CN114980976A - 共价ras抑制剂及其用途 - Google Patents

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Abstract

本公开的特征在于能够调节包括Ras的生物过程的单独或与其它治疗剂组合的化合物或其药学上可接受的盐、其药物组合物和蛋白质缀合物，以及它们在治疗癌症中的用途。

Description

共价RAS抑制剂及其用途
相关申请的交叉参考
本申请要求2019年11月27日提出申请的美国申请第62/940,947号；2020年2月3日提出申请的美国申请第62/969,415号；以及2020年5月14日提出申请的美国申请第63/024,868号的优先权益，所有申请特此以全文引用的方式并入。
序列表
本申请含有以ASCII格式通过电子方式提交的序列表，该序列表特此以全文引用的方式并入。所述ASCII副本创建于2020年11月24日，名为51432-010WO1_SequenceListing_11.24.20_ST25并且大小是5,365个字节。
背景技术
绝大多数的小分子药物是通过结合靶标蛋白上功能重要的口袋，由此调节该蛋白质的活性来起作用。例如，称为他汀类药物(statins)的降胆固醇药结合HMG-CoA还原酶的酶活性位点，由此防止该酶与其底物接合。事实上，已知许多此类药物/靶标相互作用对，可能误导人们相信能够发现针对大多数(如果不是全部的话)蛋白质的小分子调节剂进而提供合理量的时间、努力和资源。但情况远非如此。目前，据估计，所有人体蛋白质中仅约10％可作为小分子的靶标。Bojadzic和Buchwald,Curr Top Med Chem 18(8):674-699(2019)。其余90％当前被认为是以上提到的小分子药物发现难以治愈或难处理的。此类靶标通常称为“不可入药(undruggable)”的。这些不可入药的靶标包括医学上重要的人体蛋白质的大部分且通常未开发的储库。因此，人们对发现能够调节此类不可入药靶标的功能的新颖分子模态非常感兴趣。
文献中已充分确定，Ras蛋白(K-Ras、H-Ras及N-Ras)在多种人类癌症中起到至关重要的作用，并因此成为抗癌疗法的适当靶标。由活化突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见，并且在人类癌症中常常发现Ras的活化突变。参见例如Prior等人,Cancer Res 72(10):2457-2467(2012)。在Ras蛋白中，K-Ras是最常见的突变并因此是癌症疗法的重要靶标。尽管在过去数十年中，针对Ras进行了广泛的小分子药物发现尝试，但直接靶向Ras的药物仍未在临床上获得使用。不过，针对Ras蛋白的小分子的“不可成药性”说法最近受到了挑战(参见例如Ostrem等人,Nature 503(7477),548-551(2013)。需要付出更多的努力来开发用于由Ras突变驱动的癌症的新医学疗法，如通过鉴别新的小分子Ras抑制剂。
发明内容
共价药物共价键接至其生物靶标。共价药物在医学上有着悠久的历史，并将在未来继续影响药物发现和人类健康。具有如-SH、-OH、-NH2、-COOH等亲核官能团的生物靶标可能适合于共价药物发现方法。例如，不可逆共价药物依鲁替尼(ibrutinib)在2013年被FDA批准用于治疗套细胞淋巴瘤，并且其使用范围在不断地扩大。
本文提供了能够通过作为亲电子试剂反应并与Ras蛋白的亲核性Ras氨基酸形成共价键而与Ras蛋白结合形成缀合物的化合物。通过本发明化合物的共价结合来形成缀合物可破坏Ras的下游信号传导。所述Ras蛋白可以是野生型或突变型Ras蛋白。氨基酸可以例如是Ras蛋白的天冬氨酸、丝氨酸或半胱氨酸。在一些实施方案中，本发明化合物与在突变型K-Ras、H-Ras或N-Ras蛋白12位处的天冬氨酸、丝氨酸或半胱氨酸形成共价键。在一些实施方案中，本文所公开的化合物与在K-Ras G12D的12位处的天冬氨酸残基形成共价键。在一些实施方案中，本文所公开的化合物与在K-Ras G13D的13位处的天冬氨酸残基形成共价键。在一些实施方案中，本文所公开的化合物与在K-Ras G12S的12位处的丝氨酸残基形成共价键。在一些实施方案中，本发明化合物可用于治疗Ras，特别是突变型Ras起作用的疾病和病症，如癌症。前述的其它方面将在本文进一步描述。
因此，本文提供一种具有式I结构的化合物：
A-L-B
式I
其中A是Ras结合部分；L是连接体；并且B是选择性交联基团，或其药学上可接受的盐，其中在所述化合物或其药学上可接受的盐与含有Ras蛋白的样品接触后，该样品中至少20％的Ras蛋白与该化合物或其药学上可接受的盐共价反应，形成缀合物。
还提供了一种药物组合物，该药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐，以及药学上可接受的赋形剂。
还提供了一种缀合物或其盐，该缀合物包含与选择性交联基团共价结合的Ras蛋白，所述选择性交联基团通过连接体与Ras结合部分结合，其中所述选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。
还提供了一种Ras蛋白，该Ras蛋白包含与本发明化合物的共价键。在一些实施方案中，提供了与本发明化合物共价键接的受抑制的Ras蛋白。在一些实施方案中，提供了与本发明化合物共价键接的野生型Ras蛋白。在一些实施方案中，提供了与本发明化合物共价键接的突变型Ras蛋白。
也提供了一种制备缀合物的方法，该方法包括使Ras蛋白与本发明化合物或其药学上可接受的盐或者包含此类化合物或盐的药物组合物在足以使所述化合物与所述Ras蛋白共价反应的条件下或在适合允许缀合物形成的条件下接触。也提供了由此类方法制备的缀合物。
还提供了一种治疗有需要的受试者的癌症的方法，该方法包括向该受试者施用治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐或者包含此类化合物或盐的药物组合物。
还提供了一种抑制细胞中的Ras蛋白的方法，该方法包括使该细胞与有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐或者包含此类化合物或盐的药物组合物接触。
在一些实施方案中，提供了一种治疗有需要的受试者的Ras蛋白相关病症的方法，该方法包括向该受试者施用治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐或者包含此类化合物或盐的药物组合物。
具体实施方式
定义：
在本申请中，除非自上下文另有清晰说明，否则(i)术语“a(一)”应理解为意思指“至少一”；(ii)术语“或”应理解为意思指“和/或”；(iii)术语“包含”和“包括”应理解为涵盖列出的组分或步骤，无论仅呈现所述组分或步骤自身还是呈现所述组分或步骤与一种或多种额外组分或步骤的组合；以及(iv)在提供范围时，端点包括在内。
如本文所使用，术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。
如本文所使用，在描述相邻原子的情形中，术语“相邻”是指由共价键直接连接的二价原子。
应理解，本文所使用的术语“结合”典型地是指两个或更多个实体之间的缔合(例如非共价或共价缔合、氢键、范德华相互作用、疏水相互作用、磁性及其组合)。“直接”结合涉及各实体或部分之间的物理接触；间接结合涉及借助于与一个或多个中间实体的物理接触实现的物理相互作用。两个或更多个实体之间的结合可典型地通过多种情形中的任何一种情形中评估，包括在隔离或在较复杂的系统的环境中(例如在共价或以其它方式与载剂实体缔合时或在生物系统或细胞中)研究相互作用实体或部分的情形。
如本文所使用，术语“对应于”通常用于指所关注化合物中与适当参考化合物中存在的位置共用一个位置(例如在三维空间中或相对于另一个元件或部分)的结构元件或部分。例如，在一些实施方案中，该术语用于指聚合物中残基的位置/身份，如多肽中的氨基酸残基或核酸中的核苷酸残基。本领域普通技术人员应理解，出于简洁的目的，此类聚合物中的残基通常使用经典编号系统，基于参考相关聚合物指明，由此使得例如第一种聚合物中“对应于”参考聚合物中190位残基的残基未必实际上是该第一种聚合物中的第190位残基，而是对应于在参考聚合物中第190位处发现的残基；本领域普通技术人员易于理解如何鉴别“相应”氨基酸，包括通过使用一种或多种专门设计用于聚合物序列比较的可商购的算法。
如本文所使用，术语“抑制剂”是指这样一种化合物，该化合物i)抑制、减小或减弱蛋白质，如Ras蛋白的作用；或ii)抑制、减少、减弱或延迟一个或多个生物事件。术语“抑制”或其任何变化形式包括达到所希望的结果的任何可测量的减少或完全抑制。例如，减少可以是活性(例如Ras活性)相较于正常值的约、至多约或至少约5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、99％或更高百分比，或其中可衍生的任何范围的降低。
术语“纯”意思指大体上纯或不含不想要的组分(例如其它化合物)、材料污染物、混合物或缺陷。
本领域技术人员应了解，本文所描述的某些化合物可以呈一种或多种不同异构形式(例如立体异构体、几何异构体、互变异构体)和/或同位素形式(例如其中一个或多个原子被该原子的不同的同位素取代，如氢被氘取代)存在。除非另外指示或自上下文清楚可见，所描绘的结构可理解为表示个别或组合的任何此类异构或同位素形式。
本文所描述的化合物可以是不对称的(例如具有一个或多个立体中心)。除非另外指示，否则涵盖所有立体异构体，如对映异构体和非对映异构体。含有不对称取代的碳原子的本公开化合物可以呈光学活性形式或外消旋形式分离。本领域中已知由光学活性起始物质制备光学活性形式的方法，如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成方法制备。烯烃、C＝N双键等许多几何异构体也可存在于本文所描述的化合物中，并且所有此类稳定异构体均涵盖在本公开中。本公开的化合物的顺式和反式几何异构体已有描述，并且可以呈异构体混合物形式或以分开的异构形式分离。
在一些实施方案中，本文所描绘的一种或多种化合物可以呈不同互变异构形式存在。自上下文将清楚可见，除非明确地排除，否则提到此类化合物涵盖所有此类互变异构形式。在一些实施方案中，互变异构形式是由一个单键与相邻双键交换且伴随质子的迁移得到。在某些实施方案中，互变异构形式可以是质子转移互变异构体，该互变异构体是具有与参考形式相同的经验式和总电荷的异构体质子化状态。具有质子转移互变异构形式的部分的实例有酮-烯醇对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及环状形式，在所述环状形式中，质子可占据杂环系统的两个或更多个位置，如1H-咪唑和3H-咪唑、1H-三唑、2H-三唑和4H-1,2,4-三唑、1H-异吲哚和2H-异吲哚，以及1H-吡唑和2H-吡唑。在一些实施方案中，互变异构形式可处于平衡状态或通过适当取代而在空间上锁定于一种形式。在某些实施方案中，互变异构形式是由缩醛相互转化得到。
本领域技术人员应了解，在一些实施方案中，本文所描述的化合物的同位素可根据本发明制备或使用。“同位素”是指具有相同原子数但由于核中的中子数不同而具有不同质量数的原子。例如，氢的同位素包括氚和氘。其它同位素包括例如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、31P、32P、35S、18F、36Cl、123I和125I。在一些实施方案中，同位素取代(例如氢被氘取代)可改变分子的物理化学特性，如代谢作用、代谢物的分布或手性中心的外消旋速率。将一种或多种此类同位素并入化合物中的方法是本领域技术人员所知的。
如本领域中所知，许多化学实体可呈现多种不同的固体形式，如非晶形或结晶形式(例如多晶型物、水合物、溶剂化物)。在一些实施方案中，本发明化合物可以呈任何此类形式使用，包括任何固体形式。在一些实施方案中，本文所描述或描绘的化合物可以呈水合物形式或溶剂化物形式提供。
在本说明书中各处，本公开的化合物的取代基是以群组或以范围公开。确切地说，预期本公开包括所述群组和范围各成员的每一个别子组合。例如，术语“C1-C6烷基”特定地意欲个别地公开甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。此外，在一种化合物包括多个位置，并且在这些位置处，取代基是以群组或以范围公开时，除非另外指示，否则本公开意欲涵盖在每个位置处含有成员的每一个别子组合的个别化合物和化合物群组(例如种类和子类)。
术语“任选被取代的X”(例如任选被取代的烷基)意欲等效于“X，其中X任选被取代”(例如“烷基，其中该烷基任选被取代”)。并非意欲指特征“X”(例如烷基)本身是任选的。如本文所描述，某些所关注化合物可含有一个或多个“任选被取代”的部分。一般而言，术语“被取代”无论前面是否加有术语“任选地”，均意谓指定部分的一个或多个氢被适合取代基，例如本文所描述的取代基或基团中的任一者置换。除非另外指示，否则“任选被取代”的基团可在该基团的每一可取代位置处具有适合取代基，并且当在任何给定结构中的不止一个位置可被选自指定群组的不止一个取代基取代时，在每个位置处的取代基可相同或不同。例如，在术语“任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基”中，该烷基部分、该杂芳基部分或两者可任选被取代。本公开所设想的取代基的组合优选是形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所使用，术语“稳定”是指化合物当经历允许该化合物产生、检测且在某些实施方案中，允许该化合物回收、纯化以及用于一个或多个本文所公开的目的的条件时大体上不改变。
“任选被取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基可独立地为氘；卤素；-(CH2)0-4Ro；-(CH2)0-4ORo；-O(CH2)0-4Ro；-O-(CH2)0-4C(O)ORo；-(CH2)0-4CH(ORo)2；-(CH2)0- 4SRo；-(CH2)0-4Ph，该基团可被Ro取代；-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph，该基团可被Ro取代；-CH＝CHPh，该基团可被Ro取代；-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基，该基团可被Ro取代；4-8元饱和或不饱和杂环基(例如吡啶基)；3-8元饱和或不饱和环烷基(例如环丙基、环丁基或环戊基)；-NO2；-CN；-N3；-(CH2)0-4N(Ro)2；-(CH2)0-4N(Ro)C(O)Ro；-N(Ro)C(S)Ro；-(CH2)0-4N(Ro)C(O)NRo 2；-N(Ro)C(S)NRo 2；-(CH2)0-4N(Ro)C(O)ORo；-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro；-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2；-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo；-(CH2)0-4C(O)Ro；-C(S)Ro；-(CH2)0-4C(O)ORo；-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)2；-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)-S(O)2-Ro；-C(NCN)NRo 2；-(CH2)0-4C(O)SRo；-(CH2)0-4C(O)OSiRo 3；-(CH2)0-4OC(O)Ro；-OC(O)(CH2)0-4SRo；-SC(S)SRo；-(CH2)0-4SC(O)Ro；-(CH2)0-4C(O)NRo 2；-C(S)NRo 2；-C(S)SRo；-(CH2)0-4OC(O)NRo 2；-C(O)N(ORo)Ro；-C(O)C(O)Ro；-C(O)CH2C(O)Ro；-C(NORo)Ro；-(CH2)0-4SSRo；-(CH2)0-4S(O)2Ro；-(CH2)0-4S(O)2ORo；-(CH2)0-4OS(O)2Ro；-S(O)2NRo 2；-(CH2)0-4S(O)Ro；-N(Ro)S(O)2NRo 2；-N(Ro)S(O)2Ro；-N(ORo)Ro；-C(NORo)NRo 2；-C(NH)NRo 2；-P(O)2Ro；-P(O)Ro 2；-P(O)(ORo)2；-OP(O)Ro 2；-OP(O)(ORo)2；-OP(O)(ORo)Ro；-SiRo 3；-(C1-4直链或分支链亚烷基)O-N(Ro)2；或-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)O-N(Ro)2，其中各Ro可如下文所定义被取代且独立地为氢、-C1-6脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5-6元杂芳基环)，或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-6元饱和、部分不饱和或芳基环，或尽管有以上定义，但两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环，其可如下文所定义被取代。
Ro(或由两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基可独立地为卤素、-(CH2)0-2R·、-(卤代R·)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR·、-(CH2)0-2CH(OR·)2、-O(卤代R·)、-CN、-N3、-(CH2)0-2C(O)R·、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR·、-(CH2)0-2SR·、-(CH2)0-2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR·、-(CH2)0-2NR· 2、-NO2、-SiR· 3、-OSiR· 3、-C(O)SR·、-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)OR·或-SSR·，其中各R·未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代，并且独立地选自C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基环。Ro的饱和碳原子上的适合二价取代基包括＝O和＝S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下：＝O、＝S、＝NNR* 2、＝NNHC(O)R*、＝NNHC(O)OR*、＝NNHS(O)2R*、＝NR*、＝NOR*、-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-，其中R*在每次独立出现时选自氢；C1-6脂肪族基团，该基团可如下文所定义被取代；或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5-6元饱和、部分不饱和或芳基环。结合至“任选被取代”的基团的邻近可取代碳的适合二价取代基包括：-O(CR* 2)2-3O-，其中R*在每次独立出现时选自氢；C1-6脂肪族基团，该基团可如下文所定义被取代；或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
R*的脂肪族基团上的适合取代基包括卤素、-R·、-(卤代R·)、-OH、-OR·、-O(卤代R·)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR·、-NH2、-NHR·、-NR· 2或-NO2，其中各R·未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代，并且独立地为C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基环。
“任选被取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
Figure BDA0003759053970000101
Figure BDA0003759053970000102
Figure BDA0003759053970000103
或
Figure BDA0003759053970000104
其中各
Figure BDA0003759053970000105
独立地为氢；C1-6脂肪族基团，该基团可如下文所定义被取代；未被取代的-OPh；或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的3-6元饱和、部分不饱和或芳基环，或尽管有以上定义，但两个独立存在的
Figure BDA0003759053970000106
与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3-12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环。
Figure BDA0003759053970000107
的脂肪族基团上的适合取代基独立地为卤素、-R·、-(卤代R·)、-OH、-OR·、-O(卤代R·)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR·、-NH2、-NHR·、-NR· 2或-NO2，其中各R·未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代，并且独立地为C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选氮、氧或硫的杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基环。
Figure BDA0003759053970000108
的饱和碳原子上的适合二价取代基包括＝O及＝S。
如本文所使用，术语“烷基”是指含有1至20个(例如1至10个或1至6个)碳的饱和、直链或分支链单价烃基。在一些实施方案中，烷基是非分支链的(即，是线性的)；在一些实施方案中，烷基是分支链的。烷基是例如但不限于甲基、乙基、正丙基和异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基，以及新戊基。
如本文所使用，术语“亚烷基”表示由直链或分支链饱和烃通过移除两个氢原子得到的饱和二价烃基，并且其实例有亚甲基、亚乙基、亚异丙基等。术语“Cx-Cy亚烷基”表示具有在x与y个之间的碳的亚烷基。例示性x值是1、2、3、4、5及6，并且例示性y值是2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、16、18或20(例如C1-C6、C1-C10、C2-C20、C2-C6、C2-C10或C2-C20亚烷基)。在一些实施方案中，亚烷基可进一步被1、2、3或4个如本文关于烷基所定义的取代基取代。
除非另外具体说明，否则如本文所使用，术语“烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团，并且其实例是乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基等。烯基包括顺式和反式异构体两种。除非另外具体说明，否则如本文所使用，术语“亚烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的二价直链或分支链基团。
如本文所使用，术语“炔基”表示含有碳-碳三键的具有2至20个碳(例如2至4个、2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团，并且其实例有乙炔基、1-丙炔基等。
如本文所使用，术语“氨基”表示
Figure BDA0003759053970000111
如本文所描述，术语“氨基酸”是指具有侧链、氨基和酸基(例如-CO2H或-SO3H)的分子，其中该氨基酸通过所述侧链、氨基或酸基(例如侧链)连接至母分子基团。如本文所使用，术语“氨基酸”在最广泛意义上是指可例如通过形成一个或多个肽键并入多肽链中的任何化合物或物质。在一些实施方案中，氨基酸具有通用结构H2N-C(H)(R)-COOH。在一些实施方案中，氨基酸是天然存在的氨基酸。在一些实施方案中，氨基酸是合成氨基酸；在一些实施方案中，氨基酸是D-氨基酸；在一些实施方案中，氨基酸是L-氨基酸。“标准氨基酸”是指天然存在的肽中常见的二十种标准L-氨基酸中的任一种氨基酸。“非标准氨基酸”是指除标准氨基酸外的任何氨基酸，不管该氨基酸是合成制备的还是从天然来源获得的。在一些实施方案中，氨基酸，包括多肽中的羧基或氨基末端氨基酸在内，相较于以上一般结构可含有结构修饰。例如，在一些实施方案中，相较于一般结构，氨基酸可通过甲基化、酰胺化、乙酰化或取代进行修饰。在一些实施方案中，相较于含有在其它方面相同的未修饰氨基酸的多肽，此类修饰可例如改变含有修饰氨基酸的多肽的循环半衰期。在一些实施方案中，相较于含有在其它方面相同的未修饰氨基酸的多肽，此类修饰不会明显改变含有修饰氨基酸的多肽的相关活性。从上下文可知，在一些实施方案中，术语“氨基酸”用于指游离氨基酸；在一些实施方案中，氨基酸用于指多肽的氨基酸残基。在一些实施方案中，氨基酸通过羰基连接至母分子基团，在此情况下，侧链或氨基连接至羰基。在一些实施方案中，氨基酸是α-氨基酸。在某些实施方案中，氨基酸是β-氨基酸。在一些实施方案中，氨基酸是γ-氨基酸。例示性侧链包括任选被取代的烷基、芳基、杂环基、烷芳基、烷杂环基、氨基烷基、氨甲酰基烷基和羧基烷基。例示性氨基酸包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、任选被取代的羟基正缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、正缬氨酸、鸟氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、吡咯赖氨酸、硒代半胱氨酸、丝氨酸、牛磺酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸及缬氨酸。
如本文所使用，术语“芳基”表示由碳原子形成的单价单环、双环或多环系统，其中每个环都是芳香环。芳基的实例有苯基、萘基、菲基和蒽基。芳环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳环原子处连接至其侧接基团，并且除非另外具体说明，否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用，术语“C0”表示键。例如，术语-N(C(O)-(C0-C5亚烷基-H)-的一部分包括-N(C(O)-(C0亚烷基-H)-，也表示为-N(C(O)-H)-。
如本文所使用，术语“碳环”和“碳环基”是指单价、任选被取代C3-C12单环、双环或三环结构，该环结构可以是桥接环、稠合环或螺环，其中所有环均由碳原子形成，并且至少一个环是非芳香环。碳环结构包括环烷基、环烯基和环炔基。碳环基的实例有环己基、环己烯基、环辛炔基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、茚基、二氢茚基、十氢萘基等。碳环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团，并且除非另外具体说明，否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用，术语“羰基”表示C(O)基团，该基团也可表示为C＝O。
如本文所使用，术语“羧基”意思指-CO2H、(C＝O)(OH)、COOH或C(O)OH。
如本文所使用，术语“氰基”表示-CN基团。
如本文所使用，术语“环烷基”表示单价饱和环状烃基，除非另外具体说明，否则该基团可以是具有三至八个环碳的桥接环、稠合环或螺环，所述基团可以是稠合的，并且其实例有环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环庚基等。
如本文所使用，术语“二基”当用于化合物的名称中时表示二价基团。
如本文所使用，术语“非对映异构体”意思指不互为镜像且彼此不可重叠的立体异构体。
如本文所使用，术语“对映异构体”意思指具有至少80％(即，至少90％的一种对映异构体和至多10％的另一种对映异构体)、优选至少90％且更优选至少98％的光学纯度或对映异构体过量(如通过本领域中的标准方法确定)的本发明化合物的每一个别光学活性形式。
如本文所使用，术语“卤代”表示选自溴、氯、碘或氟的卤素。
如本文所使用，术语“杂烷基”是指至少一个碳原子被杂原子(例如O、N或S原子)置换的如本文所定义的“烷基”。杂原子可出现在基团的中间或末端。
如本文所使用，术语“杂芳基”表示含有至少一个完全芳香环的单价、单环或多环结构：即，它在该单环或多环系统内含有4n+2个π电子，并且在该芳香环中含有至少一个选自N、O或S的杂原子。例示性未被取代的杂芳基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂芳基”包括任一上述杂芳香环与一个或多个芳环或碳环，例如苯基环或环己烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、吡唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、咪唑基、噻唑基、喹啉基、异喹啉基、四氢喹啉基、4-氮杂吲哚基等。杂芳基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团，并且除非另外具体说明，否则任何环原子可任选被取代。在某一实施方案中，杂芳基被1、2、3或4个取代基取代。
如本文所使用，术语“杂环基”表示至少一个环是非芳香环且其中该非芳香环含有一个、两个、三个或四个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子的单价、单环、双环或多环系统，该环系统可以是桥接环、稠合环或螺环。5元环具有零至两个双键，并且6元环和7元环具有零至三个双键。例示性未被取代的杂环基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂环基”也表示具有桥接多环结构的杂环化合物，其中一个或多个碳或杂原子桥接单环的不相邻成员，例如奎宁环基。术语“杂环基”包括任一上述杂环与一个或多个芳香环、碳环、杂芳香环或杂环，例如芳基环、环己烷环、环己烯环、环戊烷环、环戊烯环、吡啶环或吡咯烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂环基的实例有吡咯烷基、哌啶基、1,2,3,4-四氢喹啉基、十氢喹啉基、二氢吡咯并吡啶基、十氢萘啶基等。杂环基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团，并且除非另外具体说明，否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用，术语“卤烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个相同或不同的卤素部分取代的烷基部分。
如本文所使用，术语“羟基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个-OH部分取代的烷基部分。
如本文所使用，术语“异构体”意思指本发明的任何化合物的任何互变异构体、立体异构体、对映异构体或非对映异构体。应认识到，本发明化合物可具有一个或多个手性中心或双键，并因此，以立体异构体形式，如以双键异构体(即，E/Z几何异构体)或非对映异构体(例如对映异构体(即，(+)或(-))或顺/反异构体)形式存在。根据本发明，本文所描绘的化学结构且因此本发明化合物涵盖所有相应立体异构体，即，立体异构纯(例如几何异构纯、对映异构体纯或非对映异构体纯)形式以及对映异构体和立体异构体混合物，例如外消旋物。本发明化合物的对映异构体和立体异构体混合物可典型地通过众所周知的方法，如手性相气相色谱法、手性相高效液相色谱法、使化合物以手性盐络合物形式结晶或使化合物在手性溶剂中结晶来拆分成其组分对映异构体或立体异构体。对映异构体和立体异构体也可由立体异构纯或对映异构纯的中间体、试剂和催化剂，通过众所周知的不对称合成方法获得。
如本文所使用，术语“硝基”表示-NO2基团。
如本文所使用，术语“氧代”表示＝O。
如本文所使用，术语“立体异构体”是指一种化合物(例如本文所描述的任何式的化合物)可能具有所有可能的不同异构以及构形形式，特别是基础分子结构的所有可能的立体化学和构形异构形式、所有非对映异构体、对映异构体或构形异构体。本发明的一些化合物可以呈不同互变异构形式存在，所有这些互变异构形式均包括在本发明的范围内。
如本文所使用，术语“磺酰基”表示-S(O)2-基团。
本领域技术人员阅读本公开将理解，本文所描述的某些化合物可以呈多种形式中的任一种提供或利用，如盐形式、被保护的形式、前药形式、酯形式、异构形式(例如光学或结构异构体)、同位素形式等。在一些实施方案中，提到的特定化合物可指该化合物的特定形式。在一些实施方案中，提到的特定化合物可指呈任何形式的该化合物。在一些实施方案中，例如，一种化合物的单一立体异构体的制剂可视为该化合物的不同形式而非该化合物的外消旋混合物；一种化合物的特定盐可视为与该化合物的另一种盐不同的形式；含有双键的一种构形异构体((Z)或(E))的制剂可视为与含有该双键的另一种构形异构体((E)或(Z))的制剂不同的形式；一个或多个原子的同位素不同于参考制剂中存在的同位素的制剂可视为呈不同形式。
术语“Ras蛋白”意思指来自相关GTP酶蛋白质的Ras家族的蛋白质，包括K-Ras、H-Ras和N-Ras。Ras蛋白可以是野生型蛋白或突变型蛋白。在一些实施方案中，Ras蛋白不是野生型蛋白。
K-Ras是由K-RAS基因编码。术语“K-Ras”也是指野生型K-Ras蛋白的天然变体，如与SEQ ID NO:1中所示野生型K-Ras的氨基酸序列具有至少85％同一性(例如85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.9％或更高同一性)的蛋白质。
SEQ ID NO:1
Figure BDA0003759053970000161
H-Ras是由H-RAS基因编码。术语“H-Ras”也是指野生型H-Ras蛋白的天然变体，如与SEQ ID NO:2中所示野生型H-Ras的氨基酸序列具有至少85％同一性(例如85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.9％或更高同一性)的蛋白质。
SEQ ID NO:2
Figure BDA0003759053970000171
N-Ras是由N-RAS基因编码。术语“N-Ras”也是指野生型N-Ras蛋白的天然变体，如与SEQ ID NO:3中所示野生型N-Ras的氨基酸序列具有至少85％同一性(例如85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.9％或更高同一性)的蛋白质。
SEQ ID NO:3
Figure BDA0003759053970000172
给定的Ras蛋白可结合至GDP或GTP。响应于细胞暴露于某些促进生长的刺激剂，将诱导RAS将其结合的GDP交换成GTP。在GTP结合的情况下，RAS"开关打开"并且能够与其它蛋白质(其"下游靶标")相互作用并活化这些蛋白质。Ras本身固有的将GTP重新水解成GDP的能力极低，因此使其处于关闭状态。将R切换为关闭状态需要称为GTP酶活化蛋白(GAP)的外来蛋白质，这种蛋白质与RAS相互作用并大幅加速GTP向GDP的转化。Ras中影响其与GAP相互作用或将GTP重新转化成GDP的能力的任何突变都将延长蛋白质的活化并因此延长传导给细胞的告知细胞继续生长和分裂的信号。由于这些信号引起细胞生长和分裂，过度活跃的RAS信号传导最终可能导致癌症。确定Ras蛋白的GDP或GTP结合状态的方法是本领域中已知的。
如本文所使用，术语“突变型Ras蛋白”意思指包含至少一个突变的Ras蛋白，其中相应野生型Ras蛋白中的氨基酸突变成不同的氨基酸，例如甘氨酸突变成天冬氨酸、丝氨酸或半胱氨酸。如本文所使用，术语“突变”指示核酸或多肽中引起核酸或多肽变化的任何修饰。术语“突变”可包括例如多核苷酸中单个或多个残基的点突变、缺失或插入，突变包括在基因的蛋白质编码区内产生的改变以及在蛋白质编码序列外的区域中的改变，如但不限于调控或启动子序列，以及扩增或染色体断裂或转位。
突变型Ras蛋白的实例包括但不限于K-Ras G12D、K-Ras G13D和K-Ras G12S。在一些实施方案中，本发明所涵盖的突变包括与致癌活性相关的突变。在一些实施方案中，本发明所涵盖的突变包括：
(a)以下K-Ras突变体：G12D、G12V、G12C、G13D、G12R、G12A、Q61H、G12S、A146T、G13C、Q61L、Q61R、K117N、A146V、G12F、Q61K、L19F、Q22K、V14I、A59T、A146P、G13R、G12L或G13V，及其组合；
(b)以下H-Ras突变体：Q61R、G13R、Q61K、G12S、Q61L、G12D、G13V、G13D、G12C、K117N、A59T、G12V、G13C、Q61H、G13S、A18V、D119N、G13N、A146T、A66T、G12A、A146V、G12N或G12R，及其组合；以及
(c)以下N-Ras突变体：Q61R、Q61K、G12D、Q61L、Q61H、G13R、G13D、G12S、G12C、G12V、G12A、G13V、G12R、P185S、G13C、A146T、G60E、Q61P、A59D、E132K、E49K、T50I、A146V或A59T，及其组合。
本发明的化合物和缀合物
本文提供了通过作为亲电子试剂反应并与Ras蛋白的亲核性Ras氨基酸形成共价键而与Ras蛋白结合形成缀合物的化合物。在一些实施方案中，本发明化合物可用于治疗Ras，特别是突变型Ras起作用的疾病和病症，如癌症。除非明确作相反陈述，否则本文所描述或描绘的化合物可呈盐形式提供或使用，例如药学上可接受的盐形式，无论是否明确陈述。
本发明化合物与Ras的共价结合可以是可逆的或不可逆的。与结合GDP的Ras或结合GTP的Ras的不可逆共价结合可通过本领域技术人员已知的方法，例如通过质谱法确定。例如，为了确定与GTP或GDP-Ras结合，可以将本发明化合物与载有适当核苷酸的Ras一起培育，接着通过质谱法确定交联。例示性方案提供于以下实施例中。
此外，本发明化合物与Ras的共价结合可扰乱Ras的构形，使得该化合物调节或破坏Ras与其效应蛋白(包括SOS和RAF)的结合。Ras-RAF破坏测定是本领域技术人员已知的，如例如Lim等人,Angew.Chem.Int.Ed.53:199(2014)所描述。通过破坏Ras与其效应蛋白的结合，化合物可破坏下游信号传导，引起生长抑制或诱导细胞凋亡。这些作用可在化合物处理之后，通过监测下游效应物的活化状态(如ERK的磷酸化状态)、执行细胞活力测定以及通过测量细胞溶解产物中凋亡蛋白酶-3的活性，在细胞培养物中测量。
本文所公开的一些化合物可与Ras形成可逆共价键，包括硼酸和三氟甲基酮。已知硼酸可与丝氨酸和苏氨酸残基相互作用，如例如Adams等人,Cancer Invest.22:304(2004)中所描述。引申开来，天冬氨酸残基也可与硼酸或其它亲电子试剂如三氟甲基酮形成可逆共价键。
因此，本公开的特征在于式I的化合物：
A-L-B
式I
其中A是Ras结合部分；
L是连接体；并且
B是选择性交联基团，
或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中，在化合物或其药学上可接受的盐与含有Ras蛋白的样品接触后，样品中至少20％的Ras蛋白与化合物或其药学上可接受的盐共价反应，形成缀合物。在一些实施方案中，在化合物或其药学上可接受的盐与含有Ras蛋白的样品接触后，样品中至少20％(例如至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少90％、至少95％、至少99％)的Ras蛋白与化合物或其药学上可接受的盐共价反应，形成缀合物(例如形成包括Ras结合部分、连接体和Ras蛋白的缀合物)。
Ras蛋白在本文中有描述。因此，Ras蛋白可以是野生型或突变型的。Ras蛋白可以是人Ras蛋白。野生型Ras蛋白可以是K-Ras、H-Ras或N-Ras。在一些实施方案中，Ras蛋白不是野生型蛋白质。在一些实施方案中，Ras蛋白是突变型Ras蛋白，如K-Ras G12D、K-RasG13D或K-Ras G12S。其它Ras突变体在本文中有描述。在一些实施方案中，含有Ras蛋白的样品是在溶液，例如缓冲溶液中包括分离的Ras蛋白的样品。在一些实施方案中，含有Ras蛋白的样品是包括表达Ras蛋白的细胞的样品。
本发明化合物或其药学上可接受的盐包括Ras结合部分。如本文所使用，“Ras结合部分”是指结合至Ras蛋白的部分。在一些实施方案中，Ras结合部分包括结合至Ras蛋白的原子团(例如5至20个原子、5至10个原子、10至20个原子、20至30个原子、30至40个原子)。在一些实施方案中，Ras结合部分的一个或多个原子不结合至Ras蛋白。
Ras蛋白可结合至Ras结合部分中单个原子。或者或另外，Ras蛋白可结合至Ras结合部分中的两个或更多个原子。在另一个替代方案中，Ras蛋白结合至模拟Ras蛋白的天然配体的基团并且其中该模拟Ras蛋白的天然配体的基团连接至Ras结合部分。在这些实施例中的结合典型地通过但不限于Ras蛋白与Ras结合部分的非共价相互作用实现。
在一些实施方案中，Ras结合部分结合至Ras蛋白的GDP结合形式。在一些实施方案中，Ras结合部分结合至Ras蛋白的GTP结合形式。在一些实施方案中，Ras结合部分结合至Ras蛋白的GDP结合形式和GTP结合形式。
在一些实施方案中，Ras结合部分是人H-Ras结合部分、人N-Ras结合部分或人K-Ras结合部分。在一些实施方案中，Ras结合部分是K-Ras结合部分。在一些实施方案中，K-Ras结合部分结合至K-Ras蛋白中K-Ras Switch-II结合袋的残基，例如K-Ras蛋白中对应于人野生型K-Ras(SEQ ID NO:1)的V7、V8、V9、G10、A11、D12、K16、P34、T58、A59、G60、Q61、E62、E63、Y64、S65、R68、D69、Y71、M72、F78、I92、H95、Y96、Q99、I100、R102或V103的残基。在一些实施方案中，Ras结合部分是H-Ras结合部分，该结合部分结合至H-Ras蛋白中H-RasSwitch-II结合袋的残基。在一些实施方案中，Ras结合部分是N-Ras结合部分，该结合部分结合至N-Ras蛋白中N-Ras Switch-II结合袋的残基。
在一些实施方案中，Ras结合部分包含下文所描述的式II至V中任一个的结构。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式II的结构：
Figure BDA0003759053970000211
其中m是0、1、2或3；
W1是N或C，其中C任选地通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
在式II的一些实施方案中，W1是N或C，其中C通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式II-1的结构：
Figure BDA0003759053970000221
其中m是0、1、2或3；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基,
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000231
其中W2是氢或羟基。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式II-1a的结构：
Figure BDA0003759053970000232
其中R1a、R1b和R2a独立地为氢、CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，R1a是卤代(例如氯)。在一些实施方案中，R1b是卤代(例如氟)。在一些实施方案中，R2a是卤代(例如氟)。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000233
Figure BDA0003759053970000241
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000242
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式II-2的结构：
Figure BDA0003759053970000243
其中m是0、1、2或3；
W1是通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体的C；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III的结构：
Figure BDA0003759053970000251
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
Figure BDA0003759053970000252
表示单键或双键；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为
Figure BDA0003759053970000253
任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基，或
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-1的结构：
Figure BDA0003759053970000261
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-1a的结构：
Figure BDA0003759053970000271
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
V是CHR5、CR5R5、OR5或NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-1b的结构：
Figure BDA0003759053970000281
其中R4是任选被取代的C6-C10双环芳基；并且
R5是任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂环基。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-2的结构：
Figure BDA0003759053970000282
其中n是0、1、2或3；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3是
Figure BDA0003759053970000291
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂环基，或
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-2a的结构：
Figure BDA0003759053970000292
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式III-3的结构：
Figure BDA0003759053970000301
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
Figure BDA0003759053970000302
表示单键或双键；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
V是NR5aR5b；
各R3独立地为
Figure BDA0003759053970000303
任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
在一些实施方案中，R4是：
Figure BDA0003759053970000311
在一些实施方案中，R4是：
Figure BDA0003759053970000312
在一些实施方案中，R4是：
Figure BDA0003759053970000313
在一些实施方案中，V是CHR5或CR5R5。在一些实施方案中，V是OR5、NHR5或NR5aR5b。在一些实施方案中，V是OR5。在一些实施方案中，V是OR5，其中R5是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中，V是OR5，其中R5是任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基。在一些实施方案中，V是NHR5或NR5aR5b。在一些实施方案中，V是NR5aR5b，其中R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基。
在一些实施方案中，V是：
Figure BDA0003759053970000321
在一些实施方案中，V是：
Figure BDA0003759053970000322
在一些实施方案中，V是：
Figure BDA0003759053970000323
在一些实施方案中，V是：
Figure BDA0003759053970000324
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000331
Figure BDA0003759053970000341
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式IV的结构：
Figure BDA0003759053970000342
其中o是0、1或2；
X1、X2和X3各自独立地为N、CH或CR6；
各R6独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R6通过C1-C3烷基桥或C1-C3杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R7和R8独立地为任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基,
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，X1、X2和X3中仅一个是N。
在一些实施方案中，X2和X3各自为CH或CR6，且X1是N。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式IVa的结构：
Figure BDA0003759053970000351
其中R6是氢、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；并且
R7和R8独立地为任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基,
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式IV具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000352
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式IVb的结构：
Figure BDA0003759053970000361
其中R6、R7a、R8a和R8b独立地为氢、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，R6a是卤代(例如氟)。在一些实施方案中，R7a是卤代(例如氟)。在一些实施方案中，R8a是任选被取代的C1-C6烷基(例如甲基)。在一些实施方案中，R8b是任选被取代的C1-C6烷基(例如异丙基)。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000362
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括式V的结构：
Figure BDA0003759053970000363
Figure BDA0003759053970000371
其中p是0、1、2或3；
R9是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R10独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或R10通过C1-C3亚烷基或C1-C3亚杂烷基桥连接至连接体；并且
R11是任选被取代的C2-C9杂芳基或任选被取代的C2-C9杂环基,
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，Ras结合部分(例如K-Ras结合部分)包括以下结构：
Figure BDA0003759053970000372
Figure BDA0003759053970000381
在一些实施方案中，Ras结合部分包括以下中所描述的Ras部分的结构：WO2020216190、WO 2020178282、WO 2020146613、WO 2020118066、WO 2020113071、WO2020106647、WO 2020102730、WO 2020101736、WO 2020097537、WO 2020086739、WO2020081282、WO 2020050890、WO 2020047192、WO 2020035031、WO 2020028706、WO2019241157、WO 2019232419、WO 2019217691、WO 2019217307、WO 2019215203、WO2019213526、WO 2019213516、WO 2019155399、WO 2019150305、WO 2019110751、WO2019099524、WO 2019051291、WO 2018218070、WO 2018218071、WO 2018218069、WO2018217651、WO 2018206539、WO 2018143315、WO 2018140600、WO 2018140599、WO2018140598、WO 2018140514、WO 2018140513、WO 2018140512、WO 2018119183、WO2018112420、WO 2018068017、WO 2018064510、WO 2017201161、WO 2017172979、WO2017100546、WO 2017087528、WO 2017058807、WO 2017058805、WO 2017058728、WO2017058902、WO 2017058792、WO 2017058768、WO 2017058915、WO 2017015562、WO2016168540、WO 2016164675、WO 2016049568、WO 2016049524、WO 2015054572、WO2014152588、WO 2014143659和WO 2013155223，所述Ras结合部分以引用的方式并入本文中。鉴于本文的公开内容以及一般知识，本领域技术人员将了解这些参考文献的化合物中的交联基团如何被本发明的选择性交联基团置换。
本发明的化合物或其药学上可接受的盐在Ras结合部分(例如A，在式I中)与选择性交联基团(例如B，在式I中)之间包括连接体。如本文所使用，“连接体”是指一种二价有机部分，该二价有机部分将式I化合物中的部分A连接至部分B，由此使所得化合物能够在Lim等人,Angew.Chem.Int.Ed.53:199(2014)中所提供的Ras-RAF破坏测定方案中达到2μM或更低的IC50。在一些实施方案中，连接体将B的反应性原子定位于距A的最近原子约5至约11埃。在一些实施方案中，连接体将B的反应性原子定位于距A的最近原子4至9个原子。在一些实施方案中，连接体包含20个或更少线性原子。在一些实施方案中，连接体包含15个或更少线性原子。在一些实施方案中，连接体包含10个或更少线性原子。在一些实施方案中，连接体的分子量低于500g/mol。在一些实施方案中，连接体的分子量低于400g/mol。在一些实施方案中，连接体的分子量低于300g/mol。在一些实施方案中，连接体的分子量低于200g/mol。在一些实施方案中，连接体的分子量低于100g/mol。在一些实施方案中，连接体的分子量低于50g/mol。
术语"反应性"当结合选择性交联基团使用时是指在常规有机合成条件下或在生理条件下易于或以实际速率反应而与Ras蛋白的亲核官能团，如羧基、羟基或硫醇基形成共价键的亲电子原子。这与不反应或需要强催化剂或不切实际的反应条件来反应的原子(即，“非反应性”或“惰性”基团)形成对比。
如本文所使用，“官能团”是指Ras蛋白内可能与本文所描述的选择性交联基团产生共价键的有机部分。官能团可以是亲核或亲电子性的，术语亲核和亲电子是本领域中已知的术语。亲核官能团的非限制性实例包括羧基、羟基和硫醇基。具有亲核官能团的Ras氨基酸的非限制性实例包括天冬氨酸、谷氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸和赖氨酸。
在一些实施方案中，连接体具有式VI的结构：
-A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-(D)-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2-
式VI
其中A1是连接体与Ras结合部分之间的键；A2是选择性交联基团与连接体之间的键；B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN；RN是氢、任选被取代的C1–4烷基、任选被取代的C2–4烯基、任选被取代的C2–4炔基、任选被取代的C2–6杂环基、任选被取代的C6–12芳基或任选被取代的C1–7杂烷基；C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基；a、b、c、d、e和f各自独立地为0或1；并且D是任选被取代的C1–10亚烷基、任选被取代的C2–10亚烯基、任选被取代的C2–10亚炔基、任选被取代的C2–6亚杂环基、任选被取代的C2–6亚杂芳基、任选被取代的C3–8亚环烷基、任选被取代的C6–12亚芳基、任选被取代的C2-C10聚乙二醇或任选被取代的C1–10亚杂烷基或连接A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-至-(B3)d-(C2)e-(B4)f–A2的化学键。
在一些实施方案中，连接体包含杂芳基，如苯基或吡啶基。此类连接体的非限制性实例包括：
Figure BDA0003759053970000401
在一些实施方案中，连接体包含杂环基，如3至8元杂环基。在一些实施方案中，连接体包含环烷基，如3至8元碳环基。
在一些实施方案中，连接体是任选被取代的杂环基，如任选被取代的3至8元杂环基。在一些实施方案中，连接体是任选被取代的环烷基，如任选被取代的3至8元碳环基。
在一些实施方案中，连接体如式VIIa至VIII中任一者所例示。在这些结构中，当氮基位于位置B处时，该氮选择性交联基团的一部分。当碳原子位于位置B处时，该碳原子是连接体的一部分。
在一些实施方案中，化合物A-L-B或其药学上可接受的盐具有式VIIao或VIIbo中任一者的结构：
Figure BDA0003759053970000411
其中q和r独立地为0、1或2；
X1是N或CH；并且
R12、R13、R14和R14a独立地为氢、氧代、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基或-CO2-任选被取代的C1-C6烷基，其中当R14不是氧代时，R14任选地包含连至A的键。在一些实施方案中，R12、R13、R14和R14a不同时为氧代。在一些实施方案中，R12、R13、R14和R14a中仅一个是氧代。
在一些实施方案中，化合物A-L-B或其药学上可接受的盐具有式VIIa或VIIb中任一式的结构：
Figure BDA0003759053970000412
Figure BDA0003759053970000421
其中q和r独立地为0、1或2；
X1是N或CH；
R12和R13独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；并且
R14是氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，其中R14任选地包含连至A的键。
关于这些式中连接体部分的描绘，另参见以下式VIIe。
在一些实施方案中，A-L-B或其药学上可接受的盐选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000422
其中Rx是接合至A的任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥(参见例如WO 2018/206539)。
在一些实施方案中，A-L-B或其药学上可接受的盐是
Figure BDA0003759053970000431
在一些实施方案中，-L-B选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000432
在一些实施方案中，A-L-B或其药学上可接受的盐是式VIIc或式VIId的结构：
Figure BDA0003759053970000433
其中s、t、u和v独立地为0、1或2；
X3是N或CH；并且
R15和R16独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
关于这些式中连接体部分的描绘，另参见以下式VIIf。
在一些实施方案中，A-L-B或其药学上可接受的盐是：
Figure BDA0003759053970000441
在一些实施方案中，连接体是无环的。例如，连接体是式VIII的结构：
Figure BDA0003759053970000442
其中R17是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
L2是任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方案中，连接体选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000443
其中Ry是接合至A的任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥(参见例如WO 2018/206539)。
在一些实施方案中，连接体具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000444
本发明的化合物或其药学上可接受的盐包括选择性交联基团。如本文所使用，“选择性交联基团”是指在常规有机合成条件下或在生理条件下，相较于Ras蛋白中存在的其它亲核官能团，优先展现出与一个或多个Ras蛋白亲核官能团的交联反应性的基团。例如，在一些实施方案中，相较于Ras蛋白中的其它亲核官能团，选择性交联基团优先与羧基、羟基或硫醇基或其组合反应。例如，在一些实施方案中，选择性交联基团优先与羧基反应。在一些实施方案中，选择性交联基团优先与羟基反应。在一些实施方案中，选择性交联基团优先与硫醇基反应。在一些实施方案中，选择性交联基团优先与羧基和羟基反应。在一些实施方案中，选择性交联基团优先与羧基和硫醇基反应。在一些实施方案中，选择性交联基团优先与羟基和硫醇基反应。作为“选择性交联基团”的部分的非限制性实例包括例如碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。在一些实施方案中，选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、环氧化物或烯糖。在一些实施方案中，选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲或氮杂环丙烷。
在一些实施方案中，选择性交联基团是形成选择性交联基团的C-O键。在一些实施方案中，选择性交联基团是形成选择性交联基团的C-S键。
在一些实施方案中，选择性交联基团具有式IX至XVIII中任一者的结构或包含在式IX至XVIII中任一者内。
在一些实施方案中，选择性交联基团是式IX的结构：
Figure BDA0003759053970000451
其中R18是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000461
Figure BDA0003759053970000471
在一些实施方案中，选择性交联基团是式Xa或Xb的结构：
Figure BDA0003759053970000472
其中X5是O或S；
X5’是O或S；
X5a不存在或为NR19；
X5a’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
R19是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R20、R21、R22、R23、R20’、R21’、R22’和R23’独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000473
Figure BDA0003759053970000481
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XIa或XIb的结构：
Figure BDA0003759053970000482
其中X6是O或S；
X6’是O或S；
X6a不存在或为NR24；
X6a’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
X7和X7’各自为O、S或NR29；
R24是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R25、R26、R27、R28、R29、R25’、R26’、R27’和R28’独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000491
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XIIa、XIIb、XIIc、XIId或XIIe的结构：
Figure BDA0003759053970000492
其中X不存在或为NR30；
X’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
Y是C(O)、C(S)(即，C＝S)、SO2或任选被取代的C1-C3烷基；
Z’是C(O)或SO2；
Z”是-CH2-或C(O)；
q是0、1或2；
各Rx独立地为氢、CN、C(O)Ry、CO2Ry、C(O)NRyRy、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各Ry独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
Rz是氢或CH3；
R30是氢或任选被取代的C1-C6烷基；
R31是氢、-C(O)R32、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R32和R33独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
在一些实施方案中，R31和Rx中至少两个是氢。在一些实施方案中，R31是CH3、C(O)CH3、SO2CH3、CH2-C6H5或CH2CH2OCH3。
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000501
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000511
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000512
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000513
在一些实施方案中，本发明化合物具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000521
在一些实施方案中，本发明化合物具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000522
其中R31是不存在、氢、C(O)CH3、SO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C1-C3烷基-C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C1-C3烷基-C2-C9杂环基；
R56是CH3或Cl；
Rz是氢、任选被取代的C1-C3烷基；
各Rx独立地为氢、CO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C6烯基或任选被取代的C2-C6炔基；并且
Z”’是N或O。
在一些实施方案中，本发明化合物具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000531
其中R31是氢、CH3、C(O)CH3、SO2CH3、CH2-C6H5或CH2CH2OCH3。
在一些实施方案中，本发明化合物具有以下结构：
Figure BDA0003759053970000532
其中R31是不存在、氢、C(O)CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C1-C3烷基-C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C1-C3烷基-C2-C9杂环基；
Rz是氢、任选被取代的C1-C3烷基；
Rx是氢、CO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C6烯基或任选被取代的C2-C6炔基；并且
Z”’是N或O。
在一些实施方案中，选择性交联基团是任选被取代的氮杂环丙烷。在一些实施方案中，选择性交联基团是任选被取代的环氧化物。
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000541
Figure BDA0003759053970000542
Figure BDA0003759053970000551
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000552
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000561
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XIV的结构：
Figure BDA0003759053970000562
其中R34和R35独立地为任选被取代的C1-C6烷基，或R34和R35与其所连接的硼组合形成任选被取代的杂环基。
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XV的结构：
Figure BDA0003759053970000563
其中w是1或2；
R36是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
各R37和R38独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970000564
Figure BDA0003759053970000571
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XVI的结构：
Figure BDA0003759053970000572
其中X8是不存在、O、S、NR40或CH2；
X9是O、NR41、S、S(O)或S(O)2；
R39是任选被取代的C1-C6烷基；并且
R40和R41独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000573
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XVII的结构：
Figure BDA0003759053970000574
其中X10是不存在、O、S、NR43或CH2；
X11是O、NR44、S、S(O)或S(O)2；
R42是任选被取代的C1-C6烷基；并且
R43和R44独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000581
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XVIII的结构：
Figure BDA0003759053970000582
其中R45是氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970000583
在一些实施方案中，选择性交联基团是式XIX的结构：
Figure BDA0003759053970000584
其中R46和R47独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
在一些实施方案中，本发明化合物具有式XX或XXI的结构：
Figure BDA0003759053970000591
其中Y是C(O)、C(S)、SO2或任选被取代的C1-C6烷基；
Z’是C(O)或SO2；
q是0、1或2；
x是0、1、2或3；
各RX独立地为氢、CN、C(O)Ry、CO2Ry、C(O)NRyRy任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各Ry独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R48独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R49是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
R50是氢或C1-C6烷基；
R51是氢、CN或C1-C6烷基；
R54是氢、-C(O)R32、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R55是氢或任选被取代的C1-C6烷基。
在一些实施方案中，R51、R54和Rx各自为氢。
在一些实施方案中，本发明化合物具有式XXII或XXIII的结构：
Figure BDA0003759053970000601
其中X是氢或羟基。
在一些实施方案中，选择性交联基团是具有下式的环氧化物：
Figure BDA0003759053970000602
在一些实施方案中，本发明化合物选自表1：
表1：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000611
Figure BDA0003759053970000621
Figure BDA0003759053970000631
Figure BDA0003759053970000641
Figure BDA0003759053970000651
Figure BDA0003759053970000661
Figure BDA0003759053970000671
Figure BDA0003759053970000681
Figure BDA0003759053970000691
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2a：
表2a：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000701
Figure BDA0003759053970000711
Figure BDA0003759053970000721
Figure BDA0003759053970000731
Figure BDA0003759053970000741
Figure BDA0003759053970000751
Figure BDA0003759053970000761
Figure BDA0003759053970000771
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2b：
表2b：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000781
Figure BDA0003759053970000791
Figure BDA0003759053970000801
Figure BDA0003759053970000811
Figure BDA0003759053970000821
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2c：
表2c：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000831
Figure BDA0003759053970000841
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2d：
表2d：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000842
Figure BDA0003759053970000851
Figure BDA0003759053970000861
Figure BDA0003759053970000871
Figure BDA0003759053970000881
Figure BDA0003759053970000891
Figure BDA0003759053970000901
Figure BDA0003759053970000911
Figure BDA0003759053970000921
Figure BDA0003759053970000931
Figure BDA0003759053970000941
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2e：
表2e：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970000942
Figure BDA0003759053970000951
Figure BDA0003759053970000961
Figure BDA0003759053970000971
Figure BDA0003759053970000981
Figure BDA0003759053970000991
在一些实施方案中，本发明化合物选自表2f：
表2f：本发明某些化合物
Figure BDA0003759053970001001
Figure BDA0003759053970001011
Figure BDA0003759053970001021
Figure BDA0003759053970001031
Figure BDA0003759053970001041
Figure BDA0003759053970001051
Figure BDA0003759053970001061
Figure BDA0003759053970001071
Figure BDA0003759053970001081
Figure BDA0003759053970001091
Figure BDA0003759053970001101
Figure BDA0003759053970001111
Figure BDA0003759053970001121
Figure BDA0003759053970001131
在本文的任何实施方案中，此类实施方案不包括以下中所公开的化合物：WO2020216190、WO 2020178282、WO 2020146613、WO 2020118066、WO 2020113071、WO2020106647、WO 2020102730、WO 2020101736、WO 2020097537、WO 2020086739、WO2020081282、WO 2020050890、WO 2020047192、WO 2020035031、WO 2020028706、WO2019241157、WO 2019232419、WO 2019217691、WO 2019217307、WO 2019215203、WO2019213526、WO 2019213516、WO 2019155399、WO 2019150305、WO 2019110751、WO2019099524、WO 2019051291、WO 2018218070、WO 2018217651、WO 2018218071、WO2018218069、WO 2018206539、WO 2018143315、WO 2018140600、WO 2018140599、WO2018140598、WO 2018140514、WO 2018140513、WO 2018140512、WO 2018119183、WO2018112420、WO 2018068017、WO 2018064510、WO 2017201161、WO 2017172979、WO2017100546、WO 2017087528、WO 2017058807、WO 2017058805、WO 2017058728、WO2017058902、WO 2017058792、WO 2017058768、WO 2017058915、WO 2017015562、WO2016168540、WO 2016164675、WO 2016049568、WO 2016049524、WO 2015054572、WO2014152588、WO 2014143659或WO 2013155223，或McGregor等人,Biochem.,56(25):3178-3183(2017)。
还提供了一种Ras蛋白，该蛋白质包含连至本发明化合物的共价键。在一些实施方案中，提供了一种缀合物或其盐，其中Ras蛋白通过连接体和选择性交联基团共价结合至Ras结合部分，连接体选择性交联基团如本文术语所定义，其中所述共价键是在选择性交联基团与Ras蛋白之间。
在一些实施方案中，缀合物或其盐具有式XIX的结构：
A-LB-C
式XIX
其中A是Ras结合部分，如式II、式III、式IV或式V的化合物；
LB是结合至选择性交联基团的连接体，如式VI、VIIe、VIIf或VIII的连接体；并且
C是Ras蛋白，其中C共价结合至B。
在关于缀合物或其盐的一些实施方案中，选择性交联基团通过连至Ras蛋白的羧基的共价键结合至Ras蛋白，该Ras蛋白如人突变型K-Ras蛋白、人突变型H-Ras蛋白或人突变型N-Ras蛋白。在一些实施方案中，Ras蛋白是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。在一些实施方案中，Ras蛋白的残基的羧基是在对应于人野生型K-Ras(SEQ ID NO:1)的12位或13位的突变位置处的天冬氨酸残基的羧基。
在一些实施方案中，缀合物或其盐包含共价结合至选择性交联基团的Ras蛋白，该选择性交联基团通过连接体结合至Ras结合部分，其中该选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。在一些实施方案中，选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、环氧化物或烯糖。在一些实施方案中，选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲或氮杂环丙烷。
在一些实施方案中，缀合物或其盐包含选自由以下组成的组的连接体：
(a)
-A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-(D)-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2-
式VI
其中A1是所述连接体与Ras结合部分之间的键；A2是选择性交联基团与连接体之间的键；B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN；RN是氢、任选被取代的C1-4烷基、任选被取代的C2-4烯基、任选被取代的C2-4炔基、任选被取代的C2-6杂环基、任选被取代的C6-12芳基或任选被取代的C1-7杂烷基；C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基；a、b、c、d、e和f各自独立地为0或1；并且D是任选被取代的C1-10亚烷基、任选被取代的C2-10亚烯基、任选被取代的C2-10亚炔基、任选被取代的C2-6亚杂环基、任选被取代的C2-6亚杂芳基、任选被取代的C3-8亚环烷基、任选被取代的C6-12亚芳基、任选被取代的C2-C10聚乙二醇或任选被取代的C1-10亚杂烷基或连接A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-与-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2的化学键；
(b)
Figure BDA0003759053970001161
其中q和r独立地为0、1或2；
X1和X2独立地为N或CH；
R12和R13独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；并且
R14是氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，其中R14任选地包含连至A的键；
(c)
Figure BDA0003759053970001162
其中s、t、u和v独立地为0、1或2；
X3和X4独立地为N或CH；并且
R15和R16独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；以及
(d)
Figure BDA0003759053970001171
其中R17是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
L2是任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C3-C6亚环烷基。
还提供了一种制造缀合物的方法，该方法包括使Ras蛋白与本发明化合物或其药学上可接受的盐或者此类化合物或盐的药物组合物在足以使该化合物与该Ras蛋白共价反应的条件下接触。也提供了制造缀合物的方法，该方法包括使Ras蛋白与本发明化合物或其药学上可接受的盐或者此类化合物或盐的药物组合物在适合允许缀合物形成的条件下接触。还提供了由此类方法制造的缀合物。
合成方法
本文所描述的化合物可由可商购的起始物质制备或使用已知的有机、无机或酶方法合成。
本发明化合物可通过有机合成领域的技术人员众所周知的多种方式制备。举例来说，本公开的化合物可使用下文和以下实施例中所描述的方法，以及合成有机化学领域中已知的合成方法或本领域技术人员所理解的关于这些方法的变化形式来合成。这些方法包括但不限于下文以及实施例部分中所描述的方法。
以下方案示出了将选择性交联基团(B)附加至包含Ras结合部分和连接体(A-L)的中间物上的合成途径。尽管仅示出了一个A-L，但任何适当的Ras结合部分和连接体可选自如以下中所描述的结构：WO 2020216190、WO 2020178282、WO 2020146613、WO 2020118066、WO 2020113071、WO 2020106647、WO 2020102730、WO 2020101736、WO 2020097537、WO2020086739、WO 2020081282、WO 2020050890、WO 2020047192、WO 2020035031、WO2020028706、WO 2019241157、WO 2019232419、WO 2019217691、WO 2019217307、WO2019215203、WO 2019213526、WO 2019213516、WO 2019155399、WO 2019150305、WO2019110751、WO 2019099524、WO 2019051291、WO 2018218070、WO 2018217651、WO2018218071、WO 2018218069、WO 2018206539、WO 2018143315、WO 2018140600、WO2018140599、WO 2018140598、WO 2018140514、WO 2018140513、WO 2018140512、WO2018119183、WO 2018112420、WO 2018068017、WO 2018064510、WO 2017201161、WO2017172979、WO 2017100546、WO 2017087528、WO 2017058807、WO 2017058805、WO2017058728、WO 2017058902、WO 2017058792、WO 2017058768、WO 2017058915、WO2017015562、WO 2016168540、WO 2016164675、WO 2016049568、WO 2016049524、WO2015054572、WO 2014152588、WO 2014143659和WO 2013155223，所述Ras结合部分以引用的方式并入本文中。鉴于本文的公开内容以及一般知识，本领域技术人员将了解这些参考文献的化合物中的交联基团如何被本发明的选择性交联基团置换。
反应方案1
Figure BDA0003759053970001191
如方案1中所示，类型4的化合物可通过以下方式制备：使适当胺如化合物1与羧酸如化合物2在标准酰胺偶合试剂存在下反应，随后在酸性条件下进行三苯甲基脱保护。
反应方案2
Figure BDA0003759053970001192
如方案2中所示，类型4的化合物可通过以下方式制备：用醛如化合物2对适当胺如化合物1进行还原胺化，随后在酸性条件下进行三苯甲基脱保护。
反应方案3
Figure BDA0003759053970001201
如方案3中所示，类型3的化合物可通过以下方式制备：使适当胺如化合物1与乙烯基磺酰氯反应，随后进行烯烃二溴化并使用适合胺碱消除。类型3的化合物与适当伯胺反应产生类型4的化合物，该化合物可在碱存在下转化成类型5的化合物。
反应方案4
Figure BDA0003759053970001202
如方案4中所示，类型3的化合物可通过使适当胺如化合物1与适合烷基卤化物或其它离去试剂，如类型2的化合物反应来制备。
反应方案5
Figure BDA0003759053970001211
如方案5中所示，类型3的化合物可通过使适当胺如化合物1与硫酰氯和胺如化合物2反应来制备。
反应方案6
Figure BDA0003759053970001212
如方案6中所示，类型3的化合物可通过使适当胺如化合物1与光气和胺如化合物2反应来制备。
药物组合物和施用方法
如本文所使用，术语“药物组合物”是指与一种或多种药学上可接受的赋形剂一起配制的活性化合物。在一些实施方案中，化合物是以适于在治疗方案中施用的单位剂量的量存在，该化合物当施用给相关群体时显示出统计显著的实现预定治疗效果的可能性。在一些实施方案中，药物组合物可特定地配制成以固体或液体形式施用，包括适于以下方式施用者：口服施用，例如药水(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如旨在经颊、舌下和全身吸收者)、大丸剂、散剂、颗粒剂、供施用于舌部的糊剂；肠胃外施用，例如通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射，如例如无菌溶液或悬浮液，或持续释放配制物；表面施用，例如施用于皮肤、肺或口腔的乳霜、软膏剂或控制释放贴片或喷雾剂；阴道内或直肠内施用，例如子宫托、乳霜或泡沫剂；舌下施用；经眼施用；经皮施用；或经鼻、肺施用和施用至其它粘膜表面。
如本文所使用，“药学上可接受的赋形剂”是指在受试者体内无毒且无发炎性的任何无活性成分(例如能够将活性化合物悬浮或溶解的媒剂)。典型赋形剂包括例如：抗粘附剂、抗氧化剂、粘合剂、包衣剂、压缩助剂、崩解剂、染料(色素)、软化剂、乳化剂、填充剂(稀释剂)、成膜剂或包衣剂、调味剂、芳香剂、助流剂(流动增强剂)、润滑剂、防腐剂、印刷油墨、吸附剂、悬浮剂或分散剂、甜味剂或水合用水。赋形剂包括但不限于：任选被取代的丁基化羟基甲苯(BHT)、碳酸钙、磷酸氢钙、硬脂酸钙、交联羧甲基纤维素、交联聚乙烯基吡咯烷酮、柠檬酸、交联聚维酮、半胱氨酸、乙基纤维素、明胶、任选被取代的羟丙基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乳糖、硬脂酸镁、麦芽糖醇、甘露糖醇、甲硫氨酸、甲基纤维素、对羟基苯甲酸甲酯、微晶纤维素、聚乙二醇、聚乙烯基吡咯烷酮、聚维酮、预胶化淀粉、对羟基苯甲酸丙酯、棕榈酸视黄酯、虫胶、二氧化硅、羧甲基纤维素钠、柠檬酸钠、羟基乙酸淀粉钠、山梨糖醇、淀粉(玉米淀粉)、硬脂酸、硬脂酸、蔗糖、滑石、二氧化钛、维生素A、维生素E、维生素C及木糖醇。本领域技术人员了解可用作赋形剂的多种试剂和材料。
除非清楚地作相反陈述，否则本文所描述或描绘的化合物，无论是否清楚地陈述，均可以呈盐形式，例如呈药学上可接受的盐形式提供或使用。如本文所使用，术语“药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内，适于与人体和动物组织接触使用而无过度毒性、刺激、过敏反应等，并且与合理效益/风险比相称的本文所描述的化合物的盐。药学上可接受的盐是本领域中众所周知的。例如，药学上可接受的盐描述于：Berge等人,J.Pharmaceutical Sciences 66:1-19,1977及Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,(P.H.Stahl及C.G.Wermuth编辑),Wiley-VCH,2008中。所述盐可在本文所描述的化合物的最终分离和纯化期间原位制备，或通过使游离碱性基团与适合有机酸反应来分离。
本发明化合物可具有可离子化基团，由此能够制备成药学上可接受的盐形式。这些盐可以是涉及无机酸或有机酸的酸加成盐，或在本发明化合物呈酸形式的情况下，所述盐可由无机碱或有机碱制备。通常，所述化合物被制备为药学上可接受的盐形式或以药学上可接受的盐形式使用，所述药学上可接受的盐形式是作为药学上可接受的酸或碱的加成产物制备。适合药学上可接受的酸和碱是本领域中众所周知的，如盐酸、硫酸、氢溴酸、乙酸、乳酸、柠檬酸或酒石酸，用于形成酸加成盐；以及氢氧化钾、氢氧化钠、氢氧化铵、咖啡因、各种胺等，用于形成碱盐。用于制备适当盐的方法是本领域中公认的。
代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-任选被取代的羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等，以及无毒铵、季铵和胺阳离子，包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。
如本文所使用，术语“受试者”是指动物王国的任何成员。在一些实施方案中，“受试者”是指处于任何发育阶段的人类。在一些实施方案中，“受试者”是指人类患者。在一些实施方案中，“受试者”是指处于任何发育阶段的非人类动物。在一些实施方案中，非人类动物是哺乳动物(例如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、猴、犬、猫、绵羊、牛、灵长类动物或猪)。在一些实施方案中，受试者包括但不限于哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼或虫类。在一些实施方案中，受试者可以是转基因动物、基因工程改造的动物或克隆。
如本文所使用，术语“剂型”是指供施用给受试者的活性化合物(例如治疗剂或诊断剂)的物理离散单元。每个单元含有预定量的活性剂。在一些实施方案中，所述量是适于根据剂量方案施用的单位剂量的量(或其整体部分)，该量当施用给相关群体(即，根据治疗剂量方案)时确定与所希望或有益的结果相关。本领域技术人员应理解，施用给特定受试者的治疗组合物或化合物的总量是由一位或多位主治医师决定，并且可涉及施用多种剂型。
如本文所使用，术语“剂量方案”是指个别地施用给受试者的一组单位剂量(典型地超过一个单位剂量)，所述单位剂量典型地间隔一定时间段。在一些实施方案中，给定治疗化合物具有推荐的剂量方案，该方案可涉及一次或多次剂量。在一些实施方案中，剂量方案包含多次剂量，所述剂量各自彼此间隔相同长度的时间段；在一些实施方案中，剂量方案包含多次剂量且至少两个不同时间段分开个别剂量。在一些实施方案中，剂量方案内的所有剂量均为相同单位剂量的量。在一些实施方案中，剂量方案内的不同剂量是不同量。在一些实施方案中，剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量，随后是呈不同于该第一剂量的量的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中，剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量，随后是呈与该第一剂量的量相同的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中，剂量方案当施用给相关群体(即，是治疗性剂量方案)时，与所希望或有益结果相关。
“治疗方案”是指在相关群体中的施用与期望或有益治疗结果相关的剂量方案。
术语“治疗”(“treatment/treat/treating”)在其最广泛意义上是指部分或完全缓解、改善、减轻、抑制特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状、特征或成因；延迟其发作；降低其严重程度；或减少其发生的物质(例如所提供的组合物)的任何施用。在一些实施方案中，此类治疗可施用给未展现相关疾病、病症或疾患的体征的受试者或仅展现该疾病、病症或疾患的早期体征的受试者。替代地或另外地，在一些实施方案中，治疗可施用给展现相关疾病、病症或疾患的一种或多种确定的体征的受试者。在一些实施方案中，治疗可用于被诊断为罹患相关疾病、病症或疾患的受试者。在一些实施方案中，治疗可用于已知具有一个或多个在统计上与发展相关疾病、病症或疾患的风险增加相关的易感因素的受试者。
术语“治疗有效量”意谓当根据治疗性剂量方案施用给罹患或易患疾病、病症或疾患的群体时足以治疗该疾病、病症或疾患的量。在一些实施方案中，治疗有效量是降低该疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发生率或严重程度或延迟其发作的量。本领域技术人员应理解，术语“治疗有效量”实际上不需要在特定个体中实现所需的成功治疗。事实上，治疗有效量可以是当施用给需要该治疗的患者时在相当大量受试者中提供特定所希望的药理学反应的量。特别需要了解的是，特定受试者实际上可以是“治疗有效量”“难治”的。举个例子，难治的受试者可具有低生物利用率，使得无法获得临床功效。在一些实施方案中，提到的治疗有效量可指如在一个或多个特定组织(例如受疾病、病症或疾患影响的组织)或流体(例如血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液)中所测量的量。本领域技术人员应理解，在一些实施方案中，治疗有效量可配制为单一剂量或以单一剂量施用。在一些实施方案中，治疗有效量可配制为多次剂量，例如配制为剂量方案的一部分，或以多次剂量施用。
为用作受试者的治疗，本发明化合物或其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或兽医学组合物形式。取决于待治疗的受试者、施用模式及所希望的治疗类型，例如预防、防治或治疗，所述化合物或其药学上可接受的盐是以与所述参数相符的方式配制。关于此类技术的概述可见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第21版,Lippincott Williams&Wilkins,(2005)；及Encyclopedia of PharmaceuticalTechnology,J.Swarbrick及J.C.Boylan编辑,1988-1999,Marcel Dekker,New York，所述文献各自以引用的方式并入本文中。
本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐的存在量以重量计可占组合物，如药物组合物总量总计1-95％。所述组合物可以呈适于以下施用的剂型提供：关节内、口服、肠胃外(例如静脉内、肌肉内)、直肠、皮肤、皮下、表面、经皮、舌下、经鼻、阴道、囊内、尿道内、鞘内、硬膜外、耳或眼施用，或通过注射、吸入或与鼻、泌尿生殖器、生殖器或口腔粘膜直接接触。因此，药物组合物可呈例如片剂、胶囊、丸剂、散剂、颗粒剂、悬浮液、乳液、溶液、凝胶(包括水凝胶)、糊剂、软膏、乳霜、硬膏剂、药水、渗透递送装置、栓剂、灌肠剂、注射剂、植入物、喷雾剂、适于离子电渗递送的制剂或气雾剂。所述组合物可根据常规医药实践配制。
本发明化合物或其药学上可接受的盐可被制备为药物组合物形式并使用，所述药物组合物包含治疗有效量的本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐以及本领域中众所周知的药学上可接受的载剂或赋形剂。在一些实施方案中，组合物包括至少两种不同的药学上可接受的赋形剂或载剂。
如本文所使用，术语“施用”是指将一种组合物(例如化合物或包括如本文所描述的化合物的制剂)施用给受试者或系统。向动物受试者(例如向人类)施用可通过任何适当的途径进行。例如，在一些实施方案中，施用可以是支气管(包括通过支气管滴注)、经颊、经肠、真皮内、动脉内、真皮内、胃内、髓内、肌肉内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、囊内、经粘膜、经鼻、口服、直肠、皮下、舌下、表面、气管(包括通过气管内滴注)、经皮、阴道和玻璃体施用。
配制物可以通过适于全身施用或者表面或局部施用的方式制备。全身配制物包括设计用于注射(例如肌肉内、静脉内或皮下注射)的配制物或可制备用于经皮、经粘膜或口服施用。配制物一般将包括稀释剂，并且在一些情况下，包括佐剂、缓冲剂、防腐剂等。化合物或其药学上可接受的盐也可以呈脂质体组合物或以微乳液形式施用。
为进行注射，可将配制物制备为常规形式，如液体溶液或悬浮液，或适于在注射之前于液体中制备为溶液或悬浮液的固体形式，或乳液形式。适合赋形剂包括例如水、生理盐水、右旋糖、甘油等。这些组合物也可含有一定量无毒辅助物质，如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等，如乙酸钠、去水山梨糖醇单月桂酸酯等等。
也已设计出各种持续释放药物系统。参见例如美国专利第5,624,677号，该案以引用的方式并入本文中。
全身施用也可包括相对无创的方法，如使用栓剂、经皮贴片、经粘膜递送及鼻内施用。口服施用也适于本发明化合物或其药学上可接受的盐。本领域中应了解，适合形式包括糖浆、胶囊和片剂。
如本文所描述，组合疗法中的每种化合物或其药学上可接受的盐都可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如，组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。
个别或分开配制的药剂可一起包装为试剂盒形式。非限制性实例包括但不限于含有例如两粒丸剂、一粒丸剂和散剂、栓剂或在小瓶中的液体、两种表面乳霜等的试剂盒。所述试剂盒可包括有助于将单位剂量施用给受试者的任选使用的组件，如用于使粉末形式复原的小瓶、注射用注射器、定制IV递送系统、吸入器等。另外，单位剂量试剂盒可含有关于所述组合物的制备和施用的说明书。试剂盒可制造为用于一名受试者的一次性单位剂量、用于特定受试者的多次使用(在恒定剂量下，或其中个别化合物或其药学上可接受的盐的效力可随治疗进展而变化)；或试剂盒可含有适于施用多名受试者的多次剂量(“整体包装”)。所述试剂盒组件可组装于纸盒、泡罩包装、瓶、管等中。
供口服使用的配制物包括含活性成分与无毒药学上可接受的赋形剂的混合物的片剂。所述赋形剂可以是例如惰性稀释剂或填充剂(例如蔗糖、山梨糖醇、糖、甘露糖醇、微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、碳酸钙、氯化钠、乳糖、磷酸钙、硫酸钙或磷酸钠)；制粒剂及崩解剂(例如纤维素衍生物，包括微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、交联羧甲基纤维素钠、海藻酸盐或海藻酸)；粘合剂(例如蔗糖、葡萄糖、山梨糖醇、阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸钠、明胶、淀粉、预胶化淀粉、微晶纤维素、硅酸镁铝、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮或聚乙二醇)；及润滑剂、助流剂及抗粘着剂(例如硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、二氧化硅、氢化植物油或滑石)。其它药学上可接受的赋形剂可以是着色剂、调味剂、塑化剂、保湿剂、缓冲剂等。
两种或更多种化合物可一起混合于片剂、胶囊或其它媒剂中，或可隔开。在一个实施例中，第一化合物是包含在片剂的内侧上，并且第二化合物是在外侧上，由此使该第二化合物的绝大部分在第一化合物释放之前释放。
供口服使用的配制物也可以呈咀嚼片形式提供，或呈硬明胶胶囊形式提供，其中活性成分与惰性固体稀释剂(例如马铃薯淀粉、乳糖、微晶纤维素、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合；或呈软明胶胶囊形式提供，其中活性成分与水或油介质，例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合。粉末、颗粒及细圆粒可使用以上关于片剂和胶囊所提到的成分，以常规方式，使用例如混合器、流体床装置或喷雾干燥设备制备。
溶出或扩散控制性释放可通过适当地包覆化合物的片剂、胶囊、细圆粒或颗粒状配制物，或通过将所述化合物或其药学上可接受的盐并入适当基质中来实现。控制释放包衣可包括一种或多种以上提到的包覆物质，例如虫胶、蜂蜡、糖蜡(glycowax)、蓖麻蜡、巴西棕榈蜡、硬脂醇、单硬脂酸甘油酯、二硬脂酸甘油酯、棕榈硬脂酸甘油酯、乙基纤维素、丙烯酸树脂、dl-聚乳酸、乙酸丁酸纤维素、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯、乙烯基吡咯烷酮、聚乙烯、聚甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸甲酯、2-任选被取代的羟基甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸酯水凝胶、1,3丁二醇、乙二醇甲基丙烯酸酯或聚乙二醇。在控制释放基质配制物中，基质材料也可包括例如水合甲基纤维素、巴西棕榈蜡和硬脂醇、卡波普(carbopol)934、硅酮、三硬脂酸甘油酯、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸甲酯、聚氯乙烯、聚乙烯或卤化氟碳化合物。
供口服施用的可并入本发明化合物或其药学上可接受的盐和组合物的液体形式包括水性溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液以及用如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油之类食用油调味的乳液，以及酏剂和类似医药媒剂。
一般而言，当施用给人类时，本发明的组合的任何化合物或其药学上可接受的盐的口服剂量将取决于该化合物的性质，并且可容易地由本领域技术人员确定。典型地，此类剂量通常是每天约0.001mg至2000mg，理想地是每天约1mg至1000mg，并且更理想地是每天约5mg至500mg。可能需要每天最多200mg剂量。
在一些实施方案中，药物组合物可进一步包含具有抗增殖活性的额外化合物。取决于投药模式，化合物或其药学上可接受的盐将配制成适合组合物以便于递送。组合疗法中的每种化合物或其药学上可接受的盐均可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如，组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。合意地，所述第一药剂和所述第二药剂是一起配制，以便同时或接近同时地施用所述药剂。
应理解，本发明化合物和药物组合物可被配制并用于组合疗法中，即，所述化合物和药物组合物可与一种或多种其它所需治疗剂或医疗程序一起配制或在施用该一种或多种其它所需治疗剂或医疗程序的同时、之前或之后施用。用于组合方案中的每种疗法(治疗剂或程序)的特定组合应考虑所需治疗剂或程序与待实现的所需治疗效果的相容性。还应理解，所采用的疗法可针对相同病症实现所需作用，或这些疗法可实现不同作用(例如控制任何不良作用)。
如本文所描述，组合疗法中每种药物的施用可独立地为每日一至四次，持续一天至一年，甚至可持续受试者的一生。长期(chronic/long-term)施用也可适用。
使用方法
在一些实施方案中，本发明公开一种治疗以Ras突变体引起的异常Ras活性为特征的疾病或病症的方法。在一些实施方案中，所述疾病或病症是癌症。在一些实施方案中，癌症是结肠直肠癌、非小细胞肺癌或小细胞肺癌。在一些实施方案中，异常Ras活性是由RasG12D突变引起。在一些实施方案中，异常Ras活性是由K-Ras G12D突变引起。在一些实施方案中，异常Ras活性是由Ras G13D突变引起。在一些实施方案中，异常Ras活性是由K-RasG13D突变引起。在一些实施方案中，异常Ras活性是由Ras G12S突变引起。在一些实施方案中，异常Ras活性是由K-Ras G12S突变引起。其它Ras突变在本文中也有描述。
也提供一种治疗有需要的受试者的癌症的方法，该方法包括向该受试者施用治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐或包含此类化合物或盐的药物组合物。在一些实施方案中，癌症是结肠直肠癌、非小细胞肺癌、胰腺癌、阑尾癌、黑色素瘤、急性骨髓性白血病、小肠癌、壶腹癌、生殖细胞癌、子宫颈癌、未知原发部位的癌症、子宫内膜癌、食管胃癌、GI神经内分泌癌、卵巢癌、性索基质瘤癌、肝胆癌症或膀胱癌。也提供一种治疗有需要的受试者的Ras蛋白相关病症的方法，该方法包括向该受试者施用治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐或包含此类化合物或盐的药物组合物。在一些实施方案中，癌症包含Ras突变，如本文所描述的Ras突变。在一些实施方案中，Ras突变是K-Ras G12D、K-RasG13D或K-Ras G12S。
在一些实施方案中，本发明化合物或其药学上可接受的盐、包含此类化合物或盐的药物组合物以及本文所提供的方法可用于治疗多种癌症，包括肿瘤，如肺癌、前列腺癌、乳癌、脑癌、皮肤癌、子宫颈癌、睾丸癌等。更具体点说，可通过本发明化合物或其盐、包含此类化合物或盐的药物组合物以及方法治疗的癌症包括但不限于如以下肿瘤类型：星形细胞、乳房、子宫颈、结肠直肠、子宫内膜、食道、胃、头颈部、肝细胞、喉、肺、口腔、卵巢、前列腺以及甲状腺癌瘤和肉瘤。其它癌症包括例如：
心脏，例如：肉瘤(血管肉瘤、纤维肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤)、粘液瘤、横纹肌瘤、纤维瘤、脂肪瘤及畸胎瘤；
肺，例如：支气管肺癌(鳞状细胞肺癌、未分化小细胞肺癌、未分化大细胞肺癌、肺腺癌)、肺泡(细支气管)癌、支气管腺瘤、肉瘤、淋巴瘤、软骨瘤性错构瘤、间皮瘤；
胃肠，例如：食道(鳞状细胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)、胃(癌瘤、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)、胰腺(导管腺癌、胰岛瘤、胰高血糖素瘤、胃泌素瘤、类癌瘤、血管活性肠肽瘤)、小肠(腺癌、淋巴瘤、类癌瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤、纤维瘤)、大肠(腺癌、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、错构瘤、平滑肌瘤)；
泌尿生殖道，例如：肾(腺癌、威尔姆氏肿瘤(Wilm's tumor)(肾母细胞瘤)、淋巴瘤、白血病)、膀胱和尿道(鳞状细胞癌、移行细胞癌、腺癌)、前列腺(腺癌、肉瘤)、睾丸(精原细胞瘤、畸胎瘤、胚胎癌、畸胎癌、绒毛膜癌、肉瘤、间质细胞癌、纤维瘤、纤维腺瘤、腺瘤样瘤、脂肪瘤)；
肝，例如：肝细胞瘤(肝细胞癌)、胆管癌、肝母细胞瘤、血管肉瘤、肝细胞腺瘤、血管瘤；
胆道，例如：胆囊癌、壶腹癌、胆管癌；
骨骼，例如：骨原性肉瘤(骨肉瘤)、纤维肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、软骨肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、恶性淋巴瘤(网状细胞肉瘤)、多发性骨髓瘤、恶性巨细胞瘤、脊索瘤、骨性软骨瘤(骨软骨外生性骨疣)、良性软骨瘤、软骨母细胞瘤、软骨粘液样纤维瘤、骨样骨瘤及巨细胞肿瘤；
神经系统，例如：颅骨(骨瘤、血管瘤、肉芽肿、黄色瘤、畸形性骨炎)、脑脊膜(脑膜瘤、脑膜肉瘤、胶质瘤病)、脑(星形细胞瘤、髓母细胞瘤、神经胶质瘤、室管膜瘤、生殖细胞瘤(松果体瘤)、多形性胶质母细胞瘤、寡树突神经胶细胞瘤、神经鞘瘤、视网膜母细胞瘤、先天性肿瘤、1型神经纤维瘤病、脊髓神经纤维瘤、脑膜瘤、神经胶质瘤、肉瘤；
妇科，例如：子宫(子宫内膜癌)、子宫颈(子宫颈癌、子宫颈癌前非典型性增生)、卵巢(卵巢癌(浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、未分类癌)、颗粒-卵泡膜细胞肿瘤、塞莱二氏细胞肿瘤(Sertoli-Leydig cell tumors)、无性细胞瘤、恶性畸胎瘤)、外阴(鳞状细胞癌、上皮内癌、腺癌、纤维肉瘤、黑色素瘤)、阴道(透明细胞癌、鳞状细胞癌、葡萄状肉瘤(胚胎性横纹肌肉瘤)、输卵管(癌瘤)；
造血系统，例如：血液(骨髓性白血病(急性和慢性)、急性淋巴母细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、骨髓发育不良综合征)、霍奇金氏病(Hodgkin's disease)、非霍奇金氏淋巴瘤(恶性淋巴瘤)；
皮肤，例如：恶性黑色素瘤、基底细胞癌、鳞状细胞癌、卡波西氏肉瘤、痣发育不良痣、脂肪瘤、血管瘤、皮肤纤维瘤、瘢痕疙瘩、牛皮癣；以及
肾上腺，例如：神经母细胞瘤。
也提供一种抑制细胞中的Ras蛋白的方法，该方法包括使该细胞与有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐接触。也提供一种抑制RAF-Ras结合的方法，该方法包括使该细胞与有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐接触。所述细胞可以是癌细胞。所述癌细胞可以是例如结肠直肠癌细胞、非小细胞肺癌细胞、胰腺癌细胞、阑尾癌细胞、黑色素瘤细胞、急性骨髓性白血病细胞、小肠癌细胞、壶腹癌细胞、生殖细胞癌细胞、子宫颈癌细胞、未知原发部位的癌症细胞、子宫内膜癌细胞、食管胃癌细胞、GI神经内分泌癌细胞、卵巢癌细胞、性索基质瘤癌细胞、肝胆癌症细胞或膀胱癌细胞。在一些实施方案中，癌症是阑尾癌、子宫内膜癌或黑色素瘤。
组合疗法
本公开还提供了用于组合物疗法的方法，在组合物疗法中，将已知用于调节其它路径或同一路径的其它组分或甚至是重叠靶标集合的剂与本公开化合物或其药学上可接受的盐组合使用。一方面，此类疗法包括但不限于一种或多种本公开化合物与抗增殖剂、化学治疗剂、治疗性抗体和放射治疗组合以提供协同或累加治疗作用。与本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐组合的其它药剂的实例将包括用于治疗相同适应症的药剂。与本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐组合的潜在药剂的另一个实例将包括用于治疗不同但仍相关联或相关的症状或适应症的药剂。
如本文所使用，术语“组合疗法”是指使受试者同时暴露于两种或更多种治疗方案(例如两种或更多种化合物，如本发明化合物)的情况。在一些实施方案中，两种或更多种化合物可同时施用；在一些实施方案中，这些化合物可依序施用；在一些实施方案中，这些化合物是以重叠的给药方案施用。在一些实施方案中，组合治疗方案采用了两种治疗剂，一种是本发明化合物并且另一种选自本文所描述的治疗剂。在一些实施方案中，组合治疗方案采用了三种治疗剂，一种是本发明化合物并且两种选自本文所描述的治疗剂。在一些实施方案中，组合治疗方案采用了四种或更多种治疗剂，一种是本发明化合物并且三种选自本文所描述的治疗剂。例如，组合疗法可采用本文所描述的Ras抑制剂、MEK抑制剂和SHP2抑制剂；本文所描述的Ras抑制剂、MEK抑制剂和SOS1抑制剂；或RAS抑制剂、PDL-1抑制剂和SHP2抑制剂。
在这一组合疗法部分中，所有参考文献中关于所描述的剂都以引用的方式并入本文中，无论是否如此明确陈述。
在一些实施方案中，本发明化合物与EGFR抑制剂组合使用。在一些实施方案中，本发明化合物可与受体酪氨酸激酶(RTK)/生长因子受体的下游成员的抑制剂组合使用，如SHP2抑制剂、SOS1抑制剂、Raf抑制剂、MEK抑制剂、ERK抑制剂、PI3K抑制剂、PTEN抑制剂、AKT抑制剂或mTORC1抑制剂。这些抑制剂的实例提供于下。
在一些实施方案中，本发明化合物可与第二Ras抑制剂组合使用。在一些实施方案中，所述Ras抑制剂靶向呈活性或GTP结合状态的Ras。在一些实施方案中，所述Ras抑制剂靶向呈无活性或GDP结合状态的Ras，如AMG 510、MRTX1257、MRTX849、JNJ-74699157、LY3499446或ARS-1620。
许多化学治疗剂是本领域中当前已知的并且都可与本公开化合物使用。在一些实施方案中，化学治疗剂选自由以下组成的组：有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、插入性抗生素、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、抗激素剂、血管生成抑制剂和抗雄激素剂。非限制性实例有化学治疗剂、细胞毒性剂和非肽小分子，如
Figure BDA0003759053970001341
(甲磺酸伊马替尼(Imatinib Mesylate))、
Figure BDA0003759053970001342
(卡非佐米(carfilzomib))、
Figure BDA0003759053970001343
(硼替佐米(bortezomib))、CasodexTM(比卡鲁胺(bicalutamide))、
Figure BDA0003759053970001344
(吉非替尼(gefitinib))和阿霉素(Adriamycin)，以及一系列化学治疗剂。化学治疗剂的非限制性实例包括烷化剂，如噻替哌(thiotepa)和环磷酰胺(CYTOXANTMTM)；烷基磺酸酯，如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan)；氮杂环丙烷，如苯佐替哌(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)和乌瑞替哌(uredopa)；乙烯亚胺和甲基蜜胺，包括六甲蜜胺(altretamine)、三乙烯蜜胺、三乙烯磷酰胺、三乙烯硫代磷酰胺及三羟甲基蜜胺；氮芥，如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、胆磷酰胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、甲氮芥(mechlorethamine)、氧化甲氮芥盐酸盐(mechlorethamine oxide hydrochloride)、美法仑(melphalan)、新恩比兴(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、乌拉莫司汀(uracil mustard)；亚硝基脲，如卡莫司汀(carmustine)、氯脲霉素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、雷诺莫司汀(ranimustine)；抗生素，如阿克拉霉素(aclacinomysin)、放线菌素(actinomycin)、安曲霉素(authramycin)、氮杂丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、刺孢霉素(calicheamicin)、卡拉比星(carabicin)、洋红霉素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、CasodexTM、色霉素(chromomycins)、放线菌素D(dactinomycin)、道诺霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸、多柔比星、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素(mitomycin)(如丝裂霉素C)、霉酚酸(mycophenolic acid)、诺拉霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泊非霉素(potfiromycin)、嘌呤霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑霉素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、左柔比星(zorubicin)；抗代谢物，如氨甲蝶呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-FU)；叶酸类似物，如二甲叶酸(denopterin)、甲氨蝶呤(methotrexate)、蝶罗呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤类似物，如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤(thioguanine)；嘧啶类似物，如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-硫唑嘧啶、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、双去氧尿苷、去氧氟尿苷(doxifiuridine)、依诺他滨(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄激素，如卡普睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪内酯(testolactone)；抗肾上腺素，如胺鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；叶酸补充剂，如亚叶酸(frolinic acid)；醋葡醛内酯(aceglatone)；醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid)；安吖啶(amsacrine)；阿莫司汀(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；伊达曲沙(edatraxate)；地磷酰胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依氟米星(elfomithine)；依利醋铵(elliptinium acetate)；依托格鲁(etoglucid)；硝酸镓；羟基脲；香菇多糖(lentinan)；氯尼达明(lonidamine)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌达醇(mopidamol)；尼曲吖啶(nitracrine)；喷司他丁(pentostatin)；蛋胺氮芥(phenamet)；比柔比星(pirarubicin)；鬼臼酸(podophyllinicacid)；2-乙基酰肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK；雷佐生(razoxane)；西佐喃(sizofiran)；锗螺胺(spirogermanium)；细交链孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亚胺醌(triaziquone)；2,2',2”-三氯三乙胺；乌拉坦(urethan)；长春地辛(vindesine)；达卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴卫矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；加西托肽(gacytosine)；阿拉伯糖苷(arabinoside)(“Ara-C”)；环磷酰胺；噻替哌；紫杉烷(taxane)，例如太平洋紫杉醇和多西他赛；视黄酸；埃斯波霉素(esperamicins)；卡培他滨(capecitabine)；以及上述任一着的药学上可接受的盐、酸或衍生物。
还包括用于调控或抑制激素对肿瘤的作用的抗激素剂作为适合的化学治疗细胞调理剂，如抗雌激素剂，包括例如他莫昔芬(tamoxifen)(NolvadexTM)、拉洛昔芬(raloxifene)、芳香酶抑制性4(5)-咪唑、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、科沃昔芬(keoxifene)、LY 117018、奥那斯酮(onapristone)和托瑞米芬(toremifene)(Fareston)；以及抗雄激素剂，如氟他胺(flutamide)、尼鲁胺(nilutamide)、比卡鲁胺(bicalutamide)、亮丙立德(leuprolide)和戈舍瑞林(goserelin)；苯丁酸氮芥；吉西他宾(gemcitabine)；6-硫鸟嘌呤；巯基嘌呤；甲氨蝶呤；铂类似物，如顺铂(cisplatin)和卡铂(carboplatin)；长春花碱(vinblastine)；铂；依托泊苷(etoposide)(VP-16)；异环磷酰胺；丝裂霉素C；米托蒽醌；长春新碱(vincristine)；长春瑞宾(vinorelbine)；诺维本(navelbine)；能灭瘤(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；道诺霉素(daunomycin)；氨基喋呤(aminopterin)；
Figure BDA0003759053970001371
伊班膦酸盐(ibandronate)；喜树碱(camptothecin)-11(CPT-11)；拓扑异构酶抑制剂RFS 2000；二氟甲基鸟氨酸(DMFO)。
必要时，本公开的化合物或药物组合物可与通常规定的抗癌药组合使用，如
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Figure BDA0003759053970001373
ABVD、AVICINE、阿巴伏单抗(Abagovomab)、吖啶甲酰胺(Acridine carboxamide)、阿德木单抗(Adecatumumab)、17-N-烯丙基氨基-17-去甲氧基格尔德霉素(demethoxygeldanamycin)、阿法拉丁(Alpharadin)、艾沃昔布(Alvocidib)、3-氨基吡啶-2-甲醛硫代半卡巴腙(thiosemicarbazone)、胺萘非特(Amonafide)、蒽二酮(Anthracenedione)、抗CD22免疫毒素、抗肿瘤发生草药、阿帕齐醌(Apaziquone)、阿替莫德(Atiprimod)、硫唑嘌呤(Azathioprine)、贝洛替康(Belotecan)、苯达莫司汀(Bendamustine)、BIBW 2992、比立考达(Biricodar)、溴他立辛(Brostallicin)、苔藓抑素(Bryostatin)、丁硫氨酸亚砜亚胺(Buthionine sulfoximine)、CBV(化学疗法)、海绵诱癌素(Calyculin)、细胞周期非特异性抗肿瘤剂、二氯乙酸、盘皮海绵内酯(Discodermolide)、依沙芦星(Elsamitrucin)、依诺他滨(Enocitabine)、艾普塞隆(Epothilone)、艾日布林(Eribulin)、依维莫司(Everolimus)、依沙替康(Exatecan)、依昔舒林(Exisulind)、弥罗松酚(Ferruginol)、呋咯地辛(Forodesine)、磷雌酚(Fosfestrol)、ICE化学疗法方案、IT-101、伊美克(Imexon)、咪喹莫特(Imiquimod)、吲哚并咔唑(Indolocarbazole)、伊洛福芬(Irofulven)、兰尼奎达(Laniquidar)、拉洛他赛(Larotaxel)、雷利米得(Lenalidomide)、甲硫蒽酮(Lucanthone)、勒托替康(Lurtotecan)、马磷酰胺(Mafosfamide)、米托唑胺(Mitozolomide)、萘克沙朵(Nafoxidine)、奈达铂(Nedaplatin)、奥拉帕尼(Olaparib)、奥他赛(Ortataxel)、PAC-1、木瓜、匹杉琼(Pixantrone)、蛋白酶体抑制剂、蝴蝶霉素(Rebeccamycin)、瑞喹莫德(Resiquimod)、鲁比替康(Rubitecan)、SN-38、盐孢菌素A(Salinosporamide A)、沙帕他滨(Sapacitabine)、斯坦福V(Stanford V)、苦马豆素(Swainsonine)、他拉泊芬(Talaporfin)、他立喹达(Tariquidar)、替加氟-尿嘧啶(Tegafur-Uracil)、替莫达(Temodar)、替西他赛(Tesetaxel)、四硝酸三铂(TriplatinTetranitrate)、三(2-氯乙基)胺、曲沙他滨(Troxacitabine)、乌拉莫司汀(Uramustine)、伐地美生(Vadimezan)、长春氟宁(Vinflunine)、ZD6126或唑喹达(Zosuquidar)。
本公开还涉及一种使用本文所提供的化合物或药物组合物与放射疗法的组合抑制异常细胞生长或治疗哺乳动物的过度增生性病症的方法。用于施用放射疗法的技术是本领域中已知的，并且这些技术可用于本文所描述的组合疗法中。这一组合疗法中本公开化合物的施用可根据本文所描述来确定。
放射疗法可通过若干方法中的一种或方法组合施用，包括但不限于外射束疗法、内放射疗法、植入放射、立体定向放射手术、全身放射疗法、放射疗法以及持久或短暂地插种近接疗法。如本文所使用，术语“近接疗法”是指通过插入体内肿瘤或其它增生性组织疾病部位处或附近的空间上限定的放射性物质递送的放射疗法。这一术语意欲但不限于包括暴露于放射性同位素(例如At-211、I-131、I-125、Y-90、Re-186、Re-188、Sm-153、Bi-212、P-32以及Lu的放射性同位素)。用作本公开的的细胞调理剂的适合放射源包括固体和液体。作为非限制性实例，放射源可以是放射性核素，如I-125、I-131、Yb-169、作为固体来源的Ir-192、作为固体来源的I-125，或发射光子、β粒子、γ放射或其它治疗射线的其它放射性核素。放射性物质也可以是由任何放射性核素溶液制造的流体，例如I-125或I-131的溶液，或放射性流体可使用含有如Au-198或Y-90之类固体放射性核素小粒子的适合流体的浆液制备。此外，放射性核素可包埋于凝胶或放射性微球中。
本公开的化合物或药物组合物可与一定量的一种或多种选自以下的物质组合使用：抗血管生成剂、信号转导抑制剂、抗增生剂、糖酵解抑制剂或自噬抑制剂。
抗血管生成剂，如MMP-2(基质金属蛋白酶2)抑制剂、MMP-9(基质金属蛋白酶9)抑制剂和COX-II(环加氧酶11)抑制剂可与本文所描述的本公开的化合物和药物组合物结合使用。抗血管生成剂包括例如雷帕霉素、替西罗莫司(CCI-779)、依维莫司(RAD001)、索拉非尼、舒尼替尼及贝伐珠单抗(bevacizumab)。有用COX-II抑制剂的实例包括阿来昔布(alecoxib)、伐地昔布(valdecoxib)和罗非昔布(rofecoxib)。有用的基质金属蛋白酶抑制剂的实例描述于WO 96/33172、WO 96/27583、EP0818442、EP1004578、WO 98/07697、WO 98/03516、WO 98/34918、WO 98/34915、WO 98/33768、WO 98/30566、EP606046、WO 90/05719、WO99/52910、WO 99/52889、WO 99/29667、WO1999007675、EP1786785、EP1181017、US20090012085、US5863949、US5861510和EP0780386中。优选的MMP-2和MMP-9抑制剂是具有极低或不具有MMP-1抑制活性的抑制剂。更优选是相对于其它基质金属蛋白酶(即，MAP-1、MMP-3、MMP-4、MMP-5、MMP-6、MMP-7、MMP-8、MMP-10、MMP-11、MMP-12及MMP-13)选择性抑制MMP-2或AMP-9的抑制剂。可用于本公开的MMP抑制剂的一些具体实例有AG-3340、RO 32-3555和RS 13-0830。
本发明化合物也可与其它抗肿瘤剂一起用于联合疗法中，如醋孟南(acemannan)、阿柔比星(aclarubicin)、阿地白介素(aldesleukin)、阿仑单抗(alemtuzumab)、阿曲诺英(alitretinoin)、六甲蜜胺、胺磷汀(amifostine)、胺柔比星(amrubicin)、安吖啶(amsacrine)、阿那格雷(anagrelide)、阿那曲唑(anastrozole)、ANCER、安塞司亭(ancestim)、ARGLABIN、三氧化砷、BAM-002(Novelos)、贝沙罗汀(bexarotene)、比卡鲁胺(bicalutamide)、溴尿苷(broxuridine)、卡培他滨、西莫白介素(celmoleukin)、西曲瑞克(cetrorelix)、克拉屈滨(cladribine)、克霉唑(clotrimazole)、阿糖胞苷烷磷酯(cytarabine ocfosfate)、DA 3030(Dong-A)、达克珠单抗(daclizumab)、地尼白介素(denileukin diftitox)、地洛瑞林(deslorelin)、右雷佐生(dexrazoxane)、地拉齐普(dilazep)、多西他赛、多可沙诺(docosanol)、度骨化醇(doxercalciferol)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、多柔比星(doxorubicin)、溴麦角环肽(bromocriptine)、卡莫司汀、阿糖胞苷、氟尿嘧啶、HIT双氯芬酸、干扰素α、道诺霉素、多柔比星、维A酸(tretinoin)、依地福新(edelfosine)、依决洛单抗(edrecolomab)、依氟鸟氨酸(eflornithine)、乙嘧替氟(emitefur)、表柔比星(epirubicin)、贝他依伯汀(epoetin beta)、磷酸依托泊苷(etoposide phosphate)、依西美坦(exemestane)、依昔舒林(exisulind)、法屈唑(fadrozole)、非格司亭(filgrastim)、非那雄胺(finasteride)、磷酸氟达拉滨(fludarabine phosphate)、福美坦(formestane)、福莫司汀(fotemustine)、硝酸镓、吉西他宾(gemcitabine)、吉妥珠单抗奥唑米星(gemtuzumab zogamicin)、吉美拉西(gimeracil)/奥特拉西(oteracil)/替加氟(tegafur)组合、glycopine、戈舍瑞林、庚铂(heptaplatin)、人绒毛膜促性腺素、人胎儿甲胎蛋白、伊班膦酸(ibandronic acid)、伊达比星(idarubicin)、咪喹莫特(imiquimod)、干扰素α、天然干扰素α、干扰素α-2、干扰素α-2a、干扰素α-2b、干扰素α-Nl、干扰素α-n3、复合干扰素-1、天然干扰素α、干扰素β、干扰素β-la、干扰素β-lb、干扰素γ、天然干扰素γ-la、干扰素γ-lb)、白细胞介素-1β、碘苄胍(iobenguane)、伊立替康、伊索拉定(irsogladine)、兰瑞肽(lanreotide)、LC 9018(Yakult)、来氟米特(leflunomide)、来格司亭(lenograstim)、硫酸香菇多糖(lentinansulfate)、来曲唑、白血球α干扰素、亮丙瑞林、左旋咪唑(levamisole)+氟尿嘧啶、利阿唑(liarozole)、洛铂(lobaplatin)、氯尼达明(lonidamine)、洛伐他汀(lovastatin)、马索罗酚(masoprocol)、美拉胂醇(melarsoprol)、甲氧氯普胺(metoclopramide)、米非司酮(mifepristone)、米替福新(miltefosine)、米立司亭(mirimostim)、错配双股RNA、米托胍腙、二溴卫矛醇、米托蒽醌、莫拉司亭(molgramostim)、那法瑞林(nafarelin)、纳洛酮(naloxone)+喷他佐辛(pentazocine)、那托司亭(nartograstim)、奈达铂、尼鲁胺、那可丁(noscapine)、新颖促红细胞生成蛋白、NSC631570奥曲肽(octreotide)、奥普瑞白介素(oprelvekin)、奥沙特隆(osaterone)、奥沙利铂、太平洋紫杉醇、帕米膦酸(pamidronicacid)、培门冬酶(pegaspargase)、聚乙二醇干扰素α-2b、戊聚糖聚硫酸钠(pentosanpolysulfate sodium)、喷司他丁、毕西巴尼(picibanil)、比柔比星、兔抗胸腺细胞多株抗体、聚乙二醇干扰素α-2a、卟吩姆钠(porfimer sodium)、雷洛昔芬(raloxifene)、雷替曲赛(raltitrexed)、rasburiembodiment、羟乙膦酸铼Re 186、RII异维A酰胺(retinamide)、利妥昔单抗(rituximab)、罗莫肽(romurtide)、来昔决南钐(153Sm)(samarium lexidronam)、沙格司亭(sargramostim)、西佐喃(sizofiran)、索布佐生(sobuzoxane)、索纳明(sonermin)、氯化锶-89、舒拉明(suramin)、他索那明(tasonermin)、他扎罗汀(tazarotene)、替加氟、替莫泊芬(temoporfin)、替莫唑胺(temozolomide)、替尼泊苷(teniposide)、四氯十氧化物(tetrachlorodecaoxide)、沙立度胺、胸腺法新(thymalfasin)、促甲状腺素α(thyrotropin alfa)、拓扑替康(topotecan)、托瑞米芬(toremifene)、托西莫单抗-碘131(tositumomab-iodine 131)、曲妥珠单抗、曲奥舒凡(treosulfan)、维A酸、曲洛司坦(trilostane)、三甲曲沙(trimetrexate)、曲普瑞林(triptorelin)、天然肿瘤坏死因子α、乌苯美司、膀胱癌疫苗、Maruyama疫苗、黑色素瘤溶解产物疫苗、戊柔比星(valrubicin)、维替泊芬(verteporfin)、长春瑞宾、维鲁利秦(VIRULIZIN)、净司他丁斯酯(zinostatin stimalamer)或唑来膦酸；阿倍瑞克(abarelix)；AE 941(Aeterna)、胺莫司汀(ambamustine)、反义寡核苷酸、bcl-2(Genta)、APC8015(Dendreon)、西妥昔单抗(cetuximab)、地西他滨(decitabine)、去氨基格鲁米特(dexaminoglutethimide)、地吖醌(diaziquone)、EL 532(Elan)、EM 800(Endorecherche)、恩尿嘧啶(eniluracil)、依他硝唑(etanidazole)、芬维A胺(fenretinide)、非格司亭(filgrastim)SD01(Amgen)、氟维司群(fulvestrant)、加洛他滨(galocitabine)、胃泌素17免疫原、HLA-B7基因疗法(Vical)、颗粒球巨噬细胞群落刺激因子(granulocytemacrophage colony stimulating factor)、组织胺二盐酸盐、替伊莫单抗(ibritumomabtiuxetan)、伊洛马司他(ilomastat)、IM 862(Cytran)、白细胞介素-2、伊普昔芬(iproxifene)、LDI 200(Milkhaus)、勒瑞斯亭(leridistim)、林妥珠单抗(lintuzumab)、CA125MAb(Biomira)、癌症MAb(Japan Pharmaceutical Development)、HER-2及Fc MAb(Medarex)、独特型105AD7 MAb(CRC Technology)、独特型CEA MAb(Trilex)、LYM-1-碘131MAb(Techni clone)、多形性上皮黏蛋白-钇90MAb(Antisoma)、马立马斯他(marimastat)、美诺立尔(menogaril)、米妥莫单抗(mitumomab)、莫特沙芬钆(motexafingadolinium)、MX 6(Galderma)、奈拉滨(nelarabine)、诺拉曲塞(nolatrexed)、P 30蛋白、培维索孟(pegvisomant)、培美曲塞(pemetrexed)、泊非霉素(porfiromycin)、普啉司他(prinomastat)、RL 0903(Shire)、鲁比特康(rubitecan)、赛特铂(satraplatin)、苯乙酸钠、斯帕福斯酸(sparfosic acid)、SRL 172(SR Pharma)、SU 5416(SUGEN)、TA 077(Tanabe)、四硫代钼酸盐、塞班斯汀(thaliblastine)、血小板生成素、锡乙基初红紫素(tinethyletiopurpurin)、替拉扎明(tirapazamine)、癌症疫苗(Biomira)、黑色素瘤疫苗(NewYork University)、黑色素瘤疫苗(Sloan Kettering Institute)、黑色素瘤肿瘤溶解产物疫苗(New York Medical College)、病毒黑色素瘤细胞溶解产物疫苗(Royal NewcastleHospital)或戊司泊达(valspodar)。
在一些实施方案中，抗癌剂是HER2抑制剂。HER2抑制剂的非限制性实例包括单克隆抗体，如曲妥珠单抗
Figure BDA0003759053970001421
和帕妥珠单抗(pertuzumab)
Figure BDA0003759053970001422
小分子酪氨酸激酶抑制剂，如吉非替尼
Figure BDA0003759053970001423
埃罗替尼
Figure BDA0003759053970001424
皮利替尼(pilitinib)、CP-654577、CP-724714、卡奈替尼(canertinib)(CI 1033)、HKI-272、拉帕替尼(lapatinib)(GW-572016；
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)、PKI-166、AEE788、BMS-599626、HKI-357、BIBW 2992、ARRY-334543及JNJ-26483327。
本发明化合物可另外与VEGFR抑制剂一起使用。以下专利和专利申请中所描述的化合物可用于组合疗法中：US 6,258,812、US 2003/0105091、WO 01/37820、US 6,235,764、WO 01/32651、US 6,630,500、US 6,515,004、US 6,713,485、US 5,521,184、US 5,770,599、US 5,747,498、WO 02/68406、WO 02/66470、WO 02/55501、WO 04/05279、WO 04/07481、WO04/07458、WO 04/09784、WO 02/59110、WO 99/45009、WO 00/59509、WO 99/61422、US 5,990,141、WO 00/12089和WO 00/02871。
在一些实施方案中，组合包含本发明的组合物与至少一种抗血管生成剂的组合。抗血管生成剂包括但不限于体外合成制备的化学组合物、抗体、抗原结合区、放射性核素以及其组合和缀合物。抗血管生成剂可以是激动剂、拮抗剂、别构调节剂、毒素，或更通常可用于抑制或刺激其靶标(例如受体或酶活化或抑制)，并由此促进细胞死亡或使细胞生长停滞。
例示性抗血管生成剂包括ERBITUXTM(IMC-C225)；KDR(激酶结构域受体)抑制剂(例如特异性结合至激酶结构域受体的抗体和抗原结合区)；抗VEGF剂(例如特异性结合VEGF的抗体或抗原结合区，或可溶性VEGF受体或其配体结合区)，如AVASTINTM或VEGF-TRAPTM，以及抗VEGF受体剂(例如特异性结合至VEGF受体的抗体或抗原结合区)、EGFR抑制剂(例如特异性结合至EGFR的抗体或抗原结合区)，如Vectibix(帕尼单抗(panitumumab))、IRESSATM(吉非替尼)、TARCEVATM(埃罗替尼)；抗Angl剂和抗Ang2剂(例如特异性结合至Angl和Ang2或其受体，例如Tie2/Tek的抗体或抗原结合区)，以及抗Tie2激酶抑制剂(例如特异性结合至Tie2激酶的抗体或抗原结合区)。本发明的药物组合物还可包括一种或多种特异性结合并抑制生长因子活性的药剂(例如抗体、抗原结合区或可溶性受体)，如肝细胞生长因子(HGF，又称为离散因子(Scatter Factor))的拮抗剂，以及特异性结合其受体“c-met”的抗体或抗原结合区。
其它抗血管生成剂包括坎帕斯(Campath)、IL-8、B-FGF、Tek拮抗剂(US2003/0162712；US6,413,932)、抗TWEAK剂(例如特异性结合的抗体或抗原结合区，或可溶性TWEAK受体拮抗剂；参见US6,727,225)、拮抗整合素与其配体的结合的ADAM解整合素结构域(US2002/0042368)、特异性结合的抗eph受体或抗蝶素抗体或抗原结合区(美国专利第5,981,245号、第5,728,813号、第5,969,110号、第6,596,852号、第6,232,447号、第6,057,124号及其专利家族成员)，和抗PDGF-BB拮抗剂(例如特异性结合的抗体或抗原结合区)，以及特异性结合至PDGF-BB配体的抗体或抗原结合区，和PDGFR激酶抑制剂(例如特异性结合至PDGFR激酶的抗体或抗原结合区)。
额外抗血管生成剂/抗肿瘤剂包括：SD-7784(Pfizer,USA)；西仑吉肽(cilengitide)(Merck KGaA,Germany,EPO 770622)；哌加他尼八钠(pegaptaniboctasodium)(Gilead Sciences,USA)；阿法他汀(Alphastatin)(BioActa,UK)；M-PGA(Celgene,USA,US 5712291)；伊洛马司他(ilomastat)(Arriva,USA,US5892112)；恩沙尼(emaxanib)(Pfizer,USA,US 5792783)；瓦他拉尼(vatalanib)(Novartis,Switzerland)；2-甲氧基雌二醇(EntreMed,USA)；TLC ELL-12(Elan,Ireland)；乙酸阿奈可他(anecortaveacetate)(Alcon,USA)；α-D148 Mab(Amgen,USA)；CEP-7055(Cephalon,USA)；抗Vn Mab(Crucell,Netherlands)、DAC抗血管生成剂(ConjuChem,Canada)；安格西丁(Angiocidin)(InKine Pharmaceutical,USA)；KM-2550(Kyowa Hakko,Japan)；SU-0879(Pfizer,USA)；CGP-79787(Novartis,Switzerland,EP 970070)；ARGENT技术(Ariad,USA)；YIGSR-Stealth(Johnson&Johnson,USA)；纤维蛋白原-E片段(BioActa,UK)；血管形成抑制剂(Trigen,UK)；TBC-1635(Encysive Pharmaceuticals,USA)；SC-236(Pfizer,USA)；ABT-567(Abbott,USA)；米塔斯他汀(Metastatin)(EntreMed,USA)；血管生成抑制剂(Tripep,Sweden)；丝抑蛋白(maspin)(Sosei,Japan)；2-甲氧基雌二醇(Oncology Sciences Corporation,USA)；ER-68203-00(IV AX,USA)；Benefin(Lane Labs,USA)；Tz-93(Tsumura,Japan)；TAN-1120(Takeda,Japan)；FR-111142(Fujisawa,Japan,JP 02233610)；血小板因子4(RepliGen,USA,EP 407122)；血管内皮生长因子拮抗剂(Borean,Denmark)；贝伐珠单抗(pINN)(Genentech,USA)；血管生成抑制剂(SUGEN,USA)；XL 784(Exelixis,USA)；XL 647(Exelixis,USA)；第二代α5β3整合素MAb(Applied Molecular Evolution,USA及Medlmmune,USA)；基因疗法，视网膜病(Oxford BioMedica，UK)；盐酸恩扎妥林(enzastaurin hydrochloride)(USAN)(Lilly,USA)；CEP 7055(Cephalon,USA及Sanofi-Synthelabo,France)；BC 1(Genoa Institute of Cancer Research,Italy)；血管生成抑制剂(Alchemia,Australia)；VEGF拮抗剂(Regeneron,USA)；rBPI 21和BPI源性抗血管生成剂(XOMA,USA)；PI 88(Progen,Australia)；西仑吉肽(pINN)(Merck KGaA,German；MunichTechnical University,Germany,Scripps Clinic and Research Foundation,USA)；西妥昔单抗(INN)(Aventis,France)；AVE 8062(Ajinomoto,Japan)；AS 1404(Cancer ResearchLaboratory,New Zealand)；SG 292,(Telios,USA)；内皮抑素(Endostatin)(BostonChildrens Hospital,USA)；ATN 161(Attenuon,USA)；ANGIOSTATIN(Boston ChildrensHospital,USA)；2-甲氧基雌二醇(Boston Childrens Hospital,USA)；ZD 6474(AstraZeneca,UK)；ZD 6126(Angiogene Pharmaceuticals,UK)；PPI 2458(Praecis,USA)；AZD 9935(AstraZeneca,UK)；AZD 2171,(AstraZeneca,UK)；瓦他拉尼(pINN)(Novartis,Switzerland及Schering AG,Germany)；组织因子路径抑制剂(EntreMed,USA)；哌加他尼(Pinn)(Gilead Sciences,USA)；束骨姜黄醇(xanthorrhizol)(Yonsei University,SouthKorea)；基于基因的VEGF-2疫苗(Scripps Clinic and Research Foundation,USA)；SPV5.2,(Supratek,Canada)；SDX 103(University of California,San Diego,USA)；PX478(ProlX,USA)；METASTATIN(EntreMed,USA)；肌钙蛋白I(Harvard University,USA)；SU6668(SUGEN,USA)；OXI 4503(OXiGENE,USA)；o-胍(Dimensional Pharmaceuticals,USA)；莫妥拉明C(motuporamine C)(British Columbia University,Canada)；CDP 791(Celltech Group,UK)；阿替莫德(atiprimod)(pINN)(GlaxoSmithKline,UK)；E 7820(Eisai,Japan)；CYC 381(Harvard University,USA)；AE 941(Aeterna,Canada)；血管生成疫苗(EntreMed,USA)；尿激酶纤维蛋白溶酶原活化物抑制剂(Dendreon,USA)；奥谷法奈(oglufanide)(pINN)(Melmotte,USA)；HIF-lα抑制剂(Xenova,UK)；CEP 5214(Cephalon,USA)；BAY RES 2622(Bayer,Germany)；安古西丁(InKine,USA)；A6(Angstrom,USA)；KR31372(Korea Research Institute of Chemical Technology,South Korea)；GW 2286(GlaxoSmithKline,UK)；EHT 0101(ExonHit,France)；CP 868596(Pfizer,USA)；CP 564959(OSI,USA)；CP 547632(Pfizer,USA)；786034(GlaxoSmithKline,UK)；KRN 633(KirinBrewery,Japan)；眼内药物递送系统，2-甲氧基雌二醇(EntreMed,USA)；安格尼斯(anginex)(Maastricht University,Netherlands，及Minnesota University,USA)；ABT510(Abbott,USA)；AAL 993(Novartis,Switzerland)；VEGI(ProteomTech,USA)；肿瘤坏死因子-α抑制剂(National Institute on Aging,USA)；SU 11248(Pfizer,USA及SUGENUSA)；ABT 518(Abbott,USA)；YH16(Yantai Rongchang,China)；S-3APG(Boston ChildrensHospital,USA和EntreMed,USA)；MAb,KDR(ImClone Systems,USA)；MAb,α5βI(ProteinDesign,USA)；KDR激酶抑制剂(Celltech Group,UK和Johnson&Johnson,USA)；GFB 116(South Florida University,USA和Yale University,USA)；CS 706(Sankyo,Japan)；考布他汀(combretastatin)A4前药(Arizona State University,USA)；软骨素酶AC(IBEX,Canada)；BAY RES 2690(Bayer,Germany)；AGM 1470(Harvard University,USA,Takeda,Japan，及TAP,USA)；AG 13925(Agouron,USA)；四硫钼酸盐(University of Michigan,USA)；GCS 100(Wayne State University,USA)；CV 247(Ivy Medical,UK)；CKD 732(ChongKun Dang,South Korea)；MAb，血管内皮生长因子(Xenova,UK)；伊索拉定(irsogladine)(INN)(Nippon Shinyaku,Japan)；RG 13577(Aventis,France)；WX 360(Wilex,Germany)；角鲨胺(pINN)(Genaera,USA)；RPI 4610(Sirna,USA)；癌症疗法(Marinova,Australia)；肝素酶抑制剂(InSight,Israel)；KL 3106(Kolon,South Korea)；厚朴酚(Honokiol)(EmoryUniversity,USA)；ZK CDK(Schering AG,Germany)；ZK Angio(Schering AG,Germany)；ZK229561(Novartis,Switzerland，和Schering AG,Germany)；XMP 300(XOMA,USA)；VGA 1102(Taisho,Japan)；VEGF受体调节剂(Pharmacopeia,USA)；VE-钙粘蛋白-2拮抗剂(ImCloneSystems,USA)；血管抑制因子(Vasostatin)(National Institutes of Health,USA)；Flk-1疫苗(ImClone Systems,USA)；TZ 93(Tsumura,Japan)；TumStatin(Beth IsraelHospital,USA)；截短的可溶性FLT 1(血管内皮生长因子受体1)(Merck&Co,USA)；Tie-2配体(Regeneron,USA)；以及凝血栓蛋白1抑制剂(Allegheny Health,Education andResearch Foundation,USA)。
自噬抑制剂包括但不限于氯喹、3-甲基腺嘌呤、羟基氯喹(PlaquenilTM)、巴佛洛霉素AI(bafilomycin AI)、5-氨基-4-咪唑甲酰胺核糖苷(AICAR)、软海绵酸、抑制第2A型或第1型蛋白质磷酸酶的自噬抑制性藻毒素、cAMP类似物和增加cAMP含量的药物，如腺苷、LY204002、N6-巯基嘌呤核糖苷及长春新碱。此外，也可使用抑制蛋白质，包括但不限于ATG5(参与自噬)的表达的反义RNA或siRNA。
可用于治疗癌症并且可与一种或多种本发明化合物组合使用的额外药物活性化合物/药物活性剂包括：阿法依伯汀(epoetin alfa)、阿法达伯汀(darbepoetin alfa)、帕尼单抗、培非格司亭(pegfilgrastim)、帕利夫明(palifermin)、非格司亭(filgrastim)、地舒单抗(denosumab)、安塞司亭(ancestim)、AMG 102、AMG 386、AMG 479、AMG 655、AMG745、AMG 951和AMG 706，或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中，本文所提供的组合物与化学治疗剂联合施用。适合化学治疗剂可包括天然产品，如长春花生物碱类(例如长春花碱、长春新碱及长春瑞宾)、太平洋紫杉醇、表鬼臼毒素(例如依托泊苷和替尼泊苷)、抗生素(例如放线菌素D(dactinomycin/actinomycin D))、道诺霉素、多柔比星及伊达比星)、蒽环霉素(anthracycline)、米托蒽醌、博来霉素(bleomycins)、光神霉素(plicamycin)(米拉霉素(mithramycin))、丝裂霉素、酶(例如L-天冬酰胺酶，其全身性代谢L-天冬酰胺并除去自身不能合成天冬酰胺的细胞)、抗血小板剂、抗增生/抗有丝分裂烷化剂如氮芥(例如甲氮芥、环磷酰胺以及类似物美法仑(melphalan)和苯丁酸氮芥)、乙烯亚胺和甲基蜜胺(例如六甲基蜜胺和噻替哌)、CDK抑制剂(例如瑞博西利(ribociclib)、阿贝西利(abemaciclib)、帕博西利(palbociclib)、塞利西利(seliciclib)、UCN-01、P1446A-05、PD-0332991、迪纳西利(dinaciclib)、P27-00、AT-7519、RGB286638及SCH727965)、烷基磺酸酯(例如白消安)、亚硝基脲(例如卡莫司汀(BCNU)及类似物，以及链佐星(streptozocin))、四氮烯-氮烯唑胺(trazenes-dacarbazinine)(DTIC)、抗增生/抗有丝分裂抗代谢物(如叶酸类似物，例如甲氨蝶呤)、嘧啶类似物(例如氟尿嘧啶、氮尿苷和阿糖胞苷)、嘌呤类似物和相关抑制剂(例如巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁及2-氯去氧腺苷)、芳香酶抑制剂(例如阿那曲唑(anastrozole)、依西美坦(exemestane)及来曲唑(letrozole))以及铂配位络合物(例如顺铂及卡铂)、丙卡巴肼(procarbazine)、羟基脲、米托坦、胺鲁米特、组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂(例如曲古抑菌素(trichostatin)、丁酸钠、艾匹丹(apicidan)、辛二酰苯胺异羟肟酸(suberoyl anilidehydroamic acid)、伏立诺他(vorinostat)、LBH 589、罗米地辛(romidepsin)、ACY-1215及帕比司他(panobinostat))、mTOR抑制剂(例如西罗莫司(temsirolimus)、依维莫司(everolimus)、地磷莫司(ridaforolimus)及西罗莫司(sirolimus)；也参见下文)、KSP(Eg5)抑制剂(例如Array 520)、DNA结合剂(例如Zalypsis)、PI3Kδ抑制剂(例如GS-1101和TGR-1202)、PI3Kδ和γ抑制剂(例如CAL-130)、多激酶抑制剂(例如TG02和索拉非尼(sorafenib))、激素(例如雌激素和激素激动剂，如促黄体激素释放激素(LHRH)激动剂(例如戈舍瑞林、亮丙瑞林(leuprolide)及曲普瑞林(triptorelin))、BAFF中和抗体(例如LY2127399)、IKK抑制剂、p38MAPK抑制剂、抗IL-6(例如CNT0328)、端粒酶抑制剂(例如GRN163L)、极光激酶抑制剂(例如MLN8237)、细胞表面单克隆抗体(例如抗CD38(HUMAX-CD38))、抗CSl(例如埃罗妥珠单抗(elotuzumab))、HSP90抑制剂(例如17AAG和KOS 953)、P13K/Akt抑制剂(例如哌立福新(perifosine))、Akt抑制剂(例如GSK-2141795)、PKC抑制剂(例如恩扎妥林(enzastaurin))、FTI(例如ZarnestraTM)、抗CD138(例如BT062)、Torcl/2特异性激酶抑制剂(例如INK128)、激酶抑制剂(例如GS-1101)、ER/UPR靶向剂(例如MKC-3946)、cFMS抑制剂(例如ARRY-382)、JAK1/2抑制剂(例如CYT387)、PARP抑制剂(例如奥拉帕尼和维利帕尼(veliparib)(ABT-888))及BCL-2拮抗剂。其它化学治疗剂可包括甲氮芥、喜树碱、异环磷酰胺、他莫昔芬、雷洛昔芬、吉西他宾、诺维本、索拉非尼(sorafenib)或前述的任何类似物或衍生物变体。
可与本发明化合物组合的其它mTOR抑制剂包括但不限于ATP竞争性mTORC1/mTORC2抑制剂，例如PI-103、PP242、PP30；Torin 1；FKBP12增强剂；4H-1-苯并吡喃-4-酮衍生物；以及雷帕霉素(rapamycin)(又称为西罗莫司)和其衍生物，包括：替西罗莫司(temsirolimus)
Figure BDA0003759053970001491
依维莫司(
Figure BDA0003759053970001492
WO94/09010)；地磷莫司(又称为地伏莫司(deforolimus)或AP23573)；雷帕霉素类似物(rapalogs)，例如WO98/02441和WO01/14387中所公开的雷帕霉素类似物，例如AP23464和AP23841；40-(2-羟乙基)雷帕霉素；40-[3-羟基(羟甲基)甲基丙酸酯]-雷帕霉素(又称为CC1779)；40-表-(四唑基)-雷帕霉素(又称为ABT578)；32-去氧雷帕霉素；16-戊炔氧基-32(S)-二氢雷帕霉素；WO05/005434中所公开的衍生物；美国专利第5,258,389号、第5,118,677号、第5,118,678号、第5,100,883号、第5,151,413号、第5,120,842号和第5,256,790号中，以及WO94/090101、WO92/05179、WO93/111130、WO94/02136、WO94/02485、WO95/14023、WO94/02136、WO95/16691、WO96/41807、WO96/41807和WO2018204416中所公开的衍生物；以及含磷的雷帕霉素衍生物(例如WO05/016252)。在一些实施方案中，mTOR抑制剂是双重空间抑制剂(bisteric inhibitor)(参见例如WO2018204416、WO2019212990和WO2019212991)，如RMC-5552。
本发明化合物也可与放射疗法、激素疗法、手术和免疫疗法组合使用，这些疗法是本领域技术人员众所周知的。
在某些实施方案中，本文所提供的药物组合物与类固醇联合施用。适合类固醇可包括但不限于21-乙酰氧基孕烯醇酮(acetoxypregnenolone)、阿氯米松(alclometasone)、阿尔孕酮(algestone)、安西奈德(amcinonide)、倍氯米松(beclomethasone)、倍他米松(betamethasone)、布地奈德(budesonide)、氯泼尼松(chloroprednisone)、氯倍他索(clobetasol)、氯可托龙(clocortolone)、氯泼尼醇(cloprednol)、皮质酮(corticosterone)、可的松(cortisone)、可的伐唑(cortivazol)、地夫可特(deflazacort)、地奈德(desonide)、去羟米松(desoximetasone)、地塞米松(dexamethasone)、二氟拉松(diflorasone)、二氟可龙(diflucortolone)、二氟孕甾丁酯(difuprednate)、甘草次酸(enoxolone)、氟扎可特(fluazacort)、氟氯奈德(fiucloronide)、氟米松(flumethasone)、氟尼缩松(flunisolide)、氟西奈德(fluocinolone acetonide)、醋酸氟轻松(fluocinonide)、氟可丁丁酯(fluocortinbutyl)、氟可龙(fluocortolone)、氟米龙(fluorometholone)、醋酸氟培龙(fluperoloneacetate)、醋酸氟泼尼定(fluprednidene acetate)、氟泼尼龙(fluprednisolone)、氟氢缩松(flurandrenolide)、丙酸氟替卡松(fluticasone propionate)、福莫可他(formocortal)、哈西奈德(halcinonide)、丙酸卤倍他索(halobetasol propionate)、卤米松(halometasone)、氢化可的松(hydrocortisone)、依碳酸氯替泼诺(loteprednoletabonate)、马泼尼酮(mazipredone)、甲羟松(medrysone)、甲泼尼松(meprednisone)、甲泼尼龙(methylprednisolone)、糠酸莫米他松(mometasone furoate)、帕拉米松(paramethasone)、泼尼卡酯(prednicarbate)、泼尼松龙(prednisolone)、25-二乙基氨基乙酸泼尼松龙、泼尼松龙磷酸钠、泼尼松(prednisone)、戊酸泼尼松龙(prednival)、泼尼立定(prednylidene)、利美索龙(rimexolone)、替可的松(tixocortol)、曲安西龙(triamcinolone)、曲安奈德(triamcinolone acetonide)、苯曲安奈德(triamcinolonebenetonide)、己曲安奈德(triamcinolone hexacetonide)，以及其盐或衍生物。在特定实施方案中，本发明化合物也可与治疗恶心的额外药物活性剂组合使用。可用于治疗恶心的药剂的实例包括：屈大麻酚(dronabinol)、格拉司琼(granisetron)、甲氧氯普胺(metoclopramide)、昂丹司琼(ondansetron)及丙氯拉嗪(prochlorperazine)，或其药学上可接受的盐。
本发明化合物也可与破坏或抑制RAS-RAF-ERK或PI3K-AKT-TOR信号传导路径的额外药物活性化合物组合使用。在一些实施方案中，所述额外药物活性化合物是PD-1或PD-L1拮抗剂。本公开的化合物或药物组合物也可与一定量的一种或多种选自以下的物质组合使用：EGFR抑制剂、MEK抑制剂、PI3K抑制剂、AKT抑制剂、TOR抑制剂、Mcl-1抑制剂、BCL-2抑制剂、SHP2抑制剂、蛋白酶体抑制剂和免疫疗法，包括单克隆抗体、免疫调节性酰亚胺(IMiD)、抗PD-1剂、抗PDL-1剂、抗CTLA4剂、抗LAGl剂和抗OX40剂、GITR激动剂、CAR-T细胞和BiTE。
EGFR抑制剂包括但不限于小分子拮抗剂、抗体抑制剂或特定反义核苷酸或siRNA。EGFR的有用抗体抑制剂包括西妥昔单抗
Figure BDA0003759053970001511
帕尼单抗
Figure BDA0003759053970001512
扎鲁目单抗(zalutumumab)、尼妥珠单抗(nimotuzumab)及马妥珠单抗(matuzumab)。EGFR的小分子拮抗剂包括吉非替尼、埃洛替尼
Figure BDA0003759053970001513
奥西替尼
Figure BDA0003759053970001514
和拉帕替尼
Figure BDA0003759053970001515
参见例如Yan L等人,Pharmacogenetics and Pharmacogenomics In OncologyTherapeutic Antibody Development,BioTechniques 2005；39(4):565-8，以及Paez J G等人,EGFR Mutations In Lung Cancer Correlation With Clinical Response ToGefitinib Therapy,Science 2004；304(5676):1497-500。
小分子EGFR抑制剂的非限制性实例包括以下专利公开中所描述的任何EGFR抑制剂以及所述EGFR抑制剂的所有药学上可接受的盐和溶剂化物：1992年12月30日公开的欧洲专利申请EP 520722；1993年10月20日公开的欧洲专利申请EP 566226；1996年10月31日公开的PCT国际公开WO 96/33980；1998年5月5日颁布的美国专利第5,747,498号；1996年10月3日公开的PCT国际公开WO 96/30347；1997年8月6日公开的欧洲专利申请EP 787772；1997年8月21日公开的PCT国际公开WO 97/30034；1997年8月21日公开的PCT国际公开WO 97/30044；1997年10月23日公开的PCT国际公开WO 97/38994；1997年12月31日公开的PCT国际公开WO 97/49688；1998年4月22日公开的欧洲专利申请EP 837063；1998年1月22日公开的PCT国际公开WO 98/02434；1997年10月23日公开的PCT国际公开WO 97/38983；1995年7月27日公开的PCT国际公开WO 95/19774；1995年7月27日公开的PCT国际公开WO 95/19970；1997年4月17日公开的PCT国际公开WO 97/13771；1998年1月22日公开的PCT国际公开WO 98/02437；1998年1月22日公开的PCT国际公开WO 98/02438；1997年9月12日公开的PCT国际公开WO 97/32881；1998年1月29日公开的德国申请DE 19629652；1998年8月6日公开的PCT国际公开WO 98/33798；1997年9月12日公开的PCT国际公开WO 97/32880；1997年9月12日公开的PCT国际公开WO 97/32880；1995年11月15日公开的欧洲专利申请EP 682027；197年1月23日公开的PCT国际公开WO 97/02266；1997年7月31日公开的PCT国际公开WO 97/27199；1998年2月26日公开的PCT国际公开WO 98/07726；1997年9月25日公开的PCT国际公开WO 97/34895；1996年10月10日公开的PCT国际公开WO 96/31510；1998年4月9日公开的PCT国际公开WO 98/14449；1998年4月9日公开的PCT国际公开WO 98/14450；1998年4月9日公开的PCT国际公开WO 98/14451；1995年4月13日公开的PCT国际公开WO 95/09847；1997年5月29日公开的PCT国际公开WO 97/19065；1998年4月30日公开的PCT国际公开WO 98/17662；1998年8月4日颁布的美国专利第5,789,427号；1997年7月22日颁布的美国专利第5,650,415号；1997年8月12日颁布的美国专利第5,656,643号；1999年7月15日公开的PCT国际公开WO 99/35146；1999年7月15日公开的PCT国际公开WO 99/35132；1999年2月18日公开的PCT国际公开WO 99/07701；以及1992年11月26日公开的PCT国际公开WO 92/20642。小分子EGFR抑制剂的其它非限制性实例包括Traxler,P.,1998,Exp.Opin.Ther.Patents 8(12):1599-1625中所描述的任何EGFR抑制剂。在一些实施方案中，EGFR抑制剂是ERBB抑制剂。在人体中，ERBB家族含有HER1(EGFR，ERBB1)、HER2(NEU，ERBB2)、HER3(ERBB3)和HER(ERBB4)。
抗体类EGFR抑制剂包括可部分或完全阻断天然配体对EGFR的活化的任何抗EGFR抗体或抗体片段。抗体类EGFR抑制剂的非限制性实例包括以下中所描述的EGFR抑制剂：Modjtahedi,H.等人,1993,Br.J.Cancer 67:247-253；Teramoto,T.等人,1996,Cancer 77:639-645；Goldstein等人,1995,Clin.Cancer Res.1:1311-1318；Huang,S.M.等人,1999,Cancer Res.15:59(8):1935-40；以及Yang,X.等人,1999,Cancer Res.59:1236-1243。因此，EGFR抑制剂可以单克隆抗体Mab E7.6.3(Yang,1999，见上文)或Mab C225(ATCC寄存编号HB-8508)或者抗体或具有其结合特异性的抗体片段。
MEK抑制剂包括但不限于考比替尼(cobimetinib)、曲美替尼(trametinib)和比美替尼(binimetinib)。
PI3K抑制剂包括但不限于沃特曼宁(wortmannin)；WO 06/044453中所述的17-羟基沃特曼宁类似物；4-[2-(IH-吲唑-4-基)-6-[[4-(甲基磺酰基)哌嗪-I-基]甲基]噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基]吗啉(又称为GDC 0941，并且描述于PCT公开第WO 09/036,082号和第WO09/055,730号中)；2-甲基-2-[4-[3-甲基-2-氧代-8-(喹啉-3-基)-2,3-二氢咪唑并[4,5-c]喹啉-I-基]苯基]丙腈(又称为BEZ 235或NVP-BEZ 235，并且描述于PCT公开第WO 06/122806号中)；(S)-l-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-甲基-4-吗啉代噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-I-基)-2-羟基丙-1-酮(描述于PCT公开第WO 2008/070740号中)；LY294002(2-(4-吗啉基)-8-苯基-4H-l-苯并吡喃-4-酮，购自Axon Medchem)；PI 103盐酸盐(3-[4-(4-吗啉基吡啶并[3',2':4,5]呋喃并[3,2-d]嘧啶-2-基]苯酚盐酸盐，购自AxonMedchem)；PIK 75(N'-[(lE)-(6-溴代吲唑并[l,2-a]吡啶-3-基)亚甲基]-N,2-二甲基-5-硝基苯磺酰肼盐酸盐，购自Axon Medchem)；PIK 90(N-(7,8-二甲氧基-2,3-二氢-咪唑并[l,2-c]喹唑啉-5-基)-烟酰胺，购自Axon Medchem)；GDC-0941双甲磺酸盐(2-(lH-吲唑-4-基)-6-(4-甲烷磺酰基-哌嗪-l-基甲基)-4-吗啉-4-基-噻吩并[3,2-d]嘧啶双甲磺酸盐，购自Axon Medchem)；AS-252424(5-[l-[5-(4-氟-2-羟基-苯基)-呋喃-2-基]-亚甲-(Z)-基]-噻唑烷-2,4-二酮，购自Axon Medchem)；和TGX-221(7-甲基-2-(4-吗啉基)-9-[I-(苯基氨基)乙基]-4H-吡啶并[I,2-a]嘧啶-4-酮，购自Axon Medchem)；XL-765；以及XL-147。其它PI3K抑制剂包括去甲氧基绿胶霉素(demethoxyviridin)、哌立福辛(perifosine)、CAL101、PX-866、BEZ235、SF1126、INK1117、IPI-145、BKM120、XL147、XL765、Palomid 529、GSK1059615、ZSTK474、PWT33597、IC87114、TGI 00-115、CAL263、PI-103、GNE-477、CUDC-907及AEZS-136。
AKT抑制剂包括但不限于Akt-1-1(抑制Aktl)(Barnett等人(2005)Biochem.J.,385(Pt.2),399-408)；Akt-1-1,2(抑制Akl和2)(Barnett等人,(2005)Biochem.J.385(Pt.2),399-408)；API-59CJ-Ome(例如Jin等人(2004)Br.J.Cancer 91,1808-12)；1-H-咪唑并[4,5-c]吡啶基化合物(例如WO05011700)；吲哚-3-甲醇及其衍生物(例如美国专利第6,656,963号；Sarkar和Li(2004)J Nutr.134(12增刊),3493S-3498S)；哌立福辛(例如干扰Akt膜定位；Dasmahapatra等人(2004)Clin.Cancer Res.10(15),5242-52,2004)；磷脂酰肌醇醚脂质类似物(例如Gills和Dennis(2004)Expert.Opin.Investig.Drugs 13,787-97)；以及曲西立滨(triciribine)(TCN或API-2或NCI标识符：NSC 154020；Yang等人(2004)Cancer Res.64,4394-9)。
TOR抑制剂包括但不限于AP-23573、CCI-779、依维莫司、RAD-001、雷帕霉素、替西罗莫司、ATP竞争性TORC1/TORC2抑制剂，包括PI-103、PP242、PP30和Torin 1。其它TOR抑制剂是FKBP12增强剂；雷帕霉素和其衍生物，包括CCI-779(替西罗莫司),RAD001(依维莫司；WO 9409010)和AP23573；雷帕霉素类似物，例如WO 98/02441和WO 01/14387中所公开者，例如AP23573、AP23464或AP23841；40-(2-羟乙基)雷帕霉素；40-[3-羟基(羟甲基)甲基丙酸酯]-雷帕霉素(又称为CC1779)；40-表-(四唑基)-雷帕霉素(又称为ABT578)；32-去氧雷帕霉素；16-戊炔氧基-32(S)-二氢雷帕霉素，以及WO 05005434中所公开的其它衍生物；美国专利第5,258,389号、WO 94/090101、WO 92/05179、美国专利第5,118,677号、美国专利第5,118,678号、美国专利第5,100,883号、美国专利第5,151,413号、美国专利第5,120,842号、WO 93/111130、WO 94/02136、WO 94/02485、WO 95/14023、WO 94/02136、WO 95/16691、WO96/41807、WO 96/41807和美国专利第5,256,790号中所公开的衍生物；含磷的雷帕霉素衍生物(例如WO 05016252)；4H-l-苯并吡喃-4-酮衍生物(例如WO 2005/056014)。
可组合使用的任选的BRAF抑制剂包括例如维罗非尼、达拉非尼(dabrafenib)及康奈非尼(encorafenib)。
MCl-1抑制剂包括但不限于AMG-176、MIK665和S63845。骨髓细胞白血病-1(MCL-1)蛋白质是B细胞淋巴瘤-2(BCL-2)蛋白质家族的关键抗细胞凋亡成员中的一种。MCL-1的过度表达与肿瘤进展以及对传统化学疗法以及包括如ABT-263之类BCL-2抑制剂在内的靶向治疗剂的抗性密切相关。
蛋白酶体抑制剂包括但不限于
Figure BDA0003759053970001551
(卡非佐米(carfilzomib))、
Figure BDA0003759053970001552
(硼替佐米(bortezomib))和奥普佐米(oprozomib)。
免疫疗法包括但不限于抗PD-1剂、抗PDL-1剂、抗CTLA-4剂、抗LAGl剂及抗OX40剂。
单克隆抗体包括但不限于
Figure BDA0003759053970001553
(达雷木单抗(daratumumab))、
Figure BDA0003759053970001554
(曲妥珠单抗(trastuzumab))、
Figure BDA0003759053970001555
(贝伐珠单抗(bevacizumab))、
Figure BDA0003759053970001557
(利妥昔单抗(rituximab))、
Figure BDA0003759053970001556
(兰尼单抗(ranibizumab))和
Figure BDA0003759053970001558
(阿柏西普(aflibercept))。
免疫调节剂(IMiD)是一类含有酰亚氨基的免疫调节药物(调节免疫反应的药物)。IMiD类药物包括沙立度胺(thalidomide)和其类似物(来那度胺(lenalidomide)、泊马度胺(pomalidomide)及阿普司特(apremilast))。
例示性抗PD-1抗体及其使用方法描述于Goldberg等人,Blood 110(1):186-192(2007)；Thompson等人,Clin.Cancer Res.13(6):1757-1761(2007)；及Korman等人,国际申请号PCT/JP2006/309606(公开第WO 2006/121168 Al号)中，各案以引用的方式明确地并入本文中，包括：YervoyTM(伊匹单抗(ipilimumab))或曲美目单抗(Tremelimumab)(针对CTLA-4)、加利昔单抗(galiximab)(针对B7.1)、BMS-936558(针对PD-1)、MK-3475(针对PD-1)(派姆单抗(pembrolizumab))、AMP224(针对B7DC)、BMS-936559(针对B7-H1)、MPDL3280A(针对B7-H1)、MEDI-570(针对ICOS)、AMG557(针对B7H2)、MGA271(针对B7H3)、IMP321(针对LAG-3)、BMS-663513(针对CD137)、PF-05082566(针对CD137)、CDX-1127(针对CD27)、抗OX40(Providence Health Services)、huMAbOX40L(针对OX40L)、阿特昔普(Atacicept)(针对TACI)、CP-870893(针对CD40)、鲁卡木单抗(Lucatumumab)(针对CD40)、达西珠单抗(Dacetuzumab)(针对CD40)、莫罗单抗(Muromonab)-CD3(针对CD3)、易普木单抗(Ipilumumab)(针对CTLA-4)。免疫疗法还包括基因工程改造的T细胞(例如CAR-T细胞)和双特异性抗体(例如BiTE)。
GITR激动剂包括但不限于GITR融合蛋白和抗GITR抗体(例如二价抗GITR抗体)，如美国专利第6111090号、欧洲专利第090505B1号、美国专利第8,586,023号、PCT公开第WO2010/003118号和第2011/090754号中所描述的GITR融合蛋白，或例如美国专利第7,025,962号、欧洲专利第1947183B1号、美国专利第7,812,135号、美国专利第8,388,967号、美国专利第8,591,886号、欧洲专利第EP 1866339号、PCT公开第WO 2011/028683号、PCT公开第WO 2013/039954号、PCT公开第WO2005/007190号、PCT公开第WO 2007/133822号、PCT公开第WO2005/055808号、PCT公开第WO 99/40196号、PCT公开第WO 2001/03720号、PCT公开第WO99/20758号、PCT公开第WO2006/083289号、PCT公开第WO 2005/115451号、美国专利第7,618,632号和PCT公开第WO 2011/051726号中所描述的抗GITR抗体。
在一些实施方案中，额外治疗剂是SHP2抑制剂。SHP2是由PTPN11基因编码的非受体蛋白质酪氨酸磷酸酶，它促成多种细胞功能，包括增殖、分化、细胞周期维持和迁移。SHP2具有两个N末端Src同源2结构域(N-SH2及C-SH2)、一个催化结构域(PTP)及一个C末端尾。所述两个SH2结构域控制SHP2的亚细胞定位和功能调控。所述分子以通过涉及来自N-SH2和PTP结构域的残基的结合网络稳定的无活性、自我抑制性构型存在。利用例如经受体酪氨酸激酶(RTK)起作用的细胞因子或生长因子刺激会引起催化位点暴露，引起SHP2的酶活化。
SHP2参与通过RAS-促分裂原活化的蛋白质激酶(MAPK)，即JAK-STAT或磷酸肌醇3-激酶-AKT路径进行的信号传导。已在以下中鉴别出PTPN11基因中且随后SHP2中的突变：若干人类发育病，如努南综合征(Noonan Syndrome)和莱帕德综合征(Leopard Syndrome)，以及人类癌症，如青少年型骨髓单核细胞白血病、神经母细胞瘤、黑色素瘤、急性骨髓性白血病以及乳癌、肺癌和结肠癌。所述突变中有一些使SHP2的自抑制性构型不稳定，并且促进SHP2的自活化或增强的生长因子驱动型活化。因此，SHP2表示开发用于治疗包括癌症在内的各种疾病的新颖疗法的特别值得关注的靶标。已经显示，SHP2抑制剂(例如RMC-4550或SHP099)与RAS路径抑制剂(例如MEK抑制剂)的组合可在体外抑制多种癌细胞系(例如胰腺癌、肺癌、卵巢癌及乳癌)的增殖。因此，涉及SHP2抑制剂和RAS路径抑制剂的组合疗法可以是用于预防多种恶性病中的肿瘤耐药性的一般策略。
本领域中已知的此类SHP2抑制剂的非限制性实例包括：Chen等人,MolPharmacol.2006,70,562；Sarver等人,J.Med.Chem.2017,62,1793；Xie等人,J.Med.Chem.2017,60,113734；及Igbe等人,Oncotarget,2017,8,113734；及PCT申请：WO2015107493；WO2015107494；WO201507495；WO2016203404；WO2016203405；WO2016203406；WO2011022440；WO2017156397；WO2017079723；WO2017211303；WO2012041524；WO2017211303；WO2019051084；WO2017211303；US20160030594；US20110281942；WO2010011666；WO2014113584；WO2014176488；WO2017100279；WO2019051469；US8637684；WO2007117699；WO2015003094；WO2005094314；WO2008124815；WO2009049098；WO2009135000；WO2016191328；WO2016196591；WO2017078499；WO2017210134；WO2018013597；WO2018129402；WO2018130928；WO20181309928；WO2018136264；WO2018136265；WO2018160731；WO2018172984；及WO2010121212，各自以引用的方式并入本文中。
在一些实施方案中，SHP2抑制剂结合于活性位点。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是混合型不可逆抑制剂。在一些实施方案中，SHP2抑制剂结合别构位点，例如非共价别构抑制剂。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是共价SHP2抑制剂，如靶向位于磷酸酶活性位点外的半胱氨酸残基(C333)的抑制剂。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是可逆抑制剂。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是不可逆抑制剂。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是SHP099。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是TNO155。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是RMC-4550。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是RMC-4630。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是JAB-3068。在一些实施方案中，SHP2抑制剂是RLY-1971。
在一些实施方案中，额外治疗剂选自由以下组成的组：HER2抑制剂、SHP2抑制剂、CDK4/6抑制剂、mTOR抑制剂、SOS1抑制剂或PD-L1抑制剂。参见例如Hallin等人,CancerDiscovery,DOI:10.1158/2159-8290(2019年10月28日)，以及Canon等人,Nature,575:217(2019)。在一些实施方案中，额外治疗剂选自由以下组成的组：EGFR抑制剂、第二Ras抑制剂、SHP2抑制剂、SOS1抑制剂、Raf抑制剂、MEK抑制剂、ERK抑制剂、PI3K抑制剂、PTEN抑制剂、AKT抑制剂、mTORC1抑制剂、BRAF抑制剂、PD-L1抑制剂、PD-1抑制剂和CDK4/6抑制剂、HER2抑制剂或其组合。在一些实施方案中，额外治疗剂是第二Ras抑制剂和PD-L1抑制剂(即，三联疗法)。
取决于所治疗的疾患，本文所描述的化合物可与本文所公开的药剂或其它适合药剂组合使用。因此，在一些实施方案中，本公开的一种或多种化合物将与上文所描述的其它药剂共同施用。当用于组合疗法中时，将本文所描述的化合物与第二药剂同时或分开施用。此组合施用可包括以同一剂型同时施用两种药剂、以独立剂型同时施用及分开施用。也就是说，本文所描述的化合物与上文所描述的任何药剂可一起配制成相同剂型并同时施用。或者，本公开的化合物与上文所描述的任何药剂可同时施用，其中两种药剂是存在于独立配制物中。在另一个替代方案中，本公开的化合物可先施用，随后立即施用上文所描述的任何药剂，或反之亦然。在分开施用方案的一些实施方案中，本公开的化合物与上文所描述的任何药剂是间隔数分钟或间隔数小时或间隔数天施用。
由于本发明的一个方面涵盖用可分开施用的药物活性化合物的组合治疗疾病/疾患，故本发明另外涉及以试剂盒形式组合独立药物组合物。所述试剂盒包含两种独立药物组合物：本发明化合物和第二药物化合物。所述试剂盒包含用于容纳所述独立组合物的容器，如分装瓶或分装箔包装。容器的额外实例包括注射器、盒和袋。在一些实施方案中，所述试剂盒包含关于独立组分的使用的指导。当所述独立组分优选地以不同剂型施用(例如口服或肠胃外施用)、以不同剂量间隔施用时，或当处方健康护理人员希望调定该组合中的个别组分时，试剂盒形式是特别有利的。
此外，应理解，在现有技术范围内的本发明的任何实施方案可明确地排除在任一个或多个权利要求项之外。由于此类实施方案被认为是本领域普通技术人员所知的，故这些实施方案可被排除在外，即使本文没有明确陈述排除。本发明组合物的任何实施方案均可出于任何原因而排除在任一个或多个权利要求项之外，不管是否与现有技术的存在相关。
编号的实施方案
[1]一种具有式I结构的化合物：
A-L-B
式I
其中A是Ras结合部分；
L是连接体；并且
B是选择性交联基团,
或其药学上可接受的盐,
其中在所述化合物或其药学上可接受的盐与含有Ras蛋白的样品接触后，所述样品中至少20％的所述Ras蛋白与所述化合物或其药学上可接受的盐共价反应，形成缀合物。
[2]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述样品中的Ras蛋白是人H-Ras、人N-Ras、人K-Ras或其组合。
[3]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述样品中的Ras蛋白是突变型Ras蛋白。
[4]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述Ras结合部分是人H-Ras结合部分、人N-Ras结合部分或人K-Ras结合部分。
[5]如段落[2]至[4]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述Ras结合部分是K-Ras结合部分并且所述样品中的Ras蛋白是K-Ras蛋白。
[6]如段落[5]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分与所述K-Ras蛋白的K-Ras Switch-II结合袋的残基相互作用。
[7]如段落[6]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中K-Ras Switch-II结合袋的所述残基是对应于人野生型K-Ras(SEQ ID NO:1)的V7、V8、V9、G10、A11、D12、K16、P34、T58、A59、G60、Q61、E62、E63、Y64、S65、R68、D69、Y71、M72、F78、I92、H95、Y96、Q99、I100、R102或V103的所述K-Ras蛋白的残基。
[8]如段落[5]至[7]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II-V中任一个的结构。
[9]如段落[8]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II的结构：
Figure BDA0003759053970001611
其中m是0、1、2或3；
W1是N或C，其中C任选地通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[10]如段落[9]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II-1的结构：
Figure BDA0003759053970001621
其中m是0、1、2或3；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[11]如段落[10]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有以下结构：
Figure BDA0003759053970001622
其中W2是氢或羟基。
[12]如段落[9]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II-2的结构：
Figure BDA0003759053970001623
Figure BDA0003759053970001631
其中m是0、1、2或3；
W1是通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体的C；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[13]如段落[8]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III的结构：
Figure BDA0003759053970001632
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
Figure BDA0003759053970001633
表示单键或双键；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为
Figure BDA0003759053970001634
任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基，或
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
[14]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III-1的结构：
Figure BDA0003759053970001641
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
[15]如段落[14]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III-1a的结构：
Figure BDA0003759053970001661
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基。
[16]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III-2的结构：
Figure BDA0003759053970001662
其中n是0、1、2或3；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3是
Figure BDA0003759053970001671
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的–C1-C6烷基-C2-C9杂环基，或
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
[17]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III-3的结构：
Figure BDA0003759053970001672
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
Figure BDA0003759053970001681
表示单键或双键；
X是N或CR’，其中R’是氢或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是NR5aR5b；
各R3独立地为
Figure BDA0003759053970001682
任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
[18]如段落[13]至[17]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中R4是
Figure BDA0003759053970001683
Figure BDA0003759053970001691
[19]如段落[13]至[17]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中R4是
Figure BDA0003759053970001692
[20]如段落[13]至[19]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中V是
Figure BDA0003759053970001693
[21]如段落[13]至[18]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中式III具有此结构：
Figure BDA0003759053970001694
[22]如段落[8]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式IV的结构：
Figure BDA0003759053970001701
其中o是0、1或2；
X1、X2和X3各自独立地为N、CH或CR6；
各R6独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R6通过C1-C3烷基桥或C1-C3杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R7和R8独立地为任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[23]如段落[22]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中X1、X2和X3中仅一个是N。
[24]如段落[22]或[23]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中式IV具有以下结构：
Figure BDA0003759053970001702
[25]如段落[8]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式V的结构：
Figure BDA0003759053970001711
其中p是0、1、2或3；
R9是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R10独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或R10通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R11是任选被取代的C2-C9杂芳基或任选被取代的C2-C9杂环基。
[26]如段落[1]至[25]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体将B的反应性原子定位成距A的最近原子约5至约11埃。
[27]如段落1至29中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体将B的反应性原子定位成距A的最近原子4至9个原子。
[28]如段落[1]至[27]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体是式VI的结构：
A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-(D)-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2
式VI
其中A1是所述连接体与所述Ras结合部分之间的键；
A2是所述选择性交联基团与所述连接体之间的键；
B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN；RN是氢、任选被取代的C1-4烷基、任选被取代的C2-4烯基、任选被取代的C2-4炔基、任选被取代的C2-6杂环基、任选被取代的C6-12芳基或任选被取代的C1-7杂烷基；
C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基；
a、b、c、d、e和f各自独立地为0或1；并且
D是任选被取代的C1–10亚烷基、任选被取代的C2–10亚烯基、任选被取代的C2–10亚炔基、任选被取代的C2–6亚杂环基、任选被取代的C2–6亚杂芳基、任选被取代的C3–8亚环烷基、任选被取代的C6–12亚芳基、任选被取代的C2-C10聚乙二醇或任选被取代的C1–10亚杂烷基或连接A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-与-(B3)d-(C2)e-(B4)f–A2的化学键。
[29]如段落[1]至[28]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体包含3至8元杂环基。
[30]如段落[29]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中A-L-B是式VIIa或VIIb的结构：
Figure BDA0003759053970001721
其中q和r独立地为0、1或2；
X1是N或CH；
R12和R13独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；并且
R14是氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，其中R14任选地包含连至A的键。
[31]如段落[30]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中A-L-B选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001731
其中Rx是接合至A的任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥。
[32]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中-L-B选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001732
[33]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中A-L-B是：
Figure BDA0003759053970001741
[34]如段落[29]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中A-L-B是式VIIc或式VIId的结构：
Figure BDA0003759053970001742
其中s、t、u和v独立地为0、1或2；
X3是N或CH；并且
R15和R16独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
[35]如段落[34]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中A-L-B是：
Figure BDA0003759053970001743
[36]如段落[1]至[28]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体是无环的。
[37]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体是式VIII的结构：
Figure BDA0003759053970001751
其中R17是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
L2是任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C3-C6亚环烷基。
[38]如段落[37]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001752
其中Ry是接合至A的任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥。
[39]如段落[1]至[38]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是形成选择性交联基团的C-O键。
[40]如段落[1]至[39]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团包含碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。
[41]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式IX的结构：
Figure BDA0003759053970001753
其中R18是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[42]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001761
Figure BDA0003759053970001771
[43]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式Xa或Xb的结构：
Figure BDA0003759053970001772
其中X5是O或S；
X5’是O或S；
X5a不存在或为NR19；
X5a’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
R19是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R20、R21、R22、R23、R20’、R21’、R22’和R23’独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[44]如段落[43]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001773
Figure BDA0003759053970001781
[45]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XIa或式XIb的结构：
Figure BDA0003759053970001782
其中X6是O或S；
X6’是O或S；
X6a不存在或为NR24；
X6a’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
X7和X7’各自为O、S或NR29；
R24是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R25、R26、R27、R28、R29、R25’、R26’、R27’和R28’、独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[46]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001791
[47]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XIIa、XIIb、XIIc、XIId或XIIe的结构：
Figure BDA0003759053970001792
其中X不存在或为NR30；
X’是N，其中所述N是任选被取代的C2-C9杂环基的环原子；
Y是C(O)、C(S)、SO2或任选被取代的C1-C3烷基；
Z’是C(O)或SO2；
Z”是-CH2-或C(O)；
q是0、1或2；
各Rx独立地为氢、CN、C(O)Ry、CO2Ry、C(O)NRyRy、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各Ry独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
Rz是氢或CH3；
R30是氢或任选被取代的C1-C6烷基；
R31是氢、-C(O)R32、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R32和R33独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[48]如段落[47]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中R31和Rx中的至少两个是氢。
[49]如段落[47]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中R31是CH3、C(O)CH3、SO2CH3、CH2-C6H5或CH2CH2OCH3。
[50]如段落[47]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001801
Figure BDA0003759053970001811
[51]如段落[40]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001812
[52]如段落[40]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001813
[53]如段落[40]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001821
[54]如段落[40]所述的化合物或其药学上可接受的盐，所述化合物或其药学上可接受的盐选自：
Figure BDA0003759053970001822
[55]如段落[40]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XXIV的结构：
Figure BDA0003759053970001823
Figure BDA0003759053970001831
其中R31是不存在、氢、C(O)CH3、SO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C1-C3烷基-C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C1-C3烷基-C2-C9杂环基；
R56是CH3或Cl；
Rz是氢、任选被取代的C1-C3烷基；
各Rx独立地为氢、CO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C6烯基或任选被取代的C2-C6炔基；并且
Z”’是N或O。
[56]如段落[40]或[55]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XIII的结构：
Figure BDA0003759053970001832
其中R31是氢、CH3、C(O)CH3、SO2CH3、CH2-C6H5或CH2CH2OCH3。
[57]如段落[40]或[55]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XXV的结构：
Figure BDA0003759053970001841
其中R31是不存在、氢、C(O)CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C1-C3烷基-C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C1-C3烷基-C2-C9杂环基；
Rz是氢、任选被取代的C1-C3烷基；
Rx是氢、CO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C6烯基或任选被取代的C2-C6炔基；并且
Z”’是N或O。
[58]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001842
Figure BDA0003759053970001843
Figure BDA0003759053970001851
Figure BDA0003759053970001861
[59]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001862
[60]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001863
[61]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XIV的结构：
Figure BDA0003759053970001864
其中R34和R35独立地为任选被取代的C1-C6烷基，或R34和R35与其所连接的硼组合形成任选被取代的杂环基。
[62]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XV的结构：
Figure BDA0003759053970001871
其中w是1或2；
R36是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
各R37和R38独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[63]如段落[61]或[62]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述-选择性交联基团选自由以下组成的组：
Figure BDA0003759053970001872
[64]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XVI的结构：
Figure BDA0003759053970001873
其中X8是不存在、O、S、NR40或CH2；
X9是O、NR41、S、S(O)或S(O)2；
R39是任选被取代的C1-C6烷基；并且
R40和R41独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[65]如段落[64]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001881
[66]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XVII的结构：
Figure BDA0003759053970001882
其中X10是不存在、O、S、NR43或CH2；
X11是O、NR44、S、S(O)或S(O)2；
R42是任选被取代的C1-C6烷基；并且
R43和R44独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[67]如段落[66]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001891
[68]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XVIII的结构：
Figure BDA0003759053970001892
其中R45是氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[69]如段落[68]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是：
Figure BDA0003759053970001893
[70]如段落[1]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是式XIX的结构：
Figure BDA0003759053970001894
其中R46和R47独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
[71]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XX或XXI的结构：
Figure BDA0003759053970001901
其中Y是C(O)、C(S)、SO2或任选被取代的C1-C6烷基；
Z’是C(O)或SO2；
q是0、1或2；
x是0、1、2或3；
各RX独立地为氢、CN、C(O)Ry、CO2Ry、C(O)NRyRy、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各Ry独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R48独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R49是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
R50是氢或C1-C6烷基；
R51是氢、CN或C1-C6烷基；
R54是氢、-C(O)R32、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R55是氢或任选被取代的C1-C6烷基。
[72]如段落[71]所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中R51、R54和Rx各自为氢。
[73]如段落[71]或[72]所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XXII或式XXIII的结构：
Figure BDA0003759053970001911
其中X是氢或羟基。
[74]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有以下结构：
Figure BDA0003759053970001912
Figure BDA0003759053970001921
Figure BDA0003759053970001931
Figure BDA0003759053970001941
Figure BDA0003759053970001951
Figure BDA0003759053970001961
Figure BDA0003759053970001971
Figure BDA0003759053970001981
Figure BDA0003759053970001991
[75]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2b中的实施例63-95中任一个实施例的结构。
[76]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2c中的实施例96-104中任一个实施例的结构。
[77]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2d中的实施例105-180中任一个实施例的结构。
[78]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2e中的实施例181-216中任一个实施例的结构。
[79]一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2f中的实施例217-300中任一个实施例的结构。
[80]一种药物组合物，包含如段落[1]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐和药学上可接受的赋形剂。
[81]一种缀合物或其盐，包含共价结合至选择性交联基团的Ras蛋白，所述选择性交联基团通过连接体结合至Ras结合部分，其中所述选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。
[82]如段落[81]所述的缀合物或其盐，包含选自由以下组成的组的连接体：
(a)
-A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-(D)-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2-
式VI
其中A1是所述连接体与所述Ras结合部分之间的键；A2是所述选择性交联基团与所述连接体之间的键；B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN；RN是氢、任选被取代的C1–4烷基、任选被取代的C2–4烯基、任选被取代的C2–4炔基、任选被取代的C2–6杂环基、任选被取代的C6–12芳基或任选被取代的C1–7杂烷基；C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基；a、b、c、d、e和f各自独立地为0或1；并且D是任选被取代的C1–10亚烷基、任选被取代的C2–10亚烯基、任选被取代的C2–10亚炔基、任选被取代的C2–6亚杂环基、任选被取代的C2–6亚杂芳基、任选被取代的C3–8亚环烷基、任选被取代的C6–12亚芳基、任选被取代的C2-C10聚乙二醇或任选被取代的C1–10杂烷基或连接A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-与-(B3)d-(C2)e-(B4)f–A2的化学键；
(b)
Figure BDA0003759053970002011
其中q和r独立地为0、1或2；
X1和X2独立地为N或CH；
R12和R13独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；并且
R14是氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，其中R14任选地包含连至A的键；
(c)
Figure BDA0003759053970002012
其中s、t、u和v独立地为0、1或2；
X3和X4独立地为N或CH；并且
R15和R16独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基；以及
(d)
Figure BDA0003759053970002021
其中R17是氢或任选被取代的C1-C6烷基；并且
L2是任选被取代的C1-C4亚烷基。
[83]如段落[81]或[82]所述的缀合物或其盐，其中所述Ras蛋白是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。
[84]如段落[81]至[82]中任一个所述的缀合物或其盐，其中所述连接体通过连至所述Ras蛋白的残基的羧基的键结合至所述Ras蛋白。
[85]如段落[83]所述的缀合物或其盐，其中所述Ras蛋白的残基的羧基是在对应于人野生型K-Ras(SEQ ID NO:1)的12位或13位的突变位置处的天冬氨酸残基的羧基。
[86]一种制备缀合物的方法，包括使Ras蛋白与如段落[1]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐或如段落[80]所述的药物组合物在足以使所述化合物与所述Ras蛋白共价反应的条件下接触。
[87]如段落[86]所述的方法，其中所述Ras蛋白是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。
[88]一种由如段落[86]或[87]所述的方法制造的缀合物。
[89]一种制备缀合物的方法，所述方法包括使Ras蛋白与如段落[1]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐或如段落[80]所述的药物组合物在适合允许所述缀合物形成的条件下接触。
[90]如段落[89]所述的方法，其中所述Ras蛋白是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。
[91]一种治疗有需要的受试者的癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如段落[1]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐或如段落[80]所述的药物组合物。
[92]如段落[91]所述的方法，其中所述癌症是结肠直肠癌、非小细胞肺癌、胰腺癌、阑尾癌、黑色素瘤、急性骨髓性白血病、小肠癌、壶腹癌、生殖细胞癌、子宫颈癌、原发部位未知的癌症、子宫内膜癌、食管胃癌、GI神经内分泌癌、卵巢癌、性索间质肿瘤癌、肝胆管癌或膀胱癌。
[93]如段落[91]或[92]所述的方法，其中所述癌症包含Ras突变。
[94]如段落[93]所述的方法，其中所述Ras突变是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。
[95]一种治疗有需要的受试者的Ras蛋白相关病症的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如段落[1]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐或如段落[80]所述的药物组合物。
[96]一种抑制细胞中的Ras蛋白的方法，所述方法包括使所述细胞与有效量的如段落1至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐或如段落[80]所述的药物组合物接触。
[97]如段落[95]或[96]所述的方法，其中所述Ras蛋白是K-Ras G12D、K-Ras G13D或K-Ras G12S。
[98]如段落[96]或[97]所述的方法，其中所述细胞是癌细胞。
[99]如段落[98]所述的方法，其中所述癌细胞是结肠直肠癌细胞、非小细胞肺癌细胞、胰腺癌细胞、阑尾癌细胞、黑色素瘤细胞、急性骨髓性白血病细胞、小肠癌细胞、壶腹癌细胞、生殖细胞癌细胞、子宫颈癌细胞、原发部位未知的癌症细胞、子宫内膜癌细胞、食管胃癌细胞、GI神经内分泌癌细胞、卵巢癌细胞、性索间质肿瘤癌细胞、肝胆管癌细胞或膀胱癌细胞。
[100]如段落[91]至[99]中任一个所述的方法或用途，其中所述方法另外包括施用额外抗癌疗法。
[101]如段落[100]所述的方法，其中所述额外抗癌疗法是EGFR抑制剂、第二Ras抑制剂、SHP2抑制剂、SOS1抑制剂、Raf抑制剂、MEK抑制剂、ERK抑制剂、PI3K抑制剂、PTEN抑制剂、AKT抑制剂、mTORC1抑制剂、BRAF抑制剂、PD-L1抑制剂、PD-1抑制剂或其组合。
[102]如段落[100]或[101]所述的方法，其中所述额外抗癌疗法是SHP2抑制剂。
实施例
以下实施例意图说明多种代表性化合物或其药学上可接受的盐的合成和用途。因此，这些实施例意图说明而非限制本发明。未具体例示的额外化合物可使用常规方法结合本文所描述的方法合成。
缩写：
Ac 乙酰基
BnNCS 异硫氰酸苯甲酯
Boc 叔丁氧羰基
Cbz 苯甲氧羰基
CbzOSu (2,5-二氧代吡咯烷-1-基)碳酸苯甲酯
COMU (1-氰基-2-乙氧基-2-氧代亚乙基氨基氧基)二甲基氨基-吗啉代-碳离子六氟磷酸盐
DBU 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯
DCM 二氯甲烷
DMA N,N-二甲基乙酰胺
DMAP N,N-二甲基胺基-4-吡啶
DMF N,N-二甲基甲酰胺
DMSO 二甲亚砜
EDC N-(3-二甲基氨基丙基)-N’-乙基-碳化二亚胺
Et 乙基
HATU N-[(二甲基氨基)-1H-1,2,3-三唑并-[4,5-b]吡啶-1-基亚甲基]-N-甲基甲铵六氟磷酸盐N-氧化物
HOBt 1-羟基苯并三唑
KHMDS 双(三甲基硅烷基)胺基钾
m-CPBA 间氯过氧苯甲酸
Me 甲基
MsCl 甲磺酰氯
MTBE 甲基叔丁基醚
NCS N-氯琥珀酰亚胺
NMM N-甲基吗啉
n-PrNCS 1-丙基异硫氰酸酯
Pd2(dba)3 三(二苯亚甲基丙酮)二钯(0)
Pd(dppf)Cl2 [1,1-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)
Ph2NTf N-苯基-双(三氟甲烷磺酰亚胺)
Pr 丙基
RuPhos 二环己基(2',6'-二异丙氧基-[1,1'-联苯]-2-基)磷烷
T3P 丙烷膦酸酐
TBAF 四丁基氟化铵
TBDPSCl 叔丁基(氯)二苯基硅烷
Tf 三氟甲磺酸酯
TFA 三氟乙酸
THF 四氢呋喃
Trt 三苯甲基
TsOH 甲苯磺酸
中间体1–合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002071
步骤1：合成(S,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在70℃下，将(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.50g，20.6mmol)、乙醇钛(9.41g，41.25mmol)和苯甲醛(2.19g，20.7mmol)的溶液加热1小时，冷却，并用H2O(250mL)稀释。将水层用EtOAc(3×80mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望产物(4.3g，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C11H15NOS的[M+H]计算值：210.10；实验值210.2。
步骤2：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向溴代乙酸乙酯(798mg，4.78mmol)于THF(15mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M于THF中，4.78mL，4.78mmol)。1小时后，经20分钟分数份添加于THF(5mL)中的(S,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(500mg，2.39mmol)。在-78℃下，将反应混合物搅拌2小时，接着通过添加饱和NH4Cl淬灭。将水层用EtOAc(3×40mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,0.1％HCO2H)纯化，得到所希望产物(480mg，61％产率)。
LCMS(ESI)m/z:C15H21NO3S的[M+H]计算值：296.13；实验值296.2。
步骤3：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(600mg，2.03mmol)于THF(4.0mL)中的溶液中添加LiOH(97.2mg，4.06mmol)于H2O(4.0mL)中的溶液。在0℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着用1M HCl酸化至pH 5。将水层用EtOAc(3×40mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的化合物(450mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M+H]计算值：268.10；实验值268.1。
中间体2–合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002081
步骤1：合成(R,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在70℃下，将(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.50g，20.6mmol)、四乙醇钛(9.41g，41.3mmol)和苯甲醛(2.19g，20.6mmol)的溶液加热1小时，冷却，并用H2O(250mL)稀释。将水层用EtOAc(3×90mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望产物(4.2g，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C11H15NOS的[M+H]计算值：210.10；实验值210.1。
步骤2：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向溴代乙酸乙酯(6.38g，38.2mmol)于THF(150mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M于THF中，7.19mL，42.9mmol)。1小时后，经20分钟分数份添加于THF(50mL)中的(R,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.0g，19.1mmol)。在-78℃下，将反应混合物搅拌2小时，接着通过添加饱和NH4Cl淬灭。将水层用EtOAc(3×80mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×60mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,0.1％HCO2H)纯化，得到所希望产物(3.9g，62％产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H21NO3S的[M+H]计算值：296.13；实验值296.2。
步骤3：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200mg，0.677mmol)于THF(1.5mL)中的溶液中添加LiOH(32.4mg，1.35mmol)于H2O(1.3mL)中的溶液。在0℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着用1M HCl酸化至pH 5。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的化合物(220mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M+H]计算值：268.10；实验值268.4。
中间体3–合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002091
步骤1：合成(2S,3R)-2,3-di羟基-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下，向肉桂酸乙酯(2.0g，11.4mmol)于t-BuOH(35.0mL)和H2O(35.0mL)中的溶液中添加AD-mix-β(15.83g，20.32mmol)和甲烷磺酰胺(1.08g，11.3mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌16小时。将反应物冷却至0℃并用KHSO4水溶液淬灭。将所得到的混合物用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×90mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈固体状的所希望产物(2.2g，82％产率)。
步骤2：合成(2S,3R)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下，向(2S,3R)-2,3-di羟基-3-苯基丙酸乙酯(2.0g，9.5mmol)和Et3N(3.97mL，28.5mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(2.11g，9.51mmol)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用H2O(300mL)稀释。将混合物用DCM(3×100mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈固体状的所希望产物(2.8g，67％产率)。
步骤3：合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯
在室温下，向(2S,3R)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯(2.80g，7.08mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加三甲基硅烷基叠氮化物(1.63g，14.2mmol)和TBAF(1M于THF中，14.16mL，14.16mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着，将反应混合物冷却至室温，用H2O(150mL)稀释，并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈油状的所希望产物(1.2g，64％产率)。
步骤4：合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯(1.20g，5.10mmol)于DMF(15.0mL)中的溶液中添加PPh3(1.61g，6.12mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌30分钟，接着加热至80℃，再保持16小时。接着，将反应混合物冷却至室温，用H2O(100mL)稀释，并用EtOAc(3×40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经Na2SO干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(16％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈油状的所希望产物(620mg，57％产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H13NO2的[M+H]计算值：192.10；实验值192.0。
步骤5：合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(0.100g，0.523mmol)于MeOH(0.70mL)中的溶液中添加LiOH(18.8mg，0.784mmol)于H2O(0.70mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1小时。接着，将混合物用MeCN(10mL)稀释，并通过过滤收集所得沉淀并用MeCN(2×10mL)洗涤，得到呈固体状的粗所希望产物(70mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H9NO2的[M+H]计算值：164.07；实验值164.0。
中间体4–合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002111
步骤1：合成(2R,3S)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下，向肉桂酸乙酯(2.0g，11.4mmol)于t-BuOH(35.0mL)和H2O(35.0mL)中的溶液中添加AD-mix-α(15.83g，20.32mmol)和甲烷磺酰胺(1.08g，11.3mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌16小时。将反应物冷却至0℃并用KHSO4水溶液淬灭。将所得到的混合物用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×80mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈固体状的所希望产物(2.2g，82％产率)。
步骤2：合成(2R,3S)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下，向(2R,3S)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯(2.10g，9.99mmol)和Et3N(4.18mL，29.9mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(2.21g，9.99mmol)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用H2O(200mL)稀释。将混合物用DCM(3×80mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×80mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈固体状的所希望产物(3.0g，68％产率)。
步骤3：合成(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯
在室温下，向(2R,3S)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯(3.0g，7.59mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加三甲基硅烷基叠氮化物(1.75g，15.2mmol)和TBAF(1M于THF中，15.18mL，15.18mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着，将反应混合物冷却至室温，用H2O(150mL)稀释，并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈油状的所希望产物(1.4g，70％产率)。
步骤4：合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯(1.40g，5.95mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加PPh3(1.87g，7.14mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌30分钟，接着加热至80℃，再保持16小时。接着，将反应混合物冷却至室温，用H2O(150mL)稀释，并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤，经Na2SO干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(16％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈油状的所希望产物(720mg，56％产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H13NO2的[M+H]计算值：192.10；实验值192.0。
步骤5：合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(0.100g，0.523mmol)于MeOH(0.70mL)中的溶液中添加LiOH(18.8mg，0.784mmol)于H2O(0.70mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1小时。接着，将混合物用MeCN(10mL)稀释，并通过过滤收集所得沉淀并用MeCN(2×10mL)洗涤，得到呈固体状的粗所希望产物(68mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H9NO2的[M+H]计算值：164.07；实验值164.0。
中间体5–合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002131
步骤1：合成(R,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在0℃下，向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g，24.75mmol)和四乙氧基钛(1.7g，7.43mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加乙醛(218.1mg，4.95mmol)。将所得到的混合物搅拌20分钟，接着用H2O(100mL)淬灭。过滤悬浮液，并用EtOAc(3×100mL)洗涤滤饼。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过正相色谱法(9％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(3g，82％产率)。LCMS(ESI)m/z:C6H13NOS的[M+H]计算值：148.08；实验值148.0。
步骤2：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向1M LiHMDS(40.75mL，40.75mmol)于THF(30.0mL)中的溶液中添加溴代乙酸乙酯(6.80g，40.75mmol)。将所得到的混合物搅拌1小时。接着，向反应混合物中添加(R,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g，20.38mmol)。在-78℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着用H2O(300mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×300mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50％MeCN/H2O)纯化，得到所希望产物(1.4g，29.5％产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H19NO3S的[M+H]计算值：234.12；实验值234.1。
步骤3：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1.0g，4.29mmol)于THF(6.4mL)和H2O(6.4mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(539.5mg，12.86mmol)。将所得到的混合物升温至室温并搅拌2小时，接着用HCl(水溶液)和饱和NH4Cl(水溶液)中和至pH 5。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取并将合并的有机层用盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的粗产物(489mg，55.6％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NO3S的[M+H]计算值：206.09；实验值206.0。
中间体6–合成(2S,3S)-1-(S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002141
步骤1：合成(S,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在0℃下，向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(5.0g，41.25mmol)和四乙氧基钛(18.82g，82.51mmol)的混合物中添加乙醛(3.63g，82.51mmol)。将所得到的混合物升温至室温并搅拌30分钟，接着用H2O(100mL)淬灭。过滤悬浮液，并用EtOAc(3×100mL)洗涤滤饼。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的粗产物(3.9g，64％产率)。LCMS(ESI)m/z:C6H13NOS的[M+H]计算值：148.08；实验值148.2。
步骤2：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向1M LiHMDS(40.75mL，40.75mmol)于THF(30.0mL)中的溶液中添加溴代乙酸乙酯(6.80g，40.75mmol)。将所得到的混合物搅拌1小时。接着，向反应混合物中添加(S,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g，20.38mmol)。在-78℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50％MeCN/H2O)纯化，得到所希望产物(2g，42％产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H19NO3S的[M+H]计算值：234.12；实验值234.0。
步骤3：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(80.0mg，0.34mmol)于THF(1.0mL)和H2O(0.2mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(32.9mg，1.37mmol)。将所得到的混合物升温至室温并搅拌4小时，接着用HCl(水溶液)酸化至pH 3。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取并将合并的有机层用盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的粗产物(70mg，99％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NO3S的[M+H]计算值：206.09；实验值206.0。
中间体7–合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002161
步骤1：合成(E)-4-甲基戊-2-烯酸
将两批丙二酸(25.0mL，240mmol)、异丁醛(34.7mL，380mmol)和吗啉(380μL，4.32mmol)于吡啶(75mL)中的溶液搅拌24小时，接着将其加热至115℃并搅拌12小时。将合并的反应混合物倒入H2SO4(1M，800mL)中并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物溶解于NaOH(1M，500mL)中，用EtOAc(2×200mL)洗涤，用HCl(4M)酸化至pH＝4–2，并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到产物(54g，98％产率)。
步骤2：合成(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯
向两批(E)-4-甲基戊-2-烯酸(6.25mL，52.6mmol)于丙酮(90mL)中的溶液中添加K2CO3(13.8g，100mmol)并将混合物搅拌30分钟。接着，添加苯甲基溴(6.31mL，53.1mmol)于丙酮(10mL)中的溶液并将混合物加热至75℃，保持5小时。将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将残余物溶解于EtOAc(200mL)和H2O(200mL)中，接着萃取至EtOAc(2×200mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(9.0g，42％产率)。
步骤3：合成(2R,3S)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向AD-mix-α(61.7g)和甲烷磺酰胺(4.19g，44.1mmol)于叔丁醇(225mL)和H2O(225mL)中的溶液中添加(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯(9g，44.1mmol)。在室温下，将混合物搅拌12小时，接着添加Na2SO3(67.5g)并搅拌30分钟。将反应混合物用EtOAc(300mL)和H2O(300mL)稀释并萃取至EtOAc(3×300mL)中，用盐水(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(8.3g，79％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H18O4的[M+Na]计算值：261.11；实验值261.0。
步骤4：合成(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物
在0℃下，向(2R,3S)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g，42.0mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加Et3N(17.5mL，126mmol)和SOCl2(4.26mL，58.8mmol)。将反应混合物搅拌30分钟，接着用DCM(30mL)和H2O(100mL)稀释，萃取至DCM(3×50mL)中，用盐水(100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到产物(11.0g，92％产率)。
步骤5：合成(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物
向(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物(11g，38.7mmol)于H2O(250mL)、MeCN(125mL)和CCl4(125mL)中的溶液中添加NaIO4(3.22mL，58.0mmol)和RuCl3·H2O(872mg，3.87mmol)。在室温下，将混合物搅拌1小时，接着用EtOAc(200mL)和H2O(50mL)稀释，过滤，并将滤液萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机层依序用盐水(200mL)和饱和Na2CO3水溶液(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(11g，95％产率)。
步骤6：合成(2S,3S)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物(11g，36.6mmol)于THF(520mL)中的溶液中添加LiBr(3.49mL，139mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌5小时，接着减压浓缩。将残余物稀释于THF(130mL)和H2O(65mL)中，冷却至0℃，接着添加H2SO4溶液(20％水溶液，1.3L)并将混合物升温至室温，并搅拌24小时。将混合物用EtOAc(1.0L)稀释，萃取至EtOAc(2×300mL)中，依序用Na2CO3(饱和水溶液，300mL)和盐水(300mL)洗涤，接着减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(10g，81％产率)。
步骤7：合成(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(2S,3S)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g，33.2mmol)于DMSO(100mL)中的溶液中添加NaN3(4.32g，66.4mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌12小时，接着用EtOAc(300mL)和H2O(200mL)稀释。将水相萃取至EtOAc(2×200mL)中，用盐水(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(7.5g，79％产率)。
步骤8：合成(2R,3R)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(7.5g，28.5mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加PPh3(7.70g，29.3mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌1小时，接着加热至70℃并搅拌4小时。将反应混合物减压浓缩并通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(4.5g，66％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值：220.13；实验值220.0。
步骤9：合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(2R,3R)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(2g，9.12mmol)于DCM(30mL)中的溶液中添加Et3N(3.81mL，27.4mmol)和三苯甲基氯(3.05g，10.9mmol)，随后添加DMAP(111mg，912μmol)。在0℃下，将反应混合物搅拌1小时，接着用DCM(50mL)和H2O(50mL)稀释，接着萃取至DCM(2×30mL)中。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25％DCM/石油醚)纯化，得到产物(3.1g，72％产率)。
步骤10：合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在H2气氛下，在室温下将两份(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(200mg，430μmol)和Pd/C(100mg)于THF(4mL)中的溶液搅拌1小时。将反应混合物合并，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(160mg，51％产率)。
中间体8–合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002191
步骤1：合成(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向AD-mix-β(61.7g)和甲烷磺酰胺(4.19g，44.1mmol)于叔丁醇(225mL)和H2O(225mL)中的溶液中添加(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯(9g，44.1mmol)。在室温下，将混合物搅拌12小时，接着添加Na2SO3(67.5g)并搅拌30分钟。将反应混合物用EtOAc(300mL)和H2O(300mL)稀释并萃取至EtOAc(3×300mL)中，用盐水(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(8.8g，84％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H18O4的[M+Na]计算值：261.11；实验值261.0。
步骤2：合成(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物
在0℃下，向(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(11.6g，48.7mmol)于DCM(116mL)中的溶液中添加Et3N(20.3mL，146mmol)和SOCl2(4.94mL，68.2mmol)。将反应混合物搅拌30分钟，接着用DCM(100mL)和H2O(100mL)稀释，萃取至DCM(3×100mL)中，用盐水(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到产物(13.0g，94％产率)。
步骤3：合成(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物
向(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物(13g，45.7mmol)于H2O(290mL)、MeCN(145mL)和CCl4(145mL)中的溶液中添加NaIO4(3.80mL，68.6mmol)和RuCl3·H2O(1.03g，4.57mmol)。在室温下，将混合物搅拌1小时，接着用DCM(500mL)和H2O(300mL)稀释，过滤，并将滤液萃取至DCM(3×200mL)中。将合并的有机层依序用盐水(500mL)和饱和Na2CO3水溶液(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(11.5g，80％产率)。
步骤4：合成(2R,3R)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物(11.5g，38.3mmol)于THF(520mL)中的溶液中添加LiBr(3.65mL，146mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌5小时，接着减压浓缩。将残余物稀释于THF(130mL)和H2O(65mL)中，冷却至0℃，接着添加H2SO4溶液(20％水溶液，1.3L)并将混合物升温至室温，并搅拌24小时。将混合物用EtOAc(1.0L)稀释，用Na2CO3(饱和水溶液，300mL)洗涤，接着减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(10g，83％产率)。
步骤5：合成(2S,3R)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(2R,3R)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g，33.2mmol)于DMSO(100mL)中的溶液中添加NaN3(4.33g，66.6mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌12小时，接着用EtOAc(300mL)和H2O(200mL)稀释。将混合物萃取至EtOAc(2×200mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(7.5g，76％产率)。
步骤6：合成(2S,3S)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2S,3R)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(7.5g，28.5mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加PPh3(7.70g，29.3mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌1小时，接着加热至70℃并搅拌3小时。将反应混合物减压浓缩并通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(4.5g，64％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值：220.13；实验值220.1。
步骤7：合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2S,3S)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(1g，4.56mmol)于MeCN(10mL)中的溶液中添加K2CO3(3.15g，22.8mmol)和苯甲基溴(812μL，6.84mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌6小时，接着用EtOAc(30mL)和H2O(30mL)稀释，萃取至EtOAc(2×30mL)中，用盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(1.3g，89％产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H23NO2的[M+H]计算值：310.18；实验值310.1。
步骤8：合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600mg，1.94mmol)于THF(6mL)、MeCN(3mL)和H2O(6mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(163mg，3.88mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌1小时并用HCl(0.5M)调至pH＝7-8。冻干得到产物(750mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值：220.13；实验值220.1。
中间体9–合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002221
步骤1：合成(R,E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在室温下，向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.0g，8.25mmol)和环丙烷甲醛(1.16g，16.55mmol)于DCM(50mL)中的溶液中添加CuSO4(3.95g，24.75mmol)。将所得到的混合物搅拌过夜。接着，将反应混合物过滤，用EtOAc洗涤滤饼，并减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC(17％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(1.4g，97.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NOS的[M+H]计算值：174.10；实验值174.1。
步骤2：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向1M LiHMDS(23mL，23mmol)于THF(50.0mL)中的溶液中添加溴代乙酸乙酯(3.83g，22.95mmol)。将所得到的混合物升温至-70℃并搅拌1小时。接着，向反应混合物中添加(R,E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.0g，11.48mmol)。在-70℃下，将所得到的混合物搅拌1小时。将反应混合物升温至0℃并用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(25％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(1.8g，60.5％产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H21NO3S的[M+H]计算值：306.14；实验值260.13。
步骤3：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(900.0mg，3.47mmol)于THF(3.0mL)和H2O(3.0mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(218.4mg，5.21mmol)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×50)萃取并将合并的有机层用盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的粗产物(400mg，29.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO3S的[M+H]计算值：232.10；实验值232.1。
中间体10–合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002231
步骤1：合成(E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.0g，33.0mmol)和CuSO4(15.80g，99.01mmol)于DCM(200.0mL)中的悬浮液中添加环丙烷甲醛(4.63g，66.0mmol)。将所得到的混合物搅拌过夜，接着过滤，用DCM(3×100mL)洗涤滤饼，并减压浓缩滤液，得到所希望产物(3.5g，61.2％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NOS的[M+H]计算值：174.10；实验值174.1。
步骤2：合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向溴代乙酸乙酯(481.91mg，2.886mmol)于THF(5.0mL)中的溶液中添加LiHMDS(2.90mL，2.90mmol)。在-78℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着添加(E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺的溶液(250.0mg，1.443mmol)。在-78℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着在0℃下用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取，并将合并的有机层经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(17％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(250mg，66.8％产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H21NO3S的[M+H]计算值：260.13；实验值260.1。
步骤3：合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(500.0mg，1.928mmol)于THF(2.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(121.34mg，2.89mmol)。将反应混合物搅拌1小时，接着用1M HCl(水溶液)酸化至pH 6。将所得到的混合物用EtOAc(2×10mL)萃取并将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩滤液，得到所希望产物(400mg，89.7％产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO3S的[M+H]计算值：232.10；实验值232.0。
中间体11–合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002251
步骤1：合成(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯
在0℃下搅拌(E)-3-环丙基丙烯酸乙酯(10.4mL，71mmol)于叔丁醇(270mL)和H2O(270mL)中的溶液。5分钟后，添加MsNH2(6.8g，71mmol)和(DHQD)2PHAL(100g，130mmol)并将反应混合物升温至室温。搅拌过夜后，添加饱和Na2SO3并将混合物搅拌30分钟。用KH2PO4将混合物酸化至pH 6。通过硅胶柱色谱法(33％EtOAC/石油醚)纯化，得到所希望产物(5.5g，44％产率)。
步骤2：合成(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯
在0℃下搅拌(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯(5.40g，31.0mmol)和Et3N(13.0mL，93.0mmol)于DCM(20mL)中的溶液并添加4-硝基苯磺酰氯(6.53g，29.5mmol)于DCM(10mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1.5小时，接着用DCM(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(33％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(6.9g，62％产率)。
步骤3：合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯
将(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯(6.90g，19.2mmol)和NaN3(6.24g，96.0mmol)于DMF(70.0mL)中的混合物加热至50℃。将反应混合物搅拌5小时，接着用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(2.8g，73％产率)。
步骤4：合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下，搅拌三苯基膦(1.84g，7.02mmol)于DMF(5mL)中的混合物。5分钟后，添加(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯(1.40g，7.03mmol)并将反应升温至室温。将反应混合物加热至80℃并搅拌1小时。接着，将混合物冷却至室温并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(230mg，46％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H13NO2的[M+H]计算值：156.10；实验值156.2。
步骤5：合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(230mg，1.5mmol)于MeOH(3.0mL)中的混合物中添加LiOH·H2O(125mg，3.0mmol)。搅拌反应3小时，接着过滤。减压浓缩滤液，得到所希望产物(150mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H9NO2的[M+H]计算值：128.07；实验值128.2。
中间体12–合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002261
步骤1：合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下，搅拌PPh3(1.4g，5.4mmol)于DMF(15.0mL)中的混合物。30分钟后，添加(2S,3S)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯(980mg，4.92mmol)。将反应混合物加热至80℃。2小时后，通过添加H2O(20mL)淬灭反应并用EtOAc(3×30mL)萃取。通过硅胶柱色谱法(17％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(500mg，65％产率)。
步骤2：合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(450mg，2.9mmol)于THF(6.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH(90mg，3.8mmol)。搅拌反应2小时，接着过滤。减压浓缩滤液，得到所希望产物(300mg，粗品)。
中间体13–合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002271
步骤1：合成(S,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向环丁烷甲醛(0.5g，5.94mmol)于THF(10mL)中的溶液中添加(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(792.48mg，6.54mmol)和Ti(OEt)4(2.47mL，11.89mmol)。在75℃下，将混合物搅拌3小时。将反应混合物冷却至室温并通过添加盐水(30mL)淬灭，并过滤以去除固体。用EtOAc(3×30mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(2％→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(907.3mg，39.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NOS的[M+H]计算值：188.1；实验值188.3。
步骤2：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向2-溴乙酸乙酯(1.60g，9.61mmol，1.06mL)于THF(9mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M，9.61mL)，2分钟后，添加(S,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.9g，4.81mmol)。在-78℃下，将混合物搅拌2小时。通过在-78℃下添加H2O(25mL)淬灭反应混合物并使其升温至室温，接着用EtOAc(3×20mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物，将其通过硅胶色谱法(10％→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(426mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO3S的[M+H]计算值：274.14；实验值274.3。
步骤3：合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸酯(100mg，365.78μmol)于MeCN(0.5mL)和H2O(0.5mL)中的溶液中添加NaOH(21.95mg，548.67μmol)，将混合物升温至室温并搅拌2小时。通过添加10％柠檬酸水溶液(约10mL)将反应混合物调至pH 5，接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望产物(92.6mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H19NO3S的[M+H]计算值：246.11；实验值246.3。
中间体14–合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002281
步骤1：合成(R,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向环丁烷甲醛(0.25g，2.97mmol)于THF(5mL)中的溶液中添加(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(396.24mg，3.27mmol)和Ti(OEt)4(1.36g，5.94mmol，1.23mL)。在75℃下，将混合物分两批搅拌3小时。将两批合并，并通过添加盐水(15mL)淬灭反应混合物。用EtOAc(3×20mL)萃取溶液并将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物，将其通过硅胶色谱法(10％→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(786.7mg，70.7％产率)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NOS的[M+H]计算值：188.1；实验值188.3。
步骤2：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下，向2-溴乙酸乙酯(236.19μL，2.14mmol)于THF(2mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M，2.14mL)，30分钟后，添加(R,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.2g，1.07mmol)。将混合物升温至-40℃并搅拌4小时。通过在-40℃下添加H2O(18mL)淬灭反应混合物并使其升温至室温。用EtOAc(3×15mL)萃取混合物并将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物，将残余物通过制备型TLC(20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(0.1g，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO3S的[M+H]计算值：274.14；实验值274.3。
步骤3：合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
分两批，在0℃下，向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(25mg，91.44μmol)于MeCN(0.25mL)和H2O(0.25mL)中的溶液中添加NaOH(5.49mg，137.17μmol)，将混合物升温至室温并搅拌5小时。将反应混合物合并，并用10％柠檬酸水溶液(10mL)将pH值调至5，接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望产物(53mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H19NO3S的[M+H]计算值：246.11；实验值246.2。
中间体15、16、17和18–合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(15)、(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(16)、(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(17)和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(18)
Figure BDA0003759053970002301
使用中间体15、16、17和18制备以下中间体19、20、21和22
步骤1：合成N-二苯甲基-1-(氧杂环丁烷-3-基)甲亚胺
在0℃下，向氧杂环丁烷-3-甲醛(5.0g，58mmol)和MgSO4(6.99g，58.1mmol)于DCM(120mL)中的溶液中添加二苯基甲胺(12.1mL，69.7mmol)。在室温下，将混合物搅拌12小时，接着过滤并减压浓缩，得到所希望的化合物(14g，95.9％产率)，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向N-二苯甲基-1-(氧杂环丁烷-3-基)甲亚胺(10g，39.79mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加TfOH(878mL，9.95mmol)，并在5分钟后，添加重氮乙酸乙酯(5.0mL，47.8mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌12小时，接着冷却至0℃并通过添加饱和NaHCO3(300mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取并将合并的有机层用盐水洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过反相色谱法(50→65％MeCN/H2O，10mM NH4HCO3)纯化，得到外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1.1g，8.2％产率)及外消旋反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(780mg，5.8％产率)。
步骤3：分离外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯：(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
通过手性制备型SFC(25％MeOH/CO2)分离外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(800mg，2.37mmol)，得到(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg，40％产率)和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg，40％产率)。
步骤4：分离外消旋反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯：(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
通过手性制备型SFC(25％EtOH，0.1％NH4OH/CO2)分离外消旋反式1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(700mg，2.07mmol)，得到(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(300mg，42％产率)和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg，43％产率)。
中间体19和20–合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸(19)和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸(20)
Figure BDA0003759053970002321
中间体19和20衍生自上述中间体15和16
步骤1：合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸(19)
向(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(15)(156mg，463mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(347mL，696mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌3小时，接着减压浓缩。用1M HCl将浓缩物酸化至pH 5并用DCM(3×5mL)萃取，并将合并的有机层用盐水洗涤，用Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望的化合物(110mg，72.6％产率)。
步骤2：合成(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸(20)
向(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(16)(150mg，444mmol)于EtOH(5mL)中的溶液中添加2M NaOH(333mL，666mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌3小时，接着用1M HCl酸化至pH 5。用DCM(3×10mL)萃取水层并将合并的有机层用盐水洗涤，用Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望的化合物(120mg，86.1％产率)。
中间体21和22–合成(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠(21)和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠(22)
Figure BDA0003759053970002331
中间体21和22衍生自上述中间体17和18
步骤1：合成(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠(21)
向(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(17)(150mg，444mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(333.42mL，666mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌3小时，接着用1M HCl将pH值调至pH 8。将所得到的溶液冻干，得到所希望的化合物(165mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18NO3的[M]计算值：308.13；实验值308.0。
步骤2：合成(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠(22)
向(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(18)(170mg，503mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(378mL，754mmol)。在室温下，将反应混合物搅拌3小时，接着用1M HCl将pH值调至pH 8。将所得到的溶液冻干，得到所希望的化合物(230mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18NO3的[M]计算值：308.13；实验值308.0。
中间体23–合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002341
步骤1：合成(R,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚胺基)乙酸甲酯
在室温下，向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(13.21g，109.01mmol)和2-氧代乙酸甲酯(8.0g，90.85mmol)于DCM(130mL)中的溶液中添加MgSO4(54.67g，454.23mmol)。将所得到的混合物加热至35℃并搅拌16小时。将所得到的混合物过滤，用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼，并减压浓缩滤液。将残余物通过正相色谱法(25％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望的(5.8g，33.4％产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3S的[M+H]计算值：192.07；实验值191.9。
步骤2：合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下，向1M LiHMDS(61.40mL，61.40mmol)于THF(300.0mL)中的溶液中添加2-溴乙酸叔丁酯(11.83g，60.65mmol)。将所得到的混合物搅拌30分钟。接着，向反应混合物中添加(R,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚胺基)乙酸甲基甲酯(5.8g，30.33mmol)。将所得到的混合物升温至-60℃并搅拌2.5小时。将反应升温至0℃并用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭。用EtOAc(3×200mL)萃取所得到的混合物。将合并的有机层用盐水(500mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50％MeCN/H2O)纯化，得到所希望产物(1.34g，4.5％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO5S的[M+H]计算值：306.14；实验值306.2。
步骤3：合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯(302.0mg，0.99mmol)于DCM(3.0mL)中的溶液中添加TFA(1.50mL)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着减压浓缩，得到所希望的粗产物(300mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H15NO5S的[M+H]计算值：250.07；实验值250.1。
中间体24–合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002351
步骤1：合成(S,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚胺基)乙酸甲酯
在室温下，向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(9.81g，80.94mmol)和2-氧代乙酸甲酯(5.94g，67.45mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加MgSO4(40.60g，337.26mmol)。将所得到的混合物加热至35℃并搅拌16小时。将所得到的混合物过滤，用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼，并减压浓缩滤液。将残余物通过正相色谱法(25％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望的(5.68g，44.0％产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3S的[M+H]计算值：192.07；实验值191.1。
步骤2：合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下，向1M LiHMDS(59.40mL，59.40mmol)于THF(300.0mL)中的溶液中添加2-溴乙酸叔丁酯(11.59g，59.40mmol)。将所得到的混合物搅拌30分钟。接着，向反应混合物中添加(S,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚胺基)乙酸甲基甲酯(5.68g，29.70mmol)。将所得到的混合物升温至-60℃并搅拌2.5小时。将反应升温至0℃并用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭。将所得到的混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(500mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50％MeCN/H2O)纯化，得到所希望产物(1.26g，13.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO5S的[M+H]计算值：306.14；实验值306.1。
步骤3：合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯(457.0mg，1.50mmol)于DCM(6.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着减压浓缩，得到所希望的粗产物(450mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H15NO5S的[M+H]计算值：250.07；实验值250.1。
中间体25和26–合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸和(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002361
步骤1：合成1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在Dean-Stark条件下，使1-乙氧基-2,2,2-三氟乙-1-醇(2.17mL，18.37mmol)和对甲氧基苯甲胺(1.89mL，14.58mmol)于甲苯(46mL)中的溶液回流16小时。将反应物减压浓缩并将所得到的残余物溶解于THF(80mL)中，并冷却至-78℃。将BF3·Et2O(0.360mL，2.92mmol)添加至溶液中，随后逐滴添加重氮乙酸乙酯(1.83mL，17.50mmol)。在室温下搅拌反应4小时。通过添加饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭反应混合物并用DCM(3×50mL)萃取所得到的溶液。将合并的有机层用H2O(20mL)和盐水(10mL)洗涤。将有机相经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(2g，45.2产率)。
步骤2：合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
将1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1g)通过SFC分离(柱：REGIS(S,S)WHELK-O1(250mm*25mm，10um)；流动相：[Neu-IPA]；B％：13％-13％，min)纯化，得到(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(530mg)和(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(470mg)。
步骤3：合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(430mg，1.42mmol)于EtOH(4mL)和H2O(6mL)中的溶液中添加NaOH(113.42mg，2.84mmol)。在室温下，将混合物搅拌5小时。用HCl水溶液(2M)将混合物酸化至pH＝1-2。将反应混合物倒入H2O(3mL)中并将水相用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机相用盐水(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望产物(350mg，89.1％产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H11FNO3的[M+H]计算值：274.08；实验值274.1。
步骤4：合成(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(370mg，1.22mmol)于H2O(2mL)和EtOH(4mL)中的溶液中添加NaOH(97.59mg，2.44mmol)。在室温下，将混合物搅拌5小时。通过添加HCl水溶液(2M)使混合物达到pH＝1–2。将反应混合物倒入H2O(3mL)中并将水相用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机相用盐水(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到所希望产物(300mg，89.0％产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H11FNO3的[M+H]计算值：234.08；实验值234.2。
中间体27和28–合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸和(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002381
步骤1：合成(2S,3R)-2,3-二溴-4,4,4-三氟丁酸乙酯
向(E)-4,4,4-三氟丁-2-烯酸乙酯(5g，29.74mmol，4.42mL)于CCl4(90mL)中的溶液中添加Br2(1.69mL，32.72mmol)并在75℃下，将溶液搅拌5小时。将反应混合物减压浓缩，得到所希望产物(10.72g，粗品)。
步骤2：合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在N2下，在-5℃下向(2S,3R)-2,3-二溴-4,4,4-三氟丁酸乙酯(10.72g，32.69mmol)于EtOH(30mL)中的溶液中缓慢添加BnNH2(12.47mL，114.42mmol)于EtOH(120mL)中的溶液。将混合物升温至室温并搅拌15小时。将混合物减压浓缩并将EtOAc(120mL)添加至残余物中。过滤出沉淀并将滤液用HCl水溶液(3％,180mL)和H2O(100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(6.02g,67.4％产率)。
步骤3：合成(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸是根据Tetrahedron Asymmetry 1999,10,2361中的程序，以Enzyme Screening Platform合成。
步骤4：合成(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200mg，731.93μmol)于EtOH(5mL)中的溶液中添加NaOH(2M，548.95μL)并在室温下，将混合物搅拌1小时。减压浓缩反应混合物以去除EtOH。接着，向混合物中添加HCl(1M)以将pH值调至1，并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到所希望产物(138mg，76.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H10F3NO2的[M+H]计算值：246.07；实验值245.9。
中间体29–合成(R)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002391
步骤1：合成(2S,4S)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在0℃下，向((苯甲氧基)羰基)-L-丙氨酸(25g，111.99mmol)和(二甲氧基甲基)苯(71.38mL，115.35mmol)于THF(180mL)中的混合物中一次性添加SOCl2(8.94g，123.19mmol)。将混合物搅拌10分钟，随后，将ZnCl2(5.77mL，123.26mmol)添加至溶液中，接着在0℃下将混合物搅拌4小时。通过逐滴添加冷H2O淬灭反应混合物并用饱和NaHCO3将其调至pH＝5，接着用EtOAc(2×100mL)萃取。将有机相用饱和NaHCO3水溶液(30mL)和盐水(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(15g，43％产率)。
步骤2：合成(2S,4S)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在N2气氛下，在20℃下将HMPA(5.22mL，29.74mmol)和LHMDS(1M，6.62mL)混合于THF(45mL)中。将此溶液冷却至-78℃并在搅拌下，逐滴添加(2S,4S)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(2.0g，6.42mmol)于THF(12mL)中的溶液。再搅拌30分钟后，逐滴添加CH2I2(1.55mL，19.27mmol)于THF(6mL)中的溶液。在-78℃下，将混合物搅拌90分钟。将混合物升温至0℃并用饱和NH4Cl水溶液(70mL)淬灭。用EtOAc(2×30mL)萃取混合物，并将合并的有机层用饱和NH4Cl水溶液(20mL)、H2O(2×20mL)和盐水(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(1→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(1.2g，41.4％产率)。
步骤3：合成(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯
在N2下，在-40℃下经10分钟向(2S,4S)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(1.2g，2.66mmol)于THF(20mL)中的混合物中逐滴添加NaOMe(957.69mg，5.32mmol，30％纯度)于MeOH(9mL)中的溶液。在-40℃下，将混合物搅拌2小时，接着升温至-20℃并搅拌1小时。通过添加H2O(20mL)淬灭反应并将所得到的混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到产物(870mg，2.24mmol，84.4％产率)。
步骤4：合成(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
在室温下，向(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯(0.87g，2.31mmol)于MeCN(125mL)中的混合物中一次性添加Ag2O(1.60g，6.92mmol)。在90℃下，将混合物搅拌30分钟。将混合物过滤并减压浓缩，得到产物(500mg，2.01mmol，86.9％产率)。
步骤5：合成(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
在N2下，在0℃下向(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(250mg，1.0mmol)于MeCN(2.5mL)和H2O(2.5mL)中的混合物中一次性添加NaOH(40.12mg，1.0mmol)。在0℃下，将混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩，得到粗产物(256mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C12H12NO4的[M+H]计算值：234.1；实验值234.1。
中间体30–合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
Figure BDA0003759053970002411
步骤1：合成异丙基-L-丝氨酸苯甲酯
在0℃下，向L-丝氨酸苯甲酯(3.65g，18.69mmol)、KOAc(1.83g，18.69mmol)和丙酮(2.5mL，33.66mmol)于DCM(60.0mL)中的溶液中分数份添加NaBH(AcO)3(4.76g，22.436mmol)。在室温下，将所得到的混合物搅拌过夜。通过在室温下添加饱和NaHCO3水溶液(50mL)淬灭反应。将所得到的混合物用DCM(3×80mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(67％EtOAc/己烷)纯化，得到呈灰白色固体状的所希望产物(2.7g，60.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H19NO3的[M+H]计算值：238.14；实验值238.2。
步骤2：合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下，向异丙基-L-丝氨酸苯甲酯(2.70g，11.378mmol)、Et3N(4.75mL，34.134mmol)和DMAP(2.57mg，0.021mmol)于DCM(50.0mL)中的溶液中逐滴添加TsCl(2.60g，13.65mmol)于DCM中的溶液。将所得到的混合物在室温下搅拌过夜，接着在40℃下搅拌4小时。将反应混合物用H2O(80mL)稀释，接着用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20％EtOAc/己烷)纯化，得到所希望产物(2.3g，93.2％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值：220.13；实验值220.1。
步骤3：合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
在0℃下，向(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(800.0mg，3.65mmol)以及H2O(6.0mL)和THF(8.0mL)的溶液中逐滴添加KOH(245.62mg，4.378mmol)于H2O(2.0mL)中的溶液。在室温下，将所得到的混合物搅拌2小时。将混合物用H2O(10mL)稀释并用MTBE(3×8mL)洗涤水层。通过冻干将水层干燥，得到所希望产物(400mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H11NO2的[M+H]计算值：130.09；实验值130.0。
中间体31–合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
Figure BDA0003759053970002421
步骤1：合成异丙基-D-丝氨酸苯甲酯
在0℃下，向D-丝氨酸苯甲酯(2.10g，10.757mmol)、KOAc(1.06g，10.757mmol)和丙酮(1.2mL，16.136mmol)于DCM(40.0mL)中的溶液中分数份添加NaBH(AcO)3的溶液(2.96g，13.984mmol)。在室温下，将所得到的混合物搅拌过夜。通过添加饱和NaHCO3水溶液(50mL)淬灭反应并将混合物用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(67％EtOAc/己烷)纯化，得到所希望产物(1.7g，66.6％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H19NO3的[M+H]计算值：238.14；实验值238.0。
步骤2：合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下，向异丙基-D-丝氨酸苯甲酯(1.75g，7.375mmol)、Et3N(2.58mL，18.437mmol)和DMAP(90.09mg，0.737mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中逐滴添加TsCl(1.69g，8.850mmol)于DCM中的溶液。在室温下，将所得到的混合物搅拌过夜，随后在40℃下搅拌4小时。将混合物用H2O(80mL)稀释，接着用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20％EtOAc/己烷)纯化，得到所希望产物(1.4g，86.6％产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值：220.13；实验值219.9。
步骤3：合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
在0℃下，向(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600.0mg，2.736mmol)于H2O(3.0mL)和THF(5.0mL)中的溶液中逐滴添加KOH(184.22mg，3.283mmol)于H2O(2.0mL)中的溶液。在室温下，将所得到的混合物搅拌2小时。接着，将混合物用H2O(10mL)稀释并用MTBE(3×8mL)洗涤水层。接着，将水层通过冻干来干燥，得到所希望产物(260mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H11NO2的[M+H]计算值：130.09；实验值130.1。
中间体32–合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002441
步骤1：合成(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(500.0mg，1.518mmol)、苯甲醇(246.2mg，2.277mmol)和DIPEA(0.793mL，4.554mmol)于MeCN(10.0mL)中的溶液中添加HATU(1.73mg，4.554mmol)。在室温下，将所得到的溶液搅拌3小时，接着减压浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈灰白色固体状的所希望产物(300mg，47.1％产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H25NO2的[M+Na]计算值：442.18；实验值442.3。
步骤2：合成(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(300.0mg，0.715mmol)于DCM(5.0mL)中的溶液中添加TFA(326.2mg，2.860mmol)和Et3SiH(332.6mg，2.860mmol)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌3小时，接着减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(10％MeOH/DCM)纯化，得到所希望产物(130mg，82.1％产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H11NO2的[M+H]计算值：178.09；实验值178.2。
步骤3：合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在室温下，向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(400.0mg，2.257mmol)和叔丁基(2-碘乙氧基)二苯基硅烷(1.85g，4.52mmol)于DMSO(10.0mL)中的溶液中添加K2CO3(935.9mg，6.772mmol)。在60℃下，将混合物搅拌5小时。将混合物用H2O(30.0mL)稀释并用EtOAc(2×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过制备型TLC(20％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(200mg，15.4％产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H33NO3Si的[M+H]计算值：460.23；实验值460.0。
步骤4：合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(200.0mg，0.435mmol)于MeOH(2.0mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(36.5mg，0.870mmol)。将所得到的混合物搅拌过夜，接着减压浓缩，得到所希望产物(200mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C21H27NO3Si的[M+H]计算值：370.18；实验值370.1。
中间体33–合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002451
步骤1：合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲基苯甲酯
在室温下，向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600.0mg，3.386mmol)和K2CO3(1.87g，13.544mmol)于DMSO(8.0mL)中的溶液中分数份添加叔丁基(2-碘乙氧基)二苯基硅烷(1.39g，3.386mmol)。在80℃下，将所得到的混合物搅拌16小时。接着，将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(60→90％MeCN/H2O)纯化，得到呈无色固体状的所希望产物(150mg，9.6％产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H33NO3Si的[M+Na]计算值：482.21；实验值482.3。
步骤2：合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲基苯甲酯(180.0mg，0.392mmol)于H2O(2.0mL)和THF(3.0mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(32.87mg，0.392mmol)于H2O(1.0mL)中的溶液。将所得到的混合物用H2O(6.0mL)稀释并用MTBE(3×4mL)洗涤水层。通过冻干来干燥水层，得到所希望产物(140mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C21H+27NO3Si的[M+H]计算值：370.18；实验值370.0。
中间体34–合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
Figure BDA0003759053970002461
步骤1：合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在60℃下，向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(250mg，1.411mmol)和K2CO3(389.96mg，2.822mmol)于DMSO(4mL)中的混合物中添加1-碘-3-甲氧基丙烷(564.38mg，2.822mmol)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着冷却至室温，用盐水(50mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(25％→40％H2O/MeCN)纯化，得到所希望产物(234mg，63.2％产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO3的[M+H]计算值：250.14；实验值250.2。
步骤2：合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
在0℃下，将(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(230mg，0.923mmol)和LiOH·H2O(77.43mg，1.845mmol)于MeOH(3mL)中的混合物搅拌1小时。将所得到的混合物减压浓缩，得到所希望产物(320mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3的[M+H]计算值：160.09；实验值160.1。
中间体35–合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
Figure BDA0003759053970002471
步骤1：合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在60℃下，向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(350.0mg，1.975mmol)和K2CO3(545.95mg，3.950mmol)于DMSO(4mL)中的混合物中添加1-碘-3-甲氧基丙烷(790.13mg，3.950mmol)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着冷却至室温，用盐水(50mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(30％→38％MeCN/H2O)纯化，得到所希望产物(170mg，31.1％产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO3的[M+H]计算值：250.14；实验值250.2。
步骤2：合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
在0℃下，将(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(170mg，0.682mmol)和LiOH(57.23mg，1.364mmol)于MeOH(2mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩，得到所希望产物(200mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3的[M+H]计算值：160.09；实验值160.3。
中间体36–合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002472
步骤1：合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(440mg，2.48mmol)和3-(碘甲基)-3-甲基氧杂环丁烷(2.11g，9.93mmol)于DMA(5mL)中的混合物中添加K2CO3(1.72g，12.42mmol)和18-冠-6(32.8mg，124μmol)。将反应混合物加热至80℃并搅拌12小时，接着用H2O(25mL)和EtOAc(25mL)稀释。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取，并将合并的有机层用盐水(5×45mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。通过制备型TLC(50％EtOAc/石油醚)纯化，得到所希望产物(367mg，57％产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H19NO3的[M+H]计算值：262.14；实验值262.0。
步骤2：合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(100mg，383μmol)于MeCN(500μL)和H2O(500μL)中的混合物中添加NaOH(23mg，574μmol)。在0℃下，将反应混合物搅拌1小时，接着减压浓缩，得到所希望产物(100mg，粗品)。LCMS(ESI)m/z:C8H13NO3的[M+H]计算值：172.10；实验值172.0。
中间体37–合成(2R,3R)-3-甲基氧杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002481
这一中间体是遵循WO2014071565 A1中略述的程序合成，该案以全文引用的方式并入。
中间体38–合成(2S,3R)-3-甲基氧杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002482
这一中间体是遵循Chem.Pharm.Bull.1990,38,323-328中略述的程序合成，该文献以全文引用的方式并入。
中间体39–合成(2R,3R)-3-苯基氧杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002491
这一中间体是遵循J.Org.Chem.1986,51,46-50中略述的程序合成，该文献以全文引用的方式并入。
中间体40–合成(2R,3S)-3-苯基氧杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002492
这一中间体是遵循J.Org.Chem.1993,58,7615-7618中略述的程序合成，该文献以全文引用的方式并入。
中间体41–合成(2R,3R)-3-乙烯基氧杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0003759053970002493
这一中间体是遵循Helv.Chim.Acta.2013,96,266-274中略述的程序合成，该文献以全文引用的方式并入。
实施例1–合成N-苯甲基-N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002501
步骤1：合成2-氨基-4-溴-5-氯-3-氟苯甲酸
并行操作三个独立的反应。对于每个反应，将2-氨基-4-溴-3-氟苯甲酸(36g，154mmol，1当量)和NCS)(20.54g，154mmol，1当量)于DMF(2L)中的混合物加热至75℃，保持16小时，接着冷却至室温。将三份独立的反应混合物合并，并倒入冰冷的H2O(9L)中。通过真空过滤分离所得到的固体并减压干燥，得到呈黄色固体状的2-氨基-4-溴-5-氯-3-氟苯甲酸(108g，87％产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H5BrClFNO2的[M+H]计算值：267.92；实验值270.1。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.67(d,J＝1.83Hz,1H)。
步骤2：合成7-溴-6-氯-8-氟喹唑啉-4(3H)-酮
并行操作三个独立的反应。对于每个反应，向2-氨基-4-溴-5-氯-3-氟-苯甲酸(35g，130mmol，1当量)于EtOH(800mL)中的溶液中添加乙酸甲脒(149g，1.43mol，11当量)。将反应混合物加热至90℃，保持16小时，接着冷却至室温。将三份独立的反应混合物合并，并减压浓缩。将残余物用H2O(2×1L)、EtOAc(2×100mL)洗涤，接着通过真空过滤分离固体并减压干燥，得到呈黄色固体状的7-溴-6-氯-8-氟-3H-喹唑啉-4-酮(80g，69％产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H4BrClFN2O的[M+H]计算值：276.92；实验值276.9。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.69(br s,1H)8.21(s,1H)8.05(d,J＝1.34Hz,1H)。
步骤3：合成6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4(3H)-酮
向7-溴-6-氯-8-氟-3H-喹唑啉-4-酮(35.0g，126mmol，1当量)和2-氟苯基硼酸(44.1g，315mmol，2.5当量)于二噁烷(1.2L)和H2O(350mL)中的混合物中逐份添加Pd(dppf)Cl2(9.23g，12.6mmol，0.10当量)和Na2CO3(40.11g，378mmol，3当量)。将所得到的混合物加热至85℃。16小时后，将反应物冷却至室温。将所得到的混合物过滤，并用EtOAc(3×30mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(1％石油醚/EtOAc)部分纯化，得到呈黄色固体状的粗产物(16g)。将粗产物通过反相色谱法(10→50％MeCN/H2O，0.05％NH4HCO3)进一步纯化，得到呈灰白色固体状的6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-3H-喹唑啉-4-酮(9.5g，26％产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H8ClF2N2O的[M+H]计算值：293.03；实验值293.2。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.68(s,1H),8.24(s,1H),8.08(d,J＝2.4Hz,1H),7.93–7.65(m,1H),7.64–7.38(m,3H)。
步骤4：合成4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉
向6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4(3H)-酮(5.1g，17.4mmol，1当量)于亚硫酰氯(40mL，548mmol，31.5当量)中的溶液中添加DMF(0.1mL)。将所得到的混合物加热至75℃。17小时后，将反应物冷却至室温并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/己烷，1.0％NEt3)纯化，得到呈白色固体状的4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(4.7g，87％产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H7Cl2F2N2的[Μ+H]计算值:311.00；实验值311.3。
步骤5：合成(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(500mg，1.6mmol，1当量)于DCM(16mL)中的溶液中添加NEt3(444μL，3.20mmol，2当量)，随后添加哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(480mg，2.4mmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌20分钟，接着用DCM(100mL)稀释，用饱和NH4Cl水溶液(50mL)，接着饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C24H26ClF2N4O2的[M+H]计算值：475.17；实验值475.4。
步骤6：合成1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐
向N-{1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(911mg，1.92mmol)于二噁烷(4.8mL)中的悬浮液中缓慢添加HCl(4M于二噁烷中，4.80mL，19.2mmol，10当量)。将所得到的混合物搅拌5小时，接着减压浓缩。在减压下，将粗产物自DCM(2×5mL)浓缩并且不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18ClF2N4的[M+H]计算值：375.12；实验值375.3。
步骤7：合成1-苯甲基-3-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)硫脲
向1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-胺盐酸盐(100mg，266μmol，1当量)于DCM(2.7mL)中的溶液中添加NEt3(111μL，798μmol，3当量)，随后添加异硫氰酸苯甲酯(35.2μL，266μmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌20小时，接着用DCM(40mL)稀释，用H2O(20mL)洗涤，随后用饱和NaCl水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C27H25ClF2N5S的[M+H]计算值：524.15；实验值524.6。
步骤8：合成N-苯甲基-N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
向1-苯甲基-3-{1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-基}硫脲(64mg，122μmol，1当量)于DCM(1.22mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(63.7μL，366μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(46.7mg，183μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌18小时，接着过滤以去除固体。将滤液用DCM(20mL)稀释，用H2O(10mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(60→100％MeCN/H2O)纯化，得到呈白色固体状的N-苯甲基-N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺(11.9mg，经4个步骤20％产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H23ClF2N5的[M+H]计算值：490.16；实验值490.2。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.63(s,1H),7.92(d,J＝1.8Hz,1H),7.63–7.56(m,1H),7.46(td,J＝7.5,1.9Hz,1H),7.41–7.35(m,5H),7.35–7.26(m,2H),4.36(s,2H),4.16–4.04(m,2H),3.72–3.49(m,3H),2.04–1.87(m,2H),1.59–1.46(m,2H)。
实施例2–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-N-苯基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002531
根据实施例1的方法，在步骤7中使用异硫氰酸苯酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C26H21ClF2N5的[M+H]计算值：476.15；实验值476.1。
实施例3–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-N-异丙基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002541
根据实施例1的方法，在步骤7中使用异硫氰酸2-丙酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C23H23ClF2N5的[M+H]计算值：442.16；实验值442.1。
实施例4–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-N-甲基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002542
根据实施例1的方法，在步骤7中使用异硫氰酸甲酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C21H19ClF2N5的[M+H]计算值：414.13，实验值414.1。
实施例5–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-N-(4-甲氧基苯基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002543
根据实施例1的方法，在步骤7中使用异硫氰酸4-甲氧基苯酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C27H23ClF2N5O的[M+H]计算值：506.16；实验值506.2。
实施例6–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-N-(4-氯苯基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002551
根据实施例1的方法，在步骤7中使用异硫氰酸4-氯苯酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C26H20Cl2F2N5的[M+H]计算值：510.11；实验值510.1。
实施例7–合成6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-N-甲基-N-(2-(((苯基亚氨基)亚甲基)氨基)乙基)喹唑啉-4-胺
Figure BDA0003759053970002552
根据实施例1的方法，在步骤5中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤7中使用异硫氰酸苯酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C24H19ClF2N5的[M+H]计算值：450.90；实验值450.1。
实施例8–合成N-(2-(((苯甲基亚氨基)亚甲基)氨基)乙基)-6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-N-甲基喹唑啉-4-胺
Figure BDA0003759053970002561
根据实施例1的方法，在步骤5中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C25H21ClF2N5的[M+H]计算值：464.92；实验值464.2。
实施例9–合成6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-N-甲基-N-(2-(((甲基亚氨基)亚甲基)氨基)乙基)喹唑啉-4-胺
Figure BDA0003759053970002562
根据实施例1的方法，在步骤5中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤7中使用异硫氰酸甲酯代替异硫氰酸苯甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C19H17ClF2N5的[M+H]计算值：388.83；实验值388.1。
实施例10–合成1-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-氯乙基)脲
Figure BDA0003759053970002563
步骤1：合成(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(500mg，1.6mmol，1当量)于DCM(16mL)中的溶液中添加NEt3(444μL，3.20mmol，2当量)，随后添加哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(480mg，2.4mmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌20分钟，接着用DCM(100mL)稀释，用饱和NH4Cl水溶液(50mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C24H26ClF2N4O2的[M+H]计算值：475.17；实验值475.4。
步骤2：合成1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-胺
向N-{1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(911mg，1.92mmol)于二噁烷(4.8mL)中的悬浮液中缓慢添加HCl(4M于二噁烷中，4.80mL，19.2mmol，10当量)。将所得到的混合物搅拌5小时，接着减压浓缩。在减压下，将粗产物自DCM(2×5mL)浓缩并且不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18ClF2N4的[M+H]计算值：375.12；实验值375.3。
步骤3：合成1-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-氯乙基)脲.
向1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-胺(145mg，386μmol，1当量)于DCM(1.5mL)中的悬浮液中添加NEt3(159μL，1.15mmol，3.0当量)，随后添加1-氯-2-异硫氰酸基乙烷(32.9μL，386μmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌30分钟，接着减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(2→25％MeOH/DCM，1.0％NEt3)纯化，得到呈白色固体状的1-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-氯乙基)脲(57.6mg，31％产率)。LCMS(ESI)m/z:C22H22Cl2F2N5O的[Μ+H]计算值：480.12；实验值480.5。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ8.80(s,1H),7.82(d,J＝1.5Hz,1H),7.57–7.48(m,1H),7.39(td,J＝7.4,1.8Hz,1H),7.32(td,J＝7.5,1.0Hz,1H),7.28–7.23(m,1H),4.86–4.77(m,1H),4.55–4.47(m,1H),4.41(t,J＝11.9Hz,2H),4.09–3.97(m,1H),3.67(t,J＝5.3Hz,2H),3.59(q,J＝5.4Hz,2H),3.50–3.35(m,2H),2.20(d,J＝13.2Hz,2H),1.72–1.58(m,2H)。
实施例11–合成4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)-N-(2-氯乙基)哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002581
根据实施例10的方法，在步骤1中使用哌嗪-1-甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C21H20Cl2F2N5O的[Μ+H]计算值：466.10；实验值466.3。
实施例12–合成1-(2-((6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)氨基)乙基)-3-(2-氯乙基)脲
Figure BDA0003759053970002582
根据实施例10的方法，在步骤1中使用(2-氨基乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C19H18Cl2F2N5O的[Μ+H]计算值：440.09；实验值440.1。
实施例13–合成N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-4,5-二氢噁唑-2-胺
Figure BDA0003759053970002591
向1-{1-[6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基]哌啶-4-基}-3-(2-氯乙基)脲(44mg，91.6μmol，1当量)于THF(915μL)和H2O(915μL)中的悬浮液中添加NEt3(15.1μL，109μmol，1.2当量)。将所得到的混合物加热至60℃。18小时后，将反应物冷却至室温并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(10→99％MeCN/H2O，0.1％NEt3)纯化，得到N-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-4,5-二氢噁唑-2-胺(17.2mg，42％)。LCMS(ESI)m/z:C22H21ClF2N5O的[Μ+H]计算值：444.14；实验值444.2。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ8.80(s,1H),7.81(d,J＝1.7Hz,1H),7.55–7.48(m,1H),7.39(td,J＝7.4,1.8Hz,1H),7.32(td,J＝7.5,1.1Hz,1H),7.28–7.24(m,1H),4.35(t,J＝8.6Hz,4H),3.85(t,J＝8.5Hz,3H),3.39(qd,J＝13.7,2.6Hz,2H),2.28(dd,J＝12.7,3.0Hz,2H),1.77–1.64(m,2H)。
实施例14–合成2-(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)-4,5-二氢噁唑
Figure BDA0003759053970002592
根据实施例13的方法，使用实施例11代替实施例10合成。LCMS(ESI)m/z:C21H19ClF2N5O的[Μ+H]计算值：430.13；实验值430.4。
实施例15–合成N1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)-N2-(4,5-二氢噁唑-2-基)乙-1,2-二胺
Figure BDA0003759053970002601
根据实施例13的方法，使用实施例12代替实施例10合成。LCMS(ESI)m/z:C19H17ClF2N5O的[Μ+H]计算值：404.11；实验值404.4。
实施例16–合成氮杂环丙烷-2-基(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)甲酮
Figure BDA0003759053970002602
步骤1：合成1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
向1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(300mg，0.873mmol，1当量)于MeCN(1.57mL)中的溶液中添加氢氧化钠(52.4mg，1.31mmol，1.5当量)于H2O(1.57mL)中的溶液。将所得到的混合物搅拌18小时，接着减压浓缩，得到1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸，该物质不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(203mg，520μmol，1当量)和粉末状
Figure BDA0003759053970002611
分子筛(200mg)于DCM(13mL)中的悬浮液中添加NEt3(143μL，1.03mmol，2当量)，随后添加哌嗪-1-甲酸叔丁酯(129mg，692μmol，1.3当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/己烷)纯化，得到4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯。LCMS(ESI)m/z:C23H24ClF2N4O2的[M+H]计算值：461.16；实验值461.4。
步骤3：合成6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)喹唑啉
将4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(90mg，195μmol，1当量)于HCl(4M于二噁烷中，1mL，109mmol，559当量)中的悬浮液搅拌1小时，接着减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C18H16ClF2N4的[M+H]计算值：361.11；实验值361.3。
步骤4：合成(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
向1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(164mg，0.499mmol，1当量)、6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)喹唑啉(180mg，0.499mmol，1当量)和HOBt(3.36mg，0.0249mmol，0.05当量)于DMA(2.5mL)中的溶液中添加NMM(119μL，1.09mmol，2.2当量)，随后添加EDC(104mg，0.549mmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着用EtOAc稀释，用1:1的H2O/饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的固体通过硅胶柱色谱法(0％→100％EtOAc/己烷)纯化，得到(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮。LCMS(ESI)m/z:C40H33ClF2N5O的[Μ+H]计算值：672.23；实验值672.3。
步骤5：合成氮杂环丙烷-2-基(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)甲酮
在0℃下，向(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(50mg，0.0744mmol，1当量)于MeOH(371μL)和CHCl3(371μL)中的溶液中逐滴添加TFA(45.5μL，0.595mmol，8当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌2小时，接着用N,N-二异丙基乙胺(129μL，0.744mmol，10当量)淬灭并升温至室温。将反应用DCM稀释，用饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的固体通过反相色谱法(10→100％MeCN/H2O)纯化，得到呈白色固体状的氮杂环丙烷-2-基(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)甲酮(11mg，35％产率)。LCMS(ESI)m/z:C21H19ClF2N5O的[Μ+H]计算值：430.12；实验值430.4。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.69(s,1H),8.08(d,J＝1.7Hz,1H),7.58(tdd,J＝7.6,5.3,1.8Hz,1H),7.45(td,J＝7.4,1.9Hz,1H),7.37(td,J＝7.5,1.1Hz,1H),7.32(dd,J＝9.7,8.4Hz,1H),4.19–4.09(m,1H),4.09–3.94(m,6H),3.87(t,J＝5.3Hz,2H),2.98(dd,J＝5.8,3.4Hz,1H),1.92(d,J＝5.8Hz,1H),1.89(d,J＝3.3Hz,1H)。
实施例17–合成1-(2-(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-1-基)乙-1-酮
Figure BDA0003759053970002621
在0℃下，向氮杂环丙烷-2-基(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-基)甲酮(20mg，0.0465mmol，1当量)于DCM(465μL)中的溶液中添加NEt3(32.3μL，0.233mmol，5当量)，随后添加乙酰氯(6.6μL，0.093mmol，2当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌1小时，接着用DCM稀释，用饱和NaHCO3水溶液、随后饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过反相色谱法(10→100％MeCN/H2O)纯化，得到呈白色固体状的1-(2-(4-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-1-基)乙-1-酮(14mg，62％产率)。LCMS(ESI)m/z:C23H21ClF2N5O2的[Μ+H]计算值：472.14；实验值472.2。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.69(s,1H),8.09(d,J＝1.8Hz,1H),7.59(dddd,J＝8.4,7.3,5.3,1.8Hz,1H),7.45(td,J＝7.4,1.8Hz,1H),7.38(td,J＝7.5,1.1Hz,1H),7.32(ddd,J＝9.6,8.4,1.0Hz,1H),4.20–3.97(m,6H),3.91(ddt,J＝13.7,7.0,3.5Hz,1H),3.82(ddt,J＝13.4,7.5,3.9Hz,1H),3.71(dd,J＝5.5,3.1Hz,1H),2.61(dd,J＝5.5,1.8Hz,1H),2.57(dd,J＝3.1,1.8Hz,1H),2.17(s,3H)。
实施例18–合成1-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-2,2,2-三氟乙-1-酮
Figure BDA0003759053970002631
向4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(70mg，0.22mmol，1当量)和2,2,2-三氟-1-(哌啶-4-基)乙-1,1-二醇盐酸盐(132mg，0.563mmol，2.5当量)于二噁烷(2.3mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(192μL，1.12mmol，5当量)。将混合物加热至50℃，保持2.5小时，接着减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/己烷)纯化，得到呈白色粉末状的1-(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)-2,2,2-三氟乙-1-酮(29mg，27％产率)。LCMS(ESI)m/z:C21H18ClF5N3O2的[Μ+H2O+H]计算值：474.10；实验值474.3。通过NMR观察到为2:1的酮/水合物的混合物。1H NMR(酮产物)(500MHz,DMSO-d6)δ8.71(s,1H),8.00(d,J＝1.5Hz,1H),7.62(dddd,J＝8.7,7.4,5.4,1.8Hz,1H),7.53(tt,J＝7.5,1.7Hz,1H),7.49–7.36(m,2H),4.38(d,J＝13.0Hz,2H),3.51–3.38(m,2H),3.23(t,J＝12.2Hz,1H),2.08(d,J＝13.5Hz,2H),1.81(qd,J＝11.7,3.9Hz,2H)。
实施例19–合成(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)硼酸
Figure BDA0003759053970002641
步骤1.合成6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)喹唑啉
向4,6-二氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉(102mg，0.327mmol，1当量)和4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶(173mg，0.820mmol，2.5当量)于二噁烷(3.3mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(281μL，1.63mmol，5当量)。将混合物加热至50℃，保持3小时，接着减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→25％EtOAc/己烷)纯化，得到呈泡沫状的6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)喹唑啉(102mg，64％)。LCMS(ESI)m/z:C25H28BClF2N3O2的[Μ+H]计算值：486.20；实验值486.4。
步骤2.合成(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)硼酸
向6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)喹唑啉(85mg，0.17mmol，1当量)于丙酮/H2O(10:1，874μL)中的溶液中添加乙酸铵(1M，524μL，0.525mmol，3当量)和高碘酸钠(112mg，0.525mmol，3当量)。24小时后，将混合物用H2O(500μL)稀释，用1N HCl酸化，并通过反相色谱法(10→99％MeCN/H2O，0.1％甲酸)纯化，得到呈白色粉末状的(1-(6-氯-8-氟-7-(2-氟苯基)喹唑啉-4-基)哌啶-4-基)硼酸(34mg，48％产率)。LCMS(ESI)m/z:C19H18BClF2N3O2的[Μ+H]计算值：404.11；实验值404.3。1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ8.63(s,1H),7.92(d,J＝1.5Hz,1H),7.64–7.58(m,1H),7.51(dd,J＝7.4,1.8Hz,1H),7.46–7.38(m,2H),4.28(dt,J＝13.2,3.7Hz,2H),3.31–3.25(m,2H),1.85–1.72(m,2H),1.64(qt,J＝11.2,3.6Hz,2H),1.12(tt,J＝11.5,3.9Hz,1H)。
实施例20–合成N-(2-甲氧基乙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002661
步骤1：合成1-溴-8-甲基萘
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向1,8-二溴萘(75g，262mmol，1当量)于THF(1.5L)中的溶液中逐滴添加MeLi(1M于2-甲基四氢呋喃中，420mL，1.6当量)，接着将混合物升温至13℃。0.5小时后，将MeI(253g，1.78mol，6.8当量)逐滴添加至混合物中。0.5小时后，将两份独立的反应混合物合并。将H2O(2L)倒入混合物中，并用EtOAc(2×800mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(800mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(100％石油醚)纯化，随后通过反相色谱法纯化，得到呈白色固体状的1-溴-8-甲基-萘(60g，51％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.84(dd,J＝1.2,7.4Hz,1H),7.79(d,J＝8.1Hz,1H),7.75–7.68(m,1H),7.39–7.33(m,2H),7.22(t,J＝7.8Hz,1H),3.14(s,3H)。
步骤2：合成4-羟基-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
并行操作五个独立的反应。对于每个反应，向3-氧代哌啶-1,4-二甲酸1-叔丁酯4-乙酯(50g，184mmol，1当量)于MeOH(1L)中的溶液中逐滴添加NaOMe(49.8g，921mmol，5当量)，随后添加硫代异脲硫酸甲酯(46.17g，332mmol，1.8当量)。在室温下，将反应混合物搅拌3小时，接着将五份独立反应混合物合并，用2M HCl酸化至pH5，并减压浓缩。将残余物悬浮于EtOAc(1.5L)和H2O(1.5L)中并将混合物快速搅拌10分钟。将所得到的悬浮液过滤，并真空干燥白色固体。将混合物与无水甲苯(500mL)共沸，接着减压浓缩，得到呈白色固体状的4-羟基-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(250g，76％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ4.41–4.18(m,2H),3.60(s,2H),2.57(s,5H),1.50(s,9H)。
步骤3：合成4-(苯甲氧基)-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
并行操作三个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向4-羟基-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(60g，202mmol，1当量)于甲苯(1.3L)中的溶液中添加Ag2CO3(44.5g，161mmol，0.8当量)和溴甲基苯(41.4g，242mmol，1.2当量)。将所得到的混合物加热至110℃，保持8小时，接着冷却至室温。将三份独立反应混合物合并，过滤并用EtOAc(2×500mL)和H2O(2×600mL)洗涤固体饼状物。将水相用EtOAc(3×500mL)萃取并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(1L)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→15％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的4-(苯甲氧基)-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(230g，98％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.46–7.29(m,5H),5.46(s,2H),4.48(s,2H),3.64(t,J＝5.6Hz,2H),2.65(s,2H),2.58–2.51(m,3H),1.48(s,9H)。
步骤4：合成4-(苯甲氧基)-2-(甲基磺酰基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向4-(苯甲氧基)-2-(甲硫基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(75g，193mmol，1当量)于DCM(780mL)中的溶液中逐份添加m-CPBA(117g，542mmol，80％纯度，2.8当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌3小时。将两份独立反应混合物合并，并用饱和Na2SO3水溶液淬灭，直至KI淀粉试纸确定无氧化剂残留。将有机相用饱和NaCl水溶液(400mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将产物通过硅胶柱色谱法(0→25％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的4-(苯甲氧基)-2-(甲基磺酰基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(100g，62％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.50–7.30(m,5H),5.55(s,2H),4.65(s,2H),3.70(t,J＝5.6Hz,2H),3.29(s,3H),2.78(s,2H),1.49(s,9H)。
步骤5：合成(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
并行操作三个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向4-(苯甲氧基)-2-(甲基磺酰基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(80g，191mmol，1当量)和(S)-(1-甲基吡咯烷-2-基)甲醇(43.9g，381mmol，2当量)于甲苯(560mL)中的溶液中添加t-BuONa(36.7g，381mmol，2当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌10分钟，接着将两份独立反应混合物合并，用H2O(1L)淬灭并萃取至EtOAc(2×300mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％MeOH/EtOAc)纯化，得到粗产物，将其悬浮于MTBE(800mL)中并搅拌20分钟。将混合物过滤并用MTBE(3×50mL)洗涤固体饼状物，接着减压浓缩滤液，得到呈黄色液体状的(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(100g，46％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.48–7.32(m,5H),5.44(s,2H),4.46(s,1H),4.49–4.41(m,2H),4.19(m,1H),3.64(t,J＝5.4Hz,2H),3.10(t,J＝7.5Hz,1H),2.64(m,3H),2.49(s,3H),2.36–2.22(m,1H),1.88–1.60(m,4H),1.48(s,9H)。
步骤6：合成(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶
向(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(80g，176mmol，1当量)于二噁烷(400mL)中的溶液中添加HCl(4M于二噁烷中，1.10L,25当量)。30分钟后，将混合物过滤并用MTBE(2×100mL)洗涤固体饼状物，接着用MTBE(300mL)研磨20分钟。将混合物过滤，并减压干燥固体饼状物。将固体悬浮于DCM(200mL)中并用饱和NaHCO3水溶液将pH值调至pH 7-8。将混合物萃取至DCM(20×100mL)中，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到呈红色固体状的(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(52g，83％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.46–7.30(m,5H),5.48–5.40(s,2H),4.44(dd,J＝5.1,10.8Hz,1H),4.20(dd,J＝6.7,10.7Hz,1H),3.88(s,2H),3.17(t,J＝7.6Hz,1H),3.10(t,J＝5.9Hz,2H),2.83–2.69(m,1H),2.58(t,J＝5.8Hz,2H),2.53(s,3H),2.40–2.29(m,1H),2.13–2.03(m,1H),1.93–1.70(m,3H)。
步骤7：合成(S)-4-(苯甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶
向(S)-4-(苯甲氧基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(20g，56.4mmol，1当量)于二噁烷(400mL)中的溶液中添加1-溴-8-甲基萘(18.7g，84.6mmol，1.5当量)、Cs2CO3(46.0g，141mmol，2.5当量)、RuPhos(5.27g，11.3mmol，0.2当量)和Pd2(dba)3(5.17g，5.64mmol，0.1当量)。将所得到的混合物加热至100℃，保持13小时，接着冷却至室温。将混合物过滤，并用DCM(3×80mL)洗涤固体饼状物，接着减压浓缩滤液。将混合物悬浮于EtOAc(90mL)和H2O(90mL)中。将水相萃取至EtOAc(3×60mL)中，将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(100％EtOAc)纯化，得到呈褐色油状的(S)-4-(苯甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(16g，44％产率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.72–7.61(m,2H),7.50–7.45(m,2H),7.44–7.30(m,5H),7.26–7.21(m,1H),5.58–5.40(m,2H),4.49–4.27(m,1H),4.25–4.05(m,2H),3.84(d,J＝17.4Hz,1H),3.52(dd,J＝5.4,11.9Hz,1H),3.28–3.04(m,2H),2.98–2.83(s,3H),2.73(d,J＝16.6Hz,2H),2.49(s,3H),2.36–2.23(m,1H),2.15–1.99(m,1H),1.89–1.55(m,5H)。
步骤8：合成(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-醇
向(S)-4-(苯甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(20g，40.4mmol，1当量)于MeOH(400mL)中的溶液中添加Pd/C(7g，10％纯度)。在H2(30psi)下，在30℃下将混合物搅拌1小时，接着过滤并用MeOH(5×100mL)洗涤滤饼。将固体饼状物悬浮于DCM(100mL)中并在15℃下将混合物搅拌10分钟，接着过滤。用DCM(5×50mL)洗涤滤饼并将合并的有机相减压浓缩。将所得到的粗产物用MTBE(100mL)研磨20分钟，接着减压干燥，得到呈白色固体状的(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-醇(10g，59％产率)。LCMS(ESI)m/z:C24H29N4O2的[M+H]计算值：405.22；实验值405.2。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.66(dd,J＝7.5,18.3Hz,2H),7.41(t,J＝7.7Hz,1H),7.35–7.29(m,2H),7.26–7.20(m,1H),4.48–4.40(m,1H),4.39–4.30(m,1H),3.89–3.81(m,1H),3.65(d,J＝17.2Hz,1H),3.48(dd,J＝6.0,11.7Hz,1H),3.25–3.13(m,2H),2.91(s,1H),2.88(s,3H),2.77(d,J＝8.6Hz,1H),2.63(s,1H),2.57(d,J＝1.8Hz,3H),2.56–2.46(m,1H),2.17–2.04(m,1H),1.94–1.69(m,3H)。
步骤9：合成三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯
向(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-醇(1.5g，3.70mmol，1当量)于DCM(10mL)中的溶液中添加DBU(553μL，3.70mmol，1当量)、N-苯基-双(三氟甲烷磺酰亚胺)(1.98g，5.55mmol，1.5当量)和DMAP(9.04mg，0.074mmol，0.02当量)。4小时后，将反应减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(0→70％EtOAc/己烷，1％NEt3)纯化，得到呈褐色油状的三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(1.5g,76％产率)。LCMS(ESI)m/z:C25H27F3N4O4S的[Μ+H]计算值：537.58；实验值537.2。
步骤10：合成(S)-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
将三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(500mg，931μmol，1当量)、哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(372mg，1.86mmol，2.0当量)和N,N-二异丙基乙胺(485μL，2.79mmol，3.0当量)添加至DMF(5mL)中。将反应物加热至95℃，保持3小时。将反应物冷却至室温并用H2O(10mL)稀释，用EtOAc(3×10mL)洗涤水相并将有机层合并，并用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C34H47N6O3的[Μ+H]计算值：587.79；实验值587.4。
步骤11：合成(S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐
向(S)-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(600mg，1.02mmol，1当量)于DCM(3mL)中的溶液中添加HCl(4M于二噁烷中，1.02mL，2当量)。搅拌反应18小时，接着减压浓缩，得到(S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C29H39N6O的[Μ+H]计算值：487.67；实验值487.3。
步骤12：合成(S)-1-(2-甲氧基乙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲
向(S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐(70mg，133μmol，1当量)于DCM(1.33mL)中的悬浮液中添加NEt3(55.5μL，399μmol，3当量)，随后添加1-异硫氰酸基-2-甲氧基乙烷(异硫氰酸2-甲氧基乙基酯)(17.1mg，146μmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌17小时，接着用DCM(20mL)稀释，用H2O(10mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥,过滤，并减压浓缩，得到呈褐色固体状的(S)-1-(2-甲氧基乙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲(53.1mg，经3个步骤66％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H46N7O2S的[M+H]计算值：604.34；实验值604.6。
步骤13：合成N-(2-甲氧基乙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
向(S)-1-(2-甲氧基乙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲(53.1mg，87.9μmol，1当量)于DCM(878μL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(45.6μL，263μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(33.4mg，131μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌16小时，接着过滤以去除固体，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O，0.4％NH4OH)纯化，得到呈浅褐色油状的N-(2-甲氧基乙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺(15.4mg，31％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H44N7O2的[M+H]计算值：570.36；实验值570.4；1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.70(d,J＝8.3Hz,1H),7.66(dd,J＝8.1,1.3Hz,1H),7.42(t,J＝7.7Hz,1H),7.36–7.29(m,2H),7.26(d,J＝7.0Hz,1H),4.39(ddd,J＝12.9,10.9,6.1Hz,1H),4.29(ddd,J＝16.6,10.9,5.8Hz,1H),4.13–4.02(m,2H),4.01–3.93(m,1H),3.71–3.58(m,2H),3.57–3.50(m,3H),3.41–3.34(m,6H),3.27–3.12(m,3H),3.08(dt,J＝9.6,4.5Hz,1H),2.94(s,3H),2.78–2.69(m,1H),2.66–2.57(m,1H),2.50(d,J＝1.1Hz,3H),2.35(q,J＝9.0Hz,1H),2.16–2.04(m,2H),2.04–1.97(m,1H),1.87–1.76(m,3H),1.76–1.56(m,2H)。
实施例21–合成N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002731
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C31H40N7O的[M+H]计算值：526.71；实验值526.3。
实施例22–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-丙基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002741
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸1-丙酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C33H44N7O的[M+H]计算值：554.36；实验值554.3。
实施例23–合成N-异丙基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002742
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸2-丙酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C33H44N7O的[M+H]计算值：554.36；实验值554.3。
实施例24–合成N-苯甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002751
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C37H44N7O的[M+H]计算值：602.81；实验值602.4。
实施例25–合成N-(3-甲氧基丙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002752
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸3-甲氧基丙酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H46N7O2的[M+H]计算值：584.37；实验值584.4。
实施例26–合成N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-N-(2-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)乙基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002753
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸1-丙酯代替2-甲氧基乙基合成。LCMS(ESI)m/z:C31H42N7O的[M+H]计算值：528.35；实验值528.3。
实施例27–合成N-(2-(((苯甲基亚氨基)亚甲基)氨基)乙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002761
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯，并在步骤12中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H42N7O的[M+H]计算值：576.77；实验值576.5。
实施例28–合成N-(2-((((4-氯苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)乙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002762
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用4-氯异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H41ClN7O的[M+H]计算值：610.31；实验值610.3。
实施例29–合成N-(2-((((4-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)乙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002771
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-(甲基氨基)乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸4-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H44N7O2的[M+H]计算值：606.36；实验值606.4。
实施例30–合成N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-N-(3-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)丙基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002772
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中异硫氰酸1-丙酯代替2-甲氧基乙基合成。LCMS(ESI)m/z:C32H44N7O的[M+H]计算值：542.75；实验值542.4。
实施例31–合成N-(3-(((苯甲基亚氨基)亚甲基)氨基)丙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002781
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H44N7O的[M+H]计算值：590.36；实验值590.3。
实施例32–合成N-(3-((((4-氯苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002782
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸4-氯苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H43ClN7O的[M+H]计算值：625.24；实验值625.3。
实施例33–合成N-(3-((((4-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970002791
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸4-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C37H46N7O2的[M+H]计算值：620.82；实验值620.4。
实施例34–合成(S)-N-(2-氯乙基)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002792
步骤1：合成(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1,4-二甲酸1-苯甲酯4-叔丁酯(50g，139mmol，1当量)于EtOAc(500mL)中的溶液中添加HCl(4M于EtOAc中，174mL，5当量)。12小时后，将反应混合物减压浓缩，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(41g，HCl盐)。LCMS(ESI)m/z:C14H18N3O2的[M+H]计算值：260.13；实验值260.2。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.47–7.31(m,5H),5.18(s,2H),4.81(s,1H),4.25(br s,1H),3.66(d,J＝12.6Hz,1H),3.56–3.32(m,3H),3.18(br d,J＝11.6Hz,1H),3.08–2.90(m,2H)。
步骤2：合成(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-氯-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
将(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(41g，158mmol，1当量)、2,4-二氯-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(48g，158mmol，1当量)和N,N-二异丙基乙胺(41g，316mmol，55mL，2.0当量)于DMSO(410mL)中的溶液加热至50℃。3小时后，将反应混合物冷却至室温并使其在EtOAc(500mL)与饱和NaCl水溶液(200mL)之间分配。将有机相用饱和NaCl水溶液(3×300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(2→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-氯-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(67g，79％产率)。LCMS(ESI)m/z:C26H32ClN6O4的[M+H]计算值：527.21；实验值527.2。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.39(s,5H),5.20(s,2H),4.72–4.60(m,2H),4.50–4.39(m,1H),4.18–4.02(m,2H),3.88(m,J＝13.0Hz,2H),3.39(m,J＝11.7Hz,3H),3.11(m,1H),2.88–2.58(m,4H),1.49(s,9H)。
步骤3：合成4-((S)-4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，向(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-氯-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(28g，53mmol，1当量)和(S)-(1-甲基吡咯烷-2-基)甲醇(30.6g，266mmol，31.5mL，5.0当量)于二噁烷(40mL)中的溶液中添加Cs2CO3(34.6g，106mmol，2当量)，并将所得到的混合物加热至90℃。12小时后，将反应物冷却至室温。将两份独立反应混合物合并，并倒入H2O(100mL)。用DCM(2×200mL)萃取水相。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(10→100％EtOAc/石油醚→20％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈黄色固体状的4-((S)-4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(43g，57％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H44N7O5的[M+H]计算值：606.33；实验值606.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.45–7.27(m,5H),5.17-5.19(m,2H),4.69(br s,1H),4.55–4.45(m,1H),4.39–4.22(m,3H),4.16–3.91(m,4H),3.82–3.70(m,1H),3.38(br d,J＝8.8Hz,2H),3.16–2.82(m,4H),2.77–2.64(m,3H),2.53–2.45(s,3H),2.41(m,1H),2.38–2.24(m,1H),2.03(m,2H),1.87–1.55(m,1H),1.49(s,9H)。
步骤4：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向4-((S)-4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(8H)-甲酸叔丁酯(33g，54.5mmol，1当量)于二噁烷(150mL)中的溶液中添加HCl(4M于二噁烷中，454mL，25当量)。1小时后，将反应减压浓缩。将所得到的残余物倒入饱和NaHCO3水溶液(100mL)中并将水相萃取至DCM(5×100mL)中。将合并的有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(25g，90％产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H36N7O3的[M+H]计算值：506.28；实验值506.3。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.48–7.22(m,5H),5.27–5.09(m,2H),4.69(s,1H),4.38–4.28(m,2H),4.15–3.95(m,3H),3.82(s,2H),3.72–3.53(m,2H),3.18–2.78(m,7H),2.73–2.61(m,2H),2.53(s,3H),2.48–2.37(m,1H),2.17–2.00(m,1H),1.89–1.63(m,3H)。
步骤5：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(20g，39.6mmol，1当量)于二噁烷(300mL)中的溶液中添加1-溴-8-甲基-萘(13.1g，59.3mmol，1.5当量)、Cs2CO3(32.2g，99mmol，2.5当量)、RuPhos(3.69g，7.91mmol，0.2当量)和Pd2(dba)3(3.62g，4.0mmol，0.1当量)并将所得到的混合物加热至100℃。12小时后，将反应物冷却至室温，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物倒入H2O(200mL)中。将水相用DCM(3×300mL)萃取并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(2→100％EtOAc/石油醚→20％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(8.2g，30％产率)。LCMS(ESI)m/z:C38H44N7O3的[M+H]计算值：646.34；实验值646.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.71–7.61(m,2H),7.48–7.19(m,9H),5.26–5.13(m,2H),4.70(br s,1H),4.38–4.25(m,2H),4.20–3.98(m,3H),3.77–3.62(m,1H),3.57–3.39(m,2H),3.26–3.14(m,3H),3.13–3.01(m,2H),2.90(s,3H),2.84(br s,1H),2.77–2.61(m,2H),2.48(d,J＝4.5Hz,3H),2.41–2.28(m,1H),2.14–2.02(m,1H),1.87–1.62(m,3H)。
步骤6：合成2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(8.2g，12.70mmol，1当量)于MeOH(120mL)和THF(120mL)中的溶液中添加Pd/C(5g，10％纯度)并在H2(30psi)下搅拌所得到的混合物。3小时后，将反应混合物通过硅藻土过滤，用MeOH(2×200mL)洗涤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(40→60％MeCN/H2O，10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(3.3g，50％产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H38N7O的[M+H]计算值：512.31；实验值512.2。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.66(dd,J＝8.0,17.3Hz,2H),7.41(dt,J＝1.8,7.7Hz,1H),7.34–7.27(m,2H),7.26–7.22(m,1H),4.41–4.25(m,2.5H),4.13–4.02(m,2H),3.92(d,J＝11.9Hz,0.5H),3.67(dd,J＝11.6,17.8Hz,1H),3.51(m,1H),3.29–3.22(m,1H),3.22–2.96(m,6H),2.91(s,3H),2.88–2.80(m,1H),2.78–2.58(m,4H),2.49(d,J＝1.6Hz,3H),2.34(q,J＝8.9Hz,1H),2.13–2.01(m,1H),1.86–1.65(m,3H)。
步骤7：合成(S)-N-(2-氯乙基)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺
向2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(30mg,58.6μmol，1当量)于THF(586μL)中的溶液中添加NEt3(16.2μL,117μmol，2.0当量)，随后1-氯-2-异氰酸基乙烷(4.99μL,58.6μmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着用DCM稀释，用H2O洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O，0.1％NEt3)纯化，得到呈白色固体状的(S)-N-(2-氯乙基)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺(13.8mg，38％)。LCMS(ESI)m/z:C33H42ClN8O2的[Μ+H]计算值：617.31；实验值617.3。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ7.76(d,J＝8.3Hz,1H),7.70(t,J＝6.9Hz,1H),7.46(dt,J＝11.5,7.7Hz,1H),7.40–7.34(m,2H),7.27(d,J＝7.8Hz,1H),4.60–4.52(m,1H),4.44–4.22(m,3H),4.11–3.92(m,3H),3.88–3.78(m,1H),3.78–3.71(m,1H),3.71–3.63(m,2H),3.61(t,J＝6.6Hz,1H),3.47–3.35(m,2H),3.19–3.00(m,6H),3.00–2.92(m,3H),2.92–2.80(m,5H),2.75–2.68(m,1H),2.63–2.54(m,1H),2.14–1.95(m,1H),1.87–1.61(m,3H)。
实施例35–合成(S)-N-(2-氯乙基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002841
步骤1：合成(S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(203mg，378μmol，1当量)于DMA(1mL)中的溶液中添加哌嗪-1-甲酸叔丁酯(56mg，303μmol，0.8当量)，随后添加NEt3(52.6μL，378μmol，1当量)。将所得到的混合物加热至100℃。1小时后，将反应物冷却至室温并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(50→100％MeCN/H2O，0.1％NEt3)纯化，得到(S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯。LCMS(ESI)m/z:C33H45N6O3的[M+H]计算值：573.36；实验值573.3。
步骤2：合成(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(哌嗪-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶盐酸盐
向(S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(126mg，219μmol)于MeOH(1.09mL)中的溶液中添加HCl(4M于二噁烷中，1.09mL，4.36mmol，20当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C28H37N6O的[M+H]计算值：473.31；实验值473.3。
步骤3：合成(S)-N-(2-氯乙基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺
根据实施例34步骤7的方法，使用(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(哌嗪-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶盐酸盐代替2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈合成。LCMS(ESI)m/z:C31H41ClN7O2的[M+H]计算值：578.30；实验值578.3。
实施例36–合成(S)-1-(2-氯乙基)-3-(2-((7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基)乙基)脲
Figure BDA0003759053970002851
根据实施例35的方法，在步骤1中使用(2-氨基乙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C29H39ClN7O2的[Μ+H]计算值：552.29；实验值552.3。
实施例37–合成(S)-3-(2-氯乙基)-1-甲基-1-(2-((7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基)乙基)脲
Figure BDA0003759053970002861
根据实施例35的方法，在步骤1中使用(2-氨基乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯代替哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C30H41ClN7O2的[Μ+H]计算值：566.30；实验值566.3。
实施例38–合成2-((S)-1-(4,5-二氢噁唑-2-基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970002862
向(S)-N-(2-氯乙基)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酰胺(50mg，81.0μmol)于MeOH(1.5mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(58μL，332μmol)并在微波中将溶液加热至150℃，保持45秒。将反应混合物减压浓缩，接着通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O，0.1％NEt3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-(4,5-二氢噁唑-2-基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(8.5mg，18％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H41N8O2的[Μ+H]计算值：581.34；实验值581.3。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.71(d,J＝8.1Hz,1H),7.67(d,J＝8.0Hz,1H),7.43(t,J＝7.7Hz,1H),7.36–7.30(m,2H),7.27(d,J＝7.2Hz,1H),4.42–4.08(m,6H),3.93–3.79(m,5H),3.71(dd,J＝17.8,2.5Hz,1H),3.63(dd,J＝10.1,4.2Hz,1H),3.56(d,J＝7.4Hz,1H),3.29–3.17(m,3H),3.16–3.03(m,2H),3.00–2.92(m,4H),2.88(dd,J＝13.0,11.0Hz,1H),2.79–2.72(m,1H),2.72–2.65(m,1H),2.51(d,J＝3.0Hz,3H),2.37(q,J＝9.0Hz,1H),2.15–2.05(m,1H),1.88–1.79(m,2H),1.76–1.67(m,1H)。
实施例39–合成2-((S)-1-(4,5-二氢噁唑-2-基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970002871
根据实施例38的方法，使用实施例35代替实施例34合成。LCMS(ESI)m/z:C31H40N7O2的[Μ+H]计算值：542.32；实验值542.4。
实施例40–合成(S)-N1-(4,5-二氢噁唑-2-基)-N2-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)乙-1,2-二胺
Figure BDA0003759053970002881
根据实施例38的方法，使用实施例36代替实施例34合成。LCMS(ESI)m/z:C29H38N7O2的[Μ+H]计算值：516.31；实验值516.3。
实施例41–合成(S)-N1-(4,5-二氢噁唑-2-基)-N1-甲基-N2-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)乙-1,2-二胺
Figure BDA0003759053970002882
根据实施例38的方法，使用实施例37代替实施例34合成。LCMS(ESI)m/z:C30H40N7O2的[Μ+H]计算值：530.33；实验值530.4。
实施例42–合成N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002891
步骤1：合成(S)-甲基(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
根据实施例35步骤1的方法，使用甲基(哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯代替哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成。
步骤2：合成(S)-N-甲基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐
根据实施例35步骤2的方法，使用(S)-甲基(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯代替(S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C30H41N6O的[M+H]计算值：501.33；实验值501.5。
步骤3：合成N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
向1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(3.34g，3.58mmol，1.5当量)、(S)-N-甲基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺(1.2g，2.39mmol，1当量)和HOBt(16.1mg，0.120mmol，0.05当量)于DMA(11.9mL)中的溶液中添加NMM(2.61mL，23.9mmol，10当量)，随后添加EDC(1g，5.25mmol，2.2当量)。将所得到的混合物搅拌3小时，接着用EtOAc稀释，用1:1H2O/饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(0→20％MeOH/DCM)纯化，得到N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(840mg，43％产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H58N7O2的[Μ+H]计算值：821.47；实验值812.7。
步骤4：合成N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下，向N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(840mg，1.03mmol，1当量)于MeOH(5.15mL)和CHCl3(5.15mL)中的溶液中逐滴添加TFA(630μL，8.24mmol，8当量)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着用二甲基吡啶(1.19mL，10.3mmol，10当量)淬灭，用DCM稀释，用H2O洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的固体通过反相色谱法(10→100％MeCN/H2O)纯化，得到呈白色固体状的N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(48mg，8％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H44N7O2的[Μ+H]计算值：570.36；实验值570.5。
实施例43–合成1-乙酰基-N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002911
在0℃下，向N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(13mg，0.023mmol，1当量)于DCM(456μL)中的溶液中添加NEt3(15.8μL，0.11mmol，5当量)，随后添加乙酰氯(3.25μL，0.046mmol，2当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌1小时，接着用DCM(5mL)稀释，用NaHCO3(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的油状物冻干，得到呈白色固体状的1-乙酰基-N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(7mg，51％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H46N7O3的[Μ+H]计算值：612.37；实验值612.5。
实施例44–合成N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002912
在0℃下，向N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(13mg，0.023mmol，1当量)于DCM(456μL)中的溶液中添加NEt3(15.8μL，0.114mmol，5当量)，随后添加甲烷磺酰氯(3.52μL，0.046mmol，2当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌1小时，接着用DCM(5mL)稀释，用NaHCO3(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的油状物冻干，得到呈白色固体状的N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(8mg，53％产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H46N7O4S的[Μ+H]计算值：648.33；实验值648.5。
实施例45–合成N,1-二甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0003759053970002921
在0℃下，向N-甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(13mg，0.023mmol)和MeI(7.1μL，0.11mmol，5当量)于THF(325μL)中的溶液中添加NaH(656μg，0.027mmol，1.2当量)。在0℃下，将所得到的混合物搅拌3小时，接着升温至室温并搅拌24小时。将反应物用EtOAc稀释，用1:1H2O/饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的油状物冻干，得到呈白色固体状的N,1-二甲基-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(12mg，86％产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H46N7O2的[Μ+H]计算值：584.37；实验值584.5。
实施例46–合成氮杂环丙烷-2-基(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)甲酮
Figure BDA0003759053970002931
步骤1：合成(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
向1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.56g，1.66mmol，1.5当量)、(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(哌嗪-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶盐酸盐(1.16g，1.11mmol，1当量)和HOBt(7.49mg，0.055mmol，0.05当量)于DMA(5.55mL)中的溶液中添加NMM(1.21mL，11.1mmol，10当量)，随后添加EDC(466mg，2.44mmol，2.2当量)。将所得到的混合物搅拌18小时，接着用EtOAc稀释，用1:1H2O/饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％MeOH/DCM)纯化，得到(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮。LCMS(ESI)m/z:C50H54N7O2的[Μ+H]计算值：784.43；实验值784.7。
步骤2：合成氮杂环丙烷-2-基(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)甲酮
在0℃下，向(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(400mg，0.510mmol，1当量)于MeOH(2.55mL)和CHCl3(2.55mL)中的溶液中逐滴添加TFA(312μL，4.08mmol，8当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，升温至室温，并搅拌1小时。用N,N-二异丙基乙胺(888μL，5.10mmol，10当量)淬灭反应，用DCM稀释，用饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的固体通过反相色谱法(10→100％MeCN/H2O)纯化，得到呈白色固体状的氮杂环丙烷-2-基(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-基)甲酮(55mg，20％产率)。LCMS(ESI)m/z:C31H40N7O2的[Μ+H]计算值：542.32；实验值542.5。
实施例47–合成1-(2-(4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-1-基)乙-1-酮
Figure BDA0003759053970002941
根据实施例43的方法，使用实施例46代替实施例42合成。LCMS(ESI)m/z:C33H42N7O3的[Μ+H]计算值：584.33；实验值584.5。
实施例48–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-苯基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002951
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸苯酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H42N7O的[M+H]计算值：588.35；实验值588.4。
实施例49–合成N-(4-氯苯甲基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002952
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸4-氯苯酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C37H43ClN7O的[M+H]计算值：636.32；实验值636.3。
实施例50–合成N-(4-甲氧基苯甲基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970002961
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸4-甲氧基苯酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C38H46N7O2的[M+H]计算值：632.37；实验值632.4。
实施例51–合成(S)-2,2,2-三氟-1-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)乙-1,1-二醇
Figure BDA0003759053970002962
向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(188mg，0.350mmol，1当量)和2,2,2-三氟-1-(哌啶-4-基)乙-1,1-二醇盐酸盐(206mg，0.876mmol，2.5当量)于二噁烷(3.50mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(302μL，1.75mmol，5当量)。将混合物加热至50℃，保持24小时，接着减压浓缩。将粗残余物溶解于EtOAc中，用H2O洗涤，接着用饱和NaCl水溶液洗涤，经MgSO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过柱色谱法(0→10％MeOH/DCM)纯化，得到呈灰白色粉末状的(S)-2,2,2-三氟-1-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)乙-1,1-二醇(35mg，17％产率)。LCMS(ESI)m/z:C31H39F3N5O3的[Μ+H]计算值：586.30；实验值586.5。
实施例52–合成(S)-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸
Figure BDA0003759053970002971
步骤1：合成(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶
向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(272mg，0.507mmol，1当量)和4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶(213mg，1.01mmol，2当量)于二噁烷(5.1mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(436μL，2.53mmol，5当量)。将混合物加热至50℃，保持2小时，接着减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％MeOH/DCM)纯化，得到呈油状的(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(189mg，62％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H49BN5O3的[Μ+H]计算值：598.40；实验值598.6。
步骤2：合成(S)-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸
向(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(189mg，0.316mmol，1当量)于丙酮/H2O(10:1,1.6mL)中的溶液中添加乙酸铵(1M，948μL，0.949mmol，3当量)和高碘酸钠(202mg，0.949mmol，3当量)。将所得到的混合物搅拌4小时，接着通过反相色谱法(10→99％MeCN/H2O，0.1％甲酸)纯化，得到呈白色粉末状的(S)-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸(38mg，23％产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H39BN5O3的[Μ+H]计算值：516.32；实验值516.5。1H NMR观察发现为硼酸酯与硼酸的2:1混合物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.74–7.58(m,2H),7.47–7.38(m,1H),7.36–7.25(m,2H),7.24–7.17(m,1H),4.22(ddd,J＝11.1,5.1,1.8Hz,1H),4.02(dd,J＝11.4,6.3Hz,1H),3.97–3.71(m,3H),3.67–3.47(m,1H),3.43–3.34(m,1H),3.09–2.88(m,4H),2.83(s,3H),2.78(dt,J＝9.8,4.4Hz,2H),2.71–2.60(m,1H),2.36(d,J＝2.0Hz,3H),2.31–2.20(m,1H),1.91(dq,J＝12.3,8.4,7.9Hz,1H),1.73–1.49(m,6H),1.40(q,J＝11.3Hz,1H),1.04–0.87(m,0.67H),0.83–0.73(m,0.33H)。
实施例53–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970002991
步骤1：合成2,6-二氯-5-氟烟酰氯
向2,6-二氯-5-氟烟酸(100g，476mmol，1当量)于DCM(1L)中的溶液中添加(COCl)2(72.5g，571mmol，1.2当量)，随后添加DMF(1mL)。将所得到的混合物搅拌3小时，接着减压浓缩，得到呈浅黄色液体状的2,6-二氯-5-氟烟酰氯，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成2,6-二氯-5-氟烟酰胺
在0℃下，向2,6-二氯-5-氟烟酰氯(109g，476mmol，1当量)于二噁烷(1L)中的溶液中添加NH3·H2O(133g，952mmol，25％w/w，2当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌1小时，接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(500mL)研磨30分钟，接着过滤并减压浓缩滤液，得到呈白色固体状的2,6-二氯-5-氟烟酰胺(95.2g，经两个步骤96％产率)。LCMS(ESI)m/z:C6H4Cl2FN2O的[M+H]计算值：208.96；实验值208.9。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.24(d,J＝7.9Hz,1H),8.11(br s,1H),7.95(br s,1H)。
步骤3：合成2,6-二氯-5-氟-N-((2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)氨甲酰基)烟酰胺
向2,6-二氯-5-氟烟酰胺(60g，287mmol，1当量)于THF(250mL)中的溶液中添加(COCl)2(43.72g，344mmol，1.2当量)并将所得到的混合物加热至65℃。1小时后，将反应物冷却至0℃并添加2-异丙基-4-甲基吡啶-3-胺(43.1g，287mmol，1当量)。1小时后，用1:1饱和NaCl水溶液/饱和NH4Cl水溶液(200mL)淬灭反应，将其萃取至EtOAc(3×300mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的2,6-二氯-5-氟-N-((2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)氨甲酰基)烟酰胺，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C16H16Cl2FN4O2的[M+H]计算值：385.06；实验值385.0。
步骤4：合成7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
在0℃下，向2,6-二氯-5-氟-N-((2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)氨甲酰基)烟酰胺(115g，298mmol，1当量)于THF(550mL)中的溶液中逐滴添加KHMDS(1M，627mL，2.1当量)，并将所得到的混合物升温至室温。2小时后，用饱和NH4Cl水溶液(500mL)淬灭反应并将其萃取至EtOAc(3×400mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(70g，67％产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H15ClFN4O2的[M+H]计算值：349.08；实验值349.1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.28(br s,1H),8.63–8.39(m,2H),7.28(d,J＝4.9Hz,1H),2.86(quin,J＝6.6Hz,1H),2.03(s,3H),1.07(d,J＝6.8Hz,3H),1.00(d,J＝6.6Hz,3H)。
步骤5：合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.0g，5.73mmol，1当量)、(2-氟苯基)硼酸(2.41g，17.2mmol，3当量)和KOAc(2.81g，28.7mmol，5当量)于二噁烷(20mL)和H2O(4mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(420mg，573μmol，0.1当量)并将所得到的混合物加热至90℃，保持2小时。用饱和NaHCO3水溶液(15mL)淬灭反应并将其萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.2g，93％产率)。LCMS(ESI)m/z:C22H19F2N4O2的[M+H]计算值：409.14；实验值409.1。
步骤6：合成4-氯-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.15g，5.26mmol，1当量)和N,N-二异丙基乙胺(3.06g，23.7mmol，4.5当量)于MeCN(20mL)中的溶液中添加POCl3(3.23g，21.1mmol，4当量)。将所得到的混合物加热至80℃，保持1小时，接着减压浓缩，得到呈褐色油状的4-氯-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮，将其不经进一步纯化即使用。
步骤7：合成(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下，向4-氯-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(4.18g，9.79mmol，1当量)于MeCN中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(6.33g，49.0mmol，5当量)，随后添加哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(2.35g，11.7mmol，1.2当量)。将所得到的混合物升温至室温。1小时后，用饱和NH4Cl水溶液(20mL)淬灭反应并将其萃取至EtOAc(3×30mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，随后反相色谱法，得到呈白色固体状的(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.05g，经两个步骤35％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H37F2N6O3的[M+H]计算值：591.28；实验值591.4。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.42(d,J＝4.9Hz,1H),8.28(d,J＝9.7Hz,1H),7.60–7.49(m,1H),7.38–7.17(m,4H),7.01(br d,J＝7.1Hz,1H),4.38(d,J＝13.4Hz,2H),3.66(d,J＝3.3Hz,1H),3.43(t,J＝12.0Hz,2H),2.71(quin,J＝6.7Hz,1H),1.98–1.87(m,5H),1.72–1.52(m,2H),1.41(s,9H),1.07(d,J＝6.7Hz,3H),0.95(d,J＝6.7Hz,3H)。
步骤8：合成4-(4-氨基哌啶-1-基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(310mg，524μmol，1当量)于DCM(3mL)中的溶液中添加TFA(4.19mmol，321μL，8当量)。搅拌反应18小时，接着减压浓缩，得到呈三氟乙酸盐形式的4-(4-氨基哌啶-1-基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:的C28H30F2N5O[Μ+H]计算值：491.24；实验值491.3。
步骤9：合成1-(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-6-甲基苯基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-丙基硫脲
向4-(4-氨基哌啶-1-基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮三氟乙酸盐(71.5mg，121μmol，1当量)于DCM(1.00mL)中的悬浮液中添加NEt3(50.5μL，363μmol，3当量)，随后添加异硫氰酸1-丙酯(12.4μL，121μmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌17小时，接着用DCM(20mL)稀释，用H2O(10mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥,过滤，并减压浓缩，得到呈褐色固体状的1-(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-丙基硫脲(56.2mg，78.4％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H37F2N6OS的[M+H]计算值：592.27；实验值592.5。
步骤10：合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向1-(1-(6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-丙基硫脲(56.2mg，94.9μmol，1当量)于DCM(1.0mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(49.4μL，284μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(36.2mg，142μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌16小时，接着过滤以去除固体，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O，0.4％NH4OH)纯化，得到呈浅褐色油状的6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(6.1mg，11.5％产率)。LCMS(ESI)m/z:C31H34F2N7O的[M+H]计算值：558.28；实验值558.3；1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ8.43(d,J＝4.9Hz,1H),8.35(d,J＝9.5Hz,1H),7.59–7.51(m,1H),7.38–7.33(m,1H),7.33–7.23(m,2H),7.22(dd,J＝4.8,0.8Hz,1H),4.26(dt,J＝13.6,4.3Hz,2H),3.73(tt,J＝8.9,4.0Hz,1H),3.57(ddd,J＝13.3,9.9,2.9Hz,2H),3.20(t,J＝6.8Hz,2H),2.72(p,J＝6.7Hz,1H),2.11–2.04(m,2H),1.94(s,3H),1.78–1.66(m,2H),1.57(h,J＝7.2Hz,3H),1.37(d,J＝9.1Hz,1H),1.31–1.22(m,4H),1.08(d,J＝6.7Hz,3H),0.98–0.89(m,6H),0.89–0.83(m,1H)。
实施例54–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003041
根据实施例53的方法，在步骤9中使用异硫氰酸2-甲氧基乙酯代替异硫氰酸1-丙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C31H34F2N7O2的[M+H]计算值：574.27；实验值574.3。
实施例55–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(甲基(3-(((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)丙基)氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003042
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C30H34F2N7O的[M+H]计算值：546.28；实验值546.3。
实施例56–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((3-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)(甲基)氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003051
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸2-甲氧基乙酯代替异硫氰酸1-丙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C30H34F2N7O2的[M+H]计算值：562.27；实验值562.3。
实施例57–合成4-((3-(((苯甲基亚氨基)亚甲基)氨基)丙基)(甲基)氨基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003052
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H34F2N7O的[M+H]计算值：594.28；实验值594.3。
实施例58–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((3-((((4-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)(甲基)氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003061
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸4-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H36F2N7O2的[M+H]计算值：624.29；实验值624.3。
实施例59–合成4-((3-((((4-氯苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)(甲基)氨基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003062
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(3-(甲基氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸4-氯苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H33ClF2N7O的[M+H]计算值：628.24；实验值628.2。
实施例60–合成N-苯甲基-N-(2-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003071
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C38H44N7O的[M+H]计算值：614.36；实验值614.3。
实施例61–合成N-(2-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)-N-丙基甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003072
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸1-丙酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H44N7O的[M+H]计算值：566.36；实验值566.4。
实施例62–合成N-(2-甲氧基乙基)-N-(2-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003081
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(2-氮杂螺[3.3]庚-6-基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:的C34H44N7O2[M+H]计算值：582.36；实验值582.4。
实施例63–合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003082
步骤1：合成(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
根据实施例16步骤1的方法，使用(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯代替1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯合成。
步骤2：合成2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈
向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(178mg，0.51mmol，1.5当量)和HATU(193mg，0.51mmol，1.5当量)于DMA(3.4mL)中的悬浮液中添加2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(174mg，0.34mmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用H2O(10mL)和DCM(10mL)稀释。将水层萃取至DCM(10mL)中并将合并的有机相用饱和NaHCO3水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C52H54N8O2Na的[M+Na]计算值：845.43；实验值845.7。
步骤3：合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(279mg，0.34mmol，1当量)于DCM(1.7mL)和MeOH(0.85mL)中的溶液中添加TFA(0.20mL，2.7mmol，8当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着升温至室温。40分钟后，将反应物减压浓缩并将所得到的粗产物通过反相色谱法(20→100％MeCN/H2O，0.4％NH4OH)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(43.9mg，22％)。LCMS(ESI)m/z:C33H41N8O2的[M+H]计算值：581.34；实验值581.3。1HNMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.70(d,J＝8.0Hz,1H),7.65(dd,J＝7.9,3.5Hz,1H),7.42(q,J＝7.3Hz,1H),7.36–7.27(m,2H),7.25(d,J＝7.0Hz,1H),4.60–4.48(m,1H),4.41–4.03(m,6H),3.82–3.64(m,2H),3.59–3.35(m,3H),3.29–3.01(m,6H),2.92(s,3H),2.90–2.81(m,1H),2.82–2.61(m,2H),2.50(d,J＝3.8Hz,3H),2.35(qd,J＝9.1,4.1Hz,1H),2.09(dq,J＝12.8,8.3Hz,1H),1.98–1.78(m,4H),1.71(tt,J＝13.0,7.2Hz,1H)。
实施例64–合成2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003101
根据实施例63的方法，在步骤1中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C33H41N8O2的[M+H]计算值：581.34；实验值581.3。
实施例65–合成4-((S)-4-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-2-甲基哌嗪-1-基)-6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003102
步骤1：合成(S)-4-(7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向4,7-二氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(6.9g粗品，17.2mmol，1当量)于MeCN(25mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(11.1g，86.0mmol，5当量)，随后添加(S)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(4.35g，20.6mmol，1.2当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌1小时，接着用饱和NaHCO3水溶液(20mL)淬灭并萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶柱色谱法(0→66％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈褐色固体状的(S)-4-(7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(3.4g，37％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.48(d,J＝4.9Hz,1H),8.37(dd,J＝5.4,8.5Hz,1H),7.25(d,J＝4.9Hz,1H),4.83(s,1H),4.24–4.09(m,1H),3.82(d,J＝13.2Hz,1H),3.73–3.56(m,2H),3.18–2.88(m,2H),2.71–2.56(m,1H),1.93(d,J＝2.2Hz,3H),1.45(s,9H),1.31(t,J＝6.0Hz,3H),1.08–1.02(m,3H),1.00(dd,J＝2.8,6.7Hz,3H)。
步骤2：合成(3S)-4-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向(S)-4-(7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(5g，9.42mmol，1当量)、(2-氟-6-羟基苯基)硼酸(2.94g，18.8mmol，2当量)和KOAc(4.62g，47.1mmol，5当量)于二噁烷(20mL)和H2O(4mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(689mg，0.942mmol，0.1当量)。将所得到的混合物加热至90℃，保持2小时，接着冷却至室温。用饱和NaHCO3水溶液(20mL)淬灭反应，将其萃取至EtOAc(4×20mL)中并将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶柱色谱法(0→66％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(3S)-4-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.9g，51％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H37F2N6O4的[M+H]计算值：607.28；实验值607.2。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.21(br d,J＝1.2Hz,1H),8.38(d,J＝4.9Hz,1H),8.27(dd,J＝9.2,12.6Hz,1H),7.32–7.22(m,1H),7.18(d,J＝5.0Hz,1H),6.77–6.64(m,2H),5.02–4.75(m,1H),4.24(t,J＝14.1Hz,1H),3.84(d,J＝12.7Hz,2H),3.75–3.56(m,1H),3.26–2.87(m,2H),2.79–2.63(m,1H),1.93–1.86(m,3H),1.45(s,9H),1.35(dd,J＝6.7,10.7Hz,3H),1.07(dd,J＝1.7,6.7Hz,3H),0.93(dd,J＝2.1,6.7Hz,3H)。
步骤3：合成6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
在0℃下，向(3S)-4-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.8g，2.97mmol，1当量)于DCM(18mL)中的溶液中添加TFA(6.77g，59.3mmol，20当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌2小时，接着减压浓缩。将残余物溶解于MeCN(2mL)中，接着逐滴添加至MTBE(20mL)中。将混合物搅拌20分钟，过滤并将固体饼状物减压干燥，得到呈浅黄色固体状的6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮三氟乙酸盐(1.78g，93％产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H29F2N6O2的[M+H]计算值：507.22；实验值507.3。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.61–8.54(m,1H),8.27(dd,J＝8.7,12.8Hz,1H),7.66(br d,J＝5.5Hz,1H),7.31–7.20(m,1H),6.70–6.56(m,2H),5.29–5.09(m,1H),4.68–4.53(m,1H),4.07–3.87(m,1H),3.59–3.40(m,4H),3.16–2.97(m,1H),2.20(d,J＝14.9Hz,3H),1.69(dd,J＝7.1,12.0Hz,3H),1.30(dd,J＝4.7,6.8Hz,3H),1.14(t,J＝6.5Hz,3H)。
步骤4：合成6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(48.7mg，148μmol，1.5当量)于DMA(0.18mL)中的悬浮液中添加6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮三氟乙酸盐(61.3mg，98.7μmol，1当量)于MeCN(1mL)中的溶液，随后添加N,N-二异丙基乙胺(51.4μL，296μmol，3当量)和COMU(59.1mg，138μmol，1.4当量)。将所得到的混合物搅拌1小时30分钟，接着用DCM(20mL)稀释，用5％柠檬酸水溶液(10mL)洗涤，接着用饱和NaHCO3水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C49H46F2N7O3的[M+H]计算值：818.36；实验值818.3。
步骤5：合成4-((S)-4-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-2-甲基哌嗪-1-基)-6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
在0℃下，向6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(80mg，97.8μmol，1当量)于DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL，6.52mmol，67当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着减压浓缩。将所得到的粗产物通过反相色谱法(10→100％MeCN/H2O，0.4％NH4OH)纯化，得到呈白色固体状的6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-((S)-2-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(23.7mg，42％产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H32F2N7O的[M+H]计算值：576.25；实验值576.2。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.42(d,J＝5.0Hz,1H),8.31–8.22(m,1H),7.29–7.21(m,2H),6.67(d,J＝8.3Hz,1H),6.60(t,J＝8.9Hz,1H),5.26–4.98(m,1H),4.65–4.28(m,3H),4.21(s,1H),4.07–3.56(m,2H),3.50–3.37(m,1H),3.30–3.16(m,1H),3.12–2.90(m,1H),2.85(dq,J＝12.7,6.7Hz,1H),2.05(dd,J＝9.3,4.2Hz,3H),1.98–1.79(m,2H),1.53(dt,J＝20.1,6.1Hz,3H),1.22(d,J＝6.4Hz,3H),1.05(dd,J＝6.6,2.6Hz,3H)。
实施例66–合成4-((S)-4-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-2-甲基哌嗪-1-基)-6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003141
根据实施例65的方法，在步骤4中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸合成。LCMS(ESI)m/z:的C30H32F2N7O[M+H]计算值：576.25；实验值576.2。
实施例67–合成6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003142
步骤1：合成6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向7-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(3g，8.60mmol，1当量)、(2-氟-6-羟基苯基)硼酸(2.68g，17.2mmol，2当量)和KOAc(4.22g，43.0mmol，5当量)于二噁烷(15mL)和H2O(3mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(629mg，0.86mmol，0.1当量)。将所得到的混合物加热至90℃，保持2小时，冷却至室温并用饱和NaHCO3水溶液(15mL)淬灭，接着萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.7g，74％产率)。
步骤2：7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
在0℃下，向6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.4g，5.66mmol，1当量)和NEt3(2.29g，22.6mmol，4当量)于MeCN(24mL)中的溶液中添加TBDPSCl(1.87g，6.79mmol，1.2当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌1小时，用饱和NaHCO3水溶液(20mL)淬灭，接着萃取至EtOAc(3×30mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.4g，64％产率)。LCMS(ESI)m/z:C38H37F2N4O3Si的[M+H]计算值：663.25；实验值663.3。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.29(s,1H),8.58–8.43(m,2H),7.72–7.65(m,1H),7.64–7.58(m,1H),7.55–7.39(m,5H),7.39–7.22(m,4H),7.16–7.04(m,1H),6.81(dt,J＝3.9,8.7Hz,1H),6.14(dd,J＝8.4,16.3Hz,1H),2.96(td,J＝6.5,13.3Hz,1H),2.81(quin,J＝6.7Hz,1H),2.08(s,1H),1.81(s,2H),1.10(t,J＝6.2Hz,3H),1.04(d,J＝6.6Hz,2H),0.82(d,J＝6.7Hz,1H),0.72(d,J＝12.5Hz,9H)。
步骤3：合成7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-4-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.25g，0.377mmol，1当量)和N,N-二异丙基乙胺(439mg，3.39mmol，9当量)于MeCN(5mL)中的溶液中添加POCl3(463mg，3.02mmol，8当量)。将所得到的混合物加热至80℃，保持1小时，接着减压浓缩，得到呈褐色油状的7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-4-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮，将其不经进一步纯化即使用。
步骤4：合成7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
在0℃下，向7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-4-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.25g，0.367mmol，1当量)于MeCN(5mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(237mg，1.83mmol，5当量)，随后添加2,2,2-三氟-1-(哌啶-4-基)乙烯酮盐酸盐(66.5mg，0.305mmol，0.83当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌30分钟，接着用饱和NH4Cl水溶液(20mL)淬灭并萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶柱色谱法(15→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.2g，经2个步骤66％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.51–8.38(m,2H),7.71–7.58(m,2H),7.55–7.20(m,9H),7.17–7.06(m,1H),6.90–6.73(m,2H),6.14(dd,J＝8.6,15.9Hz,1H),4.62–4.39(m,2H),2.76–2.69(m,1H),2.18–2.06(m,1H),1.92(s,3H),1.74(s,2H),1.08(dd,J＝2.8,6.7Hz,3H),1.01(d,J＝6.5Hz,2H),0.84(d,J＝6.7Hz,1H),0.71(d,J＝6.0Hz,9H)。
步骤5：合成6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
在0℃下，向7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.16g，0.194mmol，1当量)于THF(2mL)中的悬浮液中添加TBAF(1M，0.387mL，0.387mmol，2当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(30→55％MeCN/H2O，10mM NH4HCO3)纯化，得到呈黄色固体状的6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(2,2,2-三氟乙酰基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(70mg，61％产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H27F5N5O3的[M+H]计算值：588.20；实验值588.2。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.43–8.33(m,1H),8.27–8.18(m,1H),7.33–7.18(m,2H),6.75–6.47(m,2H),4.81–4.64(m,2H),3.54–3.32(m,2H),2.94–2.72(m,1H),2.30–2.14(m,1H),2.13–2.06(m,1H),2.05–1.96(m,3H),1.91–1.68(m,2H),1.25–1.13(m,3H),1.03(d,J＝6.8Hz,2H)。
实施例68–合成(1-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸
Figure BDA0003759053970003181
步骤1：7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
在0℃下，向7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-4-氯-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(420mg crude,0.57mmol，1当量)于MeCN(4mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(370mg，2.87mmol，5当量)，随后添加4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶盐酸盐(170mg，0.69mmol，1.2当量)。将所得到的混合物升温至室温，搅拌30分钟，接着用饱和NH4Cl水溶液(4mL)淬灭并萃取至EtOAc(3×4mL)中。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(410mg，83％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.49–8.40(m,2H),7.72–7.59(m,2H),7.54–7.20(m,9H),7.15–7.06(m,1H),6.83(t,J＝8.7Hz,1H),6.14(dd,J＝8.3,16.2Hz,1H),4.26–4.07(m,2H),3.69–3.45(m,2H),2.76–2.68(m,1H),1.99(s,2H),1.86–1.69(m,5H),1.41–1.30(m,1H),1.21(d,J＝3.1Hz,12H),1.10–1.05(m,3H),1.00(d,J＝6.8Hz,2H),0.83(d,J＝6.8Hz,2H),0.70(d,J＝5.7Hz,9H)。
步骤2：合成(1-(7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸
向7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(400mg，0.467mmol，1当量)于丙酮(4mL)和H2O(0.4mL)中的溶液中添加NaIO4(300mg，1.40mmol，3当量)和NH4OAc(1M于H2O中，4.00mL，8.56当量)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着倒入H2O(4mL)中，将其萃取至EtOAc(2×4mL)中，用饱和NaCl水溶液(4mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(1-(7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸(270mg，75％产率)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.50–8.34(m,2H),7.72–7.60(m,2H),7.58(br s,2H),7.53–7.20(m,9H),7.10(q,J＝8.0Hz,1H),6.83(t,J＝8.8Hz,1H),6.14(dd,J＝8.3,16.1Hz,1H),4.47–4.21(m,2H),3.58–3.36(m,2H),2.80–2.70(m,1H),1.93–1.88(m,3H),1.86–1.68(m,4H),1.08(d,J＝6.6Hz,3H),1.01(d,J＝6.8Hz,2H),0.84(d,J＝6.8Hz,2H),0.70(d,J＝5.9Hz,9H)。
步骤3：合成(1-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸
在0℃下，向(1-(7-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-6-氟苯基)-6-氟-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸(260mg，0.336mmol，1当量)于THF(2.5mL)中的溶液中添加TBAF(1M于THF中，0.67mL，2当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着倒入H2O(3mL)中，将其萃取至EtOAc(3×3mL)中，用饱和NaCl水溶液(3mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过反相色谱法(25→45％MeCN/H2O，10mM NH4HCO3)纯化，得到呈浅黄色固体状的(1-(6-氟-7-(2-氟-6-羟基苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硼酸(110mg，60％产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H29BF2N5O4的[M+H]计算值：536.22；实验值536.3。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.47(br s,1H),8.62(d,J＝4.9Hz,1H),8.00(d,J＝9.5Hz,1H),7.35–7.28(m,1H),7.22(d,J＝4.9Hz,1H),6.77–6.62(m,2H),6.35(brs,1H),4.39(d,J＝13.3Hz,2H),3.73–3.38(m,2H),2.80(td,J＝6.6,13.4Hz,1H),2.14–2.00(m,5H),1.98–1.85(m,2H),1.48–1.35(m,1H),1.31–1.21(m,3H),1.08(d,J＝6.7Hz,3H)。
实施例69–合成4-(4-((((苯甲基亚氨基)亚甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)-6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003201
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(哌啶-4-基甲基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸苯甲酯代替异硫氰酸1-丙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H36F2N7O的[M+H]计算值：620.29；实验值620.3。
实施例70–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-(((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003211
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(哌啶-4-基甲基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤9中使用异硫氰酸2-甲氧基乙酯代替异硫氰酸1-丙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C32H36F2N7O2的[M+H]计算值：588.29；实验值588.3。
实施例71–合成6-氟-7-(2-氟苯基)-1-(2-异丙基-4-甲基吡啶-3-基)-4-(4-((((丙基亚氨基)亚甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003759053970003212
根据实施例53的方法，在步骤7中使用(哌啶-4-基甲基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:的C32H35F2N7O[M+H]计算值：572.29；实验值572.3。
实施例72–合成N-((1r,3S)-3-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)环丁基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970003221
根据实施例20的方法，在步骤10中使用((1r,3r)-3-氨基环丁基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C32H42N7O2的[M+H]计算值：556.34；实验值556.4。
实施例73–合成N-(2-甲氧基乙基)-N-((R)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)吡咯烷-3-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003222
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(R)-吡咯烷-3-基氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:值C32H42N7O2的[M+H]计算：556.34；实验值556.4。
实施例74–合成N-(2-甲氧基乙基)-N-((S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)吡咯烷-3-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003223
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(S)-吡咯烷-3-基氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C32H42N7O2的[M+H]计算值：556.34；实验值556.4。
实施例75–合成2-((3S,4R)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003231
步骤1：合成(R)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
向4-氧代哌啶-1,3-二甲酸1-叔丁基酯3-乙酯(150g，553mmol，1当量)于甲苯(2.25L)中的溶液中添加(R)-1-苯基乙胺(77.05g，636mmol，1.15当量)和p-TsOH(10.47g，60.8mmol，0.11当量)。在Dean Stark分水器存在下，将所得到的混合物加热至140℃，保持18小时，接着冷却至室温。将反应物用饱和NaHCO3水溶液(3×900mL)洗涤并将有机相用饱和NaCl水溶液(800mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(R)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(200g，97％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.25(br d,J＝7.3Hz,1H),7.36–7.30(m,2H),7.26–7.21(m,3H),4.61(m,J＝6.9Hz,1H),4.24–4.15(m,2H),4.11–4.03(m,2H),3.49–3.38(m,1H),3.37–3.24(m,1H),2.39(d,J＝17.1Hz,1H),2.13–2.05(m,1H),1.50(d,J＝6.7Hz,3H),1.44(s,9H),1.34–1.27(m,3H)。
步骤2：合成(3S,4R)-4-(((R)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向NaBH4(8.08g，214mmol，2当量)于THF(0.58L)中的悬浮液中逐滴添加TFA(73.1g，641mmol，6当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着冷却至-45℃并添加(R)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(40g，107mmol，1当量)于MeCN(192mL)中的溶液。搅拌反应1小时，接着升温至0℃并搅拌1小时。将两份独立反应混合物合并，用25％NH4OH水溶液调至pH 7，并减压浓缩。将所得到的残余物倒入H2O(500mL)中，冷却至10℃，并添加NH4OH水溶液(108mL)。将混合物萃取至EtOAc(3×200mL)中并将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，随后通过反相色谱法(15→45％MeCN/H2O,0.1％甲酸)纯化。将含有所希望产物的洗脱部分合并，冷却至0℃，用饱和NaHCO3水溶液调至pH 7，并减压浓缩以去除MeCN。将所得到的混合物萃取至EtOAc(3×600mL)中，并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×400mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的无色油状物溶解于MTBE(55mL)中，冷却至0℃，并添加HCl(1M于二噁烷中，85mL，0.8当量)。将混合物搅拌30分钟，接着添加庚烷(200mL)，搅拌1小时，并过滤。将滤饼用庚烷(3×30mL)洗涤，接着用庚烷(100mL)研磨10分钟。将混合物过滤，并用庚烷(3×30mL)洗涤滤饼，接着真空干燥。将所得到的固体悬浮于H2O(200mL)中，调用饱和NaHCO3水溶液至pH 8，并萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到呈无色油状的(3S,4R)-4-(((R)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(39.8g，49％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.36–7.28(m,4H),7.27–7.21(m,1H),4.25–4.15(m,2H),3.98(d,J＝9.2Hz,1H),3.88(q,J＝6.5Hz,1H),3.67(s,1H),3.20(dd,J＝3.8,13.8Hz,1H),3.02(ddd,J＝3.7,9.1,13.2Hz,1H),2.87(td,J＝4.0,8.5Hz,1H),2.82–2.71(m,1H),1.81–1.70(m,2H),1.43(s,9H),1.35–1.27(m,6H)。
步骤3：合成(3S,4R)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
向(3S,4R)-4-(((R)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(39g，104mmol，1当量)于EtOH(156mL)中的溶液中添加Pd/C(13g，10％纯度)。在H2(50psi)下，在40℃下将所得到的混合物搅拌24小时，接着通过硅藻土过滤，用EtOAc(3×200mL)洗涤，并减压浓缩，得到呈无色液体状的(3S,4R)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(28g，99％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.14–4.02(m,2H),3.70–3.52(m,3H),3.44–3.25(m,3H),1.76–1.56(m,2H),1.45–1.33(m,9H),1.27–1.14(m,3H)。
步骤4：合成(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
在0℃下，向(3S,4R)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(23g，84.4mmol，1当量)于THF(230mL)中的溶液中添加(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)碳酸苯甲酯(21.05g，84.4mmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着在0℃下逐滴添加至H2O(900mL)中并萃取至DCM(3×200mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→25％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色液体状的(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(30g，73％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.41–7.29(m,5H),5.11(s,2H),4.93(brs,1H),4.32–4.20(m,1H),4.19–4.11(m,1H),4.03(br s,1H),3.68(s,1H),3.66–3.58(m,1H),3.37(d,J＝3.5Hz,1H),3.34(d,J＝3.1Hz,1H),3.32–3.22(m,1H),2.98(s,3H),2.39(s,1H),1.74(s,1H),1.46(s,9H)。
步骤5：合成(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，经20分钟向(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(32g，78.7mmol，1当量)于THF(320mL)中的溶液中添加LiAlH4(4.48g，118mmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着通过逐滴添加H2O(4.48mL)淬灭，过滤，并用EtOAc(3×100mL)洗涤滤饼。将滤液倒入H2O(300mL)中并将水相萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色油状的(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(16.5g，57％产率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.40–7.31(m,5H),5.21(s,1H),5.12(s,2H),4.17–4.04(m,1H),3.73–3.37(m,3H),3.34–2.97(m,3H),2.15–1.98(m,1H),1.70(s,1H),1.60(s,1H),1.46(s,9H)。
步骤6：合成(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(16g，43.9mmol，1当量)于DCM(160mL)中的溶液中添加NEt3(6.66g，65.9mmol，1.5当量)，随后添加MsCl(5.48g，47.8mmol，1.09当量)。将所得到的混合物升温至室温并搅拌1小时，接着在0℃下，将其逐滴添加至H2O(180mL)中并萃取至DCM(3×80mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯，将其不经进一步纯化即使用。
步骤7：合成(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
向(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(19g，42.9mmol，1当量)于DMA(380mL)中的溶液中添加NaCN(4.21g，85.9mmol，2当量)并将所得到的混合物加热至55℃，保持18小时，接着冷却至室温，倒入H2O(1L)中，并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(10→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色固体状的(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10.5g，经2个步骤58％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.43–7.32(m,5H),5.23–5.01(m,2H),4.76(br s,1H),4.13–3.65(m,3H),3.60–3.01(m,2H),2.51–2.36(m,2H),2.34–2.20(m,1H),1.71(dt,J＝4.8,8.8Hz,2H),1.53–1.42(m,9H)。
步骤8：合成((3S,4R)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯
并行操作三个独立的反应。对于每个反应，在0℃下向(3S,4R)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(3g，8.03mmol，1当量)于MeOH(24mL)中的溶液中添加HCl(4M于MeOH中，45mL，22.4当量)并将所得到的混合物搅拌30分钟。将三份独立的反应混合物合并，并减压浓缩，得到呈白色固体状的((3S,4R)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯盐酸盐，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.51–7.24(m,5H),5.12(s,2H),4.18(d,J＝3.2Hz,1H),3.35(s,1H),3.27(t,J＝3.9Hz,1H),3.23–3.05(m,2H),2.67–2.58(m,1H),2.57–2.47(m,2H),2.10–1.90(m,2H)。
步骤9：合成((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(7.95g，7.41mmol，1当量)和N,N-二异丙基乙胺(9.57g，74.1mmol，10当量)于DMF(37.5mL)中的溶液中添加((3S,4R)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯盐酸盐(2.41g，7.78mmol，1.05当量)并将所得到的混合物搅拌20分钟。将两份独立反应混合物合并，并将其逐滴添加至H2O(800mL)中，接着萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×150mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈褐色固体状的((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯(8.3g，经2个步骤78％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.68(d,J＝8.2Hz,1H),7.63(dd,J＝3.2,7.8Hz,1H),7.43–7.36(m,5H),7.35–7.30(m,2H),7.25–7.19(m,2H),5.23–5.05(m,2H),4.95(br s,1H),4.51–4.36(m,1H),4.27–4.07(m,3H),3.85(d,J＝18.1Hz,1H),3.72–3.57(m,2H),3.56–3.45(m,2H),3.41–3.24(m,1H),3.22–3.04(m,3H),2.92(d,J＝4.0Hz,3H),2.83–2.67(m,1H),2.52(d,J＝7.9Hz,5H),2.39–2.25(m,2H),1.87–1.72(m,4H)。
步骤10：合成2-((3S,4R)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，向((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯(4g，6.06mmol，1当量)于MeOH(100mL)和THF(100mL)中的溶液中添加Pd/C(4g，10％纯度)。在H2(30psi)下，将所得到的混合物搅拌0.5小时，接着将Pd/C(2g，10％纯度)添加至混合物中。0.5小时后，将两份独立的反应混合物合并，通过硅藻土过滤，用MeOH(3×300mL)洗涤，接着用THF(3×300mL)洗涤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(5→35％MeCN/H2O，0.225％甲酸)纯化。将含有2-((3S,4R)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈的洗脱部分合并，用饱和NaHCO3水溶液调至pH 7，并减压浓缩以去除MeCN。将所得到的水相萃取至EtOAc(3×200mL)中，并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到呈白色固体状的2-((3S,4R)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(2.6g，41％产率)。LCMS(ESI)m/z:C31H40N7O的[M+H]计算值：526.32；实验值526.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.68(d,J＝7.9Hz,1H),7.66–7.61(m,1H),7.40(q,J＝7.7Hz,1H),7.34–7.26(m,2H),7.26–7.20(m,1H),4.42–4.28(m,2H),4.15–4.01(m,1H),3.93(dd,J＝5.7,13.3Hz,1H),3.83(dd,J＝7.3,13.6Hz,1H),3.71(d,J＝17.7Hz,1H),3.67–3.56(m,2H),3.55–3.44(m,1H),3.29–3.19(m,2H),3.18–2.99(m,3H),2.91(s,3H),2.73(td,J＝6.8,13.6Hz,1H),2.69–2.58(m,2H),2.48(d,J＝2.0Hz,3H),2.46–2.27(m,2H),2.26–1.95(m,2H),1.95–1.58(m,5H)。
步骤11：合成1-((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲
向2-((3S,4R)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(50mg，95.1μmol，1当量)于DCM(951μL)中的溶液中添加NEt3(79.3μL，570μmol，6当量)，随后添加异硫氰酸2-甲氧基乙酯(11.2μL，104μmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌24小时，接着用DCM(20mL)稀释，用H2O(10mL)洗涤，随后用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈浅褐色油状的1-((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C35H47N8O2S的[M+H]计算值：643.35；实验值643.3。
步骤12：合成2-((3S,4R)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
向1-((3S,4R)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲(61.0mg，95μmol，1当量)于DCM(949μL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(49.5μL，285μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(36.2mg，142μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌24小时，接着过滤以去除固体，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，得到呈浅褐色固体状的2-((3S,4R)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(18.8mg，33％经2个步骤)。LCMS(ESI)m/z:C35H45N8O2的[M+H]计算值：609.37；实验值609.4。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.70(d,J＝8.1Hz,1H),7.66(ddd,J＝8.2,3.2,1.3Hz,1H),7.42(q,J＝7.5Hz,1H),7.37–7.28(m,2H),7.26(d,J＝7.0Hz,1H),4.39(ddd,J＝11.2,6.3,2.1Hz,1H),4.32(ddd,J＝11.0,9.2,5.4Hz,1H),4.10(dd,J＝17.8,14.1Hz,1H),4.01(dt,J＝8.7,3.8Hz,2H),3.96(d,J＝13.3Hz,1H),3.83(d,J＝13.9Hz,1H),3.76–3.61(m,1H),3.61–3.49(m,3H),3.44–3.37(m,5H),3.32–3.21(m,1H),3.21–3.14(m,1H),3.08(dt,J＝9.7,4.7Hz,1H),2.94(s,3H),2.75(p,J＝7.0Hz,1H),2.68–2.62(m,1H),2.61–2.53(m,2H),2.51(d,J＝2.0Hz,3H),2.48–2.40(m,1H),2.40–2.31(m,1H),2.25–1.89(m,4H),1.87–1.78(m,2H),1.74(td,J＝12.3,11.5,5.4Hz,1H)。
实施例76–合成2-((3S,4S)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003311
步骤1：合成(S)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
向4-氧代哌啶-1,3-二甲酸1-叔丁酯3-乙酯(150g，553mmol，1当量)于甲苯(1.5L)中的溶液中添加(S)-1-苯基乙胺(75.0g，619mmol，1.12当量)和p-TsOH(4.32g，27.6mmol，0.05当量)。在Dean Stark分水器存在下，将所得到的混合物加热至135℃，保持12小时，接着冷却至室温。将反应物用饱和NaHCO3水溶液(2×300mL)洗涤并将有机相用饱和NaCl水溶液(800mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈浅黄色油状的(S)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(190g，92％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.24(br d,J＝7.5Hz,1H),7.36–7.28(m,2H),7.27–7.19(m,3H),4.67–4.54(m,1H),4.26–4.13(m,2H),4.09–4.00(m,2H),3.48–3.36(m,1H),3.34–3.24(m,1H),2.44–2.32(m,1H),2.10–2.00(m,1H),1.49(d,J＝6.8Hz,3H),1.43(s,9H),1.35–1.23(m,3H)。
步骤2：合成(3R,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，在0℃下向NaBH4(11.1g，294mmol，2当量)于THF(0.83L)中的悬浮液中逐滴添加TFA(100g，881mmol，6当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着冷却至-45℃并添加(S)-4-((1-苯基乙基)氨基)-5,6-二氢吡啶-1,3(2H)-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(55g，147mmol，1当量)于MeCN(275mL)中的溶液。搅拌反应1小时，接着升温至0℃并搅拌1小时。将两份独立反应混合物合并，用25％NH4OH水溶液调至pH8，并减压浓缩。将所得到的黄色油状物溶解于EtOAc(1L)和H2O(1L)中，并添加25％NH4OH水溶液(240mL)。将所得到的混合物萃取至EtOAc(3×800mL)中并将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物溶解于MeCN(2.5L)中并过滤，得到呈白色固体状的(3R,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(30g)。减压浓缩滤液并通过反相色谱法(10→40％MeCN/H2O,0.1％TFA)纯化。将含有所希望产物的洗脱部分合并，用饱和NaHCO3水溶液调至pH 7，并减压浓缩以去除MeCN。将所得到的混合物萃取至EtOAc(3×3.5L)中，并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×1.5L)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色油状的(3R,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(86g，78％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.37–7.28(m,4H),7.25(dd,J＝3.0,5.6Hz,1H),4.27–4.15(m,2H),4.05–3.93(m,1H),3.88(q,J＝6.4Hz,1H),3.75–3.60(m,1H),3.20(dd,J＝3.9,13.8Hz,1H),3.02(ddd,J＝3.7,9.1,13.2Hz,1H),2.88(td,J＝4.1,8.4Hz,1H),2.78(d,J＝0.7Hz,1H),1.83–1.71(m,1H),1.57–1.49(m,1H),1.47–1.42(m,9H),1.37–1.23(m,6H)。
步骤3：合成(4S)-1-(叔丁氧基羰基)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-3-甲酸
向Na(15.5g，674mmol，2.95当量)于EtOH(1.9L)中的溶液中添加(3R,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(86g，228mmol，1当量)于EtOH(344mL)中的溶液，并将所得到的混合物加热至50℃，保持15小时，接着冷却至室温并减压浓缩。将所得到的残余物用饱和NaCl水溶液(1.5L)稀释，萃取至EtOAc(3×1L)中，并将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到呈黄色油状的(4S)-1-(叔丁氧基羰基)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-3-甲酸，将其不经进一步纯化即使用。
步骤4：合成(3S,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
向(4S)-1-(叔丁氧基羰基)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-3-甲酸(80g，230mmol，1当量)于DMF(800mL)中的溶液中添加K2CO3(34.9g，252mmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌30分钟，接着添加碘乙烷(39.4g，252mmol，1.1当量)。12小时后，将反应物倒入H2O(4L)中并萃取至EtOAc(3×2L)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×800mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗残余物通过硅胶柱色谱法(1→15％EtOAc/石油醚)纯化，随后通过反相色谱法(10→40％MeCN/H2O,0.1％TFA)纯化。将含有所希望产物的洗脱部分合并，用饱和NaHCO3水溶液调至pH 7，并减压浓缩以去除MeCN。将所得到的水相萃取至EtOAc(3×3.5L)中并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×1.5L)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的黄色油状物溶解于MTBE(80mL)中，并在0℃下，将其逐滴添加至HCl(1M于二噁烷中，50.5mL，0.5当量)中。将所得到的混合物搅拌30分钟，接着添加庚烷(96mL)。1小时后，接着将混合物过滤，得到白色固体。减压浓缩滤液，得到粗产物(17g)，对其进行再纯化。将分离的固体用庚烷洗涤，用庚烷(200mL)研磨并过滤，接着溶解于饱和NaHCO3水溶液中，萃取至EtOAc(3×200mL)中并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(15mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈无色油状的(3S,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(18g)。将粗产物通过相同方法再纯化，得到总计25g(27％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.34–7.28(m,4H),7.26–7.20(m,1H),4.32–4.15(m,3H),4.06–3.91(m,1H),3.82(q,J＝6.5Hz,1H),3.04–2.78(m,2H),2.67(t,J＝12.3Hz,1H),2.37–2.23(m,1H),1.75(dd,J＝2.8,6.3Hz,1H),1.44(s,9H),1.36–1.23(m,6H),1.10(d,J＝12.1Hz,1H)。
步骤5：合成(3S,4S)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
向(3S,4S)-4-(((S)-1-苯基乙基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(18g，47.8mmol，1当量)于EtOH(72mL)中的溶液中添加Pd/C(6g，10％纯度)。在H2(50psi)下，在40℃下将所得到的混合物搅拌12小时，接着通过硅藻土过滤，用EtOH(8×200mL)洗涤并减压浓缩，得到呈浅黄色油状的(3S,4S)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(11.3g，87％产率)，将其不经进一步纯化即使用。
步骤6：合成(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯
在0℃下，向(3S,4S)-4-氨基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(11.3g，41.5mmol，1当量)于THF(110mL)中的溶液中添加(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)碳酸苯甲酯(10.3g，41.5mmol，1当量)。将所得到的混合物搅拌15分钟，接着倒入H2O(200mL)中并萃取至EtOAc(3×80mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(15mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→25％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈浅黄色油状的(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(14.7g，78％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.46–7.29(m,5H),5.17–5.00(m,2H),4.81(s,1H),4.40–3.98(m,4H),3.97–3.81(m,1H),3.18–2.74(m,2H),2.44–2.29(m,1H),2.12–1.93(m,1H),1.46(s,9H),1.21(t,J＝7.2Hz,3H)。
步骤7：合成(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，在0℃下，向(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-乙酯(9g，22.1mmol，1当量)于THF(90mL)中的溶液中缓慢添加LiAlH4(1.26g，33.2mmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着将两份独立反应物合并。逐滴添加H2O(2.6mL)，随后添加15％NaOH水溶液(2.6mL)并过滤混合物。将滤饼用EtOAc(6×50mL)洗涤并用H2O(300mL)稀释滤液。将水相萃取至EtOAc(3×100mL)中并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色油状的(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(9.7g，53％产率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.46–7.30(m,5H),5.19–5.08(s,2H),4.71(d,J＝8.7Hz,1H),4.19–3.96(m,2H),3.82–3.63(m,2H),3.54–3.42(m,1H),3.31(s,1H),3.00–2.65(m,2H),1.98–1.85(m,1H),1.46(s,9H)。
步骤8：合成(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(12.7g，34.8mmol，1.0当量)于DCM(127mL)中的溶液中添加NEt3(5.29g，52.3mmol，1.5当量)，随后添加MsCl(4.35g，38.0mmol，1.09当量)。将所得到的混合物升温至室温并搅拌1小时，接着用H2O(200mL)稀释并萃取至DCM(3×100mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯，将其不经进一步纯化即使用。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.46–7.30(m,5H),5.22–4.99(m,2H),4.69(br d,J＝8.8Hz,1H),4.35–4.04(m,4H),3.71–3.49(m,1H),2.96(s,3H),2.86–2.60(m,2H),1.96(dd,J＝3.2,13.0Hz,1H),1.87–1.74(m,1H),1.46(s,9H)。
步骤9：合成(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
向(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(((甲基磺酰基)氧基)甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(15.2g，34.3mmol，1.0当量)于DMA(228mL)中的溶液中添加NaCN(3.37g，68.7mmol，2当量)并将所得到的混合物加热至55℃，保持12小时，接着冷却至室温，在0℃下倒入H2O(1L)中，并萃取至EtOAc(3×500mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(10→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈浅黄色油状的(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10.2g，76％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.45–7.31(m,5H),5.20–5.03(m,2H),4.65(d,J＝8.5Hz,1H),4.36–4.02(m,2H),3.63–3.44(m,1H),2.90–2.76(m,1H),2.72–2.48(m,2H),2.32(dd,J＝6.4,15.4Hz,1H),2.00–1.90(m,1H),1.75(s,1H),1.53–1.38(m,9H)。
步骤10：合成((3S,4S)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯
在0℃下，向(3S,4S)-4-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-(氰基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(3g，8.03mmol，1当量)于MeOH(15mL)中的溶液中添加HCl(4M于MeOH中，60mL，30当量)并将所得到的混合物升温至室温，并搅拌1小时，接着减压浓缩，得到呈白色固体状的((3S,4S)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯盐酸盐(2.49g，67％产率)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C15H20N3O2的[M+H]计算值：274.15；实验值274.2。
步骤11：合成((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯
向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(4.1g，7.64mmol，1.0当量)和N,N-二异丙基乙胺(9.88g，76.4mmol，10当量)于DMF(41mL)中的溶液中添加((3S,4S)-3-(氰基甲基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯盐酸盐(2.49g，8.02mmol，1.05当量)并将所得到的混合物搅拌40分钟，接着在0℃下缓慢添加至H2O(500mL)中。将所得到的固体过滤，得到呈黄色固体状的((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯，该物质不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.67(dd,J＝8.1,19.7Hz,2H),7.44–7.31(m,6H),7.26–7.19(m,3H),5.21–5.07(m,2H),4.74–3.97(m,6H),3.93–3.44(m,4H),3.33–3.03(m,4H),2.99–2.93(m,3H),2.79–2.64(m,3H),2.62–2.45(m,3H),2.17–1.89(m,5H),1.22–1.14(m,2H)。
步骤12：合成2-((3S,4S)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
向((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)氨基甲酸苯甲酯(7.8g，11.8mmol，1.0当量)于MeOH(25mL)和THF(200mL)中的溶液中添加Pd/C(3g，10％纯度)。在H2(30psi)下，将所得到的混合物搅拌0.5小时，接着将Pd/C(1g，10％纯度)添加至混合物中。0.5小时后，将反应物通过硅藻土过滤，用MeOH(8×100mL)洗涤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(35→65％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((3S,4S)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(3.73g，60％产率)。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.67(dd,J＝8.1,17.5Hz,20H),7.41(dt,J＝3.9,7.7Hz,1H),7.35–7.21(m,3H),4.50–4.14(m,4H),4.07(dd,J＝7.3,17.7Hz,1H),3.74–3.60(m,1H),3.56–3.46(m,1H),3.29–3.11(m,3H),3.10–3.03(m,1H),3.01–2.94(m,1H),2.92(d,J＝3.1Hz,3H),2.89–2.52(m,5H),2.50(s,3H),2.34(q,J＝8.8Hz,1H),2.15–1.91(m,2.5H),1.86–1.62(m,4H),1.47–1.34(m,0.5H)。
步骤13：合成1-((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲
向2-((3S,4S)-4-氨基-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(50mg，95.1μmol，1当量)于DCM(951μL)中的溶液中添加NEt3(79.3μL，570μmol，6当量)，随后添加异硫氰酸2-甲氧基乙酯(11.2μL，104μmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌21小时，接着用DCM(20mL)稀释，用H2O(10mL)洗涤，随后用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈浅褐色油状的1-((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C35H47N8O2S的[M+H]计算值：643.35；实验值643.4。
步骤14：合成2-((3S,4S)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
向1-((3S,4S)-3-(氰基甲基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-3-(2-甲氧基乙基)硫脲(61.0mg，95μmol，1当量)于DCM(949μL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(49.5μL，285μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(36.2mg，142μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌16小时，接着过滤以去除固体，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，得到呈浅褐色固体状的2-((3S,4S)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈(27.1mg，经2个步骤47％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H45N8O2的[M+H]计算值：609.37；实验值609.4。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.70(d,J＝8.1Hz,1H),7.66(d,J＝8.2Hz,1H),7.42(td,J＝7.8,4.2Hz,1H),7.36–7.28(m,2H),7.26(d,J＝7.0Hz,1H),4.49–4.29(m,3H),4.29–4.17(m,1H),4.14–4.05(m,1H),3.69(dd,J＝25.3,17.8Hz,1H),3.60–3.48(m,3H),3.41–3.35(m,5H),3.32–3.12(m,3H),3.12–2.97(m,2H),2.93(d,J＝5.6Hz,3H),2.91–2.82(m,2H),2.74(dt,J＝11.8,6.8Hz,1H),2.69–2.52(m,2H),2.51(s,3H),2.35(q,J＝9.0Hz,1H),2.23–2.02(m,3H),1.97–1.58(m,4H)。
实施例77–合成N-(2-甲氧基乙基)-N-((1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003401
根据实施例20的方法，在步骤10中使用(哌啶-4-基甲基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H46N7O2的[M+H]计算值：584.37；实验值584.4。
实施例78–合成N-((1r,4S)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)环己基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970003402
根据实施例20的方法，在步骤10中使用((1r,4r)-4-(甲基氨基)环己基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:的C35H48N7O2[M+H]计算值：598.39；实验值598.4。
实施例79–合成N-((1s,4R)-4-((((2-甲氧基乙基)亚胺基)亚甲基)氨基)环己基)-N-甲基-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970003403
根据实施例20的方法，在步骤10中使用((1s,4s)-4-(甲基氨基)环己基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H48N7O2的[M+H]计算值：598.39；实验值598.4。
实施例80–合成N-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003411
步骤1：合成(S)-4-(4-异硫氰酸基哌啶-1-基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶
在0℃下，向(S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-胺盐酸盐(4.2g，8.03mmol，1当量)和NEt3(4.06g，40.1mmol，5当量)于DCM(60mL)中的溶液中添加NEt3(4.06g，40.1mmol，5当量)和CS2(1.83g，24.1mmol，3当量)的混合物。在室温下，将所得到的混合物搅拌0.5小时，接着冷却至0℃并添加T3P(50％,9.20g，14.4mmol，1.8当量)。在室温下搅拌反应0.5小时，接着萃取至DCM(3×30mL)中。将合并的有机相用饱和NH4Cl水溶液(3×30mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(40mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗黄色固体不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成(S)-1-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲
向(S)-4-(4-异硫氰酸基哌啶-1-基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶(600mg，1.13mmol，1当量)于DMF(6mL)中的溶液中添加NEt3(287mg，2.84mmol，2.5当量)。将所得到的混合物冷却至0℃并添加1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺盐酸盐(172mg，1.25mmol，1.1当量)。搅拌反应3小时，接着用H2O(60mL)淬灭并萃取至DCM(3×20mL)中。将合并的有机相用饱和NH4Cl水溶液(3×30mL)洗涤，接着用饱和NaCl水溶液(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(55→75％MeCN/H2O,0.05％NH4OH+10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的(S)-1-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲(190mg，26％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H48N7O2S的[M+H]计算值：630.35；实验值630.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.69(d,J＝7.8Hz,1H),7.66–7.60(m,1H),7.41(t,J＝7.7Hz,1H),7.35–7.27(m,2H),7.27–7.21(m,1H),4.48(s,1H),4.42–4.33(m,1H),4.33–4.23(m,1H),4.20–3.96(m,3H),3.66(d,J＝17.7Hz,1H),3.56–3.40(m,3H),3.39–3.33(m,4H),3.23–3.11(m,3H),3.07(td,J＝4.6,9.7Hz,1H),2.92(s,3H),2.81–2.69(m,1H),2.68–2.57(m,1H),2.49(d,J＝0.9Hz,3H),2.34(q,J＝9.0Hz,1H),2.23–2.01(m,3H),1.89–1.65(m,4H),1.64–1.49(m,1H),1.01–0.81(m,4H)。
步骤3：合成N-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
向(S)-1-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-3-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)硫脲(70mg，111μmol，1当量)于DCM(1.1mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(57.9μL，333μmol，3当量)，随后添加2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓碘化物(42.4mg，166μmol，1.5当量)。将所得到的混合物搅拌16小时，接着过滤以去除固体，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→100％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，得到呈黄色油状的N-(1-(甲氧基甲基)环丙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺(27.5mg，42％)。LCMS(ESI)m/z:C35H46N7O2的[M+H]计算值：596.37；实验值596.4。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.70(d,J＝8.1Hz,1H),7.65(d,J＝8.2Hz,1H),7.42(t,J＝7.7Hz,1H),7.36–7.28(m,2H),7.25(d,J＝7.0Hz,1H),4.38(ddd,J＝13.1,10.9,6.0Hz,1H),4.29(ddd,J＝16.9,10.9,5.8Hz,1H),4.12–4.03(m,2H),3.97(d,J＝13.8Hz,1H),3.70–3.58(m,2H),3.54–3.49(m,1H),3.47(s,2H),3.41–3.35(m,4H),3.25–3.13(m,3H),3.08(dt,J＝9.6,4.6Hz,1H),2.93(s,3H),2.74(p,J＝6.9Hz,1H),2.66–2.56(m,1H),2.50(s,3H),2.35(q,J＝9.0Hz,1H),2.15–2.06(m,2H),2.05–1.98(m,1H),1.87–1.76(m,3H),1.76–1.58(m,2H),0.78(s,4H)。
实施例81–合成N-(2-甲氧基苯甲基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003431
根据实施例20的方法，在步骤12中使用异硫氰酸2-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C38H46N7O2的[M+H]计算值：632.37；实验值632.4。
实施例82–合成N-(2,4-二甲氧基苯甲基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003441
根据实施例80的方法，在步骤2中使用(2,4-二甲氧基苯基)甲胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C39H48N7O3的[M+H]计算值：662.38；实验值662.4。
实施例83–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003442
根据实施例80的方法，在步骤2中使用1-甲基哌啶-4-胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C36H49N8O的[M+H]计算值：609.40；实验值609.4。
实施例84–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(1-苯基哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003451
根据实施例80的方法，在步骤2中使用1-苯基哌啶-4-胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C41H51N8O的[M+H]计算值：671.42；实验值671.4。
实施例85–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(3-吗啉代丙基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003452
根据实施例20的方法，在步骤12中使用4-(3-异硫氰酸基丙基)吗啉代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C37H51N8O2的[M+H]计算值：639.41；实验值639.5。
实施例86–合成N-(异噁唑-3-基甲基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003461
根据实施例20的方法，在步骤12中使用3-(异硫氰酸基甲基)异噁唑代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H41N8O2的[M+H]计算值：593.34；实验值593.4。
实施例87–合成N-(2-(1H-咪唑-1-基)乙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003462
根据实施例80的方法，在步骤2中使用2-(1H-咪唑-1-基)乙-1-胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C35H44N9O的[M+H]计算值：606.37；实验值606.4。
实施例88–合成N-(3-(1H-咪唑-1-基)丙基)-N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003471
根据实施例80的方法，在步骤2中使用3-(1H-咪唑-1-基)丙-1-胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C36H46N9O的[M+H]计算值：620.38；实验值620.4。
实施例89–合成N-甲基-N-(2-((((1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)亚胺基)亚甲基)氨基)乙基)苯胺
Figure BDA0003759053970003472
根据实施例80的方法，在步骤2中使用N1-甲基-N1-苯基乙-1,2-二胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C39H49N8O的[M+H]计算值：645.40；实验值645.4。
实施例90–合成N-甲基-N-(3-((((1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)苯胺
Figure BDA0003759053970003473
根据实施例80的方法，在步骤2中使用N1-甲基-N1-苯基丙烷-1,3-二胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C40H51N8O的[M+H]计算值：659.42；实验值659.4。
实施例91–合成N-甲基-N-(3-((((1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)亚胺基)亚甲基)氨基)丙基)吡啶-2-胺
Figure BDA0003759053970003481
根据实施例80的方法，在步骤2中使用N1-甲基-N1-(吡啶-2-基)丙烷-1,3-二胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C39H50N9O的[M+H]计算值：660.41；实验值660.4。
实施例92–合成N-甲基-N-(2-((((1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)亚胺基)亚甲基)氨基)乙基)嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970003482
根据实施例80的方法，在步骤2中使用N1-甲基-N1-(嘧啶-4-基)乙-1,2-二胺代替1-(甲氧基甲基)环丙-1-胺合成。LCMS(ESI)m/z:C37H47N10O的[M+H]计算值：647.39；实验值647.4。
实施例93–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(3-(甲硫基)丙基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003491
根据实施例20的方法，在步骤12中使用(3-异硫氰酸基丙基)(甲基)硫烷代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C34H46N7OS的[M+H]计算值：600.35；实验值600.4。
实施例94–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(噻吩-2-基甲基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003492
根据实施例20的方法，在步骤12中使用2-(异硫氰酸基甲基)噻吩代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H42N7OS的[M+H]计算值：608.32；实验值608.3。
实施例95–合成N-(1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-4-基)-N-(2-(噻吩-2-基)乙基)甲烷二亚胺
Figure BDA0003759053970003501
根据实施例20的方法，在步骤12中使用2-(2-异硫氰酸基乙基)噻吩代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C36H44N7OS的[M+H]计算值：622.33；实验值622.3。
实施例96–合成2-((S)-1-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003502
根据反应方案4的方法，使用实施例63代替化合物1并使用苯甲基溴代替化合物2合成。LCMS(ESI)m/z:C40H47N8O2的[M+H]计算值：671.38；实验值671.4。
实施例97–合成2-((S)-1-((S)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003511
根据反应方案4的方法，使用实施例64代替化合物1并使用苯甲基溴代替化合物2合成。LCMS(ESI)m/z:C40H47N8O2的[M+H]计算值：671.38；实验值671.4。
实施例98–合成2-((S)-1-((R)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003512
根据实施例43的方法，使用实施例63代替实施例42合成。LCMS(ESI)m/z:C35H43N8O3的[M+H]计算值：623.35；实验值623.4。
实施例99–合成2-((S)-1-((S)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003513
根据实施例43的方法，使用实施例64代替实施例42合成。LCMS(ESI)m/z:C35H44N8O3的[M+2H]/2计算值：312.17；实验值312.3。
实施例100–合成2-((S)-1-(((R)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003521
根据反应方案2的方法，在步骤1中使用中间体F代替化合物1合成。LCMS(ESI)m/z:C33H43N8O的[M+H]计算值：567.36；实验值567.4。
实施例101–合成2-((S)-1-(((S)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003522
根据反应方案2的方法，在步骤1中使用中间体F代替化合物1合成。LCMS(ESI)m/z:C33H43N8O的[M+H]计算值：567.36；实验值567.4。
实施例102–合成2-((3S,4R)-4-((((2-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003531
根据实施例75的方法，在步骤11中使用异硫氰酸2-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C40H47N8O2的[M+H]计算值：671.38；实验值671.4。
实施例103–合成2-((3S,4S)-4-((((2-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌啶-3-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003532
根据实施例76的方法，在步骤13中使用异硫氰酸2-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C40H47N8O2的[M+H]计算值：671.38；实验值671.5。
实施例104–合成N-((1R,3S)-3-((((2-甲氧基苯甲基)亚胺基)亚甲基)氨基)环丁基)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003759053970003541
根据实施例20的方法，在步骤10中使用((1R,3R)-3-氨基环丁基)氨基甲酸叔丁酯代替哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯并在步骤12中使用异硫氰酸2-甲氧基苯甲酯代替异硫氰酸2-甲氧基乙酯合成。LCMS(ESI)m/z:C37H44N7O2的[M+H]计算值：618.36；实验值618.4。
实施例105–合成2-((S)-1-((R)-1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003542
向2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(400mg，689μmol，1当量)和1-溴-2-甲氧基乙烷(97μL，1.03mmol，1.5当量)于DMF(4mL)中的溶液中添加NEt3(960μL，6.89mmol，10当量)和KI(57.2mg，344μmol，0.5当量)。将所得到的混合物加热至60℃。12小时后，将反应物冷却至室温，过滤，接着通过反相色谱法(50→75％MeOH/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(45.1mg，10％产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H47N8O3的[M+H]计算值：639.38；实验值639.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.76–7.57(m,2H),7.47(d,J＝0.9Hz,1H),7.34(t,J＝7.7Hz,1H),7.27–7.17(m,2H),5.11–4.82(m,1H),4.64–4.01(m,6H),3.99–3.61(m,3H),3.58–3.34(m,5H),3.32–3.05(m,4H),3.02–2.87(m,4H),2.86–2.57(m,4H),2.57–2.42(m,3H),2.31(s,2H),2.22–1.99(m,1H),1.96–1.51(m,5H)。
实施例106–合成2-((S)-1-((S)-1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003551
根据实施例105的方法，使用实施例64代替实施例63合成。LCMS(ESI)m/z:C36H47N8O3的[M+H]计算值：639.38；实验值639.4。
实施例107–合成2-((S)-1-((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003552
在室温下，将2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(500mg，861μmol，1当量)、MeI(54μL，861μmol，1当量)和N,N-二异丙基乙胺(450μL，2.58mmol，3当量)于DMF(5mL)中的溶液搅拌2小时，接着过滤。将所得到的滤液通过反相色谱法(20→40％MeCN/H2O，0.2％甲酸)纯化，得到白色固体，接着通过反相色谱法(25→45％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)再纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(40.7mg，8％产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H43N8O2的[M+H]计算值：595.35；实验值595.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.85(s,1H),7.73–7.59(m,2H),7.47–7.37(m,1H),7.33(t,J＝7.5Hz,1H),7.29(s,1H),7.26–7.11(m,1H),5.21–5.03(m,1H),5.22–4.76(m,1H),4.43–4.03(m,4H),4.75–4.03(m,2H),4.00–3.83(m,2H),4.00–3.64(m,2H),3.47(d,J＝10.6Hz,5H),3.34–3.08(m,7H),3.06–2.96(m,1H),2.96–2.86(m,3H),2.85–2.42(m,3H),2.39–2.01(m,3H),2.00–1.76(m,2H)。
实施例108–合成(R)-1-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
Figure BDA0003759053970003561
步骤1：合成(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
在0℃下，向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(500mg，1.46mmol，1当量)于MeOH(2.5mL)和CHCl3(2.5mL)中的溶液中添加TFA(1.67mL，21.84mmol，15当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用H2O(5mL)淬灭并萃取至DCM(4×2mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(200mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基氯
在0℃下，向2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)-甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(200mg，391μmol，1当量)于DCM(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(341μL，1.95mmol，5当量)和三光气(69.6mg，234μmol，0.6当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着直接用于下一步骤中。
步骤3：合成(R)-1-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸基酯
在0℃下，向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(106mg，1.05mmol，3当量)于DCM(1mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(606μL，3.48mmol，10当量)，随后(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基氯于DCM(1mL)中的溶液。将所得到的混合物搅拌30分钟，接着用饱和NH4Cl水溶液(2mL)淬灭并萃取至DCM(4×2mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗产物通过反相色谱法(40→70％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，接着通过反相色谱法(45→70％MeCN/H2O,0.05％NH4OH+10mMNH4HCO3)再纯化，得到呈白色固体状的(R)-1-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(59.1mg，26％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H43N8O4的[M+H]计算值：639.34；实验值639.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.71–7.69(m,2H),7.65–7.33(m,2H),7.27–7.20(m,2H),4.83(s,1H),4.38–4.29(m,3H),4.24–4.18(m,3H),3.87–3.82(m,1H),3.81(s,3H),3.19–3.16(m,1H),3.11–3.10(m,1H),3.08–3.07(m,5H),3.06–3.05(m,1H),2.92(s,3H),2.66–2.65(m,5H),2.48(s,3H),1.78–1.76(m,1H),1.75–1.74(m,1H),1.74–1.73(m,3H),1.64(s,1H)。
实施例109–合成(S)-1-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
Figure BDA0003759053970003581
根据实施例108的方法，在步骤1中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H43N8O4的[M+H]计算值：639.34；实验值639.4。
实施例110–合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003591
步骤1：合成(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(7g，13.8mmol，1当量)于二噁烷(105mL)中的溶液中添加4-溴-5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑(8.17g，27.7mmol，2当量)、RuPhos(1.29g，2.77mmol，0.2当量)、Pd2(dba)3(1.90g，2.08mmol，0.15当量)和Cs2CO3(11.3g，34.6mmol，2.5当量)。将所得到的混合物加热至95℃。4小时后，将反应物冷却至室温，通过硅藻土过滤，并用DCM(4×30mL)洗涤。将滤液用H2O(2×70mL)、饱和NaCl水溶液(70mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(50→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈橙色固体状的(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(7.35g，63％产率)。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.07(s,1H),7.41–7.34(m,5H),7.29(br t,J＝8.3Hz,2H),5.74(br d,J＝8.3Hz,1H),5.26–5.12(m,2H),4.69(br s,1H),4.33(dq,J＝5.9,11.2Hz,2H),4.21(s,2H),4.16–4.02(m,3H),3.99(br d,J＝11.6Hz,1H),3.84–3.74(m,1H),3.53–3.45(m,2H),3.28(br s,1H),3.13–3.03(m,2H),3.00–2.69(m,5H),2.50(s,4H),2.43–2.28(m,4H),2.16–2.03(m,2H),1.98(br d,J＝13.2Hz,1H),1.87–1.76(m,3H),1.75–1.56(m,4H)。
步骤2：合成2-((2S)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(7g，9.72mmol，1当量)于MeOH(35mL)和THF(35mL)中的溶液中添加Pd/C(4.2g，10％纯度)并在H2(30psi)下搅拌所得到的混合物。2.5小时后，将反应混合物通过硅藻土过滤并减压浓缩，得到呈褐色固体状的2-((2S)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(5.6g，80％产率)。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.08(s,1H),7.41–7.34(m,1H),7.32–7.26(m,1H),5.75(dd,J＝2.3,9.8Hz,1H),4.41–4.34(m,1H),4.34–4.27(m,1H),4.24–4.12(m,3H),4.03–3.92(m,2H),3.79(dt,J＝3.1,11.0Hz,1H),3.52–3.45(m,2H),3.22–3.10(m,2H),3.10–3.00(m,2H),2.96–2.84(m,2H),2.84–2.69(m,3H),2.65(d,J＝6.5Hz,2H),2.55–2.45(m,4H),2.40(s,3H),2.37–2.25(m,1H),2.16–2.02(m,2H),1.98(br dd,J＝2.7,13.2Hz,1H),1.88–1.76(m,3H),1.76–1.57(m,4H)。
步骤3：合成2-((S)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((2S)-4-(7-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(4g，6.83mmol，1当量)于DCM(40mL)中的溶液中添加TFA(10.5mL，137mmol，20当量)并将所得到的混合物升温至室温。2小时后，将反应倒入冰与饱和NaHCO3水溶液的混合物中，接着将其萃取至DCM(3×50mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过反相色谱法(0→30％MeCN/H2O,0.1％TFA)纯化，得到呈褐色固体状的2-((S)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(3.07g，TFA盐)。LCMS(ESI)m/z:C27H36N9O的[M+H]计算值：502.30；实验值：502.3。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.08(s,1H),7.28(s,2H),4.76(dd,J＝3.2,12.6Hz,1H),4.59(dd,J＝7.4,12.7Hz,1H),4.48(br d,J＝14.2Hz,1H),4.29(s,2H),4.25(br d,J＝15.0Hz,1H),4.03–3.92(m,1H),3.88(br s,1H),3.74(br s,1H),3.62–3.49(m,4H),3.46–3.33(m,3H),3.24(br d,J＝8.3Hz,1H),3.09(br s,1H),3.08(s,3H),2.97(br d,J＝14.8Hz,1H),2.89–2.79(m,1H),2.42(s,3H),2.41–2.33(m,1H),2.27–2.17(m,1H),2.16–1.98(m,2H)。
步骤4：合成2-((S)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐(39.9mg，119μmol，1.2当量)、2-((S)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(50mg，99.6μmol，1当量)和HATU(45.2mg，119μmol，1.2当量)于DMF(1mL)中的悬浮液中添加N,N-二异丙基乙胺(52μL，298μmol，3当量)。将所得到的混合物搅拌3小时，接着用EtOAc(10mL)稀释。将有机相用5％柠檬酸水溶液(20mL)、饱和NaHCO3水溶液(20mL)、饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。
步骤5：合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(80mg，98.3μmol，1当量)于DCM(0.5mL)中的溶液中添加TFA(150μL，2.0mmol，20当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着用MeOH(0.5mL)，随后NEt3(273μL，1.96mmol，20当量)淬灭并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(10.0mg，经2个步骤18％产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H39N10O2的[M+H]计算值：571.33；实验值571.8。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.11(d,J＝3.1Hz,1H),7.32–7.24(m,2H),5.08–4.90(m,2H),4.45–4.09(m,7H),3.67(t,J＝12.8Hz,1H),3.57(t,J＝5.3Hz,2H),3.44–3.35(m,2H),3.31–3.23(m,1H),3.14–2.84(m,6H),2.77(q,J＝7.1Hz,1H),2.52(s,3H),2.44(s,3H),2.37(q,J＝9.0Hz,1H),2.12(dq,J＝12.8,8.3Hz,1H),1.96–1.79(m,4H),1.73(dq,J＝14.2,7.2Hz,1H)。
实施例111–合成2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003621
根据实施例110的方法，在步骤4中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐合成。LCMS(ESI)m/z:C30H39N10O2的[M+H]计算值：571.33；实验值571.8。
实施例112–合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003631
步骤1：合成1H-萘并[1,8-de][1,2,3]三嗪
在15℃下，向萘-1,8-二胺(15g，95mmol，1当量)于AcOH(30mL)和EtOH(150mL)中的溶液中逐滴添加亚硝酸丁酯(12.5mL，93mmol，0.98当量)，将温度保持在15-20℃之间。将混合物升温至室温。3小时后，将反应混合物过滤并用EtOH(3×25mL)、石油醚(25mL)洗涤滤饼，并减压干燥，得到呈红色固体状的1H-萘并[1,8-de][1,2,3]三嗪(11.5g，72％产率)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.26(br s,1H),7.27(br s,2H),6.96–7.18(m,2H),6.89(br s,1H),6.14(br d,J＝7.21Hz,1H)。
步骤2：合成8-氯萘-1-胺
向1H-萘并[1,8-de][1,2,3]三嗪(22.7g，134mmol，1当量)于HCl(12N，460mL)中的溶液中添加Cu(566mg，8.91mmol，0.066当量)。12小时后，将反应混合物用H2O(50mL)稀释并加热至85℃。30分钟后，过滤溶液，冷却，并用饱和NH4OH水溶液碱化至pH 8-9。将反应混合物萃取至EtOAc(3×50mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(2→17％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈红色固体状的8-氯萘-1-胺(18.5g，78％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.56(d,J＝8.07Hz,1H),7.25–7.31(m,1H),7.11–7.20(m,3H),6.63(dd,J＝7.09,1.47Hz,1H)。
步骤3：合成1-溴-8-氯萘
在-5℃下，向8-氯萘-1-胺(20.2g，114mmol，1当量)和TsOH·H2O(77.9g，409mmol，3.6当量)于MeCN(360mL)中的溶液中添加NaNO2(14.12g，205mmol，1.8当量)，随后添加CuBr(10.4mL，341mmol，3当量)于H2O(48mL)中的溶液。将反应混合物升温至室温。12小时后，添加饱和Na2SO3水溶液(200mL)。搅拌30分钟后，减压浓缩反应混合物以去除有机溶剂。将水相萃取至EtOAc(3×80mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(80mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(3→5％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的1-溴-8-氯萘(17.2g，63％产率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.93(dd,J＝7.46,1.22Hz,1H),7.80(ddd,J＝12.35,8.19,0.98Hz,2H),7.67(dd,J＝7.52,1.28Hz,1H),7.38(t,J＝7.83Hz,1H),7.25–7.32(m,1H)。
步骤4：合成(S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在N2下，向(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.0g，5.9mmol，1当量)于甲苯(80mL)中的溶液中添加1-溴-8-氯萘(4.3g，17.7mmol，3当量)、Cs2CO3(5.8g，17.7mmol，3当量)、Pd2(dba)3(815mg，890μmol，0.15当量)和xantphos(687mg，1.2mmol，0.2当量)。将不均匀混合物加热至90℃。12小时后，将悬浮液过滤并用EtOAc(3×50mL)洗涤。将合并的滤液用H2O(50mL)、饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→10％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(2.6g，66％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.81(d,J＝8.16Hz,1H),7.67(dd,J＝8.27,3.20Hz,1H),7.50(dd,J＝16.76,7.50Hz,2H),7.25–7.45(m,9H),5.09–5.27(m,2H),4.71(br s,1H),4.25–4.39(m,3H),4.07–4.15(m,2H),3.62–3.75(m,1H),3.38–3.61(m,2H),2.97–3.29(m,6H),2.58–2.96(m,3H),2.51(d,J＝4.41Hz,3H),2.32–2.42(m,1H),2.05–2.15(m,1H),1.77–1.88(m,2H),1.62–1.74(m,1H)。
步骤5：合成2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向(S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.50g，5.25mmol，1当量)于MeCN(35mL)中的溶液中添加TMSI(2.50mL，18.4mmol，3.5当量)并加热至50℃。2小时后，将反应混合物冷却至室温并用MeOH(20mL)淬灭。搅拌15分钟后，将反应混合物倒入0℃的HCl(1N,100mL)中并萃取至EtOAc(3×20mL)中。用0℃的NaOH(1N)将水层碱化至pH 8-9，接着萃取至EtOAc(3×30mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(15→45％MeCN/H2O，0.2％甲酸)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(1.81g，65％产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H35ClN7O的[M+H]计算值：532.26；实验值532.3；1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.77–7.82(m,1H),7.65(d,J＝8.19Hz,1H),7.41–7.53(m,2H),7.31–7.37(m,1H),7.28(dd,J＝6.72,3.67Hz,1H),4.20–4.41(m,4H),3.95–4.08(m,1H),3.89(br d,J＝13.20Hz,0.5H),3.66(br dd,J＝17.36,13.57Hz,1H),3.52(br dd,J＝5.99,3.67Hz,1H),2.91–3.29(m,7.5H),2.72–2.87(m,2H),2.61–2.70(m,2H),2.48–2.60(m,4H),2.37(qd,J＝8.91,3.85Hz,1H),1.99–2.14(m,1H),1.76–1.85(m,2H),1.66–1.76(m,1H)。
步骤6：合成2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈
向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐(34.5mg，103μmol，1.1当量)、2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(50mg，93.9μmol，1当量)和HATU(39.1mg，103μmol，1.1当量)于DMF(0.9mL)中的悬浮液中添加N,N-二异丙基乙胺(49μL，281μmol，3当量)。将所得到的混合物搅拌2小时，接着用EtOAc(10mL)稀释。将有机相用5％柠檬酸水溶液(20mL)、饱和NaHCO3水溶液(20mL)、饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。
步骤7：合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向2-((S)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(79mg，93.6μmol，1当量)于DCM(0.5mL)中的溶液中添加TFA(143μL，1.87mmol，20当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着用MeOH(1mL)，随后NEt3(260μL，1.87mmol，20当量)淬灭并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→60％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，接着通过反相色谱法(10→60％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)再纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(9.5mg，经2个步骤17％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H38ClN8O2的[M+H]计算值：601.28；实验值601.8。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ7.84(d,J＝8.1Hz,1H),7.70(dd,J＝8.2,3.1Hz,1H),7.58–7.47(m,2H),7.43–7.31(m,2H),5.06–4.93(m,1H),4.62–4.48(m,1H),4.35(dt,J＝18.1,9.5Hz,4H),4.27–4.04(m,2H),3.81–3.68(m,2H),3.67–3.41(m,2H),3.29–3.17(m,3H),3.17–3.01(m,3H),3.00–2.84(m,1H),2.82–2.63(m,2H),2.52(s,3H),2.37(dd,J＝9.0,3.7Hz,1H),2.11(dq,J＝16.5,8.2Hz,1H),1.94–1.79(m,4H),1.79–1.64(m,1H)。
实施例113–合成2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-氯萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003671
根据实施例112的方法，在步骤6中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐合成。LCMS(ESI)m/z:C32H38ClN8O2的[M+H]计算值：601.28；实验值601.8。
实施例114–合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003681
步骤1：合成特戊酸4-溴萘-2-基酯
在0℃下，向4-溴萘-2-醇(1.0g，4.5mmol，1当量)于DCM(10mL)中的溶液中添加NEt3(1.25mL，9.0mmol，2当量)和PivCl(830μL，6.7mmol，1.5当量)。10分钟后，用H2O(60mL)淬灭反应，将其萃取至EtOAc(3×30mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(2→5％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色油状的特戊酸4-溴萘-2-基酯(1.28g，93％产率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ8.22(d,J＝8.16Hz,1H),7.76–7.83(m,1H),7.51–7.62(m,4H),1.41(s,9H)。
步骤2：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(3-(特戊酰氧基)萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
将特戊酸4-溴萘-2-基酯(1.3g，4.15mmol，1.5当量)、(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.4g，2.8mmol，1当量)、RuPhos(260mg，550μmol，0.2当量)、Pd2(dba)3(260mg，280μmol，0.1当量)和Cs2CO3(2.3g，6.9mmol，2.5当量)于二噁烷(15mL)中的混合物加热至100℃。1小时后，将反应混合物过滤并减压浓缩。将粗残余物用饱和NaCl水溶液(60mL)稀释，将其萃取至EtOAc(2×50mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→5％MeOH/DCM)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(3-(特戊酰氧基)萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.7g，84％产率)。LCMS(ESI)m/z:C42H50N7O5的[M+H]计算值：732.39；实验值732.4。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ8.12–8.18(m,1H),7.77–7.83(m,1H),7.48(ddd,J＝7.72,5.84,1.43Hz,2H),7.35–7.42(m,5H),7.29(d,J＝1.98Hz,1H),6.83(d,J＝1.98Hz,1H),5.22(s,2H),4.70(br d,J＝2.87Hz,1H),4.35–4.44(m,1H),4.26(br d,J＝5.29Hz,2H),4.17–4.22(m,1H),4.03–4.09(m,1H),3.91–4.01(m,1H),3.44–3.56(m,1H),3.22–3.41(m,3H),2.95–3.16(m,3H),2.86(br d,J＝1.32Hz,2H),2.49(s,3H),2.29(br d,J＝7.72Hz,1H),1.64–1.92(m,6H),1.41(s,9H)。
步骤3：合成特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯
向(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(3-(特戊酰氧基)萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.0g，1.4mmol，1当量)于MeCN(10mL)中的溶液中添加TMSI(930μL，6.8mmol，5当量)。将反应混合物加热至50℃。1小时后，用MeOH(20mL)淬灭反应。搅拌15分钟后，将混合物添加至HCl(1N,60mL)中并萃取至EtOAc(3×30mL)中。用NaOH(1N)将水层碱化至pH 8-9，将其萃取至EtOAc(3×30mL)中，用饱和NaCl水溶液(40mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯(1.27g)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C34H44N7O3的[M+H]计算值：598.35；实验值598.3。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ8.16(d,J＝7.72Hz,1H),7.75–7.84(m,1H),7.44–7.54(m,2H),7.29(d,J＝1.76Hz,1H),6.83(d,J＝1.98Hz,1H),4.43(br s,1H),4.25(s,2H),4.17–4.22(m,1H),14.03(br d,J＝12.79Hz,1H),3.89(br d,J＝11.69Hz,1H),3.24–3.47(m,3H),2.99–3.20(m,4H),2.82–2.97(m,3H),2.66–2.77(m,1H),2.56(dd,J＝6.39,2.87Hz,2H),2.52(br s,3H),2.26–2.40(m,1H),1.71–1.95(m,4H),1.41(s,9H)。
步骤4：合成特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯
在0℃下，向特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯(570mg，950μmol，1当量)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(940mg，2.9mmol，3当量)于DMF(6mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(1.66mL，9.5mmol，10当量)和T3P(1.70mL，2.9mmol，50％纯度，3当量)。将反应混合物升温至室温。1小时后，用H2O(60mL)淬灭反应，将其萃取至EtOAc(3×30mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→5％MeOH/DCM)纯化，得到呈黄色固体状的特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯(1.14g)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C56H61N8O4的[M+H]计算值：909.48；实验值909.5。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.93(br d,J＝7.72Hz,1H),7.55–7.61(m,1H),7.33(brd,J＝7.50Hz,5H),7.06–7.12(m,7H),6.93–6.99(m,6H),6.61(d,J＝1.98Hz,1H),4.89(brd,J＝2.87Hz,1H),4.28(br dd,J＝10.69,5.62Hz,1H),3.95–4.11(m,4H),3.54–3.63(m,1H),3.37–3.46(m,1H),3.15–3.32(m,3H),3.06(br s,2H),2.55–2.84(m,7H),2.32–2.39(m,3H),2.24(br s,2H),1.52–1.78(m,5H),1.19(s,9H)。
步骤5：合成2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向特戊酸4-(4-((S)-3-(氰基甲基)-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-基)萘-2-基酯(1.0g，1.1mmol，1当量)于THF(10mL)中的溶液中添加NaOH(1.2mL，5N,5.5当量)。将反应混合物加热至40℃。16小时后，将反应混合物用H2O(60mL)淬灭，用20％甲酸水溶液调至pH 7，将其萃取至EtOAc(3×30mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(640mg)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C51H53N8O3的[M+H]计算值：825.42；实验值825.4。
步骤6：合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(400mg，490μmol，1当量)于CHCl3(2mL)和MeOH(2mL)中的溶液中添加TFA(540μL，7.3mmol，15当量)。30分钟后，将反应混合物用0℃饱和NaHCO3水溶液(60mL)淬灭，将其萃取至EtOAc(3×30mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(25→55％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈黄色固体状的2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(161mg，55％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H39N8O3的[M+H]计算值：583.31；实验值583.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.94–8.02(m,1H),7.60–7.68(m,1H),7.38–7.50(m,1H),7.28–7.34(m,1H),6.88(d,J＝0.88Hz,1H),6.53–6.63(m,1H),4.80–4.95(m,1H),4.46–4.64(m,1H),3.80–4.37(m,5H),3.08–3.51(m,4H),2.92–3.06(m,1H),2.31–2.90(m,10H),2.05–2.19(m,1H),1.68–2.02(m,7H)。
实施例115–合成2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(3-羟基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003721
根据实施例114的方法，在步骤4中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸合成。LCMS(ESI)m/z:C32H39N8O3的[M+H]计算值：583.31；实验值583.4。
实施例116–合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003731
步骤1：合成(S)-(1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲醇
向(S)-吡咯烷-2-基甲醇(9.6mL，99mmol，1当量)和K2CO3(14g，100mmol，1.01当量)于甲苯(100mL)中的混合物中添加4-溴丁-1-炔(11mL，120mmol，1.2当量)。将所得到的反应混合物加热至110℃。16小时后，将混合物用HCI(50mL，2N)淬灭，用MTBE(50mL)洗涤，用饱和NH4OH水溶液调至pH 8-9，萃取至DCM(4×20mL)中，用饱和NaCl水溶液(3×20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色油状的(S)-(1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲醇(9.48g，63％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ3.69–3.55(m,1H),3.37(d,J＝10.58Hz,1H),3.25–3.11(m,1H),2.91(dt,J＝12.07,7.86Hz,1H),2.80(s,1H),2.65(dd,J＝5.40,2.98Hz,1H),2.51(dt,J＝12.13,6.06Hz,1H),2.41-2.22(m,3H),2.04–1.92(m,1H),1.90–1.82(m,1H),1.80–1.59(m,3H)。
步骤2：合成4-羟基-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯
向3-氧代哌啶-1,4-二甲酸1-(叔丁基)酯4-乙酯(50g，180mmol，1当量)于NaOMe(50mL，920mmol，5当量，56wt％于MeOH中)中的溶液中添加甲基硫代异脲(92g，330mmol，1.8当量)。6小时后，用HCl(2N)调至pH 5来淬灭反应混合物，减压浓缩，使其悬浮于EtOAc/H2O(1.0L,1:1)中，并搅拌。10分钟后，过滤混合物，并用石油醚(100mL)洗涤滤饼，接着减压干燥，得到呈白色固体状的4-羟基-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(40.1g，73％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.34(s,2H),3.60(s,2H),2.64–2.43(m,5H),1.50(s,9H)。
步骤3：合成2-(甲硫基)-4-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯
向4-羟基-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(15g，50mmol，1当量)于DCM(150mL)中的溶液中依序添加PhNTf2(27g，76mmol，1.5当量)、DBU(7.6mL，50mmol，1当量)和DMAP(120mg，1.01mmol，0.02当量)。1小时后，用H2O(100mL)淬灭反应，将其萃取至DCM(3×50mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的2-(甲硫基)-4-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(50.25g，粗品)，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤4：合成(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯
向2-(甲硫基)-4-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(20.2g，47.1mmol，43％纯度，1当量)和(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯·3HCl(20.0g，54.1mmol，1.15当量)于DMF(200mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(41.0mL，235mmol，5当量)。1小时后，用H2O(600mL)淬灭反应，将其萃取至EtOAc(3×100mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→33％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色油状的(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(21.5g，85％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.44–7.28(m,5H),5.24–5.14(m,2H),4.73–4.57(m,2H),4.38(d,J＝18.96Hz,1H),4.04–3.73(m,3H),3.30(d,J＝11.03Hz,3H),3.00(td,J＝12.46,3.53Hz,1H),2.86–2.56(m,4H),2.51(s,3H),1.49(s,9H)。
步骤5：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(S)-4-(4-((苯甲氧基)羰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-基)-2-(甲硫基)-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-甲酸叔丁酯(18.0g，33.4mmol，1当量)于DCM(60mL)中的溶液中添加TFA(61.9mL，835mmol，25当量)。将反应混合物升温至室温。1小时后，将混合物减压浓缩，在0℃下将其添加至饱和NaHCO3水溶液(200mL)中，萃取至DCM(3×30mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(17.72g，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C22H27N6O2S的[M+H]计算值：439.19；实验值439.2。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.42–7.29(m,5H),5.22–5.13(m,2H),4.72–4.59(m,1H),4.26–4.09(m,4H),3.99(d,J＝13.45Hz,1H),3.88–3.75(m,1H),3.48–3.17(m,4H),3.13–2.98(m,1H),2.96–2.75(m,3H),2.73–2.60(m,1H),2.51–2.46(m,3H)。
步骤6：合成(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
将(S)-2-(氰基甲基)-4-(2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(15.7g，35.9mmol，1当量)、1-溴-8-甲基-萘(15.9g，71.7mmol，2当量)、Cs2CO3(29.2g，89.6mmol，2.5当量)、RuPhos(3.35g，7.17mmol，0.2当量)和Pd2(dba)3(3.28g，3.58mmol，0.1当量)于甲苯(160mL)中的溶液加热至105℃。12小时后，将混合物过滤以去除固体，添加至H2O(300mL)中并用EtOAc(2×50mL)萃取水层。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(6.63g，32％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H35N6O2S的[M+H]计算值：579.25；实验值579.3；1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.72–7.62(m,2H),7.42–7.34(m,7H),7.25–7.14(m,2H),5.21(s,2H),4.69(s,1H),4.31–4.19(m,1H),4.00–3.74(m,3H),3.56–3.39(m,2H),3.25–3.09(m,3H),3.07–2.94(m,2H),2.91(s,3H),2.80–2.58(m,3H),2.50(d,J＝4.77Hz,3H)。
步骤7：合成(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲基亚磺酰基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(7.66g，13.2mmol，1当量)于DCM(80mL)中的溶液中逐份添加mCPBA(3.22g，15.9mmol，85％纯度，1.2当量)。2小时后，将反应混合物用饱和Na2SO3水溶液淬灭，萃取至DCM(3×40mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲基亚磺酰基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(5.25g，67％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H35N6O3S的[M+H]计算值：595.25；实验值595.3。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.75–7.62(m,2H),7.46–7.32(m,7H),7.26–7.10(m,2H),5.21(s,2H),4.68(s,1H),4.51–4.22(m,2H),4.11–3.89(m,2H),3.65–3.50(m,2H),3.35–3.07(m,4H),2.94–2.89(m,6H),2.82–2.58(m,3H)。
步骤8：合成(S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(2S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(甲基亚磺酰基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(5.25g，8.83mmol，1当量)和(S)-(1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲醇(2.71g，17.7mmol，2当量)于甲苯(50mL)中的溶液中添加NaOtBu(1.70g，17.7mmol，2当量)。20分钟后，将混合物用H2O(60mL)淬灭，将其萃取至EtOAc(2×30mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.82g，63％产率)。LCMS(ESI)m/z:的C41H46N7O3[M+H]计算值：684.37；实验值684.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.90–7.68(m,1H),7.71–7.59(m,1H),7.44–7.34(m,6H),7.26–7.18(m,2H),5.21(s,2H),4.69(s,1H),4.44–3.69(m,8H),3.57–3.33(m,2H),3.26–3.03(m,5H),2.92(s,5H),2.79–2.60(m,3H),2.46–2.25(m,3H),2.02–1.62(m,6H)。
步骤9：合成2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向(S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-2-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.82g，5.59mmol，1当量)于MeCN(40mL)中的溶液中添加TMSI(3.04mL，22.3mmol，4当量)，并将反应混合物加热至50℃。2小时后，将反应物冷却至室温，用MeOH(20mL)淬灭并搅拌。15分钟后，将混合物倒入HCl(1N,100mL)中，将其保持在0-15℃之间，萃取至EtOAc(3×20mL)中，接着用NaOH(1N)将水层碱化至pH 8-9，同时保持在0-10℃之间，接着用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(1.04g，30％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H40N7O的[M+H]计算值：550.33；实验值550.3。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.65–7.54(m,2H),7.27(m,2H),7.17–7.12(m,1H),4.31(s,1H),4.15(dd,J＝18.18,6.85Hz,1H),4.01(m,1H),3.87-3.63(m,3H),3.46–3.24(m,1H),3.16–3.00(m,5H),2.94–2.74(m,7H),2.65–2.46(m,4H),2.44–2.24(m,3H),1.96–1.48(m,7H)。
步骤10：合成2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(100mg，180μmol，1当量)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(420mg，1.27mmol，7当量)于DMF(1mL)中的混合物中添加N,N-二异丙基乙胺(160μL，910μmol，5当量)，随后添加T3P(216μL，360μmol，50％纯度，2当量)。将混合物升温至室温。2小时后，用冷饱和NH4Cl水溶液淬灭反应，萃取至EtOAc(3×5mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(0→70％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈褐色固体状的2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(220mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.63–7.73(m,1H),7.52–7.62(m,4H),7.38–7.51(m,7H),7.27(m,15H),5.12(br s,1H),4.44(brs,1H),4.21–4.38(m,1H),3.73–4.05(m,2H),3.39–3.71(m,2H),3.00–3.35(m,4H),2.93(brs,3H),2.53–2.79(m,3H),2.36–2.52(m,3H),2.24(s,1H),1.95–2.04(m,2H),1.70–1.93(m,3H),1.39–1.57(m,2H)。
步骤11：合成2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-2-基)乙腈(170mg，200μmol，1当量)于MeOH(800μL)和CHCl3(800μL)中的溶液中添加TFA(290μL，4.0mmol，20当量)。30分钟后，将混合物用冷饱和NaHCO3水溶液淬灭，萃取至DCM(3×5mL)中，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→70％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(25.1mg，13％产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H43N8O2的[M+H]计算值：619.35；实验值619.4。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.59–7.76(m,2H),7.38–7.45(m,1H),7.35(t,J＝7.64Hz,1H),7.27–7.32(m,1H),7.18–7.26(m,1H),4.56–5.08(m,1H),4.36(br d,J＝10.51Hz,1H),4.19–4.32(m,1H),4.02–4.18(m,3H),3.85–4.01(m,1H),3.68–3.84(m,1H),3.36–3.59(m,2H),2.98–3.33(m,5H),2.93(s,4H),2.54–2.89(m,4H),2.24–2.46(m,3H),1.71–2.08(m,6H),1.59(br s,4H)。
实施例117–合成2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(2-(((S)-1-(丁-3-炔-1-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)-7-(8-甲基萘-1-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003801
根据实施例116的方法，在步骤10中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸合成。LCMS(ESI)m/z:C36H43N8O2的[M+H]计算值：619.35；实验值619.4。
实施例118–合成2-((S)-1-(((R)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003811
步骤1：合成(S)-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲醇
在0℃下，向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(1.3g，3.8mmol，1当量)于THF(13mL)中的溶液中添加LiBH4(412mg，18.9mmol，5当量)，随后逐滴添加MeOH(2.6mL)。将所得到的混合物升温至室温。3小时后，用H2O(20mL)缓慢淬灭反应，将其萃取至EtOAc(3×10mL)中，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的粗(S)-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲醇，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ1.11(d,J＝6.17Hz,1H),1.56(dq,J＝6.28,3.12Hz,1H),1.85(d,J＝3.31Hz,1H),2.20(br s,1H),3.68(m,1H),3.87(m,1H),7.17–7.23(m,3H),7.27(s,6H),7.38–7.51(m,6H)。
步骤2：合成(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲醛
在-78℃下，向(COCl)2(395μL，4.5mmol，1.2当量)于DCM(4mL)中的溶液中逐滴添加DMSO(734μL，9.4mmol，2.5当量)于DCM(4.5mL)中的溶液。30分钟后，将(S)-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲醇(1.5g，3.8mmol，1当量)于DCM(10mL)中的溶液逐滴添加至反应混合物中。30分钟后，添加NEt3(2.6mL，19mmol，5当量)。1小时后，将反应升温至室温，用H2O(10mL)淬灭并萃取至DCM中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲醛，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ1.54(d,J＝6.32Hz,1H),1.94(td,J＝6.32,2.50Hz,1H),2.32(d,J＝2.03Hz,1H),7.19–7.24(m,3H),7.27(s,6H),7.45(d,J＝7.39Hz,6H),9.32(d,J＝6.44Hz,1H)。
步骤3：合成2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-(((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)哌嗪-2-基)乙腈
并行操作两个独立的反应。对于每个反应，向2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(583mg，1.14mmol，1当量)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲醛(500mg，1.60mmol，1.4当量)于DCM(8mL)中的悬浮液中添加AcOH(261μL，4.56mmol，4当量)。10分钟后，添加NaCNBH3(100mg，1.60mmol，1.4当量)。1小时后，用H2O(20mL)缓慢淬灭反应并将其萃取至DCM(3×10mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将两份独立的粗残余物合并，并通过反相色谱法(75→95％MeOH/H2O,9％MeCN,0.05％NH3OH)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-(((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)哌嗪-2-基)乙腈(1.2g，65％产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H57N8O的[M+H]计算值：809.46；实验值809.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ0.89(br d,J＝8.93Hz,1H),1.21–1.33(m,2H),1.43(br d,J＝2.93Hz,1H),1.62–1.88(m,4H),1.99–2.14(m,1H),2.27–2.40(m,1H),2.40–2.54(m,4H),2.61(br d,J＝12.10Hz,1H),2.67–2.78(m,2H),2.79–2.96(m,4.5H),2.97–3.09(m,2H),3.10–3.23(m,2H),3.32–3.38(m,1H),3.42–3.60(m,3H),3.61–3.79(m,2H),3.85-3.95,(m,0.5H),4.08(br dd,J＝17.79,7.64Hz,1H),4.21–4.41(m,2H),7.16–7.25(m,4H),7.26–7.35(m,8H),7.40(td,J＝7.67,3.36Hz,1H),7.51(br d,J＝7.95Hz,6H),7.56–7.72(m,2H)。
步骤4：合成2-((S)-1-(((S)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-1-(((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)哌嗪-2-基)乙腈(300mg，371μmol，1当量)于CHCl3(1.2mL)和MeOH(1.8mL)中的溶液中添加TFA(1.65mL，22mmol，60当量)。1小时后，将反应升温至室温。12小时后，将反应混合物减压浓缩以去除过量的TFA，将其溶解于DCM(3mL)中，接着在0℃下逐滴添加饱和NaHCO3水溶液(10mL)并萃取至DCM(3×5mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(50→80％MeCN/H2O,10mMNH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-(((S)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(25mg，12％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H43N8O的[M+H]计算值：567.36；实验值567.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ1.44(br s,1H),1.62–1.74(m,1H),1.74–1.89(m,3H),2.00–2.13(m,1H),2.18(br s,1H),2.28–2.40(m,1H),2.49(d,J＝2.57Hz,3H),2.59–2.86(m,6.5H),2.91(s,3H),2.97–3.11(m,3H),3.11–3.27(m,3H),3.40–3.85(m,6H),3.87–3.96(m,0.5H),4.08(br dd,J＝17.73,10.27Hz,1H),4.25–4.43(m,2H),7.18–7.36(m,3H),7.40(td,J＝7.73,4.22Hz,1H),7.66(br dd,J＝17.18,8.01Hz,2H)。
步骤5：合成2-((S)-1-(((R)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-1-((S)-氮杂环丙烷-2-基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(88mg，155μmol，1当量)于DCM(200μL)中的混合物中添加N,N-二异丙基乙胺(135μL，776μmol，5当量)，随后逐滴添加AcCl(13.3μL，186μmol，1.2当量)。5分钟后，在0℃下将反应物逐滴添加至H2O(5mL)中，接着萃取至DCM(3×5mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(50→70％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-(((R)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(40mg，20％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H45N8O2的[M+H]计算值：609.37；实验值609.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.67(dd,J＝17.18,8.01Hz,2H),7.41(td,J＝7.73,3.97Hz,1H),7.27–7.37(m,2H),7.21–7.27(m,1H),4.28–4.42(m,2H),4.09(br dd,J＝17.73,10.03Hz,1H),3.92(br dd,J＝13.20,2.57Hz,1H),3.56–3.66(m,1H),3.42–3.56(m,2H),3.41–3.86(m,3H),3.12–3.27(m,3H),3.01–3.12(m,2H),2.95–3.01(m,1H),2.92(s,3H),2.63–2.86(m,7H),2.50(d,J＝3.30Hz,3H),2.45(br d,J＝4.77Hz,1H),2.30–2.41(m,1H),2.17(s,3H),2.03–2.13(m,1H),1.76–1.87(m,2H),1.65–1.76(m,1H)。
实施例119–合成2-((S)-1-(((S)-1-乙酰基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970003851
根据实施例118的方法，在步骤10中使用(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯代替(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯合成。LCMS(ESI)m/z:C35H45N8O2的[M+H]计算值：609.37；实验值609.5。
实施例120–合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)甲酮
Figure BDA0003759053970003852
步骤1：合成2-氨基-4-溴-6-氟苯甲腈
并行操作四个独立的反应。对于每个反应，向4-溴-2,6-二氟苯甲腈(4.0g，18mmol，1当量)于iPrOH(40mL)中的溶液中添加NH3·H2O(20mL，130mmol，25％w/w，7当量)。将所得到的混合物密封并加热至80℃，保持12小时，接着冷却至室温。将四份独立的反应混合物合并，并用H2O(640mL)淬灭，并搅拌15分钟。将所得到的固体过滤，用H2O(100mL)洗涤，溶解于甲苯(3×10mL)中并减压浓缩，得到呈白色固体状的2-氨基-4-溴-6-氟苯甲腈(14.5g，92％产率)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.74(br s,2H),6.78(dd,J＝9.26,1.54Hz,1H),6.82(s,1H)。
步骤2：合成6-氨基-4-溴-3-氯-2-氟苯甲腈
在35℃下，向2-氨基-4-溴-6-氟苯甲腈(9.5g，44mmol，1当量)于MeCN(50mL)中的溶液中逐份添加NCS(5.9g，44mmol，1当量)并将所得到的混合物逐渐加热至65℃。24小时后，用H2O(400mL)淬灭反应并萃取至EtOAc(3×100mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(80mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。在17℃下，将粗残余物用1:1EtOAc/石油醚研磨20分钟，接着过滤，得到粗产物，将该粗产物与由DCM(28mL)重结晶得到的粗产物合并，并通过硅胶柱色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的6-氨基-4-溴-3-氯-2-氟苯甲腈(14g，37％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.84(s,2H),7.02(d,1H)。
步骤3：合成7-溴-6-氯-5-氟喹唑啉-4(3H)-酮
向6-氨基-4-溴-3-氯-2-氟苯甲腈(10g，40mmol，1当量)于甲酸(100mL)中的溶液中添加H2SO4(3.2mL，60mmol，1.5当量)并将所得到的混合物加热至100℃。30分钟后，将反应混合物冷却至室温，用H2O(200mL)淬灭，搅拌10分钟，接着过滤。将滤饼依序用1:1H2O/iPrOH(100mL)、1:1iPrOH/MTBE(100mL)和MTBE(100mL)洗涤，接着用EtOAc(100mL)研磨30分钟，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的7-溴-6-氯-5-氟喹唑啉-4(3H)-酮(8.8g，79％产率)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.92(d,J＝1.76Hz,1H),8.15(s,1H),12.55(br s,1H)。
步骤4：合成(S)-3-(((7-溴-6-氯-4-羟基喹唑啉-5-基)氧基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(S)-3-(羟基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(7.5g，35mmol，1.1当量)于THF(120mL)中的溶液中逐份添加NaH(3.8g，95mmol，60％纯度，3当量)。10分钟后，将反应升温至室温。30分钟后，将7-溴-6-氯-5-氟喹唑啉-4(3H)-酮(8.8g，32mmol，1当量)添加至混合物中，并将反应物加热至65℃。16小时后，用饱和NH4Cl水溶液(520mL)淬灭反应，用EtOAc(4×200mL)萃取，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(300mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(9→17％MeOH/DCM)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-3-(((7-溴-6-氯-4-羟基喹唑啉-5-基)氧基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(11.1g，66％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.10(s,1H),7.84(s,1H),5.74–5.77(m,1H),4.06(brd,J＝11.69Hz,1H),3.95(br d,J＝5.95Hz,2H),3.76(br d,J＝11.69Hz,1H),2.99(br d,J＝6.17Hz,1H),2.91(br d,J＝11.91Hz,1H),2.54–2.86(m,3H),1.40(s,9H)。
步骤5：合成(S)-5-溴-6-氯-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(S)-3-(((7-溴-6-氯-4-羟基喹唑啉-5-基)氧基)甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(7.4g，15.6mmol，1当量)和BOP(18g，41mmol，2.6当量)于DMF(150mL)中的溶液中逐滴添加DBU(11.8mL，78.1mmol，5当量)。10分钟后，将反应混合物加热至110℃。2小时后，将反应混合物用H2O(1.5L)淬灭，用EtOAc(3×700mL)萃取，接着将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(3×500mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(44→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-5-溴-6-氯-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯(7.0g，95％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.53(s,1H),7.80(s,1H),4.79(br d,J＝13.11Hz,1H),4.56–4.67(m,2H),4.04–4.10(m,1H),3.96–4.01(m,1H),3.91(br d,J＝12.99Hz,1H),3.15–3.26(m,1H),3.06(br s,2H),1.43(s,9H)。
步骤6：合成(8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯
在15℃下，向(S)-5-溴-6-氯-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯(10g，22mmol，1当量)和(2-氟-6-羟基苯基)硼酸(4.1g，26mmol，1.2当量)于二噁烷(100mL)中的溶液中添加SPhos(900mg，2.2mmol，0.1当量)、Pd2(dba)3(2.0g，2.2mmol，0.1当量)以及K3PO4(9.3g，44mmol，2当量)于H2O(25mL)中的溶液。将所得到的混合物加热至90℃。2小时后，将反应物冷却至室温，过滤以去除固体，将其添加至H2O(500mL)中，并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法(44→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈红色固体状的(8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯(9g，82％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.04(br s,1H),8.54(s,1H),7.33(d,J＝1.54Hz,1H),7.24–7.32(m,1H),6.81(dd,J＝8.27,4.08Hz,1H),6.75(td,J＝8.71,2.43Hz,1H),4.82(br d,J＝11.25Hz,1H),4.58–4.69(m,2H),4.04–4.12(m,1H),3.89–4.01(m,2H),2.96–3.27(m,3H),1.44(s,9H)。
步骤7：合成2-((8aS)-6-氯-8,8a,9,10,11,12-六氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-5-基)-3-氟苯酚
在0℃下，向(8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-甲酸叔丁酯(2.5g，5.1mmol，1当量)于DCM(15mL)中的溶液中逐滴添加TFA(12mL，160mmol，32当量)，接着将反应升温至室温。30分钟后，将反应混合物减压浓缩。将粗残余物溶解于MeCN(3mL)中，逐滴添加至MTBE(450mL)中，搅拌5分钟，并过滤。将滤饼减压干燥，得到呈黄色固体状的2-((8aS)-6-氯-8,8a,9,10,11,12-六氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-5-基)-3-氟苯酚(2.28g，85％产率，TFA盐)。LCMS(ESI)m/z:C19H17ClFN4O2的[M+H]计算值：387.10；实验值387.1。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.78(s,1H),7.50(d,J＝2.45Hz,1H),7.27–7.35(m,1H),6.67–6.82(m,2H),5.65(br d,J＝14.67Hz,1H),4.70–4.82(m,2H),4.53(br d,J＝11.25Hz,1H),3.78(br d,J＝12.23Hz,1H),3.56–3.70(m,3H),3.33–3.39(m,1H)。
步骤8：合成((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
在0℃下，向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐(53.6mg，160μmol，1.2当量)、2-((8aS)-6-氯-8,8a,9,10,11,12-六氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-5-基)-3-氟苯酚(52mg，134μmol，1当量)和HATU(60.8mg，160μmol，1.2当量)于DMF(0.7mL)中的悬浮液中添加N,N-二异丙基乙胺(47μL，268μmol，2当量)。将所得到的混合物搅拌1小时，接着用EtOAc(10mL)稀释。将有机相用5％柠檬酸水溶液(20mL)、饱和NaHCO3水溶液(20mL)、饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C41H34ClFN5O3的[M+H]计算值：698.23；实验值698.7。
步骤9：合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)甲酮
在0℃下，向((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(95mg，136μmol，1当量)于DCM(0.7mL)中的溶液中添加TFA(210μL，2.7mmol，20当量)。将所得到的混合物搅拌5分钟，接着用MeOH(1mL)淬灭并减压浓缩。将残余物溶解于DMSO(0.8mL)中，接着添加NEt3(380μL，2.7mmol，20当量)。将所得到的混合物通过反相色谱法(5→50％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)纯化，接着通过反相色谱法(5→50％MeCN/H2O,0.4％NH4OH)再纯化，得到呈白色固体状的((R)-氮杂环丙烷-2-基)((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)甲酮(13.5mg，经2个步骤22％产率)。LCMS(ESI)m/z:C22H20ClFN5O3的[M+H]计算值：456.13；实验值456.6。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.55(s,1H),7.42(s,1H),7.28(q,J＝8.2Hz,1H),6.77(dd,J＝8.3,3.0Hz,1H),6.71(t,J＝8.7Hz,1H),5.11–4.99(m,1H),4.73–4.65(m,2H),4.65–4.57(m,1H),4.57–4.33(m,2H),4.14(s,1H),3.80–3.69(m,1H),3.62–3.48(m,1H),3.23–3.14(m,1H),3.11–2.81(m,2H),1.98–1.80(m,2H)。
实施例121–合成((S)-氮杂环丙烷-2-基)((8aS)-6-氯-5-(2-氟-6-羟基苯基)-8a,9,11,12-四氢吡嗪并[2',1':3,4][1,4]氧氮杂环庚烷并[5,6,7-de]喹唑啉-10(8H)-基)甲酮
Figure BDA0003759053970003901
根据实施例120的方法，在步骤8中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸锂盐合成。LCMS(ESI)m/z:C22H20ClFN5O3的[M+H]计算值：456.13；实验值456.5。
实施例122–合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮
Figure BDA0003759053970003911
步骤1：合成(R)-3-(2-((7-溴-6-氯-4-氧代-3,4-二氢喹唑啉-5-基)氧基)乙基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向7-溴-6-氯-5-氟喹唑啉-4(3H)-酮(2.6g，9.4mmol，1当量)和(R)-3-(2-羟基乙基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.50g，13.2mmol，1.4当量)于DMA(60mL)中的溶液中添加叔丁醇锂(3.43g，42.8mmol，4.4当量)并将所得到的混合物加热至80℃。2小时后，用MeOH(5mL)淬灭反应并在0℃下用1N HCl酸化至pH 2-3。将所得到的溶液用H2O(80mL)稀释，用DCM(3×50mL)萃取并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(5×80mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的(R)-3-(2-((7-溴-6-氯-4-氧代-3,4-二氢喹唑啉-5-基)氧基)乙基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(R)-3-(2-((7-溴-6-氯-4-氧代-3,4-二氢喹唑啉-5-基)氧基)乙基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(6.0g，9.78mmol，1当量)和PyBop(12.7g，24.4mmol，2.5当量)于THF(140mL)中的溶液中添加DBU(8.84mL，58.6mmol，6当量)并将所得到的混合物升温至室温。2小时后，将反应物用EtOAc(800mL)稀释，并用1N HCl(300mL)、H2O(2×300mL)、饱和NaCl水溶液(180mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(45％→75％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化并将含有所希望产物的洗脱部分减压浓缩以去除MeCN，接着用EtOAc(5×200mL)萃取。将合并的有机相减压浓缩，得到呈白色固体状的(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-甲酸苯甲酯(4.66g，经两个步骤98％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.48(s,1H),7.89(s,1H),7.43–7.29(m,5H),5.25–5.08(m,2H),4.86–4.55(m,1H),4.45(br s,2H),4.06–3.45(m,6H),2.31–2.16(m,1H),2.07–1.93(m,1H)。
步骤3：合成(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉
向(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-甲酸苯甲酯(2.0g，4.0mmol，1当量)于MeCN(40mL)中的溶液中添加TMSI(1.62mL,11.9mmol，3当量)。2小时后，将反应混合物用MeOH(20mL)淬灭并在0℃下用1N HCl酸化至pH 5。将所得到的溶液用H2O(50mL)稀释并用MTBE(3×30mL)洗涤。接着，在0℃下用1N NaOH将水相碱化至pH 8-9并用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉(1.3g，88％产率)，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.42(s,1H),7.83(s,1H),5.04(br,1H),4.62–4.50(m,1H),4.31(dt,J＝11.2,3.1Hz,1H),3.85–3.74(m,1H),3.31(t,J＝10.7Hz,1H),3.23–3.11(m,1H),2.97(d,J＝3.4Hz,2H),2.86(dt,J＝11.4,3.4Hz,1H),2.60(t,J＝12.3Hz,1H),2.02–1.93(m,2H)。
步骤4：合成((R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
在0℃下，向(R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉(350mg，0.947mmol，1当量)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.56g，4.73mmol，5当量)于DMF(3.5mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(1.15mL，6.63mmol，7当量)和T3P(845μL，1.42mmol，50％溶液，1.5当量)并将所得到的混合物升温至室温。1小时后，将反应混合物用H2O(20mL)稀释并萃取至EtOAc(2×5mL)中。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈褐色固体状的((R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(550mg，85％产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H32BrClN5O2的[M+H]计算值：680.13；实验值680.1。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.37–8.26(m,1H),7.82–7.69(m,1H),7.54–7.51(m,2H),7.46(td,J＝4.9,2.5Hz,4H),7.34–7.29(m,3H),7.26–7.23(m,6H),4.78–4.69(m,0.5H),4.58–4.50(m,0.5H),4.49–4.43(m,1H),4.37–4.31(m,1H),4.24–4.15(m,0.5H),4.00–3.92(m,0.5H),3.88–3.81(m,1.5H),3.73–3.65(m,1.5H),3.57–3.44(m,2H),2.34–2.14(m,2H),2.05(td,J＝6.2,3.2Hz,1.5H),1.48–1.38(m,1.5H)。
步骤5：合成((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
向((R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(550mg，0.808mmol，1当量)于二噁烷(5.5mL)和H2O(280μL)中的溶液中添加(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)硼酸(420mg，1.62mmol，2当量)、Pd(dtbpf)Cl2(52.6mg，80.8μmol，0.1当量)和Cs2CO3(789mg，2.42mmol，3当量)并将所得到的混合物加热至95℃。2小时后，将反应混合物用EtOAc(20mL)稀释，过滤，并添加至H2O(50mL)中。将溶液萃取至EtOAc(3×20mL)中并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈褐色固体状的((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(0.4g，59％产率)。LCMS(ESI)m/z:C49H47ClN7O3的[M+H]计算值：816.34；实验值816.3。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.56–8.50(m,1H),7.61–7.53(m,9H),7.39–7.28(m,8H),7.26–7.22(m,2H),5.74(dt,J＝6.8,2.6Hz,1H),4.80–4.71(m,0.5H),4.54–4.39(m,2H),4.37–4.27(m,1H),4.09–3.99(m,1.5H),3.99–3.92(m,0.5H),3.90–3.85(m,1H),3.83–3.64(m,3H),3.61–3.44(m,2H),2.65–2.52(m,1H),2.46–2.40(m,1H),2.27–2.22(m,2.5H),2.21–2.08(m,4H),2.01–1.92(m,1H),1.83–1.75(m,2H),1.70–1.64(m,1H),1.47–1.41(m,1H)。
步骤6：合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮
在0℃下，向((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(200mg，0.245mmol，1当量)于CHCl3(1mL)和MeOH(1mL)中的溶液中添加TFA(2.45mL，33.1mmol，135当量)。30分钟后，将反应升温至室温。3.5小时后，在℃下向反应物中添加饱和NaHCO3水溶液(100mL)。用EtOAc(2×40mL)萃取溶液并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(40mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(20％→40％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮(50.5mg，41％产率)。LCMS(ESI)m/z:C25H25ClN7O2的[M+H]计算值：490.17；实验值490.2；1H NMR(400MHz,甲醇d-4)δ8.49–8.42(m,1H),7.57–7.47(m,2H),7.44–7.33(m,2H),4.98–4.88(m,1H),4.63–4.49(m,2H),4.21–4.04(m,2.5H),4.03–3.94(m,1H),3.92–3.75(m,1.5H),3.75–3.59(m,1H),2.99–2.91(m,1H),2.49–2.38(m,0.5H),2.37–2.26(m,0.5H),2.25–2.19(m,3H),2.17(br d,J＝7.9Hz,0.5H),2.06–1.97(m,0.5H),1.95–1.87(m,1H),1.86–1.79(m,1H)。
实施例123–合成((S)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮
Figure BDA0003759053970003951
根据实施例122的方法，在步骤4中使用(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸代替(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸合成。LCMS(ESI)m/z:C25H25ClN7O2的[M+H]计算值：490.17；实验值490.2。
实施例124–合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮
Figure BDA0003759053970003961
步骤1：合成((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
向((R)-10-溴-11-氯-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(1g，1.47mmol，1当量)和(2-氟-6-羟基苯基)硼酸(687mg，4.41mmol，3当量)于二噁烷(10mL)和H2O(0.5mL)中的溶液中添加Pd(dtbpf)Cl2(95.7mg，147μmol，0.1当量)和Cs2CO3(1.44g，4.41mmol，3当量)。将所得到的混合物在95℃下加热2小时，接着用EtOAc(100mL)稀释，过滤并添加至H2O(300mL)中。将分离的水相用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈褐色固体状的((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮
在0℃下，向((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(1.31g，1.84mmol，1当量)于CHCl3(6.5mL)和MeOH(6.5mL)中的溶液中添加TFA(5.41mL，70.7mmol，38当量)。30分钟后，在0℃下用饱和NaHCO3水溶液(200mL)淬灭反应。用EtOAc(2×70mL)萃取水相并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(70mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(30％→52％MeCN/H2O,10mMNH4HCO3)纯化并且再通过反相色谱法(10％→40％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)进一步纯化，得到呈白色固体状的((R)-氮杂环丙烷-2-基)((14aR)-11-氯-10-(2-氟-6-羟基苯基)-1,3,4,13,14,14a-六氢-2H-吡嗪并[1',2':5,6][1,5]氧氮杂环辛四烯并[4,3,2-de]喹唑啉-2-基)甲酮(33mg，经两个步骤4.8％产率)。LCMS(ESI)m/z:C23H22ClFN5O3的[M+H]计算值：470.13；实验值470.1。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.47–8.38(m,1H),7.46–7.38(m,1H),7.30–7.22(m,1H),6.79–6.64(m,2H),4.86–4.74(m,1H),4.56–4.45(m,2H),4.18–3.97(m,3H),3.96–3.83(m,1H),3.81–3.61(m,2H),2.99–2.88(m,1H),2.47–2.22(m,1H),2.16–2.07(m,0.5H),2.01–1.87(m,1.5H),1.85–1.74(m,1H)。
实施例125中180–合成例示性化合物
下表的化合物是使用以上提到的方法或本领域技术人员已知的其变化形式制备。
表3a：通过本发明方法制备的例示性化合物
Figure BDA0003759053970003971
Figure BDA0003759053970003981
Figure BDA0003759053970003991
Figure BDA0003759053970004001
Figure BDA0003759053970004011
Figure BDA0003759053970004021
Figure BDA0003759053970004031
Figure BDA0003759053970004041
Figure BDA0003759053970004051
Figure BDA0003759053970004061
Figure BDA0003759053970004071
Figure BDA0003759053970004081
*环戊烷的立体化学是假定的。
应注意，一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下，立体异构体的相对立体化学已确定；在一些情况下，绝对立体化学已确定。在一些情况下，单个实施例编号对应于立体异构体混合物。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。
实施例181–合成2-((S)-1-((R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004091
向2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(420mg，723.24μmol，1当量)于丙酮(4mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(919.70mg，4.34mmol，6当量)和AcOH(8.69mg，144.65μmol，8.27μL，0.2当量)。将所得到的混合物在搅拌12小时，接着用H2O(20mL)淬灭。将水层用DCM(3×20mL)萃取并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40→65％MeCN/H2O,10nM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(52.22mg，11％产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H47N8O2的[M+H]计算值：623.37；实验值623.4。1H NMR(400MHz,MeOD)δ7.76–7.60(m,2H),7.46–7.37(m,1H),7.35–7.21(m,3H),5.10–4.94(m,1H),4.42–3.97(m,6H),3.83–3.47(m,3H),3.29–3.02(m,6H),2.95–2.83(m,4H),2.81–2.61(m,3H),2.49(d,J＝2.2Hz,3H),2.41–2.27(m,1H),2.15–1.95(m,2H),1.85–1.62(m,5H),1.24–1.10(m,6H)。
实施例182–合成(R)-2-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯
Figure BDA0003759053970004101
在0℃下，向2-((S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(400mg，454μmol，1当量)和NEt3(190μL，1.36mmol，3当量)于DCM(4.0mL)中的溶液中添加氯甲酸甲酯(52.8μL，681μmol，1.5当量)。将反应混合物升温至室温，搅拌1小时，接着倒入冰冷的H2O(10mL)中。用DCM(3×10mL)萃取水相并将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(40％→60％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的(R)-2-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯(51.6mg，17％产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H43N8O4的[M+H]计算值：639.34；实验值639.4；1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ＝7.74–7.60(m,2H),7.41(q,J＝7.4Hz,1H),7.35–7.22(m,3H),5.10–4.96(m,1H),4.51–4.03(m,6H),3.88–3.45(m,8H),3.26–3.01(m,5H),3.00–2.85(m,4H),2.80–2.65(m,2H),2.61–2.52(m,2H),2.49(d,J＝3.3Hz,3H),2.35(m,1H),2.09(m,1H),1.89–1.63(m,3H)。
实施例183–合成2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004111
步骤1：合成(S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向(S)-2-(氰基甲基)哌嗪-1,4-二甲酸1-苯甲酯4-(叔丁基)酯(5.0g，14mmol，1当量)于MeOH(50mL)中的溶液中添加Pd/C(1.5g，10wt.％)并在H2(15psi)下搅拌所得到的混合物。1小时后，将混合物通过硅藻土过滤，用MeOH(300mL)洗涤滤饼，并将减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→16％MeOH/DCM)纯化，得到呈灰色油状的(S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.7g，83％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ3.76–4.07(m,2H),2.91–3.06(m,3H),2.57–2.85(m,2H),2.39–2.54(m,2H),1.47(s,9H)。
步骤2：合成(S)-3-(氰基甲基)-4-(乙烯基磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(S)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.7g，12mmol，1当量)于DCM(15mL)中的溶液中添加NEt3(13.3mL，95.9mmol，8当量)。分数份添加DCM(12mL)中的乙烯磺酰氯(1.82g，14.4mmol，1.2当量)并将所得到的混合物升温至室温。1小时后，将反应混合物添加至H2O(50mL)中并用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(30mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(33→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色油状的(S)-3-(氰基甲基)-4-(乙烯基磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.38g，62％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.45–6.59(m,1H),6.32(d,J＝16.5Hz,1H),6.04(d,J＝9.70Hz,1H),4.11–4.32(m,3H),3.58–3.62(m,1H),3.02–3.20(m,2H),2.91(brs,1H),2.70–2.72(m,2H),1.49(s,9H)。
步骤3：合成(S)-4-((1-溴乙烯基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯和(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1,2-二溴乙基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向(S)-3-(氰基甲基)-4-(乙烯基磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.3g，7.3mmol，1当量)于DCM(15mL)中的溶液中添加于DCM(8.0mL)中的Br2(714μL，13.9mmol，1.9当量)，将所得到的混合物搅拌3小时，接着添加至H2O(30mL)中并用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(25→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-4-((1-溴乙烯基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯和(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1,2-二溴乙基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯的混合物(2.0g)。
步骤4：合成(3S)-4-((1-溴-2-(甲基氨基)乙基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下，向(S)-4-((1-溴乙烯基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯和(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1,2-二溴乙基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯的混合物(500mg)于DCM(5.0mL)中的溶液中添加NEt3(0.77mL，5.52mmol)和甲胺盐酸盐(107mg，1.58mmol)。将所得到的混合物升温至室温。16小时后，将混合物添加至H2O(15mL)中并用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的(3S)-4-((1-溴-2-(甲基氨基)乙基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(800mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.97–5.12(m,1H),4.07–4.43(m,3H),3.73–3.77(m,1H),3.65(q,J＝7.3Hz,1H),3.34–3.44(m,1H),3.16–3.28(m,3H),2.71–2.86(m,2H),2.48(d,J＝2.6Hz,3H),1.49(d,J＝2.7Hz,9H)。
步骤5：合成(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向(3S)-4-((1-溴-2-(甲基氨基)乙基)磺酰基)-3-(氰基甲基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(640mg，1.50mmol，1当量)于DMSO(15mL)中的溶液中添加NEt3(3.14mL，22.6mmol,15当量)并将混合物加热至75℃。16小时后，将反应物冷却至室温并添加至H2O(50mL)中，接着用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×15mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→40％MeCN/H2O,0.05％NH4OH)纯化，得到呈白色固体状的(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(60mg，11％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.04–4.45(m,3H),3.78(br d,J＝13.8Hz,0.5H),3.70(br d,J＝13.5Hz,0.5H),3.10–3.23(m,2H),2.62–3.00(m,4H),2.47(s,3H)2.38(d,J＝2.5Hz,0.5H),2.30(br s,0.5H),1.72–1.76(m,0.5H)1.67–1.71(m,0.5H),1.50(d,J＝4.5Hz,9H)。
步骤6：合成2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-2-基)乙腈
在0℃下，向(3S)-3-(氰基甲基)-4-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(30mg，87μmol，1当量)于DCM(0.3mL)中的溶液中添加TFA(129μL,1.74mmol，20当量)。2小时后，在N2气流下浓缩反应物，得到呈褐色油状的2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-2-基)乙腈(23mg，粗品)，将其不经进一步纯化即使用。
步骤7：合成2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌嗪-2-基)乙腈(23mg，94μmol，1当量)和三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(100mg，186μmol，2当量)于DMF(1mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(162μL，932μmol，5当量)。将反应混合物搅拌25分钟，接着添加至H2O(5mL)中并用DCM(3×5mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈浅黄色固体状的2-((2S)-1-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(12mg，9.5％产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H43N8O3S的[M+H]计算值：631.32；实验值631.3。NMR(400MHz,CDCl3)δ7.62–7.72(m,2H),7.31–7.45(m,2H),7.18–7.26(m,2H),4.47–4.54(m,0.5H),4.35–4.40(m,1.5H),4.22–4.30(m,1H),4.09–4.20(m,2H),3.96–4.08(m,1H),3.73–3.93(m,2H),3.44–3.61(m,2H),3.31–3.38(m,0.5H),3.14–3.30(m,2.5H),3.03–3.14(m,2H),2.94–3.03(m,2H),2.92(s,3H),2.82–2.89(m,1H),2.58–2.71(m,2H),2.45–2.52(m,5H),2.39–2.44(m,0.5H),2.33–2.36(m,0.5H),2.23–2.32(m,1H),1.99–2.11(m,1H),1.69–1.88(m,4H),1.23–1.31(m,1H)。
实施例184–合成2-((S)-1-((S)-2-甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004151
步骤1：合成(2R,4R)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在0℃下，向((苯甲氧基)羰基)-D-丙氨酸(5g，22.40mmol，1当量)和(二甲氧基甲基)苯(3.75g，24.64mmol，1.1当量)于THF(35mL)中的混合物中添加SOCl2(2.93g，24.64mmol，1.1当量)。将所得到的混合物搅拌10分钟，接着添加ZnCl2(3.36g，24.64mmol，1.1当量)。在0℃下，将反应混合物搅拌4小时，接着减压浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱法(0→10％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色油状的(2R,4R)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(20g，64.24mmol，57％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.52–7.14(m,10H),6.66(s,1H),5.26–5.09(m,2H),4.50(q,J＝6.9Hz,1H),1.59(d,J＝7.0Hz,3H)。
步骤2：合成(2R,4R)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在-78℃下，向HMPA(13.32g，74.34mmol，13.06mL，4.63当量)和LiHMDS(1M，16.54mL，1.03当量)于THF(300mL)中的溶液中逐滴添加(2R,4R)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(5g，16.06mmol，1当量)于THF(84mL)中的溶液。30分钟后，逐滴添加CH2I2(12.90g，48.18mmol，3.89mL，3当量)于THF(33mL)中的溶液。在-78℃下，将混合物搅拌90分钟，接着减压浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱法(0→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色油状的(2R,4R)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(16g，35.46mmol，55％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.47–7.39(m,6H),7.34(s,2H),6.93(d,J＝7.1Hz,2H),6.56(s,1H),5.05(s,2H),4.33(d,J＝10.1Hz,1H),3.64(d,J＝10.1Hz,1H),1.96(s,3H)。
步骤3：合成(R)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯
在-40℃下，经10分钟向(2R,4R)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(16g，35.46mmol，1当量)于THF(90mL)中的混合物中逐滴添加NaOMe(12.77g，70.91mmol，30％于MeOH中，2当量)。2小时后，将所得到的混合物升温至-20℃。1小时后，用H2O(100mL)淬灭反应并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→20％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈无色油状的(R)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯(10g，75％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.40–7.29(m,5H),5.83(br s,1H),5.19–5.06(m,2H),4.16–4.05(m,1H),3.85–3.78(m,3H),3.74(d,J＝10.3Hz,1H),1.73(s,3H)。
步骤4：合成(S)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
向(R)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯(2g，5.30mmol，1当量)于MeCN(200mL)中的混合物中添加Ag2O(3.69g，15.91mmol，3当量)。将所得到的混合物加热至90℃。30分钟后，将反应混合物冷却至室温，过滤并减压浓缩，得到呈无色油状的(S)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(5.1g，91％产率)，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,MeOD)δppm 7.42–7.29(m,5H),5.15–5.07(m,2H),3.59(s,3H),2.76(s,1H),2.29(s,1H),1.48(s,3H)。
步骤5：合成(S)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下，向(S)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(200mg，802.37μmol，1当量)于MeOH(1mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(33.67mg，802.37μmol，1当量)于H2O(1mL)中的溶液。2小时后，将反应混合物冻干，得到呈白色固体状的(S)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(220mg，粗品，Li盐)，将其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C12H12NO4的[M–H]计算值：234.08；实验值233.9。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δppm7.22-7.48(m,5H),5.03(d,J＝12.5Hz,1H),4.88(d,J＝12.5Hz,1H),2.40(s,1H),1.84(s,1H),1.29(s,3H)。
步骤6：合成(S)-2-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-1-甲酸苯甲酯
在0℃下，向(S)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(200mg，829.30μmol，1当量，Li盐)和2-((S)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(254.59mg，497.58μmol，0.6当量)于DMF(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(535.89mg，4.15mmol，5当量)和T3P(791.60mg，1.24mmol，739.81μL，50％纯度，1.5当量)。将所得到的混合物升温至室温。2小时后，添加N,N-二异丙基乙胺(535.90mg，4.15mmol，722.24μL，5当量)和T3P(395.80mg，1.24mmol，50％纯度，1.5当量)。14小时后，将反应混合物添加至冷的饱和NH4Cl水溶液(50mL)中并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(60mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将所得到的粗产物通过硅胶色谱法(0→50％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈黄色固体状的(S)-2-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-1-甲酸苯甲酯(270mg，45％产率)。LCMS(ESI)m/z:C42H49N8O4的[M+H]计算值：729.38；实验值729.5。
步骤7：合成2-((S)-1-((S)-2-甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
向(S)-2-((S)-2-(氰基甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-1-甲酸苯甲酯(200mg，274.39μmol，1当量)于MeOH(2mL)和THF(2mL)中的溶液中添加Pd/C(100mg，82.32μmol，10％纯度)。在H2(20psi)下搅拌所得到的混合物。1小时后，将反应混合物过滤并减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(25→55％MeCN/H2O,10nM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-((S)-2-甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(25mg，15％产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H43N8O2的[M+H]计算值：595.34；实验值595.4。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.69(d,J＝7.95Hz,1H),7.65(d,J＝7.95Hz,1H),7.37–7.44(m,1H),7.26–7.35(m,2H),7.21–7.26(m,1H),5.03(s,1H),4.57(s,1H),4.00–4.42(m,6H),3.63–3.78(m,1H),3.47–3.58(m,1H),3.12–3.27(m,4H),2.99–3.11(m,2H),2.91(s,4H),2.60–2.80(m,2H),2.49(d,J＝2.45Hz,3H),2.34(qd,J＝8.88,3.67Hz,1H),2.00–2.15(m,2H),1.80(d,J＝7.46Hz,3H),1.64–1.75(m,1H),1.40–1.62(m,3H)。
实施例185–合成2-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004191
向2-((S)-1-(((S)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(650mg，840μmol，1当量)和碘甲烷(57μL，920μmol，1.1当量)于DMF(6mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(440μL，2.5mmol，3eq)。2小时后，将反应物过滤，接着通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,0.05％NH3H2O,10Mm NH4HCO3)纯化，随后通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,0.05％NH3H2O,10Mm NH4HCO3)再次纯化，得到呈灰白色固体状的2-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(57mg，10％产率)。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.68(br dd,J＝7.9,16.0Hz,2H),7.42(dt,J＝3.9,7.7Hz,1H),7.36–7.21(m,3H),4.81–4.75(m,1H),4.64(br dd,J＝8.5,13.6Hz,1H),4.10(br dd,J＝9.5,17.5Hz,2H),4.03–3.91(m,1H),3.89–3.47(m,7H),3.25–3.15(m,3H),3.11(s,3H),2.91(s,4H),2.87–2.66(m,4H),2.64–2.37(m,3H),2.37–2.11(m,3H),2.11–2.04(m,4H),2.01–1.76(m,1H),1.43–1.22(m,1H)。LCMS(ESI)m/z:C34H45N8O的[M+H]计算值：581.37；实验值581.3。
实施例186–合成2-((S)-1-(((R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004201
向2-((S)-1-(((R)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(200mg，352.90μmol，1当量)于丙酮(1mL)和DCM(1mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(373.96mg，1.76mmol，5当量)和AcOH(4.24mg，70.58μmol，0.2当量)。4小时后，用H2O(10mL)淬灭反应并用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(5mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的粗材料通过反相色谱法(55→75％MeCN/H2O,10mMNH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-(((R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-4-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-2-基)乙腈(8.76mg，13.96μmol，3.9％产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H49N8O的[M+H]计算值：609.40；实验值609.5。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.69–7.65(m,2H),7.40(dt,J＝4.5,7.7Hz,1H),7.35–7.21(m,3H),4.42–4.26(m,2H),4.08(dd,J＝10.5,17.9Hz,1H),3.90(br dd,J＝2.5,12.9Hz,0.5H),3.83–3.42(m,6H),3.26–3.02(m,5H),2.91(s,3H),2.84–2.60(m,5.5H),2.56–2.44(m,4H),2.41–2.28(m,1H),2.12–2.01(m,1H),1.88–1.54(m,6H),1.49(d,J＝6.6Hz,1H),1.23–1.09(m,6H)。
实施例187–合成2-((S)-3-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)咪唑烷-4-基)乙腈
Figure BDA0003759053970004211
步骤1：合成(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸
在0℃下，向(R)-3-氨基-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(55g，269.31mmol，1当量)于MeOH(550mL)中的悬浮液中添加苯甲醛(57.16g，538.63mmol，2当量)和NEt3(81.75g，807.94mmol，3当量)。将所得到的悬浮液缓慢升温至室温。1小时后，将反应物冷却至0℃并分数份添加NaBH4(30.57g，807.94mmol，3当量)。1小时后，将反应物用H2O(80mL)稀释并减压浓缩。将所得到的残余物用0.1M NaOH(1100mL)稀释并用MTBE(2×300mL)洗涤。用1M HCl将水相酸化至pH 5–6并用氯仿(4×600mL)萃取。将合并的有机相经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈白色固体状的(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(66g，83％产率)，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2：合成(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯
在0℃下，向(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(48g，163.07mmol，1当量)于MeOH(320mL)和甲苯(160mL)中的溶液中添加TMSCHN2(2M,81.54mL，1当量)。1小时后，添加TMSCHN2(2M，81.54mL，1当量)。又1小时后，添加TMSCHN2(2M，24.46mL，0.3当量)并将溶液搅拌1小时。减压浓缩溶液。将所得到的粗材料通过硅胶柱色谱法(50→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈黄色油状的(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(15.5g，28％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.37–7.19(m,5H),5.48–5.36(m,1H),4.45–4.34(m,1H),3.85–3.68(m,5H),3.06–2.90(m,2H),1.44(s,9H)。
步骤3：合成(R)-2-氨基-3-(苯甲基氨基)丙酸甲酯
在0℃下，向(R)-3-(苯甲基氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸酯(15.5g，50.26mmol，1当量)于DCM(100mL)中的溶液中添加4M HCl之MeOH溶液(251.32mL，20当量)，并将反应升温至室温。2小时后，将混合物减压浓缩，得到呈白色固体状的(R)-2-氨基-3-(苯甲基氨基)丙酸甲酯(13g，92％产率)，将其不经进一步纯化即使用。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.63(s,2H),7.54–7.39(m,3H),4.27–4.55(m,1H),4.39(s,2H),3.93(s,3H),3.83–3.67(m,1H),3.65–3.48(m,1H)。
步骤4：合成(R)-1-苯甲基咪唑烷-4-甲酸甲酯
向(R)-2-氨基-3-(苯甲基氨基)丙酸酯(2.5g，8.89mmol，1当量)于CHCl3(25mL)中的溶液中添加三聚甲醛(800.20mg，26.67mmol，3当量)、MgSO4(4.28g，35.56mmol，4当量)、K2CO3(3.69g，26.67mmol，3当量)和NEt3(4.50g，44.46mmol，6.19mL，5当量)。24小时后，将混合物过滤并减压浓缩。将残余物悬浮于EtOAc(50mL)中，过滤，并浓缩，得到呈黄色油状的(R)-1-苯甲基咪唑烷-4-甲酸甲酯(4.4g，粗品)，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤5：合成(R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-甲酸甲酯
向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(7.04g，18.16mmol，1当量)于DMF(25mL)中的溶液中添加HATU(6.90g，18.16mmol，1当量)、N,N-二异丙基乙胺(4.69g，36.32mmol，2当量)和(R)-1-苯甲基咪唑烷-4-甲酸甲酯(4g，18.16mmol，1当量)于DMF(15mL)中的溶液。2小时后，将反应混合物用H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的(R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-甲酸甲酯(4.6g，42％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.55–7.16(m,20H),4.05(d,J＝6.2Hz,1H),3.91–3.85(m,1H),3.74(s,3H),3.66–3.56(m,2H),3.43(d,J＝12.3Hz,1H),3.26–3.18(m,1H),3.03–2.93(m,1H),2.41(s,1H),1.65–1.51(m,1H),1.43–1.33(m,1H)。
步骤6：合成((R)-3-苯甲基-5-(羟基甲基)咪唑烷-1-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮
在0℃下，向(R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-甲酸甲酯(3.6g，6.77mmol，1当量)于THF(36mL)和MeOH(3.69g，115.11mmol，4.66mL，17当量)中的溶液中添加LiBH4(2M，16.50mL，4.87当量)，并将反应升温至10℃。3小时后，将混合物用H2O(50mL)淬灭并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×9mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→100％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的((R)-3-苯甲基-5-(羟基甲基)咪唑烷-1-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(2.33g，67％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.50–7.41(m,1H),7.40–7.30(m,5H),7.26–7.05(m,13H),7.03–6.99(m,1H),4.60(br s,1H),4.45–4.32(m,1H),3.81–3.52(m,4H),3.50–3.41(m,1H),3.38–3.30(m,1H),2.99–2.87(m,1H),2.62–2.49(m,1H),2.39–2.33(m,1H),1.49–1.41(m,1H),1.33–1.26(m,1H)。
步骤7：合成甲烷磺酸((R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)甲酯
在0℃下，向((R)-3-苯甲基-5-(羟基甲基)咪唑烷-1-基)((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲酮(3.7g，7.35mmol，1当量)于DCM(30mL)中的溶液中添加NEt3(2.23g，22.04mmol，3.07mL，3eq)，随后逐滴添加MsCl(1.68g，14.69mmol，1.14mL，2eq)于DCM(7mL)中的溶液。1小时后，用H2O(40mL)淬灭反应并用DCM(3×50mL)萃取。将合并的相用饱和NaCl水溶液(25mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩，得到呈黄色固体状的甲烷磺酸((R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)甲酯(4.41g，粗品)，将该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤8：合成2-((S)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈
向甲烷磺酸((R)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)甲酯(4.27g，7.34mmol，1当量)于DMA(42.7mL)中的溶液中添加NaCN(719.45mg，14.68mmol，2当量)，并将混合物加热至50℃。12小时后，将反应物冷却至室温并用H2O(50mL)淬灭，接着用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(40mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下。将残余物通过硅胶柱色谱法(10→50％EtOAc/石油醚)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(2.01g，53％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.50–7.39(m,6H),7.32(br dd,J＝2.0,4.9Hz,4H),7.29–7.23(m,9H),7.16(br dd,J＝2.3,6.7Hz,1H),4.57–4.42(m,1H),3.97(d,J＝5.5Hz,1H),3.76–3.59(m,2H),3.43(d,J＝12.5Hz,1H),3.10–2.89(m,3H),2.77(dd,J＝3.2,16.7Hz,1H),2.43(br d,J＝1.3Hz,1H),1.56–1.49(m,1H),1.38(dd,J＝1.1,5.9Hz,1H)。
步骤9：合成2-((S)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈
向2-((S)-1-苯甲基-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(1.7g，3.32mmol，1eq)于HF(17mL)中的溶液中添加Pd/C(1.13g，10％纯度)。在H2(50Psi)下将混合物搅拌并加热至50℃。12小时后，将反应混合物冷却至室温，通过硅藻土过滤，用甲醇(2×100mL)洗涤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(5％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(164mg，10.72％产率)。LCMS(ESI):m/z:C27H26N4ONa的[M+Na]计算值：445.20；实验值445.0。
步骤10：合成2-((S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈
向三氟甲烷磺酸(S)-7-(8-甲基萘-1-基)-2-((1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基酯(347.11mg，323.46μmol，1当量)于DMF(5.2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(83.61mg，646.91μmol，2当量)和2-((S)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(164mg，388.15μmol，1.2当量)。将所得到的混合物加热至100℃。1小时后，将反应物冷却至室温，用H2O(30mL)淬灭并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过硅胶柱色谱法(50％MeOH/EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(118mg，42％产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H53N8O2的[M+H]计算值：809.42；实验值809.4。
步骤11：合成2-((S)-3-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)咪唑烷-4-基)乙腈
在0℃下，向2-((S)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)咪唑烷-4-基)乙腈(70mg，86.53μmol，1当量)于CHCl3(0.35mL)和MeOH(0.35mL)中的溶液中添加TFA(394.63mg，3.46mmol，40eq)。30分钟后，将反应升温至室温并用NaHCO3水溶液(20mL)淬灭，接着用DCM(3×25mL)萃取。将合并的有机相用饱和NaCl水溶液(2×7mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤，并减压浓缩。将所得到的残余物通过反相色谱法(30→60％MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化，得到呈白色固体状的2-((S)-3-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-1-(7-(8-甲基萘-1-基)-2-(((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)咪唑烷-4-基)乙腈(22.41mg，46％产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H39N8O2的[M+H]计算值：567.31；实验值567.3。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.68(dd,J＝8.0,17.8Hz,2H),7.45–7.38(m,1H),7.38–7.32(m,1H),7.26–7.20(m,2H),5.62–5.43(m,1H),5.33(br d,J＝6.8Hz,1H),4.66(td,J＝3.4,6.8Hz,1H),4.40(br s,1H),4.31–4.09(m,2H),4.01–3.76(m,2H),3.56(br s,1H),3.34–2.97(m,4H),2.95–2.87(m,3H),2.86–2.74(m,2H),2.72–2.39(m,4H),2.38–2.19(m,1H),2.16–1.68(m,5H),1.59(br s,3H),1.43(br s,1H)。
实施例188至216–合成例示性化合物
下表的化合物是使用以上提到的方法或本领域技术人员已知的其变化形式制备。
表3b：通过本发明方法制备的例示性化合物
Figure BDA0003759053970004271
Figure BDA0003759053970004281
Figure BDA0003759053970004291
Figure BDA0003759053970004301
Figure BDA0003759053970004311
Figure BDA0003759053970004321
Figure BDA0003759053970004331
*根据反应方案1制备，胺中间体是根据WO2019110751中所描述的程序制备。
应注意，一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下，立体异构体的相对立体化学已确定；在一些情况下，绝对立体化学已确定。在一些情况下，单个实施例编号对应于立体异构体混合物。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。
实施例219-Ras蛋白与本发明化合物交联形成缀合物
方案：K-Ras G12D(GDP)交联测定
应注意：尽管以下方案概述K-Ras G12D(GDP)的程序，但本领域技术人员可改用其它Ras蛋白，并且也可改用GDP的不可水解GTP类似物来研究结合GTP的Ras蛋白。
在K-Ras测定缓冲液(12.5mM HEPES、75mM NaCl和1mM MgCl2，pH 7.4)中将载有GDP的K-Ras(1-169)G12D、C51S、C80L、C118S以及载有GDP的K-Ras(1-169)C51S、C80L、C118S调至50μM。将5μL各蛋白质溶液的等分试样添加至含有40μL测定缓冲液的96孔微量板的每个孔中。初始化合物原料是在DMSO中以所述化合物最终测定浓度的100倍浓度制备。接着，在K-Ras测定缓冲液中将化合物稀释10倍，达到其最终浓度的10倍。将5μL每种稀释过的化合物溶液的等分试样添加至在96孔微量板中的每一蛋白质溶液中以起始反应，接着在室温下继续反应。典型的最终化合物浓度是2、10和25μM。在每个时间点，直接分析反应物或用5μL的5％甲酸溶液淬灭反应并保持在4℃以待分析。典型的测定终点是1小时和24小时。
在Agilent 6230TOF质谱仪上收集数据。在进入质谱仪之前，将所有反应物注入C4反相柱上以将蛋白质与缓冲液组分分离。通过增加流动相中的乙腈部分从柱中洗脱蛋白质，并将其直接馈入质量分析仪中。在Agilent MassHunter BioConfirm软件中进行原始数据的初始分析，并且该分析由利用最大熵算法以1Da的质量步长进行的多种蛋白质电荷状态的解卷积组成。输出所有解卷积的蛋白质质量的高度进行进一步数据分析。接着，通过以占总K-Ras蛋白峰高度的百分比计算共价修饰的K-Ras种类的峰高度来确定每种蛋白质的修饰百分比。
利用其它Ras蛋白操作相同程序，得到表4和表5中所见的结果。
表4：缀合物形成数据
Figure BDA0003759053970004351
Figure BDA0003759053970004361
Figure BDA0003759053970004371
Figure BDA0003759053970004381
Figure BDA0003759053970004391
Figure BDA0003759053970004401
Figure BDA0003759053970004411
Figure BDA0003759053970004421
Figure BDA0003759053970004431
Figure BDA0003759053970004441
Figure BDA0003759053970004451
Figure BDA0003759053970004461
Figure BDA0003759053970004471
Figure BDA0003759053970004481
Figure BDA0003759053970004491
Figure BDA0003759053970004501
Figure BDA0003759053970004511
表5：另外的缀合物形成数据
Figure BDA0003759053970004521
Figure BDA0003759053970004531
Figure BDA0003759053970004541
Figure BDA0003759053970004551
Figure BDA0003759053970004561
Figure BDA0003759053970004571
Figure BDA0003759053970004581
Figure BDA0003759053970004591
Figure BDA0003759053970004601
Figure BDA0003759053970004611
Figure BDA0003759053970004621
Figure BDA0003759053970004631
Figure BDA0003759053970004641
Figure BDA0003759053970004651
Figure BDA0003759053970004661
Figure BDA0003759053970004671
Figure BDA0003759053970004681
Figure BDA0003759053970004691
Figure BDA0003759053970004701
Figure BDA0003759053970004711
Figure BDA0003759053970004721
Figure BDA0003759053970004731
Figure BDA0003759053970004741
Figure BDA0003759053970004751
Figure BDA0003759053970004761
关键词：
G12D范围：
符号 范围(％x-连接)
0 未观察到x-连接
+ 0<×≤20
++ 20<×<40
+++ 40<×≤100
WT范围：
符号 范围(％x-连接)
0 未观察到x-连接
+ 0<×≤20
++ 20<×≤100
G12S范围：
符号 范围(％x-连接)
0 未观察到x-连接
+ 0<×≤10
++ 10<×≤100
对于每一Ras蛋白类型，ND＝未确定
实施例220–合成表2f中的例示性化合物以及其它例示性化合物
表2f中的化合物可根据反应方案1，使用羧酸如中间体1-41(和类似中间体)以及与化合物1类似的胺来制备。一些中间体产生可脱保护的产物。脱保护的方法是本领域中已知的，下文描述其中一些方法。
中间体1、2、5、6、9、10、13、14、23和24可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有亚磺酰胺的产物。亚磺酰胺可在酸性条件(例如在0℃下HI于THF中)下去除。
中间体7和8可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有三苯甲基的产物。三苯甲基可在酸性条件(例如TFA)下去除。
中间体19、20、21、22、27和28可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有苯甲基的产物。苯甲基可在水解条件下(例如H2，在催化剂例如Pd/C存在下)去除。
中间体25和26可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有对甲氧基苯甲基的产物。对甲氧基苯甲基可在氧化条件下去除。
中间体29可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有Cbz基团的产物。Cbz基团可在水解条件下(例如H2，在催化剂例如Pd/C存在下)去除。
中间体32和33可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有TBDPS基团的产物。TBDPS基团可使用TBAF去除。
所用中间体可衍生自其它中间体。例如，中间体19、20、21和22衍生自分别中间体15、16、17和18。中间体19、20、21和22可在反应方案1中与类似于化合物1的胺反应以提供含有二苯甲基的产物。二苯甲基可在水解条件下或酸性条件下去除。
按与以上在本实施例中所描述类似的方式，本领域技术人员将能够在本文所公开的其它化合物的相当的胺位置处并入中间体1-41，适当时脱保护，得到本发明化合物。
本领域技术人员仅使用常规实验将认识到或能够确定本文所描述的根据本发明的具体实施方案的许多等效内容。本发明的范围不打算局限于前述描述，而是如所附权利要求书所陈述。此外，还应理解，尽管已经结合本公开的详细描述来描述本公开，但前述描述意图说明而非限制本公开的范围，本公开的范围由所附权利要求书限定。其它方面、优势和变化将在所附权利要求书的范围内。
<110> 革命医药公司(Revolution Medicines, Inc.)
<120> 共价RAS抑制剂及其用途
<130> 51432-010WO1
<150> US 63/024,868
<151> 2020-05-14
<150> US 62/969,415
<151> 2020-02-03
<150> US 62/940,947
<151> 2019-11-27
<160> 3
<170> PatentIn 3.5版
<210> 1
<211> 189
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 1
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr
85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val
100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys
165 170 175
Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met
180 185
<210> 2
<211> 189
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 2
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr
85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg
115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr
130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu
165 170 175
Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser
180 185
<210> 3
<211> 189
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 3
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
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Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
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Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr
85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125
Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp
165 170 175
Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met
180 185

Claims (34)

1.一种具有式I的结构的化合物：
A-L-B
式I
其中A是Ras结合部分；
L是连接体；并且
B是选择性交联基团，
或其药学上可接受的盐，
其中在所述化合物或其药学上可接受的盐与含有Ras蛋白的样品接触后，所述样品中至少20％的Ras蛋白与所述化合物或其药学上可接受的盐共价反应，形成缀合物。
2.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述样品中的Ras蛋白是突变型Ras蛋白。
3.如权利要求1或2所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述Ras结合部分是K-Ras结合部分并且所述样品中的Ras蛋白是K-Ras蛋白。
4.如权利要求3所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分与所述K-Ras蛋白的K-Ras Switch-II结合袋的残基相互作用。
5.如权利要求4所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中K-Ras Switch-II结合袋的所述残基是所述K-Ras蛋白中对应于人野生型K-Ras(SEQ ID NO：1)的V7、V8、V9、G10、A11、D12、K16、P34、T58、A59、G60、Q61、E62、E63、Y64、S65、R68、D69、Y71、M72、F78、I92、H95、Y96、Q99、I100、R102或V103的残基。
6.如权利要求3至5中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II-V中任一者的结构。
7.如权利要求6所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式II的结构：
Figure FDA0003759053960000021
其中m是0、1、2或3；
W1是N或C，其中C任选地通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
各R1独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R1通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R2是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
8.如权利要求6所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式III的结构：
Figure FDA0003759053960000022
Figure FDA0003759053960000031
其中n是0、1、2、3、4、5或6；
Figure FDA0003759053960000032
表示单键或双键；
X是N或CR’，其中R’是氢，或R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
V是CHR5、CR5R5、OR5、NHR5或NR5aR5b；
各R3独立地为
Figure FDA0003759053960000033
任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；
R4是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R5独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂环基；并且
R5a和R5b各自独立地为任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂芳基或任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂环基，或
R5a和R5b连同其各自所连接的氮原子一起组合形成任选被取代的C2-C9杂环基；
条件是，当R’通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，则R3不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体，并且
另一条件是，当R3通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体时，R’不通过任选被取代的C1-C3亚烷基桥或任选被取代的C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体。
9.如权利要求6所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式IV的结构：
Figure FDA0003759053960000041
其中o是0、1或2；
X1、X2和X3各自独立地为N、CH或CR6；
各R6独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R6通过C1-C3烷基桥或C1-C3杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R7和R8独立地为任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基。
10.如权利要求9所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中X1、X2和X3中仅一个是N。
11.如权利要求6所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述K-Ras结合部分是式V的结构：
Figure FDA0003759053960000042
Figure FDA0003759053960000051
其中p是0、1、2或3；
W4是NH或O；
R9是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R10独立地为卤代、CN、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或R10通过C1-C3亚烷基桥或C1-C3亚杂烷基桥连接至所述连接体；并且
R11是任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂芳基、任选被取代的-C1-C6烷基-C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C9杂芳基或任选被取代的C2-C9杂环基。
12.如权利要求1至11中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体将B的反应性原子定位于距A的最近原子约5至约11埃。
13.如权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体是式VI的结构：
A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-(D)-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2
式VI
其中A1是所述连接体与所述Ras结合部分之间的键；
A2是所述选择性交联基团与所述连接体之间的键；
B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN；RN是氢、任选被取代的C1-4烷基、任选被取代的C2-4烯基、任选被取代的C2-4炔基、任选被取代的C2-6杂环基、任选被取代的C6-12芳基或任选被取代的C1-7杂烷基；
C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基；
a、b、c、d、e和f各自独立地为0或1；并且
D是任选被取代的C1-10亚烷基、任选被取代的C2-10亚烯基、任选被取代的C2-10亚炔基、任选被取代的C2-6亚杂环基、任选被取代的C2-6亚杂芳基、任选被取代的C3-8亚环烷基、任选被取代的C6-12亚芳基、任选被取代的C2-C10聚乙二醇或任选被取代的C1-10亚杂烷基或连接A1-(B1)a-(C1)b-(B2)c-与-(B3)d-(C2)e-(B4)f-A2的化学键。
14.如权利要求1至13中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体包含3至8元杂环基。
15.如权利要求1至13中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述连接体是无环的。
16.如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，其中所述选择性交联基团是形成选择性交联基团的C-O键。
17.如权利要求16所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XXIV的结构：
Figure FDA0003759053960000061
其中R31是不存在、氢、C(O)CH3、SO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C1-C3烷基-C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C1-C3烷基-C2-C9杂环基；
R56是CH3或Cl；
Rz是氢、任选被取代的C1-C3烷基；
各Rx独立地为氢、CO2CH3、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基、任选被取代的C2-C6烯基或任选被取代的C2-C6炔基；并且
Z”’是N或O。
18.如权利要求16或17所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XIII的结构：
Figure FDA0003759053960000071
其中R31是氢、CH3、C(O)CH3、SO2CH3、CH2-C6H5或CH2CH2OCH3。
19.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XX或XXI的结构：
Figure FDA0003759053960000081
其中Y是C(O)、C(S)、SO2或任选被取代的C1-C6烷基；
Z’是C(O)或SO2；
q是0、1或2；
x是0、1、2或3；
各RX独立地为氢、CN、C(O)Ry、CO2Ry、C(O)NRyRy、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C3-C10环烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各Ry独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
各R48独立地为CN、卤代、羟基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基，或
R49是任选被取代的C6-C10芳基或任选被取代的C2-C9杂芳基；
R50是氢或C1-C6烷基；
R51是氢、CN或C1-C6烷基；
R54是氢、-C(O)R32、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的C6-C10芳基、任选被取代的C2-C9杂环基或任选被取代的C2-C9杂芳基；并且
R55是氢或任选被取代的C1-C6烷基。
20.如权利要求19所述的化合物或其药学上可接受的盐，具有式XXII或式XXIII的结构：
Figure FDA0003759053960000091
其中X是氢或羟基。
21.一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2b中实施例63-95中任一实施例的结构。
22.一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2c中实施例96-104中任一实施例的结构。
23.一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2d中实施例105-180中任一实施例的结构。
24.一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2e中实施例181-216中任一实施例的结构。
25.一种化合物或其药学上可接受的盐，具有表2f中实施例217-300中任一实施例的结构。
26.一种药物组合物，包含权利要求1至25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐，以及药学上可接受的赋形剂。
27.一种缀合物或其盐，包含与选择性交联基团共价结合的Ras蛋白，所述选择性交联基团通过连接体结合至Ras结合部分，其中所述选择性交联基团是碳化二亚胺、氨基噁唑啉、氯乙基脲、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1，2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖。
28.一种制备缀合物的方法，包括使Ras蛋白与权利要求1至25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求26所述的药物组合物在足以使所述化合物与所述Ras蛋白共价反应的条件下接触。
29.一种由权利要求28所述的方法制备的缀合物。
30.一种治疗有需要的受试者的癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的权利要求1至25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求26所述的药物组合物。
31.一种治疗有需要的受试者的Ras蛋白相关病症的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的权利要求1至25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求26所述的药物组合物。
32.一种抑制细胞中的Ras蛋白的方法，所述方法包括使所述细胞与有效量的权利要求1至25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求26所述的药物组合物接触。
33.如权利要求32所述的方法，其中所述细胞是癌细胞。
34.如权利要求30至33中任一项所述的方法或用途，其中所述方法另外包括施用额外抗癌疗法。
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