发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一种从组织细胞中提取DNA的试剂盒,采用本试剂盒提取DNA的含量较高。
本发明的另一个目的在于提供一种从组织细胞中提取DNA的方法,该方法耗时短,不使用有毒试剂,所提DNA含量和纯度较高。
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
结合液、调节结合液和去蛋白液,所述结合液包含3-5M的异硫氰酸胍、pH3.5-5.55-50mM的Tris-HCl、5-25%的Ttiton-X 100和5-20mM的Urea,所述调节结合液为异丙醇,所述去蛋白液包含2-6M的盐酸胍、pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl和5-50%的无水乙醇。
本发明所述结合液主要用来进一步裂解细胞,并且提供磁珠与基因组DNA结合的环境;调节结合液用于促进磁珠与基因组DNA的结合,使基因组DNA和磁珠形成磁珠-DNA复合物,而蛋白、RNA以及其他代谢产物不能结合在磁珠上;去蛋白液能有效去除磁珠上残余的蛋白质,并且保证基因组DNA不会损失。
优选地,所述结合液包含4M的异硫氰酸胍、pH4.410mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100和10mM的Urea。
优选地,所述去蛋白液包含5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl和37%的无水乙醇。
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒还包括:
预处理缓冲液、裂解液、磁珠、漂洗液和洗脱液,所述预处理缓冲液pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4,所述裂解液包含0.5-5M的NaCl、pH6.5-9.05-50mM的Tris-HCl、10-50mM的EDTA和0.25-2%的SDS,所述磁珠为一种核心为Fe3O4、外周包裹了二氧化硅的磁珠,所述漂洗液包含pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl、50-200mM的NaCl和50-80%的无水乙醇,所述洗脱液为pH7.0-8.55-50mM的Tris-HCl。
本发明所述预处理缓冲液是一种不含核酸酶的磷酸盐缓冲液,主要用来悬浮细胞或者补充样品至合适体积;裂解液为DNA的提取提供了最优的缓冲条件,既能强烈抑制DNase的活性,又能高效裂解微量样品释放DNA;磁珠采用Promega公司产品,该磁珠在磁场的存在下能迅速聚集,离开磁场能够均匀分散,不出现聚集现象;漂洗液可以去除磁珠上吸附的杂质,如多糖、纤维素、脂类及提取过程中残留的胍盐、SDS等,同时保证基因组DNA不会损失;洗脱液可以有效的将磁珠上结合的基因组DNA洗脱下来。
优选地,所述裂解液包含2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA和0.5%的SDS。
优选地,所述漂洗液包含pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl和80%的无水乙醇。
优选地,所述洗脱液为pH7.5-8.05-20mM的Tris-HCl,更优选地为pH8.010mM的Tris-HCl。
本发明还提供一种从组织细胞中提取DNA的方法,包括以下步骤:
步骤1、将样品进行预处理后充分裂解,所述样品为动物组织、植物组织、细菌、真菌、细胞或全血;
步骤2、向裂解后所得溶液加入结合液混匀并静置,所得混合液加入调节结合液再次混匀,然后与磁珠充分作用,所述结合液包含3-5M的异硫氰酸胍、pH3.5-5.55-50mM的Tris-HCl、5-25%的Ttiton-X 100和5-20mM的Urea,所述调节结合液为异丙醇;
步骤3、取所述磁珠加入去蛋白液充分混匀,所述去蛋白液包含2-6M的盐酸胍、pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl和5-50%的无水乙醇;
步骤4、漂洗所述磁珠,然后洗脱所述磁珠上结合的DNA。
优选地,所述结合液包含4M的异硫氰酸胍、pH4.410mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100和10mM的Urea。
优选地,所述去蛋白液包含5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl和37%的无水乙醇。
其中,步骤2所述加入调节结合液的量为0.25-1倍于混合液体积,优选为0.8倍于混合液体积,所述静置为在55-70℃下静置5-15min,作为优选,所述裂解为在70℃下静置10min。
其中,所述预处理采用包含pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4的预处理缓冲液进行预处理。所述预处理包括对固体样品需要用液氮研磨成粉末状或者用小刀切割成小块;对液体样品需要加入一定量预处理缓冲液补足至合适体积;对细胞瓶内生长的细胞需要先收集后再用预处理缓冲液洗涤、重悬。
其中,所述裂解采用包含0.5-5M的NaCl、pH6.5-9.05-50mM的Tris-HCl、10-50mM的EDTA和0.25-2%的SDS的裂解液进行裂解,优选地,采用包含2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA和0.5%的SDS的裂解液进行裂解。
其中,所述磁珠为一种核心为Fe3O4、外周包裹了二氧化硅的磁珠。
其中,所述漂洗采用包含pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl、50-200mM的NaCl和50-80%的无水乙醇的漂洗液进行漂洗,优选地,采用包含pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl和80%的无水乙醇的漂洗液进行漂洗。
其中,所述洗脱采用pH7.0-8.55-50mM的Tris-HCl进行洗脱,优选地,采用pH8.010mM的Tris-HCl进行洗脱。
本发明所述方法采用磁珠吸附法,通过预处理缓冲液、裂解液、结合液、调节结合液、磁珠、去蛋白液、漂洗液、洗脱液从组织细胞中提取DNA。其中,生物磁珠是一种新型的亚微米级或纳米级的功能化载体,包括磁性颗粒和有活性基团的超顺磁性材料。生物磁珠是分散在基液中而形成的磁性液体材料,超顺磁性材料在一定条件下可以在溶液中分散,而在外磁场作用下可以定向运动和富集。因此,生物磁珠兼具有液体的流动性和固体磁性材料的特点,在外磁场的作用下可以定向移动或集中,撤去外磁场后稍加振荡或抽吸又可均匀分散于液体中,从而使固液相的分离变得十分快捷方便,通过简单的洗脱就可以得所提DNA。
本发明所述方法根据不同样品耗时不同,全血、细胞瓶中培养的细胞、细菌可以在40分钟内完成提取,酵母可以在90分钟内完成提取,动植物组织由于裂解难易程度不同,可在1-4小时内完成,相比常见的离心柱提取法,提取时间均不同程度缩短。
采用本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒及方法,所提DNA含量高、纯度高,提取速度快,不采用有毒试剂。
具体实施方式
本发明公开了一种从组织细胞中提取DNA的试剂盒及其方法,本领域技术人员可以借鉴本文内容,适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是,所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的,它们都被视为包括在本发明。本发明的试剂盒及方法已经通过较佳实施例进行了描述,相关人员明显能在不脱离本发明内容、精神和范围内对本文所述的方法和应用进行改动或适当变更与组合,来实现和应用本发明技术。
依照本发明,所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
结合液、调节结合液和去蛋白液,所述结合液包含3-5M的异硫氰酸胍、pH3.5-5.55-50mM的Tris-HCl、5-25%的Ttiton-X 100和5-20mM的Urea,所述调节结合液为异丙醇,所述去蛋白液包含2-6M的盐酸胍、pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl和5-50%的无水乙醇。
本发明所述结合液主要用来进一步裂解细胞,并且提供磁珠与基因组DNA结合的环境;调节结合液用于促进磁珠与基因组DNA的结合,使基因组DNA和磁珠形成磁珠-DNA复合物,而蛋白、RNA以及其他代谢产物不能结合在磁珠上;去蛋白液能有效去除磁珠上残余的蛋白质,并且保证基因组DNA不会损失。
优选地,所述结合液包含4M的异硫氰酸胍、pH4.410mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100和10mM的Urea。
优选地,所述去蛋白液包含5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl和37%的无水乙醇。
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒还包括:
预处理缓冲液、裂解液、磁珠、漂洗液和洗脱液,所述预处理缓冲液pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4,所述裂解液包含0.5-5M的NaCl、pH6.5-9.05-50mM的Tris-HCl、10-50mM的EDTA和0.25-2%的SDS,所述磁珠为一种核心为Fe3O4、外周包裹了二氧化硅的磁珠,所述漂洗液包含pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl、50-200mM的NaCl和50-80%的无水乙醇,所述洗脱液为pH7.0-8.55-50mM的Tris-HCl。
本发明所述预处理缓冲液是一种不含核酸酶的磷酸盐缓冲液,主要用来悬浮细胞或者补充样品至合适体积;裂解液为DNA的提取提供了最优的缓冲条件,既能强烈抑制DNase的活性,又能高效裂解微量样品释放DNA;磁珠采用Promega公司产品,该磁珠在磁场的存在下能迅速聚集,离开磁场能够均匀分散,不出现聚集现象;漂洗液可以去除磁珠上吸附的杂质,如多糖、纤维素、脂类及提取过程中残留的胍盐、SDS等,同时保证基因组DNA不会损失;洗脱液可以有效的将磁珠上结合的基因组DNA洗脱下来。
优选地,所述裂解液包含2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA和0.5%的SDS。
优选地,所述漂洗液包含pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl和80%的无水乙醇。
优选地,所述洗脱液为pH7.5-8.05-20mM的Tris-HCl,更优选地为pH8.010mM的Tris-HCl。
本发明还提供一种从组织细胞中提取DNA的方法,包括以下步骤:
步骤1、将样品进行预处理后充分裂解,所述样品为动物组织、植物组织、细菌、真菌、细胞或全血;
步骤2、向裂解后所得溶液加入结合液混匀并静置,所得混合液加入调节结合液再次混匀,然后与磁珠充分作用,所述结合液包含3-5M的异硫氰酸胍、pH3.5-5.55-50mM的Tris-HCl、5-25%的Ttiton-X 100和5-20mM的Urea,所述调节结合液为异丙醇;
步骤3、取所述磁珠加入去蛋白液充分混匀,所述去蛋白液包含2-6M的盐酸胍、pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl和5-50%的无水乙醇;
步骤4、漂洗所述磁珠,然后洗脱所述磁珠上结合的DNA。
优选地,所述结合液包含4M的异硫氰酸胍、pH4.410mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100和10mM的Urea。
优选地,所述去蛋白液包含5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl和37%的无水乙醇。
其中,步骤2所述加入调节结合液的量为0.25-1倍于混合液体积,优选为0.8倍于混合液体积,所述静置为在55-70℃下静置5-15min,作为优选,所述裂解为在70℃下静置10min。
其中,所述预处理采用包含pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4的预处理缓冲液进行预处理。所述预处理包括对固体样品需要用液氮研磨成粉末状或者用小刀切割成小块;对液体样品需要加入一定量预处理缓冲液补足至合适体积;对细胞瓶内生长的细胞需要先收集后再用预处理缓冲液洗涤、重悬。
其中,所述裂解采用包含0.5-5M的NaCl、pH6.5-9.05-50mM的Tris-HCl、10-50mM的EDTA和0.25-2%的SDS的裂解液进行裂解,优选地,采用包含2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA和0.5%的SDS的裂解液进行裂解。
其中,所述磁珠为一种核心为Fe3O4、外周包裹了二氧化硅的磁珠。
其中,所述漂洗采用包含pH6.5-8.05-50mM的Tris-HCl、50-200mM的NaCl和50-80%的无水乙醇的漂洗液进行漂洗,优选地,采用包含pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl和80%的无水乙醇的漂洗液进行漂洗。
其中,所述洗脱采用pH7.0-8.55-50mM的Tris-HCl进行洗脱,优选地,采用pH8.010mM的Tris-HCl进行洗脱。
本发明所述方法根据不同样品耗时不同,全血、细胞瓶中培养的细胞、细菌可以在40分钟内完成提取,酵母可以在90分钟内完成提取,动植物组织由于裂解难易程度不同,可在1-4小时内完成,相比常见的离心柱提取法,提取时间均不同程度缩短。
取相同质量的小鼠肝脏采用本发明的方法和离心柱法分别提取DNA,本发明所提取的DNA的含量为44.5μg,OD260/OD280值为1.76;离心柱法所提取的DNA的含量为26.0μg,OD260/OD280值为1.81。
取相同质量的松针采用本发明的方法和离心柱法分别提取DNA,本发明所提取的DNA的含量为6.3μg,OD260/OD280值为1.73;离心柱法所提取的DNA的含量为1.88μg,OD260/OD280值为1.89。
取相同质量的酵母采用本发明的方法和离心柱法分别提取DNA,本发明所提取的DNA的含量为1.23μg,OD260/OD280值为1.70;离心柱法所提取的DNA的含量为0.52μg,OD260/OD280值为1.81。
取相同质量的细菌采用本发明的方法和离心柱法分别提取DNA,本发明所提取的DNA的含量为13.9μg,OD260/OD280值为1.97;离心柱法所提取的DNA的含量为4.84μg,OD260/OD280值为1.99。
取相同质量的人全血采用本发明的方法和离心柱法分别提取DNA,本发明所提取的DNA的含量为2.03μg,OD260/OD280值为1.83;离心柱法所提取的DNA的含量为1.32μg,OD260/OD280值为1.87。
以上实验表明,本发明从各种组织细胞中所提取的DNA总量均明显高于离心柱法所提取的DNA,并且其OD260/OD280值均接近于标准值1.8,表明DNA纯度较高。
下面结合实施例进一步阐述本发明。
实施例1:本发明所述试剂盒
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。具体配制方法:分别称取0.8gNaCl、0.02g KCl、0.024g KH2PO4、0.18g K2HPO4,加适量蒸馏水分别溶解后混合,再用HCl调pH7.2,然后定容到100ml。
裂解液:2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA、0.5%的SDS。具体配制方法:分别量取1M的Tris-HCl(pH为8.0)2ml、0.5M的EDTA(pH为8.0)5ml、5M的NaCl 40ml、10%的SDS 5ml,加入适量蒸馏水后定容到100ml。
结合液:4M的异硫氰酸胍、pH4.410mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100、10mM的Urea。具体配制方法:分别称取47.264g异硫氰酸胍和0.06g Urea,加入适量蒸馏水分别溶解,然后加入1M的Tris-HCl(pH为4.4)1ml、Triton-X 100 20ml,50℃加热搅拌溶解,然后定容到100ml。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl、37%的无水乙醇。具体配制方法:称取47.75g盐酸胍,加蒸馏水充分溶解,然后加入1M的Tris-HCl(pH为7.5)2ml,无水乙醇37ml,定容到100ml,充分混匀。
漂洗液:pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl、80%的无水乙醇。具体配制方法:量取pH值为7.5、浓度为1M的Tris-HCl 1ml,再量取5M的NaCl 2ml,加入适量的蒸馏水混匀,再加入80ml的无水乙醇,定容到100ml,充分混匀。
洗脱液:pH8.010mM的Tris-HCl。
实施例2:从小鼠肝脏中提取DNA
利用实施例1所述试剂盒从小鼠肝脏中提取DNA。
1、提取试剂
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。
裂解液:2M的NaCl、pH8.020mM的Tris-HCl、25mM的EDTA、0.5%的SDS。
结合液:4M的异硫氰酸胍、pH4.4 10mM的Tris-HCl、20%的Ttiton-X 100、10mM的Urea。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:5M的盐酸胍、pH7.520mM的Tris-HCl、37%的无水乙醇。
漂洗液:pH7.510mM的Tris-HCl、100mM的NaCl、80%的无水乙醇。
洗脱液:pH8.010mM的Tris-HCl。
2、提取方法
(1)将-80℃保存的肝脏组织在液氮中研磨成细粉后取10mg,转入装有180μl组织裂解液的1.5ml离心管中,涡旋震荡混匀。
(2)加入20μl蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻涡旋振荡充分混匀。
(3)将裂解物放置在56℃水浴2h直到组织消化完全,期间轻柔的振荡几次帮助裂解。
(4)加入200μl结合液,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10min。每隔2min颠倒混匀一次。
(5)冷却后加入320μl异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。
(6)加入50μl磁珠,涡旋振荡充分混匀,室温孵育5min,每隔2min颠倒混匀一次。
(7)孵育完毕后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(8)加入500μl去蛋白液,涡旋混匀后室温静置1-2min,将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(9)加入700μl漂洗液,涡旋混匀后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清。重复此步骤1次。最后一次漂洗结束后,用移液器小心吸尽残液,室温晾干10min。
(10)加200μl洗脱液,涡旋混匀后56℃放置5min,期间不断涡旋混匀,将离心管置于磁性分离架上20s,将上清移至另一干净离心管中,即得基因组DNA。
3、所提DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
同样取上述本发明提取方法中所述小鼠肝脏组织粉末10mg。采用离心柱法提取DNA,采用本发明方法提取的小鼠肝脏DNA与离心柱法提取的小鼠肝脏DNA进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,上样量为3μl,电压为100V,电泳时间为25min,结果参见图1中泳道1和6。结果显示,本发明方法所提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测显示出单一的目的条带,没有出现杂带,并且条带亮度明显亮于离心柱法提取的小鼠肝脏DNA,表明本发明方法提取的小鼠肝脏DNA含量和纯度较高。
4、所提DNA的含量及OD260/OD280值检测
使用分光光度计对采用本发明方法提取的小鼠肝脏DNA与离心柱法提取的小鼠肝脏DNA进行含量和OD260/OD280值检测,结果参见表1。
表1DNA的含量及OD260/OD280值检测
结果显示,本发明所提取的DNA总量明显高于离心柱法提取的DNA总量,此外本发明所提取的DNA的OD260/OD280值与标准值(1.8)无明显差异,表明本发明方法提取的小鼠肝脏DNA含量和纯度较高。
实施例3:从松针中提取DNA
1、本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。
裂解液:0.5M的NaCl、pH6.55mM的Tris-HCl、10mM的EDTA、0.25%的SDS。
结合液:3M的异硫氰酸胍、pH3.55mM的Tris-HCl、5%的Ttiton-X100、5mM的Urea。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:2M的盐酸胍、pH6.5 5mM的Tris-HCl、5%的无水乙醇。
漂洗液:pH6.55mM的Tris-HCl、50mM的NaCl、50%的无水乙醇。
洗脱液:pH7.05mM的Tris-HCl。
2、提取方法
采用上述提取试剂从松针中提取DNA。
(1)将松针在液氮中研磨成细粉后取20mg,转入装有180μl组织裂解液的1.5ml离心管中,涡旋震荡混匀。
(2)加入20μl蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻涡旋振荡充分混匀。
(3)将裂解物放置在56℃水浴2h直到组织消化完全,期间轻柔的振荡几次帮助裂解。
(4)加入200μl结合液,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10min。每隔2min颠倒混匀一次。
(5)冷却后加入320μl异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。
(6)加入50μl磁珠,涡旋振荡充分混匀,室温孵育5min,每隔2min颠倒混匀一次。
(7)孵育完毕后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(8)加入500μl去蛋白液,涡旋混匀后室温静置1-2min,将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(9)加入700μl漂洗液,涡旋混匀后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清。重复此步骤1次。最后一次漂洗结束后,用移液器小心吸尽残液,室温晾干10min。
(10)加100μl洗脱液,涡旋混匀后56℃放置5min,期间不断涡旋混匀,将离心管置于磁性分离架上20s,将上清移至另一干净离心管中,即得基因组DNA。
3、所提DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
同样取上述本发明提取方法中所述松针粉末20mg。采用离心柱法提取DNA,采用本发明方法提取的松针DNA与离心柱法提取的松针DNA进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,上样量为3μl,电压为100V,电泳时间为25min,结果参见图1中泳道2和7。结果显示,本发明方法所提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测显示出单一的目的条带,没有出现杂带,并且条带亮度明显亮于离心柱法提取的松针DNA,表明本发明方法提取的松针DNA含量和纯度较高。
4、所提DNA的含量及OD260/OD280值检测
使用分光光度计对采用本发明方法提取的松针DNA与离心柱法提取的松针DNA进行含量和OD260/OD280值检测,结果参见表2。
表2DNA的含量及OD260/OD280值检测
结果显示,本发明所提取的DNA总量明显高于离心柱法提取的DNA总量,此外本发明所提取的DNA的OD260/OD280值与标准值(1.8)无明显差异,表明本发明方法提取的松针DNA含量和纯度较高。
实施例4:从细菌中提取DNA
1、本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。
裂解液:5M的NaCl、pH9.050mM的Tris-HCl、50mM的EDTA、2%的SDS。
结合液:5M的异硫氰酸胍、pH5.550mM的Tris-HCl、25%的Ttiton-X 100、20mM的Urea。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:6M的盐酸胍、pH8.050mM的Tris-HCl、50%的无水乙醇。
漂洗液:pH8.0 50mM的Tris-HCl、200mM的NaCl、60%的无水乙醇。
洗脱液:pH8.550mM的Tris-HCl。
2、提取方法
采用上述提取试剂从细菌中提取DNA。
(1)取1ml过夜培养的JM109细菌,10000rpm离心30s,弃上清。加入200μl预处理缓冲液重悬,10000rpm离心30s,弃上清。将细胞振荡重悬于180μl预处理缓冲液。
(2)加入5μl溶菌酶(20mg/ml)和10μl RNAase(20mg/ml),颠倒混匀,37℃孵育20min。
(3)加入20μl蛋白酶K溶液(20mg/ml),充分混匀后加入200μl结合液,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10min。每隔2min颠倒混匀一次。
(4)冷却后加入320μl异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。
(5)加入40μl磁珠(用前充分摇匀),涡旋振荡充分混匀,室温孵育5min,每隔2min颠倒混匀一次。
(6)孵育完毕后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(7)加入500μl去蛋白液,涡旋混匀后室温静置1-2min,将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(8)加入700μl漂洗液,涡旋混匀后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清。重复此步骤1次。最后一次漂洗结束后,用移液器小心吸尽残液,室温晾干10min。
(9)加100μl洗脱液,涡旋混匀后56℃放置5min,期间不断涡旋混匀,将离心管置于磁性分离架上20s,将上清移至另一干净离心管中,即得基因组DNA。
3、所提DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
同样取上述本发明提取方法中所述JM109细菌菌液1ml。采用离心柱法提取DNA,采用本发明方法提取的JM109细菌DNA与离心柱法提取的JM109细菌DNA进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,上样量为3μl,电压为100V,电泳时间为25min,结果参见图1中泳道3和8。结果显示,本发明方法所提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测显示出单一的目的条带,没有出现杂带,并且条带亮度明显亮于离心柱法提取的JM109细菌DNA,表明本发明方法提取的JM109细菌DNA含量和纯度较高。
4、所提DNA的含量及OD260/OD280值检测
使用分光光度计对采用本发明方法提取的JM109细菌DNA与离心柱法提取的JM109细菌DNA进行含量和OD260/OD280值检测,结果参见表3。
表3DNA的含量及OD260/OD280值检测
结果显示,本发明所提取的DNA总量明显高于离心柱法提取的DNA总量,此外本发明所提取的DNA的OD260/OD280值与标准值(1.8)无明显差异,表明本发明方法提取的JM109细菌DNA含量和纯度较高。
实施例5:从酵母中提取DNA
1、本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。
裂解液:3M的NaCl、pH7.525mM的Tris-HCl、20mM的EDTA、1%的SDS。
结合液:3.5M的异硫氰酸胍、pH4.020mM的Tris-HCl、10%的Ttiton-X 100、15mM的Urea。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:3M的盐酸胍、pH7.025mM的Tris-HCl、30%的无水乙醇。
漂洗液:pH7.020mM的Tris-HCl、125mM的NaCl、70%的无水乙醇。
洗脱液:pH7.520mM的Tris-HCl。
2、提取方法
采用上述提取试剂从酵母中提取DNA。
(1)取1ml酵母培养物,12000rpm离心30s,弃上清收集菌体。
(2)加入600μl Sorbitol buffer(1M山梨醇,0.1M Na2EDTA,14mMβ-巯基乙醇),充分轻柔吹打重悬细胞,加入100U Lyticase,充分颠倒混匀,37℃温育30min消化细胞壁,中间颠倒数次帮助消化。
(3)12,000rpm离心1min,尽可能吸弃上清,加180μl预处理缓冲液充分重悬细胞团。
(4)加入20μl蛋白酶K溶液(20mg/ml),55℃水浴锅中放置15min,中间颠倒数次帮助消化。
(5)加入200μl结合液,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10min。每隔2min颠倒混匀一次。
(6)冷却后加入320μl异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。
(7)加入40μl磁珠(用前充分摇匀),涡旋振荡充分混匀,室温孵育5min,每隔2min颠倒混匀一次。
(8)孵育完毕后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(9)加入500μl去蛋白液,涡旋混匀后室温静置1-2min,将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(10)加入700μl漂洗液,涡旋混匀后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清。重复此步骤1次。最后一次漂洗结束后,用移液器小心吸尽残液,室温晾干10min。
(11)加100μl洗脱液,涡旋混匀后56℃放置5min,期间不断涡旋混匀,将离心管置于磁性分离架上20s,将上清移至另一干净离心管中,即得基因组DNA。
3、所提DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
同样取上述本发明提取方法中所述酵母培养物1ml。采用离心柱法提取DNA,采用本发明方法提取的酵母DNA与离心柱法提取的酵母DNA进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,上样量为3μl,电压为100V,电泳时间为25min,结果参见图1中泳道4和9。结果显示,本发明方法所提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测显示出单一的目的条带,没有出现杂带,并且条带亮度明显亮于离心柱法提取的酵母DNA,表明本发明方法提取的酵母DNA含量和纯度较高。
4、所提DNA的含量及OD260/OD280值检测
使用分光光度计对采用本发明方法提取的酵母DNA与离心柱法提取的酵母DNA进行含量和OD260/OD280值检测,结果参见表4。
表4DNA的含量及OD260/OD280值检测
结果显示,本发明所提取的DNA总量明显高于离心柱法提取的DNA总量,此外本发明所提取的DNA的OD260/OD280值与标准值(1.8)无明显差异,表明本发明方法提取的酵母DNA含量和纯度较高。
实施例6:从人全血中提取DNA
1、本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒
本发明所述从组织细胞中提取DNA的试剂盒包括:
预处理缓冲液:pH值为7.2,包含135mM的NaCl、2.7mM的KCl、1.5mM的KH2PO4、8mM的K2HPO4。
裂解液:1M的NaCl、pH8.015mM的Tris-HCl、30mM的EDTA、1.5%的SDS。
结合液:4.5M的异硫氰酸胍、pH4.4 15mM的Tris-HCl、15%的Ttiton-X 100、12mM的Urea。
调节结合液:分析纯的异丙醇。
生物磁珠:核心为Fe3O4、外周包裹二氧化硅,Promega公司产品。
磁性分离架:内置磁铁。
去蛋白液:4M的盐酸胍、pH7.5 15mM的Tris-HCl、40%的无水乙醇。
漂洗液:pH7.5 15mM的Tris-HCl、150mM的NaCl、75%的无水乙醇。
洗脱液:pH8.015mM的Tris-HCl。
2、提取方法
采用上述提取试剂从人全血中提取DNA。
(1)将-80℃保存一年以上的人冻存血凝块在37℃水浴锅中解冻。
(2)在1.5ml离心管中依次加入350μl预处理缓冲液和50μl人全血,轻微涡旋混匀。
(3)加入20μl蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻涡旋振荡充分混匀。
(4)加入200μl结合液,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10min。每隔2min颠倒混匀一次。
(5)冷却后加入320μl异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。
(6)加入25μl磁珠,涡旋振荡充分混匀,室温孵育5min,每隔2min颠倒混匀一次。
(7)孵育完毕后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(8)加入500μl去蛋白液,涡旋混匀后室温静置1-2min,将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清,并用移液器小心吸尽残液。
(9)加入700μl漂洗液,涡旋混匀后将离心管置于磁性分离架上20s,勿将离心管取下直接倾倒上清。重复此步骤1次。最后一次漂洗结束后,用移液器小心吸尽残液,室温晾干10min。
(10)加100μl洗脱缓冲液,涡旋混匀后56℃放置5min,期间不断涡旋混匀,将离心管置于磁性分离架上20s,将上清移至另一干净离心管中,即得基因组DNA。
3、所提DNA的琼脂糖凝胶电泳检测
同样取上述本发明提取方法中所述人全血50μl。采用离心柱法提取DNA,采用本发明方法提取的人全血DNA与离心柱法提取的酵母DNA进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,上样量为3μl,电压为100V,电泳时间为25min,结果参见图1中泳道5和10。结果显示,本发明方法所提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测显示出单一的目的条带,没有出现杂带,并且条带亮度明显亮于离心柱法提取的人全血DNA,表明本发明方法提取的人全血DNA含量和纯度较高。
4、所提DNA的含量及OD260/OD280值检测
使用分光光度计对采用本发明方法提取的人全血DNA与离心柱法提取的人全血DNA进行含量和OD260/OD280值检测,结果参见表5。
表5DNA的含量及OD260/OD280值检测
结果显示,本发明所提取的DNA总量明显高于离心柱法提取的DNA总量,此外本发明所提取的DNA的OD260/OD280值与标准值(1.8)无明显差异,表明本发明方法提取的人全血DNA含量和纯度较高。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。