RU2020110764A - Способ и композиция для анализа клеточных компонентов - Google Patents
Способ и композиция для анализа клеточных компонентов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020110764A RU2020110764A RU2020110764A RU2020110764A RU2020110764A RU 2020110764 A RU2020110764 A RU 2020110764A RU 2020110764 A RU2020110764 A RU 2020110764A RU 2020110764 A RU2020110764 A RU 2020110764A RU 2020110764 A RU2020110764 A RU 2020110764A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- cell
- paragraphs
- reporter
- cells
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1065—Preparation or screening of tagged libraries, e.g. tagged microorganisms by STM-mutagenesis, tagged polynucleotides, gene tags
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2537/00—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature
- C12Q2537/10—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature the purpose or use of
- C12Q2537/143—Multiplexing, i.e. use of multiple primers or probes in a single reaction, usually for simultaneously analyse of multiple analysis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/149—Particles, e.g. beads
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/159—Microreactors, e.g. emulsion PCR or sequencing, droplet PCR, microcapsules, i.e. non-liquid containers with a range of different permeability's for different reaction components
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/185—Nucleic acid dedicated to use as a hidden marker/bar code, e.g. inclusion of nucleic acids to mark art objects or animals
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (69)
1. Способ получения информации о последовательности из целевой нуклеиновой кислоты, содержащейся в единичной клетке, который включает:
a) введение клеточной суспензии в первый капельный манипулятор;
b) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для такого дозирования множества капель, включающих клеточную суспензию, при котором каждая капля включает единичную клетку;
c) введение буфера лизиса клеток во второй капельный манипулятор;
c) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для дозирования множества капель, включающих буфер лизиса клеток;
d) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для объединения множества капель буфера лизиса клеток и множества капель клеточной суспензии, что приводит к получению множества капель лизата клеток;
e) введение раствора реагента, включающего первую репортерную группу и ферменты, в третий капельный манипулятор, где по меньшей мере один фермент обладает способностью вводить первую репортерную группу в целевую нуклеиновую кислоту, и при этом первая репортерная группа идентифицирует единичную клетку;
f) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для дозирования множества капель, включающих раствор реагента;
g) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для объединения множества капель лизата клеток с каплями реагента, которое приводит к образованию множества капель, включающих первую репортерную группу, в котором репортерные группы введены в нуклеиновые кислоты, содержащиеся в каплях клеточного лизата;
h) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для дозирования множества капель, включающих промывной раствор;
i) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для объединения множества капель, включающих первую репортерную группу, с каплями промывного раствора, что приводит к удалению фермента, остающегося после реакции, из нуклеиновой кислоты и образованию множества капель, включающих целевую нуклеиновую кислоту, причем целевая нуклеиновая кислота включает первую репортерную группу;
(j) по меньшей мере однократное повторение этапов (e)-(i), в котором последующие растворы реагентов включают репортерные группы, отличающиеся от первой репортерной группы, что приводит к образованию множества капель, включающих целевую нуклеиновую кислоту, включающую множество репортерных групп;
(k) получение информации о последовательности из целевой нуклеиновой кислоты, включающей одну или более репортерных групп, и сопоставление информации о последовательности с единичной клеткой.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий:
(l) введение в капельный манипулятор раствора реагента для мечения белка, включающего метки, специфичные для белков;
(m) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для дозирования множества капель, включающих раствор реагента для мечения белка;
(n) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для объединения множества растворов реагента для мечения белка с множеством капель, включающих целевую нуклеиновую кислоту, включающую множество репортерных групп, где по меньшей мере часть белков из единичной клетки включает метку, уникальную для единичной клетки, и идентификацию по меньшей мере части белков, включающих метки.
3. Способ по п. 2, в котором способ получения информации о последовательности из целевой нуклеиновой кислоты осуществляют одновременно с идентификацией по меньшей мере части белков, включающих метки.
4. Способ по любому из пп. 1-3, в котором целевая нуклеиновая кислота представляет собой РНК.
5. Способ по любому из пп. 1-3, в котором целевая нуклеиновая кислота представляет собой ДНК.
6. Способ по п. 5, в котором целевая нуклеиновая кислота представляет собой геномную ДНК.
7. Способ по любому из пп. 1-3, в котором целевая нуклеиновая кислота представляет собой и РНК, и ДНК.
8. Способ по любому из пп. 1-7, в котором первая репортерная группа введена в целевую нуклеиновую кислоту посредством лигирования.
9. Способ по любому из пп. 1-8, дополнительно включающий:
(i) введение раствора реагента, включающего репортерные группы, специфичные для продуктов метаболизма клетки, в капельный манипулятор;
(ii) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для дозирования множества капель реагента, включающего репортерные группы, специфичные для продуктов метаболизма клетки;
(iii) применение операций с каплями, проводимых посредством электродов, для объединения множества капель реагента с множеством капель, включающих целевую нуклеиновую кислоту, включающую множество репортерных групп, где по меньшей мере часть продуктов метаболизма клетки, получаемых из единичной клетки, включает репортерную группу, уникальную для единичной клетки, и идентификацию по меньшей мере части продуктов метаболизма клетки.
10. Способ получения информации о последовательности из клеточной нуклеиновой кислоты, который включает:
(a) нанесение одной или более клеток на твердую подложку, где твердая подложка включает группы, иммобилизующие клетки, и в результате такого нанесения одна или более клеток оказываются иммобилизованными на твердой подложке;
(b) проведение лизиса клеток, иммобилизованных на твердой подложке, с образованием клеточного лизата;
(c) обеспечение наличия репортерной группы для нуклеиновой кислоты, содержащейся в клеточном лизате, и модификацию нуклеиновой кислоты с образованием нуклеиновой кислоты, включающей первую репортерную группу;
(d) получение информации о последовательности из нуклеиновой кислоты, включающей первую репортерную группу.
11. Способ по п. 10, в котором нуклеиновая кислота представляет собой геномную ДНК.
12. Способ по п. 10, в котором нуклеиновая кислота представляет собой РНК.
13. Способ по п. 12, дополнительно включающий обратную транскрипцию РНК в кДНК.
14. Способ по любому из пп. 10-13, дополнительно включающий обеспечение наличия дополнительных репортерных групп для нуклеиновой кислоты этапа (c), включающей первую репортерную группу, и модификацию нуклеиновой кислоты этапа (c) с целью дополнительного включения одной или более дополнительных репортерных групп.
15. Способ по п. 14, в котором дополнительные репортерные группы отличаются от первой репортерной группы.
16. Способ по любому из пп. 10-15, в котором первая репортерная группа уникальна для каждой клетки, что позволяет идентифицировать клеточный источник нуклеиновой кислоты, включающей первый индекс.
17. Способ по любому из пп. 10-16, в котором нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту из единичной клетки.
18. Способ по любому из пп. 10-17, в котором нуклеиновая кислота представляет собой и РНК, и ДНК.
19. Способ по любому из пп. 10-18, в котором твердая подложка выбрана из группы, состоящей из проточных ячеек, гранул и микролунок.
20. Способ по любому из пп. 10-19, в котором группы, иммобилизующие клетки, представляют собой антитела, где антитела связываются с белками клеточной поверхности.
21. Способ по п. 20, в котором антитела представляют собой моноклональные антитела.
22. Способ по любому из пп. 20-21, в котором антитела специфично связываются с белками клеточной поверхности, специфичными для раковых клеток.
23. Способ по любому из пп. 10-22, дополнительно включающий воздействие на клеточный лизат меток, специфичных для белков, где по меньшей мере часть белка клетки включает метку, уникальную для клетки, и идентификацию по меньшей мере части белков, включающих метки.
24. Способ по п. 23, в котором идентификация по меньшей мере части белков, включающих метки, и получение информации о последовательности из клеточной нуклеиновой кислоты производят одновременно.
25. Способ по любому из пп. 10-24, в котором одна или более репортерные группы включают по меньшей мере один штрих-код.
26. Способ по любому из пп. 10-25, в котором одна или более репортерные группы включают участок связывания праймера.
27. Способ по любому из пп. 10-26, в котором модификацию нуклеиновой кислоты, включающей первую репортерную группу, производят лигированием.
28. Способ по любому из пп. 10-25, в котором модификацию нуклеиновой кислоты, включающей одну или более дополнительных репортерных групп, производят лигированием.
29. Способ по любому из пп. 10-28, в котором модифицированную нуклеиновую кислоту, включающую первую репортерную группу, подвергают амплификации до получения информации о последовательности.
30. Способ по любому из пп. 10-29, в котором модифицированную нуклеиновую кислоту, включающую две или более репортерные группы, подвергают амплификации до получения информации о последовательности.
31. Способ по любому из пп. 10-29, в котором по меньшей мере часть клеток связана с заболеванием.
32. Способ по п. 31, в котором по меньшей мере часть клеток связана с раковым заболеванием.
33. Способ анализа клеточных компонентов, включающий:
(a) нанесение одной или более клеток на твердую подложку, где твердая подложка включает группы, иммобилизующие клетки, и в результате такого нанесения одна или более клеток оказываются иммобилизованными на твердой подложке;
(b) проведение лизиса клеток, иммобилизованных на твердой подложке, с образованием клеточного лизата;
(c) включение одной или более репортерных групп в клеточный лизат, в результате чего одно или более анализируемых веществ, находящихся в клеточном лизате, включают одну или более репортерных групп, и при этом одна или более репортерных групп идентифицирует клетку;
(d) анализ анализируемых веществ, включающих одну или более репортерных групп, причем такой анализ позволяет идентифицировать клетки и обнаруживать компоненты клетки.
34. Способ по п. 33, в котором единичные клетки иммобилизованы на твердой подложке.
35. Способ по любому из пп. 33-34, в котором в котором твердая подложка выбрана из группы, состоящей из проточных ячеек, гранул и микролунок.
36. Способ по любому из пп. 33-35, в котором группы, иммобилизующие клетки, представляют собой антитела, где антитела связываются с белками клеточной поверхности.
37. Способ по п. 36, в котором антитела представляют собой моноклональные антитела.
38. Способ по любому из пп. 36-37, в котором антитела специфично связываются с белками клеточной поверхности, специфичными для раковых клеток.
39. Способ по п. 33, в котором анализируемые вещества выбраны из группы, состоящей из белка, нуклеиновой кислоты, органелл, липидов, углеводов, продуктов метаболизма клетки.
40. Способ по любому из пп. 33-39, в котором одна или более репортерные группы включают участок связывания праймера.
41. Способ по любому из пп. 33-39, в котором одно или более анализируемых веществ представляют собой нуклеиновые кислоты.
42. Способ по п. 41, в котором перед проведением анализа нуклеиновые кислоты, включающие репортерные группы, подвергают амплификации.
43. Способ по любому из пп. 41, 42, в котором анализ нуклеиновой кислоты производят секвенированием.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562114505P | 2015-02-10 | 2015-02-10 | |
US62/114,505 | 2015-02-10 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017127628A Division RU2717491C2 (ru) | 2015-02-10 | 2016-02-10 | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2021133017A Division RU2021133017A (ru) | 2015-02-10 | 2021-11-15 | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020110764A true RU2020110764A (ru) | 2020-05-29 |
RU2020110764A3 RU2020110764A3 (ru) | 2021-04-21 |
RU2761432C2 RU2761432C2 (ru) | 2021-12-08 |
Family
ID=55587329
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2020110764A RU2761432C2 (ru) | 2015-02-10 | 2016-02-10 | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов |
RU2017127628A RU2717491C2 (ru) | 2015-02-10 | 2016-02-10 | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017127628A RU2717491C2 (ru) | 2015-02-10 | 2016-02-10 | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US11634707B2 (ru) |
EP (2) | EP3256604B1 (ru) |
JP (1) | JP7001475B2 (ru) |
KR (3) | KR20210135626A (ru) |
CN (3) | CN116083546A (ru) |
AU (2) | AU2016219328B2 (ru) |
BR (1) | BR112017017025B1 (ru) |
CA (2) | CA3174951A1 (ru) |
DK (1) | DK3256604T3 (ru) |
ES (1) | ES2786652T3 (ru) |
PT (1) | PT3256604T (ru) |
RU (2) | RU2761432C2 (ru) |
SG (2) | SG11201706504RA (ru) |
WO (1) | WO2016130704A2 (ru) |
Families Citing this family (120)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110016499B (zh) | 2011-04-15 | 2023-11-14 | 约翰·霍普金斯大学 | 安全测序系统 |
US20150376609A1 (en) | 2014-06-26 | 2015-12-31 | 10X Genomics, Inc. | Methods of Analyzing Nucleic Acids from Individual Cells or Cell Populations |
US10752949B2 (en) | 2012-08-14 | 2020-08-25 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10323279B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-06-18 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US9388465B2 (en) | 2013-02-08 | 2016-07-12 | 10X Genomics, Inc. | Polynucleotide barcode generation |
US10400280B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-09-03 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US11591637B2 (en) | 2012-08-14 | 2023-02-28 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for sample processing |
US9701998B2 (en) | 2012-12-14 | 2017-07-11 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US9951386B2 (en) | 2014-06-26 | 2018-04-24 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
CN104956225B (zh) | 2012-10-29 | 2018-10-02 | 约翰·霍普金斯大学 | 卵巢和子宫内膜癌的帕帕尼科拉乌测试 |
WO2014093676A1 (en) | 2012-12-14 | 2014-06-19 | 10X Technologies, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10533221B2 (en) | 2012-12-14 | 2020-01-14 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
EP3102722B1 (en) | 2014-02-04 | 2020-08-26 | Jumpcode Genomics, Inc. | Genome fractioning |
AU2015243445B2 (en) | 2014-04-10 | 2020-05-28 | 10X Genomics, Inc. | Fluidic devices, systems, and methods for encapsulating and partitioning reagents, and applications of same |
US9975122B2 (en) | 2014-11-05 | 2018-05-22 | 10X Genomics, Inc. | Instrument systems for integrated sample processing |
CN107407638B (zh) | 2014-12-03 | 2021-01-12 | 伊索普莱西斯公司 | 细胞分泌特征的分析和筛选 |
CN112126675B (zh) | 2015-01-12 | 2022-09-09 | 10X基因组学有限公司 | 用于制备核酸测序文库的方法和系统以及用其制备的文库 |
EP4286516A3 (en) | 2015-02-24 | 2024-03-06 | 10X Genomics, Inc. | Partition processing methods and systems |
WO2016138292A1 (en) * | 2015-02-25 | 2016-09-01 | Igenomx International Genomics Corporation | Methods and compositions for in silico long read sequencing |
US11286531B2 (en) | 2015-08-11 | 2022-03-29 | The Johns Hopkins University | Assaying ovarian cyst fluid |
US11371094B2 (en) | 2015-11-19 | 2022-06-28 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid processing using degenerate nucleotides |
US11339427B2 (en) | 2016-02-12 | 2022-05-24 | Jumpcode Genomics, Inc. | Method for target specific RNA transcription of DNA sequences |
JP7120630B2 (ja) | 2016-05-02 | 2022-08-17 | エンコディア, インコーポレイテッド | 核酸エンコーディングを使用した巨大分子解析 |
WO2017197338A1 (en) | 2016-05-13 | 2017-11-16 | 10X Genomics, Inc. | Microfluidic systems and methods of use |
US10894990B2 (en) | 2016-05-17 | 2021-01-19 | Shoreline Biome, Llc | High throughput method for identification and sequencing of unknown microbial and eukaryotic genomes from complex mixtures |
US11708574B2 (en) | 2016-06-10 | 2023-07-25 | Myriad Women's Health, Inc. | Nucleic acid sequencing adapters and uses thereof |
AU2017299803B2 (en) | 2016-07-22 | 2023-06-29 | Illumina, Inc. | Single cell whole genome libraries and combinatorial indexing methods of making thereof |
WO2018057779A1 (en) * | 2016-09-23 | 2018-03-29 | Jianbiao Zheng | Compositions of synthetic transposons and methods of use thereof |
US11854666B2 (en) | 2016-09-29 | 2023-12-26 | Myriad Women's Health, Inc. | Noninvasive prenatal screening using dynamic iterative depth optimization |
JP7348066B2 (ja) * | 2016-11-11 | 2023-09-20 | アイソプレキシス コーポレイション | 単一細胞のゲノム、トランスクリプトームおよびプロテオームの同時解析のための組成物および方法 |
US11525783B2 (en) | 2016-11-22 | 2022-12-13 | IsoPlexis Corporation | Systems, devices and methods for cell capture and methods of manufacture thereof |
US10011872B1 (en) | 2016-12-22 | 2018-07-03 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10550429B2 (en) | 2016-12-22 | 2020-02-04 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10815525B2 (en) | 2016-12-22 | 2020-10-27 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
CA3048863A1 (en) * | 2016-12-29 | 2018-07-05 | Illumina, Inc. | Analysis system for orthogonal access to and tagging of biomolecules in cellular compartments |
US10894979B2 (en) | 2017-01-27 | 2021-01-19 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Construction of next generation sequencing (NGS) libraries using competitive strand displacement |
ES2908704T3 (es) * | 2017-01-27 | 2022-05-03 | Integrated Dna Tech Inc | Construcción de colecciones de secuenciación de nueva generación (NGS) usando desplazamiento de hebra competitivo |
EP3545089B1 (en) | 2017-01-30 | 2022-03-09 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for droplet-based single cell barcoding |
US10752946B2 (en) | 2017-01-31 | 2020-08-25 | Myriad Women's Health, Inc. | Methods and compositions for enrichment of target polynucleotides |
WO2018144216A1 (en) * | 2017-01-31 | 2018-08-09 | Counsyl, Inc. | Methods and compositions for enrichment of target polynucleotides |
US10995333B2 (en) | 2017-02-06 | 2021-05-04 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid preparation |
FI3452621T3 (fi) * | 2017-02-21 | 2022-12-15 | Tagmentaatio käyttäen immobilisoituja transposomeja linkkereillä | |
EP3602359A4 (en) | 2017-03-24 | 2021-01-06 | Myriad Women's Health, Inc. | NUMBER OF COPIES VARIANT CALLER |
EP3615671B1 (en) | 2017-04-23 | 2021-07-21 | Illumina Cambridge Limited | Compositions and methods for improving sample identification in indexed nucleic acid libraries |
WO2018197950A1 (en) | 2017-04-23 | 2018-11-01 | Illumina Cambridge Limited | Compositions and methods for improving sample identification in indexed nucleic acid libraries |
ES2937929T3 (es) | 2017-04-23 | 2023-04-03 | Illumina Inc | Composiciones y métodos para mejorar la identificación de muestras en bibliotecas de ácido nucleico indexadas |
AU2018260627A1 (en) | 2017-04-23 | 2019-11-14 | Illumina Cambridge Limited | Compositions and methods for improving sample identification in indexed nucleic acid libraries |
CA3060369A1 (en) | 2017-05-01 | 2018-11-08 | Illumina, Inc. | Optimal index sequences for multiplex massively parallel sequencing |
CN111148846B (zh) * | 2017-05-05 | 2024-06-18 | 西比欧生物科学公司 | 在水凝胶中捕获离散生物单元并使其条码化的方法 |
AU2018266377B2 (en) | 2017-05-08 | 2024-06-20 | Illumina, Inc. | Universal short adapters for indexing of polynucleotide samples |
AU2018273401A1 (en) | 2017-05-23 | 2019-12-19 | President And Fellows Of Harvard College | Multiplex end-tagging amplification of nucleic acids |
SG11201901822QA (en) | 2017-05-26 | 2019-03-28 | 10X Genomics Inc | Single cell analysis of transposase accessible chromatin |
US10400235B2 (en) | 2017-05-26 | 2019-09-03 | 10X Genomics, Inc. | Single cell analysis of transposase accessible chromatin |
EP4293122A3 (en) | 2017-06-07 | 2024-01-24 | Oregon Health & Science University | Single cell whole genome libraries for methylation sequencing |
CN110785813A (zh) | 2017-07-31 | 2020-02-11 | 伊鲁米那股份有限公司 | 具有多路生物样本聚合的测序系统 |
EP3662083A4 (en) | 2017-08-01 | 2021-03-03 | Illumina, Inc. | SPATIAL INDEXING OF GENETIC MATERIAL AND LIBRARY MANUFACTURING USING HYDROGEL BEADS AND FLOW CELLS |
MX2020001575A (es) | 2017-08-07 | 2020-11-18 | Univ Johns Hopkins | Materiales y métodos para evaluar y tratar el cáncer. |
CN111727248A (zh) * | 2017-09-25 | 2020-09-29 | 弗雷德哈钦森癌症研究中心 | 高效靶向原位全基因组剖析 |
US10590244B2 (en) | 2017-10-04 | 2020-03-17 | 10X Genomics, Inc. | Compositions, methods, and systems for bead formation using improved polymers |
US10837047B2 (en) | 2017-10-04 | 2020-11-17 | 10X Genomics, Inc. | Compositions, methods, and systems for bead formation using improved polymers |
CA3081441C (en) | 2017-10-31 | 2023-08-29 | Encodia, Inc. | Kits for analysis using nucleic acid encoding and/or label |
SG11201913654QA (en) | 2017-11-15 | 2020-01-30 | 10X Genomics Inc | Functionalized gel beads |
US10829815B2 (en) | 2017-11-17 | 2020-11-10 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for associating physical and genetic properties of biological particles |
SG11201911784PA (en) | 2018-01-08 | 2020-01-30 | Illumina Inc | Systems and devices for high-throughput sequencing with semiconductor-based detection |
EP3752832A1 (en) | 2018-02-12 | 2020-12-23 | 10X Genomics, Inc. | Methods characterizing multiple analytes from individual cells or cell populations |
CA3186025A1 (en) | 2018-02-13 | 2019-08-22 | Illumina, Inc. | Dna sequencing using hydrogel beads |
US11639928B2 (en) | 2018-02-22 | 2023-05-02 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for characterizing analytes from individual cells or cell populations |
US20190367909A1 (en) | 2018-04-02 | 2019-12-05 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for making controls for sequence-based genetic testing |
WO2019195166A1 (en) | 2018-04-06 | 2019-10-10 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for quality control in single cell processing |
MX2019014802A (es) * | 2018-04-20 | 2021-03-02 | Illumina Inc | Métodos para encapsular células individuales, las células encapsuladas y usos de las mismas. |
SG11202011073RA (en) * | 2018-05-07 | 2020-12-30 | Bitbiome Inc | Method for performing single-cell analysis and device therefor |
RU2744175C1 (ru) * | 2018-05-17 | 2021-03-03 | Иллумина, Инк. | Высокопроизводительное секвенирование одиночной клетки со сниженной ошибкой амплификации |
ES2966028T3 (es) * | 2018-06-04 | 2024-04-18 | Illumina Inc | Bibliotecas de transcriptomas unicelulares de alto rendimiento y métodos de preparación y de uso |
US11703427B2 (en) | 2018-06-25 | 2023-07-18 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for cell and bead processing |
US20200032335A1 (en) | 2018-07-27 | 2020-01-30 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for metabolome analysis |
SG11202102703VA (en) | 2018-10-26 | 2021-04-29 | Illumina Inc | Modulating polymer beads for dna processing |
WO2020096015A1 (ja) * | 2018-11-07 | 2020-05-14 | 国立大学法人 東京大学 | 1種以上の被検物質と共存した細胞のゲノム関連情報を検出する方法 |
CN109540855B (zh) * | 2018-11-07 | 2021-03-23 | 沈阳化工大学 | 一种荧光金壳磁性椭球的制备方法 |
BR112021006183A2 (pt) * | 2018-11-30 | 2021-06-29 | Illumina, Inc. | análise de múltiplos analitos com o uso de um único ensaio |
WO2020114918A1 (en) | 2018-12-05 | 2020-06-11 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for cluster generation by bridge amplification |
US11459607B1 (en) | 2018-12-10 | 2022-10-04 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for processing-nucleic acid molecules from a single cell using sequential co-partitioning and composite barcodes |
CN112739830A (zh) | 2018-12-18 | 2021-04-30 | 伊卢米纳剑桥有限公司 | 使用单一表面引物进行配对末端测序的方法和组合物 |
AU2019402925A1 (en) | 2018-12-19 | 2021-01-14 | Illumina, Inc. | Methods for improving polynucleotide cluster clonality priority |
US11845983B1 (en) | 2019-01-09 | 2023-12-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for multiplexing of droplet based assays |
CN113302301A (zh) * | 2019-01-09 | 2021-08-24 | 凯杰科学有限责任公司 | 检测分析物的方法及其组合物 |
TW202100247A (zh) | 2019-01-29 | 2021-01-01 | 美商伊路米納有限公司 | 流通槽 |
TW202043486A (zh) | 2019-01-29 | 2020-12-01 | 美商伊路米納有限公司 | 定序套組 |
TW202045709A (zh) | 2019-01-29 | 2020-12-16 | 美商伊路米納有限公司 | 流體槽 |
EP3921081A4 (en) | 2019-02-04 | 2022-11-30 | Illumina Inc | MICROFLUIDIC DROPLET GENERATORS |
US11851683B1 (en) | 2019-02-12 | 2023-12-26 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for selective analysis of cellular samples |
CA3113841A1 (en) | 2019-03-01 | 2020-09-10 | Illumina, Inc. | High-throughput single-nuclei and single-cell libraries and methods of making and of using |
JP2022530584A (ja) | 2019-04-29 | 2022-06-30 | イルミナ インコーポレイティッド | 迅速なインキュベーション及び核酸富化による微生物試料の同定及び分析 |
EP3963070A4 (en) | 2019-04-30 | 2023-02-22 | Encodia, Inc. | METHODS OF PREPARATION OF ANALYTES AND RELATED KITS |
WO2020243074A1 (en) * | 2019-05-31 | 2020-12-03 | Illumina, Inc. | Obtaining information from a biological sample in a flow cell |
CN111088331B (zh) * | 2019-12-16 | 2023-04-14 | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 一种基于压电声波传感器的单分子测序方法 |
CN114008199A (zh) | 2019-12-19 | 2022-02-01 | 伊路敏纳公司 | 高通量单细胞文库及其制备和使用方法 |
WO2021231477A2 (en) | 2020-05-12 | 2021-11-18 | Illumina, Inc. | Generating nucleic acids with modified bases using recombinant terminal deoxynucleotidyl transferase |
WO2021252617A1 (en) | 2020-06-09 | 2021-12-16 | Illumina, Inc. | Methods for increasing yield of sequencing libraries |
JP2023532231A (ja) | 2020-06-30 | 2023-07-27 | イルミナ インコーポレイテッド | 傷なしdnaを生成するための触媒的に制御された合成による配列決定 |
IL299042A (en) | 2020-07-08 | 2023-02-01 | Illumina Inc | Beads as transpososome carriers |
US20230265499A1 (en) * | 2020-08-14 | 2023-08-24 | Factorial Diagnostics, Inc. | In Situ Library Preparation for Sequencing |
KR20230051508A (ko) * | 2020-08-18 | 2023-04-18 | 일루미나, 인코포레이티드 | 핵산의 서열-특이적 표적화된 전위 및 선택과 분류 |
EP4229216A1 (en) * | 2020-10-15 | 2023-08-23 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University | Detection and analysis of structural variations in genomes |
KR102576409B1 (ko) * | 2021-01-18 | 2023-09-08 | 충남대학교병원 | 알지네이트 비드 매개의 세포절편 제작방법 |
EP4298244A1 (en) | 2021-02-23 | 2024-01-03 | 10X Genomics, Inc. | Probe-based analysis of nucleic acids and proteins |
KR102526386B1 (ko) * | 2021-03-19 | 2023-05-02 | 충남대학교병원 | 알지네이트와 pva 복합비드를 매개로 하는 세포절편 제작방법 |
CN117597453A (zh) | 2021-06-23 | 2024-02-23 | 伊鲁米纳公司 | 用于测序试剂的组合物、方法、试剂盒、料筒和系统 |
WO2023086847A1 (en) | 2021-11-10 | 2023-05-19 | Encodia, Inc. | Methods for barcoding macromolecules in individual cells |
US20230193147A1 (en) | 2021-12-21 | 2023-06-22 | Illumina Cambridge Limited | Wax-microsphere matrix compositions and methods of making and using the same |
EP4206674A1 (en) | 2021-12-28 | 2023-07-05 | Encodia, Inc. | High-throughput serotyping and antibody profiling assays |
WO2023126457A1 (en) | 2021-12-29 | 2023-07-06 | Illumina Cambridge Ltd. | Methods of nucleic acid sequencing using surface-bound primers |
AU2023248405A1 (en) | 2022-04-07 | 2024-01-04 | Illumina, Inc. | Altered cytidine deaminases and methods of use |
WO2023209606A1 (en) | 2022-04-29 | 2023-11-02 | Illumina Cambridge Limited | Methods and systems for encapsulating lyophilised microspheres |
EP4272764A1 (en) | 2022-05-03 | 2023-11-08 | Scipio Bioscience | Method of complexing biological units with particles |
GB202208728D0 (en) * | 2022-06-14 | 2022-07-27 | Cambridge Entpr Ltd | Methods for spatial genomic, epigenomic and multi-omic profiling using transposases and light-activated spatial barcoding |
WO2023245129A2 (en) * | 2022-06-15 | 2023-12-21 | Quantum-Si Incorporated | Directed protein evolution |
WO2024073047A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Cytidine deaminases and methods of use in mapping modified cytosine nucleotides |
WO2024069581A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Helicase-cytidine deaminase complexes and methods of use |
WO2024073043A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Methods of using cpg binding proteins in mapping modified cytosine nucleotides |
WO2024118903A1 (en) | 2022-11-30 | 2024-06-06 | Illumina, Inc. | Chemoenzymatic correction of false positive uracil transformations |
Family Cites Families (92)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4469863A (en) | 1980-11-12 | 1984-09-04 | Ts O Paul O P | Nonionic nucleic acid alkyl and aryl phosphonates and processes for manufacture and use thereof |
US5034506A (en) | 1985-03-15 | 1991-07-23 | Anti-Gene Development Group | Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages |
US5235033A (en) | 1985-03-15 | 1993-08-10 | Anti-Gene Development Group | Alpha-morpholino ribonucleoside derivatives and polymers thereof |
US5216141A (en) | 1988-06-06 | 1993-06-01 | Benner Steven A | Oligonucleotide analogs containing sulfur linkages |
EP0450060A1 (en) | 1989-10-26 | 1991-10-09 | Sri International | Dna sequencing |
US5602240A (en) | 1990-07-27 | 1997-02-11 | Ciba Geigy Ag. | Backbone modified oligonucleotide analogs |
US5386023A (en) | 1990-07-27 | 1995-01-31 | Isis Pharmaceuticals | Backbone modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through reductive coupling |
US5432272A (en) | 1990-10-09 | 1995-07-11 | Benner; Steven A. | Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases |
US5644048A (en) | 1992-01-10 | 1997-07-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Process for preparing phosphorothioate oligonucleotides |
US5637684A (en) | 1994-02-23 | 1997-06-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Phosphoramidate and phosphorothioamidate oligomeric compounds |
US5677170A (en) | 1994-03-02 | 1997-10-14 | The Johns Hopkins University | In vitro transposition of artificial transposons |
US5846719A (en) | 1994-10-13 | 1998-12-08 | Lynx Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide tags for sorting and identification |
US5750341A (en) | 1995-04-17 | 1998-05-12 | Lynx Therapeutics, Inc. | DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions |
GB9620209D0 (en) | 1996-09-27 | 1996-11-13 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
GB9626815D0 (en) | 1996-12-23 | 1997-02-12 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
ES2563643T3 (es) | 1997-04-01 | 2016-03-15 | Illumina Cambridge Limited | Método de secuenciación de ácido nucleico |
US6969488B2 (en) | 1998-05-22 | 2005-11-29 | Solexa, Inc. | System and apparatus for sequential processing of analytes |
CA2256128A1 (en) | 1998-12-29 | 2000-06-29 | Stephen William Davies | Coded dna processing |
US6565727B1 (en) | 1999-01-25 | 2003-05-20 | Nanolytics, Inc. | Actuators for microfluidics without moving parts |
US6294063B1 (en) | 1999-02-12 | 2001-09-25 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Method and apparatus for programmable fluidic processing |
US6274320B1 (en) | 1999-09-16 | 2001-08-14 | Curagen Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
US7955794B2 (en) | 2000-09-21 | 2011-06-07 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
US7582420B2 (en) | 2001-07-12 | 2009-09-01 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
EP2100971A3 (en) | 2000-07-07 | 2009-11-25 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Real-time sequence determination |
US8529743B2 (en) | 2000-07-25 | 2013-09-10 | The Regents Of The University Of California | Electrowetting-driven micropumping |
US6773566B2 (en) | 2000-08-31 | 2004-08-10 | Nanolytics, Inc. | Electrostatic actuators for microfluidics and methods for using same |
WO2002044425A2 (en) | 2000-12-01 | 2002-06-06 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
EP1438398A2 (en) * | 2001-10-26 | 2004-07-21 | Immunivest Corporation | Multiparameter analysis of comprehensive nucleic acids and morphological features on the same sample |
JP2005510347A (ja) | 2001-11-26 | 2005-04-21 | ケック グラデュエイト インスティテュート | 化学、生化学、および生物学的アッセイ等のためにエレクトロウェッティングを介してマイクロ流体制御する方法、装置、および物 |
US7057026B2 (en) | 2001-12-04 | 2006-06-06 | Solexa Limited | Labelled nucleotides |
FR2841063B1 (fr) | 2002-06-18 | 2004-09-17 | Commissariat Energie Atomique | Dispositif de deplacement de petits volumes de liquide le long d'un micro-catenaire par des forces electrostatiques |
JP2006509040A (ja) | 2002-08-23 | 2006-03-16 | ソレックサ リミテッド | 修飾されたヌクレオチド |
US6911132B2 (en) | 2002-09-24 | 2005-06-28 | Duke University | Apparatus for manipulating droplets by electrowetting-based techniques |
US8349276B2 (en) | 2002-09-24 | 2013-01-08 | Duke University | Apparatuses and methods for manipulating droplets on a printed circuit board |
US7547380B2 (en) | 2003-01-13 | 2009-06-16 | North Carolina State University | Droplet transportation devices and methods having a fluid surface |
WO2004106925A2 (en) * | 2003-03-03 | 2004-12-09 | Nagaoka & Co.Ltd. | Methods and apparatus for use in detection and quantitation of various cell types and use of optical bio-disc for performing same |
TW200510723A (en) | 2003-07-15 | 2005-03-16 | Bioarray Solutions Ltd | Concurrent optimization in selection of primer and capture probe sets for nucleic acid analysis |
GB0321306D0 (en) | 2003-09-11 | 2003-10-15 | Solexa Ltd | Modified polymerases for improved incorporation of nucleotide analogues |
WO2005039499A2 (en) | 2003-10-24 | 2005-05-06 | Adhesives Research, Inc. | Rapidly disintegrating film |
JP4773360B2 (ja) | 2003-11-17 | 2011-09-14 | コーニンクレッカ フィリップス エレクトロニクス エヌ ヴィ | 流体を操作するためのシステム |
EP3673986A1 (en) | 2004-01-07 | 2020-07-01 | Illumina Cambridge Limited | Improvements in or relating to molecular arrays |
FR2866493B1 (fr) | 2004-02-16 | 2010-08-20 | Commissariat Energie Atomique | Dispositif de controle du deplacement d'une goutte entre deux ou plusieurs substrats solides |
FR2872715B1 (fr) | 2004-07-08 | 2006-11-17 | Commissariat Energie Atomique | Microreacteur goutte |
FR2872809B1 (fr) | 2004-07-09 | 2006-09-15 | Commissariat Energie Atomique | Methode d'adressage d'electrodes |
JP2006058031A (ja) | 2004-08-17 | 2006-03-02 | Hitachi High-Technologies Corp | 化学分析装置 |
US7315019B2 (en) | 2004-09-17 | 2008-01-01 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Arrays of optical confinements and uses thereof |
WO2006064199A1 (en) | 2004-12-13 | 2006-06-22 | Solexa Limited | Improved method of nucleotide detection |
US7458661B2 (en) | 2005-01-25 | 2008-12-02 | The Regents Of The University Of California | Method and apparatus for promoting the complete transfer of liquid drops from a nozzle |
US8623628B2 (en) | 2005-05-10 | 2014-01-07 | Illumina, Inc. | Polymerases |
US20090081688A1 (en) * | 2005-06-20 | 2009-03-26 | Advanced Cell Diagnostics | Methods of detecting nucleic acids in individual cells and of identifying rare cells from large heterogeneous cell populations |
US7464936B2 (en) | 2005-07-19 | 2008-12-16 | New Vision Gaming & Development, Inc. | Method of playing a video poker game |
GB0514936D0 (en) | 2005-07-20 | 2005-08-24 | Solexa Ltd | Preparation of templates for nucleic acid sequencing |
US20070023292A1 (en) | 2005-07-26 | 2007-02-01 | The Regents Of The University Of California | Small object moving on printed circuit board |
US7405281B2 (en) | 2005-09-29 | 2008-07-29 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Fluorescent nucleotide analogs and uses therefor |
GB0522310D0 (en) | 2005-11-01 | 2005-12-07 | Solexa Ltd | Methods of preparing libraries of template polynucleotides |
CN101460953B (zh) | 2006-03-31 | 2012-05-30 | 索雷克萨公司 | 用于合成分析的序列的系统和装置 |
WO2007120241A2 (en) | 2006-04-18 | 2007-10-25 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Droplet-based biochemistry |
CN101490562B (zh) | 2006-07-10 | 2012-12-19 | 株式会社日立高新技术 | 液体输送设备 |
US7414163B1 (en) | 2006-07-28 | 2008-08-19 | Uop Llc | Iridium and germanium-containing catalysts and alkylaromatic transalkylation processes using such catalysts |
AU2007309504B2 (en) | 2006-10-23 | 2012-09-13 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Polymerase enzymes and reagents for enhanced nucleic acid sequencing |
US9266076B2 (en) | 2006-11-02 | 2016-02-23 | The Regents Of The University Of California | Method and apparatus for real-time feedback control of electrical manipulation of droplets on chip |
US8872527B2 (en) | 2007-02-15 | 2014-10-28 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Capacitance detection in a droplet actuator |
US9029085B2 (en) | 2007-03-07 | 2015-05-12 | President And Fellows Of Harvard College | Assays and other reactions involving droplets |
WO2008134153A1 (en) | 2007-04-23 | 2008-11-06 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Bead-based multiplexed analytical methods and instrumentation |
CN101679932A (zh) | 2007-06-27 | 2010-03-24 | 数字化生物系统 | 用于热交换化学过程的基于数字微流体的装置 |
US8093064B2 (en) | 2008-05-15 | 2012-01-10 | The Regents Of The University Of California | Method for using magnetic particles in droplet microfluidics |
US9080211B2 (en) | 2008-10-24 | 2015-07-14 | Epicentre Technologies Corporation | Transposon end compositions and methods for modifying nucleic acids |
EP2359289A4 (en) | 2008-11-26 | 2015-11-11 | Illumina Inc | METHODS AND SYSTEMS FOR ANALYZING SEQUENCING DATA |
US20100323348A1 (en) | 2009-01-31 | 2010-12-23 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Methods and Compositions for Using Error-Detecting and/or Error-Correcting Barcodes in Nucleic Acid Amplification Process |
KR101423936B1 (ko) | 2009-03-11 | 2014-07-29 | (주)바이오니아 | 실시간 핵산 분석 통합 장치 및 이를 이용한 타겟 핵산의 검출방법 |
WO2011002957A2 (en) | 2009-07-01 | 2011-01-06 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Droplet actuator devices and methods |
WO2011038403A1 (en) | 2009-09-28 | 2011-03-31 | Yuling Luo | Methods of detecting nucleic acid sequences with high specificity |
EP3072968A1 (en) | 2010-02-25 | 2016-09-28 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Method of making nucleic acid libraries |
EP2625320B1 (en) * | 2010-10-08 | 2019-03-27 | President and Fellows of Harvard College | High-throughput single cell barcoding |
US8829171B2 (en) | 2011-02-10 | 2014-09-09 | Illumina, Inc. | Linking sequence reads using paired code tags |
CA2821299C (en) * | 2010-11-05 | 2019-02-12 | Frank J. Steemers | Linking sequence reads using paired code tags |
US9074251B2 (en) | 2011-02-10 | 2015-07-07 | Illumina, Inc. | Linking sequence reads using paired code tags |
US10144950B2 (en) * | 2011-01-31 | 2018-12-04 | Roche Sequencing Solutions, Inc. | Methods of identifying multiple epitopes in cells |
US10457936B2 (en) * | 2011-02-02 | 2019-10-29 | University Of Washington Through Its Center For Commercialization | Massively parallel contiguity mapping |
US9365897B2 (en) | 2011-02-08 | 2016-06-14 | Illumina, Inc. | Selective enrichment of nucleic acids |
WO2012112804A1 (en) * | 2011-02-18 | 2012-08-23 | Raindance Technoligies, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
SG10201605049QA (en) * | 2011-05-20 | 2016-07-28 | Fluidigm Corp | Nucleic acid encoding reactions |
GB201108678D0 (en) | 2011-05-24 | 2011-07-06 | Olink Ab | Multiplexed proximity ligation assay |
EP2718465B1 (en) | 2011-06-09 | 2022-04-13 | Illumina, Inc. | Method of making an analyte array |
WO2013063382A2 (en) | 2011-10-28 | 2013-05-02 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
WO2013078470A2 (en) * | 2011-11-22 | 2013-05-30 | MOTIF, Active | Multiplex isolation of protein-associated nucleic acids |
CN102703426A (zh) * | 2012-05-21 | 2012-10-03 | 吴江汇杰生物科技有限公司 | 构建核酸库的方法、试剂及试剂盒 |
US9977861B2 (en) | 2012-07-18 | 2018-05-22 | Illumina Cambridge Limited | Methods and systems for determining haplotypes and phasing of haplotypes |
CN104736725A (zh) | 2012-08-13 | 2015-06-24 | 加利福尼亚大学董事会 | 用于检测生物组分的方法和系统 |
US9388465B2 (en) * | 2013-02-08 | 2016-07-12 | 10X Genomics, Inc. | Polynucleotide barcode generation |
WO2014142850A1 (en) | 2013-03-13 | 2014-09-18 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
CN104032377A (zh) * | 2014-06-30 | 2014-09-10 | 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 | 单细胞转录组测序文库的构建方法及其应用 |
-
2016
- 2016-02-10 CA CA3174951A patent/CA3174951A1/en active Pending
- 2016-02-10 WO PCT/US2016/017391 patent/WO2016130704A2/en active Application Filing
- 2016-02-10 JP JP2017541101A patent/JP7001475B2/ja active Active
- 2016-02-10 KR KR1020217035607A patent/KR20210135626A/ko not_active Application Discontinuation
- 2016-02-10 SG SG11201706504RA patent/SG11201706504RA/en unknown
- 2016-02-10 DK DK16711039.4T patent/DK3256604T3/da active
- 2016-02-10 RU RU2020110764A patent/RU2761432C2/ru active
- 2016-02-10 EP EP16711039.4A patent/EP3256604B1/en active Active
- 2016-02-10 AU AU2016219328A patent/AU2016219328B2/en active Active
- 2016-02-10 BR BR112017017025-6A patent/BR112017017025B1/pt active IP Right Grant
- 2016-02-10 PT PT167110394T patent/PT3256604T/pt unknown
- 2016-02-10 US US15/549,334 patent/US11634707B2/en active Active
- 2016-02-10 EP EP20165203.9A patent/EP3725893A1/en active Pending
- 2016-02-10 RU RU2017127628A patent/RU2717491C2/ru active
- 2016-02-10 CN CN202310017511.3A patent/CN116083546A/zh active Pending
- 2016-02-10 KR KR1020207004910A patent/KR20200020997A/ko not_active IP Right Cessation
- 2016-02-10 CN CN202310862581.9A patent/CN117106871A/zh active Pending
- 2016-02-10 SG SG10202104816QA patent/SG10202104816QA/en unknown
- 2016-02-10 ES ES16711039T patent/ES2786652T3/es active Active
- 2016-02-10 CA CA2975739A patent/CA2975739C/en active Active
- 2016-02-10 KR KR1020177025457A patent/KR20170135834A/ko active Application Filing
- 2016-02-10 CN CN201680017121.4A patent/CN107406890B/zh active Active
-
2022
- 2022-04-07 AU AU2022202345A patent/AU2022202345A1/en active Pending
-
2023
- 2023-02-27 US US18/114,509 patent/US20230374493A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2020110764A (ru) | Способ и композиция для анализа клеточных компонентов | |
US11434524B2 (en) | Methods for determining a location of an analyte in a biological sample | |
Datta et al. | Laser capture microdissection: Big data from small samples | |
Rotem et al. | Single-cell ChIP-seq reveals cell subpopulations defined by chromatin state | |
Liu et al. | Advancing single-cell proteomics and metabolomics with microfluidic technologies | |
CN105189749B (zh) | 用于标记和分析样品的方法和组合物 | |
Wang et al. | Single cell analysis: the new frontier in ‘omics’ | |
WO2018119447A3 (en) | Methods and systems for processing polynucleotides | |
Xu et al. | Benchtop-compatible sample processing workflow for proteome profiling of< 100 mammalian cells | |
JP2016525344A5 (ru) | ||
DeLaughter | The use of the Fluidigm C1 for RNA expression analyses of single cells | |
DE69937447D1 (de) | Verfahren zur erkennung von nukleinsäuren | |
Leonavicius et al. | Multi-omics at single-cell resolution: comparison of experimental and data fusion approaches | |
Zhang et al. | High‐Throughput Isolation of Cell Protrusions with Single‐Cell Precision for Profiling Subcellular Gene Expression | |
Krcmar et al. | Identification of species-specific DNA in feedstuffs | |
US20180163251A1 (en) | Target region enrichment method based on multiplex pcr, and reagent | |
WO2013010134A3 (en) | Systems, apparatus and methods for biochemical analysis | |
WO2017056251A1 (ja) | 分析方法および分析用デバイス | |
Kothamachu et al. | Role of digital microfluidics in enabling access to laboratory automation and making biology programmable | |
US20180299360A1 (en) | Methods for selectively analyzing biological samples | |
EP3736324A1 (en) | System for identifying and targeting individual cells within a heterogeneous population for selective extraction of cellular content | |
Sarwal et al. | Functional proteogenomics—embracing complexity | |
Cao et al. | Microfluidics-based single cell analysis: from transcriptomics to spatiotemporal multi-omics | |
US20220106631A1 (en) | Barcoding in droplets for cell-cell interaction and secreted protein detection and analysis | |
US20240026446A1 (en) | Systems and methods for spatial screening of analytes |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HE9A | Changing address for correspondence with an applicant |