 0,812 ммоль) в ДХМ (10 мл) добавляли раствор (R)-2 -((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропан-1-ола 15 ( 500 мг, 2,03 ммоль) и пиридина (153 мг, 1,93 ммоль) в ДХМ (10 мл) по каплям при 20°C. После того, как реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 30 мин, ее концентрировали и (R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропилкарбонохлоридат 16 использовали непосредственно на следующей стадии без дополнительной очистки.
Раствор соединения 16 (626 мг, 2,03 ммоль) в ДХМ (10 мл) добавляли по каплям к раствору трет-бутил (5-((5-(5-амино-4-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-2-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метоксифенил)карбамата 1 (1,50 г, 1,57 ммоль) и пиридина (161 мг, 2,05 ммоль) при 20 oC. Реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 3 часов. Растворитель удаляли и остаток очищали флэш-хроматографией на колонке (EtOAc в петролейном эфире 0~30%), получая трет-бутил (2-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-5-((5-(4-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метокси-5-((((R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)проpокси)карбонил)амино)фенокси)пентил)окси)-4-метоксифенил)карбамат 17 (1,6 г, 83%) в виде желтой пены. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=1,360 мин, [M+Na]+1247,4.
К раствору соединения 17 (900 мг, 0,734 ммоль) в ТГФ/Н2О (10 мл/10 мл) добавляли HOAc (15 мл) при 20°C. Реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 24 часов. Реакционную смесь разбавляли EtOAc (50 мл) и промывали водой (2×20 мл), насыщенным водным раствором NaHCO3 (30 мл) и насыщенным раствором соли (30 мл). Ее сушили и концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали флэш-хроматографией (ДХМ:MeOH=100:1~20:1), чтобы получить трет-бутил (2-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-5-((5-(4-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метокси-5-((((R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропокси)карбонил)амино)фенокси)пентил)окси)-4-метоксифенил)карбамат 18 (700 мг, 95,6%) в виде желтой пены. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,978 мин, [M+H]+997,6.
К раствору соединения 18 (700 мг, 0,702 ммоль) в ДХМ (40 мл) добавляли прейодат Десса-Мартина, ПДМ, 1,1,1-Трис (ацетилокси)-1,1-дигидро-1,2-бензиодоксол-3-(1H)-он, Sigma Aldrich, регистрационный ХРС(CAS) № 87413-09-0 (1,19 мг, 2,81 ммоль) при 20°C. Реакционную смесь перемешивали при 20°C в течение 1 часа. Реакцию гасили насыщенным раствором NaHCO3/Na2SO3 (20 мл/20 мл) и экстрагировали с помощью ДХМ (3×10 мл). Объединенный органический слой промывали NaHCO3/Na2SO3 (10 мл/10 мл), насыщенным раствором соли (20 мл), сушили и концентрировали, получая смесь трет-бутил (11S,11aS)-11-гидрокси-8-((5-(((11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-10-(((R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропокси)карбонил)-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата 19 (ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ =0,912 мин, [M+Na]+1015,3) и трет-бутил (S)-8-((5-(((11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-10-(((R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропокси)карбонил)-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-7-метокси-2-метилен-5,11-диоксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата 20, которая была непосредственно использована в следующей стадии.
Холодную ТФК (8 мл) добавляли к неочищенной смеси 19 и 20 (600 мг, 0,604 ммоль) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин. Реакционную смесь добавляли по каплям к холодному насыщенному водному раствору NaHCO3 (150 мл) при 0°C и экстрагировали ДХМ (4×40 мл). Объединенный органический слой промывали насыщенным раствором соли (50 мл), сушили и концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью подготавливающей ТСХ (ДХМ:MeOH=15:1) для отделения чистого LD-51 (28 мг, 5,2%), в виде желтой пены. ЖХМС: (5-95, АВ, 1,5 мин), 0,739 мин, масса/заряд=891,2 (М +1). 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,26 (s, 1H), 8,31 (d, J=6,8 H, 1Гц), 8,18 (s, 1H), 7,62 (d, J=8,4 Гц, 1H), 7,41 (s, 1H), 7,18 (s, 1H), 6,77 (s, 1H), 6,41 (s, 1H), 5,60 (d, J=10,0 Гц, 1H), 5,20-5,06 (m, 4H), 4,50-3,81 (m, 18H), 3,70-3,60 (m, 1H), 3,50-3,40 (m, 1H), 3,18 (br, 1H), 2,98-2,62 (m, 6H), 1,95-1,86 (m, 4H), 1,70-1,52 (m, 2H), 1,17 (d, J=6,4 Гц, 3H).
Синтез (11S,11aS)-(R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил 11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата (LD-52)
К раствору CLD-1 (45 мг, 0,050 ммоль) в ТГФ (3,0 мл) добавляли NaBH3CN (3 мг, 0,050 ммоль) и HOAc (0,05 мл) при 0 oC. Смесь перемешивали при 0°C в течение 2 мин. Реакционный раствор очищали подготавливающей ТСХ (7% метанол в ДХМ, Rf=0,5) с получением LD-52 (20 мг, 0,022 ммоль, выход 42,1%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,878 мин, [M+H]+877,2. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,19 (s, 1H), 8,27 (d, J=6,8 Гц, 1H), 7,58 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,53 (s, 1H), 7,24 (s, 1H), 6,69 (s, 1H), 6,02 (s, 1H), 5,56 (d, J=9,7 Гц, 1H), 5,12 (s, 2H), 5,05 (d, J=11,2 Гц, 2H), 4,54 (br.s, 1H), 4,42-4,38 (m, 1H), 4,29-4,22 (m, 4H), 4,13-4,09 (m, 1H), 4,02-3,39 (m, 8H), 3,79 (s, 3H), 3,63 (t, J=8,0 Гц, 1H), 3,53 (d, J=11,9 Гц, 1H), 3,37-3,31 (m, 1H), 3,16-3,14 (m, 1H), 2,94-2,88 (m, 2H), 2,74-2,71 (m, 1H), 2,44-2,39 (m, 1H), 1,93-1,85 (m, 4H), 1,66-1,56 (m, 2H), 1,24-1,14 (m, 3H).
Пример 3. Получение компараторных пирролбензодиазепиновых линкер-лекарственных промежуточных соединений (таблица 2В)
Синтез (R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропил (11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата (CLD-1)
К раствору 18 (50 мг, 0,050 ммоль) в ДХМ (2,0 мл) добавляли ПДМ (149 мг, 0,35 ммоль) при 25°C. Реакционную смесь перемешивали при 25°C в течение 2 часов. Реакционную смесь разбавляли ДХМ (5 мл) и гасили насыщенным раствором NaHCO3/Na2SO3 (2 мл/2 мл) и экстрагировали ДХМ (2×5 мл). Объединенный органический слой промывали NaHCO3/Na2SO3 (2 мл/2 мл), насыщенным раствором соли (5 мл), сушили и концентрировали. Остаток очищали с помощью подготавливающей ТСХ ДХМ:MeOH=20:1), получая трет-бутил (11S,11aS)-11-гидрокси-8-((5-(((11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-10-(((R)-2-((5-нитропиридин-2-ил)дисульфанил)пропокси)карбонил)-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 19, который использовался непосредственно в следующем этапе. ЖХМС: (5-95, АВ, 1,5 мин), 0,830 мин, масса/заряд=1013,4 (М +23).
Холодную ТФК (1 мл) добавляли к 19 (20 мг, 0,020 ммоль) при 0 oC. Реакционную смесь перемешивали при 0°C в течение 20 мин. Реакционную смесь добавляли по каплям к холодному насыщенному водному раствору NaHCO3 (20 мл) при 0°C и экстрагировали ДХМ (3×15 мл). Объединенный органический слой промывали насыщенным раствором соли (15 мл), сушили и концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью подготавливающей ТСХ (ДХМ:MeOH=15:1) с получением CLD-1 (4 мг, 23%) в виде серого твердого вещества. ЖХМС: (5-95, АВ, 1,5 мин), 0,89 мин, масса/заряд=873,6 (М +1). 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,22 (s, 1H), 8,38 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,78 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,68 (d, J=4,4 Гц, 1H), 7,49 (s, 1H), 7,33 (s, 1H), 6,82 (s, 1H), 6,77 (s, 1H), 5,20-5,13 (m, 4H), 4,36-4,26 (m, 5H), 4,20-3,95 (m, 7H), 4,89-3,70 (m, 8H), 3,50-2,70 (m, 5H), 2,05-1,82 (m, 4H), 1,40-1,15 (m, 3H).
Синтез 4-((S)-2-((S)-2-(6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексанамидо)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил(11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилата CLD-4
Figure 00000038
К раствору трифосгена (156 мг, 0,52 ммоль) в ДХМ (20 мл) добавляли раствор 1 (1,0 г, 1,05 ммоль) и Et3N (318 мг, 3,15 ммоль) в ДХМ (5,0 мл). Смесь перемешивали при 0°C в течение 1 часа и концентрировали с получением неочищенного промежуточного соединения, которое добавляли (0,88 г, 1,53 ммоль) в ДХМ (20 мл), добавляли к смеси триэтиламина (310 мг, 3,07 ммоль) и 6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)-N-((S)-1-(((S)-1-((4-(гидроксиметил)фенил)амино)-1-оксо-5-уреидопентан-2-ил)амино)-3-метил-1-оксобутан-2-ил)гексанамида, MC-VC-PAB (1,0 г, 1,02 ммоль) в ДМФА (DMF) (10 мл) при 0°C. Смесь разбавляли ДХМ (40 мл), промывали водой (2×30 мл). Органический слой сушили над Na2SO4, концентрировали и очищали хроматографией на силикагеле (0-10% MeOH в ДХМ ) с получением трет-бутил (2-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-5-((5-(4-((S)-2-(((трет-бутилдиметилсилил)окси)метил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-5-((((4-((S)-2-((S)-2-(6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексанамидо)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил)окси)карбонил)амино)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-4-метоксифенил)карбамата 21 (1,0 г, 0,64 ммоль, выход 62,4%) в виде желтого твердого вещества.
К раствору соединения 21 (1,0 г, 0,64 ммоль) в ТГФ (6,0 мл) добавляли воду (6,0 мл) и уксусную кислоту (9,0 мл). Смесь перемешивали при 20°C в течение 12 часов. В смесь добавляли EtOAc (100 мл), и органический слой промывали водой (50 мл ×3) и насыщенным раствором NaHCO3 (50 мл) и концентрировали, чтобы получить трет-бутил (5-((5-(5-((((4-((S)-2-((S)-2-(6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексанамидо)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил)окси)карбонил)амино)-4-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-2-метоксифенокси)пентил)окси)-2-((S)-2-(гидроксиметил)-4-метиленпирролидин-1-карбонил)-4-метоксифенил)карбамат 22 (700 мг, 0,53 ммоль, выход 82,1%) в виде белого твердого вещества.
К раствору 22 (597 мг, 0,45 ммоль) в ДМСО (DMSO) (5,0 мл) добавляли 2-иодоксибензойную кислоту, IBX (126 мг, 0,45 ммоль) при 18 oC. Реакционную смесь перемешивали при 37°C в течение 8 часов и очищали подготавливающей ВЭЖХ (ацетонитрил 40-70%/0,225% FA в воде) с получением трет-бутил (11S,11aS)-8-((5-(((11S,11aS)-10-(((4-((S)-2-((S)-2-((6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексил)амино)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил)окси)карбонил)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,10,11,11a-гексагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-11-гидрокси-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат гидрата 23 (120 мг, 0,089 ммоль, выход 19,8%) в виде белого твердого вещества.
Раствор 23 (100 мг, 0,080 ммоль) в ТФК (4,0 мл) перемешивали при 0°C в течение 30 минут, а затем добавляли к холодному насыщенному раствору NaHCO3 (40 мл). Его экстрагировали EtOAc (60 мл ×3). Объединенные органические слои концентрировали, получая 4-((S)-2-((S)-2-(6-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)гексанамидо)-3-метилбутанамидо)-5-уреидопентанамидо)бензил (11S,11aS)-11-гидрокси-7-метокси-8-((5-(((S)-7-метокси-2-метилен-5-оксо-2,3,5,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-8-ил)окси)пентил)окси)-2-метилен-5-оксо-2,3,11,11a-тетрагидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат 24 (90 мг) в виде желтого твердого вещества, которое непосредственно использовалось в следующей стадии.
К раствору соединения 24 (90 мг, 0,070 ммоль) в ДМФА (DMF) (4,0 мл) добавляли триацетоксиборгидрид натрия (9,42 мг, 0,1500 ммоль). Цианоборгидрид натрия также можно использовать в качестве восстановителя. Смесь перемешивали при 20°C в течение 30 мин. Полученный остаток очищали подготавливающей ВЭЖХ (ацетонитрил 0-40/0,1% HCl в воде) с получением CLD-4 (28 мг, 0,022 ммоль, выход 29,5%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС: (5-95, АВ, 1,5 мин), 0,832 мин, масса/заряд=602,7, 1203,6 (M+1).
Пример 4. Получение антител с внесенным цистеином для конъюгации путем восстановления и повторного окисления
Аминокислоты легкой цепи нумеруют в соответствии с нумерацией Кабата (Kabat et al., Sequences of proteins of immunological interest, (1991) 5th Ed., US Dept of Health and Human Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD). Аминокислоты тяжелой цепи нумеруют в соответствии с системой нумерации ЕС (Edelman et al (1969) Proc. Natl. Acad. of Sci. 63(1):78-85), за исключением случаев, когда отмечено что нумерация выполнена по Кабату. Используются однобуквенные аббревиатуры аминокислот.
Полноразмерные моноклональные антитела с внесенным цистеином (THIOMAB™), экпрессированные в клетках CHO, содержат цистеиновые аддукты (цистины) или являются глутатионилированными по внесенных цистеинах в связи с условиями культивирования клеток. Как есть, THIOMAB™ выделенные из клеток СНО нельзя конъюгировать с Cys-реакционноспособными линкер-лекарственными промежуточными соединениями. Антитела с внесенным цистеином могут быть сделаны реакционноспособными для конъюгации с линкер-лекарственными промежуточными соединениями, такими как в таблице 2А, путем обработки восстановителем, таким как ДТТ (DTT) (реактив Клеланда, дитиотреитол) или TCEP (трис(2-карбоксиэтил)фосфин гидрохлорид, Getz et al (1999) Anal. Biochem. Vol 273:73-80; Soltec Ventures, Беверли, Массачусетс) с последующим повторным формированием межцепочечных дисульфидных связей (повторное окисление) мягким окислителем, таким как дегидроаскорбиновая кислота. Полноразмерные моноклональные антитела с внесенным цистеином (THIOMAB™), экспрессированные в клетках CHO (Gomez et al (2010) Biotechnology and Bioeng. 105(4):748-760; Gomez et al (2010) Biotechnol. Prog. 26:1438-1445) были восстановлены, например, с помощью около 50-кратного избытка ДТТ (DTT) в течение ночи в 50 мМ Трис, pH 8,0 с 2 мМ ЭДТА при комнатной температуре, который удаляет Cys и глутатионовые аддукты, а также восстанавливает межцепочечные дисульфидные связи в антителе. Удаление аддуктов контролировалось обращенно-фазовой ЖХМС с использованием колонки PLRP-S. Восстановленный THIOMAB™ разбавляли и подкисляли добавлением по меньшей мере к четырем объемам 10 мМ сукцината натрия, буфер рН 5.
В альтернативном варианте, антитело разбавляли и подкисляли путем добавления по меньшей мере к четырем объемам 10 мМ сукцината, рН 5 и титровали 10% уксусной кислотой до тех пор, пока рН не составляло около пяти. Затем пониженный pH и разбавленный THIOMAB™ загружали в ионообменную колонку HiTrap S, промывали несколькими объемами колонки 10 мМ ацетата натрия, pH 5 и элюировали 50 мМ Tris, pH 8,0, 150 мМ хлорида натрия. Дисульфидные связи восстанавливались между остатками цистеина, присутствующими в исходном Mab, путем повторного окисления. Элюированный восстановленный THIOMABTM, описанный выше, обрабатывается 15X дегидроаскорбиновой кислотой (DHAA) в течение около 3 часов или, в альтернативном варианте, от 200 нМ до 2 мМ водным сульфатом меди (CuSO4) при комнатной температуре в течение ночи. Могут быть применены другие окислители, то есть окисляющие вещества и окислительные условия, которые известны в данной области техники. Также может быть эффективным окисление окружающим воздухом. Этот мягкий, частично повторно окисляющий этап с высокой точностью формирует внутрицепочечные дисульфидные связи. Повторное окисление контролировали обращенно-фазовой ЖХМС с применением колонки PLRP-S. Повторно окисленный THIOMAB™ разбавляли сукцинатным буфером, как описано выше, для достижения рН около 5, и очистку на колонке S проводили, как описано выше, за исключением того, что элюирование проводили с помощью градиента 10 мМ сукцинат, рН 5, 300 мМ натрий хлорид (буфер B) в 10 мМ сукцинате, рН 5 (буфер А). К элюированному THIOMAB™ добавляли EDTA до конечной концентрации 2 мМ и концентрировали, если необходимо, до конечной концентрации больше чем 5 мг/мл. Полученный THIOMAB™, готовый к конъюгации, хранили при -20°C в аликвотах. Жидкостную хроматографию/масс-спектрометрический анализ проводили на серии 6200 TOF или QTOF Agilent ЖХ/МС. Образцы хроматографировали на микрокапиллярной колонке PRLP-S®, 1000 A, (50 мм ×2,1 мм, Polymer Laboratories, Шропшир, Великобритания), нагретой до 80°C. Использовали линейный градиент от 30-40% B (растворитель A: 0,05% ТФК в воде, растворитель B: 0,04% ТФК в ацетонитриле), и элюент был непосредственно ионизирован с использованием источника электрораспыления. Данные были собраны и скорректированы c поправкой на помехи программным обеспечением MassHunter. Перед анализом ЖХ/МС антитела или лекарственные конъюгаты (50 мкг) обрабатывали PNGase F (2 единицы/мл, Prozyme, Сан-Леандро, Калифорния) в течение 2 часов при 37°C для удаления N-связанных углеводов.
В альтернативном варианте, антитела или лекарственные конъюгаты частично расщепляли LysC (0,25 мкг на 50 мкг (микрограмм) антитела или конъюгата) в течение 15 минут при 37°С с получением фрагмента Fab и Fc для анализа ЖХМС. Пики в скорректированных c поправкой на помехи спектрах ЖХМС были определены и количественно посчитаны. Отношение лекарственное средство-антитело (ОЛА, DAR - Drug-to-antibody ratios) рассчитывали путем вычисления отношения интенсивностей пика или пиков, соответствующих антителу, конъюгированному с лекарственным средством, по отношению ко всем наблюдаемым пикам.
Пример 5. Конъюгация линкер-лекарственных промежуточных соединений с антителами
После процедур восстановления и повторного окисления в примере 2, для антитела с внесенным цистеином (THIOMAB™), в 10 мМ сукцинате, pH 5, 150 мМ NaCl, 2 мМ ЭДТА, доводили pH до рН 7,5-8,5 с помощью 1 М Триса. Избыток, от около 3 до 20 эквивалентов линкер-лекарственного промежуточного соединения с тио-реакционноспособной пиридилдисульфидной группой, включая, но не ограничиваясь теми что в таблице 2А, растворяют в ДМФА (DMF) или ДМА (DMA) и добавляют к восстановленному, повторно окисленному антителу с доведенным рН. Реакцию инкубируют при комнатной температуре или 37°C и контролируют до завершения (от 1 до 24 часов), как определено ЖХ-МС-анализом реакционной смеси. Когда реакция завершена, конъюгат очищают одной или любой комбинацией нескольких способов, целью которой является удаление оставшегося непрореагировавшего линкер-лекарственного промежуточного соединения и агрегированного белка (если присутствует в значительных количествах). Например, конъюгат может быть разбавлен 10 мМ гистидин-ацетатом с рН 5,5 до конечного значения рН около 5,5 и очищен с помощью катионообменной хроматографии S с использованием либо колонок HiTrap S, соединенных с системой очистки Akta (GE Healthcare), либо спин-колонок S maxi (Pierce). В альтернативном варианте, конъюгат может быть очищен гель-фильтрационной хроматографией с использованием колонки S200, соединенной с системой очистки Akta, или спиновых колонок Zeba. В альтернативном варианте, может применятся диализ. Конъюгаты лекарственного средства THIOMAB были составлены в 20 мМ His/ацетат, pH 5, 240 мМ сахарозы, применяя или гель-фильтрацию, или диализ. Очищенный конъюгат концентрируют ультрафильтрацией центрифугированием и фильтруют через 0,2 мкм фильтр в стерильных условиях и замораживают для хранения. Конъюгаты антитело-лекарственное средство были охарактеризованы методом BCA для определения концентрации белка, аналитической ЭХ (SEC) для анализа агрегации, и ЖХ-МС после обработки эндопептидазой Lysine C (LysC) для расчета ОЛА (DAR).
Эксклюзионную хроматографию проводят на конъюгатах с применением колонки Shodex KW802.5 в 0,2 М фосфате калия pH 6,2 с 0,25 мМ хлоридом калия и 15% IPA при скорости потока 0,75 мл/мин. Состояние агрегации конъюгата определяли путем интегрирования площади элюированного пика поглощения при 280 нм.
Анализ ЖХ-МС может выполняться на КАЛС (ADC) с применением прибора Agilent QTOF 6520 ESI. В качестве примера конъюгат антитело-лекарственное средство обрабатывают 1:500 мас./об. эндопротеиназой Lys C (Promega) в Tris, pH 7,5, в течение 30 мин при 37°С. Полученные расщепленные фрагменты загружают в колонку 1000Å (Ангстрем), 8 мкм (микрон) PLRP-S (сильно перекрестно-сшитый полистирол), нагретую до 80°C, и элюируют с градиентом от 30% B до 40% B за 5 минут. Подвижная фаза А представляла собой H2O с 0,05% ТФК, а подвижная фаза В представляла собой ацетонитрил с 0,04% ТФК. Скорость потока составляла 0,5 мл/мин. Элюирование белков контролировали детектированием УФ-поглощения при 280 нм до электрораспылительной ионизации и МС-анализа. Обычно достигалось хроматографическое разделение неконъюгированного фрагмента Fc, остаточного неконъюгированного Fab и лекарственного Fab. Полученные спектры масса/заряд были скорректированы c поправкой на помехи с использованием программного обеспечения Mass Hunter™ (Agilent Technologies) для расчета массы фрагментов антител.
В соответствии с этими процедурами готовили конъюгаты лекарственное средство-модифицированное цистеином антитело из таблиц 3А и 3В.
Пример 6. Анализ пролиферации клеток in vitro
Эффективность КАЛС (ADC) измеряли с помощью анализа пролиферации клеток, применяя следующий протокол (Анализ жизнеспособности люминесцентных клеток CELLTITER GLO™, технический бюллетень TB288 Promega Corp., Mendoza et al (2002) Cancer Res. 62:5485-5488). Протокол является модификацией анализа клеток люминесцентных клеток CELLTITER GLO™:
1. Аликвоту 100 мкл клеточной культуры, содержащей около 104 клеток (SKBR-3, BT474, MCF7 или MDA-MB-468) в среде, осаждали в каждую лунку 96-луночной плашки с непрозрачными стенками.
2. Готовили контрольные лунки, содержащие среду и без клеток.
3. КАЛС (ADC) добавляли в экспериментальные лунки и инкубировали в течение 3-5 дней.
4. Плашки уравновешивали до комнатной температуры в течение около 30 минут.
5. Добавляли объем реактива CELLTITER GLO™, равный объему клеточной культуральной среды, присутствующей в каждой лунке.
6. Содержимое перемешивали в течение 2 минут на орбитальном шейкере для индукции клеточного лизиса.
7. Плашку инкубировали при комнатной температуре в течение 10 минут для стабилизации сигнала люминесценции.
8. Люминесценция регистрировалась и представлялась на графиках как ОЕЛ(RLU)=относительные единицы люминесценции.
Данные нанесены на график как среднее значение люминесценции для каждого набора реплик с планками погрешности среднего квадратического отклонения, как показано на фиг. 1A-E.
Среда: SK-BR-3 растет в 50/50/10%ФБС/глутамин/250 мкг/мл G-418 OVCAR-3 растет в RPMI/20%ФБС/глутамин.
Пример 7. Ингибирование роста опухоли, эффективность in vivo у мышей с ксенотрансплантатом
Опухоли были пересажены и им позволяли расти до объема 150-200 мм3 (как измерено с применением штангенциркулей) до однократного лечения в день 0. Объем опухоли измеряли с применением штангенциркулей по формуле: V (мм3)=0,5A X B2, где A и B - длинный и короткий диаметры соответственно. Мышей подвергали эвтаназии до того, как объем опухоли достигал 3000 мм3 или когда опухоли проявляли признаки надвигающегося изъязвления. Данные, собранные из каждой экспериментальной группы (10 мышей на группу), были выражены как среднее значение+среднеквадратическая ошибка.
Инокулируют n=150 мышей клетками KPL-4 HER2 в количестве 3 миллиона клеток/мышь, суспендированных в HBSS/матригеле, в торакальную молочную железу в объеме 0,2 мл. Когда опухоли достигали среднего объема опухоли 100-250 мм3, их группировали в 10 групп по 8-10 мышей каждая. Однократное лечение будет вводиться внутривенно через хвостовую вену в День 0. Объем не должен превышать 0,3 мл, размер иглы 28 или 29 калибр.
Линия клеток HCC1569 экспрессирует Ly6E и была получена из АКТП (Американская коллекция типовых культур, Манассас, Вирджиния), и сублиния HCC1569X2 была получена в Genlineech для оптимального роста у мышей. Каждую самку C.B-17 SCID-бежевых мышей (лаборатория Чарльз-Ривер) инокулировали в торакальную молочную железу пятью миллионами клеток HCC1569X2, суспендированными в HBSS/матригель (соотношение 1:1). Когда ксенотрансплантатные опухоли достигали среднего объема опухоли 100-300 мм3 (обозначено как День 0), животных рандомизировали в группы по 5 мышей каждая и они получали одну внутривенную инъекцию конъюгата антитело-лекарственное средство через хвостовую вену. Опухоли и массы тела мышей измеряли 1-2 раза в неделю на протяжении всего исследования. Мышей быстро подвергали эвтаназии, когда потеря массы тела составляла больше чем 20% от начального веса. Все животные были подвергнуты эвтаназии до того, как опухоли достигли 3000 мм3 или появлялись признаки надвигающегося изъязвления. Объем опухоли измеряли в двух измерениях (длина и ширина) с применением штангенциркулей, и объем опухоли рассчитывали по формуле: размер опухоли (мм3)=(более длинное измерение x более короткое измерение2) x 0,5 (WO 2013/177055).
Модель опухоли молочной железы мыши Fo5 использовали для оценки эффективности in vivo конъюгатов антитело-лекарственное средство по изобретению после однократных внутривенных инъекций и как описано ранее (Phillips GDL, Li GM, Dugger DL, et al. Targeting HER2-Positive Breast Cancer with Trastuzumab-DM1, an Antibody-Cytotoxic Drug Conjugate. (2008) Cancer Res. 68:9280-90), включено в данный документ посредством ссылки. Анти-Her2 КАЛС (ADC) тестировали с помощью модели Fo5, модели трансгенной мыши, в которой человеческий ген HER2 чрезмерно экспрессируется в эпителии молочной железы при транскрипционной регуляции промотора вируса опухоли молочной железы мыши (MMTV-HER2), как показано на фиг. 3 и 5. Чрезмерная экспрессия HER2 вызывает спонтанное развитие опухоли молочной железы. Опухоль молочной железы одного из этих животных-основателей (основатель № 5 [Fo5]) была распространена в последующих поколениях мышей FVB путем последовательной трансплантации опухолевых фрагментов (размером около 2×2 мм). Все исследования проводились в соответствии с Руководством по уходу и использованию лабораторных животных. Каждый конъюгат антитело-лекарственное средство (разовая доза) дозировался девяти животным внутривенно в начале исследования и через 14 дней после трансплантации. Первоначальный размер опухоли составлял около 200 мм3 объема. Измерения ингибирования роста опухоли со временем конъюгатами антитело-лекарственное средство по изобретению и контролями показаны на фиг. 2-8.
Другая модель эффективности трансплантации молочной железы может быть использована, как описано (Chen et al. (2007) Cancer Res 67:4924-4932), оценивая объем опухоли после однократной внутривенной дозы и используя опухоли, вырезанные из мыши с внутрибрюшинной опухолью, затем серийно пассируя в молочных железах реципиентных мышей.
Активности уничтожения клеток для анти-CD22 и анти-Napi-КАЛС (ADC) определяли в CD22 или Napi-экспрессирующих клеточных линиях после 5-дневной инкубаций и у мышей с ксенотрансплантатом.
Пример 8. Анализ связывания/алкилирования олигонуклеотидов
Изучали взаимодействие соединений пирролобензодиазепина с дуплекс-образующими олигонуклеотидами различной длины и последовательностей с последовательностями Pu-GAATG-Py>Pu-GATC-Py>>Pu-GATG-Py или Pu-GAATC-Py, где Pu представляет собой пуриновый нуклеотид A или G, и Py представляет собой пиримидиновый нуклеотид C или T для внутрицепочечного и межцепочечного перекрестного сшивания что было ранее идентифицированно (Rahman KM, et al (2009) J Am Chem Soc 131:13756-13766). Внутрицепочечный G дуплекс, 5'-TATAGAAATCTATA-3' и 3'-ATATCTTTAGATAT-5', и межцепочечный G дуплекс, 5'-TATAGAAATGTATA-3' и 3'-ATATCTTTACATAT-5', были изучены следующим образом:
Соединения в объеме 100 мкМ инкубировали с 50 мкМ двухцепочечных дезоксиолигонуклеотидов (ДНК) в течение 1 часа в 10 мМ Бис-Трис, рН 7,1 при 37°С. Образцы анализировали с помощью ЖХ/МС/УФ на Sciex TripleTOF 5600 на колонке Hypersil Gold C18 (100×2,1, 1,9 мкМ, Thermo Scientific). Колонку элюировали со скоростью 0,4 мл/мин с помощью градиента буфера A (50 мМ гексафторизопропанола и 15 мМ диэтиламина) к буферу B (50% А и 50% метанола:ацетонитрил 1:1), от 5% до 25% B через 8 мин, до 75% В через 5 мин, и до 95% В через 1 мин.
Пример 9. Исследование безопасности/токсичности на яванских макаках
Конъюгаты антитело-лекарственное средство по изобретению оценивали на предмет токсичности у яванских макак, включая легочные эффекты антигензависимой токсичности из-за экспрессии в легких.
План исследования:
Курс лечения: ВВ (IV) (внутривенное) дозирование дважды, в дни 1 и 22 для оценки токсичности в течение 2 полных циклов. 10 дней свинец (1M на группу), дозированный за 10 дней до 1М/2F для снижения риска развития острой заболеваемости/смертности.
Потенциальные клинические наблюдения могут включать покраснение кожи, черное обесцвечивание кожи, шелушение/отслаивание, язвы, отечность лица/отек, тело с низким процентом жировой ткани, отсутствие аппетита и общее предсмертное состояние.
Возможные клинические патологические изменения, связанные с дозировкой конъюгата антитело-лекарственное средство у яванских макак, могут включать увеличение азота мочевины и креатинина в сочетании с неадекватно сконцентрированной мочой, изменениями количеств натрия, хлора и калия, вероятно, связанными с нарушенной функцией трубочек почек, альвеолярную дегенерацию легких, и изменения в гематологических параметрах и воспаление в ответ на дозу.
Основные органы подверженные токсичности могут включать почки, глаза, кожу/подкожный слой/мышцы, костный мозг, легкие, лимфоидные органы (истощение селезенки и тимуса).
Дозозависимое увеличение тяжести результатов патологии может позволить сравнить характеристики безопасности/токсичности конъюгатов антитело-лекарственное средство и контрольных соединений.
Пример 10. Эффективность в мышах
Эффективность конъюгатов анти-Her2 антитело-лекарственное средство исследовали в модели аллотрансплантата мыши MMTV-HER2 Основатель № 5 (Founder #5) (опухоль молочной железы мыши) или мышиной модели ксенотрансплантата KPL4, HCC1569X2 (рак молочной железы человека).
Модель MMTV-HER2 Основатель № 5 (Fo5) (разработанная в Genentech) представляет собой модель трансгенной мыши, в которой ген HER2 человека под транскрипционной регуляцией промотора вируса опухоли молочной железы мыши (MMTV-HER2) сверхэкспрессируется в эпителии молочной железы. Сверхэкспрессия вызывает спонтанное развитие опухолей молочной железы, которые сверхэкспрессируют человеческий рецептор HER2. Опухоль молочной железы из одного из животных-основателей (основателя № 5, Fo5) была хирургически имплантирована в торакальную молочную железу мышиных самок nu/nu или FVB (Charles River Laboratories) в виде опухолевых фрагментов размером около 15-30 мм3.
Клеточная линия рака молочной железы KPL4 была получена в лаборатории доктора Дж. Куребайаши (Япония). Клеточная линия рака молочной железы HCC1569 была получена из АКТК (Американская коллекция типовых культур, Манассас, Вирджиния), и сублиния HCC1569X2 была получена в Genentech для оптимального роста в мышах. Обе клеточные линии экспрессируют HER2, как определено СКАФ (сортировка клеток с активированной флуоресценцией, FACS) и ИГХ (иммуногистохимия, IHC). Чтобы создать модель, каждой мышиной самке C.B-17 SCID-beige (Charles River Laboratories) инокулировали в торакальную молочную железу 3 миллиона клеток KPL4 или 5 миллионов клеток HCC1569X2, суспендированных в HBSS/матригель (соотношение 1:1).
Когда опухоли достигли среднего объема опухоли 100-300 мм3, животных рандомизировали в группы по 5-10 мышей каждая и они получали однократную внутривенную инъекцию КАЛС (ADC) (обозначено День 0). Опухоли и массы тела мышей измеряли 1-2 раза в неделю на протяжении всего исследования. Мышей быстро подвергали эвтаназии, когда потеря массы тела составляла больше чем 20% от начального веса. Все животные были подвергнуты эвтаназии до того, как опухоли достигли 3000 мм3 или появлялись признаки надвигающегося изъязвления. Объем опухоли измеряли в двух измерениях (длина и ширина) с применением штангенциркулей, и объем опухоли рассчитывали по формуле: размер опухоли (мм3)=0,5×(длинна × ширина × ширина). Данные этого теста показаны на фиг. 12 и 13.
Пример 11. Токсикология у яванских макак
Анти-HER2 hu7C2 LC:K149C-LD-51 исследование токсикологии яванских макак
Экспериментальное исследование токсичности повышения доз было проведено на яванских макаках. Животные получали две или четыре медленных болюсных дозы ВВ (IV) каждые три недели анти-HER2 hu7C2 LC:K149C-LD-51, начиная с дозы 1 мг/кг. Повышение дозы проводилось поэтапно к 2-3 недели. План исследования приведен в таблице 7 ниже.
Таблица 7: План исследования токсикологии анти-HER2-LD51 LC: K149C у яванских макак
Тестируемое изделие N/пол Доза (мг/кг) Режим дозирования
Наполнитель 2M/2F 0 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 1M 1 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 1M 2 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 1M 4 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 1M 8 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 2M/2F 16 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 2M/2F 16 4X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 2M/2F 24 2X каждые три недели
Анти-HER2-LD51 1M 36 2X каждые три недели
Токсичность оценивали с помощью клинических и офтальмологических исследований и лабораторной клинической диагностики (гематология, химия сыворотки, коагуляция и анализ мочи, примерно еженедельно в течение всего исследования). Определение гистологических макро- и микропатологий проводили на тканях, собранных при вскрытии через три недели после последней дозы.
У животных, которым вводили четыре дозы 16 мг/кг анти-HER2 hu7C2 LC:K149C-LD-51 каждые три недели, гистологические патологии обычно были более тяжелыми, чем после двух доз 16 мг/кг. Наблюдалась дегенерация трубочек почек (легко-умеренная), лимфоидное истощение (тимус, селезенка, лимфатические узлы, легко- умеренное), пигментация кожи/гиперкератоз (легкий), дегенерация слизистой оболочки тонкой кишки (легкая) и легкая альвеолярная дегенерация/фиброплазия (легкая) легких.
Основными целевыми органами анти-HER2 hu7C2 LC:K149C-LD-51 у яванских макак являются почки, костный мозг, кожа, легкие, лимфоидные органы (селезенка, тимус, лимфатические узлы), тонкая кишка и глаз (роговица). Максимальная переносимая доза (МПД) в виде схемы приема лекарств 2X каждые три недели составляет 16 мг/кг, тогда как МПД в виде схемы приема лекарств 4X каждые три недели составляет 8 мг/кг.
Никаких исследований анти-HER2-CLD-1 не проводилось у обезьян. Тем не менее, 2X МПД доза CLD-1 каждые три недели при конъюгировании с другими антителами с внесенным цистеином определялась у яванских макак. МПД двух доз анти-NaPi2b-CLD-1 каждые три недели составляла 0,5 мг/кг, тогда как у не нацеленного на мишень конъюгата gD-CLD-1 она составляла 0,5 мг/кг. Наблюдаемые аналогичные эффекты для органов-мишеней свидетельствуют о том, что токсичность в значительной степени антиген-независима и связана к CLD-1 или LD-51. Увеличенная МПД конъюгатов LD-51 по сравнению с конъюгатами CLD-1 указывает на улучшение переносимости LD-51 по сравнению с CLD-1. Данные для этих испытаний показаны на фиг. 12 и 13.
Пример 12. Исследование токсичности C-1 и DM-2 на крысах
Проведено токсикологическое исследование экспериментальных одиночных доз на крысах, для сравнения свободных лекарственных средств C-1 (ПБД-бис-алкилирующее вещество) и DM-2 (ПБД-моноалкилирующее вещество). Животные получали ВВ (IV) единичную дозу C-1, DM-2 или наполнителя, и за ними наблюдали в течение семидневного периода восстановления. План исследования приведен в таблице 8 ниже.
Таблица 8: План исследования токсичности свободных лекарственных средств C-1 и DM-2 на крысах
Тестируемое изделие N/пол Доза (мг/кг)
Наполнитель 0
C-1 0,05
C-1 0,1
C-1 0,2
DM-2 0,5
DM-2 1
DM-2 2
Токсичность оценивали по клиническими наблюдениями и с помощью лабораторной клинической диагностики (гематология и клиническая химия в 72 и 168 час после дозы). В целом, как правило, результаты были одинаковыми для DM-2 при в десять раз большей дозе по сравнению с C-1. Для C-1 дозозависимое снижение количества ретикулоцитов наблюдалось при всех дозах через 72 часа, восстанавливаясь в группах 0,05 и 0,1 мг/кг к 168 часу после введения дозы. При дозе 0,2 мг/кг наблюдались клинико-патологические изменения, указывающие на токсичность для печени и почек. Дозы 0,05 и 0,1 мг/кг хорошо переносились без клинических проявлений.
Величины доз 0,5 и 1 мг/кг DM-2 хорошо переносились, что не приводило к появлению клинических проявлений или ранних эвтаназий. Животные, которым вводили 2 мг/кг, теряли около 14% от их массы тела с 2 по 4 день и подвергались эвтаназии в предсмертном состоянии в День 4. Дозозависимое снижение количества ретикулоцитов наблюдалось при всех дозах DM-2 через 72 часа после дозы, которое восстанавливалось в группах 0,5 и 1 мг/кг к 168 часу после введения дозы. При дозе 2 мг/кг наблюдались клинико-патологические изменения, указывающие на токсичность для печени и почек.
Таким образом, профиль токсичности, возникающий в результате однократной дозы С-1 или DM-2, был аналогичным, при этом С-1 примерно в десять раз превосходил DM-2. Основными органами-мишенями обоих тестируемых изделий были костный мозг, почки и печень. МПД С-1 и DM-2 составляли 0,1 и 1 мг/кг, соответственно, в виде одной ВВ (IV) дозы у крыс. Результаты этого исследования показывают улучшенную переносимость DM-2 по сравнению с C-1.
Пример 13. Активность in vitro в HER2 положительных клеточных линиях рака молочной железы SK-BR-3 и KPL-4
Клетки высевали в 96-луночные плашки и оставляли для прилипания в течение ночи при 37 °С в увлажненной атмосфере с 5% СО2. Затем среду удаляли и заменяли свежей культуральной средой, содержащей различные концентрации каждого лекарственного средства. Cell Titer-Glo (Promega Corp.) добавляли в лунки через 5 дней после введения лекарственного средства, а люминесцентный сигнал измеряли с применением EnVision Multilabel Plate Reader (PerkinElmer). Тестируемыми соединениями являлись анти-HER2 hu7C2 LC:K149C CLD-7; анти-HER2 hu7C2 LC:K149C CLD-8; анти-HER2 hu7C2 LC:K149C CLD-9; и анти-HER2 hu7C2 LC:K149C LD-51.
Figure 00000039
CLD-7
Figure 00000040
CLD-8
Figure 00000041
CLD-9
Данные этого теста показаны на фиг. 14 и в таблице 9 ниже.
Таблица 9
Линкер-лекарст-венное средство Мишень ОЛА (DAR) SK-BR-3
IC 50 		KPL-4
IC 50
нг/мл нМ нг/мл нМ
CLD-7 HER2 (7C2) 1,9 >10000 >67 >100000 >67
CLD-8 HER2 (7C2) 1,94 >10000 >67 63000 422
CLD-9 HER2 (7C2) 2,0 180 1,2 1480 9,9
LD-51 HER2 (7C2) 1,9 27,7 0,19 1240 8,3
Пример 14. Эффективность in vivo для мышиного аллотрансплантата
Эффективность конъюгатов анти-Her2 антитело-лекарственное средство (КАЛС (ADC)) исследовали в модели аллотрансплантата мыши MMTV-HER2 Основатель № 5 (опухоль молочной железы мыши). Модель MMTV-HER2 Основатель № 5 (Fo5) (разработанная в Genentech) представляет собой модель трансгенной мыши, в которой ген HER2 человека под транскрипционной регуляцией промотора вируса опухоли молочной железы мыши (MMTV-HER2) сверхэкспрессируется в эпителии молочной железы. Сверхэкспрессия вызывает спонтанное развитие опухолей молочной железы, которые сверхэкспрессируют человеческий рецептор HER2. Опухоль молочной железы из одного из животных-основателей (основателя № 5, Fo5) была размножена у мышей FVB (Charles River Laboratories) путем последовательной трансплантации опухолевых фрагментов.
Для исследований эффективности трансгенную опухоль молочной железы Fo5 хирургически имплантировали в торакальную молочную железу мышиных самок nu/nu (Charles River Laboratories; Холлистер, Калифорния) в виде опухолевых фрагментов размером около 15-30 мм3. Когда опухоли аллотрансплантата достигали среднего объема опухоли 100-300 мм3 (обозначено День 0), животных рандомизировали в группы по 7 мышей каждая и они получали однократную внутривенную инъекцию КАЛС (ADC). Опухоли и массы тела мышей измеряли 1-2 раза в неделю на протяжении всего исследования. Мышей быстро подвергали эвтаназии, когда потеря массы тела составляла больше чем 20% от начального веса. Все животные были подвергнуты эвтаназии до того, как опухоли достигали 3000 мм3 или появлялись признаки надвигающегося изъязвления. Объем опухоли измеряли в двух измерениях (длина и ширина) с применением штангенциркулей, и объем опухоли рассчитывали по формуле: размер опухоли (мм3)=0,5×(длинна × ширина × ширина). Данные этого исследования показаны на фиг. 15. Среди четырех анти-Her2 КАЛС (ADC) только анти-Her2-LD-51 продемонстрировал явную противоопухолевую активность по сравнению с группой наполнителей (контролей). Эффективность анти-Her2-LD-51 была зависимой от мишени, поскольку соответствующий не нацеленный на мишень анти-CD22-LD-51 не влиял на рост опухоли.
Пример 15. Синтез DM-4, C-1, C-2, C-3, CLD-2, CLD, 3, CLD-5 и CLD-6
Метод синтеза для получения C-1, C-2, C-3 и CLD-2 может быть найден в следующих документах: C-1: Journal of Medicinal Chemistry (2004), 47(5), 1161-1174; C-2: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2000), 10(16), 1845-1847 or PCT Int. Appl. WO 2000012508; C-3: PCT Int. Appl. WO 2000012508; C-3: PCT Int. Appl. WO 2015155753; и CLD-2 US 20160074527.
Синтез CLD-7
Схема
Figure 00000042
Экспериментальный
Figure 00000043
К раствору трифосгена (60,6 мг, 0,200 ммоль) в ДХМ (15 мл) добавляли раствор пиридина (129 мг, 1,63 ммоль) и 2 (55,3 мг, 0,220 ммоль) в ДХМ (15 мл). Смесь перемешивали при 0°С в течение 10 мин, ТСХ (25% EtOAc в петролейном эфире, Rf=0,5) показала, что исходный материал израсходован. Смесь концентрировали досуха и растворяли в ДХМ (10 мл) и добавляли к раствору соединения 1 (150,0 мг, 0,200 ммоль) и Et3N 103,3 мг, 1,02 ммоль в ДХМ (15 мл). Смесь перемешивали при 0°С в течение 1 часа. ТСХ (50% EtOAc в петролейном эфире) показала, что исходное вещество было израсходовано. Смесь концентрировали и неочищенный продукт очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (0-33% EtOAc в петролейном эфире). Его концентрировали, получая 3 (180,0 мг, 81%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=1,014 мин, [M+H]+ 1007,1.
Figure 00000044
К раствору HOAc (5,0 мл, 87 ммоль) в смеси ТГФ (3,0 мл) и воды (3,0 мл) добавляли 3 (150,0 мг, 0,1500 ммоль). Реакционный раствор перемешивали при 40°С в течение 16 часов. Раствор концентрировали для удаления растворителя и остаток разбавляли EtOAc (100 мл), промывали H2O (30 мл ×4), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (5% МеОН в ДХМ, R f =0,5), получая 4 (100 мг, 75%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,776 мин, [M+H]+893,2.
Figure 00000045
К раствору ПДМ (22,8 мг, 0,0500 ммоль) в безводном ДХМ (10,0 мл) добавляли соединение 4 (40,0 мг, 0,0400 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 18 °С в течение 1 часа. Смесь разбавляли ДХМ (50 мл), фильтровали. Фильтрат промывали Na2SO3 (30 мл ×3), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (5% MeOH в ДХМ, R f =0,5) с получением CLD-7 (GNT_B343_867-1) (20 мг, 50%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,761 мин, [M+H]+ 891,0 показали 96% целевого продукта. ВЭЖХ (10-80AB/15 мин): ВУ=8,40 мин, показала 94,9% желаемого продукта.
Синтез CLD-8
Схема
Figure 00000046
Экспериментальный
Figure 00000047
К раствору соединения 1 (40,0 мг, 0,190 ммоль) в ТГФ (5,0 мл)/вода (5,0 мл) добавляли ТКЭФ (TCEP) (277,9 мг, 0,970 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 16 °С в течение 48 часов. Раствор разбавляли H2O (10 мл), экстрагировали ДХМ (20 мл × 3). Объединенные органические слои сушили над Na2SO4, фильтровали и непосредственно использовали в следующем этапе.
Figure 00000048
К раствору соединения 2 (40,0 мг, 0,380 ммоль) в смеси ДХМ (25 мл) и MeOH (25 мл) добавляли соединение 3 (238,3 мг, 0,770 ммоль). Реакционный раствор перемешивали при 16°C в течение 16 часов и добавляли MnO2 (500 мг) и смесь перемешивали в течение 0,5 часа. Смесь фильтровали и фильтрат концентрировали в вакууме. Остаток разбавляли MeOH (5 мл), снова фильтровали, чтобы удалить большую часть оставшегося соединения 3, фильтрат концентрировали и очищали подготавливающей ТСХ (33% EtOAc в петролейном эфире, R f =0,5) с получением соединения 4 (50 мг, 0,157 ммоль, выход 40,8%) в виде бесцветного масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,805 мин, [M+H]+ 258,9 показали 81% целевого продукта.
Figure 00000049
К перемешиваемой смеси трифосгена (64,6 мг, 0,220 ммоль) и 4Å MS (30 мг) в безводном ДХМ (8 мл) добавляли раствор соединения 5 (160,0 мг, 0,220 ммоль) и триэтиламина (110,1 мг, 1,09 ммоль ) в безводном ДХМ (8 мл) медленно. Реакционную смесь перемешивали при 16°С в течение 1 часа и смесь концентрировали под вакуумом для удаления растворителя. Его растворяли в безводном ДХМ (10,0 мл) и добавляли триэтиламин (65,8 мг, 0,650 ммоль) с последующим добавлением раствора 4 (50,0 мг, 0,190 ммоль) в безводном ДХМ (5,0 мл). Реакционную смесь перемешивали при 16°С в течение 16 часов. Смесь фильтровали, фильтрат концентрировали и очищали подготавливающей ТСХ (10% MeOH в ДХМ , R f =0,8), получая соединение 6 (100 мг, 0,0814 ммоль, выход 37,6%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=1,119 мин, [M+H]+ 1019,4 показали 83% целевого продукта.
Figure 00000050
Раствор соединения 6 (100,0 мг, 0,1000 ммоль) в смеси уксусной кислоты (3,0 мл), ТГФ (2,0 мл) и воды (1,0 мл) перемешивали при 16°С в течение 48 часов. Раствор концентрировали под вакуумом и остаток разбавляли ДХМ (30 мл), промывали H2O (20 мл ×3), сушили, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (10% MeOH в ДХМ, R f =0,5) с получением соединения 7 (55 мг, 0,0602 ммоль, выход 61,3%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,892 мин, [M+H]+ 905,2 показали 99% целевого продукта.
Figure 00000051
К смеси соединения 7 (55 мг, 0,060 ммоль) и 4Å MS (30 мг) в безводном ДХМ (6,0 мл) добавляли ПДМ (44,0 мг, 0,104 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 16°С в течение 1 часа. Смесь разбавляли EtOAc (30 мл), гасили насыщенным раствором Na2SO3 (30 мл) и экстрагировали EtOAc (30 мл ×3). Объединенные органические слои сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (10% MeOH в ДХМ, R f =0,5), получая CLD-8 (GNT_B343_866-1) (42 мг, выход 77%) в виде бледно-желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,868 мин, [M+H]+ 903,2 показали 98% целевого продукта.
Синтез CLD-9
Схема
Figure 00000052
Экспериментальный
Figure 00000053
К раствору соединения 2 (2383 мг, 7,68 ммоль) в ДХМ (10 мл)/MeOH (10 мл) добавляли соединение 1 (300 мг, 3,84 ммоль). Раствор перемешивали при 16°С в течение 2 часов. MnO2 (5,0 г) добавляли в раствор, смесь перемешивали при 16°С в течение 30 мин. Смесь фильтровали и фильтрат концентрировали под вакуумом и остаток промывали MeOH (15 мл), фильтровали и концентрировали. Неочищенный продукт очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (ДХМ) с получением соединения 3 (800 мг, 3,25 ммоль, выход 84,8%) в виде масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,608 мин, [M+H]+232,8.
Figure 00000054
Соединение 3 (65,0 мг, 0,280 ммоль) и пиридин (88,5 мг, 1,12 ммоль) в безводном ДХМ (5,0 мл) добавляли по каплям в раствор трифосгена (41,5 мг, 0,140 ммоль) в безводном ДХМ (5,0 мл) при 0°С. Раствор перемешивали при 0°С в течение 10 мин и смесь концентрировали, получая неочищенное соединение 4 в виде белого твердого вещества, которое использовали в следующем этапе.
Figure 00000055
К раствору соединения 5 (4000 мг, 5,84 ммоль) в безводном ДХМ (80 мл) добавляли имидазол (2,38 г, 35,1 ммоль) с последующим добавлением TBSCl (1,761 г, 11,7 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 40°С в течение 3 часов. Смесь разбавляли ДХМ (100 мл), промывали H2O (50 мл ×3), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (0-3,3% MeOH в ДХМ) с получением соединения 6 (2,50 г, 3,13 ммоль, выход 53,6%) в виде бледно-желтого твердого вещества.
ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,945 мин, [M+H]+799,2.
Figure 00000056
К раствору соединения 6 (2,30 г, 2,88 ммоль) в безводном ДХМ (100 мл) добавляли ПДМ (4,88 г, 11,52 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 2 часов. Ее фильтровали, фильтрат разбавляли EtOAc (600 мл), гасили насыщенным раствором Na2SO3 (200 мл), насыщенным раствором Na2SO3/NaHCO3 (об./об.=1:1, 200 мл) и насыщенным раствором соли. Органический слой сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали с получением неочищенного масла, которое растворяли в tBuOH (40 мл, 2,88 ммоль)/вода (20 мл) и затем обрабатывали 2-метил-2-бутеном (30 мл, 2,88 ммоль) и дигидрофосфатом натрия (1,382 мг, 11,5 ммоль) последовательно при 10°С. После перемешивания при 10°С в течение 0,5 часа реакционную смесь перемешивали с хлоритом натрия (1,56 г, 17,3 ммоль) при 10°С в течение 1 часа. Смесь разбавляли EtOAc (300 мл) и промывали водой (100 мл) и насыщенным раствором соли (100 мл). Органический слой сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом с получением соединения 7 (2,0 г, 2,46 ммоль, выход 85,5%) в виде неочищенного продукта. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,929 мин, [M+H]+813,2.
Figure 00000057
К раствору соединения 7 (2,0 г, 2,46 ммоль) в ДМФА (DMF) (20 мл) добавляли K2CO3 (680 мг, 4,92 ммоль) с последующим добавлением MeI (3,95 г, 27,8 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 1 часа. Смесь разбавляли EtOAc (200 мл), промывали насыщенным раствором соли (40 мл ×5), затем сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом с получением соединения 8 (2,0 г, 2,42 ммоль, выход 98,3%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,975 мин, [M+H]+827,2.
Figure 00000058
К смеси соединения 8 (2,0 г, 2,42 ммоль) и железа (1,35 г, 24,2 ммоль) в EtOH (20 мл)/вода (10 мл) добавляли NH4Cl (2,59 г, 48,7 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 70 °С в течение 2 часов. Смесь фильтровали, фильтрат концентрировали под вакуумом для удаления EtOH, и водную суспензию экстрагировали EtOAc (50 мл × 3). Объединенные EtOAc-слои сушили над Na2SO4, фильтровали, концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (3-5% MeOH в ДХМ, Rf=0,5), получая соединение 9 (1,5 г, 1,89 ммоль, выход 78,1%) в виде желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,845 мин, [M+H]+735,3.
Figure 00000059
К раствору соединения 9 (100 мг, 0,140 ммоль) и ДИЭА (DIEA) (68,8 мг, 0,680 ммоль) в ДХМ (15 мл) добавляли соединение 4 (80,2 мг, 0,270 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 0 °С в течение 1 часа. Смесь концентрировали и остаток очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (0-5% MeOH в ДХМ, Rf=0,5), получая соединение 10 (130 мг, 0,117 ммоль, выход 85,8%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,985 мин, [M+H]+993,4.
Figure 00000060
К раствору уксусной кислоты (6,0 мл, 105 ммоль) в ТГФ (6,0 мл)/вода (3,0 мл) добавляли соединение 10 (130 мг, 0,130 ммоль). Реакционный раствор перемешивали при 40°С в течение 24 часов. Раствор концентрировали под вакуумом для удаления растворителя, остаток разбавляли EtOAc (30 мл), промывали H2O (10 мл ×4), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (8% MeOH в ДХМ, R f =0,5) с получением соединения 11 (60 мг, 0,0683 ммоль, выход 52,2%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,763 мин, [M+H]+879,0.
Figure 00000061
К раствору соединения 11 в безводном ДХМ (5 мл) добавляли ПДМ (17,4 мг, 0,0400 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 18°С в течение 1 часа. Смесь разбавляли ДХМ (50 мл), фильтровали. Фильтрат промывали Na2SO3 (30 мл ×3), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом. Неочищенный продукт очищали подготавливающей ТСХ (5% MeOH в ДХМ, Rf=0,5), получая CLD-9 (GNT_B343_865-1) (12,2 мг, 0,0136 ммоль, выход 39,9%) в виде бледно-желтого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,739 мин, [M+H]+877,2.
Синтез DM-4
Схема
Figure 00000062
Экспериментальный
Figure 00000063
К раствору соединения 1 (3,0 г, 14,9 ммоль) в ДХМ (80 мл) добавляли ПДМ (9,48 г, 22,4 ммоль). После перемешивания смеси при 0°С в течение 1 часа ее разбавляли Na2S2O3 (50 мл)/NaHCO3 (50 мл) и MTBE (130 мл). Органическую фазу промывали водой (60 мл ×3) и концентрировали с получением соединения 2 (2,9 г, 14,6 ммоль, выход 97,6%) в виде бесцветного масла.
Figure 00000064
К раствору соединения 2 (2,9 г, 14,6 ммоль) и диметил (1-диазо-2-оксопропил) фосфоната в MeOH (20 мл) добавляли K2CO3 (6,03 г, 43,7 ммоль). После того как реакционную смесь перемешивали при 20°С в течение 1 часа, ее концентрировали под вакуумом и остаток очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (10% EtOAc в РЕ) с получением соединения 3 (2,0 г, 10,24 ммоль, выход 70,4%) в виде бесцветного масла.
Figure 00000065
К раствору соединения 3 (2,0 г, 10,2 ммоль) и соединения 4 (5,4 г, 15,4 ммоль) в ДМФА (DMF) (50 мл) добавляли Cs2CO3 (3,97 г, 20,5 ммоль) и Pd(PPh3)4 (785 мг, 1,54 ммоль). Смесь перемешивали при 95 °С в атмосфере азота в течение 1 часа. Смесь концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (20% EtOAc в РЕ) с получением соединения 5 (1,60 г, 2,44 ммоль, 23,8% выход) в виде бесцветного масла.
ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,994 мин, [M+H-56]+410,0.
Figure 00000066
К раствору соединения 5 (2,0 г, 4,3 ммоль) в MeOH (10 мл) добавляли Pd/CaCO3 (200,0 мг, 21,5 ммоль). Смесь перемешивали при 30°С в течение 1 часа в атмосфере H2 (1 атм). Смесь фильтровали и фильтрат концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (10% EtOAc в РЕ) с получением продукта соединение 6 (1,0 г, 2,14 ммоль, выход 49,8%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,983 мин, [M+Na]+490,1.
Figure 00000067
К раствору соединения 6 (0,90 г, 1,92 ммоль) в EtOAc (10 мл) добавляли HCl/EtOAc (6,0 мл). После перемешивания смеси при 25°С в течение 1 часа ее концентрировали с получением неочищенного соединения 7 (0,77 г, 1,90 ммоль, выход 99%) в виде белого твердого вещества.
Figure 00000068
К раствору соединения 7 (0,77 г, 1,91 ммоль) в MeOH (30 мл) добавляли NaOMe (1,03 г, 19,06 ммоль). Смесь перемешивали при 30 °С в течение 2 часов. Смесь концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (25-75% EtOAc в РЕ) с получением соединения 8 (0,60 г, 1,79 ммоль, выход 93,8%) в виде желтого масла. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3)δ м.д. 1,89-2,11 (m, 3 H) 2,18-2,33 (m, 1 H) 3,59 (dt, J=12,0, 7,6 Гц, 1 H) 3,80 (dt, J=11,5, 5,8 Гц, 1 H) 3,90-3,96 (m, 1 H) 3,97 (s, 3 H) 5,19 (s, 2 H) 5,86 (dd, J=10,0, 4,8 Гц, 1 H) 6,53 (dd, J=10,0, 2,0 Гц, 1 H) 6,69 (s, 1 H) 7,29-7,35 (m, 1 H) 7,36-7,41 (m, 2 H) 7,42-7,48 (m, 2 H) 7,62 (s, 1 H).
Figure 00000069
К раствору соединения 8 (580 мг, 1,73 ммоль) в ДХМ (50 мл) добавляли TiCl4 (656 мг, 3,46 ммоль). Смесь перемешивали при 30°С в течение 12 часов. В смесь добавляли HCl (1,0 М, 20 мл) и EtOAc (100 мл). Органический слой промывали водой (50 мл ×3) и концентрировали с получением неочищенного продукта соединения 9 (250 мг, 0,44 ммоль, выход 25,3%) в виде желтого твердого вещества.
Figure 00000070
В раствор соединения 9 (50,0 мг, 0,20 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл) добавляли K2CO3 (42,26 мг, 0,31 ммоль) и 1,5-дииодопентан (333 мг, 1,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°С в течение 3 часов. Реакционную смесь очищали хроматографией на колонке с силикагелем (0-50% EtOAC в петролейном эфире) с получением соединения 10 (60 мг, 0,178 ммоль, выход 87,6%) в виде масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,765 мин, [M+H]+332,0.
Figure 00000071
К раствору соединения 10 (60,0 мг, 0,18 ммоль) в ДХМ (6,0 мл) добавляли триэтиламин (55 мг, 0,54 ммоль) и MsCl (41 мг, 0,36 ммоль). После перемешивания смеси при 35°С в течение 1 часа ее разбавляли EtOAc (80 мл) и промывали водой (50 мл ×3). Органический слой концентрировали с получением неочищенного продукта (70 мг) в виде бесцветного масла. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,679 мин, [M+H]+410,0.
Figure 00000072
К раствору соединения 11 (70 мг, 0,17 ммоль) и соединения 12 (87 мг, 0,19 ммоль) в ДМФА (DMF) (5,0 мл) добавляли K2CO3 (47 мг, 0,34 ммоль) и KI (5,68 мг, 0,030 ммоль). Смесь перемешивали при 90°С в течение 3 часов и очищали подготавливающей ВЭЖХ (НСООН) с получением соединения 13 (70 мг, 0,084 ммоль, выход 49,2%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,845 мин, [M+H]+774,4.
Figure 00000073
Раствор соединения 13 (50 мг, 0,060 ммоль) в смеси ТФК (1,9 мл) и воды (0,10 мл) перемешивали при 35°С в течение 1 часа. Смесь распределяли между насыщенным раствором NaHCO3 (30 мл) и EtOAc (50 мл). Органический слой промывали водой (30 мл ×2), насыщенным раствором соли (30 мл) и сушили над Na2SO4. Его концентрировали и очищали подготавливающей ТСХ (5% МеОН в ДХМ, Rf=0,5) с получением продукта DM-4 (GNT_B343_655-1) (20 мг, 0,034 ммоль, выход 53,1%) в виде белого твердого вещества. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,825 мин, [M+H]+572,1. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3)δ м.д. 1,65-1,75 (m, 3H) 1,88-2,10 (m, 8H) 2,19-2,31 (m, 1H) 2,82-3,29 (m, 2H) 3,60 (dt, J=11,9, 7,5 Гц, 1H) 3,81 (dt, J=11,6, 5,9 Гц, 1H) 3,86-3,91 (m, 1H) 3,94 (s, 6H) 3,97 (br. s., 1H) 4,01-4,18 (m, 4H) 4,30 (s, 2H) 5,19 (d, J=10,6 Гц, 2H) 5,89 (dd, J=9,9, 5,1 Гц, 1H) 6,53-6,63 (m, 1H) 6,66 (s, 1H) 6,81 (s, 1H) 7,51 (s, 1H) 7,59 (s, 1H) 7,68 (d, J=4,4 Гц, 1H).
Синтез CLD-3
Схема
Figure 00000074
Экспериментальный
Figure 00000075
К раствору соединения 6 (5,00 г, 37,83 ммоль) и Et3N (11,49 г, 113,50 ммоль) в ДХМ (100 мл) добавляли по каплям MsCl (8,97 г, 78,32 ммоль) при 0°С. После перемешивания при 25°С в течение 2 часов в атмосфере N2 реакционную смесь выливали в ледяную воду (200 мл) и экстрагировали ДХМ (100 мл ×2). Органическую фазу промывали насыщенным раствором соли, сушили над Na2SO4 и концентрировали под вакуумом, получая неочищенный продукт (7,0 г, 95%) в виде желтого масла. Его смешивали с KSAc (6,59 г, 57,66 ммоль) в ацетоне/воде (50 мл/50 мл) и перемешивали при 25°C в течение 10 часов. Реакционную смесь концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (PE/EtOAc=100/1~40/1) с получением чистого соединения 8 (1,0 г, 14,6%) в виде желтого масла.
Figure 00000076
К суспензии LiAlH4 (692 мг, 18,23 ммоль) в ТГФ (20 мл) добавляли раствор соединения 8 (867 мг, 4,56 ммоль) в ТГФ (5 мл) при 0°С в атмосфере N2. Реакционную смесь перемешивали при 75 °С при нагревании с обратным холодильником в течение 2 часов. Реакционную смесь гасили EtOAc (3,0 мл) и раствором HCl (2,0 М, 5 мл) при 0°С. Реакционную смесь непосредственно использовали в следующем этапе.
Figure 00000077
К раствору соединения 10 (2,84 г, 9,12 ммоль) в ДХМ /МеОН (25 мл/25 мл) добавляли раствор соединения 9 (с вышеописанного этапа) при 25°С. Смесь перемешивали при 25°С в течение 10 часов. В реакционную смесь добавляли MnO2 (3,4 г, 39,6 ммоль) и фильтровали. Фильтрат концентрировали под вакуумом и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (ДХМ) и SFC с получением соединения 2 (0,80 г, 67,4%) в виде желтого масла. ЖХМС (5-95 АВ, 1,5 мин): ВУ=1,020 мин, М+Н+=260,9.
Figure 00000078
К раствору трифосгена (46 мг, 0,16 ммоль) в ДХМ (3,0 мл) добавляли по каплям раствор соединения 2 (100 мг, 0,38 ммоль) и пиридина (30 мг, 0,38 ммоль) в ДХМ (3 мл) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 15 мин и добавляли по каплям при 26°С к раствору соединения 1 (280 мг, 0,29 ммоль) и пиридина (30 мг, 0,38 ммоль) в ДХМ (4,0 мл). Реакционную смесь перемешивали при 26°С в течение 2 часов. Растворитель удаляли и остаток очищали подготавливающей ТСХ (растворитель: 30% EtOAc в петролейном эфире) с получением соединения 3 (300 мг, 82,4%) в виде желтой пены. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=1,248 мин, [M+H]+1239,5.
Figure 00000079
К раствору соединения 3 (312 мг, 0,24 ммоль) в ТГФ/Н2О (4 мл/4 мл) добавляли HOAc (6,0 мл) при 26°С. После того, как реакционную смесь перемешивали при 26°С в течение 24 часов, ее разбавляли EtOAc (20 мл) и промывали водой (2×10 мл), насыщенным. водн. NaHCO3 (15 мл) и насыщенным раствором соли (15 мл). Его сушили, концентрировали и очищали колоночной флэш-хроматографией на силикагеле (0-5% MeOH в ДХМ) с получением соединения 4 (240 мг, 97,1%) в виде желтой пены. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,876 мин, [M+H]+ 1011,3.
Figure 00000080
К раствору соединения 4 (101 мг, 0,10 ммоль) в ДХМ (5,0 мл) добавляли ПДМ (125 мг, 0,29 ммоль) при 0°C. Реакционную смесь перемешивали при 26°С в течение 2 часов. Реакцию гасили с помощью насыщенного раствора NaHCO3/Na2SO3 (2,0 мл/2,0 мл) и экстрагировали ДХМ (3×5 мл). Объединенный органический слой промывали NaHCO3/Na2SO3 (2 мл/2 мл), насыщенным раствором соли (5 мл), сушили и концентрировали. Остаток очищали подготавливающей ТСХ (ДХМ /MeOH=15:1) с получением соединения 5 (66 мг, 66,2%) в виде желтой пены. ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,815 мин, [(M-100)/2+Na]+ 476,1.
Figure 00000081
Холодную ТФК (95% в воде, 2,0 мл) добавляли к соединению 5 (66 мг, 0,06 ммоль) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин. Реакционную смесь добавляли по каплям к холоду. водн. раствору NaHCO3 (4,0 мл) при 0°С и экстрагировали ДХМ (4×8,0 мл). Объединенный органический слой промывали насыщенным раствором соли (20 мл), сушили и концентрировали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью подготавливающей ТСХ (6,25% MeOH в ДХМ, Rf=0,5) с получением CLD-3 (GNT_B343_427-1) (27,4 мг, 47,4%) в виде желтой пены. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ 9,21 (s, 1H), 8,38-8,35 (m, 1H), 7,79 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,69 (d, J=4,4 Гц, 1H), 7,47 (s, 1H), 7,17 (s, 1H), 6,80 (s, 1H), 6,50 (s, 1H), 5,57 (d, J=9,2 Гц, 1H), 5,20-5,13 (m, 4H), 4,29-4,25 (m, 5H), 4,14-4,09 (m. 4H), 3,96-3,87 (m, 8H), 3,38 (d, J=8,0 Гц, 1H), 3,58 (d, J=8,0 Гц, 2H), 3,44 (s, 1H), 3,16-3,09 (m, 1H), 2,97-2,89 (m, 3H), 2,71-2,67 (m, 1H), 1,95-1,91 (m, 6H), 1,45-1,22 (m, 3H). ЖХМС (5-95AB/1,5 мин): ВУ=0,750 мин, [M+H]+ 889,8.
Синтез CLD-5
(R)-2-((4-нитрофенил)дисульфанил)пропил (11S,11aS)-11-гидрокси-7,8-диметокси-5-оксо-2-(хинолин-6-ил)-11,11a-дигидро-1H-бензо[e]пирроло[1,2-a][1,4]диазепин-10(5H)-карбоксилат
Figure 00000082
Figure 00000083
2М раствор оксалилхлорида (39 мл, 77,14 ммоль) и 60 мл дихлорметана смешивали в колбе на 500 мл, охлаждали до -78°С. ДМСО (DMSO) (5,77 мл, 77,14 ммоль) добавляли шприцом в течение около 2-3 мин. Смесь перемешивали в течение 20 мин при -78°C, затем добавляли шприцом исходное вещество (5S)-5-[[трет-бутил(диметил)силил]оксиметил]-1-(4,5-диметокси-2-нитро-бензоил)пирролидин-3-он (11,33 г, растворенное в 30 мл дихлорметана плюс 10 мл промывки, синтезированное в соответствии с Journal of Medicinal Chemistry, 2010, 53, 2927-2941 и Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2000, 10, 1845-1847). Через 30 мин при -78°С шприцом добавляли Et3N (22,6 мл, 154,3 ммоль) в течение 2 мин. Через около 4 мин смесь нагревали до 0°С и перемешивали в течение 1 часа. Смесь выливали в 100 мл воды. Дихлорметан отделяли. Водный слой экстрагировали EtOAc (2×75 мл). Объединенные органические экстракты промывали 1 н. HCl, затем насыщенным раствором бикарбонат натрия, сушили над Na2SO4 и концентрировали. Остаток очищали хроматографией на колонке с силикагелем (70%-90% EtOAc/гептан) с получением целевого продукта в виде слегка желтой пены (10,12 г).
Figure 00000084
(5S)-5-[[трет-бутил(диметил)силил]оксиметил]-1-(4,5-диметокси-2-нитро-бензоил)пирролидин-3-он (1,20 г, 2,74 ммоль), 2,6 -лутидина (1,27 мл, 10,9 ммоль) смешивали в дихлорметане (45 мл) и затем охлаждали до -35°С. Затем медленно добавляли ангидрид трифторметансульфокислоты (0,87 мл, растворенный в около 5,2 мл ДХМ ) шприцом---смесь становилась ярко-желтой, а температура ванны увеличивалась до -33°С. Температура реакции не должна превышать -20°C. После в общем около 1 часа реакционную смесь пипетировали в смеси насыщенного водного раствора NaHCO3, льда и EtOAc, затем дважды экстрагировали этилацетатом (всего около 400 мл). Объединенный органический слой промывали 1н. вод. HCl, затем насыщенным раствором соли, а затем сушили над сульфатом натрия, концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (40%-100% EtOAc/гептан) с получением целевого продукта в виде желтого твердого вещества (957 мг).
Figure 00000085
К винилтрифлату (957 мг, 1,68 ммоль) в колбе на 250 мл добавляли этанол (8,75 мл) и воду (2,5 мл), 6-хинолилбороновую кислоту (348 мг, 2,01 ммоль), фосфат калия (1,10 г, 5,03 ммоль), а затем добавляли [1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен]дихлорпалладий(ii) (982 мг, 0,134 ммоль). Смесь продували азотом и затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере азота. После проведения реакции (около 10 мин) к реакционной смеси добавляли EtOAc (50 мл). Смесь фильтровали, чтобы удалить любое твердое вещество. К фильтрату добавляли воду (около 5 мл). Фильтрат экстрагировали EtOAc (2x). Объединенные органические слои сушили сульфатом натрия и концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (40%-100% EtOAc/гептан) с получением целевого продукта в виде желтого твердого вещества (928 мг).
Figure 00000086
Нитро-исходный материал (322 мг, 0,586 ммоль) растворяли в 6 мл этанола и затем добавляли пыль цинка (383 мг, 5,86 ммоль) с последующим добавлением 1,5 мл 5% муравьиной кислоты в воде (75 мкл муравьиной кислоты в 1,5 мл воды). Затем смесь нагревали до 53°С и перемешивали до завершения реакции (около 3,5 часа). Смесь охлаждали до комнатной температуры, фильтровали. Фильтрат разбавляли EtOAc (около 10 мл) и затем добавляли 3 М аммиак (около 3 мл). Смесь экстрагировали EtOAc (3х). Объединенные органические слои сушили сульфатом натрия и концентрировали с получением неочищенного анилина, который использовали в следующем этапе без очистки.
Figure 00000087
Трифосген (79,4 мг, 0,268 ммоль) растворяли в 1,5 мл дихлорметана, затем добавляли раствор (2R)-2-[(5-нитро-2-пиридил)дисульфанил]пропан-1-ола (196 мг, 0,797 ммоль) и пиридина (0,092 мл) в 2 мл дихлорметана. Через 30 мин вышеуказанный раствор добавляли к раствору исходного анилина и пиридина (0,092 мл) в 4,5 мл дихлорметана. После окончания реакции (около 1 часа) смесь разбавляли EtOAc, затем промывали 1 М раствором HCl и затем насыщенным раствором карбоната натрия. Органические слои сушили над сульфатом натрия и концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (30%-70% EtOAc/гептан) с получением целевого карбамата (182 мг).
Figure 00000088
Спирт, защищенный TBS (182 мг, 0,230 ммоль), растворяли в 4 мл:1 мл ТГФ:вода и затем добавляли 4 мл уксусной кислоты. Смесь нагревали до 55°С. После завершения реакции (около двух суток) смесь охлаждали до комнатной температуры и затем разбавляли 50 мл этилацетата. Добавляли карбонат калия для нейтрализации уксусной кислоты до достижения рН около 10. Смесь дважды экстрагировали этилацетатом. Объединенные органические слои сушили сульфатом натрия и концентрировали. Остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле (0-10% MeOH/EtOAc) с получением целевого спирта (125 мг).
Figure 00000089
Спиртовое исходное вещество (116 мг, 0,171 ммоль) растворяли в 6 мл дихлорметана, а затем при комнатной температуре добавляли перйодат Десса-Мартина (89,8 мг, 0,205 ммоль). Через около 2,5 часов добавляли насыщенный раствор бикарбоната натрия (около 6 мл) и 1 М раствор тиосульфата натрия (около 4 мл). Смесь экстрагировали дихлорметаном один раз и дважды хлороформом. Объединенные органические слои (около 75 мл) сушили над сульфатом натрия, концентрировали, получая около 103 мг неочищенного продукта, который очищали с помощью обращенно-фазовой ВЭЖХ с получением желаемого продукта (29,5 мг).
1H ЯМР (400 МГц, ДМСО (DMSO)-d 6) δ 9,24 (s, 1H), 8,83 (dd, J=1,6, 4,2 Гц, 1H), 8,47 (dd, J=2,6, 8,9 Гц, 1H), 8,32 (d, J=8,0 Гц, 1H), 8,12 (dd, J=1,9, 8,9 Гц, 1H), 7,92 (d, J=8,8 Гц, 1H), 7,87 (d, J=1,8 Гц, 1H), 7,80 (s, 1H), 7,75 (d, J=8,5 Гц, 1H), 7,51 (dd, J=4,2, 8,3 Гц, 1H), 7,20 (s, 1H), 7,07 (s, 1H), 6,95 (d, J=6,3 Гц, 1H), 5,78-5,62 (m, 1H), 4,30 (d, J=6,8 Гц, 1H), 4,00 (td, J=3,2, 10,0 Гц, 1H), 3,85 (s, 6H), 3,56-3,44 (m, 1H), 3,08 (d, J=14,6 Гц, 1H), 1,14 (d, J=6,3 Гц, 3H), 0,07 (s, 12H). МС масса/заряд=676 [M+1]+;
Синтез CLD-6
2-((4-нитрофенил)дисульфанил)этил(11S, 11aS)-11-гидрокси-7,8-диметокси-5-оксо-2-(хинолин-6-ил) -11,11а-дигидро-1Н-бензо[е]пирроло[1,2-а][1,4]диазепин-10 (5H)-карбоксилат
Figure 00000090
Figure 00000091
К раствору соединения 1 (1,13 кг, 4,59 моль, 1,00 экв.) в ТГФ (10 л) при 0°C добавляли LiBH4 (99,90 г, 4,59 моль, 1,00 экв.) двумя порциями (почти без температурного заряда при добавлении LiBH4). Суспензию перемешивали при 0°C в течение 1 часа, затем при 10-20°C в течение 18 часов. Смесь охлаждали до 0°С и добавляли водный NH4Cl (5 л). Слои разделяли и водный слой экстрагировали EA (5 л ×3). Объединенные органические слои промывали насыщенным раствором соли. Органические слои сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали, получая соединение 2 в виде прозрачного масла (1600 г, 7,36 моль, выход 80,2%).
Figure 00000092
В 50-литровую колбу было загружено соединение 2 (1,60 кг, 7,36 моль, 1,00 экв.), ДХМ (20 л) с последующим добавлением по каплям по очереди TEA (1,12 кг, 11,05 моль, 1,50 экв.) и ацетилхлорида (635,54 г, 8,10 моль, 1,10 экв.) с перемешиванием при 0°C. После добавления полученный раствор перемешивали при 15-25°С в течение 18 часов, гасили добавлением 5 л воды и экстрагировали 3×2 л ДХМ. Объединенные органические слои сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали под вакуумом, получая соединение 3 в виде бесцветного масла (2,46 кг, 9,49 моль, выход 128,90%).
Figure 00000093
В 20-литровую трехгорлую круглодонную колбу загружали соединение 3 (1,23 кг, 4,75 моль, 1,00 экв.) в ДХМ (12 л) с последующим добавлением PCC (1,54 кг, 7,13 моль) несколькими партиями при 15°C. Полученный раствор перемешивали при 15-25°C в течение 18 часов. Твердые вещества отфильтровывали и фильтрат концентрировали под вакуумом. Остаток очищали на колонке с силикагелем, элюируя смесью этилацетат:петролейный эфир (1:5), получая соединение 4 в виде светло-желтой жидкости (1,13 кг, 4,38 моль, выход 46,15%).
Figure 00000094
В 10-литровую трехгорлую круглодонную колбу загружали метил(трифенил)фосфонийбромид (958,03 г, 2,68 моль), ТГФ (2,5 л) с последующим добавлением трет-BuOK (300,94 г, 2,68 моль) порциями при 0°C в течение 2 часов. К этому добавляли по каплям раствор 4 (460,00 г, 1,79 моль) в ТГФ (2,5 л) с перемешиванием при 0°C. Полученный раствор перемешивали при -5~0°С в течение 20 мин, гасили добавлением 500 мл воды и экстрагировали 3×500 мл этилацетата. Объединенные органические слои сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали под вакуумом. Остаток очищали на колонке с силикагелем, элюируя смесью этилацетат:петролейный эфир (1:20), получая соединение 5 в виде светло-желтой жидкости (275,00 г, 1,08 моль, 30,09%).
Figure 00000095
Смесь соединения 5 (330,00 г, 1,29 моль) в HCl (газ)/EtOAc (3 л, 4 М/л) перемешивали при 0°C 20 мин. Затем смесь перемешивали при 10-30°С в течение 1 часа. Смесь концентрировали под вакуумом, получая соединение 6 в виде желтого твердого вещества (250,00 г, 1,30 моль, 101%), которое использовали в следующем этапе без очистки.
Figure 00000096
В 3000-мл трехгорлую круглодонную колбу, продутую и поддерживаемую инертной атмосферой азота, загружали раствор соединения 7 (354,42 г, 1,56 моль, 1,30 экв.) в ТГФ (1,5 л) с последующим добавлением SOCl2 (1,71 кг, 14,33 моль, 11,94 экв.) по каплям при перемешивании. Полученный раствор перемешивали при 20-30°C в течение 4 часов и затем концентрировали под вакуумом. В другую трехгорлую круглодонную колбу объемом 3000 мл, продутую и поддерживаемую инертной атмосферой азота, загружали раствор соединения 6 (230,00 г, 1,20 моль, 1,00 экв.) в ДХМ (2,5 л). К этому добавляли по каплям Et3N (485,75 г, 4,80 моль, 4,00 экв.) при перемешивании при -40°С, затем раствор в первой колбе при -40°С. Давали подняться температуре до 0°C естественным образом, гасили добавлением 3000 мл воды/льда и экстрагировали 3×1000 мл дихлорметана. Объединенные органические слои сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали под вакуумом. Остаток очищали на колонке с силикагелем, элюируя EtOAc:PE (1:3), получая соединение 8 в виде светло-коричневого масла (210,00 г), которое использовали на следующей стадии без очистки.
Figure 00000097
К смеси соединения 8 (90,00 г, 247,02 ммоль, 1,00 экв.) в ТГФ (400 мл), MeOH (100 мл), H2O (400 мл) добавляли NaOH (29,64 г, 741,05 ммоль, 3,00 экв.) в одной порции при 0 oC. Смесь перемешивали при 20-30°C в течение 18 часов. Водную фазу экстрагировали EtOAc (300 мл ×3). Объединенную органическую фазу промывали насыщенным раствором соли (100 мл), сушили безводным Na2SO4, фильтровали и концентрировали под вакуумом, чтобы получить соединение 9 в виде желтого твердого вещества (90,26 г, неочищенное), которое применяли в следующем этапе без дополнительной очистки.
Figure 00000098
В 2000 мл трехгорлую круглодонную колбу, снабженную температурным зондом, магнитными мешалками и входом для азота, были добавлены TBDMSCl (126,62 г, 840,12 ммоль), имидазол (57,20 г, 840,12 ммоль, 3,00 экв.) в ДМФА (DMF) (1 л). Затем к смеси добавляли раствор соединения 9 (90,26 г, 280,04 ммоль, 1,00 экв.) в ДМФА (DMF) (1 л) при 0°C. Полученную реакционную смесь перемешивали в течение 2 часов при 25-30°C. Реакционную смесь выливали в ледяную воду (1 л) и затем экстрагировали ДХМ (200 мл ×3). Объединенные органические фазы промывали насыщенным раствором соли (100 мл), сушили над Na2SO4 и концентрировали под вакуумом с получением остатка, с получением соединения 10 в виде желтого масла (126,00 г), которое использовали в следующем этапе без дополнительной очистки.
Figure 00000099
К смеси соединения 10 (126,00 г, 288,61 ммоль, 1,00 экв.) в AcOH (1 л) порциями добавляли Zn (188,72 г, 2,89 моль), поддерживая температуру ниже 30°C. Смесь перемешивали при 20-30°С в течение 30 мин. Остаток выливали в EtOAc (500 мл) и фильтровали. Фильтрат концентрировали под вакуумом. Остаток очищали хроматографией на силикагеле (PE/EtOAc=10/1, 1/1) с получением 11 в виде желтого масла (58,00 г, 142,64 ммоль, выход 49%).
1H ЯМР (400 МГц, хлороформ-d) δ м.д. 6,71 (s, 1 H) 6,22 (s, 1 H) 4,85-4,97 (m, 2 H) 4,52 (br. s., 1 H) 4,14-4,23 (m, 1 H) 3,99-4,13 (m, 1 H) 3,82 (s, 3 H) 3,77 (s, 3 H) 3,59 (d, J=5,73 Гц, 1 H) 2,63-2,72 (m, 2 H) 2,01-2,04 (m, 1 H) 1,23 (t, J=7,06 Гц, 1 H) 0,85 (s, 9 H) -0,06-0,06 (m, 5 H).
2-((4-нитрофенил)дисульфанил)этил(11S, 11aS)-11-гидрокси-7,8-диметокси-5-оксо-2-(хинолин-6-ил) -11,11а-дигидро-1Н-бензо[е]пирроло[1,2-а][1,4]диазепин-10 (5H)-карбоксилат
Figure 00000100
Указанное в заголовке соединение синтезировали следуя стадиям 5-7, как описано выше. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО -d 6) δ 9,24 (d, J=2,3 Гц, 1H), 8,66-8,34 (m, 1H), 8,15-7,62 (m, 1H), 7,11 (s, 1H), 6,98 (s, 1H), 6,67 (d, J=5,8 Гц, 1H), 5,37 (dd, J=9,5, 6,3 Гц, 1H), 5,13 (d, J=6,2 Гц, 2H), 4,54-4,31 (m, 1H), 4,12 (d, J=15,6 Гц, 1H), 4,03-3,91 (m, 2H), 3,86-3,78 (m, 6H), 3,76 (d, J=3,4 Гц, 1H), 3,48 (t, J=8,8 Гц, 1H), 3,24-3,00 (m, 2H), 2,96-2,80 (m, 1H). МС масса/заряд=549 [M+1]+.
Хотя вышеприведенное изобретение было описано более подробно с помощью иллюстрации и примера для ясности понимания, описания и примеры не следует рассматривать как ограничивающие объем изобретения. Все патенты, заявки на патенты и ссылки, приведенные в описании, полностью включены посредством ссылки.
--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> GENENTECH, INC., ET AL.
<120> ПИРРОЛОБЕНЗОДИАЗЕПИНОВЫЕ КОНЪЮГАТЫ АНТИТЕЛО-ЛЕКАРСТВЕННОЕ СРЕДСТВО И
СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
<130> P32858-WO
<140>
<141>
<150> 62/236,429
<151> 2015-10-02
<160> 70
<170> PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 16
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 1
Arg Ser Ser Gln Ser Ile Val His Ser Val Gly Asn Thr Phe Leu Glu
1 5 10 15
<210> 2
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 2
Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser
1 5
<210> 3
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 3
Phe Gln Gly Ser Gln Phe Pro Tyr Thr
1 5
<210> 4
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 4
Gly Tyr Glu Phe Ser Arg Ser Trp Met Asn
1 5 10
<210> 5
<211> 18
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 5
Gly Arg Ile Tyr Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Ser Gly Lys Phe
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 6
<211> 11
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 6
Asp Gly Ser Ser Trp Asp Trp Tyr Phe Asp Val
1 5 10
<210> 7
<211> 107
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 7
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Gln Gly Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Thr Ser Asn Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Ser Glu Leu Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 8
<211> 120
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 8
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Thr Gly Tyr
20 25 30
Ser Val Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu Trp Leu
35 40 45
Gly Met Ile Trp Gly Asp Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys
50 55 60
Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Val Leu
65 70 75 80
Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Tyr Tyr Phe Asn Tyr Ala Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 9
<211> 11
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 9
Ser Ala Ser Gln Gly Ile Ser Asn Tyr Leu Asn
1 5 10
<210> 10
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 10
Tyr Thr Ser Asn Leu His Ser
1 5
<210> 11
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 11
Gln Gln Tyr Ser Glu Leu Pro Trp Thr
1 5
<210> 12
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 12
Gly Phe Ser Leu Thr Gly Tyr Ser Val Asn
1 5 10
<210> 13
<211> 16
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 13
Met Ile Trp Gly Asp Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 14
<211> 12
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 14
Asp Tyr Tyr Val Asn Tyr Ala Ser Trp Phe Ala Tyr
1 5 10
<210> 15
<211> 214
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 15
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Gln Gly Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Thr Ser Asn Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Ser Glu Leu Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Cys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 16
<211> 450
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 16
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Thr Gly Tyr
20 25 30
Ser Val Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu Trp Leu
35 40 45
Gly Met Ile Trp Gly Asp Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys
50 55 60
Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Val Leu
65 70 75 80
Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Tyr Tyr Phe Asn Tyr Ala Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365
Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445
Gly Lys
450
<210> 17
<211> 112
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 17
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Gly Ser
20 25 30
Arg Phe Thr Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Lys Tyr Ala Ser Ile Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His Ser Trp
85 90 95
Glu Ile Pro Pro Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 18
<211> 118
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 18
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Met Ile His Pro Leu Asp Ala Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Arg Asp Arg Val Thr Ile Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Thr Tyr Asp Gly Gly Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 19
<211> 15
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 19
Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Gly Ser Arg Phe Thr Tyr Met His
1 5 10 15
<210> 20
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 20
Tyr Ala Ser Ile Leu Glu Ser
1 5
<210> 21
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 21
Gln His Ser Trp Glu Ile Pro Pro Trp Thr
1 5 10
<210> 22
<211> 5
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 22
Gly Tyr Trp Met Asn
1 5
<210> 23
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 23
Met Ile His Pro Leu Asp Ala Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe Arg
1 5 10 15
Asp
<210> 24
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 24
Gly Thr Tyr Asp Gly Gly Phe Glu Tyr
1 5
<210> 25
<211> 219
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 25
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Gly Ser
20 25 30
Arg Phe Thr Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Lys Tyr Ala Ser Ile Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His Ser Trp
85 90 95
Glu Ile Pro Pro Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 26
<211> 448
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 26
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Met Ile His Pro Leu Asp Ala Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Arg Asp Arg Val Thr Ile Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Thr Tyr Asp Gly Gly Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215 220
His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
435 440 445
<210> 27
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 27
Met Ile His Pro Met Asp Ser Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe Arg
1 5 10 15
Asp
<210> 28
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 28
Met Ile His Pro Leu Asp Ser Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe Arg
1 5 10 15
Asp
<210> 29
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 29
Gly Thr Tyr Asp Gly Gly Phe Lys Tyr
1 5
<210> 30
<211> 219
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 30
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Gly Ser
20 25 30
Arg Phe Thr Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Lys Tyr Ala Ser Ile Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His Ser Trp
85 90 95
Glu Ile Pro Pro Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Cys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 31
<211> 448
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 31
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Met Ile His Pro Leu Asp Ala Glu Ile Arg Ala Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Arg Asp Arg Val Thr Ile Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Thr Tyr Asp Gly Gly Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Cys Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215 220
His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
435 440 445
<210> 32
<211> 11
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 32
Lys Ala Ser Asp Leu Ile His Asn Trp Leu Ala
1 5 10
<210> 33
<211> 8
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 33
Tyr Gly Ala Thr Ser Leu Glu Thr
1 5
<210> 34
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 34
Gln Gln Tyr Trp Thr Thr Pro Phe Thr
1 5
<210> 35
<211> 11
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 35
Gly Tyr Ser Ile Thr Asn Asp Tyr Ala Trp Asn
1 5 10
<210> 36
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 36
Gly Tyr Ile Ser Tyr Ser Gly Tyr Thr Thr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys
1 5 10 15
Ser
<210> 37
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 37
Ala Arg Trp Ala Ser Gly Leu Asp Tyr
1 5
<210> 38
<211> 108
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 38
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Asp Leu Ile His Asn Trp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Thr Ser Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Trp Thr Thr Pro Phe
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 39
<211> 116
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 39
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Asn Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Tyr Ser Gly Tyr Thr Thr Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Ala Ser Gly Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 40
<211> 11
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 40
Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp Tyr Ala Trp Asn
1 5 10
<210> 41
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 41
Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu Lys
1 5 10 15
Ser
<210> 42
<211> 15
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 42
Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 15
<210> 43
<211> 17
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 43
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Arg Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu
1 5 10 15
Ala
<210> 44
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 44
Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser
1 5
<210> 45
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 45
Gln Gln Tyr Tyr Asn Tyr Pro Arg Thr
1 5
<210> 46
<211> 124
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 46
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Gly Tyr Ile Ser Asn Ser Gly Ser Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Arg Asn Tyr Asp Tyr Asp Asp Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 47
<211> 113
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 47
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Arg
20 25 30
Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys
35 40 45
Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Asn Tyr Pro Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 48
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 48
Gly Phe Ser Phe Ser Asp Phe Ala Met Ser
1 5 10
<210> 49
<211> 18
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 49
Ala Thr Ile Gly Arg Val Ala Phe His Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Met
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 50
<211> 13
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 50
Ala Arg His Arg Gly Phe Asp Val Gly His Phe Asp Phe
1 5 10
<210> 51
<211> 16
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 51
Arg Ser Ser Glu Thr Leu Val His Ser Ser Gly Asn Thr Tyr Leu Glu
1 5 10 15
<210> 52
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 52
Arg Val Ser Asn Arg Phe Ser
1 5
<210> 53
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 53
Phe Gln Gly Ser Phe Asn Pro Leu Thr
1 5
<210> 54
<211> 120
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 54
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Ser Asp Phe
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Thr Ile Gly Arg Val Ala Phe His Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Met
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg His Arg Gly Phe Asp Val Gly His Phe Asp Phe Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 55
<211> 113
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 55
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Glu Thr Leu Val His Ser
20 25 30
Ser Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Arg Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile
65 70 75 80
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly
85 90 95
Ser Phe Asn Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg
<210> 56
<211> 117
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 56
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Leu Pro Gly Gly Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Glu Ile Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Ala Thr Phe Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Arg Arg Val Pro Ile Arg Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 57
<211> 112
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
полипептид"
<400> 57
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Glu
20 25 30
Gly Asp Ser Phe Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105 110
<210> 58
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 58
Gly Tyr Thr Phe Ser Ser Tyr Trp Ile Glu
1 5 10
<210> 59
<211> 18
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 59
Gly Glu Ile Leu Pro Gly Gly Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Glu Ile Phe
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 60
<211> 10
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 60
Thr Arg Arg Val Pro Ile Arg Leu Asp Tyr
1 5 10
<210> 61
<211> 15
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 61
Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Glu Gly Asp Ser Phe Leu Asn
1 5 10 15
<210> 62
<211> 7
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 62
Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser
1 5
<210> 63
<211> 9
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
пептид"
<400> 63
Gln Gln Ser Asn Glu Asp Pro Leu Thr
1 5
<210> 64
<211> 1255
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 64
Met Glu Leu Ala Ala Leu Cys Arg Trp Gly Leu Leu Leu Ala Leu Leu
1 5 10 15
Pro Pro Gly Ala Ala Ser Thr Gln Val Cys Thr Gly Thr Asp Met Lys
20 25 30
Leu Arg Leu Pro Ala Ser Pro Glu Thr His Leu Asp Met Leu Arg His
35 40 45
Leu Tyr Gln Gly Cys Gln Val Val Gln Gly Asn Leu Glu Leu Thr Tyr
50 55 60
Leu Pro Thr Asn Ala Ser Leu Ser Phe Leu Gln Asp Ile Gln Glu Val
65 70 75 80
Gln Gly Tyr Val Leu Ile Ala His Asn Gln Val Arg Gln Val Pro Leu
85 90 95
Gln Arg Leu Arg Ile Val Arg Gly Thr Gln Leu Phe Glu Asp Asn Tyr
100 105 110
Ala Leu Ala Val Leu Asp Asn Gly Asp Pro Leu Asn Asn Thr Thr Pro
115 120 125
Val Thr Gly Ala Ser Pro Gly Gly Leu Arg Glu Leu Gln Leu Arg Ser
130 135 140
Leu Thr Glu Ile Leu Lys Gly Gly Val Leu Ile Gln Arg Asn Pro Gln
145 150 155 160
Leu Cys Tyr Gln Asp Thr Ile Leu Trp Lys Asp Ile Phe His Lys Asn
165 170 175
Asn Gln Leu Ala Leu Thr Leu Ile Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala Cys
180 185 190
His Pro Cys Ser Pro Met Cys Lys Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser
195 200 205
Ser Glu Asp Cys Gln Ser Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys
210 215 220
Ala Arg Cys Lys Gly Pro Leu Pro Thr Asp Cys Cys His Glu Gln Cys
225 230 235 240
Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
245 250 255
His Phe Asn His Ser Gly Ile Cys Glu Leu His Cys Pro Ala Leu Val
260 265 270
Thr Tyr Asn Thr Asp Thr Phe Glu Ser Met Pro Asn Pro Glu Gly Arg
275 280 285
Tyr Thr Phe Gly Ala Ser Cys Val Thr Ala Cys Pro Tyr Asn Tyr Leu
290 295 300
Ser Thr Asp Val Gly Ser Cys Thr Leu Val Cys Pro Leu His Asn Gln
305 310 315 320
Glu Val Thr Ala Glu Asp Gly Thr Gln Arg Cys Glu Lys Cys Ser Lys
325 330 335
Pro Cys Ala Arg Val Cys Tyr Gly Leu Gly Met Glu His Leu Arg Glu
340 345 350
Val Arg Ala Val Thr Ser Ala Asn Ile Gln Glu Phe Ala Gly Cys Lys
355 360 365
Lys Ile Phe Gly Ser Leu Ala Phe Leu Pro Glu Ser Phe Asp Gly Asp
370 375 380
Pro Ala Ser Asn Thr Ala Pro Leu Gln Pro Glu Gln Leu Gln Val Phe
385 390 395 400
Glu Thr Leu Glu Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Tyr Ile Ser Ala Trp Pro
405 410 415
Asp Ser Leu Pro Asp Leu Ser Val Phe Gln Asn Leu Gln Val Ile Arg
420 425 430
Gly Arg Ile Leu His Asn Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gln Gly Leu
435 440 445
Gly Ile Ser Trp Leu Gly Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly
450 455 460
Leu Ala Leu Ile His His Asn Thr His Leu Cys Phe Val His Thr Val
465 470 475 480
Pro Trp Asp Gln Leu Phe Arg Asn Pro His Gln Ala Leu Leu His Thr
485 490 495
Ala Asn Arg Pro Glu Asp Glu Cys Val Gly Glu Gly Leu Ala Cys His
500 505 510
Gln Leu Cys Ala Arg Gly His Cys Trp Gly Pro Gly Pro Thr Gln Cys
515 520 525
Val Asn Cys Ser Gln Phe Leu Arg Gly Gln Glu Cys Val Glu Glu Cys
530 535 540
Arg Val Leu Gln Gly Leu Pro Arg Glu Tyr Val Asn Ala Arg His Cys
545 550 555 560
Leu Pro Cys His Pro Glu Cys Gln Pro Gln Asn Gly Ser Val Thr Cys
565 570 575
Phe Gly Pro Glu Ala Asp Gln Cys Val Ala Cys Ala His Tyr Lys Asp
580 585 590
Pro Pro Phe Cys Val Ala Arg Cys Pro Ser Gly Val Lys Pro Asp Leu
595 600 605
Ser Tyr Met Pro Ile Trp Lys Phe Pro Asp Glu Glu Gly Ala Cys Gln
610 615 620
Pro Cys Pro Ile Asn Cys Thr His Ser Cys Val Asp Leu Asp Asp Lys
625 630 635 640
Gly Cys Pro Ala Glu Gln Arg Ala Ser Pro Leu Thr Ser Ile Ile Ser
645 650 655
Ala Val Val Gly Ile Leu Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly
660 665 670
Ile Leu Ile Lys Arg Arg Gln Gln Lys Ile Arg Lys Tyr Thr Met Arg
675 680 685
Arg Leu Leu Gln Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly
690 695 700
Ala Met Pro Asn Gln Ala Gln Met Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Leu
705 710 715 720
Arg Lys Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys
725 730 735
Gly Ile Trp Ile Pro Asp Gly Glu Asn Val Lys Ile Pro Val Ala Ile
740 745 750
Lys Val Leu Arg Glu Asn Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu
755 760 765
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg
770 775 780
Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser Thr Val Gln Leu Val Thr Gln Leu
785 790 795 800
Met Pro Tyr Gly Cys Leu Leu Asp His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg
805 810 815
Leu Gly Ser Gln Asp Leu Leu Asn Trp Cys Met Gln Ile Ala Lys Gly
820 825 830
Met Ser Tyr Leu Glu Asp Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
835 840 845
Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe
850 855 860
Gly Leu Ala Arg Leu Leu Asp Ile Asp Glu Thr Glu Tyr His Ala Asp
865 870 875 880
Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu Arg
885 890 895
Arg Arg Phe Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val
900 905 910
Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ala Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala
915 920 925
Arg Glu Ile Pro Asp Leu Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro
930 935 940
Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met
945 950 955 960
Ile Asp Ser Glu Cys Arg Pro Arg Phe Arg Glu Leu Val Ser Glu Phe
965 970 975
Ser Arg Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Phe Val Val Ile Gln Asn Glu
980 985 990
Asp Leu Gly Pro Ala Ser Pro Leu Asp Ser Thr Phe Tyr Arg Ser Leu
995 1000 1005
Leu Glu Asp Asp Asp Met Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Glu Tyr
1010 1015 1020
Leu Val Pro Gln Gln Gly Phe Phe Cys Pro Asp Pro Ala Pro Gly
1025 1030 1035
Ala Gly Gly Met Val His His Arg His Arg Ser Ser Ser Thr Arg
1040 1045 1050
Ser Gly Gly Gly Asp Leu Thr Leu Gly Leu Glu Pro Ser Glu Glu
1055 1060 1065
Glu Ala Pro Arg Ser Pro Leu Ala Pro Ser Glu Gly Ala Gly Ser
1070 1075 1080
Asp Val Phe Asp Gly Asp Leu Gly Met Gly Ala Ala Lys Gly Leu
1085 1090 1095
Gln Ser Leu Pro Thr His Asp Pro Ser Pro Leu Gln Arg Tyr Ser
1100 1105 1110
Glu Asp Pro Thr Val Pro Leu Pro Ser Glu Thr Asp Gly Tyr Val
1115 1120 1125
Ala Pro Leu Thr Cys Ser Pro Gln Pro Glu Tyr Val Asn Gln Pro
1130 1135 1140
Asp Val Arg Pro Gln Pro Pro Ser Pro Arg Glu Gly Pro Leu Pro
1145 1150 1155
Ala Ala Arg Pro Ala Gly Ala Thr Leu Glu Arg Pro Lys Thr Leu
1160 1165 1170
Ser Pro Gly Lys Asn Gly Val Val Lys Asp Val Phe Ala Phe Gly
1175 1180 1185
Gly Ala Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Thr Pro Gln Gly Gly Ala
1190 1195 1200
Ala Pro Gln Pro His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro Ala Phe Asp
1205 1210 1215
Asn Leu Tyr Tyr Trp Asp Gln Asp Pro Pro Glu Arg Gly Ala Pro
1220 1225 1230
Pro Ser Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr
1235 1240 1245
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val
1250 1255
<210> 65
<211> 14
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
олигонуклеотид"
<400> 65
tatagaaatc tata 14
<210> 66
<211> 14
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
олигонуклеотид"
<400> 66
tatagatttc tata 14
<210> 67
<211> 14
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
олигонуклеотид"
<400> 67
tatagaaatg tata 14
<210> 68
<211> 14
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<221> источник
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: Синтетический
олигонуклеотид"
<400> 68
tatacatttc tata 14
<210> 69
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 69
Met Ala Glu Ala Ile Thr Tyr
1 5
<210> 70
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 70
Thr Ala Phe Arg Phe Pro Asp
1 5
<---

Claims (127)

1. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство Формулы I
Figure 00000101
где X
Figure 00000102
Y представляет собой C(=O)-NH или CH2-NH;
A представляет собой пиррол, необязательно замещенный группой =C(R)2, в которой R независимо выбран из H и C1-C6-алкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила или R1 и R2 образуют циклопропил;
R3 представляет собой NO2; и
m равно 1 или 2.
2. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1 Формулы Ia
Figure 00000103
3. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1 Формулы Ic
Figure 00000104
где каждый R4 и R5 представляет собой H или R4 и R5 представляют собой =O.
4. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1 Формулы Id
Figure 00000105
где каждый R4 и R5 представляет собой H или R4 и R5 представляют собой =O.
5. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.4, где каждый R4 и R5 представляет собой H.
6. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1 Формулы Ie
Figure 00000106
7. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.3, где R4 и R5 представляют собой =O.
8. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1 Формулы If
Figure 00000107
9. Промежуточное соединение линкер-лекарственное средство по п.1, где R1 и R2 вместе с атомом углерода, к которому они присоединены, образуют циклопропильное или циклобутильное кольцо.
10. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II
Figure 00000108
где X
Figure 00000102
Y представляет собой C(=O)-NH или CH2-NH;
A представляет собой пиррол, необязательно замещенный группой =C(R)2, в которой R независимо выбран из H и C1-C6-алкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила или R1 и R2 образуют циклопропил;
p равно целому числу от 1 до 8; и
Ab представляет собой антитело, которое выбрано из группы, состоящей из анти-HER2, анти-CD22, анти-CD33, анти-Napi2b и анти-CLL-1.
11. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10 Формулы IIa
Figure 00000109
12. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10 Формулы IIc
Figure 00000110
где каждый R4 и R5 представляет собой H или R4 и R5 представляют собой =O.
13. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.12, где каждый R4 и R5 представляет собой H.
14. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.12, где каждый R4 и R5 представляет собой =О.
15. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.12 Формулы IId
Figure 00000111
16. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.12 Формулы IIe
Figure 00000112
17. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.12 Формулы IIf
Figure 00000113
18. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10, в котором Ab представляет собой модифицированное цистеином антитело.
19. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.18, в котором модифицированное цистеином антитело содержит K149C LC или A118C HC в качестве сайта конъюгации лекарственного средства.
20. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10, где p равно 1, 2, 3 или 4.
21. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10, включающее смесь соединений конъюгата антитело-лекарственное средство, причем среднее количество молекул лекарственного средства на антитело, р, в смеси соединений конъюгата антитело-лекарственное средство составляет от около 2 до около 5.
22. Фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество соединения конъюгата антитело-лекарственное средство по п.10 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
23. Способ лечения злокачественной опухоли позитивной по HER2, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по п.22.
24. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство Формулы II
Figure 00000114
где X
Figure 00000102
Y представляет собой C(=O)-NH или CH2-NH;
A представляет собой пиррол, необязательно замещенный группой =C(R)2, в которой R независимо выбран из H и C1-C6-алкила;
R1 и R2 независимо выбраны из H или C1-C6-алкила или R1 и R2 образуют циклопропил;
p равно целому числу от 1 до 8; и
Ab представляет собой анти-HER2 антитело, содержащее:
(a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22;
(b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23;
(c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24;
(d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19;
(e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и
(f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
25. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, в котором антитело против HER2 содержит вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность SEQ ID NO: 17, и вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность SEQ ID NO: 18.
26. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.25 Формулы IIa
Figure 00000115
27. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.25 Формулы IIc
Figure 00000116
где каждый R4 и R5 представляет собой H или R4 и R5 представляют собой =O.
28. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.27, где каждый R4 и R5 представляет собой H.
29. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.27, где R4 и R5 представляют собой =О.
30. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.27 Формулы IId
Figure 00000117
31. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.27 Формулы IIe
Figure 00000118
32. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.27 Формулы IIf
Figure 00000119
33. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, в котором анти-HER2 антитело представляет собой модифицированное цистеином антитело.
34. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.33, в котором модифицированное цистеином антитело, содержит K149C LC или A118C HC в качестве сайта конъюгации лекарственного средства.
35. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, где p равно 1, 2, 3 или 4.
36. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, включающее смесь соединений конъюгата антитело-лекарственное средство, причем среднее количество молекул лекарственного средства на антитело, р, в смеси соединений конъюгата антитело-лекарственное средство составляет от около 2 до около 5.
37. Фармацевтическая композиция для лечения гиперпролиферативного заболевания, содержащая терапевтически эффективное количество соединения конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, равное от 0,1 до 10 мг/кг от веса пациента, и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
38. Способ лечения злокачественной опухоли, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения конъюгата антитело-лекарственное средство по п.24, где злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль позитивную по HER2.
39. Способ по п.38, где злокачественная опухоль позитивная по HER2 представляет собой рак молочной железы или рак желудка.
40. Способ по п.38, дополнительно включающий введение пациенту дополнительного терапевтического агента, выбранного из антитела или иммуноконъюгата, который связывается с HER2.
41. Способ по п.40, где дополнительным терапевтическим агентом является
(i) антитело или иммуноконъюгат, который связывается с доменом II HER2, и/или
(ii) антитело или иммуноконъюгат, который связывается с доменом IV HER2.
42. Способ по п.40, где дополнительным терапевтическим агентом является
(i) антитело или иммуноконъюгат, который связывается с эпитопом 2C4, и/или
(ii) антитело или иммуноконъюгат, который связывается с эпитопом 4D5.
43. Способ по п.40, где дополнительный терапевтический агент выбран из трастузумаба, трастузумаба-MCC-DM1 (T-DM1) или пертузумаба.
44. Способ по п.40, дополнительно включающий введение пациенту
(1) трастузумаба или Т-DM1 и
(2) пертузумаба.
45. Конъюгат антитело-лекарственное средство Формулы IIf
Figure 00000120
где Ab представляет собой модифицированное цистеином анти-HER2 антитело и p равно около 2 и
где Ab представляет собой анти-HER2 антитело, содержащее:
(a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22;
(b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23;
(c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24;
(d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19;
(e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и
(f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
46. Соединение конъюгата антитело-лекарственное средство по п.45, в котором анти-HER2 антитело содержит вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность SEQ ID NO: 17, и вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность SEQ ID NO: 18.
47. Фармацевтическая композиция для лечения гиперпролиферативного заболевания, содержащая терапевтически эффективное количество соединения конъюгата антитело-лекарственное средство по п.45, равное от 0,1 до 10 мг/кг от веса пациента, и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
48. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.45, где анти-HER2 антитело содержит:
(i) тяжелую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 26 и легкую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 30; или
(ii) тяжелую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 31 и легкую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 25.
49. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.45, где p равно примерно 2.
50. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.45, где модифицированное цистеином антитело содержит замену K149C в легкой цепи согласно нумерации Кабат или замену A118C в тяжелой цепи согласно нумерации EU в качестве места конъюгации лекарственного средства.
51. Конъюгат антитело-лекарственное средство Формулы IIe
Figure 00000121
где Ab представляет собой модифицированное цистеином анти-HER2 антитело и р равно примерно 2 и
где Ab представляет собой анти-HER2 антитело, содержащее:
(а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22;
(b) HRV-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23;
(c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24;
(d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19;
(e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и
(f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
52. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.51, где анти-HER2 антитело содержит вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность SEQ ID NO: 17, и вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18.
53. Фармацевтическая композиция для лечения гиперпролиферативного заболевания, содержащая терапевтически эффективное количество конъюгата антитело-лекарственное средство по п.51, равное от 0,1 до 10 мг/кг от веса пациента, и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
54. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.51, где анти-HER2 антитело содержит:
(i) тяжелую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 26 и легкую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 30; или
(ii) тяжелую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 31 и легкую цепь с последовательностью SEQ ID NO: 25.
55. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.51, где p равно примерно 2.
56. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п.51, где модифицированное цистеином антитело содержит замену K149C в легкой цепи согласно нумерации Кабат или замену A118C в тяжелой цепи согласно нумерации EU в качестве места конъюгации лекарственного средства.
RU2018115802A 2015-10-02 2016-09-30 Пирролобензодиазепиновые конъюгаты антитело-лекарственное средство и способы их применения RU2736725C1 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562236429P 2015-10-02 2015-10-02
US62/236,429 2015-10-02
PCT/US2016/054858 WO2017059289A1 (en) 2015-10-02 2016-09-30 Pyrrolobenzodiazepine antibody drug conjugates and methods of use

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2736725C1 true RU2736725C1 (ru) 2020-11-19

Family

ID=57145040

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018115802A RU2736725C1 (ru) 2015-10-02 2016-09-30 Пирролобензодиазепиновые конъюгаты антитело-лекарственное средство и способы их применения

Country Status (25)

Country Link
US (3) US10058613B2 (ru)
EP (1) EP3355935B1 (ru)
JP (3) JP6663984B2 (ru)
KR (1) KR102111338B1 (ru)
CN (1) CN108391422B (ru)
AR (1) AR106235A1 (ru)
AU (1) AU2016331931C1 (ru)
BR (1) BR112018006016A2 (ru)
CA (1) CA2996902C (ru)
CL (1) CL2018000813A1 (ru)
CO (1) CO2018004152A2 (ru)
CR (1) CR20180243A (ru)
HK (1) HK1259127A1 (ru)
IL (1) IL258046A (ru)
MA (1) MA43345A (ru)
MX (1) MX2018003628A (ru)
NZ (1) NZ741261A (ru)
PE (1) PE20181067A1 (ru)
PH (1) PH12018500693A1 (ru)
RU (1) RU2736725C1 (ru)
SG (1) SG10201912680RA (ru)
TW (1) TW201718027A (ru)
UA (1) UA123104C2 (ru)
WO (1) WO2017059289A1 (ru)
ZA (1) ZA201801957B (ru)

Families Citing this family (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2011265054B2 (en) * 2010-06-08 2016-09-15 Genentech, Inc. Cysteine engineered antibodies and conjugates
EP3191135B1 (en) 2014-09-12 2020-08-19 Genentech, Inc. Anti-her2 antibodies and immunoconjugates
MA43345A (fr) 2015-10-02 2018-08-08 Hoffmann La Roche Conjugués anticorps-médicaments de pyrrolobenzodiazépine et méthodes d'utilisation
MA43354A (fr) * 2015-10-16 2018-08-22 Genentech Inc Conjugués médicamenteux à pont disulfure encombré
CN109689111B (zh) 2016-08-11 2024-04-05 基因泰克公司 吡咯并苯并二氮杂䓬前药及其抗体缀合物
TW202405006A (zh) 2017-09-29 2024-02-01 日商第一三共股份有限公司 抗體－吡咯并苯二氮呯衍生物複合體
CA3084804A1 (en) * 2017-12-06 2019-06-13 Yale University Prodrugs activated by reduction in the cytosol
GB201803342D0 (en) 2018-03-01 2018-04-18 Medimmune Ltd Methods
GB201806022D0 (en) 2018-04-12 2018-05-30 Medimmune Ltd Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
EP3853251A1 (en) 2018-09-19 2021-07-28 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical composition for the treatment of cancers resistant to immune checkpoint therapy
CN113227119A (zh) 2018-12-10 2021-08-06 基因泰克公司 用于与含Fc的蛋白质进行位点特异性缀合的光交联肽
EP3914241A4 (en) * 2019-01-25 2023-01-18 Yale University ANTICANCER DRUGS AND METHODS OF PRODUCTION AND USE THEREOF
CN113677360A (zh) * 2019-02-04 2021-11-19 艾克森埃缇克生物科学公司 使用糖聚唾液酸化治疗性蛋白的方法
WO2020196475A1 (ja) * 2019-03-25 2020-10-01 第一三共株式会社 抗ｈｅｒ２抗体－ピロロベンゾジアゼピン誘導体コンジュゲート
CA3139180A1 (en) * 2019-03-27 2020-10-01 Daiichi Sankyo Company, Limited Combination of antibody-pyrrolobenzodiazepine derivative conjugate and parp inhibitor
US20220363776A1 (en) 2019-10-04 2022-11-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical composition for the treatment of ovarian cancer, breast cancer or pancreatic cancer
WO2021113740A1 (en) * 2019-12-04 2021-06-10 The Research Foundation For The State University Of New York Compositions and methods for reducing off-target toxicity of antibody drug conjugates
TW202216771A (zh) 2020-06-26 2022-05-01 德商拜耳廠股份有限公司 用於治療應用之ccr8抗體
US20230323299A1 (en) 2020-08-03 2023-10-12 Inserm (Institut National De La Santé Et De La Recherch Médicale) Population of treg cells functionally committed to exert a regulatory activity and their use for adoptive therapy
CN112125924B (zh) * 2020-09-15 2021-09-24 吉林大学 一种螺旋寡聚物、仿生离子通道、制备方法、应用
US20240108766A1 (en) 2021-01-22 2024-04-04 Bayer Aktiengesellschaft Lrrc15 antibodies and conjugates thereof
WO2023215293A1 (en) 2022-05-02 2023-11-09 Athanor Biosciences, Inc. Cancer eradicating – bio-nanoparticles (ce-bnp)

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2314309C2 (ru) * 2003-03-31 2008-01-10 Каунсил Оф Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Пирроло [2.1-c][1.4] бензодиазепины, способ их получения и фармацевтическая композиция на их основе
WO2012112708A1 (en) * 2011-02-15 2012-08-23 Immunogen, Inc. Cytotoxic benzodiazepine derivatives and methods of preparation
WO2013053873A1 (en) * 2011-10-14 2013-04-18 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines
WO2014011518A1 (en) * 2012-07-09 2014-01-16 Genentech, Inc. Immunoconjugates comprising anti-cd22 antibodies
WO2014096368A1 (en) * 2012-12-21 2014-06-26 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
RU2545080C2 (ru) * 2009-02-05 2015-03-27 Иммьюноджен, Инк. Новые производные бензодиазепина

Family Cites Families (383)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US798959A (en) 1904-12-19 1905-09-05 George W Goss Corn-husker.
IL47062A (en) 1975-04-10 1979-07-25 Yeda Res & Dev Process for diminishing antigenicity of tissues to be usedas transplants by treatment with glutaraldehyde
US4665077A (en) 1979-03-19 1987-05-12 The Upjohn Company Method for treating rejection of organ or skin grafts with 6-aryl pyrimidine compounds
US4427588A (en) 1982-11-08 1984-01-24 Bristol-Myers Company Process for conversion of oxotomaymycin to tomaymycin
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4676980A (en) 1985-09-23 1987-06-30 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Target specific cross-linked heteroantibodies
US5583024A (en) 1985-12-02 1996-12-10 The Regents Of The University Of California Recombinant expression of Coleoptera luciferase
US6548640B1 (en) 1986-03-27 2003-04-15 Btg International Limited Altered antibodies
IL85035A0 (en) 1987-01-08 1988-06-30 Int Genetic Eng Polynucleotide molecule,a chimeric antibody with specificity for human b cell surface antigen,a process for the preparation and methods utilizing the same
DE3883899T3 (de) 1987-03-18 1999-04-22 Sb2 Inc Geänderte antikörper.
IL85746A (en) 1988-03-15 1994-05-30 Yeda Res & Dev Preparations comprising t-lymphocyte cells treated with 8-methoxypsoralen or cell membranes separated therefrom for preventing or treating autoimmune diseases
FI891226A (fi) 1988-04-28 1989-10-29 Univ Leland Stanford Junior Reseptordeterminanter i anti-t-celler foer behandling av autoimmunsjukdom.
EP0368684B2 (en) 1988-11-11 2004-09-29 Medical Research Council Cloning immunoglobulin variable domain sequences.
WO1990008187A1 (en) 1989-01-19 1990-07-26 Dana Farber Cancer Institute Soluble two domain cd2 protein
RO110397B1 (ro) 1989-03-21 1996-01-30 Immune Response Corp San Diego Vaccin pentru prevenirea sau tratarea unor boli care rezulta din raspunsuri patogene, prin populatii de celule t specifice, procedeu de obtinere si metode de diagnostic si tratament cu acesta
DE3920358A1 (de) 1989-06-22 1991-01-17 Behringwerke Ag Bispezifische und oligospezifische, mono- und oligovalente antikoerperkonstrukte, ihre herstellung und verwendung
DE69031919T3 (de) 1989-07-19 2005-01-27 Connetics Corp., Palo Alto T-zell-rezeptor-peptide als heilmittel für autoimmune und bösartige krankheiten
WO1991002536A1 (en) 1989-08-23 1991-03-07 Scripps Clinic And Research Foundation Compositions and methods for detection and treatment of epstein-barr virus infection and immune disorders
US5959177A (en) 1989-10-27 1999-09-28 The Scripps Research Institute Transgenic plants expressing assembled secretory antibodies
US6150584A (en) 1990-01-12 2000-11-21 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
US6075181A (en) 1990-01-12 2000-06-13 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
JPH053790A (ja) 1990-04-19 1993-01-14 Fujisawa Pharmaceut Co Ltd デヒドロペプチダーゼ−ｉ
US5256643A (en) 1990-05-29 1993-10-26 The Government Of The United States Human cripto protein
US5770429A (en) 1990-08-29 1998-06-23 Genpharm International, Inc. Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies
AU9016591A (en) 1990-10-25 1992-05-26 Tanox Biosystems, Inc. Glycoproteins associated with membrane-bound immunoglobulins as antibody targets on B cells
ES2113940T3 (es) 1990-12-03 1998-05-16 Genentech Inc Metodo de enriquecimiento para variantes de proteinas con propiedades de union alteradas.
US5571894A (en) 1991-02-05 1996-11-05 Ciba-Geigy Corporation Recombinant antibodies specific for a growth factor receptor
JP4156662B2 (ja) 1991-03-29 2008-09-24 ジェネンテック・インコーポレーテッド ヒトｐｆ４ａ受容体とその使用
US5543503A (en) 1991-03-29 1996-08-06 Genentech Inc. Antibodies to human IL-8 type A receptor
US5440021A (en) 1991-03-29 1995-08-08 Chuntharapai; Anan Antibodies to human IL-8 type B receptor
LU91067I2 (fr) 1991-06-14 2004-04-02 Genentech Inc Trastuzumab et ses variantes et dérivés immuno chimiques y compris les immotoxines
GB9114948D0 (en) 1991-07-11 1991-08-28 Pfizer Ltd Process for preparing sertraline intermediates
JP3050424B2 (ja) 1991-07-12 2000-06-12 塩野義製薬株式会社 ヒトエンドセリンリセプター
US5264557A (en) 1991-08-23 1993-11-23 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Polypeptide of a human cripto-related gene, CR-3
US7018809B1 (en) 1991-09-19 2006-03-28 Genentech, Inc. Expression of functional antibody fragments
US5587458A (en) 1991-10-07 1996-12-24 Aronex Pharmaceuticals, Inc. Anti-erbB-2 antibodies, combinations thereof, and therapeutic and diagnostic uses thereof
WO1993008829A1 (en) 1991-11-04 1993-05-13 The Regents Of The University Of California Compositions that mediate killing of hiv-infected cells
US6011146A (en) 1991-11-15 2000-01-04 Institut Pasteur Altered major histocompatibility complex (MHC) determinant and methods of using the determinant
US6153408A (en) 1991-11-15 2000-11-28 Institut Pasteur And Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale Altered major histocompatibility complex (MHC) determinant and methods of using the determinant
DE69334255D1 (de) 1992-02-06 2009-02-12 Novartis Vaccines & Diagnostic Marker für Krebs und biosynthetisches Bindeprotein dafür
IL107366A (en) 1992-10-23 2003-03-12 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Genes coding for megakaryocyte potentiator
US5644033A (en) 1992-12-22 1997-07-01 Health Research, Inc. Monoclonal antibodies that define a unique antigen of human B cell antigen receptor complex and methods of using same for diagnosis and treatment
US5801005A (en) 1993-03-17 1998-09-01 University Of Washington Immune reactivity to HER-2/neu protein for diagnosis of malignancies in which the HER-2/neu oncogene is associated
US5869445A (en) 1993-03-17 1999-02-09 University Of Washington Methods for eliciting or enhancing reactivity to HER-2/neu protein
EP0714409A1 (en) 1993-06-16 1996-06-05 Celltech Therapeutics Limited Antibodies
US5773223A (en) 1993-09-02 1998-06-30 Chiron Corporation Endothelin B1, (ETB1) receptor polypeptide and its encoding nucleic acid methods, and uses thereof
US5750370A (en) 1995-06-06 1998-05-12 Human Genome Sciences, Inc. Nucleic acid encoding human endothlein-bombesin receptor and method of producing the receptor
US5789199A (en) 1994-11-03 1998-08-04 Genentech, Inc. Process for bacterial production of polypeptides
US5840523A (en) 1995-03-01 1998-11-24 Genetech, Inc. Methods and compositions for secretion of heterologous polypeptides
US5731168A (en) 1995-03-01 1998-03-24 Genentech, Inc. Method for making heteromultimeric polypeptides
JPH08336393A (ja) 1995-04-13 1996-12-24 Mitsubishi Chem Corp 光学活性なγ−置換−β−ヒドロキシ酪酸エステルの製造法
US5869046A (en) 1995-04-14 1999-02-09 Genentech, Inc. Altered polypeptides with increased half-life
US5707829A (en) 1995-08-11 1998-01-13 Genetics Institute, Inc. DNA sequences and secreted proteins encoded thereby
US20020193567A1 (en) 1995-08-11 2002-12-19 Genetics Institute, Inc. Secreted proteins and polynucleotides encoding them
GB9603256D0 (en) 1996-02-16 1996-04-17 Wellcome Found Antibodies
JP3646191B2 (ja) 1996-03-19 2005-05-11 大塚製薬株式会社 ヒト遺伝子
CA2254843A1 (en) 1996-05-17 1997-11-27 Schering Corporation Human b-cell antigens, related reagents
US7371376B1 (en) 1996-10-18 2008-05-13 Genentech, Inc. Anti-ErbB2 antibodies
KR100628846B1 (ko) * 1996-10-18 2006-09-29 제넨테크, 인크. 항-ＥｒｂＢ２ 항체
US5945511A (en) 1997-02-20 1999-08-31 Zymogenetics, Inc. Class II cytokine receptor
US20030185830A1 (en) 1997-02-25 2003-10-02 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of prostate cancer
US7033827B2 (en) 1997-02-25 2006-04-25 Corixa Corporation Prostate-specific polynucleotide compositions
US6541212B2 (en) 1997-03-10 2003-04-01 The Regents Of The University Of California Methods for detecting prostate stem cell antigen protein
DE69824287T2 (de) 1997-03-10 2005-06-16 The Regents Of The University Of California, Oakland Prostata stammzell-antigen (psca)
US6261791B1 (en) 1997-03-10 2001-07-17 The Regents Of The University Of California Method for diagnosing cancer using specific PSCA antibodies
US6555339B1 (en) 1997-04-14 2003-04-29 Arena Pharmaceuticals, Inc. Non-endogenous, constitutively activated human protein-coupled receptors
US6319688B1 (en) 1997-04-28 2001-11-20 Smithkline Beecham Corporation Polynucleotide encoding human sodium dependent phosphate transporter (IPT-1)
EP0979281B1 (en) 1997-05-02 2005-07-20 Genentech, Inc. A method for making multispecific antibodies having heteromultimeric and common components
US6890749B2 (en) 1997-05-15 2005-05-10 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting diseases of the prostate
WO1998051824A1 (en) 1997-05-15 1998-11-19 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting disease of the urinary tract
PT994903E (pt) 1997-06-24 2005-10-31 Genentech Inc Metodos e composicoes para glicoproteinas galactosiladas
US6040498A (en) 1998-08-11 2000-03-21 North Caroline State University Genetically engineered duckweed
US6602677B1 (en) 1997-09-19 2003-08-05 Promega Corporation Thermostable luciferases and methods of production
US20030060612A1 (en) 1997-10-28 2003-03-27 Genentech, Inc. Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
AU759779B2 (en) 1997-10-31 2003-05-01 Genentech Inc. Methods and compositions comprising glycoprotein glycoforms
US20020034749A1 (en) 1997-11-18 2002-03-21 Billing-Medel Patricia A. Reagents and methods useful for detecting diseases of the breast
US6610833B1 (en) 1997-11-24 2003-08-26 The Institute For Human Genetics And Biochemistry Monoclonal human natural antibodies
US6110695A (en) 1997-12-02 2000-08-29 The Regents Of The University Of California Modulating the interaction of the chemokine, B Lymphocyte Hemoattractant, and its Receptor, BLR1
BR9813365A (pt) 1997-12-05 2004-06-15 Scripps Research Inst Método para produção e humanização de um anticorpo monoclonal de rato
WO2004031238A2 (en) 2002-10-03 2004-04-15 Mcgill Univeristy Antibodies and cyclic peptides which bind cea (carcinoembryonic antigen) and their use as cancer therapeutics
JP4603157B2 (ja) 1998-03-13 2010-12-22 ザ バーナム インスティチュート 種々の選択された器官または組織にホーミングする分子
CA2324494A1 (en) 1998-03-27 1999-09-30 Genentech, Inc. Apo-2 ligand-anti-her-2 antibody synergism
JP2002510481A (ja) 1998-04-02 2002-04-09 ジェネンテック・インコーポレーテッド 抗体変異体及びその断片
US6194551B1 (en) 1998-04-02 2001-02-27 Genentech, Inc. Polypeptide variants
ATE458007T1 (de) 1998-04-20 2010-03-15 Glycart Biotechnology Ag Glykosylierungs-engineering von antikörpern zur verbesserung der antikörperabhängigen zellvermittelten zytotoxizität
AU4078599A (en) 1998-05-13 1999-11-29 Epimmune, Inc. Expression vectors for stimulating an immune response and methods of using the same
US20030064397A1 (en) 1998-05-22 2003-04-03 Incyte Genomics, Inc. Transmembrane protein differentially expressed in prostate and lung tumors
US20020187472A1 (en) 2001-03-09 2002-12-12 Preeti Lal Steap-related protein
PT1193270E (pt) 1998-08-27 2003-10-31 Spirogen Ltd Pirrolobenzodiazepinas
WO2000012130A1 (en) 1998-08-27 2000-03-09 Smithkline Beecham Corporation Rp105 agonists and antagonists
GB9818731D0 (en) 1998-08-27 1998-10-21 Univ Portsmouth Compounds
JP4689781B2 (ja) 1998-09-03 2011-05-25 独立行政法人科学技術振興機構 アミノ酸輸送蛋白及びその遺伝子
AU5963699A (en) 1998-10-02 2000-04-26 Mcmaster University Spliced form of (erb)b-2/neu oncogene
US6962980B2 (en) 1999-09-24 2005-11-08 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US6468546B1 (en) 1998-12-17 2002-10-22 Corixa Corporation Compositions and methods for therapy and diagnosis of ovarian cancer
US6858710B2 (en) 1998-12-17 2005-02-22 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US20030091580A1 (en) 2001-06-18 2003-05-15 Mitcham Jennifer L. Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US20020119158A1 (en) 1998-12-17 2002-08-29 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
EP1141017B1 (en) 1998-12-30 2008-09-10 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Characterization of the soc/crac calcium channel protein family
PL209786B1 (pl) 1999-01-15 2011-10-31 Genentech Inc Przeciwciało zawierające wariant regionu Fc ludzkiej IgG1, przeciwciało wiążące czynnik wzrostu śródbłonka naczyń oraz immunoadhezyna
US6737056B1 (en) 1999-01-15 2004-05-18 Genentech, Inc. Polypeptide variants with altered effector function
NZ513062A (en) 1999-01-29 2003-10-31 Smithkline Beecham HER-2/neu fusion proteins
GB9905124D0 (en) 1999-03-05 1999-04-28 Smithkline Beecham Biolog Novel compounds
US7232889B2 (en) 1999-03-08 2007-06-19 Genentech, Inc. PRO300 antibodies
AU3395900A (en) 1999-03-12 2000-10-04 Human Genome Sciences, Inc. Human lung cancer associated gene sequences and polypeptides
EP2264166B1 (en) 1999-04-09 2016-03-23 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. Method for controlling the activity of immunologically functional molecule
US7304126B2 (en) 1999-05-11 2007-12-04 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
AU4952600A (en) 1999-06-03 2000-12-28 Takeda Chemical Industries Ltd. Screening method with the use of cd100
EP1191944A2 (en) 1999-06-25 2002-04-03 Genentech, Inc. METHODS OF TREATMENT USING ANTI-ErbB ANTIBODY-MAYTANSINOID CONJUGATES
US6949245B1 (en) 1999-06-25 2005-09-27 Genentech, Inc. Humanized anti-ErbB2 antibodies and treatment with anti-ErbB2 antibodies
US7041292B1 (en) 1999-06-25 2006-05-09 Genentech, Inc. Treating prostate cancer with anti-ErbB2 antibodies
US7589172B2 (en) 1999-07-20 2009-09-15 Genentech, Inc. PRO256 polypeptides
US7297770B2 (en) 1999-08-10 2007-11-20 Genentech, Inc. PRO6496 polypeptides
US7294696B2 (en) 1999-08-17 2007-11-13 Genentech Inc. PRO7168 polypeptides
JP3951035B2 (ja) 1999-09-01 2007-08-01 ジェネンテック・インコーポレーテッド 分泌及び膜貫通ポリペプチドとそれをコードしている核酸
US20030206918A1 (en) 1999-09-10 2003-11-06 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US20030232056A1 (en) 1999-09-10 2003-12-18 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US20030129192A1 (en) 1999-09-10 2003-07-10 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of ovarian cancer
US7125978B1 (en) 1999-10-04 2006-10-24 Medicago Inc. Promoter for regulating expression of foreign genes
WO2001025454A2 (en) 1999-10-04 2001-04-12 Medicago Inc. Method for regulating transcription of foreign genes in the presence of nitrogen
US7504256B1 (en) 1999-10-19 2009-03-17 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Process for producing polypeptide
DE60039448D1 (de) 1999-10-29 2008-08-21 Genentech Inc Gegen das prostata-stammzellantigen (psca) gerichtete antikörper und deren verwendung
EP1235847B1 (en) 1999-11-29 2016-01-20 The Trustees of Columbia University in the City of New York ISOLATION OF FIVE NOVEL GENES CODING FOR NEW Fc RECEPTORS-TYPE MELANOMA INVOLVED IN THE PATHOGENESIS OF LYMPHOMA/MELANOMA
WO2001040269A2 (en) 1999-11-30 2001-06-07 Corixa Corporation Compositions and methods for therapy and diagnosis of breast cancer
WO2001041787A1 (en) 1999-12-10 2001-06-14 Epimmune Inc. INDUCING CELLULAR IMMUNE RESPONSES TO HER2/neu USING PEPTIDE AND NUCLEIC ACID COMPOSITIONS
US20030180714A1 (en) 1999-12-15 2003-09-25 Genentech, Inc. Shotgun scanning
AU2458001A (en) 1999-12-23 2001-07-03 Zymogenetics Inc. Method for treating inflammation
UA84830C2 (ru) 1999-12-23 2008-12-10 Займодженетікс, Інк. Растворимый рецептор интерлейкина-20
US6610286B2 (en) 1999-12-23 2003-08-26 Zymogenetics, Inc. Method for treating inflammation using soluble receptors to interleukin-20
NZ502058A (en) 1999-12-23 2003-11-28 Ovita Ltd Isolated mutated nucleic acid molecule for regulation of ovulation rate
US7294695B2 (en) 2000-01-20 2007-11-13 Genentech, Inc. PRO10268 polypeptides
US20030224379A1 (en) 2000-01-21 2003-12-04 Tang Y. Tom Novel nucleic acids and polypeptides
US20020039573A1 (en) 2000-01-21 2002-04-04 Cheever Martin A. Compounds and methods for prevention and treatment of HER-2/neu associated malignancies
AU2001243142A1 (en) 2000-02-03 2001-08-14 Hyseq, Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
WO2001062794A2 (en) 2000-02-22 2001-08-30 Millennium Pharmaceuticals, Inc. 18607, a human calcium channel
US20030219806A1 (en) 2000-02-22 2003-11-27 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel 18607, 15603, 69318, 12303, 48000, 52920, 5433, 38554, 57301, 58324, 55063, 52991, 59914, 59921 and 33751 molecules and uses therefor
US20040002068A1 (en) 2000-03-01 2004-01-01 Corixa Corporation Compositions and methods for the detection, diagnosis and therapy of hematological malignancies
US20040005561A1 (en) 2000-03-01 2004-01-08 Corixa Corporation Compositions and methods for the detection, diagnosis and therapy of hematological malignancies
CA2402293A1 (en) 2000-03-07 2001-09-13 Hyseq, Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
CA2403637A1 (en) 2000-03-24 2001-10-04 Fahri Saatcioglu Novel prostate-specific or testis-specific nucleic acid molecules, polypeptides, and diagnostic and therapeutic methods
WO2001072830A2 (de) 2000-03-31 2001-10-04 Ipf Pharmaceuticals Gmbh Diagnostik- und arzneimittel zur untersuchung des zelloberflächenproteoms von tumor- und entzündungszellen sowie zur behandlung von tumorerkrankungen und entzündlichen erkrankungen vorzugsweise mit hilfe einer spezifischen chemokinrezeptor-analyse und der chemokinrezeptor-ligand-interaktion
AU2001253140A1 (en) 2000-04-03 2001-10-15 The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Tumor markers in ovarian cancer
IL152136A0 (en) 2000-04-07 2003-05-29 Arena Pharm Inc Non-endogenous, constitutively activated known g protein-coupled receptors
HUP0300369A2 (hu) 2000-04-11 2003-06-28 Genentech, Inc. Többértékű antitestek és alkalmazásuk
US20030119115A1 (en) 2000-05-17 2003-06-26 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
WO2001088133A2 (en) 2000-05-18 2001-11-22 Lexicon Genetics Incorporated Human semaphorin homologs and polynucleotides encoding the same
NZ522444A (en) 2000-05-19 2004-09-24 Genentech Inc Gene detection assay for improving the likelihood of an effective response to an ErbB antagonist cancer therapy
AU2001274888A1 (en) 2000-05-19 2001-12-03 Human Genome Sciences, Inc. Nucleic acids, proteins, and antibodies
WO2001094641A2 (en) 2000-06-09 2001-12-13 Idec Pharmaceuticals Corporation Gene targets and ligands that bind thereto for treatment and diagnosis of ovarian carcinomas
WO2001098351A2 (en) 2000-06-16 2001-12-27 Incyte Genomics, Inc. G-protein coupled receptors
CA2406649A1 (en) 2000-06-30 2002-01-10 Human Genome Sciences, Inc. B7-like polynucleotides, polypeptides, and antibodies
EP1383892A2 (en) 2000-06-30 2004-01-28 Incyte Genomics, Inc. Human extracellular matrix and cell adhesion polypeptides
CA2413262A1 (en) 2000-06-30 2002-01-10 Amgen, Inc. B7-like molecules and uses thereof
WO2002006339A2 (en) 2000-07-03 2002-01-24 Curagen Corporation Proteins and nucleic acids encoding same
US20040044179A1 (en) 2000-07-25 2004-03-04 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
AU2001283507A1 (en) 2000-07-27 2002-02-13 Mayo Foundation For Medical Education And Research B7-h3 and b7-h4, novel immunoregulatory molecules
US7205108B2 (en) 2000-07-28 2007-04-17 Ulrich Wissenbach Trp8, Trp9 and Trp10, novel markers for cancer
US7229623B1 (en) 2000-08-03 2007-06-12 Corixa Corporation Her-2/neu fusion proteins
AU2001283360A1 (en) 2000-08-14 2002-02-25 Corixa Corporation Methods for diagnosis and therapy of hematological and virus-associated malignancies
KR20030048009A (ko) 2000-08-14 2003-06-18 코릭사 코포레이션 Ｈｅｒ-2/ｎｅｕ 관련 악성 종양의 치료 및 진단용 조성물및 방법
US6984494B2 (en) 2000-08-15 2006-01-10 Genentech, Inc. Analytical method
KR20030029847A (ko) 2000-08-24 2003-04-16 제넨테크, 인크. 종양의 진단 및 치료를 위한 조성물 및 방법
GB0020953D0 (en) 2000-08-24 2000-10-11 Smithkline Beecham Biolog Vaccine
CA2421949A1 (en) 2000-09-11 2002-03-21 Hyseq, Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
US6613567B1 (en) 2000-09-15 2003-09-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibition of Her-2 expression
US7491797B2 (en) 2000-09-15 2009-02-17 Genentech, Inc. PRO6308 polypeptide
US7855269B2 (en) 2000-09-15 2010-12-21 Zymogenetics, Inc. Method for treating inflammation
AU2001292724B2 (en) 2000-09-18 2005-05-26 Biogen Idec Ma Inc. CRIPTO mutant and uses thereof
UA83458C2 (ru) 2000-09-18 2008-07-25 Байоджен Айдек Ма Інк. Выделенный полипептид baff-r (рецептор фактора активации в-клеток семейства tnf)
DK2314686T4 (da) 2000-10-06 2023-08-21 Kyowa Kirin Co Ltd Celler, der danner antistofsammensætninger
US6946292B2 (en) 2000-10-06 2005-09-20 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Cells producing antibody compositions with increased antibody dependent cytotoxic activity
US7064191B2 (en) 2000-10-06 2006-06-20 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Process for purifying antibody
AU2002215345A1 (en) 2000-10-13 2002-04-22 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of prostate cancer, compositions and methods of screening for modulators of prostate cancer
US6596541B2 (en) 2000-10-31 2003-07-22 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Methods of modifying eukaryotic cells
AU2002230659A1 (en) 2000-11-07 2002-05-21 Zymogenetics Inc. Human tumor necrosis factor receptor
US20020150573A1 (en) 2000-11-10 2002-10-17 The Rockefeller University Anti-Igalpha-Igbeta antibody for lymphoma therapy
KR100857943B1 (ko) 2000-11-30 2008-09-09 메다렉스, 인코포레이티드 인간 항체의 제조를 위한 형질전환 트랜스염색체 설치류
WO2002061087A2 (en) 2000-12-19 2002-08-08 Lifespan Biosciences, Inc. Antigenic peptides, such as for g protein-coupled receptors (gpcrs), antibodies thereto, and systems for identifying such antigenic peptides
AU2002243495A1 (en) 2001-01-12 2002-07-24 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey Bone morphogenetic protein-2 in the treatment and diagnosis of cancer
US20030119119A1 (en) 2001-01-16 2003-06-26 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
US20030119133A1 (en) 2001-01-16 2003-06-26 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
US7754208B2 (en) 2001-01-17 2010-07-13 Trubion Pharmaceuticals, Inc. Binding domain-immunoglobulin fusion proteins
AU2002245317A1 (en) 2001-01-24 2002-08-06 Protein Design Labs Methods of diagnosis of breast cancer, compositions and methods of screening for modulators of breast cancer
AU2002251841A1 (en) 2001-01-30 2002-08-12 Corixa Corporation Compositions and methods for the therapy and diagnosis of pancreatic cancer
WO2002064798A1 (en) 2001-02-12 2002-08-22 Bionomics Limited Dna sequences differentially expressed in tumour cell lines
US20030087250A1 (en) 2001-03-14 2003-05-08 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid molecules and proteins for the identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer
AU2002311787A1 (en) 2001-03-28 2002-10-15 Zycos Inc. Translational profiling
WO2003008537A2 (en) 2001-04-06 2003-01-30 Mannkind Corporation Epitope sequences
US6820011B2 (en) 2001-04-11 2004-11-16 The Regents Of The University Of Colorado Three-dimensional structure of complement receptor type 2 and uses thereof
WO2002083866A2 (en) 2001-04-17 2002-10-24 The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas Repeat sequences of the ca125 gene and their use for diagnostic and therapeutic interventions
EP1463928A2 (en) 2001-04-18 2004-10-06 Protein Design Labs Methods of diagnosis of lung cancer, compositions and methods of screening for modulators of lung cancer
WO2003083041A2 (en) 2002-03-22 2003-10-09 Biogen, Inc. Cripto-specific antibodies
RS20110024A (en) 2001-04-26 2011-08-31 Biogen Idec Ma Inc. ANTIBODIES THAT BLOCK CRIPTO AND USE IT
EP1515982A4 (en) 2001-05-09 2005-10-26 Corixa Corp METHODS AND COMPOSITIONS FOR THE THERAPY AND DIAGNOSIS OF PROSTATE CANCER
US20030078399A1 (en) 2001-05-11 2003-04-24 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Nucleic acid sequence encoding ovarian antigen, CA125, and uses thereof
CN1612750B (zh) 2001-05-24 2012-10-31 津莫吉尼蒂克斯公司 Taci-免疫球蛋白融合蛋白质
US7157558B2 (en) 2001-06-01 2007-01-02 Genentech, Inc. Polypeptide encoded by a polynucleotide overexpresses in tumors
WO2003000842A2 (en) 2001-06-04 2003-01-03 Curagen Corporation Novel proteins and nucleic acids encoding same
AU2002314901A1 (en) 2001-06-04 2002-12-16 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis and treatment of androgen-dependent prostate cancer, prostate cancer undergoing androgen-withdrawal, and androgen-independent prostate cancer
ATE483976T1 (de) 2001-06-05 2010-10-15 Exelixis Inc Gfats als modifikatoren des p53-wegs und verwendungsverfahren
AU2002310256A1 (en) 2001-06-05 2002-12-16 Exelixis Inc. Ppp2cs as modifiers of the p53 pathway and methods of use
US7235358B2 (en) 2001-06-08 2007-06-26 Expression Diagnostics, Inc. Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection
WO2002101075A2 (en) 2001-06-13 2002-12-19 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of cervical cancer
US7189507B2 (en) 2001-06-18 2007-03-13 Pdl Biopharma, Inc. Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer
WO2002102235A2 (en) 2001-06-18 2002-12-27 Eos Biotechnology Inc. Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer
US7705120B2 (en) 2001-06-21 2010-04-27 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of breast cancer
WO2003002717A2 (en) 2001-06-28 2003-01-09 Schering Corporation Biological activity of ak155
AU2002314433A1 (en) 2001-07-02 2003-01-21 Licentia Ltd. Ephrin-tie receptor materials and methods
US20040076955A1 (en) 2001-07-03 2004-04-22 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of bladder cancer, compositions and methods of screening for modulators of bladder cancer
WO2003003984A2 (en) 2001-07-05 2003-01-16 Curagen Corporation Novel proteins and nucleic acids encoding same
WO2003055439A2 (en) 2001-07-18 2003-07-10 The Regents Of The University Of California Her2/neu target antigen and use of same to stimulate an immune response
WO2003009814A2 (en) 2001-07-25 2003-02-06 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of prostate cancer
CA2453995A1 (en) 2001-08-03 2003-02-20 Genentech, Inc. Tacis and br3 polypeptides and uses thereof
WO2003011878A2 (en) 2001-08-03 2003-02-13 Glycart Biotechnology Ag Antibody glycosylation variants having increased antibody-dependent cellular cytotoxicity
WO2003016475A2 (en) 2001-08-14 2003-02-27 The General Hospital Corporation Nucleic acid and amino acid sequences involved in pain
US20030092013A1 (en) 2001-08-16 2003-05-15 Vitivity, Inc. Diagnosis and treatment of vascular disease
WO2003018621A2 (en) 2001-08-23 2003-03-06 Oxford Biomedica (Uk) Limited Genes
US6902930B2 (en) 2001-08-29 2005-06-07 Vanderbilt University Human Mob-5 (IL-24) receptors and uses thereof
US20030124579A1 (en) 2001-09-05 2003-07-03 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer
WO2003022995A2 (en) 2001-09-06 2003-03-20 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled steap-1 useful in treatment and detection of cancer
EP1434881A4 (en) 2001-09-17 2005-10-26 Protein Design Labs Inc METHOD FOR DIAGNOSIS OF CANCER COMPOSITIONS AND METHOD FOR SCREENING ON CANCER MODULATORS
KR101008758B1 (ko) 2001-09-18 2011-01-14 제넨테크, 인크. 종양의 진단 및 치료를 위한 방법 및 이를 위한 조성물
US20050004017A1 (en) 2001-09-18 2005-01-06 Yuval Reiss Methods and compositions for treating hcap associated diseases
CA2460621A1 (en) 2001-09-19 2003-03-27 Nuvelo, Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
WO2003026493A2 (en) 2001-09-28 2003-04-03 Bing Yang Diagnosis and treatment of diseases caused by mutations in cd72
AU2002362454A1 (en) 2001-10-03 2003-04-14 Origene Technologies, Inc. Regulated breast cancer genes
US20050130117A1 (en) 2001-10-03 2005-06-16 Davis Cong L. Modulators of lymphocyte activation and migration
US20040241703A1 (en) 2002-08-19 2004-12-02 Genentech, Inc. Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
US20050123925A1 (en) 2002-11-15 2005-06-09 Genentech, Inc. Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
EP1578385A4 (en) 2001-10-19 2011-11-09 Genentech Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF INFLAMMATORY INTESTINAL DISEASES
US7825089B2 (en) 2001-10-24 2010-11-02 National Jewish Health Three-dimensional structures of TALL-1 and its cognate receptors and modified proteins and methods related thereto
WO2003035835A2 (en) 2001-10-25 2003-05-01 Genentech, Inc. Glycoprotein compositions
DE60217152T2 (de) 2001-10-31 2007-10-31 Alcon Inc. Knochen-morphogene proteine (bmp), bmp-rezeptoren und bmp-bindungsproteine und ihre verwendung bei der diagnose und behandlung des glaukoms
WO2003042661A2 (en) 2001-11-13 2003-05-22 Protein Design Labs, Inc. Methods of diagnosis of cancer, compositions and methods of screening for modulators of cancer
US20030232350A1 (en) 2001-11-13 2003-12-18 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of cancer, compositions and methods of screening for modulators of cancer
US7344843B2 (en) 2001-11-29 2008-03-18 Serono Genetics Institute S.A. Agonists and antagonists of prolixin for the treatment of metabolic disorders
AU2002349784A1 (en) 2001-12-03 2003-06-17 Asahi Kasei Pharma Corporation Nf-kappab activating genes
AU2002366951A1 (en) 2001-12-10 2003-07-09 Nuvelo,Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
US20040093621A1 (en) 2001-12-25 2004-05-13 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd Antibody composition which specifically binds to CD20
US20030134790A1 (en) 2002-01-11 2003-07-17 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey Bone Morphogenetic Protein-2 And Bone Morphogenetic Protein-4 In The Treatment And Diagnosis Of Cancer
US7452675B2 (en) 2002-01-25 2008-11-18 The Queen's Medical Center Methods of screening for TRPM4b modulators
AU2003224624B2 (en) 2002-02-21 2008-08-28 Duke University Reagents and treatment methods for autoimmune diseases
EP1575480A4 (en) 2002-02-22 2008-08-06 Genentech Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING DISEASES RELATED TO THE IMMUNE SYSTEM
WO2003083047A2 (en) 2002-03-01 2003-10-09 Exelixis, Inc. MP53s AS MODIFIERS OF THE p53 PATHWAY AND METHODS OF USE
WO2003104399A2 (en) 2002-06-07 2003-12-18 Avalon Pharmaceuticals, Inc Cancer-linked gene as target for chemotherapy
US6660856B2 (en) 2002-03-08 2003-12-09 Kaohsiung Medical University Synthesis of pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine analogues
EP2258712A3 (en) 2002-03-15 2011-05-04 Multicell Immunotherapeutics, Inc. Compositions and Methods to Initiate or Enhance Antibody and Major-histocompatibility Class I or Class II-restricted T Cell Responses by Using Immunomodulatory, Non-coding RNA Motifs
WO2004000997A2 (en) 2002-03-19 2003-12-31 Curagen Corporation Therapeutic polypeptides, nucleic acids encoding same, and methods of use
US7202033B2 (en) 2002-03-21 2007-04-10 Sunesis Pharmaceuticals, Inc. Identification of kinase inhibitors
US7193069B2 (en) 2002-03-22 2007-03-20 Research Association For Biotechnology Full-length cDNA
AU2003245239A1 (en) 2002-03-25 2003-11-03 Uab Research Foundation FC receptor homolog, reagents, and uses thereof
AU2003222103A1 (en) 2002-03-28 2003-10-13 Idec Pharmaceuticals Corporation Novel gene targets and ligands that bind thereto for treatment and diagnosis of colon carcinomas
US20030194704A1 (en) 2002-04-03 2003-10-16 Penn Sharron Gaynor Human genome-derived single exon nucleic acid probes useful for gene expression analysis two
BR0308953A (pt) 2002-04-05 2006-03-14 Agensys Inc composições, proteìna, polinucleotìdeo, método de geração de uma resposta imune, método de detecção, composição farmacêutica, anticorpo ou seu fragmento, animal transgênico, hibridoma, método de fornecimento de um agente citotóxico ou agente de diagnóstico e método de inibição do crescimento de células cancerosas
EP1502603A4 (en) 2002-04-09 2006-12-13 Kyowa Hakko Kogyo Kk AN ANTIBODY COMPOSITION CONTAINING MEDICAMENT FOR PATIENTS WITH Fc gamma RIIIa POLYMORPHISM
CA2481656A1 (en) 2002-04-09 2003-10-16 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Cells in which activity of the protein involved in transportation of gdp-fucose is reduced or lost
US7691568B2 (en) 2002-04-09 2010-04-06 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd Antibody composition-containing medicament
US20040110704A1 (en) 2002-04-09 2004-06-10 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Cells of which genome is modified
AU2003236018A1 (en) 2002-04-09 2003-10-20 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. METHOD OF ENHANCING ACTIVITY OF ANTIBODY COMPOSITION OF BINDING TO FcGamma RECEPTOR IIIa
US20040132140A1 (en) 2002-04-09 2004-07-08 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Production process for antibody composition
WO2003087768A2 (en) 2002-04-12 2003-10-23 Mitokor Targets for therapeutic intervention identified in the mitochondrial proteome
JP2005536190A (ja) 2002-04-16 2005-12-02 ジェネンテック・インコーポレーテッド 腫瘍の診断と治療のための組成物と方法
WO2003089904A2 (en) 2002-04-17 2003-10-30 Baylor College Of Medicine Aib1 as a prognostic marker and predictor of resistance to encocrine therapy
WO2003093444A2 (en) 2002-05-03 2003-11-13 Incyte Corporation Transporters and ion channels
AU2003229294A1 (en) 2002-05-15 2003-12-02 Avalon Pharmaceuticals Cancer-linked gene as target for chemotherapy
AU2003232453A1 (en) 2002-05-30 2003-12-19 David K. Bol Human solute carrier family 7 member 11 (hslc7a11)
WO2003102157A2 (en) 2002-06-03 2003-12-11 Genentech, Inc. Synthetic antibody phage libraries
CA2488284A1 (en) 2002-06-04 2003-12-11 Avalon Pharmaceuticals, Inc. Cancer-linked gene as target for chemotherapy
WO2003101283A2 (en) 2002-06-04 2003-12-11 Incyte Corporation Diagnostics markers for lung cancer
BRPI0311822B8 (pt) 2002-06-06 2021-05-25 Oncotherapy Science Inc composição farmacêutica para o tratamento de câncer
AU2003242633A1 (en) 2002-06-06 2003-12-22 Molecular Engines Laboratories Dudulin genes, non-human animal model: uses in human hematological disease
WO2003105758A2 (en) 2002-06-12 2003-12-24 Avalon Pharmaceuticals, Inc. Cancer-linked gene as target for chemotherapy
US20040249130A1 (en) 2002-06-18 2004-12-09 Martin Stanton Aptamer-toxin molecules and methods for using same
EP1552002A4 (en) 2002-06-18 2006-02-08 Archemix Corp APTAMER TOXIN MOLECULES AND METHOD FOR THEIR USE
AU2003245615A1 (en) 2002-06-20 2004-01-06 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for modulating lymphocyte activity
EP1534331B1 (en) 2002-06-21 2014-10-29 Johns Hopkins University School of Medicine Membrane associated tumor endothelium markers
AU2003281515A1 (en) 2002-07-19 2004-02-09 Cellzome Ag Protein complexes of cellular networks underlying the development of cancer and other diseases
WO2004011611A2 (en) 2002-07-25 2004-02-05 Genentech, Inc. Taci antibodies and uses thereof
AR040956A1 (es) 2002-07-31 2005-04-27 Schering Ag Nuevos conjugados de efectores, procedimientos para su preparacion y su uso farmaceutico
JP2004121218A (ja) 2002-08-06 2004-04-22 Jenokkusu Soyaku Kenkyusho:Kk 気管支喘息または慢性閉塞性肺疾患の検査方法
WO2004015426A1 (en) 2002-08-06 2004-02-19 Bayer Healthcare Ag Diagnostics and therapeutics for diseases associated with human cxc chemokine receptor 5(cxcr5)
ES2361739T3 (es) 2002-08-16 2011-06-21 Immunogen, Inc. Reticulantes con elevada reactividad y solubilidad y su uso en la preparación de conjugados para el suministro dirigido de fármacos de molécula pequeña.
EP1572957A4 (en) 2002-08-27 2007-10-10 Bristol Myers Squibb Pharma Co IDENTIFICATION OF POLYNUCLEOTIDES FOR PREDICTING THE ACTIVITY OF COMPOUNDS INTERACTING WITH AND / OR MODULATING TYROSINE KINASE PROTEINS AND / OR TYROSINE KINASE PROTEIN PATHWAYS IN MAMMARY CELLS
WO2004020595A2 (en) 2002-08-29 2004-03-11 Five Prime Therapeutics, Inc. Novel human polypeptides encoded by polynucleotides
AU2002951346A0 (en) 2002-09-05 2002-09-26 Garvan Institute Of Medical Research Diagnosis of ovarian cancer
MXPA05002455A (es) 2002-09-06 2005-06-03 Mannkind Corp Secuencias de epitopes.
AU2003300776A1 (en) 2002-09-09 2004-05-25 Omeros Corporation G protein coupled receptors and uses thereof
JP2004113151A (ja) 2002-09-27 2004-04-15 Sankyo Co Ltd 癌遺伝子及びその用途
US20060183120A1 (en) 2002-10-04 2006-08-17 Teh Bin T Molecular sub-classification of kidney tumors and the discovery of new diagnostic markers
US7361740B2 (en) 2002-10-15 2008-04-22 Pdl Biopharma, Inc. Alteration of FcRn binding affinities or serum half-lives of antibodies by mutagenesis
CA2503748A1 (en) 2002-11-08 2004-05-27 Genentech, Inc. Compositions and methods for the treatment of natural killer cell related diseases
CA2503621A1 (en) 2002-11-13 2004-05-27 Genentech, Inc. Methods and compositions for diagnosing dysplasia
EP1569685B8 (en) 2002-11-15 2012-12-05 MUSC Foundation For Research Development Complement receptor 2 targeted complement modulators
EP1578372A4 (en) 2002-11-15 2007-10-17 Univ Arkansas CA125 GENE AND ITS USE IN DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC INTERVENTIONS
US20080213166A1 (en) 2002-11-20 2008-09-04 Biogen Idec Inc. Novel Gene Targets and Ligands that Bind Thereto for Treatment and Diagnosis of Colon Carcinomas
CA2507044A1 (en) 2002-11-21 2004-06-10 Mary Lucero Purinergic modulation of smell
US20040253606A1 (en) 2002-11-26 2004-12-16 Protein Design Labs, Inc. Methods of detecting soft tissue sarcoma, compositions and methods of screening for soft tissue sarcoma modulators
WO2004053079A2 (en) 2002-12-06 2004-06-24 Diadexus, Inc. Compositions, splice variants and methods relating to ovarian specific genes and proteins
JP2004198419A (ja) 2002-12-13 2004-07-15 Bayer Healthcare Llc Ｔｉｍｐ１を用いた検出方法
CN103833854B (zh) 2002-12-16 2017-12-12 健泰科生物技术公司 免疫球蛋白变体及其用途
ES2388280T3 (es) 2002-12-20 2012-10-11 Abbott Biotherapeutics Corp. Anticuerpos que reaccionan frente a GPR64 y utilización de los mismos
AU2003299819A1 (en) 2002-12-23 2004-07-22 Human Genome Sciences, Inc. Neutrokine-alpha conjugate, neutrokine-alpha complex, and uses thereof
WO2004063709A2 (en) 2003-01-08 2004-07-29 Bristol-Myers Squibb Company Biomarkers and methods for determining sensitivity to epidermal growth factor receptor modulators
US20050227301A1 (en) 2003-01-10 2005-10-13 Polgen Cell cycle progression proteins
US20050181375A1 (en) 2003-01-10 2005-08-18 Natasha Aziz Novel methods of diagnosis of metastatic cancer, compositions and methods of screening for modulators of metastatic cancer
EP1583820A4 (en) 2003-01-14 2007-07-18 Bristol Myers Squibb Co ASSOCIATED POLYNUCLEOTIDES AND POLYPEPTIDES ASSOCIATED WITH THE NF-KB WAY
JP2007520996A (ja) 2003-01-15 2007-08-02 ミレニアム・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド ４４３９０、５４１８１、２１１、５６８７、８８４、１４０５、６３６、４４２１、５４１０、３０９０５、２０４５、１６４０５、１８５６０、２０４７、３３７５１、５２８７２、１４０６３、２０７３９、３２５４４、４３２３９、４４３７３、５１１６４、５３０１０、１６８５２、１５８７、２２０７、２２２４５、２３８７、５２９０８、６９１１２、１４９９０、１８５４７、１１５、５７９、１５９８５、１５６２５、７６０、１８６０３、２３９５、２５５４、８６７５、３２７２０、４８０９、１４３０３、１６８１６、１７８２７、３２６２０、５７７、６１９、１４２３、２１５８、８２６３、１５４０２、１６２０９、１６３８６、２１１６５、３０９１１、４１８９７、１６４３、２５４３、９６２６、１３２３１、３２４０９、８４２６０、２８８２、８２０３、３２６７８または５５０５３を用いて泌尿器科障害を処置するための方法および組成物
WO2004065416A2 (en) 2003-01-16 2004-08-05 Genentech, Inc. Synthetic antibody phage libraries
CA2516128A1 (en) 2003-02-14 2004-09-02 Sagres Discovery, Inc. Therapeutic targets in cancer
US20030224411A1 (en) 2003-03-13 2003-12-04 Stanton Lawrence W. Genes that are up- or down-regulated during differentiation of human embryonic stem cells
CA2520898C (en) 2003-03-31 2009-10-20 Council Of Scientific And Industrial Research Non-cross-linking pyrrolo(2,1-c)(1,4)benzodiazepines as potential antitumour agents and process thereof
GB0321295D0 (en) 2003-09-11 2003-10-15 Spirogen Ltd Synthesis of protected pyrrolobenzodiazepines
CA2542046A1 (en) 2003-10-08 2005-04-21 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Fused protein composition
CA2542125A1 (en) 2003-10-09 2005-04-21 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Process for producing antibody composition by using rna inhibiting the function of .alpha.1,6-fucosyltransferase
SI2380911T1 (en) 2003-11-05 2018-07-31 Roche Glycart Ag ANTIGEN-RELATED PATIENTS WITH INCREASED ATTENTION ON THE RECEPTOR FC AND EFFECTORAL FUNCTION
SG195524A1 (en) 2003-11-06 2013-12-30 Seattle Genetics Inc Monomethylvaline compounds capable of conjugation to ligands
WO2005053742A1 (ja) 2003-12-04 2005-06-16 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. 抗体組成物を含有する医薬
PL1720881T3 (pl) 2004-03-01 2013-05-31 Medimmune Ltd Pochodne 11-hydroksy-5h-pirolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-onu jako kluczowe związki pośrednie do otrzymywania C2 podstawionych pirolobenzodiazepin
ES2527292T3 (es) 2004-03-31 2015-01-22 Genentech, Inc. Anticuerpos anti-TGF-beta humanizados
US7785903B2 (en) 2004-04-09 2010-08-31 Genentech, Inc. Variable domain library and uses
CA2885854C (en) 2004-04-13 2017-02-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Anti-p-selectin antibodies
FR2869231B1 (fr) 2004-04-27 2008-03-14 Sod Conseils Rech Applic Composition therapeutique contenant au moins un derive de la pyrrolobenzodiazepine et la fludarabine
KR20120064120A (ko) 2004-06-01 2012-06-18 제넨테크, 인크. 항체 약물 접합체 및 방법
TWI309240B (en) 2004-09-17 2009-05-01 Hoffmann La Roche Anti-ox40l antibodies
US20100111856A1 (en) 2004-09-23 2010-05-06 Herman Gill Zirconium-radiolabeled, cysteine engineered antibody conjugates
SI1791565T1 (sl) 2004-09-23 2016-08-31 Genentech, Inc. Cisteinsko konstruirana protitelesa in konjugati
JO3000B1 (ar) 2004-10-20 2016-09-05 Genentech Inc مركبات أجسام مضادة .
EP3698807A1 (en) 2005-01-21 2020-08-26 Genentech, Inc. Fixed dosing of her antibodies
EP2399605A1 (en) 2005-02-23 2011-12-28 Genentech, Inc. Extending time to disease progression or survival in cancer patients
WO2007056441A2 (en) 2005-11-07 2007-05-18 Genentech, Inc. Binding polypeptides with diversified and consensus vh/vl hypervariable sequences
WO2007064919A2 (en) 2005-12-02 2007-06-07 Genentech, Inc. Binding polypeptides with restricted diversity sequences
PL1813614T3 (pl) 2006-01-25 2012-03-30 Sanofi Sa Środki cytotoksyczne zawierające nowe pochodne tomaymycyny
CA2651567A1 (en) 2006-05-09 2007-11-22 Genentech, Inc. Binding polypeptides with optimized scaffolds
RS54163B1 (en) 2006-05-30 2015-12-31 Genentech Inc. ANTI-CD22 ANTIBODIES, THEIR IMMUNCONJUGATES AND THEIR USE
EP1864682A1 (en) 2006-06-09 2007-12-12 Sanofi-Aventis Leptomycin derivatives
WO2008027236A2 (en) 2006-08-30 2008-03-06 Genentech, Inc. Multispecific antibodies
US20080226635A1 (en) 2006-12-22 2008-09-18 Hans Koll Antibodies against insulin-like growth factor I receptor and uses thereof
CN100592373C (zh) 2007-05-25 2010-02-24 群康科技(深圳)有限公司 液晶显示面板驱动装置及其驱动方法
MX350962B (es) 2008-01-07 2017-09-27 Amgen Inc Metodo para fabricar moleculas heterodimericas de fragmentos cristalizables de anticuerpo, utilizando efectos electrostaticos de direccion.
GB0819097D0 (en) 2008-10-17 2008-11-26 Spirogen Ltd Pyrrolobenzodiazepines
GB0819095D0 (en) 2008-10-17 2008-11-26 Spirogen Ltd Pyrrolobenzodiazepines
FR2949469A1 (fr) 2009-08-25 2011-03-04 Sanofi Aventis Derives anticancereux, leur preparation et leur application en therapeutique
JP2013519392A (ja) 2010-02-16 2013-05-30 メディミューン，エルエルシー Ｈｓａ関連組成物および使用方法
CN102167742B (zh) 2010-02-25 2014-05-14 上海百迈博制药有限公司 一种全人源抗her2单克隆抗体、其制备方法及用途
KR101671360B1 (ko) 2010-04-15 2016-11-01 시애틀 지네틱스, 인크. 표적화된 피롤로벤조디아제핀 접합체
NZ602933A (en) 2010-04-15 2014-09-26 Seattle Genetics Inc Pyrrolobenzodiazepines used to treat proliferative diseases
JP5972864B2 (ja) 2010-04-15 2016-08-17 メディミューン リミテッド ピロロベンゾジアゼピン及びそれらのコンジュゲート
TWI586806B (zh) 2010-04-23 2017-06-11 建南德克公司 異多聚體蛋白質之製造
AU2011265054B2 (en) 2010-06-08 2016-09-15 Genentech, Inc. Cysteine engineered antibodies and conjugates
FR2963007B1 (fr) 2010-07-26 2013-04-05 Sanofi Aventis Derives anticancereux, leur preparation et leur application therapeutique
CA2816426A1 (en) * 2010-11-17 2012-06-07 Genentech, Inc. Alaninyl maytansinol antibody conjugates
CA2825064C (en) 2011-02-04 2022-08-30 Genentech, Inc. Fc variants and methods for their production
WO2012130831A1 (en) 2011-03-29 2012-10-04 Roche Glycart Ag Antibody fc variants
WO2013017705A1 (es) 2011-08-03 2013-02-07 Salvador Moreno Rufino Baltasar Sistema de panel para construccion con retroiluminacion a base de diodos electroluminosos
BR112014006703A8 (pt) 2011-09-20 2018-01-09 Spirogen Sarl "pirrolobenzodiazepinas
ES2945932T3 (es) 2011-10-14 2023-07-10 Seagen Inc Pirrolobenzodiazepinas y conjugados dirigidos
EP2750713B1 (en) 2011-10-14 2015-09-16 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof
EA026643B1 (ru) 2011-10-14 2017-04-28 Сиэтл Дженетикс, Инк. Пирролбензодиазепины и конъюгаты направленного действия
EP2849753B1 (en) 2012-05-14 2022-08-10 Sanofi Method for producing recombinant 11-de-o-methyltomaymycin
AR091098A1 (es) 2012-05-21 2015-01-14 Genentech Inc ANTICUERPOS E INMUNOCONJUGADOS CONTRA Ly6E Y METODOS DE USO
WO2013177481A1 (en) 2012-05-25 2013-11-28 Immunogen, Inc. Benzodiazepines and conjugates thereof
JP6392763B2 (ja) 2012-10-12 2018-09-19 エイディーシー・セラピューティクス・エス・アーＡｄｃ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ Ｓａ ピロロベンゾジアゼピン−抗体結合体
WO2014057118A1 (en) 2012-10-12 2014-04-17 Adc Therapeutics Sarl Pyrrolobenzodiazepine-anti-cd22 antibody conjugates
EP2906252B1 (en) 2012-10-12 2017-06-14 ADC Therapeutics SA Pyrrolobenzodiazepine-anti-her2 antibody conjugates
US9745303B2 (en) 2012-10-12 2017-08-29 Medimmune Limited Synthesis and intermediates of pyrrolobenzodiazepine derivatives for conjugation
EP2906250B1 (en) 2012-10-12 2018-05-30 ADC Therapeutics SA Pyrrolobenzodiazepine-anti-psma antibody conjugates
BR112015008173A2 (pt) 2012-10-12 2017-11-28 Adc Therapeutics Sarl conjugados de pirrolobenzodiazepina-anticorpo anti-psma
TR201902494T4 (tr) 2012-10-12 2019-03-21 Medimmune Ltd Pirrolobenzodiazepinler ve onların konjugatları.
US9919056B2 (en) 2012-10-12 2018-03-20 Adc Therapeutics S.A. Pyrrolobenzodiazepine-anti-CD22 antibody conjugates
SI2906296T1 (en) 2012-10-12 2018-06-29 Adc Therapeutics Sa Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
EP2906297B1 (en) 2012-10-12 2017-12-06 ADC Therapeutics SA Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
AU2013366490B9 (en) 2012-12-21 2018-02-01 Medimmune Limited Unsymmetrical pyrrolobenzodiazepines-dimers for use in the treatment of proliferative and autoimmune diseases
ME03394B (me) 2013-02-22 2020-01-20 Medimmune Ltd Antidllз-antitelo-pbd konjugati i nihovа upotreba
AU2014307080B2 (en) * 2013-08-12 2018-06-07 Genentech, Inc. 1-(chloromethyl)-2,3-dihydro-1H-benzo(E)indole dimer antibody-drug conjugate compounds, and methods of use and treatment
JP6681838B2 (ja) 2013-12-16 2020-04-15 ジェネンテック， インコーポレイテッド ペプチド模倣薬化合物及びその抗体−薬剤複合体
MX371092B (es) * 2013-12-16 2020-01-16 Genentech Inc Compuestos peptidomimeticos y conjugados de anticuerpo-farmaco de los mismos.
EP3191135B1 (en) 2014-09-12 2020-08-19 Genentech, Inc. Anti-her2 antibodies and immunoconjugates
CA2957354A1 (en) 2014-09-12 2016-03-17 Genentech, Inc. Cysteine engineered antibodies and conjugates
CA2959689A1 (en) 2014-09-17 2016-03-24 Genentech, Inc. Pyrrolobenzodiazepines and antibody disulfide conjugates thereof
CN107124870A (zh) 2014-09-17 2017-09-01 基因泰克公司 包含抗her2抗体和吡咯并苯并二氮杂*的免疫缀合物
GB201513607D0 (en) * 2015-07-31 2015-09-16 Feingold Jay M Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
CN115300640A (zh) 2015-08-10 2022-11-08 杭州多禧生物科技有限公司 新型连接体及其用于药物和生物分子的特异性偶联
MA43345A (fr) 2015-10-02 2018-08-08 Hoffmann La Roche Conjugués anticorps-médicaments de pyrrolobenzodiazépine et méthodes d'utilisation

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2314309C2 (ru) * 2003-03-31 2008-01-10 Каунсил Оф Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Пирроло [2.1-c][1.4] бензодиазепины, способ их получения и фармацевтическая композиция на их основе
RU2545080C2 (ru) * 2009-02-05 2015-03-27 Иммьюноджен, Инк. Новые производные бензодиазепина
WO2012112708A1 (en) * 2011-02-15 2012-08-23 Immunogen, Inc. Cytotoxic benzodiazepine derivatives and methods of preparation
WO2013053873A1 (en) * 2011-10-14 2013-04-18 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines
WO2014011518A1 (en) * 2012-07-09 2014-01-16 Genentech, Inc. Immunoconjugates comprising anti-cd22 antibodies
WO2014096368A1 (en) * 2012-12-21 2014-06-26 Spirogen Sàrl Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Grimm, J., Liu, F., Stefanick, S., Sorgi, K. L., & Maryanoff, C. A. (2003). Reaction Safety: An Improved Procedure for the Preparation of 1,3,4,12a-Tetrahydro-11H-[1,4]-oxanio[3,4-c][1,4]benzodiazepine-6,12-dione with Iron in Acetic Acid. Organic Process Research & Development, 7(6), 1067-1070. doi:10.1021/op034073p. *
Kang, G.-D., Howard, P. W., & Thurston, D. E. (2003). Synthesis of a novel C2-aryl substituted 1,2-unsaturated pyrrolobenzodiazepine. Chemical Communications, (14), 1688.doi:10.1039/b303274d. *

Also Published As

Publication number Publication date
JP2021167356A (ja) 2021-10-21
KR20180054849A (ko) 2018-05-24
AU2016331931C1 (en) 2020-01-16
AR106235A1 (es) 2017-12-27
AU2016331931B2 (en) 2019-09-26
CR20180243A (es) 2018-07-31
CO2018004152A2 (es) 2018-07-19
CL2018000813A1 (es) 2019-02-22
US20180326062A1 (en) 2018-11-15
US10632196B2 (en) 2020-04-28
ZA201801957B (en) 2020-07-29
EP3355935A1 (en) 2018-08-08
JP2019218405A (ja) 2019-12-26
NZ741261A (en) 2019-11-29
CN108391422B (zh) 2021-10-22
CA2996902A1 (en) 2017-04-06
EP3355935B1 (en) 2020-10-21
US20180185486A1 (en) 2018-07-05
US10639373B2 (en) 2020-05-05
CN108391422A (zh) 2018-08-10
IL258046A (en) 2018-05-31
PE20181067A1 (es) 2018-07-04
JP6663984B2 (ja) 2020-03-13
US10058613B2 (en) 2018-08-28
BR112018006016A2 (pt) 2019-01-29
TW201718027A (zh) 2017-06-01
HK1259127A1 (zh) 2019-11-22
AU2016331931A1 (en) 2018-04-12
MX2018003628A (es) 2018-08-01
WO2017059289A1 (en) 2017-04-06
SG10201912680RA (en) 2020-03-30
KR102111338B1 (ko) 2020-05-15
CA2996902C (en) 2020-06-02
US20170095570A1 (en) 2017-04-06
MA43345A (fr) 2018-08-08
JP2018530545A (ja) 2018-10-18
PH12018500693A1 (en) 2018-10-01
UA123104C2 (uk) 2021-02-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2736725C1 (ru) Пирролобензодиазепиновые конъюгаты антитело-лекарственное средство и способы их применения
US20230330102A1 (en) Protac antibody conjugates and methods of use
US20240002379A1 (en) Asymmetric conjugate compounds
US20240109916A1 (en) Cytotoxic agents
US20230067037A1 (en) Conjugated chemical inducers of degradation and methods of use
US20210371413A1 (en) Polycyclic amides as cytotoxic agents
US20220098191A1 (en) G-a crosslinking cytotoxic agents
US20230302142A1 (en) Cytotoxic Agents