JPH11505729A - ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子のdna配列、及びある種の除草剤に耐性のある、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子を含む植物の生産 - Google Patents

ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子のdna配列、及びある種の除草剤に耐性のある、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子を含む植物の生産

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JPH11505729A JP8536268A JP53626896A JPH11505729A JP H11505729 A JPH11505729 A JP H11505729A JP 8536268 A JP8536268 A JP 8536268A JP 53626896 A JP53626896 A JP 53626896A JP H11505729 A JPH11505729 A JP H11505729A
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Abstract

(57)【要約】 ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子のDNA配列、及び除草剤に耐性のある、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子を含む植物の取得。ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの遺伝子のDNA配列;細菌又は植物からの単離;除草剤に耐性のある植物の取得のための使用。

Description

【発明の詳細な説明】 ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼの 遺伝子のDNA配列、及びある種の除草剤に耐性のあ る、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナー ゼの遺伝子をむ植物の生産 本発明は、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)の 遺伝子、この遺伝子をコード配列として含むキメラ遺伝子、及びある種の除草剤 に耐性がある植物の生産へのこれの使用に関する。 ある種の除草剤、例えば特にフランス特許出願第95 06800号、及び第 95 13570号に記載されているイソキサゾール、特にとうもろこしの選択 的除草剤であるイソキサフルトール、欧州特許出願第0 496 630号、第 0 496 631号に記載されているようなジケトニトリル、特に2−シアノ −3−シクロプロピル−1−(2−SO2CH3−4−CF3フェニル)プロパン −1,3−ジオン、及び2−シアノ−3−シクロプロピル−1−(2−SOCH3 −2,3−Cl2フェニル)プロパン−1,3−ジオン、欧州特許出願第0 6 25 505号及び第0 625 508号に記載されているトリケトン、 特にスルコトリオンが知られている。しかしながらこのような除草剤に耐性のあ る遺伝子は、まだ記載されたことがない。 ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシケナーゼは、パラ−ヒドロキシ−フ ェニル−ピルベートのホモゲンチゼートへの転換反応を触媒する酵素である。 また、Pseudomonas sp.P.J.874に由来するヒドロキシ −フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼのアミノ酸配列が記載されているが、除 草剤への植物の耐性におけるその役割についての記載はない(リュッチ(Rue tschi)ら:Eur.J.Biochem、205巻、459−466頁、 1992年)。この文献には、このタンパク質をコードする遺伝子の記載はない 。 今やこの型の遺伝子の配列が発見され、このような配列は、植物細胞中に一度 組込まれたら、植物中にHPPDの過剰発現(surexpression)又 はHPPDの活性を与える。従って最近のいくつかの除草剤、例えばイソキサゾ ール類又はトリケトン類の除草剤に対する耐性を植物に与えることができる。 本発明は、非ヒト起源、非海洋性細菌起源、あるいはさらに は植物起源の遺伝子の単離されたDNA配列、又はこの単離された配列とハイブ リダイズしうる配列において、これがヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキシ ゲナーゼ(HPPD)を発現することを特徴とする配列を目的とする。 より詳しくはこの配列は、細菌起源のもの、例えば特にPseudomona s属であってもよく、あるいはさらには植物起源のもの、例えば特に単子葉植物 又は双子葉植物、特にArabidopsis又はセリ科のもの、例えばニンジ ン(Daucus carotta)であってもよい。これは、天然または野生 のものであってもよく、あるいは場合によっては変異されたものであってもよい 。但し、基本的にはHPPD阻害剤、例えばイソキサゾール類又はトリケトン類 の除草剤に対して、除草剤耐性を保持していなければならない。 本発明はまた、前記遺伝子の単離方法において、 ・プライマーとして、HPPDのアミノ酸配列に由来するいくつかのオリゴヌ クレオチドを選ぶこと、 ・これらのプライマーから、PCRにより増幅断片を合成すること、 ・ゲノムバンクの作成及びスクリーニングによって遺伝子を 単離すること、及び .遺伝子をクローン化すること、 を特徴とする方法を含んでいる。 好ましくは、Pseudomonas属の細菌のHPPD配列に由来するプラ イマーを用いる。特に好ましくは、これらはPseudomonas fluo rescensに由来するものである。 本発明はさらに、植物の形質転換方法においてHPPDをコードする遺伝子を 、植物に対してある種の除草剤への耐性を与えることができるマーカー遺伝子、 又はコード配列として用いることをも目的とする。該遺伝子はまた、その他のマ ーカー遺伝子及び/又は農学的特性をコードする配列と組合わせて用いることも できる。 コード遺伝子は、基本的にはHPPD阻害剤、例えばイソキサゾール類又はト リケトン類の除草剤に対して除草剤耐性を保持していれば、天然又は野生起源の ものであってもよく、あるいは場合によっては変異されたあらゆる起源のもので あってもよい。コード配列としては特に、前記の本発明によるものを用いること ができる。 植物細胞の形質転換は、あらゆる既知の適切な手段によって行なうことができ る。一連の方法の1つは、DNA配列と連結している粒子で、細胞又はプロトプ ラストを衝撃することから成る。 一連の方法のもう1つは、プラスミドに挿入されたキメラ遺伝子の植物への伝 達手段として、Agrobacterium tumefaciensのTi又 はAgrobacterium rhizogenesのRiを用いることから 成る。 本発明はさらに、転写方向に、少なくとも1つのプロモーター調節配列、ヒド ロキシ−フェニルピルビン酸ジオキキシゲナーゼを発現する異種コード配列、及 びターミネーター調節又はポリアデニル化配列を含むキメラ遺伝子をも対象とす る。 プロモーター調節配列として、植物中に自然に発現される遺伝子のあらゆるプ ロモーター配列、特に細菌起源、ウイルス起源、又は植物起源のプロモーターを 用いることができる。例えばリブロース−ビスカルボキシラーゼ(RuBisC O)の小さいサブユニットの遺伝子のプロモーター、又はαチューブリンの遺伝 子のプロモーター(欧州特許出願第0 652 286号)、あるいはさらには 植物ウイルス遺伝子のプロモーター、 カリフラワーモザイクウイルスのプロモーター(CAMV19S又は35S)が あるが、適切な既知のあらゆるプロモーターを用いることができる。好ましくは 、コード配列の過剰発現を促進するプロモーター調節配列を利用する。例えば欧 州特許出願第0 507698号に記載されている、少なくとも1つのヒストン プロモーターを含んでいる配列を利用する。 本発明によれば、プロモーター調節配列と組合わせて、その他の調節配列を用 いることもできる。これらは、プロモーターとコード配列との間に位置するもの であり、例えば転写活性化物質「エンハンサー」、例えば特許出願WO87/0 7644号に記載されているたばこのエッチウイルス(TEV)の翻訳活性化物 質、又はシングル又はダブルのトランジットペプチドがある。この場合、場合に よっては、中間配列によって分離されているものである。すなわち、転写の方向 に、色素体局在酵素をコードする植物遺伝子のトランジットペプチドをコードす る配列、色素体局在酵素をコードする植物遺伝子の成熟N末端部分の配列の一部 、ついで色素体局在酵素をコードする植物遺伝子の成熟N末端部分の配列部分か ら成る、色素体局在酵素をコードする植物遺伝子の第二トランジットペプチドを コー ドする配列を含んでいるものであり、例えば欧州特許出願第0 508 909 号に記載されているものである。 ターミネーター調節配列又はポリアデニル化配列として、細菌起源のあらゆる 対応配列を用いることができる。例えばAgrobacterium tume faciensのnosターミネーターがあり、又は植物起源のあらゆる対応配 列、例えば欧州特許出願第0 633 317号に記載されているヒストンター ミネーターがある。 本発明はさらに、植物細胞、単子葉植物又は双子葉植物を対象とする。特に前 記方法の1つによって形質転換され、かつゲノム中にヒドロキシ−フェニルピル ビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)を発現する遺伝子を有効量含む栽培作物を 目的とする。このように形質転換された植物は、最近のいくつかの除草剤に対し て大きな耐性を示すことが観察された。最近の除草剤とは例えば、特にフランス 特許出願第95 06800号及び第95 13570号に記載されているイソ キサゾール、特に4−[4−CF3−2−(メチルスルフォイル)ベンゾイル] −5−シクロプロピルイソキサゾール、及び特にトウモロコシの選択的除草剤で あるイソキサフルトール、例えば欧州特許出 願第0 496 630号、第0 496 631号に記載されたジケトニトリ ル、特に2−シアノ−3−シクロプロピル−1−(2−SO2CH3−4−CF3 フェニル)プロパン−1,3−ジオン及び2−シアノ−3−シクロプロピル−1 −(2−SO2CH3−4−2,3−Cl2フェニル)プロパン−1,3−ジオン 、欧州特許出願第0 625 505号及び第0 625 508号に記載され たトリケトン、特にスルコトリオンである。 最後に本発明は、植物、特に栽培作物のこの型の除草剤による除草方法におい て、本発明によって形質転換された植物に対して、播種前(presemis) であれ、作物の発芽前(prelevee)であれ発芽後(postlevee )であれ、この除草剤を使用することを特徴とする方法をも目的とする。 本発明はさらに、植物種の「形質転換−再生」サイクル及び前記除草剤の選択 中における、マーカー遺伝子としてのHPPD遺伝子の使用をも目的とする。 本発明の様々な側面は、下記実施例によってよりよく理解できるであろう。実施例1:P.fluorescensA32のHPPD遺伝子の単離 Pseudomonas sp.P.J.874のHPPDのアミノ酸配列( リュッチ(Ruetschi U)ら、1992年、Eur.J.Bioche m、205巻、459−466頁)から、P.fluorescensA32( マッケラー(McKellar)R.C.1982年、J.Appl Bact eriol.第53巻:305−316頁)によって単離されたもの)のHPP Dのコード配列の一部をPCRによって増幅するための種々のオリゴヌクレオチ ドの配列が導き出される。このHPPDの遺伝子の増幅断片を用いて、P.fl uorescensA32の部分ゲノムバンクをスクリーニングし、この酵素を コードする遺伝子を単離した。 A)P.fluorescensA32のゲノムDNAの調製 細菌を、28℃で48時間、最小培地M63(KH2PO4 13.6g/l, (NH42SO4 2g/l,MgSO4 0.2g/l,FeSO4 0.005g /l pH7+唯一の炭素源としてのL−チロシン10mM)40ml中におい て 培養した。 洗浄後、細胞を溶解緩衝液1ml(トリスHCl 100mM pH8.3、 NaCl1.4M及びEDTA 10mM)中に再び取り、10分間65℃でイ ンキュベートする。フェノール/クロロフォルム(24/l)処理及びクロロフ ォルム処理後、イソプロパノール1容の添加によって核酸を沈殿させ、ついでこ の核酸を滅菌水300μl中に再び取り、最終10μg/mlのRNAseで処 理する。DNAを再びフェノール/クロロフォルム、クロロフォルムで処理し、 酢酸ナトリウム3M pH5 1/10容とエタノール2容との添加によって、 再沈殿させる。ついでDNAを滅菌水中に再び取り、秤量する。 B)オリゴヌクレオチドの選択及び合成 Pseudomonas sp.P.J.874のHPPDのアミノ酸配列か ら、5つのオリゴヌクレオチドを選び、2つはタンパク質のNH2末端において 、タンパク質のCOOH末端の方へ向け、3つは逆の方向に向ける(図1参照) 。選択は次の2つの規則に従ったものである: ・安定オリゴヌクレオチドの3’末端部、すなわち一義的な少なくとも2つの 塩基。 ・できるだけ少ない縮重。 選ばれたオリゴヌクレオチドは、次の配列を有する: これらは、商標MILLPOREの合成器「サイクロンプラスDNA合成器」 において合成された。 PCRによるこれら5つのオリゴヌクレオチドを用いた場合、配列番号1によ って理論的に得られるはずの増幅断片は、次のサイズである: プライマーP1及びP3を用いた場合→約690bp プライマーP1及びP4を用いた場合→約720bp プライマーP1及びP5を用いた場合→約1000bp プライマーP2及びP3を用いた場合→約390bp プライマーP2及びP4を用いた場合→約420bp プライマーP2及びP5を用いた場合→約700bp C)P.fluorescensA32のHPPDのコード化部分の増幅 増幅は、装置PCR PERKIN ELMER 9600において、Taq ポリメラーゼPERKIN ELMERとその緩衝液を用いて標準状態で、すな わち反応液50μlあたり200μMのdNTP、20μMのプライマー、Ta qポリメラーゼ2.5単位及びP.fluorescensA322.5μgを 用いて実施した。 用いた増幅計画は、95℃で5分、ついで35サイクル<45秒95℃、45 秒49℃、72℃>で1分ついで72℃で5分である。 これらの条件下、得られたすべての増幅断片は、前記理論サイズと相容れるサ イズであり、このことは増幅の特異性が良好であることを示す。 プライマーのセットP1/P4、P1/P5、及びP2/P4を用いて得られ た増幅断片は、EcoRVによるこのプラスミドの消化、及びddTTPの存在 下における末端トランスフェラーゼ処理の後、pBSIISK(−)中に結合す る。これは例えばホルトン(HOLTON)T.A及びグラハム(GRAHAM ) M.W.1991年、N.A.R.第19巻、5号、1156頁に記載され ている。 3つの型の各々のクローンは一部配列決定されている。このため、これらの3 つの場合に、P.fluorescensA32のHPPDのコード領域の一部 が十分に増幅されていることが確認できる。断片P1/P4は、P.fluor escensA32の部分ゲノムバンクをスクリーニングし、かつHPPDの完 全な遺伝子を単離するためのプローブとして保持する。 D)遺伝子の単離 サザン(Southern)によって、BamHI制限酵素によるP.flu orescensA32のDNAの消化後、7Kbp断片が、HPPD P1/ P4プーブとハイブリダイズすることが示されている。従ってBamHI制限酵 素によりP.fluorescensA32のDNA 400μgを消化し、ア ガロースゲルでDNA断片を精製した。これで約7Kbpが生じる。 これらの断片を、pBSII SK(−)中に結合する。pBSII SK( −)自体は、Bam HIによって消化し、アルカリホスファターゼ処理によっ て脱ホスフォリル化したものである。E.coli DH10bの形質転換後、 部分ゲノムバンクを、HPPD P1/P4プローブでスクリーニング する。 陽性クローンを単離し、これをpRP Aと名付けた。この単純化された図が 図2に示されている。この図には、HPPD遺伝子のコード化部分の位置が示さ れている。これは、358のアミノ酸をコードする1077のヌクレオチドから 成っている(配列番号1参照)。P.fluorescensA32のHPPD は、Pseudomonas sp.株P.J.874のものと、良好なアミノ 酸相同性を示す。実際、これらの2つのタンパク質間には92%の同一性がある (図3参照)。実施例2:2つのキメラ遺伝子の構成 植物にHPPDを阻害する除草剤に対する耐性を与えるために、2つのキメラ 遺伝子を作る。 第一のキメラ遺伝子は、ノパリンシンターゼ遺伝子のターミネーターと共に、 P.fluorescensA32のHPPD遺伝子のコード部分をヒストン二 重プロモーター(欧州特許出願第0507 698号)、ついでタバコエッチウ イルス(TEV)翻訳エンハンサー(pRTL−GUS(キャリントン(Car rington)及びフリード(Freed)、1990年、J.Virol. 64巻、1590−1597頁) の制御下に置くことから成る。従ってHPPDは、細胞質中に局在化される。 第二のキメラ遺伝子は、第一のものと同じであるが、但し、翻訳活性物質TE Vと、HPPDのコード部分との間に、最適化されたトランジットペプチド(O TP)を挿入する(欧州特許出願第0508 909号)。従ってHPPDは、 葉緑体中に局在化される。 A)ベクターpRPA−RD−153の構築: − pRPA−RD−11: ノパリンシンターゼのポリアデニル化部位(N OS polyA)(欧州特許出願第0 652 286号)を含むpBS−I I SK(−)(ストラタジェーヌ社(stratagene) カタログ♯2 12206)の誘導体を、KpnI部位とSalI部位との間でクローン化する 。KpnI部位を、150μMのデオキシヌクレオチドトリホスフェートの存在 下のT4 DNAポリメラーゼIでの処理、ついでNotIリンカー(ストラタ ジェーヌ社 カタログ♯1029)との連結によって、NotI部位に変換する 。このようにしてクローンカヤットNOSpolyAが得られる。 − pRPA−RD−127:pRPA−RD−11中でクローン化されたp RPA−BL−466(欧州特許出願第0 337 899号)の誘導体であっ て、oxy遺伝子の発現カセットを作り出し、かつリブロース−ビスカルボキシ ラーゼの小サブユニットのプロモーターを含むもの。 「プロモーター(SSU)−oxy遺伝子−NOS polyA」 このプラスミドを作るために、pRPA−BL−488を、XbaI及びHi ndIIIで消化し、1.9kbp断片を単離した。この1.9kbp断片は、 SSUプロモーター及びoxy遺伝子を含んでいる。この遺伝子は、適合性酵素 で消化されたプラスミドpRPA−RD−11中に連結したものである。 − pRPA−RD−132:これは、pRPA−RD−127中でクローン 化されたpRPA−BL−488(欧州特許出願第0 507 698号)の誘 導体であり、この時、ヒストン二重プロモターと共にoxy遺伝子の発現力セッ トを生じる。 「ヒストン二重プロモター−oxy遺伝子−NOS polyA」 このプラスミドを製造するために、pRPA−BL−466を、HindII Iによって消化し、Klenowによって処 理し、ついでNcoIで再び消化する。ヒストン二重プロモターH3A748を 含む精製1.35kbp断片を、プラスミドpRPA−RD−127と結合する 。このプラスミドは、XbaIによって消化され、Klenowによって処理さ れ、ついでNcoIで再び消化されたものである。 − pRPA−RD−153:これは、タバコエッチウイルス(TEV)の翻 訳活性物質を含んでいるpRPA−RD−132の誘導体である。pRTL−G US(キャリントン(Carrington)及びフリード(Freed)、1 990年、J.Virol 64巻、1590−1597頁)を、NcoI及び EcoRIで消化し、150bp断片を、同じ酵素で消化されたpRPA−RD −132中に結合した。従って、プロモーターを含む発現カセットが作られた。 「ヒストン二重プロモーター−TEV−oxy遺伝子−NOSpolyA」 B)ベクターpRPA−RD−185の構成: pUC19/GECA:数多くのクローン化部位を含むpUC19(ジブコ社 (Gibco)カタログ♯15364−011)の誘導体。pUC−19を、E coRIで消化し、オリゴヌ クレオチドリンカーIと結合する。 リンカーI: 選択されたクローンは、EcoRI部位ついでポリリンカーを含む。このポリ リンカーは下記部位を含む:EcoRI、ApaI、AvrII、PmeI、S fiI、SacI、KpnI、SmaI、BamHI、XbaI、SalI、P stI、SphI、及びHindIII。 −pRPA−RD−185:これは、修飾ポリリンカーを含むpUC19/G ECAの誘導体である。pUC19/GECAを、HindIIIによって消化 し、オリゴヌクレオチドリンカー2と結合する: リンカー2: 選択されたクローンは、ポリリンカーの中にHindIII部位を含む。この ポリリンカーは、次の部位を含んでいる:EcoRI、ApaI、AvrII、 PmeI、SfiI、SacI、KpnI、SmaI、BamHI、XbaI、 SalI、PstI、SphI、HindIII、PacI、 AscI、XhoI及びEcoNI。 C)ベクターpRPTの構築: − pRP O:HPPDの発現カセット、すなわちヒストン二重プロモータ ー−TEV−HPPD遺伝子−Nosターミネーターを含むpRPA−RD−1 53の誘導体である。pRP Oを製造するために、pRPA−RD−153を HindIIIによって消化し、Klenowによって処理し、ついでNcoI によって再び消化して、oxy遺伝子を除去し、これをHPPD遺伝子と代える 。このHPPD遺伝子は、BstEII消化、Klenow処理、及びNcoI 再消化によってプラスミドpRP Aから生じたものである。 − pRP R:これを得るためには、プラスミドpRP Oを、PvuII 及びSacIによって消化し、キメラ遺伝子が精製し、ついで同様にPvuII 及びSacIによって消化したpRPA−RD−185中に結合した。 − pRP T:これは、SacI及びHindIIIによる消化後pRP Rから生じたキメラ遺伝子を、同じ酵素によって消化したプラスミドpRPA− BL 150アルファ2に連結して得られたものである。(欧州特許出願第0 508 909号)。 従ってベクターpRP Tのキメラ遺伝子は、下記構造を有する: D)ベクターpRP Vの構築: − pRP P:これは、最適化されたトランジットペプチドついでHPPD 遺伝子を含むpRPA−RD−7(欧州特許出願第0 652 286号)の誘 導体である。これは、BstEII及びNcoI消化、Klenow処理によっ てpRPAから得られたHPPDのコード部分と、によって、SphI及びAc cIによって消化され、DNAseポリメラーゼT4で処理されたプラスミドp RPA−RD−7とを連結して得られたものである。 − pRP Q:これは、HPPDの発現カセット、すなわちヒストン二重プ ロモーター−TEV−OTP−HPPD遺伝子−ターミネーターNosを含むp RPA−RD−153の誘導体である。これを作るためには、プラスミドpRP A−RD−153をSal Iで消化し、Klenowで処理し、ついでNco Iによって再び消化して、oxy遺伝子を除去し、こ れを、BstEII消化、Klenow処理、Ncol再消化によってプラスミ ドpRP Pから生じたHPPD遺伝子と代えられる。 − pRP S:これを得るために、プラスミドpRP QをPvuII及び SacIによって消化して、キメラ遺伝子を切り出し、このキメラ遺伝子を、P vuII及びSacIによって消化したpRPA−RD−185に結合した。 − pRP V:これは、SacI及びHindIIIによる消化後にpRP Sから生じたキメラ遺伝子を、プラスミドpRPA−BL150 アルファ2 に連結して得られたものである(欧州特許出願第0 508 909号)。 従ってベクターpRP Qのキメラ遺伝子は、下記構造を有する: 実施例3:工業たばこPBD6の形質転換 これらの2つのキメラ遺伝子の効率を測定するため、欧州特許出願第0 50 8 909号に既に記載されている転換及び再生手順に従って、これらのキメラ 遺伝子を工業たばこPBD 6中に伝達した。 1)形質転換: コスミドpTVK291(コマリ(Komari)ら、1986年)を有する Agrobacterium EHA101の非腫瘍形成性菌株(フード(Ho od)ら、1987年)中に、このベクターを導入する。この形質転換技術は、 ホーシュ(Horsh.R)ら(1985年)Science第227巻、12 29−1231頁の手順に基づいている。 2)再生: 葉の外植片からのたばこPBD6(フランス国セータ社(SEITA)からの もの)の再生を、ムラシゲ(Murashige)及びスコーグ(Skoog) (MS)基本培地で実施する。この培地は、サッカロース30g/lとカナマイ シン200μg/mlとを含んでいる。葉の外植片は、温室又は試験管内の植物 から採取し、葉盤(disques foliaires)技術(Scienc e1985年、第227巻、1229−1231頁)に従って、連続する3工程 で形質転換する。第一工程は、ナフチル酢酸(ANA)0.05mg/lとベン ジルアミノプリン(BAP)2mg/lを含む、サッカロース30 g/lが添加されたMS培地での15日間の発芽の誘導である。この工程中に形 成された若芽を、ついで、サッカロース30g/lが添加されてはいるが、ホル モンは含まないMS培地での10日間の培養によって成長させる。ついで成長し た若芽を採取し、これを、塩、ビタミン及び糖含量が半分で、かつホルモンを含 まないMS発根培地で培養する。約15日後、発根した若芽を土に移す。実施例4:たばこの4−[4−CF3−2−(メチルスルフォニル)ベンゾイル ]−5−シクロプロピルイソキサゾールに対する耐性の測定:発芽後処理 形質転換されたたばこの実生を、試験管から出して、5週間、温室に適応させ (相対湿度60%;温度:夜間20℃、日中23℃)、ついで4−[4−CF3 −2−(メチルスルフォニル)ベンゾイル]−5−シクロプロピルイソキサゾー ルで処理する。 形質転換されずに、4−[4−CF3−2−(メチルスルフォニル)ベンゾイ ル]−5−シクロプロピルイソキサゾールで50〜400g/haの用量で処理 された対照たばこは、約72時間で退緑を示す。これは1週間で強まり、非常に 顕著な壊死の方へと進行する(末端葉の約80%を覆う)。 形質転換後、P.fluorescensのHPPDを過剰発現するこの同じ たばこは、4−[4−CF3−2−(メチルスルフォニル)ベンゾイル]−5− シクロプロピルイソキサゾール400g/haでの処理に対して、非常によく保 護されている。 過剰発現酵素が細胞質中にある場合、すなわち形質転換がベクターpRP T によってもたらされた遺伝子によってなされたものであるならば、植物は非常に 軽度の退緑を示し、これは中間葉の上だけに限定されている。 過剰発現酵素が葉緑体中にある場合、すなわち形質転換がベクターpRP V によってもたらされた遺伝子によってなされたものであるならば、植物は完全に 保護され、まったく症状がでない。実施例5:たばこの4−[4−CF3−2−(メチルスルフォニル)ベンゾイル ]−5−シクロプロピルイソキサゾールに対する耐性の測定:発芽前処理 a)試験管内テスト: 実施例1〜3に記載された、用量400g/haのイソキサフルトールでの葉 の処理に対して耐性のある、「形質転換−再 生」サイクルから生じた植物から収穫されたたばこの種子を用いる。 これらの種子を、フィタガール(phytagar)10g/l、及び0〜1 mg/lの様々な濃度のイソキサフルトールを含むボックスに蒔く。ついで明期 12時間/暗期12時間の光周期で、25℃で発芽を行なった。 この手順に従って、野生たばこの種子を発芽させ、2つの型のトランスジェニ ックたばこの種子を発芽させた。すなわちHPPDが細胞質に局在化されたCY たばこと、HPPDが葉緑体に局在化されたCOたばこである。 耐性測定は、播種の2〜3週間後に視覚的に実施した。 米国特許第4,780,127号の生成物No.51による生成物を用いて同 様な操作を行なって、野生たばこ及びCOた ばこについて、濃度0mg/l及び0.1mg/lで同じ結果が得られる。 b)温室試験 実施例4のように操作を行なう。但しこの処理は、発芽前、播種の24時間前 に実施する。野生種子の播種は、正常に行なわれる。これらの条件下、処理され ていない対照播種については、少なくとも10g/haの除草剤用量すべてにつ いて、発芽がないことが観察される。これとは逆に、CYたばこは100g/h aまで、上記a)で定義されているような症状はまったく示さない。同様に、C Oたばこも、200g/haまで、上記a)で定義されているような症状はまっ たく示さない。 これらの結果が示すことから、P.fluorescensのHPPD遺伝子 が、イソキサフルトールでの発芽前処理に対して、たばこに耐性を与えることが 明らかである。この耐性は、タンパク質が細胞質ではなく葉緑体に局在する場合 に、さらに良好である。実施例6 : Pseudomonas fluorescensのHPPD遺伝子が、植物 種の「形質転換−再生」サイクルの間に、マー カー遺伝子として用いうるかどうかを調べる目的で、たばこをHPPD遺伝子で 形質転換した。形質転換された植物は、イソキサフルトールの選択後に得られた 。材料及び方法及び結果 下記pRP Vキメラ遺伝子を、欧州特許出願第0 508 909号に既に 記載されている形質転換及び再生手順に従って、工業たばこPBD6に伝達する 。 ベクターpRP Vのキメラ遺伝子は、次の構造を有する。 1)形質転換: ベクターを、コスミドpTVK291(コマリ(Komari)ら、1986 年)を有するAgrobacterium EHA101の非腫瘍形成性菌株( フード(Hood)ら、1987年)中に導入する。この形質転換技術は、ホー シュ(Horsh.R)ら(1985年)の手順に基づいている。 2)再生: 葉の外植片からのたばこPBD6(フランス国セータ社(SEITA)からの もの)の再生を、ムラシゲ(Murashige) 及びスコーグ(Skoog)(MS)基本培地で実施する。この培地は、サッカ ロース30g/lと、セフォタキシム350mg/l及びイソキサフルトール1 mg/lを含んでいる。葉の外植片は、温室又は試験管内の植物から採取され、 葉盤(disque foliaire)技術(Science、1985年、 第227巻、1229−1231頁)に従って、連続する3工程で形質転換され る。第一工程は、ナフチル酢酸(ANA)0.05mg/1とベンジルアミノプ リン(BAP)2mg/lを含みサッカロース30g/l、及びイソキサフルト ール1mg/lが添加されたMS培地での15日間の発芽の誘導である。この工 程中に形成された緑の若芽を、ついで、サッカロース30g/l及びイソキサフ ルトール1mg/lが添加されてはいるが、ホルモンは含まないMS培地での1 0日間の培養によって成長させる。ついで、成長した若芽を採取し、これを、塩 、ビタミン及び糖含量が半分でイソキサフルトール1mg/lを含むが、ホルモ ンを含まないMS発根培地で培養する。約15日後、発根した若芽を土に移す。 この手順に従って得られたすべての実生を、P.fluorscensのHP PDの特定のプライマーを用いてPCRに より分析する。このPCR分析によって、このようにして得られたすべての実生 は、HPPD遺伝子を十分に組込んでいることが確認できた。 結論として、この試験から確認されたことは、HPPD遺伝子はマーカー遺伝 子として用いることができること、及びイソキサフルトールはこの遺伝子と組合 わされると、良好な選択剤になることである。実施例7及び8:Arabidosis thalianaのHPPD遺伝子及 びニンジン(Daucus carotta)のHPPD遺伝子の単離 a)cDNAバンクの作成 Arabidopsis thalianaの若い実生から抽出されたmRN A、及び培養ニンジン細胞から抽出されたmRNAを用いて、ストラタジェーヌ 社(Stratagen)から販売されているベクターUni ZapTMXR中 に、2つのcDNAバンクを形成するのに用いられた。この際、この会社によっ て推奨されている手順に従った。 b)cDNAバンクのスクリーニング これらの2つのバンクを、部分的長さのArabidopsis thalianaのcDNAに対応するプローブを用いてスクリーニングした。 これは、アラビドプシス・バイオロジカル・リソース・センター(Arabid opsis Biological Resource Center)(米国 オハイオ州)から得られ、ESTクローンNo.91B13T7としてリストに 挙げられているものである。このクローンは約500の塩基対から構成されてお り、このうち228だけが、MSU−DOEプラント・リサーチ・ラボラトリー によって、Arabidopsis thalianaのcDNAの無作為配列 の枠内で配列決定されている。本発明者らは、このクローンの使用前に500塩 基対を完全に配列し、溶菌斑の従来のハイブリダイゼーション技術によって、A rabidopsis thaliana及びニンジンのcDNAバンクをスク リーニングした(文献?)。 c)1338塩基対に対応するArabidopsis thalianaのc DNA(配列番号2)が得られた。このcDNAは、25位に翻訳開始コドン、 1336位に翻訳終了コドンを有する。従ってこのcDNAは完全であり、44 5のアミノ酸のタンパク質をコードする。 d)1329塩基対に対応するニンジン(Daucus carotta)cDNA(配列番号3)が得られた。このcDNAは、1位に 翻訳開始コドン、1329位に翻訳終了コドンを有する。従ってこのcDNAは 完全であり、442のアミノ酸のタンパク質をコードする。 示された配列は次のとおりである: 配列番号1:Pseudomonas fluorescens A32のH PPD遺伝子の配列 配列番号2:Arabidopsis thalianaのHPPDのcDN Aの配列 配列番号3:Daucus carottaのHPPDのcDNAの配列 下記図面は、本発明を例証するために示されている。 図1は、Pseudomonas sp.株P.J.874のHPPDのタン パク質配列と、対応するコード部分の理論的ヌクレオチド配列とを示す。このコ ード領域の一部の増幅を行なうために選ばれた5つのオリゴヌクレオチドは、5 つの矢印によって示されている。 図2は、P.fluorescens A32のHPPD遺伝子を含む7kb のゲノムDNA断片を有するプラスミドの図 を表わす。 図3は、P.fluorescens A32のHPPD、及びPseudo monas sp.株P.J.874のHPPDのアミノ酸配列の比較(2つの 配列間の異なるアミノ酸のみが示されている)、並びにコンセンサス配列を示す 。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI (C12N 15/09 ZNA C12R 1:39) (31)優先権主張番号 96/05944 (32)優先日 1996年5月17日 (33)優先権主張国 フランス(FR) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S Z,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD ,RU,TJ,TM),AL,AU,BB,BG,BR ,CA,CN,CZ,EE,GE,HU,IL,IS, JP,KP,KR,LK,LR,LT,LV,MG,M K,MN,MX,NO,NZ,PL,RO,SG,SI ,SK,TR,TT,UA,US,UZ,VN (72)発明者 パレツト,ケン イギリス国、エセツクス・シー・エム・ 5・0・エイチ・ダブリユ、オンガー(番 地なし)

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 非ヒト起源又は非海洋性細菌起源の単離された遺伝子配列、又はこの配列 とハイブリダイズしうる配列であって、ヒドロキシ−フェニルピルビン酸ジオキ シゲナーゼ(HPPD)を発現することを特徴とする配列。 2. 細菌起源又は植物起源であることを特徴とする、請求項1に記載の配列。 3. Pseudomonas sp.に由来することを特徴とする、請求項2 に記載の配列。 4. Pseudomonas fluorescensに由来することを特徴 とする、請求項3に記載の配列。 5. 植物起源のものであることを特徴とする、請求項1に記載の配列。 6. Arabidopsisに由来することを特徴とする、請求項5に記載の 配列。 7. セリ科に由来することを特徴とする、請求項5に記載の配列。 8. プライマーとして、HPPDのアミノ酸配列に由来する オリゴヌクレオチドを選び、 これらのプライマーから、PCRにより増幅断片を合成し、 ゲノムバンクの作成及びスクリーニングによって遺伝子を単離し、 この遺伝子をクローン化する、 ことを特徴とする、請求項1〜4いずれか1つに記載の遺伝子の単離方法。 9. 転写の方向に、 植物内で自然に発現される遺伝子に由来する少なくとも1つのプロモーター調 節配列、 異種コード配列、 少なくとも1つのポリアデニル化配列、 を含む植物の遺伝的形質転換用のキメラ遺伝子であって、コード配列が、ヒドロ キシ−フェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)を発現する遺伝子の配 列であることを特徴とするキメラ遺伝子。 10. プロモーター調節配列が、コード配列の過剰発現を促進することを特徴 とする、請求項9に記載のキメラ遺伝子。 11. プロモーター調節配列が、少なくとも1つのヒストン プロモーターを含むことを特徴とする、請求項10に記載のキメラ遺伝子。 12. プロモーター調節配列とコード配列との間に、トランジットペプチドを 含むことを特徴とする、請求項9〜11のいずれかに記載のキメラ遺伝子。 13. 色素体局在酵素をコードする植物遺伝子のトランジットペプチドをコー ドする配列、色素体局在酵素をコードする植物遺伝子の成熟N末端部分の配列の 一部、ついで色素体局在酵素をコードする植物遺伝子の第二トランジットペプチ ドをコードする配列を転写の方向に含む最適化されたトランジットペプチドを、 プロモーター調節配列とコード配列との間に含むことを特徴とする、請求項9に 記載のキメラ遺伝子。 14. プロモーター調節配列とコード化配列との間に、転写活性化物質(エン ハンサー)の配列を含むことを特徴とする、請求項9〜13のいずれかに記載の キメラ遺伝子。 15. 請求項9〜14のいずれかに記載のキメラ遺伝子を含むことを特徴とす る、植物の遺伝的形質変換に用いうるベクター。 16. 請求項9〜14のいずれかに記載のキメラ遺伝子を含 むことを特徴とする植物細胞。 17. 請求項16に記載の細胞から再生されることを特徴とする植物。 18. 双子葉類に属することを特徴とする、請求項17に記載の植物。 19. HPPDの阻害剤に対して耐性にするための、植物の形質転換方法であ って、外生HPPDを発現する遺伝子を植物細胞に導入することを特徴とする方 法。 20. 伝達が、Agrobacterium tumefaciens又はA grobacterium rhizogenesを用いて実施されることを特 徴とする、請求項19に記載の方法。 21. 伝達が、DNAを含有する粒子による衝撃によってもたらされることを 特徴とする、請求項19に記載の方法。 22. 選択マーカーとして外生HPPDを発現する遺伝子を植物細胞に導入す ることを特徴とする、植物の形質転換方法。 23. 請求項17又は18に記載の植物に、HPPD遺伝子の阻害剤を適用す ることを特徴とする、植物の選択的除草剤処理方法。 24. HPPD遺伝子の阻害剤がイソキサゾール類であるこ とを特徴とする、請求項23に記載の方法。 25. イソキサゾールが、4−[4−CF3−2−(メチルスルフォイル)ベ ンゾイル]−5−シクロプロピルイソキサゾールであることを特徴とする、請求 項24に記載の方法。 26. HPPD遺伝子の阻害剤がジケトニトリル類であることを特徴とする、 請求項23に記載の方法。 27. HPPD遺伝子の阻害剤がトリケトン類であることを特徴とする、請求 項23に記載の方法。 28. HPPD遺伝子の阻害剤がスルコトリオンであることを特徴とする、請 求項23に記載の方法。
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