JP2868179B2 - 糸状菌類のプロモーターを用いるタンパク質の製造方法 - Google Patents

糸状菌類のプロモーターを用いるタンパク質の製造方法

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の分野】この発明は、糸状菌類におけるタンパク
質の発現および分泌を伴なうタンパク質の発現に関する
ものである。
【0002】
【発明の背景】組換えDNA技術のひとつの目標は、容
易にしかも経済的に入手できる宿主細胞に商業的にある
いは科学的に価値のあるタンパク質をコードしているD
NAセグメントを挿入することである。一般に、挿入の
ために選ばれる遺伝子は、それら本来の宿主で限られた
量しか産生されないタンパク質をコードしているもの、
あるいは高価すぎて維持することのできない宿主に固有
のものである。より多くの収量で、あるいは同様の収量
でより経済的にタンパク質を産生することが可能な宿主
に、制御された方法で遺伝情報を転移することにより、
タンパク質産生のためのより望ましいビヒクルが得られ
る。
【0003】タンパク質をコードしている遺伝子は、本
質的に、タンパク質コード(暗号)領域の5'末端に接し
ているDNAのプロモーター領域を含んでいる。プロモ
ーター領域は、RNAポリメラーゼIIとの結合部位を
含んでいる。RNAポリメラーゼIIは、コード領域の
適当なDNA鎖と相補的なメッセンジャーRNAの組立
てを効果的に触媒する。ほとんどのプロモーター領域に
は、“TATAボックス"として一般に知られている配
列に関係するヌクレオチド塩基配列が存在し、そして、
該配列は通常、コード領域の始まりから幾分離れた上流
に位置していて、正確な転写開始反応には必要なもので
ある。コード領域を正しく機能させ、制御するのに重要
な、あるいは必須であるそれ以外の特徴も、コード領域
の始まりの上流にあるプロモーター領域中に含まれてい
る。
【0004】糸状菌類、特に、アスペルギルス属(Aspe
rgillus)、たとえばアスペルギルス・ニーガー(A.nig
er)のような糸状嚢子菌類は、有用なタンパク質をコー
ドしている外来遺伝子の受容体として適している微生物
群の一種である。現在、A.ニーガーとその関連(近縁)
種は、たとえば食品業界において使用するような酵素の
工業生産に係る業界で広範に用いられている。それらの
用途は、微生物の分泌能力に基づくものである。微生物
は十分に特徴づけられていて、広範に利用され、受け入
れられているので、有用なタンパク質を得るために、
A.ニーガーの細胞やA.ニデュランス(A.nidulans)
を含むその関連種の細胞を遺伝的に修飾し増強するよう
な工業的でかつ科学的な誘因(動機)が存在する。
【0005】糸状菌類由来の外来タンパク質を発現、分
泌させる方法は、いまだ完成されていない。酵母におい
て成功した試みが、アスペルギルス属のような糸状菌類
において成功するかどうかは決して自明のことでない。
酵母は、糸状菌類の遺伝子を発現させるのに適した組織
ではなく[ペンチラ(Pentilla)らのモレキュラー・ジー
ン・ジェネティック(Molec.Gen.Genet.)(198
4)194:494−499]、また酵母遺伝子は糸状菌
類中で発現しないことが明らかにされた。最近になっ
て、A.ニデュランスおよびA.ニーガーにおける遺伝
子工学技術が発達してきた。これらの技術は、外来的に
加えられる遺伝子が、発現することのできる形態でアス
ペルギルス・ゲノムに組込まれることと関連している。
【0006】現在までのところ、これらの技術を用いて
も、外来タンパク質は糸状菌類中で発現されず、該菌類
から分泌されなかった。これは、適当な発現ベクターや
その組立て構成要素がないことによっていた。これらの
構成要素には、上述したアスペルギルス・プロモーター
配列、所望の生産物をコードしている領域、および所望
の生産物を細胞外媒質に導くために加えられる関連配列
が含まれる。
【0007】上記のように、宿主細胞によって外来遺伝
子が発現するには、タンパク質をコードしている領域の
上流に位置するプロモーター領域が存在することが必要
である。このプロモーター領域は、それと関連するコー
ド領域が、最後には所望のタンパク質生産物に翻訳され
るメッセンジャーRNAに転写されることの制御におい
て活性である。このようにして産生されるタンパク質
は、宿主に関する運命に基づいて2つの種類に分類され
る。
【0008】第一の種類のタンパク質は、細胞内に残
る。細胞内にある場合、所望のタンパク質を抽出するに
は、生産物を放出させて、最終的に精製するために、遺
伝子的に操作された宿主を破壊あるいは溶解する必要が
ある。細胞内生産物は、いくつかの点で都合がよい。こ
のタンパク質生産物は、濃縮することができ、すなわち
細胞塊とともにペレットにすることができ、もし、生産
物が細胞外状況で不安定、あるいは構造的に分泌するこ
とができない場合には、これは、産生および精製の望ま
しい方法である。
【0009】2番目の種類のタンパク質は、細胞から分
泌されるものである。この場合、精製は、細胞自身より
も細胞外媒質上で行われる。生産物は、アフィニティー
クロマトグラフィーのような方法で抽出することがで
き、連続液中発酵が可能である。また、特定の生産物
は、細胞外でより安定であり、細胞外精製が有利であ
る。真核生物におけるタンパク質の分泌は、通常、タン
パク質のアミノ基末端に位置している分泌シグナルペプ
チド(以下、シグナルペプチドと呼ぶ)によって、ほとん
ど常に指令を受けていることが実験的に明らかとなって
いる。シグナルペプチドは、ジー・ボン ヘイジン
(G.Von Heijin)のヨーロピアン・ジャーナル・バ
イオケム(Eur.J.Biochem)17−21(1983)に
よって記述されているように、特徴的な分布を有してい
て、当業者によりそのことは理解されている。シグナル
ペプチドは、細胞に認識された時点で、タンパク質を分
泌経路へと導びく。分泌の間に、シグナルペプチドは開
裂して除かれ、タンパク質は、細胞外媒質から成熟した
形で収穫することができるようになる。
【0010】細胞内および細胞外の両種のタンパク質は
ともに、コード領域と連結しているプロモーター領域を
含む遺伝子によってコードされている。細胞外へ導かれ
るタンパク質をコードしている遺伝子は、細胞内のタン
パク質をコードしている遺伝子と、細胞外タンパク質を
コードしている遺伝子では、シグナルペプチドをコード
しているプロモーター(それは、RNAポリメラーゼに
よって最初に転写される部分である)に最も近いコード
領域部分がシグナルペプチドをコードしているという点
で異なっている。シグナルペプチドをコードしているヌ
クレオチド配列は、以下ではシグナルペプチドのコード
領域あるいはシグナル配列と表わされるが、それ自体コ
ード領域の機能的な部分である。
【0011】
【発明の概要】所望のタンパク質を発現するために糸状
菌類を形質転換する方法(システム)が、ここに開発され
た。この方法によれば、形質転換によって、そのタンパ
ク質が天然に分泌されるものであるかどうかに関係な
く、該タンパク質を発現するばかりでなく、そのタンパ
ク質を分泌することのできる糸状菌類を得ることができ
る。その上、本発明のある面においては、発現されるタ
ンパク質の濃度レベルを、コントロールすることができ
る。当業者には、本明細書で示される方法によって、糸
状菌類がタンパク質の貴重な産生源として機能し、多く
の適用例で、細菌や酵母による方法(系)よりも秀れてい
る代替系がもたらされることを理解できるであろう。
【0012】このように一般的な態様では、本発明は、
糸状菌類細胞の遺伝子構成を改良し、これらの細胞によ
って発現されるタンパク質の性質または量を変えるため
の糸状菌類の形質転換方法(系)を提供するものである。
本発明のより具体的な態様を以下に記述する。本発明に
おけるひとつの態様では、A.ニーガー、A.ニデュラ
ンスあるいはその関連(近縁)種のような糸状菌類におけ
るコード領域と関連するプロモーター領域を、同定、分
離し、細胞外で2番目の異なるコード領域と機能的な関
係の下で適当に結合させ、そして、適当なベクターを用
いて、宿主糸状菌類に再び導入する形質転換された宿主
細胞は、導入されたプロモーター領域のコントロールの
下で、2番目のコード領域のタンパク質を発現する。特
定の宿主が天然では発現しないタンパク質を発現する場
合、および該タンパク質を分泌するいくつかの場合に
は、この2番目のコード領域は、宿主種にとって外来の
ものであるかもしれない。他方、2番目のコード領域が
タンパク質発現を改良または増強するために特定の宿主
内でそのタンパク質が自然の状態で関連しているプロモ
ーター領域とは異なるプロモーター領域と関連している
場合には、第2の暗号領域は宿主本来のものであるかも
しれない。
【0013】第2のコード領域が、通常分泌されるタン
パク質をコードしているものである場合にはその配列
は、転写および翻訳後、タンパク質生産物のアミノ基末
端にシグナルペプチドを存在せしめるようなヌクレオチ
ド配列を、5'末端、すなわちシグナルペプチドのコー
ド領域に含んでいるだろう。そのシグナルペプチドは、
菌類宿主によって認識され得、そして、タンパク質生産
物は、細胞の分泌経路へと導びかれ、分泌され得る。
【0014】もうひとつの態様では、本発明は、シグナ
ルペプチド、すなわちシグナルペプチドのコード領域を
コードしているDNA配列であって、コード領域内でコ
ードされているタンパク質の分泌を促すように、糸状菌
類、好ましくは嚢子菌類種、たとえばA.ニーガーや
A.ニデュランスによって、認識されるDNA配列を提
供するものである。これらのシグナルペプチドのコード
領域は、天然状態では細胞内に保持されるタンパク質の
分泌を誘導するために該タンパク質をコードしているコ
ード領域と連結することができる。一方、通常分泌され
るタンパク質は、普通、これらのシグナルペプチドのコ
ード領域を天然に含んでいるので、シグナルペプチドを
コードしている領域を挿入することは通常必要としない
が、それでも、所望により、本発明のシグナルペプチド
のコード領域で、天然に存在するこのような配列を置換
してもよい。従って、シグナルペプチドのコード領域
が、非分泌性のタンパク質をコードしている領域と連結
されている場合には、そのものは上記コード領域にとっ
て、外来性であるだろう。
【0015】本発明は、菌類宿主が異種タンパク質を発
現するように配列されたプロモーターを伴った外来性の
コード領域を糸状菌類中に導入し得る方法(性能)を提供
するものである。また、本発明は、そこに、天然に存在
する個々の遺伝子、あるいはそこに導入された外来遺伝
子の転写を、その遺伝子と共に宿主に導入されたプロモ
ーター領域を介して調節することのできる方法をも提供
する。たとえば、A.ニデュランスのアルコール・デヒ
ドロゲナーゼI(alc A)遺伝子やアルデヒド・デヒド
ロゲナーゼ(ald A)遺伝子と天然で連なっているプロ
モーター領域は、細胞外媒質のエタノール、スレオニ
ン、あるいは他の誘導物質によって調節できる。この効
果は、alcRとして知られる遺伝子の保全に依存してい
る。alcAあるいはaldAプロモーター領域が、アスペル
ギルスなどにおいて、外来タンパク質をコードしている
媒質と連なっている時には、本発明に従って、エタノー
ルあるいはその他の誘導物質によって、異なる遺伝子の
発現を同様に調節することができる。
【0016】さらなる例として、A.ニーガーにおいて
グルコアミラーゼ遺伝子と天然で連なっていて、本発明
の態様において使用されるプロモーター領域は、デンプ
ンおよび他の糖類によって正に誘導される。本明細書で
用いる「誘導性プロモーター」は、例えば、エタノー
ル、トレオニン、デンブンならびに他の糖、および他の
誘導物質のような誘導因子に反応して転写を誘導するこ
とができるプロモーターを意味する。
【0017】もうひとつの態様では、本発明は、シグナ
ルペプチドをコードしている領域と機能的に連なるプロ
モーター領域であって、その3'側に位置し、シグナル
配列と同じ解読枠内に所望のタンパク質をコードしてい
る領域を導入させ得る領域を含むDNA構築物を提供す
るものである。プロモーター/シグナル構築物は、タン
パク質コード領域をシグナルペプチドのコード領域に正
確に連結させ得る制限部位をその側面に有している。
【0018】他の態様では、本発明は、プロモーターや
シグナルペプチドのコード領域を含むセグメントを、完
全なタンパク質のコード領域と共に、糸状菌類宿主のゲ
ノムに導入することのできる遺伝子ベクターを提供する
ものである。そのタンパク質をコードしている領域は、
宿主の糸状菌類にとって、固有のものであって、外来の
ものであってもよい。
【0019】このように、本発明は、アスペルギルス・
ニーガー、アスペルギルス・ニデュランスなどの糸状菌
類細胞において、プロモーター領域として活性なDNA
配列、およびシグナルペプチドのコード領域として活性
なDNA配列を提供するものである。
【0020】更に、本発明は、糸状菌類細胞においてプ
ロモーター領域として活性なDNA配列、および該DN
A配列と機能的な関連性を持って化学的に結合している
コード領域(つまり、該コード領域は糸状菌類宿主にお
いて、前記DNA配列の影響下で発現することができ
る)からなる新規な構築物を提供するものでもある。
【0021】更に、本発明は、形質転換されたアスペル
ギルス宿主細胞において発現することのできるコード領
域、および形質転換されたアスペルギルス宿主細胞にお
いて活性であるプロモーター領域(コード領域とプロモ
ーターとは化学的に結合し、互いに機能的に関連してい
る)を、適当なベクターによって宿主細胞に導入するこ
とからなる、糸状菌類宿主細胞を遺伝子的に修飾する方
法を提供する。
【0022】この方法は、遺伝子発現の水準を上げるた
めに、選択された構築物の多数のコピーを宿主に導入す
ることも包含している。要すれば、あるいは所望ならば
複数の構築物のコピーの導入に伴なって、構築物に対し
て調節作用を有する生産物をコードしている遺伝子の多
数のコピーを導入する。本発明は、本発明の構築物によ
って形質転換された糸状菌類細胞をも含むものである。
【0023】
【好ましい態様の説明】本発明において好ましい宿主
は、子嚢菌種の糸状菌類で、最も好ましくは、A.ニー
ガー、A.ニデュランスなどを含むアスペルギルス属で
ある。発明の好ましい態様においては、A.ニーガー・
グルコアミラーゼ遺伝子、あるいは、A.ニデュランス
のアルコール、デヒドロゲナーゼI遺伝子またはアルデ
ヒド・デヒドロゲナーゼ遺伝子と関連しているプロモー
ター領域、のいずれかと関連しているプロモーター領域
を、適当なベクター・プラスミドを製造する上で使用す
る。
【0024】これらプロモーター領域のうちいずれか、
あるいは全ては、適当な誘導物質を加えることで宿主細
胞内で調節することができる。alcAaldAにおいて
は、この誘導は、第3の遺伝子のタンパク質生産物であ
る、プロモーターを介してコントロールされるalcR
よって調節される。alcAプロモーターあるいはaldA
ロモーターを含む構築物の多数のコピーを、対応するal
cR遺伝子の多数のコピーの導入を伴なわずに宿主に導
入した場合、alcR生産物の利用可能性によって、alcA
およびaldAプロモーターのプロモーター機能を制限し
得ることが明らかにされている。このような場合、宿主
が産生することのできるalcR生産物の量は、alcR生産
物による誘導を必要とするいくつかのプロモーターの要
求量に応ずるのに不十分であることがある。従って、al
cAあるいはaldAプロモーターを含む構築物の多数のコ
ピーによる糸状菌類の形質転換には、本発明の好ましい
態様に従がってalcR遺伝子の多数のコピーの導入を併
わせて行う。他方、たとえば、高濃度のグルコース(お
よび、いくつかの他の炭素源)を、宿主の増殖に用いる
培地中に使用することによって、転写を抑制することが
できる。そして、コード領域によりコードされていて、
プロモーターによって制御されている生産物の発現は、
細胞生育相の終了の後、つまり、グルコースの全てが消
費され、その遺伝子の抑制が解除される時まで遅延す
る。この時に、プロモーターの活性を増強するために誘
導物質を添加する。
【0025】上述したプロモーターの制御のもとで、発
現するように選択されたコード領域のタンパク質生産物
の運命は、該コード領域のヌクレオチド配列によって決
定される。既述したように、もし、タンパク質生産物が
天然で細胞外環境に導びかれるものならば、生来、分泌
性のシグナルペプチドのコード領域を含んでいるであろ
う。通常、細胞内に存在するタンパク質生産物には、こ
のシグナルペプチドが欠如している。
【0026】このように本明細書の目的においては、
“コード領域"は、細胞内に残っているか、分泌されて
いるかのいずれかのタンパク質をコードしていると解す
べきである。(この“コード領域"とは、当業界では、時
に構造遺伝子すなわち遺伝子の、タンパク質をコードし
ている部分を指して呼ばれることがある。)タンパク質
が、それを産生する細胞内に残っている場合には、通
常、コード領域は、シグナルペプチドのコード領域を欠
如しているだろう。コード領域が本来、分泌タンパク質
をコードしているコード領域のセグメントと翻訳解読フ
レームにおいて天然で連結しているシグナルペプチドの
コード領域を含んでいる場合には、コード領域内でコー
ドされているタンパク質は、細胞代謝における当然の結
果として分泌され得る。この場合、シグナルペプチドの
コード領域を挿入する必要はない。一方、分泌タンパク
質をコードしているコード領域部分にとって外来のシグ
ナルペプチドのコード領域を導入するように操作するこ
ともある。コード領域が、シグナルペプチドのコード領
域を天然で含んでいない場合、あるいは天然のシグナル
ペプチドと通常連結している所望のタンパク質の分泌を
増強するために天然のシグナルペプチドのコード領域と
単に置換する場合には、この外来性シグナルペプチドの
コード領域が必要となる。
【0027】従って、本発明の他の好ましい態様におい
ては、要すれば、すなわち、上述したプロモーターの制
御のもとで発現するために選択されたコード領域が、そ
れ自身シグナルペプチドのコード領域を含んでいない時
には、シグナルペプチドのコード領域を供給する。使用
されるシグナルペプチドのコード領域は、A.ニーガー
のグルコアミラーゼ遺伝子に伴なっているもの、あるい
in vitroで作られる合成シグナルペプチドのコード
領域であることが好ましく、適当なベクター・プラスミ
ドの作成に使用する。他のベクターの他の成分とライゲ
イトできるように、これらシグナルペプチドのコード領
域の片方あるいは両方の末端が修飾されていることが最
も好ましい。シグナルペプチドのコード領域が、コード
領域の、成熟した機能的タンパク質をコードしているセ
グメントと同一フレーム中にあるように、シグナルペプ
チドのコード領域をプロモーター領域とコード領域のタ
ンパク質をコードしているセグメントの間に挿入するよ
うな方法で行うと、このライゲイションは効果的であ
る。
【0028】
【好ましい態様の詳細な説明】本発明において、A.ニ
ーガーあるいはA.ニデュランスなどにおいて機能的な
遺伝子のプロモーター領域が同定された。所望のプロモ
ーター領域を含む各々の遺伝子を同定する方法は同様で
あるため、alcA遺伝子およびそれに含まれているプロ
モーターの位置を決め、同定する方法について概説す
る。この目的のために、選択したタンパク質、たとえば
alcAを発現するように、選択種の細胞を誘導し、これ
らの細胞から、メッセンジャーRNAを分離する。それ
らの一部は、未だ同定されていないが、alcAをコード
している。フラグメントの相補的DNAを、mRNAフ
ラグメントより作成し、ベクターにクローン化する。誘
導されたA.ニデュランスより分離されたメッセンジャ
ーRNAをサイズ分画してalcA配列を豊富化し、末端
を標識してalcA +菌株より調製されたcDNAクローン
ーとハイブリダイズする。alcA + mRNAとハイブリダ
イズするcDNAを含むクローンは、alcA mRNAのD
NAコピーを含んでいる。この切片を、選択したアスペ
ルギルス菌株由来の全DNA遺伝子バンクとハイブリダ
イズし、選択したコード領域たとえばalcAおよびその
非翻訳領域を分離する。aldAコード領域も同様の方法
を用いて分離した。
【0029】そのコード領域は、他のコード領域および
タンパク質と同様に、メチオニンをコードしているコド
ンATGを伴った5'末端より始まる。発現されるタン
パク質のアミノ酸配列が知られている場合には、コード
領域のDNA配列は、容易にわかる。ATGコドンのす
ぐ“上流"は、プロモーター領域に発行されるメッセン
ジャーRNAのリーダー部分である。
【0030】図1〜7では、A.ニデュランス由来の全
DNA配列を、従来からの塩基表示法によって図示して
いる。図1、図2及び図3に示した部分は、プロモータ
ー領域およびアルコールデヒドロゲナーゼI酵素をコー
ドしているalcA遺伝子のコード領域を含んでいる。図
4、図5、図6及び図7に示した部分は、プロモーター
領域およびアルデヒドデヒドロゲナーゼ酵素、すなわち
aldAをコードしている領域を含んでいる。(両方とも
に、“IVS"の用語は、介在配列を表わす。)これら2
つの酵素のアミノ酸配列は、他の種において公知であ
る。これらより、領域10および10'がコード領域で
あると認められる。コード領域は各々、12位のメチオ
ニン・コドンATGを有する5'(“上流")末端より開始
する。タンパク質のコード領域によってコードされる相
応のアミノ酸配列を、図1〜図7のそれぞれの列の下
に、従来からの省略法によって付記する。コドン12の
すぐ上流は、メッセンジャーRNAのリーダー領域およ
びプロモーター領域をコードしている領域で、長さは、
プロモーターとして機能する上で必須の構造的特徴を全
て含ませるために決定するか、あるいは少なくとも概算
しておく必要がある。図1〜図7の各々には、ATGコ
ドン12より上流の約800塩基の配列をそれぞれ示
す。
【0031】機能するのに必須なものは全て、約100
0塩基の長さの配列中に、おそらく図示した800塩基
配列中含まれているだろうし、さらには、最初の200
〜300塩基配列、すなわち図1〜図7における約14
の位置よりも後にあるだろうことは、他の既知のプロモ
ーターとの類似性によって予測できる。プロモーター領
域の本質的な機能は、転写の正確な開始のための部位を
提供することで、それはTATAボックス配列として知
られている。このような配列は、図1、図2及び図3の
alcAプロモーター配列上の16、および図4、図5、
図6及び図7のaldAプロモーター配列上の16'部に見
出される。プロモーター領域のもうひとつの機能は、た
とえば遺伝子の転写を増強する調節分子のためのあるい
は遺伝子を活性または不活性にするための結合部位のよ
うな遺伝子転写の調節において活性な、適当なDNA配
列を提供することである。このような調節領域は、図1
〜図7に、それぞれalcAおよびaldA遺伝子として図示
したプロモーター領域中にある。
【0032】本発明でプロモーター領域として使用され
るDNA配列の正確な上流5'末端は、それが本明細書
で記述するような必須の機能的な配列を含んでいるなら
ば、決定的なものではない。5'末端の上流にある余分
なDNA配列は、必要なものではないが、本発明におい
て有害なものではないようである。
【0033】本明細書記載の操作によって、ある遺伝子
のプロモーター領域を組立てるのに必須の機能的特徴全
てを含む配列の大きさを決定したなら、次の工程では、
プロモーター領域の末端の下流の都合よい位置でDNA
鎖を切断し、タンパク質のコード領域を取り除き、基本
的に、プロモーター領域および、時にメッセンジャーR
NAのリーダー領域をコードしている領域部分を含む配
列を残す。この目的のためには、適当な位置に制限部位
が存在していなければならず、次いで、適当な制限酵素
でDNAを処理して有効に切断する。切断部位は、図
1、図2及び図3に図示されるalcA配列によってわか
る。上流の切断には、プロモーター領域にとって必須の
機能部位の全てを保持される部分に含めるように、十分
な距離をもって上流に部位を選択する。下流の開裂部位
に関しては、alcCの場合、正確にATGコドン12の
位置にある、制限部位は存在していない。該部分に最も
近い下流の制限部位は、13における配列GGGCCC
で、そこでは、その鎖を制限酵素ApaIによって切断す
ることができる。もし所望ならば、このような開裂の
後、位置13から位置12までの残ったヌクレオチド
は、エキソヌクレアーゼを用いて段階的に取り除くこと
ができる。このような取り除かれるヌクレオチドの数が
わかっているなら、エキソヌクレアーゼの作用を、位置
12を過ぎる時に適当に停止させることができる。図
4、図5、図6及び図7に示すaldAコード領域のメチ
オニン・コドン12の下流に同様の制限部位を位置決め
することによって、このプロモーター領域をもその後の
使用のために同様に切り出す。多くの場合、プロモータ
ー領域の5'末端上で残ったヌクレオチドは、塩基トリ
プレットの解読フレームが維持される限りは、プロモー
ター領域の機能に害を与えることはなく、該機能を有意
に妨げることもない。
【0034】添付の図4、図5、図6及び図7は、本発
明に従ってアスペルギルス形質転換体を形成するのに使
用できるプラスミドpDG6を作成する方法の工程を概
略的に示したものである。図4、図5、図6及び図7に
おいては、18は、最近セルロモナス・フィミ(Cellul
omonas fimi)由来のエンドグルコナーゼ(セルラーゼ)
のコード領域30すなわち既知のベクターM13MP8
におけるC.フィミ由来のBamHIエンドグルカナーゼ
・フラグメントを含む組換えプラスミドである。それ
は、図示した適切なEcoRI、Hind IIIおよびBam
HI制限部位、並びに、図示されていない、本発明にと
って問題外の他の制限部位を含んでいる。項目20は、
p5と名付けられた組換えプラスミドで、既知の大腸菌
(E.coli)プラスミドpBR322より組立てられ、開
始コドンATGをも含む、alcAコード領域の一部分と
ともに、上述のようにして作成されたalcAプロモータ
ー領域を含むA.ニデュランスのEcoRIフラグメント
を含有している。それは、図示した制限部位、並びに本
発明では使用されないために図示されていない他の制限
部位を有している。プラスミドp5は、EcoRI部位
(3')からHind III(5')に至るDNA配列22を有
しており、該部分は事実上、図1、図2及び図3で示し
ている配列の一部で、それは配列の上部に位置15(Ec
oRI制限部位の構成部位である配列GAATTC)から
位置17と表わされている部分に相当する。プラスミド
20における配列22は、約2kbの長さである。
【0035】次に、プラスミド18と20を制限酵素E
coRIおよびHindIIIで切断して、alcAプロモータ
ー領域と、エンドグルカナーゼのコード領域30とを切
り取り、HindIII切断プラスミドpUC12とライゲ
イトして、pUC12上にこれらの配列を含む、図8に
示すような新規な構築物pDG5Aを作成する。プラス
ミドpUC12は公知で、市販されている大腸菌プラス
ミドであり、該プラスミドは大腸菌内において効率的に
複製するので、所望ならば、pDG5Aのコピーを豊富
に産することができる。新規な構築物pDG5Aを、構
築物調製における他の生産物より分離する。次いで、構
築物pDG5Aに選択マーカーを付ければ、続いて得ら
れる首尾よく構築物を導入されたアスペルギルスの形質
転換体を選別、分離することができる。ArgB- アスペ
ルギルス宿主の場合、この目的のために、一般にA.ニ
デュランス由来のArgB遺伝子を適当に使用することが
できる。ArgB遺伝子は、酵素オルニチン・トランスカ
ルバミラーゼをコードしていて、この遺伝子を含む菌株
は、通常の平板培養法および培養技術によって、ArgB
- 菌株より容易に選別、分離することができる。ArgB-
菌株は、アルギニン欠損の培地で発育できない。
【0036】図8に示すように本発明のこの態様におい
て、選択マーカーを組込むには、XbaIを使用してA.
ニデュランス由来のArgB +遺伝子を含むプラスミドpD
GATCC53006のXbaIフラグメント32(ブク
ストン(Buxton)らの米国特許出願、通し番号06/6
78,578、1984年12月5日出願を参照)と構築
物pDG5Aをライゲイトし、エンドグルカナーゼのコ
ード領域とalcAプロモーター配列およびArgB遺伝子
を含有する新規な構築物pDG6を形成する。そして、
実施例1において、より詳細に記述するが、プラスミド
pDG6を形質転換に使用し、alcAプロモーターの制御
下にあるエンドグルカナーゼのコード領域を含む新規な
アスペルギルス突然変異体菌株を作成する。
【0037】図9には、HindIII部位24からHind
III部位26までの構築物pDG6の機能部である配
列の概略を、線状で示す。それは、図1〜図7で示した
ようにalcAプロモーター領域22とATGコドン12
およびATGコドンの下流にあるalcAコード領域の残
余部分の一部を含んでいて、それに続いてプラスミド1
8由来のセルラーゼのコード領域30を含んでいる。
【0038】プラスミドpDG6は、糸状菌類にとって
外来のタンパク質のコード領域と結合した糸状菌類プロ
モーターを含むベクターの1例にすぎない。図27に示
した本明細書中でpALCA1AMYと呼ぶもうひとつ
のベクターにおいては、alcA遺伝子の糸状菌類プロモ
ーターと、天然に存在するα−アミラーゼ酵素、つまり
形質転換された菌類宿主にとって外来の生産物をコード
している配列とが連結されている。ベクターpDG6お
よびpALCA1AMYのタンパク質生産物は、両方と
も、それぞれの形質転換された宿主によって発現する。
さらに、α−アミラーゼのコード領域は、天然でシグナ
ルペプチドのコード領域を含んでいるので、この生産物
は、宿主にとっては外来性であるにもかかわらず、宿主
の分泌機序を用いて、形質転換される宿主によって分泌
され得る。
【0039】このように、糸状菌類のプロモーター領域
を同定、分離することによって、所望の暗号領域と連結
したこれらのプロモーター領域を含むベクターで、形質
転換することによって宿主を操作し得る。
【0040】もし、ベクターのコード領域がシグナルペ
プチドのコード領域を必要とするか、あるいは存在する
シグナル配列を、別の、好ましい、より効率的なシグナ
ルペプチドのコード領域によって置き換えられるなら、
このようなシグナルペプチドのコード領域は、プロモー
ターと、分泌タンパク質をコードしているセグメントと
の間に挿入することができる。プラスミドpGL2(図1
0)およびpALCA1S(図15)は、特にこの目的に達
した中間体クローニングベクターを例示している。各々
は、カセットとして機能することができ、プロモータ
ー、シグナル配列および、シグナル配列と一緒に、正し
い転写解読フレームに、タンパク質のコード領域を挿入
することを可能ならしめる、シグナル配列下流の制限部
位を提供するものである。
【0041】図10において示すプラスミドpGL2
は、グルコアミラーゼ遺伝子のプロモーター40、シグ
ナル配列42および開始部分46を含むpGL1より作
成することができ、それらすべては本明細書で示す方法
に従い、A.ニーガーDNA由来の1つのセグメントか
ら導かれる。このセグメントにおいては、以下のチャー
ト1に再現するヌクレオチド配列の末端(しかし、グル
コアミラーゼのシグナル配列42の内部にある)に向け
て、BssHII制限部位が得られる。
【0042】
【化1】
【0043】シグナル配列42をもった解読フレーム
に、タンパク質のコード領域を受け入れることのできる
セグメント、すなわちリンカー44を該シグナル配列の
下流に供給するためには、シグナル配列中に存在するB
ssHII部位およびその下流のSstI部位を利用する。
この特別な態様においては、セグメント46をpGL1
から取り出し、図11に示すA、BあるいはCと表示し
た3つのリンカーのうちひとつを選んでそれにより置き
換える。各々のリンカーは、BssHII末端およびSst
I末端とライゲイトすることができる。BssHIIによ
るセグメント46の開裂に際して欠損されたシグナル配
列の末端コドンを修復するためにもリンカーを操作でき
る。さらに、所望のコード領域をベクターpGL2に挿
入できるようにするために、各々のリンカーを、そのヌ
クレオチド配列中のEcoRVおよびBglII/XhoII
部位を唯一に限定する。
【0044】適当なリンカーの選択は、リンカーに挿入
されるタンパク質のコード領域の少なくとも最初の2、
3のコドンについての知見に基づいて行われる。有意に
翻訳されるべきタンパク質のコード領域のためには、タ
ンパク質のコード領域の開始部位は、シグナル配列の開
始点に直接結合しているか、開始点から特定の数のヌク
レオチド(即ち、トリプレット)をもって結合しているべ
きである。従って、もし、挿入されるタンパク質のコー
ド領域が一つあるいは二つの不必要なヌクレオチド(あ
るいは、それらの非トリプレット因子)をその5'領域に
通常の開裂により生じるように有していれば、図11に
示す三つのリンカーのうちのひとつで、余分で不必要な
ヌクレオチドの存在に対処することができ、シグナル配
列をもつ転写解読フレームに、タンパク質のコード領域
の始まりを位置せしめることができる。
【0045】リンカーA、BおよびCによってコードさ
れるアミノ酸残基は、図11に示すようにヌクレオチド
配列の下に示されており、このことから、リンカーの解
読フレームに及ぼす、さらに最終的には、挿入されるタ
ンパク質のコード領域に及ぼす、余分なヌクレオチドの
リンカー配列への付加の影響がわかるであろう。制限部
位が常に解読フレームの修飾部より下流にあるようにリ
ンカーを設計し(つまり、リンカーA、B、あるいはC
におけるそれぞれ一つ、二つあるいは三つのアデニン残
基)そうすることによって、制限部位に挿入されるコー
ド領域の解読フレームを、適当なリンカーを選択するこ
とで維持することができる。
【0046】プラスミドpGL2や、特定のリンカーセ
グメントA、BあるいはCを使用するプラスミドには、
例えば、Bリンカーを用いたpGL2BIFNがあり、
これを用いて糸状菌類たとえばアスペルギルス菌種を形
質転換するとインターフェロンα−2が分泌され、さら
には、Cリンカーを用いたpGL2CENDOがあり、
これを用いてこのような糸状菌類を形質転換すると、エ
ンドグルカナーゼが分泌される。
【0047】プラスミドpGL2は天然に存在するシグ
ナル配列を利用しているが、合成シグナル配列を含むベ
クターを利用することも、本発明の範囲内に属する。こ
のようなベクターの1例は、pALCA1Sで、それは
糸状菌類を形質転換することのできるベクターを形成す
るためにタンパク質のコード領域を挿入できるプラスミ
ドpGL2と同様の中間型ベクターである。しかし、pG
L2と異なり、pALCA1Sは、alcAプロモーターを
利用し、プロモーターと連結した合成シグナル配列を利
用している。pALCA1Sを図15に示し、その組立
て模式図を表わし、さらに実施例を参考に挙げる。pA
LCA1Sから作られるプラスミドには、例えば、形質
転換された糸状菌類にインターフェロンα−2を分泌さ
せるpALCA1SIFN、および糸状菌類宿主にエン
ドグルカナーゼを分泌させるpALCA1SENDOが
ある。両方の場合とも、宿主にとって分泌タンパク質が
外来性であっても分泌できる。
【0048】さらに、以下の実施例によって、本発明を
さらに詳細に説明、例示する。しかし、それは本発明を
限定するものではない。
【0049】以下に挙げる実施例1および2の各々によ
って、天然で存在するが非菌類のコード領域と連結され
た糸状菌類から導かれたプロモーターを有するベクター
を用いて、糸状菌類宿主を首尾よく形質転換できること
を示す。
【0050】
【実施例】実施例1 pDG6 ATCC 53169を使用する
A.ニデュランスの形質転換 まず、図8に示すベクター構築物pDG6を、標準的な
通常のライゲイションおよび制限技術を用いて図8に示
した設計方法に従って製造した。次いで、以下のように
構築物pDG6をアスペルギルス・ニデュランスArgB-
変異体細胞に導入した:2l の円錐形フラスコ中に0.0
2%アルギニンと10-5%ビオチンを含有する完全培地
(Cove 1966)500mlを入れ、A.ニデュランス
ArgB- 菌株の分生胞子105個/mlを植え付け、20時
間250rpmで攪拌しながらインキュベートした。ワッ
トマンNo.54濾紙を通して菌糸を収穫し、無菌脱イオ
ン水で洗浄して、吸引乾燥した。菌糸1g当たり20mg
のノボザイム234(ノボ・エンザイム・インダストリ
ーズ(Novo Enzyme Industries))、0.1ml(=15
000単位)のβ−グルクロニダーゼ(シグマ(Sigma))
および3mgの牛血清アルブミンを添加した、250mlフ
ラスコ中の濾過滅菌した1.2M MgSO4・10mMリ
ン酸カリウム(pH5.8)に菌糸を加えた。光学顕微鏡に
よってスフェロプラストの生成を周期的に確認しなが
ら、ゆっくりと攪拌して、50−70分間、37℃で消
化を行なった。50mlの無菌イオン交換水を加え、30
umのナイロンメッシュに通して濾過することでスフェロ
プラストを未消化のフラグメントから分離し、室温で5
0mlの円錐底管に入れ、振盪ローター(swing out rot
or)で5分間2500gで遠心分離して収穫した。0.6
M KCl 10ml中で再懸濁と遠心分離を行ない、スフ
ェロプラストを2回洗浄した。スフェロプラストの数を
血球計算器を用いて計測し、最終濃度が108個/mlと
なるように、pH7.5の1.2Mソルビトール、10mM
トリス/HCl、10mM CaCl2中に再懸濁した。DN
A pDG6(pH8の、10mMトリス/HCl・1mM E
DTA中、全量40μl)を加えたプラスチック管に、
0.4mlの部分標本を入れ、室温で25分間、インキュ
ベートした。pH7.5の60%PEG4000、10m
Mトリス/HCl、10mM CaCl2の部分標本0.4m
l、0.4ml、そして1.6mlを、添加の都度おだやか
に、しかし完全に混合しながら、各々のチューブに順次
加え、次いで20分間室温でインキュベートした。そし
て、形質転換されたスフェロプラストを、適当に補充し
た最小培地1%寒天上層(overlay)に加え、45℃で0.
6M KClを加えるか減じるかして、直ちに、プレート
内の同一の(冷えてはいるが)培地上に注ぎ入れた。37
℃で3〜5日培養し、増殖しているコロニーの数を計測
した(エフ・ブクストン(F.Buxton)らのジーン(Gen
e)37、207−204(1985))。エルトン(Yelto
n)らの方法[プロナス(Proc.Nat'l Acad.Sci.)
アメリカ(U.S.A)81;1370−1374(198
0)]も使用した。
【0051】コロニーを2つの群に分けた。組み込まれ
たセルラーゼ遺伝子を誘導するために、ひとつの群のイ
ンキュベート培地に、スレオニン(11.9g/リットル)
とフルクトース(1g/リットル)を加えた。他の群に
は、誘導物質を加えないで、炭素源としてグルコースだ
けを使用した最小培地上で発育させることで抑制した。
培養した後に、菌糸を濾過して分離し、凍結乾燥して、
すりつぶし、pH7の20mMトリス/HClでタンパク
質を抽出し、両群ともにバイオラド分析(BioRad As
say)によって全タンパク質生産を検定した。
【0052】セルラーゼの生産を調べるために、セルロ
ース(9g/リットル、カルボキシメチルセルロース)含
有の寒天培地のプレートを作成し、ガラス繊維のフィル
ター物質の小片を用意し、お互いを分離して、形質転換
体のひとつからの全タンパク質75μgを各々フィルタ
ーに加えた。プレートを一晩37℃でインキュベートし
た。そして、フィルターを取り除き、下の寒天培地にお
けるセルロースの破壊で明らかになるように、プレート
をコンゴーレッドで着色して、フィルター上の全タンパ
ク質にどこにセルラーゼが存在しているかを確認した。
プレートを5MNaCl水溶液で洗浄してよごれを取り除
き、肉眼で様相の違いを検定した。
【0053】スレオニンとフルクトースによって誘導さ
れた4つの形質転換体のうち3つが、全タンパク質生産
物中のセルラーゼの存在を明らかに示した。誘導されな
かった、グルコース抑制形質転換体は、セルラーゼ産生
を示さなかった。
【0054】同じベクター系および菌株より3つのコン
トロール(対照)形質転換体を作成したが、この場合はプ
ロモーター配列を除いた。それらはどれも、誘導物質が
あろうとなかろうとセルラーゼを産生しなかった。スレ
オニン誘導された、形質転換菌株由来の媒地が、C.フ
ィミのエンドグルカナーゼに対して惹起したモノクロー
ナル抗体と反応を示す事実によって、C.フィミ・エン
ドグルカナーゼのコード領域の存在を確認した。このモ
ノクローナル抗体は、コントロール菌株の細胞内A.ニ
デュランスタンパク質とは交差反応を示さなかった。
【0055】実施例2 pALCA1AMY ATCC
53380を使用したA.ニデュランスの形質転換 ベクター構築物pALCA1AMYを図27に示すよう
に、標準的な通常のライゲイションおよび制限技術を用
いて調製した。図27を参照しながら具体的に説明する
と、プラスミドp501[S.J.ロスステイン(S.J.R
othstein)ら、ネイチャー(Nature)、308、662−
655(1984)を参照]上に規定されたEcoRI−Ec
oRIフラグメント中に含まれている小麦α−アミラー
ゼ遺伝子72のコード領域を挿入するために、A.ニデ
ュランス・アルコールデヒドロゲナーゼ1のプロモータ
ー22が位置している(上述)HindIII−EcoRIセ
グメントを含有するベクターpALCA1を、そのEco
RI部位で切断した。小麦α−アミラーゼは、自然に分
泌されるタンパク質であるのでそのコード領域72は、
シグナルペプチドのコード領域76と、成熟型の分泌さ
れたα−アミラーゼをコードしているセグメント78を
含有している。p501のEcoRI−EcoRIセグメン
ト中に含有されているコード領域72を、pALCA1
のEcoRI切断部位とライゲイトすることで、AlcA
ロモーター22がα−アミラーゼのコード領域と機能的
に連結しているプラスミドpALCA1AMYが得られ
る。pALCA1AMY中でのp501起源のα−アミラ
ーゼコード領域の正しい方向性は、常法によりライゲイ
ション部位の配列を決定することで確認する。プロモー
ター/コード領域の結合部のヌクレオチド配列を図28
に示す。
【0056】A.ニデュランスを実施例1に記載の方法
で形質転換し、細胞外媒質の試料を取り出して、1%溶
解性でんぷん寒天上に置かれたガラス繊維濾過紙に適用
する。そして、37℃で8時間後、濾過紙を取り出し、
固体ヨードの入ったビーカー(50℃の水浴中)上で裏返
す。きれいなはん点は、でんぷんの減成を表わしてい
て、一方残ったでんぷんは、深い紫色に変わり、これに
より、分泌されたα−アミラーゼの存在を確認する。
【0057】以下に挙げる実施例3−12においては、
完全なベクターによって形質転換された糸状菌類から、
外来性タンパク質を分泌させるために、分泌シグナルペ
プチドのコード領域を導入したベクターを提供する。
【0058】実施例3 中間型ベクター、プラスミドp
GL2の産生 A) プロモーターおよびシグナルペプチド配列の供給
ATCCにカタログ番号22343で寄託されている
A.ニーガー株から得られるDNAから誘導された遺伝
子バンクをプローブして、A.ニーガーのグルコアミラ
ーゼ遺伝子を分離した。このプローブは、バイオサーチ
・オリゴヌクレオチド合成装置とグルコアミラーゼ・タ
ンパク質の公開されているアミノ酸配列の情報を用いて
調製したオリゴヌクレオチド・プローブを用いて行っ
た。アミノ酸配列のデータをヌクレオチド配列データに
“逆翻訳"して、プローブを合成した。プローブされた
特定の遺伝子バンクは、大腸菌内で生存でき、複製し得
る市販のプラスミドpUC12のBamHI部位にクロー
ンされた、上述のA.ニーガーDNAのSav3A部分消
化物であった。
【0059】グルコアミラーゼ遺伝子を含むHindII
I−BglIIのDNA断片を、pUC12にサブクロー
ンした。次いで、所望のプロモーター領域、シグナルペ
プチドのコード領域およびグルコアミラーゼタンパク質
のコード領域の位置を、サブクローンしたフラグメント
を含有するpUC12中に確認した。
【0060】EcoRI/EcoRIフラグメント(図10
参照)の配列を決定し、その配列データをウイスコンシ
ン(Wisconsin)大学の配列分析プログラムを用いて分析
した結果、該フラグメントは長く、オープン翻訳解読フ
レームを含んでいることがわかった。
【0061】HindIII−BglIIフラグメント内の
5'EcoRI部位とBssHII3'部位の間のグルコアミ
ラーゼ遺伝子の領域部分であるヌクレオチド配列の分析
結果を図12に示す。この領域には、グルコアミラーゼ
プロモーターおよびシグナルペプチドのコード領域を含
んでいる。
【0062】このフラグメント内、すなわちヌクレオチ
ド97−102はタータボックス(TATA box)48
であり、これは正確な転写開始のために、多くの真核生
物のプロモーター領域に必要とされる部位(多分RNA
ポリメラーゼII結合部位)である。従って、プロモー
ター領域の少なくとも一部分が存在することが確認され
る。さらに、機能的必須部の全てが約1000塩基の長
さの配列内に含まれているらしく、特にコード領域の開
始コドン、すなわちヌクレオチド206−208、即ち
メチオニンに対応するコドン“ATG"49の上流の最
初の200塩基内にあるらしいことを他の既知のプロモ
ーター領域との類似性から予言できる。このように、プ
ロモーターと転写リーダー配列は、ヌクレオチド205
で終了する。プロモーター領域は、RNAポリメラーゼ
II結合部位およびその機能に必要な他の全ての特徴を
含んでいるにちがいないが、プロモーター領域の始まり
を確認することは、それ程重要なことではない。このよ
うに、EcoRI−EcoRI配列は、グルコアミラーゼ遺
伝子の完全なプロモーター領域を表わしていると考えら
れるがプラスミドpGL2に使用するフラグメントは、
完全なプロモーター領域が、得られたプラスミド中に適
切に含まれることを確実にするために、もっと大きいH
indIII−BamI/BglIIセグメント中にこのフラ
グメントをまぜたものである。
【0063】成熟グルコアミラーゼのアミノ酸配列が既
知であることに基いて(スベンソン(Svensson)らの“ア
スペルギルス・ニーガー由来の2形態のグルコアミラー
ゼの特徴付け"、カールスベルグ・リサーチ・コミユン
(Carlsberg Res.Commun)、47、55−69(19
82)を参照)、シグナルペプチドのヌクレオチド配列を
正確に決定することができる。分泌タンパク質をコード
している遺伝子のシグナルペプチドのコード領域は、A
TGコドン49によってコードされているメチオニン残
基によって開始することで知られている。ヌクレオチド
配列の開始部分以外、すなわちATGコドン3'側を確
認することにより、該部分のアミノ酸配列を決定するこ
とのできる情報が得られる。このアミノ酸配列を発表さ
れているアミノ酸配列と比較することによって、その比
較した、発表されている配列に対応する部分が存在しな
いグルコアミラーゼの部分的遺伝子として、シグナルペ
プチドを同定することができる。本明細書で定義されて
いるグルコアミラーゼのシグナルペプチド・コード領域
は、先にこの方法によって確認された。
【0064】上記の方法により、Sau3A部分消化によ
り生成され、pUC12に組込まれたHindIII−Bam
HI/BglIIフラグメントが、グルコアミラーゼ遺伝
子の以下の特徴を含むことを確認した:開始部、たぶん
無関係な部分、プロモーター領域、シグナルペプチドの
コード領域、およびコード領域の残りの部分。HindI
II−BamHI/BglIIによる開裂およびライゲイシ
ョンで、pUC12プラスミドに挿入されたこのフラグ
メントは、図10にプラスミドpGL1として模式的に
示されている。このプラスミドは、大腸菌中でも依然と
して選択でき、複製できるような、複製などに必要な全
ての特徴を含んでいる。
【0065】B) プラスミドpGL2の組立て 前駆体としてpGL1を使用して、プラスミドベクターp
GL2を図10に示すように形成することができる。本
明細書図11に示した合成リンカー配列A、Bあるいは
Cを挿入するために、シグナル配列42の3'末端近く
の制限部位BssHIIを、唯一の下流のSstI部位とと
もに利用する。このように、pGL1をBssHIIとSs
tIのふたつで開裂し、それによって、そこに含まれて
いるグルコアミラーゼのコード領域46の開始部分を取
り除く。その後、BssHII/SstIに適合した末端を
持つ様に設計した合成リーダー配列AからCまでのうち
のひとつを選んで挿入し、ライゲイトし、プラスミドp
GL2を作成する。3つのリンカー配列、即ちA、Bあ
るいはCのいずれを使用するかにより、得られたプラス
ミドを、以下、それぞれpGL2A、pGL2Bあるいは
pGL2Cと呼ぶ。
【0066】本明細書に示した合成リンカー配列は、図
11に示す様に単一のEcoRVおよびBglII制限部位
を備えており、そこへ所望のタンパク質のコード領域を
挿入する。挿入すれば、得られたプラスミドは、宿主、
たとえばA.ニーガー、A.ニデュランスなどを形質転
換するのに使用できる。宿主に認識されるプロモーター
領域およびシグナルペプチドのコード領域が存在するこ
とによって、タンパク質のコード領域を発現させ、その
発現されたタンパク質を分泌させることができる。
【0067】実施例4 pGL2BIFN作成時のプラ
スミドpGL2の使用 プラスミドpGL2の使用例を以下に図13を参照して
述べる。図13では、pGL2B由来のプラスミドpGL
2BIFNの組立てを図示している。図11に示される
合成リンカー配列“B"を挿入することを除いて、pGL
2に関して一般的に述べた方法に従ってプラスミドpG
L2Bを作成する。従って、図13においては、参照番
号44を“44B"と置き換えた。ベクターpGL2Bに
開裂部を設けるために、プラスミドをリンカー44Bの
内部のEcoRV部位で切断する。開裂によって平滑末端
が生じるが、これは、この目的のために有用であると知
られているリガーゼを使用して、平滑末端を両端に持つ
フラグメントとライゲイトできる。
【0068】図13に記載する態様においては、ヒトイ
ンターフェロンα−2のコード領域を含有するフラグメ
ント60を挿入してpGL2BIFNを作成する。具体
的には、ヒトインターフェロンα−2をコードしている
コード領域を含むDdeI−BamHIフラグメント60
を、既知であるこの遺伝子の配列および制限地図に基づ
いて、プラスミドpN5H8(表示していない)より取り
出した。
【0069】プラスミドpN5H8は、既知のプラスミ
ドpAT153をBamHI部位でインターフェロン遺伝
子と結合させたものである。そのインターフェロン遺伝
子は、スロコンブ(Slocomb)らによるプロナス(Procee
dings of the NationalAcademy of Science
s)、USA、79巻、5455−5459頁(1982)
の“ファージM13mp7におけるクローンされたインタ
ーフェロンα−2遺伝子の高レベルの発現およびモノク
ローナル抗体によるその精製"において開示されてい
る。
【0070】インターフェロン・フラグメントの粘着末
端をpGL2BのEcoRV切断部位にアニールするため
に、逆転写酵素を用いてDdeIおよびBamHI粘着末端
を充填し、常法に従って適当なリガーゼでライゲイトす
る。インターフェロンα−2のコード領域の解読フレー
ムおよび、そのヌクレオチド配列、および適当な場合に
はアミノ酸配列についての再生されたシグナルペプチド
配列との関係を示している図14により、pGL2の挿
入のためにリンカー配列Bを選ぶのが都合よいことは明
らかであろう。
【0071】図14は、49におけるメチオニンコドン
ATGから始まり、50におけるリジンコドンAAGで
終わるグルコアミラーゼのシグナルペプチド配列42部
分に連結した、シグナル配列の5'部にあるプロモータ
ー領域40の部分を表わしている。実際には、シグナル
ペプチドのコード領域は、さらにひとつの残基、つまり
52におけるアルギニンに対応するCGCコドンまで延
びているが、この残基は、リンカー配列を挿入するため
の開裂およびライゲイションの間に欠損したアルギニン
残基を補うように操作された合成リンカー配列44Bに
よって構成されている。この様にすれば、シグナルの遺
伝子配列は、もとのままである。
【0072】同様にリンカー配列は、解読フレームを変
更することなく、インターフェロンα−2のコード領域
の挿入を可能にする。図13および図14は、EcoRV
によるリンカー配列44Bの開裂により、平滑末端を有
するリンカー・フラグメント44B'および44B"が得
られることを示している。インターフェロンα−2コー
ド領域をDdeI部位で切り取り、その酵素によって形成
した粘着末端を充填すると、コード領域の配列をきずつ
けずに所望のヌクレオチド配列がつくられる。DdeI部
位を充填したインターフェロン配列をEcoRVで開裂し
たリンカー配列内にライゲイションしたものは、リンカ
ーの44B'部とインターフェロンのコード領域60の
間のトリプレット・コドン状態で明らかのように、イン
ターフェロンコード領域の本来の解読フレームを維持し
ている。万一、リンカーBよりもヌクレオチドがひとつ
少ない図11に示すリンカーAを選ぶと、ひとつのヌク
レオチドによって全解読フレームがシフトし、ナンセン
ス配列となってしまうだろう。合成リンカーBを選ぶこ
とによって、平滑末端にしたIFα−2フラグメントを
正しく方向づける時に、コード領域の解読フレームを変
えないシグナルペプチド配列とインターフェロンのコー
ド領域の間のコドンを使用することができる。正しい方
向性は、ライゲイション結合部にまたがる挿入体をもっ
たクローンの塩基配列を決めることによって選択する。
【0073】実施例5 pGL2BIFN ATCC
53371で形質転換されたA.ニデュランスからの発
現および分泌 プラスミドpGL2BIFNを同時形質転換した。すな
わち、米国特許出願通し番号678,578(1984年
12月5日出願)により詳しく記載されているArgB +
伝子を含有するプラスミドでA.ニデュランスのArgB
-菌株を、argB選択マーカーを含有する別のプラスミド
といっしょに同時形質転換した。ArgB +形質転換体を
選択すると、その20個のうち18個が1−100のコ
ピー数のヒトインターフェロンα−2のコード領域を含
有していた。
【0074】いくつかの形質転換体をでんぷん培地上で
培養し、グルコアミラーゼ・プロモーターを誘導して、
セルテック(CellTech)IFα−2分析キットを用い
て、細胞外媒質を定量してヒトIFα−2を分析した。
全ての形質転換体が、あるレベルの合成と、定量可能な
タンパク質の分泌を示した。2つのコントロール(対
照)、つまり宿主菌株(形質転換されていないもの)およ
び検出可能なヒトIFα−2DNAを持たないひとつの
argB+形質転換体については、IFα−2タンパク質の
合成を検出できなかった。別の実験では、必要な変更を
加えた上記と同様の方法で、pGL2BIFNを用い
て、A.ニデュランスの代りにA.ニーガーを形質転換
すると、IFα−2分泌能力を有するA.ニーガーが観
察された。
【0075】プロモーターとpGL2BIFNのシグナ
ル領域は、A.ニーガー由来であるけれど、それらは
A.ニデュランスおよびA.ニーガーの両方において機
能し得ることがわかる。本発明においては、グルコアミ
ラーゼのプロモーター領域以外のプロモーター領域も使
用できる。図1〜図7に示したアルコールデヒドロゲナ
ーゼI遺伝子およびアルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子
のプロモーター領域を使用するのが適当である。
【0076】実施例6 プラスミドpALCAIS、A
TCC53368中間型ベクターの組立て 本実施例では、受託番号53169の下、宿主、E.C
oli(大腸菌)JM83に入れてATCCに保管されてい
る10.3kbプラスミドpDG6中に含まれているalcA
プロモーターを使用した。pDG6のプラスミド地図を
図8に示す。尚、alcAプロモーターを使用するもうひ
とつの態様の例示を容易にするために、ここで参照する
図15にもこのプラスミドを示す。
【0077】pDG6は、そのHindIII−EcoRI
(最初のもの)セグメント中に、alcA遺伝子のプロモー
ター領域22および開始コドンの3'側にあるalcAコー
ド領域の5'部分も一部含んでいる(エンドグルカナーゼ
のコード領域30と結合している)。さらにpDG6は、
C.フィミのエンドグルカナーゼのコード領域20の下
流に多数のクローン部位62を含んでいる。
【0078】alcAプロモーター領域22を得るため、p
DG6をPstIおよびXhoIで切断し、エンドグルカナ
ーゼのコード領域の大部分を除去した。第2の工程で
は、この直線化したプラスミド64を、エキソヌクレア
ーゼIII(これはXhoI−切断DNA末端から切除し
て行くが、PstI末端からは切除しない)を用いる制御
された方法で1方向から切除し、次いでS1ヌクレアー
ゼで仕上げた。酵素がalcAATGコドンの5'側50塩
基の位置までヌクレオチドを除去し、TATAボックス
を残し、メッセンジャーRNAの開始部位を無傷のまま
残す様に切断を調節した。
【0079】切除した後、ベクター66を再ライゲート
(再環状化)し、プロモーター領域22のすぐ下流に,S
alI−XbaI制限部位を有するベクター68を創製し
た。SalI/XbaIによるベクター68の切断により、
ベクター内の適切な位置にシグナルペプチドのコード領
域を導入することが可能になる。
【0080】本実施例で用いる特定のシグナルペプチド
のコード領域を合成してヘイジン[G.Von Heijne,
Eur.J.Biochem.,17−21(1983)]が開示し
ている常法に従って同定される特徴あるシグナルペプチ
ドのコード領域を作成した。SalI切断部位に相補的な
5'側配列、およびXbaI制限配列とライゲーションし
うる3'側配列を供するようにこの合成シグナルを設計
した。
【0081】この合成分泌シグナル68の配列は以下の
式で示される。
【化2】
【0082】この分泌シグナル自身はMetで始まり、矢
印で示した4回目のAlaで終わる。シグナルとして作用
するこの合成配列68が得られたなら、これをベクター
70のSalI−XbaI部位にクローニングし、alcA
ロモーター領域22および合成ペプチドシグナルのコー
ド領域68を含有するプラスミドpALCA1Sを得
る。このシグナルペプチドのコード領域が多重クローニ
ング部位62の上流に挿入されているということは、こ
の部位62が、種々のタンパク質のコード化セグメント
をこのプラスミド内にクローニングすることを可能にし
ている部位であるという点で重要である。従って、pA
LCA1Sは本発明の重要な具体例である。
【0083】実施例7 プラスミドpALCA1SIF
Nの構築 pALCA1Sの有用性の例として、pALCA1SIF
Nの創製を示す図16について言及する。このプラスミ
ドは、alcA遺伝子のプロモーター領域22および合成
シグナルペプチドのコード領域68[この両者はpALC
A1S(図15)由来である]を含有する。さらに、この
プラスミドはpGL2BIFN由来のヒトインターフェ
ロンα−2をコードしているコード領域60を含有して
いる。
【0084】タンパク質のコード化セグメントを得るた
めに、pGL2BIFNをEcoRIで切断し、そしてBg
lIIで部分的に切断する(内部にBglII部位が存在す
るので)。このタンパク質のコード領域の挿入は、pAL
CA1SをBamHIおよびEcoRIで切断し(この両者
は、多重クローニング部位62中に存在する)、そこへ
該コード領域をライゲートすることによって行なわれ、
こうしてpALCA1SIFNが創製される。
【0085】得られたプラスミドのヌクレオチド配列、
すなわちHindIIIの1170ヌクレオチド下流の部
位からEcoRIまでを、制限エンドヌクレアーゼ消化の
関連部位を表示する図17〜図21に示す。図19か
ら、このIFα−2コード領域60が合成シグナルペプ
チドのコード領域68の適切な解読フレーム内に存在す
ることがわかるであろう。
【0086】実施例8 プラスミドALCA1SIFN
で形質転換したA.ニデュランスからの発現および分泌 上記のようにして調製したプラスミドpALCA1SI
FNをA.ニデュランスといっしょにして同時形質転換
してargB選択マーカーを付与し、このargB+形質転換
体を選別し、ヒトインターフェロンα−2のコード領域
の存在についてチェックし、次いでスレオニン含有培地
で増殖させてalcAプロモーターを誘起した(すべて前記
実施例3の記載と同様にして)。セル・テク(Cell Te
ch)IFα−2検定キットを用いて、この細胞外培地を
ヒトIF−2について検定した。形質転換体20個のう
ち11個が、スレオニンの存在下で誘起され、そしてグ
ルコースの存在下で抑制されるインターフェロンの分泌
を示した。
【0087】実施例9 pGL2CENDO ATCC
53372 リンカー配列“B"のかわりに合成リンカー配列“C"
(図11)を用い、図13で示されるpGL2BIFNに
類似しているが、インターフェロン2コード領域のかわ
りにエンドグルカナーゼコード領域を含有する、pGL
2CENDOと命名したベクタープラスミドを、プラス
ミドpGL2C ATCC 53367から、前記実施
例に記載の方法に従って構築した。C.フミイ(fim
i)エンドグルカナーゼコード領域30を含有するBamH
IフラグメントをpGL2CのBglII部位に挿入し
た。A.ニデュランス形質転換体はこのベクタープラス
ミドから調製され、この形質転換体はデンプン調節性の
セルラーゼ分泌を示した(実施例1の記載のようにして
検定して)。ベクタープラスミドpGL2CENDOの地
図を添付の図22に示すが、ここで30はエンドグルカ
ナーゼコード領域(図8および実施例1に関連して記載
した、セルロモナス・フィミのエンドグルカナーゼコー
ド領域)を、42はグルコアミラーゼ遺伝子のシグナル
ペプチドのコード領域を、そして40はグルコアミラー
ゼ遺伝子のプロモーター領域を示す。このヌクレオチド
配列を図23に示すが、これは、リンカー配列C(図1
1)の使用によってシグナルペプチドコード化領域42
およびエンドグルカナーゼコード化領域30の解読フレ
ームが保持されていることを例証している。
【0088】実施例10 プラスミドpALCA1SE
NDO ATCC53370の構築 前記実施例に記載の方法に従い、実施例5(図15)に
記載したようにしてEcoRIで直線化したプラスミドp
ALCA1Sを、プラスミドpDG5B(pUC12が逆
向きであるHindIIIフラグメントの配向を有するpD
G5;図8参照)由来であり、かつエンドグルカナーゼコ
ード化領域30を含有するEcoRIフラグメントと結合
させることによって、pALCA1SENDOと命名し
たベクタープラスミドを構築した。pALCA1SEN
DOの地図を図24に示し、その関連領域のヌクレオチ
ド配列を図25及び図26に示す。これらの図におい
て、alcA由来のプロモーター領域は数字22で、合成
シグナルペプチドコード化領域は68で、そしてエンド
グルカナーゼコード化領域は30で表示する。
【0089】実施例11 pALCA1SENDOおよ
びpGL2CENDOで形質転換したA.ニデュランス
からの発現および分泌 前記のようにして調製したプラスミドpALCA1SE
NDOまたはpGL2CENDOおよびargB+選別可能
マーカーで、A.ニデュランスを同時形質転換した。得
られた同時形質転換体のうち数個が、実施例1に記載し
たものと同じモノクローナル抗体試験系およびカルボキ
シメチルセルロースプレートで検定したとき、レベルの
異なるセルラーゼ(すなわちエンドグルカナーゼ)の分泌
を示した。両プラスミドの形質転換体は、結合させたプ
ロモーターによって制御される分泌を示した。プラスミ
ドpGL2CENDOはデンプンで誘起し、pALCA1
SENDOはスレオニンで誘起した。
【0090】実施例12 pGL2CENDOで形質転
換したA.ニーガーからの発現および分泌 A.ニーガーをargB+選択マーカーおよびプラスミドp
GL2CENDOで同時形質転換した。形質転換体のい
くつかがレベルの異なるエンドグルカナーゼの分泌を示
した(実施例1に記載のように検定して)。この分泌は培
地中にデンプンを存在させることによって誘起した。
【0091】実施例13 増加させたコピー数の調節遺
伝子 アスペルギルス・ニデュランスにおいて適切な誘導物質
(たとえばエタノール)の存在下、alcR(alcAのための
陽性調節遺伝子)の遺伝子産物の作用によって、alcA
ロモーターを作動させる。多重コピー形質転換体(多数
alcAプロモーターを含有する)を有する証拠は、alc
遺伝子産物が、数個のalcAプロモーター(刺激を必要
とする)のプロモーター機能を制限していることを示唆
する。alcR遺伝子のコピー数の増加はalcRの発現を増
加させ、このような状況を改善する。この証拠は以下の
ようである。
【0092】多重のalcRという状況下(alcRメッセン
ジャーRNAを過剰生産することがわかっている)で
は、それ自身のコード領域(ADH I)と融合した多重
コピーalcAプロモーターを有する形質転換体は、エタ
ノール上では十分に増殖しない。これは、おそらくエタ
ノールのADH分解の産物であるアルデヒドの急速な蓄
積によるものであろう。これらの菌株中のADH活性は
高い。コピー数の増加によりADH活性が増加したとい
うのが、おそらくこれらの観察結果の説明となろう。
【0093】多重alcRという状況下では、インターフ
ェロンα−2と融合した多重コピーalcAプロモーター
を有する形質転換体は、かなり高レベルの分泌インター
フェロンを産生する。これらの菌株においては、単一コ
ピーalcRを有する菌株と異なり、より多数のalcAプロ
モーターがalcR調節タンパク質を利用することができ
る。
【0094】すなわち、本発明の好ましい態様は、形質
転換されたときには所望のタンパク質を分泌するであろ
う糸状菌類宿主に、コード領域を導入するための手段を
提供するものである。この目的のための特に有用な中間
型プラスミドはpALCA1SおよびpGL2(A、Bま
たはC)である。
【0095】これらのプラスミドから創製された有用な
形質転換ベクターには、pALCA1SIFN、pGL2
BIFN、pALCA1SENDOおよびpGL2CEN
DOが含まれる。これらのプラスミドおよび本明細書に
挙げたその他のプラスミドそれぞれの培養物は、現在永
久生存しうる状態でアレリックス社(Allelix Inc.,
6850 Goreway Drive,Mississauga,Ontario,
Canada)の研究室に保管されている。これらのプラスミ
ドは、本特許出願が継続している間じゅうこの状態で保
管し、許可を与えられた者が利用できるようにする。本
出願について特許が付与された後は、ブダペスト条約に
基づいて認められたATCC寄託機関から制限されるこ
となく利用することができるようにする。寄託物および
それぞれの受託番号を以下の表に挙げる。
【0096】
【表1】 プラスミド 宿 主 受託番号 寄 託 日 pDG6 E.コリJM83 53169 1985年6月7日 pGL2A 〃 53365 1985年12月16日 pGL2B 〃 53366 〃 pGL2C 〃 53367 〃 pALCA1S 〃 53368 〃 pALCA1SENDO 〃 53370 〃 pALCA1SIFN 〃 53369 〃 pGL2BIFN 〃 53371 〃 pGL2CENDO 〃 53372 〃 pALCA1AMY 〃 53380 1985年12月20日
【図面の簡単な説明】
【図1】 アスペルギルス・ニデュランスのアルコール
デヒドロゲナーゼI(alcA)遺伝子におけるコード領域
およびプロモーター領域を構成しているDNA塩基配列
の前段の模式図である。かかるDNA塩基配列の模式図
は図1〜図3まで連続的である。
【図2】 アスペルギルス・ニデュランスのアルコール
デヒドロゲナーゼI(alcA)遺伝子におけるコード領域
およびプロモーター領域を構成しているDNA塩基配列
の中段の模式図である。
【図3】 アスペルギルス・ニデュランスのアルコール
デヒドロゲナーゼI(alcA)遺伝子におけるコード領域
およびプロモーター領域を構成しているDNA塩基配列
の後段の模式図である。
【図4】 A.ニデュランスのアルデヒドデヒドロゲナ
ーゼ(aldA)遺伝子におけるコード領域およびプロモー
ター領域を構成しているDNA塩基配列の一部の模式図
である。かかるDNA塩基配列の模式図は図4〜図7ま
で連続的である。
【図5】 A.ニデュランスのアルデヒドデヒドロゲナ
ーゼ(aldA)遺伝子におけるコード領域およびプロモー
ター領域を構成しているDNA塩基配列の一部の模式図
である。
【図6】 A.ニデュランスのアルデヒドデヒドロゲナ
ーゼ(aldA)遺伝子におけるコード領域およびプロモー
ター領域を構成しているDNA塩基配列の一部の模式図
である。
【図7】 A.ニデュランスのアルデヒドデヒドロゲナ
ーゼ(aldA)遺伝子におけるコード領域およびプロモー
ター領域を構成しているDNA塩基配列の一部の模式図
である。
【図8】 糸状菌類細胞を形質転換するのに有効なプラ
スミドpDG6を組立てる方法の概略的模式図である。
【図9】 図8のプラスミドpDG6の一部分の線状表
示図である。
【図10】 pGL1およびpGL2のプラスミド地図の
概略的模式図である。
【図11】 プラスミドpGL2への挿入のための合成
リンカー配列の選択性の模式図である。
【図12】 pGL2のフラグメントのヌクレオチド配
列の模式図である。
【図13】 pGL2BおよびpGL2BIFNのプラス
ミド地図の模式図である。
【図14】 pGL2BIFNのフラグメントのヌクレ
オチド配列の模式図である。
【図15】 プラスミドpALCA1Sおよびその作成
方法の模式図である。
【図16】 pALCA1SIFNのプラスミド地図お
よびその作成方法の模式図である。
【図17】 pALCA1SIFNのフラグメントのヌ
クレオチド配列の一部の模式図である。かかる配列の模
式図は図17〜図21まで連続的である。
【図18】 pALCA1SIFNのフラグメントのヌ
クレオチド配列の一部の模式図である。
【図19】 pALCA1SIFNのフラグメントのヌ
クレオチド配列の一部の模式図である。
【図20】 pALCA1SIFNのフラグメントのヌ
クレオチド配列の一部の模式図である。
【図21】 pALCA1SIFNのフラグメントのヌ
クレオチド配列の一部の模式図である。
【図22】 pGL2CENDOのプラスミド地図の模
式図である。
【図23】 pGL2CENDOのフラグメントのヌク
レオチド配列の模式図である。
【図24】 pALCA1SENDOのプラスミド地図
である。
【図25】 pALCA1SENDOのフラグメントの
ヌクレオチド配列の一部の模式図である。かかる配列の
模式図は図25〜図26まで連続的である。
【図26】 pALCA1SENDOのフラグメントの
ヌクレオチド配列の模式図である。
【図27】 プラスミドpALCA1AMYおよびその
作成方法の模式図である。
【図28】 図27に示すpALCA1AMYのセグメ
ントのヌクレオチド配列の模式図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI (C12P 21/02 C12R 1:66) (72)発明者 フランシス・ポール・バクストン カナダ国オンタリオ、トロント、インデ ィアン・ロード727番 (72)発明者 マーク・ハドソン・ピケット カナダ国オンタリオ、ブランプトン、ア プト1105、ナイツブリッジ・ロード3番 (72)発明者 ロジャー・ウェイン・デイビス カナダ国オンタリオ、ライムハウス、ア ール・アール ナンバー1番 (72)発明者 クロディオ・スカゾキオ フランス国ビュール・シュール・イベッ ト91440、リュ・ドゥ・ロワヨーム14、 パルク・ドゥ・ビュール6番 (56)参考文献 特表 昭59−501694(JP,A) EMBO.J,1984[3]p.1581− 1586 GENE,1985[33]p.137−149

Claims (1)

  1. (57)【特許請求の範囲】 1.アスペルギルス遺伝子由来の、アスペルギルスの構
    造遺伝子の上流に位置する少なくとも約800ヌクレオ
    チドからなる誘導性プロモーター及び、そのプロモータ
    ーにとって外来性であるポリペプチドをコードする、そ
    のプロモーターと作動可能に連結されたDNAフラグメ
    ントを含有するDNA構築物、を含有する形質転換され
    たアスペルギルス株の細胞中でタンパク質を発現させる
    方法。 2.形質転換されたアスペルギルス株の細胞が該DNA
    構築物の多重コピーを含有している、請求項1に記載の
    方法。 3.形質転換されたアスペルギルス株が形質転換された
    アスペルギルス・ニデュランス株である請求項1又は請
    求項2に記載の方法。 4.形質転換されたアスペルギルス株が形質転換された
    アスペルギルス・ニーガー株である請求項1又は請求項
    2に記載の方法。 5.該プロモーターがアスペルギルス・ニデュランスの
    遺伝子由来のものである、請求項1から請求項4までの
    いずれかに記載の方法。 6.該プロモーターがアスペルギルス・ニデュランスの
    アルコールデヒドロゲナーゼ又はアルデヒドデヒドロゲ
    ナーゼ遺伝子由来のものである、請求項5に記載の方
    法。 7.該プロモーターがアスペルギルス・ニーガーの遺伝
    子由来のものである、請求項1から請求項4までのいず
    れかに記載の方法。 8.該プロモーターがアスペルギルス・ニーガーのグル
    コアミラーゼ遺伝子由来のものである、請求項1から請
    求項4までのいずれかに記載の方法。 9.該ポリペプチドがアスペルギルスにとって外来性で
    ある、請求項1から請求項8までのいずれかに記載の方
    法。 10.シグナルペプチドをコードするDNAフラグメン
    トが該プロモーターとポリペプチドをコードする該DN
    Aフラグメントとの間に存在しており、そのシグナルペ
    プチド及びポリペプチドをコードする両DNAフラグメ
    ントが作動可能に連結され、それによりアスペルギルス
    にて発現させた場合にそのポリペプチドが分泌されるこ
    とを特徴とする、請求項1から請求項9までのいずれか
    に記載の方法。 11.該シグナルペプチドが該ポリペプチドに本来のも
    のである請求項10に記載の方法。 12.該シグナルペプチドが該プロモーターに本来のも
    のである請求項10に記載の方法。 13.該シグナルペプチドが該プロモーター及び該ポリ
    ペプチドにとって外来性である請求項10に記載の方
    法。
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