RU2014144722A - Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце - Google Patents

Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце Download PDF

Info

Publication number
RU2014144722A
RU2014144722A RU2014144722A RU2014144722A RU2014144722A RU 2014144722 A RU2014144722 A RU 2014144722A RU 2014144722 A RU2014144722 A RU 2014144722A RU 2014144722 A RU2014144722 A RU 2014144722A RU 2014144722 A RU2014144722 A RU 2014144722A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
acid molecule
target nucleic
sequence
oligonucleotide
Prior art date
Application number
RU2014144722A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2601129C2 (ru
Inventor
Дэниэл ШЭФФЕР
Стивен А. ДЖУДИС
Original Assignee
Инвайролоджикс Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=49328090&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2014144722(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Инвайролоджикс Инк. filed Critical Инвайролоджикс Инк.
Publication of RU2014144722A publication Critical patent/RU2014144722A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2601129C2 publication Critical patent/RU2601129C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851—Quantitative amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria

Abstract

1. Способ количественного определения специфического продукта в реакции амплификации с внесением одноцепочечных разрывов и достройкой, при этом способ включает:(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;(b) образование ампликонов, содержащих по меньшей мере часть указанной целевой молекулы нуклеиновой кислоты; и(c) выявление сигнала, специфичного для гибридизации олигонуклеотидного зонда с целевой молекулой нуклеиновой кислоты или ее ампликоном, где сигнал указывает на количество целевой молекулы нуклеиновой кислоты, присутствующей в образце, или ее ампликона.2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что 2′-модификацию выбирают из группы, состоящей из 2′-O-метила, 2′-метоксиэтокси, 2′-фтора, 2′-гидроксила, 2-аллила, 2′-O-[2-(метиламино)-2-оксоэтила], 4′-тио, 4′-CH-O-2′-мостика, 4′-(CH)-O-2′-мостика, 2′-LNA и 2′-O-(N-метилкарбамата) или содержащих аналоги оснований.3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 5′-конце послед

Claims (49)

1. Способ количественного определения специфического продукта в реакции амплификации с внесением одноцепочечных разрывов и достройкой, при этом способ включает:
(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих по меньшей мере часть указанной целевой молекулы нуклеиновой кислоты; и
(c) выявление сигнала, специфичного для гибридизации олигонуклеотидного зонда с целевой молекулой нуклеиновой кислоты или ее ампликоном, где сигнал указывает на количество целевой молекулы нуклеиновой кислоты, присутствующей в образце, или ее ампликона.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что 2′-модификацию выбирают из группы, состоящей из 2′-O-метила, 2′-метоксиэтокси, 2′-фтора, 2′-гидроксила, 2-аллила, 2′-O-[2-(метиламино)-2-оксоэтила], 4′-тио, 4′-CH2-O-2′-мостика, 4′-(CH2)2-O-2′-мостика, 2′-LNA и 2′-O-(N-метилкарбамата) или содержащих аналоги оснований.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов, расположенных на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты, отделены от сайта одноцепочечного разрыва с помощью 1, 2, 3, 4, 5 или более немодифицированных нуклеотидов.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что два или более 2′-модифицированных нуклеотида являются смежными.
7. Способ по п. 3, отличающийся тем, что 5 смежных нуклеотидов с 2′-O-метильной модификацией расположены на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
8. Способ по п. 4, отличающийся тем, что 5 смежных нуклеотидов с 2′-O-метильной модификацией расположены на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
9. Способ по п. 1, отличающийся тем, что на этапе выявления не выявляют ампликон нецелевой молекулы.
10. Способ по п. 1, отличающийся тем, что способ выполняют в режиме реального времени.
11. Способ по п. 1, отличающийся тем, что способ представляет собой полуколичественный и/или количественный способ порогов для определения количества молекулы нуклеиновой кислоты, присутствующей в биологическом образце до амплификации.
12. Способ по п. 1, отличающийся тем, что расположение одного или нескольких 2′-модифицированных нуклеотидов ближе к 5′-концу последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты, увеличивает время выявления в амплификации.
13. Способ по п. 1, дополнительно включающий применение соотношений олигонуклеотидных праймеров/матриц для обеспечения повышенной степени выявления продуктов реакции, получаемых из различных количеств исходного целевого материала.
14. Способ по п. 1, дополнительно включающий применение модификатора скорости амплификации для обеспечения повышенной степени выявления продуктов реакции, получаемых из различных количеств исходного целевого материала.
15. Способ по п. 1, отличающийся тем, что целевая молекула нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты ДНК или РНК.
16. Способ по любому из пп. 1-15, отличающийся тем, что зонд представляет собой SYBR Green или молекулярный маяк.
17. Способ по любому из пп. 1-15, отличающийся тем, что зонд представляет собой неамплифицируемый выявляемый полинуклеотидный зонд, содержащий по меньшей мере приблизительно 10 нуклеотидов, комплементарных целевой последовательности, выявляемый фрагмент и молекулу, подавляющую активность полимеразы, где молекула, подавляющая активность полимеразы, предотвращает амплификацию зонда с помощью полимеразы в условиях, поддерживающих полимеразную активность в остальных случаях.
18. Способ выявления множества различных продуктов реакции, получаемых в ходе одной реакции, при этом способ включает:
(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих по меньшей мере часть указанной целевой молекулы нуклеиновой кислоты; и
(c) выявление сигнала, специфичного для гибридизации олигонуклеотидного зонда с целевой молекулой нуклеиновой кислоты или ее ампликоном, где сигнал указывает на количество целевой молекулы нуклеиновой кислоты, присутствующей в образце, или ее ампликона.
19. Способ количественного определения специфического продукта в реакции амплификации с внесением одноцепочечных разрывов и достройкой, при этом способ включает:
(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит 5 смежных нуклеотидов с 2′-O-метильной модификацией, расположенных на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих по меньшей мере часть указанной целевой молекулы нуклеиновой кислоты; и
(c) выявление сигнала, специфичного для гибридизации олигонуклеотидного зонда с целевой молекулой нуклеиновой кислоты или ее ампликоном, где сигнал указывает на количество целевой молекулы нуклеиновой кислоты, присутствующей в образце, или ее ампликона.
20. Способ по п. 18, отличающийся тем, что этап (c) выполняют в режиме реального времени для определения количества целевой молекулы, присутствующей в реакционной смеси.
21. Способ контроля в режиме реального времени реакции амплификации с внесением одноцепочечных разрывов и достройкой, при этом способ включает:
(a) приведение тестируемого образца в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих по меньшей мере часть указанной целевой молекулы нуклеиновой кислоты; и
(c) выявление сигнала в режиме реального времени с количественным определением, таким образом, целевой(целевых) молекулы(молекул) нуклеиновой кислоты.
22. Способ по п. 21, отличающийся тем, что тестируемый образец содержит патоген.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что патоген представляет собой вирус, бактерию, дрожжи или гриб.
24. Способ по п. 21, отличающийся тем, что тестируемый образец представляет собой биологический образец.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что биологический образец представляет собой биологическую жидкость, клетку или образец ткани.
26. Способ по п. 25, отличающийся тем, что биологическая жидкость представляет собой мочу, сперму, влагалищный секрет или кал.
27. Способ по п. 21, отличающийся тем, что тестируемый образец представляет собой пробу из окружающей среды.
28. Способ по п. 21, отличающийся тем, что этап (c) выполняют в режиме реального времени.
29. Способ контроля в режиме реального времени целевой молекулы нуклеиновой кислоты в NEAR-реакции, включающий:
(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, специфичным для гетеродуплексов ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих целевую последовательность, связывающуюся с выявляемым олигонуклеотидным зондом; и
(c) выявление сигнала в режиме реального времени с количественным определением, таким образом, целевой молекулы нуклеиновой кислоты.
30. Способ контроля в режиме реального времени целевой молекулы нуклеиновой кислоты в тестируемом образце, при этом способ включает:
(a) приведение целевой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт в практически изотермических условиях с полимеразой, двумя или более олигонуклеотидными праймерами/матрицами, каждый из которых специфически связывается с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты, ферментом, вносящим одноцепочечный разрыв, репаративным ферментом или ферментом для исправления ошибок и выявляемым полинуклеотидным зондом, где каждый из олигонуклеотидных праймеров/матриц содержит один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты;
(b) образование ампликонов, содержащих целевую последовательность, связывающуюся с выявляемым олигонуклеотидным зондом; и
(c) выявление сигнала в режиме реального времени с количественным определением, таким образом, целевой молекулы нуклеиновой кислоты.
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что тестируемый образец содержит патоген.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что патоген представляет собой вирус, бактерию, дрожжи или гриб.
33. Способ по п. 30, отличающийся тем, что тестируемый образец представляет собой биологический образец.
34. Способ по п. 33, отличающийся тем, что биологический образец представляет собой биологическую жидкость, клетку или образец ткани.
35. Способ по п. 34, отличающийся тем, что биологическая жидкость представляет собой мочу, сперму, влагалищный секрет или кал.
36. Способ по п. 30, отличающийся тем, что тестируемый образец представляет собой пробу из окружающей среды.
37. Способ по п. 30, отличающийся тем, что этап (c) выполняют в режиме реального времени.
38. Набор для выявления целевой последовательности в NEAR-реакции, при этом набор содержит один или несколько олигонуклеотидных праймеров/матриц, которые специфически связываются с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты и содержат один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов в последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты, и инструкцию для применения олигонуклеотидного праймера/матрицы в способах по настоящему изобретению.
39. Выделенный олигонуклеотид, содержащий в направлении 5′-3′:
i) первый участок и
ii) второй участок,
где первый участок содержит последовательность распознавания для фермента, вносящего одноцепочечный разрыв; где второй участок содержит по меньшей мере 9 нуклеотидов, специфически связывающихся с комплементарной последовательностью в целевой молекуле нуклеиновой кислоты; и где второй участок содержит один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов.
40. Выделенный олигонуклеотид по п. 39, где 2′-модификация выбрана из группы, состоящей из 2′-O-метила, 2′-метоксиэтокси, 2′-фтора, 2′-гидроксила, 2′-аллила, 2′-O-[2-(метиламино)-2-оксоэтила], 4′-тио, 4′-CH2-O-2′-мостика, 4′-(CH2)2-O-2′-мостика, 2′-LNA и 2′-O-(N-метилкарбамата) или содержащих аналоги оснований.
41. Выделенный олигонуклеотид по п. 39, где один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
42. Выделенный олигонуклеотид по п. 39, где один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов расположены на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
43. Выделенный олигонуклеотид по п. 42, где один или несколько 2′-модифицированных нуклеотидов, расположенных на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты, отделены от сайта одноцепочечного разрыва с помощью 1, 2, 3, 4, 5 или более немодифицированных нуклеотидов.
44. Выделенный олигонуклеотид по п. 39, где два или более 2′-модифицированных нуклеотида являются смежными.
45. Выделенный олигонуклеотид по п. 44, где количество смежных 2′-модифицированных нуклеотидов составляет 2, 3, 4, 5 или более.
46. Выделенный олигонуклеотид по любому из пп. 39-45, где последовательность распознавания для фермента, вносящего одноцепочечный разрыв, представляет собой 5′-GAGT-3′.
47. Выделенный олигонуклеотид по п. 41, где 5 смежных нуклеотидов с 2′-O-метильной модификацией расположены на 3′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
48. Выделенный олигонуклеотид по п. 42, где 5 смежных нуклеотидов с 2′-O-метильной модификацией расположены на 5′-конце последовательности, комплементарной целевой молекуле нуклеиновой кислоты.
49. Выделенный олигонуклеотид, где олигонуклеотид является одним из представленных на фигуре 1.
RU2014144722/10A 2012-04-09 2013-04-09 Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце RU2601129C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261621975P 2012-04-09 2012-04-09
US61/621,975 2012-04-09
PCT/US2013/035750 WO2013155056A1 (en) 2012-04-09 2013-04-09 Compositions and methods for quantifying a nucleic acid sequence in a sample

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016138585A Division RU2732589C2 (ru) 2012-04-09 2013-04-09 Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014144722A true RU2014144722A (ru) 2016-06-10
RU2601129C2 RU2601129C2 (ru) 2016-10-27

Family

ID=49328090

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016138585A RU2732589C2 (ru) 2012-04-09 2013-04-09 Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце
RU2014144722/10A RU2601129C2 (ru) 2012-04-09 2013-04-09 Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016138585A RU2732589C2 (ru) 2012-04-09 2013-04-09 Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце

Country Status (18)

Country Link
US (8) US9096897B2 (ru)
EP (2) EP3587587A1 (ru)
JP (4) JP5801513B2 (ru)
KR (4) KR102048946B1 (ru)
CN (2) CN114134207A (ru)
AU (3) AU2013246080C1 (ru)
BR (1) BR112014025262A8 (ru)
CA (1) CA2869971C (ru)
DK (1) DK2836609T4 (ru)
ES (1) ES2743050T5 (ru)
HK (1) HK1210228A1 (ru)
IN (1) IN2014DN08831A (ru)
MX (2) MX338296B (ru)
NZ (2) NZ701145A (ru)
RU (2) RU2732589C2 (ru)
UA (2) UA125112C2 (ru)
WO (1) WO2013155056A1 (ru)
ZA (3) ZA201408116B (ru)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
UA125112C2 (uk) 2012-04-09 2022-01-12 Енвіролоджикс Інк. Спосіб ампліфікації полінуклеотиду
MX2016013877A (es) 2014-04-22 2017-03-09 Envirologix Inc Composiciones y metodos para mejorar y/o predecir la amplificacion de adn.
CN106574299A (zh) * 2014-04-30 2017-04-19 龙公司 用来检测黄龙病的组合物和方法
EP3207159B1 (en) * 2014-10-14 2019-11-20 Abbott Laboratories Sequence conversion and signal amplifier dna having poly dna spacer sequences and detection methods using same
EP4141128A1 (en) 2014-10-20 2023-03-01 Envirologix Inc. Compositions and methods for detecting an rna virus
CA2975328A1 (en) 2015-01-30 2016-08-04 Envirologix Inc. Substrates for a nicking and extension reaction
WO2016122698A1 (en) * 2015-01-30 2016-08-04 Envirologix, Inc. Compositions and methods for rapid detection of salmonella
CN108027335B (zh) * 2015-06-25 2021-05-04 罗斯韦尔生物技术股份有限公司 生物分子传感器和方法
US20200208199A1 (en) * 2015-07-20 2020-07-02 Envirologix Inc. Compositions and methods for rapid detection of salmonella serovar d1
EP3368654A4 (en) * 2015-10-30 2019-06-05 Alere Inc. DETERMINATION OF POLYMORPHISMS BY ISOTHERMAL AMPLIFICATION OF NUCLEIC ACID
US10329601B2 (en) 2015-12-28 2019-06-25 Ionian Technologies, Inc. Nicking and extension amplification reaction (NEAR) of Streptococcus species
EP4137808A1 (en) 2016-01-28 2023-02-22 Roswell Biotechnologies, Inc. Method of making a sequencing device
US11624725B2 (en) 2016-01-28 2023-04-11 Roswell Blotechnologies, Inc. Methods and apparatus for measuring analytes using polymerase in large scale molecular electronics sensor arrays
JP6854532B2 (ja) 2016-02-09 2021-04-07 ロズウェル バイオテクノロジーズ，インコーポレイテッド 電子的、標識フリーのｄｎａおよびゲノムシークエンシング
US10597767B2 (en) 2016-02-22 2020-03-24 Roswell Biotechnologies, Inc. Nanoparticle fabrication
GB201611469D0 (en) 2016-06-30 2016-08-17 Lumiradx Tech Ltd Improvements in or relating to nucleic acid amplification processes
US9829456B1 (en) 2016-07-26 2017-11-28 Roswell Biotechnologies, Inc. Method of making a multi-electrode structure usable in molecular sensing devices
CA3052062A1 (en) 2017-01-10 2018-07-19 Roswell Biotechnologies, Inc. Methods and systems for dna data storage
KR20230158636A (ko) 2017-01-19 2023-11-20 로스웰 바이오테크놀로지스 인코포레이티드 2차원 레이어 재료를 포함하는 솔리드 스테이트 시퀀싱 디바이스들
KR20200002897A (ko) 2017-04-25 2020-01-08 로스웰 바이오테크놀로지스 인코포레이티드 분자 센서들을 위한 효소 회로들
US10508296B2 (en) 2017-04-25 2019-12-17 Roswell Biotechnologies, Inc. Enzymatic circuits for molecular sensors
KR102606670B1 (ko) 2017-05-09 2023-11-24 로스웰 바이오테크놀로지스 인코포레이티드 분자 센서들을 위한 결합 프로브 회로들
US10538808B2 (en) 2017-05-26 2020-01-21 Vibrant Holdings, Llc Photoactive compounds and methods for biomolecule detection and sequencing
TWI754652B (zh) * 2017-07-10 2022-02-11 英商盧米瑞德克斯英國有限公司 核酸擴增方法中或相關之改良
KR20200039795A (ko) 2017-08-30 2020-04-16 로스웰 바이오테크놀로지스 인코포레이티드 Dna 데이터 저장을 위한 진행성 효소 분자 전자 센서들
RU2020100221A (ru) 2017-08-31 2021-09-30 Иониан Текнолоджис, Ллс Реакция амплификации с разрывом и удлинением (near) разновидностей респираторно-синцитиального вируса
WO2019075100A1 (en) 2017-10-10 2019-04-18 Roswell Biotechnologies, Inc. METHODS, APPARATUS AND SYSTEMS FOR STORING DNA DATA WITHOUT AMPLIFICATION
GB2569965A (en) 2018-01-04 2019-07-10 Lumiradx Uk Ltd Improvements in or relating to amplification of nucleic acids
CN108588252A (zh) * 2018-03-29 2018-09-28 杭州泰熙生物技术有限公司 一种寄生虫检测试剂盒及其检测方法
KR20210024010A (ko) * 2018-06-26 2021-03-04 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 Crispr 이중 닉카제 기반 증폭 조성물, 시스템, 및 방법
GB201812149D0 (en) * 2018-07-25 2018-09-05 Sense Biodetection Ltd Nucleic acid detection method
KR102154628B1 (ko) 2019-01-03 2020-09-10 베트올 (주) 반정량 수평류 면역진단 기술을 이용한 랄스토니아 솔라나세아룸과 푸사리움 옥시스포룸의 동시 진단 방법
KR102199394B1 (ko) * 2019-07-01 2021-01-06 한국화학연구원 이중분자비콘과 산화그래핀을 포함하는 핵산 검출용 조성물 및 이를 이용한 핵산 검출의 비색신호 증폭 방법
KR102531590B1 (ko) * 2019-07-16 2023-05-11 고려대학교 산학협력단 절단효소 인식부위의 미러링 결합에 의한 표적핵산의 검출 방법 및 핵산 검출용 조성물
CN110408678A (zh) * 2019-07-26 2019-11-05 宁儿医院股份有限公司 单管型多重微生物检测体系及其即时检测方法
WO2023107998A1 (en) * 2021-12-08 2023-06-15 Massachusetts Institute Of Technology Cold-temperature isothermal amplification of polynucleotides
WO2023221939A1 (en) * 2022-05-14 2023-11-23 Jiangsu Code Biomedical Technology Co., Ltd. Novel compositions and methods for cell-free dna detection
WO2024006552A1 (en) * 2022-07-01 2024-01-04 Sherlock Biosciences, Inc. Ambient temperature nucleic acid amplification and detection
WO2024030985A1 (en) 2022-08-04 2024-02-08 Abbott Laboratories Assays for detecting monkeypox virus

Family Cites Families (65)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5455166A (en) † 1991-01-31 1995-10-03 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification
WO1994003635A1 (en) 1992-08-04 1994-02-17 Institute Of Molecular Biology & Biotechnology Rapid amplification and detection of nucleic acids
US5648211A (en) 1994-04-18 1997-07-15 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification using thermophilic enzymes
US5629179A (en) 1995-03-17 1997-05-13 Novagen, Inc. Method and kit for making CDNA library
AT402203B (de) 1995-06-13 1997-03-25 Himmler Gottfried Dipl Ing Dr Verfahren zur transkriptionsfreien amplifizierung von nucleinsäuren
WO1997035026A1 (en) * 1996-03-18 1997-09-25 Molecular Biology Resources, Inc. Target nucleic acid sequence amplification
DK0912767T3 (da) * 1996-07-16 2006-10-30 Gen Probe Inc Fremgangsmåde til sporing og forstærkning af nukleinsyresekvenser ved anvendelse af modificerede oligonukleotider med foröget targetspecifikt TM
GB9716231D0 (en) 1997-07-31 1997-10-08 Amersham Int Ltd Base analogues
AU1366299A (en) 1997-10-27 1999-05-17 Boston Probes, Inc. Methods, kits and compositions pertaining to pna molecular beacons
US5952202A (en) 1998-03-26 1999-09-14 The Perkin Elmer Corporation Methods using exogenous, internal controls and analogue blocks during nucleic acid amplification
AU1908100A (en) 1998-11-06 2000-05-29 Molecular Biology Resources, Inc. Isothermal nucleic acid amplification methods
US6436677B1 (en) 2000-03-02 2002-08-20 Promega Corporation Method of reverse transcription
AU2001274869A1 (en) * 2000-05-20 2001-12-03 The Regents Of The University Of Michigan Method of producing a dna library using positional amplification
US6191267B1 (en) 2000-06-02 2001-02-20 New England Biolabs, Inc. Cloning and producing the N.BstNBI nicking endonuclease
ATE312942T1 (de) * 2000-10-25 2005-12-15 Hoffmann La Roche Amplifizierung unter verwendung von modifizierten primern
NZ527128A (en) * 2000-12-27 2005-11-25 Invitrogen Corp Primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids
AU2002313683A1 (en) 2001-07-15 2003-03-03 Keck Graduate Institute Nucleic acid amplification using nicking agents
US20030082590A1 (en) 2001-07-15 2003-05-01 Keck Graduate Institute Exponential nucleic acid amplification using nicking endonucleases
AU2002325538B2 (en) 2001-08-20 2007-03-22 Takara Bio Inc. Nucleic acid amplification methods
US6977148B2 (en) 2001-10-15 2005-12-20 Qiagen Gmbh Multiple displacement amplification
US6617137B2 (en) 2001-10-15 2003-09-09 Molecular Staging Inc. Method of amplifying whole genomes without subjecting the genome to denaturing conditions
US7399590B2 (en) 2002-02-21 2008-07-15 Asm Scientific, Inc. Recombinase polymerase amplification
US20030211483A1 (en) 2002-05-09 2003-11-13 Schroeder Benjamin G. Methods for the enrichment of low-abundance polynucleotides
JP4632788B2 (ja) 2002-09-20 2011-02-16 ニュー・イングランド・バイオラブズ・インコーポレイティッド 核酸のヘリカーゼ依存性増幅
US7662594B2 (en) 2002-09-20 2010-02-16 New England Biolabs, Inc. Helicase-dependent amplification of RNA
WO2004067726A2 (en) 2003-01-29 2004-08-12 Keck Graduate Institute Isothermal reactions for the amplification of oligonucleotides
JP4380305B2 (ja) 2003-11-21 2009-12-09 味の素株式会社 発酵法によるｌ−アミノ酸の製造法
US20090017452A1 (en) 2004-03-05 2009-01-15 University Of Chicago Methods and compositions relating to the pharmacogenetics of different gene variants
US20060115838A1 (en) 2004-10-19 2006-06-01 Trevigen Inc. Real-time detection of amplicons using nucleic acid repair enzymes
JP5068175B2 (ja) * 2005-01-04 2012-11-07 日立化成工業株式会社 プライマー生成ローリングサークル型増幅
JP4555136B2 (ja) * 2005-03-31 2010-09-29 本田技研工業株式会社 燃料電池の電気システム、燃料電池車両及び電力供給方法
US7435561B2 (en) 2005-07-25 2008-10-14 Asm Scientific, Inc. Methods for multiplexing recombinase polymerase amplification
DK1924704T3 (da) 2005-08-02 2011-09-05 Rubicon Genomics Inc Sammensætninger og fremgangsmåder til bearbejdning og mangfoldiggørelse af DNA, herunder ved anvendelse af flere enzymer i en enkelt reaktion
EP1762627A1 (de) 2005-09-09 2007-03-14 Qiagen GmbH Verfahren zur Aktivierung einer Nukleinsäure für eine Polymerase-Reaktion
US7947286B2 (en) 2005-10-07 2011-05-24 Panthera Biopharma Llc Drosophila cell lines producing recombinant secretable filovirus surface glycoproteins lacking the membrane spanning domain
US20090092967A1 (en) 2006-06-26 2009-04-09 Epoch Biosciences, Inc. Method for generating target nucleic acid sequences
US20080096257A1 (en) 2006-08-15 2008-04-24 Zuxu Yao Methods for Rapid, Single-Step Strand Displacement Amplification of Nucleic Acids
DE102006039396A1 (de) 2006-08-22 2008-03-13 Robert Bosch Gmbh Laserlichtquelle
US8399188B2 (en) 2006-09-28 2013-03-19 Illumina, Inc. Compositions and methods for nucleotide sequencing
AU2007304776A1 (en) 2006-10-06 2008-04-10 Dna Genotek Inc. Stabilizing compositions and methods for extraction of ribonucleic acid
JP2008136451A (ja) 2006-12-05 2008-06-19 Hitachi Ltd 核酸増幅法
US8202972B2 (en) 2007-01-10 2012-06-19 General Electric Company Isothermal DNA amplification
US20090081760A1 (en) † 2007-01-12 2009-03-26 Monsanto Technology Llc Dmo methods and compositions
US20080254458A1 (en) 2007-04-10 2008-10-16 Asiagen Corporation Method of pre-treating in pleural effusion for detection of Mycobacterium tuberculosis
US20080274458A1 (en) 2007-05-01 2008-11-06 Latham Gary J Nucleic acid quantitation methods
US9689031B2 (en) * 2007-07-14 2017-06-27 Ionian Technologies, Inc. Nicking and extension amplification reaction for the exponential amplification of nucleic acids
WO2009020609A2 (en) 2007-08-06 2009-02-12 Nanogen, Inc. Isolation of nucleic acids molecules using modified solid supports
US20090197254A1 (en) 2007-12-14 2009-08-06 Ming-Chou Lee Variant scorpion primers for nucleic acid amplification and detection
US20090325169A1 (en) 2008-04-30 2009-12-31 Integrated Dna Technologies, Inc. Rnase h-based assays utilizing modified rna monomers
EP2333109B1 (en) 2008-09-03 2013-08-07 Takara Bio, Inc. Composition for detection of rna
AU2010206492B2 (en) 2009-01-21 2012-07-12 Human Genetic Signatures Pty Ltd Improved isothermal strand displacement amplification
EP2408936A4 (en) 2009-03-18 2013-01-30 Sequenom Inc USE OF HEAT-STAINED ENDONUCLEASES FOR THE PREPARATION OF REPORTER MOLECULES
WO2010126913A1 (en) 2009-04-27 2010-11-04 Gen-Probe Incorporated Methods and kits for use in the selective amplification of target sequences
WO2012021493A2 (en) † 2010-08-13 2012-02-16 Envirologix Inc. Compositions and methods for quantifying a nucleic acid sequence in a sample
EP2420579A1 (en) * 2010-08-17 2012-02-22 QIAGEN GmbH Helicase dependent isothermal amplification using nicking enzymes
DK2756101T3 (en) 2011-09-15 2018-08-27 David A Shafer PROBLEMS: ANTISON DETAIL COMPOSITIONS FOR DETECTING HIGH OR SPECIFIC DNA OR RNA
WO2013101783A2 (en) 2011-12-30 2013-07-04 Bio-Rad Laboratories, Inc. Methods and compositions for performing nucleic acid amplification reactions
UA125112C2 (uk) 2012-04-09 2022-01-12 Енвіролоджикс Інк. Спосіб ампліфікації полінуклеотиду
EP2867366B1 (en) 2012-06-29 2018-05-16 General Electric Company Method for isothermal dna amplification starting from an rna template in a single reaction mixture
JP2014082936A (ja) 2012-10-19 2014-05-12 Kyoto Univ 変異型逆転写酵素
MX2016013877A (es) 2014-04-22 2017-03-09 Envirologix Inc Composiciones y metodos para mejorar y/o predecir la amplificacion de adn.
CN106574299A (zh) 2014-04-30 2017-04-19 龙公司 用来检测黄龙病的组合物和方法
EP4141128A1 (en) 2014-10-20 2023-03-01 Envirologix Inc. Compositions and methods for detecting an rna virus
BR112017008718A2 (pt) 2014-10-28 2017-12-19 Envirologix Inc ?recipientes de preparação de amostra, circuitos de microfluídos, e sistemas e métodos para preparação, extração e análise da amostra?
WO2016122698A1 (en) 2015-01-30 2016-08-04 Envirologix, Inc. Compositions and methods for rapid detection of salmonella

Also Published As

Publication number Publication date
US9096897B2 (en) 2015-08-04
CA2869971A1 (en) 2013-10-17
IN2014DN08831A (ru) 2015-05-22
US9631231B2 (en) 2017-04-25
US20220243262A1 (en) 2022-08-04
KR20200111287A (ko) 2020-09-28
UA116205C2 (uk) 2018-02-26
US20180094310A1 (en) 2018-04-05
DK2836609T4 (da) 2022-09-05
MX2014012214A (es) 2015-05-08
NZ701145A (en) 2016-09-30
EP2836609B2 (en) 2022-06-15
US20180363046A1 (en) 2018-12-20
CA2869971C (en) 2022-10-25
KR20150031229A (ko) 2015-03-23
ES2743050T3 (es) 2020-02-18
US20160122811A1 (en) 2016-05-05
MX338296B (es) 2016-04-11
WO2013155056A1 (en) 2013-10-17
UA125112C2 (uk) 2022-01-12
KR20150080023A (ko) 2015-07-08
HK1210228A1 (en) 2016-04-15
EP2836609A4 (en) 2015-11-11
US20170166960A1 (en) 2017-06-15
AU2013246080B2 (en) 2015-07-23
RU2732589C2 (ru) 2020-09-21
US20200239947A1 (en) 2020-07-30
WO2013155056A9 (en) 2014-01-09
JP2017029154A (ja) 2017-02-09
JP6480511B2 (ja) 2019-03-13
MX367666B (es) 2019-08-30
CN104685066B (zh) 2021-09-21
US10584376B2 (en) 2020-03-10
US9322053B2 (en) 2016-04-26
ZA201607642B (en) 2018-05-30
KR102159818B1 (ko) 2020-09-25
JP6169660B2 (ja) 2017-07-26
JP2016073273A (ja) 2016-05-12
JP6321738B2 (ja) 2018-05-09
US10077467B2 (en) 2018-09-18
US20150315635A1 (en) 2015-11-05
RU2601129C2 (ru) 2016-10-27
JP2018007658A (ja) 2018-01-18
ZA201508197B (en) 2017-05-31
EP3587587A1 (en) 2020-01-01
BR112014025262A8 (pt) 2021-06-29
EP2836609A1 (en) 2015-02-18
ZA201408116B (en) 2016-02-24
KR101570951B1 (ko) 2015-11-23
CN104685066A (zh) 2015-06-03
AU2013246080A1 (en) 2014-11-13
JP2015512654A (ja) 2015-04-30
NZ723570A (en) 2018-06-29
AU2018201671A1 (en) 2018-04-05
JP5801513B2 (ja) 2015-10-28
AU2015246059B2 (en) 2017-12-07
KR102362649B1 (ko) 2022-02-14
RU2016138585A3 (ru) 2020-03-19
DK2836609T3 (da) 2019-08-26
EP2836609B1 (en) 2019-05-22
AU2013246080C1 (en) 2018-03-29
ES2743050T5 (es) 2022-10-20
RU2016138585A (ru) 2018-12-13
US11866773B2 (en) 2024-01-09
KR20190132570A (ko) 2019-11-27
BR112014025262A2 (pt) 2017-06-20
CN114134207A (zh) 2022-03-04
US20150104788A1 (en) 2015-04-16
KR102048946B1 (ko) 2019-11-27
AU2018201671B2 (en) 2019-11-14
US11208687B2 (en) 2021-12-28
AU2015246059A1 (en) 2015-11-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014144722A (ru) Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце
US8034569B2 (en) Methods for molecular detection
CN1703521A (zh) 基因表达的定量
US20210246499A1 (en) Detection of short homopolymeric repeats
JP2018516594A5 (ru)
Ludgate et al. A streamlined method for analysing genome-wide DNA methylation patterns from low amounts of FFPE DNA
CN103261437B (zh) 用于hpa基因分型的方法及所用引物
DE60309817D1 (de) Dopplezweck -Primer und -Proben für verbesserte Hybridisierungsassays durch Zerstörung von Sekundärstrukturen
CN104805199A (zh) 一种Gilbert综合征基因突变检测试剂盒
RU2015123459A (ru) Одновременная детекция белка-мишени и нуклеиновых кислот-мишеней в одной клетке
JP6983231B2 (ja) 皮膚バリア機能診断用組成物
CN105331740B (zh) 一种快速区分鸭甲肝病毒1型和3型pcr-hrm的引物和方法
KR101705577B1 (ko) 멜론 괴저반점 바이러스 저항성 및 이병성 품종 판별용 프라이머 세트 및 이를 이용한 멜론 괴저반점 바이러스 저항성 및 이병성 품종 선별방법
US20180346974A1 (en) Methods and kits for nucleic acid detection
US20210268508A1 (en) Parallelized sample processing and library prep
US20170335382A1 (en) Isothermal Amplification Assay for the Detection of Short Nucleic Acid Sequences
RU2020128098A (ru) Композиции и способы для количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты в образце
Labbé et al. Targeting discriminatory SNPs in Salmonella enterica serovar Heidelberg genomes using RNase H2-dependent PCR
CN113302301A (zh) 检测分析物的方法及其组合物
US20230295746A1 (en) A detection method
Zhao et al. A high-throughput analytical method for multiple DNA targets based on microdroplet PCR coupled with DGGE
EP3377651B1 (en) A method and a kit for nucleic acid detection
CN117867153A (zh) 一种基于Rep-529基因片段的弓形虫DNA检测方法及其应用
KR20180112442A (ko) 스크렙토코커스 및 이리도바이러스 동시 검출용 프라이머 세트
US20160122810A1 (en) Systems and methods for nucleic acid capture