BCMA抗原结合蛋白
相关申请的交叉引用
本申请根据35 U.S.C.§119要求2012年12月7日提交的美国临时申请序列号61/734,767、2013年2月1日提交的美国临时申请序列号61/759,702、2013年3月8日提交的美国临时申请序列号61/775,125和2013年10月11日提交的美国临时申请序列号61/890,064的权益,所述临时申请在此以引用的方式并入。
发明领域
本发明涉及B细胞成熟抗原(BCMA)抗原结合蛋白,尤其是抗体,编码所述抗原结合蛋白的多核苷酸序列及用于治疗疾病的组合物和方法。本发明的方面还包括抗体药物偶联物及其用途。
背景
B细胞成熟抗原(BCMA)、B细胞活化因子受体(BAFF-R)及跨膜活化剂和钙调节剂与亲环素配体相互作用分子(TACI)通过衔接增殖诱导配体(APRIL)和/或BAFF(B细胞活化因子)来促进B细胞在不同发育阶段存活。异常的信号传导可促进B细胞存活和增殖,导致自身免疫和肿瘤形成。关于综述,参见Rickert等人,ImmunologicalReviews 2011,第244卷:115-133。
BAFF和APRIL展现结构相似性和重叠但不同的受体结合特异性。BAFF和APRIL结合BCMA,但APRIL:BCMA相互作用具有较高的亲和力,而BAFF-R仅以高亲和力结合BAFF。负性调节因子TACI以相似的亲和力结合BAFF和APRIL。B细胞谱系中的BCMA表达局限于胚中心B细胞、记忆B细胞(在人中)和浆细胞。BCMA是用于BAFF和APRIL在骨髓浆细胞上衔接的受体,尽管TACI也在这些细胞上表达。长寿命浆细胞的存活不需要BAFF,但取决于APRIL。
BCMA表达高度局限于浆细胞。多发性骨髓瘤是由恶性浆细胞的克隆扩增引起的。到2020年,主要市场上多发性骨髓瘤(MM)新发病例的总数将从46,400增加到55,300。新诊断的骨髓瘤病例在三个疾病阶段相似地分布,其中阶段1、2和3各占诊断病例的约33%。在美国,每年有大约20,500人被诊断患有多发性骨髓瘤且每年几乎有11,000位MM患者死亡。尽管存在疗法进步,但多发性骨髓瘤仍然是无法治愈的疾病,参见Jemal A等人,CA Cancer J Clin.2008;58:71-96;Kyle RA等人,Mayo Clin Proc.2003;778:21-33;BergsagelDE等人,Blood.1999,94:1174-1182。
附图简述
图1显示人BCMA(SEQ ID NO:285)和猕猴(食蟹猴(Macacafascicularis))BCMA(SEQ ID NO:286)的氨基酸序列。
图2是显示示例性连接子和毒素结构的抗体药物偶联物的一个实施方案的示意图。
图3显示BCMA mRNA在>99%的多发性骨髓瘤患者样本上表达。
图4A和B是两种方案的单克隆抗体产生、筛选和表征的示意图。
图5A-C是两种方案的单克隆抗体产生、筛选和表征的数据表。
图6显示2A1和1E1mAb与骨髓瘤细胞系H929的结合。
图7显示各种骨髓瘤和B细胞系上的2A1mAb结合的BCMA。
图8是2A1和1E1抗体的ADCC活性图(2A1的EC50为11ng/ml且1E1的EC50为76ng/ml)。
图9显示2A1抗体在H929细胞上与BCMA结合后易于内化。
图10是通过质谱法分析的各种2A1-MCC-DM1 ADC。
图11描绘与不同的连接子和美登素(maytansine)分子偶联并对其杀伤骨髓瘤细胞的能力进行分析的两种不同抗体(2A1和1E)。
图12A-F显示针对各种多发性骨髓瘤细胞系测试2A1-MCC-DM1 ADC,包括H929、U266、MMIR、MMIS、EW36B细胞淋巴瘤细胞系和RAMOS伯基特淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)细胞系。
图13图示说明暴露于游离DM1且实际上被游离DM1杀伤的各种细胞系。
图14A和B显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的Tm。
图15是显示各种2A1 mAb协变突变蛋白与H919细胞结合的图。
图16A和B显示一些2A1突变蛋白抗体与BCMA保持相对于亲本2A1(2A1WT)而言相当的结合,而2A1协变3、8、9和11-19抗体与BCMA的结合减小。
图17显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的相当ADCC活性。
图18A和B显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的相当ADCC活性。
图19A和B显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的相当ADCC活性。
图20是显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的相当表达效价的直方图。
图21A和B显示各种2A1mAb协变突变蛋白的相当结合活性。
图22A和B显示各种2A1 mAb协变突变蛋白的相当ADCC活性。
图23显示来自第二方案的抗huBCMA抗体具有结合猕猴BCMA的能力。
图24显示来自第二方案的一些抗huBCMA抗体具有结合H929多发性骨髓瘤细胞系上的huBCMA的能力。
图25A和25B显示由29C12.1、29G5.1、32B5.1、33C7.1、35D2.1、37B2.1和40D7.1抗体制得的ADC选择性地杀伤表达huBCMA的靶细胞。
图26显示各种候选抗体(包括来自第二方案的协变突变蛋白抗体)在H929细胞上与huBCMA的结合相当。
图27说明由各种ADC相对杀伤H929细胞。
图28显示来自第二方案的大多数协变突变蛋白抗体保持结合猕猴BCMA的能力。
图29图示描绘BCMAADC可抑制H929骨髓瘤细胞在异种移植物皮下肿瘤模型中的生长。用2A1-MCC-DM1处理显示在200ugDM1/kg高剂量(10mg Ab/kg)下的强肿瘤生长抑制作用和在67ugDM1/kg中等剂量(3mgAb/kg)下的适度肿瘤生长抑制作用。
图30显示2A1CV5-MCC-DM1、32B5-MCC-DM1和29C12-MCC-DM1ADC能够靶向和杀伤表达BCMA的骨髓瘤细胞(H929)。
图31描绘将2A1CV5和2A1CV5-MCC-DM1内化至H929细胞中的水平和速度。
图32显示在H929向骨性(bone-tropic)异种移植物模型中用2A1-MCC-DM1或2A1CV5-MCC-DM1单次处理后观测到完全肿瘤消退。
图33图示说明2A1CV5-MCC-DM1在U266人骨髓瘤向骨性异种移植物模型中能够调节显著的肿瘤消退。
图34A和B显示实施例13的测定方案和门控方法。
图35证实2A1抗体及其突变蛋白在测试的几乎所有多发性骨髓瘤患者样本上都能够结合BCMA。
图36显示BCMA抗体(2A1CV4-pHrodo标记的)在所有29个多发性骨髓瘤患者样本中都有效内化,证实2A1抗体及其突变蛋白在测试的所有多发性骨髓瘤患者样本上都能够结合BCMA并被有效内化。
图37是显示2A1CV5-MCC-DM1将DM1传递到原发性骨髓瘤骨髓单核肿瘤细胞(BMMC)样本和MM1R骨髓瘤细胞系中的直方图。
图38显示κ轻链的产生与H929肿瘤大小有关。
图39显示在来自H929异种移植物的血清中检测到κ轻链,但在来自经2A1CV5-MCC-DM1处理的小鼠的血清中未检测到。
图40显示基于在多发性骨髓瘤患者BMMC样本中的治疗史,BCMA表达似乎未改变。
图41A和41B是具有最佳特性的协变突变蛋白的重链和轻链可变结构域的序列比对。
图42A和42B描绘亲本抗体可变轻链和重链结构域序列的分支,说明2A1抗体相对于29C12、32B5与来自第二方案的其它抗体之间的差异。
图43A至F描绘显示以约155pM的平衡离解速率常数(Kd)特异性地结合人BCMA且以>10nM的平衡离解速率常数(Kd)与大鼠BCMA仅少量相互作用(即,不特异性地结合)的Ab-1的生物传感器数据。Ab-2和Ab-3分别以约1.11nM和750pM的平衡离解速率常数(Kd)结合人BCMA。Ab-2和Ab-3分别以约2.35nM和2.07nM的平衡离解速率常数(Kd)特异性地结合大鼠BCMA。
图44显示人BCMA的胞外结构域:SEQ ID NO:352的氨基酸2-51、猕猴BCMA的胞外结构域:SEQ ID NO:353的氨基酸2-51;和大鼠BCMA的胞外结构域:SEQ ID NO:351的氨基酸2-49的序列比对。
图45提供人BCMA的胞外结构域的氨基末端从SEQ ID NO:350的rhuBCMA融合蛋白(6xHis::Sumo::huBCMA(aa 5-51)::GGS::G3::Avi)开始三个逐渐变小的片段的序列(SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:355和SEQ ID NO:356)。
图46显示SEQ ID NO:350和人BCMA的胞外结构域的氨基末端的三个逐渐变小片段(峰A:SEQ ID NO:354、峰B:SEQ ID NO:355和峰C:SEQ ID NO:356)的尺寸排阻色谱法结果(尺寸估计值以道尔顿计)。
图47A-D是显示Ab-1结合人BCMA的各种片段(即,SEQ IDNOS:350、354、355和356)的色谱图。图47A显示SEQ ID NO:350的保留时间。图47B显示Ab-1的保留时间。图47C显示过量的Ab-1(60ug)相对于3ug BCMA(SEQ ID NO:350)导致无包括剪除片段的游离BCMA(即,SEQ ID NOS:354-356),而且两个峰代表与各种BCMA片段结合的Ab-1(保留时间为2.748)和未结合的多余Ab-1(保留时间为3.078)。图47D显示Ab-1抗体(30ug)在过量BCMA(60ug的SEQID NO:350)中结合BCMA,但也有小量的BCMA片段(SEQ IDNOS:354-356)。
图48A-C是类似于在图47A-D中关于2A1mAb所见,显示29C12mAb结合所有形式的人BCMA的色谱图。
图49A显示在Sumo与Sumo-BCMA之间存在可检测的尺寸差异且图49B显示无关抗体对照物(抗SA)不结合Sumo-BCMA。图49C显示2A1和29C12不结合Sumo。
图50A提供显示由2A1抗体结合的截短形式的BCMA的色谱图(峰A、B、D和E)。图50B显示由29C12抗体结合的截短形式的BCMA(峰A、B、C和E)。
图51是huBCMA在huBCMA和Ab-1Fab的复合物(Ab-1 Fab未显示)中的总体结构布置的图示。二硫键以棒状表示来显示。
具体实施方式
本文所用的章节标题仅用于组织目的且不应理解为限制所述的主题。实施例和权利要求书是本发明具体实施方式的部分。超出目前提出的其它权利要求可由此描述来起草。
标准技术可用于重组DNA、寡核苷酸合成、组织培养和转化、蛋白纯化等。酶促反应和纯化技术可根据制造商的说明或如本领域中通常所完成的或如本文中所述来进行。以下程序和技术通常可根据本领域中熟知且如说明书上下文引用和论述的各种一般和更具体参考文献中所述的常规方法来进行。参见例如Sambrook等人,2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第3版,Cold Spring HarborLaboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,其以引用的方式并入本文用于任意目的。除非提供具体定义,否则结合本文所述的分析化学、有机化学和医药与药物化学所用的术语及其实验室程序和技术是本领域中熟知且常用的。标准技术可用于化学合成、化学分析、药物制剂、配制物和对患者的传递和治疗。
如本文中更全面描述,本发明的方面提供特异性地结合BCMA且抑制由BCMA配体所介导的BCMA活化的抗原结合蛋白,诸如(但不限于)BAFF和APRIL。本发明的方面包括特异性地结合人BCMA的抗体药物偶联物(ADC)。一经与细胞表面上表达的BCMA结合,BCMA抗体即促使BCMA/ADC复合物内化至内涵体小室中并最终将ADC传递至溶酶体。内化的ADC特定地经由与抗体偶联的药物杀伤细胞。如本文中更全面描述,本发明的方面包括ADC在治疗B细胞相关癌症(包括多发性骨髓瘤)中的用途。
BCMA
如本文中所用的“BCMA”意思是结合BAFF和/或APRIL的细胞表面受体(或包含BCMA的受体复合物)。人BCMA(huBCMA)的氨基酸序列以NCBI登录号Q02223(GI:313104029)提供并显示在图1中(SEQ ID NO:285)。BCMA蛋白也可包括变体。BCMA蛋白也可包括片段,诸如不具有全部或部分跨膜的胞外结构域和/或胞内结构域以及胞外结构域的片段。胞外结构域的实例包括SEQ ID NO:285的氨基酸1-50至54或8-48。可溶性形式的huBCMA包括保持结合BAFF和/或APRIL的能力的胞外结构域或胞外结构域的片段。术语“BCMA”也包括BCMA氨基酸序列的翻译后修饰。翻译后修饰包括(但不限于)N-和O-连接糖基化。本发明的方面涉及与猕猴BCMA交叉反应的抗体。
BCMA抗原结合蛋白
本发明提供特异性地结合BCMA的抗原结合蛋白。实施方案包括结合huBCMA的单克隆抗体。实施方案包括包含本文所述的一个或多个单克隆抗体的部分或全部多肽序列的多肽。BCMA的正常组织表达高度局限于B细胞谱系,其中其主要在扁桃体/淋巴结的次级卵泡/胚中心中、在成浆细胞上和在分化的浆细胞上表达。BCMA以比在正常浆细胞中观测到的水平相对较高的水平在恶性浆细胞中表达,尤其在多发性骨髓瘤、冒烟型骨髓瘤和意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)浆细胞中。BCMA是一种用于治疗表达BCMA的B细胞相关恶性肿瘤的尤其有利靶标,因为其表达高度局限于正常和恶性浆细胞,且因此应具有最小的非靶标组织毒性。另外,如图40中所示,在面对正在进行或早前的治疗方案时,在多发性骨髓瘤患者样本上仍保持BCMA表达。
极少产生与天然huBCMA结合,不与huBAFF-R或huTACI交叉反应并快速内化至表达BCMA的骨髓瘤细胞系和来自多发性骨髓瘤患者的初级分离株中的高度特异性人抗huBCMA抗体。
实施方案包括结合huBCMA而且也与猕猴BCMA交叉反应的抗体(图1中的SEQ ID NO:286)。这是本文提供的抗体的一种独特且有利的特征。结合猕猴BCMA的抗huBCMA抗体和由其制得的ADC(例如参见实施例2)可在猕猴动物模型中用于测试毒性、药物动力学和其它药理学特征。
本文所述的抗体的另一种独特且有利的特征是对huBCMA相对于其它相关受体的特异性。针对与huBCMA高亲和力结合特异性选择并针对与huTACI和huBAFF-R无特异性结合筛选本文所述抗体的实施方案(例如参见实施例2)。对huBCMA的特异性以及缺少与huTACI和huBAFF-R的交叉反应性为本文所述的抗体提供了一种用于靶向浆B细胞和在治疗多发性骨髓瘤和其它B细胞相关癌症中的独特优势。
本文所述的实施方案的另一种独特且有利的特征在于抗体通过抑制huBCMA的配体APRIL的生物活性来抑制其活化。针对此重要生物属性选择性地筛选本文提供的实施方案(例如参见实施例2)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于针对异常高度的ADCC活性来选择抗体(例如参见实施例4和8)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于抗体对huBCMA不具激动性且因此在结合时不活化huBCMA。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于在与在细胞表面上表达的huBCMA结合时能够被内化。由于huBCMA的胞外结构域极小(约50个氨基酸),因此这并不重要而且肯定不可预测。尤其重要的是能够通过huBCMA介导的胞吞作用结合并内化至多发性骨髓瘤初级分离株以及经过加工和冷冻的多发性骨髓瘤样本中以及在多发性骨髓瘤细胞系中(例如参见实施例3、5、7、8、10、11、13和14)。
本文提供的选定实施方案的另一种独特且有利的特征在于通过定点诱变实现的根据经验工程化的增强的抗体的稳定性和可制造性(例如参见实施例8)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于能够成功地与连接子和药物(也称为毒素)偶联而且仍能够以高亲和力结合huBCMA、被内化且成功地杀伤细胞(例如参见实施例6、7和9-11)。不可预测且高度需要的是偶联形式的Ab-1抗体(即,Ab-1ADC,本文中也称为2A1CV5-MCC-DM1或2A1CV5ADC)以这种高亲和力结合。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于结合骨髓瘤细胞表面上的huBCMA后,例如Ab-1ADC类似于未偶联的抗体被内化且在H929肿瘤细胞生长抑制测定中具有约78pM的IC50(抗体浓度)(例如参见实施例11)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于平均BCMA表达密度低至每个细胞3,000个位点的多发性骨髓瘤细胞系可由Ab-1ADC和其它抗huBCMA ADC杀伤(例如参见实施例10)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于Ab-1ADC在多发性骨髓瘤患者样本的初级分离株中被有效内化(例如参见实施例13和14)。
本文提供的实施方案的另一种独特且有利的特征在于在三种体内骨髓瘤肿瘤异种移植物模型中,抗huBCMA ADC在所有三种模型中均介导抗肿瘤活性并在三分之二的模型中介导肿瘤消退。在确定的向骨性多发性骨髓瘤小鼠模型中施用单次静脉内剂量的Ab-1ADC后,在骨中观测到肿瘤完全消退,无可检测到的肿瘤负荷(例如参见实施例9和12)。
因此,本文提供的抗体经选择性地筛选、根据经验工程化并进行化学改变以最大化使其区别于其它抗体的多种独特、不可预测且令人惊讶的属性。
抗原结合蛋白的实施方案包括特异性地结合huBCMA的肽和/或多肽(任选地包括翻译后修饰)。抗原结合蛋白的实施方案包括如本文中多方面定义的特异性地结合huBCMA的抗体及其片段。本发明的方面包括特异性地与huBCMA结合且抑制BAFF和/或APRIL结合和/或活化huBCMA的抗体或包含huBCMA的多聚或异聚受体复合物。
本发明的抗原结合蛋白特异性地结合人BCMA。如本文中所用的“特异性地结合”意思是抗原结合蛋白优先于其它蛋白质结合人BCMA。在一些实施方案中,“特异性地结合”意思是BCMA抗原结合蛋白对BCMA具有比其它蛋白质较高的亲和力。举例来说,平衡离解常数<10-7至10-11M或<10-8至<10-10M或<10-9至<10-10M。用于确定抗原结合蛋白是否特异性地结合huBCMA的测定实施例可见于实施例2和16中。
应了解,在参考本文所述的BCMA抗体的各种实施方案时,也涵盖其BCMA结合片段。BCMA结合片段包含本文所述的仍能够特异性地结合人BCMA的任何抗体片段或结构域。所述BCMA结合片段可在本文所述的任何支架中。如说明书上下文中所述,所述BCMA结合片段也能够抑制BCMA的活化。
本发明的方面包括结合huBCMA上与Ab-1、Ab-2和/或Ab-3抗体相同或相似表位的抗体。抗体表位通常定义为抗原中可与抗体的可变区结合的三维结构。(Greenbaum等人,J Molec Recognition,2007,20:75-82)。“相同或相似表位”是如实施例17中所示和本文中所述如由x射线晶体学识别来定义。
本发明的方面包括竞争性地抑制Ab-1、Ab-2和/或Ab-3抗体与huBCMA结合的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括竞争性地抑制Ab-1、Ab-2和/或Ab-3抗体与huBCMA结合的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括竞争性地抑制Ab-1、Ab-2和/或Ab-3抗体与huBCMA结合的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的方面包括竞争性地抑制如本文中多方面定义的Ab-1与huBCMA结合的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括竞争性地抑制如本文中多方面定义的Ab-1与huBCMA结合的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括竞争性地抑制如本文中多方面定义的Ab-1与huBCMA结合的分离的人单克隆IgG抗体。在基于细胞或基于重组蛋白的ELISA测定中,当竞争性抗体(即,非Ab-1)相对于Ab-1为等摩尔或两倍摩尔过量时,如果抗体使Ab-1与huBCMA的结合减少90%,则抗体竞争性地抑制Ab-1的结合。
实施例16提供Ab-1特异性地结合SEQ ID NO:285的人BCMA和SEQ ID NO:286的猕猴BCMA,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的大鼠BCMA的证据。在这种差异性结合的情形下和在下文描述实施方案中,短语“不特异性地结合”意思是在如实施例16中所述的测定中或在本领域已知的相当测定中,抗体以>10nM的平衡离解速率常数(Kd)结合靶蛋白。图44显示人BCMA的胞外结构域:SEQ IDNO:352的氨基酸2-51、猕猴BCMA的胞外结构域:SEQ ID NO:353的氨基酸2-51和大鼠BCMA的胞外结构域:SEQ ID NO:351的氨基酸2-49的序列比对。
鉴于物种之间有限的序列多样性,Ab-1的差异性结合表明Ab-1结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1-20且更具体来说包含SEQ IDNO:285的氨基酸1-11的人BCMA上的中和决定簇。本文提供的实验证据证实Ab-1特异性地结合SEQ ID NO:352的人BCMA的胞外结构域,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的大鼠BCMA的胞外结构域。因此,本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:285和SEQID NO:286,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:352,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:285和SEQ ID NO:286,但不特异性地结合SEQ IDNO:351的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:352,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:285和SEQ IDNO:286,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:352,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:285和SEQ ID NO:286,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括特异性地结合SEQ ID NO:352,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括以1nM和.01nM之间的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括以1nM和.01nM之间的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括以1nM和.01nM之间的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ IDNO:351的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的方面包括以1nM和.01nM之间的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG1抗体。Kd值可使用实施例16中所述的测定或相当的测定来确定。
本发明的方面包括以约0.16nM的Kd特异性地结合SEQ IDNO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的单克隆抗体。“约0.16nM”意思是0.16nM±0.1nM。本发明的方面包括以约0.16nM的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆抗体。本发明的方面包括以约0.16nM的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的方面包括以约0.16nM的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351的分离的人单克隆IgG1抗体。Kd值可使用实施例16中所述的测定或相当的测定来确定。
实施例16还提供Ab-1结合人BCMA胞外结构域的氨基末端的逐渐变小片段(即,SEQ ID NO:350、354、357、355和356,如图45-47A-D和图50A中所示)的证据。SEQ ID NO:356为所有BCMA片段所共有,且因此显示Ab-1结合人BCMA的氨基末端。此证据连同Ab-1与BCMA的不同直系同源物的差异性结合一起证实Ab-1结合人BCMA上包含SEQ ID NO:285的氨基酸1-20的中和决定簇,且更具体来说结合包含SEQ ID NO:285的1-11的中和决定簇。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体。本发明的实施方案包括结合包含SEQID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体。前述实施方案不需要结合1至20个氨基酸结构域或1至11个氨基酸结构域中的每个氨基酸。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ IDNO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ IDNO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ IDNO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的实施方案包括结合包含SEQ IDNO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQID NO:352。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ IDNO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ IDNO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ IDNO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ IDNO:285。
本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ IDNO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ IDNO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。本发明的优选实施方案包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的分离的人单克隆IgG1抗体,其中所述抗体如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量以约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体在如实施例11中所述的FACS测定中以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285.
本发明的方面包括(但不限于)以下实施方案,诸如实施方案1:一种分离的抗体或其BCMA结合片段,其选自:包含Ab-1的六个CDR的抗体;包含Ab-2的六个CDR的抗体;包含Ab-3的六个CDR的抗体;包含Ab-4的六个CDR的抗体;包含Ab-5的六个CDR的抗体;包含Ab-6的六个CDR的抗体;包含Ab-7的六个CDR的抗体;包含Ab-8的六个CDR的抗体;包含Ab-9的六个CDR的抗体;包含Ab-10的六个CDR的抗体;包含Ab-11的六个CDR的抗体;包含Ab-12的六个CDR的抗体;包含Ab-13的六个CDR的抗体;包含Ab-14的六个CDR的抗体;包含Ab-15的六个CDR的抗体;包含Ab-16的六个CDR的抗体;包含Ab-17的六个CDR的抗体;包含Ab-18的六个CDR的抗体;包含Ab-19的六个CDR的抗体;包含Ab-20的六个CDR的抗体;包含Ab-21的六个CDR的抗体;包含Ab-22的六个CDR的抗体;包含Ab-23的六个CDR的抗体;包含Ab-24的六个CDR的抗体;包含Ab-25的六个CDR的抗体;包含Ab-26的六个CDR的抗体;包含Ab-27的六个CDR的抗体;包含Ab-28的六个CDR的抗体;包含Ab-29的六个CDR的抗体;包含Ab-30的六个CDR的抗体;包含Ab-31的六个CDR的抗体;包含Ab-32的六个CDR的抗体;包含Ab-33的六个CDR的抗体;包含Ab-34的六个CDR的抗体;包含Ab-35的六个CDR的抗体;包含Ab-36的六个CDR的抗体;包含Ab-37的六个CDR的抗体;和包含Ab-38的六个CDR的抗体。实施方案2:实施方案1的抗体或片段,其中所述抗体或片段选自:包含Ab-1的六个CDR的抗体;包含Ab-2的六个CDR的抗体;和包含Ab-3的六个CDR的抗体。实施方案3:实施方案1或2的抗体或片段,其中所述抗体或片段是包含Ab-1的六个CDR的抗体。实施方案4:实施方案1-3的抗体或片段,其中所述Ab-1的CDR包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3;其中所述Ab-2的CDR包括包含SEQ ID NO:10的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:11的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:12的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:112的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:113的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:114的Vl-CDR3;其中所述Ab-3的CDR包括包含SEQ ID NO:16的Vh-CDR1、包含SEQID NO:17的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:18的Vh-CDR3、包含SEQID NO:118的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:119的Vl-CDR2和包含SEQID NO:120的Vl-CDR3;其中所述Ab-4的CDR包括包含SEQ IDNO:22的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:23的Vh-CDR2、包含SEQ IDNO:24的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:124的Vl-CDR1、包含SEQ IDNO:125的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:126的Vl-CDR3;其中所述Ab-5的CDR包括包含SEQ ID NO:28的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:29的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:30的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:130的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:131的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:132的Vl-CDR3;其中所述Ab-6的CDR包括包含SEQ ID NO:34的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:35的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:36的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:136的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:137的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:138的Vl-CDR3;其中所述Ab-7的CDR包括包含SEQ ID NO:40的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:41的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:42的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:142的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:143的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:144的Vl-CDR3;其中所述Ab-8的CDR包括包含SEQ ID NO:46的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:47的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:48的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:148的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:149的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:150的Vl-CDR3;其中所述Ab-9的CDR包括包含SEQ ID NO:52的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:53的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:54的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:154的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:155的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:156的Vl-CDR3;其中所述Ab-10的CDR包括包含SEQ ID NO:58的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:59的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:60的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:160的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:161的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:162的Vl-CDR3;其中所述Ab-11的CDR包括包含SEQ ID NO:64的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:65的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:66的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:166的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:167的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:168的Vl-CDR3;其中所述Ab-12的CDR包括包含SEQ ID NO:70的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:71的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:72的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:172的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:173的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:174的Vl-CDR3;其中所述Ab-13的CDR包括包含SEQ ID NO:76的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:77的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:78的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:178的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:179的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:180的Vl-CDR3;其中所述Ab-14的CDR包括包含SEQ ID NO:82的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:83的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:84的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:184的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:185的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:186的Vl-CDR3;其中所述Ab-15的CDR包括包含SEQ ID NO:88的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:89的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:90的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:190的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:191的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:192的Vl-CDR3;其中所述Ab-16的CDR包括包含SEQ ID NO:94的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:95的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:96的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:196的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:197的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:198的Vl-CDR3;且其中所述Ab-17的CDR包括包含SEQ ID NO:100的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:101的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:102的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:202的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:203的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:204的Vl-CDR3。实施方案5:实施方案1-4的抗体或片段,其中所述Ab-1的CDR包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3;其中所述Ab-2的CDR包括包含SEQ ID NO:10的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:11的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:12的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:112的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:113的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:114的Vl-CDR3;且其中所述Ab-3的CDR包括包含SEQ ID NO:16的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:17的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:18的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:118的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:119的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:120的Vl-CDR3。实施方案6:实施方案1-5的抗体或片段,其中所述Ab-1的CDR包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3。实施方案7:实施方案1-6的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:240的Ab-1Vl结构域和包含SEQ IDNO:206的Ab-1Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ IDNO:242的Ab-2Vl结构域和包含SEQ ID NO:208的Ab-2Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:244的Ab-3Vl结构域和包含SEQ ID NO:210的Ab-3Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:246的Ab-4Vl结构域和包含SEQ ID NO:212的Ab-4Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:248的Ab-5Vl结构域和包含SEQ ID NO:214的Ab-5Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:250的Ab-6Vl结构域和包含SEQ ID NO:216的Ab-6Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:252的Ab-7Vl结构域和包含SEQ ID NO:218的Ab-7Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:254的Ab-8Vl结构域和包含SEQ IDNO:220的Ab-8Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ IDNO:256的Ab-9Vl结构域和包含SEQ ID NO:222的Ab-9Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:258的Ab-10Vl结构域和包含SEQ ID NO:224的Ab-10Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:260的Ab-11Vl结构域和包含SEQ ID NO:226的Ab-11Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:262的Ab-12Vl和包含SEQ ID NO:228的Ab-12Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:264的Ab-13Vl结构域和包含SEQ IDNO:230的Ab-13Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ IDNO:266的Ab-14Vl结构域和包含SEQ ID NO:232的Ab-14Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:268的Ab-15Vl结构域和包含SEQ ID NO:234的Ab-15Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:270的Ab-16Vl结构域和包含SEQ ID NO:236的Ab-16Vh结构域;且其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:272的Ab-17Vl结构域和包含SEQ ID NO:238的Ab-17Vh结构域)结构域。实施方案8:实施方案1-7的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:240的Ab-1Vl结构域和包含SEQ ID NO:206的Ab-1Vh结构域;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:242的Ab-2Vl结构域和包含SEQ ID NO:208的Ab-2Vh结构域;且其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:244的Ab-3Vl结构域和包含SEQID NO:210的Ab-3Vh结构域。实施方案9:实施方案1-8的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:240的Ab-1Vl结构域和包含SEQ ID NO:206的Ab-1Vh结构域。实施方案10:实施方案1-9的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:282的Ab-2轻链和包含SEQ ID NO:276的Ab-2重链;其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:284的Ab-3轻链和包含SEQ ID NO:278的Ab-3重链;其中所述抗体或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;其中所述抗体或片段包括两条包含SEQ ID NO:282的Ab-2轻链和两条包含SEQ ID NO:276的Ab-2重链;且其中所述抗体或片段包括两条包含SEQ ID NO:284的Ab-3轻链和两条包含SEQ IDNO:278的Ab-3重链)。实施方案11:实施方案1-10的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;且其中所述抗体或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链。实施方案12:实施方案1-11的抗体或片段,其中所述抗体或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ IDNO:274的Ab-1重链。实施方案13:实施方案1-12的抗体或片段,其中所述抗体或片段是人抗体或片段。实施方案14:实施方案1-13的抗体或片段,其中所述抗体或片段是人单克隆抗体。实施方案15:实施方案1-12的抗体或片段,其中所述抗体或片段是嵌合单克隆抗体。实施方案16:实施方案1-15的抗体或片段,其中所述抗体或片段特异性地结合人BCMA。实施方案17:实施方案1-16的抗体或片段,其中所述抗体或片段特异性地结合人BCMA并与猕猴BCMA交叉反应。实施方案18:实施方案1-17的抗体或片段,其中所述抗体或片段不特异性地结合TACI或BAFF-R。实施方案19:实施方案1-18的抗体或片段,其中所述抗体或片段结合人骨髓瘤细胞表面上的BCMA。实施方案20:实施方案1-19的抗体或片段,其中所述抗体或片段结合人多发性骨髓瘤细胞表面上的BCMA。实施方案21:实施方案1-20的抗体或片段,其中所述抗体或片段结合人细胞表面上的BCMA并被所述细胞内化。实施方案22:实施方案1-21的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含连接子。实施方案23:实施方案1-22的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含药物或化疗剂。实施方案24:实施方案1-23的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含选自以下的连接子:6-马来酰亚胺基己酰基、马来酰亚胺基丙酰基、缬氨酸-瓜氨酸、丙氨酸-苯丙氨酸、对氨基苄氧羰基、Mal-dPEG4-NHS、N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(“SPP”)、N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”或“MCC”)和N-琥珀酰亚胺基(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯(“SIAB”)。实施方案25:实施方案1-24的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含连接子,其中所述连接子是N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”或“MCC”)。实施方案26:实施方案1-25的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含选自以下的药物或化疗剂:噻替派(thiotepa)和环磷酰胺(CYTOXAN.TM);烷基磺酸酯类,诸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan);氮杂环丙烷类,诸如苯佐替哌(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)和乌瑞替哌(uredopa);乙撑亚胺类和甲基蜜胺类,包括六甲蜜胺、三乙撑蜜胺、三乙撑磷酰胺、三乙撑硫代磷酰胺和三羟甲基蜜胺;番荔枝内酯类(尤其是布拉它辛(bullatacin)和布拉它辛酮(bullatacinone));喜树碱(包括合成类似物拓朴替康(topotecan));苔藓抑素;海绵多烯酮类化合物;CC-1065(包括它的阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物);念珠藻素类(尤其是念珠藻素1和念珠藻素8);尾海兔素;倍癌霉素(包括合成类似物KW-2189和CBI-TMI);艾榴塞洛素(eleutherobin);水鬼蕉碱(pancratistatin);匍枝珊瑚醇A(a sarcodictyin);海绵素;氮芥类,诸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlomaphazine)、胆磷酰胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、甲氮芥(mechlorethamine)、盐酸氧甲氮芥(mechlorethamine oxidehydrochloride)、美法仑(melphalan)、新恩比兴(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲洛磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥;硝基脲类,诸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲霉素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、雷莫司汀(ranimustine);抗生素类,诸如烯二炔抗生素类(例如,卡里奇霉素(calicheamicin),尤其是卡里奇霉素.γ1和卡里奇霉素θI,例如参见Angew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994);达内霉素(dynemicin),包括达内霉素A;埃斯培拉霉素(esperamicin);以及新制癌菌素发色团和相关色蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素(aclacinomysin)、放线菌素(actinomycin)、安曲霉素(authramycin)、重氮丝氨酸、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、卡拉比星(carabicin)、卡米诺霉素(caminomycin)、嗜癌素(carzinophilin);色霉素、放线菌素D(dactinomycin)、柔红霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-氧代-L-正亮氨酸、阿霉素(包括吗啉代-阿霉素、氰基吗啉代-阿霉素、2-吡咯啉子基-阿霉素和脱氧阿霉素)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、依达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、尼托霉素(nitomycin)、霉酚酸、诺加霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泊非霉素(potfiromycin)、嘌呤霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑菌素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin);抗代谢物类,诸如甲氨蝶呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,诸如二甲叶酸、甲氨蝶呤、蝶罗呤、三甲曲沙(trimetrexate);嘌呤类似物,诸如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤、硫鸟嘌呤;嘧啶类似物,诸如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷、双脱氧尿苷、脱氧氟尿苷、依诺他滨(enocitabine)、氟尿苷、5-FU;雄激素类,诸如卡鲁睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾内酯;抗肾上腺类,诸如氨鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,诸如亚叶酸;醋葡醛内酯;醛磷酰胺糖苷;氨基乙酰丙酸;安吖啶(amsacrine);阿莫司汀(bestrabucil);比生群(bisantrene);依达曲沙(edatraxate);磷胺氮芥(defofamine);地美可辛(demecolcine);地吖醌(diaziquone);伊弗米辛(elfomithine);依利醋铵(elliptinium acetate);埃博霉素(epothilone);依托格鲁(etoglucid);硝酸镓;羟脲;香菇多糖(lentinan);氯尼达明(lonidamine);美登素类化合物,诸如美登素和安丝菌素;米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫哌达醇(mopidamol);二胺硝吖啶(nitracrine);喷司他丁(pentostatin);蛋氨氮芥(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基酰肼;丙卡巴肼(procarbazine);PSK.RTM.;雷佐生(razoxane);根霉素(rhizoxin);西佐喃(sizofuran);螺旋锗;细交链孢菌酮酸;三亚胺醌;2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢菌素类(尤其是T-2毒素、疣孢菌素A、杆孢菌素A和蛇行菌素);乌拉坦(urethan);长春地辛(vindesine);达卡巴嗪(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);加西托星(gacytosine);阿拉伯糖苷(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替派;紫衫烷类,例如紫杉醇(TAXOL.TM.,Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)和多西他赛(doxetaxel)(TAXOTERE.RTM.,Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥(chlorambucil);吉西他滨(gemcitabine);6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;甲氨蝶呤;铂类似物,诸如顺铂和卡铂;长春碱;铂;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺;丝裂霉素C;米托蒽醌;长春新碱(vincristine);长春瑞滨(vinorelbine);诺威本(navelbine);能灭瘤(novantrone);替尼泊苷(teniposide);道诺霉素(daunomycin);氨基蝶呤(aminopterin);希罗达(xeloda);伊班膦酸盐(ibandronate);CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);视黄酸;卡培他滨(capecitabine);他莫昔芬(tamoxifen)、雷洛昔芬(raloxifene)、抑制芳香酶的4(5)-咪唑类、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、那洛昔芬(keoxifene)、LY117018、奥那司酮(onapristone)和托瑞米芬(toremifene)(法乐通(Fareston));和抗雄激素类,诸如氟他米特(flutamide)、尼鲁米特(nilutamide)、比卡米特(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)、戈舍瑞林(goserelin)、秋水仙碱-位点结合剂(Curacin)、康普立停(Combretastatin)(AVE806、康普立停A-4前药(CA4P)、Oxi-4503)、念珠藻素类(LY355703)、圆皮海绵内酯、尾海兔素和类似物(阿里他汀(Auristatin)PHE、尾海兔素10、ILX-651、西姆司他丁1(Symplostatin 1)、TZT-1027)、埃博霉素(BMS-247550、BMS-310705、EP0906、KOS-862、ZK-EPO)、艾榴塞洛素、FR182877、软海绵素B(E7389)、哈利米特(Halimide)(NPI-2352和NPI-2358)、哈米特林(Hemiasterlin)(HTI-286)、劳力莫大环内酯(Laulimalide)、美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)(比伐单抗-DM1(Bivatuzumab mertansine)、美坎珠单抗(Cantuzumab mertansine)、huN901-DM1/BB-10901TAP、MLN591DM1、My9-6-DM1、曲司珠单抗(Trastuzumab)-DM1)、PC-SPES、派罗塞特A(Peloruside A)、白藜芦醇(Resveratrol)、S-烯丙巯基半胱氨酸(SAMC)、海绵素、维替米特(Vitilevuamide)、分子发动机-驱动蛋白(SB-715992)、设计的秋水仙碱-位点结合剂(A-289099、A-293620/A-318315、ABT-751/E7010、D-24851/D-64131、ZD6126)、其它新型的纺锤体毒素(2-甲氧基雌二醇(2-ME2)、苯并咪唑氨基甲酸酯类(ANG 600系列,甲苯咪唑)、CP248/CP461、HMN-214、R440、SDX-103、T67/T607)。实施方案27:实施方案1-26的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含选自以下的药物或化疗剂:美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)。实施方案28:实施方案1-27的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含DM1。实施方案29:实施方案1-28的抗体或片段,其中所述抗体或片段的药物与抗体比率在1和10之间。实施方案30:实施方案1-29的抗体或片段,其中所述抗体或片段的药物与抗体比率在2和5之间。实施方案31:一种分离的多肽或其BCMA结合片段,其选自:包含Ab-1的六个CDR的多肽;包含Ab-2的六个CDR的多肽;包含Ab-3的六个CDR的多肽;包含Ab-4的六个CDR的多肽;包含Ab-5的六个CDR的多肽;包含Ab-6的六个CDR的多肽;包含Ab-7的六个CDR的多肽;包含Ab-8的六个CDR的多肽;包含Ab-9的六个CDR的多肽;包含Ab-10的六个CDR的多肽;包含Ab-11的六个CDR的多肽;包含Ab-12的六个CDR的多肽;包含Ab-13的六个CDR的多肽;包含Ab-14的六个CDR的多肽;包含Ab-15的六个CDR的多肽;包含Ab-16的六个CDR的多肽;包含Ab-17的六个CDR的多肽;包含Ab-18的六个CDR的多肽;包含Ab-19的六个CDR的多肽;包含Ab-20的六个CDR的多肽;包含Ab-21的六个CDR的多肽;包含Ab-22的六个CDR的多肽;包含Ab-23的六个CDR的多肽;包含Ab-24的六个CDR的多肽;包含Ab-25的六个CDR的多肽;包含Ab-26的六个CDR的多肽;包含Ab-27的六个CDR的多肽;包含Ab-28的六个CDR的多肽;包含Ab-29的六个CDR的多肽;包含Ab-30的六个CDR的多肽;包含Ab-31的六个CDR的多肽;包含Ab-32的六个CDR的多肽;包含Ab-33的六个CDR的多肽;包含Ab-34的六个CDR的多肽;包含Ab-35的六个CDR的多肽;包含Ab-36的六个CDR的多肽;包含Ab-37的六个CDR的多肽;和包含Ab-38的六个CDR的多肽。实施方案32:实施方案31的多肽或片段,其中所述多肽或片段选自:包含Ab-1的六个CDR的多肽;包含Ab-2的六个CDR的多肽;和包含Ab-3的六个CDR的多肽。实施方案33:实施方案31-32的多肽或片段,其中所述多肽或片段是包含Ab-1的六个CDR的多肽。实施方案34:实施方案31-33的多肽或片段,其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:10的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:11的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:12的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:112的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:113的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:114的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:16的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:17的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:18的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:118的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:119的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:120的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:22的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:23的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:24的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:124的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:125的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:126的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:28的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:29的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:30的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:130的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:131的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:132的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:34的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:35的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:36的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:136的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:137的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:138的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:40的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:41的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:42的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:142的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:143的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:144的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:46的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:47的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:48的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:148的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:149的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:150的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:52的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:53的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:54的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:154的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:155的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:156的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:58的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:59的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:60的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:160的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:161的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:162的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:64的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:65的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:66的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:166的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:167的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:168的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:70的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:71的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:72的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:172的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:173的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:174的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:76的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:77的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:78的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:178的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:179的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:180的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:82的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:83的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:84的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:184的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:185的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:186的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:88的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:89的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:90的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:190的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:191的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:192的Vl-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:94的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:95的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:96的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:196的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:197的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:198的Vl-CDR3;且其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:100的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:101的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:102的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:202的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:203的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:204的Vl-CDR3。实施方案35:实施方案31-34的多肽或片段,其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3;其中所述CDR包括包含SEQ ID NO:10的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:11的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:12的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:112的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:113的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:114的Vl-CDR3;且其中所述CDR包括包含SEQID NO:16的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:17的Vh-CDR2、包含SEQID NO:18的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:118的Vl-CDR1、包含SEQID NO:119的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:120的Vl-CDR3。实施方案36:实施方案31-35的多肽或片段,其中所述CDR包括包含SEQID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:5的Vh-CDR2、包含SEQ IDNO:6的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:106的Vl-CDR1、包含SEQ IDNO:107的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:108的VL-CDR3。实施方案37:实施方案31-36的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括包含SEQID NO:240的Vl结构域和包含SEQ ID NO:206的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:242的Vl结构域和包含SEQ IDNO:208的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:244的Vl结构域和包含SEQ ID NO:210的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:246的Vl结构域和包含SEQ ID NO:212的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:248的Vl结构域和包含SEQ ID NO:214的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:250的Vl结构域和包含SEQ ID NO:216的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:252的Vl结构域和包含SEQ ID NO:218的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ IDNO:254的Vl结构域和包含SEQ ID NO:220的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:256的Vl结构域和包含SEQ IDNO:222的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:258的Vl结构域和包含SEQ ID NO:224的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:260的Vl结构域和包含SEQ ID NO:226的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:262的Vl和包含SEQ ID NO:228的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQID NO:264的Vl结构域和包含SEQ ID NO:230的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:266的Vl结构域和包含SEQ IDNO:232的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:268的Vl结构域和包含SEQ ID NO:234的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:270的Vl结构域和包含SEQ ID NO:236的Vh结构域;且其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:272的Vl结构域和包含SEQ ID NO:238的Vh结构域)结构域。实施方案38:实施方案31-37的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括包含SEQ IDNO:240的Vl结构域和包含SEQ ID NO:206的Vh结构域;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:242的Vl结构域和包含SEQ IDNO:208的Vh结构域;且其中所述多肽或片段包括包含SEQ IDNO:244的Vl结构域和包含SEQ ID NO:210的Vh结构域。实施方案39:实施方案31-38的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括包含SEQID NO:240的Vl结构域和包含SEQ ID NO:206的Vh结构域。实施方案40:实施方案31-39的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:282的Ab-2轻链和包含SEQ ID NO:276的Ab-2重链;其中所述多肽或片段包括包含SEQ IDNO:284的Ab-3轻链和包含SEQ ID NO:278的Ab-3重链;其中所述多肽或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;其中所述多肽或片段包括两条包含SEQID NO:282的Ab-2轻链和两条包含SEQ ID NO:276的Ab-2重链;且其中所述多肽或片段包括两条包含SEQ ID NO:284的Ab-3轻链和两条包含SEQ ID NO:278的Ab-3重链)。实施方案41:实施方案31-40的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链;且其中所述多肽或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链。实施方案42:实施方案31-41的多肽或片段,其中所述多肽或片段包括两条包含SEQ ID NO:280的Ab-1轻链和两条包含SEQ ID NO:274的Ab-1重链。实施方案43:实施方案31-42的多肽或片段,其中所述多肽或片段特异性地结合人BCMA。实施方案44:实施方案31-43的多肽或片段,其中所述多肽或片段特异性地结合人BCMA且与猕猴BCMA交叉反应。实施方案45:实施方案31-44的多肽或片段,其中所述多肽或片段不特异性地结合TACI或BAFF-R。实施方案46:实施方案31-45的多肽或片段,其中所述多肽或片段结合人骨髓瘤细胞表面上的BCMA。实施方案47:实施方案31-46的多肽或片段,其中所述多肽或片段结合人多发性骨髓瘤细胞表面上的BCMA。实施方案48:实施方案31-47的多肽或片段,其中所述多肽或片段结合人细胞表面上的BCMA并被所述细胞内化。实施方案49:实施方案31-48的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含连接子。实施方案50:实施方案31-49的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含药物或化疗剂。实施方案51:实施方案31-50的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含选自以下的连接子:6-马来酰亚胺基己酰基、马来酰亚胺基丙酰基、缬氨酸-瓜氨酸、丙氨酸-苯丙氨酸、对氨基苄氧羰基、Mal-dPEG4-NHS、N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(“SPP”)、N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”或“MCC”)和N-琥珀酰亚胺基(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯(“SIAB”)。实施方案52:实施方案31-51的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含连接子,其中所述连接子是N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”或“MCC”)。实施方案53:实施方案31-52的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含选自以下的药物或化疗剂:噻替派和环磷酰胺(CYTOXAN.TM.);烷基磺酸酯类,诸如白消安、英丙舒凡和哌泊舒凡;氮杂环丙烷类,诸如苯佐替哌、卡波醌、美妥替哌和乌瑞替哌;乙撑亚胺类和甲基蜜胺类,包括六甲蜜胺、三乙撑蜜胺、三乙撑磷酰胺、三乙撑硫代磷酰胺和三羟甲基蜜胺;番荔枝内酯类(尤其是布拉它辛和布拉它辛酮);喜树碱(包括合成类似物拓朴替康);苔藓抑素;海绵多烯酮类化合物;CC-1065(包括它的阿多来新、卡折来新和比折来新合成类似物);念珠藻素类(尤其是念珠藻素1和念珠藻素8);尾海兔素;倍癌霉素(包括合成类似物KW-2189和CBI-TMI);艾榴塞洛素;水鬼蕉碱;匍枝珊瑚醇A;海绵素;氮芥类,诸如苯丁酸氮芥、萘氮芥、胆磷酰胺、雌莫司汀、异环磷酰胺、甲氮芥、盐酸氧甲氮芥、美法仑、新恩比兴、苯芥胆甾醇、泼尼莫司汀、曲洛磷胺、尿嘧啶氮芥;硝基脲类,诸如卡莫司汀、氯脲霉素、福莫司汀、洛莫司汀、尼莫司汀、雷莫司汀;抗生素类,诸如烯二炔抗生素类(例如,卡里奇霉素,尤其是卡里奇霉素.γ1和卡里奇霉素θI,例如参见Angew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994);达内霉素,包括达内霉素A;埃斯培拉霉素;以及新制癌菌素发色团和相关色蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素、放线菌素、安曲霉素、重氮丝氨酸、博来霉素、放线菌素C、卡拉比星、卡米诺霉素、嗜癌素;色霉素、放线菌素D、柔红霉素、地托比星、6-重氮基-5-氧代-L-正亮氨酸、阿霉素(包括吗啉代-阿霉素、氰基吗啉代-阿霉素、2-吡咯啉子基-阿霉素和脱氧阿霉素)、表柔比星、依索比星、依达比星、麻西罗霉素、尼托霉素、霉酚酸、诺加霉素、橄榄霉素、培洛霉素、泊非霉素、嘌呤霉素、三铁阿霉素、罗多比星、链黑菌素、链佐星、杀结核菌素、乌苯美司、净司他丁、佐柔比星;抗代谢物类,诸如甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,诸如二甲叶酸、甲氨蝶呤、蝶罗呤、三甲曲沙;嘌呤类似物,诸如氟达拉滨、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤、硫鸟嘌呤;嘧啶类似物,诸如安西他滨、阿扎胞苷、6-氮尿苷、卡莫氟、阿糖胞苷、双脱氧尿苷、脱氧氟尿苷、依诺他滨、氟尿苷、5-FU;雄激素类,诸如卡鲁睾酮、丙酸屈他雄酮、环硫雄醇、美雄烷、睾内酯;抗肾上腺类,诸如氨鲁米特、米托坦、曲洛司坦;叶酸补充剂,诸如亚叶酸;醋葡醛内酯;醛磷酰胺糖苷;氨基乙酰丙酸;安吖啶;阿莫司汀;比生群;依达曲沙;磷胺氮芥;地美可辛;地吖醌;伊弗米辛;依利醋铵;埃博霉素;依托格鲁;硝酸镓;羟脲;香菇多糖;氯尼达明;美登素类化合物,诸如美登素和安丝菌素;米托胍腙;米托蒽醌;莫哌达醇;二胺硝吖啶;喷司他丁;蛋氨氮芥;吡柔比星;鬼臼酸;2-乙基酰肼;丙卡巴肼;PSK.RTM.;雷佐生;根霉素;西佐喃;螺旋锗;细交链孢菌酮酸;三亚胺醌;2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢菌素类(尤其是T-2毒素、疣孢菌素A、杆孢菌素A和蛇行菌素);乌拉坦;长春地辛;达卡巴嗪;甘露莫司汀;二溴甘露醇;二溴卫矛醇;哌泊溴烷;加西托星;阿拉伯糖苷(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替派;紫衫烷类,例如紫杉醇(TAXOL.TM.,Bristol-MyersSquibb Oncology,Princeton,N.J.)和多西他赛(TAXOTERE.RTM.,Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥;吉西他滨;6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;甲氨蝶呤;铂类似物,诸如顺铂和卡铂;长春碱;铂;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺;丝裂霉素C;米托蒽醌;长春新碱;长春瑞滨;诺威本;能灭瘤;替尼泊苷;道诺霉素;氨基蝶呤;希罗达;伊班膦酸盐;CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);视黄酸;卡培他滨;他莫昔芬、雷洛昔芬、抑制芳香酶的4(5)-咪唑类、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬、那洛昔芬、LY117018、奥那司酮和托瑞米芬(法乐通);和抗雄激素类,诸如氟他米特、尼鲁米特、比卡米特、亮丙瑞林、戈舍瑞林、秋水仙碱-位点结合剂(Curacin)、康普立停(AVE806、康普立停A-4前药(CA4P)、Oxi-4503)、念珠藻素类(LY355703)、圆皮海绵内酯、尾海兔素和类似物(阿里他汀PHE、尾海兔素10、ILX-651、西姆司他丁1、TZT-1027)、埃博霉素(BMS-247550、BMS-310705、EP0906、KOS-862、ZK-EPO)、艾榴塞洛素、FR182877、软海绵素B(E7389)、哈利米特(NPI-2352和NPI-2358)、哈米特林(HTI-286)、劳力莫大环内酯、美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)(比伐单抗-DM1、美坎珠单抗、huN901-DM1/BB-10901TAP、MLN591DM1、My9-6-DM1、曲司珠单抗-DM1)、PC-SPES、派罗塞特A、白藜芦醇、S-烯丙巯基半胱氨酸(SAMC)、海绵素、维替米特、分子发动机-驱动蛋白(SB-715992)、设计的秋水仙碱-位点结合剂(A-289099、A-293620/A-318315、ABT-751/E7010、D-24851/D-64131、ZD6126)、其它新型的纺锤体毒素(2-甲氧基雌二醇(2-ME2)、苯并咪唑氨基甲酸酯类(ANG 600系列,甲苯咪唑)、CP248/CP461、HMN-214、R440、SDX-103、T67/T607)。实施方案54:实施方案31-53的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含选自以下的药物或化疗剂:美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)。实施方案55:实施方案31-54的多肽或片段,其中所述多肽或片段还包含DM1。实施方案56:实施方案31-55的多肽或片段,其中所述多肽或片段的药物与多肽比率在1和10之间。实施方案57:实施方案31-57的多肽或片段,其中所述多肽或片段的药物与多肽比率在2和5之间。实施方案58:一种组合物,其包含实施方案1-57中任一项的抗体、多肽或其片段。实施方案59:一种药物组合物,其包含实施方案1-58中任一项的抗体、多肽或其片段。实施方案60:实施方案59的药物组合物,其还包含药学上可接受的稀释剂、载剂、增溶剂、乳化剂和/或防腐剂。实施方案61:一种治疗疾病的方法,其包括施用有效量的实施方案58-60中任一项的组合物,其中所述疾病选自:B细胞癌症、多发性骨髓瘤、恶性浆细胞肿瘤、卡勒氏病(Kahler’s disease)和骨髓瘤病;浆细胞白血病;浆细胞瘤;B细胞幼淋巴细胞白血病;毛细胞白血病;B细胞非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);急性骨髓性白血病(AML);慢性骨髓性白血病(CML);急性淋巴细胞白血病(ALL);慢性淋巴细胞白血病(CLL);滤泡性淋巴瘤(包括滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤类型);伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)(地方性伯基特氏淋巴瘤;散发性伯基特氏淋巴瘤);边缘区淋巴瘤(粘膜相关淋巴组织;MALT/MALToma;单核细胞样B细胞淋巴瘤;伴绒毛状淋巴细胞的脾淋巴瘤);套细胞淋巴瘤;大细胞淋巴瘤(弥漫性大细胞;弥漫性混合细胞;免疫母细胞性淋巴瘤;原发性纵隔B细胞淋巴瘤;血管中心性淋巴瘤-肺B细胞);小淋巴细胞淋巴瘤(SLL);前体B-淋巴母细胞淋巴瘤;骨髓性白血病(粒细胞;骨髓性;急性骨髓性白血病;慢性骨髓性白血病;亚急性骨髓性白血病;髓细胞肉瘤;绿色瘤;粒细胞肉瘤;急性早幼粒细胞白血病;急性粒单核细胞白血病);瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症(Waldenstrom's macroglobulinemia)或其它B细胞淋巴瘤。实施方案62:实施方案61的方法,其中所述疾病选自:B细胞癌症、多发性骨髓瘤、恶性浆细胞肿瘤或其它B细胞淋巴瘤。实施方案63:实施方案62的方法,其中所述疾病是多发性骨髓瘤。实施方案64:实施方案61-63的方法,其还包括施用一种或多种选自以下的其它治疗:化学治疗、放射治疗、外科手术、蛋白酶体抑制剂、皮质类固醇和干细胞移植。实施方案65:实施方案64的方法,其中施用所述其它治疗是在施用实施方案58-60中任一项的组合物之前、与此同时或之后,或以各自的组合形式。实施方案66:实施方案62-65的方法,其中实施方案58-60中任一项的组合物是通过肠胃外施用。实施方案67:一种分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸编码实施方案1-21和31-48中任一项的抗体或多肽。实施方案68:实施方案67的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:1的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:2的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:3的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:103的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:104的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:105的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:7的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:8的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:9的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:109的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:110的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:111的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:13的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:14的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:15的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:115的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:116的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:117的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:19的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:20的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:21的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:121的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:122的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:123的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:25的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:26的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:27的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:127的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:128的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:129的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:31的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:32的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:33的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:133的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:134的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:135的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:37的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:38的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:39的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:139的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:140的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:141的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:43的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:44的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:45的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:145的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:146的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:147的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:49的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:50的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:51的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:151的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:152的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:153的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:55的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:56的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:57的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:157的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:158的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:159的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:61的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:62的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:63的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:163的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:164的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:165的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:67的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:68的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:69的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:169的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:170的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:171的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:73的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:74的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:75的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:175的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:176的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:177的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:79的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:80的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:81的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:181的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:182的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:183的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:85的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:86的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:87的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:187的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:188的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:189的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:91的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:92的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:93的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:193的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:194的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:195的Vl-CDR3;且其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:97的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:98的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:99的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:199的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:200的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:201的Vl-CDR3。实施方案69:实施方案67-68的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:1的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:2的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:3的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:103的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:104的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:105的Vl-CDR3;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:7的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:8的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:9的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:109的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:110的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:111的Vl-CDR3;且其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:13的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:14的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:15的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:115的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:116的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:117的Vl-CDR3。实施方案70:实施方案67-69的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:1的Vh-CDR1、包含SEQ ID NO:2的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:3的Vh-CDR3、包含SEQ ID NO:103的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:104的Vl-CDR2和包含SEQ ID NO:105的Vl-CDR3。实施方案71:实施方案67-70的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:239的Ab-1Vl和包含SEQ ID NO:205的Ab-1Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:241的Ab-2Vl和包含SEQ ID NO:207的Ab-2Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:243的Ab-3Vl和包含SEQ ID NO:209的Ab-3Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:245的Ab-4Vl和包含SEQ ID NO:211的Ab-4Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:247的Ab-5Vl和包含SEQ ID NO:213的Ab-5Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:249的Ab-6Vl和包含SEQ ID NO:215的Ab-6Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:251的Ab-7Vl和包含SEQ ID NO:217的Ab-7Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:253的Ab-8Vl和包含SEQ ID NO:219的Ab-8Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:255的Ab-9Vl和包含SEQ ID NO:221的Ab-9Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:257的Ab-10Vl和包含SEQ ID NO:223的Ab-10Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:259的Ab-11Vl和包含SEQ ID NO:225的Ab-11Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:261的Ab-12Vl和包含SEQ IDNO:227的Ab-12Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:263的Ab-13Vl和包含SEQ ID NO:229的Ab-13Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:265的Ab-14Vl和包含SEQ ID NO:231的Ab-14Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:267的Ab-15Vl和包含SEQ ID NO:233的Ab-15Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:269的Ab-16Vl和包含SEQ ID NO:235的Ab-16Vh;且其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:271的Ab-17Vl和包含SEQ ID NO:237的Ab-17Vh。实施方案72:实施方案67-71的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:239的Ab-1Vl和包含SEQ ID NO:205的Ab-1Vh;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:241的Ab-2Vl和包含SEQ ID NO:207的Ab-2Vh;且其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:243的Ab-3Vl和包含SEQ ID NO:209的Ab-3Vh。实施方案73:实施方案67-72的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:239的Ab-1Vl和包含SEQ ID NO:205的Ab-1Vh。实施方案74:实施方案67-72的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ IDNO:279的轻链和包含SEQ ID NO:273的重链;其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:281的轻链和包含SEQ ID NO:275的重链;且其中所述多核苷酸序列包括包含SEQ ID NO:283的轻链和包含SEQ ID NO:277的重链。实施方案75:一种质粒,其包含实施方案67-72中任一项的多核苷酸。实施方案76:实施方案75的质粒,其中所述质粒包含表达载体。实施方案77:一种分离的细胞,其包含实施方案76所述的质粒,其中所述细胞选自:a.原核细胞;b.真核细胞;c.哺乳动物细胞;d.昆虫细胞;和e.CHO细胞。实施方案78:一种制造实施方案1-21和31-48中任一项的抗体或多肽的方法,其包括在允许实施方案77所述的分离的细胞表达所述抗体或多肽的条件下对其进行孵育。实施方案79:一种分离的抗体,其包括由实施方案77的CHO细胞产生的抗体,其中所述抗体包含由包含SEQ IDNO:273的序列编码的重链和由包含SEQ ID NO:279的序列编码的轻链。实施方案80:一种药物组合物,其包含实施方案79的抗体。实施方案81:一种分离的单克隆抗体,其包括特异性地结合SEQ IDNO:285和SEQ ID NO:286,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的单克隆抗体。实施方案82:实施方案81的抗体,其中所述抗体是人单克隆抗体。实施方案83:实施方案82的抗体,其中所述抗体是IgG。实施方案84:一种分离的单克隆抗体,其包括特异性地结合SEQ IDNO:352,但不特异性地结合SEQ ID NO:351的单克隆抗体。实施方案85:实施方案84的抗体,其中所述抗体是人单克隆抗体。实施方案86:实施方案85的抗体,其中所述抗体是IgG。实施方案87:实施方案85的抗体,其中所述抗体是IgG1。实施方案88:实施方案81至87中任一项的抗体,其中所述抗体以1nM和.01nM之间的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ IDNO:351。实施方案89:实施方案81至88中任一项的抗体,其中所述抗体以约0.16nM的Kd特异性地结合SEQ ID NO:352且以大于10nM的Kd结合SEQ ID NO:351。实施方案90:一种分离的单克隆抗体,其包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至20(包括端点在内)的中和决定簇的单克隆抗体。实施方案91:实施方案90的抗体,其中所述抗体是人单克隆抗体。实施方案92:实施方案91的抗体,其中所述抗体是IgG。实施方案93:实施方案92的抗体,其中所述抗体是IgG1。实施方案94:一种分离的单克隆抗体,其包括结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1至11(包括端点在内)的中和决定簇的单克隆抗体。实施方案95:实施方案94的抗体,其中所述抗体是人单克隆抗体。实施方案96:实施方案95的抗体,其中所述抗体是IgG。实施方案97:实施方案96的抗体,其中所述抗体是IgG1。实施方案98:实施方案90至97中任一项的抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285。实施方案99:实施方案90至98中任一项的抗体,其中所述抗体以如在生物传感器测定中所测量的约0.16nM±0.1nM的Kd结合SEQ ID NO:352。实施方案100:实施方案90至97中任一项的抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。实施方案101:实施方案90至97中任一项的抗体,其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。实施方案102:实施方案90至97和101中任一项的抗体,其中所述抗体通过FACS分析以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。实施方案103:实施方案90至97中任一项的抗体,其中所述抗体以小于或等于1nM的Kd结合SEQ ID NO:285,且其中所述抗体以小于或等于10nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。实施方案104:实施方案90至97和103中任一项的抗体,其中所述抗体以如在实施例16中所述的生物传感器测定中所测量的约0.16nM的Kd结合SEQ ID NO:352,且其中所述抗体通过FACS分析以约1.2nM的EC50结合在H929细胞表面上表达的SEQ ID NO:285。实施方案105:实施方案1-3和31-33中任一项的抗体,其中所述六个CDR由AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种来确定。实施方案106:实施方案1-14中任一项的抗体,其中抗体是人单克隆IgG抗体。实施方案107:实施方案1-14和106中任一项的抗体,其中抗体是人单克隆IgG1抗体。
如上文所述,假定抗体表位通常定义为在可与抗体的可变区结合的抗原中的三维结构,就通过用于对表位进行描述的方法来定义表位的具体方面。一些方法描述表位的结构方面,诸如通过溶剂可及表面积(ASA)分析测量的抗原上被结合抗体所覆盖的表面积。如由溶剂可及表面积(ASA)分析所确定,本发明的实施方案包括类似于Ab-1与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人单克隆抗体)。如由溶剂可及表面积(ASA)分析所确定,本发明的实施方案包括类似于Ab-2与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人单克隆抗体)。如由溶剂可及表面积(ASA)分析所确定,本发明的实施方案包括类似于Ab-3与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人单克隆抗体)。
一些方法描述表位的功能方面,即在与抗体上的残基相互作用的抗原上的残基,诸如接触距离分析。与huBCMA上的残基相互作用的抗体上的残基总称为抗体的互补位。
“相互作用”意思是抗体和HuBCMA的氨基酸残基在它们之间形成一种或多种非共价力,诸如氢键、盐桥、静电力、疏水力和/或范德瓦耳斯力(van derWaals force)。
如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-1与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)(“约”在关于结晶学接触距离分析使用时意思是)。如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-1与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)。如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-2与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)。如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-2与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)。如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-3与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)。如由约的x射线晶体学接触距离分析所定义,本发明的实施方案包括类似于Ab-3与huBCMA结合的单克隆抗体(具体来说是人IgG单克隆抗体)。
因此,本发明的方面包括(但不限于)其它实施方案,诸如实施方案108:一种分离的单克隆抗体或其片段,其中所述抗体或其片段特异性地结合SEQ ID NO:285的人BCMA并抑制APRIL的生物活性,且其中所述抗体竞争性地抑制人IgG1单克隆抗体的结合,所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:4的Vh-CDR1、包含SEQ IDNO:5的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:6的Vh-CDR3、包含SEQ IDNO:106的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:107的Vl-CDR2和包含SEQ IDNO:108的VL-CDR3,且其中所述抗体对于人BCMA而言具有1和.01nM之间(包括端点在内)的Kd。实施方案109:实施方案108的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是人抗体或其片段,且其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:206的Vh结构域和包含SEQID NO:240的Vl结构域。实施方案110:实施方案108或109的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是人抗体或其片段,且其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:274的重链和包含SEQ IDNO:280的轻链。实施方案111:实施方案108至110的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以0至 (包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ IDNO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17和His19相互作用。实施方案112:实施方案111的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以3.4至 (包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ IDNO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Cys8、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19和Ala20相互作用。实施方案113:实施方案112的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以3.4至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Cys8、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19、Ala20、Ile22、Leu26、Arg27、Pro33、Pro34、Leu35和Leu36相互作用。实施方案114:实施方案113的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以0至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gln7、Asp15、Ser16、Leu17和His19形成氢键。实施方案115:一种分离的单克隆抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是特异性地结合SEQ IDNO:285的人BCMA并抑制APRIL的生物活性的人IgG单克隆,且其中所述抗体包含与SEQ ID NO:206具有至少90%同一性的Vh结构域和与SEQ ID NO:240具有至少90%同一性的Vl结构域。实施方案116:实施方案115的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含与SEQ ID NO:274具有至少90%同一性的重链和与SEQ ID NO:280具有至少90%同一性的轻链。实施方案117:实施方案115的抗体或其片段,其中抗体或其片段包含与SEQ ID NO:206具有至少95%同一性的重链可变结构域和与SEQ ID NO:240具有至少95%同一性的轻链可变结构域。实施方案118:实施方案117的抗体,其中所述抗体包含与SEQ ID NO:274具有至少95%同一性的重链和与SEQ IDNO:280具有至少95%同一性的轻链。实施方案119:实施方案115至118的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含Vl结构域的Asn32、Thr33、Asn35、Asn51、Trp92、Asp94和Trp99及Vh结构域的Arg52、Ser101和Tyr103。实施方案120:实施方案115至119的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含Vl结构域的Ser26、Ser31、Asn32、Thr33、Val34、Asn35、Leu47、Phe50、Asn51、Tyr52、His53、Gln54、Lys67、Trp92、Asp93、Asp94、Asn97和Trp99及Vh结构域的Ala33、Ser35、Val50、Arg52、Tyr56、Ser101、Gly102、Tyr103、Trp107、Pro109、Phe110和Asp111。实施方案121:实施方案108至120的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段对于人BCMA而言具有0.16nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案122:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合SEQ ID NO:285的人BCMA上与包括包含SEQ ID NO:206的Vh结构域和包含SEQ ID NO:240的Vl结构域的人IgG1单克隆抗体相同的表位,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案123:实施方案122的抗体或其Fab片段,其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:274的重链和包含SEQ ID NO:280的轻链。实施方案124:实施方案122或123的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学来定义。实施方案125:实施方案124的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学和0至(包括端点在内)的接触距离分析来定义。实施方案126:实施方案125的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学和3.4至(包括端点在内)的接触距离分析来定义。实施方案127:实施方案125或126的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段覆盖 的SEQ ID NO:285的人BCMA的表面积且具有0.70±0.03的形状互补性。实施方案128:实施方案122至127的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。实施方案129:实施方案128的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案130:实施方案129的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案131:实施方案122至130的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段不特异性地结合SEQ ID NO:351的大鼠BCMA且对于所述大鼠BCMA而言具有大于10nM的Kd。实施方案132:实施方案122至131的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有1和.01nM之间(包括端点在内)的Kd。实施方案133:实施方案132的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有0.16nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案134:实施方案133的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段也特异性地结合由SEQ ID NO:285的氨基酸1-20(包括端点在内)组成的人BCMA的片段。实施方案135:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合人BCMA且如由x射线晶体学所定义以0至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17和His19相互作用,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案136:实施方案135的抗体或其Fab片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以3.4至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Cys8、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19和Ala20相互作用。实施方案137:实施方案136的抗体或其Fab片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以3.4至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Cys8、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19、Ala20、Ile22、Leu26、Arg27、Pro33、Pro34、Leu35和Leu36相互作用。实施方案138:实施方案137的抗体或其Fab片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以0至(包括端点在内)(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ IDNO:360的人BCMA的Gln7、Asp15、Ser16、Leu17和His19形成氢键。实施方案139:实施方案135至138中任一项的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。实施方案140:实施方案139的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案141:实施方案140的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案142:实施方案135至141的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有1和.01nM之间(包括端点在内)的Kd。实施方案143:实施方案142的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有0.16nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案144:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合SEQ ID NO:360的人BCMA,且因此如由x射线晶体学所定义以0至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率在SEQ IDNO:360的氨基酸残基Gly6、Gln7、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19、Ala20、Ile22、Arg27、Pro34和Leu35处使所述人BMCA上的溶剂可及表面积改变大于50%,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案145:实施方案144的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。实施方案146:实施方案145的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案147:实施方案146的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案148:实施方案144至147的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有1和.01nM之间(包括端点在内)的Kd。实施方案149:实施方案148的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有0.16nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案150:实施方案149的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段也特异性地结合由SEQID NO:285的氨基酸1-20(包括端点在内)组成的人BCMA的片段。实施方案151:一种分离的单克隆抗体或其片段,其中所述抗体或其片段特异性地结合SEQ ID NO:285的人BCMA并抑制APRIL的生物活性,且其中所述抗体竞争性地抑制人IgG1单克隆抗体的结合,所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:10的Vh-CDR1、包含SEQID NO:11的Vh-CDR2、包含SEQ ID NO:12的Vh-CDR3、包含SEQID NO:112的Vl-CDR1、包含SEQ ID NO:113的Vl-CDR2和包含SEQID NO:114的Vl-CDR3,其中所述抗体对于人BCMA而言具有0.75至1.11nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案152:实施方案151的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是人抗体或其片段,且其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:208的Vh结构域和包含SEQ ID NO:242的Vl。实施方案153:实施方案151或152的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是人抗体或其片段,且其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:276的重链和包含SEQID NO:282的轻链。实施方案154:实施方案151至153的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以0至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Tyr13、Ser16、Leu17、His19、Arg27和Leu35相互作用。实施方案155:实施方案154的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以3.4至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18和His19相互作用。实施方案156:实施方案155的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以3.4至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQID NO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19、Arg27、Ser30、Thr32、Pro33、Pro34和Leu35相互作用。实施方案157:实施方案156的抗体或其片段,其中如由x射线晶体学所定义,所述人IgG1单克隆抗体以0至 (包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gln7、Ser16和His19形成氢键且在Arg27处形成盐桥。实施方案158:一种分离的单克隆抗体或其片段,其中所述抗体或其片段是特异性地结合SEQ ID NO:285的人BCMA并抑制APRIL的生物活性的人IgG单克隆,且其中所述抗体包含与SEQ ID NO:208具有至少90%同一性的Vh结构域和与SEQID NO:242具有至少90%同一性的Vl结构域。实施方案159:实施方案158的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含与SEQ IDNO:276具有至少90%同一性的重链和与SEQ ID NO:282具有至少90%同一性的轻链。实施方案160:实施方案158的抗体或其片段,其中抗体或其片段包含与SEQ ID NO:208具有至少95%同一性的Vh结构域和与SEQ ID NO:242具有至少95%同一性的Vl结构域。实施方案161:实施方案160的抗体,其中所述抗体包含与SEQ ID NO:276具有至少95%同一性的重链和与SEQ ID NO:282具有至少95%同一性的轻链。实施方案162:实施方案158至161的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含Vl结构域的Tyr37、Ala96、Leu97和Arg101及Vh结构域的Ser31、Val53、Asp56、Asp98、Gly105和Trp107。实施方案163:实施方案158至162的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段包含轻链可变结构域的His31、Asn33、Tyr37、Ala96、Leu97、Gln98、Pro99和Arg101及重链可变结构域的Thr28、Ser30、Ser31、Ala33、Asn35、Ala50、Ile51、Ser52、Val53、Gly54、Gly55、Asp56、Tyr58、Arg71、Asp98、Val100、Met102、Gly105、Val106、Trp107、Tyr108和Tyr109。实施方案164:实施方案158至163的抗体或其片段,其中所述抗体或其片段对于人BCMA而言具有0.75至1.11nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案165:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合SEQ IDNO:285的人BCMA上与包括包含SEQ ID NO:208的Vh结构域和包含SEQ ID NO:242的Vl结构域的人IgG1单克隆抗体相同的表位,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案166:实施方案165的抗体或其Fab片段,其中所述人IgG1单克隆抗体包括包含SEQ ID NO:276的重链和包含SEQ ID NO:282的轻链。实施方案167:实施方案165或166的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学来定义。实施方案168:实施方案167的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学和0至(包括端点在内)的接触距离分析来定义。实施方案169:实施方案168的抗体或其Fab片段,其中所述表位由x射线晶体学和3.4至(包括端点在内)的接触距离分析来定义。实施方案170:实施方案168或169的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段覆盖的SEQ IDNO:285的人BCMA的表面积且具有0.71±0.03的形状互补性。实施方案171:实施方案168至170中任一项的抗体,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。
实施方案172:实施方案171的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案173:实施方案172的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案174:实施方案165至173中任一项的抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段对于SEQ ID NO:285的huBCMA而言具有0.75至1.11nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案175:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合人BCMA且如由x射线晶体学所定义以0至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ IDNO:360的人BCMA的Gly6、Gln7、Tyr13、Ser16、Leu17、His19、Arg27和Leu35相互作用,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案176:实施方案175的抗体,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以3.4至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ IDNO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18和His19相互作用。实施方案177:实施方案175或176的抗体,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以3.4至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Ala5、Gly6、Gln7、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、Leu18、His19、Arg27、Ser30、Thr32、Pro33、Pro34和Leu35相互作用。实施方案178:实施方案175至177的抗体,其中如由x射线晶体学所定义,所述抗体或其Fab片段以0至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率与SEQ ID NO:360的人BCMA的Gln7、Ser16和His19形成氢键并在Arg27处形成盐桥。实施方案179:实施方案175至178的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。实施方案180:实施方案179的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案181:实施方案180的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案182:实施方案175至181的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有0.75至1.11nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案183:一种分离的单克隆抗体或其Fab片段,其中所述抗体或其Fab片段特异性地结合SEQ ID NO:360的人BCMA,且因此如由x射线晶体学所定义以0至(包括端点在内)的接触距离分辨率(包括端点在内)的接触距离分辨率在SEQ ID NO:360的氨基酸残基Gly6、Tyr13、Phe14、Asp15、Ser16、Leu17、His19、Thr32、Pro34和Leu35处使所述人BMCA上的溶剂可及表面积改变大于50%,且其中所述抗体或其Fab片段抑制APRIL的生物活性。实施方案184:实施方案183的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人单克隆抗体或其Fab片段。实施方案185:实施方案184的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG。实施方案186:实施方案185的抗体或其Fab片段,其中所述单克隆抗体或其Fab片段是人IgG1。实施方案187:实施方案183至186的抗体,其中所述抗体或其Fab片段对于人BCMA而言具有0.75至1.11nM±0.1nM(包括端点在内)的Kd。实施方案188:实施方案108至187中任一项的抗体或其片段,其还包含连接子。实施方案189:实施方案188的抗体或其片段,其还包含药物或化疗剂。实施方案190:实施方案189的抗体或片段,其中所述多肽或片段还包含选自以下的连接子:6-马来酰亚胺基己酰基、马来酰亚胺基丙酰基、缬氨酸-瓜氨酸、丙氨酸-苯丙氨酸、对氨基苄氧羰基、Mal-dPEG4-NHS、N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(“SPP”)、N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”或“MCC”)和N-琥珀酰亚胺基(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯(“SIAB”)。实施方案191:实施方案190的抗体或片段,其中所述连接子是N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯。实施方案192:实施方案188至191的抗体或片段,其中所述抗体或片段还包含选自以下的药物或化疗剂:噻替派和环磷酰胺(CYTOXAN.TM.);烷基磺酸酯类,诸如白消安、英丙舒凡和哌泊舒凡;氮杂环丙烷类,诸如苯佐替哌、卡波醌、美妥替哌和乌瑞替哌;乙撑亚胺类和甲基蜜胺类,包括六甲蜜胺、三乙撑蜜胺、三乙撑磷酰胺、三乙撑硫代磷酰胺和三羟甲基蜜胺;番荔枝内酯类(尤其是布拉它辛和布拉它辛酮);喜树碱(包括合成类似物拓朴替康);苔藓抑素;海绵多烯酮类化合物;CC-1065(包括它的阿多来新、卡折来新和比折来新合成类似物);念珠藻素类(尤其是念珠藻素1和念珠藻素8);尾海兔素;倍癌霉素(包括合成类似物KW-2189和CBI-TMI);艾榴塞洛素;水鬼蕉碱;匍枝珊瑚醇A;海绵素;氮芥类,诸如苯丁酸氮芥、萘氮芥、胆磷酰胺、雌莫司汀、异环磷酰胺、甲氮芥、盐酸氧甲氮芥、美法仑、新恩比兴、苯芥胆甾醇、泼尼莫司汀、曲洛磷胺、尿嘧啶氮芥;硝基脲类,诸如卡莫司汀、氯脲霉素、福莫司汀、洛莫司汀、尼莫司汀、雷莫司汀;抗生素类,诸如烯二炔抗生素类(例如,卡里奇霉素,尤其是卡里奇霉素.γ1和卡里奇霉素θI,例如参见Angew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994);达内霉素,包括达内霉素A;埃斯培拉霉素;以及新制癌菌素发色团和相关色蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素、放线菌素、安曲霉素、重氮丝氨酸、博来霉素、放线菌素C、卡拉比星、卡米诺霉素、嗜癌素;色霉素、放线菌素D、柔红霉素、地托比星、6-重氮基-5-氧代-L-正亮氨酸、阿霉素(包括吗啉代-阿霉素、氰基吗啉代-阿霉素、2-吡咯啉子基-阿霉素和脱氧阿霉素)、表柔比星、依索比星、依达比星、麻西罗霉素、尼托霉素、霉酚酸、诺加霉素、橄榄霉素、培洛霉素、泊非霉素、嘌呤霉素、三铁阿霉素、罗多比星、链黑菌素、链佐星、杀结核菌素、乌苯美司、净司他丁、佐柔比星;抗代谢物类,诸如甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,诸如二甲叶酸、甲氨蝶呤、蝶罗呤、三甲曲沙;嘌呤类似物,诸如氟达拉滨、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤、硫鸟嘌呤;嘧啶类似物,诸如安西他滨、阿扎胞苷、6-氮尿苷、卡莫氟、阿糖胞苷、双脱氧尿苷、脱氧氟尿苷、依诺他滨、氟尿苷、5-FU;雄激素类,诸如卡鲁睾酮、丙酸屈他雄酮、环硫雄醇、美雄烷、睾内酯;抗肾上腺类,诸如氨鲁米特、米托坦、曲洛司坦;叶酸补充剂,诸如亚叶酸;醋葡醛内酯;醛磷酰胺糖苷;氨基乙酰丙酸;安吖啶;阿莫司汀;比生群;依达曲沙;磷胺氮芥;地美可辛;地吖醌;伊弗米辛;依利醋铵;埃博霉素;依托格鲁;硝酸镓;羟脲;香菇多糖;氯尼达明;美登素类化合物,诸如美登素和安丝菌素;米托胍腙;米托蒽醌;莫哌达醇;二胺硝吖啶;喷司他丁;蛋氨氮芥;吡柔比星;鬼臼酸;2-乙基酰肼;丙卡巴肼;PSK.RTM.;雷佐生;根霉素;西佐喃;螺旋锗;细交链孢菌酮酸;三亚胺醌;2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢菌素类(尤其是T-2毒素、疣孢菌素A、杆孢菌素A和蛇行菌素);乌拉坦;长春地辛;达卡巴嗪;甘露莫司汀;二溴甘露醇;二溴卫矛醇;哌泊溴烷;加西托星;阿拉伯糖苷(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替派;紫衫烷类,例如紫杉醇(TAXOL.TM.,Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)和多西他赛(TAXOTERE.RTM.,Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥;吉西他滨;6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;甲氨蝶呤;铂类似物,诸如顺铂和卡铂;长春碱;铂;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺;丝裂霉素C;米托蒽醌;长春新碱;长春瑞滨;诺威本;能灭瘤;替尼泊苷;道诺霉素;氨基蝶呤;希罗达;伊班膦酸盐;CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);视黄酸;卡培他滨;他莫昔芬、雷洛昔芬、抑制芳香酶的4(5)-咪唑类、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬、那洛昔芬、LY117018、奥那司酮和托瑞米芬(法乐通);和抗雄激素类,诸如氟他米特、尼鲁米特、比卡米特、亮丙瑞林、戈舍瑞林、秋水仙碱-位点结合剂(Curacin)、康普立停(AVE806、康普立停A-4前药(CA4P)、Oxi-4503)、念珠藻素类(LY355703)、圆皮海绵内酯、尾海兔素和类似物(阿里他汀PHE、尾海兔素10、ILX-651、西姆司他丁1、TZT-1027)、埃博霉素(BMS-247550、BMS-310705、EP0906、KOS-862、ZK-EPO)、艾榴塞洛素、FR182877、软海绵素B(E7389)、哈利米特(NPI-2352和NPI-2358)、哈米特林(HTI-286)、劳力莫大环内酯、美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)(比伐单抗-DM1、美坎珠单抗、huN901-DM1/BB-10901TAP、MLN591DM1、My9-6-DM1、曲司珠单抗-DM1)、PC-SPES、派罗塞特A、白藜芦醇、S-烯丙巯基半胱氨酸(SAMC)、海绵素、维替米特、分子发动机-驱动蛋白(SB-715992)、设计的秋水仙碱-位点结合剂(A-289099、A-293620/A-318315、ABT-751/E7010、D-24851/D-64131、ZD6126)、其它新型的纺锤体毒素(2-甲氧基雌二醇(2-ME2)、苯并咪唑氨基甲酸酯类(ANG 600系列,甲苯咪唑)、CP248/CP461、HMN-214、R440、SDX-103、T67/T607)。实施方案193:实施方案192的抗体或片段,其中药物或化疗剂选自:美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)。实施方案194:实施方案193的抗体或片段,其中所述药物或化疗剂是DM1。实施方案195:实施方案193或194的抗体或片段,其中所述抗体或片段的药物与抗体/抗体片段比率在1和10之间(包括端点在内)。实施方案196:实施方案195的抗体或片段,其中所述抗体或片段的药物与抗体/抗体片段比率在2和5之间(包括端点在内)。实施方案197:一种组合物,其包含实施方案108至196中任一项的抗体或其片段。实施方案198:一种药物组合物,其包含实施方案108至196中任一项的抗体或其片段。实施方案199:实施方案198的药物组合物,其包含药学上可接受的稀释剂、载剂、增溶剂、乳化剂和/或防腐剂。实施方案200:一种治疗疾病的方法,其包括施用有效量的实施方案197至199中任一项的组合物,其中所述疾病选自:B细胞癌症、多发性骨髓瘤、恶性浆细胞肿瘤、卡勒氏病和骨髓瘤病;浆细胞白血病;浆细胞瘤;B细胞幼淋巴细胞白血病;毛细胞白血病;B细胞非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);急性骨髓性白血病(AML);慢性骨髓性白血病(CML);急性淋巴细胞白血病(ALL);慢性淋巴细胞白血病(CLL);滤泡性淋巴瘤(包括滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤类型);伯基特氏淋巴瘤(地方性伯基特氏淋巴瘤;散发性伯基特氏淋巴瘤);边缘区淋巴瘤(粘膜相关淋巴组织;MALT/MALToma;单核细胞样B细胞淋巴瘤;伴绒毛状淋巴细胞的脾淋巴瘤);套细胞淋巴瘤;大细胞淋巴瘤(弥漫性大细胞;弥漫性混合细胞;免疫母细胞性淋巴瘤;原发性纵隔B细胞淋巴瘤;血管中心性淋巴瘤-肺B细胞);小淋巴细胞淋巴瘤(SLL);前体B-淋巴母细胞淋巴瘤;骨髓性白血病(粒细胞;骨髓性;急性骨髓性白血病;慢性骨髓性白血病;亚急性骨髓性白血病;髓细胞肉瘤;绿色瘤;粒细胞肉瘤;急性早幼粒细胞白血病;急性粒单核细胞白血病);瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症或其它B细胞淋巴瘤。实施方案201:实施方案200的方法,其中所述疾病选自:B细胞癌症、多发性骨髓瘤、恶性浆细胞肿瘤或其它B细胞淋巴瘤。实施方案202:实施方案201的方法,其中所述疾病是多发性骨髓瘤。实施方案203:实施方案200至202中任一项的方法,还包括施用一种或多种选自以下的其它治疗:化学治疗、放射治疗、外科手术、蛋白酶体抑制剂、皮质类固醇和干细胞移植。实施方案204:实施方案203的方法,其中施用所述其它治疗是在施用实施方案197至199中任一项的组合物之前、与此同时或之后,或以各自的组合形式。
在BCMA抗原结合蛋白用于治疗应用的实施方案中,BCMA抗原结合蛋白的一种特征在于它可以抑制BAFF和/或APRIL活化BCMA。这类抗体因为能够抑制BAFF和/或APRIL活化BCMA而被认为是中和抗体。在这种情形下,抗原结合蛋白特异性地结合BCMA并使BAFF和/或APRIL对BCMA的生物活性受到10%至100%之间的抑制,诸如至少约20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99%或99%以上(例如通过在如本文中,诸如实施例2中所述的体外竞争性结合测定中测量结合)。本发明的方面包括特异性地结合人BCMA并在实施例2中所述的测定条件或相当的测定下使人APRIL与人BCMA的结合受到约89%(±5%)的抑制的人单克隆抗体,如Ab-1。
如本文中多方面定义,抗原结合蛋白的实施方案包括具有一个或多个互补决定区(CDR)的支架结构。抗原结合蛋白的实施方案包含具有一个或多个可变结构域的支架结构。实施方案包括表1中所列的抗体以及其片段、衍生物、突变蛋白和变体。实施方案包括表1中所列抗体的ADC。序列表中提供表1中所列抗体的序列。
表1.
抗体 |
氨基酸SEQ ID NO: |
核酸SEQ ID NO: |
Ab-1(2A1CV5) |
|
|
全长重链 |
274 |
273 |
全长轻链 |
280 |
279 |
Vh |
206 |
205 |
Vl |
240 |
239 |
Vh CDR1 |
4 |
1 |
Vh CDR2 |
5 |
2 |
Vh CDR3 |
6 |
3 |
Vl CDR1 |
106 |
103 |
Vl CDR2 |
107 |
104 |
Vl CDR3 |
108 |
105 |
|
|
|
Ab-2(29C12_mut) |
|
|
全长重链 |
276 |
275 |
全长轻链 |
282 |
281 |
Vh |
208 |
207 |
Vl |
242 |
241 |
Vh CDR1 |
10 |
7 |
Vh CDR2 |
11 |
8 |
Vh CDR3 |
12 |
9 |
Vl CDR1 |
112 |
109 |
Vl CDR2 |
113 |
110 |
Vl CDR3 |
114 |
111 |
|
|
|
Ab-3(32B5_mut) |
|
|
全长重链 |
278 |
277 |
全长轻链 |
284 |
283 |
Vh |
210 |
209 |
Vl |
244 |
243 |
Vh CDR1 |
16 |
13 |
Vh CDR2 |
17 |
14 |
Vh CDR3 |
18 |
15 |
Vl CDR1 |
118 |
115 |
Vl CDR2 |
119 |
116 |
Vl CDR3 |
120 |
117 |
|
|
|
Ab-4(1E1) |
|
|
Vh |
212 |
211 |
Vl |
246 |
245 |
Vh CDR1 |
22 |
19 |
Vh CDR2 |
23 |
20 |
Vh CDR3 |
24 |
21 |
Vl CDR1 |
124 |
121 |
Vl CDR2 |
125 |
122 |
Vl CDR3 |
126 |
123 |
|
|
|
Ab-5(2A1) |
|
|
Vh |
214 |
213 |
Vl |
248 |
247 |
Vh CDR1 |
28 |
25 |
Vh CDR2 |
29 |
26 |
Vh CDR3 |
30 |
27 |
Vl CDR1 |
130 |
127 |
Vl CDR2 |
131 |
128 |
Vl CDR3 |
132 |
129 |
|
|
|
Ab-6(11F12_LC#1) |
|
|
Vh |
216 |
215 |
Vl |
250 |
249 |
Vh CDR1 |
34 |
31 |
Vh CDR2 |
35 |
32 |
Vh CDR3 |
36 |
33 |
Vl CDR1 |
136 |
133 |
Vl CDR2 |
137 |
134 |
Vl CDR3 |
138 |
135 |
|
|
|
Ab-7(11F12_LC#2) |
|
|
Vh |
218 |
217 |
Vl |
252 |
251 |
Vh CDR1 |
40 |
37 |
Vh CDR2 |
41 |
38 |
Vh CDR3 |
42 |
39 |
Vl CDR1 |
142 |
139 |
Vl CDR2 |
143 |
140 |
Vl CDR3 |
144 |
141 |
|
|
|
Ab-8(29C12) |
|
|
Vh |
220 |
219 |
Vl |
254 |
253 |
Vh CDR1 |
46 |
43 |
Vh CDR2 |
47 |
44 |
Vh CDR3 |
48 |
45 |
Vl CDR1 |
148 |
145 |
Vl CDR2 |
149 |
146 |
Vl CDR3 |
150 |
147 |
|
|
|
Ab-9(30E1) |
|
|
Vh |
222 |
221 |
Vl |
256 |
255 |
Vh CDR1 |
52 |
49 |
Vh CDR2 |
53 |
50 |
Vh CDR3 |
54 |
51 |
Vl CDR1 |
154 |
151 |
Vl CDR2 |
155 |
152 |
Vl CDR3 |
156 |
153 |
|
|
|
Ab-10(32B5) |
|
|
Vh |
224 |
223 |
Vl |
258 |
257 |
Vh CDR1 |
58 |
55 |
Vh CDR2 |
59 |
56 |
Vh CDR3 |
60 |
57 |
Vl CDR1 |
160 |
157 |
Vl CDR2 |
161 |
158 |
Vl CDR3 |
162 |
159 |
|
|
|
Ab-11(33C7_HC#1) |
|
|
Vh |
226 |
225 |
Vl |
260 |
259 |
Vh CDR1 |
64 |
61 |
Vh CDR2 |
65 |
62 |
Vh CDR3 |
66 |
63 |
Vl CDR1 |
166 |
163 |
Vl CDR2 |
167 |
164 |
Vl CDR3 |
168 |
165 |
|
|
|
Ab-12(32H3) |
|
|
Vh |
228 |
227 |
Vl |
262 |
261 |
Vh CDR1 |
70 |
67 |
Vh CDR2 |
71 |
68 |
Vh CDR3 |
72 |
69 |
Vl CDR1 |
172 |
169 |
Vl CDR2 |
173 |
170 |
Vl CDR3 |
174 |
171 |
|
|
|
Ab-13(33C7_HC#2) |
|
|
Vh |
230 |
229 |
Vl |
264 |
263 |
Vh CDR1 |
76 |
73 |
Vh CDR2 |
77 |
74 |
Vh CDR3 |
78 |
75 |
Vl CDR1 |
178 |
175 |
Vl CDR2 |
178 |
176 |
Vl CDR3 |
180 |
177 |
|
|
|
Ab-14(33D4) |
|
|
Vh |
232 |
231 |
Vl |
266 |
265 |
Vh CDR1 |
82 |
79 |
Vh CDR2 |
83 |
80 |
Vh CDR3 |
84 |
81 |
Vl CDR1 |
184 |
181 |
Vl CDR2 |
185 |
182 |
Vl CDR3 |
186 |
183 |
|
|
|
Ab-15(35D2) |
|
|
Vh |
234 |
233 |
Vl |
268 |
267 |
Vh CDR1 |
88 |
85 |
Vh CDR2 |
89 |
86 |
Vh CDR3 |
90 |
87 |
Vl CDR1 |
190 |
187 |
Vl CDR2 |
191 |
188 |
Vl CDR3 |
192 |
189 |
|
|
|
Ab-16(37B2) |
|
|
Vh |
236 |
235 |
Vl |
270 |
269 |
Vh CDR1 |
94 |
91 |
Vh CDR2 |
95 |
92 |
Vh CDR3 |
96 |
93 |
Vl CDR1 |
196 |
193 |
Vl CDR2 |
197 |
194 |
Vl CDR3 |
198 |
195 |
|
|
|
Ab-17(40D7) |
|
|
Vh |
238 |
237 |
Vl |
272 |
271 |
Vh CDR1 |
100 |
97 |
Vh CDR2 |
101 |
98 |
Vh CDR3 |
103 |
99 |
Vl CDR1 |
202 |
199 |
Vl CDR2 |
203 |
200 |
Vl CDR3 |
204 |
201 |
使用Aho编号系统来表征用于本文所述的各种抗体的CDR结构域。本领域中熟知Aho编号系统,参见Honegger,A.和Plückthun,A.(2001),J.Mol.Biol.309,657-670。本发明的实施方案包括包含在使用其它常规的编号系统(诸如Kabat和Clothia编号系统)识别的本文所述的Vh和Vl结构域中发现的CDR的抗体。这些编号系统在本领域中熟知(参见http://www.bioc.uzh.ch/antibody)。关于这些CDR编号系统的比较,参见:http://www.bioc.uzh.ch/antibody/Numbering/NumFrame.html。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:114)。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:144)。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174)。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:192)。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQID NO:206)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-5Vl(SEQ IDNO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ IDNO:216)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)结构域的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ IDNO:220)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-14Vl(SEQID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)结构域的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的分离的抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含两条Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和两条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含两条Ab-2轻链(SEQ IDNO:282)和两条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含两条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的单克隆抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少95%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-2Vl(SEQID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-3Vl(SEQ IDNO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-4Vl(SEQ IDNO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-5Vl(SEQ IDNO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-6Vl(SEQ IDNO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-7Vl(SEQ IDNO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-8Vl(SEQ IDNO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-9Vl(SEQ IDNO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-10Vl(SEQ IDNO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-11Vl(SEQ IDNO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-12Vl(SEQ IDNO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-13Vl(SEQ IDNO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-14Vl(SEQ IDNO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-15Vl(SEQ IDNO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-16Vl(SEQ IDNO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括包含分别与Ab-17Vl(SEQ IDNO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括与Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括与Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)具有至少95%同一性的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括与Ab-2轻链(SEQ IDNO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体。本发明的方面包括与Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ IDNO:278)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
如本文中所用,术语“抗体”指的是如本文中多方面描述的包含一个或多个与抗原特异性结合的多肽链的各种形式的单体或多聚蛋白。在某些实施方案中,通过重组DNA技术来产生抗体。在其它实施方案中,通过酶促或化学裂解天然存在的抗体来产生抗体。在另一方面,抗体选自:人抗体;人源化抗体;嵌合抗体;单克隆抗体;抗原结合抗体片段;单链抗体;双链抗体(diabody);三链抗体(triabody);四链抗体(tetrabody);Fab片段;F(ab’)2片段;IgD抗体;IgE抗体;IgM抗体;IgA抗体;IgG1抗体;IgG2抗体;IgG3抗体;和IgG4抗体。
作为一般结构,本发明的抗原结合蛋白包含(a)一个支架和(b)多个CDR。如本文中所用的“互补决定区”或“CDR”指的是构成用于抗原结合的主要表面接触点的结合蛋白区。本发明的实施方案包括一个或多个嵌埋在抗原结合蛋白的支架结构中的CDR。抗原结合蛋白的支架结构可以是抗体或其片段或变体的骨架,或在性质上可完全是合成的。下文中进一步描述本发明的抗原结合蛋白的各种支架结构的例子。
如说明书上下文中结合诸如肽、多肽、核酸、宿主细胞等生物物质所用的术语“天然存在的”指的是自然界中存在的物质。在天然存在的抗体中,H-CDR1典型地包含约五(5)个至约七(7)个氨基酸,H-CDR2典型地包含约十六(16)个至约十九(19)个氨基酸,且H-CDR3典型地包含约三(3)个至约二十五(25)个氨基酸。L-CDR1典型地包含约十(10)个至约十七(17)个氨基酸,L-CDR2典型地包含约七(7)个氨基酸,且L-CDR3典型地包含约七(7)个至约十(10)个氨基酸。表1中提供用于本发明的各种抗体的特定CDR的序列标识符。
天然存在的抗体典型地包括信号序列,其引导抗体进入细胞途径用于蛋白分泌且在成熟抗体中不存在。如下文所述,编码本发明的抗体的多核苷酸可编码天然存在的信号序列或异源信号序列。
本领域中已描述天然存在的抗体中的CDR的一般结构和特性。简单来说,在传统的抗体支架中,CDR嵌埋在重链和轻链可变区中的骨架内,在其中它们构成主要负责抗原结合和识别的区。可变区在骨架区内(指定的骨架区1-4、FR1、FR2、FR3和FR4,Kabat等人,1991,上文;也参见Chothia和Lesk,1987,上文)包含至少三个重链或轻链CDR,参见上文(Kabat等人,1991,Sequences ofProteins ofImmunologicalInterest,Public Health Service N.I.H.,Bethesda,MD;也参见Chothia和Lesk,1987,J.Mol.Biol.196:901-917;Chothia等人,1989,Nature 342:877-883)。参见下文。然而,如本文所述,本发明提供的CDR不仅可用于定义传统抗体结构的抗原结合结构域,而且可嵌埋在各种其它的支架结构中。
本发明的抗体可包含本领域中已知的任何恒定区。轻链恒定区例如可以是κ-或λ-型轻链恒定区,例如人κ-或λ-型轻链恒定区。重链恒定区例如可以是α-、δ-、ε-、γ-或μ-型重链恒定区,例如人α-、δ-、ε-、γ-或μ-型重链恒定区。在一个实施方案中,轻链或重链恒定区是天然存在的恒定区的片段、衍生物、变体或突变蛋白。
实施方案包括使用人抗体支架组分(例如,恒定结构域)。用于重链的人IgG1恒定结构域的优选实施方案在SEQ ID NO:274中进行描述(和Vh结构域一起)且用于重链的优选人IgG1恒定结构域在SEQID NO:280中进行描述(和Vl结构域一起)。实施方案包括人抗体支架组分的使用。当然,应了解可采用本领域中已知的任何合适的抗体支架。
传统的抗体结构单位典型地包括四聚物。每个四聚物典型地由两对相同的多肽链组成,每对具有一个“轻链”(典型地具有约25kDa的分子量)和一个“重链”(典型地具有约50-70kDa的分子量)。每条连的氨基末端部分包括约100至110或更多个氨基酸的可变区主要负责抗原识别。每条链的羧基末端部分界定主要负责效应子功能的恒定区。人轻链分类为κ和λ轻链。重链分类为μ、δ、γ、α或ε,并将抗体的同种型分别定义为IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。IgG具有几个子类,包括(但不限于)IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。IgM具有子类,包括(但不限于)IgM1和IgM2。本发明的实施方案包括如本文中所述合并有抗原结合蛋白的可变结构域或CDR的所有这些类别的抗体。
在轻链和重链中,可变区和恒定区通过约十二(12)个或更多个氨基酸的“J”区连接,其中重链还包括约十(10)个或更多个氨基酸的“D”区。通常参见Paul,W.编,1989,Fundamental Immunology第7章,第2版,Raven Press,N.Y。每对轻链/重链的可变区形成抗体结合位点。本发明的支架包括这些区。
然而,在一些实施方案中,支架组分可以是来自不同物种的混合物。因此,如果抗原结合蛋白是抗体,那么这种抗体可以是嵌合抗体和/或人源化抗体。一般来说,“嵌合抗体”和“人源化抗体”指的是合并有来自一种以上物种的区的抗体。举例来说,“嵌合抗体”传统上包含来自小鼠(或在某些情形下是大鼠)的可变区和来自人的恒定区。
“人源化抗体”通常指的是可变结构域骨架区与在人抗体中发现的序列交换的非人抗体。通常在人源化抗体中,整个抗体(除了CDR以外)由人来源的多核苷酸编码或与这种抗体相同(除了在其CDR中以外)。CDR(其中一些或全部由源自非人生物体的核酸编码)被移植到人抗体可变区的β-折叠骨架中以产生抗体,其特异性由被移植的CDR来决定。这类抗体的产生例如在WO 92/11018,Jones,1986,Nature321:522-525,Verhoeyen等人,1988,Science 239:1534-1536中有所描述。人源化抗体也可以使用具有基因工程免疫系统的小鼠而产生。Roque等人,2004,Biotechnol.Prog.20:639-654。在本发明中,识别的CDR是人CDR,且因此本文中的人源化和嵌合抗体包括一些非人CDR;例如,可产生包含CDRH3和CDRL3区的人源化抗体,其中一个或多个其它CDR区来自不同的特殊来源。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是多特异性抗体,且尤其是双特异性抗体,有时也称为“双链抗体”。这些是结合两种(或两种以上)不同抗原的抗体。双链抗体可以通过本领域中已知的各种方式来制造(Holliger和Winter,1993,Current Opinion Biotechnol.4:446-449),例如,通过化学方式制备或由杂交杂交瘤来制造。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是微型抗体。微型抗体是包含与CH3结构域连接的scFv的最小化抗体样蛋白。Hu等人,1996,CancerRes.56:3055-3061。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是结构域抗体;参见例如美国专利号6,248,516。结构域抗体(dAb)是抗体的功能结合结构域,对应于人抗体dAB的重链(VH)或轻链(VL)的可变区,具有约13kDa的分子量或小于完整抗体的十分之一尺寸。dAB在包括细菌、酵母和哺乳动物细胞系统的多种宿主中充分表达。另外,即使在经受严酷条件,诸如冷冻干燥或热变性后,dAb仍高度稳定且保持活性。参见例如美国专利6,291,158;6,582,915;6,593,081;6,172,197;美国连续案号2004/0110941;欧洲专利0368684;美国专利6,696,245、WO04/058821、WO04/003019和WO03/002609。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是作为本文中概述的保持与BCMA的结合特异性的任一种抗体的片段的抗体片段。在各种实施方案中,抗体结合蛋白包括(但不限于)F(ab)、F(ab')、F(ab')2、Fv或单链Fv片段(ScFv)。在最低限度上,如本文中提到的抗体包括可以与包含全部或部分轻链或重链可变区(诸如一个或多个CDR)的BCMA特异性结合的多肽。
BCMA结合抗体片段的其它例子包括(但不限于)(i)由VL、VH、CL和CH1结构域组成的Fab片段;(ii)由VH和CH1结构域组成的Fd片段;(iii)由单一抗体的VL和VH结构域组成的Fv片段;(iv)由单一可变组成的dAb片段(Ward等人,1989,Nature 341:544-546);(v)分离的CDR区;(vi)F(ab')2片段,一种包含两个连接的Fab片段的二价片段;(vii)单链Fv分子(scFv),其中VH结构域和VL结构域通过使两个结构域可缔合形成抗原结合位点的肽连接子连接(Bird等人,1988,Science 242:423-426,Huston等人,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:5879-5883);(viii)双特异性单链Fv二聚物(PCT/US92/09965);和(ix)“双链抗体”或“三链抗体”,其为通过基因融合构建的多价或多特异性片段(Tomlinson等人,2000,MethodsEnzymol.326:461-479;WO94/13804;Holliger等人,1993,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90:6444-6448)。抗体片段可以经修饰。举例来说,分子可通过并入连接VH和VL结构域的二硫桥而得以稳定(Reiter等人,1996,NatureBiotech.14:1239-1245)。本发明的方面包括其中这些片段的非CDR组分是人序列的实施方案。
特定实施方案包括完全是人抗体的BCMA抗体。在此实施方案中,如上文概述,具体结构包含所述包含CDR区的完全重链和轻链。其它实施方案使用本发明的一个或多个CDR,其它CDR、骨架区、J区和D区、恒定区等来自其它人抗体。举例来说,本发明的CDR可代替任何数量的人抗体,尤其是市场上相关的抗体的CDR。
使用技术来制备本文提供的人抗体(参见实施例2)。此技术能够产生人免疫球蛋白分子和在产生鼠科免疫球蛋白分子和抗体方面不足的抗体。通过使用这种技术,可产生针对BCMA的完全人单克隆抗体。在一个实施方案中,用huBCMA免疫小鼠的细胞系,从表达抗体的小鼠回收淋巴细胞(诸如B细胞),并使这些细胞与髓细胞型的细胞系融合来制备永生化的杂交瘤细胞系,而且对这些杂交瘤细胞系进行筛选和选择来鉴定产生对所关注的抗原具有特异性的抗体的杂交瘤细胞系。本文提供用于制造产生对BCMA具有特异性的抗体的多个杂交瘤细胞系的方法。此外,本文提供对由这些细胞系产生的抗体进行表征,包括这些抗体的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。
或者,对由从小鼠的免疫细胞系分离的回收细胞产生的抗体进一步筛选其针对初始抗原(优选的是BCMA蛋白)的反应性,而非与骨髓瘤细胞融合产生杂交瘤。这些筛选包括使用BCMA蛋白进行ELISA,其中BCMA蛋白体外结合(例如)稳定表达全长BCMA的293T细胞。随后使用标准的BCMA特异性结合测定(诸如通过FACS)分离分泌所关注抗体的单一B细胞。分离单一抗原特异性浆细胞并从单一浆细胞分离编码抗体特异性的遗传信息。使用逆转录酶PCR,可以克隆编码所分泌抗体的可变区的DNA。这些克隆的DNA随后可进一步插入合适的表达载体中,优选是诸如pcDNA的载体盒,更优选是含有免疫球蛋白重链和轻链的恒定结构域的这种pcDNA载体。所产生的载体随后可转染到宿主细胞中,优选是CHO细胞,并在适当经改进的常规营养培养基中进行培养以用于诱导启动子、选择转化子或扩增编码所需序列的基因。
来自小鼠的B细胞也可以用作可产生抗体展示文库的遗传物质的来源。这些文库可使用本领域中的一般技术通过核糖体展示在噬菌体、酵母中或体外产生。高免疫小鼠可以是可分离高亲和力、抗原反应性抗体的丰富来源。因此,可使用针对BCMA高免疫的小鼠来产生可分离针对BCMA的高亲和力抗体的抗体展示文库。可针对表达BCMA的细胞来对这些库进行筛选以证实对于天然展示抗原的特异性。随后可使用重组DNA技术来表达完整的IgG抗体。参见例如,WO 99/53049。
一般来说,由上述细胞系产生的抗体具备具有人κ轻链的完全人IgG1或IgG2重链。在一个实施方案中,在通过固相或溶液相测量时,抗体具备高亲和力,典型地具备约10-9至约10-13M的亲和力常数。如本领域技术人员所了解,根据本发明实施方案的抗体可在除杂交瘤细胞系以外的细胞系中表达。编码特定抗体的序列可用于转化合适的哺乳动物宿主细胞。转化可通过用于将多核苷酸引入宿主细胞的任何已知方法进行,例如包括将多核苷酸包装在病毒(或病毒载体中)并用病毒(或载体)转导宿主细胞或通过本领域中已知的转染程序,如美国专利号4,399,216、4,912,040、4,740,461和4,959,455所示例的(这些专利以引用的方式并入本文)。所用的转化程序取决于将转化的宿主。用于将异源多核苷酸引入哺乳动物细胞中的方法在本领域中熟知且包括葡聚糖介导的转染、磷酸钙沉淀、聚凝胺介导的转染、原生质体融合、电穿孔、将多核苷酸囊封在脂质体中和将DNA直接微注射至核中。可用作用于表达的宿主的哺乳动物细胞系在本领域中熟知且包括可从美国典型培养物保藏中心(American Type CultureCollection,ATCC)获得的多种永生化细胞系,包括(但不限于)中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、幼仓鼠肾(BHK)细胞、猴肾细胞(COS)、人肝细胞癌细胞(例如,Hep G2)和许多其它细胞系。尤其优选的细胞系通过确定哪些细胞系具有高表达水平并产生具有基本BCMA结合特性的抗体来进行选择。
单链抗体可通过由氨基酸桥(短肽连接子)连接重链和轻链可变结构域(Fv区)片段来形成,产生单一多肽链。这些单链Fv(scFv)已通过在编码两个可变结构域多肽(VL和VH)的DNA之间融合编码肽连接子的DNA来制备。得到的多肽可折叠回自身上以形成抗原结合单体,或它们可形成多聚物(例如,二聚物、三聚物或四聚物),这取决于两个可变结构域之间的柔性连接子的长度(Kortt等人,1997,Prot.Eng.10:423;Kortt等人,2001,Biomol.Eng.18:95-108)。通过合并不同的包含VL和VH的多肽,可以形成与不同表位结合的多聚scFv(Kriangkum等人,2001,Biomol.Eng.18:31-40)。开发用于产生单链抗体的技术包括美国专利号4,946,778;Bird,1988,Science 242:423;Huston等人,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879;Ward等人,1989,Nature 334:544,de Graaf等人,2002,Methods Mol Biol.178:379-87中所述的那些技术。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是一种抗体融合蛋白(本文中有时称为“抗体偶联物”或“抗体药物偶联物”或“ADC”)。偶联物配偶体可以是蛋白质或非蛋白质的;后者通常使用抗原结合蛋白上(参见关于抗原结合蛋白的共价修饰的论述)和在偶联物配偶体上的官能团产生。举例来说,连接子在本领域中已知;例如同源或异源双功能连接子是熟知的(参见以引用方式并入本文的1994PierceChemical Company目录,关于交联剂的技术部分,第155-200页)。下文和实施例中更详细描述本发明的ADC。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体类似物,有时称为“合成抗体”。举例来说,各种最近的工作使用具有移植CDR的替代性蛋白支架或人工支架。这些支架包括(但不限于)被引入用于稳定结合蛋白的三维结构的突变以及例如由生物相容性聚合物组成的完全合成支架。参见例如Korndorfer等人,2003,Proteins:Structure,Function,andBioinformatics,第53卷,第1期:121-129。Roque等人,2004,Biotechnol.Prog.20:639-654。另外,可使用肽抗体模拟物(“PAM”),以及基于使用纤连蛋白组分作为支架的抗体模拟物的工作。
除了Ab-1、2和3中示例的人IgG1支架以外,可设想的支架的其它例子包括:纤连蛋白、新制癌菌素CBM4-2、脂质运载蛋白、T细胞受体、蛋白-A结构域(蛋白Z)、Im9、TPR蛋白、锌指结构域、pVIII、鸟类胰多肽、GCN4、WW结构域、Src同源结构域3、PDZ结构域、TEM-1β-内酰胺酶、硫氧还蛋白、葡萄球菌核酸酶、PHD指结构域、CL-2、BPTI、APPI、HPSTI、大肠杆菌素、LACI-D1、LDTI、MTI-II、蝎毒素、昆虫防御素-A肽、EETI-II、Min-23、CBD、PBP、细胞色素b-562、Ldl受体结构域、γ-晶体蛋白、泛素、转铁蛋白(transferring)和/或C-型凝集素样结构域。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174)。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的多肽,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQID NO:206)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ IDNO:210)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-4Vl(SEQID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-6Vl(SEQ IDNO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)结构域的多肽。本发明的方面包括包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的分离的多肽。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的多肽。本发明的方面包括包含Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ IDNO:278)的分离的多肽。本发明的方面包括包含两条或更多条Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和两条或更多条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的多肽。本发明的方面包括包含两条或更多条Ab-2轻链(SEQ IDNO:282)和两条或更多条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的多肽。本发明的方面包括包含两条或更多条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条或更多条Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的多肽。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的多肽,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。
本发明的方面包括包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ IDNO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-8Vl(SEQ IDNO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ IDNO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ IDNO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ IDNO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ IDNO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ IDNO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ IDNO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。本发明的方面包括包含分别与Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ IDNO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的多肽。
本发明的方面包括与包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和/或Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的多肽具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的多肽。本发明的方面包括与包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和/或Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的多肽具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的多肽。本发明的方面包括与包含Ab-3轻链(SEQ IDNO:284)和/或Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的多肽具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的多肽。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
如本文中所用“蛋白质”意思是至少两个共价连接的氨基酸,包括蛋白质、多肽、寡肽和肽。在一些实施方案中,两个或更多个共价连接的氨基酸通过肽键连接。如下文所概述,蛋白质可由天然存在的氨基酸和肽键组成,例如当使用表达系统和宿主系统重组制得蛋白时。或者,蛋白质可包括合成氨基酸(例如,高苯丙氨酸、瓜氨酸、鸟氨酸和正亮氨酸)或拟肽类结构,即“肽或蛋白质类似物”,诸如类肽(参见Simon等人,1992,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89:9367,以引用的方式并入本文),它们可对蛋白酶或其它生理学和/或储存条件具有抗性。尤其在通过本领域中熟知的常规方法体外合成抗原结合蛋白时,可并入这些合成氨基酸。另外,可使用拟肽类、合成和天然存在的残基/结构的任意组合。“氨基酸”也包括亚氨基酸残基,诸如脯氨酸和羟基脯氨酸。氨基酸“R基团”或“侧链”可以是(L)-或(S)-构型。在一个具体实施方案中,氨基酸是(L)-或(S)-构型。
“重组蛋白”是使用本领域中已知的任何技术和方法,即通过如本文中所述表达重组核酸,使用重组技术制得的蛋白。本领域中熟知用于产生重组蛋白的方法和技术。
在一些实施方案中,本发明的抗原结合蛋白是分离的蛋白质或基本上纯的蛋白质。“分离的”蛋白质不伴有通常在其自然状态下相关的至少一些物质,例如在指定样品中占总蛋白质的至少约5重量%或至少约50重量%。应了解,视环境而定,分离的蛋白质可占总蛋白含量的5至99.9重量%。举例来说,蛋白质可通过使用诱导型启动子或高表达启动子以显著较高的浓度制成,以便以增加的浓度水平制备蛋白质。此定义包括在本领域中已知的多种生物体和/或宿主细胞中产生抗原结合蛋白。
对于氨基酸序列而言,通过使用本领域中已知的标准技术来确测序列同一性和/或相似性,所述标准技术包括(但不限于)Smith和Waterman,1981,Adv.Appl.Math.2:482的局部序列同一性算法、Needleman和Wunsch,1970,J.Mol.Biol.48:443的序列同一性比对算法、Pearson和Lipman,1988,Proc.Nat.Acad.Sci.U.S.A.85:2444的相似性检索方法、电脑实施这些算法(Wisconsin Genetics软件包,Genetics Computer Group,575Science Drive,Madison,Wis.中的GAP、BESTFIT、FASTA和TFASTA)、Devereux等人,1984,Nucl.AcidRes.12:387-395所述的最佳匹配序列程序,优选地使用默认值设置或通过检查。优选地通过FastDB基于以下参数来计算同一性百分比:错配罚分为1;空位罚分为1;空位大小罚分为0.33;且连接罚分为30,“Current Methods in Sequence Comparison and Analysis,”Macromolecule Sequencing and Synthesis,Selected Methods andApplications,第127-149页(1988),Alan R.Liss,Inc.
适用算法的一个例子是PILEUP。PILEUP使用渐进式的成对比对由一组相关序列产生多序列对准。也可以描绘成树形,展示用于产生对准的群集关系。PILEUP使用Feng&Doolittle,1987,J.Mol.Evol.35:351-360的简化渐进式比对方法;此方法与Higgins和Sharp,1989,CABIOS 5:151-153所述的方法相似。适用的PILEUP参数包括3.00的默认空位权重、0.10的默认空位长度权重和加权端空位。
适用算法的另一个例子是BLAST算法,在Altschul等人,1990,J.Mol.Biol.215:403-410;Altschul等人,1997,Nucleic Acids Res.25:3389-3402;和Karin等人,1993,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90:5873-5787中有述。尤其适用的BLAST程序是由Altschul等人,1996,Methods in Enzymology 266:460-480获得的WU-BLAST-2程序。WU-BLAST-2使用几个检索参数,大部分都设置成默认值。可调整的参数设置成以下值:重叠间隔(overlap span)=1、重叠分数(overlapfraction)=0.125、单词阈值(wordthreshold)(T)=II。HSP S和HSP S2参数是动态值并由程序本身视特测序列的组成和针对其检索所关注序列的特定数据库的组成来确定;然而,这些值可进行调整以增加灵敏度。
另一种适用的算法是如Altschul等人,1993,Nucl.Acids Res.25:3389-3402所报道的有空位的BLAST。有空位的BLAST使用BLOSUM-62取代分值;阈值T参数设置为9;二次击中方法用以触发无空位的延伸,负责k的空位长度,成本为10+k;Xu设置为16且对于数据库检索阶段而言Xg设置为40且对于算法的输出阶段而言Xg设置为67。通过对应于约22比特的分值触发有空位的对准。
个别变体CDR之间的氨基酸同源性、相似性或同一性通常为本文所述序列的至少80%,且更典型的是同源性或同一性优选地增加至少85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%和几乎增加100%。以相似的方式,对于本文识别的结合蛋白的核酸序列而言的“核酸序列同一性百分比(%)”定义为候选序列中与抗原结合蛋白的编码序列中的核苷酸残基相同的核苷酸残基的百分比。一种特殊方法使用设置为默认参数的WU-BLAST-2的BLASTN模块,其中重叠间隔和重叠分数分别设置为1和0.125。
尽管用于引入氨基酸序列变化的位点或区域是预定的,但突变本身不需要预定。举例来说,为了优化指定位点的突变性能,可在靶标密码子或区域进行随机诱变并针对所需活性的优化组合筛选表达的抗原结合蛋白CDR变体。熟知用于在具有已知序列的DNA中的预定位点进行取代突变的技术,例如M13引物诱变和PCR诱变。例如使用实施例中所述的测定来进行突变体的筛选。
氨基酸取代典型地是单一残基的氨基酸取代;插入通常在约一(1)个至约二十(20)个氨基酸残基的级别上,尽管可以容忍相当更大的插入。缺失在约一(1)个至约二十(20)个氨基酸残基的范围内,尽管在某些情形下缺失可大得多。取代、缺失、插入或其任意组合可用于获得最终的衍生物或变体。通常在几个氨基酸上进行这些变化以使得对分子的改变最小化,尤其是抗原结合蛋白的免疫原性和特异性。然而,在某些情况下可容忍更大的改变。通常根据如表2中描述的以下图表来进行保守性取代。
表2
通过选择比表2中所示的取代较不保守的取代来对功能或免疫一致性进行实质性改变。举例来说,可进行取代,这些取代更显著地影响:改变区域中的多肽主链结构,例如α-螺旋结构或β-折叠结构;分子在靶位点处的电荷或疏水性;或侧链体积。一般希望对多肽特性产生最大改变的取代是其中(a)亲水性残基(例如丝氨酰基或苏氨酰基)取代疏水性残基(例如,亮氨酰基、异亮氨酰基、苯丙氨酰基、缬氨酰基或丙氨酰基)(或由其取代);(b)半胱氨酸或脯氨酸取代任何其它残基(或由其取代);(c)具有正电性侧链的残基(例如,赖氨酰基、精氨酰基或组氨酰基)取代负电性残基(例如,谷氨酰基或天冬氨酰基)(或由其取代);或(d)具有庞大侧链的残基(例如,苯丙氨酸)取代不具有侧链的残基(例如,甘氨酸)(或由其取代)的那些取代。
变体典型地展现与天然存在的类似物相同的定性生物活性并将引发与天然存在的类似物相同的免疫反应,尽管视需要也选择变体来修改抗原结合蛋白的特征。或者,变体可经过设计以便改变抗原结合蛋白的生物活性。举例来说,可如本文中论述改变或除去糖基化位点。BCMA抗原结合蛋白的这种修饰(包括抗体)是衍生物的一个例子。多肽的“衍生物”是例如通过与另一个化学部分(诸如聚乙二醇、白蛋白(例如,人血清白蛋白))偶联、磷酸化和糖基化而进行化学修饰的多肽(例如,抗体)。
在本发明的范畴内,BCMA抗体的其它衍生物包括BCMA抗体或其片段与其它蛋白或多肽诸如通过表达包含与BCMA抗体多肽的N-末端或C-末端融合的异源多肽的重组融合蛋白的共价或聚集性偶联物。举例来说,偶联肽可以是异源信号(或前导)多肽,例如酵母α-因子前导肽或诸如表位标签的肽。含有BCMA抗体的融合蛋白可包含为便于纯化或识别BCMA抗体所加入的肽(例如,多组氨酸)。如Hopp等人,Bio/Technology 6:1204,1988和美国专利5,011,912中所述,BCMA抗体多肽也可以与FLAG肽DYKDDDDK(SEQ ID NO:447)连接。FLAG肽具有高度抗原性并提供由特异性单克隆抗体(mAb)可逆结合的表位,使得可进行快速测定并易于纯化过表达的重组蛋白。适用于制备其中FLAG肽与指定多肽融合的融合蛋白的试剂在市场上有售(Sigma,St.Louis,MO)。
可采用含有一种或多种BCMA抗体多肽的低聚物作为BCMA拮抗剂。低聚物可以是共价连接或非共价连接的二聚物、三聚物或更高等级的低聚物形式。预期使用包含两种或两种以上BCMA抗体多肽的低聚物,一种例子为同源二聚物。其它低聚物包括异源二聚物、同源三聚物、异源三聚物、同源四聚物、异源四聚物等。一个实施方案涉及包含通过与BCMA抗体多肽融合的肽部分之间的共价或非共价相互作用连接的多个BCMA抗体多肽的低聚物。这些肽可以是肽连接子(间隔子)或具有促进低聚作用特性的肽。如下文更详细描述,亮氨酸拉链和源自抗体的某些多肽是可促使与其连接的BCMA抗体多肽的低聚作用的肽。在特定实施方案中,低聚物包含两种至四种BCMA抗体多肽。低聚物的BCMA抗体部分可以是任何上述形式,例如,变体或片段。
本发明的一个实施方案涉及一种包含通过使BCMA抗体的BCMA结合片段与抗体的Fc区融合所产生的两种融合蛋白的二聚物。二聚物可以通过例如以下方式制得:将编码融合蛋白的基因融合物插入适当的表达载体中,在经过重组表达载体转化的宿主细胞中表达基因融合物,并使表达的融合蛋白如同抗体分子般组装,基于此在Fc部分之间形成链间的二硫键,以产生二聚物。或者,低聚物是包含多个BCMA抗体多肽,具有或不具有肽连接子(间隔子肽)的融合蛋白。合适的肽连接子是美国专利4,751,180和4,935,233中所述的那些。
另一种制备低聚BCMA抗体衍生物的方法涉及使用亮氨酸拉链。亮氨酸拉链结构域是促使发现它们的蛋白质的低聚作用的肽。亮氨酸拉链最初在若干种DNA结合蛋白中识别(Landschulz等人,1988,Science 240:1759)而且已在各种不同的蛋白中发现。已知的亮氨酸拉链是天然存在的二聚或三聚的肽和其衍生物。适合产生可溶性低聚蛋白的亮氨酸拉链结构域的例子在PCT申请WO 94/10308中进行描述,且源自肺表面活性蛋白D(SPD)的亮氨酸拉链在Hoppe等人,1994,FEBSLetters 344:191中进行描述,所述文献都以引用的方式并入本文中。使用使与其融合的异源蛋白进行稳定三聚作用的经过修饰的亮氨酸拉链在Fanslow等人,1994,Semin.Immunol.6:267-78中进行描述。在一种方法中,在合适的宿主细胞中表达包含与亮氨酸拉链肽融合的BCMA抗体片段或衍生物的重组融合蛋白,并从培养物上清液中除去形成的可溶性低聚BCMA抗体片段或衍生物。
共价修饰也被认为是BCMA抗原结合蛋白的衍生物且包括在本发明的范畴内,且通常但不总是在翻译后进行。举例来说,通过使抗原结合蛋白的特定氨基酸残基与能够与选定的侧链或N-或C-末端残基反应的有机衍生剂反应来向分子中引入对抗原结合蛋白的若干种共价修饰类型。
半胱氨酰残基最常与α-卤代乙酸酯(和相应的胺)(诸如氯乙酸或氯乙酰胺)反应以产生羧甲基或羧酰胺基甲基衍生物。半胱氨酰残基也通过与溴三氟丙酮、α-溴-β-(5-咪唑基)丙酸、氯乙酰基磷酸酯、N-烷基马来酰亚胺、3-硝基-2-吡啶基二硫化物、甲基2-吡啶基二硫化物、对氯汞基苯甲酸酯、2-氯汞基-4-硝基苯酚或氯-7-硝基苯并-2-氧杂-1,3-二唑反应来衍生。
组氨酰基残基通过与焦碳酸二乙酯在pH 5.5-7.0下反应来衍生,因为这种试剂对组氨酰基侧链具有相对特异性。对溴苯甲酰甲基溴化物也适用;反应优选地在0.1M卡可基酸钠中在pH 6.0下进行。
赖氨酰基和氨基末端残基与琥珀酸或其它羧酸酐反应。用这些试剂衍生具有使赖氨酰基残基的电荷反转的作用。用于衍生含有α-氨基的残基的其它合适试剂包括亚氨酸酯,诸如甲基吡啶亚胺甲酯;磷酸吡哆醛;吡哆醛;硼氢化氯;三硝基苯磺酸;O-甲基异脲;2,4-戊二酮;和转氨酶催化的与乙醛酸的反应。
通过与一种或若干种常规试剂,如苯甲酰甲醛、2,3-丁二酮、1,2-环己烷二酮和茚三酮反应来修饰精氨酰基残基。精氨酸残基的衍生要求反应在碱性条件下进行,因为胍官能团具有高pKa。此外,这些试剂可与赖氨酸基团以及精氨酸ε-氨基反应。
尤其在将光谱标签引入酪氨酰基残基中时,可通过与芳香族重氮化合物或四硝基甲烷反应来进行酪氨酰基残基的特异性修饰。最常见的是分别使用N-乙酰基咪唑和四硝基甲烷来形成O-乙酰基酪氨酰基物质和3-硝基衍生物。使用125I或131I碘化酪氨酰基残基来制备用于放射性免疫测定的标记蛋白,上文所述的氯胺T方法是合适的。
通过与碳化二亚胺(R'—N=C=N--R')反应来选择性地修饰羧基侧基(天冬氨酰基或谷氨酰基),其中R和R'任选地是不同的烷基,诸如1-环己基-3-(2-吗啉代-4-乙基)碳化二亚胺或1-乙基-3-(4-氮阳离子-4,4-二甲基戊基)碳化二亚胺。此外,天冬氨酰基和谷氨酰基残基通过与铵离子反应而转化为天冬酰胺酰基和谷氨酰胺酰基残基。
用双功能剂衍生适用于使抗原结合蛋白与非水溶性的支撑基质或表面偶联而用于多种方法中。常用的偶联剂包括例如1,1-双(重氮乙酰基)-2-苯基乙烷、戊二醛、N-羟基琥珀酰亚胺酯,例如与4-叠氮基水杨酸形成的酯、同型双功能亚氨酸酯,包括二琥珀酰亚胺基酯(诸如3,3'-二硫代双(琥珀酰亚胺基丙酸酯))和双功能马来酰亚胺(诸如双-N-马来酰亚胺基-1,8-辛烷)。诸如甲基-3-[(对叠氮基苯基)二硫]丙酸酰亚胺酯的衍生剂产生在光的存在下能形成交联的光活化中间物。或者,采用诸如溴化氰活化碳水化合物的反应性非水溶性基质和美国专利号3,969,287、3,691,016、4,195,128、4,247,642、4,229,537和4,330,440中所述的反应性底物用于蛋白质固定。
谷氨酰胺酰基和天冬酰胺酰基残基常分别经去酰胺基化为相应的谷氨酰基和天冬氨酰基残基。或者,这些残基在弱酸性条件下去酰胺基化。每种形式的这些残基都在本发明的范畴内。
其它修饰包括脯氨酸和赖氨酸的羟基化、丝氨酰基或苏氨酰基残基的羟基的磷酸化、赖氨酸、精氨酸和组氨酸侧链的α-氨基的甲基化(T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman&Co.,San Francisco,1983,第79-86页)、N-末端胺的乙酰化和任何C-末端羧基的酰胺化。
本发明范畴内所包括的抗原结合蛋白的另一种共价修饰类型包括改变蛋白质的糖基化模式。如本领域中已知,糖基化模式可取决于蛋白质的序列(例如,存在或不存在下文论述的特定糖基化氨基酸残基)或产生蛋白质的宿主细胞或生物体。下文论述特定的表达系统。
多肽的糖基化典型地是N连接或O连接的。N连接指的是碳水化合物部分与天冬酰胺残基的侧链相连接。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X是除脯氨酸以外的任意氨基酸)是用于酶促连接碳水化合物部分与天冬酰胺侧链的识别序列。因此,在多肽中存在这些三肽序列中的任一种产生潜在的糖基化位点。O连接的糖基化指的是糖N-乙酰基半乳糖胺、半乳糖或木糖之一与羟基氨基酸连接,最常见的是丝氨酸或苏氨酸,尽管也可以使用5-羟基脯氨酸或5-羟基赖氨酸。
便利地通过改变氨基酸序列以使其含有一个或多个上述三肽序列(对于N连接的糖基化位点而言)来实现向抗原结合蛋白中添加糖基化位点。也可以通过向起始序列(对于O连接的糖基化位点而言)添加一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基或被一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基取代来进行改变。简单起见,优选地通过在DNA水平上变化,尤其通过使编码靶标多肽的DNA在预选的碱基处发生突变以便产生将翻译成所需氨基酸的密码子来改变抗原结合蛋白氨基酸序列。
另一种增加抗原结合蛋白上的碳水化合物部分的数量的方式是通过使糖苷与蛋白质化学或酶促偶联。这些程序的有利之处在于它们不需要在具有糖基化能力以供N-和O-连接的糖基化的宿主细胞中产生蛋白质。视所用的偶联模式而定,糖可连接至(a)精氨酸和组氨酸、(b)游离羧基、(c)游离巯基,诸如半胱氨酸的巯基、(d)游离羟基,诸如丝氨酸、苏氨酸或羟基脯氨酸的羟基、(e)芳香族残基,诸如苯丙氨酸、酪氨酸或色氨酸的芳香族残基或(f)谷氨酰胺的酰胺基团。这些方法在1987年9月11日公布的WO 87/05330中和Aplin和Wriston,1981,CRC Crit.Rev.Biochem.,第259-306页中有所描述。
除去起始抗原结合蛋白上存在的碳水化合物部分可通过化学方式或酶促方式来完成。化学去糖基化需要将蛋白质暴露于化合物三氟甲烷磺酸或等效化合物。此处理导致除连接糖(N-乙酰基葡萄糖胺或N-乙酰基半乳糖胺)以外的大部分或所有糖裂解,同时留下完整的多肽。化学去糖基化由Hakimuddin等人,1987,Arch.Biochem.Biophys.259:52和Edge等人,1981,Anal.Biochem.118:131描述。如Thotakura等人,1987,Meth.Enzymol.138:350所述,可通过使用多种内切和外切糖苷酶来实现对多肽上的碳水化合物部分的酶促裂解。如Duskin等人,1982,J.Biol.Chem.257:3105所述,可通过使用化合物衣霉素来防止潜在糖基化位点发生糖基化。衣霉素阻止形成蛋白质-N-糖苷键联。
抗原结合蛋白的另一种共价修饰类型包括以美国专利号4,640,835、4,496,689、4,301,144、4,670,417、4,791,192或4,179,337中所述的方式使抗原结合蛋白与各种非蛋白质聚合物连接,所述非蛋白质聚合物包括(但不限于)各种多元醇,诸如聚乙二醇、聚丙二醇或聚氧化烯。另外,如本领域中已知,可在抗原结合蛋白中的各个位置进行氨基酸取代以便于添加诸如PEG的聚合物。
在一些实施方案中,本发明的抗原结合蛋白的共价修饰包括添加一个或多个标记。术语“标记基团”意思是任何可检测的标记。合适标记基团的例子包括(但不限于)以下:放射性同位素或放射性核素(例如,3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I)、荧光基团(例如,FITC、罗丹明(rhodamine)、镧系元素磷光体)、酶促基团(例如,辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶、碱性磷酸酶)、化学发光基团、生物素基团或由二级报道体识别的预定多肽表位(例如,亮氨酸拉链对序列、二抗的结合位点、金属结合结构域、表位标签)。在一些实施方案中,标记基团通过各种长度的间隔子臂与抗原结合蛋白偶联以减小潜在位阻。各种用于标记蛋白质的方法在本领域中是已知的且可用于进行本发明。
一般来说,标记取决于将对其进行检测的测定属于各种类别:a)同位素标记,可以是放射性或重同位素;b)磁性标记(例如,磁性粒子);c)氧化还原活性部分;d)光学染料;酶促基团(例如,辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶、碱性磷酸酶);e)生物素化的基团;和f)由二级报道体识别的预定多肽表位(例如,亮氨酸拉链对序列、二抗的结合位点、金属结合结构域、表位标签等)。在一些实施方案中,标记基团通过各种长度的间隔子臂与抗原结合蛋白偶联以减小潜在位阻。各种用于标记蛋白的方法在本领域中是已知的且可用于进行本发明。
特异性标记包括光学染料,包括(但不限于)发色团、磷光体和荧光团,后者在多种情况下具有特异性。荧光团可以是“小分子”荧光体或蛋白质荧光体。
“荧光标记”意思是可通过其固有的荧光特性进行检测的任何分子。合适的荧光标记包括(但不限于)荧光素、罗丹明、四甲基罗丹明、伊红、赤藓红、香豆素、甲基香豆素、芘、孔雀石绿(Malacite green)、芪、荧光黄(Lucifer Yellow)、Cascade BlueJ、德克萨斯红(Texas Red)、IAEDANS、EDANS、BODIPY FL、LC Red 640、Cy 5、Cy 5.5、LC红705、俄勒冈绿(Oregon green)、Alexa-Fluor染料(Alexa Fluor 350、Alexa Fluor 430、AlexaFluor 488、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 660、Alexa Fluor 680)、Cascade Blue、Cascade Yellow和R-藻红蛋白(PE)(Molecular Probes,Eugene,OR)、FITC、罗丹明和德克萨斯红(Pierce,Rockford,IL)、Cy5、Cy5.5、Cy7(Amersham Life Science,Pittsburgh,PA)。合适的光学染料(包括荧光团)在以引用的方式明确并入本文的Richard P.Haugland的Molecular Probes Handbook中有所描述。
合适的蛋白质荧光标记还包括(但不限于)绿色荧光蛋白,包括GFP的Renilla、Ptilosarcus或Aequorea种类(Chalfie等人,1994,Science 263:802-805)、EGFP(Clontech Laboratories,Inc.,基因库登录号U55762)、蓝色荧光蛋白(BFP,Quantum Biotechnologies,Inc.1801deMaisonneuve Blvd.West,8th Floor,Montreal,Quebec,Canada H3H1J9;Stauber,1998,Biotechniques 24:462-471;Heim等人,1996,Curr.Biol.6:178-182)、增强型黄色荧光蛋白(EYFP,Clontech Laboratories,Inc.)、荧光素酶(Ichiki等人,1993,J.Immunol.150:5408-5417)、β半乳糖苷酶(Nolan等人,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:2603-2607)和Renilla(WO92/15673、WO95/07463、WO98/14605、WO98/26277、WO99/49019、美国专利号5292658、5418155、5683888、5741668、5777079、5804387、5874304、5876995、5925558)。上文引用的全部参见案都以引用的方式明确并入本文。
编码BCMA抗原结合蛋白的多核苷酸
本发明涵盖编码BCMA抗原结合蛋白的多核苷酸,尤其是如本文定义的抗体。本文中提供重链可变区和轻链可变区的多核苷酸序列、CDR和选定抗体的全长重链和轻链。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:138)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ IDNO:208)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-5Vl(SEQ IDNO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQID NO:218)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-10Vl(SEQID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ IDNO:232)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-17Vl(SEQID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ IDNO:276)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和两条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条Ab-2轻链(SEQ IDNO:282)和两条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的单克隆抗体的分离的多核苷酸。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:106)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-2Vl(SEQID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-7Vl(SEQID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-12Vl(SEQID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ IDNO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-16Vl(SEQID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的单克隆抗体的分离的多核苷酸。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:1)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:2)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:3)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:103)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:104)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:105)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:7)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:8)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:9)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:109)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:110)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:111)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:13)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:14)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:15)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:115)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:116)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:117)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:19)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:20)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:21)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:121)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:122)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:123)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:25)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:26)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:27)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:127)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:128)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:129)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:31)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:32)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:33)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:133)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:134)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:135)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:37)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:38)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:39)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:139)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:140)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:141)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:43)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:44)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:45)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:145)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:146)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:147)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:49)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:50)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:51)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:151)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:152)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:153)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:55)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:56)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:57)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:157)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:158)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:159)。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:61)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:62)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:63)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:163)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:164)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:165)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:67)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:68)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:69)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:169)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:170)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:171)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:73)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:74)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:75)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:175)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:176)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:177)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:79)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:80)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:81)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:181)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:182)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:183)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:85)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:86)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:87)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:187)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:188)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:189)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:91)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:92)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:93)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:193)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:194)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:195)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:97)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:98)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:99)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:199)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:200)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:201)。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-1Vl(SEQ IDNO:239)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:205)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:241)和Ab-2Vh(SEQ IDNO:207)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:243)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:209)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-4Vl(SEQ ID NO:245)和Ab-4Vh(SEQID NO:211)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:247)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:213)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:249)和Ab-6Vh(SEQID NO:215)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:251)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:217)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:253)和Ab-8Vh(SEQID NO:219)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:255)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:221)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:257)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:223)结构域。本发明的方面包括编码包含Ab-11的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:259)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:225)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:261)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:227)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:263)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:229)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-14Vl(SEQ IDNO:265)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:231)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:267)和Ab-15Vh(SEQ IDNO:233)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:269)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:235)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的Vl和Vh结构域的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:271)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:237)。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包括抗体Ab-1的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ ID NO:279)和重链(SEQ ID NO:273)。本发明的方面包括编码包括抗体Ab-2的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ IDNO:281)和重链(SEQ ID NO:275)。本发明的方面包括编码包含抗体Ab-3的单克隆抗体的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ ID NO:283)和重链(SEQ ID NO:277)。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:120)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:162)。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ IDNO:214)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-7Vl(SEQ IDNO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQID NO:228)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-14Vl(SEQID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ IDNO:236)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含Ab-3轻链(SEQID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和两条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条或更多条Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和两条或更多条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含两条或更多条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条或更多条Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代。
本发明的方面包括编码包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-2Vl(SEQ IDNO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-3Vl(SEQID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-10Vl(SEQ IDNO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-11Vl(SEQID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQID NO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-16Vl(SEQ IDNO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。本发明的方面包括编码包含分别与Ab-17Vl(SEQID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的多肽的分离的多核苷酸。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ ID NO:1)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:2)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:3)、Vl-CDR1(SEQID NO:103)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:104)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:105)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:7)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:8)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:9)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:109)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:110)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:111)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQ IDNO:13)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:14)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:15)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:115)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:116)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:117)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:19)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:20)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:21)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:121)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:122)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:123)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:25)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:26)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:27)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:127)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:128)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:129)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:31)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:32)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:33)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:133)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:134)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:135)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:37)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:38)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:39)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:139)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:140)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:141)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:43)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:44)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:45)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:145)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:146)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:147)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:49)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:50)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:51)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:151)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:152)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:153)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:55)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:56)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:57)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:157)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:158)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:159)。本发明的方面包括编码包含Ab-11的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:61)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:62)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:63)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:163)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:164)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:165)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:67)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:68)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:69)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:169)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:170)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:171)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:73)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:74)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:75)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:175)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:176)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:177)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:79)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:80)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:81)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:181)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:182)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:183)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:85)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:86)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:87)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:187)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:188)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:189)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:91)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:92)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:93)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:193)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:194)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:195)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的六个CDR的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Vh-CDR1(SEQID NO:97)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:98)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:99)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:199)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:200)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:201)。
本发明的方面包括编码包含Ab-1的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:239)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:205)。本发明的方面包括编码包含Ab-2的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:241)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:207)。本发明的方面包括编码包含Ab-3的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:243)和Ab-3Vh(SEQID NO:209)。本发明的方面包括编码包含Ab-4的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-4Vl(SEQ IDNO:245)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:211)。本发明的方面包括编码包含Ab-5的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:247)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:213)。本发明的方面包括编码包含Ab-6的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:249)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:215)。本发明的方面包括编码包含Ab-7的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:251)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:217)。本发明的方面包括编码包含Ab-8的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:253)和Ab-8Vh(SEQID NO:219)。本发明的方面包括编码包含Ab-9的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-9Vl(SEQ IDNO:255)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:221)。本发明的方面包括编码包含Ab-10的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:257)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:223)结构域。本发明的方面包括编码包含Ab-11的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-11Vl(SEQ IDNO:259)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:225)。本发明的方面包括编码包含Ab-12的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:261)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:227)。本发明的方面包括编码包含Ab-13的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:263)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:229)。本发明的方面包括编码包含Ab-14的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-14Vl(SEQ ID NO:265)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:231)。本发明的方面包括编码包含Ab-15的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:267)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:233)。本发明的方面包括编码包含Ab-16的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:269)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:235)。本发明的方面包括编码包含Ab-17的Vl和Vh结构域的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:271)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:237)。
本发明的方面包括编码包含抗体Ab-1的重链和轻链的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ ID NO:279)和重链(SEQ ID NO:273)。本发明的方面包括编码包含抗体Ab-2的重链和轻链的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ ID NO:281)和重链(SEQ ID NO:275)。本发明的方面包括编码包含抗体Ab-3的重链和轻链的多肽的分离的多核苷酸,其中所述多核苷酸序列包含轻链(SEQ ID NO:283)和重链(SEQ ID NO:277)。
将用作分离核酸的探针或引物或用作数据库检索的查询序列的对应于本文所述的氨基酸序列的核苷酸序列可以通过从氨基酸序列“回译”或通过用已识别编码DNA序列的多肽来识别氨基酸同一性区域来获得。可采用熟知的聚合酶链式反应(PCR)程序来分离并扩增编码BCMA抗原结合蛋白的DNA序列或所需的BCMA抗原结合蛋白多肽片段组合。采用定义DNA片段组合的所需末端的寡核苷酸作为5'和3'引物。寡核苷酸另外可含有限制性内切核酸酶的识别位点以便于将扩增的DNA片段组合插入表达载体中。PCR技术在Saiki等人,Science 239:487(1988);Recombinant DNA Methodology,Wu等人编,Academic Press,Inc.,San Diego(1989),第189-196页;和PCRProtocols:A Guide to Methods and Applications,Innis等人编,AcademicPress,Inc.(1990)中有所描述。
本发明的核酸分子包括单链和双链形式的DNA和RNA,以及相应的互补序列。DNA包括例如cDNA、基因组DNA、化学合成的DNA、PCR扩增的DNA及其组合。本发明的核酸分子包括全长基因或cDNA分子以及其片段的组合。本发明的核酸优选地源自人来源,但本发明也包括源自非人的那些核酸。
在从天然存在来源分离的核酸的情形下,“分离的核酸”是从分离核酸的生物体基因组中存在的相邻基因序列分离的核酸。在以酶促方式从模板合成或以化学方式合成核酸诸如PCR产物、cDNA分子或寡核苷酸的情形下,应了解由这些方法产生的核酸是分离的核酸。分离的核酸分子指的是独立片段形式或作为较大核酸构建体组分的核酸分子。在一个优选的实施方案中,核酸基本上不含污染性的内源物质。核酸分子优选地源自以基本上纯的形式至少分离一次的DNA或RNA且其量或浓度使得能够通过标准生物化学方法(诸如Sambrook等人,Molecular Cloning:ALaboratory Manual,第2版,Cold SpringHarbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY(1989)中概述的那些方法)来识别、操纵和回收其组分核苷酸序列。所述序列优选地以未受内部非翻译序列或内含子(典型地在真核基因中存在)中断的开放阅读框形式来提供和/或构建。非翻译DNA的序列可存在于开放阅读框的5'或3'处,其中同样不影响编码区的操纵或表达。
本发明还包括在适度严苛的条件下且更优选地在高度严苛的条件下与如本文中所述编码BCMA抗原结合蛋白的核酸杂交的核酸。影响杂交条件选择的基本参数和关于设计合适条件的指导由Sambrook,Fritsch和Maniatis(1989,Molecular Cloning:ALaboratoryManual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,第9章和第11章;和Current Protocols in Molecular Biology,1995,Ausubel等人编,John Wiley&Sons,Inc.,章节2.10和6.3-6.4)陈述且本领域一般技术人员例如可基于DNA的长度和/或碱基组成来容易地确定。实现适度严苛条件的一种方式涉及使用含有5×SSC、0.5%SDS、1.0mM EDTA(pH 8.0)的预洗溶液,约50%甲酰胺、6×SSC的杂交缓冲液和约55℃的杂交温度(或其它类似的杂交溶液,诸如含有约50%甲酰胺的杂交溶液,杂交温度为约42℃)和约60℃在0.5×SSC、0.1%SDS中的洗涤条件。高度严苛的条件通常定义为如上文的杂交条件,但大致在68℃、0.2×SSC、0.1%SDS中洗涤。可以用SSPE(1×SSPE是0.15M NaCl、10mM NaH2PO4和1.25mM EDTA,pH 7.4)代替杂交和洗涤缓冲液中的SSC(1×SSC是0.15M NaCl和15mM柠檬酸钠);在杂交完成后进行洗涤15分钟。应了解,如本领域技术人员所知且在下文中进一步描述,必要时可调整洗涤温度和洗涤盐浓度以通过应用控制杂交反应和双链体稳定性的基本原则来实现所需的严格程度(参见例如,Sambrook等人,1989)。在使核酸与具有未知序列的靶核酸杂交时,假设杂交体的长度为杂交核酸的长度。当杂交具有已知序列的核酸时,可以通过比对核酸序列并识别具有最佳序列互补性的一个或多个区域来确定杂交体的长度。预期长度小于50个碱基对的杂交体的杂交温度应比杂交体的熔解温度(Tm)低5至10℃,其中Tm根据以下等式来确定。对于长度小于18个碱基对的杂交体来说,Tm(℃)=2(A+T碱基的数量)+4(G+C碱基的数量)。对于长度在18个碱基对以上的杂交体来说,Tm(℃)=81.5+16.6(log10[Na+])+0.41(%G+C)-(600/N),其中N是杂交体中的碱基数,且[Na+]是杂交缓冲液中的钠离子浓度(对于1×SSC而言,[Na+]=0.165M)。所述杂交核酸优选地各自具有至少15个核苷酸的长度(或更优选地为至少18个核苷酸或至少20个核苷酸或至少25个核苷酸或至少30个核苷酸或至少40个核苷酸,或最优选地至少50个核苷酸),或为本发明中与它杂交的核酸长度的至少25%(更优选地为至少50%或至少60%或至少70%且最优选地至少80%),且与本发明中与它杂交的核酸具有至少60%的序列同一性(更优选地为至少70%、至少75%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%和最优选地至少99.5%),其中如上文中更详细描述,通过在比对时比较杂交核酸的序列以使得重叠和同一性最大化,同时使序列间隙最小化来确测序列同一性。
如本文中所概述,通常使用盒式诱变或PCR诱变或本领域中熟知的其它技术在编码抗原结合蛋白的DNA中通过核苷酸的位点特异性诱变以产生编码变体的DNA,且此后在细胞培养物中表达重组DNA来制备根据本发明的变体。然而,可以通过使用确定的技术体外合成来制备包含具有多达约100-150个残基的变体CDR的抗原结合蛋白片段。变体典型地展现与天然存在的类似物相同的定性生物活性(例如,结合BCMA和抑制信号转导),尽管也可以选择如将在下文更全面概述的具有修饰特征的变体。
如本领域技术人员将了解,由于遗传密码的简并性,可制得极大量的核酸,它们全部编码本发明的CDR(以及抗原结合蛋白的重链和轻链或其它组分)。因此,在已鉴定特定氨基酸序列的情况下,本领域技术人员可通过以不改变编码蛋白质的氨基酸序列的方式简单地修饰一个或多个密码子的序列来制得任何数量的不同的核酸。
本发明还提供包含至少一个如上述多核苷酸的质粒、表达载体、转录盒或表达盒形式的表达系统和构建体。另外,本发明提供包含所述表达系统或构建体的宿主细胞。
任何宿主细胞中所用的表达载体典型地将含有用于质粒维系和用于克隆与表达外源性核苷酸序列的序列。所述序列(在某些实施方案中总称为“侧翼序列”)将典型地包括一个或多个以下核苷酸序列:启动子、一个或多个增强子序列、复制起点、转录终止序列、含有供体和受体剪接位点的完全内含子序列、编码用于多肽分泌的前导序列的序列、核糖体结合位点、聚腺苷酸化序列、用于插入编码将要表达的多肽的核酸的多连接子区和可选标记元件。下文论述每个这些序列。
载体可任选地含有“标签”编码序列,即位于BCMA抗原结合蛋白编码序列的5'或3'末端的寡核苷酸分子;寡核苷酸序列编码聚组氨酸(诸如六组氨酸)或另一种“标签”,诸如FLAG、HA(血球凝集素流感病毒)或myc,它们存在市场上有售的抗体。此标签在表达多肽时典型地与多肽融合,且可充当用于从宿主细胞亲和力纯化或检测BCMA抗原结合蛋白的一种方式。亲和力纯化例如可通过使用针对此标签的抗体作为亲和力基质的柱色谱法来完成。标签任选地可随后通过诸如使用某些用于裂解的肽酶的各种方式从经过纯化的BCMA抗原结合蛋白除去。
侧翼序列可以是同源的(即,来自与宿主细胞相同的物种和/或菌株)、异源的(即,来自除宿主细胞物种或菌株以外的物种)、杂合的(即,来自一种以上来源的侧翼序列的组合)、合成的或天然的。同样地,侧翼序列的来源可以是任何原核或真核生物体、任何脊椎动物或无脊椎动物生物体或任何植物,条件是侧翼序列在宿主细胞机制中起作用且可由宿主细胞机制活化。
适用于本发明载体中的侧翼序列可通过本领域中熟知的若干种方法中的任一种来获得。本文中适用的侧翼序列典型地将通过绘图和/或通过限制性内切核酸酶消化来预先识别,且因此可使用适当的限制性内切核酸酶从适当的组织来源分离。在某些情形下,可已知侧翼序列的完整核苷酸序列。本文中,可使用本文中所述用于核酸合成或克隆的方法来合成侧翼序列。
无论已知侧翼序列的全部或仅一部分,都可以使用聚合酶链式反应(PCR)和/或通过用诸如来自同一物种或另一物种的寡核苷酸和/或侧翼序列片段的合适探针筛选基因组文库来获得。当侧翼序列未知时,可从例如可含有编码序列或甚至另一种基因的大片DNA分离含有侧翼序列的DNA片段。可通过限制性内切核酸酶消化以产生适当的DNA片段,接着使用琼脂糖凝胶纯化、柱色谱法(Chatsworth,CA)或本领域技术人员已知的其它方法的分离来实现分离。选择合适的酶来实现此目的将易于为本领域一般技术人员所显而易见。
复制起点典型地是在市场上购买的那些原核表达载体的一部分,且此起点有助于载体在宿主细胞中扩增。如果选择的载体不含复制起点位点,则可以基于已知的序列来化学合成并连接到载体中。举例来说,来自质粒pBR322(New England Biolabs,Beverly,MA)的复制起点适合于大多数革兰氏阴性细菌,且各种病毒起点(例如,SV40、多瘤病毒、腺病毒、水泡性口炎病毒(VSV)或乳头瘤病毒,诸如HPV或BPV)适用于在哺乳动物细胞中克隆载体。哺乳动物表达载体通常不需要复制起点组分(例如,常常只使用SV40起点,因为它也含有病毒早期启动子)。
转录终止序列典型地位于多肽编码区的3'末端并用以终止转录。原核细胞中的转录终止序列通常是富含G-C的片段,接着是多聚胸苷酸序列。尽管序列易于从文库中克隆或甚至作为载体的一部分从市场上购买,但它也可以使用诸如本文所述的那些用于核酸合成的方法容易地合成。
可选的标记基因编码对于在选择性培养基中生长的宿主细胞的存活和生长而言必要的一种蛋白质。典型的选择标记基因编码(a)赋予对于抗生素或其它毒素(例如,对于原核宿主细胞而言为氨苄青霉素、四环素或卡那霉素)的抗性;(b)补足细胞的营养缺陷型;或(c)提供无法从复合物或确定的培养基获得的重要营养素的蛋白质。特异性的可选标记是卡那霉素抗性基因、氨苄青霉素抗性基因和四环素抗性基因。有利的是,新霉素抗性基因也可以用于在原核和真核宿主细胞中进行选择。
其它可选基因可用于扩增将要表达的基因。扩增是其中产生对于生长和细胞存活而言重要的蛋白质所需的基因在连续产生重组细胞的染色体中串联重复。对于哺乳动物细胞而言合适的可选标记例子包括二氢叶酸还原酶(DHFR)和无启动子胸苷激酶基因。将哺乳动物细胞转化子置于选择压力下,其中只有转化子通过载体中存在的可选基因独特地适应存活。通过在培养基中的选择剂浓度连续增加的条件下培养经过转化的细胞来施加选择压力,由此导致可选基因和编码另一种基因的DNA(诸如与BCMA多肽结合的抗原结合蛋白抗体)都扩增。因此,由经过扩增的DNA合成增加量的多肽,诸如BCMA抗原结合蛋白。
核糖体结合位点对于rnRNA的翻译起始而言通常是必要的而且由Shine-Dalgarno序列(原核生物)或Kozak序列(真核生物)来表征。此元件典型地位于启动子的3'和将要表达的多肽的编码序列的5'。
在一些情形下,诸如在真核宿主细胞表达系统中需要糖基化时,可以操纵各种导序列或前序列来改良糖基化或产率。举例来说,可以改变特定信号肽的肽酶裂解位点或添加前序列,这也可以影响糖基化作用。最终的蛋白产物在-1位(相对于成熟蛋白的第一个氨基酸而言)可具有一个或多个易发生表达的其它氨基酸,它们可不经完全除去。举例来说,最终的蛋白产物可具有一个或两个在肽酶裂解位点中发现的氨基酸残基连接至氨基末端。或者,使用一些酶裂解位点可产生轻微截短形式的所需多肽,如果此酶在成熟多肽内的这种区域处缩短。
本发明的表达和克隆载体将典型地含有由宿主生物体识别并与编码BCMA抗原结合蛋白的分子可操作性连接的启动子。启动子是位于控制结构基因转录的结构基因(通常在约100至1000bp以内)的起始密码子上游(即,5')的非转录序列。启动子常规分为以下两类:诱导型启动子和组成型启动子。诱导型启动子在响应培养条件的某些变化(诸如存在或不存在营养素或温度的变化)时,引发在其控制下的自DNA的增加水平的转录。另一方面,组成型启动子均匀地转录与其可操作性连接的基因,即对基因表达的很少控制或无控制。熟知由多种潜在的宿主细胞识别的大量启动子。通过用限制性酶消化从来源DNA除去启动子并将所需的启动子序列插入载体中来将合适的启动子可操作性地连接至编码包含本发明的BCMA抗原结合蛋白的重链或轻链的DNA。
本领域中也熟知与酵母宿主一起使用的合适启动子。酵母增强子有利地与酵母启动子一起使用。熟知与哺乳动物宿主细胞一起使用的合适启动子且包括(但不限于)由诸如多瘤病毒、鸡痘病毒、腺病毒(诸如腺病毒2)、牛乳头瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨细胞病毒、反转录病毒、B型肝炎病毒和最优选的猿猴病毒40(SV40)的病毒基因组获得的那些启动子。其它合适的哺乳动物启动子包括异源哺乳动物启动子,例如热休克启动子和肌动蛋白启动子。
可受到关注的其它启动子包括(但不限于):SV40早期启动子(Benoist和Chambon,1981,Nature 290:304-310);CMV启动子(Thornsen等人,1984,Proc.Natl.Acad.U.S.A.81:659-663);Rous肉瘤病毒的3'长末端重复序列中所含的启动子(Yamamoto等人,1980,Cell22:787-797);疱疹胸苷激酶启动子(Wagner等人,1981,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.78:1444-1445);来自金属硫蛋白(metallothionine)基因的启动子和调节序列(Prinster等人,1982,Nature 296:39-42);和原核启动子,诸如β-内酰胺酶启动子(Villa-Kamaroff等人,1978,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.75:3727-3731);或tac启动子(DeBoer等人,1983,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.80:21-25)。同样受到关注的是展现组织特异性并已用于转基因动物的以下动物转录控制区:在胰腺腺泡细胞中有活性的弹性蛋白酶I基因控制区(Swift等人,1984,Cell 38:639-646;Ornitz等人,1986,Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.50:399-409;MacDonald,1987,Hepatology 7:425-515);在胰腺β细胞中有活性的胰岛素基因控制区(Hanahan,1985,Nature 315:115-122);在淋巴样细胞中有活性的免疫球蛋白基因控制区(Grosschedl等人,1984,Cell38:647-658;Adames等人,1985,Nature 318:533-538;Alexander等人,1987,Mol.Cell.Biol.7:1436-1444);在睾丸细胞、乳腺细胞、淋巴样细胞和肥大细胞中有活性的小鼠乳腺肿瘤病毒控制区(Leder等人,1986,Cell45:485-495);在肝中有活性的白蛋白基因控制区(Pinkert等人,1987,Genes and Devel.1:268-276);在肝中有活性的甲胎蛋白(alpha-feto-protein)基因控制区(Krumlauf等人,1985,Mol.Cell.Biol.5:1639-1648;Hammer等人,1987,Science 253:53-58);在肝中有活性的α1-抗胰蛋白酶基因控制区(Kelsey等人,1987,Genes and Devel.1:161至171);在髓样细胞中有活性的β-球蛋白基因控制区(Mogram等人,1985,Nature 315:338-340;Kollias等人,1986,Cell46:89-94);在脑中的少突胶质细胞中有活性的髓磷脂碱性蛋白基因控制区(Readhead等人,1987,Cell 48:703-712);在骨骼肌中有活性的肌球蛋白轻链-2基因控制区(Sani,1985,Nature 314:283-286);和在下丘脑有活性的促性腺素释放激素基因控制区(Mason等人,1986,Science234:1372-1378)。
可将增强子序列插入载体中以通过高等真核生物增加编码组成本发明的BCMA抗原结合蛋白的轻链或重链的DNA的转录。增强子是作用于启动子以增加转录的DNA的顺式作用元件,长度通常约为10-300bp。增强子具有相对的方向和位置独立性,已在转录单元的5’和3’位置处发现增强子。已知可获自哺乳动物基因的若干种增强子序列(例如,球蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、甲胎蛋白和胰岛素)。然而,典型地使用来自病毒的增强子。本领域中已知的SV40增强子、巨细胞病毒早期启动子增强子、多瘤病毒增强子和腺病毒增强子是用于活化真核启动子的示例性增强元件。虽然增强子在载体中可定位于编码序列的5’或3’,但典型地位于启动子的位点5’处。可将编码适当天然或异源信号序列(前导序列或信号肽)的序列并入表达载体中以促使抗体的细胞外分泌。信号肽或前导序列的选择取决于将产生抗体的宿主细胞类型,且异源信号序列可取代天然信号序列。在哺乳动物宿主细胞中起作用的信号肽的例子包括以下:美国专利号4,965,195中所述的用于白介素-7(IL-7)的信号序列;Cosman等人,1984,Nature312:768中所述的用于白介素-2受体的信号序列;欧洲专利号0367566中所述的白介素-4受体信号肽;美国专利号4,968,607中所述的I型白介素-1受体信号肽;欧洲专利号0 460 846中所述的II型白介素-1受体信号肽。
本发明的表达载体可以由起始载体(诸如市售载体)来构建。这类载体可含有或可不含所有所需的侧翼序列。如果本文所述侧翼序列的一个或多个并非已存在于载体中,则其可单独获得并与载体连接。本领域技术人员熟知用于获得各个侧翼序列的方法。
在构建载体并将编码包含BCMA抗原结合序列的轻链、重链或轻链和重链的核酸分子插入载体的适当位点后,可将已完成的载体插入合适的宿主细胞中用于扩增和/或多肽表达。将BCMA抗原结合蛋白的表达载体转化至所选的宿主细胞中可通过众所周知的方法来实现,所述包括转染、感染、磷酸钙共沉淀、电穿孔、微注射、脂转染、DEAE-葡聚糖介导的转染或其它已知的技术。所选方法部分可随待使用的宿主细胞类型而变化。这些方法和其它合适方法为技术人员所熟知,且例如在同上的Sambrook等人,2001中有所陈述。
宿主细胞当培养在适当的条件下时合成BCMA抗原结合蛋白,BCMA抗原结合蛋白随后可从培养基收集(如果宿主细胞将其分泌到培养基中)或直接从产生其的宿主细胞中收集(如果不分泌的话)。适当宿主细胞的选择将取决于各种因素,例如所需的表达水平、活性所需要或必需的多肽修饰(诸如糖基化或磷酸化)以及折叠成生物活性分子的容易程度。宿主细胞可以是真核或原核的。
可用作表达宿主的哺乳动物细胞系在本领域中熟知且包括(但不限于)可获自美国典型培养物保藏中心(ATCC)的永生化细胞系,且本领域中已知的用于表达系统中的任何细胞系都可用来制造本发明的重组多肽。一般来说,用包含编码所需抗BCMA抗体多肽的DNA的重组表达载体来转化宿主细胞。可采用的宿主细胞是原核生物、酵母或高等真核细胞。原核生物包括革兰氏阴性或革兰氏阳性生物体,例如大肠杆菌(E.coli)或芽孢杆菌(bacilli)。高等真核细胞包括昆虫细胞和哺乳动物来源的确定细胞系。合适的哺乳动物宿主细胞系的例子包括猴肾细胞的COS-7细胞系(ATCC CRL 1651)(Gluzman等人,1981,Cell 23:175)、L细胞、293细胞、C127细胞、3T3细胞(ATCC CCL 163)、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或其衍生物(诸如Veggie CHO和生长在无血清培养基中的相关细胞系)(Rasmussen等人,1998,Cytotechnology 28:31)、HeLa细胞、BHK(ATCC CRL 10)细胞系和如McMahan等人,1991,EMBO J.10:2821所述源自非洲绿猴肾细胞系CVI(ATCC CCL70)的CVI/EBNA细胞系、人胚胎肾细胞(诸如293、293EBNA或MSR293)、人表皮A431细胞、人Colo205细胞、其它转化的灵长类动物细胞系、正常的二倍体细胞、源自体外培养初生组织、初生外植体、HL-60、U937、HaK或Jurkat细胞的细胞株。当在各种信号转导或报道体测定中需要使用多肽时,诸如HepG2/3B、KB、NIH 3T3或S49的哺乳动物细胞系任选地例如可用于表达多肽。或者,可能在诸如酵母的低等真核生物或诸如细菌的原核生物中产生多肽。合适的酵母包括酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、克鲁维酵母属菌株(Kluyveromycesstrain)、假丝酵母(Candida)或能够表达异源多肽的任何酵母菌株。合适的细菌菌株包括大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草杆菌(Bacillussubtilis)、鼠伤寒沙门氏杆菌(Salmonella typhimurium)或能够表达异源多肽的任何细菌菌株。如果在酵母或细菌中产生多肽,可需要例如通过磷酸化或糖基化适当的位点来修饰其中产生的多肽从而获得功能性多肽。所述共价连接可以使用已知的化学或酶促方法来实现。也可以通过将本发明的分离核酸可操作性地连接至一个或多个昆虫表达载体中的合适控制序列并采用昆虫表达系统来产生多肽。用于杆状病毒/昆虫细胞表达系统的材料和方法以试剂盒的形式可购自例如Invitrogen,San Diego,Calif.,U.S.A.(试剂盒)且所述方法在本领域中熟知,如Summers和Smith,Texas Agricultural ExperimentStation Bulletin No.1555(1987)及Luckow和Summers,Bio/Technology6:47(1988)中所述。也可以采用无细胞的翻译系统以使用源自本文公开的核酸构建体的RNA来产生多肽。与细菌、真菌、酵母和哺乳动物细胞宿主一起使用的适当克隆和表达载体由Pouwels等人(CloningVectors:A Laboratory Manual,Elsevier,New York,1985)描述。包含优选与至少一个表达控制序列可操作性连接的本发明的分离核酸的宿主细胞是“重组宿主细胞”。
在某些实施方案中,可以通过确定哪些细胞系具有高表达水平且构成性地产生具有BCMA结合特性的抗原结合蛋白来选择细胞系。在另一个实施方案中,可选择来自不产生其自身的抗体但能够产生并分泌异源抗体的B细胞谱系的细胞系。
抗体药物偶联物(ADC)
本发明的实施方案包括抗体药物偶联物(ADC)。如了解,与诸如毒素或其它分子的药物偶联的抗体高度适用于靶向杀伤表达可由特异性结合分子(诸如抗体)特异性结合的分子的细胞。如在实施例1中所示,BCMA在恶性浆细胞(多发性骨髓瘤和冒烟型骨髓瘤)和意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)浆细胞中以比在正常浆细胞中观测到的水平相对较高的水平来表达。
ADC通常包含本文所述的BCMA抗原结合蛋白,优选地是与化疗剂(例如,细胞毒性剂、细胞抑制剂、毒素或放射性药剂)偶联的抗体(更优选地是人单克隆抗huBCMA抗体,诸如Ab-1、Ab-2或Ab-3)。可使用连接子分子使药物与抗体偶联。适用于ADC技术的多种连接子和药物在本领域中已知且可用于本发明的实施方案中。(参见US20090028856;US2009/0274713;US2007/0031402;WO2005/084390;WO2009/099728;US5208020;US5416064;US5475092;5585499;6436931;6372738;和6340701,全部以引用的方式并入本文中)。
实施方案包括包含在本申请通篇中提供的如本文所定义与药物偶联的序列的BCMA抗原结合蛋白。优选的实施方案包括如本文所述的与抗huBCMA抗体偶联的药物。优选的实施方案包括如本文所述使用连接子与抗huBCMA抗体偶联的药物。优选的实施方案包括如本文所述使用连接子与抗huBCMA抗体偶联的药物,其中连接子不可裂解,诸如MCC或Mal-dPEG4-NHS。优选的实施方案包括如本文所述使用不可裂解的连接子与抗huBCMA抗体偶联的药物,其中连接子是MCC(在本文中也称为SMCC,参见图2)。如下文所述,优选的药物包括美登素类化合物,且具体来说是DM1或DM4。因此,在优选的实施方案中,如本文所述的抗huBCMA抗体通过MCC连接子与DM1偶联。在尤其优选的实施方案中,抗huBCMA抗体是如本文中多方面描述的通过MCC连接子与DM1偶联的Ab-1、Ab-2或Ab-3。
连接子
在某些实施方案中,ADC包含由一个或多个连接子组分组成的连接子。示例性的连接子组分包括6-马来酰亚胺基己酰基、马来酰亚胺基丙酰基、缬氨酸-瓜氨酸、丙氨酸-苯丙氨酸、对氨基苄氧羰基、Mal-dPEG4-NHS(QuantaBiodesign)和与连接子试剂偶联所产生的那些组分,所述连接子试剂包括(但不限于)N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(“SPP”)、N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”,本文中也称为“MCC”)和N-琥珀酰亚胺基(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯(“SIAB”)。连接子可以是“可裂解”连接子或“不可裂解”连接子(Ducry和Stump,Bioconjugate Chem.2010,21,5-13;以全文引用的方式并入本文中)。可裂解的连接子设计成在经历某些环境因素时(例如,在内化至靶细胞中时)释放药物。可裂解的连接子包括酸不稳定连接子、蛋白酶敏感性连接子、光不稳定连接子、二甲基连接子或含二硫化物的连接子。不可裂解的连接子经过由靶细胞内化并在靶标细胞中降解而倾向于与抗体和药物的至少一种氨基酸保持共价缔合。示例性的不可裂解的连接子是MCC(本文中也称为SMCC)。如下文所示,对于BCMAADC而言最优选的不可裂解的连接子是N-琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1羧酸酯(“SMCC”,本文中也称为“MCC”)或Mal-dPEG4-NHS。
药物
在某些实施方案中,抗体与化疗剂偶联。化疗剂的例子包括烷基化剂,诸如噻替派和环磷酰胺(CYTOXAN.TM.);烷基磺酸酯类,诸如白消安、英丙舒凡和哌泊舒凡;氮杂环丙烷类,诸如苯佐替哌、卡波醌、美妥替哌和乌瑞替哌;乙撑亚胺类和甲基蜜胺类,包括六甲蜜胺、三乙撑蜜胺、三乙撑磷酰胺、三乙撑硫代磷酰胺和三羟甲基蜜胺;番荔枝内酯类(尤其是布拉它辛和布拉它辛酮);喜树碱(包括合成类似物拓朴替康);苔藓抑素;海绵多烯酮类化合物;CC-1065(包括它的阿多来新、卡折来新和比折来新合成类似物);念珠藻素类(尤其是念珠藻素1和念珠藻素8);尾海兔素;倍癌霉素(包括合成类似物KW-2189和CBI-TMI);艾榴塞洛素;水鬼蕉碱;匍枝珊瑚醇A;海绵素;氮芥类,诸如苯丁酸氮芥、萘氮芥、胆磷酰胺、雌莫司汀、异环磷酰胺、甲氮芥、盐酸氧甲氮芥、美法仑、新恩比兴、苯芥胆甾醇、泼尼莫司汀、曲洛磷胺、尿嘧啶氮芥;硝基脲类,诸如卡莫司汀、氯脲霉素、福莫司汀、洛莫司汀、尼莫司汀、雷莫司汀;抗生素类,诸如烯二炔抗生素类(例如,卡里奇霉素,尤其是卡里奇霉素.γ1和卡里奇霉素θI,例如参见Angew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994);达内霉素,包括达内霉素A;埃斯培拉霉素;以及新制癌菌素发色团和相关色蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素、放线菌素、安曲霉素、重氮丝氨酸、博来霉素、放线菌素C、卡拉比星、卡米诺霉素、嗜癌素;色霉素、放线菌素D、柔红霉素、地托比星、6-重氮基-5-氧代-L-正亮氨酸、阿霉素(包括吗啉代-阿霉素、氰基吗啉代-阿霉素、2-吡咯啉子基-阿霉素和脱氧阿霉素)、表柔比星、依索比星、依达比星、麻西罗霉素、尼托霉素、霉酚酸、诺加霉素、橄榄霉素、培洛霉素、泊非霉素、嘌呤霉素、三铁阿霉素、罗多比星、链黑菌素、链佐星、杀结核菌素、乌苯美司、净司他丁、佐柔比星;抗代谢物类,诸如甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,诸如二甲叶酸、甲氨蝶呤、蝶罗呤、三甲曲沙;嘌呤类似物,诸如氟达拉滨、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤、硫鸟嘌呤;嘧啶类似物,诸如安西他滨、阿扎胞苷、6-氮尿苷、卡莫氟、阿糖胞苷、双脱氧尿苷、脱氧氟尿苷、依诺他滨、氟尿苷、5-FU;雄激素类,诸如卡鲁睾酮、丙酸屈他雄酮、环硫雄醇、美雄烷、睾内酯;抗肾上腺类,诸如氨鲁米特、米托坦、曲洛司坦;叶酸补充剂,诸如亚叶酸;醋葡醛内酯;醛磷酰胺糖苷;氨基乙酰丙酸;安吖啶;阿莫司汀;比生群;依达曲沙;磷胺氮芥;地美可辛;地吖醌;伊弗米辛;依利醋铵;埃博霉素;依托格鲁;硝酸镓;羟脲;香菇多糖;氯尼达明;美登素类化合物,诸如美登素和安丝菌素;米托胍腙;米托蒽醌;莫哌达醇;二胺硝吖啶;喷司他丁;蛋氨氮芥;吡柔比星;鬼臼酸;2-乙基酰肼;丙卡巴肼;PSK.RTM.;雷佐生;根霉素;西佐喃;螺旋锗;细交链孢菌酮酸;三亚胺醌;2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢菌素类(尤其是T-2毒素、疣孢菌素A、杆孢菌素A和蛇行菌素);乌拉坦;长春地辛;达卡巴嗪;甘露莫司汀;二溴甘露醇;二溴卫矛醇;哌泊溴烷;加西托星;阿拉伯糖苷(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替派;紫衫烷类,例如紫杉醇(TAXOL.TM.,Bristol-MyersSquibb Oncology,Princeton,N.J.)和多西他赛(TAXOTERE.RTM.,Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥;吉西他滨;6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;甲氨蝶呤;铂类似物,诸如顺铂和卡铂;长春碱;铂;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺;丝裂霉素C;米托蒽醌;长春新碱;长春瑞滨;诺威本;能灭瘤;替尼泊苷;道诺霉素;氨基蝶呤;希罗达;伊班膦酸盐;CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);视黄酸;卡培他滨;和以上各物中任一者的药学上可接受的盐、酸或衍生物。此定义中还包括用以调节或抑制激素对肿瘤的作用的抗激素剂,诸如抗雌激素,例如包括他莫昔芬、雷洛昔芬、抑制芳香酶的4(5)-咪唑类、4-羟基他莫昔芬、曲沃昔芬、那洛昔芬、LY117018、奥那司酮和托瑞米芬(法乐通);和抗雄激素类,诸如氟他米特、尼鲁米特、比卡米特、亮丙瑞林和戈舍瑞林;siRNA和以上各物中任一者的药学上可接受的盐、酸或衍生物。可与本发明一起使用的其它化疗剂在美国公布号20080171040或美国公布号20080305044中公开并以全文引用的方式并入本文中。
存在大量影响从天然来源萃取物获得的细胞微管的化合物和似乎具备作为用于产生免疫偶联物的毒素的潜能的半合成和合成类似物。所述分子和利用这些分子的药物产品的例子包括以下:秋水仙碱-位点结合剂(Curacin)、康普立停(AVE806、康普立停A-4前药(CA4P)、Oxi-4503)、念珠藻素类(LY355703)、圆皮海绵内酯、尾海兔素和类似物(阿里他汀PHE、尾海兔素10、ILX-651、西姆司他丁1、TZT-1027)、埃博霉素(BMS-247550、BMS-310705、EP0906、KOS-862、ZK-EPO)、艾榴塞洛素、FR182877、软海绵素B(E7389)、哈利米特(NPI-2352和NPI-2358)、哈米特林(HTI-286)、劳力莫大环内酯、美登素类化合物(“DM1”、“DM3”或“DM4”)(比伐单抗-DM1、美坎珠单抗、huN901-DM1/BB-10901TAP、MLN591DM1、My9-6-DM1、曲司珠单抗-DM1)、PC-SPES、派罗塞特A、白藜芦醇、S-烯丙巯基半胱氨酸(SAMC)、海绵素、维替米特、分子发动机-驱动蛋白(SB-715992)、设计的秋水仙碱-位点结合剂(A-289099、A-293620/A-318315、ABT-751/E7010、D-24851/D-64131、ZD6126)、其它新型的纺锤体毒素(2-甲氧基雌二醇(2-ME2)、苯并咪唑氨基甲酸酯类(ANG 600系列,甲苯咪唑)、CP248/CP461、HMN-214、R440、SDX-103、T67/T607)。此外,其它源自海洋的毒素在Mayer,A.M.S.Marine Pharmacology in1998:Antitumor and Cytotoxic Compounds.The Pharmacologist.41(4):159-164(1999)中综述。
在优选的实施方案中,BCMA ADC包含如本文所述的与一个或多个美登素类化合物分子偶联的抗体,它们是通过抑制微管蛋白聚合起作用的有丝分裂抑制剂。美登素类化合物(包括各种修饰)在美国专利号3896111;4151042;4137230;4248870;4256746;4260608;4265814;4294757;4307016;4308268;4309428;4313946;4315929;4317821;4322348;4331598;4361650;4364866;4424219;4450254;4362663;4371533;和WO 2009/099728中有述。美登素类化合物药物部分可从天然来源分离、使用重组技术产生或通过合成方式制备。示例性的美登素类化合物包括C-19-脱氯(美国专利号4256746)、C-20-羟基(或C-20-脱甲基)+/-C-19-脱氯(美国专利号4307016和4361650)、C-20-脱甲氧基(或C-20-酰氧基(-OCOR)、+/-脱氯(美国专利号4294757)、C-9-SH(美国专利号4,424,219)、C-14-烷氧基甲基(脱甲氧基/CH2OR)(美国专利号4,331,598)、C-14-羟基甲基或酰氧基甲基(CH2OH或CH2OAc)(美国专利号4,450,254)、C-15-羟基/酰氧基(美国专利号4,364,866)、C-15-甲氧基(美国专利号4,313,946和4,315,929)、C-18-N-脱甲基(美国专利号4,362,663和4,322,348)和4,5-脱氧(美国专利号4,371,533)。视所需的连接类型而定,美登素类化合物上的各个位置都可以用作键联位置。举例来说,对于形成酯键联而言,具有羟基的C-3位置、经羟甲基修饰的C-14位置、经羟基修饰的C-15位置和具有羟基的C-20位置都是合适的(美国专利号5208020、RE39151和6913748;美国专利申请公布号20060167245和20070037972和WO 2009099728)。
优选的美登素类化合物包括本领域中称为DM1、DM3和DM4的那些(美国专利申请公布号2009030924和20050276812,以引用的方式并入本文)。安丝菌素P-3经过合成性改变以产生弹头(warhead)DM1。DM1据报道在长春花生物碱结合位点处结合微管蛋白且抑制微管蛋白聚合。
含有美登素类化合物的ADC、制造所述ADC的方法及其治疗用途在美国专利号5208020和5416064、美国专利申请公布号20050276812和WO 2009099728(全部以引用的方式并入本文)中公开。本领域中已知适用于制造美登素类化合物ADC的连接子(美国专利号5208020和美国专利申请公布号2005016993和20090274713;全部以引用的方式并入本文)。包含SMCC连接子的美登素类化合物ADC可如美国专利公布号2005/0276812中所公开来制备。
本发明的实施方案包括Ab-1-MCC-DM1、Ab-2-MCC-DM1、Ab-3-MCC-DM1、Ab-4-MCC-DM1、Ab-5-MCC-DM1、Ab-6-MCC-DM1、Ab-7-MCC-DM1、Ab-8-MCC-DM1、Ab-9-MCC-DM1、Ab-10-MCC-DM1、Ab-11-MCC-DM1、Ab-12-MCC-DM1、Ab-13-MCC-DM1、Ab-14-MCC-DM1、Ab-15-MCC-DM1、Ab-16-MCC-DM1和Ab-17-MCC-DM1。
药物负载
现有抗体-药物偶联物的主要缺陷在于它们因为靶抗原的数量有限以及如甲氨蝶呤、柔红霉素和长春新碱的制癌药物的细胞毒性相对温和而无法向靶标位点递送足够浓度的药物。为了达到显著的细胞毒性,大量药物分子有必要直接与抗体键联或通过聚合载体分子与抗体键联。然而,这种重度修饰的抗体常展示出与靶抗原的结合受损且从血流中快速体内清除。
目前用于美登素类化合物与细胞结合剂偶联的方法在本领域中熟知并用于产生BCMAADC。如美国专利号5,208,020中所述,偶联方法可包涵两个反应步骤。用于美登素类化合物偶联的单步骤方法可用于产生BCMA ADC并在美国专利号6,441,163中描述。基于美登素类化合物的免疫毒素技术可从ImmunoGen Corporation(Cambridge,Mass.)获得。
美登素类化合物(例如,DM1)与如本文所述的BCMA抗体偶联的过程将产生一种包含与美登素类化合物(例如,DM1)群体偶联的抗体的组合物,每个抗体具有一系列美登素类化合物(例如,DM1)分子(药物-抗体比率或DAR)。BCMA ADC中每个抗体可具有1至20种化疗剂。BCMA ADC的组合物可由组合物中每个抗体分子的药物部分的平均数来表征。药物部分的平均数可由诸如质谱法、免疫测定和HPLC的常规方式来确定(例如,参见实施例7)。在一些情况下,可通过逆相HPLC或电泳来分离并纯化同源的BCMAADC群体。因此,药学BCMAADC组合物可含有连接有1、2、3、4、5、6、7或更多个药物部分的抗体的异源或同源群体。本发明的实施方案包括包含每个BCMA ADC的美登素类化合物(例如,DM1)分子的平均数在1和10之间、在2和7之间或优选地在3和5之间的组合物。在优选的实施方案中,BCMAADC的组合物中每个BCMAADC的美登素类化合物(例如,DM1)分子的平均数为约3.0、约3.1、约3.2、约3.3、约3.4、约3.5、约3.6、约3.7、约3.8、约3.9、约4.0、约4.1、约4.2、约4.3、约4.4、约4.5、约4.6、约4.7、约4.8、约4.9或约5.0。这种组合物可含有治疗有效量的BCMAADC而且可以冻干。在尤其优选的实施方案中,BCMA ADC包含如本文多方面描述以上述比率通过MCC连接子与DM1偶联的抗体Ab-1、Ab-2或Ab-3。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:132),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ IDNO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198),其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204),其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQID NO:206)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-3Vl(SEQ ID NO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-4Vl(SEQ IDNO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ IDNO:222)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-12Vl(SEQ IDNO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ IDNO:236)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含两条Ab-1轻链(SEQ IDNO:280)和两条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含两条Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和两条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含两条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-3Vl(SEQ IDNO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-5Vl(SEQ IDNO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-7Vl(SEQ IDNO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-9Vl(SEQ IDNO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-11Vl(SEQID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ IDNO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含分别与Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括与Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括与Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括与Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。如通过AHo、Kabat或Clothia编号系统中的任一种所确定,本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:18)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:126),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:150),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:184)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:89)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:198),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,尤其是Vh-CDR1(SEQID NO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204),其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQID NO:206)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-3Vl(SEQ IDNO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-5Vl(SEQ ID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物。本发明的方面包括包含Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ ID NO:216)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)结构域的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ IDNO:222)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-11Vl(SEQ IDNO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-12Vl(SEQ ID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQ ID NO:230)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ IDNO:232)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-16Vl(SEQ IDNO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-17Vl(SEQ ID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)结构域的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含两条Ab-1轻链(SEQ IDNO:280)和两条Ab-1重链(SEQ ID NO:274)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含两条Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和两条Ab-2重链(SEQ ID NO:276)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含两条Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和两条Ab-3重链(SEQ IDNO:278)的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。本发明的方面包括前述的片段、衍生物、突变蛋白和变体。
本发明的方面包括包含Ab-1的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:4)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:5)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:6)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:106)、Vl-CDR2(SEQID NO:107)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:108)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-2的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:10)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:11)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:12)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:112)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:113)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:114)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-3的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:16)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:17)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:18)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:118)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:119)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:120)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-4的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:22)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:23)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:24)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:124)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:125)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:126)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-5的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:28)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:29)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:30)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:130)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:131)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:132)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-6的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:34)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:35)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:36)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:136)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:137)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:138)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-7的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:40)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:41)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:42)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:142)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:143)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:144)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-8的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:46)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:47)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:48)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:148)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:149)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:150)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-9的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:52)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:53)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:54)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:154)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:155)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:156)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-10的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:58)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:59)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:60)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:160)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:161)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:162)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-11的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:64)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:65)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:66)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:166)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:167)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:168)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-12的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:70)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:71)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:72)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:172)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:173)和Vl-CDR3(SEQ IDNO:174)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-13的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:76)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:77)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:78)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:178)、Vl-CDR2(SEQ IDNO:179)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:180)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-14的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:82)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:83)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:84)、Vl-CDR1(SEQ IDNO:184)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:185)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:186)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-15的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:88)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:89)、Vh-CDR3(SEQ IDNO:90)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:190)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:191)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:192)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-16的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ ID NO:94)、Vh-CDR2(SEQ IDNO:95)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:96)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:196)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:197)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:198)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含Ab-17的六个CDR的分离的单克隆抗体,其中CDR包括Vh-CDR1(SEQ IDNO:100)、Vh-CDR2(SEQ ID NO:101)、Vh-CDR3(SEQ ID NO:102)、Vl-CDR1(SEQ ID NO:202)、Vl-CDR2(SEQ ID NO:203)和Vl-CDR3(SEQ ID NO:204)的不超过一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸添加、缺失或取代,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括包含分别与Ab-1Vl(SEQ ID NO:240)和Ab-1Vh(SEQ ID NO:206)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-2Vl(SEQ ID NO:242)和Ab-2Vh(SEQ ID NO:208)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-3Vl(SEQ IDNO:244)和Ab-3Vh(SEQ ID NO:210)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-4Vl(SEQ ID NO:246)和Ab-4Vh(SEQ ID NO:212)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-5Vl(SEQID NO:248)和Ab-5Vh(SEQ ID NO:214)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-6Vl(SEQ ID NO:250)和Ab-6Vh(SEQ IDNO:216)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-7Vl(SEQ ID NO:252)和Ab-7Vh(SEQ ID NO:218)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-8Vl(SEQ ID NO:254)和Ab-8Vh(SEQ ID NO:220)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-9Vl(SEQ ID NO:256)和Ab-9Vh(SEQ ID NO:222)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-10Vl(SEQ ID NO:258)和Ab-10Vh(SEQ ID NO:224)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-11Vl(SEQ ID NO:260)和Ab-11Vh(SEQ ID NO:226)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-12Vl(SEQID NO:262)和Ab-12Vh(SEQ ID NO:228)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-13Vl(SEQ ID NO:264)和Ab-13Vh(SEQID NO:230)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-14Vl(SEQ ID NO:266)和Ab-14Vh(SEQ ID NO:232)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-15Vl(SEQ ID NO:268)和Ab-15Vh(SEQ ID NO:234)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-16Vl(SEQ ID NO:270)和Ab-16Vh(SEQ ID NO:236)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括包含分别与Ab-17Vl(SEQID NO:272)和Ab-17Vh(SEQ ID NO:238)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的Vl和Vh氨基酸序列的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
本发明的方面包括与Ab-1轻链(SEQ ID NO:280)和Ab-1重链(SEQ ID NO:274)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括与Ab-2轻链(SEQ ID NO:282)和Ab-2重链(SEQ ID NO:276)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。本发明的方面包括与Ab-3轻链(SEQ ID NO:284)和Ab-3重链(SEQ ID NO:278)具有至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的分离的单克隆抗体,其中所述抗体还包含连接子和药物,且其中所述连接子是MCC且所述药物是美登素类化合物,诸如DM1。前述实施方案的方面包括人单克隆抗体、人单克隆IgG抗体和人单克隆IgG1抗体。
BCMA抗原结合蛋白用于治疗目的的用途
本说明书上下文中所述的BCMA抗原结合蛋白的所有方面都可用于制备用以治疗本文所述各种病况和疾病的药物。本说明书上下文中所述的BCMA抗原结合蛋白的所有方面都可用于治疗与表达BCMA的B细胞和尤其是记忆B细胞和血浆B细胞相关的疾病或病况。如在实施例1中所示,BCMA在恶性浆细胞(多发性骨髓瘤和冒烟型骨髓瘤)和意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)浆细胞中以比在正常浆细胞中观测到的水平相对较高的水平来表达。
如本文多方面描述的BCMA ADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可用于治疗B细胞相关癌症,其中恶性B细胞在其表面上表达BCMA。BCMAADC结合恶性B细胞的表面上的BCMA,通过受体介导的胞吞作用内化,在细胞内释放化疗药物(典型地通过溶酶体-核内体途径的酸性环境)并由此杀伤恶性细胞。在细胞内释放药物减少了由游离药物旁观杀伤非恶性细胞。因此,如本文多方面描述的BCMAADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可用于治疗包括(但不限于)B细胞癌症且尤其是多发性骨髓瘤和恶性浆细胞肿瘤以及BCMA+高级别淋巴瘤的疾病。如本文多方面描述的BCMAADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC也可用于治疗卡勒氏病和骨髓瘤病;浆细胞白血病;浆细胞瘤;B细胞幼淋巴细胞白血病;毛细胞白血病;B细胞非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);急性骨髓性白血病(AML);慢性骨髓性白血病(CML);急性淋巴细胞白血病(ALL);慢性淋巴细胞白血病(CLL);滤泡性淋巴瘤(包括滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤类型);伯基特氏淋巴瘤(地方性伯基特氏淋巴瘤;散发性伯基特氏淋巴瘤);边缘区淋巴瘤(粘膜相关淋巴组织;MALT/MALToma;单核细胞样B细胞淋巴瘤;伴绒毛状淋巴细胞的脾淋巴瘤);套细胞淋巴瘤;大细胞淋巴瘤(弥漫性大细胞;弥漫性混合细胞;免疫母细胞性淋巴瘤;原发性纵隔B细胞淋巴瘤;血管中心性淋巴瘤-肺B细胞);小淋巴细胞淋巴瘤(SLL);前体B-淋巴母细胞淋巴瘤;骨髓性白血病(粒细胞;骨髓性;急性骨髓性白血病;慢性骨髓性白血病;亚急性骨髓性白血病;髓细胞肉瘤;绿色瘤;粒细胞肉瘤;急性早幼粒细胞白血病;急性粒单核细胞白血病);瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症或其它B细胞淋巴瘤。
如本文多方面描述的BCMA ADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可与标准癌症治疗组合使用,诸如(但不限于)外科手术、放射治疗和化学治疗以及蛋白酶体抑制剂、皮质类固醇和干细胞移植。如本文多方面描述的BCMAADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可与施用化疗剂组合使用。化疗剂可在施用如本文多方面描述的一种或多种BCMA ADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC之前、与此同时或在此之后施用。化疗剂是用于治疗癌症的化合物。化疗剂的例子包括(但不限于):13-顺-视黄酸、2-CdA 2-氯脱氧腺苷、5-阿扎胞苷5-氟尿嘧啶5-FU、6-巯基嘌呤、6-MP 6-TG 6-硫鸟嘌呤、紫杉醇(Abraxane)、放线菌素-D、 阿地白介素(Aldesleukin)、阿仑单抗(Alemtuzumab)、ALIMTA、阿利维A酸(Alitretinoin)、 全反视黄酸、α干扰素、六甲蜜胺、甲氨蝶呤(Amethopterin)、阿米福汀(Amifostine)、氨鲁米特(Aminoglutethimide)、阿那格雷(Anagrelide)、阿那曲唑(Anastrozole)、阿糖胞苷(Arabinosylcytosine)、Ara-C、 三氧化二砷(Arsenic Trioxide)、天冬酰胺酶(Asparaginase)、ATRA、阿扎胞苷、BCG、BCNU、苯达莫司汀(Bendamustine)、贝伐单抗(Bevacizumab)、贝沙罗汀(Bexarotene)、比卡米特、BiCNU、博来霉素、硼替佐米(Bortezomib)、白消安、C225、甲酰四氢叶酸钙(Calcium Leucovorin)、喜树碱-11、卡培他滨CaracTM、卡铂、卡莫司汀、卡莫司汀晶片、CC-5013、CCI-779、CCNU、CDDP、CeeNU、西妥昔单抗(Cetuximab)、苯丁酸氮芥、顺铂、嗜橙菌因子(Citrovorum Factor)、克拉屈滨(Cladribine)、可的松(Cortisone)、CPT-11、环磷酰胺、阿糖胞苷、阿糖胞苷脂质体、 达卡巴嗪、达克金(Dacogen)、放线菌素D、阿法达贝泊汀(DarbepoetinAlfa)、达沙替尼(Dasatinib)、道诺霉素、柔红霉素、盐酸柔红霉素、柔红霉素脂质体、地塞米松(Decadron)、地西他滨(Decitabine)、地尼白介素(Denileukin Diftitox)、DepoCytTM、地塞米松(Dexamethasone)、醋酸地塞米松(Dexamethasone Acetate)、地塞米松磷酸钠(DexamethasoneSodium Phosphate)、地塞米松(Dexasone)、右雷佐生(Dexrazoxane)、DHAD、DIC、地奥德赛(Diodex)、多西他赛(Docetaxel)、阿霉素、阿霉素脂质体、DroxiaTM、DTIC、 EligardTM、EllenceTM、EloxatinTM、表柔比星、阿法依泊汀(Epoetin Alfa)、爱必妥(Erbitux)、埃罗替尼(Erlotinib)、欧文氏菌L-天冬酰胺酶(Erwinia L-asparaginase)、雌莫司汀、阿米福汀(Ethyol)、依托泊苷、磷酸依托泊苷、依西美坦(Exemestane)、 非格司亭(Filgrastim)、氟尿苷、氟达拉滨、氟脲嘧啶(Fluorouracil)、氟甲睾酮(Fluoxymesterone)、氟他米特、亚叶酸、氟维司群(Fulvestrant)、G-CSF、吉非替尼(Gefitinib)、吉西他滨、吉妥珠单抗(Gemtuzumab)、奥佐米星(ozogamicin)、健择(Gemzar)、GleevecTM、晶片、GM-CSF、戈舍瑞林、甲氟烯索(Hexadrol)、六甲嘧胺(Hexamethylmelamine)、HMM、Hydrocort氢化可的松(Hydrocortisone)、氢化可的松磷酸钠、氢化可的松琥珀酸钠、磷酸氢化可的松、羟脲、替伊莫单抗(Ibritumomab)、替坦异贝莫单抗(Ibritumomab Tiuxetan)、依达比星、IFN-α、异环磷酰胺、伊马替尼(Imatinib)、甲磺酸盐(mesylate)、咪唑、甲酰胺、干扰素α、干扰素α-2b(PEG偶联物)、白介素-2、白介素-11、内含子(干扰素α-2b)、伊立替康(Irinotecan)、异维甲酸(Isotretinoin)、伊沙匹隆(Ixabepilone)、IxempraTM、天冬酰胺酶(Kidrolase)、拉帕替尼(Lapatinib)、L-天冬酰胺酶、LCR、来那度胺(Lenalidomide)、来曲唑(Letrozole)、甲酰四氢叶酸(Leucovorin)、苯丁酸氮芥(Leukeran)、LeukineTM、亮丙瑞林、长春新碱(Leurocristine)、LeustatinTM、脂质体Ara-C、液体洛莫司汀、L-PAM、L-溶肉瘤素(L-Sarcolysin)、Lupron地塞米松(Maxidex)、甲氮芥、盐酸甲氮芥、甲地孕酮(Megestrol)、醋酸甲地孕酮(Megestrol Acetate)、美法仑、巯基嘌呤、美司钠(Mesna)、MesnexTM、甲氨蝶呤、甲氨蝶呤钠、甲泼尼龙(Methylprednisolone)、丝裂霉素、丝裂霉素-C、米托蒽醌、MTC、MTX、盐酸氮芥(Mustine)、 MylocelTM、奈拉滨(Nelarabine)、NeulastaTM、尼鲁米特、氮芥(Nitrogen Mustard)、 奥曲肽(Octreotide)、醋酸奥曲肽、 OnxalTM、奥普瑞白介素(Oprevelkin)、奥沙利铂(Oxaliplatin)、紫杉醇、紫杉醇结合蛋白、帕米膦酸盐(Pamidronate)、帕尼单抗(Panitumumab)、 PEG干扰素、培门冬酶(Pegaspargase)、培非格司亭(Pegfilgrastim)、PEG-INTRONTM、PEG-L-天冬酰胺酶、PEMETREXED、喷司他丁、苯丙氨酸氮芥(Phenylalanine Mustard)、泼尼松龙(Prednisolone)、泼尼松(Prednisone)、丙卡巴肼、具有卡莫司汀植入物的Prolifeprospan 20、雷洛昔芬、 利妥昔单抗(Rituximab)、(干扰素α-2a)、盐酸柔红霉素(Rubidomycin hydrochloride)、善得定(Sandostatin)沙格司亭(Sargramostim)、索拉非尼(Sorafenib)、SPRYCELTM、STI-571、链佐星、SU11248、舒尼替尼(Sunitinib)、他莫昔芬、替莫唑胺(Temozolomide)、替西罗莫司(Temsirolimus)、替尼泊苷、TESPA、沙利度胺(Thalidomide)、硫鸟嘌呤、硫鸟嘌呤硫代磷酰胺(Thiophosphoamide)、噻替派、拓扑替康(Topotecan)、托瑞米芬(Toremifene)、托西莫单抗(Tositumomab)、曲司珠单抗、维甲酸(Tretinoin)、TrexallTM、TSPA、VCR、VectibixTM、ViadurTM、长春碱、硫酸长春碱、长春新碱(Vincasar)、长春新碱、长春瑞滨、酒石酸长春瑞滨、VLB、VM-26、伏立诺他(Vorinostat)、VP-16、ZevalinTM、 唑来膦酸(Zoledronic acid)、伏立诺他(Zolinza)、等等。
如上文提到的,如本文多方面描述的BCMAADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可与标准的癌症治疗组合使用,诸如(但不限于)蛋白酶体抑制剂且具体来说是卡非佐米(carfilzomib)(诸如)。
另外,如本文多方面描述的BCMA ADC,尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC可用于治疗自体免疫病症,其中由浆细胞产生的抗体有助于疾病的免疫发病机理,诸如(但不限于)全身性红斑狼疮(SLE)、类风湿性关节炎(RA)、多发性硬化症(MS)、修格连氏病(Sjogrens)、免疫介导性血小板减少症、溶血性贫血、大疱性类天疱疮、重症肌无力、I型糖尿病、格雷夫斯病(Graves’disease)、阿狄森病(Addison’s disease)、落叶型天疱疮、牛皮癣、牛皮癣性关节炎和强直性脊柱炎。在其它实施方案中,可使用未与药物偶联的抗huBCMA抗体来治疗此段落中所列的自体免疫疾病,尤其是如本文多方面描述的Ab-1、Ab-2或Ab-3且更尤其是Ab-1。更具体来说,可使用Ab-1来治疗SLE。更具体来说,可使用Ab-1来治疗MS。应了解,如本说明书其它处所述,上述方法也涵盖用于第一和第二医学用途及其权利要求的相对方法。
诊断用途、测定和试剂盒
本发明的BCMA抗原结合蛋白可用于诊断测定,例如结合测定来检测和/或定量在组织(诸如骨髓)或细胞(诸如浆细胞)中表达的BCMA。BCMA抗原结合蛋白可用在进一步研究BCMA在疾病中的作用的研究中。BCMA抗原结合蛋白可用来进一步研究BCMA在形成均聚和/或异聚受体复合物中的作用和所述BCMA受体复合物在疾病中的作用。
在某些实施方案中,患者分层测定可用来确定患者是否适合用BCMA ADC来治疗。具体来说,多发性骨髓瘤患者可经过预筛进行治疗。举例来说,如果在患者B细胞上检测到BCMA表达的阈值水平,患者就适合治疗。相反,如果患者B细胞上未达到BCMA表达的阈值水平,患者可能不适合治疗。可通过测试患者细胞中存在BCMA编码RNA或存在在细胞表面上表达的BCMA蛋白来确定BCMA表达。样本可以是血液样本或活检样本。本文所述的BCMA抗体可用在这些测定中来定量在患者细胞表面上表达的BCMA的量。
本发明的方面包括测量BCMAADC的药效的测定。如本文所述,BCMAADC结合细胞表面BCMA并被内化,由此使抗体发生分解代谢,向细胞质中释放lys-MCC-DM1,在细胞质中其抑制微管蛋白聚合并诱发有丝分裂阻滞和细胞死亡。多发性骨髓瘤是由浆细胞在骨髓中扩增而驱使的一种疾病,但外周浆细胞的数量通常太小而无法在骨髓小室中用作肿瘤细胞的替代品(Dingli D,Nowakowski GS,DispenzieriA等人,Blood 107,3384-8(2006))。用来评估BCMAADC对浆细胞的作用的药效学替代标记的一个实施方案是用血清分析物测量肿瘤负荷的减少。肿瘤负荷的水平是多发性骨髓瘤中的一种常用评估,而且是用来确定疾病状态和从多发性骨髓瘤分离MGUS的一种评估(Waxman AJ等人,Clin Lymphoma Myeloma Leuk.10,248-57(2010))。3g/dL的血清单克隆(M)蛋白含量是用来诊断MM的标准,且血清M-蛋白的减少是用来定义临床反应的一种标准(Schaefer EW等人,Cancer 116,640-6(2010))。血清M-蛋白分析测量在血液中循环的单克隆蛋白的量。此分析是在多发性骨髓瘤诊断中常用的一种临床上经过验证的分析。一小部分的MM患者(2-5%)在血清中不分泌单克隆蛋白。
BCMA的血清含量可以是预后的,而且是一种用来测量肿瘤负荷的新工具(Sanchez E等人,Serum B-cell maturation antigen iselevated in multiple myeloma and correlates with disease status andsurvival.Br J Haematology 158,727-38(2012))。本发明的实施方案包括诊断测定和试剂盒以测量可溶性BCMA是肿瘤细胞上的膜结合BCMA的潜在替代品。举例来说,在单独或与常规治疗组合用一种或多种BCMA ADC治疗之前测量可溶性BCMA来确定血清BCMA的基线含量并进行周期性地测试来监控对所述治疗的反应。骨髓基质细胞将BCMA配体BAFF和APRIL分泌到肿瘤微环境中并检测MM血清样本中的BAFF(Moreaux J等人,Blood 106,1021-30(2005);TaiYT等人,CancerRes.66,6675-82(2006);和Fragioudaki M等人,LeukRes.36,1004-8(2012))。正如上文所述,预期可溶性BMCA、APRIL和BAFF诊断分析(诸如ELISA、流式细胞术等)用来监控患者的临床状态。如果确定适当分析,就测试MM血清的可溶性BCMA、APRIL和BAFF的含量。
研究人IgG游离轻链(κ)作为潜在的生物标记而作为Ab-1(2A1CV5)ADC实验的体内药理学的部分,证实Ab-1(2A1CV5)ADC在H929向骨性异种移植模型中介导肿瘤消退(参见实施例12)。人免疫球蛋白分子由两条定义类别的重链(IgG、IgA、IgM、IgD、IgE)和相同的轻链(κ或λ)组成。在健康个体中,血清中存在的大多数轻链都与重链结合。游离轻链(FLC)是B淋巴细胞的天然产物且代表了与赘生性和反应性B细胞相关的病症的独特生物标记。FLC增加与各种恶性血浆病症相关。检测FLC是用于包括多发性骨髓瘤、冒烟型骨髓瘤和意义未明的单克隆丙种球蛋白病的多种疾病的一种重要的辅助诊断手段。人IgG FLCκELISA(Biovendor,RD 194088100R-K)用来分析在来自H929异种移植物的血清中是否存在FLC。在用2A1CV5-MCC-DM1治疗18天后,在小鼠血清中未检测到κ轻链抗体,但在接受媒介物(PBS)或同种型对照偶联物(抗链霉亲和素-MCC-DM1)的小鼠血清中有检测到(参见图38和39)。因此,对血清中抗体游离γ和κ轻链(sFLC)的测量可用作诊断小组中的多发性骨髓瘤生物标记。sFLC的一种尤其适用的特性是它们的半衰期短,这使得临床医生可以确定几天内对治疗的反应(Davids MS等人,Serumfree light chain analysis.AmJ.Hematology 85,787-790(2010))。
本发明的抗原结合蛋白可用于诊断目的来检测、诊断或监控与BCMA相关的疾病和/或病况。本发明提供使用本领域技术人员已知的经典免疫组织学方法检测样本中BCMA的存在(例如,Tijssen,1993,Practice and Theory of Enzyme Immunoassays,第15卷(R.H.Burdon和P.H.van Knippenberg编,Elsevier,Amsterdam);Zola,1987,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,第147-158页(CRCPress,Inc.);Jalkanen等人,1985,J.Cell.Biol.101:976-985;Jalkanen等人,1987,J.CellBiol.105:3087-3096)。可以体内或体外进行BCMA的检测。适用于检测BCMA的存在的方法实例包括ELISA、FACS、RIA等。
对于诊断应用来说,通常用可检测的标记基团来标记BCMA抗原结合蛋白。合适的标记基团包括(但不限于)以下:放射性同位素或放射性核素(例如,3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I)、荧光基团(例如,FITC、罗丹明、镧系元素磷光体)、酶促基团(例如,辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶、碱性磷酸酶)、化学发光基团、生物素基基团或由二级报导体识别的预定多肽表位(例如,亮氨酸拉链对序列、用于二级抗体的结合位点、金属结合结构域、表位标签)。在一些实施方案中,标记基团通过各种长度的间隔子臂与抗原结合蛋白偶合以减小潜在的位阻。用于标记蛋白质的各种方法在本领域中已知且可用来进行本发明。
本发明的一个方面提供识别表达BCMA的细胞。在一个具体实施方案中,用标记基团标记抗原结合蛋白并检测经过标记的抗原结合蛋白与BCMA的结合。在另一个具体实施方案中,体内检测抗原结合蛋白与BCMA的结合。在另一个具体实施方案中,使用本领域中已知的技术来分离和测量抗原结合蛋白-BCMA。参见例如Harlow和Lane,1988,Antibodies:A Laboratory Manual,New York:Cold SpringHarbor(1991年编和定期增刊);John E.Coliganb编,1993,CurrentProtocols In Immunology New York:John Wiley&Sons。
本发明的另一方面提供检测与本发明的抗原结合蛋白竞争结合BCMA的测试分子的存在。一种所述测定的实例将涉及在存在或不存在测试分子的情形下检测含有一定量BCMA的溶液中的游离抗原结合蛋白的量。游离抗原结合蛋白(即,未结合BCMA的抗原结合蛋白)的量增加将表示测试分子能与抗原结合蛋白竞争结合BCMA。在一个实施方案中,用标记基团标记抗原结合蛋白。或者,标记测试分子并在存在或不存在抗原结合蛋白的情形下监控游离测试分子的量。
药物配制物、施用途径
在一些实施方案中,本发明提供药物组合物,其包含治疗有效量的一种或多种本发明的抗原结合蛋白以及药学上可接受的稀释剂、载剂、增溶剂、乳化剂、防腐剂和/或佐剂。另外,本发明提供通过施用所述药物组合物来治疗患者的方法。
在一些实施方案中,BCMAADC、尤其是Ab-1ADC是包含治疗有效量的至少一种本文所述的BCMA ADC、尤其是Ab-1ADC以及药学上可接受的稀释剂、载剂、增溶剂、乳化剂、防腐剂和/或佐剂的药物组合物。另外,本发明提供通过施用所述药物组合物来治疗患者的方法。
如本文多方面描述的包含BCMA ADC、尤其是Ab-1ADC的药物组合物可用于治疗B细胞相关癌症,其中恶性B细胞在其表面上表达BCMA。BCMAADC结合恶性B细胞的表面上的BCMA,通过受体介导的胞吞作用被内化,在细胞内释放化疗药物(典型地通过溶酶体-核内体途径的酸性环境)并由此杀伤恶性细胞。在细胞内释放化疗药物减少了由游离药物旁观杀伤非恶性细胞。因此,如本文多方面描述的包含BCMA ADC、尤其是Ab-1ADC的药物组合物可用于治疗包括(但不限于)B细胞癌症且尤其是多发性骨髓瘤和恶性浆细胞肿瘤的疾病。如本文多方面描述的BCMA ADC,尤其是Ab-1ADC也可用于治疗卡勒氏病和骨髓瘤病;浆细胞白血病;浆细胞瘤;B细胞幼淋巴细胞白血病;毛细胞白血病;B细胞非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);急性骨髓性白血病(AML);慢性骨髓性白血病(CML);急性淋巴细胞白血病(ALL);慢性淋巴细胞白血病(CLL);滤泡性淋巴瘤(包括滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤类型);伯基特氏淋巴瘤(地方性伯基特氏淋巴瘤;散发性伯基特氏淋巴瘤);边缘区淋巴瘤(粘膜相关淋巴组织;MALT/MALToma;单核细胞样B细胞淋巴瘤;伴绒毛状淋巴细胞的脾淋巴瘤);套细胞淋巴瘤;大细胞淋巴瘤(弥漫性大细胞;弥漫性混合细胞;免疫母细胞性淋巴瘤;原发性纵隔B细胞淋巴瘤;血管中心性淋巴瘤-肺B细胞);小淋巴细胞淋巴瘤(SLL);前体B-淋巴母细胞淋巴瘤;骨髓性白血病(粒细胞;骨髓性;急性骨髓性白血病;慢性骨髓性白血病;亚急性骨髓性白血病;髓细胞肉瘤;绿色瘤;粒细胞肉瘤;急性早幼粒细胞白血病;急性粒单核细胞白血病);瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症或其它B细胞淋巴瘤。
另外,如本文多方面描述的包含BCMAADC、尤其是Ab-1、Ab-2或Ab-3ADC且更尤其是Ab-1ADC的药物组合物可用于治疗自体免疫病症,其中由浆细胞产生的抗体有助于疾病的免疫发病机理,诸如(但不限于)全身性红斑狼疮(SLE)、类风湿性关节炎(RA)、多发性硬化症(MS)、修格连氏病、免疫介导性血小板减少症、溶血性贫血、大疱性类天疱疮、重症肌无力、I型糖尿病、格雷夫斯病、阿狄森病、落叶型天疱疮、牛皮癣、牛皮癣性关节炎和强直性脊柱炎。在其它实施方案中,可使用包含未与药物偶联的抗huBCMA抗体的药物组合物来治疗此段落中所列的自体免疫疾病,尤其是如本文多方面描述的Ab-1、Ab-2或Ab-3且更尤其是Ab-1。更具体来说,可使用包含Ab-1的药物组合物来治疗SLE。更具体来说,可使用包含Ab-1的药物组合物来治疗MS。
在某些实施方案中,可接受的配制物物质优选地在所采用的剂量和浓度下对接受者无毒。在某些实施方案中,药物组合物可含有用于改善、维持或保留例如组合物的pH、渗透性、粘度、澄清度、颜色、等渗性、气味、无菌性、稳定性、溶解或释放速率、吸收或渗透的配制物物质。在所述实施方案中,合适的配制物物质包括(但不限于)氨基酸(诸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸);抗微生物剂;抗氧化剂(诸如抗坏血酸、亚硫酸钠或亚硫酸氢钠);缓冲剂(诸如硼酸盐、碳酸氢盐、Tris-HCl、柠檬酸盐、磷酸盐或其它有机酸);膨胀剂(诸如甘露糖醇或甘氨酸);螯合剂(诸如乙二胺四乙酸(EDTA));络合剂(诸如咖啡因、聚乙烯吡咯烷酮、β-环糊精或羟丙基-β-环糊精);填充剂;单糖;二糖;和其它碳水化合物(诸如葡萄糖、甘露糖或糊精);蛋白质(诸如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白);着色剂、调味剂和稀释剂;乳化剂;亲水性聚合物(诸如聚乙烯吡咯烷酮);低分子量多肽;成盐平衡离子(诸如钠);防腐剂(诸如苯扎氯铵、苯甲酸、水杨酸、硫柳汞、苯乙醇、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、氯己定、山梨酸或过氧化氢);溶剂(诸如甘油、丙二醇或聚乙二醇);糖醇(诸如甘露糖醇或山梨糖醇);悬浮剂;表面活性剂或湿润剂(诸如普朗尼克(pluronic)、PEG、山梨聚糖酯、聚山梨醇酯(诸如聚山梨醇酯20)、聚山梨醇酯、氚核、缓血酸胺、卵磷脂、胆固醇、泰洛沙泊(tyloxapal));稳定性增强剂(诸如蔗糖或山梨糖醇);张力增强剂(诸如碱金属卤化物,优选是氯化钠或氯化钾、甘露糖醇、山梨糖醇);递送媒介物;稀释剂;赋形剂和/或药物佐剂。参见REMINGTON'SPHARMACEUTICAL SCIENCES,第18”版(A.R.Genrmo编),1990,Mack Publishing Company。
在某些实施方案中,本领域技术人员将例如视预期的施用途径、递送方式和所需的剂量来确定最佳的药物组合物。参见例如前文的REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES。在某些实施方案中,所述组合物可影响本发明的抗原结合蛋白的物理状态、稳定性、体内释放速率和体内清除速率。在某些实施方案中,药物组合物中的主要媒介物或载剂可具有含水或不含水性质。举例来说,合适的媒介物或载剂可以是注射用水、生理盐水溶液或人工脑脊液,可能补充有在用于肠胃外施用的组合物中常见的其它物质。中性缓冲盐水或与血清白蛋白混合的盐水是进一步的示例性媒介物。在具体实施方案中,药物组合物包含pH为约7.0-8.5的Tris缓冲剂或pH为约4.0-5.5的醋酸盐缓冲剂,且可另外包括山梨糖醇或其合适的替代物。在本发明的某些实施方案中,可以通过将具有所需纯度的选定组合物与任选的配制剂(REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES,前文)混合成冻干饼或水溶液的形式来制备BCMA抗原结合蛋白组合物以供储存。另外,在某些实施方案中,可使用诸如蔗糖的适当赋形剂将BCMA抗原结合蛋白产物配制成冻干产物。
可选择本发明的药物组合物用于肠胃外递送。或者,可选择组合物用于吸入或通过消化道(诸如经口)递送。所述药学上可接受的组合物的制备在本领域的技术内。
配制物组分优选地以施用位点可接受的浓度存在。在某些实施方案中,使用缓冲剂来使组合物维持在生理学pH或略微较低的pH下,典型地在约5至约8的pH范围内。
当涵盖肠胃外施用时,用于本发明的治疗组合物可以不含热原的在药学上可接受的媒介物中包含所需BCMA抗原结合蛋白的肠胃外可接受的水溶液形式来提供。用于肠胃外注射的尤其合适的媒介物是无菌蒸馏水,BCMA抗原结合蛋白在其中配制成适合保存的无菌等渗溶液。在某些实施方案中,制备可涉及配制所需分子与诸如可注射微球、生物易蚀粒子、聚合化合物(诸如聚乳酸或聚乙醇酸)、珠粒或脂质体的药剂,这可提供可控或持续释放可通过积存注射递送的产品。在某些实施方案中,也可以使用透明质酸,具有促进在循环中的持续作用时间的作用。在某些实施方案中,可使用植入式的药物递送装置来引入所需的抗原结合蛋白。
本发明的药物组合物可配制成用于吸入。在这些实施方案中,BCMA抗原结合蛋白有利地配制成干燥可吸入的粉末。在具体实施方案中,也可以用推进剂来配制BCMA抗原结合蛋白吸入溶液以供气雾剂递送。在某些实施方案中,溶液可以雾化。因此在国际专利申请号PCT/US94/001875中进一步描述肺部递送和配制方法,此专利申请以引用的方式并入且描述经肺递送经过化学修饰的蛋白质。也预期配制物可经口施用。以此方式施用的BCMA抗原结合蛋白可用或不用在诸如片剂和胶囊的固体剂型混配中常用的载剂配制。在某些实施方案中,胶囊可设计成在胃肠道中生物可用性最大且系统前退化最小的点处释放配制物的活性部分。可包括其它药剂以促进BCMA抗原结合蛋白的吸收。也可以采用稀释剂、调味剂、低熔点蜡、植物油、润滑剂、悬浮剂、片剂崩解剂和粘合剂。
优选地提供包括有效量的一种或多种BCMA抗原结合蛋白与适合制造片剂的无毒赋形剂的混合物的本发明的药物组合物。通过将片剂溶解在无菌水或另一种适当媒介物中,可制备单位剂型的溶液。合适的赋形剂包括(但不限于)惰性稀释剂,诸如碳酸钙、碳酸钠或碳酸氢钠、乳糖或磷酸钙;或粘合剂,诸如淀粉、明胶或阿拉伯胶;或润滑剂,诸如硬脂酸镁、硬脂酸或滑石。
其它药物组合物将为本领域技术人员显而易见,包括在持续或控制释放递送配制物中包含BCMA抗原结合蛋白的配制物。用于配制多种其它持续或可控传递方式的技术(诸如脂质体载剂、生物易蚀微粒或多孔珠粒和积存注射)也为本领域技术人员所知。参见例如国际专利申请号PCT/US93/00829,此专利申请以引用的方式并入且描述控制释放多孔聚合微粒以用于递送药物组合物。持续释放型制剂可包括成形物品形式的半渗透性聚合物基质,例如薄膜或微胶囊。持续释放型基质可包括聚酯、水凝胶、聚丙交酯(如美国专利号3,773,919和欧洲专利申请公布号EP 058481中公开,其各自以引用的方式并入)、L-谷氨酸与γL-谷氨酸乙酯的共聚物(Sidman等人,1983,Biopolymers2:547-556)、聚(2-羟乙基-甲基丙烯酸酯)(Langer等人,1981,J.Biomed.Mater.Res.15:167-277和Langer,1982,Chem.Tech.12:98-105)、乙烯醋酸乙烯酯(Langer等人,1981,前文)或聚-D(-)-3-羟基丁酸(欧洲专利申请公布号EP 133,988)。持续释放型组合物还可以包括可由本领域中已知的若干种方法中的任何方法制备的脂质体。参见例如Eppstein等人,1985,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.82:3688-3692;欧洲专利申请公布号EP 036,676;EP 088,046和EP 143,949,它们都以引用的方式并入。
用于体内施用的药物组合物通常以无菌制剂的形式提供。通过经无菌过滤膜过滤来实现灭菌。在组合物冻干时,可在冻干和复水之前或之后使用此方法进行灭菌。用于肠胃外施用的组合物可以冻干形式或在溶液中储存。肠胃外组合物通常放在具有无菌进入孔的容器中,例如具有皮下注射针可刺穿的塞子的静脉内溶液带或小瓶。
关于蛋白质稳定和配制物质以及在此方面适用的方法存在各种阐述,诸如Arakawa等人,“Solvent interactions in pharmaceuticalformulations,”Pharm Res.8(3):285-91(1991);Kendrick等人,“Physicalstabilization ofproteins in aqueous solution,”在:RATIONAL DESIGNOF STABLE PROTEIN FORMULATIONS:THEORYAND PRACTICE中,Carpenter和Manning编,Pharmaceutical Biotechnology.13:61-84(2002)和Randolph等人,“Surfactant-protein interactions,”PharmBiotechnol.13:159-75(2002),其各自以全文引用的方法并入本文中,尤其是关于根据本发明用于自缓冲蛋白配制物的赋形剂及其方法的部分,尤其关于用于兽医和/或人医学用途的蛋白质药物产物和方法。
适用于本发明的各种赋形剂列举在表3中并在下文中进一步描述。
表3:赋形剂的类型及其功能
根据本发明的某些实施方案可使用盐来例如调节配制物的离子强度和/或等渗性和/或改良蛋白质的溶解度和/或物理稳定性。盐对于减小蛋白配制物的粘度也有效,而且在本发明中可用于此目的。如众所周知,离子可以通过与蛋白质表面上的带电残基结合并通过屏蔽蛋白质中的带电和极性基团和减小其静电相互作用、吸引和排斥相互作用的强度来稳定蛋白质的天然状态。离子也可以通过尤其与蛋白质的变性肽键(-CONH)结合来稳定蛋白质的变性状态。此外,与蛋白质中的带电和极性基团的离子相互作用亦可以减小分子间的静电相互作用,并因此防止或减少蛋白聚集和不溶性。
离子种类在其对蛋白质的作用方面显著不同。已研发了大量分类等级的离子及其对蛋白质的作用可用来配制根据本发明的自缓冲蛋白组合物。一个实例是Hofmeister系列,它通过对溶液中蛋白质的构象稳定性的作用定级为离子性和极性非离子性溶质。稳定化溶质称为“离液序列低(kosmotropic)”。减稳溶质称为离液序列高(chaotropic)。低离液序列通常在高浓度下(例如,>1摩尔的硫酸铵)使用以使蛋白质从溶液沉淀(“盐析”)。通常使用高离液序列来使蛋白质变性和/或溶解(“盐溶”)。离子对“盐溶”和“盐析”的相对有效性确定了它们在Hofmeister系列中的位置。
为了维持根据本发明的优选实施方案的肠胃外配制物中的等渗性、改善蛋白质溶解性和/或稳定性、改善粘度特征、避免对蛋白质稳定性和聚集的有害盐作用及防止盐介导的蛋白质降解,配制物中的盐浓度可小于150mM(就单价离子而言)且对于多价离子而言为150mEq/升。在这方面,在本发明的某些尤其优选实施方案中,总的盐浓度为约75mEq/L至约140mEq/L。
可在配制物中用于稳定蛋白质的游离氨基酸(诸如(但不限于)赖氨酸、脯氨酸、丝氨酸和丙氨酸)可在BCMAADC配制物中用作膨胀剂、稳定剂和抗氧化剂以及其它标准用途。甘氨酸适用于冻干以确保准确的饼结构和特性。精氨酸可适用于在液体和冻干配制物中抑制蛋白质聚集。蛋氨酸适合用作抗氧化剂。
多元醇包括糖(例如,甘露糖醇、蔗糖和山梨糖醇)和多羟醇(诸如甘油和丙二醇)且对于本文论述目的而言包括聚乙二醇(PEG)和相关物质。多元醇是离液序列低的。它们是液体和冻干配制物中的适用稳定剂以保护蛋白质免于物理和化学降解过程。多元醇也适用于调节配制物的渗透压。
适用于本发明的选定实施方案的多元醇是甘露糖醇,通常用于确保冻干配制物中饼的结构稳定性。它确保了饼的结构稳定性。它通常与冻干保护剂(例如,蔗糖)一起使用。山梨糖醇和蔗糖是用于调节渗透压和作为稳定剂来进行保护以防在运输期间的冷冻-解冻应力或在制造过程期间产生大块的优选药剂。
BCMA ADC配制物的实施方案可任选地还包含表面活性剂。蛋白质分子可易于吸附到表面上并在气液、固液和液液界面处变性且随后聚集。这些作用通常与蛋白质浓度成反比。这些有害的相互作用通常与蛋白质浓度成反比且典型地由诸如在产品运输和操作期间产生的物理搅动而加剧。表面活性剂常规用于防止、最小化或减少表面吸附。就此而言本发明中的适用表面活性剂包括聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、聚乙氧基化山梨聚糖的其它脂肪酸酯和泊洛沙姆(poloxamer)188。表面活性剂也常用于控制蛋白质的构象稳定性。就此而言表面活性剂的使用具有蛋白质特异性,因为任何给定的表面活性剂典型地将稳定某些蛋白而使其它蛋白减稳。聚山梨醇酯易于发生氧化分解且供应时常含有足量的过氧化物从而导致蛋白质残基侧链发生氧化,尤其是蛋氨酸。因此,聚山梨醇酯应谨慎使用,且在使用时应以其最低的有效浓度使用。就此而言,聚山梨醇酯示例了通用规则,即赋形剂应以其最低的有效浓度使用。
BCMA ADC配制物的实施方案可任选地还包含一种或多种抗氧化剂。在某种程度上,在药物配制物中可通过维持适当水平的环境氧和温度并通过避免暴露于光线来防止蛋白质的不利氧化作用。也可以使用抗氧化剂赋形剂来防止蛋白质的氧化分解。就此而言,适用的抗氧化剂是还原剂、氧/自由基清除剂和螯合剂。根据本发明适用于治疗性蛋白质配制物中的抗氧化剂优选地是水溶性的且在产品的整个保存期限内维持其活性。抗氧化剂可损坏蛋白质。举例来说,还原剂(尤其诸如谷胱甘肽)可破坏分子内的二硫键。因此,尤其选择适用于本发明的抗氧化剂来消除或充分减小其自身损坏配制物中的蛋白质的可能性。
根据本发明的配制物可包括作为蛋白质辅助因子且对形成蛋白质配位复合物而言必要的金属离子。金属离子也可以抑制使蛋白质降解的某些过程。
BCMA ADC配制物的实施方案可任选地还包含一种或多种防腐剂。在开发包含一种以上来自同一容器的提取物的多剂量肠胃外配制物时,防腐剂是必要的。它们的主要功能在于在药物产品的整个保存期限内或从药物产品的使用角度而言抑制微生物生长并确保产品的无菌性。常用的防腐剂包括苯甲醇、苯酚和间甲酚。在配制和开发防腐剂型期间需要考虑几个方面。药物产品中的有效防腐剂浓度必须优化。这需要测试剂型中的指定防腐剂,其中浓度范围赋予抗微生物有效性而不损坏蛋白质稳定性。
开发含有防腐剂的液体配制物可能比冻干配制物更具挑战。冷冻干燥的产品可以在无防腐剂的情形下冻干并在使用时用含有稀释剂的防腐剂复水。这缩短了防腐剂与蛋白质接触的时间,使得相关的稳定性风险显著最小化。在液体配制物的情形下,必须在产品的整个保存期限(约18至24个月)内维持防腐剂的有效性和稳定性。重要的注意点在于在含有活性药物和所有赋形剂组分的最终配制物中必须显示防腐剂的有效性。
药物组合物一经配制,就以溶液、悬浮液、凝胶、乳液、固体、晶体或以脱水或冻干粉末的形式储存在无菌小瓶中。所述配制物可储存成即用形式或在施用前复水的形式(例如,冻干)。本发明还提供用于产生单剂量施用单位的试剂盒。本发明的试剂盒可各自含有具有干燥蛋白的第一容器和具有含水配制物的第二容器。在本发明的某些实施方案中,提供含有单腔和多腔预填充注射器(例如,液体注射器和冻干注射器)的试剂盒。
将采用的含有BCMAADC的药物组合物的治疗有效量将取决于例如治疗程度和目标。本领域技术人员将了解,用于治疗的适当剂量水平将部分取决于所递送的分子、BCMA ADC所用于的适应症、施用途径和患者的大小(体重、体表或器官大小)和/或状况(年龄和一般健康状况)而变化。在某些实施方案中,临床医生可滴定剂量并改变施用途径来获得最佳的治疗效果。视上文提到的因素而定,典型的剂量可在约0.1μg/kg至高达约30mg/kg或更高的范围内。
给药频率将取决于所用配制物中特定BCMA ADC的药物动力学参数。临床医生典型地施用组合物直到达到实现所需效果的剂量。组合物因此可作为单次剂量施用,或随时间以作为两次或多次剂量(可含有或不含有相同量的所需分子)施用,或通过植入装置或导管以连续输液的方式施用。本领域一般技术人员常规对适当剂量进行进一步改进而且在他们常规进行的任务范围内。可以通过使用适当的剂量-反应数据来确定适当的剂量。在某些实施方案中,本发明的抗原结合蛋白可经过延长的时间段施用至患者。
药物组合物的施用途径是根据已知方法,例如经口、通过静脉内、腹膜内、脑内(脑实质内)、脑室内、肌肉内、眼内、动脉内、门静脉或病灶内途径注射;通过持续释放系统或通过植入装置。在某些实施方案中,组合物可通过推注或连续输液或通过植入装置来施用。组合物还可以通过植入上面吸附或囊封有所需分子的膜、海绵或另一种适当材料来局部施用。在某些实施方案中,当使用植入装置时,可将装置植入任何合适的组织或器官中,且所需分子的递送可通过输液、定时释放大丸剂或连续施用。
本说明书主体内引用的所有参考文献都以全文引用的方式明确并入本文。
实施例
提供以下实施例(包括进行的实验和实现的结果)只用于说明性目的且不应解释为限制本发明。
实施例1
除了含有来自正常个体的固有浆细胞(包括骨髓和肠道样本)的正常组织以外,在多发性骨髓瘤、冒烟型骨髓瘤和MGUS患者样本中对BCMAmRNA表达进行广泛分析。通过电脑模拟(in silico)分析,通过在Amgen可用的肿瘤DNA微阵列数据库(包括Oncomine/Oncomine Power Tools和AscentaTM)中查询来获得BCMA mRNA表达结果。在OncomineTM数据集中,存在994例原发性多发性骨髓瘤样本用于BCMA表达检查,且其中仅5个样本未表达可检测的BCMAmRNA信号水平(信号处于检测限值且与非B直系组织中观测的信号相同,非B直系组织包括与背景水平一致的黑素瘤和皮肤而且是已知不表达BCMA的组织)。
结果显示BCMA mRNA在多发性骨髓瘤中高度表达。图3显示使用来自Compendia Bioscience的市售Oncomine Power Tools(由LifeTechnologies获得)产生的散布图。使用12个数据集(GSE4452、GSE9782、GSE2912、GSE17498、GSE5788、GSE2361、GSE2113、GSE3526、GSE1133、GSE1159、GSE2658、GSE5900)和两个基于Affymetrix的平台(Human Genome U133Plus 2.0Array&HumanGenome U133A阵列)构建表达曲线。使用Affymetrix Probeset 206641确定BCMA(HUGO符号:TNFRSF17)线性表达,并在七种组织类型(骨髓、CD34+外周血细胞、意义未明的单克隆丙种球蛋白病、多发性骨髓瘤、外周血、浆细胞白血病和冒烟型骨髓瘤)和四种样本类型(骨髓穿刺液、骨髓标本、外周血标本和组织标本)之间进行测量。
数据处理和标准化:
在产生信号强度值的阵列上测量样本。不使用共同参考。作者提供的数据文档常经过MAS4、MAS5或RMA加工。在合并MAS5数据时,包括所有表达值且忽略缺席/进行呼叫。通过从每个值减去中值使每次微阵列实验的中值缩放到零。进行此步骤以除去样本之间信号强度的偏差。这假定中值表达水平在样本之间接近相同且每种样本具有相同数量在中值上下表达的基因。这使得样本之间的中值标准化。
线性规模解释:
中值=1。倍数变化解释为“x轴单位”-中值基因表达以上的倍数。举例来说,30的线性规模值是比1的中值基因表达大30倍。
此数据显示BCMA mRNA在多发性骨髓瘤、冒烟型骨髓瘤以及意义未明的单克隆丙种球蛋白病中高度表达。此数据显示BCMAmRNA在>99%的多发性骨髓瘤患者样本中表达(85%(796/934)的多发性骨髓瘤样本具有大于10的线性表达值)。此数据显示BCMA是用于靶向使用如本文多方面描述的BCMA抗体和ADC来治疗前文提到的和本文所述的其它癌症的一种高度有利的受体蛋白。
实施例2
使用Abgenix(现为Amgen Fremont Inc.)技术进行针对人BCMA的完全人单克隆抗体的开发(美国专利号6,114,598;6,162,963;6,833,268;7,049,426;7,064,244,它们以全文引用的方式并入本文中;Green等人,1994,Nature Genetics 7:13-21;Mendez等人,1997,Nature Genetics 15:146-156;Green和Jakobovitis,1998,J.Ex.Med.188:483-495))。
第一方案概述:
图4A中提供概述。用293T/BCMA瞬时表达细胞或含有单体和二聚物形式huBCMA的可溶性huBCMA蛋白混合物对动物进行免疫。产生杂交瘤并在CHO/BCMA瞬时细胞上由FMAT识别抗原特异性结合子。使用人H929和L3055细胞系针对与内源性huBCMA结合筛选416个结合子的小组。使用FACs分析在293/cynoBCMA瞬时细胞上产生其它的猕猴交叉反应性数据。通过与内源性人BCMA最佳结合,且接着其次通过与猕猴受体的最佳交叉反应性对抗体划分等级来识别22个杂交瘤细胞系的重要小组。此重要小组继续亚克隆、扩充、测序并纯化。同时,评估416个结合子小组的APRIL阻断以及与鼠BCMA的交叉反应性。在22个杂交瘤细胞系中,只有三种抗体是完全人抗体(亲本Ab-1(即,2A1)、亲本Ab-4(即,1E1)和亲本Ab-6(即,11F12)),剩余都是人重链和小鼠轻链嵌合体的组合,其中三种无法亚克隆。三种抗体亲本Ab-1(2A1)、亲本Ab-4(1E1)和亲本Ab-6(11F12)经重组克隆为IgG1抗体。此数据表明产生具有有利属性的完全人抗体并非常规和可预测的。
第二方案概述:
图4B中提供概述。免疫原和初级筛选与第一方案相同。第二方案产生581个与人BCMA特异性结合的抗体小组。通过FACs测试此小组与猕猴BCMA的交叉反应性。使用猕猴交叉反应性数据来选择90个具有可检测的猕猴交叉反应性的抗体。通过FACs,使用瞬时表达系统测试此90子集与TACI和BAFF-R的结合。排除具有任何可检测结合水平的抗体。筛选这90种抗体用于轻链用途并排除具有鼠λ轻链的那些抗体。这些次级筛选导致识别出90种抗体中是完全人IgG且对人BCMA的选择性超过TACI和BAFFR的45种抗体。此45种抗体的小组接着通过使用猕猴BCMA FACs数据进一步改进以由cyno结合的程度来对小组划分等级。30种最佳cyno交叉反应性结合子接着继续亚克隆、扩充、测序并纯化。包括另一种细胞活力筛选来识别ADC组分Ab。此处,使用与SMCC-DM1偶联的抗huFc二抗来代替直接DM1偶联。初始的具有类似分支特性的七种抗体的集合满足筛选标准并以IgG1的形式被重组克隆出来。一组结合子(对于人和猕猴BCMA而言)继续重组克隆(32B5、37B2、35D2、29C12、40D7、33C7)。开始热点修复,固定N连接的糖基化位点和协变冲突。选择热点修复了所包括的抗体、表达和纯化特征、对细胞表面结合的FACS评估、ADC偶联和细胞活力分析。与细胞表面表达的BCMA的的表观亲和力低于2A1且2A1CV5-MCC-DM1的ADC潜能与关于32B5或29C12-MCC-DM1所观测的相比改良了2至3倍。识别两种序列相关的工程化抗体(29C12.V1和32B5.V1)具有独特且有利的属性用于产生ADC和药物组合物。
免疫:
使用技术,工程化为用以表达相应同种型的完全人IgGΚ和IgGλ抗体的各种全部项目的转基因小鼠来产生BCMA的完全人抗体(Mendez,M.J.等人,(1997)Nature genetics 15,146-156;Kellermann,S.A.等人,(2002)Current opinion in biotechnology 13,593-597)。用两种形式的BCMA免疫原对小鼠的XMG1-KL、XMG2-K、XMG2-KL、XMG4-KL品系进行免疫:表达全长人BCMA的293T转染子和纯化的BCMA可溶性蛋白。BCMA可溶性蛋白免疫原由两种形式的混合物组成:表达成具有avi-His标签的单体胞外域的BCMA和表达成人Fc连接的同源二聚物的BCMA。以每只小鼠10μg的剂量对可溶性蛋白免疫以供第一次加强,且接着以每只小鼠5μg可溶性BCMA的剂量施用加强(单体:二聚物的比率为1:1)。以每只小鼠4.0×106个BCMA转染细胞给药进行细胞免疫原,且随后的加强剂量为每只小鼠2.0×106个BCMA转染细胞。所用的注射位点是皮下尾根部与腹膜内的组合。所用佐剂是TiterMax Gold(Sigma;目录号T2684),根据制造商说明来制备Alum(E.M.Sergent Pulp andChemical Co.,Clifton,NJ,目录号1452-250)并以佐剂乳液与抗原溶液1:1的比率混合。经过4至12周的时间以11至17次加强范围对小鼠进行免疫。
在首次注射后约5和9周时收集血清并通过FACs染色在CHO-S细胞上瞬时表达的重组BCMA受体来确定具体效价。总计识别38只动物具有特异性免疫反应,将这些动物汇集成6组并继续产生抗体。
制备单克隆抗体:
从免疫动物收集排出的淋巴结和脾脏并收集用于每个同期群。在合适的培养基(例如,杜尔贝科改良伊格尔培养基(Dulbecco’s ModifiedEagle Medium;DMEM;可从Invitrogen,Carlsbad,CA获得)中从组织离解淋巴细胞和脾细胞以从组织释放细胞,并悬浮在DMEM中。使用合适的方法选择B细胞和/或使其扩增,并与合适的融合伴侣融合,例如非分泌性骨髓瘤P3X63Ag8.653细胞(American Type CultureCollection CRL 1580;Kearney等人,J.Immunol.123,1979,1548-1550)。
将B细胞与融合伴侣细胞以1:4的比率混合。通过在400×g下的离心使细胞混合物轻柔沉淀4分钟,倾析上清液并通过使用1ml移液管将细胞混合物轻柔混合。用PEG/DMSO(聚乙二醇/二甲亚砜;从Sigma-Aldrich,St.Louis MO获得;每百万个淋巴细胞1ml)诱发融合。经过一分钟伴随轻柔搅动缓慢添加PEG/DMSO,接着进行一分钟混合。随后经过2分钟伴随轻柔搅动添加IDMEM(不含谷氨酰胺的DMEM;每百万个B细胞2ml),接着经历3分钟添加另外的IDMEM(每百万个B细胞8ml)。
将融合细胞轻柔沉淀(400×g下6分钟)并以每百万个B细胞再悬浮于20ml选择培养基(例如,含有重氮丝氨酸和次黄嘌呤[HA]且视必要含有其他补充物质的DMEM)中。将细胞在37℃下孵育20-30分钟且随后再悬浮于200ml选择培养基中,并在T175烧瓶中培养三至四天,之后进行96孔铺板。
使用标准技术将细胞分布于96孔板中以使所得菌落的克隆性最大化。培养几天后,收集杂交瘤上清液并使其经历如下文实施例中详述的筛选测定,包括证实结合人BCMA受体、通过配体结合竞争分析识别APRIL阻断抗体和评估与BCMA受体相关的其它受体(例如,TACI和BAFF受体)的交叉反应性。随后进一步选择经识别具有所关注的结合特性的杂交瘤细胞系并使其经历标准克隆和亚克隆技术。使无性系体外扩增,并对获得的所分泌的人抗体进行分析和V基因测序。
通过FMAT选择BCMA受体特异性结合抗体:
培养14天后,通过荧光微体积测定技术(FMAT)(AppliedBiosystems,Foster City,CA)筛选杂交瘤上清液的BCMA特异性单克隆抗体。针对由人BCMA瞬时转染的CHO-S细胞筛选上清液并针对由不含BCMA基因的相同表达质粒瞬时转染的CHO-S细胞进行反筛选。
简单来说,将Freestyle培养基(Invitrogen,Carlsbad,CA)中的细胞以每孔50μL的体积,对于稳定转染子而言以每孔约4000个细胞的密度且对于亲本细胞而言以每孔约16,000个细胞的密度接种在384孔的FMAT板中,并将细胞在37℃下孵育过夜。随后每孔加入10μL上清液并将板在4℃下孵育约一小时,此后每孔加入10μL浓度为2.8μg/ml的抗人IgG-Cy5二抗(Jackson Immunoresearch,West Grove,PA)(最终浓度为400ng/ml)。随后将板在4℃下孵育一小时,并使用FMAT大共焦扫描仪(Applied Biosystems,Foster City,CA)读取荧光。
多次筛选方案后,识别一组897个抗BCMA结合杂交瘤细胞系并继续进行进一步的表征测定。
通过流式细胞术(FACs)进行另一结合表征:
进行FACS结合分析来评估抗BCMA受体特异性抗体与在H929和L3055肿瘤细胞系上表达的内源性BCMA受体的结合。另外,与鼠和猕猴BCMA同源物交叉反应性结合而且与相关B细胞受体也结合;还通过使用重组形式的在293T细胞上瞬时表达的各种受体的FACs来评估TACI和BAFF-R。
通过在4℃下将杂交瘤上清液与10,000至25,000个细胞孵育一小时,接着用PBS/2%FBS洗涤两次来进行FACs分析。随后在4℃下用荧光染料标记的二抗处理细胞,接着进行两次洗涤。将细胞再悬浮于50ul的PBS/2%FBS中并使用FACSCaliburTM仪器分析抗体结合。
通过FACS的配体结合竞争测定来识别阻断抗体:
开发配体结合竞争方法来识别结合BCMA受体且阻断APRIL配体结合的抗体(在杂交瘤上清液中)。在96孔V形底板(Sarstedt#82.1583.001)中,将50,000个瞬时转染293T细胞与15μl抗BCMA杂交瘤上清液在在4℃下孵育1小时,接着用PBS/2%FBS洗涤两次。随后向每个孔中加入50μl 2.5μg/ml的经Alexa647标记的APRIL-Fc并将板在4℃下孵育1小时。随后洗涤细胞并通过流式细胞术定量细胞相关的经Alexa647标记的APRIL-Fc的量。
实验包括阴性对照杂交瘤上清液。采用这些阴性对照实验中观察到的平均信号作为测定的最大可能信号。将实验上清液与此最大信号相比并计算每个孔的抑制百分比(抑制%=(1-(抗BCMA杂交瘤上清液的FL4几何平均值/最大FL4几何平均信号))。
进一步表征2A1和1E1:
一种重要标准是针对在细胞表面上表达的野生型人BCMA的剧烈选择性。使用标准技术在经过瞬时转染以表达全长BCMA、TACI或BAFF-R的细胞上进行FACS结合。将约40×106个瞬时转染的靶细胞再悬浮于染色溶液(2%山羊血清、1%兔血清、PBS中的0.02%叠氮化物)中并根据实验设计等分试样到圆底的96孔培养板(CorningIncorp.,Acton,MA)中。将细胞在4℃下孵育30分钟以阻断非特异性位点。将抗体滴定到染色溶液中。通过以每孔200ul使细胞再悬浮在冲洗溶液(PBS+0.02%叠氮化物)中冲洗细胞。将细胞在4℃下以1500rpm离心7分钟。除去冲洗溶液并重复冲洗步骤。将细胞以每孔30ul再悬浮于适当的抗体溶液中(参见表4中的基质)并在4℃下孵育30分钟。huIgG1阴性对照的二级试剂是生物素化的抗huIgG(Jackson Cat.109-065-098),接着是链霉亲和素-藻红蛋白(SA-PE)偶联物(BDPharmingen Cat.554061);1E1、2A1和11F12二级试剂是相同的生物素化抗huIgG,之后是SA-PE。对于小鼠IgG1阴性对照和两种小鼠抗体(1.183和1.288)而言,二级试剂是抗小鼠IgG-PE偶联物(BDPharmingen Cat.550589)。如上所述冲洗细胞/抗体以除去多余/未结合的抗体。最后冲洗后,将细胞再悬浮于200ul冲洗溶液中,加入一滴染色溶液来阻止细胞聚集。在FACS上以532nM的波长来读取样本。如果MFI是阴性对照值的两倍,就认为样本对于结合而言是阳性的。
如表4中所示,2A1和1E1抗体对BCMA具特异性,而11F12与结构同源受体TACI和BAFF-R交叉反应。1.183和1.288是与TACI和/或BAFF-R交叉反应的小鼠抗huBCMA单克隆抗体且因此充当交叉反应性的阳性对照。
表4.
|
BCMA |
TACI |
BAFF-R |
1E1 |
+ |
- |
- |
2A1 |
+ |
- |
- |
11F12 |
+ |
+ |
- |
1.183 |
+ |
+ |
- |
1.288 |
+ |
- |
+ |
通过FACS分析评估2A1和1E1抗体与在细胞表面上表达的人和猕猴(cyno)BCMA的结合亲和力。简言之:
第1天-制备经猕cyno或人BCMA瞬时转染的293T细胞
第2天-向细胞中添加5mM丁酸钠以改良BCMA表达
第3天-在37℃下,在培养基(FreestyleTM 293表达介质(Gibco/Invitrogen,San Diego,CA)+2%FBS+50ug/mL G418+0.05%叠氮化钠)中建立平衡测定持续约16小时
平衡条件:
800nM的每种Mab以1:2滴定,且随后以1:4滴定,在4℃和37℃处10个数据点;
制备2×104个细胞和3×105个瞬时表达细胞人BCMA的293T细胞,且
制备2×104个细胞和2.6×105个瞬时表达细胞cyno BCMA的293T细胞
第4天-FACS分析:对于每种mAb产生两条曲线,一条Kd对照曲线、一条Ab对照曲线
通过BIAcoreTM表面等离子体共振分析来评估2A1和1E1抗体对人和猕猴(cyno)BCMA的平衡离解常数(Kd)。
分析条件:在25℃下,在HBS-EP缓冲系统(10mM HEPES pH7.4、150mM NaCl、3.4mM EDTA和0.005%表面活性剂P20)中使用装配有CM5传感器芯片的BIAcoreTM 3000光学生物传感器(GEHealthcare,Piscataway,NJ)来进行生物传感器分析。自动进样器保持在4℃下。
表面制备:使用标准胺偶联化学方法(10,000-11,000RU),将山羊抗人IgG捕集抗体(Jackson ImmunoResearch Laboratories,Inc.,WestGrove,PA;109-005-098)固定在传感器芯片的所有流动细胞上。此表面类型在每次再生步骤后提供用于重复捕集新鲜分析抗体(配体)的形式。
配体制备:使用流动细胞2、3和4来分析捕集到的抗BCMA抗体(约350-480RU),同时使用流动细胞1作为参照流动细胞。
分析物制备:在运行缓冲液中制备在75.0至0.103nM(3倍稀释)范围内的七种抗huBCMA浓度。
相互作用参数:七种分析物样本浓度各自一式三份且以混合的次序运行,作为评估结合和管理潜在系统偏差对于注射次序的再现性的方式。还运行多次空白(缓冲液)注射并用于评估和减掉系统假象。所有分析物浓度的缔合和离解阶段分别以50uL/min的流速监控180s和900s。另外,使用75.0nM的rhu BCMA浓度,以50uL/min的流速进行5400s的长离解阶段实验。
表面再生:以50uL/min的流速,用10mM甘氨酸(pH 1.5)经过35s使表面再生。
模型/拟合:将数据对准、双重参考并使用Scrubber软件(BioLogic Software Pty Ltd,Campbell,Australia)拟合,此软件是SPR数据加工和非线性最小二乘法回归拟合程序。首先,对于1A2和1E1抗BCMA抗体而言,从5400s离解阶段数据确定离解速率系数(kd)。其次,此值在针对1:1结合模型的180s缔合阶段数据的整体拟合中用作固定的参数,从而确定缔合速率系数(ka)和Rmax值。对于11F12-1抗BCMA抗体而言,从稳定态信号评估平衡离解常数(Kd)并拟合为简单的1:1结合等温线。
如表5中所示,2A1和1E1对人BCMA显示低nM亲和力。重要的是,2A1以与人BCMA相似的亲和力结合cyno BCMA。相反,1E1以相当低的亲和力(即,>100nM)结合猕猴BCMA。此数据进一步证实2A1抗体的独特且少有的特征。出于2A1抗体对BCMA的异常特异性、其对huBCMA的高亲和力及其与cyno BCMA的交叉反应性而选择其进行进一步表征和开发。1E1和11F12不共有这些独特特征。
表5.对于抗BCMA抗体而言,源自Biacore的平衡离解常数(Kd)和相对FACS亲和力
实施例3
如果确定2A1和1E1抗体结合在瞬时表达细胞上表达的huBCMA(实施例2),那么重要的是确定这些抗体是否能够结合从骨髓瘤患者(例如,最初来自骨髓瘤患者的H929细胞系)分离的天然BCMA表达的B-淋巴细胞。另外,测试多种不同骨髓瘤和B细胞系来确定2A1和1E1抗体是否结合这些细胞表面上的BCMA以及结合程度。
根据实验设计,将约10至40×106个H929骨髓瘤细胞再悬浮于染色溶液(2%山羊血清、1%兔血清、0.02%PBS中的叠氮化物)中并等分试样到圆底的96孔板(Corning Incorp.,Acton,MA)中。将细胞在4℃下孵育30分钟以阻断非特异性位点。将抗体滴定到染色溶液中。通过以每孔200ul使细胞再悬浮在冲洗溶液(PBS+0.02%叠氮化物)中冲洗细胞。将细胞在4℃下以1500rpm离心7分钟。除去冲洗溶液并重复冲洗步骤。以每孔30ul用2A1或1E1使细胞再悬浮并在4℃下孵育30分钟。huIgG1阴性对照的二级试剂是生物素化的抗huIgG(Jackson Labs,Bar Harbor,Me,Cat.109-065-098),之后是链霉亲和素-藻红蛋白(SA-PE)偶联物(BD Pharmingen,San Diego,CA,Cat.554061)。2A1和1E1二级试剂是相同的生物素化抗huIgG,之后是SA-PE。如上所述冲洗细胞/抗体以除去多余/未结合的抗体。最后冲洗后,将细胞再悬浮于200ul冲洗溶液中,加入一滴染色溶液来阻止细胞聚集。在FACS上以532nM的波长来读取样本。
如图5中所示,2A1和1E1抗体结合在骨髓瘤细胞系表面上表达的人BCMA(H929)。尽管两种抗体都充分结合,但2A1抗体比1E1抗体具有相当更佳的结合特征。此数据进一步证实2A1抗体的独特之处在于与骨髓瘤细胞中表达的人BCMA结合优越。
测试多种不同骨髓瘤和B细胞系来确定2A1和1E1抗体是否结合这些细胞表面上的BCMA以及结合程度。测试以下骨髓瘤细胞系的2A1结合:H929、RPMI 8226、OPM2、MM1S、U266和MM1R、以及B细胞系RAMOS和EW36。根据实验设计,将约10至40×106个细胞再悬浮于染色溶液(2%山羊血清、1%兔血清、0.02%PBS中的叠氮化物)中并等分试样到圆底的96孔板(Corning Incorp.,Acton,MA)中。将细胞在4℃下孵育30分钟以阻断非特异性位点。将抗体滴定到染色溶液中。通过以每孔200ul使细胞再悬浮在冲洗溶液(PBS+0.02%叠氮化物)中冲洗细胞。将细胞在4℃下以1500rpm离心7分钟。除去冲洗溶液并重复冲洗步骤。使用标准方法,诸如EMPBiotech提供的那些方法(用于标记和纯化蛋白以形成分别在大致652nm和671nm处具有荧光激发和荧光发射最大值的蛋白染料偶联物的Fluoro-Spin 649蛋白标记和纯化试剂盒),使用DY-649的反应性琥珀酰亚胺基酯使2A1抗体和人IgG1同种型对照抗体与Dy649偶联。将细胞以每孔30ul用2A1或对照抗体再悬浮并在4℃下孵育30分钟。如上所述冲洗细胞/抗体以除去多余/未结合的抗体。最后冲洗后,将细胞再悬浮于200ul冲洗溶液中,加入一滴染色溶液来阻止细胞聚集。
如图7中所示,2A1抗体结合所有骨髓瘤细胞系和B细胞系,尽管与RAMOS B细胞系结合相当低。此数据显示2A1抗体能够结合多种人骨髓瘤细胞上的BCMA。此数据因此显示2A1抗体用于靶向标表达BCMA的各种人骨髓瘤细胞上的BCMA的用途。
实施例4
优选实施方案的高度有利属性是能够通过多种方式杀伤靶细胞,所述方式包括ADCC(抗体依赖性细胞介导的细胞毒性)。ADCC典型地包涵抗体对自然杀伤细胞(NK细胞)的活化。NK细胞表达FcγR(Fc受体蛋白)。FcγR结合抗体的Fc部分,诸如IgG1,它已与靶细胞的表面结合。一经结合,NK细胞即释放进入靶细胞的细胞因子和含有穿孔蛋白和颗粒酶的细胞毒性颗粒,并通过触发细胞凋亡来促进细胞死亡。本文提供的抗体和ADC的实施方案是IgG1同种型(如上文所述)且因此保持ADCC活性的希望。
体外ADCC测定:
如下对靶细胞H929(一种最初从以相对高水平表达BCMA的骨髓瘤患者分离的人B-淋巴细胞细胞系)标记钙黄绿素-AM。收获H929细胞并以每毫升2×106个细胞再悬浮于cRPMI-10培养基(RPMI(LifeTechnologies,Carlsberg,CA)+10%胎牛血清)中。将无水DMSO中4mM的钙黄绿素-AM(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)加入到10μM的最终浓度(1:400稀释)。将细胞在37℃下孵育30分钟,接着在PBS中洗涤两次(1500rpm,在4℃下每次5分钟)。将沉淀再悬浮于cRPMI-10中并调节至每毫升0.2×106个细胞的浓度且放置在冰上以供下一步使用。将测试抗体以从10ug/ml开始的10倍连续滴定加入到U形底的96孔板中(BD,Franklin Lakes,NJ)。使用利妥昔单抗(Genentech,South San Francisco,CA)作为阳性抗体对照。另外,使用1E1抗体的IgG2同种型作为对照。向每个孔中加入钙黄绿素-AM标记的H929细胞(每个孔1×104个细胞)并在37℃下与抗体孵育20分钟。孵育之后,向每个孔中加入50μl浓度为每毫升4×106个细胞的NK细胞或浓度为每毫升20×106个细胞的PBMC并在37℃下孵育4小时。将作为效应细胞的NK细胞或PBMC在4℃下以1500rpm沉淀5分钟并再悬浮于cRPMI-10中,将细胞浓度调节至每毫升4×106个细胞(NK)或每毫升20×106个细胞(PBMC)。孵育之后,通过每孔加入20μl9%的NP-40(IGEPAL CA630,Sigma-Aldrich)刺激100%溶解来制备阳性对照物。所有其它孔每孔只接受20μl cRPMI-10培养基。将板在4℃下以800RPM旋转4分钟。除去约150μl上清液并转移到透明底的黑色96孔板(Corning,Lowell,MA)中并在标准酶标仪(MolecularDevices,Spectra max GEMINI)上读取荧光,激发485、发射535。根据(样本值-自发溶解)/(100%溶解-自发溶解)×100来计算最大溶解百分比。
如图8中所示,2A1和1E1抗体显示优良的ADCC活性,对于2A1而言EC50为11ng/ml且对于1E1而言EC50为76ng/ml。这些抗体的ADCC活性远超过Rituxan基准抗体。因此,2A1和1E1抗体的独特之处在于其异常的ADCC活性,且因此这些抗体的ADC形式为杀伤癌症患者(诸如多发性骨髓瘤)中的BCMA表达细胞提供了多种途径。
实施例5
这些实验证实2A1抗体经过结合人骨髓瘤细胞上的huBCMA被内化。这是候选抗体发展成ADC的重要属性,原因在于抗体优选通过BCMA介导的胞吞作用被内化以供ADC被内化到核内体/溶酶体途径中来选择性地杀伤那种细胞,而使旁观者杀伤最小化。
将H929骨髓瘤肿瘤细胞培养在生长培养基(RPMI 1640、10%FBS、MEM非必需氨基酸、HEPES、β-巯基乙醇、Pen/Strep、L-谷氨酰胺、丙酮酸钠、艮他霉素(gentamicin))中。将H929细胞以每管约500,000个细胞收集到两个3-ml的FACS管中并用测定培养基(含有2%FBS的PBS)洗涤一次。将细胞与2A1或CD138抗体以每管每毫升10μg(每管200μL)悬浮在分析培养基中。在4℃下孵育30分钟后,将细胞用测定培养基洗涤一次。向细胞中加入抗人IgG、Alexa 488(Molecular Probes Inc.,Eugene,OR.目录号A11013,在分析培养基中以1:1,000稀释)和Hoechst 33342(Molecular Probes Inc.,Eugene,OR,目录号H21492,在分析培养基中以1:2000稀释)的混合物。将细胞在4℃下孵育15分钟后,将细胞洗涤一次且随后用0.5ml的测定培养基再悬浮以达到每毫升1×106个细胞的浓度。将50μL细胞转移到96孔板中,每种抗体位于8个孔中。从零时间开始通过添加50μl的BD固定/破膜试剂盒(BD Biosicences.目录号554714)使细胞固定并渗透或将细胞在37℃、5%CO2下孵育持续0.5、1和2小时的时间点。在每次孵育时间,都使用如关于0时间点所示的相同步骤使细胞固定并渗透。在ArrayScan VTI HCS阅读器(版本6,Cellomics,ThermoFisher Scientific,Pittsburgh,PA)上,使用采用40倍物镜的BioApplication“Spot Detector”算法来定量内化速率。用于内化的过滤器设置在下表中示出。每孔中计数至少200个细胞。
表6.用于内化的过滤器设置:
通道 |
靶标 |
标记 |
过滤器 |
1 |
所有细胞的核酸 |
Hoechst 33342 |
DAPI(蓝色) |
2 |
内化斑点 |
Alexa 488 |
FITC(绿色) |
ArrayScan的输出参数算法是“SpotCountPerObjectCh2”。结果报导为每200个细胞的总斑点计数。使用Prism 4.01(GraphPad,SanDiego,CA)进行统计学分析。斑点计数表达为重复测量(n=2)的平均值±平均值的标准误差(SEM)。使用分析工具,使每单位时间的斑点计数(内化速率=T1/2)拟合为单阶段指数关联方程。使用来自GraphPadTM Prism的单阶段指数关联计算内化作用的半衰期。
图9显示抗体2A1在结合H929细胞上的BCMA后易于内化。此进一步证实此抗体的独特属性及其用作靶向BCMA的ADC以通过清除表达BCMA的B细胞来治疗癌症的用途。
实施例6
使用不可裂解的连接子(SMCC)使亲本2A1抗体(SEQ ID NO:287的重链氨基酸序列和SEQ ID NO:288的轻链氨基酸序列)与美登素(DM1)偶联,产生称为2A1-MCC-DM1的ADC。
开发与DM1-SMCC(琥珀酰亚胺基4-[N-马来酰亚胺基甲基]环己烷-1-羧酸酯,其含有NHS酯和马来酰亚胺)的单步骤偶联。DM1-SMCC试剂独立合成并如下文所示用作ADC方法中的单独偶联试剂。通过装载药物美登素,例如且在此情形下为已与连接子偶联的DM1,避免产生大量潜在的过程杂质。
偶联概述:
如下文图示描绘,与SMCC-DM1偶联的抗huBCMA 2A1的单步骤制备。用8、10和12倍摩尔过量的DMA中的连接子-药物(10%)修饰50mM磷酸钾、50mM NaCl、2mM EDTA(pH 7.5中)的2.5mg/mL2A1。在室温下,在震荡器上进行反应持续90min,且随后放置在震荡器上在4℃下过夜孵育。通过HiLoad 16/60SuperdexTM 200除去未反应的连接子-药物。汇集未聚集的部分并在Ultra-15 30kDMWCO离心过滤器上浓缩且接着使用0.22微米的过滤器过滤。
使用质谱法分析各种2A1-MCC-DM1ADC(参见图10)。为简化完整的质量分布,在PBS缓冲液中使用PNGase F(New EnglandBiolabs)、重量比为1/20的酶/底物比在37℃下过夜(16小时)使ADC样本去糖基化。在具有双重雾化器电喷雾离子源的Agilent 6210TOFLC/MS系统中分析20μg去糖基化的ADC样本。将2.1×150mmPursuit二苯基柱、5μM粒度(Agilent Technologies)连接至LC系统并以0.4ml/min操作。柱温度为75℃,溶剂A是水中的0.1%TFA且溶剂B是乙腈中的0.1%TFA。B的梯度百分比在3、5、30、32、33和35min内分别为5-5、5-25、25-80、80-80、80-5、5-。调整TOF质谱仪并在100至10000m/z的范围内校准。TOF MS条件包括毛细管电压为4500V、干燥气体流速为12L/min、干燥气体温度为300℃、雾化器气体流速为40L/min且碎裂电压为350V。通过AgilentMassHunter定性分析程序分析MS数据。
如表7中所示,得到的2A1-MCC-DM1的平均药物:抗体比率(DAR)约为2.8至3.4。
表7.亲本2A1的初步偶联
使用各种连接子和药物自2A1和1E1抗体产生ADC。除了MCC-DM1偶联以外,2A1和1E1抗体与PEG4-Mal-DM4成功偶联。这证实使用连接子和药物技术超过DM1-SMCC方法来制备本文所述的ADC,尤其对于2A1抗体而言。
2A1CV5(Ab-1)的偶联:
基本上如上文所述进行2A1CV5(Ab-1)和2A1CV4抗体与DM1-SMCC的偶联。一般来说,在pH 8.5的缓冲溶液中进行偶联。初始偶联完成后,引入甘氨酸来清除/淬灭未反应的DM1-SMCC和水解不稳定的DM1-MCC偶联物。通过正切流动过滤(TFF)自小分子组分分离ADC。此特定偶联的条件是:将5g/L抗体在50mM硼酸、50mM NaCl、2mM EDTA(pH 8.5)中稀释。加入10倍摩尔过量的DM1-SMCC(在7.5%DMAC中)并在20℃下孵育90分钟。使用200mM在pH 8.0下经历30min淬灭反应。将pH调整至pH 5.2并使溶液经历正切流动过滤以缓冲交换到配制物缓冲液(10mM谷氨酸盐、4%甘露糖醇、2%蔗糖,pH 5.0)中且浓缩至大约11-14g/L。然后将物质在10mM谷氨酸盐、4%甘露糖醇、2%蔗糖、0.01%PS-20(pH 5.0)中稀释到10g/L的最终浓度。2A1CV5(Ab-1)和2A1CV4抗体通过偶联方法可接受且等同地作用。表8概述2A1CV5(Ab-1)和2A1CV4ADC的最终偶联结果。
表8.偶联2A1CV5(Ab-1)和2A1CV4ADC的概述
|
2A1CV4 ADC |
2A1CV5(Ab-1)ADC |
蛋白质 |
1.92g |
2.36g |
DAR |
5.1 |
4.8 |
未偶联的Ab |
3% |
3% |
纯度(聚集体) |
98.2%(1.8%) |
99.4%(0.6%) |
游离DM1物质 |
0.2% |
0.5% |
残余DMAC(溶剂) |
<10ppm |
17ppm |
经过进一步分析,具有高DAR值的ADC在IV pH阶跃测试中具有自溶液沉淀析出的趋势。后续研究确定DAR小于4的ADC在IV pH阶跃测试中未显示观测到沉淀或混浊。使用DAR为3-4的2A1CV5(Ab-1)的进一步偶联研究发现对pH变化稳定。通过减少在偶联过程中所用DM1-SMCC的摩尔当量,实现3至4的所需平均DAR(参见上文)。偶联本文所述抗体(尤其是2A1CV5(Ab-1))的方法包括使用上述“单步骤”方法,这种方法相对于抗体的量使用X倍摩尔过量的偶合前美登素-连接子,尤其是DM1-MCC,其中X可以是3、4、5、6、7、8、9或10和其间的任意值。
实施例7
测试ADC靶向和杀伤表达BCMA的骨髓瘤细胞的能力。发光细胞生存力测定是一种基于定量存在的ATP来确定培养基中活细胞数量的均相方法,这标志着存在代谢活性细胞。测定适用于细胞毒性分析(更多信息参见http://www.promega.com/products/cell-health-assays/cell-viability-assays/celltiter_glo-luminescent-cell-viability-assay/)。使用细胞生存力测定来评估各种ADC在各种多发性骨髓瘤细胞系和B细胞系上的相对杀伤能力。接下来是在Cell Titer-Glo试剂盒(Promega G7572)中提供的实验方案。简而言之,将90ul RPMI 1640、10%FBS中的5×103个靶细胞等分试样到透明、平底、白壁的96孔板(Costar#3903)中。将ADC稀释到10倍储备液中以产生500nM美登素药物等效物。每种ADC从500nM的储备液开始,在RPMI 1640、10%FBS中以2倍稀释连续稀释。将10ul的10×ADC连续稀释液加入到培养基中的90ul细胞中(一式三份的孔)。ADC的最高浓度为约50nM美登素药物等效物,且ADC的最低浓度为约50pM美登素药物等效物。包括同种型对照ADC(与MCC-DM1偶联的抗链霉亲和素huIgG1)以及仅培养基对照。将板在37℃、5%CO2下孵育96小时。孵育之后,向每孔加入100ul底物溶液(Promega G7572)。在EnVisionTM多标记阅读器(PerkinElmer)或分析人员HT酶标仪(Analyst HT plate)(LJLBiosciences)上读取发光。使用GraphPad PrismTM分析数据并对数据绘图以确定ADC在各种癌症细胞系上的相对功效。
在第一次实验中,使两种不同抗体(2A1和1E)与不同的连接子和美登素分子偶联并分析它们杀伤骨髓瘤细胞的能力。尤其在H929骨髓瘤细胞上测试1E1-PEG4-Mal-DM4、1E1-MCC-DM1、2A1-PEG4-Mal-DM4和2A1-MCC-DM1。如图11中所示,PEG4-Mal-DM4和MCC-DM1ADC在选择性地杀伤骨髓瘤细胞方面表现极佳。2A1-PEG4-Mal-DM4ADC具有2.2nM的IC50且2A1-MCC-DM1ADC具有2.4nM的IC50,而1E1-PEG4-Mal-DM4ADC具有680pM的IC50且1E1-MCC-DM1ADC具有630pM的IC50。此数据表明2A1和1E1可成功偶联以产生生物学活性且有效的ADC。此数据也表明2A1ADC的优越性。
接着,针对各种多发性骨髓瘤细胞系测试2A1-MCC-DM1 ADC,所述细胞系包括H929、U266、MMIR、MMIS、EW36B细胞淋巴瘤细胞系和RAMOS伯基特氏淋巴瘤细胞系。作为对照,使各种细胞系暴露于游离的DM1以确定细胞实际上被游离DM1杀伤(参见图13)。如图12A-F中所说明,2A1-MCC-DM1 ADC对杀伤各种骨髓瘤细胞系极为有效且杀伤EW36和RAMOS细胞的程度低得多。IC50(nMDM1)值为:
H929:IC50为0.6nM DM1
U266:IC50为0.8nM DM1
MM1R:IC50为3.9nM DM1
MMIS:IC50为1.0nM DM1
EW36:IC50为30nM DM1
RAMOS:IC50为32nM DM1
实施例8
分析2A1抗体的可导致不良稳定性、潜在聚集、错误折叠等的潜在问题性氨基酸残基。轻链和重链可变区是由源自亲本2A1杂交瘤的独立亚克隆扩增的PCR。确定抗体2A1由VL1/1c/JL3bλ轻链可变区和VH3-15-22/JH4γ可变区组成。将轻链可变区经克隆到具有VK1|O2O12信号肽的λ轻链恒定区上,且将γ链可变区经克隆到具有VK1|O2O12信号肽的IgG1(z)、非-x、非-a恒定区上。基本上如WO 2011/005621中所述,使用标准技术和试剂进行定点诱变。简而言之,通过使用QuikChangeTM定点诱变(Strategene)使用于选择氨基酸的密码子发生突变来产生IgG1变体。通过DNA测序证实预期的突变。使用pTT5瞬时哺乳动物表达载体在293E细胞中表达野生型和突变体蛋白(Durocher Y.等人,Nucleic Acid Research 30(2):E9)。使用标准蛋白-A色谱法(5ml柱,Pierce)纯化突变蛋白。
观测与MCC-DM1偶联的2A1亲本抗体的聚集。对2A1抗体的序列分析识别在VH中107位存在的Cys残基,它变成了Ala(在种系中表示)。另外,识别CDRL1和CDRL3中的三个假定Asn脱酰氨基位点以及CDRH2和CDRL3中的Asp异构化位点。CDRL3和CDRH3也含有倾向氧化的Trp残基。应用几轮协变分析来增加亲本2A1Fab区的稳定性和生物物理学特性(Tm Fab=66℃)。在2A1抗体的可变重链结构域(SEQ ID NO:287)中识别到协变冲突,并设计以下协变突变来校正侵犯型氨基酸:K14Q、R17G、T24A、G32S、F44V、G56S、D84N、F88T、T98A、T107A和S108K;以及在可变轻链结构域(SEQ ID NO:287)中为:E144K。本发明的方面包括具有前述突变的任意组合的2A1抗体。
评估协变冲突(包括非二硫键结的Cys)(10VH,1LC)的产生、与细胞结合和体外ADCC效能。在表9中提供这组2A1突变蛋白。
表9. 2A1突变蛋白序列
使用差示扫描量热法(DSC)来比较亲本和工程化抗体的热稳定性。DSC是用于直接评估样本中在调节温度增加或减小时发生的热能吸收的热力学工具。通常采用DSC来评估蛋白质的热和构象稳定性。蛋白质或个别结构域的熔解温度可由DSC曲线获得,而且如果反应可逆,就可以确定解折叠的热力学参数。当Tm(转变温度)越高,就认为蛋白质越热稳定。当热稳定性数据与其它生物分析方法(如尺寸排阻色谱法(SEC))相比时,观测到较大的热稳定性(较高的Tm)和聚集减少之间的相关性。Tm较高且聚集形成减少的抗体具有长期稳定性改良的潜能,因此可能产生更好的生物治疗剂。
DSC是使用装配有自动进样器的MicroCalTM VP-Capillary DSC系统(GE Healthcare,Piscataway,NJ)来进行。连续测量参照物和样本细胞之间的温度差,并针对供电装置校准。举例来说,将表10中所示的全长抗体在缓冲溶液中稀释至0.5mg/mL。在135μL细胞中以每小时60℃的加热速率从20至110℃测量溶液参照物和蛋白样本。预扫描设定为15分钟,而过滤时间为10秒钟。来自空白缓冲溶液的信号用于基线减除。使用MicroCalTM Origin 7软件进行数据分析。通过针对蛋白质浓度标准化来计算蛋白质熔解期间的热容量。
表10.
如图14A和B中所示,如由Tm所测量,通过定点诱变选择性地工程化的抗体更热稳定。图14B显示三次协变变化导致Tm增加8.2℃。对其它工程化突变蛋白进行进一步研究且结果显示在下表11中。总而言之,此数据显示若干种工程化抗体,尤其是表11中所示的那些抗体(即,Ab-1(2A1CV5))具有与其它抗体相比增加的稳定性。热稳定性增加是药物制剂的一种高度有利的属性。
表11.选定抗体的差示扫描量热法(DSC)结果
为了进一步表征工程化的突变蛋白抗体,通过FACS分析测试它们结合BCMA的能力。使用标准FACs技术测试抗体与在各种细胞上内源性表达的BCMA的结合,这些细胞包括由来自骨髓瘤/浆细胞瘤患者的B-淋巴细胞产生的H929细胞系(ATCC,Manassa,VA)。使用标准方法制备试剂:500mL FACs缓冲液(PBS、1%BSA、5mM EDTA、0.02%NaN3)和FACs阻断缓冲液(30mL FACs缓冲液、5%正常兔血清、5%正常人血清)。将约10至50×106个H929细胞等分试样到标准的96孔板中(优选的是深孔,诸如Corning提供的那些)。调整细胞体积以使所有体积提高到1mL/管w/FACs缓冲液。使细胞在4℃下以1200rpm离心10分钟。除去上清液并在每个管中将细胞沉淀再悬浮于100uL的FACs阻断缓冲液中。将细胞在冰上孵育30至60分钟。通过在FACS阻断缓冲液中,以每毫升抗体10ug开始(举例来说),最终体积为100ul来制备抗体的1:3连续稀释液的预混物来制备BCMA抗体。将阻断的细胞在4℃下以1200rpm离心10分钟。除去上清液并将细胞沉淀再悬浮于100uL含有BCMA抗体的FACs阻断缓冲液中。将细胞在冰上孵育60分钟。孵育之后,向每个管中加入1mL的冷FACs阻断缓冲液。将细胞在4℃下以1200rpm离心10分钟。除去上清液并将细胞沉淀再悬浮于100uL以1:100在FACs阻断缓冲液中稀释的含有生物素化抗huIgG的FACs阻断缓冲液中(Jackson Labs,BarHarbor,Me,目录号109-065-098)。将细胞在冰上孵育45分钟。孵育之后,向每个管中加入1mL的冷FACs阻断缓冲液。将细胞在4℃下以1200rpm离心10分钟。除去上清液并将细胞沉淀再悬浮于100uL以1:100在FACs阻断缓冲液中稀释的含有链霉亲和素-藻红蛋白(SA-PE)偶联物的FACs阻断缓冲液中(BD Pharmingen,San Diego,CA,目录号554061)。将细胞在冰上孵育45分钟。孵育之后,向每个管中加入1mL的冷FACs阻断缓冲液。将细胞在4℃下以1200rpm离心10分钟。除去上清液并将细胞沉淀再悬浮于每管0.2mL的PBS中的4%多聚甲醛中并通过流式细胞术进行分析。
在初步研究中,如上所述通过流式细胞术测试2A1-C107T、2A1-S108R和2A1-C107T+S108R突变蛋白与人骨髓瘤细胞(H929细胞)上的BCMA的结合。图15显示2A1亲本抗体和三种突变蛋白之间在H929细胞上与BCMA的结合相当。接下来通过流式细胞术测试较大组的2A1突变蛋白(即,表9中所列的那些突变蛋白)结合H929细胞上的BCMA。图16A和B显示一些2A1突变蛋白抗体与BCMA的结合保持相对于亲本2A1(2A1WT)相当,而2A1协变3、8、9和11-19抗体与BCMA的结合减小。
另一个重要的考虑因素是诱变对抗体ADCC活性的影响且因此使用标准方法测试各种突变蛋白抗体的相对ADCC活性。靶细胞H929(具有相对高水平的BCMA表达)和JD38(具有相对低水平的BCMA表达)。JD 38是源自在患有复发性未分化的非伯基特淋巴瘤的男性儿童的外周血液中循环的肿瘤细胞的爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)-阴性细胞系。H929和JD38都用钙黄绿素-AM标记。收集H929和JD38并以每毫升2×106个细胞再悬浮于cRPMI-10培养基(RPMI(LifeTechnologies,Carlsberg,CA)+10%胎牛血清)中。将在无水DMSO中4mM的钙黄绿素-AM(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)添加至10μM的最终浓度(1:400稀释)。将细胞在37℃下孵育30分钟,接着在PBS中洗涤两次(1500rpm,在4℃下,每次5分钟)。将沉淀再悬浮于cRPMI-10中并调整至每毫升0.2×106个细胞的浓度且放置在冰上以供下一步使用。首先自10ug/ml开始,以10倍连续滴定将各种2A1突变蛋白抗体添加到U形底的96孔板(BD,Franklin Lakes,NJ)中。利妥昔单抗(Genentech,South San Francisco,CA)在使用时作为基准抗体对照物。来自先前的钙黄绿素-AM标记靶细胞随后加入每个孔中(每孔10,000个细胞)并与抗体在37℃下孵育20分钟。制备效应细胞:将NK细胞或PBMC在4℃下以1500rpm沉淀5分钟并再悬浮于cRPMI-10中,对于NK细胞而言达到每毫升4×106个细胞或对于PBMC而言达到每毫升20×106个细胞的最终细胞浓度。孵育之后,向每孔中加入50μl浓度为每毫升4×106个细胞的NK细胞或浓度为每毫升20×106个细胞的PBMC并在37℃下孵育4小时。孵育之后,通过向每孔中加入20μl 9%NP-40(IGEPAL CA630,Sigma-Aldrich)来刺激100%溶解来制备对照孔。所有其它孔每孔只接受20μl cRPMI-10培养基。将板在4℃下以800RPM旋转4分钟。除去上清液(150μl)并转移到透明底的黑色96孔板(Corning,Lowell,MA)中并在酶标仪(Molecular Devices,Spectra max GEMINI)上读取荧光,激发485、发射535。根据(样本值-自发溶解)/(100%溶解-自发溶解)×100来计算最大溶解百分比。
在初步研究中,如上所述测试2A1-C107T、2A1-S108R和2A1-C107T+S108R突变蛋白的ADCC活性。图17和表12(概述了2A1突变蛋白的EC50(ng/ml))显示2A1亲本抗体与三种突变蛋白之间的ADCC活性相当。接下来测试较大组的2A1突变蛋白(即,表9中所列的一些突变蛋白)的ADCC活性。图18A、18B、19A和19B和表13显示一些2A1突变蛋白抗体保持相对于亲本2A1(2A1WT)而言相当的ADCC活性,而一些2A1协变具有相对于亲本2A1而言减小的ADCC活性。
表12. 2A1突变蛋白的ADCC EC50(ng/ml)
|
EC50(ng/ml) |
2A1亲本 |
29 |
2A1C107T |
31 |
2A1S108R |
43 |
2A1C107T+S108R |
49 |
表13. 2A1突变蛋白的ADCC EC50(ng/ml)
另一个考虑因素是诱变对工程化抗体表达水平的影响。使用自动24孔转染实验方案在293-6E哺乳动物细胞中瞬时表达表9中所列的抗体。使用以下实验方案:
试剂:
-标准化为20ng/uL的DNA
-25kDa线性PEI MaxTM(Polysciences,目录号24765)转染试剂(3mg/mL储备液)
-2936E细胞,每毫升1e6个细胞且生存力>98%
生长和转染培养基:
-生长培养基:1L 293FreestyleTM培养基(Life Technologies,目录号12338-018),补充有10mL普朗尼克(Pluronic)F68(Life Technologies,目录号24040)和0.5mL遗传霉素(50mg/mL,Life Technologies,目录号10131)
-蛋白胨重新填料:Difco TC Yeastolate UF储备液20%w/v(BDBiosciences,目录号292805)
供应商:
-高压蒸汽处理的24深孔板:Seahorse Bioscience 201272-100(Fisher 50 995 855)
-高压蒸汽处理的u形烧瓶盖
-96孔costar 3799培养板(Fisher 07 200 95)
自动转染方法:
在Vi-Cell(Beckman Coulter)上测量活细胞密度(VCD),目标是每毫升约1×106个细胞的VCD和大于98%的生存力。每毫升培养物加入0.25ug DNA。将50uL标准化汇集的HC/LC DNA转移到24孔培养板中(1ug总的DNA)。向24孔培养板中加入200uL培养基(未补充293Freestyle)+7ug PEI(1:7DNA:PEI比率)。向板中加入DNA,接着加入培养基+PEI。使DNA/培养基/PEI复合10分钟。通过将4mL约每毫升1×106个细胞的2936E细胞悬浮液等分试样为4.25mL的最终体积将细胞分配到板中。将细胞放置在具有无菌u形烧瓶盖的KuhnerTM恒温器中。在转染后1-4小时通过添加20%w/v Yeastolate至0.5%w/v的最终浓度用基于蛋白胨的培养基重新填料。通过在37℃和5%CO2下将细胞放置在240rpm的定轨振荡器上使细胞返回恒温器以用于生产阶段。使细胞在生长培养基中传代并测量VCD以使细胞保持在对数期(每毫升约1.5×105至2×106个细胞)。细胞大约每隔一天传代一次。在第6天通过使板以3000rpm旋转10分钟并将上清液转移到新的板来收集上清液。
使用再生实验方案的对准蛋白A基本定量在ForteBio OctetQKeTM上分析IgG水平。
材料:
-黑色平底测定板(来自Greiner Bio-One的BLK NS 96孔半区域平底PP微量滴定板,制造商部件号675076,Fisher-Scientific部件号_NC9624456)
-中和缓冲液(ForteBio稀释剂-PBS,pH 7.4,具有0.1%BSA、0.02%0.05%叠氮化钠),在4℃下
-再生缓冲液(瞬时洗提缓冲液-10mM甘氨酸、150mM NaCl、pH 2.0)
使用蛋白A传感器来定量人IgG。标准曲线(STD CRV)在1-500ug/mL范围内运行。将传感器预浸在ForteBio稀释剂中。通过向黑色测定板的孔中加入100uL Fortebio稀释剂并将传感器的齿条安置在黑色测定板的顶部来制备每个样本一个传感器。测定之前使传感器浸泡至少10min。制备同种型匹配的标准对照物(huIgG1)。通过一式两份向柱2-10加入100uL ForteBio稀释剂且向柱1加入200uL在ForteBio稀释剂中稀释至500ug/mL的对照抗体来在测定板中滴定对照抗体。进行连续稀释(100uL,从柱1至柱10),产生具有以下浓度的标准曲线:500、250、125、62.5、31.25、15.63、7.81、3.91、1.95、0.98ug/mL。在单独的黑色测定板中,通过将培养基在Fortebio稀释剂中稀释到100uL的总体积来制备抗体样本。所用的软件是“DataAcquisition 7.0”和“Basic Quantitation with Regeneration”。“测定设定”经过设定以使‘时间(s)’域设定为120秒钟且‘振荡速度’域设定为400。‘再生’和‘中和’步骤的‘时间(s)’域设定为5秒钟,‘振荡速度’为400。经过“DataAnalysis 7.0”软件对测定结果进行分析。
图20显示表9中所列协变突变蛋白抗体的表达效价,以ug/ml计。若干种协变突变蛋白显示提高的表达水平。许多协变突变蛋白展示可接受的表达水平。
对其它2A1协变突变蛋白进行进一步分析。使用上述方法测试表14中的2A1突变蛋白(列举为“变体”)的Tm,以及用于评估产率(mg/L)。此数据显示C107A的Tm略优于C107S和C107T变体,但都是可接受的。
表14. 2A1协变突变蛋白抗体的产率/L和Tm
为确保最近一轮的协变突变蛋白抗体保持所需的生物活性,使用两种不同的细胞系对其它2A1突变蛋白进行BCMA-结合和ADCC活性。使用上述测定,测试以下2A1突变蛋白在H929骨髓瘤细胞系(对BCMA具有相对高的表面表达)和JD38细胞系(对BCMA具有相对低的表面表达)上与BCMA结合。测试以下协变突变蛋白2A1抗体:2A1(C107T)、2A1(R17G、C107A)、2A1(F88T、C107A)、2A1(T24A、C107A)、2A1(T24A、F88T、C107A)、2A1(R17G、F88T、C107A)、2A1(R17G、T24A、C107A)和2A1(R17G、T24A、F88T、C107A)。图21A和B显示协变突变蛋白与在髓骨瘤细胞上表达的BCMA保持结合且在所测试的抗体之间存在少量结合差异。图22A和B显示协变突变蛋白与在两种癌症细胞系上表达的BCMA保持ADCC活性。
使用上述测定对来自第二方案的抗体进行表征和序列工程化。如上所述由纯化的杂交瘤上清液制备其它Xenomouse人单克隆抗体(IgG2或IgG4抗huBCMAmAb 30E1.1、29C12.1、29G5.1、32B5.1、32H3.1、33C7.1、33D4.1、35D2.1、37B2.1和40D7.1)。如本文所述,进一步分析这些抗体结合经过瞬时转染来表达猕猴BCMA的293T细胞上的猕猴BCMA。图23显示此选定组的抗体与猕猴BCMA显示交叉反应性且十分之七的抗体具有比2A1抗体更高的与猕猴BCMA的结合。这组抗体经过进一步表征结合多发性骨髓瘤细胞系H929上的huBCMA。图24显示存在宽的结合谱,进一步证实获取与huBCMA具有充分结合能力的人单克隆抗体不可预测或并非常规。
基本上如实施例6中所述由纯化的杂交瘤上清液制备其它Xenomouse人单克隆抗体的抗体-药物-偶联物(抗huBCMA mAb30E1.1、29C12.1、29G5.1、32B5.1、32H3.1、33C7.1、33D4.1、35D2.1、37B2.1和40D7.1)。使用实施例10中所述的发光细胞生存力测定测试这些ADC靶向和杀伤表达huBCMA的骨髓瘤细胞(H929细胞系)的能力。图25A和25B显示29C12.1、29G5.1、32B5.1、33C7.1、35D2.1、37B2.1和40D7.1ADC对表达huBCMA的骨髓瘤靶细胞显示细胞毒性。
来自第二方案的抗体组被转化成人IgG1同种型。如上所述分析序列的协变冲突。表15概述所列抗体的取代清单。
表15.第二方案抗体的协变分析
通过定点诱变开发多种协变体并通过各种方式(如上文所述)进行分析。表16概述序列变化、效价、产率、纯度和Tm。值得注意的是,29C12(LC:N69Q)和32B5(HC:A11G、H92Q、S97R;LC:N69Q、F103V)协变体的效价、产率和Tm显著增加。表17提供全长轻链和重链的氨基酸序列。
表16.第二方案抗体的协变突变蛋白的表征
表17.协变突变蛋白抗体的氨基酸序列
测试来自上述第二方案的若干种协变抗体的功能活性来评估诱变对生物活性的影响。图26显示各种候选抗体(包括来自第二方案的一些协变抗体)对于结合H929细胞上的huBCMA而言的结合相当。基本上如实施例6中所述产生以下抗体的ADC:32B5亲本、32B5(V1D)、32B5(I5T)、32B5(A11G、S97R、F103V)、32B5(A11G、H92Q、S97R、F103V)、35D2/32B5(N69Q)、37B2/35B5(N69Q)、29C12(N69Q)和29C12/40D7(N69Q)。使用实施例10中所述的发光细胞生存力测定测试这些ADC靶向和杀伤表达BCMA的骨髓瘤细胞(H929细胞系)的能力。图27显示各种ADC对H929细胞的相对杀伤性。图28显示来自第二方案的大多数协变抗体保持结合猕猴BCMA(经过瞬时转染的293T细胞)的能力。
如本文所述具有最佳特性的协变突变蛋白的重链和轻链可变结构域的序列比对在图41A和B中提供(29C12cv1是Ab-8,29C12cv2是Ab-2,32B5cv1在表11中提供为SEQ ID NO:315-320,32B5cv2是Ab-3,2A1cv4在表11中提供为SEQ ID NO:309-314且2A1cv5是Ab-1)。此表明在2A1相对于29C12和32B5协变突变蛋白之间存在显著的序列分歧。亲本抗体可变轻链和重链结构域序列的分支进一步说明2A1抗体相对于来自第二方案的29C12、32B5和其它抗体之间的差异(图42A和42B)。CDR或抗体互补位的此序列差异证实抗体的两个分支可能结合huBCMA上的不同表位。
实施例9
以下实施例显示抗BCMA ADC抑制H929骨髓瘤细胞在异种移植皮下肿瘤模型中生长。大多数多发性骨髓瘤肿瘤细胞存在于骨髓中且肿瘤负荷与溶骨性骨病相关。另外,骨髓基质细胞和破骨细胞可保护多发性骨髓瘤肿瘤细胞免受化学治疗。参见Dougall,WC等人,RANKL is a therapeutic target in multiple myeloma,Roodman-GD编,Myeloma Bone Disease.Humana Press.2010:169-182。已报道NSG/NOG小鼠模型是多发性骨髓瘤细胞在骨中生长的一种改良宿主(Miyakawa-Y等人,BBRC 313(2004)258-262)。NSG小鼠模型也已经过优化用于荧光素酶标记而用于生物发光成像和离体选择以供增加肿瘤获取和生长速率(参见实施例10)。使用生长因子减少的MatrigelTM(BD Biosciences)将5×106个H929人骨髓瘤细胞经皮下植入雌性NSG(NOD/SCID IL2Rg-/-)小鼠体内以产生肿瘤异种移植用于功效研究。H929细胞每个细胞平均表达约24,000个BCMA位点。当肿瘤大小达到平均约150mm3时,开始用2A1-MCC-DM1或对照偶联物(抗链霉亲和素-MCC-DM1)进行治疗。将携带肿瘤的动物根据肿瘤大小随机分组,每组十只动物并通过静脉内给药一次。在20-200ug DM1/kg(1-10mgAb/kg)范围内的剂量下进行2A1-MCC-DM1的盲剂量反应研究。在研究过程中,任何给药组中都未观测到体重损失。不提供营养补充。
如图29中所示,用2A1-MCC-DM1治疗显示在200ug DM1/kg(10mg Ab/kg)高剂量下的稳固肿瘤生长抑制作用和在67ug DM1/kg(3mg Ab/kg)中等剂量下的适度肿瘤生长抑制作用。此数据证实2A1-ADC在本领域认可的多发性骨髓瘤动物模型中的体内功效。
实施例10
测试2A1CV5-MCC-DM1、32B5-MCC-DM1和29C12-MCC-DM1ADC靶向和杀伤表达BCMA的骨髓瘤细胞(H929)的能力。发光细胞生存力测定是一种基于定量存在的ATP来确定培养基中活细胞数量的均相方法,这标志着存在代谢活性细胞。测定适用于细胞毒性测定(更多信息参见http://www.promega.com/products/cell-health-assays/cell-viability-assays/celltiter_glo-luminescent-cell-viability-assay/)。使用细胞生存力分析来评估各种ADC对各种多发性骨髓瘤细胞系和B细胞系的相对杀伤能力。接下来是在Cell Titer-Glo试剂盒(Promega G7572)中提供的实验方案。简而言之,将90ul RPMI 1640、10%FBS中的5×103个靶细胞等分试样到透明、平底、白壁的96孔板(Costar#3903)中。将ADC稀释到10倍储备液中以产生500nM美登素药物等效物。每种ADC从500nM的储备液开始,在RPMI 1640、10%FBS中以2倍稀释连续稀释。将10ul的10×ADC连续稀释液加入到培养基中的90ul细胞中(一式三份的孔)。ADC的最高浓度为约50nM美登素药物等效物,且ADC的最低浓度为约50pM美登素药物等效物。包括同种型对照ADC(与MCC-DM1偶联的抗链霉亲和素huIgG1)以及仅培养基对照。将板在37℃、5%CO2下孵育96小时。孵育之后,向每孔加入100ul底物溶液(Promega G7572)。在EnVisionTM多标记阅读器(PerkinElmer)或分析人员HT酶标仪(LJLBiosciences)上读取发光。使用GraphPad PrismTM分析数据并对数据绘图以确定ADC对各种癌症细胞系的相对功效。
图30显示所有三种ADC与对照偶联物相比都是H929细胞生长的有效抑制剂。2A1CV5-MCC-DM1(具有234pM的IC50)展现效能与关于32B5-MCC-DM1和29C12-MCC-DM1(分别具有506pM和390pM的IC50)观测到的效能相比增加2-3倍。
实施例11
以下实验进一步表征Ab-1(2A1CV5)ADC(本文中也称为2A1CV5-MCC-DM1)并提供在多发性骨髓瘤细胞(H929)中BCMA介导的内化作用的证据。使用本文所述的测定方法,发现完全人抗huBCMA抗体2A1CV5以比关于完全人抗BCMA抗体32B5和29C12观测到的亲合力好3倍的亲合力结合在人多发性骨髓瘤细胞系H929上表达的天然人BCMA。如由流式细胞术所评估,2A1CV5-MCC-DM1抗体药物偶联物(ADC)展示一定量级的与天然人BCMA结合,这与未偶联2A1CV5观测到的结合类似。关于2A1CV5观测到的结合EC50比关于2A1CV5-MCC-DM1观测到的结合好两倍,而32B5-MCC-DM1与天然BCMA的结合EC50比关于32B5观测到的结合EC50低约2倍(表18)。通过使用BiacoreTM相互作用技术(如本文所述)测量2A1(2A1CV5同样地结合)和32B5结合重组可溶性人BCMA的能力来确定它们平衡结合的准确测量。结果表明2A1CV5以两位数的pM亲和力结合重组人BCMA。
表18. 2A1CV5和32B5与其MCC-DM1偶联配对物的结合对比
将2A1CV5-MCC-DM1内化到H929细胞中的能力与未偶联的2A1CV5的内化作用相比较。
材料
-抗链霉亲和素-MCC-DM1(αSA-MCC-DM1,具有4.5的DAR)
-2A1CV5-MCC-DM1(DAR4.8)
-肿瘤细胞,H929在生长培养基:RPMI 1640+10%FBS+MEM非必需氨基酸+HEPES+β-巯基乙醇+Pen/Strep+L-谷氨酰胺+丙酮酸钠+艮他霉素中培养。
-山羊抗人IgG(H+L)、Alexa 488(Molecular Probes Inc.,Eugene,OR.目录号A11013)。
-Hoechst 33342(Molecular Probes Inc.,Eugene,OR.目录号H21492)。
在生长培养基(RPMI 1640、10%FBS、MEM非必需氨基酸、HEPES、β-巯基乙醇、Pen/Strep、L-谷氨酰胺、丙酮酸钠、艮他霉素)中培养H929骨髓瘤肿瘤细胞。将H929细胞以每管约500,000个细胞收集到两个3-ml的FACS管中并用测定培养基(含有2%FBS的PBS)洗涤一次。将细胞与2A1或CD138抗体以每管每毫升10μg(每管200μL)悬浮在测定培养基中。在4℃下孵育30分钟后,将细胞用测定培养基洗涤一次。向细胞中加入抗人IgG、Alexa 488(MolecularProbes Inc.,Eugene,OR.目录号A11013,在测定培养基中以1:1,000稀释)和Hoechst 33342(Molecular Probes Inc.,Eugene,OR,目录号H21492,在测定培养基中以1:2000稀释)的混合物。将细胞在4℃下孵育15分钟后,将细胞洗涤一次且随后用0.5ml的测定培养基再悬浮以达到每毫升1×106个细胞的浓度。将50μL细胞转移到96孔板中,每种抗体位于8个孔中(参见下文表19)。从零时间开始通过添加50μl的BD固定/破膜试剂盒(BD Biosicences.目录号554714)使细胞固定并渗透或将细胞在37℃、5%CO2下孵育持续0.5、1和2小时的时间点。在每次孵育时间,都使用如关于0时间点所示的相同步骤使细胞固定并渗透。在ArrayScan VTI HCS阅读器(版本6,Cellomics,Thermo Fisher Scientific,Pittsburgh,PA)上,使用采用40倍物镜的BioApplication“Spot Detector”算法来定量内化速率。用于内化的过滤器设置在下表中示出。每孔中计数至少200个细胞。
表19.
表20.用于内化作用的过滤器设置:
通道 |
目标 |
标记 |
过滤器 |
1 |
用于所有细胞的核酸 |
Hoechst 33342 |
DAPI(蓝色) |
2 |
内化斑点 |
Alexa 488 |
FITC(绿色) |
ArrayScan的输出参数算法是“SpotCountPerObjectCh2”。结果报导为每200个细胞的总斑点计数。使用Prism 4.01(GraphPad,SanDiego,CA)进行统计学分析。斑点计数表达为重复测量(n=2)的平均值±平均值的标准误差(SEM)。使用分析工具,使每单位时间的斑点计数(内化速率=T1/2)拟合为单阶段指数关联方程。使用来自GraphPadTM Prism的单阶段指数关联计算内化作用的半衰期。
内化到H929细胞中的水平和速率与2A1CV5和2A1CV5-MCC-DM1类似,达到在孵育开始后约30分钟时的最大内化水平的一半(图31)。另外,2A1CV5-MCC-DM1内化到MM1R多发性骨髓瘤细胞系中的速率接近H929,达到在孵育开始后约50分钟时的最大内化水平的一半。这些结果证实在与BCMA结合后,2A1CV5-MCC-DM1可快速内化到表达BCMA的细胞中。
使用本文所述的测定测试2A1CV5 ADC杀伤各种多发性骨髓瘤细胞系的能力。如表21中所示,2A1CV5 ADC能有效杀伤多种具有广泛范围BCMA细胞表面表达的多发性骨髓瘤细胞系。
表21. 2A1-CV5-MCC-DM1杀伤若干种多发性骨髓瘤细胞系
实施例12
评估Ab-1(2A1CV5)ADC的体内药理学。这些实验显示Ab-1(2A1CV5)ADC在H929向骨性异种移植模型中介导肿瘤消退。简而言之,将每个细胞平均表达约24,000个BCMA位点的H929荧光素酶标记的骨髓瘤细胞通过静脉内(1×106个细胞)施用到NSG小鼠体内。肿瘤接种后14天,基于后肢生物发光(肿瘤负荷)将携带肿瘤的动物随机分组,每组十只动物并通过静脉内给药一次。在此确定的向骨性肿瘤模型中采用250ug DM1/kg(10mg Ab/kg)的单一剂量进行2A1CV5-MCC-DM1、未偶联的2A1CV5和对照偶联物的盲给药研究。不提供营养补充。
研究设计:
·1×106个细胞H929-luc细胞,静脉内
·在第14天由后肢BLI确定的分成等组的小鼠
·在第14天以10mg/kg静脉内抗体的单次治疗
·每周2次测量BLI(盲)
·研究终点第35天
·在1/13/11对80NSG(NOD/SCID IL2Rg-/-)小鼠静脉内注射1×106个H929luc细胞
·每周测量两次BLI
·在第14天,如BLI所测量,基于后肢肿瘤负荷将小鼠分成五个相等的组(n=10)
·治疗计划:一次静脉内注射
·盲治疗组且包括:
·媒介物(PBS)
·抗huBCMA-huIgG1-2A1-CV5(未偶联)
·抗huBCMA-huIgG1-2A1-CV5-MCC-DM1
·抗huBCMA-huIgG1-2A1-WT-MCC-DM1
·抗链霉亲和素-MCC-DM1
·以10mpk使用的抗huBCMA-2A1-CV5-MCC-DM1
·基于2A1-CV5-MCC-DM1在10mpk下的美登素类化合物药物当量来标准化抗huBCMA-2A1-WT-MCC-DM1和抗链霉亲和素-MCC-DM1
·时间安排:注射H929luc细胞,ADC治疗在第14天开始,在第35天进行分析
图32显示在用2A1-MCC-DM1或2A1CV5-MCC-DM1以250ugDM1/kg单次治疗后观测到完全肿瘤消退。在以与偶联物相同的抗体剂量下用未偶联的2A1CV5单次治疗后,可见中等的肿瘤生长抑制作用。另外,在用2A1CV5-MCC-DM1治疗的小鼠体内未观测到溶骨性病变,但在接受媒介物(PBS)或同种型对照偶联物(抗链霉亲和素-MCC-DM1)的小鼠体内观测到溶骨性病变。在用对照偶联物或媒介物治疗的动物体内未检测到抗肿瘤作用。在研究过程中,任何给药组中都未观测到体重损失。
在与上文类似的另一骨髓瘤向骨性异种移植模型中,将每个细胞平均表达9,000个BCMA位点的由U266荧光素酶标记的骨髓瘤细胞通过静脉内(1×106个细胞)施用到NSG小鼠体内。肿瘤接种后28天,基于后肢生物发光(肿瘤负荷)将具有肿瘤的动物随机分组,每组十只动物,并如红色Rx符号所示通过静脉内或腹膜内给药。在此确定的向骨性肿瘤模型中,采用在第28天施用的250ug DM1/kg(10mgAb/kg)的单一剂量进行2A1CV5-MCC-DM1、未偶联的2A1CV5和PBS的盲给药研究。安乐死后,对动物拍射线照片。使后肢脱节、固定在10%中性缓冲福尔马林(formalin)中并脱钙。接着处理骨骼、包埋、切片,并用H&E、TRAP染色对来自每只动物的单一代表性骨骼进行染色且用于huCD138表达(IHC)。通过显微镜检查骨切片来确定是否存在残余疾病(huCD138+细胞)并评估TRAP+破骨细胞对髓腔和骨针表面的覆盖程度。
异种移植细胞使得正常小鼠的骨髓细胞群体被湮没。具有大肿瘤负荷的动物似乎具有增加数量的TRAP+破骨细胞,沿骨髓腔排成一行并覆盖骨针。在具有活性异种移植体的动物中,赘生细胞有时横穿骨皮质的宽度并到达骨膜。通过髓内TRAP+破骨细胞的减少和存在正常小鼠骨髓表征治疗成功。通过静脉内或腹膜内途径递送的抗体2A1CV-MCC-DM1在以单次注射形式递送时完全治愈小鼠的疾病。未偶联的抗体2A1CV减缓肿瘤生长,但未治愈动物疾病。先前经过2A1CV或媒介物(在第28天)治疗的动物接着经抗体2A1CV-MCC-DM1(在第63天和第84天)治疗,使疾病完全治愈。TRAP+破骨细胞在具有显著肿瘤负荷的动物体内比在经过成功治疗的动物体内似乎更充足。在以250ug DM1/kg通过任一途径施用2A1CV5-MCC-DM1单次治疗后,观测到肿瘤完全消退(图33)。在用未偶联的2A1CV5治疗的动物体内观测到肿瘤生长适度减少。在肿瘤接种后第63天,接着将经过PBS或未偶联的2A1CV5治疗的动物随机分成两组,每组5只动物,且随后以10mgAb/kg通过静脉内再施用一次2A1CV5-MCC-DM1治疗。2A1CV5-MCC-DM1治疗在具有比在肿瘤接种后第28天开始治疗时大2个等级幅度的肿瘤负荷的这些组动物中引发稳固的肿瘤消退(图33)。这些结果显示2A1CV5-MCC-DM1能在U266人骨髓瘤向骨性模型中介导显著的肿瘤消退,在U266人骨髓瘤向骨性模型中,肿瘤表达比在H929向骨性骨髓瘤异种移植模型中几乎低3倍的平均受体密度。
实施例13
通过流式细胞术,采用不与BAFF-R或TACI交叉反应的BCMA选择性单克隆抗体(2A1CV4)对42个原发性骨髓瘤患者样本评估BCMA蛋白表达。样本从商业来源(AllCells,Conversant,Proteogenex)获得以每个样本获取约1×106个浆细胞。个别多发性骨髓瘤(MM)样本在室温(RT)下轻柔解冻。将解冻细胞在RT下逐滴加入4ml的50%FBS(胎牛血清)RPMI缓冲液中。向细胞悬浮液中加入3ml的10%FBS RPMI。将细胞悬浮液轻柔颠倒进行混合并低速离心使细胞沉淀。抽吸培养基并将细胞沉淀再悬浮于1%FBS PBS(磷酸盐缓冲盐水)中。在血细胞计数器上对细胞手动计数。将细胞添加至10FBS RPMI中并使其在37℃和5%CO2下在恒温器中恢复1hr。如下评估细胞生存力。将来自初始MM和H929细胞系的细胞以每孔200,000个细胞铺板在具有新鲜的10%FBS RPMI缓冲液的96孔板中,每种样本5个孔。使板离心来沉淀细胞并抽吸培养基且再悬浮于PBS中三次。根据制造商实验方案用紫色活细胞/死细胞染色剂(MolecularProbes-L34955)对细胞进行染色并在RT下在黑暗中孵育30分钟。随后使板离心来沉淀细胞并抽吸培养基且再悬浮于10%FBS RPMI中三次。如下评估内化/免疫表型(IP)。向每种样本的一个孔中加入抗BCMA-pHrodo或抗CD38-pHrodo试剂且所有样本都在37℃和5%CO2下孵育。4小时后,使板离心来沉淀细胞并抽吸培养基且再悬浮于PBS中三次。在三个未经处理的孔中,向每种样本的一个孔和所有样本中加入抗BCMA-pHrodo、抗BCMA-DyLight488或抗CD38-pHrodo试剂。所有孔都用IP组(CD19PE-Cy5、CD56PE-Cy7、CD38 A594、CD138 APC、CD45 APC-H7,参见表22)染色。将板在4℃下孵育1hr。如下进行固定和分析。所有孔都固定在1%多聚甲醛中。使用LSRII(BD Bioscience)评估每个孔的细胞并产生FCS文档。使用以下门控进行浆细胞识别:门控样本的生存力;选择副门控别用于CD138/CD38表达;产生关于BCMA表达和内化以及CD38内化且最终关于FMO对照物的直方图;且输出细胞计数或MFI用于在ExcelTM和GraphPadTM中综述分析和图示表示(参见图34A和34B)。
表22.
流式细胞术结果证实评估的98%(42个中的41个)多发性骨髓瘤患者样本表达可检测的BMCA蛋白。如图35中所示,测试的所有29种骨髓瘤患者样本(总计42种样本中的子集)与FMO对照物(黑色条)相比表达可检测的BCMA表达(绿色条)。此数据进一步证实BCMA在来自多发性骨髓瘤患者的分离细胞上表达且用作使用本文所述的BCMAADC进行治疗干预的优良目标。此数据也证实2A1抗体及其突变蛋白能结合几乎所有的多发性骨髓瘤患者样本上的BCMA。
通过对来自如上所述的骨髓单核细胞制剂的CD138+浆细胞部分进行流式细胞术来评估2A1抗体(2A1CV4)在多发性骨髓瘤患者样本上的内化作用。图36显示BCMA抗体(2A1CV4-pHrodo标记)在所有29种多发性骨髓瘤患者样本中都有效内化。此数据也证实2A1抗体及其突变蛋白能结合BCMA并在所测试的所有多发性骨髓瘤患者样本上都有效内化。
实施例14
开发一种使用抗DM1特异性单克隆抗体作为检测试剂的基于流式细胞术的内化测定来评估2A1CV5-MCC-DM1(Ab-1ADC)是否能将DM1递送至由多发性骨髓瘤患者的骨髓获得的原发性骨髓瘤肿瘤细胞中。使用表达相对低水平的BCMA的人骨髓瘤肿瘤细胞系MM1R作为相对阳性对照物来评估是否由2A1CV5-MCC-DM1递送足够的DM1到细胞中来诱发细胞死亡。图37显示2A1CV5-MCC-DM1将DM1递送到原发性骨髓瘤骨髓单核肿瘤细胞(BMMC)样本和MM1R骨髓瘤细胞系中(MM1R和BMMC#12的远端右侧直方图中的峰与其紧接左侧的对照直方图相比向右迁移,表明DM1已内化到细胞中)。在所检查的13种可评估的原发性多发性骨髓瘤患者BMMC样本中,2A1CV5-MCC-DM1向所有13种患者样本中递送不同水平的DM1。此数据为2A1CV5 ADC结合BCMA、被内化且选择性地杀伤原发性多发性骨髓瘤患者样本提供明确证据。
实施例15
研究人IgG游离轻链(κ)作为Ab-1(2A1CV5)ADC实验的体内药理学部分的潜在生物标记,表明Ab-1(2A1CV5)ADC在H929向骨性异种移植模型中介导肿瘤消退(参见实施例12)。人免疫球蛋白分子由定义类别(IgG、IgA、IgM、IgD、IgE)的两条重链和相同的轻链(κ或λ)组成。在健康个体中,血清中的大部分轻链结合重链存在。游离轻链(FLC)是B淋巴细胞的天然产物且代表赘生性和反应性B细胞相关病症的独特生物标记。FLC增加与各种恶性血浆病症相关。检测FLC是用于包括多发性骨髓瘤、冒烟型骨髓瘤和意义未明的单克隆丙种球蛋白病等各种疾病的一种重要诊断辅助手段。人IgG FLCκELISA(Biovendor,RD 194088100R-K)用来分析在来自H929异种移植物的血清中是否存在FLC。在用2A1CV5-MCC-DM1治疗18天后的小鼠血清中未检测到κ轻链抗体,但在接受媒介物(PBS)或同种型对照偶联物(抗链霉亲和素-MCC-DM1)的小鼠血清中有检测到(参见图38和39)。
实施例16
测定与重组人(rhu)BCMA和重组大鼠(rrat)BCMA结合的Ab-1(即,2A1CV5)、Ab-2(即,29C12_mut)和Ab-3(即,32B5_mut)的缔合和离解速率常数(ka、kd)以及离解平衡结合常数(Kd)。
测定条件:在25℃下在HBS-P缓冲液系统(10mM HEPES pH7.4、150mM NaCl和0.5%表面活性剂P20)中,使用装配有CM5传感器芯片的Biacore T200光学生物传感器,根据制造商的通用实验方案进行生物传感器分析。使自动进样器维持在8℃下。
表面制备:使用标准胺偶联化学方法(9,000RU),使山羊抗人IgG捕集抗体(Jackson Laboratories;109-005-098)固定至传感器芯片的所有流动细胞。此表面类型提供一种在每次再生步骤后可重复捕集新鲜分析抗体(配体)的形式。
配体制备:使用流动细胞1、2和3来分析捕集的抗BCMA抗体(约400-500RU),同时使用流动细胞4作为参照流动细胞。
分析物制备:在运行的缓冲液中制备在75.0至0.309nM范围内的六种rBCMA浓度(3倍稀释)。rrat BCMA融合蛋白(GS::6xHis::Sumo::ratBCMA(aa 2-49)::GGS::G3::Avi)序列:
MGSSHHHHHHGSGLVPRGSASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGAQRCFH SEYFDSLLHACKPCRLRCSNPPAPCQPYCDPSMTSSVRGTYTGGSGGGLNDIFEAQKIEWHE(SEQ ID NO:349)
rhuBCMA融合蛋白(6xHis::Sumo::huBCMA(aa5-51)::GGS::G3::Avi)序列:
MGSSHHHHHHGSGLVPRGSASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGAGQCSQ NEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNSVKGTNAGGGSGGGLNDIFEAQKIEWHE(SEQ ID NO:350)
相互作用参数:六种分析物样本浓度各自一式两份且以混合的次序运行,作为评估结合和管理潜在系统偏差对于注射次序的再现性的方式。还运行多次空白(缓冲液)注射并用于评估和减掉系统假象。所有分析物浓度的缔合和离解阶段分别以50uL/min的流速监控300s和3600s。
表面再生:以50uL/min的流速,用10mM甘氨酸(pH 1.5)经过30s使表面再生。
模型/拟合:将数据对准、双重参考并使用Scrubber 2TM软件拟合,此软件是SPR数据加工和非线性最小二乘法回归拟合程序。首先,从最初600s离解阶段数据来确定离解速率系数(kd)。其次,离解速率系数在使用1:1结合模型的300s缔合阶段数据的整体拟合中用作固定的参数,从而确定缔合速率系数(ka)和Rmax值。
结果:
在SEQ ID NO:350的情形下,Ab-1以约155pM的平衡离解速率常数(Kd)特异性地结合人BCMA,且只最低限度地以>10nM的平衡离解速率常数(Kd)与大鼠BCMA相互作用。在SEQ ID NO:350的情形下,Ab-2和Ab-3分别以约1.11nM和750pM的平衡离解速率常数(Kd)结合人BCMA。在SEQ ID NO:349的情形下,Ab-2和Ab-3分别以约2.35nM和2.07nM的平衡离解速率常数(Kd)结合大鼠BCMA。参见图43A-F和表23。
表23.
抗体 |
分析物 |
Rmax(RU) |
ka(1/Ms) |
kd(1/s) |
Kd(nM) |
Ab-1 |
rhu BCMA |
51.1 |
1.54E+06 |
2.38E-04 |
0.155 |
Ab-1 |
rrat BCMA |
未检测 |
未检测 |
未检测 |
>10 |
Ab-2 |
rhu BCMA |
52.5 |
6.38E+05 |
7.07E-04 |
1.11 |
Ab-2 |
rrat BCMA |
50.2 |
5.97E+05 |
1.40E-03 |
2.35 |
Ab-3 |
rhu BCMA |
40.2 |
5.65E+05 |
4.24E-04 |
0.750 |
Ab-3 |
rrat BCMA |
31.3 |
6.26E+05 |
1.29E-03 |
2.07 |
此数据提供人BCMA上对于Ab-1结合而言重要的结构域和氨基酸的证据。Ab-1特异性地结合人和猕猴BCMA,但不结合大鼠BCMA。图44显示人BCMA的胞外结构域的氨基酸2-51:
LQMAGQCSQNEYFD
SLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNSVKG(SEQ IDNO:352);猕猴BCMA的胞外结构域的氨基酸2-51:
LQMARQCSQNEYFDSLLHDCKPCQLRCSSTPPLT
CQRYCNASMTNSVKGM(SEQ ID NO:353);和大鼠BCMA的胞外结构域的氨基酸2-49:
AQRCFHSEYFDSLLHACKPCRLRCSNPPAPCQPYCDPSMTSSVRGTYT(SEQ ID NO:351)的序列比对。
就物种之间的有限序列多样性而言,Ab-1的不同结合表明Ab-1在结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1-20且更具体来说包含SEQ IDNO:285的氨基酸1-11的人BCMA上的中和决定簇。
使用尺寸排阻色谱法(SEC)来检测抗huBCMA抗体(2A1或29C12)和单体[6x组氨酸-SUMO]-huBCMA(SEQ ID NO:350)及其羧基末端截短形式之间的相互作用。实际上,2A1和29C12(150kDa)的抗体分离物或单体[6x组氨酸-SUMO]-huBCMA(约15-18kDa)分离物在SEC上比通过将抗huBCMA 2A1或29C12与[6x组氨酸-SUMO]-huBCMA孵育形成的复合物更慢地移动。为了确定哪些形式的6xHis-SUMO-huBCMA结合抗huBCMA抗体,分离并分析SEC部分。如图45中所示,从SEQ ID NO:350的rhuBCMA融合蛋白(6xHis::Sumo::huBCMA(aa 5-51)::GGS::G3::Avi)产生截短形式的人BCMA的胞外结构域的羧基末端片段。
根据制造商推荐使用Superdex 200TM 10/30cm SEC柱(GEHealthcare Life Sciences)并在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中运行。在室温下进行用过量水平的sumoBCMA孵育抗体持续至少30分钟。图46显示SEQ ID NO:350和人BCMA的胞外结构域的氨基末端的三个逐渐变小的片段(峰A:SEQ ID NO:354、峰B:SEQ ID NO:355和峰C:SEQ ID NO:356)的尺寸排阻色谱法结果(尺寸估计值以道尔顿计)。
如图47A-D中所示的SEC色谱图中所说明,显示Ab-1结合人BCMA的所有片段(即,SEQ ID NO:350、354、355和356)。图47A显示SEQ ID NO:350的保留时间。图47B显示Ab-1的保留时间。图47C显示相对于3ug BCMA(SEQ ID NO:350),过量的Ab-1(60ug)导致无游离的BCMA,包括截短片段(即,SEQ ID NO:354-356),而且两个峰代表与各种BCMA片段结合的Ab-1(保留时间为2.748)和未结合的过量Ab-1(保留时间为3.078)。图47D显示过量BCMA(60ug的SEQ ID NO:350)中的Ab-1抗体(30ug)结合BCMA,但也有少量BCMA片段(SEQ ID NO:354-356)。如图48A-C中所示,对于29C12抗体显示类似结果。此数据也表明每种抗体BCMA分子的2:1化学计量比。
在为了证实2A1和29C12抗体结合截短形式的BCMA胞外结构域(羧基末端片段)的另一实验中,使SEC按比例放大来为分析由LC/MS捕集的SEC峰提供起始材料。根据制造商推荐的条件使用Superdex 200TM 10/30cm SEC柱(GE Healthcare Life Sciences)并在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中运行。在室温下进行用过量水平的sumoBCMA孵育抗体持续至少30分钟。在SEC柱上运行500ug 2A1或29C12、以及500ug 2A1或29C12外加500ug SumoBCMA。SEC对照物包括500ug 2A1或29C12外加300ug Sumo(从SumoBCMA裂解)和500ug结合链霉亲和素的无关抗体(SA)外加500ug Sumo-BCMA。图49A显示Sumo和Sumo-BCMA之间存在可检测的尺寸差异(尽管在Sumo制剂中可小于10-15%Sumo-BCMA)。图49B显示无关抗体对照物(抗SA)不结合Sumo-BCMA。图49C显示2A1和29C12不结合Sumo。
使用液相色谱法和质谱分析(LC/MS)来识别由2A1和29C12所结合的huBCMA的形式(即,全长和各种截断形式)。
样本:
1. 2A1+Sumo-总浓度:0.6mg/ml
2. 2A1+SumoBCMA-总浓度:4.3mg/ml
3. 29C12+Sumo-总浓度:0.6mg/ml
4. 29C12+SumoBCMA-总浓度:2.2mg/ml
5. Sumo(主要是Sumo,具有小百分比Sumo-BCMA)
6. Sumo-BCMA
7. 2A1抗体
8. 29C12抗体
实验方案:
将5ug总蛋白在55℃下在50mM Tris/4M胍/9mM DTT(pH 8.0)中还原15min并在使用Vydac C8柱、2.1mm ID×150mm、5μM粒度的Agilent LCTOF系统中进行分析。柱温度是55℃,溶剂A是水中的0.1%TFA,溶剂B是乙腈中的0.1%TFA且流动速率是0.2ml/min。B的梯度百分比在3、5、40、42、42.5和45min内分别为5-5、5-10、10-80、80-80、80-5、5-。调整TOF质谱仪并在100至3200m/z的范围内校准。TOF MS条件包括毛细管电压为4000V、干燥气体流速为10L/min、干燥气体温度为300℃、雾化器气体流速为40L/min且碎裂电压为300V。通过Agilent MassHunterTM定性分析程序分析MS数据。
2A1和29C12结合全长和截短形式的BCMA。如图50A中所示,2A1抗体结合的截短形式的BCMA包括峰A、B、D和E,且如图50B中所示,29C12抗体结合的截短形式的BCMA包括峰A、B、C和E。参考图50A和B,峰A对应于SEQ ID NO:354、峰D对应于SEQ IDNO:355且峰E对应于SEQ ID NO:356(参见图45)。在这种更详细的分析中,识别结合BCMAmAb的BCMA的另外两个羧基末端片段(粗体且加下划线的部分是BCMA):
峰B:
GSSHHHHHHGSGLVPRGSASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIPPKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQR(SEQ ID NO:357)
峰C:
GSSHHHHHHGSGLVPRGSASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCS(SEQ ID NO:358)
此数据显示Ab-1结合人BCMA的逐渐变小片段(即,SEQ IDNO:350、354、357、355和356),所有片段均保留部分氨基末端。SEQID NO:356为所有BCMA片段所共有,且因此显示Ab-1结合人BCMA的氨基末端。清晰起见,SEQ ID NO:356由SEQ ID NO:285的huBCMA的氨基酸5至20(包括端点在内)组成。此证据连同Ab-1与BCMA的不同直系同源基因的差异性结合一起证实Ab-1结合人BCMA上的包含SEQ ID NO:285的氨基酸1-20的中和决定簇,或更具体来说结合包含SEQ ID NO:285的氨基酸1-11的中和决定簇。应了解,Ab-1不需要结合1至20氨基酸结构域或1至11氨基酸结构域中的每个氨基酸。
实施例17
huBCMA:Ab-1、huBCMA:Ab-2和huBCMA:Ab-3复合物的晶体结构和表位绘图。
蛋白质表达和纯化:
如同在含有在铰链区的半胱氨酸N-末端后插入的半胱天冬酶-3敏感性位点以便此位点处的裂解呈现Fab片段的pTT5表达载体中的全长抗体(Lonza,Basel,Switzerland),在293-6E细胞中表达Ab-1(2A1CV5)、Ab-2(29C12_mut)和Ab-3(32B5_mut)。使用标准Lonza生产实验方案和抗体纯化实验方案来产生完整抗体。在PBS中配制完整抗体,其中添加高达100:1w/w比的组氨酸标记的半胱天冬酶-3与抗体以产生Fab片段。使用与HisTrapTM(GE Healthcare LifeSciences)柱在线连接的MabSelect SuRETM蛋白A柱(GE HealthcareLife Sciences)从Fc和完整抗体分离Fab片段以除去组氨酸标记的半胱天冬酶-3酶。通过使用在大肠杆菌GM221细胞中表达的具有氨基酸5-54构建体的GSS::6xHis::Sumo::huBCMA胞外结构域产生可溶性蛋白形式的人BCMA:
GSSHHHHHHGSGLVPRGSASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNSVKGTNA(SEQID NO:359)
基本上根据制造商推荐的实验方案,在镍琼脂糖FastFlowTM柱(GE Healthcare Life Sciences)和HiLoad SuperdexTM 200 26/60(GEHealthcare Life Sciences)上纯化蛋白质。用于使以下数据与线性序列相关目的的huBCMA(aa 5-54)的近似胞外结构域的氨基酸序列如下:(注意:第一个Ala是5号位置,且对于参照点来说是相对于SEQ IDNO:285的5号氨基酸):
AGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNSVKGTNA(SEQ ID NO:360)。
huBCMA-Fab复合物形成和纯化:
通过混合Fab和过量huBCMA形成huBCMA:Ab-1Fab、huBCMA:Ab-2Fab和huBCMA:Ab-3Fab的复合物。将每种复合物在HiLoad SuperdexTM 200 16/60上纯化并浓缩至10mg/mL用于结晶。使huBCMA:Ab-1Fab复合物在0.2M硫酸铵、0.1M醋酸钠和22%聚乙二醇4000中结晶。使huBCMA:Ab-2Fab复合物在0.2M酒石酸二铵和20%聚乙二醇3350中结晶。使huBCMA:Ab-3Fab复合物在0.2M硫酸铵、0.1M Hepes(pH 7.0)和28%聚乙二醇3350中结晶。所有结晶实验都在20℃下使用沉滴蒸气扩散方法来进行。此方法在本领域中众所周知,例如参见Dessau等人,J VisExp.,2011;47:2285。
数据收集和结构解析:
根据以下解析度由阿尔贡国家实验室(Argonne NationalLaboratory,Argonne,IL)的高级光子源(Advanced Photon Source)分析复合物:huBCMA:Ab-1Fab处于下,huBCMA:Ab-2Fab处于下且huBCMA:Ab-3Fab处于下。所有数据都经过处理并由衡量。通过具有使用Fab CR9114(pdb编码:4FQH)的公开结构的程序的分子置换方法来解析huBCMA:Ab-1Fab的结构。使用CCP4程序组中的自动建模软件来解析huBCMA的结构。通过具有使用先前解析的huBCMA:Ab-1Fab结构的程序的分子置换方法来解析huBCMA:Ab-2Fab和huBCMA:Ab-3Fab的结构。使用和重复进行几轮结构改进和建模。
Ab-1(2A1CV5)Fab
huBCMA:Ab-1Fab复合物的晶体结构以16.4%的R因子(22.4%的R游离因子)被解析为的解析度。存在不对称单位的一种复合物。复合物由一个huBCMA分子和一个Ab-1Fab组成。总之,复合物中huBCMA和Ab-1中的大部分残基都在电子密度方面充分解析,尤其是表位和互补位区域。huBCMA胞外结构域(ECD)分子折叠成鞍状结构,此结构含有两个模块(每个模块作为鞍的一半)和独特的螺旋状作为‘扶手’(图51)。作为分子的N末端一半的A1模块含有三个β链和一个二硫键。另一个模块(称为D2)在分子的C末端一半含有两个短的α-螺旋和两个二硫键。与人APRIL结合的人BCMA的晶体结构先前已在Hymowitz等人,JBio Chem,2005,第280卷,第7218-7227页中有所描述,其中作者将β1-β2结构域指定为大致跨越SEQ IDNO:352的氨基酸4-22。本领域技术人员应了解,此指定是基于算法的近似值且实际结构域可能比指定的略长或略短。
Ab-1使得与覆盖总表面积的huBCMA产生广泛的非共价相互作用,这大大超过的常规抗体:抗原表面积。另外,假如大多数单克隆抗体的典型形状互补性为0.64-0.68,那么0.70的形状互补性即是尤佳的。Ab-1利用重链和轻链可变结构域的所有六个CDR环与huBCMA相互作用。对于huBCMA而言,N-末端、β1-β2环、β2至α1的区段、α1-α2环和α-2螺旋的N末端与抗体产生直接相互作用。
基于1)在将huBCMA以其游离形式和与Fab复合的形式相比较时溶剂可及表面积的变化和2)huBCMA与Fab之间的接触距离来分析huBCMA:Ab-1界面。通过以上分析以及相互作用的性质来识别表位和互补位区域。Ab-1与具有来自轻链和重链的CDR的huBCMA相互作用,其中轻链与huBCMA产生9个氢键和343次范德瓦耳斯接触(对于总计),且重链CDR具有5个氢键和248次范德瓦耳斯接触(对于总计)。huBCMA的A2模块中的β1-β2环插入Ab-1的CDR区中的重链与轻链之间的裂缝中,这可部分解释Ab-1与huBCMA的异常高亲和力。huBCMA的D2模块(C-末端)主要与Ab-1的轻链相互作用。huBCMA的A2模块中的β1-β2环是重要的标记表位区,因为在huBCMA的β1-β2环和N-末端观测到了所有的氢键相互作用和密切的范德瓦耳斯相互作用
表24.基于溶剂可及表面积(ASA)分析(由ASA的变化(%)分级)的huBCMA:Ab-1界面面积。huBCMA中的残基是相对于SEQ IDNO:360而言。
截止值大于ASA变化的10%差异
*具有弱电子密度的残基
表25.基于接触距离分析的huBCMA与Ab-1之间的相互作用。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
*具有相对弱的电子密度的残基
表26A和26B.基于接触距离分析的Ab-1Fab:huBCMA互补位面积。Ab-1中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:240而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:206而言。
26A.轻链可变结构域
26B.重链可变结构域
表27.Ab-1Fab与huBCMA之间的氢键相互作用(无可检测的盐桥)。Ab-1中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:240而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:206而言。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
氢键(L=Vl结构域;H=Vh结构域)
Ab-2(29C12)Fab
huBCMA:Ab-2Fab复合物的晶体结构以21.3%的R因子(22.8%的R游离因子)被解析为的解析度。复合物由一个huBCMA分子和一个Ab-2Fab组成。总之,复合物中huBCMA和Ab-2中的大部分残基都在电子密度方面充分解析,包括表位和互补位区域。huBCMA的部分D2模块展现较差的电子密度,表明它是柔性的,尤其在残基Thr32、Leu35和Gln38周围。
总而言之,Ab-2与huBCMA产生相对广泛的相互作用,覆盖 的总表面积,其形状互补性为0.71。Ab-2利用重链可变结构域的所有三个CDR环和轻链可变结构域的CDR1和CDR3与huBCMA相互作用。对于huBCMA而言,N-末端、β1-β2环和α1-α2环(包括C末端α1和N末端α2)与Ab-1相互作用。
基于1)在将huBCMA以其游离形式和与Ab-2Fab复合的形式相比较时溶剂可及表面积的变化和2)huBCMA与Ab-2之间的接触距离来分析huBCMA:Ab-2Fab界面。通过以上分析以及相互作用的性质来识别表位和互补位区域。Ab-2识别具有轻链和重链可变结构域的huBCMA,其中轻链可变结构域与huBCMA产生2个氢键和106次范德瓦耳斯接触(对于总计),且重链可变结构域具有3个氢键、2个盐桥和319次范德瓦耳斯接触(对于总计)。因此,Ab-2重链可变结构域的CDR在识别huBCMA中具有重要作用。huBCMA的A2模块中的β1-β2环充当重要的标记表位区,其插入Ab-2Fab的CDR区中的重链与轻链之间的裂缝中。huBCMA的D2模块(C-末端)只与重链可变结构域相互作用。主要在huBCMA中的β1-β2环和N-末端观测到所有的氢键相互作用和密切的范德瓦耳斯相互作用由D2模块中的残基(诸如Arg27和Leu35)呈现的相互作用因其较差的电子密度数据而可能不太重要。
表28.基于溶剂可及表面积(ASA)分析(由ASA的变化(%)分级)的huBCMA:Ab-2界面面积。huBCMA中的残基是相对于SEQ IDNO:360而言。
截止值大于ASA变化的10%差异
*具有较差的电子密度的残基
表29.基于接触距离分析的huBCMA与Ab-2之间的相互作用。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
*/**具有相对弱(*)至极差(**)的电子密度的残基
表30A和30B.基于接触距离分析的Ab-2Fab:huBCMA互补位面积。Ab-2中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:242而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:208而言。
30A.轻链可变结构域
30B.重链可变结构域
表31A和31B.Ab-2Fab与huBCMA之间的氢键相互作用和盐桥。Ab-2中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:242而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:208而言。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
31A.氢键(L=轻链;H=重链)
31B.盐桥(L=轻链;H=重链)
Ab-3(32B5_mut)Fab
huBCMA:Ab-3Fab复合物的晶体结构以21.8%的R因子(24.3%的R游离因子)被解析为的解析度。复合物由一个huBCMA分子和一个Ab-3Fab组成。总之,复合物中huBCMA和Ab-3中的大部分残基都在电子密度方面充分解析,包括表位和互补位区域。huBCMA的部分D2模块展现较差的电子密度,表明它是柔性的,尤其在残基Arg39和Asn31周围。
总而言之,Ab-3与huBCMA产生相对广泛的相互作用,覆盖 的总表面积,其形状互补性为0.71。Ab-3利用重链可变结构域的所有三个CDR环和轻链可变结构域的CDR1和CDR3与huBCMA相互作用。对于huBCMA而言,N-末端、β1-β2环和α1-α2环(包括C末端α1和N末端α2)与Ab-3相互作用
基于1)在将huBCMA以其游离形式和与Ab-3Fab复合的形式相比较时溶剂可及表面积的变化和2)huBCMA与Ab-3之间的接触距离来分析huBCMA:Ab-3Fab界面。通过以上分析以及相互作用(即,在如本文提供的“相互作用”定义中描绘的那些相互作用)的性质来识别表位和互补位区域。Ab-3识别具有轻链和重链可变结构域的huBCMA,其中轻链可变结构域与huBCMA产生1个氢键和101次范德瓦耳斯接触(对于总计),且重链可变结构域具有4个氢键、2个盐桥和339次范德瓦耳斯接触(对于总计)。因此,Ab-3重链可变结构域的CDR在与huBCMA的相互作用中具有重要作用。huBCMA的A2模块中的β1-β2环是重要的标记表位区,其插入Ab-3的CDR区中的重链与轻链之间的裂缝中。huBCMA的D2模块(C-末端,如上文所述)只与Ab-3的重链可变结构域相互作用。主要在huBCMA中的β1-β2环和N-末端观测到所有的氢键相互作用和密切的范德瓦耳斯相互作用由D2模块中的残基(诸如Arg27、Thr32和Leu35)呈现的相互作用因其较弱的电子密度数据而可能不太重要。
表32.基于溶剂可及表面积(ASA)分析(由ASA的变化(%)分级)的huBCMA:Ab-3界面面积。huBCMA中的残基是相对于SEQ IDNO:360而言。
截止值大于ASA变化的10%差异
*具有较差的电子密度的残基
表33.基于接触距离分析的huBCMA与Ab-3之间的相互作用。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
*/**具有相对弱(*)至极差(**)的电子密度的残基
表34A和34B.基于接触距离分析的Ab-3Fab:huBCMA互补位面积。Ab-3中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:244而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:210而言。
34A.轻链可变结构域
34B.重链可变结构域:
表35A和35B.Ab-3Fab与huBCMA之间的氢键相互作用和盐桥。Ab-3中的残基对于Vl结构域来说是相对于SEQ ID NO:244而言且对于Vh结构域来说是相对于SEQ ID NO:210而言。huBCMA中的残基是相对于SEQ ID NO:360而言。
35A.氢键(L=轻链;H=重链)
35B.盐桥(L=轻链;H=重链)
结晶学数据证明Ab-1、2和3与huBCMA上的重要结构域(即,β1-β2环和N-末端)以及此重要区域以外的残基相互作用。结晶学数据证实实施例16中Ab-1的基于肽的表位定位,其显示Ab-1结合逐渐变小的huBCMA片段(即,SEQ ID NO:350、354、357、355和356),所有片段都保留部分氨基末端。SEQ ID NO:356为所测试的所有huBCMA片段所共有;SEQ ID NO:356由SEQ ID NO:285的huBCMA的氨基酸5至20(包括端点在内)(或SEQ ID NO:360的氨基酸1至16(包括端点在内))组成,其涵盖接近整个β1-β2环。总而言之,这证实huBCMA的氨基末端,且尤其是β1-β2环是Ab-1的表位中的重要结构域,如关于结晶学数据的更详细分析所示,应了解Ab-1与此区域以外的huBCMA上的残基相互作用。
huBCMA与Ab-1和Ab-2/Ab-3之间的具体相互作用是不同的。关于Ab-1与huBCMA的β1链和α1至α2螺旋所观测到的其它相互作用也是广泛的,这由Ab-1的重链和轻链来识别。然而,关于Ab-2和Ab-3与huBCMA的C末端α1至N末端α2的区段(残基Arg27至Leu35)所观测到的其它相互作用由于此区域的弱电子密度而可能不太明显,这只由Ab-2和Ab-3的重链来识别。