HU211600A9 - Yeast expressing system - Google Patents

Yeast expressing system Download PDF

Info

Publication number
HU211600A9
HU211600A9 HU95P/P00592P HU9500592P HU211600A9 HU 211600 A9 HU211600 A9 HU 211600A9 HU 9500592 P HU9500592 P HU 9500592P HU 211600 A9 HU211600 A9 HU 211600A9
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
glu
leu
asp
ala
polypeptide
Prior art date
Application number
HU95P/P00592P
Other languages
English (en)
Inventor
Kjeld Norris
Soren Bjorn
Fanny Norris
Original Assignee
Novo Nordisk As
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=26065137&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=HU211600(A9) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Priority claimed from DK494189A external-priority patent/DK494189D0/da
Application filed by Novo Nordisk As filed Critical Novo Nordisk As
Publication of HU211600A9 publication Critical patent/HU211600A9/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • C12N15/625DNA sequences coding for fusion proteins containing a sequence coding for a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/575Hormones
    • C07K14/62Insulins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/81Protease inhibitors
    • C07K14/8107Endopeptidase (E.C. 3.4.21-99) inhibitors
    • C07K14/811Serine protease (E.C. 3.4.21) inhibitors
    • C07K14/8114Kunitz type inhibitors
    • C07K14/8117Bovine/basic pancreatic trypsin inhibitor (BPTI, aprotinin)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14Fungi; Culture media therefor
    • C12N1/16Yeasts; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/033Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a motif for targeting to the internal surface of the plasma membrane, e.g. containing a myristoylation motif
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/036Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif targeting to the medium outside of the cell, e.g. type III secretion
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/04Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing an ER retention signal such as a C-terminal HDEL motif
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/61Fusion polypeptide containing an enzyme fusion for detection (lacZ, luciferase)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/70Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • C07K2319/74Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
    • C07K2319/75Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Processing Of Solid Wastes (AREA)
  • Chemical Or Physical Treatment Of Fibers (AREA)
  • Silver Salt Photography Or Processing Solution Therefor (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Thermotherapy And Cooling Therapy Devices (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Particle Accelerators (AREA)

Description

A jelen találmány élesztőgombákban expresszált és előállított polipeptidekkel, az ilyen peptideket kódoló DNS szekvenciát tartalmazó DNS szerkezettel, az ilyen DNS fragmenteket hordozó vektorokkal és a vektorokkal transzformált élesztőgomba-sejtekkel, akárcsak az élesztőgombákban való heterológ proteinek termelési folyamatával kapcsolatos.
Az élesztőgombák számos intracellurálisan szintetizált fehérjét termelnek, melyeknek azonban sejten kívüli funkciójuk van. Az ilyen extracelluláris proteinekre, mint kiválasztott proteinekre utalunk. Ezek a kiválasztott proteinek kezdetben a sejten belül expresszálódnak egy az expresszált termék endoplazmás retikulum (ER) membránon keresztül történő hatékony áthaladását biztosító előszekvenciát tartalmazó formájában. A preszekvencia, melyet rendes körülmények között jel peptidnek neveznek, általában lehasad a kívánt termékről a transzlokáció alatt. Amikor belép a kiválasztási reakcióútba a protein a Golgi apparátushoz szállítódik. A Golgi apparátusból a protein különböző útvonalakat követhet, melyek olyan részekhez vezetnek, mint amilyen a sejtvakuolum vagy a sejtmembrán, vagy ki vezetődhetnek a sejtből, hogy a külső tápközegbe választódjanak ki (Pfeffer, S. R. and Rothman, J. E. Ann. Rév. Biochem. 56 (1987), 829-852).
Számos megközelítést javasoltak az élesztőgombák heterológ proteinjeinek élesztőgombákban való expresszálásához. A 0 088 632A számú Európai Közzétett Szabadalmi Alkalmazás leír egy eljárást, mellyel az élesztőgombák hetrológ proteinjei kerülnek expresszálásra, előállításra és kiválasztásra oly módon, hogy egy élesztőgombát transzformáinak egy a kívánt proteint és egy jel peptidet kódoló DNS-at tartalmazó expressziós vektorral, a transzformált mikroszervezetből tenyészetet készítenek, a tenyészetet elszaporítják és a tenyész tápközegből kinyerik a fehérjét. A jel peptid lehet a kívánt proteinek saját jel peptidje, egy heterológ jel peptid vagy az eredeti és heterológ jel peptid egy hibridje.
Az élesztőgombával heterológ jel peptidek használatakor felmerülő probléma lehet, hogy a heterológ jel peptid nem biztosít hatékony transzlokációt és/vagy hasítást a jel peptid után.
A S. cerevisiae MFal (a=faktor) 165 aminosav preproformájaként szintetizálódik, mely aminosav tartalmaz egy 19 aminosav hosszúságú jel vagy prepeptidet, melyet egy 64 aminosav hosszúságú „vezető” vagy propeptid követ, körülvéve 3 N-kötésű glikozilációs helyet, melyet a (LysArg(Asp/Glu, Ala)2.3a-faktor)4 követ (Kurjan, J. and Herskowitz, I. Cell. 30 (1982), 933-943). A prepro MFal jel-vezető részét széleskörűen alkalmazzák a heterológ proteinek S. cerevisiaeben való szintézisének és szekréciójának elérése céljából.
Az élesztőgombákkal homológ jel/vezető peptidek használata ismert a 4 546 082 számú US szabadalmi specifikációból, a 0 116 201 A, 0 123 294 A, 0 123 544 A, 0 163 529 A és 0 123 289 A számú Európai Közzétett Szabadalmi Alkalmazásokból és a 2484/84 és 3614/83 számú dán szabadalmi specifikációkból.
Az EP 0 123 289 A számú szabadalomban a S. cerevisiae a-faktor prekurzor hasznosítása került leírásra, míg a DK 2484/84 számú szabadalomban a Saccharomyces cerevisiae invertáz jel peptid hasznosítását írja le és a DK 3614/83 számú szabadalom a Saccharomyces cerevisiae PH05 jel peptid hasznosítása az idegen proteinek kiválasztása céljából.
A 4 546 082 számú US szabadalmi specifikáció, az EP 016 201 A, 0 123 394 A, 0 123 544 A és 0 163 529 A számú szabadalmak olyan eljárásokat írnak le, melyekkel a Saccharomyces verevisiaeből származó α-faktor jelvezető (MFal, vagy MFa2) kerül alkalmazásra az élesztőgombákban expresszált heterológ proteinek szekréciós folyamatában. A kívánt protein szekréciójához szükséges gén 5’ végén levő S. cerevisiae MFal jel/vezető szekvenciát kódoló DNS szekvencia fuzionálása és a kívánt protein előállítása került bemutatásra.
Az EP 206 783 számú szabadalom leír egy a S. cerevisiaeből történő polipeptidek szekréciójához való rendszert, amiből az α-faktor vezető szekvenciát megcsonkították az eredeti vezető szekvencián jelen levő négy α-faktor peptid eliminálása céljából, azért, hogy a vezető peptidet magát hagyják a heterológ polipeptidhez fuzionálni a LysArgGiuAlaGluAla α-faktor előállítási helyen keresztül. Ez a szerkezet hivatott vezetni a kisebb peptidek (kevesebb mint 50 aminosav) hatékony előállítását. A nagyobb polipeptidek szekréciójá és előállításához az eredeti α-faktor vezető szekvenciát megcsonkították, hogy csupán egy vagy két a-faktor peptidet hagyjanak a vezető peptid és a polipeptid között.
Számos szekretált proteint úgy irányítanak, hogy ki legyen téve egy proteolitikus előállítási rendszernek, mely fel tudja hasítani a peptidkötést két egymás után levő bázikus aminosav karboxil végén. Ezt az enzimatikus aktivitást a 5. cerevisiaben a KEX2 gén kódolja [Julius, D. A. et al.: Cell. 37 (1984 b), 1075]. A termék KEX2 géntermék által történő feldolgozása szüksséges az aktív S. cerevisiae al párosodási faktor (MFal vagy α-faktor) szekréciójához, de nem tartozik bele az aktív 5. cerevisiae a párosodási faktor szekréciójába.
A szekretálásra szánt polipeptid szekrécióját és helyes előállítását néhány olyan esetben lehet elérni, amikor a fent megadott irodalomban jelölt módon megszerkesztett vektorral transzformált élesztőgombát szaporítunk. Számos esetben azonban, a szekréció szintje nagyon alacsony, vagy nincs szekréció, vagy a proteolitikus előállítás nem megfelelő vagy nem teljes. A jelen találmány leírói jelenleg úgy gondolják, hogy ez bizonyos mértékig a vezető peptid C-terminális vége és a heterológ protein N-terminális vége között levő előállító hely nem megfelelő kitevésének tudható be úgy, hogy az nem hozzáférhető vagy legalábbis kevésbé hozzáférhető a proteolitikus hasításhoz.
A következőkben megadjuk a találmány összegzését.
Meglepően azt találtuk, hogy bizonyos módosításokat biztosítva a vezető peptid C-terminális végénél és/vagy a vezető peptidhez fuzionált heterológ polipep2
HU 211 600 A9 tid N-terminális végénél levő előállítási helyhez közel nagyobb hozamot lehet elérni a megfelelően előállított proteinből, mint a módosítás nélküli vezető peptid heterológ polipeptid szerkezettel.
Ennek megfelelően, a jelen találmány egy polipeptiddel kapcsolatos, mely polipeptid tartalmazza egy jel peptid, egy vezető peptid és egy heterológ protein vagy polipeptid fúzióját, mely polipeptidet úgy módosítottuk, a vezető peptid C-terminális vége és a heterológ protein N-terminális vége között pozícionált élesztőgomba-előállítási hellyel szomszédos aminosav szekvenciáját, hogy úgy biztosítsuk az előállítási hely beállítását, hogy hozzáférhető legyen a proteolitikus hasításhoz. A polipeptid szerkezete a következő; jel peptid - vezető peptid -X'-X2-X3-X4- heterológ protein, ahol
X1 egy peptidkötés, vagy egy vagy több aminosavat képvisel, melyek lehetnek azonosak vagy eltérőek,
X2 és X3 azonosak vagy különbözők és egy a Lys-t és
Arg-t tartalmazó csoportból szelektált bázikus aminosavat képviselnek,
X2 és X3 együttesen meghatároznak egy élesztőgomba előállítási helyet és
X4 egy peptidkötés, vagy egy vagy több aminosavat képvisel, melyek lehetnek azonosak vagy különbözők. azzal a feltétellel, hogy X1 és/vagy X4 egy vagy több aminosavat képviselnek és hogy az X1 és/vagy X4 által képviselt aminosavak közül legalább egy a Glu-t és Asp-t tartalmazó csoportból szelektált negatív töltésű aminosav, azzal a további feltétellel, hogy ha X1 egy peptidkötés, akkor X4 jelentése nem lehet Glu-Ala-Glu-Ala vagy GluAla-Glu-Ala-Ser-Leu-Asp, és ha X4 peptidkötés, akkor XI jelentése nem lehet Ser-Leu-Asp.
A jelen összefüggésben a .jel peptidet” úgy kell értelmezni, mint egy előszekvenciát, mely túlnyomóan hidrofób természetű és egy élesztőgombában expreszszált extracelluláris protein prekurzor formáján N-terminális szekvenciaként van jelen. A jel peptid funkciója, hogy lehetővé tegye a szekretálandó heterológ protein számára, hogy belépjen az endoplazmás retikulumba. A jel peptid rendes körülmények között ezen folyamat során lehasad. A jel peptid lehet heterológ vagy homológ a proteint termelő élesztő szervezettel, de mint azt fent magyaráztuk, a jel peptiddel sokkal hatékonyabb hasítást lehet elérni, ha az homológ a kérdéses élesztő szervezettel.
A „vezető peptid” kifejezést úgy kell értelmezni, hogy egy túlnyomórészt hidrofil peptidet jelöl, melynek az a funkciója, hogy lehetővé tegye a szekretálandó heterológ protein számára, hogy az endoplazmás retikulumból a Golgi apparátushoz irányítódjon, majd tovább egy szekréciós vezikulumba, a tápközegbe való kiválasztódás céljából (azaz, egy expresszált protein vagy polipeptid exportálását a sejtfalon keresztül vagy legalább a sejtmembránon át a sejt periplazmás terébe).
A „heterológ protein vagy polipeptid” kifejezés egy olyan proteint vagy polipeptidet hivatott jelölni, mely a természetben nem termelődik a gazda élesztő szervezetben. A „protein” és „polipeptid” fogalmakat alapjában véve egymással kicserélhető fogalmakként használjuk a következő leírásban.
A polipeptid előállítási helynél lévő módosítása (az a hely, ahol a vezető peptidet a heterológ proteinből élesztőgomba protelitikus enzimekkel végzett proteolitikus hasítással távolítottuk el), mely módosítást az X1 és/vagy X4 képviseli, lehet a vezető peptid C-terminális végén és/vagy a heterológ protein N-terminális végén levő egy vagy több aminosav extenziójának, helyettesítésének vagy deléciójának formájában.
A találmány értelmében, meglepően azt találtuk, hogy sokkal hatékonyabb és helyesebb heterológ proteinelőállítást lehet elérni, ha legalább egy azon aminosavak közül, melyekkel a polipeptid szekvenciáját kibővítettük, vagy melyekkel a szekvenciában levő eredeti aminosavak közül egyet vagy többet helyettesítettünk, negatív töltésű aminosav, mint azok, melyeket fent jelöltünk. Hasonló hatás figyelhető meg, amikor negatív töltésű aminosavat biztosítottunk delécióval az előállító hely közelében, azaz eltávolítottunk egy vagy több aminosavat a vezető peptid C-terminális végéből vagy a protein szekvencia N-terminális végéből míg egy negatív töltésű aminosav van jelen az előállítási hely közelében.
Bármely adott elméletre való korlátozódás óhaja nélkül, az a feltételezés, hogy ez a hatás az előállítási hely szomszédságában levő negatív töltésű aminosavak által adott megnövekedett hidrofilitásnak tudható be, ami a vizes intracelluláris környezetben ez előállítási helynél levő polipeptid tercier szerkezetének megnövekedett kitettségét eredményezi, így sokkal hozzáférhetőbb az előállító enzim által történő proteolitikus hasításhoz. A negatív töltésű aminosavak előnyös hatása a pozitív töltésű vagy semleges aminosavakkal szemben az ezen aminosavak negatív töltésű oldalláncainak tulajdonítható, mely az előállítási hely tercier szerkezetének hidrofilitásához járul hozzá anélkül, hogy az előállító enzimet bármilyen lehetséges módon gátolná.
Az is lehetséges, hogy a negatív töltésű aminosavak hozzájárulnak az előállítási hely tercier szerkezetének létrehozásához és fenntartásához (pl. fordulók, hajtűk vagy hurok szerkezetek) máshogy, mint pl. a polipeptidekben levő más aminosav maradékokkal való kölcsönhatás a negatív töltésű aminosavak és az előállító enzim között. így, úgy gondoljuk, hogy az előállítási hely két bázikus aminosavjával szomszédos elhelyezkedésű negatív töltésű aminosavak irányíthatják az előállító enzimet, hogy egy megfelelő és hatékony hasítást végezzen a proteinek közötti és/vagy a protein és oldószer közötti töltés kölcsönhatások révén.
Más szempontból a jelen találmány a fent meghatározott polipeptidet kódoló DNS szekvenciát tartalmazó DNS szerkezettel kapcsolatos.
Egy további szempontból a jelen találmány egy rekombináns expressziós vektoreal kapcsolatos, mely képes élesztőgombában replikálódni és mely a fent meghatározott peptidet kódoló DNS szerkezetet hor3
HU 211 600 A9 doz, kapcsolatos egy élesztőgomba törzzsel is, mely képes expresszálni a heterológ proteint vagy polipeptidet és melyet ezzel a vektorral transzformáltunk.
Egy még további szempontból a jelen találmány kapcsolatos egy az élesztőgombában való heterológ protein vagy polipeptid termelésére való eljárással, mely tartalmazza a transzformált élesztőgomba törzs egy megfelelő tápközegben való szaporítását a heterológ protein vagy polipeptid expressziójának és szekréciójának elérése céljából, mely után a proteint vagy polipeptidet izoláljuk a tápközegből.
A következőkben megadjuk a találmány részletes leírását.
A fent megadott magyarázattal összhangban, ha X1 egy magányos aminosav, akkor Glu vagy Asp.
X1 és/vagy X4 megfelelően 1-6 aminosavat képvisel.
X1 két aminosav szekvenciáját képviseli, akkor BA szerkezete lehet, ahol A Glu vagy Asp és B Glu, Asp, Val, Gly vagy Leu, pl. LeuGlu.
Ha X1 három aminosav szekvenciáját képviseli, CBA szerkezete lehet, ahol Aés B a fenti meghatározás szerinti és C Glu, Asp, Pro, Gly, Val, Leu, Arg vagy Lys, pl. AspLeuGlu.
Ha X1 kettőnél több aminosav szekvenciáját képviseli, a további aminosavak egyike megfelelően lehet Pro vagy Gly, minthogy ezek az aminosavak úgy ismertek. hogy fordulók, hajtűk és hurok szerkezeteket vezetnek be és/vagy ezek részét képezik, valószínűleg elősegítik az előállítási hely hozzáférhetőségét a proteolitikus enzim számára.
Ha X1 négy aminosav szekvenciáját képviseli, DCBA szerkezete lehet, ahol A, B, és C olyan amilyennek fent meghatároztuk és D-nek ugyanolyan jelentései vannak, mint C-nek, pl. GluArgLeuGlu, LysGluLeuGlu vagy LeuAspLeuGlu.
Ha X1 öt aminosav szekvenciáját képviseli, szerkezete EDCBA lehet, ahol A, B, C és D olyan amilyennek fent meghatároztuk és E-nek ugyanolyan jelentései vannak, mint C-nek. pl. LeuGluArgLeuGlu.
Ha X1 hat aminosav szekvenciáját képviseli, szerkezete EDCBA lehet, ahol A, B, C, D és E olyan amilyennek fent meghatároztuk és F-nek ugyanolyan jelentései vannak, mint C-nek, pl. ValLeuGluArgLeuGlu.
Érthető, hogy az aminosavak más kombinációi is lehetségesek, mint X1 jelentései, a találmány elméletétől való eltávolodás nélkül, azt biztosítva, hogy a szekvenciában az aminosavak közül legalább egy negatív töltésű aminosav, mint azt fent meghatároztuk.
Az X4 megfelelő jelentései lehetnek az X1 esetében bemutatottak, bár az aminosav sorrendje tipikusan fordított (pl. ABC CBA helyett stb.).
A találmány polipeptidjeinek megtestesülésében, ahol a heterológ proteint egy vagy több pozitív töltésű aminosav vagy hidrofób aminosav iniciál, X4 előnyösen egy vagy több aminosavat képvisel a peptidkötések helyett, mivel azt gondoljuk, hogy ez a proleolitikus enzimek számára nagyobb hozzáférhetőséget biztosít.
Olyan esetekben, ahol X4 1-6 aminosavnak egy N-terminális extenzióját képviseli, megfelelő lehet egy további előállítási hely biztosítása az X4 és a heterológ protein N-terminális vége által képviselt aminosav vagy aminosavak között. Ez különösen akkor fontos, amikor a proteint olyan célokra kívánjuk felhasználni, ahol N-terminális extenzióval nem rendelkező protein jelentése a kívánatos. A további N-terminális aminosavak in vitro proteolitikus hasítással el lehet távolítani megfelelő proteolitikus enzimet alkalmazva, mint amilyen pl. egy tripszin-szerű proteázt vagy egy vegyszert, mint pl. a cianogén bromidot alkalmazva. A további előállítási helynél levő hasítást befolyásolni lehet gazda élesztő szervezettel egy másik élesztő proteolitikus enzimre specifikus előállítási helyet szelektálva.
Néhány célból azonban előnyös lehet az N-terminális extenziót úgy tervezni, hogy speciális célhoz legyen megfelelő. így az extenzió markerként szolgálhat a protein detektálásához, mint a protein tisztításánál segítségként, vagy egy gyógyszer hatásának in vivő szabályozására, pl. egy szer felezési idejének megnyújtására vagy a testben való speciális elhelyezés tervezésénél.
A jelen találmány polipeptidjének előnyben részesített megtestesítésében X1 és/vagy X4 IX aminosavak aminosav szekvenciáját képviselik. Ebben a megtestesítésben az X2-vel közvetlenül szomszédos aminosav előnyösen Glu vagy Asp, az X3-mal közvetlenül szomszédos aminosav előnyösen Glu vagy Asp vagy mindkettő Glu vagy Asp, mivel ez az előállítási hely kedvező elhelyezkedését biztosítja ezen aminosavak hidrofil tulajdonságának köszönhetően, ahogy azt a fentiekben bővebben részleteztük. Az X1 vagy X4 által képviselt aminosav szekvencia megfelelően tartalmazhat egynél több Glu-t vagy Asp-t.
A találmány polipeptidjének egy másik érdekes megtestesítésében X1 és X4 mind egy vagy több aminosavat képvisel, más szóval a polipeptid módosított mind a vezető peptid C-terminális végénél, mind a heterológ protein N-terminális végénél. Ebben a megtestesítésben X1 és X4 szimmetrikusan azonos lehet, azaz az X1 és X4 által képviselt aminosav vagy aminosavak ugyanazok sorrendben az X2-ből és X3-ból kinyúlva.
A találmány polipeptidjének jel peptid szekvenciája bármely jel peptid lehet, mely biztosítja az expresszált polipeptid sejtben való kiválasztási reakcióútjára való hatékony irányítását. A jel peptid lehet egy a természetben előforduló jel peptid vagy annak funkcionális részei, vagy lehet egy szintetikus peptid. Az a-faktor jel peptidet az egér nyál amiláz jel peptidjet, a módosított karboxipeptidáz jel peptidet vagy az élesztőgomba BARI jel peptidet megfelelő jel peptideknek találtuk, Az egér nyál amiláz jel szekvenciát O. Hagenbüchle et al., írták le, Natúré 289, 1981, pp. 643-646. A karboxipeptidáz jel szekvenciát L. A. Valis et al. írták le Cell 48, 1987, pp. 887-897. A BARI jel peptidet a WO 87/02 670 számú szabadalomban írták le.
A találmány polipeptidjének vezető peptid szekvenciája lehet bármely olyan vezető peptid. mely részt
HU 211 600 A9 vesz az expresszált polipeptid endoplazmás retikulumhoz való irányításában és tovább a kiválasztási útvonalon. Lehetséges vezető szekvenciák, melyek erre a célra megfelelőek, élesztőgombákból vagy más szervezetekből származó természtes vezető szekvenciák, mint amilyen az α-faktor vezető vagy annak egy funkcionális analógja. A vezető peptid lehet egy szintetikus vezető peptid is, pl. az egyik szintetikus vezetőt a WO 89/02463 közzétételi számú International Patent Application-ben írták le a következő aminosav szekvenciával:
A. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Gly-Phe-Leu-AspLeu-Ala-Gly-Glu-Glu-Ile-Ala-Glu-Asn-Thr-ThrLeu-Ala
B. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-LEu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala
C. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Ile-Ala-Glu-Asn-Thr-Thr-Leu-Ala
D. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala-Asn-Val-Ala-Met-Ala és
E. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala-Asn-Val-Ala-Met-Ala vagy ezek egy származézával.
A találmány módszerével létrehozott heterológ protein lehet bármely olyan protein, melyet előnyösen lehet termelni élesztőgombában. Az ilyen proteinekre példák az aprotinin, vagy más proteáz inhibitorok, az inzulin (ide értve az inzulin prekurzorokat), a humán vagy szarvasmarha növekedési hormon, az interleukin, a glukagon. a szövet plazminogén aktívátor, a VII Faktor. a VIII Faktor, a XIII Faktor, a trombocita eredetű növekedési faktor, az enzimek stb., vagy ezek egy funkcionális analógja. A jelen összefüggésben a „funkcionális analóg” fogalom egy a természetes proteinnel hasonló funkciójú polipeptidet hivatott jelölni (ezt úgy kell értelmezni, hogy inkább a természetes protein természetére, mintsem a biológiai aktivitás szintjére vonatkozik). A polipeptid szerkezetileg lehet hasonló a természetes proteinhez és származhat a természetes proteinből a természetes protein C és N terminális végeinek egyikéhez vagy mindkettőhöz való egy vagy több aminosav hozzáadásával, a természetes aminosav szekvencia egy vagy több különböző helyén, vagy egy vagy több aminosav helyettesítésével a természetes protein egyik vagy mindkét végén vagy az aminosav szekvencia egy vagy több helyén, vagy egy vagy több aminosav deléciójával, vagy a természetes aminosav szekvenciában egy vagy több helyen egy vagy több aminosav inzertálásával. Jól ismertek ilyen módosítások számos fent említett protein esetében.
A találmánynak megfelelően, meglepően azt tapasztaltuk, hogy a vezető peptid C-terminális végén vagy a heterológ protein N-terminális végén levő módosítások. ahogy fent leírtuk, lehetővé teszik a helyesen előállított aprotinin (vagy ahogy fent meghatároztuk egy funkcionális analógjának) magas hozamú termelését. Az aprotinin egy proteázgátló protein, melyet tulajdonságai hasznossá tesznek számos orvosi célra (pl. a pancreatitis kezelésében, a szeptikus sokk szindrómában, a hiperfibrinolitikus vérzésben és a szívinfarktus esetén). Az aprotinin adagolás nagy dózisban csökkenti a vérveszteséget szívsebészet vagy más nagyobb sebészeti beavatkozás esetében. Az aprotinin hasznos, mint tenyésztápközeg-adalék, mivel gátolja a gazda sejt proteázokat, melyek máskülönben az expresszált proteinek nemkívánatos proteolitikus hasítását okozzák. Élesztőgombákban helyesen előállított aprotinin magas hozamának elérése nehézségekbe ütközött ismert természetes vezető szekvenciákat - mint pl. amilyen az α-faktor vezetőt - használva. A természetes aprotinint az N-végnél egy bázikus aminosav (Arg) iniciálja és ezen oknál fogva az előző előállítási hely kevésbé megfelelő lehet a proteolitikus hasításhoz (mint azt fent magyaráztuk), ha az ismert vezető peptidek (pl. az α-faktor vezető) egyikét a jelen találmánynak megfelelő módosítás nélkül alkalmazzuk, a helyesen előállított aprotinin alacsony hozamát eredményezve, ha van egyáltalán hozam.
A jelen találmánynak megfelelően, különösen jó eredményeket értünk el az aprotinin termelést figyelembe véve, ha X1 GluArgLeuGlu-t képvisel, vagy ha X4 GluLeu vagy GluLeuAspLeu (lásd a következő példákat), bár azt várjuk, hogy kedvező aprotinin hozamokat lehet elérni X1 és X4 más jelentéseivel, feltéve, ha legalább egy aminosav - és legelőnyösebben az előállítási helyhez legközelebb levő - egy negatív töltésű aminosav, ahogy azt fent magyaráztuk.
Szintén a találmánynak megfelelően, azt találtuk, hogy a fent leírtak szerint a vezető peptid C-terminális végén vagy a heterológ polipeptid N-terminális végén levő módostások lehetővé teszik a helyesen előállított inzulin prekurzor vagy ahogy fent meghatároztuk ennek egy funkcionális analógja magas hozamú termelését. A találmány ezen megtestesítésében η X1 Glu-ArgLeu-Glu-t vagy Lys-Glu-Leu-Glu-t képviselhet, mely esetben X4 általában egy peptidkötést képvisel. Másik lehetőségként X4 a Glu-t képviselheti, mely esetben X1 általában egy peptidkötést képvisel. Különösen előnyös eredményeket értünk el a találmánynak megfelelően a B61-29)-AlaAlaLys-A(l-29) inzulin analóg prekurzor expresszióját tekintve, ha X1 LysGluLeuGlut képvisel vagy ha X4 a Phe Glu-val való helyettesítését képviseli - mint az inzulin prekurzor első aminosavját - (lásd a következő példákat). A B(l-29)SerAspAspAlaLys-A(l-29) inzulin analóg prekurzorból is elfogadható mennyiséget lehetett elérni, ha X1 Lys-Glu-LeuGlu-t képviselt. Továbbá azt várjuk, hogy az inzulin prekurzorból magas hozamot lehet elérni az X1 és X4 más jelentéseivel, feltételezve, hogy legalább egy aminsav és legelőnyösebben az, amelyik az előállítási helyhez legközelebb van, egy negatív töltésű aminosav, amint azt korábban magyaráztuk.
A találmány polipeptidjét kódoló DNS szerkezet előállítható szinetikusan, megalapozott standard módszerekkel pl. az S. L. Beaucage and Μ. H. Caruthers, Tetrahedron Letters 22, 1981, pp. 1859-1869 által leírt
HU 211 600 A9 foszforamidit módszertel, vagy a Matthes etal., EMBO Journal 3, 1984 pp. 801-805 által leírt módszerrel. A foszforamidit módszernek megfelelően oligonukleotidokat szintetizálunk pl. egy automata DNS szintetizálón, tisztítjuk őket, duplexeket képezünk és ligáluk a szintetikus DNS szerkezet létrehozása céljából.
A találmány DNS szerkezete lehet genom vagy cDNS eredetű, pl. egy genom vagy cDNS könytár preparálásával és a találmány polipeptidjének egészét vagy részét kódoló DNS szekvencia standard technikáknak megfelelően (lásd T. Maniatis et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1982) szintetikus oligonukleotid próbákkal végzett hiridizációjával való szkrineléssel lehet kinyerni. Ebben az esetben egy a jel és a vezető peptidet kódoló genom vagy cDNS szekvencia kapcsolódhat egy a heterológ proteint kódoló genom vagy cDNS szekvenciával, mely után a DNS szekvenciát módosítani lehet a polipeptid X'-T2-T3-X4 aminosav szekvenciának megfelelő helynél, pl. helyirányított mutagenezissel, a homológ rekombinációhoz szükséges kívánt aminosav szekvenciái kódoló szintetikus oligonukleotidokat használva. a jól ismert eljárásokkal egyező módon.
Végül a DNS szerkezet lehet kevert szintetikus és genom DNS, kevert szintetikus és cDNS vagy kevert genom és cDNS. melyeket a szintetikus genom vagy cDNS eredetű fragmentek - mely fragmentek megfelelnek a teljes DNS szerkezet különböző részeinek kétszálúvá tételével készítettünk (megfelelően), standard technikáknak megfelelően. így előre látható, hogy a heterológ proteint kódoló DNS szekvencia genom eredetű, míg a vezető peptidet kódoló szekvencia szintetikusan állítható elő.
Az aprotinint kódoló előnyben részesített DNS szerkezetek olyanok, mint amilyenek a 4. 7. 9. 11. és
12. csatolt ábrákban láthatók, vagy ezek aprotinint kódoló megfelelő módosításai, vagy ezek funkcionális analógjai. A DNS szekvenciák megfelelő módosításaira példák a nukleotid helyettesítések, melyek nem változtatják meg a protein aminosav szekvenciáját, de amely egyezik az élesztő szervezet kódon használatával, melybe a DNS szerkezetet inzertáltuk, vagy nukletoid helyettesítések, melyek hozzájárulnak egy eltérő aminosav szekvencia kialakulásához és ezért feltehetően egy eltérő protein szerkezethez, anélkül azonban, hogy káros hatással lennének az eredeti aprotinin antiprotenáz tulajdonságaira. A lehetséges módosításokra más példák a szenvenciába való egy vagy több nukleotid inzertálása, a szekvencia bármely végére való egy vagy több nukletoid hozzáadása és egy vagy több nukletoid deléciója a szekvencia bármely végén vagy a szekvencián belül. A specifikus aprotinin analógokra példák a 339 942 közzétételi számú Európai Patent Alkalmazásban kerültek leírásra.
Az inzulin prekurzorokat kódoló előnyben részesített DNS szerkezetek azok, amelyeket a 16. és 17. csatolt ábrákban mutattunk be, vagy azok megfelelő módosításai, ahogy fent meghatároztuk.
A találmány polipeptidjét kódoló DNS szekvenciát hordozó rekombináns expressziós vektor bármely vektor lehet, mely képes élesztő szervezetekben replikálódni. A vektorban a találmány polipeptidjét kódoló DNS szekvencia működőképesen kell kapcsolódjon egy megfelelő promoter szekvenciához. A promoter lehet bármely DNS szekvencia, mely transzkripciós aktivitást mutat élesztőgombában és származhat az élesztőgombákkal akár homológ, akár heterológ proteineket kódoló génekből. A promoter előnyösen származhat egy az élesztőgombával homológ proteint kódoló génből. A megfelelő promoterekre példák a Saccharomyces cerevisiae Mai, TPI, ADH, vagy PKG promoterek.
A találmány polipeptidjét kódoló DNS szekvencia működőképesen kell kapcsolódjon egy megfelelő terminátorhoz is, pl. a TPI terminátorhoz (lásd T. Alber and G. Kawasaki, J. Mól. Appl. Génét. 1, 1982, pp. 419-434).
A találmány rekombináns expressziós vektora továbbá tartalmaz egy DNS szekvenciát, mely képessé teszi a vektort az élesztőgombában való replikálódásra. Az ilyen szekvenciákra példák az élesztőgomba plazmid REP 1 -3 2 μ-os replikációs génjei és a replikációs origó. A vektor tartalmazhat egy szelektálható markert is, pl. Schizosaccharomycer pombe TPI gént, amint azt P. R. Russell Gene 40, 1985, pp. 125-130 leírta.
A találmány polipeptidjét kódoló DNS szekvenciák sorrendben a promoter és a terminátor ligálásához használt eljárások és ezek az élesztőgombában való replikációhoz szükséges információt hordozó megfelelő élesztőgomba vektorokba való inzertálásához használt eljárások jól ismertek a tudomány e területén képzett szakember számára (lásd pl. Maniatis et al., op. cit.). Érthető, hogy a vektor megszerkeszthető úgy, hogy vagy először a találmány polipeptidjét kódoló teljes DNS szekvenciát tartalmazó DNS szerkezetet hozzuk létre és ezt követően ezt a fragmentet egy alkalmas expressziós vektorba inzertáluk, vagy folyamatosan inzertáljuk az egyes elemek (mint pl. a jel-vezető vagy heterológ protein) genetikai információit tartalmazó DNS fragmenteket a ligálást megelőzően.
A találmány eljárásában használt élesztő szervezet lehet bármely alkalmas élesztő szervezet, mely a tenyésztés során nagy mennyiségben termeli a kérdéses heterológ proteint vagy polipeptidet. Az alkalmas élesztő szervezetekre példák lehetnek a saccharomyces cerevisiae. a saccharomyces kuyveri, Schizosaccharomyses pombe vagy a Saccharomyces uvarum élesztő fajok törzsei. Az élesztőgomba sejtek transzformációját protoplaszt képzéssel lehet befolyásolni, pl. (ld. később az 1. Példát), melyet a per se ismert módon végzett transzformáció követ. A sejtek szaporításához használt tápközeg bármely hagyományos tápközeg lehet, mely alkalmas élesztő szervezetek szaporítására. A szelektált heterológ proteint melynek egy jelentős része a tápközegben lesz jelen megfelelően előállított formában hagyományos eljárásokkal lehet a tápközegből kinyerni. Ezen eljárások magukba foglalják az élesztőgomba sejtek szeparlását a tápközegből centrifugálással vagy szűréssel, a felülúszó
HU 211 600 A9 vagy szűrlet proteines tartalmának egy sóval pl. ammónium szulfáttal való kicsapatását, melyet számos kromatográfiás eljárással, pl. inocserés kromatográfiával. affinitás kromatográviával vagy hasonlókkal végzett tisztítás követ.
További szempontból a találmány kapcsolatos az általános formájú X4-aprotinin(l-58) egy új aprotinin analógjával, ahol X4 egy vagy több aminosavból álló N-terminális extenziót képvisel, mely aminosavak közül legalább egy a Glu-t és Asp-t tartalmazó csoportból szelektált negatív töltésű aminosav. Az X4 egy 1-6 aminosavból álló szekvenciát képviselnek előnyösen 1-4 aminosavból állót és a fent leírt jelentések valamelyikét tartalmazhatja. A különösen előnyben részesített X4 jelentés a Glu-Leu és GluLeu-Asp-Leu.
A következőkben megadjuk a találmány ábráinak rövid ismertetését.
A találmányt a továbbiakban a következő példákban írjuk le a csatolt rajzokra hivatkozva, melyekben: Lábra: az aprotinin(l-58) DNS és aminosav sorrendjét szemlélteti. A DNS szekvenciában látható lépcsőzetes vonalak azokat a helyeket jelölik, ahová a szintetikus oligonukleotidokból képzett duplexeket ligáltuk.
2. ábra: A pKFN-802 és a pKFN-803 plazmid szerkezetét mutatja.
3. ábra: A pKFN-849 és pKFN-855 plazmid szerkezetét mutatja.
4. ábra: A pKFN-849 és a pKFN-855 plazmidokból való 406 bpár hosszúságú EcoRl-Cbal fragment DNS szekvenciáját mutatja. A nyíl azt a helyet jelöli, ahol a szekréció során a proteolitikus hasítás lezajlik.
5/A és 5/B ábra: A tripszin és plazmid aprotinin általi gátlását mutatja, ·’ a szarvasmarha pankreatikus aprotinint jelöli, x a GluLeu aprotinit jelöli és Δ a GluLeuAspLeu aprotinit jelöli.
6. ábra: a pKFN-852 és pKFN-858 plazmidok szerkezetét mutatja.
7. ábra: a pKFN-852 és a pKFN-858 plazmidokból való 412 bázispár hosszúsága EcoRl-Xbal fragment DNS szekvenciáját mutatja. A nyíl azt a helyet jelöli, ahol a szekréció során a proteolitikus hasítás lezejlik.
8. ábra: A pKNF-995 és pKNF-998 plazmidok szerkezetét mutatja.
9. ábra: A pKFN-995 és a pKFN-998 plazmidokból való 412 bázispár hosszúságú EcoRl-Xbal franment DNS szekvenciáját mutatja. A nyíl azt a helyet jelöli, ahol a szekréció során a proteolitikus hasítás lezajlik.
10. ábra: A pKFN-1000 és a pKFN-1003 plazmidok szerkezetét mutatja.
11. ábra: a pKFN-1000 és a pKFN-1003 plazmidokból való 412 bázispár hosszúságú £coRIXbal fragment DNS szekvenciáját mutatja. A nyíl azt a helyet jelöli, ahol a szekréció alatt a proteolitikus hasítás történik.
12. ábra: A szintetikus aprotinin(3-58) gén DNS szekvenciáját mutatja. A lépcsőzetes vonal azt a helyet jelöli, a szekvencián belül, ahová a 10 szintetizált oligonukleotidból képzett 5 duplexet ligáltuk.
13. ábra: A pKFN-305 és pKFN-374/375 plazmidok szerkezetét mutatja.
14. ábra: A pMT636 plazmid szerkezetét mutatja.
15. ábra: A pLaC240 plazmid szerkezetét mutatja.
16. ábra: A pLaC240-ből való módosított vezető inzulin prekurzor gén DNS szekvenciáját mutatja.
17. ábra: a pKFN-458 plazmidból való 508 bázispár hosszúságú EcoRl-Xbal fragment DNS szekvenicáját mutatja, mely az MFa-jel-vezető(l-85)-öt és az inzulin analóg prekurzor B(l-29, lGlu+27Glu)-AlaAlaLys-A(l-21)et kódolja.
A következőkben példákkal szemléltetjük a találmányt.
1. Példa
A KNF-837 élesztőgomba törzsből való Glu-LeuA-aprotinin (1-58) termelés
a) A pKFN—802 plazmid megszerkesztése Ligálással 10 oligonukleotidból szerkesztettünk meg egy az aprotinin(l-58)-at kódoló szintetikus gént.
Az oligonukletoidokat automata DNS szintetizálón szintetizáltuk foszforamidit kémiát alkalmazva szabályozott pórusos üveg segítségével (Beaucage, S. L. and
Caruthers, Μ. H., Tetrahedron Letters 22 (1981) 18591869).
A következő 10 oligonukleotidot szintetizáltuk:
NOR-760: CATGGCCAAAAGAAGGCCTGATTT CTGTTTGGAACCTCCATACACTGG TCC
NOR-754: TTACATGGACCAGTGTATGGAGGT TCCAAACAGAAATCAGGCCTTCTT TTGGC
NOR-354: ATGTAAAGCTAGAATCATCAGATA CTTCTACAACG
NOR-355: CTTGGCGTTGTAGAAGTATCTGAT GATTCTAGCT
NOR-356: CCAAGGCTGGTTTGTGTCAAACTT TCGTTTACGGTGGCT
NOR-357: CTCTGCAGCCACCGTAAACGAAA GTTTGACACAAACCAGC
NOR-358: GCAGAGCTAAGAGAAAGAACTTCA AGT
NOR-359: AGCAGACTTGAAGTTGTTTCTCTT AG
NOR-360: CTGCTGAAGACTGCATGAGAACTT GTGGTGGTGCCTAAT
NOR-361: CTAGATTAGGCACCACCACAAGTT CTCATGCAGTCTTC
Öt duplexet A-E hoztunk létre a fenti 10 ligonukleotidból, melyek az 1. ábrán láthatók.
pmol-t képeztünk a duplexek mindegyikéből
A-E, 5’ foszforilált oligonukleotidok megfelelő párjai7
HU 211 600 A9 ból 5 percig tartó hevítéssel 90 ”C hőmérsékleten, melyet szobahőmérsékletre való hűtés követett 75 perces időtartam alatt. Az 5 duplexet összekvertük és T4 DNS ligázzal kezeltük. A szintetikus gént a ligációs keverék 2%-os agaróz gélen való elektroforézisét követően izolultuk, mint egy 191 bázispár hosszúságú sávot. A nyert szintetikus gént az 1. ábra mutatja.
A szintetikus gént ligáltuk egy a pLaC212spx3 plazmidból származó 209 bázispár hosszúságú EcoRICMroI fragmenthez és a pUC19 plazmid 2,7 kbázisú EcoRi-Xbaí fragmentjéhez (Yanisch-Perron, C., Vieira, J. and Messing, J., Gene 33, (1985), 103-119). A pLaC 212spx3 plazmid a WO 89/02463 közzétételi számú International Patent Application 3. példájában került leírásra.
ApLaC212spx3 plazmid 209 bpár hosszúságú EcoRI-M?ol fragmentje egy szintetikus élesztőgomba vezető peptidet kódol.
A ligációs elegyet kompetens E. coli(r~, m+) törzsek transzformálására használtuk és ampicillin rezisztenciára szelektáltuk. Egy 22P-Xbal-Ecol fragment szekvenálása (Maxem. A. and Gilbert, W., Methods Enzymol. 65 (1980) 495-560) azt mutatta, hogy a kapott telepekből származó plazmidok tartalmazzák az aprotinin(l58) helyes DNS szekvenciáját.
Egy pKFN-802 plazmidot izoláltunk további használat céljából. A 2. ábra mutatja a pKFN-802 plazmid szerkezetét.
b) A pKFN-849, pKFN-855 plazmidok és a KFN837 élesztőgomba törzs megszerkesztése.
A pKFN-802 3. o kbázisú Ncoí-Stui fragmentjét ligáltuk a NOR-790/791 szintetikus fragmentjéhez T4 DNS ligázzal:
MAKRELR
CATGGCTAAGAGAGAATGAGA
CGATTCTCTCTTAACTCT
A ligációs elegyet a Stul resktrikciós enzimmel emésztettük, hogy csökkentsük a pKFN-802 bármilyen hátterét és a nyert elegyet kompetens E. coli (τ', m+) törzsek transzformálására használtuk, ampicillin rezisztenciára való szelektálással. A nyert telepek egyikéből származó pKFN-849 plazmidról DNS szekvenálással mutattuk ki [Sanger, E, Micklen, S., and Coulson, A. R., Proc. Natl. Acad Sci. USA 74 (1977) 54635467), hogy a szintetikus élesztőgomba vezető génhez helyesen fuzionálva tartalmazza a Glu-Leu-Aprotinin(l—58) DNS szekvenciát. A pKFN-849 plazmid szerkezetét a 3. ábra illusztrálja.
A pKFN-849 plazmidot vágtuk az £coRL-gyel és Cbal-gyel és a 406 bpár hosszúságú fragmentet ligáltuk a pMT636-ból való 9,5 kbázisú Ncol-Xbal fragmenthez és a pMT636-ból való 1,4 kbázisú Ncol-EcoRI fragmenthez. mely a pKFN-855 plazmidot eredményezte, lásd a 3. ábrát. A pMT636 plazmid a PCT/DK88/00138 számú International Patent Application-ben került leírásra.
A pMT636 egy E. coli-S. cerevisiae hordozó vektor. mely tartalmazza a Schizosaccharomyces pombe TP1 gént (PÓT) [Russel. P. R., Gene 40 (1985), 125130), a 5. cerevisiae trióz-foszfát izomeráz promotert és terminátort, a TPIp-t és TPIT-t (Alber, T., and Kawasaki, G., J. Mól. Appl. Gén. 1 (1982), 419^134). A pKFN-855 plazmid a következő szekvenciát tartalmazza:
TPIp-LaC212spx3 jel-vezető-Glu-Leu-aprotinin(l-58)-TPIT ahol LaC212spx3 jel-vezető az a szintetikus élesztőgomba vezető, ami a WO 89/0263 közzétételi számú International Patent Application-ben került leírásra. A pKFN-849 és pKFN-855 plazmidokból származó 406 bázispár hosszúságú EcoRl-Xbal fragment DNS szekvenciáját a 4. ábra mutatja.
AS. cerevisiae MT663 törzset (Έ2-7Β ΧΕ11-36 a/, tpi tpi, pép 4-3/pep 4-3)YPGal-on (1% Bacto élesztőkivonat, 2% Bacto pepton, 2% galaktóz, 1% laktát) szaporítottuk 600 nm hullámhosszon mért 0,6 O. D. értékig.
100 ml tenyészetből gyűjtöttük össze a sejteket centrifugálással, 10 ml vízzel mostuk, újra centrifugáltuk és 1.2 M szorbitot, 215 mM Na2EDTA-t pH=8,0 és 6,7 mg/ml ditiotreitolt tartalmazó 10 ml oldatban szuszpendáltuk. A szuszpenziót 30 °C hőmérsékleten 15 percig inkubáltuk, centrifugáltuk és a sejteket 10 ml 1,2 M szorbit 10 mM Na2EDTA-t 10,1 M Na-citrátot. pH=5,8 és 2 mg NovozymR-234-et tartalmazó elegyben reszuszpendáltuk. Az elegyet 30 °C hőmérsékleten 30 percig inkubáltuk, a sejteket centrifugálással összegyűjtöttük 10 ml 1,2 M szorbitot és 10 ml CAS-t (1,2 M szorbit, 10 mM CaCl2, 10 mM Tris-Hcl (Tris=Tris (hidroximetil)aminometán) pH=7 .5) tartalmazó elegyben mostuk és 2 ml CASben reszuszpendáltuk. A transzformáláshoz 0,1 ml CAS-ben reszuszpendált sejtet kevertünk megközelítően 1 pg pKFN-855 plazmiddal és a keveréket 15 percig szobahőmérsékleten hagytuk. 1 ml 20%-os polietilén glikol 4000-ret, 20 mM CaCI2t, 10 mM CaCl2, 10 mM Tris-HCl-ot, pH=7,5 tartalmazó elegyet adtunk hozzá és a keveréket további 30 percig szobahőmérsékleten hagytuk. A keveréket centrifugáltuk és a pelletet 0,1 ml SOS-ben (1,2 M szorbit, 33% v/v YPD. 6,7 mM CaCl2, 14 pg/ml leucin) resuszpendáltuk és 2 órán át 30 °C hőmérsékleten inkubáltuk. A szuszpenziót ezután centrifugáltuk és a pelletet 0,5 ml 1,2 M-os szorbitban reszuszpendáltuk. Ezután 52 °C hőmérsékleten 6 ml fedő agart (Sherman et al., SC tápközege, Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory (1981)], mely 1,2 M szorbitot + 2,5% agart tartalmaz) adtunk hozzá, majd a szuszpenziót ugyanezen agarral szilárdított szorbit tartalmú tápközeget tartalmazó lemezek tetejére öntöttük. A transzformáns telepeket 30 ’C hőmérsékleten való 3 napig tartó inkubálás után újra izoláltuk és folyékony tenyészetek inokulálásához használtuk. Egy ilyen KFN-837 transzformánst szelektáltunk a további jelleméshez.
A KFN-837 élesztőgomba törzset YPD tápközegen |1% élesztőki vonat, 2% pepton (Difco Laboratoriestól) és 6% glükóz) szaporítottuk. A törzs tenyészetének 200 ml mennyiségét rázattuk 250 rpm fordulaton 30 °C hőmérsékleten 3 napig 600 nm hullámhosszon mért 20
HU 211 600 A9
O. D. értékig (a száraz élesztőgomba biomassza 18,8 g/liter). Centrifugális után a felülúszót analizáltuk FPLC inocserés kromatográfiával. Az élesztőgomba felülúszót 0,22 pm Millex GV szűrőegységen szűrtük keresztül és 1 ml-t 20 mM Bicine-nel (pH=8,7) equlibrált MonoS kationcserés oszlopra (0,5x5,0 cm) helyeztük. Az equlibrációs pufferrel való mosás után az oszlopot equlibrációs pufferben lineáris NaCl grádienssel (0-1 M) eluáltuk. A tripszin inhibitor aktivitást spektrofotometriás vizsgálattal (Kassel, B., Methods Enzymol. 19 (1970), 844-852) határoztuk meg az eluált frakciókban, majd a továbbiakban a 280 nm hullámhosszon mért abszorpció integrálásával a következő egyenletből:
1%
E (aprotinin)=8,3
A hozam 120 mg/liter Glu-Leu-aprotinin(l-58) volt.
Az aminosav analízishez és az N-terminális szekvenáláshoz a grádiens eluált Glu-Leu-aprotinin(l58)-at koncentráltuk és fordított fázisú oszlopon (Vydac C4 4,6x250 mm) végzett HPLC-vel tisztítottuk. Az eluálást 0,1%-os TFA-ban CHjCN grádienssel végeztük. Az összegyűjtött frakciókat 100 μΙ-re koncentráltuk be vákum centrifugálással és a mintákat N-terminális szekvenáláshoz és aminosav analízishez használtuk.
Az N-terminális szekvencálással a következő szekvenciáit találtuk:
Glu-Leu-Arg-Pro-Asp-Phe-X-Leu-Glu-Pro-Pro-TyrThr-Gly-Pro-X-Lys-Ala-Arg-Ile-Ile-Arg-Tyr-Phe-TyrAsn-Ala-Lys-Ala megerősítve, hogy az N-terminális vég helyes. A félcisztein maradékokat nem határoztuk meg ezzel a módszerrel, melyeket a vak ciklusokkal (X) megegyezően a 7-es és 16-os számú maradékokra kaptunk.
Az aminosav analízist az 1. táblázat mutatja. Ebből a táblázatból kitűnik, hogy a termékek a várt aminosav összetétele van. pl. több Glu és Leu. A kicsit alacsonyabb Ile tartalom legvalószínűbben az Ile( 18)-Ile( 19) nem teljes hidrolízisének tulajdonítható (ez jól ismert a tudomány számára). Az Arg szintén egy kevéssel több, mint vártuk. Ez azonban a természetes aprotinin esetén is látható (1. táblázat, 3. oszlop).
Ha Kassel fent említett módszerével összehasonlítjuk a Glu-Leu-aprotinin(l-58) specifikus aktivitása megegyezik a kísérleti hibán belül a természetes aprotinin aspecifikus aktivitásával. A Glu-Leu-aprotinin (1-58) tripszin és plazma gátlása a később leírtak szerini meghatározott titrálási görbe szempontjából elkülöníthetetlen volt a szarvasmarha pankreáz aprotininétől (Aprotinin Novo). Az enzim aprotininnel vagy annak analógjával való 30 percig tartó inkunbálása után 0.6 mM S 2251 -et (KabiVitrum) adtunk és az aktivitást, mint a nitroanilin termelés arányát határoztuk meg. Az aktivitást az aprotinin koncentráció függvényeként ábrázoltuk az 5A és 5B ábrákban. Mind a 3 inhibitorral mindkét eznim teljes gátlását figyeltük meg.
2. példa
A Glu-Leu-Asp-Leu-aprotinin( 1-58) KFN-840 élesztőgomba törzsben való termelése
Egy a Glu-Leu-Asp-Leu-aprotinin(l-58)-at kódoló szintetikus gént az 1. Példában leírtak szerint szerkesztettük meg. A NOR-793/794 szintetikus fragmentet használtuk a NOR-790/791 helyett:
MAKRELDLR
CATGGCTAAGAGAGAATTGGACTTGAGA
CGATTCTCTCTTAACCTGAACTCT
A pUC19 eredetű pKFN-852 plazmidot a pKFN849 plazmidhoz hasonló módon szerkesztettük meg.
Az 1. Példa eljárását követve egy pKFN-858 plazmidot nyertünk, mely a következő szerkezetet tartalmazza:
TPIP-LaC212spx3-jel-vezető-GluLeuAspLeu-aprotinin (l-58)-TPIT.
A pKFN-852 és pKFN-858 plazmidok megszerkesztését a 6. ábra illusztrálja. A pKFN-852 és pKFN858 plazmidokból való 412 bázispár hosszúságú EcoRI-ΧάαΙ fragment DNS szekvenciáját a 7. ábrában adtuk meg.
A pKFN-858 plazmidot az MT663 élesztőgomba törzsbe transzformáltuk, mely a KFN-840 élesztőgomba törzset eredményezte. A kFN-840 200 ml tenyészetét YPD tápközegben rázattuk 250 rpm fordulaton 30 °C hőmérsékleten, 3 napig 600 nm hullámhosszon mért 18 O. D. értékig (a száraz biomassza 16,7 mg/liter). A felülúszó FPLC ion kromatográfiája, ahogy fent leírtuk 90 mg/liter Glu-Leu-Asp-Leu-aptoinin (1-58) hozamot eredményezett.
Az aminosav analízis az 1. táblázatban látható és megerősíti a várt aminosav összetételt.
A Glu-Leu-Asp-Leu-aprotinin(l-58) tripszin és plazmin gátlási titrációs görbéi elkülöníthetetlenek voltak a szarvasmarha pankreáz aprotininétől (Aprotinin Novo). lásd az 5/A és %/B ábrákat.
3. Példa
A KFN-1006 élesztőgomba törzsből való aprotinin(l-58) termelése
A pKFN-995 plazmidot a pKFN-802 plazmidból szerkesztettük meg, a 3,0 kbázis hosszúságú Ncol-Stul fragment NOR-848/849 szintetikus fragmenthez való ligái ásával:
MaAKELERKRR
CATGGCTAAGGAATTGGAGAAGAGAAGG
CGATTCCTTAACCTCTTCTCTTCC
A ligációs elegyet a Ball restrikciós enzimmel emésztettük, hogy csökkentsük a pKFN-802 bármilyen hátterét.
A pKFN-998 élesztőgomba expressziós plazmidot alapjában véve az 1. példában leírtak szerint szerkesztettük meg. amint azt a 8. ábra mutatja:
TPlP-LaC212spx3 jel-vezető(l-47) Lys-Glu-LeuGlu (Lys-Arg)-Aprotinin(l-58)-TPIT.
A pKFN-995 és pKFN-998 plazmidokból való 412 bázispár hosszúságú FcoRI-ΧάαΙ fragment DNS szekvenciáját a 9. ábrán adtuk meg.
HU 211 600 A9
A pKFN-998 plazmidot az MT663 élesztőgomba törzsbe tranformáltuk az 1. példában leírtak szerint, mely a KFN-1006 élesztőgomba törzset eredményezte. A transzformált kKFN-1006 törzset YPD tápközegben való tenyésztését és az aprotinin(l-58) felülúszóban való analízisét a fent leírtak szerint végeztük.
Az aprotinin(l-58) hozam 30 mg/liter volt.
A tisztított anyag aminosav analízise megerősítette a várt aminosav összetételt.
4. Példa
A KFN-1008 élesztőgomba törzsből való aprotinin( 1-58) termelés
ApUC eredetű pKFN-1000 plazmidot az 1. példában leírtak szerint szerkesztettük meg a pKFN-802 plazmnid 3,0 kbázisű Ncol-Stul fragment NOR850/851 szintetikus fragmenthez való ligálásával: M-AERLEKRR
CATGGCTGAGAGATTGGAGAAGAGAAGG
CGACTCTCTAACCTCTTCTCTTCC
Az 1. és 3. példa eljárását követve egy pKFN-1003 élesztőgomba expressziós plazmidot nyertünk, mely a következő szerkezetet tartalmazta:
TPIP-LaC212spx3-jel-vezető(l—47)-GluArgLeuG lu(Lys-Arg)-aprotinin(l-58)-TPIT.
A pKFN-1000 és pKFN-1003 plazmidok szerkezetét a 10. ábra illusztrálja. A pKFN-1000 és pKFN-1003 plazmidokból való 412 bázispár hosszúságú £coRI-Y6aI fragment DNS szekvenciáját all. ábrán adtuk meg.
A pKFN-1003 plazmidot az MT663 élesztőgomba törzsbe transzformáltuk a fent leírtak szerint, mely a KFN-1008 élesztőgomba törzset eredményezte.
A transzformált KFN-1008 törzs YPD tápközegben való tenyésztését és az aprotinin( 1-58) felülúszóban való analízisét a fent leírtak szerint végeztük. Az aprótinin) 1-58) hozam 120 mg/liter volt.
A tisztított anyag aminosav analízise igazolta a várt aminosav összetételt. Továbbá a teljes elsődleges szerkezet igazolását a redukált piridiletilált polipeptid gáz fázisú szekvenálásával nyertük.
Továbbá a rekombináns aprotinin(l-58) tripszinnel szembeni specifikus gátló aktivitása megkülönböztethetetlen volt a szarvasmarha pankreáz aprotininétől.
5. Példa
A KFN-783 élesztőgomba törzsből való aprotinin( 1-58) termelés
A pKFN-802 plazmidot (lásd az 1. példát) £coRIgyel és ΧάαΙ-gyel vágtuk és a 400 bázispár hosszúságú fragmentet a pMT636 plazmidból származó 9,5 kbázisú Ncol-Xbal fragmenthez és a pMT636 plazmidból származó 1,4 kbázisú Ncol-Ecol fragmenthez ligáltuk, mely a pKFN-803 plazmidot eredményezte, lásd a 2. ábrát. A pKFN-803 a következő szerkezetet tartalmazza:
TPIP-LaC212spx3 jel-vezető-aprotinin( 1—58)—TPIT.
1. Táblázat Aminosav összetétel
Aminosav Aprotinin Elméleti Aprotinin Mért KFN-837 Mért KFN-840 Mért
Asp 5 5,00 4,95 5,93 (+1)
Thr 3 2,86 2,84 2,85
Ser 1 0,94 0,92 0,93
Glu 3 3,04 3,97 (+1) 3,99 (+1)
Pro 4 4,18 3,90 3,86
Gly 6 5,95 5,91 5,94
Alá 6 5,85 5,92 5,94
Cys 6 5.20 5,21 5.22
Val 1 0,99 1,00 1,01
Met 1 0,83 0,65 0,67
Ile 0 1.39 1,58 1,58
Leu Ί 1.97 3,00(+1) 4,00 (+2)
Tyr 4 3,84 3,74 3,71
Phe 4 3,98 3,94 3,92
Lys 4 3,92 3,99 3,99
Arg 6 6,39 6,35 6,34
Összesen L 56.33 57.87 59.88
A fent leírtak szerint transzformáltuk az MT663 35 élesztőgomba törzsbe a pKFN-803 plazmidot. A fent leírtak szerint tenyésztettük a transzformált KFN-783 törzset YPD tápközegben és a felülúszó FPLC ion kormatográfiáját a fent leírtak szerint végezzük. Az aprotinin(l-58) mennyiségi meghatározását a szarvasmarha pankreázból tisztított autentikus aprotinin standardizált oldatának kromatográfiájával való összehasonlítással végeztük. Az aprotinin( 1-58) hozama 1 mg/liter alatt volt.
6. Példa
Az aprotininf 3-58) termelése
Az aprotinin (3-58) szintetikus génjét ligálással szerkesztettük meg, számos oligonukleotidból.
Az 1. példában leírtak szerint szintetizáltuk a következő 10 oligonukleotidot.
I : AAAGAGATTTCTGTTTGGAACCTCCATACACTGGTCC
II : TTACATGGACCAGTGTATGGAGGTTCCAAACAGAAACT
III : ATGTAAAGCTAGAATCATCAGATACTTCTACAACG
IV: CTTGGCGTTGTAGAAGTATCTGATGATTCTAGCT
V: CCAAGGCTGGTTTGTGTCAAACTTTCGTTTACGGTGGCT
VI : CTCTGCAGCCACCGTAAACGAAAGTTTGACACAAACCAGC
VII: GCAGAGCTAAGAGAAACAACTTCAAGT
VIII: AGCAGACTTGAAGTTGTTTCTCTTAG
IX: CTGCTGAAGACTGCATGAGAACTTGTGGTGGTGCCTAAT
X: CTAGATTAGGCACCACCACAAGTTCTCATGCAGTCTTC
5-mer 3 8-mer 3 5-mer 34-mer
39- mer
40- mer 27-mer 26-mer 39-mer 38-mer
HU 211 600 A9
Öt duplexet A-E hoztunk létre a fenti oligonukleotidokból, amint azt a 12. ábra mutatja.
A duplexek A-E mindegyikéből 20 pmol mennyiséget hoztunk létre az 5’-foszforilált oligonukleotidok I-X megfelelő párjaiból 5 percig tartó 90 ’C hőmérsékleten való hevítéssel, melyet 75 percig tartó szobahőmérsékletre való hűtés követett. Az 5 duplexet összekevertük és T4 ligázzal kezeltük. A szintetikus gént, mint egy 176 bázispár hosszúságú sávot izoláltuk a ligációs keverék 2%-os agaróz gélen való elektroforézise után. A nyert szintetikus gént a 12. ábrán mutatjuk.
A szintetikus 176 bázispár hosszúságú gént ligáltuk egy a 5. cerevisiae al párosodási faktor jel-vezető(l85) szekvenciát (Markussen, J. et al., Protein-Engineering 1. (1987), 215-223] kódoló pKFN-9 plazmidból származó 330 bázispár hosszúságú EcoJti-Hgal fragmenthez és a pUC19 (Yanisch-perron, C., Vieira, J. and Messing, J„ Gene 33 (1985), 103-119] plazmidból származó 2,7 kbázisú EcőftA-Xba\ fragmenthez. Az MFal vezető szekvencia után közvetlenül egy Hga\ helyet tartalmazó pKFN-9 szerkezete az EP 214826 sz. szabadalomban került leírásra.
A ligitációs keveréket egy kompetens E coli (r, m+)törzs tranformálására használtuk ampicillin renisztencára való szelektálással. A 32P-Xi>alragment szelektálása (Maxam, A., and Gilbert, W., Methods Enzymol 65 (1980). 499-560) azt mutatta, hogy a nyert telepekből származó plazmidok az aprotinin (3-58) helyes DNS szekvenciáját tartalmazzák.
Egy plazmidot. a pKFN-305 plazmidot, szelektáltuk további használat céljából. A pKFN-305 plazmid szerkezetét a 13. ábrán illusztráltuk.
A pKFN-305 plazmidot EcoRI-gyel és ΧάαΙ-gyel vágtuk és a 0.5 kbázisú fragmentet ligáltuk a pMT636 plazmidból származó 9,5 kbázisú Ncol-Xbal fragmenthez és a pMT636 plazmidból származó 1,4 kbázisú M?oI-£coRI fragmenthez, mely a pKFN374 plazmidot eredményezte, lásd a 13. ábrát. A pMT636 plazmidot a pMT608 palzmidból a LEU-2 gén deléciója után és a pMT479 plazmidból szerkesztettük meg. lásd a 14. ábrát. A pMT608 plazmid az EP 195 691 számú szabadalomban került leírásra. A pMT479 plazmid az EP163 529 számú szabadalomban került leírásra. A pMT 479 plazmid tartalmazza a Schizosaccharomyces pombe TPI gént (PÓT), a S. cerevisiae triózfoszfát izomeráz promotert és terminátort. a TPIP-t és a TPIT-t (Aber, T. and Kawasaki, G„ J. Mól. Appl. Gén. 1 (1982), 419-434]. A pKFN374 plazmid a következő TPIP-MF 1-jel-vezetői 1-85 )-aprotinin(3-58)-TPIT, ahol MFa a 5. cerevisiae 1 párosodási faktort kódoló szekvencia (Kurjan. J. and Herskowitz, I., Cell 30(1982), 933-943), a jel-vezetó(l-85) azt jelenti, hogy a szekvencia tartalmazza az MFal jel-vezető szekvencia első 85 aminosav maradékát és az aprotinin (3-58) egy az első két aminosav maradékkal nem rendelkező aprotinin származékot kódoló szintetikus szekvencia.
A 5. cerevisiae MT663 törzsét (E2-7B XE11-36 a/aAtpiAtpi. pep4-3/pep4-3) YPD tápközegen (1%
Bacto élesztőkivonal, 2% Bacto pepton, 2% galaktóz, 1% laktát) szaporítottuk 600 nm hullámhosszon mért 0,6 O. D: értékig.
A nyert tenyészet 100 ml mennyiségből a sejteket centrifugálással összegyűjtöttük, 10 ml vízzel mostuk, újra centrifugáltuk és 10 ml 1,2 M szorbitot, 25 mM Na2EDTA-t (pH=8,0) és 6,7 mg/ml ditiotreitolt tartalmazó oldatban szuszpendáltuk. A szuszpenziót 15 percig 30 ’C hőmérsékleten inkubáltuk, centrifugáltuk és a sejteket 10 ml 1,2 M szorbitot, 10 mM Na2EDTA-t, 0,1 M nátrium-citrátot (pH=5,8) és 2 mg NovozymR 234-et tartalmazó oldatban reszuszpendáltuk. A szuszpenziót 30 percig 3§ ’C hőmérsékleten inkubáltuk, a sejteket centrifugálással összegyűjtöttük 10 ml 1,2 ml 1,2 M szorbit és 10 ml CAS (1,2 M szorbit, 10 mM CaCl2, 10 mM Tris-HCl (Tris-Tris(hidroximetil)aminomentán (pH=7,5) elegyében mostuk és 2 ml CAS-ben reszuszpendáltuk. A transzformációhoz a 0,1 ml CAS-ben reszuszpendált sejteket összekevertük megközelítően lpg pKFN374 plazmiddal és 15 percig szobahőmérsékleten hagytuk. Egy ml 20% polietilén glikol 4000, lOmM CaCl2, 10 mM Tris HCI (pH=7,5) elegyét adtuk hozzá és a keveréket további 30 percig szobahőmérsékleten hagytuk. A keveréket centrifugáltuk és apelletet 0,1 ml SOS-ben (1,2 M szorbit, 33% v/v YPD, 6,7 mM CaCl2, 14 pg/ml leucin) reszuszpendáltuk és 2 órán keresztül 30 ’C hőmérsékleten inkubáltuk. A szuszpenziót ekkor centrifugáltuk és a pelletet reszuszpendáltuk 0,5 ml 1,2 M-os szorbitban. Ezután 6 ml fedő agart (Sherman et al.-fék SC tápközeg (Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratories, 1981), mely 1,2 M szorbitot +2,5% agart tartalmaz] adtunk 52 ’C hőmérsékleten hozzá és a szuszpenziót ugyanezen ágánál szilárdított szorbit tartalmú tápközeget tartalmazó lemezek felületére öntöttük. Atranszformáns telepeket 30 ’C hőmérsékleten 3 nap után újra izoláltuk és folyadék tenyészetek indításához használtuk őket. Egy ilyen KFN-322 transzformánst szelektáltunk további jellemzés céljából.
A KFN-322 élesztőgomba törzset YPD tápközegen szaporítottuk [1% élesztőkivonat, 2% pepton (a Difco Laboratoriestól) és 2% glükóz]. A törzs 10 ml tenyészetét 30 ’C hőmérsékleten rázattuk, 600 nm hullámhosszon mért 32 O. D. értékig. Centrifugálás után a felülúszót FPLC ioncserés kromatográfiával vizsgáltuk. Az élesztőgomba felülúszót 0,22 pm-es MillexR GV szűrőegységen szűrtük át és 1 ml-t adtunk egy MonoS kationcserés oszlopra (0,5x5 cem), melyet 20 m -os Bicine-nel (pH=8,7) equlibráltunk. Az equlibrációs pufferrel való mosás után az oszlopot equlibrációs pufferben levő lineáris NaCl grádienssel (0-1 M) eluáltuk. A tripszin inhibitor aktivitás mennyiségi meghatározását az eluált frakciókban spektrofotometriás vizsgálattal végeztük, majd a továbbiakban a 280 nm hullámhosszon mért abszorpció integrálásával a következő egyenletből:
1% ^280 (aprotinin)=8,3
A hozam kb.3 mg/liter aprotinin(3-58) volt.
HU 211 600 A9
7. Példa
Az inzulin prekurzor B(J-29)-AlaAlaLys-A( J-21) termelése a LaCl 667 élesztőgomba törzsből A WO 89/02 463 számú szabadalomban leírt pLac
212spx3 plazmidból izoláltuk az 589 bpár hosszúságú Sphl-Ncol és a 172 bpár hosszúságú Hpal-Xbal fragmenteket. Ezeket a ragmenteket kapcsoltuk a szintetikus adaptorhoz:
MAKELEKRFV
NOR-962 CATGGCTAAGGAATTGGAAAAGA GATTCGTT
NOR-964 CGATTCCTTAACCTTTTCTCTAAGC AA és a pMT-743 plazmidból való a WO 89/02463 számú szabadalmakban leírt 10 kbázisú Xbal-Sphl fragmenthez, mely a pLaC240 plazmidot eredményezte (lásd a 15. ábrát). A pLaC24O plazmidból való módosított vezetőinzulin prekurzor gén DNS szekvenciáját a 16. ábra mutatja.
Az MT663 élesztőgomba törzs pLaC240 plazmiddal való transzformálása egy inzulin prekurzort szekretáló törzshöz a LaCl 1667-hez (MT663/PlaC240) vezetett. melynek produktivitása 165%-a a WO 89/02463 számú szabadalomban leírt módosítás nélküli vezetőinzulin prekurzort kódoló gént tartalmazó LaC1414 (MT663/pLaC212spx3) törzshöz viszonyítva.
8. Példa
Az inzulin analóg prekurzor B( 1-29,
IGlu+27Glu)-AlaAlaLys-A( 1-2]) termelése a
KFN^47O élesztőgomba törzsből
Tíz oligonukleotid ligálásával egy az inzulin analóg prekurzor B(l-29, lGlu+27Glu)-AlaAlaLysA(l —21 )-et kódoló szintetikus gént szerkesztettünk meg. A B (1-29. lGlu+27Glu) a humán inzulin B láncának (melyben Glu maradékokkal helyettesítették a BIPhe és a B27Thr maradékokat) első 29 aminosav maradékát tartalmazó polipeptidet juttatja kifejezésre. Az A(l—21) a humán inzulin A lánca. Az AlaAIaLys tripeptid a B29Lys maradékot kapcsolja az AlGly maradékhoz.
A következő 10 oligonukleotid szintetizáltuk: NOR-542: AAAGAGAAGTTAACCAACACTTG
TGCGGTTCCCAC
NOR-543: AACCAAGTGGGAACCGCACAAGT GTTGGTTAACTTC
NOR-69: TTGGTTGAAGCTTTGTACTTGGTT TGCGGTGAAAGAGGTTTCT
NOR-73: GTAGAAGAAACCTCTTTCACCGCA AACCAAGTACAAAGCTTC
NOR-315: TCTACGAACCTAAGGCTGCTAAGG GTATTGCT
NOR-316: ATTGTTCGACAATACCCTTAGCAG CCTTACGTTC
NOR-70: GAACAATGCTGTACCTCCATCTGC TCCTTGTACCAAT
NOR-71: TTTTCCAATTGGTACAAGGAGCAG ATGGAGGTACAGC
NOR-78: TGGAAAACTACTGCAACTAGACG CAGCCCGCAGGCT
NOR-72: CTAGAGCCTGCGGGCTGCGTCTAG TTGCAGTAG
Öt duplexet képeztünk a fenti 10 oligonukleotidból és a duplexeket az 1. Példában leírtakhoz hasonló módon ligáltuk. A szintetikus 175 bázispár hosszúságú gént ligáltuk a S. cerevisiae 1 párosodási faktor jel-vezető (1-85) szekvenciát (Markussen, J. et. al., Protein Engineering 1 (1987), 215-223] kódoló pKFN-9 plazmidból való 330 bázispár hosszúságú EcoRl-Hgal fragmenthez és a pUC19 plazmid (Yanisch-Perron, C., Vieira, J. and Messing, J., Gene 33 (1985), 103-119] 2,7 kbázisú EchoR\-Xba\ fragmentjéhez.
A ligációs keveréket eg kompetens E. coli (r'm+) törzs transzformálására használtuk, amplicillin rezisztenciára szelektálva. A 22P-Xbal-EcoRl fragment szekvenálására [Maxam, A. and Gilbert, W., Methods Enzymol. 65 (1980) 499-560] azt mutatta, hogy a kapott telepekből származó plazmidok tartalmazták az inzulin analóg prekurzor helyes DNS szekvenciáját.
Egy plazmidot, a pKFN-456 plazmidot szelektáltuk további használatra.
Az 1. Példa eljárását követve egy élesztőgomba expressziós plazmidot, a pKFN-458 plazmidot nyertük, mely a következő expressziós kazettát tartalmazza: TPlp-MF 1 -jel-vezetőd -85 )-B( 1-29, 1G1u+27G1u)AlaAlaLys-A(l-21)-TPIT.
A pKFN-456 és pKFN-458 plazmidokból származó 508 bázispár hosszúságú EcoRl-Xbal fragment DNS szekvenciáját a 17. ábrában adtuk meg.
A pKFN-458 plazmidot az MT663 élesztőgomba törzsbe transzformáltuk a fent leírtak szerint, mely a KFN-470 élesztőgomba törzset eredményezte.
A KFN-470 transzformált törzs YPD tápközegen való tenyésztését a fent leírtak szerint végeztük. A felülúszóban levő inzulin analóg prekurzor hozamot a leírtak szerint [L. Snel et al., Chromatographia 24 (1987), 329-332) HPLC-vel határoztuk meg.
A 2. táblázatban az inzulin analóg prekurzorok a B(l—29, 1G1u+27G1u)-AlaAIaLys-A(l-21) és Bf 1-29, 27Glu)-AlaAlaLys-A(l-21) és az inzulin prekurzor B (l-29)-AlaAlaLvs-A( 1-21) expressziós szintjeit hasonlítottuk össze. Mind a három prekurzort ugyanabban a gazda törzsben, az MT663-ban expresszáltuk és az expressziós kazettát tartalmazó plazmidokat tartalmazó S. pombe TPI génnel transzformáltuk. Az expressziós kazetta:
TPIp-MF 1 -jel-vezető( 1-85 )-pre kurzor-ΤΡ1Ψ.
2. táblázat
Élesztőgomba transzformánsokban levő inzulin és inzulin analóg prekurzorok expressziós szintjei Prekurzor Expressziós szint’
B(l-29)-AlaAlaLys-A(l-21) 100%
B( 1-29. 27Glu)-AlaAlaLys-A(l-21) 148%
B(l-29. lGlu+27Glu)-AlaAlaLysA(l-21) 479%
Az expressziós szinteket az inzulin prekurzor B(l29)-AlaAlaLvs-A(l-21) expressziós szintjének százalékában adtuk meg, melyet önkényesen 100%-nak vettünk.

Claims (44)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. Egy jel peptid, egy vezető peptid és egy heterológ protein vagy polipeptid fúzióját tartalmazó polipeptid, mely polipeptidnek módosítottuk egy élesztőgomba előállítási hellyel szomszédos aminosav szekvenciáját, melyet úgy pozícionáltunk a vezető peptid C-terminális vége és a heterológ protein N-terminális vége közé, hogy biztosítsa az előállítási hely egy olyan beállítását, mely hozzáférhetővé teszi azt a proteolitikus hasítás számára, a polipeptidnek a következő szerkezete van:
    jel peptid-vezetó peptid-X’-X2-X3-X4-heterológ protein, ahol
    X1 egy peptid kötés, vagy egy vagy több aminosavat képvisel, melyek lehetnek azonosak vagy eltérőek,
    X2 és X3 ugyanolyanok vagy eltérőek és egy a Lys-t és
    Arg-t tartalmazó csoportból szelektált bázikus aminosavat képvsileik,
    X2 és X3 együttesen egy élesztőgomba előállítási helyet határoznak meg, és
    X4 egy peptid kötés vagy egy vagy több aminosavat képvisel, melyek azonosak vagy eltérőek lehetnek, azzal a feltétellel, hogy X1 és/vagy X4 egy vagy több aminosavat képviselnek és hogy legalább egy az X1 és/vagy X4 által képviselt aminosav a Glu-t és Asp-t tartalmazó csoportból szelektált negatív töltésű aminosav, azzal a további feltétellel, hogy ha X’ jelentése peptidkötés, akkor X4 nem lehet Glu-Ala-Glu-Ala vagy Glu-Ala-Glu-Ala-Ser-LeuASp, és ha X4 jelentése peptidkötés, akkor X1 jelentése nem lehet Ser-Leu-Asp.
  2. 2. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 Glu-t vagy Asp-t képvisel.
  3. 3. Egy az 1, igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X' egy a BA szerkezetű két aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A Glu vagy Asp és B Glu. Asp, Val, Gly vagy Leu.
  4. 4. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X' egy a CBA szerkezetű három aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A és B olyan mint ahogy azt fent meghatároztuk és C Glu, Asp, Pro, Gly, Val, Leu, Arg vagy Lys.
  5. 5. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 egy a DCBA szerkezetű négy aminosavból állószekvenciát képvisel, ahol A, B és C olyan mint a fent meghatározott és D ugyanolyan jelentésű, mint C.
  6. 6. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 egy az EDCBA szerkezetű öt aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B, C és D olyan, mint a fent meghatározott és E ugyanolyan jelentésű mint C.
  7. 7. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 egy az FEDCBA szerkezetű hat aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B, C, D és E olyan mint a fent meghatározott és F ugyanolyan szerkezetű, mint C.
  8. 8. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 Glu vagy Asp.
  9. 9. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egy az AB szerkezetű két aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A Glu vagy Asp és B Glu Asp, Val, Gly vagy Leu.
  10. 10. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egy az ABC szerkezetű három aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A és B olyan mint a fent meghatározott és C Glu, Asp, Pro, Gly, Val, Leu, Arg vagy Lys.
  11. 11. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egy az ABCD szerkezetű négy aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B és C olyan mint a fent meghatározott és D ugyanolyan jelentésű mint C.
  12. 12. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egy az ABCDE szerkezetű öt aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol ABC és D ugyanolyan mint a fent meghatározott és E ugyanolyan jelentésű, mint C.
  13. 13. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egy az ABCDEF szerkezetű hat aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B, C, D és E olyan mint a fent meghatározott és F ugyanolyan jelentésű, mint C.
  14. 14. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 és/vagy X4 1-nél több aminosavat képvisel, az X2-vel közvetlenül szomszédos aminosav Glu vagy Asp, az X3-mal közvetlenül szomszédos aminosav Glu vagy Asp vagy mindkettő Glu vagy Asp.
  15. 15. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy ha X1 és/vagy X4 1-nél több aminosavat képvisel, akár X1 akár X4 vagy mindkettő több mint egy Glu-t vagy Asp-t tartalmaz.
  16. 16. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 és X4 J 1 aminosavat képvisel.
  17. 17. Egy a 16. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy XI és X4 szimmetrikusan azonos.
  18. 18. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy ha X4 1 vagy több aminosavat képvisel, eg további előállítási hely biztosított az X4 és a heterológ protein N-terminális vége között.
  19. 19. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a jelpeptid egy α-faktor jelpeptid, az egér nyál amiláz jel peptidje, a karbocipeptidáz jel peptid, vagy az élesztőgomba BARI jel peptidje.
  20. 20. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a vezető peptid egy természetes vezető peptid, mint amilyen az α-faktor vezető peptid.
  21. 21. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a vezető peptid egy szintetikus vezető peptid, mint amilyen az:
    A. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Gly-Phe-Leu-AspLeu-Ala-Gly-Glu-Glu-Ile-Ala-Glu-Asn-Thr-ThrLeu-Ala
    B. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala
    C. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Iel-Ala-Glu-Asn-Thr-Thr-Leu-Ala
    HU 211 600 A9
    D. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala-Asn-Val-Ala-Met-Ala és
    E. Ala-Pro-Val-Thr-Gly-Asp-Glu-Ser-Ser-Val-GluIle-Pro-Glu-Glu-Ser-Leu-Ile-Ile-Ala-Glu-Asn-ThrThr-Leu-Ala-Asn-Val-Ala-Met-Ala vagy ezek egy származékával.
  22. 22. Egy az 1. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a heterológ proteint vagy polipeptidet a következőket tartalmazó csoportból szelektáltuk: aportinin vagy más proteáz inhibitorok, inzulin és inzulin prekurzorok, humán vagy szarvasmarha növekedési hormonok, interleukin, szövet plazminogén aktivátor glukagon, VII Faktor, VIII Faktor, XIII Faktor, trombocita eredetű növekedési faktor, enzimek, és ezen proteinek bármelyikének funkcionális analógjai.
  23. 23. Egy a 22. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy heterológ protein vagy poilpeptid aprotinin vagy annak egy funkcionális analógja.
  24. 24. Egy a 23. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 Glu-Arg-Leu-Glu vagy Lys-GluLeu-Glu.
  25. 25. Egy a 23. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 Glu-Leu vagy Glu-Leu-Asp-Leu.
  26. 26. Egy a 22. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a heterológ protein vagy polipeptid inzulin vagy egy inzulin prekurzor vagy annak egy funkcionális analógja.
  27. 27. Egy a 26. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X1 Glu-Arg-Leu-Glu vagy Lys-GluLeu-Glu.
  28. 28. Egy a 26. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 Glu.
  29. 29. Egy a 26-28. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy a heterológ protein vagy polipeptid egy inzulin analóg prekurzor B81—29)AlaAlaLys-A(l-29) és ahol X1 Lys-Glu-Leu-Glu.
  30. 30. Egy a 26-28. igénypontok bármelyike szerint polipeptid azzal jellemezve, hogy a heterológ protein vagy polipeptid egy inzulin analóg prekurzor B(l-29)-SerAspAspAla Lys-A (1-29) és ahol X1 Lys-Glu-Leu-Glu.
  31. 31. Egy DNS szerkezet, mely egy az 1-30. igénypontok szerinti polipeptidet kódoló DNS szekvenciát tartalmaz.
  32. 32. Egy a 31. igénypont szerinti DNS szerkezet azzal jellemezve, hogy tartalmazza a 4., 7., 9. vagy 11. ábrákon bemutatott DNS szekvenciát vagy ennek megfelelő módosítását.
  33. 33. Egy rekombináns expressziós vektor, mely képes élesztőgombában replikálódni és mely egy a 31. vagy 32. igénypontok szerinti DNS szerkezetet hordoz.
  34. 34. Egy élesztőgomba törzs, mely képes egy heterológ proteint vagy polipeptidet expresszálni és melyet egy a 33. igénypont szerinti vektorral transzformáltunk.
  35. 35. Egy eljárás heterológ protein vagy plipeptid élesztőgombában való termelésére, mely tartalmazza egy a 34. igénypont szerinti élesztőgomba törzs egy megfelelő tápközegben való tenyésztését a heterológ protein vagy polipeptid expresszálásának, szekréciójának, előállításának céljából, mely után a proteint vagy polipeptidet a tápközegből izoláljuk.
  36. 36. Az X4-aprotinin(l-58) általános formula egy aprotinin analógja, ahol X4 egy vagy több aminosav N-terminális extenzióját képviseli, mely aminosavak közül legalább egy a Glu-t és Asp-t tartalmazó csoportból szelektált negatív töltésű aminosav.
  37. 37. Egy a 36. igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 Glu vagy Asp.
  38. 38. Egy a 36. igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 egy AB szerkezetű két aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol a A Glu vagy Asp B Giu, Asp, Val, Glu, vagy Leu.
  39. 39. Egy a 36. igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 egy ABC szerkezetű három aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A és B olyan mint a fent meghatározott és C Glu, Asp, Pro, Gly, Val, Leu, Arg vagy Lys.
  40. 40. Egy a 36. igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 egy ABCD szerkezetű négy aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B és C olyan mint a fent meghatározott és D ugyanolyan jelentésű mint C.
  41. 41. Egy a 36. igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 egy ABCDE szerkezetű öt aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B, C, és D olyan mint a fent meghatározott és E ugyanolyan jelentésű mint C.
  42. 42. Egy a 36. igénypont szerniti analóg azzal jellemezve. hogy X4 egy ABCDEF szerkezetű hat aminosavból álló szekvenciát képvisel, ahol A, B, C, D és E olyan mint a fent meghatározott és F ugyanolyan jelentésű mint C.
  43. 43. Egy a 36. igénypont szerinti polipeptid azzal jellemezve, hogy X4 egynél több aminosavat képvisel, X4 egynél több Glu-t vagy Asp-t tartalmaz.
  44. 44. Egy a 36 igénypont szerinti analóg azzal jellemezve, hogy X4 Glu-Leu vagy Glu-Leu-Asp-Leu.
HU95P/P00592P 1989-03-03 1995-06-29 Yeast expressing system HU211600A9 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DK105489A DK105489D0 (da) 1989-03-03 1989-03-03 Polypeptid
DK494189A DK494189D0 (da) 1989-10-06 1989-10-06 Polypeptid

Publications (1)

Publication Number Publication Date
HU211600A9 true HU211600A9 (en) 1995-12-28

Family

ID=26065137

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU902376A HU215538B (hu) 1989-03-03 1990-03-01 Eljárás heterológ proteinek előállítására új élesztő kifejező rendszerrel
HU95P/P00592P HU211600A9 (en) 1989-03-03 1995-06-29 Yeast expressing system

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU902376A HU215538B (hu) 1989-03-03 1990-03-01 Eljárás heterológ proteinek előállítására új élesztő kifejező rendszerrel

Country Status (23)

Country Link
US (3) US5395922A (hu)
EP (1) EP0461165B2 (hu)
JP (1) JP2609367B2 (hu)
KR (1) KR970005928B1 (hu)
AT (1) ATE110414T1 (hu)
AU (1) AU624694B2 (hu)
CA (1) CA2050336C (hu)
CZ (1) CZ285239B6 (hu)
DD (1) DD296965A5 (hu)
DE (1) DE69011853T3 (hu)
DK (2) DK105489D0 (hu)
ES (1) ES2062514T5 (hu)
FI (1) FI104985B (hu)
HU (2) HU215538B (hu)
IE (1) IE66469B1 (hu)
IL (1) IL93609A (hu)
NO (2) NO304236B1 (hu)
NZ (1) NZ232742A (hu)
PL (1) PL163532B1 (hu)
RU (1) RU2194758C2 (hu)
UA (1) UA27706C2 (hu)
WO (1) WO1990010075A1 (hu)
ZA (1) ZA901476B (hu)

Families Citing this family (72)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5591603A (en) * 1987-08-28 1997-01-07 Novo Nordisk A/S Process for preparing aprotinin and aprotinin analogs in yeast cells
DK105489D0 (da) * 1989-03-03 1989-03-03 Novo Nordisk As Polypeptid
WO1990014431A1 (en) * 1989-05-19 1990-11-29 Biotechnology Research And Development Corporation Fusion proteins having an in vivo post-translational modification site and methods of manufacture and purification
GB9015825D0 (en) * 1990-07-18 1990-09-05 Ciba Geigy Ag In vitro processing of fusion proteins
DK300090D0 (da) * 1990-12-19 1990-12-19 Novo Nordisk As Fremgangsmaade til fremstilling af leadersekvenser
GB9106185D0 (en) * 1991-03-22 1991-05-08 Wellcome Found Biological control agents
FR2686899B1 (fr) * 1992-01-31 1995-09-01 Rhone Poulenc Rorer Sa Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant.
FI92601C (fi) * 1992-03-11 1994-12-12 Marja Makarow Menetelmä hyötyproteiinien erittämiseksi hiivoista
US5521086A (en) * 1993-09-16 1996-05-28 Cephalon, Inc. Secretion sequence for the production of a heterologous protein in yeast
DE4417353A1 (de) * 1994-05-18 1996-01-25 Bayer Ag Verfahren zur Herstellung von rekombinantem Aprotinin und rekombinanten Aprotinin Varianten mit der natürlichen N-terminlaen Sequenz
IL114160A (en) * 1994-06-17 2006-12-31 Novo Nordisk As Dna constructs encoding heterologous proteins and processes for the heterologous protein production in yeast
US6500645B1 (en) 1994-06-17 2002-12-31 Novo Nordisk A/S N-terminally extended proteins expressed in yeast
US5861267A (en) * 1995-05-01 1999-01-19 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Methods, nucleotide sequences and host cells for assaying exogenous and endogenous protease activity
ZA9610456B (en) * 1995-12-20 1997-06-20 Novo Nordisk As N-terminally extended proteins expressed in yeast
US5851800A (en) * 1996-05-14 1998-12-22 Pharmacia & Upjohn Ab Process for producing a protein
DE19629982A1 (de) 1996-07-25 1998-01-29 Bayer Ag Aprotinin-Varianten mit verbesserten Eigenschaften
EP1365028B1 (en) 1996-12-13 2009-03-18 Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. Method for expression of PDGF or IGF proteins in yeast
AU7873798A (en) * 1996-12-20 1998-07-17 Novo Nordisk A/S N-terminally extended proteins expressed in yeast
EP0954589A1 (en) * 1997-01-24 1999-11-10 Novo Nordisk A/S Synthetic leader peptide sequences
US6046000A (en) * 1997-11-07 2000-04-04 Millennium Biotherapeutics, Inc. Method for identifying genes encoding signal sequences
KR20010034305A (ko) 1998-01-23 2001-04-25 한센 핀 베네드 효모에서 원하는 폴리펩티드를 만드는 방법
CN1415019A (zh) 1999-12-29 2003-04-30 诺沃挪第克公司 用于生产在酵母中具有改进发酵产量的胰岛素前体和胰岛素前体类似物的方法
US20050100991A1 (en) * 2001-04-12 2005-05-12 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
CA2405557C (en) 2000-04-12 2013-09-24 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US20050054051A1 (en) * 2001-04-12 2005-03-10 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US7507413B2 (en) * 2001-04-12 2009-03-24 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US7595172B2 (en) 2001-07-24 2009-09-29 Novo Nordisk A/S Method for making acylated polypeptides
AU2002364587A1 (en) 2001-12-21 2003-07-30 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
EP2261250B1 (en) 2001-12-21 2015-07-01 Human Genome Sciences, Inc. GCSF-Albumin fusion proteins
US7309505B2 (en) 2002-09-13 2007-12-18 Cornell Research Foundation, Inc. Using mutations to improve Aspergillus phytases
EP1594530A4 (en) 2003-01-22 2006-10-11 Human Genome Sciences Inc HYBRID PROTEINS OF ALBUMIN
JP2007532096A (ja) 2003-11-14 2007-11-15 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ アシル化されたインスリンの製造方法
CN102816228A (zh) 2003-12-03 2012-12-12 诺和诺德公司 单链胰岛素
WO2007020256A1 (en) 2005-08-16 2007-02-22 Novo Nordisk A/S Method for making mature insulin polypeptides
US8722620B2 (en) 2006-02-27 2014-05-13 Novo Nordisk A/S Insulin derivatives
US20080026376A1 (en) * 2006-07-11 2008-01-31 Huaming Wang KEX2 cleavage regions of recombinant fusion proteins
US8198046B2 (en) 2006-07-11 2012-06-12 Danisco Us Inc. KEX2 cleavage regions of recombinant fusion proteins
HUE029512T2 (hu) 2006-09-22 2017-03-28 Novo Nordisk As Proteázrezisztens inzulinanalógok
JP5503968B2 (ja) 2006-09-27 2014-05-28 ノボ・ノルデイスク・エー/エス 成熟インスリンポリペプチドの作製方法
ES2425413T3 (es) 2006-11-22 2013-10-15 Novo Nordisk A/S Método para preparar carboxipeptidasa activada
JP5688969B2 (ja) 2007-07-16 2015-03-25 ノボ・ノルデイスク・エー/エス プロテアーゼに対して安定しているペグ化インスリンアナログ
ES2558930T3 (es) 2007-08-13 2016-02-09 Novo Nordisk A/S Análogos de la insulina de acción rápida
EP2178912B1 (en) 2007-08-15 2015-07-08 Novo Nordisk A/S Insulin analogues with an acyl and aklylene glycol moiety
ES2526924T3 (es) 2007-08-15 2015-01-16 Novo Nordisk A/S Insulinas con una fracción acilo que comprende unidades repetitivas de aminoácidos que contienen alquilenglicol
US8501449B2 (en) 2007-12-04 2013-08-06 Proteon Therapeutics, Inc. Recombinant elastase proteins and methods of manufacturing and use thereof
WO2009115469A1 (en) 2008-03-18 2009-09-24 Novo Nordisk A/S Protease stabilized, acylated insulin analogues
WO2009121884A1 (en) 2008-04-01 2009-10-08 Novo Nordisk A/S Insulin albumin conjugates
CA2755300A1 (en) * 2009-03-12 2010-09-16 Bigtec Private Limited A polynucleotide and polypeptide sequence and methods thereof
PT2612677E (pt) 2009-06-26 2015-09-10 Novo Nordisk As Preparação compreendendo insulina, nicotinamida e arginina
CN102639559B (zh) 2009-11-25 2015-04-29 诺沃—诺迪斯克有限公司 用于制备多肽的方法
CN102791730A (zh) 2010-01-22 2012-11-21 诺沃—诺迪斯克有限公司 低度o-糖基化的fgf21的制备方法
WO2011161125A1 (en) 2010-06-23 2011-12-29 Novo Nordisk A/S Insulin derivatives containing additional disulfide bonds
CN102933599A (zh) 2010-06-23 2013-02-13 诺沃—诺迪斯克有限公司 包含额外的二硫键的人胰岛素
EP2585484A1 (en) 2010-06-23 2013-05-01 Novo Nordisk A/S Insulin analogues containing additional disulfide bonds
JP2014501239A (ja) 2010-12-14 2014-01-20 ノヴォ ノルディスク アー/エス インスリン、ニコチンアミドおよびアミノ酸を含む製剤
EP2651432A1 (en) 2010-12-14 2013-10-23 Novo Nordisk A/S Fast-acting insulin in combination with long-acting insulin
EP2720711A1 (en) 2011-06-15 2014-04-23 Novo Nordisk A/S Multi substituted insulins
RU2460795C1 (ru) * 2011-07-06 2012-09-10 Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГУП "ГосНИИгенетика") Способ микробиологического синтеза секретируемого соматотропина человека и штамм дрожжей saccharomyces cerevisiae - продуцент секретируемого соматотропина человека
WO2013186138A1 (en) 2012-06-14 2013-12-19 Novo Nordisk A/S Preparation comprising insulin, nicotinamide and arginine
EP2925345B1 (en) 2012-12-03 2018-09-05 Merck Sharp & Dohme Corp. Method for making o-glycosylated carboxy terminal portion (ctp) peptide-based insulin and insulin analogues
CN103254277B (zh) * 2013-05-03 2017-02-08 南京工业大学 强分泌性信号肽增强小肽模序及其应用
JP2016521701A (ja) 2013-06-07 2016-07-25 ノヴォ ノルディスク アー/エス 成熟インスリンポリペプチドを作製するための方法
PL233560B1 (pl) 2014-12-05 2019-10-31 Mabion Spolka Akcyjna Sposób otrzymywania insuliny lub analogu insuliny z prekursora rekombinowanego białka
US10562951B2 (en) 2015-03-10 2020-02-18 Merck Sharp & Dohme Corp. Process for preparing recombinant insulin using microfiltration
EP3303380B1 (en) 2015-06-02 2020-01-15 Novo Nordisk A/S Insulins with polar recombinant extensions
JP2018531901A (ja) 2015-08-25 2018-11-01 ノヴォ ノルディスク アー/エス 新規インスリン誘導体及びその医学的使用
WO2017032797A1 (en) 2015-08-25 2017-03-02 Novo Nordisk A/S Novel insulin derivatives and the medical uses hereof
JP2018531900A (ja) 2015-08-25 2018-11-01 ノヴォ ノルディスク アー/エス 新規インスリン誘導体及びその医学的使用
KR102043067B1 (ko) * 2017-08-08 2019-11-11 엘지전자 주식회사 차량용 사이드 미러 및 차량
CN111032685A (zh) 2017-08-17 2020-04-17 诺沃挪第克公司 新型酰化胰岛素类似物及其用途
CA3159114A1 (en) 2019-12-11 2021-06-17 Frantisek Hubalek Novel insulin analogues and uses thereof
WO2023144240A1 (en) 2022-01-26 2023-08-03 Novo Nordisk Research Centre Oxford Limited Glucose sensitive insulin derivatives and uses thereof

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU5712580A (en) * 1979-04-05 1980-10-09 James Joseph Connell Engine charging and scavenging
US4546082A (en) * 1982-06-17 1985-10-08 Regents Of The Univ. Of California E. coli/Saccharomyces cerevisiae plasmid cloning vector containing the alpha-factor gene for secretion and processing of hybrid proteins
JPS60501140A (ja) * 1983-04-22 1985-07-25 アムジエン 酵母による外因性ポリペプチドの分泌
US4588684A (en) * 1983-04-26 1986-05-13 Chiron Corporation a-Factor and its processing signals
DK58285D0 (da) * 1984-05-30 1985-02-08 Novo Industri As Peptider samt fremstilling og anvendelse deraf
JPS61264000A (ja) * 1985-03-21 1986-11-21 イミユネツクス コ−ポレイシヨン 標識ペプチドによるタンパク質の合成
JPS6236183A (ja) * 1985-06-20 1987-02-17 ザ・サルク・インステイチユ−ト・バイオテクノロジ−/インダストリアル・アソシエイツ・インコ−ポレ−テツド サツカロミセス・セレビシエからのポリペプチドの発現および分泌
MC1834A1 (fr) * 1986-07-10 1988-06-03 Transgene Sa Bloc fonctionnel d'adn et plasmide codant pour l'hirudine,levure transformee,procede de preparation de l'hirudine,hirudine obtenue et son utilisation
US4987070A (en) * 1987-03-04 1991-01-22 Suntory Limited Use of a 97 amino acid leader sequence from the E. coli B-galactosidase gene for the production of hanp and hptc as fusion proteins
AU1987088A (en) * 1987-06-24 1989-01-19 Novo Nordisk A/S A process for preparing a protein or polypeptide, a dna sequence coding for the polypeptide, a microorganism containing the dna sequence as well as the polypeptide and its use as a pharmaceutical preparation
DK450187D0 (da) * 1987-08-28 1987-08-28 Novo Industri As Fremgangsmaade til fremstilling af proteiner
DK463887D0 (da) * 1987-09-07 1987-09-07 Novo Industri As Gaerleader
JPH01240191A (ja) * 1988-02-16 1989-09-25 Green Cross Corp:The 酵母で機能する新規シグナルペプチドおよびこれを用いた異種蛋白質の分泌発現
DK336188D0 (da) * 1988-06-20 1988-06-20 Nordisk Gentofte Propeptider
EP0387319B1 (en) * 1988-07-23 1996-03-06 Delta Biotechnology Limited Secretory leader sequences
DK105489D0 (da) * 1989-03-03 1989-03-03 Novo Nordisk As Polypeptid

Also Published As

Publication number Publication date
NO974899L (no) 1997-10-23
NO913427L (no) 1991-11-01
KR920701452A (ko) 1992-08-11
WO1990010075A1 (en) 1990-09-07
NZ232742A (en) 1991-10-25
AU5261290A (en) 1990-09-26
JPH04504846A (ja) 1992-08-27
HU215538B (hu) 1999-01-28
NO913427D0 (no) 1991-09-02
DE69011853T2 (de) 1994-12-15
HUT58370A (en) 1992-02-28
IE66469B1 (en) 1995-12-27
PL163532B1 (pl) 1994-04-29
EP0461165B2 (en) 1998-03-25
DK0461165T3 (da) 1994-11-21
AU624694B2 (en) 1992-06-18
DK105489D0 (da) 1989-03-03
FI104985B (fi) 2000-05-15
CZ285239B6 (cs) 1999-06-16
DE69011853D1 (de) 1994-09-29
ATE110414T1 (de) 1994-09-15
IE900749L (en) 1990-09-03
NO304236B1 (no) 1998-11-16
CZ103990A3 (cs) 1999-03-17
CA2050336C (en) 2000-01-18
ZA901476B (en) 1990-11-28
ES2062514T3 (es) 1994-12-16
EP0461165B1 (en) 1994-08-24
ES2062514T5 (es) 1998-06-01
IL93609A (en) 2001-11-25
FI914125A0 (fi) 1991-09-02
DD296965A5 (de) 1991-12-19
HU902376D0 (en) 1991-11-28
US5395922A (en) 1995-03-07
CA2050336A1 (en) 1990-09-04
JP2609367B2 (ja) 1997-05-14
US5514585A (en) 1996-05-07
US5510249A (en) 1996-04-23
KR970005928B1 (ko) 1997-04-22
NO974899D0 (no) 1997-10-23
EP0461165A1 (en) 1991-12-18
UA27706C2 (uk) 2000-10-16
DE69011853T3 (de) 1998-06-25
IL93609A0 (en) 1990-12-23
RU2194758C2 (ru) 2002-12-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
HU211600A9 (en) Yeast expressing system
JP3730255B2 (ja) イーストにおいて発現されたn末端に伸長した蛋白質
US5162498A (en) Synthetic yeast leader peptides
RU2143495C1 (ru) Способ получения гетерологичного белка
US5639642A (en) Synthetic leader peptide sequences
US6500645B1 (en) N-terminally extended proteins expressed in yeast
EP0195691A1 (en) Process for the preparation of Insulin Precursors and process for the preparation of human insulin
JP2001527387A (ja) 合成リーダーペプチド配列
EP0946735B1 (en) N-terminally extended proteins expressed in yeast
EP0868523B1 (en) Vector for expression of n-terminally extended proteins in yeast cell