ES2243726T3 - Procedimiento de preparacion de 2'-halo-beta-l-arabinofuranosil nucleosidos. - Google Patents

Procedimiento de preparacion de 2'-halo-beta-l-arabinofuranosil nucleosidos.

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ES2243726T3
ES2243726T3 ES02731195T ES02731195T ES2243726T3 ES 2243726 T3 ES2243726 T3 ES 2243726T3 ES 02731195 T ES02731195 T ES 02731195T ES 02731195 T ES02731195 T ES 02731195T ES 2243726 T3 ES2243726 T3 ES 2243726T3
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Abstract

Un procedimiento para la preparación de un 2¿-desoxi-2¿-halo-/-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I) en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I); B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; preparando una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa que comprende las etapas de (a) obtener un 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II): en la que cada uno de R1 y R2 es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo; y (b) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa.

Description

Procedimiento de preparación de 2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos.
Campo de la invención
Esta invención está en el área de la síntesis de 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos, y se refiere especialmente a un procedimiento eficiente de síntesis y elaboración de 1-(2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil)-timina (L-FMAU).
Antecedentes de la invención
La infección por el virus de la hepatitis B es un problema de enormes dimensiones. El virus de la hepatitis B ha alcanzado niveles epidémicos en todo el mundo. Se estima que tantas como 350 millones de personas en todo el mundo están infectadas persistentemente con HBV, muchas de las cuales desarrollan patologías asociadas tales como insuficiencia hepática crónica, cirrosis y carcinoma hepatocelular. Después de un periodo de incubación de dos o tres meses en el cual el huésped es inconsciente de la infección, la infección con HBV puede conducir a hepatitis aguda y daño del hígado que causa dolor abdominal, ictericia, y elevados niveles en sangre de ciertas enzimas. Aproximadamente el 1-2% de estos desarrollan hepatitis fulminante, una forma de la enfermedad que progresa rápidamente a menudo mortal en la cual las secciones masivas del hígado se destruyen, con una tasa de mortalidad del 60-70%.
El virus Epstein-Barr es un miembro del género Linfocriptovirus, el cual pertenece a la subfamilia gammaherpesvirina. Es notablemente linfotrófico. El EBV tiene la estructura clásica de los herpesvirus, es decir, su genoma de DNA de cadena doble está contenido en una nucleocápsida icosaédrica, la cual, a su vez, está rodeada por una envoltura lipídica incrustada de glicoproteínas virales. Los EBV se reconocen ahora como una causa de las enfermedades linfoproliferativas, se han ligado a una diversidad de otras enfermedades severas y crónicas, incluyendo un síndrome progresivo raro similar a mononucleosis y una leucoplasia vellosa oral en pacientes de SIDA. La sugerencia de que EBV es una causa principal de la fatiga crónica no resistió escrutinio. EBV se transmite principalmente a través de saliva, aunque algunas infecciones se transmiten mediante transfusión de sangre. Más del 85% de los pacientes en la fase aguda de la mononucleosis infecciosa segregan EBV.
Se ha descubierto que ciertos L-nucleósidos, imágenes especulares de los constituyentes naturales del DNA pueden inhibir la síntesis de DNA a nivel de trifosfato probablemente por la unión estrecha a la polimerasa viral en el primer estadio de la síntesis de DNA viral.
Los 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos tienen la fórmula general:
1
en el que B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática.
Síntesis de L-FMAU comunicada
Yung Chi Cheng, Chung K. Chu y otros notificaron primero que 1-(2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil)-timina (L-FMAU) muestra actividad superior contra el virus de la hepatitis B y el virus Epstein Barr en 1994. Véanse las patentes de los Estados Unidos nº.: 5.587.362; 5.567.688; 5.565.438 y 5.808.040 y la solicitud de patente internacional publicada como WO 95/20595.
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2
Las patentes de Cheng describen una síntesis de L-FMAU del azúcar L-xilosa (fórmula A) tal como el azúcar L-ribosa (fórmula B).
3
Estas patentes describen la síntesis de F-MAU a partir de la L-xilosa por medio de la conversión del intermediario clave 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa (véase por ejemplo la patente '688, comenzando en la columna 4, línea 62). El intermedio clave se sintetizó a partir de L-xilosa en un rendimiento total del 20% (véase también L. Vargha, Chem. Ber., 1954, 87, 1351; Holy, A., y col., Syntetic Procedures in Nucleic Acid Chemistry, V1, 163-67). Esta síntesis se notificó en Ma, T; Pai, S.B.; Zhu, Y.L.; Lin, T.S.; Shanmunganathan, K.; Du, J.F.; Wang, C.G.; Kim, H.; Newton, G.M.; Cheng, Y.C.; Chu, C.K. J. Med. Chem. 1996, 39, 2835. La inversión del grupo hidroxilo de L-xilosa se logró por medio de la formación del 5-O-benzoil-1,2-O-isopropilideno-\alpha-L-ribofuranósido, seguido por una transferencia de hidruro estereoselectiva durante la reducción de la furanósido de ciclocetona con NaBH_{4}. El ribofuranósido resultante se convirtió después a 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa, el intermedio clave en la síntesis de L-FMAU (véase esquema A).
Esquema A
4
La 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa puede sintetizarse además directamente del material inicial más caro L-ribosa (véase por ejemplo la patente '688, comenzando en la columna 6, línea 30, y Holy, A., y col., Synthetic Procedures in Nucleic Acid Chemistry, 163-167). Esta síntesis alternativa de 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa (rendimiento del 55%) se notificó también por Chu, C.K. y col. Antimicrobial Agents Chemoter. 1995, 39, 979. Esta ruta sintética para L-FMAU se presenta a continuación en el esquema B.
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Esquema B
5
El intermedio clave se fluoró subsiguientemente en una reacción de desplazamiento nucleofílica en C_{2} para obtener 1,3,5-tri-O-benzoil-2-desoxi-2-fluoro-L-arbinofuranosa, la cual se condensó con una base deseada, tal como timina (5-metiluracilo) hasta el bromoazúcar para proporcionar los 2'-desoxi-2'-fluoro-arabinofuranosil nucleósidos en diversos rendimientos.
Chu y col. desarrollaron más tarde una síntesis para la producción de L-FMAU de L-arabinosa en 14 etapas y un rendimiento general del 8% (Du, J; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187). La L-arabinosa se convirtió a L-ribosa en 5 etapas (esquema C). La L-ribosa se usó después en la síntesis de 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa, la cual como se describe anteriormente conduce a la formación de L-FMAU.
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Esquema C
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6
Los procedimientos mencionados anteriormente comienzan bien a partir de un azúcar caro (L-ribosa o L-xilosa) y/o bien son muy largos, con bajos rendimientos. Además, implican el uso de una forma nucleofílica de fluoruro tal como KHF_{2} o Et_{3}N-3HF, la cual es difícil de manejar y requiere el desplazamiento de un grupo hidroxilo activado. La inestabilidad de DAST evita su uso a gran escala. La conversión de 1-O-acetil-2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa (TBAR) a 1,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa genera 2,3,5-tri-O-benzoil-\beta-L-ribofuranosa como un producto secundario, aunque se puede reconvertir a TBAR.
Síntesis Comunicada de 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-arabinofuranósido
La síntesis de 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-\alpha-D-arabinofuranósido, se ha comunicado por Wright y col. (Wright, J.A.; Taylor, N.F.; Fox, J.J. J. Org. Chem 1969, 34, 2632, y referencias de los mismos). En esta notificación, se usa D-xilosa como el material de inicio, la cual después de una conversión a la furanosa correspondiente y una serie de reacciones de protección, dio un furanósido epoxi como un intermedio. Este compuesto se convirtió adicionalmente a 5-O-bencil-1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-\alpha-D-arabinosa, la cual después de eliminarse el grupo bencilo proporcionó 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-\alpha-D-arabinofuranósido (esquema D).
Esquema D
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7
La síntesis del arabinofuranósido 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-\beta-D-arabinofuranósido (el anómero del compuesto anterior) se reportó por Marquez y col. (Wysocki, R.J.; Siddiqui, M.A.; Barchi, J.J.; Driscoll, J.S.; Marquez, V.E. Synthesis 1991, 1005). La D-ribosa se convirtió en varias etapas a 1,3,5-tri-O-benzoil-2-desoxi-2-fluoro-\beta-D-arabinofuranosa, el derivado bromoazúcar correspondiente se produjo bajo condiciones de HBr/AcOH y la reacción de carbonato de potasio en metanol dio el compuesto deseado (esquema E).
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Esquema E
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8
Síntesis Comunicada de 2-desoxi-2-fluoro-D-arabinopiranosa
Se hizo previamente 2-desoxi-2-fluoro-D-arabinopiranosa a partir de D-arabinosa por medio de D-arabinal como se muestra en el esquema F (Albano, E.L. y col. Carbohyd. Res. 1971, 19, 63).
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Esquema F
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9
El mismo material se hizo a partir de D-ribosa como se muestra más adelante en el Esquema G (Bols, M; Lundt, I.; Acta Chem. Scand. 1990, 44, 252).
\newpage
Esquema G
10
Síntesis Comunicada de 2-desoxi-2-fluoro-3,4-di-O-acetil-D-arabinopiranosa
El compuesto título se hizo previamente como un resultado de una adición electrofílica de selectfluor en D-arabinal (Albert, M, y col. Tetrehedron 1998, 54, 4839; esquema H).
Esquema H
11
A la luz de la importancia comercial de L-FMAU, y su uso en el tratamiento de pacientes afligidos con hepatitis B y virus Epstein Barr, proporcionar una síntesis mejorada de L-FMAU y nucleótidos relacionados es un objeto de la invención.
Es otro objeto de la invención proporcionar una síntesis de 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos para materiales de partida económicos en un rendimiento relativamente alto.
Sumario de la invención
La presente invención es un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos, y en particular, 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) de L-arabinosa, la cual está disponible comercialmente y es menos cara que L-ribosa o L-xilosa. El procedimiento implica la síntesis inicial de una 2-desoxi-2-halo-3,4-di-O-protegida-L-arabinospiranosa, por medio de un agente halogenante electrofílico, y en particular un agente fluorante. La desprotección e isomerización proporciona un 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranósido, un intermedio clave en esta síntesis. Los grupos 3-hidroxilo y 5-hidroxilo se pueden proteger después, preferiblemente por medio de benzoilación, y la posición 1 se puede activar, preferiblemente halogenar, e incluso más preferiblemente brominar. Este compuesto se puede condensar con una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática para formar el deseado 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabinofuranosil-nucleósido.
Este procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabinofuranosil-nucleósido, y en particular, L-FMAU, es la primera síntesis de esta clase de nucleósidos a partir de L-arabinosa en diez etapas. Todos los reactivos y materiales de partida son económicos y no se requiere equipamiento especial para llevar a cabo las reacciones. Una etapa clave para la síntesis es la conversión de un piranósido, 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa, dentro de un furanósido, 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranósido.
En particular, en una realización de la presente invención, se proporciona un procedimiento para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I):
12
en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I), si bien preferiblemente flúor; y B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; comprendiendo
(a) obtener una 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
13
en la que cada uno de R^{1} y R^{2} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo:
(b) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa;
(c) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(d) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida; y
(e) desproteger, si es necesario, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
En otra realización de la invención, se proporciona un procedimiento para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I):
14
en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I), si bien preferiblemente flúor; y B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; comprendiendo
\newpage
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
15
en la que cada R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno o un grupo adecuado de oxígeno tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
16
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
17
(d) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
18
en la que X es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente F;
(e) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa;
(f) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(g) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida; y
(h) desproteger, si es necesario, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
En una realización particular de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabino-furanosa se lleva a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico. En una realización adicional de la presente invención la conversión de 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabino-furanosa se lleva a cabo en metanol seco. En una realización preferida, la conversión del 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa se llevó a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico en metanol seco.
En otra realización de la presente invención, un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) comprende
(a) obtener una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-A):
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19
en la que cada R^{1} y R^{2} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa;
(c) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I) si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(d) acoplar la arabinofuranosa a una timidina opcionalmente protegida; y
(e) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
En aún otra realización de la invención, un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) comprende
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
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en la que cada uno de R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
\newpage
(b) sustituir OR^{1}con un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
21
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
22
(d) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a);
23
(f) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa en una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa;
(g) OR^{1} opcionalmente sustituido con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(h) acoplar la arabinofuranosa a una timina opcionalmente protegida; y
(i) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
En una realización particular de la presente invención, la halogenación, y en particular, la fluoración, del compuesto de la fórmula (III) se realiza en nitrometano:agua. En una realización alternativa, la halogenación, y en particular, la fluoración, del compuesto de fórmula (III) se realiza en acetona:agua.
En una realización particular de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-fluoro-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa se lleva a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico. En una realización adicional de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa se lleva a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico en metanol seco.
En una realización de la invención la 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil timina, se puede funcionalizar adicionalmente, tal como fosforilar o acilar para formar sales o profármacos farmacéuticamente aceptables.
Breve descripción de la figura
La figura 1 es un ejemplo no limitante de un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina, de acuerdo a la presente invención.
Descripción detallada de la invención
La presente invención es un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósidos, y en particular, 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU), a partir de L-arabinosa, la cual está comercialmente disponible y es menos cara que L-ribosa o L-xilosa. El procedimiento implica la síntesis inicial de una 2-desoxi-2-halo-3,4-di-O-protegida-L-arabinopiranosa, y en particular 2-desoxi-2-fluoro-3,4-di-O-acetil-L-arabinospiranosa, por medio de un agente halogenante electrofílico, y en particular un reactivo fluorante. La desprotección e isomerización proporciona un 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranósido, y en particular, 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranósido, un intermedio clave en esta síntesis. Los grupos hidroxilo 3- y 5- se pueden proteger después, preferiblemente por benzoilación, y la posición 1 se puede activar, preferiblemente halogenar, e incluso más preferiblemente brominarse para formar, por ejemplo, 1-bromo-3,5-di-O-benzoil-2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa. Este compuesto puede después condensarse con una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática para formar el deseado 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabinofuranosil-nucleósido.
Este procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabinofuranosil-nucleósido, y en particular, L-FMAU, es la primera síntesis de esta clase de nucleósidos a partir de L-arabinosa en diez etapas. Todos los reactivos y materiales de partida son económicos y no se requiere equipo especial para llevar a cabo las reacciones. Una etapa clave para la síntesis es la conversión de un piranósido, 2-desoxi-2-halo-L-arabopiranosa, en un furanósido, 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranósido.
El término "análogo de L-FMAU" o "nucleósido relacionado" como se usa en el presente documento se refiere a un nucleósido que se forma a partir de una base pirimidínica o púrica que se acopla a un resto 2-fluoro-arabinofuranosilo.
En particular, en una realización de la presente invención, se proporciona un procedimiento para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I):
24
en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I), si bien preferiblemente flúor; y B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; comprendiendo
(a) obtener un 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
25
en la que cada uno de R^{1} y R^{2} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo:
(b) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa;
(c) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
\newpage
(d) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida; y
(e) desproteger, si es necesario, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
En una realización particular de la invención, la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
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26
en la que R^{1} y R^{2} son como se definen anteriormente, se proporciona mediante un procedimiento que comprende
(a) obtener un L-arabinal opcionalmente protegido de la fórmula (III)
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27
en la que cada uno de los R^{3} es independientemente hidrógeno o un grupo protector oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo, si es necesario, para formar la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II).
En una realización incluso más particular de la invención, se proporciona la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
28
en la que cada uno de R^{1} y R^{2} es como se define anteriormente, se proporciona mediante un procedimiento, que comprende
\newpage
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
29
en la que cada uno de R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
30
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
31
(d) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II).
En una realización de la invención, se proporciona un procedimiento para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I):
32
en la que X es un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferentemente flúor; y B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; que comprende
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
33
en la que cada uno de R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
34
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
35
(d) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
36
en la que X es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente F;
(e) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-piranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa;
(f) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado , tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(g) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida, y
(h) desproteger, si es necesario, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
En una realización particular de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa se lleva cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico. En una realización adicional de la presente invención, se lleva cabo la conversión de la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa usando un equivalente de ácido sulfúrico en metanol seco.
En otra realización de la presente invención, un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosiltimina (L-FMAU) comprende
(a) obtener un 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a)
37
en la que R^{1} y R^{2} son independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa en una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa;
(c) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente a través de un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(d) acoplar la arabinofuranosa a una timidina opcionalmente protegida; y
(e) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
En una realización particular de la invención, se proporciona la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a):
38
en la que R^{1} y R^{2} son como se define anteriormente, mediante un procedimiento que comprende
(a) obtener un L-arabinal opcionalmente protegido de la fórmula (III)
39
en la que cada R^{3} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo, si es necesario, para formar la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a).
En una realización incluso más particular de la invención, se proporciona la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a):
40
en la que R^{1} y R^{2} son como se define anteriormente, mediante un procedimiento, que comprende
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
41
en la que R^{3} y R^{4} son independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo, o sililo;
(b) OR^{1} sustituido con un halógeno (F, Br, Cl o I) preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
42
en la que X_{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
43
(d) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a).
En una realización de la invención, un procedimiento para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) comprende
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
44
en la que cada R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br, para obtener un compuesto de la fórmula (V);
45
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
46
(d) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar el 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a);
47
(f) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa;
(g) sustituir opcionalmente OR^{1} con un grupo saliente adecuado, tal como O-Acil (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br;
(h) acoplar la arabinofuranosa a una timina opcionalmente protegida; y
(i) desprotegerlo, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
En una realización particular de la presente invención, la halogenación, y, en particular, la fluoración de un compuesto de fórmula (III) se lleva a cabo en nitrometano:agua. En una realización alternativa, la halogenación, y en particular, la fluoración, del compuesto de fórmula (III) se lleva a cabo en acetona:agua.
En una realización particular de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa se lleva a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico. En una realización adicional de la presente invención, la conversión de la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-arabinofuranosa se lleva a cabo en metanol seco. En una realización preferida, la conversión de la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa se acomplejó usando un equivalente de ácido sulfúrico en metanol seco.
Ejemplos no limitantes de agentes de fluoración que se pueden usar en la adición electrófila de flúor al L-arabinal incluyen: hipofluorito de trifluorometilo (CF_{3}OF), hipofluorito de acetilo (CH_{3}COOF), difluoruro de xenón (XeF_{2}), flúor elemental (F_{2}). En una realización preferida el agente de fluoración es Selectfluor™ (F-TEDA-BF_{4}).
I. Nucleósidos Que Se Pueden Sintetizar de Acuerdo con la Presente Invención
La invención como se discute en el presente documento se usa para producir compuestos de fórmula (C)
48
en los que cada R y R' son independientemente hidrógeno, alquilo, acilo, arilo, monofosfato, difosfato, trifosfato, aminoácido, o un grupo protector de oxígeno;
X es un halógeno (F, Br, Cl o I), y preferiblemente flúor; y
B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática.
Estos compuestos bien poseen actividad antiviral (es decir, virus anti-hepatitis B o virus anti-Epstein-Barr), se metabolizan a un compuesto que presenta tal actividad, o bien se pueden usar en un proceso de elaboración para preparar compuestos que tienen tal actividad.
II. Definiciones
Como se usa en el presente documento, el término "sustancialmente libre de" o "sustancialmente en ausencia de" se refiere a una composición nucleosídica que incluye al menos del 95% al 98%, o más preferiblemente, del 99% al 100%, del enantiómero diseñado de ese nucleósido. En una realización preferida, se prepara el compuesto sustancialmente libre de su correspondiente isómero \beta-D.
El término "enriquecido enantioméricamente", se usa a lo largo de toda la memoria descriptiva para describir un nucleósido el cual incluye al menos un 95%, preferiblemente al menos un 98%, e incluso más preferiblemente al menos un 99% o más de un único enantiómero de ese nucleósido. Cuando un nucleósido de una configuración particular (D o L) es nombrado en esta memoria descriptiva, se presume que el nucleósido es un nucleósido enantioméricamente enriquecido, a menos que se establezca otra cosa.
El término alquilo, como se usa en el presente documento, a menos que se establezca otra cosa, se refiere a un hidrocarburo primario, secundario, o terciario lineal, ramificado o cíclico saturado, típicamente de C_{1} a C_{18}, incluye alquilo inferior, e incluye específicamente metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, t-butilo, pentilo, ciclopentilo, isopentilo, neopentilo, hexilo, isohexilo, ciclohexilo, ciclohexilmetilo, 3-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo y 2,3-dimetil-butilo. El grupo alquilo se puede sustituir opcionalmente con grupos funcionales según se desea, como se sabe por aquellos expertos en la técnica, por ejemplo, como se enseña en Greene, y col., Protective Groups in Organic Sinthesys, John Wiley and Sons, segunda edición, 1991. El término alquilo inferior, como se usa en el presente documento, y a menos que se especifique otra cosa, se refiere a un grupo alquilo lineal, ramificado, o si es apropiado, cíclico (por ejemplo, ciclopropilo) saturado de C_{1} a C_{4}, incluyendo tanto formas sustituidas como insustituidas.
El término "protegido" como se usa en el presente documento y a menos que se defina otra cosa se refiere a un grupo que se añade a un átomo de oxígeno, nitrógeno, o fósforo para prevenir su reacción adicional o para otros propósitos. Una amplia diversidad de grupos protectores de oxígeno y nitrógeno se conocen por aquellos expertos en la técnica o síntesis orgánica. Los grupos protectores adecuados se describen, por ejemplo, en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991.
El término arilo, como se usa en el presente documento, y a menos que se especifique otra cosa, se refiere a fenilo, bifenilo, o naftilo, y preferiblemente fenilo. El grupo arilo se puede sustituir opcionalmente como se conoce por aquellos expertos en la técnica, por ejemplo, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991.
El término acilo se refiere a motivos de la fórmula -C(O)R', en los que R' es alquilo; arilo, alcarilo, aralquilo, heteroaromático, heterocíclico, alcoxialquilo que incluye metoximetilo; arilalquilo que incluye bencilo; ariloxialquilo, tal como fenoximetilo; arilo que incluye fenilo opcionalmente sustituido con grupos halo, alquilo(C_{1}-C_{4}) o alcoxi(C_{1}-C_{4}) o el residuo de un aminoácido.
El término sililo se refiere a un resto de la fórmula -SiR'_{3}, en la que cada R' es independientemente grupo alquilo o grupo arilo como se define en el presente documento. El grupo alquilo o arilo se puede sustituir opcionalmente como se sabe por aquellos expertos en la técnica, por ejemplo, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991.
El término "halógeno", como se usa en el presente documento, incluye flúor, cloro, bromo y yodo.
El término base púrica o pirimidínica incluye, pero no se limita a, adenina, 6-alquilpurinas, 6-acilpurinas (en las que acilo es C(O)(alquilo, arilo, alquilarilo o arilalquilo), 6-bencilpurina, 6-halopurina, N^{6}-acilpurina, 6-hidroxialquilpurina, 6-tioalquilpurina, N^{2}-alquilpurinas, N^{2}-alquil-6-tiopurinas, timina, citosina, 5-fluorocitosina, 5-metilcitosina, 6-azapirimidina, incluyendo 6-azacitosina, 2- y/o 4-mercaptopirimidina, uracilo, 5-halouracilo, que incluye 5-fluorouracilo, C^{5}-alquilpirimidinas, C^{5}-bencil-pirimidinas, C^{5}-halopirimidinas, C^{5}-vinilpirimidina, pirimidina C^{5}-acetilénica, C^{5}-acilpirimidina, C^{5}-hidroxialquilpirimidina, C^{5}-aminopirimidina, C^{5}-cianopirimidina, C^{5}-nitropirimidina, C^{5}-aminopirimidina, 5-azacitidinilo, 5-azauracililo, tiazolopiridinilo, imidazolopiridinilo, pirrolopiridinilo y pirazolopirimidinilo. Las bases púricas incluyen, pero no se limitan a, guanina, adenina, hipoxantina, 2,6-diaminopurina, y 6-cloropurina. Los grupos funcionales de oxígeno y nitrógeno en la base se pueden proteger como sea necesario o deseado. Los grupos protectores adecuados se conocen bien por aquellos expertos en la técnica, e incluyen trimetilsililo, dimetilhexilsililo, t-butildimetilsililo y t-butildifenilsililo, tritilo, grupos alquilo, grupos acilo tales como acetilo y propionilo, metanosulfonilo, y p-toluenosulfonilo. El grupo heteroaromático se puede sustituir opcionalmente como se describe anteriormente para arilo.
El término heteroarilo o heteroaromático, como se usa en el presente documento, se refiere a un compuesto aromático que incluye al menos un azufre, oxígeno, nitrógeno o fósforo en el anillo aromático. El término heterocíclico se refiere a grupos cíclicos no aromáticos en los que hay al menos un heteroátomo, tal como oxígeno, azufre, nitrógeno o fósforo en el anillo. Ejemplos no limitantes de grupos heteroarilo y heterocíclicos incluyen furilo, furanilo, piridilo, pirimidilo, tienilo, isotiazolilo, imidazolilo, tetrazolilo, pirazinilo, benzofuranilo, benzotiofenilo, quinolilo, isoquinolilo, benzotienilo, isobenzofurilo, pirazolilo, indolilo, isoindolilo, benzimidazolilo, purinil, carbazolilo, oxazolilo, tiazolilo, isotiazolilo, 1,2,4-tiadiazolilo, isooxazolilo, pirrolilo, quinazolinilo, cinnolinilo, ftalazinilo, xantinilo, hipoxantinilo, tiofeno, furano, pirrol, isopirrol, pirazol, imidazol, 1,2,3-triazol, 1,2,4-triazol, oxazol, isoxazol, tiazol, isotiazol, pirimidina o piridazina, y pteridinilo, aziridinas, tiazol, isotiazol, 1,2,3-oxadiazol, tiazina, piridina, pirazina, piperazina, pirrolidina, oxaziranos, fenacina, fenotiazina, morfolinilo, pirazolilo, piridazinilo, pirazinilo, quinoxalinilo, xantinilo, hipoxantinilo, pteridinilo, 5-azacitidinilo, 5-azauracililo, triazolopiridinilo, imidazolopiridinilo, pirrolopirimidinilo, pirazolopirimidinilo, adenina, N^{6}-alquilpurinas, N^{6}-benzilpurina, N^{6}-halopurina, N^{6}-vinipurina, N^{6}-purina acetilénica, N^{6}-acilpurina, N^{6}-hidroxialquilpurina, N^{6}-tioalquilpurina, timina, citosina, 6-azapirimidina, 2-mercaptopirimidina, uracilo, N^{5}-alquilpirimidinas, N^{5}-bencilpirimidinas, N^{5}-halopirimidinas, N^{5}-vinilpirimidinas, N^{5}-pirimidina acetilénica, N^{5}-acilpirimidina, N^{5}-hidroxialquilpurina, y N^{6}-tioalquilpurina, e isoxazolilo. El grupo heteroaromático se puede sustituir opcionalmente como se describe anteriormente por arilo. El grupo heterocíclico o heteroaromático se puede sustituir opcionalmente con uno o más sustituyentes seleccionados de halógeno, haloalquilo, alquilo, alcoxi, hidroxi, derivados carboxilo, amido, amino, alquilamino, dialquilamino. El compuesto heteroaromático puede hidrogenarse parcialmente o totalmente según se desee. Como un ejemplo no limitante, se puede usar dihidropiridina en lugar de piridina. Se pueden proteger el oxígeno funcional y los grupos de nitrógeno en el grupo heterocíclico o heteroarilo según sea necesario o deseado. Los grupos protectores adecuados se conocen bien por aquellos expertos en la técnica, e incluyen trimetilsililo, dimetilhexilsililo, t-butildimetilsililo, y t-butildifenilsililo, tritilo o tritilo sustituido, grupos alquilo, grupos acilo tales como acetilo y propionilo, metanosulfonilo, y p-toluenilsulfonilo.
Estas bases púricas o pirimidínicas, heteroaromáticas o heterocíclicas se pueden sustituir con grupos alquilo o anillos aromáticos, unidos a través de enlaces simples o dobles o fusionados al sistema anillo heterocíclico. La base púrica, base pirimidínica, heteroaromática o heterocíclica se puede unir al resto azúcar a través de cualquier átomo disponible, incluyendo el anillo de nitrógeno y el anillo de carbono (produciendo un C-nucleósido).
III. Descripción Detallada de las Etapas del Procedimiento Preparación de Material de Partida - 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II)
El material de partida clave para este procedimiento es una 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II). La 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II) se puede comprar o se puede preparar mediante cualesquiera procedimientos conocidos que incluyen la reducción estándar y las técnicas de adición electrofílica. En una realización, la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II) se preparó a partir de L-arabinal seguido por halogenación. El L-arabinal se puede comprar o se puede preparar mediante cualesquiera medios conocidos que incluyen técnicas de reducción estándar. Por ejemplo, el L-arabinal se puede preparar a partir de una L-arabinosa apropiadamente protegida, preferiblemente protegida con un grupo acilo tal como con un grupo acetilo, de acuerdo al siguiente protocolo.
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Se puede proteger L-arabinosa (1) por medios bien conocidos para aquellos expertos en la técnica, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991, para formar una L-arabinosa apropiadamente protegida (2), en la que cada P es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno apropiado tal como un grupo alquilo, acilo o sililo, si bien preferiblemente es un grupo acilo tal como un grupo acetilo. La protección se puede llevar a cabo en cualquier disolvente apropiado que facilita el resultado deseado. En una realización la reacción se llevó a cabo en una base débil, tal como piridina. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es de temperatura ambiente a condiciones de reflujo.
La L-arabinosa apropiadamente sustituida (2) se puede halogenar después, preferiblemente brominar, usando cualquier haluro apropiado bajo cualesquiera condiciones apropiadas, si bien preferiblemente condiciones ácidas, para obtener una 1-\alpha-halo-2,3,4-tri-O-protegida-L-arabinopiranosa (3), tal como 1-\alpha-halo-2,3,4-tri-O-acetil-L-arabinopiranosa (3). La halogenación se puede llevar a cabo en cualquier disolvente apropiado que facilite el resultado deseado. En un ejemplo no limitante, el compuesto (2) se puede halogenar con H-X, en el que X es F, Cl, Br o I, preferiblemente un ácido de acilo tal como ácido acético, opcionalmente con un anhídrido de acilo tal como anhídrido acético. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita avanzar a la reacción a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es de temperatura ambiente a condiciones de reflujo.
La 1-\alpha-halo-2,3,4-tri-O-protegida-L-arabinopiranosa (3) se puede reducir después usando cualquier agente reductor adecuado para obtener el L-arabinal (4). Los posibles agentes reductores son reactivos que promueven reducción, incluyendo pero no limitados a, polvo de cinc en presencia de pentahidrato de CuSO_{4} y acetato de sodio en AcOH/H_{2}O. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es desde por debajo de -5ºC hasta temperatura ambiente. El L-arabinal se puede preparar en cualquier disolvente que es adecuado para la temperatura y la solubilidad de los reactivos. Los disolventes pueden constar de cualquier disolvente prótico que incluye, pero no se limita a, alcohol, tal como metanol, etanol, isopropanol, butanol, pentanol, o hexanol, ácido acílico tal como ácido acético, agua o cualquier combinación de los mismos, si bien preferiblemente el disolvente es ácido acético y agua.
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El L-arabinal (4) se puede halogenar después, preferentemente fluorar, usando un reactivo halogenador electrofílico apropiado para proporcionar compuesto (5). Los agentes halogenantes electrofílicos posibles son reactivos que promueven halogenación específica de región. En una realización particular, se usa un agente electrofílico de fluoración. Los ejemplos no limitantes de agentes de fluoración que se pueden usar en la adición electrofílica de flúor a L-arabinal incluyen, pero no se limitan a, hipofluorito de trifluorometilo (CF_{3}OF), hipofluorito de acetilo (CH_{3}COOF), difluoruro de xenón (XeF_{2}), flúor elemental (F_{2}). En una realización alterna el agente de fluoración es Selectfluor™. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es de temperatura ambiente a condiciones de reflujo. La halogenación se puede preparar en cualquier disolvente que es adecuado para la temperatura y la solubilidad de los reactivos. Los disolventes pueden constar de cualquier disolvente prótico o aprótico polar que incluye, pero no se limita a, alcohol, tal como metanol, etanol, isopropanol, butanol, pentanol o hexanol, acetona, acetato de etilo, ditianos, THF, dioxano, acetonitrilo, nitrometano, dimetilformamida (DMF), dimetilsulfóxido (DMSO), dimetilaetamida, agua, o cualesquiera combinaciones de los mismos, si bien preferiblemente el disolvente es agua/nitrometano y agua/acetona: (1/2).
La 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa opcionalmente protegida (5) se puede desproteger, si es necesario, mediante procedimientos bien conocidos por aquellos expertos en la técnica, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991, para obtener la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II). La desprotección se puede llevar a cabo en cualquier disolvente apropiado que facilite el resultado deseado. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. Por ejemplo, los grupos protectores de acilo, y en particular el grupo acetilo, se puede desproteger con metóxido de sodio en metanol a temperatura ambiente.
En una realización preferida de la invención, este procedimiento, se puede adaptar para producir los compuestos intermedios críticos para la síntesis de análogos de L-FMAU o L-FMAU.
Preparación de 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa
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La 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa (II) se hace reaccionar con un ácido adecuado (en gas o en forma líquida), tal como, pero no limitado a ácido sulfúrico o clorhídrico bien en cantidades catalizadores o bien en exceso para formar una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa (7). En una realización de la presente invención, se usa 1 equivalente molar de ácido sulfúrico para esta reacción. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es de temperatura ambiente a condiciones de reflujo. Esta reacción se puede llevar a cabo en cualquier disolvente que sea adecuado para la temperatura y la solubilidad de los reactivos. Los disolventes pueden constar de cualquier disolvente prótico o aprótico polar, incluyendo, pero no limitándose a, un alcohol, tal como metanol, etanol, isopropanol, butanol, pentanol o hexanol, acetona, acetato de etilo, ditianos, THF, dioxano, acetonitrilo, nitrometano, dimetilformamida (DMF), dimetilsulfóxido (DMSO), dimetil-acetamida, agua, o cualquier combinación de los mismos, si bien preferiblemente el disolvente es metanol.
La 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa (7) se puede proteger opcionalmente mediante procedimientos bien conocidos para aquellos expertos en la técnica, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991, para formar una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa apropiadamente protegida (8), en la que cada P es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno apropiado tal como un grupo alquilo, acilo o sililo, si bien preferiblemente un grupo acilo tal como un grupo benzoilo. La protección se puede llevar a cabo en cualquier disolvente apropiado que facilita el resultado deseado. En una realización la reacción se lleva a cabo en una base débil, tal como piridina. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es de 0ºC a temperatura ambiente.
Preparación de 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido
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La 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa apropiadamente protegida (8) se activa opcionalmente para formar una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa activada (9), en la que LG es un grupo saliente adecuado, tal como O-acilo (incluyendo OAc) o un halógeno (F, Br, Cl o I), si bien preferiblemente un halógeno, e incluso más preferiblemente Br. En un ejemplo no limitante, se halogena el compuesto (8) con halogenado con H-X, en el que X es F, Cl, , Br, o I, si bien preferiblemente Br, opcionalmente con un ácido adecuado, preferiblemente un ácido de acilo tal como ácido acético, para proporcionar compuesto (9). Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es temperatura ambiente. Esta reacción se puede llevar a cabo en cualquier disolvente que sea adecuado para la temperatura y la solubilidad de los reactivos. Los disolventes pueden constar de cualquier disolvente prótico o aprótico polar que incluye, pero no se limita a, un alcohol, tal como metanol, etanol, isopropanol, butanol, pentanol o hexanol, acetona, acetato de etilo, ditianos, THF, dioxano, acetonitrilo, nitrometano, diclorometano, dicloroetano, éter dietílico, dimetiformamida (DMF), dimetilsulfóxido (DMSO), dimetilacetamida, agua, o cualquier combinación de los mismos, si bien preferiblemente el disolvente es diclorometano.
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La 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa activada (9) se puede acoplar con una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida para proporcionar el 2'-desoxi-2'-halo-L-arabinonucleósido opcionalmente protegido (11). Los sustituyentes solubilizantes se pueden añadir a la base púrica, base pirimidínica, heteroaromática o heterociclo para promover solubilidad en el sistema disolvente deseado. Debería entenderse también que ciertos grupos funcionales de la base púrica, base pirimidínica, heteroaromática o heterociclo pudieran necesitar protegerse o prevenir reacciones secundarias innecesarias. Los restos reactivos se pueden proteger usando medios convencionales y los grupos apropiadamente protectores bien conocidos por aquellos expertos en la técnica, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991. Por ejemplo, la amina libre en la citosina se puede proteger mediante reacción con cloruro de benzoilo o cualquier otro compuesto acilo adecuado para prevenir el acoplamiento innecesario en la posición N^{4}, para activar la base citosina, y/o para ayudar en solubilizar el compuesto en un disolvente orgánico. Alternativamente, la amina libre y/o el hidroxilo libre en la base púrica, base pirimidínica, heteroaromática o heterociclo, tal como timina, se puede proteger con un grupo sililo, tal como cloruro de trimetilsililo para evitar productos secundarios innecesarios, para activar la base púrica, base pirimidínica, heteroaromática o heterociclo, tal como timina, y/o para ayudar en la solubilización del compuesto en el disolvente orgánico. Cualquier compuesto que contiene un nitrógeno que es capaz de reaccionar con un centro de deficiencia de electrones se puede usar en la reacción de condensación. En una realización una base timina O-protegida, por ejemplo una timina sililada tal como trimetilsili-timina, se acopla con compuesto (9). En una realización preferida, la base de pirimidina o purina se silila con un agente sililante adecuado para formar una base sililada. Agentes sililantes posibles son reactivos que promueven sililación, incluyendo pero no limitándose a, 1,1,1,3,3,3-hexametildisilazano, opcionalmente con una cantidad catalítica de sulfato de amonio. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es la de las condiciones de reflujo.
La reacción de acoplamiento se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. La temperatura preferida es temperatura ambiente. La reacción puede tener lugar en cualquier disolvente que proporciona la temperatura apropiada y la solubilidad de los reactivos. Los ejemplos de disolventes incluyen cualquier disolvente aprótico tal como un disolvente alquilo tal como hexano y ciclohexano, toluneno, acetona, acetato de etilo, ditianos, THF, dioxano, acetonitrilo, cloroformo, diclorometano, éter dietílico, piridina, dimetilformamida (DMF), dimetilsulfóxido (DMSO), dimetilacetamida, 1,1,1,3,3,3-hexametildisilazano o cualquier combinación de los mismos, preferiblemente diclorometano, dicloroetano o una combinación de cloroformo y 1,1,1,3,3,3-hexametildisilazano.
El 2'-desoxi-2'-halo-L-arabinonucleósido opcionalmente protegido (11) se puede desproteger después, si es necesario, mediante procedimientos bien conocidos para aquellos expertos en la técnica, como se enseña en Greene, y col., "Protective Groups in Organic Sinthesys", John Wiley and Sons, segunda edición, 1991, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-L-arabinonucleósido (I). La desprotección se puede llevar a cabo en un disolvente adecuado que facilita el resultado deseado. Esta reacción se puede llevar a cabo a cualquier temperatura que permita a la reacción avanzar a una velocidad aceptable sin promover descomposición o productos secundarios excesivos. Por ejemplo, productos protectores de acilo, y en particular un grupo benzoilo, se puede desproteger con n-butilamina en metanol a reflujo.
En casos donde los compuestos son suficientemente básicos o ácidos para formar sales ácidas o básicas no tóxicas estables, se pueden sintetizar las sales farmacéuticamente aceptables. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen aquellas derivadas de bases y ácidos inorgánicos y orgánicos farmacéuticamente aceptables. Las sales adecuadas incluyen aquellas derivadas de metales alcalinos tales como sodio y potasio, metales alcalinotérreos tales como calcio y magnesio, entre numerosos otros ácidos bien conocidos en la técnica farmacéutica. En particular, ejemplos de sales farmacéuticamente aceptables son sales de adición de ácidos orgánicos formadas con ácidos, las cuales forman un anión fisiológicamente aceptable, por ejemplo, tosilato, metanosulfonato, acetato, citrato, malonato, tartrato, succinato, benzoato, ascorbato, \alpha-cetoglutarato, y \alpha-glicerofosfato. También se pueden formar las sales inorgánicas adecuadas, incluyendo sales sulfato, nitrato, bicarbonato, y carbonato.
Las sales farmacéuticamente aceptables se pueden obtener usando procedimientos estándar bien conocidos en la técnica, por ejemplo haciendo reaccionar un compuesto suficientemente básico tal como una amina con un ácido adecuado que proporciona un anión fisiológicamente aceptable. Se pueden fabricar también sales de ácidos carboxílicos con metales alcalinos (por ejemplo, sodio, potasio o litio) o metales alcalinotérreos (por ejemplo calcio) de ácidos carboxílicos.
Cualquiera de los nucleósidos descritos hasta ahora en el presente documento se puede derivar a su profármaco nucleósido o nucleótido. Se conoce un número de ligandos profármacos nucleotídicos. En general, se conoce bien en la técnica la alquilación, acilación u otra modificación lipofílica del mono, di, o trifosfato del nucleósido. Ejemplos de grupos sustituyentes que pueden reemplazar uno o más hidrógenos en el resto fosfato son alquilo, arilo, esteroides, carbohidratos, incluyendo azúcares, 1,2-diacilglicerol y alcoholes. Muchos se han descrito en R. Jones y N. Bischofberger, Antiviral Research, 27 (1995) 1-17. Cualquiera de estos se puede usar para funcionalizar los nucleótidos descritos para lograr un profármaco deseado.
El nucleósido activo se puede proporcionar también como un lípido de 5'-fosfoéter lípido o lípido de 5'-éter, como se discute en las siguientes referencias: Kucera, L.S., N, Iyer, E. Leake, A. Raben, Modest E.K., D.L.W. y C. Piantadosi, 1990. "Novel membrane-interactive etherlipid analogs that inhibit infectious HIV-1 production and induce defective virus formation". AIDS Res. Hum. Retro Viruses. 6:491-501; Piantadosi, C., J. Marasco C.J,, S.L. Morris-Natschke, K.L. Meyer, F. Gumus, J.R. Surles, K.S. Ishag, L.S. Kucera, N, Iyer, C.A., Wallen S. Piantradosi y E.J. Modest, 1991. "Synthesis and evaluation of novel ether lipid nucleoside conjugates for anti-HIV activity". J. Med. Chem. 34: 1408-1414; Hosteller, K.Y., D.D. Richman, D.A Carson , L.M. Stuhmiller, G.M.T. van Wijk, y H. van den Bosch. 1992. "Greatly enhanced inhibition of human immunodeficiency virus type 1 replication in CEM and HT4-6C cells by 3'-deoxythymidine diphosphate dimyristoylglyceol, a lipid prodrug of 3'-desoxithymidine". Antimicrob. Agents Chemother. 36:2025-2029; Hosetler, K.Y., L.M. Stuhmiller, H.B. Lenting, H. van den Bosch, y D.D.Richman, 1990. "Synthesis and antiretroviral activity of phospholipid analogs of azidothymidine and other antiviral nucleosides". J. Biol. Chem. 265:61127.
Ejemplos no limitantes de patentes de los Estados Unidos que describen adecuadamente sustituyentes lipofílicos que se pueden incorporar covalentemente en los nucleósidos, preferiblemente en la posición 5'-OH del nucleósido o preparaciones lipofílicas, que incluyen las patentes de los Estados Unidos n^{os}.: 5.149.794 (22-septiembre-1992, Yatvin y col.); 5.194.654 (16-marzo-1993, Hostetler y col.); 5.223.263 (29-junio-1993, Hostetler y col.); 5.256.641 (26-octubre-1993, Yatvin y col.); 5.411.947 (2-mayo-1995, Hostetler y col.); 5.463.092 (31-octubre-1995, Hostetler y col.); 5.543.389 (6-agosto-1996; Yatvin y col.); 543.390 (6-agosto-1996, Yatvin y col.); 5.543.391 (6-agosto-1996, Yatvin y col.); y 5.554.728 (10-septiembre-1996; Basava y col.). Solicitudes de patente extranjeras que describen sustituyentes lipofílicos que se pueden unir a los nucleósidos de la presente invención, o preparaciones lipofílicas, incluyen WO 89/02733, WO 90/00555; WO 91/16920, WO 91/18914, WO 91/00910, WO 94/26273, WO 96/15132, EP 0350287, EP 93917054,4, y WO 91/19721.
Preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina (L-FMAU)
El bromoazúcar peracetilado de L-arabinosa (15, figura 1) se puede obtener de acuerdo con el procedimiento de la bibliografía como un sólido, en un rendimiento del 57% después de cristalización a partir de éter (Balog, A; Yu, M.S.; Curran, D.P. Synthetic Comm. 1996, 26, 935). El material es muy inestable a temperatura ambiente y se tuvo que usar inmediatamente o almacenarse en un congelador.
Un L-arabinal opcionalmente protegido se puede obtener también de acuerdo a un procedimiento de la bibliografía en un rendimiento del 60% después de la cromatografía en columna (Smiatacz, Z.; Myszka, H. Carbohydr. Res. 1988, 172, 171).
El L-arabinal opcionalmente protegido se puede fluorar también por medio de adición de Selectfluor™ mediante una modificación de un procedimiento de la bibliografía para proporcionar una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa como un jarabe en un rendimiento del 42% (Albert, M.; Dax. K.; Ortner, J. Tetrahedron 1988, 54, 4839). Trazas del que podría posiblemente ser el isómero de L-ribo se detectaron mediante RMN ^{19}F (razón L-arabino:L-ribo 30:1). El D-isómero de 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa se fabricó mediante un procedimiento similar (Albert, M.; Dax, K.; Ortner, J. Tetrahedron 1988, 54, 4839). En la referencias, nitrometano:agua se usó como un disolvente, el cual puede dar cuenta de mejores rendimientos (D-arabino al 68% y 7% del isómero D-ribo). Alternativamente, se puede usar acetona:agua, el cual puede dar cuenta de mejor selectividad.
La 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa opcionalmente protegida se puede después desproteger si es necesario. Por ejemplo, la desacetilación de 3,4-di-O-acetil-2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa (17, figura 1) se pudo lograr con NaOMe en metanol en una hora a temperatura ambiente. Se obtuvo la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa (18) deseada desprotegida como un aceite en una producción del 100%. RMN ^{1}H y RMN ^{13}C son coincidentes con las descritas en la bibliografía para el isómero D (Bols, M.; Lundt, I. Acta Chem. Scand. 1990, 44, 252). El D-isómero de 18 se hizo previamente por 3 grupos diferentes pero en una forma menos eficiente.
El tratamiento de 2-desoxi-2-fluoro-L-arabopiranosa desprotegida con un equivalente tanto de ácido sulfúrico como de ácido clorhídrico a temperatura ambiente falló en dar el furanósido deseado. Sólo se detectó el material de partida que no reaccionó. Usando nueve equivalentes de ácido clorhídrico dio el producto deseado 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa, la cual estaba contaminada con material de partida (razón 2:1). El mejor resultado, hasta ahora, se logró sometiendo a reflujo 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa con 1 equivalente de ácido sulfúrico en metanol seco. Después de 6 horas todo el material de partida ha desaparecido proporcionando 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa como un aceite en producción del 80%. RMN ^{13}C y RMN ^{19}F indican una mezcla de anómeros \alpha:\beta 3:1, con algunas impurezas menores. L-ribo-piranósido y L-arabinopiranósido igual que L-ribofuranósido son los posibles productos secundarios. El D-isómero de 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa se hizo previamente mediante dos grupos diferentes, pero en formas menos eficientes (Wright, J.A.; Taylor, N.F.; Fox, J.J. J. Org. Chem 1969, 34, 2632 y Wysocki, R.J.; Siddiqui, M.A.; Barchi, J.J.; Driscoll, J.S.; Marquez, V.E. Synthesis 1991, 1005).
Se puede proteger después opcionalmente 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinosa. Por ejemplo, la bencilación de 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa dio una mezcla que se resolvió mediante cromatografía en columna para proporcionar la forma \alpha-furanósido de 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-3,5-di-O-benzoil-L-arabinofuranósido (20) como un aceite en 44% de rendimiento. Otras fracciones se aislaron y se han caracterizado y el derivado \beta-L-arabinofuranósido correspondiente se detectó como la impureza principal. La misma reacción se describe para el D-isómero (J. Med. Chem. 1970, 13, 269). Describen parcialmente el D-isómero de la rotación óptica 20 y CHN, pero no se proporcionó ningún dato espectroscópico. El valor absoluto de la rotación óptica fue similar al descrito para el D-isómero: [\alpha]_{D}^{20} = -98 (c 1,0 EtOH) (valor en la bibliografía: \alpha]_{D}^{20} = +108 (c 1,8 EtOH para el isómero D).
Se puede activar después la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa opcionalmente protegida, preferiblemente por medio de brominación, y acoplarse a una timina opcionalmente protegida 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabino-furanosil-timina. Por ejemplo, el glucósido de metilo (20) se puede convertir en el bromoazúcar intermedio (21) a condición de que haya HBr/AcOH, el cual se puede a su vez acoplar con timina sililada (22) bajo condiciones estándar proporcionando la conocida di-O-benzoil-L-FMAU (23) en un rendimiento en bruto del 42% (del 30% después de cristalización a partir de EtOH). La RMN ^{1}H fue idéntica a las descritas en la bibliografía para los L-isómeros y D-isómeros (Du, J.; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187), y a una muestra de referencia (Ma, T.; Pai, S.B.; Zhu, Y.L.; Lin, T.S.; Shanmunganathan, K.; Du, J.F.; Wang, C.-G.; Kim, H.; Newton, G.M.; Cheng, Y.-C.; Chu, C.K. J. Med. Chem. 1996, 39, 2835; y Du, J.; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187; y Tan, C.H.; Brodfuehrer, P.R.; Brundidge, S.P.; Sapino, C.; Howell, H.G. J. Org, Chem. 1985, 50, 3647). Sin embargo, el punto de fusión (160ºC) fue idéntico a la muestra de referencia pero difiere con los valores publicados en la bibliografía: 120-122ºC para el D-isómero y 118-120ºC para el L-isómero (Tan, C.H.; Brodfuehrer, P.R.; Brundidge, S.P.; Sapino, C.; Howell, H.G. J. Org. Chem. 1985, 50, 3647; y Du, J; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187).
La 2'-desoxi-2'-fluoro-L-arabino-furanosil-timina opcionalmente protegida se puede después desproteger, si es necesario, Por ejemplos, di-O-benzoil-L-FMAU (23) se puede desbenzolilar con n-butilamina en metanol a reflujo reduciendo el tiempo de reacción a 3 horas, desde las 24 o 48 horas requeridas cuando se usó amonio a temperatura ambiente (Ma, T.; Pai, S.B.; Zhu, Y.L.; Lin, T.S.; Shanmunganathan, K.; Du, J.F.; Wang, C.-G.; Kim, H.; Newton, G.M.; Cheng, Y.-C.; Chu, C.K. J. Med. Chem. 1996, 39, 2835; y Du, J.; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187). El rendimiento de L_FMAU (24) fue del 77%. Punto de fusión: 188ºC (p.f. en la bibliografía: 185-187ºC, 184-185ºC, 187-188ºC) para el D-isómero; [\alpha]_{D}^{20} = -93 (c 0,25 MeOH) (valor en la bibliografía: [\alpha]_{D}^{20} = -111 (c 0,23 MeOH), [\alpha]_{D}^{20} = -112 (c 0,23 MeOH)); RMN ^{1}H fue idéntico a los descritos en la bibliografía y a una muestra de referencia (Ma, T.; Pai, S.B.; Zhu, Y.L.; Lin, T.S.; Shanmunganathan, K.; Du, J.F.; Wang, C.-G.; Kim, H.; Newton, G.M.; Cheng, Y.-C.; Chu, C.K. J. Med. Chem. 1996, 39, 2835; y Du, J.; Choi, Y.; Lee, K.; Chun, B.K.; Hong, J.H.; Chu, C.K. Nucleosides and Nucleotides 1999, 18, 187; y Tan, C.H.; Brodfuehrer, P.R.; Brundidge, S.P.; Sapino, C.; Howell, H.G. J. Org, Chem. 1985, 50, 3647).
Ejemplos
Los puntos de fusión se determinaron en tubos capilares abiertos en un aparato MFB-595-010 M Gallenkamp y están sin corregir. Los espectros de absorción UV se grabaron en un espectrofotómetro Uvikon 931 (KONTRON) en etanol. Los espectros de RMN ^{1}H se desarrollaron a temperatura ambiente en DMSO-d_{6} con un espectrofotómetro Bruker AC 250 ó 400. Los cambios químicos se dan en partes por millón, estableciéndose DMSO-d_{5} a 2,49 ppm como referencia. Se llevó a cabo intercambio de deuterio experimentos desacoplantes, o 2D-COSY con el fin de confirmar asignaciones de protones. Las multiplicidades señal se representan mediante s (singlete), d (doblete), dd (doblete de dobletes), t (triplete), c (tetraplete), a (ancho), m (multiplete). Todos los valores de J están en Hz. El espectro de masas de FAB se registró en el modo de ión positivo (FAB > 0) o negativo (FAB < 0) sobre un espectrómetro de masas JEOL DX 300. La matriz fue 3-nitrobencilalcohol (NBA) o una mezcla (50:50, v/v) de glicerol y tioglicerol (GT). Las rotaciones específicas se midieron en un espectropolarímetro Perkin-Elmer 241 (longitud del recorrido 1 cm) y se proporcionan en unidades de 10^{-1} grados\cdotcm^{2}\cdotg^{-1}. El análisis elemental se llevó a cabo mediante el "Service de Microanalyses du CNRS, Division de Vernaison" (Francia). Los análisis indicados por los símbolos de los elementos o funciones estuvieron dentro de los valores teóricos \pm4%. La cromatografía en capa fina se llevó a cabo en láminas de aluminio prerrecubiertas de gel de sílice 60 F_{254} (Merck, art. 5554), llevándose a cabo la visualización de los productos mediante absorbancia de UV seguida por carbonización con ácido sulfúrico etanólico al 10% y calentando. La cromatografía en columna se llevó a cabo en gel de sílice 60 (Merck, Art. 9385) a presión
atmosférica.
Ejemplo 1 1,2,3,4-tetra-O-acetil-L-arabinopiranosa (14)
A una suspensión bien agitada de L-arabinosa (13) (100 g, 0,67 mol) en piridina seca (270 ml) a 0ºC, se añadió lentamente anhídrido acético (360 ml, 388 g, 3,8 mol). La suspensión se agitó después a temperatura ambiente durante 4 horas, después de lo cual llega a ser una disolución coloreada de marrón claro. Se eliminaron piridina y anhídrido acético en exceso mediante evaporación azeotrópica con tolueno. Se obtuvo producto en bruto (14) como un aceite transparente, y se usó en la siguiente etapa sin ninguna purificación adicional.
Ejemplo 2 1-\alpha-bromo-2,3,4-tri-O-acetil-L-arabinopiranosa (15)
La tetra-O-acetil-L-arabopiranosa (14) se disolvió en una mezcla de HBr al 30% en peso en AcOH (400 ml, 2,0 mol) y anhídrido acético (8,0 ml). La disolución se agitó a temperatura ambiente durante 36 horas. La mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno (400 ml), y se lavó sucesivamente con: agua (3 x 600 ml), NaHCO_{3} saturado (2 x 500 ml) y agua (3 x 600 ml), se secó, se filtró y se evaporó hasta dar un jarabe que se cristalizó a partir de éter etílico para proporcionar (14) (129 g, 0,380 mol, 57% a partir de 13), como un sólido blanco. RMN H^{1} (CDCl_{3}) \delta 6,67 (1H, d, J = 3,8, H-1), 5,37 (2H, m) y 5,06 (1H, m) (H-2, H-3 y H-4), 4,18 (1H, d, J = 13,3, H-5), 3,91 (1H, dd, J = 13,3 y J = 1,7, H-5'), 2,13 (3H, s, CH_{3}COO), 2,09 (3H, s, CH_{3}COO), 2,01 (3H, s, CH_{3}COO).
Ejemplo 3 3,4-di-O-acetil-L-arabinal (16)
A una disolución bien agitada de NaOAc (35 g, 0,53 mol) y AcOH (115 ml) en agua (200 ml) a -5ºC, se añadió lentamente una disolución de CuSO_{4}\cdot5H_{2}O (7 g, 28 mmol) en agua (23 ml), y después se añadió polvo de Zn (70 g, 0,11 mol) en partes, manteniendo la temperatura a -5ºC o por debajo de -5ºC. A esta suspensión se añadió el bromoazúcar 15 (34 g, 0,10 mol) en partes y la mezcla se agitó vigorosamente durante 3 horas a -5ºC y después durante toda una noche a temperatura ambiente. La mezcla se filtró y se lavó con agua (250 ml) y cloruro de metileno (250 ml). Las fases se separaron, y la fase acuosa se lavó con cloruro de metileno (2 x 125 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron sucesivamente con: agua (2 x 250 ml), NaHCO_{3} saturado (2 x 1250 ml) y agua (2 x 250 ml), se secaron, se filtraron, y se evaporaron hasta dar un jarabe incoloro (\simeq 20 g). El jarabe se modificó mediante cromatografía ultrarrápida en columna (300 g de gel de sílice, hexano:EtOAc 4:1) para proporcionar 16 (12,0 g, 60 mmol, 60%) como un jarabe incoloro: RMN ^{1}H (CDCl_{3}) \delta 6,48 (1H, d, J = 6,0 H-1), 5,44 (1H, m, H-3), 5,19 (1H, dt, J = 4, J = 4, J = 4, J = 9, H-4), 4,83 (1H, dd, J = 5, J = 6, H-4), 4,00 (2H, m, H-5 y H-5'), 2,08 (3H, s, CH_{3}COO), 2,07 (3H, s, CH_{3}COO).
Ejemplo 4 3,4-di-O-acetil-2-desoxi-2-fluoro-L-arabopiranosa (17)
A una disolución bien agitada de glical (16) (12,0 g, 60 mmol) en acetona:agua (4:2 v:v, 120 ml) se añadió Selectfluor™ (26 g, 73 mmol). La disolución se agitó durante toda una noche a temperatura ambiente. La disolución se calentó después a reflujo durante 1 hora para completar la reacción. Después de enfriar a temperatura ambiente, la acetona se eliminó al vacío. Se añadió agua (150 ml) y se extrajo con EtOAc (3 x 150 ml). Las fracciones orgánicas combinadas se lavaron sucesivamente con: HCl 1N (2 x 200 ml), y agua (2 x 200 ml), se secaron, se filtraron, y se evaporaron para proporcionar 17 (6,0, 25 mmol, al 42%) como un jarabe: RMN ^{13}C (CDCl_{3}) \delta 170,35 (CH_{3}COO), 170,27 (CH_{3}COO), 95,01 (C-1\alpha, d, J_{C-1,F} = 24,5), 90,81 (C-1\beta, d, J_{C-1,F} = 21,5), 89,10 (C-2\alpha, d, J_{C-2,F} = 184,3), 85,85 (C-2\betad, J_{C-2,F} = 188,0), 70,61 (C-3\alpha, d, J_{C-3,F} = 19,5), 69,57 (C-4\beta, d, J_{C-4,F} = 7,7), 68,66 (C-4\alpha, d, J_{C-4,F} = 8,3), 67,53 (C-3\beta, d, J_{C-3,F} = 17,8), 63,90 (C-5\alpha), 60,26 (C-5\beta), 20,73 (CH_{3}COO), 20,67 (CH_{3}COO), 20,62 (CH_{3}COO), 20,56 (CH_{3}COO).
Anal. calc. para C_{9}H_{13}O_{6}F: C, 45,77; H, 5,55. Hallado: C, 45,64; H, 5,51.
Ejemplo 5 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa (18)
Una disolución de 17 (5,7 g, 24,1 mmol) en metanol seco (220 ml) se trató con NaOMe 0,1 N en metanol (114 ml, 11,4 mmol) y se agito durante 1 hora a temperatura ambiente. La disolución se neutralizó después con DOWEX 50W X8-100, se filtró y se evaporó para proporcionar 18 (3,7 g, 24 mmol, 100%) como un jarabe amarillo: RMN ^{13}C (D_{2}O) \delta 94,19 (C-1\alpha, d, J_{C-1,F}= 23,0), 92,24 (C-2\alpha, d, J_{C-2,F}= 179,6), 90,10 (C-1\beta, d, J_{C-1,F}= 20,3), 88,60 (C-2\beta, d, J_{C-2,F}= 182,3), 70,77 (C-3\alpha, d, J_{C-3,F} = 18,2), 69,03 (C-4\beta, d, J_{C-4,F} = 8,0), 68,90 (C-4\alpha, d, J_{C-4,F} =10,2), 66,85 (C-3\beta, d, J_{C-3,F} = 18,2), 66,32 (C-5\alpha), 62,21 (C-5\beta).
Ejemplo 6 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosido (19)
Una disolución de 18 (790 mg, 5,2 mmol) y H_{2}SO_{4} (60,1 \mul, 1,1 mmol) en metanol seco (12,2 ml) se trató a reflujo durante 6 horas. La reacción se enfrió a temperatura ambiente, se neutralizó con DOWEX SRB, se filtró y se evaporó, para proporcionar 19 (700 mg, 4,21 mmol, 80%) como un jarabe: RMN ^{13}C (CD_{3}OD) \delta 107,48 (C-1\alpha, d, J_{C-1,F}= 35,6), 103,20 (C-2\alpha, d, J_{C-2,F}= 178,8), 101,98 (C-1\beta, d, J_{C-1,F}= 16,8), 96,80 (C-2\beta, d, J_{C-2,F}= 199,3), 85,15 (C-4\alpha, d, J_{C-3,F} = 5,0), 83,69 (C-4\beta, d, J_{C-4,F} = 10,7), 76,70 (C-3\alpha, d, J_{C-4,F} = 27,0), 74,54 (C-3\beta, d, J_{C-3,F} = 21,5), 65,00 (C-5\beta), 62,52 (C-5\alpha), 55,58 (OCH_{3}\beta), 54,94 (OCH_{3}\alpha).
Ejemplo 7 1-O-metil-2-desoxi-2-fluoro-3,5-di-O-benzoil-L-arabinofuranosido (20)
A una disolución agitada en pocillo de 19 (664 mg, 4 mmol) en piridina seca (10 ml) a 0ºC, se añadió lentamente cloruro de benzoilo (2,5 ml, 3,0 g, 21,5 mmol). Después de agitar durante 30 minutos a 0ºC, se dejó a temperatura ambiente durante 3 horas. La reacción se desactivó con agua (10 ml) y NaHCO_{3} saturado (30 ml) y se agitó durante 30 minutos. Se diluyó después con cloruro de metileno (50 ml) y más NaHCO_{3} saturado (30 ml). La fase orgánica se separó y se lavó sucesivamente con: NaHCO_{3} saturado (50 ml), agua (2 x 50 ml), HCl 1N (2 x 50 ml), agua (50 ml), NaHCO_{3} saturado (50 ml) y agua (2 x 50 ml), se secó, se filtró y se evaporó hasta dar un jarabe marrón (1,9 g), que se purificó mediante cromatografía ultrarrápida en columna (50 g de gel de sílice, hexano:EtOAc 95:5). Una parte principal se aisló como un jarabe y se caracterizó como 20 (anómero \alpha, 670 mg, 1,79 mmol, 44%): [\alpha]_{D}^{20} = -98 (c 1,0 EtOH) (valor en la bibliografía: [\alpha]_{D}^{20} = + 108 (c 1,8 EtOH) para el D-isómero); RMN ^{1}H (CDCl_{3}) \delta 8,20-7,40 (15 H, m, ArH), 5,48 (1H, dd, J = 23,1, H-3), 5,21 (1H, d, J = 10,6, H-1), 5,11 (1H, d, J = 49,2, H-2), 4,76 (1H, dd, J = 3,6 y J = 12,0, H-5), 4,63 (1H, dd, J = 4,4 y J = 12,0, H-5'), 3,45 (3H, s, OCH_{3}); RMN ^{13}C (DCl_{3}) \delta 166,20 (C=O), 165,67 (C=O), 133,57 (Ar), 133,07 (Ar), 129,87 (Ar), 129,76 (Ar), 128,49 (Ar), 128,31 (Ar), 106,22 (C-1, d, J_{C-3,F} = 35,1), 98,20 (C-2, d, J_{C-2,F} = 182,7), 80,85 (C-4), 77,58 (C-3, d, J_{C-3,F} = 30,44), 63,62 (C-5), 54,86 (OCH_{3}).
Anal. calc. para C_{2}H_{19}O_{6}F: C, 64,17, H, 5,12. Hallado: C, 64,14; H, 5,08.
Ejemplo 8 1-(3,5-di-O-benzoil-2-desoxi-2-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil) timina (23)
A una disolución agitada en pocillo de 20 (289 mg, 0,75 mmol) en cloruro de metileno seco (0,56 ml) a 0ºC, se añadió lentamente HBr al 30% en peso en AcOH (0,8 ml, 1,08 g, 0,32 g de HBr, 4,0 mmol). La disolución se agitó después a temperatura ambiente durante toda una noche. La disolución marrón-rojiza se evaporó a vacío a 40ºC o por debajo de 40ºC. Se coevaporó con benceno seco (3 x 3 ml) y después una vez con cloroformo seco (3 ml). El bromoazúcar 21, un jarabe, se redisolvió en cloroformo seco (2 ml): disolución A. Al mismo tiempo se calentó a reflujo durante toda una noche una mezcla de timina (25, 208 mg, 1,65 mmol), sulfato de amonio (19 mg), y 1,1,1,3,3,3-hexametildisilazano (798 mg, 1,04 ml, 4,95 mmol) en cloroformo seco (7,12 ml). La disolución transparente resultante (una indicación de que toda la timina está sililada para formar compuesto 22) se enfrió a temperatura ambiente: disolución B. La disolución A se añadió a la disolución B y se calentaron a reflujo durante 4 horas. Se añadió agua (10 ml), y la mezcla se agitó durante 20 minutos. Se añadió cloroformo (10 ml), se separó la fase orgánica, se lavó con agua (2 x 10 ml), se secó, se filtró y se evaporó hasta dar un jarabe que se purificó mediante cromatografía ultrarrápida en columna (hexano:EtOAc 1:1). Se obtuvo producto en bruto 23 (150 mg, 0,32 mmol, al 42%) como un sólido. Se cristalizó a partir de EtOH para proporcionar 23 puro (100 mg, 0,22 mmol, al 30%) como un sólido blanco: p.f.: 160ºC fue idéntico a una muestra original de 23 (valor en la bibliografía: p.f.: 120-122ºC para el D-isómero y 118-120ºC para el L-isómero); RMN ^{1}H (CDCl_{3}) \delta 8,52 (1H, sa, N-H), 8,13-7,43 (10H, m, ArH), 7,36 (1H, c, J = 1), C-H timina, 6,35 (1H, dd, J = 3,0 y J = 22,2, H-1), 5,64 (1H, dd, J = 3,0 y J = 18,0, H-3), 5,32 (1H, dd, J = 3,0 y J = 50,0, H-2), 4,86-4,77 (2H, m, H-5 y H'-5), 4,49 (1H, c, H-4), 1,76 (3H, d, J = 1,0, timina CH_{3}).
Ejemplo 9 1-(2-desoxi-2-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil)timina (24)
Se calentó a reflujo una disolución de 23 (47 mg, 0,1 mmol) y n-butilamina (0,74 g, 1,0 ml, 10 mmol) en metanol (2 ml) durante 3 horas. La disolución se evaporó hasta sequedad y se trituró con éter etílico para proporcionar un sólido que se filtró, se lavó con éter y se secó para proporcionar 24 (20 mg, 0,077 mmol, 77% como un sólido blanco: p.f.: 188ºC (valor en la bibliografía: p.f.: 185-187ºC, 184-185ºC, 187-188ºC para el D-isómero); [\alpha]_{D}^{20} = = -111 (c 0,23 MeOH), [\alpha]_{D}^{20} = = -122 (c 0,23 MeOH)); RMN ^{1}H RMN (DMSO-d_{6}) \delta 11,0 (1H, sa, N-H), 7,58 (1H, s, C-H timina), 6,09 (1H, dd, J = 4,2 y J = 15,6, H-1), 5,85 (1H, sa, OH), 5,10 (1H, sa, OH), 5,02 (1h, dt, J -4,0, J -3,8 y J -52,8, H-2), 4,22 (1H, dt, J -3,8, J -4,0 y J = 20,3, H-3), 3,76 (1H, c, J = 4,0 y J = -9,5 , H-4), 3,69-3,57 (2H, m, H-5 y H-5'), 1,77 (3H, s, timina CH_{3}).

Claims (15)

1. Un procedimiento para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I)
54
en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I); B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; preparando una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa que comprende las etapas de
(a) obtener un 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
55
en la que cada uno de R^{1} y R^{2} es independientemente hidrógeno o un grupo protector de oxígeno adecuado tal como alquilo, acilo o sililo; y
(b) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa.
2. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que el procedimiento comprende adicionalmente las etapas de:
(a) sustituir opcionalmente OR^{1} de la 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa con O-acilo o un halógeno (F, Cl, Br o I);
(b) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida; y
(c) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
3. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que el procedimiento comprende adicionalmente el procedimiento para la preparación de 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II) que comprende las etapas de:
(a) obtener un L-arabinal opcionalmente protegido de la fórmula (III)
56
en la que cada R^{3} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo, o sililo;
(b) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo, si es necesario, para formar 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II).
4. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que el procedimiento comprende adicionalmente el procedimiento para la preparación de 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II) que comprende las etapas de:
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
57
en la que cada uno de R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo, o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I) para obtener un compuesto de la fórmula (V);
58
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I);
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
59
(d) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar el 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II).
5. Un procedimiento de acuerdo con la reivindicación I para la preparación de un 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido de la fórmula (I):
60
en la que X es un halógeno (F, Cl, Br o I); y B es una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática; que comprende las etapas de:
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
61
en la que cada R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I), para obtener un compuesto de la fórmula (V);
62
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I), preferiblemente Br;
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
63
(d) halogenar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-halo-L-arabinopiranosa de la fórmula (II):
64
en la que X es un halógeno (F, Br, Cl o I);
(e) convertir la 2-desoxi-2-halo-L-arabinosa a una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa;
(f) sustituir opcionalmente OR^{1} con O-acilo o un halógeno (F, Br, Cl o I);
(g) acoplar la arabinofuranosa a una base pirimidínica, púrica, heterocíclica o heteroaromática opcionalmente protegida; y
(h) desproteger, si es necesario, para obtener el 2'-desoxi-2'-halo-\beta-L-arabinofuranosil nucleósido.
6. Un procedimiento de acuerdo con la reivindicación 1 para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) preparando una 2-desoxi-2-halo-L-arabinofuranosa que comprende las etapas de:
(a) obtener una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabopiranosa de la fórmula (II-a):
65
en la que cada R^{1} y R^{2} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo o sililo; y
(b) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa a una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa.
7. El procedimiento de la reivindicación 6, en el que el procedimiento adicional comprende las etapas de:
(a) sustituir opcionalmente OR^{1} con O-acilo o un halógeno (F, Br, Cl o I);
(b) acoplar la arabinofuranosa a una timidina opcionalmente protegida; y
(c) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
8. El procedimiento de la reivindicación 6, en el que el procedimiento comprende adicionalmente los procedimientos para la preparación de 2-desoxi-2-fluoro-arabinopiranosa de la fórmula (II-a) que comprende las etapas de:
(a) obtener el L-arabinal opcionalmente tratado de la fórmula (III)
66
en la que cada uno de los R^{3} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo o sililo;
(b) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo, si es necesario, para formar la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a).
9. El procedimiento de la reivindicación 6, en el que el procedimiento comprende adicionalmente el procedimiento para la preparación de 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a) que comprende las etapas de:
(a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
67
en la que cada uno de R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1}con un halógeno (F, Br, Cl o I) para obtener un compuesto de la fórmula (V);
68
en la que X^{1} es un halógeno (F, Br, Cl o I);
(c) reducir los compuestos de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
69
(d) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a).
10. Un procedimiento de acuerdo con la reivindicación 1 para la preparación de 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timina (L-FMAU) que comprende:
a) obtener una L-arabinosa opcionalmente protegida de la fórmula (IV):
70
en la que cada uno de R^{1}, R^{2}, R^{3} y R^{4} es independientemente hidrógeno, alquilo, acilo o sililo;
(b) sustituir OR^{1} con un halógeno (F, Br, Cl o I) para obtener un compuesto de la fórmula (V);
71
en la que X^{1}es un halógeno en (F, Br, Cl o I)
(c) reducir el compuesto de fórmula (V) para formar un compuesto de fórmula (III)
72
(d) fluorar el compuesto de fórmula (III) y desprotegerlo si es necesario para formar la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa de la fórmula (II-a)
73
(e) convertir la 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinopiranosa con una 2-desoxi-2-fluoro-L-arabinofuranosa;
(f) sustituir opcionalmente OR^{1} con O-acilo o un halógeno (F, Br, Cl o I);
(g) acoplar la arabinofuranosa a una timina opcionalmente protegida; y
(h) desproteger, si es necesario, para obtener la 2'-desoxi-2'-fluoro-\beta-L-arabinofuranosil timidina.
11. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que la halogenación del compuesto de fórmula (III) se lleva a cabo en nitrometano:agua.
12. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que la halogenación del compuesto de fórmula (III) se lleva a cabo en acetona:agua.
13. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que la conversión de la L-arabinopiranosa a la L-arabinofuranosa se lleva a cabo usando un equivalente de ácido sulfúrico.
14. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que la conversión de la L-arabinopiranosa a la L-arabinofuranosa se lleva a cabo en metanol seco.
15. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 6-10, en el que la fluoración del compuesto de fórmula (III) se lleva a cabo usando Selectfluor^{TM} (F-TEDA-BH_{4}).
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