JP2020014474A - 呼吸器合胞体ウイルス(rsv)ワクチン - Google Patents

呼吸器合胞体ウイルス(rsv)ワクチン Download PDF

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Abstract

【課題】呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の薬学的組成物の調製のための、mRNA配列、または複数のmRNA配列を含んでいる組成物の使用、及びmRNAワクチンを用いたRSV感染の処置または予防法の提供。【解決手段】RSVの融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リンタンパク質P、非構造タンパク質NS1、または非構造タンパク質NS2に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでおり、上記コード領域のG/C含有量は、野生型mRNAのコード領域のGC含有量と比べて向上されており、好ましくは野生型mRNAの、コードされているアミノ酸配列と比べて、変更されていない、mRNA配列。【選択図】なし

Description

発明の詳細な説明
本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくはタンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいるmRNA配列に関する。さらに、本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくはタンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいる複数のmRNA配列を含んでいる組成物に関する。
さらに、本発明はまた、薬学的組成物(特にワクチン(例えばRSV感染の予防または処置における使用のための))の調製のための、mRNA配列、または複数のmRNA配列を含んでいる組成物の使用を開示している。本発明は、mRNAワクチンを用いたRSV感染の処置または予防の方法を、さらに説明している。
RSVの全世界的な医薬の必要性または経済的な影響力は、非常に高い。RSVは、乳児または幼児の間における通院という結果を招く、急性の下気道感染(ALRI)の最も重要な原因である。例えば、合衆国では、60%を超える乳児が、最初のRSVの活動期の間にRSVに感染し、ほぼすべてが2〜3歳までに感染する。5歳未満のおよそ230万人の合衆国の子供(入院患者としての3%、救急診療における25%、および小児診療における73%)は、毎年、RSV疾患の処置を受けている。全世界的に、5歳未満の子供において、RSVは、毎年、推定で3380万人のALRI(すべてのALRIの22%を超える)を引き起こしており、66000〜199000人の死者(99%は発展途上国において発生している)を出している。RSVはまた、老人において呼吸器疾患の多くみられる原因であり、インフルエンザに強く免疫化されている集団におけるインフルエンザと同程度の入院期間をもたらす。RSVは、呼吸の飛沫、または感染者もしくは汚染物との密接な接触によって伝播する。温帯気候において、例年の冬季の流行がある。乳児は、最初の6か月において重篤なRSV疾患について最も高い危険な状態にあり、入院加療のピークは、2〜3か月齢にある。早期出産および心肺疾患は、重篤なRSV疾患にとっての危険因子である。乳児のRSV感染は、他の呼吸器ウイルスのほとんどに対する免疫よりも速やかに衰えると思われる防御免疫を部分的に引き出す。生年にRSVに感染したほとんどの子供は、一般により低い重篤度において翌年に再感染する。再感染は、しぱしば上気道の症状、ときに下気道または副鼻腔の併発をともなって生涯にわたって持続する。RSV細気管支炎の推奨される処置は、呼吸器の支持および加湿から主になる。特異的な抗ウイルス療法は推奨されていない。中和モノクローナル抗体Palivizumabは、重篤な感染への最も高い危険な状態にある乳児の予防に使用されるが、一般的な使用には高価でありすぎ、実際的ではない。現在、使用許諾されているRSVワクチンがなく、安全かつ有効なRSVワクチンの開発は、世界的な公衆衛生の優先事項である。
1960年代のワクチン治験において、乳児および幼児は、ホルマリン不活性化された全ビリオンのRSV調製物(FIRSV)または同等のパラミクソウイルス調製物(FIPIV)を用いて免疫化されていた。FI−PIVを用いて免疫化され、かつそれから、次のRSVの活動期の間にRSVに自然に感染した対象の5%は、入院させられ;FI−RSVを用いて免疫化され、それからRSVに感染した対象の80%は、入院させられ;2人の子供は死亡した。ワクチン接種に起因するRSVの増進は、RSV感染に対するワクチンの開発に特有の問題点である(Shaw et al. Curr Opin Virol. 2013 Jun;3(3):332-42. doi: 10.1016/j.coviro.2013.05.003. Epub 2013 May 30.)に概括されている)。
したがって、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)感染は、発展途上国において乳児ワクチンの未解決の必要性を最も強く残しており、全世界的に重要な未解決の乳児ワクチンを必要としている。40年を超える試みは、ヒト用に使用許諾されたワクチンをいまだにもたらしていない。
まとめると、パラミクソウイルスのウイルス科に属するRSVは、最も伝染性の高い病原体の1つであり、乳児、老人および免疫障害のある患者における気道感染に大きく寄与している。
上述の通り、現在のところ、ウイルスの表面Fタンパク質に対するヒト化されたモノクローナル抗体は、高い危険性とみなされている乳児(早期出産の乳児および慢性の肺疾患にかかっている乳児)に推奨されている、市場における予防的な製品のみである(The IMpact-RSV Study Group. 1998. Palivizumab, a Humanized Respiratory Syncytial VirusMonoclonal Antibody, Reduces Hospitalization From Respiratory Syncytial Virus Infection in High-risk Infants. Pediatrics, 102(3), S.531-537., Tablan et al. 2003. Guidelines for preventing health-care--associated pneumonia, 2003: recommendations of CDC and the Healthcare Infection Control Practices Advisory Committee. MMWR. Recommendations and Reports: Morbidity and Mortality Weekly Report. Recommendations and Reports / Centers for Disease Control, 53(RR-3), S.1-36.)。
動物モデルを用いた最近の研究は、RSV Fタンパク質を標的とする十分な量の中和抗体が、ウイルス複製を制限し、疾患の重篤度のより小さい経過を導くことを証明した(Singh, S.R. et al., 2007. Immunogenicity and efficacy of recombinant RSV-F vaccine in a mouse model. Vaccine, 25(33), S.6211-6223.、Zhan, X. et al., 2007. Respiratory syncytial virus (RSV) F protein expressed by recombinant Sendai virus elicits B-cell and T-cell responses in cotton rats and confers protection against RSV subtypes A and B. Vaccine, 25(52), S.8782-8793.、Vaughan, K., et al., 2005. DNA immunization against respiratory syncytial virus (RSV) in infant rhesus monkeys. Vaccine, 23(22), S.2928-2942)。
さらに、平衡の保たれている制御性のエフェクターT細胞機能は、ウイルスの排除および疾患の重篤度の低下に必要とされていることが、示されている(Liu, J. et al., 2010. Epitope-specific regulatory CD4 T cells reduce virus-induced illness while preserving CD8 T-cell effector function at the site of infection. Journal of Virology, 84(20), S.10501-10509)。
上述したヒト化されたモノクローナル抗体にもかかわらず、強い免疫応答を引き出すが、特定の標的の群(乳児、子供、老人、および免疫障害のある患者)における使用について推奨されない、弱毒化された生ワクチンが、開発された。また、B細胞エピトープを担持しているRSV Fタンパク質を発現するDNAベクターが、中和抗体の産生を誘導するために使用された。これに関して、国際公開第2008/077527号および国際公開第96/40945号は、ワクチンとしての用途ために、RSV Fタンパク質をコードしているDNA配列を含んでいるベクターを開示している。しかし、ワクチンとしてのDNAの使用は、機能的な遺伝子の妨害およびがんもしくは抗DNA抗体の形成をおそらく導く、ゲノムへの所望されない挿入のために危険であり得る。
したがって、特に乳児、老人および免疫障害のある患者における、RSV感染の予防または処置のためのワクチンとしての使用を目的とする、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているmRNA配列を提供することが、根本的な発明の目的である。
これらの目的は、添付の特許請求の範囲の主題によって解決される。特に、本発明の根本をなす目的は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいる発明のmRNAによる第1の局面にしたがって解決される。
明確さおよび読みやすさを目的として、以下の科学的な背景の情報および定義づけが示されている。それらによって明らかにされる任意の技術的な特徴点は、本発明の各実施形態およびすべての実施形態の一部であり得る。さらなる定義づけおよび説明は、本開示に鑑みて示され得る。
免疫系:免疫系は、感染から生体を保護し得る。病原体が生体の物理的な障壁を通り抜け、この生体に侵入すると、先天性免疫系は、急速な非特異的応答をもたらす。病原体がこの先天性応答を回避した場合に、脊椎動物は、防御の第2の層である適応免疫系を保有している。ここで、免疫系は、上記病原体の認識を向上させるために、感染の間にその応答を適合させる。この向上された応答は、それから、上記病原体が排除された後に、免疫記憶の形において保持され、適応性の免疫系に遭遇するそれぞれのときにより早く、より強い攻撃を適応免疫系が仕掛けることを可能にする。これによれば、免疫系は、先天性免疫系および適応免疫系を包含している。これらの2つの部分のそれぞれは、いわゆる液性免疫成分および細胞性免疫成分を含んでいる。
免疫応答:免疫応答は、典型的に、特定の抗原に対する適応免疫系の特異的応答(いわゆる特異的免疫応答または適応免疫応答)、または先天性免疫系の非特異的応答(いわゆる非特異的免疫応答または先天的免疫応答)のいずれかであり得る。本発明は、適応免疫系の特異的反応(適応免疫応答)にとっての中心に関する。特に、本発明は、例えばRSV感染のような、ウイルスによる感染に対する適応免疫反応に関する。しかし、この特異的反応は、追加の非特異的反応(先天性免疫応答)によって補助され得る。したがって、本発明はまた、有効な適応免疫応答を誘起するための、先天性免疫系および適応免疫系の同時刺激のための化合物に関する。
適応免疫系:適応免疫系は、高度に特化された系統細胞、ならびに病因となる増殖を排除するか、または防ぐ過程によって構成されている。適応免疫応答は、特定の病原体を認識し、かつ記憶する能力および病原体と遭遇するそれぞれのときにより強い攻撃を加える能力を、脊椎動物の免疫系にもたらす。上記系は、体性超変異(高頻度の体性変異の過程)、およびV(D)J組換え(抗原受容体遺伝子部分の不可逆的な遺伝学的組換え)のために、高い適応性を有している。この機序は、少ない数の遺伝子が、個々のリンパ球のそれぞれにおいて後ほど独自に発現される膨大な数の異なる抗原受容体を生成することを可能にする。遺伝子再配列は、各細胞(同じ受容体特異性をコードしている遺伝子を受け継いでいる後代の細胞(子孫)のすべて(長期にわたる特異的免疫にとって重要なメモリB細胞およびメモリT細胞が挙げられる))のDNAにおける不可逆的な変化を導く。免疫ネットワーク理論は、適応免疫系がどのように機能する(すなわちT細胞およびB細胞の受容体の可変領域、ならびに可変領域を有しているT細胞およびB細胞によって作られる分子の間における相互作用に基づいている)かの理論である。
適応免疫応答:適応免疫応答は、抗原特異的であると典型的に理解される。抗原特異性は、特定の抗原、病原体または病原体感染細胞に合わせられている応答の発生を可能にする。合わせられているこれらの応答を行う能力は、「メモリ細胞」によって、身体に維持されている。病原体が2回以上にわたって身体に感染すると、これらの特定メモリ細胞は、病原体を速やかに排除するために使用される。これに関して、適応免疫応答の第1段階は、抗原提示細胞による抗原特異的な免疫応答を誘導可能な、ナイーブな特定のT細胞または異なる免疫細胞の活性化である。これは、ナイーブなT細胞が常に通過しているリンパ組織および器官において生じる。抗原提示細胞として機能し得る細胞種は、特に、樹状細胞、マクロファージおよびB細胞である。これらの細胞のそれぞれは、免疫応答の誘起において特徴的な機能を有している。樹状細胞は、ファゴサイトーシスおよびマクロピノサイトーシスによって抗原を取り込み、例えば外来性の抗原と、接触することによって刺激されて、成熟樹状細胞にそれらが分化する局所のリンパ組織に移動する。マクロファージは、粒状の抗原(例えば細菌)を摂取し、病原性物質または他の適切な刺激剤によって誘導されて、MHC分子を発現する。B細胞受容体を介した可溶性のタンパク質を結合し、かつ当該タンパク質を内部移行させる、B細胞の固有の能力はまた、T細胞を誘導するために重要であり得る。MHC分子に抗原を提示することは、それらの増殖および武装した(armed)エフェクターT細胞への分化を誘導するT細胞の活性化を導く。エフェクターT細胞の最も重要な機能は、CD8+細胞傷害性T細胞によって感染細胞を死滅させること、および細胞媒介性免疫をともに形成するTh1細胞によるマクロファージの活性化、ならびに異なるクラスの抗体を産生し、したがって液性免疫応答を促進するための、Th1細胞およびTh2細胞の両方によるB細胞の活性化である。上記細胞は、抗原を直接に認識し、かつ結合しない代わりに、他の細胞の表面にあるMHC分子に結合されている短いペプチド断片(例えば抗原由来のタンパク質抗原の)を認識するT細胞受容体によって抗原を認識する。
細胞性免疫/細胞性免疫応答:細胞性免疫は、典型的に、マクロファージ、ナチュラルキラー細胞(NK)、抗原特異的な細胞傷害性Tリンパ球の活性化、および抗原に応じた種々のサイトカインの放出に関する。より一般的に、細胞性免疫は、抗体に関しておらず、免疫系の細胞の活性化に関する。細胞性免疫は、例えば、(1)表面に抗原のエピトープを提示している体細胞(例えば、ウイルス感染細胞、細胞内に細菌を有している細胞、腫瘍抗原を提示しているがん細胞)におけるアポトーシスを誘導可能な、抗原特異的な細胞障害性Tリンパ球を活性化すること;(2)マクロファージおよびナチュラルキラー細胞を活性化すること(それらを、病原体を破壊可能にする);ならびに(3)細胞を刺激して適応免疫応答および先天性免疫応答に関与する他の細胞の機能に影響する、種々のサイトカインを分泌することによって、特徴付けられている。
液性免疫/液性免疫応答:液性免疫は、抗体産生、およびそれに付随し得る補助的な過程に、典型的に関する。液性免疫応答は、例えばTh2活性化およびサイトカイン産生、胚中心形成およびアイソタイプスイッチング、結合性成熟およびメモリ細胞生成によって、典型的に特徴付けられている。液性免疫はまた、抗体のエフェクター機能(病原体および毒素の中和、古典的な補体の活性化、ならびにファゴサイトーシスおよび病原体排除のオプソニン促進)を指し得る。
先天性免疫系:先天性免疫系(非特異的免疫系としても知られている)は、他の生体による感染から、非特異的な様式において宿主を防御する細胞および機序を包含している。これは、適応免疫系と異なり、一般的な方法において、先天性系の細胞が病原体を認識し、応答することを意味し、宿主に対する長期の免疫または防御的な免疫を付与しない。先天性免疫系は、例えば、病原体関連分子パターン(PAMP)受容体(例えばトル様受容体(TLR))のリガンドもしくは他の補助物質(例えば、リポ多糖、TNF−アルファ、CD40リガンド)、またはサイトカイン、モノカイン、リンフォカイン、インターロイキンもしくはケモカイン(IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−12、IL−13、IL−14、IL−15、IL−16、IL−17、IL−18、IL−19、IL−20、IL−21、IL−22、IL−23、IL−24、IL−25、IL−26、IL−27、IL−28、IL−29、IL−30、IL−31、IL−32、IL−33、IFN−アルファ、IFN−ガンマ、GM−CSF、G−CSF、M−CSF、LT−ベータ、TNF−アルファ、成長因子およびhGH)、ヒトのトル様受容体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10のリガンド、マウスのトル様受容体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、TLR11、TLR12またはTLR13のリガンド、NODライク受容体のリガンド、RIG−1ライク受容体のリガンド、免疫刺激性の核酸分子、免疫刺激性のRNA(isRNA)、CpG−DNA、抗菌剤、または抗ウイルス剤によって、活性化され得る。先天的免疫系の応答は、化学因子(サイトカインと呼ばれる、特殊化された化学媒介因子が挙げられる)の産生を介して、感染の部位に免疫細胞を補充すること;補体カスケードの活性化;器官、組織、血液およびリンパに存在する外来性物質の、特殊化された白血球による識別および除去;抗原提示として知られている過程を介した適応免疫系の活性化;および/または感染性物質に対する物理的および化学的な障壁として機能することを、典型的に包含している。
アジュバント剤/アジュバント成分:最も広義におけるアジュバント剤またはアジュバント成分は、典型的に、他の作用物質(例えば、薬剤またはワクチン)の有効性を変更(例えば向上)し得る(例えば薬学的または免疫学的な)作用物質または組成物である。通常、上記用語は、本発明に関して、免疫原および/または薬学的に活性な化合物にとっての担体または補助物質として機能する化合物または組成物を指す。上記用語は、広い意味において解釈されるべきであり、問題のアジュバント剤に組み込まれているか、または当該アジュバント剤とともに投与される抗原の免疫原性を向上させ得る広い範囲の物質を指す。本発明に関して、アジュバント剤は、本発明の活性剤の特異的な免疫原性作用を好ましく向上させる。典型的に、「アジュバント剤」または「アジュバント剤成分」は、同じ意味を有しており、相互に使用され得る。アジュバント剤は、免疫増強作用剤、抗原送達系またはその組合せに分類され得る。
「アジュバント剤」という用語は、それら自身によって免疫をもたらす作用物質を包含していないと、典型的に理解される。アジュバント剤は、例えば免疫系に対する抗原の提示または非特異的な先天性免疫応答の誘導を促進することによって、抗原特異的な免疫応答を向上させるために、免疫系を非特異的に補助する。さらに、アジュバント剤は、例えば有意なTh2に基づく抗原特異的な応答を、よりTh1に基づく抗原特異的な応答に、またはその逆に変更することによって、例えば抗原特異的な免疫応答を好ましく調節し得る。したがって、アジュバント剤は、サイトカイン発現/分泌、抗原提示、免疫応答の型などを有利に調節し得る。
本発明に関する免疫刺激性RNA(isRNA)は、典型的に、それ自身が先天性免疫応答を誘導可能なRNAであり得る。通常、isRNAは、オープンリーディングフレームを有しておらず、ペプチド抗原または免疫原をもたらさないが、例えばトル様受容体(TLR)または適切な他の受容体のうちの特定の種類に対する結合によって、先天性免疫応答を引き出す。しかし、当然、オープンリーディングフレームを有しており、ペプチド/タンパク質(例えば、抗原機能)をコードしているmRNAは、先天性免疫応答を誘導し得る。
抗原:本発明によれば、「抗原」という用語は、免疫系によって認識され得、適応免疫応答の一部としての抗体または抗原特異的なT細胞の形成によって、抗原特異的な免疫応答を誘起可能であり得る物質を、典型的に指す。抗原は、タンパク質またはペプチドであり得る。これに関連して、適応免疫応答の第1段階は、ナイーブな抗原特異的なT細胞の、抗原提示細胞による活性化である。これは、ナイーブT細胞が常に通過しているリンパ組織または器官において生じる。抗原提示細胞として機能するこれらの細胞種は、樹状細胞、マクロファージ、およびB細胞である。これらの細胞のそれぞれは、誘起する免疫応答において特徴的な機能を有している。組織の樹状細胞は、ファゴサイトーシスおよびマクロピノサイトーシスによって抗原を取り込み、感染によって刺激されて、それらが成熟樹状細胞に分化する局所的なリンパ組織に移動する。マクロファージは、粒状の抗原(例えば細菌)を摂取し、感染性因子によって誘導されて、MHCクラスII分子を発現する。それらの受容体を介して、可溶性タンパク質抗原と結合し、可溶性のタンパク質抗原を内部移行させる、B細胞の固有の能力は、T細胞を誘導するために重要であり得る。MHC分子上に抗原を提示することによって、それらの増殖および武装したエフェクターT細胞への分化を誘導するT細胞の活性化を導く。エフェクターT細胞の最も重要な能力は、CD8細胞傷害性T細胞による感染細胞の殺傷および細胞媒介性免疫をともに作り上げているTH1細胞によるマクロファージの活性化、ならびに異なるクラスの抗体を産生する(したがって液性免疫を起こさせる)ための、TH2細胞およびTH1細胞の両方によるB細胞の活性化である。T細胞は、直接には抗原を認識せず、抗体と結合しないが、例えば病原体のタンパク質抗原の、短いペプチド断片(他の細胞の表面上にあるMHC分子に対して結合される)を認識するそれらのT細胞受容体によって抗原を認識する。
T細胞は、異なるエフェクター機能を有している2つの主要なクラスに分類される。2つのクラスは、細胞表面タンパク質CD4およびCD8の発現によって識別される。身体の組織によってそれらの構造および発現パターンに差異を有しているMHC分子の2つのクラス−MHCクラスI分子およびMHCクラスII分子がある。MHCクラスI分子およびMHCクラスII分子は、それらを認識するT細胞の異なるエフェクター機能を反映している、細胞内における異なる分布を有している。MHCクラスI分子は、それらが特異的に認識する任意の細胞を殺傷するために特殊化されている細胞傷害性T細胞に分化するCD8T細胞に、例えば病原体(一般的にウイルス)からの、細胞質由来および核由来のペプチドを提示する。ほとんどすべての細胞は、MHCクラスI分子を発現するが、恒常的な発現のレベルは、1つの細胞種から次の細胞種までにおいて異なる。ウイルス由来の病原性ペプチドが、MHCクラスI分子によって提示されるだけでなく、自己抗原様の腫瘍抗原もMHCクラスI分子によって提示される。MHCクラスI分子は、細胞質において分解され、小胞体に輸送されたペプチドと結合する。感染細胞の表面におけるMHCクラスI:ペプチド複合体を認識するCD8T細胞は、外来性ペプチドを提示している任意の細胞を殺傷し、したがってウイルスおよび他の病原体に感染している細胞の集団を駆除することに特化されている。MHCクラスII分子を認識するCD4T細胞(CD4ヘルパーT細胞)の主要な機能は、免疫系の他のエフェクター細胞を活性化することである。したがって、MHCクラスII分子は、免疫応答に参加する細胞であるBリンパ球、マクロファージおよび樹状細胞の上に通常に見られるが、他の組織細胞上には見られない。マクロファージは、例えば、それらが内部に含んでいる小胞内の病原体を殺傷するために活性化され、B細胞は、外来性の分子に対する免疫グロブリンを分泌するために活性化される。MHCクラスII分子は、エンドソームにおいて分解されたタンパク質に由来するペプチドを結合する。それらは、マクロファージの小胞系に入っている病原体由来のペプチド、または成熟樹状細胞、B細胞の免疫グロブリン受容体によって内部移行された病原体由来のペプチドを捕捉し得る。マクロファージおよび樹状細胞の小胞の内部に蓄積している多数の病原体は、TH1細胞の分化を刺激する傾向にあり、細胞外抗原は、TH2細胞の生成を刺激する傾向にある。TH1細胞は、マクロファージの殺菌特性を活性化させ、食作用性細胞による摂食のために細胞外病原体にオプソニンを作用させることに非常に有効なIgG抗体を生成するためにB細胞を誘導し、TH2細胞は、B細胞を活性化することによって液性応答を開始させて、IgGを分泌させ、微弱にオプソニン化させる抗体(例えば、IgG1およびIgG3(マウス);およびIgG2およびIgG4(ヒト);ならびにIgAおよびIgE(マウスおよびヒト))の産生を誘導する。
エピトープ(いわゆる「抗原決定基」):本発明に関してT細胞エピトープまたはそのタンパク質の部分は、約6〜約20またはそれ以上のアミノ酸の長さを好ましく有している断片(例えば、好ましくは約8〜約10アミノ酸(例えば8、9または10(さらに11または12アミノ酸))の長さを有している、MHCクラスI分子によって処理され、提示されるような断片、または好ましくは約13以上のアミノ酸(例えば、13、14、15、16、17、18、19、20またはそれ以上のアミノ酸)の長さを有している、MHCクラスII分子によって処理され、提示されるような断片)を構成し得る。ここで、これらの断片は、アミノ酸配列の任意の部分から選択され得る。これらの断片は、ペプチド断片およびMHC分子からなる複合体の形態においてT細胞によって典型的に認識される。
B細胞エピトープは、典型的に、抗体によって認識され得る(すなわちそれらの未変性の形態にある)、好ましくは5〜15アミノ酸、より好ましくは5〜12アミノ酸、より一層好ましくは6〜9アミノ酸を有している、本明細書に規定されているような(未変性の)タンパク質またはペプチド抗原の外表面に位置している、断片である。
タンパク質またはペプチドのそのようなエピトープは、当該タンパク質またはペプチドの本明細書に述べられているバリアントのいずれかからさらに選択され得る。これに関連して、抗原決定基は、立体配置的または不連続なエピトープであり得る。本明細書に規定されているようなタンパク質またはペプチドの断片(本明細書に規定されているようなタンパク質またはペプチドのアミノ酸配列において不連続であるが、3次元構造において集合しているか、または単一のポリペプチド鎖によって構成されている連続するエピトープもしくは直鎖状のエピトープである)によって構成されている。
ワクチン:ワクチンは、少なくとも1つの抗原または抗原性機能をもたらす予防的または治療的な材料であると、典型的に理解される。抗原または抗原性機能は、身体の適応性免疫系を刺激して、適応免疫応答をもたらし得る。
抗原をもたらすmRNA:本発明に関する抗原をもたらすmRNAは、当該mRNAを備えている細胞または生物によって翻訳され得る少なくとも1つのオープンリーディングフレームを有している、mRNAであり得る。この翻訳の産物は、抗原、好ましくは免疫原として機能し得るペプチドまたはタンパク質である。上記産物はまた、2つ以上の免疫原によって構成されている融合タンパク質(例えば、同じか、または異なるウイルスタンパク質に由来する2つ以上のエピトープ、ペプチドまたはタンパク質)であり得る。ここで、当該エピトープ、ペプチドまたはタンパク質は、リンカー配列によって連結され得る。
二機能性/多機能性mRNA:mRNAは、2(バイシストロン性)またはそれ以上(多シストロン性)のオープンリーディングフレーム(ORF)を有し得る。これに関連して、オープンリーディングフレームは、ペプチドまたはタンパク質に翻訳され得る数個のヌクレオチドトリプレット(コドン)の配列である。そのようなmRNAの翻訳は、(ORFが同一ではない条件のもとに)2(バイシストロン性)またはそれ以上(多シストロン性)の別個の翻訳産物を生じさせる。真核生物における発現にとって、そのようなmRNAは、例えば、内部リボソーム進入部位(IRES)配列を含み得る。
5’キャップ構造:5’キャップ構造は、典型的に、mRNA分子の5’末端に加えられている修飾ヌクレオチド(特にグアニンヌクレオチド)である。好ましくは、5’キャップは、5’−5’−3リン酸結合(m7GpppNとも呼ばれる)を用いて付加される。5’キャップ構造のさらなる例としては、グリセリン、逆位デオキシ脱塩基残基(部分)、4’,5’メチレンヌクレオチド、1−(ベータ−D−エリスロフラノシル)ヌクレオチド、4’−チオヌクレオチド、炭素管式ヌクレオチド、1,5−アンヒドロヘキシトールヌクレオチド、L−ヌクレオチド、アルファ−ヌクレオチド、修飾塩基ヌクレオチド、スレオ−ペントフラノシルヌクレオチド、非環式の3’,4’−セコヌクレオチド、非環式の3,4−ジヒドロブチルヌクレオチド、非環式の3,5ジヒドロキシフェニルヌクレオチド、3’−3’−逆位ヌクレオチド部分、3’−3’−逆位脱塩基ヌクレオチド部分、3’−2’−逆位脱塩基部分、1,4−ブタンジオールホスフェート、3’−ホスホラミダイト、ヘキシルホスフェート、アミノヘキシルホスフェート、3’−ホスフェート、3’ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、または架橋もしくは非架橋のメチルホスホネート部分が挙げられる。これらの修飾5’キャップ構造は、本発明に関連して、発明のmRNA配列を修飾するために使用され得る。本発明に関連して使用され得るさらなる5’キャップ構造は、CAP1(mGpppNの隣接するヌクレオチドのリボースのメチル化)、CAP2(mGpppNから2番目にある下流のヌクレオチドのリボースのメチル化)、CAP3(mGpppNから3番目にある下流のヌクレオチドのリボースのメチル化)、CAP4(mGpppNから4番目にある下流のヌクレオチドのリボースのメチル化)、ARCA(アンチリバースキャップアナログ(anti-reverse CAP ananlog)、修飾ARCA(例えば、ホスホチオネート修飾されているARCA)、イノシン、N1−メチルグアノシン、2’−フルオロ−グアノシン、7−デアザ−グアノシン、8−オキソ−グアノシン、2−アミノグアノシン、LNA−グアノシン、および2−アジド−グアノシンである。
タンパク質の断片:本発明に関連するタンパク質の「断片」は、本来(天然)のタンパク質(またはコードされているその核酸分子)のアミノ酸配列と比べて、そのアミノ酸配列(コードされているその核酸分子)について、N末端および/またはC末端がトランケートされている、本明細書に規定されているようなタンパク質またはペプチドの配列を典型的に含み得る。したがって、そのようなトランケーションは、アミノ酸レベルまたはそれに対応する核酸レベルのいずれかにおいて生じ得る。したがって、本明細書に規定されているような当該断片に対する配列同一性は、本明細書に規定されているようなタンパク質もしくはペプチドの全体、または当該タンパク質もしくはペプチドの全体の(コードしている)核酸分子を、好ましく指し得る。
本発明に関連するタンパク質またはペプチドの断片は、少なくとも5アミノ酸の長さ、好ましくは少なくとも6アミノ酸(好ましくは少なくとも7アミノ酸、より好ましくは少なくとも8アミノ酸、より一層好ましくは少なくとも9アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも10アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも11アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも12アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも13アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも14アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも15アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも16アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも17アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも18アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも19アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも20アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも25アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも30アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも35アミノ酸;より一層好ましくは少なくとも50アミノ酸;または最も好ましくは少なくとも100アミノ酸)の長さを有している、本明細書に規定されているような配列をさらに含み得る。例えば、そのような断片は、約6〜約20またはそれ以上のアミノ酸の長さを有し得る(例えば、MHCクラスI分子によって処理され、提示されるような断片(好ましくは約8〜約10アミノ酸(例えば、8、9または10(または6、7、11または12アミノ酸)))、またはMHCクラスII分子によって処理され、提示されるような断片(好ましくは約13以上のアミノ酸(例えば、13、14、15、16、17、18、19、20またはそれ以上のアミノ酸)))。ここで、これらの断片は、アミノ酸配列の任意の部分から選択され得る。これらの断片は、ペプチド断片およびMHC分子からなる複合体の形態においてT細胞によって典型的に認識される(すなわち、当該断片は、それらの本来の形態において典型的に認識されない)。タンパク質またはペプチドの断片は、それらのタンパク質またはペプチドの少なくとも1つのエピトープを含み得る。さらに、タンパク質の、細胞外ドメイン、細胞内ドメインもしくは膜貫通ドメイン、および短縮されているか、もしくはトランケートされている変形物はまた、タンパク質の断片を含んでいると理解され得る。
タンパク質のバリアント:本発明に関して規定されているような、タンパク質またはペプチドの「バリアント」が、1つ以上の変異(例えば、1つ以上の置換されているアミノ酸、1つ以上の挿入されているアミノ酸、および/または1つ以上の欠失されているアミノ酸)において本来の配列と異なるアミノ酸配列を有して、生成され得る。好ましくは、これらの断片および/またはバリアントは、全長の本来のタンパク質と比べて、同じ生物学的な機能または特定の活性(例えば、特異的な抗原性特性)を有している。本発明に関連して規定されているようなタンパク質またはペプチドの「バリアント」は、それらの本来の(すなわち変異されていない生理学的な)配列と比べて、(複数の)保存的なアミノ酸置換を含み得る。特に、これらのアミノ酸配列およびそれらのコードしている核酸配列は、本明細書に規定されているようなバリアントという用語の範囲にある。同じ種類に由来するアミノ酸が互いに交換される置換は、保存的な置換と呼ばれる。特に、脂肪族側鎖、正もしくは負に荷電している側鎖、側鎖もしくはアミノ酸にある芳香族基、水素結合に加わり得る側鎖(例えば、ヒドロキシル官能基を有している側鎖)を有しているアミノ酸がある。これは、極性側鎖を有しているアミノ酸が、同じく極性側鎖を有している他のアミノ酸によって置き換えられるか、または例えば、疎水性側鎖によって特徴付けられているアミノ酸が、同じく疎水性側鎖によって特徴付けられている他のアミノ酸によって置換(例えば、スレオニン(セリン)によるセリン(スレオニン)またはイソロイシン(ロイシン)によるロイシン(イソロイシン))されることを意味する。挿入および置換は、三次元構造に変化を生じさせないか、結合領域に影響しないこれらの配列位置において起こり得る。(複数の)挿入または置換による三次元構造に対する変化は、CDスペクトル(円偏光二色性スペクトル)(Urry, 1985, Absorption, Circular Dichroism and ORD of Polypeptides, in: Modern Physical Methods in Biochemistry, Neuberger et al. (ed.), Elsevier, Amsterdam)を用いて容易に決定され得る。
タンパク質またはペプチドの「バリアント」は、当該タンパク質またはおよびの10、20、30、50、75または100アミノ酸の範囲の全体にわたって、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%または99%のアミノ酸同一性を有している。
さらに、核酸分子によってコードされ得る、本明細書に規定されているようなタンパク質またはペプチドのバリアントはまた、コード核酸配列のヌクレオチドが遺伝暗号の縮重にしたがって、タンパク質またはペプチドのそれぞれのアミノ酸配列の変化を導くことなく交換されている(すなわち当該アミノ酸配列またはその少なくとも一部が、上述した意味の範囲において本来の配列から、1つ以上の変異において異なり得ない)これらの配列を包含している。
2つの配列(例えば、本明細書に規定されているような複数の核酸配列またはアミノ酸配列(好ましくは本明細書に規定されているような重合性担体の核酸配列によってコードされているアミノ酸配列、またはアミノ酸配列自身))が同一であるパーセンテージを決定するために、上記配列は、後に互いに比較されるために、整列化され得る。したがって、例えば、第1の配列の位置は、第2の配列の対応する位置と比較され得る。第1の配列における位置が、第2の配列における位置にある同じ成分(残基)によって占められている場合、2つの配列は、この位置において同一である。こうではない場合、配列はこの位置において異なる。挿入が、第1の配列と比べて第2の配列に生じている場合、ギャップが第1の配列に挿入されて、さらなる整列化を可能にする。欠失が、第1の配列に比べて第2の配列に生じている場合、ギャップが第1の配列に挿入されて、さらなる整列化を可能にする。それから、2つの配列が同一であることのパーセンテージは、1つの配列のみに占められているこれらの位置を含んでいる位置の総数によって割った同一の位置の数の相関関係である。2つの配列が同一であるパーセンテージは、数学的アルゴリズムを用いて決定され得る。好ましくは、使用され得る数学的アルゴリズムの例は、これらに限定されないが、好ましくは、Karlin et al. (1993), PNAS USA, 90:5873-5877またはAltschulet al. (1997), Nucleic Acids Res., 25:3389-3402のアルゴリズムである。本発明の配列と特定の程度まで同一である配列は、このプログラムによって同定され得る。
タンパク質またはペプチドの誘導体:タンパク質またはペプチドの誘導体は、他の分子(例えば、上記タンパク質またはペプチド)に由来する分子であると典型的に理解される。タンパク質またはペプチドの「誘導体」はまた、本発明に使用されるペプチドまたはタンパク質を含んでいる融合物を包含する。例えば、上記融合物は、標識(例えば、エピトープ(例えば、FLAGエピトープまたはV5エピトープ))を含んでいる。例えば、上記エピトープはFLAGエピトープである。そのようなタグは、例えば融合タンパク質の精製にとって有用である。
モノシストロン性mRNA:モノシストロン性mRNAは、典型的に、1つのオープンリーディングフレームのみをコードしているmRNAであり得る。これに関連してオープンリーディングフレームは、ペプチドまたはタンパク質に翻訳され得る複数のヌクレオチドトリプレット(コドン)の配列である。
核酸:核酸という用語は、任意のDNA分子またはRNA分子を意味し、ポリヌクレオチドと同義に使用される。特定のタンパク質および/またはペプチドをコードしている核酸または核酸配列に言及がなされている場合には、当該核酸または核酸配列のそれぞれはまた、適切な宿主(例えばヒト)におけるその発現(例えば、特定のタンパク質またはペプチドをコードしている上記核酸配列の転写および/または翻訳)を可能にする制御配列を含んでいる。
ペプチド:ペプチドは、アミノ酸単量体の重合体である。通常、そのような単量体は、ペプチド結合によって連結されている。「ペプチド」という用語は、アミノ酸の重合体鎖の長さを限定しない。本発明のいくつかの実施形態において、ペプチドは、例えば、50未満の単量体ユニットを含んでいる。典型的に50〜600の単量体ユニット、より詳細には50〜300の単量体ユニットを有しているより長いペプチドは、ポリペプチドとも呼ばれる。
薬学的に有効な量:本発明に関連して薬学的に有効な量は、免疫応答を誘導するために十分な量であると典型的に理解される。
タンパク質:タンパク質は、典型的に、三次元的な形態に折りたたまれ、生物学的な機能を促進する1つ以上のペプチドおよび/またはポリペプチドからなる。
ポリ(C)配列:ポリ(C)配列は、典型的に、シトシンヌクレオチド、典型的に約10〜約200のシトシンヌクレオチド、好ましくは約10〜約100のシトシンヌクレオチド、より好ましくは約10〜約70のシトシンヌクレオチド、より一層好ましくは約20〜約50のシトシンヌクレオチドまたはさらには約20〜約30のシトシンヌクレオチドの長い配列である。ポリ(C)配列は、核酸によって構成されているコード領域の3’に好ましく配置され得る。
ポリAテイル:「3’ポリ(A)テイル」とも呼ばれるポリAテイルは、典型的に、約400以下のアデノシンヌクレオチド(例えば、約25〜約400、好ましくは約50〜約400、より好ましくは約50〜約300、より一層好ましくは約50〜約250、最も好ましくは約60〜約250のアデノシンヌクレオチド)の、RNAの3’末端に付加されているアデノシンヌクレオチドの長い配列である。
安定化された核酸:安定化された核酸は、典型的に、インビボ分解(例えば、エキソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼによる分解)、および/またはエクスビボ分解(例えば、例えば投与されるワクチン溶液の調製の間における、ワクチン投与の前における製造過程による)に対する耐性を向上させる修飾を示す。RNAの安定化は、例えば5’キャップ構造、ポリAテイルまたは他のUTR修飾を付与することによって、実現され得る。RNAの安定化はまた、核酸の骨格修飾またはG/C含有量の変更によって実現され得る。種々の他の方法は、当該分野において知られており、本発明に関連して理解される。
担体/重合性担体:本発明に関連する担体は、典型的に、他の化合物の輸送および/または複合体化を促進する化合物であり得る。そのような担体は、上記他の化合物と複合体を形成し得る。重合性担体は、重合体から形成されている担体である。
カチオン性成分:「カチオン性成分」という用語は、典型的に約1〜9のpH値、好ましくは9以下(例えば、5〜9)、8以下(例えば、5〜8)、7以下(例えば、5〜7)のpH値、最も好ましくは生理学的pH値(例えば、7.3〜7.4)において正に荷電している、帯電分子(カチオン)を、典型的に指す。したがって、本発明に係るカチオン性のペプチド、タンパク質または重合体は、生理学的な条件下(特にインビボにおける細胞の生理学的な塩の条件)において正に荷電している。カチオン性のペプチドまたはタンパク質は、他のアミノ酸より多数のカチオン性のアミノ酸(例えば、Arg、His、LysまたはOrn)(例えば、AspまたはGluのようなアニオン性のアミノ酸より多くのカチオン性のアミノ酸)、またはカチオン性のアミノ酸残基によって支配的に形成されているブロックを好ましく含んでいる。「カチオン性」の定義は、「ポリカチオン性」の成分をも指す。
ビヒクル:薬学的組成物またはワクチンの成分を個体に投与することを容易にするために、薬学的組成物内において典型的に使用され得る、作用物質(例えば担体)。
3’非翻訳領域(3’UTR):3’UTRは、典型的に、mRNAの、タンパク質をコードしている領域(すなわちオープンリーディングフレーム)およびポリ(A)配列の間に配置されているmRNAの一部である。mRNAの3’UTRは、アミノ酸配列に翻訳されない。3’UTR配列は、遺伝子発現過程の間に、それぞれのmRNAに転写される遺伝子によって一般的にコードされている。ゲノム配列は、付加的なイントロンを含んでいる未成熟mRNAにまず転写される。未成熟mRNAは、それから成熟過程において成熟mRNAにさらに処理される。この成熟過程は、5’キャッピング、付加的なイントロンを切除するための未成熟mRNAのスプライシング、および3’末端の修飾(例えば、未成熟mRNAの3’末端のポリアデニル化)および付加的なエキソヌクレアーゼ切断もしくはエンドヌクレアーゼ切断などを含んでいる。本発明に関連して、3’UTRは、タンパク質をコードしている領域のストップコドンに対する3’に(好ましくはタンパク質をコードしている領域のストップコドンに対する3’に)配置されており、かつポリ(A)配列の5’側に(好ましくはポリ(A)配列に対するすぐ5’にあるヌクレオチドに)伸びている、成熟mRNAの配列に対応する。「対応する」という用語は、3’UTR配列が、例えば3’UTR配列を規定するために使用されるmRNA配列における、RNA配列、または当該RNA配列に対応するDNA配列であり得ることを意味する。本発明に関連して、「遺伝子の3’UTR」(例えば、「アルブミン遺伝子の3’UTR」)は、この遺伝子に由来する成熟mRNA(すなわち上記遺伝子の転写および未成熟mRNAの成熟によって得られるmRNA)の3’UTRに対応する配列である。「遺伝子の3’UTR」という用語は、3’UTRのDNA配列およびRNA配列を包含している。
5’非翻訳領域(5’UTR):5’UTRは、メッセンジャーRNA(mRNA)の特定の部分であると典型的に理解される。5’UTRは、mRNAのオープンリーディングフレームの5’に配置されている。典型的に、5’UTRは、転写開始部位に始まり、オープンリーディングフレームの開始コドンの1ヌクレオチド前で終わる。5’UTRは、遺伝子発現を制御するためのエレメント(制御エレメントとも呼ばれる)を含み得る。当該制御エレメントは、例えば、リボソーム結合部位または5’末端オリゴピリミジントラクトであり得る。5’UTRは、例えば5’キャップの付加によって、転写後に修飾され得る。本発明に関連して、5’UTRは、5’キャップおよび開始コドンの間に配置されている、成熟mRNAの配列に対応する。好ましくは、5’UTRは、5’キャップに対する3’に配置されているヌクレオチド(好ましくは5’キャップに対するすぐ3’に配置されているヌクレオチド)から、タンパク質をコードしている領域の開始コドンに対する5’に配置されているヌクレオチド(好ましくはタンパク質をコードしている開始コドンに対するすぐ5’に配置されているヌクレオチド)まで伸びている配列に対応する。成熟mRNAの5’キャップに対するすぐ3’に配置されているヌクレオチドは、転写開始部位に対応する。「対応する」という用語は、5’UTR配列が、例えば5’UTR配列を規定するために使用されるmRNAにある、RNA配列、または当該RNA配列に対応するDNA配列であり得ることを意味する。本発明に関連して、「遺伝子の5’UTR」(例えば「TOP遺伝子の5’UTR」)という用語は、この遺伝子に由来する成熟mRNA(すなわち遺伝子の転写および未成熟mRNAの成熟によって得られるmRNA)の5’UTRに対応する配列である。「遺伝子の5’UTR」という用語は、5’UTRのDNA配列およびRNA配列を包含している。
5’末端オリゴピリミジントラクト(TOP):5’末端オリゴピリミジントラクト(TOP)は、典型的に、核酸分子の5’末端領域(例えば、あるmRNA分子の5’末端領域)、またはある遺伝子の機能的な全体(例えば転写される領域)の5’末端領域に配置されているピリミジンヌクレオチドのストレッチ(stretch)である。上記配列は、転写開始部位に一般的に対応するシチジン始まり、当該配列の後に約3〜30のピリミジンヌクレオチドのストレッチが続く。例えば、TOPは、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30またはそれ以上のヌクレオチドを含み得る。ピリミジンのストレッチ、およびしたがって5’TOPは、TOPの下流に配置されている最初のプリンヌクレオチドに対する5’の1ヌクレオチドで終わる。5’末端オリゴピリミジントラクトを含んでいるメッセンジャーRNAは、TOP mRNAとしばしば呼ばれる。したがって、当該メッセンジャーRNAをもたらす遺伝子は、TOP遺伝子と呼ばれる。TOP配列は、ペプチド伸長因子およびリボソームタンパク質をコードしている遺伝子およびmRNAに見られる。
TOPモチーフ:本発明に関連して、TOPモチーフは、以上に規定されているような5’TOPに対応する核酸配列である。したがって、本発明に関連するTOPモチーフは、好ましくは、3〜30ヌクレオチドの長さを有しているピリミジンヌクレオチドのストレッチである。好ましくは、TOPモチーフは、少なくとも3のピリミジンヌクレオチド、好ましくは少なくとも4のピリミジンヌクレオチド、好ましくは少なくとも5のピリミジンヌクレオチド、より好ましくは少なくとも6のピリミジンヌクレオチド、より好ましくは少なくとも7のピリミジンヌクレオチド、最も好ましくは少なくとも8のピリミジンヌクレオチドからなる。ここで、ピリミジンヌクレオチドの上記ストレッチは、シトシンヌクレオチドをともなうその5’に好ましく始まる。TOP遺伝子およびTOP mRNAにおいて、TOPモチーフは、好ましくは、転写開始部位をともなうその5’末端に始まり、上記遺伝子またはmRNAにおける最初のプリン残基に対する5’にある1ヌクレオチドで終わる。本発明の意味において、TOPモチーフは、5’UTRを表す配列の5’末端、または5’UTRをコードしている配列の5’末端に好ましく配置されている。したがって、好ましくは、3以上のピリミジンヌクレオチドのストレッチは、当該ストレッチがそれぞれの配列(例えば本発明のmRNA)の5’末端に配置されている場合に、本発明の意味において、いわゆる「TOPモチーフ」、本発明のmRNAの5’UTRエレメント、または本明細書に記載されているようなTOP遺伝子の5’UTRに由来する核酸配列である。言い換えれば、5’UTRまたは5’UTRエレメントの5’末端に配置されておらず、5’UTRまたは5’UTRエレメントの範囲のいずれかにある3以上のピリミジンヌクレオチドのストレッチは、好ましくは、「TOPモチーフ」と呼ばれない。
TOP遺伝子:TOP遺伝子は、5’末端オリゴピリミジントラクトによって典型的に特徴付けられる。さらに、ほとんどのTOP遺伝子は、成長と関連する転写制御によって特徴付けられる。しかし、組織特異的な転写制御をともなうTOP遺伝子がまた、知られている。以上に規定されている通り、TOP遺伝子の5’UTRは、好ましくは5’キャップに対する3’に配置されているヌクレオチドから、開始コドンに対する5’に配置されているヌクレオチドまで伸びている、TOP遺伝子に由来する成熟mRNAの5’UTRの配列に対応する。TOP遺伝子の5’UTRは、任意の開始コドンを典型的に含んでおらず、好ましくは上流のAUG(uAUG)または上流のオープンリーディングフレーム(uORF)がない。これらにおいて、上流のAUGおよび上流のオープンリーディングフレームは、翻訳されるべきオープンリーディングフレームの開始コドン(AUG)の5’に存在するAUGおよびオープンリーディングフレームであると典型的に理解される。TOP遺伝子の5’UTRはむしろ一般的に短い。TOP遺伝子の5’UTRの長さは、20ヌクレオチド〜500ヌクレオチドの間において変化し得、典型的に約200ヌクレオチド未満、好ましくは約150ヌクレオチド未満、より好ましくは約100ヌクレオチド未満である。本発明の意味においてTOP遺伝子の例示的な5’UTRは、特許出願PCT/EP2012/002448WO2013/143700(参照によって本明細書に組み込まれる)の配列番号1〜1363、配列番号1395、配列番号1421および配列番号14221〜1363にしたがう配列、またはその相同物もしくはバリアントにおいて、5位のヌクレオチドから、開始コドン(例えばATG)に対してすぐ5’に配置されているヌクレオチドまで伸びている核酸配列である。これに関連して、TOP遺伝子の特に好ましい断片は、5’TOPモチーフを欠いているTOP遺伝子の5’UTRである。「TOP遺伝子の5’UTR」という用語は、天然に存在するTOP遺伝子の5’UTRを好ましく指す。
核酸配列(特にmRNA)の断片:核酸配列の断片は、当該断片の核酸配列にとっての基準である全長核酸配列におけるヌクレオチドの連続するストレッチに対応する、ヌクレオチドの連続するストレッチからなり、当該全長核酸配列の、少なくとも20%、好ましくは少なくとも30%、より好ましくは少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%、より一層好ましくは少なくとも60%、より一層好ましくは少なくとも70%、より一層好ましくは少なくとも80%、最も好ましくは少なくとも90%を示す。本発明の意味において、好ましくは、当該断片は、全長核酸配列の核酸配列の機能的な断片である。
核酸配列(特にmRNA)のバリアント:核酸配列のバリアントは、核酸配列の基準を形成する核酸配列のバリアントを指す。例えば、バリアントの核酸配列は、当該バリアントが由来する核酸配列と比べて、1つ以上のヌクレオチドの欠失、挿入、付加および/または置換を示し得る。好ましくは、核酸配列のバリアントは、当該バリアントが由来する核酸配列に対して、少なくとも40%、好ましくは少なくとも50%、より好ましくは少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より一層好ましくは少なくとも80%、より一層好ましくは少なくとも90%、最も好ましくは少なくとも95%同一である。好ましくは、バリアントは機能的なバリアントである。核酸配列の「バリアント」は、当該核酸配列の10、20、30、50、75または100ヌクレオチドのストレッチの全体にわたって、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%または99%のヌクレオチド同一性を有し得る。
核酸配列の相同物:核酸配列の「相同物」という用語は、特定の配列以外の、他の種の配列を指す。核酸配列は、ヒト由来であることが特に好ましく、したがって、相同物はヒトの核酸配列の相同物であることが好ましい。
ジェットインジェクション:本明細書に使用されるとき「ジェットインジェクション」という用語は、針を使用しない注入方法を指し、ここで、少なくとも1つの本発明のmRNA配列および任意にさらなる好適な賦形剤を含んでいる液体が、開口部を押し通され、このようにして哺乳類の皮膚、および注入の設定に依存して皮下組織もしくは筋組織を貫通可能な高圧の超微細な流体流を生成させる。基本的に、流体流は、流体流が標的組織に押し込まれる皮膚に穴を形成する。好ましくは、ジェットインジェクションは、本発明に係るmRNA配列の皮内注入、皮下注入または筋肉内注入に使用される。好ましい実施形態において、ジェットインジェクションは、本発明のmRNAの皮内注入に使用される。
本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域を含んでいるmRNA配列が、抗原特異的な免疫応答を誘導し、したがって呼吸器合胞体ウイルス(RSV)感染を、予防するか、もしくは少なくとも最小化するという、本発明者らの意外な発見に基づく。本発明のmRNA配列が、ウイルス全体からなる不活性化RSVに基づくワクチンと比べて、少なくとも同様の免疫応答を誘導することは、非常に意外であった。より一層意外なことに、RSVの抗原タンパク質をコードしている本発明のmRNA配列は、不活性化RSVに基づくワクチンと対照的に、抗原特異的なCD8+−T細胞を誘導した。さらに、コットンラットのRSV抗原投与モデルにおいて、mRNAをワクチン接種した動物の鼻および肺におけるウイルス力価は、不活性化RSVウイルスに基づくワクチンを用いてワクチン接種した動物と比べて、非常に低かった。安全性について、本発明者らは、mRNAに基づくRSVワクチンがワクチンを介した疾患亢進に関する徴候を、ホルマリン不活性化ウイルスに基づくワクチンと比べて、肺病理に関してまったく示さないことを示し得た。さらに、意外にも、本発明のmRNA配列を用いた単独かつ単回のワクチン接種はすでに、投与された(複数の)抗原に対する免疫応答を誘起するために十分であることが、本発明者らによって見出されている。好ましくは皮内注入または筋肉内注入による、本発明のmRNAの単独かつ単回のワクチン接種は、RSVウイルスを用いた抗原投与後の肺におけるウイルス力価の低下に非常に有効であることが、見出されている。
まとめると、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つのペプチドまたはタンパク質をコードしているコード領域を含んでいる、本発明のmRNAは、特に乳児、老人および免疫障害のある患者にとって、有効かつ安全なワクチンを提供し得る。
これに関連して、本発明のmRNA配列は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼ(large polymerase)L、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1もしくは非構造タンパク質NS2、またはその断片、バリアントもしくは誘導体に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域を含んでいることが、特に好ましい。
本発明の第1の局面に係る本発明のmRNAのコード領域は、モノ、バイまたはマルチ−シストロン性のmRNA(すなわち1、2またはそれ以上のタンパク質またはペプチドのコード領域を保有しているmRNA)として存在する。モノ、バイまたはマルチ−シストロン性のmRNAにおいて、そのようなコード領域は、例えば本明細書に記載されているような、少なくとも1つの内部リボソーム進入部位(IRES)、またはいくつかのタンパク質もしくはペプチドを含んでいる結果として生じるポリペプチドを誘導するシグナルペプチドによって分離され得る。
本発明の第1の局面によれば、本発明のmRNAは、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメーラゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1もしくは非構造タンパク質NS2、またはその断片、バリアントもしくは誘導体に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域を含んでいる。本発明の第1の局面の特に好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、核タンパク質NもしくはM2−1タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域を含んでいる。
これに関連して、少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質のアミノ酸配列は、任意のRSV単離物の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短いタンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1もしくは非構造タンパク質NS2に由来する任意のペプチドまたはタンパク質から、または合成的に改変されたRSVペプチドもしくはRSVタンパク質から、またはその断片、バリアントもしくは誘導体から選択され得る。
特定の実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1または非構造タンパク質NS2の全長タンパク質は、本発明のmRNAに含まれているコード領域によってコードされている。
これに関連して、融合タンパク質Fおよび核タンパク質Nからの全長タンパク質が特に好ましい。さらに、細胞質尾部の欠失を有しているFタンパク質の変異体が特に好ましい。そのような変異体の例は、Oomens et al. 2006. J. Virol. 80(21):10465-77に係るRSV−Fdel 554−574 longタンパク質である。
特に好ましいさらなる実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1または非構造タンパク質NS2の少なくとも1つのエピトープを含んでいる断片は、本発明のmRNAに含まれているコード領域によってコードされている。
特に好ましいのは、NCBIアクセション番号AY911262にしたがう、RSV株 long(ATCC VR−26)のアミノ酸配列である。
RSV株ATCC VR−26 longの融合タンパク質F:
配列番号1にしたがうアミノ酸配列:
MELPILKANA ITTILAAVTF CFASSQNITE EFYQSTCSAV SKGYLSALRT GWYTSVITIE LSNIKENKCN GTDAKVKLIN QELDKYKNAV TELQLLMQST TAANNRARRE LPRFMNYTLN NTKKTNVTLS KKRKRRFLGF LLGVGSAIAS GIAVSKVLHL EGEVNKIKSA LLSTNKAVVS LSNGVSVLTS KVLDLKNYID KQLLPIVNKQ SCRISNIETV IEFQQKNNRL LEITREFSVN AGVTTPVSTY MLTNSELLSL INDMPITNDQ KKLMSNNVQI VRQQSYSIMS IIKEEVLAYV VQLPLYGVID TPCWKLHTSP LCTTNTKEGS NICLTRTDRG WYCDNAGSVS FFPQAETCKV QSNRVFCDTM NSLTLPSEVN LCNVDIFNPK YDCKIMTSKT DVSSSVITSL GAIVSCYGKT KCTASNKNRG IIKTFSNGCD YVSNKGVDTV SVGNTLYYVN KQEGKSLYVK GEPIINFYDP LVFPSDEFDA SISQVNEKIN QSLAFIRKSDELLHHVNAGK STTNIMITTI IIVIIVILLS LIAVGLLLYC KARSTPVTLS KDQLSGINNI AFSN。
RSV株ATCC VR−26 longの糖タンパク質G:
配列番号2にしたがうアミノ酸配列:
MSKNKDQRTA KTLEKTWDTL NHLLFISSGL YKLNLKSIAQ ITLSILAMII STSLIITAII FIASANHKVT LTTAIIQDAT SQIKNTTPTY LTQDPQLGIS FSNLSEITSQ TTTILASTTP GVKSNLQPTT VKTKNTTTTQ TQPSKPTTKQ RQNKPPNKPN NDFHFEVFNF VPCSICSNNP TCWAICKRIP NKKPGKKTTT KPTKKPTFKT TKKDLKPQTT KPKEVPTTKP TEEPTINTTK TNITTTLLTN NTTGNPKLTS QMETFHSTSS EGNLSPSQVS TTSEHPSQPS SPPNTTRQ。
RSV株ATCC VR−26 longの短い疎水性タンパク質HS:
配列番号3にしたがうアミノ酸配列:
MENTSITIEF SSKFWPYFTL IHMITTIISL LIIISIMTAI LNKLCEYNVF HNKTFELPRA RVNT。
RSV株ATCC VR−26 longのマトリクスタンパク質M:
配列番号4にしたがうアミノ酸配列:
METYVNKLHE GSTYTAAVQY NVLEKDDDPA SLTIWVPMFQ SSMPADLLIK ELANVNILVK QISTPKGPSL RVMINSRSAL LAQMPSKFTI CANVSLDERS KLAYDVTTPC EIKACSLTCL KSKNMLTTVK DLTMKTLNPT HDIIALCEFE NIVTSKKVII PTYLRSISVR NKDLNTLENI TTTEFKNAIT NAKIIPYSGL LLVITVTDNK GAFKYIKPQS QFIVDLGAYL EKESIYYVTT NWKHTATRFA IKPMED。
RSV株ATCC VR−26 longの核タンパク質N:
配列番号5にしたがうアミノ酸配列:
MALSKVKLND TLNKDQLLSS SKYTIQRSTG DSIDTPNYDV QKHINKLCGM LLITEDANHK FTGLIGMLYA MSRLGREDTI KILRDAGYHV KANGVDVTTH RQDINGKEMK FEVLTLASLT TEIQINIEIE SRKSYKKMLK EMGEVAPEYR HDSPDCGMII LCIAALVITK LAAGDRSGLT AVIRRANNVL KNEMKRYKGL LPKDIANSFY EVFEKHPHFI DVFVHFGIAQ SSTRGGSRVE GIFAGLFMNA YGAGQVMLRW GVLAKSVKNI MLGHASVQAE MEQVVEVYEY AQKLGGEAGF YHILNNPKAS LLSLTQFPHF SSVVLGNAAG LGIMGEYRGT PRNQDLYDAA KAYAEQLKEN
GVINYSVLDL TAEELEAIKH QLNPKDNDVE L。
RSV株ATCC VR−26 longのラージポリメラーゼL:
配列番号6にしたがうアミノ酸配列:
MDPIINGNSA NVYLTDSYLK GVISFSECNA LGSYIFNGPY LKNDYTNLIS RQNPLIEHMN LKKLNITQSL ISKYHKGEIK LEEPTYFQSL LMTYKSMTSL EQIATTNLLK KIIRRAIEIS DVKVYAILNK LGLKEKDKIK SNNGQDEDNS VITTIIKDDI LSAVKDNQSH LKADKNHSTK QKDTIKTTLL KKLMCSMQHP PSWLIHWFNL YTKLNNILTQ YRSNEVKNHG FILIDNQTLS GFQFILNQYG CIVYHKELKR ITVTTYNQFL TWKDISLSRL NVCLITWISN CLNTLNKSLG LRCGFNNVIL TQLFLYGDCI LKLFHNEGFY IIKEVEGFIM SLILNITEED QFRKRFYNSM LNNITDAANK AQKNLLSRVC HTLLDKTVSD NIINGRWIIL LSKFLKLIKL AGDNNLNNLS ELYFLFRIFG HPMVDERQAM DAVKVNCNET KFYLLSSLSM LRGAFIYRII KGFVNNYNRW PTLRNAIVLP LRWLTYYKLN TYPSLLELTERDLIVLSGLR FYREFRLPKK VDLEMIINDK AISPPKNLIW TSFPRNYMPS HIQNYIEHEK LKFSESDKSR RVLEYYLRDN KFNECDLYNC VVNQSYLNNP NHVVSLTGKE RELSVGRMFA MQPGMFRQVQ ILAEKMIAEN ILQFFPESLT RYGDLELQKI LELKAGISNK SNRYNDNYNN YISKCSIITD LSKFNQAFRY ETSCICSDVL DELHGVQSLF SWLHLTIPHV TIICTYRHAP PYIRDHIVDL NNVDEQSGLY RYHMGGIEGW CQKLWTIEAI SLLDLISLKG KFSITALING DNQSIDISKP VRLMEGQTHA QADYLLALNS LKLLYKEYAG IGHKLKGTET YISRDMQFMS KTIQHNGVYY PASIKKVLRV GPWINTILDD FKVSLESIGS LTQELEYRGE SLLCSLIFRN VWLYNQIALQ LKNHAL
CNNK LYLDILKVLK HLKTFFNLDN IDTALTLYMN LPMLFGGGDP NLLYRSFYRR TPDFLTEAIV HSVFILSYYT NHDLKDKLQD LSDDRLNKFL TCIITFDKNP NAEFVTLMRD PQALGSERQA KITSEINRLA VTEVLSTAPN KIFSKSAQHY TTTEIDLNDI MQNIEPTYPH GLRVVYESLP FYKAEKIVNL ISGTKSITNI LEKTSAIDLT DIDRATEMMR KNITLLIRIL PLDCNRDKRE ILSMENLSIT ELSKYVRERS WSLSNIVGVT SPSIMYTMDI KYTTSTIASG IIIEKYNVNS LTRGERGPTK PWVGSSTQEK KTMPVYNRQV LTKKQRDQID LLAKLDWVYA SIDNKDEFMEELSIGTLGLT YEKAKKLFPQ YLSVNYLHRL TVSSRPCEFP ASIPAYRTTN YHFDTSPINR ILTEKYGDED IDIVFQNCIS FGLSLMSVVE QFTNVCPNRI ILIPKLNEIH LMKPPIFTGD VDIHKLKQVI QKQHMFLPDK ISLTQYVELF LSNKTLKSGS HVNSNLILAH KISDYFHNTY ILSTNLAGHW ILIIQLMKDS KGIFEKDWGE GYITDHMFIN LKVFFNAYKT YLLCFHKGYG KAKLECDMNT SDLLCVLELI DSSYWKSMSK VFLEQKVIKY ILSQDASLHR VKGCHSFKLW FLKRLNVAEF TVCPWVVNID YHPTHMKAIL TYIDLVRMGL INIDRIHIKN KHKFNDEFYT SNLFYINYNF SDNTHLLTKH IRIANSELEN NYNKLYHPTP ETLENILANP IKSNDKKTLN DYCIGKNVDS IMLPLLSNKK LVKSSAMIRT NYSKQDLYNL FPTVVIDRII DHSGNTAKSN QLYTTTSHQI SLVHNSTSLY CMLPWHHINR FNFVFSSTGC KISIEYILKD LKIKDPNCIA FIGEGAGNLL LRTVVELHPD IRYIYRSLKD CNDHSLPIEF LRLYNGHINI DYGENLTIPA TDATNNIHWS YLHIKFAEPI SLFVCDAELP VTVNWSKIII EWSKHVRKCK YCSSVNKCTL IVKYHAQDDI DFKLDNITIL KTYVCLGSKL KGSEVYLVLT IGPANIFPVF NVVQNAKLIL SRTKNFIMPK KADKESIDAN IKSLIPFLCY PITKKGINTA LSKLKSVVSG DILSYSIAGR NEVFSNKLIN HKHMNILKWFNHVLNFRSTE LNYNHLYMVE STYPYLSELL NSLTTNELKK LIKITGSLLY NFHNE。
RSV株ATCC VR−26 longのM2−1タンパク質:
配列番号7にしたがうアミノ酸配列:
MSRRNPCKFE IRGHCLNGKR CHFSHNYFEW PPHALLVRQN FMLNRILKSM DKSIDTLSEI SGAAELDRTE EYALGVVGVL ESYIGSINNI TKQSACVAMS KLLTELNSDD IKKLRDNEEL NSPKIRVYNT VISYIESNRK NNKQTIHLLK RLPADVLKKT IKNTLDIHKS ITINNPKELT VSDTNDHAKN NDTT。
RSV株ATCC VR−26 longのM2−2タンパク質:
配列番号8にしたがうアミノ酸配列:
MTMPKIMILP DKYPCSITSI LITSRCRVTM YNRKNTLYFN QNNPNNHMYS PNQTFNEIHW TSQDLIDTIQ NFLQHLGVIE DIYTIYILVS。
RSV株ATCC VR−26 longのリン酸タンパク質P:
配列番号9にしたがうアミノ酸配列:
MEKFAPEFHG EDANNRATKF LESIKGKFTS PKDPKKKDSI ISVNSIDIEV TKESPITSNS TIINPTNETD DNAGNKPNYQ RKPLVSFKED PIPSDNPFSK LYKETIETFD NNEEESSYSY EEINDQTNDN ITARLDRIDE KLSEILGMLH TLVVASAGPT SARDGIRDAM VGLREEMIEK IRTEALMTND RLEAMARLRN EESEKMAKDT SDEVSLNPTS EKLNNLLEGN DSDNDLSLED F。
RSV株ATCC VR−26 longの非構造タンパク質NS−1:
配列番号10にしたがうアミノ酸配列:
MGSNSLSMIK VRLQNLFDND EVALLKITCY TDKLIHLTNA LAKAVIHTIK LNGIVFVHVI TSSDICPNNN IVVKSNFTTM PVLQNGGYIW EMMELTHCSQ PNGLIDDNCE IKFSKKLSDS TMTNYMNQLS ELLGFDLNP。
RSV株ATCC VR−26 longの非構造タンパク質NS−2:
配列番号11にしたがうアミノ酸配列:
MDTTHNDTTP QRLMITDMRP LSLETTITSL TRDIITHRFI YLINHECIVR KLDERQATFT FLVNYEMKLL HKVGSTKYKK YTEYNTKYGT FPMPIFINHD GFLECIGIKP TKHTPIIYKY DLNP。
本発明に関連して、本明細書に開示されている配列番号1〜11にしたがうアミノ酸配列に加えて、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の異なる単離物のアミノ酸配列はまた、本発明にしたがって使用され得、本明細書に組み込まれる。呼吸器合胞体ウイルス(RSV)のこれらの単離物は、配列番号1〜11にしたがうアミノ酸配列と、少なくとも70%、より好ましくは少なくとも805、最も好ましくは少なくとも90%の同一性を好ましく示す。
さらにこれに関連して、融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1、もしくは非構造タンパク質NS2、またはその断片、バリアントもしくは誘導体に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の任意の単離物、またはその断片もしくはバリアントに由来するコード領域を含んでいる核酸配列から選択され得る。
特に好ましいのは、NCBIアクセション番号AY911262にしたがう、RSV株 long(ATCC VR−26)のコード領域の野生型mRNA配列である。
RSV株ATCC VR−26 longの融合タンパク質FをコードしているmRNA:
配列番12にしたがうmRNA配列:
auggaguugccaauccucaaagcaaaugcaauuaccacaauccucgcugcagucacauuuugcuuugcuucuagucaaaacaucacugaagaauuuuaucaaucaacaugcagugcaguuagcaaaggcuaucuuagugcucuaagaacugguugguauacuaguguuauaacuauagaauuaaguaauaucaaggaaaauaaguguaauggaacagaugcuaagguaaaauugauaaaccaagaauuagauaaauauaaaaaugcuguaacagaauugcaguugcucaugcaaagcacaacagcagcaaacaaucgagccagaagagaacuaccaagguuuaugaauuauacacucaacaauaccaaaaaaaccaauguaacauuaagcaagaaaaggaaaagaagauuucuugguuuuuuguuagguguuggaucugcaaucgccaguggcauugcuguaucuaagguccugcacuuagaaggagaagugaacaagaucaaaagugcucuacuauccacaaacaaggccguagucagcuuaucaaauggaguuagugucuuaaccagcaaaguguuagaccucaaaaacuauauagauaaacaauuguuaccuauugugaauaagcaaagcugcagaauaucaaauauagaaacugugauagaguuccaacaaaagaacaacagacuacuagagauuaccagggaauuuaguguuaaugcagguguaacuacaccuguaagcacuuacauguuaacuaauagugaauuauugucauuaaucaaugauaugccuauaacaaaugaucagaaaaaguuaauguccaacaauguucaaauaguuagacagcaaaguuacucuaucauguccauaauaaaagaggaagucuuagcauauguaguacaauuaccacuauauggugugauagauacaccuuguuggaaauuacacacauccccucuauguacaaccaacacaaaagaagggucaaacaucuguuuaacaagaacugacagaggaugguacugugacaaugcaggaucaguaucuuucuucccacaagcugaaacauguaaaguucaaucgaaucgaguauuuugugacacaaugaacaguuuaacauuaccaagugaaguaaaucucugcaauguugacauauucaaucccaaauaugauuguaaaauuaugacuucaaaaacagauguaagcagcuccguuaucacaucucuaggagccauugugucaugcuauggcaaaacuaaauguacagcauccaauaaaaaucguggaaucauaaagacauuuucuaacgggugugauuauguaucaaauaaagggguggacacugugucuguagguaacacauuauauuauguaaauaagcaagaaggcaaaagucucuauguaaaaggugaaccaauaauaaauuucuaugacccauuaguauuccccucugaugaauuugaugcaucaauaucucaagucaaugagaagauuaaccagaguuuagcauuuauucguaaauccgaugaauuauuacaucauguaaaugcugguaaaucaaccacaaauaucaugauaacuacuauaauuauagugauuauaguaauauuguuaucauuaauugcuguuggacugcuccuauacuguaaggccagaagcacaccagucacacuaagcaaggaucaacugagugguauaaauaauauugcauuuaguaacuga。
RSV株ATCC VR−26 longの糖タンパク質GをコードしているmRNA:
配列番号13にしたがうmRNA配列:
auguccaaaaacaaggaccaacgcaccgcuaagacacuagaaaagaccugggacacucucaaucauuuauuauucauaucaucgggcuuauauaaguuaaaucuuaaaucuauagcacaaaucacauuauccauucuggcaaugauaaucucaacuucacuuauaauuacagccaucauauucauagccucggcaaaccacaaagucacacuaacaacugcaaucauacaagaugcaacaagccagaucaagaacacaaccccaacauaccucacucaggauccucagcuuggaaucagcuucuccaaucugucugaaauuacaucacaaaccaccaccauacuagcuucaacaacaccaggagucaagucaaaccugcaacccacaacagucaagacuaaaaacacaacaacaacccaaacacaacccagcaagcccacuacaaaacaacgccaaaacaaaccaccaaacaaacccaauaaugauuuucacuucgaaguguuuaacuuuguacccugcagcauaugcagcaacaauccaaccugcugggcuaucugcaaaagaauaccaaacaaaaaaccaggaaagaaaaccaccaccaagccuacaaaaaaaccaaccuucaagacaaccaaaaaagaucucaaaccucaaaccacuaaaccaaaggaaguacccaccaccaagcccacagaagagccaaccaucaacaccaccaaaacaaacaucacaacuacacugcucaccaacaacaccacaggaaauccaaaacucacaagucaaauggaaaccuuccacucaaccuccuccgaaggcaaucuaagcccuucucaagucuccacaacauccgagcacccaucacaacccucaucuccacccaacacaacacgccaguag。
RSV株ATCC VR−26 longの短い疎水性タンパク質をコードしているmRNA:
配列番号14にしたがうmRNA配列:
auggaaaauacauccauaacaauagaauucucaagcaaauucuggccuuacuuuacacuaauacacaugaucacaacaauaaucucuuugcuaaucauaaucuccaucaugacugcaauacuaaacaaacuuugugaauauaacguauuccauaacaaaaccuuugaguuaccaagagcucgagucaacacauag。
RSV株ATCC VR−26 longのマトリクスタンパク質MをコードしているmRNA:
配列番号15にしたがうmRNA配列:
auggaaacauacgugaacaagcuucacgaaggcuccacauacacagcugcuguucaauacaauguccuagaaaaagacgaugacccugcaucacuuacaauaugggugcccauguuccaaucaucuaugccagcagauuuacuuauaaaagaacuagcuaaugucaacauacuagugaaacaaauauccacacccaagggaccuucacuaagagucaugauaaacucaagaagugcauugcuagcacaaaugcccagcaaauuuaccauaugugcuaauguguccuuggaugaaagaagcaaacuggcauaugauguaaccacacccugugaaaucaaggcauguagucuaacaugccuaaaaucaaaaaauauguuaacuacaguuaaagaucucacuaugaagacacucaaccccacacaugauauuauugcuuuaugugaauuugaaaacauaguaacaucaaaaaaagucauaauaccaacauaccuaagauccaucagugucagaaauaaagaucugaacacacuugaaaauauaacaaccacugaauucaaaaaugccaucacaaaugcaaaaaucaucccuuacucaggauuacuauuagucaucacagugacugacaacaaaggagcauucaaauacauaaagccgcaaagucaauucauaguagaucuuggagcuuaccuagaaaaagaaaguauauauuauguuaccacaaauuggaagcacacagcuacacgauuugcaaucaaacccauggaagauuaa。
RSV株ATCC VR−26 longの核タンパク質NをコードしているmRNA:
配列番号16にしたがうmRNA配列:
auggcucuuagcaaagucaaguugaaugauacacucaacaaagaucaacuucugucaucuagcaaauacaccauccaacggagcacaggagauaguauugauacuccuaauuaugaugugcagaaacacaucaauaaguuauguggcauguuauuaaucacagaagaugcuaaucauaaauucacuggguuaauagguauguuauaugcuaugucuagguuaggaagagaagacaccauaaaaauacucagagaugcgggauaucauguaaaagcaaauggaguagauguaacaacacaucgucaagacaucaaugggaaagaaaugaaauuugaaguguuaacauuggcaagcuuaacaacugaaauucaaaucaacauugagauagaaucuagaaaauccuacaaaaaaaugcuaaaagaaaugggagagguagcuccagaauacaggcaugauucuccugauugugggaugauaauauuauguauagcagcauuaguaauaaccaaauuggcagcaggggauagaucuggucuuacagccgugauuaggagagcuaauaauguccuaaaaaaugaaaugaaacguuacaaaggcuuacuacccaaggauauagccaacagcuucuaugaaguguuugaaaaacauccccacuuuauagauguuuuuguucauuuugguauagcacaaucuuccaccagagguggcaguagaguugaagggauuuuugcaggauuguuuaugaaugccuauggugcagggcaaguaaugcuacgguggggagucuuagcaaaaucaguuaaaaauauuauguuaggacaugcuagugugcaagcagaaauggaacaaguuguugagguuuaugaauaugcccaaaaauuggguggagaagcaggauucuaccauauauugaacaacccaaaagcaucauuauuaucuuugacucaauuuccucacuuuuccaguguaguauuaggcaaugcugcuggccuaggcauaaugggagaguacagagguacaccgaggaaucaagaucuauaugaugcagcaaaggcauaugcugaacaacucaaagaaaauggugugauuaacuacaguguauuagacuugacagcagaagaacuagaggcuaucaaacaucagcuuaauccaaaagauaaugauguagagcuuuga。
RSV株ATCC VR−26 longのラージポリメラーゼLをコードしているmRNA:
配列番号17にしたがうmRNA配列:
auggaucccauuauuaauggaaauucugcuaauguuuaucuaaccgauaguuauuuaaaagguguuaucucuuucucagaguguaaugcuuuaggaaguuacauauucaaugguccuuaucucaaaaaugauuauaccaacuuaauuaguagacaaaauccauuaauagaacacaugaaucuaaagaaacuaaauauaacacaguccuuaauaucuaaguaucauaaaggugaaauaaaauuagaagagccuacuuauuuucagucauuacuuaugacauacaagaguaugaccucguuggaacagauugcuaccacuaauuuacuuaaaaagauaauaagaagagcuauagaaauaagugaugucaaagucuaugcuauauugaauaaacuagggcuuaaagaaaaggacaagauuaaauccaacaauggacaggaugaagacaacucaguuauuacgaccauaaucaaagaugauauacuuucagcuguuaaggauaaucaaucucaucuuaaagcagacaaaaaucacucuacaaaacaaaaagacacaaucaaaacaacacucuugaagaaauuaauguguucaaugcagcauccuccaucaugguuaauacauugguuuaauuuauacacaaaauuaaacaacauauuaacacaguaucgaucaaaugagguuaaaaaccauggguuuauauugauagauaaucaaacucuuaguggauuucaauuuauuuugaaucaauaugguuguauaguuuaucauaaggaacucaaaagaauuacugugacaaccuauaaucaauucuugacauggaaagauauuagccuuaguagauuaaauguuuguuuaauuacauggauuaguaacugcuugaacacauuaaauaaaagcuuaggcuuaagaugcggauucaauaauguuaucuugacacaacuauuccuuuauggugauuguauacuaaagcuauuucacaaugagggguucuacauaauaaaagagguagagggauuuauuaugucucuaauuuuaaauauaacagaagaagaucaauucagaaaacgauuuuauaauaguaugcucaacaacaucacagaugcugcuaauaaagcucagaaaaaucugcuaucaagaguaugucauacauuauuagauaagacaguauccgauaauauaauaaauggcagauggauaauucuauuaaguaaguuccuuaaauuaauuaagcuugcaggugacaauaaccuuaacaaucugagugaacuauauuuuuuguucagaauauuuggacacccaaugguagaugaaagacaagccauggaugcuguuaaaguuaauugcaaugagaccaaauuuuacuuguuaagcaguuugaguauguuaagaggugccuuuauauauagaauuauaaaaggguuuguaaauaauuacaacagauggccuacuuuaagaaaugcuauuguuuuacccuuaagaugguuaacuuacuauaaacuaaacacuuauccuucuuuguuggaacuuacagaaagagauuugauuguguuaucaggacuacguuucuaucgugaguuucgguugccuaaaaaaguggaucuugaaaugauuauaaaugauaaagcuauaucacccccuaaaaauuugauauggacuaguuucccuagaaauuauaugccgucacacauacaaaacuauauagaacaugaaaaauuaaaauuuuccgagagugauaaaucaagaagaguauuagaguauuauuuaagagauaacaaauucaaugaaugugauuuauacaacuguguaguuaaucaaaguuaucucaacaacccuaaucaugugguaucauugacaggcaaagaaagagaacucaguguagguagaauguuugcaaugcaaccgggaauguucagacagguucaaauauuggcagagaaaaugauagcugaaaacauuuuacaauucuuuccugaaagucuuacaagauauggugaucuagaacuacaaaaaauauuagaauugaaagcaggaauaaguaacaaaucaaaucgcuacaaugauaauuacaacaauuacauuaguaagugcucuaucaucacagaucucagcaaauucaaucaagcauuucgauaugaaacgucauguauuuguagugaugugcuggaugaacugcaugguguacaaucucuauuuuccugguuacauuuaacuauuccucaugucacaauaauaugcacauauaggcaugcaccccccuauauaagagaucauauuguagaucuuaacaauguagaugaacaaaguggauuauauagauaucacaugggugguauugaaggguggugucaaaaacuauggaccauagaagcuauaucacuauuggaucuaauaucucucaaagggaaauucucaauuacugcuuuaauuaauggugacaaucaaucaauagauauaagcaaaccagucagacucauggaaggucaaacucaugcucaagcagauuauuugcuagcauuaaauagccuuaaauuacuguauaaagaguaugcaggcauaggucacaaauuaaaaggaacugagacuuauauaucacgagauaugcaauuuaugaguaaaacaauucaacauaacgguguauauuacccugcuaguauaaagaaaguccuaagagugggaccguggauaaacacuauacuugaugauuucaaagugagucuagaaucuauagguaguuugacacaagaauuagaauauagaggugaaagucuauuaugcaguuuaauauuuagaaauguaugguuauauaaucaaauugcucuacaauuaaaaaaucaugcguuauguaacaauaaauuauauuuggacauauuaaagguucugaaacacuuaaaaaccuuuuuuaaucuugauaauauugauacagcauuaacauuguauaugaauuuacccauguuauuuggugguggugaucccaacuuguuauaucgaaguuucuauagaagaacuccugauuuccucacagaggcuauaguucacucuguguucauacuuaguuauuauacaaaccaugacuuaaaagauaaacuucaagauuugucagaugauagauugaauaaguucuuaacaugcauaaucacguuugacaaaaacccuaaugcugaauucguaacauugaugagagauccucaagcuuuagggucugagagacaagcuaaaauuacuagugaaaucaauagacuggcaguuacagagguuuugaguacagcuccaaacaaaauauucuccaaaagugcacaacauuauaccacuacagagauagaucuaaaugauauuaugcaaaauauagaaccuacauauccucacgggcuaagaguuguuuaugaaaguuuacccuuuuauaaagcagagaaaauaguaaaucuuauaucagguacaaaaucuauaacuaacauacuggaaaagacuucugccauagacuuaacagauauugauagagccacugagaugaugaggaaaaacauaacuuugcuuauaaggauacuuccauuggauuguaacagagauaaaagagaaauauugaguauggaaaaccuaaguauuacugaauuaagcaaauauguuagggaaagaucuuggucuuuauccaauauaguugguguuacaucacccaguaucauguauacaauggacaucaaauauacaacaagcacuauagcuaguggcauaauuauagagaaauauaauguuaacaguuuaacacguggugagagaggaccaacuaaaccauggguugguucaucuacacaagagaaaaaaacaaugccaguuuauaauagacaaguuuuaaccaaaaaacaaagagaucaaauagaucuauuagcaaaauuggauuggguguaugcaucuauagauaacaaggaugaauucauggaagaacucagcauaggaacccuuggguuaacauaugaaaaggccaaaaaauuauuuccacaauauuuaagugucaacuauuugcaucgccuuacagucaguaguagaccaugugaauucccugcaucaauaccagcuuauagaacaacaaauuaucacuuugacacuagcccuauuaaucgcauauuaacagaaaaguauggugaugaagauauugacauaguauuccaaaacuguauaagcuuuggccuuagcuuaaugucaguaguagaacaauuuacuaauguauguccuaacagaauuauucucauaccuaagcuuaaugagauacauuugaugaaaccucccauauucacaggugauguugauauucacaaguuaaaacaagugauacaaaaacagcauauguuuuuaccagacaaaauaaguuugacucaauauguggaauuauucuuaaguaacaaaacacucaaaucuggaucucauguuaauucuaauuuaauauuggcacauaaaauaucugacuauuuucauaauacuuacauuuuaaguacuaauuuagcuggacauuggauucuaauuauacaacuuaugaaagauucuaaagguauuuuugaaaaagauuggggagagggauauauaacugaucauauguuuauuaauuugaaaguuuucuucaaugcuuauaagaccuaucucuuguguuuucauaaagguuauggcaaagcaaaacuggagugugauaugaacacuucagaucuucuauguguauuggaauuaauagacaguaguuauuggaagucuaugucuaagguauuuuuagaacaaaaaguuaucaaauacauucuuagccaagaugcaaguuuacauagaguaaaaggaugucauagcuucaaauuaugguuucuuaaacgucuuaauguagcagaauuuacaguuugcccuuggguuguuaacauagauuaucauccaacacauaugaaagcaauauuaacuuauauagaucuuguuagaaugggauugauaaauauagauagaauacacauuaaaaauaaacacaaauucaaugaugaauuuuauacuucuaaucucuuuuacauuaauuauaacuucucagauaauacucaucuauuaacuaaacauauaaggauugcuaauucagaauuagaaaauaauuacaacaaauuauaucauccuacaccagaaacccuagagaauauacuagccaauccgauuaaaaguaaugacaaaaagacacugaacgacuauuguauagguaaaaauguugacucaauaauguuaccauuguuaucuaauaagaagcuuguuaaaucgucugcaaugauuagaaccaauuacagcaaacaagaccuguacaaucuauucccuacgguugugaucgauagaauuauagaucauucagguaauacagccaaauccaaccaacuuuacacuacuacuucccaucaaauaucuuuagugcacaauagcacaucacuuuauugcaugcuuccuuggcaucauauuaauagauucaauuuuguauuuaguucuacagguuguaaaauuaguauagaguauauuuuaaaagaccuuaaaauuaaagauccuaauuguauagcauucauaggugaaggagcagggaauuuauuauugcguacagugguggaacuucauccugacauaagauauauuuacagaagucugaaagauugcaaugaucauaguuuaccuauugaguuuuuaaggcuauacaauggacauaucaacauugauuauggugaaaauuugaccauuccugcuacagaugcaaccaacaacauucauuggucuuauuuacauauaaaguuugcugaaccuaucagucuuuuuguaugugaugccgaauugccuguaacagucaacuggaguaaaauuauaauagaauggagcaagcauguaagaaaaugcaaguacuguuccucaguuaauaaauguacguuaauaguaaaauaucaugcucaagaugauauugauuucaaauuagacaauauaacuauauuaaaaacuuauguaugcuuaggcaguaaguuaaagggaucggagguuuacuuaguccuuacaauagguccugcaaauauauuuccaguauuuaauguaguacaaaaugcuaaauugauacuaucaagaaccaaaaauuucaucaugccuaagaaagcugauaaagagucuauugaugcaaauauuaaaaguuugauacccuuucuuuguuacccuauaacaaaaaaaggaauuaauacugcauugucaaaacuaaagaguguuguuaguggagauauacuaucauauucuauagcuggacggaaugaaguuuucagcaauaaacuuauaaaucauaagcauaugaacaucuuaaagugguucaaucauguuuuaaauuucagaucaacagaacuaaacuauaaccauuuauauaugguagaaucuacauauccuuaccuaagugaauuguuaaacagcuugacaacuaaugaacuuaaaaaacugauuaaaaucacagguagucuguuauacaacuuucauaaugaauaa。
RSV株ATCC VR−26 longのタンパク質M2−1をコードしているmRNA:
配列番号18にしたがうmRNA配列:
Augucacgaaggaauccuugcaaauuugaaauucgaggucauugcuugaaugguaagagaugucauuuuagucauaauuauuuugaauggccaccccaugcacugcucguaagacaaaacuuuauguuaaacagaauacuuaagucuauggauaaaaguauagauaccuuaucagaaauaaguggagcugcagaguuggacagaacagaagaguaugcucuugguguaguuggagugcuagagaguuauauaggaucaauaaauaauauaacuaaacaaucagcauguguugccaugagcaaacuccucacugaacucaauagugaugauaucaaaaaacugagagacaaugaagagcuaaauucacccaagauaagaguguacaauacugucauaucauauauugaaagcaacaggaaaaacaauaaacaaacuauccaucuguuaaaaagauugccagcagacguauugaagaaaaccaucaaaaacacauuggauauccacaagagcauaaccaucaacaacccaaaagaauuaacuguuagugauacaaaugaccaugccaaaaauaaugauacuaccuga。
RSV株ATCC VR−26 longのタンパク質M2−2をコードしているmRNA:
配列番号19にしたがうmRNA配列:
augaccaugccaaaaauaaugauacuaccugacaaauauccuuguaguauaacuuccauacuaauaacaaguagauguagagucacuauguauaaucgaaagaacacacuauauuucaaucaaaacaacccaaauaaccauauguacucaccgaaucaaacauucaaugaaauccauuggaccucacaagacuugauugacacaauucaaaauuuucuacagcaucuagguguuauugaggauauauauacaauauauauauuagugucauaa。
RSV株ATCC VR−26 longのリン酸タンパク質PをコードしているmRNA:
配列番号20にしたがうmRNA配列:
auggaaaaguuugcuccugaauuccauggagaagaugcaaacaacagggcuacuaaauuccuagaaucaauaaagggcaaauucacaucaccuaaagaucccaagaaaaaagauaguaucauaucugucaacucaauagauauagaaguaaccaaagaaagcccuauaacaucaaauucaaccauuauuaacccaacaaaugagacagaugauaaugcagggaacaagcccaauuaucaaagaaaaccucuaguaaguuucaaagaagacccuauaccaagugauaaucccuuuucaaaacuauacaaagaaaccauagagacauuugauaacaaugaagaagaaucuagcuauucauaugaagaaauaaaugaucagacgaacgauaauauaacugcaagauuagauaggauugaugaaaaauuaagugaaauacuaggaaugcuucacacauuaguaguagcaagugcaggaccuacaucugcuagggaugguauaagagaugccaugguugguuuaagagaagaaaugauagaaaaaaucagaacugaagcauuaaugaccaaugacagauuagaagcuauggcaagacucaggaaugaggaaagugaaaagauggcaaaagacacaucagaugaagugucucucaauccaacaucagagaaauugaacaaccuguuggaagggaaugauagugacaaugaucuaucacuugaagauuucuga。
RSV株ATCC VR−26 longの非構造タンパク質NS1をコードしているmRNA:
配列番号21にしたがうmRNA配列:
augggcagcaauucguugaguaugauaaaaguuagauuacaaaauuuguuugacaaugaugaaguagcauuguuaaaaauaacaugcuauacugacaaauuaauacauuuaacuaaugcuuuggcuaaggcagugauacauacaaucaaauugaauggcauuguguuugugcauguuauuacaaguagugauauuugcccuaauaauaauauuguaguaaaauccaauuucacaacaaugccagugcuacaaaauggagguuauauaugggaaaugauggaauuaacacauugcucucaaccuaauggucuaauagaugacaauugugaaauuaaauucuccaaaaaacuaagugauucaacaaugaccaauuauaugaaucaauuaucugaauuacuuggauuugaucuuaauccauaa。
RSV株ATCC VR−26 longの非構造タンパク質NS2をコードしているmRNA:
配列番号22にしたがうmRNA配列:
auggacacaacccacaaugauaccacaccacaaagacugaugaucacagacaugagaccguugucacuugagacuacaauaacaucacuaaccagagacaucauaacacacagauuuauauacuuaauaaaucaugaaugcauagugagaaaacuugaugaaagacaggccacauuuacauuccuggucaacuaugaaaugaaacuauugcacaaaguaggaagcacuaaauauaaaaaauauacugaauacaacacaaaauauggcacuuucccuaugccgauauucaucaaucaugauggguucuuagaaugcauuggcauuaagccuacaaagcauacucccauaauauacaaguaugaucucaauccauag。
本発明に関連して、本明細書に開示されている核酸配列番号に加えて、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の異なる単離物の核酸配列はまた、本明細書に組み込まれる。呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の異なるこれらの単離物は、配列番号12〜22にしたがう核酸配列に対する好ましくは少なくとも50%、60%、70%、より好ましくは少なくとも80%、最も好ましくは少なくとも90%、またはその断片の、同一性を好ましく有している。
好ましい実施形態において、本発明に係るmRNA配列は、レポーター遺伝子またはマーカー遺伝子を含んでいない。好ましくは、本発明に係るmRNA配列は、例えば、ルシフェラーゼ;緑色蛍光タンパク質(GFP)およびそのバリアント(例えば、eGFP、RFPまたはBFP);αグロブリン;ヒポキサンチン−グアニンホスホシボシルトランスフェラーゼ(HGPRT);βガラクトシダーゼ;ガラクトキナーゼ;アルカリホスファターゼ;分泌型の胚性アルカリホスファターゼ(SEAP)または耐性遺伝子(例えば、ネオマイシン、ピューロマイシン、ハイグロマイシンおよびゼオシンに対する耐性遺伝子)を含んでいない。好ましい実施形態において、本発明に係るmRNA配列は、ルシフェラーゼをコードしていない。他の実施形態において、本発明に係るmRNA配列は、GFPまたはそのバリアントをコードしていない。
さらなる好ましい実施形態において、本発明に係るmRNA配列は、オルソミクソウイルス科に属するウイルスに由来するタンパク質(またはタンパク質の断片)をコードしていない。好ましくは、上記mRNAは、インフルエンザウイルス、好ましくはインフルエンザAウイルスに由来するタンパク質をコードしていない。好ましくは、本発明に係るmRNA配列は、ヘマグルチニン(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、M1、M2、NS1、NS2(NEP:核搬出タンパク質)、PA、PB1(polymerase basic 1)、PB1−F2およびPB2からなる群から選択されるインフルエンザAタンパク質をコードしていない。好ましい他の実施形態において、本発明に係るmRNAは、オブアルブミン(OVA)またはその断片をコードしていない。好ましくは、本発明に係るmRNAは、インフルエンザAタンパク質またはオブアルブミンをコードしていない。
さらなる実施形態によって、本発明のmRNAは、少なくとも1つの以下の構造エレメント:5’非翻訳領域エレメント(UTRエレメント)および/または3’UTR、特にTOP遺伝子の5’UTRまたはその断片、相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる5’UTRエレメント、または安定なmRNAをもたらす遺伝子に由来する5’UTRエレメントおよび/または3’UTRエレメントまたはその相同物、断片もしくはバリアント;ヒストン−ステムループ構造、好ましくはその3’非翻訳領域におけるヒストン−ステムループ;5’キャップ構造;ポリAテイル;またはポリ(C)配列を含んでいる。
本発明の第1の局面の好ましい実施形態において、本発明のmRNAは、少なくとも5’または3’UTRエレメントを含んでいる。これに関連して、UTRエレメントは、天然に存在する任意の遺伝子、または遺伝子の5’もしくは3’UTRの断片、バリアントもしくは相同物に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。好ましくは、本発明にしたがって使用される5’または3’UTRは、本発明のmRNA配列のコード領域に対して相同である。天然に存在する遺伝子に由来する5’または3’UTRエレメントが好ましい場合にさえ、合成的に改変されたUTRエレメントが、本発明に関連して使用され得る。本発明の第1の局面の特に好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列は、TOP遺伝子の5’UTR、またはTOP遺伝子の5’UTRの断片、相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる少なくとも5’非翻訳領域エレメント(5’UTRエレメント)を含んでいる。
本発明の第1の局面の特に好ましい実施形態において、本発明のmRNAは、TOP遺伝子の5’UTR、またはTOP遺伝子の5’UTRの断片、相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる少なくとも1つの5’非翻訳領域エレメント(5’UTRエレメント)を含んでいる。
5’UTRは、以上に規定されているようなTOPモチーフまたは5’TOPを含んでいないことが、特に好ましい。
いくつかの実施形態において、TOP遺伝子の5’UTRに由来する5’UTRエレメントの核酸配列は、由来する遺伝子またはmRNAの開始コドン(A(U/T)G)の1、2、3、4、5、6、7、8、9または10位上流に配置されているヌクレオチドを有しているその3’末端において終結している。したがって、5’UTRエレメントは、タンパク質コード領域の任意の部分を含んでいない。したがって、本発明のmRNAのタンパク質をコードしている領域のみが、コード領域によってもたらされていることが好ましい。
TOP遺伝子の5’UTRに由来する核酸配列は、真核生物のTOP遺伝子、好ましくは植物または動物のTOP遺伝子、より好ましくは脊索動物のTOP遺伝子、より一層好ましくは脊椎動物のTOP遺伝子、最も好ましくは哺乳類のTOP遺伝子(例えばヒトのTOP遺伝子)に由来する。
例えば、5’UTRエレメントは、特許出願WO2016/143700(その開示が参照によって本明細書に組み込まれる)の配列番号1421および配列番号1422、ならびに特許出願WO2016/143700(その開示が参照によって本明細書に組み込まれる)の配列番号1421および配列番号1422の相同物、そのバリアントからなる群、または好ましくは対応するRNA配列から選択される核酸配列に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる5’UTRから好ましく選択される。「特許出願WO2016/143700の配列番号1421および配列番号1422」という表現は、特許出願WO2016/143700の配列番号1〜1363、配列番号1395、配列番号1421および配列番号1422にしたがう配列に対して相同な、ホモサピエンス以外の他の種の配列を指す。
好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、特許出願WO2016/143700の配列番号1〜1363、配列番号1395、配列番号1421および配列番号1422、特許出願WO2016/143700の配列番号1〜1363、配列番号1395、配列番号1421および配列番号1422の相同物、そのバリアント、または対応するRNA配列から選択される核酸配列の、5位のヌクレオチド位置(すなわち、配列における5位に配置されているヌクレオチド)から、開始コドン(例えば、配列の3’末端に配置されている)に対するすぐ5’位にあるヌクレオチド(例えば、ATG配列に対するすぐ5’にあるヌクレオチド位置)まで伸びている核酸配列に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。5’UTRエレメントは、特許出願WO2016/143700の配列番号1〜1363、配列番号1395、配列番号1421および配列番号1422の相同物、そのバリアント、または対応するRNA配列の、5’TOPに対するすぐ3’にあるヌクレオチド位置から、開始コドン(配列の3’末端に配置されている)に対するすぐ5’にあるヌクレオチド位置(例えば、ATG配列に対するすぐ5’にあるヌクレオチド位置)伸びている核酸配列に由来することが、特に好ましい。
特に好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、リボソームタンパク質をコードしているTOP遺伝子、またはリボソームタンパク質をコードしているTOP遺伝子の5’UTRのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。例えば、5’UTRエレメントは、特許出願WO2013/143700の配列番号67、170、193、244、259、554、650、675、700、721、913、1016、1063、1120、1138および1284〜1360のいずれかにしたがう核酸配列の5’UTR、対応するRNA配列、または本明細書に記載されているようなその相同物もしくはバリアント(好ましくは5’TOPモチーフを欠いている)に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。上述されている通り、5位からATG(配列の3’末端に配置されている)に対するすぐ5’にあるヌクレオチドまで伸びている配列は、上記配列の5’UTRに対応する。
好ましくは、5’UTRエレメントは、リボソーム巨大タンパク質(RLP)をコードしているTOP遺伝子の5’UTR、またはリボソーム巨大タンパク質(RLP)をコードしているTOP遺伝子の5’UTRの相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。例えば、5’UTRエレメントは、特許出願2013/143700の配列番号67、259、1284〜1318、1344、1346、1348〜1354、1357、1358、1421および1422のいずれかにしたがう核酸配列の5’UTR、対応するRNA配列、本明細書に記載されているようなその相同物、またはバリアント(好ましくは5’TOPを欠いている)に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。
特に好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、リボソームタンパク質ラージ32遺伝子(好ましくは脊椎動物のリボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子、より好ましくはヒトのリボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子)の5’UTR、またはリボソームタンパク質ラージ32遺伝子(好ましくは脊椎動物のリボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子、より好ましくは哺乳類のリボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子、最も好ましくはヒトのリボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子)の5’UTRのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。ここで、5’UTRエレメントは、上記遺伝子の5’TOPを含んでいないことが好ましい。
したがって、特に好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、配列番号23にしたがう核酸配列(5’末端オリゴピリジントラクトを欠いているヒトのリボソームタンパク質ラージ32の5’UTR:GGCGCTGCCTACGGAGGTGGCAGCCATCTCCTTCTCGGCATC;特許出願WO2013/143700の配列番号1368にしたがう)または好ましくは対応するRNAに対する、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の同一性を有している核酸配列を含んでいるか、もしくは当該核酸配列からなるか、または少なくとも1つの5’UTRエレメントは、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の、配列番号23にしたがう核酸配列に対する同一性を有している核酸配列の、断片を含んでいるか、または当該断片からなる。ここで、好ましくは、当該断片は、本明細書に記載されている通りである(すなわち、全長5’UTRの少なくとも20%、好ましくは少なくとも30%、より好ましくは少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%、より一層好ましくは少なくとも60%、より一層好ましくは少なくとも70%、より一層好ましくは少なくとも80%、最も好ましくは少なくとも90%に相当するヌクレオチドの連続するストレッチである)。好ましくは、上記断片は、少なくとも約20またはそれ以上のヌクレオチド、好ましくは少なくとも約30またはそれ以上のヌクレオチド、より好ましくは少なくとも約40またはそれ以上のヌクレオチドの長さを示す。好ましくは、上記断片は、本明細書に記載されているような機能的な断片である。
いくつかの実施形態において、本発明のmRNAは、脊椎動物のTOP遺伝子(例えば、哺乳類(例えばヒト)のTOP遺伝子)の5’UTR、またはその相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる5’UTRエレメントを含んでいる。当該脊椎動物のTOP遺伝子は、RPSA、RPS2、RPS3、RPS3A、RPS4、RPS5、RPS6、RPS7、RPS8、RPS9、RPS10、RPS11、RPS12、RPS13、RPS14、RPS15、RPS15A、RPS16、RPS17、RPS18、RPS19、RPS20、RPS21、RPS23、RPS24、RPS25、RPS26、RPS27、RPS27A、RPS28、RPS29、RPS30、RPL3、RPL4、RPL5、RPL6、RPL7、RPL7A、RPL8、RPL9、RPL10、RPL10A、RPL11、RPL12、RPL13、RPL13A、RPL14、RPL15、RPL17、RPL18、RPL18A、RPL19、RPL21、RPL22、RPL23、RPL23A、RPL24、RPL26、RPL27、RPL27A、RPL28、RPL29、RPL30、RPL31、RPL32、RPL34、RPL35、RPL35A、RPL36、RPL36A、RPL37、RPL37A、RPL38、RPL39、RPL40、RPL41、RPLP0、RPLP1、RPLP2、RPLP3、RPLP0、RPLP1、RPLP2、EEF1A1、EEF1B2、EEF1D、EEF1G、EEF2、EIF3E、EIF3F、EIF3H、EIF2S3、EIF3C、EIF3K、EIF3EIP、EIF4A2、PABPC1、HNRNPA1、TPT1、TUBB1、UBA52、NPM1、ATP5G2、GNB2L1、NME2、UQCRBから選択される。ここで、必要に応じて、5’UTRエレメントは、5’末端オリゴピリミジントラクトの1、2、3、4、5、6、7、8、9または10位下流に配置されているヌクレオチドをともなってその5’末端から始まっている。ここで、必要に応じてさらに、TOP遺伝子の5’UTRに由来する5’UTRエレメントは、それが由来する遺伝子の開始コドン(A(U/T)G)の1、2、3、4、5、6、7、8、9または10位上流に配置されているヌクレオチドとともにその3’末端において終結する。
特に好ましいさらなる実施形態において、5’UTRエレメントは、リボソームタンパク質ラージ32遺伝子(RPL32)、リボソームタンパク質ラージ35遺伝子(RPL35)、リボソームタンパク質ラージ21遺伝子(RPL21)、プロトン輸送するATP合成酵素 ミトコンドリアF1複合体αサブユニット 心筋(ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle)(ATP5A1)遺伝子、ヒドロキシステロイド(17−ベータ)脱水素酵素4遺伝子(HSD17B4)、アンドロゲン誘導1遺伝子、チトクロームcオキシダーゼサブユニットVIc遺伝子(COX6C)もしくはN−アシルスフィンゴシン アミドヒドロラーゼ(酸セラミダーゼ)1遺伝子(ASAH1)またはそのバリアント、好ましくはまたは脊椎動物のリボソームタンパク質ラージ32遺伝子(RPL32)、脊椎動物のリボソームタンパク質ラージ35遺伝子(RPL35)、脊椎動物のリボソームタンパク質ラージ21遺伝子(RPL21)、脊椎動物のプロトン輸送するATP合成酵素 ミトコンドリアF1複合体αサブユニット 心筋(ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle)(ATP5A1)遺伝子、脊椎動物のヒドロキシステロイド(17−ベータ)脱水素酵素4遺伝子(HSD17B4)、脊椎動物のアンドロゲン誘導1遺伝子、脊椎動物のチトクロームcオキシダーゼサブユニットVIc遺伝子(COX6C)もしくは脊椎動物のN−アシルスフィンゴシン アミドヒドロラーゼ(酸セラミダーゼ)1遺伝子(ASAH1)そのバリアント、より好ましくは哺乳類のリボソームタンパク質ラージ32遺伝子(RPL32)、哺乳類のリボソームタンパク質ラージ35遺伝子(RPL35)、哺乳類のリボソームタンパク質ラージ21遺伝子(RPL21)、哺乳類のプロトン輸送するATP合成酵素 ミトコンドリアF1複合体αサブユニット 心筋(ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle)(ATP5A1)遺伝子、哺乳類のヒドロキシステロイド(17−ベータ)脱水素酵素4遺伝子(HSD17B4)、哺乳類のアンドロゲン誘導1遺伝子、哺乳類のチトクロームcオキシダーゼサブユニットVIc遺伝子(COX6C)もしくは哺乳類のN−アシルスフィンゴシン アミドヒドロラーゼ(酸セラミダーゼ)1遺伝子(ASAH1)またはそのバリアント、最も好ましくはヒトのリボソームタンパク質ラージ32遺伝子(RPL32)、ヒトのリボソームタンパク質ラージ35遺伝子(RPL35)、ヒトのリボソームタンパク質ラージ21遺伝子(RPL21)、ヒトのプロトン輸送するATP合成酵素 ミトコンドリアF1複合体αサブユニット 心筋(ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle)(ATP5A1)遺伝子、ヒトのヒドロキシステロイド(17−ベータ)脱水素酵素4遺伝子(HSD17B4)、ヒトのアンドロゲン誘導1遺伝子、ヒトのチトクロームcオキシダーゼサブユニットVIc遺伝子(COX6C)もしくはヒトのN−アシルスフィンゴシン アミドヒドロラーゼ(酸セラミダーゼ)1遺伝子(ASAH1)またはそのバリアントの5’UTRに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸からなる。ここで、好ましくは、5’UTRエレメントは、上記遺伝子の5’TOPを含んでいない。
したがって、特に好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の、特許出願WO2013/143700の配列番号1368または配列番号1412〜1420にしたがう核酸配列もしくは対応するRNA配列に対する同一性を有している核酸配列を含んでいるか、もしくは当該核酸配列からなるか、または少なくとも1つの5’UTRエレメントは、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、好ましくは少なくとも約より80%、よりましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の、特許出願WO2013/143700の配列番号1368もしくは配列番号1412〜1420にしたがう核酸配列に対する同一性を有している核酸配列の、断片を含んでいるか、もしくは当該核酸配列からなる。ここで、上記断片は、上述されている通りである(すなわち、全長5’UTRの少なくとも約20%などに相当するヌクレオチドの連続するストレッチである)。好ましくは、上記断片は、少なくとも約20ヌクレオチドまたはそれ以上、好ましくは少なくとも約30ヌクレオチドまたはそれ以上、より好ましくは少なくとも約40ヌクレオチドまたはそれ以上の長さを示す。好ましくは、上記断片は、本明細書に記載されているような機能的な断片である。
したがって、特に好ましい実施形態において、5’UTRエレメントは、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の、配列番号36(5’末端オリゴピリジントラクト:GCGGCTCGGCCATTTTGTCCCAGTCAGTCCGGAGGCTGCGGCTGCAGAAGTACCGCCTGCG-GAGTAACTGCAAAGを欠いている、ATP5A1の5’UTR;特許出願WO2013/143700の配列番号1414に対応する)にしたがう核酸配列もしくは対応するRNA配列に対する同一性を有している核酸配列を含んでいるか、もしくは当該核酸配列からなるか、または少なくとも1つの5’UTRエレメントは、少なくとも約40%、好ましくは少なくとも約50%、好ましくは少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%、より一層好ましくは少なくとも約95%、より一層好ましくは少なくとも約99%の、配列番号26にしたがう核酸配列もしくはより好ましくは対応するRNA配列に対する同一性を有している核酸配列を含んでいるか、もしくは当該核酸配列からなる。ここで、好ましくは、上記断片は、上述されている通りである(すなわち、全長5’UTRの少なくとも20%などに相当するヌクレオチドの連続するストレッチである)。好ましくは、上記断片は、少なくとも約20ヌクレオチドまたはそれ以上、より好ましくは少なくとも約30ヌクレオチドまたはそれ以上、より好ましくは少なくとも約40ヌクレオチドまたはそれ以上の長さを示す。上記断片は、本明細書に記載されているような機能的な断片である。
さらなる好ましい実施形態において、本発明のmRNAは、脊索動物の遺伝子、好ましくは脊椎動物の遺伝子、より好ましくは哺乳類の遺伝子、最も好ましくはヒトの遺伝子の3’UTR、または脊索動物の遺伝子、好ましくは脊椎動物の遺伝子、より好ましくは哺乳類の遺伝子、最も好ましくはヒトの遺伝子の3’UTRのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる少なくとも1つの3’UTRエレメントをさらに含んでいる。
「3’UTRエレメント」という用語は、3’UTRまたは3’UTRのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる核酸配列を指す。本発明の意味において、3’UTRは、mRNAの3’UTRに相当し得る。したがって、本発明の意味において、3’UTRエレメントは、mRNA、好ましくは人工mRNAの3’UTRであり得るか、または3’UTRエレメントは、mRNAbの3’UTRにとっての転写テンプレートであり得る。したがって、3’UTRエレメントは、mRNAの3’UTR、好ましくは人工mRNA(例えば、遺伝工学的に生成されるベクターコンストラクトの転写によって得られるmRNA)の3’UTRに対応する核酸配列である。好ましくは、3’UTRエレメントは、3’UTRの機能を実現するか、または3’UTRの機能を実現する配列をコードしている。
好ましくは、本発明のmRNA配列は、向上されている半減期を有している(安定したmRNAをもたらす)mRNAに関連する遺伝子に由来し得る3’UTRエレメント(例えば、以下に規定されており、記載されているような3’UTRエレメント)を含んでいる。
特に好ましい実施形態において、3’UTRは、アルブミン遺伝子、αグロビン遺伝子、βグロビン遺伝子、チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、およびコラーゲンアルファ遺伝子(例えばコラーゲンアルファ1(I)遺伝子)からなる群から選択される遺伝子に3’UTR、または特許出願WO2013/143700(開示事項は参照によって本明細書に組み込まれる)の配列番号1369〜1390にしたがうアルブミン遺伝子、αグロビン遺伝子、βグロビン遺伝子、チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、およびコラーゲンアルファ遺伝子(例えばコラーゲンアルファ1(I)遺伝子)からなる群から選択される遺伝子の3’UTRのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。特に好ましい実施形態において、3’UTRエレメントは、アルブミン遺伝子、好ましくは脊椎動物のアルブミン遺伝子、より好ましくは哺乳類のアルブミン遺伝子、最も好ましくは配列番号24にしたがうヒトのアルブミンの3’UTRに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。ヒトのアルブミンの3’UTR 配列番号24:
CATCACATTT AAAAGCATCT CAGCCTACCA TGAGAATAAG AGAAAGAAAA TGAAGATCAA AAGCTTATTC ATCTGTTTTT CTTTTTCGTT GGTGTAAAGC CAACACCCTG TCTAAAAAAC ATAAATTTCT TTAATCATTT TGCCTCTTTT CTCTGTGCTT CAATTAATAA AAAATGGAAA GAATCT(特許出願WO2013/143700の配列番号1369に対応する)。
これに関連して、本発明のmRNAは、特許出願WO2013/143700の配列番号1369〜1390にしたがう核酸に由来する対応するRNA配列、またはその断片、相同物もしくはバリアントを含んでいる3’UTRエレメントを含んでいることが好ましい。
最も好ましくは、3’UTRエレメントは、配列番号25:
アルブミン7の3’UTR
CATCACATTTAAAAGCATCTCAGCCTACCATGAGAATAAGAGAAAGAAAATGAAGATCAATAGCTTATTCATCTCTTTTTCTTTTTCGTTGGTGTAAAGCCAACACCCTGTCTAAAAAACATAAATTTCTTTAATCATTTTGCCTCTTTTCTCTGTGCTTCAATTAATAAAAAATGGAAAGAACCT(特許出願WO2013/143700の配列番号1376に対応する配列番号25)
にしたがうヒトのアルブミンの断片に由来する核酸配列を含んでいる。
これに関連して、本発明のmRNAの3’UTRエレメントは、配列番号25にしたがう核酸配列の対応するRNAを含んでいるか、または当該RNAからなることが特に好ましい。
特に好ましい他の実施形態において、3’UTRエレメントは、αグロビン、好ましくは脊椎動物のαもしくはβグロビン、より好ましくは哺乳類のαもしくはβグロビン、最も好ましくは配列番号26〜28:
ホモサピエンス ヘモグロビン,α1(HBA1)の3’UTR
GCTGGAGCCTCGGTGGCCATGCTTCTTGCCCCTTGGGCCTCCCCCCAGCCCCTCCTCCCCTTCCTGCACCCGTACCCCCGTGGTCTTTGAATAAAGTCTGAGTGGGCGGC(特許出願WO2013/143700の配列番号1370に対応する、配列番号26)
ホモサピエンス ヘモグロビン,α2(HBA2)の3’UTR
GCTGGAGCCTCGGTAGCCGTTCCTCCTGCCCGCTGGGCCTCCCAACGGGCCCTCCTCCCCTCCTTGCACCGGCCCTTCCTGGTCTTTGAATAAAGTCTGAGTGGGCAG(特許出願WO2013/143700の配列番号1371に対応する、配列番号27)
ホモサピエンス ヘモグロビン,β(HHB)の3’UTR
GCTCGCTTTCTTGCTGTCCAATTTCTATTAAAGGTTCCTTTGTTCCCTAAGTCCAACTACTAAACTGGGGGATATTATGAAGGGCCTTGAGCATCTGGATTCTGCCTAATAAAAAACATTTATTTTCATTGC(特許出願WO2013/143700の配列番号1372に対応する、配列番号28)
にしたがうヒトのαもしくはβグロビンに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる。
例えば、3’UTRエレメントは、好ましくは配列番号29:
αグロビン遺伝子の3’UTRの、中央のα複合体結合部分(本明細書において「muag」とも呼ばれる)
GCCCGATGGGCCTCCCAACGGGCCCTCCTCCCCTCCTTGCACCG(特許出願WO2103/143700の配列番号1393に対応する配列番号29)
にしたがう、αグロビン遺伝子(例えば、ヒトのαグロビン遺伝子)の、中央のα複合体結合部分を含んでいるか、または当該中央のα複合体結合部分からなる。
これに関連して、本発明のmRNAの3’UTRエレメントは、配列番号29にしたがう核酸配列またはその相同物、断片またはバリアントの対応するRNA配列を含んでいるか、または当該RNA配列からなることが特に好ましい。
「[・・・]遺伝子の3’UTRに由来する核酸配列」という用語は、[・・・]遺伝子の3’UTR配列に基づくか、またはその部分(例えば、アルブミン遺伝子、αグロビン遺伝子、βグロビン遺伝子、チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、またはコラーゲンアルファ遺伝子(例えばコラーゲンアルファ1(I)遺伝子)、好ましくはアルブミン遺伝子、またはその部分の3’UTR)に基づく核酸配列を好ましく指す。この用語は、全体の3’UTR配列(すなわち遺伝子の全長3’UTR配列)に対応する配列、および遺伝子(例えば、アルブミン遺伝子、αグロビン遺伝子、βグロビン遺伝子、チロシンヒドロキシゲナーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、またはコラーゲンアルファ遺伝子(例えば、コラーゲンアルファ1(I)遺伝子))、好ましくはアルブミン遺伝子の3’UTR配列の断片に対応する配列を包含している。
「[・・・]遺伝子の3’UTRのバリアントに由来する核酸配列」という用語は、遺伝子3’UTR配列のバリアント(例えば、アルブミン遺伝子、αグロビン遺伝子、βグロビン遺伝子、チロシンヒドロキシゲナーゼ遺伝子またはコラーゲンアルファ遺伝子(例えば、コラーゲンアルファ1(I)遺伝子))または上述のようなその断片に基づく核酸配列を指す。この用語は、遺伝子の3’UTRのバリアントの全体配列(すなわち遺伝子の全長のバリアント3’UTR配列)に対応する配列、および遺伝子のバリアント3’UTR配列の断片に対応する配列を包含している。好ましくは、これに関連するバリアントは、全長のバリアント3’UTRの少なくとも20%、好ましくは少なくとも30%、より好ましくは少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%、より一層好ましくは少なくとも60%、より一層好ましくは少なくとも70%、より一層好ましくは少なくとも80%、最も好ましくは少なくとも90%に相当する全長のバリアント3’UTRにおけるヌクレオチドの連続する広がりに対応するヌクレオチドの連続する広がりからなる。本発明の意味において、バリアントのそのような断片は、本明細書に記載のようなバリアントの機能的な断片であることが好ましい。
好ましくは、少なくとも1つの5’UTRエレメントおよび少なくとも1つの3’UTRエレメントは、相乗的に作用して、上述のような本発明のmRNAからのタンパク質産生を向上させる。
特に好ましい実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはそのバリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいる本発明のmRNAは、ヒストン ステム−ループ配列/構造を含んでいる。そのようなヒストン ステム−ループ配列は、WO2012/019780(開示事項は参照によって本明細書に組み込まれる)に開示されているようなヒストン ステム−ループ配列から選択される。
本発明の範囲において使用されるために好適なヒストン ステム−ループ配列は、以下の式(I)または(II):
式(I)(ステム境界配列なしのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
式(II)(ステム境界配列ありのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
の少なくとも1つのから選択されることが好ましく、
ステム1またはステム2の境界エレメントN1−6は、1〜6、好ましくは2〜6、より好ましくは2〜5、より一層好ましくは3〜5、最も好ましくは4〜5、または5のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され;)
ステム1[N0−2GN3−5]は、ステム2のエレメントと逆相補的または部分的に逆相補的であり、かつ5〜7ヌクレオチドの間の連続する配列であり;
0−2は、0〜2、好ましくは0〜1、より好ましくは1のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され;
3−5は、3〜5、好ましくは4〜5、より好ましくは4のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され;
Gは、グアノシンまたはその類似物であり、ステム2におけるその相補的なシチジンヌクレオチドがグアノシンによって置き換えられている条件のもとに、任意にシチジンまたはその類似物に置き換えられ得;
ループ配列[N0−4(U/T)N0−4]は、ステム1およびステム2のエレメントの間に配置されており、3〜5ヌクレオチド、より好ましくは4ヌクレオチドの連続する配列であり;
0−4のそれぞれは、他のNから独立して、0〜4、好ましくは1〜3、より好ましくは1〜2のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され、U/Tは、ウリジンまたは任意にチミジンを表しており;
ステム2[N3−5CN0−2]は、ステム1のエレメントと逆相補的または部分的に逆相補的であり、かつ5〜7ヌクレオチドの間の連続する配列であり;
3−5は、3〜5、好ましくは4〜5、より好ましくは4のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され;
0−2は、0〜2、好ましくは0〜1、より好ましくは1のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびC、またはそのヌクレオチド類似物から選択されるヌクレオチドから選択され;
Cは、シチジンまたはその類似物であり、ステム1におけるその相補的なグアノシンヌクレオチドがシチジンに置き換えられている条件のもとに、グアノシンまたはその類似物に任意に置き換えられ得;
ステム1およびステム2は、互いに塩基対形成可能であり、例えばヌクレオチドAとU/Tと、またはGとCとのワトソン−クリック塩基対形成または非ワトソン−クリック塩基対形成(例えば、ゆらぎ塩基対形成、逆ワトソン−クリック塩基対形成、フーグスティーン塩基対形成、逆フーグスティーン塩基対形成)によって、塩基対形成がステム1およびステム2の間に生じ得る逆相補性配列を形成しているか、またはステム1およびステム2は、互いに塩基対形成可能であり、不完全な塩基対形成がステム1およびステム2の間に、2つのステムにおける1つ以上の塩基が他方のステムの逆相補的な配列において相補的な塩基を有していないことに基づいて、生じ得る部分的な逆相補性配列を形成している。
本発明の第1の局面のさらなる好ましい実施形態によれば、本発明のmRNA配列は、以下の特定の式(Ia)または(IIa):
式(Ia)(ステム境界エレメントなしのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
式(IIa)(ステム境界エレメントありのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
の少なくとも1つにしたがうヒストン ステム−ループ配列の少なくとも1つを含み得る(ここで、N、C、G、TおよびUは以上に規定されている通りである)。
第1の局面のさらなるより好ましい実施形態によれば、本発明のmRNA配列は、以下の特定の式(Ib)または(IIb):
式(Ib)(ステム境界エレメントなしのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
式(IIb)(ステム境界エレメントありのステム−ループ配列):
Figure 2020014474
の少なくとも1つにしたがうヒストン ステム−ループ配列の少なくとも1つを含み得る(ここで、N、C、G、TおよびUは以上に規定されている通りである)。
特に好ましいヒストン ステム−ループ配列は、配列番号30 CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCAにしたがう配列、またはより好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列対応するRNA配列(CAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCA 配列番号37)である。
本発明の第1の局面の特に好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域に加えて、ポリ(A)配列(ポリAテイルとも呼ばれる)を、好ましくは本発明のmRNAの3’末端に、含んでいる。存在する場合、そのようなポリ(A)配列は、約25〜約400のアデノシンヌクレオチドの配列、好ましくは約50〜約400のアデノシンヌクレオチドの配列、より好ましくは約50〜300のアデノシンヌクレオチドの配列、より一層好ましくは約60〜約250のアデノシンヌクレオチドの配列を含んでいる。これに関連して、「約」という用語は、それが付されている(複数の)値の±10%の偏差を指す。このポリ(A)配列は、本発明の第1の局面に係る本発明のmRNAに含まれているコード領域の3’に好ましく配置されている。
さらなる好ましい実施形態において、本発明のmRNAは、少なくとも10のシトシン、好ましくは少なくとも20のシトシン、より好ましくは少なくとも30のシトシンの配列(「ポリ(C)配列」と呼ばれる)によって修飾され得る。より詳細には、mRNAは、典型的に約10〜200のシトシンヌクレオチド、好ましくは約10〜100のシトシンヌクレオチド、より好ましくは約10〜70のシトシンヌクレオチド、より一層好ましくは約20〜50のシトシンヌクレオチドまたは20〜30のシトシンヌクレオチドのポリ(C)配列を含み得る。このポリ(C)配列は、好ましくはコード領域の3’、より好ましくは本発明の第1の局面に係る本発明のmRNAに含まれている付加的なポリ(A)配列の3’に、配置されている。
これに関連して、本発明のmRNA配列は、特定の実施形態において、
a.)5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b.)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の、好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質Fに由来する、少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質をコードしているコード領域;
c.)64のアデノシンを好ましく含んでいる。ポリ(A)配列;および
d.)任意に、30のシトシンを好ましく含んでいる、ポリ(C)配列
を含み得る。
本発明の第1の局面の特に好ましい実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいる本発明のmRNAは、
好ましくは5’から3’方向に、
a.)5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b.)狂犬病ウイルスの、好ましくは狂犬病ウイルスの糖タンパク質G(RAV−G)に由来する、少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質をコードしているコード領域;
c.)好ましくは64のアデノシンを含んでいる、ポリ(A)配列;
d.)任意に、好ましくは30のシトシンを含んでいる、ポリ(C)配列;ならびに
e.)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、ヒストン ステム−ループ
を含んでいる。
本発明の第1の局面の、特に好ましいさらなる実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体を含んでいる本発明のmRNAは、
好ましくは5’から3’方向に、
a.)5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b.)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の、好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質に由来する、少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質をコードしているコード領域;
c.)任意に、好ましくは配列番号29にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、アルファグロビン遺伝子に由来する3’UTRエレメント、その相同物、断片もしくはバリアント;
d.)好ましくは64のアデノシンを含んでいる、ポリ(A)配列;
e.)任意に、好ましくは30のシトシンを含んでいる、ポリ(C)配列;および
f.)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、ヒストン ステム−ループ
を含んでいる。
好ましい他の実施形態において、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでいる本発明のmRNAは、
好ましくは5’から3’方向に、
a.)5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b.)任意に、TOP遺伝子に由来する、好ましくは配列番号23にしたがう核酸配列の対応するRNA配列に由来する、5’UTRエレメント、またはその断片もしくはバリアント;
c.)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の、好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質Fに由来する、少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質をコードしているコード領域;
d.)任意に、安定なmRNAをもたらす、遺伝子またはその相同物、断片もしくはバリアントに由来する(配列番号25にしたがう核酸配列の対応するRNAに由来する)3’UTRエレメント;
e.)好ましくは64のアデノシンを含んでいる、ポリ(A)配列;
f.)任意に、好ましくは30のシトシンを含んでいる、ポリ(C)配列;ならびに
g.)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、ヒストン ステム−ループ
を含んでいる。
上記コード領域は、配列番号1〜11にしたがうアミノ酸配列、またはその断片、バリアントもしくは誘導体の少なくとも1つを部分的にコードし得る。さらに、本発明のmRNAの上記コード領域は、これらのアミノ酸配列の組合せ、またはその断片、バリアントもしくは誘導体の組合せをコードし得る。これに関連して特に好ましいのは、核タンパク質Nとの融合タンパク質Fの組合せ、ならびに融合タンパク質FおよびM2−1タンパク質の組合せである。
さらに、上記コード領域は、配列番号12〜配列番号22にしたがう配列、またはその断片、相同物もしくはバリアントの少なくとも一部であり得るか、または当該一部を含み得る。さらに、上記mRNAは、これらの配列の少なくとも2つの組合せ、その断片、相同物もしくはバリアント組合せを含み得る。
例えばインビボ分解(例えば、エンドヌクレアーゼまたはエキソヌクレアーゼによる)に対する、耐性のさらなる向上のために、本発明のmRNAは、例えば修飾核酸の形態において、安定化された核酸配列として提供され得る。したがって、本発明のさらなる実施形態によれば、本発明のmRNAは、好ましくは骨格修飾、糖修飾および/または塩基修飾によって安定化されていること、より好ましくはG/C含有量の変更によって安定化されていることが好ましい。これらの変更のすべては、翻訳されるmRNAの機能(呼吸器合胞体ウイルス(RSV)のペプチドまたはタンパク質に由来する抗原性機能)を妨げることなく、本発明のmRNAに導入され得る。
本発明に関連する骨格修飾は、本発明のmRNAに含まれているヌクレオチドの骨格のリン酸が、化学的に修飾される修飾(例えば、アニオン性のヌクレオチド間結合、N3’→N5’修飾、非架橋酸素原子の、水素化ホウ素による置換、中性のヌクレオチド間結合、複数のヌクレオチドのアミド結合、メチレン(メチルアミノ)結合、ホルムアセタールおよびチオホルムアセタール結合、またはスルホニル基の導入など)であることが好ましい。
本発明に関連する糖修飾は、本発明のmRNAのヌクレオチドの糖の化学修飾(例えば、リボース残基のメチル化など)であることが好ましい。
他の実施形態によれば、本発明のmRNAは、本発明のmRNA(好ましくはそのコード領域)のG(グアノシン)/C(シトシン)含有量を変更することによって、修飾され得、かつ安定化され得る。
本明細書において、好ましくはコード領域の、本発明のmRNAのG/C含有量は、その特定の野生型コード領域(すなわち未修飾のmRNA)のG/C含有量と比べて、特に向上されている。しかし、本発明のmRNAのコードされているアミノ酸配列は、特定の野生型/未修飾のmRNAのコードされているアミノ酸配列と比べて、変更されていないことが好ましい。
本発明のmRNAのG/C含有量の変更は、向上したG(グアノシン)/C(シトシン)含有量を有しているRNA配列が、向上したA(アデノシン)/U(ウラシル)を有しているRNA配列より安定であることに基づいている。コード配列のコドンまたは全RNAは、したがって、それらがG/Cヌクレオチドの向上した量を含んでおり、翻訳されたアミノ酸配列が維持されているように、野生型のコード配列またはmRNAと比べて変更され得る。いくつかのコドンが1つの同じアミノ酸をコードしていることに関して、安定性に有利なコドンのほとんどが、決定され得る(いわゆる代替的なコドンの利用)。好ましくは、本発明に係る本発明のmRNAのコード領域のG/C含有量は、野生型RNAのコードされる領域のG/C含有量と比べて、少なくとも7%、より好ましくは少なくとも15%、特に好ましくは少なくとも20%向上されている。特定の実施形態によれば、本明細書に規定されているようなタンパク質もしくはペプチド、またはその断片もしくはバリアントをコードしている領域、または野生型のmRNA配列もしくはコード配列の全配列における置換可能なコドンの、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、より好ましくは少なくとも70%、より一層好ましくは80%、最も好ましくは少なくとも90%、95%または100%が置換されて、それによって、上記配列のG/C配列を向上させている。これに関連して、特にコードにおける、本発明のmRNAのG/C含有量を最大まで(すなわち置換可能な100%のコドン)、野生型の配列と比べて向上させることが特に好ましい。
本発明のさらなる実施形態によれば、本発明のmRNAは、翻訳のために最適化されている(例えば、所定のアミノ酸のより低頻度のtRNAのためのコドンを、それぞれのアミノ酸の、より高頻度に存在するtRNAのためのコドンによって置換することによって翻訳のために最適化されている)。これは、翻訳効率がまた、細胞におけるtRNAの存在における異なる頻度によって決定されるという知見に基づいている。したがって、いわゆる「低頻度のコドン」が、向上された程度において本発明のmRNAに存在する場合、対応する修飾RNAは、より高頻度のtRNAをコードしているコドンが存在する場合と比べて顕著に低い程度において翻訳される。好ましくは、本発明のmRNAのコード領域は、細胞において相対的にまれなtRNAまたは低頻度のtRNAをコードしている、野生型配列の少なくとも1つのコドンが、細胞においてより高頻度または最も高頻度にあり、かつ相対的にまれなtRNAまたは低頻度のtRNAと同じアミノ酸を運ぶtRNAをコードしているコドンに交換されるように、野生型RNAまたはコード配列の対応する領域と比べて変更されている。この変更によって、本発明のmRNAの配列は、より高頻度に存在するtRNAが利用可能であるコドンが挿入されるように変更され得る。言い換えると、本発明によれば、この修飾によって、細胞において相対的にまれなtRNAをコードしている野生型配列のすべてのコドンは、細胞において相対的に高頻度のtRNAをコードしており、かつ相対的にまれなtRNAと同じアミノ酸を運ぶコドンにそれぞれについて交換され得る。さらに、本発明のmRNAのコード領域によってコードされているタンパク質(すなわちコード領域)のアミノ酸配列を変更することなく、本発明のmRNAにおいて向上されている(特に最大化されている)結果として生じるG/C含有量を、「高頻度の」コドンと結び付けることが特に好ましい。この好ましい実施形態は、特に効率的に翻訳され、安定化される(修飾されている)本発明のmRNAの提供を可能にする。
塩基の置換、付加または除去は、よく知られている部位特異的変異生成の手法による核酸分子の調製のためのDNAマトリクスを用いてか、またはオリゴヌクレオチド連結を用いて、好ましく実施される。そのような処理において、本発明に規定されているような本発明の組合せワクチンの少なくとも1つのRNAの調製のために、対応するDNA分子がインビトロ転写され得る。このDNAマトリクスは、調製される少なくとも1つのRNAのための所望されるヌクレオチド配列が後ろに続く、インビトロ転写にとって好適なプロモータ(例えば、T7またはS6プロモータ)、およびインビトロ転写のための終結シグナルを好ましくは含んでいる。少なくとも1つの所望のRNAのマトリクスを形成するDNA分子は、発酵性増殖および細菌において複製され得るプラスミドの一部としての続く単離によって調製され得る。本発明にとって好適であると述べられ得るプラスミドは、例えば、プラスミドpT7T(GenBank accession number U26404; Lai et al., Development 1995, 121: 2349 to 2360)、pGEM(登録商標)(例えば、pGEM(登録商標)−1)(GenBank accession number X65300; from Promega)、およびpSP64(GenBank accession number X65327)(Mezei and Storts, Purification of PCR Products, in: Griffin and Griffin (ed.), PCR Technology: Current Innovation, CRC Press, BocaRaton, FL, 2001も参照)。
特に好ましい実施形態において、本発明の第1の局面に係る本発明のmRNA配列は、
好ましくは5’から3’方向に、
a)本明細書に規定されているような5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1、または非構造タンパク質NS2に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしている、好ましくは野生型mRNAのコード領域のG/C含有量と比べて、向上しているか、または最大化されているG/C含有量を有している、コード領域;
c)好ましくは安定なmRNAをもたらす遺伝子、より好ましくは配列番号29にしたがう核酸配列の対応するRNA、またはその相同物、断片もしくはバリアントに由来する、本明細書に規定されているような3’UTRエレメント;
d)好ましくは64のアデノシンからなる、ポリ(A)配列;
e)任意に、好ましくは30のシトシンからなる、ポリ(C)配列;ならびに
f)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列、少なくとも1つのヒストン ステム−ループ配列
を含んでいる。
最も好ましくは、その特定の実施形態の、本発明のmRNAは、RSV longの融合タンパク質Fをコードしている本発明のmRNAの例を用いた、図1(配列番号31)に示されているような配列修飾を含んでいる。
特に好ましいさらなる実施形態において、本発明の第1の局面に係る本発明のmRNA配列は、
好ましくは5’から3’方向に、
a)本明細書に規定されているような5’キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
b)本明細書に規定されているような5’UTRエレメント、好ましくはTOP遺伝子の5’UTR(好ましくは配列番号23にしたがう、5’末端オリゴピリミジントラクトを欠いている人のリボソームタンパク質ラージ32の5’UTR)、またはその断片、相同物もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる5’UTRエレメント;
c)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G,短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、非構造タンパク質NS1もしくは非構造タンパク質NS2、またはその断片、バリアントもしくは誘導体に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしている、好ましくは野生型mRNAのコード領域のG/C含有量と比べて、向上されているか、または最大化されているG/C含有量を有している、コード領域;
d)3’UTRエレメント、好ましくは配列番号24にしたがうヒトのアルブミンの3’UTRもしくは対応するRNA、またはその相同物、断片もしくはバリアント;
e)好ましくは64のアデノシンからなる、ポリ(A)配列;
f)任意に、好ましくは20のシトシンからなる、ポリ(C)配列。
g)少なくとも1つのヒストン ステム−ループ、好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列
を含んでいる。
最も好ましくは、特定のその実施形態の、本発明のmRNAは、RSV longの融合タンパク質Fをコードしている本発明のmRNAの例を用いて、図2(配列番号32)に示されているような配列修飾を含んでいる。
より一層好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列は、配列番号31および配列番号35にしたがう図1〜5に示されている配列を含んでいるか、または当該配列からなる。
さらなる特定の実施形態において、例えば本発明のmRNAが、2つ以上の抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしている場合に、本発明に係るmRNAは、いくつかのオープンリーディングフレームを分離し得る内部リボソーム進入部位(IRES)配列またはIRESモチーフをさらに含み得る。IRES配列は、mRNAがバイシストロン性または多シストロン性のmRNAである場合に、特に有用である。
さらに、本発明のmRNAは、当該分野において知られている任意の方法(固層合成およびインビトロ法(例えばインビトロ転写反応)が挙げられる)を用いて調製され得る。
本発明の一実施形態によれば、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域を含んでいる本発明のmRNAは、本発明のmRNAまたはさらに含まれている核酸のトランスフェクション効率および/または免疫刺激特性を向上させるための、さらなる任意のビヒクル、トランスフェクション剤または複合化剤をともなうことなしに、露出させて投与され得る。
好ましい実施形態において、本発明のmRNAは、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物、および重合体担体とともに調合され得る。したがって、本発明のさらなる実施形態において、本発明のmRNA、または本発明の薬学的組成物に含まれている任意の他の核酸は、mRNAまたは核酸の、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体に対する、約6:1(w/w)〜約0.25:1(w/w)、より好ましくは約5:1〜約0.5:1(w/w)、より一層好ましくは約4:1〜約1:1(w/w)もしくは約3:1(w/w)〜約1:1(w/w)の範囲から選択される重量比、最も好ましくは約3:1〜約2:1(w/w)の比率;または任意に、約0.1〜10の範囲、好ましくは0.3〜4もしくは0.3〜1の範囲、最も好ましくは0.5〜1または0.7〜1の範囲、より一層好ましくは0.3〜0.9または0.5〜0.9の範囲における、mRNAまたは核酸の、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体に対する、窒素/リン酸比において、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体をともなっているか、またはこれらと複合化されていることが好ましい。
したがって、本発明の薬学的組成物に含まれている本発明のmRNAまたは任意の他の核酸はまた、本発明のmRNAまたは任意に含まれている、さらに含まれている核酸のトランスフェクション効率および/または免疫刺激特性を向上させるためのビヒクル、トランスフェクション剤または複合化剤をともない得る。
これに関連して、特に好ましい剤であるカチオン性またはポリカチオン性の化合物としては、プロタミン、ヌクレオリン、スペルミンもしくはスペルミジン、または他のカチオン性ペプチド(例えば、ポリ−L−リジン(PLL)、ポリアルギニン、塩基性ポリペプチド、細胞浸透性ペプチド(CPP)(HIV結合ペプチド、HIV−1 Tat(HIV)、Tat由来ペプチド、ペネトラチン、VP22誘導体ペプチドもしくはVP22類似ペプチド、HSV(単純ヘルペス)、MAP、KALAもしくはタンパク質伝達ドメイン(PTD)、PpT620、プロリンリッチペプチド、アルギニンリッチペプチド、リジンリッチペプチド、MPG−ペプチド、Pep−1、L−オリゴマー、カルシトシンペプチド、アンテナペディア由来ペプチド(特にDrosophila antennapediaに由来する)、pAntp、pIsl、FGF、ラクトフェリン、トランスポータン、ブフォリン−2、Bac715−24、SynB、SynB(1)、pVEC、hCT由来ペプチド、SAPまたはヒストンが挙げられる))が挙げられる。
これに関連して、プロタミンが特に好ましい。
さらに、好ましいカチオン性またはポリカチオン性のタンパク質またはペプチドは、以下の全体の式(III)を有している以下のタンパク質:
(Arg);(Lys);(His);(Orn);(Xaa) (式(III))
(ここで、l+m+n+o+x=8〜15、l、m、nまたはoのそれぞれは互いに独立して、Arg、Lys、HisおよびOrnの全体の含有量がオリゴペプチドの全アミノ酸の50%に相当する条件において、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15から選択される任意の数字であり;Xaaは、Arg、Lys、HisまたはOrn以外の天然の(天然に存在する)、または非天然のアミノ酸から選択される任意のアミノ酸であり得;xは、Xaaの全体の含有量がオリゴペプチドの全アミノ酸の50%を超えない条件において0、1、2、3または4から選択される任意の数字であり得る)から選択され得る。これに関連して、特に好ましいカチオン性のペプチドは、例えば、Arg、Arg、Arg、H、R、H、YSSRSSY、(RKH)、Y(RKH)Rなどである。これに関連して、WO2009/030481の開示事項は、参照によって本明細書に組み込まれる。
トランスフェクション剤または複合化剤として使用され得るさらなる好ましいカチオン性またはポリカチオン性の化合物としては、カチオン性の多糖(例えば、キトサン、ポリブレン)、カチオン性の重合体(例えば、ポリエチレンイミン(PEI))、カチオン性の脂質(例えば、DOTMA:[1−(2,3−シオレイオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメリルアンモニウムクロリド、DMRIE:ジ−C14−アミジン、DOTIM、SAINT、DC−Chol、BGTC、CTAP、DOPC、DOPAD,DOPE:ジオレイルホスファチジルエタノールアミン、DOSPA、DODAB、DOIC、DMEPC、DOGS:ジオクタデシルアミドグリシルスペルミン、DIMRI:ジミリスト−オキソプロピルジメチルヒドロキシエチルアンモニウムブロミド、DOTAP:ジオレイロキシル−3−(トリメチルアンモニオ)プロパン、DC−6−14:O,O−ジテトラデカノイル−N−(α−トリメチルアンモニオアセチル)ジエタノールアミンクロリド、CLOP1:rac−[(2,3−ジオクタデシルオキシプロピル)(2−ヒドロキシエチル)]−ジメチルアンモニウムクロリド、CLIP6:rac−[2(2,3−ジヘキサデシルオキシプロピロキシメチロキシ)エチル]−トリメチルアンモニウム、CLIP9:rac[2(2,3−ジヘキサデシルオキシプロピルオキシスクシニロキシ)エチル]−トリメチルアンモニウム、オリゴフェクタミン)、またはカチオン性もしくはポリカチオン性の重合体(例えば、修飾ポリアミノ酸(例えば、β−アミノ酸重合体または逆重合体))など、修飾ポリエチレン(例えば、PVP(ポリ(N−エチル−4−ビニルピリジニウムブロミド)))など、修飾アクリル酸塩(例えば、pDMAEMA(ポリ(ジメチルアミノエチルメチルアクリル酸塩)))など、修飾アミドアミン(例えば、pAMAM(ポリ(アミドアミン)))など、修飾ポリベータアミノエステル(PBAE)(例えば、ジアミン末端修飾の1,4ブタンジオールジアクリル酸塩−5−アミノ−1−ペンタノール共重合体)など、デンドリマー(例えば、ポリプロピルアミンデンドリマーまたはpAMAMに基づくデンドリマー)など、ポリイミン(例えば、PEI:ポリ(エチレンイミン)、ポリ(プロピレンイミン))など、ポリアリルアミン、糖骨格に基づく重合体(例えば、シクロデキストリンに基づく重合体、デキストランに基づく重合体、キトサン)など、シラン骨格に基づく重合体(例えば、PMOXA−PDMS共重合体)など、1つ以上のカチオン性ブロック(例えば、上述されているようなカチオン性の重合体から選択される)および1つ以上の親水性もしくは疎水性のブロック(例えば、ポリエチレングリコール)の組合せからなるブロック重合体などが挙げられ得る。
本発明にしたがって使用される重合体担体は、ジスルフィド架橋されたカチオン性の化合物によって形成される重合体担体であり得る。ジスルフィド架橋されたカチオン性の化合物は、互いに同じか、または異なり得る。重合体担体はまた、さらなる成分を含み得る。また、本発明にしたがって使用される重合体担体は、本明細書に記載されているようなジスルフィド結合によって架橋されている、カチオン性のペプチド、タンパク質もしくは重合体、および任意に本明細書に規定されているようなさらなる成分の混合物を含んでいることが好ましい。これに関連して、WO2012/013326の開示事項は、参照によって本明細書に組み込まれる。
これに関連して、ジスルフィド結合によって、重合体担体のための中心を形成するカチオン性の成分は、この目的に適した任意の好適なカチオン性またはポリカチオン性のペプチド、タンパク質または重合体(特に、本発明にしたがって規定されているようなmRNAまたは核酸を複合体化可能であり、これによってmRNAまたは核酸を好ましく縮合する、任意のカチオン性またはポリカチオン性のペプチド、タンパク質または重合体)から典型的に選択される。カチオン性またはポリカチオン性のペプチド、タンパク質または重合体は、直鎖状の分子であることが好ましいが、分枝鎖状のカチオン性またはポリカチオン性のペプチド、タンパク質または重合体も使用され得る。
本発明の薬学的組成物またはワクチンに含まれている本発明のmRNAまたはさらなる任意の核酸を複合体化するために使用され得る重合体担体の、ジスルフィド架橋されたカチオン性またはポリカチオン性のタンパク質、ペプチドまたは重合体は、本明細書に述べられているような重合体担体のカチオン性成分としての少なくとも1つのさらなるカチオン性またはポリカチオン性のタンパク質、ペプチドまたは重合体との縮合によってジスルフィド結合を形成可能な、少なくとも1つのSH−部分、最も好ましくは少なくとも1つのシステイン残基、またはさらなる任意の化学基を示すSH−部分を含んでいる。
以上に規定されている通り、本発明の薬学的組成物またはワクチンに含まれている本発明のmRNAまたはさらなる任意の核酸を複合体化するために使用され得る重合体担体は、ジスルフィド架橋されたカチオン性(ポリカチオン性)の成分によって形成され得る。
好ましくは、少なくとも1つのSH−部分を含んでいるか、または当該SH−部分を含めるために付加的に修飾されている、重合体担体のそのようなカチオン性またはポリカチオン性のペプチドまたはタンパク質または重合体は、複合化剤について以上に規定されているようなタンパク質、ペプチドおよび重合体から選択される。
さらなる特定の実施形態において、本発明の薬学的組成物またはワクチンに含まれている本発明のmRNAまたはさらなる核酸を複合体化するために使用され得る重合体担体は、一般式(IV):
L−P−S−[S−P−S]−S−P−L 式(IV)
にしたがう重合体担体分子から選択され、
およびPは、互いに同じか、または異なり、直鎖状または分枝鎖状の疎水性重合体鎖を表しており、PおよびPのそれぞれは、成分P(または当該成分がPおよびPまたはPおよびPの間におけるリンカーとして使用される場合に、代替的に(AA)、(AA)、もしくは[(AA)および/またはさらなる成分(例えば、(AA)、(AA)、[(AA)、またはL)との縮合によってジスルフィド結合を形成可能な、少なくとも1つの−SH部分を示しており、直鎖状または分枝鎖状の疎水性重合体鎖は互いに独立して、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ−N−(2−ヒドロキシプロピル)メタクリルアミド、ポリ−2−(メタクリロキシルオキシ)エチルホスホリルクロリン、ポリ(ヒドロキシアルキルL−アスパラギン)、ポリ(2−(メタクリロキシルオキシ)エチルホスホリルクロリン)、ヒドロキシエチルスターチまたはポリ(ヒドロキシアルキルL−グルタミン)から選択され、疎水性重合体鎖は、約1kDa〜約100kDa、好ましくは約2kDa〜約25kDa;より好ましくは約2kDa〜約10kDa(例えば、約5kDa〜約25kDaまたは5kDa〜約10kDa)の分子量を示し;
は、好ましくは約3〜約100のアミノ酸の長さ、より好ましくは約3〜約50のアミノ酸の長さ、より一層好ましくは約3〜25のアミノ酸(例えば、約3〜10、5〜15、10〜20または15〜25のアミノ酸)の長さ、より好ましくは約5〜20のアミノ酸の長さ、より一層好ましくは約10〜約20の長さを有している、ジスルフィド架橋された成分によって形成されている重合体担体のための、例えば本明細書に規定されているような、カチオン性またはポリカチオン性のペプチドまたはタンパク質であるか;または
約0.5kDa〜約30kDaの分子量(約1kDa〜約20kDa、より一層好ましくは約1.5kDa〜約10kDaの分子量)を典型的に有しているか、または約0.5kDa〜約100kDaの分子量(約10kDa〜約50kDa、より一層好ましくは約10kDa〜約30kDaの分子量が挙げられる)を有している、ジスルフィド架橋された成分によって形成されている重合体担体のための、例えば本明細書に規定されているような、カチオン性またはポリカチオン性のペプチドまたはタンパク質であり;
のそれぞれは、さらなる成分P、または(複数の)成分Pおよび/またはP、または代替的にさらなる成分(例えば(AA)、(AA)、または[(AA))とジスルフィド結合を形成可能な、少なくとも2つの−SH部分を示し;
−S−S−(大括弧はより読みやすいように省略されている)は、(可逆的な)ジスルフィド結合であり、Sは、好ましくは、(可逆的な)ジスルフィド結合を有している硫黄または−SHを担持する部分を表す。(可逆的な)ジスルフィド結合は、いずれかの成分PおよびP、PおよびP、またはPおよびP、または任意に、本明細書に規定されているようなさらなる成分(例えば、(AA)、(AA)、または[(AA)など)の−SH部分の縮合によって好ましく形成され;−SH部分は、これらの成分の構造の一部であり得るか、もしくは以下に規定されているような修飾によって加えられ得;
Lは、互いに独立して、RGD、トランスフェリン、フォレート、シグナルペプチドもしくはシグナル配列、局在化シグナルもしくは局在化配列、核局在化シグナルもしくは核局在化配列(NLS)、抗体、細胞透過性ペプチド(例えば、TATまたはKALA)、リガンドもしくは受容体(例えば、サイトカイン、ホルモン、成長因子など)、小分子(例えば、マンノースもしくはガラクトースのような炭水化物、または合成リガンド)、小分子アゴニスト、受容体の阻害剤もしくはアンタゴニスト(例えば、RGDペプチド模倣類似物)、または本明細書に規定されているようなさらなるタンパク質などから選択され得る、存在し得るか、または存在し得ない選択性のリガンド(ligand)であり;
nは、典型的に約1〜50の範囲、好ましくは約1、2もしくは3〜30、より好ましくは約1、2、3、4もしくは5〜25の範囲、または好ましくは約1、2、3、4もしくは5〜20の範囲、または好ましくは約1、2、3、4もしくは5〜15の範囲、好ましくは約1、2、3、4もしくは5〜10の範囲(約4〜9、4〜10、3〜20、4〜20、5〜20もしくは10〜20の範囲、または約3〜15、4〜15、5〜15、10〜15の範囲、または約6〜11もしくは7〜10の範囲が挙げられる)から選択される整数である。最も好ましくは、nは、約1、2、3、4もしくは5〜10の範囲、より好ましくは1、2、3もしくは4〜9の範囲、1、2、3もしくは4〜8の範囲、または1、2もしくは3〜7の範囲にある。
これに関連して、WO2011/026641の開示事項は、参照によって本明細書に組み込まれる。親水性重合体PおよびPのそれぞれは、少なくとも1つの−SH部分を典型的に示し、ここで、少なくとも1つの−SH部分は、PおよびP、またはPおよびPの間におけるリンカーとして使用される場合に成分Pまたは成分(AA)もしくは(AA)との、および2つ以上の−SH部分が含まれている場合にさらなる成分(例えば、Lおよび/または(AA)もしくは(AA))との反応によってジスルフィド結合を形成可能である。上述の一般式(V)の範囲にある、以下の下位の式「P−S−S−P」および「P−S−S−P」(大括弧はより読みやすいように省略されており、S、PおよびPはいずれも本明細書に規定されている通りである)は、親水性重合体PおよびPの1つの−SH部分は上述の一般式(V)の成分Pの1つの−SH部分と縮合された状態を表しており、ここで、これらの−SH部分の両方の硫黄が、式(V)において本明細書に規定されている通りジスルフィド結合−S−S−を形成している。これらの−SH部分は、親水性重合体のPおよびPいずれかによって、例えば内部システイン、または−SH部分を有している任意のさらなる(修飾)アミノ酸もしくは化合物を介して、備えられている。したがって、下位の式「P−S−S−P」および「P−S−S−P」はまた、−SH部分がシステインによってもたらされる場合に「P−Cys−Cys−P」および「P−Cys−Cys−P」とも記載され得、ここで、Cys−Cysという用語は、ペプチド結合ではなく、ジスルフィド結合を介して結合されている2つのシステインを表している。この場合に、これらの式における「−S−S−」という用語は、「−S−Cys」、「−Cys−S」または「−Cys−Cys−」とも記載され得る。これに関連して、「−Cys−Cys−」という用語は、ペプチド結合を表しておらず、ジスルフィド結合を形成するためのそれらの−SH部分を介した2つのシステインの結合を表している。したがって、「−Cys−Cys−」という用語はまた、「−(Cys−S)−(Cys−S)−」と一般的に理解され得、ここで、特定の場合に、Sはシステインの−SH部分の硫黄を示している。同様に、「S−Cys」および「−Cys−S」という用語は、−SHを含んでいる部分およびシステインの間におけるジスルフィド結合を示しており、「−S−(S−Cys)−」および「−Cys−S−S」とも記載され得る。代替的に、親水性重合体PおよびPは、好ましくは−SH部分を保持している化合物との化学反応を介して、親水性重合体PおよびPのそれぞれが少なくとも1つの当該−SH部分を保持するように、−SH部分を用いて修飾され得る。−SH部分を保持している当該化合物は、(さらなる)システイン、または−SH部分保持しているさらなる任意の(修飾)アミノ酸であり得る。当該化合物はまた、本明細書に規定されているような親水性重合体PおよびPに−SH部分を含んでいるか、または導入可能な任意の非アミノ酸化合物または非アミノ酸部分であり得る。当該非アミノ酸化合物は、例えば、3−チオプロピオン酸もしくはチオイモランの結合、アミド形成(例えば、カルボン酸、スルホン酸、アミンなど)、ミカエル付加(例えば、マレイミド部分、α,β不飽和カルボニルなど)、クリックケミストリー(例えば、アジドまたはアルキン)、アルケン/アルキンメサテシス(methatesis)(例えば、アルケンまたはアルキン)、イミンまたはヒドラゾンの形成(アルデヒドもしくはケトン、ヒドラジン、ヒドロキシアミン、アミン)、錯体形成反応(アビジン、ビオチン、タンパク質G)またはS型置換反応を可能にする構成要素(例えば、ハロゲンアルカン、チオール、アルコール、アミン、ヒドラジン、ヒドラジド、スルホン酸エステル、オキシホスホニウム塩)もしくはさらなる構成要素の結合に利用され得る他の化学部分による、化学反応または化合物の結合を介して、本発明に係る重合体担体の、式(V)の親水性重合体PおよびPに結合され得る。これに関連して、特に好ましいPEG誘導体は、アルファメトキシオメガメルカプトポリ(エチレングリコール)である。それぞれの場合に、例えばシステインまたはさらなる任意の(修飾)アミノ酸または化合物の、SH部分は、親水性重合体PおよびPの、末端または任意の位置の内部に存在し得る。本明細書に規定されている通り、親水性重合体PおよびPのそれぞれは、好ましくは末端おける、少なくとも1つの−SH部分を典型的に示しているが、本明細書に規定されているようなさらなる構成要素(例えば、リガンド、アミノ酸要素(AA)もしくは(AA)、抗体、細胞透過性ペプチド、またはエンハンサペプチド(例えば、TAT、KALA)など)を付加的に結合するために使用され得る2つ以上の−SH部分を示し得る。
これに関連して、本発明のmRNAは、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体、好ましくはカチオン性またはポリカチオン性のタンパク質またはペプチドと、少なくとも部分的に複合体化されていることが好ましい。これに関連して、WO2010/037539およびWO2012/113513は、参照によって本明細書に組み込まれる。本発明のmRNAの一部のみが、カチオン性の化合物と複合体化されており、本発明のmRNAの残りが、複合体化されていない形態(「遊離」)にある(本発明の薬学的組成物またはワクチンに含まれている)ことを部分的に意味している。好ましくは、(本発明の薬学的組成物またはワクチンにおける)複合体化されたmRNA:遊離mRNAの比率は、約5:1(w/w)〜約1:10(w/w)の範囲、より好ましくは約4:1(w/w)〜約1:8(w/w)の範囲、より一層好ましくは約3:1(w/w)〜約1:5または1:3(w/w)の範囲から選択され、最も好ましくは、本発明の薬学的組成物またはワクチンにおける遊離mRNAに対する複合体化されたmRNAの比率は、約1:1(w/w)の比率から選択される。
本発明の薬学的組成物またはワクチンにおいて複合体化されているmRNAは、好ましくは本明細書に規定されているような、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体と本発明のmRNAを、安定な複合体を形成するための特定の割合において、複合体化させる第1のステップにしたがって好ましく調製される。これに関連して、mRNAの複合体化後において、構成要素または複合体化されたmRNAには、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物もしくは重合体担体が残っていないか、または無視できるほどに少量のそれらしか残っていないことが、非常に好ましい。したがって、複合体化されたmRNAの構成要素における、mRNAならびにカチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体の比率は、mRNAが全体的に複合体化されており、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物もしくは重合体担体が残っていないか、または無視できるほどに少量のそれらしか残っていない範囲において典型的に選択される。
好ましくは本明細書に規定されているような、mRNAの、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体に対する比率は、約6:1(w/w)〜約0.25:1(w/w)の範囲、より好ましくは約5:1(w/w)〜約0.5:1(w/w)の範囲、より一層好ましくは約4:1(w/w)〜約1:1(w/w)または約3:1(w/w)〜約1:1の範囲、最も好ましくは約3:1〜約2:1(w/w)の範囲から選択されることが好ましい。代替的に、好ましくは本明細書に規定されているような、mRNAの、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体に対する比率はまた、複合体全体の窒素/リン酸比(N/P比)に基づいて算出され得る。本発明の関連において、mRNA:好ましくは本明細書に規定されているような、カチオン性またはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体の、複合体における比率について、複合体におけるカチオン性またはポリカチオン性の化合物が、カチオン性またはポリカチオン性のペプチドもしくはタンパク質、および/または本明細書に規定されているような重合体担体である条件のもとに、N/P比は、約0.1〜10の範囲、好ましくは0.3〜4の範囲、最も好ましくは約0.5〜2または0.7〜2の範囲、最も好ましくは約0.7〜1,5、0.5〜1または0.7〜1の範囲、さらに最も好ましくは0.3〜0.9または0.5〜0.9の範囲にあることが好ましい。
さらなる局面において、本発明は、複数または2を超えて、好ましくは2〜10、より好ましくは2〜5、最も好ましくは2〜4の、本明細書に規定されているような本発明のmRNAを含んでいる組成物を提供する。これらの本発明の組成物は、好ましくは異なる複数の病原性抗原、またはその断片、バリアントもしくは誘導体を含んでいる異なる複数のペプチドまたはタンパク質を好ましくコードしている、2以上の本発明のmRNA配列を含んでいる。これに関連して、少なくとも1つのmRNA配列は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質Fに由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしていること、ならびに少なくとも1つのmRNAは、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の他の抗原(特に核酸タンパク質NまたはM2−1タンパク質に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしていることが特に好ましい。
これに関連して、抗原の特に好ましいさらなる組合せは、
・F+G(血清型A)+G(血清型B)
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+M2−1
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M2−1
・F+M2−1+N
・F+M2−1
・F+N
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M2−1+P+M−2+M+L
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M2−1+P+M2−2+M
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M−2+P+M2−2+L
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M−2+P+M+L
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+M−2+M2−2+M+L
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+N+P+M2−2+M+L
・F+G(血清型A)+G(血清型B)+M2−2+P+M2−2+L
である。
したがって、特に好ましいさらなる局面において、本発明はまた、(1)本明細書に規定されているような少なくとも1つの本発明のmRNAを含んでいる薬学的組成物、または(2)本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNAおよび任意に薬学的に許容可能な担体および/またはビヒクルを含んでいる組成物を提供する。
第1の成分として、本発明の薬学的組成物は、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列の少なくとも1つを含んでいる。
第2の成分として、本発明の薬学的組成物は、少なくとも1つの付加的な薬学的に活性な構成要素を任意に含み得る。これに関する薬学的に活性な構成要素は、本明細書に述べられているような特定の徴候または疾患を治癒させるか、寛解させるか、または予防する治療有効性を有している化合物である。当該化合物としては、あらゆる限定を意味することなしに、好ましくは本明細書に規定されているような、ペプチドもしくはタンパク質、好ましくは本明細書に規定されているような、核酸、好ましくは本明細書に規定されているような、(治療に有効な)低分子量の有機化合物もしくは無機化合物(5000未満、好ましくは1000未満の分子量)、糖、抗原もしくは抗体、従来公知の治療剤、抗原性の細胞、抗原性の細胞性断片、細胞性画分;細胞壁成分(例えば多糖)、(化学的にか、または放射線照射によって)修飾、弱毒または不活性化されている病原体(例えば、ウイルス、細菌など)、好ましくは本明細書に規定されているような、アジュバントなどが挙げられる。これに関連して、特に好ましいのは、RSVワクチンまたはRSV免疫グロブリン(例えばPalivizumab(Synagis)(登録商標))である。
本発明の薬学的組成物は、経口的に、非経口的に、吸入噴霧によって、局所的に、直腸的に、鼻腔的に、口腔的に、経膣的にか、または埋め込み式のリザーバを介して、投与され得る。本明細書に使用されるとき、非経口という用語は、皮下、静脈内、筋肉内、関節内、滑液内、胸骨内、皮内、くも膜下腔内、肝臓内、病巣内、頭蓋内、経皮、皮内、肺内、腹膜内、心臓内、動脈内、および舌下の注入または導入の手法を包含している。
特に好ましいのは、皮内注入または筋肉内注入である。本発明の薬学的組成物の滅菌した注入可能な形態は、水性または油性の懸濁物であり得る。これらの懸濁物は、好適な分散剤もしくは湿潤剤、および懸濁剤を用いて、従来公知の手法にしたがって調合され得る。
特に好ましい実施形態において、本発明の薬学的組成物は、針に基づく従来の注入手法または針なしのシステム(例えばジェットインジェクション)を用いることによって、皮内または筋肉内の注入を介して投与される。好ましいさらなる実施形態において、本発明の薬学的組成物は、本明細書に規定されているようなジェットインジェクションによって投与され得る。好ましくは、本発明の薬学的組成物は、ジェットインジェクションによって筋肉内に投与され得る。他の実施形態によれば、薬学的組成物はジェットインジェクションによって皮内に投与される。
好ましい実施形態において、薬学的組成物は、好ましくは皮内または筋肉内の注入によって、好ましくはジェットインジェクションによって、1回、2回または3回にわたって投与され得る。一部の実施形態によれば、好ましくは皮内注入または筋肉内注入を介した、好ましくはジェットインジェクションを用いることによる、本発明の薬学的組成物の単回投与は、本発明に係るmRNA配列によってコードされている少なくとも1つの抗原に対する免疫応答を誘起するために、十分である。好ましい実施形態において、薬学的組成物の単回投与は、結果としてウイルスの中和を生じる免疫応答を誘起する。これに関連して、薬学的組成物の皮内または筋肉内の単回注入は特に好ましい。好ましくは、薬学的組成物のさらなる投与は、免疫応答を向上させるか、および/または延長させるために任意に実施され得る。
特定の実施形態によれば、本発明の薬学的組成物は、アジュバントを含み得る。これに関連して、アジュバントは、先天的な免疫系お免疫応答(すなわち非特異的な免疫応答)を開始または向上させるために好適な任意の化合物と理解され得る。言い換えると、投与されるときに、本発明の薬学的組成物は、当該薬学的組成物に任意に含まれているアジュバントに起因して、先天的な免疫応答を好ましく誘起させる。好ましくは、そのようなアジュバントは、この場合(すなわち哺乳類における先天的な免疫応答の誘導を補助する)に好適な、当業者に知られているアジュバント(例えば、本明細書に規定されているようなアジュバントタンパク質または以下に規定されているようなアジュバント)から選択され得る。
蓄積および送達にとって好適なアジュバントとして特に好ましいのは、本発明のmRNA配列のとってのビヒクル、トランスフェクション剤または複合化剤としての、以上に規定されているようなカチオン性またはポリカチオン性の化合物であり得る。
さらに、本発明の薬学的組成物は、好ましくは病原体関連分子パターン(PAMP)に結合することによって、先天的な免疫系の免疫応答(すなわち非特異的な免疫応答)を開始または向上させるために好適な、1つ以上の付加的なアジュバントを含み得る。言い換えると、投与されるときに、薬学的組成物またはワクチンは、それらに任意に含まれているアジュバントに起因して先天的な免疫応答を誘起する。好ましくは、そのようなアジュバントは、この場合(すなわち哺乳類における先天的な免疫応答の誘導を補助すること)に好適な、当業者に知られているアジュバント(例えば、本明細書に規定されているようなアジュバントタンパク質または以下に規定されているようなアジュバント)から選択され得る。一実施形態によれば、そのようなアジュバントは、本明細書に規定されているようなアジュバントから選択され得る。
また、そのようなアジュバントは、この場合(すなわち哺乳類における先天的な免疫応答の誘導を補助すること)に好適な、および/または本発明の薬学的組成物またはワクチンの構成要素の蓄積および送達にとって好適な、当業者に知られている任意のアジュバントから選択され得る。蓄積および送達にとって好適なアジュバントして好ましいのは、以上に規定されているようなカチオン性またはポリカチオン性の化合物である。同様に、アジュバントは、例えば、本明細書に規定されているようなカチオン性またはポリカチオン性の化合物からなる群、キトサン、TDM、MDP、ムラミルジペプチド、Pluronic、乳酸アルミニウム容器、水酸化アルミニウム、ADJUMERTN(ポリホスファゼン);リン酸アルミニウムゲル;藻類に由来するグルカン;プルロニクス;水酸化アルミニウムゲル(alum);タンパク質高吸着性の水酸化アルミニウムゲル;低粘度の水酸化アルミニウムゲル;AFもしくはSPT(スクアラン(5%)、Tween 80(0.2%)、Pluronic L121(1.25%)、リン酸緩衝化生理食塩水、pH7.4);AVRIDINETM(プロパンジアミン);BAY R1005TM((N−(2−デオキシ−2−L−ロイシルアミノブ−D−グルコピラノシル)−N−オクタデシル−アミド ヒドロ酢酸塩);CALCITROLTM(1−アルファ,25−ジヒドロキシ−ビタミンD3);リン酸カルシウムゲル;CARTM(リン酸カルシウムナノ粒子);コレラホロトキシン;コレラトキシンのコレラ−トキシン−A1−タンパク質−A−D−断片融合タンパク質,サブユニットB;CRL 1005(ブロック共重合体P1205);サイトカイン含有リポソーム;DDA(ジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド);DHEA(デヒドロエピアンドロステロン);DMPC(ジメチルホスファチジルコリン);DMPG(ジミリストイルホスファチジルグリセロール);DOC/alum複合体(デオキシコリン酸のナトリウム塩);フロイント完全アジュバント;フロイント不完全アジュバント;ガンマイヌリン;Gerbuアジュバント(i)N−アセチルグルコサミニル−(P1−4)−N−アセチルムラミル−L−アラニル−D35 グルタミン(GMDP)、ii)ジメチルジオクタデシルアンモニウムクロリド(DDA)、iii)亜鉛−L−プロリン塩複合体(ZnPro−8)の混合物);GM−CSF;GMDP(N−アセチルグルコサミニル−(b1−4)−N−アセチルムラミル−L47 アラニル−D−イソグルタミン);イミキモド(−(2−メチプロピル)−1H−イミダゾ[4,5−c]キノリン−4−アミン);ImmTher(商標);DRV(脱水−再水和ビヒクルから調製された免疫リポソーム);インターフェロンガンマ;インターロイキン−1ベータ;インターロイキン−2;インターロイキン−7;インターロイキン−12;ISCOMSTM;ISOCOPREP7.0.3.TM;リポソーム;LOXORIBINETM(7−アリル−8−オキソグアノシン);LT 5 経口アジュバント(E.coliの不安定エンテロトキシン−プロトキシン);任意の組成の微小球および微小粒子;MF59TM;(スクアレン水乳液);MONTANIDE ISA 51TM(精製されたフロイント不完全アジュバント);MONTANIDE ISA 720TM(代謝可能な油状アジュバント);MPLTM(3−Q−デサシル−4’−モノホスホリル脂質A);MTP−PE;およびMTP−PEリポソーム((N−アセチル−L−アラニル−D−イソグルタミニル−L−アラニン−2−(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−(ヒドロキシホスホリロキシ))エチルアミド)の1ナトリウム塩);MURAMETINETM(Nac−Mur−L−Thr−D−isoGln−sn−グリセロールジパルミトイル);NAGO(ノイラミニダーゼ−ガラクトースオキシダーゼ);任意の組成の微小球および微小粒子;NISV(非イオン性界面活性剤のビヒクル);PLEURANTM(β−グルカン);PLGA、PGAおよびPLA(乳酸およびグリコール酸のホモ共重合体;ミクロスフェア/ナノスフェア);PLURONIC L121TM;PMMA(ポリメチルメタクリル酸);PODDSTM(プロテノイドミクロスフェア);ポリエチレンカルバミン酸塩誘導体;ポリrA:ポリrU(ポリアデニル酸−ポリウリジル酸の複合体);ポリソルベート80(Tween80);タンパク質コクリエート(cochleate)(Avanti Polar Lipids, Inc., Alabaster, AL);STIMULONTM(QS−21);Quil−A(Quil−Aサポニン);S−28463(4−アミノ−otec−ジメチル−2−エトキシメチル−1H−イミダゾ[4,5−c]キノリン−1−エタノール);SAF−1TM(「Syntexアジュバント調製物」);SendaiプロテオリポソームおよびSendai含有脂質マトリクス;Span−85(ソルビタントリオレイン酸塩);Specl(Marcol52、Span85およびTween85の乳液);スクアレン、すなわちRobane(登録商標)(2,6,10,15,19,23−ヘキサメチルテトラコサンおよび2,6,10,15,19,23−ヘキサメチル−2,6,10,14,18,22−テトラコサヘキサン);ステアリルチロシン(オクタデシルチロシンヒドロクロリド);Theramid(登録商標)(N−アセチルグルコサミニル−N−アセチルムラミル−L−Ala−D−isogGlu−L−Alaジパルミトキシプロピルアミド);Theronyl−MDP(TermurtideTM or [thr 1]-MDP;N−アセチルムラミル−Lスレオニル−D−イソグルタミン);Ty粒子(Ty−VLPすなわりウイルス様粒子);Walter-Reedリポソーム(水酸化アルミニウムに吸収されている脂質Aを含んでいるリポソーム)、およびリポペプチド(特定のアルミニウム塩におけるPam3Cys(例えば、Adju−phos、Alhydrogel、Rehydrogel)が挙げられる)、乳液(CFA、SAF、IFA、MF59、Provax、TiterMax、Montanide、Vaxfectinが挙げられる);共重合体(Optivax(CRL1005)、L121、Poloaxmer4010)などが挙げられる);リポソーム(Stealthが挙げられる)、コクリエート(BIORAL);植物由来のアジュバント(Q521、Quil A、Iscomatrix、ISCOMが挙げられる);共刺激のための安定なアジュバント(Tomatineが挙げられる)、生体高分子(PLG、PMM、Inulinが挙げられる)、微生物由来のアジュバント(Romurtide、DETOX、MPL、CWS、Mannose、CpG核酸配列、CpG7909、ヒトTLR1〜10のリガンド、マウスTLR1〜13のリガンド、ISS−1018、35 IC31、Imidazoquinoline、Ampligen、Ribi529、IMOxine、IRIV、VLP、コレラトキシン、熱不安定性毒素、Pam3Cys、Fkagellin、GPIアンカー、LNFPIII/Lweis X、抗菌ペプチド、UC−1V150、RSV融合タンパク質cdiGMPが挙げられる);およびアンタゴニストとして安定なアジュバント(CGRP神経ペプチドが挙げられる)から選択され得る。
特に好ましいアジュバントは、Th1免疫応答またはナイーブT細胞の成熟の誘導を補助するアジュバント(例えば、GM−CSF、IL−12、IFNg、以上に規定されているような任意の免疫刺激性核酸(好ましくは、免疫刺激性RNA、CpG DNAなど)から選択され得る。
さらなる好ましい実施形態において、本発明の薬学的組成物はまた、さらなる抗原もしくはさらなる抗原性をもたらす核酸;さらなる免疫治療剤;1つ以上の補助物質;またはヒトのトル様受容体に対するその結合親和性に起因して(リガンドとして)免疫刺激すると知られているさらなる任意の成分;および/またはアジュバント核酸(好ましくは免疫刺激性RNA(isRNA))からなる群から選択されるさらなる成分を、抗原性をもたらすmRNAに加えて、含んでいることが見込まれる。
本発明の薬学的組成物は、所望される場合に、その免疫原性または免疫刺激能を向上させるために、1つ以上の補助物質を付加的に含み得る。本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、および本発明の薬学的組成物に必要に応じて含まれ得る補助物質の相乗作用は、それによって好ましく実現される。補助物質の種々の型に依存して、種々の機序は、この観点において考慮に入れられ得る。例えば、リポ多糖、TNF−アルファまたはCD40リガンドは好適な補助物質の分類を形成している。一般的に、目的の様式において、免疫応答を向上させるか、および/または免疫応答に影響することを可能にする「危険信号」(LPS、GP96など)またはサイトカイン(例えばGM−CFS)の様式において、免疫系に影響する任意の作用物質を補助物質として使用することが見込まれる。特に好ましい補助物質は、先天性の免疫応答をさらに促進するサイトカイン(例えば、モノカイン、リンフォカイン、インターロイキンまたはケモカイン(例えば、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−12、IL−13、IL−14、IL−15、IL−16、IL−17、IL−18、IL−19、IL−20、IL−21、IL−22、IL−23、IL−24、IL−25、IL−26、IL−27、IL−28、IL−29、IL−30、IL−31、IL−32、IL−33、IFN−アルファ、IFN−ベータ、IFN−ガンマ、GM−CSF、M−CSF、LT−ベータ、またはTNF−アルファ、成長因子(例えばhGH)))である。
本発明の薬学的組成物に含められ得るさらなる添加剤は、乳剤(例えばTween(登録商標)など);湿潤剤(例えば、ラウリル硫酸ナトリウムなど);着色剤;味質付加剤、薬学的な担体;タブレット形成剤;安定化剤;抗酸化剤;保存剤である。
本発明の薬学的組成物はまた、ヒトのトル様受容体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、またはマウスのトル様受容体TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10、TLR11、TLR12もしくはTLR13に対するその結合親和性に起因して(リガンドとして)免疫刺激すると知られている、さらなる任意の化合物を付加的に含み得る。
これに関連して、必要に応じて含まれているアジュバント成分は、本発明の薬学的組成物に含まれている抗原性をもたらすmRNA(例えば、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているmRNA)と同じ本発明のmRNAを含んでいることが、特に好ましい。
しかし、本発明の薬学的組成物は、薬学的組成物の投与および薬学的組成物の成分の取り込みを促進するためのさらなる成分を含み得る。そのようなさらなる成分は、適切な担体もしくはビヒクル、任意の免疫応答を補助するための付加的なアジュバント、抗菌剤および/または抗ウイルス剤であり得る。
したがって、さらなる実施形態において、本発明の薬学的組成物は、薬学的に許容可能な担体および/またはビヒクルをさらに含んでいる。
そのような薬学的に許容可能な担体は、本発明の薬学的組成物の成分を含んでいる組成物の脂質または非脂質基剤を典型的に含んでいる。組成物が脂質の形態においてもたらされている場合、担体は、典型的に、発熱物質を含んでいない水、等張性の生理食塩水または緩衝化(水性)溶液(例えば、リン酸、クエン酸などの緩衝化溶液)である。注入バッファーは、特定の基準培地を基準にして高張性、等張性または低張性(すなわちバッファーは、特定の基準培地を基準にしてより高い塩含有量、同一の塩含有量、またはより低い塩含有量を有している)であり得、ここで、好ましくは、浸透圧作用または他の濃度作用に起因する細胞の障害を導かないような、上述の塩の濃度が、使用され得る。基準培地は、例えば、「インビボ法」に見出される液体(例えば、血液、リンパ液、細胞基質液または他の体液)、または例えば、「インビトロ」法において基準培地として使用され得る液体(例えば、通常のバッファーまたは液体)である。そのような通常のバッファーまたは液体は、当業者に知られている。乳酸リンガー溶液は、液体の材料として特に好ましい。
しかし、処置される患者への投与に好適な、1つ以上の適合性の固体または液体の、充填剤または希釈剤または封入化合物は、本発明に係る薬学的組成物についてと同様に使用され得る。本明細書に使用されるとき、「適合性」という用語は、本発明の薬学的組成物のこれらの成分が、典型的な使用条件における薬学的組成物の薬学的有効性を大きく減ずる相互作用を起こさない様式において、本発明の薬学的組成物の成分と混合可能であることを意味する。
本発明の薬学的組成物のさらなる成分は、免疫グロブリン、好ましくはIgG、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、または(複数の)ポリクローナル血清など、最も好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)を対象にしている免疫グロブリン(例えばPalivizumab)から選択され得る免疫治療剤であり得る。好ましくは、そのようなさらなる免疫治療剤は、ペプチド/タンパク質として準備され得るか、または核酸、好ましくはDNAもしくはRNA、より好ましくはmRNAによってコードされ得る。そのような免疫治療剤は、本発明の抗原性をもたらすmRNAによって標的化されている能動的なワクチン接種に加えて、受動的なワクチン接種をもたらすことを可能にする。
さらに、特定の実施形態において、抗原性をもたらすmRNAに加えて、さらなる抗原は、本発明の薬学的組成物に含められ得、典型的に、細胞、細胞溶解液、ウイルス、弱毒化ウイルス、不活性化ウイルス、タンパク質、ペプチド、核酸、または他の生体分子もしくは他の生体高分子(またはその断片)などの物質である。好ましくは、抗原は、タンパク質およびペプチド(例えば、好ましくは5〜15、より好ましくは6〜9アミノ酸を有している、これらのタンパク質またはペプチドのエピトープ)、またはその断片であり得る。特に、上記タンパク質、ペプチドまたはエピトープは、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1もしくは非構造タンパク質NS2、またはこれらの断片、バリアントもしくは誘導体に由来し得る。さらに、抗原はまた、任意の他の生体分子(例えば、脂質、炭水化物など)を含み得る。好ましくは、抗原は、タンパク質もしくは(ポリ)ペプチドの抗原、核酸、タンパク質もしくは(ポリ)ペプチドの抗原をコードしている核酸、多糖の抗原、多糖と結合された抗原、脂質の抗原、糖脂質の抗原、細菌、細胞(ワクチン)、または死滅させたウイルスもしくは弱毒化されたウイルスである。
本明細書に規定されているような本発明の薬学的組成物またはワクチンは、さらなる添加剤または付加的な化合物をさらに含み得る。薬学的組成物に含まれ得るさらなる添加剤は、乳剤(例えばTween(登録商標)など);湿潤剤(例えばラウリル硫酸ナトリウムなど);着色剤;味質付加剤、薬学的担体;タブレット形成剤;安定化剤:抗酸化剤;保存剤;RNA阻害剤および/または抗菌剤もしくは抗ウイルス剤である。さらに、本発明の薬学的組成物は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の遺伝子を対象にする低分子干渉RNA(siRNA)(例えば、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、リン酸タンパク質P、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、非構造タンパク質NS1または非構造タンパク質NS2をコードしている遺伝子を対象にするsiRNA)を包含し得る。本発明の薬学的組成物は、本発明の薬学的組成物の、「安全かつ有効な量の」成分、特に本明細書に規定されているような(複数の)本発明のmRNA配列、を典型的に含んでいる。本明細書に使用されるとき、「安全かつ有効な量」は、疾患もしくは障害の改善に向かう変化を大きく誘導するため、または疾患(好ましくは本明細書に規定されているようなRSV感染)を予防するために十分である、本明細書に規定されているような(複数の)本発明のmRNA配列の量を意味する。しかし同時に、「安全かつ有効な量」は、副作用を避けるため、ならびに利点および危険性の目的に即した関係性を可能にするために十分に小さい。これらの境界の決定は、目的に即した医学的判断の範囲内にある。
本発明の薬学的組成物は、一般的な薬学的組成物またはワクチンとして、ヒトおよび獣医の医療目的(好ましくはヒトの医療目的)に使用され得る。
好ましい特定の他の局面によれば、本発明の薬学的組成物(すなわち本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物)は、ワクチンとして提供され得るか、または使用され得る。典型的に、そのようなワクチンは、薬学的組成物について、以上に規定されている。さらに、そのようなワクチンは、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物を典型的に含んでいる。
また、本発明のワクチンは、本発明の薬学的組成物にとっての、本明細書に規定されているような、薬学的に許容可能な担体、アジュバントまたはビヒクルを含み得る。特にこの本発明のワクチンに関連して、薬学的に許容可能な担体は、本発明のワクチンが投与される方法によって原則として決定され得る。本発明のワクチンは、例えば全身的または局所的に、投与され得る。全身投与のための経路としては、一般的に、例えば、経皮、経口、非経口(皮下、静脈内、筋肉内、動脈内、皮内、および腹腔内の注入、および/または鼻腔内投与経路が挙げられる)の経路が挙げられる。局所(local)投与のための経路としては、一般的に、例えば、局所(topical)投与経路だけでなく、皮内、経皮、皮下もしくは筋肉内の注入または病巣内、頭蓋内、肺内、心臓内および舌下の注入が挙げられる。より好ましくは、ワクチンは、皮内、皮下または筋肉内の経路であり得る。したがって、本発明のワクチンは、液体(ときに固体)の形態において好ましく調合され得る。
好ましい実施形態において、本発明のワクチンは、皮内または筋肉内の注入を介して、好ましくは従来の針に基づく注入手法を用いることによって、または針なしの系(例えば、ジェットインジェクション)を用いることによって、投与され得る。好ましいさらなる実施形態において、本発明のワクチンは、本明細書に規定されているようなジェットインジェクションによって投与され得る。好ましくは、本発明のワクチンは、ジェットインジェクションよって筋肉内に投与される。他の実施形態によれば、ワクチンは、ジェットインジェクションを介して皮内に投与される。
好ましい実施形態において、ワクチンは、好ましくは皮内または筋肉内の注入によって、1回、2回または3回にわたって投与され得る。一部の実施形態によれば、好ましくはジェットインジェクションを用いる、好ましくは皮内または筋肉内の注入を介した、本発明のワクチンの単回投与は、本発明に係るmRNAによってコードされている少なくとも1つの抗原に対する免疫応答を誘起するために十分である。好ましい実施形態において、ワクチンの単回投与は、ウイルスの中和を生じる免疫応答を誘起する。これに関連して、ワクチンの単独かつ単回の皮内または筋肉内の注入が特に好ましい。好ましくは、ワクチンのさらなる投与は、免疫応答を向上させるため、および/または延長させるために、任意に実施され得る。
本発明のワクチンは、必要に応じてその免疫原性または免疫刺激能を向上させるために、1つ以上の補助的な物質を付加的に含み得る。特に好ましいのは、薬学的組成物について規定されているような、補助的な物質または添加剤としてのアジュバントである。
さらなる局面において、本発明は、本発明のmRNA配列の成分、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明の薬学的組成物もしくはワクチン、ならびに任意に当該組成物の投与および用量についての情報を有している技術的な取扱説明書を備えているキットまたはキットの部分に関する。
本発明のmRNA配列の成分に加えて、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明の薬学的組成物またはワクチン 上記キットは、本明細書に規定されているような薬学的に許容可能なビヒクル、アジュバントおよび少なくとも1つのさらなる成分を付加的に含み得る。本発明のmRNAの成分、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明の薬学的組成物もしくはワクチン、および例えばアジュバントは、凍結乾燥された形態において提供され得る。したがって、好ましい実施形態において、ワクチン接種用のキットの使用前に、備えられているビヒクルは、例えば備えられている技術的な取扱説明書に、記載されているような予め決められている量において、凍結乾燥されている成分に加えられる。本発明のmRNA配列をそうすることによって、上述の局面に係る、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、以上に規定されているような方法において、後に使用され得る。
本発明は、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明の薬学的組成物、本発明のワクチン(いずれも本明細書に規定されているような本発明のmRNAを含んでいる)、または当該mRNAを含んでいるキットのいくつかの用途および使用をさらに提供する。
さらなる局面において、本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているmRNA配列、組成物、薬学的組成物、ワクチンおよびキット(いずれもRSV感染の予防処置および治療処置の方法における使用のためのmRNA配列を含んでいる)を提供する。したがって、さらなる局面において、本発明は、医薬として規定されているような、本発明のmRNA配列、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物、本発明のワクチン、および本発明のキットの第1の医療用途に関する。特に、本発明は、以上に規定されているような、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているmRNA配列の、医薬の調製のための、使用を提供する。
他の局面によれば、本発明は、本明細書に規定されているような呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているmRNA配列(必要に応じて、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる組成物、薬学的組成物またはワクチン、キットまたはキットの部分の形態における)の、本明細書に規定されているようなRSV感染の処置のための、第2の医薬用途に関する。特に、上述の通りの方法に使用される、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているmRNAは、薬学的組成物、必要に応じて添加されるアジュバントおよび以上に規定されているような必要に応じて添加されるさらなる成分(例えば、さらなる抗原またはRSV免疫グロブリン)とともに調合されるmRNA配列である。これに関連して、特に、乳児、老人および免疫障害のある患者の(予防的な)処置が好ましい。より一層好ましいのは、早期産児および慢性の肺疾患にかかっている乳児の(予防的な)処置である。
本発明のmRNA配列は、数回の用量によってRSV感染を予防または処置するために投与されるように、代替的に提供され得る。上記用量のそれぞれは、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしている本発明のmRNAを含んでおり、例えば、第1の用量は、融合タンパク質Fに由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質(またはその断片、バリアントもしくは誘導体)をコードしている少なくとも1つのmRNAを含んでおり、第2の用量は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の異なる抗原、好ましくは核タンパク質G(またはその断片、バリアントもしくは誘導体)、M2−1または糖タンパク質G(またはその断片、バリアントもしくは誘導体)に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしている少なくとも1つのmRNAを含んでいる。その実施形態によれば、両方の用量は、両方(例えば、融合タンパク質FをコードしているmRNAおよび核タンパク質NをコードしているmRNA)を含んでいる1つの単回組成物の投与と同じ免疫学的作用を実現するために、時差的な方法において(すなわち、続いて、一方の直後(例えば、10分未満、好ましくは2分未満のうち)に他方を)、身体の同じ部位に投与される。
特定の実施形態によれば、本発明のmRNA配列または本発明の薬学的組成物もしくはワクチンは、単回用量として患者に投与され得る。一部の実施形態において、本発明のmRNAまたは本発明の薬学的組成物もしくはワクチンは、単回用量、それに続く、第2の用量および必要に応じて第3、第4(またはそれ以降)の用量として患者に投与され得る。この実施形態によれば、本発明のmRNA配列または本発明の薬学的組成物もしくはワクチンを用いた追加接種は、第2(または第3、第4など)の接種に続いて、好ましくは以下に規定されているように、特定の期間において患者に投与され得る。これに関連して、数回の用量は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の同じ抗原ペプチドまたは抗原タンパク質(例えば、融合タンパク質F)をコードしている同じmRNA配列を含んでいることが特に好ましい。その実施形態において、容量は、特定の期間(例えば、20〜30日間)において与えられる。例えば、ばくろ後の予防のために、本発明のmRNA配列、または本発明の薬学的組成物もしくはワクチンの少なくとも5回の用量は、20〜30日間に投与され得る。
好ましい実施形態において、本発明のmRNA、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、好ましくは従来の針に基づく注入手法または針なしの系(例えば、ジェットインジェクション)を用いることによって、皮内または筋肉内の注入を介して投与される。好ましいさらなる実施形態において、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、本明細書に規定されているようなジェットインジェクションによって投与され得る。好ましくは、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、ジェットインジェクションによって筋肉内に投与される。他の実施形態によれば、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、ジェットインジェクションを介して皮内に投与される。
好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンは、好ましくは皮内または筋肉内の注入によって、好ましくはジェットインジェクションによって、1回、2回または3回にわたって投与され得る。一部の実施形態において、好ましくは皮内または筋肉内の注入を介した、好ましくはジェットインジェクションによる本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンの単回投与は、本発明に係るmRNA配列によってコードされている少なくとも1つの抗原に対する免疫応答誘起するために十分である。好ましい実施形態において、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンの単回投与は、ウイルスの中和を生じる免疫応答を誘起する。これに関連して、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンの、単独かつ単回の皮内または筋肉内の注入は、特に好ましい。好ましくは、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンのさらなる投与は、免疫応答を向上させるか、および/または延長させるために、必要に応じて実施され得る。
一部の実施形態において、本発明のmRNA配列、本発明の薬学的組成物またはワクチンを用いたそのような追加接種は、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列または本発明の薬学的組成物もしくはワクチンのために規定されているような、付加的な化合物または成分を利用し得る。
また、さらなる局面において、本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リン酸タンパク質P、非構造タンパク質NS1または非構造タンパク質NS2に由来する、コードされている抗原ペプチドまたは抗原タンパク質の発現のための方法を提供する。当該方法は、例えば、ステップa)本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物を、準備すること、ステップb)本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物を、発現系(例えば、無細胞発現系、細胞(例えば、発現宿主細胞または体細胞)、組織または生体)に使用することまたは投与することを包含している。上記方法は、検査室、研究、ペプチドもしくはタンパク質の工業生産および/または治療目的に適用され得る。これに関連して、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNA配列を含んでいる組成物を調製した後に、それは、露出した形態もしくは複合化された形態においてか、または本明細書に規定されているような薬学的組成物もしくはワクチンとして、好ましくはトランスフェクションを介してか、または本明細書に規定されている投与様式のいずれかを用いて、無細胞発現系、細胞(例えば、発現宿主細胞または体細胞)、組織または生体に対して、典型的に使用されるか、または投与される。上記方法は、インビトロ、インビボまたはエクスビボにおいて実施され得る。上記方法は、特定の疾患(特に感染性疾患、好ましくは本明細書に規定されているようなRSV感染)の処置に関連して、さらに実施され得る。
これに関連して、インビトロは、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNAを含んでいる本発明の組成物の、生体外にある培養細胞へのトランスフェクションまたは形質導入であると、本明細書において規定され;インビボは、本発明のmRNA配列、または複数の本発明のmRNAを含んでいる本発明の組成物の、当該本発明のmRNA配列または本発明の組成物の使用による、生体の全体または個体への、トランスフェクションまたは形質導入であると、本明細書において規定され;;エクスビボは、本発明のmRNA配列、または複数の本発明のmRNAを含んでいる本発明の組成物の、生体または個体の外にある細胞へのトランスフェクションまたは形質導入、ならびにトランスフェクションされた細胞の生体または個体への、続く使用であると、本明細書において規定される。
同様に、他の局面によれば、本発明はまた、例えば本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数の本発明のmRNAを含んでいる本発明の組成物を、例えば無細胞発現系、細胞(例えば、発現宿主細胞または体細胞)、組織または生体に対して、使用すること、または投与することによる、好ましくは診断目的もしくは治療目的、コードされている抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質の発現のための、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数のmRNA配列を含んでいる本発明の組成物の使用を提供する。上記使用は、検査室、研究、ペプチドもしくはタンパク質の工業生産用の診断、および/または治療目的に適用され得る。これに関連して、本明細書に規定されているような本発明のmRNA配列、または本明細書に規定されているような複数のmRNAを含んでいる本発明の組成物を調製した後に、それは、露出した形態もしくは複合化された形態においてか、または本明細書に規定されているような薬学的組成物もしくはワクチンとして、好ましくはトランスフェクションを介してか、または本明細書に規定されている投与様式のいずれかを用いて、無細胞発現系、細胞(例えば、発現宿主細胞または体細胞)、組織または生体に対して、典型的に使用されるか、または投与される。使用は、インビトロ、インビボまたはエクスビボにおいて実施され得る。使用は、特定の疾患(特に感染性疾患、好ましくは本明細書に規定されているようなRSV感染)の処置に関連して、さらに実施され得る。
さらなる局面において、本発明は、RSV感染の処置または予防の方法を提供する。当該方法は、以下のステップ:
a)本発明のmRNA配列、複数の本発明のmRNA配列を含んでいる組成物、本発明の薬学的組成物、または本明細書に規定されているような本発明のmRNAを含んでいるキットもしくはキットの部分を準備すること;
b)mRNA配列番号、組成物、薬学的組成物またはキットもしくはキットの部分を、組織または生体に使用すること、または投与すること;
c)必要に応じてRNA免疫グロブリンを投与すること
を包含している。
まとめると、本発明は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドまたはタンパク質をコードしているコード領域を含んでいるmRNA配列を、一部の局面において提供する。本発明のmRNA配列は、合胞体ウイルス(RSV)によって引き起こされる感染の予防的処置および治療的処置の方法における使用を目的としている。したがって、本発明は、RSV感染の予防的処置および/または治療的処置の方法における使用のための、本明細書に規定されているようなmRNA配列に関する。
本発明において、特に明記されていなければ、複数の代替物および実施形態の異なる特徴は、好適な場合に互いに組合せられ得る。さらに、「含んでいる」という用語は、特に言及がなされていない場合、「からなる」のみに限定して、狭く解釈されるべきではない。本発明に関して、「からなる」は、「含んでいる」が本明細書に使用されているいずれの場合にも、「含んでいる」の範囲にあることを、本発明者らによって特に意図されている実施形態である。
明細書に言及されているすべての刊行物、特許および特許出願は、個々の特許または特許出願のそれぞれが、参照によって本明細書に組み込まれると詳細かつ個々に示されているかのように、参照によって本明細書に組み込まれる。上述の発明は、例示および理解の容易さを目的として詳細に説明されているが、特定の変更および修正が添付の特許請求の範囲の精神または範囲から逸脱することなくなされ得ることは、本発明の教示を考慮した当業者にとって容易に明らかである。
〔図面の簡単な説明〕
以下に示されている図面は、単なる例証であり、さらなる一面において本発明を説明している。これらの図面は、それらに本発明を限定しているとは解釈されるべきではない。
図1:RSV long株のRSV−Fタンパク質(RSV−F long)をコードしているR1691の、RSV−F long mRNAワクチンに含まれている通りのG/C最適化されたmRNA配列(配列番号31)。
図2:RSV long株のRSV−Fタンパク質(RSV−F long)をコードしているR2510の、RSV−F long mRNAワクチンに含まれている通りのG/C最適化されたmRNA配列(配列番号32)。
図3:RSV long株(HSV−F−long)のRSV−F del554−574変異体タンパク質をコードしているR2821の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号33)。
図4:RSV long株(HSV−F−long)のRSV−Nタンパク質をコードしているR2831の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号34)。
図5:RSV long株(HSV−F−long)のRSV−M2−1タンパク質をコードしているR2833の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号35)。
図6:RSV−F long mRNAワクチンが、不活性化RSVに対する抗体力価に匹敵する、RSV−Fタンパク質に対する抗体力価を誘導することを示している。
メスのBALB/cマウスの内皮(i.d.)に、RSV−F long mRNAワクチン(160μgのR1691)またはバッファーコントロールとしての乳酸リンゲル液(RiLaバッファー)を注入した。1群の筋肉内(i.m.)に、10μgの不活性化RSV longワクチンを注入した。すべての動物は、21日および35日に追加注入を受け、血液サンプルを、実施例2に記載の通りに、プールされた抗体力価の決定のために49日に回収した。
明らかなように、RSV−F long mRNAワクチンは、サブクラスIgG1およびIgG2aの抗Fタンパク質抗体を誘導する。抗体力価はグラフに示されている(n=5 マウス/群)。
図7:RSV−F long mRNAワクチン(R1691)が、長期にわたる免疫応答をマウスにおいて誘導することを示している。
実験を実施例3に記載の通りに実施し、抗体の総IgG力価をELISAによって決定した。
明らかなように、抗体の力価は、最後の追加ワクチン接種後の少なくとも11か月にわたって安定である。
図8:RSV−F long mRNAワクチン(R1691)が、RSV Fusion(F)タンパク質特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。
実験を実施例4に記載の通りに実施し、T細胞を、細胞内のサイトカイン染色によって、抗原特異的な、サイトカインの誘導について分析した。細胞を、RSV−Fペプチド(stim.F;KYKNAVTEL)またはコントロールのインフルエンザHAペプチド(stim.HA;IYSTVASSL)によって刺激した。グラフにおける線は中央値を表している(n=5 マウス/群)。
明らかなように、RSV Fusion(F)タンパク質特異的な多機能性CD8T細胞を誘導し、対照的に、不活性化RSVに基づくワクチンは、Fタンパク質特異的なCD8T細胞を誘導できない。
図9:RSV−N mRNAワクチン(R2831)が、核タンパク質特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。
実験を実施例5に記載の通りに実施し、細胞を、ProMix RSV-M(15merペプチド)を用いた刺激後におけるサイトカインの抗原特異的な誘導について、細胞内サイトカイン染色によって分析した。グラフにおける線は、中央値を表している(n=5 マウス/群)。
明らかなように、RSV−N mRNAワクチンは、RSV核タンパク質(N)−特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導し、対照的に不活性化RSVに基づくワクチンは、Nタンパク質特異的なCD8T細胞を誘導できない。
図10:RSV−N mRNAワクチン(R2831)が、核タンパク質(N)−特異的な多機能性CD4細胞をマウスにおいて誘導することを示している。
実験を実施例5に記載の通りに実施し、T細胞を、ProMix RSV-M(15merペプチド)を用いた刺激後におけるサイトカインの抗原特異的な誘導について、細胞内サイトカイン染色によって分析した。グラフにおける線は、中央値を表している(n=5 マウス/群)。
明らかなように、RSV−N mRNAワクチンは、RSV核タンパク質(N)特異的な多機能性CD4T細胞を誘導し、対照的に、不活性化RSVに基づくワクチンは、Nタンパク質特異的なCD4T細胞を誘導しない。
図11:RSV−M2−1 mRNAワクチン(R2833)は、M2−1特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。
実験を実施例5に記載の通りに実施し、T細胞を、M2−1特異的な9merペプチドを用いた刺激後におけるサイトカインの抗原特異的な誘導について、細胞内サイトカイン染色によって分析した。グラフにおける線は、中央値を表している(n=5 マウス/群)。
明らかように、RSV−M2−1 mRNAワクチンは、RSV RSV−M2−1特異的な多機能性CD8T細胞を誘導し、対照的に、不活性化RSVに基づくワクチンは、M2−1タンパク質特異的なCD8T細胞をできない。
図12:単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574変異体=R2831)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンは、コットンラットにおいて液性免疫応答を誘導することを示している。
実験を実施例6に記載の通りに実施し、RSV−F特異的な総IgG力価を、49日にELISAによって決定した。血清を、後に示されている通り、異なる希釈率において分析した。
図13:単独(RSV−F、R2510;RSV−Fdel554−574変異体、R2821)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンが、ウイルス中和抗体力価によって示されている通り、コットンマウスにおいて機能的な抗体の形成を誘導することを示している。
実験を実施例6に記載の通りに実施し、49日におけるウイルス中和力価を、プラーク形成アッセイによって決定した。
図14:単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574変異体=R2821)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンが、RSVウイルスを用いて抗原投与されたコットンマウスにおいて、肺および鼻腔の力価を低下させることを示している。
実験を実施例6に記載の通りに実施した。
(A)RSV抗原投与感染後の5日における肺の力価。mRNAワクチンを用いてワクチン接種されたすべての動物群は、実施されたウイルス力価測定の検出レベル以下のウイルス力価を示し、ウイルスの肺の力価についてワクチン接種されたコットンラットの防御を証明している。mRNAワクチンと比べて、ホルマリン不活性化RSVに基づくワクチンは、肺におけるウイルス力価を抑制できなかった。
(B)RSV抗原投与感染後の5日における鼻腔の力価。また、鼻腔組織におけるウイルス力価は、mRNAを用いてワクチン接種された群において大きく低下した。mRNAと比べて、ホルマリン不活性化ウイルスに基づくワクチンは、鼻腔のウイルス力価を低下させ得なかった。
図15:実施例6に記載されているRSVコットンラット抗原投与試験から得られた肺の組織病理分析の結果を示している。
図16:ウイルスゲノムのコピー数(RSV NS−1遺伝子のコピー数を測定することによる)の定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)、または実施例6に記載されているRSVコットンラット抗原投与試験のRSV感染動物(またはコントロール)の肺組織からの、発現されたサイトカインの結果を示している。
図17:RSV−F mRNAワクチン(RSV−F=r2510;RSV F*(RSV−Fdel554−574変異体)R2821)が、RSVウイルスを用いて抗原投与されたコットンラットにおける肺の力価を低下させることを示している。
実験を実施例7に記載の通りに実施した。
(A)RSV抗原投与感染後の5日における肺力価。mRNAを用いて皮内にワクチン接種されたすべての動物群は、バッファーコントロール群と比べて低下したウイルス力価を示し、ウイルスの肺の力価についてワクチン接種されたコットンラットの防御を証明している。RSV−F mRNA枠地温の前もっての単回用量は、肺におけるウイルス力価を効果的に低下させた。
(B)―RSV抗原投与感染後の5日における肺の力価。また、肺におけるウイルス力価は、mRNAを用いて筋肉内にワクチン接種された群において強く低下された。
〔実施例〕
以下に示されている実施例は、単に例示であり、さらなる様式において本発明を説明している。これらの実施例は、それらに本発明を限定することを意図されていない。
(実施例1:mRNAワクチンの調製)
1.DNAコンストラクトおよびmRNAコンストラクトの調製
本実施例のために、RSV long株のRSV−Fタンパク質(R1691およびR2510)、RSV−F del554−574(R2821)変異タンパク質、RSV
N−タンパク質(R2831)およびRSV M2−1タンパク質(R2833)をコードしている複数のDNA配列を準備し、続くインビトロ転写反応に使用した。RSV−F del554−574変異タンパク質は、これまでに説明されている(Oomens et al. 2006. J. Virol. 80(21):10465-77)。
第1の調製にしたがって、上述のmRNAをコードしているDNA配列を調製した。コンストラクトR1691を、安定化のためのGC最適化配列(その後ろに、アルファ−グロビン−3’−UTR(配列番号29にしたがうmuag(変異されたアルファ−グロビン−3’−UTR))から得られた安定化配列、64のアデノシンのストレッチ(ポリ(A)配列)、30のシトシンのストレッチ、および配列番号30にしたがうヒストンステムループがある)を導入することによる野生型のコード配列を修飾することによって、調製した。配列番号31において(図1を参照)、対応するmRNAの配列が示されている。コンストラクトR2510、R2821、R2831およびR2833を、配列番号23にしたがうリボソームタンパク質32Lから得られた5’−TOR−UTRを導入すること、安定化のためのGC最適化配列(その後ろに、アルブミン−3’−UTR(配列番号25にしたがうアルブミン7)から得られた安定化配列、64のアデノシンのストレッチ(ポリ(A)配列)、30のシトシンのストレッチ(ポリ(C)配列)および配列番号30にしたがうヒストンステムループ)を導入することによって野生型のコード配列を変更することによって、調製した。配列番号32〜35(図2〜5を参照)において、対応するmRNAの配列が示されている。
Figure 2020014474
2.インビトロ転写
第1段落にしたがって調製したそれぞれのDNAプラスミドを、キャップ類似物(mGpppG)の存在下において、T7ポリメラーゼを用いて、インビトロにおいて転写させた。続いて、mRNAを、PureMessenger(登録商標)(CureVac、Tubingen、Germany;国際公開第2008/07592号)を用いて精製した。
3.試薬
複合化試薬:プロタミン。
4.ワクチンの調製
mRNAを、比率(1:2)(w/w)(免疫賦活成分)におけるプロタミンの、mRNAに対する添加によって、プロタミンと複合化させた。10分間のインキュベーション後に、抗原提示するmRNAとして使用された同量の遊離mRNAを加えた。
例えば:配列番号31にしたがうRSV Fタンパク質 long(R1691)をコードしている、2:1の比率(w/w)においてプロタミンと複合化されているmRNA、および配列番号31にしたがうRSV Fタンパク質 long(R1691)をコードしている、抗原提示する遊離mRNAからなる免疫賦活成分(比率1:1;複合化RNA:遊離RNA)を含んでいるRSV−F longワクチン(R1691)。
(実施例2:RSV−F long mRNAワクチンによる、マウスにおける液性免疫応答の誘導)
免疫化
BALB/cマウスに、RSV−f long mRNAワクチン(実施例1にしたがうR1691;25μg/マウス/ワクチン接種日)またはバッファーコントロールとしての乳酸リンゲル液)を皮下に(i.d.)、0日に、表2に示されている通りに注入した。コントロール群に、10μgの不活性化RSV longワクチンを筋肉内に(i.m.)、注入した。不活性化「呼吸器合胞体ウイルス抗原」(不活性化RSV long)を、INSTITUT VIRION/SERION GmbH-SERION IMMUNDIAGNOSTICA GmbHから購入した。不活性化ウイルスを、0.2μg/μLの最終濃度が達成されるように、滅菌PBSにおいて希釈した。すべての動物は、14日および28日に追加免疫を受けた。血液サンプルを、抗RSV F抗原の力価の決定のために42日に回収した。
Figure 2020014474
抗RSV Fタンパク質抗体の、ELISAによる決定
ELISAプレートを、組換えヒトRSV融合糖タンパク質(rec.hu F-protein;最終濃度:5μg/mL)(Sino Biological Inc.)を用いて被覆した。被覆されたプレートを、所定の血清希釈物を用いてインキュベートし、Fタンパク質に対して特異的に結合することを、ビオチン化アイソトープに特異的な抗マウス抗体を、ABTS基質をともなったストレプトアビジン−HRP(ホースラディッシュペルオキシダーゼ)との組合せにおいて用いて、検出する。
結果
図6から明らかなように、RSV−F long mRNAワクチンは、不活性化RSVに対する抗体力価に匹敵する、RSV Fタンパク質に対する抗体力価(総IgG、IgG1およびIgG2a)を含んでいる。
(実施例3:RSV−F long mRNAワクチンによる、マウスにおける長期にわたる液性免疫応答の誘導)
免疫化
BALB/cマウスの皮内(i.d.)に、20μgのRSV−F long mRNAワクチン(R1691)または乳酸リンゲル液(LiLa)バッファーを、表3に示されているワクチン接種予定にしたがって注入した。
血液を、最後の免疫化から2週間後、4か月後および11か月後に採取した。
Figure 2020014474
結果
図7から明らかなように、RSV−F long mRNAワクチンは、最後の追加免疫から11か月にわたる安定な抗体力価によって証明される通り、長期にわたる免疫応答を誘導した。
(実施例4:RSV−F long mRNAワクチンによる、マウスにおける細胞性免疫応答の誘導)
表4に示されているように、BALB/cマウスの皮内(i.d.)に、RSV−F long mRNAワクチン R1691、またはバッファーコントロールとしての乳酸リンゲル液(RiLa)を、0日に注入した。コントロール群の筋肉内(i.m.)に、10μgの不活性化RSV longワクチンを注入した。不活性化「呼吸器合胞体ウイルス抗原」(不活性化RSV)を、INSTITUT VIRION/SERION GmbH-SERION IMMUNDIAGNOSTICA GmbHから購入した。不活性化ウイルスを、0.2μg/μLの最終濃度が達成されるように滅菌PBSに希釈した。
すべての動物は、14日および28日に追加免疫を受けた。脾臓を、抗原特異的なT細胞のために14日に採取した。
Figure 2020014474
細胞内サイトカイン染色
ワクチン接種されたマウスおよびコントロールのマウスからの脾臓細胞を、標準的なプロトコルにしたがって分離した。簡単に説明すると、分離した脾臓細胞を細胞ろ過器に通してすりつぶし、PBS/1%FBSにおいて洗浄し、赤血球を溶解させた。PBS/1%FBSを用いた十分な洗浄段階の後に、脾臓細胞を、96ウェルプレート(2×10細胞/ウェル)に播いた。翌日に、細胞を、RSV−Fペプチド(KYKNAVTEL;5Mg/ml;H−2kdの再構築されたT細胞エピトープ)または無関係なインフルエンザHAタンパク質由来のコントロールペプチド(IYSTVASSL;5μg/ml;EMC Microcollectionsから購入した)、ならびに抗CD28抗体(BD Biosciences)を用いて、GolgiPlug(商標)/GolgiStop(商標)(ブレフェルディンAおよびモネンシンを含んでいるタンパク質輸送阻害剤;それぞれBD Biosciences)の混合物の存在下において、37℃において6時間にわたって刺激した。刺激の後に、細胞を洗浄し、Cytofix/Cytoperm試薬(BD Biosciences)を用いて、製造者のマニュアルにしたがって細胞内サイトカインのために染色した。以下の抗体:CD8−PECy7(1:200)、CD3−FITC(1:200)、IL2−PerCP−Cy5.5(1:100)、TNFα−PE(1:100)、IFNγ−APC(1:100)(eBioscience)、CD4−BD Horizon V450(1:200)(BD Biosciences)を染色のために使用し、1:100希釈されたFcγ−ブロックとともにインキュベートされた。生細胞/死細胞を区別するために、Aqua Dye(Invitrogen)を使用した。細胞を、Canto IIフローサイトメーター(Beckton Dickinson)を用いて回収した。フローサイトメトリーのデータを、FlowJoソフトウェア(Tree Star, Inc.)を用いて解析した。統計解析を、GraphPad Prismソフトウェア、Version 5.01を用いて実施した。群の間における統計的な差を、マンホイットニー検定によって評価した。
結果
図8から明らかなように、RSV−Flong mRNAワクチン(R1691)は、RSV Fタンパク質を対象にしている、IFNγ陽性、TNFα陽性およびIFNγ/TNFα二重陽性の多機能性CD8T細胞を誘導した。意外にも、不活性化RSVウイルスに基づくワクチンは、抗原特異的なCD8T細胞を誘導し得なかった。
(実施例5:RSV−N mRNAワクチンおよびRSV−M2−1mRNAワクチンによる、マウスにおける細胞性免疫の誘導)
免疫化
表5に示されているように、BALB/cマウスの皮内(i.d.)に、異なる投与量のRSV−N mRNAワクチン R2381、RSV−M2−1 mRNAワクチン R2833、またはバッファーコントロールとしての乳酸リンゲル液(RiLa)を、0日に注入した。コントロール群の筋肉内(i.m.)に、10μgの不活性化RSV longワクチンを注入した。不活性化「呼吸器合胞体ウイルス抗原」(不活性化RSV long)を、INSTITUT VIRION/SERION GmbH-SERION IMMUNDIAGNOSTICA GmbHから購入した。不活性化ウイルスを、0.2μl/μLの最終濃度が達成されるように、滅菌PBSにおいて希釈した。すべての動物は、7日および21日に追加免疫を受けた。脾臓を、抗原特異的なT細胞の分析のために27日に回収した。
Figure 2020014474
細胞内サイトカイン染色を、細胞を以下の刺激を用いて処理したことを除いて、実施例4に記載の通りに実施した。
上述の通り、群4〜8 M2−1ペプチド(5μg/ml);(Proimmuneから提供されているSYIGSINNI);1〜3、群7および8 ProMix N(1μg/ml);コントロール:培地+DMSO+抗CD28、群1〜8。
結果
図9から明らかな通り、RSV−N mRNAワクチン(R2831)は、RSV Nタンパク質を対象にしている、IFNγ陽性、TNFα陽性、およびIFNγ/IFNα二重陽性の多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導した。
意外にも、不活性化RSVウイルスに基づくワクチンは、抗原特異的なCD8T細胞を誘導し得なかった。
図10から明らかなように、RSV−N mRNAワクチン(R2831)は、RSV
Nタンパク質を対象にしている、IFNγ陽性、TNFα陽性およびIFNγ/TNFα二重陽性の多機能性CD4T細胞をマウスにおいて誘導した。
意外にも、不活性化RSVウイルスに基づくワクチンは、抗原特異的なCD4T細胞を誘導し得なかった。
図11から明らかなように、RSV−M2−1 mRNAワクチン(R2833)は、RSV M2−1タンパク質を対象にしている、IFNγ陽性、TNFα陽性およびIFNγ/TNFα二重陽性の多機能性CD8T細胞を、マウスにおいて誘導した。
意外にも、不活性化RSVウイルスに基づくワクチンは、抗原特異的なCD8細胞を誘導し得なかった。
(実施例6:コットンラットのRSV抗原投与試験I)
RSVワクチン開発にとって、コットンラットは、特に抗原投与感染のために、一般に認められている動物モデルである。コットンラットは、強い肺病理をともなってホルマリン不活性化RSVウイルスワクチンに応答する。これは、強い疾患現象の観点からワクチン接種の安全の評価を可能にする。
RSV特異的な免疫応答を拡張し、かつ最適化するために、異なるRSVタンパク質(RSV F、変異体RSV−Fdel554−574、NおよびM2−1)をコードしているmRNAワクチンを、実施例にしたがって調製した。単独または組合せのワクチンの作用を評価するために、これらのワクチンを、表5に示されているように、単独または組合せ(カクテルワクチン)のいずれかにおいて投与した。2×50μlのワクチン体積を、コットンラットの背中の皮内(i.d.)に注入した。追加の群を、β−プロピオラクトン不活性化RSV(INSTITUT VIRION/SERION GmbH-SERION IMMUNDIAGNOSTICA GmbH)、ホルマリン不活性化RSV(Sigmovir)または生RSV/A2(Sigmovir)(10プラーク形成ユニット、pfu)を用いて、mRNAワクチンに対するそれらの免疫原性を比較するために免疫化した。他の群は、モノクローナル抗RSV抗体SYNAGIS(登録商標)(Palivizumab)のi.m.注入を、受動免疫として受けた。SYNAGIS(登録商標)を、RSV抗原投与の前日に15mg/kgの用量を用いて投与した。したがって、動物の体重を測定し、SYNAGIS(登録商標)の適切な量を動物の体重にしたがて算出した。i.m.注入にとっての最大体積は、100gのラットについて200μlであった。免疫化後に、コットンラットを、RSV/A2ウイルス(10PFU;Sigmovir)を用いた鼻腔内(i.n.)感染によって抗原投与した。
Figure 2020014474
免疫応答を分析するために以下のアッセイ:RSV Fタンパク質血清IgG ELISA、RSVウイルス中和抗体の力価(VNT)、RSVウイルスの力価測定および肺組織病理を、実施した。
RSV Fタンパク質血清IgG ELISA
抗RSV Fタンパク質抗体の誘導を、実施例2にしたがってELISAによって決定した。
RSVウイルス中和抗体の力価(VNT)
血清を、ウイルス中和試験(VNT)によって分析した。簡単に説明すると、血清サンプルを、EMEMを用いて1:10に希釈し、熱不活性化し、1:4にさらに段階希釈した。希釈された血清サンプルを、室温において1時間にわたってRSV(25〜50PFU)とともにインキュベートし、24ウェルプレートにおけるHEp−2のコンフルエントな単層に2組にして播いた。5% COインキュベータにおける37℃の1時間にわたるインキュベーション後に、ウェルを、0.75%のメチルセルロース培地によって覆った。インキュベーションの4日後に、覆いを取り除き、細胞を、0.1%のクリスタルバイオレット染色によって固定し、それからすすぎ洗いし、風乾させた。対応する相互作用性の中和抗体の力価を、ウイルスコントロールの60%低下の終点において、決定した。
RSVウイルスの力価測定および肺組織病理
54日に、鼻腔組織を、回収し、ウイルスの力価測定のためにホモジナイズした。肺を、ひとまとまりにして回収し、ウイルスの力価測定(左の切片)、組織病理(右の切片)およびPCR分析(舌葉(lingular lobe))のために3つに切片化した。さらに、RSVウイルスゲノムのコピー数(RSV NS−1遺伝子のコピー数を測定することによって)およびサイトカインのmRNAレベルを、定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(pRT−PCR)によって決定した。
結果
図12から明らかなように、単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574)、または他のRSVタンパク質(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)をコードしているmRNAとの組合せのいずれかにおけるRSV−F mRNAワクチンは、49日の総合IgG抗体によって示されている通り、コットンラットにおいてRSV Fに特異的な液性免疫応答を誘導する。
図13から明らかなように、単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574変異体=R2821)、または他のRSVタンパク質(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)をコードしているmRNAとの組合せにおけるRSV−F mRNAワクチンは、ウイルス中和抗体の力価によって示されている通り、コットンラットにおけるRSVに特異的な機能的な抗体の形成を誘導する。
図14から明らかなように、単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574)、または他のRSVタンパク質(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)をコードしているmRNAとの組合せにおけるRSV−F mRNAワクチンは、RSVウイルスを用いて抗原投与されたコットンラットにおける肺および鼻腔のウイルス力価を低下させる。
図14Aから明らかなように、mRNAワクチンを用いてワクチン接種されたすべての動物群は、実施されたウイルス力価測定の検出レベルを下回るウイルス力価を示し、肺のウイルス力価に関してワクチン接種されたラットの保護を証明した。対照的に、ホルマリン不活性化ウイルスワクチンは、RiLaバッファーコントロール群と比べて、肺のウイルス力価を最小にしか低下させない。β−プロピオラクトン不活性化RSVワクチンの作用は、より明らかであったが、この群の動物のすべてにおいて検出レベルを下回って肺のウイルス力価を低下させなかった。図14Bから明らかなように、また、鼻腔組織におけるウイルス力価は、mRNAを用いてワクチン接種された群において大きく低下した。ホルマリン不活性化ウイルスの鼻腔のウイルス力価は、RiLaワクチン接種された群におけるウイルス力価に匹敵した。β−プロピオラクトン不活性化ウイルスワクチンは、(少なくとも5匹の動物のうち2匹について)より有効であった。それらと対照的に、mRNAワクチン接種された群のすべては、RiLaワクチン接種された群と比べて、鼻腔のウイルス力価を低下させた。
図15から明らかなように、RSVコットンラットの抗原投与試験からの肺組織の分析は、種々の動物群について異なる病理学的スコアを示している。組織病理から、mRNAワクチン接種された群は、ホルマリン不活性化RSVワクチンを用いてワクチン接種された群のように強い肺病理を示さなかったことが結論付けられ得る。気管支周囲(PB)、周囲血管炎(PV)、間質性肺炎(IP)および肺胞炎(A)についての平均の病理スコアは、mRNAを用いてワクチン接種されたすべての群について、群H(ホルマリン不活性化RSV)と比べて非常に低かった。さらに、R2510を用いてワクチン接種されている群(群B;RSV F)またはR2821(群C;RSV F変異体)は、RiLaバッファーワクチン接種され、続いてRSV感染させた群(G)と比べて、低い肺病理を示すと思われる。
図16から明らかなように、定量的RT−PCRは、種々の動物群について異なる発現パターンを示す。RSV NS−1遺伝子を測定することによる、RSVゲノムコピー数の定量化は、Aに示されている。ゲノムコピー数は、RiLaバッファーコントロール(群G)と比べてmRNAワクチンを用いたワクチン接種によって低下される。これは、ホルマリン不活性化RSVを用いてワクチン接種された群(群H)についてではない。Bに示されているように、ホルマリン不活性化RSVワクチンを用いたワクチン接種(群H)は、RiLaバッファーを用いてワクチン接種されたコントロール群と比べて、TH2サイトカインIL−4の増進された発現を誘導する。対照的に、RSV−F変異体をコードしているmRNA R28221を用いたワクチン接種は、RSV抗原投与感染後の胚において、RiLaコントロール群と比べて、IL−4mRNA発現を顕著に低下させた。C.IFN−γ mRNAの発現。D.IL−5 mRNAの発現。IL−5の発現は、R2510またはR2821を用いてワクチン接種された群において、RiLaバッファーワクチン接種された動物と比べて顕著に低下される。ウイルスNS−1 RNAまたは肺組織から分離されたサイトカインmRNAの発現は、抗原投与の5日に測定される。統計的解析を、ステューデントT検定(* 群G(RiLaコントロール)と比べたときにp<0.05)を用いて実施した。
(実施例7:RSVコットンラットの抗原投与試験II)
RSV Fタンパク質(F)または変異体RSV−Fタンパク質(F*)(RSV F
del554−574)をコードしているmRNAワクチンを、実施例1にしたがって調製した。単回ワクチン接種または数回ワクチン接種(初回および追加のワクチン接種)の作用を評価するために、これらのワクチンを、1回、2回または3回(表6に示す通り)にわたって投与した。2×50μlのワクチン体積を、コットンラットの背中の皮内(i.d.)に注入した。追加の群の、右後ろ脚の筋肉内(i.m.)に、1×100μlのワクチン体積によって免疫化した。コントロールとして、1群の筋肉内に、乳酸リンゲルバッファー(バッファー)を注入した。免疫化後に、コットンラットを、RSV/A2ウイルス(100μlにおける10PFU;Sigmovir)を用いた鼻腔内(i.n.)注入によって抗原投与した。コントロールとして、1群を、処理せず、ウイルスを用いて抗原投与しなかった(未処理)。
Figure 2020014474
RSVウイルスの力価測定
RSVウイルス力価の決定を、実施例6に記載の通りに実施した。
結果
図17Aに示されているように、RSV Fタンパク質(F)または変異体RSV−Fタンパク質(F*)(RSV F del554−574)をコードしているmRNAワクチンを用いた、前もっての単回の皮内ワクチン接種は、バッファーコントロール群と比べて、肺におけるウイルス力価の低下に非常に有効であった。2回目および3回目のワクチン接種(「追加のワクチン接種」)は、検出レベルを下回って、ウイルス力価を低下させた。
図17Bに示されているように、RSV Fタンパク質(F)または変異体RSV−Fタンパク質(F*)(RSV F del554−574)をコードしているmRNAワクチンを用いた、前もっての2回のワクチン接種は、バッファーコントロール群と比べて、肺におけるウイルス力価を大きく低下させた。
RSV long株のRSV−Fタンパク質(RSV−F long)をコードしているR1691の、RSV−F long mRNAワクチンに含まれている通りのG/C最適化されたmRNA配列(配列番号31)を示している。 RSV long株のRSV−Fタンパク質(RSV−F long)をコードしているR2510の、RSV−F long mRNAワクチンに含まれている通りのG/C最適化されたmRNA配列(配列番号32)を示している。 RSV long株(HSV−F−long)のRSV−F del554−574変異体タンパク質をコードしているR2821の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号33)を示している。 RSV long株(HSV−F−long)のRSV−Nタンパク質をpコードしているR2831の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号34)を示している。 RSV long株(HSV−F−long)のRSV−M2−1タンパク質をコードしているR2833の、G/C最適化されたmRNA配列(配列番号35)を示している。 RSV−F long mRNAワクチンが、不活性化RSVに対する抗体力価に匹敵する、RSV−Fタンパク質に対する抗体力価を誘導することを示している。 RSV−F long mRNAワクチン(R1691)が、長期にわたる免疫応答をマウスにおいて誘導することを示している。 RSV−F long mRNAワクチン(R1691)が、RSV Fusion(F)タンパク質特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。 RSV−N mRNAワクチン(R2831)が、核タンパク質特異的な多機能性Cd8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。 RSV−N mRNAワクチン(R2831)が、核タンパク質(N)−特異的な多機能性CD4細胞をマウスにおいて誘導することを示している。 SV−M2−1 mRNAワクチン(R2833)は、M2−1特異的な多機能性CD8T細胞をマウスにおいて誘導することを示している。 単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574変異体=R2831)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンは、コットンラットにおいて液性免疫応答を誘導することを示している。 単独(RSV−F、R2510;RSV−Fdel554−574変異体、R2821)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンが、ウイルス中和抗体力価によって示されている通り、コットンマウスにおいて機能的な抗体の形成を誘導することを示している。 単独(RSV−F=R2510;RSV−Fdel554−574変異体=R2821)または他のRSVタンパク質をコードしているmRNAとの組合せ(RSV−N=R2831;RSV−M2−1=R2833)のいずれかのRSV−F mRNAワクチンが、RSVウイルスを用いて抗原投与されたコットンマウスにおいて、肺および鼻腔の力価を低下させることを示している。 実施例6に記載されているRSVコットンラット抗原投与試験から得られた肺の組織病理分析の結果を示している。 ウイルスゲノムのコピー数(RSV NS−1遺伝子のコピー数を測定することによる)の定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)、または実施例6に記載されているRSVコットンラット抗原投与試験のRSV感染動物(またはコントロール)の肺組織からの、発現されたサイトカインの結果を示している。 SV−F mRNAワクチン(RSV−F=r2510;RSV F*(RSV−Fdel554−574変異体)R2821)が、RSVウイルスを用いて抗原投与されたコットンラットにおける肺の力価を低下させることを示している。

Claims (32)

  1. 呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、糖タンパク質G、短い疎水性タンパク質SH、マトリクスタンパク質M、核タンパク質N、ラージポリメラーゼL、M2−1タンパク質、M2−2タンパク質、リンタンパク質P、非構造タンパク質NS1、または非構造タンパク質NS2に由来する少なくとも1つの抗原ペプチドもしくは抗原タンパク質、またはその断片、バリアントもしくは誘導体をコードしているコード領域を含んでおり、
    上記コード領域のG/C含有量は、野生型mRNAのコード領域のGC含有量と比べて向上されており、好ましくは、上記GC富化されたmRNAの、コードされているアミノ酸配列は、野生型mRNAの、コードされているアミノ酸配列と比べて、変更されていない、mRNA配列。
  2. 上記コード領域は、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、核タンパク質Nまたは糖タンパク質Gの全長タンパク質をコードしている、請求項1に記載のmRNA配列。
  3. 上記抗原ペプチドまたは抗原タンパク質は、RSV株ATCC VR−26 long由来である、請求項1または2に記載のmRNA配列。
  4. a)5’キャップ構造
    b)ポリ(A)配列、
    c)および任意に、ポリ(C)配列
    をさらに含んでいる、請求項1〜3のいずれかに記載のmRNA配列。
  5. 上記ポリ(A)配列は、約25〜約400のアデノシンヌクレオチドの配列、好ましくは、約50〜約400のアデノシンヌクレオチドの配列、より好ましくは約50〜300のアデノシンヌクレオチドの配列、より一層好ましくは約50〜約250のアデノシンヌクレオチドの配列、最も好ましくは約60〜約250のアデノシンヌクレオチドの配列を含んでいる、請求項4に記載のmRNA配列。
  6. 少なくとも1つのヒストン ステム−ループをさらに含んでいる、請求項1〜5のいずれかに記載のmRNA配列。
  7. 上記少なくとも1つのヒストン ステム−ループは、以下の式(I)または(II):式(I)(ステム境界エレメントなしのステム−ループ配列):
    Figure 2020014474

    式(II)(ステム境界エレメントありのステム−ループ配列):
    Figure 2020014474

    から選択され、
    ステム1またはステム2の境界エレメントN1−6は、1〜6、好ましくは2〜6、より好ましくは2〜5、より一層好ましくは3〜5、最も好ましくは4〜5または5のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され;
    ステム1[N0−2GN3−5]は、ステム2のエレメントと逆相補的または部分的に逆相補的であり、かつ5〜7のヌクレオチドの間の連続する配列であり;
    0−2は、0〜2、好ましくは0〜1、より好ましくは1のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され;
    3−5は、3〜5、好ましくは4〜5、より好ましくは4のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され、
    Gは、グアノシンまたはその類似物であり、ステム2におけるその相補的なシチジンヌクレオチドがグアノシンによって置き換えられている条件のもとに、シチジンまたはその類似物に任意に置き換えられ得;
    ループ配列[N0−4(U/T)N0−4)]は、ステム1およびステム2のエレメントの間に配置されており、3〜5のヌクレオチド、より好ましくは4のヌクレオチドの連続する配列であり;
    0−4のそれぞれは、他のNから独立して、0〜4、好ましくは1〜3、より好ましくは1〜2のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され;
    U/Tは、ウリジン、または任意にチミジンを表しており;
    ステム2[N3−5CN0−2]は、ステム1のエレメントと逆相補的または部分的に逆相補的であり、5〜7のヌクレオチドの間の連続する配列であり;
    3−5は、3〜5、好ましくは4〜5、より好ましくは4のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され;
    0−2は、0〜2、好ましくは0〜1、より好ましくは1のNの連続する配列であり、Nのそれぞれは、他のNから独立して、A、U、T、GおよびCから選択されるヌクレオチド、またはそのヌクレオチド類似物から選択され;
    Cは、シチジンまたはその類似物であり、ステム1におけるその相補的なグアノシンヌクレオチドがシチジンに置き換えられている条件のもとに、グアノシンまたはその類似物に任意に置き換えられ得;
    ステム1およびステム2は、互いに塩基対形成可能であり、塩基対形成がステム1およびステム2の間に生じ得る逆相補性配列を形成しているか、または不完全な塩基対形成がステム1およびステム2の間に生じ得る部分的な逆相補性配列を形成している、請求項6に記載のmRNA配列。
  8. 上記少なくとも1つのヒストン ステム−ループは、以下の式(Ia)または(IIa):
    Figure 2020014474

    式(Ia)(ステム境界エレメントなしのステム−ループ配列)
    Figure 2020014474

    式(IIa)(ステム境界エレメントありのステム−ループ配列)
    のうちの少なくとも1つのから選択される、請求項7に記載のmRNA配列。
  9. 3’−UTRエレメントをさらに含んでいる、請求項1〜8のいずれかに記載のmRNA配列。
  10. 上記少なくとも1つの3’−UTRエレメントは、安定なmRNAをもたらす遺伝子の3’−UTR、またはその相同物、断片もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる、請求項9に記載のmRNA配列。
  11. 上記3’−UTRエレメントは、アルブミン遺伝子、α−グロビン遺伝子、β−グロビン遺伝子、ヒストンヒドロキシラーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、およびコラーゲンアルファ遺伝子からなる群から選択される遺伝子の3’UTR、またはその相同物、断片もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいる、化合物または当該核酸配列からなる、請求項10に記載のmRNA配列。
  12. 上記3’−UTRエレメントは、好ましくは配列番号29にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、α−グロビン遺伝子の3’−UTR、またはその相同物、断片もしくはバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる、請求項11に記載のmRNA配列。
  13. 好ましくは5’から3’方向に向かって、
    a.)5’−キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
    b.)好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質Fに由来する、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質をコードしているコード領域
    c.)好ましくは配列番号29にしたがう核酸配列に対応するRNA配列を含んでいる、アルファグロビン遺伝子に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる3’−UTRエレメント、その相同物、断片またはバリアント
    d.)好ましくは64のアデノシンを含んでいる、ポリ(A)配列;
    e.)好ましくは30のシトシンを含んでいる、ポリ(C)配列;ならびに
    f.)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列に対応する、mRNA配列を含んでいる、ヒストン−ステム−ループ
    を含んでいる、請求項9〜12のいずれかに記載のmRNA配列。
  14. 上記mRNA配列は、配列番号31にしたがうRNA配列を含んでいる、請求項13に記載のmRNA配列。
  15. 上記少なくとも1つの3’−UTRエレメントは、脊椎動物のアルブミン遺伝子の3’−UTRもしくはそのバリアント、好ましくは哺乳類のアルブミン遺伝子の3’−UTRもしくはそのバリアント、より好ましくはヒトのアルブミン遺伝子の3’−UTRもしくはそのバリアント、より一層好ましくはGenBank Accession番号NM_000477.5にしたがうヒトのアルブミン遺伝子の3’−UTRもしくはそのバリアントに由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる、請求項9に記載のmRNA配列。
  16. 上記3’−UTRエレメントは、配列番号25にしたがう核酸配列、好ましくは対応するRNA配列、その相同物、断片またはバリアントに由来する、請求項15に記載のmRNA配列。
  17. TOP遺伝子の5’−UTR、好ましくは対応するRNA配列、またはその相同物、断片もしくはバリアント(好ましくは5’TOPモチーフを欠いている)に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる5’−UTRエレメントを、さらに含んでいる、請求項1〜16のいずれかに記載のmRNA配列。
  18. 上記5’−UTRエレメントは、リボソームタンパク質をコードしているTOP遺伝子の5’−UTRに由来する核酸配列、好ましくは対応するRNA配列、またはそれらの相同物、断片もしくはバリアント(好ましくは5’TOPモチーフを欠いている)を含んでいるか、または当該核酸配列からなる、請求項17に記載のmRNA配列。
  19. 上記5’−UTRエレメントは、リボソーム巨大タンパク質(RPL)をコードしているTOP遺伝子の5’−UTR、またはそれらの相同物、断片もしくはバリアント(好ましくは5’TOPモチーフを欠いている)に由来する核酸配列を含んでいるか、または当該核酸配列からなる、より好ましくは配列番号23にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいるか、または当該RNA配列からなる、請求項18に記載のmRNA配列。
  20. 好ましくは5’から3’方向に、
    a.)5’−キャップ構造、好ましくはm7GpppN;
    b.)TOP遺伝子の5’UTRに由来する核酸配列、その相同物、断片もしくはバリアントを含んでいるか、または当該核酸配列からなる、好ましくは配列番号23にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいるか、または当該RNA配列からなる、5’−UTRエレメント;
    c.)呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の少なくとも1つの抗原ペプチドまたは抗原タンパク質(好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質Fに由来する)をコードしているコード領域;
    d.)安定なmRNAをもたらす遺伝子に由来する核酸配列、その相同物、断片もしくはバリアントを含んでいるか、または当該核酸配列からなる(好ましくは配列番号18にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいるか、または当該RNA配列からなる)、3’UTRエレメント;
    e.)好ましくは64のアデノシンを含んでいる、ポリ(A)配列;
    f.)好ましくは30のシトシンを含んでいる、ポリ(C)配列;ならびに
    g.)好ましくは配列番号30にしたがう核酸配列の対応するRNA配列を含んでいる、ヒストン−ステム−ループ
    を含んでいる、請求項19に記載のmRNA配列。
  21. 配列番号32または33にしたがうRNA配列を含んでいる、請求項20に記載のmRNA配列。
  22. 任意に、mRNAの、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物、および/または重合体担体に対する約6:1(w/w)〜約0.25:1(w/w)、より好ましくは約5:1(w/w)〜約0.5:1(w/w)、最も好ましくは約3:1(w/w)〜約2:1(w/w)の範囲から選択される重量比において;または任意に、約0.1〜10の範囲、好ましくは約0.3〜4または0.3〜1の範囲、最も好ましくは約0.5〜1または0.7〜1の範囲、なかでも最も好ましくは約0.3〜0.9または0.5〜0.9の範囲における、mRNAの、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体の窒素/リン酸塩の比において、
    カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物、または重合体担体と会合しているか、または複合化されている、請求項1〜21に記載のmRNA配列。
  23. カチオン性のタンパク質またはペプチド、好ましくはプロタミンと会合しているか、または複合化されている、請求項22に記載のmRNA配列。
  24. 請求項1〜23のいずれかに記載のそれぞれのmRNA配列のうちの複数または2つ以上を含んでいる、組成物。
  25. 請求項1〜23のいずれかに規定されているmRNA配列または請求項24に規定されている組成物、ならびに任意に薬学的に許容可能な担体を含んでいる、薬学的組成物。
  26. 上記mRNAは、カチオン性もしくはポリカチオン性の化合物および/または重合体担体、好ましくは複数のカチオン性のタンパク質もしくはペプチド、最も好ましくはプロタミンと少なくとも部分的に複合化されている、請求項25に記載の薬学的組成物。
  27. 複合化されているmRNAの、遊離mRNAに対する比は、約5:1(w/w)〜約1:10(w/w)、より好ましくは約4:1(w/w)〜約1:8(w/w)、より一層好ましくは約3:1(w/w)〜約1:5(w/w)または1:3(w/w)の範囲から選択され、最も好ましくは、複合化されているmRNAの、遊離mRNAに対する比は、1:1(w/w)の比から選択される、請求項26に記載の薬学的組成物。
  28. 請求項1〜23のいずれかに規定されているmRNA配列、請求項24に規定されている組成物、請求項25〜27のいずれかに規定されている薬学的組成物の構成要素、ならびに任意に上記構成要素の投与および投与量に関する情報を有している技術的な指示書を含んでいる、キットまたはキットの部分。
  29. 医薬としての使用のための、請求項1〜23のいずれかに規定されているmRNA配列、請求項24に規定されている組成物、請求項25〜27のいずれかに規定されている薬学的組成物、ならびに請求項28に規定されているキットまたはキットの部分。
  30. RSV感染の処置または予防における使用のための、請求項1〜23のいずれかに規定されているmRNA配列、請求項24に規定されている組成物、請求項25〜27のいずれかに規定されている薬学的組成物、ならびに請求項28に規定されているキットまたはキットの部分。
  31. 上記処置は、RSVの免疫グロブリン、特にPalivizumabの投与と組み合わせられる、請求項30にしたがう使用のための、mRNA配列、組成物、薬学的組成物、ならびにキットまたはキットの部分。
  32. a)請求項1〜23のいずれかに規定されているmRNA配列、請求項24に規定されている組成物、請求項25〜27のいずれかに規定されている薬学的組成物、または請求項28に規定されているキットもしくはキットの部分を準備すること;
    b)上記mRNA、組成物、薬学的組成物、またはキットもしくはキットの部分を、組織または生体に使用すること、または投与すること;
    c)任意に、RSV免疫グロブリンを投与することを包含している、RSV感染の処置または予防の方法。
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