ES2322426T3 - Polipeptidos con actividad alfa-amilasa y acidos nucleicos que codifican a los mismos. - Google Patents

Polipeptidos con actividad alfa-amilasa y acidos nucleicos que codifican a los mismos. Download PDF

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Bjarne Roenfeldt Nielsen
Torben Vedel Borchert
Vibeke Skovgaard Nielsen
Henrik Bisgard-Frantzen
Allan Svendsen
Carsten Andersen
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Abstract

Polipéptido aislado con actividad alpha-amilasa y con una secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4.

Description

Polipéptidos con actividad \alpha-amilasa y ácidos nucléicos que codifican a los mismos.
Antecedentes de la invención Campo de la invención
La presente invención se refiere a polipéptidos aislados que contienen actividad \alpha-amilasa y secuencias de ácidos nucleicos aisladas que codifican los polipéptidos. La invención también se refiere a constructos de ácidos nucleicos, vectores, y células huéspedes que comprenden las secuencias de ácidos nucleicos al igual que métodos para producir y usar los polipéptidos. Además, la invención también se refiere a composiciones para lavandería, lavado de vajilla y/o limpieza de superficies duras.
Descripción de las técnicas relacionadas
Durante varios años las enzimas \alpha-amilasas han sido usadas con algunos propósitos diferentes, los más importantes la licuefacción de almidón, el desencolado textil, la modificación de almidón en la industria del papel y de la pasta de papel, y la elaboración de cerveza y panadería. Otro uso de las \alpha-amilasas, que cada vez es más importante, es la eliminación de manchas amidáceas durante el lavado con un detergente a pH alcalino.
Ejemplos de productos comerciales de \alpha-amilasa son Termamyl®, Duramyl^{TM}, Natalase®, BAN® y Fungamyl®, todos disponibles a través de Novo Nordisk A/S, Dinamarca. Estos y otros productos similares de otras fuentes comerciales tienen un pH óptimo que va de ácido a neutro, normalmente en el rango de pH 5-7.5, y éstos no presentan actividad óptima en soluciones detergentes a pH alcalino.
WO 95/26397 expone una \alpha-amilasa de una cepa de Bacillus.
WO 96/23873 describe variantes de amilasas de Bacillus con un rendimiento mejorado bajo condiciones de lavado.
US 5.147.796 describe una pululanasa alcalina con actividad alfa-amilasa. La Fig. 2b del documento muestra actividad amilasa óptima a pH 8-8.5.
M. Takagi et al., J. Ferment. Bioeng., vol 81, Nº 6: 557-559 (1996) describe una pululanasa de alfa-amilasa alcalifílica de Bacillus sp. La enzima tiene actividad amilasa óptima a pH 9, pero la actividad cae rápidamente a pH más alto, y la actividad a pH 10 es menor que a pH 7.
WO 97/00324 (KAO) expone un gen que codifica una \alpha-amilasa alcalina licuefactante derivada de la cepa KSM-AP1378 de Bacillus sp. con el nº de depósito FERM BP-3048 adecuada para detergentes.
Es un objetivo de la presente invención proporcionar nuevas \alpha-amilasas con un rendimiento mejorado en soluciones alcalinas, especialmente en soluciones detergentes alcalinas a pH aproximadamente 9-11.
Resumen de la invención
La presente invención se refiere a polipéptidos aislados con actividad \alpha-amilasa y con una secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No:2 o la SEC ID No:4.
La presente invención también se refiere a secuencias de ácidos nucleicos aisladas que codifican los polipéptidos y a constructos de ácidos nucleicos, vectores, y células huéspedes que comprenden las secuencias de ácidos nucleicos al igual que métodos para producir y usar los polipéptidos.
Breve descripción de las figuras
La presente invención está ilustrada con mayor detalle con referencia a los dibujos anexos, donde:
La Figura 1 muestra el alineamiento de varias \alpha-amilasas de Bacillus.
La Figura 2 muestra el Perfil de pH de las \alpha-amilasas AAI-6 y AAI-10 en comparación con las \alpha-amilasas SP722 y SP690. La actividad se muestra en valores absolutos como Abs650/mg. El perfil de pH se mide a 37ºC.
La Figura 3 muestra el Perfil de Temperatura de las \alpha-amilasas AAI-6 y AAI-10 a pH 9.0 en comparación con las \alpha-amilasas de referencia SP722 y SP690.
La Figura 4 muestra el rendimiento de lavado de AAI-6 y AAI-10 en el AP Model Detergent 97 en comparación con SP722, SP690 y Termamyl®.
\newpage
La Figura 5 muestra el rendimiento de lavado de AAI-6 y AAI-10 en Omo Multi Acao en comparación con SP722, SP690 y Termamyl®.
La Figura 6 muestra el rendimiento de lavado de AAI-6 y AAI-10 en Omo Concentrado en comparación con SP722, SP690 y Termamyl®.
La Figura 7 muestra el rendimiento de lavado de AAI-6 y AAI-10 en Ariel Futur líquido en comparación con SP722, SP690 y Termamyl®.
Descripción detallada de la invención Fuente microbiana
Las \alpha-amilasas alcalinas de la invención pueden ser derivadas de una cepa de Bacillus. Cepas preferidas son las cepas DSM 12650 (la \alpha-amilasa AAI-6) o DSM 12651 (la \alpha-amilasa AAI-10) de Bacillus sp. Estas cepas fueron depositadas el 25 de enero de 1999 por los inventores según las condiciones del Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional del Depósito de Microorganismos a los fines del Procedimiento en Materia de Patentes en la empresa Deutshe Sammmlung von Microorganismen und Zellkulturen Gmbh (DSMZ), Mascheroder Weg 1b, D-38124 Braunschweig DE.
Las cepas denominadas NN049469 y NN049468 de Escherichia coli que contienen los genes de \alpha-amilasa en los plásmidos pLiH1300 (AAI 6) y pLiH1298 (AAI10), respectivamente, también fueron depositados el 7 de abril de 1999 según las condiciones del Tratado de Budapest con la empresa Deutshe Sammmlung von Microorganismen und Zellkulturen Gmbh (DSMZ), Mascheroder Weg 1b, D-38124 Braunschweig DE, y fueron dados los números de acceso DSM12763 y DSM12762, respectivamente. Los organismos donantes de Bacillus sp. depositados anteriormente fueron recogidos en Islandia en 1997.
Polipéptidos con Actividad \alpha-amilasa
Las \alpha-amilasas (\alpha-1,4-glucano-4-glucanohidrolasas, EC 3,2,1,1) constituyen un grupo de enzimas, que catalizan la hidrólisis del almidón y otros oligo y polisacáridos 1,4-glucosídicos lineales y ramificados. A efectos de la presente invención, la actividad \alpha-amilasa es determinada usando el ensayo Phadebas o el ensayo pNPG7 descritos más adelante en la sección "Materiales y Métodos".
Homología de Enzima
La homología de la secuencia de aminoácidos se puede determinar como el grado de identidad entre las dos secuencias que indica una derivación entre la primera secuencia y la segunda. La homología puede ser determinada de forma adecuada mediante programas informáticos conocidos en la técnica. Así, el GAP proporcionado en la versión 8 del GCG (Needleman, S.B. and Wunsch, C.D., (1970), Journal of Molecular Biology, 48: 443-453) puede ser usado para alinear parejas de las secuencias y calcular el grado de identidad o grado de homología usando los ajustes por defecto. De forma alternativa, el GAP de la versión 9 del GCG puede ser usado con una versión 8 traducida de la matriz de marcado peptídico, una penalización de creación de Gap de 30, una penalización de extensión de Gap de 1 usando matriz de ntol (http://plasmid/\simbioweb/matrix/) sin penalización de Gap terminal.
Homología para \alpha-amilasas conocidas de Bacillus sp
Una búsqueda de homología de secuencias conocidas mostró homologías para las secuencias de la invención con varias amilasas de Bacillus en el rango 67-81% en aminoácidos determinadas como se ha descrito anteriormente.
Específicamente, las \alpha-amilasas homólogas a las secuencias de la invención (es decir, la SEC ID No: 2 y la SEC ID No: 4) son SP690 (la SEC ID No: 1 de la patente US nº 5.856.164, que es homóloga en aproximadamente un 81%), SP722 (la SEC ID No: 2 de la patente US nº 5.856.164, que es homóloga en aproximadamente un 81%) y la parte madura (aminoácidos 31-516) de la \alpha-amilasa KSM-AP1378 obtenida de Bacillus sp. divulgada como la SEC ID No: 2 de WO 97/00324, que es homóloga en aproximadamente un 81% a las secuencias de la invención.
Preferiblemente, los polipéptidos de la presente invención comprenden la secuencia de aminoácidos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 o una variante alélica de la misma; o un fragmento del mismo que tenga actividad \alpha-amilasa. La SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 muestran la parte madura de las \alpha-amilasas alcalinas de la invención.
Un fragmento de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 son polipéptidos con uno o más aminoácidos delecionados del amino y/o carboxilo terminal de esta secuencia de aminoácidos.
Una variante alélica denota cualquiera de las dos o más formas alternativas de un gen que ocupa la misma localización cromosómica. Una variación alélica surge de forma natural a través de una mutación, y puede suponer polimorfismo dentro de poblaciones. Las mutaciones de genes pueden ser silenciosas (ningún cambio en el polipéptido codificado) o pueden codificar polipéptidos que tengan secuencias de aminoácidos alterados. Una variante alélica de un polipéptido es un polipéptido codificado por una variante alélica de un gen.
Las secuencias de aminoácidos de los polipéptidos homólogos pueden diferir de la secuencia de aminoácidos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 por una inserción o deleción de uno o más residuos aminoácidos y/o la sustitución de uno o más residuos aminoácidos por diferentes residuos aminoácidos. Preferiblemente, los cambios de aminoácidos son de una naturaleza menor que la de las sustituciones de aminoácidos conservadoras que no afectan de forma significativa al doblamiento y/o a la actividad de la proteína; pequeñas deleciones, normalmente de uno a aproximadamente 30 aminoácidos; extensiones amino o carboxilo terminales pequeñas, tales como un residuo de metionina aminoterminal; un pequeño péptido de enlace de hasta aproximadamente 20-25 residuos; o una pequeña extensión que facilite la purificación cambiando la carga neta u otra función, tal como un tracto de polihistidina, un epítopo antigénico o un dominio de unión.
Se encuentran ejemplos de sustituciones conservadoras dentro de los grupos de aminoácidos básicos (arginina, lisina e histidina), aminoácidos acídicos (ácido glutámico y ácido aspártico), aminoácidos polares (glutamina y asparagina), aminoácidos hidrofóbicos (leucina, isoleucina y valina), aminoácidos aromáticos (fenilalanina, triptófano y tirosina), y aminoácidos pequeños (glicina, alanina, serina, treonina y metionina). Las sustituciones de aminoácidos, que generalmente no alteran la actividad específica, son conocidas en la técnica y son descritas, por ejemplo, por H. Neurath y R.L. Hill, 1979, en The Proteins, Academic Press, New York. Los cambios que se dan con más frecuencia son Ala/Ser, Val/Ile, Asp/Glu, Thr/Ser, Ala/Gly, Ala/Thr, Ser/Asn, Ala/Val, Ser/Gly, Tyr/Phe, Ala/Pro, Lys/Arg, Asp/Asn, Leu/Ile, Leu/Val, Ala/Glu y Asp/Gly al igual que los mismos a la inversa.
En una segunda forma de realización, la presente invención se refiere a polipéptidos aislados con actividad \alpha-amilasa los cuales son codificados por secuencias de ácidos nucleicos que hibridan bajo condiciones de astringencia media, más preferiblemente bajo condiciones de astringencia media-alta, incluso más preferiblemente bajo condiciones de astringencia alta, y de la forma más preferible bajo condiciones de astringencia altísima con una sonda de ácidos nucleicos que hibride según las mismas condiciones con (i) la secuencia de ácidos nucléicos de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, (ii) la secuencia de ADNc de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, (iii) una subsecuencia de (i) o (ii), o (iv) una cadena complementaria de (i), (II), o (iii) (J. Sambrook, E.F. Fritsch, and T. Maniatus, 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2d edition, Cold Spring Harbor, New York). La subsecuencia de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 puede ser de al menos 100 nucleótidos o preferiblemente al menos 200 nucleótidos. Además, la subsecuencia puede codificar un fragmento de polipéptido que tenga actividad \alpha-amilasa. Los polipéptidos pueden ser también variantes alélicas o fragmentos de los polipéptidos que tengan actividad \alpha-amilasa.
La secuencia de ácidos nucléicos de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 o una subsecuencia de la misma, al igual que la secuencia de aminoácidos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 o un fragmento de la misma, puede ser usada con el fin de diseñar una sonda de ácidos nucleicos para identificar y clonar ADN que codifique polipéptidos con actividad \alpha-amilasa de cepas de diferentes géneros o especies según métodos bien conocidos en la técnica. En particular, esta clase de sondas pueden ser usadas para la hibridación con el ADN genómico o ADNc del género o especie de interés, siguiendo los procedimientos de transferencia estándar de Southern, con el fin de identificar y aislar el gen correspondiente en su interior. Este tipo de sondas pueden ser considerablemente más cortas que la secuencia entera, pero deberían ser de al menos 15, preferiblemente de al menos 25, y más preferiblemente de al menos 35 nucleótidos de longitud. También pueden ser usadas sondas más largas. Ambas sondas de ADN y ARN pueden ser usadas. Las sondas son marcadas de forma típica para detectar el gen correspondiente (por ejemplo, con 32P, 3H, 35S, biotina o avidina). La presente invención abarca este tipo de sondas.
Así, un ADN genómico o una genoteca de ADNc obtenidos a partir de estos otros organismos pueden ser cribados para ADN que hibride con las sondas descritas anteriormente y que codifique un polipéptido que tenga actividad \alpha-amilasa. El ADN genómico u otro ADN puede ser separado de estos otros organismos mediante agarosa o electroforesis en gel de poliacrilamida, u otras técnicas de separación. El ADN de las genotecas o el ADN separado puede ser transferido e inmovilizado en nitrocelulosa u otro material portador adecuado. Para identificar un clon o ADN homólogo a la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 o subsecuencias de las mismas, el material portador es usado en una transferencia de Southern. A efectos de la presente invención, la hibridación indica que la secuencia de ácidos nucléicos hibrida a una sonda de ácidos nucleicos correspondiente a la secuencia de ácidos nucléicos mostrada en la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, su cadena complementaria, o una subsecuencia de la misma, bajo condiciones de astringencia media hasta altísima. Las moléculas a las que la sonda de ácidos nucleicos hibrida bajo estas condiciones son detectadas usando película radiográfica.
En otra forma de realización preferida, la sonda de ácidos nucleicos es la secuencia de ácidos nucléicos contenida en los plásmidos pLiH1300 (AAI6) o pLiH1298 (AAI10), respectivamente, que están contenidas en la DSM12763 de Escherichia coli o la DSM12762 de Escherichia coli, respectivamente, o, en el lugar donde la secuencia de ácidos nucléicos codifica un polipéptido con actividad \alpha-amilasa ácida de la invención y se muestran en la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, respectivamente.
Para sondas largas de al menos 100 nucleótidos de longitud, las condiciones de astringencia media a altísima se definen como prehibridación e hibridación a 42ºC en 5X SSPE, 0.3% de SDS, 200 micro g/ml de ADN de esperma de salmón cortado y desnaturalizado, 35% de formamida para astringencias medias y medias-altas, o 50% de formamida para astringencias altas y altísimas, siguiendo procedimientos de transferencia estándar de Southern.
Para sondas largas de al menos 100 nucleótidos de longitud, el material portador es finalmente lavado tres veces cada uno durante 15 minutos usando 2 X de SSC, 0.2% de SDS preferiblemente al menos a 55ºC (astringencia media), preferiblemente al menos a 60ºC (astringencia media-alta), más preferiblemente al menos a 65ºC (astringencia alta), y de la forma más preferible al menos a 70ºC (astringencia altísima).
Para sondas cortas que tengan aproximadamente de 15 nucleótidos a aproximadamente 70 nucleótidos de longitud, las condiciones de astringencia se definen como prehibridación, hibridación, y lavado post-hibridación a 5ºC hasta 10ºC por debajo del T_{m} calculado usando el cálculo según Bolton y McCarti (1962, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 48:1390) en 0.9 M de NaCl, 0.09 M de tris-HCl a pH 7.6, 6 mM de EDTA, 0.5% de NP-40, 1X de la solución de Denhardt, 1 mM de pirofosfato de sodio, 1 mM de sodio fosfato monobásico, 0.1 mM de ATP, y 0.2 mg de de ARN de levadura por ml siguiendo los procedimientos de transferencia estándar de Southern.
Para sondas cortas, con aproximadamente 15 nucleótidos hasta aproximadamente 70 nucleótidos de longitud, el material portador es lavado una vez en 6X SCC más 0.1% SDS durante 15 minutos y dos veces cada uno durante 15 minutos usando 6X SSC a 5ºC hasta 10ºC por debajo del T_{m} calculado.
En una tercera forma de realización, la presente invención se refiere a polipéptidos aislados, es decir, los polipéptidos mostrados en la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, que tienen las propiedades fisicoquímicas siguientes:
Una temperatura óptima (véase la Fig. 3) determinada mediante el método de Phadebas (pH 9.0) en el rango entre 55 y 65ºC, más precisamente a aproximadamente 60ºC.
Un pl para AAI-6 determinado mediante enfoque isoeléctrico resultó estar entre 7-7.3, y el pl para AAI-10 resultó estar entre 7-8.
Un polipéptido de la presente invención puede ser obtenido a partir de microorganismos de cualquier género. A efectos de la presente invención, el término "obtenido a partir de" utilizado en este caso, en relación con una fuente dada, significará que el polipéptido codificado por la secuencia de ácidos nucléicos ha sido producido por la fuente o por una célula en la cual se ha insertado la secuencia de ácidos nucléicos de la fuente.
Un polipéptido de la presente invención puede ser un polipéptido bacteriano. Por ejemplo, el polipéptido puede ser un polipéptido de bacteria gram positiva tal como un polipéptido de Bacillus, p. ej., un polipéptido de Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheni formis, Bacillus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, o Bacillus thuringiensis; o un polipéptido de Streptomyces, p. ej., un polipéptido de Streptomyces lividans o Streptomyces murinus; o un polipéptido de bacteria gram negativa, p. ej., un polipéptido de E. coli o de Pseudomona sp.
En otra forma de realización preferida, el polipéptido es un polipéptido de Bacillus sp., en una forma de realización más preferida, el polipéptido es un polipéptido DSM 12650 de Bacillus sp. y un polipéptido DSM 12651 de Bacillus sp., p. ej., el polipéptido con la secuencia de aminoácidos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, respectivamente.
Se entenderá que para las especies mencionadas anteriormente, la invención abarca tanto el estado perfecto como el imperfecto, y otros equivalentes taxonómicos, p. ej., anamorfos, a pesar del nombre de especie por el que estos son conocidos. Los expertos en la técnica reconocerán fácilmente la identidad de equivalentes apropiados.
Cepas de estas especies están fácilmente disponibles para el público en varias colecciones de cultivo, tales como el American Type Culture Collection (ATCC), la Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen Gmbh (DSM), el Centraalbureau Voor Schimmelcultures (CBS), y la Agricultural Research Service Patent Culture Collection, Northern Regional Research Center (NRRL).
Además, los polipéptidos de este tipo pueden ser identificados y obtenidos de otras fuentes incluyendo microorganismos aislados provenientes de la naturaleza (p. ej., de tierra, abonos, agua, etc.) usando las sondas mencionadas anteriormente. Son bien conocidas en la materia técnicas para aislar microorganismos de hábitats naturales.
La secuencia de ácidos nucléicos puede ser entonces derivada seleccionando por similaridad una genoteca genómica o genoteca de ADNc de otro microorganismo. Una vez ha sido detectada con la(s) sonda(s) una secuencia de ácidos nucléicos que codifique un polipéptido, la secuencia puede ser aislada o clonada utilizando técnicas conocidas para los técnicos en la materia (véase, p. ej., Sambrook et al., 1989, supra).
Tal y como se define aquí, un polipéptido "aislado" es un polipéptido esencialmente libre de otros polipéptidos que no son de \alpha-amilasa, p. ej., con al menos aproximadamente un 20% de pureza, preferiblemente con al menos aproximadamente un 40% de pureza, más preferiblemente con aproximadamente un 60% de pureza, incluso más preferiblemente con aproximadamente un 80% de pureza, de la forma más preferible con aproximadamente un 90% de pureza, e incluso de la forma más preferible con aproximadamente un 95% de pureza, como se ha determinado por SDS-PAGE.
Los polipéptidos codificados por secuencias de ácidos nucleicos de la presente invención también incluyen polipéptidos fusionados o polipéptidos divisibles de fusión en los cuales otro polipéptido es fusionado en el N-terminal o el C-terminal del polipéptido o fragmento del mismo. Un polipéptido fusionado es producido fusionando una secuencia de ácidos nucléicos (o una parte de la misma) que codifique otro polipéptido a una secuencia de ácidos nucléicos (o una parte de la misma) de la presente invención. Son conocidas en la materia técnicas para producir polipéptidos de fusión, e incluyen ligar las secuencias codificantes que codifican los polipéptidos de modo que queden en forma estructurada y que la expresión del polipéptido fusionado quede bajo el control del mismo promotor(es) y terminador.
El término "rendimiento de lavado mejorado" en el contexto de la presente invención significa un rendimiento determinado según las condiciones de lavado descritas en el ejemplo 9, el cual es superior a otras alfa-amilasas usadas para lavar, p. ej., SP690; SP722 y Termamyl®, o en el caso de un mutante/variante de la invención en comparación con la alfa-amilasa parental, es decir, el no mutado, tal como una estructura de alfa-amilasa no sustituida.
Termoestabilidad incrementada
En el contexto de la invención el término "pH ácido" significa un pH por debajo de 7.0, especialmente por debajo del rango de pH en el cual son realizados normalmente los procesos de licuefacción de almidón industrial, que está entre un pH 5.5 y 6.2.
En el contexto de la presente invención el término "baja concentración de calcio" hace referencia a concentraciones por debajo del nivel normal usado en la licuefacción de almidón industrial. Las concentraciones normales varían dependiendo de la concentración de Ca^{2+} libre en el maíz. Normalmente se añade una dosis correspondiente a 1 mM (40 ppm), la cual junto con el nivel en el maíz hacen entre 40 y 60 ppm de Ca^{2+} libre.
En el contexto de la invención el término "altas temperaturas" quiere decir entre 95ºC y 160ºC, especialmente el rango de temperatura en el cual se realizan normalmente los procesos de licuefacción de almidón industrial, que es entre 95ºC y 105ºC.
Se puede mencionar aquí que los residuos aminoácidos, respectivamente, en las posiciones correspondientes a N195, V206, E212 y E216, respectivamente, en la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4 constituyen residuos aminoácidos, los cuales son conservados en numerosas alfa-amilasas del tipo Termamyl, es decir, Termamyl® (alfa-amilasa de B. licheniformis). Así, por ejemplo, las posiciones correspondientes de los residuos en AAI-10 y AAI-6 y Termamyl se pueden ver en el alineamiento de la Fig. 1 y en las Tabla 1 y Tabla 2, a continuación.
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TABLA 1
1
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TABLA 2
2
Clonación de una secuencia de ADN que codifica una \alpha-amilasa
La secuencia de ADN que codifica una alf\alpha-amilasa parental tal y como se ha definido anteriormente puede ser aislada de cualquier célula o microorganismo que produzca la alfa-amilasa en cuestión, usando diferentes métodos bien conocidos en la técnica. En primer lugar debería construirse un ADN genómico y/o genoteca de ADNc usando ADN cromosómico o ARN mensajero del organismo que produce la alfa-amilasa que se va a estudiar. Entonces, si la secuencia de aminoácidos de la alfa-amilasa es conocida, las sondas oligonucleótidas homólogas marcadas pueden ser sintetizadas y usadas para identificar clones que codifiquen alfa-amilasas de una genoteca genómica obtenida a partir del organismo en cuestión. De forma alternativa, una sonda de oligonucleótidos marcada que contenga secuencias homólogas a un gen conocido de alfa-amilasa podría ser usada como sonda para identificar clones que codifiquen alfa-amilasas, usando condiciones de hibridación y lavado de menor astringencia.
Otro método para identificar clones que codifiquen alfa-amilasas implicaría insertar fragmentos de ADN genómico en un vector de expresión, tal como un plásmido, transfomar las bacterias alfa-amilasa negativas con la genoteca de ADN genómico resultante, y luego fijar las bacterias transformadas sobre agar que contenga un sustrato para alfa-amilasa, permitiendo de ese modo identificar clones que expresen la alfa-amilasa.
De forma alternativa, la secuencia de ADN que codifica la enzima puede ser preparada sintéticamente mediante métodos estándares establecidos, p. ej., el método de fosforamidita descrito por S.L. Beaucage y M.H. Caruthers (1981) o el método descrito por Matthes et al. (1984). En el método de fosforamidita, los oligonucleótidos son sintetizados, p. ej., en un sintetizador de ADN automático, purificado, anillado, ligado y clonado en vectores apropiados.
Finalmente, la secuencia de ADN puede ser de origen mixto genómico y sintético, de origen mixto sintético y de ADNc o de origen mixto genómico y de ADNc, preparado mediante la ligadura de fragmentos de origen sintético, genómico o de ADNc (según el caso, los fragmentos correspondientes a las diferentes partes de la secuencia de ADN entera), conforme a técnicas estándares. La secuencia de ADN también puede ser preparada por reacción en cadena de polimerasa (PCR) usando cebadores específicos, por ejemplo como se describe en US 4.683.202 o en R.K. Saiki et al. (1988).
Mutagénesis dirigida
Una vez haya sido aislada una secuencia de ADN que codifique la alfa-amilasa, y hayan sido identificados sitios deseables para la mutación, las mutaciones pueden ser introducidas usando oligonucleótidos sintéticos. Estos oligonucleótidos contienen secuencias de nucleótidos que flanquean los sitios de mutación deseados; los nucleótidos mutantes son insertados durante la síntesis oligonucleótida. En un método específico, un espacio monocatenario de ADN, que conecta la secuencia de alfa- amilasas, es creado en un vector portador del gen de alfa-amilasa. Después, el nucleótido sintético que soporta la mutación deseada es anillado a una parte homóloga del ADN monocatenario. El espacio restante es llenado entonces con ADN polimerasa I (fragmento de Klenow) y el constructo es ligado usando T4 ligasa. Un ejemplo específico de este método está descrito en Morinaga et al. (1984). US 4.760.025 revela la introducción de oligonucleótidos que codifican mutaciones múltiples realizando alteraciones menores del casete. No obstante, una variedad de mutaciones incluso mayor puede ser introducida en cualquier momento mediante el método de Morinaga, ya que puede ser introducida una multitud de oligonucleótidos de diferentes longitudes.
Se describe otro método para introducir mutaciones en secuencias de ADN que codifiquen alfa-amilasas en Nelson and Long (1989). Ello implica la generación en 3 fases de un fragmento de PCR que contenga la mutación deseada, la cual se introduce usando una cadena de ADN sintetizada químicamente como uno de los cebadores en las reacciones PCR. Del fragmento generado de PCR, un fragmento de ADN portador de la mutación puede ser aislado mediante ruptura con endonucleasas de restricción y reinsertado en un plásmido de expresión.
Métodos alternativos para suministrar variantes de alfa-amilasa
Métodos alternativos para suministrar variantes de la invención incluyen el método de redistribución de genes conocido en la técnica, incluyendo los métodos, p. ej., descritos en WO 95/22625 (de Affymax Technologies N.V.) y WO 96/00343 (de Novo Nordisk NS).
Expresión de variantes de alfa-amilasa
Según la invención, una secuencia de ADN que codifica la variante producida mediante métodos anteriormente descritos, o mediante cualquier método alternativo conocido en la técnica, puede ser expresada, en forma de enzima, usando un vector de expresión, el cual normalmente incluye secuencias de control que codifican un promotor, operador, centro de unión de ribosomas, señal de iniciación de traducción, y, opcionalmente, un gen represor o varios genes activadores.
El vector de expresión recombinante portador de la secuencia de ADN que codifica una variante de alfa-amilasa de la invención puede ser cualquier vector que pueda ser expuesto convenientemente a procedimientos de ADN recombinantes, y la elección del vector dependerá frecuentemente de la célula huésped en la que éste se vaya a introducir. Así, el vector puede ser un vector de replicación autónoma, es decir, un vector que exista como una entidad extracromosómica, la replicación del cual sea independiente de replicaciones cromosómicas, p. ej., un plásmido, un bacteriófago o un elemento extracromosómico, un minicromosoma o un cromosoma artificial. De forma alternativa, el vector puede ser tal que, al ser introducido en una célula huésped, sea integrado en el genoma de la célula huésped y replicado junto con el (los) cromosoma(s) en el que ha sido integrado.
En el vector, la secuencia de ADN debería estar operativamente conectada a una secuencia promotora adecuada. El promotor puede ser cualquier secuencia de ADN que muestre actividad transcripcional en la célula huésped de elección y que pueda ser derivada de genes que codifiquen proteínas, ya sean homólogas o heterólogas a la célula huésped. Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la transcripción de la secuencia de ADN que codifica una variante de alfa-amilasa de la invención, especialmente en un huésped bacteriano, son el promotor del operón lac de E. coli, los promotores dagA de los genes de agarasa de Streptomyces coelicolor, los promotores de los genes de alfa-amilasa de Bacillus licheniformis (amyL), los promotores de los genes de amilasa maltogénica de Bacillus stearothermophilus (amyM), los promotores de la alfa-amilasa de Bacillus amyloliquefaciens (amyQ), los promotores de los genes xylA y xylB de Bacillus subtilis, etc. Para la transcripción en un huésped fúngico son ejemplos de promotores útiles aquellos derivados del gen que codifica la amilasa TAKA de A. oryzae, la proteinasa aspártica de Rhizomucor miehei, la alfa-amilasa neutra de A. niger, la alfa-amilasa estable en ácido de A. niger, la glucoamilasa de A. niger, la lipasa de Rhizomucor miehei, la proteasa alcalina de A. oryzae, la Triosafosfato isomerasa de A. oryzae o la acetamidasa de A. nidulans.
El vector de expresión de la invención también puede comprender un terminador de transcripción adecuado y, en eucariotas, secuencias de poliadenilación operativamente conectadas a la secuencia de ADN que codifica la variante de alfa-amilasa de la invención. La terminación y las secuencias de poliadenilación pueden derivar de manera adecuada de las mismas fuentes que el promotor.
El vector puede comprender además una secuencia de ADN que permita replicar el vector en la célula huésped en cuestión. Ejemplos de secuencias de este tipo son los orígenes de la replicación de los plásmidos pUC19; pACiC177; pUB110; pE194; pAMB1 y p0J702.
El vector puede comprender también un marcador seleccionable, p. ej. un gen cuyo producto complemente un defecto en la célula huésped, tal como el gen dal de B. subtilis o B. licheniformis, o uno que confiera resistencia antibiótica a p. ej. la ampicilina, la canamicina, el cloranfenicol o la tetraciclina. Además, el vector puede comprender marcadores de selección de Aspergillus tales como amdS, argB, niaD y sC o un marcador que origine resistencia a la higromicina; o se puede realizar la selección por cotransformación, p. ej., como se describe en WO 91/17243.
A pesar de que la expresión intracelular puede ser ventajosa en algunos aspectos, p. ej., cuando se usan bacterias determinadas como células huéspedes, se prefiere generalmente que la expresión sea extracelular. En general, las alfa-amilasas de Bacillus mencionadas aquí comprenden una preregión que permite la secreción en el medio de cultivo de la proteasa expresada. Si se desea, esta preregión puede sustituirse por una preregión diferente o secuencia de señal, convenientemente realizada mediante sustitución de las secuencias de ADN que codifican las respectivas preregiones.
Los procedimientos usados para enlazar el constructo de ADN de la invención que codifica una variante de alfa-amilasa, el promotor, terminador y otros elementos, respectivamente, y para insertarlos en vectores adecuados que contengan la información necesaria para la replicación son bien conocidos por los expertos en la técnica (cf., por ejemplo, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor, 1989).
La célula de la invención, ya comprenda un constructo de ADN o un vector de expresión de la invención tal como se ha definido anteriormente, se usa ventajosamente como célula huésped en la producción recombinante de una variante de alfa-amilasa de la invención. La célula puede ser transformada con el constructo de ADN de la invención que codifica la variante, integrando convenientemente el constructo de ADN (en una o más copias) en el cromosoma huésped. Esta integración está considerada generalmente como una ventaja en tanto en cuanto la secuencia de ADN tiene más posibilidades de mantenerse estable en la célula. La integración de los constructos de ADN en el cromosoma huésped puede realizarse según métodos convencionales, p. ej., mediante recombinación homóloga o heteróloga. De forma alternativa, la célula puede ser transformada con un vector de expresión como se ha descrito anteriormente en relación con los diferentes tipos de células huéspedes.
La célula de la invención puede ser una célula de un organismo superior tal como un mamífero o un insecto, pero preferiblemente es una célula microbiana, p. ej., una célula bacteriana o fúngica (incluyendo la levadura).
Son ejemplos de bacterias adecuadas las bacterias Gram positivas tales como Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Bacillus lentus, Bacillus brevis, Bacillus stearothermophilus, Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus coagulans, Bacillus circulans, Bacillus lautus, Bacillus megaterium, Bacillus thuringiensis, o Streptomyces lividans o Streptomyces murinus, o las bacterias Gram negativas tales como E. coli. La transformación de las bacterias puede, por ejemplo, ser efectuada por transformación de protoplasto o usando células competentes de manera conocida per se.
El organismo de levadura se puede seleccionar favorablemente de una especie de Saccharomyces o Schizosaccharomyces, p. ej., de Saccharomyces cerevisiae. El hongo filamentoso puede pertenecer ventajosamente a una especie de Aspergillus, p. ej., Aspergillus oryzae o Aspergillus niger. Las células micóticas pueden ser transformadas mediante un proceso que implica la formación de protoplastos y la transformación de los protoplastos seguida de la regeneración de la pared celular de forma conocida per se. Un procedimiento adecuado para transformar células huéspedes de Aspergillus está descrita en EP 238 023.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un método para producir una variante de alfa-amilasa de la invención, el cual implica cultivar una célula huésped como se ha descrito anteriormente, bajo condiciones propicias para la producción de la variante, y recuperar la misma a partir de las células y/o el medio de cultivo.
El medio usado para cultivar las células puede ser cualquier medio convencional adecuado para que crezca la célula huésped en cuestión y para obtener la expresión de la variante de alfa-amilasa de la invención.
Medios adecuados se pueden conseguir a través de proveedores comerciales, o se pueden preparar según recetas publicadas (p. ej., como se describe en los catálogos de la American Type Culture Collection).
La variante de alfa-amilasa segregada por las células huéspedes puede recuperarse convenientemente a partir del medio de cultivo mediante procedimientos bien conocidos, que incluyen separar las células del medio por centrifugado o filtración, y precipitar componentes proteínicos del medio utilizando una sal tal como sulfato de amonio, seguido de procedimientos cromatográficos tales como la cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de afinidad, o similar.
Secuencias de ácidos nucleicos
La presente invención también se refiere a secuencias de ácidos nucleicos aisladas, las cuales codifican un polipéptido de la presente invención. En una forma de realización preferida, la secuencia de ácidos nucléicos está establecida en la SEC ID No: 1. En otra forma de realización más preferida, la secuencia de ácidos nucléicos es la secuencia contenida en el plásmido pLIH1300 (AAI 6) o el plásmido LiH1298 (AAI 10), respectivamente, que está contenida en la DSM12763 de Escherichia coli y en la DSM 12762 de Escherichia coli, respectivamente. En otra forma de realización preferida, la secuencia de ácidos nucléicos es la región de codificación de los polipéptidos maduros de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3. La presente invención también abarca secuencias de ácidos nucleicos que codifican un polipéptido con la secuencia de aminoácidos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, las cuales difieren de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 en virtud de la degeneración del código genético. La presente invención también se refiere a subsecuencias de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 que codifican fragmentos de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, respectivamente, con actividad \alpha-amilasa.
Las subsecuencias de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 son secuencias de ácidos nucleicos contenidas en la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3 excepto que el o los nucleótidos de los extremos 5' y/o 3' han sido delecionados.
La presente invención también se refiere a secuencias de ácidos nucleicos mutantes que comprenden al menos una mutación en la secuencia de codificación del polipéptido maduro de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, en las cuales la secuencia de ácidos nucléicos mutante codifica un polipéptido que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4.
Las técnicas usadas para aislar o clonar una secuencia de ácidos nucléicos que codifica un polipéptido son conocidas en la materia e incluyen el aislamiento a partir de ADN genómico, la preparación a partir de ADNc, o una combinación de los mismos. La clonación de las secuencias de ácidos nucleicos de la presente invención a partir de dicho ADN genómico puede efectuarse, p. ej., usando la bien conocida reacción en cadena de la polimerasa (PCR) o el cribado de anticuerpos de librerías de expresión para detectar fragmentos de ADN clonados con características estructurales compartidas. Véase, p. ej., Innis et al., 1990, PCR: A Guide to Methods and Application, Academic Press, New York. Se pueden usar otros procedimientos de amplificación de ácidos nucleicos tales como la reacción en cadena de la ligasa (LCR), la transcripción activada ligada (LAT) y la amplificación basada en una secuencia de ácidos nucleicos (NASBA). La secuencia de ácidos nucléicos puede ser clonada a partir de una cepa de Bacillus, u otro organismo u organismo emparentado y de este modo, por ejemplo, puede ser una variante alélica o de especie del polipéptido que codifica una región de la secuencia de ácidos nucléicos.
El término "secuencia de ácidos nucleicos aislada" como se utiliza en este caso se refiere a una secuencia de ácidos nucleicos que está esencialmente libre de otras secuencias de ácidos nucleicos, p. ej., que tiene al menos aproximadamente un 20% de pureza, preferiblemente al menos aproximadamente un 40% de pureza, más preferiblemente al menos aproximadamente un 60% de pureza, incluso más preferiblemente al menos aproximadamente un 80% de pureza, y de la forma más preferible al menos aproximadamente un 90% de pureza como se ha determinado por electroforesis de agarosa. Por ejemplo, una secuencia de ácidos nucléicos aislada puede obtenerse mediante procedimientos de clonación estándares usados en la ingeniería genética para recolocar la secuencia de ácidos nucleicos desde su ubicación natural a un sitio diferente, donde ésta se reproducirá. Los procedimientos de clonación pueden implicar la escisión y el aislamiento de un fragmento de ácido nucleico deseado que comprenda la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido, la inserción del fragmento en una molécula de vector, y la incorporación del vector recombinante en una célula huésped, donde se replicarán copias múltiples o clones de la secuencia de ácidos nucleicos. La secuencia de ácidos nucleicos puede ser de origen genómico, de ADNc, de ARN, semisintético, sintético, o de cualquier combinación de los mismos.
Constructos de Ácidos Nucleicos
La presente invención también se refiere a constructos de ácidos nucleicos que comprenden una secuencia de ácidos nucleicos de la presente invención, operativamente enlazada a una o más secuencias de control, la cual dirige la expresión de la secuencia codificante en una célula huésped adecuada bajo condiciones compatibles con las secuencias de control. Se entenderá que la expresión incluye cualquier fase implicada en la producción del polipéptido incluyendo, pero no limitándose a la transcripción, modificación postranscripcional, traducción, modificación postraduccional, y secreción.
Un "constructo de ácidos nucleicos" se define aquí como una molécula de ácido nucleico, ya sea mono o bicatenaria, que es aislada de un gen de origen natural o que ha sido modificada para contener segmentos de ácidos nucleicos, los cuales se combinan y superponen de modo que, de no ser así, no existirían en la naturaleza. El término constructo de ácidos nucleicos es sinónimo al término casete de expresión cuando el constructo de ácidos nucléicos contiene todas las secuencias de control requeridas para la expresión de una secuencia codificante de la presente invención. El término "secuencia codificante" se define aquí como una parte de una secuencia de ácidos nucleicos, que especifica directamente la secuencia de aminoácidos de su producto proteínico. Los límites de la secuencia codificante están generalmente determinados por un centro de unión de ribosoma (procariotas) o por el codón de iniciación ATG (eucariotas), localizado justo encima del marco de lectura abierta en el extremo 5' del ARNm, y una secuencia del terminador de la transcripción localizado justo debajo del marco de lectura abierta en el extremo 3' del ARNm. Una secuencia codificante puede incluir, pero no se limita a ADN, ADNc, y secuencias de ácidos nucleicos
recombinantes.
Una secuencia de ácidos nucleicos aislada que codifica un polipéptido de la presente invención puede ser manipulada de varias maneras para proporcionar la expresión del polipéptido. La manipulación de la secuencia de ácidos nucléicos antes de su inserción en un vector puede ser deseable o necesaria dependiendo del vector de expresión. Las técnicas para modificar secuencias de ácidos nucleicos utilizando técnicas de ADN recombinante son bien conocidas en la materia.
El término "secuencias de control", según se define aquí, incluye todos los componentes que son necesarios o ventajosos para la expresión de un polipéptido de la presente invención. Cada secuencia de control puede ser nativa o extraña para la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido. Este tipo de secuencias de control incluyen, pero no se limitan a una secuencia líder, una secuencia de poliadenilación, una secuencia de propéptidos, un promotor, una secuencia de péptidos señal, y un terminador de la transcripción. Como mínimo, las secuencias de control incluyen un promotor, y señales de parada transcripcionales y traduccionales. Las secuencias de control pueden estar provistas de enlaces con el propósito de introducir sitios de restricción específicos que faciliten la ligadura de las secuencias de control con la región codificante de la secuencia de ácidos nucléicos que codifica un polipéptido. El término "operativamente enlazado" se define aquí como una configuración en la cual una secuencia de control está colocada apropiadamente en una posición relativa a la secuencia codificante de la secuencia de ADN de manera que la secuencia de control dirije la expresión de un polipéptido.
Secuencia promotora
La secuencia de control puede ser una secuencia promotora apropiada, una secuencia de ácidos nucléicos reconocida por una célula huésped para la expresión de la secuencia de ácidos nucleicos. La secuencia promotora contiene secuencias de control transcripcionales, las cuales median la expresión del polipéptido. El promotor puede ser cualquier secuencia de ácidos nucleicos que muestre actividad transcripcional en la célula huésped de elección incluyendo los promotores mutantes, truncados, e híbridos, y puede obtenerse a partir de genes que codifican polipéptidos extracelulares o intracelulares, ya sean homólogos o heterólogos a la célula huésped.
Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la transcripción de los constructos de ácidos nucleicos de la presente invención, especialmente en una célula huésped bacteriana, son los promotores obtenidos del operón lac de E. coli, genes de agarasa de Streptomyces coelicolor (dagA), genes de levansucrasa de Bacillus subtilis (sacB), genes de alfa-amilasa de Bacillus licheniformis (amyL), genes de amilasa maltogénica de Bacillus stearothermophilus (amyM), genes de alfa-amilasa de Baccillus amyloliquefaciens (amyQ), genes de penicilinasa de Bacillus licheniformis (penP), los genes xylA y xylB de Bacillus subtilis, y genes procariotas de beta-lactamasa (Villa-Kamaroff et al., 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 3727-3731), al igual que el promotor tac (DeBoer et al., 1983, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 80: 21-25). Se describen otros promotores en "Useful proteins from recombinant bacteria" en Scientific American, 1980, 242: 74-94; yen Sambrook et al., 1989, supra.
Secuencia del Terminador
La secuencia de control puede ser también una secuencia adecuada del terminador de la transcripción, una secuencia reconocida por una célula huésped para terminar la transcripción. La secuencia del terminador está operativamente enlazada al término 3' de la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido. Cualquier terminador que sea funcional en la célula huésped de elección puede usarse en la presente invención.
Péptido señal
La secuencia de control también puede ser una región de codificación de péptido señal que codifique una secuencia de aminoácidos enlazada al amino-término de un polipéptido y dirija el polipéptido codificado dentro de la vía secretora de la célula. El extremo 5' de la secuencia codificante de la secuencia de ácidos nucléicos puede contener de forma intrínseca una región de codificación de péptido señal naturalmente enlazada con el segmento de la región de codificación que codifica el polipéptido segregado en el marco de lectura de la traducción. De forma alternativa, el extremo 5' de la secuencia codificante puede contener una región de codificación del péptido señal extraña para la secuencia codificante. La región de codificación extraña del péptido señal puede ser requerida allí donde la secuencia codificante no contenga de forma natural una región de codificación del péptido señal. De forma alternativa, la región de codificación extraña del péptido señal puede tan sólo reemplazar la región codificante natural del péptido señal con el fin de aumentar la secreción del polipéptido. No obstante, en la presente invención puede usarse cualquier región de codificación del péptido señal que dirija el polipéptido expresado dentro de la vía secretora de una célula huésped de elección.
Regiones de codificación efectivas del péptido señal para células huéspedes bacterianas son las regiones de codificación del péptido señal obtenidas a partir de los genes para la amilasa maltogénica NCIB 11837 de Bacillus, la alfa-amilasa de Bacillus stearothermophilus, la subtilisina de Bacillus licheniformis, la beta-lactamasa de Bacillus licheniformis, las proteasas neutrales Bacillus stearothermophilus (nprT, nprS, nprM), y el prsA de Bacillus subtilis. Otros péptidos señal están descritos en Simonen and Palva, 1993, Microbiological Reviews 57: 109-137.
Sistema regulador
También puede ser deseable añadir secuencias reguladoras que permitan la regulación de la expresión del polipéptido relativa al crecimiento de la célula huésped. Ejemplos de sistemas reguladores son aquellos que causan la expresión del gen para conectarse o desconectarse en respuesta a un estímulo químico o físico, incluyendo la presencia de un compuesto regulador. Sistemas reguladores en sistemas procarióticos incluyen los sistemas operadores lac, tac, y trp. En levadura se pueden usar el sistema ADH2 o el sistema GAL1. En hongos filamentosos se pueden usar el promotor de alfa-amilasa TAKA, el promotor de glucoamilasa de Aspergillus Niger, y el promotor de glucoamilasa de Aspergillus otyzae como secuencias reguladoras. Otros ejemplos de secuencias reguladoras son aquellas que permiten la amplificación génica. En sistemas eucarióticos, éstas incluyen el gen de dihidrofolato-reductasa, el cual se amplifica en presencia de metotrexato, y los genes de metalotioneina, los cuales se amplifican con metales pesados. En estos casos, la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido estaría operativamente enlazada a la secuencia reguladora.
Vectores de expresión
La presente invención también se refiere a vectores de expresión recombinantes que comprenden una secuencia de ácidos nucleicos de la presente invención, un promotor, y señales de parada transcripcionales y traduccionales. Las diferentes secuencias de ácidos nucleicos y de control anteriormente descritas se pueden unir para producir un vector de expresión recombinante, el cual a su vez puede incluir uno o más sitios de restricción convenientes para permitir la inserción o sustitución de la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido en tales sitios. De forma alternativa, la secuencia de ácidos nucleicos de la presente invención se puede expresar insertando la secuencia de ácidos nucleicos o un constructo de ácidos nucleicos que comprenda la secuencia dentro de un vector apropiado para la expresión. En la creación del vector de expresión, la secuencia codificante está localizada en el vector de tal manera que la secuencia codificante esté operativamente enlazada a las secuencias de control apropiadas para la expresión.
El vector de expresión recombinante puede ser cualquier vector (p. ej., un plásmido o virus) que se pueda someter de forma conveniente a procedimientos de ADN recombinantes y pueda provocar la expresión de la secuencia de ácidos nucleicos. La elección del vector dependerá normalmente de la compatibilidad del vector con la célula huésped en la que se vaya a introducir el vector. Los vectores pueden ser plásmidos circulares lineales o cerrados.
El vector puede ser un vector de replicación autónoma, es decir, un vector que existe como una entidad extracromosómica, la replicación de la cual es independiente de la replicación cromosómica, p. ej., un plásmido, un elemento extracromosómico, un minicromosoma, o un cromosoma artificial. El vector puede contener cualquier clase de medios para asegurar la autorreplicación. De forma alternativa, el vector puede ser uno que, al introducirse en la célula huésped, se integre dentro el genoma y se replique junto con el cromosoma(s) en el cual éste se ha integrado. Además, se puede usar un vector único o plásmido o dos o más vectores o plásmidos, los cuales contienen en conjunto el ADN total que se va a introducir en el genoma de la célula huésped; o un transposón.
Los vectores de la presente invención contienen preferiblemente uno o más marcadores seleccionables que permiten una fácil selección de células transformadas. Un marcador seleccionable es un gen cuyo producto proporciona resistencia a los biocidas o a los virus, resistencia a los metales pesados, prototrofía para auxótrofos, y similares. Ejemplos de marcadores bacterianos seleccionables son los genes dal de Bacillus subtilis o Bacillus licheniformis, o marcadores, los cuales confieren resistencia antibiótica tal como resistencia a la ampicilina, la canamicina, el cloranfenicol o la tetraciclina. Marcadores adecuados para células huéspedes de levadura son ADE2, HIS3, LEU2, LiS2, MET3, TRP1, y URA3. Un marcador seleccionable para el uso en una célula huésped filamentosa fúngica se puede seleccionar del grupo que incluye, pero no se limita a amdS (acetamidasa), argB (ornitina-carbamoiltransferasa), bar (fosfonitricina acetiltransferasa), hygB (higromicina fosfotransferasa), niaD (nitrato-reductasa), pyrG (orotidina-5'-fosfato-descarboxilasa), sC (sulfato adenil transferasa), trpC (antranilato sintasa), así como equivalentes de los mismos. Son preferidos para el uso en una célula de Aspergillus los genes amdS y pyrG de Aspergillus nidulans o Aspergillus oryzae y el gen bar de Streptomyces higroscopicus.
Los vectores de la presente invención contienen preferiblemente un(os) elemento(s) que permite(n) la integración estable del vector en el genoma de la célula huésped o la replicación autónoma del vector en la célula independientemente del genoma de la célula.
Para su integración en el genoma de la célula huésped, el vector puede depender de la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido o cualquier otro elemento del vector para la integración estable del vector en el genoma mediante recombinación homóloga o no homóloga. De forma alternativa, el vector puede contener secuencias de ácidos nucleicos adicionales para dirigir la integración mediante recombinación homóloga en el genoma de la célula huésped. Las secuencias de ácidos nucleicos adicionales permiten que el vector sea integrado en el genoma de la célula huésped en una(s) ubicación(es) precisa(s) en el (los) cromosoma(s). Para aumentar la probabilidad de integración en una ubicación precisa, los elementos integracionales deberían contener preferiblemente un número suficiente de ácidos nucleicos, tal como uno entre 100 y 1.500 pares de bases, preferiblemente entre 400 y 1.500 pares de bases, y de la forma más preferible entre 800 y 1.500 pares de bases, que sean altamente homólogos a la secuencia objetivo correspondiente para aumentar la probabilidad de recombinación homóloga. Los elementos integracionales pueden ser cualquier secuencia que sea homóloga a la secuencia objetivo en el genoma de la célula huésped. Además, los elementos integracionales pueden ser secuencias de ácidos nucleicos no codificantes o codificantes. En cambio, el vector puede integrarse en el genoma de la célula huésped mediante recombinación no homóloga.
Para la replicación autónoma, el vector puede comprender además un origen de replicación que permita al vector replicarse de manera autónoma en la célula huésped en cuestión. Ejemplos de orígenes bacterianos de replicación son los orígenes de replicación de los plásmidos pBR322; pUC19; pACYC177, y pACYC184 que permiten la replicación en E. coli, y pUB110; pE194; pTA1060, y pAMf\beta1 que permiten la replicación en Bacillus. Ejemplos de orígenes de replicación para su uso en una célula huésped de levadura son el origen de replicación de 2 micras, ARS1, ARS4, la combinación de ARS1 y CEN3, y la combinación de ARS4 y CENE. El origen de replicación puede tener una mutación que haga su función termosensible en la célula huésped (véase, p. ej., Ehrlich, 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 1433).
Se puede insertar más de una copia de una secuencia de ácidos nucleicos de la presente invención en la célula huésped para aumentar la producción del producto genético. Se puede obtener un aumento en el número de copias de la secuencia de ácidos nucléicos integrando al menos una copia adicional de la secuencia en el genoma de la célula huésped o incluyendo un gen marcador seleccionable amplificable junto con la secuencia de ácidos nucleicos donde las células que contienen copias amplificadas del gen marcador seleccionable, y de ese modo las copias adicionales de la secuencia de ácidos nucléicos, pueden seleccionarse mediante el cultivo de las células en presencia del agente seleccionable apropiado.
Los procedimientos utilizados para enlazar los elementos descritos anteriormente con el objetivo de construir los vectores de expresión recombinantes de la presente invención son bien conocidos por el experto en la materia (véase, p. ej., Sambrook et al., 1989, supra).
Células huéspedes
La presente invención también se refiere a células huéspedes recombinantes que comprenden una secuencia de ácidos nucléicos de la invención, las cuales se usan ventajosamente en la producción recombinante de los polipéptidos. Un vector que comprende una secuencia de ácidos nucléicos de la presente invención se introduce en una célula huésped de tal manera que el vector es mantenido como integrante cromosómico o como vector extracromosómico que se replica a sí mismo como se ha descrito anteriormente.
El término "célula huésped" abarca cualquier descendiente de una célula parental que no sea idéntica a la célula parental debido a mutaciones que ocurren durante la replicación. La elección de una célula huésped dependerá en gran parte del gen que codifica el polipéptido y su fuente.
La célula huésped puede ser un mocroorganismo unicelular, p. ej., un procariota; o un microorganismo no unicelular, p. ej., un eucariota.
Son células unicelulares útiles las células bacterianas tales como las bacterias gram positivas incluyendo, pero no limitándose a la célula de Bacillus, p. ej., de Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, y Bacillus turingiensis; o una célula de Streptomyces, p. ej., de Streptomyces lividans o Streptomyces murinus, o bacterias gram negativas tales como E. coli y Pseudomonas sp. En una forma de realización preferida, la célula huésped bacteriana es una célula de Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus stearothermophilus o Bacillus subtilis. En otra forma de realización preferida, la célula de Bacillus es un Bacillus alcalofílico.
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La introducción de un vector en una célula huésped bacteriana puede, por ejemplo, efectuarse mediante transformación de protoplasto (véase, p. ej., Chang and Cohen, 1979, Molecular General Genetics 168: 111-115), usando células competentes (véase, p. ej., Young and Spizizin, 1961, Journal of Bacteriology 81: 823-829; o Dubnau and Davidoff-Abelson, 1971, Journal of Molecular Biology 56: 209-221), electroporación (véase, p. ej., Shigekawa and Dower, 1988, Biotechniques 6: 742-751), o conjugación (véase, p. ej., Koehler and Thorne, 1987, Journal of Bacteriology 169: 5771-5278).
Métodos de Producción
La presente invención también se refiere a métodos para producir un polipéptido de la presente invención que comprenden (a) cultivar una cepa que sea capaz en su forma salvaje de producir el polipéptido para producir un sobrenadante que comprenda el polipéptido; y (b) recuperar el polipéptido. Preferiblemente, la cepa es del género Bacillus sp.
La presente invención también se refiere a métodos para producir un polipéptido de la presente invención que comprenden (a) cultivar una célula huésped bajo condiciones propicias para la producción del polipéptido; y (b) recuperar el polipéptido.
La presente invención también se refiere a métodos para producir un polipéptido de la presente invención que comprenden (a) cultivar una célula huésped bajo condiciones propicias para la producción del polipéptido, en las cuales la célula huésped comprende una secuencia de ácidos nucléicos mutante con al menos una mutación en la región de codificación del polipéptido maduro de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, donde la secuencia de ácidos nucleicos mutante codifica un polipéptido consistente en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4, y (b) recuperar el polipéptido.
Composiciones
En otro aspecto ulterior, la presente invención se refiere a composiciones que comprenden un polipéptido de la presente invención. Preferiblemente, las composiciones están enriquecidas con un polipéptido de la presente invención. En el contexto presente, el término "enriquecido" indica que la actividad \alpha-amilasa de la composición ha sido aumentada, p. ej., con un factor enriquecedor de 1.1.
La composición puede comprender un polipéptido de la invención como componente enzimático más importante, p. ej., una composición monocomponente. De forma alternativa, la composición puede comprender actividades enzimáticas múltiples, tales como una aminopeptidasa, amilasa, carbohidrasa, carboxipeptidasa, catalasa, celulasa, quitinasa, cutinasa, ciclodextrina glicosiltransferasa, desoxiribonucleasa, esterasa, alfa-galactosidasa, beta-galactosidasa, glucoamilasa, alfa-glucosidasa, beta-glucosidasa, haloperoxidasa, invertasa, lacasa, lipasa, manosidasa, oxidasa, enzima pectinolítica, peptidoglutaminasa, peroxidasa, fitasa, polifenoloxidasa, enzima proteolítica, ribonucleasa, transglutaminasa, o xilanasa. La(s) enzima(s) adicional(es) puede(n) ser producible(s) mediante un microorganismo que pertenezca al género Aspergillus, preferiblemente al Aspergillus aculeatus, Aspergillus awamori, Aspergillus niger, o Aspergillus oryzae, o al Trichoderma, Humicola, preferiblemente al Humicola insolens, o al Fusarium, preferiblemente al Fusarium bactridioides, Fusarium cerealis, Fusarium crookwellense, Fusarium culmorum, Fusarium graminearum, Fusarium graminum, Fusarium heterosporum, Fusarium negundi, Fusarium oxysporum, Fusarium reticulatum, Fusarium roseum, Fusarium sambucinum, Fusarium sarcochroum, Fusarium sulphureum, Fusarium toruloseum, Fusarium tnchothecioides, o Fusarium venenatum.
Las composiciones de polipéptidos pueden prepararse conforme a métodos conocidos en la técnica y pueden estar en forma líquida o de composición seca. Por ejemplo, la composición de polipéptidos puede estar en forma granulada o microgranulada. El polipéptido que se va a incluir en la composición puede estabilizarse conforme a métodos conocidos en la técnica.
A continuación se dan ejemplos de usos preferidos de las composiciones de polipéptidos de la invención. La dosificación de la composición de polipéptidos de la invención y otras condiciones bajo las cuales se usa la composición se pueden determinar en base a métodos conocidos en la técnica.
Aplicaciones industriales
Debido a su actividad a valores de pH alcalinos, las \alpha-amilasas de la invención son adecuadas para su uso en diversos procesos industriales, en particular la enzima encuentra aplicaciones potenciales como componentes en detergentes, p. ej., composiciones detergentes para lavandería, lavado de la vajilla y limpieza de superficies duras, pero también puede ser útil para el desencolado de tejidos, telas y prendas, hacer o elaborar cerveza, en la producción de pasta y papel, y también en la producción de edulcorantes y etanol, tales como etanol combustible, industrial y bebible, a partir de almidón o granos enteros.
Conversión de Almidón
Se describen procesos convencionales de conversión de almidón, tales como los procesos de licuefacción y sacarificación, en, p. ej., la patente US Nº. 3.912.590 y las publicaciones de patentes EP Nos. 252.730 y 63.909, incorporadas aquí como referencia.
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Producción de Pasta y Papel
Las \alpha-amilasas alcalinas de la invención también pueden utilizarse en la producción de materiales lignocelulósicos, tales como pasta, papel y cartón, a partir de papel residual reforzado con almidón y cartón, especialmente cuando se produzca la reducción a pasta a pH superior a 7 y donde las amilasas puedan facilitar la desintegración del material de desecho mediante la degradación del almidón de refuerzo. Las \alpha-amilasas de la invención son especialmente útiles en un proceso para producir una pasta de papel a partir de papel impreso revestido de almidón. El proceso se puede realizar como se describe en WO 95/14807, comprendiendo las fases siguientes:
a)
desintegración del papel para producir una pasta,
b)
tratamiento con una enzima degradante de almidón antes, durante o después de la fase a), y
c)
separación de las partículas de tinta de la pasta después de las fases a) y b).
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Las \alpha-amilasas de la invención también pueden ser muy útiles a la hora de modificar almidón donde el almidón modificado enzimáticamente se usa en la fabricación de papel junto con productos de relleno alcalinos tales como carbonato cálcico, caolín y arcillas. Con las \alpha-amilasas alcalinas de la invención se hace posible modificar el almidón en presencia del relleno permitiendo así un proceso integrado más simple.
Desencolado de Tejidos, Telas, y Prendas
Las \alpha-amilasas de la invención también pueden ser muy útiles en el desencolado textil. En la industria del tratamiento textil, las \alpha-amilasas son utilizadas generalmente como auxiliares en el proceso de desencolado para facilitar la eliminación del encolado con contenido de almidón, el cual ha servido como revestimiento protector en hilos de trama durante el entretejido. La eliminación completa de la cola de revestimiento después del entretejido es importante para asegurar resultados óptimos en los procesos posteriores, en los cuales la tela se lava, blanquea y tiñe. Se prefiere la descomposición de almidón enzimático porque ésta no implica efecto nocivo alguno en la materia fibrosa. Con el fin de reducir el coste del tratamiento y aumentar el rendimiento del triturador, el tratamiento de desencolado se combina a veces con las fases de lavado y blanqueamiento. En estos casos, los auxiliares no enzimáticos tales como agentes alcalinos u oxidantes se utilizan normalmente para descomponer el almidón, ya que las alfa-amilasas tradicionales no son muy compatibles con niveles altos de pH y agentes blanqueadores. La descomposición no enzimática del encolado con contenido de almidón conlleva algún daño en la fibra debido a los productos químicos más bien agresivos que se usan. Por consiguiente, sería deseable usar las alfa-amilasas de la invención por su rendimiento mejorado en soluciones alcalinas. Las alfa-amilasas pueden ser usadas solas o en combinación con una celulasa a la hora de desencolar tela o tejidos con contenido de celulosa.
Los procesos de desencolado y blanqueamiento son bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, tales procesos están descritos en WO 95/21247, en la patente US 4.643.736, y en EP 119.920 incorporadas aquí como referencia.
Los productos para el desencolado disponibles a nivel comercial incluyen Aquazyme® Ultra de Novo Nordisk NS.
Elaboración de Cerveza
Las \alpha-amilasas de la invención también pueden ser muy útiles en un proceso de elaboración de cerveza; las \alpha-amilasas normalmente se añadirán durante el proceso de maceración.
Composiciones detergentes
La enzima de la invención puede añadirse convirtiéndose así en un componente de una composición detergente.
La composición detergente de la invención puede formularse por ejemplo como una composición detergente para lavar a mano o en una máquina de lavandería que incluye una composición de aditivos para lavandería adecuada para el pretratamiento de tejidos manchados y una composición suavizante añadida para el lavado de tejidos, o formularse como una composición detergente para uso doméstico en operaciones de limpieza de superficies duras, o formularse para operaciones de lavado de la vajilla, a mano o a máquina.
En un aspecto específico, la invención proporciona un aditivo detergente que comprende la enzima de la invención. El aditivo detergente, al igual que la composición detergente, puede comprender otra u otras enzimas tales como una proteasa, lipasa, cutinasa, amilasa, carbohidrasa, celulasa, pectinasa, mananasa, arabinasa, galactanasa, xilanasa, oxidasa, p. ej., lacasa, y/o peroxidasa.
En general, las propiedades de la(s) enzima(s) elegida(s) deberían ser compatibles con el detergente seleccionado, (es decir, pH óptimo, compatibilidad con otros ingredientes enzimáticos y no enzimáticos, etc.), y la(s) enzima(s) debería(n) presentarse en cantidades eficaces. Proteasas: las proteasas adecuadas incluyen las de origen animal, vegetal o microbiano. Se prefieren las de origen microbiano. Se incluyen mutantes modificados químicamente o por ingeniería proteica. La proteasa puede ser una serina proteasa o una metalo proteasa, preferiblemente una proteasa alcalina microbiana o una proteasa de tipo tripsina. Ejemplos de proteasas alcalinas son las subtilisinas, especialmente aquellas derivadas de Bacillus, p. ej., la subtilisina Novo, subtilisina Carlsberg, subtilisina 309, subtilisina 147 y subtilisina 168 (descrita en WO 89/06279). Ejemplos de proteasas de tipo tripsina son la tripsina (p. ej. de origen porcino o bovino) y la proteasa de Fusarium descrita en WO 89/06270 y WO 94/25583.
Son ejemplos de proteasas útiles las variantes descritas en WO 92/19729, WO 98/20115, WO 98/20116, y WO 98/34946, especialmente las variantes con sustituciones en una o más de las siguientes posiciones: 27, 36, 57, 76, 87, 97, 101, 104, 120, 123, 167, 170, 194, 206, 218, 222, 224, 235 y 274.
Entre las enzimas proteásicas preferidas disponibles a nivel comercial se incluyen Alcalase^{TM}, Savinase^{TM},
Primase^{TM}, Duralase^{TM}, Esperase^{TM}, y Kannase^{TM} (Novo Nordisk A/S), Maxatase^{TM}, Maxacal^{TM}, Maxapem^{TM},
Properase^{TM}, Purafect^{TM}, Purafect OxP^{TM}, FN2^{TM}, y FN3^{TM} (Genencor International Inc.).
Lipasas: entre las lipasas adecuadas se incluyen aquellas de origen bacteriano o fúngico. Se incluyen mutantes modificados químicamente o por ingeniería protéica. Ejemplos de lipasas útiles incluyen las lipasas de Humicola (sinónimo de Thermomyces), p. ej. de H. lanuginosa (T. lanuginosus) como se describe en EP 258 068 y EP 305 216 o de H. insolens como se describe en WO 96/13580, una lipasa de Pseudomonas, p. ej., de P. alcaligenes o P. pseudoalcaligenes (EP 218 272), P. cepacia (EP 331 376), P. stutzeri (GB 1.372.034), P. fluorescens, la cepa SD 705 de Pseudomonas sp. (WO 95/06720 y WO 96/27002), P. wisconsinensis (WO 96/12012), una lipasa de Bacillus, p. ej. de B. subtilis (Dartois et al. (1993), Biochemica et Biophyisica Acta, 1131: 253-360), B. stearothermophilus (JP 64/744992) o B. pumilus (WO 91/16422).
Otros ejemplos son variantes de lipasa tales como las descritas en WO 92/05249, WO 94/01541, EP 407 225, EP 260 105, WO 95/35381, WO 96/00292, WO 95/30744, WO 94/25578, WO 95/14783, WO 95/22615, WO 97/04079 y WO 97/07202.
Entre las enzimas lipasa preferidas disponibles a nivel comercial se incluyen Lipolase^{TM} y Lipolase Ultra^{TM} (Novo Nordisk A/S).
Amilasas: bajo las amilasas adecuadas (\alpha y/o \beta) se incluyen las de origen bacteriano o fúngico. Se incluyen mutantes modificados químicamente o por ingeniería protéica. Las amilasas incluyen, por ejemplo, \alpha-amilasas obtenidas a partir de Bacillus, p. ej. una cepa especial de B. licheniformis, descrita con más detalle en GB 1.296.839.
Son ejemplos de amilasas útiles las variantes descritas en WO 94/02597, WO 94/18314, WO 96/23873, y WO 97/43424, especialmente las variantes con sustituciones en una o más de las siguientes posiciones: 15, 23, 105, 106, 124, 128, 133, 154, 156, 181, 188, 190, 197, 202, 208, 209, 243, 264, 304, 305, 391, 408, y 444.
Son amilasas disponibles a nivel comercial Duramyl^{TM}, Termamyl\dagger, Fungamyl^{TM} y BAN^{TM} (novo Nordisk A/S), Rapidase^{TM} y Purastar^{TM} (de Genencor International Inc.).
Celulasas: entre las celulasas adecuadas se incluyen las de origen bacteriano o fúngico. Se incluyen mutantes modificados químicamente o por ingeniería protéica. Entre las celulasas adecuadas se incluyen celulasas de los géneros Bacillus, Pseudomonas, Humicola, Fusarium, Thielavia, Acremonium, p. ej. las celulasas fúngicas producidas a partir de Humicola insolens, Myceliophthora thermophila y Fusarium oxysporum descritas en US 4.435.307, 5.648.263, 5.691.178, 5.776.757 y WO 89/09259.
Celulasas especialmente adecuadas son celulasas alcalinas o neutras que tienen beneficios en el cuidado del color. Ejemplos de celulasas de este tipo son las celulasas descritas en EP 0 495 257, EP 0 531 372, WO 96/11262, WO 96/29397, WO 98/08940. Otros ejemplos son variantes de celulasa tal como las descritas en WO 94/07998, EP 0 531 315, 5,457,046, 5,686,593, 5,763,254, WO 95/24471, WO 98/12307 y PCT/DK98/00299.
Entre las celulasas disponibles a nivel comercial se incluyen Celluzime^{TM}, y Carezime^{TM} (Novo Nordisk A/S), Clazinase^{TM}, y Puradax HA^{TM} (Genencor International Inc.), y KAC-500(B)^{TM}(Kao Corporation).
Peroxidasas/oxidasas: entre las peroxidasas/oxidasas adecuadas se incluyen las que provienen de plantas, bacterias u hongos. Se incluyen mutantes modificados químicamente o por ingeniería protéica. Ejemplos de peroxidasas útiles incluyen peroxidasas de Coprinus, p. ej. de C. cinereus, y variantes de las mismas como las que se describen en WO 93/24618, WO 95/10602, y WO 98/15257.
Entre las peroxidasas disponibles a nivel comercial se incluye Guardzime^{TM} (Novo Nordisk A/S).
La(s) enzima(s) detergente(s) se puede(n) incluir en una composición detergente añadiendo aditivos independientes que contengan una o más enzimas, o añadiendo un aditivo combinado que comprenda todas estas enzimas. Un aditivo detergente de la invención, es decir, un aditivo independiente o un aditivo combinado, puede formularse p. ej. como un granulado, un líquido, una pasta, etc. Formulaciones de aditivos detergentes preferidas son las granuladas, en particular las granuladas no pulverulentas; las líquidas, en particular líquidas estabilizadas, o las pastas.
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Los granulados no pulverulentos se pueden producir, p. ej., como se describe en US 4.106.991 y 4.661.452 y opcionalmente se pueden revestir mediante métodos conocidos en la técnica. Son ejemplos de materiales de revestimiento ceroso los productos de óxido de poli(etileno) (polietilenoglicol, PEG) con pesos molares medios de 1000 a 20000; los nonilfenoles etoxilados con entre 16 y 50 unidades de óxido de etileno; los alcoholes etoxilados grasos en los cuales el alcohol contiene de 12 a 20 átomos de carbono y en los cuales hay de 15 a 80 unidades de óxido de etileno; los alcoholes grasos; los ácidos grasos; y los mono-, di- y triglicéridos de ácidos grasos. Se dan ejemplos de materiales de revestimiento filmógenos adecuados para la aplicación mediante técnicas de lecho fluidificado en GB 1483591. Las preparaciones enzimáticas líquidas se pueden, por ejemplo, estabilizar añadiendo un poliol tal como propilenoglicol, azúcar o alcohol de azúcar, ácido láctico o ácido bórico según métodos establecidos. Se pueden preparar enzimas protegidas según el método descrito en EP 238.216.
La composición detergente de la invención puede tener cualquier forma conveniente, p. ej., de barra, pastilla, polvo, gránulo, pasta o líquido. Un detergente líquido puede ser acuoso, conteniendo normalmente hasta un 70% de agua y un 0-30% de disolvente orgánico, o no acuoso.
La composición detergente comprende uno o más agentes tensioactivos, los cuales pueden ser no iónicos, inclusive semipolares, y/o aniónicos y/o catiónicos y/o zwitteriónicos. Los agentes tensioactivos están presentes normalmente a un nivel del 0.1% al 60% en peso.
Cuando se incluye en él, el detergente normalmente contendrá aproximadamente de un 1% a aproximadamente un 40% de un tensioactivo aniónico tal como alquilbencenosulfonato lineal, alfa-olefinsulfonato, sulfato de alquilo (sulfato de alcohol graso), etoxisulfato de alcohol, alcanosulfonato secundario, alfa-sulfo éster metílico de ácido graso, ácido alquilo o alquenilsuccínico o jabón.
Cuando se incluye en él, el detergente normalmente contendrá aproximadamente de un 0.2% a aproximadamente un 40% de un tensioactivo no iónico tal como alcohol etoxilato, nonilfenol, etoxilato alquilpoliglicósido, óxido de alquildimetilamina, monoetanolamida de ácido graso etoxilado, monoetanolamida de ácido graso, amida de ácido graso alquilopolihidroxilado, o N-acilo N-alquilo derivados de glucosamina ("glucamidas").
El detergente puede contener un 0-65% de un constructor de detergente o agente complejante tal como zeolita, difosfato, trifosfato, fosfonato, carbonato, citrato, ácido nitrilotriacético, ácido etilenodiaminatetraacético, ácido dietilenotriaminopentaacético, ácido alquilo o alquenilsuccínico, silicatos solubles o silicatos estratificados (p. ej. SKS-6 de Hoechst).
El detergente puede comprender uno o más polímeros. Son ejemplos la carboximetilcelulosa, poli(vinilpirrolidona), poli(etilenglicol), (alcohol) poli(vinílico), (N-óxido de poli(vinilpiridina), poli(vinil imidazol), policarboxilatos tales como poliacrilatos, copolímeros de ácido maléico/acrílico y copolímeros de lauril metacrilato/ácido
acrílico.
El detergente puede contener un sistema blanqueante, el cual puede comprender una fuente de H_{2}O_{2} tal como perborato o percarbonato, la cual se puede combinar con un activador de blanqueamiento de peracido tal como tetraacetiletilenodiamina o nonanoiloxibencenosulfonato. De forma alternativa, el sistema blanqueante puede comprender peroxiácidos de tipo p. ej. amida, imida, o sulfona.
La enzima(s) de la composición detergente de la invención se puede estabilizar usando agentes convencionales estabilizantes, p. ej., un poliol tal como propilenoglicol o glicerol, un azúcar o alcohol de azúcar, ácido láctico, ácido bórico, o un derivado de ácido bórico, p. ej., un éster de borato aromático, o un fenilo derivado de ácido borónico tal como ácido borónico de 4-formilfenilo, y la composición puede formularse como se describe en, p. ej., WO 92/19709 y WO 92/19708.
El detergente puede contener también otros ingredientes de detergentes convencionales tales como, p. ej., acondicionadores de tela, incluyendo arcillas, reforzadores de espuma, supresores de espuma, agentes anticorrosivos, agentes de supensión de suciedad, agentes de redisposición antisuciedad, tintes, bactericidas, blanqueadores ópticos, hidrotropos, inhibidores de decoloración, o perfumes.
Actualmente se contempla que en las composiciones detergentes se puede añadir cualquier enzima, en particular la enzima de la invención, en una cantidad correspondiente a 0.01-100 mg de proteína enzimática por litro de licor de lavado, preferiblemente 0.05-5 mg de proteína enzimática por litro de licor de lavado, en particular 0.1-1 mg de proteína enzimática por litro de licor de lavado.
La enzima de la invención se puede incorporar de forma adicional en las formulaciones de detergente descritas en WO 97/07202, la cual es incorporada aquí como referencia.
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Composiciones Detergentes para el Lavado de la Vajilla
La enzima de la invención también se puede usar en composiciones detergentes para el lavado de la vajilla, incluyendo lo siguiente:
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(Continuación)
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(Continuación)
5
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(Continuación)
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(Continuación)
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(Continuación)
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Usos
La presente invención va dirigida también a métodos para usar los polipéptidos que tengan actividad \alpha-amilasa en composiciones detergentes; en particular en composiciones detergentes para lavandería y composiciones detergentes para el lavado de la vajilla, composiciones para la limpieza de superficies duras, y en la composición para el desencolado de tejidos, telas, o prendas, para la producción de pasta y papel, la elaboración de cerveza, y los procesos de conversión de almidón como se han descrito anteriormente.
La presente invención se describe con más detalle más adelante a través de los siguientes ejemplos, los cuales no deberían ser interpretados de forma que limiten el ámbito de la invención.
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Materiales y métodos
Los productos químicos usados como tampones y sustratos fueron productos comerciales de al menos grado reactivo.
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Materiales Enzimas
SP690: \alpha-amilasa descrita en la SEC ID No: 1 de la US Nº. 5.856.164.
SP722: \alpha-amilasa descrita en la SEC ID No: 2 de la US Nº. 5.856.164.
Termamyl®: \alpha-amilasa de Bacillus licheniformis descrita en la SEC ID No: 1 de la US Nº. 5.830.837.
AAI-10: \alpha-amilasa de la invención mostrada en la SEC ID No: 2.
AAI-6: \alpha-amilasa de la invención mostrada en la SEC ID No: 4.
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Modelo de detergente
\quad
El detergente modelo A/P (Asia/Pacific) tiene la composición siguiente: 20% de tripolifosfato sódico (tripolifosfato de sodio), 25% de Na_{2}SO_{4}, 15% de Na_{2}CO_{3}, 20% de LAS (sulfonato de alquilbenceno lineal, Nansa 80S), 5% de alcohol etoxilato C_{12}-C_{15} (Dobanol 25-7), 5% de Na_{2}Si_{2}O_{5}, 0.3% de NaCl.
\quad
Omo Multi Acao (Brasil),
\quad
Omo polvo concentrado (EU) (Unilever)
\quad
Ariel Futur líquido (EU) (Procter and Gamble)
Depósito de Material Biológico
El material biológico siguiente ha sido depositado según las condiciones del tratado de Budapest con la Deutshe Sammmlung von Microorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), Mascheroder Weg 1b, D-38124 Braunschweig DE, y se ha dado el número de registro siguiente:
9
Las cepas se han depositado bajo condiciones que aseguran que el acceso al cultivo estará disponible durante el estado de pendiente de esta solicitud de patente a quien sea autorizado por el Comisionado de Patentes y Marcas Registradas según 37 C.F.R. \NAK1.14 y 35 U.S.C. \NAK122. El depósito representa un cultivo substancialmente puro de la cepa depositada. El depósito está disponible según se requiere por leyes para patentes extranjeras en países donde se soliciten duplicados del contenido de la solicitud, o sus sucesoras. No obstante, se debe entender que la disponibilidad de un depósito no constituye una licencia para la práctica del contenido de la invención en derogación de los derechos para las patentes garantizados por la acción gubernamental.
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Organismo huésped
Cepa SHa273 descrita en WO 95/10603
Cepa SJ2 de E. coli (Diderichsen et al. (1990)), J. Bacteriol., vol. 172, págs. 4315-4321.
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Plásmidos
El vector de genoteca fue el pSJ1678, el cual se describe con más detalle en WO 94/19454, la cual es incorporada aquí como referencia.
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Métodos Métodos de biología molecular general
A menos que se mencione lo contrario las manipulaciones de ADN y las transformaciones fueron realizadas usando métodos estándares de biología molecular (Sambrook et al. (1989); Ausubel et al. (1995); Harwood and Cutting (1990).
Fermentación de alfa-amilasas y variantes
La fermentación puede ser realizada por métodos bien conocidos en la técnica o como sigue.
Una cepa de B. subtilis que contiene el plásmido de expresión pertinente es avetado en una placa de LB agar con 10 micro g/ml de canamicina de un caldo a -80ºC, y hecho crecer durante la noche a 37ºC. Las colonias son transferidas a 100 ml de medios BPX complementados con 10 micro g/ml de canamicina en un matraz de agitación de 500 ml. Composición del medio BPX:
10
El cultivo se agita a 37ºC a 270 r.p.m. durante 5 días.
Las células y los detritos de células se eliminan del caldo de fermentación por centrifugado a 4500 r.p.m. durante 20-25 minutos. Después, el sobrenadante se filtra para obtener una solución completamente clara. El filtrado se concentra y lava en un filtro de ultrafiltración (membrana de 10000 cortes) y el tampón se cambia a 20 mM de acetato a pH 5.5. El filtrado por ultrafiltración se aplica en una S-sefarosa F.F. y la elución se realiza por elución en fases con 0.2M de NaCl en el mismo tampón.
El eluato se dializa contra 10 mM de Tris, a pH 9.0 y se aplica a una Q-sefarosa F.F. y se eluye con un gradiente lineal de 0-0.3M de NaCl sobre 6 volúmenes de columna. Las fracciones, las cuales contienen la actividad (medida mediante el ensayo de Phadebas) se agrupan, el pH se ajustó a pH 7.5 y el color restante se eliminó mediante un tratamiento con 0.5% peso/vol. de carbón activo durante 5 minutos.
Ensayos para la Actividad \alpha-amilasa 1. Ensayo de Phadebas
La actividad \alpha-amilasa se determina mediante un método que utiliza comprimidos de Phadebas® como sustrato. Los comprimidos de Phadebas (Prueba de la amilasa de Phadebas®, suministrado por Pharmacia Diagnostic) contienen un polímero de almidón reticulado insoluble coloreado de azul, el cual ha sido mezclado con albúmina de suero bovino y una sustancia tampón y dispuesto en comprimidos.
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Para cada medición se suspende un comprimido en un tubo con un contenido de 5 ml del tampón Britton-Robinson 50 mM (50 mM de ácido acético, 50 mM de ácido fosfórico, 50 mM de ácido bórico, 0.1 mM de CaCl_{2}, a pH ajustado al valor de interés con NaOH). El test se realiza en un baño de agua a la temperatura de interés. La \alpha-amilasa que se va a evaluar se diluye en x ml del tampón Britton-Robinson 50 mM. Se añade 1 ml de esta solución de \alpha-amilasa a los 5 ml del tampón Britton-Robinson 50 mM. El almidón es hidrolizado por la \alpha-amilasa obteniéndose fragmentos azules solubles. La absorbencia de la solución azul resultante, medida espectrofotométricamente a 620 nm, es una función de la actividad \alpha-amilasa.
Es importante que los 620 nm de absorbencia medidos después de 10 o 15 minutos de incubación (tiempo de prueba) estén en el rango de 0.2 a 2.0 unidades de absorbencia a 620 nm. En este rango de absorbencia hay linealidad entre actividad y absorbencia (ley de Lambert-Beer). En consecuencia, la dilución de la enzima se debe ajustar para adaptarse a este criterio. Bajo un conjunto de condiciones especificas (temp., pH, tiempo de reacción, condiciones de tampón), 1 mg de una \alpha-amilasa dada hidrolizará una cantidad determinada de sustrato y se producirá un color azul. La intensidad del color se mide a 620 nm. La absorbencia medida es directamente proporcional a la actividad específica (actividad/mg de proteína de \alpha-amilasa pura) de la \alpha-amilasa en cuestión según el conjunto de condiciones
dadas.
Medición de la estabilidad en función del calcio y el pH
Normalmente, los procesos de licuefacción industriales se realizan usando pH 6.0-6.2 como pH de licuefacción y una adición de 40 ppm de calcio libre con el fin de mejorar la estabilidad a 95ºC-105ºC. Algunas de las sustituciones propuestas aquí se han hecho con el propósito de mejorar la estabilidad a
1. pH inferior a pH 6.2 y/o
2. a niveles de calcio libre inferiores a 40 ppm de calcio libre.
Pueden utilizarse dos métodos diferentes para medir las alteraciones en la estabilidad obtenida por las diferentes sustituciones en las alfa-amilasas en cuestión:
Método 1. Un ensayo que mide la estabilidad a pH reducido, pH 5.0, en presencia de 5 ppm de calcio libre. Se incuban 10 micro g de la variante según las condiciones siguientes: Una solución de 0,1 M de acetato, pH ajustado a pH 5.0, conteniendo 5 ppm de calcio y un 5% p/p de almidón de maíz común (libre de calcio). La incubación se realiza en un baño de agua a 95ºC durante 30 minutos.
Método 2. Un ensayo que mide la estabilidad en ausencia de calcio libre, en el cual el pH se mantiene a pH 6.0. Este ensayo mide la reducción en la sensibilidad del calcio: 10 micro g de la variante se incubaron según las condiciones siguientes: Una solución de 0.1 M de acetato, pH ajustado a pH 6.0, conteniendo un 5% p/p de almidón de maíz común (libre de calcio). La incubación se realizó en un baño de agua a 95ºC durante 30 minutos.
Determinación de la Estabilidad
Todos los procesos de estabilidad se realizan usando la misma configuración. El método es:
\quad
La enzima se incuba según las condiciones pertinentes (1-4). Las muestras se toman a los 0, 5, 10, 15 y 30 minutos y se diluyen 25 veces (la misma dilución para todas las muestras tomadas) en tampón de ensayo (0.1M de tampón Britton 50 mM a pH 7.3) y la actividad se mide usando el ensayo de Phadebas (Pharmacia) bajo condiciones estándares a pH 7.3 y 37ºC.
\quad
La actividad medida antes de la incubación (0 minutos) se usa como referencia (100%). El descenso en porcentaje se calcula como función del período de incubación.
Determinación de la actividad específica
La actividad específica se determina usando el ensayo de Phadebas (Pharmacia) como actividad/mg de enzima.
Cocinado por chorro y licuefacción con alfa-amilasa y variantes
Los experimentos de licuefacción se realizan en el sistema mini-jet, el cual utiliza una dosificación de 50 NU/g de DS a pH 5.5 con 5 ppm de Ca^{++} añadido, para comparar el rendimiento de la variante de alfa-amilasa formulada con el de de la alfa- amilasa parental. La reacción se controla midiendo el aumento de DE (método de la Neocuproina) en función del tiempo.
Las mezclas de almidón de maiz se preparan suspendiendo aproximadamente 11.8 kg de Cerestar C*Pharm GL 03406 (89% de almidón) en agua desionizada y completando hasta 30 kg. El pH se ajusta a pH 5.5 a una temperatura ambiente, después de añadir 0.55 g de CaCl_{2}. 2H_{2}O.
\newpage
Se añade una cantidad de enzima correspondiente a 50 NU/g de DS, y la conductividad se ajusta a 300mS usando NaCl. Las condiciones estándares son las siguientes:
11
Después del eyectado, el almidón licuado se recoge y transporta en termos sellados desde la instalación de ensayo hasta el laboratorio, donde se continúa la licuefacción secundaria a 95ºC.
Se toman muestras de 10 ml a intervalos de 15 minutos durante 15-90 minutos. Se añaden 2 gotas de 1 N HCl para inactivar la enzima. De estas muestras, se pesan 0.3-0.1 g (según el DE previsto) y se diluyen hasta los 100 ml. Los azúcares de reducción se determinan entonces según el método de la Neocuproina (Determination of reducing sugar with improved precision. Dygert, Li, Florida and Thomas (1965). Anal. Biochem 13: 368) y los valores de DE determinados. Se compara el desarrollo de DE en función del tiempo.
Materiales del desencolado
12
Ensayos de cribado de filtro
El ensayo puede utilizarse para cribar variantes de alfa-amilasa con una estabilidad mejorada a pH alto en comparación con la enzima parental, y de variantes de alfa-amilasa con una estabilidad mejorada a pH alto y a temperaturas medias en comparación con la enzima parental que depende del ajuste de selección de temperatura.
Ensayo de filtro a pH alto
Se colocan las bibliotecas de Bacillus en una placa a modo de sándwich de acetato de celulosa (OE 67, Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) - y filtros de nitrocelulosa (Protran-Ba 85, Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) en placas de agar TY con 10 micro g/ml de canamicina a 37ºC durante al menos 21 horas. El estrato de acetato de celulosa se encuentra en la placa de agar TY.
Cada sándwich de filtro se marca de forma específica con una aguja después de la colocación en placas pero antes de la incubación, con el fin de que sea capaz de localizar variantes positivas en el filtro, y el filtro de nitrocelulosa que contiene variantes enlazadas se transfiere a un recipiente con tampón de glicina-NaOH, a pH 8.6-10.6 y se incuba a temperatura ambiente (puede ser alterado entre 10º-60ºC) durante 15 minutos. Los filtros de acetato de celulosa con colonias se almacenan en las placas TY a temperatura ambiente hasta su uso. Tras la incubación, se detecta la actividad residual en placas conteniendo un 1% de agarosa, un 0.2% de almidón en un tampón de glicina-NaOH, a pH 8.6-10.6. Las placas de ensayo con filtros de nitrocelulosa se marcan del mismo modo que el sándwich de filtro y se incuban durante 2 horas a temperatura ambiente. Después de la eliminación de los filtros las placas de ensayo se manchan con una solución con un 10% de Lugol. Se detectan las variantes que degradan con almidón en forma de manchas blancas sobre un fondo azul oscuro y posteriormente se identifica en las placas de almacenamiento. Las variantes positivas se recriban dos veces bajo las mismas condiciones del primer cribado.
Ensayo de filtro con un nivel bajo de calcio
Se colocan las bibliotecas de Bacillus en una placa a modo sándwich de acetato de celulosa (OE 67, Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) - y filtros de nitrocelulosa (Protran-Ba 85, Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) en placas de agar TY con un antibiótico pertinente, p. ej., canamicina o cloranfenicol, a 37ºC durante al menos 21 horas. El estrato de acetato de celulosa se encuentra en la placa de agar TY.
Cada sándwich de filtro se marca específicamente con una aguja después de la colocación en placas y antes de la incubación con el objetivo de que sea capaz de localizar variantes positivas en el filtro, y el filtro de nitrocelulosa con variantes enlazadas se transfiere a un recipiente con tampón de carbonato/bicarbonato a pH 8.5-10 y con concentraciones de EDTA diferentes (0.001 mM-100 mM). Los filtros se incuban a temperatura ambiente durante 1 hora. Los filtros de acetato de celulosa que contienen colonias se almacenan en las placas TY a temperatura ambiente hasta su uso. Tras la incubación, se detecta la actividad residual en placas conteniendo un 1% de agarosa y un 0.2% de almidón en tampón de carbonato/bicarbonato a pH 8.5-10. Las placas de ensayo con filtros de nitrocelulosa se marcan de la misma forma que el sándwich de filtro y se incuban durante 2 horas a temperatura ambiente. Después de la eliminación de los filtros se manchan las placas de ensayo con una solución de Lugol al 10%. Se detectan las variantes que degradan con almidón en forma de manchas blancas sobre un fondo azul oscuro y después se identifica en las placas de almacenamiento. Las variantes positivas se recriban dos veces bajo las mismas condiciones del primer cribado.
Ejemplos Ejemplo 1 Aislamiento de ADN genómico de las cepas DSM 12560 y DSM 12651
Las cepas DSM 12650 de Bacillus sp. (la \alpha-amilasa AAI-6) y DSM 12651 de Bacillus sp. (la \alpha-amilasa AAI-10) se propagaron en un medio de TY líquido (según se describe en Ausubel et al.(1995)). Después de 16 horas de incubación a 37ºC y 300 r.p.m. se cosecharon las células y se aisló el ADN genómico por el método descrito por Pitcher et al. (1989).
Construcción de una genoteca genómica
El ADN genómico de las cepas anteriormente mencionadas se digerió parcialmente con la enzima de restricción Sau3A y se fraccionó mediante electroforesis en un gel de agarosa al 0.7%. Los fragmentos de entre 2 y 10 kb de tamaño se aislaron mediante electroforesis sobre papel de celulosa DEAE (Dretzen et al. (1981).
Los fragmentos de ADN aislados se ligaron al ADN del plásmido digerido pSJ1678 de BamHI, y la mezcla de ligadura se usó para transformar las SJ2 de E. coli.
Transformación
Las células huéspedes SJ2 de E. coli se prepararon y transformaron mediante electroporación usando un gen PULSER electroporador de Bio-Rad, como describe el proveedor.
Identificación de transformantes positivos
Las bibliotecas de ADN en la SJ2 de E. coli, construidas como se ha descrito anteriormente, se cribaron en placas de agar LB (descritas en Ausbel et al.(1995)) con un 5% de amilosa AZCL (Megazyme) y 10 micro g/ml de cloranfenicol y se incubaron durante toda la noche a 37ºC. Los clones que expresan actividad amilasa de expresión aparecieron con halos de difusión azules. Un clon de este tipo que expresaba amilasa AAI-6 fue denominado como LiH1300. Otro clon que expresaba amilasa AAI-10 fue denominado como LiH1298. El ADN se caracterizó ulteriormente por secuenciar parte de los fragmentos de ADN clonados Sau3A.
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Ejemplo 2 Determinación de la secuencia de ADN del gen que codifica alfa-amilasa de la cepa DSM 12650 (AAI-6)
El clon que constituye un fragmento cromosómico amplio, el cual contiene el gen que codifica la actividad amilolítica insertada en los plásmidos pSJ1678 y pLiH1300, se usó como molde en un intento de amplificar, específicamente mediante PCR, fragmentos de ADN internos de la amilasa que codifica el gen usando cebadores degenerados dirigidos hacia las regiones conservadas en las \alpha-amilasas conocidas de Bacillus.
Los cebadores degenerados fueron dirigidos hacia las siguientes regiones/secuencias de aminoácidos:
For36: GITA(L/V/I)W(I/L) (SEC ID NO: 5)
For97: VY(G/A)D(V/F/L)V(M/L/I/F)NH (SEC ID NO: 6)
For227: DG(F/I)R(F/L/I/V)DA(A/V)KH (SEC ID NO: 7)
Rev235: DG(F/I)R(F/L/I/V)DA(A/V)KKH (SEC ID NO: 8)
Rev328: VTFV(D/E)NHD (SEC ID NO: 9)
Rev410: GWTREG (SEC ID NO: 10)
Las diferentes combinaciones de cebadores directos (For) e inversos (Rev) se usaron en la PCR y los fragmentos de ADN internos se pudieron amplificar. Los fragmentos de ADN se purificaron por columnas QIAquick spin (QUIGEN) y se ordenaron utilizando los mismos cebadores degenerados.
De esta secuencia inicial se determinó la secuencia de ADN de la región de codificación completa de la \alpha-amilasa AAI-6 de la SEC ID No: 2 mediante un proceso estándar de desplazamiento de los cebadores.
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Ejemplo 3 Determinación de la secuencia de ADN del gen que codifica la alfa-amilasa de la cepa DSM 12651 (AAI-10)
El clon que constituye un fragmento cromosómico amplio, el cual contiene el gen que codifica la actividad amilolítica insertada en los plásmidos pSJ1678 y pLiH1298, se usó como molde en un intento de amplificar, específicamente mediante PCR, fragmentos de ADN internos de la amilasa que codifica el gen usando cebadores degenerados dirigidos hacia las regiones conservadas en las alfa-amilasas conocidas de Bacillus.
Los cebadores degenerados fueron dirigidos hacia las siguientes regiones/secuencias de aminoácidos:
For36: GITA(L/V/I)W(I/L) (SEC ID NO: 5)
For97: VY(G/A)D(V/F/L)V(M/L/I/F)NH (SEC ID NO: 6)
For227: DG(F/I)R(F/L/I/V)DA(A/V)KH (SEC ID NO: 7)
Rev235: DG(F/I)R(F/L/I/V)DA(A/V)KH (SEC ID NO: 8)
Rev328: VTFV(D/E)NHD (SEC ID NO: 9)
Rev410: GWTREG (SEC ID NO: 10)
Las diferentes combinaciones de cebadores directos (For) e inversos (Rev) se usaron en la PCR y se pudieron amplificar los fragmentos de ADN internos.
Los fragmentos de ADN se purificaron por columnas QIAquick spin (QUIGEN) y se ordenaron utilizando los mismos cebadores degenerados.
A partir de esta secuencia inicial fue determinada la secuencia de ADN (SEC ID No: 1) de la región de codificación completa de la \alpha-amilasa AAI-10 (SEC ID NO: 4) mediante un acercamiento estándar de los cebadores.
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Ejemplo 4 Subclonación de la \alpha-amilasa DSM 12650(AAI-6) en la pTVB110
La pTVB110 es una replicación del plásmido en el Bacillus subtilis debido al uso del origen de la replicación a partir de pUB110 (Gryczan, T.J. (1978) J. Bact 134:318-329). El plásmido también codifica el gen cat, confiriendo resistencia frente al clorampenicol, obtenido del plásmido pC194 (Horinouchi, S. and Weisblum, B. (1982), J. Bact. 150: 815-825). El plásmido alberga una versión truncada de los genes de alfa-amilasa de Bacillus licheniformis, amyL, de manera que el promotor amyL, la secuencia señal y el terminador de transcripción están presentes, pero el plásmido no proporciona un fenotipo amy-plus (formación de un halo en almidón con contenido de agar).
Con el objetivo de expresar una cantidad alta de la amilasa AAI-6 el gen maduro fue fusionado de forma precisa con la secuencia señal de amyL de manera que la transcripción es iniciada por el promotor de amyL y la translocación es dirigida por la secuencia señal amyL.
Los cebadores 197 clonador de N y 197 clonador de C se usaron para amplificar un fragmento de aproximadamente 1480 pares de bases mediante PCR en el plásmido pLiH1300 usando la polimerasa Pwo bajo condiciones recomendadas por el fabricante (Boehringer Mannheim).
El fragmento resultante de aproximadamente 1480 pares de bases fue digerido con las endonucleasas de restricción PstI y SfiI y ligado a el plásmido digerido con las mismas enzimas.
La proteasa y amilasa de la cepa delecionada SHa273 de Bacillus subtilis (descrita en W095/10603) se transformó con la mezcla de ligadura y se verificó la secuencia de ADN de un amy-plus transformante. Este plásmido se denomina pTVB230.
Oligonucleótidos
197 clonador de C:
5' CCG AGC TCG GCC GGC TGG GCC GTC GAC TTA TCG TTT CAC CCA TAC GG (SEC ID No: 11)
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197 clonador de N:
5' CAT TCT GCA GCA GCG GCG CAT CAC GAT GGG ACG AAC GG (SEC ID NO: 12)
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Ejemplo 5 Subclonación de la alfa-amilasa AAI-10 en pTVB110
La secuenciación del ADN reveló una identidad más bien alta entre las alfa-amilasas de las cepas AAI-6 y AAI-10. Por consiguiente se utilizaron los mismos oligonucleótidos y la misma estrategia para clonar la alfa-amilasa AAI-10 en el vector de expresión pTVB110 dando como resultado el plásmido pTVB229, que entonces fue fermentado mediante técnicas estándares.
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Ejemplo 6 Purificación de la \alpha-amilasa AAI-6
El caldo de cultivo se floculó añadiendo 0.01 ml de CaCl_{2} al 50% (p/p), 2H_{2}O, 0. ml de sodio aluminato al 12% (p/p), 0.025 ml de C521 al 10% y 0.075 ml de A130 al 0.1% por ml de caldo de cultivo. Se obtuvo una solución clara después del centrifugado. A la solución enzimática se le añadió sulfato de amonio hasta conseguir una concentración final de 1.2 M y ésta se aplicó en una columna de Butilo Toyo Pearl (100 ml) previamente equilibrada en 1.2 M de sulfato de amonio, 10 mM de Tris-HCl, a pH 7.0. La amilasa fue eluida usando 5 mM de Tris-HCl, a pH 7.0, y la agrupación eluida fue dializada contra 5 mM de Tris-HCl durante la noche. La fracción fue sometida entonces a una cromatografía de intercambio iónico usando una columna de Q-Sepharose (200 ml) previamente equilibrada en 20 mM de Tris-HCl, a pH 9.0. El material no enlazado fue lavado con el tampón de equilibrado, y la amilasa fue eluida usando un gradiente lineal de 0-1 M de NaCl, 20 mM de Tris-HCl, a pH 9.0. La pureza de la preparación de amilasa fue juzgada en más de un 95% por SDS-PAGE.
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Ejemplo 7 Purificación de la \alpha-amilasa AAI-10
El caldo de cultivo fue floculado como se ha descrito anteriormente. A la solución enzimática se le añadió sulfato de amonio hasta obtener una concentración final de 1.2 M y ésta fue aplicada en una columna de Butyl Toyo Pearl (100 ml) previamente equilibrada en 1.2 M de sulfato de amonio, 10 mM de Tris-HCl, a pH 7.0. El 20% de la actividad fue eluida con 5 mM de Tris-HCl, a pH 7.0, y el resto con isopropanol. La agrupación combinada fue fraccionada en una columna de Q-Sepharose (100 ml), a pH 9.7. El material no enlazado fue lavado con el tampón de equilibrado, y la amilasa fue eluida usando un gradiente lineal de 0-1 M de NaCl, 20 mM de Tris-HCl, a pH 9.4. La amilasa que contenía la agrupación fue finalmente fraccionada en un columna de S Sefarosa, a pH 5.5. La pureza de la preparación de amilasa fue juzgada en más de un 95% por SDS-PAGE.
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Ejemplo 8 Caracterización de las \alpha-amilasas AAI-6 y AAI-10
La actividad \alpha-amilasa se midió usando el ensayo de Phadebas (37ºC, pH 7.3) y el Ensayo Alternativo pNPG7 (25ºC, pH 7.1) anteriormente descrito. Los perfiles de pH y temperatura se hicieron con valores de pH y temperatura seleccionados. El perfil de pH se midió a 37ºC y el perfil de temperatura se midió a pH 9.0
El Punto Isoeléctrico se determinó mediante isoelectroenfoque (Pharmacia, Ampholine, pH 3.5-9.3).
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TABLA 1 Actividad específica y pl
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El resultado de la determinación de pH óptimo y la determinación de temperatura óptima se muestra en la figura 2 y figura 3, respectivamente.
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Ejemplo 9 Prueba de lavado
El rendimiento de lavado se evaluó mediante el lavado de muestras de prueba sucias durante 15 y 30 minutos a 25 y 40ºC respectivamente en soluciones detergentes con las \alpha-amilasas AAI-6 y MI-10 de la invención.
Los detergentes usados están descritos a continuación en la Tabla 3. El Detergente Modelo A/P está descrito en la sección anterior de Materiales. Los otros detergentes son detergentes disponibles comercialmente. Los detergentes comerciales que contienen amilasa fueron inactivados antes del lavado mediante microondas.
Las \alpha-amilasas recombinantes purificadas AAI-6 y AAI-10 de los ejemplos 6 y 7 se añadieron a las soluciones detergentes con la concentración que se indica a continuación. Las muestras de prueba se ensuciaron con almidón de arroz naranja (las muestras CS-28 disponibles del CFT, Center for Test Material, Holland).
Después del lavado, las muestras se evaluaron midiendo la remisión a 460 nm, usando un Espectrofómetro de Remisión Elrepho. Los resultados se expresan como \DeltaR = remisión de la muestra lavada con la alfa amilasa menos la remisión de una muestra lavada en las mismas condiciones sin la alfa-amilasa.
TABLA 3 Detergentes y condiciones de lavado
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Los resultados se muestran en las Figuras 4-7. Los resultados demuestran que la \alpha-amilasa de la invención es eficaz en ambos detergentes a pH alcalino alto.
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Ejemplo 10 Prueba de desencolado con la AAI-10
La alfa-amilasa parental AAI-10 se usa para desencolar telas usando el método de TEGEWA (Método y escalas estándar obtenibles de Verband TEGEWA, Karlstrasse 21, Frankfurt a.M., Alemania). Las condiciones están descritas en la sección "Materiales y Métodos".
La alfa-amilasa AAI-10 se usa en pruebas de desencolado realizadas a 30 y 55ºC. La enzima se dosifica de 0.05 a 2 g/l en la solución de impregnación. El procedimiento post-lavado se realiza lavando las telas en agua en vez de en soda caliente, como normalmente se hace.
El efecto de esto se mide usando la Escala Violeta (TEGEWA), escala de TEGEWA: 1-9.
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Referencias
Ausubel, F. M. et al. (eds.); Current protocols in Molecular Biology; 1995; John Wiley and Sons.
Sambrook et al.; Molecular Cloning: A Laboratory Manual; 1989; Cold Spring Harbor Lab.; Cold Spring Harbor; NY.
Harwood C. R., and Cutting S. M. (eds.); Molecular Biological Methods for Bacillus; 1990; John Wiley and Sons.
Diderichsen B., Wedsted U., Hedegaard L., Jensen B. R., Sjøholm C.; Cloning of aldB, which encodes alpha-acetolactate decarboxylase, an exoenzyme from Bacillus brevis; J. Bacteriol., 1990, vol. 172, pp. 4315-4321.
Pitcher D. G., Saunders N. A., Owen R. J.; Rapid extraction of bacterial genomic DNA with guanidium thiocyanate; Lett. Appl. Microbiol.; 1989; vol. 8; pp. 151-156.
Dretzen G., Bellard M., Sassone-Corsi P., Chambon P.; A reliable method for the recovery of DNA fragments from agarose and acrylamide gels; Anal. Biochem.; 1981; vol. 112; pp. 295-298.
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Documentos citados en la descripción
Esta lista de documentos citados por el solicitante ha sido recopilada exclusivamente para la información del lector y no forma parte del documento de patente europea. La misma ha sido confeccionada con la mayor diligencia; la OEP sin embargo no asume responsabilidad por eventuales errores u omisiones.
Documentos de patente citados en la descripción
\bullet WO 9526397 A [0004]
\bullet WO 9535381 A [0123]
\bullet WO 9623873 A [0005] [0125]
\bullet WO 9600292 A [0123]
\bullet US 5147796 A [0006]
\bullet WO 9530744 A [0123]
\bullet WO 9700324 A [0008] [0018]
\bullet WO 9425578 A [0123]
\bullet US 5856164 A [0018] [0018] [0147] [0147] [0205]
\bullet WO 9514783 A [0123]
{}\hskip0.2cm [0205]
\bullet WO 9522615 A [0123]
\bullet US 4683202 A, R.K. Saiki [0052]
\bullet WO 9704079 A [0123]
\bullet US 1988 A [0052]
\bullet WO 9707202 A [0123] [0142]
\bullet US 4760025 A [0053]
\bullet GB 1296839 A [0124]
\bullet WO 9522625 A [0055]
\bullet WO 9402597 A [0125]
\bullet WO 9600343 A [0055]
\bullet WO 9418314 A [0125]
\bullet WO 9117243 A [0061]
\bullet WO 9743424 A [0125]
\bullet EP 238023 A [0067]
\bullet US 4435307 A [0126]
\bullet US 3912590 A [0109]
\bullet US 5648263 A [0126]
\bullet EP 252730 A [0109]
\bullet US 5691178 A [0126]
\bullet EP 63909 A [0109]
\bullet US 5776757 A [0126]
\bullet W0 9514807 A [0110]
\bullet WO 8909259 A [0126]
\bullet WO 9521247 A [0113]
\bullet EP 0495257 A [0127]
\bullet US 4643736 A [0113]
\bullet EP 0531372 A [0127]
\bullet EP 119920 A [0113]
\bullet W0 9611262 A [0127]
\bullet WO 8906279 A [0119]
\bullet WO 9629397 A [0127]
\bullet WO 8906270 A [0119]
\bullet WO 9808940 A [0127]
\bullet WO 9425583 A [0119]
\bullet WO 9407998 A [0127]
\bullet WO 9219729 A [0120]
\bullet EP 0531315 A [0127]
\bullet WO 9820115 A [0120]
\bullet US 5457046 A [0127]
\bullet WO 9820116 A [0120]
\bullet US 5686593 A [0127]
\bullet WO 9834946 A [0120]
\bullet US 5763254 A [0127]
\bullet EP 258068 A [0122]
\bullet WO 9524471 A [0127]
\bullet EP 305216 A [0122]
\bullet WO 9812307 A [0127]
\bullet WO 9613580 A [0122]
\bullet DK 9800299 W[0127]
\bullet EP 218272 A [0122]
\bullet WO 9324618 A [0128]
\bullet EP 331376 A [0122]
\bullet WO 9510602 A [0128]
\bullet GB 1372034 A [0122]
\bullet WO 9815257 A [0128]
\bullet WO 9506720 A [0122]
\bullet US 4106991 A [0131]
\bullet WO 9627002 A [0122]
\bullet US 4661452 A [0131]
\bullet WO 9612012 A [0122]
\bullet GB 1483591 A [0131]
\bullet JP 64744992 B [0122]
\bullet EP 238216 A [0131]
\bullet WO 9116422 A [0122]
\bullet WO 9219709 A [0139]
\bullet WO 9205249 A [0123]
\bullet WO 9219708 A [0139]
\bullet WO 9401541 A [0123]
\bullet US 5830837 A [0147]
\bullet EP 407225 A [0123]
\bullet WO 9510603 A [0152] [0199]
\bullet EP 260105 A [0123]
\bullet WO 9419454 A [0153]
Bibliografía distinta de patentes citada en la descripción
\bullet M. TAKAGI et al. J. Ferment. Bioeng., 1996, vol. 81 (6), 557-559 [0007]
\bullet H. NEURATH; R.L. HILL. The Proteins. Academic Press, 1979 [0023]
\bullet J. SAMBROOK; E.F. FRITSCH; T. MANIATUS. Molecular Cloning, A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor, 1989 [0024]
\bulletBOLTON; MCCARTHY. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 1962, vol. 48, 1390 [0030]
\bulletSAMBROOK et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor, 1989 [0063]
\bulletINNIS et al. PCR: A Guide to Methods and Application. Academic Press, 1990 [0075]
\bulletVILLA-KAMAROFF et al. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 1978, vol. 75, 3727-3731 [0082]
\bulletDEBOER et al. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 1983, vol. 80, 21-25 [0082]
\bullet Useful proteins from recombinant bacteria. Scientific American, 1980, vol. 242, 74-94 [0082]
\bulletSIMONEN; PALVA. Microbiological Reviews, 1993, vol. 57, 109-137 [0085]
\bulletEHRLICH. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 1978, vol. 75, 1433 [0093]
\bulletCHANG; COHEN. Molecular General Genetics, 1979, vol. 168, 111-115 [0100]
\bulletYOUNG; SPIZIZIN. Journal of Bacteriology, 1961, vol. 81, 823-829 [0100]
\bulletDUBNAU; DAVIDOFF-ABELSON. Journal of Molecular Biology, 1971, vol. 56, 209-221 [0100]
\bulletSHIGEKAWA; DOWER. Biotechniques, 1988, vol. 6, 742-751 [0100]
\bulletKOEHLER; THORNE. Journal of Bacteriology, 1987, vol. 169, 5771-5278 [0100]
\bulletNEEDLEMAN, S.B.; WUNSCH, C.D. Journal of Molecular Biology, 1970, vol. 48, 443-453 [0016]
\bulletDARTOIS et al. Biochemica et Biophysica Acta, 1993, vol. 1131, 253-360 [0122]
\bullet Efficient manganese catalysts for low-temperature bleaching. Nature, 1994, vol. 369, 637-639 [0143]
\bulletDIDERICHSEN et al. J. Bacteriol., 1990, vol. 172, 4315-4321 [0152]
\bulletDYGERT, LI; FLORIDA; THOMAS. Anal. Biochem, 1965, vol. 13, 368 [0175]
\bulletGRYCZAN, T.J. J. Bact, 1978, vol. 134, 318-329 [0195]
\bulletHORINOUCHI, S.; WEISBLUM, B. J. Bact., 1982, vol. 150, 815-825 [0195]
\bullet Current protocols in Molecular Biology. John Wiley and Sons, 1995 [0215]
\bulletSAMBROOK et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Lab, 1989 [0215]
\bullet Molecular Biological Methods for Bacillus. John Wiley and Sons [0215]
\bulletDIDERICHSEN B.; WEDSTED U.; HEDEGAARD L.; JENSEN B. R.; SJØHOLM C. Cloning of aldB, which encodes alpha-acetolactate decarboxylase, an exoenzyme from Bacillus brevis. J. Bacteriol., 1990, vol. 172, 4315-4321 [0215]
\bulletPITCHER D. G.; SAUNDERS N. A.; OWEN R. J. Rapid extraction of bacterial genomic DNA with guanidium thiocyanate. Lett. Appl. Microbiol., 1989, vol. 8, 151-156 [0215]
\bulletDRETZEN G.; BELLARD M.; SASSONE-CORSI P.; CHAMBON P. A reliable method for the recovery of DNA fragments from agarose and acrylamide gels. Anal. Biochem., 1981, vol. 112, 295-298 [0215]
\global\parskip0.000000\baselineskip
<110> Novo Nordisk A/S
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<120> POLIPÉPTIDOS CON ACTIVIDAD ALCALINA DE ALFA-AMILASA Y ÁCIDOS NUCLEICOS QUE CODIFICAN LAS MISMAS
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<160> 12
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<170> FastSEQ para Windows Version 3.0
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<210> 1
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<211> 1458
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<223> Xaa=Leu, Val, Ile
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<223> Xaa=Ile, Leu
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<223> Región de cebador degenerado
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<223> región de cebador degenerado
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<223> Xaa=Gly, Ala
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<223> Xaa=Met, Leu, Ile, Phe
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26
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<213> desconocido
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<223> Xaa=Phe, Ile
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<223> Xaa=Phe, Leu, Ile, Val
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<223> Región de Cebador Degenerado
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27
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<223> Región de Cebador Degenerado
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<223> Xaa=Phe, Ile
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<223> Xaa=Phe, Leu, Ile, Val
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28
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<223> Región de Cebador Degenerado
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<223> Xaa=Asp, Glu
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29
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<223> Región de Cebador Degenerado
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30
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<211> 47
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Cebador 197 clonador de C
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<400> 11
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ccgagctcgg ccggctgggc cgtcgactta tcgtttcacc catacgg
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47
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<211> 38
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<212> ADN
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<223> 197 clonador de N
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cattctgcag cagcggcgca tcacgatggg acgaacgg
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Claims (13)

1. Polipéptido aislado con actividad \alpha-amilasa y con una secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4.
2. Polipéptido según la reivindicación 1, el cual está codificado por la secuencia de ácidos nucleicos contenida en los plásmidos ppLiH1300 o pLiH1298 contenidos en la DSM12769 de E. coli o la DSM 12768 de E. coli, respectivamente.
3. Secuencia de ácidos nucleicos aislada que comprende una secuencia de ácidos nucleicos, la cual a su vez codifica el polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1-2.
4. Secuencia de ácidos nucleicos aislada que comprende una secuencia de ácidos nucleicos con al menos una mutación en la secuencia codificante del polipéptido maduro de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, donde la secuencia de ácidos nucleicos mutante codifica un polipéptido que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4.
5. Secuencia de ácidos nucleicos aislada según la reivindicación 4, producida mediante (a) la hibridación de un ADN bajo condiciones de astringencia medias con (i) la secuencia de ácidos nucleicos de la SEC ID No: 1, (ii) la secuencia de ADNc de la SEC ID No: 1, (iii) una subsecuencia de (i) o (ii) de al menos 100 nucleótidos, o (iv) una cadena complementaria de (i), (ii), o (iii); y (b) el aislamiento de la secuencia de ácidos nucleicos.
6. Vector de expresión recombinante que comprende la secuencia de ácidos nucleicos de cualquiera de las reivindicaciones 3-5.
7. Célula huésped recombinante que comprende el constructo de ácidos nucleicos según la reivindicación 6.
8. Método para producir de una secuencia de ácidos nucleicos mutante, la cual comprende (a) la introducción de al menos una mutación en la secuencia codificante del polipéptido maduro de la SEC ID No: 1 o la SEC ID No: 3, donde la secuencia de ácidos nucleicos mutante codifica un polipéptido que consiste en los aminoácidos del 1 al 485 de la SEC ID No: 2 o la SEC ID No: 4; y (b) la recuperación de la secuencia de ácidos nucleicos mutante.
9. Secuencia de ácidos nucleicos mutante producida según el método de la reivindicación 8.
10. Método para producir un polipéptido, el cual comprende (a) el cultivo de una cepa que a su vez comprende la secuencia de ácidos nucleicos mutante según la reivindicación 9, la cual codifica el polipéptido para producir un sobrenadante que comprenda el polipéptido; y (b) la recuperación del polipéptido.
11. Método para producir el polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1-2, que comprende (a) el cultivo de una cepa para producir un sobrenadante que comprenda el polipéptido; y (b) la recuperación del polipéptido.
12. Composición, en particular una composición detergente, que comprende un polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1-2.
13. Uso del polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1-2 en una composición detergente, en particular una composición detergente para lavandería y una composición detergente para el lavado de la vajilla y composiciones para la limpieza de superficies duras, o en una composición de desencolado.
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ES (1) ES2322426T3 (es)
WO (1) WO2000060058A2 (es)

Families Citing this family (98)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020155574A1 (en) 2000-08-01 2002-10-24 Novozymes A/S Alpha-amylase mutants with altered properties
JP4426716B2 (ja) 2000-10-11 2010-03-03 花王株式会社 高生産性α−アミラーゼ
AU2002254876A1 (en) 2001-05-15 2002-11-25 Novozymes A/S Alpha-amylase variant with altered properties
CN1313608C (zh) * 2004-01-18 2007-05-02 中国科学院微生物研究所 一种碱性α-淀粉酶及其编码基因与生产方法
JP4190479B2 (ja) * 2004-10-22 2008-12-03 ライオン株式会社 アミラーゼ含有粒状洗剤組成物
CA2592083C (en) 2004-12-22 2017-02-21 Novozymes A/S Hybrid enzymes consisting of an endo-amylase first amino acid sequence and a carbohydrate-binding module as second amino acid sequence
DE102006038448A1 (de) 2005-12-28 2008-02-21 Henkel Kgaa Enzym-haltiges Reinigungsmittel
BRPI1009263A2 (pt) * 2009-03-10 2015-10-06 Danisco Us Inc alfa-amilases relacionadas com cepa de bacillus megaterium dsm90 e métodos de uso das mesmas.
CN102869759B (zh) 2010-02-10 2015-07-15 诺维信公司 在螯合剂存在下具有高稳定性的变体和包含变体的组合物
MX353621B (es) 2011-06-30 2018-01-22 Novozymes As Variantes de alfa-amilasa.
EP2540824A1 (en) * 2011-06-30 2013-01-02 The Procter & Gamble Company Cleaning compositions comprising amylase variants reference to a sequence listing
WO2014099525A1 (en) * 2012-12-21 2014-06-26 Danisco Us Inc. Paenibacillus curdlanolyticus amylase, and methods of use, thereof
CN104884614A (zh) * 2012-12-21 2015-09-02 丹尼斯科美国公司 α-淀粉酶变体
US9902946B2 (en) 2013-01-03 2018-02-27 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same
EP3978604A1 (en) * 2013-03-11 2022-04-06 Danisco US Inc. Alpha-amylase combinatorial variants
US20160160202A1 (en) 2013-05-29 2016-06-09 Danisco Us Inc. Novel metalloproteases
EP3110833B1 (en) 2013-05-29 2020-01-08 Danisco US Inc. Novel metalloproteases
EP3004342B1 (en) 2013-05-29 2023-01-11 Danisco US Inc. Novel metalloproteases
US20160108388A1 (en) 2013-05-29 2016-04-21 Danisco Us Inc. Novel metalloproteases
WO2015089441A1 (en) 2013-12-13 2015-06-18 Danisco Us Inc. Serine proteases of bacillus species
WO2015089447A1 (en) 2013-12-13 2015-06-18 Danisco Us Inc. Serine proteases of the bacillus gibsonii-clade
WO2015095046A1 (en) 2013-12-16 2015-06-25 E. I. Du Pont De Nemours And Company Use of poly alpha-1,3-glucan ethers as viscosity modifiers
AU2014364772B2 (en) 2013-12-18 2018-07-26 Nutrition & Biosciences USA 4, Inc. Cationic poly alpha-1,3-glucan ethers
WO2015123323A1 (en) 2014-02-14 2015-08-20 E. I. Du Pont De Nemours And Company Poly-alpha-1,3-1,6-glucans for viscosity modification
ES2734726T3 (es) 2014-03-11 2019-12-11 Du Pont Poli alfa-1,2-glucano oxidado como reforzante de detergente
MX2016012044A (es) 2014-03-21 2017-06-29 Danisco Us Inc Serina proteasas de especies de bacillus.
WO2015189370A1 (en) * 2014-06-12 2015-12-17 Novozymes A/S Oxidation stable alpha-amylase variants
CN106459944B (zh) 2014-06-12 2022-04-12 诺维信公司 α-淀粉酶变体
US9714403B2 (en) 2014-06-19 2017-07-25 E I Du Pont De Nemours And Company Compositions containing one or more poly alpha-1,3-glucan ether compounds
US9771548B2 (en) 2014-06-19 2017-09-26 E I Du Pont De Nemours And Company Compositions containing one or more poly alpha-1,3-glucan ether compounds
WO2016061438A1 (en) 2014-10-17 2016-04-21 Danisco Us Inc. Serine proteases of bacillus species
EP3212782B1 (en) 2014-10-27 2019-04-17 Danisco US Inc. Serine proteases
EP3212662B1 (en) 2014-10-27 2020-04-08 Danisco US Inc. Serine proteases
DK3212781T3 (da) 2014-10-27 2019-12-16 Danisco Us Inc Serinproteaser
EP3212783A1 (en) 2014-10-27 2017-09-06 Danisco US Inc. Serine proteases
WO2016069557A1 (en) 2014-10-27 2016-05-06 Danisco Us Inc. Serine proteases of bacillus species
EP3221447A1 (en) 2014-11-20 2017-09-27 Novozymes A/S Alicyclobacillus variants and polynucleotides encoding same
CN107109450A (zh) 2014-12-23 2017-08-29 纳幕尔杜邦公司 酶促产生的纤维素
EP3294881B1 (en) 2015-05-08 2022-12-28 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same
CN107750275A (zh) 2015-05-08 2018-03-02 诺维信公司 α‑淀粉酶变体以及编码它们的多核苷酸
EP3294883A1 (en) * 2015-05-08 2018-03-21 Novozymes A/S Alpha-amylase variants having improved performance and stability
RU2733987C2 (ru) 2015-05-13 2020-10-09 ДАНИСКО ЮЭс ИНК. Варианты протеазы клады aprl и их применения
WO2016201040A1 (en) 2015-06-09 2016-12-15 Danisco Us Inc. Water-triggered enzyme suspension
WO2016201044A1 (en) 2015-06-09 2016-12-15 Danisco Us Inc Osmotic burst encapsulates
WO2016201069A1 (en) 2015-06-09 2016-12-15 Danisco Us Inc Low-density enzyme-containing particles
EP3310911B1 (en) 2015-06-17 2023-03-15 Danisco US Inc. Bacillus gibsonii-clade serine proteases
MX2018004683A (es) 2015-10-28 2018-07-06 Novozymes As Composicion detergente que comprende variantes de amilasa y proteasa.
BR112018008946A2 (pt) 2015-11-05 2020-11-03 Danisco Us Inc. mananases de paenibacillus sp.
EP3371307A1 (en) 2015-11-05 2018-09-12 Danisco US Inc. Paenibacillus and bacillus spp. mannanases
JP6997706B2 (ja) 2015-11-13 2022-01-18 ニュートリション・アンド・バイオサイエンシーズ・ユーエスエー・フォー,インコーポレイテッド 洗濯ケアおよび織物ケアにおいて使用するためのグルカン繊維組成物
EP3374401B1 (en) 2015-11-13 2022-04-06 Nutrition & Biosciences USA 4, Inc. Glucan fiber compositions for use in laundry care and fabric care
JP7045313B2 (ja) 2015-11-13 2022-03-31 ニュートリション・アンド・バイオサイエンシーズ・ユーエスエー・フォー,インコーポレイテッド 洗濯ケアおよび織物ケアにおいて使用するためのグルカン繊維組成物
BR112018011755A2 (pt) 2015-12-09 2018-12-04 Danisco Us Inc variantes combinatórias de alfa-amilase
EP3390625B1 (en) 2015-12-18 2023-09-06 Danisco US Inc. Polypeptides with endoglucanase activity and uses thereof
CN114480035A (zh) 2016-04-08 2022-05-13 诺维信公司 洗涤剂组合物及其用途
EP3452585A1 (en) 2016-05-03 2019-03-13 Danisco US Inc. Protease variants and uses thereof
EP3452584B1 (en) 2016-05-05 2021-01-06 Danisco US Inc. Protease variants and uses thereof
EP3464599A1 (en) 2016-05-31 2019-04-10 Danisco US Inc. Protease variants and uses thereof
BR112018075933A2 (pt) 2016-06-17 2019-10-01 Danisco Us Inc variantes de protease e usos das mesmas
US20190264138A1 (en) 2016-11-07 2019-08-29 Danisco Us Inc. Laundry detergent composition
DE102016221851A1 (de) * 2016-11-08 2018-05-09 Henkel Ag & Co. Kgaa Amylase für Wasch- und Reinigungsmittelanwendungen
WO2018118917A1 (en) 2016-12-21 2018-06-28 Danisco Us Inc. Protease variants and uses thereof
US11946081B2 (en) 2016-12-21 2024-04-02 Danisco Us Inc. Bacillus gibsonii-clade serine proteases
WO2018169750A1 (en) 2017-03-15 2018-09-20 Danisco Us Inc Trypsin-like serine proteases and uses thereof
CN110662836B (zh) 2017-03-31 2024-04-12 丹尼斯科美国公司 α-淀粉酶组合变体
WO2018183662A1 (en) 2017-03-31 2018-10-04 Danisco Us Inc Delayed release enzyme formulations for bleach-containing detergents
JP2020527339A (ja) 2017-06-30 2020-09-10 ダニスコ・ユーエス・インク 低凝集の酵素含有粒子
WO2019036721A2 (en) 2017-08-18 2019-02-21 Danisco Us Inc VARIANTS OF ALPHA-AMYLASES
CN111373039A (zh) 2017-11-29 2020-07-03 丹尼斯科美国公司 具有改善的稳定性的枯草杆菌蛋白酶变体
EP3728543A1 (en) 2017-12-21 2020-10-28 Danisco US Inc. Enzyme-containing, hot-melt granules comprising a thermotolerant desiccant
BR112020016068A2 (pt) 2018-02-08 2020-12-08 Danisco Us Inc. Partículas cera termicamente resistente matriz para encapsulamento de enzima
WO2019245704A1 (en) 2018-06-19 2019-12-26 Danisco Us Inc Subtilisin variants
EP3799601A1 (en) 2018-06-19 2021-04-07 Danisco US Inc. Subtilisin variants
MX2021001213A (es) 2018-07-31 2021-08-24 Danisco Us Inc Variantes de alfa-amilasas que tienen sustituciones de aminoácidos que bajan el pka del ácido general.
US20210189295A1 (en) 2018-08-30 2021-06-24 Danisco Us Inc Enzyme-containing granules
EP3856882A1 (en) 2018-09-27 2021-08-04 Danisco US Inc. Compositions for medical instrument cleaning
WO2020077331A2 (en) 2018-10-12 2020-04-16 Danisco Us Inc Alpha-amylases with mutations that improve stability in the presence of chelants
WO2020112599A1 (en) 2018-11-28 2020-06-04 Danisco Us Inc Subtilisin variants having improved stability
CN113302270A (zh) 2018-12-03 2021-08-24 诺维信公司 低pH粉末洗涤剂组合物
EP3976776A1 (en) 2019-05-24 2022-04-06 Danisco US Inc. Subtilisin variants and methods of use
US20220306968A1 (en) 2019-06-06 2022-09-29 Danisco Us Inc Methods and compositions for cleaning
WO2021080948A2 (en) 2019-10-24 2021-04-29 Danisco Us Inc Variant maltopentaose/maltohexaose-forming alpha-amylases
US20240034960A1 (en) 2020-08-27 2024-02-01 Danisco Us Inc Enzymes and enzyme compositions for cleaning
EP4284906A1 (en) 2021-01-29 2023-12-06 Danisco US Inc. Compositions for cleaning and methods related thereto
CN117616120A (zh) 2021-06-30 2024-02-27 丹尼斯科美国公司 变体脂肪酶及其用途
CN117916354A (zh) 2021-09-03 2024-04-19 丹尼斯科美国公司 用于清洁的衣物洗涤组合物
CN117957318A (zh) 2021-09-13 2024-04-30 丹尼斯科美国公司 含有生物活性物质的颗粒
WO2023114939A2 (en) 2021-12-16 2023-06-22 Danisco Us Inc. Subtilisin variants and methods of use
WO2023114932A2 (en) 2021-12-16 2023-06-22 Danisco Us Inc. Subtilisin variants and methods of use
WO2023114988A2 (en) 2021-12-16 2023-06-22 Danisco Us Inc. Variant maltopentaose/maltohexaose-forming alpha-amylases
WO2023114936A2 (en) 2021-12-16 2023-06-22 Danisco Us Inc. Subtilisin variants and methods of use
WO2023168234A1 (en) 2022-03-01 2023-09-07 Danisco Us Inc. Enzymes and enzyme compositions for cleaning
WO2023225459A2 (en) 2022-05-14 2023-11-23 Novozymes A/S Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections
WO2023250301A1 (en) 2022-06-21 2023-12-28 Danisco Us Inc. Methods and compositions for cleaning comprising a polypeptide having thermolysin activity
WO2024050346A1 (en) 2022-09-02 2024-03-07 Danisco Us Inc. Detergent compositions and methods related thereto
WO2024050343A1 (en) 2022-09-02 2024-03-07 Danisco Us Inc. Subtilisin variants and methods related thereto
WO2024050339A1 (en) 2022-09-02 2024-03-07 Danisco Us Inc. Mannanase variants and methods of use
WO2024102698A1 (en) 2022-11-09 2024-05-16 Danisco Us Inc. Subtilisin variants and methods of use

Family Cites Families (77)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB1296839A (es) 1969-05-29 1972-11-22
GB1372034A (en) 1970-12-31 1974-10-30 Unilever Ltd Detergent compositions
US3912590A (en) 1973-01-03 1975-10-14 Novo Industri As Procedure for liquefying starch
GB1483591A (en) 1973-07-23 1977-08-24 Novo Industri As Process for coating water soluble or water dispersible particles by means of the fluid bed technique
GB1590432A (en) 1976-07-07 1981-06-03 Novo Industri As Process for the production of an enzyme granulate and the enzyme granuate thus produced
DK187280A (da) 1980-04-30 1981-10-31 Novo Industri As Ruhedsreducerende middel til et fuldvaskemiddel fuldvaskemiddel og fuldvaskemetode
FR2498783B1 (fr) 1981-01-23 1988-03-04 Decis Mario Dispositif de controle automatique de presence
JPS57174089A (en) 1981-04-20 1982-10-26 Novo Industri As Chain dividing enzyme product
FR2543181B1 (fr) 1983-03-22 1985-07-26 Ugine Kuhlmann Procede ameliore de desencollage-blanchiment simultane des tissus
US4760025A (en) 1984-05-29 1988-07-26 Genencor, Inc. Modified enzymes and methods for making same
DK263584D0 (da) 1984-05-29 1984-05-29 Novo Industri As Enzymholdige granulater anvendt som detergentadditiver
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
DE3684398D1 (de) 1985-08-09 1992-04-23 Gist Brocades Nv Lipolytische enzyme und deren anwendung in reinigungsmitteln.
EG18543A (en) 1986-02-20 1993-07-30 Albright & Wilson Protected enzyme systems
DK122686D0 (da) 1986-03-17 1986-03-17 Novo Industri As Fremstilling af proteiner
ES2052565T3 (es) 1986-07-09 1994-07-16 Novo Nordisk As Un procedimiento para licuar una suspension de almidon o granos amilaceos.
EP0258068B1 (en) 1986-08-29 1994-08-31 Novo Nordisk A/S Enzymatic detergent additive
NZ221627A (en) 1986-09-09 1993-04-28 Genencor Inc Preparation of enzymes, modifications, catalytic triads to alter ratios or transesterification/hydrolysis ratios
EP0305216B1 (en) 1987-08-28 1995-08-02 Novo Nordisk A/S Recombinant Humicola lipase and process for the production of recombinant humicola lipases
JPS6474992A (en) 1987-09-16 1989-03-20 Fuji Oil Co Ltd Dna sequence, plasmid and production of lipase
DK6488D0 (da) 1988-01-07 1988-01-07 Novo Industri As Enzymer
EP0394352B1 (en) 1988-01-07 1992-03-11 Novo Nordisk A/S Enzymatic detergent
JP3079276B2 (ja) 1988-02-28 2000-08-21 天野製薬株式会社 組換え体dna、それを含むシュードモナス属菌及びそれを用いたリパーゼの製造法
JP2728531B2 (ja) 1988-03-24 1998-03-18 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ セルラーゼ調製品
US5648263A (en) 1988-03-24 1997-07-15 Novo Nordisk A/S Methods for reducing the harshness of a cotton-containing fabric
GB8915658D0 (en) 1989-07-07 1989-08-23 Unilever Plc Enzymes,their production and use
US5147796A (en) 1989-09-19 1992-09-15 Kao Corporation Alkaline pullulanase Y having α-amylase activity
JP3112937B2 (ja) 1990-04-14 2000-11-27 カリ―ヒエミー アクチエンゲゼルシヤフト アルカリ性バチルスーリパーゼ、これをコード化するdna配列およびこのリパーゼを生産するバチルス
DK115890D0 (da) 1990-05-09 1990-05-09 Novo Nordisk As Enzym
ATE118545T1 (de) 1990-05-09 1995-03-15 Novo Nordisk As Eine ein endoglucanase enzym enthaltende zellulasezubereitung.
DE69129988T2 (de) 1990-09-13 1999-03-18 Novo Nordisk As Lipase-varianten
DE69133035T2 (de) 1991-01-16 2003-02-13 Procter & Gamble Kompakte Waschmittelzusammensetzungen mit hochaktiven Cellulasen
EP0511456A1 (en) 1991-04-30 1992-11-04 The Procter & Gamble Company Liquid detergents with aromatic borate ester to inhibit proteolytic enzyme
ATE136055T1 (de) 1991-04-30 1996-04-15 Procter & Gamble Gerüstsubstanzhaltige flüssigwaschmittel mit borsäure-polyolkomplex zur ptoteolytischen enzyminhibierung
US5858757A (en) 1991-05-01 1999-01-12 Novo Nordisk A/S Stabilized enzymes and detergent compositions
DK72992D0 (da) 1992-06-01 1992-06-01 Novo Nordisk As Enzym
DK88892D0 (da) 1992-07-06 1992-07-06 Novo Nordisk As Forbindelse
JP3678309B2 (ja) 1992-07-23 2005-08-03 ノボザイムス アクティーゼルスカブ 突然変異α−アミラーゼ、洗剤、皿洗い剤及び液化剤
MX9306229A (es) 1992-10-06 1994-05-31 Novo Nordisk As Variantes de celulasa y composiciones detergentes que la contienen.
DK0867504T4 (da) 1993-02-11 2011-08-29 Genencor Int Oxidativ stabil alfa-amylase
WO1994019454A2 (en) 1993-02-19 1994-09-01 Novo Nordisk A/S An amylolytic enzyme
PL306812A1 (en) 1993-04-27 1995-04-18 Gist Brocades Nv Novel lipase variants suitable for use in detergents
DK52393D0 (es) 1993-05-05 1993-05-05 Novo Nordisk As
JP2859520B2 (ja) 1993-08-30 1999-02-17 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ リパーゼ及びそれを生産する微生物及びリパーゼ製造方法及びリパーゼ含有洗剤組成物
US5830837A (en) 1994-11-22 1998-11-03 Novo Nordisk A/S Amylase variants
JPH09503916A (ja) 1993-10-08 1997-04-22 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ アミラーゼ変異体
BR9407808A (pt) 1993-10-13 1997-05-06 Novo Nordisk As Variante de peroxidase com melhorada estabilidade para peróxido de hidrogenio em condições alcalinas composição de alvejamento e composição detergente
DK131193D0 (es) 1993-11-23 1993-11-23 Novo Nordisk As
JPH07143883A (ja) 1993-11-24 1995-06-06 Showa Denko Kk リパーゼ遺伝子及び変異体リパーゼ
MY111537A (en) 1994-02-02 2000-07-31 Novo Nordisk As A combined desizing and bleaching process.
US5605793A (en) 1994-02-17 1997-02-25 Affymax Technologies N.V. Methods for in vitro recombination
ATE222604T1 (de) 1994-02-22 2002-09-15 Novozymes As Methode zur herstellung einer variante eines lipolytischen enzymes
DK0749473T3 (da) 1994-03-08 2006-02-27 Novozymes As Hidtil ukendte alkaliske cellulaser
ATE305031T1 (de) 1994-03-29 2005-10-15 Novozymes As Alkalische amylase aus bacellus
AU2524695A (en) 1994-05-04 1995-11-29 Genencor International, Inc. Lipases with improved surfactant resistance
AU2884595A (en) 1994-06-20 1996-01-15 Unilever Plc Modified pseudomonas lipases and their use
AU2884695A (en) 1994-06-23 1996-01-19 Unilever Plc Modified pseudomonas lipases and their use
DE4422198C2 (de) 1994-06-24 1997-08-28 Audi Ag Verfahren zum Steuern der elektrischen Beheizung eines Katalysators
US5919691A (en) 1994-10-06 1999-07-06 Novo Nordisk A/S Enzyme and enzyme preparation with endoglucanase activity
BE1008998A3 (fr) 1994-10-14 1996-10-01 Solvay Lipase, microorganisme la produisant, procede de preparation de cette lipase et utilisations de celle-ci.
US5827719A (en) 1994-10-26 1998-10-27 Novo Nordisk A/S Enzyme with lipolytic activity
AR000862A1 (es) * 1995-02-03 1997-08-06 Novozymes As Variantes de una ó-amilasa madre, un metodo para producir la misma, una estructura de adn y un vector de expresion, una celula transformada por dichaestructura de adn y vector, un aditivo para detergente, composicion detergente, una composicion para lavado de ropa y una composicion para la eliminacion del
JPH08228778A (ja) 1995-02-27 1996-09-10 Showa Denko Kk 新規なリパーゼ遺伝子及びそれを用いたリパーゼの製造方法
CN101955921A (zh) 1995-03-17 2011-01-26 诺沃奇梅兹有限公司 新的内切葡聚糖酶
JP3025627B2 (ja) 1995-06-14 2000-03-27 花王株式会社 液化型アルカリα−アミラーゼ遺伝子
DE69633825T2 (de) 1995-07-14 2005-11-10 Novozymes A/S Modifiziertes enzym mit lipolytischer aktivität
ATE267248T1 (de) 1995-08-11 2004-06-15 Novozymes As Neuartige lipolytische enzyme
CN1217742A (zh) * 1996-03-07 1999-05-26 普罗格特-甘布尔公司 含有改进的淀粉酶的洗涤剂组合物
US5763385A (en) 1996-05-14 1998-06-09 Genencor International, Inc. Modified α-amylases having altered calcium binding properties
BR9612702A (pt) * 1996-08-01 1999-08-03 Procter & Gamble Composição detergentes compreendendo amilase aperfeiçoada para limpeza de tecidos encardidos
AU3938997A (en) 1996-08-26 1998-03-19 Novo Nordisk A/S A novel endoglucanase
CN100362100C (zh) 1996-09-17 2008-01-16 诺沃奇梅兹有限公司 纤维素酶变体
AU730286B2 (en) 1996-10-08 2001-03-01 Novo Nordisk A/S Diaminobenzoic acid derivatives as dye precursors
BR9712473B1 (pt) 1996-11-04 2009-08-11 variantes de subtilase e composições.
BR9712878A (pt) 1996-11-04 2000-02-01 Novo Nordisk As Variante de enzima subtilase, processos para a identificação de uma variante de protease apresentando estabilidade autoproteolìtica e paraq a produção de uma enzima subtilase mutante e de uma variante de subtilase, sequência de dna, vetor, célula hospedeira microbiana, composição e uso de uma variante de subtilase.
WO1998034946A1 (en) 1997-02-12 1998-08-13 Massachusetts Institute Of Technology Daxx, a novel fas-binding protein that activates jnk and apoptosis
AU7908898A (en) 1997-07-04 1999-01-25 Novo Nordisk A/S Family 6 endo-1,4-beta-glucanase variants and cleaning composit ions containing them

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