本申请要求2010年9月28日提交的美国申请No.61/387,402和2010年12月10日提交的美国申请No.61/422,091的优先权,其公开内容通过提述并入本文。
附图简述
图1A-1C绘出了本文中所描述的指定嵌合多肽的每日施用在对C57/B6雌性小鼠施用后对食物摄取和体重变化(%经媒介物校正的)的影响,如实施例4中描述的。图1A:食物摄取。图1B:体重变化(%经媒介物校正的)。图1C:剂量响应曲线。
图2A-2C绘出了本文中所描述的指定嵌合多肽的每日施用在对C57/B6雌性小鼠施用后对食物摄取和体重变化(%经媒介物校正的)的影响,如实施例5中描述的。图2A:食物摄取。图2B:体重变化(%经媒介物校正的)。图2C:剂量响应曲线。
发明详述
I.定义
“肥胖症”和“超重”指具有比正常预期更大的重量的哺乳动物,并且可以通过例如身体外观、如本领域中已知的体重指数(BMI)、腰臀围比、皮褶厚度、腰围等来确定。疾病控制和预防中心(CDC)将超重定义为成人具有25至29.9的BMI;并将肥胖定义为成人具有30或更高的BMI。存在用于测定肥胖症的其它量度。例如,CDC宣称具有大于1.0的腰臀比的人是超重的。
“瘦体重”指无脂肪的体重,即总体重减去身体脂肪重量为瘦体重。可以通过如本领域中已知的方法如流体静力学称量(hydrostatic weighing)、计算机化室(computerized chamber)、双能x-射线吸收测量学、皮肤卡尺(skincaliper)、磁共振成象(MRI)和生物电阻抗分析(BIA)来测量瘦体重。
“哺乳动物”指一般具有软毛或毛发,活产其后代,并且用乳喂养其后代的温血动物。哺乳动物包括人;同伴动物(例如犬、猫);家畜动物(例如牛、马、绵羊、猪、山羊);野生动物等等。在一个实施方案中,所述哺乳动物是雌性。在一个实施方案中,所述哺乳动物是女性。在一个实施方案中,所述哺乳动物是猫或犬。在一个实施方案中,所述哺乳动物是患糖尿病的哺乳动物,例如具有2型糖尿病的人。在一个实施方案中,所述哺乳动物是肥胖的患糖尿病的哺乳动物,例如具有2型糖尿病的肥胖哺乳动物。术语“受试者”在本文中描述的方法的背景中指哺乳动物。
在多肽背景中的“片段”在本文中在习惯的化学意义上指多肽的一部分。例如,片段可以源自亲本多肽的一个或多个残基的N端缺失或C端缺失,和/或片段可以源自亲本多肽的一个或多个残基的内部缺失。“片段”在抗体的背景中指抗体中可以与生物学活性分子连接以调控溶解度、受试者内的分布等的部分。例如,本文中描述的瘦蛋白A200是Fc抗体片段与瘦蛋白的缀合物,如本领域中已知的。参见例如WO98/28427和US2007/002084。术语“亲本”在多肽背景中在习惯的意义上指充当修饰,例如插入、缺失和/或取代前的参照结构的多肽。
如用于本文的,“类似物”在多肽的背景中指相对于亲本化合物具有氨基酸的插入、缺失和/或取代的化合物。类似物可以具有卓越的稳定性、溶解度、效力、半衰期,等等。在一些实施方案中,类似物是相对于亲本化合物具有至少50%,例如50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或甚至更高的序列同一性的化合物。
“同一性”、“序列同一性”等在比较两种或更多种核酸或多肽序列的背景中,指根据使用本领域中已知的序列比较算法例如BLAST或BLAST2.0测量,相同的或具有规定百分比的相同氨基酸残基或核苷酸(即在比较窗或指定区里为了最大对应性而比较和比对时,在规定区域里约50%同一性,优选地50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性)的两种或更多种序列或亚序列。此定义包括具有缺失和/或添加的序列、以及那些具有取代的序列、以及天然存在的(例如多态性或等位)变体、和人工制备的变体。在优选的算法中,如本领域中已知的,解决缺口等。对于序列比较,通常一种序列作用为与测试序列比较的参照序列。当使用序列比较算法时,使测试和参照序列进入计算机中,在必要时指定随后的坐标,并指定序列算法程序参数。优选地,可以使用缺省程序参数或可以指定备选参数。然后,序列比较算法基于程序参数计算测试序列相对于参照序列的百分比序列同一性。可以进行比较序列的最佳比对,例如通过Smith&Waterman,1981,Adv.Appl.Math.2:482的局部同源性算法,通过Needleman&Wunsch,1970,J.Mol.Biol.48:443的同源性比对算法,通过Pearson&Lipman,1988,Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA85:2444的搜索相似性方法,通过这些算法的计算机化实现(WisconsinGenetics软件包中的GAP,BESTFIT,FASTA和TFASTA,Genetics ComputerGroup,575Science Dr.,Madison,Wis.),或通过手动比对和视觉检查来进行。参见例如Current Protocols in Molecular Biology(Ausubel等编1995增刊))。适合于测定百分比序列同一性和序列相似性的算法的优选例子包括BLAST和BLAST2.0算法,其记载于Altschul等,1977,Nuci.Acids Res.25:3389-3402和Altschul等,1990,J.Mol.Biol.215:403-410。如本领域中已知的,使用BLAST和BLAST2.0来测定本发明的核酸和蛋白质的百分比序列同一性。用于实施BLAST分析的软件经由国家生物技术信息中心(National Center forBiotechnology Information)的网站公开可获得。此算法牵涉首先通过鉴定询问序列中长度W的短词来鉴定高得分序列对(HSP),所述短词在与数据库序列中相同长度的词比对时匹配或满足某一正值的阈值得分T。T称为相邻词得分阈值(Altschul等,同前)。这些初始的相邻词命中(hits)作用为启动搜索以寻找含有它们的较长HSP的种子。将词命中沿着每条序列以两个方向延伸,只要可以增加累积比对得分。例如对于核苷酸序列,使用参数M(一对匹配残基的奖励得分;总是>0)和N(错配残基的惩罚得分;总是<0)来计算累积得分。对于氨基酸序列,使用评分矩阵来计算累积得分。在如下情况时停止每个方向的词命中延伸:累积比对得分从其最大实现值下降数量X;由于一个或多个负评分残基比对的积累,累积得分变为0以下;或达到任一序列的末端。BLAST算法参数W、T和X决定比对的灵敏度和速度。BLASTN程序(对于核苷酸序列)使用字长(W)为11,期望值(E)为10,M=5,N=-4和两条链的比较作为缺省。对于氨基酸序列,BLASTP程序使用字长为3,期望值(E)为10,和BLOSUM62评分矩阵(参见Henikoff&Henikoff,1989,Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:10915)比对(B)为50,期望值(E)为10,M=5,N=-4和两条链的比较作为缺省。
除非另外明确指出,术语“约”在数字值的背景中指数字值的+/-10%。
术语“肽”和“多肽”在本文中所描述的化合物的背景中是同义的。
瘦蛋白。“多种瘦蛋白”和“一种瘦蛋白”分别意指:多种瘦蛋白、多种瘦蛋白活性片段、多种瘦蛋白类似物、和多种瘦蛋白衍生物;和一种瘦蛋白、一种瘦蛋白活性片段、一种瘦蛋白类似物、和一种瘦蛋白衍生物。因而,除非另外记载,提及“多种瘦蛋白”意为涵盖多种瘦蛋白、多种瘦蛋白活性片段、多种瘦蛋白类似物、和多种瘦蛋白衍生物,如本文中公开的。类似地,除非另外记载,提及“一种瘦蛋白”意为涵盖一种瘦蛋白、一种瘦蛋白活性片段、一种瘦蛋白类似物、和一种瘦蛋白衍生物,如本文中公开的。可以在本文中公开的嵌合多肽的设计、制备和使用中采用的例示性瘦蛋白包括如下那些瘦蛋白,其引发本领域中已知在对受试者施用瘦蛋白时引发的一种或多种生物学应答(参见例如公布的美国专利申请No.US2007/0020284和US2008/0207512,美国专利No.6,309,853和US7,183,254,以及PCT公布的申请No.WO96/005309,WO98/28427和WO2009/064298),如:食物摄取减少、体重减轻、体重增加减少、诱发过饱、热量利用度降低、热量效率降低、代谢平台(plateau)降低、胰岛素敏感性升高、高脂血症减轻、改正血脂障碍、高甘油三酯血症(hypertriglyceridemia)减轻、改善肥胖症、改善超重、改善糖尿病(包括I型糖尿病、II型糖尿病和妊娠糖尿病)、改善胰岛素抗性、改善其关联的脂肪营养不良状况、以及本领域中已知在施用瘦蛋白后引发的其它生物学应答(参见例如公布的美国专利申请No.US2007/0020284和US2008/0207512,美国专利No.6,309,853,和US7,183,254,以及PCT公布的申请No.WO96/005309,WO98/28427,和WO2009/064298)。
瘦蛋白包括但不限于在下列专利中描述的化合物:美国专利No.US5,594,101,US5,851,995,US5,691,309,US5,580,954,US5,554,727,US5,552,523,US5,559,208,US5,756,461,US6,309,853,公布的美国专利申请No.US2007/0020284、和PCT公布的申请No.WO96/23517,WO96/005309,WO98/28427,WO2004/039832,WO98/55139,WO98/12224,和WO97/02004,每篇完整并入本文并用于所有目的。在体外和体内测定瘦蛋白活性和生物学应答,包括过饱、食物摄取抑制活性和重量减轻活性的方法是本领域中已知的,并且记载于本文中及还在本文中引用的上述参考文献和其它参考文献中。
代表性的瘦蛋白、瘦蛋白类似物、瘦蛋白活性片段、和瘦蛋白衍生物包括下列各项:
成熟的鼠瘦蛋白:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHT-Xaa-SVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLESLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLQQLDLSPGC,其中第28位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:1)。
成熟的鼠瘦蛋白形式1:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSAKQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQVLTSLPSQNVLQIANDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTSGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:2)。
成熟的鼠瘦蛋白形式2:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTSVSAKQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQVLTSLPSQNVLQIANDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTSGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:3)。
具有N端甲硫氨酸的成熟鼠瘦蛋白:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHT-Xaa-SVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLESLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLQQLDLSPGC,其中第29位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:4)。
具有N端甲硫氨酸的成熟鼠瘦蛋白形式1:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSAKQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQVLTSLPSQNVLQIANDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTSGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:5)。
具有N端甲硫氨酸的成熟鼠瘦蛋白形式2:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTSVSAKQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQVLTSLPSQNVLQIANDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTSGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:6)。
成熟的猪瘦蛋白:
VPIWRVQDDTKTLIKTIVTRISDISHMQSVSSKQRVTGLDFIPGLHPVLSLSKMDQTLAIYQQILTSLPSRNVIQISNDLENLRDLLHLLASSKSCPLPQARALETLESLGGVLEASLYSTEVVALSRLQGALQDMLRQLDLSPGC(SEQ IDNO:7)。
具有N端甲硫氨酸的成熟猪瘦蛋白:
MVPIWRVQDDTKTLIKTIVTRISDISHMQSVSSKQRVTGLDFIPGLHPVLSLSKMDQTLAIYQQILTSLPSRNVIQISNDLENLRDLLHLLASSKSCPLPQARALETLESLGGVLEASLYSTEVVALSRLQGALQDMLRQLDLSPGC(SEQID NO:8)。
成熟的牛瘦蛋白:
VPICKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHT-Xaa-SVSSKQRVTGLDFIPGLHPLLSLSKMDQTLAIYQQILTSLPSRNVVQISNDLENLRDLLHLLAASKSCPLPQVRALESLESLGVVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDMLRQLDLSPGC,其中第28位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:9)。
具有N端甲硫氨酸的成熟牛瘦蛋白:
MVPICKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHT-Xaa-SVSSKQRVTGLDFIPGLHPLLSLSKMDQTLAIYQQILTSLPSRNVVQISNDLENLRDLLHLLAASKSCPLPQVRALESLESLGVVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDMLRQLDLSPGC,其中第29位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:10)。
未加工的全长人瘦蛋白(即包含21个残基的N端信号序列):
MHWGTLCGFLWLWPYLFYVQAVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ ID NO:11)
成熟的人瘦蛋白(除去N端21个氨基酸的信号序列):
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISH-Xaa-Xaa-SVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC,其中第27位Xaa是T或A;且第28位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:12)。
具有N端甲硫氨酸的成熟人瘦蛋白:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISH-Xaa-Xaa-SVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC,其中第28位Xaa是T或A;且第29位Xaa是Q或缺乏的(SEQ ID NO:13)。
成熟的猕猴瘦蛋白:
VPIQKVQSDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQRVTGLDFIPGLHPVLTLSQMDQTLAIYQQILINLPSRNVIQISNDLENLRDLLHLLAFSKSCHLPLASGLETLESLGDVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ IDNO:14)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的猕猴瘦蛋白:
MVPIQKVQSDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQRVTGLDFIPGLHPVLTLSQMDQTLAIYQQILINLPSRNVIQISNDLENLRDLLHLLAFSKSCHLPLASGLETLESLGDVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:15)。
成熟的大鼠瘦蛋白:
VPIHKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSARQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQILTSLPSQNVLQIAHDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTRGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:16)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的大鼠瘦蛋白:
MVPIHKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSARQRVTGLDFIPGLHPILSLSKMDQTLAVYQQILTSLPSQNVLQIAHDLENLRDLLHLLAFSKSCSLPQTRGLQKPESLDGVLEASLYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQID NO:17)。
成熟的鸭嘴兽瘦蛋白:成熟的鸭嘴兽瘦蛋白序列如下:
ISIEKIQADTKTLTKTIITRIIQLSTQNGVSTDQRVSGLDFIPGNQQFQNLADMDQTLAVYQQILSSLPMPDRTQISNDLENLRSLFALLATLKNCPFTRSDGLDTMEIWGGIVEESLYSTEVVTLDRLRKSLKNIEKQLDHIQG(SEQ IDNO:18)。
未加工的全长鸭嘴兽瘦蛋白(即包含21个残基的N端信号序列):包含21个残基的N端信号序列的鸭嘴兽瘦蛋白的全长序列如下:
MRCILLYGFLCVWQHLYYSHPISIEKIQADTKTLTKTIITRIIQLSTQNGVSTDQRVSGLDFIPGNQQFQNLADMDQTLAVYQQILSSLPMPDRTQISNDLENLRSLFALLATLKNCPFTRSDGLDTMEIWGGIVEESLYSTEVVTLDRLRKSLKNIEKQLDHIQG(SEQ ID NO:19)。
成熟的人瘦蛋白形式1:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ IDNO:20)。
成熟的人瘦蛋白形式2:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHAQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ IDNO:21)。
成熟的人瘦蛋白形式3:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ IDNO:22)。
成熟的人瘦蛋白形式4:
VPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHASVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ IDNO:23)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式1(也称为美曲普汀
(Metreletpin),或A100):
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:24)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式2:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHAQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:25)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式3:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:26)。
具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式4:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHASVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:27)。
海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:28)。
氨基酸71-92用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:29)。
氨基酸30和71-92分别用美曲普汀的氨基酸32和73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:30)。
具有N端甲硫氨酸的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:31)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸71-92用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:32)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和71-92分别用美曲普汀的氨基酸32和73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:33)。
瘦蛋白A200:瘦蛋白A200是Fc抗体片段与瘦蛋白的缩合产物,如本领域中已知的。参见例如Lo等,2005,Protein Eng.Design&Selection,18:1-10。A200的氨基酸序列如下:
MDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQ ID NO:34)
瘦蛋白A300:瘦蛋白A300是具有取代W101Q和W139Q(N端1Met以残基1计数)的美曲普汀:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLQQLDLSPGC(SEQID NO:35)。
瘦蛋白A400:瘦蛋白A400是第78位丝氨酸残基用半胱氨酸残基替换的美曲普汀,如下文列出的:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQICNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPGC(SEQID NO:36);其已经经由第78位半胱氨酸残基附接有20千道尔顿(kDa)PEG模块。
瘦蛋白A500:包括发明人在内的许多调查人员的研究聚焦于瘦蛋白中的残基取代对聚集的影响。参见例如Ricci等,2006.“Mutational approach to
improve physical stability of protein therapeutics susceptible to aggregation:Roleof altered conformation in irreversible precipitation,”书章.于:MISBEHAVINGPROTEINS:PROTEIN(MIS)FOLDING,AGGREGATION,AND STABILITY,Murphy RM,Tsai AM编,New York.Springer.第331页-第350页,其通过提述并入本文并用于所有目的。因而,在本文中描述的某些化合物和方法中使用了具有以下序列的瘦蛋白A500:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLEFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLESLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLQQLDLSPGC(SEQ IDNO:37)。
瘦蛋白A100变体:具有下列氨基酸取代的瘦蛋白A100变体如下:
D41E,H98S,W101Q,D109E,G113E,M137I,W139Q和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLEFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQASGLETLESLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:38)。
H98S,W101Q,A102T,G113E,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:39)。
H98S,W101Q,G113E,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQASGLETLDSLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:40)。
W101Q,G113E,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:41)。
H98S,W101Q,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:42)。
W101Q,G113E,M137I,W139Q,L143V,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:43)。
H98S,W101Q,A102T,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQTSGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:44)。
H98S,W101Q,D109E,G113E,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQASGLETLESLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPEC(SEQ IDNO:45)。
W101Q,M137I,W139Q,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDLSPEC(SEQ IDNO:46)。
W101Q,M137I,W139Q,L143V,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:47)。
H98S,W101Q,A102T,M137I,W139Q,L143V,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQTSGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDILQQLDVSPEC(SEQ IDNO:48)。
H98S,W101Q,A102T,G113E,和G146E:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCSLPQTSGLETLDSLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLSPEC(SEQ IDNO:49)。
W101Q,G113E,和W139Q:
MVPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSKMDQTLAVYQQILTSMPSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPQASGLETLDSLGEVLEASGYSTEVVALSRLQGSLQDMLQQLDLSPGC(SEQID NO:50)。
W101Q,G113E,W139Q,和G146E:
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II.嵌合多肽
在本公开内容的一个方面,描述了一系列嵌合多肽。这些嵌合多肽基于野生型海豹瘦蛋白多肽,其中野生型海豹瘦蛋白序列的至少一个1-30个氨基酸的连续区用成熟人瘦蛋白序列的1-30个氨基酸的连续区替换。野生型海豹瘦蛋白序列包括野生型海豹瘦蛋白的序列(SEQ ID NO:28)和具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白的序列(SEQ ID NO:31)。可用于嵌合化如本文中提供的野生型海豹瘦蛋白的成熟人瘦蛋白序列包含上文所描述的以下序列:成熟的人瘦蛋白(SEQ ID NO:12)、具有N端甲硫氨酸的成熟人瘦蛋白(SEQ IDNO:13)、成熟的人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)、成熟的人瘦蛋白形式2(SEQID NO:21)、成熟的人瘦蛋白形式3(SEQ ID NO:22)、成熟的人瘦蛋白形式4(SEQ ID NO:23)、具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式1(美曲普汀,或A100,SEQ ID NO:24)、具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式2(SEQ IDNO:25)、具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式3(SEQ ID NO:26)、具有N端甲硫氨酸的成熟的人瘦蛋白形式4(SEQ ID NO:27),A200(SEQ ID NO:34),A300(SEQ ID NO:35),A400(SEQ ID NO:36),A500(SEQ ID NO:37),和A100变体(SEQ ID NO:38-51)。在一些实施方案中,描述了一系列嵌合多肽,其中野生型海豹瘦蛋白序列(SEQ ID NO.28或SEQ ID NO:31)的至少一个1-30个氨基酸的连续区已经用A100(SEQ ID NO.24)的1-30个氨基酸的连续区替换。
在任何公开的嵌合多肽中,1-30个氨基酸的连续区可以包含任何天然或非天然存在的氨基酸。可以无限制地采用任意氨基酸组合。也就是说,连续区中的两个或更多个氨基酸可以用天然存在的氨基酸、非天然存在的氨基酸、保守取代、非保守取代或其任意组合替换。
在增强的物理特性外,本文中所描述的嵌合多肽已经表明生物学活性。例如,海豹-人嵌合多肽在体外和体内显示瘦蛋白活性。如实施例所显示的,嵌合多肽与用于衍生该序列的成熟人瘦蛋白多肽相比显示增强的稳定性和溶解度。
术语“瘦蛋白活性”包括瘦蛋白结合活性和瘦蛋白功能活性。使用适合于测量瘦蛋白结合或瘦蛋白功能活性的测定法,熟练技术人员会识别出具有瘦蛋白活性的瘦蛋白类似物化合物。瘦蛋白类似物化合物在瘦蛋白结合测定法,诸如本文中描述的瘦蛋白结合测定法中可以具有约200nM或更小、约100nM或更小、或约50nM或更小、或约5nM或更小、或约1nM或更小的IC50。术语“IC50”在习惯意义中指抑制生物学或生化功能的化合物的半最大抑制浓度。因而,在受体结合研究的背景中,IC50指与规定受体竞争已知配体的一半的测试化合物浓度。瘦蛋白类似物化合物在瘦蛋白功能测定法,诸如本文中描述的瘦蛋白功能测定法中可以具有约20nM或更小、约10nM或更小、约5nM或更小、约1nM或更小、或约0.1nM或更小的EC50。术语“EC50”在习惯意义中指诱导介于基线响应和最大响应之间的中间响应的化合物有效浓度,如本领域中已知的。
A.掺入人螺旋1的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的螺旋1区跨越20个氨基酸的连续区。螺旋1和螺旋3是形成瘦蛋白中针对其受体的结合位点II的一部分的反向平行螺旋。此位点与瘦蛋白受体的细胞因子受体同源域(CRH)相互作用,并且认为是一种主要的受体结合位点,但不牵涉受体激活。参见例如Peelman等,2004,J.Biol.Chem.279:41038.
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟人瘦蛋白的螺旋1序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28位置第3位-第22位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第5位-第24位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含SEQ IDNO:52中描述的序列:
氨基酸3-22分别用美曲普汀的氨基酸5-24(螺旋1)替换的海豹瘦蛋白:PIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:52)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第3位-第22位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第5位-第24位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含SEQ ID NO:53中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸3-22分别用美曲普汀的氨基酸5-24(螺旋1)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:53)。
B.掺入人螺旋2的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的螺旋2区跨越16个连续氨基酸的区。此螺旋埋藏于4-螺旋束中,如记载于Zhang等(Nature1997387:206)的最初晶体结构论文中的。
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟人瘦蛋白的螺旋2序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第50位-第65位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第52位-第67位的氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含SEQ IDNO:54中描述的序列:
氨基酸50-65分别用美曲普汀的氨基酸52-67(螺旋2)替换的海豹瘦蛋白:PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSKMDQTLAVYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:54)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第50位-第65位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第52位-第67位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含SEQ ID NO:55中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸50-65分别用美曲普汀的氨基酸52-67(螺旋2)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSKMDQTLAVYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:55)。
C.掺入人螺旋3的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的螺旋3区跨越22个氨基酸的连续区。螺旋3和螺旋1是形成瘦蛋白中针对其受体的结合位点II的一部分的反向平行螺旋。此位点与瘦蛋白受体的细胞因子受体同源域(CRH)相互作用,并且认为是一种主要的受体结合位点,但不牵涉受体激活。参见例如Peelman等,2004,J.Biol.Chem.279:41038。
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟的人瘦蛋白的螺旋3序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ IDNO:28的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含SEQ ID NO:29中描述的序列:
氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:29)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:32中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:32)。
D.掺入人螺旋4的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的螺旋4区跨越22个氨基酸的连续区。认为螺旋4形成瘦蛋白的结合位点I和结合位点III的部分,这两种结合位点对受体激活都是重要的。参见例如Peelman等,2004,J.Biol.Chem.279:41038。
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟人瘦蛋白的螺旋4序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第120位-第141位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第122位-第143位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:56中描述的序列:
氨基酸120-141分别用美曲普汀的氨基酸122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQ IDNO:56)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第120位-第141位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第122位-第143位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:57中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸120-141分别用美曲普汀的氨基酸122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQ IDNO:57)。
E.掺入人AB环的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的AB环区跨越27个氨基酸的连续区。认为AB环形成瘦蛋白中结合位点III的部分以及瘦蛋白结合位点I的小部分。参见例如Peelman等,2004,J.Biol.Chem.279:41038。该区还含有绝对保守的基序GLDFIP。
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟人瘦蛋白的AB环序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ IDNO:58中描述的序列:
氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换的海豹瘦蛋白:PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:58)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:59中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:59)。
F.掺入人环3-4的嵌合多肽
成熟的人瘦蛋白多肽的环3-4区跨越27个氨基酸的连续区。认为环3-4含有瘦蛋白中针对其受体的结合位点III的一部分。参见例如Peelman等,2004,J.Biol.Chem.279:41038。
在一个方面,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及掺入的来自成熟人瘦蛋白的环3-4序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQID NO:60中描述的序列:
氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:60)。
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:61中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:61)。
G.嵌合组合多肽
在本公开内容的另一个方面,描述了一系列嵌合组合多肽。这些嵌合组合多肽基于野生型海豹瘦蛋白多肽,其中野生型海豹瘦蛋白序列(例如SEQID NO:28或SEQ ID NO:31)的两个或更多个1-30个氨基酸的连续区已经在每个区用成熟人瘦蛋白序列的1-30个氨基酸的连续区替换。可以工程化改造嵌合组合多肽,以在保留人瘦蛋白生物学活性的情况中与用于衍生该序列的成熟人瘦蛋白多肽相比表明增强的物理特性。
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入螺旋1序列和掺入螺旋3序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽(SEQ ID NO:28)的氨基酸序列,其中跨越SEQ ID NO:28的第3位-第22位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQID NO:24)的第5位-第24位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ IDNO:62中描述的序列:
氨基酸3-22分别用美曲普汀的氨基酸5-24(螺旋1)替换,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:62)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第3位-第22位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第5位-第24位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:63中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸3-22分别用美曲普汀的氨基酸5-24(螺旋1)替换,以及氨基酸72-93分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:63)
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入螺旋3序列和掺入AB环序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ IDNO:64中描述的序列:
氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换,且氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:64)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:65中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换,以及氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:65)
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入螺旋3序列和掺入环3-4序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQID NO:66中描述的序列:
氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换,且氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:66)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:67中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换,以及氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVCSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:67)
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入AB环序列和掺入螺旋4序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第120位-第141位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第122位-第143位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:68中描述的序列:
氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,且氨基酸120-141分别用美曲普汀的氨基酸122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQID NO:68)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第120位-第141位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第122位-第143位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:69中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,以及氨基酸120-141分别用美曲普汀的氨基酸122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQID NO:69)
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入AB环序列和掺入环3-4序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQID NO:70中描述的序列:
氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,且氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:70)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:71中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,以及氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ ID NO:71)。
在一些实施方案中,本公开内容涉及嵌合多肽,其基于野生型海豹瘦蛋白及来自成熟人瘦蛋白的掺入AB环序列、掺入环3-4序列和掺入螺旋3序列。在一些实施方案中,嵌合多肽包含野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQID NO:28),其中跨越SEQ ID NO:28的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ IDNO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:28的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的位置73-94处的氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ IDNO:72中描述的序列:
氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,且氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:72)
在一些实施方案中,嵌合多肽包含具有N端甲硫氨酸的野生型海豹瘦蛋白多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:31),其中跨越SEQ ID NO:31的第23位-第49位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第25位-第51位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第93位-第119位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ ID NO:24)的第95位-第121位氨基酸的连续区替换,且跨越SEQ ID NO:31的第71位-第92位氨基酸的连续区已经用跨越A100(SEQ IDNO:24)的第73位-第94位氨基酸的连续区替换。在一些实施方案中,嵌合多肽包含在SEQ ID NO:73中描述的序列:
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸23-49分别用美曲普汀的氨基酸25-51(AB环)替换,氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸95-121(环3-4)替换,且氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISHTQSVSSKQKVTGLDFIPGLHPILTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:73)。
在一些实施方案中,本发明提供的嵌合多肽在野生型海豹多肽序列的第30位含有Cys到Ser的氨基酸取代。依照一些实施方案,提供了下列嵌合多肽:
氨基酸30和3-22分别用美曲普汀的氨基酸32和5-24(螺旋1)替换的海豹瘦蛋白:
PIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:74)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和3-22分别用美曲普汀的氨基酸32和
5-24(螺旋1)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:75)。
氨基酸30和50-65分别用美曲普汀的氨基酸32和52-67(螺旋2)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSKMDQTLAVYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:76)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和50-65分别用美曲普汀的氨基酸32和52-67(螺旋2)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSKMDQTLAVYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:77)。
氨基酸30和71-92分别用美曲普汀的氨基酸32和73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:30)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和71-92分别用美曲普汀的氨基酸32和73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:33)。
氨基酸30和120-141分别用美曲普汀的氨基酸32和122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQ IDNO:78)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和120-141分别用美曲普汀的氨基酸32和122-143(螺旋4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLQGSLQDMLWQLDLNPGC(SEQ IDNO:79)。
氨基酸30和93-119分别用美曲普汀的氨基酸32和95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:80)。
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30和93-119分别用美曲普汀的氨基酸32和95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRSVVQIANDLANLRALLRLLASAKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:81)。
氨基酸30、氨基酸3-22、和氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸32、氨基酸5-24(螺旋1)和氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
PIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:82)
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30、氨基酸3-22、和氨基酸71-92分别用美曲普汀的氨基酸32、氨基酸5-24(螺旋1)和氨基酸73-94(螺旋3)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQKVQDDTKTLIKTIVTRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCPVPRARGSDTIKGLGNVLRASVHSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:83)
氨基酸30、氨基酸71-92、和氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸32、氨基酸73-94(螺旋3)和氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
PIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQ IDNO:84)
具有N端甲硫氨酸,且氨基酸30、氨基酸71-92、和氨基酸93-119分别用美曲普汀的氨基酸32、氨基酸73-94(螺旋3)和氨基酸95-121(环3-4)替换的海豹瘦蛋白:
MPIQRVQDDTKTLIKTIITRINDISPPQGVSSRPRVAGLDFIPRVQSVRTLSGMDQILATYQQILTSLQSRNVIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSCHLPWASGLETLDSLGGVLEASGYSTEVVALSRLKAALQDMLRQLDRNPGC(SEQID NO:85)。
其它实施方案。理解的是,还涵盖本文中公开的每种多肽包括(任选地)与其天然存在的第一个氨基酸以符合读码框方式融合的N端甲硫氨酸。例如,美曲普汀(瘦蛋白A100)由已经添加有N端甲硫氨酸的成熟人瘦蛋白组成,如SEQ ID NO:24中公开的。类似地,可以在贯穿本文中所公开的任意氨基酸序列和分子式的N端纳入甲硫氨酸残基。
在一些实施方案中,提供了嵌合多肽类似物。相对于亲本嵌合多肽,嵌合多肽类似物可以具有至少80%,例如80%,85%,90%,95%,98%或甚至更高的序列同一性。在一些实施方案中,亲本嵌合多肽是SEQ ID NO:29,SEQ IDNO:30,SEQ ID NO:32,SEQ ID NO:33,SEQ ID NO:52,SEQ ID NO:53,SEQID NO:54,SEQ ID NO:55,SEQ ID NO:56,SEQ ID NO:57,SEQ ID NO:58,SEQ ID NO:59,SEQ ID NO:60,SEQ ID NO:61,SEQ ID NO:62,SEQ IDNO:63,SEQ ID NO:64,SEQ ID NO:65,SEQ ID NO:66,SEQ ID NO:67,SEQID NO:68,SEQ ID NO:69,SEQ ID NO:70,SEQ ID NO:71,SEQ ID NO:72,SEQ ID NO:73,SEQ ID NO:74,SEQ ID NO:75,SEQ ID NO:76,SEQ IDNO:77,SEQ ID NO:78,SEQ ID NO:79,SEQ ID NO:80,ID NO:81,SEQ IDNO:82,SEQ ID NO:83,SEQ ID NO:84,或SEQ ID NO:85中所列的多肽。因而,在一些实施方案中,相对于选自由SEQ ID NO:29,SEQ ID NO:30,SEQ IDNO:32,和SEQ ID NO:33组成的组的任何嵌合多肽,嵌合多肽类似物可以具有至少80%,例如80%,85%,90%,95%,98%或甚至更高的序列同一性。在一些实施方案中,相对于SEQ ID NO:33中列出的嵌合多肽,嵌合多肽类似物可以具有至少80%,例如80%,85%,90%,95%,98%或甚至更高的序列同一性。在一些实施方案中,相对于SEQ ID NO:29,SEQ ID NO:30,SEQ ID NO:32,或SEQ ID NO:33中列出的嵌合多肽,嵌合多肽类似物可以具有至少90%序列同一性。在一些实施方案中,相对于SEQ ID NO:33中列出的嵌合多肽,嵌合多肽类似物可以具有至少90%序列同一性。
另外,可以依照本发明设计、制备并使用嵌合多肽类似物,其中选自下组的嵌合多肽的1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20或甚至21个氨基酸用另一种氨基酸,如保守氨基酸或非保守氨基酸取代或以其它方式改变:SEQ ID NO:29,SEQ ID NO:30,SEQ ID NO:32,SEQ ID NO:33,SEQ ID NO:52,SEQ ID NO:53,SEQ ID NO:54,SEQ ID NO:55,SEQ IDNO:56,SEQ ID NO:57,SEQ ID NO:58,SEQ ID NO:59,SEQ ID NO:60,SEQID NO:61,SEQ ID NO:62,SEQ ID NO:63,SEQ ID NO:64,SEQ ID NO:65,SEQ ID NO:66,SEQ ID NO:67,SEQ ID NO:68,SEQ ID NO:69,SEQ IDNO:70,SEQ ID NO:71,SEQ ID NO:72,SEQ ID NO:73,SEQ ID NO:74,SEQID NO:75,SEQ ID NO:76,SEQ ID NO:77,SEQ ID NO:78,SEQ ID NO:79,SEQ ID NO:80,ID NO:81,SEQ ID NO:82,SEQ ID NO:83,SEQ ID NO:84,和SEQ ID NO:85。如本领域中惯用的,术语“保守的”在氨基酸取代的背景中指保留电荷类型(例如阴离子、阳离子、中性、极性,等等)、疏水性或亲水性、体积(bulk)(例如范德华(van der Waals)接触等等)和/或功能性(例如羟基、胺、巯氢基等等)特性的取代。术语“非保守的”指非保守的氨基酸取代。
在另一个方面,本发明提供了包含来自成熟人瘦蛋白类似物序列的至少一个1-30个氨基酸的连续区的嵌合多肽类似物,所述成熟人瘦蛋白类似物序列在如下位置处含有至少一处氨基酸取代,在来自另一物种的瘦蛋白中与前述位置对应的位置中观察到趋异。
如本领域中理解的,例如鼠瘦蛋白、大鼠瘦蛋白、牛瘦蛋白、猪瘦蛋白、和猕猴瘦蛋白,如本文中公开的那些瘦蛋白各自与人瘦蛋白是基本上同源的;特别地,这些瘦蛋白的成熟形式与成熟的瘦蛋白是基本上同源的,且进一步地,尤其是在蛋白质的N端部分附近。可以制备这类瘦蛋白的类似物,如成熟的人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)和美曲普汀(SEQ ID NO:24),如通过取代或以其它方式改变这类序列中的一个或多个如下位置处的氨基酸残基来进行,所述位置处的趋异在相应的成熟小鼠、大鼠、牛、猪或猕猴瘦蛋白中观察到。例如,成熟的人瘦蛋白(例如SEQ ID NO:20)在例如小鼠、大鼠和猴中引发生物学应答。参见例如WO98/28427,WO2009/064298,US2007/0020284,US2008/0207512,和Murakami等,1995,Biochem.Biophys.Res.Comm.209:944-952。由于人成熟瘦蛋白在例如这类物种中具有生物学活性,可以设计并制备瘦蛋白类似物,其中在来自一种或多种这类物种的瘦蛋白中的相应位置处趋异的位置处的一个或多个氨基酸用在这类相应的趋异位置处的氨基酸取代。
例如,使用依照SEQ ID NO:20的人成熟瘦蛋白蛋白质(其中第一个氨基酸是缬氨酸,且第146位氨基酸是半胱氨酸),可以用存在于SEQ ID NO:2中的相应位置处的相应氨基酸用另一种氨基酸取代位置32,35,50,64,68,71,74,77,89,97,100,101,105,106,107,108,111,112,118,136,138,142,和145处的一个或多个氨基酸,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。另外,也可以将另一种氨基酸如保守氨基酸或非保守氨基酸取代入例如SEQ ID NO:20的位置32,35,50,64,68,71,74,77,89,97,100,101,105,106,107,108,111,112,118,136,138,142,和145之一个或多个中,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。
可以基于成熟的大鼠瘦蛋白蛋白质序列(SEQ ID NO:16)来进一步制备其它瘦蛋白类似物。参见例如WO98/28427,US2007/0020284和Murakami等,1995,同上,通过提述完整并入本文中并用于所有目的。成熟的大鼠瘦蛋白与成熟的人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)在下列位置处有所不同:4,32,33,35,50,68,71,74,77,78,89,97,100,101,102,105,106,107,108,111,112,118,136,138和145。因而,在SEQ ID NO:20中的一个或多个这类位置处,可以用存在于成熟大鼠瘦蛋白(SEQ ID NO:16)中的相应位置处找到的氨基酸取代,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。另外,也可以将另一种氨基酸如保守氨基酸或非保守氨基酸取代入例如SEQ IDNO:20的位置4,32,33,35,50,68,71,74,77,78,89,97,100,101,102,105,106,107,108,111,112,118,136,138和145之一个或多个中,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。
与成熟人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)趋异的来自成熟大鼠瘦蛋白(SEQ ID NO:16)和成熟鼠瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:2)两者的位置是:4,32,33,35,50,64,68,71,74,77,78,89,97,100,102,105,106,107,108,111,112,118,136,138,142和145。因而,在SEQ ID NO:20中的一个或多个这类位置处,可以用存在于成熟大鼠瘦蛋白序列(SEQ ID NO:16)或成熟鼠形式1序列(SEQID NO:2)中的相应位置处找到的氨基酸取代,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。另外,也可以将另一种氨基酸如保守氨基酸或非保守氨基酸取代入位置4,32,33,35,50,64,68,71,74,77,78,89,97,100,102,105,106,107,108,111,112,118,136,138,142,和145之一个或多个中,从而设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物。
另外,与成熟人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)趋异的存在于猕猴成熟瘦蛋白(SEQ ID NO:14)中的氨基酸是(以一字母氨基酸缩写在括号中记录氨基酸残基):8(S),35(R),48(V),53(Q),60(I),66(I),67(N),68((L),89(L),100(L),108(E),112(D)和118(L)。由于人成熟瘦蛋白在猴中引发生物学应答,在设计并制备依照本发明的嵌合多肽包含的瘦蛋白类似物中可以采用瘦蛋白,如用另一种氨基酸如括号中的氨基酸替换一个或多个猕猴趋异氨基酸的成熟人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)。应当注意的是,某些猕猴趋异氨基酸也是那些存在于例如上述成熟的鼠瘦蛋白形式1(位置35,68,89,100和112)中的氨基酸。如此,可以制备如下的瘦蛋白类似物,其中例如成熟的人瘦蛋白形式1(SEQ ID NO:20)的位置4,8,32,33,35,48,50,53,60,64,66,67,68,71,74,77,78,89,97,100,102,105,106,107,108,111,112,118,136,138,142,和145处的一个或多个氨基酸用小鼠或猕猴瘦蛋白(例如SEQ ID NO:2和/或SEQID NO:14)中这类位置处的相应氨基酸替换。
依照本发明,可以将嵌合多肽类似物设计并制备为包含来自人瘦蛋白类似物的氨基酸连续区。在一些实施方案中,本发明提供了基于野生型海豹瘦蛋白多肽的嵌合多肽,其中野生型海豹瘦蛋白序列的至少一个1-30个氨基酸的连续区已经用成熟的人瘦蛋白类似物序列的1-30个氨基酸的连续区替换,
且其中成熟的人瘦蛋白类似物序列在如下位置处含有至少一处氨基酸取代,在来自另一物种的瘦蛋白中与前述位置对应的位置中观察到趋异。还提供了嵌合多肽类似物,其包含成熟人瘦蛋白类似物序列的两个或更多个1-30个氨基酸的连续区。
附接有化学模块的嵌合多肽是多肽衍生物。已经发现通过附接一种或多种化学模块对嵌合多肽的衍生化在某些情况下提供某种优点,如提高治疗性蛋白质的稳定性和循环时间以及降低免疫原性和例如生成中和性抗体的倾向和/或注射部位反应的发生率。参见例如WO98/28427,US2007/0020284,美国专利No.4,179,337,Davis等,1979年12月18日公告。关于综述,参见Abuchowski等,于ENZYMES AS DRUGS.(J.S.Holcerberg和J.Roberts编第367页-第383页(1981));Francis等,同上。
多肽衍生物可以构成多肽,已经对该多肽对其氨基酸侧基、α-碳原子、末端氨基基团或末端羧酸基团之一种或多种做出化学修饰。化学修饰包括但不限于附接一种或多种化学模块、创建新键、和除去一种或多种化学模块。在氨基酸侧基处的修饰包括但不限于烷基化、酰化、酯形成、马来酰亚胺偶联、赖氨酸ε-氨基基团的酰化、精氨酸、组氨酸或赖氨酸的N-烷基化、谷氨酸或天冬氨羧酸基团的烷基化,以及谷氨酰胺或天冬酰胺的脱酰胺作用。对末端氨基的修饰包括但不限于脱氨基、N-低级烃基、N-二-低级烃基和N-酰基修饰。对末端氨基的修饰包括但不限于脱氨基、N-低级烃基、N-二-低级烃基和N-酰基修饰,如烷基酰基、分支烷基酰基、烷基芳基-酰基。对末端羧基基团的修饰包括但不限于酰胺、低级烃基酰胺、二烃基酰胺、芳基酰胺、烃基芳基酰胺和低级烃基酯修饰。低级烃基是C1-C4烃基。此外,可以通过普通技能的合成化学人员已知的保护基来保护一种或多种侧基或末端基团。氨基酸的α-碳可以是单或二甲基化的。
这类衍生物包括与一种或多种水溶性聚合物分子,如聚乙二醇(“PEG”)或各种长度的脂肪酸链(例如硬脂酰基、棕榈酰基、辛酰基)缀合的多肽,其通过添加多聚氨基酸,如多聚-his、多聚-arg、多聚-lys、和多聚-ala,或通过添加小分子取代基,包括短烃基和约束的烃基(例如分支、环状、融合的、金刚烷基),以及芳香基基团来得到。在一些实施方案中,水溶性聚合物分子会具有范围为约500道尔顿到约60,000道尔顿的分子量。
这类聚合物缀合可以在如本文中公开的嵌合多肽的N或C端或序列内的氨基酸残基的侧链单一发生。或者,沿着这类嵌合多肽的氨基酸序列可以有多个衍生化位点。用赖氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、或半胱氨酸取代一个或多个氨基酸可以为衍生化提供额外的位点。参见例如美国专利No.5,824,784和5,824,778。在一些实施方案中,嵌合多肽可以与1个、2个、或3个聚合物分子缀合。
在一些实施方案中,将水溶性聚合物分子与氨基、羧基或硫醇基团连接,并且可以通过N或C端,或者在赖氨酸、天冬氨酸、谷氨酸或半胱氨酸的侧链连接。或者,水溶性聚合物分子可以与二胺和二羧基基团连接。在一些实施方案中,嵌合多肽经由赖氨酸氨基酸上的ε氨基基团与1个、2个或3个PEG分子缀合。
多肽衍生物还包括具有对一个或多个氨基酸残基的化学变化的多肽。这类化学变化包括酰胺化、糖基化、酰化、硫酸化、磷酸化、乙酰化和环化。化学变化可以在瘦蛋白的N或C端或者在序列内的氨基酸残基的侧链单一发生。在一个实施方案中,这些肽的C端可以具有游离的-OH或-NH2基团。在另一个实施方案中,可以用以下基团对N端末端加帽:异丁基氧基羰基基团、异丙基氧基羰基、n-丁基氧基羰基基团、乙氧基羰基基团、异己酰基基团(“isocap”)、辛酰基基团、辛基甘氨酸基团(称为“G(Oct)”或“octylGly”)、8-氨基辛酸基团、丹酰基和/或Fmoc基团。在一些实施方案中,环化可以经由形成二硫化物桥。或者,沿着多肽氨基酸序列可以有化学变化的多个位点。
在某些实施方案中,将嵌合多肽化学改变为包含鲍尔通-亨特(Bolton-Hunter)基团。鲍尔通-亨特试剂是本领域中已知的(“Radioimmunoassay and related methods,”A.E.Bolton和W.M.Hunter,HANDBOOK OF EXPERIMENTAL IMMUNOLOGY的第26章,第I卷,IMMUNOCHEMISTRY,D.M.Weir编,Blackwell Scientific Publications,1986),并且可以用于经由氨基端α-氨基基团或赖氨酸的ε-氨基基团用中性连接引入酪氨酸样模块。在一些实施方案中,多肽的N端末端修饰为具有鲍尔通-亨特基团。在一些实施方案中,内部赖氨酸残基修饰为具有鲍尔通-亨特基团。在一些实施方案中,沿着多肽氨基酸序列可以有多个鲍尔通-亨特修饰位点。用于多肽修饰的鲍尔通-亨特试剂是商业化的,并且可以包括但不限于水溶性鲍尔通-亨特试剂磺基琥珀酰亚氨基-3-[4-羟苯基]丙酸盐(Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL)和鲍尔通-亨特试剂2,N-琥珀酰亚氨基3-(4-羟基-3-碘苯基)丙酸盐(Wako Pure Chemical Industries,Ltd.,Japan,产品目录编号#199-09341)。下文例示了经由酰胺连接与多肽缀合的例示性鲍尔通-亨特基团,其中虚线通过酰胺键:
可以在鲍尔通-亨特修饰之前或之后将多肽碘化(如用125I放射性标记)。
多肽衍生物可以包含“非必需”氨基酸残基的一处或多处修饰。在本发明的背景中,“非必需”氨基酸残基是可以在没有消除或实质性降低嵌合多肽的活性(例如激动剂活性)的情况中改变例如衍生化的残基。本发明的嵌合多肽可以包含1,2,3,4,5,6,7,8,9,10或更多个氨基酸残基的衍生化;这些之中,一个或多个氨基酸残基可以是非必需氨基酸残基。另外,可以将本发明的多肽衍生化,使得它们在没有消除或实质性降低多肽活性的情况中包含至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10或更多个氨基酸的添加。另外,可以将这类非必需氨基酸残基用适合于衍生化的氨基酸残基取代,如全文描述的。
如全文使用的,“氨基酸”、“氨基酸残基”等指天然氨基酸、非天然氨基酸和经修饰的氨基酸。除非相反说明,一般或通过名称明确对氨基酸的任何提述包括提述D和L立体异构体两者,若其结构允许这类立体异构体形式的话。天然氨基酸包括丙氨酸(Ala)、精氨酸(Arg)、天冬酰胺(Asn)、天冬氨酸(Asp)、半胱氨酸(Cys)、谷氨酰胺(Gln)、谷氨酸(Glu)、甘氨酸(Gly)、组氨酸(His)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、赖氨酸(Lys)、甲硫氨酸(Met)、苯丙氨酸(Phe)、脯氨酸(Pro)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)和缬氨酸(Val)。非天然氨基酸包括但不限于高赖氨酸、高精氨酸、高丝氨酸、铃兰氨酸(azetidinecarboxylic acid)、2-氨基己二酸、3-氨基己二酸、β-丙氨酸、氨基丙酸、2-氨基丁酸、4-氨基丁酸、6-氨基己酸、2-氨基庚酸、2-氨基异丁酸、3-氨基异丁酸、2-氨基庚二酸、叔丁基甘氨酸、2,4-二氨基异丁酸、锁链素、2,2’-二氨基庚二酸、2,3-二氨基丙酸、N-乙基甘氨酸、N-乙基天冬酰胺、高脯氨酸、羟基赖氨酸、别-羟基赖氨酸、3-羟脯氨酸、4-羟脯氨酸、异锁链素、别-异亮氨酸、N-甲基丙氨酸、N-甲基甘氨酸、N-甲基异亮氨酸、N-甲基戊基甘氨酸、N-甲基缬氨酸、萘丙氨酸、正缬氨酸、正亮氨酸、鸟氨酸、戊基甘氨酸、哌可酸(pipecolic acid)和硫代脯氨酸。其它非天然氨基酸包括可逆或不可逆地化学封闭的或者在其N端氨基基团或其侧链基团上化学修饰的经修饰氨基酸残基,如例如,N-甲基化的D和L氨基酸或如下的残基,其中侧链官能团化学修饰为另一种官能团。例如,经修饰的氨基酸包括甲硫氨酸亚砜;甲硫氨酸砜;天冬氨酸-(β-甲酯)(天冬氨酸的一种经修饰的氨基酸);N-乙基甘氨酸(甘氨酸的一种经修饰的氨基酸);或丙氨酸羧酰胺(丙氨酸的一种经修饰的氨基酸)。可以掺入的其它残基记载于Sandberg等,J.Med.Chem.41:2481-91,1998。
如上文提述的,适合于嵌合多肽的这类衍生化的化学模块包括例如各种水溶性聚合物。优选地,为了终产物制备物的治疗性用途,聚合物会是药学可接受的。本领域技术人员会能够基于如下的考虑来选择期望的聚合物,所述考虑诸如聚合物/蛋白质缀合物是否会治疗性使用,并且如果这样的话,期望的剂量、循环时间、对蛋白酶解的抗性,以及其它考虑。对于嵌合多肽,可以如下确定衍生化的效率,即以期望的形式(即通过渗透泵,或更优选地通过注射或输注,或进一步配制用于例如口服、肺或鼻投递)施用衍生化的多肽,并观察如本文中描述的生物学效应和生物学应答。
这类水溶性聚合物可以选自下组:例如聚乙二醇、乙二醇/丙二醇的共聚物、羧甲基纤维素、右旋糖苷、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环(dioxolane)、聚-1,3,6-三口恶烷(trioxane)、乙烯/马来酸酐共聚物、聚氨基酸(均聚物或随机共聚物)、和右旋糖苷或聚(n-乙烯基吡咯烷酮)聚乙二醇、丙二醇均聚物、聚氧化丙烯/氧化乙烯共聚物、聚氧乙烯(polyoxyethylated)多元醇和聚乙烯醇。聚乙二醇丙醛由于其在水中的稳定性而可以具有制造优点。还有,也可以使用琥珀酸酯、苯乙烯、和羟乙基淀粉。
可以通过附接聚氨基酸或分支点氨基酸来制备依照本发明的嵌合多肽衍生物。例如,聚氨基酸可以是别的载体蛋白如Fc模块,其可以用来还延长嵌合多肽的循环半衰期。另外,这类聚氨基酸可以选自下组:血清清蛋白(如人血清清蛋白)、别的抗体或其部分(例如Fc区)、或其它聚氨基酸例如聚赖氨酸。如下文指示的,聚氨基酸的附接位置可以位于多肽的N端或C端或中间的其它位置,并且也可以通过化学“接头”模块与多肽连接,如肽接头或非肽接头。
聚合物可以具有任意分子量,并且可以是分支的或不分支的。对于聚乙二醇,为了易于操作和制造,优选的分子量在约2千道尔顿(kDa)和约100kDa(术语“约”指示在聚乙二醇制备物中,一些分子的重量会超过叙述的分子量,一些会小于叙述的分子量)之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约2kDa和约60kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约2kDa和约40kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约5kDa和约40kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约10kDa和约40kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约5kDa和约30kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约5kDa和约20kDa之间。在某些实施方案中,聚乙二醇在约10kDa和约20kDa之间。根据期望的治疗概况(例如期望的持续释放持续时间、溶解度特征、对生物学活性的影响(若有的话)、操作的方便、抗原性的程度或缺乏和与本发明的瘦蛋白和/或嵌合多肽附接的聚乙二醇的其它已知效应),可以使用其它大小。可以影响选择可与嵌合多肽附接以生成依照本发明的嵌合衍生物的特定分子量的PEG的其它考虑包括这类分子量PEG可以实现如下功能的程度:当存在于药物可接受组合物或配制剂中时,或者当对受试者施用(如通过注射进行)后暴露于生理学流体或组织时,降低嵌合多肽的聚集和/或提高溶解度;在通过注射对受试者施用后降低由于施用嵌合多肽引起的注射部位反应的发生;减少中和性抗体的生成,所述中和性抗体由于对受试者施用这类嵌合多肽而可以针对嵌合多肽生成;等等。
如此附接的聚合物分子的数目可以变化,并且本领域技术人员会能够确定对功能所致的影响。可以用相同或不同的化学模块(例如聚合物,如不同重量的聚乙二醇)单衍生化,或者可以提供二、三、四衍生化或衍生化的某种组合。聚合物分子与要衍生化的嵌合多肽分子的比例会变化,它们在反应混合物中的浓度也会变化。一般而言,就没有过量未反应的嵌合多肽或聚合物的反应效率而言,最佳比率会由诸如期望的衍生化程度(例如单、二、三等)、所选聚合物的分子量、聚合物是分支的还是或不分支的、和反应条件等因素确定。
化学模块应当在考虑对嵌合多肽的功能或抗原域影响的情况中与嵌合多肽附接。存在有本领域技术人员可用的许多附接方法。例如通过提述并入本文中的EP0401384(将PEG与G-CSF偶联),还可见Malik等,1992,Exp.Hematol.20:1028-1035(报告了使用Tresyl氯使GM-CSF聚乙二醇化(pegylation))。例如,聚乙二醇可以经由反应性基团如游离的氨基或羧基基团共价结合到氨基酸残基。反应性基团是那些可以与活化的聚乙二醇分子结合的。具有游离氨基基团的氨基酸残基可以包括赖氨酸残基和N端氨基酸残基。那些具有游离羧基基团的氨基酸残基可以包括天冬氨酸残基、谷氨酸残基、和C端氨基酸残基。硫氢基基团也可以用作附接聚乙二醇分子的反应性基团。对于治疗目的优选的是在氨基基团附接,如在N端或赖氨酸基团附接。如果期望受体结合,那么应当避免在对受体结合重要的残基处的附接。
可以明确地期望设计并制备N端经化学修饰的本发明的嵌合多肽。使用聚乙二醇作为本组合物的例示,可以自多种聚乙二醇分子(根据分子量、分支,等等)、反应混合物中聚乙二醇分子与嵌合多肽分子的比例、待实施的PEG化反应的类型、和获得选择的N端PEG化的蛋白质的方法选择。获得N端PEG化的制备物(即在必要时将此模块与其它单PEG化的模块分开)的方法可以通过从PEG化的蛋白质分子群体纯化N端PEG化的材料进行。选择性N端化学修饰可以通过还原烷基化完成,所述还原烷基化利用特定蛋白质中可用于衍生化的不同类型的伯氨基团(赖氨酸对N端)的差异反应性。在合适的反应条件下,用含有羰基基团的聚合物实现N端的蛋白质实质性选择性衍生化。例如,可以通过在如下的pH实施反应来使蛋白质选择性地在N端PEG化,该pH允许利用赖氨酸残基的ε-氨基基团和蛋白质N端残基的α-氨基基团之间的pKa差异。通过这类选择性衍生化,水溶性聚合物与蛋白质的附接受到控制:与聚合物的缀合主要在蛋白质的N端发生,并且对其它反应性基团如赖氨酸侧链氨基基团没有发生重大修饰。使用还原烷基化,水溶性聚合物可以是上文所描述的类型的,并且应当具有用于与蛋白质缀合的单一反应性醛。可以使用含有单一反应性醛的聚乙二醇丙醛。
III.设计和生成的方法
构建体的设计。可以在氨基酸水平上设计本文中描述的嵌合多肽。然后,可以使用本领域中已知的多种软件产品回译(back translate)这些序列,从而例如针对基于期望的表达宿主的蛋白质表达、密码子优化、限制性位点含量优化核苷酸序列。例如,可以针对基于大肠杆菌的蛋白质表达和限制性位点含量优化核苷酸序列。基于感兴趣的核苷酸序列,可以为多步PCR提供重叠的寡核苷酸,如本领域中已知的。可以在本领域中公知的条件下在多重PCR反应中使用这些寡核苷酸以建立编码感兴趣蛋白质的cDNA。一个例子是1XAmplitaq缓冲液、1.3mM MgCl2、200uM dNTP、4U Amplitaq Gold、0.2uM每种引物(AmpliTaq Gold,ABI),循环参数为:(94C:30秒、58C:1分钟、72C:1分钟),35个循环。
如本领域中已知的,可以将限制性位点添加至PCR产物的末端以在载体连接中使用。特定的位点可以包括Nde1和Xho1,使得cDNA然后可以在pET45b表达载体(Novagen)中的合适的阅读框中。通过使用这些位点,可以除去此载体中的任何N端His标签,因为那样的话翻译起始位点会在该标签的下游。一旦完成表达构建物,如本领域中已知的,可以使用例如T7启动子引物、T7终止子引物和标准ABI BigDye Term v3.1方案通过测序进行验证。可以从例如ABI3730DNA分析仪获得序列信息,并且可以使用Vector NTI v.10软件(Invitrogen)对其分析。可以以模块方式设计表达构建体,从而可以容易地切出并改变接头序列,如本领域中已知的。
可以将本领域中已知的或本文中描述的蛋白酶识别位点掺入构建体中,该构建体可用于本文中描述的重组嵌合多肽的设计、构建、操作和生成。
通用生成方法。可以使用本领域中已知的生物学、化学和/或重组DNA技术来制备本文中描述的嵌合多肽。例示性的方法记载于本文和美国专利No.6,872,700;WO2007/139941;WO2007/140284;WO2008/082274;WO2009/011544;和美国公开文本No.2007/0238669,其公开内容通过提述完整并入本文并用于所有目的。在本文中列出了用于制备该化合物的其它方法。
可以使用标准的固相肽合成技术,如自动化或半自动化的肽合成仪来制备本文中描述的嵌合多肽。可以使用氨基酸和/或反应性侧链受保护的氨基酸衍生物通过非生物学肽合成生成嵌合多肽,所述非生物学肽合成包括逐步偶联所述氨基酸和/或氨基酸衍生物以形成反应性侧链受保护的依照第一方面的多肽,从多肽的反应性侧链除去保护性基团,并在水性溶液中折叠该多肽。如此,使用正常的氨基酸(例如甘氨酸、丙氨酸、苯丙氨酸、异亮氨酸、亮氨酸和缬氨酸)和经预保护的氨基酸衍生物在溶液中或在有机溶剂中的固体支持物上序贯建立多肽序列。当建立完整的多肽序列时,除去保护基,并允许多肽在水性溶液中折叠。
通常,使用这类技术,将经α-N-氨基甲酰基保护的氨基酸和对树脂上的生长肽链附着的氨基酸于RT在惰性溶剂(例如二甲基甲酰胺、N-甲基吡咯烷酮、二氯甲烷等)中在存在偶联剂(例如二环己基碳二亚胺、1-羟基苯并三唑等)的情况下在存在碱(例如二异丙基乙胺等)的情况下偶联。使用试剂(例如三氟乙酸、哌啶等)从所得的肽-树脂除去α-N-氨基甲酰基保护基,并且用下一期望的、要对肽链添加的、经N保护的氨基酸重复偶联反应。合适的N保护基是本领域中公知的,如叔丁基氧化羰基(t-butyloxycarbonyl)(tBoc)、芴基甲氧基羰基(fluorenylmethoxycarbonyl)(Fmoc)等。可以从Applied BiosystemsInc.(Foster City,Calif.)购买溶剂、氨基酸衍生物和肽合成仪中使用的4-甲基二苯甲基胺树脂。
对于化学合成,可以对嵌合多肽使用固相肽合成,因为一般地,固相合成是一种具有向商业规模的卓越可扩缩性的直接方法。可以使用NMP/HOBt(选项1)系统和具有加帽的tBoc或Fmoc化学(参见Applied Biosystems ABI430A肽合成仪用户手册,版本1.3B1988年7月1日,第6部分,第49页-第70页,Applied Biosystems,Inc.,Foster City,Calif.)用自动肽合成仪(430A型,Applied Biosystems Inc.,Foster City,Calif.)来实施固相肽合成。可以用HF切割Boc-肽-树脂(-5°C至0°C,1小时)。可以用交替的水和乙酸从树脂提取肽,并将滤液冻干。可以依照标准方法(例如Introduction to Cleavage Techniques,Applied Biosystems,Inc.,1990,第6页-第12页)来切割Fmoc-肽树脂。也可以使用Advanced Chem Tech合成仪(MPS350型,Louisville,Ky.)来装配肽。
也可以使用本领域中已知的方法,如Sambrook等,1989,MOLECULARCLONING:A LABORATORY MANUAL,第2版,ColdSpringHarbor使用重组DNA技术来制备本文中描述的化合物。可以通过本领域已知的方法来制备非肽化合物。例如,可以使用本领域中已知的方法,如记载于Bartlett等,1986,Biorg.Chem.14:356-377的方法来制备含有磷酸的氨基酸和含有这类氨基酸的肽。
或者,可以通过本领域中公知的重组技术来生成嵌合多肽。参见例如Sambrook等,1989(同上)。可以从多核苷酸表达通过重组技术生成的这些嵌合多肽。考虑到密码子选择的简并性,本领域技术人员会领会编码这类嵌合多肽的多核苷酸(包括DNA和RNA)可以从野生型cDNA(例如人瘦蛋白)获得,并且在期望时可以进一步工程化改造以掺入指定的取代。这些多核苷酸序列可以掺入促进mRNA在微生物宿主中的转录和翻译的密码子。可以依照本领域中公知的方法容易地构建这类制造序列。参见例如WO83/04053,其通过提述完整并入本文中并用于所有目的。任选地,上述多核苷酸还可以编码N端甲硫氨酰基残基。可用于本发明的非肽化合物可以通过本领域中已知的方法来制备。例如,可以使用本领域中已知的方法来制备含有磷酸的氨基酸和含有这类氨基酸的肽。参见例如Bartlett和Landen,1986,Bioorg.Chem.14:356-77。
可以利用多种表达载体/宿主系统以含有并表达嵌合多肽编码序列。这些包括但不限于微生物如用重组噬菌体、质粒或粘粒DNA表达载体转化的细菌;用酵母表达载体转化的酵母;用病毒表达载体(例如杆状病毒)感染的昆虫细胞系统;用病毒表达载体(例如花椰菜花叶病毒,CaMV;烟草花叶病毒,TMV)转染或用细菌表达载体(例如Ti或pBR322质粒)转化的植物细胞系统;或动物细胞系统。可用于重组蛋白质生成的哺乳动物细胞包括但不限于,VERO细胞、HeLa细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞系、COS细胞(如COS-7)、WI38、BHK、HepG2、3T3、RIN、MDCK、A549、PC12、K562和293细胞。用于蛋白质重组表达的例示性方案是在本文中描述的和/或本领域中已知的。
因而,多核苷酸序列可用于生成新的且有用的病毒和质粒DNA载体、新的且有用的经转化的和经转染的原核和真核宿主细胞(包括培养物中培养的细菌、酵母和哺乳动物细胞)、和新的且有用的方法,该方法用于能够表达本嵌合多肽的这类宿主细胞的培养生长。编码本文中嵌合多肽的多核苷酸序列在嵌合多肽的生成不足会得到减轻或其水平升高的需要会得到满足的情况中可用于基因疗法。
本发明还提供了用于本嵌合多肽的重组DNA生成的方法。提供了用于从含有编码嵌合多肽的核酸的宿主细胞生成嵌合多肽的方法,包括:(a)在促进DNA分子表达的条件下培养含有编码嵌合多肽的多核苷酸的宿主细胞;并(b)获得嵌合多肽。
宿主细胞可以是原核或真核的,并且包括细菌、哺乳动物细胞(如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、猴细胞、幼仓鼠肾细胞、癌细胞或其它细胞)、酵母细胞和昆虫细胞。
用于表达重组蛋白质的哺乳动物宿主系统也是本领域技术人员公知的。可以对宿主细胞菌株选择加工表达的蛋白质或产生在提供蛋白质活性中会有用的某些翻译后修饰的特定能力。对多肽的这类修饰包括但不限于乙酰化、羧基化、糖基化、磷酸化、脂质化和酰化。切割蛋白质的“前原(prepro)”形式的翻译后加工对于正确的插入、折叠和/或功能也可能是重要的。不同宿主细胞(如CHO、HeLa、MDCK、293、WI38,等等)对于这类翻译后活动具有特异性细胞机器和特征性机制,并且可以对其选择以确保对引入的外来蛋白质的正确修饰和加工。
或者,可以采用酵母系统来生成本发明的嵌合多肽。通过PCR扩增嵌合多肽DNA的编码区。使用含有α交配因子基因的核苷酸1-20的一种引物和与此基因的核苷酸255-235互补的另一种引物在PCR反应中从酵母基因组DNA扩增编码酵母前原α前导序列的DNA(Kurjan和Herskowitz,1982,Cell,30:933-43)。将该前原α前导编码序列和嵌合多肽编码序列片段连接到含有酵母醇脱氢酶(ADH2)启动子的质粒中,从而使该启动子指导由融合的前原α因子和成熟的嵌合多肽组成的融合蛋白的表达。如由Rose和Broach,Meth.Enz.185:234-79,Goeddel编,Academic Press,Inc.,San Diego,California(1990)教导的,载体进一步包含在克隆位点下游的ADH2转录终止子、酵母“2微米”复制起点、酵母leu-2d基因、酵母(E.coli)REP1和REP2基因、大肠杆菌β-内酰胺酶基因、和大肠杆菌复制起点。β-内酰胺酶和leu-2d基因分别提供细菌和酵母中的选择。leu-2d基因还促进酵母中质粒的拷贝数增加以诱导更高水平的表达。REP1和REP2基因编码牵涉质粒拷贝数调节的蛋白质。
使用已知的方法例如醋酸锂处理(Steams等,1990,.Meth.Enz.185:280-297),将前段中描述的DNA构建体转化到酵母细胞中。当耗尽生长培养基中的葡萄糖后诱导ADH2启动子(Price等,1987,Gene55:287)。前原α序列实现从细胞分泌融合蛋白。伴随地,酵母KEX2蛋白从成熟的嵌合多肽切割前原序列(Bitter等,1984,Proc.Natl.Acad.Sci.USA81:5330-5334)。
也可以使用商品化的表达系统,例如毕赤酵母表达系统(Invitrogen,SanDiego,California)遵循制造商的用法说明书在酵母例如毕赤酵母(Pichia)中重组表达本发明的嵌合多肽。此系统也依赖于前原α序列来指导分泌,但是插入物的转录在甲醇诱导后由醇氧化酶(AOX1)启动子驱动。从酵母生长培养基纯化分泌性嵌合多肽,其通过例如用于从细菌和哺乳动物细胞上清液纯化所述嵌合多肽的方法进行。
或者,可以将编码嵌合多肽的DNA克隆到杆状病毒表达载体例如pVL1393(PharMingen,San Diego,California)中。然后,依照制造商的指导(PharMingen)或已知的技术使用此嵌合多肽编码载体来感染例如在sF9无蛋白质培养基中培养的草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)细胞,及生成重组蛋白。使用本领域中已知的方法,例如肝素-Sepharose柱(Pharmacia,Piscataway,New Jersey)和序贯分子分筛柱(sequential molecular sizing column)(Amicon,Beverly,Massachusetts)从培养基纯化并浓缩蛋白质,并将其在合适的溶液,例如PBS中重悬。可以使用SDS-PAGE分析来表征蛋白质,例如通过显示确认期望的嵌合多肽大小的单一条带来进行,全氨基酸氨基酸序列分析(例如Proton2090肽测序仪上的Edman测序),或其N端序列的确认也可以。
例如,可以将编码预测的成熟嵌合多肽的DNA序列克隆到含有期望的启动子和任选地前导序列的质粒中(参见例如Better等,1988,Science240:1041-1043)。可以通过自动化测序确认此构建体的序列。然后使用标准方法将该质粒转化到大肠杆菌菌株MC1061中,该方法采用CaCl2温育和热休克处理细菌(Sambrook等,同上)。在补充有羧苄西林(carbenicillin)的LB培养基中培养经转化的细菌,并通过在合适的培养基中生长诱导表达蛋白质的生成。若存在的话,前导序列会影响成熟嵌合多肽的分泌,并且在分泌期间被切割。通过本文中描述的方法从细菌培养基纯化分泌性重组嵌合多肽。
或者,可以在昆虫系统中表达嵌合多肽。用于蛋白质表达的昆虫系统是本领域技术人员公知的。在一种这类系统中,将苜蓿银纹夜蛾(Autographacalifornica)核型多角体病毒(AcNPV)用作载体在草地夜蛾细胞中或在粉纹夜蛾(Trichoplusia)幼虫中表达外来基因。将嵌合多肽编码序列克隆到病毒的非必需区(如多角体蛋白基因)中,并置于多角体蛋白启动子的控制下。嵌合多肽的成功插入会使得多角体蛋白无活性,并生成缺乏外壳蛋白外壳的重组病毒。然后,使用重组病毒来感染草地夜蛾细胞或粉纹夜蛾幼虫,其中表达本发明的嵌合多肽(Smith等,1983,J.Virol.46:584;Engelhard等,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA91:3224-3227)。
在另一个例子中,可以通过PCR扩增编码嵌合多肽的DNA序列,并且将其克隆到合适的载体例如pGEX-3X(Pharmacia,Piscataway,New Jersey)中。pGEX载体设计为生成融合蛋白,其包含由载体编码的谷胱甘肽-S-转移酶(GST)和由插入载体克隆位点中的DNA片段编码的蛋白质。可以生成包含例如合适的切割位点的PCR引物。然后,可以从融合蛋白的GST部分切割重组融合蛋白。将pGEX-3X/嵌合多肽构建体转化到大肠杆菌XL-1Blue细胞(Stratagene,La Jolla,California)中,并分离个别转化体,在LB培养基(补充有羧苄西林)中于37°C培养至波长600nm处光密度为0.4,接着在存在0.5mM异丙基β-D-硫代半乳糖吡喃糖苷(Sigma Chemical Co.,St.Louis,Missouri)的情况下再温育4小时。将来自个别转化体的质粒DNA纯化,并使用自动化测序仪来部分测序以确认正确取向的期望的嵌合多肽编码基因插入物的存在。
当预期在细菌中以不溶性包含体生成时,可以如上文描述的或如下纯化融合蛋白。通过离心收获细胞;在0.15M NaCl,10mM Tris,pH8,1mM EDTA中清洗;并用0.1mg/mL溶菌酶(Sigma Chemical Co.)于RT处理15分钟。通过超声处理使裂解液澄清,并通过以12,000xg离心10分钟使细胞碎片沉淀。将含有融合蛋白的团粒在50mM Tris,pH8,和10mM EDTA中重悬,在50%甘油上成层,并以6000xg离心30分钟。将团粒在无Mg++和Ca++的标准磷酸盐缓冲盐水溶液(PBS)中重悬。通过将重悬的团粒在变性SDS聚丙烯酰胺凝胶中分级来对融合蛋白进一步纯化(Sambrook等,见上文)。将凝胶在0.4M KCl中浸泡以显现蛋白质,将该蛋白质切出,并在缺少SDS的凝胶运行缓冲液中电洗脱。如果GST/嵌合多肽融合蛋白在细菌中以可溶性蛋白质生成,那么可以使用GST纯化模块(Pharmacia Biotech)将其纯化。
融合蛋白可以进行消化以从成熟的嵌合多肽切割GST。将消化反应(0.5mL PBS中20-40μg融合蛋白,20-30个单位人凝血酶(4000U/mg(Sigma))于RT温育16-48小时,并在变性SDS-PAGE凝胶上加载以分级反应产物。将凝胶在0.4M KCl中浸泡以显现蛋白质条带。可以使用自动化测序仪(AppliedBiosystems473A型,Foster City,California)通过部分氨基酸序列分析确认与嵌合多肽的预期分子量对应的的蛋白质条带的身份。
在本发明嵌合多肽的重组表达的特别例示性方法中,可以通过磷酸钙方法用在pCMV载体(5’CMV启动子,3’HGH多聚A序列)和pSV2neo(含有neo抗性基因)中含有嵌合多肽cDNA的质粒共转染293细胞。在一个实施方案中,应当在转染前用ScaI将载体线性化。类似地,可以使用一种备选的构建体,其使用掺有neo基因的类似pCMV载体。从单一细胞克隆选择稳定的细胞系,其通过在含有0.5mg/mL G418(新霉素样抗生素)的生长培养基中有限稀释10-14天来进行。通过ELISA或Western印迹针对嵌合多肽的表达筛选细胞系,并且扩大高表达细胞系以用于大规模生长。
优选的是使用经转化的细胞进行长期、高产量的蛋白质生成,因此稳定表达是期望的。一旦用含有与期望的表达盒一起的选择标志物的载体转化这类细胞,可以允许细胞在将它们转换到选择培养基前在富集培养基中生长1-2天。选择标志物设计为赋予对选择的抗性,并且其存在允许成功表达导入序列的细胞的生长和回收。可以使用适合于细胞的组织培养技术增殖经稳定转化的细胞的抗性块。
可以使用许多选择系统来回收已经经过转化以用于重组蛋白质生成的细胞。这类选择系统包括但不限于分别在tk、hgprt或aprt细胞中的HSV胸苷激酶、次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶和腺嘌呤磷酸核糖基转移酶基因。还有,可以将抗代谢物抗性用作对以下基因选择的基础:dhfr,其赋予对甲氨蝶呤的抗性;gpt,其赋予对霉酚酸的抗性;neo,其赋予对氨基糖苷G418的抗性;also,其赋予对绿磺隆(chlorsulfuron)的抗性;和hygro,其赋予对潮霉素的抗性。可用的其它可选择基因包括trpB(其允许细胞利用吲哚代替色氨酸),或hisD(其允许细胞利用组氨醇(histinol)代替组氨酸)。为转化体的鉴定给出视觉指示的标志物包括花色素苷、β-葡糖醛酸糖苷酶及其底物、GUS、和萤光素酶及其底物萤光素。
可以使用自动化肽合成和重组技术两者的组合来生成本发明的嵌合多肽。例如,本发明的嵌合多肽可以含有修饰的组合,所述修饰包括缺失、取代、插入和通过PEG化(或其它模块,例如聚合物、脂肪酰基链、C端酰胺化)的衍生化。可以在各阶段中生成这类嵌合多肽。在第一阶段,可以通过如描述的重组技术来生成中间嵌合多肽,其含有缺失、取代、插入和其任意组合的修饰。然后,在如本文中描述的任选纯化步骤后,经由用合适的PEG化试剂(例如来自NeKtar Transforming Therapeutics,San Carlos,California)的化学修饰将中间嵌合多肽PEG化(或进行其它化学衍生化,例如酰化、C端酰胺化)以产生期望的嵌合多肽衍生物。本领域技术人员会领会,可以将上文所描述的规程一般化以适用于含有修饰的组合的嵌合多肽,所述修饰选自缺失、取代、插入、衍生化和本领域中公知的且由本发明涵盖的其它修饰手段。
可以通过本领域中已知的许多方法,包括如本文中描述的方法来纯化肽。在一种方法中,使用Waters Delta Prep3000系统通过RP-HPLC(制备型和分析型)纯化肽。可以使用C4、C8或C18制备柱(10μ,2.2X25cm;Vydac,Hesperia,Calif.)来分离肽,并且可以使用C4、C8或C18分析柱(5μ,0.46X25cm;Vydac)来测定纯度。可以将溶剂(A=0.1%TFA/水且B=0.1%TFA/CH3CN)以1.0ml/分钟的流速投递至分析柱,以15ml/分钟投递制备柱。可以在Waters PicoTag系统上实施氨基酸分析,并使用Maxima程序处理。可以通过蒸汽相酸水解(115°C,20-24h)将肽水解。可以将水解产物衍生化,并通过标准方法分析(Cohen等,THE PICO TAG METHOD:A MANUAL OF ADVANCED TECHNIQUES FORAMINO ACID ANALYSIS,第11页-第52页,Millipore Corporation,Milford,Mass.(1989))。可以通过M-Scan,Incorporated(West Chester,Pa.)实施快速原子轰击分析。可以使用碘化铯或碘化铯/甘油来实施质量校正。使用飞行时间检测的等离子体解吸电离分析可以在Applied Biosystems Bio-Ion20质谱仪上实施。
嵌合多肽表达测定法。用于测定宿主细胞的蛋白质表达水平的方法是可用的。在以下典型的方案中例示了可用于测定宿主细胞的蛋白质表达水平的规程。用2ul质粒DNA(嵌合多核苷酸的表达载体)转化约25μl BL21大肠杆菌细胞。可以将细胞铺板,并在37℃温育过夜或于室温(RT)在48小时期间里温育。可以选出单个菌落,并用于在4ml具有合适抗生素的LB培养基中培养起始培养物达约6小时。通过向900ul储液添加100ul80%无菌甘油来制备甘油储液,然后可以将其温和混合并在-80C贮存。对于TCP未诱导的样品可以取出250μl样品。可以用5μl起始培养物接种等分试样,例如2ml含有合适抗生素的Magic培养基,然后可以将其于37C以300rpm温育过夜(长达24小时)。如本领域中已知的,Magic培养基是自身诱导的。或者,可以在250ml或125mlThompson烧瓶中用60μl起始培养物接种60ml含有合适抗生素的Magic培养基,然后将其于30C以300rpm温育过夜(长达24小时)。温育后,可以从每管取出250μl培养物,并将细胞沉淀。可以将细胞在1ml50mM Tris pH8,150mM NaCl中重悬,可以对其添加0.1体积(100ul)POP培养试剂和1μl r-溶菌酶(在r-溶菌酶缓冲液中以1:750稀释)。可以将混合物充分混合,并于RT温育至少10分钟。然后,将制备物以14000x G离心10分钟。可以将上清液(可溶性级分)取出并保留,并且可以制备样品以进行凝胶分析(15μl+5μlLDS)。可以将剩余的包含体团粒通过超声处理在1ml1%SDS中重悬。可以制备样品以进行凝胶分析(15ul+5μl LDS)。对于未诱导的样品,可以添加1.0体积POP培养试剂和1μl r-溶菌酶(在r-溶菌酶缓冲液中以1:750稀释)。可以将溶液充分混合,并于RT温育至少10分钟。这些样品可以不需要离心。然后,可以制备样品以进行凝胶分析(15ul+5μl LDS)。可以运行1XMES缓冲液中的非还原性NU-PAGE凝胶(4-12%),并用SimplyBlue微波方案染色。可以进行脱色过夜,如本领域中已知的。可以保留凝胶图像,并进行分析以测定蛋白质表达水平。
包含体制备。对于在包含体级分中找到的嵌合多肽,以下规程可以是有益的。对于每50ml培养物,可以将细胞团粒在最少100ml裂解缓冲液中重悬。在添加30ml时,可以使用10ml移液管来重悬,然后再用70ml冲洗管。可以将重悬的细胞溶液以100PSI(min)多次运行(例如4次通过)流过微射流仪(microfluidizer),注意贯穿整个过程将室在冰水中保持。可以以14000x g将流化的浆体离心20分钟(例如JLA10.5,10,000rpm,使用250ml
瓶)。在用移液管尖端破坏后,可以将包含体团粒在冰上在冰冷的裂解缓冲液中用搅拌棒和搅拌盘于4C重悬1小时。在用移液管尖端破坏后,可以将团粒在蒸馏H2O中用搅拌棒和搅拌盘于4C第二次重悬1小时,接着以14000x g离心15分钟。可以将上清液取出并弃去。可以于-80C贮存所得物。
蛋白质纯化。如本文中描述的,众多用于分离表达的多肽的方法是已知的。以下是一个例子。可以将包含体团粒在合适体积的溶解缓冲液(8M尿素或8M胍,50mM Tris,10mM DTT,pH7.75)中在RT溶解1小时。溶解的团粒可以以27000g离心20分钟。可以将经过滤(例如0.4um)的上清液于RT逐滴转移到适当体积的重折叠缓冲液(50mM Tris-HCl,1M尿素,0.8M精氨酸,4mM半胱氨酸,1mM胱胺;pH8)中。然后,可以将所得物在温和混合的情况下置于4°C过夜或更长。可以将样品浓缩,并在4C环境中使用GE HealthsciencesAKTAFPLC
TM以1-2ml/分钟在凝胶过滤柱(Superdex
TM7526/60)上运行。可以将含有合适蛋白质的级分经由SDS-PAGE鉴定,合并,并运行通过第二凝胶过滤柱。然后,可以将合并的蛋白质在Amicon滤器中浓缩至合适的浓度,并使用例如
PTS阅读器(Charles River)测定内毒素水平,如本领域中已知的。一旦蛋白质样品已经通过内毒素标准,那么就可以将其无菌过滤,分配成等分试样,并运行经过质量控制测定法。质量控制测定法可以包括分析型HPLC-SEC、非还原性SDS PAGE和RP HPLC–MS以获得大致质量。可以在1xPBS(137mM氯化钠、2.7mM氯化钾、4.3mM磷酸二钠、1.4mM磷酸单钾,pH7.2)中获得蛋白质,分配成等分试样,并速冻以于-70C至-80°C贮存。
IV.使用和治疗疾病的方法
适应症。涵盖通过本文中描述的多肽化合物和方法有益治疗的多种疾病和病症。
肥胖症和超重。肥胖症及其关联病症(包括超重)是美国和全世界的常见且严重的公共健康问题。上身肥胖症是2型糖尿病已知的最强的风险因子,并且是心血管疾病的强风险因子。肥胖症是高血压、动脉粥样硬化、充血性心力衰竭、中风、胆囊疾病、骨关节炎、睡眠呼吸暂停、生殖性病症如多囊卵巢综合征、乳腺癌、前列腺癌和结肠癌、以及全身麻醉并发症发生率增加的公认的风险因子。参见例如Kopelman,2000,Nature404:635-43。
肥胖症缩短寿命,并且携带上文所列出的合并症,以及病症如感染、静脉曲张、黑棘皮病、湿疹、运动不耐(exercise intolerance)、胰岛素抗性、高血压血胆固醇过多、胆石症、矫形损伤(orthopedic injury)和血栓栓塞性疾病的严重风险。参见例如Rissanen等,1990,Br.Med.J.,301:835-7。肥胖症也是称作胰岛素抗性综合征或“综合征X”和代谢综合征的一组状况的风险因子。肥胖症和关联病症的全世界医学成本是巨大的。
认为肥胖症的发病机制是多因素的。一个问题是,在肥胖的受试者中,营养利用度和能量消耗不进入平衡,直到存在有过量的脂肪组织。中枢神经系统(CNS)控制能量平衡,并协调适合于动物代谢状态的多种行为的、自主的和内分泌的活动。控制这些活动的机制或系统在前脑(例如下丘脑)、后脑(例如脑干)和脊髓间广泛分布。最终,来自这些系统的代谢(即燃料利用度)和认知(即习得偏爱)信息得到整合,并且开启(进餐获取和启动)或关闭(进餐终止)参与食欲(食物寻找)和完成(摄食)行为的决定。认为下丘脑主要负责整合这些信号,然后向脑干发出命令。脑干核控制完成运动控制系统的元件(例如负责咀嚼和吞咽的肌肉)。因而,这些CNS核照字面意义称为构成摄取行为的“最终共同途径”。
神经解剖学和药理学证据支持能量和营养稳态的信号在前脑核中整合,而且完成运动控制系统驻留于脑干核中,可能在围绕三叉神经运动核的区域中。在下丘脑和脑干之间有广泛的交互连接。多种CNS定向性抗肥胖症治疗剂(例如小分子和肽)主要聚焦于驻留于下丘脑中的前脑基质和/或驻留于脑干中的后脑基质。
肥胖症仍然是一种不太好治疗的、慢性的、基本上难治的代谢性病症。因而,需要可用于受试者中的重量减轻和/或重量维持的新疗法。这类疗法会对受试者的健康产生深刻的有益效果。采用本文中公开的嵌合多肽(单独地或与其它抗肥胖症药剂联合(参见例如WO2009064298和US20080207512))的方法和疗法可以提供这类有益效果。
瘦蛋白缺陷。已经显示了瘦蛋白缺陷导致肥胖症。一种瘦蛋白缺陷形式是先天性瘦蛋白缺陷,即一种罕见的遗传病症。参见Montaque等,1997,Nature387:903-908。重度瘦蛋白缺陷可以是不受控制的胰岛素缺陷性糖尿病的结果,所述不受控制的胰岛素缺陷性糖尿病源自对胰岛素分泌性β细胞的破坏。理论化的是,胰岛素缺乏导致脂肪组织中甘油三酯的合成和贮存,这阻止重量增加,并且继而显著降低血浆瘦蛋白水平,因为瘦蛋白是在脂肪组织中合成的。可以用瘦蛋白替换疗法,诸如经由每日瘦蛋白或瘦蛋白激动剂注射来治疗这些和其它瘦蛋白缺陷、以及源自这类缺陷的疾病及病症。本文中描述的嵌合多肽能提供对这类疾病和病症的更方便的且有利的治疗性处理。
糖尿病和心血管疾病。认为糖尿病是一种复杂的慢性疾病,其中糖尿病患者中占所有病例死亡的60%至70%是心血管并发症的结果。糖尿病不仅被视为冠心病风险等同体,而且还鉴定为不利事件的独立预测物,所述不利事件包括复发性心肌梗死、充血性心力衰竭、和心血管事件后的死亡。预期采用更紧密的葡萄糖控制和心血管风险因子的攻击性治疗会降低冠心病并发症的风险,并且改善糖尿病患者间的总体存活。然而,糖尿病患者比非糖尿病患者以2至3倍更可能经历急性心肌梗死,并且糖尿病患者比非糖尿病患者少活8至13年。
了解糖尿病/急性心肌梗死患者的高风险性质,美国心脏病学会/美国心脏学会(American College of Cardiology/American Heart Association,“ACC/AHA”)不稳定心绞痛(unstable angina)或非ST-升高心肌梗死(统称为“ACS”)住院患者管理临床实践指南最近认为住院糖尿病患者是一个需要高血糖症攻击性管理的特殊群体。具体地,该指南宣称住院糖尿病/ACS患者的降葡萄糖疗法应当靶向为达到小于10mg/dL的餐前葡萄糖、小于180mg/dL的最大每日目标(maximum daily target)、和小于7%的出院后血红蛋白A1c。
在全国性老年ACS患者样本中,表明糖尿病患者中30天死亡率的增加与医院收治后具有较高葡萄糖值的患者一致。参见“Diabetic Coronary ArteryDisease&Intervention,”Coronary Therapeutics2002,Oak Brook,IL,2002年9月20日。有越来越多的证据的是,医院收治后持续的高血糖而非短暂升高的葡萄糖与严重的不利事件相关。尽管不容易知道患者中高血糖和血管风险的理想度量,但是表现为住院期间的均值葡萄糖值对死亡率最具预测性。在来自美国的超过40家医院的ACS患者的不同研究中,发现与医院收治后的随机葡萄糖值形成对比,持续性高血糖对住院死亡率更具预测性。参见AcuteCoronary Syndrome Summit:A State of the Art Approach,Kansas City,MO,2002年9月21日。与收治后的葡萄糖值相比,在整个住院里葡萄糖控制的逻辑回归模型对死亡率最具预测性。在120mg/dL上葡萄糖每升高10mg/dL,住院期间的死亡风险几乎增加2倍。在连续性糖尿病/ACS患者的一个较小分组中,随着医院收治后葡萄糖水平升高,存在有1年时死亡率的分级增加。在医院背景中,ACC/AHA指南建议启动攻击性胰岛素疗法以实现住院期间的较低血液葡萄糖。
已经报道了瘦蛋白对于治疗糖尿病可以具有直接的益处,特别是在I型糖尿病和II型糖尿病(存在或不存在肥胖症)中,且更特别是在低血清瘦蛋白的状况中。已经报道了瘦蛋白补充在伴有或没有肥胖症的1和2型糖尿病的多种动物模型中降低或阻止高胰岛素血症、胰岛素抗性和高血糖症。例如,通过药理学施用瘦蛋白或用腺病毒基因疗法产生的高瘦蛋白血浆水平在STZ诱导的糖尿病中降低高血糖和关联的血浆胰高血糖素水平升高,尽管胰岛素水平持续较低。
脂质调节疾病。如本领域中已知的,脂肪营养不良的特征在于身体脂肪组织的异常或变性性状况。血脂障碍是血液中正常脂质组分受破坏。认为延长的胰岛素水平的升高可以导致血脂障碍。高脂血是血液中存在升高或异常水平的脂质和/或脂蛋白。下丘脑性闭经是一种由于牵涉下丘脑的问题所致的月经停止数月的状况。已经发现了具有下丘脑性闭经的女性中瘦蛋白替换疗法改善生殖、甲状腺和生长激素轴和骨形成标志物,而不引起不利效应。参见例如Oral等,N Engl J Med.2004,351:959-962,987-997。脂肪肝病,例如非酒精性脂肪肝病(NAFLD)指一大批肝病,其范围为简单的脂肪肝(脂肪变性(steatosis)),至非酒精性脂肪肝炎(NASH),至肝硬化(cirrhosis)(不可逆的、进行性肝瘢痕化)。NAFLD的所有阶段共同具有肝脏细胞(肝细胞)中的脂肪积累(脂肪浸润)。认为瘦蛋白是包括NASH在内的各种慢性肝病中炎症和纤维化进展的关键调节物之一。见例如Ikejima等,Hepatology Res.33:151-154。
另外,不希望受任何理论束缚,认为2型糖尿病中的相对胰岛素缺陷、葡萄糖毒性、和通过经由门静脉从腹内脂肪组织投递的升高而增加的肝游离脂肪酸负荷暗示为脂肪肝病症的可能原因。实际上,已经假设进食行为是驱动肥胖症的代谢综合征及其许多必然结果(包括NASH)的关键因素。因而,如已经在2型糖尿病中证明的,针对减少食物摄取并增加小餐次数的治疗可以有效治疗并预防NASH。促进胰岛素分泌和体重减少,并延迟胃排空的药物也有效改善葡萄糖耐受性,并且如此可以改善脂肪肝及其伴随的高胰岛素血症。如此,嵌合瘦蛋白多肽的使用可以完全适合作为针对此状况的治疗形式。因而,本文中描述的嵌合多肽在治疗脂肪肝病症中可以是有用的。
阿耳茨海默氏病。如本领域中已知的,阿耳茨海默氏病(AD)与脑中的斑块和缠结(其包括A-β蛋白的失调)有关。认为脑脂质复杂地牵涉A-β相关的致病途径,且脂质稳态的一种重要调控物为瘦蛋白。因而,瘦蛋白可以调控双向A-β动态,在胞外降低其水平。实际上,已经表明了对AD转基因动物长期施用瘦蛋白降低脑A-β负载,从而成为其治疗潜力的基础。参见Fewlass等,2004,FASEB J.,18:1870-1878。另外,2型糖尿病和AD共享的流行病学和生化特征在于两者都以具有纤维状构象的不溶性蛋白聚集物(在2型DM胰岛中为胰淀素(amylin),而在AD脑中为Aβ)为特征。不希望受任何理论束缚,认为类似的毒性机制可以表征2型DM和AD。参见Lim等,FEBS Lett.,582:2188-2194。
代谢综合征X。代谢综合征X的特征为胰岛素抗性、血脂障碍、高血压、和脂肪组织的内脏分布,并且在2型糖尿病的病理生理学中起着枢要作用。还已经发现了它与NASH、纤维化、和肝损伤高度关联。因而,本文中描述的嵌合多肽可用于治疗代谢综合征X。
亨廷顿氏病。亨廷顿氏病是一种常染色体显性的神经变性性疾病。该疾病的特征包括运动障碍、痴呆、精神病问题和无意识的重量减轻。本文中描述的嵌合多肽可用于治疗亨廷顿氏病。
因而,在一个方面,提供了用于治疗受试者中疾病或病症的方法。受试者需要治疗该疾病或病症。所述疾病或病症可以是脂肪营养不良、血脂障碍、高脂血、超重、肥胖症、下丘脑性闭经、阿耳茨海默氏病、瘦蛋白缺陷、脂肪肝病或糖尿病(包括I型和II型)。可以通过本文中描述的化合物和方法治疗的其它疾病和病症包括非酒精性脂肪肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、代谢综合征X和亨廷顿氏病。治疗方法包括以有效治疗该疾病或病症的量对受试者施用如本文中描述的嵌合多肽。
V.测定法
一般地,用于生成和测定本文中描述的嵌合多肽的方法是熟练技术人员可用的。此外,具体的方法记载于本文以及本文引用的专利公开文本和其它参考文献中,其通过提述并入以用于此额外目的。
食物摄取。不希望受任何理论束缚,认为食物摄取可用于评估如本文中描述的化合物的效用。例如,已知许多代谢病理学涉及食物摄取(例如糖尿病、肥胖症)。因而,可以进行初始筛选以确定通过施用本文中描述的化合物调控食物摄取的程度,并且阳性初始筛选在化合物的后续开发中可以是有用的。
体外测定法。不希望受任何理论或作用机制束缚,认为体外(例如受体)测定法的结果和药剂用于治疗代谢性疾病和病症的效用之间存在相关性。因而,体外测定法(例如基于细胞的测定法)可用作潜在代谢剂的筛选策略,如本文中描述的。多种体外测定法是本领域中已知的,包括那些如下描述的。
瘦蛋白结合测定法。可以通过测试化合物在从由32D OBECA细胞系呈现的表面膜表达的嵌合瘦蛋白(Hu)–EPO(Mu)受体置换125I-重组瘦蛋白(鼠)中的效力来测量瘦蛋白结合(J Biol Chem1998;273(29):18365-18373)。可以从收获的32D OBECA细胞汇合细胞培养物通过匀浆化制备纯化的细胞膜。可以在96孔聚苯乙烯板中将膜与125I-rec-鼠瘦蛋白和递增浓度的测试化合物于环境温度一起温育3小时。然后,通过快速过滤到在0.5%PEI(聚乙烯亚胺)中预封闭至少60’的96孔GF/B板上分开结合的和未结合的配体级分。然后,可以干燥玻璃纤维板,添加闪烁体,并通过在能够读出放射性标记的碘的多孔闪烁计数器上阅读来测定CPM。
瘦蛋白功能测定法。可以在用测试化合物处理异位表达嵌合Hu-瘦蛋白/Mu-EPO受体的32D-Keptin细胞后测量升高的磷酸化STAT5(信号转导物和转录激活物5)水平。可以使32D-Keptin细胞(与32D-OBECA细胞相同,但是在具有瘦蛋白的培养物中维持)脱离瘦蛋白过夜,然后在96孔板中用测试化合物于37°C处理30分钟,接着进行细胞提取。可以使用Perkin Elmer
pSTAT5测定试剂盒以384孔形式(Proxiplate
TM384Plus)测定细胞裂解物中的pSTAT5水平。可以相对于来自用人瘦蛋白处理的细胞的细胞裂解物中的最大信号测定测试化合物的效力。
VI.药物组合物
在一个方面,提供了包含与药学可接受赋形剂(例如载体)组合的本文中描述的化合物的药物组合物。如本文中使用的,术语“药学可接受载体”指药用赋形剂,例如适合于肠或胃肠外应用的药学、生理学可接受的有机或无机载体物质,其不与活性剂有害地起反应。合适的药学可接受载体包括水、盐溶液(例如林格(Ringer)氏溶液等)、醇、油、明胶、和碳水化合物如乳糖、直链淀粉或淀粉、脂肪酸酯、羟甲基纤维素、和聚乙烯吡咯烷。可以将这类制剂灭菌,并且在期望时与不与本发明的化合物有害地起反应的辅助剂如润滑剂、防腐剂、稳定剂、湿润剂、乳化剂、用于影响渗透压的盐、缓冲剂、染料、和/或芳香物质等混合。
A.方法
可以对受试者单独地或者可以共施用本文中描述的嵌合多肽。共施用意为包括单独或组合地(超过一种化合物)同时或序贯施用化合物。例如,已经发现了可以用包括瘦蛋白(例如美曲普汀)和某些其它抗肥胖症化合物的联合疗法有益地治疗肥胖症。参见例如美国公开的申请No.2008/0207512。因而,本文中描述的嵌合多肽对于肥胖症的治疗可以是有用的。
在一些实施方案中,本文中描述的配制剂和方法进一步提供了与一种或多种抗糖尿病剂如抗高血糖剂,例如胰岛素、胰淀素(amylins)、普兰林肽(pramlintide)、二甲双胍(metformin)共施用嵌合多肽。
在一些实施方案中,本文中描述的配制剂和方法进一步提供了与一种或多种胆固醇和/或甘油三酯降低剂共施用嵌合多肽。例示性药剂包括HMGCoA还原酶抑制剂(例如阿托伐他汀(atorvastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、洛伐他汀(lovastatin)、普伐他汀(pravastatin)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)、辛伐他汀(simvastatin));胆汁螯合剂(例如考来维仑(colesevelam)、考来烯胺(cholestyramine)、考来替泊(colestipol));贝特类(fibrates)(例如非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、吉非贝齐(gemfibrozil));依泽替米贝(ezetimibe)、烟碱酸、普罗布考(probucol)、洛伐他汀/烟酸(niacin)组合;阿托伐他汀/氨氯地平(amlodipine)组合;和辛伐他汀/依泽替米贝组合。
或者,可以与其它抗肥胖症药剂如艾塞那肽(exenatide)或利拉鲁肽(liraglutide)共施用个别嵌合多肽。
由于瘦蛋白化合物是治疗活性化合物,本公开内容提供了用作药物(即在疗法中使用)的组合物。本文中还明确涵盖并例示包含嵌合多肽(液体或干形式)和任选地至少一种药学可接受载体和/或赋形剂的组合物。
可以通过与第二药剂分开施用嵌合多肽,或者通过施用包含嵌合多肽和第二药剂的单一药用配制剂来实现共施用。适合于第二药剂的剂量方案一般是本领域中已知的。
在期望时,也可以与如本领域中已知的其它活性物质(例如以降低代谢性降解)或其它治疗活性剂共施用所述制剂。
胰淀素。胰淀素是由胰腺β细胞合成的肽激素,其响应营养物摄取而与胰岛素共分泌。胰淀素的序列在哺乳动物物种间高度保守,其与降钙素基因相关肽(CGRP)、降钙素、垂体中间叶激素、和肾上腺髓质素具有结构相似性,如本领域中已知的。胰淀素的葡萄糖调节作用补充胰岛素的葡萄糖调节作用,其通过经由抑制营养物刺激的胰高血糖素分泌调节循环中葡萄糖出现的速率,并减缓胃排空来实现。在经胰岛素治疗的糖尿病患者中,普兰林肽(人胰淀素的一种合成的且等效的类似物)通过抑制不适当地升高的餐后胰高血糖素分泌并延缓胃排空来降低餐后葡萄糖偏移(excursion)。大鼠胰淀素、人胰淀素和普兰林肽的序列如下:
大鼠胰淀素:KCNTATCATQRLANFLVRSSNNLGPVLPPTNVGSNTY(SEQID NO:86);
人胰淀素:KCNTATCATQRLANFLVHSSNNFGAILSSTNVGSNTY(SEQ IDNO:87);
普兰林肽:KCNTATCATQRLANFLVHSSNNFGPILPPTNVGSNTY(SEQ IDNO:88)。
达瓦林肽(Davalintide)。达瓦林肽,也称为“AC-2307”,是一种可用于治疗多种疾病适应症的有力的胰淀素激动剂。参见WO2006/083254和WO2007/114838,每篇通过提述完整并入本文中并用于所有目的。达瓦林肽是一种嵌合肽,其具有胰淀素或降钙素及其类似物的N端环区、降钙素或其类似物的α-螺旋区的至少一部分的α-螺旋区或具有胰淀素α-螺旋区和降钙素α-螺旋区或其类似物的一部分的α-螺旋区、和胰淀素或降钙素的C端尾部区。人降钙素、鲑鱼降钙素和达瓦林肽的序列如下:
人降钙素:CGNLSTCMLGTYTQDFNKFHTFPQTAIGVGAP(SEQ IDNO:89);
鲑鱼降钙素:CSNLSTCVLGKLSQELHKLQTYPRTNTGSGTP(SEQ IDNO:90);
达瓦林肽:KCNTATCVLGRLSQELHRLQTYPRTNTGSNTY(SEQ IDNO:91)。
不希望受任何理论束缚,认为胰淀素和达瓦林肽及其片段和类似物可要求C端酰胺化来引发完全的生物学应答。理解的是,可以在C端酰胺化胰淀素化合物,如本文中描述的那些胰淀素化合物,其包括胰淀素和/或达瓦林肽及其片段和类似物。
“胰淀素激动剂化合物”包括天然的胰淀素肽、胰淀素类似物肽、和其它具有胰淀素激动剂活性的化合物(例如小分子)。“胰淀素激动剂化合物”可以自天然来源衍生,可以是合成的,或可以自重组DNA技术衍生。胰淀素激动剂化合物具有胰淀素激动剂受体结合活性,并且可以包含氨基酸(例如天然的、非天然的或其组合),肽模拟物,化学模块等。使用胰淀素受体结合测定法或通过在比目鱼肌测定法中测量胰淀素激动剂活性,熟练技术人员会识别胰淀素激动剂化合物。在一个实施方案中,胰淀素激动剂化合物在胰淀素受体结合测定法中会具有约200nM或更低、约100nM或更低、或约50nM或更低的IC50,所述胰淀素受体结合测定法诸如在本文、美国专利No.5,686,411、和美国公开文本No.2008/0176804(其公开内容通过提述完整并入本文并用于所有目的)中描述的胰淀素受体结合测定法。在一个实施方案中,胰淀素激动剂化合物在比目鱼肌测定法(如在本文中和美国专利No.5,686,411中记载的)中会具有约20nM或更低、约15nM或更低、约10nM或更低、或约5nM或更低的EC50。在一个实施方案中,胰淀素激动剂化合物与25,28,29Pro-人胰淀素具有至少90%或100%序列同一性。在一个实施方案中,胰淀素激动剂化合物是胰淀素(例如人胰淀素、大鼠胰淀素等)和降钙素(例如人降钙素、鲑鱼降钙素等)的肽嵌合物。合适的且例示性的胰淀素激动剂化合物还记载于美国公开文本No.2008/0274952中,其公开内容通过提述完整并入本文并用于所有目的。
如本文中使用的,“胰淀素类似物”意指与胰淀素的天然存在形式(大鼠的或人的或来自任何其它物种的)具有至少50%序列同一性,优选地至少70%序列同一性,且通过对参照氨基酸序列的修饰(包括插入、取代、延伸和/或缺失)自其衍生而来的胰淀素激动剂。
胰淀素类似物序列与参照胰淀素可以具有至少50%,55%,60%,65%,70%,75%,80%,90%或95%的氨基酸序列同一性。在一个方面,相对于参照化合物,类似物具有0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15或甚至16处氨基酸取代、插入、延伸、和/或缺失。在一个实施方案中,胰淀素类似物可以包含保守或非保守的氨基酸取代(包括非天然的氨基酸和L和D形式)。优选地,这些类似物为肽、肽衍生物或肽模拟物。典型的胰淀素类似物会是肽,特别是32-37个氨基酸,例如27-45,特别是28-38,且甚至31-36个氨基酸的肽。
与大鼠和人胰淀素具有同一性的胰淀素类似物包括25,28,29Pro-h-胰淀素(普兰林肽);脱-1Lys-h-胰淀素;25Pro,26Val,28,29Pro-h-胰淀素;18Arg,25,28Pro-h-胰淀素;脱-1Lys,18Arg,25,28Pro-h-胰淀素;18Arg,25,28,29Pro-h-胰淀素;脱-1Lys,18Arg,25,28,29Pro-h-胰淀素;脱-1,Lys25,28,29Pro-h-胰淀素;25Pro,26Val,28,29Pro-h-胰淀素;28Pro-h-胰淀素,2,7-环-[2Asp,7Lys]-h-胰淀素;2-37h-胰淀素;1Ala-h-胰淀素;2Ala-h-胰淀素;2,7Ala-h-胰淀素;1Ser-h-胰淀素;29Pro-h-胰淀素;25,28Pro-h-胰淀素;脱-1Lys,25,28Pro-h-胰淀素;23Leu,25Pro,26Val,28,29Pro-h-胰淀素;23Leu25Pro26Val28Pro-h-胰淀素;脱-1Lys,23Leu,25Pro,26Val,28Pro-h-胰淀素;18Arg,23Leu,25Pro,26Val,28Pro-h-胰淀素;18Arg,23Leu,25,28,29Pro-h-胰淀素;18Arg23Leu,25,28Pro-h-胰淀素;17Ile,23Leu,25,28,29Pro-h-胰淀素;17Ile,25,28,29Pro-h-胰淀素;脱-1Lys,17Ile,23Leu,25,28,29Pro-h-胰淀素;17Ile,18Arg,23Leu-h-胰淀素;17Ile,18Arg,23Leu,26Val,29Pro-h-胰淀素;17Ile,18Arg,23Leu,25Pro,26Val,28,29Pro-h-胰淀素;13Thr,21His,23Leu,26Ala,28Leu,29Pro,31Asp-h-胰淀素;13Thr,21His,23Leu,26Ala,29Pro,31Asp-h-胰淀素;脱-1Lys,13Thr,21His,23Leu,26Ala,28Pro,31Asp-h-胰淀素;13Thr,18Arg,21His,23Leu,26Ala,29Pro,31Asp-h-胰淀素;13Thr,18Arg,21His,23Leu,28,29Pro,31Asp-h-胰淀素;和13Thr,18Arg,21His,23Leu,25Pro,26Ala,28,29Pro,31Asp-h-胰淀素。
胰淀素类似物包括下述式(I)的残基1-37的氨基酸序列,其中式(I)中列出的氨基酸的多达25%可以缺失或用不同氨基酸取代:
X’-Xaa1-Cys2-Asn3-Thr4-Ala5-Thr6-Cys7-Ala8-Thr9-Gln10-Arg11-Leu12-Ala13-Asn1 4-Phe15-Leu16-Val17-His18-Ser19-Ser20-Xaa21-Asn22-Phe23-Xaa24-Xaa25-Xaa26-Xaa27-Xaa28-Xaa29-Thr30-Xaa31-Val32-Gly33-Ser34-Asn35-Thr36-Tyr37-X(SEQ ID NO:92)(I)。
在式(I)中,X’是氢、N端加帽基团、或与持续时间延长模块的接头。Xaa1是Lys或键,Xaa21是Lys、Cys或Asn,Xaa24是Lys、Cys或Gly,Xaa25是Lys、Cys或Pro,Xaa26是Lys、Cys或Ile,Xaa27是Lys、Cys或Leu,Xaa28是Lys、Cys或Pro,Xaa29是Lys、Cys或Pro,且Xaa31是Lys、Cys或Asn。进一步关于式(I),变量X代表C端官能度(例如C端帽)。X是取代或未取代的氨基、取代或未取代的烃基氨基(alkylamino)、取代或未取代的二烃基氨基、取代或未取代的环烃基氨基、取代或未取代的芳基氨基、取代或未取代的芳烷基氨基、取代或未取代的烷氧基、取代或未取代的芳氧基、取代或未取代的芳烷基氧基、或羟基。如果具有式(I)残基1-37的序列的多肽组分的C端用官能度X加帽,那么优选地,X是胺,由此形成C端酰胺。在一些实施方案中,在依照式(I)的多肽组分中缺失或取代式(I)残基1-37的氨基酸的多达5%,10%,15%,20%,25%,30%,35%,40%,45%或甚至50%。在一些实施方案中,相对于式(I)中列出的氨基酸序列,胰淀素类似物组分具有0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15或甚至16处氨基酸取代。在一些实施方案中,胰淀素类似物具有相对于依照式(I)的氨基酸序列的残基1-37具有限定序列同一性的序列。在一些实施方案中,本文中描述的胰淀素类似物和式(I)的残基1-37之间的序列同一性为50%,55%,60%,65%,70%,75%,80%,85%,90%,95%或甚至更高。在一些实施方案中,可以缺失或用不同氨基酸取代式(I)的残基1-37中列出的氨基酸的多达50%,45%,40%,35%,30%,25%,20%,15%,10%,5%或甚至更少。在一些实施方案中,序列同一性在75%-100%的范围内。在一些实施方案中,序列同一性在75%-90%的范围内。在一些实施方案中,序列同一性在80%-90%的范围内。在一些实施方案中,序列同一性为至少75%。在一些实施方案中,胰淀素类似物具有式(I)的残基1-37的序列。
在一些实施方案中,胰淀素类似物(包括式(I)的那些胰淀素类似物)形成多肽组分的基础,所述多肽组分与一种或多种持续时间延长模块连接(任选地经由接头进行),以形成胰淀素多肽缀合物。如此,多肽组分充当模板(“多肽模板”),其优选地通过共价附接来与一种或多种持续时间延长模块附接。持续时间延长模块与多肽组分的连接可以经由如本文中描述的接头进行。或者,持续时间延长模块与多肽组分的连接可以经由直接的共价键进行。持续时间延长模块可以是如本文中描述的水溶性聚合物。在一些实施方案中,多种持续时间延长模块附接于多肽组分,在此情况下与每种持续时间延长模块的每种接头独立选自本文中描述的接头。
可用作本文中描述的多肽组分的胰淀素类似物包括但不限于,在下表1中提供的式(I)的残基1-37中列出的化合物。除非相反指明,以游离的羧化物和酰胺化形式两者涵盖本文中描述的所有肽,包括具有明确提供的序列的肽。
表1.可用于本文中描述的化合物的组分多肽。
术语“接头”等,在本文中描述的胰淀素多肽缀合物中持续时间延长模块与多肽组分附接的背景中,意指二价种类(-L-),其依次与具有可用于键合的一价的多肽组分及与具有可用于键合的一价的持续时间延长模块共价键合。便利地,多肽组分上可用的键合位点是侧链残基(例如赖氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸及其同系物)。在一些实施方案中,多肽组分上可用的键合位点是赖氨酸或半胱氨酸残基的侧链。在一些实施方案中,多肽组分上可用的键合位点是N端胺。在一些实施方案中,多肽组分上可用的键合位点是C端羧基。在一些实施方案中,多肽组分上可用的键合位点是其主链原子。如本文中使用的,术语“连接氨基酸残基”意指与持续时间延长模块附接(任选地经由接头进行)的式(I)的残基1-37内的氨基酸。
在一些实施方案中,提供了具有将多肽组分与持续时间延长模块共价连接的接头的化合物。接头是任选的;即任何接头可以仅是键。在一些实施方案中,接头附着于多肽组分的侧链。在一些实施方案中,接头与多肽组分的主链原子附接。
在另一个方面,提供了胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且第2位至第37位氨基酸残基已经用赖氨酸残基或半胱氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸酸残基或半胱氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接,其中氨基酸编号方式与SEQ ID NO:88中的氨基酸编号一致。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中位置2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,31,32,33,34,35,36或37之任一个中的氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中位置21,24-29或31之任一个中的氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第21位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第24位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第25位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第26位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第27位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第28位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第29位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在另一个方面,本发明涉及胰淀素多肽缀合物,其是具有SEQ ID NO:88的普兰林肽或其类似物的衍生物,其中第1位氨基酸残基是缺乏的(即脱-Lys1)且其中第31位氨基酸残基用赖氨酸残基取代,且其中所述赖氨酸残基任选地经由接头与聚乙二醇聚合物连接。
在一些实施方案中,所述持续时间延长模块是水溶性聚合物。“水溶性聚合物”意指要可用于本文中描述的方法的聚合物,其在例如温度、离子浓度等生理条件下在水中是充分可溶的,如本领域中已知的。水溶性聚合物可以增加附接有此类水溶性聚合物的肽或其它生物分子的溶解度。实际上,已经提出了这类附接作为用于体内改善施用的蛋白质的循环寿命、水溶解度和/或抗原性的手段。参见例如美国专利No.4,179,337;美国公开的申请No.2008/0032408。针对此目的已经使用了许多不同水溶性聚合物和附接化学,如聚乙二醇、乙二醇/丙二醇共聚物、羧甲基纤维素、右旋糖苷、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环、聚-1,3,6-三
烷、乙烯/马来酸酐共聚物、聚氨基酸(均聚物或随机共聚物)等。
在一些实施方案中,连接的持续时间延长模块包括聚乙二醇。致力于获得治疗可用的多肽,已经使用聚乙二醇(“PEG”)。参见例如Zalipsky,S.,1995,Bioconjugate Chemistry,6:150-165;Mehvar,R.,2000,J.Pharm.Pharmaceut.Sci.,3:125-136。如本领域技术人员领会的,PEG主链[(CH2CH2-O-)n,n:重复单体数目]是柔性的且两亲性的。不希望受任何理论或作用机制束缚,认为长的、链样的PEG分子或模块在水性介质中为严重水合的且处于快速运动中。认为此快速运动引起PEG清除较大体积,并阻止其它分子的接近和干扰。因此,当附接于另一化学实体(如肽)时,PEG聚合物链可以保护这类化学实体免于免疫学应答和其它清除机制。因此,PEG化可以通过优化药代动力学、增加生物利用度、并降低免疫原性和剂量给药频率来导致改善的药物效力和安全性。“PEG化”在习惯意义中指PEG模块与另一种化合物的缀合。例如,已经显示PEG的附接保护蛋白质免于蛋白酶解。参见例如Blomhoff,H.K.等,1983,Biochim Biophys Acta,757:202-208。除非相反明确指明,术语“PEG”、“聚乙二醇聚合物”等指聚乙二醇聚合物及其衍生物,包括甲氧基-PEG(mPEG)。
已经使用了多种手段将聚合物模块如PEG及相关聚合物附接至蛋白质上找到的反应性基团。参见例如美国专利No.4,179,337;美国专利No.4,002,531;Abuchowski等,1981,于"Enzymes as Drugs,"J.S.Holcerberg和J.Roberts,(编),第367页-第383页;Zalipsky,S.,1995,Bioconjugate Chemistry,6:150-165。已经讨论了PEG及其它聚合物修饰蛋白质的用途。参见例如Cheng,T.-L.等,1999m,Bioconjugate Chem.,10:520-528;Belcheva,N.等,1999,Bioconjugate Chem.,10:932-937;Bettinger,T.等,1998,Bioconjugate Chem.,9:842-846;Huang,S.-Y.等,1998,Bioconjugate Chem.,9:612-617;Xu,B.等1998,Langmuir,13:2447-2456;Schwarz,J.B.等,1999,J.Amer.Chem.Soc.,121:2662-2673;Reuter,J.D.等,1999,Bioconjugate Chem.,10:271-278;Chan,T.-H.等,1997,J.Org.Chem.,62:3500-3504。蛋白质中典型的附接位点包括伯氨基团如那些在赖氨酸残基上或N末端的伯氨基团、巯基基团如那些位于半胱氨酸侧链上的巯基基团、和羧基基团如那些在谷氨酸或天冬氨酸残基上或C端的羧基基团。附接的常见位点是对糖蛋白的糖残基、半胱氨酸或对靶多肽的N端和赖氨酸。术语“PEG化的”等指聚乙二醇与多肽或其它生物分子的共价附接,任选地经由如本文中描述的和/或如本领域中已知的接头进行。
在一些实施方案中,本文中描述的胰淀素多肽缀合物中的PEG模块具有在规定范围内的名义分子量。如本领域中习惯的,通过对通常以千道尔顿(kD)提供的名义分子量的提述指示PEG模块的大小。以本领域中已知的多种方式,包括数目、重量、粘度和“Z”平均分子量计算分子量。理解聚合物如PEG等以约名义平均值的分子量分布存在。
作为PEG分子量的术语的例示,术语“mPEG40KD”指具有名义分子量40千道尔顿的甲氧基聚乙二醇聚合物。对其它分子量的PEG的提述遵循这一惯例。在一些实施方案中,PEG模块具有10-100KD,20-80KD,20-60KD或20-40KD范围内的名义分子量。在一些实施方案中,PEG模块具有10,15,20,25,30,35,40,45,50,55,60,65,70,75,80,85,90,95或甚至100KD的名义分子量。优选地,PEG模块具有20,25,30,40,60或80KD的分子量。
通常将可用于多肽衍生化的PEG分子分为PEG的线性、分支和Warwick(即
)类别,如本领域中已知的。除非相反明确指示,本文中描述的PEG模块是线性PEG。此外,术语“两臂分支的”、“Y形的”等指分支的PEG模块,如本领域中已知的。在PEG背景中的术语“Warwick”,也称为“梳”或“梳型”PEG指附接于主链(通常为聚(异丁烯酸酯))的多种多臂PEG,如本领域中已知的。关于包括在本文提供的表中采用的惯例在内的命名法,缺乏相反指明,PEG模块附接于肽的主链。例如,Cmpd19是mPEG40KD与Cmpd1的N末端氮缀合的结果。类似地,Cmpd20是mPEG40KD与Cmpd2的N端氮缀合的结果。可以使用氨基酸的标准单字母缩写,也可以使用标准三字母缩写。例如,Cmpd24是Cmpd10的类似物,其中对Cmpd9的第26位残基取代赖氨酸,且赖氨酸26(即K
26)的下垂胺官能度与PEG40KD模块缀合。下表2中提供了例示性化合物。
表2.聚乙二醇化的化合物
Cmpd |
描述 |
19 |
mPEG40KD-Cmpd1 |
20 |
mPEG40KD-Cmpd2 |
21 |
[K21(mPEG40KD)]-Cmpd3 |
22 |
[K21(mPEG40KD)]-Cmpd4 |
23 |
[K26(mPEG40KD)]-Cmpd5 |
24 |
[K26(mPEG40KD)]-Cmpd6 |
25 |
[K31(mPEG40KD)]-Cmpd7 |
26 |
[K31(mPEG40KD)]-Cmpd8 |
27 |
[K26(Y-shaped-mPEG40KD)]-Cmpd5 |
28 |
[K21(mPEG40KD)]-Cmpd11 |
29 |
[K26(mPEG40KD)]-Cmpd12 |
30 |
[K31(mPEG40KD)]-Cmpd13 |
31 |
[K26(Y-shaped-mPEG40KD)]-Cmpd12 |
32 |
[K24(mPEG40KD)]-Cmpd14 |
33 |
[K25(mPEG40KD)]-Cmpd15 |
34 |
[K27(mPEG40KD)]-Cmpd16 |
35 |
[K28(mPEG40KD)]-Cmpd17 |
36 |
[K29(mPEG40KD)]-Cmpd18 |
B.配制剂
本发明的药用化合物可以与药学可接受载体或稀释剂以及任何其它已知的佐剂和赋形剂一起配制,其依照常规技术如那些披露于E.W.Martin的Remington's Pharmaceutical Sciences中的常规技术进行。亦参见Wang等(1988)J.of Parenteral Sci.and Tech.,Technical Report No.10,Supp.42:2S。
一般而言,可以将嵌合多肽配制成稳定的、安全的药物组合物以对患者施用。设想在本发明方法中使用的药物配制剂可以包含约0.01至1.0%(w/v),在某些情况下0.05至1.0%的嵌合多肽、约0.02至0.5%(w/v)的乙酸盐、磷酸盐、柠檬酸盐或谷氨酸盐缓冲物(其允许最终组合物的pH为约3.0至约7.0);约1.0至10%(w/v)碳水化合物或多元醇张力调节剂,以及任选地,约0.005至1.0%(w/v)选自下组的防腐剂:间甲酚、苯甲醇、对羟基苯甲酸甲酯、乙酯、丙酯和丁酯以及酚。如果配制的肽要包含在多用途产品中,那么一般包含这类防腐剂。
在一个具体的实施方案中,本嵌合多肽的药用配制剂可以含有一定浓度范围的化合物,例如在这些实施方案中在约0.01%至约98%w/w之间、或在约1至约98%w/w之间、或优选地在80%-90%w/w之间、或优选地在约0.01%至约50%w/w之间、或更优选地在约10%至约25%w/w之间。可以使用足量的注射用水来获得期望的溶液浓度。
若期望的话,也可以存在其它张力调节剂如氯化钠以及其它已知的赋形剂。在一些情况下,这类赋形剂可用于维持化合物的总体张力。可以以各种浓度将赋形剂包含在目前描述的配制剂中。例如,可以以下列浓度范围包含赋形剂:约0.02%至约20%w/w,优选地约0.02%和0.5%w/w之间,约0.02%至约10%w/v,或约1%至约20%w/w。另外,与目前制剂自身类似,可以以固态(包括粉末的)、液态、半固态或凝胶形式包含赋形剂。
药用配制剂可以以各种形式,例如固体、液体、半固体或液体构成。如本文中使用的,术语“固体”意指涵盖此术语的所有正常使用,例如,粉末或冻干配制剂。目前描述的配制剂可以是冻干的。
术语缓冲剂、缓冲溶液和缓冲的溶液在提及氢离子浓度或pH使用时,指系统(特别是水性溶液)在添加酸或碱后、或用溶剂稀释后对抗pH变化的能力。缓冲溶液(其在添加酸或碱时经历较小的pH变化)的特征在于,存在弱酸和该弱酸的盐、或弱碱或该弱碱的盐。前一种系统的一个例子是醋酸和醋酸钠。只要添加的水合氢离子和氢氧根离子的量不超过缓冲系统将其中和的能力,pH的变化就是略微的。
如本文中描述的,多种液体媒介物适合用于嵌合多肽的配制剂,例如水或水性/有机溶剂混合物或悬浮液。
通过将配制剂的pH维持在通过本领域中已知的方法确定的范围中来增强如本文中描述的那样使用的嵌合多肽配制剂的稳定性。在某些实施方案中,将配制剂的pH维持在约3.5至5.0或约3.5至6.5,在一些实施方案中约3.7至4.3或约3.8至4.2的范围中。在一些实施方案中,pH可以为约4.0、约5.0、约6.0、约7.0、约8.0、约9.0或甚至更高。在一些实施方案中,pH可以在生理学范围pH6-8,优选地pH7-7.6中。
在某些实施方案中,具有嵌合多肽的缓冲液是醋酸盐缓冲液(优选地,最终配制剂浓度为约1-5至约60mM)、磷酸盐缓冲液(优选地,最终配制剂浓度为约1-5至约30mM)或谷氨酸盐缓冲液(优选地,最终配制剂浓度为约1-5至约60mM)。在一些实施方案中,缓冲剂是醋酸盐(优选地,最终配制剂浓度为约5至约30mM)。
配制剂中可以包含稳定剂,但是并非是必要需要的。然而,如果包含的话,可用在本发明的实践中的稳定剂是碳水化合物或多元醇。可用在本发明实践中的合适稳定剂是约1.0至10%(w/v)碳水化合物或多元醇。多元醇和碳水化合物在其主链中具有相同特征,即-CHOH-CHOH-,其负责稳定化蛋白质。多元醇包括诸如山梨糖醇、甘露醇、甘油和聚乙二醇(PEG)等化合物。这些化合物是直链分子。在另一方面,碳水化合物如甘露糖、核糖、蔗糖、果糖、海藻糖、麦芽糖、肌醇和乳糖是可以含有酮或醛基团的环状分子。已经证明了这两类化合物在使蛋白质稳定化免于通过升高的温度及通过冷冻-融化或冷冻-干燥过程引起的变性中是有效的。合适的碳水化合物包括:半乳糖、阿拉伯糖、乳糖或对糖尿病患者没有不利影响的任何其它碳水化合物,即该碳水化合物没有代谢为在血液中形成大得不可接受的浓度的葡萄糖。适合于糖尿病的这类碳水化合物是本领域中公知的。蔗糖和果糖适合于在非糖尿病应用(例如治疗肥胖症)中与化合物一起使用。
在某些实施方案中,如果包含稳定剂,那么用多元醇如山梨糖醇、甘露醇、肌醇、甘油、木糖醇和聚丙二醇/聚乙二醇共聚物以及具有分子量200,400,1450,3350,4000,6000,8000和甚至更高的各种聚乙二醇(PEG)使化合物稳定化。在一些实施方案中,甘露醇是优选的多元醇。本发明的冻干配制剂的另一个有用的特征在于,用用来维持其稳定性的相同配制剂组分维持本文中描述的冻干配制剂的张力。在一些实施方案中,甘露醇是优选的用于此目的的多元醇。
美国药典(USP)宣称必须向包含在多剂量容器中的制剂添加抑制细菌或抑制真菌浓度的抗微生物剂。它们在使用时必须以足够的浓度存在,从而阻止在用皮下针和注射器、或使用其它侵入性投递手段(如笔型注射器)取出内容物的部分时疏忽引入到制剂中的微生物的增殖。必须评估抗微生物剂以确保与配方的所有其它组分的相容性,并且应当在总配方中评估其活性以确保在一种配制剂中有效的特定药剂在另一种中不是无效的。不罕见的是,发现一种特定的抗微生物剂在一种配制剂中会是有效的,但是在另一种配制剂中不是有效的。
防腐剂在常见的药学意义中是阻止或抑制微生物生长并且可以为此目的添加到药物配制剂以避免随之发生微生物对配制剂的酸败的物质。尽管防腐剂的量不大,不过其可以影响肽的总体稳定性。
尽管用在药物组合物中的防腐剂可以在0.005至1.0%(w/v)的范围内,在一些实施方案中单独的或与其它防腐剂组合的每种防腐剂的范围为:苯甲醇(0.1-1.0%)、或间甲酚(0.1-0.6%)、或酚(0.1-0.8%)或对羟基苯甲酸甲酯(0.05-0.25%)和乙酯或丙酯或丁酯(0.005%-0.03%)的组合。羟基苯甲酸酯类是对羟基苯甲酸的低级烷基酯。在Remington's Pharmaceutical Sciences(同上)中列出了每种防腐剂的详细描述。
当处于液体形式时,嵌合多肽可能没有吸附到玻璃容器中的玻璃上的趋势,因此可能不需要表面活性剂来进一步稳定化药物配制剂。然而,对于处于液体形式时确实具有这类趋势的化合物,应当在其配制剂中使用表面活性剂。然后,可以将这些配制剂冻干。表面活性剂经常因疏水性破坏及通过盐桥分离两者而引起蛋白质的变性。相对低浓度的表面活性剂可以施加有力的变性活性,这是由于表面活性剂模块与蛋白质上反应性位点之间的强相互作用。然而,对此相互作用的审慎使用能使蛋白质稳定化而免于界面或表面变性。任选地,能进一步稳定化嵌合多肽的表面活性剂可以以占总配制剂的约0.001至0.3%(w/v)的范围存在,且包括聚山梨酯80(即聚氧乙烯(20)山梨聚糖单油酸酯)、
(即3-[(3-胆氨丙基)二甲基铵基]1-丙烷磺酸盐)、
(例如
35,其为(聚氧乙烯(23)月桂醚)、泊洛沙姆(poloxamer)、或另一种非离子型表面活性剂。
还可以期望添加氯化钠或其它盐以调节药物配制剂的张力,这取决于选择的张力调节剂。然而,这是任选的,并且取决于选择的具体配制剂。优选地,胃肠外配制剂可以是等张的或实质性等张的。
优选的用于胃肠外产品的媒介物是水。可以通过蒸馏或反渗透来制备具有适合胃肠外施用的质量的水。注射用水是优选用在药物配制剂中的水性媒介物。
有可能的是,其它成分可以存在于药物配制剂中。这类其它成分可以包括例如湿润剂、乳化剂、油、抗氧剂、膨胀剂、张力修饰剂、螯合剂、金属离子、油质媒介物、蛋白质(例如人血清清蛋白、明胶或蛋白质)和两性离子(例如氨基酸如甜菜碱、牛磺酸、精氨酸、甘氨酸、赖氨酸和组氨酸)。另外,聚合物溶液或与聚合物的混合物提供肽受控释放的机会。当然,这类其它成分不应当不利地影响本发明的配药物制剂的总体稳定性。
容器也是注射配制剂的组成部分,并且可以视为组件,因为没有完全惰性或不以某种方式影响其含有的液体的容器,特别若液体是水性的话。因此,具体注射液的容器选择必须基于容器以及溶液组成、和其会进行的处理的考虑。如果必要的话,也可以通过使用硼硅酸盐玻璃,例如Wheaton I型硼硅酸盐玻璃#33(Wheaton I型-33)或其等同物(Wheaton Glass Co.)使肽对小瓶玻璃表面的吸附最小化。对于制造可接受的类似硼硅酸盐玻璃小瓶和药筒(cartridge)的其它供应商包括Kimbel Glass Co.,West Co.,Bunder Glas GMBH和Form a Vitrum。可以通过在存在5%甘露醇和0.02%Tween80的情况下在Wheaton I型-33硼硅酸盐血清小瓶中配制并冻干至化合物终浓度为0.1mg/ml和10mg/ml使化合物的生物学和化学特性稳定化。
对于要通过注射投递的配制剂,为了允许将针从皮下注射器导入多剂量小瓶中并在取出针时就提供再密封,优选地,将每个小瓶的开口端用由铝带适当固定的橡皮塞闭合物密封。
可以将玻璃小瓶的塞子如West4416/50,4416/50(以特氟纶(Teflon)为表面)和4406/40、Abbott5139或任何等同的塞子用作注射用药物的闭合物。对于包含肽性抗肥胖症药剂的配制剂,这些塞子与肽以及配制剂其它组分是相容的。或者,可以将肽冻干入小瓶、注射器或药筒中以用于随后的重建。可以将本发明的液体配制剂填充到1或2室的药筒、或1或2室的注射器中。
上文所描述的药物配制剂的每种组分是本领域中已知的,且记载于PHARMACEUTICAL DOSAGE FORMS:PARENTERAL MEDICATIONS,第1卷,第2版,Avis等编,Mercel Dekker,New York,N.Y.1992,其通过提述完整并入本文并用于所有目的。
上述液体配制剂的制造过程一般牵涉混合、无菌过滤和填充步骤。混合规程牵涉以特定次序(防腐剂,接着是稳定剂/张力剂、缓冲剂和肽)溶解成分或同时溶解。
备选的配制剂(例如非胃肠外)可以不需要灭菌。然而,如果灭菌是期望或必需的话,可以在开发本发明的肽药物配制剂中使用任何合适的灭菌方法。典型的灭菌方法包括过滤、蒸汽(湿热)、干热、气体(例如环氧乙烷、甲醛、二氧化氯、环氧丙烷、β-丙内酯(propiolactone)、臭氧、三氯硝基甲烷(chloropicrin)、过氧乙酸甲基溴等)、暴露于辐射源、和无菌操作。过滤是本发明液体配制剂灭菌的优选方法。无菌过滤牵涉过滤通过0.45um和0.22um(1或2),其可以串联连接。过滤后,将溶液填充到合适的小瓶或容器中。
在某些实施方案中,将本文中描述的嵌合多肽对受试者外部施用。在一些实施方案中,本发明的液体药物配制剂意图用于胃肠外施用。合适的施用途径包括肌内、静脉内、皮下、皮内、关节内、鞘内等等。在一些实施方案中,皮下施用途径是优选的。在某些实施方案中,粘膜投递也是优选的。这些途径包括但不限于口服、鼻、舌下、肺部和含服途径,其可以包括液体、半固体或固体形式的肽的施用。对于包含嵌合多肽的配制剂,经由这些途径的施用可以由于与胃肠外投递相比降低的生物利用度而需要实质上更多的化合物来获得期望的生物学效果。另外,可以通过形成聚合的微囊剂、基质、溶液、植入物和装置,并胃肠外施用它们或通过手术手段来实现胃肠外受控释放投递。受控释放配制剂的例子记载于美国专利Nos.6,368,630,6,379,704,和5,766,627中,其通过提述并入本文。这些剂量形式由于有些肽在聚合物基质或装置中包载而可以具有较低的生物利用度。参见例如美国专利Nos.6,379,704,6,379,703,和6,296,842,每篇通过提述完整并入本文并用于所有目的。
可以以剂量单位形式提供所述化合物,该剂量单位形式含有在一剂或多剂中会有效的嵌合多肽量。
如本领域技术人员会公认的,嵌合多肽的有效量会随许多因素而变化,包括受试者的年龄和重量、受试者的身体状况、待治疗的状况、和本领域中已知的其它因素。嵌合多肽的有效量还会随施用的具体组合而变化。如本文中描述的,联合施用嵌合多肽可以允许任何施用的嵌合多肽的降低量成为有效量。
C.有效剂量
本文中提供的药物组合物包括如下的组合物,其中以治疗有效量,即以有效实现其意图目的的量含有活性成分。对具体应用有效的实际量会取决于所治疗的状况,等等。例如,当在治疗糖尿病的方法中施用时,这类组合物会含有有效实现期望结果(例如降低受试者中的空腹血液葡萄糖)的活性成分量。当在治疗肥胖症的方法中施用时,这类组合物会含有有效实现期望结果(例如降低体重)的活性成分量。
施用的化合物的剂量和频率(单剂或多剂)可以随着多种因素而变化,包括施用途径;体格、年龄、性别、健康、体重、体重指数、和接受者饮食;所治疗疾病症状的性质和程度(例如响应本文中描述的化合物的疾病);存在其它疾病或其它健康相关问题;同时治疗的种类;和来自任何疾病或治疗方案的并发症。可以与本发明的方法和化合物联合使用其它治疗方案或药剂。
可以从动物模型中确定人用的治疗有效量。例如,可以将人用剂量配制为达到已经发现在动物中有效的浓度。可以通过监测一种或多种生理学参数,包括但不限于血液葡萄糖和体重,并将该剂量向上或向下调节来调节人用剂量,如上文所描述的且本领域中已知的。
剂量可以随患者要求和所采用的化合物而变化。在本发明的背景中,对患者施用的剂量应当足以随时间影响患者中的有益治疗响应。剂量大小也会通过任何不利副作用的存在、性质和程度来确定。一般地,治疗以较小的剂量启动,该剂量小于化合物的最佳剂量。此后,将剂量增加较小的增量,直到达到各情形下的最佳效果。在本发明的一个实施方案中,剂量范围是0.001%至10%w/v。在另一个实施方案中,剂量范围是0.1%至5%w/v。
然而,典型的剂量可以含有每天的下限约0.1mg至上限约200mg药物化合物。还涵盖了其它剂量范围如每剂1mg至100mg化合物,和每剂3mg至70mg。每日剂量可以以离散单位剂量投递,或在24小时时段或该24小时的任何部分中连续提供。
可以个别调节剂量量和时间间隔以提供对所治疗的特定临床适应症有效的施用化合物的水平。这会提供与个体疾病状态的严重性匹配的治疗方案。
利用本文中提供的教导,可以计划有效的预防性或治疗性处理方案,其不引起实质性毒性,但是对于治疗特定患者表明的临床症状却是完全有效的。此计划应当牵涉活性化合物的认真选择,其通过考虑下列因素如化合物效力、相对生物利用度、患者体重、不利副作用的存在和严重性、优选的施用模式、和所选药剂的毒性概况来进行。
D.毒性
特定化合物的毒性和治疗效果之间的比率是其治疗指数,并且可以表示为LD50(在50%群体中致命的化合物量)和ED50(在50%群体中有效的化合物量)之间的比率。优选展现出高治疗指数的化合物。从细胞培养测定法和/或动物研究中获得的治疗指数数据可以用于制定人用的剂量范围。优选地,这类化合物的剂量位于包括具有很少毒性或无毒性的ED50的血浆浓度范围内。剂量可以随采用的剂量形式和利用的施用途径而在此范围内变化。参见例如Fingl等,于:THE PHARMACOLOGICAL BASIS OF THERAPEUTICS,第1章,第l页,1975。确切的配制剂、施用途径和剂量可以由各个临床医师根据患者状况和使用化合物的特定方法进行选择。
VII.实施例