JP2018515118A - コリネバクテリウムグルタミクムを用いた2’−フコシルラクトースの生産方法 - Google Patents
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Abstract
Description
HMOはプレバイオティック(prebiotic)効果、病原菌感染予防、免疫システム調節及び頭脳発達のように乳児の発達及び健康に肯定的な影響を及ぼす様々な生物学的活性を提供するため、乳児期における母乳育児が非常に重要である。
母乳には約200種のオリゴ糖が含まれており、中でも、特に、2’−フコシルラクトースと3’−フコシルラクトースが前述の様々な生物学的活性に関与する主要HMOであると報告されている。これによって、最近では、フコシルラクトースが乳児用粉ミルク、老人用健康機能食品素材及び医薬品素材として利用される可能性から注目されている。しかし、女性の約20%はフコシルオリゴ糖を合成するフコース転移酵素の変異のため体内でそれらをよく合成できないと知られている。このため、フコシルラクトースの産業的生産が必要な実情である。
現在、フコシルラクトースは産業的に大量生産し難いため、それらに代えて、類似体であるガラクトオリゴ糖(galactooligosaccharide)又はフラクトオリゴ糖(fructooligosaccharide)を離乳食に添加して類似の効果を期待しているのが実情である。
一方、フコシルラクトースの生産方法には、母乳から直接抽出する方法及び化学的又は酵素的方法で合成する方法がある。
直接抽出する方法は、母乳供給の限界及び低い生産性が問題であり、化学的合成法は、高価の基質、低い異性体選択性(stereo−selectivity)と生産収率、毒性有機溶媒の使用などの問題がある。また、酵素的合成法はフコースの供与体(donor)として利用されるGDP−L−fucoseが非常に高価という問題及びフコース転移酵素(fucosyltransferase)の精製コストが高いという問題がある。
上記のような問題から、直接抽出、化学的又は酵素的生産法は、フコシルラクトースの大量生産に適用し難く、大量生産のための技術がほとんどないのが実情である。しかし、2’−フコシルラクトースを用いた健康機能性食品及び医薬品素材への開発は期待できるため、微生物を用いた2’−フコシルラクトースの産業的生産のためのより多い研究が切望されている。
また、大腸菌の細胞膜成分がエンドトキシンとして作用し得ることから、2’−フコシルラクトースの生産において分離精製のコストが多くかかる。したがって、食品及び医薬品の素材であるフコシルラクトースを生産する宿主細胞として大腸菌を用いることには困難がある。
本発明者らは、大韓民国特許登録番号第10−1544184号(2015.08.21)において「大腸菌を用いた2’−フコシルラクトース生産方法」の特許を受けたことがある。しかし、2’−フコシルラクトースを機能性食品添加物として用いるにあたって、それを、大腸菌を用いて生産することは、大腸菌が有する様々な安全上の心配から問題になり得るという指摘がある。したがって、本発明では食品安全上の問題がない代替菌株を用いて2’−フコシルラクトースを生産する。
下記の本発明の実施例では大腸菌のLacオペロンからlacZが除去されたlacYA遺伝子を導入して実験したが、本発明においてLacオペロンの導入理由がラクトースの流入に関するものであるため、必ずしもlacA遺伝子を要せず、lacY遺伝子だけを導入しても十分である。
本発明で使用する「発現」という用語は、本発明のコリネバクテリウムグルタミクム菌株が独自で発現させられない酵素を人為的に発現させるために、外部由来の遺伝子を菌株内に導入して発現させることを意味する。「過発現」という用語は、本発明のコリネバクテリウムグルタミクム菌株が独自で該当の酵素を暗号化する遺伝子を備えており、独自で発現させることができるが、大量生産の目的でその発現量を増大させるために人為的に該当の酵素の発現量を増大させて過発現することを意味する。
本発明の2’−フコシルラクトースの生産方法は、グルコース又はラクトースをさらに供給する流加式培養であることが好ましい。流加式培養によってグルコース又はラクトースを持続して供給すると、細胞の成長をより増大させ、高純度、高収率、高生産性でフコシルラクトースを生産できる。流加式培養に関する細部の枝葉的な技術も当業界の公知技術を用いることができ、それについてはその記載を省くものとする。
プラスミド製作及び2’−フコシルラクトース(2’−fucosyllactose,2’−FL)の生産のために、それぞれ、大腸菌(Escherichia coli)TOP10及びコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)ATCC13032を用いた。
pVBCLプラスミドを構築するためにコリネバクテリウムグルタミクムATCC13032のgenomic DNAから2つのDNA primer(F_PstI−manBとR_BamHI−SpeI−XbaI−manB)を用いたPCR反応によってmanB遺伝子を増幅した。その後、制限酵素PstIとBamHIを処理して同制限酵素が処理されたpVWEx2プラスミドにこれを挿入した。構築された上記プラスミドに、再びコリネバクテリウムグルタミクムATCC13032のgenomic DNAから2つのDNA primer(F_XbaI−manCとR_SpeI−manC)を用いたPCR反応によってmanC遺伝子を増幅し、制限酵素XbaIとSpeIを処理した後に挿入することによって、pVmBCを構築した。そして、先行研究(韓国登録特許第10−1544184号)で構築されたpGlacYAプラスミドから2つのDNA primer(F_inf_AsiSI_lacYAとR_inf_AsiSI_lacYA)を用いたPCR反応によってlacYA遺伝子クラスタを増幅した後、制限酵素AsiSIを処理して同制限酵素が処理されたpVmBCプラスミドにこれを挿入することによってpVBCLプラスミドを構築した。
種菌培養には適切な抗生剤(kanamycin 25μg/mL,tetracycline 5μg/mL)が含まれた5mLのBHI(Brain Heart Infusion)培地が入っている実験管を利用し、温度は30℃、撹拌速度を250rpmに維持しつつ12時間培養した。
回分式培養は100mL又は1Lの最小培地((NH4)2SO4 20g/L、urea 5g/L、KH2PO4 1g/L、K2HPO4 1g/L、MgSO4 0.25g/L、MOPS 42g/L、CaCl2 10mg/L、Biotin 0.2mg/L、Protocatechuic acid 30mg/L、FeSO47H20 10mg/L、MnSO4H2O 10mg/L、ZnSO47H2O 1mg/L、CuSO4 0.2mg/L、NiCl26H2O 0.02mg/L、pH7.0)が入っている500mL入の生物反応器(bioreactor,Kobiotech,Incheon,Korea)において30℃で行った。撹拌速度は、フラスコは250rpm、生物反応器は1000rpm、2vvmに維持しつつ培養した。回分式培養時には光学密度(OD600)が0.8に達した時点でIPTG(isopropyl−β−D−thiogalactopyranoside)、ラクトースを最終濃度がそれぞれ1.0mM、10g/Lになるように添加した。
初期に添加したグルコースが完全に枯渇した後、800g/Lのグルコースを含む流入溶液(feeding solution)を5.7g/L/hの速度にて連続(continuous feeding)方式で供給した。これと同時に、tacプロモータ−媒介遺伝子発現を誘導して2’−フコシルラクトースを生産するために、IPTG、ラクトースを、最終濃度が1.0mM、10g/Lになるように添加した。
乾燥細胞重量は、光学密度(optical density,OD)にあらかじめ測定した変換定数0.3をかけて決定した。光学密度(OD)は、サンプルを適切に希釈して光学密度を0.1〜0.5の範囲に合わせた後に、分光光度計(spectrophotometer,Ultrospec 2000,Amersham Pharmacia Biotech,USA)を用いて吸光度600nmで測定した。
2’−フコシルラクトース、ラクトース、ラクテート、グルコース及び酢酸の濃度は、’Carbohydrate Analysis column(Rezex ROA−organic acid,Phenomenex,USA)’及び’RI(refractive index)’検出器の装着されたHPLC(high performance liquid chromatography)(Agilent 1100LC,USA)を用いて測定した。60℃で加熱したカラムを適用して10倍希釈された20μlの培養培地を分析した。0.6mL/min流速で5mMのH2SO4溶液を移動相として用いた。
本実験例では、コリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)で2’−フコシルラクトースを生合成するためにラクトース輸送体を導入し、これによる影響を調べた。
そのために、先行研究(韓国登録特許第10−1544184号)で構築されたE.coli K−12由来のlacZ遺伝子が除去されたlacオペロン(lacYA)をコリネバクテリウムグルタミクムに導入して2’−フコシルラクトースの生産を試みた。
しかし、GDP−L−fucose生合成酵素であるManB、ManC、Gmd、WcaG、FucT2及びlacZ遺伝子が除去されたlacオペロン(lacYA)を導入した菌株(実施例1)では2’−フコシルラクトースが生産されることを確認した(表5及び図2)。
図2は、lacZが除去されたlacオペロン(lacYA)の導入がコリネバクテリウムグルタミクムでの2’−フコシルラクトース生産に及ぼす影響を評価して示すグラフである。図2aは対照群、図2bは比較例1及び図2cは実験例1の培養結果である。
実験例1で構築された組換えコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)の2’−フコシルラクトース生産性能及び発酵特徴を調べるために、ManB、ManC、Gmd、WcaG、FucT2及びlacZが除去されたlacオペロン(lacYA)を導入した組換えコリネバクテリウムグルタミクムをそれぞれフラスコと発酵器で回分式培養した。光学密度(OD600)が0.8に達した時点で、IPTG、ラクトースを、最終濃度がそれぞれ1.0mM、10g/Lになるように添加した。
フラスコ回分式培養の結果、246mg/Lの2’−フコシルラクトースが生産され、この時のラクトースに対する2’−フコシルラクトースの収率は0.22mole 2’−フコシルラクトース/moleラクトース、生産性は4.97mg/L/hだった(図3及び表6)。
上記実験例2の回分式培養で生産された2’−フコシルラクトースを確認するために、LC−MS/MSを用いて定性分析を実施した。
MALDI−TOP MSを用いて陽イオンモードで分子量を測定した結果、2−フコシルラクトースに1分子のナトリウムが結合された分子量である511.164m/zのピークの存在が確認できた。
また、このピークの構造的組成を確認するために、タンデム質量分析法(Tandem mass spectrometry)(MS/MS)を用いて分析した結果、2’−フコシルラクトースを構成するグルコース、ガラクトース及びフコースで構成されていることを確認した(図4)。図4は、組換えコリネバクテリウムグルタミクムの培養液にLC−MS/MS分析を行って2’−フコシルラクトースの生産を確認した結果である。図4aは、MALDI−TOP MSを用いて培養液中の物質を陽イオンモードで分子量分析してフコシルラクトースの生成を確認したものであり、図4bは、タンデム質量分析法(Tandem mass spectrometry)(MS/MS)を用いて511.134m/zのピークが2’−フコシルラクトースであることを構造的に確認したものである。
実験の結果、上記の回分式培養で2’−フコシルラクトースが生産されたことが確認できた。
高濃度の細胞培養によって高濃度2’−フコシルラクトースを生産するために、pVBCL、pEGWTプラスミドを導入した組換えコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)を用いて2.5Lレベルの発酵器で流加式培養を実施した。
初期に添加した40g/Lのグルコースを全て消費した時点から細胞生長を維持するために流入溶液(feeding solution)を連続(continuous feeding)方式を用いて5.7g/L/hの速度で供給した。これと同時に、2’−フコシルラクトースの生産を誘導するためにIPTGとラクトースを添加した。
2’−フコシルラクトースの生産のための流加式培養の結果を表7に示す。図5は、組換えコリネバクテリウムグルタミクムpVBCL+pEGWTを用いた流加式培養結果を示すグラフである。
bラクトースと2’−フコシルラクトースの濃度は、培地にあるものだけを定量した数値である。
(1)コドン最適化(codon optimization)されたfucT2遺伝子(COfucT2)の製作
組換えコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)でヘリコバクターピロリ(H.pylori)由来のα−1,2−フコース転移酵素であるfucT2遺伝子の翻訳(translation)効率を増大させるために、fucT2遺伝子をコリネバクテリウムグルタミクムのコドン使用頻度(codon usage)によってコドン最適化を実施した。
実験の結果、既存のfucT2遺伝子に比べて約17.1%の配列が変異(mutation)されたことを確認した(図6)。図6は、fucT2遺伝子をコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)に合うようにコドン最適化した結果である。
コドン最適化されたfucT2遺伝子(COfucT2)を用いて構築された組換えコリネバクテリウムグルタミクム(C.glutamicum)の2’−フコシルラクトース生産性能及び発酵特徴を調べるために、フラスコで回分式培養、発酵器で流加式培養をそれぞれ実施した。
回分式培養では、光学密度(OD600)が0.8に達した時点で、IPTG及びラクトースを、最終濃度がそれぞれ1.0mM、10g/Lになるように添加し、流加式培養では、初期に添加した40g/Lのグルコースを全て消耗した時点から、細胞生長を維持するために流入溶液(feeding solution)を連続式(continuous feeding)方法を用いて5.7g/L/hの速度で供給した。これと同時に、2’−フコシルラクトースの生産を誘導するためにIPTGとラクトースを添加した。
回分式培養の結果、370mg/Lの2’−フコシルラクトースが生産され、この時のラクトースに対する2’−フコシルラクトースの収率は0.28mole 2’−フコシルラクトース/moleラクトース、生産性は7.18mg/L/hだった(図7a及び表8)。これは、実験例2の結果に比べて2’−フコシルラクトースの最終濃度が約50%、収率は27%、生産性は44%向上した数値である。
一方、流加式培養結果では8.1g/Lの2’−フコシルラクトースが生産され、ラクトースに対する2’−フコシルラクトースの収率は0.42mole/mole、生産性は0.07g/L/hが得られた(図7b及び表8)が、これは、野生型fucT2を導入した時の結果(実験例4)に比べて2’−フコシルラクトースの最終濃度が約39%、生産性は17%向上した数値である。
Claims (7)
- α−1,2−フコース転移酵素(α−1,2−fucosyltransferase)が発現されるように形質転換され、
GDP−D−マンノース−4,6−デヒドラターゼ(GDP−D−mannose−4,6−dehydratase)が発現されるように形質転換され、
GDP−L−フコースシンターゼ(GDP−L−fucose synthase)が発現されるように形質転換され、
ラクトースペルメアーゼ(lactose permease)が発現されるように形質転換され、
ホスホマンノムターゼ(Phosphomannomutase)及びGTP−マンノース−1−フォスフェートグアニリルトランスフェラーゼ(GTP−mannose−1−phosphate guanylyltransferase)を保有していることを特徴とする組換えコリネバクテリウムグルタミクム(Corynebacterium glutamicum)。 - 前記α−1,2−フコース転移酵素(α−1,2−fucosyltransferase)は、fucT2遺伝子で暗号化されたものである請求項1に記載の組換えコリネバクテリウムグルタミクム。
- 上記fucT2遺伝子は、配列番号6の核酸配列で構成されている請求項2に記載の組換えコリネバクテリウムグルタミクム。
- 上記組換えコリネバクテリウムグルタミクムは、ホスホマンノムターゼ(Phosphomannomutase)が過発現されるように形質転換され、
GTP−マンノース−1−フォスフェートグアニリルトランスフェラーゼ(GTP−mannose−1−phosphate guanylyltransferase)が過発現されるように形質転換されたものである請求項1に記載の組換えコリネバクテリウムグルタミクム。 - ラクトースが添加されている培地に、請求項1に記載の組換えコリネバクテリウムグルタミクム(Corynebacterium glutamicum)を培養することを特徴とする2’−フコシルラクトースの生産方法。
- 上記培地は、グルコースをさらに含む請求項5に記載の2’−フコシルラクトースの生産方法。
- 上記フコシルラクトースの生産方法は、
グルコース又はラクトースをさらに供給する流加式培養である請求項6に記載の2’−フコシルラクトースの生産方法。
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