RU2635087C2 - Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов - Google Patents

Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов Download PDF

Info

Publication number
RU2635087C2
RU2635087C2 RU2014136162A RU2014136162A RU2635087C2 RU 2635087 C2 RU2635087 C2 RU 2635087C2 RU 2014136162 A RU2014136162 A RU 2014136162A RU 2014136162 A RU2014136162 A RU 2014136162A RU 2635087 C2 RU2635087 C2 RU 2635087C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
reaction
acid
group
oxo
regeneration
Prior art date
Application number
RU2014136162A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2014136162A (ru
Inventor
Ортвин Эртль
Николе ШТАУНИГ
Марта СУТ
Бернд Майер
Original Assignee
Анникки Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/EP2012/067781 external-priority patent/WO2013117251A1/de
Priority claimed from AT12842012A external-priority patent/AT513721B1/de
Application filed by Анникки Гмбх filed Critical Анникки Гмбх
Publication of RU2014136162A publication Critical patent/RU2014136162A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2635087C2 publication Critical patent/RU2635087C2/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • C12P19/28N-glycosides
    • C12P19/30Nucleotides
    • C12P19/36Dinucleotides, e.g. nicotineamide-adenine dinucleotide phosphate
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/02Monosaccharides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P33/00Preparation of steroids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P41/00Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture
    • C12P41/002Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by oxidation/reduction reactions

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Plant Substances (AREA)

Abstract

Изобретение относится к способу ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, в частности, и NADP+/NADPH в совместной реакции, в котором в результате по меньшей мере двух катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций, протекающих в одной реакционной массе (реакций образования продукта), один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме, a) в реакции регенерации, при которой восстановленный кофактор преобразуется в исходную окисленную форму, восстанавливают кислород или соединение общей формулы
Figure 00000035
где R1 - линейная или разветвленная (С14)-алкильная группа или (С14)-карбоксиалкильная группа, а b) в реакции регенерации, при которой окисленный кофактор преобразуется в исходную восстановленную форму, окисляют (С48)-циклоалканол или соединение общей формулы
Figure 00000036
где R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей Н, (C1-C6) алкил, где алкил является линейным или разветвленным, (C1-C6) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и содержит от одной до трех двойных связей, арил, в частности С6-C12 арил, карбоксил, или (C14) карбоксиалкил, в частности также циклоалкил, например С38 циклоалкил, где окислительная реакция (реакции) и восстановительная реакция (реакции) протекают на одной и той же основной молекулярной цепи. Технический результат: создан способ регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, в частности, NADP+/NADPH для экономически эффективного осуществления двух или более катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций в одной реакционной массе. 13 з.п. ф-лы, 11 ил., 13 пр.

Description

Предпосылки создания изобретения
Настоящее изобретение относится к способу ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и NADP+/NADPH в совместной реакции, в котором в результате по меньшей мере двух катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций, протекающих в одной и той же реакционной массе (реакций образования продукта) один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме.
Предшествующий уровень техники
Катализируемые ферментами окислительно-восстановительные реакции используются в промышленности, например, в производстве хиральных спиртов, α-аминокислот и α-оксикислот. В промышленных окислительно-восстановительных реакциях преимущественно применяются кофакторы, например, NADH или NADPH. Особый интерес среди катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций представляют те, в которых окислительно-восстановительные кофакторы регенерируются в ходе реакции с помощью регенерационных систем. Это объясняется тем, что появляется возможность расходовать только каталитические количества дорогостоящих кофакторов (NAD(P)+/NAD(P)H). Наличие соответствующих дегидрогеназ и других ферментов привело к созданию различных систем регенерации кофакторов.
Известные системы можно классифицировать следующим образом: связанные ферментами, связанные субстратами, in vivo (системы регенерации природных кофакторов в живых организмах), фотохимические, химические и электроферментные. В заявленном способе используется связанная ферментами система регенерации. Преимущества связанных ферментами систем заключаются в высокой селективности, пригодности для получения различных продуктов и высокой степени повторного использования кофактора (полное число оборотов - TTN).
В середине 90-х годов первая система связанной ферментами регенерации кофакторов была задействована в промышленном масштабе в объеме нескольких тонн. В ней использовалась дегидрогеназа из Candida boidinii. В известных промышленных процессах, как правило, один окислительно-восстановительный фермент служит для синтеза продукта, а другой - для регенерации кофактора.
От таких способов следует отличать процессы, в которых в одной реакционной среде без промежуточного разделения имеют место две или более ферментных окислительно-восстановительных реакций, связанных с получением продукта, и две ферментные системы регенерации кофактора (одновременной или последовательной). В последнее время такие ферментные каскадные реакции, именуемые здесь совместными реакциями, привлекают большое внимание, поскольку они существенно сокращают производственные затраты, экономят время и снижают нагрузку на окружающую среду. Кроме того, ферментные каскады окислительно-восстановительных реакций облегчают преобразования, которые нелегко осуществить с помощью обычных химических реакций.
Однако осуществить одновременно несколько реакций (окисления и восстановления) в одной совместной реакции с параллельной регенерацией кофактора затруднительно, поскольку часто для отдельных преобразований требуются совершенно разные условия реакции. На сегодняшний день выполнено незначительное число опытов ведения совместных реакций, включающих окислительные и восстановительные реакции с задействованными системами регенерации кофакторов.
В литературе (Advanced Synth. Catal., 2008, Volume 351, Issue 9, p. 1303-1311) описана экспериментальная совместная реакция с участием 7α-гидроксистероид-дегидрогеназы, (HSDH), 7β-HSDH и 12α-HSDH. В этом процессе окисление, как региоселективное, так и стереоселективное, имеет место в положениях 7 и 12 холевой кислоты, с последующим регио- и стереоселективным восстановлением в положении 7. При этом системами регенерации кофактора служат как лактат-дегидрогеназа (NAD+-зависимая), так и глюкозо-дегидрогеназа (NADP+-независимая). Косубстратами являются пируват и глюкоза. Хотя изначально этот процесс замышлялся как совместный, в конце его окислительные и восстановительные реакции выполняются раздельно. При этом разделение этапов окисления и восстановления осуществляют в так называемом реакторе типа «чайный пакет» или в мембранном реакторе. Такое разделение необходимо, чтобы избежать образования побочных продуктов ввиду низкой селективности NADPH-глюкозо-дегидрогеназы по отношению к кофактору. Однако в ходе совместной реакции NADP+ в глюкозо-дегидрогеназе частично преобразуется в NAD+, что препятствует окислению. В описанном способе используется всего 12.5 мМ (~0,5%) субстрата - холевой кислоты, что делает способ неинтересным с экологической точки зрения.
Более того, описана также попытка осуществить дерацемизацию рацематов вторичных спиртов через промежуточный прохиральный кетон с использованием совместной реакции (J. Am. Chem. Soc, 2008, Volume 130, p. 13969-13972). Дерацемизацию вторичных спиртов осуществляют через две спиртовые дегидрогеназы (S- и R-специфичные), обладающие различной специфичностью по отношению к кофактору. В данной системе NADP регенерируют NADPH-оксидазой (создающей перекись водорода), a NADH - формиатной дегидрогеназой. Косубстратами служат формиат и кислород. В этой системе используют 4 фермента, а стадии окисления и восстановления не разделяются. Недостатком способа является крайне низкая концентрация используемого субстрата - 0.2-0.5%, что непригодно для промышленных масштабов.
Еще одна совместная реакция описана в WO 2009/121785 А2. Здесь стереоизомер оптически активного вторичного спирта окисляют до кетона, а затем восстанавливают до соответствующего оптического антипода с применением двух спиртовых дегидрогеназ, имеющих противоположную стереоселективность и различную специфичность по отношению к кофактору. Кофакторы регенерируют с помощью так называемой «системы переноса гидрида», с только одним дополнительным ферментом. Для регенерации кофакторов используют различные ферменты, например, формиат-дегидрогеназу, глюкозо-дегидрогеназу, лактат-дегидрогеназу. Недостатком данного процесса является низкая концентрация субстратов.
Общим недостатком известных ферментных совместных способов с участием систем регенерации кофакторов является очень низкая концентрация субстрата, недостаточная для промышленных процессов.
Напротив, уже известны многие индивидуальные ферментные окислительно-восстановительные реакции, в которых используются системы регенерации кофакторов. Описаны опыты с цельными микроорганизмами, лизатами клеток или выделенными ферментами, которым сопутствует регенерация NAD(P)H или NAD(P)+. К известным ферментным системам регенерации кофакторов относятся, например, формиат-дегидрогеназа для NADH (косубстратом служит формиат), спиртовая дегидрогеназа из Pseudomonas sp. для NADH (косубстратом служит 2-пропанол), гидрогеназа для NADH и NADPH (косубстратом служит Н2), глюкоза-6-фосфат-дегидрогеназа из L. mesenteroides для NADPH (косубстратом служит глюкоза-6-фосфат), глюкозо-дегидрогеназа для NADH и NADPH (косубстратом служит глюкоза), NADH оксидаза для NADH (косубстратом служит О2) и фосфит-дегидрогеназа для NADH (косубстратом служит фосфит).
В качестве примера можно привести использование таких индивидуальных окислительно-восстановительных реакций в производстве хиральных гидроксисоединений, начиная с соответствующих прохиральных кетосоединений. Здесь кофактор регенерируют с помощью дополнительного фермента. Общим для этих способов является то, что реакция восстановления протекает изолированно и что регенерируется NAD(P)H (см., например, ЕР 1152054).
Описаны ферментные процессы с использованием гидроксистероидных дегидрогеназ в сочетании с системой регенерации кофактора, которые протекают при повышенных концентрациях субстрата (> около 1%) (ЕР 1731618; WO 2007/118644; Appl. Microbiol. Biotechnol., 2011 Volume 90 p. 127-135). В таких способах кофакторы NAD(P)H или NAD(P) регенерируют с помощью различных ферментов, например, лактат-дегидрогеназы (косубстратом служит пируват), спиртовой дегидрогеназы из Т. brockii (косубстратом служит изопропанол), спиртовой дегидроненазы из L. brevis, L. minor, Leuconostoc carnosum, Т. ethanolicus, Clostridium beijerinckii. Однако эти известные способы относятся только к изолированным одиночным реакциям окисления гидроксисоединения или восстановления оксосоединения.
Уже была описана система регенерации кофактора для NADH с использованием малат-дегидрогеназы («малатного фермента») (Can. J. Chem. Eng. 1992, Volume 70, p. 306-312). В этой публикации речь идет о восстановительном аминировании пирувата аланин-дегидрогеназой. Пируват, образующийся при регенерации кофактора, далее используют в реакции образования продукта.
В WO 2004/022764 также описана регенерация NADH малат-дегидрогеназой. В отличие от предыдущей публикации, пируват, образующийся при окислительном декарбоксилировании малата, далее не используется.
Описан пример ферментного восстановления D-ксилозы до ксилита с применением системы регенерации кофактора (FEBS J., 2005, Volume 272, р. 3816-3827). Ферментом, регенерирующим кофактор, служит NADPH-зависимый мутант фосфит-дегидронегазы из Pseudomonas sp. Здесь также имеет место одиночная реакция образования целевого продукта.
Опубликованы и другие примеры ферментативного получения обогащенных хиральными энантиомерами органических соединений - спиртов, аминокислот и т.п. (Organic Letters, 2003, Volume 5, p. 3649-3650; US 7,163,815; Biochem. Eng. J., 2008, Volume 39(2) p. 319-327; ЕР 1285962). В этих системах ферментом, регенерирующим кофактор, служит NAD(P)H-зависимая оксидаза из Lactobacillus brevis или Lactobacillus sanfranciscensis. Речь идет подобным образом об одиночной реакции образования целевого продукта.
В WO 2011/000693 описаны 17-бета-гидроксистероид-дегидрогеназа и способ, позволяющие осуществить окислительно-восстановительные реакции в положении 17 4-андростен-3,17-диона. Это опять-таки одиночная восстановительная реакция. Все рассмотренные индивидуальные реакции окисления или восстановления не обладают преимуществами совместной реакции - низкой себестоимостью за счет экономии времени и материалов и лучшей кратностью оборота за счет ферментных каскадных реакций.
Задача изобретения и описание способа
Задачей настоящего изобретения является создание способа регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, например, и NADP+/NADPH для экономически эффективного осуществления двух или более катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций в одной реакционной массе.
В соответствии с изобретением поставленная задача достигается тем, что в указанном выше способе ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, например, и NADP+/NADPH, путем совместной реакции, в котором в результате по меньшей мере двух катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций в одной реакционной массе (реакций образования целевого продукта) один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме, указанный способ отличается тем, что
а) в реакции регенерации, при которой восстановленный кофактор преобразуется в исходную окисленную форму, восстанавливают кислород или соединение общей формулы
Figure 00000001
где R1 - линейная или разветвленная (С14-алкильная группа или (С14)-карбоксиалкильная группа, а
b) в реакции регенерации, в которой окисленный кофактор преобразуется в исходную восстановленную форму, окисляют (С48)-циклоалканол или соединение общей формулы
Figure 00000002
где R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей Н, (C16) алкил, где алкил является линейным или разветвленным, (C16) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и содержит от одной до трех двойных связей, арил, в частности, С612 арил, карбоксил или (С14) карбоксиалкил, в частности, циклоалкил, например, С3-C8 циклоалкил.
Способ, заявленный в настоящем изобретении, также называется «способом в соответствии с настоящим изобретением».
В ином аспекте в соответствии с настоящим изобретением заявлен способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, например, и NADP+/NADPH, путем совместной реакции, где в результате по меньшей мере двух дальнейших катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций в той же реакционной массе (реакций образования целевого продукта) один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме, отличающийся тем, что
a) в ходе регенерации окисленного кофактора восстанавливают соединение общей формулы
Figure 00000003
где R1 - замещенная или незамещенная С14 алкильная группа, а
b) в ходе регенерации восстановленного кофактора окисляют соединение общей формулы
Figure 00000004
где R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей
1) - H,
2) - (С16) алкил, где алкил является линейным или разветвленным,
3) - (C16) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и выборочно содержит от одной до трех двойных связей,
4) - циклоалкил, в частности, С3-C8 циклоалкил.
5) - арил, в частности, С612 арил,
6) - (С14) карбоксиалкил, а в случае, если соединение формулы I является пируватом, и выборочно, также карбоксил.
В еще одном аспекте в способе в соответствии с изобретением R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей Н, (С16) алкил, где алкил является линейным или разветвленным, (C16) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и содержит от одной до трех двойных связей, арил, в частности, С612 арил, карбоксил или (С14) карбоксиалкил.
По сравнению с уровнем техники способ в соответствии с изобретением существенно усовершенствует процессы, в которых соединения подвергаются как ферментному окислению, так и восстановлению, поскольку позволяет вести необходимые реакции окисления и восстановления, а также сопутствующие реакции регенерации кофактора, в одной реакционной массе, используя гораздо более высокие, чем в известных способах, концентрации субстрата.
В способе в соответствии с данным изобретением используются кофакторы NADH и/или NADPH. NAD+ означает окисленную форму, a NADH - восстановленную форму никотинамидаденин динуклеотида, тогда как NADP+ означает окисленную форму, a NADPH - восстановленную форму никотинамидаденин динуклеотидфосфата.
Катализируемые ферментами окислительно-восстановительные реакции, которые не связаны с регенерацией кофактора, а в способе в соответствии с изобретением участвуют в образовании целевого продукта, называются «окислительными реакциями» и «восстановительными реакциями». «Окислительные реакции» и «восстановительные реакции» объединены термином «реакции образования продукта». В способе в соответствии с данным изобретением в каждом случае имеет место по меньшей мере одна окислительная реакция и по меньшей мере одна восстановительная реакция.
Если NAD+ служит кофактором для окислительной реакции (реакций), то NADPH является кофактором для восстановительной реакции (реакций). Если NADP+ служит кофактором для окислительной реакции (реакций), то NADH является кофактором для восстановительной реакции (реакций).
В способе в соответствии с настоящим изобретением окислительную реакцию (реакции) и восстановительную реакцию (реакции) можно вести хронологически параллельно или в хронологической последовательности, предпочтительно хронологически параллельно в одной реакционной массе.
Соединения, используемые для получения целевого продукта, далее называются субстратами. Соединения, которые реагируют при регенерации кофакторов, далее называются косубстратами.
В способе в соответствии с настоящим изобретением могут использоваться один или несколько субстратов. При этом окислительные и/или восстановительные реакции могут протекать как на одном субстрате (основной молекулярной цепи), так и на разных субстратах, предпочтительно на одном субстрате. Далее, в способе в соответствии с настоящим изобретением восстановительные и/или окислительные реакции могут протекать на одной или разных функциональных группах.
Способ в соответствии с настоящим изобретением пригоден для разнообразных реакций, например, для инверсии конфигурации стереоизомерных гидроксисоединений путем окисления до соответствующего кетона с последующим восстановлением до противоположного стереоспецифического гидроксисоединения.
Процесс, в котором для образования продукта используются две или более ферментные окислительно-восстановительные реакции, а две ферментные системы для регенерации кофакторов действуют в одной реакционной массе без выделения промежуточных соединений, здесь называется «совместной реакцией».
Если здесь упоминается какая-либо кислота или соль кислоты, подразумеваются ее соответствующие неназванные соединения. Подобным образом упоминание кислот, в частности, желчных кислот, подразумевает все производные эфиры таких кислот. Далее, упоминание какого-либо вещества подразумевает наличие защитных групп, в т.ч. частичных.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что окислительная реакция и восстановительная реакция протекают хронологически параллельно.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что окислительная реакция и восстановительная реакция протекают на одной основной молекулярной цепи.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что в качестве соединения формулы I (2-оксокислоты) используют пируват (косубстрат), который восстанавливают до лактата с помощью лактат-дегидрогеназы, т.е. в реакции регенерации, при которой восстановленный кофактор возвращают в исходную окисленную форму, пируват восстанавливают до лактата с помощью лактат-дегидрогеназы.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что в качестве соединения формулы II (вторичного спирта) используют 2-пропанол (изопропиловый спирт, IPA) (косубстрат), который окисляют до ацетона с помощью спиртовой дегидрогеназы, т.е. в реакции регенерации, при которой окисленный кофактор возвращают в исходную восстановленную форму, 2-пропанол окисляют до ацетона с помощью спиртовой дегидрогеназы.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что используют кислород, восстановленный с помощью NADH оксидазы.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что в качестве вторичного спирта используют малат (косубстрат), который окисляют до пирувата и СО2 с помощью декарбоксилирующей оксалоацетат малат-дегидрогеназы («малатного фермента»), т.е. в реакции регенерации, при которой окисленный кофактор возвращают в исходную восстановленную форму, малат окисляют до пирувата и СО2 с помощью с помощью малат-дегидрогеназы.
В этом варианте образующийся пируват вступает в последующую окислительно-восстановительную реакцию, которая не связана с образованием целевого продукта, а представляет собой реакцию регенерации второго кофактора.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что его используют для проведения по меньшей мере одной окислительной реакции и по меньшей мере одной восстановительной реакции соответственно в той же реакционной массе на соединениях общей формулы
Figure 00000005
где
R4 - водород, метальная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R5 - водород, гидроксигруппа, оксогруппа или метальная группа,
R6 - водород или гидроксигруппа,
R7 - водород, -COR13, где R13 - С14 алкильная группа, незамещенная или замещенная гидроксигруппой, или С14 карбоксиалкильная группа, замещенная, в частности, гидроксигруппой или незамещенная,
или R6 и R7 вместе представляют собой оксогруппу,
R8 - водород, метильная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R9 - водород, метильная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R10 - водород, метильная группа или галоген,
R11 - водород, метильная группа, гидроксигруппа, оксогруппа или галоген, а
R12 - водород, гидроксигруппа, оксогруппа или метильная группа,
где структурный элемент
Figure 00000006
означает бензольное кольцо или кольцо, содержащее 6 атомов углерода и 0, 1 или 2 С-С-двойные связи;
причем субстрат (субстраты) предпочтительно присутствуют в концентрации <5 мас. % в реакционной массе для восстановительной реакции (реакций), связанных с образованием целевого продукта.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что имеет место ферментное преобразование дегидроэпиандростерона (DHEA) формулы
Figure 00000007
в тестостерон формулы
Figure 00000008
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что ферментная эпимеризация гидроксистероидного соединения 3α,7α-дигидрокси-5β-холановой кислоты (хенодеоксихолевой кислоты, CDC) формулы
Figure 00000009
происходит путем окисления до кетолитохолевой кислоты (KLC) формулы
Figure 00000010
и восстановления до 3α,7β-дигидрокси-5β-холановой кислоты (урсодеоксихолевой кислоты, UDC) формулы
Figure 00000011
например, с использованием двух противоположных стереоспецифических гидроксистероидных дегидрогеназ.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что его используют для ферментной эпимеризации гидроксистероидного соединения 3α,7α,12α-тригидрокси-5β-холановой кислоты (холевой кислоты) формулы
Figure 00000012
путем либо
А) окисления с получением 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-CDC) формулы
Figure 00000013
которая далее реагирует с получением 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-KLC) формулы
Figure 00000014
и последующего восстановления до стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы
Figure 00000015
либо
В) путем окисления с получением 3α,12α-дигидрокси-7-оксо-5β-холановой кислоты формулы
Figure 00000016
с последующим ферментным окислением с получением 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-KLC) формулы XI и последующим восстановлением до стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы XII, либо
С) путем окисления с получением 3α,12α-дигидрокси-7-оксо-5β-холановой кислоты формулы XIII с последующим ферментным восстановлением до 3α,7β,12α-тригидрокси-5β-холановой кислоты формулы
Figure 00000017
и с последующим окислением с получением стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы XII;
либо
с помощью любой комбинации А), В) и/или С),
например, с использованием 3 стереоспецифичных гидроксистероидных дегидрогеназ, 2 из которых обладают противоположной стереоспецифичностью.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что в качестве субстрата используют С5- или С6-сахар, например, способ используют для изомеризации С5- или С6-сахаров.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что изомеризацию глюкозы осуществляют путем восстановления до сорбита и окисления до фруктозы, например, способ используют для изомеризации глюкозы путем ее восстановления до сорбита и последующего окисления до фруктозы.
Способ в соответствии с настоящим изобретением предпочтительно осуществляют в водной системе, где субстрат для реакции восстановления и окисления частично присутствует в нерастворенном состоянии в виде суспензии и/или в виде второй жидкой фазы.
В одном из вариантов осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что субстрат (субстраты) для окислительной реакции (реакций), связанных с получением продукта, вводят в реакционную массу в концентрации по меньшей мере 5 мас. % и более, предпочтительно 7 мас. % и более, особенно предпочтительно 9 мас. % и более, в пределах от 5 до 20 мас. %, например, 5-15 мас. %, например, 5-12 мас. %, например, 5-10 мас. %.
В одном из вариантов осуществления изобретения способ в соответствии с настоящим изобретением отличается тем, что в реакциях получения продукта в целом достигается конверсия >70%, в частности, >90%.
В способе в соответствии с настоящим изобретением в водную систему можно добавлять буфер. Пригодными буферами являются, например, фосфат калия, Tris-HCl и глицин с pH от 5 до 10, предпочтительно от 6 до 9. В дополнение или вместо них в систему можно вводить для стабилизации ферментов ионы, например, Mg2+, или другие добавки. В способе в соответствии с настоящим изобретением концентрация введенных кофакторов NAD(P)+ и NAD(P)H обычно составляет от 0.001 мМ до 10 мМ, предпочтительно от 0.01 мМ до 1 мМ.
В зависимости от используемых ферментов способ в соответствии с настоящим изобретением можно осуществлять при температуре от 10°С до 70°С, предпочтительно от 20°С до 45°С.
Гидроксистероидные дегидрогеназы (HSDH) - это ферменты, которые катализируют окисление гидроксигрупп в соответствующие кетогруппы или, наоборот, восстановление кетогрупп до соответствующих гидроксигрупп в стероидном скелете.
Пригодные гидроксистероидные дегидрогеназы, которые могут использоваться для окислительно-восстановительных реакций на гидроксистероидах, - это, например, 3α-HSDH, 3β-HSDH, 7α-HSDH, 7β-HSDH или 17β-HSDH.
Пригодные ферменты с активностью 7α-HSDH можно получить, например, из Clostridia (Clostridium absonum, Clostridium sordelii), Escherichia coli или Bacteroides fragilis.
Пригодные ферменты с активностью 7β-HSDH можно получить, например, из Ruminococcus sp. или Clostridium absonum.
Пригодные лактат-дегидрогеназы можно получить, например, из Oryctolagus cuniculus.
Пригодные спиртовые дегидрогеназы можно получить, например, из Lactobacillus kefir.
Пригодную ксилозо-редуктазу можно получить, например, из Candida tropicalis.
Пригодные сорбит-дегидрогеназы можно получить, например, из печени овец, Bacillus subtilis или Malus domestica.
Пригодные NADH-оксидазы можно получить, например, из Leuconostoc mesenteroides, Streptococcus mutans, Clostridium aminovalericum.
В способе в соответствии с настоящим изобретением ферменты преимущественно используются как белки, имеющие рекомбинантную сверхпродукцию в Е. coli, а лизаты соответствующих клеток преимущественно используются повторно без дальнейшей очистки. Поэтому единица фермента 1 U соответствует количеству фермента, необходимому для реакции с 1 мкмолем субстрата в минуту.
Описание чертежей
На фиг. 1 представлена схема реакции эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту через промежуточную 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и пируват.
На фиг. 2 представлена схема реакции эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту через промежуточную 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют малат и пируват.
На фиг. 3 представлена схема реакции эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту через промежуточную 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и кислород.
На фиг. 4 представлена схема реакции изомеризации глюкозы в фруктозу, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и пируват.
На фиг. 5 представлена схема реакции изомеризации глюкозы в фруктозу, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и кислород.
На фиг. 6 представлена схема реакции эпимеризации холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту через промежуточные 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту и 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и пируват.
На фиг. 7 представлена схема реакции эпимеризации холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту через промежуточные 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту и 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и кислород.
На фиг. 8 и фиг. 9 представлены схемы реакции эпимеризации холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту через промежуточные 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту и 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановую кислоту, причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол, пируват и кислород.
На фиг. 10 представлены возможные схемы реакции эпимеризации холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту через различные промежуточные соединения и с различными системами регенерации кофакторов. Для регенерации NAD+ используют либо лактат-дегидрогеназу (субстратом служит пируват), либо NADH-оксидазу (субстратом служит кислород). Для регенерации NADPH используют спиртовую дегидрогеназу (субстратом служит изопропанол).
На фиг. 11 представлена схема реакции эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту через промежуточную 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановую кислоту (7-кетолитохолевую кислоту = 7K-LCA=KLC), причем для регенерации кофактора используют 2-пропанол и 2-пентанол (то и другое для спиртовой дегидрогеназы), а также пируват (для лактат-дегидрогеназы) и кислород (для NADH-оксидазы).
На чертежах приняты следующие сокращения:
BsSDH сорбит-дегидрогеназа из Bacillus subtilis
СА = 3α,7α,12α-тригидрокси-5β-холановая кислота
7β-СА = 3α,7β,12α-тригидрокси-5β-холановая кислота
Саохо NADH-оксидаза из Clostridium aminovalericum
CDC, CDCA 3α,7α-дигидрокси-5β-холановая кислота
CtXR ксилозо-редуктаза из Candida tropicalis
7α-HSDH 7α-гидроксистероидная дегидрогеназа
7β-HSDH 7β-гидроксистероидная дегидрогеназа
12α-HSDH = 12α-гидроксистероидная дегидрогеназа
KLC 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановая кислота
7K-LCA = 3α-гидрокси-7-оксо-5β-холановая кислота
LacDH NAD(Н)-зависимая лактат-дегидрогеназа
LkADH NADP(Н)-зависимая спиртовая дегидрогеназа из Lactobacillus kefir
Lmoxid = NADH-оксидаза из Leuconostoc mesenteroides
MalDH NADP(Н)-зависимая малат-дегидрогеназа из Е. coli
7охо-СА = 3α,12α-дигидрокси-7-оксо-5β-холановая кислота
12oxo-CDC = 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановая кислота
12oxo-KLC = 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановая кислота
12oxo-UDC = 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановая кислота
SISDH сорбит-дегидрогеназа из печени овец
SmOxo NADH-оксидаза из Streptococcus mutans
UDC. UDCA 3α,7β-дигидрокси-5β-холановая кислота
В нижеследующих примерах все данные о температуре приведены в градусах Цельсия (°С). Использованы следующие сокращения:
EtOAc этилацетат
h час(часы)
IPA изопропиловый спирт (2-пропанол)
МеОН метанол
Rt комнатная температура
Пример 1
Эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и спиртовой дегидрогеназы кофакторов
Используют 0.5 мл загрузки, включающей 50 мг хенодеоксихолевой кислоты, 12 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 6 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 0.5 мМ NAD+ и 0.3 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 6 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы и 350 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 6 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и поначалу 2.4 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону урсодеоксихолевой кислоты. Через 6 часов дополнительно дозируют 1.6 мас. % IPA, через 16 часов - еще 2.4 мас. % IPA, через 24 часа - 3.9 мас. % IPA и через 40 часов - 0.8 мас. % IPA. Кроме того, через 24 часа добавляют 20 мкл 4-метил-2-пентанола. Через 46 часов добавляют 200 мкл 2-пентанола и 1.6 мас. % IPA. Через 48 часов доля урсодеоксихолевой кислоты среди всех желчных кислот в реакционной смеси составляет >97%.
Пример 2
Эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и малат-дегидрогеназы кофакторов
Используют 0.5 мл загрузки, включающей 50 мг хенодеоксихолевой кислоты, 20 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 20 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 1 мМ NAD+ и 1 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 10 U лактат-дегидрогеназы (фирмы Sigma-Aldrich), а для запуска реакции - 16.5 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 20 U рекомбинантной малат-дегидрогеназы из Escherichia coli и 320 мМ малата натрия. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать выделению образующегося СО2. Через 16 часов и через 40 часов дополнительно дозируют 20 U 7α-HSDH и 10 U лактат-дегидрогеназы. Через 20, 24, 44 и 48 часов дополнительно дозируют 10 U 7β-HSDH. Наконец, через 40 часов добавляют 10 U малат-дегидрогеназы. Через 72 часа доля урсодеоксихолевой кислоты среди всех желчных кислот в реакционной смеси составляет около 90%.
Пример 3
Эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от NADH-оксидазы и спиртовой дегидрогеназы кофакторов
Используют 0.5 мл загрузки, включающей 50 мг хенодеоксихолевой кислоты, 12 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 7.5 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 1 мМ NAD+ и 1 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 20 U рекомбинантной NADH-оксидазы из Clostridium aminovalericum. Для регенерации NADPH используют 5 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и поначалу 2% мас. IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 6) при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону урсодеоксихолевой кислоты. Через 18 часов, 22 часа, 26 часов и 41 час дополнительно дозируют по 2 мас. % IPA, а через 41 час и 48 часов - еще по 5% IPA. Через 24 часа добавляют 20 U NADH-оксидазы, а через 41 час - 7,5 U 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы и 5 U спиртовой дегидрогеназы. Через 48 часов доля урсодеоксихолевой кислоты среди всех желчных кислот в реакционной смеси составляет около 95-98%.
Пример 4
Переработка и анализ желчных кислот
По завершении реакций, описанных в примерах 1-3, реакционную смесь экстрагируют EtOAc. Затем растворитель удаляют выпариванием. Выпаренный осадок растворяют в смеси МеОН:ацетонитрил:буферный фосфат натрия с рН 3, 0.78 г/л (40:30:37) и контролируют конверсию хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту высокоточной жидкостной хроматографией. Для этого используют сепарационную колонку с обратной фазой (ZORBAX®Eclipse® XDB С18, расход 0.8 мл/мин) и детектор рефракции света (RID) модели Agilent 1260 Infinity®, оба фирмы Agilent Technologies Inc.
Пример 5
Конверсия глюкозы в фруктозу с помощью ксилозо-редуктазы и сорбит-дегидрогеназы при использовании спиртовой дегидрогеназы для регенерации NADPH и лактат-дегидрогеназы для регенерации NAD+
Загрузка 0.5 мл содержит 50 мг/мл глюкозы и 6 U/мл рекомбинантной ксилозо-редуктазы из Candida tropicalis (сверхпродуцированной в E. coli BL21 (DE3)) и 0.1 мМ NADP+. Для регенерации кофактора добавляют 7% IPA и рекомбинантную спиртовую дегидрогеназу из Lactobacillus kefir (сверхпродуцированную в E. coli BL21 (DE3)). Ферменты применяют в виде лизатов клеток. Реакцию проводят в течение 24 часов при 40°С и рН 9 (50 мМ буфера Tris-HCl) в открытой системе с непрерывным перемешиванием (900 об/мин). Открытость системы позволяет удалять ацетон, что способствует сдвигу реакции в сторону образования сорбита. В открытой системе вода и IPA также испаряются, поэтому их дополнительно дозируют через 6 часов и через 21 час. Таким образом, в системе постоянно поддерживается общий объем 0.5 мл и концентрация IPA 7 об. %. Через 24 часа реакционную массу инкубируют в вакууме при 60°С с целью инактивации ферментов и испарения органических растворителей. После охлаждения до комнатной температуры добавляют рекомбинантную сорбит-дегидрогеназу из Bacillus subtilis (сверхпродуцированную в E. coli BL21 (DE3)) в конечной концентрации 5 U/мл, ZnCb в конечной концентрации 1 мМ и NAD+ в конечной концентрации 0.1 мМ. Для регенерации кофактора используют 5 U/мл (конечная концентрация) лактат-дегидрогеназы из мышечной массы кролика (фирмы Sigma Aldrich) и 300 мМ пирувата. Загрузку доливают водой до объема 0.5 мл. Реакцию проводят еще 24 часа при 40°С в закрытой системе с непрерывным перемешиванием (900 об/мин). Достигается конверсия D-глюкозы в D-фруктозу >90%.
Пример 6
Конверсия глюкозы в фруктозу с помощью ксилозо-редуктазы и сорбит-дегидрогеназы при использовании спиртовой дегидрогеназы для регенерации NADPH и NADH-оксидазы для регенерации NAD+
Загрузка 0.5 мл содержит 50 мг/мл глюкозы, 6 U/мл рекомбинантной ксилозо-редуктазы из Candida tropicalis (сверхпродуцированной в E.coli BL21 (DE3)) и 0.1 мМ NADP+. Для регенерации кофактора добавляют 7 об. % IPA и рекомбинантную спиртовую дегидрогеназу из Lactobacillus kefir (сверхпродуцированную в E. coli BL21 (DE3)). Ферменты применяют в виде лизатов клеток. Реакцию проводят в течение 24 часов при 40°С и рН 8 (50 мМ буфера Tris-HCl) в открытой системе с непрерывным перемешиванием (900 об/мин). Открытость системы позволяет удалять ацетон, что способствует сдвигу реакции в сторону образования сорбита. В открытой системе вода и IPA также испаряются, поэтому их дополнительно дозируют через 6 часов и через 21 час. Таким образом, в системе постоянно поддерживается общий объем 0.5 мл и концентрация IPA 7 об. %. Через 24 часа реакционную массу инкубируют в вакууме при 60°С с целью инактивации ферментов и испарения IPA и любых органических растворителей. После охлаждения до комнатной температуры добавляют рекомбинантную D-сорбит-дегидрогеназу из Bacillus subtilis (сверхпродуцированную в E. coli BL21 (DE3)) в конечной концентрации 5 U/мл, CaCl2 в конечной концентрации 1 мМ и смесь NAD+ и NADH в конечной концентрации 0.1 мМ. Для регенерации кофактора используют 10 U/мл (конечная концентрация) NADH-оксидазы из Leuconostoc mesenteroides (сверхпродуцированной в E. coli BL21 (DE3)). Ферменты применяют в виде лизатов клеток. Загрузку доливают водой до объема 0.5 мл. Реакцию проводят 24 часа при 40°С в открытой системе с непрерывным перемешиванием (900 об/мин), чтобы обеспечить достаточное поступление кислорода из воздуха для NADH-оксидазы. В этой открытой системе вода испаряется. Поэтому через 6 часов и через 21 час ее доливают водой до объема 0,5 мл. Достигается конверсия D-глюкозы в D-фруктозу около 98%.
Пример 7
Переработка и анализ сахаров
Загрузку инкубируют при 65°С 10 мин для инактивации ферментов и затем центрифугируют. Супернатант фильтруют сквозь фильтр из ПВДФ 0,2 мкм и анализируют лигандообменной высокоточной жидкостной хроматографией (аппаратура фирмы Agilent Technologies Inc.). При этом сахара и полиолы разделяют через свинцовую колонку фирмы Showa Denko К.К. (Shodex® Sugar SP0810) с расходом 0.5 мл/мин воды (VWR International GmbH, HPLC Grade) при 80°C. Используют детектор рефракции света (RID, Agilent 1260 Infinity®, Agilent Technologies Inc.). Также применяют встроенный фильтр фирмы Agilent Technologies Inc. и предварительные колонки - анионообменную (Shodex® Axpak-WAG), с обратной фазой (Shodex® Asahipak® ODP-50 6Е) и предварительную сахарную колонку (SUGAR SP-G) фирмы Showa Denko К.К.
Пример 8
Биоконверсия холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту с помощью 12α-гидроксистероидной дегидрогеназы, 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы с системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и спиртовой дегидрогеназы кофакторов
Загрузка 0,5 мл содержит 25 мг холевой кислоты, 12,5 U рекомбинантной 12α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Eggertella lenta or Lysinibacillus sphaericus, 16 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 6 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 1 мМ NAD+ и 1 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 12.5 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы из Oryctolagus cuniculus (мышечная изоформа) и 200 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 5 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и поначалу 2 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты. Через 18 часов и 24 часа дополнительно дозируют по 2 мас. % IPA. Через 48 часов 61% холевой кислоты прореагировали с образованием 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты.
Пример 9
Биоконверсия холевой кислоты в 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановую кислоту с помощью 12α-гидроксистероидной дегидрогеназы, 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы с системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы, NADH-оксидазы и спиртовой дегидрогеназы кофакторов
Загрузка 0,5 мл содержит 25 мг холевой кислоты, 12,5 U рекомбинантной 12α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Eggertella lenta or Lysinibacillus sphaericus, 16 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 6 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 1 мМ NAD+ и 1 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 5 U рекомбинантной NADH-оксидазы из Leuconostoc mesenteroides и 12.5 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы из Oryctolagus cuniculus (мышечная изоформа) и 200 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 5 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы из Oryctolagus cuniculus (мышечная изоформа) и 200 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 5 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и первоначально 2 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) и при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин).
Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты. Через 18 часов и 24 часа дополнительно дозируют по 2 мас. % IPA. Через 48 часов 70% холевой кислоты прореагировали с образованием 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты.
Пример 10
Эпимеризация хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и спиртовой дегидрогеназы кофакторов. Преимущества добавления хлорида марганца (MnCl2)
Используют 0.5 мл загрузки, включающей 50 мг хенодеоксихолевой кислоты, 12 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 6 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 0.5 мМ NAD+ и 0.3 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 6 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы и 350 мМ пирувата натрия. Для регенерации NADPH используют 6 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и поначалу 2.4 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) и 5 мМ MnCl2 при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону урсодеоксихолевой кислоты. Через 6 часов дополнительно дозируют 1.6 мас. % IPA, через 16 часов - еще 2.4 мас. % IPA и через 24 часа - 3.9 мас. % IPA. Через 36 часов добавляют 200 мкл 2-пентанола и 3 мас. % IPA, а через 48 часов - 100 мкл 2-пентанола и 4 мас. %» IPA. Через 64 часа доля урсодеоксихолевой кислоты среди всех желчных кислот в реакционной смеси составляет >99%. В частности, на хенодеоксихолевую кислоту приходится около 0.3%. В контрольных опытах без добавления MnCl2 доля хенодеоксихолевой кислоты составляет около 2%, а доля урсодеоксихолевой кислоты - около 97.5% (средняя величина по 5 опытам в каждой группе).
Пример 11
Эпимеризация хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от спиртовой дегидрогеназы кофакторов, а также комбинированной системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и NADH-оксидазы кофакторов
Используют 0.5 мл загрузки, включающей 50 мг хенодеоксихолевой кислоты, 12 U рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 6 U рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 0.5 мМ NAD+ и 0.3 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 6 U рекомбинантной лактат-дегидрогеназы и 350 мМ пирувата натрия. Дополнительно для регенерации NAD+ используют 9 U рекомбинантной NADH-оксидазы из Leuconostoc mesenteroides и 6 U рекомбинантной NADH-оксидазы из Clostridium aminovalericum.. Для регенерации NADPH используют 6 U рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и первоначально 2.4 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) при 25°С и при непрерывном перемешивании (850 об/мин). Система используется все время открытой, чтобы способствовать испарению ацетона и сдвигу реакции в сторону урсодеоксихолевой кислоты. Через 6 часов дополнительно дозируют 1.6 мас. % IPA, через 16 часов - еще 2.4 мас. % IPA и через 24 часа - 3.9 мас. % IPA. Через 36 часов добавляют 200 мкл 2-пентанола и 3 мас. % IPA, а через 48 часов - 100 мкл 2-пентанола и 4 мас. % IPA. Через 64 часа доля урсодеоксихолевой кислоты среди всех желчных кислот в реакционной смеси составляет >99%. В частности, на хенодеоксихолевую кислоту приходится около 0.2%. В контрольных опытах без добавления NADH-оксидазы доля хенодеоксихолевой кислоты составляет около 2%, а доля урсодеоксихолевой кислоты - около 97.5% (средняя величина по 5 опытам в каждой группе).
Пример 12
Эпимеризации хенодеоксихолевой кислоты в урсодеоксихолевую кислоту 7α-гидроксистероидной дегидрогеназой и 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой с системой регенерации зависимых от спиртовой дегидрогеназы кофакторов, а также комбинированной системой регенерации зависимых от лактат-дегидрогеназы и NADH-оксидазы кофакторов. Эффект от добавлении 2-пентанола и 2-пропанола
Используют 50 мл загрузки, включающей 5 г хенодеоксихолевой кислоты, 24 U/мл рекомбинантной 7α-гидроксистероидной дегидрогеназы из Escherichia coli, 12 U/мл рекомбинантной 7β-гидроксистероидной дегидрогеназы из Ruminococcus torques, а также 0.55 мМ NAD+ и 0.3 мМ NADPH. Для регенерации NAD+ используют 12 U/мл рекомбинантной лактат-дегидрогеназы и 350 мМ пирувата натрия. Дополнительно для регенерации NAD+ используют 18 U/мл рекомбинантной NADH-оксидазы из Leuconostoc mesenteroides и 12 U/мл рекомбинантной NADH-оксидазы из Clostridium aminovalericum.. Для регенерации NADPH используют 12 U/мл рекомбинантной спиртовой дегидрогеназы из Lactobacillus kefir и поначалу 1.5 мас. % IPA. Реакцию проводят в водной среде с буфером - фосфатом калия (100 мМ, рН 7.8) и 5 мМ МnСl2 при 25°С. В трехгорлышковой колбе перемешивание осуществляется прецизионной стеклянной мешалкой со скоростью около 100 об/мин. Ацетон, выделяющийся в ходе реакции, отводят потоком воздуха через реакционный сосуд (около 400-600 мл/мин). Поскольку при этом испаряется и 2-пропанол, необходимо его дополнительное дозирование, например, в количестве 0.75 мл (1,5 часа), 0.75 мл (3 часа), 0.5 мл (4 часа), 0.75 мл (6 часов), 0.75 мл (8 часов), 0.5 мл (11 часов), 0.5 мл (14 часов), 0.5 мл (17 часов), 0.5 мл (21 час), 1 мл (23 часа), 2.5 мл (25 часов), 4 мл (29 часов). Через примерно 30 часов добавляют 20 мл 2-пентанола и 2 мл 2-пропанола. Через 46 часов с начала реакции доля 7-кетолитохолевой кислоты составляет около 1% (от суммы хенодеоксихолевой, урсодексихолевой и 7-кетолитохолевой кислот). Далее добавляют 2-пропанол: 3 мл (46 часов), 4 мл (52 часа), 4 мл (54 часа), а также 10 мл 2-пентанола. Через 72 часа реакции содержание 7-кетолитохолевой кислоты может быть сведено до менее 0.2%. Доля урсодеоксихолевой кислоты составляет >99%.
Пример 13
Исследование и анализ желчных кислот
После завершения реакций, описанных в примерах 8-12, можно анализировать желчные кислоты, присутствующие в опытах, по методике, приведенной в примере 4.

Claims (76)

1. Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, в частности, и NADP+/NADPH в совместной реакции, в котором в результате по меньшей мере двух катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций, протекающих в одной реакционной массе (реакций образования продукта), один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме, отличающийся тем, что
a) в реакции регенерации, при которой восстановленный кофактор преобразуется в исходную окисленную форму, восстанавливают кислород или соединение общей формулы
Figure 00000018
где R1 - линейная или разветвленная (С14)-алкильная группа или (С14)-карбоксиалкильная группа, а
b) в реакции регенерации, при которой окисленный кофактор преобразуется в исходную восстановленную форму, окисляют (С48)-циклоалканол или соединение общей формулы
Figure 00000019
где R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей Н, (C1-C6) алкил, где алкил является линейным или разветвленным, (C1-C6) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и содержит от одной до трех двойных связей, арил, в частности С6-C12 арил, карбоксил, или (C14) карбоксиалкил, в частности также циклоалкил, например С38 циклоалкил,
где окислительная реакция (реакции) и восстановительная реакция (реакции) протекают на одной и той же основной молекулярной цепи.
2. Способ по п. 1 ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов NAD+/NADH и/или, в частности, и NADP+/NADPH в совместной реакции, в котором в результате по меньшей мере двух катализируемых ферментами окислительно-восстановительных реакций, протекающих в той же реакционной массе (= реакций образования продукта), один из двух окислительно-восстановительных кофакторов накапливается в восстановленной форме, а другой, соответственно, в окисленной форме, отличающийся тем, что
a) при регенерации окисленного кофактора восстанавливают соединение общей формулы
Figure 00000020
где R1 - замещенная или незамещенная C1-С4 алкильная группа, а
b) при регенерации восстановленного кофактора окисляют соединение общей формулы
Figure 00000021
где R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей
1) -Н,
2) -(C1-C6) алкил, где алкил является линейным или разветвленным,
3) -(C1-C6) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и выборочно содержит от одной до трех двойных связей,
4) -циклоалкил, в частности С3-C8 циклоалкил,
5) -арил, в частности C6-C12 арил,
6) -(C14) карбоксиалкил, а в случае, если соединение формулы I является пируватом, выборочно, также карбоксил.
3. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что R2 и R3 независимо друг от друга выбраны из группы, включающей Н, (C1-C6) алкил, где алкил является линейным или разветвленным, (C1-C6) алкенил, где алкенил является линейным или разветвленным и содержит от одной до трех двойных связей, арил, в частности C6-C12 арил, карбоксил или (C14) карбоксиалкил.
4. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что окислительная реакция (реакции) и восстановительная реакция (реакции) протекают хронологически параллельно.
5. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что при реакции регенерации, в которой окисленный кофактор преобразуется в исходную восстановленную форму, 2-пропанол окисляют до ацетона с помощью спиртовой дегидрогеназы.
6. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что при реакции регенерации, в которой восстановленный кофактор преобразуется в исходную окисленную форму, пируват восстанавливают до лактата с помощью лактат-дегидрогеназы.
7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что при реакции регенерации, в которой окисленный кофактор преобразуется в исходную восстановленную форму, малат окисляют до пирувата и СО2 с помощью малат-дегидроненазы.
8. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что его используют для проведения по меньшей мере одной окислительной реакции и по меньшей мере одной восстановительной реакции соответственно в той же реакционной массе на соединениях общей формулы
Figure 00000022
где
R4 - водород, метальная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R5 - водород, гидроксигруппа, оксогруппа или метальная группа,
R6 - водород или гидроксигруппа,
R7 - водород, -COR13, где R13 - С14 алкильная группа, незамещенная или замещенная гидроксигруппой, или C14 карбоксиалкильная группа, замещенная, в частности, гидроксигруппой или незамещенная,
или R6 и R7 вместе представляют собой оксогруппу,
R8 - водород, метальная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R9 - водород, метальная группа, гидроксигруппа или оксогруппа,
R10 - водород, метальная группа или галоген,
R11 - водород, метальная группа, гидроксигруппа, оксогруппа или галоген, а
R12 - водород, гидроксигруппа, оксогруппа или метальная группа,
где структурный элемент
Figure 00000023
означает бензольное кольцо или кольцо, содержащее 6 атомов углерода и 0, 1 или 2 С-С-двойные связи; причем субстрат (субстраты) предпочтительно присутствуют в концентрации <5 мас. % в реакционной массе для восстановительной реакции (реакций), связанных с образованием целевого продукта.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что его используют для конверсии дегидроэпиандростерона (DHEA) формулы
Figure 00000024
в тестостерон формулы
Figure 00000025
10. Способ по п. 8, отличающийся тем, что его используют для ферментной эпимеризации 3α,7α-дигидрокси-5β-холановой кислоты (хенодеоксихолевой кислоты) формулы
Figure 00000026
в кетолитохолевую кислоту формулы
Figure 00000027
путем окисления
и в стереоизомерное гидроксисоединение 3α,7β-дигидрокси-5β-холановую кислоту (урсодеоксихолевую кислоту) формулы
Figure 00000028
путем последующего восстановления,
с использованием двух противоположно стереоспецифичных гидроксистероидных дегидрогеназ, в частности, где окислительную реакцию катализируют 7α-гидроксистероидной дегидронегазой из Е. coli; и/или восстановительную реакцию катализируют 7β-гидроксистероидной дегидрогеназой из Ruminococcus torques.
11. Способ по п. 8, отличающийся тем, что его используют для ферментной эпимеризации 3α,7α,12α-тригидрокси-5β-холановой кислоты (холевой кислоты) формулы
Figure 00000029
либо
А) путем окисления с получением 3α,7α-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-CDC) формулы
Figure 00000030
которая далее реагирует с получением 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-KLC) формулы
Figure 00000031
и последующего восстановления до стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы
Figure 00000032
либо
B) путем окисления с получением 3α,12α-дигидрокси-7-оксо-5β-холановой кислоты формулы
Figure 00000033
с последующим ферментным окислением до 3α-гидрокси-7,12-диоксо-5β-холановой кислоты (12-оксо-KLC) формулы XI и последующим восстановлением до стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы XII,
либо
C) путем окисления с получением 3α,12α-дигидрокси-7-оксо-5β-холановой кислоты формулы XIII с последующим ферментным восстановлением до 3α,7β,12α-тригидрокси-5β-холановой кислоты формулы
Figure 00000034
и последующего окисления до стереоизомерного гидроксисоединения 3α,7β-дигидрокси-12-оксо-5β-холановой кислоты (12-кето-урсодеоксихолевой кислоты) формулы XII;
с использованием 3 стереоспецифичных гидроксистероидных дегидрогеназ, из которых 2 обладают противоположной стереоспецифичностью.
12. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что его используют для изомеризации C5-или С6-сахаров, в частности для изомеризации глюкозы путем восстановления сорбитом и последующего окисления до фруктозы.
13. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что субстрат (субстраты) для окислительной реакции (реакций), связанных с получением продукта, вводят в реакционную массу в концентрации по меньшей мере 5 мас. % и более, предпочтительно 7 мас. % и более, особенно предпочтительно 9 мас. % и более.
14. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что в реакциях получения продукта в целом достигается конверсия ≥70%, в частности ≥90%.
RU2014136162A 2012-02-07 2013-02-06 Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов RU2635087C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP12450007.5 2012-02-07
EP12450007 2012-02-07
PCT/EP2012/067781 WO2013117251A1 (de) 2012-02-07 2012-09-12 Verfahren zur enzymatischen regenerierung von redoxkofaktoren
EPPCT/EP2012/067781 2012-09-12
ATA1284/2012 2012-12-10
AT12842012A AT513721B1 (de) 2012-12-10 2012-12-10 Verfahren zur enzymatischen Regenerierung von Redoxkofaktoren
PCT/EP2013/052313 WO2013117584A1 (de) 2012-02-07 2013-02-06 Verfahren zur enzymatischen regenerierung von redoxkofaktoren

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014136162A RU2014136162A (ru) 2016-03-27
RU2635087C2 true RU2635087C2 (ru) 2017-11-09

Family

ID=48946925

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014136162A RU2635087C2 (ru) 2012-02-07 2013-02-06 Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов

Country Status (29)

Country Link
US (3) US9644227B2 (ru)
EP (1) EP2812439B1 (ru)
JP (1) JP6329086B2 (ru)
KR (1) KR102022137B1 (ru)
CN (2) CN104136620A (ru)
AR (1) AR089841A1 (ru)
AU (1) AU2013218042B2 (ru)
BR (1) BR112014019287B1 (ru)
CA (1) CA2862384C (ru)
ES (1) ES2742381T3 (ru)
HK (1) HK1204010A1 (ru)
HR (1) HRP20191514T1 (ru)
HU (1) HUE044690T2 (ru)
IN (1) IN2014DN07015A (ru)
LT (1) LT2812439T (ru)
MX (1) MX358771B (ru)
MY (1) MY172493A (ru)
NZ (1) NZ627477A (ru)
PH (1) PH12014501770B1 (ru)
PL (1) PL2812439T3 (ru)
PT (1) PT2812439T (ru)
RS (1) RS59114B1 (ru)
RU (1) RU2635087C2 (ru)
SA (1) SA113340270B1 (ru)
SG (1) SG11201404614XA (ru)
SI (1) SI2812439T1 (ru)
TW (1) TW201343623A (ru)
UA (1) UA117453C2 (ru)
WO (1) WO2013117584A1 (ru)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
TW201343623A (zh) 2012-02-07 2013-11-01 Annikki Gmbh 使氧化還原輔因子經酶催化再生之方法
AT513928B1 (de) 2013-02-06 2015-06-15 Annikki Gmbh Verfahren zur Herstellung von Fructose
WO2014154676A1 (de) * 2013-03-27 2014-10-02 Annikki Gmbh Verfahren zur isomerisierung von glucose
EP3636743A1 (en) * 2014-04-02 2020-04-15 The Regents of The University of California A synthetic biochemistry molecular purge valve module that maintains co-factor balance
US9890397B1 (en) 2015-07-15 2018-02-13 Gaurab Chakrabarti Hydrogen peroxide production method, system, and apparatus
US20180216142A1 (en) * 2015-07-24 2018-08-02 Annikki Gmbh Process for enzymatic production of oxidation and reduction products of mixed sugars
CN105861613B (zh) * 2016-03-30 2019-12-13 中山百灵生物技术有限公司 一种熊去氧胆酸制备方法
WO2017202686A1 (de) 2016-05-23 2017-11-30 Annikki Gmbh Verfahren zur enzymatischen umwandlung von d-glucose in d-fructose via d-sorbitol
WO2018036982A1 (de) * 2016-08-22 2018-03-01 Pharmazell Gmbh Chemisch-biokatalytisches verfahren zur herstellung von ursodesoxycholsäure
US11203769B1 (en) 2017-02-13 2021-12-21 Solugen, Inc. Hydrogen peroxide and gluconic acid production
CN106957886A (zh) * 2017-03-01 2017-07-18 南京远淑医药科技有限公司 一种熊去氧胆酸的制备方法
CN107315038B (zh) * 2017-07-06 2019-06-18 江南大学 一种批量化对酒类样品中氨基甲酸乙酯快速测定的方法
JP6559745B2 (ja) 2017-08-23 2019-08-14 株式会社東芝 半導体デバイス検査装置、半導体デバイス検査方法、そのプログラム、半導体装置およびその製造方法
CN108251491A (zh) * 2018-03-09 2018-07-06 中山百灵生物技术有限公司 一种酶促法合成熊去氧胆酸的方法
EP3775178A4 (en) * 2018-04-06 2022-01-05 Braskem S.A. NEW NADH-DEPENDENT ENZYMMUTANTS FOR THE CONVERSION OF ACETONE INTO ISOPROPANOL
CN109055473A (zh) * 2018-08-21 2018-12-21 湖南宝利士生物技术有限公司 一种基于酶法偶联技术合成熊去氧胆酸和高手性纯度d-氨基酸的方法
CN111217744A (zh) * 2018-11-26 2020-06-02 中国科学院大连化学物理研究所 一种d-氨基酸基nad+类似物及其合成和应用
CN109486896A (zh) * 2018-12-04 2019-03-19 南京工业大学 一种催化拆分制备异甘草酸的方法
CN109486895A (zh) * 2018-12-04 2019-03-19 南京工业大学 一种催化拆分制备异甘草酸的方法
CN110387360B (zh) * 2019-06-18 2021-12-28 华东理工大学 羟基类固醇脱氢酶及其在合成熊去氧胆酸前体中的应用
CN111593085A (zh) * 2020-05-26 2020-08-28 四川澄华生物科技有限公司 一种12-酮基胆酸的制备方法
CN112813128A (zh) * 2021-01-12 2021-05-18 中山百灵生物技术股份有限公司 一种别熊去氧胆酸的合成方法
KR102504343B1 (ko) 2021-02-22 2023-02-28 전남대학교산학협력단 단량체 이소시트레이트 디하이드로게나아제에 기반한 nadph 재생 시스템 및 이의 용도
CN116536279B (zh) * 2022-01-25 2023-11-14 杭州馨海酶源生物科技有限公司 一种基因工程菌及在制备去氢表雄酮上的应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2426791C2 (ru) * 2006-04-11 2011-08-20 Иеп Гмбх Способ получения стероидных производных восстановлением оксостероидных соединений или окислением гидроксистероидных соединений с использованием гидроксистероидной дегидрогеназы

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3502141A1 (de) * 1985-01-23 1986-10-16 Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V., 8000 München Verfahren zur intrasequentiellen cofaktor-regeneration bei enzymatischen synthesen, insbesondere bei der herstellung von vitamin c
CZ20012792A3 (cs) 1999-12-03 2002-03-13 Kaneka Corporation Polypeptid, polynukleotid kódující polypeptid, expresní vektor, transformant a způsob přípravy
DE10140088A1 (de) 2001-08-16 2003-03-13 Degussa NADH-Oxidase aus Lactobacillus
AU2003257986A1 (en) 2002-07-31 2004-02-16 Georgia Tech Research Corporation Methods and compositions for nad(p)(h) oxidases
DE10240603A1 (de) 2002-09-03 2004-03-11 Degussa Ag Verwendung von Malat-Dehydrogenase zur NADH-Regenerierung
EP1731618A1 (en) 2005-06-07 2006-12-13 Prodotti Chimici E Alimentari Spa Process for the selective oxydation of colic acid
EP1925674A1 (en) 2006-11-27 2008-05-28 Universiteit van Amsterdam Regeneration of NADPH and/or NADH cofactors
AT506639A1 (de) 2008-04-01 2009-10-15 Kroutil Wolfgang Dipl Ing Dr T Verfahren zur deracemisierung von enantiomerengemischen unter verwendung von enzymsystemen
IT1398729B1 (it) 2009-07-01 2013-03-18 F S I Fabbrica Italiana Sint Processo per la preparazione di testosterone
JP2013511973A (ja) * 2009-11-30 2013-04-11 ファルマツェル、ゲーエムベーハー 新規7β−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼおよびその使用
US8530213B2 (en) 2009-12-02 2013-09-10 Georgia Tech Research Corporation Compositions and methods for using NADH oxidases
WO2013117251A1 (de) 2012-02-07 2013-08-15 Annikki Gmbh Verfahren zur enzymatischen regenerierung von redoxkofaktoren
TW201343623A (zh) 2012-02-07 2013-11-01 Annikki Gmbh 使氧化還原輔因子經酶催化再生之方法

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2426791C2 (ru) * 2006-04-11 2011-08-20 Иеп Гмбх Способ получения стероидных производных восстановлением оксостероидных соединений или окислением гидроксистероидных соединений с использованием гидроксистероидной дегидрогеназы

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
C. V. Voss et al. "Orchestration of Concurrent Oxidation and Reduction Cycles for Stereoinversion and Deracemisation of sec-Alcohols" JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Vol. 130, N42, 2008, 13969-13972. *
D. Monty et al. "One-Pot Multienzymatic Synthesis of 12-Ketoursodeoxycholic Acid: Subtle Cofactor Specificities Rule the Reaction Equilibria of Five Biocatalysts Working in a Row" ADVANCED SYNTHESIS & CATALYSIS, Vol. 351, N9, 2009, 1303-1311. *
J. H. Schrittwieser et al. "Recent biocatalytic oxidation-reduction cascades" CURRENT OPINION IN CHEMICAL BIOLOGY, Vol. 15, N2, 2011, 249-256. *
R. Woodyer et al. "Mechanistic investigation of a highly active phosphite dehydrogenase mutant and its application for NADPH refeneration" FEBS JOURNAL, Vol. 272, N15, 2005, 3816-3827. *
Shin-Ichiro Suye et al. "Enzymatic Production of L-Alanine from Malic Acid with Malic Enzyme and Alanine Dehydrogenase with Coenzyme Regeneration" THE CANADIAN JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING, Vol. 70, N2, 1992, 306-312. *
Shin-Ichiro Suye et al. "Enzymatic Production of L-Alanine from Malic Acid with Malic Enzyme and Alanine Dehydrogenase with Coenzyme Regeneration" THE CANADIAN JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING, Vol. 70, N2, 1992, 306-312. R. Woodyer et al. "Mechanistic investigation of a highly active phosphite dehydrogenase mutant and its application for NADPH refeneration" FEBS JOURNAL, Vol. 272, N15, 2005, 3816-3827. C. V. Voss et al. "Orchestration of Concurrent Oxidation and Reduction Cycles for Stereoinversion and Deracemisation of sec-Alcohols" JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Vol. 130, N42, 2008, 13969-13972. J. H. Schrittwieser et al. "Recent biocatalytic oxidation-reduction cascades" CURRENT OPINION IN CHEMICAL BIOLOGY, Vol. 15, N2, 2011, 249-256. *

Also Published As

Publication number Publication date
PT2812439T (pt) 2019-09-10
WO2013117584A1 (de) 2013-08-15
CA2862384C (en) 2021-07-13
MX2014009455A (es) 2014-11-12
HRP20191514T1 (hr) 2019-11-29
JP6329086B2 (ja) 2018-05-23
JP2015506707A (ja) 2015-03-05
EP2812439A1 (de) 2014-12-17
US10370691B2 (en) 2019-08-06
KR102022137B1 (ko) 2019-09-17
RU2014136162A (ru) 2016-03-27
MX358771B (es) 2018-09-04
US20170218417A1 (en) 2017-08-03
US11339415B2 (en) 2022-05-24
CA2862384A1 (en) 2013-08-15
BR112014019287A8 (pt) 2017-07-11
US20140377798A1 (en) 2014-12-25
SA113340270B1 (ar) 2015-09-03
KR20140127258A (ko) 2014-11-03
AR089841A1 (es) 2014-09-24
LT2812439T (lt) 2019-10-10
BR112014019287A2 (pt) 2017-06-20
SG11201404614XA (en) 2014-10-30
AU2013218042A1 (en) 2014-08-07
IN2014DN07015A (ru) 2015-04-10
US20190323051A1 (en) 2019-10-24
PH12014501770A1 (en) 2014-11-10
ES2742381T3 (es) 2020-02-14
US9644227B2 (en) 2017-05-09
CN104136620A (zh) 2014-11-05
CN113337568A (zh) 2021-09-03
NZ627477A (en) 2015-12-24
AU2013218042B2 (en) 2016-07-28
HK1204010A1 (en) 2015-11-06
PH12014501770B1 (en) 2014-11-10
HUE044690T2 (hu) 2019-11-28
TW201343623A (zh) 2013-11-01
BR112014019287B1 (pt) 2021-07-06
MY172493A (en) 2019-11-27
SI2812439T1 (sl) 2019-10-30
RS59114B1 (sr) 2019-09-30
EP2812439B1 (de) 2019-05-22
PL2812439T3 (pl) 2019-11-29
UA117453C2 (uk) 2018-08-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2635087C2 (ru) Способ ферментной регенерации окислительно-восстановительных кофакторов
Hummel et al. Strategies for regeneration of nicotinamide coenzymes emphasizing self-sufficient closed-loop recycling systems
Rehn et al. Application of NAD (P) H oxidase for cofactor regeneration in dehydrogenase catalyzed oxidations
PT2004838E (pt) Processo para a preparação de derivados esteróides mediante a redução de compostos oxosteróides ou mediante a oxidação de compostos hidroxisteróides com recurso a uma hidroxisteróide desidrogenase
WO2013117251A1 (de) Verfahren zur enzymatischen regenerierung von redoxkofaktoren
KR101948948B1 (ko) 담즙산, 이들의 염 또는 유도체의 선택적 산화를 위한 신규한 공정
CN104350157B (zh) 在双相系统中选择性还原胆汁酸,它们的盐或衍生物的方法
Asako et al. Biocatalytic reduction system for the production of chiral methyl (R)/(S)-4-bromo-3-hydroxybutyrate
US10113192B2 (en) Method for producing fructose
Chadha et al. Microbial alcohol dehydrogenases: recent developments and applications in asymmetric synthesis
Ferrandi et al. New trends in the in situ enzymatic recycling of NAD (P)(H) cofactors
US11254959B2 (en) Process for the conversion of sugars
AT513721B1 (de) Verfahren zur enzymatischen Regenerierung von Redoxkofaktoren
Ouedraogo et al. Flavoprotein Oxidases
Cabadaj et al. Investigation of process stability of a whole-cell biocatalyst with Baeyer–Villiger monooxygenase activity in continuous bioreactors
US7795004B2 (en) Process for the racemization of optically active secondary alcohols with the use of two alcohol dehydrogenases
JP2000224984A (ja) 新規な2級アルコール脱水素酵素、この酵素の製造方法、およびアルコール、アルデヒド、ケトンの製造方法