JP6426713B2 - Gpc3キメラ抗原受容体蛋白質をコードする核酸及びgpc3キメラ抗原受容体蛋白質を発現するtリンパ球 - Google Patents
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Description
scFv(GPC3)−CD8−CD3ζ、
scFv(GPC3)−CD8−CD137−CD3ζ、
scFv(GPC3)−CD28a−CD28b−CD3ζ、
scFv(GPC3)−CD28a−CD28b−CD137−CD3ζ、
の順で連結してなるキメラ抗原受容体蛋白質、およびそれらの組み合わせから選ばれるものであってもよく、ただし、関連するキメラ抗原受容体蛋白質におけるCD28aはCD28分子の膜貫通ドメインを示し、CD28bはCD28分子の細胞内シグナルドメインを示す。前記各種のGPC3標的キメラ抗原受容体はscFv(GPC3)−CARと総称する。
下表1では、本発明で例示されるキメラ抗原受容体の各部分の連結順番が説明され、それらの連結は図2にも示される。
(1) scFv(GPC3)配列の増幅
scFv(GPC3)配列の増幅は、本ラボラトリーで構築された一本鎖二重特異性抗体ヌクレオチドGPC3/CD3を鋳型とし、鋳型の配列は中国特許出願201210480326.xにおける配列番号9を参照する。増幅に用いられるプライマー対はフォワードプライマー5’−gatgttgtgatgactcagtctc−3’(配列番号1)とリバースプライマー5’−gcgctggcgtcgtggttgaggagacggtgaccag−3’(配列番号2)であり、scFv(GPC3)の増幅に用いられた;目的増幅バンドのサイズはいずれも746bpであった。PCR増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:58℃、40s;伸長:68℃、40s;25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。セファロース電気泳動により、PCR増幅バンドは想定の断片サイズに一致することが確認した。
GPC3キメラ抗原受容体蛋白質のscFv(GPC3)以外の他の部分の核酸配列はそれぞれ、中国特許出願番号201310108532.2で開示された配列番号1〜4の配列を鋳型として、PCR手段により得られた。具体的には、以下の各種のGPC3キメラ抗原受容体蛋白質のscFv(GPC3)以外のCAR部分のうち、CD8−CD3ζ(Z)およびCD28a−CD28b−CD137−CD3ζ(28BBZ)はそれぞれscFv(EFGR)−CD8−CD3ζ(中国特許出願201310108532.2における配列番号1)とscFv(EFGR)−CD28a−CD28b−CD137−CD3ζ(中国特許出願201310108532.2における配列番号2)を鋳型として、フォワードプライマー5’−accacgacgccagcgccgcgaccac−3’(配列番号3)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatgtgaag−3’(配列番号4)を用いて増幅し、PCR増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:60℃、40s;伸長:68℃、40s;25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。目的バンドはそれぞれ549bpと816bpであり、セファロース電気泳動により、PCR増幅バンドは想定の断片サイズに一致することが確認した。
(i) フォワードプライマー5’−gtcaccgtctcctcaaccacgacgccagcg−3’(配列番号5)とリバースプライマー5’−ggtgataaccagtgacaggag−3’(配列番号6)を用いて増幅し、CD8αヒンジドメイン−膜貫通ドメインを得、PCR増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、30s;アニーリング:58℃、30s;伸長:68℃、30s;25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。バンドの理論的なサイズは198bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(ii) フォワードプライマー5’−gtcaccgtctcctcaaccacgacgccagcg−3’(配列番号5)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctacgcgggggcgtctgcgctcctgctgaacttcactctggtgataaccagtg−3’(配列番号7)を用いて増幅し、CD8αヒンジドメイン−膜貫通ドメイン−delta Z(即ちCD8−CD3 deltaζ)を得、PCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは261bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(iii) フォワードプライマー5’−ttttgggtgctggtggtggttgg−3’(配列番号8)とリバースプライマー5’−gctgaacttcactctggagcgataggctgcgaag−3’(配列番号9)を用いて増幅し、CD28膜貫通ドメイン−細胞内シグナルドメイン断片を得、PCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは219bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(iiii) フォワードプライマー5’−aaacggggcagaaagaaactc−3’(配列番号10)とリバースプライマー5’−cagttcacatcctccttc−3’(配列番号11)を用いて増幅し、CD137細胞内ドメインを得、PCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは126bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(iiiii) フォワードプライマー5’−cactggttatcaccagagtgaagttcagcaggagc−3’(配列番号12)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を用いて増幅し、CD3 zetaシグナルドメインを得、PCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは339bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(i) フォワードプライマー5’−accacgacgccagcgccg−3’(配列番号14)とリバースプライマー5’−cacccagaaaataataaag−3’(配列番号15)を用いてライゲーションし、CD8αヒンジドメイン−CD28膜貫通ドメインを得、ライゲーション条件は:CD8αヒンジドメイン(50ng)+CD28膜貫通ドメイン(50ng)初期変性:94℃、4min;変性:94℃、30s;アニーリング:60℃、30s;伸長:68℃、30s、5サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであり、DNAポリメラーゼおよびフォワード/リバースプライマーを補充した後、25サイクルのPCR増幅を行い、増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、30s;アニーリング:60℃、30s;伸長:68℃、30s、25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。理論的なサイズは216bpである。セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(ii) フォワードプライマー5’−aaacggggcagaaagaaactc−3’(配列番号10)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を用いてライゲーションして増幅し、CD137−CD3ζ、即ちBBZを得、ライゲーションおよびPCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは478bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(iii) フォワードプライマー5’−gtcaccgtctcctcaaccacgacgccagcg−3’(配列番号5)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を用いてCD8αヒンジドメイン−膜貫通ドメインをBBZとライゲーションし、且つPCRを行い、目的断片としてのCD8αヒンジドメイン−膜貫通ドメイン−BBZ細胞内ドメイン、即ちCD8−CD137−CD3ζを得、ライゲーションおよびPCR増幅条件は上記と同様であった。理論的なサイズは691bpである。セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
(iiii) フォワードプライマー5’−gtcaccgtctcctcaaccacgacgccagcg−3’(配列番号5)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を用いてCD8αヒンジドメイン−CD28膜貫通ドメイン−細胞内ドメインとZを上記と同様にライゲーションし、且つPCR増幅を行い、目的断片としてのCD8αヒンジドメイン−CD28膜貫通ドメイン−28Z細胞内ドメイン、即ちCD28a−CD28b−CD3ζを得、ライゲーションおよびPCR増幅条件は上記と同様であった。バンドの理論的なサイズは706bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
フォワードプライマー5’−cttacgcgtcctagcgctaccggtcgccaccatggtgagcaagggcgaggag−3’(配列番号16)とリバースプライマー5’−cggcctggcggcgtggagcag−3’(配列番号17)を用いてレンチウイルスベクターにおける3’末端にF2AおよびCD8αシグナルペプチドを有するeGFP核酸断片を増幅し、中国特許出願201310108532.2で開示されたpWPT−eGFP−F2A−806−Zを鋳型として、PCR増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:56℃、40s;伸長:68℃、50s、25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであり、理論的なサイズは883bpであり、セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
前記段落「(2) キメラ抗原受容体の他の部分の核酸配列」で増幅して得られた断片CD8−CD3ζ、CD8−CD137−CD3ζ、CD28a−CD28b−CD3ζ、CD28a−CD28b−CD137−CD3ζと、等モル量の前記段落「(3) キメラ抗原受容体の他の部分の核酸配列」で増幅して得られた3’末端にF2AおよびCD8αシグナルペプチドを有するeGFP核酸断片(質量は約50ngである)と、等モル量のscFv(GPC3)(質量は約50ngである)との三つの断片をそれぞれ、図2に示すパターンでライゲーションし、且つPCRを行い、ライゲーション条件は:初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:60℃、40s;伸長:68℃、140s、5サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであり、DNAポリメラーゼおよびフォワードプライマー5’−cttacgcgtcctagcgctaccggtcgccaccatggtgagcaagggcgaggag−3’(配列番号16)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を補充した後、25サイクルのPCR増幅を行い、増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:60℃、40s;伸長:68℃、140s、25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。増幅して得られたeGFP−GPC3−Z、eGFP−GPC3−BBZ、eGFP−GPC3−28ZおよびeGFP−GPC3−28BBZの理論的なサイズはそれぞれ2161bp、2278bp、2302bpおよび2428bpである。セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
A.抗EGFRの新規異性体EGFRvAの細胞内ドメインポリペプチド(WTE)の2D3一本鎖抗体核酸断片の獲得
抗WTEポリペプチドのハイブリドーマ2D3細胞株(上海鋭勁生物科技株式会社で調製する)mRNAを鋳型として、RT−PCRキットを用いて逆転写し、ファーストストランドcDNAを合成した。ファーストストランドcDNAを鋳型として、Heavy Primers、Light Primers Mixをプライマー(プライマーは上海鋭勁生物科技株式会社から購入する)として、VH、VL遺伝子をそれぞれ増幅し、PCR条件は:94℃で4min初期変性し、94℃で40s変性し、55℃で40sアニーリングし、68℃で40s伸長し、30サイクルを行った後、68℃で7min伸長した。セファロース電気泳動によりPCR産物を検出し、ゲル抽出キットでVH、VL断片をそれぞれ回収した。
Sfi I、Not Iで前記工程におけるscFv断片とpCANTAB 5Eベクター(Pharmacia社から購入する)を二重酵素切断し、ゲル抽出によって酵素断片を回収し、16℃で一晩ライゲーションした後、コンピテントE.coli HB2151に形質転換し、翌日、形質転換プレートから20個の単一クローンを引き出して30℃で培養し、OD600が0.4〜0.6になるまで培養した時点で、最終濃度0.05mmol/LのIPTGを加えて発現を一晩(18h)誘導した。遠心して上清を取り、培養上清における可溶性scFvの発現状況をELISAで解析した。具体的には、抗原WTE−BSA(上海鋭勁生物科技株式会社で調製する)によってそれぞれ50ng/ウェル(1ng/μl、50μl/ウェル)で96ウェルプレートを覆い、37℃で2hインキュベートし、5%PBS脱脂粉乳(光明乳業株式会社)によって37℃で2hブロッキングし、0.1Mのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で3回洗浄した後、前記で誘導発現した培養上清を一つのウェルにつき50μlで96ウェルプレートに入れ、37℃で1hインキュベートした。PBST(PBS+0.05%Tween20)で3回洗浄した後、HRP標識anti−E tag抗体(上海鋭勁生物科技株式会社から購入する)を1:1000で希釈し、50μl/ウェルで37℃で1hインキュベートした。PBSTで3回洗浄し、1:1000で希釈したヤギ抗マウスIgG−HRP(Santa Cruz社から購入する)を加え、37℃で1hインキュベートした。PBSTで5回洗浄し、ABTS発色液を100μl/ウェルで加え、37℃で遮光下で10min発色させた。Bio−Rad Model 680マイクロプレートリーダーを用いて、波長405nmで吸光度値を測定し、陰性コントロールウェルの吸光度値より2倍以上高いものを陽性とした。OD値が最も高いクローン2D3−3を取って塩基配列を決定した後、本出願に適用される無関連コントロールCARに用いられる一本鎖抗体2D3としてのプラスミドpCANTAB 5E 2D3−3 scFvを抽出し、且つそれと、前記段落「(2) キメラ抗原受容体の他の部分の核酸配列」で増幅して得られた断片CD28a−CD28b−CD137−CD3ζと、等モル量の前記段落「(3) キメラ抗原受容体の他の部分の核酸配列」で増幅して得られた3’末端にF2AおよびCD8αシグナルペプチドを有するeGFP核酸断片(質量は約50ngである)との三つの断片をそれぞれ、図2に示すパターンでライゲーションし、且つPCRを行い、ライゲーション条件は:初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:60℃、40s;伸長:68℃、140s、5サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであり、DNAポリメラーゼおよびフォワードプライマー5’−cttacgcgtcctagcgctaccggtcgccaccatggtgagcaagggcgaggag−3’(配列番号16)とリバースプライマー5’−gaggtcgacctagcgagggggcagggcctgcatg−3’(配列番号13)を補充した後、25サイクルのPCR増幅を行い、増幅条件は、初期変性:94℃、4min;変性:94℃、40s;アニーリング:60℃、40s;伸長:68℃、140s、25サイクルを行い、そして最終伸長:68℃、10minであった。増幅して得られたeGFP−2D3−28BBZの理論的なサイズは2443bpである。セファロース電気泳動により、増幅産物は理論的なサイズに一致することが確認した。
例示としての本発明にかかるレンチウイルスプラスミドベクターの構築に用いられるベクター系は、第3世代の自己不活性型レンチウイルスベクターシステムに属し、当該システムは、蛋白質Gag/Polをコードし、Rev蛋白質をコードするパッケージングプラスミドpsPAX2と、VSV−G蛋白質をコードするエンベローププラスミドPMD2.Gと、空ベクターpPWT−eGFPに基づき、目的遺伝子CARをコードする組換え発現ベクターとの合計で三つのプラスミドを含む。
6〜10代目まで培養した293T細胞(ATCC:CRL−11268)を10cm培養ディッシュに6×106の密度で接種し、37℃、5% CO2で一晩培養し、トランスフェクションに用いた。培地は10%牛胎児血清(PAA社)含有DMEM(PAA社)であり、翌日、トランスフェクションの約2時間前に、培地を無血清DMEMに変更した。
4.1 20μgの空プラスミドpWPT−eGFP(mockコントロール)または20μgの各目的遺伝子プラスミドpWPT−eGFP−F2A−CARをそれぞれ、15μgのパッケージングプラスミドPAX2および6μgのエンベローププラスミドpMD2.Gとともに500μL MillQ水中に溶解させ、均一に混合し、
4.2 62μL 2.5M CaCl2(Sigma社)を滴下し、1200rpm/minで均一に渦流混合し、
4.3 最後に500μL 2×HeBS(280mM NaCl、10mM KCl、1.5mM Na2HPO42H2O、12mMグルコース、50mM Hepes(Sigma社)、pH7.05、0.22μM濾過除菌)を滴下し、1200rpm/minで10s均一に渦流混合し、
4.4 直ちに培養ディッシュに滴下し、軽く振とうして均一にし、37℃、5% CO2で4〜6h培養した後、10%牛胎児血清含有DMEMに変更した。
1日目、1×105/mLの293T細胞を100μL/ウェルで96ウェル培養プレートに接種し、37℃、5% CO2で培養し、培地は10%牛胎児血清含有DMEMにした。2日目、50μL/ウェルの培養上清を捨て、最終濃度6μg/mLのポリブレンを含有する新鮮な前記培地を50μL/ウェルで追加し、37℃、5% CO2で30minインキュベートした。ウイルス原液を10μL/ウェルで、またはウイルス濃縮液を1μL/ウェルで加え,5倍に希釈し、勾配を4つにし、重複ウェルを2つにし、37℃、5% CO2で培養した。感染から48h後、フローサイトメーターによりeGFPを検出し、陽性率が5〜20%になる細胞数を好ましく選出し、力価(U/mL)=陽性率×希釈倍数×100×104で力価を算出した。リン酸カルシウムトランスフェクション法でパッケージングされた前記mock(即ち空ベクター)コントロールおよび各eGFP−F2A−CARを含むウイルスの力価はいずれも約0.5〜2×106U/mLのレベルであり、濃縮してから測定されたウイルスの力価は約2×107U/mLであった。
健常人末梢血から密度勾配遠心法によりヒト末梢血単核球(上海市血液センターから提供する)を獲得し、末梢血単核球からCTL細胞磁気ビーズ(Stem Cell Technologies)ネガティブ分離方法によりCTLを獲得し、分離されたCTL細胞について、フローサイトメトリーによりCTL細胞の純度を測定し、CTL細胞の陽性率≧95%のものを好ましく選出し、次の操作に進めた。Quantum 007リンパ球培地液(PAA社)を約1×106/mLの密度で加えて培養し、且つ細胞:磁気ビーズの比率が1:1になるように抗CD3およびCD28抗体で共に覆われた磁気ビーズ(Invitrogen社)と、最終濃度100U/mLの組換えヒトIL−2(上海華新生物高技術株式会社)とを加え、24h刺激培養した。そして、MOI≒5で前記レンチウイルスを用いてCTL細胞を感染した。感染された細胞を一日おきに5×105/mLの密度で継代するとともに、リンパ球培地に最終濃度100U/mLの組換えヒトIL−2を追加した。
インビトロ傷害性試験に使用される標的細胞は、下表3に示す肝細胞癌細胞系であり、エフェクター細胞は、実施例2で検証され、インビトロで12日間培養され、FACSによるキメラ抗原受容体発現検出における陽性細胞であり、キメラ抗原受容体陽性(CAR+)CTLと記す。
各試験群:各標的細胞+異なるキメラ抗原受容体を発現するCTL、
コントロール群1:標的細胞最大放出LDH、
コントロール群2:標的細胞自発放出LDH、
コントロール群3:エフェクター細胞自発放出LDH。
検出方法:CytoTox 96非放射性細胞傷害性検出キット(Promega社)を用いて行った。当該方法は比色法に基づく検出方法であり、51Cr放出法の代わりとして用いられる。CytoTox 96(登録商標)検出は乳酸脱水素酵素(LDH)を定量的に測定する。LDHは安定な細胞質酵素であり、細胞が溶解する時に放出され、その放出形態は放射性解析における51Crの放出形態と殆ど同様である。培地上清中に放出されたLDHは、30分間カップリングする酵素反応によって検出することができ、酵素反応において、LDHは一種のテトラゾリド(INT)を赤色のホルマザン(formazan)に変換させることができる。生成される赤色の産物の量は溶解した細胞の数に比例する。具体的には、CytoTox 96非放射性細胞傷害性検出キットの取扱説明書を参照する。
具体的には表4に示すように、本発明にかかるキメラ抗原受容体GPC3−Z CAR+を発現するCTLおよびGPC3−28BBZ CAR+を発現するCTLは、GPC3陽性の肝細胞癌細胞系HepG2、Huh−7、Hep3BおよびPLC/PRF/5細胞のいずれにも非常に顕著な特異的な細胞傷害作用を表し、且つエフェクター細胞対標的細胞比勾配依存性、つまり、エフェクター細胞対標的細胞比が高いほど、細胞傷害作用が強いことを示すが、GPC3陰性の肝細胞癌系SK−HEP−1に対して特異的な細胞傷害作用を有しない。ただし、GPC3−28BBZは、エフェクター細胞対標的細胞比が3:1である場合、GPC3陽性肝癌細胞HepG2に対する細胞傷害性が97%と高く、GPC3陽性肝癌細胞PLC/PRF/5に対する細胞傷害性が84%と高い。
動物の群分け:1群あたり6〜7匹で、6〜8週齢のNOD/SCIDマウス40匹を無作為に6群に分け、試験群はそれぞれGPC3−Z CAR Tリンパ球群、異なるエフェクター細胞対標的細胞比(1:1と1:2)のGPC3−28BBZ CAR Tリンパ球群であり、コントロール群はそれぞれGPC3−δZ CAR Tリンパ球群、mock CAR Tリンパ球コントロール群、および食塩水コントロール群であった。
腫瘍接種:対数増殖期にあり且つ良好に生長しているHuh−7細胞を収集し、生理食塩水で細胞密度を1×107/mlに調整し、注射体積を200μL(2×106/匹)にし、腫瘍接種の日を0日目とした。
腫瘍接種:対数増殖期にあり且つ良好に生長しているPLC/PRF/5細胞を収集し、生理食塩水で細胞密度を2.5×107/mLに調整し、注射体積を200μL(5×106/匹)にし、腫瘍接種の日を0日目とした。
腫瘍接種:対数増殖期にある良好なHuh−7(Luc+)を収集し、生理食塩水で細胞密度を1×108/mlに調整し、25μLの細胞懸濁液を25μLのmetrigelマトリックスゲルと(氷上で)混合し、無菌クリーンベンチ中で開腹術を行い、細胞をそれぞれ均一に混合し、40匹の6〜8週齢のNOD/SCIDマウスの肝臓右葉に(2.5×106/匹で)接種し、腫瘍接種の日を0日目とした。
Claims (8)
- ヒトTリンパ球表面に発現する抗GPC3キメラ抗原受容体蛋白質をコードする核酸であって、前記抗GPC3キメラ抗原受容体蛋白質は、GPC3のC末端エピトープを特異的認識する一本鎖抗体scFv(GPC3)を含む細胞外結合ドメインと、膜貫通ドメインと、細胞内シグナルドメインとがこの順で連結してなるものを含み、前記キメラ抗原受容体蛋白質は、配列番号22〜25のうちの一つの配列を有することを特徴とする、核酸。
- 配列番号18〜21のうちの一つの配列を有することを特徴とする、請求項1に記載の核酸。
- 請求項1または2に記載の核酸を含むベクター。
- 前記ベクターはレンチウイルスプラスミドpWPT−eGFPであって、且つ配列番号27〜30のうちの一つの核酸配列を有することを特徴とする、請求項3に記載のベクター。
- 請求項3または4に記載のベクターを含むウイルス。
- 請求項1または2に記載の核酸、または請求項3または4に記載のベクター、または請求項5に記載のウイルスが形質導入されたことを特徴とする、遺伝子修飾Tリンパ球。
- 配列番号18〜21のうちの一つの核酸でコードされて発現するキメラ抗原受容体をその表面に発現していることを特徴とする、遺伝子改変Tリンパ球。
- アミノ酸配列が配列番号22〜25から選ばれるものを有するキメラ抗原受容体をその表面に発現していることを特徴とする、遺伝子改変Tリンパ球。
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