JP5837891B2 - 感染性インフルエンザウイルスの発生のためのトランスフェクションシステム - Google Patents
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Description
RNAウイルスのゲノムは、単一分子またはセグメント化分子、(+)または(−)極性の1本鎖もしくは2本鎖などの種々のコンホメーションを有している。しかし、次の2つの本質的で、一般的な要件がウイルスの間に共有されている。(1)ゲノムRNAは、子孫ウイルス粒子へのアセンブリーに効果的に使用することができる形態に効率よくコピーされなければならず、(2)ウイルスタンパク質に効率よく翻訳することができるmRNAが合成されなければならない。一般的に、RNAウイルス(レトロウイルスを除く)は、新たなゲノムRNA(子孫へのアセンブリーのため)およびmRNA(ウイルスタンパク質への翻訳のため)の合成を触媒するRNA依存性RNAポリメラーゼをコードかつ/または保有する。真核宿主細胞は一般的に、RNA鋳型を複製する、あるいはマイナス鎖または2本鎖RNA鋳型からポリペプチドを翻訳する機構を含んでいないので、ゲノム内にこれらの核酸を含むウイルスは、ウイルス粒子中にRNAポリメラーゼタンパク質を保有しなければならない。このような理由から、マイナス鎖または2本鎖RNAウイルスの脱タンパク質RNA分子(関連RNAポリメラーゼを欠いている)は、非感染性である。これと対照的に、プラス鎖RNAウイルスのゲノムからの脱タンパク質RNAは、一般的に、コードされたウイルスタンパク質が宿主細胞の機構により翻訳されるので、感染性である。
オルトミクソウイルスであるインフルエンザA型ウイルスは、マイナスセンスRNAウイルスであり、セグメント化されたゲノムを有する。ゲノムRNAは、5’および3’末端における非コーディング配列が両端に隣接する1つまたは複数のオープンリーディングフレームを含む(デッセルベルガーら(Desselberger et al.)、Gene 1980年、第8巻、315ページ)。ウイルスRNAは、ビリオン中および感染細胞中でウイルス核タンパク質(NP)およびポリメラーゼタンパク質(PB1、PB2およびPA)と結合して、リボ核タンパク質(RNP)複合体を形成する(シューら(Hsu et al.)、Proc Natl.Acad.Sci.米国1987年、84巻、8140ページ)。その遺伝組成は、このウイルスが異なる株からの遺伝子セグメントの再構築によって発生することを可能にする。この再構築によって、新たに感染した生物が既往免疫応答を示さない新たな変異株が生ずる。水鳥において循環するインフルエンザの15種の赤血球凝集素(HA)および9種のノイラミニダーゼ(NA)サブタイプのうち、3種、すなわち、H1N1、H2N2およびH3N2サブタイプがヒトにおける汎流行病を引き起こしたことが知られている(ウェブスターら(Webster et al.)、Microbiol.Rev.1992年、第56巻、152ページ)。ヒトで病原性の新しい株を発生させるための中間宿主(「混合容器」)としてブタを使用できることが示されている(ショルティセクら(Scholtissek et al.)、Virology 1985年、第147巻、287ページ)。1997年に香港でH5N1インフルエンザAが大発生したことから、高度病原性インフルエンザA型ウイルスがトリ種から直接にヒトに伝播する可能性もあることがわかる(クラースら(Claas et al.)、Lancet 1998年、第351巻、472ページ;スアレツら(Suarez et al.)、J.Virol.1998年、第72巻、6678ページ;スバラオら(Subbarao et al.)、Science 1998年、第279巻、393ページ;ショートリッジ(Shortridge)、Vaccine 1999年、第17巻(増刊)、S26−S29ページ)。インフルエンザA型ウイルスが天然貯蔵庫における莫大な数の循環株から新たな病原性株を発生させる能力があることから、疾患のコントロールには、これらのウイルスをモニターすることと、進歩した抗ウイルス療法とワクチンを開発する必要があることがわかる。新株が発生する速度に対応するには、モニタリング努力の監視が必要であり、流行病または汎流行病を予防するために新たに同定された病原性株に対する十分な量のワクチンが生産できるように現行の技術を改良する必要がある。
ロタウイルス属のウイルスを含むレオウイルス科に属するウイルスは、二本鎖のセグメントRNAゲノムを含んでいる。ヒトロタウイルスは、年間約50,000件の入院と20−50例の死亡の原因となっており、推定年間医療費が10億ドルを超える米国における重症の小児下痢の最も一般的なウイルス病原体である。発展途上国では、ロタウイルスは、すべての下痢関連の入院の1/3の原因であり、また、年間約850,000例の死亡の原因となっている。
米国および欧州における使用が公衆衛生当局によって現在認可されているインフルエンザワクチンは、不活性化インフルエンザワクチンである。疫学的に重要なインフルエンザAおよびインフルエンザB株をもたらすウイルスを発育鶏卵中で成長させ、その後、ウイルス粒子を精製し、化学的手段によって不活性化する。毎年、WHOは循環する可能性のあるサブタイプを選択している。現在、インフルエンザAの2つの株(H1N1およびH3N2)とB株がある。
本発明に従って、通常の分子生物学、微生物学および組換えDNA技術を当技術分野の熟練の範囲内で用いることができる。そのような技術は、文献に十分に説明されている。例えば、サンブルック、フリッシュおよびマニアチス(Sambrook、Fritsch & Maniatis)、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、第2版(1989年)Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、New York(本明細書では「サムブルックら(Sambrook et al)、1989年」);DNA Cloning:A Practical Approach、第IおよびII巻(ディーエヌ グローバー(D.N.Glover)編、1985年);Oligonucleotide Synthesis(エムジェー ガイト(M.J.Gait)編、1984年);Nucleic Acid Hybridization[ビーディー ハメス、エスジェー ヒギンス(B.D.Hames & S.J.Higgins)編(1985年)];Transcription And Translation[B.D.Hames & S.J.Higgins編(1984年)];Animal Cell Culture[アールアイ フレシュネイ(R.I.Freshnery)編(1986年)];Immobilized Cells And Enzymes[IRL Press(1986年)];ビー パーバル(B.Perbal)、A Practical Guide To Molecular Cloning(1984年);エフエム オースベルら(F.M.Ausubel et al.)編、Current Protocols in Molecular Biology、John Wiley & Sons,Inc.(1994年)を参照のこと。
上記のように、本発明はRNAウイルス感染、好ましくはマイナス鎖RNAウイルス感染を治療または予防するためのワクチンの生産の効率のよい、経済的な戦略を提供する。本発明による最少のプラスミドに基づくシステムは、選択の必要性をなくし、再構築ウイルスの精密なコントロールを提供する。不活性化インフルエンザワクチンの生産のために、高収量株(例えば、PR/8/34(H1N1))の非糖タンパク質セグメント(例えば、PB1、PB2、PA、NP、MおよびNS)を含む6つのプラスミドを推奨ワクチンサブタイプのHAおよびNAcDNAを含む2つの発現プラスミドとともにコトランスフェクトすることができる。ヘルパーウイルスは必要でないので、発生したウイルスは、所望の遺伝子配列を有するインフルエンザウイルスである。同様のアプローチを用いて、ワクチン用の不活性化再構築RNAウイルスの変種を生産することができる。標的ウイルスのウイルス遺伝子セグメント(例えば、非糖タンパク質セグメント)を含む発現プラスミドを、所与の感染性ウイルスサブタイプ(例えば、現在集団において循環しているウイルスサブタイプ)に対応するタンパク質をコードする他の発現プラスミドとともにコトランスフェクトすることができる。本発明によって生成させたウイルスは、ワクチン接種に対する伝統的または新規のアプローチ(ビルセルおよびカワオカ(Bilsel and Kawaoka)著、ニコルソン、ウェブスターおよびメイ(Nicholson、Webster and May)編、Textbook of Influenza、第32章、422−434ページを参照)、特に、弱毒化生ワクチン(以下で詳細に論じる)の開発に用いることができる。特に、本発明は、宿主の範囲が限られていることや、弱毒化が予測できないなどの、再構築ウイルスの開発に関する現在の技術の欠点を克服するものである(id)。
不活性化ウイルスワクチンは、RNAウイルス感染(例えば、インフルエンザ)を予防するためのワクチン接種についてよく確立されている(ニコルソン(Nicholson)著、ニコルソン、ウェブスターおよびメイ(Nicholson、Webster and May)編、Textbook of Influenza、第27章、358−372ページを参照)。不活性化ウイルスを調製するために、トランスフェクトしたウイルスを細胞培養またはふ化卵中で成長させる。ウイルスは、ホルムアルデヒド、ベータプロピオラクトン、エーテル、界面活性剤(Tween−80など)を含むエーテル、セチルトリメチルアンモニウムブロミド(CTAB)およびTriton N101、デオキシコール酸ナトリウムおよびリン酸トリ(n−ブチル)で処理して不活性することができる(ファーミンガー(Furminger)、上記;ウッドおよびウイリアムス(Wood and Williams)、上記)。不活性は、尿膜液(卵中で生産されたウイルスからの)の清澄化の後、または前に行うことができる。遠心によりビリオンを分離し、精製する(ファーミンガー(Furminger)、上記、326ページを参照)。ワクチンの効力を評価するために、単一放射免疫核酸(SRD)試験を用いた(シルドら(Schild et al.)、Bull.World Health Organ.1975年、第52巻、43−50ページおよび223−31ページ;モストウら(Mostow et al.)、J.Clin.Microbiol.1975年、第2巻、531ページ)。十分な免疫応答に必要な用量は、標準化されており、15μgHA/株/投与である。不活性化ワクチンは、注射により筋肉内に投与することができる。
弱毒化低温適応生RNAウイルスワクチン(インフルエンザワクチン)が開発された(ケイテルおよびピードラ(Keitel and Piedra)著、ニコルソン、ウェブスターおよびメイ(Nicholson、Webster and May)編、Textbook of Influenza、第28章、373−390ページ;ゲンドン(Ghendon)著、ニコルソン、ウェブスターおよびメイ(Nicholson、 Webster and May)編、Textbook of Influenza、第29章、391−399ページを参照)。8プラスミドから完全にインフルエンザウイルスを発生させることができることから、ワクチン株の弱毒化の調節が可能であり、標的集団に最適のワクチン株の開発が可能である(ビルセルおよびカワオカ(Bilsel and Kawaoka)、上記を参照)。現在、インフルエンザ株A/Ann Arbor/6/60(H2N2)またはインフルエンザB/Ann Arbor/1/66の株が弱毒化生ワクチンの調製に用いられているので、インフルエンザの内部遺伝子(PB2、PB1、PA、NP、M、NS)の6つのcDNAsのそれぞれをpHW2000のようなプラスミドに挿入するであろう。関連するインフルエンザ株の糖タンパク質HAおよびNAを含む2つのプラスミドを構築し、非グリコシル化インフルエンザタンパク質をコードする6つのマスタープラスミドとともにコトランスフェクトするであろう。
プラスミドの数を少なくする最初の段階として、この実施例は、同じプラスミド上にpolIおよびpolIIプロモーターを含むプラスミドの構築とトランスフェクションを報告し、このシステムが1つの鋳型からのvRNAとタンパク質の発現を可能にするという証拠を提示する。この実施例は公表された(ホフマンら(Hoffmann et al.)、Virology 2000年、第267号、310ページ)。
プラスミドのクローニング
すべてのクローニングおよびPCR反応は、標準プロトコールに従って実施した。簡単に述べると、A/WSN/33のポリメラーゼ複合遺伝子の発現プラスミドは、ヒトサイトメガロウイルス(CMV)の即時型プロモーターおよびウシ成長ホルモン(BGH)をコードする遺伝子のポリA部位を含むpcDNA3(Invitrogen)から得られた。ウイルスcDNAは、発現構成物pHW25−NP、pHW23−PA、pHW21−PB2、pHW22−PB1を得るために、プラスミドpWNP143、pWSNPA3、pWSNPB2−14、pGW−PB1から得た。pHW12は、ヒトpolIプロモーターおよびターミネーター配列をpolIIプロモーターとポリA部位との間に挿入して得た。プラスミドpHW52は、HindIIIおよびXhoI部位により延長されたPB1の非コーディング領域を含むオリゴヌクレオチドを最初に挿入し、次に、pHW22−PB1のPB1コーディング領域をこれらの部位に挿入して、pHW12から得た。プラスミドpHW82−PB1は、CMVプロモーター配列の削除によりpHW52−PB1から得た。pEGFP−N1(Clontech)を鋳型として用いてPCR増幅を行ない、SacII/XhoI消化後にcDNAをヒトpolIプロモーターおよびマウスターミネーターならびにSacII/XhoI部位により分離されたMセグメントの非コーディング領域を含むプラスミドpHW72に挿入した後にリポーター構成物pHW72−EGFPにおける増強緑色蛍光タンパク質(EGFP)のコーディング領域を得た。pHW127−MおよびpHW128−NSは、セグメント特異的配列およびBsmBI部位を含むプライマーを用いてウイルスRNAをRT−PCR増幅し、BsmBI消化ベクターpHH21に挿入して、構築した(イー ホフマン(E Hoffmann)、Ph.D.学位論文1997年、Justus Liebig University、Giessen、ドイツ;ニューマンら(Neumann et al.)、Proc.Natl.Acad.Sci.米国1999年、第96巻、9345ページ)。プラスミドpPolI−WSN−PB1、 pPolI−WSN−PB2、pPolI−WSN−PA、pPolI−WSN−NP、pPolI−WSN−HA、pPolI−WSN−NA、 pEWSN−HAおよびpCAGGS−WNA15は、他の論文(ニューマンら(Neumann et al.)、上記)に記載された。
Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞を10%ウシ胎児血清(FBS)を含む修飾Eagle培地(MEM)中で維持し、293Tヒト胚腎臓細胞を10%FBSを含むDulbecco修飾Eagle培地(DMEM)中で培養した。製造業者の指示に従って、TransIT LT−1(Panvera、Madison、Wisconsin)を用いて1×106個の293T細胞をトランスフェクトした。種々の量のプラスミド(表1)をTransITLT−1(2μlTransITLT−1/1μg DNA)と混合し、室温で45分間インキュベートし、細胞に加えた。6時間後に、DNA−トランスフェクション混合物を0.3%ウシ血清アルブミン(BSA)および0.01%FBSを含むOpti−MEM(Gibco/BRL、Gaithersburg、Maryland)で置換した。トランスフェクションの48時間後に、ウイルスを含む上清をMDCK細胞で力価測定した。
製造業者の指示に従ってRNeasyキット(Qiagen、Valencia、California)を用いて、ウイルスRNAをウイルス粒子から分離した。組換えインフルエンザの特性を検討するために、供給されたプロトコールに従ってAccess RT−PCRキット(Promega、Madison、Wisconsin)を用いた。RT−PCR実験に次のプライマーを用いた。 Seq−PBI#1:5’−AGG ATG GGA TTC CTC AAG G−3’(SEQ ID NO:1);Seq−PB1#2:5’−GCT ATG GTT TCC AGA GCC CG−3’(SEQ ID NO:2);Bm−PB1−1:5’−TAT TCG TCT CAG GGA GCG AAA GCA GGC A−3’(SEQ ID NO:3);Bm−PB1−2341R:5’−ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GCA TTT−3’(SEQ ID NO:4)。RT−PCR実験は、PCT−200 DNAエンジン(MJ Research、Watertown、Massachusetts)を用いて実施した。増幅プログラムは、48℃で45分間(第1鎖cDNA合成)の1サイクルおよび94℃で2分間(AMV逆転写酵素の不活性化およびcDNA変性)の1サイクルから開始した。これらのサイクルに続いて、94℃で20秒間、52℃で30秒間、72℃で30秒間の40サイクル(PCR増幅)を行った。プログラムは72℃で5分間の1サイクルで終了した。PCR生成物をアガロースゲル電気泳動で分析し、プライマーSeq−PB1#1またはSeq−PB1#2を用いて配列決定した。
トランスフェクションの48時間後に、293T細胞をリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄し、ペレットとし、PBS+5%FBSに再懸濁した。フローサイトメトリー分析をFACS Caliburフローサイトメーター(Becton Dickinson)を用いて実施し、データをCellQuestソフトウエアパッケージを用いて解析した。EGFP発現分析には、EGFP媒介蛍光検出の高い感度を達成するために530nmの発光波長(FL1)を用いた。
2種の真核プロモーターを含むクローニングベクターpHW12の設計および特徴
インフルエンザA型ウイルスは、マイナスセンス極性を有するRNA分子を含むセグメントウイルスである。複製サイクル中、リボ核タンパク質複合タンパク質(PB2、PB1、PA、NP)による8vRNAセグメントの5’および3’構造の認識は、インフルエンザウイルス遺伝子の複製と転写をもたらす。末端配列要素が高度に保存されているということから、転写された人工RNAが5’および3’末端の配列と同じ配列を有していることがわかる(ルオら(Luo et al.)、J.Virol.1991年、第65巻、2861ページ;フリックら(Flick et al.)、RNA 1996年、第2巻、1046ページ)。クローニングベクターpHW12が構築され、制限エンドヌクレアーゼBsmBIを用いてpolIプロモーターとターミネータとの間に問題の配列の挿入がなされた。polI転写単位の両端に、サイトメガロウイルス(CMV)からのpolIIプロモーターと、ウシ成長ホルモンをコードする遺伝子のポリアデニル化シグナルが隣接している。CMVプロモーター、ポリA部位およびプラスミドのバックボーンは、クローニングベクターpcDNA3由来である。
polI/polII1プラスミド転写システムを試験するために、A/WSN/33ウイルスのPB1遺伝子のcDNAをクローニングベクターpHW12に挿入したところ、プラスミドpHW52−PB1が得られた。HindIIIおよびXhoI制限部位をこの遺伝子の5’および3’非コーディング領域に挿入した。発生した組換えウイルスがRT−PCRによって同定できるようにするために、これらの遺伝標識を含めた。本願発明者らは、このプラスミドでトランスフェクトされたヒト細胞が2種のRNA、すなわち、細胞polIによって合成されるPB1−vRNAおよびpolIIによって合成される5’キャップ構造を有するmRNAを生成することを予想した。mRNAの翻訳によりPB1−タンパク質が合成される。
感染性インフルエンザA型ウイルスの発生のためには、プラスミドpHW52−PB1が、PB1mRNAおよびタンパク質だけでなく、子孫ウイルスにパッケージングすることができる十分な量のPB1−vRNAも供給することが必要である。残りの7種のvRNAについては、本願発明者らは、ヒトpolIプロモーターとマウスターミネーターが両端に隣接した、A/WSN/33ウイルスの全長RNAのcDNAsを含むプラスミドを用いた。これらのプラスミドのトランスフェクションにより、新たなvRNAを生成するポリメラーゼタンパク質によって複製され、転写される8種のウイルスRNAのすべての合成がもたらされるはずである。構造タンパク質の合成の後に、RNPsが新しいウイルス粒子にパッケージングされるであろう。
この実施例では、クローン化cDNAからインフルエンザA型ウイルスを完全に救出するためのプラスミドに基づくトランスフェクションシステムの使用を記載する。確立されたプラスミドに基づくシステムと異なり、インフルエンザA型ウイルスの発生のためのこのシステムでは、それぞれがウイルス遺伝子セグメントに対応する異なるウイルスcDNAの1つのコピーを含む8つの発現プラスミドのみの構築とトランスフェクションを用いる。この逆遺伝学システムは、インフルエンザA型ウイルスの回収に必要なプラスミドの数を低減させ、再構築ウイルスの予測可能かつ効率的な発生を可能にするものである。
プラスミドのクローニング
プラスミドpHW2000(図3A)をpHW12から得た(実施例1)。pHW2000クローニングベクターは、2つのBsmBI部位で隔てられた225bpのヒトpolIプロモーターと33bpのマウスターミネーター配列を含む。polIプロモーターおよびターミネーター要素の両端には、ヒトサイトメガロウイルスのtruncated即時型プロモーター(pcDNA3[Invitrogen、Carlsband、California]に認められるように転写部位の約350bp上流で始まる)とウシ成長ホルモンをコードする遺伝子のポリアデニル化シグナルが隣接している。ウイルスA/WSN/33(H1N1)のcDNAを含む8つのプラスミド(pHW181−PB2、pHW181−PB1、pHW183−PA、pHW184−HA、pHW185−NP、pHW186−NA、pHW187−MおよびpHW188−NS)は、プラスミドpPolI−WSN−PB2、pPolI−WSN−PB1、pPolI−WSN−PA、pPolI−WSN−NP、pPolI−WSN−HA、pPolI−WSN−NA(ニューマンら(Neumann et al.)、Proc.Natl.Acad.Sci.米国1999年、第96巻、9345ページ)、pHW127−MおよびpHW128−NS(実施例1)のApaI−SalI断片(ウイルスcDNAならびにpolIプロモーターおよびターミネーター配列を含む)をpHW2000のApaI−SalIベクター断片に挿入して構築した。A/Teal/HK/W312/97(H6N1)のcDNAを含む8つのプラスミド(pHW241−PB2、pHW242−PB1、pHW243−PA、pHW244−HA、pHW245−NP、pHW246−NA、pHW247−MおよびpHW248−NS)は、ウイルスRNAの逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)増幅によって構築した。PCR反応に用いたプライマーは、それらの3’末端のセグメント特異的配列およびそれらの5’末端のBsmBIまたはBsaI制限部位配列を含んでいた。PCR生成物をBsmBIまたはBsaIで消化させた後、断片をベクターpHW2000中でクローンした(図3A)。A/Teal/HK/W312/97(H6N1)のゲノムの増幅に用いたプライマーの配列は以下の通りである。プライマーは5’および3’末端に対応して左から右に示す。インフルエンザA特異的ヌクレオチドは下線で示す。
インフルエンザウイルスA/WSN/33(H1N1)およびA/Teal/HK/W312/97(H6N1)を10日齢卵中で増殖させた。Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞を10%FBSを含む修飾Eagle培地(MEM)中で維持した。293Tヒト胚腎臓細胞を5%FBSを含むOpti−MEMI(Life Technologies、Gaithersburg、Maryland)中で培養した。トランスフェクション実験には6ウエル組織培養プレートを用いた。トランスフェクションの前日に、75cm2フラスコ中の集密的293TおよびMDCK細胞をトリプシン処理し、各細胞株の10%を18mlのOptiMEM I中で混合した。この細胞懸濁液の3mlを6ウエルプレートの1ウエルに播種した。同時培養したMDCKおよび293T細胞(ウエル当たり各0.2−1×106細胞)をトランスフェクション実験に用いた。製造業者の指示に従って、TransIT LT−1(Panvera、Madison、Wisconsin)を用いて細胞をトランスフェクトした。簡単に述べると、DNA1μg当たり2μlのTransIT LT−1を混合し、室温で45分間インキュベートし、細胞に加えた。6時間後にDNA−トランスフェクション混合物をOpti−MEM Iで置換した。トランスフェクションの30時間後に、TPCK−トリプシンを含む1mlのOpti−MEM Iを細胞に加えた。この添加で、TPCK−トリプシンの最終濃度は、細胞上清中0.5μg/mlとなった。細胞上清のウイルス力価は、MDCK細胞上の上清の力価測定により測定した。
製造業者の指示に従ってRNeasyキット (Qiagen、Valencia、California)を用いて、ウイルスRNAをウイルス粒子から分離した。組換えインフルエンザウイルスの特性を検討するために、供給されたプロトコールに従ってAccess RT−PCRキット(Promega、Madison、Wisconsin)を用いた。RT−PCR実験では次のプライマーを使用した。Bm−NS#1(5’−TAT TCG TCT CAG GGA GCA AAA GCA GGG TG−3;SEQ ID NO:5)およびBm−NS#2(5’−ATA TCG TCT CGT ATT AGT AGA AAC AAG GGT GTT TT−3;SEQ ID NO:12)。RT−PCR実験は、PCT−200 DNAエンジン(MJ Research、Watertown、Massachusetts)を用いて実施した。増幅プログラムは、48℃で45分間の1サイクルおよび94℃で2分間の1サイクルから開始した。これらのサイクルに続いて、94℃で20秒間、52℃で30秒間、72℃で40秒間の40サイクル(PCR増幅)を行った。プログラムは72℃で5分間の1サイクルで終了した。PCR生成物をアガロースゲル電気泳動で分析し、プライマーBm−NS#1を用いて配列決定した。St.Jude Children’s Research Hospitalの生物工学センター(Center for Biotechnology)が鋳型DNAの配列を、AmpliTaq(登録商標)DNAポリメラーゼFS(Perkin−Elmer、Applied Biosystems,Inc.[PE/AB]、Foster City、CA)および合成オリゴヌクレオチドを用いるローダミンまたはdRhodamine色素ターミネーターサイクル配列決定即時反応キット(rhodamine or dRhodamine dye−terminator cycle sequencing ready reaction kits)を用いて決定した。試料を電気泳動、検出およびPE/ABIモデル373、モデル373 Stretchまたはモデル377 DNAシークエンサーを用いた分析に供した。
A/WSN/33(H1N1)の発生用のpolI−polIIシステムの確立
インフルエンザA型ウイルスのゲノムは8つのセグメントを含んでいるので、polIプロモーターとpolIIプロモーターとの間への8つのインフルエンザA cDNAすべての挿入が、8つのvRNA、すべてのウイルスRNAの転写、ならびに10種すべてのウイルスタンパク質の合成をもたらすと推論した(図1)。構造タンパク質によるすべてのウイルスリボ核タンパク質のアセンブリーの後に、感染性インフルエンザA型ウイルスが生成するはずである(図2)。
1918年からのヒトインフルエンザ汎流行株から最初に得られたインフルエンザウイルスA/WSN/33(H1N1)(ゴトーおよびカワオカ(Goto and Kawaoka)、Proc.Acad.Sci.米国1998年、95巻、10224ページ;レイドら(Reid et al.)、Proc.Natl.Acad.Sci.米国1999年、96巻、1651ページ)は、マウス脳で継代培養されており、細胞培養における成長によく適応している。細胞培養における成長に適応していないクローン化cDNAからのウイルスの発生に関する8プラスミドシステムの効率を評価するために、クローン化cDNAのみからのウイルスA/Teal/HK/W312/97(H6N1)の発生を試みた。このH6N1ウイルスは、1997年の香港におけるH5N1の突発時に死亡したコガモから分離された。このウイルスの遺伝分析から、このウイルスは7つのセグメントを有し、病原性H5N1ウイルス株と97%以上のヌクレオチド相同性を有することが示された。RNAを感染尿膜液から抽出し、RT−PCRにより増幅したcDNAsをpHW2000に挿入した。この挿入によって8つの発現プラスミドが得られた(図3)。同時培養した293T−MDCK細胞へのpHW241−PB2、pHW242−PB1、pHW243−PA、pHW244−HA、pHW245−NP、pHW246−NA、pHW247−MおよびpHW248−NS(各1μg)のトランスフェクションの72時間後に、ウイルス誘発性の細胞変性効果がMDCK細胞に認められた(表2)。ウイルス収量は、トランスフェクトされた細胞の上清1ml当たり2×105感染性ウイルスであった。図4(AおよびB、レーン2)に示すように、NSセグメントの特性の確認によって回収されたウイルスの同一性が立証された。これらの結果から、このプラスミドシステムは1つのプラスミドベクターへの8つのcDNAのみのクローニングを必要とするものであり、8つの発現プラスミドのトランスフェクションによって、哺乳動物細胞中での成長に適応していないウイルスの抗原性を有するインフルエンザA型ウイルスの回収が可能であることがわかる。
再構築ウイルスの発生に関する8プラスミドシステムの有用性を試験した。このDNAトランスフェクションシステムは選択システムを必要としないので、再構築ウイルスの回収は、トランスフェクション反応における発現プラスミドの適切な組合せによって達成できるはずである。A/Teal/HK/W312/97(H6N1)のcDNAを含む7つの発現プラスミドをA/WSN/33(H1N1)のcDNAを含む1つの発現プラスミドとともにコトランスフェクトした(表3)。コガモウイルスの7セグメントとWSNウイルスのMセグメントまたはNSセグメントを含む再構築ウイルスについて、高いウイルス収量が得られた。NAおよびHA再構築ウイルスについては、より低いウイルス収量が得られた(表3)。単一の再構築ウイルスが8プラスミドシステムにより救出されたので、次の段階では、ウイルスが1つのウイルス由来の多セグメントにより救出できるかどうかを検討することとした。したがって、H6N1ウイルスRNP複合体遺伝子のcDNAを含む4つの発現プラスミド(pHW241−PB2、pHW242−PB1、pHW243−PAおよびpHW245−NP)をWSNウイルスのcDNAを含むプラスミド(pHW184−HA、pHW186−NA、pHW187−MおよびpHW188−NS)とともにトランスフェクトした(表3)。細胞上清1ml当たり2×106個のウイルスが回収された。図4(レーン10)に示すように、4重(quadruple)再構築ウイルスの増幅NSセグメントがNcoIにより切断された。したがって、NSセグメントはWSNウイルス由来である。これらの結果から、8プラスミドトランスフェクトシステムは単一および4重再構築ウイルスの回収を可能にすることがわかる。
A/Teal/HK/W312/97(H6N1)またはA/WSN/33(H1N1)のcDNAを含む8つの発現プラスミドのトランスフェクションの後のインフルエンザA型ウイルスを救出する能力があることは、polI−polII転写システムが感染性インフルエンザA型ウイルスの生成に十分な量のvRNAとウイルスタンパク質を提供することを立証している。コーディング領域が異なる2つのタイプのmRNAが合成される(図1)。すべてのウイルスタンパク質をコードするタイプのmRNAは、polIIによって直接に転写される。これらのmRNAは、非コーディング領域(NCR)のインフルエンザウイルス配列に加えて、polIプロモーターおよびマウスターミネーター領域の配列を含む。重要なことに、開発されたpolI−polII発現システムは、33bpのマウスターミネーター配列のみを含む。リポーター遺伝子クロルアンフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)および緑色蛍光タンパク質(GFP)を用いた以前の試験で、174bpのターミネーター領域の配列がタンパク質のpolIIによる発現を低減させることが示された(ホフマン イー(Hoffmann E.)Ph.D.学位論文1997年、Justus Liebig University、Giessen、ドイツ)。第2のタイプのmRNAは、ウイルス複製および転写過程の開始後に生成される(図2)。このmRNAは、ウイルスのポリメラーゼタンパク質によって合成され、インフルエンザウイルス非コーディング配列に先立つキャップ引き抜き(snatching)により細胞RNAから得られた5キャップ構造を含む。両mRNAから翻訳された構造タンパク質はRNP複合体と結合して、新たなウイルス粒子を生成する。トランスフェクタントウイルスの出芽後に、発生したウイルス粒子は、293T細胞中および同時培養されたMDCK細胞中で複製することができる。
トウおよびカワオカ(Goto and Kawaoka)、Proc.Natl.Acad.Sci.米国1998年、第95巻、10224ページ;シュルマンおよびパレセ(Schulman and Palese)、J.Virol.1977年、第24巻、170ページ;ヤスダら(Yasuda et al.)、J.Virol.1994年、第68巻、8141ページ)。
インフルエンザAおよびB型ウイルスは、各々極性が負の1本鎖RNSAの8セグメントを含んでいる(総説については、ラムおよびクルグ(Lamb and Krug)著、「Orthomyxoviridae:The viruses and their replication」、フィールド(Fields)編、Virology、1353−1395ページを参照のこと)。インフルエンザAと異なり、インフルエンザBの8セグメントは11タンパク質をコードする。3つの最大遺伝子はRNAポリメラーゼの成分であるPB1、PB2およびPAをコードする。セグメント4は赤血球凝集素をコードする。セグメント5は、ウイルスRNAに結合している主要な構造成分である核タンパク質をコードし、セグメント6はノイラミニダーゼ(NA)およびNBタンパク質をコードする。両タンパク質NBおよびNAは、biscistronic mRNAの重複リーディングフレームから翻訳される。インフルエンザBのセグメント7も2つのタンパク質、BM1およびBM2をコードする。最小のセグメントは2つの産物をコードし、NS1は全長RNAから翻訳され、一方、NS2はスプライスされたmRNAから翻訳される。
ワクチン生産のためのこのプラスミドに基づくシステムの商業上の有用性を検討するために、本願発明者らは、不活性化ワクチンの生産に現在用いられているマスター株A/PR/8/34(H1N1)を実施例2で記載したようにクローン化cDNAから完全に発生させた。組換えウイルスの卵中での継代培養の後にHA検定により測定したウイルス収量は、親野生型ウイルスのウイルス収量と同様に高かった。これらの結果から、組換えウイルスは卵成長親ウイルスと同じ成長特性を有することが立証され、8プラスミドトランスフェクション法は現在用いられているワクチンウイルスの生産方法を改良する可能性をもっていることがわかる。
ウイルスおよびトランスフェクション
インフルエンザウイルスA/PR/8/34(H1N1)は、St.Jude Children’s Research Hospitalのレポジトリから入手し、10日齢ふ化卵中で増殖させた。Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞を10%FBSを含むMEM中で維持した。293Tヒト胚腎臓細胞およびベロ細胞を5%ウシ胎児血清(FBS)を含むOpti−MEM I(Life Technologies、Gaithersburg、MD)中で培養した。トランスフェクション実験には、6ウエル組織培養プレートを用いた。同時培養したMDCKおよび293T細胞(ウエル当たり各0.21×106細胞)をトランスフェクション実験に用いた。製造業者の指示に従って、TransIT LT−1(Panvera、Madison、WI)を用いて細胞をトランスフェクトした。簡単に述べると、DNA1μg当たり2μlのTransIT LT−1を混合し、室温で45分間インキュベートし、細胞に加えた。6時間後にDNA−トランスフェクション混合物をOpti−MEM Iで置換した。トランスフェクションの24時間後に、TPCK−トリプシンを含む1mlのOpti−MEM Iを細胞に加えた。この添加で、TPCK−トリプシンの最終濃度は、細胞上清中0.5μg/mlとなった。ウイルス力価は、MDCK細胞上での細胞上清を継代培養して、プラーク検定により測定した。
ウイルスRNAは、200μlのウイルスを含むふ化卵の尿膜液からQiagen RNeasy Kitを用いて抽出した。2段階RT−PCRを用いて各ウイルス遺伝子セグメントを増幅した。簡単に述べると、提供されたプロトコールに従って、RNAをAMV逆転写酵素(Roche Diagnostics、ドイツ)を用いてcDNAに転写し、次いで、Expand High Fidelity PCRシステム(Roche Diagnostics、ドイツ)を用いてcDNAを増幅した。増幅プログラムは94℃で2分間の1サイクルから開始し、続いて、94℃で20秒間、54℃で30秒間、72℃で3分間の30サイクルを行った。プログラムは72℃で5分間の1サイクルで終了した。クローニングベクターpHW2000への消化されたPCR断片の精密な挿入ができるように、用いたプライマーにはBsaIまたはBsmBIの配列を含めた(実施例2を参照)。
ウイルス様vRNASsおよびmRNAの細胞内合成を可能にするために、本願発明者らはRNA polI−polII発現システムを確立した(実施例2)。このシステムでは、cDNAがヒトRNAポリメラーゼI(polI)プロモーターとターミネーター配列との間に挿入されている。この完全なpolI転写単位の両端には、RNAポリメラーゼII(polII)プロモーターとポリ(A)部位が隣接している。2つの転写単位の配向は、1つのウイルスcDNA鋳型からマイナスセンスウイルスRNAとプラスセンスmRNAとが合成されることを可能にしている。polI−polIIシステムは、2つの細胞RNAポリメラーゼ酵素の、おそらく分子の異なるコンパートメントにおけるそれら自体のプロモーターからの転写の開始から始まる(図1参照)。293T細胞への8プラスミドのトランスフェクションにより、細胞およびウイルス転写および翻訳機構により得られるすべての分子の相互作用がもたらされ、最終的に感染性インフルエンザA型ウイルスが発生する。このシステムは、インフルエンザウイルスA/WSN/33(H1N1)およびA/Teal/HK/W312/97(H6N1)の生成に非常に有効であることが証明された(実施例2)。
本発明による8プラスミドシステムは、タンパク質の発現のための別のプラスミドの使用(発明の背景を参照)を避けることができ、したがって、クローン化cDNAから完全にインフルエンザA型ウイルスを発生させる方法を簡略化することができる。ワクチンの生産は、卵または細胞培養中でのワクチンウイルスの生産のためのウイルス種子として用いるウイルスの発生を必要とする。ワクチン接種の有効性は、ワクチン接種集団における高い特異抗体力価を刺激し、有効な防御をもたらすために循環病原性株に厳密に適合するサブタイプを選択することに依存する。内部インフルエンザA遺伝子をコードする6種のA/PR/8/34マスタープラスミド(pHW191−PB2、pHW192−PB1、pHW193−PA、pHW195−NP、pHW197−MおよびpHW198−NS)を、現在循環している株の糖タンパク質HAおよびNAをコードするプラスミドとコトランスフェクションするのに今や用いることができる。各遺伝子セグメントを操作できることは、卵または細胞培養中での再構築ウイルスの高収量をもたらす成長を確保するのにどの遺伝子セグメントが重要であるかを評価することが可能となる。
先の実施例では、マイナスセンスvRNAとプラスセンスmRNAが発現する、8プラスミドのみをトランスフェクトすることによるインフルエンザA型ウイルスの発生のためのシステムを記載している(この試験は後に公表された;ホフマンら(Hoffmann et al.)、2000年、Proceedings of the National Academy of Sciences、米国、第97巻、6108−6113ページ)。この実施例では、1つの鋳型からのキャップ構造のないプラスセンスcRNAと5’キャップ構造のあるmRNAの合成を可能にするウイルス様RNAの発現のための異なる転写システムの確立を記載する。A/WSN/33(H1N1)のcDNAを含む8つのRNA polI−polIIタンデムプロモータープラスミドのコトランスフェクションによって、2方向システムよりもウイルス収量は低かったが、感染性インフルエンザA型ウイルスの発生がもたらされた。最小限のセットのプラスミドから細胞内でvRNAおよびmRNAまたはcRNAおよびmRNAを生成させる本願発明者らのアプローチは、他のRNAウイルスの逆遺伝学システムの確立と最適化に有用である。
マイナスセンスRNAウイルスの発生のために、マイナスセンスvRNAまたはプラスセンスcRNAを鋳型とすることができる。ウイルスの回収に必要なプラスミドの数を減らすために、本願発明者らは細胞RNApolIおよびpolIIが1つの鋳型からcRNAおよびmRNAを合成することが可能であると推論した。したがって、本願発明者らは1方向polI−polII転写システムを開発した(図5)。ウイルスcDNAをプラスセンス配向でRNApolIプロモーターとターミネーター配列との間に挿入した。この全polI転写単位をプラスセンス配向でRNApolIIプロモーターとポルアデニル化部位との間に挿入した(図5)。本願発明者らの2方向転写システムではマイナスセンスvDNAとプラスセンスmRNAが発生した(図1)のとは異なり、2つのタイプのプラスセンスRNAが合成されると予想された。polIIプロモーターから、5’キャップ構造をもったmRNAが核質内で転写されるはずである。この転写物はタンパク質に翻訳される。仁中で、細胞polIは、5’末端に三リン酸基を有する全長のプラスセンスインフルエンザウイルスcRNAを合成すると予想される(図5)。任意のcDNA断片の挿入に用いることができるクローニングベクターpHW11を構築した(図6)。このプラスミドは、polIIプロモーター(ヒトサイトメガロウイルスの即時型プロモーター)と、polIターミネーター配列およびポリ(A)部位の上流にあるヒトpolIプロモーターを含んでいる。
Claims (6)
- クローン化ウイルスcDNAから感染性マイナス鎖RNAウイルスを生成する際に使用するための一組のプラスミドを含む組成物であって、
前記一組のプラスミドが、前記RNAウイルス由来の全てのウイルスゲノムセグメントに相当するウイルスcDNAを含み、かつ前記一組のプラスミド中のプラスミドの総数が、ウイルスゲノムセグメントの総数を超えず、
前記一組のプラスミド中の各プラスミドが、一つのウイルスゲノムセグメントに相当するウイルスcDNAを含み、
前記ウイルスゲノムセグメントに相当するウイルスcDNAがRNAポリメラーゼI(PolI)プロモーターとターミネーター配列との間に挿入され、それによってvRNAの発現が生じ、次に、RNAポリメラーゼII(PolII)プロモーターとポリアデニル化シグナルとの間に挿入され、それによってウイルスmRNAの発現を生じさせ、
ベロ細胞およびCOS−1細胞からなる群から選択される宿主細胞中に感染した場合に感染性マイナス鎖RNAウイルスを生成することができる組成物。 - 前記polIプロモーターが前記ポリアデニル化シグナルに隣接していて、前記ターミネーター配列が前記polIIプロモーターに隣接している、請求項1に記載の組成物。
- 請求項1または2に記載の組成物を含む、Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞、ベロ細胞、CV1細胞、COS−1細胞、COS−7細胞、およびBHK−1細胞からなる群から選択される宿主細胞。
- 感染性マイナス鎖RNAウイルスビリオンを生成する方法であって、ウイルスタンパク質およびvRNAの産生を可能にする条件下で請求項3に記載の宿主細胞を培養し、それにより感染性マイナス鎖RNAウイルスを生成することを含む方法。
- 弱毒化マイナス鎖RNAウイルスを発生させる方法であって、
(a)請求項1または2に記載の組成物中の1つまたは複数のウイルス遺伝子を突然変異させること、および
(b)適切な宿主細胞に導入した組成物によって生成された感染性マイナス鎖RNAウイルスが弱毒化されるかどうかを判定することを含む方法。 - ワクチン用の感染性マイナス鎖RNAウイルスを生成する方法であって、
(a)前記ウイルスを発生させるために、請求項1または2に記載の組成物を含み、Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞、ベロ細胞、CV1細胞、COS−1細胞、COS−7細胞、およびBHK−1細胞からなる群から選択される宿主細胞を培養すること、および
(b)前記宿主細胞によって生成した前記ウイルスを精製することを含む方法。
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