CN114364672A - 苯并异噁唑磺酰胺衍生物 - Google Patents

苯并异噁唑磺酰胺衍生物 Download PDF

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龚蓓蓓
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Abstract

本发明涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A、R1‑R8和n如本申请中所定义。新的苯并异噁唑磺酰胺衍生物可以用于治疗患者的异常细胞生长,例如癌症。其他实施方案涉及包含所述化合物的药物组合物以及使用所述化合物和组合物治疗患者的异常细胞生长的方法。

Description

苯并异噁唑磺酰胺衍生物
发明领域
本发明涉及新的苯并异噁唑磺酰胺衍生物,其用作MYST家族的赖氨酸乙酰转移酶(KAT)抑制剂,并且可用于治疗患者的异常细胞生长,例如癌症。本发明还涉及包含所述化合物的药物组合物以及使用所述化合物和组合物治疗患者的异常细胞生长的方法。
发明背景
MYST家族是最大的KAT家族,以酵母和哺乳动物中的组成成员命名:MOZ、Ybf2/Sas3、Sas2和TIP60(Dekker 2014)。MYST蛋白介导许多生物学功能,包括基因调控、DNA修复、细胞周期调控和发育(Avvakumov 2007;Voss 2009)。MYST家族的KAT蛋白在组蛋白的翻译后修饰中起关键作用,因此对真核细胞核中的染色质结构具有显著影响(Avvakumov2007)。该家族目前包含五种哺乳动物KAT:TIP60(KAT5;HTATIP;MIM 601409)、MOZ(KAT6A;MIM 601408;MYST3)、MORF(KAT6b;QKF;MYST4)、HBO(KAT8;HBO1;MYST2)和MOF(KAT8;MYST1)(Voss 2009)。MYST家族的这五个成员存在于人类中,并且已知MYST蛋白的功能障碍与癌症有关(Avvakumov 2007)。MYST家族成员最常用的名称是:
常用名称 MYST名称 系统名称
MOF MYST1 KAT8
HBO MYST2 KAT7
MOZ MYST3 KAT6A
MORF MYST4 KAT6B
TIP60 KAT5
MYST功能结构域
MYST蛋白在多亚基蛋白复合物中起作用,包括衔接蛋白,例如介导DNA结合的ING蛋白(Avvakumov 2007)。例如,TIP60隶属于NuA4多蛋白复合物(包含超过16个成员)(Zhang2017)。然而,也有一些关于在MOZ蛋白自身结构中存在螺旋-转角-螺旋DNA结合基序的报道(Holbert 2007),这表明直接与DNA结合的能力。
MYST蛋白的乙酰转移酶活性受MYST结构域(催化结构域)的影响。MYST结构域包含在结构上与其他HAT一样保守的乙酰辅酶A结合基序,以及不寻常的C2HC型锌指(Voss2009)。高度保守的MYST结构域,包括乙酰辅酶A结合基序和锌指,被认为是该酶家族的限定性特征(Avvakumov 2007)。
MYST蛋白的作用
组蛋白残基的乙酰化通常与转录激活有关。然而,在某些情况下,转录抑制也归因于MYST蛋白(Voss 2009)。已知MYST家族的个体成员参与广泛的重要生化相互作用:
HBO1通过组蛋白底物的乙酰化正向调节DNA复制的启动(Avvakumov 2007;Aggarwal 2004;Doyon 2006;Iizuka 2006),其可能会导致更易接近的染色质构象(Avvakumov 2007,Iizuka 2006)。还已知HBO1通过促进癌症干细胞样细胞的富集(Duong2013)和通过经由泛素化破坏雌激素受体α(ERα)而在乳腺癌的发病机制中发挥作用,该泛素化是通过HBO1的组蛋白乙酰化活性进行的(Iizuka 2013)。HBO1也与急性髓系白血病(AML)有关联(Shi 2015)。
TIP60(KAT5)是MYST家族中研究最多的成员。TIP60不仅在转录调控中发挥重要作用,而且在DNA损伤修复过程中,尤其是在DNA双链断裂(DSB)中发挥重要作用(Gil 2017)。TIP60可以乙酰化p53、ATM和c-Myc。TIP60和MOF在DNA损伤时特异性乙酰化p53的赖氨酸120(K120)(Avvakumov 2007)。TIP60也被认为对调节性T细胞(Treg)生物学很重要。FOXP3是Treg发育和功能的主要调节因子,并且已经显示TIP60对FOXP3的乙酰化对于FOXP3活性是必不可少的(Li 2007,Xiao 2014)。要强调的是,小鼠中的条件性TIP60缺失导致皮屑样致命自身免疫性疾病,与在FOXP3敲除小鼠中看到的表型相仿(Xiao 2014)。在癌症中,Treg细胞可以通过抑制针对肿瘤的获得性免疫来促进肿瘤进展。
MOF(“males absent on the first”)最初被确定为果蝇中剂量补偿的组分之一,并根据功能研究和序列分析被归类为MYST家族的成员(Su 2016)。人类直系同源物与果蝇MOF具有显著的相似性;含有乙酰辅酶A结合位点、染色质域(其结合组蛋白)和C2HC型锌指(Su 2016)。MOF是乙酰化组蛋白H4K16的关键酶,含MOF的复合物涉及与癌症相关的各种基本细胞功能(Su 2016)。除了组蛋白乙酰化的整体减少外,哺乳动物细胞中MOF的消耗会导致基因转录异常,特别是导致某些肿瘤抑制基因或癌基因的异常表达,表明MOF在肿瘤发生中的关键作用(Su 2016)。例如,MOF的KAT活性已被证明是维持MLL-AF9白血病所必需的,并且可能对多种AML亚型很重要(Valerio 2017)。
KAT6B(Querkopf)最初是在胚胎发育过程中调节增殖和分化之间平衡的基因的突变筛选中确定的(Thomas 2000)。KAT6B突变等位基因纯合的小鼠在大脑皮层发育方面存在严重缺陷,这是由于胚胎发育过程中特别是皮质神经前体细胞群的增殖和分化严重减少所致。KAT6B是维持成体神经干细胞群所需的,并且是调节干细胞分化为神经元的系统的一部分(Merson 2006)。KAT6B在罕见的白血病类型中也是突变的(Vizmanos 2003)。
MOZ基因座在所有癌症类型中最常扩增的区域中排名第12位(Zack 2013)。MOZ位于8p11-p12扩增子内,其在各种癌症,尤其是乳腺癌和卵巢癌中发现的频率约为10-15%(Turner-Ivey 2014)。在检查急性髓系白血病(AML)中的特定染色体易位的过程中,MOZ首先被确定为CREB结合蛋白(CBP)的融合伴侣(fusion partner)(Avvakumov 2007;Borrow1996)。MOZ KAT活性是促进MEIS1和HOXa9表达所必需的,MEIS1和HOXa9是通常观察到在某些淋巴瘤和白血病中过度表达的蛋白。观察到在B细胞淋巴瘤的Eμ-Myc转基因模型中MOZ+/-杂合子小鼠的存活率增加,其中单个MOZ等位基因的丢失导致前B细胞中Meis1和Hoxa9水平的生物学相关的降低(Sheikh 2015)。
一些MYST的抑制剂是已知的。例如,报道了以下漆树酸衍生物(Ghizzoni 2012)抑制TIP60(IC50=74μM)和MOF(IC50=47μM):
Figure BDA0003504892550000041
其他已知的抑制剂包括(Zhang 2017):
Figure BDA0003504892550000042
Figure BDA0003504892550000051
鉴于一般地KAT且特别是MYST在诸如癌症的疾病中的作用,对这些蛋白质的新抑制剂存在需求。
发明内容
以下描述的本发明的实施方案中的每一个都可以与本申请中描述的本发明的一个或多个其他实施方案组合,所述实施方案与其所组合的实施方案不矛盾。此外,以下描述本发明的实施方案中的每一个在其范围内设想了本发明化合物的药学上可接受的盐。因此,短语“或其药学上可接受的盐”隐含在本申请中所述的所有化合物的描述中。
本发明涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000052
其中
R1为氢或任选地被甲基取代的5-6元杂芳基;
R2为氢或任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CHR8)n-(5-9元杂芳基),
条件是R1和R2之一为氢,
另外的条件是R1和R2不都为氢;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基,环A为C6-C10芳基或9-10元杂芳基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基;
R8为氢或-OH;并且
n为0或1。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为5-6元杂芳基,R2为氢;R1为5元杂芳基,R2为氢;或R1为吡唑基,R2为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为氢,R2为5-6元杂芳基;R1为氢,R2为5元杂芳基;R1为氢,R2为吡唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CHR8)-(5-6元杂芳基),R8为-OH;R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CH2)-(5-6元杂芳基);R1为氢,R2为-(CHR8)-(5-6元杂芳基),R8为-OH;R1为氢,R2为-(CH2)-(5-6元杂芳基);R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CHR8)-(5元杂芳基),R8为-OH;R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CH2)-(5元杂芳基);R1为氢,R2为-(CHR8)-(5元杂芳基),R8为-OH;R1为氢,R2为-(CH2)-(5元杂芳基);R1为氢,R2为-(CH2)-三唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素或C1-C3烷基取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为任选地被C1-C3烷基取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为被甲基取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为-(CH2)-(6元杂芳基);R1为氢,R2为-(CHR8)-(6元杂芳基),R8为-OH;R1为氢,R2为-(CH2)-吡啶、-(CH2)-吡嗪或-(CH2)-嘧啶;R1为氢,R2为-(CH2)-(5-9元杂芳基);或R1为氢,R2为-(CH2)-吲唑基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3;R4为氢。
本发明的一个实施方案涉及的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢,R4为卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基;R3为氢、氟、溴或甲基;R3为氟;R3为甲基;R3为氢;R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R4为氢;R4为C1-C3烷氧基;或R4为甲氧基,以及其R3和R4的任意组合。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3和R4中至少一个为氢。
本发明的一个实施方案涉及的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基,R4为氢;R3为氢、氟、溴或甲基,R4为氢;R3为甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R3为氢,R4为氢;R3为氢,R4为C1-C3烷氧基;R3为氢,R4为甲氧基;或R3为氟,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基、喹啉基、苯并噁唑基、茚满基或四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基或四氢萘基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯并噁唑基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基或苯并噁唑基,R5为甲基或乙基,R6为氢,R7为氢。
应当理解,式(I)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000091
其中
R1为氢或任选地被甲基取代的5-6元杂芳基;
R2为氢或任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CH2)n-(5-6元杂芳基),
条件是R1和R2之一为氢,
另外的条件是R1和R2不都为氢;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、-CF2H、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基,条件是R3和R4中至少一个为氢;
环A为C6-C10芳基或9-10元杂芳基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基;并且
n为0或1。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为5-6元杂芳基,R2为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为5元杂芳基,R2为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为吡唑基,R2为氢;R1为氢,R2为5-6元杂芳基;R1为氢,R2为5元杂芳基;R1为氢,R2为吡唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CH2)-(5-6元杂芳基);R1为氢,R2为-(CH2)-(5-6元杂芳基);R1为氢,R2为任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CH2)-(5元杂芳基);R1为氢,R2为-(CH2)-(5元杂芳基);R1为氢,R2为-(CH2)-三唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素或C1-C3烷基取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为任选地被卤素取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为任选地被C1-C3烷基取代的-(CH2)-吡唑基;R1为氢,R2为被甲基取代的-(CH2)-吡唑基;或R1为氢,R2为-(CH2)-吡唑基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为卤素、C1-C3烷基、-CF2H、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3;R4为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢,R4为卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基。
本发明的一个实施方案涉及式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3和R4中至少一个为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基,R4为氢;R3为氢、氟、溴或甲基,R4为氢;R3为甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R3为氢,R4为氢;R3为氢,R4为C1-C3烷氧基;或R3为氢,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基、喹啉基、苯并噁唑基、茚满基或四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基或四氢萘基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯并噁唑基。
本发明的一个实施方案涉及式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基或苯并噁唑基,R5为甲基或乙基,R6为氢,R7为氢。
应当理解,式(Ia)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000121
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
环A为C6-C10芳基或9-10元杂芳基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;并且
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH;R2a不存在,为氟或甲基;R2a不存在;R2a为氟;或R2a为甲基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基;R3为氢、氟、溴或甲基;R3为氟;R3为甲基;R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R4为氢:R4为C1-C3烷氧基;或R4为甲氧基,和R3和R4的任意组合。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氟,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3和R4中至少一个为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基,R4为氢;R3为氢、氟、溴或甲基,R4为氢;R3为甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R3为氢,R4为氢;R3为氢,R4为C1-C3烷氧基;R3为氢,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基、喹啉基、苯并噁唑基、茚满基或四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为四氢萘基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为茚满基或四氢萘基,R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为苯并噁唑基。
本发明的一个实施方案涉及式(II)的化合物或其药学上可接受的盐,其中环A为喹啉基,R5为甲基或乙基,R6为氢,R7为氢。
应当理解,式(II)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000141
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3,C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;以及
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH;R2a不存在,为氟或甲基;R2a不存在;R2a为氟;或R2a为甲基。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基;R3为氢、氟、溴或甲基;R3为氟;R3为甲基;R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R4为氢;R4为C1-C3烷氧基;R4为甲氧基;或R3为氟,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3和R4中至少一个为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基,R4为氢;R3为氢、氟、溴或甲基,R4为氢;R3为甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基;R3为氢,R4为氢;R3为氢,R4为C1-C3烷氧基;或R3为氢,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(III)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
应当理解,式(III)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000161
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;并且
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH;R2a不存在,为氟或甲基;R2a不存在;R2a为氟;或R2a为甲基。
本发明的一个实施方案涉及式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
应当理解,式(IV)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000171
其中
X为N或-C(H)-;
Y为N或-C(H)-,
条件是X和Y中至少一个为-C(H)-;
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
R5为氢、甲基、-CF3、C1-C3烷氧基、-CH2-OCH3或-C(O)OCH3;以及
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中X为N,Y为-C(H)-。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中X为-C(H)-,Y为N。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中X为-C(H)-,Y为-C(H)-。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH;R2a不存在,为氟或甲基;R2a不存在;R2a为氟;或R2a为甲基。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4为氢、氟、乙基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;R4为C1-C4烷氧基;R4为甲氧基;或R4为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(V)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为氢。
应当理解,式(V)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003504892550000181
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素或C1-C3烷基;
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基,条件是R3和R4至少一个为氢;
R5为氢、甲基、-CH2-OCH3、-CF3、C1-C3烷氧基或-C(O)OCH3;以及
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH;R2a不存在,为氟或甲基;R2a不存在;R2a为氟;或R2a为甲基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为氢、氟或甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢;R3为甲基,R4为氢;R3为氢,R4为氢、氟、乙基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;R3为氢,R4为C1-C4烷氧基;或R3为氢,R4为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6为氢。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基。
本发明的一个实施方案涉及式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5为甲氧基,R6为氢。
应当理解,式(VI)的上述实施方案的任何一个可以与上述任何其他一个或多个实施方案组合,只要其相容即可。
本发明的一个实施方案提供了化合物,其选自实施例1至实施例133(包括实施例1和133本身)中所例示的化合物或其药学上可接受的盐。
本发明涉及式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的任一实施方案的化合物或其药学上可接受的盐,其被氘标记。
本发明涉及包含式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体或稀释剂的药物组合物。
本发明涉及包含式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体或稀释剂的药物组合物,其用于治疗癌症。
本发明涉及治疗患者的癌症的方法,其包括给予患者有效治疗癌症的量的式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)或式(V)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐。
本发明涉及式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐,其用于治疗患者的癌症。
本发明涉及式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗癌症的药物中的用途。
本发明涉及式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐与抗肿瘤剂或与放射治疗的组合,其用于治疗癌症。
本发明涉及式(I)、式(Ia)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)或式(VI)的化合物的实施方案中任一项的化合物或其药学上可接受的盐与抗肿瘤剂的组合,其用于治疗癌症。
在本发明的一个实施方案中,癌症为乳腺癌。
在本发明的一个实施方案中,癌症为乳腺癌,所述乳腺癌为ER阳性乳腺癌。
附图简要说明
图1显示2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水物的PXRD谱(1型)。
发明详述
通过参考以下对本发明优选实施方案的详细描述和本申请中包括的实施例,可以更容易地理解本发明。应当理解,本申请中使用的术语仅用于描述具体实施方案,而不是旨在限制。还应理解,除非在本申请中被具体定义,否则本申请中使用的术语被赋予其在相关领域中已知的传统含义。
如本申请中所使用,除非另有说明,否则单数形式“一个”、“一种”和“该”包括复数形式。例如,“一个”取代基包括一个或多个取代基。
本申请中描述的本发明适合地可以在本申请中未具体公开的任何一个或多个要素不存在的情况下实施。因此,例如,在本申请中的每种情况中,术语“包含”、“基本上由……组成”和“由……组成”中的任何一个可以用其他两个术语中的任一个代替。
为方便起见,使用众所周知的缩写表示许多化学部分和化合物,其包括但不限于:Ac(乙酰基)、AcOH(乙酸)、AIBN(偶氮二异丁腈)、n-BuLi(正丁基锂)、CN(氰基)、CPME(环戊基甲基醚)、DCM(二氯甲烷或亚甲基氯)、丙酮-d6(氘代丙酮)、CDCl3(氘代氯仿)、DMSO-d6(氘代二甲基亚砜)、甲醇-d4(氘代甲醇)、D2O(氘代水)、DIAD(偶氮二甲酸二异丙基酯)、DMAP(N,N-二甲基吡啶-4-胺)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)、DMSO(二甲基亚砜)、dppf(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)、dppp(1,3-双(二苯基膦基)丙烷)、Et(乙基)、乙酸乙酯(EtOAc)、EtOH(乙醇)、LDA(二异丙基氨基锂)、Me(甲基)、MeOH(甲醇)、MeCN(乙腈)、MeOAc(乙酸甲酯)、Ms(甲磺酰基)、MsCl(甲磺酰氯)、MTBE(甲基叔丁基醚)、NADPH(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)、N/D(未确定);NaOMe(甲醇钠)、NaOtPn(叔戊醇钠)、Pd(OAc)2(乙酸钯(II))、PdCl2(dppf)或Pd(dppf)Cl2(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁二氯化钯(II))、Pd(PPh3)4(四(三苯基膦)钯(0))、Pet.醚(石油醚)、Ph(苯基)、2-PrOH(异丙醇,2-丙基)、t-Bu(叔丁基)、TBAF(氟化四正丁铵)、TBS(叔丁基二甲基甲硅烷基)、TMG(四甲基胍)、TBSCl(叔丁基二甲基甲硅烷基氯)、TEA(三乙胺)、TFA(三氟乙酸)、THF(四氢呋喃)、TMEDA(四甲基乙二胺)和X-Phos(2-二环己基膦基-2′,4′,6′-三异丙基联苯)。
另外,TLC是指薄层色谱法,HPLC是指高效液相色谱法,LCMS是指液相色谱-质谱法,SFC(超临界流体色谱法)。
其他缩写:rt或Rt(保留时间),min((数)分钟),h(小时),RT(室温),aq.(水),satd.(饱和),eq或eq.(当量)。
如本申请中所使用,术语“卤素”是指氟、氯、溴或碘原子或氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)或碘(I)。
如本申请中所使用,术语“烷基”是指具有直链或支链部分的饱和一价烃基,其在某些实施方案中含有1至6个或1至3个碳原子。术语“C1-C4烷基”是指含有一至四个碳原子且具有直链或支链部分的烷基。术语“C1-C4烷基”在其定义内包括术语“C1-C3烷基”。烷基的实例包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。
如本申请中所使用,术语“烷氧基”是指与氧原子单键键合的烷基。烷氧基与分子的连接点是通过氧原子。烷氧基可以描绘为烷基-O-。术语“C1-C4烷氧基”和“C1-C3烷氧基”是指分别含有1至4个碳原子和1至3个碳原子的具有直链或支链部分的烷氧基。烷氧基包括但不限于甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基等。
如本申请中所使用,术语“芳基”是指衍生自芳族烃的环状基团。术语“C6-C10芳基”含有6至10个碳原子。这些基团的实例包括但不限于苯基和萘基。术语“芳基”还包括稠合多环芳环系统,其中芳环稠合到一个或多个环。实例包括但不限于1-萘基,2-萘基,1-蒽基和2-蒽基。如本申请中所使用,在术语“芳基”的范围内还包括其中芳环稠合到一个或多个非芳环的基团,例如在茚满基(2,3-二氢-1H-茚)或四氢萘(也称为1,2,3,4-四氢萘基)中,其中连接基团或连接点在芳环上。
如本申请中所使用,术语“杂环”是指衍生自芳基的基团,其中环碳原子中的至少一个已经被选自氧、氮和硫的杂原子替代。
如本申请中所使用,术语“杂芳基”是指衍生自芳族单环或双环杂环的基团,特别是指双环杂环、苯并稠合杂环基团,其中芳族或非芳族杂环稠合到苯基。如本申请中所使用,术语“5元杂芳基”在其环系统中具有总共5个原子,术语“5-6元杂芳基”在其环系统中具有总共5或6个原子,术语“5-9元杂芳基”在其环系统中具有总共5、6、7、8或9个原子。另外,“5元杂芳基”、“5-6元杂芳基”和“5-9元杂芳基”中的每一个具有1个、2个或3个独立地选自氮和氧的杂原子,条件是该环系统不包含两个相邻的氧原子。实例包括但不限于吡唑基和三唑基。如本申请中所使用,术语“9-10元杂芳基”在其环系统中具有总共9或10个原子,并且一个或两个杂原子各自独立地选自氮和氧,条件是环系统不包含两个相邻的氧原子。
根据本发明的“9-10元杂芳基”的实例包括但不限于
Figure BDA0003504892550000231
Figure BDA0003504892550000241
除非另有说明,否则本申请中所使用的术语“治疗(treating)”是指逆转、减轻、抑制这样的术语适用的疾病、障碍或病症或这样的疾病、障碍或病症的一种或多种症状的进展,或预防这样的术语适用的疾病、障碍或病症或这样的疾病、障碍或病症的一种或多种症状。除非另有说明,否则本申请中所使用的术语“治疗(treatment)”是指上文刚定义的“治疗(treating)”的治疗行为。
除非另有说明,否则本申请中所使用的术语“组合”是指固定剂量组合或根据相同或不同的给药途径间歇、同时或顺序给药的药剂的组合。如本申请中所使用,“有效”量是指作为单剂量或根据多剂量方案的、单独的或与其他药剂或物质组合的物质、药剂、化合物或组合物的量,其足以导致疾病症状的严重程度降低、疾病无症状期的频率和持续时间增加、预防由病痛引起的损伤或失能。本领域普通技术人员将能够基于诸如以下的因素来确定这样的量:患者体型、患者症状的严重程度以及所选择的具体组合、组合物或给药途径来确定这些量。患者或受试者可以是需要治疗的人或非人类哺乳动物。在一个实施方案中,患者是人。
除非另有说明,否则本申请中对本发明化合物的所有提及均包括对其盐、溶剂化物、水合物及复合物的提及,以及对其盐的溶剂化物、水合物及复合物的提及,包括其多晶型物、立体异构体和同位素标记的形式。
本申请中公开的实施方案包括同位素标记的化合物,其与式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)中列举的那些相同,但一个或多个原子被原子质量或质量数不同于自然界中通常存在的原子质量或质量数的原子所替代。可掺入本申请中公开的实施方案的化合物中的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟和氯的同位素,分别是例如但不限于2H、3H、13C、14C、15N、18O、17O、31P、32P、35S、18F和36Cl。在一个实施方案中,掺入式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)的化合物中的同位素是2H。含有上述同位素和/或其他原子的其他同位素的所述化合物的本申请中所述的化合物和药学上可接受的盐在本实施方案的范围内。本申请中公开的实施方案的某些同位素标记的化合物,例如其中掺入诸如3H和14C的放射性同位素的化合物,可用于药物和/或底物组织分布分析。氚代即3H同位素和碳14即14C同位素是特别优选的,因为它们易于制备和检测。此外,用较重的同位素例如氘(即2H)进行取代可以提供由于更高的代谢稳定性,例如增加的体内半衰期,或减少的剂量需求带来的某些治疗优势,因此在某些情况下可以是优选的。本申请中公开的实施方案的同位素标记的化合物通常可以通过实施以下方案和/或实施例中公开的过程,通过用容易获得的同位素标记的试剂代替非同位素标记的试剂来制备。在一个实施方案中,式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)的化合物是氘标记的。
一些实施方案涉及本申请中所述化合物的药学上可接受的盐。本申请中所述的性质为碱性的化合物能够与各种无机酸和有机酸形成各种盐。可以用于制备本申请中所述的这样的碱性化合物的药学上可接受的酸加成盐的酸是形成无毒酸加成盐的酸,所述无毒酸加成盐例如含有药学上可接受的阴离子的盐,例如盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、硝酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、磷酸盐、酸式磷酸盐、异烟酸盐、乙酸盐、乳酸盐、水杨酸盐、柠檬酸盐、酸式柠檬酸盐、酒石酸盐、泛酸盐、酒石酸氢盐、抗坏血酸盐、琥珀酸盐、马来酸盐、龙胆酸盐(gentisinate)、富马酸盐、葡萄糖酸盐、葡萄糖醛酸盐、糖酸盐、甲酸盐、苯甲酸盐、谷氨酸盐、甲磺酸盐、乙磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐和双羟萘酸盐[即,1,1’-亚甲基-双-(2-羟基-3-萘甲酸盐)]。除了上述酸以外,本申请中所述的包含碱性部分例如氨基的化合物可以与各种氨基酸形成药学上可接受的盐。
也可以形成酸和碱的半盐,例如半硫酸盐和半钙盐。
有关合适盐的综述,请参见Stahl和Wermuth的药用盐手册:特性、选择和使用(Handbook of Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use)(Wiley-VCH,2002)。制备本申请中所述化合物的药学上可接受的盐的方法是本领域技术人员已知的。
术语“溶剂化物”在本申请中中用于描述包含本申请中所述的化合物和一种或多种药学上可接受的溶剂分子例如乙醇的分子复合物。
本申请中所述的化合物也可以以非溶剂化和溶剂化形式存在。因此,一些实施方案涉及本申请中所述的化合物的水合物和溶剂化物。当溶剂或水紧密结合时,复合物将具有明确的与湿度无关的化学计量。然而,当溶剂或水较弱地结合时,如在通道溶剂化物(channel solvate)和吸湿性化合物中,水/溶剂含量将取决于湿度和干燥条件。在这样的情况下,非化学计量将是正常的。术语“溶剂化物”在本申请中中用于描述包含本发明的化合物和一种或多种药学上可接受的溶剂分子例如乙醇的分子复合物。当溶剂是水时,使用术语“水合物”。根据本发明的药学上可接受的溶剂化物包括其中结晶溶剂可以被同位素替代的水合物和溶剂化物,例如D2O、d6-丙酮、d6-DMSO。
还包括在本发明范围内的是诸如包合物、药物主体包合络合物的复合物,其中与上述溶剂化物相比,药物和主体以化学计量或非化学计量的量存在。还包括含有化学计量的或非化学计量的量的两种或更多种有机和/或无机组分的药物的复合物。得到的复合物可以是离子化的、部分离子化的或非离子化的。对于这样的复合物的综述,参见Haleblian的J Pharm Sci,64(8),1269-1288(1975年8月),通过引用将其公开内容整体并入本申请。
本发明还涉及本申请中提供的所示结构式的化合物的前药。因此,本发明的化合物的某些本身可以具有很少或没有药理活性的衍生物在给予患者时可以例如通过水解裂解转化为本发明的化合物。这样的衍生物被称为“前药”。有关使用前药的更多信息,请参见“作为新递送系统的前药(Pro-drugs as Novel Delivery Systems)”,第14卷,ACSSymposium Series(T Higuchi和W Stella)和“药物设计中的生物可逆性载体(Bioreversible Carriers in Drug Design)”,Pergamon Press,1987(E B Roche编,American Pharmaceutical Association),通过引用将其公开内容整体并入本申请。
根据本发明的前药可以例如通过用本领域技术人员已知的某些部分,如例如在HBundgaard的“前药的设计(Design of Prodrugs)”(Elsevier,1985)中描述的“前部分(pro-moiety)”替代本发明化合物中存在的合适的官能团来制备,通过引用将其公开内容整体并入本申请。
根据本发明的前药的一些非限制性实例包括:
(i)当化合物含有羧酸官能团(-COOH)时,其酯,例如,用(C1-C8)烷基替代氢;
(ii)当化合物含有醇官能团(-OH)时,其醚,例如,用(C1-C6)烷酰氧基甲基或用磷酸醚基团替代氢;以及
(iii)当化合物含有伯氨基或仲氨基官能团(-NH2或-NHR,其中R≠H)时,其酰胺,例如,一个或两个氢被适合的代谢不稳定基团,例如酰胺、氨基甲酸酯,脲、膦酸酯、磺酸酯等替代。
根据前述实例的替代基团的另外的实例和其他前药类型的实例可在前述参考文献中找到。最后,某些本发明的化合物本身可以充当其他本发明的化合物的前药。
还包括在本发明范围内的是本申请中所述各式的化合物的代谢物,即在给予药物后在体内形成的化合物。
本申请中所述的含有一个或多个不对称碳原子的化合物可以作为两个或更多个立体异构体存在。在本申请中所述的化合物含有烯基或亚烯基的情况下,几何顺式/反式(或Z/E)异构体是可能的。在结构异构体可通过低能垒相互转化的情况下,可能会发生互变异构现象(“互变异构”)。这在本申请中描述的含有例如亚氨基、酮基或肟基的化合物中的质子中可以表现为互变异构形式,或在含有芳族部分的化合物中表现为所谓的价互变异构形式。单一化合物可以表现出多于一种类型的异构现象。
本申请中所述实施方案的化合物包括本申请中所述化合物的所有立体异构体(例如顺式和反式异构体)和所有光学异构体(例如R和S对映异构体),以及这样的异构体的外消旋混合物、非对映异构体混合物和其他混合物。尽管所有立体异构体都包含在我们的权利要求的范围内,但本领域技术人员将认识到特定的立体异构体可能是优选的。
在一些实施方案中,本申请中所述的化合物可以以几种互变异构形式存在,包括烯醇和亚胺形式,以及酮和烯胺形式及其几何异构体和混合物。所有这样的互变异构形式都包括在本发明的实施方案的范围内。互变异构体在溶液中作为互变异构体组的混合物存在。在固体形式中,通常一种互变异构体占优势。尽管可以描述一种互变异构体,但本发明的实施方案包括本发明化合物的所有互变异构体。
本发明的实施方案还包括本申请中所述化合物的阻转异构体。阻转异构体是指可以分离成旋转受限异构体的化合物。
包括在本发明的实施方案的范围内的是本申请中所述的化合物的所有立体异构体、几何异构体和互变异构形式,包括表现出多于一种类型的异构现象的化合物,及其一种或多种的混合物。
顺式/反式异构体可以通过本领域技术人员熟知的常规技术分离,例如色谱法和分级结晶。
用于制备/分离单个对映异构体的常规技术包括从合适的光学纯前体手性合成或使用例如手性高效液相色谱(HPLC)或SFC拆分外消旋体(或盐或衍生物的外消旋体)。
供选择地,外消旋体(或外消旋前体)可以与合适的光学活性化合物例如醇反应,或者在本申请中所述的化合物含有酸性或碱性部分的情况下,与碱或酸例如1-苯基乙基胺或酒石酸反应。得到的非对映异构体混合物可以通过色谱法和/或分级结晶进行分离,并且通过本领域技术人员熟知的方法将一种或两种非对映异构体转化为相应的(多种)纯对映异构体。
除非另有说明,本申请中所使用的“异常细胞生长”或“癌症”是指不依赖于正常调节机制的细胞生长(例如,失去接触抑制)。这包括以下的异常生长:(1)通过表达突变的酪氨酸激酶或受体酪氨酸激酶的过表达而增殖的肿瘤细胞(肿瘤);(2)其中发生酪氨酸激酶异常活化的其他增殖性疾病的良性和恶性细胞;(3)任何通过受体酪氨酸激酶增殖的肿瘤;(4)任何通过丝氨酸/苏氨酸激酶异常活化增殖的肿瘤;(5)其中发生异常丝氨酸/苏氨酸激酶活化的其他增殖性疾病的良性和恶性细胞;(6)任何通过异常信号传导、代谢、表观遗传和转录机制增殖的肿瘤;以及(7)其中信号传导、代谢、表观遗传和转录机制异常的其他增殖性疾病的良性和恶性细胞。
为方便起见,本申请中可以使用某些众所周知的缩写,包括:雌激素受体阳性(ER+)、人表皮生长因子受体2阴性(HER2-)、非小细胞肺癌(NSCLC)和去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。
另外的实施方案涉及治疗患者的异常细胞生长的方法。另外的实施方案涉及治疗患者的异常细胞生长的方法,其包括给予患者有效治疗异常细胞生长的量的本申请中所述的化合物。
在其他实施方案中,异常细胞生长是癌症。
在一些实施方案中,癌症选自肺癌、间皮瘤、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内黑色素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、肛区癌、胃癌、肝癌、结肠癌、乳腺癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌、宫颈癌、阴道癌、外阴癌、霍奇金病、食管癌、小肠癌、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、前列腺癌、血液学恶性肿瘤、慢性或急性白血病、淋巴细胞性淋巴瘤、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾细胞癌、肾盂癌、中枢神经系统(CNS)肿瘤、原发性CNS淋巴瘤、脊髓轴肿瘤、胶质母细胞瘤、脑干神经胶质瘤、垂体腺瘤或上述癌症中的两种或更多种的组合。
另外的实施方案涉及治疗患者实体瘤的方法。一些实施方案涉及治疗患者的实体瘤,包括给予患者有效治疗实体瘤的量的本申请中所述的化合物。
在一个实施方案中,实体瘤是乳腺癌、肺癌、结肠癌、脑癌、前列腺癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、黑色素瘤、内分泌癌、子宫癌、睾丸癌或膀胱癌。
在一个实施方案中,实体瘤是乳腺癌、肺癌、前列腺癌、胰腺癌或卵巢癌。
在一个实施方案中,癌症是乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是ER+乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是ER+HER2-乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是局部晚期或转移性ER+HER2-乳腺癌。
在一个实施方案中,肺癌是非小细胞肺癌。
在一个实施方案中,肺癌是局部晚期或转移性非小细胞肺癌。
在一个实施方案中,前列腺癌是去势抵抗性前列腺癌。
在一个实施方案中,前列腺癌是局部晚期或转移性去势抵抗性前列腺癌。
另外的实施方案涉及治疗患者血液肿瘤的方法。一些实施方案涉及治疗患者的血液肿瘤,包括给予患者有效治疗血液肿瘤的量的本申请中所述的化合物。
在一个实施方案中,血液肿瘤是白血病、淋巴瘤或多发性骨髓瘤。
在一个实施方案中,血液肿瘤是白血病或淋巴瘤。
另外的实施方案涉及治疗患者的癌症的方法,其包括给予患者有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物。
在一个实施方案中,癌症是乳腺癌、肺癌、结肠癌、脑癌、前列腺癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、黑色素瘤、内分泌癌、子宫癌、睾丸癌、膀胱癌或血液癌症。
在一个实施方案中,癌症是乳腺癌、肺癌、前列腺癌、胰腺癌、卵巢癌或血液癌症。
在一个实施方案中,癌症是乳腺癌、肺癌、前列腺癌、胰腺癌或卵巢癌。
在一个实施方案中,癌症是乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是ER+乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是ER+HER2-乳腺癌。
在一个实施方案中,乳腺癌是局部晚期或转移性ER+HER2-乳腺癌。
在一个实施方案中,肺癌是非小细胞肺癌。
在一个实施方案中,肺癌是局部晚期或转移性非小细胞肺癌。
在一个实施方案中,前列腺癌是去势抵抗性前列腺癌。
在一个实施方案中,前列腺癌是局部晚期或转移性去势抵抗性前列腺癌。
在一个实施方案中,癌症是血液癌症。
在一个实施方案中,血液肿瘤是白血病或淋巴瘤。
另外的实施方案涉及治疗患者的癌症的方法,其包括给予患者与抗肿瘤剂组合的有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物,所述抗肿瘤剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、嵌入性抗生素、生长因子抑制剂、放射、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、抗体、细胞毒素、抗激素和抗雄激素。
再有实施方案涉及用于治疗患者的癌症的药物组合物,其包含有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物,以及药学上可接受的载体。
另外的实施方案涉及治疗患者,特别是人的癌症的方法,其包括给予患者有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物或前药。在该方法的一个实施方案中,癌症包括但不限于肺癌、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内黑色素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、肛区癌、胃癌、结肠癌、乳腺癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌、宫颈癌、阴道癌、外阴癌、霍奇金病、食管癌、小肠癌、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、前列腺癌、慢性或急性白血病、淋巴细胞性淋巴瘤、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾细胞癌、肾盂癌、中枢神经系统(CNS)肿瘤、原发性CNS淋巴瘤、脊髓轴肿瘤、脑干神经胶质瘤、垂体腺瘤或上述癌症中的一种或更多种的组合。在一个实施方案中,该方法包括给予患者有效治疗所述癌症实体瘤的量的本申请中所述的化合物。在一个优选的实施方案中,实体瘤是乳腺癌、肺癌、结肠癌、脑癌、前列腺癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、皮肤癌(黑色素瘤)、内分泌癌、子宫癌、睾丸癌和膀胱癌。
在所述方法的另一个实施方案中,所述癌症是良性增殖性疾病,包括但不限于牛皮癣、良性前列腺肥大或再狭窄。
一些实施方案涉及治疗患者的癌症的方法,其包括给予所述患者与抗肿瘤剂组合的有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物或前药,所述抗肿瘤剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、嵌入性抗生素、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、抗体、细胞毒素、抗激素和抗雄激素。
另外的实施方案涉及用于治疗患者,特别是人的癌症的药物组合物,其包含有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物或前药,以及药学上可接受的载体。在所述组合物的一个实施方案中,癌症包括但不限于肺癌、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内黑色素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、肛区癌、胃癌、结肠癌、乳腺癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌、宫颈癌、阴道癌、外阴癌、霍奇金病、食管癌、小肠癌、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、前列腺癌、慢性或急性白血病、淋巴细胞性淋巴瘤、膀胱癌、肾癌或输尿管癌、肾细胞癌、肾盂癌、中枢神经系统(CNS)肿瘤、原发性CNS淋巴瘤、脊髓轴肿瘤、脑干神经胶质瘤、垂体腺瘤或上述癌症中的一种或更多种的组合。在所述药物组合物的另一个实施方案中,所述异常细胞生长是良性增殖性疾病,包括但不限于牛皮癣、良性前列腺肥大或再狭窄。
另外的实施方案涉及治疗患者的癌症的方法,其包括给予所述患者与另一种抗肿瘤剂组合的有效治疗癌症的量的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物或水合物,所述抗肿瘤剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、嵌入性抗生素、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、抗体、细胞毒素、抗激素和抗雄激素。一些实施方案考虑了用于治疗异常细胞生长的药物组合物,其中该组合物包含有效治疗异常细胞生长的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物或水合物,以及另一种选自以下的抗肿瘤剂:有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、嵌入性抗生素、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、抗体、细胞毒素、抗激素和抗雄激素。
再有实施方案涉及治疗患者(包括人)中与血管生成相关的障碍的方法,其包括给予所述患者与一种或多种以上列出的抗肿瘤剂组合的有效治疗所述障碍的量的如上定义的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物或前药。这样的障碍包括癌性肿瘤,例如黑色素瘤;眼部障碍,如年龄相关性黄斑变性、眼假组织胞质菌病综合征和增生性糖尿病视网膜病变引起的视网膜新生血管形成;类风湿关节炎;骨质流失障碍,如骨质疏松症、佩吉特病、恶性肿瘤的体液性高钙血症、由骨转移肿瘤引起的高钙血症和糖皮质激素治疗诱导的骨质疏松症;冠状动脉再狭窄;以及某些微生物感染,包括与选自腺病毒、汉坦病毒、伯氏疏螺旋体、耶尔森菌属、百日咳博德特氏菌和A群链球菌的微生物病原体相关的感染。
一些实施方案涉及治疗患者的癌症的方法(和药物组合物),其包含与一定量的一种或多种选自抗血管生成剂、信号转导抑制剂(例如,抑制控制细胞生长、分化和存活的基本过程的调节分子在细胞内通讯的方式)和抗增殖剂的物质组合的一定量的本申请中所述的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物或水合物,它们的量一起有效用于治疗所述异常细胞生长。
抗血管生成剂,例如MMP-2(基质金属蛋白酶2)抑制剂、MMP-9(基质金属蛋白酶9)抑制剂和COX-II(环氧合酶II)抑制剂,可与本申请中所述的化合物联合用于本申请中所述的方法和药物组合物。
酪氨酸激酶抑制剂也可以与本申请中所述的化合物组合。
VEGF抑制剂,例如舒尼替尼和阿西替尼,也可以与本申请中所述的化合物组合。
ErbB2受体抑制剂可以与本申请中所述的化合物组合给药。各种其他化合物,如苯乙烯衍生物,也已被证明具有酪氨酸激酶抑制特性,并且一些酪氨酸激酶抑制剂已被确定为erbB2受体抑制剂。
表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
PI3K抑制剂,例如PI3Kα或PI3Kβ抑制剂,可以与本发明的化合物组合给药。
哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
c-Met抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
CDK抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
MEK抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
PARP抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
JAK抑制剂可以与本发明的化合物组合给药。
程序性死亡1蛋白(PD-1)的拮抗剂可以与本发明的化合物组合给药。
程序性死亡配体1(PD-L1)的拮抗剂可以与本发明的化合物组合给药。
可以与本申请中所述的化合物一起使用的其他抗增殖剂包括酶法呢基蛋白转移酶的抑制剂和受体酪氨酸激酶PDGFr的抑制剂。
本申请中所述的化合物还可以与可用于治疗异常细胞生长或癌症的其他药剂一起使用,所述药剂包括但不限于能够增强抗肿瘤免疫反应的药剂,例如CTLA4(细胞毒性淋巴细胞抗原4)抗体和能够阻断CTLA4的其他药剂;以及抗增殖剂,例如其他法呢基蛋白转移酶抑制剂,例如法呢基蛋白转移酶。
本申请中所述的化合物可以作为单独疗法应用或可以涉及一种或多种其他抗肿瘤物质,例如选自例如有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、嵌入性抗生素、酶和抗激素的那些。
本申请中所述的化合物可以单独使用或与多种抗癌剂或支持性护理剂中的一种或多种组合使用。例如,本申请中所述的化合物可以与细胞毒剂一起使用。一些实施方案还考虑将本申请中所述的化合物与激素疗法一起使用。此外,一些实施方案提供单独的或与一种或多种支持性护理产品组合的本申请中所述的化合物,所述支持性护理产品例如是选自非格司亭(Neupogen)、昂丹司琼(Zofran)、法安明(Fragmin)、普罗克瑞(Procrit)、帕洛诺司琼(Aloxi)、阿瑞匹坦(Emend)或其组合的产品。这样的联合治疗可以通过治疗的各个组分的同时、顺序或分开给药来实现。
本申请中所述的化合物可以与抗肿瘤剂、烷化剂、抗代谢物、抗生素、植物来源的抗肿瘤剂、喜树碱衍生物、酪氨酸激酶抑制剂、抗体、干扰素和/或生物反应调节剂一起使用。在这方面,以下是可以与本申请中所述的化合物一起使用的辅助药剂的实例的非限制性列表。
一些实施方案还涉及包含与药学上可接受的辅助剂、稀释剂或载体结合的如上文所定义的式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂化物的药物组合物。
另外的实施方案涉及药物组合物,其包括混合如上文所定义的式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂化物,以及药学上可接受的辅助剂、稀释剂或载体。
对于上述治疗用途,给药剂量当然会随所采用的化合物、给药方式、期望的治疗和指定的障碍而变化。式(I)、(Ia)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)的化合物或其药学上可接受的盐的日剂量可以在1毫克至1克;1毫克至250毫克;1毫克至100毫克;1毫克至50毫克;1毫克至25毫克;以及1毫克至10毫克的范围内。
本发明的实施方案还包括持续释放组合物。
本申请中所述的化合物(下文称为“活性化合物”)的给药可以通过能够将化合物递送到作用部位的任何方法来实现。这些方法包括口服途径、十二指肠内途径、肠胃外注射(包括静脉内、皮下、肌内、血管内或输注)、局部和直肠给药。
活性化合物可以作为单一疗法应用或可以包括一种或多种其他抗肿瘤物质,例如选自以下的那些:例如有丝分裂抑制剂,例如长春碱;烷化剂,例如顺铂、卡铂和环磷酰胺;抗代谢物,例如5-氟尿嘧啶、阿糖胞苷和羟基脲,或例如欧洲专利申请第239362号中公开的优选抗代谢物之一,例如N-(5-[N-(3,4-二氢-2-甲基-4-氧代喹唑啉-6-基甲基)-N-甲基氨基]-2-噻吩甲酰基)-L-谷氨酸;生长因子抑制剂;细胞周期抑制剂;嵌入性抗生素,例如阿霉素和博来霉素;酶,例如干扰素;以及抗激素,例如抗雌激素如
Figure BDA0003504892550000361
(他莫昔芬),或例如抗雄激素如
Figure BDA0003504892550000362
(4'-氰基-3-(4-氟苯基磺酰基)-2-羟基-2-甲基-3'-(三氟甲基)丙酰苯胺)。这样的联合治疗可以通过治疗的各个组分的同时、顺序或分开给药来实现。
例如,药物组合物可以是例如合适的形式,以作为片剂、胶囊、丸剂、散剂、缓释制剂、溶液、混悬剂用于口服给药,作为无菌溶液、混悬剂或乳剂用于肠胃外注射,作为软膏或乳膏用于局部给药,或作为栓剂用于直肠给药。药物组合物可以是适合单次给予精确剂量的单位剂型。药物组合物将包含常规的药物载体或赋形剂和作为活性成分的本申请中所述的化合物。此外,它可以包含其他药物或药学药剂、载体、辅助剂等。
示例性的肠胃外给药形式包括活性化合物在无菌水溶液中的溶液或悬浮液,例如丙二醇或葡萄糖水溶液。如果需要,可以适当地缓冲这样的剂型。
合适的药物载体包括惰性稀释剂或填充剂、水和各种有机溶剂。如果需要,药物组合物可以包含额外的成分,例如调味剂、粘合剂、赋形剂等。因此,对于口服给药,含有各种赋形剂如柠檬酸的片剂可以与各种崩解剂如淀粉、藻酸和某些复合硅酸盐以及粘合剂如蔗糖、明胶和阿拉伯胶一起使用。此外,润滑剂如硬脂酸镁、十二烷基硫酸钠和滑石粉通常可用于制片目的。类似类型的固体组合物也可以用于软和硬填充明胶胶囊。因此,优选的材料包括乳糖(lactose)或乳糖(milk sugar)和高分子量聚乙二醇。当需要水性混悬剂或酏剂用于口服给药时,其中的活性化合物可以与以下组合:各种甜味剂或调味剂,色素或染料,乳化剂或助悬剂(如果需要),以及稀释剂如水、乙醇、丙二醇、甘油,或其组合。
以下提供的实施例和制备进一步说明和例示本申请中所述的化合物和制备这样的化合物的方法。本申请中描述的实施方案的范围不以任何方式受到以下实施例和制备的限制。在以下实施例中,除非另有说明,否则具有单一手性中心的分子以外消旋混合物的形式存在。除非另有说明,否则具有两个或更多个手性中心的那些分子以非对映异构体的外消旋混合物的形式存在。单一对映异构体/非对映异构体可以通过本领域技术人员已知的方法获得。
在显示的实施例中,由于在基于HPLC的色谱法纯化过程中的流动相添加剂,偶尔会分离出盐的形式。在这些情况下,在没有进一步处理的情况下分离和测试诸如甲酸盐、三氟乙酸盐和乙酸盐的盐。将认识到,本领域普通技术人员将能够通过标准方法(例如使用离子交换柱,或使用温和的碱水溶液进行简单的碱性萃取)来实现游离碱形式。
一般而言,本申请中所述的化合物可通过化学领域中已知的方法,特别是根据本申请中所包含的描述进行制备。提供本申请中所述化合物的某些制备方法作为实施方案的另外的特征,并在下文提供的反应方案和实验部分中进行说明。
实施例
如本申请中所述,提供以下实施例仅以说明本发明,而无意限制本发明的范围。
通用实验细节
除非另有说明,否则适用以下概括。在Bruker Ultrashield Plus(400MHz)或Bruker AVANCE III(400MHz)上记录1H NMR光谱。由以下缩写指定信号的多重性:s,单峰;d,双重峰;t,三重峰;q,四重峰;p,五重峰;sept,七重峰;dd,双重双峰;dt,双重三峰;tt,三重三峰;br,宽峰;m,多重峰。所有观察到的耦合常数J均以赫兹(Hz)报告。可交换的质子不总是能观察到。使用Agilent 6100系列单四级杆、Agilent 1260Infinity系列UPLC/MS、Agilent 1200(LCMS-A)、Waters 2695alliance、Agilent 6120单四级杆或质量定向型HPLC-MS生成LCMS数据。氯同位素报告为35Cl,溴同位素报告为79Br或81Br或79Br/81Br二者。
下文提供了代表性LCMS方法:
仪器:Agilent 6100系列单四级杆LC/MS,Agilent 1200系列HPLC,泵:1200系列G1311A四元泵,自动进样器:1200系列G1329A恒温自动进样器,检测器:1200系列G1314B可变波长检测器
LC条件:反相HPLC分析,柱:Luna C8(2)5μm 50×4.6mm
Figure BDA0003504892550000381
Figure BDA0003504892550000382
柱温:30℃,进样体积:5μL,溶剂A:水0.1%甲酸,溶剂B:MeCN 0.1%甲酸,梯度:在10min内5-100%溶剂B,检测:254nm或214nm
MS条件:离子源:四极,离子模式:多模式-ES,干燥气体温度:300℃,汽化器温度:200℃,毛细管电压(V):2000(正),毛细管电压(V):4000(负),扫描范围:100-1000,步长:0.1秒,获取时间:10分钟
LCMS方法A(LCMS-A):LC型号:Agilent 1200,泵类型:二元泵,检测器类型:DAD,MS型号:Agilent G6110A四极杆,LC条件:柱:Xbridge-C18,2.5μm,2.1×30mm,柱温:30℃,获取波长:214nm,254nm,流动相:A:0.07%HCOOH水溶液,B:MeOH;MS条件:MS:离子源:ES+(或ES-),MS范围:50-900m/z,碎裂电压:60,干燥气体流速:10L/min,雾化器压力:35psi,干燥气体温度:350℃,Vcap:3.5kV
梯度表:
流速(mL/min) T(min) A(%) B(%)
0.5 0.0 70 30
0.5 0.2 70 30
0.5 1.8 5 95
0.5 2.4 5 95
0.5 2.6 70 30
0.5 3.5 70 30
样品制备:
将样品溶解于甲醇中,浓度约0.11-1mg/mL,然后经0.22μm注射器式过滤器过滤。(进样体积:1-10μL)
通用方法:
除非另有说明,否则方案I至VI中的变量具有与本申请中所定义的相同含义。
方案I:
Figure BDA0003504892550000401
如方案I中所例示,可以用类型II的化合物在有效的碱(例如Cs2CO3)的存在下在适当的溶剂(例如MeCN)中处理类型I的化合物,以提供类型III的化合物。可以通过用N-羟基乙酰胺在有效的碱(例如K2CO3或1,1,3,3-四甲基胍)的存在下在适当的溶剂混合物(例如DMF/H2O)中进行处理,使类型III的化合物转化为类型IV的化合物。可以在纯净的有效的碱(例如吡啶、NaH或NaOtPn)存在下或在适当溶剂(例如THF或DMF)中用类型V的化合物处理类型IV的化合物,以提供式(A)的化合物。在一些情况下,类型II、III和IV或式(A)的化合物可以含有保护基团,其可以通过合成顺序中的额外步骤使用本领域已知的条件添加或去除(有机合成中的保护基团(Protective Groups in Organic Synthesis),A.Wiley-Interscience Publication,1981或保护基团(Protecting Groups),10Georg ThiemeVerlag,1994)。可以通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R2a、R3、R4、R5、R6、R7和R8如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
方案II:
Figure BDA0003504892550000411
如方案II中所例示,可以通过用有效的碱(例如Cs2CO3)在适当的溶剂(例如CD3OD)中进行处理,使类型VI的化合物氘代,以提供类型VII的化合物。可以通过用N-羟基乙酰胺在有效的碱(例如1,1,3,3-四甲基胍)的存在下在适当的溶剂混合物(例如MeCN/D2O)中进行处理,使类型VII的化合物转化为类型VIII的化合物。可以用类型V的化合物在纯净的有效的碱(例如吡啶)存在下处理类型VIII的化合物,以提供式(B)的化合物。可以通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R3、R4、R5、R6和R7如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
方案III:
Figure BDA0003504892550000421
如方案III中所例示,可以通过用1-(甲磺酰基)-1H-吡唑在有效的碱(例如Cs2CO3)的存在下在适当溶剂(例如MeCN)中进行处理,使类型IX的化合物转化为类型X的化合物。可以用类型V的化合物在纯净的有效的碱(例如吡啶)的存在下处理类型X的化合物,以提供式(C)的化合物。可以通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R3、R4、R5、R6和R7如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
方案IV:
Figure BDA0003504892550000431
如方案IV中所例示,可以通过用1H-吡唑在有效的碱(例如Cs2CO3)的存在下在适当的溶剂(例如MeCN)中进行处理,使具有适当的离去基(例如-Br或-SO2CH3)的类型XI的化合物转化为类型VI的化合物。可以通过用N-羟基乙酰胺在有效的碱(例如1,1,3,3-四甲基胍)的存在下在适当的溶剂混合物(例如DMF/H2O)中进行处理,使类型VI的化合物转化为类型X的化合物。可以用类型V的化合物在纯净的适当的碱(例如吡啶)的存在下处理类型X的化合物,以提供式(C)的化合物。可通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R3、R4、R5、R6和R7如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
方案V
Figure BDA0003504892550000441
如方案V中所例示,可通过用适当的任选地取代的1H-吡唑在有效的碱(例如Cs2CO3)的存在下在适当的溶剂(例如MeCN)中进行处理,使类型XII的化合物转化为类型XIII的化合物。类型XIII的化合物可以在Suzuki交叉偶联条件下,在有效的催化剂(例如甲烷磺酸基(三叔丁基膦基)(2"氨基-1,1-联苯基-2-基)钯(II))的存在下在适当的溶剂混合物(例如PhMe/H2O)中转化为类型XIV的化合物。可以通过用N-羟基乙酰胺在有效的碱(例如1,1,3,3-四甲基胍)的存在下在适当的溶剂混合物(例如DMF/H2O)中进行处理,使类型XIV的化合物转化为类型XV的化合物。可以用类型V的化合物在纯净的适当的碱(例如吡啶)的存在下处理类型XV的化合物,以提供式(D)的化合物。可以通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R2a、R4、R5、R6及R7如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
方案VI:
Figure BDA0003504892550000451
如方案VI中所例示,可以通过用(3,5-二甲氧基苯基)甲醇在Mitsunobu条件下(PPh3,DIAD)在适当的溶剂(例如2-Me-THF)中进行处理,使类型XVI的化合物转化为类型XVII的化合物。类型XVII的化合物可以在Suzuki交叉偶联条件下,在有效的催化剂/配体组合(例如Pd(OAc)2/X-Phos)的存在下在适当溶剂(例如CPME/H2O)中转化为类型XVIII的化合物。可以通过用有效的酸(例如TFA)在适当的溶剂(例如DCM)中进行处理,使类型XVII的化合物转化为式(C)的化合物。可以通过标准技术,例如柱色谱、结晶或反相SFC或HPLC纯化每个步骤的化合物。变量R3、R4、R5、R6及R7如本申请中的实施方案、方案、实施例和权利要求中所定义。
中间体的合成:
根据方案1制备2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)。
Figure BDA0003504892550000461
方案1:
Figure BDA0003504892550000462
步骤1:4-溴-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(1b)的合成。
在0℃下向4-溴-2,6-二氟苯甲腈(1a)(40.0g,183.5mmol)在THF(210.0mL)和MeOH(30.0mL)的溶液中分批加入NaOMe(11.9g,220mmol)。混合物在室温下搅拌16h。TLC分析(1:4 EtOAc/石油醚)显示原料耗尽。将混合物转移至分液漏斗,并用H2O(150mL)洗涤。水层用EtOAc(300mL)萃取。合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。粗产物通过急骤色谱法纯化(330g SiO2,10%EtOAc/石油醚)得到4-溴-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(1b)(15.7g,收率52%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.49(dd,J=1.5,8.8Hz,1H),7.41(s,1H),3.98(s,3H)。
步骤2:4-氰基-3-氟-5-甲氧基苯甲酸甲酯(1c)的合成。
将4-溴-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(1b)(15.7g,68.2mmol)、TEA(20.7g,205mmol)、dppp(2.8g,6.8mmol)和Pd(OAc)2(766mg,3.4mmol)的MeOH(150mL)溶液在80℃下在CO气氛下搅拌16h。TLC分析(1:4EtOAc/石油醚)显示原料耗尽。将反应浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(120g SiO2,1:4EtOAc/石油醚)得到4-氰基-3-氟-5-甲氧基苯甲酸甲酯(1c)(10.0g,收率70%),为黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.53-7.47(m,2H),4.03(s,3H),3.91(s,3H)。
步骤3:2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)的合成。
在0℃下向4-氰基-3-氟-5-甲氧基苯甲酸甲酯(1c)(9.5g,45.4mmol)的THF(50mL)溶液中分批加入LiBH4(2.0g,90.8mmol)。将混合物在70℃下搅拌2h。LCMS分析显示原料耗尽,并形成期望的产物物质。通过缓慢加入H2O(100mL)淬灭反应。将混合物转移到分液漏斗,并用EtOAc(2x150 mL)萃取。合并的有机萃取物用盐水和饱和NaHCO3水溶液洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩得到2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)(7.9g,收率96%),为棕色油状物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.05(s,1H),6.98(d,J=10.0Hz,1H),4.58(d,J=5.7Hz,2H),3.95(s,3H)。
根据用于合成2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表1:
Figure BDA0003504892550000471
Figure BDA0003504892550000481
根据方案2替代性制备2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)。
Figure BDA0003504892550000482
方案2:
Figure BDA0003504892550000483
步骤1:2,6-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈(2b)的合成。
将2,6-二氟-4-甲酰基苯甲腈(2a)(21.5g,129mmol)的绝对EtOH(400mL)溶液在冰水浴中冷却至约3℃(内部)。加入固体NaBH4(5x1 g颗粒,5.0g,130mmol),导致轻微气体逸出。在冰水浴冷却下将混合物搅拌2h,然后在同样温度下通过滴加去离子H2O(100mL,5min内)淬灭。缓慢加入HCl水溶液(2.0N,50mL,30min内),维持温度<10℃(内部)。真空浓缩溶液以去除EtOH。将水性残留物转移至分液漏斗,留下粘性白色固体。水相用EtOAc(2x)萃取。合并的有机萃取物用盐水洗涤(2x),用MgSO4干燥,过滤,并浓缩。将粗材料与庚烷一起研磨,过滤,并真空干燥得到2,6-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈(2b)(21.3g,98%),为自由流动的白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.34(d,J=9.3Hz,2H),5.69(br.s,1H),4.60(br.s,2H)。
步骤2:2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)的合成。
用干冰/乙腈浴将2,6-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈(2b)(21.3g,126mmol)的无水MeOH(400mL)溶液冷却至-40℃(内部)。通过滴液漏斗滴加,在10min内加入NaOMe溶液(5.0M的MeOH溶液,100mL,500mmol)。完成加入后,将冷却浴移除。使混合物自然升温至室温,再搅拌8h。将反应混合物冷却至0℃(内部),滴加HCl(2.0N,200mL),得到pH约5-6的溶液。真空浓缩混合物以去除MeOH。用EtOAc(3x)萃取水溶液。合并的有机萃取物用盐水(2x)洗涤,用MgSO4干燥并过滤。在旋转蒸发仪上将混合物浓缩至约150mL(浴温约35℃),使得到的浆液冷却至室温。通过过滤收集固体。用庚烷(2x)洗涤滤饼。进一步浓缩滤液和庚烷洗液,得到第二批固体,通过过滤收集该固体。真空干燥合并的固体,得到2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)(18.6g,82%),为浅黄色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.82(s,1H),6.79(d,J=9.2Hz,1H),4.76(s,2H),3.97(s,3H)。
根据用于合成2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表2:
Figure BDA0003504892550000491
根据方案3制备2-氟-4-(羟甲基)苯甲腈(Int-06)。
Figure BDA0003504892550000492
方案3:
Figure BDA0003504892550000501
将2-氟-4-甲酰基苯甲腈(3a)(5.0g,33.5mmol)的EtOH(100mL)溶液冷却至0℃。加入NaBH4(1.3g,33mmol),并将反应在0℃下搅拌2h。通过滴加H2O(25mL,5min内)淬灭混合物。加入稀HCl(2N,13mL),维持内温<10℃。真空浓缩溶液以去除EtOH。用EtOAc(2x)萃取水性混合物。合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物与庚烷一起研磨并干燥,得到2-氟-4-(羟甲基)苯甲腈(Int-06)(4.2g,收率82%),为黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.87(dd,J=7.9,6.8Hz,1H),7.42(dd,J=10.6,1.3Hz,1H),7.35(dd,J=8.0,1.3Hz,1H),5.55(t,J=5.7Hz,1H),4.60(d,J=5.7Hz,2H)。
根据方案4制备5-溴-4-(溴甲基)-2-氟苯甲腈(Int-07)。
Figure BDA0003504892550000502
方案4:
Figure BDA0003504892550000503
向5-溴-2-氟-4-甲基苯甲腈(4a)(1.01g,4.72mmol)的MeCN(10.0mL)溶液中加入1,3-二溴-5,5-二甲基咪唑烷-2,4-二酮(701mg,2.45mmol)和AIBN(101mg,0.613mmol)。将混合物在80℃下搅拌过夜,然后浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(80g SiO2,0-30%EtOAc/庚烷)得到(Int-07)(847mg,收率84%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.84(d,J=6.0Hz,1H),7.38(d,J=8.9Hz,1H),4.54(s,2H)。
根据用于合成5-溴-4-(溴甲基)-2-氟苯甲腈(Int-07)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表3:
Figure BDA0003504892550000511
根据方案5制备甲磺酸(4-氰基-2,5-二氟苯基)甲酯(Int-09)。
Figure BDA0003504892550000512
方案5:
Figure BDA0003504892550000513
步骤1:2,5-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈的合成(5b)
将2,5-二氟-4-甲酰基苯甲腈(5a)(250mg,1.5mmol)的EtOH(5.0mL)溶液用冰浴冷却至0℃,然后加入NaBH4(60mg,1.6mmol)。将混合物在0℃下搅拌30min。在相同温度下,通过加入H2O(0.5mL)和HCl(6.0N,0.32mL)淬灭反应。用EtOAc萃取混合物。有机层用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到2,5-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈(5b)(202mg,收率80%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.44(dd,J=5.62,8.80Hz,1H),7.30(dd,J=4.89,8.56Hz,1H),4.85(s,2H)。
步骤2:甲磺酸(4-氰基-2,5-二氟苯基)甲酯(Int-09)的合成
将2,5-二氟-4-(羟甲基)苯甲腈(5b)(915mg,5.41mmol)的DCM(25.0mL)溶液冷却至0℃,然后加入TEA(871mg,5.84mmol)和MsCl(649g,5.66mmol)。2h后,将反应直接负载到SiO2上,并通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,0-75%EtOAc/庚烷)得到甲磺酸(4-氰基-2,5-二氟苯基)甲酯(Int-09)(1.15g,收率86%),为澄清油状物,其在静置时固化。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.44-7.39(m,2H),5.34-5.32(m,2H),3.14(s,3H)。
根据用于合成甲磺酸(4-氰基-2,5-二氟苯基)甲酯(Int-09)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表4:
Figure BDA0003504892550000521
根据方案6制备2-氟-4-(羟甲基)-5-甲基苯甲腈(Int-11).
Figure BDA0003504892550000522
方案6:
Figure BDA0003504892550000531
步骤1:4-氰基-5-氟-2-甲基苯甲酸甲酯(6b)的合成
在100mL不锈钢容器中向4-溴-2-氟-5-甲基苯甲腈(6a)(1.0g,4.67mmol)和TEA(1.7g,17mmol)的MeOH(30.0mL)溶液中加入PdCl2(dppf)(247mg,0.327mmol)。将容器用CO加压至4巴,在55℃下搅拌20h。将反应过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,0-55%EtOAc/庚烷)得到4-氰基-5-氟-2-甲基苯甲酸甲酯(6b)(716mg,收率79%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.74(d,J=9.4Hz,1H),7.52(d,J=6.1Hz,1H),3.95(s,3H),2.59(s,3H)。
步骤2:2-氟-4-(羟甲基)-5-甲基苯甲腈(Int-11)的合成
向4-氰基-5-氟-2-甲基苯甲酸甲酯(6b)(710mg,3.68mmol)的THF(18.4mL)溶液中加入LiBH4(120mg,5.51mmol),并将混合物在室温下搅拌过夜。反应用H2O(3mL)淬灭。将混合物搅拌30min,然后用冰浴冷却。用HCl(6.0N,0.60mL)小心淬灭混合物。真空去除THF,残留物分配于EtOAc和1:1H2O/饱和NaHCO3水溶液之间。有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(24g SiO2,0-80%EtOAc/庚烷)得到2-氟-4-(羟甲基)-5-甲基苯甲腈(Int-11)(495mg,收率82%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.44-7.35(m,2H),4.74(d,J=5.5Hz,2H),2.26(s,3H),1.84(t,J=5.5Hz,1H);19F NMR(376MHz,CDCl3)δ-110.29(dd,J=5.7,10.3Hz)。
根据方案7制备(3-氨基-5-氟-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-6-基)甲醇(Int-12)。
Figure BDA0003504892550000541
方案7:
Figure BDA0003504892550000542
步骤1:(2,3,5-三氟苯基)甲醇(7b)的合成
在0℃下向2,3,5-三氟苯甲醛(7a)(1.8g,11mmol)的THF(30mL)溶液中分批加入NaBH4(468mg,12.4mmol)。将混合物在0℃下搅拌2h。LCMS分析显示原料耗尽。通过缓慢加入H2O(10mL)淬灭反应,并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,0-50%EtOAc/庚烷)得到(2,3,5-三氟苯基)甲醇(7b)(740mg,收率41%),为无色油状物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.10-6.96(m,1H),6.94-6.78(m,1H),4.81(d,J=5.9Hz,2H),1.91(t,J=6.1Hz,1H)。
步骤2:叔丁基(二甲基)[(2,3,5-三氟苯基)甲氧基]硅烷(7c)的合成
向(2,3,5-三氟苯基)甲醇(7b)(740mg,4.56mmol)的DCM(20mL)溶液中加入DMAP(27.9mg,0.228mmol)、TEA(639mg,6.85mmol)和TBSCl(894mg,5.93mmol)的DCM(5mL)溶液。将混合物在环境温度下搅拌18h。LCMS显示原料耗尽。将混合物浓缩至干,残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,0-10%EtOAc/石油醚)得到叔丁基(二甲基)[(2,3,5-三氟苯基)甲氧基]硅烷(7c)(1.1g,收率87%),为无色油状物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.06-6.95(m,1H),6.87-6.70(m,1H),4.79(s,2H),0.95(s,9H),0.13(s,6H)。
步骤3:4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-2,3,6-三氟苯甲腈(7d)的合成
将LDA(在THF中0.07M,20.0mL,1.41mmol)的THF(20mL)溶液冷却至-70℃,然后用叔丁基(二甲基)[(2,3,5-三氟苯基)甲氧基]硅烷(7c)(300mg,1.09)的THF(5mL)溶液在5min内逐滴处理。将混合物在-70℃下搅拌2h,然后用对甲苯磺酰氰(216mg,1.19mmol)的THF(5mL)溶液在10min内逐滴处理。将混合物在-70℃下搅拌1h。通过加入饱和NH4Cl水溶液淬灭混合物,并分配于EtOAc(60mL)和H2O(60mL)之间。有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(SiO2,3:1-10:1EtOAc/石油醚)。合并的含有产物的级分通过制备HPLC用Agela DuraShell C18柱(150x25mm,粒度5μm)再纯化,用70-100%MeCN/H2O(+0.04%NH4OH,+10mM NH4HCO3)以25mL/min的流速洗脱,得到4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-2,3,6-三氟苯甲腈(7d)(150mg,收率46%),为黄色油状物。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.10-7.02(m,1H),4.69(s,2H),0.81(s,9H),0.00(s,6H)。
步骤4:4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-3,6-二氟-2-甲氧基苯甲腈(7e)的合成
在0℃下向4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-2,3,6-三氟苯甲腈(7d)(150mg,0.498mmol)的THF(20mL)溶液中加入NaOMe(71.7mg,0.398mmol)。将混合物在0℃下搅拌1h。用H2O淬灭混合物,并分配于EtOAc和H2O之间。有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-3,6-二氟-2-甲氧基苯甲腈(7e)粗品(150mg,收率96%),为黄色油状物,其无需进一步纯化即可使用。
步骤5:(3-氨基-5-氟-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-6-基)甲醇(Int-12)的合成
向4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-3,6-二氟-2-甲氧基苯甲腈(7e)粗品(150mg,0.479mmol)和N-羟基乙酰胺(108mg,1.33mmol)在DMF(10mL)和H2O(2mL)的溶液中加入K2CO3(397mg,2.87mmol)。将混合物在60℃下搅拌16h。将混合物过滤,将滤液浓缩至干。残留物通过制备HPLC用Agela DuraShell C18柱(150x25mm,粒度5μm)纯化,用5-35%MeCN/H2O H2O(+0.04%NH4OH,+10mM NH4HCO3)以25mL/min的流速洗脱,得到(3-氨基-5-氟-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-6-基)甲醇(Int-12)(25mg,两步总收率24%),为白色固体。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.12(d,J=4.3Hz,1H),6.03(s,2H),5.47(t,J=5.8Hz,1H),4.62(d,J=5.6Hz,2H),4.05(s,3H);m/z(ESI+)213.1(M+H)+.
根据方案8制备1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-13)。
Figure BDA0003504892550000561
方案8:
Figure BDA0003504892550000562
在0℃下向1H-吡唑(8a)(33.0g,485mmol)和TEA(73.6mg,727mmol)的DCM溶液中缓慢加入MsCl(73.9g,645mmol)。将混合物在0℃下搅拌10min,然后在室温下搅拌1h。TLC分析(1:1EtOAc/石油醚)显示原料耗尽。反应用饱和NH4Cl水溶液(200mL)稀释,并分离混合物。水层用DCM(200mL)萃取。合并的有机层用盐水(300mL)和饱和Na2CO3水溶液(300mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-13)(64g,收率90%),为浅黄色油状物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.04(d,J=2.6Hz,1H),7.86-7.79(m,1H),6.46(dd,J=1.6,2.7Hz,1H),3.33(s,3H)。
根据用于合成1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-13)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果指出,分离出区域异构体混合物而无需进一步分离。
表5:
Figure BDA0003504892550000571
根据方案9制备4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-17)。
Figure BDA0003504892550000572
方案9:
Figure BDA0003504892550000581
步骤1:4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑(9b)的合成
向(1H-吡唑-4-基)甲醇(9a)(500mg,5.1mmol)的DCM(10.0mL)溶液中加入TBSCl(845mg,5.6mmol)、TEA(774mg,7.7mmol)和DMAP(31.1mg,0.26mmol)。将溶液在室温下搅拌16h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。混合物用DCM(20mL)稀释,并依次用H2O(20mL)、饱和NaHCO3水溶液(20mL)和盐水(20mL)洗涤。有机相用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑(9b)(1.0g,收率92%),其无需进一步纯化即可使用。m/z(ESI+)212.8(M+H)+.
步骤2:4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-17)的合成。
向4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑(9b)(1.0g,4.7mmol)的DCM(15.0mL)溶液中加入TEA(619mg,6.1mmol)。用冰水浴将混合物冷却至0℃。滴加MsCl(3.8g,33.0mmol)。将混合物在0℃下搅拌2h,在室温下搅拌16h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。混合物用DCM(100mL)稀释,并依次用H2O(50mL)、饱和水溶液NaHCO3(50mL)和盐水(50mL)洗涤。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-17)(1.1g,收率80%),其无需进一步纯化即可使用。m/z(ESI+)291.1(M+H)+.
根据用于合成4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-17)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果指出,分离出区域异构体混合物而无需进一步分离。
表6:
Figure BDA0003504892550000591
根据方案10制备2,4,6-三甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-19)。
Figure BDA0003504892550000592
方案10:
Figure BDA0003504892550000593
将氯磺酸(15.0mL)冷却至-10℃,并一次性加入1,3,5-三甲氧基苯(10a)(1.4g,8.4mmol)。混合物在-10℃下搅拌15min。TLC分析(1:1EtOAc/石油醚)显示原料耗尽。通过小心倒到冰-水上来淬灭反应。用DCM(3x100 mL)萃取混合物。合并的有机萃取物用饱和NaHCO3水溶液(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(20gSiO2,0-50%EtOAc/石油醚)得到2,4,6-三甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-19)(1.8g,收率60%),为固体,其无需进一步纯化即可使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.12(s,2H),3.96(s,6H),3.89(s,3H)。
根据用于合成2,4,6-三甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-19)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表7:
Figure BDA0003504892550000601
根据方案11制备2-甲氧基-5-(三氟甲氧基)苯-1-磺酰氯(Int-21)。
Figure BDA0003504892550000602
方案11:
Figure BDA0003504892550000603
将氯磺酸(26.0mL)冷却至0℃,一次性加入1-甲氧基-4-(三氟甲氧基)苯(11a)(2.0g,10.4mmol)。将混合物在室温下搅拌18h。通过小心倒到冰-水上来淬灭反应。用EtOAc(2x60 mL)萃取混合物。合并的有机萃取物用饱和水溶液Na2CO3(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到2-甲氧基-5-(三氟甲氧基)苯-1-磺酰氯(Int-21)(2.6g,收率86%),为黄色油状物,其无需进一步纯化即可使用。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.85(d,J=2.8Hz,1H),7.56(dd,J=2.4,9.1Hz,1H),7.16(d,J=9.2Hz,1H),4.08(s,3H)。
根据方案12制备2-甲氧基-5,6,7,8-四氢萘-1-磺酰氯和3-甲氧基-
5,6,7,8-四氢萘-2-磺酰氯(Int-22)。
Figure BDA0003504892550000611
方案12:
Figure BDA0003504892550000612
将CHCl3(10.0mL)和氯磺酸(1.0mL)的混合物冷却至-10℃,并加入6-甲氧基-1,2,3,4-四氢萘(12a)(1.0g,6.1mmol)。将混合物在-10℃下搅拌15min。TLC分析(1:1EtOAc/石油醚)显示原料耗尽。通过小心倒到冰-水上来淬灭反应。用DCM(3x50mL)萃取混合物。合并的有机萃取物用饱和水溶液NaHCO3(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,0-50%EtOAc/石油醚)得到2-甲氧基-5,6,7,8-四氢萘-1-磺酰氯和3-甲氧基-5,6,7,8-四氢萘-2-磺酰氯(Int-22)(约1:1混合物,600mg,收率37%),为浅黄色胶状物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.65(s,1H),7.35(d,J=8.5Hz,1H),6.92(d,J=8.5Hz,1H),6.79(s,1H),4.01(s,6H),3.23(t,J=6.0Hz,2H),2.91-2.63(m,6H),1.88-1.69(m,8H)。
根据用于合成2-甲氧基-5,6,7,8-四氢萘-1-磺酰氯和3-甲氧基-5,6,7,8-四氢萘-2-磺酰氯(Int-22)的方法制备了下表中的中间体。以下中间体是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表8:
Figure BDA0003504892550000621
根据方案13制备4-环丙基-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-24)
Figure BDA0003504892550000622
方案13:
Figure BDA0003504892550000623
在冰水浴中冷却(13a)(1.0g,5.61mmol)(J.Org.Chem.2008,7481-7485)和TMEDA(717mg,6.17mmol)的石油醚(15.0mL)溶液,然后通过加料漏斗用n-BuLi(2.5M的己烷溶液,2.5mL,6.17mmol)逐滴处理,维持温度<5℃(内部)。将混合物在0℃下搅拌20min,然后用干冰/丙酮浴冷却至-70℃。缓慢加入预冷却的SO2(5.4g,84.2mmol)的Et2O(100mL)溶液(-65℃),维持温度<-60℃(内部)。将浅黄色反应混合物缓慢升温至10℃。通过过滤收集得到的固体,并用干燥Et2O洗涤。将滤饼悬浮在己烷(30mL)中,将混合物冷却至0℃。向冷的悬浮液中缓慢加入SOCl2(757mg,5.61mmol)的己烷(20mL)溶液,维持温度<3℃(内部)。将得到的混合物在0℃下搅拌18h。过滤溶液,并用冷的己烷(20mL)洗涤滤饼。将固体溶于EtOAc(50mL)中,并用H2O(50mL)洗涤。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到4-环丙基-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-24)(856mg,收率55%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.32(s,2H),3.97(s,6H),1.93(tt,J=5.0,8.3Hz,1H),1.18-1.11(m,2H),0.86-0.80(m,2H)。
根据方案14制备4-甲氧基-6-((4-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基)苯并[d]异噁唑-3-胺(Int-25)。
Figure BDA0003504892550000631
方案14:
Figure BDA0003504892550000632
步骤1:4-(溴甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(14b)的合成
向2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)(8.0g,44.2mmol)和PPh3(18.7g,71.2mmol)的乙腈(400mL)溶液中加入Br2(11.8g,73.8mmol),并将混合物在55℃下加热2h。加入水和过量的Na2SO3,并用EtOAc萃取混合物。合并的有机层用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物通过柱色谱法纯化(石油醚/EtOAc=10/1)得到标题化合物(9.7g,91%),为白色固体,其直接用于下一步。
步骤2:2-氟-6-甲氧基-4-((4-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基)苯甲腈(14c)的合成。
将4-(溴甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(14b)(100mg,0.41mmol)、4-甲基-1H-吡唑(40mg,0.49mmol)和K2CO3(113mg,0.82mmol)在DMF(5mL)中的混合物在60℃下加热过夜。混合物用水稀释,用EtOAc萃取,有机萃取物用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。用4-(溴甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(14b)(500mg,2.05mmol)将反应规模相应地放大,将两批合并,并通过柱色谱法纯化(DCM/MeOH=10/1)得到标题化合物(380mg,63%),为黄色固体。m/z 246.0[M+H]+.
步骤3:4-甲氧基-6-((4-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基)苯并[d]异噁唑-3-胺(Int-25)的合成
在0℃下向N-羟基乙酰胺(238mg,3.18mmol)的无水DMF(13mL)溶液中加入t-BuOK(357mg,3.18mmol),并将混合物搅拌30min。然后加入2-氟-6-甲氧基-4-((4-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基)苯甲腈(14c)(260mg,1.06mmol),将混合物升温至RT并搅拌过夜。加入水,并用EtOAc萃取混合物。合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱法纯化(DCM/MeOH=50/1)得到标题化合物(150mg,55%),为黄色固体。m/z 259.1[M+H]+.1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.37(s,1H),7.20(s,1H),6.76(s,1H),6.43(s,1H),5.31(s,2H),3.90(s,3H),2.07(s,3H)。
根据方案15制备2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)。
Figure BDA0003504892550000641
方案15:
Figure BDA0003504892550000642
在0℃下在N2下向1,3-二甲氧基苯(5.0g,36mmol)和TMEDA(4.6g,39.8mmol)的正己烷(100mL)溶液中滴加n-BuLi(2.5M己烷溶液,16.0mL,39.8mmol),同时保持内部反应温度低于5℃。将混合物在0℃下搅拌20min,然后冷却至-78℃,用SO2气鼓泡20min。然后将混合物缓慢升温至10℃,通过过滤收集得到的沉淀,并用干燥乙醚洗涤。将固体悬浮于正己烷(100mL)中,冷却至0℃,滴加SO2Cl2(4.9g,36mmol)的正己烷(20mL)溶液,同时保持内温低于3℃。然后将混合物在0℃下搅拌for 1h,通过过滤收集固体,用冷的正己烷洗涤。然后将固体分配于乙醚和水之间,分离各层,水层再用乙醚萃取。合并的有机萃取物用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到标题化合物(4.0g,47%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.54(t,J=8.4Hz,1H),6.66(d,J=8.4Hz,2H),3.97(s,6H)。
根据方法AA制备N-(6-溴-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-27)。
Figure BDA0003504892550000651
方法AA:
Figure BDA0003504892550000652
在-78℃在N2下向胺(0.5mmol,1.0当量)的无水THF(10mL)的溶液中滴加LiHMDS(1M的THF溶液,3当量),将混合物在-78℃下搅拌30min。然后滴加磺酰氯(1.5当量)的无水THF(2.0mL)溶液,将混合物升温至RT并搅拌过夜。加入水,并用EtOAc萃取混合物。合并的有机萃取物用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱或制备TLC纯化,得到标题化合物。上述条件的变化已在下表中注明。
表9:
Figure BDA0003504892550000661
根据方案16制备7-溴-5-甲基苯并[d]异噁唑-3-胺(Int-28)。
Figure BDA0003504892550000662
方案16:
Figure BDA0003504892550000663
步骤1:3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酸(16a)的合成
在-78℃下在N2下向2-溴-1-氟-4-甲基苯(10.0g,53mmol)和二异丙基胺(5.9g,58mmol)的无水THF(200mL)溶液中滴加n-BuLi(2.5M的己烷溶液,25.6mL,64.0mmol),并将混合物在-78℃下搅拌1h。加入过量的固体CO2(干冰),并继续在-78℃下搅拌3h。混合物用水(500mL)稀释,并用EtOAc(500mL)萃取。有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到标题化合物(12.3g,100%),为棕色固体,其不经进一步纯化直接用于下一步。m/z232.8[M+H]+.
步骤2:3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰氯(16b)的合成
在RT下在N2下向3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酸(16a)(12.3g,53mmol)和DMF(4滴)的DCM(100mL)溶液中滴加草酰氯(13.0g,106mmol),并将混合物搅拌2h。将混合物减压浓缩得到标题化合物(14.0g,100%),为棕色固体,其不经进一步纯化直接用于下一步。
步骤3:3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰胺(16c)的合成
将3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰氯(16b)(14.0g,53mmol)的DCM(100mL)溶液滴加到30%氢氧化铵水溶液(100mL)中,并将混合物搅拌2h。混合物用EtOAc(200mL)稀释,用水(200mL×3)、盐水洗涤,有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到标题化合物(12.0g,97%),为棕色固体,其不经进一步纯化直接用于下一步。m/z 231.9[M+H]+.
步骤4:3-溴-2-氟-5-甲基苯甲腈(16d)的合成
3-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰胺(16c)(10.0g,43.0mmol)和氯化亚砜(15.4g,129mmol)的DMF(100mL)溶液在100℃下加热3h。混合物用EtOAc(200mL)稀释,用水(400mL×5)、盐水洗涤,有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到标题化合物(5.0g,54%),为棕色固体,其不经进一步纯化直接用于下一步。m/z 213.9[M+H]+.
步骤5:7-溴-5-甲基苯并[d]异噁唑-3-胺(Int-28)的合成
将N-羟基乙酰胺(5.27g,70.2mmol)和t-BuOK(7.88g,70.2mmol)在无水DMF(200mL)中的悬浮液在0℃下搅拌1h。然后加入3-溴-2-氟-5-甲基苯甲腈(16d)(5.0g,23.4mmol),将混合物升温至RT并搅拌过夜。混合物用EtOAc(300mL)稀释,用水(600mL×4)、盐水洗涤,有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱法纯化(石油醚/EtOAc=10/1)得到标题化合物(2.8g,52%),为黄色固体。m/z 226.9[M+H]+.
根据方法AB制备N-(7-溴-5-甲基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-29)。
Figure BDA0003504892550000681
方法AB:
Figure BDA0003504892550000682
向胺(0.2mmol,1.0当量)的吡啶(2mL)溶液中加入磺酰氯(1.5当量),将混合物在120℃下在微波辐射下加热2h。将混合物分配于水和EtOAc之间,分离各层,有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用制备TLC纯化得到标题化合物。上述条件的变化已在下表中注明。
表10:
Figure BDA0003504892550000683
Figure BDA0003504892550000691
磺酰胺形成方法:
Figure BDA0003504892550000692
方法A:
向类型IV的化合物(1.0当量)的吡啶(c=0.1M)溶液中加入类型V的化合物(1.2当量)。将混合物在80和120℃之间的温度下搅拌加热约3-16h。将反应冷却至室温,浓缩至干,通过本领域技术人员已知的标准方法纯化得到式(A)的化合物。
方法B:
在0℃下向NaH(60%的矿物油分散物,3.0当量)的THF(c=0.15M)悬浮液中滴加类型IV的化合物(1.0当量)在1:1THF/DMF(c=0.15M)或THF(c=0.15M)中的溶液。在相同温度下加入类型V的化合物(1.3当量)在2:1THF/DMF(c=0.15M)或THF(c=0.15M)中的溶液。将反应混合物在60℃下搅拌16h。将反应冷却至室温,浓缩至干,并通过本领域技术人员已知的标准方法纯化得到式(A)的化合物。
方法C:
向类型IV的化合物(1.0当量)的THF(c=0.3M)溶液中加入NaOtPn(40%的PhMe溶液,1.0当量)和类型V的化合物(1.0当量)的THF(c=0.3M)溶液。将混合物在60℃下搅拌16h。将反应冷却至室温,浓缩至干,并通过本领域技术人员已知的标准方法纯化得到式(A)的化合物。
方法D:
向类型IV的化合物(1.0当量)和类型V的化合物(1.2当量)的ACN(c=0.2M)溶液中加入0.05M DMSO的ACN溶液(1.0mL/mmol类型IV的化合物,0.05当量DMSO),接着加入3,5-二甲基吡啶(3.0当量)。将混合物在室温下搅拌16小时,浓缩至干,并通过本领域技术人员已知的标准方法纯化得到式(A)的化合物。
实施例的制备
实施例01:根据方案A制备5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550000701
方案A:
Figure BDA0003504892550000711
步骤1:2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(A-1)的合成。
向2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)(7.0g,38.6mmol)和1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-13)(6.2g,42.5mmol)的MeCN(150mL)溶液中加入Cs2CO3(18.9g,58mmol)。将混合物在70℃下搅拌2h。LCMS分析显示原料耗尽。过滤反应,并将滤液浓缩至干。粗残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,1:1EtOAc/石油醚)得到2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(A-1)(7.0g,收率78%),为黄色固体。m/z(ESI+)231.8(M+H)+.
步骤2:4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)的合成。
向2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(A-1)(7.0g,30.3mmol)和N-羟基乙酰胺(6.8g,90.8mmol)在DMF(200mL)和H2O(30mL)中的溶液中加入K2CO3(25.1g,182mmol)。将混合物在60℃下搅拌16h。TLC分析(EtOAc)显示原料耗尽。将反应混合物浓缩以去除大部分DMF,然后用H2O(100mL)稀释。通过过滤收集得到的沉淀。用H2O(3x20mL)洗涤滤饼并真空干燥,得到4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(6.0g)。上述滤液用EtOAc(2x30mL)萃取。合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(SiO2,EtOAc)得到另外的一批4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(0.5g)。合并两批产物并真空干燥,得到4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(6.5g,收率88%),为黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.88(d,J=2.0Hz,1H),7.51(d,J=1.3Hz,1H),6.70(s,1H),6.63(s,1H),6.31(t,J=2.0Hz,1H),6.08-5.78(m,2H),5.52-5.31(m,2H),3.93-3.73(m,3H)。m/z(ESI+)244.8(M+H)+.
步骤3:根据磺酰胺形成方法A合成5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例01)。
向4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(1.23g,5.032mmol)的吡啶(2.5mL)溶液中加入5-乙基-2-甲氧基苯-1-磺酰氯(1.54g,6.54mmol)。将反应在80℃下搅拌3.5h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。反应在冷却时固化。用最少量的MeOH将固体溶解于DCM和AcOH(1.4mL)中。混合物通过急骤色谱法纯化(40gSiO2,10-70%MeOAc/庚烷)。收集纯的含有标题化合物的级分。不纯的级分通过急骤色谱再纯化(40gSiO2,10-70%MeOAc/庚烷)。将纯的级分与之前分离的纯的级分合并,浓缩得到白色固体。将固体悬浮于MeOAc,回流1h,并冷却至室温。通过过滤收集得到的固体,真空干燥得到5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例01)(1.4g,收率63%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.98(s,1H),7.87(d,J=2.0Hz,1H),7.62(d,J=2.3Hz,1H),7.49(d,J=1.5Hz,1H),7.46(dd,J=2.0,8.5Hz,1H),7.10(d,J=8.5Hz,1H),6.83(s,1H),6.74(s,1H),6.30(t,J=2.0Hz,1H),5.43(s,2H),3.81(s,3H),3.74(s,3H),2.59(q,J=7.5Hz,2H),1.13(t,J=7.5Hz,3H);m/z(ESI+)443.1(M+H)+.
实施例02:根据方案B制备2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550000731
实施例03:根据方案B制备2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550000732
方案B:
Figure BDA0003504892550000741
步骤1:2-氟-6-甲氧基-4-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-1)和2-氟-6-甲氧基-4-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-2)的合成
向1-(甲磺酰基)-3-甲基-1H-吡唑和1-(甲磺酰基)-5-甲基-1H-吡唑(Int-15)在MeCN(25mL)中的混合物(约1:1)中加入2-氟-4-(羟甲基)-6-甲氧基苯甲腈(Int-01)(1.0g,5.5mmol)和Cs2CO3(2.3g,7.2mmol)。将混合物在70℃下搅拌1h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。将反应冷却至室温,并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(20gSiO2,100%EtOAc)得到2-氟-6-甲氧基-4-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-1)和2-氟-6-甲氧基-4-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-2)的混合物(约1:1)(1.13g,收率84%),为黄色胶状物。m/z(ESI+)245.8(M+H)+.
步骤2:4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-3)和4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-4)的合成
向2-氟-6-甲氧基-4-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-1)和2-氟-6-甲氧基-4-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(B-2)(1.13g,4.73mmol)在DMF(20mL)和H2O(3mL)中的混合物(约1:1)中加入N-羟基乙酰胺(1.07g,14.2mmol)和K2CO3(3.9g,28.4mmol)。将混合物在60℃下搅拌16h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。将混合物浓缩至干。将残留物溶于EtOAc(30mL),用H2O(30mL)洗涤。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(20g SiO2,100%EtOAc)得到4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-3)和4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-4)的混合物(约1:1)(916mg,收率75%),为固体。m/z(ESI+)258.8(M+H)+.
步骤3:根据磺酰胺形成方法A合成2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例02)和2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例03)
向4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-3)和4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(B-4)(800mg,3.1mmol)在吡啶(10.0mL)中的混合物(约1:1)中加入2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(1.1g,4.65mmol)。将混合物在120℃下搅拌2h。将反应冷却至室温并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(20g SiO2,1:4MeOH/EtOAc)。材料通过制备HPLC用YMC Triart柱(20x150 mm,粒度7μm)再纯化,用23-63%MeCN/H2O(+0.225%甲酸)以25mL/min的流速洗脱。材料通过制备SFC用Diacel CHIRALCEL OD-H柱(30x250 mm,粒度5μm)再纯化,用45%EtOH/CO2(+0.1%NH4OH)以60mL/min的流速洗脱,得到作为第一个洗脱峰的2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例02)(63mg,收率4%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.62(br.s,1H),7.74(d,J=2.1Hz,1H),7.49(t,J=8.4Hz,1H),6.81(s,1H),6.77(d,J=8.3Hz,3H),6.07(d,J=2.1Hz,1H),5.33(s,2H),3.93-3.84(m,3H),3.77(s,6H),2.15(s,3H);m/z(ESI+)458.8(M+H)+。得到作为第二个洗脱峰的2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例03)(33mg,收率2%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.64(br.s,1H),7.49(t,J=8.6Hz,1H),7.40(d,J=1.7Hz,1H),6.78(s,1H),6.76(s,1H),6.66(s,1H),6.61(s,1H),6.11(dd,J=1.8,0.9Hz,1H),5.41(s,2H),3.86(s,3H),3.76(s,6H),2.21(s,3H);m/z(ESI+)458.8(M+H)+.
根据用于合成5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例01)、2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例02)和2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例03)的方法和通用磺酰胺形成方法A-D合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果需要,区域异构体混合物的分离在本领域已知的标准方法,例如SFC或HPLC下进行,并且在合成顺序中的任何合适的步骤中进行。
表11:
Figure BDA0003504892550000761
Figure BDA0003504892550000771
Figure BDA0003504892550000781
Figure BDA0003504892550000791
Figure BDA0003504892550000801
Figure BDA0003504892550000811
Figure BDA0003504892550000821
Figure BDA0003504892550000831
Figure BDA0003504892550000841
Figure BDA0003504892550000851
Figure BDA0003504892550000861
Figure BDA0003504892550000871
Figure BDA0003504892550000881
实施例45:根据方案C(路线A)制备2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550000891
方案C:
Figure BDA0003504892550000892
向4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(2.5g,10mmol)在吡啶(8.0mL)中的悬浮液中加入2-甲氧基苯-1-磺酰氯(3.17g,15.4mmol)。将反应在120℃下搅拌1.5h。将混合物冷却至室温,并用MeOH稀释。过滤得到的悬浮液,并用MeOH(30mL)洗涤滤饼。将固体溶解于DCM(50mL)中,并加入MeOH(30mL)。真空去除DCM,并通过过滤收集沉淀。通过冻干干燥滤饼,得到2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例45)(2.5g,收率59%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.18(s,1H),7.87(d,J=2.0Hz,1H),7.80(dd,J=1.6,7.9Hz,1H),7.66-7.59(m,1H),7.49(d,J=1.5Hz,1H),7.19(d,J=8.3Hz,1H),7.09(t,J=7.7Hz,1H),6.83(s,1H),6.74(s,1H),6.30(t,J=2.0Hz,1H),5.44(s,2H),3.82(s,3H),3.78(s,3H);m/z(ESI+)415.0(M+H)+.
实施例45:根据方案D替代性制备2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550000893
方案D:
Figure BDA0003504892550000901
向配备有顶置式搅拌器的100mL反应器中装入4-甲氧基-6-(1H-吡唑-1-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(10.00g,40.94mmol)、2-甲氧基苯磺酰氯(10.15g,49.13mmol)和乙腈(100mL)。将得到的悬浮液在25℃下搅拌55分钟。通过移液管一次性加入二甲基亚砜(0.36mL,4.09mmol)。通过注射器在15分钟内滴加3,5-二甲基吡啶(14.8mL,122.82mmol)。将得到的浅黄色悬浮液在25℃下搅拌18小时以通过LCMS判断达到>98%转化率。将反应混合物用1M HCl水溶液(100mL)酸化,然后浓缩至约80mL(旋转蒸发仪,40℃,85毫巴)。再用1MHCl水溶液(40mL)处理浆液,以从容器壁冲洗下来,然后在20℃下搅拌2.5小时。通过抽滤收集得到的沉淀。滤饼用水(2x50mL)洗涤,然后在35℃下真空干燥48小时,得到2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺粗品(实施例45)(15.2g,收率90%,LCMS纯度98%),为固体。m/z 415.1(M+H)+.
为纯化粗产物,在40℃浴中加热2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺粗品(实施例45)(14.00g,33.78mmol)在二氯甲烷(210mL)中的悬浮液,直到得到澄清溶液(10分钟)。过滤混合物,将滤液返回到干净的反应容器,再用另外的二氯甲烷(70mL)来定量转移。在2分钟内将乙酸乙酯(140mL)加入溶液,然后将混合物搅拌2.5小时。未观察到结晶,因此减压浓缩溶液(200毫巴)以去除二氯甲烷(体积减少约70mL)。再将乙酸乙酯(140mL)加入残留物中,将混合物在室温下搅拌21小时。将得到的悬浮液减压浓缩(40℃,200毫巴)至约280mL,然后在室温下搅拌3小时。通过过滤收集固体,用额外的乙酸乙酯(70mL)冲洗反应容器和滤饼。滤饼在真空烘箱中在35℃下干燥23小时,得到2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例45)(12.0g,收率85%,UPLC纯度97.9%,无大于0.5%的单杂质),为固体。m/z 415.1(M+H)+.
为进一步纯化,将2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例45)(2.0g,4.73mmol)在丙酮(80mL)中的悬浮液在搅拌下加热至回流(浴温55℃)2小时。当混合物还在被加热时,缓慢加入乙酸乙酯(30mL),使得内温保持高于45℃。将得到的浆液在轻微真空下(浴温65℃)浓缩至约30mL,然后以1℃/min的速度缓慢冷却至20℃(约31分钟)。通过抽滤收集得到的沉淀。滤饼在50℃下真空干燥22小时,得到2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例45)(1.825g,收率93%,UPLC纯度99.5%),为结晶固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.14(dd,J=1.7,7.8Hz,1H),8.04(s,1H),7.59-7.51(m,2H),7.44(d,J=2.2Hz,1H),7.14-7.06(m,1H),6.95(d,J=8.3Hz,1H),6.78(d,J=0.6Hz,1H),6.45(s,1H),6.32(t,J=2.1Hz,1H),5.38(s,2H),3.97(s,3H),3.91(s,3H)。
实施例45b:根据方案C-1(路线B)制备2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱
(1型)。
Figure BDA0003504892550000911
方案C-1:
Figure BDA0003504892550000921
将2-甲氧基苯-1-磺酰氯(7.6g,37mmol)置于配备有内部温度计的二颈圆底烧瓶中。加入4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(8.18g,33.5mmol),并在温和加热下将内容物溶解于吡啶(55mL,0.6M)。在110℃的油浴温度和101℃的内部温度下开始加热。加热5h后,通过LCMS分析确定反应完成。将反应冷却至室温,分配于DCM(200mL)、6N HCl(100mL)和冰水(100mL)之间。将产物萃取到DCM(x3)中,合并的DCM萃取物用1N HCl(x3)洗涤以去除痕量的吡啶。DCM萃取物用MgSO4干燥,浓缩成深色油状物。油状物经急骤色谱法纯化,用40-100%
EtOAc的庚烷溶液梯度洗脱得到4.6g产物,其经NMR确认。通过以下步骤将4.6g产物重结晶:首先在回流下溶解于CH3CN(60mL)中直到大部分固体溶解。使用装有凹槽形滤纸的预热/热玻璃漏斗过滤该热溶液。该步骤去除任何无机或硅胶杂质。滤纸用小部分CH3CN洗涤,总洗涤体积加起来为10mL。将滤液收集于配备有搅拌棒的250mL烧杯中。将MTBE(45mL)加入热滤液中并开始搅拌。搅拌30秒后,开始形成白色沉淀。在400rpm下继续搅拌,同时迫使温和的N2气流通过溶液顶部以帮助加速蒸发过程。强制N2蒸发继续3h,直到总体积为50mL。过滤白色固体,用MTBE(x2)和庚烷(x2)洗涤。将白色粉末置于3英寸直径结晶皿中,用滤纸片覆盖,在70℃真空烘箱中加热48h,使用缓慢进出干燥烘箱的N2流来帮助干燥过程。干燥后,获得3.9g结晶产物,其经NMR确认。熔点=203-204℃。C19H18N4O5S分析计算值:C,55.06;H,4.38;N,13.52。实测值:C,55.09;H,4.41;N,13.57。
通过粉末X射线衍射(PXRD)对上文制备的无水结晶固体(1型)进一步表征。在装有θ-2θ测角仪和Lynxeye检测器的Bruker A25 D8 Advance粉末X射线衍射仪上进行粉末X射线衍射分析,PSD窗口大小为3.3°,主索勒狭缝设为2.5°,发散狭缝设为0.6mm恒定照明。X射线管电压及安培数分别设为40kV和40mA。在铜波长下使用0.02度的步长、0.3s的步时(steptime)从3.0到40.0°2-θ收集数据。通过将粉末置于Si低背景腔支架(cavity holder)中来准备样品。使用抹刀按压样品粉末以确保达到适当的样品高度。用Bruker DIFFRAC软件收集数据,并通过DIFFRAC EVA软件进行分析。将所收集的PXRD图输入到Bruker DIFFRAC EVA软件中。利用该软件的“峰搜索功能”进行峰选择,然后仔细检查并校正以确保所有峰位置均已准确地分配。选择相对强度≥4.0%的峰。峰位置中±0.2°2-θ的典型误差适用于该数据。与该测量相关的微小误差可由于多种因素发生,包括:(a)样品制备(例如样品高度),(b)仪器,(c)校正,(d)操作者(包括在确定峰位置时存在的那些误差),和(e)材料的性质(例如优选的取向和透明度误差)。因此,峰被认为具有±0.2°2-θ的典型相关误差。当列表中的两个峰被认为重叠时,将强度较小的峰从列表中去除。在强度较高的相邻峰上作为肩峰存在的峰也已经从峰列表中去除。虽然肩峰距相邻峰的位置可以>0.2°2-θ,但不认为其可与相邻峰区别开。
为了获得绝对峰位置,应将粉末图与参比物进行比对。该参比物可为在室温下的相同形式的晶体结构的模拟粉末图或内标(例如二氧化硅或刚玉)。无水2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(1型)的模拟粉末图得自单晶结构。为制备单晶,将200mg实施例45b的材料溶解于CH3CN(3mL),同时加热至回流。加入MTBE(2mL),将混合物在敞口试管中静置48h,使得溶剂缓慢蒸发。形成较大晶体,将其过滤,用MTBE(x2)和庚烷(x2)冲洗并真空干燥。得到116mg(回收率58%)实施例45b的材料,为结晶白色固体,经1H NMR确认。由偏振光显微镜可视化的晶体显示较大粒度且为三斜晶形状。通过使用作为CCDC软件套件的一部分的Mercury 4.1.0计算获得来自单晶结构的模拟粉末图。
2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺1型无水物(实施例45a)的PXRD图显示于图1中。下表12中提供了2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水1型(实施例45a)(2-θ°)的PXRD峰列表和相对强度数据。特征性PXRD峰位置由星号表示。
表12:实施例45的1型无水游离碱的PXRD峰列表。
Figure BDA0003504892550000941
Figure BDA0003504892550000951
本发明的一个实施方案涉及2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱的晶型,其粉末X射线衍射图包含在13.4和18.1°2θ±0.2°2θ的2θ值处的峰。
本发明的一个实施方案涉及2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱的晶型,其粉末X射线衍射图包含在13.4和18.1°2θ±0.2°2θ的2θ值处的峰,并且还包含至少一个选自11.4、14.1和17.5°2θ±0.2°2θ的2θ值的峰。
本发明的一个实施方案涉及2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱的晶型,其粉末X射线衍射图包含在13.4和18.1°2θ±0.2°2θ的2θ值处的峰,并且还包含在11.4、14.1和17.5°2θ±0.2°2θ的2θ值处的峰。
本发明的一个实施方案涉及2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱的晶型,其粉末X射线衍射图包含在11.4、13.4、14.1、17.5和18.1°2θ±0.2°2θ的2θ值处的峰。
根据用于合成5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例01)、2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例02)和2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例03)和通用的磺酰胺形成方法C,以高通量库形式合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表13:
Figure BDA0003504892550000961
Figure BDA0003504892550000971
Figure BDA0003504892550000981
Figure BDA0003504892550000991
Figure BDA0003504892550001001
Figure BDA0003504892550001011
Figure BDA0003504892550001021
Figure BDA0003504892550001031
Figure BDA0003504892550001041
Figure BDA0003504892550001051
实施例87:根据方案E制备N-(6-{[4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001061
方案E:
Figure BDA0003504892550001062
步骤1:6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-胺(E-2)的合成。
向4-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(E-1)(如实施例01中制备,500mg,1.33mmol)和N-羟基乙酰胺(300mg,3.99mmol)在DMF(10.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中加入K2CO3(1.1g,7.99mmol)。将混合物在60℃下搅拌16h。LCMS分析显示原料耗尽。浓缩反应混合物以去除DMF,并用H2O稀释。通过过滤收集得到的沉淀。真空干燥滤饼。LCMS分析显示为期望产物和脱TBS副产物的混合物。将粗品固体与用200mg 4-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-2-氟-6-甲氧基苯甲腈进行的平行反应合并。将合并的固体溶于DCM(10.0mL)中。加入TBSCl(178mg,1.18mmol)、TEA(149mg,1.48mmol)和DMAP(6.0mg,0.49mol)。将反应在室温下搅拌16h。混合物用DCM(100mL)稀释,并依次用H2O(50mL)、饱和NaHCO(50mL)和盐水(50mL)洗涤。有机相用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(20g SiO2,60-70%EtOAc/石油醚)得到6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-胺(E-2)(280mg,2步反应收率34%),为白色固体。m/z(ESI+)388.9(M+H)+.
步骤2:根据磺酰胺形成方法B合成N-(6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(E-3)
向NaH(60%的矿物油分散物,40.1mg,1.00mmol)的THF(2.0mL)悬浮液中加入6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-胺(E-2)(130mg,0.335mmol)的THF(2.0mL)的溶液。将反应在室温下搅拌15min,然后加入2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(95.0mg,0.402mmol)的THF(2.0mL)溶液。将反应混合物在室温下搅拌17h。将悬浮液过滤并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(12gSiO2,1:1EtOAc/石油醚)得到N-(6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(E3)(80mg,收率41%),为浅黄色胶状物。m/z(ESI+)589.1(M+H)+
步骤3:N-(6-{[4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例87)的合成
向N-(6-{[4-({[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基}甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(E-3)(80.0mg,0.16mmol)的THF(2.0mL)的溶液中加入TBAF(76.3mg,0.32mmol)。将反应溶液搅拌1h。LCMS分析显示原料耗尽,形成期望的产物物质。将反应浓缩至干。将残留物溶于EtOAc(15mL)中,并用H2O(10mL)洗涤。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。残留物通过制备HPLC用YMC-Actus Triart C-18柱(30x150mm,粒度5μm)纯化,用5-25%MeCN/H2O(0.05%NH4OH)以35mL/min的流速洗脱得到N-(6-{[4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例87)(4.5mg,收率6%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.73(br.s,1H),7.40(br.s,2H),6.74(br.s,4H),5.35(br.s,2H),4.81(t,J=5.4Hz,1H),4.34(d,J=5.4Hz,2H),3.97-3.59(m,9H);m/z(ESI+)475.0(M+H)+.
根据用于合成N-(6-{[4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基]甲基}-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例87)的方法合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果需要,区域异构体混合物的分离在本领域已知的标准方法,例如SFC或HPLC下进行,并且在合成顺序中的任何合适的步骤中进行。
表14:
Figure BDA0003504892550001081
Figure BDA0003504892550001091
实施例90:根据方案F制备2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001092
方案F:
Figure BDA0003504892550001093
步骤1:2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]苯甲腈(F-1)的合成
向2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(164mg,0.703mmol)(A-1)的CD3OD(4.0mL)溶液中加入Cs2CO3(229mg,0.703mmol)。将混合物在40℃下搅拌2h。将反应冷却至室温并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(24g SiO2,0-40%EtOAc/DCM)得到2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]苯甲腈(F-1)(81.0mg,收率49%),为白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.61(d,J=1.71Hz,1H),7.47(d,J=2.32Hz,1H),6.52-6.57(m,2H),6.37(t,J=2.08Hz,1H),3.88-3.91(m,3H);m/z(ESI+)234.2(M+H)+.
步骤2:4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(F-2)的合成。
向2-氟-6-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]苯甲腈(F-1)(81.0mg,0.35mmol)和N-羟基乙酰胺(78.2mg,1.04mmol)在MeCN(2.7mL)和D2O(0.3mL)中的悬浮液中加入1,1,3,3-四甲基胍(240mg,2.08mmol)。将混合物在60℃下搅拌7h,并在65℃下再搅拌2h。将反应冷却至室温并浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(24g SiO2,60-100%EtOAc/DCM)得到4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(F-2)(32mg,收率37%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.85-7.89(m,1H),7.49(d,J=1.83Hz,1H),6.70(d,J=0.86Hz,1H),6.63(d,J=0.73Hz,1H),6.30(t,J=2.08Hz,1H),5.93(s,2H),3.83-3.87(m,3H);m/z(ESI+)247.2(M+H)+.
步骤3:根据磺酰胺形成方法A合成2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例90)。
将4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(F-2)(25.0mg,0.10mmol)和2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(36.0mg,0.152mmol)在吡啶中的混合物在95℃下搅拌2h。得到的胶状物用DCM稀释,用AcOH(46μL,0.812mmol)将处理。混合物直接通过急骤色谱法纯化(24g SiO2,70-100%EtOAc/庚烷)得到2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例90)(37.0mg,收率82%),为白色固体。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.60(s,1H),7.88(d,J=2.08Hz,1H),7.43-7.54(m,2H),6.84(s,1H),6.73-6.80(m,3H),6.30(t,J=2.08Hz,1H),3.87(s,3H),3.76(s,6H);m/z(ESI+)448.1(M+H)+.
根据用于合成2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)(2H2)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例90)的方法合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表15:
Figure BDA0003504892550001111
实施例92:根据方案G制备N-{5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001112
方案G:
Figure BDA0003504892550001121
步骤1:5-溴-2-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(G-1)的合成
向5-溴-4-(溴甲基)-2-氟苯甲腈(Int-07)(280mg,0.956mmol)的MeCN(6.4mL)的溶液中加入1H-吡唑(71.6mg,1.05mmol)和Cs2CO3(0.374mg,1.15mmol)。将混合物在室温下搅拌6h。混合物用EtOAc稀释并过滤。滤液浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(40gSiO2,10-100%EtOAc/庚烷)得到5-溴-2-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(G-1)(188mg,收率70%),为澄清油状物,其在静置时固化成浅黄色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.83(d,J=5.7Hz,1H),7.65(d,J=1.7Hz,1H),7.53(d,J=2.2Hz,1H),6.52(d,J=9.3Hz,1H),6.40(t,J=2.1Hz,1H),5.43(s,2H);m/z(ESI+)280.0,282.0(M+H)+.
步骤2:5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(G-2)的合成
向5-溴-2-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(G-1)(185mg,0.66mmol)和N-羟基乙酰胺(149mg,1.98mmol)在MeCN(3.5mL)和H2O(0.35mL)中的溶液中加入1,1,3,3-四甲基胍(45.9mg,0.399mmol)。将混合物在75℃下搅拌4h。将反应浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,30-90%EtOAc/庚烷)得到5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(G-2)(157mg,收率81%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.18(s,1H),7.87(d,J=2.2Hz,1H),7.55(d,J=1.3Hz,1H),6.80(s,1H),6.50(s,2H),6.34(t,J=2.1Hz,1H),5.51(s,2H);m/z(ESI+)293.0,295.0(M+H)+.
步骤3:N-{5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例92)的合成
将5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(G-2)(155mg,0.529mmol)和2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(188mg,0.793mmol)的吡啶(0.31mL)溶液加热至95℃,此时反应变得均质。将反应在95℃下搅拌2h,然后浓缩至干。将残留物溶于最小量的DCM中,并用AcOH(0.10mL,1.75mmol)处理。混合物直接负载到SiO2上,并通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,35-100%MeOAc/庚烷)得到N-{5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例92)(221mg,收率84%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.55(s,1H),8.39(s,1H),7.87(d,J=2.1Hz,1H),7.54(d,J=1.3Hz,1H),7.47(t,J=8.4Hz,1H),6.88(s,1H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),6.34(t,J=2.1Hz,1H),5.52(s,2H),3.75(s,6H);m/z(ESI+)493.0,495.0(M+H)+.
根据用于合成N-{5-溴-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例92)的方法合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果需要,区域异构体混合物的分离在本领域已知的标准方法,例如SFC或HPLC下进行,并且在合成顺序中的任何合适的步骤中进行。
表16:
Figure BDA0003504892550001131
Figure BDA0003504892550001141
实施例95:根据方案H制备N-{4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001142
方案H:
Figure BDA0003504892550001151
步骤1:2-溴-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-1)的合成
将2-溴-4-(溴甲基)-6-氟苯甲腈(Int-08)(459mg,1.57mmol)、1H-吡唑(159mg,2.34mmol)和Cs2CO3(767mg)在2-Me-THF(3.1mL)中的悬浮液在室温下搅拌5.5h。LCMS分析显示原料耗尽。将混合物分配于H2O(5mL)和EtOAc(20mL)之间。水层用EtOAc(20mL)萃取。合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,用MgSO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(40gSiO2,0-100%EtOAc/庚烷)得到2-溴-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-1)(295mg,收率66%),为黄色油状物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.62(d,J=1.7Hz,1H),7.47(d,J=2.3Hz,1H),7.28(s,1H),6.92(d,J=8.9Hz,1H),6.38(t,J=2.1Hz,1H),5.36(s,2H);m/z(ESI+)280.0,282.0(M+H)+.
步骤2:2-乙基-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-2)的合成
将装有2-溴-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-1)(79.3mg,0.283mmol)、乙基三氟硼酸钾(60.0mg,0.441mmol)、K2CO3(108mg,0.778mmol)和甲磺酸(三叔丁基膦基)(2"氨基-1,1-联苯基-2-基)钯(II)(P(t-Bu)3Pd(7.9mg,0.014mmol)的微波管密封,抽真空,并回充N2。加入PhMe(0.60mL)和去离子H2O(0.30mL),将混合物在100℃下搅拌5h。LCMS分析显示形成期望产物物质。将混合物分配于饱和NH4Cl(10mL)水溶液和EtOAc(15mL)之间。水层用EtOAc(15mL)萃取。合并的有机层用盐水洗涤,用MgSO4干燥,过滤并浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化(12g SiO2,0-100%EtOAc/庚烷)得到2-乙基-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-2)(43.1mg,收率66%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.60(d,J=1.6Hz,1H),7.46(d,J=2.2Hz,1H),6.92(s,1H),6.76(d,J=9.2Hz,1H),6.36(t,J=2.1Hz,1H),5.36(s,2H),2.85(q,J=7.6Hz,2H),1.28(t,J=7.6Hz,3H);m/z(APCI+)230.1(M+H)+.
步骤3:4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(H-3)的合成
向2-乙基-6-氟-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(H-2)(40.6mg,0.177mmol)和N-羟基乙酰胺(43.9mg,0.585mg)在MeCN(1.0mL)和H2O(0.1mL)中的溶液中加入1,1,3,3-四甲基胍(120mg,1.0mmol)。将混合物在75℃下搅拌24h。将混合物浓缩至干,并通过急骤色谱法纯化(12g SiO2,0-100%EtOAc/庚烷)得到4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(H-3)(13.2mg,收率31%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.60(d,J=1.6Hz,1H),7.45(d,J=2.0Hz,1H),7.04(s,1H),6.87(s,1H),6.34(t,J=2.0Hz,1H),5.44(s,2H),4.35(br.s,2H),2.93(q,J=7.6Hz,2H),1.34(t,J=7.6Hz,3H);m/z(APCI+)243.1(M+H)+.
步骤4:N-{4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例95)的合成
将4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(H-3)(13.2mg,0.055mmol)和2.6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(21.3mg,0.090mmol)在吡啶(0.15mL)中的悬浮液在95℃下搅拌3h。LCMS分析显示原料耗尽。将反应浓缩至干并通过急骤色谱法纯化(4g SiO2,0-100%EtOAc/庚烷)得到N-{4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例95)(12.0mg,收率50%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.14(s,1H),7.87(d,J=2.2Hz,1H),7.57-7.50(m,1H),7.49(d,J=1.5Hz,1H),7.20(br.s,1H),7.06(br.s,1H),6.79(br.d,J=7.8Hz,2H),6.29(t,J=2.1Hz,1H),5.46(s,2H),3.77(br.s,6H),3.07(q,J=7.5Hz,2H),1.21(t,J=7.5Hz,3H);m/z(APCI+)443.1(M+H)+.
根据用于合成N-{4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例95)的方法合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表17:
Figure BDA0003504892550001171
Figure BDA0003504892550001181
实施例97:根据方案J制备5-环丙基-2-甲氧基-N-{6-[(1H-吡唑-
1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001182
方案J:
Figure BDA0003504892550001183
步骤1:5-溴-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-2)的合成
在0℃下向5-溴-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-1)(如实施例01中制备,700mg,1.42mmol)、PPh3(930mg,3.55mmol)和(3,5-二甲氧基苯基)甲醇(358mg,2.13mmol)的2-Me-THF(30mL)溶液中滴加DIAD(574mg,2.84mmol)。将溶液搅拌16h,得到浅黄色悬浮液。过滤悬浮液,并将滤液浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(40g SiO2,1:2石油醚/EtOAc)得到5-溴-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-2)(200mg,收率22%),为白色固体。
步骤2:5-环丙基-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-3)的合成
向5-溴-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-2)(200mg,0.311mmol)在CPME(10.0mL)和H2O(1.0mL)中的溶液中加入环丙基三氟硼酸钾(138mg,0.932mmol)、Pd(OAc)2(14.0mg,0.062mmol)、K2CO3(172mg,1.24mmol)和X-Phos(44.4mg,0.093mmol)。将混合物抽真空并回充N2(3x),然后在100℃下在N2气氛下搅拌16h。将反应冷却至室温,用EtOAc(20mL)稀释并过滤。将滤液浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(20g SiO2,EtOAc)得到5-环丙基-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-3)(100mg,收率53%),为白色固体。m/z(ESI+)605.3(M+H)+.
步骤3:5-环丙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例97)的合成
向5-环丙基-N-[(3,5-二甲氧基苯基)甲基]-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(J-3)(100mg,0.165mmol)的DCM(2.0mL)溶液中加入TFA(2.0mL)。将混合物搅拌1h,然后浓缩至干。残留物通过急骤色谱法纯化(12gSiO2,1:10MeOH/EtOAc)。材料通过制备HPLC用Phenomenex Gemini-NX柱(150x30 mm,粒度5μm)再纯化,用2-42%MeCN/H2O(+0.05%NH4OH)以30mL/min的流速洗脱得到5-环丙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例97)(50mg,收率67%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.10(br s,1H),7.88(d,J=1.9Hz,1H),7.51(dd,J=1.6,11.0Hz,2H),7.27(br.d,J=6.8Hz,1H),7.05(br.d,J=8.9Hz,1H),6.82(br.s,1H),6.72(br.s,1H),6.30(t,J=1.9Hz,1H),5.44(s,2H),3.83(s,2H),3.90(br.d,J=8.3Hz,1H),3.73(s,2H),3.76-3.67(m,1H),2.01-1.89(m,1H),1.04-0.78(m,2H),0.70-0.42(m,2H)。m/z(ESI+)454.8(M+H)+.
实施例98:根据方案K制备N-(6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺[或2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺]。
Figure BDA0003504892550001201
方案K:
Figure BDA0003504892550001202
步骤1:由14b供选择地合成4-((1H-吡唑-1-基)甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(A-1)
将1H-吡唑(2.0g,29.6mmol)和NaH(60%w/w的矿物油分散物,1.5g,37.1mmol)的DMF(520mL)的溶液在0℃下搅拌1h。然后加入4-(溴甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(14b)(6.0g,24.7mmol)的DMF(80mL)溶液,并将混合物在RT下搅拌过夜。反应用水淬灭,并用EtOAc萃取混合物。合并的有机层用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱法纯化(石油醚/EtOAc=6/1)得到4-((1H-吡唑-1-基)甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(A-1)(2.4g,42%),为黄色固体。m/z 232.0[M+H]+.
步骤2:用叔丁醇钾供选择地合成6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(A-2)
在RT下向乙酰氧肟酸(3.7g,49.5mmol)的无水DMF(150mL)溶液中加入叔丁醇钾(5.6g,49.5mmol),并将混合物在RT下搅拌1h。然后加入4-((1H-吡唑-1-基)甲基)-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(A-1)(3.8g,16.5mmol),并继续在60℃下搅拌4h。加入水并用EtOAc萃取混合物。合并的有机层用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱法纯化(石油醚/EtOAc=5/1)得到6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(A-2)(2.1g,53%),为黄色固体。m/z 245.0[M+H]+.1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.87(dd,J=1.6,0.4Hz,1H),7.50(dd,J=1.6,0.4Hz,1H),6.69(s,1H),6.62(s,1H),6.30(t,J=2.1Hz,1H),5.93(s,2H),5.41(s,2H),3.86(s,3H)。
步骤3:N-(6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例98)的合成
将6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(A-2)(50mg,0.205mmol)和2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)(73mg,0.308mmol)在吡啶(1mL)中的混合物在120℃下在微波辐射下加热2h(第1批)。
将6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(A-2)(500mg,2.1mmol)和2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)(746mg,3.2mmol)的吡啶(5mL)混合物在120℃下在微波辐射下加热2h(第2批)。
以完全相同的规模将该反应再重复一次(第3批)。
将6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(A-2)(350mg,1.4mmol)和2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)(509mg,2.2mmol)在吡啶(4mL)中的混合物在120℃下在微波辐射下加热2h(第4批)。
合并4批反应混合物,用水稀释,用2M HCl水溶液调节至pH 5-6,并用EtOAc(300mLx 3)萃取。合并的有机萃取物用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用柱色谱法纯化(石油醚/EtOAc=2/1)得到N-(6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例98)(1.07g,43%),为白色固体。m/z 445.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.58(s,1H),7.87(d,J=2.0Hz,1H),7.50-7.46(m,2H),6.83(s,1H),6.76(m,3H),6.30(s,1H),5.44(s,2H),3.87(s,3H),3.76(s,6H)。
实施例98:根据方案L替代性制备2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001221
方案L:
Figure BDA0003504892550001222
步骤1:用1,1,3,3-四甲基胍供选择地合成4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2).
将2-氟-6-甲氧基-4-(1H-吡唑-1-基甲基)苯甲腈(A-1)(15.43g,66.7mmol)、N-羟基乙酰胺(15.0g,200mmol)和1,1,3,3-TMG(46.1g,400mmol)在乙腈(270mL)和去离子水(30mL)中的悬浮液加热至60℃持续7小时。真空除去乙腈,将残留的粘稠油状物分配于乙酸乙酯(300mL)和去离子水(250mL)之间。水层用乙酸乙酯(2x150mL)萃取。合并所有的有机层,并用饱和NaCl水溶液洗涤。有机层中开始形成一些固体,因此加入甲醇(约10mL),并将悬浮液加热直到均质为止。冷却至室温后,有机层用硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将得到的浅黄色固体悬浮于乙酸乙酯(125mL)中,短暂加热至回流。将悬浮液冷却至室温,通过过滤收集得到的固体,并用庚烷冲洗滤饼。将滤液和庚烷洗液浓缩至干,将残留的固体悬浮于乙酸乙酯(15mL)中,将悬浮液短暂加热至回流,并如前所述收集第二批沉淀。真空干燥合并的沉淀批料得到4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(11.86g,48.6mmol),为浅黄色粉末。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.87(d,J=1.8Hz,1H),7.49(d,J=1.2Hz,1H),6.69(s,1H),6.62(s,1H),6.30(t,J=2.1Hz,1H),5.93(s,2H),5.41(s,2H),3.86(s,3H)。LCMS:[M+H]+245.
步骤2:22,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例98)的合成
将4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(A-2)(9.5g,39mmol)和2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)(12.1g,51.1mmol)在吡啶(20mL)中的混合物加热至内部97℃持续1小时。冷却至50℃后,将溶液倒入含有碎冰(200g)和6N HCl(100mL)的烧瓶中。反应烧瓶用二氯甲烷冲洗以定量转移。用二氯甲烷(4x100mL)萃取得到的水性混合物。合并的有机萃取物用去离子水和饱和NaCl水溶液洗涤,用硫酸镁干燥,过滤并浓缩成黄色泡沫状物。将乙酸甲酯(50mL)加入泡沫状物中,并将悬浮液在室温下搅拌1小时。抽滤收集固体,并用庚烷冲洗。真空干燥后,得到2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1H-吡唑-1-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺粗品(实施例98)(16.1g,95%),为橙褐色固体。将固体粗品与乙酸乙酯一起再研磨两次未能去除橙色,因此在温热的二氯甲烷中研磨粗产物,冷却至室温并过滤,得到乳白色的固体。二氯甲烷母液进一步通过色谱法纯化(330g硅胶柱,用60-100%乙酸乙酯的庚烷溶液洗脱)得到白色固体。将来自DCM研磨和DCM滤液色谱的固体合并,在回流的乙酸甲酯中搅拌,经2小时冷却至室温。通过抽滤收集得到的固体,并在100℃真空烘箱中干燥过夜,得到纯化的2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1H-吡唑-1-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例98)(15.3g,89%),为灰白色粉末。
将如上所述制备的实施例98的三批(总计54.3g)合并,悬浮于乙酸甲酯(250mL)中,加热至回流持续1小时。从加热浴中移除后,随着混合物冷却至室温,继续搅拌4小时。通过过滤收集得到的沉淀,并用庚烷冲洗。将固体在室温下真空干燥2小时,然后在130℃真空烘箱中再干燥16小时,得到2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1H-吡唑-1-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例98)(53.55g,99%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.60(s,1H),7.88(d,J=1.7Hz,1H),7.45-7.52(m,2H),6.83(s,1H),6.77(d,J=8.4Hz,3H),6.30(t,J=2.1Hz,1H),5.44(s,2H),3.87(s,3H),3.76(s,6H)。LCMS:[M+H]+445.C20H20N4O6S分析计算值:C,54.05;H,4.54;N,12.61;S,7.21.实测值:C,53.91;H,4.58;N,12.51;S,7.09.
实施例99:根据方法AC制备N-(6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-3-甲基喹啉-8-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001241
实施例100:根据方法AC制备2,6-二甲氧基-N-(4-甲氧基-6-((4-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基)苯并[d]异噁唑-3-基)苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001242
方法AC:
Figure BDA0003504892550001251
向胺(0.2mmol,1.0当量)的吡啶(2mL)溶液中加入磺酰氯(1.5当量),将混合物在120℃下在微波辐射下加热2h。将混合物分配于水和EtOAc之间,分离各层,有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用制备TLC纯化得到标题化合物。上述条件的变化已在表18中注明。
表18:
Figure BDA0003504892550001252
Figure BDA0003504892550001261
实施例101:根据方案M制备2,6-二甲氧基-N-(4-甲氧基-6-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯并[d]异噁唑-3-基)苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001262
方案M:
Figure BDA0003504892550001263
向N-(6-溴-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-27)(40mg,0.09mmol)在1,4-二氧六环(8mL)和水(2mL)中的溶液中加入(1-甲基-1H-吡唑-4-基)硼酸(80mg,0.631mmol)、Na2CO3(100mg,0.948mmol)和Pd(PPh3)4(37mg,0.032mmol),将混合物在回流下在N2气氛下加热过夜。用1M HCl水溶液将混合物调节至pH 4-5,用EtOAc稀释,用水、盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用制备TLC纯化(DCM/MeOH=50/1)得到标题化合物(22mg,55%),为白色固体。m/z 445.0[M+H]+.1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.52(s,1H),8.35(s,1H),8.05(s,1H),7.50(t,J=8.5Hz,1H),7.38(s,1H),7.05(s,1H),6.78(d,J=8.5Hz,2H),3.98(s,3H),3.87(s,3H),3.78(s,6H)。
实施例102:根据方案N制备2,6-二甲氧基-N-(5-甲基-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯并[d]异噁唑-3-基)苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001271
方案N:
Figure BDA0003504892550001272
向N-(7-溴-5-甲基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-29)(50mg,0.117mmol)在1,4-二氧六环(8mL)和水(2mL)中的溶液中加入(1-甲基-1H-吡唑-4-基)硼酸(22mg,0.176mmol)、Na2CO3(50mg,0.468mmol)和Pd(dppf)Cl2(9mg,0.012mmol),将混合物在回流下在N2气氛下加热过夜。用1M HCl水溶液将混合物调节至pH 5,用水稀释,并用EtOAc(30mL×3)萃取。合并的有机萃取物用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残留物用制备TLC纯化(石油醚/EtOAc=3/1)得到标题化合物(24mg,48%),为白色固体。m/z429.0[M+H]+.1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.24(s,1H),7.99(s,1H),7.55(s,1H),7.49-7.22(m,2H),6.67(d,J=8.6Hz,2H),3.88(s,3H),3.69(s,6H),2.39(s,3H)。38(s,1H),7.05(s,1H),6.78(d,J=8.5Hz,2H),3.98(s,3H),3.87(s,3H),3.78(s,6H)。
实施例103:根据方案O制备3-羟基-2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001281
实施例104:根据方案O制备2-羟基-6-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001282
实施例105:根据方案O制备N-{6-[(4-羟基-1H-吡唑-1-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001283
方案O:
Figure BDA0003504892550001291
向500mL Erlenmeyer烧瓶中加入HPLC级H2O(27.2mL)、磷酸钾缓冲水溶液(1.0M,4.0mL,pH 7.5)、MgCl2水溶液(165mM,0.8mL)、地塞米松诱导的雄性大鼠肝微粒体(4.0mL,20mg/mL,Xenotech)和2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺的溶液(如实施例98中制备,5mM的MeCN溶液,0.20mL,1.0μmol)。加入新制备的NADPH水溶液(4.0mL,13mM)开始孵育。将未加盖的Erlenmeyer烧瓶在维持在37℃的水浴中振荡1.5h。通过加入MeCN(40mL)淬灭孵育混合物,接着以约1700g离心5min。将上清液在真空离心机中部分蒸发。用MeCN(0.5mL)、纯净甲酸(0.5mL)和去离子H2O处理剩余溶液,以得到约50mL的最终体积。使溶液在约40,000g下经受离心30min。使用JASCO PU-1580HPLC泵,在约60min内以0.8mL/min的流速将上清液吸附到Zorbax Polaris C18-AHPLC柱(250×4.6mm,粒度5μm)上。将该HPLC柱转移至Thermo LTQ Velos质谱仪,该质谱仪与包含四元泵、自动进样器及光电二极管阵列紫外/可见光检测器的Waters AcquityUHPLC仪器关联。施加MeCN/H2O(+0.1%甲酸)梯度以分离目标产物。在通过PDA检测器后,洗脱液以大约15:1的比率分开,其中较大部分进入级分收集器,较小部分进入质谱仪。每20s收集级分,并使用与Thermo Accela UHPLC及二极管阵列紫外/可见光检测器关联且具有CTC Analytics Leap自动进样器(Thermo-Fisher)的Thermo Orbitrap Elite高分辨率离子阱质谱仪,通过UHPLC-UV-HRMS分析含有目标峰的那些级分。将样品(10μL)进样到维持在45℃的Phenomenex Kinetex C18 UHPLC柱(50×2.1mm,粒度1.7μm)上,用MeCN/H2O(+0.1%甲酸)梯度以0.4mL/min的流速洗脱。在UHPLC-UV-HRMS分析之后,将级分合并,并通过真空离心去除溶剂。通过NMR光谱法对干燥的样品进行分析,并使用Topspin V3.2内的ERETIC2函数,通过针对在DMSO-d6中的5.0mM苯甲酸标准溶液的1H NMR谱进行外部校正来定量。得到N-{6-[(4-羟基-1H-吡唑-1-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例105)(0.028μmol,收率3%),为第一洗脱峰。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ8.45(s,1H),7.38(m,1H),7.32(s,1H),7.06(s,1H),6.70(m,3H),6.63(s,1H),5.22(s,2H),3.86(s,3H),3.69(s,6H)。HRMS(ESI-TOF)(C20H21N4O7S)[M+H]+计算值m/z=461.1125,实测值461.1121(-0.45ppm)。得到3-羟基-2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例103)(0.072μmol,收率7%),为第二洗脱峰。1HNMR(600MHz,DMSO-d6)δ9.33(s,1H),7.88(d,J=2.4Hz,1H),7.50(s,1H),7.01(d,J=9.0Hz,1H),6.80(s,1H),6.76-6.68(m,2H),6.31(t,J=2.3Hz,1H),5.44(s,2H),3.87(s,3H),3.76(s,3H),3.65(s,3H)。HRMS(ESI-TOF)(C20H21N4O7S)[M+H]+计算值m/z=461.1125,实测值461.1123(-0.25ppm)。得到2-羟基-6-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例104)(0.19μmol,收率19%),为第三洗脱峰。1HNMR(600MHz,DMSO-d6)δ7.86(s,1H),7.50(s,1H),7.13(m,1H),6.63(s,1H),6.53(m,2H),6.40(d,J=8.1Hz,2H),6.30(s,1H),5.41(s,2H),3.83(s,3H),3.72(s,3H)。HRMS(ESI-TOF)(C19H19N4O6S)计算值[M+H]+431.1020,实测值431.1017(-0.28ppm).
实施例106:根据方案P制备N-{6-[羟基(吡啶-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001311
实施例107:根据方案P制备2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡啶-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001312
方案P:
Figure BDA0003504892550001313
步骤1:N-{6-[羟基(吡啶-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例106)的合成:
将N-(6-溴-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-27)(628mg,1.42mmol)的无水THF(20mL)溶液冷却至-78℃。滴加n-BuLi(1.20mL的2.5己烷溶液,3.00mmol)。将得到的浆液在-78℃下搅拌1h。然后滴加吡啶-2-甲醛(187mg,1.75mmol)的无水THF(2mL)溶液。将得到的反应混合物在-78℃下搅拌1h。加入另外的吡啶-2-甲醛(75mg,0.71mmol)的1mL无水THF溶液。将得到的反应混合物升温至室温并在室温下搅拌18h。用HOAc(0.5mL)淬灭反应。将淬灭的反应混合物分配于EtOAc(50mL)和水(50mL)之间。分离有机相,用盐水洗涤,用硫酸钠干燥,过滤并通过急骤色谱法纯化,用0-100%EtOAc的庚烷溶液梯度,然后用0-20%2-PrOH的EtOAc溶液梯度洗脱,得到N-{6-[羟基(吡啶-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例106),为固体(247mg,37%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.61(d,J=4.9Hz,1H),8.23(s,1H),7.82(t,J=7.7Hz,1H),7.42-7.33(m,3H),7.10(s,1H),6.85(s,1H),6.58(d,J=8.4Hz,2H),5.99(s,1H),4.01(s,3H),3.88(s,6H)。m/z 472.2[M+H].
步骤2:N-(6-(氯(吡啶-2-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(P-1)的合成:
向N-{6-[羟基(吡啶-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例106)(113mg,0.240mmol)的无水DCM(5mL)溶液中加入SOCl2(0.20mL,2.7mmol)。将得到的反应混合物在室温下搅拌3h。去除溶剂,将得到的残留物分配于EtOAc(50mL)和饱和NaHCO3水溶液(50mL)之间。分离有机相,用硫酸钠干燥,浓缩得到N-(6-(氯(吡啶-2-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(P-1)(78mg,收率66%),其不经进一步纯化用于下一步。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.57(br.d,J=4.2Hz,1H),8.25(s,1H),7.75(dt,J=1.7,7.8Hz,1H),7.57(d,J=7.8Hz,1H),7.37(t,J=8.5Hz,1H),7.27-7.22(m,1H),7.10(s,1H),6.82(s,1H),6.57(d,J=8.6Hz,2H),6.17(s,1H),4.00(s,3H),3.87(s,6H),缺少磺酰胺NH;m/z 490.1[M+H]+.
步骤3:2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡啶-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例107)的合成:
向N-(6-(氯(吡啶-2-基)甲基)-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(P-1)(75mg,0.153mmol)的HOAc(5mL)的溶液中加入锌粉(69mg,1.1mmol),将溶液加热至60℃。在60℃下3h后,反应完成。将反应冷却至室温,用饱和NaHCO3小心中和。用EtOAc(2x50mL)萃取有机物,用硫酸钠干燥合并的有机萃取液,浓缩至干,并通过急骤色谱法纯化,用0-100%EtOAc的庚烷溶液梯度,接着用0-20%2-PrOH的EtOAc溶液梯度洗脱。浓缩纯的级分得到2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡啶-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例107)(38mg,两步55%),为固体。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.57(br.s,1H),8.23(s,1H),7.65(t,J=7.6Hz,1H),7.37(t,J=8.5Hz,1H),7.19(br.d,J=6.6Hz,2H),6.89(s,1H),6.64-6.53(m,3H),4.23(s,2H),3.98(s,3H),3.87(s,6H)。m/z 456.3[M+H].
实施例108:根据方案Q制备N-{6-[(S*)-羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001331
实施例109:根据方案Q制备N-{6-[(R*)-羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001332
实施例110:根据方案Q制备2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1,3-噁唑-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001341
方案Q:
Figure BDA0003504892550001342
步骤1:N-(6-溴-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-1)的合成
在0℃下向N-(6-溴-4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(Int-27)(15g,34mmol)的THF(300mL)溶液和2,4-二甲氧基苄醇(8.54g,50.8mmol)、PPh3(22.2g,84.6mmol)中滴加DIAD(13.7g,67.7mmol)。将反应溶液升温至室温,并搅拌16h。反应混合物用EtOAc(300mL)稀释,用水(150mL)、盐水、饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,再用盐水洗涤。有机相用硫酸钠干燥并过滤。减压去除溶剂得到混合物,将其通过急骤色谱法纯化,用60%-70%EtOAc的石油醚溶液洗脱得到具有一些残留三苯基氧膦的粗产物。固体粗品在MeOH中重结晶得到N-(6-溴-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-1)(8.0g,收率40%),为白色固体。
步骤2:外消旋-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-N-{6-[羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-2)的合成
在-78℃下,在氩气气氛下向N-(6-溴-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基)-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-1)(500mg 0.843mmol)的THF(9.5mL)溶液中滴加n-BuLi(0.506mL的2.5M己烷溶液,1.26mmol)。在-78℃下30min后,加入噁唑-2-甲醛(123mg 1.26mmol)的THF(0.5mL)溶液。将反应缓慢升温至室温并搅拌16h。将反应混合物倒入饱和NH4Cl水溶液(20mL)中。水层用两部份EtOAc(2x20mL)萃取。合并的萃取液用盐水(20mL)洗涤,用MgSO4干燥,并真空浓缩。残留物通过急骤色谱法纯化,用100%EtOAc洗脱得到外消旋-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-N-{6-[羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-2)(150mg,收率29%),为黄色胶状物。
步骤3:N-{6-[(S*)-羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例108)和N-{6-[(R*)-羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯磺酰胺(实施例109)的合成
将外消旋-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-N-{6-[羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-2)(150mg 0.245mmol)的TFA(5mL)溶液在室温下搅拌2h。观察到粉红色溶液,并真空浓缩反应混合物。将残留物用急骤色谱预纯化,用EtOAc/MeOH 10:1洗脱得到实施例108和109的外消旋混合物,使其经受手性SFC纯化。使用Chiralpak AS-3 100×4.6mm I.D.,3um柱,以由CO2(A)和含有0.05%DEA的乙醇(B)组成的流动相使化合物彼此分离。梯度洗脱在4min内从5%到40%的B,保持40%的B持续2.5min,然后5%的B持续1.5min。手性SFC分离后,获得20mg的每种产物。峰1=实施例108 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.06(d,J=0.6Hz,1H),7.45(br.t,J=8.4Hz,1H),7.18(d,J=0.6Hz,1H),7.15(s,1H),6.86(s,1H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),6.67(d,J=5.1Hz,1H),5.93(d,J=5.3Hz,1H),3.88(s,3H),3.74(s,6H),缺少磺酰胺NH峰;m/z 462.0(M+H)+.峰2=实施例109 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.06(d,J=0.6Hz,1H),7.50(t,J=8.5Hz,1H),7.13-7.26(m,2H),6.90(s,1H),6.78(d,J=8.4Hz,2H),6.70(d,J=5.4Hz,1H),5.95(d,J=5.3Hz,1H),3.89(s,3H),3.78(s,6H),缺少磺酰胺NH峰;m/z 462.0(M+H)+.
步骤4和5:N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1,3-噁唑-2-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(Q-3)的合成在室温下向外消旋-N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-N-{6-[羟基(1,3-噁唑-2-基)甲基]-4-甲氧基-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(Q-2)(150mg 0.245mmol)的DCM(5mL)溶液中加入氯化亚砜(290mg,2.44mmol)。将溶液搅拌1h,同时形成浅黄色溶液。通过TLC确定反应完成,混合物用水(20mL)淬灭,并用DCM(20mL)萃取。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到仲氯化物(150mg,黄色油状物),其不经进一步纯化用于下一步。在室温下向仲氯化物(150mg,0.238mmol)的HOAc(5mL)溶液中加入锌粉(467mg,7.14mmol)。将反应在室温下搅拌1h。通过TLC确定反应完成,混合物用EtOAc(50mL)稀释并过滤。用饱和Na2CO3水溶液将滤液调节至pH7-8。有机层用Na2SO4干燥并浓缩得到残留物,将其通过急骤色谱法纯化得到N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1,3-噁唑-2-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(Q-3)(80mg),为黄色油状物。
步骤6:2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1,3-噁唑-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例110)的合成将N-[(2,4-二甲氧基苯基)甲基]-2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1,3-噁唑-2-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(Q-3)(80mg0.13mmol)的TFA(5mL)溶液在室温下搅拌1h。浓缩反应,通过急骤色谱预纯化,用EtOAc/MeOH 10:1洗脱。得到的粗产物进一步通过制备HPLC纯化,将纯的级分冷冻并冻干得到10mg产物,通过1H NMR测定其仍被杂质污染。该样品通过制备TLC进一步纯化得到2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(1,3-噁唑-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例110)(5mg,收率8.4%),为白色固体。m/z 446.0(M+H)+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.87(s,1H),7.43(t,J=8.5Hz,1H),7.14(s,1H),6.92(s,1H),6.72(d,J=8.5Hz,3H),4.34-4.11(m,2H),4.00(s,3H),3.81(s,7H)。
实施例111:根据方案R制备2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡嗪-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001371
方案R:
Figure BDA0003504892550001372
步骤1:2-氟-4-[羟基(吡嗪-2-基)甲基]-6-甲氧基苯甲腈(R-2)的合成
为250mL三颈圆底烧瓶配备温度计、搅拌棒和氮气入口。向烧瓶中装入4-溴-2-氟-6-甲氧基苯甲腈(1b)(4.00g,17.4mmol)和100mL无水THF。用隔膜塞将烧瓶封盖,用氮气吹扫,并冷却至-20℃(冰/MeOH浴)。滴加iPrMgCl-LiCl(17.5mL,1.3M,22.8mmol),同时维持温度低于-15℃。将得到的混合物在-20℃下搅拌1h。然后,加入吡嗪-2-甲醛(2.95g,1.57mmol)的20mL无水THF溶液,同时维持温度低于-10℃。将得到的反应在-10℃下搅拌1h,然后用4NHCl(10mL)淬灭。将淬灭的反应混合物分配于EtOAc(200mL)和水(200mL)之间。分离有机相,水相再用EtOAc(1x100mL)萃取。合并的有机相用Na2SO4干燥,浓缩至干,并通过急骤色谱使用20-100%EtOAc的庚烷溶液梯度纯化,得到2-氟-4-[羟基(吡嗪-2-基)甲基]-6-甲氧基苯甲腈(R-2)(2.6g,收率58%),为胶状物。m/z 260.0(M+H)+1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.67(d,J=0.7Hz,1H),8.56-8.50(m,2H),6.93(s,1H),6.87(d,J=9.2Hz,1H),5.88(s,1H),4.57(br.s,1H),3.94(s,3H)。
步骤2-4:2-氟-6-甲氧基-4-[(吡嗪-2-基)甲基]苯甲腈(R-3)的合成
在0℃下向2-氟-4-[羟基(吡嗪-2-基)甲基]-6-甲氧基苯甲腈(R-2)(145mg,0.559mmol)和Et3N(0.120mL,0.861mmol)的无水THF(10mL)溶液中加入甲磺酰氯(0.050mL,0.64mmol)。将得到的混合物升温至室温并搅拌30min。反应混合物用DCM(30mL)稀释,用水(1x30mL)和饱和水溶液NaHCO3(1x30mL)洗涤。萃取液用Na2SO4干燥并浓缩至干。材料不经进一步纯化用于下一步。将甲磺酸酯粗品(173mg,0.513mmol)和LiBr(137mg,1.58mmol)在无水DMF(4mL)中的混合物在室温下搅拌16h。将反应混合物分配于EtOAc(50mL)和水(50mL)之间。分离有机相,用水(1x50mL)和盐水(1x50mL)洗涤,用Na2SO4干燥并浓缩。使用0-100%EtOAc的庚烷溶液梯度,通过急骤色谱实现纯化,得到72mg(44%)仲溴化物。将仲溴化物(43mg,0.13mmol)和锌粉(90mg,1.4mmol)在80℃下在HOAc(2mL)中搅拌8h。冷却至室温后,用EtOAc(50mL)稀释反应,并用饱和NaHCO3(50mL)水溶液小心洗涤。然后用盐水(1x50mL)洗涤有机层,并用Na2SO4干燥。浓缩至干后,粗产物经急骤色谱法纯化,用0-100%EtOAc的庚烷溶液梯度洗脱,得到10mg(31%)2-氟-6-甲氧基-4-[(吡嗪-2-基)甲基]苯甲腈(R-3)(10mg,收率31%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.56(br.s,3H),6.74-6.69(m,2H),4.18(s,2H),3.94(s,3H);m/z 244.0(M+H)+.
步骤5-6:2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡嗪-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例111)的合成
向2-氟-6-甲氧基-4-[(吡嗪-2-基)甲基]苯甲腈(R-3)(178mg,0.732mmol)和N-羟基乙酰胺(165mg,2.20mmol)在CH3CN(5mL)和水(0.5mL)的混合物中加入1,1,3,3-四甲基胍(0.55mL,4.4mmol)。将得到的反应混合物在60℃下搅拌16h,然后冷却至室温。去除溶剂,将得到的残留物分配于EtOAc和水之间。分离有机相,水相再次用EtOAc(50mL)萃取。合并的有机萃取液用Na2SO4干燥,浓缩至干,并通过急骤色谱法纯化,用40-100%EtOAc的庚烷溶液梯度洗脱。得到82mg(44%)胺中间体,为油状物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.68(d,J=1.1Hz,1H),8.60-8.55(m,1H),8.51(d,J=2.6Hz,1H),6.91(s,1H),6.69(s,1H),5.87(br.s,2H),4.22(s,2H),3.88(s,3H);m/z 257.1(M+H)+。用2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)
(100mg,0.43mmol)和吡啶(2mL)处理来自上述反应的胺(73mg,0.28mmol)。将反应混合物在110℃下搅拌3h。然后,加入另外的2,6-二甲氧基苯-1-磺酰氯(Int-26)(50mg,0.21mmol),继续在110℃下再加热1h。冷却至室温后,将反应混合物分配于乙酸乙酯(20mL)和2N HCl(20mL)之间。分离有机相,用Na2SO4干燥,通过急骤色谱法纯化,用20-100%EtOAc的庚烷溶液梯度接着0-20%2-PrOH的EtOAc溶液的第二梯度洗脱,得到2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡嗪-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例111)(44mg,收率34%),为固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.50(s,1H),8.68(d,J=1.0Hz,1H),8.58-8.53(m,1H),8.50(d,J=2.4Hz,1H),7.49(t,J=8.5Hz,1H),7.07(s,1H),6.83(s,1H),6.77(d,J=8.6Hz,2H),4.25(s,2H),3.89(s,3H),3.77(s,6H);m/z 456.8(M+H)+.
根据用于合成2,6-二甲氧基-N-[4-甲氧基-6-(吡嗪-2-基甲基)-1,2-苯并噁唑-3-基]苯磺酰胺(实施例111)的方法合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。如果需要,区域异构体混合物的分离在本领域已知的标准方法,例如SFC或HPLC下进行,并且在合成顺序中的任何合适的步骤中进行。
表19:
Figure BDA0003504892550001401
Figure BDA0003504892550001411
Figure BDA0003504892550001421
Figure BDA0003504892550001431
Figure BDA0003504892550001441
Figure BDA0003504892550001451
实施例128:根据方案S制备N-{5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺。
Figure BDA0003504892550001452
方案S:
Figure BDA0003504892550001461
步骤1:4-(苄氨基)-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-1)的合成将苄胺(38.0mL,347mmol)、2,4,5-三氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(51.0g,232mmol)和三乙胺(161mL,1160mmol)的DMSO(500mL)溶液在100℃下加热18小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,用乙酸乙酯萃取。有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,用硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。残留物用硅胶色谱法纯化(用5/1石油醚/乙酸乙酯洗脱)得到4-(苄氨基)-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-1)(41g,收率57%),为浅黄色油状物。LCMS m/z 308.1[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.43-7.20(m,6H),4.74(br s,1H),4.63(br s,2H),3.97-3.80(m,6H)。
步骤2:4-氨基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-2)的合成。
用Pd/C(7.0g)处理4-(苄氨基)-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-1)(41g,133mmol)的甲醇(500mL)溶液,并在50℃下在氢(45psi)下搅拌48小时。经
Figure BDA0003504892550001462
垫过滤悬浮液,浓缩滤液得到4-氨基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-2)(28.0g,收率96%),为灰白色固体。LCMS m/z 217.9[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.27(dd,J=6.3,11.6Hz,1H),6.21(s,2H),3.77(d,J=1.1Hz,6H)。
步骤3:4-氰基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-3)的合成
将4-氨基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-2)(28.0g,129mmol)和氰化亚铜(I)(34.6g,387mmol)在CH3CN(1L)中的悬浮液升温至65℃。滴加亚硝酸异戊酯(22.7g193mmol),并将反应在65℃下搅拌1h。通过LCMS分析显示剩余一些原料,再加入另外的亚硝酸异戊酯(15.1g 129mmol)。将反应在65℃下加热18h。冷却至室温后,用EtOAc(200mL)稀释反应并过滤。浓缩滤液并通过急骤色谱法纯化,用0-50%EtOAc的庚烷溶液梯度洗脱得到4-氰基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-3)(14.0g,收率47%),为黄色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.36(dd,J=4.8,8.4Hz,1H),4.21(d,J=3.1Hz,3H),3.97(s,3H)。
步骤4:3,6-二氟-4-(羟甲基)-2-甲氧基苯甲腈(S-4)的合成
在0℃下向4-氰基-2,5-二氟-3-甲氧基苯甲酸甲酯(S-3)(14g,62mmol)的THF(400mL)溶液中缓慢加入LiBH4(20g,92mmol)。完成加入后,将反应升温至室温然后加热至50℃持续2h。冷却至室温后,通过缓慢加入H2O(100mL)淬灭反应混合物,用EtOAc(2x300mL)萃取有机物。合并的有机萃取液用盐水和饱和NaHCO3洗涤,用Na2SO4干燥并过滤。去除溶剂后,得到3,6-二氟-4-(羟甲基)-2-甲氧基苯甲腈(S-4)(10g,81%),为黄色固体。该材料不经进一步纯化用于下一步。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.06(dd,J=4.8,8.8Hz,1H),4.81(s,2H),4.17(d,J=3.3Hz,3H),2.48(br s,1H)。
步骤5:3,6-二氟-2-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(S-5)的合成
向3,6-二氟-4-(羟甲基)-2-甲氧基苯甲腈(S-4)(10g,50mmol)和1-(甲磺酰基)-1H-吡唑(Int-13)(8.8g,60mmol)的CH3CN(500mL)溶液中加入Cs2CO3(24.5g,75.3mmol),并在70℃下搅拌2h。通过LCMS分析显示原料耗尽。将反应冷却至室温并过滤。将滤液浓缩后,残留物通过急骤色谱法纯化,用20-50%EtOAc的石油醚溶液梯度洗脱,得到3,6-二氟-2-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(S-5)(8.4g,收率67%),为黄色胶状物。LCMS m/z250.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.89(d,J=2.2Hz,1H),7.62-7.40(m,1H),6.76(dd,J=5.0,9.1Hz,1H),6.33(t,J=2.1Hz,1H),5.49(d,J=1.1Hz,2H),4.13(d,J=3.2Hz,3H)。
步骤6:5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(S-6)的合成
向3,6-二氟-2-甲氧基-4-[(1H-吡唑-1-基)甲基]苯甲腈(S-5)(8.4g,34mmol)和N-羟基乙酰胺(7.6g,100mmol)在CH3CN(400mL)和水(80mL)中的溶液中缓慢加入1,1,3,3-四甲基胍(23g,200mmol)。将混合物在60℃下加热16h。将混合物冷却并浓缩以除去CH3CN。黄色固体从溶液中沉淀出,将其用水洗涤,然后用10%EtOAc在石油醚中的混合物洗涤。过滤得到的浅黄色固体,得到5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(S-6)(6.1g,收率69%),为浅黄色固体。LCMS m/z 262.9[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.59(d,J=1.7Hz,1H),7.43(d,J=2.2Hz,1H),6.70(d,J=9.2Hz,1H),6.50(s,1H),6.35(t,J=2.1Hz,1H),5.31(s,2H),2.23(tt,J=5.1,8.4Hz,1H),1.20-1.14(m,2H),0.81-0.73(m,2H)。
步骤7:N-{5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例128)的合成
向5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-胺(S-6)(6.1g,23mmol)的吡啶(100mL)溶液中加入2,6-二甲氧基苯磺酰氯(Int-26)(6.1g,26mmol),并将得到的混合物在70℃下搅拌18h。将混合物浓缩并通过急骤色谱法纯化,用10%MeOH的DCM溶液洗脱得到实施例128粗品(8g),为黄色固体。将黄色固体在CH3CN(100mL)中的悬浮液回流10min。大部分固体仍然存在。因此,以100mL的增量加入另外的CH3CN(500mL),直到固体完全溶解。将溶液冷却至5min,并在剧烈搅拌下加入MTBE(400mL)。开始形成白色固体,将混合物浓缩至1/3体积,将溶液在20℃下剧烈搅拌18h。通过过滤收集沉淀,用庚烷洗涤,并真空干燥得到3.2g(30%)实施例128,为白色固体。将滤液浓缩得到4.7g实施例128粗品,为黄色固体,如下文所述对其进行进一步纯化。通过急骤色谱对4.7g再纯化,用0-20%EtOAc的DCM溶液梯度洗脱,得到3克白色固体,将其溶解于CH3CN(10mL)和MTBE(25mL)中。搅拌无色溶液,直到其变浑浊且白色固体沉淀出来。通过过滤收集白色固体,并用MTBE(3x5mL)洗涤。该批白色固体与3.2g批次合并,将合并的固体悬浮于CH3CN(30mL)中,然后加热以溶解。逐渐加入MTBE(60mL),白色固体从溶液中沉淀出来。将混合物冷却至室温,并浓缩至总体积为30mL。通过过滤收集得到的白色固体,用MTBE(3x10mL)洗涤,在真空烘箱中在60℃下干燥6h,得到N-{5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例128)(5.3g,收率49%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.13(br.s,1H),7.86(br.s,1H),7.59-7.43(m,2H),6.90(br.d,J=3.3Hz,1H),6.78(br.d,J=8.5Hz,2H),6.31(br.s,1H),5.50(br.s,2H),4.04(br.s,3H),3.76(s,6H);m/z463.0[M+H]+.
根据用于合成N-{5-氟-4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例128)、N-{4-乙基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}-2,6-二甲氧基苯-1-磺酰胺(实施例95)、5-乙基-2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例01)、2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(3-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例02)和2,6-二甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(5-甲基-1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺(实施例03)以及通用的磺酰胺形成方法A-D合成了下表中的实施例。以下实施例是在对示例性程序进行本领域技术人员将能够实现的非关键改变或替换的情况下合成的。
表20:
Figure BDA0003504892550001501
Figure BDA0003504892550001511
生物分析部分1KAT分析方案:
A.化合物制备
1.由固体材料在100%DMSO中制备10mM储备溶液
2.在100%DMSO中3倍连续稀释10mM、1mM或0.1mM化合物储备液以用于11点剂量反应
B.试剂制备
1.制备含有10mM Tris HCL pH 8.0、2.5mM NaCl、0.5mM EDTA、0.005%BSG和0.02%吐温20的1x分析缓冲液
2.在分析缓冲液中将组蛋白肽(CPC Scientific)和AcCoA(Sigma)一起稀释至2x。
3.在分析缓冲液中将KAT酶稀释至2x。
C.酶反应
1.在20ul分析反应体积中每个KAT分析的最终反应条件:
i.KAT5 25nM,1uM AcCoA,2uM H4 1-21肽,30分钟反应
ii.KAT6A 15nM,1uM AcCoA,2uM H3 1-21肽,45分钟反应
iii.KAT6B 25nM,1uM AcCoA,2uM H3 1-21肽,60分钟反应
iv.KAT7 12.5nM,1uM AcCoA,2uM H3 1-21肽,45分钟反应
v.KAT8 15nM,1uM AcCoA,2uM H3 1-21肽,45分钟反应
2.将0.5ul稀释的化合物加到分析板(384孔V形底聚丙烯板)上,或将0.5ul DMSO加到对照孔。
3.将10ul 2x组蛋白肽/2x AcCoA混合物加到分析板上。
4.将10ul 2x酶加到分析板上。
5.在指定时间后,加入2ul的5%甲酸终止反应
6.使用自组装单层解吸/离子化飞行时间质谱法分析每个反应(Mrksich,Milan(2008)自组装单分子层的质谱分析:分子表面科学的新工具(Mass Spectrometry ofSelf-Assembled Monolayers:A New Tool for Molecular Surface Science)ACS Nano2008 2(1),7-18;SAMDI Tech,Inc.(Chicago,IL))。
7.在M.W.2561[底物+H]+及2603[产物+H]+分别测定了KAT5的底物峰和产物峰的曲线下面积(AUC),其中公差为+/-1Da
8.在M.W.2723[底物+H]+及2765[产物+H]+分别测定了KAT6A、KAT6B、KAT7和KAT8的底物和产物峰的曲线下面积(AUC),其中公差为+/-1Da。
9.通过AUC产物/(AUC底物+AUC产物)计算转化为产物的百分比。
D.数据分析
1.通过用Pfizer专属曲线拟合软件将每个抑制剂浓度下的转化率%拟合为4参数IC50方程来确定IC50值。
2.通过用Pfizer专属曲线拟合软件将每个抑制剂浓度下的转化率%拟合为紧密结合竞争性抑制剂的Morrison方程来确定Ki值。
材料
使用杆状病毒表达系统表达KAT酶并在Pfizer,La Jolla纯化。组蛋白H3(1-21)肽(ARTKQTARKSTGGKAPRKQLA,SEQ ID NO:3)和组蛋白H4(1-21)肽(SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKV,SEQ ID NO:4)购自CPC Scientific(Sunnyvale,CA)。乙酰辅酶A购自Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)。所有其他生物化学试剂购自Sigma-Aldrich或ThermoFisher Scientific(Waltham,MA)。
KAT反应
在室温下在含有1μM AcCoA、2μM组蛋白肽、10mM Tris HCL pH 8.0、2.5mM NaCl、0.5mM EDTA、0.005%BSG和0.02%吐温20的分析缓冲液中进行KAT分析。将10ul 2x组蛋白肽/AcCoA混合物加到含有0.5ul在100%二甲基亚砜(DMSO)中连续稀释的测试化合物的384孔V形底聚丙烯分析板。为启动反应,将10ul 2x酶溶液加到分析板。在30-60分钟后,添加2ul 5%甲酸终止KAT分析。所有分析均使用组蛋白H3(1-21)肽,除了KAT5分析,其使用组蛋白H4(1-21)肽。每个KAT的最终酶浓度如下:KAT5,25nM;KAT6A,15nM;KAT6B,25nM;KAT7,12.5nM;KAT8 15nM。使用自组装单层解吸/离子化飞行时间质谱法分析每个反应(Mrksich,Milan(2008)自组装单分子层的质谱分析:分子表面科学的新工具(Mass Spectrometry ofSelf-Assembled Monolayers:A New Tool for Molecular Surface Science)ACS Nano2008 2(1),7-18;SAMDI Tech,Inc.(Chicago,IL))。
数据处理和分析
在M.W.2561[底物+H]+及2603[产物+H]+分别测定了KAT5的底物和产物峰的曲线下面积(AUC),其中公差为+/-1Da。在M.W.2723[底物+H]+及2765[产物+H]+分别测定了KAT6A、KAT6B、KAT7及KAT8的底物及产物峰的曲线下面积(AUC),其中公差为+/-1Da。通过AUC产物/(AUC底物+AUC产物)计算转化为产物的百分比。通过用Pfizer专属曲线拟合软件将每个抑制剂浓度下的转化率%拟合为4参数IC50方程来确定IC50值。通过用Pfizer专属曲线拟合软件将每个抑制剂浓度下的转化率%拟合为紧密结合竞争性抑制剂的Morrison方程来确定Ki值。
KAT6a及KAT6b Ki提供于下表21中,KAT5、KAT7及KAT8 Ki提供于下表22中。
表21:
Figure BDA0003504892550001541
Figure BDA0003504892550001551
Figure BDA0003504892550001561
Figure BDA0003504892550001571
Figure BDA0003504892550001581
表22:
Figure BDA0003504892550001591
Figure BDA0003504892550001601
Figure BDA0003504892550001611
Figure BDA0003504892550001621
Figure BDA0003504892550001631
生物分析部分2
蛋白制备
KAT5
分子生物学:由GenScript USA Inc(Piscataway,New Jersey,USA)合成了编码人KAT5同种型的氨基酸残基2至461(Uniprot Q92993-2)的密码子优化的DNA序列(以供在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达)。将该DNA序列连接到被设计成编码N末端六组氨酸标签的修饰的pET43a大肠杆菌表达载体中,接着是烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEV)切割位点和KAT5序列。所产生的蛋白序列列示如下(SEQ ID NO:5)。
MGHHHHHHGTENLYFQGSAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGAARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDCKGFHIVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKWAS*
蛋白表达:为了产生重组KAT5蛋白,将表达质粒转化到大肠杆菌BL21 DE3菌株中且在37℃下在补充有100μg/mL氨苄青霉素和50μM锌的1L体积的Terrific肉汤(TB)培养基中振荡生长,直到OD600达到0.8。将培养物转移到18℃并通过添加异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷至最终浓度为0.5mM来诱导蛋白表达,并将培养物再振荡过夜16小时。在表达后,将细胞培养物以5000x g离心20min并将细胞团块在-20℃下冷冻储存。
蛋白纯化:通过用每1g细胞6mL缓冲液的比例,使细胞团块(25g湿重)在裂解缓冲液(50mM Hepes pH 7.4,500mM NaCl,5mM咪唑,5%[v/v]甘油,0.1%[w/v]CHAPS,2mM 2-巯基乙醇,3mM MgCl2,0.5mg/mL溶菌酶,benzonase核酸内切酶[EMD Millipore],1mM PMSF,不含EDTA的全蛋白酶抑制剂片[Roche])中解冻来启动蛋白纯化。使用Misonix液体处理器(6x30秒脉冲,振幅60[70瓦特]),通过声波处理使细胞进一步裂解,然后在4℃下以48,000xg离心。将上清液(细胞裂解物)与用Q缓冲液(20mM Hepes pH 7.4,1M NaCl)预平衡的20mLQ-琼脂糖凝胶FF树脂(GE Healthcare)混合。然后使来自Q-琼脂糖凝胶FF的未结合部分与用IMAC洗涤缓冲液(20mM hepes pH 7.4,500mM NaCl,35mM咪唑)预平衡的5mL cOmpleteHis-标签纯化树脂(Roche)一起孵育。用IMAC洗涤缓冲液洗涤该树脂,用IMAC洗脱缓冲液(20mM hepes pH 7.4,500mM NaCl,300mM咪唑)洗脱结合的KAT5。使用串联的2x HiPrep26/10脱盐柱(GE Healthcare),将IMAC洗脱的蛋白立即脱盐到储存缓冲液(50mM柠檬酸钠pH 6.5,500mM NaCl,5%[v/v]甘油)中。通过使脱盐的蛋白经过在储存缓冲液中预平衡的HiLoad 26/60Superdex 75柱对其进行进一步纯化。最后,使用Amicon Ultra离心过滤器单元(Utra-15 MWCO 10kDa)将KAT5蛋白浓缩至1.5mg/mL,在液氮中速冻并储存在-70℃的冰箱中。
KAT6A
分子生物学:通过PCR扩增了编码人KAT6A的氨基酸残基507至778(UniprotQ92794-1)的DNA序列并将其连接到被设计成编码NusA溶解性标签的修饰的pET大肠杆菌表达载体中,接着是六组氨酸标签和烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEV)切割位点和KAT6A序列。所产生的蛋白序列列示如下(SEQ ID NO:6)。
MNKEILAVVEAVSNEKALPREKIFEALESALATATKKKYEQEIDVRVQIDRKSGDFDTFRRWLVVDEVTQPTKEITLEAARYEDESLNLGDYVEDQIESVTFDRITTQTAKQVIVQKVREAERAMVVDQFREHEGEIITGVVKKVNRDNISLDLGNNAEAVILREDMLPRENFRPGDRVRGVLYSVRPEARGAQLFVTRSKPEMLIELFRIEVPEIGEEVIEIKAAARDPGSRAKIAVKTNDKRIDPVGACVGMRGARVQAVSTELGGERIDIVLWDDNPAQFVINAMAPADVASIVVDEDKHTMDIAVEAGNLAQAIGRNGQNVRLASQLSGWELNVMTVDDLQAKHQAEAHAAIDTFTKYLDIDEDFATVLVEEGFSTLEELAYVPMKELLEIEGLDEPTVEALRERAKNALATIAQAQEESLGDNKPADDLLNLEGVDRDLAFKLAARGVCTLEDLAEQGIDDLADIEGLTDEKAGALIMAARNICWFGDEATSGSGHHHHHHSAGENLYFQGAMGRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRLPKLYLCEFCLKYMKSRTILQQHMKKCGWFHPPVNEIYRKNNISVFEVDGNVSTIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTQNDVKGCHLVGYFSKEKHCQQKYNVSCIMILPQYQRKGYGRFLIDFSYLLSKREGQAGSPEKPLSDLGRLSYMAYWKSVILECLYHQNDKQISIKKLSKLTGICPQDITSTLHHLRMLDFRSDQFVIIRREKLIQDHMAKLQLNLRPVDVDPECLRWTP
蛋白表达:为了产生重组KAT6A蛋白,将表达质粒转化到大肠杆菌BL21 DE3菌株中并在37℃下在补充有100μg/mL氨苄青霉素的1L体积的Terrific肉汤(TB)培养基中振荡生长,直到OD600达到0.8。将培养物转移到18℃并通过添加异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷至最终浓度为0.5mM来诱导蛋白表达,并将培养物再振荡过夜16小时。在表达后,将细胞培养物以5000x g离心20min并将细胞团块在-20℃下冷冻储存。
蛋白纯化:通过用每1g细胞5mL缓冲液的比例,使细胞团块(40g湿重)在裂解缓冲液(25mM Tris-HCl pH 7.8,500mM NaCl,5mM DTT,0.01%[v/v]Triton-X 100,5%[v/v]甘油,2mM MgCl2,10mM咪唑,0.5mg/mL溶菌酶,benzonase核酸内切酶[EMD Millipore],1mMPMSF,不含EDTA的全蛋白酶抑制剂片[Roche])中解冻来启动蛋白纯化。通过使细胞经过冰冷却的Avestin C5细胞破碎机3次(在15000psi下)使其进一步裂解,然后在4℃下以48,000x g离心。经5μm过滤器过滤上清液(细胞裂解物),并且用Profinia亲和色谱法纯化系统(Bio-Rad)将其施加到用IMAC洗涤缓冲液(25mM Tris-HCl pH 7.8,500mM NaCl,5mM DTT,0.01%[v/v]Triton-X 100,5%[v/v]甘油,20mM咪唑)预平衡的5mL HiTrap IMAC琼脂糖凝胶FF柱(GE Healthcare)上。然后用IMAC洗涤缓冲液冲洗IMAC柱,并用IMAC洗脱缓冲液(25mM Tris-HCl pH 7.8,500mM NaCl,5%[v/v]甘油,5mM DTT,250mM咪唑)洗脱结合的KAT6A蛋白。通过使IMAC洗脱的蛋白经过在储存缓冲液(25mM Tris-HCl pH 7.8,500mMNaCl,5mM DTT,5%[v/v]甘油)中预平衡的HiLoad 26/60Superdex 200柱对其进行进一步纯化。最后,使用Amicon Ultra离心过滤器单元(Utra-15 MWCO 10kDa)将KAT6A蛋白浓缩至≤1mg/mL,在液氮中速冻并储存在-70℃的冰箱中。
KAT7
分子生物学:由GenScript USA Inc(Piscataway,New Jersey,USA)合成了编码人KAT7的氨基酸残基325至611(Uniprot O95251-1)的密码子优化的DNA序列。将该DNA序列连接到被设计成编码N末端六组氨酸标签的修饰的pET43a大肠杆菌表达载体中,接着是烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEV)切割位点和KAT7序列。所产生的蛋白序列在以下列出(SEQ ID NO:7)。
MGHHHHHHGTENLYFQGSRLQGQITEGSNMIKTIAFGRYELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSISVFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKNSFLNYNVSCILTMPQYMRQGYGKMLIDFSYLLSKVEEKVGSPERPLSDLGLISYRSYWKEVLLRYLHNFQGKEISIKEISQETAVNPVDIVSTLQALQMLKYWKGKHLVLKRQDLIDEWIAKEAKRSNSNKTMDPSCLKWTPPKGTAS
蛋白表达:为了产生重组KAT7蛋白,将表达质粒转化到大肠杆菌BL21 DE3 RIL菌株中并在37℃下在补充有100μg/mL氨苄青霉素和50μM锌的1L体积的Terrific肉汤(TB)中振荡生长,直到OD600达到0.8。将培养物转移到18℃并通过加入异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷至最终浓度为0.5mM来诱导蛋白表达,并使培养物再振荡过夜16小时。在表达后,使细胞培养物以5000x g离心20min并将细胞团块在-20℃下冷冻储存。
蛋白纯化:通过用每1g细胞10mL缓冲液的比例,使细胞团块(10g湿重)在裂解缓冲液(50mM Hepes pH 7.5,300mM NaCl,5mM DTT,5mM咪唑,0.05%[v/v]Brij 35,10%[v/v]甘油,3mM MgCl2,0.5mg/mL溶菌酶,benzonase核酸内切酶[EMD Millipore],1mM PMSF,不含EDTA的全蛋白酶抑制剂片[Roche])中解冻来启动蛋白纯化。使用Misonix液体处理器(6x30秒脉冲,振幅60[70瓦特]),通过声波处理使细胞进一步裂解,然后在4℃下以48,000xg离心。将上清液(细胞裂解物)与用IMAC洗涤缓冲液1(25mM Hepes pH 7.5,800mM NaCl,5mM咪唑,10%[v/v]甘油,5mM DTT,0.01%[v/v]Brij 35,50mM精氨酸,50mM谷氨酸)预平衡的1mL cOmplete His-标签纯化树脂(Roche)一起孵育。利用IMAC洗涤缓冲液1和IMAC洗涤缓冲液2(25mM hepes pH 7.5,300mM NaCl,20mM咪唑,10%[v/v]甘油,5mM DTT,0.01%[v/v]Brij 35,50mM精氨酸,50mM谷氨酸)依次洗涤树脂。用IMAC洗脱缓冲液(25mM hepes pH7.5,200mM NaCl,500mM咪唑,10%[v/v]甘油,5mM DTT 0.01%[v/v]Brij 35,50mM精氨酸,50mM谷氨酸)洗脱结合的KAT7蛋白。将洗脱的蛋白直接收集到4体积的脱盐缓冲液(50mM柠檬酸钠pH 6.5,200mM NaCl,0.01%[v/v]Brij 35,10%[v/v]甘油,5mM DTT)中,以使最终咪唑浓度为100mM。使用串联的2xHiPrep 26/10脱盐柱(GE Healthcare),将IMAC洗脱的蛋白立即脱盐到脱盐缓冲液中。通过使脱盐的蛋白经过在储存缓冲液(50mM柠檬酸钠pH 6.5,200mM NaCl,10%[v/v]甘油,5mM DTT)中预平衡的HiLoad 26/60Superdex 75柱对其进行进一步纯化。最后,用Amicon Ultra离心过滤器单元(Utra-15 MWCO 10kDa)将KAT7蛋白浓缩至3.5mg/mL,在液氮中速冻并储存于-70℃的冰箱中。
乙酰基转移酶生物化学分析
为了确定测试化合物对KAT酶活性的抑制,在384孔低容量分析板中以8μL的体积进行了分析反应。在分析缓冲液(100mM Tris-HCl,pH 7.8,15mM NaCl,1mM EDTA,0.01%吐温20,1mM二硫苏糖醇和0.01%m/v鸡蛋白蛋白)中进行分析反应。
用1μM乙酰辅酶A、100nM通过限制生物素化(limited biotinylation)标记的全长重组组蛋白(KAT6A、KAT7:H3.1、KAT5)、分别为10/5/8/40/20nM的KAT5/KAT6A/KAT7酶和乙酰基-赖氨酸特异性抗体(H3.1:Cell Signaling Technology,H4:Abcam)建立反应。在DMSO中制备测试化合物的11点稀释系列;使用针头(pin tool)将100nL的体积转移到含有底物的分析板中,然后加入酶以开始反应。阳性(无化合物,仅DMSO)和阴性(省去AcCoA)对照反应包括在同一板上,并且接受与化合物处理的孔相同量的DMSO。在加入所有试剂后,将板用粘合密封件密封且在室温下孵育90min。然后加入另外4μL的含有
Figure BDA0003504892550001692
蛋白A受体珠及链霉亲和素供体珠(PerkinElmer,Waltham,MA)的分析缓冲液至最终浓度为8μg/mL。在孵育2小时后,用EnVision 2103多标记读板仪(PerkinElmer)以HTS
Figure BDA0003504892550001693
模式读板。通过以下步骤由原始读数获得了IC50值:计算同一板上每个反应相对于对照的抑制百分比(I%)(I%=(I-CN)/(CP-CN),其中CN/CP分别为阴性/阳性反应的平均值),然后将I%数据对化合物浓度[I]拟合成I%=(A+((B-A)/(1+((C/[I])^D)))),其中A为下渐近线,B为上渐近线,C为IC50值,D为斜率。
结果显示在下表23中:
表23:
Figure BDA0003504892550001691
组蛋白H3赖氨酸23乙酰化生物标志物分析
在以下分析中测试了化合物抑制组蛋白H3K23标志物乙酰化的能力:
在96孔光学质量组织培养板中将细胞系U2OS以9,000个细胞/孔的密度接种于RPMI培养基及10%胎牛血清中,并使其在标准培养条件(37摄氏度,5%CO2)下贴壁24小时。在该时间段结束时,将培养基吸出。将在DMSO中制备的化合物稀释液添加到培养基,其中保留阴性对照孔仅用DMSO处理且100%抑制阳性对照接受10μM浓度的强效抑制剂化合物(例如cas 2055397-28-7,苯甲酸,3-氟-5-(2-吡啶基)-,2-[(2-氟苯基)磺酰基]酰肼)(Baell,J.,Nguyen,H.N.,Leaver,D.J.,Cleary,B.L.,Lagiakos,H.R.,Sheikh,B.N.,Thomas.T.J.,Aryl sulfonohydrazides,WO2016198507A1,2016),并将200μL转移到细胞。孵育24小时后,用3.7%甲醛的PBS溶液将细胞在室温下固定20分钟,用含有0.1%吐温20的磷酸盐缓冲盐水洗涤(5x5分钟),且用含有0.1%TritonX100的Odyssey封闭缓冲液(LI-COR,Lincoln,NE)封闭。添加在含有0.1%吐温20的Odyssey封闭缓冲液中的抗H3K23ac特异性抗体(Abcamab177275),并在4摄氏度下孵育16小时。在洗涤(如上文)后,加入用Alexa647染料(LifeTechnologies)和Hoechst 33342(1μg/mL,SigmaAldrich)标记的二抗孵育1小时。如前所述洗涤板并在PerkinElmer Phenix高内涵成像平台上读取。使用Columbus影像分析管线,通过Hoechst 33342染色定位单个细胞核,通过同一区域中的Alexa647相关强度计算乙酰化水平。将产生的每个细胞的平均强度直接转化为相对于同一板上的对照的抑制百分比,且针对四参数对数模型拟合数据以确定50%抑制浓度(IC50)。
结果示于下表24中:
表24:
实施例 组蛋白H3赖氨酸23生物标志物IC50(μM)
98 =0.0006
99 N/D
100 =0.046
101 N/D
102 N/D
组蛋白H3赖氨酸14乙酰化生物标志物分析
在以下分析中测试了化合物抑制组蛋白H3赖氨酸14标志物乙酰化的能力:
在384孔光学质量组织培养板中以3,000个细胞/孔的密度将细胞系U2OS接种于补充有10%胎牛血清和10mM Hepes的RPMI培养基中。使细胞在标准培养条件(37摄氏度,5%CO2)下贴壁24小时。在该时间段结束时,用无血清培养基洗涤细胞。将在DMSO中制备的化合物稀释液添加到无血清培养基,其中保留阴性对照孔仅用DMSO处理且100%抑制阳性对照接受10μM浓度的强效抑制剂化合物(例如(Z)-4-氟-N-((3-羟基苯基)磺酰基)-5-甲基-[1,1'-联苯基]-3-甲酰肼)。孵育24小时后,用4%甲醛的PBS溶液将细胞在室温下固定15分钟,用磷酸盐缓冲盐水洗涤并用含有0.2%TritonX100和2%BSA的封闭缓冲液封闭。添加在封闭缓冲液中的抗H3K14ac特异性抗体(Cell Signalling Technologies),并在4摄氏度下孵育过夜。在洗涤后,添加用AlexaFluor 488染料(ThermoFisher)和Hoechst 33342(1μg/mL,Life Technologies)标记的二抗,在室温下孵育2小时。洗涤板且在PerkinElmer OperaHCS高内涵成像平台上读取。使用Columbus影像分析管线,通过Hoechst 33342染色定位单个细胞核,通过同一区域中的AlexaFluor 488相关强度计算乙酰化水平。将产生的每个细胞的平均强度转化成相对于同一板上的对照的抑制百分比,并针对四参数对数模型拟合数据以确定50%抑制浓度(IC50)。
结果显示在下表25中:
表25:
实施例 组蛋白H3赖氨酸14生物标志物IC50(μM)
98 N/D
99 =1.55
100 =1.36
101 N/D
102 =28.33
H2A.Z赖氨酸7乙酰化生物标志物分析
在以下分析中测试了化合物抑制组蛋白H2A.Z赖氨酸7乙酰化标志物的能力:
在384孔光学质量组织培养板中以3,000个细胞/孔的密度将细胞系U2OS接种于补充有10%胎牛血清和10mM Hepes的RPMI培养基中。使细胞在标准培养条件(37摄氏度,5%CO2)下贴壁24小时。在该时间段结束时,用无血清培养基洗涤细胞。将在DMSO中制备的化合物稀释液添加到无血清培养基,其中保留阴性对照孔仅用DMSO处理且100%抑制阳性对照接受30μM浓度的强效抑制剂化合物7-碘-N-(2-(噁唑-2-基)-2-苯基乙基)-2H-苯并[e][1,2,4]噻二嗪-3-甲酰胺1,1-二氧化物的对映异构体1,其为2018年8月31日提交的共同待决申请案GB1713962.7的化合物146。孵育24小时后,用4%甲醛的PBS溶液将细胞在室温下固定15分钟,用磷酸盐缓冲盐水洗涤并用含有0.2%TritonX100和2%BSA的封闭缓冲液封闭。添加在封闭缓冲液中的抗H2A.ZK7ac特异性抗体(Abcam),并在4摄氏度下孵育过夜。在洗涤后,添加用AlexaFluor 488染料(ThermoFisher)和Hoechst 33342(1μg/mL,LifeTechnologies)标记的二抗,在室温下孵育2小时。洗涤板并在PerkinElmer Opera HCS高内涵成像平台上读取。使用Columbus影像分析管线,通过Hoechst 33342染色定位单个细胞核,通过同一区域中的AlexaFluor 488相关强度计算乙酰化程度。将产生的每个细胞的平均强度转化成相对于同一板上的对照的抑制百分比,并针对四参数对数模型拟合数据以确定50%抑制浓度(IC50)。
结果显示在下表26中:
表26:
实施例 H2A.Z赖氨酸7生物标志物IC50(μM)
98 N/D
99 =11.40
100 =14.98
101 N/D
102 >40.00
参考文献
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CTXT PTY LTD
<120> 苯并异噁唑磺酰胺衍生物
<130> PC072525A
<150> US 62/863,199
<151> 2019-06-18
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<150> US 63/025,278
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<160> 7
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 20
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1
Ala Arg Thr Lys Gln Thr Ala Arg Lys Ser Thr Gly Gly Lys Ala Pro
1 5 10 15
Arg Lys Gln Leu
20
<210> 2
<211> 20
<212> PRT
<213> 智人
<400> 2
Ser Gly Arg Gly Lys Gly Gly Lys Gly Leu Gly Lys Gly Gly Ala Lys
1 5 10 15
Arg His Arg Lys
20
<210> 3
<211> 21
<212> PRT
<213> 智人
<400> 3
Ala Arg Thr Lys Gln Thr Ala Arg Lys Ser Thr Gly Gly Lys Ala Pro
1 5 10 15
Arg Lys Gln Leu Ala
20
<210> 4
<211> 21
<212> PRT
<213> 智人
<400> 4
Ser Gly Arg Gly Lys Gly Gly Lys Gly Leu Gly Lys Gly Gly Ala Lys
1 5 10 15
Arg His Arg Lys Val
20
<210> 5
<211> 480
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 修饰的KAT5蛋白
<400> 5
Met Gly His His His His His His Gly Thr Glu Asn Leu Tyr Phe Gln
1 5 10 15
Gly Ser Ala Glu Val Gly Glu Ile Ile Glu Gly Cys Arg Leu Pro Val
20 25 30
Leu Arg Arg Asn Gln Asp Asn Glu Asp Glu Trp Pro Leu Ala Glu Ile
35 40 45
Leu Ser Val Lys Asp Ile Ser Gly Arg Lys Leu Phe Tyr Val His Tyr
50 55 60
Ile Asp Phe Asn Lys Arg Leu Asp Glu Trp Val Thr His Glu Arg Leu
65 70 75 80
Asp Leu Lys Lys Ile Gln Phe Pro Lys Lys Glu Ala Lys Thr Pro Thr
85 90 95
Lys Asn Gly Leu Pro Gly Ser Arg Pro Gly Ser Pro Glu Arg Glu Val
100 105 110
Lys Arg Lys Val Glu Val Val Ser Pro Ala Thr Pro Val Pro Ser Glu
115 120 125
Thr Ala Pro Ala Ser Val Phe Pro Gln Asn Gly Ala Ala Arg Arg Ala
130 135 140
Val Ala Ala Gln Pro Gly Arg Lys Arg Lys Ser Asn Cys Leu Gly Thr
145 150 155 160
Asp Glu Asp Ser Gln Asp Ser Ser Asp Gly Ile Pro Ser Ala Pro Arg
165 170 175
Met Thr Gly Ser Leu Val Ser Asp Arg Ser His Asp Asp Ile Val Thr
180 185 190
Arg Met Lys Asn Ile Glu Cys Ile Glu Leu Gly Arg His Arg Leu Lys
195 200 205
Pro Trp Tyr Phe Ser Pro Tyr Pro Gln Glu Leu Thr Thr Leu Pro Val
210 215 220
Leu Tyr Leu Cys Glu Phe Cys Leu Lys Tyr Gly Arg Ser Leu Lys Cys
225 230 235 240
Leu Gln Arg His Leu Thr Lys Cys Asp Leu Arg His Pro Pro Gly Asn
245 250 255
Glu Ile Tyr Arg Lys Gly Thr Ile Ser Phe Phe Glu Ile Asp Gly Arg
260 265 270
Lys Asn Lys Ser Tyr Ser Gln Asn Leu Cys Leu Leu Ala Lys Cys Phe
275 280 285
Leu Asp His Lys Thr Leu Tyr Tyr Asp Thr Asp Pro Phe Leu Phe Tyr
290 295 300
Val Met Thr Glu Tyr Asp Cys Lys Gly Phe His Ile Val Gly Tyr Phe
305 310 315 320
Ser Lys Glu Lys Glu Ser Thr Glu Asp Tyr Asn Val Ala Cys Ile Leu
325 330 335
Thr Leu Pro Pro Tyr Gln Arg Arg Gly Tyr Gly Lys Leu Leu Ile Glu
340 345 350
Phe Ser Tyr Glu Leu Ser Lys Val Glu Gly Lys Thr Gly Thr Pro Glu
355 360 365
Lys Pro Leu Ser Asp Leu Gly Leu Leu Ser Tyr Arg Ser Tyr Trp Ser
370 375 380
Gln Thr Ile Leu Glu Ile Leu Met Gly Leu Lys Ser Glu Ser Gly Glu
385 390 395 400
Arg Pro Gln Ile Thr Ile Asn Glu Ile Ser Glu Ile Thr Ser Ile Lys
405 410 415
Lys Glu Asp Val Ile Ser Thr Leu Gln Tyr Leu Asn Leu Ile Asn Tyr
420 425 430
Tyr Lys Gly Gln Tyr Ile Leu Thr Leu Ser Glu Asp Ile Val Asp Gly
435 440 445
His Glu Arg Ala Met Leu Lys Arg Leu Leu Arg Ile Asp Ser Lys Cys
450 455 460
Leu His Phe Thr Pro Lys Asp Trp Ser Lys Arg Gly Lys Trp Ala Ser
465 470 475 480
<210> 6
<211> 791
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 修饰的KAT6A蛋白
<400> 6
Met Asn Lys Glu Ile Leu Ala Val Val Glu Ala Val Ser Asn Glu Lys
1 5 10 15
Ala Leu Pro Arg Glu Lys Ile Phe Glu Ala Leu Glu Ser Ala Leu Ala
20 25 30
Thr Ala Thr Lys Lys Lys Tyr Glu Gln Glu Ile Asp Val Arg Val Gln
35 40 45
Ile Asp Arg Lys Ser Gly Asp Phe Asp Thr Phe Arg Arg Trp Leu Val
50 55 60
Val Asp Glu Val Thr Gln Pro Thr Lys Glu Ile Thr Leu Glu Ala Ala
65 70 75 80
Arg Tyr Glu Asp Glu Ser Leu Asn Leu Gly Asp Tyr Val Glu Asp Gln
85 90 95
Ile Glu Ser Val Thr Phe Asp Arg Ile Thr Thr Gln Thr Ala Lys Gln
100 105 110
Val Ile Val Gln Lys Val Arg Glu Ala Glu Arg Ala Met Val Val Asp
115 120 125
Gln Phe Arg Glu His Glu Gly Glu Ile Ile Thr Gly Val Val Lys Lys
130 135 140
Val Asn Arg Asp Asn Ile Ser Leu Asp Leu Gly Asn Asn Ala Glu Ala
145 150 155 160
Val Ile Leu Arg Glu Asp Met Leu Pro Arg Glu Asn Phe Arg Pro Gly
165 170 175
Asp Arg Val Arg Gly Val Leu Tyr Ser Val Arg Pro Glu Ala Arg Gly
180 185 190
Ala Gln Leu Phe Val Thr Arg Ser Lys Pro Glu Met Leu Ile Glu Leu
195 200 205
Phe Arg Ile Glu Val Pro Glu Ile Gly Glu Glu Val Ile Glu Ile Lys
210 215 220
Ala Ala Ala Arg Asp Pro Gly Ser Arg Ala Lys Ile Ala Val Lys Thr
225 230 235 240
Asn Asp Lys Arg Ile Asp Pro Val Gly Ala Cys Val Gly Met Arg Gly
245 250 255
Ala Arg Val Gln Ala Val Ser Thr Glu Leu Gly Gly Glu Arg Ile Asp
260 265 270
Ile Val Leu Trp Asp Asp Asn Pro Ala Gln Phe Val Ile Asn Ala Met
275 280 285
Ala Pro Ala Asp Val Ala Ser Ile Val Val Asp Glu Asp Lys His Thr
290 295 300
Met Asp Ile Ala Val Glu Ala Gly Asn Leu Ala Gln Ala Ile Gly Arg
305 310 315 320
Asn Gly Gln Asn Val Arg Leu Ala Ser Gln Leu Ser Gly Trp Glu Leu
325 330 335
Asn Val Met Thr Val Asp Asp Leu Gln Ala Lys His Gln Ala Glu Ala
340 345 350
His Ala Ala Ile Asp Thr Phe Thr Lys Tyr Leu Asp Ile Asp Glu Asp
355 360 365
Phe Ala Thr Val Leu Val Glu Glu Gly Phe Ser Thr Leu Glu Glu Leu
370 375 380
Ala Tyr Val Pro Met Lys Glu Leu Leu Glu Ile Glu Gly Leu Asp Glu
385 390 395 400
Pro Thr Val Glu Ala Leu Arg Glu Arg Ala Lys Asn Ala Leu Ala Thr
405 410 415
Ile Ala Gln Ala Gln Glu Glu Ser Leu Gly Asp Asn Lys Pro Ala Asp
420 425 430
Asp Leu Leu Asn Leu Glu Gly Val Asp Arg Asp Leu Ala Phe Lys Leu
435 440 445
Ala Ala Arg Gly Val Cys Thr Leu Glu Asp Leu Ala Glu Gln Gly Ile
450 455 460
Asp Asp Leu Ala Asp Ile Glu Gly Leu Thr Asp Glu Lys Ala Gly Ala
465 470 475 480
Leu Ile Met Ala Ala Arg Asn Ile Cys Trp Phe Gly Asp Glu Ala Thr
485 490 495
Ser Gly Ser Gly His His His His His His Ser Ala Gly Glu Asn Leu
500 505 510
Tyr Phe Gln Gly Ala Met Gly Arg Cys Pro Ser Val Ile Glu Phe Gly
515 520 525
Lys Tyr Glu Ile His Thr Trp Tyr Ser Ser Pro Tyr Pro Gln Glu Tyr
530 535 540
Ser Arg Leu Pro Lys Leu Tyr Leu Cys Glu Phe Cys Leu Lys Tyr Met
545 550 555 560
Lys Ser Arg Thr Ile Leu Gln Gln His Met Lys Lys Cys Gly Trp Phe
565 570 575
His Pro Pro Val Asn Glu Ile Tyr Arg Lys Asn Asn Ile Ser Val Phe
580 585 590
Glu Val Asp Gly Asn Val Ser Thr Ile Tyr Cys Gln Asn Leu Cys Leu
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Leu Ala Lys Leu Phe Leu Asp His Lys Thr Leu Tyr Tyr Asp Val Glu
610 615 620
Pro Phe Leu Phe Tyr Val Leu Thr Gln Asn Asp Val Lys Gly Cys His
625 630 635 640
Leu Val Gly Tyr Phe Ser Lys Glu Lys His Cys Gln Gln Lys Tyr Asn
645 650 655
Val Ser Cys Ile Met Ile Leu Pro Gln Tyr Gln Arg Lys Gly Tyr Gly
660 665 670
Arg Phe Leu Ile Asp Phe Ser Tyr Leu Leu Ser Lys Arg Glu Gly Gln
675 680 685
Ala Gly Ser Pro Glu Lys Pro Leu Ser Asp Leu Gly Arg Leu Ser Tyr
690 695 700
Met Ala Tyr Trp Lys Ser Val Ile Leu Glu Cys Leu Tyr His Gln Asn
705 710 715 720
Asp Lys Gln Ile Ser Ile Lys Lys Leu Ser Lys Leu Thr Gly Ile Cys
725 730 735
Pro Gln Asp Ile Thr Ser Thr Leu His His Leu Arg Met Leu Asp Phe
740 745 750
Arg Ser Asp Gln Phe Val Ile Ile Arg Arg Glu Lys Leu Ile Gln Asp
755 760 765
His Met Ala Lys Leu Gln Leu Asn Leu Arg Pro Val Asp Val Asp Pro
770 775 780
Glu Cys Leu Arg Trp Thr Pro
785 790
<210> 7
<211> 307
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 修饰的KAT7蛋白
<400> 7
Met Gly His His His His His His Gly Thr Glu Asn Leu Tyr Phe Gln
1 5 10 15
Gly Ser Arg Leu Gln Gly Gln Ile Thr Glu Gly Ser Asn Met Ile Lys
20 25 30
Thr Ile Ala Phe Gly Arg Tyr Glu Leu Asp Thr Trp Tyr His Ser Pro
35 40 45
Tyr Pro Glu Glu Tyr Ala Arg Leu Gly Arg Leu Tyr Met Cys Glu Phe
50 55 60
Cys Leu Lys Tyr Met Lys Ser Gln Thr Ile Leu Arg Arg His Met Ala
65 70 75 80
Lys Cys Val Trp Lys His Pro Pro Gly Asp Glu Ile Tyr Arg Lys Gly
85 90 95
Ser Ile Ser Val Phe Glu Val Asp Gly Lys Lys Asn Lys Ile Tyr Cys
100 105 110
Gln Asn Leu Cys Leu Leu Ala Lys Leu Phe Leu Asp His Lys Thr Leu
115 120 125
Tyr Tyr Asp Val Glu Pro Phe Leu Phe Tyr Val Met Thr Glu Ala Asp
130 135 140
Asn Thr Gly Cys His Leu Ile Gly Tyr Phe Ser Lys Glu Lys Asn Ser
145 150 155 160
Phe Leu Asn Tyr Asn Val Ser Cys Ile Leu Thr Met Pro Gln Tyr Met
165 170 175
Arg Gln Gly Tyr Gly Lys Met Leu Ile Asp Phe Ser Tyr Leu Leu Ser
180 185 190
Lys Val Glu Glu Lys Val Gly Ser Pro Glu Arg Pro Leu Ser Asp Leu
195 200 205
Gly Leu Ile Ser Tyr Arg Ser Tyr Trp Lys Glu Val Leu Leu Arg Tyr
210 215 220
Leu His Asn Phe Gln Gly Lys Glu Ile Ser Ile Lys Glu Ile Ser Gln
225 230 235 240
Glu Thr Ala Val Asn Pro Val Asp Ile Val Ser Thr Leu Gln Ala Leu
245 250 255
Gln Met Leu Lys Tyr Trp Lys Gly Lys His Leu Val Leu Lys Arg Gln
260 265 270
Asp Leu Ile Asp Glu Trp Ile Ala Lys Glu Ala Lys Arg Ser Asn Ser
275 280 285
Asn Lys Thr Met Asp Pro Ser Cys Leu Lys Trp Thr Pro Pro Lys Gly
290 295 300
Thr Ala Ser
305

Claims (34)

1.式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003504892540000011
其中
R1为氢或任选地被甲基取代的5-6元杂芳基;
R2为氢或任选地被卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH取代的-(CHR8)n-(5-9元杂芳基),
条件是R1和R2之一为氢,
另外的条件是R1和R2不都为氢;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
环A为C6-C10芳基或9-10元杂芳基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基;
R8为氢或-OH;并且
n为0或1。
2.权利要求1所述的化合物或盐,其中R1为5-6元杂芳基且R2为氢。
3.权利要求1所述的化合物或盐,其中R1为氢且R2为5-6元杂芳基。
4.权利要求1所述的化合物或盐,其具有式(II)
Figure FDA0003504892540000021
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
环A为C6-C10芳基或9-10元杂芳基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;并且
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
5.权利要求1-4中任一项所述的化合物或盐,其中环A为苯基、喹啉基、苯并噁唑基、茚满基或四氢萘基。
6.权利要求5所述的化合物或盐,其中环A为苯基。
7.权利要求1或权利要求4所述的化合物或盐,其具有式(III)
Figure FDA0003504892540000031
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、-CHF2、-CF3、C1-C4烷氧基、-OCHF2或-OCF3
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;并且
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
8.权利要求1、4或7中任一项所述的化合物或盐,其具有式(IV)
Figure FDA0003504892540000032
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R5为氢、氟、氰基、C1-C3烷基、-CHF2、-CF3、环丙基、C1-C3烷氧基、-OCHF2、-OCF3、-O-环丙基、-CH2-O-CH3、-C(O)OCH3或-C(O)N(H)CH3
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基;并且
R7为氢、溴、氯、氟或甲氧基。
9.权利要求1-8中任一项所述的化合物或盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基,R7为氢。
10.权利要求1-8中任一项所述的化合物或盐,其中R5为甲氧基,R6为氢,R7为氢。
11.权利要求1、4或7中任一项所述的化合物或盐,其具有式(VI)
Figure FDA0003504892540000041
其中
R2a不存在,为卤素、C1-C3烷基、-CH2OH或-OH;
R3为氢、卤素或C1-C3烷基;
R4为氢、卤素、C1-C3烷基、环丙基、C1-C4烷氧基或-O-环丙基,
条件是R3和R4中至少一个为氢;
R5为氢、甲基、-CH2-OCH3、-CF3、C1-C3烷氧基或-C(O)OCH3;并且
R6为氢、氟、甲基、-OH或甲氧基。
12.权利要求1-11中任一项所述的化合物或盐,其中R2a不存在,为氟、甲基、-CH2OH或-OH。
13.权利要求1-11中任一项所述的化合物或盐,其中R2a不存在。
14.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R3为氢、卤素或C1-C3烷基。
15.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R3为氢、氟、溴或甲基。
16.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R4为氢、氟、甲基、乙基、环丙基、-O-环丙基或C1-C4烷氧基。
17.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R4为氢。
18.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R4为C1-C3烷氧基。
19.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R4为甲氧基。
20.权利要求1-7或11-13中任一项所述的化合物或盐,其中R3和R4中至少一个为氢。
21.权利要求11-20中任一项所述的化合物或盐,其中R5为甲氧基,R6为甲氧基。
22.权利要求11-20中任一项所述的化合物或盐,其中R5为甲氧基,R6为氢。
23.权利要求1所述的化合物,其为
Figure FDA0003504892540000051
或其药学上可接受的盐。
24.权利要求1所述的化合物,其为
Figure FDA0003504892540000061
或其药学上可接受的盐。
25.权利要求1所述的化合物,其为
Figure FDA0003504892540000062
或其药学上可接受的盐。
26.一种药物组合物,其包含前述权利要求中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,和药学上可接受的载体或稀释剂。
27.一种治疗患者的癌症的方法,其包括给予该患者有效治疗癌症的量的权利要求1-25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
28.权利要求27所述的方法,其中所述癌症为乳腺癌。
29.权利要求27所述的方法,其中所述癌症为ER阳性乳腺癌。
30.权利要求1-25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐与抗肿瘤剂或与放射治疗的组合,其用于治疗癌症。
31.权利要求1-25中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐与抗肿瘤剂的组合,其用于治疗癌症。
32.权利要求30或31所述的组合,其中所述癌症为乳腺癌。
33.权利要求32所述的组合,其中所述乳腺癌为ER阳性乳腺癌。
34.2-甲氧基-N-{4-甲氧基-6-[(1H-吡唑-1-基)甲基]-1,2-苯并噁唑-3-基}苯-1-磺酰胺无水游离碱的晶型,其具有包含在以下2θ值处的峰的粉末X射线衍射图:13.4和18.1°2θ±0.2°2θ。
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