CZ300762B6 - Fúzní proteiny interferonu-beta-1a a jejich použití - Google Patents

Fúzní proteiny interferonu-beta-1a a jejich použití Download PDF

Info

Publication number
CZ300762B6
CZ300762B6 CZ20011330A CZ20011330A CZ300762B6 CZ 300762 B6 CZ300762 B6 CZ 300762B6 CZ 20011330 A CZ20011330 A CZ 20011330A CZ 20011330 A CZ20011330 A CZ 20011330A CZ 300762 B6 CZ300762 B6 CZ 300762B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
beta
interferon
ifn
sequence
polypeptide
Prior art date
Application number
CZ20011330A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ20011330A3 (cs
Inventor
Whitty@Adrian
Runkel@Laura
Brickelmaier@Margot
Hochman@Paula
Original Assignee
Biogen Idec Ma Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biogen Idec Ma Inc. filed Critical Biogen Idec Ma Inc.
Publication of CZ20011330A3 publication Critical patent/CZ20011330A3/cs
Publication of CZ300762B6 publication Critical patent/CZ300762B6/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/555Interferons [IFN]
    • C07K14/565IFN-beta
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K19/00Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • A61P11/02Nasal agents, e.g. decongestants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/02Drugs for disorders of the nervous system for peripheral neuropathies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02Ophthalmic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/06Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/30Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto

Abstract

Fúzní polypeptid, který obsahuje (a) mutantu interferonu-beta-1a (IFN-.beta.) vybranou ze skupiny sestávající z mutant IFN-.beta., které mají aminokyselinové sekvence uvedené v tabulce 1 jako A1, B1, C1, CD1, CD2 a DE1, a (b) kloubovou oblast a domény CH2 a CH3 imunoglobulinu, pricemž výhodne je IFN-.beta. lidský interferon-beta-1a. Polypeptid podle vynálezu je užitecný pri lécení virových onemocnení, jako je infekce ECM, chripka, infekce respiracního traktu, vzteklina nebo hepatitida, autoimunitních onemocnení, jako je lupus nebo sclerosis multiplex, zánetlivých onemocnení, jako je fibróza, angiogenních onemocnení, jako je diabetická retinopatie, retinopatie predcasne narozených, makulární degenerace, odvržení štepu rohovky, neovaskulární glaukom, retrolentální fibroplázie, rubeóza a Osler-Weberuv syndrom, a také nádorových onemocnení, jako je osteogenní sarkom, lymfom, akutní lymfocytární leukémie, karcinom prsu, melanom, nasofaryngeální karcinom nebo hemangiom.

Description

Fúzní proteiny interferonu-beta-la a jejich použiti
Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká fúzního polypeptidu, který má aminokyselinovou sekvenci X-Y-Z nebo alespoň její část, přičemž tato sekvence obsahuje aminokyselinovou sekvenci, glykosylovaného interferonu-beta (X), přičemž Y je volitelná spojovací část a Z je polypeptid obsahující alespoň část polypeptidu jiného než je glykosylovaný interferon-beta. Výhodné je X lidský interio feron-beta-la. Vynález se také týká mutant interferonu-beta-la.
Dosavadní stav techniky
Použití polypeptidů a proteinů pro systémové léčení specifických nemocí je nyní běžně přijímanou lékařskou praxí. Role, jakou hrají látky tohoto typu v terapii je tak důležitá, že mnohé výzkumy jsou zaměřeny na syntézu velkého množství těchto látek technologií rekombinantní DNA. Mnohé z těchto molekul jsou endogenní molekuly, které jsou velmi účinné a specifické ve svém biologickém účinku.
Hlavním faktorem, který omezuje užitečnost látek proteinového charakteru pro jejich zamýšlené aplikace, je to, že při parenterálním podávání jsou z těla za velmi krátký čas eliminovány. Ř tomu dochází proto, že jsou metabolizovány proteázami, nebo se na jejich eliminaci podílí běžná clearance metabolickými cestami eliminace proteinů, jako je např. filtrace v ledvinách. Problémy spojené s uvedenými způsoby podávání proteinů jsou ve farmaceutickém průmyslu dobře známy a byly proto užity různé strategie, jak je řešit.
Peptidová rodina, která je cílem klinického výzkumu a mnohých snah o zlepšení podávání a bioasimilace, je rodina interferonu. Interferony byly testovány při mnoha nemocech. Použití humán30 ního interferonu beta, jednoho členu této rodiny, je již zavedeno při léčení roztroušené sklerózy mozkomíšní (sclerosis multiplex). Dvě formy rekombinantního interferonu beta byly povoleny v Evropě a v USA pro léčení této nemoci. Jedna forma je interferon beta la (ochranná známka AVONEX®, výrobce Biogen, lne,, Cambridge, MA). Termíny „interferon-beta-la“ nebo „IFNbeta-la“ nebo IFN-p-la“ nebo „interferon-fkla“ jsou v popisu vynálezu užívány zcela zamě35 nitelně. Jinou formou je interferon-beta-lb (ochranná známka BETASERON®, Berlex, Richmond, CA), dále označovaný jako „interferon-beta-lb“. Interferon beta-la je produkován v savčích buňkách pomocí přirozené sekvence lidského genu a je glykosylován, zatímco interferon beta-lb je produkován v buňkách E. coli pomocí modifikované sekvence lidského genu, který obsahuje substituci, kde cystein je nahrazen serinem v pozici 17, a není glykosylován.
Již dříve byla přímým způsobem srovnána relativní aktivita in vitro interferonu beta-la a interferonu beta-lb ve funkčním testu a bylo ukázáno, že specifická aktivita interferonu beta-la je přibližně lOx vyšší než specifická aktivita interferonu beta-lb (Runkel etal., 1998, Pharm. Res. 15: 641-649). Ve studiích, jejíchž cílem bylo zjistit strukturní příčiny rozdílných aktivit, byla identifikována glykosylace jako jediný známý strukturní rozdíl mezi uvedeným dvěma produkty, který ovlivňuje specifickou aktivitu. Vliv sacharidů se projevoval zejména účinkem na stabilizaci struktury. Stabilizující účinek sacharidů na strukturu byl evidentní při experimentech s tepelnou denaturací a v analýze SEC. Nepřítomnost glykosylace také korelovala se zvýšenou agregací a zvýšenou citlivostí k tepelné denaturací. Enzymatické odstranění sacharidů z inter50 feronu beta-la pomocí PNGázy F vedlo k extenzivní precipitaci deglykosylovaného produktu.
Tyto studie ukazují, že i přes konzervativní aminokyselinovou sekvenci interferonu beta-la a interferonu beta-lb se jedná o odlišné biochemické jednotky a většina znalostí o interferonu beta-lb nemůže být aplikována na interferon beta-la a naopak.
-1 Podstata vynálezu
Vynález využívá výhod glykosylovaného interferonu-beta ve srovnání s neglykosylovanou for5 mou. Zejména byl vyvinut přípravek obsahující interferon-beta-la se zvýšenou aktivitou vzhledem k interferonu beta-lb, který má také prospěšné vlastnosti fúzního proteinu obecně, aniž by došlo ke ztrátě aktivity ve srovnání s formami interferonu beta-la, které nejsou ve formě fúzního proteinu. Tudíž byly provedeny takové modifikace, že produkty (tj. fúzní proteiny interferonu beta-la) si uchovávají celou nebo většinu své biologické aktivity, a přitom bylo dosaženo násle10 dujících vlastností: změněná farmakokinetika a farmakodynamika vedoucí k delšímu biologickému poločasu a změnám tkáňové distribuce (např. schopnost zůstat delší dobu v cévách). Takový přípravek představuje podstatný pokrok v oboru medicíny a farmacie a byl by významným příspěvkem pro léčení nemocí, kde interferon prokázal svou užitečnost jako je např. sclerosis multiplex, fibróza a další zánětlivá a autoimunitní onemocnění, různé druhy rakovin, hepatitida a další virové nemoci a nemoci charakterizované neovaskularizací. Zejména schopnost zůstávat po delší dobu v cévním systému umožňuje, aby byl interferon-beta la použit k inhibici angiogeneze a potenciálně také k přestoupení hematoencefalické bariéry.
Předkládaný vynález se zejména týká izolovaného polypeptidu, který má aminokyselinovou sekvenci X-Y-Z, kde X je polypeptid mající aminokyselinovou sekvenci, nebo alespoň její část, odpovídající aminokyselinové sekvenci interferonu-beta, Y je volitelná spojovací Část a Zje polypeptid obsahující alespoň část polypeptidu jiného než je interferon-beta. Volitelná část (skupina) Y a nutná část z jsou navázány buďto na N- nebo C-konec interferonu-beta (X). Výhodně je X lidský interferon-beta-la.
Ve výhodných provedeních Z je alespoň část konstantního úseku imunoglobulinu a může pocházet z imunoglobulinu vybraného ze třídy IgM, IgG, IgD, IgA a IgE. Pokud je imunoglobulin ze třídy IgG, pak jde o jeden z IgGl, IgG2, IgG3 a IgG4. Konstantní úsek lidského IgM a IgE obsahuje 4 konstantní úseky, a sice CH1 (kloub), CH2, CH3 a CH4, zatímco konstantní úsek lidského
IgG, IgA a IgD obsahuje jen 3 konstantní úseky, a sice CH1 (kloub) CH2 a CH3. V nejvýhodnějším fúzním proteinu podle vynálezu obsahuje konstantní úsek alespoň úsek kloubu a domény CH2aCH3.
V jiném provedení je část Z alespoň část polypeptidu, který obsahuje domény podobné imuno35 globulinu. K příkladům takových polypeptidů patří CD1, CD2, CD4 a členy hlavních histokompatibilních antigenů 1. a II. třídy.
Dalším provedením vynálezu je fúzní protein mající amino-koncový úsek, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci interferonu-beta nebo její část, a karboxy-koncový úsek, který obsahuje alespoň část proteinu jiného než je interferon-beta. Karboxy-koncový úsek je výhodně alespoň část konstantního úseku imunoglobulinu pocházejícího ze třídy imunoglobulinů IgM, IgG, IgD, IgA nebo IgE. V nej výhodnějším fúzním proteinu konstantní úsek obsahuje alespoň kloubový úsek a domény CH2 a CH3.
Dalším provedením vynálezu je fúzní protein, jehož interferon-beta část (tj. X ve vzorci uvedeném výše) byla mutována, čímž vznikly muteiny se selektivně zvýšenou antivirovou a/nebo antiproliferační aktivitou nebo s jinými výhodnými vlastnostmi ve srovnání s nemutovanými formami interferonu-beta-1 a.
Ještě dalším provedením předkládaného vynálezu je izolovaná DNA kódující fúzní protein popsaný výše. Vynález se týká také rekombinantní DNA, která obsahuje izolovanou DNA kódující výše popsaný fúzní protein a expresní kontrolní sekvenci (tj. sekvenci řídící expresi), kde expresní kontrolní sekvence je operativně spojena s DNA. Vynález zahrnuje také hostitelské buňky transformované rekombinantní DNA podle vynálezu.
-2Předkládaný vynález se dále týká způsobu přípravy rekombinantního polypeptidu, který spočívá v tom, že se poskytne populace hostitelských buněk podle vynálezu, tato populace hostitelských buněk se kultivuje v podmínkách, kde je exprimován polypeptid kódovaný rekombinantní DNA, a nakonec se tento rekombinantní polypeptid izoluje.
Další aspekt vynálezu se týká fůzního proteinu interferonu-beta-la, který obsahuje interferonbeta-la a další polypeptid, se kterým není v přírodě asociován, v podstatě čisté formě, přičemž fůzní protein (zkráceně fuze) má antivirovou aktivitu, která je přibližně s antivirovou aktivitou interferonu-beta-la postrádajícího další polypeptid.
Dalším aspektem předkládaného vynálezu je farmaceutický přípravek obsahující terapeuticky účinné množství fůzního proteinu interferonu-beta-la.
Ještě další aspekt vynálezu se týká inhibice angiogeneze a neovaskularizace užitím polypeptidů 15 podle vynálezu.
Přehled obrázků na výkresech
Obr. 1. cDNA sekvence a dedukovaná aminokyselinová sekvence fuze interferonu-beta s histidinovou značkou (také označ. Jako „his IFN-beta“ nebo „His6-znaČený“)
Na obrázku jsou uvedeny úplná DNA sekvence (sekvence id. č. 3) a proteinová sekvence (sekvence id. č. 4) histidinem značeného IFN-beta-1 a. Štěpená signální sekvence VCAM-1 zanechá 3 zbytky amino-konce (SerGlyGly) „upstream“ od hístidinové značky (His6, sekvence id. č. 63, pozice 4 až 9). Sekvence enterokinázové spojky (linkeru) (AspAspAspAspLys) (sekvence id. č. 62) je od histidinové značky oddělena oddělovací sekvencí (spacerem) (SerSerGly, pozice 10 až 12). Přírodní sekvence proteinu IFN-beta-la představuje sekvence Metl8 až Asnl83.
Obr. 2. cDNA sekvence a dedukovaná aminokyselinová sekvence fuze interferonu-beta-la/Fc
Na obrázku jsou uvedeny úplná DNA sekvence (sekvence id. Č. 1) a proteinová sekvence (sekvence id. č. 2) fuze „lidský IFN-beta-la/myší Fc“. Sekvence lidského IFN-beta-la proteinu představuje zbytky 1 až 166 (pozice DNA sekvence 1 až 498). Sekvence enterokinázové spojky (linkeru) (AspAspAspAspLys) zaujímá aminokyselinové zbytky 167 až 171 (pozice DNA sekvence 499 až 513). Sekvence těžkého řetězce myšího IgG2a zaujímá aminokyselinové zbytky 172 až 399 (pozice DNA sekvence 514 až 437).
Obr, 3. Vazba mutanty interferonu-beta se substituovaným alaninem na dimemí fúzní protein obsahující extracelulámí doménu receptoru interferonu typu I, IFNAR2/Fc
Vazebné afinity alaninem substituované mutanty IFN (AI až E) pro receptor IFNAR2 byly stanoveny postupem jak je popsáno v příkladu 1 (část D). Histogram představuje vazebné afinity v testu ve srovnání s vazebnými afinitami divokého typu his-IFN-beta (v % d.t„ divokého typu). Hodnoty % d.t. byly vypočteny následovně: (afinita divokého typu his-IFN-beta/afmita mutovaného IFN-beta) x 100. Jsou uvedeny hodnoty % d.t. (O) pro jednotlivé experimenty (n=3) a průměrné hodnoty % d.t. (x) pro experimentální soubor. Mutanty A2, AB1, AB2 a E neváží IFNAR2/Fc v koncentraci 500 x vyšší než je EC50 divokého typu (d.t.) his-IFN-beta (*).
-3CZ 300762 B6
Obr. 4. Vazba mutanty interferonu-beta-1 se substituovaným alaninem na povrchový komplex receptoru interferonu typu I {komplex IFNAR1/2) exprimovaný na buňkách Daudi z Burkittova lymfomu
Receptorově vazebné vlastnosti mutanty se substituovaným alaninem (Al-E) byly stanoveny pomocí vazebného testu pro povrchový buněčný receptor založeného na analýze FACS, jak byl popsán v příkladu 1 (část D). Histogram představuje vazebné afinity v testu ve srovnání s vazebnými afinitami divokého typu his-IFN-beta (v % d.t., divokého typu). Hodnoty % d.t, pro každou mutantu byly vypočteny následovně: (afinita divokého typu his-IFN-beta/ afinita mutoio váného IFN-beta) x 100. Jsou uvedeny hodnoty % d.t. (O) pro jednotlivé experimenty a průměrné hodnoty % d.t. (x) pro experimentální soubor.
Obr. 5. Antivirová aktivita mutant interferonu-beta se substituovaným alaninem
Antivirová aktivita mutant se substituovaným alaninem (Al-E) byla stanovena na lidských buňkách A549 infikovaných EMC virem jak bylo popsáno v příkladu 1 (část E). Histogram představuje aktivitu v testu ve srovnání s aktivitou divokého typu his-IFN-beta (v % d.t., divokého typu). Hodnoty % d.t. pro každou mutantu byly vypočteny následovně: (koncentrace divokého typu his-IFN-beta(50%cpe)/koncentrace mutovaného IFN-beta(50%cpe) x 100. Jsou uvedeny hodnoty % d.t. (O) pro vícenásobné pokusy a průměrné hodnoty z pokusného souboru (x).
Obr. 6. Antiproliferační aktivita mutant interferonu-beta se substituovaným alaninem
Antiprolíferaění aktivita mutant se substituovaným alaninem (Al-E) byla stanovena na Daudi buňkách Burkittova lymfomu jak bylo popsáno v příkladu 1 (část E). Histogram představuje aktivity v testu ve srovnání s aktivitou divokého typu his-IFN-beta (v % d.t., divokého typu). Hodnoty % d.t. pro každou mutantu byly vypočteny následovně: (koncentrace divokého typu his-IFN-beta (50% inhibice růstu)/koncentrace mutovaného IFN-beta (50% inhibice růstu) x 100. Jsou uvedeny hodnoty % d.t. (O) pro víceěetné experimenty a průměrné hodnoty % d.t.
(x) pro experimentální soubor.
Obr. 7. Relativní antivirové a antiproliferační aktivity mutant interferonu-beta se substituovaným alaninem
Relativní aktivity mutant se substituovaným alaninem (Al-E) v testu antivirové (osa x) a antiproliferační (osa y) aktivity byly srovnány. Pro toto srovnání byly užity hodnoty průměrného % divokého typu his-IFN-beta (% d.t., x) uvedené na obr. 5 a 6. Mutanty, které vykazují koordinované změny v obou aktivitách se objeví přímo na vertikální linii nebo v její blízkosti. Mutanty vykazující ztrátu/přírůstek antivirové aktivity, která není úměrná změně v antiproliferační aktivi40 tě, se objeví výrazně mimo diagonálu (DE1, D, Cl). Významnost byla stanovena na základě směrodatných odchylek příslušných použité průměrné hodnotě % d.t.
Obr. 8. Antivirová aktivita fúze interferon-beta-la/Ig
Aktivita interferonu-beta-1 a (byl použit AVONEX®) nebo fúze interferon-beta-la/myší Ig2a v koncentracích uvedených na ose x byly hodnoceny v antivirovém testu užitím buněk lidského plicního karcinomu (A549) infikovaných virem EMC. Po dvoudenní inkubaci za přítomnosti viru byly živé buňky obarveny MTT a misky byly vyhodnoceny na čtecím zařízení při 450 nm, a absorbance, která je odrazem životnosti buněk, Je uvedena na ose y. Směrodatné odchylky jsou uvedeny jako svislé úsečky. Koncentrace interferonu-beta-1 a (byl použit jako surový meziprodukt AVONEX®), která poskytla 50 % maxima při 450 nm a tudíž při které došlo k 50% usmrcení buněk virem („50% cytopatický účinek“) byla 0,4 pM a 50% cytopatický účinek pro fúzovaný interferon-beta-la byl přibližně 0,15 pM.
-4Obr. 9. Měření antivirové aktivity interferonu-beta v plazmě myší ošetřených ťuzí interferonubeta-la/Fc nebo interferonem-beta-la
Myším bylo injikováno buďto 50 000jednotek interferonu-beta-la (surový meziprodukt
AVONEX®), nebo 50 000 jednotek fůze interferonu-beta-la/Fc. Krev z těchto zvířat byla získána retroorbitálním odběrem v různých časech po injekci, jak ukazuje osa x. Pro každý časový bod byla odebrána krev alespoň ze třech myší, byla připravena plazma a zamražena až do stanovení aktivity interferonu-beta v antivirovém testu s buňkami lidského plicního karcinomu (A549) po infekci virem encefalomyokarditidy. Živé buňky byly obarveny roztokem MTT, io destičky byly pak změřeny ve 450 nm ke stanovení absorbance, která je odrazem životnosti buněk a aktivity interferonu-beta. Na každé destičce byly také připraveny standardní (kalibrační) křivky užitím interferonu-beta-1 a jako AVONEX* a byly použity ke kvantitativnímu stanovení aktivity interferonu-beta v každém vzorku. Na grafu jsou ukázána data z jednotlivých zvířat is Obr. 10. Úplná DNA sekvence a proteinová sekvence otevřených Čtecích rámců přímé fuze lidského IFN-beta a lidského IgGIFc (ZL5107),
Obr. 11. Úplná DNA sekvence a proteinová sekvence otevřeného čtecího rámce Iuzního proteinu „lidský IFN-beta/G4S linker/lidský IgGIFc (ZL6206).
Obr. 12. Schématické znázornění celkové strategie klonování a exprese.
Všechna odborná literatura citovaná v popisu je formou odkazu zahrnuta do popisu, pokud není uvedeno jinak. V popisu vynálezu jsou užívány následující termíny:
I. Definice „Interferon (zkráceně označovaná také jako IFN) je malý, druhově specifický, jednořetězcový polypeptid, kteiý se tvoří v buňkách savců jako reakce na expozici různých induktorúm jako jsou např. viry, polypeptidy, mitogeny apod. Nejvýhodnější interferon podle vynálezu je glykosylovaný lidský interferon-beta, který je glykosylován na 80. zbytku (Asn80) a výhodně je připraven technikami rekombinantní DNA. Výhodný glykosylovaný interferon je označován „interferonbeta-1 a“ (nebo také „IFN-beta-1 a“, „IFN-fJ-la“, „interferon beta la“ nebo „interferon-fMa“ přičemž všechny uvedené názvy jsou užívány zaměnitelně). Termín „interferon-beta-1 a“ podle vynálezu zahrnuje i mutované formy interferonu (viz příklad l) za předpokladu, že i tyto mutanty jsou glykosylované na 80. zbytku (Asn80). Metody přípravy proteinů technikami rekombinantní DNA jsou známy, včetně přípravy různých interferonů, víz např. patenty US 4 399 216, US 5 149 636 a US 5 179 017 (Axel et al.) a US 4 470 461 (Kaufman).
Výhodné interferon-beta-la polynukleotidy, které lze užít podle předkládaného vynálezu, byly odvozeny ze sekvencí interferonu divokého typu různých obratlovců, výhodně savců, a byly získány metodami, které jsou odborníkovi známé a byly popsány, viz např. patent US 5 641 656 (udělený 24. 6.1997, DNA kódující ptačí interferonový pro-protein typu I a zralý ptačí interferon typul), patent US 5 605 688 (25, února 1997-rekombinantní psí a koňské interferony typul), patent US 5 231 176 (27. července 1993, DNA molekula kódující lidský leukocytární interferon), patent US 5 071 761 (10.12.1991, DNA sekvence kódující subsekvence lidských lymfoblastoidních interferonů LyIFN-alfa-2 a LyIFN-alfa-3), patent US 4 970 161 (13. listopadu 1990, DNA sekvence kódující lidský interferon gama), patent US 4 738 931 (19. dubna 1988, DNA sekvence obsahující gen lidského interferonu beta), patent US 4 695 543 (22. září 1987, lidský gen alfa-interferonu Gx-1) a US 4 456 748 (26. června 1984, DNA sekvence kódující subsekvence různých přirozeně se vyskytujících leukocytových interferonů).
Ve vynálezu se mohou užít také mutanty interferonu-beta-la. Mutace se připravují v oboru známými metodami cílené mutageneze. Kromě toho vynález poskytuje funkčně ekvivalentní
-5CZ 300762 B6 polynukleotidy interferonu-beta-1 a. které kódují funkčně ekvivalentní polypeptidy interferonubeta-1 a.
První polynukleotid interferonu-beta-1 a je „funkčně ekvivalentní“ ve srovnání s druhým poly5 nukleotidem interferonu-beta-1 a, pokud splňuje alespoň jednu z následuj ících podmínek:
a) „funkčně ekvivalentní“ je první polynukleotid, který hybridízuje s druhým polynukleotidem za standardních hybridizačních podmínek a/nebo je degenerovanou sekvencí vzhledem k sekvenci druhého polynukleotidu, nejvýhodněji kóduje mutantu ínterferonu mající (teraio peuti ckou) aktivitu interferonu-beta-1 a,
b) „funkčně ekvivalentní“ je první polynukleotid, kóduje expresi aminokyselinové sekvence kódované polynukleotidem.
Lze shrnout, že obecný termín „interferon“ zahrnuje, který druhým avšak není omezen pouze na ně, všechna agens uvedená v předchozím textu, a také jejich funkční ekvivalenty. Termín „funkční ekvivalent“ v popisu vynálezu se týká proteinu interferonu-beta-1 a nebo polynukleotidu kódujícího interferon-beta-la, který má stejný nebo lepší prospěšný účinek na savčího příjemce jako původní interferon, k němuž se funkční ekvivalent vztahuje. Odborníkovi je zřejmé, že funkčně ekvivalentní protein může být připraven rekombinantní technikou, tj. expresí „funkčně ekvivalentní“ DNA. Tudíž předmětem předkládaného vynálezu jsou také interferony kódované přirozeně se vyskytující DNA, a také kódované DNA, která se přirozeně nevyskytuje, ale kóduje stejný protein jako je kódován přirozeně se vyskytující DNA. Díky degeneraci nukleotidových kódujících sekvencí se mohou užít jiné polynukleotidy pro kódování interferonů. K nim patří celé nebo části výše uvedených sekvencí, které byly změněny substitucí různých kodonů, které kódují stejný aminokyselinový zbytek v sekvenci, jde tedy o umlčenou záměnu. Takové změněné sekvence se považují za ekvivalenty těchto sekvencí. Tak např. Phe (F) je kódován dvěma kodony, a sice TTC nebo TTT, Tyr (Y) je kódován TAC nebo TAT a His (H) je kódován CAC nebo CAT. Na druhé straně Trp (W) je kódován jediným kodonem TGG. Tudíž je jasné, že pro danou jo sekvenci DNA kódující konkrétní interferon existuje mnoho degenerovaných DNA sekvencí, které ho kódují. Tyto degenerované sekvence jsou také předmětem předkládaného vynálezu.
„Fúze“ (také fúzní polypeptid nebo fúzní protein) označuje koíineámí spojení dvou nebo více proteinů nebo jejich fragmentů prostřednictvím peptidové kostry, a to výhodně tak, že se expri35 muje polynukleotidová molekula kódující tyto proteiny. K výhodným fúzním proteinům patři interferon-beta-la nebo jeho fragment kovalentně spojený s druhou částí, která je odlišná od interferonů. Specificky fuzní protein nebo fůze „interferon~beta/Ig“ je protein obsahující molekulu interferonu-beta podle předkládaného vynálezu (tj. interferonu-beta-1 a), nebo její fragment, jejíž N-konec nebo C-konec je navázán naN-konec imunoglobulínového řetězce, přičemž část N-konce imunoglobulinu je nahrazena interferonem-beta-la. Druhým interferon-beta/Ig fúzního proteinu je fúzní protein „interferon-beta/Fc“, což je protein obsahující molekulu interferonu-beta podle předkládaného vynálezu (tj. interferon-beta-la) spojenou s alespoň částí konstantní domény imunoglobulinu. Výhodná Fc fúze obsahuje molekulu interferonu-beta podle vynálezu spojenou s fragmentem protilátky obsahujícím C-koncovou doménu těžkého imuno45 globulinového řetězce.
Termín „fúzní protein“ znamená také protein interferonu-beta chemicky vázaný prostřednictvím mono- nebo heterofunkční molekuly ke druhé části, která je odlišná od proteinu interferonu-beta, a je připravena de novo z puntíkovaného proteinu, jak bude dáte popsáno.
Termín „rekombinantní“ znamená v popisu vynálezu protein pocházející z rekombinantních savčích expresních systémů. Protein exprtmovaný ve většině bakteriálních kultur, jako je např. £. coli, bude bez glykanů, a proto takový expresní systém není výhodný. Protein exprimovaný v kvasinkách může obsahovat otigosacharidové struktury, které jsou odlišné od struktur expri55 movaných v savčích buňkách.
-ΛJUU/DA DU
Termín „biologicky aktivní“ užívaný v předkládaném popisu jako charakteristika interferonubeta-la znamená, že příslušná molekula sdílí s provedeními vynálezu zde popsanými homologii v sekvenci aminokyselin dostatečnou k tomu, že vykazuje antivirovou aktivitu při měření in vitro antivirovým testem stejného typu, jaký je v příkladu 1 (viz popis dále).
Termín „léčivý přípravek“ nebo „farmaceutický přípravek“ v popisu vynálezu označuje přípravky obsahující proteiny podle vynálezu a další fyziologicky kompatibilní přísady. Léčívý/farmaceutický přípravek dále obsahuje excipienty jako je např. voda, minerály a nosiče jako např. pro10 teiny.
Termín „účinné množství“ činidla nebo přípravku označuje takové množství, které poskytuje požadovaný výsledek nebo projevuje vliv na určité onemocnění, které je léčeno.
„Aminokyselina“ je monomemf jednotka peptidu, polypeptidu nebo proteinu. Existuje dvacet aminokyselin, které se nacházejí v přirozeně se vyskytujících peptidech, polypeptidech nebo proteinech, a všechny jsou L-izomery, Vynález zahrnuje také analogy aminokyselin a D-izomery aminokyselin tvořících proteiny a jejich analogy.
„Derivatizovaná“ aminokyselina je přírodní aminokyselina nebo aminokyselina nevyskytující se v přírodě, kde normálně se vyskytující postranní řetězce nebo koncové skupiny (nebo cukerná část v případě interferonu-beta-la) jsou modifikovány chemickou reakcí. K takovým modifikacím patří např. gama-karboxylace, beta-karboxylace, PEGylace, sulfatace, sulfonace, fosforylace, amidizace, esterifikace, N-acetylace, karbobenzylace, tosylace a další modifikace, které jsou odborníkům známy. Takže „derivatízovaný polypeptid“ je polypeptid obsahující jednu nebo více derivatizovaných aminokyselin a/nebo jeden nebo více derivatizovaných cukrů, pokud jde o glykosyiovaný polypeptid.
„Protein“ je polymer složený v podstatě z kterýchkoliv z dvaceti proteinových aminokyselin.
1 když termín „polypeptid“ se často užívá k označení relativně velkých polypeptidů a termín „peptid“ se často užívá k označení relativně malých polypeptidů, použití těchto termínů v oboru se často překrývá a je proměnné. V tomto textu se užívá termín „protein“ k označení peptidů, proteinů i polypeptidů, pokud není výslovně uvedeno jinak, „Funkční ekvivalent“ aminokyselinového zbytku je aminokyselina, která má podobné fyzikálněchemické vlastnosti, jako aminokyselinový zbytek, který byl nahrazen funkčním ekvivalentem.
Termín „mutanta“ (případně „mutace“) označuje jakoukoliv změnu v genetickém materiálu organismu, konkrétně je to jakákoliv změna (tj. delece, substituce, adice nebo alterace) v polynukleo40 tidové sekvenci divokého typu nebo jakákoliv změna v proteinu divokého typu. Termín „mutein“ se užívá zaměnitelně s termínem mutanta.
Termín „divoký typ“ označuje přirozeně se vyskytující polynukleotidovou sekvenci exonu proteinu nebo její část, nebo aminokyselinovou sekvenci proteinu nebo její část, tak jak se normálně vyskytuje in vivo.
„Standardní hybridizační podmínky“ jsou podmínky definované koncentrací solí a teplotou v podstatě shodné s podmínkami 0,5 x SSC až 5 x SSC a 65 °C, a to jak pro vlastní hybridizaci, tak i promývání. Termín „standardní hybridizační podmínky“ zde užívaný je proto operační defi50 nice zahrnující celou řadu různých hybridizačních podmínek. Podmínky s vysokou stringencí (přísností) znamenají např. hybridizaciv pufru pro screening plaků polyvínylpyrrolidon, 0,2% Ficoll 400, 0,2% hovězí sérový albumin (BSA), 50mM Tris-HCI (pH 7,5), sodný, 1% SDS) s lMNaCl, 0,1% hydrogenfosforečnan 10% dextransulfátem a 100 μg/ml denaturované sonikované DNA lososího spermatu při 65 °C po 12 až 20 hodin a promývání v 75mM NaCl/7,5mM citrát sodný (0,5 x SSC)/1% SDS při 65 °C. Podmínky s nízkou stringencí jsou např. hybridizace
-7v pufru pro screening plaků s 10% dextransulfátem a 110 pg/ml denaturované sonikované DNA lososího spermatu při 55 °C po 12 až 20 hodin a promývání v 300mM NaCl/30mM citrát sodný (2,0 x SSC) /1% SDS při 55 °C (viz Current Protocols in Molecular Biology, John Willey and Sons, lne., New York, 6.3.1. - 6.3.6., 1989).
„Expresní kontrolní sekvence“ je polynukleotidová genů, když je sekvence, která řídí a reguluje expresi s těmito geny operativně spojena.
„Operativně spojena“ znamená v případě polynukleotidová sekvence (DNA, RNA), že je „operaío tivně spojena“ s expresní kontrolní sekvencí, když expresní kontrolní sekvence řídí a reguluje transkripci a translaci této polynukleotidové sekvence. Termín „operativně spojena“ znamená, že před polynukleotidovou sekvencí, která má být exprimována, je vhodný startovací signál (např.
ATG), a že sekvence jeve správném čtecím rámci, který dovoluje expresi polynukleotidové sekvence pod kontrolou expresní kontrolní sekvence, a tudíž produkci požadovaného polypeptidů kódovaného izolovanou polynukleotidovou sekvencí.
„Expresní vektor“ je poiynukleotid, většinou DNA plazmid nebo fág (jako nejběžnější příklady z dalších), který dovoluje expresi alespoň jednoho genu, když je vektor vnesen do hostitelské buňky. Vektor může ale nemusí být schopen replikace v hostitelské buňce.
Termín „izolovaný“ (užívaný v předkládané přihlášce zaměnitelně s termínem „v podstatě čistý“), pokud se týká nukleových kyselin, tj. polynukleotidových sekvencí, které kódují polypeptidy, znamená RNA nebo DNA poiynukleotid, část genomového polynukleotidu, cDNA nebo syntetický poiynukleotid, který v důsledku svého původu nebo zacházení s ním: I) není spojen se všemi polynukleotidy se kterými je spojen v přírodě (např. je přítomen v hostitelské buňce jako expresní vektor nebo jeho část), II) je spojen s nukleovou kyselinou nebo jinou chemickou skupinou, které se odlišují od těch, se kterými je spojen v přírodě, nebo III) nevyskytuje se v přírodě. Jako „izolovaná“ se dále označuje polynukleotidová sekvence, která je: I) amplifikovaná in vitro např. metodou polymerázové řetězové reakce (PCR), II) syntetizovaná chemicky,
III) rekombinantně připravená klonováním nebo IV) purifikovaná, např. štěpením agelovou separací.
Takže „v podstatě čistá nukleová kyselina“ je nukleová kyselina která není bezprostředně souvisle spojena s jednou nebo oběma sekvencemi, se kterými je normálně souvisle spojena v přírodně se vyskytujícím genomu organismu, ze kterého je izolována. V podstatě čistá DNA je také rekombinantní DNA, která je částí hybridního genu kódujícího další sekvence.
Termín „izolovaný“ (užívaný v předkládané přihlášce zaměnitelně s termínem „v podstatě čistý“), pokud jde o polypeptidy, znamená polypeptid nebo jeho část, který v důsledku svého původu nebo zacházení sním: I)je přítomen v hostitelské buňce jako expresní produkt úseku expresního vektoru, nebo II)je spojen sjinými proteiny nebo chemickými skupinami, než se kterými je spojen v přírodě, nebo III) nevyskytuje se v přírodě. Jako „izolovaný“ se dále označuje polypeptid, který I) byl chemicky syntetizován, II) byl exprimován v hostitelské buňce a purifikován od asociovaných proteinů. Výhodně je izolovaný polypeptid purifíkován také od dalších látek, jako jsou např. protilátky nebo gelová matrix (polyakrylamíd), které se užívají k purifikaci.
„Heterologní promotor“ je promotor, který v přírodě není spojen s genem nebo purifikovanou nukleovou kyselinou.
Termín „homologní“ je zde užíván jako synonymum pro „identický“ a týká se sekvenční podobnosti dvou polypeptidů nebo molekul nebo dvou nukleových kyselin. Když je jedna určitá pozice ve dvou srovnávaných sekvencích obsazena stejnou bází nebo aminokyselinou (např. pozice ve dvou molekulách DNA je obsazena adeninem nebo pozice ve dvou polypeptidech je obsazena lysinem), pak dvě srovnávané molekuly jsou v této pozici homologní. Procento homologie mezi dvěma sekvencemi je funkcí počtu shodných nebo homologních pozic sdílených dvěma sekven-8cemi dělený celkovým počtem pozic a vynásobený 100. Tak např. jestliže 6 z 10 pozic je shodných nebo-li homotogních, pak tyto sekvence jsou z 60 % homologní. Nebo např. DNA sekvence CTGACT a CAGGTT sdílejí 50% homologíi (3 pozice ze 6 jsou shodné). Obecně se srovnání provádí, když jsou sekvence vzájemně přiřazeny tak, aby bylo dosaženo maximální homologie.
Takové přiřazení a srovnání lze provést metodou, kterou publikoval Needleman et al., (J. Mol. Biol. 48: 443-453, 1970), a která je standardně implementována v příslušných počítačových programech jako je např. program „Align“ (DNAstar, lne.). Homologní sekvence sdílejí shodné nebo podobné zbytky aminokyselin, kde podobné aminokyselinové zbytky jsou konzervativní substituce nebo tzv. „povolené“ bodové mutace odpovídajících aminokyselinových zbytků vzhleio dem k odpovídající přirazené referenční sekvenci. V tomto smyslu „konzervativní substituce“ aminokyselinového zbytku v referenční sekvenci znamená substituci aminokyselinou, která je fyzikálně nebo funkčně podobná odpovídajícímu zbytku v referenční sekvenci, tedy např. má podobnou velikost, tvar, elektrický náboj, chemické vlastnosti včetně schopnosti vytvářet kovalentní nebo vodíkové vazby apod. Zvláště výhodné jsou kovalentní substituce, které splňují krité15 ria definovaná jako „přijatelné bodové mutace“ v publikaci Dayhoff etal., Atlas of protein Sequence and Structure 5, Suppl. 3, Chapter 22: 352-354, Nat. Biomed. Res. Foundation, Washington D.C., 1978.
Termíny „polynukleotidová sekvence“ a „nukleotidová sekvence“ jsou užívány v popisu zaměni20 tělně.
Termíny „angiogeneze“ a „neovaskularizace“ jsou užívány v nejširším významu a znamenají vytváření nových krevních cév. Zejména angiogeneze se týká také vytváření nových krevních cév v místě nádoru.
Termíny „IFNAR2“, „IFNAR1“ a „1FNAR1/2“ označují proteiny, které tvoří interferonový receptor typu I na povrchu buněk. Extracelulámí část (ektodoména) receptoru IFNAR2 sama může vázat ínterferon beta nebo alfa.
Při provádění předkládaného vynálezu byly použity standardní metody buněčné biologie, buněčných kultur, molekulární biologie, mikrobiologie, rekombinantní DNA, proteinové chemie a imunologie, které jsou odborníkům známy. Tyto metody byly publikovány v odborné literatuře. Viz např. Molecular Cloning: ALaboratory Manual, 2ndedition. (Sambrook, Fritsch and Maniatís, eds.), Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989; DNA Cloning, Volumes I and II (D.N. Glover, ed.), 1985; Oligonucleotide Synthesis, (M.J. Gait, ed.), 1984; Patent US 4 683 195 (Mullis etal.,); Nucleic Acid Hybridization (B.D. Hames and S.J. Higgins, eds.), 1984; Transcription and Translation (B.D. Hames and S.J. Higgins, eds.), 1984; Culture of Animal Cells (R.L Freshney, ed). Alan R. Liss, lne., 1987; Immobilized Cells and Enzymes, IRL Press, 1986; A Practical Guide to Molecular Cloning (B. Perbal), 1984; Methods in Enzymology, Volu40 mes 154 and 155 (Wu et al„ eds), Academie Press, New York; Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.H. Miller and M.P. Calos, eds.), 1987, Cold Spring Harbor Laboratory; ímmunochemical Methods in Cell and Molecular Biology (Mayer and Walker, eds.), Academie Press. London, 1987; Handbook of Experiment Immunology, Volumes I—IV (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds.), 1986; Manipulating the Mouše Embryo, Cold Spring Harbor Laboratory Press,
1986.
II. Produkce a exprese fůzních proteinů
Předkládaný vynález se týká systému pro vytváření fůzních proteinů interferonu-beta-la. Vyná50 lez se zejména týká těchto proteinů a také molekul rekombinantní DNA používaných pro jejich produkci.
Polypeptidy podle vynálezu lze produkovat různými metodami, které jsou odborníkům známy. Tak např. ínterferon-beta-la úplné délky nebo zkrácený interferon-beta-la mohou být připra55 vény známými metodami rekombinantní DNA užitím cDNA (viz dále).
-9CZ, JUU/OZ tJO
Gen kódující požadovaný polypeptid interferonu-beta-la může být konstruován na základě aminokyselinové sekvence požadovaného polypeptidu. Pro syntézu genu se pak užijí standardní metody. Tak např. aminokyselinové sekvence se užije pro konstrukci „zpětně přeloženého“ genu.
Oligomer DNA obsahující nukleotidovou sekvenci kódující interferon-beta-la může být syntetizován v jediném kroku. Alternativně může být připraveno několik menších oligonukleotidů kódujících Části požadovaného interferonu-beta-la a ty se pak ligací spojí dohromady. Výhodně se DNA sekvence kódující interferon-beta-la připraví jako několik samostatných oligonukleotidů, které se následně navzájem pospojují (viz příklad 2). Jednotlivé nukleotidy typicky obsahují io 5'- nebo 3'-přesahy (přesahující úseky), které umožňují spojení na základě komplementarity.
Po sestavení výhodné geny budou charakteristické tím, že budou rozpoznávány restrikčními endonukleázami (včetně jedinečných restrikčních míst pro přímé vkládání do klonovacího nebo expresního vektoru), preferovaným využitím kodonů vzhledem k hostitelskému expresnímu orga15 nismu, který se bude užívat (výhodně savčí buňky), a tím, že po transkripci produkují stabilní a účinně translatovanou RNA. Správné sestavení lze ověřit sekvenováním, restrikčním mapováním a nebo expresí biologicky aktivního polypeptidu ve vhodném hostiteli.
Savčí cDNA pro interferon-beta může být izolována pomocí vhodné DNA sekvence lidského
2o interferonu-beta-la jakožto sondy pro screening konkrétní savčí cDNA knihovny mezidruhovou hybridizací. V předkládaném vynálezu byl užit interferon-beta ze savců jako jsou např. primáti, člověk, myš, pes, kočka, kráva, kůň a prase. Savčí interferon-beta lze získat mezidruhovou hybridizací, a sice užitím jednořetězcové cDNA pocházející DNA lidského interferonu-beta jakožto hybridizační sondy k izolaci cDNA pro interferon-beta ze savčích cDNA knihoven.
K metodám, které mohou být použity pro izolaci a klonování sekvencí interferonového genu, patří metody popsané ve výše citovaných patentech USA. Relevantní je zejména patent US 4 738 931 (19. Duben 1988), popisující DNA obsahující gen lidského interferonu-beta.
Předkládaný vynález se také týká molekul rekombinantní DNA, které obsahují výše uvedené sekvence DNA.
Molekuly rekombinantní DNA podle vynálezu jsou schopné řídit expresi polypeptidu podle vynálezu v hostiteli, který je jimi transformován. Aby bylo dosaženo exprese, musí sekvence DNA kódující fúzní polypeptid podle vynálezu být operativně spojena s expresní kontrolní sekvencí. Aby bylo dosaženo odpovídající transkripce rekombinantního konstruktu podle vynálezu, do rekombinantního vektoru se výhodně vloží vhodná sekvence promotor/enhanceru, za předpokladu, že sekvence promotor/enhancer je schopna řídit transkripci sekvence nukleové kyseliny kódující glykosylovaný interferon-beta. K promotorům, které se mohou užít k řízení exprese fúzních proteinů založených na imunoglobulinu patří, aniž by tento výčet byl omezující, časný promotor SV40 (Benoist a Chambon, 1981, Nátuře 290: 304-310), promotor obsažený v3koncové dlouhé terminální repetici (LTR) viru Rousova sarkomu (Yamamoto, etal., 1980, Celt 22: 787-797), thymidinkinázový promotor z herpes viru (Wagner etal., 1981, Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 78: 144-1445), regulační sekvence metallothioninového genu (Brinster etal., 1982, Nátuře 296: 39-42), rostlinné expresní vektory obsahující promotor nopalinsyntetázy (Herrera-Estrella et al., Nátuře 303: 209-213) nebo 35S RNA promotor z viru mozaiky květáku (Gardner, etal., 1981, Nucl. Acids Res. 9: 2871), a také promotor fotosyntetického enzymu ribulózabisfofátkarboxylázy (Herrera-Estrella et al., 1984, Nátuře 310: 115-120); promotorové elementy z kvasinek nebo jiných hub jako je např. Gal4 promotor, promotor ADC (alkoholdehydrogenázy), promotor PGK (fosfoglycerolkinázy), promotor alkalické fosfatázy, a také následující zvířecí transkripční kontrolní úseky, které vykazují tkáňovou specifítu a byly užity u transgenních zvířat: kontrolní úsek genu elastázy 1, který je aktivní v buňkách pankreatu (Swift etal., 1984, Cell 38: 639-646; Omitz et al., 1986, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50: 399-409; MacDonald, 1987, Hematology 7: 425515); zesilovače (enhancery) nebo promotory genu pro insulin, které jsou aktivní v beta-buňkách pankreatu (Hanahan, 1985, Nátuře 315: 115—
122); enhancery nebo promotory imunoglobulinových genů, které jsou aktivní v lymfatických
-10buňkách (Grossched, etaL, 1984, Cell 38: 647-658; Adames etal., 1985, Nátuře 318: 533-538; Alexander etal., 1987, Mol. Cell. Biol. 7:1 436-1 444); úsek promotoru aenhanceru časných genů cytomegaioviru (Boshart et al., 1985, Cell 41: 521530); kontrolní úsek myšího viru nádoru prsní žlázy, který je aktivní v buňkách varlat a prsu, a lymfatických a žírných buňkách (Leder etal., 1986, Cell 45: 485—495); kontrolní úsek albuminového genu, který je aktivní v játrech (Pinkert etal., 1987, Genes and Devel. 1: 268-276); kontrolní úsek genu pro alfafetoprotein, který je aktivní v játrech (Krumlauf et al., 1985, Mol. Cello Biol. 5: 1 639-1 648; Hammer et al., 1987, Science 235: 53-58); kontrolní úsek genu alfa 1-antitrypsinu, který je aktivní v játrech (Kelsey etal, 1987, Genes and Devel. 1: 161-171); kontrolní úsek beta-globinového genu, který io je aktivní vmyeloidních buňkách (Mogram etal., 1985, Nátuře315: 338-340; Kollias etal., 1986, Cell 46: 89-94); kontrolní úsek genu pro myelinový bazický protein, který je aktivní voligodendrocytech mozku (Readhead etal., 1987, Cell48: 703-712); kontrolní úsek lehkého řetězce 2myosinu, který je aktivní v kosterním svalstvu (Sani, 1985, Nátuře 314:283-286); a kontrolní úsek genu hormonu uvolňujícího gonadotropiny, který je aktivní v hypothalamu (Mason et al., 1986, Science 234: 1 372-1 378). Prokaryotické expresní systémy, jako např. LAC promotor nebo betar-laktamázový promotor (Villa-Kamaroff, etal., 1978, Proč. Nati. Acad, Sci. U.S.A, 75: 3 727-3 731) nejsou výhodné pro předkládaný vynález, neboť takto exprimovaný interferon-beta by nebyl glykosylovaný. Nicméně prokaryotické expresní systémy, které umožní glykosylaci interferonu-beta buďto v prokaryotickém, nebo eukaryotickém hostiteli, jsou také předmětem předkládaného vynálezu.
Expresní vektory, které mohou být použity, jsou například, aniž by však tento výčet byl omezující, následující vektory nebo jejich deriváty: lidské nebo zvířecí viry jako je virus vakcínie, vektory založené na adenovirech nebo retrovirech, hmyzí viry jako bakuloviry, kvasinkové vektory, bakteriofágové vektory (např. lambda) a plazmidové a kosmidové DNA vektory, abychom jmenovali alespoň některé. Specificky k užitečným expresním vektorům pro výhodné eukaryotické hostitele patří vektory obsahující expresní kontrolní sekvence z SV40, hovězího papillomavíru a cytomegaioviru. Uvnitř každého specifického vektoru se vyberou různá místa pro vložení požadované DNA sekvence. Tato místa jsou většinou definována restrikčními endo30 nukleázami, které v těchto místech štěpí DNA. Odborníkovi je toto dobře známo. Je také jasné, že daný expresní vektor užitečný pro vynález nemusí mít restrikční endonukleázová místa pro inzerci vybraného fragmentu DNA. Místo toho se vektor spojí s fragmentem alternativním způsobem.
Expresní vektor, místo vybrané pro inzerci vybraného fragmentu DNA a operativní spojení k expresní kontrolní sekvenci jsou určeny mnoha různými faktory jako je např. počet míst štěpitelných konkrétním restrikčním enzymem, velikost polypeptidu, citlivost polypeptidu k proteolytické degradaci apod. Výběr vektoru a inzerčních míst pro danou DNA je pak dán balancí těchto faktorů.
Rekombinantní konstrukty podle vynálezu se vnesou do buněk, které jsou schopné exprimovat fúzní protein, metodami, které jsou odborníkům známy. K těmto metodám patří transformace (např. metodou s DEAE-dextranem nebo kalciumfosfátem), transfekce, mikroinjekce, infekce, vstřelování do buňky a elektroporace buňky. Může být užita jakákoliv hostitelská buňka, za před45 pokladu, že sekvence rekombinantní nukleové kyseliny bude adekvátně transkribována do RNA v buňkách tohoto typu a že tyto buňky jsou schopny glykosylovat protein. Kromě toho jakékoliv konstrukty rekombinantní nukleové kyseliny podle vynálezu mohou být užity k vytvoření transgenních zvířat, s výjimkou člověka, schopných produkovat fúzní proteiny založené na imunoglobulinu. Ve výhodném provedení vynálezu jsou hostitelské buňky savčí buňky jako jsou např.
buňky COS nebo CHO.
Úspěšnou inkorporaci těchto polynukleotídových konstruktů do daného expresního vektoru je možno identifikovat obecně třemi možnými postupy: (a) DNA-DNA hybridizací, (b) přítomností či absencí funkcí „markerových“ genů, a (c) expresí vložené sekvence. V prvním z uvedených případů se přítomnost genu interferonu-beta-1 a v expresním vektoru detekuje hybridizací DNA-11CZ 300762 B6
DNA užitím sondy, která obsahuje sekvence homologní s vloženým genem fúzního proteinu. Ve druhém případě se rekombinantní systém vektor/hostitel identifikuje a selektuje na základě přítomnosti nebo nepřítomnosti určité markerové funkce (např. thymidinkinázová aktivita, resistence k antibiotikům jak např. G418, transformovaný fenotyp, vytváření okluzních tělísek u bakuloviru apod.) způsobené vložením cizorodého genu do vektoru. Tak např. když je polynukleotid vložen do vektoru tak, že přerušuje sekvenci markerového genu, rekombinanty obsahující inzert jsou identifikovány na základě absence funkce markerového genu. Ve třetím případě je rekombinantní expresní vektor identifikován testováním exprese cizorodého genového produktu z rekombinantního vektoru. Takové testy jsou např. založeny na fyzikálních nebo funkčních vlastnostech genového produktu v biologických testovacích systémech.
Je třeba mít na paměti, že ne všechny kombinace hostitel/expresní vektor fungují se stejnou účinností při expresi DNA kódující polypeptid podle vynálezu. Avšak odborník může provést konkrétní výběr kombinace hostitel/expresní vektor při uvážení principů stanovených v předkládané15 ho vynálezu aniž by se odchýlil od vynálezecké myšlenky předkládaného vynálezu.
Výhodné provedení předkládaného vynálezu zahrnuje fúzní proteiny a sekvence DNA, které tyto proteiny kódují. Tyto fúzní proteiny mají amino-koncový úsek charakterizovaný aminokyselinovou sekvencí interferonu-beta-la a karboxy-koncový úsek obsahující doménu proteinu jiného než je interferon-beta-la. Generický vzorec výhodného fúzního proteinu je protein mající aminokyselinovou sekvenci X-Y-Z, kde X je polypeptid mající aminokyselinovou sekvenci, nebo alespoň její část, odpovídající aminokyselinové sekvenci lidského interferonu-beta, Y je volitelná spojovací Část (linker) a Z je polypeptid obsahující alespoň část polypeptidu jiného než je lidský interferon-beta. V jednom provedení část Z je část polypeptidu, který obsahuje imuno25 globulinu podobnou doménu. K příkladům takových polypeptidu patří CD1, CD2, CD4 a členy I. a II. třídy antigenů hlavního histokompatibilního systému (pro příklady těchto polypeptidu viz také přihlášku US 5 565 335, Capon et al.).
Část Z obsahuje např. několik histidinových zbytků, nebo výhodné Fc úsek imunoglobulinu, přičemž „Fc“ je definován jako fragment protilátky obsahující C-koncovou doménu těžkého řetězce imunoglobulinu.
V nej výhodnějším provedení íuzního proteinu podle vynálezu je polypeptid interferonu-beta-la fúzován prostřednictvím svého C-konce s alespoň částí Fc úseku imunoglobulinu. Interferon35 beta-la tak vytváří amino-koncovou část a Fc vytváří karboxy-koncovou část fúzního proteinu.
V těchto fúzních proteinech je výhodně omezen na kloubový úsek konstantní domény a domény CH2 a CH3. Fc fragment těchto íuzních proteinů může být také omezen na část kloubového úseku, která je schopna tvořit intermolekulámí disulfidické můstky, a domény CH2 a CH3, nebo odpovídající funkční ekvivalent. Takové konstantní úseky mohou pocházet z jakéhokoliv savce (výhodně člověka) a mohou být získány zjakékoliv třídy a/nebo izotypu protilátky včetně IgA, IgD, IgM, IgE and IgGl, IgG2, IgG3 a IgG4.
Molekuly rekombinantní nukleové kyseliny kódující Ig fúze lze připravit jakoukoliv metodou v oboru známou (viz Maniatis etak, 1982, Molecular Cloning; A Laboratory to Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N. Y.) nebo užitím veřejně dostupných klonů. Metody přípravy genů, které kódují konstantní úseky těžkých a lehkých řetězců imunoglobulinu, byly popsány např. v Robinson, R. etal., mezinárodní patentová přihláška PCT publikovaná jako WO87/02671. Sekvence cDNA kódující molekulu interferonu nebo její fragment může být přímo spojena s DNA sekvencí kódující konstantní úsek těžkého řetězce imunoglobulinu nebo může být spojena prostřednictvím spojovací sekvence (linkeru). V jiném provedení vynálezu je rekombinantní expresní systém vytvořen tak, že obsahuje sekvenci kódující interferon-beta ve správném čtecím rámci se syntetickým úsekem pro kloubovou oblast protilátky. Kromě toho může být potřebné vložit, jako část rekombinantního vektorového systému, nukleové kyseliny odpovídající 3-koncový úsek lemující imunoglobulinový gen obsahující místa pro Štěpení a polyadenylaci
RNA a „downstream“ sekvence. A dále může být potřebné vložit signální sekvenci do polohy
-12„upstream“ od kódující sekvence imunoglobulinového fuzního proteinu, aby se umožnila sekrece fuzní molekuly z buněk trans formovaných rekombinantním vektorem.
Předkládaný vynález poskytuje dimemí fuzní molekuly a také monomemí nebo multimemí mole5 kuly obsahující fuzní proteiny. Takové multimemí molekuly mohou být připraveny užitím takových Fc úseků Ig molekul, nebo jejich Částí, které jsou obvykle multivalentní jako jsou např. pentamery IgM nebo dimery IgA. Je zřejmé, že polypeptid J řetězce je potřebný pro vytvoření a stabilizaci pentamerů IgM a dimerů IgA. Alternativně multímery fuzních proteinů interferonubeta-la mohou být připraveny užitím proteinu s afinitou k Fc úseku Ig molekul, jako je např.
protein A. Tak např. mnohé fuzní proteiny interferon-beta-la/imunoglobulin mohou být navázány na agarózové perličky s proteinem A.
Tyto polyvalentní formy jsou užitečné, neboť mají mnoho vazebných míst pro receptor interferonu-beta-la. Např. bivalentní rozpustný interferon-beta-la je složen ze dvou tandemově se opakujících sekvencí aminokyselin 1 až 166 v sekvenci id. ě. 2 (nebo kódovaných úsekem 1 až 498 sekvence id. č. 1) (ěástX v generickém vzorci) oddělených spojovacím úsekem (část Y), a tato repetice je spojena s alespoň částí konstantní domény imunoglobulinu (část Z). Pozměněné polyvalentní formy mohou být zkonstruovány, např. chemickým navázáním fůze interferonbeta-la/Ig na klinicky přijatelnou nosičovou molekulu, polymer vybraný ze skupiny obsahující
Ficoll, polyethylenglykol nebo dextran, a sice obvyklými metodami konjugace. Alternativně může být interferon-beta-la chemicky konjugován sbiotinem, a tento konjugát biotin-interferon-beta-Fc se pak naváže na avidin, čímž vznikne tetravalentní molekula avidin/biotin/interferon-beta. Fúze interferon-beta-la/Ig může být také kovalentně navázána na dinitrofenol (DNP) nebo trinitrofenol (TNP), a výsledný konjugát pak precipitován pomocí anti-DNP nebo anti-TNPIgM, čímž se vytvoří dekamemí konjugáty s valencí 10 pro vazebná místa k receptoru interferonu-beta.
Proteiny interferonu-beta-1 a a jejich fragmenty a fuzní proteiny podle vynálezu mohou být izolovány a purifikovány obvyklými metodami, jako je např. extrakce, precipitace, chromatografie, afinitní chromatografie, elektroforéza apod. Např. interferonové proteiny a jejich fragmenty se mohou purifikovat tak, že se jejich roztok nanese na kolonu obsahující imobilizovaní receptory interferonu (viz např. patent US 4 725 669). Navázané molekuly interferonu se pak eluují užitím chaotropní soli nebo užitím vodného roztoku kyseliny octové. Imunoglobulinové fuzní proteiny mohou být purifikovány tak, že procházejí přes obsahující mobilizovaný protein A nebo pro35 tein G, které selektivně váží úsek Fc fuzního proteinu (viz např. Reis, K. J., et al., J. Immunol. 132: 30983102 (1984); PCT přihláška publikovaná jako W087/00329). Chimérická protilátka se pak eluuje užitím chaotropní soli nebo užitím vodného roztoku kyseliny octové.
Alternativně se molekuly fúzního proteinu interferonu a imunoglobulinu pro získání v podstatě
Čistého proteinu purifikují na koloně s anti-interferonovou protilátkou nebo na koloně s antiimunoglobulinovou protilátkou.
Termínem „v podstatě čistý“ je míněn protein zbavený nečistot, které jsou s ním v přirozeném stavu spojeny. V podstatě čistý stav je možné dokázat výskytem jediného pásu při elektroforéze.
Příkladem užitečného fúzního proteinu interferon-beta-la/Ig podle vynálezu je protein sekvence id. č. 2, který je secemován v buněčné kultuře eukaryotických buněk obsahujících expresní plazmid pCMG261 (viz příklad 2). Tento protein se skládá ze zralého lidského interferonu-betala fúzovaného s částí kloubového úseku a konstantními doménami CH2 a CH3 myšího Ig.
Přitom obsahuje úsek myšího imunoglobulinu dostatečný k tomu, aby byl rozpoznán Fc vazebným proteinem, a sice proteinem A.
Další fuzní proteiny podle vynálezu obsahující lidský interferon-beta-1 jsou uvedeny: (a)jako sekvence id. č, 3 a 4, ukazující cDNA a dedukovanou aminokyselinovou sekvenci his-označené
- 13JVV/Vi DU fúze interferonu-beta-1 a (také ukázána na obr. 1), a (b) sekvence id, č. 1 pro cDNA kódující fúzní protein interferon-beta-la/Ig se sekvencí id. č. 2 (ukázán také na obr. 2).
Výhodné proteiny interferonu-beta-la podle vynálezu obsahující novou „spojovací“ sekvenci
DNA id. č. 5 a aminokyselinovou sekvenci id. č. 6 představující kodony 11 tripletů na obou stranách spoje mezi DNA lidského interferonu-beta a DNA kódující konstantní úsek lidského imunoglobulinu (viz příklad 5: sekvence id. č. 41 a 42). Specificky, sekvence id. č. 5 kódující lidský interferon-beta-la končí nukleotidovým tripletem 568-570 (AAC) a DNA kódující konstantní úsek lidského IgGl začíná tripletem (GAC) počínaje nukleotidem č. 574 v sekvenio ciid. č. 41, Odpovídající dedukovaná aminokyselinová „spojovací“ sekvence je uvedena jako sekvence id. č. 6 a je založena na sekvenci id. č. 42. Byla definována i další jedinečná „spojovací“ sekvence, která zahrnuje linkerovou sekvenci ve výsledném DNA konstruktu (viz příklad 5: sekvence id. č. 43 a 44). Tato sekvence „spojovací“ DNA a příslušná aminokyselinová sekvence jsou uvedeny jako sekvence id. č, 7 a 8, které ukazují kodony 11 tripletů na obou stranách spoje přímo mezi koncem sekvence interferonu-beta-la (nukleotid č. 570 v sekvenci id. č. 43) a sekvencí linkeru (nukleotidy 571 až 585 v sekvenci id. č. 43, GGGGS (sekvence id. č. 64) v sekvenci id. č. 8).
„Spojovací“ DNA sekvence mohou být užity jako DNA sondy a jsou to minimální DNA potřebné pro hybridizaci za standardních podmínek s jakoukoliv DNA sekvencí kódující fúzní protein interferon-beta-la/Ig. Nicméně za předpokladu, že celá sonda hybridizuje s oběma stranami spojovací sekvence a obě strany spoje interferon-beta/konstantní úsek se podílejí na hybridizaci, mohou existovat i menší sekvence. Navíc odborníkovi je zřejmé, že DNA sekvence větší než sekvence id. č. 7 jsou také vhodné pro hybridizaci. Odborník může snadno otestovat, zda konkrétní sonda, jak např. sekvence id. č. 5 nebo 7, je schopna hybridízace na obou stranách spojení, a to tak, že označí 5'-konec buďto jednořetězcového „sense“ oligonukleotidu, nebo jednořetězcového „anti-sense“ oligonukleotidu vhodně značeným fosfátem z ATP užitím polynukleotidkinázy. Sekvence podle vynálezu musí hybridizovat s oběma, a tudíž být označena oběma oligonukleotidovými sondami. Odborníkovi je také zřejmé, že vynález zahrnuje také plně degenerované sekvence kódující spojovací sekvenci id. č. 5 nebo 7.
III. Další varianty interferonových fúzních polypeptidů
K derivátům proteinů podle vynálezu patří také různé strukturní formy primárních proteinů, které si uchovávají biologickou aktivitu. Díky přítomnosti ionizovatelné aminoskupiny a karboxylové skupiny mohou být fúzní proteiny interferonu-beta např. ve formě kyselých nebo bazických solí, nebo mohou být v neutrální formě. Jednotlivé aminokyselinové zbytky mohou být modifikované oxidací nebo redukcí. A dále primární aminokyselinová struktura (včetně N- a/nebo C-koncových úseků) nebo glykanová část interferonu-beta mohou být modifikovány (derivatizovány) vytvářením kovalentních nebo agregovaných konjugátů sjinými chemickými skupinami, jako jsou např. glykosylové skupiny, polyalkylenglykolové polymery jako např. polyethylenglykol (PEG: viz současně projednávané přihlášky stejného přihlašovatele č. 60/104,491 a 60/120,237), lipidy, fosfáty, acetylové skupiny apod., a nebo vytvářením mutací aminokyselinových sekvencí.
K dalším derivátům interferonu-beta/Ig patří kovalentní nebo agregované konjugáty interferonubeta nebo jeho fragmentů sjinými proteiny nebo polypeptidy, které jsou připojeny syntézou v rekombinantní kultuře jako dodatečné C- nebo N-konce. Tak např. konjugovaný peptid může být signální (nebo tzv. vedoucí) polypeptidová sekvence v N-koncovém úseku proteinu, která při translaci (kotranslačně) nebo po translaci (posttranslačně) směruje přenos proteinu z místa jeho syntézy do místa jeho působení uvnitř buňky nebo vně buněčné membrány nebo buněčné stěny (např. vedoucí sekvence alfa-faktoru kvasinek). Receptorové proteiny interferonu-beta mohou obsahovat peptidy přidané pro usnadnění purifikace nebo identifikace interferonu-beta (např. fúze histidin/interferon-beta-la). Aminokyselinová sekvence interferonu-beta může být také spojena s peptidem Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (DYK.DDDDK) (sekvence id. č. 61) (Hopp et al., Bio/Technology 6: 1 204,1988.) Tato sekvence Je silně antigenní a poskytuje epitop
- 14reverzibilně vázaný specifickou monoklonální protilátkou, což umožňuje rychlé testování a snadné Čištění exprimovaného rekombinantního proteinu. Tato sekvence je také specificky štěpena enterokinázou z hovězí sliznice v místě zbytku bezprostředně následujícím po dvojici Asp-Lys.
K dalším analogům patří fuzní proteiny interferonu-beta s Fc nebo jejich biologicky aktivní fragmenty, jejichž sekvence interferonu-beta se liší od sekvencí uvedených jako sekvence id, ě. 2,4, 6 nebo 8 jednou nebo více konzervativními záměnami aminokyselin nebo jednou či více nekonzervativními záměnami, a nebo delecemi nebo inzercemi, které nenarušují biologickou aktivitu izolovaného proteinu. Ke konzervativním substitucím typicky patří substituce jedné aminokyseío líny druhou aminokyselinou s podobnými vlastnostmi, jako jsou např. substituce v rámci následujících skupin: valin, alanin a glycin; leucin a isoleucin; kyselina asparagová a glutamová, asparagin; a glutamin; serin a threonin; lysin a arginin; a fenylalanin a tyrosin. K nepolárním hydrofobním aminokyselinám patří alanin, leucin, isoleucin, valin, prolin, fenylalanin, tryptofan a methionín. K polárním neutrálním aminokyselinám patří glycin, serin, threonin, cystein, tyrosin, aspara15 gin a glutamin. K pozitivně nabitým (bazickým) aminokyselinám patří arginin, lysin a histidin. K negativně nabitým (kyselým) aminokyselinám patří kyselina asparagová a kyselina glutamová. Další konzervativní substituce jsou odborníkovi jasné. Tak např. pro konzervativní substituci aminokyseliny alaninu je možné vybrat kteroukoliv z aminokyselin jako je D-alanin, glycin, beta-alanin, L-cystein a D-cystein. Pro lysin lze vybrat jako náhradu kteroukoliv z aminokyselin
D-lysin, arginin, D-arginin, homo-arginin, methionin, D-methionin, omitin a D-omitin. Obecně substituce, u kterých se dá očekávat, že způsobí změny ve funkčních vlastnostech izolovaných polypeptidů, jsou případy, kdy: (i) polární zbytek, např. serin nebo threonin, je nahrazen (nebo se užije k nahrazení) hydrofobním zbytkem, např. leucinem, isoleucinem, fenylalaninem nebo alaninem (ii) cysteinový zbytek je nahrazen (nebo se užije k nahrazení) jiným zbytkem a nebo (iii) zbytek mající elektropozitivní vedlejší řetězec např. lysin, arginin nebo histidin, je nahrazen (nebo se užije k nahrazení) zbytkem majícím elektronegativní vedlejší řetězec, jako je např. kyselina glutamová nebo asparagová, nebo (iv) zbytek mající objemný vedlejší řetězec, jako je např. fenylalan, je nahrazen (nebo se užije k nahrazení) zbytkem, který nemá takový vedlejší řetězec, např. glycinem. Vynález také zahrnuje izolované molekuly, které jsou alelickými variantami, přirozenými mutantami, indukovanými mutantami nebo proteiny, které jsou kódovány DNA hybridizující za podmínek vysoké či nízké stringence s nukleovými kyselinami kódujícími polypeptid se sekvencemi id. č. 2,4,6 nebo 8.
Původci připravili další mutanty interferonu-beta-la, které jsou dalšími variantami části inter35 feronu-beta-la v proteinu podle vynálezu. Tyto interferon-beta-la části mohou být zvláště užitečné, pokud projevují nové vlastností, které nemá interferon-beta-la divokého typu (viz příklad 1). Stručně shrnuto, byla provedena mutační analýza lidského interferonu-beta-la s cílem mapovat aminokyselinové zbytky nutné pro aktivitu a vazbu receptoru. Dostupnost trojrozměrné krystalové struktury lidského interferonu-beta-la (viz Karpusas etal., 1997, Proč.
Nati. Acad. Sci. 94: 11 813-11818) umožnila identifikovat, pro alaninové (nebo serinové) substituce zbytky, které jsou vystaveny rozpouštědlu a jsou dostupné pro interakce s receptorem interferonu-beta, a přitom zachovat aminokyselinové zbytky podílející se na vytváření intramolekulámích vazeb. Byl připraven panel 15 alaninových „skenovacích“ mutant, kde bylo nahrazeno 2 až 8 zbytků v určitých oblastech šroubovic (A, B, C, D, E) a smyček (AB1, AB2, AB3,
CD1, CD2, DE1, DE2) interferonu-beta-1 a (viz příklad 1).
Amino-koncová histidinová značka („his“ tag) byla vložena pro afinitní purifikaci mutant exprimovaných v savčích buňkách (sekvence id. č. 2, obr. 1). Funkční důsledky těchto mutací byly vyhodnoceny pomocí antivirových a antiproliferačních testů. Byl také vyvinut neradioaktivní so vazebný test pro analýzu schopnosti mutant vázat se na receptor interferonu-beta na povrchu buněk (buněčný povrchový receptor IFNAR1/2). Navíc byl užit test založený na EUSA-testu užívající fúzní protein „ektodoméma IFNAR2/Fc“ k navázání interferonu pro mapování povrchových interakcí mezi interferonem-beta-la a IFNAR2 (viz příklad 2). Tyto mutační analýzy ukázaly, že N- a C-konce leží v části molekuly interferonu-beta, která není důležitá pro vazbu receptoru nebo pro biologickou funkci.
-15LZ. JUU7<tí Bft
Byly identifikovány tři druhy účinků, které byly způsobeny cílenou mutagenezí. Tyto účinky mohou být za určitých okolností výhodné při vývoji interferonových léčiv. Tyto tři účinky byly následující: (a) mutanty s vyšší antivirovou aktivitou než interferon-beta-la divokého typu s his-značkou (např. mutanta Cl), (b) mutanty aktivní jak v antivirovém, tak antiproliferačním testu, ale jejich antiproliferační aktivita byla neúměrně nízká ve srovnání s antivirovou aktivitou, vzhledem k interferonu-beta-1 a divokého typu s his-značkou (např. mutanty Cl, D a DE1), a(c)funkčně antagonistické mutanty (např. AI, B2, CD2 a DE1), které vykazují antivirovou i antiproliferační aktivitu, která byla neúměrně nízká ve srovnání s vazebnou aktivitou k recep10 toru, vzhledem k interferonu-beta-1 a divokého typu.
Kromě toho i spojení mezi interferonovou částí (X) a druhou částí (Z), která je odlišná od interferonu-beta-1 a (např. Fc fragment imunogiobulinu) může být způsobeno chemickou reakcí, která bude vázat obě molekuly tak dlouho, dokud si imunoglobulin a interferon-beta-la zacho15 vají své aktivity. K takovým chemickým spojením patří např. kovalentní vazba, afinitní vazba, interkalace, koordinační vazba a vytvoření komplexu. Příkladem spojovacích činidel (tj. linkeru Y v generickém vzorci), která vytvoří kovalentní vazby mezí interferonovou a imunoglobulinovou částí patří organické sloučeniny jako např. thioestery, karbodiimidy, sukcinimidestery, diisokyanáty jako je tolylen-2,6-diisokyanát, glutaraldehydy, diazobenzeny a hexamethylen20 diaminy jako je např. bis-(p-díazoniumbenzoyl)-ethylendiamin, bifunkční deriváty imidoesterů jako je dimethyladipimidát, a biaktivní sloučeniny fluoru jako je l,5-difluoro-2,4-ďinitrobenzen. Tento výčet není samozřejmě vyčerpávajícím seznamem různých tříd chemických vazebných činidel v oboru známých. Mnohá z nich jsou také komerčně dostupná jako např. N-sukcinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionát (SPDP), hydrochlorid l-ethyl-3-(3-dimethyl-aminopropyl)25 karbodiimidu (EDC); 4-sukcinimidyloxykarbonyl-alfa-methyl-alfa-(2-pyridyldithio)-toluen (SMPT: Pierce Chem. Co., katalog, č. 21558G).
IV. Využití vynálezu
Fúzní proteiny podle vynálezu se mohou využít ve farmaceutických přípravcích tam, kde je potřeba užit léčení interferonem. Tyto molekuly mají výhody fúzních proteinů, zejména fůzních proteinů s Ig, jde zejména o změněnou farmakokinetiku a farmakodynamiku, která vede k prodlouženému biologickému poločasu a prodloužené době setrvání v cévním systému. Kromě toho zvláště výhodné proteiny glykosylovaného interferonu-beta-1 a, ačkoliv jsou strukturně podobné interferonu-beta-lb, mají mnohonásobně vyšší biologickou aktivitu než neglykosylovaný interferon-beta-lb (viz Runkel et al., 1998, Pharm. Res. 15: 641-649).
Produkty podle vynálezu byly shledány užitečnými pro udržení biologického poločasu terapeutického interferonu-beta-1 a, a mohou být pro terapeutické podávání upraveny např. rozpuštěním ve vodě nebo v jiném vhodném kapalném médiu, podávání se provádí parenterálním nebo perorálním způsobem nebo ve formě aerosolu. Pro perorální podávání mohou být připraveny jemné koloidní suspenze pro dosažení depotního účinku pří parenterálním podávání, nebo při perorálním podávání, zatímco aerosolové přípravky jsou povahou kapalné přípravky nebo ve formě suchého prášku. Fúze interferonu-beta-1 a podle předkládaného vynálezu by měly mít dobrou stabilitu při skladování v suchém lyofilizovaném stavu nebo jako kapalné přípravky.
Terapeutické proteiny mohou být užity k profylaxi podle předkládaného vynálezu nebo k léčení jakékoliv nemoci nebo poruchy, pro které je účinnou složkou interferon-beta-la. Kromě toho fúzní proteiny podle vynálezu se mohou užít pro diagnózu složek, stavů nebo nemocí v biologic50 kých systémech nebo vzorcích, stejně tak jako pro diagnostiku v jiných než fyziologických systémech.
Při terapeutickém využití předkládaný vynález předpokládá využití k léčení zvířete, která buďto již trpí, nebo je latentně náchylné k onemocnění a vyžaduje tudíž takové léčení, které spočívá v tom, že se zvířeti podává účinné množství fúzního proteinu podle vynálezu, které je terapeutic-16ky účinné pro danou nemoc nebo poruchu. K subjektům, které budou léčeny fuzními proteiny podle vynálezu patří zvířata a především člověk. V závislosti na nemoci nebo stavu, které mají být léčeny, zvířeti se podává fuzní protein interferonu-beta-la podle vynálezu v jakékoliv terapeuticky účinné a bezpečné dávce, kterou odborník snadno stanoví bez nutnosti nadměrného experimentování. Vzhledem k mezidruhové bariéře pro interferony typu I je nezbytné připravit fuzní proteiny interferonu-beta-la podle vynálezu vždy s interferony zodpovídajícího biologického druhu.
Antiproliferační buněčná aktivita interferonu-beta-la je dobře známa. Konkrétně některé fuze io interferonu-beta-la popsané v předkládané přihlášce jsou užitečné k léčení nádorových a rakovinných onemocnění, jako je např. osteogenní sarkom, lymfom, akutní lymfocytámí leukémie, karcinom prsu, melanom a nasofaryngeální karcinom, a také autoimunitních onemocnění jako je např. fibróza, lupus a roztroušená skleróza mozkomíšní. Také se dá očekávat, že antivirová aktivita, kterou projevují fuzní proteiny podle vynálezu, se využije k léčení virových onemocnění, jak je např. infekce ECM, chřipka a další infekce respiračního traktu, hepatitida a rabies. Také se dá očekávat, že imunomodulační aktivita, kterou projevují fuzní proteiny podle vynálezu, se využije k léčení autoimunitních a zánčtlivých onemocnění jako je např. fibróza a roztroušená skleróza mozkomíšní. Schopnost interferonu-beta-la inhibovat vytváření nových krevních cév (tj. inhibovat angiogenezi a neovaskularizaci) předurčuje fuzní proteiny podle vynálezu k použití při léčení angiogenních nemocí jako je např. diabetická retinopatie, retinopatie předčasně narozených, makulámí degenerace, odvržení štěpu rohovky, neovaskulámí glaukom, retrolentální fibroplázie, rubeóza a Osler-Weberův syndrom. Kromě toho antiendoteliální aktivita interferonu je již nějakou dobu známa a jeden z možných mechanismů působení interferonu může být narušení aktivity endotelových buněk tím, že inhibuje produkci nebo aktivitu angiogenních faktorů produkovaných nádorovými buňkami. Některé cévní nádory, jako např. hemangiomy, jsou zvláště citlivé k léčení interferonem. Léčení interferonem alfa je zatím jediným doloženým způsobem léčení této nemoci. Lze očekávat, že léčení fuzními proteiny interferonu-beta-la podle vynálezu poskytne značný farmaceutický prospěch ve smyslu zlepšené farmakokinetiky a farmakodynamiky, neboť konjugáty zůstávají v cévách po delší dobu než nekonjugované inter30 ferony, což umožňuje mnohem účinnější terapii při použití konjugátů jako antiangiogenního léčiva (viz příklad 9).
Fúze polymer-ínterferon-beta-la podle vynálezu mohou být podávány jako takové a nebo ve formě farmaceuticky přijatelných esterů, solí nebo jiných fyziologicky aktivních derivátů.
V těchto farmaceutických přípravcích je interferon-beta-la výhodně užíván společně s jedním nebo více farmaceuticky přijatelnými nosiči, a volitelně jakýmikoliv dalšími terapeutickými složkami. Nosič musí být farmaceuticky přijatelný v tom smyslu, že musí být kompatibilní s ostatními složkami v přípravku a nesmí být nadměrně škodlivý pro příjemce. Přípravek interferonubeta-la se podává v množství účinném pro dosažení požadovaného farmakologického účinku, jak již bylo popsáno výše, a v takových dílčích množstvích, aby bylo dosaženo požadované denní dávky.
K vhodným lékovým formám patří formy pro parenterální i jiné podávání, k vhodným specifickým způsobům podávání patří např. podávání perorální, rektální, bukální, topické, nazální, oftal45 mické, subkutánní, intramuskulámí, intravenózní, transdermální, intrathekální, intraartikulámí, intraarteriální, subarachnoidální, bronchiální, lymfatické, vaginální a intrauterinní. Výhodné jsou lékové formy pro perorální, nazální a parenterální podávání.
Pokud je interferon-beta-la užit v přípravku, který obsahuje tekutý roztok, přípravek se výhodně podává perorálně nebo parenterálně. Pokud je interferon-beta-la užit v přípravku, který je ve formě tekuté suspenze nebo suchého prášku formulován společně s biologicky kompatibilním nosičem, pak se může výhodně podávat perorálně, rektálně nebo bronchiálně.
Pokud je interferon-beta-la užit v přípravku přímo jako tuhá látka ve formě prášku, výhodně se může podávat perorálně. Alternativně se může podávat nazálně nebo bronchiálně, pomocí nebu- 17lizace prášku v nosičovém plynu, kdy se vytváří disperze prášku v plynu, kterou pacient vdechuje, a sice užitím vhodného nebulizačního zařízení.
Přípravky obsahující fúzní proteiny podle předkládaného vynálezu se výhodně formulují do jednotkových lékových forem, a sice jakýmikoliv metodami, které jsou odborníkům ve farmacii známy. Tyto metody obecně obsahují krok, kdy se účinná složka smísí s nosičem a případně dalšími pomocnými složkami. Typicky se přípravky připravují uniformním a dokonalým smísením účinné složky (čí více účinných složek) s kapalným nosičem, jemně rozmělněným tuhým nosičem nebo oběma, a pak se produkt podle potřeby formuluje do požadovaných lékových forem.
Přípravky podle vynálezu vhodné pro perorální podávání jsou v podobě diskrétních jednotek jako jsou např, tobolky, oplatky, tablety nebo pastilky, kdy každá taková forma obsahuje předem stanovené množství účinné složky v podobě prášku nebo granulátu, nebo v tekuté formě, vodné nebo bezvodé,jako je např. sirup, elixír, emulze nebo pěna.
Tablety se připravují lisováním nebo odléváním, případě s jednou nebo více pomocnými složkami. Lisované tablety se připravují lisováním na vhodných zařízeních, kde se užívá účinná složka ve volně sypké formě jako je prášek nebo granulát, která se případně mísí s pojidly, rozvoíňující20 mi činidly, lubrikanty a inertními ředidly, povrchově aktivními činidly a uvolňovacími činidly, odlévané tablety obsahují směs práškového polymerového konjugátu s vhodným nosičem a připravují se odléváním pomocí vhodného zařízení.
Sirup se připraví přidáním účinné látky do koncentrovaného vodného roztoku cukru, např. sacha25 rózy, ke kterému se přidají ještě další pomocné přísady. K takovým přísadám patří příchutě, konzervační činidla, činidla zpomalující rozpustnost krystalízaci cukru a činidla zvyšující rozpustnost ostatních složek jako jsou např. polyhydroxyalkoholy, jako je glycerol nebo sorbitol.
Lékové formy vhodné pro parenterální podávání výhodně obsahují sterilní vodné přípravky aktivního proteinu, které jsou výhodně isotonické s krví příjemce (např. fyziologický solný roztok). Takové přípravky obsahují také suspendující činidla a zahušťovadla nebo jiné mikročásticové systémy, které jsou určeny k zacílení sloučeniny na krevní složky nebo do jednoho či více orgánů. Přípravky jsou buďto vjednodávkové, nebo vícedávkové lékové formě.
Přípravky ve formě nosního spreje obsahují puntíkované vodné roztoky aktivního konjugátu s konzervačními a isotonickými činidly. Tyto přípravky mají obvykle pH a tonicítu upravené tak, aby byly kompatibilní s nosní slíznicí.
Lékové formy pro rektální podávání jsou obvykle čípky, kde vhodným nosičem je kakaové más40 lo, hydrogenované tuky nebo hydrogenované mastné karboxylové kyseliny.
Oftalmické přípravky jako např. oční kapky jsou připraveny podobně jako nosní spreje, s tím rozdílem že pH a tonicita jsou nastaveny kompatibilně pro oko.
Topické přípravky obsahují konjugáty podle vynálezu rozpuštěné nebo suspendované v jednom nebo více médiích, jako je např. minerální olej, vazelína, polyhydroxyalkoholy nebo jiná farmaceutická báze pro topické přípravky.
Kromě výše uvedených složek mohou přípravky podle vynálezu ještě dále obsahovat jednu nebo více doplňkových složek jako jsou např. ředidla, pufry, příchutě, rozvolňující činidla, povrchově aktivní látky, zahušťovadla, lubrikanty, konzervační látky (včetně antíoxidantů) a další.
Tudíž předkládaný vynález poskytuje fuzní proteiny vhodné pro /n vitro stabilizaci interferonubeta-la v roztoku, což je příklad výhodné, jiné než terapeutické aplikace vynálezu. Fúzní protei55 ny mohou být také využity ke zvýšení tepelné stability a odolnosti proti enzymatické degradaci
-18interferonu-beta-la a poskytují tak způsob, jak zvýšit dobu skladovatelnosti, stabilitu při teplotě místnosti a trvanlivost reagencií a souprav užívaných pro výzkum.
Následující příklady slouží k ilustraci vynálezu a nijak jeho předmět neomezují. Je zřejmé, že 5 zejména in vivo experimenty se zvířaty zde popsané mohou být provedeny různými způsoby, takže jsou možné různé modifikace a variace základních metod zde popsaných. Tak např. v příkladu 7 může odborník užít jiný neopterinový test nebo může změnit druh či počet primátů v pokusu. Všechny takové modifikace a variace spadají do rozsahu předkládaného vynálezu.
Příklady provedení vynálezu
Příklad l
Studie struktury/aktivity lidského interferonu-beta-la s použitím substitučních mutací alanin/serin: analýza vazebných míst receptoru a funkčních domén
Přehled
Byla prováděna obsáhlá mutační analýza lidského interferonu-beta-la (IFN-beta-la) s cílem mapovat zbytky nutné pro aktivitu a vazbu receptoru. Dostupnost trojrozměrné (3-D) krystalové struktury lidského IFN-beta (Karpusas, M. etal., 1977, Proč. Nati. Acad. Sci. USA,94, 11 813-11 818) umožnila původcům identifikovat substituce alaninu (nebo šeřinu) zbytků vysta25 vených rozpouštědlu dostupných pro receptorové interakce a ponechat aminokyseliny zapojené do intramolekulámích vazeb. Byl navržen panel 15 slaninových substitucí, které nahradily 2 až 8 zbytků v průběhu rozdílných oblastí každého helixu (A, B, C, D) a smyček (AB, CD2, DE). Pro účely afinitní purifíkace byla začleněna amino-koncová histidinová značka obsahující 6 histidinových zbytků, jakož i enterokinázová spojovací sekvence (linker) pro odstranění amino30 koncové extenze. Výsledné interferony jsou nazývány jako „interferon(IFN)-beta se značkou his“ nebo „His-interferon-beta“ nebo „His6-interferon-beta“ apod.
Byly konstruovány různé mutace expresních plazmidů IFN-beta se značkou his s použitím genového konstruktu s divokým typem IFN-beta jako templátem pro mutagenezi. Strategie muta35 geneze vyžadovala nejdříve vnesení štěpného místa jedinečného restrikčního enzymu prostřednictvím genu IFN -beta se značkou his, a pak nahrazení přesných sekvencí DNA mezi vybranými restrikčními místy syntetickými oligonukleotidovými duplexy, které kódovaly slaninové (nebo serinové) substituční mutace. Nakonec byly mutované geny IFN subklonovány do plazmidu, který řídil expresi savčích buněk v buněčné linii 293 z lidských ledvin.
Funkční následky těchto mutací byly hodnoceny antivirovými a antiproliferačními testy. Byl vyvinut neradioaktivní vazebný test pro IFN, který analyzoval vazbu těchto mutant k povrchovému receptoru („IFNAR1/2 komplex) buněk Daudi lidského Burkittova lymfomu. Navíc byl vyvinut test pro mapování povrchů při interakcích mezi mutanty his-IFN-beta a IFNAR2, který používal fúzní protein IFNAR2/Fc, složený z extracelulámí domény proteinu IFNAR2 receptoru IFN fúzované ke kloubové doméně, doménám CH2 a CH3 lidského IgGl.
1. Vytvoření genu interferonu-beta jako templátu pro mutagenezi so Při strategii původců pro tvoření mutant IFN-beta substituované alaninem (nebo serinem) nejdříve vznikl modifikovaný gen IFN-beta, který kódoval protein divokého typu, ale který nesl štěpná místa jedinečných restrikčních enzymů v genu. Jedinečná místa byla použita pro záměnu sekvencí divokého typu syntetickými oligonukleotidovými duplexy, které kódovaly mutované kodony. Aby se získala expresní kazeta lidského IFN-beta-la vhodná pro tvorbu mutovaných genů, byla cDNA IFN-beta (GenBank přístupové č. E00029) amplifikována pomocí PCR. Bylo
-19DO nezbytné počáteční klonování genu IFN-beta do plazmidu pMJB107, derivátu pACYC184, (viz Rose, et. al., 1988, Nucleic Acids Res., 16(1), 355), aby se mohla provádět místně cílená mutageneze genu v plazmidu, kterému chyběla specifická restrikční místa vytvářená během mutageneze.
Primery pro PCR použité pro subklonování kódujících sekvencí genu lidského IFN-beta také umožnily původcům zavést enterokinázovou spojovací sekvenci v protisměru a v rámci s genem IFN-beta:
5' PCR primer:
5' - TTCTCCGGAGACGATGATGACAAGATGAGCTACAACTTGCTTGGATTCCTACAAAGAAGC - 3' (sekvence id, č. 9: „ΒΕΓ-021), a 3* PCR primer:
5'-GCCGCTCGAGTTATCAGTTTCGGAGGTAACCTGTAAGTC-3' io (sekvence id. č. 10 : „BET - 022“) a hraniční oblasti míst restrikčních enzymů (BspEI a Xhol) užitečné pro klonování do míst plazmidu pMJB107. Výsledná DNA byla nazvána PCR fragment A.
Výkonná signální sekvence z lidské adhezivní molekuly cévní buňky-1 (VCAM-1) a značka („tag“) šesti histidinů byly vneseny do konečného konstruktu z druhého fragmentu DNA vytvořeného z pDSW247 (fragment B). Plazmid pDSW247 je derivát pCEP4 (Invitrogen, Carlsbad, CA), ze kterého byl odstraněn gen EBNA-1 a který nese signální sekvenci VCAM-1 (VCAMss) fúzovanou v protisměru a v rámci se značkou šesti histidinů. Primery PCR, které byly použity pro vytvoření kazetové skupiny VCAMss-1/histidinová značka, byly K.1D-369 (5 1 PCR primer):
5‘-AGCTTCCGGGGGCCATCATCATCATCATCATAGCT-31 (sekvence id. S.: 11) a KID-421 (31 PCR primer);
5'-CCGGAGCTATGATGATGATGATGATGGCCCCCGGA-3' (sekvence id. č.: 12) začleňující hraniční štěpná místa restrikčních enzymů (Notl a BspEI), která umožnila excizi fragmentu B DNA.
Pro vytvoření plazmidového vektoru, který nesl signální sekvenci VCAM-1, značku his a gen interferon-beta, prováděli původci trojcestnou ligaci s použitím DNA fragmentů purifikovaných přes gel z plazmidového vektoru pMJB107 (štěpeného Notl a Xhol), PCR fragmentu A (štěpeného BspEI a Xhol) a fragmentu B (štěpeného Notl a BspEI). Ligovaný plazmid byl použit pro transformaci buněk E. coli buď JA221, nebo XLl-Blue a byly vybírány kolonie rezistentní na ampicilin a testovány na výskyt inzertů analýzou restrikčních map. Byla izolována DNA pomocí Maxiprepu a sekvence inzertu byla ověřena sekvenováním DNA. Výsledný konstrukt byl nazván pCMG260.
2. Příprava mutant lidského interferonu-beta v pCMG260 substitucí alaninu
Plazmid pCMG260 byl použit jako templát pro několikrát opakovanou mutagenezi (U.S.E. Sítě
Dírected Mutagenesis Kit (Boehringer-Mannheim), která zavedla jedinečná restrikční štěpná místa do pozic v průběhu kódující sekvence proteinu IFN-beta, ale nezměnila výslednou sekvenci proteinu. Mutované plazmidy byly použity pro transformaci buď JA221, nebo XLl-Blue kmene E. coli a rekombinantní kolonie byly vybírány podle rezistence na chloramfenikol. Kolo-20nie rezistentní na chloramfenikol byly dále testovány na výskyt požadovaného místa jedinečného restrikčního enzymu pomocí analýzy restrikčních map DNA. Výsledný plazmid IFN-beta, pCMG275.8, obsahoval úplnou sadu jedinečných štěpných míst restrikčních enzymů a DNA sekvence genu byla ověřena. Kompletní sekvence DNA modifikovaného genu interferon-beta se značkou his, společně s kódující sekvencí proteinu divokého typu, jsou uvedeny na obrázku 1.
Kompletní soubor alaninových substitučních mutací je uveden v tabulce I (další stránka). Názvy mutant specifikují strukturální oblasti (helixy a smyčky), do kterých byly vneseny mutace. Panel veškerých mutací alaninových (serinových) substitucí má za následek mutace 65 až 165 aminoio kyselin lidského IFN-beta.
Panel mutant byl vytvořen z pCMG275.8 nahrazením segmentů DNA mezi jedinečnými restrikčními místy syntetickými oligonukleotidovými duplexy, které nesly genetickou kódující informaci uvedenou v tabulce 2 (viz níže). Aby se vytvořily plazmidy s různými alaninovými substi15 tučními mutantami, byly spolu ligovány vektor pCMG275.8 purifikovaný přes gel (štěpený příslušným restrikčním enzymem, jak uvedeno na seznamu dále v textu, pro každou strukturální oblast IFN-beta) a oligonukleotidové duplexy (kódující sekvence vláken jsou uvedeny v tabulce 2). Ligační směsi byly použity pro transformaci JA221 kmene £. coli a rekombinantní kolonie byly vybírány podle rezistence na arapicilin. Kolonie rezistentní na ampicilin byly testovány na výskyt inzertů s mutacemi prostřednictvím screeningu na příslušná místa restrikčních enzymů. Pro dvě mutanty (A2 a CD2) strategie klonování vyžadovala použití dvou duplexů syntetických oligonukleotidů (uvedených v tabulce 2), které nesly komplementární přesahující konce, aby bylo možné ligovat je k sobě navzájem, a ke kostře vektoru IFN-beta v trojcestné ligaci. Následující seznam ukazuje místa, která byla použita ke klonování mutovaných oligonukleotidů z tabulky 2.
Schéma klonování (pododdíl B) ukazuje pozice těchto jedinečných míst v genu interferonu beta.
A helix Smyčka AB
B helix C helix
Smyčka CD2 D helix Smyčka DE E helix
BspEI až MunI nebo BglII až Pstl MunI až Pstl nebo MunI až BsaHI BspHI až Bsal nebo BsaHI až Bsal Bsal až Xbal
Xbal až BspHI nebo Xbal až DralII BspHI až DralII
BspHI až Pvuí Pvul až BstEII
-21CZ JUU/OZ »0
Tabulka 1
Pozice alaninových substitučních mutací HUIFN-p
10 20 10 40 S0
IFN-S MSYJILLGFLQRSSNFQCQKLLWQIJSGRLBYCIiKDRMNFDIPEEIKQLQQFQKE
Al -A-AA--A--A-----------------------------------------A2 --------------AA-AA--AA-----------------------------AB1 ---------------------------AAA-AA-------------------AB2 ..................................-AA-A--A---........
AB3 -----------------------.-------------------- -AAAAA-AAA |__Jwlix A_) j__AB loop_
Í0 70 to oo 100
IFN-β DAALTIYEMWNlFAiraQDSSSTGWNETTVENLLANVYHQINlíLKTVLBEKLEKB
B1 ..........A--AS----------------------------------------B2 -........-......-AAA.............-......................
Cl ...........................AS--AA--S....................
C2 --------------------------------------A---A--AA--------CDl -- — ---------------------------------------------AA--AAA |_helix B_| |_( j_CD loop
110 110 130 140 150 100
IFN-S DFTRGKLMSSUiLKRYYGRILHYLKAKEYSHCAWTIVRVElLRNFYFXiniLTQYLRN
CD2 AA-A--A--A----------------------------------------------D ------------------A-AA--A-------------------------------DS1 ......-................—-AA.............................
DE2 -----------------------------AA..........................
B .....................................A--A--A--A-------CD loop_| |._helix D I |_helix B_[
K tab. 1: Řádek označený IFN-β ukazuje divoký typ sekvence lidského lFN-β. Alaninové nebo serinové substituce zbytků IFN-β jsou ukázány pro každou mutantu a čárky, pod relevantními oblastmi, označují sekvence divokého typu. Struktury helixů a smyček jsou uvedeny jako plné čáry pod mutantami. Smyčka DE překlenuje mezeru mezi helixy D a E. Byly vytvořeny dvě další alaninové substituční mutanty (H93A, H97A a H121A) a byly analyzovány v antivirových io testech pro stanovení účinku mutací těchto histidinů, které tvoří cheláty se zinkem v krystalové struktuře dimeru. Obě tyto mutanty si podržely plnou aktivitu divokého typu v antivirových testech, což svědčí pro to, že zinkem zprostředkovaná tvorba dimeru není důležitá pro aktivitu IFNp.
-22Tabulka 2
AI sekv. id,
Č.13
BET-053
CCGGAGACGATGATGACAAGATGGCTTACGCCGCTCTTGGAGCCCTACAA
GCTTCTAGCAATTTTCAGTGTCAGAAGCTCCTGTGGC
A2 sekv. id.
e.i4
BET-039
GATCTAGCAATGCTGCCTGTGCTGCCCTCCTGGCTGCCTTGAATGGGAGG
CTTGAATACT
AB1
AB2
AB3
Bl
B2
Cl
C2
CD1 sekv. id. Ě .15 BET-041 sekv. id
Č.16
BET-080 sekv. id. č.17 BET-082 sekv. id.
e.i8
BET-084
GCCTCAAGGACAGGATGAACTTTGACATCCCTGAGGAGATTAAGCAGCTG
CA
AATTGAATGGGAGGGCTGO«3CTTGCGCTGCAGACAGGATGAACTTTGAC
ATCCCTGAGGAGATTAAGCAGCTGCA
AATTGAATGGGAGGCTTGAATACTGCCTCAAGGACAGGGCTGCATTTGCT
ATCCCTGCAGAGATTAAGCAGCTGCA
AATTGAATGGGAGGCTTGAATACTGCCTCAAGGACAGGATGAACTTTGAC
A sekv. id. TCCCTGAGGAGATTGCTGCAGCTGCAGCTTTCGCTGCAGCTGA fi.19
BET -08fi sekv. id
e.2o
BET-110 sekv. id. fi.2l BET-112 sekv. id. £.22 BET-114 sekv. id. δ.23 BET-092
CGCCGCGTTGACCATCTATGAGATGCTCGCTAACATCGCTAGCATTTTCA
GACAAGATTCATCTAGCACTGGCTGGAA
CGCCGCATTGACCATCTATGAGATGCTCCAGAACATCTTTGCTATTTTCG
CTGCAGCTTCATCTAGCACTGGCTGGAA
GGAATGCTTCAATTGTTGCTGCACTCCTGAGCAATGTCTATCATCAGATA AACCATC TGAAGACAGTTCTAG
GGAATGAGACCATTGTTGAGAACCTCCTGGCTAATGTCGCTCATCAGATA
GCACATCTGGCTGCAGTTCTAG sekv. id. CTAGCTGCAAAACTGGCTGCAGCTGATTTCACCAGGGGAAAACT fi.24
BET-094
-23CZ. JUV/OZ tJO
CD2 sekv. id. č.25 BET-096 CTAGAAGAAAAACTGGAGAAAGAAGCAGCTACCGCTGGAAAAGCAATGA GCGCGCTGCACCTGAAAAGA
sekv, id. Č.26 BET-106 tattatgggaggattctgcattacctgaaggccaaggagtactcacac TGT
Dl sekv. id. e.27 BET-108 CATGAGCAGTCTGCACCTGAAAAGATATTATGGGGCAATTGCTGCATAC ctggcagccaaggagtactcacactgt
DE1 sekv. id. č.28 BET-116 catgagcagtctgcacctgaaaagatattatgggaggattctgcatta cctgaaggccgctgcatactcacactgtgcctggacgat
DE2 sekv. id. č.29 BET-11B catgagcagtctgcacctgaaaagatattatgggaggattctgcatta cctgaaggcaaaggagtacgctgcatgtgcctggacgat
El sekv. id. č.30 BET-104 CGTCAGAGCTGAAATCCTAGCAAACTTTGCATTCATTGCAAGACTTACAG
B. Konstrukce expresních plazmidů EBNA 293
Gen divokého typu a mutovaný gen IFN-beta, fúzované se signální sekvencí VCAM-1, značkou his a enterokinázovou spojovací sekvencí, byly puntíkovány přes gel jako restrikční fragmenty Notl a BamHI o velikosti 761 párů bází. Puntíkované geny byly subklonovány do plazmidového vektoru pDSW247, což je derivát pCEP4 (Invitrogen, Carlsbad, CA), štěpeného Notl a BamHI, jak je ukázáno ve schématu. Plazmid pDSW247 je expresní vektor pro přechodnou expresi proteinu v buňkách EBNA 293 z lidských ledvin (Invitrogen, Carlsbad, CA). Obsahuje cytoio megalovirový promotor časného genu a EBV regulační prvky, které jsou nezbytné pro vysokou hladinu genové exprese v tomto systému, jakož i markéry selekce pro £. coli (rezistence na ampicilin) a pro buňky EBNA 293 (rezistence na hygromycin). Ligované plazmidy byly použity pro transformaci buď JA221, nebo XLl-Blue kmenů E. coli a kolonie rezistentní na ampicilin byly vybírány a testovány na výskyt inzertů analýzou restrikčních map. Byla izolována DNA pomocí maxiprepu a sekvence inzertů byly ověřeny sekvenováním DNA. Pozitivní klony projevující požadované mutované sekvence byly použity pro transfekcí buněk EBNA 293 lidských ledvin takt jak je popsáno níže.
Obecné klonovací a expresní strategie jsou uvedeny na obrázku 12.
C. Exprese a kvantifikace IFN-beta-la alaninových substitučních mutant
Lidské buňky EBNA 293 (Invitrogent Carlsbad, CA, Chittenden, T. 1989, J. Virol, 63, 3016— 3025) byly udržovány jako subkonfluentní kultury v Eagleho médiu modifikovaném dle Dulbec25 ca doplněném 10%fetáIním bovinním sérem, 2mM glutaminem a 250g/ml geneticinu (Life Technologies, Gaithersburg, MD). Expresní plazmidy pDSW247 byly přechodně transfekovány do buněk EBNA 293 s použitím protokolu s lipofektaminem (Gibco/BRL, Life Technologies). Kondicionovaná média byla sklízena 3 až 4 dny po transfekcí, buněčná debris byla odstraněna centrifugací a koncentrace his-IFN-beta byla kvantifikována testem ELISA.
ELISA byla prováděna s použitím polyklonálních králičích protilátek (metodou proteinu A puntíkované IgG, protilátky byly pěstovány proti puntíkovanému lidskému IFN-beta-1 a) pro navázání na 96-jamkové destičky pro testy ELISA a biotinylovaná forma téhož polyklonálního králi-24čího IgG byla použita jako sekundární reagencíe pro umožnění detekce interferonu s použitím křenové peroxidázy konjugované se streptavidinem (HRP: Jackson ImmunoResearch, W. Grove, PA). Pro vytvoření standardních křivek koncentrace byla použita řada ředění interferonu-betala, Kondicionovaná média z EBNA transfektant obsahující his-IFN-beta byla naředěna tak, aby se získaly vzorky s koncentracemi v rozmezí od 10 do 0,3 ng/ml v testu ELISA. Aby byly koncentrace IFN-beta v médiu zjištěné testem ELISA potvrzeny, byla provedena analýza westernovým přenosem. Redukované supematanty z tkáňových kultur a standardy IFN-beta-la byly podrobeny SDA-PAGE na gelech s gradientem 10 až 20% (Novex, San Diego, CA) a přeneseny na membrány PDVF. Imunoreaktivní pásy byly detekovány králičím polyklonálním antisérem io anti-IFN-beta-la (č. 447, Biogen. Inc., druhé antisérum, které bylo pěstováno proti IFN-betala), a pak následovalo ošetření oslím protikráličím IgG konjugovaném s HRP (Jackson ImmunoResearch, W. Grove, PA).
D. Hodnocení mutant interferonu-beta na vazbu k receptorů
Vlastnost vázat receptor mutant interferonu-beta popsaných v části C byla hodnocena s použitím dvou odlišných vazebných testů. Jeden test měřil vazbu mutant interferonu-beta k fúzní mu proteinu, IFNAR2/Fc, zahrnujícímu extracelulámí doménu lidského receptorů IFNAR2 fúzovanou k částí konstantní oblasti lidského IgG. IFNAR2-Fc byl exprimován v buňkách ovarií čínského křečka (CHO) a purifikován prostřednictvím afmitní chromatografíe s protein A Sepharose podle instrukcí výrobce (Pierce Chem. Co., Rockford, IL, kat. č. 20334). Vazba mutant interferonubeta k IFNAR2-Fc byla měřena v testu ELISA. Destičky pro test ELISA byly připraveny přes noc ve 4 °C navázáním 50 μΐ/jamku myší proti—lidské IgGl monoklonální protilátky (CDG5AA9, Biogen, Inc.) v koncentraci 10 g/ml ve vazebném pufru (50mM NaHCOj, 0,2mM MgCl2,
0,2mM CaCL, pH 9,6) na 96-jamkové destičky s plochým dnem. Destičky byly dvakrát promyty sPBS obsahujícím 0,05% Tween-20, a blokovány s0,5% netučným sušeným mlékem v PBS 1 hodinu při teplotě místnosti. Po dvou dalších promytích bylo do každé jamky přidáno 50 μΐ 1 g/ml IFNAR2-Fc v 0,5% mléce v PBS obsahujícím 0,05% Tween-20 a inkubováno 1 hodinu při teplotě místnosti a destičky pak byly ještě dvakrát promyty. Vazba mutant interferonu-beta k IFNAR2-Fc byla měřena přidáním 50 μΐ/jamku mutanty interferonu-beta v kondicionovaném médiu, sériově ředěné Eagleho médiem modifikovaným dle Dulbecca (DMEM) doplněném 10% fetálním bovinním sérem, a inkubací 2 hodiny ve 4 °C. Ředění mutanty interferonu-beta se typicky pohybovalo od přibližně 1 M dolů k 10 pM. Po promytí byl interferon-beta navázaný na destičky detekován přidáním 50 μΐ/jamku koktejlu skládajícího se z 1:1 000 ředěné králičí poly35 klonální anti-interferonové protilátky (č.447) plus oslího proti—králičího IgG značeného křenovou peroxidázou (HRP) (Jackson ImmunoResearch), a probíhala inkubace 15 minut ve 4 °C. Po dvou promytích byl přidán HRP substrát a destička byla inkubována ve 4 °C před odečtem na čtecím zařízení pro destičky ELISA při absorbanci 450 nm. Data byla vynesena jako absorbance proti koncentraci mutant interferonu-beta a afinita vazby mutanty interferonu-beta k IFNAR240 Fc byla určována vynesením dat do jednoduché hyperbolické vazebné rovnice. Výsledky z těchto analýz jsou ukázány na obrázku 3, na kterém je vazebná afinita každé mutanty, zjišťovaná alespoň ve třech nezávislých pokusech, vyjádřena jako procento afinity měřené pro His<}-divoký typ Interferonu-beta-1 a. Druhý test vazby receptorů byl použit pro měření afinity, se kterou se mutanty interferonu-beta vážou na buňky Daudi exprimující oba receptorové řetězce, IFNAR1 a IFNAR2, které dohromady obsahují receptor pro interferon-beta. Tento test založený na FACS používal blokující monoklonální protilátku namířenou proti extracelulámí doméně IFNAR1, EA12 (Biogen, Inc.) pro odlišení neobsazeného (volného receptorů od receptorů, na který byl navázán interferon-beta. Buňky Daudi (20 μΐ při 2,5 x 107 buněk/ml) byly naneseny na 96jamkové destičky pro test ELISA se dnem ve tvaru v a inkubovány 1 hodinu ve 4 °C s různými kon50 centracemi mutanty interferonu-beta (20 μΐ v pufru FACS, 5% FBS, 0,1% NaN3 v PBS). Žádoucí sériová ředění mutant interferonu-beta se pohybovala v rozmezí od 0,5 M do 0,5 pM. Ke každé jamce bylo přidáno 100 ng biotinylované myší antí-IFNARl monoklonální protilátky EA12 (10 μΐ) a destičky byly inkubovány další dvě minuty při teplotě místnosti před dvojím promytím pufrem FACS (4 °C). Pak byly buňky inkubovány 30 minut ve 4 °C s 50 μΙ/jamku 1:200 naředě-25CZ 300762 B6 ného streptavidinu konjugovaného s R-fykoerythrinem (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA), dvakrát promyty pufrem FACS, resuspendovány ve 300 μΙ pufru FACS obsahujícím 0,5% paraformaldehyd a přeneseny do polystyrénových zkumavek 12x75 (Falcon 2052). Pak byly vzorky analyzovány průtokovou cytometrií na přístroji FACScan (Becton Dickinson). Data byla s vynesena do grafu jako průměrná intenzita fluorescence kanálu (MFCI) proti koncentraci mutanty interferonu-beta, vazebné afinity byly definovány jako koncentrace mutanty interferonu-beta poskytující 50% inhibici barvení protilátky. Každá mutanta byla testována několikanásobně.
Obrázek 2 ukazuje vazebnou afinitu k receptoru pro každou mutantu interferonu-beta, zjištěnou touto metodou, vyjádřenou jako procento afinity měřené pro His6-divoký typ Interferonu-betaio 1 a v každém pokusu.
E. Hodnocení funkce mutant interferonu-beta
Mutanty interferonu-beta byly také testovány na funkční aktivitu s použitím in vitro testů pro ís antivirovou aktivitu a na schopnost interferonu-beta inhibovat buněčnou proliferaci. Pro každou mutantu byly prováděny minimálně tři antivirové testy, každý v trojím opakování. His6-divoký typ Interferonu-beta-la byl do každého pokusu zahrnut jako reference. Antivirové testy byly prováděny ošetřením buněk A549 z lidského plicního karcinomu (ATCC CCL 185) přes noc dvojkovým sériovým ředěním mutant interferonu-beta v koncentracích, které překlenovaly roz20 sah mezi plnou antivirovou ochranou a žádnou ochranou před usmrcením buněk virem. Následující den byly buňky stimulovány pod dobu dvou dnů virem encefalomyokarditidy (ECMV) v ředění, které mělo za následek úplnou smrt buněk při chybění interferonu. Destičky pak byly vyvíjeny s metabolickým barvivém MTT (2,3-bis[2-methoxy-4-nitro-5-sulfo-fenyl]-2H-tetrazolium-5-karboxyanilid) (M-56551 Sigma, St. Louis, MO). Zásobní roztok MTT byl připraven v koncentraci 5 mg/ml v PBS a sterilizován filtrací a 50 μΐ tohoto roztoku bylo naředěno do tkáňových kultur (100 μΐ na jamku). Po inkubaci při teplotě místnosti po dobu 30 až 60 minut byl roztok MTT/médium odstraněn, buňky byly promyty se 100 μΐ PBS a nakonec byla metabolizovaná barva solubilizována ve 100 μΐ 1,2N kyseliny chlorovodíkové v 90% isopropanolu. Životaschopné buňky (jak prokázáno přítomností barviva) byly kvantifikovány při absorbanci ve
450 nm. Data byla analyzována vynesením do grafu absorbance proti koncentraci mutanty interferonu-beta a aktivita každé mutanty byla definována jako koncentrace, ve které bylo usmrceno 50 % buněk. Obrázek 5 ukazuje aktivitu každé mutanty vyjádřenou jako procento aktivity měřené pro divoký typ Interferonu-beta-la se značkou his v každém pokusu.
U mutant interferonu-beta byla také hodnocena funkce v antiproliferačním testu. Buňky Daudi lidského Burkittova lymfomu (ATCC ě. CCL 213) byly vysety v koncentraci 2 x 105 buněk/ml in RPMI 1620 doplněném 10% definovaným fetálním telecím sérem (Hyclone, Logan, Utah), a 2mM L-glutaminem. Každá jamka také obsahovala danou koncentraci mutanty interferonubeta v konečném celkovém objemu 100 μΐ média na jamku, použité koncentrace interferonu-beta byly vybrány tak, aby překlenuly rozsah od maximální inhibice proliferace Daudi buněk k žádné inhibici (tj. plná proliferace). Každá koncentrace testované mutanty interferonu-beta byla použita v duplikátech a ve všech pokusech byla zařazena série neošetřených buněk v duplikátech. Buňky byly inkubovány dva dny ve 37 °C, v inkubátorech s 5% CO2, a potom byl do každé jamky přidán 1 Ci thymidinu s tritiem ((methyl-3H)thymidin, Amersham TRK758) v 50 μΐ média a inku45 bován další 4 hodiny. Buňky byly sklízeny s použitím přístroje LKB pro sklízení buněk z destiček a byla měřena inkorporace thymidinu s tritiem při použití čtecího zařízení pro destičky LKB beta. Duplikáty experimentálních hodnot byly zprůměměny a určeny standardní odchylky. Data byla vynesena do grafu jako průměrné počty za minutu proti koncentraci mutanty interferonubeta a aktivita každé mutanty byla definována jako koncentrace požadovaná poskytnout 50 % maximální pozorované inhibice růstu. Pro každou mutantu byly prováděny několikanásobné testy. Obrázek 6 ukazuje výsledky vyjádřené jako procento aktivity nalezené pro divoký typ Interferonu-beta-la se značkou his v každém pokusu.
-26VXw ťVVíV£ DU
F. Vlastnosti mutant interferonu-beta
Bylo zjištěno, že divoký typ interferonu-beta-la s histidinovou značkou měl v antivirových a antiproliferaěních testech aktivitu, která byla přibližně 3krát nižší než odpovídající aktivita nalezená u neznačeného divokého typu Interferonu-beta-la. Protože ze všech mutant interferonu-beta obsahovaly Al-E na svých N-koncích totožnou sekvenci značky his, byla účinky mutací na vlastnosti molekuly určovány srovnáním aktivit těchto mutant v antivirových, antiproliferaěních a vazebných testech s aktivitou pozorovanou pro divoký typ Interferonu-beta-la se značkou his. Při provádění tohoto srovnávání původci předpokládali, že odchylky aktivit mutant Al-E, ve ío srovnání s divokým typem interferonu-beta-la se značkou his, jsou kvalitativně a kvantitativně přibližně stejné, jako účinek, ktety by téže mutanty měly v nepřítomnosti N-koncové značky his. Odpovídající předpoklad pro značené nebo fiúzní konstrukty jiných rozpustných cytokinů je obecně pokládán za platný odborníky pracující s technikou alaninové skenovací mutageneze („alanine scanning mutagenesis“), zejména když in vitro funkční aktivita značeného nebo fuzního kon15 struktu je blízká aktivitě divokého typu cytokinů, jak je tomu v tomto případě (viz například Pearce, K.H. Jr, etal., J. Biol. Chem., 272, 20 595-20 602, 1997, aJones, J.T., etal., J. Biol. Chem. 273,11 667-11 674, 1998).
Data ukázaná na obrázcích 3-6 naznačují tři typy účinku, který byl vyvolán cílenou mutagenezí.
Tento účinek může být výhodný pro vývoj interferonových léčiv za jistých okolností. Tyto tři typy účinku jsou: a) mutanty s vyšší antivirovou aktivitou než je aktivita divokého typu Interferonu-beta-la (např. mutanta Cl), b) mutanty, které projevují aktivitu v obou testech, antivirovém a antiproliferačním, ale u kterých je antiproliferační aktivita disproporčnč nízká vzhledem kantivirové aktivitě ve srovnání sdivokým typem interferonu-beta-la (např. mutanty Cl, D a DE1), a c) funkční antagonisté (např. AI, B2, CD2 a DE1), které vykazují antivirovou aantiproliferační aktivitu, která je disproporčně nízká vzhledem k vazbě receptorů ve srovnání s divokým typem interferonu-beta-la. Je možné pozorovat, že některé mutanty spadají do více než jedné skupiny. Tyto skupiny jsou uvedeny v přehledu níže. I když původci charakterizovali tyto skupiny mutant vzhledem k těmto příkladům uvedeným v seznamu, je nutné si uvědomit, že další mutace v těchto oblastech mohou mít za následek podobný nebo dokonce zvýšený vliv na aktivitu:
a) Mutanta Cl má antivirovou aktivitu, která je přibližně 6 krát větší než aktivita divokého typu Interferonu-beta-la se značkou his. Předpovídá sel že tato mutanta a další stejného typu jsou užitečné pro snížení množství interferonu-beta, které musí být podáváno pro dosažení daného stupně antivirového účinku. Očekává se, že snížení množství podávaného proteinu zredukuje imunogeničnost proteinu a může také snížit vedlejší účinky toxicity, která není založena na mechanismu účinku. Je předpovídáno, že mutace v této skupině jsou výhodné v situacích, kdy terapeutický prospěch podávání interferonu-beta vyplývá z jeho antivirových účinků a kdy anti40 proliferační účinky přispívají k toxicitě nebo nežádoucím vedlejším účinkům.
b) Relativní aktivity (% divokého typu) alaninových substitučních mutant v antivirovém a antiproliferačním testu jsou srovnány na obrázku 7. U většiny mutant (které jsou uvedeny na diagonální čáře) lze pozorovat koordinovaně změněné aktivity (tj. antivirové a antiproliferační aktivity, které se liší o stejný faktor od aktivit divokého typu Interferonu-beta-la se značkou his). Ale několik mutant vykazuje větší odchylky v aktivitě v jednom testu relativně ke druhému, ve srovnání s divokým typem interferonu-beta-la se značkou his, jak je dokázáno posunem od diagonální linie. Tyto tři mutanty jsou uvedeny v tabulce níže. Mutanta Cl vykazuje antivirovou aktivitu, která je ~6 krát větší, než je aktivita divokého typu Interferonu-beta-la se značkou his, ale jeho aktivita v antiproliferačním testu je podobná aktivitě divokého typu. Mutanta C1 má tudíž antivirovou aktivitu, která je zvýšena faktorem 5,2 proti jeho antiproliferační aktivitě, relativně k divokému typu interferonu-beta-la se značkou his. Podobně mutanta D projevuje 65% aktivity divokého typu v antivirovém testu, ale pouze 20 % aktivity divokého typu v antiproliferačním testu, a tudíž má antivirovou aktivitu, která je zvýšena 3,4 krát proti jeho antiproliferační aktivitě ve srovnání s divokým typem. Mutanta DE1 projevuje 26% aktivity divokého typu
-27CZ JIHI76Z B6 v antivirovém testu, ale pouze 8,5 % v antiproliferačním testu, a má tedy antivirovou aktivitu, která je zvýšena 3,0 krát proti jeho antiproliferační aktivitě ve srovnání s divokým typem interferonu-beta-la se značkou his. Když jsou podávány v koncentraci postačující pro dosažení požadovaného stupně antivirové aktivity, ukazují tyto mutanty proteinů podstatně nižší úroveň anti5 proliferační aktivity než protein divokého typu. Předpovídá se, že mutace v této skupině, jako ty ve skupině a), jsou výhodné v situacích, kdy terapeutický prospěch podávání interferonu-beta vyplývá zjeho antivirových účinků a kdy antiproliferační účinky přispívají k toxicitě nebo nežádoucím vedlejším účinkům.
Mutanta Antivirová (AV) aktivita (% divokého typu) Ant iproliferační aktivita (% divokého typu) (AP) AV/AP
Cl 571 109 5,2
D 65 19 Í,4
DE1 26 8,5 3,0
io c) Mutanty s antivirovou a antiproliferační aktivitou, která je nízká vzhledem k vazbě receptoru, ve srovnání s divokým typem interferonu-beta-la se značkou his (viz tabulka níže). Mutanta Al projevuje antivirovou a antiproliferační aktivity, které jsou 2,0 krát a 1,8 krát větší než aktivity pozorované u divokého typu Interferonu-beta-la se značkou his, ale váže se na analogický receptor na buňkách Daudi s afinitou, která je 29 krát větší než u divokého typu. Vazba této is mutanty na receptor IFN-beta je tudíž zvýšena přibližně 15 krát ve srovnání s antivirovou a antiproliferační aktivitou proteinu. Podobně mutanty B21 CD2 a DE1 vykazují zvýšení vazby proti antivirové aktivitě 4,6krát, 4,6krát a 18krát, podle pořadí, a proti antiproliferační aktivitě 3,5krát, 15krát a 54krát. Předpovídá se, že tyto proteiny jsou užitečné jako funkční antagonisté aktivity endogenního IFN-beta, a možná dalších endogenních interferonu typu I, protože mají schopnost vázat a obsadit receptor a navíc vyvolat pouze malou část funkční odpovědi v cílových buňkách, jaká by byla pozorována u divokého typu IFN-beta.
Mutanta Antivirová aktivita (AV) (% wt) Antiproliferační aktivita (AP) (* wt) Vazebná aktivita k buňkám (% hmot.) Vazba/AV Vazba/AP
Al 200 180 2900 15 16
B2 7,1 9,2 33 4,6 3,5
CD2 150 46 690 4,6 15
DE1 26 8,5 460 18 54
G. Vztah muteinu k trojrozměrné struktuře interferonu
Zatímco publikované krystalové struktury neglykosylované formy myšího interferonu-beta (T. Senda, S. Saitoh a Y. Mitsumi„Refined Crystal Structure of Recombinant Murine Interferonat 2,15 Resolution, J. Mol. Biol,, 253, 187-207, 1995) a lidského interferonu alfa—2b (R. Radhakrishnan, L.J. Walter, A. Hrůza, P. Reichert, P.P. Trotta, T.L. Nagabhushan a M.R. Walter, Zinc Mediated Dimer of Human Interferon- 2b Revealed by X-ray Crystallography, Structure, 4,
1 453-1463,1996) poskytly modely pro polypeptidovou kostru lidského interferonu-beta, původci nedávno dořešili strukturu interferonu-beta-la v jeho glykosylovaném stavu (M. Karpusas,
-28M. Nolte, C.B. Benton, W. Meier, W.N. Lipscomb, a S.E Goelz, The Crystal Structure of Human Interferon- at 2,2 Resolution, Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 94,11 813-11 818,1997).
Výsledky mutačních analýz původců mohou být shrnuty vzhledem k trojrozměrné struktuře ínter5 feronu-beta-la (zde neuvedeno). Některé mutace vyvolaly snížení aktivity (2 až 5 krát snížení). Mutované oblasti odpovídaly substitucím uvedeným v tabulkách 1 a 2.
Mutace, které jsou nejvýznamnější, co se týče jejich účinku na funkci, měly za následek dramatické snížení jak aktivity, tak vazby buněčného povrchového receptoru. Mutace v této oblasti (A2 io helix, AB a AB2 smyčky a E helix) odpovídají mutacím ve vazebném místu IFNAR2, protože žádná z těchto mutant nevázala v testech původců IFNAR/Fc.
I když tyto mutace, které byly důležité pro vazbu 1FNAR2, také ovlivnily buněčnou vazbu, vazebné vlastnosti buněčného povrchu jsou také ovlivněny zbytky v dalších oblastech molekuly (Bl helix, C2 helix). Na trojrozměrných modelech (zde neuvedených), které zobrazují působení alaninových substitučních mutant, je možné pozorovat, že N-koncová oblast, C-koncová oblast a glykosylovaná oblast C helixu molekuly IFN-beta-la neleží ve vazebném místě receptoru. Mutace v těchto oblastech nesnížily biologickou aktivitu nebo vazbu buněčného povrchového receptoru.
Příklad 2
Konstrukce plazmidů pro expresi fůzního proteinu interferon-beta-la (IFN-beta/Fc)
Pro vytvoření expresního plazmidu byla použita technologie PCR kódujícího DNA sekvenci lidského IFN-beta fúzovanou kFc části molekuly těžkého řetězce myšího IgG2a. Plazmidový vektor pDSW247 (viz příklad 1) je derivát pCEP4 (Invitrogen, Carlsbad, CA), ze kterého byl odstraněn gen EBNA-1. Tento plazmid byl použit pro konstrukci expresního vektoru použitelné30 ho pro přechodnou expresi proteinu v buňkách EBNA 293 z lidských ledvin (Invitrogen, Carlsbad, CA, Shen, E.S., et al., 1995, Gene, 156,235-239). Byl navržen tak, aby obsahoval signální sekvenci lidské adhezivní molekuly cévní buňky, (VCAM-1) v rámci a v protisměru od sekvence interferonu beta a sekvencí Ig.
Expresní kazeta fůzního proteinu byla sestavena z několika fragmentů DNA. Aby se získal fragment DNA kódující lidský gen IFN-beta, byl použit cDNA subklon lidského IFN-beta (GenBank přístupové č. E00029) jako templát pro PCR s použitím primerů:
1 -GGTGGTCTCACATGAGCTACAACTTGCTTGGATTCCTACAAAGAAGC (sekvence id. fi. 31: BET-025) a
5' -GCCCTCGAGTCGACCTTGTCATCATCGTCGTTTCGGAGGTAACCTGTAAG (sekvence id. č. 32: BET -026), které také obsahovaly Štěpné místo restríkěního enzymu (Bsal) v protisměru od prvního kodonu IFN-beta. 3' PCR primer (sekvence id. Č. 32 BET-026) pro gen IFN-beta eliminoval terminační kodon IFN-beta a inkorporoval jak do rámce enterokinázovou spojovací sekvenci (DDDDK) (sekvence id. č. 62), tak terminální místo restrikčního enzymu (Xhol), použitelné pro subklonování do expresního vektoru. Místo Bsal zavedené v protisměru od kódující sekvence IFN-beta umožnilo původcům ligovat signální sekvenci VCAM-1 do protisměru a v rámci škodující sekvencí genu IFN-beta. Tato signální sekvence VCAM-1 byla také vytvářena pomocí PCR s použitím páru primerů:
-29CZ JUU762 Bb
5'-CAAGCTTGCTAGCGGCCGCGG-3' ](sekvence id. č. 33: BET-023 a 5 '-GGTGGTCTCACATGGCTTGAGAAGCTGC-3'](sekvence id. č. 34:
„BET-024“), které obsahovaly 5' štěpné místo restrikčního enzymu (Notl, pro ligaci do klonovacího místa Notl v pDSW247) a 3' štěpné místo restrikčního enzymu (Bsal, pro ligaci do 5' PCR fragmentu interferonu-beta-1 a). Templát pro PCR byla cDNA lidské adheztvní molekuly cévní buňky, (VCAM-1) (GenBank přístupové číslo XS3051).
Aby byl vytvořen fúzní gen IFN-beta-la/Fc, byly prováděny následující postupy. Fragment myšího IgG2a byl odstraněn zpEAG293 gelovou purifikací DNA fragmentu po štěpení SalI+BamHI. Plazmid pEAG293 je subklon kloubové domény, domén CH2 a CH3 myšího IgG2a io (GenBank přístupové číslo V00798) vBluescrípt IISK+ (Stratagene, LaJolla CA, katalog.
č. 212205). Následující páry příměrů pro PCR:
5'-AGGTSMARCTGCAGSAGTCW-3' (sekvence id. č. 35), kde S=C nebo G, M=A nebo C, R=A nebo G, W=A nebo T, a
5'-CTGAGCTCATtTACCCGGAGTCCGGGAGAAGCTCTT-3' (sekvence id. č. 36) vytvořily hraniční místa Sáli a Notl na 5' a 3' koncích kazety, v příslušném pořadí. Kazeta myší domény IgG2a Fc se liší od sekvence z GenBank v jedné bázi (kodon V369), vytvářející umlčenou mutaci. Z této IgG2a Fc kazety je tudíž exprimován divoký typ proteinu Fc.
DNA fragment obsahující signální sekvenci VCAM-1 fúzovanou ke genu huIFN-beta sC20 koncovou enterokinázovou spojovací sekvencí byl vystřižen z pCMG258 štěpením s Notl až BamHI a purifikován na gelu. Místo Sáli se vyskytovalo na původním plazmidů pDSW247 a je lokalizováno ihned po směru a v rámci s kódující sekvencí IFN-beta. Plazmídový vektor pDSW247 byl připraven purifikací na gelu fragmentu Notl + BamHI (viz příklad 1). Aby se sestavil konečný expresní vektor kódující fůzi IFN-beta-l/IgG2, byla prováděna trojcestná liga25 ce s použitím výše uvedených fragmentů. Tento expresní plazmid byl nazván pCMG261 a obsahoval signální sekvenci VCAM-1 ve fúzi s genem pro zralý lidský IFN-beta, enterokinázovou spojovací sekvenci a Fc doménu myšího IgG2a. Kompletní DNA (sekvence id. č. 1) a proteinová (sekvence id. č. 2) sekvence fúzního proteinu jsou uvedeny na obrázku 2.
Příklad 3
Produkce fúzního proteinu interferonu-beta-1 a v savčích buňkách
Expresní vektor rekombinantního IFN-beta/Fc, pCMG261, byl přechodně transfekován do buněk
EBNA293 z lidských ledvin, aby byla dosažena exprese fúzního proteinu ÍFN-beta-la podle vynálezu. Tento rekombinantní expresní plazmid byl transfekován podle lipofektaminového protokolu (katalog, č. 18324-020, Life Techonologies) do buněk EBNA283 z lidských ledvin podle protokolu výrobce (Life Technologies, Gaithersburg, MD, Hawley-Nelson, P., Ciccarone,
V., Gebeyehu, G. Jessee, J., Felgner, P.L., 1993, Focus 15.73) s použitím 1 až 3 g plazmidové
DNA pro lOOmm misky pro tkáňové kultury pro buňky EBNA293. Den po lipofektaminové transfekci buněk byla média nahrazena růstovým médiem (Eagleho médium modifikované dle Dulbecca, 10% fetální bovinní sérum, 4mM glutamin, 250 g Gentecinu/ml (Life Technologies, Gaithersburg, MD)). Kondicionovaná média byla sklízena 3 až 4 dny později a byla určována koncentrace IFN-beta-l-Fc tak, jak je popsáno níže.
Produkce fúzního proteinu IFN-beta/Fc v jiných savčích buňkách a expresních systémech pro prokaryotické buňky může být také prováděna po přenesení proteinové kódující oblasti pro fúzní protein do příslušných expresních vektorů pro tyto systémy. Alternativní expresní systémy zahr50 nují savčí buněčné jako jsou například buňky ovarií čínského křečka (CHO) (Barsoum, J., 1995,
-30Methods v Mol. Biol. 48, kapitola 18, 225-237) a myší buňky NS-0 (Rossman, C. et al., 1996, protein Expression and Pur,, 7, 335-342), a buňky ledvin opice COS7 (Ettinger, R. et. al., 1996, Proč. NatL Acad. Sci. USA, 93: 23,13 102-13 107). Další eukaiyotické expresní systémy, které by mohly být použitelné, jsou kvasinky Pichia pastoris (Eldin, P.E. et al., 1997, I. Immun. s Methods, 201, 67-75) a Saccharomyces cerevisiae (Horwitz, A.H., 1988, Proč. Nati. Acad. Sci.
USA, 85, 8678-8682).
Kvantifikace stupně exprese proteinu IFN-beta-la-Fc ve tkáňových supematantech ztransfekovaných buněk EBNA 293 byla prováděna pomocí testu ELISA s použitím IgG frakce ío králičích polyklonálních protilátek anti-IFN-beta-la purifikované metodou proteinu A (antigen byl purifikovaný IFN-beta-la, Biogen, lne.) pro navázání na 96-jamkové destičky. Protilátka detekuje standardy IFN-beta-la a tkáňové supematanty v rozmezí koncentrace interferonu mezi ng/ml a 0,3 ng/ml, Pro detekci navázaných interferonu byly použity biotinylovaný králičí polyklonální anti-IFN-beta-la (stejné protilátky jako uvedeny výše) a křenová peroxidáza konjugovaná se streptavidinem. Pro potvrzení hodnot získaných z testu ELISA byla prováděna analýza westernovým přenosem, kdy redukované tkáňové supematanty a standardy IFN-beta-1 byly separovány na 5 až 20% Tris-glycinových gelech (Novex, San Diego, CA), přeneseny na membrány PVDF (Amersham Life Science, lne., Cleveland, OH) a detekovány odlišným králičím polyklonálním sérem (pěstovaným proti IFN-beta-la), a pak následovaly oslí proti—králičí
IgG protilátky konjugované s křenovou peroxidázou (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA).
Příklad 4
Antivirová aktivita fúzního proteinu IFN-beta-la/myší IgG2a
Buňky lidského plicního karcinomu (A549) byly předem ošetřovány 24 hodin s IFN-beta-la nebo IFN-beta-myší IgG2a(61,41,27,18, 12, 8,2, 5,5,3,7,2,5,1,6 pg/ml) před stimulací virem encefalomyokarditidy virus (EMCV). Po dvoudenní inkubaci s virem byly živé buňky barveny roztokem XTT: PMS (2,3-bis(2-methoxy-4—nitro-5-sulfofenyl)-2H-tetrazolium-5-karboxanilid, vnitřní sůl: fenazinmethosulfát, v koncentraci 333 g/ml a 2ng/ml, v daném pořadí, v pufrovaném solném roztoku) a detekovány spektroskopií v 450nM. Test byl prováděn ve trojím opakování pro každou koncentrací IFN.
Na obrázku 8 jsou ukázány standardní odchylky jako svislé úsečky. Bylo zjištěno, že 50% cytopatický účinek pro IFN-beta-la byl přibližně 0,4 pM. Pro IFN-beta-myší IgG2a byl 50% cytopatický účinek 0,15 pM.
Příklad 5
Konstrukce a produkce fúzního proteinu „lidský interferon beta-la/lidský IgGl Fc“
A. Konstrukce fúzního proteinu lidský interferon beta-la/lidský IgGl Fc
PCR technologie byla použita pro vytvoření expresního plazmidu kódujícího DNA sekvenci lidského IFN beta fúzovanou s částí Fc (kloubová doména, domény CH2 a CH3) molekuly těžkého řetězce lidského IgGl.
EBNA konstrukt:
Plazmidový vektor pCH269 je derivát pCEP4 (Invitrogen, Carlsbad, CA), ze kterého byl odstraněn gen EBNA-1. Plazmid byl použit pro konstrukci expresního vektoru použitelného pro pře-31 CZ 300762 Bó chodnou expresi proteinu v buňkách EBNA 293 z lidských ledvin (Invitrogen, Carlsbad, CA, Shen, E.S., et, al„ 1995, Gene, 156,235 - 239).
Expresní kazeta fúzního proteinu byla sestavena ze tří fragmentů DNA: fragment Notl/Sall kódující signální sekvenci VCAM-1 v rámci a fúzovanou se sekvencí kódující lidský IFN beta, fragment Sall/Notl kódující kloubovou doménu, domény CH2 a CH3 lidského IgGl a fragment Notl EBNA expresního vektoru pCH269.
Dva nezávislé fragmenty Notl/Sall kódující zralou signální sekvenci VCAM-1 v rámci a fúzoio vanou ke genu lidského IFN beta byly vytvořeny technologií PCR. PCR templát byl plazmid pCMG258 (viz příklad 2 výše), který kóduje zralou signální sekvenci VCAM-1 v rámci a fúzovanou ke genu lidského IFN beta, který sám také v rámci a fúzovaný k enterokinázové spojovací sekvenci. Byly použity dvě sady primerů pro PCR. Jedna sada primerů:
5'-AGCTTGCTAGCGGCCGCGGCCTCACTGGCTTCA-3' (sekvence id. č. 37) a 5'- ATACGCGTCGACGTTTCGGAGGTAACATGTAAGTCTG-3' (sekvence id. 38) vnesla změnu aminokyselin od G do C v pozici 162. Tento fragment byl nazván lidský IFN beta-C 162. Druhá sada primerů:
5’-AGCTTGCTAGCGGCCGCGGCCTCACTGGCTTCA-3'{ sekvence id. č. 39) a 5’-TACACGTCGACGCTGCCACCACCGCCGTTTCGGAGGTAACATGTAAGTCTG-3 F (sekvence id. č. 40) také zavedla substituci aminokyselin G162 až Cl62 a změnila enterokinázovou spojovací sekvenci (DDDDK) (sekvence id. č. 62) na spojovací sekvenci GGGGS (sekvence id, ě. 64) v rámci a fúzovanou k lidskému genu IFN beta. Tento fragment byl nazván lidský IFN beta-C 162/G4S. Obě sady primerů obsahovaly 5' Notl místo pro umožnění ligace do pCH269, a 3' Sáli štěpné místo pro umožnění ligace s fragmentem Sall/Notl lidského IgGl.
Lidský fragment IgGl, kteiý kóduje kloubovou doménu a domény CH2 a CH3 lidského IgGl, byl připraven pomocí štěpení restrikčními enzymy (Sall/Notl) plazmidů pEAG409, derivátu plazmidu SABI44 (popsaného v patentu Spojených Států US 5 547 853). Fragment byl vyříznut a purifikován přes gel. EBNA expresní vektorový plazmid pCH269 byl štěpen Notl a purifikován přes gel.
Dva fúzní konstrukty lidského IFN beta-lidského IgGl Fc byly vytvořeny dvěma trojcestnými ligacemi. Jeden konstrukt, nazvaný ZL6206, obsahoval spojovací sekvenci G4S, druhý konstrukt, nazvaný ZL5107, je přímá fúze. Kompletní sekvence DNA a proteinu otevřeného Čtecího rámce přímé fuze (viz obrázek 10) jsou uvedeny v sekvenci id. č. 41 a v sekvenci id. č. 42, podle pořadí. Kompletní sekvence DNA a proteinu otevřeného čtecího rámce fuze spojovací sekvence (viz obrázek 11) jsou uvedeny v sekvenci id, č. 43 a v sekvenci id. č. 44, podle pořadí.
CHO konstrukt:
Byl vytvořen konstrukt v buňkách CHO s trvalou expresí fúze „lidský IFN beta-lidský IgGl Fc“, který obsahoval lidský IFN beta přímo spojený s lidským IgGl Fc. Fragment lidský IFN betalidský IgGl Fc byl vystřižen z plazmidů ZL5I07 sNotl a purifikován pres gel, byl ligován do místa Notl v pEAG347 (expresní vektor obsahující tandem časného promotoru SV40 a hlavního pozdního adenovirového promotoru [pocházejícího z plazmidů pAD2beta], jedinečné klonovací místo Notl následované signály pro pozdní ukončení transkripce SV40 a polyA [pocházející z plazmidů pCMVbeta]. pEAG347 obsahuje plazmidovou kostru pocházející z pUC 19 a dhfr pro MTX selekci a amplifikaci v transfekovaných buňkách CHO), .3? .
LZ, OUV/OA OO
B. Produkce fúzního proteinu lidský interferon-beta-la/lidský IgGl Fc
Přechodná transfekce fúzních konstruktů lidského IFN beta do buněk EBNA293:
Rekombinantní expresní vektory IFN-beta/lidský IgGl Fc popsané výše byly přechodně transfekovány do buněk EBNA 293 z lidských ledvin pro dosažení exprese fúzního proteinu IFNbeta-la podle vynálezu. Tyto rekombinantní expresní plazmidy byly transfekovány podle lipofektaminového protokolu (katalog, č. 18324-020, Life Technologies) do buněk z lidských ledvin EBNA 293 podle protokolu popsaného v příkladu 3 výše.
Stabilní transfekce dhfr- CHO buněk fúzním konstruktem „lidský IFN-beta-la/lidsky IgGl Fc“ (bez spojovací sekvence):
Expresní vektor dhfr obsahující rekombinantní IFN-beta/lidský IgGl Fc (bez spojovací sekven15 ce) popsaný výše byl trvale transfekován do buněk, aby bylo dosaženo exprese fuzního proteinu IFN-beta-la podle vynálezu. Tento rekombinantní expresní plazmid byl transfekován elektroporaci a selekce pozitivních klonů byla prováděna podle následujícího protokolu:
Plazmidová DNA (20 g) Štěpena s BglII byla precipitována, resuspendována v 800 μΐ pufru
HEPES a přidána k 10x107 buněk/ml CHO. Po elektroporaci byly buňky pěstovány 2 dny v kompletním médiu DMEM. Pak byly buňky rozděleny na 20 až 40 lOcm misek s kompletním DMEM/dialyzovaným 10% FBS a pěstovány 5 dnů před přenesením buněk na selekční média se stoupající koncentrací (50 až 200 ng/ml) MTX v DMEM po dobu dvou týdnů. Na konci dvou týdnů byly selektovány jednotlivé kolonie buněk a namnoženy. Supematanty pocházející z 22 klonů CHO byly testovány v antivirových testech.
Aktivita:
Antivirová aktivita fuzních proteinů byla zjišťována v testech CPE, jak popsáno v příkladu 4.
Na základě specifické aktivity 60 MU/mg standardu interferonu-beta-1 a použitého v tomto testu, byla aktivita přechodně (EBNA) exprimovaného fuzního proteinu lidský interferon-beta-la/lidský IgGl Fc se spojovací sekvencí 900 U/ml a aktivita bez spojovací sekvence byla 440 U/ml. Aktivita fúzního proteinu exprimovaného v buňkách CHO lidský interferon-beta-la/lidský IgGl Fc byla 50 U/ml.
Příklad 6
Měření antivirové aktivity interferonu-beta-la v plazmě myší ošetřených interferonem-beta-la a fúzním proteinem interferon-beta-la/myší IgG2a
Myším (C57/B16) byla podána do žíly v ocasu i.v. injekce 50 000 jednotek interferonu-beta-la (volného) nebo 5000 jednotek fúzního proteinu interferon-beta-la-myší IgG2a. Jako kontrola byl podáván stejný objem fosfátového pufru.
Krev byla odebírána retroorbitálními krevními odběry v různým časových bodech (okamžitě, 0,25, 1, 4, 24 a 48 hodin) po injekci interferonu beta. V každém časovém bodě byly alespoň tři myši. Plná krev byla odebírána do zkumavek obsahujících antikoagulant, buňky byly odstraněny a zbylá plazma zmražena až do doby testování. Vzorky plazmy byly naředěny 1:10 médiem bez so séra a ponechaly se protéci přes 0,2 m filtr ve stříkačce.
Naředěné vzorky pak byly titrovány do určených jamek na 96-jamkové destičce pro tkáňové kultury obsahující buňky A549. Na každé destičce byla testována ředění standardů interferonubeta-la (10,6,7, 4,4,2,9, 1,3, 0,9 a 0,6 U/ml AVONEX) a čtyři vzorky plazmy. Buňky byly pře55 dem ošetřeny se vzorky po 24 hodin před stimulací virem EMC. Po dvoudenní inkubaci s virem
-33CZ 300762 B6 byly životaschopné buňky barveny roztokem MTT (5 mg/ml ve fosfátovém pufru) po dobu 1 hodiny, promyty fosfátovým pufrem a solubilizovány s 1,2N HCI v isopropanolu. Jamky pak byly odečítány ve 450 nm. Pro každou destičku byly vytvořeny standardní křivky a použity pro určení množství aktivity interferonu-beta-1 a v každém testovaném vzorku. Aktivita ve vzorcích od různých myší byla vynesena do grafu proti časovým bodům na obrázku 9.
Pomalejší ztráta fúze interferonu-beta-1 a z krevního oběhu jako funkce času ukazuje, že biologický poločas vzorku fúzního proteinu je mnohem delší než poločas nemodifikovaného kontrolního interferonu-beta-la. Druhé velmi významné zjištění z této studie bylo to, že velmi málo ío fúzního proteinu bylo ztraceno v průběhu distribuční fáze, jak prokázáno podobnými vysokými hladinami aktivity v 15 a 60 minutách. Data ukazují, že na rozdíl od kontrol interferonu-beta-la, je distribuce fuzního proteinu interferonu-beta-la převážně omezena na cévní zásobení.
Příklad 7
Srovnávací farmakokinetické a farmakodynamické studie na primátech
Komparativní studie byly prováděny s fúzí interferonu-beta-la a nativním interferonem-beta-la (jako neformulovaný volný meziprodukt AVONEX® interferonu-beta-la ve lOOmM fosfátu sodném, 200mMNaCl, pH7,2) pro zjištění jejich relativní stability a aktivity na primátech. V těchto studiích byla srovnávána farmakokinetika a farmakodynamika fuze interferonu-beta-la u primátů s nativním interferonem-beta-la a racionální závěry mohou být rozšířeny na člověka.
Zvířata a metody
Návrh studie
Toto byla studie s paralelními skupinami a opakovanými dávkami pro vyhodnocení komparativní farmakokinetíky a farmakodynamiky fúzního proteinu interferonu-beta-la a nefúzovaného interferonu-beta-la.
Pro tuto studii byly použiti zdraví primáti (výhodně makak „rhesus“, Macaca mullata). Před podáváním dávek byly u všech zvířat vyšetřeny příznaky nemocí veterinářem při dvou příleži35 tostech během 14 dnů před prvním podáním testované sloučeniny, jedno vyšetření muselo být v průběhu 24 hodin před prvním podáním testované sloučeniny. Pouze zdravá zvířata dostala testovanou sloučeninu. Vyhodnocení zahrnovalo obecné fyzikální vyšetření a krevní odběry před podáním dávky pro vyšetření základních klinických patologických ukazatelů a výchozí hladiny protilátek proti interferonu-beta-la. Všechna zvířata byla zvážena a během 24 hodin před podá40 ním testované sloučeniny byla zaznamenávána tělesná teplota.
Bylo zaregistrováno dvanáct zvířat a rozděleno do skupin po třech, které dostávaly 1 MU/kg interferonu-beta-la buď jako fúzovaný, nebo nefúzovaný, ale jinak identický interferon-betala. Podávání bylo prováděno buď subkutánně (SC), nebo intravenózně (IV). Šest samců dostalo testovanou sloučeninu IV způsobem (3/ošetření) a dalších 6 samců dostalo testovanou sloučeninu SC způsobem (3/ošetření), Všechna zvířata musela být nedotčena ošetřením interferonem-beta, Čili tzv. naivní. Každému zvířeti byly podávány dávky ve dvou dobách, dávky byly odděleny čtyřmi týdny. Objem dávky byl 1,0 ml/kg.
Pro farmakokinetické testování byla odebírána krev v 0, 0,083, 0,25, 0,5, 1, 1,5, 2,4, 6, 8, 12, 24, 48, 72 a 96 hodin po každé injekci. V 0, 24, 48, 72, 96, 168, 336, 504 hodin po podávání studovaného léčiva byly také odebírány vzorky krve pro měření markéru biologické reakce indukované interferonem, sérového neopterinu.
- 34VZ, JUU/OÍ DO
Hodnocení během období studie zahrnují klinická vyšetřování známek toxicity prováděná 30 minut a l hodinu po podání dávky. Byla prováděna denní pozorování přes klec a byl zaznamenáván celkový vzhled, příznaky toxicity, neklid a změny chování. Během 21 dnů po podání dávky byla zaznamenávána tělesná hmotnost a tělesná teplota.
Testovací metody
Hladiny interferonu-beta v séru byly kvantifikovány s použitím testu na hodnocení cytopatického účinku (CPE). Test CPE měřil stupeň antivirové aktivity zprostředkované interferonem. Stupeň io antivirové aktivity ve vzorku odráží poěet molekul aktivního interferonu obsažených ve vzorku v okamžiku, kdy je odebírána krev. Tento přístup byl standardní metodou pro stanovení farmakokinetiky interferonu-beta. Test CPE použitý v předkládané studii detekuje schopnost interferonubeta chránit buňky lidského plicního karcinomu (A549, č. CCL-185, ATCC, Rockville, MD) před cytotoxicitou způsobenou virem encefalomyokarditidy (EMC). Buňky byly předem inkubo15 vány 15 až 20 hodin se vzorky séra, aby se umožnila indukce a syntéza proteinů, které lze indukovat interferonem, a které pak zvyšují antivirovou reakci. Potom byl přidán virus EMC a inkubován dalších 30 hodin před tím, než se vyhodnotila cytotoxicita s použitím barveni krystalovou violetí. Na každé testované destičce byl současně se vzorky testován vnitřní standard interferonubeta, jakož i vnitřní standard interferonu-beta-Ig. Tento standard byl kalibrován proti referenč20 nímu standardu přirozeného interferonu lidských fibroblastů (WHO Second International Standard for Interferon, Human Fibroblast, Gb23-902-53). Každá testovaná destička také zahrnovala jamky s kontrolou buněčného růstu, které neobsahovaly ani interferon-beta jakéhokoliv druhu, ani EMC, a jamky s virovou kontrolou, které obsahovaly buňky a EMC, ale neobsahovaly interferon-beta. Pro zjišťování účinku, byl-li jaký, vzorků na buněčný růst byly také připraveny kont25 rolní destičky obsahující standardy a vzorky. Tyto destičky byly obarveny bez přidání viru.
Vzorky a standardy byly testovány v duplikátech na každé ze dvou opakujících se testovacích destiček, poskytující čtyři údaje o vzorku. Byl uváděn geometrický průměr hodnot koncentrace ze čtyřech opakovaní. Limit detekce v tomto testuje 10 jednotek (U)/ml.
Sérové koncentrace neopterinu byly určovány na oddělení klinické farmakologie s použitím komerčně dostupných testů.
Farmakokinetické a statistické metody
Software RstripTM (MicroMath, lne., Salt Lake City, UT) byl použit pro prokládání (fitování) dat pomocí farmakokinetických modelů. Geometrické průměry hodnot koncentrace byly vyneseny do grafu proti času pro každou skupinu. Protože výsledky testu jsou vyjádřeny jako ředění, jsou geometrické průměry považovány za vhodnější, než aritmetické průměry. Hladiny sérového interferonu byly srovnány podle výchozích hodnot a nedetekovatelné koncentrace v séru byly stanoveny na 5 U/ml, což představovalo jednu polovinu spodního limitu detekce.
Pro data z IV infuzí byl fitován IV infuzní model se dvěma kompartmenty pro detekovatelné koncentrace v séru pro každý subjekt a SC data byla filtrována podle injekčního modelu se dvě45 ma kompartmenty.
Byly vypočítány následující farmakokinetické parametry:
i) pozorovaná vrcholová koncentrace, Cmax (U/ml) ii) oblast pod křivkou od 0 do 48 hodin, AUC se vypočetla pomocí lichoběžníkového pravidla, iii) poločas eliminace, a, z dat získaných při IV infuzi (když byl použit IV způsob podávání):
-35CZ 300762 B6 iv) poločas distribuce (hodiny, h),
v) clearance (ml/h), vi) zjevný distribuční objem, Vd (I).
Pro výpočet poločasu eliminace po SC a IM injekci byl použit software WinNonlin (verze 1.0,
Scientific Consulting lne., Apex, NC).
Pro neopterin jsou uvedeny hodnoty aritmetického průměru v každé skupině. Byla vypočtena
Ema*, maximální hodnota změny proti základní hodnotě. CmM, AUC a EmiX byla pak analyzovány io jednosměrnou analýzou rozptylu pro srovnání skupin lišících se dávkami. Hodnoty Cmax a AUC byly logaritmicky transformovány před analýzou, jsou uváděny geometrické průměry.
Příklad 8 15
Antiangiogenní účinky fúze interferonu-beta-la: Hodnocení schopnosti fúze interferonu-betala inhibovat proliferaci endotelových buněk in vitro
Buňky z lidského cévního endotelu (Cell Systems, katalog, č. 2V0-P75) a buňky endotelu kož20 nich kapilár (Cell Systems, katalog, č. 2M1-C25) byly udržovány v kultuře s médiem ze soupravy CS-C Medium Kit (Cell Systems, katalog, č. 4Z0-50O). Čtyřiadvacet hodin před pokusem byly buňky ošetřeny trypsinem, resuspendovány v testovacím médiu, 90% Ml99 a 10%fetální hovězí sérum (FBS), a upraveny na požadovanou hustotu. Pak byly buňky vysety na 24 nebo
96jamkové destičky potažené želatinou, s hustotou 12 500 buněk/jamka nebo 2000 buněk/jamka. 25
Po inkubaci přes noc bylo testovací médium nahrazeno čerstvým médiem obsahujícím 20 ng/ml lidského rekombinantního bazického fibroblastového růstového faktoru bFGF (Becton Dickinson, katalog, č. 400600) a různé koncentrace fúzovaných nebo nefúzovaných proteinů interferonu-beta-la nebo pozitivní kontroly (jako pozitivní kontrola lze užít endostatin nebo proti30 látka k bFGF). Celkový objem byl nastaven na 0,5 ml ve 24jamkové destičce nebo 0,2 ml v 96jamkové destičce.
Po dvaasedmdesáti hodinách byly buňky ošetřeny trypsinem pro počítání na Coulteru, zamraženy pro odečítání fluorescence CyQuant nebo značeny [JH] thymidinem.
Tento in vitro test sloužil k hodnocení molekul lidského interferonu-beta podle vynálezu z hlediska účinků na proliferaci endotelových buněk, která může být indikátorem antiangiogenních účinků in vivo. Viz např. 0'Reilly, M.S., T. Boehm., Y. Shing, N. Fukal, G. Vasios, W. Lané, E. Flynn, J. Birkhead, B. Olsen, J. Folkman, 1997, Endostatin: An Endogenous Inhibitor of
Angiogenesis and Tumor Growth, Cell, 88,277-285.
Příklad 9
In vivo model pro testováni antiangiogenního a antineovaskularizačního účinku fúze interferonubeta- la/Ig
Pro testováni antiangiogenních a antineovaskularizaěních účinků molekul podle vynálezu byla vyvinuta celá řada modelů. Některé z těchto modelů byly popsány v patentech US 5 733 876 (31. března 1998, „Method of inhibiting angiogenesis“) aUS5 135919 (4, srpen 1992, „Method and pharmaceutical composition for the inhibition of angogenesis“). K dalším testům patří např. test s chorioalantoidní membránou bez skořápky (CAM) podle S. Taylor a J. Folkman, Nátuře, 297, 307, 1982 a R. Crum, S. Szabo a J. Folkman, Science, 230, 1 375, 1985, model angiogeneze se vzdušným dorzálním vakem u myší podle J. Folkman, etal., J. Exp. Med., 133, 275,
-3A1971, a test s mikrokapsou rohovky podle Gimbrone, M.A.Jr. et al., Nati. Cancer Inst., 52, 413,
1974, kde je vaskularizace rohovky indukována u dospělých samců laboratorních potkanů kmene
Sprague-Dawley (Charles River, Japonsko) implantací 500 ng bazického FGF (hovězí, R and D systems, lne.) impregnovaného v EVA (kopolymer ethylen-vinylacetátu) peletech do každé rohovky.
K dalším metodám testování fúzí interferonu-beta/Ig na antiangiogenní účinky na zvířecím modelu patří (i když výčet tím není omezen) screeningové testy nových potenciálních protírakovinných léčiv, jak byly popsány v původní publikaci Cancer Chemotherapy Reports, Part 3, ío Vol. 3, No. 2, září 1972 a v suplementu In vivo Cancer Models, 1 976-1 982, NIH Publ. No. 842635, únor 1984. Vzhledem kmezidruhové bariéře pro interferony typul, pro hodnocení antiangiogenní aktivity fúzí interferonu-beta na modelech hlodavců, byly připraveny přípravky fúzí interferonu-beta/Ig hlodavců. Screeningové metody jsou ukázány na příkladu protokolu pro testování antiangiogenního účinku fúzí myšího interferonu-beta/Ig na subkutánně implantovaný t5 Lewisův plicní karcinom.
Původ nádorové linie
Vznikla spontánně v r. 1951 jako karcinom plic u myši C57BL/6.
Souhrn testovacích procedur
Fragment nádoru byl implantován do subkutánně do axilámí oblasti myší B6D2F1. Testované činidlo (např. fuzní protein podle vynálezu) byl podáván v různých dávkách subkutánně (SC) nebo intraperitoneálně (IP) po několik dní po implantaci nádoru. Měřeným parametrem pak byl medián času přežití. Výsledky jsou uvedeny jako procenta času přežití kontroly.
Zvířata
Propagace nádoru: myši C57BL/6
Testovací zvířata: myši B6D2F1
Hmotnost: myši by měly mít hmotnost s rozpětím 3 g s minimální hmotností u samců 18 g a samic 17 g
Pohlaví: zvířata jednoho pohlaví jsou užita pro test i kontrolu v jednom pokusu 35 Zdroj: jeden zdroj, pokud je to možné, pro všechna zvířata v jednom pokusu
Rozsah experimentu zvířat v jedné testovací skupině 40
Přenos nádoru
Propagace nádoru:
Fragment: připravit 2 až 4 mm fragment nádoru SC dárcovského nádoru 45 Doba: 13. až 15, den
Místo: fragment implantován SC do axilámí oblasti vpichem v ingvinální oblasti
Testování:
Fragment: příprava fragmentu o velikosti 2 až 4 mm ze s.c. dárcovského tumoru.
Doba: 13. až 15. den
Místo: implantace fragmentu s.c. do axilámí oblasti vpichem v ingvinální oblasti.
-37Cl 300762 B6
Testovací schéma:
Den 0: implantace tumoru. Založení bakteriálních kultur. Testování pozitivní kontrolní slouče5 niny v každém experimentu s lichým číslem. Příprava materiálů. Denní záznam úmrtí.
Den 1: kontrola kultur. Odstranění kontaminovaného experimentu. Randomizace zvířat. Ošetřování dle instrukcí (v den 1 a následující dny).
ío Den 2: Opětná kontrola kultur. Odstranění kontaminovaného experimentu.
Den 5: Hodnocení dne 2 a den počátečního testu vyhodnocení toxicity přípravku.
Den 14: Kontrolní den časného úmrtí.
Den 48: Kontrolní den.
Den 60: Konec a vyhodnocení experimentu. Vyšetření tumoru plic pouhým okem.
Kontrola kvality:
Stanovení pozitivní kontrolní sloučeniny (NSC 26271 (Cytoxan v dávce 100 mg/kg/injekce)) v každém experimentu s lichým číslem, jehož režim byl v den 1 pouze intraperitoneální. Spodní limit testu/kontroly pro pozitivní kontroluje 140 %. Přijatelný medián přežití u neošetřené kont25 roly byl 19 až 35,6 dnů.
Vyhodnocení:
Měřený parametr je medián přežití. Výpočet průměrné tělesné hmotnosti zvířat v den 1 a v den 5, výpočet poměru test/kontrola pro všechny testované skupiny. Jsou vypočítány průměrné tělesné hmotnosti zvířat ve dny odečítání a v den konečného vyhodnocení. Poměr test/kontrola je vypočítán pro všechny testované skupiny s > 65 % přeživších v den 5. Poměr test/kontrola < 86% indikuje toxicitu. Pro hodnocení toxicity může být také použita nepřiměřená změna tělesné hmotnosti (test minus kontrola).
Měřítka aktivity:
Výchozí poměr test/kontrola větší nebo rovný 140 % považován za nezbytný pro průkaz mírné aktivity. Reprodukovatelná hodnota poměru test/kontrola větší nebo rovná 150 % je považována za významnou aktivitu.
SEZNAM SEKVENCÍ <110> WHITTY, ADRIAN
RUNKEL, LAURA BRICKELMAIER, MARGOT HOCHMAN, PAULA <120> INTERFERON-BETA FUSION PROTEINS AND USES <130> A064CONUS <140>
<141>
-38<150> 09/832,659 <151> 2001-04-11 <150> PCT/US99/24200 <15I> 1999-10-15 <150> 60/120,237 <151> 1999-02-16 io <150> 60/104,491 <151> 1998-10-16 <160> 64 < 170> Patentln Ver. 3,3 <210> 1 <211> 1197 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct 25 <220>
<221>CDS <222> (1)..(1197) <400> 1
atg agc tac aac Asn ttg ctt gga ttc cta caa Gly Phe Leu Gin 10 aga agc agc aat Asn ttt Phe 15 cag Gl n 48
Met ser 1 Tyr Leu 5 Leu Arg Ser ser
tgt cag aag ctc ctg tgg caa ttg aat ggg Gly agg ctt gaa tac tgc ctc 96
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Arg Leu Glu Tyr 30 Cys Leu
aag gac agg atg aac ttt gac atc cct gag att aag cag ctg cag 144
Lys Asp Arg 35 Met Asn Phe Asp Ile 40 Pro Glu Glu ile Lys 45 Gin Leu Gin
cag ttc cag aag gag gac gcc gca ttg acc atc tat gag atg ctc cag 192
Gin Phe Gin Lys Glu ASp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
aac atc ttt gct att ttc aga caa gat tca tet agc act ggc tgg aat 240
Asn Ile Phe Ala ile Phe Arg Gin Asp ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
gag act att gtt gag aac ctc ctg get aat Leu Ala Asn 90 gtc tat val Tyr cat HÍS cag ata aac 288
Glu Thr Ile val Glu 85 Asn Leu Gin ile 95 Asn
cat ctg aag aca gtc ctg gaa gaa aaa ctg gag aaa gaa gat ttc acc 336
His Leu Lys Thr Val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
agg gga aaa ctc atg age agt ctg cac ctg aaa aga tat tat ggg Gly agg 384
Arg Gly Lys 115 Leu Met ser ser Leu 120 His Leu Lys Arg & Tyr Arg
att ctg cat tac ctg aag gcc aag gag tac agt cac tgt gcc tgg acc 432
ile Leu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr Ser His 140 cys Al a Trp Thr
ata gtc aga «3 gaa atc cta agg aac ttt tac ttc att aac aga ctt 480
ile val Arg Glu ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
aca ggt tac ctc ega aac gac gat gat gac aag gtc gac aaa act cac 528
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn Asp Asp ASD Asp Lys Val ASp Lys Thr His
165 170 175
aca tgc cca ccg tgc cca gca cct gaa ctc ctg ggg gga Gly Gly ccg tea gtc 576
Thr Cys Pro Pro Cys pro Ala pro Glu Leu Leu Pro Ser Val
180 185 190
ttc ctc ttc CCC cca aaa ccc aag gac acc ctc atg atc tcc cgg acc 624
Phe Leu Phe pro Pro Lys Pro Lys ASp Thr Leu Met Ile ser Arg Thr
195 200 205
cct pro gag Glu gtc val aca Thr tgc cys gtg gta gtg val val val gac Asp ?3 age ser cac HÍS gaa gac Glu ASp cct pro gag Glu 672
210 215 220
gtc aag ttc aac tgg tac gtg val gac ggc ?3 gag gtg val cat aat gcc aag 720
val Lys phe Asn Trp Tyr 230 Asp Gly Glu His Asn Ala Lys
225 235 240
aca aag ccg cgg gag gag cag tac aac age acg tac cgt ?3 gtc age 768
Thr Lys pro Arg Glu Glu Gin Tyr Asn ser Thr Tyr Arg val ser
245 250 255
gtc ctc acc gtc ctg cac cag gac tgg ctg aat ggc aag gag tac aag 816
Val Leu Thr Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
260 265 270
tgc aag gtc tcc aac aaa gcc ctc cca gcc ccc atc gag aaa acc atc 864
cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile
275 280 285
tcc aaa gcc aaa ggg Giy cag ccc ega gaa cca cag 53 tac acc ctg ccc 912
ser Lys Ala Lys Gin pro Arg Glu pro Gin Tyr Thr Leu pro
290 295 300
cca tcc cgg gat gag ctg acc aag aac cag gtc age ctg acc tgc ctg 960
Pro ser Arg Asp GlU Leu Thr Lys Asn Gin val Ser Leu Thr cys Leu
305 310 315 320
gtc aaa ggc ttc tat CCC age gac atc gcc gtg gag tgg gag age aat 1008
val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser ASp Ile Ala val Glu Trp Glu Ser Asn
325 330 335
gqg cag Gly Gin ccg gag Pro Glu 340 aac Asn aac tac aag acc acg cct ccc gtg ttg gac tcc 1056
Asn Tyr Lys Thr 345 Thr pro pro val Leu 350 Asp ser
gac ggc tcc ttc ttc ctc tac agc aag ctc acc «3 gac aag agc agg 1104
Asp Gly ser 355 Phe Phe Leu Tyr ser 360 Lys Leu Thr & Lys Ser Arg
tgg cag cag 909 Gly aac gtc ttc tca tgc tcc gtg val atg cat gag gct ctg 1152
Trp Gin Gin Asn val Phe ser Cys ser Met His Glu Ala Leu
370 375 380
cac aac cac tac acg cag aag agc ctc tcc ctg tct ccc 999 Gly aaa 1197
HIS Asn His Typ Thr Gin Lys ser Leu ser Leu ser pro Lys
385 390 395
<210> 2 <211> 399 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic construct o <400 > 2
wet Ser 1 Tyr Asn Leu 5 Leu Gly Rhe Leu Gin Arg 10 Ser Ser Asn Phe 15 Gin
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu T5 cys Leu
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile pro Glu Glu ile Lys Gin ueu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn 65 ile phe Ala Ile Phe 70 Arg Gin Asp ser ser 75 Ser Thr Gly Trp Asn 80
Glu Thr Ile Val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin Ile Α5Π
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met ser ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
115 120 125
ile Leu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr ser His 140 cys Ala Trp Thr
Ile val Arg val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn Asp Asp Asp Asp Lys val Asp Lys Thr His
165 170 175
Thr cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly pro Ser Val
180 185 190
Phe Leu Phe pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met ile ser Arg Thr
-41 CZ 300762 B6
195 200 205
Pro Glu 210 val Thr Cys Val val val 215 Asp val ser His 220 Glu Asp Pro Glu
val Lys Phe Asn Trp Tyr val Asp Gly val Glu Val His Asn Ala Lys
225 230 235 240
Thr Lys pro Arg Glu Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg val val Ser
245 250 255
val Leu Thr Val Leu HÍS Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
260 265 270
cys Lys val Ser Asn tys Ala Leu pro Ala Pro lle Glu Lys Thr lle
275 280 285
ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Arg Glu pro Gin val Tyr Thr Leu Pro
290 295 300
pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin Val ser Leu Thr Cys Leu
305 310 315 320
val Lys Gly Rhe Tyr pro Ser ASp lle Ala val Glu Trp Glu ser Asn
325 330 335
Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu ASp ser
340 345 350
Asp Gly ser Phe phe Leu Tyr ser Lys Leu Thr val Asp Lys Ser Arg
355 360 365
Trp Gin Gin Gly Asn val Phe Ser Cys ser Val Met His Glu Ala Leu
370 375 380
His Asn His Tyr Thr Gin Lys Ser Leu ser Leu ser Pro Gly Lys
<2103 <211> 549 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct io <220>
<221>CDS <222> (1)..(549) <400>3
tec ggg Ser Gly 1 ggc cat Gly His cat cat cat cat HÍS cat His age tcc gga gac gat gat gac
HIS 5 Hns HIS Ser 10 Ser Gly Asp ASp Asp 15 Asp
aag atg age tac aac ttg ctt gga ttc cta caa aga age age aat ttt
Lys Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg ser Ser Asn Phe
20 25 30
cag tgt cag aag ctc ctg tgg caa ttg aat 999 agg ctt gaa tac tgc
Gin cys Glr> Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys
.47.
\jL· juu/uí UU
ctc aag gac Leu Lys Asp agg atg aac ttt Phe 55 gac atc cct gag gag att aag cag ctg
Arg Met Asn Asp lle Pro Glu Glu 60 lle Lys Gin Leu
50
cag cag ttc cag aag gag gac gcc gca ttg acc atc tat gag atg ctc
Gin Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr lle Tyr Glu Met Leu
65 70 75 80
cag aac atc ttt get att ttc aga caa gat tea tet age act ggc Thr Gly tgg
Gin Asn lle Phe Ala lle Phe Arg Gin Asp ser ser ser Trp
85 90 95
aat gag act att gtt gag aac ctc ctg get aat gtc tat cat cag ata
Asn Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val iyr His Gin lle
100 105 110
aac cat ctg aag aca gtc ctg gaa gaa aaa ctg gag aaa gaa gat ttc
Asn His Leu Lys Thr Val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe
115 120 125
acc agg gga Gly aaa ctc atg age agt ctg cac ctg aaa aga tat tat ggg Gly
Thr Arg Lys Leu Met ser Ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr
130 135 140
agg att ctg cat tac ctg aag gcc aag gag tac agt cac tgt gcc tgg
Ϊ8 lle Leu His Tyr Leu 150 Lys Ala Lys Glu Tyr 155 ser HÍS Cys Ala Trp 160
acc ata gtc aga gtg val gaa atc cta agg aac ttt tac ttc att aac aga
Thr lle val Arg Glu He Leu Arg Asn Phe Tyr phe XIe Asn Arg
165 170 175
192
240
288
336
384
432
480
528 ctt aca ggt tac Leu Thr Gly Tyr
180 ctc ega aac Leu Arg Asn
549 <210> 4 <211> 183 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct o <400> 4
Ser Gly Gly His His His HÍS His His ser ser Gly Asp Asp ASp Asp
1 5 10 15
Lys Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg ser Ser Asn phe
20 25 30
Gin cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys
35 40 45
Leu Lys 50 ASp Arg Met Asn Phe 55 ASp lle pro Glu GlU 60 lle Lys Gin Leu
Gin Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr lle Tyr Glu Met Leu
65 70 75 80
-43Cl 300762 B6
Gin Asn Ile Phe Ala ile Phe Arg Gin Asp ser ser Ser Thr Gly Trp
85 90 95
Asn Glu Thr Ile Val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin ile
100 105 110
Asn His Leu 115 Lys Thr val Leu Glu 120 Glu Lys Leu Glu $ Glu ASp phe
Thr Arg Gly Lys Leu Met Ser ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly
130 135 140
Arg Ile Leu MÍ 5 Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr Ser His cys Ala Trp
145 150 155 160
Thr ile val Arg val 165 Glu ile Leu Arg Asn 170 Phe Tyr Phe ile Asn 175 Arg
Leu Thr Gly Leu Arg Asn
180 <210>5 <211> 69
J <212>DNA <213> Artificial Sequence <220 <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct <220>
<221>CDS <222> (1)..(69) <400> 5 ttc att aac aga ctt aca tgt tac ctc ega aac gtc gac aaa act cac 48
Pne ile Asn Arg Leu Tbr cys Tyr Leu Arg Asn Val Asp Lys Thr His
5 10 15 aca tgc cca ccg tgc cca gca 69
Thr Cys Pro Pro Cys pro Ala <210>6 <211> 23 <212> PRT <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct <400> 6
Phe ile Asn Arg Leu Thr Cys Tyr Leu Arg Asn val Asp Lys Thr His 15 10 15
Thr Cys Pro Pro Cys pro Ala 20 . ΔΑ .
<210> 7 <211>81 <212>DNA <213> Artifícial Sequence
V Z- rfVV f V* urv <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct <220>
io <221>COS <222> (1)..(81) <400> 7
ttc att aac aga ctt aca tgt tac ctc ega aac ggc ggt ggt ggc age 48
Phe 1 zle Asn Arg Leu 5 Thr cys Tyr Leu Aa Asn Giy Gly Gly Gi^ Ser
gtc gac aaa act cac aca tgc cca ccg tgc cca 81
val Asp Lys Thr His Thr Cys pro pro cys Pro
20 25
<210> 8 <211> 27 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct <400>8
Phe Ile Asn Arg Leu Thr Cys Tyr Leu Arg Asn Gly Gly Gly Gl£ Ser val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro pro Cys Pro <210> 9 <211> 60 <212>DNA <213> Artific ial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 9 ttctccggag acgatgatga caagatgagc tacaacttgc ttggattcct acaaagaagc 60
-45CZ 300762 B6 <2Ι0> 10 <211> 39 <212>DNA <213> Artifícial Sequence <220>
<223> Description of Artifícial Sequence: Synthetic primer <400> 10 gccgctxgag ttatcagttt cggaggtaac ctgtaagtc 39 <21011 <211> 35 <212>DNA <213> Artifícial sequence <220>
<223> Description of Artifícial Sequence: Synthetic primer <400> 11 agcttccggg ggccatcatc atcatcatca tagct 35 <210> 12 <211> 35 <212>DNA <213> Artifícial sequence <220>
<223> Description of Artifícial Sequence: Synthetic primer <400> 12 ccggagctat gatgatgatg atgatggccc ccgga 35 <210> 13 35 <211>87 <212> DNA <213> Artifícial sequence <220>
<223> Description of Artifícial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 13 ccggagacga tgatgacaag atggcttacg ccgctcttgg agccctacaa gcttctagca 60 attttcagtg tcagaagctc ctgtggc 87
Λ £
CZ JUU/OZ BO <210> 14 <211> <50 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetíc oligonucleotide <400> 14 gatctagcaa tgctgcctgt gctgccctcc tggctgcctt gaatgggagg cttgaatact 60 <210> 15 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 15 gcctcaagga caggatgaac tttgacatcc ctgaggagat taagcagctg ca 52 <210> 16 <211> 76 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide 30 <400 16 aattgaatgg gagggctgca gcttgcgctg cagacaggat gaactrtgac atccctgagg 60 agattaagca gctgca 76 <210> 17 35 <211>76 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 17 aattgaatgg gaggcttgaa tactgcctca aggacagggc tgcatttgct atccctgcag 60 agattaagca gctgca 76
-47CZ 300762 B6 <210> 18 <211> 51 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetíc oligonucleotide <400> 18 aattgaatgg gaggcttgaa tactgcctca aggacaggat gaactttgac a 51 <21O> 19 <211> 43 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 19 tccctgagga gattgctgca gctgcagctt tcgctgcagc tga 43 <210> 20 <211> 78 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic oligonucleotide 30 <400> 20 cgccgcgttg accatctatg agatgctcgc taacatcgct agcattttca gacaagattc 60 atctagcact ggctggaa 78 <210» 21 35 <211» 78 <2I2>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 21 cgccgcattg accatctatg agatgctcca gaacatcttt gctattttcg ctgcagcttc 60 atctagcact ggctggaa 78 . AU .
JUV/ΟΛ DO <210> 22 <211> 72 <212> DNA <213> Artificial Sequence 5 <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 22 ggaatgcttc aattgttgct gcactcctga gcaatgtcta tcatcagata aaccatctga 60 io agacagttct ag 72 <210> 23 <211> 72 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 23 ggaatgagac cattgttgag aacctcctgg ctaatgtcgc tcatcagata gcacatctgg 60 ctgcagttct ag 72 <210> 24 <211> 44 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide 30 <400> 24 ctagctgcaa aactggctgc agctgatttc accaggggaa aact 44 <210> 25 35 <211>69 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 25 ctagaagaaa aactggagaa agaagcagct accgctggaa aagcaatgag cgcgctgcac 60 ctgaaaaga 69
-49vz. uvu/oí no <210> 26 <211> 51 <212> DNA <213> Artiflcial Sequence <220>
<223> Description of Artiflcial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 26 tattatggga ggattctgca ttacctgaag gccaaggagt actcacactg t 51 <210> 27 <211> 76 <212>DNA <213> Artiflcial Sequence <220>
<223> Description of Artiflcial sequence: Synthetic oligonucleotide <400 27 catgagcagt ctgcacctga aaagatatta tggggcaatt gctgcatacc tggcagccaa 60 ggagtactca cactgt 76 <210> 28 <211> 87 <212>DNA <213> Artiflcial Sequence <220>
<223> Description of Artiflcial sequence: Synthetic oligonucleotide 30 <400> 28 catgagcagt ctgcacctga aaagatatta tgggaggatt ctgcattacc tgaaggccgc 60 tgcatactca cactgtgcct ggacgat 87 <2I0> 29 35 <211>87 <212>DNA <213> Artiflcial sequence <220>
<223> Description of Artiflcial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 29 catgagcagt ctgcacctga aaagatatta tgggaggatt ctgcattacc tgaaggcaaa 60 ggagtacgct gcatgtgcct ggacgat 87
-50<210> 30 <211> 50 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 30 cgtcagagct gaaatcctag caaactttgc attcattgca agacttacag 50 <210> 31 <211> 47 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic primer <400> 31 ggtggtctca catgagctac aacttgcttg gattcctaca aagaagc 47 <210> 32 <211> 50 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic primer 30 <400> 32 gccctcgagt cgaccttgtc atcatcgtcg tttcggaggt aacctgtaag 50 <210> 33 35 <211>21 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400>33 caagcttgct agcggccgcg g 21
-51 CZ 300762 B6 <210> 34 <211> 28 <212>DNA <213> Artificiaí sequence <220>
<223> Description of Artificiaí Sequence: Synthetic primer <400> 34 ggtggtctca catggcttga gaagctgc 28 <210> 35 <211> 20 <212>DNA <213> Artificiaí sequence <220>
<223> Description of Artificiaí sequence: Synthetic primer <400> 35 aggtsmarct gcagsagtcw 20 <210> 36 <211> 36 <212>DNA <213> Artificiaí sequence <220>
<223> Description of Artificiaí sequence: Synthetic primer 30 <400> 36 ctgagctcat ttacccggag tccgggagaa gctctt 36 <210> 37 35 <21l>33 <212>DNA <213> Artificiaí sequence <220>
<223> Description of Artificiaí Sequence: Synthetic primer <400>37 agcttgctag cggccgcggc ctcactggct tca 33
LZ 3UU/0A no <210> 38 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic primer <400> 38 atacgcgtcg acgtttcgga ggtaacatgt aagtctg 37 <2I0> 39 <211> 33 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic primer <400> 39 agcttgctag cggccgcggc ctcactggct tca 33 <210>40 <211> 51 <212>DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic primer 30 <400> 40 tacacgtcga cgctgccacc accgccgttt cggaggtaac atgtaagtct g 51
-53CZ 300762 B6 <210 41 <211> 1257 <212>DNA <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct <220>
io <221>CDS <222> (1)..(1254) <400 41
atg cct ggg aag atg gtc val 33 atc Ile ctt Leu gga Gly 10 gcc tca aat ata ile ctt Leu 15 tgg Trp 48
Met 1 Pro Gly Lys Met 5 Ala Ser Asn
ata atg ttt gca gct tct caa gcc atg agc tac aac ttg ctt gga ttc 96
ile Met Phe Ala Ala ser Gin Ala Met ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe
20 25 30
cta caa aga agc agc aat ttt cag tgt cag aag ctc ctg tgg caa ttg 144
Leu Gin Arg Ser Ser Asn phe Gin cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu
35 40 45
aat 999 agg ctt gaa tac tgc ctc aag gac agg atg aac ttt gac atc 192
Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu Lys Asp Arg Met Asn phe Asp Ile
50 55 60
cct gag gag att aag cag ctg cag cag ttc cag aag gag gac gca 240
Pro Glu Glu ile tys Gin Leu Gin Gin Phe Gin Lys Glu ASp Ala Ala
65 70 75 80
ttg acc atc tat gag atg ctc cag aac atc ttt gct att ttc aga caa 288
Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin Asn ile Phe Ala ile phe Arg Gin
85 90 95
gat tca tct agc act ggc tgg aat gag act att gtt gag aac ctc ctg 336
Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn Glu Thr Ile Val Glu Asn Leu Leu
100 105 110
gct aat gtc tat cat cag ata aac cat ctg aag aca gtc ctg gaa gaa 384
Ala Asn Val Tyr HIS Gin ile Asn His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu
C£ auu/oz bo
115
120
125
aaa ctg gag aaa gaa gat ttc acc agg gga aaa ctc atg age agt ctg
tys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr Arg Gly Lys Leu Met Ser Ser Leu
130 135 140
cac ctg aaa aga tat tat ggg agg att ctg cat tac ctg aag gcc aag
His Leu uys Arg Tyr Tyr Gly Arg lle Leu HÍS Tyr Leu Lys Ala Lys
145 150 155 160
gag tac agt cac tgt gcc tgg acc ata gtc aga gtg gaa atc cta agg
Glu Tyr ser His cys Ala trp Thr lle val Arg val GlU lle Leu Arg
165 170 175
aac ttt tac ttc att aac aga ctt aca tgt tac ctc ega aac gtc gac
Asn Phe Tyr Phe zle Asn Arg Leu Thr cys Tyr Leu Arg Asn val Asp
180 185 190
aaa act cac aca tgc cca ccg tgc cca gca cct gaa ctc ctg ggg gga
Lys Thr His Thr Cys pro Pro cys Pro Ala pro Glu Leu Leu Gly Gly
195 200 205
ccg tea gtc ttc ctc ttc ccc cca aaa ccc aag gac acc ctc atg atc
pro Ser 210 val Phe Leu Phe Pro 215 Pro Lys pro Lys a Thr Leu Met Zle
tec ser cgg Arg acc Thr cct Pro gag Glu gtc val aca Thr tgc Cys gtg val «3 gtg val gac Asp gtg val age ser cac HÍ5 gaa Glu
225 230 235 240
gac Asp cct pro gag Glu gtc val aag Lys 245 ttc Phe aac Asn tgg Trp tac Tyr 250 gac ASp ggc Gly gtg val gag Glu gtg val 255 cat HÍS
aat gcc aag aca aag ccg cgg gag g?g cag tac aac age acg tac cgt
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
260 265 270
gtg gtc age gtc ctc acc gtc ctg cac cag gac tgg ctg aat ggc aag
val val ser val Leu Thr val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
275 280 285
gag tac aag tgc aag gtc tcc aac aaa gcc ctc cca gcc ccc atc gag
Glu Tyr Lys cys Lys val Ser Asn Lys Ala Leu pro Ala Pro lle Glu
290 295 300
aaa acc atc tcc aaa gcc aaa ggg cag ccc ega gaa cca cag gtg tac
Lys Thr lle Ser Lys Ala Lys Gly Gin pro Arg Glu Pro Gin Val Tyr
305 310 315 320
acc ctg ccc cca tcc cgg gat gag ctg acc aag aac cag gtc age ctg
Thr Leu Pro Pro ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin val Ser Leu
32S 330 335
acc tgc ctg gtc aaa ggc ttc tat ccc age gac atc gcc gt? gag tgg
Thr cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser ASp lle Ala val Glu Trp
340 345 350
gag age aat ggg cag ccg gag aac aac tac aag acc acg cct ccc gtg
Glu ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro pro val
355 360 365
ttg gac tcc gac ggc tcc ttc ttc ctc tac age aag ctc acc gtg gac
Leu Asp ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr ser Lys Leu Thr val Asp
432
480
528
576
672
720
768
864
912
960
1008
1056
1104
1152
624
816
370 375 380
aag Lys 385 agc ser agg tgg cag cag Gin 390 ggg Gly aac gtc ttc tca tgc tcc gtg atq car 1200
Arg Trp Gin Asn Val Phe ser cys 395 Ser Val Met His 400
gag ?ct ctg cac aac cac tac acg cag aag agc ctc tcc ctg tet CCC 1248
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys ser Leu Ser Leu ser Pro
405 410 415
ggg aaa tga 1257
Gly Lys <210> 42 <211> 418 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct o <400> 42
Met 1 Pro Gly Lys Met val val Ile Leu Gly Ala ser Asn Ile Leu 15 Trp
5 10
ile Met Phe Ala Ala Ser Gin Ala Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe
20 25 30
Leu Gin Arg Ser ser Asn Phe Gin cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu
35 40 45
Asn Gly 50 Arg Leu Glu Tyr cg Leu Lys Asp Arg Met 60 Asn Phe ASP ile
Pro Glu Glu ile Lys Gin Leu Gin Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala
65 70 75 80
Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin Asn ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin
85 90 95
Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu
100 105 110
Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu
115 120 125
Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr Arg Gly Lys Leu Met Ser Ser Leu
130 135 140
His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg Ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys
145 150 155 160
Glu Tyr ser His Cys Ala Trp Thr Ile Val Arg val Glu ile Leu Arg
165 170 175
Asn Phe Tyr phe 180 Ile ASn Arg Leu Thr 185 cys Tyr Leu Arg Asn 190 val Asp
Lys Thr HIS Thr Cys pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
195 200 205
Pro Ser Val phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met ile
C£ tc JUU/OA DO
210 215 220
Ser Arg Thr Pro Glu val Thr cys Val Val val Asp val ser His Glu
225 230 235 240
Asp Pro Glu val Lys Phe Asn Trp Tyr val ASp Gly Val GlU val His
245 250 255
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Asn Ser Thr iyr Arg
260 265 270
val Val Ser val Leu Thr Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
275 280 285
Glu Tyr tys cys Lys val ser Asn Lys Ala Leu pro Ala Pro Ile Glu
290 295 300
Lys 305 Thr Ile Ser Lys Ala 310 Lys Gly Gin pro Arg 315 Glu Pro Gin Val Tyr 320
Thr Leu Pro Pro Ser Arg ASP Glu Leu Thr Lys Asn Gin Val Ser Leu
325 330 335
Thr cys Leu val Lys Gly phe Tyr pro Ser Asp Ile Ala val Glu Trp
340 345 350
Glu ser Asn 355 Gly Gin Pro Glu Asn 360 Asn Tyr Lys Thr Thr 365 pro pro val
Leu Asp 370 Ser Asp Gly ser Phe Phe 375 Leu Tyr Ser Lys 380 Leu Thr val ASP
& ser Arg Trp Gin Gin 390 Gly Asn Val Phe ser 395 Cys Ser val Met HÍS 400
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys ser Leu ser Leu Ser pro
405 410 415
Gly Lys <210> 43 <21 í> 1272 <212>DNA <213> Artifícial sequence <220>
<223> Description of Artifícial sequence: Synthetic construct io <220>
<221>COS <222> (1)..(1269) <400> 43
atg cct ggg aag atg gtc gtg atc ctt gga gcc tea aat ata ctt tgg 48
Met Pro Gly Lys Met Val Val ile Leu Gly Ala Ser Asn ile Leu Trp
1 5 10 15
ata atg ttt gca gct tet caa gcc atg age tac aac ttg ctt gga ttc 96
ile Met Phe Ala Ala Ser Gin Ala Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe
20 25 30
-57CZ 300762 B6
cta caa aga age Ser age ser aat ttt cag tgt cag aag ctc ctg tgg caa Gin ttg Leu 144
Leu Gin Arg 35 Asn Phe Gin cys Gin 40 Lys Leu Leu 45 Trp
aat ggg agg ctt gaa tac tgc ctc aag gac agg atg aac ttt gac atc 192
Asn Arg Leu Glu Tyr Cys 55 Leu Lys Asp Arg Met 60 Asn Phe Asp ile
cct gag gag att aag cag ctg cag cag ttc cag aag gag gac gca 240
Pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin Gin Phe Gin Lys Glu ASp Ala Ala
65 70 75 80
ttg acc atc tat gag atg ctc cag aac atc ttt gct att ttc aga caa 288
Leu Thr xl e Tyr Glu Met Leu Gin Asn Ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin
85 90 95
gat tca tet age act ggc tgg aat gag act att gtt gag aac ctc ctg 336
Asp Ser Ser ser Thr Gly Trp Asn Glu Thr Ile Val Glu Asn Leu Leu
100 105 110
gct aat gtc tat cat cag ata aac cat ctg aag aca gtc ctg gaa gaa 384
Ala Asn Val Tyr HÍS Gin ile Asn His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu
115 120 125
aaa ctg gag aaa gaa gat ttc acc agg gga aaa ctc atg age agt ctg 432
Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr Arg Gly Lys Leu Met ser Ser Leu
130 135 140
cac ctg aaa aga tat tat ggg agg att ctg cat tac ctg aag gcc aag 480
His 145 Leu tys Arg Tyr KS Gly Arg Ile Leu His 155 Tyr Leu Lys Ala Lys 160
gag tac agt cac tgt gcc tgg acc ata gtc aga gtg val gaa atc cta agg 528
Glu Tyr Ser His Cys Ala Trp Thr Ile val Arg Glu ile Leu Arg
165 170 175
aac ttt tac ttc att aac aga ctt aca tgt tac ctc ega aac ggc ggt 576
Asn phe Tyr Phe 180 Ile Asn Arg Leu Thr 185 cys Tyr Leu Arg Asn 190 Gly Gly
ggt ggc age gtc gac aaa act cac aca tgc cca ccg tgc cca gca cct 624
Gly Gly Ser Val Asp Lys Thr HiS Thr cys pro pro Cys Pro Ala Pro
195 200 205
gaa Glu ctc Leu ctg Leu ggg gga Gly Gly ccg pro tca Ser gtc val ttc Phe ctc Leu ttc Phe ccc Pro cca Pro aaa Lys ccc Pro aag Lys 672
210 215 220
gac acc ctc atg atc tcc cgg acc cct gag gtc aca tgc gtg gtg val val 33 720
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu val Thr Cys
225 230 235 240
gac gtg vaT age cac gaa gac cct gag gtc aag ttc aac tgg tac gtg val gac 768
ASP ser His Glu Asp Pro Glu val Lys Phe Asn Trp Tyr Asp
245 250 255
ggc «3 gag gtg val cat aat gcc aag aca aag ccg cgg gag gag cag tac 816
Gly Glu His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr
260 265 270
aac age acg tac cgt gtg val gtc age gtc ctc acc gtc ctg cac cag gac 864
Asn ser Thr Tyr Arg val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin ASp
275 280 285
- SR-
tgg ctg aat Asn ggc aag gag tac aag tgc aag gtc tcc aac aaa gcc ctc 912
Trp Leu 290 Gly Lys GlU iyr Lys 295 cys Lys val ser 300 Asn Lys Ala Leu
cca gcc ccc atc gag aaa acc atc tcc aaa gcc aaa ggg cag ccc ega 960
pro 305 Ala pro Ile Glu Lys 310 Thr ile ser Lys Ala 315 Lys eiy Gin Pro Arg 320
gaa cca cag gtg val tac acc ctg ccc cca tcc cgg gat gag ctg acc aag 1008
Glu Pro Gin Tyr 325 Thr Leu pro Pro Ser 330 Arg Asp Glu Leu Thr 335 Lys
aac cag gtc age ctg acc tgc ctg gtc aaa ggc ttc tat ccc age gac 1056
Asn Gin val ser Leu Thr cys Leu val Lys Gly Phe Tyr ΡΓΟ ser Asp
340 345 350
atc gcc sa 355 gag tgg gag age aat a? cag ccg gag aac aac tac aag 1104
Ile Ala Glu Trp Glu ser Asn 360 Gin Pro Glu Asn 365 Asn Tyr Lys
acc acg cct ccc gtg val ttg gac tcc gac ggc tcc ttc ttc ctc tac age 1152
Thr Thr Pro Pro Leu Asp ser Asp Gly ser Phe Phe Leu Tyr Ser
370 375 380
aag ctc acc S3 gac aag age agg tgg cag cag ggg Gly aac gtc ttc tea 1200
Lys 385 Leu Thr Asp ser Arg Trp Gin Gin 395 Asn val Phe ser 400
tgc tcc gtg val atg cat gag get ctg cac aac cac tac acg cag aag age 1248
cys ser Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys Ser
405 410 415
ctc tcc ctg tet ccc ggg aaa tga 1272
Leu ser Leu Ser pro Gly Lys
420 <210> 44 <211> 423 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic construct o
<400> 44
Met Pro Gly Lys Met Val Val ile Leu Gly Ala ser Asn ile Leu Trp
1 5 10 15
ile Met phe Ala Ala ser Gin Ala Met Ser tyr Asn Leu Leu Gly phe
20 25 30
Leu Gin Arg 35 Ser Ser Asn Phe Gin 40 Cys Gin Lys Leu Leu 45 Trp Gin Leu
Asn Gly 50 Arg Leu Glu Tyr cys 55 Leu Lys Asp Arg Met 60 Asn Phe Asp ile
pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin Gin phe Gin Lys Glu ASp Ala Ala
65 70 75 80
Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin Asn Ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin
-59Cl 300762 B6
85 90 95
Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn Glu Thr Ile val Glu Asn Leu Leu
100 105 110
Ala Asn val iyr His Gin ile Asn His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu
115 120 125
Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr Arg Gly Lys Leu Met Ser ser Leu
130 135 140
His 145 Leu Lys Arg Tyr Tyr 150 Gly Arg ile Leu His 155 Tyr Leu Lys Ala Lys 160
Glu Tyr ser His cys Ala Trp Thr Ile val Arg Val Glu Ile Leu Arg
165 170 175
Asn Phe Tyr Phe Ile 180 Asn Arg Leu Thr 185 cys Tyr Leu Arg Asn 190 Gly Gly
Gly Gly ser Val Asp Lys Thr His Thr cys Pro Pro Cys pro Ala Pro
195 200 205
Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
210 215 220
ASp 225 Thr Leu Met Ile ser 230 Arg Thr Pro Glu Val 235 Thr cys val val Val 240
ASp val ser HiS Glu Asp Pro Glu val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp
245 250 255
Gly val Glu Val HIS Asn Ala Lys Thr tys pro Arg Glu Glu Gin Tyr
260 265 270
Asn ser Thr Tyr Arg Val val Ser Val Leu Thr val Leu His Gin Asp
275 280 285
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys cys Lys val Ser Asn Lys Ala Leu
290 295 300
pro 305 Ala pro ile Glu Lys 310 Thr Ile Ser Lys Ala 315 Lys Gly Gin pro Arg 320
GlU Pro Gin val & Thr Leu Pro Pro ser 330 Arg Asp Glu Leu Thr 335 Lys
Asn Gin val Ser Leu Thr cys teu Val Lys Gly Phe Tyr pro Ser Asp
340 345 350
Ile Ala val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
355 360 365
Thr Thr pro Pro val Leu Asp Ser Asp Gly ser Phe Phe Leu Tyr Ser
370 375 380
Lys Leu Thr val Asp Lys ser Arg Trp Gin Gin Gly Asn val Phe Ser
385 390 395 400
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys Ser
405 410 415
Leu Ser Leu ser Pro Gly Lys 420
JUUSCM DO <210> 45 <211> 166 <212> PRT <213> Homo sapiens <400>45
Met Ala Tyr Ala Ala Leu Gly Ala Leu Gin Ala ser ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys Asp ΑΓ? Met Asn Phe Asp Ile 40 Pro Glu Glu ile Lys 45 Gin Leu Gin
Gin Phe 50 Gin Lys Glu Asp Ala 55 Ala Leu Thr ile Tyr 60 Glu Met Leu Gin
Asn Ile phe Ala ile Phe Arg Gin Asp ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile val Glu Α5Π Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin Ile Asn
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 no
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser Ser Leu 120 His Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Arg
ile Leu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr Ser His 140 cys Ala Trp Thr
ile val Arg val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg 165 ASíl
<210> 46
<211> 166
<212> PRT
<213> Homo sapie ns
<400> 46
Met ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser ser Asn Ala Ala
1 5 10 15
cys Ala Ala Leu Leu Ala Ala Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp ile pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn ile Phe Ala ile Phe Arg Gin Asp Ser ser ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
-61 CZ 300762 B6
Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin Ile Asn
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met Ser Ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
115 120 125
Ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr ser His Cys Ala Trp Thr
130 135 140
ile val Arg Val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Leu ΑΓ| Asn
Thr Gly Tyr <210> 47 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 47
Met 1 Ser Tyr Asn Leu 5 Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser ser Asn Phe Gin
10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Ala Ala Ala cys Ala
20 25 30
Ala Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin phe Gin Lys Glu ASp Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp Ser ser ser Thr Gly Trn Asn
65 70 75 80
Glu Thr Ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin Ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr Val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser ser Leu 120 HlS Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Arg
ile Leu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr ser His 140 cys Ala Trp Thr
ile val Arg val Glu ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn
JUU/UA OU <210 48 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400 48
Met Ser Tyr Α5Π Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser Ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu Tyr 30 Cys Leu
Lys Asp Arg Ala Ala phe Ala ile pro Ala Glu ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala Ile phe Arg Gin Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 SO
Glu Thr Ile Val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser Ser Leu 120 HiS Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Arg
ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr Ser His cys Ala Trp Thr
130 135 140
ile val Arg val Glu ile Leu Arg Asn phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Tbr Gly Tyr Leu Arg Asn
165
<210>49
<211> 166
<212> PRT
<213> Homo! sapíe ns
<400> 49
Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg ser ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Α5Π Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys ASp Arg Met Asn phe Asp Ile Pro GlU Glu Ile Ala Ala Ala Ala
35 40 45
Ala phe Ala Ala Ala Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala ile Phe Arg Gin Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile Val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu GlU Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met Ser ser Leu HiS Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
115 120 125
-63 CZ 300762 B6
Ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr Ser His cys Ala Trp Thr
130 135 140
Ile Val Arg Val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn
165 <210 50 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 50
Met Ser 1 Cys Gin Tyr Asn Leu Leu Gly Gin Phe Leu Gin Arg Ser ser 10 Asn Phe Gin 15
Lys Leu 20 Leu Trp Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu Tyr 30 Cys Leu
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp ile Pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin tys Glu Asp Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Ala
50 55 60
Asn Ile Ala Ser Ile Phe Arg Gin Asp Ser ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser Ser Leu 120 His Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Arg
ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr Ser His cys Ala Trp Thr
130 135 140
Ile Val Arg Val Glu Ile Leu Arg Asn Phe ίϊξ phe Ile Asn Arg Leu
145 150 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn 165 <210 51 <211> 166 <212> PRT <213> Homo sapiens <400 51
Met ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg ser ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu ile Lys Gin Leu Gin
CZ JUU76Z BĎ
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu ASD Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala Ile phe Ala Ala Ala ser ser ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr Ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr HÍS Gin Ile Asn
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu ASp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met ser Ser Leu His Leu Lys Arg Tr Tyr Gly Arg
115 120 125
xl e ueu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr ser His cys Ala Trp Thr 140
il e val Arg val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr phe ile Asn Arg Leu
145 ISO 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg 165 Asn
<210> 52 <211>166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 52
Met Ser Tyr Asn Leu Leu cly Phe Leu Gin Arg ser ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
Cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu GlU Tyr cys Leu
20 25 30
Lys ASp Arg 35 Met Asn Phe Asp ile 40 Pro Glu Glu Ile Lys 45 Gin Leu Glri
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Ala ser Ile val Ala Ala Leu Leu Ser Asn Val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr val Leu GlU Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met Ser ser Leu HIS Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
115 120 125
ile Leu 130 HÍS Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr ser His 140 Cys Ala Trp Thr
ile val Arg val Glu ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn
165
-65CZ 300762 B6 <210 53 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400 53
Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser Ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu Tyr 30 cys Leu
tys Asp A5? Met Asn Phe Asp Ile 40 pro Glu Glu Ile Lys 45 Gin Leu Gin
Gin Phe 50 Gin Lys GlU Asp Ala 55 Ala Leu Thr ile Tyr 60 Glu Met Leu Gin
Asn Ile Phe Ala ile Phe Arg Gin ASp Ser ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr Ile Val GlU Asn Leu Leu Ala Asn val Ala His Gin ile Ala
85 90 95
«15 Leu Ala Ala 100 val Leu GlU Glu Leu Glu Lys Glu Asp 110 Phe Thr
Arg Gly uys 115 Leu Met ser Ser Leu 120 HÍS Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Arg
Ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr ser His cys Ala Trp Thr
130 135 140
Ile Val Arg val Glu Ile teu Arg Asn Phe Tyr Phe Ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg 165 Asn
<210> 54
<211> 166
<212> PRT
<213> Homo sapii ens
<400> 54
Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser Ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu 35 cys Leu
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp Ser Ser ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
LZ, JVV/O4 DO
Glu Thr lle Val Glu Asn 85
His Leu Lys Thr val Leu 100
Arg Gly Lys Leu Met ser lle Leu His Tyr Leu Lys 130 lle Val Arg val Glu lle 145 150
Thr Gly Tyr Leu Ar| Asn
Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn
90 95
Ala Ala Lys Leu Ala Ala Ala Asp Phe Thr
105 110
ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
120 125
Ala Lys Glu Tyr Ser His cys Ala Trp Thr
135 140
Leu Arg Asn Phe Tyr phe ile Asn Arg Leu
155 160
<210> 55 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 55
Met 1 Ser Tyr Asn Leu 5 Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser Ser 10 Asn Phe 15 Gin
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu Tyr cys 30 Leu
Lys ASP *3? Met Asn Phe Asp Ile 40 pro Glu Glu Zle Lys 45 Gin Leu Gin
Gin Phe 50 Gin Lys Glu Asp Ala Ala 55 Leu Thr ile Tyr 60 Glu Met Leu Glrt
Asn 65 Ile Phe Ala Ile Phe 70 Arg Gin Asp Ser ser 75 ser Thr Gly Trp Asn 80
Glu Thr ile val Glu 85 Asn Leu Leu Ala Asn 90 val Tyr His Gin ile 95 Asn
His Leu Lys Thr Val 100 Leu Glu Glu Lys 105 Leu Glu Lys Glu Ala 110 Ala Thr
Ala Gly Lys 115 Ala Met Ser Ala Leu 120 HÍS Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr cly Arg
ile Leu 130 His Tyr Leu Lys Ala 135 Lys Glu Tyr ser His Cys Ala 140 Trp Thr
ile Val 145 Arg val Glu lle 150 Leu Arg Asn Phe Tyr 155 phe Ile asπ Arg Leu 160
Thr Gly Tyr Leu Arg 165 Asn
-67CZ 300762 B6 <210> 56 <211> 166 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 56
Met 1 ser Tyr Asn Leu 5 Leu cly Phe Leu Gin Arg Ser ser Asn Phe Gin
10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys Asp Arg 35 Met Asn Phe Asp Ile 40 Pro Glu Glu ile Lys 45 Gin Leu Gin
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp ser ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
HlS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser Ser Leu 120 His Leu Lys Arg Tyr 125 Tyr Gly Ala
Ile Ala 130 Ala Tyr Leu Ala Ala 135 Lys Glu Tyr Ser His 140 cys Ala Trp Thr
Ile Val Arg val GlU Ile Leu Arg ASH Phe Phe Ile Asn Arg Leu
145 150 160
Thr Gly Tyr Leu ÍS Asn
<210 57 10 <211> 166 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 57
Met ser Tyr Asn Leu Leu Gly phe Leu Gin Arg ser ser Asn phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu Glu Tyr 30 cys Leu
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp ile Pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Α5Π ile phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp Ser Ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr Val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Met ser Ser Leu His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
115 120 125
k/ώ jwíví ον ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Ala Ala Tyr ser His Cys Ala Trp Thr 130 135 140
Ile Val Arg Val Glu ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu 145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn 165 <210> 58 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 58
Met ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg Ser Ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr cys Leu
20 25 30
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr Ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn ile Phe Ala ile phe Arg Gin Asp Ser Ser ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr Ile Val Glu. Asn Leu Leu Ala Α5Π Val Tyr His Gin Ile Asn
85 90 95
HÍS Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu ASp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met Ser Ser Leu 120 His Leu Lys Arg X Tyr Gly Arg
ile Leu HÍ5 Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr Ala Ala Cys Ala Trp Thr
130 135 140
ile val Arg val Glu Ile Leu Arg Asn phe Tyr phe Ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn
165
<210> 59
<211> 166
<212> PRT
<213> Homo sapk :ns
<400> 59
Met Ser Tyr Asn Leu Leu Gly Phe Leu Gin Arg ser Ser Asn Phe Gin
1 5 10 15
cys Gin Lys Leu Leu Trp Gin Leu Asn Gly Arg Leu Glu Tyr Cys Leu
20 25 30
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu ile tys Gin Leu Gin
-69CZ 300762 B6
40 45
Gin Phe 50 Gin Lys Glu ASP Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin
55 60
Asn ile Phe Ala Ile Phe Arg Gin Asp Ser ser ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile Val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr val Leu Glu Glu Lys Leu Glu Lys Glu Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met ser ser Leu 120 His Leu Lys Arg Tyr Tyr Gly Arg
Ile Leu HiS Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr ser His cys Ala Trp Thr
130 135 140
Ile Val Arg Ala Glu Ile Leu Ala Asn Phe Ala phe Ile Ala Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg 165 Asn
<210> 60 <211> 166 <212>PRT <213> Homo sapiens <400> 60
Met 1 ser Tyr Asn Leu 5 Leu Gly Phe Leu Gin 10 Arg ser ser Asn Phe 15 Gin
cys Gin Lys Leu 20 Leu Trp Gin Leu Asn 25 Gly Arg Leu GlU cys Leu
Lys Asp Arg Met Asn Phe Asp Ile Pro Glu Glu Ile Lys Gin Leu Gin
35 40 45
Gin Phe Gin Lys Glu Asp Ala Ala Leu Thr ile Tyr Glu Met Leu Gin
50 55 60
Asn Ile Phe Ala ile Phe Arg Gin Asp ser ser Ser Thr Gly Trp Asn
65 70 75 80
Glu Thr ile val Glu Asn Leu Leu Ala Asn Val Tyr His Gin ile Asn
85 90 95
His Leu Lys Thr Val Leu Glu GlU Lys Leu Glu Lys GlU Asp Phe Thr
100 105 110
Arg Gly Lys 115 Leu Met ser ser Leu 120 HiS Leu Lys Arg Tyr Tyr 125 Gly Arg
ile Leu His Tyr Leu Lys Ala Lys Glu Tyr ser His Cys Ala Trp Thr
130 135 140
ile val Arg val Glu Ile Leu Arg Asn Phe Tyr Phe ile Asn Arg Leu
145 150 155 160
Thr Gly Tyr Leu Arg Asn
165
-70<210> 61 <211> 8 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220 <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400 61
Asp iyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys <210> 62 <211>5 <212>PRT ís <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 62
Asp Asp Asp Asp Lys 1 5 <210> 63 <211>6 <212>PRT <213> Artificial Sequence <220>
<223> Description of Artificial sequence: Synthetic 6x His tag 30 <400> 63
His His His His His HÍS 1 5 <210> 64 35 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial sequence <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 64
Gly Gly Gly Gly ser 1 5
-71 CZ 300762 B6

Claims (18)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    I. Polypeptid obsahující:
    s (a) mutantu interferonu-beta-la (IFN-β) vybranou ze skupiny sestávající z mutant IFN-β, které mají aminokyselinové sekvence uvedené v tabulce 1 jako AI, Bl, Cl, CD1, CD
  2. 2 a DE1, a (b) kloubovou oblast a domény CH2 a CH3 imunoglobulinu.
    io 2. Polypeptid podle nároku 1, kde imunoglobulin je lidský imunoglobulin.
  3. 3. Polypeptid podle nároku 1 nebo 2, kde imunoglobulin je imunoglobulin IgG.
  4. 4. Polypeptid podle nároku 3, kde imunoglobulin IgG je imunoglobulin IgGl.
  5. 5. Polypeptid podle kteréhokoliv z nároků 1 až 4, kde mutanta interferonu-beta-la (IFN-β) je glykosylovaná na aminokyselině v sekvenci aminokyselin.
  6. 6. Polypeptid podle kteréhokoliv z nároků 1 až 4, kde mutanta interferonu-beta-la (IFN-β) je 20 derivatizovaná na aminokyselině v sekvenci aminokyselin.
  7. 7. Polypeptid podle nároku 5, kde mutanta interferonu-beta-1 a (IFN-β) je dále derivatizovaná.
  8. 8. Polypeptid podle nároku 6 nebo 7, kde mutanta interferonu-beta-la je derivatizovaná poly25 alkylglykolovým polymerem.
  9. 9. Polypeptid podle nároku 8, kde polyalkylglykolový polymer je kondenzován na N-konec aminokyselinové sekvence mutanty interferonu-beta-la (IFN-β).
    30 10, Sekvence DNA kódující polypeptid podle kteréhokoliv z nároků 1 až 4.
    II. Rekombinantní DNA obsahující sekvenci DNA podle nároku 10 a sekvenci řídící expresi, kde sekvence řídící expresi je operativně spojena se sekvencí DNA.
    35 12. Hostitelská buňka obsahující molekulu rekombinantní DNA podle nároku 11.
  10. 13. Způsob přípravy polypeptidů podle kteréhokoliv z nároků laž4, vyznačující se tím, že zahrnuje kroky, kdy
    40 a) se poskytne populace hostitelských buněk podle nároku 12,
    b) buňky se kultivují v podmínkách, kdy je exprimován polypeptid kódovaný molekulou rekombinantní DNA, a
    45 c) exprimovaný polypeptid se izoluje.
  11. 14. Farmaceutická kompozice, vyznačující se tím, že obsahuje terapeuticky účinné množství polypeptidů podle kteréhokoliv z nároků 1 až 9 a farmaceuticky přijatelný nosič.
    50
  12. 15. Použití polypeptidů podle kteréhokoliv z nároků 1 až 9 pro výrobu léku.
  13. 16. Použití podle nároku 15, kdy lék je k léčení nebo prevenci zánčtlivých, autoimunitních, angiogenních, nádorových nebo virových onemocnění.
    - 77 .
    LZ. OUU/04 DO
  14. 17. Použití podle nároku 16, kdy virové onemocnění je infekce ECM, chřipka, infekce respiračního traktu, vzteklina nebo hepatitida.
  15. 18. Použití podle nároku 16, kdy autoimunitní onemocnění je lupus nebo sclerosis multiplex.
  16. 19. Použití podle nároku 16, kdy zánětlivé onemocnění je fíbróza.
  17. 20. Použití podle nároku 16, kdy angiogenní onemocnění je diabetická retinopatie, retinopatie předčasně narozených, makulámí degenerace, odvržení štěpu rohovky, neovaskulámí glaukom, io retrolentální fibroplázie, rubeóza nebo Osler-Weberův syndrom.
  18. 21. Použití podle nároku 16, kdy nádorové onemocnění je osteogenní sarkom, lymfom, akutní lymfocytámí leukémie, karcinom prsu, melanom, nasofaryngeální karcinom nebo hemangiom.
CZ20011330A 1998-10-16 1999-10-15 Fúzní proteiny interferonu-beta-1a a jejich použití CZ300762B6 (cs)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US10449198P 1998-10-16 1998-10-16
US12023799P 1999-02-16 1999-02-16

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20011330A3 CZ20011330A3 (cs) 2001-09-12
CZ300762B6 true CZ300762B6 (cs) 2009-08-05

Family

ID=26801613

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20011330A CZ300762B6 (cs) 1998-10-16 1999-10-15 Fúzní proteiny interferonu-beta-1a a jejich použití

Country Status (28)

Country Link
US (3) US6800735B2 (cs)
EP (1) EP1121382B9 (cs)
JP (2) JP4761621B2 (cs)
KR (1) KR100767649B1 (cs)
CN (1) CN100480266C (cs)
AT (1) ATE327254T1 (cs)
AU (1) AU766190B2 (cs)
BR (1) BR9915548A (cs)
CA (1) CA2343094A1 (cs)
CY (1) CY1105173T1 (cs)
CZ (1) CZ300762B6 (cs)
DE (1) DE69931507T2 (cs)
DK (1) DK1121382T3 (cs)
EA (1) EA005005B1 (cs)
EE (1) EE05111B1 (cs)
ES (1) ES2265693T3 (cs)
HK (1) HK1042098B (cs)
HU (1) HUP0200414A2 (cs)
IL (2) IL142350A0 (cs)
IS (1) IS5887A (cs)
MX (1) MXPA01003790A (cs)
NO (1) NO20011861L (cs)
NZ (1) NZ510559A (cs)
PL (1) PL200586B1 (cs)
PT (1) PT1121382E (cs)
SK (1) SK287491B6 (cs)
TR (1) TR200101087T2 (cs)
WO (1) WO2000023472A2 (cs)

Families Citing this family (91)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK1039931T3 (da) * 1997-12-01 2005-08-08 Fang Fang Multivalente rekombinante antistoffer til at behandle HRV infektioner
ES2265693T3 (es) * 1998-10-16 2007-02-16 Biogen Idec Ma Inc. Proteinas de fusion con interferon-beta y usos.
ES2630278T3 (es) * 1998-10-16 2017-08-21 Biogen Ma Inc. Conjugados poliméricos de interferón beta-1a y usos de los mismos
US20030035798A1 (en) * 2000-08-16 2003-02-20 Fang Fang Humanized antibodies
US7144574B2 (en) 1999-08-27 2006-12-05 Maxygen Aps Interferon β variants and conjugates
US7431921B2 (en) 2000-04-14 2008-10-07 Maxygen Aps Interferon beta-like molecules
US6531122B1 (en) 1999-08-27 2003-03-11 Maxygen Aps Interferon-β variants and conjugates
US6697363B1 (en) 2000-06-28 2004-02-24 Alcatel Canada Inc. Method and apparatus for longest matching prefix determination in a communication network
WO2002036628A2 (en) * 2000-11-02 2002-05-10 Maxygen Aps New multimeric interferon beta polypeptides
KR100804885B1 (ko) * 2000-12-06 2008-02-20 라보라토리스 세로노 에스.에이. 경피증의 치료 또는 예방을 위한 sarp-1의 용도
DE50204952D1 (de) * 2001-02-01 2005-12-22 Roche Diagnostics Gmbh Verfahren zur herstellung von rekombinantem trypsin
YU48703A (sh) 2001-02-27 2006-05-25 Maxygen Aps Novi interferonu beta-slični molekuli
CA2441095A1 (en) * 2001-03-15 2002-09-26 Merck Patent Gesellschaft Mit Beschraenkter Haftung Modified interferon beta with reduced immunogenicity
JP2005522192A (ja) * 2001-07-19 2005-07-28 パーラン セラピューティクス, インコーポレイテッド マルチマータンパク質およびマルチマータンパク質を作製および使用する方法
AU2003209755B2 (en) * 2002-02-06 2007-11-22 Ares Trading S.A. Tumor necrosis factor combined with interferon in demyelinating diseases
MXPA05000658A (es) * 2002-07-17 2005-08-19 Biogen Idec Inc Terapias para la insuficiencia renal utilizando interferon-beta.
AU2003254641A1 (en) * 2002-08-28 2004-03-19 Maxygen Aps Interferon beta-like molecules for treatment of cancer
CA2498319A1 (en) * 2002-09-09 2004-03-18 Nautilus Biotech Rational evolution of cytokines for higher stability, the cytokines and encoding nucleic acid molecules
NZ565990A (en) * 2002-09-27 2009-10-30 Biogen Idec Inc Therapies for chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy using interferon-beta
US20040137581A1 (en) * 2002-10-01 2004-07-15 Xencor Interferon variants with improved properties
EP2204190A1 (en) * 2003-07-15 2010-07-07 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha IgM production by transformed cells and methods for quantifying said IgM production
JP2007503838A (ja) 2003-09-05 2007-03-01 ジーティーシー バイオセラピューティクス, インコーポレイティド トランスジェニック動物の乳汁中での融合タンパク質の産生方法
US20070212346A1 (en) 2003-10-09 2007-09-13 Tomoyuki Igawa Highly Concentrated Stabilized Igm Solution
EP1682584B1 (en) 2003-11-13 2013-04-17 Hanmi Science Co., Ltd. A pharmaceutical composition comprising an immunoglobulin fc region as a carrier
US8110665B2 (en) 2003-11-13 2012-02-07 Hanmi Holdings Co., Ltd. Pharmaceutical composition comprising an immunoglobulin FC region as a carrier
AU2005211362B2 (en) 2004-02-02 2008-03-13 Ambrx, Inc. Modified human interferon polypeptides and their uses
JP2007526317A (ja) * 2004-03-01 2007-09-13 エンゾン ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド インターフェロン−ベータ・ポリマー結合体
US20050276785A1 (en) * 2004-06-09 2005-12-15 Schering Aktiengesellschaft Treatment of cardiomyopathy and of endothelial dysfunction
US7670595B2 (en) * 2004-06-28 2010-03-02 Merck Patent Gmbh Fc-interferon-beta fusion proteins
LT1845925T (lt) * 2005-01-12 2016-09-26 Biogen Ma Inc. Interferono-beta pateikimo būdas
JP2009507003A (ja) 2005-09-01 2009-02-19 アレス トレーディング ソシエテ アノニム 視神経炎の治療
US8450269B2 (en) 2006-02-03 2013-05-28 Prolor Biotech Ltd. Long-acting growth hormone and methods of producing same
US7553940B2 (en) 2006-02-03 2009-06-30 Modigene Inc Long-acting EPO polypeptides and derivatives thereof and methods thereof
US8048849B2 (en) 2006-02-03 2011-11-01 Modigene, Inc. Long-acting polypeptides and methods of producing same
US20140113860A1 (en) 2006-02-03 2014-04-24 Prolor Biotech Ltd. Long-acting polypeptides and methods of producing and administering same
US8759292B2 (en) 2006-02-03 2014-06-24 Prolor Biotech, Llc Long-acting coagulation factors and methods of producing same
US10351615B2 (en) 2006-02-03 2019-07-16 Opko Biologics Ltd. Methods of treatment with long-acting growth hormone
US8946155B2 (en) 2006-02-03 2015-02-03 Opko Biologics Ltd. Long-acting polypeptides and methods of producing and administering same
US10221228B2 (en) 2006-02-03 2019-03-05 Opko Biologics Ltd. Long-acting polypeptides and methods of producing and administering same
US8476234B2 (en) 2006-02-03 2013-07-02 Prolor Biotech Inc. Long-acting coagulation factors and methods of producing same
US20150038413A1 (en) 2006-02-03 2015-02-05 Opko Biologics Ltd. Long-acting polypeptides and methods of producing and administering same
US9249407B2 (en) 2006-02-03 2016-02-02 Opko Biologics Ltd. Long-acting coagulation factors and methods of producing same
US9458444B2 (en) 2006-02-03 2016-10-04 Opko Biologics Ltd. Long-acting coagulation factors and methods of producing same
WO2007110231A2 (en) * 2006-03-28 2007-10-04 Nautilus Biotech, S.A. MODIFIED INTERFERON-β (IFN-β) POLYPEPTIDES
JO3324B1 (ar) 2006-04-21 2019-03-13 Amgen Inc مركبات علاجية مجففة بالتبريد تتعلق بالعصارة الهضمية
MX2008014971A (es) 2006-05-24 2008-12-05 Serono Lab Regimen de cladribine para tratar esclerosis multiple.
US8414897B1 (en) * 2006-10-02 2013-04-09 The Uab Research Foundation Pathway for Th-17 cell development and methods utilizing same
FR2907454B1 (fr) * 2006-10-18 2009-01-23 Biomethodes Sa Variants ameliores de l'interferon beta humain
WO2008137471A2 (en) 2007-05-02 2008-11-13 Ambrx, Inc. Modified interferon beta polypeptides and their uses
US20090304719A1 (en) 2007-08-22 2009-12-10 Patrick Daugherty Activatable binding polypeptides and methods of identification and use thereof
BRPI0817108B8 (pt) 2007-09-21 2021-05-25 Univ California composição compreendendo uma proteína de fusão, kit compreendendo a referida composição e uso da mesma.
US20100203009A1 (en) * 2007-10-02 2010-08-12 The Uab Research Foundation Pathway for Th-17 Cell Development and Methods Utilizing Same
AU2008314697B2 (en) * 2007-10-22 2013-08-29 Merck Serono S.A. Single IFN-beta fused to a mutated lgG Fc fragment
SG188143A1 (en) 2008-02-08 2013-03-28 Ambrx Inc Modified leptin polypeptides and their uses
US10138283B2 (en) 2008-07-23 2018-11-27 Ambrx, Inc. Modified bovine G-CSF polypeptides and their uses
MX2011000861A (es) 2008-07-23 2011-06-21 Hanmi Holdings Co Ltd Un complejo polipeptidico que consiste en un polimero no-peptidil que posee tres terminaciones funcionales.
RU2636046C2 (ru) 2009-01-12 2017-11-17 Сайтомкс Терапьютикс, Инк Композиции модифицированных антител, способы их получения и применения
BRPI1011384A2 (pt) 2009-02-23 2016-03-15 Cytomx Therapeutics Inc pro-proteinas e seus metodos de uso
CA2759333A1 (en) 2009-04-22 2010-10-28 Merck Patent Gmbh Antibody fusion proteins with modified fcrn binding sites
US9663778B2 (en) 2009-07-09 2017-05-30 OPKO Biologies Ltd. Long-acting coagulation factors and methods of producing same
BR112012015597A2 (pt) 2009-12-21 2017-01-31 Ambrx Inc peptídeos de somatotropina suínos modificados e seus usos
MX349301B (es) 2009-12-21 2017-07-21 Ambrx Inc Polipéptidos de somatotropina bovina modificados y sus usos.
HUE025878T2 (en) * 2010-02-12 2016-05-30 Biogen Ma Inc Neuroprotection in demyelinating diseases
US9308277B2 (en) 2010-02-25 2016-04-12 Mesoblast International Sàrl Protease-resistant mutants of stromal cell derived factor-1 in the repair of tissue damage
AR080993A1 (es) 2010-04-02 2012-05-30 Hanmi Holdings Co Ltd Formulacion de accion prolongada de interferon beta donde se usa un fragmento de inmunoglobulina
AR083006A1 (es) 2010-09-23 2013-01-23 Lilly Co Eli Formulaciones para el factor estimulante de colonias de granulocitos (g-csf) bovino y variantes de las mismas
CN103747795A (zh) * 2011-06-07 2014-04-23 美索布拉斯特国际有限公司 使用基质细胞衍生因子-1的蛋白酶抵抗突变体修复组织损伤的方法
SG10201602076QA (en) 2011-10-01 2016-04-28 Glytech Inc Glycosylated polypeptide and pharmaceutical composition containing same
EP3559049A4 (en) 2011-10-28 2019-12-04 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd POLYPEPTIDE CONSTRUCTS AND APPLICATIONS THEREOF
MY167814A (en) 2012-04-19 2018-09-26 Opko Biologics Ltd Long-acting oxyntomodulin variants and methods of producing same
US9783589B2 (en) * 2012-08-13 2017-10-10 Immungene Inc Engineered antibody-interferon fusion molecules for treatment of autoimmune diseases
CA2891393A1 (en) 2012-11-20 2014-05-30 Opko Biologics Ltd. Method of increasing the hydrodynamic volume of polypeptides by attaching to gonadotrophin carboxy terminal peptides
US9803021B2 (en) 2012-12-07 2017-10-31 The Regents Of The University Of California CD138-targeted interferon demonstrates potent apoptotic and anti-tumor activities
KR102073748B1 (ko) 2013-01-31 2020-02-05 한미약품 주식회사 재조합 효모 형질전환체 및 이를 이용하여 면역글로불린 단편을 생산하는 방법
CN104334574B (zh) 2013-03-29 2020-01-14 株式会社糖锁工学研究所 附加唾液酸化糖链的多肽
US11117975B2 (en) 2013-04-29 2021-09-14 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd Anti-CD38 antibodies and fusions to attenuated interferon alpha-2B
EP2992013B1 (en) 2013-04-29 2019-12-04 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd Anti-cd38 antibodies and fusions to attenuated interferon alpha-2b
CN106967175A (zh) * 2013-05-15 2017-07-21 复旦大学 长效干扰素及其制备方法和用途
US10093745B2 (en) 2013-05-29 2018-10-09 The Regents Of The University Of California Anti-CSPG4 fusions with interferon for the treatment of malignancy
AR096891A1 (es) 2013-07-12 2016-02-03 Hanmi Pharm Ind Co Ltd Conjugado de monómero polipéptido biológicamente activo y conjugado de fragmento fc de inmunoglobulina, que muestra aclaramiento mediado por receptor reducido, y el método para la preparación del mismo
US20150158926A1 (en) 2013-10-21 2015-06-11 Opko Biologics, Ltd. Long-acting polypeptides and methods of producing and administering same
EP3083977B1 (en) 2013-12-20 2018-02-28 F. Hoffmann-La Roche AG Improved recombinant polypeptide production methods
UA119352C2 (uk) 2014-05-01 2019-06-10 Тева Фармасьютикалз Острейліа Пті Лтд Комбінація леналідоміду або помалідоміду і конструкції анти-cd38 антитіло-атенуйований інтерферон альфа-2b та спосіб лікування суб'єкта, який має cd38-експресуючу пухлину
AU2015337858B2 (en) 2014-10-29 2020-09-24 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd. Interferon alpha2b variants
CN108289851B (zh) 2015-06-19 2021-06-01 Opko生物科学有限公司 长效凝固因子及其产生方法
DK3313879T3 (da) 2015-06-24 2022-03-14 Hoffmann La Roche Anti-transferrinreceptor-antistoffer med tilpasset affinitet
AR106189A1 (es) 2015-10-02 2017-12-20 Hoffmann La Roche ANTICUERPOS BIESPECÍFICOS CONTRA EL A-b HUMANO Y EL RECEPTOR DE TRANSFERRINA HUMANO Y MÉTODOS DE USO
CN114014936A (zh) 2015-10-02 2022-02-08 豪夫迈·罗氏有限公司 双特异性抗人cd20/人转铁蛋白受体抗体及使用方法
US11236141B2 (en) * 2016-05-13 2022-02-01 Orionis Biosciences BV Targeted mutant interferon-beta and uses thereof
KR102506179B1 (ko) * 2020-01-23 2023-03-06 주식회사 제넥신 Pd-l1 단백질이 포함된 융합 단백질 및 이의 용도
JP2023520468A (ja) * 2020-04-03 2023-05-17 ザ ユニバーシティ オブ ノース カロライナ アット チャペル ヒル Ace2標的化ウイルスに対して有用な結合タンパク質

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1983002461A1 (en) * 1982-01-19 1983-07-21 Cetus Corp Multiclass hybrid interferons
WO1997024137A1 (en) * 1995-12-28 1997-07-10 Tanox Biosystems, Inc. HYBRID WITH INTERFERON-α AND AN IMMUNOGLOBULIN Fc LINKED THROUGH A NON-IMMUNOGENIC PEPTIDE
EP1121382A2 (en) * 1998-10-16 2001-08-08 Biogen, Inc. Interferon-beta fusion proteins and uses

Family Cites Families (67)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3359030A (en) * 1966-12-16 1967-12-19 Newman George Bumper guard assembly
US4179337A (en) 1973-07-20 1979-12-18 Davis Frank F Non-immunogenic polypeptides
US4002531A (en) 1976-01-22 1977-01-11 Pierce Chemical Company Modifying enzymes with polyethylene glycol and product produced thereby
US4414147A (en) 1981-04-17 1983-11-08 Massachusetts Institute Of Technology Methods of decreasing the hydrophobicity of fibroblast and other interferons
US6936694B1 (en) 1982-05-06 2005-08-30 Intermune, Inc. Manufacture and expression of large structural genes
DE3380726D1 (en) 1982-06-24 1989-11-23 Japan Chem Res Long-acting composition
GB8334102D0 (en) 1983-12-21 1984-02-01 Searle & Co Interferons with cysteine pattern
EP0154316B1 (en) 1984-03-06 1989-09-13 Takeda Chemical Industries, Ltd. Chemically modified lymphokine and production thereof
GB8412564D0 (en) * 1984-05-17 1984-06-20 Searle & Co Structure and properties
US4917888A (en) 1985-06-26 1990-04-17 Cetus Corporation Solubilization of immunotoxins for pharmaceutical compositions using polymer conjugation
JP2524586B2 (ja) * 1985-06-26 1996-08-14 シタス コーポレイション ポリマ−接合を利用する医薬組成物用蛋白質の可溶化
US4766106A (en) * 1985-06-26 1988-08-23 Cetus Corporation Solubilization of proteins for pharmaceutical compositions using polymer conjugation
US4935233A (en) * 1985-12-02 1990-06-19 G. D. Searle And Company Covalently linked polypeptide cell modulators
JP2514950B2 (ja) 1986-03-10 1996-07-10 エフ・ホフマン―ラ ロシユ アーゲー 化学修飾蛋白質,その製造法および中間体
JPS63152393A (ja) 1986-07-03 1988-06-24 Takeda Chem Ind Ltd グリコシル誘導体
US4868802A (en) * 1986-07-28 1989-09-19 Kabushiki Kaisha Toshiba Magnetooptic recording and erasing head which performs biasing, tracking and focusing
US4894226A (en) 1986-11-14 1990-01-16 Cetus Corporation Solubilization of proteins for pharmaceutical compositions using polyproline conjugation
US4904584A (en) 1987-12-23 1990-02-27 Genetics Institute, Inc. Site-specific homogeneous modification of polypeptides
US4847325A (en) 1988-01-20 1989-07-11 Cetus Corporation Conjugation of polymer to colony stimulating factor-1
CA1340810C (en) 1988-03-31 1999-11-02 Motoo Yamasaki Polypeptide derivatives of human granulocyte colony stimulating factor
JPH04502011A (ja) 1988-11-23 1992-04-09 ジェネンテク,インコーポレイテッド ポリペプチド誘導体
DE68925966T2 (de) 1988-12-22 1996-08-29 Kirin Amgen Inc Chemisch modifizierte granulocytenkolonie erregender faktor
US5116964A (en) * 1989-02-23 1992-05-26 Genentech, Inc. Hybrid immunoglobulins
US5286637A (en) 1989-08-07 1994-02-15 Debiopharm, S.A. Biologically active drug polymer derivatives and method for preparing same
JPH04218000A (ja) 1990-02-13 1992-08-07 Kirin Amgen Inc 修飾ポリペプチド
US5252714A (en) 1990-11-28 1993-10-12 The University Of Alabama In Huntsville Preparation and use of polyethylene glycol propionaldehyde
SG47099A1 (en) 1991-03-15 1998-03-20 Amgen Boulder Inc Pegylation of polypeptides
US5595732A (en) 1991-03-25 1997-01-21 Hoffmann-La Roche Inc. Polyethylene-protein conjugates
WO1993000109A1 (en) 1991-06-28 1993-01-07 Genentech, Inc. Method of stimulating immune response using growth hormone
US5281698A (en) 1991-07-23 1994-01-25 Cetus Oncology Corporation Preparation of an activated polymer ester for protein conjugation
WO1993012145A1 (en) 1991-12-19 1993-06-24 Baylor College Of Medicine Pva or peg conjugates of peptides for epitope-specific immunosuppression
ZA933926B (en) 1992-06-17 1994-01-03 Amgen Inc Polyoxymethylene-oxyethylene copolymers in conjuction with blomolecules
US5255519A (en) 1992-08-14 1993-10-26 Millennium Technologies, Inc. Method and apparatus for increasing efficiency and productivity in a power generation cycle
US5382657A (en) 1992-08-26 1995-01-17 Hoffmann-La Roche Inc. Peg-interferon conjugates
AU5098193A (en) 1992-09-01 1994-03-29 Berlex Laboratories, Inc. Glycolation of glycosylated macromolecules
US5298410A (en) 1993-02-25 1994-03-29 Sterling Winthrop Inc. Lyophilized formulation of polyethylene oxide modified proteins with increased shelf-life
US5359030A (en) 1993-05-10 1994-10-25 Protein Delivery, Inc. Conjugation-stabilized polypeptide compositions, therapeutic delivery and diagnostic formulations comprising same, and method of making and using the same
US5681811A (en) 1993-05-10 1997-10-28 Protein Delivery, Inc. Conjugation-stabilized therapeutic agent compositions, delivery and diagnostic formulations comprising same, and method of making and using the same
US5874075A (en) 1993-10-06 1999-02-23 Amgen Inc. Stable protein: phospholipid compositions and methods
US5643575A (en) 1993-10-27 1997-07-01 Enzon, Inc. Non-antigenic branched polymer conjugates
US5951974A (en) 1993-11-10 1999-09-14 Enzon, Inc. Interferon polymer conjugates
PT730470E (pt) 1993-11-10 2002-08-30 Enzon Inc Conjugados melhorados de interferao-polimero
DE69534676T2 (de) 1994-02-08 2006-08-17 Amgen Inc., Thousand Oaks Orale Verabreichung von chemisch modifizierten Proteinen
US5545723A (en) 1994-03-15 1996-08-13 Biogen Inc. Muteins of IFN-β
GB9415379D0 (en) * 1994-07-29 1994-09-21 Smithkline Beecham Plc Novel compounds
US5824784A (en) 1994-10-12 1998-10-20 Amgen Inc. N-terminally chemically modified protein compositions and methods
US5738846A (en) 1994-11-10 1998-04-14 Enzon, Inc. Interferon polymer conjugates and process for preparing the same
CA2206852A1 (en) 1994-12-07 1996-06-13 Novo Nordisk A/S Polypeptide with reduced allergenicity
US5672662A (en) 1995-07-07 1997-09-30 Shearwater Polymers, Inc. Poly(ethylene glycol) and related polymers monosubstituted with propionic or butanoic acids and functional derivatives thereof for biotechnical applications
KR0154850B1 (ko) * 1995-10-09 1998-10-15 김광호 바이씨모스 및 그의 제조방법
US5702717A (en) 1995-10-25 1997-12-30 Macromed, Inc. Thermosensitive biodegradable polymers based on poly(ether-ester)block copolymers
US5908621A (en) 1995-11-02 1999-06-01 Schering Corporation Polyethylene glycol modified interferon therapy
US5747639A (en) 1996-03-06 1998-05-05 Amgen Boulder Inc. Use of hydrophobic interaction chromatography to purify polyethylene glycols
ATE200030T1 (de) 1997-01-29 2001-04-15 Polymasc Pharmaceuticals Plc Pegylationsverfahren
US5990237A (en) 1997-05-21 1999-11-23 Shearwater Polymers, Inc. Poly(ethylene glycol) aldehyde hydrates and related polymers and applications in modifying amines
NZ502375A (en) 1997-07-14 2001-11-30 Bolder Biotechnology Inc The addition of non-natural cysteine derivatives to cause the protein to act as antagonists of the GH family
US6180095B1 (en) 1997-12-17 2001-01-30 Enzon, Inc. Polymeric prodrugs of amino- and hydroxyl-containing bioactive agents
US5981709A (en) 1997-12-19 1999-11-09 Enzon, Inc. α-interferon-polymer-conjugates having enhanced biological activity and methods of preparing the same
US5985263A (en) 1997-12-19 1999-11-16 Enzon, Inc. Substantially pure histidine-linked protein polymer conjugates
US5965119A (en) 1997-12-30 1999-10-12 Enzon, Inc. Trialkyl-lock-facilitated polymeric prodrugs of amino-containing bioactive agents
ES2307865T3 (es) 1998-03-12 2008-12-01 Nektar Therapeutics Al, Corporation Metodo para preparar conjugados polimericos.
CA2330451A1 (en) 1998-04-28 1999-11-04 Applied Research Systems Ars Holding N.V. Polyol-ifn-beta conjugates
US6703381B1 (en) 1998-08-14 2004-03-09 Nobex Corporation Methods for delivery therapeutic compounds across the blood-brain barrier
ES2630278T3 (es) 1998-10-16 2017-08-21 Biogen Ma Inc. Conjugados poliméricos de interferón beta-1a y usos de los mismos
BR0013638A (pt) 1999-08-27 2002-05-14 Maxygen Aps Novas moléculas semelhantes a interferon beta
MXPA02006216A (es) 1999-12-22 2004-02-26 Nektar Therapeutics Al Corp Derivados estericamente impedidos de polimeros solubles en agua.
US20080033818A1 (en) 2005-03-17 2008-02-07 Inc2 Webcom Ltd. Real time interactive response system and methods

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1983002461A1 (en) * 1982-01-19 1983-07-21 Cetus Corp Multiclass hybrid interferons
WO1997024137A1 (en) * 1995-12-28 1997-07-10 Tanox Biosystems, Inc. HYBRID WITH INTERFERON-α AND AN IMMUNOGLOBULIN Fc LINKED THROUGH A NON-IMMUNOGENIC PEPTIDE
EP1121382A2 (en) * 1998-10-16 2001-08-08 Biogen, Inc. Interferon-beta fusion proteins and uses

Also Published As

Publication number Publication date
JP2010268810A (ja) 2010-12-02
SK5102001A3 (en) 2003-03-04
MXPA01003790A (es) 2002-09-18
NO20011861L (no) 2001-06-13
WO2000023472A2 (en) 2000-04-27
CY1105173T1 (el) 2010-03-03
IL142350A0 (en) 2002-03-10
KR20010085932A (ko) 2001-09-07
DK1121382T3 (da) 2006-11-13
IS5887A (is) 2001-03-14
US7527946B2 (en) 2009-05-05
ES2265693T3 (es) 2007-02-16
KR100767649B1 (ko) 2007-10-17
IL142350A (en) 2007-07-04
BR9915548A (pt) 2001-08-14
CZ20011330A3 (cs) 2001-09-12
AU766190B2 (en) 2003-10-09
WO2000023472A3 (en) 2000-08-31
ATE327254T1 (de) 2006-06-15
HUP0200414A2 (en) 2002-06-29
PT1121382E (pt) 2006-10-31
PL347932A1 (en) 2002-04-22
US20050214253A1 (en) 2005-09-29
EA200100447A1 (ru) 2001-10-22
US20090286958A1 (en) 2009-11-19
PL200586B1 (pl) 2009-01-30
US6800735B2 (en) 2004-10-05
EA005005B1 (ru) 2004-10-28
SK287491B6 (sk) 2010-11-08
CA2343094A1 (en) 2000-04-27
DE69931507D1 (de) 2006-06-29
CN100480266C (zh) 2009-04-22
AU1315800A (en) 2000-05-08
JP4761621B2 (ja) 2011-08-31
EE05111B1 (et) 2008-12-15
EE200100223A (et) 2002-06-17
EP1121382B1 (en) 2006-05-24
NZ510559A (en) 2003-12-19
HK1042098A1 (en) 2002-08-02
US20020155547A1 (en) 2002-10-24
HK1042098B (zh) 2009-10-30
NO20011861D0 (no) 2001-04-11
DE69931507T2 (de) 2007-01-11
JP2002527100A (ja) 2002-08-27
CN1333785A (zh) 2002-01-30
TR200101087T2 (tr) 2001-09-21
EP1121382B9 (en) 2007-07-04
EP1121382A2 (en) 2001-08-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CZ300762B6 (cs) Fúzní proteiny interferonu-beta-1a a jejich použití
JP5396358B2 (ja) インターフェロン−β−1aのポリマー結合体および使用
JP2002527100A5 (cs)
JP2002527491A5 (cs)
EP1739090A2 (en) Interferon-beta fusion proteins and uses
MXPA01003791A (es) Conjugados polimericos de interferon beta - 1a y usos de los mismos

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20121015