JP2018538339A - 抗癌治療における組み合わせ使用のためのメソテリンキメラ抗原受容体(car)およびpd−l1阻害剤に対する抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2015年12月22日に出願の米国仮出願62/270780に基づく優先権を主張し、その内容は、全体として引用により本明細書に包含させる。
本出願はASCII形式で電子的に提供しており、引用によりその全体を本明細書に包含させる配列表を含む。該ASCIIコピーは、2016年12月20日に作成し、N2067-7099WO_SL.txtなる名称であり、520,028バイトサイズである。
本発明は、一般に疾患処置のために、PD−L1阻害剤と組み合わせた、メソテリンを標的とするキメラ抗原受容体(CAR)を発現するように改変した細胞、例えば、免疫エフェクター細胞の使用に関する。
メソテリンは、元々Pastanおよび同僚により、正常組織による発現が限定的であり、腫瘍で過発現されるため、腫瘍関連抗原として同定された。Chang K, et al., Cancer Res. 1992;52(1):181-186およびChang K, et al. ProcNatlAcadSciUSA. 1996;93(1):136-140。メソテリン遺伝子は前駆体71kDaタンパク質をコードし、これは処理されて40kDaタンパク質、メソテリンを産生し、グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合および巨核球増強因子(MPF)と称されるアミノ末端31kDa脱落フラグメントにより、細胞膜に固定される。両フラグメントはN−グリコシル化部位を含む。“可溶性メソテリン/MPF関連”と称される40kDaカルボキシル末端フラグメントの可溶性スプライスバリアントが、膵管腺癌(PDA)を有する患者の血清で見つかっている。Johnston, F, et al. Clinical Cancer Research. 2009;15(21):6511。メソテリンは、現在治療標的ならびに疾患活性および治療応答のバイオマーカーの両方として探索されている。Argani P, et al. Clin Cancer Res. 2001;7(12):3862-3868。
本発明は、少なくとも一部、メソテリンに特異的に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞、例えば、免疫エフェクター細胞(ここでは“メソテリンCAR発現細胞”とも称する)およびプログラム死リガンド1阻害剤(ここでは“PD−L1阻害剤”とも称する)を含む、組み合わせ治療の使用により、対象におけるメソテリンの発現と関連する疾患、例えば、癌を処置するための方法および組成物に関する。ある実施態様において、メソテリンに特異的に結合するCARは、例えば、ここに記載する、抗原結合ドメイン、例えば、メソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含む。ある実施態様において、PD−L1阻害剤は、抗体分子、ポリペプチド、小分子またはポリヌクレオチド、例えば、阻害性核酸である。ある実施態様において、PD−L1阻害剤は、抗体分子、例えば、ここに記載する抗体分子である。理論に拘束されることを意図しないが、メソテリン発現と関連する疾患、例えば、ここに記載する癌を有する対象のメソテリンCAR発現細胞とPD−L1阻害剤を含む組み合わせ治療での処置は、例えば、メソテリンCAR発現細胞またはPD−L1阻害剤単独での該疾患を有する対象の処置と比較して、腫瘍進行の阻害または低減を改善すると考えられる。
ここに提供されるのは、ここに記載する方法または組成物の何れかに使用するためのPD−L1阻害剤である。ここに記載する方法または組成物の何れにおいても、PD−L1阻害剤は、抗体分子、小分子、ポリペプチド、例えば、融合タンパク質または阻害性核酸、例えば、siRNAまたはshRNAを含む。
PD−L1発現、例えば、PD−L1の転写または翻訳の阻害または低減;PD−L1活性の阻害または低減、例えば、PD−L1のその受容体、例えば、PD−1またはCD80(B7−1)または両方への結合の阻害または低減;またはPD−L1またはその受容体、例えば、PD−1への結合。
i)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号308のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
ii)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号312のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
iii)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
iv)配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号320のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
v)配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
vi)配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
vii)配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号360のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
viii)配列番号332のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
ix)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
x)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号308のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xi)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xii)配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号344のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xiii)配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xiv)配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xv)配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xvi)配列番号356のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
xvii)配列番号78のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号368のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む。
i)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号310のアミノ酸配列を含む軽鎖;
ii)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号214のアミノ酸配列を含む軽鎖;
iii)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
iv)配列番号318のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号322のアミノ酸配列を含む軽鎖;
v)配列番号318のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
vi)配列番号326のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
vii)配列番号326のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号362のアミノ酸配列を含む軽鎖;
viii)配列番号334のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
ix)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
x)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号310のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xi)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xii)配列番号342のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号346のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xiii)配列番号342のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xiv)配列番号350のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xv)配列番号350のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xvi)配列番号358のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xvii)配列番号366のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号370のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xviii)配列番号393のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号322のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xix)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
xx)配列番号382のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む。
ここに提供されるのは、ここに記載する方法または組成物の何れかにおいて使用するための、メソテリンを標的とする、例えば、特異的に結合する、キメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞、例えば、免疫エフェクター細胞である。メソテリンに特異的に結合するCARはここでは“メソテリンCAR”または“mesoCAR”とも称する。ここに記載するメソテリンCAR発現細胞により発現されるメソテリンCARは、メソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含む。ある実施態様において、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激ドメインおよび/または一次シグナル伝達ドメインを含む。
定義
特に断らない限り、ここで使用する全ての技術的および科学的用語は、本発明が属する分野における当業者により共通して理解されるのと同じ意味を有する。
例えば、記憶T細胞、例えば、記憶T細胞前駆体の次のマーカーの1以上の発現増加:CD62L高、CD127高、CD27+およびBCL2;
例えば、記憶T細胞、例えば、記憶T細胞前駆体の、KLRG1発現減少;および
記憶T細胞前駆体、例えば、次の特徴の何れかの1または組み合わせを有する細胞の数の増加:CD62L高増加、CD127高増加、CD27+増加、KLRG1減少およびBCL2増加;
ここで、上記変化の何れも、例えば、非処置対象と比較して、例えば、少なくとも一過性に、起こる。
ここに提供されるのは、メソテリンを標的とするキメラ抗原受容体、例えば、メソテリンCARを含む細胞を、PD−L1阻害剤と組み合わせて投与することによる、癌などの疾患を処置するための、組成物および方法である。メソテリンCARおよびメソテリンCAR発現細胞を産生するための成分の例は、ここに開示される。PD−L1阻害剤の例もここに記載される。
本発明は、メソテリンを標的とし、例えば、特異的に結合する、CAR分子(メソテリンCAR)を含む免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)を包含する。ある実施態様において、免疫エフェクター細胞は、メソテリンCARを発現するように改変される。ある実施態様において、免疫エフェクター細胞は、メソテリンCARをコードする核酸配列を含む組み換え核酸構築物を含む。
ある態様において、本発明のCARは、抗原結合ドメインとも称する標的特異的結合要素を含む。ある実施態様において、CARの抗原結合ドメインを含む部分は、メソテリンを標的とし、例えば、特異的に結合する、抗原結合ドメインを含む。ある実施態様において、抗原結合ドメインは、ヒトメソテリンを標的とし、例えば、特異的に結合する。
ここに開示するメソテリンCAR構築物の例は、この表2または3に開示するscFv(例えば、ヒトcFv)を含み、所望により任意のリーダー配列(例えば、リーダーアミノ酸およびヌクレオチド配列の例についてそれぞれ配列番号1および配列番号12)が前にある。scFvフラグメントの配列(配列番号39〜62のアミノ酸配列)は、ここに表2に提供する。メソテリンCAR構築物は、さらに任意のヒンジドメイン、例えば、CD8ヒンジドメイン(例えば、配列番号2のアミノ酸配列を含むまたは配列番号13の核酸配列によりコード);膜貫通ドメイン、例えば、CD8膜貫通ドメイン(例えば、配列番号6のアミノ酸配列を含むまたは配列番号17のヌクレオチド配列によりコード);細胞内ドメイン、例えば、4−1BB細胞内ドメイン(例えば、配列番号7のアミノ酸配列を含むまたは配列番号18のヌクレオチド配列;および機能的シグナル伝達ドメイン、例えば、CD3ゼータドメイン(例えば、配列番号9または10のアミノ酸配列を含むまたは配列番号20または21のヌクレオチド配列によりコード)を含む。ある実施態様において、これらドメインは連続するかまたは同一リーディングフレームにあり、単一融合タンパク質を形成する。他の実施態様において、これらドメインは、例えば、ここに記載するRCAR分子におけるように、別のポリペプチドにある。
ある実施態様において、多特異的抗体分子は、二特異的抗体分子である。二特異的抗体は、2を超える抗原に特異性を有しない。二特異的抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する第一免疫グロブリン可変ドメイン配列および第二エピトープに結合特異性を有する第二免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。ある実施態様において、第一および第二エピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)にある。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複する。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複しない。ある実施態様において、第一および第二エピトープは異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)にある。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列ならびに第二エピトープに結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する半抗体および第二エピトープに結合特異性を有する半抗体を含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントおよび第二エピトープに結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントを含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントおよび第二エピトープに結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントを含む。
ある態様において、本発明のメソテリン抗体および抗体フラグメント(例えば、表2または3に記載のもの)は、T細胞受容体(“TCR”)鎖の1以上の定常ドメイン、例えば、TCRアルファまたはTCRベータ鎖に移植し、メソテリンに特異的に結合するキメラTCRを作ることができる。理論に拘束されないが、キメラTCRは抗原結合によりTCR複合体を介してシグナル伝達すると考えられる。例えば、ここに開示するメソテリンscFvは、TCR鎖、例えば、TCRアルファ鎖および/またはTCRベータ鎖の定常ドメイン、例えば、細胞外定常ドメインの少なくとも一部、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインに移植され得る。他の例として、メソテリン抗体フラグメント、例えば、ここに記載するVLドメインを、TCRアルファ鎖の定常ドメインに移植でき、メソテリン抗体フラグメント、例えば、ここに記載するVHドメインを、TCRベータ鎖の定常ドメインに移植できる(またはあるいは、VLドメインを、TCRベータ鎖の定常ドメインに移植してよく、VHドメインをTCRアルファ鎖に移植してよい)。他の例として、メソテリン抗体または抗体フラグメントのCDR、例えば、表4または5に記載のメソテリン抗体または抗体フラグメントのCDRをTCRアルファおよび/またはベータ鎖に移植し、メソテリンに特異的に結合するキメラTCRを作り得る。例えば、ここに開示するLCDRをTCRアルファ鎖の可変ドメインに移植してよく、ここに開示するHCDRをTCRベータ鎖の可変ドメインに移植してよく、またはその逆が可能である。このようなキメラTCRは,当分野で知られる方法により産生され得る(例えば、Willemsen RA et al, Gene Therapy 2000; 7: 1369-1377; Zhang T et al, Cancer Gene Ther 2004; 11: 487-496; Aggen et al, Gene Ther. 2012 Apr;19(4):365-74)。
膜貫通ドメインに関して、種々の実施態様において、CARは、CARの細胞外ドメインに結合する膜貫通ドメインを含むように設計され得る。膜貫通ドメインは、膜貫通領域に隣接した1以上のさらなるアミノ酸、例えば、該膜貫通タンパク質が由来したタンパク質の細胞外領域と関連する1以上のアミノ酸(例えば、細胞外領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10から最大15アミノ酸)および/または該膜貫通タンパク質が由来したタンパク質の細胞内領域と関連する1以上のさらなるアミノ酸(例えば、細胞内領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10から最大15アミノ酸)を含み得る。ある態様において、膜貫通ドメインは、使用したCARの他のドメインの1つと関連するものであり、例えば、ある実施態様において、膜貫通ドメインは、シグナル伝達ドメイン、共刺激ドメインまたはヒンジドメインが由来するのと同じタンパク質由来であり得る。他の態様において、膜貫通ドメインは、CARの他のドメインの何れかが由来するものと同じタンパク質に由来しない。ある場合、膜貫通ドメインは、このようなドメインの同一または異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインとの結合を避ける、例えば、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小化するために、選択するかまたはアミノ酸置換により修飾され得る。ある態様において、膜貫通ドメインは、CAR発現細胞の細胞表面の他のCARとホモ二量体化できる。異なる態様において、膜貫通ドメインのアミノ酸配列は、同じCAR発現細胞に存在する天然結合パートナーの結合ドメインとの相互作用を最小化するために、修飾または置換され得る。
CARの細胞質ドメインまたは領域は、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。細胞内シグナル伝達ドメインは、一般にCARが導入されている免疫細胞の正常エフェクター機能の少なくとも1つの活性化を担う。用語“エフェクター機能”は、細胞の特殊化機能をいう。T細胞のエフェクター機能は、例えば、サイトカイン分泌を含む、細胞溶解活性またはヘルパー活性であり得る。それ故に、用語“細胞内シグナル伝達ドメイン”はエフェクター機能シグナルを導入し、細胞に特殊化機能の実施を指示する、タンパク質の部分をいう。通常細胞内シグナル伝達ドメイン全体を用いてよいが、多くの場合、鎖全体を用いる必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインの切断部分を使用する限り、このような切断部分は、それがエフェクター機能シグナルを伝達する限り、インタクト鎖の代わりに使用され得る。用語細胞内シグナル伝達ドメインは、それ故に、エフェクター機能シグナルの伝達に十分な細胞内シグナル伝達ドメインのあらゆる切断部分を含むことを意味する。
ある実施態様において、ここに記載するCAR分子はナチュラルキラー細胞受容体(NKR)の1以上の成分を含み、それによりNKR−CARを形成する。NKR成分は、次のナチュラルキラー細胞受容体の何れかからの膜貫通ドメイン、ヒンジドメインまたは細胞質ドメインであり得る:キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、例えば、KIR2DL1、KIR2DL2/L3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、DIR2DS5、KIR3DL1/S1、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR2DP1およびKIR3DP1;天然細胞毒性受容体(NCR)、例えば、NKp30、NKp44、NKp46;免疫細胞受容体のシグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAM)ファミリー、例えば、CD48、CD229、2B4、CD84、NTB−A、CRACC、BLAMEおよびCD2F−10;Fc受容体(FcR)、例えば、CD16およびCD64;およびLy49受容体、例えば、LY49A、LY49C。ここに記載するNKR−CAR分子は、アダプター分子または細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、DAP12と相互作用し得る。NKR成分を含むCAR分子の配置および配列の例は、内容を引用により本明細書に包含させる、国際公開WO2014/145252号に記載される。
ある実施態様において、ここに記載するCAR発現細胞は、スプリットCARを使用する。スプリットCARアプローチは、引用により本明細書に包含させる公報WO2014/055442号およびWO2014/055657号により詳細に記載される。簡潔には、スプリットCARシステムは、第一抗原結合ドメインおよび共刺激ドメイン(例えば、41BB)を有する第一CARを発現する細胞を含み、該細胞は第二抗原結合ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ゼータ)を有する第二CARも発現する。細胞が第一抗原に遭遇したとき、共刺激ドメインが活性化され、細胞が増殖する。細胞が第二抗原に遭遇したとき、細胞内シグナル伝達ドメインが活性化され、殺細胞活性が開始される。それ故に、CAR発現細胞は、両抗原存在下でのみ完全に活性化される。ある実施態様において、第一抗原結合ドメインは、ここに記載する腫瘍抗原またはB細胞抗原を認識し、例えば、ここに記載する抗原結合ドメインを含み、第二抗原結合ドメインは第二抗原、例えば、ここに記載する第二腫瘍抗原または第二B細胞抗原を認識する。
第二CARの共発現
ある態様において、ここに記載するCAR発現細胞は、第二CAR、例えば、同一標的(メソテリン)または異なる標的(例えば、間質細胞上のメソテリン以外の標的、例えば、FAP;前立腺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、アンドロゲン受容体、OR51E2、PSMA、PSCA、PDGRF−β、TARP、GloboH、MAD−CT−1またはMAD−CT−2;卵巣癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、Tn、PRSS21、CD171、ルイスY、葉酸受容体α、クローディン6、GloboHまたは精子タンパク質17、例えば、肺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、VEGF、HER3、IGF−1R、EGFR、DLL4またはTrop−2)への異なる抗原結合ドメインを含む、例えば、第二CARをさらに含み得る。ある実施態様において、CAR発現細胞は、第一抗原を標的とし、共刺激シグナル伝達ドメインを有するが、一次シグナル伝達ドメインを有しない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第一CARおよび第二の、異なる抗原を標的とし、一次シグナル伝達ドメインを有するが、共刺激シグナル伝達ドメインを有しない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第二CARを含む。共刺激シグナル伝達ドメイン、例えば、4−1BB、CD28、CD27、OX−40またはICOSの第一CARへのおよび一次シグナル伝達ドメイン、例えば、CD3ゼータの第二CARへの配置は、細胞に対するCAR活性を両標的が発現されたときに限定し得る。ある実施態様において、CAR発現細胞は、メソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび共刺激ドメインを含む第一メソテリンCARおよびメソテリン以外の抗原(例えば、間質細胞上のメソテリン以外の標的、例えば、FAP;前立腺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、アンドロゲン受容体、OR51E2、PSMA、PSCA、PDGRF−β、TARP、GloboH、MAD−CT−1またはMAD−CT−2;卵巣癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、Tn、PRSS21、CD171、ルイスY、葉酸受容体α、クローディン6、GloboHまたは精子タンパク質17、例えば、肺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、VEGF、HER3、IGF−1R、EGFR、DLL4またはTrop−2)を標的とし、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび一次シグナル伝達ドメインを含む第二CARを含む。他の実施態様において、CAR発現細胞は、メソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび一次シグナル伝達ドメインを含む第一メソテリンCARおよびメソテリン以外の抗原(例えば、間質細胞上のメソテリン以外の標的、例えば、FAP;前立腺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、アンドロゲン受容体、OR51E2、PSMA、PSCA、PDGRF−β、TARP、GloboH、MAD−CT−1またはMAD−CT−2;卵巣癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、Tn、PRSS21、CD171、ルイスY、葉酸受容体α、クローディン6、GloboHまたは精子タンパク質17、例えば、肺癌細胞のメソテリン以外の標的、例えば、VEGF、HER3、IGF−1R、EGFR、DLL4またはTrop−2)を標的とし、該抗原に対する抗原結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび共刺激シグナル伝達ドメインを含む第二CARを含む。
他の態様において、ここに記載するCAR発現細胞は、他の薬剤、例えば、CAR発現細胞の活性または適応度を増強する薬剤をさらに発現し得る。
ある実施態様において、ここに記載するCAR発現細胞、例えば、メソテリンCAR発現細胞は、さらにケモカイン受容体分子を含む。T細胞におけるケモカイン受容体CCR2bまたはCXCR2のトランスジェニック発現は、黒色腫および神経芽腫を含むCCL2−またはCXCL1分泌固形腫瘍への輸送を増強する(Craddock et al., J Immunother. 2010 Oct; 33(8):780-8 and Kershaw et al., Hum Gene Ther. 2002 Nov 1; 13(16):1971-80)。それ故に、理論に拘束されることを意図しないが、腫瘍、例えば、固形腫瘍により分泌されるケモカインを認識するCAR発現細胞において発現されるケモカイン受容体は、CAR発現細胞の腫瘍へのホーミングを改善でき、CAR発現細胞の腫瘍への浸潤を促進し、CAR発現細胞の抗腫瘍有効性を増強すると考えられる。ケモカイン受容体分子は、天然に存在するまたは組み換えケモカイン受容体またはそのケモカイン結合フラグメントを含み得る。ここに記載するCAR発現細胞(例えば、CAR−Tx)における発現に適するケモカイン受容体分子は、CXCケモカイン受容体(例えば、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CXCR6またはCXCR7)、CCケモカイン受容体(例えば、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10またはCCR11)、CX3Cケモカイン受容体(例えば、CX3CR1)、XCケモカイン受容体(例えば、XCR1)またはそのケモカイン結合フラグメントを含む。ある実施態様において、ここに記載するCARと発現するケモカイン受容体分子は、腫瘍により分泌されるケモカインに基づき選択される。ある実施態様において、ここに記載するCAR発現細胞は、さらに、CCR2b受容体またはCXCR2受容体を含む、例えば、発現する。ある実施態様において、ここに記載するCARおよびケモカイン受容体分子は同じベクターにあるかまたは2個の異なるベクターにある。ここに記載するCARおよびケモカイン受容体分子が同じベクターにあるある実施態様において、CARおよびケモカイン受容体分子は各々2個の異なるプロモーターの制御下にあるかまたは同じプロモーターの制御下にある。
本発明は、本発明の1以上のCAR構築物をコードする核酸配列を含むCAR導入遺伝子を提供する。ある態様において、CAR導入遺伝子はメッセンジャーRNA転写物として提供される。ある態様において、CAR導入遺伝子はDNA構築物として提供される。
本発明はまた本発明のDNAが挿入される、ベクターも提供する。レンチウイルスなどのレトロウイルス由来のベクターは、導入遺伝子の長期の、安定な組込みおよびその娘細胞における増殖を可能とするため、長期遺伝子導入の達成に適当なツールである。レンチウイルスベクターは、肝細胞などの非増殖細胞に形質導入できる点で、マウス白血病ウイルスなどのオンコレトロウイルス由来ベクターを超える利点を提供する。それらはまたさらに低免疫原性である利点もある。
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGACGCTTGCCTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCGCGGCGACGCAAAGGGCCTTGGTGCGGGTCTCGTCGGCGCAGGGACGCGTTTGGGTCCCGACGGAACCTTTTCCGCGTTGGGGTTGGGGCACCATAAGCT
(配列番号597)
PGK100:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTG
(配列番号598)
PGK200:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACG
(配列番号599)
PGK300:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCG
(配列番号600)
PGK400:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGACGCTTGCCTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCG
(配列番号601)
T2A: (GSG) E G R G S L L T C G D V E E N P G P(配列番号602)
P2A: (GSG) A T N F S L L K Q A G D V E E N P G P(配列番号603)
E2A: (GSG) Q C T N Y A L L K L A G D V E S N P G P(配列番号604)
F2A: (GSG) V K Q T L N F D L L K L A G D V E S N P G P(配列番号605)
ここに開示されるのは、インビトロ転写RNA CARを産生する方法である。本発明はまた、細胞に直接トランスフェクトされ得るCARコードRNA構築物も含む。トランスフェクションに使用するためのmRNAを産生する方法は、一般に50〜2000塩基長(配列番号35)の、3’および5’非翻訳配列(“UTR”)、5’キャップおよび/または配列内リボソーム進入部位(IRES)含有構築物を産生するための、特別に設計されたプライマーを用いる鋳型のインビトロ転写(IVT)、ポリA付加を含み得る。このように産生されたRNAは、異なる種の細胞を効率的にトランスフェクトし得る。ある態様において、鋳型はCARの配列を含む。
ある態様において、非ウイルス方法を使用して、ここに記載するCARをコードする核酸を細胞または組織または対象に送達し得る。
例えば、ここに記載するCARを発現させるための増大および遺伝的修飾の前に、細胞、例えば、T細胞またはNK細胞は、対象から得ることができる。用語“対象”は、免疫応答が誘発され得る生存動物(例えば、哺乳動物)を含むことを意図する。対象の例は、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラットおよびこれらのトランスジェニック種を含む。T細胞は、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織および腫瘍を含む、多くのの供給源から得ることができる。本発明のある態様において、当分野で利用可能なあらゆる多くのT細胞株が用いられ得る。本発明のある態様において、T細胞は、FicollTM分離などの当業者に知られる多くの技法の何れかを使用して、対象から採取した血液から得ることができる。ある好ましい態様において、個体の循環血からの細胞は、アフェレーシスにより得る。アフェレーシス産物は、一般に、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球を含むリンパ球、赤血球および血小板を含む。ある態様において、アフェレーシスにより採取した細胞は、血漿フラクションを除くために洗浄し、細胞をその後の処理段階に適する緩衝液または媒体に入れてよい。本発明のある態様において、細胞は、リン酸緩衝化食塩水(PBS)で洗浄される。別の態様において、洗浄溶液はカルシウムを欠き、マグネシウムを欠いてよくまたは全てではないにしても大部分の二価カチオンを欠く。カルシウム非存在下の初期活性化工程は、活性化を増強させ得る。当業者には容易に認識されるとおり、洗浄段階は当業者に既知の方法により達成でき、例えば、製造業者の指示に従い、半自動化“フロースルー”遠心分離(例えば、Cobe 2991 cell processor、Baxter CytoMateまたはHaemonetics Cell Saver 5)を使用するなどである。洗浄後、細胞を、例えば、無Ca、無MgPBS、PlasmaLyte Aまたは緩衝剤を伴うまたは伴わない他の食塩水溶液に、再懸濁し得る。あるいは、アフェレーシスサンプルの望ましくない成分を除去し、細胞を培養培地に直接再懸濁してよい。
ここに記載するある実施態様において、免疫エフェクター細胞は同種免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞またはNK細胞であり得る。例えば、細胞は、同種T細胞、例えば、機能的T細胞受容体(TCR)および/またはヒト白血球抗原(HLA)、例えば、HLAクラスIおよび/またはHLAクラスIIの発現を欠く同種T細胞であり得る。
ある実施態様において、TCR発現および/またはHLA発現は、細胞、例えば、T細胞において、TCRおよび/またはHLAおよび/またはここに記載する阻害性分子(例えば、PD1、PD−L1、PD−L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7−H3(CD276)、B7−H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、をアデノシンおよびTGFRベータ)をコードする核酸を標的とするsiRNAまたはshRNAを使用して阻害させ得る。siRNAおよびshRNAの発現系およびshRNA例は、例えば、全体を引用により本明細書に包含させる、2015年3月13日出願の国際出願WO2015/142675号のパラグラフ649および650に記載される。
ここで使用する“CRISPR”または“TCRおよび/またはHLAに対するCRISPR”または“TCRおよび/またはHLAを阻害するCRISPR”は、クラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピートのセットまたは該反復のセットを含む系をいう。ここで使用する“Cas”は、CRISPR関連タンパク質をいう。
TALEN”または“HLAおよび/またはTCRに対するTALEN”または“HLAおよび/またはTCRを阻害するTALEN”は、細胞、例えば、T細胞におけるHLAおよび/またはTCR遺伝子および/またはここに記載する阻害性分子(例えば、PD1、PD−L1、PD−L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7−H3(CD276)、B7−H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシンおよびTGFRベータ)の編集に使用され得る人工ヌクレアーゼである転写アクティベーター様エフェクターヌクレアーゼをいう。
“ZFN”または“亜鉛フィンガーヌクレアーゼ”または“HLAおよび/またはTCRに対するZFN”または“HLAおよび/またはTCRを阻害するZFN”は、細胞、例えば、T細胞におけるHLAおよび/またはTCR遺伝子および/またはここに記載する阻害性分子(例えば、PD1、PD−L1、PD−L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7−H3(CD276)、B7−H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシンおよびTGFRベータ)の編集に使用され得る人工ヌクレアーゼである亜鉛フィンガーヌクレアーゼをいう。
何らかの特定の理論に拘束されることを意図しないが、ある実施態様において、治療T細胞は、T細胞における短テロメアにより、患者で短期残留性を有し、従って、テロメラーゼ遺伝子でのトランスフェクションは、T細胞のテロメアを延長し、患者におけるT細胞の残留性を改善し得る。Carl June, “Adoptive T cell therapy for cancer in the clinic”, Journal of Clinical Investigation, 117:1466-1476 (2007)参照。それ故に、ある実施態様において、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞は、テロメラーゼサブユニット、例えば、テロメラーゼの触媒サブユニット、例えば、TERT、例えば、hTERTを異所性に発現する。ある態様において、本発明は、細胞とテロメラーゼサブユニット、例えば、テロメラーゼの触媒サブユニット、例えば、TERT、例えば、hTERTをコードする核酸を接触させることを含む、CAR発現細胞を産生する方法を提供する。細胞は、CARをコードする構築物と接触させる前、同時または後に該核酸と接触させ得る。
T細胞などの免疫エフェクター細胞は、例えば、一般に米国特許6,352,694号、6,534,055号、6,905,680号、6,692,964号、5,858,358号、6,887,466号、6,905,681号、7,144,575号、7,067,318号、7,172,869号、7,232,566号、7,175,843号、5,883,223号、6,905,874号、6,797,514号、6,867,041号および米国出願公開20060121005号に記載の方法を使用して活性化および増大され得る。
他の態様において、本発明は、CAR発現細胞の集団、例えば、メソテリンCAR発現細胞の集団を提供する。ある実施態様において、CAR発現細胞の集団は、種々のCARを発現する細胞の混合物を含む。
免疫系は、腫瘍細胞を認識し、排除する能力を有するが、しかしながら、腫瘍は、免疫を回避するために複数の戦略を使用し得る。免疫チェックポイントの遮断は、治療抗腫瘍免疫活性化または再活性化のアプローチの1つである。プログラム死リガンド1(PD−L1)は、免疫阻害性受容体プログラム死1(PD−1)のリガンドとして記載されている。PD−L1のPD−1への結合は、T細胞受容体介在リンパ球増殖およびサイトカイン分泌の阻害に至る(Freeman et al. (2000) J Exp Med 192:1027-34)。それ故に、PD−L1の遮断は抗腫瘍免疫の増強をもたらし得る。
重鎖(WO2013/079174号に記載の配列番号24)
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYIMMWVRQAPGKGLEWVSSIYPSGGITFYADKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARIKLGTVTTVDYWGQGTLVTVSS(配列番号611)
軽鎖(WO2013/079174号に記載の配列番号25)
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSN RPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTRVFGTGTKVTVL(配列番号612)
ある実施態様において、PD−L1阻害剤は、次の性質の1以上を有する抗体分子(例えば、単離または組み換え抗体分子)を含む。
(i)PD−L1、例えば、ヒトPD−L1に高親和性で、例えば、少なくとも約107M−1、一般に約108M−1およびより一般に、約109M−1〜1010M−1またはそれ以上の親和性定数で結合する;
(ii)CD28、CTLA−4、ICOSまたはBTLAと実質的に結合しない;
(iii)PD−L1の受容体、例えば、PD−1またはCD80(B7−1)または両方への結合を阻害または低減する;
(iv)PD−L1のエピトープ、例えば、マウスモノクローナル抗体BAP058またはキメラ抗体BAP058、例えば、BAP058−chiにより認識されるエピトープと同じまたは類似するエピトープに特異的に結合する;
(v)BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかと同等の結合親和性または特異性または両方を示す;
(vi)表1に記載する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同等の結合親和性または特異性または両方を示す;
(vii)表1に示すアミノ酸配列を有する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同等の結合親和性または特異性または両方を示す;
(viii)表1に示すヌクレオチド配列によりコードされる抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同等の結合親和性または特異性または両方を示す;
(ix)PD−L1に対する第二抗体分子の結合を阻害、例えば、競合的阻害し、ここで、第二抗体分子は、ここに記載する抗体分子、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(x)PD−1に対する第二抗体分子と同一または重複エピトープに結合し、ここで、第二抗体分子は、ここに記載する抗体分子、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(xi)PD−L1に対する第二抗体分子と結合を競合するおよび/または同じエピトープと結合し、ここで、第二抗体分子はここに記載する抗体分子、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(xii)ここに記載する抗体分子、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される、例えば、抗体分子の1以上の生物学的性質を有する;
(xiii)ここに記載する抗体分子、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される、例えば、抗体分子の1以上の薬物動態性質を有する;
(xiv)例えば、腫瘍浸潤性リンパ球増加、T細胞受容体介在増殖増加または癌性細胞による免疫回避減少の1以上をもたらす、PD−L1の1以上の活性を阻害する;または
(xv)ヒトPD−L1に結合し、カニクイザルPD−L1と交差反応性である。
(i)各々表6に開示の配列番号287、配列番号290または配列番号290から選択されるVHCDR1アミノ酸配列;配列番号288のVHCDR2アミノ酸配列;および配列番号289のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)各々表6に開示の配列番号1のVLCDR295アミノ酸配列、配列番号2のVLCDR296アミノ酸配列および配列番号3のVLCDR297アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)各々表6に開示の配列番号287、配列番号290または配列番号290から選択されるVHCDR1アミノ酸配列;配列番号291のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号292のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)各々表6に開示の配列番号1のVLCDR298アミノ酸配列、配列番号2のVLCDR299アミノ酸配列および配列番号3のVLCDR300アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
本発明は、メソテリンの発現と関連する疾患および障害処置用組成物および方法を提供する。メソテリンと関連する疾患または障害の例は、中皮腫である。
ステージI癌は一方または両方の卵巣に限局される。癌は、卵巣の一方または両方が関与し、子宮および/または卵管または骨盤における他の部位に広がったならば、ステージIIである。癌は、卵巣の一方または両方が関与し、腸または肝臓表面などの、リンパ節または骨盤外であるが、なお腹腔内である他の部位に広がっているならば、ステージIII癌である。癌は、一方または両方の卵巣が関与し、癌が腹部外または肝臓内に広がっているならば、ステージIV癌である。
ここに記載する方法の何れも、他の既知薬剤および治療と組み合わせて使用し得る。
B群腫瘍溶解性アデノウイルス(ColoAd1)(PsiOxus Therapeutics Ltd.)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT02053220参照);顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)(Oncos Therapeutics)を含むアデノウイルスであるONCOS−102(以前はCGTG−102称される)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01598129参照);ヒトPH20ヒアルロニダーゼをコードする遺伝子修飾腫瘍溶解性ヒトアデノウイルスであるVCN−01(VCN Biosciences, S.L.)(例えば、Clinical Trial Identifiers: NCT02045602およびNCT02045589参照);
網膜芽細胞腫/E2F経路が下方制御された癌細胞で選択的に複製するように修飾されている、野生型ヒトアデノウイルス血清型5(Had5)由来ウイルスである制限増殖型アデノウイルスICOVIR−5(Institut Catala d’Oncologia)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01864759参照);ICOVIR5、腫瘍溶解性アデノウイルスで感染させた骨髄由来自己間葉性幹細胞(MSCs)を含むCelyvir(Hospital Infantil Universitario Nino Jesus, Madrid, Spain/Ramon Alemany)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01844661参照);ヒトE2F−1プロモーターが必須E1aウイルス遺伝子の発現を駆動し、それによりRb経路欠損腫瘍細胞のウイルス複製および細胞毒性を制御する、制限増殖型腫瘍溶解性血清型5アデノウイルス(Ad5)であるCG0070(Cold Genesys, Inc.)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT02143804参照);または網膜芽細胞腫(Rb)経路欠損細胞で選択的に複製し、あるRGD結合インテグリンを発現する細胞により効率的に感染するように改変されているアデノウイルスであるDNX−2401(以前の名前デルタ−24−RGD)(Clinica Universidad de Navarra, Universidad de Navarra/DNAtrix, Inc.)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01956734参照)。
R1は水素、場合によりヒドロキシで置換されていてよいC1−C6アルキルであり;
R2は水素またはハロゲンであり;
R3は水素またはハロゲンであり;
R4は水素であり;
R5は水素またはハロゲンであり;
またはR4およびR5は互いに結合し、結合、−CH2−、−CH2−CH2−、−CH=CH−、−CH=CH−CH2−;−CH2−CH=CH−;または−CH2−CH2−CH2−であり;
R6およびR7は互いに独立してH、場合によりヒドロキシで置換されていてよいC1−C6アルキルル、場合によりハロゲンもしくはヒドロキシで置換されていてよいC3−C6シクロアルキルまたはハロゲンであり;
R8、R9、R、R’、R10およびR11は互いに独立してHまたは場合によりC1−C6アルコキシで置換されていてよいC1−C6アルキルであるか;またはR8、R9、R、R’、R10およびR11の何れかの2個はそれらが結合している原子と共に3〜6員飽和炭素環式環を形成してよく;
R12は水素または場合によりハロゲンもしくはC1−C6アルコキシで置換されていてよいC1−C6アルキルであり;
またはR12およびR8、R9、R、R’、R10またはR11の何れかの一個はそれらが結合している原子と共に4員、5員、6員または7員アザ環式環を形成してよく、該環は所望によりハロゲン、シアノ、ヒドロキシル、C1−C6アルキルまたはC1−C6アルコキシで置換されていてよく;
nは0または1であり;
R13は場合によりC1−C6アルキル、C1−C6アルコキシまたはN,N−ジ−C1−C6アルキルアミノで置換されていてよいC2−C6アルケニル;場合によりC1−C6アルキルまたはC1−C6アルコキシで置換されていてよいC2−C6アルキニル;または場合によりC1−C6アルキルで置換されていてよいC2−C6アルキレニルオキシドである。〕
の化合物またはその薬学的に許容される塩である。
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ、例えば、メソテリンCAR発現細胞およびPD−L1阻害剤を、低い、免疫増強用量のmTOR阻害剤と組み合わせて投与する。
本発明の医薬組成物は、ここに記載するCAR発現細胞、例えば、複数のCAR発現細胞を、1以上の薬学的にまたは生理学的に許容される担体、希釈剤または添加物と組み合わせて含み得る。このような組成物は、中性緩衝化食塩水、リン酸緩衝化食塩水などの緩衝液;グルコース、マンノース、スクロースまたはデキストラン、マンニトールなどの炭水化物;タンパク質;グリシンなどのポリペプチドまたはアミノ酸;抗酸化剤;EDTAまたはグルタチオンなどのキレート剤;アジュバント(例えば、水酸化アルミニウム);および防腐剤を含み得る。本発明の組成物は、ある態様で静脈内投与用に製剤される。
“免疫学的有効量”、“効果的用量”、“抗癌有効量”、“癌阻害有効量”または“治療量”をいうとき、本発明の組成物の投与すべき厳密な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の程度および状態の個々の差異を考慮して、医師により決定され得る。
PD−L1抗体と組み合わせたメソテリンCART治療の抗腫瘍活性を、膵臓癌マウスモデル、PANC02.03で評価した。PANC02.03マウスモデルにおけるメソテリンCAR治療での先の試験は、メソテリンCAR T細胞が腫瘍で増大および浸潤することを示した。これらの腫瘍浸潤性CAR T細胞のフローサイトメトリーによる分析は、PD−1(図1A参照)およびPD−L1発現を確認した。さらに、PAN02.03癌細胞は、インビトロおよびインビボ両方で試験したとき、PD−L1およびPD−L2を発現した(図1B参照)。
メソテリンCAR T細胞とPDL1阻害の相乗性の試験のための続く実験において、5×106 PANC02.03膵臓腫瘍細胞を、免疫無防備状態NSGマウスの脇腹に皮下にインプラントした。PANC02.03マウスを、CART治療単独、PD−L1治療単独またはCARTとPD−L1阻害剤治療の組み合わせで処置した。PD−L1阻害剤治療のCART治療に対する投与順の抗腫瘍活性に対する影響を、下記実験で評価した。
T細胞を、レンチウイルス形質導入により、M5メソテリンCAR構築物(例えば、表2の配列番号67)を発現するように改変した。対照CAR T細胞を、CD19 CARを発現するよう改変した。マウスを9群に分け、下記投与量および処置スケジュールに従い処置した。4×106 CART細胞の2用量を、腫瘍インプラント後23日および28日目に静脈内注射した。PD−L1抗体を、腫瘍インプラント後21日目、例えば、CART治療48時間前に腹腔内注射した。
図2に示す結果は、mesoCARTとPD−L1阻害剤の組み合わせ治療が、一過性腫瘍退縮とその後の腫瘍静止を示す。組み合わせ処置は、mesoCART単独処置より、腫瘍進行阻止に効果的であることが示された。CD19 CART単独またはPD−L1阻害剤との組み合わせでの処置は、腫瘍進行に効果がなかった。
次の実験において、PD−L1阻害剤治療をメソテリンCART治療後に投与した。4×106 M5 CART細胞を、腫瘍インプラント21日後に投与した。PD−1またはPD−L1抗体を、10mg/kgで毎週i.v.投与し、第一用量をCART投与24時間後に投与した。
処置の腫瘍進行に対する効果を図3に示す。M5 CART治療とPD−L1抗体処置の組み合わせは、僅かなかつ一過性抗腫瘍活性のみを示した。
2実験からのデータを合わせると、CART治療投与前のPD−L1阻害剤が、より強固な抗腫瘍効果を示す。
4×106 M5メソテリンCAR陽性T細胞で処置したNSGマウスからのPANC02.03腫瘍をさらに特徴付けるために、さらなる分析を実施した。PANC02.03腫瘍サンプルを、M5メソテリンCARTで処置したマウスから35日目に得た。腫瘍サンプルを腫瘍におけるメソテリンおよびPD−L1発現ならびにCART浸潤およびアポトーシスの分析のために、調製し、連続的切片染色を行った。メソテリン抗体、抗PD−L1抗体(#SP263, Ventana Medical Systems, Tuscon, AZ)、抗ヒトCD3抗体(#2GV6, Ventana Medical Systems)および抗CC3抗体(アポトーシスマーカー)(#9661, Cell Signaling Technology, Danvers, MA)を、例えば、免疫組織化学当分野で知られる技法を使用する、免疫組織化学染色に使用した。メソテリンmRNAのインサイチュハイブリダイゼーション(#413101, ACDBio, Hayward, CA)も実施した。
図4は、腫瘍におけるメソテリン発現およびPD−L1発現を示す。腫瘍は、メソテリンタンパク質発現レベルと逆相関しているように見える、高PD−L1染色領域を有する。図5は、CAR T細胞浸潤(CD3染色サンプル、上左パネル)、アポトーシス(CC3染色サンプル、下左パネル)、PD−L1発現(上右パネル)およびメソテリンmRNA発現(下右パネル)を示す。この発現分析の結果は、PD−L1発現が腫瘍領域で高く、メソテリンタンパク質およびmRNA発現が低く(図4)、さらに高いCAR T細胞浸潤(図5)を示す。これらのPD−L1高メソテリン低細胞は、類紡錘または間葉形態により特徴付けられ、上皮性間葉形質転換により生じた可能性がある。この過程は、膵臓腫瘍で詳しく報告されており、免疫抑制的腫瘍微小環境および疾患進行に寄与する可能性がある。それ故に、これらの結果は、メソテリンCARTおよびPD−L1阻害剤の組み合わせ処置が、一方でメソテリン発現腫瘍細胞を標的とし、致死させ、他方で、例えば、癌細胞および腫瘍間質細胞からの免疫抑制性シグナルを阻害して、メソテリン発現腫瘍における有効性増強に相乗効果を有することを示唆する。
インビトロでのCAR T細胞増殖に対する低用量のRAD001の効果を、CART発現細胞と標的細胞を、種々の濃度のRAD001の存在下、共培養することにより評価した。
CAR形質導入T細胞の産生
ヒト化、抗ヒトCD19 CAR(huCART19)レンチウイルス導入ベクターを、VSVg偽型レンチウイルス粒子に封入されたゲノム材料の産生に使用した。ヒト化抗ヒトCD19 CAR(huCART19)のアミノ酸およびヌクレオチド配列は、2014年3月15日出願のPCT公開WO2014/153270号に記載されるCAR 1、ID 104875であり、そこで配列番号85および31と指定されている。
レンチウイルス導入ベクターDNAを、リポフェクタミン試薬と組み合わせて3パッケージング成分VSVg env、gag/polおよびrevと混合し、レンチ−X 293T細胞をトランスフェクトする。培地を24時間および30時間後に交換し、ウイルス含有培地を採取し、濾過し、−80℃で保存する。CARTを、健常ドナー血液またはleukopakの陰性磁気選択から得た新鮮または凍結ナイーブT細胞の形質導入により得る。T細胞を24時間抗CD3/抗CD28ビーズとのインキュベーションにより活性化し、その後、ウイルス上清または濃縮ウイルス(各MOI=2または10)を培養物に添加する。修飾T細胞を約10日増大させる。細胞形質導入のパーセンテージ(細胞表面上のCARを表す)およびCAR発現レベル(相対的蛍光強度、Geo Mean)を、7〜9日にフローサイトメトリー分析により決定する。増殖速度減速および約350fLに近づくT細胞サイズの組み合わせが、後の分析のために凍結保存するT細胞の状態を決定する。
CARTの機能性を評価するために、T細胞を解凍し、計数し、生存能をCellometerにより評価する。各培養物におけるCAR陽性細胞数を、非形質導入T細胞(UTD)を使用して正規化する。CARTに対するRAD001の影響を、50nMから開始するRAD001の力価測定により試験した。全共培養実験に使用した標的細胞株は、CD19を発現し、ルシフェラーゼ発現のために形質導入されている、ヒトプレB細胞急性リンパ芽球性白血病(ALL)細胞株、Nalm−6である。
CARTの増殖を測定するために、T細胞を、標的細胞と1:1比で培養する。アッセイを4日行い、その時点で細胞をCD3、CD4、CD8およびCAR発現について染色する。T細胞数を、参照としてカウンティングビーズを使用するフローサイトメトリーにより評価する。
CART細胞の増殖能を、4日共培養アッセイで試験した。多数のCAR陽性CD3陽性T細胞(濃色バー)および総CD3陽性T細胞(薄色バー)を、CAR遺伝子導入および非形質導入T細胞をNalm−6と培養後に評価した(図6)。huCART19細胞は、0.016nMより少ないRAD001の存在下で培養したとき増大し、高濃度の該化合物存在下、低度に増大した。重要なことに、0.0032nMおよび0.016nM両方のRAD001で、増殖はRAD001添加せずに観察されたものより高かった。非形質導入T細胞(UTD)は検出可能な増大を示さなかった。
本実施例は、種々の濃度のRAD001存在下、huCAR19細胞がインビボで増殖する能力を評価する。
材料および方法:
NALM6−luc細胞:NALM6ヒト急性リンパ芽球性白血病(ALL)細胞株を、再発性ALLを有する患者の末梢血から展開した。次いで、細胞をホタルルシフェラーゼで標識した。これらの懸濁液細胞を10%熱不活性化胎仔ウシ血清添加RPMIで培養した。
マウス:6週齢NSG(NOD.Cg−PrkdcscidIl2rgtm1Wjl/SzJ)マウスを、Jackson Laboratory(stock number 005557)から得た。で
腫瘍インプラント:NALM6−luc細胞を、インビトロで10%熱不活性化胎仔ウシ血清添加RPMIで増殖および増大させた。次いで細胞を15mlコニカルチューブに移し、冷無菌PBSで2回洗浄した。次いでNALM6−luc細胞を計数し、PBS1mlあたり10×106細胞濃度で再懸濁した。細胞を氷に乗せ、直ぐに(1時間以内に)マウスにインプラントした。NALM6−luc細胞を、100μl容積で、マウスあたり計1×106細胞で尾静脈から静脈内注射した。
CAR T細胞投与:マウスに、腫瘍インプラント7日後5×106 CAR T細胞を投与した。細胞は、37℃水浴で一部解凍され、次いで、細胞含有チューブへの1mlの冷無菌PBS添加により完全に解凍された。解凍細胞を、15mlファルコンチューブに移し、10mlの最終容積にPBSで調節した。細胞を各1000rpmで10分で2回洗浄し、次いで、血球計算板で計数した。次いで、T細胞を冷PBS1mlあたり50×106 CAR T細胞濃度で再懸濁し、マウスに投与するまで氷上に維持した。マウスに、100μlのCAR T細胞を、マウスあたり5×106 CAR T細胞用量で、尾静脈から静脈内注射した。群あたり8マウスを、100μlのPBS単独(PBS)またはヒト化CD19 CAR T細胞で処置した。
RAD001投与:1mg RAD001に等しい50mg濃縮マイクロエマルジョンを製剤し、次いで、D5W(デキストロース5%水溶液)に投与時に再懸濁した。マウスに、200μlの所望の用量のRAD001を連日経口投与した(強制経口投与)。
PK分析:マウスに、腫瘍インプラント7日後に開始して、連日RAD001を投与した。投与群は次のとおりである。0.3mg/kg、1mg/kg、3mg/kgおよび10mg/kg。マウスは、最初の投与後0日目および14日目ならびにRAD001の最後の投与後下記の15分、30分、1時間、2時間、4時間、8時間、12時間および24時間の時点でPK分析のために採血した。
RAD001の増大および薬物動態を、NALM6−luc腫瘍を有するNSGマウスで試験した。RAD001単独の連日経口投与は、NALM6−luc腫瘍増殖に影響を有しなかった(図7)。RAD001の薬物動態分析は、腫瘍担持マウス血液で相当安定であることを示した(図8Aおよび8B)。0日目および14日目両方のPK分析は、血中RAD001濃度が、試験した最低用量(0.3mg/kg)投与24時間後でさえ、10nmを超えることを示す。
これらの用量に基づき、huCAR19 CAR T細胞を、これらの細胞の増殖能を決定するために、RAD001と共にまたは伴わずに投与した。使用した最高用量は、24時間投与後の血液中のRAD001のレベルに基づき、3mg/kgであった。RAD001濃度が、RAD001最終投与24時間後10nMを超えていたため、いくつかの低用量のRAD001を、CAR T細胞でのインビボ試験に用いた。CAR T細胞を、連日経口RAD001投与開始1日前にIV投与した。マウスを、T細胞増についてFACSでモニターした。
RAD001の最低用量は、CAR T細胞の増殖増強を示した(図9Aおよび9B)。この増殖増強は、CD8+CAR T細胞よりCD4+CAR T細胞で顕著かつ長期である。しかしながら、CD8+CAR T細胞で、増殖増強はCAR T細胞後の初期時点で見ることができる。ある実施態様において、RNA CART細胞も、チェックポイント阻害剤と組み合わせて使用した。
ここに引用する全特許、特許出願および刊行物の各々のおよび全ての発明を、引用によりその全体を本明細書に包含させる。本発明は特定の態様を参照して開示されているが、本発明の他の態様およびバリエーションが、本発明の精神および範囲から逸脱することなく当業者により考案され得ることは明らかである。添付の特許請求の範囲は、全てのこのような態様および均等なバリエーションを含むと解釈されることが意図される。
Claims (81)
- メソテリン発現と関連する疾患を有する対象の処置方法であって、該対象に
i)キメラ抗原受容体(CAR)を含む、例えば、発現する、細胞、例えば、免疫エフェクター細胞の集団であって、CARがメソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含むもの;および
ii)PD−L1阻害剤
を投与することを含み、ここで、PD−L1阻害剤がCARを含む細胞の投与前に投与される、方法。 - CAR発現細胞およびPD−L1阻害剤が処置インターバルで投与され、ここで、処置インターバルは、PD−L1阻害剤1回投与およびCAR発現細胞1回投与を含む、請求項1に記載の方法。
- 処置インターバルがPD−L1阻害剤投与により開始され、CAR発現細胞投与により完了する、請求項2に記載の方法。
- 処置インターバルが、さらに、PD−L1阻害剤の1以上、例えば、1、2、3、4または5またはそれ以上の続く投与を含む、請求項2または3に記載の方法。
- CAR発現細胞がPD−L1阻害剤投与の少なくとも2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週後に投与される、請求項2〜4の何れかに記載の方法。
- CAR発現細胞がPD−L1阻害剤投与の2日後に投与される、請求項5に記載の方法。
- CAR発現細胞およびPD−L1阻害剤が処置インターバルで投与され、ここで、処置インターバルは、PD−L1阻害剤の第一および第二の投与およびCAR発現細胞1回投与を含み、ここで、CAR発現細胞を、PD−L1阻害剤の第一の投与後であって、PD−L1阻害剤の第二の投与前に投与する、請求項1に記載の方法。
- 処置インターバルが、PD−L1阻害剤の第一の投与により開始され、PD−L1阻害剤の第二の投与により完了する、請求項7に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の第二の投与を、PD−L1阻害剤の最初の投与の少なくとも5日、7日、1週、2週または3週後に行う、請求項7または8に記載の方法。
- CAR発現細胞が、PD−L1阻害剤の第一の投与の少なくとも2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週間後に投与される、請求項7〜9の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤の第二の投与を、CAR発現細胞の最初の投与の少なくとも2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週後に行う、請求項7〜10の何れかに記載の方法。
- 処置インターバルが、例えば、1回以上、例えば、1回、2回、3回、4回または5回またはそれ以上反復される、請求項2〜11の何れかに記載の方法。
- 処置インターバルが、1以上、例えば、1、2、3、4または5のその後の処置インターバルに続く、請求項2〜11の何れかに記載の方法。
- 1以上のその後の処置インターバルが、第一のまたは先の処置インターバルと異なる、請求項13に記載の方法。
- 1以上のその後の処置インターバルを、第一のまたは先の処置インターバル完了少なくとも1日、例えば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週間後に、適用する、請求項13または14に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上のその後の投与、例えば、1、2、3、4または5またはそれ以上の投与を、1以上の処置インターバル完了後に行う、請求項2〜15の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤を、1以上の処置インターバル完了の5日、7日、2週、3週または4日後に投与する、請求項16に記載の方法。
- 処置インターバルが、PD−L1阻害剤の投与2日後のCAR発現細胞の投与を含み、ここで、処置インターバルが2回反復され、処置インターバルが先の処置インターバル完了の3日後に開始される、請求項2〜6の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上のその後の投与が、第二処置インターバル後、5日、7日、2週、3週または4週毎に行われる、請求項18に記載の方法。
- 対象がCAR発現細胞の1回用量およびPD−L1阻害剤の1回用量が投与される、請求項1に記載の方法。
- CAR発現細胞1回投与が、PD−L1阻害剤1回投与の少なくとも2日、例えば、2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週間後に、行われる、請求項20に記載の方法。
- CAR発現細胞の1以上、例えば、1、2、3、4または5のその後の投与が、CAR発現細胞の最初の投与後に対象に行われる、請求項21に記載の方法。
- CAR発現細胞の1以上のその後の投与が、CAR発現細胞の先の投与の少なくとも2日、例えば、2日、3日、4日、5日、6日、7日または2週間後に行われる、請求項22に記載の方法。
- CAR発現細胞の1以上のその後の投与が、CAR発現細胞の先の投与の少なくとも5日後に行われる、請求項23に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上、例えば、1、2、3、4または5のその後の投与が、PD−L1阻害剤1回投与後に行われる、請求項21〜24の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上のその後の投与が、PD−L1阻害剤の先の投与の少なくとも5日、7日、2週、3週または4週間後に行われる、請求項25に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上のその後の投与が、CAR発現細胞の投与、例えば、CAR発現細胞の最初の投与少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日または7日後に、行われる、請求項25に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の1以上、例えば、1、2、3、4または5の投与が、CAR発現細胞の最初の投与前に行われる、請求項25に記載の方法。
- AR発現細胞の1回以上の投与およびPD−L1阻害剤の1回以上の投与が反復される、請求項20〜28の何れかに記載の方法。
- CAR発現細胞の用量が、少なくとも約1〜3×107〜1〜3×108を含む、請求項1〜29の何れかに記載の方法。
- CAR発現細胞の用量が約1〜3×108細胞である、請求項30に記載の方法。
- CAR発現細胞の用量が約1〜3×108細胞である、請求項30に記載の方法。
- PD−L1阻害剤の用量が1〜30mg/kg、例えば、約5〜25mg/kg、約10〜20mg/kgまたは約1〜5mg/kgである、請求項1〜32の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤の用量が約10〜20mg/kgである、請求項33に記載の方法。
- PD−L1阻害剤が抗体分子、小分子、ポリペプチド、例えば、融合タンパク質または阻害性核酸、例えば、siRNAまたはshRNAを含む、請求項1〜34の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤が、
i)PD−L1発現、例えば、PD−L1の転写または翻訳阻害または低減;
ii)PD−L1活性の阻害または低減、例えば、PD−L1のその同族受容体、例えば、PD−1への結合の阻害または低減;または
iii)PD−L1またはその受容体、例えば、PD−1への結合
の1以上により特徴付けられる、請求項1〜35の何れかに記載の方法。 - PD−L1阻害剤は抗体分子である、請求項1〜36の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤がYW243.55.S70、MPDL3280A(アテゾリズマブ)、MEDI−4736、MSB−0010718C(アベルマブ)、MDX−1105および表6に提供される何れかの抗PD−L1抗体分子からなる群から選択される、請求項1〜37の何れかに記載の方法。
- PD−L1阻害剤が、
i)表6に挙げる何れかのPD−L1抗体分子アミノ酸配列の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3);および
ii)表6に挙げる何れかのPD−L1抗体分子アミノ酸配列の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)
を含む抗PD−L1抗体分子である、請求項1〜38の何れかに記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が、
i)a)配列番号287、290または195から選択されるHC CDR1アミノ酸配列、配列番号288のHC CDR2アミノ酸配列および配列番号289のHC CDR3アミノ酸配列;および
b)配列番号295のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号296のLC CDR2アミノ酸配列および配列番号297のLC CDR3アミノ酸配列;または
ii)a)配列番号287、290または195から選択されるHC CDR1アミノ酸配列、配列番号291のHC CDR2アミノ酸配列および配列番号292のHC CDR3アミノ酸配列;および
b)配列番号298のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号299のLC CDR2アミノ酸配列および配列番号300のLC CDR3アミノ酸配列
を含む、請求項39に記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が、
i)表6に挙げる何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号304、316、324、332、336、340、348、356または364;
ii)表6に挙げる何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号304、316、324、332、336、340、348、356または364に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表6に挙げる何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号304、316、324、332、336、340、348、356または364と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む重鎖可変領域を含む、請求項39または40に記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が、
i)表6に挙げる何れかの重鎖のアミノ酸配列、例えば、配列番号306、318、326、334、338、342、350、358、366、393、377または382;
ii)表6に挙げる何れかの重鎖、例えば、配列番号306、318、326、334、338、342、350、358、366、393、377または382に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表6に挙げる何れかの重鎖のアミノ酸配列、例えば、配列番号306、318、326、334、338、342、350、358、366、393、377または382と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む重鎖を含む、請求項39〜41の何れかに記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が
i)表6に挙げる何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号308、312、320、328、344、352、360、368または372;
ii)表6に挙げる何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号308、312、320、328、344、352、360、368または372に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表6に挙げる何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列、例えば、配列番号308、312、320、328、344、352、360、368または372と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む軽鎖可変領域を含む、請求項39〜42の何れかに記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が
i)表6に挙げる何れかの軽鎖のアミノ酸配列、例えば、配列番号310、314、322、330、346、354、362、370または374;
ii)表6に挙げる何れかの軽鎖、例えば、配列番号310、314、322、330、346、354、362、370または374に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表6に挙げる何れかの軽鎖のアミノ酸配列、例えば、配列番号310、314、322、330、346、354、362、370または374と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む軽鎖を含む、請求項39〜43の何れかに記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が
i)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号308のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
ii)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号312のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
iii)配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
iv)配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号320のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
v)配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
vi)配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
vii)配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号360のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
viii)配列番号332のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
ix)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号328のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
x)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号308のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xi)配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xii)配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号344のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xiii)配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号372のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xiv)配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xv)配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号386のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
xvi)配列番号356のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号352のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
xvii)配列番号78のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号368のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む、請求項39〜44の何れかに記載の方法。 - 抗PD−L1抗体分子が
i)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号310のアミノ酸配列を含む軽鎖;
ii)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号214のアミノ酸配列を含む軽鎖;
iii)配列番号306のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
iv)配列番号318のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号322のアミノ酸配列を含む軽鎖;
v)配列番号318のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
vi)配列番号326のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
vii)配列番号326のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号362のアミノ酸配列を含む軽鎖;
viii)配列番号334のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
ix)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;
x)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号310のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xi)配列番号338のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xii)配列番号342のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号346のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xiii)配列番号342のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xiv)配列番号350のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xv)配列番号350のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号374のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xvi)配列番号358のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xvii)配列番号366のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号370のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xviii)配列番号393のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号322のアミノ酸配列を含む軽鎖;
xix)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号330のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
xx)配列番号382のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号354のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、請求項39〜45の何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインが、表2に挙げる何れかのメソテリン重鎖結合ドメインアミノ酸配列の重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3);および表2に挙げる何れかのメソテリン軽鎖結合ドメインアミノ酸配列の軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む、請求項1〜46の何れかに記載の方法。
- メソテリン結合ドメインが表4におけるHC CDRアミノ酸配列に従うHC CDR1、HC CDR2およびHC CDR3および表5におけるLC CDRアミノ酸配列に従うLC CDR1、LC CDR2およびLC CDR3を含む、請求項47に記載の方法。
- メソテリン結合ドメインが
i)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列;
ii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜48の何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインが
i)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖のアミノ酸配列;
ii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの重鎖のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜49の何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインが
i)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列;
ii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜50の何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインが
i)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖のアミノ酸配列;
ii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)表2に挙げるメソテリン結合ドメインの何れかの軽鎖のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜51の何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインが表2に挙げる何れかの重鎖可変領域のアミノ酸配列および表2に挙げる何れかの軽鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、請求項1〜52の何れかに記載の方法。
- メソテリン結合ドメインが
i)配列番号43、配列番号49、配列番号275、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61または配列番号62からなる群から選択されるアミノ酸配列;
ii)配列番号43、配列番号49、配列番号275、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61または配列番号62の何れかに少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
iii)配列番号43、配列番号49、配列番号275、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61または配列番号62の何れかのアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜53の何れかに記載の方法。 - 膜貫通ドメインがタンパク質T細胞受容体のアルファ、ベータまたはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137およびCD154からなる群から選択される膜貫通ドメインを含む、請求項1〜54の何れかに記載の方法。
- 膜貫通ドメインが
(i)配列番号6のアミノ酸配列、
(ii)配列番号6のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を含むが、修飾が20、10または5を超えないアミノ酸配列または
(iii)配列番号6のアミノ酸配列と95〜99%同一性の配列のアミノ酸配列
を含む、請求項1〜の55何れかに記載の方法。 - メソテリン結合ドメインがヒンジ領域により膜貫通ドメインに結合される、請求項1〜56の何れかに記載の方法。
- ヒンジ領域が配列番号2またはそれと95〜99%同一性を有する配列を含む、請求項1〜57の何れかに記載の方法。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、MHCクラスI分子、TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ性活性化分子(SLAMタンパク質)、活性化NK細胞受容体、BTLA、Tollリガンド受容体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、4−1BB(CD137)、B7−H3、CDS、ICAM−1、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8アルファ、CD8ベータ、IL2Rベータ、IL2Rガンマ、IL7Rアルファ、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA−6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA−1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA−1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB−A、Ly108)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO−3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP−76、PAG/Cbp、CD19aおよびCD83と特異的に結合するリガンドからなる群から選択されるタンパク質から得た機能的シグナル伝達ドメインを含む共刺激シグナル伝達ドメインを含む、請求項1〜58の何れかに記載の方法。
- 共刺激ドメインが配列番号7のアミノ酸配列または配列番号7のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が20、10または5を超えないアミノ酸配列または配列番号7のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59に記載の方法。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが4−1BBの機能的シグナル伝達ドメインおよび/またはCD3ゼータの機能的シグナル伝達ドメインを含む、請求項1〜60の何れかに記載の方法。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが配列番号7のアミノ酸配列および/または配列番号9または配列番号10のアミノ酸配列;または配列番号7および/または配列番号9または配列番号10のアミノ酸配列のアミノ酸配列に少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が20、10または5を超えないアミノ酸配列;または配列番号7のアミノ酸配列および/または配列番号9または配列番号10のアミノ酸配列と95〜99%同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1〜61の何れかに記載の方法。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが配列番号7のアミノ酸配列および配列番号9または配列番号10のアミノ酸配列を含み、ここで、細胞内シグナル伝達ドメインを含むアミノ酸配列が同じフレームにかつ単一ポリペプチド鎖として発現される、請求項1〜62の何れかに記載の方法。
- CARが、さらに、配列番号1のアミノ酸配列を含むリーダー配列を含む、請求項1〜63の何れかに記載の方法。
- CARが
(i)配列番号67;配列番号73、配列番号278、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85または配列番号86の何れかのアミノ酸配列;
(ii)配列番号67、配列番号73、配列番号278、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85または配列番号86の何れかに少なくとも1、2または3修飾を有するが、修飾が30、20または10を超えないアミノ酸配列;または
(iii)配列番号67;配列番号73、配列番号278、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85または配列番号86の何れかと95〜99%同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項1〜64の何れかに記載の方法。 - CARを含む細胞がCARをコードする核酸を含む、請求項1〜65の何れかに記載の方法。
- CARをコードする核酸がレンチウイルスベクターである、請求項66に記載の方法。
- CARをコードする核酸が細胞にレンチウイルス形質導入により導入される、請求項66または67に記載の方法。
- CARをコードする核酸がRNA、例えば、インビトロ転写RNAである、請求項66に記載の方法。
- CARをコードする核酸が細胞にエレクトロポレーションにより導入される、請求項69に記載の方法。
- 細胞がT細胞またはNK細胞である、請求項1〜70の何れかに記載の方法。
- T細胞が自己または同種T細胞である、請求項71に記載の方法。
- さらにメソテリン発現と関連する疾患を処置する付加的治療剤、例えば、抗癌剤を投与する、請求項1〜72の何れかに記載の方法。
- メソテリン発現と関連する疾患が癌である、請求項1〜73の何れかに記載の方法。
- 癌が中皮腫、悪性胸膜中皮腫、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、扁平上皮細胞肺癌または大細胞肺癌、膵臓癌、膵管腺癌、膵臓転移、卵巣癌または結腸直腸癌および膀胱癌またはその転移癌の1以上から選択される、請求項74に記載の方法。
- 対象が哺乳動物、例えば、ヒトである、請求項1〜75の何れかに記載の方法。
- 対象がPD−L1および/またはPD−L2を発現する、請求項1〜76の何れかに記載の方法。
- 対象における癌細胞または癌細胞に近接する細胞がPD−L1および/またはPD−L2を発現する、請求項74に記載の方法。
- CAR発現細胞がPD−1および/またはPD−L1を発現する、請求項1〜78の何れかに記載の方法。
- CARを含む細胞、例えば、免疫エフェクター細胞の集団であって、ここで、CARがメソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含むもの;および
表6から選択されるPD−L1阻害剤;
を含む、対象におけるメソテリン発現と関連する疾患、例えば、癌を処置するための組み合わせ。 - CARを含む細胞、例えば、免疫エフェクター細胞の集団であって、ここで、CARがメソテリン結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインであるもの、および
表6から選択されるPD−L1阻害剤
を含む、組成物(例えば、1以上の組成物または投与形態)。
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