JP4883872B2 - 微生物発酵によるエタノール生産を向上させる方法 - Google Patents

Description

【０００１】
（発明の分野）
本発明は、嫌気性（または通性）酢酸生産菌を用いて少なくとも１種の還元剤を含有する気体状基質からエタノールを生産する微生物発酵方法の改良に向けたものである。
【０００２】
（発明の背景）
本発明者らは、特定の嫌気性細菌を用いて適切な栄養素および微量鉱物を含有する培地中で気体状基質の微生物発酵を起こさせることでとりわけエタノール（他の有機酸、アルコール類、水素および有機酸塩の中でも）を生産する方法を見いだしていた。例えば、本発明者らは、以前に、希ガス混合物を廃棄気体成分を利用する１種以上の嫌気性細菌株を入れておいたバイオリアクターに直接経路で導入してそれに所望の化合物を生成させることを見いだした。その生成させた化合物を回収するに適した方法を用いて、その化合物をその水相から個別の容器１個または２個以上の中に回収する。回収方法の例には抽出、蒸留またはこれらの組み合わせ、または他の効率の良い回収方法が含まれる。その細菌をその水相から回収して前記バイオリアクターに再循環させることで高い細胞濃度を維持してもよく、このようにして、生産率を最大限にすることができる。望まれるならば、遠心分離、膜濾過または他の技術を用いて細胞分離を達成する。例えば、１９９８年１月８日付けで公開された国際特許出願番号ＷＯ９８／００５５８、米国特許第５，８０７，７２２号、米国特許第５，５９３，８８６号および米国特許第５，８２１，１１１号を参照のこと。
【０００３】
嫌気性細菌株であるクロストリジウム・リュングダリイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｌｊｕｎｇｄａｈｌｉｉ）は、その主産物である酢酸に加えて、また、一酸化炭素（ＣＯ）と水素（Ｈ₂）と二酸化炭素（ＣＯ₂）の変換でエタノールも産物として生成し得る。ＣＯとＣＯ₂とＨ₂からの酢酸（ＣＨ₃ＣＯＯＨ）およびエタノール（Ｃ₂Ｈ₅ＯＨ）の生成は下記の全体的化学量論式で示される：
４ＣＯ＋２Ｈ₂Ｏ→ＣＨ₃ＣＯＯＨ＋２ＣＯ₂（１）
４Ｈ₂＋２ＣＯ₂→ＣＨ₃ＣＯＯＨ＋２Ｈ₂Ｏ（２）
６ＣＯ＋３Ｈ₂Ｏ→Ｃ₂Ｈ₅ＯＨ＋４ＣＯ₂（３）
６Ｈ₂＋２ＣＯ₂→Ｃ₂Ｈ₅ＯＨ＋３Ｈ₂Ｏ（４）
Ｃ．リュングダリイの典型的ないくつかの株には、ＰＥＴＣ株（米国特許第５，１７３，４２９号）、ＥＲＩ２株（米国特許第５，５９３，８８６号）そしてＣ−０１およびＯ−５２株（米国特許第６，１３６，５７７号）が含まれる。これらの菌株は各々Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ、１０８０１ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｂｏｕｌｅｖａｒｄ、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡ ２０１１０−２２０９にそれぞれＡｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．５５３８３（以前はＡＴＣＣ Ｎｏ．４９５８７）、５５３８０、５５９８８および５５９８９の下で寄託されている。Ｃ．リュングダリイ株は各々グアニンとシトシン（Ｇ＋Ｃ）ヌクレオチド含有量が約２２モル％の嫌気性グラム陽性細菌である。これらの細菌は増殖で多様な基質を利用するが、メタノールもラクテートも利用しない。これらの株はＣＯ耐性、比ガス吸収率および比生産率の点で異なる。自然界に存在する「野生」株が生成するエタノールの量は非常に僅かであることは認識されている。Ｃ．リュングダリイ株は３７℃で理想的に機能して、「野生」の状態で典型的にエタノールをアセチル（即ち、遊離もしくは分子状酢酸と酢酸塩の両方を指す）に対して約１：２０の生産比（エタノールをアセチル２０部当たり１部）で生成する。エタノールの濃度は典型的に１−２ｇ／Ｌのみである。そのような「野生」細菌がエタノールを生成する能力を有することは興味が持たれることではあるが、エタノール生産率が低いことから、それを用いてエタノールを商業的基礎で経済的に生産するのは不可能である。
【０００４】
上述したＣ．リュングダリイ株を用い、栄養素を僅かに処理すると、エタノールとアセチルが１：１の生産比（エタノールとアセチルが等しい部）で生成されはしたが、エタノールの濃度は１０ｇ／Ｌ未満であり、もたらされた生産率のレベルは低く、１０ｇ／Ｌ・日未満であった。加うるに、培養菌の安定性も問題であり、その理由は、主に、エタノールの存在に加えてアセチルの濃度が相対的に高い（８−１０ｇ／Ｌ）ことによる（分子状の酢酸が１Ｌ当たり２．５−３ｇ）。その上、エタノールの生産量をより高くしようとする努力で気体速度（ｇａｓ ｒａｔｅ）を高くすると培養菌が最初に分子状酢酸によって阻害され、次にＣＯによって阻害される。その結果として培養菌が不安定になり、気体を吸収しなくなってさらなる産物を生成しなくなる。更に、本発明者らが行った先の研究により、定常状態の処理で生成されるエタノールとアセチルの比率を２：１より高くするのは困難であることが分かった。例えば、とりわけＫｌａｓｓｏｎ他、１９９０ 「Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ」、Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ １１ｔｈ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ ｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｆｏｒ Ｆｕｅｌｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、２４／２５：８５７；Ｐｈｉｌｌｉｐｓ他、１９９３ 「Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ」、Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ １４ｔｈ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ ｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｆｏｒ Ｆｕｅｌｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、３９／４０：５５９を参照のこと。
【０００５】
ＣＯとＣＯ₂とＨ₂を消費しない糖発酵でＣ．リュングダリイ以外の嫌気性細菌を用いて溶媒を生産することを記述している資料は数多く存在する。エタノールを高い収率で生じさせる試みで、栄養素の種類、微生物、還元剤の特定添加、ｐＨ変動および外来ガスの添加を包含する多様なパラメーターを変えることが行われた。例えばＲｏｔｈｓｔｅｉｎ他、１９８６ Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．、１６５（１）：３１９−３２０；Ｌｏｖｉｔｔ他、１９８８ Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．、１７０（６）：２８０９；Ｔａｈｅｒｚａｄｅｈ他、１９９６ Ａｐｐｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．、４６：１７６を参照のこと。
【０００６】
産業的気体状基質を取り扱う技術では、そのような気体、特に廃棄気体、例えばＨ₂、ＣＯおよびＣＯ₂などから価値ある商品を取り出すことができることが求められているままである。アセトジェニック細菌によるそのような気体の発酵で通常に生じるエタノールの生産率を他の産物の生産率より高くすることが求められている。
【０００７】
（発明の要約）
本発明は、本技術の要求に答えて、培養菌の増殖および良好な培養菌安定性を継続して可能にしながら結果として生じるエタノールの濃度が１０ｇ／Ｌより高くかつアセテートの濃度が約８−１０ｇ／Ｌ未満であるような定常状態の連続方法である新規な方法を提供するものである。
【０００８】
本発明は、１つの面において、エタノールを気体状基質の嫌気性細菌発酵で安定かつ連続的に製造する方法を提供する。この方法は、発酵バイオリアクター内で嫌気性アセトジェニック細菌を液状栄養培地中で培養しそして前記バイオリアクターにＣＯおよびＨ₂から成る群から選択される少なくとも１種の還元ガスを含んで成る気体状基質を供給する段階を含んで成る。前記細菌が前記バイオリアクター内で定常状態、例えば安定な細胞濃度を達成した後に発酵ブイヨン（ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｂｒｏｔｈ）中の酸化還元電位を下げるか或はＮＡＤ（Ｐ）に対するＮＡＤ（Ｐ）Ｈの比率を高くすることによって前記バイオリアクター内の前記細菌を処理する。前記バイオリアクター内の遊離酢酸濃度を遊離酸が５ｇ／Ｌ未満であるように維持する。前記培養および処理段階によって、前記バイオリアクター内の前記細菌がエタノールを発酵ブイヨン中で１日当たり１０ｇ／Ｌより高い生産率で生成するようにする。エタノールとアセテートの両方が前記発酵ブイヨン中でエタノール対アセテートの比率が１：１から２０：１の範囲の比率で生成されるようにする。
【０００９】
本方法の１つの態様では、前記処理段階に下記の段階の１つ以上を含める：栄養培地含有量、栄養供給速度、水供給速度、処理圧、処理ｐＨ、気体状基質含有量、気体供給速度、発酵ブイヨン撹拌速度、生産物阻害段階、細胞密度および基質阻害から成る群から選択される少なくとも１つのパラメーターを変える。
【００１０】
本方法の別の態様では、前記処理段階に、還元ガスであるＣＯを含んで成る前記気体状基質を前記バイオリアクターに所望の吸収率で供給することを含める。その率を望ましくはＣＯが前記バイオリアクター内の細菌の乾燥細胞１グラム当たり０．３から２ミリモル／分になるようにする。
【００１１】
本方法の更に別の態様では、前記処理段階に、パントテン酸カルシウムを制限量で含んで成る前記栄養培地を前記発酵バイオリアクターに供給することを含める。前記パントテン酸カルシウムを望ましくは前記バイオリアクター内で産生する細菌の乾燥細胞１グラム当たり０．５から５０μｇの範囲にする。
【００１２】
本発明は更に別の面も提供する。本方法の別の態様は、前記制限量のパントテン酸カルシウムを供給する前に前記バイオリアクターに還元ガスであるＨ₂を過剰に供給することを包含する。
【００１３】
本発明は、さらなる面において、コバルトを制限量で含んで成る前記栄養培地を前記発酵バイオリアクターに供給することを包含する処理段階を伴う方法を提供する。このコバルトの量を望ましくは前記バイオリアクター内で産生する細菌の乾燥細胞１グラム当たり５から１００μｇのコバルトの範囲にする。
【００１４】
本発明の方法は、別の態様において、コバルト濃度を一定に維持しかつ１つ以上のパラメーター、例えば気体速度、液体速度、撹拌速度およびＨ₂ガス分圧などを調整することで前記バイオリアクター内の前記細菌が前記量のコバルトに順化しないようにすることを包含する。
【００１５】
本方法の任意の追加的段階は、前記ブイヨンのサンプルに遠心分離を受けさせて細胞を除去しそしてそれをガスクロにかけることで前記比率および／または生産率値の維持を監視することを包含する。
【００１６】
本方法は、別の態様において、Ｈ₂を気体状基質としてエタノール生産の化学量論的量よりも若干過剰量で供給することを包含する。更に別の態様では、前記気体状基質に更にＣＯも前記細菌が要求する量よりも若干過剰量で含めることで前記細菌がＨ₂を取り込まないようにしかつ前記ブイヨン中のＮＡＤ（Ｐ）に対するＮＡＤ（Ｐ）Ｈの比率を高くする。
【００１７】
本方法の更に別の態様では、培養ブイヨンに存在する分子状酢酸が２ｇ／Ｌに近づくか或は２ｇ／Ｌを超えた時点で水供給速度を高くして分子状酢酸による阻害を軽減する段階を設ける。
【００１８】
本方法の別の態様では、処理段階に、前記バイオリアクターに入っている培地と細菌と気体状基質を選択した撹拌速度で撹拌することを含めてもよい。例えば、撹拌速度が遅いとＣＯが発酵ブイヨンに移行する量が少なくなる。このようにＣＯが移行する速度が遅いとＨ₂変換率が高くなり、その結果として、還元ガスであるＨ₂が前記バイオリアクター内に前記細菌の増殖に要求される量を超える量で存在することになってしまう。気体速度が遅いとまた同様に移行するＣＯの量が少なくなることでＨ₂変換率が高くなる結果として還元ガスであるＨ₂が前記発酵バイオリアクター内に前記細菌の増殖に要求される量を超える量で存在することになってしまう可能性がある。
【００１９】
本方法の更に別の態様では、前記栄養培地のパントテン酸カルシウム濃度またはコバルト濃度を制限する前に前記バイオリアクター内の前記細菌培養を最初に所望細胞濃度に持って行ってもよい。
【００２０】
本発明の方法の別の態様では、発酵ブイヨンを生産用リアクター（この中でエタノールの大部分を生成させる）に送り込む増殖用リアクターで構成させた２段階ＣＳＴＲ（バイオリアクター）を用いる。
【００２１】
本発明の別の面では、この上に記述した方法に下記の任意段階を含める：前記発酵ブイヨンを前記バイオリアクターから取り出し、このブイヨンからエタノールを蒸留しそしてエタノールを回収することによるエタノール回収。追加的または好適には、前記ブイヨンのサンプルに遠心分離を受けさせて細胞を除去しそしてガスクロを用いて前記比率の維持を監視する。
【００２２】
本発明の方法では、更に別の面において、更に、前記リアクター内にエタノールとアセチルの間の平衡状態が達成されるように前記エタノール生産に由来する水（アセチルを５ｇ／Ｌに及んで含有）を再循環させて前記リアクターに戻す追加的段階を用いてもよい。その結果として、前記リアクターに送り込まれて産物に変化するＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂がより多い量でエタノール生成をもたらす。
【００２３】
以下に本発明の好適な態様を詳細に記述することで本発明の他の面および利点を更に説明する。
【００２４】
（本発明の詳細な記述）
本発明は、少なくとも１種の還元ガス、特に産業廃棄および合成ガスの気体状成分（例えばＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂）を含有する気体状基質の嫌気性発酵でエタノールを生じさせる方法を包含する。本方法では、主題細菌の生物学的経路を処理することで１０ｇ／Ｌ・日を超えるエタノール生産率をもたらす。本発明の１つの方法ではＮＡＤ（Ｐ）よりもＮＡＤ（Ｐ）Ｈの方を豊富に存在させる。ＮＡＤ（Ｐ）ＨがＮＡＤ（Ｐ）に酸化されると培養菌が生成する酢酸が還元を受けてエタノールが生じる。別法として、本発明の嫌気性発酵でエタノールを高濃度で生産する他の方法は、発酵ブイヨンの酸化還元電位を低くすることで酢酸に還元を受けさせてエタノールを生じさせることを包含する。本発明の方法を用いると生じるエタノールの濃度が高くなり（即ち約１０ｇ／Ｌを超え、好適には約１５ｇ／Ｌを超え）、かつアセテートの濃度が低くなる（即ちバイオリアクター内の遊離酢酸が約５ｇ／Ｌ未満になる）。本方法では、また、装置を方法の異常から迅速に回復させる補助でエタノールと酢酸の連続生産に適した方法条件を維持かつ制御する。更に、本発明の方法は培養菌が低栄養素濃度に順化する（これは培養菌の性能にとって有害であり得る）ことがないようにするにも役立つ。本発明は実行可能な商業的エタノール生産方法を提供するものである。
Ｉ． 定義
特に明記しない限り、本明細書の全体に渡って用いる如き下記の用語を下記の如く定義する。
【００２５】
用語「連続方法」を本明細書で用いる場合、これは、連続的な栄養供給、基質供給、バイオリアクター内の細胞産生、バイオリアクターからの細胞除去（またはパージ）および産物取り出しを包含する発酵方法を指す。このような連続的供給、除去または細胞産生を同じまたは異なる流れの中で起こさせてもよい。連続方法では、結果として、バイオリアクター内に定常状態が達成される。「定常状態」は、そのような測定可能変数（即ち供給速度、バイオリアクター内に維持される基質および栄養素濃度、バイオリアクター内の細胞濃度そしてバイオリアクターからの細胞除去、バイオリアクターからの産物取り出しばかりでなく、条件的変数、例えば温度および圧力など）の全部が経時的に一定であることを意味する。
【００２６】
用語「気体状基質」を本明細書で用いる場合、これは、ＣＯ単独、ＣＯとＨ₂、ＣＯ₂とＨ₂、またはＣＯとＣＯ₂とＨ₂［これらは場合により気体状態の他の元素または化合物（窒素およびメタンを包含）と混ざり合っていてもよい］を意味する。そのような気体状基質には、直接または燃焼のいずれかで大気に典型的に放出または排出される気体または流れが含まれる。本方法のいくつかの態様における気体状基質はＣＯを含んで成る。本発明の他の態様における気体状基質はＣＯ₂とＨ₂を含んで成る。更に別の態様における気体状基質はＣＯとＨ₂を含んで成る。特に好適な態様における気体状基質はＣＯとＣＯ₂とＨ₂を含んで成る。本発明の更に別の基質はこの上に挙げた成分に加えて窒素、ＣＯ₂、エタンおよびメタンの中の少なくとも１種の気体を含有していてもよい。従って、そのような基質は、炭素生成物（メタンを包含）の気化に由来する「ｓｙｎｇａｓ」、即ち合成ガスと通常呼ばれる基質ばかりでなくいろいろな産業方法に由来する廃棄気体が含まれる。
【００２７】
用語「還元ガス」はＣＯまたはＨ₂のいずれかまたは両方を意味する。語句「還元ガスの量が細菌の増殖に必要な量を超える量」は、還元ガスの量が所定の栄養培地材料の時に細菌が増殖または代謝で利用し得る量を超える量であることを意味する。還元ガスの正味量を多くするか或は鍵となる栄養材料の量を少なくする（気体の量を多くすることなく気体の過剰量が達成されるように）か或は細菌に送り込む気体の速度を高くすることで、そのような量を達成することができる。細菌が増殖に要する量よりも多い量の還元ガスにさらされると、そのような細菌はエタノールの生成量を多くすることを通してそれに反応する。
【００２８】
「主題細菌」は、ＣＯと水またはＨ₂とＣＯ₂を産物であるエタノールと酢酸に変える能力を有する嫌気性（または通性）アセトジェニック細菌である。本発明は従う有用な細菌には、これらに限定するものでないが、アセトゲニウム・キブイ（Ａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｋｉｖｕｉ）、アセトバクテリウム・ウウジイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｗｏｏｄｉｉ）、アセトアナエロビウム・ノテラエ（Ａｃｅｔｏａｎａｅｒｏｂｉｕｍ ｎｏｔｅｒａｅ）、クロストリジウム・アセチクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ａｃｅｔｉｃｕｍ）、ブチリバクテリウム・メチロトロフィクム（Ｂｕｔｙｒｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ）、Ｃ．アセトブチリクム（Ｃ．ａｃｅｔｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ)、Ｃ．テルモアセチクム（Ｃ．ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｉｃｕｍ）、ユーバクテリウム・リモスム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｍｏｓｕｍ）、Ｃ．リュングダリイ ＰＥＴＣ、Ｃ．リュングダリイ ＥＲＩ２、Ｃ．リュングダリイ Ｃ−０１、Ｃ．リュングダリイ Ｏ−５２、およびペプトストレプトコッカス・プロダクツス（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｏｄｕｃｔｓ）が含まれる。本分野の技術者は本方法で用いるに適した他の嫌気性アセトジェニック細菌を選択するであろう。
【００２９】
用語「混合菌株」は、２種以上の主題細菌の混合培養菌を意味する。本発明の方法では本明細書の上に挙げた細菌のそのような「混合菌株」を用いる。
【００３０】
用語「バイオリアクター」、「リアクター」または「発酵バイオリアクターには、１つ以上の容器および／または塔または配管配置で構成されている発酵装置が含まれ、それらには、連続撹拌タンクリアクター（ＣＳＴＲ）、固定セルリアクター（ＩＣＲ）、散水床リアクター（ＴＢＲ）、バブルカラム、ガスリフト発酵装置（Ｇａｓ ｌｉｆｔ Ｆｅｒｍｅｎｔｅｒ）、固定式混合装置、または気体と液体の接触で用いるに適した他の装置が含まれる。本発明の方法で用いるに適した発酵バイオリアクターは、好適には、増殖リアクター［これで発酵ブイヨンを２番目の発酵バイオリアクター（この中で産物であるエタノールの大部分を生成させる）に送り込む］を含んで成る。
【００３１】
「栄養培地」を、一般に、ビタミンと鉱物を選択した主題細菌の増殖に充分な量で含有する通常の細菌増殖用培地を記述する目的で用いる。そのような培地には糖を含めない。本発明の使用に適したいろいろな栄養培地の成分は公知であり、本発明者らの出版物を包含する先行出版物に報告されている。例えば国際特許出願番号ＷＯ９８／００５５８、米国特許第５，８０７，７２２号、米国特許第５，５９３，８８６号および米国特許第５，８２１，１１１号ばかりでなくこの上に示した出版物に記述されている栄養培地処方を参照のこと。本発明に従ってＣＯとＣＯ₂とＨ₂からアセテートを生じさせようとする時には、実験室の典型的な栄養培地にパントテン酸カルシウムを０．９ｍｇ／Ｌ含有させる。しかしながら、ＣＯとＣＯ₂とＨ₂からエタノールを生じさせようとする時には、実験室の典型的な栄養培地にパントテン酸カルシウムを０．０２ｍｇ／Ｌ含有させる。
【００３２】
用語「制限基質」または「制限栄養素」は、栄養培地または気体状基質中のある物質がバイオリアクター内で培養菌が増殖している間にその培養菌によって定常状態をもはや支えることができないレベルまたはバイオリアクター内の安定な細菌増殖をもはや支えることができなくなるレベルにまで使い尽くされることを定義する用語である。従って、そのような栄養培地または気体状基質に存在する他の物質は全部過剰量で存在し、「制限しない」。そのような制限の証拠は、培養菌に送り込むそのような制限基質の添加速度、即ち栄養供給速度または気体供給速度を高くすると相当して細胞密度が高くなることで気体吸収速度（１分当たりの気体のミリモル）が高くなることにある。
【００３３】
特に明記しない限り、発酵ブイヨンに存在する分子状または遊離酢酸と酢酸塩の混合物を記述する目的で用語「アセテート」を用いる。分子状酢酸とアセテートの比率はその系のｐＨに依存する、即ち「アセテート」濃度が一定であるとすると、酢酸塩に対する分子状酢酸の濃度はｐＨが低くなればなるほど高くなる。
【００３４】
本明細書における「細胞濃度」は、サンプル１リットル当たりの細菌の乾燥重量を基にした濃度である。細胞濃度の測定を直接にか或は光学密度との相互関係に対する較正を伴わせて行う。
【００３５】
用語「自然状態」は、通常は存在する追加的電子もプロトンも持たない何らかの化合物、元素または経路（ｐａｔｈｗａｙ）を記述する用語である。逆に、用語「還元状態」は、１つ以上の電子を過剰量で有する何らかの化合物、元素または経路を記述する用語である。１つ以上の電子を「自然状態」に付加させる、即ち発酵ブイヨンの酸化還元電位を低くすると「還元状態」が達成される。
【００３６】
「エタノール生産率」は、連続装置では定常状態のエタノール濃度と液体保持時間（ｌｉｑｕｉｄ ｒｅｔｅｎｔｉｏｎ ｔｉｍｅ）（ＬＲＴ）の比率として計算したエタノール体積生産率であり、或はバッチ装置の場合にはエタノール濃度とこの濃度をもたらすに要した時間の比率として計算したエタノール体積生産率である。語句「高いエタノール生産率」は、１０ｇ／Ｌ・日を超える体積エタノール生産率を記述する語句である。
【００３７】
語句「高濃度のエタノール」は、発酵ブイヨンに入っているエタノールが約１０ｇ／Ｌを超え、好適には１５ｇ／Ｌを超えるか或はエタノールとアセテートの産物比率が５：１以上であることを意味する。
【００３８】
「過剰量のＨ₂」は、変換を受けるＣＯのモルの２倍と変換を受けるＣＯ₂のモルの３倍の合計に対する供給ガスに入っているＨ₂のモル比が１．０より大きい時にエタノールの生成に利用される。この比率が１．０未満であると過剰量のＨ₂が利用されなくなることでエタノールの生成が起こり得るとしても単に異なる制御機構（ｃｏｎｔｒｏｌｌｉｎｇ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ）を通してである。
ＩＩ． 本発明の方法で利用する生物学的経路
理論で範囲を限定することを望むものでないが、本発明者らは、本明細書に記述する方法でエタノールの嫌気性生成を向上させる方法は独立栄養増殖のためのアセトジェニック経路の基本的経路サイクル内のＮＡＤ（Ｐ）ＨからＮＡＤ（Ｐ）への変換を伴う生物学的経路が基になっていると理論付けする。本発明は、そのような経路を処理して高濃度エタノールの連続生産と維持を安定な処理条件下でアセテート濃度を低くしながら行うことができるようにすることでエタノールを産業用気体から生じさせる商業的に有用な方法を提供することを包含する。
【００３９】
そのような生物学的経路におけるＮＡＤ（Ｐ）ＨからＮＡＤ（Ｐ）への必須なかかわりは下記の如くであると記述する：気体状成分、例えばＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂などからエタノール生成は３段階の生物学的方法で起こる。１番目の段階で基質であるＣＯとＨ₂が酸化を受け、それによってＮＡＤ（Ｐ）Ｈが放出される：
ＮＡＤ（Ｐ）→ＮＡＤ（Ｐ）Ｈ
ＣＯ＋Ｈ₂＋Ｈ₂Ｏ→ＣＯ₂＋４Ｈ⁺
次に、段階１の産物が酢酸に変わる段階はＮＡＤ（Ｐ）Ｈを要する
ＮＡＤ（Ｐ）Ｈ→ＮＡＤ（Ｐ）
ＣＯ＋ＣＯ₂＋６Ｈ⁺→ＣＨ₃ＣＯＯＨ＋Ｈ₂Ｏ
最後に、段階１の反応の方が段階２の反応よりも速い速度で進行することから過剰量のＮＡＤ（Ｐ）Ｈが利用されるようにすると、酢酸が還元を受けてエタノールが生じる。
【００４０】
ＮＡＤ（Ｐ）Ｈ→ＮＡＤ（Ｐ）
ＣＨ₃ＣＯＯＨ＋４Ｈ⁺→Ｃ₂Ｈ₅ＯＨ＋Ｈ₂Ｏ
従って、基質の酸化で生じた過剰量のＮＡＤ（Ｐ）Ｈが利用されるようにすると結果として酢酸からエタノールが生じる。
【００４１】
アセトジェニック経路には下記の２つの公知基本的経路サイクルが存在する：（１）アセチル−ＣｏＡサイクルおよび（２）ＴＨＦサイクル（このサイクルでＣＯ₂が還元を受けてメチル基になる）。エタノールが生じる順とこれから酢酸が生じる順がＪ．Ｒ．Ｐｈｉｌｌｉｐｓ他、１９９４ 「Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ」、４５／４６：１４５に説明されている。アセチル−ＣｏＡサイクルは内部サイクル（本明細書でＣＯサイクルと呼ぶ）を有する。ＣＯサイクルの反応は一般に時計回りに起こることからフェレドキシンが還元を受ける。フェレドキシンはまたＨ₂でも還元を受け得る（それが酵素であるヒドロゲナーゼで酸化を受ける時に）。その結果として、アセチル−ＣｏＡサイクルの反応はまた時計回りであり、フェレドキシンが酸化を受ける。内部ＣＯサイクルとアセチル−ＣｏＡサイクルの反応速度が同じであるとすると、フェレドキシンは酸化還元平衡状態にある。しかしながら、この２つのサイクルが同じ速度で起こらない、即ちＣＯサイクルの反応速度の方がアセチル−ＣｏＡサイクルの反応速度よりも速いと、還元を受けたフェレドキシンが蓄積される。また、Ｈ₂を過剰量で用いると、また、還元を受けたフェレドキシンが過剰量でもたらされる可能性もある。このように還元を受けたフェレドキシンが過剰量で存在するとＮＡＤ（Ｐ）が再生（還元）を受けてＮＡＤ（Ｐ）Ｈが生じ、これが過剰分を構成し、これは平衡状態になると考えるべきであり、それによって酢酸が還元を受けてエタノールが生じる。
【００４２】
ＴＨＦサイクルは細胞増殖で機能し、連続的培養に必要であり、従って、完全に停止することは起こり得ない。ＴＨＦサイクルの速度を遅くすることでもまたＮＡＤ（Ｐ）に対するＮＡＤ（Ｐ）Ｈの比率が高くなる。ＮＡＤ（Ｐ）Ｈは酸化を２カ所で受ける。この酸化［これによって細胞内の全ＮＡＤ（Ｐ）ＨとＮＡＤ（Ｐ）の比率が均衡状態に保持されるであろう］を制限すると酢酸からエタノールが生じる還元でＮＡＤ（Ｐ）Ｈが用いられる。
【００４３】
酢酸に還元を受けさせてエタノールを生じさせる２番目の基本的方法は、発酵ブイヨンの酸化還元電位を直接下げることによる方法である。還元状態を培養菌の自然状態よりも充分に低くするとＮＡＤ（Ｐ）Ｈが豊富に存在することが促されることで酢酸からエタノールへの還元が助長される。
ＩＩＩ． 本発明の方法
本方法の基本的段階は下記を包含する：産物の回収を伴う連続発酵方法を図１を参照して記述しかつ以下に示す実施例１で例示する。主題細菌を入れておいた発酵バイオリアクター３に少なくとも１種の還元ガス、例えばＣＯまたはＨ₂などを含んで成る気体状基質１の連続流れを選択した気体供給速度で供給しかつ液相である栄養培地２の連続流れを選択した栄養供給速度で供給する。バイオリアクター３内で前記細菌が前記培地と気体状基質を発酵させてエタノールと酢酸を生じさせる。定常状態条件下で安定な細胞濃度が達成された時点で、その連続系（ｃｏｎｔｉｎｕｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ）の成分（ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ）を処理することによって、前記バイオリアクター内の遊離酢酸濃度を５ｇ／Ｌ未満に保持しながら発酵ブイヨン中の酸化還元電位を低くするか或はＮＡＤ（Ｐ）に対するＮＡＤ（Ｐ）Ｈの比率を高くする。本発明の方法は、発酵ブイヨン中で生じるエタノールとアセテートの生成をエタノールとアセテートの比率が１：１から２０：１の範囲の時のエタノール生産率が１０ｇ／Ｌ・日を超えるようにしかつ維持するように設計した方法である。１つの態様では前記比率が３：１を超える。別の態様では前記比率が５：１を超える。更に別の態様では前記比率が１０：１を超える。更に別の態様では前記比率が１５：１を超える。本発明の方法は、別法として、エタノールが高濃度（エタノールが１５−３５ｇ／Ｌ）で生成されかつアセテートが低濃度（アセテートが０−５ｇ／Ｌ）で生成されるように向上させた安定な連続（定常状態）生産、即ち方法の良好な安定性を伴わせながらＣＯとＣＯ₂とＨ₂から生じるエタノールとアセテートの比率が３：１以上になるような安定な連続（定常状態）生産に有効である。
【００４４】
本発明の方法では、この過程中に前記ブイヨンのサンプルを定期的に取り出して通常の検定方法で前記比率を測定する。例えば、このサンプルから細胞を例えば遠心分離などで分離した後、この細胞を除去しておいたサンプルに検定方法、例えば好適なガスクロ方法などを受けさせる。しかしながら、本分野の技術者は他の便利な検定方法を選択するであろう。前記比率を達成しそして／または維持する目的で本方法に任意の追加的段階を加えてもよい。実施例２にそのような検定方法を示す。
【００４５】
系の成分を処理しそして所望のエタノール生産率またはアセテートに対するエタノールの比率を維持しそして／または達成する目的で用いる段階に下記の段階の少なくとも１つ、望ましくは組み合わせを含める：栄養培地含有量、栄養供給速度、水供給速度、処理圧、処理ｐＨ、気体状基質含有量、気体供給速度、発酵ブイヨン撹拌速度を変えること、生産物阻害段階を回避すること、バイオリアクター内の細胞密度を低くすること、または基質阻害を防止すること。好適ないくつかの処理には、液相栄養素（パントテン酸塩またはコバルト）を制限し、供給ガス中のＣＯとＨ₂を若干過剰量にすることを伴わせてバイオリアクターへの供給を行うこと、アセテート濃度を最小限にすること、液相の低い栄養素濃度への培養菌の順化を回避すること、培養菌を相対的に速い速度で適切な細胞濃度に持って行くこと、培養菌のｐＨを４．５より高いｐＨにまで上昇させること、細菌の細胞をバイオリアクターからパージ洗浄して細胞濃度をそれがバイオリアクター内の還元ガスまたは栄養基質の全部を利用する安定な定常状態濃度未満になるようにすること、そして発酵バイオリアクターのブイヨンに存在するアセテートの遊離酢酸分率が２ｇ／Ｌを超えた時点で水供給速度を高くすることで遊離酢酸濃度が望ましくなくいくらか増加することがないようにすることが含まれる。このような段階の全部を以下に詳述する。
【００４６】
リアクターに由来するＣＯとＣＯ₂とＨ₂以外の気体と変換を受けなかったＣＯとＣＯ₂とＨ₂を含有する排気４をリアクターから排出させて、それらの燃料価に関して使用する。過剰量のＨ₂を制御機構として用いる場合には、その段階によるエタノールとアセテートの比率の制御を同定する目的で、流出ガス中のＨ₂分圧および排出ガス中のＣＯ₂分圧に対するＨ₂分圧の比率を用いる。前記バイオリアクター内の細胞濃度を高くする目的で細胞再循環を利用し（必要ではないが）、このようにして、ＣＯとＣＯ₂とＨ₂の変換で用いられる生体触媒の量をより多くする。細胞再循環を用いる場合には、リアクターから流出する液５を細胞分離装置６に送り込んで、細胞７と透過液（細胞を含まない液）８を分離する。細胞７をバイオリアクターに戻しそして透過液８を産物回収に送る。
【００４７】
細胞分離を連続遠心分離、中空繊維もしくは螺旋巻き濾過装置、セラミック濾過装置または他の固体／液体分離装置を用いて達成する。前記透過液（または、別法として、細胞分離を利用しない時にはリアクターから出る流出液５）からエタノールを多様な技術で回収することができ、そのような技術には蒸留および吸着が含まれる。透過液８に分離を蒸留塔内で受けさせると９５％エタノール塔頂液（９５％ ｅｔｈａｎｏｌ ｏｖｅｒｈｅａｄ）１０がもたらされかつ水１１がもたらされ、この水１１を再循環させてリアクター３に戻す。この再循環水１１は発酵で使用されなかった過剰分の栄養素を含有するが、発酵または細胞溶解でいくらか生じた余分なビタミンは熱蒸留で分解される。前記９５％エタノール塔頂液１０をモレキュラーシーブ１２に送り込んで、所望の最終産物である無水エタノール１３を希エタノール１４から分離し、その希エタノール１４を蒸留塔９に戻す。
【００４８】
追加的培養菌を補充することなくＣＯとＣＯ₂とＨ₂を栄養素と一緒に供給することを通してエタノール（および少量の酢酸）生産で用いる連続方法を多数カ月に渡って処理することができるように、増殖、死亡および細胞パージ（ｃｅｌｌ ｐｕｒｇｅ）の連続組み合わせで細胞濃度を一定に維持する。本発明の方法では、エタノールと酢酸を連続的に生成するに適した条件を維持および管理しかつ方法の異常が起こらないようにするか或は方法の異常を迅速に補正する。本発明の方法は、また、培養菌が低い栄養素濃度に順化（これは培養菌性能に有害であり得る）することがないようにするにも役立つ。以下および本実施例に示す記述において、特に明記しない限り、用いる圧力は１気圧でありそして用いる温度は３６−４１℃の範囲である。本分野の技術者はバイオリアクターで用いるように選択した微生物に応じて望ましい温度および圧力を決定することができるであろう。
【００４９】
以下に具体的に記述する多様な処理を本発明の基本的な段階に加えることでエタノールの生産を高めることができる。好適には、液相栄養素制限（ｌｉｑｕｉｄ ｐｈａｓｅ ｎｕｔｒｉｅｎｔ ｌｉｍｉｔａｔｉｏｎ）（パントテン酸塩またはコバルト）またはＨ₂もしくはＣＯの過剰使用が、所望のエタノール生産率を達成して維持しかつ発酵ブイヨン中にエタノールとアセテートを安定な濃度および比率で生じさせる目的で用いる本発明の方法段階（以下に詳述する）である。そのような条件にするとエタノールとアセテートを発酵ブイヨン中に安定な濃度で生じさせることが可能になる。好適な多様では、発酵ブイヨン中に生じたエタノールとアセテートの産物比率が１０：１を超えかつエタノール濃度が１５ｇ／Ｌを超える。
Ａ． パントテン酸カルシウム制限
本発明の１つの具体的な態様では、エタノールの生成が有利に起こりかつ酢酸の生成が制限されるように生物学的経路を処理する方法に、栄養培地に入れるパントテン酸カルシウムの量を当該細菌がその供給されるパントテン酸カルシウムを完全に利用するであろう安定な定常状態の濃度に維持されるに必要な量より少ない量に制限することを伴わせる。パントテン酸塩はアセチル−ＣｏＡの一成分であり、従って、栄養培地に入れるパントテン酸カルシウムの量を制限すると、アセチル−ＣｏＡサイクル速度（ｃｙｃｌｅ ｒａｔｅ）の方がＣＯサイクル速度よりも遅くなる。それによって、還元を受けたフェレドキシンが蓄積しかつＮＡＤ（Ｐ）からＮＡＤ（Ｐ）Ｈへの還元が促されることで、最終産物としてのエタノールの生成量が多くなる。
【００５０】
パントテン酸カルシウムをリアクター内で産生する細胞１グラム（ｇ）（乾燥重量）当たり０．５から１００ミクログラム（μｇ）の範囲で送り込むとパントテン酸塩制限が観察される。より望ましいパントテン酸塩制限は、パントテン酸カルシウムをリアクター内で産生する乾燥細胞１グラム（ｇ）当たり２５から７５μｇの範囲にした時である。更に好適なパントテン酸塩制限は、パントテン酸カルシウムをリアクター内で産生する細胞１グラム（ｇ）当たり０．５から５０μｇの範囲にした時である。この制限の別の態様は、パントテン酸カルシウムをリアクター内で産生する細胞１グラム（ｇ）当たり約１−２５μｇにする態様である。この制限の別の態様は、パントテン酸カルシウムをリアクター内で産生する細胞１グラム（ｇ）当たり約１０−３０μｇにする態様である。栄養素をそのような量にするとエタノールの生成がアセテート生成より優先的に起こることが維持される。このような方法の１つの態様を実施例４に示す。
【００５１】
本方法の別の面では、パントテン酸カルシウム濃度が一定に維持されるように発酵パラメーターを調節または調整すると同時に気体供給速度、液体供給速度、撹拌速度またはＨ₂分圧の中の少なくとも１つ、時には２つ以上のパラメーターを調整することを通して、発酵バイオリアクター内の当該細菌が低い制限パントテン酸カルシウム濃度に順化しないようにする。栄養素が大きく変化しないようにして、栄養供給濃度を比較的一定に維持する。培養菌が低い液相制限栄養素に順化すると不可逆的な方法でエタノール／アセテートの産物比が劣ってきて、アセテート１ｇ当たり１．０ｇ以下のエタノールにまでなってしまう。従って、リアクターを休止させて再接種を行う必要が生じる。好適には、この上に記述したように、最初に供給ガスに入れるＨ₂を過剰にしてそれをバイオリアクターに供給した後に栄養培地に入れるパントテン酸カルシウムを制限することを通して、エタノール生成が有利に起こって酢酸生成が制限されるように生物学的経路を制御する。
【００５２】
実際のところ、開始時には、低い栄養素濃度への順化、即ち、結果として培養菌が生成する性能が非常に劣る可能性がありかつその能力が失われる可能性がある条件を回避する目的で、通常は制限液相栄養素であるパントテン酸カルシウムを過剰な状態に保持することで、Ｈ₂を過剰量で用いなくても１０ｇ／Ｌ・日を超える高いエタノール生産率が達成されるようにする。そのような特別な細菌培養の発酵パラメーターに関する調節の例を実施例１７に示す。
Ｂ． コバルト制限
本発明の別の態様では、エタノールの生成が有利に起こりかつ酢酸の生成が制限されるように生物学的経路を処理する方法に、栄養培地に入れるコバルトの量を当該細菌がその供給されるコバルトを完全に利用するであろう安定な定常状態の濃度に維持されるに要する量より少ない量に制限することを伴わせる。コバルトをバイオリアクター内で産生する細胞１グラム（ｇ）（乾燥重量）当たり５から１００ミクログラム（μｇ）の範囲でリアクターに送り込むとコバルト制限が観察される。好適には、コバルト制限に、コバルトをリアクター内で産生する細胞１グラム当たり約２０から５０μｇの範囲の量でリアクターに供給することを伴わせる。このような方法でコバルトをそのような量にするとエタノールの生成がアセテート生成よりも優先的に起こることが維持される。実施例１８に、このような方法に従ってリアクターに送り込むコバルトを制限する方法の態様を示す。
【００５３】
発酵ブイヨンに入れるコバルトの量を制限することでもまたアセチル−ＣｏＡサイクル速度が遅くなる可能性がある。メチル基がＴＨＦサイクルからアセチル−ＣｏＡサイクルに伝達される時にコバルトが用いられることから、発酵ブイヨンに入れるコバルトの量を制限するとまたその伝達が起こらなくなることでＴＨＦサイクルの機能が低下する。コバルトを制限するとＴＨＦサイクルの速度が遅くなり、それによってまたＮＡＤ（Ｐ）に対するＮＡＤ（Ｐ）Ｈの比率がより高くなることでエタノールの生成がもたらされる。
【００５４】
低い制限コバルト濃度への順化が起こらないようにすることで本方法を更に処理する。低いパントテン酸塩濃度への順化を回避する様式とほぼ同じ様式で、コバルトの濃度を一定に維持しながら発酵パラメーター（気体速度、液体速度、撹拌速度、ＣＯ₂含有量およびＨ₂ガス分圧）の中の１つ以上を調整する。栄養素が大きく変化しないようにして、その代わりに、栄養供給材料濃度を比較的一定に維持する。そのような特別な細菌培養の発酵パラメーターに関する調節の例を実施例１９に示す。
【００５５】
好適には、この上に記述したように、最初にリアクターにＨ₂を過剰に供給した後に栄養培地に入れるコバルトを制限することを通して、エタノール生成が有利に起こって酢酸生成が制限されるように生物学的経路を制御する。開始時には、低い栄養素濃度への順化、即ち、結果として培養菌性能が非常に劣る可能性がありかつ培養菌が産物を１：１を超える比率で生成する能力が失われる可能性がある条件を回避する目的で、制限液相栄養素であるコバルトを過剰な状態に保持する。
Ｃ． 水素の過剰供給
更に別の態様では、エタノールの生成が有利に起こりかつ酢酸の生成が制限されるように生物学的経路を処理する方法に、Ｈ₂を供給ガスに過剰に入れてそれを供給するか或は結果としてＨ₂が過剰になるように気体状炭素を制限することを伴わせるが、その過剰量のＨ₂は後で生物学的経路で用いられる。好適には、還元ガスであるＨ₂をＣＯに比べて過剰量にし、このようにＨ₂を過剰量にすると、発酵ブイヨン中で当該細菌が生成するアセテートに対するエタノールの比率が高くなる。変換を受けるＣＯ（気体のモルで表す）の２倍と変換を受けるＣＯ₂（気体のモルで表す）の３倍の合計に対するＨ₂（供給する気体のモル）の比率が１よりも大きくなるようにすると、発酵装置が炭素制限状態になる。排出ガスに存在するＨ₂の分圧が好適には０．４気圧よりも高くなるようにする。最終的には、ＣＯ₂の全部が利用されるに充分な量でＨ₂が利用され得ることを確保する目的で、ＣＯ₂分圧に対するＨ₂分圧の比率が３．０より大きくなるようにすべきである。ＣＯ₂分圧が０．１気圧よりも高いと、増殖が他の様式で制限される可能性がある。このような方法段階の説明に関しては実施例２０を参照のこと。
【００５６】
開始段階中には、栄養制限を行うよりもＨ₂を過剰量で用いる方が好ましいが、その理由は主に制御がより容易なことにある。Ｈ₂を過剰量で用いることの利点は酢酸が余分に生成されないようにすることにあり、酢酸が余分に生成されると結果として産物比率が劣りかつ酢酸による阻害が起こる可能性があるばかりでなく低い栄養素濃度への順化がもたらされる可能性がある。
Ｄ． 一酸化炭素の過剰供給
本方法の成分を処理する別の方法は、経路で用いられる気体状基質に入れる還元ガスであるＣＯを過剰量で供給することを伴い、これは、発酵ブイヨンの酸化還元電位を直接下げる働きをする。このように、この態様に従い、ＣＯを含んで成る気体状基質をバイオリアクターに供給することで、そのバイオリアクターに存在するＣＯの量が当該細菌がその供給されるＣＯを完全に利用するであろう安定な定常状態濃度に維持されるに必要な量よりも多くする。ＣＯの比吸収速度［リアクターに存在する細胞（乾燥重量）１グラム当たりに送り込まれるＣＯのミリモル／分、即ちミリモル／細胞ｇ・分］が０．３を超えるようにした時のＣＯ過剰供給がエタノールの生成の方を酢酸生成よりも有利に起こさせる１つの方法である。この段階は、より好適には、ＣＯの比吸収速度を０．５よりも高くすることを伴う。このことは、各細胞がこれの代謝でＣＯを平均で少なくとも０．３ミリモル／ｇ・分の速度、より理想的には少なくとも０．５ミリモル／ｇ・分の速度で利用することを意味する。好適には、ＣＯ吸収が細菌の細胞（乾燥重量）１グラム当たり０．３から２ミリモル／分で起こるような速度でＣＯを供給する。別の態様では、細菌の細胞（乾燥重量）１グラム当たり０．５から１．５ミリモルのＣＯ／分の速度でＣＯを供給する。別の態様では、細菌の細胞（乾燥重量）１グラム当たり約１ミリモルのＣＯ／分の速度でＣＯを供給する。実施例２４に、このような方法段階の１つの態様の説明を与える。
【００５７】
ＣＯ吸収率をそのような比率にするとアセテートの生成よりもエタノールの生成の方が優先的に起こることが維持される。培養ブイヨンに溶解しているＣＯが気体の圧力または非常に良好な質量移動によって多くなるようにＣＯを供給すると、そのような発酵ブイヨンでは還元が起こる度合がより高くなる。ＣＯを過剰供給すると追加的利点が２つ得られる。ＣＯを過剰にすると、ＣＯサイクルがより速い速度で機能する可能性があり、かつアセチル−ＣｏＡサイクルが他の様式で制限されてＣＯサイクルに遅れずについて行くことができない時には還元を受けたフェレドキシンが蓄積する可能性がある。ＣＯはまたそのような全体で３段階の方法の段階２（中間体である酢酸の生成）を基質阻害で遅くする可能性もある。このように段階２の速度の方が段階１よりも遅いとＮＡＤ（Ｐ）Ｈが過剰量になり、それによってエタノールの生成の方が酢酸の生成よりも有利に起こる。
【００５８】
ＣＯを過剰にすると結果として発酵ブイヨンの酸化還元電位が直接低くなることでエタノール生成が向上し得るが、ＣＯを過剰量で存在させるとまたＣＯ−デヒドロゲナーゼが阻害され、従ってＨ₂の吸収が阻害されることで増殖が阻害される。ＣＯを過剰に存在させると、不幸なことにまたＨ₂の変換率も劣り、これは経済的に好ましくない可能性がある。基質が阻害された状態で処理を長期間行うと結果としてＨ₂の吸収率が劣ってくる。それによって最終的に細胞溶解が起こり、リアクターを再出発させる必要が生じる。このような方法が培養菌の初期増殖中またはその後に意図しないＣＯ基質阻害結果（有効細胞に対してＣＯがあまりにも多く存在）をもたらす場合には、そのような基質阻害が軽減されるまで気体供給速度および／または撹拌速度を遅くする。そのような効果が達成されるように気体速度または撹拌速度をどのように調整するかに関する説明を実施例２１に示す。
Ｅ． 追加的処理段階
この上に記述した主要な方法向上段階に加えて、望ましくは、いくつかの方法段階を本エタノール生産方法に含める。
１． 質量移動の向上
そのような１つの追加的態様は、気体供給に由来するＣＯまたはＨ₂が液状の発酵ブイヨンに質量移動する速度の方が当該細菌がその溶解した気体を利用し得る速度よりも速いことを確保することを伴う。例えば、バイオリアクターにＣ．リュングダリイを入れてこれにＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂を供給しそしてそれを栄養素（例えばパントテン酸塩またはコバルト）の制限なしに処理するか或はＨ₂を過剰量で存在させないで処理すると、液相の中に移動する気体量によって細胞増殖が制限されることで、そのような系では酢酸が産物としてもたらされる。培養菌にＣＯまたはＨ₂を培養菌増殖に要する量よりも若干過剰量で供給すると、それによってエタノールの生成がもたらされる。しかしながら、液相の中に送り込む気体の量を培養菌が利用する量に比べてあまりにも多くすると基質阻害が起こり、それによって、培養の異常および細胞の死亡がもたらされる可能性がある。このように、質量移動を過剰にして処理する範囲は非常に狭い。実施例２２にそのような方法の説明を示す。
【００５９】
アセチル−ＣｏＡサイクルに関して、還元を受けたフェレドキシンが過剰量で生じるようにするには、ＣＯサイクルまたはヒドロゲナーゼによるフェレドキシンの還元の方がアセチル−ＣｏＡサイクルよりも迅速に起こるようにすべきである。本明細書に記述する方法では、当該細菌が必須栄養素、例えばパントテン酸カルシウムもしくはコバルトなどまたは他の基質、例えばＣＯ₂ガスなどを利用する速度を制限するか或は培養菌に供給する基質であるＨ₂またはＣＯを過剰にすることを通して、その有機体がその溶解している気体を利用し得る速度を制限する。
【００６０】
当該細菌が基質を利用し得る速度よりも速い理論的な質量移動速度は他の制限を伴わない時でも計算可能である。そのような速度を達成すると、これは当該有機体の自然増殖速度で制限される。従って、最も生産的な態様は、最も高くなる可能性のある濃度の細胞が基質を全く制限なしに利用することができる速度に比べて質量移動（気体流量または撹拌速度）の方が速くなるようにする態様である。基質の阻害が起こると細胞の死滅が急速に起こる可能性がありかつ結果として培養菌に有害な副産物濃度になることから、そのような処理範囲は非常に狭い可能性がある。
２． ＣＯとＨ₂を過剰供給
本発明の方法の別の態様では、コバルトまたはパントテン酸カルシウムを制限する方法において、エタノールの高い濃度／酢酸の制限された生成の安定性を達成する、即ちＨ₂とＣＯを豊富に供給する。この段階に従い、培養菌が気体状基質であるＣＯ、Ｈ₂およびＣＯ₂を炭素源およびエネルギー源として利用するようになるにつれて、ＣＯとＨ₂を若干過剰に供給する。定常処理を達成した後に気体供給速度および／または撹拌速度をＣＯとＨ₂の変換率が正に降下し始めるところまで次第に高くして行く（１０％以下の増分で）ことを通して、ＣＯとＨ₂の若干過剰量を達成する。これは質量移動制限（酢酸の生成が有利に起こる）を回避する１つの手段であり、かつＮＡＤ（Ｐ）からＮＡＤ（Ｐ）Ｈへの還元が起こりかつエタノールが生成されるように還元を受けたフェレドキシンを過剰に供給する１つの手段である。ＣＯとＨ₂を若干過剰量で供給しないと質量移動制限が起こることで経路の均衡が生じる。その結果としてアセテートに対するエタノールの産物比が劣ってしまう（アセテートの濃度が高くなってしまう）。アセテートの濃度が高いと最終的に酢酸による阻害がもたらされる可能性があり、それによって、当該細菌がＨ₂を取り込む能力が制限され、最終的に培養の失敗がもたらされる可能性がある。
【００６１】
質量移動制限を回避する段階には、撹拌速度または気体速度を高くしてより多くのＣＯとＨ₂が液相の中に運び込まれるようにすることでＣＯとＨ₂が若干過剰量で存在するようにすることが含まれる。質量移動制限の結果として生産物阻害が起こった場合には、酢酸による阻害を排除する目的で液体供給速度を高めて結果として生じたアセテートの濃度が低くなるように希釈を行う必要がある。培地供給速度を高くすると産生する細胞１グラム当たりのパントテン酸塩またはコバルトのμｇが多くなる可能性があることから、これを行う期間を短期間のみにすべきか或は培地濃度を調整するか或は水供給速度を高くしてパントテン酸塩またはコバルトが過剰にならないようにすべきである。
３． 酢酸による生産物阻害の制御
この上に記述した方法では、分子状の酢酸がバイオリアクター内にあまりにも多い量、即ち＞２ｇ／Ｌの量で蓄積すると酢酸による生産物阻害が起こって細胞が増殖しなくなりかつエタノールのさらなる生成が起こらなくなる可能性がある。培養の失敗を回避する目的で別の処理段階を用いる。１つの修飾は、液体もしくは水供給速度を短期間高くすることで阻害する酢酸の液相濃度を２ｇ／Ｌ未満にまで低くすることを伴う。リアクター内の特別な培養に関する前記段階の一例を実施例２３に示す。
４． 水再循環段階
本発明の方法で酢酸の正味の生成なしにエタノールをただ１種類の産物としてもたらす安定な培養を維持する更に別の任意方法段階は、蒸留で得た循環水を発酵リアクターに戻して加えることを伴う（例えば実施例１５を参照）。この上に示したように、水（アセテートを５ｇ／Ｌ以下の量で含有）を再循環させると、生成されたアセテートがリアクターに再循環で戻って酢酸が正味全くもたらされないと言った利点が得られる。このようにしてリアクター内にエタノールとアセテートの間に平衡状態を確立する。その結果として、培養の維持で用いられる分を除いてリアクターに供給したＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂の全部が産物に変化し、その結果としてエタノールが生じる。
５． 細胞密度の低下
本方法にとって有用な更に別の処理段階は、細菌の細胞をバイオリアクターから定期的または連続的にパージ（ｐｕｒｇｉｎｇ）してバイオリアクター内の細胞濃度を低くすることを開始させる段階である。このような処理を用いて細胞濃度をバイオリアクター内の還元ガスまたは栄養基質の全部が利用される安定な定常状態の細胞濃度より低い濃度に低下させる。このようにして細胞密度を変えることで、バイオリアクター内でエタノールの生成の方がアセテートの生成よりも有利に起こるようにする。例えば実施例２５を参照のこと。
６． ２段階ＣＳＴＲ
培地の制限を伴わせてエタノールを生成させることに関連した問題の１つは、培養菌が最終的にそのような制限条件に適応するようになり得るか或はそのような傾向がありそして数カ月に渡る処理後にエタノールの生成を継続して行わなくなる点にある。その代わりに、最終的にアセテートが主要な産物になってしまう。このような低い制限栄養素濃度への順化が起こると結果として培養菌がエタノールよりも酢酸の方を多く生成するようになり（アセテートに対するエタノールの産物比が１．０以下になり）、それによってエタノールの濃度が低くなってしまう（時には１ｇ／Ｌの如く低くなってしまう）。開始期間中の培養菌に栄養素を充分な量で与えない時にそのような適応が最も起こり易く、その場合には、増殖速度の方がエタノール生成速度よりも重要である。加うるに、定常状態処理中にも培養菌が低い制限栄養素濃度に順化し得る危険性もあり、特にアセテート反応系を取り除く目的で制限栄養素濃度を下方に調節した時に順化し得る危険性がある。
【００６２】
栄養素を有効量で用いて培養菌を増殖させる代わりにこの上に示したパントテン酸塩またはコバルトによる制限段階を用いた時に起こるそのような適応を回避しかつこの上に述べた危険性を回避する目的で、本方法の別の修飾を用いることができる。１番目の段階で制限栄養素を若干過剰量で用いて主に良好な培養菌増殖を起こさせ（恐らくは酢酸の生成を伴うが）そして次に１番目の段階で得た培養菌にこの時点で制限栄養素による制限を受けさせそしてこれを用いてエタノールを高濃度で生成させる生産段階を伴わせた２段階ＣＳＴＲ系が本発明の別の修飾である。このような修飾を用いると安定な培養の維持が可能になり、その培養菌は低いパントテン酸塩濃度にも低いコバルト濃度にも順化しなくなる。このような修飾は、エタノール生成の大部分を起こさせる生産用リアクター（段階２）への供給を行う増殖用リアクター（段階１）が備わっている２段階ＣＳＴＲを処理することを伴う。前記増殖用リアクターの処理をこの上に記述した栄養素制限段階なしに行い、このようにすると培養菌は制限条件にあまり順化しなくなる。
【００６３】
このような２段階ＣＳＴＲ装置の図式図を図２に示し、この図に下記の説明を参考として付ける。この態様に従い、増殖段階を約２４時間の液体保持時間（ＬＲＴ）で処理する。増殖段階のＣＳＴＲ１にパントテン酸塩またはコバルトを培地２に入れて充分な量で供給することで健康な培養菌を生じさせる（そしていくらかではあるが酢酸も同様に生じ得る）。このように、リアクター内に酢酸が過剰に生成されるが、高い安定性を伴う。このようなパントテン酸塩もしくはコバルト濃度は、エタノールの生産で用いられる単一のＣＳＴＲに通常送り込まれるであろう濃度よりも高い。このリアクターに供給する気体供給材料は生産段階４で変換を受けなかった気体３でありそして液体供給材料は新鮮な培地２である。増殖段階ＣＳＴＲの処理を細胞の再循環なしに行う。この増殖段階リアクターの目的は、後のエタノール生産で用いる健康な培養菌が低いパントテン酸塩濃度に順化しないようにすることにある。
【００６４】
生産段階リアクター４を２０時間未満の僅かなＬＲＴで処理する。このＣＳＴＲには細胞再循環を伴わせて、これに新鮮な気体供給材料５を送り込み、そしてこの場合の変換率は低い可能性がある。これに新鮮な培地供給材料６ばかりでなく増殖段階に由来する培養菌供給材料７も送り込む。このリアクターに送り込むパントテン酸塩またはコバルトの量を最小限にする、と言うのは、増殖段階によってそれを余分に利用することができるからである。このリアクターでは、リアクター９に送られて戻る細胞から最も高い生産を得る目的で細胞再循環８を利用する。液状産物１０に入って出て来るエタノールの濃度が２０ｇ／Ｌよりも高くなるようにすべきである。この２段階ＣＳＴＲ装置の特徴には、低いパントテン酸塩もしくはコバルト濃度への順化の変化がほとんどないこと、全体的ＬＲＴが３０時間に等しいか或はそれ以下であること、同じ大きさの単一のＣＳＴＲを用いた時に比較してエタノールの生産率が高くかつエタノールの濃度が高いと期待されることが含まれる。
７． 開始時修飾
本発明の実施で好適に利用する更に別の方法段階は、発酵培養の初期開始時に細胞を生成させることを伴う。バイオリアクターに供給したＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールと酢酸が生じる生成の開始を、原料培養菌（ｓｔｏｃｋ ｃｕｌｔｕｒｅ）を用いたバッチ式接種（実施例１１）または現存するリアクターから接種材料を培養菌供給材料として連続的に用いること（実施例１２）で達成する。培養菌が低いパントテン酸塩濃度にも低いコバルト濃度にも順化しないようにすることを考察した時にこの上に示したように、最も望ましくは、栄養素を制限する前に培養菌を高い細胞濃度に持って行くが、この培養菌にＨ₂を過剰に供給する。このような迅速な開始を行うと培養菌の順化が回避されかつ良好な産物比がもたらされる（エタノール濃度が高くなってアセテート濃度が低くなる）。このような迅速開始を用いないと劣った産物比がもたらされる可能性がありかつ培養菌が低い液相栄養素濃度に順化する可能性があり、それによってリアクターに再接種を受けさせる必要が生じ得る。
【００６５】
バッチ式液相（ｂａｔｃｈ ｌｉｑｕｉｄ ｐｈａｓｅ）を低い撹拌速度［実験室のＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）リアクターでは恐らくは４００−６００ｒｐｍ］および所望のｐＨで用いてリアクターに開始を受けさせる（液状培地を最初はリアクターに連続的には供給しない）。このようにすると、リアクター内の液相はビタミン類と塩類を含有する１バッチの栄養培地に加えて僅かな濃度の制限栄養素であるパントテン酸カルシウムまたはコバルトのいずれか（例として２０μｇ／Ｌのパントテン酸塩または７５ｐｐｂのコバルト）で構成される。現存リアクターを用いた連続接種を利用する時には、バッチ式液相処理を同様には行う必要がない。この場合には初期開始段階中に気体をリアクターに低い供給速度で連続的に送り込む。理想的には、開始時の気相にＣＯ₂を含めないようにして、Ｈ₂が豊富な状態にしてもよく、そしてＣＯ基質阻害を回避する目的で気体速度と撹拌速度を低いレベルに保持してもよい。
【００６６】
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを商業的に実行可能な濃度で生産して維持するに適した典型的な一般的開始時プロトコルを下記の個々別々の３段階で構成させる：（ａ）細胞産生が重要な初期開始段階、（ｂ）生成速度が重要になってくる開始段階そして（ｃ）定常状態処理。初期開始段階は本質的にバッチ液の接種を僅かな制限栄養素［コバルト（７５ｐｐｂ）またはパントテン酸カルシウム（２０μｇ／Ｌ）から選択］を伴わせて所望ｐＨ（典型的には４．５−５．５）で行うことを特徴とする。開始を容易にする目的で、優先的には、気体供給速度と撹拌速度を低く保ちながらＨ₂を過剰に供給する。開始時に起こるエタノール生成の原因はＨ₂が過剰に存在することにあり、栄養制限を後で行う。このように、実際には、開始段階中には培養菌が望ましくなく低い栄養に順化しないようにする目的で液状の栄養素を過剰に存在させる。発酵を接種後数時間に渡って進行させるにつれてＣＯ₂が生成されてＨ₂が消費される。このような率の変化は、質量移動制限が起こらないように撹拌速度をゆっくりと僅かに高く（実験室のリアクターでは恐らく２−３日間かけて２００−３００ｒｐｍ）してゆくべきであることを示していた。
【００６７】
このように連続接種を用いた系では原料培養菌を用いたバッチ式接種とは対照的にＣＯ₂の生成がずっとより迅速に起こる。しかしながら、撹拌速度をあまりにも速くするとＣＯ基質阻害が起こってしまう。このようなＨ₂変換（またはＣＯ₂生成）を監視する手順と同時に撹拌速度を目標の撹拌速度に到達するまで比較的速い速度で僅かに高くして行く。このようにバッチ式液状培養では、撹拌速度を高くして行く時には産物の生成ではなく細胞の生成が最も重要である。
【００６８】
目標撹拌速度に到達［実験室のＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）リアクターでは８００−１０００ｒｐｍ］した時点で、Ｈ₂の取り込みを確実にする目的で培養を定常状態にする。開始段階を生産速度が重要になる様式に移行させる。アセテートの濃度を制限しかつ遊離の分子状酢酸の濃度を制限しながらエタノールの生成を確保するにはＣＯ変換率が８０％を超えるようにしかつ排出ガス中のＨ₂分圧を高く（少なくとも０．５５気圧）するのが望ましい。その後、液状培地供給をある速度で開始させ（原料培養菌を用いたバッチ式接種を受けさせた系の場合）て連続的な液体供給を開始させかつ気体速度を目標の流量に向かって１０％増分で高くして行く。酢酸が余分に生成されないようにＨ₂を過剰なままにする。気体速度を高くして行くにつれて液相栄養素（パントテン酸カルシウムまたはコバルト）が制限を受けるが、そのような制限の影響は、目標生産の時にＨ₂変換率が少し降下することにある。
【００６９】
定常状態の処理時には１５−３５ｇ／Ｌのエタノールおよび０−５ｇ／Ｌのアセテート生産率に到達する。この段階で制限栄養素、液体供給速度および気体供給速度を少し調整する必要があるが、本技術の現存認識ばかりでなく本発明の教示を身につけた本分野の技術者はそれらを選択するであろう。このエタノール生産方法に細胞再循環を加える場合には、これをその時点で気体速度（上昇）および栄養濃度（低下）の調整と一緒に加える。
【００７０】
安定な処理条件下でエタノールを高い濃度で連続的に生産することに加えて生じる副生成物であるアセテートの濃度を低くすることを維持するこの上に記述した方法は、主題細菌をエタノールの生産で商業的規模で用いることを向上させるものである。この上に示した方法で概略を示した段階は、ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを商業的に生産する目的で主題細菌を利用することに関する制限を克服するものである。本方法では連続バイオリアクターを好適に用いるが、大規模にエタノールを生産する目的で経済的に実行する可能性は低いがバッチ式および供給バッチ式（ｆｅｄ−ｂａｔｃｈ）発酵方法もまた用いる。
【００７１】
以下に示す実施例で本発明に従ういろいろな面、方法および方法段階を説明する。本実施例は本発明を限定するものでなく、本発明の範囲を添付請求の範囲に具体的に示す。
【００７２】
（実施例）
実施例１． 本発明の典型的な方法
撹拌タンク型バイオリアクターにＣ．リュングダリイ株と一緒にビタミン類と微量金属と塩類を含有する通常の液状培地を入れておいて、これにＣＯおよび／またはＣＯ₂／Ｈ₂を含有する合成もしくは廃棄気体を連続的に導入する。１つの望ましい栄養培地を以下の表１に報告する。
【００７３】
培養菌接種材料を１０％以下の量で用いた方法開始段階中ではバッチ液相を用いてリアクターを処理し、この段階では前記液状培地をリアクターに連続的には供給しない。従って、このリアクター内の液相は１バッチの栄養培地に加えて僅かな濃度の制限栄養素、即ちパントテン酸カルシウムまたはコバルトで構成されている。別法として、また、酵母抽出液、トリプチカーゼまたは他の複合栄養素を含有する豊富な培地を用いることも可能である。
【００７４】
理想的には、開始時の気相にＣＯ₂を含めないで、Ｈ₂を過剰に含有させる。ＣＯとＨ₂が若干過剰になるがそれと同時にＣＯ基質阻害が回避されるように気体速度および撹拌速度を低いレベル［Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターでは５００ｒｐｍ未満］に保持する。一例として１リットルの実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターの場合には、供給ガスの組成を６３％がＨ₂で３２％がＣＯで５％がＣＨ₄であるようにし、開始段階を開始させる時の撹拌速度を４００ｒｐｍにしそして気体速度を２０ｍｌ／分にする。この開始段階中に起こるエタノール生成の原因はＨ₂が過剰なことが原因であり、後で栄養素への制限を行う。このように、実際には、開始段階中に培養菌が望ましくなく低い栄養に順化しないようにする目的で液状栄養素（パントテン酸塩、コバルト）を過剰に存在させる。
【００７５】
発酵を接種後数時間に渡って進行させるにつれてＣＯの変換でＣＯ₂が生じかつＣＯ₂と一緒にＨ₂が消費されるが、これは、気体質量移動制限を回避する目的で撹拌速度を僅かに高くして行く合図である。このＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲの場合の排出ガスは２５％がＣＯで６７％がＨ₂で２％がＣＯ₂で６％がＣＨ₄である。撹拌速度をあまりにも急速に高くするとＣＯ基質阻害が起こり、これは撹拌速度を高くした後にメタンの濃度が低くなることで明らかになる。このように、撹拌速度を典型的には２４時間で２００ｒｐｍだけ高くするようにしてもよい。このようにＣＯ₂生成（またはＨ₂変換）を監視する手順と同時に撹拌速度を僅かに高くして行くことを目標撹拌速度に到達するまで比較的速い速度で行う。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターの場合の典型的な目標撹拌速度は９００ｒｐｍである。このようにバッチ式液状培養の場合、撹拌速度を高くして行く時には産物の生成ではなく細胞の生成が最も重要である。このように、約１．５ｇ／Ｌの細胞濃度を達成する一方で、バッチ式培養菌が典型的に生成する産物の濃度はエタノールが１０ｇ／Ｌでアセテートが２ｇ／Ｌである。
【００７６】
目標撹拌速度に到達した時点で、Ｈ₂取り込みが最大になるように系を増殖させる。酢酸生成を制限しながらエタノールの生成を確保するには非常に高いＨ₂排出濃度（典型的には＞６０％）にするのが望ましい。次に、液状培地供給を始めて（原料培養菌を用いてバッチ式接種を受けさせた系の場合）、連続的な液体供給を始め、かつ気体供給速度を目標の流量に向けて高くして行く。実験室のＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターの場合には、液体供給速度を典型的に０．５ｍｌ／分にする一方で、気体流量を目標流量である１２５ｍｌ／分に向けて２４時間毎に１０から１５％づつ高くして行く。
【００７７】
酢酸が余分に生成されないようにするには供給ガスにＨ₂を過剰に入れることが重要である。気体流量を高くして行くにつれて細胞の産生が増加し、最終的に、リアクターが液相栄養素（パントテン酸カルシウムまたはコバルト）で制限されるようになるが、これは目標生産率の時にＨ₂変換率が少し降下することで明らかになる。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲの場合のそれは目標生産率である２０ｇ／Ｌ・日の時にＨ₂変換率が１０％降下することで認識される。
【００７８】
次に、前記生産方法およびリアクター系を定常状態に維持するが、それによってエタノールが産物として１５から３５ｇ／Ｌもたらされかつアセテートが０から５ｇ／Ｌもたらされ、定常状態の時に制限栄養素、液体速度および気体速度を時々調整する度合は少しのみである。細胞再循環を伴わない実験室のＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターの場合の典型的な定常状態条件は、気体保持時間（気体流量／リアクター液体体積）が２０分間で液体保持時間（液体流量／リアクター液体体積）が３０時間で撹拌速度が９００ｒｐｍであり、パントテン酸塩制限を伴わせた時にもたらされるＣＯの変換率は９２％でＨ₂変換率は６０％である。
【００７９】
細胞再循環をリアクター系に加えた時の本方法の態様では、その時点でそれに気体速度（上昇）および栄養素濃度（降下）の調整を加える。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲに細胞再循環を伴わせた場合の気体保持時間は典型的に８分間であり、液体保持時間は１２時間であり、細胞保持時間は４０時間でありそして撹拌速度は９００ｒｐｍである。このような条件にしてパントテン酸塩制限を伴わせた場合に典型的にもたらされるＣＯ変換率は９２％でＨ₂変換率は５０％である。
実施例２． ガスクロによるサンプル分析
適切な生産率および比率を達成および／または維持する目的で、発酵バイオリアクターに入っている発酵ブイヨンのサンプルを定期的に採取すべきである。このバイオリアクターに入っている培養菌から１．５ｍｌを超える量の培養菌をサンプルとして取り出す。このサンプルをミクロ遠心分離管に入れそしてこの管を均衡に必要なバラストが備わっているＦｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｍｉｃｒｏ １４遠心分離器に入れる。このサンプルに８０００ｒｐｍを１．５分間かける。上澄み液のサンプル０．５００ｍｌをガスクロオートサンプラーで用いるに適するように設計されている１．５ｍｌのビンに入れる。脱イオン水にｎ−プロパノールが５ｇ／Ｌと８５％燐酸が５％体積／体積入っている内部標準溶液のサンプル０．５００ｍｌ。この燐酸はアセテートが全部酢酸に変化することを確保するものであり、その酢酸をガスクロで検出する。
【００８０】
次に、その調製したサンプルの１μｌをオートサンプラーで２５ｍ ｘ ０．５３ｍｍ（ＩＤ）の００７ ＦＦＡ Ｑｕａｄｒｅｘ融合シリカ毛細管カラムが備わっているＨｅｗｌｅｔｔ−Ｐａｃｋａｒｄ ５８９０ Ｓｅｒｉｅｓ ＩＩ Ｇａｓ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈに注入する。担体ガスであるヘリウムをスプリット−フロー（ｓｐｌｉｔ−ｆｌｏｗ）様式で用い、スプリット−フローを６６ｍｌ／分にしそして注入器パージを７．９３ｍｌ／分にして分析を実施する。カラム頭部圧力を４ｐｓｉｇに設定し、それによって７ｍｌ／分のカラム担体流量がもたらされる。温度プログラムを下記にする：７５℃に０．２分間、３０℃／分の速度で１９０℃に上昇そして１９０℃における保持時間を５．１７分。その結果として得た運転時間（ｒｕｎｔｉｍｅ）は８分である。前記装置にエタノール（０−２５ｇ／Ｌ）、酢酸（０−２５ｇ／Ｌ）、ｎ−ブタノール（０−５ｇ／Ｌ）および酪酸（０−５ｇ／Ｌ）に関する較正を受けさせる。この較正で試薬等級の材料から調製した５種類の標準を用いる。サンプルが較正濃度範囲外（例えばエタノールが＞２５ｇ／Ｌ）の時には、０．２５０ｍｌのサンプルと０．２５０ｍｌの脱イオン水を０．５００ｍｌの内部標準と一緒にビンに入れて、その希釈係数を解析に含める。
実施例３：細胞再循環を伴わせた実験室ＣＳＴＲを用いた酸生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂から酢酸を生産する目的でクロストリジウム・リュングダリイ株ＥＲＩ２（ＡＴＣＣ ５５３８０）を用いて実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターを細胞再循環を伴わせて処理した。気体供給材料はＨ₂を４０％とＣＯを５０％とＮ₂を１０％含有しており、１リットルの前記リアクターに対する気体保持時間を７．７から８．６分にした。ビタミン類と塩類と微量元素を含有する液状培地を２．６から２．９時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは５．１から５．２であり、撹拌速度を１０００ｒｐｍにしそして細胞保持時間を約４０時間にした。このような質量移動制限（栄養制限を伴わない）条件下におけるＣＯ変換率は９４から９８％でＨ₂変換率は８０から９７％であった。細胞濃度は４から８ｇ／Ｌでありそしてアセテートが１０から１３ｇ／Ｌ生じた。エタノールは全く生じなかった。前記リアクターを質量移動制限（気体が培養菌に移行する能力で制限）下で処理しそしてこのように産物として生じたのは酢酸のみであったが、パントテン酸塩制限、コバルト制限またはＨ₂もしくはＣＯの過剰存在によるエタノール生産のパラメーターを監視して、エタノールを主産物として生じさせる時の比較として用いた。
【００８１】
表２に示すように、産生する細胞１単位当たりに供給したｄ−パントテン酸Ｃａは産生細胞１グラム当たり１５７５から３１５０ミクログラム（μｇ／産生細胞ｇ）であった。同様に、産生する細胞１グラム当たりに供給したコバルトは１７３４から３４６８（μｇ／産生細胞ｇ）であった。比ＣＯ吸収速度は０．３５から０．６１ミリモル／細胞ｇ・分であった。変換を受けるＣＯのモルの２倍と変換を受けるＣＯ₂のモルの３倍の合計に対する供給Ｈ₂のモルの比率は０．４６未満であった。このように、これらのパラメーターのいずれも前記培養菌がエタノールを生成するに所望の処理範囲ではなかった。
【００８２】
質量移動制限下で酢酸が産物として生じている時の前記リアクターにパントテン酸塩およびコバルトを大過剰量で送り込むことを実際に行う。即ち、パントテン酸塩および／またはコバルトのレベルを大きく下げることは可能であったが、それでもパントテン酸塩もしくはコバルト制限のレベルよりも高かった。このことを示す目的で、１リットルのＮｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）発酵バイオリアクターに送り込む培地に修飾を受けさせて、コバルト添加量をコバルト制限が起こるコバルト濃度より僅かに高いレベルにまで有意に低くした。前記リアクターに再びＣ．リュングダリイ株ＥＲＩ２を入れてＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂から酢酸を生じさせた。気体供給材料はＨ₂を５５％とＣＯを２５％とＣＯ₂を１５％とＣＨ₄（標準ガス）を５％含有しており、気体保持時間を７．５から８．０分にした。塩類とビタミン類と微量元素を含有する液状培地を３．０から３．５時間の液体保持時間で供給しそして細胞保持時間を４０時間にした。ｐＨは５．０から５．３であり、撹拌速度を９００から１０００ｒｐｍにした。このような条件にした時のＣＯ変換率は９５から９９％でＨ₂変換率は９４から９８％であった。細胞濃度は２．５から４．０ｇ／Ｌでありそしてアセテートがただ１種類の産物であり、１０から１４ｇ／Ｌで存在していた。
【００８３】
細胞１グラム当たりにリアクターに供給したｄ−パントテン酸Ｃａは産生細胞１グラム当たり２２５０から３６００μｇのパントテン酸塩であった。産生する細胞１単位当たりに供給するコバルトの量を産生細胞１グラム当たり６２．０から９９．２μｇのコバルトの範囲にまで下げた。比ＣＯ吸収速度は０．３２５から０．４ミリモル／細胞ｇ・分であった。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は０．８７５であった。
実施例４． パントテン酸塩制限を伴わせた実験室ＣＳＴＲを用いたエタノール生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）を用いて実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＩＩ発酵バイオリアクターをパントテン酸塩制限のストレートスルー（ｓｔｒａｉｇｈｔ ｔｈｒｏｕｇｈ）ＣＳＴＲ（細胞再循環を伴わない）として処理した。前記リアクターに供給する気体はＨ₂を６３．３％とＣＯを３１．４％とＣ₂Ｈ₆（標準ガス）を５．３％含有しており、これを２７分間の気体保持時間で供給した。過剰量の塩類と痕跡量の元素と制限供給量のパントテン酸塩を含有させた液状培地を１．５５リットルのリアクターに３１．４時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは４．６から４．７であり、撹拌速度を６５０ｒｐｍにした。このような処理条件にした時のＣＯ変換率は９８％でＨ₂変換率は８３％で細胞濃度は１．５から２．０ｇ／Ｌであった。エタノールが１５から１９ｇ／Ｌの濃度で生じそしてアセテートが１．５ｇ／Ｌ生じた。エタノールの生産率は１１．５から１４．５ｇ／Ｌ・日の範囲であった。
【００８４】
エタノール生産のパラメーターの解析では、細胞産生に対するパントテン酸塩供給の比率がパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり１７．７から２３．６μｇになるようにして処理を行うことを通して、パントテン酸塩制限を確認した。この比率を実施例３で行った酸生産の場合のパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり２２５０から３６００μｇおよびパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり１５７５−３１５０μｇと比較する。産生細胞１単位当たりに送り込んだコバルトはコバルトが産生細胞１ｇ当たり５０００から６０００μｇ、即ち実施例３の場合のレベルよりもずっと高くてコバルト制限が起こらないことを保証するレベルであった。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．２３から０．３０ミリモル／分であった。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は１．０３でありそして排出ガス中のＨ₂分圧は０．５５−０．６４気圧であった。Ｈ₂を過剰にするか或はパントテン酸塩を制限するとエタノール生成が起こり得る。
【００８５】
また、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）を用いて細胞再循環を伴わせた別の実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＩＩリアクターの処理でもエタノール生産に関するパントテン酸塩制限を取り扱った。このリアクターにＨ₂を６１．７％とＣＯを３０．６％とＣ₂Ｈ₆（標準ガス）を５．２％含有する気体を１２．３分間の気体保持時間で送り込んだ。過剰量の塩類と痕跡量の元素と一緒に制限供給量のパントテン酸塩を含有させた液状培地を２．４リットルの前記リアクターに２４．８時間の液体保持時間で供給した。０．２μｍの中空繊維膜を用いて細胞を再循環させそして細胞保持時間を６９時間にした。ｐＨは４．６であり、撹拌速度を６５０ｒｐｍにした。このような条件にした時のＣＯ変換率は９０％でＨ₂変換率は５３％で細胞濃度は２．５ｇ／Ｌであった。エタノール濃度は１８ｇ／Ｌでアセテート濃度は３ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は１７．４ｇ／Ｌ・日であった。
【００８６】
エタノール生産のパラメーターの解析（表２）では、産生細胞１単位当たりに供給するパントテン酸塩の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり８．０８μｇになるようにした。再び、アセテート生産に必要なレベルよりもずっと低いレベルで処理を行うことでパントテン酸塩制限を確保した。産生細胞１単位当たりに送り込むコバルトをコバルトが産生細胞１ｇ当たり３９６０μｇになるようにした。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．３３ミリモル／分であった。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は１．１４でありそして排出ガス中のＨ₂分圧は０．６０−０．６５気圧であった。Ｈ₂を過剰にしたことが恐らくはエタノール生成が起こった理由であろうが、しかしながら、排出ガス中のＣＯ₂含有量が高い（０．１４気圧）ことは増殖がパントテン酸塩によって制限されたことを示している。
【００８７】
別の実験では、ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂から酢酸を生産する時には産生する細胞１ｇ当たりのパントテン酸塩が１５００から３６００μｇになるようにＣ．リュングダリイ株ＥＲＩ２にパントテン酸塩を送り込んだ、即ちリアクターがパントテン酸塩による制限を受けない（または、気体が培養菌に伝達され得ることを除いて他の如何なる制限も受けない）条件にしたが、その間には産物流れの中にエタノールが全く確認されなかった。
【００８８】
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でパントテン酸塩制限を行う時には、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１にパントテン酸塩を生成細胞１ｇ当たり８から２４μｇ送り込みながら他の全ての栄養素を過剰に保持した。このような条件にするとＣ−０１株はエタノールを１５から１９ｇ／Ｌとアセテートを１．５から３．０ｇ／Ｌ生成した。
実施例５． コバルト制限を伴わせた実験室ＣＳＴＲを用いたエタノール生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）を用いて実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＩＩ発酵バイオリアクターをコバルト制限を伴うストレートスルーＣＳＴＲ（細胞再循環を伴わない）として処理した。前記リアクターに供給する気体はＨ₂を６０％とＣＯを３５％とＣＨ₄（標準ガス）を５％含有しており、これを１４分間の気体保持時間で供給した。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の金属（制限するコバルトを除く）を含有させた液状培地を２．５Ｌの前記リアクターに４０時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは４．９であり、撹拌速度を６５０ｒｐｍにした。このような条件にした時のＣＯ変換率は９１％である一方、Ｈ₂変換率は２０から８０％で変化したが名目上５５％であった。エタノールが２６ｇ／Ｌ生じ、アセテートが４ｇ／Ｌ生じそして細胞濃度は２．５ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は１５．６ｇ／Ｌ・日であった。
【００８９】
エタノール生産のパラメーターの解析では、細胞産生に対するパントテン酸塩供給の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり１５．２μｇになるようにした。このレベルは極めて低く、その結果として、パントテン酸塩制限ほどにはコバルト制限が確保されない可能性がある。コバルトを生成細胞１ｇ当たり３３．３μｇ、即ちコバルト制限を伴わないリアクターで用いたレベルよりも１００倍低いレベルで用いて処理を行うことを通して、コバルト制限を確認した。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は０．９４であった。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．３７ミリモル／分であった。
【００９０】
また、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）を用いて細胞再循環を伴わせたＣＳＴＲでもエタノール生産に関するコバルト制限を立証した。この実施例の前に用いたリアクターとは対照的に、パントテン酸塩が過剰に存在している時のコバルト制限を立証する目的でこの実験を実施した。細胞再循環用の０．２μｍの中空繊維膜が備わっている実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）２０００発酵バイオリアクターにＨ₂を６０％とＣＯを３５％とＣＨ₄（標準ガス）を５％含有する気体を５分間の気体保持時間で送り込んだ。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の金属（再び、制限するコバルトを除く）を含有させた液状培地を１．２リットルの前記リアクターに１６時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは５．１であり、撹拌速度を８２５ｒｐｍにした。細胞再循環用中空繊維を伴わせたそのようなＣＳＴＲの場合の細胞保持時間は４０時間であった。このような条件にした時のＣＯ変換率は８３％でＨ₂変換率は５０％で細胞濃度は４．２ｇ／Ｌであった。エタノール濃度は１８ｇ／Ｌでアセテート濃度は４ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は２７ｇ／Ｌ・日であった。
【００９１】
このようなリアクターを用いた時のエタノール生産のパラメーターの取り扱い（表２）では、細胞産生に対する供給パントテン酸塩の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり８５．７μｇ、即ちこの実施例の先のリアクターで用いたレベルより５．５倍高いレベルにした。コバルトを産生細胞１ｇ当たり４７．６μｇ用いた処理でコバルト制限を確認した。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は１．０３でありそして排出ガス中のＨ₂分圧は０．６０気圧であった。再び、Ｈ₂を過剰にしたことが恐らくはエタノール生成が起こった理由であろうが、しかしながら、排出ガス中のＣＯ₂含有量が高い（０．１−０．１５気圧）ことは増殖がコバルトによって制限されたことを示している。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．５０ミリモル／分であった。
実施例６． ＣＯを過剰に存在させて実験室ＣＳＴＲを処理した時のエタノール生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて高圧ＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）を培養菌循環および細胞再循環を伴うＣＳＴＲとして過剰なＣＯの存在下で５０時間処理した。前記リアクターを２５ｐｓｉｇで処理し、これにＨ₂を５７％とＣＯを３６％とＣ₂Ｈ₆を６％含有する気体を送り込んだ。気体保持時間は変動したが、名目上３．０分間であった。過剰量の塩類とビタミン類（パントテン酸塩を包含）と痕跡量の金属を含有させた液状培地を６００ｍｌの前記リアクターに８．２時間の液体保持時間で供給した。リアクター流出液をセラミック製中空繊維フィルターに通すことで得た細胞保持時間は１８．５時間であった。ｐＨは４．５であり、撹拌速度を４５０ｒｐｍにしそして液体再循環速度を０．４から０．５ｇｐｍにした。このような条件にすると気体変換率が変動したが、ＣＯ変換率は名目上７２％でＨ₂変換率は名目上１２％であった。細胞濃度は２．７ｇ／Ｌであった。エタノールが９．９ｇ／Ｌ生じそしてアセテートが２．６ｇ／Ｌ生じた。エタノール生産率は２９．０ｇ／Ｌ・日であった。
【００９２】
エタノール生産のパラメーターの解析では、細胞産生に対するパントテン酸塩供給の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり９７μｇになるようにした。このレベルはパントテン酸塩が制限しないことを確保するに充分なほど高い。細胞産生当たりに送り込んだコバルトの比率はコバルトが産生細胞１ｇ当たり８３６μｇ、即ち再びコバルトが制限しないことを確保するレベルであった。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は１．０９であり、Ｈ₂分圧は１．６気圧であった。排出ガス中のＣＯ₂含有量が高い（０．５気圧）ことは、過剰なＨ₂がエタノール生産の原因にならないことを保証している。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり１．３４ミリモル／分、即ちエタノールを生産する方法としてＣＯが過剰であることを確保するレベルであった。
【００９３】
また、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて再び細胞再循環および培養菌循環を伴うＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）装置を用いて生産を２４時間行うことで、エタノールの生産でＣＯを過剰に用いる技術を別の実験でも立証した。この実験では、６００ｍｌの前記リアクターにＨ₂を１５．８％とＣＯを３６．５％とＮ₂を３８．４％とＣＯ₂を９．３％含有する気体を１４分間の気体保持時間で送り込んだ。このリアクターの圧力を４０ｐｓｉｇに維持した。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の金属を含有させた液状培地を４．８時間の液体保持時間で供給し、そして流出液をセラミック製中空繊維に通すことで得た細胞保持時間は１９．２時間であった。ｐＨは４．５であり、撹拌速度を１０００ｒｐｍにしそして液体再循環速度を０．４から０．５ｇｐｍにした。このような条件にした時のＣＯ変換率は７１．６％でＨ₂変換率は１１．８％であった。細胞濃度は７．１ｇ／Ｌであり、エタノールが１２ｇ／Ｌ生じそしてアセテートが２．７ｇ／Ｌ生じた。エタノール生産率は６０ｇ／Ｌ・日であった。
【００９４】
エタノール生産のパラメーターの解析（表２）では、細胞産生に対する供給パントテン酸塩の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり２９４μｇになるようにした。このレベルは、パントテン酸塩制限が理由でエタノール生産が起こるに必要な最低レベルよりもずっと過剰なレベルである。細胞産生に対する供給コバルトの比率をコバルトが産生細胞１ｇ当たり７３５μｇ、即ち再びコバルトが過剰量で送り込まれることを確保するレベルにした。変換を受けるＣＯの２倍と変換を受けるＣＯ₂の３倍の合計に対する供給Ｈ₂の比率は０．３であった。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．６７ミリモル／分、即ちエタノールを生産する方法として過剰なＣＯを利用することができることを再び確保するレベルであった。
実施例７． Ｈ₂を過剰に存在させたエタノール生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）を用いて実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ発酵バイオリアクターをストレートスルーＣＳＴＲ（細胞再循環を伴わない）として過剰なＨ₂の存在下で処理した。前記リアクターに供給する気体はＨ₂を７７％とＣＯを１９％とＣＨ₄（標準ガス）を４％含有しており、これを３０分間の気体保持時間で供給した。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の元素を含有させた液状培地を前記リアクターに３６時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは５．０であり、撹拌速度を１０００ｒｐｍにした。このような処理条件にした時のＣＯ変換率は９７−９９％でＨ₂変換率は６０−８０％であった。細胞濃度は０．８−１．０ｇ／Ｌでエタノール濃度は１０ｇ／Ｌでアセテート濃度は３．３ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は６．７ｇ／Ｌ・日であった。
【００９５】
エタノール生産のパラメーターの解析では、細胞産生に対するパントテン酸塩供給の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり９００−１１２５μｇにした、従ってパントテン酸塩が過剰に存在することを確保した。同様に、細胞産生に対するコバルト供給の比率をコバルトが産生細胞１ｇ当たり９９１−１２３９μｇ、即ち再びコバルトが過剰に存在することを確保する比率にした。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．２８−０．３５ミリモル／分、即ち過剰なＣＯがエタノールの生産の原因にならないようなレベルであった。変換を受けるＣＯのモルの２倍と変換を受けるＣＯ₂のモルの３倍の合計に対する供給Ｈ₂のモルの比率は１．９６、即ちＨ₂が過剰に存在することでエタノールの生成を制限する可能性があるレベルである１．０を超える比率であった。排出ガス中のＨ₂分圧は０．７０−０．８７気圧であり、そしてこの排出ガス中のＣＯ₂分圧に対するＨ₂分圧の比率は６５であった。従って、このようなリアクターがエタノールを生成した理由はＨ₂が過剰に存在していることによる。
【００９６】
２番目の実験では、ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて高圧ＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）を培養菌循環および細胞再循環を伴うＣＳＴＲとして過剰なＨ₂の存在下で処理した。前記リアクターに供給する気体はＨ₂を８１％とＣＯを１６％とＣＨ₄（標準ガス）を３％含有しており、これを２．２１分間の気体保持時間で送り込んだ。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の元素を含有させた液状培地を前記リアクターに８．９７時間の液体保持時間で供給した。細胞保持時間は２２．７時間でｐＨは４．５であり、撹拌速度を８００ｒｐｍにした。このような処理条件にした時のＣＯ変換率は９１．５％でＨ₂変換率は４３．４％であった。細胞濃度は５．５ｇ／Ｌでアセテート濃度は２．８５ｇ／Ｌであった。このリアクターのエタノール生産率は２１５−２４０ｇ／Ｌ・日であった。
【００９７】
エタノール生産のパラメーターの解析では、細胞産生に対するパントテン酸塩供給の比率をパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり４６μｇ、即ちパントテン酸塩制限を示す可能性のあるレベルにした。細胞産生に対するコバルト供給の比率はコバルトが産生細胞１ｇ当たり４６０μｇ、即ちコバルトが制限しないのを確保するレベルであった。比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり１．６８ミリモル／分、即ちＣＯが過剰に存在していることを示すであろうレベル（もしＨ₂吸収率が細胞１ｇ当たり４．１４ミリモル／分のように高い場合には起こらないであろう）であり、これはＨ₂変換に対する基質阻害が起こらないことを示している。変換を受けるＣＯのモルの２倍と変換を受けるＣＯ₂のモルの３倍の合計に対する供給Ｈ₂のモルの比率は５．６７、即ちＨ₂を過剰に存在させた場合に必要な比率である１．０をずっと超える比率であった。排出ガス中のＨ₂分圧は２．６１気圧であり、そしてこの排出ガス中のＣＯ₂分圧に対するＨ₂分圧の比率は１０．９であった。このように、このリアクターはエタノールを生成したが、これはＨ₂が過剰に存在している結果であった。
【００９８】
実施例３から７の方法パラメーターおよび結果を要約した比較を以下の表２に示す。
実施例８． 培地配合を用いたＣ．リュングダリイ株ＥＲＩ２、Ｃ−０１およびＰＥＴＣにおける産物移行
本発明の方法はＣ．リュングダリイ株のいずれにも適用可能である。株ＥＲＩ２、Ｃ−０１およびＰＥＴＣを用いた培地処理実験で得た結果を以下の表３に示す。これらの実験の目的は、単に培地を処理することで前記株の各々を酢酸生成からエタノール生成に移行させることができることを示すことにあった。このように、酢酸を主産物として生成させる目的で培養菌に栄養素（パントテン酸塩およびコバルトを包含）を過剰に供給し、そして次に、エタノールを主産物として生成させる目的でパントテン酸塩またはコバルトを制限した。これらの実験の目的は単に培地処理の結果として前記株の各々が生成する産物が移行し得ることを示すことにあることを強調すべきであろう。このように、これらの実験の焦点は高い産物濃度および生産率を達成することではない。
【００９９】
これらの培養実験の各々でリアクターをストレートスルーＣＳＴＲ（細胞再循環なし）として処理した。気体保持時間を名目上５０分に設定し、液体保持時間を名目上４０時間に設定しそして撹拌速度を名目上１０００ｒｐｍに設定した。高い生産率を達成するのではなく前記株の比較を行うことができるように条件を選択した。
【０１００】
表３に示すように、ＥＲＩ２株に５種類の培地変更を受けさせたが、それによって、産物が主産物としての酢酸から主産物としてのエタノールに行き戻りした。この株のエタノール生成でパントテン酸塩制限とコバルト制限の両方が立証された。Ｃ−０１株には培地処理を用いた移行を３回受けさせたが、再び、パントテン酸塩制限とコバルト制限の両方がエタノール生成機構として立証された。ＰＥＴＣ株に受けさせた移行は１回のみであったが、これはコバルトを制限するとエタノールを生成した。前記株は各々が主産物としてエタノールではなく酢酸を生成する時の方が高いＨ₂変換率を示した。これが起こった理由は質量移動制限（培養菌に送る気体の量を制限）下では酢酸が生成される一方で栄養素を制限するとエタノールが生成されることが理由であり、このように気体を過剰に供給すると気体変換率に負の影響が生じる可能性がある。主産物がエタノールの時には産物流れに常にアセテートが少量存在している。しかしながら、酢酸が主産物の時に存在するエタノールの濃度は一般に測定不能な濃度である。栄養素を処理することで主産物をエタノールから酢酸に移行させる点に関して、痕跡量のエタノールを全部除去するのは非常に困難であることが分かった。エタノールの完全の除去が起こったのは酢酸強化培地（ａｃｅｔｉｃ ａｃｉｄ ｅｎｈａｎｃｉｎｇ ｍｅｄｉｕｍ）を用いた処理を数週間に渡って継続した後のみであった。
実施例９． 細胞再循環有り無しの定常状態処理
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する最終的な商業的目標は、定常状態でエタノールの高い濃度を達成すると同時にアセテートに対するエタノールの産物比を高くしかつ高い生産率を得ることにある。Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用い、Ｈ₂を２０％とＣＯを６５％とＣＯ₂を１０％とＣＨ₄を５％含有するＣＯが豊富な気体を用いてエタノールをストレートスルーＣＳＴＲ（細胞再循環なし）で生産した場合の定常状態データを表４に示す。この表に示すＧＲＴは気体保持時間（流入気体流量に対する液体体積の比率）を指し、ＬＲＴは液体保持時間（液体流量に対する液体体積の比率）を指し、そしてＸＲＴは細胞保持時間（細胞がリアクターの中で消費する平均時間）を指す。表４に示すように、１７．５から３３ｇ／Ｌのエタノール濃度を得て、エタノール生産率は１４．４から２１．１ｇ／Ｌ・日の範囲であった。
【０１０１】
ＣＯがあまり豊富でない気体を用いたエタノール生産に関する同様な結果も示す。再循環を伴わせないでＣ．リュングダリイＣ−０１を用いた実験で使用した気体はＨ₂を１６％とＣＯを２７％とＣＯ₂を６％とＮ₂を５１％含有しており、その結果を表５に報告する。このような気体を用いた時に得たエタノールの濃度は１１から２６ｇ／Ｌの範囲であり、二次的産物としてアセテートが２．０から５．０ｇ／Ｌ存在していた。エタノール生産率は１１．１−２０．１ｇ／Ｌ・日の範囲であった。＊細胞濃度は乾燥細胞重量が基になっており、これを表５に示す。
【０１０２】
最後に、細胞再循環を伴わせてＣ．リュングダリイＯ−５２（ＡＴＣＣ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．５５９８９）を用いたＣＳＴＲにおけるＨ₂を５０％とＣＯを４５％とＣＨ₄を５％含有する気体の変換率に関する定常状態データを以下の表６に示す。１８から２３．５ｇ／Ｌのエタノール濃度および３．０から５．７ｇ／Ｌのアセテート濃度を達成した。エタノール生産率は２１．１から３９．０ｇ／Ｌ・日の範囲であった。
実施例１０． 細胞再循環と圧力を伴わせたＣＳＴＲでエタノールを多量に生産
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生産する目的でＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて高圧ＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）を培養菌循環および細胞再循環を伴うＣＳＴＲとして処理した。前記リアクターを３０ｐｓｉｇで処理し、これにＨ₂を６２％とＣＯを３１％とＣ₂Ｈ₆を５％含有する気体を送り込んだ。気体保持時間を１．１４分間（大気圧を基準）にしたが、実際の気体保持時間は３．５分であった。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の金属を含有させた液状培地を６００ｍｌのリアクターに３．６時間の液体保持時間で供給した。ｐＨは４．５であり、撹拌速度を８２５ｒｐｍにした。このような条件にすると細胞濃度は８ｇ／Ｌであり、ＣＯ変換率は９０％でありそしてＨ₂変換率は４０％であった。産物流れのエタノール含有量は２０ｇ／Ｌでアセテート含有量は２．７５ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は１５０ｇ／Ｌ・日であった。
【０１０３】
Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて別の高圧ＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）を培養菌循環および細胞再循環を伴うＣＳＴＲとして処理したが、この場合には、このリアクターを６気圧（７５ｐｓｉｇ）で処理して、これにＨ₂を５５％とＣＯを３０％とＣＨ₄を５％とＣＯ₂を１０％含有する合成ガスを送り込んだ。気体保持時間を１分間（大気圧を基準）にしたが、実際の気体保持時間は６．０分であった。過剰量の塩類とビタミン類と痕跡量の金属を含有させた液状培地を前記リアクターに１．６２時間の液体保持時間で供給した。細胞保持時間は２４時間であり、ｐＨは４．５であり、そして撹拌速度を８００ｒｐｍにした。このような条件にすると細胞濃度は２．０ｇ／Ｌであり、ＣＯ変換率は９５％でありそしてＨ₂変換率は６０％であった。産物流れのエタノール含有量は２５ｇ／Ｌでアセテート含有量は３ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は３６９ｇ／Ｌ・日であった。
実施例１１： Ｈ₂を過剰に存在させて原料培養菌を用いた開始
原料培養菌によるバッチ式接種を用いた開始を行うと汚染物を含まない健康な接種が確保されるが、特に方法パラメーター、例えば気体速度および撹拌速度などが接種直後にあまりにも急速に上方に押し上げられる場合には必ずしも接種手順として常に成功するとは限らない、と言うのは、用いる細胞密度がむしろ低いからである。
【０１０４】
この実施例では原料培養菌によるバッチ式接種を用いた開始を考察する。リアクターの接種を行うための原料培養菌を調製する目的で、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．５５９８８）の培養菌を１５０ｍｌの血清用ボトル（ｓｅｒｕｍ ｂｏｔｔｌｅｓ）に入れて、塩類およびビタミン類として酵母抽出液が１ｇ／Ｌとトリプチカーゼが１ｇ／Ｌ入っている豊富な培地を用いてＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂で増殖させた。用いたビタミンの濃度はパントテン酸カルシウムが５０．５ｍｇ／Ｌとｄ−ビオチンが２０．６ｍｇ／ＬとチアミンＨＣｌが５０．６ｍｇ／Ｌ入っている水溶液が培地１Ｌ当たり０．４ｍｌであった。ボトルを振とう器のインキュベーターに入れて３７℃でインキュベートした。この培養菌を目で見た検査で測定して指数的増殖段階になるまで増殖させた。各接種毎に１リットルの培地に約９０ｍｌの原料培養菌を血清用ボトルから移したが、これは９％体積の接種に相当する。成功した接種を以下に記述する。この概略を示した手順を数回繰り返すことで効果的な接種を得ることができる。
【０１０５】
効果的な接種を得ようとして、ビタミン類と塩類が０．４ｍｌ／Ｌ入っている１リットルバッチの基礎培地（表１に示す）に接種材料を９０ｍｌ／Ｌ加えた（ｔ＝０）。撹拌速度を２４０ｒｐｍにし、ｐＨは５．３であり、温度を３８．５℃にしそして気体保持時間（連続気体流れ）を１１０分にした。気体供給材料はＨ₂を６２％とＣＯを３１％とＣ₂Ｈ₆を７％含有していた。１３時間（ｔ＝１３時間）後にＣＯ変換がいくらか起こることを注目し、そしてｔ＝２３時間の時に撹拌速度を２４０ｒｐｍから３００ｒｐｍまで高くした。ｔ＝２７時間の時に気体保持時間を１００分間にまで下げそしてｔ＝４６時間の時に気体保持時間を更に下げた。また撹拌速度もｔ＝２８時間、５９時間、７２時間および８５時間の時に１００ｒｐｍの増分で高くした。
【０１０６】
ｔ＝１１０時間までは、気体保持時間を８０分間および撹拌速度を６００ｒｐｍにして装置を処理した。細胞濃度は０．５ｇ／ＬでＣＯ変換率は３５％であった。Ｈ₂変換率はまだ０であったが、このバッチ式培養菌ブイヨンには少量ではあるがエタノールとアセテート（各々〜１ｇ／Ｌ）が蓄積していた。この時までに行った努力は細胞増殖をリアクター内で起こさせることを強調することであった。
【０１０７】
ｔ＝１２０時間の時に基礎培地の場合と同じ濃度を用いた培地流れを０．４ｍｌ／分の速度で流し始めた。次に、その系を過剰なＨ₂下に注意深く維持しながら気体速度、撹拌速度および培地速度を僅かに高くするプログラムを開始させた。ｔ＝２１０時間までのエタノール濃度は１７ｇ／Ｌであり、アセテート濃度は１ｇ／Ｌであり、細胞濃度は１．６ｇ／Ｌであり、ＣＯ変換率はほぼ１００％でありそしてＨ₂変換率は９０％であった。エタノール生産率は１１．４ｇ／Ｌ・日に到達した。
【０１０８】
気体速度を徐々に高くするプログラムを再び開始させた。同時にビタミン添加速度を培地１Ｌ当たり０．７ｍｌにすることでビタミンの量を高くした（表１を参照）。ｔ＝６１０時間まではリアクターが生成したエタノールは２０ｇ／Ｌでアセテートは約２ｇ／Ｌであった。ＣＯ変換率はほぼ１００％でありそしてＨ₂変換率は８５％であった。エタノール生産率は１４ｇ／Ｌ・日に到達した。
実施例１２． 現存ＣＳＴＲによる接種を用いた開始
現存ＣＳＴＲによる連続接種を用いたＣＳＴＲの開始の方が原料培養菌のバッチボトルを用いた開始よりもずっと速くかつずっと信頼できる。現存ＣＳＴＲによる連続接種を用いて、単離（Ｉｓｏｌａｔｅ）Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１（ＡＴＣＣ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．５５９８８）（これは既にエタノール生成をほぼ止めていて、液相産物としてエタノールを２−３ｇ／Ｌ、アセテートを７−８ｇ／Ｌおよびブタノールを約０．３ｇ／Ｌ生成する）が入っているＣＳＴＲを再び開始させた。
【０１０９】
この接種材料を取り出す元のＣＳＴＲはエタノールを約１７ｇ／Ｌおよびアセテートを１−２ｇ／Ｌ生成していたが、この間それを２５分間の気体保持時間、３２時間の液体保持時間、６５０ｒｐｍの撹拌速度、３８．５℃の温度および４．６６のｐＨで処理した。細胞濃度は１．７ｇ／Ｌであり、ＣＯ変換率は本質的に１００％でありそしてＨ₂変換率は８５％であった。
【０１１０】
連続接種材料添加を開始（ｔ＝０）し、この時点で撹拌速度を５００ｒｐｍにまで下げそして気体保持時間を３８分間に設定した。この生産性リアクターから出る流出液（０．５ｍｌ／分）を接種を受けさせるＣＳＴＲの連続接種材料として用い、連続接種を数時間に渡って行った。ｔ＝５時間（連続接種を開始して５時間後）までの気体変換率を注目し、そして撹拌速度を７００ｒｐｍにまで高くした。ｔ＝２８時間の時に連続接種を止めた。気体変換率が一貫して向上し、気体速度を一貫して高くし（気体保持時間を短くし）そして撹拌速度を７５０ｒｐｍまで高くした。ｔ＝３０時間まではＣＯ変換率が９５％でＨ₂変換率が８０％であった。エタノール濃度は１３ｇ／Ｌでアセテート濃度は１．５ｇ／Ｌであり、これは１００時間を充分に超える時間に渡って１．４ｇ／Ｌで一定であった。この期間の間のエタノール生産率は１０から１５ｇ／Ｌ・日であった。
実施例１３． 方法のひどい異常からの回復
細胞再潤滑剤を伴わせたＣＳＴＲにＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１を入れてこれに気体および液体栄養素を連続的に送り込んで定常状態でエタノールを１５−３５ｇ／Ｌおよびアセテートを０−５ｇ／Ｌ生成（例えば実施例１）させていても、方法の条件が予想外に変化し、例えばリアクターの機械的問題などが起こると異常が生じる。リアクター系の異常は、気体速度が短期間高くなる（これによって基質阻害が短期間起こる）ような僅かな異常であるか、或は気体速度がより長い時間に渡って高くなる（それによって最終的に酢酸の生産量が高くなることで分子状酢酸による産物阻害がよりひどい度合でもたらされる）ような重大な異常であり得る。
【０１１１】
短期間の異常は異常パラメーターを単に再調整し（例えば気体速度を元々のレベルに下げ）そして当該リアクターの進行を監視してそのような異常によって長期の問題がもたらされないことを保証することで容易に補正される。
【０１１２】
しかしながら、酢酸による産物阻害はより重大な問題である。培養菌が長期の基質阻害、過剰な栄養素添加、ＣＯ₂蓄積またはいろいろな種類の機械的問題の結果として分子状酢酸を過剰に生成するようになった場合には、最初に、過剰な酢酸をもたらすようになった問題を補正すべきである。酢酸が過剰になると急速に産物阻害がもたらされるが、この場合には、液体速度を高くして酢酸（および不幸なことにはエタノール）を装置から洗い流すことで装置を奇麗にする。アセテートのレベルが３−５ｇ／Ｌ未満になった時点で液体速度を再設定して、リアクターを過剰なＨ₂供給下か或はビタミンもしくはコバルト制限下に戻す（細胞再循環の有り無しで）。このようにリアクターを元に戻すことは、気体速度を低くして基質阻害を回避しそして／または細胞洗い流しおよび溶解が起こる前に撹拌速度を遅くすることを伴う。次に、撹拌速度または気体速度を実施例１に記述した如く高くする。
【０１１３】
具体的な一例として、ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールと酢酸を生成しているＣ．リュングダリイ株Ｃ−０１が入っている細胞再循環を伴うＣＳＴＲが機械的問題に応答して酢酸を生産し始めた。この２１００ｍｌのリアクターにＨ₂を６２％とＣＯを３１％とＣ₂Ｈ₆を７％含有する気体を１５分間の気体保持時間で送り込んで、それを６００ｒｐｍの撹拌速度および４．６８のｐＨで処理した。液体保持時間を２３時間にしそして細胞保持時間を６８時間にした。塩類とビタミン類がビタミン溶液が培地１リットル当たり０．４ｍｌの濃度で入っている液状栄養培地（表２を参照）に、Ｂビタミン溶液（パントテン酸カルシウムが５０．５ｍｇ／Ｌとｄ−ビオチンが２０．６ｍｇ／ＬとチアミンＨＣｌが５０．６ｍｇの水性混合物）を存在させた。エタノールの濃度が降下して７ｇ／Ｌになる一方でアセテート濃度が上昇して７ｇ／Ｌになった、即ちリアクターの処理にとって安定でなくかつエタノール生産にとっても経済的でない条件になった。細胞濃度は２．４ｇ／ＬでＣＯ変換率は８５％でＨ₂変換率は２５％であった。
【０１１４】
このようにリアクターの回復で用いた方策は、このリアクターへの気体供給速度を最初に劇的に低くした後にＨ₂を過剰量で存在させて前記リアクターを徐々に回復させることから成っていた。この例では、アセテートの濃度が極端には高くなかったことから、前記リアクターへの液体速度を低くしても産物阻害が取り除かれることはなかった。その代わりに、気体流量を低下させた後にＨ₂を過剰量に存在させて処理を行うことで、酢酸濃度をより徐々に低下させて非阻害レベルになるようにした。このようにリアクターを回復させる時の具体的な手順を以下に考察する。
【０１１５】
細胞再循環を止めた後、気体速度を劇的に７０％低くすることで気体保持時間を６２分間にする一方で液体保持時間をほんの若干調整して２３時間から３０時間にした（ｔ＝０）。前記培地に入っているビタミンの濃度は変えなかった。このように気体速度を変えるとＣＯ変換率が９８％にまで高くなりかつＨ₂変換率が８０％にまで高くなった。より重要なことに、流出ガスに入っているＣＯ₂が１９％から５％にまで低下したことで明らかなように、その系にはＨ₂が過剰に存在していた。Ｈ₂を過剰にし始めるとアセテート濃度が降下する一方でエタノール濃度が上昇した。例えば、ｔ＝６６時間（細胞再循環を止めて６６時間後）の時、アセテート濃度が４ｇ／Ｌにまで降下しかつエタノール濃度が若干上昇して７．５ｇ／Ｌになった。
【０１１６】
Ｈ₂を過剰に存在させる（そしてアセテート濃度を低くする）場合、後で気体速度を最初はゆっくりと高くした後、より速い速度で高くする。ｔ＝２１５時間までは気体保持時間を９２分間にし、エタノール濃度は１２ｇ／Ｌでアセテート濃度は３ｇ／Ｌであった。エタノール生産率は８ｇ／Ｌ・日であった。ＣＯ₂が流出ガスに６％存在し、ＣＯ変換率は９８％でＨ₂変換率は８０％であった。ｔ＝３１５時間まではエタノール濃度が１６ｇ／Ｌでアセテート濃度が４ｇ／Ｌであり、再び良好な気体変換率を伴い、気体保持時間は２０分間であった。エタノール生産率は１１ｇ／Ｌ・日であった。ｔ＝４６５時間までにエタノール濃度が２０ｇ／Ｌに到達したが、アセテートもまた３．５−４ｇ／Ｌ存在していた。エタノール生産率は１６ｇ／Ｌ・日であった。気体保持時間を１６分間にまで降下させると、ＣＯ変換率とＨ₂変換率がそれぞれ９５％および７３％になった。このような条件がほぼ２００時間に渡る連続処理で維持され、このことは、前記リアクター系が回復してエタノールを生産し得るようになって以前の処理条件を本質的に保持するようになったことを示している。
実施例１４． ＣＯを過剰供給することを伴わせたエタノール生産方法
ＣＯを高濃度で存在させると酢酸生成からエタノール生成への移行が起こることを立証する目的で細胞再循環を伴う連続高圧撹拌タンク型リアクターを用いた簡単な実験を実施した。この実験を行うに先立って、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１が入っているリアクターを２０−２５ｐｓｉｇの圧力で処理し、これにＨ₂を５７％とＣＯを３６％とＣ₂Ｈ₆を７％含有する気体を供給した。気体保持時間を２分未満にし、液体保持時間を３８時間にし、細胞保持時間を２８時間にし、撹拌速度を６００ｒｐｍにしそして温度を３８℃にした。このような条件にするとＣＯ変換率が変動し、平均で８５％であり、かつＨ₂変換率も変動し、平均で２０％であった。細胞濃度は約２．５ｇ／Ｌでありそして産物流れはエタノールを９ｇ／Ｌとアセテートを３ｇ／Ｌ含有していた。
【０１１７】
この試験を準備する時の１番目の段階として、ＣＯが過剰に存在しないことを確保する目的で気体保持時間を長くした。圧力を２３−２４ｐｓｉｇに維持した。ｐＨが正常な処理範囲である４．５−４．６で安定であることを確保するに充分な時間に渡ってｐＨを追跡した。次に、高純度のＣＯを普通の供給気体にブレンドしてＨ₂が４７％でＣＯが４７％でＣ₂Ｈ₆が６％の気体供給材料を生じさせて気体保持時間を２．３分間にした。次に、リアクターのｐＨ、排出ガス組成および産物流れを経時的に監視した。
【０１１８】
表７に、そのような系にＣＯを余分に添加した後のｐＨの変化および産物組成を経時的に示す。ＣＯを添加して３０分後、リアクターのｐＨが５．２５にまで高くなって、培養が１．５４ｇ／Ｌ（０．０２５７モル／Ｌ）のアセテートから１．１２ｇ／Ｌ（０．０２４３モル／Ｌ）のエタノールに移行した。このようなｐＨの上昇は遊離酢酸がエタノールに変化した結果として起こったものである。このような変化に付随してＣＯ変換率が９１％から７１％にまで低下した。培養菌循環速度を０．４ｇｐｍから０．１５ｇｐｍにまで下げるとリアクターのｐＨが降下したが、エタノールの濃度とアセテートの濃度はそのままであった。
【０１１９】
ＣＯを導入して５０分後のエタノール濃度は１１．２９ｇ／Ｌでアセテート濃度は１．７５ｇ／Ｌであった。この時点で、ＣＯを過剰にすることを止めるとエタノール濃度とｐＨが再び降下し始めかつアセテート濃度が上昇し始めた。そのようなｐＨの降下はエタノールが分子状酢酸に変化したことによるものであった。このように、ＣＯを過剰に供給することによるエタノール−酢酸の移行は可逆的である。
実施例１５． アセテート生成を最小限にする目的で水を再循環
生じる流出液を最小限にしかつリアクターからのエタノール収率を最大限にしかつ生成される酢酸を制限するには、蒸留でエタノールを回収した後に方法水を発酵バイオリアクターに再循環させて戻すことが必須である。リアクターから得た１５−３５ｇ／Ｌのエタノールを濃縮して９５％のエタノールにする最も経済的な方法は蒸留であることを確認した。その後、モレキュラーシーブを用いた吸着でエタノールを更に濃縮して所望の濃度にする。この蒸留を実施する時に水中９５％のエタノールが塔頂産物として生じる。蒸留中に水が釜残産物として生じる。この釜残産物は発酵中に生じた酢酸（リアクターに由来）を含有（アセテートを３−５ｇ／Ｌ）しかつ発酵中に消費されなかったか或は蒸留の熱で分解した栄養素、例えば微量金属および他の鉱物などをいくらか含有する。その栄養素を再利用すると流出液の量が最小限になるが、その場合にはそれを処理する必要があるばかりでなくそのような量の栄養素を後で発酵バイオリアクターに添加する必要がある。このようなアセテートの再利用によってエタノールと酢酸の間の平衡状態を確立することでさらなる酢酸の生成を防止する。このように、水を再循環させると酢酸が正味もたらされなくなる。アセテートが３−５ｇ／Ｌを超える量で再循環されると結果としてリアクター内で酢酸による阻害が起こる可能性がある。このように、アセテートを含有する水を再循環させると、結果として、基質であるＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂がただ１種類の産物としてのエタノールに変換される可能性がある。
【０１２０】
表８に、Ｃ．リュングダリイ株Ｏ−５２を用いてＣＯを５０％とＨ₂を４５％とＣＨ₄を５％含有する気体の発酵を水再循環を伴わせて行った時の結果を示す。この実験では、細胞再循環で用いた中空繊維濾過で得た透過液を蒸留に送った。エタノールを除去した後の水を０．２ミクロンのフィルターで濾過することでいくらか沈澱した副産物を除去した。このような実験でリアクターに送り込んだ水全体（培地として）と比較した時の再循環水の分率は２５−１００％の範囲であった。１００％水再循環を伴わせた実験をほぼ５００時間または約２０倍の液体保持時間に渡って継続した。１００％水再循環を伴わせた時の結果で示されるように、酢酸は正味全く生じなかった。実際には酢酸が最終的に少量消費された。エタノール生産率は１２から２７ｇ／Ｌ・日の範囲であった。
実施例１６． パントテン酸塩を増殖段階に供給することを伴わせた２段階ＣＳＴＲ装置
パントテン酸塩を増殖段階に適切に供給することは最適にすべき変数である。Ｃ．リュングダリイＣ−０１を用いた増殖段階用リアクターの典型的な結果を実施例１１および１２に記述したが、但し、ここでは、健康で安定な培養を確保する目的で追加的パントテン酸塩またはコバルトを増殖段階に送り込んだことから、そのリアクターでは酢酸が若干ではあるが多く生産されるであろう。用いたビタミン濃度は、パントテン酸塩カルシウムが５０．５ｍｇ／Ｌとｄ−ビオチンが２０．６ｍｇ／ＬとチアミンＨＣｌが５０．６ｍｇ／Ｌ入っている水溶液が培地１リットル当たり０．７から０．８ｍｌであった。細胞再循環を伴う生産段階ＣＳＴＲに前記増殖段階用リアクターからの流出液を送り込んで、エタノールを主産物として生じさせる。このリアクターに送り込むパントテン酸塩の濃度は前記増殖段階の場合よりもずっと低く、パントテン酸塩カルシウムが５０．５ｍｇ／Ｌとｄ−ビオチンが２０．６ｍｇ／ＬとチアミンＨＣｌが５０．６ｍｇ／Ｌ入っている水溶液が培地１リットル当たり０．１−０．２ｍｌの全ビタミン量のみであった。この生産段階では気体保持時間を１１−３０分にし、液体保持時間を約２０時間にし、細胞保持時間を３０−５０時間にしそして撹拌速度を８００−９００ｒｐｍにした。ｐＨは５．０であり、温度を３８℃にした。リアクターが定常状態に到達した時点で、気体保持時間を１１分間に一定に保持し、液体保持時間を１９時間に設定し、細胞保持時間を３７時間に一定にし、そして撹拌速度を９００ｒｐｍにした。ＣＯ変換率は平均で９６％でＨ₂変換率は平均で６０％であった。エタノール濃度は一定して２５−３０ｇ／Ｌであり、またアセテートも約３ｇ／Ｌ存在していた。エタノール生産率は３１．６−３７．９ｇ／Ｌ・日であった。
実施例１７． 低い制限パントテン酸カルシウムへの順化を避ける目的で発酵パラメーターを調節
発酵バイオリアクター内の培養菌が低い制限パントテン酸カルシウム濃度に順化することを、下記のように、栄養素が大きく変化しないようにして栄養素供給濃度が比較的一定に維持されるようにしながら発酵パラメーター（気体速度、液体速度、撹拌速度、Ｈ₂分圧）を調節することで回避する。
【０１２１】
実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲの開始段階中に、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１に培養菌に栄養を与えるに必要なビタミン類と微量鉱物と塩類を含有する液状栄養流れを供給した。バイオリアクター内の細胞産生の度合が低かったことから、前記栄養培地中のパントテン酸塩濃度を２０μｇ／Ｌ、即ち培地の供給速度を遅くすることと組み合わせた時に産生細胞１グラム当たりに供給されるパントテン酸カルシウムが１００μｇを超えることを確保する濃度（パントテン酸塩を過剰）にした。同様に、前記培地中のコバルト濃度を１ｐｐｍ、即ちコバルトもまた過剰に存在することを確保する濃度にした。その代わりに、Ｈ₂を６３．３％とＣＯを３１．４％とＣ₂Ｈ₆を５．３％含有していてＣＯ₂を全く含有しない気体を送り込み、このようにして、Ｈ_{2 fed}／（２ＣＯ_converted＋３ＣＯ_{2 converted}）の比率が１よりも高くなるようにしそして気体供給速度および撹拌速度を注意深く調節することを通して、排出ガスに存在するＨ₂の分圧を０．５５気圧を超える度合で過剰に保持することで、９５％を超えるＣＯ変換率と８０％を超えるＨ₂変換率を達成した。これらの高い変換率を経時的に達成するにつれて細胞濃度が最初のほぼ０ｇ／Ｌのレベルから約１．５ｇ／Ｌのレベルになった。
【０１２２】
この開始段階中にパントテン酸塩濃度を一定に保持したことから、産生細胞１グラム当たりのパントテン酸塩のμｇはパントテン酸塩が産生細胞１ｇ当たり１５μｇ未満になるまで徐々に低下し、この時点でパントテン酸塩制限状態になる。このように、この系は増殖してパントテン酸塩制限状態になる。開始段階全体を通してＨ₂を過剰にすると高いエタノール：アセテート産物比が達成される。別法として、初期の開始段階中にリアクターが酢酸を生成するようにし、後でパントテン酸塩制限による制御下でそのような産物比に持って行く。
実施例１８． リアクターへのコバルトを制限
ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂から酢酸を生成させている間、Ｃ．リュングダリイ株ＥＲＩ２にコバルトを産生細胞１ｇ当たり６２から３５００μｇ供給した、即ちリアクターがコバルト制限を受けない（または、気体が培養菌に伝達され得る以外は他の如何なる制限も受けない）条件にしたところ、産物流れに全くエタノールが観察されなかった。ＣＯ、ＣＯ₂およびＨ₂からエタノールを生成させる目的でコバルトを制限する時には、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１にコバルトを産生細胞１ｇ当たり３３から４８μｇ供給しながら他の全ての栄養素を過剰に維持した。このような条件にするとＣ−０１菌株はエタノールを１８から２６ｇ／Ｌとアセテートを約４ｇ／Ｌ生成した。
実施例１９． 低い制限コバルト濃度への順化を回避
下記のように、栄養素が大きく変化しないようにして栄養素供給濃度が比較的一定に維持されるようにしながら発酵パラメーター（気体速度、液体速度、撹拌速度、ＣＯ₂含有量）を調節することで、低い制限コバルト濃度への順化を回避する。
【０１２３】
実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲの開始段階中に、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１に、培養菌に栄養を与えるに必要なビタミン類と微量鉱物と塩類を含有する液状栄養流れを供給した。バイオリアクター内の細胞産生の度合が低かったことから、前記栄養培地中のコバルト濃度を７５ｐｐｂ、即ち培地の供給速度を遅くすることと組み合わせた時に産生細胞１ｇ当たりに供給されるコバルトが５０μｇを超えることを確保する濃度（コバルトを過剰）にした。同様に、前記培地中のパントテン酸塩濃度を２０μｇ／Ｌ、即ちパントテン酸塩もまた過剰に存在することを確保する濃度にした。その代わりに、Ｈ₂を多量に含有していてＣＯ₂を全く含有しない気体を送り込みかつ気体供給速度および撹拌速度を注意深く調節することを通して、排出ガスに存在するＨ₂の分圧を０．５５気圧の過剰に保持することで、９５％を超えるＣＯ変換率と８０％を超えるＨ₂変換率を達成した。これらの高い変換率が経時的に達成されるにつれて細胞濃度が最初のほぼ０ｇ／Ｌのレベルから約１．５ｇ／Ｌのレベルになった。この開始段階中にコバルト濃度を一定に保持したことから、産生細胞１ｇ当たりのコバルトのμｇはコバルトが産生細胞１ｇ当たり５０μｇ未満になるまで徐々に低下し、この時点でコバルト制限状態になる。このように、この系は増殖してコバルト制限状態になる。開始段階全体を通して供給材料にＨ₂を過剰に用いると高いエタノール収率が達成される。別法として、初期の開始段階中にリアクターが酢酸を生成するようにし、後でコバルト制限による制御下でそのような産物比に持って行く。
実施例２０． 水素の過剰供給
実験室用ＡＵＴＯＫＬＡＶ（商標）リアクター（Ｂｕｃｈｉ）の処理を液体再循環および細胞再循環を伴うＣＳＴＲとして処理している間、Ｃ．リュングダリイを、培養菌に栄養を与えるに必要な過剰量のビタミン類と微量鉱物と塩類で処理した。供給気体にＨ₂を過剰に存在させて前記リアクターを処理し、その結果として、変換を受けるＣＯのモルの２倍と変換を受けるＣＯ₂のモルの３倍の合計に対する供給Ｈ₂のモルの比率は５．６７であった。もしこの比が１．０以下であると、リアクターにＨ₂が過剰に存在しなくなって、Ｈ₂が過剰に存在することによるエタノール生成が起こらなくなる可能性がある。更に、排出ガス中のＨ₂分圧は２．６１気圧、即ち、Ｈ₂が過剰なことによるエタノール生成に必要な０．４気圧を超えるレベルであった。最後に、排出ガス中のＣＯ₂分圧に対するＨ₂分圧の比率は１０．８８、即ち有効炭素の全部が利用されるに充分な量でＨ₂が存在することが確保される３．０よりも高いレベルであった。このような条件下で前記リアクターはエタノールをほぼ２６ｇ／Ｌ生成しそしてアセテートの量は３ｇ／Ｌ未満であった。エタノール生産率は２００ｇ／Ｌ・日を超えていた。この上に示した基準のいずれかが満たされないと、そのようなリアクターではＨ₂が過剰に存在することによるエタノールの生成が起こらなくなり得る。Ｈ₂を豊富に存在させることに関する別の面は、ヒドロゲナーゼによる酸化を通して還元を受けたフェロドキシンが追加的にもたらされる点にある。
実施例２１． ＣＯ基質阻害の軽減
実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（商標）ＣＳＴＲを８００ｒｐｍの撹拌速度で処理する場合、これを流出気体中のＣＯが５％のみになるように前以て処理すると、流出ＣＯ濃度が１０％になることが分かる。その撹拌速度を下げて６００ｒｐｍにするとＣＯ阻害が取り除かれて、流出ＣＯ濃度が５％に戻る。その結果としてＨ₂吸収率が高くなる、即ち、リアクターに供給される気体の全部を効率良く利用するに必要な条件になる。
実施例２２． 質量移動
質量移動を過度にするとエタノール生成がもたらされることを示す一例として、Ｃ．リュングダリイ株ＥＲＩ２が入っている細胞再循環を伴う実験室用ＣＳＴＲを栄養素制限も供給気体にＨ₂またはＣＯを過剰に存在させることも伴わせないで処理することを考慮する。即ち、パントテン酸塩をパントテン酸カルシウムが産生細胞１グラム当たり１００μｇを超える供給速度で供給しかつコバルトを産生細胞１グラム当たり１００μｇを超える供給速度で供給した。Ｈ₂が排出ガス中に約０．２気圧で存在し、そして比ＣＯ吸収率は細胞１ｇ当たり０．３ミリモル未満のＣＯ／分である。撹拌速度を８００ｒｐｍにする。このような条件下で培養菌は酢酸のみを生成する（産物流れにエタノールが全く存在しない）。撹拌速度を急速に９００ｒｐｍにまで高くするか或は気体速度を約１０％高くすると産物流れにエタノールが観察されるようになり、これは細胞濃度が高くなって気体を取り込むようになるまでか或は培養菌が基質阻害が原因で死亡するまで観察される。
実施例２３． 酢酸による産物阻害を制御
酢酸を８ｇ／Ｌとエタノールを１０ｇ／Ｌ生成している実験室用ＣＳＴＲに関して、培養菌がより多くのエタノールを生成する能力を制限している余分な酢酸をリアクターから洗い流す試みで、液体保持時間を３６時間に渡って２４時間から１２時間に下げた。他のリアクター処理条件および栄養条件の全部を一定に保つ。この期間の後、液体保持条件を２４時間に戻すと、結果として、アセテート含有量が３ｇ／Ｌでエタノール含有量が１５から２５ｇ／Ｌの産物流れがもたらされる。産物阻害を排除するには液体保持時間を下げる試みを数回行う必要がある。別法として、過剰なＨ₂による制御が可能なようにＨ₂を気体供給材料に添加する、と言うのは、ＣＯ₂が過剰に存在しているとまたエタノールよりも酢酸生成の方が有利に起こり得るからである。このような修飾を用いて酢酸の過剰生成を防止し、従って産物比が劣らないようにしかつエタノール生産率が低くならないようにする。その後、Ｈ₂を供給気体に過剰に入れて用いるか或は液相栄養素濃度を制限することを再び始める。
実施例２４． 一酸化炭素の過剰供給
Ｃ．リュングダリイ株ＥＲＩ２に栄養素を過剰（パントテン酸塩およびコバルトを過剰）に供給しそして供給気体に入れるＨ₂を豊富にしないと、比ＣＯ吸収率が０．２３から０．４８ミリモル／ｇ・分になりかつ産物流れにエタノールが確認されなくなった。しかしながら、Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１に同様に栄養素を過剰に供給することに加えてＨ₂を供給気体に豊富に存在させないがＣＯを過剰に供給してエタノール生成をもたらす条件下にした時の比ＣＯ吸収率は０．６７から１．３４ミリモル／ｇ・分であった。このような条件下で培養菌はエタノールを９．９から１２．０ｇ／Ｌとアセテートを２．６から２．７ｇ／Ｌ生成した。
実施例２５： 細胞パージによる産物比の制御
Ｃ．リュングダリイ株Ｃ−０１を用いて細胞再循環（細胞保持時間＝４０時間および液体保持時間＝６時間）を伴うＣＳＴＲ（ｐＨ＝５．０、温度＝３８℃、圧力＝２０ｐｓｉｇ）で気体状基質（ＣＯが３０％でＨ₂が１５％でＣＯ₂が１０％でＮ₂が４５％）の発酵を起こさせ、そしてこの培養菌の増殖にコバルトによる制限もパントテン酸カルシウムによる制限も他の如何なる栄養素による制限も受けさせない。この培養菌が増殖するにつれて、比吸収率（乾燥細胞１グラム当たりのＣＯのミリモル／分）が０．５未満になりかつ酢酸がエタノールより優先的に生成されるような細胞密度に到達する。これが起こらないようにするには、細胞濃度が一貫してＣＯが乾燥細胞１グラム当たり０．５ミリモル／分より高いと言った比吸収率が維持されるに充分なほど低く保持されるように、細胞パージ率を高くして細胞密度が高くならないようにする。このようにして細胞保持時間を６から２５時間の範囲にまで短くする。
【０１２４】
【表１】

【０１２５】
【表２】

【０１２６】
【表３】

【０１２７】
【表４】

【０１２８】
【表５】

【０１２９】
【表６】

【０１３０】
【表７】

【０１３１】
【表８】

【０１３２】
公開された資料の全部を引用することによって本明細書に組み入れる。本発明の数多くの修飾形および変形をこの上に示した明細に含めそしてそれらが本分野の技術者に明らかになったと期待する。本発明の組成物および方法に対するそのような修飾形および変形は添付請求の範囲の範囲内に包含されると考えている。
【図面の簡単な説明】
【図１】 本発明に従う産物回収を伴う連続発酵方法を説明する図式図である。気体状基質１と液相栄養培地２を主題細菌培養液が入っているバイオリアクター３に送り込む。このバイオリアクター３内で前記気体状基質からエタノールと酢酸への変換が起こる。ＣＯとＣＯ₂とＨ₂以外の気体と変換を受けなかったＣＯとＣＯ₂とＨ₂を含有する排出気体４をバイオリアクター３から排出させて、燃料として燃焼させるか或は燃えさせる。細胞再循環を伴わせる場合には、液状の流出液５を細胞分離装置６に送り込んで、細胞７と細胞を含まない透過液８を分離する。細胞７をバイオリアクター３に送って戻しそして透過液８を産物回収に送る。前記透過液８（または別法として細胞分離を用いない時には流出液５）からエタノールを回収することができる。透過液８に分離を蒸留塔９内で受けさせることで９５％のエタノール塔頂液１０と水１１を生じさせ、前記水１１を再循環でバイオリアクター３に戻す。この９５％のエタノール塔頂液１０をモレキュラーシーブ１２に送って、所望の最終産物である無水のエタノール１３を希エタノール１４から分離し、前記希エタノール１４を蒸留塔９に戻す。
【図２】 培養の安定性を向上させるに適した２段階の連続撹拌型リアクター（ＣＳＴＲ）装置の図式図である。増殖段階のＣＳＴＲ１に液状培地２を送り込む。生産段階のＣＳＴＲで変換を受けなかった気体３を増殖段階のＣＳＴＲ１に送り込む。生産段階のＣＳＴＲ４に新鮮な気体供給材料５および新鮮な培地供給材料６を送り込むばかりでなく増殖段階のＣＳＴＲ１から培養菌供給材料７も送り込む。細胞再循環８を用いることで生産段階のＣＳＴＲ４に送られる細胞９から最大の生産率を得る。細胞９を増殖段階のＣＳＴＲには再循環させない。発酵ブイヨン中の希エタノールで構成されている液状産物１０を最終蒸留用産物として生じさせて、それを図１と同様に無水エタノールとして回収する。

Claims (8)

1. 一酸化炭素を含んでなる気体状基質の嫌気性細菌発酵からエタノールを生産する連続的方法であって、
   前記方法が、パントテン酸カルシウムを含む液体栄養培地中で、５．５未満のｐHで、発酵バイオリアクター中の遊離酢酸濃度が５ｇ／Ｌ未満で且つ前記バイオリアクター中の発酵ブイヨンにおけるエタノールと酢酸アセテートの比率が１：１から１：２０で、エタノールを製造できるクロストリジウム・リュングダリイを発酵バイオリアクター中で培養することを含んでなり、
   前記パントテン酸カルシウムが、バイオリアクター中で産生する細菌の乾燥細胞１グラム当たり０．５から５０μｇの量で、前記発酵バイオリアクター中に供給され、そして少なくとも０．５ミリモル一酸化炭素／細菌の細胞乾燥重量ｇ／分である、一酸化炭素取り込みの特定の比率が前記バイオリアクター中で維持され、それによりエタノールが１０ｇ／Ｌ／日より大きい生産性で安定な状態で製造されることを特徴とする、上記方法。
2. 前記発酵バイオリアクターが、得られる発酵ブイヨンを前記エタノールの大部分を生成させる２番目の発酵バイオリアクターに送り込む増殖用リアクターを含むことを特徴とする、請求項１記載の方法。
3. 発酵ブイヨンを前記バイオリアクターから取り出し、エタノールを前記ブイヨンから蒸留しそして前記エタノールを回収することを更に含む、請求項１または２に記載の方法。
4. 前記蒸留段階からのアセテート含有水を再循環させて前記バイオリアクターに戻すことを更に含む、請求項３記載の方法。
5. 前記クロストリジウム・リュングダリイが株ＰＥＴＣ、ＥＲＩ２、Ｏ−５２およびＣ−０１から選択されることを特徴とする、請求項１から４のいずれかに記載の方法。
6. 前記気体状基質が、（ａ）一酸化炭素、（ｂ）一酸化炭素と水素、（ｃ）一酸化炭素、二酸化炭素と水素、および（ｄ）窒素またはメタンと一緒の（ａ）から（ｃ）のいずれか、から選択されることを特徴とする、請求項１から５のいずれかに記載の方法。
7. 気体速度、液体速度、撹拌速度、栄養供給速度および水素ガス分圧から選択されるパラメーターを調整することで前記バイオリアクター内の前記細菌が前記パントテン酸カルシウム量に順化しないようにする段階を含む、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
8. 前記バイオリアクターに水素還元ガスを過剰に供給することを更に含む、請求項７記載の方法。

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