JP6219481B2 - L−リジン生産能を有する微生物を用いてl−リジンを生産する方法 - Google Patents
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Description
ター、それらのポリヌクレオチドを含む微生物、及びそれを用いてL−リジンを生産する
方法に関する。
ム(Corynebacterium glutamicum)は、L−リジン生産に多く用いられるグラム陽性の微生
物である。L−リジンは、動物飼料、人間の医薬品及び化粧品産業に使用されており、コ
リネバクテリウム属菌株を用いた発酵により生産されている。
たL−リジンの生産方法が周知である。例えば、特許文献1には、lysE遺伝子(リジ
ン排出キャリア遺伝子)が強化され、dapA遺伝子、lysC遺伝子、pyc遺伝子及
びdapB遺伝子からなる群から選択される遺伝子がさらに導入されたコリネバクテリウ
ムを培養してL−リジンを生産する方法が開示されている。
する方法が用いられてきた。例えば、特許文献2と特許文献3では、それぞれddhとl
ysC−asdオペロンのプロモーターを改良し、コリネバクテリウムに導入してL−リ
ジンを生産する方法が開示されており、特許文献4では、リジン生合成経路遺伝子である
aspB、lysC、asd、dapA、dapB、lysA、pycを染色体内で2コ
ピーに増幅してリジン生産効率を向上させる方法が開示されている。
開始する開始コドンはATGであり、遺伝子の開始コドンによって翻訳レベルが異なって
調節されうるので、開始コドンの塩基配列はタンパク質活性調節において重要である。し
かし、一般的な開始コドンであるATGとは異なり、コリネバクテリウムグルタミカム由
来リジンの生合成関連遺伝子のうち、lysCとpycの開始コドンがGTGであり、ペ
ントースリン酸経路上に存在するtktの開始コドンがTTGであることが確認された(
非特許文献1)。
型であるlysC、tkt及びpyc遺伝子の開始コドンをATGに置換することにより
、アスパラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ及びピルビン酸カルボキシラーゼの活性
を内在的活性より増加させることができることを確認し、本発明を完成するに至った。
ysCともいう)、トランスケトラーゼ(transketolase; EC: 2.2.1.1; 以下、Tktとも
いう)、又はピルビン酸カルボキシラーゼ(pyruvate carboxylase; EC: 6.4.1.1; 以下、
Pycともいう)をコードするそれぞれのポリヌクレオチドの開始コドンをATGに置換
した変異型ポリヌクレオチドを提供することである。
ゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリヌクレ
オチドの少なくとも1つの変異型ポリヌクレオチドを含むベクターを提供することである
。
り増加した微生物を提供することである。
からL−リジンを回収する工程とを含む、L−リジンを生産する方法を提供することであ
る。
シラーゼをコードする各遺伝子、又は様々な組み合わせを含む全遺伝子の開始コドンを置
換することにより、当該酵素の活性が天然微生物の内在的活性より増加し、L−リジンの
生産能が向上したコリネバクテリウム属微生物を提供することができる。
LysCともいう)、トランスケトラーゼ(transketolase; EC: 2.2.1.1; 以下、Tktと
もいう)、又はピルビン酸カルボキシラーゼ(pyruvate carboxylase; EC: 6.4.1.1; 以下
、Pycともいう)をコードするそれぞれのポリヌクレオチドの開始コドンをATGに置
換した変異型ポリヌクレオチドを提供する。
コードするそれぞれのポリヌクレオチドは、それぞれの酵素活性を有するものであれば、
一部のヌクレオチドが置換、欠失、挿入及び付加されたものも含まれ、70%以上、好ま
しくは80%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、最も好ま
しくは100%の相同性を有する。
及びpyc遺伝子と、それらに対応する変異型遺伝子であって、一部のヌクレオチドが置
換、欠失、挿入及び付加されたlysC遺伝子、tkt遺伝子及びpyc遺伝子との核酸
配列の同一性の程度を示すものである。
コード配列がタンパク質に翻訳される際の翻訳開始点に該当する3つのヌクレオチドを意
味する。一般に微生物の染色体上で見られる開始コドンとしては、ATG(mRNA上で
はAUG)、GTG(mRNA上ではGUG)、及びTTG(mRNA上ではUUG)があり
、コリネバクテリウムグルタミカムの全ゲノム塩基配列の分析結果によれば、これらはそ
れぞれ62.5%〜66.5%、23.1%〜24.3%、及び10.3%〜13.2%
の割合で存在することが分かる(非特許文献2)。
のうちlysCとpycはGTGを開始コドンとして用い、tktはTTGを開始コドン
として用いる。すなわち、前記遺伝子はATGを開始コドンとして用いず、これはコリネ
バクテリウム固有の特徴とみなされる。
始コドンがATGに置換されたことを特徴とし、この開始コドンが置換された変異型ポリ
ヌクレオチドは、本発明者らにより最初に見出されたものである。より具体的には、本発
明により前記アスパラギン酸キナーゼ(LysC)及びピルビン酸カルボキシラーゼ(Py
c)をコードするポリヌクレオチドの開始コドンはGTGからATGに置換され、前記ト
ランスケトラーゼ(Tkt)をコードするポリヌクレオチドの開始コドンはTTGからAT
Gに置換される。より好ましくは、前記lysC、tkt、pycの遺伝子配列がそれぞ
れ配列番号13、14、15である場合、開始コドンがATGに置換された遺伝子配列は
それぞれ配列番号16、17、18である。
ite-specific mutagenesis)、相同組換えにより行われるが、これらに限定されるもので
はない。
ゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリヌクレ
オチドの少なくとも1つの変異型ポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリ
ヌクレオチドは、それぞれの酵素活性を有するものであれば、遺伝子の一部のヌクレオチ
ドが置換、欠失、挿入及び付加されたものも含まれ、70%以上、好ましくは80%以上
、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、最も好ましくは100%の
相同性を有する。
ギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異
型ポリヌクレオチドは、ATGに置換された開始コドンが含まれるものであれば、アスパ
ラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする遺
伝子の一部のみを含むものも含まれる。
るように、好適な調節配列に作動可能に連結された遺伝子の塩基配列を含有するDNA産
物を意味する。前記調節配列は、転写を開始しうるプロモーター、その転写を調節するた
めの任意のオペレーター配列、好適なmRNAリボソーム結合部位をコードする配列、並
びに転写及び翻訳の終結を調節する配列を含む。本発明において用いられるベクターは、
宿主内で複製可能なものであれば特に限定されるものではなく、当業界で公知の任意のベ
クターを用いることができる。例えば、プラスミド、ファージ粒子、又は単に潜在的ゲノ
ム挿入物であってもよく、好ましくは、pDZ(特許文献4)を用いることができるが、こ
れらに限定されるものではない。ベクターは好適な宿主内に形質転換された後、宿主ゲノ
ムに関係なく複製又は機能することができ、ゲノム自体に組み込まれてもよい。
列(それぞれ配列番号13、14及び15)を確保し、それに基づいて開始コドンがATG
に置換されたプライマーを合成した。このプライマーを用いて、L−リジン生産菌株の染
色体DNAを鋳型としてPCRを行うことにより、一方の末端がATGに置換されたDN
Aが得られた。得られたDNA断片をベクターにクローニングすることにより、最終的に
組換えベクターが得られた。より具体的には、本発明において、それぞれベクターpDZ
−lysC(ATG)、pDZ−tkt(ATG)及びpDZ−pyc(ATG)を作製した。
キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼからなる群から選択され
る少なくとも1つの酵素をコードする変異型ポリヌクレオチドを含み、これらから転写さ
れたmRNAのタンパク質への翻訳レベルが向上した結果として、前記酵素の少なくとも
1つの酵素の活性が内在的活性より増加した微生物を提供する。本発明の微生物は、AT
Gに置換された開始コドンを有する、アスパラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ又は
ピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリヌクレオチドを用いて、それぞれ1
種、2種又は3種の組み合わせにより当該酵素の活性が増加した形態であってもよい。
の様々な方法を用いることができる。例えば、微生物に内在するlysC、tkt及びp
ycの開始コドン配列を染色体上に置換することができ、他の方法としては、開始コドン
配列が置換された当該遺伝子をプラスミドの形態で微生物内に導入することもできる。
、コリネバクテリウム属又はブレビバクテリウム属微生物であることが好ましく、例えば
前記コリネバクテリウム属又はブレビバクテリウム属微生物としては、コリネバクテリウ
ムグルタミカムATCC13032、コリネバクテリウムサーモアミノゲネス(Corynebac
terium thermoaminogenes)FERM BP−1539、ブレビバクテリウムフラバム(Brev
ibacterium flavum)ATCC14067、ブレビバクテリウムラクトファーメンタム(Bre
vibacterium lactofermentum)ATCC13869が挙げられる。また、これらから作製
されたL−リジン生産突然変異体又は菌株、例えば、コリネバクテリウムグルタミカムK
CCM11016P(前記微生物はKFCC10881で公開されたが、ブダペスト条約
上の国際寄託機関に再寄託されてKCCM11016Pの寄託番号が与えられた;特許文
献5,特許文献6)、コリネバクテリウムグルタミカムKFCC11001が含まれ、最
も好ましくは、受託番号KCCM11016Pのコリネバクテリウムグルタミカムである
。
れぞれATGに置換された開始コドンを有する、アスパラギン酸キナーゼ、トランスケト
ラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードするポリヌクレオチドを含むベクターで
形質転換することにより組換えコリネバクテリウムグルタミカムが得られ、より具体的に
は、受託番号KCCM11016Pのコリネバクテリウムグルタミカムにそれぞれベクタ
ーpDZ−lysC(ATG)、pDZ−tkt(ATG)又はpDZ−pyc(ATG)を導
入することにより組換えコリネバクテリウムグルタミカムが得られた。
をコードするポリヌクレオチドを含むベクターpDZ−lysC(ATG)、pDZ−tk
t(ATG)及びpDZ−pyc(ATG)をコリネバクテリウムグルタミカムKCCM11
016Pに導入して得た形質転換体KCCM11016P−lysC−pyc−tktを
コリネバクテリウムグルタミカムCA01−2059と命名し、2011年5月2日付け
でブダペスト条約上の国際寄託機関である韓国微生物保存センター(Korean Culture cent
er of Microorganisms, 以下、「KCCM」略称する)に受託番号KCCM11188P
として寄託した。すなわち、前記寄託は、ブダペスト条約に基づいて国際寄託機関に寄託
されたものである。
れたことを特徴とし、それによりlysC、tkt及びpyc遺伝子から転写された各m
RNAのタンパク質への翻訳レベルが大幅に増加した結果、アスパラギン酸キナーゼ、ト
ランスケトラーゼ及びピルビン酸カルボキシラーゼの酵素活性が野生型酵素の内在的活性
より増加したことを特徴とする。
し、例えば、コリネバクテリウム属微生物が天然に有する、アスパラギン酸キナーゼ、ト
ランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼの酵素活性を意味する。「内在的活性
の増加」とは、天然状態の酵素活性に比べて活性がさらに向上したことを意味する。
ン酸キナーゼ酵素活性を親菌株であるKCCM11016Pと比較した結果、2.73倍
増加したアスパラギン酸キナーゼ活性を示すことが確認された(表4)。また、tkt遺伝
子の開始コドンがATGに置換された菌株が示すトランスケトラーゼ酵素活性を親菌株で
あるKCCM11016Pと比較した結果、3.5倍増加したトランスケトラーゼ活性を
示すことが確認された(表5)。また、pyc遺伝子の開始コドンがATGに置換された菌
株が示すピルビン酸カルボキシラーゼ活性を親菌株であるKCCM11016Pと比較し
た結果、1.89倍増加したピルビン酸カルボキシラーゼ活性を示すことが確認された(
表6)。
組み合わせの活性を増加させることにより、微生物のL−リジン生産性が向上する。
KCCM11016P−lysC、KCCM11016P−tkt、KCCM11016
P−pyc、KCCM11016P−lysC−tkt、KCCM11016P−lys
C−pyc、KCCM11016P−lysC−pyc−tktから生産されたL−リジ
ン生産量を測定した結果、親菌株であるKCCM11016Pと比較して著しく向上した
L−リジン生産量を示すことが分かった(表7)。同様に、lysC、pyc及びtktの
開始コドンがATGに置換された、KFCC10750(特許文献7)、KCCM1077
0P(特許文献4)、CJ3P(非特許文献3)のコリネバクテリウムグルタミカム属に属す
る他のリジン生産菌株においても、親菌株と比較して著しく向上したL−リジン生産量を
示すことが分かった(表8〜10)。このような結果は、染色体上でATGに変異した開始
コドンを有するLysC、Tkt、Pycをコードする変異型ポリヌクレオチドをそれぞ
れ1種類ずつ保有する微生物、LysC及びTkt、LysC及びPyc、Tkt及びP
ycをコードする変異型ポリヌクレオチドをそれぞれ2種類ずつ保有する微生物、Lys
C、Tkt及びPycをコードする変異型ポリヌクレオチドを3種類全て保有する微生物
が野生型のGTG又はTTG開始コドンを有する微生物より著しく向上したL−リジン生
産効率を示すことを裏付けるものである。
養培地からL−リジンを回収する工程とを含む、L−リジンを生産する方法を提供する。
ことができる。前記培養は、周知の方法で行うことができ、培養温度、培養時間、培地の
pHなどの条件は適宜調節することができる。これら周知の培養方法は、非特許文献4及
び5に詳細に記述されている。また、培養方法にはバッチ培養(batch culture)、連続培
養(continuous culture)及び流加培養(fed-batch culture)が含まれ、好ましくは、バッ
チプロセス又は流加もしくは反復流加プロセス(fed batch or repeated fed batch proce
ss)で連続して培養することができるが 、これらに限定されるものではない。
リネバクテリウム属微生物の培養培地は公知である(例えば、非特許文献6)。用いること
のできる糖源としては、グルコース、サッカロース、ラクトース、フルクトース、マルト
ース、デンプン、セルロースなどの糖及び炭水化物、大豆油、ヒマワリ油、ヒマシ油、コ
コナッツ油などの油脂、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸などの脂肪酸、グリセ
リン、エタノールなどのアルコール、酢酸などの有機酸が挙げられる。これらの物質は、
単独で用いることもでき、混合物として用いることもできる。用いることのできる窒素源
としては、ペプトン、酵母抽出物、肉汁、麦芽抽出物、トウモロコシ浸漬液、大豆ミール
及び尿素、又は無機化合物、例えば硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、リン酸アンモ
ニウム、炭酸アンモニウム及び硝酸アンモニウムが挙げられる。窒素源は、単独で用いる
こともでき、混合物として用いることもできる。用いることのできるリン源としては、リ
ン酸二水素カリウム又はリン酸水素二カリウム、若しくはそれらに相当するナトリウム含
有塩が挙げられる。また、培養培地は、成長に必要な硫酸マグネシウム又は硫酸鉄などの
金属塩を含有しなければならない。前記物質以外にも、アミノ酸及びビタミンなどの必須
成長物質が含まれてもよい。また、培養培地に好適な前駆体が用いられてもよい。前述し
た原料は、培養過程において培養物に好適な方法でバッチ式又は連続的に添加されてもよ
い。
のような酸化合物を好適な方法で用いて培養物のpHを調節することができる。また、脂
肪酸ポリグリコールエステルなどの消泡剤を用いて気泡生成を抑制することができる。好
気状態を保持するために、培養物内に酸素又は酸素含有気体(例えば、空気)を注入する。
培養物の温度は、通常20℃〜45℃、好ましくは25℃〜40℃である。培養は、L−
リジンの所望の生成量が最大限に得られるまで続ける。このような目的で、通常10〜1
60時間で達成される。L−リジンは、培養培地中に排出されるか、微生物中に含まれて
いる場合もある。
ジンを回収する工程を含む。微生物又は培養培地からL−リジンを回収する方法は当業界
で周知である。前記L−リジン回収方法には、濾過、陰イオン交換クロマトグラフィー、
結晶化及びHPLCなどを用いることができるが、これらに限定されるものではない。
以下、実施例を挙げて本発明をより詳細に説明する。しかし、これらの実施例は本発明
を例示的に示すものであり、本発明の範囲がこれらの実施例に限定されるものではない。
016Pに由来するアスパラギン酸キナーゼの遺伝子lysC、トランスケトラーゼの遺
伝子tkt、及びピルビン酸カルボキシラーゼの遺伝子pycの開始コドンをGTG又は
TTGからATGに置換するための組換えベクターを作製した。前記ベクターをコリネバ
クテリウムグルタミカムKCCM11016P菌株に形質転換して染色体上の開始コドン
が置換された菌株を得ることにより、リジン生産効率が増加した菌株を作製した。
コリネバクテリウムグルタミカム野生株(ATCC13032)を親菌株として人工変異法
により作製された、S−(2−アミノエチル)システイン(AEC)に対する耐性及びホモセリ
ン流出(homoserine leaky)の特徴を有する菌株である(KFCC10881で公開された
。特許文献5、6参照)。また、KFCC10750菌株は、人工変異法により作製され
たホモセリン栄養要求性と、L−ロイシン類似体である4−アザロイシン及び抗生剤の一
種であるリファンピシンに対する耐性とを有するコリネバクテリウムグルタミカムL−リ
ジン生産菌株であり(特許文献7)、KCCM10770P菌株は、リジン生合成経路構成
遺伝子のうち6種を染色体上に2コピーずつ保有する、KCCM11016P由来のL−
リジン生産菌株であり(特許文献4)、CJ3P菌株は、Binderらにより報告された
技術(非特許文献3)に基づいて、野生株のpyc、hom、lysC遺伝子3種にそれぞ
れP458S、V59A、T311I変異を導入してL−リジン生産能を付与したコリネ
バクテリウムグルタミカム菌株である。
された組換えベクター(pDZ−lysC(ATG))の作製、及び開始コドン置換菌株の作
製
組換えベクターは、pDZ(特許文献4参照)を基本ベクターとして用いた。作製過程は
次の通りである。
コリネバクテリウムグルタミカム由来lysC遺伝子を確保するために、人工変異法に
より作製されたリジン生産菌株(コリネバクテリウムグルタミカムKCCM11016P)
の染色体DNAを鋳型として用いた。米国国立保健研究所の遺伝子バンク(NIH GenBank)
に基づいてlysC遺伝子(NCBI登録番号NC_003450,Ncgl0247)の
開始コドン部位を含む塩基配列を確保し(配列番号13)、これに基づいて開始コドンをG
TGからATGに置換するための2対のプライマー(表1,配列番号1〜4)を合成した。
Rを行った。ポリメラーゼにはPfuUltraTMハイファイDNAポリメラーゼ(Str
atagene社)を用いた。PCR条件は、96℃で30秒間の変性、55℃で30秒間のアニ
ーリング、及び72℃で30秒間の重合反応を30サイクル繰り返した。こうして得られ
た2つのDNA断片を、制限酵素XbaIで処理したpDZベクターにIn−Fusio
n PCR クローニングキット(Clontech社)でクローニングすることにより、最終的にp
DZ−lysC(ATG)組換えベクターを作製した。
作製したpDZ−lysC(ATG)ベクターをKCCM11016Pに電気パルス法で
形質転換し(非特許文献7による形質転換法を用いる)、その後カナマイシン25mg/L
を含有する選択培地で染色体上の同遺伝子との相同性に基づいて挿入された菌株を選択し
た。ベクターの染色体挿入が成功したか否かは、X−gal(5−ブロモ−4−クロロ−
3−インドリル−β−D−ガラクトシド)を含む固体培地で青色を示すか否かにより確認
することができる。染色体が1次挿入された菌株を栄養培地で振盪培養(30℃,8時間)
し、その後それぞれ10−4から10−10に希釈し、X−galを含む固体培地に塗抹
した。ほとんどのコロニーが青色を示すのに対して、低い割合で出現する白色のコロニー
を選択することにより、2次交差(crossover)によりlysCの開始コドン部位の塩基配
列が置換された菌株を選択した。選択した菌株の開始コドンの塩基置換が行われたか否か
は、配列番号1及び4のプライマーを用いてPCRを行い、その後標的部位の塩基配列分
析過程を経て最終確認した。
れた組換えベクター(pDZ−tkt(ATG))の作製、及び開始コドン置換菌株の作製
tkt遺伝子は配列上に開始コドンと予想される2つのコドンが存在するが、RBS(
リポゾーム結合部位)との距離プロテオミクス(proteomics)の結果とに基づいて、本発明
においては下流に存在するコドンを開始コドンとした。
コリネバクテリウムグルタミカム由来tkt遺伝子を確保するために、KCCM110
16Pの染色体DNAを鋳型として用いた。米国国立保健研究所のジェンバンク(NIH Gen
Bank)に基づいてtkt遺伝子(NCBI登録番号NC_003450,Ncgl1512
)の開始コドン部位を含む塩基配列を確保し(配列番号14)、これに基づいて開始コドン
をTTGからATGに置換するための2対のプライマー(表2,配列番号5〜8)を合成し
た。
例1−1の条件でPCRを行った。こうして得られた2つのDNA断片を、制限酵素Xb
aIで処理したpDZベクターにIn−Fusion PCR クローニングキット(Clont
ech社)でクローニングすることにより、最終的にpDZ−tkt(ATG)組換えベクター
を作製した。
作製したpDZ−tkt(ATG)ベクターを実施例1−2と同じ過程でリジン生産菌株
KCCM11016Pに形質転換し、2次交差過程を経て染色体上でtktの開始コドン
がATGに置換されたKCCM11016P−tktを得た。遺伝子の開始コドンの塩基
置換が行われた否かは、配列番号5及び8のプライマーを用いてPCRを行い、その後標
的部位の塩基配列分析により最終確認した。
れた組換えベクター(pDZ−pyc(ATG))の作製、及び開始コドン置換菌株の作製
(1)pDZ−pyc(ATG)組換えベクターの作製
コリネバクテリウムグルタミカム由来pyc遺伝子を確保するために、KCCM110
16Pの染色体DNAを鋳型として用いた。米国国立保健研究所のジェンバンクに基づい
てpyc遺伝子(NCBI登録番号NC_003450,Ncgl0659)の開始コドン
部位を含む塩基配列を確保し(配列番号15)、これに基づいて開始コドンをGTGからA
TGに置換するための2対のプライマー(表3,配列番号9〜12)を合成した。
例1−1の条件でPCRを行った。こうして得られた2つのDNA断片を、制限酵素Xb
aIで処理したpDZベクターにIn−Fusion PCR クローニングキット(Clont
ech社)でクローニングすることにより、最終的にpDZ−pyc(ATG)組換えベクター
を作製した。
作製したpDZ−pyc(ATG)ベクターを実施例1−2と同じ過程でリジン生産菌株
KCCM11016Pに形質転換し、2次交差過程を経て染色体上でpycの開始コドン
がATGに置換されたKCCM11016P−pycを得た。遺伝子の開始コドンの塩基
置換が行われたか否かは、配列番号9及び12のプライマーを用いてPCRを行い、その
後標的部位の塩基配列分析により最終確認した。
ン酸キナーゼ酵素活性の測定
対数期の菌体を遠心分離(5,000rpm,15分)により回収し、0.1%Tris
.HCl(pH8.0)緩衝液で3回洗浄し、その後同緩衝液で610nmの濁度が160
程度になるように懸濁した。懸濁液1.5ml当たり1.25gのガラスビーズ(glass b
ead)を添加し、その後ビーズ式粉砕機(bead beater)を用いて6分間菌体を破砕した。遠
心分離(15,000rpm,20分)により上清を回収し、ブラッドフォード方法(非特
許文献8)によりタンパク質濃度を定量し、その後アスパラギン酸キナーゼ(LysC)酵
素活性の測定のための粗タンパク質溶液として用いた。LysC酵素活性の測定は、0.
1M Tris.HCl(pH8.0)、0.01M塩化マグネシウム(MgCl2)、0.
6M塩酸ヒドロキシルアミン(Hydroxylamine.HCl)(pH7.0)、4mM ATP、0.2
Mアスパラギン酸塩(Aspartate)を含む反応液に0.05mlの粗タンパク質溶液を添加
することにより反応を開始した。30℃で30分間反応させ、その後停止液(stop soluti
on)(10%FeCl2,3.3%TCA,0.7N HCl)を添加して反応を終了させ、
遠心分離により上清を回収し、540nmで吸光度を測定した。LysC酵素活性単位(
U)は、1分間に1mgのタンパク質を生成するアスパラギン酸塩ヒドロキサメートのn
moleと定義した。
016Pと比較した結果、2.73倍増加したLysC活性を示すことが確認された(表
4)。
ラーゼ酵素活性の測定
対数期の菌体を遠心分離(5,000rpm,15分)により回収し、0.1%Tris
.HCl(pH7.5)緩衝液で3回洗浄し、その後同緩衝液で610nmの濁度が160
程度になるように懸濁した。懸濁液1.5ml当たり1.25gのガラスビーズを添加し
、その後ビーズ式粉砕機を用いて6分間菌体を破砕した。遠心分離(15,000rpm
,20分)により上清を回収し、ブラッドフォード方法によりタンパク質濃度を定量し、
その後トランスケトラーゼ(Tkt)酵素活性の測定のための粗タンパク質溶液として用い
た。Tkt酵素活性の測定は、1ml当たり0.1M Tris.HCl(pH7.5)、
10mM D−R5P、2mM D−Xu5P、10μM ThDP、1.2mM MgCl
2、100μM NADH、1unitトリオースリン酸イソメラーゼ(triosephosphate
isomerase)、1unitグリセロール−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(glycerol-3-phosph
ate dehydrogenase)を含む反応液に粗タンパク質溶液を添加することにより反応を開始し
た。30℃で20〜30分間反応させ、340nmで吸光度を測定した。Tkt酵素活性
単位(U)は、1分間に1μmolのグリセルアルデヒド3−リン酸(glyceraldehyde 3-ph
osphate)の形成を促進する酵素の量(mg)と定義し、比活性度(specific activity)はu
nits/mgと定義した(非特許文献9)。
6Pと比較した結果、3.5倍増加したTkt活性を示すことが確認された(表5)。
ルボキシラーゼ酵素活性の測定
対数期の菌体を遠心分離(5,000rpm,15分)により回収し、50mM塩化ナト
リウムを含む50mM Tris.HCl(pH6.3)緩衝液で2回洗浄し、その後20
%グリセリンを含む100mM HEPES(pH7.5)緩衝液で懸濁した。懸濁液にC
TABを0.3%となるように添加し、その後氷中に1分間放置した。菌体を遠心分離(
5,000rpm,10分)により回収し、その後100mM Tris.HCl(pH7
.3)緩衝液で懸濁した。ブラッドフォード方法によりタンパク質濃度を定量し、その後
ピルビン酸カルボキシラーゼ(Pyc)酵素活性の測定のための粗タンパク質溶液として用
いた。Pyc酵素活性の測定は、25mM NaHCO3、5mM MgCl2、3mMピ
ルビン酸塩、4mM ATPを含む反応液に粗タンパク質を添加することにより反応を開
始した。30℃で1.5分間反応させ、その後80μlの停止液(30% ο-リン酸)を添加
して反応を終了させ、遠心分離(12,000rpm,15分,4℃)により上清を回収し
た。1ml当たり50μlの上清、150mM Tris.HCl(pH7.8)、150
μM NADH、2.5U乳酸デヒドロゲナーゼ(lactate dehydrogenase)を添加し、その
後37℃、340nmで吸光度を測定した。Pyc酵素活性単位(U)は、1分間に1mg
のタンパク質を生成する乳酸塩のnmoleと定義した。
6Pと比較した結果、1.89倍増加したPyc活性を示すことが確認された(表6)。
せにより少なくとも2つの遺伝子の開始コドンがATGに置換された菌株の開発
組換えベクターは、実施例1、2、3で作製したpDZ−lysC(ATG)、pDZ−
tkt(ATG)、pDZ−pyc(ATG)を用いた。作製過程は次の通りである。
TGからATGに置換されたKCCM11016P−lysCに形質転換し、2次交差過
程を経て染色体上でlysCとtktの開始コドンがATGに置換されたKCCM110
16P−lysC−tktを得た。遺伝子の開始コドンの塩基置換が行われたか否かは、
配列番号5及び8のプライマーを用いてPCRを行い、その後標的部位の塩基配列分析に
より最終確認した。
sCの開始コドンがGTGからATGに置換されたKCCM11016P−lysCに形
質転換し、2次交差過程を経て染色体上でlysCとpycの開始コドンがATGに置換
されたKCCM11016P−lysC−pycを得た。遺伝子の開始コドンの塩基置換
が行われた否かは、配列番号9及び12のプライマーを用いてPCRを行い、その後標的
部位の塩基配列分析により最終確認した。
ドンがGTGからATGに置換されたKCCM11016P−lysC−pycに形質転
換し、2次交差過程を経て染色体上でlysC、pyc及びtktの開始コドンがATG
に置換されたKCCM11016P−lysC−pyc−tktを得た。遺伝子の開始コ
ドンの塩基置換が行われたか否かは、配列番号5及び8のプライマーを用いてPCRを行
い、その後標的部位の塩基配列分析により最終確認した。
これらに限定されるものではない。
実施例1、2、3、7で最終的に作製したKCCM11016P−lysC、KCCM
11016P−tkt、KCCM11016P−pyc、KCCM11016P−lys
C−tkt、KCCM11016P−lysC−pyc、KCCM11016P−lys
C−pyc−tktをL−リジンの生産のために下記の方法で培養した。
M11016P、KCCM11016P−lysC、KCCM11016P−tkt、K
CCM11016P−pyc、KCCM11016P−lysC−tkt、KCCM11
016P−lysC−pyc、KCCM11016P−lysC−pyc−tktを接種
し、30℃で20時間(200rpm)振盪培養した。下記の生産培地24mlを含有する
250mlのバッフル付三角フラスコに1mlの種培養液を接種し、30℃で120時間
(200rpm)振盪培養した。
11016P、KCCM11016P−lysC、KCCM11016P−tkt、KC
CM11016P−pyc、KCCM11016P−lysC−tkt、KCCM110
16P−lysC−pyc、KCCM11016P−lysC−pyc−tktに対する
培養液中のL−リジンの生産量の結果は下記表7の通りである。
原糖20g,ペプトン10g,酵母抽出物5g,尿素1.5g,KH2PO4 4g,
K2HPO4 8g,MgSO47H2O 0.5g,ビオチン100μg,チアミンHC
l 1000μg,パントテン酸カルシウム2000μg,ニコチンアミド2000μg(
蒸留水1リットル中)
ブドウ糖100g,(NH4)2SO4 40g,大豆タンパク質2.5g,コーンステ
ィープソリッド(Corn Steep Solids)5g,尿素3g,KH2PO4 1g,MgSO47
H2O 0.5g,ビオチン100μg,チアミン塩酸塩1000μg,パントテン酸カ
ルシウム2000μg,ニコチンアミド3000μg,CaCO3 30g(蒸留水1リッ
トル中)
カムKCCM11016P−lysC、KCCM11016P−tkt、KCCM110
16P−pyc、KCCM11016P−lysC−tkt、KCCM11016P−l
ysC−pycは、親菌株であるKCCM11016Pに比べて、L−リジン生産が4〜
9%増加したことが確認され、特に、3種の形質が全て導入されたKCCM11016P
−lysC−pyc−tktは、親菌株であるKCCM11016Pに比べて、L−リジ
ン生産が実に12%も増加したことが確認された。
C10750由来菌株の開発、及びリジン生産能の比較
コリネバクテリウムグルタミカムに属する他のリジン生産菌株においても、lysC、
pyc、tkt遺伝子の開始コドンをATGに置換した場合にリジン生産能増加効果があ
るかを確認するために、L−リジン生産菌株であるコリネバクテリウムグルタミカムKF
CC10750(特許文献7)に、実施例8で最も優れたリジン生産能増加効果を示した3
種の形質を全て導入した組換え菌株を作製し、KFCC10750−lysC−pyc−
tktと命名した。実施例8と同様の方法で培養し、そのL−リジン濃度を分析した(表
8)。
KFCC10750−lysC−pyc−tktは、親菌株KFCC10750に比べて
、リジン生産が15%増加した。
CM10770P由来菌株の開発、及びリジン生産能の比較
他のL−リジン生産菌株であるコリネバクテリウムグルタミカムKCCM10770P
(特許文献4)に、実施例8で最も優れたリジン生産能増加効果を示した3種の形質を全て
導入した組換え菌株を作製し、KCCM10770P−lysC−pyc−tktと命名
した。実施例8と同様の方法で培養し、そのL−リジン濃度を分析した(表9)。
KCCM10770P−lysC−pyc−tktは、親菌株KCCM10770Pに比
べて、リジン生産が11%増加した。
換された菌株の開発、及びリジン生産能の比較
さらに他のL−リジン生産菌株であるコリネバクテリウムグルタミカムCJ3P(非特
許文献3)に、実施例8で最も優れたリジン生産能増加効果を示した3種の形質を全て導
入した組換え菌株を作製し、CJ3P−lysC−pyc−tktと命名した。実施例8
と同様の方法で培養し、そのL−リジン濃度を分析した(表10)。
本発明は以下の態様を包含し得る。
[1] アスパラギン酸キナーゼ(LysC)、トランスケトラーゼ(Tkt)、又はピルビン酸カルボキシラーゼ(Pyc)をコードするそれぞれのポリヌクレオチドの開始コドンをATGに置換した変異型ポリヌクレオチド。
[2] 前記アスパラギン酸キナーゼ(LysC)又はピルビン酸カルボキシラーゼ(Pyc)をコードするポリヌクレオチドの開始コドンがGTGであり、前記トランスケトラーゼ(Tkt)をコードするポリヌクレオチドの開始コドンがTTGである上記[1]に記載の変異型ポリヌクレオチド。
[3] 前記変異型ポリヌクレオチドが、配列番号16、17又は18の塩基配列で表される上記[1]に記載の変異型ポリヌクレオチド。
[4] ATGに置換された開始コドンを有する、アスパラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリヌクレオチドを少なくとも1つ含むベクター。
[5] ATGに置換された開始コドンを有する、アスパラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ又はピルビン酸カルボキシラーゼをコードする変異型ポリヌクレオチドを少なくとも1つ含むことにより、前記酵素の少なくとも1つの酵素の活性が内在的活性より増加した微生物。
[6] 前記微生物が、上記[4]のベクターで形質転換された上記[5]に記載の微生物。
[7] 前記微生物が、コリネバクテリウム属微生物である上記[5]に記載の微生物。
[8] 前記コリネバクテリウム属微生物が、コリネバクテリウムグルタミカム(Corynebacterium glutamicum)である上記[7]に記載の微生物。
[9] 上記[5]〜[8]のいずれかによる微生物を培養する工程と、
前記培養した微生物又は培養培地からL−リジンを回収する工程とを含む、L−リジンを生産する方法。
Claims (4)
- アスパラギン酸キナーゼ、トランスケトラーゼ及びピルビン酸カルボキシラーゼからなる群より選択される2つの酵素活性が内在的活性より増加したリジン生産微生物であって、
前記酵素をコードするポリヌクレオチドの開始コドンが、ATGに置換されており、
前記微生物が、コリネバクテリウムグルタミカム(Corynebacterium glutamicum)である、リジン生産微生物。 - 請求項1に記載の微生物を培養する工程と、
前記培養した微生物又は培養培地からL−リジンを回収する工程とを含む、L−リジンを生産する方法。 - 前記アスパラギン酸キナーゼ(LysC)又はピルビン酸カルボキシラーゼ(Pyc)をコードするポリヌクレオチドの置換前の開始コドンがGTGであり、前記トランスケトラーゼ(Tkt)をコードするポリヌクレオチドの置換前の開始コドンがTTGである、請求項1に記載のリジン生産微生物。
- 前記置換ポリヌクレオチドが、配列番号16、17又は18の塩基配列で表される請求項1に記載のリジン生産微生物。
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