KR20120003017A - 클로스트리듐 디피실리 독소에 대한 항체 및 이의 용도 - Google Patents

클로스트리듐 디피실리 독소에 대한 항체 및 이의 용도 Download PDF

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Abstract

씨. 디피실리의 독소에 특이적으로 결합하는 항체, 이의 항원 결합 부위, 및 이 항체와 이의 항원 결합 부위의 제조 및 사용 방법이 본원에 제공되어 있다.

Description

클로스트리듐 디피실리 독소에 대한 항체 및 이의 용도{ANTIBODIES AGAINST CLOSTRIDIUM DIFFICILE TOXINS AND USES THEREOF}
관련 정보
본 출원은 2004년 2월 6일자로 출원된 미국 가출원 제60/542,357호와, 2004년 9월 28일자로 출원된 미국 가출원 제60/613,854호를 우선권으로 주장하는데, 상기 가출원 둘 모두의 전체 내용은 본원에 참고로 포함된다.
본원 명세서 전반에 걸쳐 인용되는 모든 특허, 특허 출원 및 참고 문헌의 내용 전체가 본원에 참고로 포함된다.
클로스트리듐 디피실리 (Clostridium difficile) (씨. 디피실리)는 인간에 있어서 위장 질환을 야기하는 그램 양성 박테리아이다. 씨. 디피실리는 입원 환자에 있어서 감염성 설사의 가장 일반적인 원인균이며, 전체적으로 가장 일반적인 병원 감염균 중 하나이다 (Kelly et al., New Eng. J. Med., 330: 257-62, 1994). 사실, 이 병원균과 관련된 질환은 미국에서 해마다 300만명만큼 많은 입원 환자를 괴롭힐 수 있다 (McFarland et al., New Eng. J. Med., 320: 204-10, 1989; Johnson et al., Lancet, 336: 97-100, 1990).
정상적인 장내 세균총 (intestinal flora)을 붕괴시키는 암피실린, 아목시실린, 세팔로스포린 및 클린다마이신과 같은 항생제를 이용한 치료는 씨. 디피실리가 장에 콜로니화하게 하여 씨. 디피실리 질환에 이르게 할 수 있다 (Kelly and Lamont, Annu. Rev. Med., 49: 375-90, 1998). 씨. 디피실리 질환의 발병은 전형적으로 항생제 치료를 시작한지 4일 내지 9일 후에 나타나지만, 항생제 치료의 중단 후에도 나타날 수 있다. 씨. 디피실리는, 복통, 수양성 설사, 및 전신성 질병 (예를 들어, 발열, 오심)을 특징으로 하는 중증 형태의 대장염인 위막성 대장염 (peudomembraneous clitis, PMC)을 포함하는, 경증 내지 중증의 범위의 설사 및 대장염 증상을 생성할 수 있다. 재발성 질환이 질환의 첫번째의 증상의 발현 (episode)에 대하여 치료된 환자 중 최대 20%에서 나타날 수 있으며, 재발된 이들은 추가의 재발에 있어서 보다 큰 위험 상태에 있다 (Kelly and Lamont, Annu. Rev. Med., 49: 375-90, 1998).
씨. 디피실리 질환은 장 상피 상에서 2가지 외독소인 독소 A 및 독소 B의 작용에 의해 야기되는 것으로 생각된다. 상기 독소 둘 모두는 숙주 세포에서 액틴 중합에 연루되는 작은 GTP-결합 단백질인 Rho 단백질의 공유 결합 변형을 촉매하는 고분자량 단백질 (280-300 kDa)이다. 상기 독소들에 의한 Rho 단백질의 변형은 Rho 단백질을 불활성화시켜 액틴 필라멘트의 탈중합 및 세포 사멸에 이르게 한다. 둘 모두의 독소는 비경구 투여에 의해 주사될 경우 생쥐에 치명적이다 (Kelly and Lamont, Annu. Rev. Med., 49: 375-90, 1998).
씨. 디피실리 질환은 대변 샘플에서 독소 A 또는 독소 B의 존재 또는 활성을 검출하는 분석법, 예를 들어 효소 면역분석법에 의해 진단될 수 있다. 세포 독소 분석법을 사용하여 독소 활성을 검출할 수 있다. 세포 독소 분석을 수행하기 위하여, 대변을 여과하여 박테리아를 제거하고, 배양된 세포에 대한 독소의 세포 병리학적 영향을 측정한다 (Merz et al., J. Clin. Microbiol., 32: 1142-47, 1994).
씨. 디피실리 치료는 항생제가 씨. 디피실리-관련 질환을 일으킨다는 사실에 의해 복잡해진다. 그럼에도 불구하고, 항생제는 현재로서는 일차적인 치료 상의 선택 사항이다. 씨. 디피실리-관련 질환을 가장 덜 야기할 것 같은 항생제, 예를 들어 반코마이신 및 메트로니다졸이 빈번하게 사용된다. 다른 미생물에서 발달하는 반코마이신 내성은 치료를 위하여 상기 항생제를 사용하는 데 있어서의 관심에 대한 이유가 되는데, 그 이유는 이것이 다른 미생물에의 감염에 있어서 유일한 효과적인 치료법이기 때문이다 (Gerding, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 250: 127-39, 2000). 아마도 적소 (niches)에 대하여 병원성 박테리아와 경쟁하는 비병원성 미생물을 대상체에게 투여하는 프로바이오틱 (probiotic) 접근법도 사용된다. 예를 들어 반코마이신과 사카로마이세스 불라르디이 (Saccharomyces boulardii)의 조합물을 이용한 치료가 보고되었다 (McFarland et al., JAMA., 271(24): 1913-8, 1994. Erratum in: JAMA, 272(7): 518, 1994).
질환의 감염 모델에서 치사량 공격 (lethal challenge)으로부터 동물을 보호하는 백신이 개발되었다 (Torres et al., Infect. Immun. 63(12): 4619-27, 1995). 또한, 다중클론 항체가 주사 또는 급식에 의해 투여될 경우 햄스터를 질환으로부터 보호하는 것으로 밝혀졌다 (Giannasca et al., Infect. Immun. 67(2): 527-38, 1999; Kink and Williams, Infect. Immun., 66(5): 2018-25, 1998). 씨. 디피실리 독소에 결합하고 생체내 및 시험관내에서 그의 활성을 중화시키는 쥣과 단일클론 항체가 단리되었다 (Corthier et al., Infect. Immun., 59(3): 1192-5, 1991). 독소 중화 항체를 포함하는 인간 다중클론 항체가 씨. 디피실리 재발을 예방할 수 있다는 몇몇 보고서가 존재한다 (Salcedo et al., Gut., 41(3): 366-70, 1997). 독소 A에 대한 항체 응답은 질환의 결과와 상관 관계가 있었는데, 이는 감염의 제어에 있어서의 체액성 응답의 효능을 나타내는 것이다. 활발한 (robust) 독소 A ELISA 응답을 갖는 개체는 낮은 독소 A 항체 수준을 갖는 개체에 비하여 덜 중증인 질환에 걸렸다 (Kyne et al., Lancet, 357(9251): 189-93, 2001).
질환의 병인에서의 독소 A 및 독소 B의 개개의 역할과, 씨. 디피실리 질환으로부터의 보호에서의 항-독소 항체의 역할은 논쟁의 여지가 있으며 숙주에 의존적일 수 있다. 인간에 있어서, 항-독소 A 항체 응답은 질환의 결과와 상관 관계가 있었는데, 이는 보호에 있어서 항-독소 A 응답이 필요함을 시사하는 것이다. 이러한 관찰 결과는 독소 B만을 발현하는 질환 야기 씨. 디피실리 유기체에 대한 보고서와 대조를 이루는데, 이는 독소 B가 인간에 있어서 질환에 기여할 수 있음을 뜻한다. 이러한 독소 A-음성 주 (strain)도 햄스터에서 질환을 야기할 수 있다 (Sambol et al., J. Infect. Dis., 183(12): 1760-6, 2001).
본 발명은 부분적으로는 대상체에게 씨. 디피실리 독소 A에 대한 항체를 투여하는 것이 생체내에서 씨. 디피실리-매개 질환의 재발로부터 대상체를 보호할 수 있다는 발견에 기초한다. 독소 A 및 독소 B 중 하나 또는 이들 둘 모두에 대한 항체의 투여는 일차적인 씨. 디피실리-매개 질환을 예방할 수 있다. 높은 친화도의 씨. 디피실리 독소에 대한 항체가 예를 들어 생쥐, 예를 들어 인간 면역글로불린 유전자 절편을 발현하는 트랜스제닉 생쥐에서 생산될 수 있다. 이러한 항체는 시험관내에서 독소의 세포 독성을 중화시키고, 생체내에서 독소의 장독성을 중화시킬 수 있다. 독소 A 및/또는 독소 B를 인식하는 항체는 생체내에서 질환을 억제하고 질환으로부터 보호할 수 있다.
일 태양에 있어서, 본 발명은 클로스트리듐 디피실리 (씨. 디피실리)의 내독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 그 특징으로 한다. 소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리 독소 A (독소 A)에 특이적으로 결합한다. 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리 독소 B (독소 B)에 특이적으로 결합한다. 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A 및 독소 B 둘 모두에 특이적으로 결합한다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 시험관내에서 독소 A를 중화시키며, 독소 A의 포유동물 세포에의 결합을 억제하고/하거나 생체내에서 씨. 디피실리-매개 질환을 억제한다.
*다양한 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 하기의 특징 중 하나 이상의 특징을 갖는다: 생쥐에 투여될 경우, 이들은 항체를 투여하지 않은 대조 생쥐에 치명적인 양의 씨. 디피실리 독소의 투여에 대하여 생쥐를 보호하거나; 대상체에서 씨. 디피실리-매개 대장염, 항생제-관련 대장염, 또는 위막성 대장염 (PMC)으로부터 보호하거나 이를 억제하거나; 대상체에서 설사로부터 보호하거나 설사를 억제하고/하거나; 씨. 디피실리-매개 질환의 재발을 억제한다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A의 N-말단의 절반 내의 에피토프, 예를 들어 독소 A의 아미노산 1-1256 사이의 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있다. 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A의 C-말단 수용체 결합 도메인 내의 에피토프, 예를 들어 독소 A의 아미노산 1852-2710 사이의 에피토프, 또는 아미노산 659-1852 사이의 에피토프, 예를 들어 독소 A의 아미노산 잔기 900-1852, 900-1200, 또는 920-1033 내의 에피토프에 특이적으로 결합한다. 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A의 아미노산 1-600, 400-600, 또는 415-540 내의 에피토프에 특이적으로 결합한다. 다른 특정 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A의 아미노산 잔기 1-100, 100-200, 200-300, 300-400, 400-500, 500-600, 600-700, 700-800, 900-1000, 1100-1200, 1200-1300, 1300-1400, 1400-1500, 1500-1600, 1600-1700, 1800-1900, 1900-200, 2100-2200 또는 2200-2300, 2300-2400, 2400-2500, 2500-2600, 2600-2710, 또는 그의 임의의 구간, 부분 또는 범위 내의 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 20 x 10-6 M 미만의 KD로 독소 A에 특이적으로 결합한다. 특정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 10 x 10-7 M 미만, 약 10 x 10-8 M 미만, 약 10 x 10-9 M 미만, 또는 약 10 x 10-10 M 미만의 KD로 독소 A에 특이적으로 결합한다. 다른 특정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 50 x 10-10 M 미만, 약 20 x 10-10 M 미만, 약 15 x 10-10 M 미만, 약 8 x 10-10 M 미만, 또는 약 5 x 10-10 M 미만의 KD로 독소 A에 특이적으로 결합한다.
다양한 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 3D8 (서열 번호 1), 1B11 (서열 번호 2), 또는 3H2 (서열 번호 3)에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 3D8 (서열 번호 4), 1B11 (서열 번호 5), 또는 3H2 (서열 번호 6)에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함한다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위 각각은 클론 3D8 (서열 번호 1), 1B11 (서열 번호 2), 또는 3H2 (서열 번호 3)에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역과, 클론 3D8 (서열 번호 4), 1B11 (서열 번호 5), 또는 3H2 (서열 번호 6)에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역 둘 모두를 포함한다.
다양한 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 3D8, 1B11, 또는 3H2에 의해 생산되는 항체가 결합하는 에피토프와 중복되는 에피토프에 특이적으로 결합하고/하거나 독소 A에의 결합에 대하여 클론 3D8, 1B11 또는 3H2에 의해 생산되는 항체와 경쟁한다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 7-9), 1B11 (서열 번호 10-12), 또는 3H2 (서열 번호 13-15)에 의해 생산되는 항체의 상보성 결정 영역 (complementarity determining region, CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있다 (표 1에도 예시되어 있음).
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있다 (표 2에도 예시되어 있음).
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 7-9), 1B11 (서열 번호 10-12), 또는 3H2 (서열 번호 13-15)에 의해 생산되는 항체의 상보성 결정 영역 (CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있으며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 7-9), 1B11 (서열 번호 10-12), 또는 3H2 (서열 번호 13-15)에 의해 생산되는 항체의 상보성 결정 영역 (CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다.
몇몇 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다.
몇몇 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함하며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 7-9), 1B11 (서열 번호 10-12), 또는 3H2 (서열 번호 13-15)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함한다. 이 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 7-9), 1B11 (서열 번호 10-12), 또는 3H2 (서열 번호 13-15)에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역과 동일한 3개의 CDR을 포함하며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 16-18), 1B11 (서열 번호 19-21), 또는 3H2 (서열 번호 22-24)에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR과 동일한 3개의 CDR을 포함하는데, 예를 들어, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역은 클론 3D8 (서열 번호 1, 서열 번호 4), 1B11 (서열 번호 2, 서열 번호 5) 또는 3H2 (서열 번호 3, 서열 번호 6)에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역과 동일하다.
몇몇 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 시험관 내에서 독소 B를 중화시키며, 생체 내에서 독소 B의 포유동물 세포에의 결합을 억제하고/하거나 독소 B를 중화시킨다.
몇몇 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 B의 C-말단 부분 내의 (예를 들어 독소 B의 아미노산 1777-2366) 에피토프에 특이적으로 결합한다. 다른 특정 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 B의 아미노산 잔기 1-100, 100-200, 200-300, 300-400, 400-500, 500-600, 600-700, 700-800, 900-1000, 1100-1200, 1200-1300, 1300-1400, 1400-1500, 1500-1600, 1600-1700, 1800-1900, 1900-200, 2100-2200 또는 2200-2366, 또는 그의 임의의 구간, 부분 또는 범위 내의 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 20 x 10-6 M 미만의 KD로 독소 B에 특이적으로 결합한다. 특정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 10 x 10-7 M 미만, 약 10 x 10-8 M 미만, 약 10 x 10-9 M 미만, 또는 약 10 x 10-10 M 미만의 KD로 독소 B에 특이적으로 결합한다. 다른 특정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약 50 x 10-10 M 미만, 약 20 x 10-10 M 미만, 약 15 x 10-10 M 미만, 약 8 x 10-10 M 미만, 또는 약 5 x 10-10 M 미만의 KD로 독소 B에 특이적으로 결합한다.
다양한 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 124-152 (즉, 서열 번호 58에 예시되어 있는 아미노산 서열), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다. 소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 124-152 (즉, 서열 번호 58에 예시되어 있는 아미노산 서열), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함한다.
소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위 각각은 클론 124-152 (즉, 서열 번호 54에 예시되어 있는 아미노산 서열), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역과, 클론 124-152 (즉, 서열 번호 58에 예시되어 있는 아미노산 서열), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 이상 동일한 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역 둘 모두를 포함한다.
다양산 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 125-152, 2A11 또는 1G10에 의해 생산되는 항체가 결합하는 에피토프와 중복하는 에피토프에 특이적으로 결합하고/하거나 독소 B에의 결합에 대하여 클론 125-152, 2A11 또는 1G10에 의해 생산되는 항체와 경쟁한다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 상보성 결정 영역 (CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있다 (표 3).
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 상보성 결정 영역 (CDR)을 포함할 수 있다 (표 4).
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 상보성 결정 영역 (CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있으며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99% 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함할 수 있다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역의 상보성 결정 영역 (CDR)에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다. 소정 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다.
다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 하나 이상의 CDR을 포함하며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함한다. 이 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 99%, 또는 그 이상 동일한 3개의 CDR을 포함할 수 있다.
또다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역의 CDR과 동일한 3개의 CDR을 포함하며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 68, 70 또는 72), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역의 CDR과 동일한 3개의 CDR을 포함하며, 예를 들어 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역은 클론 124-152 (서열 번호 62, 64 또는 66), 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역과 동일하다.
*본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 전장 항체일 수 있으며, 이펙터 (effector) 도메인, 예를 들어 Fc 도메인을 포함할 수 있으며, 면역글로불린 감마 이소타입 항체, 단쇄 항체 또는 Fab 단편일 수 있다. 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 약학적으로 허용가능한 담체 및/또는 표지를 추가로 포함할 수 있다.
다양한 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 함유하는 조성물에는 다른 인간 폴리펩티드가 없다 (예를 들어 조성물은 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위 이외의 5% 미만의 인간 폴리펩티드를 함유함).
또다른 태양에 있어서, 본 발명은 (a) 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위; 및 (b) 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 다중클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 함유하는 조성물을 그 특징으로 한다.
일 실시 형태에 있어서, 본 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합하며, 본 다중클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합한다. 일 실시 형태에 있어서, 본 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합하며, 본 다중클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합한다. 본 항체는 본원에 기술된 다른 특징부를 포함할 수 있다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 클로스트리듐 디피실리 (씨. 디피실리)의 외독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 그 특징으로 하며, 여기서, 항체는 (a) 인간 VH 3-33 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역을 포함하고/하거나; (b) Vκ L19, Vκ L6, Vκ L15로 이루어진 군으로부터 선택되는 인간 Vκ 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다. 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 본원에 기술된 다른 특징부를 포함할 수 있다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 클로스트리듐 디피실리 (씨. 디피실리)의 외독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 그 특징으로 하며, 여기서, 항체는 (a) 인간 VH 5-51 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역을 포함하고/하거나; (b) 인간 Vκ A27 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다. 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 본원에 기술된 다른 특징부를 포함할 수 있다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 하이브리도마 클론 3D8, 1B11, 또는 3H2 (본원에서 "3D8", "1B11" 및 "3H2"로도 칭해짐)에 의해 생산되는 항체의 항원 결합 부위를 포함하는 단리된 폴리펩티드를 그 특징으로 한다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 하이브리도마 클론 124-152, 2A11, 또는 1G10 (본원에서 "124-152", "2A11", 및 "1G10"으로도 칭해짐)에 의해 생산되는 항체의 항원 결합 부위를 포함하는 단리된 폴리펩티드를 그 특징으로 한다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하며, 이 독소를 중화시키고, 억제하고/하거나, 씨. 디피실리-매개 질환으로부터 보호하는 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 그 특징으로 한다. 일 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 포유동물 (예를 들어 인간) 항체 또는 이의 항원 결합 부위이다. 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 본원에 기술된 다른 특징부를 포함할 수 있다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 (a) 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위; 및 (b) 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 함유하는 조성물을 그 특징으로 한다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 서열 번호 1, 2, 3, 4, 5 또는 6의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 서열을 포함하는 단리된 핵산을 그 특징으로 하는데, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 38, 39, 40, 35, 36 또는 37의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하다. 본 발명은 또한 서열 번호 1, 2, 3, 4, 5 또는 6의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 핵산을 포함하는 발현 벡터를 그 특징으로 하는데, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 38, 39, 40, 35, 36 또는 37의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하며, 이외에도, 본 발명은 서열 번호 1, 2, 3, 4, 5 또는 6의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 핵산을 포함하는 숙주 세포, 예를 들어 박테리아 세포, 예를 들어 이. 콜라이 (E. coli) 세포를 그 특징으로 하는데, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 38, 39, 40, 35, 36 또는 37의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 서열 번호 54, 56, 58 또는 60의 서열에 대하여 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 서열을 포함하는 단리된 핵산을 그 특징으로 하며, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 55, 57, 59 또는 61의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하다. 본 발명은 또한 서열 번호 54, 56, 58 또는 60의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 핵산을 포함하는 발현 벡터를 그 특징으로 하며, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 55, 57, 59 또는 61의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하다. 본 발명은 또한 서열 번호 54, 56, 58 또는 60의 서열에 대하여 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 핵산을 포함하는 숙주 세포, 예를 들어 박테리아 세포, 예를 들어 이. 콜라이 세포를 제공하며, 예를 들어, 여기서, 핵산 서열은 서열 번호 55, 57, 59 또는 61의 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99% 또는 그 이상 동일하다.
숙주 세포는 또한 진핵 세포, 예를 들어 효모 세포, 포유동물 세포, 예를 들어 중국 햄스터 난소 (Chinese hamster ovary, CHO) 세포, NOO 세포, 또는 골수종 세포일 수 있다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 클로스트리듐 디피실리 (씨. 디피실리)의 외독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 예를 들어 본원에 기술된 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 키트를 그 특징으로 한다. 본 키트는 씨. 디피실리-매개 질환의 예방 또는 치료에서의 사용에 대한 사용 설명서를 포함할 수 있다.
본 키트는 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 다중클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 추가로 포함할 수 있다다. 일 실시 형태에 있어서, 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합한다. 일 실시 형태에 있어서, 본 다중클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합한다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 (a) 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체; 및 (b) 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체를 포함하는 키트를 그 특징으로 한다.
본 발명은 또한 대상체에게 클로스트리듐 디피실리 (씨. 디피실리)의 외독소에 특이적으로 결합하는 유효량의 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 투여하여, 씨. 디피실리 질환, 예를 들어 씨. 디피실리-매개 대장염, 항생제-관련 대장염, 씨. 디피실리-매개 위막성 대장염 (PMC) 또는 설사, 또는 씨. 디피실리-매개 질환의 재발을 억제하는 단계에 의해 대상체에서 씨. 디피실리 질환을 치료하는 방법을 그 특징으로 한다. 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 예를 들어 정맥내, 근육내 또는 피하 투여에 의해 대상체에게 투여될 수 있다.
본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 단독으로, 또는 다른 치료제, 예를 들어 제2 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위와 조합되어 투여될 수 있다. 일례에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 A에 특이적으로 결합하며, 제2 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리의 독소 B에 특이적으로 결합한다. 다른 예에 있어서, 제2 약제는 항생제, 예를 들어 반코마이신 또는 메트로니다졸이다. 제2 약제는 다중클론 감마-글로불린 (예를 들어 인간 감마-글로불린)일 수 있다.
특정 실시 형태에 있어서, 클론 3D8에 의해 생산되는 항체의 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역과 동일한 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역을 포함하는 (즉, 서열 번호 4의 서열과 동일한 경쇄 가변 영역 서열 및 서열 번호 1의 서열과 동일한 중쇄 가변 영역 서열을 포함함) 항체 또는 이의 항원 결합 부위가 투여된다.
다른 실시 형태에 있어서, 이 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 클론 124-152에 의해 생산되는 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역과 동일한 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역을 포함하는 (즉, 서열 번호 58의 서열과 동일한 경쇄 가변 영역 서열 및 서열 번호 54의 서열과 동일한 중쇄 가변 영역 서열을 포함함) 항체 또는 이의 항원 결합 부위와 조합되어 투여된다.
또다른 실시 형태에 있어서, 클론 3D8에 의해 생산되는 항체 또는 이의 항원 결합 부위 (즉, 서열 번호 4의 서열과 동일한 경쇄 가변 영역 서열 및 서열 번호 1의 중쇄 가변 영역 서열을 포함함)은 클론 124-152에 의해 생산되는 항체 또는 이의 항원 결합 부위 (즉, 서열 번호 58의 서열과 동일한 경쇄 가변 영역 서열 및 서열 번호 54의 서열과 동일한 중쇄 가변 영역을 포함함)과 조합되어 투여된다.
다른 태양에 있어서, 본 발명은 인간 중쇄 트랜스진 및 인간 경쇄 트랜스진을 포함하는 게놈을 갖는 인간외 트랜스제닉 동물을 불활성화 외독소를 함유하는 조성물로 면역화하는 단계, 및 항체를 이 동물로부터 단리하는 단계에 의해 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 제조하는 방법을 그 특징으로 한다. 이 외독소는 예를 들어 UDP-디알데히드를 이용한 처리에 의해 또는 돌연변이에 의해 (예를 들어 재조합 방법을 사용함) 불활성화시킬 수 있다. 이 방법은 본 항체의 외독소에의 결합을 평가하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
본 발명은 또한 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 코딩하는 핵산을 제공하는 단계, 및 이 핵산을 숙주 세포에서 발현시키는 단계에 의해 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 제조하는 방법을 그 특징으로 한다.
또다른 태양에 있어서, 본 발명은 클론 3D8, 1B11, 또는 3H2에 의해 생산되는 항체의 항원 결합 부위 (예를 들어, CDR 또는 가변 영역)를 코딩하는 핵산을 포함하는 하이브리도마 또는 트랜스펙토마 (transfectoma)를 그 특징으로 한다.
또다른 태양에 있어서, 본 발명은 클론 124-152, 2A11, 또는 1G10에 의해 생산되는 항체의 항원 결합 부위 (예를 들어, CDR 또는 가변 영역)를 코딩하는 핵산을 포함하는 하이브리도마 또는 트랜스펙토마를 그 특징으로 한다.
또한, 본 발명은 인간 중쇄 트랜스진 및 인간 경쇄 트랜스진을 포함하는 게놈을 갖는 인간외 트랜스제닉 동물을, 불활성화시킨 외독소를 함유하는 조성물로 면역화하는 단계; 비장 세포를 이 동물로부터 단리하는 단계; 비장 세포로부터 하이브리도마를 생성하는 단계; 및 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 항체를 생산하는 하이브리도마를 선발하는 단계에 의해 씨. 디피실리의 외독소에 특이적으로 결합하는 항체를 발현하는 하이브리도마를 제조하는 방법을 그 특징으로 한다.
인간 단일클론 항체를 이용한 인간의 치료는 여러 장점을 제공한다. 예를 들어 이 항체는 인간외 항체보다 인간에서 면역원성이 덜할 가능성이 있다. 이 치료법은 신속하며, 독소 불활성화는 항체가 감염 부위에 도달하고 질환 야기 독소(들)을 직접 중화시키자마자 곧 일어날 수 있다. 인간 항체는 인간외 항체보다 더 효율적으로 인간에 있어서 적절한 부위로 국지화된다. 또한, 이 치료는 씨. 디피실리에 특이적이며, 전통적인 항생제 치료법과는 달리, 정상적인 장 세균총을 붕괴시킬 것 같지 않다.
본 발명의 다른 특징 및 장점은 하기의 발명의 상세한 설명 및 청구의 범위로부터 명백해질 것이다.
도 1은 각각의 클론으로부터의 mRNA 서열에 의해 코딩되는 VH 및 VL 쇄의 아미노산 서열을 열거하는 표이다. 소문자는 리더 펩티드 내의 아미노산을 나타낸다. CDR에는 밑줄이 그어져 있다. 6개의 특유한 경쇄 V 영역을 발현하는 클론 3D8은 I군 아미노산 서열만을 발현하였다.
도 2A는 클론 3D8에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 2B는 클론 3D8에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편, D-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 3A는 클론 1B11에 의해 발현되는 VL 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 3B는 클론 1B11에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편, D-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 4A는 클론 33.3H2 (본원에서 3H2로 칭해지며, 33.3H2 및 3H2는 본원에서 서로 바꾸어서 사용할 수 있음)에 의해 발현되는 VL 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 4B는 클론 33.3H2에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 5는 독소 A에 대한 항-독소 A 단일클론 항체의 결합을 측정하는 ELISA 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 6A-B는 항-독소 A 단일클론 항체의 존재 및 부재 하에서의 시험관내 중화 분석의 결과를 도시하는 그래프 세트이다. 도 6A에는 IMR-90 세포를 이용하여 수행된 분석에 있어서의 결과가 도시되어 있다. 도 6B에는 T-84 세포를 이용하여 수행된 분석에 있어서의 결과가 도시되어 있다.
도 7은 에피토프 지도화 연구에 있어서 분석된 단편을 나타내는, 독소 A 폴리펩티드의 개략도이다.
도 8A-B는 에피토프 지도화 연구에 있어서 분석된 독소 A 단편의 개략도이다.
도 9는 항-독소 A 단일클론 항체에 의해 독소를 이용한 치사량 공격으로부터의 생쥐의 보호를 측정하는 생체내 분석의 결과를 열거하는 표이다.
도 10은 생체내에서 항-독소 항체의 중화 효능을 측정하기 위한 생쥐 회장 루프액 (ileal loop fluid) 축적 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 11A는 햄스터 재발 모델에서 햄스터에게 다양한 약제를 투여하는 시각표의 개략도이다.
도 11B는 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후에 생존하는 햄스터의 백분율로서의 분석 결과를 도시하는 그래프이다.
도 12는 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후 생존하는 햄스터의 백분율로서의 햄스터 재발 분석 결과를 도시하는 그래프이다.
도 13은 유독소 (toxoid) B로 면역화한 염소 유래의 다중클론 항혈청의 존재 또는 부재하에 독소 A 및 독소 B의 시험관내 중화를 측정한 분석의 결과를 도시하는 그래프이다. "G330"은 염소 #330 유래의 혈청을 시험한 샘플을 말한다. "G331"은 염소 #331 DBFODML 혈청을 시험한 샘플을 말한다.
도 14는 햄스터 재발 모델에서 햄스터에게 다양한 약제를 투여하는 시각표의 개략도이다.
도 15는 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후 생존하는 햄스터의 백분율로서의 햄스터 재발 분석 결과를 도시하는 그래프이다. 햄스터를 반코마이신, 반코마이신 및 3D8, 반코마이신 및 염소 #331 유래의 항혈청, 또는 반코마이신, 3D8 및 염소 #331 유래의 항혈청으로 처리하였다.
도 16은 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후 건강한 동물의 백분율로서의 햄스터 재발 분석 결과를 도시하는 그래프이다. "염소 331"은 염소 #331 유래의 항혈청을 말한다.
도 17은 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후 생존하는 햄스터의 백분율로서의 햄스터 재발 분석의 결과를 도시하는 그래프이다. 햄스터는 클린다마이신 처리 이전에 독소 B의 단편으로 면역화하였다. 햄스터는 반코마이신, 반코마이신 및 3D8로 처리하거나, 처리를 전혀 하지 않았다.
도 18은 클린다마이신 처리, 이어서 씨. 디피실리 공격 후 건강한 동물의 백분율로서의 햄스터 재발 분석의 결과를 도시하는 그래프이다. 햄스터는 클린다마이신 처리 이전에 독소 B의 단편으로 면역화하였다.
도 19는 씨. 디피실리의 직접적인 공격 모델에서 햄스터에게 다양한 약제를 투여하는 시각표의 개략도이다. "331"은 염소 #331 유래의 항혈청을 말한다. "Clinda"는 클린다마이신을 이용한 처리를 말한다.
도 20은 직접적인 씨. 디피실리 공격에 생존하는 햄스터의 백분율로서의 직접적인 공격 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 21은 씨. 디피실리를 이용한 직접적인 공격 후 건강한 동물의 백분율로서의 직접적인 공격 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 22는 씨. 디피실리의 독소 A의 아미노산 서열을 나타낸 것이다.
도 23은 씨. 디피실리의 독소 B의 아미노산 서열을 나타낸 것이다.
도 24는 직접적인 씨. 디피실리 공격에 생존하는 햄스터의 백분율로서의 일차 공격 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 25는 직접적인 씨. 디피실리 공격에 생존하는 햄스터의 백분율로서의 일차 공격 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 26은 직접적인 씨. 디피실리 공격에 생존하는 햄스터의 백분율로서의 일차 공격 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 27은 독소 B에 대한 단일클론 항체 또는 독소 B에 대한 염소 다중클론 혈청의 존재 하에 독소 A 및 독소 B의 시험관내 중화를 측정한 분석의 결과를 도시하는 그래프이다.
도 28은 클론 124-152에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편, D-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 29는 클론 124-152에 의해 발현되는 VL 쇄의 아미노산 서열 및 핵산 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 및 핵산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 30은 클론 124-152에 의해 발현되는 VH 쇄의 아미노산 및 관련 생식 세포의 서열을 나타낸 것이다. V-절편, D-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 31은 클론 124-152에 의해 발현되는 VL 쇄의 아미노산 및 관련 생식 세포의 서열을 나타낸 것이다. V-절편 및 J-절편 유전자가 아미노산 서열 위에 열거되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있다.
도 32는 에피토프 지도화 연구에 있어서 분석한 단편을 나타내는, 독소 B 폴리펩티드의 개략도이다.
다양한 도면에서 유사한 참고 기호는 유사한 요소를 나타낸다.
본 명세서 및 청구의 범위의 명확한 이해의 제공을 위하여, 하기의 정의가 이하에 편리하게 제공되어 있다.
정의
"독소 A"라는 용어는 씨. 디피실리에 의해 코딩되는 독소 A 단백질을 말한다. 씨. 디피실리 독소 A의 아미노산 서열 (서열 번호 41)은 등록 번호 A37052, 버전 GI 98593 하에 젠뱅크 (GenBank) (등록상표)에 제공되어 있다 (도 22 참조). "독소 B"는 씨. 디피실리에 의해 코딩되는 독소 B 단백질을 말한다. 씨. 디피실리 독소 B의 아미노산 서열 (서열 번호 42)은 등록 번호 S70172, 버전 GI 7476000 하에 젠뱅크(등록상표)에 제공되어 있다 (도 23 참조). "단백질"은 "폴리펩티드"와 서로 바꾸어서 사용될 수 있다.
"항-씨. 디피실리 항체"는 씨. 디피실리 박테리아에 의해 생산되는 단백질 또는 기타 성분과 상호 작용하는 (예를 들어 결합하는) 항체이다. "항-독소 항체"는 씨. 디피실리에 의해 생산되는 독소 (예를 들어 독소 A 또는 독소 B)와 상호 작용하는 항체이다. 항-독소 단백질 항체는 에피토프, 예를 들어 배좌형 또는 선형 에피토프, 또는 전장 독소 단백질의 단편에 결합할 수 있다.
"인간 항체"는 인간 생식 세포 면역글로불린 서열로부터 유래되는 가변 및 불변 영역을 갖는 항체이다. 본원에 기술되어 있는 인간 항체는 인간 생식 세포 면역글로불린 서열에 의해 코딩되지 않는 아미노산 잔기 (예를 들어 시험관내 랜덤 또는 부위 특이적 돌연변이 유발에 의해 또는 생체내 체세포 돌연변이에 의해 도입되는 돌연변이)를 포함할 수 있다.
항-독소 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 단독으로 또는 제2 약제와 조합되어 투여될 수 있다. 대상체는 씨. 디피실리로 감염되거나, 씨. 디피실리-관련 질환의 증상 ("CDAD"; 예를 들어 설사, 대장염, 복통) 또는 씨. 디피실리-관련 질환에 대한 소질 (예를 들어 항생제를 이용한 치료를 받고 있거나, 씨. 디피실리-관련 질환 경험이 있거나 이 질환의 재발 위험성이 있음)을 갖는 환자일 수 있다. 치료는 감염 및 감염과 관련된 질환, 질환의 증상, 또는 질환에 대한 소질을 고치거나, 치유하거나, 완화시키거나, 경감시키거나, 변경시키거나, 구제하거나, 좋아지게 하거나, 누그러지게 하거나, 개선하거나, 영향을 주기 위한 것일 수 있다.
CDAD의 치료에 유효한 항-독소 항체의 양, 또는 "치료적 유효량"은 대상체에서 CDAD를 억제하는 데 있어서 대상체에게 단일 또는 다중 용량을 투여시 유효한 항체의 양이다. 항체 또는 항체 단편의 치료적 유효량은 개체의 질환 상태, 연령, 성별 및 체중과, 개체에 있어서 원하는 응답을 이끌어내는 항체 또는 항체 부분의 능력과 같은 요인에 따라 달라질 수 있다. 또한 치료적 유효량은 치료적으로 유익한 효과가 항체 또는 항체 부분의 모든 유독하거나 유해한 효과보다 큰 것이다. 항체가 측정가능한 파라미터를 억제하는 능력은 인간에서 효능을 예측하는 동물 모델 시스템에서 평가할 수 있다. 예를 들어, 씨. 디피실리를 이용한 치사량 공격으로부터 생쥐를 보호하는 항-독소 항체의 능력에 의해 인간에서의 효능이 예측될 수 있다. 효능을 예측하는 다른 동물 모델, 예를 들어 실시예에 기술되어 있는 장 라이게이션 모델이 본원에 기술되어 있다. 대안적으로는, 항체 또는 항체 조성물의 이러한 특성은 이 화합물의 조정 능력을 조사함으로써 평가할 수 있는데, 분석에 의한 그러한 시험관내 조정은 숙련자에게 공지되어 있다. 시험관내 분석법은 결합 분석법, 예를 들어 ELISA 및 중화 분석법을 포함한다.
장애를 예방하기에 유효한 항-독소 항체의 양, 또는 항체의 "예방적 유효량"은 대상체에게 단일 용량 또는 다중 용량 투여시 CDAD의 발병 또는 재발의 발생을 예방 또는 지연시키거나, 그의 증상을 억제하는 데에 유효한 양이다. 그러나, 보다 긴 시간 간격의 보호가 요망될 경우, 증가된 용량이 투여될 수 있다.
예를 들어 두 상태 사이의 정량적 차이를 나타내는 "작동시키는", "유발하는", "억제하는", "강화하는", "상승시키는", "증가시키는", "감소시키는" 등의 용어는 차이, 예를 들어, 두 상태 사이의 통계학적 또는 임상적으로 유의한 차이를 말한다.
본원에 사용되는 바와 같이, "특이적 결합" 또는 "특이적으로 결합하는"은 항체가 (1) 씨. 디피실리의 독소에 1 x 107 M-1의 친화도로 결합하고, (2) 비특이성 항원에 대한 친화도보다 2배 이상 더 큰 친화도로 씨. 디피실리의 독소에 결합하는 능력을 말한다.
"항체"는 적어도 하나 또는 2개의 중쇄 (H) 가변 영역 (본원에서 VHC로 약칭됨), 및 적어도 하나 또는 2개의 경쇄 (L) 가변 영역 (본원에서 VLC로 약칭됨)을 포함하는 단백질이다. VHC 및 VLC 영역은 "골격 영역" (framework region, FR)으로 칭해지는 보다 보존된 영역이 산재된, "상보성 결정 영역" (complementarity determining region, "CDR")으로 칭해지는 과변이 영역으로 추가로 세분될 수 있다. 골격 영역 및 CDR의 범위는 정확하게 정의되었다 (본원에 참고로 포함된 문헌[Kabat, E.A., et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242, 1991] 및 문헌[Chothia, C. et al., J. Mol. Biol. 196: 901-917, 1987] 참조). 바람직하게는, 각각의 VHC 및 VLC는 하기의 순서로 아미노-말단에서 카르복시-말단으로 배열된 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성된다: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.
항체의 VHC 또는 VLC 쇄는 전부 또는 일부의 중쇄 또는 경쇄 불변 영역을 추가로 포함할 수 있다. 일 실시 형태에 있어서, 본 항체는 2개의 면역글로불린 중쇄 및 2개의 면역글로불린 경쇄의 사량체이며, 여기서, 면역글로불린 중쇄 및 면역글로불린 경쇄는 예를 들어 디술피드 결합에 의해 상호 연결되어 있다. 중쇄 불변 영역은 3개의 도메인, CH1, CH2 및 CH3을 포함한다. 경쇄 불변 영역은 하나의 도메인, CL로 이루어진다. 중쇄 및 경쇄의 가변 영역은 항원과 상호 작용하는 결합 도메인을 포함한다. 항체의 불변 영역은 전형적으로 면역계의 다양한 세포 (예를 들어 이펙터 세포) 및 고전적 보체계의 첫번째 성분 (C1q)를 포함하는 숙주 세포 또는 인자에의 항체의 결합을 매개한다. "항체"라는 용어는 IgA, IgG, IgE, IgD, IgM 유형의 완전한 면역글로불린 (및 그의 아형)을 포함하며, 여기서, 면역글로불린의 경쇄는 카파 또는 람다 유형의 것일 수 있다.
"면역글로불린"은 면역글로불린 유전자에 의해 실질적으로 코딩되는 하나 이상의 폴리펩티드로 이루어진 단백질을 말한다. 인지되는 인간 면역글로불린 유전자는 카파, 람다, 알파 (IgA1 및 IgA2), 감마 (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), 델타, 입실론 및 뮤 불변 영역 유전자와, 무수히 많은 면역글로불린 가변 영역 유전자를 포함한다. 전장 면역글로불린 "경쇄 (약 25 KD 및 214개의 아미노산)은 NH2-말단의 가변 영역 (약 110개의 아미노산)의 유전자와 COOH-말단의 카파 또는 람다 불변 영역 유전자에 의해 코딩된다. 전장 면역글로불린 "중쇄" (약 50 KD 및 446개의 아미노산)는 가변 영역 유전자 (DR 116개의 아미노산) 및 전술한 불변 영역 유전자 중 하나, 예를 들어 감마 (약 330개의 아미노산을 코딩함)에 의해 유사하게 코딩된다. "면역글로불린"이라는 용어는 인간 또는 인간외 공급원 유래의 CDR을 갖는 면역글로불린을 포함한다. 면역글로불린의 골격은 인간, 인간화, 또는 인간외, 예를 들어 인간에서 항원성을 가소시키도록 변형된 쥣과 골격, 또는 합성 골격, 예를 들어 콘센서스 (consensus) 서열의 것일 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, "이소타입"은 중쇄 불변 영역 유전자에 의해 코딩되는 항체류 (예를 들어, IgM 또는 IgG1)를 말한다.
본원에 사용되는 바와 같이 항체의 "항원 결합 부위" (또는 단순히 "항체 부분" 또는 "부분")이라는 용어는 씨. 디피실리의 독소 (예를 들어 독소 A)에 특이적으로 결합하는 항체의 부분, 예를 들어 하나 이상의 면역글로불린 쇄가 전장이 아니지만 독소에 특이적으로 결합하는 분자를 말한다. 항체의 "항원 결합 부위"라는 용어 내에 포함되는 결합 부분의 예는 (i) VLC, VHC, CL 및 CH1 도메인으로 이루어진 일가 단편인 Fab 단편; (ii) 경첩 영역에서 디술피드 가교에 의해 결합된 2개의 Fab 단편을 포함하는 이가 단편인 F(ab')2 단편; (iii) VHC 및 CH1 도메인으로 이루어진 Fd 단편; (iv) 항체의 단일 암 (arm)의 VLC 및 VHC 도메인으로 이루어진 Fv 단편; (v) VHC 도메인으로 이루어진 dAb 단편 (Ward et al., Nature 341: 544-546, 1989); 및 (vi) 특이적으로 결합하기에 충분한 골격을 갖는 단리된 상보성 결정 영역 (CDR), 예를 들어 가변 영역의 항원 결합 부위를 포함한다. 경쇄 가변 영역의 항원 결합 부위 및 중쇄 가변 영역의 항원 결합 부위, 예를 들어 Fv의 2개의 도메인, VLC 및 VHC는 재조합 방법을 사용하여 이들을 단쇄 단백질로 만들어지게 할 수 있는 합성 링커에 의해 결합시킬 수 있으며, 여기서, VLC 및 VHC 영역은 쌍을 이루어 일가 분자를 형성한다 (단쇄 Fv (scFv)로 공지됨); 예를 들어 문헌[Bird et al. (1988) Science 242: 423-426]; 및 문헌[Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 5879-5883] 참조). 그러한 단쇄 항체도 항체의 "항원 결합 부위"라는 용어 내에 포함된다. 이러한 항체 부분은 당업계의 숙련자에게 공지된 통상적인 기술을 사용하여 수득되며, 이 부분은 완전한 항체와 동일한 방식으로 유용성에 대하여 스크리닝된다.
"1특이성 항체"라는 용어는 특정 표적, 예를 들어 에피토프에 대하여 단일한 결합 특이성 및 친화도를 나타내는 항체를 말한다. 이 용어는 "단일클론 항체" 또는 "단일클론 항체 조성물"을 포함하는데, 이는 본원에 사용되는 바와 같이 단일 분자 조성을 갖는 항체 또는 그의 부분의 제제를 말한다.
본원에 사용되는 바와 같이, "재조합" 항체라는 용어는 재조합 방법에 의해 제조, 발현, 생성 또는 단리되는 항체, 예를 들어 숙주 세포 내로 트랜스펙션되는 재조합 발현 벡터를 사용하여 발현되는 항체, 재조합체로부터 단리되는 항체, 조합 항체 라이브러리, 인간 면역글로불린 유전자에 대하여 트랜스제닉인 동물 (예를 들어 생쥐)로부터 단리되는 항체 또는 인간 면역글로불린 유전자 서열의 다른 DNA 서열로의 스플라이싱을 포함하는 임의의 다른 방법에 의해 제조, 발현, 생성 또는 단리되는 항체를 말한다. 그러한 재조합 항체는 인간화, CDR 그래프팅, 키메라, 시험관내 생성 (예를 들어 파지 디스플레이에 의해) 항체를 포함하며, 인간 생식 세포 면역글로불린 서열로부터 유래되는 불변 영역을 선택적으로 포함할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, "실질적으로 동일한" (또는 "실질적으로 상동성인")이라는 용어는 제1 및 제2 아미노산 또는 뉴클레오티드 서열이 유사한 활성을 갖도록 제2 아미노산 또는 뉴클레오티드 서열에 대하여 동일하거나 등가인 (예를 들어, 유사한 측쇄, 예를 들어 보존된 아미노산 치환체를 가짐) 충분한 갯수의 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 포함하는 제1 아미노산 또는 뉴클레오티드 서열을 말한다. 항체의 경우, 제2 항체는 동일한 특이성을 가지며 제1 항체의 친화도의 적어도 50%를 갖는다.
2개의 서열들 사이의 "상동성"의 계산은 하기와 같이 수행한다. 서열들을 최적의 비교 목적용으로 정렬한다 (예를 들어, 최적의 정렬을 위하여 제1 및 제2 아미노산 또는 핵산 서열 중 하나 또는 이들 둘 모두에 갭을 도입할 수 있으며 비상동성 서열은 비교 목적에 있어서는 무시할 수 있음). 비교 목적용으로 정렬되는 참고 서열의 길이는 참고 서열의 길이의 적어도 50%이다. 이어서 상응하는 아미노산 위치 또는 뉴클레오티드 위치의 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 비교한다. 제1 서열 중의 위치가 제2 서열 중의 상응하는 위치와 동일한 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드에 의해 점유되면, 이 분자는 그 위치에서 동일하다 (본원에서 사용되는 바와 같이, 아미노산 또는 핵산 "동일성"은 아미노산 또는 핵산의 "상동성"과 등가임). 2개의 서열들 사이의 동일성 퍼센트는 2개의 서열의 최적 정렬을 위하여 도입될 필요가 있는 갭의 개수, 및 각각의 갭의 길이를 고려하여, 이 서열에 의해 공유되는 동일한 위치의 갯수의 함수이다.
서열들 사이의 비교 및 2개의 서열들 사이의 상동성 퍼센트의 결정은 수학적 알고리즘을 사용하여 달성할 수 있다. 2개의 아미노산 서열들 사이의 상동성 퍼센트는 문헌[Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48: 444-453, 1970]의 알고리즘을 사용하여 결정하는데, 이 알고리즘은 12의 갭 페널티, 4의 갭 연장 페널티, 및 5의 프레임시프트 (frameshift) 갭 페널티를 갖는 Blossum 62 스코어링 매트릭스가 사용되는 GCG 소프트웨어 패키지 내의 GAP 프로그램 내로 포함되었다.
본원에 사용되는 바와 같이, "낮은 엄격도, 중간 정도의 엄격도, 높은 엄격도, 또는 매우 높은 엄격도의 조건 하에서 혼성화하는"이라는 용어는 혼성화 및 세척 조건을 설명하는 것이다. 혼성화 반응을 수행하는 것에 대한 지침은 본원에 참고로 포함된 문헌[Current Protocols in Molecualr Biology, John Wiley & Sons, N.Y. 6.3.1-6.3.6, 1989]에서 발견할 수 있다. 수성 및 비수성 방법이 상기 참고 문헌에 기술되어 있으며 이들 중 어느 하나의 방법이 사용될 수 있다. 본원에서 언급되는 구체적인 혼성화 조건은 하기와 같다: 1) 낮은 엄격도의 혼성화 조건: 약 45℃에서 6X 염화나트륨/시트르산나트륨 (SSC), 이어서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서 적어도 50℃에서 2회의 세척 (세척 온도는 낮은 엄격도의 조건의 경우 55 C로 증가시킬 수 있음); 2) 중간 정도의 엄격도의 혼성화 조건: 약 45℃에서 6X SSC, 이어서 60℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서 1회 이상의 세척; 3) 높은 엄격도의 혼성화 조건: 약 45℃에서 6X SSC, 이어서 65℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서 1회 이상의 세척; 및 4) 매우 높은 엄격도의 혼성화 조건: 65℃에서 0.5 M 인산나트륨, 7% SDS, 이어서 65℃에서 0.2X SSC, 1% SDS에서 1회 이상의 세척.
본원에 기술된 항체 및 이의 항원 결합 부위는 추가의 보존성 또는 비필수 아미노산 치환체를 가질 수 있으며, 이들은 폴리펩티드 기능에 실질적인 영향을 미치지 않는다는 것이 이해된다. 특정 치환이 견디어지는지, 즉, 기술된 생물학적 특성, 예를 들어 결합 활성에 악영향을 미치지 않을 것인지 아닌지는 문헌[Bowie et al., Science, 247: 1306-1310, 1990]에 기술되어 있는 바와 같이 결정할 수 있다. "보존성 아미노산 치환"은 어느 한 아미노산 잔기가 유사한 측쇄를 갖는 아미노산 잔기로 대체된 것이다. 유사한 측쇄를 갖는 아미노산 잔기 패밀리는 당업계에 정의되어 있다. 이러한 패밀리는 염기성 측쇄를 갖는 아미노산 (예를 들어, 라이신, 아르기닌, 히스티딘), 산성 측쇄 (예를 들어, 아스파르트산, 글루탐산), 비하전 극성 측쇄 (예를 들어, 아스파라긴, 글루타민, 세린, 트레오닌, 타이로신, 시스테인), 비극성 측쇄 (예를 들어, 글리신, 알라닌, 발린, 류신, 이소류신, 프롤린, 페닐알라닌, 메티오닌, 트립토판), 베타-분지형 측쇄 (예를 들어, 트레오닌, 발린, 이소류신) 및 방향족 측쇄 (예를 들어, 타이로신, 페닐알라닌, 트립토판, 히스티딘)를 포함한다.
"비필수" 아미노산 잔기는 생물학적 활성을 실질적으로 변경시키지 않고, 폴리펩티드, 예를 들어 결합 제제, 예를 들어 항체의 야생형 서열로부터 변경될 수 있는 잔기이며, 반면, "필수" 아미노산 잔기는 그러한 변화를 생성한다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 기술적 과학적 용어는 본 발명이 속하는 당업계의 숙련자가 일반적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기술되어 있는 것과 유사하거나 등가인 방법 및 재료가 본 발명의 실행 또는 시험에서 사용될 수 있지만, 적합한 방법 및 재료가 하기에 기술되어 있다. 본원에 언급된 모든 공보, 특허 출원, 특허 및 참고 문헌은 그의 전체 내용이 참고로 포함된다. 상충될 경우, 정의를 포함하는 본 발명의 명세서가 좌우할 것이다. 또한, 재료, 방법 및 실시예는 단지 예시적인 것이며 한정하려는 것이 아니다.
개관
씨. 디피실리는 인간에서 항생제-관련 설사 및 대장염을 야기하며 독소를 생산하는 그램 양성 박테리아이다. 본원에 제공되어 있는 것은 씨. 디피실리-관련 질환 (CDAD)의 치료 및 예방을 위한 방법 및 조성물이다. 본 조성물은 씨. 디피실리에 의해 생산되는 독소 (예를 들어, 독소 A 및 독소 B)를 인식하는 항체를 포함하는, 씨. 디피실리 박테리아의 단백질 및 기타 분자 성분 (예를 들어, 지질, 탄수화물, 핵산)을 인식하는 항체를 함유한다. 특히, 인간 단일클론 항체가 제공된다. 소정 실시 형태에 있어서, 이러한 인간 단일클론 항체는 인간 면역글로불린 유전자 절편을 발현하는 생쥐에서 생산된다 (하기에 기술되어 있음). 항-독소 항체의 조합도 제공된다.
새로운 방법은 씨. 디피실리 독소에 결합하는 항체 (및 이의 항원 결합 부위)를 대상체에게 투여하여 대상체에서 CDAD를 억제하는 단계를 포함한다. 예를 들어, 본원에 기술되어 있는 인간 단일클론 항-독소 A 항체는 독소 A를 중화시키고 씨. 디피실리-매개 질환의 재발을 억제할 수 있다. 다른 예에 있어서, 항-독소 A 항체 (예를 들어 항-독소 A 단일클론 항체)와 항-독소 B 항체의 조합물을 투여하여 일차 질환을 억제하고 질환의 재발의 이환율을 감소시킬 수 있다. 인간 단일클론 항체는 생체내에서 질환 부위 (예를 들어, 장)에 국지화될 수 있다.
1. 항체의 생성
면역원
일반적으로, 동물은 항체의 생성을 위하여 씨. 디피실리에 의해 발현되는 항원으로 면역화한다. 항-독소 항체의 생성에 있어서, 동물을 불활성화 독소 또는 유독소로 면역화한다. 독소는, 예를 들어 포름알데히드, 글루타르알데히드, 퍼옥사이드, 또는 산소 처리를 이용한 처리에 의해 불활성화시킬 수 있다 (예를 들어 문헌[Relyveld et al., Methods in Enzymology, 93: 24, 1983]; 문헌[Woodrow and Levine, eds., New Generation Vaccines, Marcel Dekker, Inc., New York, 1990] 참조). 독성이 감소된 돌연변이 씨. 디피실리 독소는 재조합 방법을 사용하여 생성할 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 제5,085,862호; 동 제5,221,618호; 동 제5,244,657호; 동 제5,332,583호; 동 제5,358,868호; 및 동 제5,433,945호 참조). 예를 들어, 독소 활성 부위 중에 결실 또는 점 돌연변이를 포함하는 돌연변이체가 만들어질 수 있다. 재조합 독소 단편이 면역원으로 사용될 수 있다. 다른 접근법은 UDP-디알데히드를 이용한 처리로 독소를 불활성화시키는 것이다 (Genth et al., Inf. and Immun., 68(3): 1094-1101, 2000). 이방법은 다른 처리보다 손쉽게 독소의 천연 구조를 보존하며, 따라서 천연 독소에 대하여 더욱 반응성인 항체를 이끌어낼 수 있다. 이 방법도 하기 실시예 1에 기술되어 있다.
독소 A에 결합하여 그를 중화시키는 항-독소 항체는 독소 A의 특정 에피토프와 상호 작용할 수 있다. 예를 들어, 항-독소 A 항체는 독소 A의 N-말단 영역 (예를 들어, 독소 A의 아미노산 1-1033 사이), 또는 C-말단 영역 (예를 들어, 독소 A의 아미노산 1853-2710 사이)의 에피토프에 결합할 수 있다. 일례에 있어서, 독소 A에 결합하여 그를 중화시키는 항체는 독소 A의 아미노산 1853-2710 내의 에피토프에 결합한다.
이와 유사하게, 항-독소 B 항체는 독소 B의 특정 에피토프, 예를 들어, N-말단 에피토프, 또는 C-말단 에피토프를 인식할 수 있다. 일례에 있어서, 독소 B에 결합하여 그를 중화시키는 항체는 독소 B의 아미노산 1777-2366 내의 에피토프에 결합한다.
HuMAb 생쥐에서의 인간 단일클론 항체의 생성
단일클론 항체는 다중클론 항체에서는 가능하지 않은 방식으로 생산될 수 있다. 다중클론 항혈청은 동물마다 다르며, 반면, 단일클론 제제는 균일한 항원 특이성을 나타낸다. 쥣과 동물 시스템이 단일클론 항체의 생성에 유용하며, 면역화 프로토콜, 비장 세포의 단리 및 융합 기술과, 하이브리도마의 생성을 위한 방법 및 시약은 잘 알려져 있다. 단일클론 항체는 통상적인 단일클론 항체에 대한 방법을 포함하여 다양한 기술에 의해, 예를 들어, 문헌[Kohler and Milstein, Nature, 256: 495, 1975]의 표준 체세포 혼성화 기술에 의해 생성될 수 있다. 일반적으로, 문헌[Harlow, E. and Lane, D. Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1988]을 참조한다.
이러한 표준 기술이 공지되어 있지만, 인간 대상체의 치료를 위하여 쥣과 항체보다는 오히려 인간화 또는 인간 항체를 사용하는 것이 바람직한데, 이는 인간은 생쥐 및 기타 종 유래의 항원에 대한 면역 응답을 실시하기 때문이다. 쥣과 항체에 대한 면역 응답은 인간 항-생쥐 항체 또는 HAMA 응답으로 불리우며 (Schroff, R. et al, Cancer Res., 45: 879-885, 1985) 인간에서 혈청병을 야기하는 병이고 개체의 순환기로부터 쥣과 항체를 신속하게 제거한다. 인간에서의 면역 응답은 쥣과 면역글로불린의 가변 영역 및 불변 영역 둘 모두에 대한 것으로 밝혀졌다. 인간단일클론 항체는 다른 동물로부터 유래되는 항체 및 인간 다중클론 항체보다 인간에게 투여하기에 더 안전하다.
인간 단일클론 항체의 생성을 위한 다른 유용한 유형의 동물로는 그 자신의 생쥐 면역글로불린 유전자보다 오히려 인간 면역글로불린 유전자를 발현하는 트랜스제닉 생쥐가 있다. 그러한 트랜스제닉 생쥐, 예를 들어, "HuMAbTM" 생쥐는 미전위 인간 중쇄 (μ 및 γ) 및 κ 경쇄 면역글로불린 서열을 코딩하는 인간 면역글로불린 유전자의 미니유전자좌 (miniloci)를, 내인성 μ 및 κ 쇄 유전자좌를 불활성화시키는 표적화된 돌연변이와 함께 포함한다 (예를 들어, 문헌[Lonberg, N. et al., Nature 368(6474): 856-859, 1994] 및 미국 특허 제5,770,429호 참조). 따라서, 생쥐는 생쥐 IgM 또는 κ의 발현 감소를 나타내며, 면역화에 응답하여, 도입된 인간 중쇄 및 경쇄 트랜스진은 분류군 스위칭 (class switching) 및 체세포 돌연변이를 받아 높은 친화도의 인간 IgGκ 단일클론 항체를 생성한다. (문헌[Lonberg, N. et al., supra]; 하기에 개관됨: 문헌[Lonberg, N. Handbook of Experimental Pharmacology 113: 49-101, 1994]; Lonberg, N. and Huszar, D., Intern. Rev. Immunol, 13: 65-93, 1995], 및 [Harding, F. and Lonberg, N., Ann. N.Y. Acad. Sci., 764: 536-546, 1995]).
그러한 트랜스제닉 생쥐의 제법이 문헌[Taylor, L. et al., Nucleic Acids Research, 20: 6287-6295, 1992]; 문헌[Chen, J. et al., International Immunology 5: 647-656, 1993]; Tuaillon et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 90: 3720-3724, 1993]; Choi et al., Nature Genetics, 4: 117-123, 1993]; 문헌[Chen, J. et al., EMBO J., 12: 821-830, 1993]; 문헌[Tuaillon et al., J. Immunol., 152: 2912-2920, 1994]; 문헌[Taylor, L. et al., International Immunology, 6: 579-591, 1994]; 및 문헌[Fishwild, D. et al., Nature Biotechnology, 14: 845-851, 1996]에 더욱 상세하게 기술되어 있다. 또한 미국 특허 제5,545,806호; 미국 특허 제5,569,825호, 미국 특허 제5,625,126호, 미국 특허 제5,633,425호, 미국 특허 제5,661,016호, 미국 특허 제5,770,429호, 미국 특허 제5,789,650호, 미국 특허 제5,814,318호, 미국 특허 제5,874,299호 및 미국 특허 제5,877,397호 -모두 Lonberg 및 Kay의 특허임 - 와, 국제 공보 제WO 01/14424호, 제WO 98/24884호, 제WO 94/25585호, 제WO 93/1227호, 및 제WO 92/03918호를 참조한다.
문헌[Lonberg, N. et al., Nature, 368(6474): 856-859, 1994]; 문헌[Fishwild, D. et al, Nature Biotechnology, 14: 845-851, 1996] 및 국제 공보 제WO 98/24884호에 기술되어 있는 바와 같이, 항원에 대하여 완전히 인간형인 단일클론 항체를 생성하기 위하여, HuMAb 생쥐를 면역원으로 면역화할 수 있다. 바람직하게는 생쥐는 제1 면역화시 6-16주령의 것이다. 예를 들어, 불활성화된 독소 A의 정제된 제제를 사용하여 HuMAb 생쥐를 복강내로 면역화할 수 있다. 씨. 디피실리의 단백질, 지질 및/또는 탄수화물 분자에 대한 항체의 생성을 위하여, 생쥐는 사멸되거나 비생육성인 씨. 디피실리 유기체로 면역화할 수 있다.
HuMAb 트랜스제닉 생쥐는 처음에 완전 프로인트 아쥬반트 (complete Freund's adjuvant) 중 항원으로 복강내 (IP) 면역화하고, 이어서 격주로 (최대 총 6주) 불완전 프로인트 아쥬반트 중 항원으로 면역화할 때 가장 우수하게 응답한다. 면역 응답은 레트로오비탈 (retroorbital) 채혈로 수득되는 혈장을 이용한 면역화 프로토콜 코스에 걸쳐 모니터링될 수 있다. 혈장은, 예를 들어 ELISA 또는 유세포 분류법으로 스크리닝될 수 있으며, 충분한 역치의 항-독소 인간 면역글로불린을 갖는 생쥐가 융합에 사용될 수 있다. 생쥐는 항원으로 정맥내 면역 증폭되고 3일 후에 희생되고 비장이 제거될 수 있다. 각각의 항원에 대하여 2-3회의 융합이 수행될 필요가 있을 수 있다고 예기된다. 전형적으로 여러 마리의 생쥐가 각각의 항원에 대하여 면역화된다.
표준 프로토콜에 기초하여 생쥐 비장 세포를 단리하고 PEG를 이용하여 생쥐 골수종 세포주에 융합시킬 수 있다. 이어서 생성된 하이브리도마는 항원 특이성 항체의 생산에 대하여 스크리닝된다. 예를 들어, 면역화 생쥐 유래의 비장 림프구의 단일 세포 현탁물은 50% PEG를 이용하여1/6개의 갯수의 P3X63-Ag8.653 비분비 생쥐 골수종 세포 (ATCC, CRL 1580)에 융합된다. 세포는 평평한 바닥의 마이크로타이터 플레이트에 대략 2 x 105개로 도말되고, 이어서 20% 태아 Clone 혈청, 18%의 "653" 조절 배지, 5% 오리겐 (IGEN), 4 mM의 L-글루타민, 1 mM의 L-글루타민, 1 mM의 피루브산나트륨, 5 mM HEPES, 0.055 mM의 2-메르캅토에탄올, 50 단위/ml의 페니실린, 50 mg/ml의 스트렙토마이신, 50 mg/ml의 겐타마이신 및 1x HAT (Sigma; HAT는 융합 24시간 후 첨가됨)를 함유하는 선발 배지에서 2주간 배양한다. 2주 후 세포는 HAT를 HT로 대체한 배지에서 배양된다. 이어서 개개의 웰로부터의 상청액은 ELISA로 인간 항-독소 세포 단일클론 IgM 및 IgG 항체에 대하여 스크리닝된다. 항체 분비 하이브리도마는 재도말되고, 다시 스크리닝되고, 인간 IgG에 대하여 여전히 양성일 경우, 항-독소 단일클론 항체는 제한 희석에 의해 2회 이상 서브클로닝될 수 있다. 이어서 안정한 서브클론을 시험관내에서 배양하여 특성화용의 조직 배양 배지에서 소량의 항체를 생성한다.
일 실시 형태에 있어서, 독소에 대한 인간 항체의 생성을 위하여 사용되는 트랜스제닉 동물은 WO 98/24884의 실시예 10에 기술되어 있는 JH 결실 동물로 번식된 자손과, WO 98/24884의 실시예 5, 6, 8 또는 14에 기술되어 있는 단일 카피의 경쇄 트랜스진을 포함하는 동물로 번식된 WO 98/24884의 실시예 12에 기술되어 있는 트랜스진 (예를 들어 pHC1 또는 pHC2)을 적어도 1 카피, 전형적으로 2-10 카피, 및 때로 25-50 또는 그 이상의 카피를 포함하는데, 상기 국제공보의 내용은 본원에 참고로 명확하게 포함된다. 동물은 이러한 3가지 형질 각각에 대하여 동형접합성으로 번식된다. 그러한 동물은 하기의 유전자형을 갖는다: (염색체의 반수체 세트 당) 단일 카피의 인간 중쇄 비재배열 미니-유전자좌 (WO 98/24884의 실시예 12에 기술되어 있음), (염색체의 반수체 세트 당) 단일 카피의 재배열 인간 K 경쇄 제작물 (WO 98/24884의 실시예 14에 기술되어 있음), 및 기능성 JH 절편 모두가 제거된 각각의 내인성 생쥐 중쇄 유전자좌에서의 결실 (WO 98/24884의 실시예 10). 그러한 동물은 JH 절편의 결실 (WO 98/24884의 실시예 10)에 대하여 동형접합성인 생쥐로 번식되어 JH 결실에 대해서는 동형접합성이고 인간 중쇄 및 경쇄 제작물에 대해서는 반접합성인 (hemizygous) 자손을 생성한다. 생성된 동물에 항원을 주사하고 이를 상기 항원에 대한 인간 단일클론 항체의 생성에 사용한다.
그러한 동물로부터 단리된 B 세포는 인간 중쇄 및 경쇄와 관련하여 1특이성인데, 이는 상기 B 세포가 각각의 유전자의 단일 카피만을 포함하기 때문이다. 또한, 상기 B 세포는 인간 또는 생쥐 중쇄와 관련하여 1특이성인데, 이는 내인성 생쥐 중쇄 유전자 카피 둘 모두가 WO 98/24884의 실시예 9 및 12에 기술되어 있는 바와 같이 도입되는 JH 영역에 걸쳐 있는 결실에 의해 비기능성이기 때문이다. 또한, 상당한 분율의 B 세포가 인간 또는 생쥐 경쇄와 관련하여 1특이성인데, 이는 단일 카피의 재배열 인간 카파 경쇄 유전자의 발현이 상당한 분율의 B 세포에서 내인성 생쥐 카파 및 람다 쇄 유전자의 재배열을 대립 유전자에 의해 그리고 이소타입에 의해 제외할 것이기 때문이다.
일 실시 형태에 있어서, 트랜스제닉 생쥐는 이상적으로는 천연 생쥐의 것과 실질적으로 유사하게 유의한 레퍼토리로 면역글로불린 생성을 나타낸다. 따라서, 예를 들어, 내인성 Ig 유전자가 불활성화된 실시 형태에 있어서, 총 면역글로불린의 수준은 약 0.1 내지 10 mg/ml의 혈청, 예를 들어 0.5 내지 5 mg/ml, 또는 적어도 약 1.0 mg/ml의 범위이다. IgM으로부터의 IgG로의 스위치를 초래할 수 있는 트랜스진이 트랜스제닉 생쥐에 도입되었을 경우, 성체 생쥐의 혈청 중 IgG 대 IgM의 비는 바람직하게는 약 10:1이다. IgG 대 IgM의 비는 미성숙 생쥐에서 훨씬 더 작다. 일반적으로, 약 10% 초과, 예를 들어 약 40 내지 80%의 비장 및 림프절 B 세포는 인간 IgG 단백질을 배타적으로 발현한다.
트랜스제닉 생쥐에서의 레퍼토리는 이상적으로는 비-트랜스제닉 생쥐에서 보여지는 것에 가까우며, 일반적으로 높을 경우 적어도 약 10%, 바람직하게는 높을 경우 25 내지 50%이다. 일반적으로, 주로 생쥐 게놈 내로 도입되는 상이한 V, J 및 D 영역의 갯수에 따라 적어도 약 1000개의 상이한 면역글로불린 (이상적으로는 IgG), 바람직하게는 104 또는 106 또는 그 이상의 면역글로불린이 생성된다. 전형적으로, 면역글로불린은 적어도 약 107M-1, 109M-1, 1010M-1, 1011M-1, 1012M-1, 또는 그 이상, 예를 들어 최대 1013M-1 또는 그 이상의 사전 선택된 항원에 대한 친화도를 나타낸다.
HuMAb 생쥐는 트랜스진간 스위치 재조합 (시스-스위칭)을 통하여 분류군 스위칭을 경험하고 독소에 반응성인 면역글로불린을 발현하는 B 세포를 생산할 수 있다. 면역글로불린은 인간 서열의 항체일 수 있으며, 여기서, 중쇄 및 경쇄 폴리펩티드는 인간 트랜스진 서열에 의해 코딩되며, 상기 서열은 체세포 돌연변이에 의해 유래되는 서열 및 V 영역 재조합 접합부와, 생식 세포 코딩 서열을 포함할 수 있다. 이러한 인간 서열 면역글로불린은, 비록 다른 비-생식 세포 서열이 체세포 돌연변이 및 차별적인 V-J 및 V-D-J 재조합 접합부의 결과로서 존재할 수 있기는 해도, 인간 VL 또는 VH 유전자 절편 및 인간 JL 또는 JL 절편에 의해 코딩되는 폴리펩티드 서열과 실질적으로 동일한 것으로 언급될 수 있다. 그러한 인간 서열 항체에 대해서, 각각의 쇄의 가변 영역은 전형적으로 인간 생식 세포 V, J 유전자, 그리고 중쇄의 경우, D 유전자 절편에 의해 적어도 80% 코딩된다. 빈번하게는 가변 영역 중 적어도 85퍼센트가 트랜스진 상에 존재하는 인간 생식 세포 서열에 의해 코딩된다. 흔히는, 가변 영역 서열 중 90 또는 95퍼센트 또는 그 이상이 트랜스진 상에 존재하는 인간 생식 세포 서열에 의해 코딩된다. 그러나, 비-생식 세포 서열이 체세포 돌연변이와 VJ 및 VDJ 접합에 의해 도입되기 때문에, 인간 서열 항체는 빈번하게는 생쥐의 생식 세포에서 인간 트랜스진(들)에서 발견되는 바와 같이 인간 V, D 또는 J 유전자 절편에 의해 코딩되지 않는 몇몇 가변 영역 서열 (및 덜 빈번하게는 불변 영역 서열)을 가질 것이다. 전형적으로, 그러한 비-생식 세포 서열 (또는 개개의 뉴클레오티드 위치는 CDR 내에 또는 CDR 근처에, 또는 체세포 돌연변이가 클러스터 (cluster)되는 것으로 공지된 영역 내에 클러스터링할 것이다.
독소에 결합하는 인간 서열 항체는, 인간 서열의 감마 쇄 (예를 들어, 감마 1, 감마 2 또는 감마 3) 및 인간 서열의 경쇄 (예를 들어 K)를 포함하는 인간 항체가 생성되도록 이소타입 스위칭으로부터 생길 수 있다. 흔히 그러한 이소타입-스위칭된 인간 서열 항체는, 특히 이차 (또는 후속적인) 항원 공격 후의 항원에 의한 B 세포의 선발 및 친화력 성숙 (affinity maturation)의 결과로서 가변 영역 내에 그리고 흔히 CDR의 약 10개의 잔기 내 또는 이내에 하나 이상의 체세포 돌연변이(들)를 포함한다. 이러한 높은 친화도의 인간 서열 항체의 결합 친화도는 적어도 약 1 x 109 M-1, 전형적으로는 적어도 5 x 109 M-1, 빈번하게는 1 x 1010 M-1 초과, 그리고 때로는 5 x 1010 M-1 내지 1 x 1011 M-1 또는 그 이상이다.
항-독소 항체는 또한 비-트랜스제닉 생쥐, 인간 토끼 및 염소를 포함하는 다른 포유동물에서 증대될 수 있다.
항-독소 A 항체
독소 A에 특이적으로 결합하는 인간 단일클론 항체는 본원에 기술되어 있는 3D8, 1B11, 및 3H2에 의해 생산되는 항체를 포함한다. 3D8, 1B11, 및 3H2의 중쇄 및 경쇄 가변 영역에 대하여 80% 이상 동일한 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 갖는 항체도 독소 A에 결합할 수 있다. 관련 실시 형태에 있어서, 항-독소 A 항체는 예를 들어 3D8, 1B11, 및 3H2의 가변성 중쇄 및/또는 가변성 경쇄의 상보성 결정 영역 (CDR)을 포함한다. 이러한 클론 유래의 중쇄 가변 영역의 CDR이 하기 표 1에 예시되어 있다.
가변성 중쇄 CDR의 아미노산 서열
클론 쇄 CDR 아미노산 서열 서열 번호
3D8 H CDR1 NYGMH 7
1B11 H CDR1 SYGMH 10
3H2 H CDR1 KYGMH 13
3D8 H CDR2 LIWYDGSNEDYTDSVKG 8
1B11 H CDR2 VIWASGNKKYYIESVEG 11
3H2 H CDR2 VIWYDGTNKYYADSMKG 14
3D8 H CDR3 WGMVRGVIDVFDI 9
1B11 H CDR3 ANFDY 12
3H2 H CDR3 DPPTANY 15
이 클론 유래의 경쇄 가변 영역의 CDR이 하기 표 2에 예시되어 있다.
가변성 경쇄 CDR의 아미노산 서열
클론 쇄 CDR 아미노산 서열 서열 번호
3D8 L CDR1 RASQGISSWLA 16
1B11 L CDR1 RASQSVSSYLA 19
3H2 L CDR1 RASQGISSWLA 22
3D8 L CDR2 AASSLQS 17
1B11 L CDR2 DASNRAT 20
3H2 L CDR2 AASSLQS 23
3D8 L CDR3 QQANSFPWT 18
1B11 L CDR3 QQRSNWSQFT 21
3H2 L CDR3 QQYKSYPVT 24
CDR은 특정 항원에 대한 특이성을 결정하는 면역글로불린의 부분이다. 소정 실시 형태에 있어서, 서열 변이 (예를 들어 보존성 치환)를 갖는 표 1 및 2의 CDR에 상응하는 CDR은 독소 A에 결합할 수 있다. 예를 들어, CDR 중의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 잔기, 또는 전체 잔기의 20% 미만의 잔기가 치환 또는 결실된 CDR이 독소 A에 결합하는 항체 (또는 이의 항원 결합 영역)에 존재할 수 있다.
이와 유사하게, 항-독소 항체는 콘센서스 서열을 포함하는 CDR을 가질 수 있는데, 이는 다수의 항체 중에서 보존된 서열 모티프가 결합 활성에 중요할 수 있기 때문이다. 예를 들어, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역의 CDR1은 아미노산 서열 R-A-S-Q-X-X-S-S-X-L-A (서열 번호 25)을 포함할 수 있으며, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역의 CDR2는 아미노산 서열 A-S-X-X-X-S/T (서열 번호 26)을 포함할 수 있고/있거나, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 경쇄 가변 영역의 CDR3은 아미노산 서열 Q-Q-X-X-S/N-X-P/S (서열 번호 27)을 포함할 수 있으며, 여기서, X는 임의의 아미노산이다.
몇몇 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역의 CDR1은 아미노산 서열 Y-G-M-H (서열 번호 28)을 포함하고/하거나, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 중쇄 가변 영역의 CDR2는 아미노산 서열 I-W-X-X-G-X-X-X-Y-X-X-S-X-X-G (서열 번호 29)를 포함하며, 여기서, X는 임의의 아미노산이다.
인간 항-독소 항체는 특정의 인간 면역글로불린 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 가변 영역을 포함할 수 있다. 예를 들어, 이 항체는 인간 VH3-33 유전자의 산물이거나, 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역을 포함할 수 있다. 이 유전자로부터 유래되는 다수의 항체 서열은 젠뱅크(등록상표)에서 입수가능하다 (예를 들어, 등록 번호: AJ555951, GI 번호: 29836865; 등록 번호: AJ556080, GI 번호: 29837087; 등록 번호:AJ556083, GI 번호: 29837012, 및 젠뱅크(등록상표)에서 제공되는 기타 인간 VH3-33 재배열 유전자 절편 참조). 또한, 또는 대안적으로는, 본 항체는 인간 VκL19 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다 (예를 들어, 재배열된 인간 VκL19 유전자 절편의 부분적인 서열에 대해서 젠뱅크(등록상표) 등록 번호: AJ556049, GI 번호: 29837033 참조). 당업계에 공지되어 있는 바와 같이, 그리고 상기에 이 절에서 기술되어 있는 바와 같이, 재조합 항체의 면역글로불린 가변 영역은 이 영역을 코딩하는 게놈 절편에 가변성을 도입하는 생체내 재조합 과정에 의해 유래된다. 따라서, 인간 VH-33 또는 VκL19 유전자로부터 유래되는 가변 영역은 비-림프 조직에서 발견되는 유전자의 뉴클레오티드와는 다른 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 이러한 뉴클레오티드 차이는 전형적으로 CDR에 집중되어 있다.
항-독소 B 항체
독소 B에 특이적으로 결합하는 인간 단일클론 항체는 본원에 기술되어 있는 124-152, 2A11 및 1G10 클론에 의해 생산되는 항체를 포함한다. -152, 2A11 및 1G10의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역에 대하여 적어도 80%, 또는 그 이상 동일한 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체도 독소 B에 결합할 수 있다. 관련된 실시 형태에 있어서, 항-독소 B 항체는 예를 들어 -152, 2A11 또는 1G10의 가변성 중쇄 및/또는 가변성 경쇄의 상보성 결정 영역 (CDR)을 포함한다. 이러한 클론 유래의 중쇄 가변 영역의 CDR이 하기 표 3에 예시되어 있다.
가변성 중쇄 CDR의 아미노산 서열
클론 쇄 CDR 아미노산 서열 서열 번호
(아미노산)		 서열 번호
(뉴클레오티드)
124-152 H CDR1 SYWIG 62 63
124-152 H CDR2 IFYPGDSSTRYSPSFQG 64 65
124-152 H CDR3 RRNWGNAFDI 66 67
이 클론으로부터의 경쇄 가변 영역의 CDR이 하기 표 4에 예시되어 있다.
가변성 경쇄 CDR의 아미노산 서열
클론 쇄 CDR 아미노산 서열 서열 번호
(아미노산)		 서열 번호
(뉴클레오티드)
124-152 L CDR1 RASQSVSSSYLAW 68 69
124-152 L CDR2 GASSRAT 70 71
124-152 L CDR3 QQYGSSTWT 72 73
CDR은 특정 항원에 대한 특이성을 결정하는 면역글로불린 부분이다. 소정 실시 형태에 있어서, 서열 변이 (예를 들어 보존성 치환)를 갖는 표 3 및 4의 CDR에 상응하는 CDR은 독소 B에 결합할 수 있다. 예를 들어, CDR 중의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 잔기, 또는 전체 잔기의 20% 미만의 잔기가 치환 또는 결실된 CDR이 독소 B에 결합하는 항체 (또는 이의 항원 결합 영역)에 존재할 수 있다.
인간 항-독소 B 항체는 특정의 인간 면역글로불린 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 가변 영역을 포함할 수 있다 (도 28-31 참조). 예를 들어, 이 항체는 인간 VH 5-51 유전자의 산물이거나, 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역을 포함할 수 있다. 또한, 또는 대안적으로는, 본 항체는 인간 Vκ A27 유전자 및/또는 JK1 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다. 당업계에 공지되어 있는 바와 같이, 그리고 상기에 이 절에서 기술되어 있는 바와 같이, 재조합 항체의 면역글로불린 가변 영역은 이 영역을 코딩하는 게놈 절편에 가변성을 도입하는 생체내 재조합 과정에 의해 유래된다. 따라서, 인간 VH 5-51 또는 Vκ A27/JK1 유전자로부터 유래되는 가변 영역은 비-림프 조직에서 발견되는 유전자의 뉴클레오티드와는 다른 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 이러한 뉴클레오티드 차이는 전형적으로 CDR에 집중되어 있다.
2. 항체의 생성 및 변형
다수의 상이한 유형의 항-독소 항체가 CDAD의 억제에 유용할 수 있다. 항체는 IgG (예를 들어, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), IgM, IgA1, IgA2, IgD 또는 IgE를 포함하는 다양한 이소타입의 것일 수 있다. 바람직하게는 항체는 IgG 이소타입, 예를 들어 IgG1이다. 항체 분자는 전장일 수 있거나 (예를 들어, IgG1 또는 IgG4 항체) 단지 항원 결합 단편 (예를 들어, Fab, F(ab')2, Fv 또는 단쇄 Fv 단편)을 포함할 수 있다. 이들은 단일클론 항체 (예를 들어 인간 단일클론 항체), 재조합 항체, 키메라 항체, 및 인간화 항체와, 전술한 것의 항원 결합 부위를 포함한다.
또한, 본 발명에서 유용한 항-독소 항체 또는 그의 부분은 원하는 항체의 면역글로불린 경쇄 및 중쇄를 코딩하는 DNA로 형질전환된 숙주 세포에 의해 생산되는 재조합 항체일 수 있다. 재조합 항체는 공지된 유전 공학 기술에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 재조합 항체는 원하는 항체의 면역글로불린 경쇄 및 중쇄를 코딩하는 뉴클레오티드 서열, 예를 들어 cDNA 또는 게놈 DNA를 클로닝함으로써 제조될 수 있다. 이어서 이러한 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 둘 모두의 유전자가 그 자신의 전사 및 번역 발현 제어 서열에 작동되게 결합되도록 발현 벡터 내로 삽입된다. 발현 벡터 및 발현 제어 서열은 사용되는 발현용 숙주 세포와 상용성이 되도록 선택된다. 전형적으로, 상기 유전자 둘 모두는 동일한 발현 벡터 내로 삽입된다. 원핵 또는 진핵 숙주 세포가 사용될 수 있다.
진핵 숙주 세포에서의 발현이 바람직한데, 이는 그러한 세포가 원핵 세포보다 적당하게 폴딩되고 면역학적으로 활성인 항체를 어셈블링하고 분비할 가능성이 더 높기 때문이다. 그러나, 부적당한 폴딩으로 인하여 불활성인 생산된 임의의 항체는 잘 알려진 방법에 따라 재생시킬 수 있다 (Kim and Baldwin, Ann. Rev. Biochem., 51: 459-89, 1982). 숙주 세포는 완전한 항체의 부분들, 예를 들어 경쇄 이량체 또는 중쇄 이량체를 생산하는 것이 가능한데, 이는 본 발명에 따른 항체의 동족체이기도 하다.
본원에 기술된 항체는 또한 예를 들어 당업계에 잘 알려져 있는 바와 같이 유전자 트랜스펙션 방법과 재조합 DNA 기술의 조합법을 사용하여 숙주 세포 트랜스펙토마에서 생산될 수 있다 (Morrison, S., Science, 229: 1202, 1985). 예를 들어, 일 실시 형태에 있어서, 목적 유전자(들), 예를 들어 인간 항체 유전자는 WO 87/04462, WO 89/01036 및 EP338 841에 개시되어 있는 GS 유전자 발현 시스템, 또는 당업계에 잘 알려져 있는 기타 발현 시스템에서 사용되는 것과 같은 진핵 발현 플라스미드와 같은 발현 벡터 내로 라이게이션시킬 수 있다. 클로닝된 항체 유전자를 포함하는 정제된 플라스미드는 진핵 숙주 세포, 예를 들어 CHO-세포 또는 NSO-세포 또는 대안적으로는 기타 진핵 세포, 예를 들어 식물 유래 세포, 진균류 또는 효모 세포 내에 도입될 수 있다. 이러한 유전자를 도입하기 위하여 상요되는 방법은 당업계에 기술되어 잇는 임의의 방법, 예를 들어 전기천공법, 리포펙틴법, 리포펙타민 또는 발사식 (ballistic) 트랜스펙션일 수 있는데, 여기서 세포는 목적 DNA를 지니는 미립자로 포격된다 (Rodin, et al. Immunol. Lett., 74(3): 197-200, 2000). 숙주 세포 내로의 상기 항체 유전자의 도입 후, 항체를 발현하는 세포를 동정 및 선발할 수 있다. 이러한 세포는 트랜스펙토마를 나타내고 그 후 이것은 그의 발현 수준을 위하여 증폭되고 수준이 높아져 (upscaled) 항체를 생산할 수 있다. 재조합 항체는 표준 기술을 사용하여 상기 배양 상청액 및/또는 세포로부터 단리 및 정제될 수 있다.
상기 절차에 대한 변이가 본 발명에서 유용하다는 것이 이해된다. 예를 들어, 항체의 경쇄 또는 중쇄 중 하나 (그러나 둘 모두는 아님)를 코딩하는 DNA로 숙주 세포를 형질전환시키는 것이 요망될 수 있다. 재조합 DNA 기술은 결합에 필요하지 않은 경쇄 및 중쇄 중 어느 하나 또는 이들 둘 모두를 코딩하는 DNA의 일부 또는 전부를 제거하기 위해서 e한 사용될 수 있는데, 예를 들어 불변 영역은 예를 들어 특정 아미노산의 결실에 의해 변형될 수 있다. 그러한 절단형 (truncated) DNA 분자로부터 발현되는 분자는 본원에 기술된 방법에서 유용하다. 또한, 하나의 중쇄 및 하나의 경쇄가 독소에 결합하며, 다른 중쇄 및 경쇄는 독소 이외의 항원, 또는 독소의 다른 에피토프에 특이적인 2기능성 항체가 제조될 수 있다.
키메라 항체는 당업계에 공지된 재조합 DNA 기술로 제조될 수 있다. 예를 들어, 쥣과 (또는 다른 종) 단일클론 항체 분자의 Fc 불변 영역을 코딩하는 유전자는 제한 효소로 절단되어 쥣과 Fc를 코딩하는 영역이 제거되고, 인간 Fc 불변 영역을 코딩하는 유전자의 등가의 부분이 치환된다 (Robinson 등의 국제 공보 제PCT/US86/02269호; Akira 등의 유럽 특허 출원 제184,187호; Taniguchi, M.의 유럽 특허 출원 제171,496호; Morrison 등의 유럽 특허 출원 제173,494호; Neuberger 등의 국제 공보 제WO 86/01533호; Cabilly 등의 미국 특허 제4,816,567호; Cabilly 등의 유럽 특허 출원 제125,023호; 문헌[Better et al. (1988 Science, 240: 1041-1043)]; 문헌[Liu et al. (1987) PNAS, 84: 3439-3443]; 문헌[Liu et al., 1987, J. Immunol., 139: 3521-3526]; 문헌[Sun et al. (1987) PNAS 84: 214-218]; 문헌[ishimura et al., 1987, Canc. Res., 47: 999-1005]; 문헌[Wood et al. (1985) Nature, 314: 446-449]; 및 문헌[Shaw et al., 1988, J. Natl. Cancer Inst., 80: 1553-1559] 참조). 키메라 항체가 재조합 DNA 기술에 의해 또한 생성될 수 있는데, 여기서, 쥣과 V 영역을 코딩하는 DNA는 인간 불변 영역을 코딩하는 DNA에 라이게이션될 수 있다.
항체 또는 면역글로불린 쇄는 당업계에 공지된 방법으로 인간화될 수 있다. 예를 들어, 일단 쥣과 항체가 수득되면, 가변 영역의 서열을 결정할 수 있다. CDR 및 골격 잔기의 위치가 결정될 수 있다 (문헌[Kabat, E.A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242] 및 문헌[Chothia, C. et al. (1987) J. Mol. Biol., 196: 901-917] 참조). 경쇄 및 중쇄 가변 영역은 선택적으로 상응하는 불변 영역에 라이게이션될 수 있다. 실제, 완전 인간형인 항체를 포함하는 본원에 기술되어 있는 임의의 항체는 예를 들어, 원하는 항체의 구조, 기능 (예를 들어 이펙터 기능), 아형, 알로타입 (allotype), 아류 등의 성취를 위하여 치환 불변 영역, 예를 들어 Fc 영역, 또는 그의 일부(들)를 포함하도록 (예를 들어, 돌연변이, 치환에 의해) 변경될 수 있다는 것이 이해된다. 항-독소 항체는 당업계에 인지되는 기술을 사용하여 서열 결정될 수 있다. CDR-그래프팅된 항체 분자 또는 면역글로불린은 CDR-그래프팅 또는 CDR 치환에 의해 제조될 수 있으며, 여기서, 면역글로불린 쇄의 하나, 2개 또는 모두의 CDR은 대체될 수 있다. 예를 들어 미국 특허 제5,225,539호; 문헌[Jones et al., 1986, Nature, 321: 552-525]; 문헌[Verhoeyan et al., 1988, Science, 239: 1534]; 문헌[Beidler et al., 1988, J. Immunol., 141: 4053-4060]; 및 Winter의 미국 특허 제5,225,539호를 참조한다.
Winter는 본 발명의 항체의 제조에 사용될 수 있는 CDR-그래프팅 방법을 기술하고 있는데 (1987년 3월 26일자로 출원된 영국 특허 출원 제GB 2188638A호; Winter의 미국 특허 제5,225,539호), 그 내용은 명확하게 참고로 포함된다. 예를 들어, 특정 항체의 모든 CDR이 인간 CDR의 적어도 일부 (예를 들어, 표 1 및 2에 예시되어 있는 바와 같이, 클론 3D8 유래의 CDR 및/또는 표 3 및 4에 예시되어 있는 바와 같이, 클론 124-152 유래의 CDR)로 대체될 수 있거나 CDR의 일부만이 대체될 수 있다. 소정의 항원 (예를 들어 씨. 디피실리의 외독소)에의 항체의 결합에 필요한 갯수의 CDR을 대체하는 것만이 필요하다.
인간화 항체는 항원 결합에 직접적으로 연루되지 않은 Fv 가변 영역의 서열을 인간 Fv 가변 영역 유래의 등가의 서열로 대체함으로써 생성할 수 있다. 인간화 항체의 일반적인 제조 방법은 문헌[Morrison, S.L., 1985, Science, 229: 1202-1207], 문헌[Oi et al., 1986, BioTechniques, 4: 214] 및 Queen 등의 미국 특허 제5,585,089호, 미국 특허 제5,693,761호 및 미국 특허 제5,693,762호에 제공되어 있다. 이러한 방법은 중쇄 또는 경쇄 중 적어도 하나로부터의 면역글로불린 Fv 가변 영역의 모두 또는 일부를 코딩하는 핵산 서열을 단리, 조작 및 발현하는 것을 포함한다. 그러한 핵산의 공급원은 당업계의 숙련자에게 잘 알려져 있으며, 상기한 바와 같이, 소정의 표적에 대한 항체를 생산하는 하이브리도마로부터 수득될 수 있다. 이어서 인간화 항체, 또는 이의 단편을 코딩하는 재조합 DNA는 적절한 발현 벡터 내로 클로닝될 수 있다. 항체의 인간화를 위한 다른 기술은 1992년 12월 23일자로 공개된 Padlan 등의 EP 519596 A1에 개시되어 있다.
또한 본 발명의 범주 이내인 것은 특정 아미노산이 치환, 결실 또는 부가된 항체이다. 특히, 바람직한 항체는 항원에의 결합의 개선을 위한 것과 같이, 골격 영역 내에 아미노산 치환을 갖는다. 예를 들어, 면역글로불린 쇄의 선택된 소수의 수용체 골격 잔기는 상응하는 공여 아미노산에 의해 대체될 수 있다. 바람직한 치환 위치는 CDR에 인접한 아미노산 잔기 또는 CDR과 상호 작용할 수 있는 아미노산 잔기를 포함한다 (예를 들어, 미국 특허 제5,585,089호 참조). 공여체로부터의 아미노산의 선발 기준은 본원에 그 내용이 참고로 포함된 미국 특허 제5,585,089호 (예를 들어 컬럼 12-16)에 개시되어 있다. 수용체 골격은 성숙한 인간 항체 골격 서열 또는 콘센서스 서열일 수 있다.
"콘센서스 서열"은 관련된 서열 패밀리에서 가장 빈번하게 나타나는 아미노산 (또는 뉴클레오티드)로부터 형성되는 서열이다 (예를 들어, 문헌[Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987)] 참조). 단백질 패밀리에 있어서, 콘센서스 서열 중의 각각의 위치는 이 패밀리 중의 상기 위치에서 가장 빈번하게 나타나는 아미노산에 의해 점유된다. 2개의 아미노산이 동일하게 빈번히 나타날 경우, 둘 중 하나는 콘센서스 서열 내에 포함될 수 있다. 면역글로불린의 "콘센서스 골격"은 콘센서스 면역글로불린 서열 내의 골격 영역을 말한다.
항-독소 항체, 또는 이의 항원 결합 부위는 다른 기능성 분자 (예를 들어, 다른 펩티드 또는 단백질)에 결합되거나 유도체화될 수 있다. 예를 들어, 항체는 하나 이상의 다른 분자 실체, 예를 들어 다른 항체, 검출가능한 작용제 (agent), 세포 독성 작용제, 약학적 작용제, 및/또는 다른 분자와의 관련을 매개할 수 있는 단백질 또는 펩티드 (예를 들어 스트렙타비딘 코어 영역 또는 폴리히스티딘 태그)에 (화학적 커플링, 유전자 융합, 비공유 결합에 의한 관련 또는 다른 것에 의해) 기능적으로 결합될 수 있다.
유도된 단백질의 하나의 유형은 (동일한 유형 또는 상이한 유형의) 2종 이상의 단백질의 가교 결합에 의해 생성된다. 적합한 가교 결합제는 적절한 스페이서 (예를 들어, m-말레이미도벤조일-N-히드록시숙신이미드 에스테르)에 의해 분리되는 2개의 특유한 반응기를 갖는 헤테로2작용성 또는 호모2작용성 (예를 들어 디숙신이미딜 수베레이트)인 것을 포함한다. 그러한 결합제는 미국 일리노이주 록포드 소재의 Pierce Chemical Company로부터 입수가능하다.
단백질을 유도체화할 수 있는 (또는 표지할 수 있는) 유용한 검출가능한 작용제는 형광 화합물, 다양한 효소, 보결 분자단 (prosthetic group), 발광 물질, 생물 발광 물질 및 방사능 물질을 포함한다. 예시적인 형광성 검출가능성 작용제는 플루오레세인, 플루오레세인 이소티오시아네이트, 로다민 및 피코에리트린을 포함한다. 단백질 또는 항체도 검출가능한 효소, 예를 들어 알칼린 포스파타제, 서양 고추냉이 퍼옥시다제, β-갈락토시다제, 아세틸콜린에스테라제, 글루코스 옥시다제 등으로 유도체화할 수 있다. 단백질이 검출가능한 효소로 유도체화될 경우, 이는 효소가 이용하는 추가의 시약을 첨가하여 검출가능한 반응 생성물을 생성함으로써 검출된다. 예를 들어, 검출가능한 작용제인 서양 고추냉이 퍼옥시다제가 존재할 경우, 과산화수소 및 디아미노벤지딘의 첨가에 의해 착색된 반응 생성물이 생성되며, 이는 검출가능하다. 단백질은 보결 분자단 (예를 들어, 스트렙타비딘/비오틴 및 아비딘/비오틴)으로 유도체화될 수 있다. 예를 들어, 항체는 비오틴으로 유도체화되고, 아비딘 또는 스트렙타비딘 결합의 간접적 측정을 통하여 검출될 수 있다.
예를 들어 표지된 단백질 및 항체는 임상 시험 절차의 일부로서 조직에서의 단백질의 수준의 모니터링을 위하여, 예를 들어 주어진 치료 섭생법의 효능의 측정을 위하여 (i) 표준 기술, 예를 들어 친화성 크로마토그래피 또는 면역침전에 의한 소정 항원의 단리; 및 (ii) 소정 항원 (예를 들어 독소, 예를 들어 세포 용해물 또는 환자 샘플 중의 독소의 검출을 포함하는 다수의 정황에서 진단 및/또는 실험용으로 사용될 수 있다.
항-독소 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다른 분자 실체, 예를 들어 표지에 콘쥬게이션될 수 있다.
3. 스크리닝 방법
항-독소 항체는 다양한 공지 기술로 독소에 대한 결합에 대하여 특성화될 수 있다. 항체는 전형적으로 먼저 ELISA에 의해 특성화된다. 간략하게는, 마이크로타이터 플레이트를 PBS 중 독소 또는 유독소 항원으로 코팅하고, 이어서 PBS 중에 희석시킨 소 혈청 알부민 (BSA)과 같은 무관한 단백질로 차단할 수 있다. 독소-면역화 생쥐 유래의 혈장의 희석물을 각각의 웰에 첨가하고 37℃에서 1-2시간 동안 인큐베이션한다. 플레이트를 PBS/트윈 20으로 세척하고 이어서 알칼린 포스파타제에 콘쥬게이션된 염소-항-인간 IgG Fc-특이성 다중클론 시약과 함께 37℃에서 1시간 동안 인큐베이션한다. 세척 후, 플레이트를 ABTS 기질로 발색시키고, 405 nm의 OD에서 분석한다. 바람직하게는, 가장 높은 역치를 나타내는 생쥐를 융합에 사용한다.
상기에 기술되어 있는 ELISA 분석은 항체, 따라서 독소와 양성 반응성을 나타내는 항체를 생산하는 하이브리도마의 스크리닝에 사용될 수 있다. 이어서 독소에 결합하는, 바람직하게는 높은 친화도로 독소에 결합하는 항체를 생산하는 하이브리도마를 서브클로닝하고 추가로 특성화할 수 있다. 이어서 부모 세포의 반응성을 유지하는 각각의 하이브리도마 유래의 하나의 클론 (ELISA에 의해)을 세포 은행의 제조와 항체 정제를 위하여 선발할 수 있다.
항-독소 항체의 정제를 위하여, 선발된 하이브리도마를 롤러 병, 2리터 스피너 (spinner)-플라스크 또는 기타 배양 시스템에서 배양할 수 있다. 상청액은 여과 및 농축시킨 후 단백질 A-세파로스 (Pharmacia, 미국 뉴저지주 피스카타웨이 소재)를 이용한 친화성 크로마토그래피로 단백질을 정제할 수 있다. PBS로의 완충제 교환 후, 농도를 분광 광도 측정법으로 측정할 수 있다.
선발된 단일클론 항체가 특유한 에피토프에 결합하는지를 측정하기 위하여, 각각의 항체는 구매가능한 시약 (Pierce, 미국 일리노이주 록포드 소재)을 사용하여 비오티닐화할 수 있다. 비오티닐화 MAb 결합은 스트렙타비딘 표지 프로브로 검출할 수 있다. 항-독소 항체는 웨스턴 블로팅 (Western blotting)으로 독소와의 반응성에 대하여 추가로 시험될 수 있다.
항-독소 항체의 활성을 측정하는 다른 분석법은 중화 분석법을 포함한다. 시험관내 중화 분석으로 배양 중 세포에 대한 세포 병리학적 영향을 억제하는 항체의 능력을 측정할 수 있다 (하기 실시예 3 참조). 독소 중화를 측정하기 위한 생체내 분석법이 하기 실시예 5, 6 및 7에 기술되어 있다.
4. 약학 조성물 및 키트
다른 태양에 있어서, 본 발명은 조성물, 예를 들어 약학적으로 허용가능한 조성물을 제공하며, 이는 본원에 기술된 항체 분자 또는 이의 항원 결합 부위가 약학적으로 허용가능한 담체와 함께 제형화된 것을 함유한다.
"약학적으로 허용가능한 담체"는 생리학적으로 상용성인 임의의, 그리고 모든 용제, 분산 매질, 등장성의 흡수 지연제 등을 포함한다. 담체는 (예를 들어, 주사 또는 주입에 의한) 정맥내, 근육내, 피하, 비경구, 직장, 척추 또는 표피 투여에 적합할 수 있다.
본 발명의 조성물은 다양한 형태로 존재할 수 있다. 이는 예를 들어 액체, 반고체 및 고체 투여 형태, 예를 들어 액체 용액 (예를 들어, 주사가능하거나 주입가능한 용액), 분산액 또는 현탁액, 리포좀 및 좌약제를 포함한다. 바람직한 형태는 의도되는 투여 양식 및 치료 용도에 따라 달라진다. 유용한 조성물은 주사가능하거나 주입가능한 용액의 형태로 존재한다. 유용한 투여 경로는 비경구 투여 경로이다 (예를 들어, 정맥내, 피하, 복강내, 근육내). 예를 들어, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 정맥내 주입 또는 주사로 투여될 수 있다. 다른 실시 형태에 있어서, 본 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 근육내 또는 피하 주사로 투여된다.
본원에 사용되는 바와 같이, "비경구 투여" 및 "비경구 투여에 의해 투여되는"이라는 용어는 일반적으로 장 및 국소 투여 이외의, 주사에 의한 투여 양식을 의미하며, 한정됨이 없이, 정맥내, 근육내, 동맥내, 척수강내, 피막내, 안와내, 심장내, 피내, 복강내, 경기관, 피하, 각피하, 관절내, 피막하, 지주막하, 척수강내, 경막외, 및 흉골내 주사 및 주입을 포함한다.
치료용 조성물은 전형적으로 제조 및 보관 조건 하에서 안정하고 살균한 것이어야 한다. 조성물은 용액, 미세에멀젼, 분산액, 리포좀, 또는 높은 항체 농도에 적합한 기타 규정된 구조체로서 제형화될 수 있다. 주사가능한 살균 용액은 필요한 양의 활성 화합물 (즉, 항체 또는 항체 부분)을 상기에 열거되어 있는 성분들 중 하나 또는 그의 조합을 포함하는 적절한 용제 중에 혼입시키고, 이어서 필요할 경우 여과 살균함으로써 제조할 수 있다. 일반적으로, 분산액은 기본적인 분산 매질 및 상기에 열거된 것으로부터의 기타 성분을 포함하는 살균 비히클 내로 활성 화합물을 혼입함으로써 제조된다. 주사가능한 살균 용액 제조용의 살균 분말의 경우, 유용한 제조 방법은 이전에 살균 여과시킨 용액으로부터 활성 성분의 분말 + 임의의 추가의 원하는 성분을 생성하는 진공 건조 및 냉동 건조법이다. 용액의 적당한 유동도는 예를 들어 코팅, 예를 들어 레시틴의 사용에 의해, 분산액의 경우 필요한 입자 크기의 유지에 의해, 그리고 계면활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다. 주사가능한 조성물의 흡수 연장은 조성물 중에 흡수를 지연시키는 제제, 예를 들어 모노스테아레이트 염 및 젤라틴을 함유시킴으로써 초래될 수 있다.
본원에 기술되어 있는 항체 및 항체 부분은 당업계에 공지된 다양한 방법에 의해, 그리고 다수의 치료 용도로 투여될 수 있다. 숙련자라면 알 수 있듯이, 투여 경로 및/또는 양식은 원하는 결과에 따라 달라진다.
소정 실시 형태에 있어서, 항체 또는 그의 항체 부분은 예를 들어 불활성 담체 또는 동화성 (assimilable) 식용 담체와 함께 경구 투여될 수 있다. 화합물 (및 원할 경우 기타 성분)은 또한 경질 또는 연질 쉘 젤라틴 캡슐 내에 둘러싸이거나, 정제로 압착되거나, 대상체의 규정식 (diet) 내로 직접 혼입될 수 있다. 치료적 경구 투여에 있어서, 화합물은 부형제와 함께 혼입되며 복약가능한 정제, 협측용 정제, 트로키제, 캡슐, 엘릭시르, 현탁액, 시럽, 웨이퍼 (wafer) 등의 형태로 사용될 수 있다. 비경구 투여 이외의 방법으로 본 발명의 화합물을 투여하기 위하여, 본 화합물을 그의 불활성화를 방지하기 위한 물질로 코팅하거나 본 화합물을 상기 물질과 함께 공동 투여하는 것이 필요할 수 있다. 치료용 조성물은 당업계에 공지된 의료 장치를 이용하여 투여할 수 있다.
투여 섭생법은 최적의 원하는 응답 (예를 들어, 치료적 응답)을 제공하도록 조정된다. 예를 들어, 단일 볼루스를 투여하거나, 여러 나뉘어진 용량을 시간이 지남에 따라 투여할 수 있거나, 이 용량을 치료 상황의 위급성에 의해 나타내어지는 바와 같이 비례식으로 감소 또는 증가시킬 수 있다. 투여의 용이성 및 투여량의 균일성을 위하여 비경구용 조성물을 단위 투여 형태로 제형화하는 것이 특히 유리하다. 본원에 사용되는 바와 같이, 단위 투여 형태는 치료할 대상체를 위한 단일 투여량으로서 적합화된 물리적으로 별개인 단위를 말하며, 각각의 단위는 필요한 약학 담체와 연합되어 원하는 치료 효과를 생성하도록 계산된 소정량의 활성 화합물을 함유한다. 본 발명의 단위 투여 형태에 대한 명세 사항은 (a) 활성 화합물의 특유한 특징 및 성취할 특정 치료 효과와, (b) 개체에 있어서 민감성의 치료를 위한 그러한 활성 화합물의 혼합 기술에 내재적인 제한 사항에 직접적으로 의존하여 지시된다.
본 발명의 항체 또는 항체 부분의 치료적 또는 예방적 유효량의 예시적인 비제한적 범위는 0.1-60 mg/kg, 예를 들어, 0.5-25 mg/kg, 1-2 mg/kg 또는 0.75-10 mg/kg이다. 임의의 특정 대상에 있어서, 구체적인 투여량 섭생법은 개체의 필요성 및 조성물을 투여하거나 조성물의 투여를 감독하는 사람의 전문적인 판단에 따라 시간이 지남에 따라 조정되어야 하며, 본원에 나타내어진 상기 투여량 범위는 단지 예시적인 것으로서 청구된 조성물의 범주 또는 그 실행을 한정하려는 것이 아니다.
또한 본 발명의 범주 이내인 것은 항-독소 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 키트이다. 본 키트는 사용 설명서; 기타 시약, 예를 들어 표지, 치료제, 또는 킬레이팅 또는 그렇지 않을 경우 커플링에 유용한 제제, 표지 또는 치료제에의 항체, 또는 투여용 항체의 제조를 위한 기타 물질; 약학적으로 허용가능한 담체; 및 대상에게 투여하기 위한 장치 또는 기타 물질을 포함하는 하나 이상의 다른 요소를 포함할 수 있다.
항체의 다양한 조합물이 함께 포장될 수 있다. 예를 들어, 키트는 독소 A에 결합하는 항체 (예를 들어, 3D8의 중쇄 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체) 및 독소 B에 결합하는 항체 (예를 들어, 인간 단일클론 항-독소 B, 예를 들어 124-152, 2A11, 및/또는 1G10, 또는 독소 B와 반응성인 다중클론 항혈청)를 포함할 수 있다. 본 항체는 함께 혼합되거나, 키트 내에 개별적으로 포장될 수 있다.
사용 설명서는 예를 들어 CDAD 증상을 갖는 환자에 있어서 투여량 및/또는 투여 양식 제안을 포함하는 치료 용도에 대한 지시를 포함할 수 있다. 다른 지시는 킬레이트제, 표지 또는 치료제에의 항체의 커플링에 대한 지시, 또는 예를 들어 미반응 콘쥬게이션 성분으로부터의 콘쥬게이션된 항체의 정제에 대한 지시를 포함할 수 있다.
본 키트는 검출가능한 표지, 치료제, 및/또는 킬레이팅 또는 그렇지 않을 경우 표지 또는 치료제의 항체에의 커플링에 유용한 시약을 포함할 수 있다. 커플링제는 N-히드록시숙신이미드 (NHS)와 같은 제제를 포함한다. 그러한 경우, 본 키트는 출발 재료 또는 반응 중간체로부터 최종 생성물을 분리하는 데에 사용하기 위한 분리 장치, 예를 들어 크로마토그래피 컬럼 또는 반응을 실시하기 위한 반응 용기 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 키트는 하나 이상의 추가의 시약, 예를 들어 진단제 또는 치료제, 예를 들어 본원에 기술되어 있는 진단제 또는 치료제, 및/또는 하나 이상의 별개의 약학 제제 내에 적절하게 제형화된 하나 이상의 추가의 항-독소 또는 항-씨. 디피실리 항체 (또는 그의 부분)을 추가로 포함할 수 있다.
다른 키트는 항-독소 항체를 코딩하는 최적화 핵산 및 이 핵산의 발현에 대한 지시를 포함할 수 있다.
5. 치료 방법 및 치료용 조성물
새로운 단백질 및 항체는 시험관내 및 생체내에서 치료, 예방 및 진단 상의 유용성을 갖는다. 예를 들어, 이러한 항체는 예를 들어 시험관내 또는 엑스 비보에서 배양 중인 세포에, 또는 예를 들어 생체내에서 대상에게 투여되어 씨. 디피실리 및 씨. 디피실리와 관련된 질환을 치료, 억제, 재발 방지, 및/또는 진단할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, "대상체"라는 용어는 인간 및 인간외 동물을 포함하려는 것이다. "인간외 동물"이라는 용어는 모든 척추 동물, 예를 들어 포유동물 및 포유동물 외의 척추 동물, 예를 들어 포유동물외 영장류, 닭, 생쥐, 개, 고양이, 돼지, 소 및 말을 포함한다.
본 단백질 및 항체는 예를 들어 시험관내 또는 엑스 비보에서 배양 중인 세포 상에 사용될 수 있다. 예를 들어, 세포는 배양 배지에서 시험관내에서 배양될 수 있으며, 접촉 단계는 항-독소 항체 또는 이의 단편을 배양 배지에 첨가함으로써 행할 수 있다. 이 방법은 생체내 (예를 들어 치료 또는 예방) 프로토콜의 일부로서 대상체에 존재하는 비리온 또는 세포 상에서 수행될 수 있다. 생체내 실시 형태에 있어서, 접촉 단계는 대상체에서 행해지며 대상체에서, 예를 들어 장에서 박테리아에 의해 발현되는 임의의 독소에의 항체 또는 부분의 결합을 허용하기에 효과적인 조건 하에서 대상체에게 항-독소 항체 또는 그의 부분을 투여하는 것을 포함한다.
항체 분자의 투여 방법이 본원에 기술되어 있다. 사용되는 분자의 적합한 투여량은 대상체의 연령 및 체중과 사용되는 특정 약물에 따라 달라진다. 항체 분자는 리간드 결합에 대한 경쟁제로서 사용되어 바람직하지 못한 상호작용을 억제 또는 감소시킬 수 있는데, 예를 들어 위장 상피에의 독소의 결합을 억제시킬 수 있다.
본 항-독소 항체 (또는 이의 항원 결합 부위는 다른 항-씨. 디피실리 항체 (예를 들어, 다른 단일클론 항체, 다중클론 감마-글로불린)과 조합되어 투여될 수 있다. 사용될 수 있는 항체의 조합물은 항-독소 A 항체 또는 이의 항원 결합 부위와 항-독소 B 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함한다. 항-독소 A 항체는 3D8, 3D8의 가변 영역을 포함하는 항체, 또는 3D8의 가변 영역에 대하여 적어도 90% 동일한 가변 영역을 포함하는 항체일 수 있다. 항-독소 B 항체는 124-152, 2A11, 1G10, 또는 전술한 항체, 예를 들어 124-152의 가변 영역에 대하여 적어도 90% 동일한 가변 영역을 갖는 항체일 수 있다. 항-독소 A (3D8)과 항-독소 B (예를 들어, 124-152)의 조합물은 CDAD의 강력한 억제를 제공할 수 있다.
본 발명의 임의의 약제, 예를 들어 항-독소 A 또는 항-독소 B 항체, 또는 이의 단편은 치료 효과 개선을 위하여 예를 들어 상이한 비 또는 양으로 조합될 수 있다. 실제, 본 발명의 약제는 당업계에 인지되는 기술을 사용하여 혼합물로서 제형화되거나, 화학적 또는 유전학적으로 결합되고, 그럼으로써 공유 결합에 의해 결합된 항체 (또는 공유 결합에 의해 결합된 항체 단편)을 생성할 수 있는데, 이는 항-독소 A 및 항-독소 B 결합 특성 둘 모두를 갖는다. 조합된 제형은 친화도, 친화성, 또는 단독이거나 다른 약제와 조합된 약제의 생물학적 효능과 같은 하나 이상의 파라미터의 결정에 의해 안내될 수 있다. 또한 본 발명의 약제는 씨. 디피실리 또는 그 항원의 표적화, 제거 및/또는 봉쇄에 있어서 치료제의 접근, 반감기 또는 안정성을 증강시키는 다른 약제와 조합되어 투여될 수 있다.
그러한 병용 치료법은 예를 들어 씨. 디피실리-관련 질환 또는 장애의 억제, 예방 (예를 들어, 재발의 방지), 및/또는 치료에 있어서 그의 치료 활성이 누가적이며 심지어 상승 작용성을 갖는 것이 바람직하다 (예를 들어, 단일 및 조합 항체 치료법의 효능을 보여주는 실시예 16 참조). 그러한 병용 치료법의 시행은 원하는 효과의 성취에 필요한 치료제 (예를 들어, 항체 또는 항체 단편 혼합물, 또는 가겨 결합되거나 유전자 융합된 2특이성 항체 또는 항체 단편)의 투여량을 감소시킬 수 있다.
면역학적 유효량의 독소 또는 이의 단편을 함유하는 면역원성 조성물이 본원에 기술되어 있으며 이 조성물은 항-독소 항체의 생성에 사용될 수 있다. 독소 서열 중의 면역원성 에피토프는 당업계에 공지된 방법에 따라 동정될 수 있으며, 이 에피토프를 포함하는 단백질 또는 단편은 다양한 수단으로 백신 조성물 형태로 전달될 수 있다. 적합한 조성물은 예를 들어 리포펩티드 (lipopeptide) (예를 들어, 문헌[Vitiello et al., J. Clin. Invest. 95: 341 (1995)]), 폴리(DL-락티드-코-글리콜리드) ("PLG") 미소구체 중에 캡슐화된 펩티드 조성물 (예를 들어, 문헌[Eldridge et al., Molec. Immunol. 28: 287-94 (1991)]; 문헌[Alonso et al., Vaccine 12: 299-306 (1994)]; 문헌[Jones et al., Vaccine 13: 675-81 (1995)] 참조), 면역 자극 복합체 (immune stimulating complexs, ISCOMS)에 포함된 펩티드 조성물 (예를 들어, 문헌[Takahashi et al., Nature 344: 873-75 (1990)]; 문헌[Hu et al., Clin. Exp. Immunol. 113: 235-43 (1998)] 참조); 및 다중 항원 펩티드 시스템 (multiple antigen peptide systems, MAPs) (예를 들어, 문헌[Tam, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 5409-13 (1988)]; 문헌[Tam, J. Immunol. Methods 196: 17-32 (1996)] 참조)을 포함한다.
본 발명의 면역원성 조성물에 사용될 수 있는 유용한 담체는 잘 알려져 있으며, 예를 들어 갑상선 글로불린, 알부민, 예를 들어 인간 혈청 알부민, 파상풍 유독소, 폴리아미노산, 예를 들어 폴리 L-리신, 폴리 L-글루탐산, 인플루엔자, B형 간염 바이러스 코어 단백질 등을 포함한다. 본 조성물은 생리학적으로 견딜 수 있는 (즉, 허용가능한) 희석제, 예를 들어 물, 또는 염수, 전형적으로는 인산염 완충 염수를 함유할 수 있다. 본 조성물 및 백신은 전형적으로 아쥬반트도 함유한다. 아쥬반트, 예를 들어 불완전 프로인트 아쥬반트, 인산알루미늄, 수산화알루미늄 또는 명반이 당업계에 잘 알려진 물질의 예이다. 추가로, CTL 응답은 지질에 콘쥬게이션된 독소 (또는 이의 단편, 불활성 유도체 또는 유사체), 예를 들어 트리팔미토일-S-글리세릴시스테인일-세릴-세린 (P3CSS)에 의해 프라이밍될 수 있다.
본 항-독소 항체는 CDAD를 치료하기 위한 조성물과 같이, 다른 약제와 조합되어 투여될 수 있다. 예를 들어, 항-독소 항체와 조합되어 투여될 수 있는 치료제는 CDAD의 치료에 사용되는 항생제, 예를 들어 반코마이신, 메트로니다졸 또는 바시트라신을 포함한다. 항체는 프로바이오닉제, 예를 들어 사카로마이세스 불라르디이와 조합되어 사용될 수 있다. 또한 본 항체는 씨. 디피실리 백신, 예를 들어 유독소 백신과 조합되어 투여될 수 있다.
6. 기타 방법
항-독소 항체 (예를 들어, 단일클론 항체)는 표준 기술, 예를 들어 친화성 크로마토그래피 또는 면역침전법에 의해 독소를 단리하기 위하여 사용될 수 있다. 또한, 항-독소 항체를 사용하여 (예를 들어 대변 샘플 중의) 독소를 검출할 수 있는데, 예를 들어 씨. 디피실리의 존재에 대하여 샘플을 스크리닝할 수 있다. 항-독소를 사용하여 임상 시험 절차의 일부로서 조직에서의 독소의 수준을 진단용으로 모니터링할 수 있는데, 예를 들어 주어진 치료 섭생법의 효능을 측정할 수 있다.
실례
달리 언급되지 않는 한, 실시예 전반에 걸쳐 하기의 재료 및 방법을 사용하였다.
재료 및 방법
일반적으로, 본 발명의 실행에서는 달리 나타내지 않는 한 화학, 분자 생물학의 통상적인 기술, 재조합 DNA 기술, 면역학 기술 (특히, 예를 들어 항체 기술), 및 폴리펩티드 제조에 있어서의 표준 기술이 이용된다. 예를 들어, 문헌[Sambrook, Fritsch and Maniatis, Molecular Cloning: Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)]; 문헌[Antibody Engineering Protocols (Methods in Molecular Biology), 510, Paul, S., Humana Pr (1996)]; 문헌[Antibody Engineering: A Practical Approach (Practical Approach Series, 169), McCafferty, Ed., Irl Pr (1996)]; 문헌[Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow et al., C.S.H.L. Press, Pub. (1999)]; 및 문헌[Current Protocols in Molecular Biology, eds. Ausubel et al., John Wiley & Sons (1992)]를 참조한다.
[실시예]
본 발명을 하기 실시예에서 추가로 설명하는데, 실시예는 청구의 범위에 기술되어 있는 본 발명의 범주를 한정하지 않는다.
실시예 1. 항-독소 A 단일클론 항체의 생성
씨. 디피실리 독소 A를 Techlab, Inc. (Blacksburg, Va)로부터 획득하거나 재조합 생성법에 의해 수득하였다. 독소는 정제 및 불활성화시킨 후 면역화하였다. 불활성화는 반응성 UDP-디알데히드를 이용한 처리로 수행하였는데, 상기 처리에 의해 촉매 잔기는 알킬화되는 반면, 천연 독소 구조는 보존된다.상세한 프로토콜에 대해서는, 문헌[Genth et al, Inf and Immun. 68(3): 1094-1101, 2000]을 참조한다. 간략하게는, 정제된 독소 A를 완충제 중 UDP-2',3'-디알데히드 (0.1-1.0 mM)와 함께 37℃에서 18시간 동안 인큐베이션하고, 100 kDa-컷오프 (cutoff) 필터를 통하여 여과시켜 미반응 UDP-2',3'-디알데히드를 제거하고, 완충제로 세척하였다. 불활성화 독소 A (유독소 A)를 면역화에 사용하였다.
"HuMAb 생쥐에서의 인간 단일클론 항체의 생성"이라는 표제 하의 절에서 상기한 바와 생성한, 그리고 미국 캘리포니아주 밀피타스 소재의 Medarex에 의해 공급되는 HCo7 트랜스제닉 생쥐를 각각 RIBI 아쥬반트 중 10 ㎍의 유독소로 6-12회 복강내 면역화하였다. HCo7 트랜스제닉 생쥐에 있어서, 내인성 생쥐 카파 경쇄 유전자는 문헌[Chen et al. (1993) EMBO J. 12: 811-820]에 기술되어 있는 바와 같이 동형 접합에 의해 붕괴시키고 내인성 생쥐 중쇄 유전자는 국제 공보 제WO 01/09187호의 실시예 1에 개시되어 있는 바와 같이 동형 접합에 의해 붕괴시켰다. HCo7 트랜스제닉 생쥐는 문헌[Fishwild et al. (1996) Nature Biotechnology 14: 845-851]에 기술되어 있는 인간 카파 경쇄 트랜스진, KCo5와, 미국 특허 제5,545,806호; 동 제5,625,825호; 및 동 제5,545,807호에 개시되어 있는 HCo7 인간 중쇄 트랜스진을 지닌다. 혈청을 각각의 생쥐로부터 수집하고 ELISA에 의해 독소 A에의 반응성에 대하여 시험하고 IMR-90 세포 상에서의 세포 독성의 중화에 대하여 시험하였다. 독소 A-반응성 및 중화 항혈청에 있어서 양성으로 시험된 생쥐에 꼬리 정맥을 통하여 5-10 ㎍의 유독소 A를 주사하였다. 꼬리 정맥 주사를 수행한지 대략 3일 후에 생쥐를 희생시키고 비장을 하이브리도마에의 융합을 위하여 단리하였다.
하이브리도마 클론을 생성하고 ELISA로 스크리닝하였다. 카파/감마 경쇄 양성, 항원 특이성, 및 4종의 개별적인 하이브리도마 융합체로부터 생성되는 클론의 스크리닝에 의해 확인한 중화 클론의 백분율이 표 5에 열거되어 있다.
융합체 카파/감마 양성 % 항원 특이성 % 중화 %
1 5.7 (94/1632) 3.4 (56/1632) 0.7 (12/1632)
2 0.2 (1/384) 0 (0/384) 0 (0/384)
3 1.8 (14/768) 0.39 (3/768)
4 4.4 (43/960) 1.7 (17/960)
하기의 3개의 하이브리도마 클론을 추가의 분석을 위하여 선발하였다: 3D8, 1B11 및 33.3H2. 각각의 클론 유래의 cDNA를 mRNA로부터의 RT-PCR로 증폭시키고, 클로닝하고, 서열 결정하였다. 하나의 중쇄 V 영역 콘센서스 서열이 각각의 클론에 있어서 발견되었다. 모든 3개의 클론에서는 동일한 생식 세포 V 영역 유전자 (VH 3-33)로부터 유래되는 VH 영역이 이용되지만, 상이한 J 서열이 이용되었다. 각각의 클론으로부터의 이 VH 및 VL 영역의 아미노산 서열이 도 1에 도시되어 있다 (서열 번호 1-6). 상보성 결정 영역 (CDR)은 이 도면에서 위에 줄이 그어져 있다.
카파 V (Vκ 경쇄) 유전자의 서열 분석에 의하면 HuMAb 1B11 및 33.3H2 각각은 하나의 콘센서스 카파쇄 V 서열을 발현하는 것으로 나타났다. 1B11 하이브리도마는 Vκ L6 생식 세포 유전자로부터 유래되는 Vκ 경쇄를 발현하며, 반면, 33.3H2 하이브리도마는 Vκ L15 생식 세포 유전자로부터 유래되는 Vκ 경쇄를 발현한다. HuMAb 3D8 유래의 Vκ 클론의 분석시, 6개 (I-VI)의 경쇄가 mRAN 수준에서 발현되었다 (도 1). 이 경쇄들 중 어느 것이 단백질 수준에서 발현되는지를 결정하기 위하여, 정제된 3D8의 N-말단 서열 결정 및 질량 분광법을 수행하였다. 경쇄를 세포 단백질로부터 단리하고 질량 분광법으로 분석할 경우, 23,569 달톤의 질량을 갖는 단일 경쇄가 확인되었다. 이는 도 1에 도시되어 있는 I군 아미노산 서열을 갖는 경쇄에 상응하는데, 이는 Vκ L19 생식 세포 유전자로부터 유래된다. 경쇄의 N-말단 서열 결정에 의해 이 결과를 확인하였다. 도 2A, 3A 및 4A에는 각각 3D8 (I군; 서열 번호 4, 및 30-34), 1B11 (서열 번호 5) 및 33.3H2 (서열 번호 6)의 Vκ의 뉴클레오티드 및 아미노산 서열이 각각 도시되어 있다. CDR은 위에 줄이 그어져 있으며 생식 세포의 Vκ 및 Jκ가 예시되어 있다.
따라서, 3D8 항체는 인간 VH 3-33 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역 및 인간 Vκ L19 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다. 1B11 항체는 인간 VH 3-33 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역 및 인간 Vκ L6 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다. 33.3H2 항체는 인간 VH 3-33 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 중쇄 가변 영역 및 인간 Vκ L15 유전자의 산물이거나 이 유전자로부터 유래되는 경쇄 가변 영역을 포함한다.
항체 3D8 및 1B11은 인간 IgG1 불변 영역을 발현하며, 항체 33.3H2는 인간 IgG3 불변 영역을 발현한다. 실시예 2-7에 기술되어 있는 항체는 이러한 하이브리도마로부터 단리되며, 따라서 인간 불변 영역 이외에 도 1에 예시된 가변 서열을 발현한다. 각각의 클론의 항원 결합 부위를 코딩하는 DNA를 인간에게 투여하기 위한 인간 항체로서 발현시킬 벡터 내로 클로닝하였다.
실시예 2. 항-독소 A 항체의 결합 활성
독소 A에의 각각의 항체의 결합을 표준 기술을 사용하여 ELISA로 측정하였다. 이 분석 결과가 도 5에 도시되어 있다. 3D8, 1B11 및 33.3H2에 의해 생산되는 항체를 독소 A 결합 활성을 갖는 제4 인간 단일클론 항체, 8E6과 비교하였다. 도 5에는 이 항체들이 독소 A에 비견할만한 친화도로 결합한다는 것이 도시되어 있다.
독소 A에 대한 3D8 및 1B11의 친화도는 Biacore(등록상표) 기기를 이용해서도 측정하였는데, 상기 기기는 표면 플라스몬 공명 기술을 이용하여 생체 분자 결합 상호 작용을 검출한다. 각각의 항체를 단백질-A 코팅된 센서 칩에 첨가하고, 독소 A를 칩 위에 유동하게 하여 결합력을 측정하였다. 3D8의 KD는 14.6 x 10-10 M이었다. 1B11의 KD는 7.38 x 10-10 M이었다. 따라서, 항체는 독소 A에 높은 친화도로 결합한다. 이러한 결합 상수는 본 항체가 인간 치료에서 사용하기에 적합한 친화도를 갖는다는 것을 나타낸다.
실시예 3. 항-독소 A 항체에 의한 독소 중화
1B11, 3D8 및 33.3H2 하이브리도마에 의해 발현되는 항체를 시험관내에서 독소 A 중화 활성에 대하여 시험하였다. 세포를 다양한 농도의 독소 A의 존재 하에 인큐베이션하였는데, 이는 세포가 둥글게 되게 하고 세포 배양용 접시에의 유착성을 상실하게 한다. 세포 병리학적 효과 (cytopathic effect, CPE)를 세포의 시각적 점검으로 결정하였다. 0-4의 CPE 스코어를 시각적 검사 결과에 기초하여 결정하였다 (4=100%의 세포 독성, 0=0%의 독성). 이러한 분석 결과가 도 6A 및 6B에 도시되어 있다. 인간 폐 섬유모세포주, IMR-90 및 인간 장 상피 세포주, T-84에 대한 독성 중화를 측정하였다. 도 6A는 모든 항체가 IMR-90 세포에 대하여 중화 능력을 갖는다는 것을 보여주고 있다. IMR-90 세포 상에서의 독소 A의 세포 독성의 상대적인 중화 활성은 1B11 > 3H2 > 3D8이었다. 흥미롭게도, 상대적인 중화 활성은 T-84 세포에 대하여 3D8≥ 1B11 > 3H2이었는데, T-84 세포는 인간 결장 상피 세포이다 (도 6A). T-84 세포는 다른 세포 유형보다 독소 A에 더 민감한 것으로 생각된다. T-84 세포는 독소 A의 세포 독성의 측정을 위한 보다 관련된 표적 세포를 제공할 수 있다.
실시예 4. 항-독소 A 항체의 에피토프 지도화
각각의 단일클론 항체가 결합하는 독소 A의 에피토프를 웨스턴 블로팅으로 결정하였다. 효소 도메인 (즉, 독소 A의 아미노산 1-659), 수용체 결합 도메인 (즉, 독소 A의 아미노산 1853-2710) 및 그 사이의 2개의 영역 (즉, 독소 A의 아미노산 660-1255 및 1256-1852)을 나타내는 독소 A의 4개의 단편을 발현하는 재조합 이. 콜라이 클론을 제작하였다. 독소 A 유전자의 적절한 절편을 씨. 디피실리 주 ATCC 43255로부터 제조한 게놈 DNA로부터 PCR-증폭시켰다. 단편을 pET 벡터를 사용하여 클로닝하고 발현을 위하여 이것으로 BL21 DE3 세포를 형질전환시켰다. 벡터는 유도성 발현 및 정제 (즉, His-태그)와 검출 (즉, V5 에피토프 태그)를 위한 친화성 도메인을 제공한다. 발현은 IPTG로 유도하였으며 단편을 친화성 크로마토그래피로 정제하였다. 하기의 독소 A의 4개의 상이한 단편에의 결합을 측정하였다: 아미노산 1-659에 상응하는 단편 1; 아미노산 660-1255에 상응하는 단편 2; 아미노산 1256-1852에 상응하는 단편 3; 및 아미노산 1853-2710에 상응하는 단편 4 (도 7). 1B11은 단편 1 및 2와 반응하였다. 33.3H2는 단편 2와 반응하였다. 3D8 및 다른 인간 단일클론 항체 6B4는 단편 4 (수용체 결합 도메인)와 반응하였다. 유독소 A로 면역화한 토끼 유래의 다중클론 항혈청은 모든 4개의 단편과 반응하였다.
1B11 및 33.3H2 에피토프를 추가로 상세하게 지도화하였다. 1B11의 에피토프의 지도화를 위하여, 아미노산 1-540, 1-415, 1-290 및 1-165에 상응하는 단편 1 (아미노산 1-659)의 서브단편을 생성하였다 (도 8A). 1B11은 단편 1과 아미노산 1-540을 포함하는 단편에 결합하였다. 1B11은 다른 서브단편에 결합하지 않았다. 따라서, 1B11이 결합하는 에피토프는 독소 A의 아미노산 415-540 사이에 지도화된다.
33.3H2 에피토프의 지도화를 위하여, 아미노산 660-1146, 660-1033, 660-920 및 660-807에 상응하는 단편 2 (아미노산 660-1255)의 서브단편을 생성하였다 (도 8B). 33.3H2는 아미노산 660-1255, 660-1146 및 660-1033에 결합하였다. 33.3H2는 다른 서브단편에 결합하지 않았다. 따라서, 33.3H2가 결합하는 에피토프는 독소 A의 아미노산 902-1033 사이에 지도화된다.
실시예 5. 항-독소 A 항체의 투여에 의한 독소 A의 치사량 공격으로부터의 생쥐의 보호
치사량의 독소 A를 이용한 공격으로부터 생쥐를 보호하는 능력에 대하여 각각의 항체를 시험하였다. 독소 A를 이용한 공격 이전에 중량이 각각 10-20그램인 Swiss Webster 암컷 생쥐에 최대 250 ㎍의 3D8, 1B11 또는 33.3H2, 또는 대조 항체 (항-RSV (respiratory syncytial virus) 항체, MedImmune)를 복강내 주사하였다. 주사한지 대략 24시간 후, 치사량 (LD50)의 10배보다 큰 용량, 전형적으로 100 ng의 독소 A로 생쥐를 공격하였다. 동물은 다음 7일 동안 독성 징후에 대하여 관찰하였다. 이 실험 결과가 도 9에 요약되어 있다. 데이터는 생존률로 표현된다. 250 ㎍ 이외의 용량이 주어질 경우, 괄호 안의 숫자가 항체의 용량을 나타낸다. 도 9는 항체 각각이 독소 A의 치사량 공격으로부터 생쥐를 어느 정도 보호할 수 있음을 보여준다. 3D8로 처리할 경우 생쥐의 생존률은 10-100% 범위였다. 33.3H2로 처리할 경우 생쥐의 생존률은 20-100% 범위였다. 1B11로 처리할 경우 생쥐의 생존률은 0-60%였다. 생쥐를 보호하는 이 단일클론의 상대적인 능력은 3H2≥3D8>1B11이었다.
실시예 6. 항-독소 A 항체를 이용한 결찰 생쥐 장 루프에서의 독소 A의 장 독성의 중화
생쥐 회장 루프 모델에서의 독소 A의 장독성의 중화에 대하여 3D8 및 33.3H2 항체를 시험하였다. 이 모델은 생쥐 장에서의 독소 A-유도 유체의 축적을 측정한다. 이 실험의 수행을 위하여, 각각의 생쥐를 16시간 동안 단식시키고, 마취하고, 맹장 다음의 회장을 노출시켰다. 3 내지 5센티미터의 루프를 각각의 말단에서 이중 결찰시키고 10 ㎍의 독소 A를 주사하였다. 회장 루프를 복강으로 되돌려놓고, 창상을 봉합하고, 동물을 회복시켰다. 수술한지 4시간 후, 동물을 안락사시키고 루프를 동물로부터 제거하였다. 각각의 절편의 길이를 재측정하고 관내액을 추출하였다. 이 유체의 부피 및 센티미터 당 밀리리터 단위의 부피 대 길이 (V:L)의 비를 각각의 루프에 대하여 계산하였다. 시험 생쥐에 수술 1-2일 전에 항체를 비경구 투여에 의해 주사하였다. 이 실험 결과가 도 10에 도시되어 있다. 독소 A의 주사는 장액의 중량 대 길이의 비를 50% 증가시켰다. 3D8 및 33.3H2 둘 모두 유체 축적에 있어서의 이 증가를 방지하였다. 둘 중 어느 하나의 항체를 투여한 생쥐의 중량 대 길이의 비는 독소 A 주사를 전혀 받지 않은 생쥐에 비견할 만하였다. 따라서, 3D8 및 33.3H2는 생체내에서 장액이 축적되지 못하게 한다.
이 결과는 항-독소 A 단일클론 항체가 생체내에서의 독소-A 매개 장독성이 일어나지 않게 한다는 것을 나타낸다. 생쥐 결찰 루프 데이터는 이 단일클론 항체가 전신 투여될 경우 점막 손상이 일어나지 않게 할 수 있음을 보여준다.
실시예 7. 항-독소 A 항체를 이용한 씨. 디피실리 재발로부터의 햄스터의 보호
3D8을 햄스터 재발 모델에서 시험하였다. 햄스터는 씨. 디피실리 독소의 독성 효과에 민감하며, 전형적으로 씨. 디피실리의 존재 하에 단일 용량의 클린다마이신을 수여받은지 2-3일 이내에 사망한다. 햄스터에서의 3D8의 효능을 시험하기 위하여, 재발 모델을 사용하였다. 이 모델에서, 햄스터에게는 1회 용량의 클린다마이신 및 1일 후 1회 용량의 씨. 디피실리 B1 포자를 주었다. 하나의 대조 햄스터 세트는 추가의 항생제 또는 항체를 전혀 수여하지 않았다. 제2 대조 햄스터 세트는 10 mg/kg/일의 반코마이신으로 처리하였다. 반코마이신은 씨. 디피실리 질환의 치료에 사용되는 항생제이다. 도 11A에 도시되어 있는 바와 같이, 햄스터 시험 세트에게는 도면에서 화살표로 나타낸 바와 같이 10 mg/kg/일의 반코마이신과, 씨. 디피실리 노출 후 7일 동안 매일 독소 A에 대하여 증대시킨 2 mg/kg/일의 토끼 다중클론 항혈청을 수여하였다. 제2 햄스터 시험 세트에게는 동일한 시간 간격으로 10 mg/kg/일의 반코마이신 및 50 mg/kg/일의 3D8을 수여하였다. 햄스터 생존률을 시간에 대하여 도시하였는데, 이는 도 11B에 도시되어 있다.
도 11B는 클린다마이신 및 씨. 디피실리 (◆)만을 수여받은 햄스터 모두가 박테리아를 이용한 공격 2일 이내에 사망하였다는 것을 보여준다. 반코마이신으로 처리한 햄스터 (■) 중 12% (2/17)가 박테리아를 이용한 공격에서 살아남았으며; 88% (15/17)는 8일 이내에 사망하였다. 반코마이신 및 3D8로 처리한 햄스터 (X) 중 41% (7/17)는 공격에서 살아남았으며, 59% (10/17)는 7일 이내에 사망하였다. 반코마이신 및 다중클론 토끼 혈청으로 처리한 햄스터 (▲) 중 64% (7/11)는 박테리아를 이용한 공격에서 살아남았으며, 36% (4/11)는 9일 이내에 사망하였다. 이 데이터는 각각의 처리 군에서의 총 생존자의 백분율로서 도 12에 또한 도시되어 있다. 이 도면에 도시되어 있는 바와 같이, 반코마이신 및 다중클론 토끼 혈청을 수여받은 군에서의 생존자의 백분율이 가장 높았다 (64%). 3D8 및 반코마이신을 수여받은 군의 생존률이 두번째로 가장 높았다 (41%). 반코마이신 처리 햄스터 중 단지 12%가 생존하였다. 처리를 전혀 하지 않은 것은 모두 사망하였다. 이러한 데이터는 다중클론 및 단일클론 항-독소 항체가 감염 후 투여할 경우 생체 내에서 씨. 디피실리 질환의 재발이 일어나지 않게 한다는 것을 보여준다.
실시예 8. 인간에서 투여하기 위한 항-독소 A 항체의 생성
3D8의 가변성 중쇄 및 경쇄를 코딩하는 핵산 서열을 표준 재조합 DNA 방법을 사용하여 pIE-U감마1F 벡터 내로 클로닝하였다. 이 벡터를 이. 콜라이에서 증폭시키고, 정제하고, CHO-dg44 세포 내로 트랜스펙션시켰다. 트랜스펙션된 세포를 96웰 접시에 웰 당 4 x 105개의 세포로 도말하고 G418을 이용하여 벡터 트랜스펙션에 대하여 선발하였다. 1D3으로 명명된 하나의 클론은 원래 G418 내성에 의해 선발하고, 이어서 IgG의 생산에 대하여 다른 트랜스펙토마와 함께 분석하였다. 1D3의 IgG의 생산 수준은 여러 라운드의 확장 동안 다른 트랜스펙션체에 비하여 더 높았다. 3D8 항체의 발현은 농도가 증가하는 메토트렉세이트의 존재 하에서의 배양으로 증폭시켰다. 175 nm의 메토트렉세이트에서 성장할 수 있는 배양물을 추가의 발달을 위한 단일 세포의 클로닝을 위하여 선택하였다. 이 배양물을 96웰 플레이트에 낮은 밀도로 도말하여 단일 세포 또는 클론으로부터 생기는 배양물이 생성되게 하였다. 이 배양물을 인간 IgG의 생산에 대하여 스크리닝하고, 가장 높은 수준의 IgG를 생산하는 세포를 추가의 사용을 위하여 선발하였다. 메토트렉세이트 증폭 클론을 확장시켜 다수의 냉동 세포 바이알을 포함하는 세포 은행을 생성하였다.
트랜스펙션된 세포로부터 항체를 제조하기 위하여, 이전 단계에서 단리한 클론 유래의 세포를 생물 반응기용 접종체로서 배양 및 확장시킨다. 전형적으로 생물 반응기에는 500리터 부피의 배양 배지가 들어간다. 세포는 세포 생육력이 강하될 때까지 생물 반응기에서 배양하는데, 이는 최대 항체 농도가 배양물에서 생성되었음을 나타낸다. 세포를 여과로 제거한다. 여과액을 단백질 A 컬럼에 적용한다. 항체는 이 컬럼에 결합하며, 이를 낮은 pH의 세척으로 용출시킨다. 다음, 항체를 Q-세파로스 컬럼에 적용하여 잔류 오염물질, 예를 들어 CHO 세포 단백질, DNA 및 기타 오염물질 (예를 들어, 존재할 경우 바이러스 오염물질)을 제거한다. 항체를 Q-세파로스 컬럼으로부터 용출시키고, 나노 여과시키고, 농축시키고, 완충제, 예를 들어 PBS에서 세척한다. 이어서 이 제제를 투여를 위하여 바이알 내로 무균 분취한다.
실시예 9. 다중클론 항-독소 B 항체의 제조 및 특성화
2마리의 Nubian 염소 (#330 및 #331)에 50 ㎍의 UDP 디알데히드-불활성화 독소 B (Techlab) 및 완전 프로인트 아쥬반트를 근육내 주사하였다. 25 ㎍의 추가 접종량의 유독소 B를 프로인트 불완전 아쥬반트와 함께 2주 간격으로 근육내로 주었다. 시험 혈액을 4회의 면역화 후 수득하였다. ELISA 반응성과 독소 A 및 독소 B 둘 모두에 대한 세포 독성의 중화를 평가하여 혈청의 특이성 및 교차 반응성을 측정하였다.
ELISA에 의해 측정되는 바와 같이 동물 2마리 모두는 독소 B에 잘 응답하였으며 독소 A에는 보다 덜한 정도로 응답하였다. 염소 #331 유래의 혈청은 독소 A 교차 반응성이 덜하였으며 대부분의 후속 실험을 위하여 선택되었다. IMR-90 세포에 대한 세포 독성의 중화를 실시예 3에 기술되어 있는 바와 같이 측정하였다. 세포 독성 중화 결과가 도 13에 도시되어 있는데, 도 13은 2마리 모두의 동물 유래의 혈청은 우수한 독소 B 중화 항체 역치와, 매우 낮지만 검출가능한 독소 A 중화 항체 역치를 나타낸다는 것을 보여준다. 생쥐를 독소 B (100 ng)를 이용한 복강내 치사량 공격으로부터 보호하는 염소 혈청의 능력도 확인되었다 (데이터는 예시되어 있지 않음).
실시예 10. 항-독소 A 및 항-독소 B 항체를 이용한 씨. 디피실리 재발로부 터의 햄스터의 보호
햄스터 군 (n=20)을 클린다마이신 및 씨. 디피실리로 공격하고 이어서 실시예 7의 햄스터 재발 모델에서 기술한 바와 같이 반코마이신으로 처리하였다. 항체 (염소 #331 유래의 혈청, 3D8 중 어느 하나, 또는 염소 #331 유래의 혈청 및 3D8)를 반코마이신 처리후 매일 2회 주었다 (도 14). 동물을 생존성 (도 15) 또는 병 (도 16)에 대하여 모니터링하였다. 항체 용량은 염소 #331 유래의 혈청의 경우 매일 2회 1 ml, 그리고 3D8의 경우 매일 2회 3 mg 주었다. 반코마이신만을 수여받은 동물 (즉, 항체를 전혀 처리하지 않음)은 음성 대조로 그 역할을 하였다. 이전에 관찰된 바와 같이, 3D8 및 반코마이신 처리 단독은 부분적인 보호 효과를 입증하였는데, 여기서, 20마리의 동물 중 10마리가 치명성으로부터 보호되었다 (도 15). 이 군의 동물 중 50%가 건강한채 남아있었다 (도 16). 단독의 반코마이신 처리를 받은 20마리의 동물 중 6마리가 보호되었다 (도 15). 30%는 건강한채 남아있었다 (도 16). 염소 혈청을 단독으로 사용했을 때 부분적인 보호 (9/20마리의 동물이 보호됨)가 또한 관찰되었다 (도 15). 40%는 건강한채 남아있었다. 보호율은 염소 혈청 및 3D8 둘 모두가 함께 주어졌을 때 거의 100%로 증가하였으며 (18/20) 질환 발병도 지연되었다 (도 15). 상기 동물 중 90%가 건강한채 남아있었다 (도 16). 명확하게는, 병으로부터의 보호는 치명성으로부터의 보호와 유사한 패턴을 따랐다. 이러한 데이터는 독소 B가 또한 중화될 경우 햄스터 질환 모델에서 3D8이 완전히 보호성일 수 있음을 입증하는 것이다.
실시예 11. 독소 B로 면역화한 햄스터에서의 씨. 디피실리 재발로부터의 햄 스터의 보호
햄스터를 이. 콜라이에서 발현시킨 독소 B의 COOH-말단 (독소 B의 아미노산 1777-2366에 상응함) 10 ㎍으로 RIBI를 아쥬반트로 사용하여 복강내로 면역화하였다. 동물은 7회분의 용량의 독소 B 항원을 수여받았다. 중화 항체 응답이 시험한 동물에서 관찰되었다. 면역화 햄스터 군을 클린다마이신 및 씨. 디피실리로 공격하고 이어서 실시예 7에 햄스터 재발 모델에서 기술한 바와 같이 반코마이신으로 처리하였다. 반코마이신을 19마리의 동물에게 처리한 후 항체 (3D8, 3 mg/투약)를 매일 2회 주고 이를 처리를 전혀 하지 않은 음성 대조군 (n=20)과 비교하였다 (도 17 및 18). 6마리의 동물을 반코마이신 처리 없이 공격하여 독소 B 항원으로 면역화한 햄스터가 씨. 디피실리 감염에 민감하게 되는 것을 보장하였다. 동물을 생존 (도 17) 또는 병 (도 18)에 대하여 모니터링하였다. 도 17은 3D8이 주어지지 않은 면역화 동물에서 이전에 관찰된 것과 유사한 비율로 재발된다는 것을 보여준다 (65% 재발률). 3D8을 수여받은 독소 B-면역화 동물은 이전에 관찰된 것보다 더 재발로부터 보호되었다 (이전에 다른 실험에서 독소 B로 면역화하지 않은 동물에서의 대략 50%의 재발률과 비교하여, 10%의 재발률).
도 18은 3D8을 수여받은 면역화 동물 중 일부가 병들게 되었으나 설사로부터 회복되었음을 보여준다. 단독의 반코마이신을 수여받은 면역화 동물 중 35%가 건강한채 남아있었다. 독소 B 반응성 혈청이 동물에서 존재하지 않는 실험에 있어서, 사실상 설사를 앓은 모든 동물이 후에 사망하였다. 이러한 데이터는 독소 B가 또한 중화될 경우 햄스터 질환 모델에서 3D8이 완전히 보호성일 수 있다는 추가의 증거를 제공한다. 독소 A 외에도 독소 B의 중화가 이 모델에서의 씨. 디피실리 질환으로부터의 최적의 보호에 필요하였다.
실시예 12. 염소 항-독소 B 혈청으로 처리한 햄스터에서 3D8을 사용한 일차 씨. 디피실리 공격으로부터의 햄스터의 보호
햄스터에서의 씨. 디피실리 질환의 재발의 방지는 직접적인 공격 (즉, 반코마이신 투여 없이 공격)으로부터의 보호보다 입증하기가 보다 용이하였다. 투끼 혈청을 이용한 실험에 의하면 직접적인 공격으로부터의 약한 보호만이 입증되었으며 3D8은 직접적인 공격에 대하여 검출가능한 영향을 미치지 못하였다. 3D8은 독소 B 중화 항체의 배경에서 보다 보호성이었기 때문에, 3D8과 항-독소 B 항혈청의 조합된 투여가 직접적인 공격으로 인한 질환을 예방할 수 있는지를 결정하였다. 도 19에 도시되어 있는 바와 같이, 5마리의 햄스터의 군은 매일 1회 투여의 3D8 (3 mg), 3D8 (3 mg)과 염소 #331 혈청 (1 ml)의 조합물을 수여받은 후 공격하거나, 공격 전에 3일 동안 항체를 전혀 수여하지 않았다. 도 20의 데이터는 항체를 전혀 수여받지 않거나 3D8 또는 염소 혈청 중 어느 하나를 단독으로 수여받은 동물은 모두 씨. 디피실리 공격 48시간에서 사망하였다는 것을 보여준다. 3D8 및 염소 혈청 둘 모두를 수여받은 대부분의 동물 (80%)은 생존하였으며 영향을 받은 동물은 공격 후 10일 동안 생존하였다. 도 21은 3D8 및 염소 혈청으로 처리한 동물이 병들게 되지만 회복하였다는 것을 보여준다. 이러한 데이터는 독소 B가 또한 중화될 경우 햄스터 질환 모델에서 3D8이 완전히 보호성일 수 있다는 추가의 증거를 제공하는 것이다. 독소 A 외에도 독소 B의 중화가 이 모델에서의 씨. 디피실리 질환으로부터의 최적의 보호에 필요하였다.
씨. 디피실리로 직접 공격한 햄스터의 성공적인 보호는 새로운 독소 B 후보의 스크리닝에 여러 장점을 제공한다. 보다 적은 수의 동물이 사용될 수 있는데, 이는 미처리 동물 100%가 사망하기 때문이다. 항체, 예를 들어 단일클론 항체 (예를 들어, 인간 단일클론 항체)를 햄스터에서 직접 스크리닝할 수 있는데, 그 이유는 이 절차가 100 mg 이하의 시험 항체를 필요로 하기 때문이다. 다른 시험 양식, 예를 들어 재발 모델은 재발 모델에서 낮은 공격률로 인하여 그램 단위의 양을 생성하는 노력을 필요로 하는데, 이는 보다 많은 수의 동물의 시험을 필요로 한다. 직접적인 공격 실험은, 재발 모델에서 7-10일인 것과 비교하여 씨. 디피실리 공격 3-4일 이내에 결정적인 판독 정보를 주어 지속 기간이 또한 보다 짧다. 또한, 스크리닝 방법으로부터의 반코마이신 처리의 배제는 동물을 다루는 횟수를 감소시킨다.
실시예 13. 항-독소 b 단일클론 항체의 생성
씨. 디피실리 독소 B를 Techlab, Inc. (미국 버지니아주 블랙스버그 소재)으로부터 획득하거나 재조합 생성법에 의해 수득하였다. 이 독소를 정제하고 불활성화시킨 후 면역화하였다. 불활성화는 반응성 UDP-디알데히드를 이용한 처리로 수행하였는데, 상기 처리에 의해 촉매 잔기는 알킬화되는 반면, 천연 독소 구조는 보존된다. 간략하게는, 정제된 독소 B를 완충제 중 UDP-2',3'-디알데히드 (0.1-1.0 mM)와 함께 37℃에서 18시간 동안 인큐베이션하고, 100 kDa-컷오프 필터를 통하여 여과시켜 미반응 UDP-2',3'-디알데히드를 제거하고, 완충제로 세척하였다. 불활성화 독소 B (유독소 B) 또는 재조합 독소 B 단편을 면역화에 사용하였다. 독소 B 수용체 결합 도메인 (아미노산 잔기 1777-2366)을 니켈 킬레이트 친화성 크로마토그래피를 사용한 친화 정제를 위한 면역태그 (헥사히스타딘)를 포함하는 융합 단백질로서 이. 콜라이에서 발현시켰다 (단편 4로 명명; 실시예 11 참조).
"HuMAb 생쥐에서의 인간 단일클론 항체의 생성"이라는 표제 하의 절에서 상기한 바와 생성한, 그리고 미국 캘리포니아주 밀피타스 소재의 Medarex에 의해 공급되는 HCo12 트랜스제닉 생쥐를 각각 RIBI 아쥬반트 중 10 ㎍의 유독소로 6-12회 복강내 면역화하였다. HCo12 트랜스제닉 생쥐에 있어서, 내인성 생쥐 카파 경쇄 유전자는 문헌[Chen et al. (1993) EMBO J. 12: 811-820]에 기술되어 있는 바와 같이 동형 접합에 의해 붕괴시키고 내인성 생쥐 중쇄 유전자는 국제 공보 제WO 01/09187호의 실시예 1에 개시되어 있는 바와 같이 동형 접합에 의해 붕괴시켰다. HCo12 트랜스제닉 생쥐는 문헌[Fishwild et al. (1996) Nature Biotechnology 14: 845-851]에 기술되어 있는 바와 같이 인간 카파 경쇄 트랜스진, KCo5와, 미국 특허 제5,545,806호; 동 제5,625,825호; 및 동 제5,545,807호에 개시되어 있는 HCo12 인간 중쇄 트랜스진을 지닌다. 혈청을 각각의 생쥐로부터 수집하고 ELISA에 의해 독소 B에의 반응성에 대하여 시험하고 IMR-90 세포 상에서의 세포 독성의 중화에 대하여 시험하였다. 독소 B-반응성 및 중화 항혈청에 있어서 양성으로 시험된 생쥐에 꼬리 정맥을 통하여 5-10 ㎍의 유독소 B 또는 단편 4를 주사하였다. 꼬리 정맥 주사를 수행한지 대략 3일 후에 생쥐를 희생시키고 비장을 하이브리도마에의 융합을 위하여 단리하였다.
하이브리도마 클론을 생성하고 ELISA로 스크리닝하였다. 하기의 3개의 하이브리도마 클론을 추가의 분석을 위하여 선발하였다: 124-152, 2A11 및 1G10. 특히, 124-152 클론 유래의 cDNA를 mRAN로부터의 RT-PCR로 증폭시키고, 클로닝하고 서열 결정하였다. 중쇄 V 영역은 생식 세포 서열 VH 5-51로부터 유래되고, D 영역은 생식 세포 서열 7-27로부터 유래되고, J 서열은 생식 세포 영역 JH3b로부터 유래된다는 것이 결정되었다. 경쇄 (카파) 영역은 JK1 유래의 J 영역 및 A27로부터 유래된다는 것이 결정되었다. 124-152 클론의 이소타입은 IgG1인 것으로 결정되었다. 124-152 클론의 VH 및 VL 영역의 아미노산 서열이 도 27-28에 도시되어 있다. 상보성 결정 영역 (CDR)이 이 도면에 나타내어져 있다. VH 및 VL 영역의 관련 생식 세포 서열이 도 30-31에 도시되어 있다.
항체 124-152; 2A11; 및 1G10을 상응하는 하이브리도마로부터 단리하고 그의 결합 특징에 대하여 시험하였다 (하기). 124-152 클론을 코딩하는 DNA를 인간에 투여하기 위한 인간 항체로서 발현시킬 벡터 내로 클로닝하였다.
실시예 14. 항-독소 B 항체의 결합 활성
각각의 항체의 독소 B에의 결합을 표준 기술을 사용하여 Biacore로 측정하였다. 이 분석 결과가 표 6에 예시되어 있다. 124-152; 2A11; 및 1G10에 의해 생산되는 항체를 적절한 대조와 비교하였다.
특히, 독소 B에 대한 124-152; 2A11; 및 1G10의 친화도를 Biacore(등록상표) 기기로 측정하였는데, 상기 기기는 표면 플라스몬 공명 기술로 생분자 결합 상호 작용을 탐지한다. 각각의 항체를 단백질 A-코팅 센서 칩에 첨가하고, 독소 B를 칩 위에 유동시켜 결합력을 측정하였다. 124-152의 KD는 1.64 x 10-10 M이었으며, 2A11의 KD는 0.24 x 10-10 M이었으며, 1G10의 KD는 2.98 x 10-10 M이었다. 따라서, 본 항체는 독소 B에 높은 친화도로 결합한다. 이러한 결합 상수는 본 항체가 생체내 용도에서, 예를 들어, 인간 치료에서 사용하기에 적합한 친화도를 갖는다는 것을 나타낸다.
샘플 ID KD x 10-10
(M)		 ka x 105
(1/Ms)		 kd x 10-5
(1/s)
2A11 0.24 21 5.07
124.152 1.64 34.5 56.4
51.1G10 2.98 1.31 3.89
실시예 15. 항-독소 B 항체에 의한 독소의 중화
124-152; 2A11; 및 1G10 하이브리도마에 의해 발현되는 항체를 시험관내에서 독소 B 중화 활성에 대하여 시험하였다. 세포를 다양한 농도의 독소 B 특이성 단일클론 항체의 존재 하에 인큐베이션하였는데, 이는 독소 B에의 노출 후 세포가 둥글게 되지 않게 한다. 세포 병리학적 효과 (CPE)를 세포의 시각적 점검으로 결정하였다. 0-4의 CPE 스코어를 시각적 점검 결과에 기초하여 결정하였다 (4=100%의 세포 독성, 0=0%의 독성). 이러한 분석 결과가 도 27에 도시되어 있다. 인간 폐 섬유모세포주, IMR-90에 대한 독성 중화를 측정하였다. 도 27은 모든 항체가 IMR-90 세포에 대하여 중화 능력을 갖는다는 것을 보여주고 있다. IMR-90 세포 상에서의 독소 A의 세포 독성의 상대적인 중화 활성은 124-152 > 1G10 > 2A11이었다.
실시예 16. 항-독소 A 항체를 사용한 일차 씨. 디피실리 공격으로부터의 햄 스터의 보호
씨. 디피실리의 접종의 직접적인 공격으로부터의 보호 (-1일에 클린다마이신 및 0일에 씨. 디피실리 포자 (1/100,000의 희석)를, 항-독소 B 항체의 존재 또는 부재 하에 4 내지 10일의 기간에 걸쳐 수행하였다. 도 24에 도시되어 있는 바와 같이, 5마리의 햄스터의 군은 3D8 (4일에 걸쳐 총 20 mg), 조합된 3D8 (Id.) 및 염소 #331 (3 ml) 혈청, 항-독소 B 항체 124-152 (4일에 걸쳐 총 18 mg), 2A11 (4일에 걸쳐 총 20 mg) 또는 1G10 (4일에 걸쳐 총 20 mg)과 조합된 3D8을 매일 1회 투약하거나 공격 이전에 3일 동안 항체를 전혀 투약하지 않은 후 공격하였다. 도 24의 데이터는 항체를 전혀 수여받지 않거나 3D8 또는 염소 항체 중 어느 하나를 단독으로 수여받은 동물은 씨. 디피실리 공격 72시간 이내에 모두 사망하였으며, 반면 3D8 및 항-독소 B 항체를 수여받은, 바람직하게는 124-152와 조합된 것을 수여받은 동물은 생존률이 40%였다 (도 24). (보다 묽은 씨. 디피실리 접종체를 사용한 것을 제외하고는) 전술한 것과 유사한 10일간의 연구를 증가하는 양의 항-독소 B 항체 124-152 (-3일, -2일, -1일 및 0일에 0.56 mg, 1.7 mg 또는 5.0 mg)를 이용하여 수행하였다. 3D8 및 염소 혈청 둘 모두를 수여받은 동물은 생존하였으며 대부분의 동물 (60%-70%)은 3D8을 124-152와 조합하여 줄 경우 공격 후 10일 동안 생존하였다. 심지어 최저 투여량의 항-독소 B 항체 124-152 (3D8과 조합하여 0.56 mg)가 가장 효과적이었다 (70%의 생존률; 도 25 참조). 결과는 단독의 124-152 및 3D8은 조합되어 사용될 때 -여기서, 누가적인 것보다 큰, 실제 상승 작용적인 치료 결과가 성취됨 - 보다 덜 효과적이다. 이러한 데이터는 항-독소 B 항체가 고도로 효과적이며, 특히 항-독소 A 항체 3D8과 조합되어 고도로 효과적이라는 추가의 증거를 제공한다. 독소 A 외에도 독소 B의 중화가 이 모델에서 씨. 디피실리 질환으로부터의 보호를 제공하는 것으로 결정되었다.
실시예 17. 항-독소 B 항체의 에피토프 지도화
각각의 단일클론 항체가 결합하는 독소 B의 에피토프를 웨스턴 블로팅으로 결정하였다. 독소 B의 상이한 도메인을 나타내는 독소 B의 단편을 발현하는 재조합 이. 콜라이 클론을 제작하였다. 독소 B 유전자의 적절한 절편을 적절한 씨. 디피실리 주로부터 제조한 DNA로부터 PCR-증폭시켰다. 단편을 발현 벡터 내로 클로닝하고 이. 콜라이에서 발현시켰다. 인간 단일클론 항체 152를 사용하여 웨스턴 블롯에서 독소 B 단편을 프로빙하여 결합 에피토프를 지도화하였다. 독소 B 단백질 단편을 독소 B 유전자의 일부를 포함하는 이. 콜라이로부터 단리하고 SDS-PAGE를 사용하여 분리하였다. 전기영동 후, 독소 B 단편을 니트로셀룰로오스로 옮기고 단일클론 항체 152, 이어서 알칼린 포스파타제 콘쥬게이션된 염소 항 인간으로 프로빙하여 MAb 152 결합을 검출하였다. HuMab 152는 아미노산 1777 내지 2366 사이의 독소 B의 -COOH 단편 부분에 결합하는 것으로 결정되었다 (예를 들어, 도 32 참조).
기타 실시 형태
본 발명의 다수의 실시 형태를 기술하였다. 그럼에도 불구하고, 본 발명의 정신 및 범주로부터 벗어남이 없이 다양한 변형이 행해질 수 있다는 것이 이해될 것이다. 따라서, 기타 실시 형태는 하기의 청구의 범위의 범주 이내이다.
SEQUENCE LISTING <110> AMBROSINO, DONNA BABCOCK, GREGORY J. BROERING, THERESA GRAZIANO, ROBERT HERNANDEZ, HECTOR JAVIER LOWY, ISRAEL MANDELL, ROBERT MOLRINE, DEBORAH THOMAS, JR., WILLIAM D. ZHANG, HUI-FEN <120> ANTIBODIES AGAINST CLOSTRIDIUM DIFFICILE TOXINS AND USES THEREOF <130> MJI-001 <140> 11/051,453 <141> 2005-02-04 <150> 60/542,357 <151> 2004-02-06 <150> 60/613,854 <151> 2004-09-28 <160> 82 <170> PatentIn Ver. 3.3 <210> 1 <211> 122 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Ser Asn Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Leu Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Asp Tyr Thr Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Trp Gly Met Val Arg Gly Val Ile Asp Val Phe Asp Ile Trp 100 105 110 Gly Gln Gly Thr Val Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 2 <211> 114 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Gln Met Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Ser Phe Asn Ser Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Val Ile Trp Ala Ser Gly Asn Lys Lys Tyr Tyr Ile Glu Ser Val 50 55 60 Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Ala Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val 100 105 110 Ser Ser <210> 3 <211> 116 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Thr Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Met 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Met Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Asp Pro Pro Thr Ala Asn Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val 100 105 110 Thr Val Ser Ser 115 <210> 4 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln His Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 5 <211> 108 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Ser Gln 85 90 95 Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys 100 105 <210> 6 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 6 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Lys Ala Pro Lys Ser Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Lys Ser Tyr Pro Val 85 90 95 Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 7 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 7 Asn Tyr Gly Met His 1 5 <210> 8 <211> 17 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 8 Leu Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Asp Tyr Thr Asp Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly <210> 9 <211> 13 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 9 Trp Gly Met Val Arg Gly Val Ile Asp Val Phe Asp Ile 1 5 10 <210> 10 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 10 Ser Tyr Gly Met His 1 5 <210> 11 <211> 17 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 11 Val Ile Trp Ala Ser Gly Asn Lys Lys Tyr Tyr Ile Glu Ser Val Glu 1 5 10 15 Gly <210> 12 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 12 Ala Asn Phe Asp Tyr 1 5 <210> 13 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 13 Lys Tyr Gly Met His 1 5 <210> 14 <211> 17 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 14 Val Ile Trp Tyr Asp Gly Thr Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Met Lys 1 5 10 15 Gly <210> 15 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 15 Asp Pro Pro Thr Ala Asn Tyr 1 5 <210> 16 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 16 Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp Leu Ala 1 5 10 <210> 17 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 17 Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser 1 5 <210> 18 <211> 9 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 18 Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Trp Thr 1 5 <210> 19 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 19 Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 20 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 20 Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr 1 5 <210> 21 <211> 10 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 21 Gln Gln Arg Ser Asn Trp Ser Gln Phe Thr 1 5 10 <210> 22 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 22 Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp Leu Ala 1 5 10 <210> 23 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 23 Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser 1 5 <210> 24 <211> 9 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 24 Gln Gln Tyr Lys Ser Tyr Pro Val Thr 1 5 <210> 25 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> MOD_RES <222> (5)..(6) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (9) <223> Variable amino acid <400> 25 Arg Ala Ser Gln Xaa Xaa Ser Ser Xaa Leu Ala 1 5 10 <210> 26 <211> 6 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> MOD_RES <222> (3)..(5) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (6) <223> Ser or Thr <400> 26 Ala Ser Xaa Xaa Xaa Xaa 1 5 <210> 27 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> MOD_RES <222> (3)..(4) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (5) <223> Ser or Asn <220> <221> MOD_RES <222> (6) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (7) <223> Pro or Ser <400> 27 Gln Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 1 5 <210> 28 <211> 4 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 28 Tyr Gly Met His 1 <210> 29 <211> 15 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> MOD_RES <222> (3)..(4) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (6)..(8) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (10)..(11) <223> Variable amino acid <220> <221> MOD_RES <222> (13)..(14) <223> Variable amino acid <400> 29 Ile Trp Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Xaa Tyr Xaa Xaa Ser Xaa Xaa Gly 1 5 10 15 <210> 30 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 30 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Lys Ala Pro Lys Ser Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ser Tyr Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 31 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 31 Val Ile Trp Met Thr Gln Ser Pro Ser Leu Leu Ser Ala Ser Thr Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Met Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Glu Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ser Tyr Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 32 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 32 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln His Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ser Tyr Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 33 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 33 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Lys Ala Pro Lys Ser Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ser Tyr Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 34 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 34 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Leu Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Lys Ala Pro Lys Ser Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 35 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(321) <400> 35 gac atc cag atg acc cag tct cca tct tcc gtg tct gca tct gta gga 48 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 gac aga gtc acc atc act tgt cgg gcg agt cag ggt att agc agc tgg 96 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 tta gcc tgg tat cag cat aaa cca ggg aaa gcc cct aag ctc ctg atc 144 Leu Ala Trp Tyr Gln His Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 tat gct gca tcc agt ttg caa agt ggg gtc cca tca agg ttc agc ggc 192 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 agt gga tct ggg aca gat ttc act ctc acc atc agc agc ctg cag cct 240 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 gaa gat ttt gca act tac tat tgt caa cag gct aat agt ttc cct tgg 288 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Trp 85 90 95 acg ttc ggc caa ggg acc aag gtg gaa atc aaa 321 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 36 <211> 324 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(324) <400> 36 gaa att gtg ttg aca cag tct cca gcc acc ctg tct ttg tct cca ggg 48 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 gaa aga gcc acc ctc tcc tgc agg gcc agt cag agt gtt agc agc tac 96 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr 20 25 30 tta gcc tgg tac caa cag aaa cct ggc cag gct ccc agg ctc ctc atc 144 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile 35 40 45 tat gat gca tcc aac agg gcc act ggc atc cca gcc agg ttc agt ggc 192 Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly 50 55 60 agt ggg tct ggg aca gac ttc act ctc acc atc agc agc cta gag cct 240 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro 65 70 75 80 gaa gat ttt gca gtt tat tac tgt cag cag cgt agc aac tgg tct caa 288 Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Ser Gln 85 90 95 ttc act ttc ggc cct ggg acc aaa gtg gat atc aaa 324 Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys 100 105 <210> 37 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(321) <400> 37 gac atc cag atg acc cag tct cca tcc tca ctg tct gca tct gta gga 48 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 gac aga gtc acc atc act tgt cgg gcg agt cag ggt att agc agc tgg 96 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp 20 25 30 tta gcc tgg tat cag cag aaa cca gag aaa gcc cct aag tcc ctg atc 144 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Lys Ala Pro Lys Ser Leu Ile 35 40 45 tat gct gca tcc agt ttg caa agt ggg gtc cca tca agg ttc agc ggc 192 Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 agt gga tct ggg aca gat ttc act ctc acc atc agc agc ctg cag cct 240 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 gaa gat ttt gca act tat tac tgc caa cag tat aag agt tac ccg gtc 288 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Lys Ser Tyr Pro Val 85 90 95 act ttc ggc gga ggg acc aag gtg gag atc aaa 321 Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 38 <211> 366 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(366) <400> 38 cag gtg cag ctg gtg gag tct ggg gga ggc gtg gtc cag cct ggc agg 48 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 tcc ctg aga ctc tcc tgt gcg gcg tct gga ttc agc ttc agt aac tat 96 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Ser Asn Tyr 20 25 30 ggc atg cac tgg gtc cgc cag gct cca ggc aag ggg ctg gag tgg gtg 144 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 gca ctt ata tgg tat gat gga agt aat gag gac tat aca gac tcc gtg 192 Ala Leu Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Asp Tyr Thr Asp Ser Val 50 55 60 aag ggc cga ttc acc atc tcc aga gac aat tcc aag aac acg ctg tat 240 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 ctg caa atg aac agc ctg aga gcc gag gac acg gct gtg tat tac tgt 288 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 gcg aga tgg ggg atg gtt cgg gga gtt atc gat gtt ttt gat atc tgg 336 Ala Arg Trp Gly Met Val Arg Gly Val Ile Asp Val Phe Asp Ile Trp 100 105 110 ggc caa ggg aca gtg gtc acc gtc tct tca 366 Gly Gln Gly Thr Val Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 39 <211> 342 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(342) <400> 39 cag atg cag ctg gtg gag tct ggg ggc ggc gtg gtc cag cct ggg agg 48 Gln Met Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 tcc ctg aga ctc tcc tgt gaa gcg tct gga ttc tcc ttc aat agc tat 96 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Ser Phe Asn Ser Tyr 20 25 30 ggc atg cac tgg gtc cgc cag gct cca ggc aag ggg ctg gag tgg gtg 144 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 tca gtc ata tgg gcc agt gga aat aag aaa tat tat ata gaa tcc gtg 192 Ser Val Ile Trp Ala Ser Gly Asn Lys Lys Tyr Tyr Ile Glu Ser Val 50 55 60 gag ggc cga ttc acc atc tcc aga gac aat tcc aag aac acg ctg tat 240 Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 ctg caa atg aac agc ctg aga gcc gag gac acg gct gtg tat tac tgt 288 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 gcg aga gcc aat ttt gac tac tgg ggc cag gga acc ctg gtc acc gtc 336 Ala Arg Ala Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val 100 105 110 tcc tca 342 Ser Ser <210> 40 <211> 348 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(348) <400> 40 cag gtg cag ctg gtg gag tct ggg gga ggc gtg gtc cag cct ggg agg 48 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 tcc ctg aga ctc tcc tgt gca gcg tct gga ttc acc ttc aat aaa tat 96 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Tyr 20 25 30 ggc atg cac tgg gtc cgc cag gct cca ggc aag ggg ctg gag tgg gtg 144 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 gca gtt ata tgg tat gat gga act aat aaa tac tat gca gac tcc atg 192 Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Thr Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Met 50 55 60 aag ggc cga ttc acc atc tcc aga gac aat tcc aag aat atg ctg tat 240 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Met Leu Tyr 65 70 75 80 ctg caa atg aac agc cta aga gcc gag gac acg gct gtg tat tac tgt 288 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 gcg aga gat ccc ccc act gct aac tac tgg ggc cag gga acc ctg gtc 336 Ala Arg Asp Pro Pro Thr Ala Asn Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val 100 105 110 acc gtc tcc tca 348 Thr Val Ser Ser 115 <210> 41 <211> 2710 <212> PRT <213> Clostridium difficile <400> 41 Met Ser Leu Ile Ser Lys Glu Glu Leu Ile Lys Leu Ala Tyr Ser Ile 1 5 10 15 Arg Pro Arg Glu Asn Glu Tyr Lys Thr Ile Leu Thr Asn Leu Asp Glu 20 25 30 Tyr Asn Lys Leu Thr Thr Asn Asn Asn Glu Asn Lys Tyr Leu Gln Leu 35 40 45 Lys Lys Leu Asn Glu Ser Ile Asp Val Phe Met Asn Lys Tyr Lys Thr 50 55 60 Ser Ser Arg Asn Arg Ala Leu Ser Asn Leu Lys Lys Asp Ile Leu Lys 65 70 75 80 Glu Val Ile Leu Ile Lys Asn Ser Asn Thr Ser Pro Val Glu Lys Asn 85 90 95 Leu His Phe Val Trp Ile Gly Gly Glu Val Ser Asp Ile Ala Leu Glu 100 105 110 Tyr Ile Lys Gln Trp Ala Asp Ile Asn Ala Glu Tyr Asn Ile Lys Leu 115 120 125 Trp Tyr Asp Ser Glu Ala Phe Leu Val Asn Thr Leu Lys Lys Ala Ile 130 135 140 Val Glu Ser Ser Thr Thr Glu Ala Leu Gln Leu Leu Glu Glu Glu Ile 145 150 155 160 Gln Asn Pro Gln Phe Asp Asn Met Lys Phe Tyr Lys Lys Arg Met Glu 165 170 175 Phe Ile Tyr Asp Arg Gln Lys Arg Phe Ile Asn Tyr Tyr Lys Ser Gln 180 185 190 Ile Asn Lys Pro Thr Val Pro Thr Ile Asp Asp Ile Ile Lys Ser His 195 200 205 Leu Val Ser Glu Tyr Asn Arg Asp Glu Thr Val 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aca atg gtc acc gtc tct tca 357 Thr Met Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 56 <211> 138 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 56 Met Gly Ser Thr Ala Ile Leu Ala Leu Leu Leu Ala Val Leu Gln Gly 1 5 10 15 Val Cys Ala Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys 20 25 30 Ser Gly Glu Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe 35 40 45 Thr Ser Tyr Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu 50 55 60 Glu Trp Met Gly Ile Phe Tyr Pro Gly Asp Ser Ser Thr Arg Tyr Ser 65 70 75 80 Pro Ser Phe Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Val Asn 85 90 95 Thr Ala Tyr Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met 100 105 110 Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Arg Asn Trp Gly Asn Ala Phe Asp Ile Trp 115 120 125 Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser 130 135 <210> 57 <211> 414 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 57 atggggtcaa ccgccatcct cgccctcctc ctggctgttc tccaaggagt ctgtgccgag 60 gtgcagctgg tgcagtctgg agcagaggtg aaaaagtccg gggagtctct gaagatctcc 120 tgtaagggtt ctggatacag ctttaccagc tactggatcg gctgggtgcg ccagatgccc 180 gggaagggcc tggagtggat ggggatcttc tatcctggtg actctagtac cagatacagc 240 ccgtccttcc aaggccaggt caccatctca gccgacaagt ccgtcaacac cgcctacctg 300 cagtggagca gcctgaaggc ctcggacacc gccatgtatt actgtgcgag acgtcgaaac 360 tggggaaatg cttttgatat ctggggccaa gggacaatgg tcaccgtctc ttca 414 <210> 58 <211> 108 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 58 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 20 25 30 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Thr 85 90 95 Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 59 <211> 324 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(324) <400> 59 gaa att gtg ttg acg cag tct cca ggc acc ctg tct ttg tct cca ggg 48 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 gaa aga gcc acc ctc tcc tgc agg gcc agt cag agt gtt agc agc agc 96 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 20 25 30 tac tta gcc tgg tac cag cag aaa cct ggc cag gct ccc agg ctc ctc 144 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 atc tat ggt gca tcc agc agg gcc act ggc atc cca gac agg ttc agt 192 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 ggc agt ggg tct ggg aca gac ttc act ctc acc atc agc aga ctg gag 240 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 cct gaa gat ttt gca gtg tat tac tgt cag cag tat ggt agc tca acg 288 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Thr 85 90 95 tgg acg ttc ggc caa ggg acc aag gtg gaa atc aaa 324 Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 60 <211> 128 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 60 Met Glu Thr Pro Ala Gln Leu Leu Phe Leu Leu Leu Leu Trp Leu Pro 1 5 10 15 Asp Thr Thr Gly Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser 20 25 30 Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser 35 40 45 Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala 50 55 60 Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro 65 70 75 80 Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile 85 90 95 Ser Arg Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr 100 105 110 Gly Ser Ser Thr Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 115 120 125 <210> 61 <211> 384 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 61 atggaaaccc cagcgcagct tctcttcctc ctgctactct ggctcccaga taccaccgga 60 gaaattgtgt tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 120 ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agcagctact tagcctggta ccagcagaaa 180 cctggccagg ctcccaggct cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca 240 gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 300 cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gctcaacgtg gacgttcggc 360 caagggacca aggtggaaat caaa 384 <210> 62 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 62 Ser Tyr Trp Ile Gly 1 5 <210> 63 <211> 15 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(15) <400> 63 agc tac tgg atc ggc 15 Ser Tyr Trp Ile Gly 1 5 <210> 64 <211> 17 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 64 Ile Phe Tyr Pro Gly Asp Ser Ser Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gln 1 5 10 15 Gly <210> 65 <211> 51 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(51) <400> 65 atc ttc tat cct ggt gac tct agt acc aga tac agc ccg tcc ttc caa 48 Ile Phe Tyr Pro Gly Asp Ser Ser Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gln 1 5 10 15 ggc 51 Gly <210> 66 <211> 10 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 66 Arg Arg Asn Trp Gly Asn Ala Phe Asp Ile 1 5 10 <210> 67 <211> 30 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(30) <400> 67 cgt cga aac tgg gga aat gct ttt gat atc 30 Arg Arg Asn Trp Gly Asn Ala Phe Asp Ile 1 5 10 <210> 68 <211> 12 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 68 Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 69 <211> 36 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(36) <400> 69 agg gcc agt cag agt gtt agc agc agc tac tta gcc 36 Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 70 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 70 Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr 1 5 <210> 71 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(21) <400> 71 ggt gca tcc agc agg gcc act 21 Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr 1 5 <210> 72 <211> 9 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 72 Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Thr Trp Thr 1 5 <210> 73 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(27) <400> 73 cag cag tat ggt agc tca acg tgg acg 27 Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Thr Trp Thr 1 5 <210> 74 <211> 15 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 74 Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 15 <210> 75 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 75 Ser Tyr Trp Ile Gly 1 5 <210> 76 <211> 17 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 76 Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gln 1 5 10 15 Gly <210> 77 <211> 10 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 77 Ala Arg Arg Arg Asn Trp Gly Asn Ala Phe 1 5 10 <210> 78 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 78 Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 79 <211> 12 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 79 Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 1 5 10 <210> 80 <211> 9 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 80 Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Trp Thr 1 5 <210> 81 <211> 98 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 81 Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu 1 5 10 15 Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr 20 25 30 Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met 35 40 45 Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe 50 55 60 Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg <210> 82 <211> 96 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 82 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 20 25 30 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 85 90 95

Claims (45)

1.5 x 10-9 M 이하의 KD로 클로스트리듐 디피실리(Clostridium difficile)(씨. 디피실리)의 외독소에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리 독소 A(독소 A)에 특이적으로 결합하는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 씨. 디피실리 독소 B(독소 B)에 특이적으로 결합하는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제2항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 시험관내 또는 생체내에서 독소 A를 중화시키는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제3항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 시험관내 또는 생체내에서 독소 B를 중화시키는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는
개체에서 씨. 디피실리-매개 대장염으로부터 보호하거나 대장염을 억제하는 특징;
개체에서 항생제-관련 대장염으로부터 보호하거나 대장염을 억제하는 특징;
개체에서 씨. 디피실리-매개 위막성 대장염(pseudomembranous colitis, PMC)으로부터 보호하거나 대장염을 억제하는 특징;
개체에서 씨. 디피실리-매개 설사로부터 보호하거나 설사를 억제하는 특징; 및
씨. 디피실리-매개 질환의 재발을 억제하는 특징
중 하나 이상의 특징을 갖는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제2항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 독소 A의 아미노산 1853-2710, 415-540 또는 920-1033 사이의 에피토프에 결합하는 것인 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 2 또는 서열 번호 3을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 5 또는 서열 번호 6을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 2 및 5, 또는 서열 번호 3 및 6의 아미노산 서열을 각각 포함하는 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
(i) 서열 번호 10을 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 11을 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR2;
서열 번호 12을 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR3;
서열 번호 19을 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 20을 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR2;
서열 번호 21을 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR3; 및
(ii) 서열 번호 13을 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 14를 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR2;
서열 번호 15를 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR3;
서열 번호 22를 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 23을 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR2;
서열 번호 24를 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR3;
으로 이루어진 군으로부터 선택된 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역 CDR1, CDR2 및 CDR3 서열을 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 54 또는 서열 번호 56을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 58 또는 서열 번호 60의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 54 및 58, 서열 번호 56 및 60의 아미노산 서열을 각각 포함하는 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
서열 번호 62를 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 64를 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR2;
서열 번호 66를 포함하는 중쇄 가변 영역 CDR3;
서열 번호 68를 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR1;
서열 번호 70를 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR2; 및
서열 번호 72을 포함하는 경쇄 가변 영역 CDR3
를 포함하는 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역 CDR1, CDR2, 및 CDR3를 포함하는, 단리된 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위.
제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 항체와 결합하는 데 경쟁하는 단리된 항체.
제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 항체에 의해 결합된 에피토프에 결합하는 단리된 항체.
제2항 또는 제3항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 항체는 인간 항체, 인간화 항체 또는 키메릭(chimeric) 항체인 것인 단리된 단일클론 항체.
제2항 또는 제3항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 항체의 항원 결합 부위는 Fab, Fab'2, ScFv, Fd, Fv 또는 dAb인 것인 단리된 단일클론 항체.
약학적 허용가능한 담체에 제1항 내지 제3항, 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 조성물.
씨. 디피실리 독소 A에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체, 및 씨. 디피실리 독소 B에 특이적으로 결합하는 단리된 인간 단일클론 항체를 포함하는 조성물.
씨. 디피실리 독소 A에 결합하는 제1 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 및 씨. 디피실리 독소 B에 결합하는 제2 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 조성물로서, 씨. 디피실리 독소 A에 결합하는 제1 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 하기를 포함하는 것인 조성물:
(a) 서열 번호 1, 2 또는 3의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 또는
(b) 서열 번호 4, 5 또는 6의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역.
제22항에 있어서, 씨. 디피실리 독소 B에 결합하는 제2 단일클론 항체, 또는 이의 항원 결합 부위는 서열 번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역, 또는 서열 번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역, 또는 이의 조합을 포함하는 것인 조성물.
씨. 디피실리 독소 A에 결합하는 제1 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 및 씨. 디피실리 독소 B에 결합하는 제2 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 조성물로서, 씨. 디피실리 독소 B에 결합하는 제2 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 서열 번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역, 또는 서열 번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 것인 조성물.
제24항에 있어서, 씨. 디피실리 독소 A에 결합하는 제1 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 하기를 포함하는 것인 조성물:
(a) 서열 번호 1, 2, 또는 3의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역; 또는
(b) 서열 번호 4, 5, 또는 6의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역.
제1 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 및 제2 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 포함하는 조성물로서,
(a) 제1 항체, 또는 이의 항원 결합 부위는 각각 서열 번호 1 및 4, 서열 번호 2 및 5, 또는 서열 번호 3 및 6의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하며;
(b) 제2 항체, 또는 이의 항원 결합 부위는 각각 서열 번호 54 및 58의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 조성물.
제21항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 항체 또는 제2 항체는 인간 항체, 인간화 항체 또는 키메릭 항체인 것인 조성물.
제21항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 항체 또는 제2 항체의 항원 결합 부위는 Fab, Fab'2, ScFv, Fd, Fv 또는 dAb인 것인 조성물.
제21항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 및 제2 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 시험관내 또는 생체내에서 씨. 디피실리 독소 A 및 씨. 디피실리 독소 B를 중화시키는 것인 조성물.
씨. 디피실리 독소 A 또는 씨. 디피실리 독소 B에 결합하며, 서열 번호 2, 서열 번호 3, 서열 번호 5, 서열 번호 6, 서열 번호 54, 서열 번호 56, 서열 번호 58, 또는 서열 번호 60과 90% 이상 동일한 폴리펩티드를 코딩하는 서열을 포함하는 단리된 핵산.
제30항의 핵산을 포함하는 발현 벡터.
제30항의 핵산을 포함하는 숙주 세포.
제32항에 있어서, 상기 숙주 세포는 박테리아 세포인 숙주 세포.
제32항에 있어서, 상기 숙주 세포는 진핵 세포인 숙주 세포.
제32항에 있어서, 상기 숙주 세포는 포유동물 세포인 숙주 세포.
제1항 내지 제3항, 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 단리된 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위, 또는 제21항 내지 제26항 중 어느 한 항의 조성물, 및 씨. 디피실리-매개 질환 치료를 위한 사용 지시서를 포함하는 키트.
제1항 내지 제3항, 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 항체 또는 이의 항원 결합 부위의 유효량, 또는 제21항 내지 제26항 중 어느 한 항의 조성물의 유효량을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 개체의 씨. 디피실리 질환을 치료하는 방법.
제37항에 있어서, 개체는 인간인 것인 방법.
제37항에 있어서, 항체 또는 이의 항원 결합 부위는 개체에게 정맥내, 근육내, 또는 피하 투여되는 것인 방법.
제37항에 있어서, 항체 또는 이의 결합 부위는 제2 약제와 조합되어 투여되는 것인 방법.
제40항에 있어서, 제2 약제는 제2 인간 단일클론 항체 또는 이의 항원 결합 부위인 것인 방법.
제40항에 있어서, 제2 약제는 항생제인 것인 방법.
제40항에 있어서, 제2 약제는 반코마이신 또는 메트로니다졸인 것인 방법.
제40항에 있어서, 제2 약제는 씨. 디피실리 백신인 것인 방법.
제37항에 있어서, 씨. 디피실리는 항생제-연관 설사, 씨. 디피실리-매개 위막성 대장염(PMC), 설사, 또는 씨. 디피실리-매개 질환의 재발을 초래하는 것인 방법.

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